Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000164556 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00960000187029 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 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ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00980000200525 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00980000200525 ENSGT00390000007818 #22 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ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Murinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000015359 #7 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.qb.b.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Mus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000015359 #7 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 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ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.qb.b.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a.i #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Golden Hamster MODERN SPECIES 654 Mvd (ENSMAUG00000020072) #7 Snai3 (ENSMAUG00000001685) #8 Rnf166 (ENSMAUG00000018616) #9 Ctu2 (ENSMAUG00000020048) #10 Piezo1 (ENSMAUG00000021717) #11 Cdt1 (ENSMAUG00000022237) #12 Aprt (ENSMAUG00000021299) #13 Galns (ENSMAUG00000021453) #14 Trappc2l (ENSMAUG00000018071) #15 Pabpn1l 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ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.qb.b.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a.i #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 12 Mvd (ENSMOCG00000022955) #7 Snai3 (ENSMOCG00000003536) #8 Rnf166 (ENSMOCG00000018742) #9 Ctu2 (ENSMOCG00000004755) #10 Piezo1 (ENSMOCG00000008460) #11 Cdt1 (ENSMOCG00000008713) #12 Aprt (ENSMOCG00000000737) #13 Galns (ENSMOCG00000009269) #14 ENSMOCG00000017231 #15 Pabpn1l (ENSMOCG00000007955) #16 Cbfa2t3 (ENSMOCG00000021007) #17 Acsf3 (ENSMOCG00000016996) #18 Cdh15 (ENSMOCG00000003048) #19 ENSMOCG00000003172 #20 Spg7 (ENSMOCG00000022814) #21 ENSMOCG00000009058 #22 Cpne7 (ENSMOCG00000016113) #23 Sult5a1 (ENSMOCG00000018322) #24 Dpep1 (ENSMOCG00000003603) #25 ENSMOCG00000006103 #26 ENSMOCG00000002553 #27 ENSMOCG00000019950 Cdk10 (ENSMOCG00000013570) #28 Spata2l (ENSMOCG00000001425) #29 ENSMOCG00000022018 #30 Zfp276 (ENSMOCG00000005818) #31 ENSMOCG00000014977 #32 Spire2 (ENSMOCG00000004491) #33 Tcf25 (ENSMOCG00000019952) #34 Tubb3 (ENSMOCG00000006039) #36 Def8 (ENSMOCG00000002074) #37 Prairie vole MODERN SPECIES 353 ENSMOCG00000001905 Tigd2 (ENSMOCG00000011023) Fam13a (ENSMOCG00000014628) Herc3 (ENSMOCG00000021374) Nap1l5 (ENSMOCG00000006906) Abcg2 (ENSMOCG00000012726) ENSMOCG00000013438 Fkbp1b (ENSMOCG00000012542) Wdcp (ENSMOCG00000013612) Mfsd2b (ENSMOCG00000012318) Ubxn2a (ENSMOCG00000020669) Atad2b (ENSMOCG00000000408) Klhl29 (ENSMOCG00000007430) ENSMOCG00000012724 ENSMOCG00000013271 ENSMOCG00000002216 #22 Apob (ENSMOCG00000021753) Gdf7 (ENSMOCG00000010905) ENSMOCG00000021323 Hs1bp3 (ENSMOCG00000022226) Rhob 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SPECIES 1108 Rnf166 (ENSNGAG00000021980) #9 Ctu2 (ENSNGAG00000023366) #10 Piezo1 (ENSNGAG00000017101) #11 Cdt1 (ENSNGAG00000022315) #12 ENSNGAG00000016112 #13 Galns (ENSNGAG00000022107) #14 ENSNGAG00000024083 #15 Pabpn1l (ENSNGAG00000023992) #16 Cbfa2t3 (ENSNGAG00000016320) #17 Acsf3 (ENSNGAG00000022957) #18 Cdh15 (ENSNGAG00000016069) #19 Ankrd11 (ENSNGAG00000015118) #20 ENSNGAG00000008560 #20 ENSNGAG00000024166 Spg7 (ENSNGAG00000020726) #21 Rpl13 (ENSNGAG00000018467) ##22 Cpne7 (ENSNGAG00000023423) #23 Sult5a1 (ENSNGAG00000022110) #24 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 15 Tvp23b (ENSMOCG00000018047) Fbxw10 (ENSMOCG00000004826) Zfp286 (ENSMOCG00000019959) Zfp287 (ENSMOCG00000021290) ENSMOCG00000003144 Lrrc75a (ENSMOCG00000005975) Trpv2 (ENSMOCG00000005798) ENSMOCG00000009869 Cenpv (ENSMOCG00000022318) Pigl (ENSMOCG00000003178) Ncor1 (ENSMOCG00000020819) Ttc19 (ENSMOCG00000022785) Zswim7 (ENSMOCG00000015607) Adora2b (ENSMOCG00000012952) Specc1 (ENSMOCG00000016774) ENSMOCG00000011602 ##22 Akap10 (ENSMOCG00000017550) Ulk2 (ENSMOCG00000012863) Prpsap2 (ENSMOCG00000001958) Slc5a10 (ENSMOCG00000015473) Fam83g (ENSMOCG00000018318) Grap (ENSMOCG00000020247) Epn2 (ENSMOCG00000017784) B9d1 (ENSMOCG00000010416) Mapk7 (ENSMOCG00000018009) Mfap4 (ENSMOCG00000012652) Rnf112 (ENSMOCG00000010911) Slc47a1 (ENSMOCG00000013787) Slc47a2 (ENSMOCG00000016547) Aldh3a2 (ENSMOCG00000018442) Aldh3a1 (ENSMOCG00000014708) Prairie vole MODERN SPECIES 13 ENSMOCG00000021474 ENSMOCG00000008845 ENSMOCG00000020404 Or8b49 (ENSMOCG00000018010) Or8b44 (ENSMOCG00000012548) ENSMOCG00000005803 ENSMOCG00000015638 ENSMOCG00000020879 ENSMOCG00000005209 ENSMOCG00000005898 Or8c9 (ENSMOCG00000006717) Or8c15 (ENSMOCG00000005900) Or8c17 (ENSMOCG00000005410) ENSMOCG00000006586 ENSMOCG00000017544 ENSMOCG00000016985 ##22 Or8b39 (ENSMOCG00000012341) Or8b101 (ENSMOCG00000010544) ENSMOCG00000001106 Or8b8 (ENSMOCG00000006874) Or8b12c (ENSMOCG00000011599) ENSMOCG00000006202 ENSMOCG00000021221 ENSMOCG00000008143 Panx3 (ENSMOCG00000004239) Tbrg1 (ENSMOCG00000018217) Siae (ENSMOCG00000020482) Spa17 (ENSMOCG00000014358) Nrgn (ENSMOCG00000013776) Vsig2 (ENSMOCG00000013088) Esam (ENSMOCG00000011840) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Mvd (ENSPEMG00000018457) #7 Snai3 (ENSPEMG00000029324) #8 Rnf166 (ENSPEMG00000018748) #9 Ctu2 (ENSPEMG00000016552) #10 Cdt1 (ENSPEMG00000010002) #12 Aprt (ENSPEMG00000007366) #13 Galns (ENSPEMG00000018911) #14 Trappc2l (ENSPEMG00000026189) #15 Pabpn1l (ENSPEMG00000016624) #16 Cbfa2t3 (ENSPEMG00000008145) #17 Acsf3 (ENSPEMG00000014608) #18 Cdh15 (ENSPEMG00000018346) #19 Ankrd11 (ENSPEMG00000015479) #20 ENSPEMG00000027773 Spg7 (ENSPEMG00000016642) #21 Rpl13 (ENSPEMG00000010342) ##22 Cpne7 (ENSPEMG00000013758) #23 Sult5a1 (ENSPEMG00000007963) #24 Dpep1 (ENSPEMG00000012103) #25 Chmp1a (ENSPEMG00000013566) #26 ENSPEMG00000018787 #27 Cdk10 (ENSPEMG00000012841) #28 Spata2l (ENSPEMG00000027370) #29 ENSPEMG00000025161 #30 Fanca (ENSPEMG00000017722) #32 Spire2 (ENSPEMG00000000826) #33 Tcf25 (ENSPEMG00000016492) #34 Mc1r (ENSPEMG00000006381) #35 Tubb3 (ENSPEMG00000019163) #36 Def8 (ENSPEMG00000009051) #37 Afg3l1 (ENSPEMG00000008295) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Rat MODERN SPECIES 13 Ift52 (ENSRNOG00000007692) Sgk2 (ENSRNOG00000033573) L3mbtl1 (ENSRNOG00000007044) Srsf6 (ENSRNOG00000006380) Ptprt (ENSRNOG00000032656) Chd6 (ENSRNOG00000016744) Emilin3 (ENSRNOG00000016734) Lpin3 (ENSRNOG00000016636) Zhx3 (ENSRNOG00000027988) Plcg1 (ENSRNOG00000051490) Top1 (ENSRNOG00000047611) ENSRNOG00000066616 Mafb (ENSRNOG00000016037) Dhx35 (ENSRNOG00000015928) Fam83d (ENSRNOG00000015794) LOC120101775 (ENSRNOG00000029227) ##22 Ppp1r16b (ENSRNOG00000015614) Actr5 (ENSRNOG00000023989) Slc32a1 (ENSRNOG00000015393) Arhgap40 (ENSRNOG00000015359) Ralgapb (ENSRNOG00000014836) ENSRNOG00000065727 Lbp (ENSRNOG00000014532) Bpi (ENSRNOG00000034195) Kiaa1755 (ENSRNOG00000014424) Tgm2 (ENSRNOG00000012956) Rprd1b (ENSRNOG00000012923) Tti1 (ENSRNOG00000012880) Vstm2l (ENSRNOG00000034031) Mpc1l-ps3 (ENSRNOG00000049208) Ctnnbl1 (ENSRNOG00000012021) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Shrew mouse MODERN SPECIES 12 Abce1 (MGP_PahariEiJ_G0022857) MGP_PahariEiJ_G0022856 Smad1 (MGP_PahariEiJ_G0022855) Mmaa (MGP_PahariEiJ_G0022854) 1700011L22Rik (MGP_PahariEiJ_G0022853) MGP_PahariEiJ_G0022852 Lsm6 (MGP_PahariEiJ_G0022851) Slc10a7 (MGP_PahariEiJ_G0022850) MGP_PahariEiJ_G0022849 Pou4f2 (MGP_PahariEiJ_G0022848) Ttc29 (MGP_PahariEiJ_G0022847) Ednra (MGP_PahariEiJ_G0022846) MGP_PahariEiJ_G0022845 Arhgap10 (MGP_PahariEiJ_G0022844) Nr3c2 (MGP_PahariEiJ_G0022843) MGP_PahariEiJ_G0022842 ##22 MGP_PahariEiJ_G0022841 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.b.b ##22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2931 ENSMSIG00000008113 Ska3 (ENSMSIG00000008137) Mrpl57 (ENSMSIG00000008177) ENSMSIG00000008195 Micu2 (ENSMSIG00000008286) ENSMSIG00000008391 ENSMSIG00000008451 ##22 ENSMSIG00000008463 ENSMSIG00000008485 Rcbtb1 (ENSMSIG00000008493) Steppe mouse MODERN SPECIES 3305 Ddx52 (ENSMSIG00000012043) Synrg (ENSMSIG00000011874) Dusp14 (ENSMSIG00000011867) Tada2a (ENSMSIG00000011818) Gm11437 (ENSMSIG00000011800) Acaca (ENSMSIG00000011559) Aatf (ENSMSIG00000011523) Lhx1 (ENSMSIG00000011492) Mrm1 (ENSMSIG00000011460) Dhrs11 (ENSMSIG00000011441) Ggnbp2 (ENSMSIG00000011309) Pigw (ENSMSIG00000011294) Myo19 (ENSMSIG00000011255) Znhit3 (ENSMSIG00000011245) Car4 (ENSMSIG00000011228) ENSMSIG00000011217 ##22 Usp32 (ENSMSIG00000011103) Chct1 (ENSMSIG00000011050) ENSMSIG00000011045 Appbp2 (ENSMSIG00000010989) ENSMSIG00000010975 Ppm1d (ENSMSIG00000010931) Bcas3 (ENSMSIG00000010472) Tbx2 (ENSMSIG00000010345) Tbx4 (ENSMSIG00000010313) ENSMSIG00000010306 ENSMSIG00000010296 Ints2 (ENSMSIG00000010230) Med13 (ENSMSIG00000010075) Rnft1 (ENSMSIG00000010045) Rps6kb1 (ENSMSIG00000009982) spretus MODERN SPECIES 16 Osbpl5 (MGP_SPRETEiJ_G0031854) Tnfrsf26 (MGP_SPRETEiJ_G0031853) Cars (MGP_SPRETEiJ_G0031852) Nap1l4 (MGP_SPRETEiJ_G0031851) Phlda2 (MGP_SPRETEiJ_G0031850) Slc22a18 (MGP_SPRETEiJ_G0031849) Cdkn1c (MGP_SPRETEiJ_G0031848) Kcnq1 (MGP_SPRETEiJ_G0031847) Tssc4 (MGP_SPRETEiJ_G0031846) Trpm5 (MGP_SPRETEiJ_G0031845) Cd81 (MGP_SPRETEiJ_G0031844) Tspan32 (MGP_SPRETEiJ_G0031843) Ascl2 (MGP_SPRETEiJ_G0031842) Th (MGP_SPRETEiJ_G0031841) MGP_SPRETEiJ_G0031840 MGP_SPRETEiJ_G0031839 ##22 Ins2 (MGP_SPRETEiJ_G0031838) Igf2 (MGP_SPRETEiJ_G0031837) Mrpl23 (MGP_SPRETEiJ_G0031836) Tnnt3 (MGP_SPRETEiJ_G0031835) MGP_SPRETEiJ_G0031834 Lsp1 (MGP_SPRETEiJ_G0031833) Tnni2 (MGP_SPRETEiJ_G0031832) Syt8 (MGP_SPRETEiJ_G0031831) Ctsd (MGP_SPRETEiJ_G0031830) Ifitm10 (MGP_SPRETEiJ_G0031829) MGP_SPRETEiJ_G0031828 MGP_SPRETEiJ_G0031827 MGP_SPRETEiJ_G0031826 MGP_SPRETEiJ_G0031825 MGP_SPRETEiJ_G0031824 Mouse MODERN SPECIES 17 Mvd (ENSMUSG00000006517) #7 Snai3 (ENSMUSG00000006587) #8 Rnf166 (ENSMUSG00000014470) #9 Ctu2 (ENSMUSG00000049482) #10 Piezo1 (ENSMUSG00000014444) #11 Cdt1 (ENSMUSG00000006585) #12 Aprt (ENSMUSG00000006589) #13 Galns (ENSMUSG00000015027) #14 Trappc2l (ENSMUSG00000015013) #15 Pabpn1l (ENSMUSG00000069867) #16 Cbfa2t3 (ENSMUSG00000006362) #17 Acsf3 (ENSMUSG00000015016) #18 Cdh15 (ENSMUSG00000031962) #19 Ankrd11 (ENSMUSG00000035569) #20 Spg7 (ENSMUSG00000000738) #21 Rpl13 (ENSMUSG00000000740) ##22 Cpne7 (ENSMUSG00000034796) #23 Sult5a1 (ENSMUSG00000000739) #24 Dpep1 (ENSMUSG00000019278) #25 Chmp1a (ENSMUSG00000000743) #26 Spata33 (ENSMUSG00000048478) Cdk10 (ENSMUSG00000033862) #28 Spata2l (ENSMUSG00000033594) #29 Vps9d1 (ENSMUSG00000001062) #30 Zfp276 (ENSMUSG00000001065) #31 Fanca (ENSMUSG00000032815) #32 Spire2 (ENSMUSG00000010154) #33 Tcf25 (ENSMUSG00000001472) #34 Mc1r (ENSMUSG00000074037) #35 Tubb3 (ENSMUSG00000062380) #36 Def8 (ENSMUSG00000001482) #37 Muroidea DUPLICATION Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.a ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 188 ENSCGRG00001008839 Il36a (ENSCGRG00001005772) ENSCGRG00001015320 Tbpl2 (ENSCGRG00001015310) ENSCGRG00001009248 ENSCGRG00001001542 ENSCGRG00001024843 ENSCGRG00001008614 Spopl (ENSCGRG00001010346) Nxph2 (ENSCGRG00001024840) ENSCGRG00001024491 ENSCGRG00001009004 ENSCGRG00001012428 Kynu (ENSCGRG00001005556) Arhgap15 (ENSCGRG00001011371) ENSCGRG00001008381 ##22 Gtdc1 (ENSCGRG00001014426) ENSCGRG00001006690 Zeb2 (ENSCGRG00001003812) ENSCGRG00001000890 Acvr2a (ENSCGRG00001024754) Orc4 (ENSCGRG00001001352) Mbd5 (ENSCGRG00001001266) Epc2 (ENSCGRG00001024568) Kif5c (ENSCGRG00001021373) Lypd6b (ENSCGRG00001008503) Lypd6 (ENSCGRG00001009801) Mmadhc (ENSCGRG00001008423) Rnd3 (ENSCGRG00001018416) Tas2r134 (ENSCGRG00001008402) ENSCGRG00001014515 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1657 Cdc25a (ENSNGAG00000009307) Camp (ENSNGAG00000005185) Nme6 (ENSNGAG00000003988) Spink8 (ENSNGAG00000000582) ENSNGAG00000019896 Plxnb1 (ENSNGAG00000019575) Ccdc51 (ENSNGAG00000018471) Tma7 (ENSNGAG00000018078) ENSNGAG00000017174 Trex1 (ENSNGAG00000013292) ENSNGAG00000012072 ##22 Shisa5 (ENSNGAG00000000521) Pfkfb4 (ENSNGAG00000018540) ENSNGAG00000001944 Uqcrc1 (ENSNGAG00000018184) Tmem89 (ENSNGAG00000017089) ENSNGAG00000015652 ENSNGAG00000017439 Celsr3 (ENSNGAG00000021190) ENSNGAG00000018381 Ip6k2 (ENSNGAG00000017095) Prkar2a (ENSNGAG00000015534) Slc25a20 (ENSNGAG00000014160) Arih2 (ENSNGAG00000013630) P4htm (ENSNGAG00000006218) Wdr6 (ENSNGAG00000000962) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.b ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.b ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.qb.a.b ##22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 Atp6v1g1 (ENSCGRG00001012480) Tmem268 (ENSCGRG00001006011) Tex48 (ENSCGRG00001003062) Tnfsf15 (ENSCGRG00001002029) Tnfsf8 (ENSCGRG00001001108) Tnc (ENSCGRG00001018791) ENSCGRG00001006736 Pappa (ENSCGRG00001024813) Trim32 (ENSCGRG00001006161) Astn2 (ENSCGRG00001021662) TLR4 (ENSCGRG00001015165) ENSCGRG00001015949 Brinp1 (ENSCGRG00001000741) Cdk5rap2 (ENSCGRG00001010238) Megf9 (ENSCGRG00001023864) ENSCGRG00001023328 ##22 Tle1 (ENSCGRG00001010603) ENSCGRG00001003137 ENSCGRG00001001298 Rasef (ENSCGRG00001001324) 2310002L09Rik (ENSCGRG00001024634) ENSCGRG00001022505 Frmd3 (ENSCGRG00001020520) Kdm4c (ENSCGRG00001014973) ENSCGRG00001003314 Dmac1 (ENSCGRG00001012676) Ptprd (ENSCGRG00001001921) Tyrp1 (ENSCGRG00001020616) Lurap1l (ENSCGRG00001018238) ENSCGRG00001017051 Mpdz (ENSCGRG00001023758) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3273 Gm10229 (ENSMSIG00000012050) Krtap22-2 (ENSMSIG00000012058) Krtap19-9b (ENSMSIG00000012068) ENSMSIG00000012075 Krtap19-5 (ENSMSIG00000012077) Krtap19-4 (ENSMSIG00000012087) Krtap19-3 (ENSMSIG00000012094) ENSMSIG00000012101 ENSMSIG00000012114 Gm20741 (ENSMSIG00000012121) Gm5965 (ENSMSIG00000012131) 2310057N15Rik (ENSMSIG00000012151) Krtap13 (ENSMSIG00000012161) Krtap13-1 (ENSMSIG00000012169) 2310061N02Rik (ENSMSIG00000012174) ENSMSIG00000012180 ##22 Krtap27-1 (ENSMSIG00000012189) Krtap26-1 (ENSMSIG00000012203) 2310079G19Rik (ENSMSIG00000012210) Krtap24-1 (ENSMSIG00000012229) Cldn8 (ENSMSIG00000012231) Cldn17 (ENSMSIG00000012238) ENSMSIG00000012245 Grik1 (ENSMSIG00000012264) Bach1 (ENSMSIG00000012636) ENSMSIG00000012654 Cct8 (ENSMSIG00000012682) Usp16 (ENSMSIG00000012823) Rwdd2b (ENSMSIG00000012918) Ltn1 (ENSMSIG00000012949) N6amt1 (ENSMSIG00000013117) Rat MODERN SPECIES 10 Mvd (ENSRNOG00000013376) #7 Snai3 (ENSRNOG00000013586) #8 Rnf166 (ENSRNOG00000013777) #9 Ctu2 (ENSRNOG00000051531) #10 Piezo1 (ENSRNOG00000056786) #11 Cdt1 (ENSRNOG00000013970) #12 Aprt (ENSRNOG00000014405) #13 Galns (ENSRNOG00000014461) #14 Trappc2l (ENSRNOG00000014581) #15 Pabpn1l (ENSRNOG00000029558) #16 Cbfa2t3 (ENSRNOG00000014723) #17 Acsf3 (ENSRNOG00000015077) #18 Cdh15 (ENSRNOG00000027954) #19 Ankrd11 (ENSRNOG00000027906) #20 Spg7 (ENSRNOG00000015150) #21 Rpl13 (ENSRNOG00000015335) ##22 Cpne7 (ENSRNOG00000015397) #23 Sult5a1 (ENSRNOG00000015695) #24 Dpep1 (ENSRNOG00000015880) #25 Chmp1a (ENSRNOG00000016001) #26 Spata33 (ENSRNOG00000038239) #27 Cdk10 (ENSRNOG00000016088) #28 Spata2L (ENSRNOG00000016167) #29 Vps9d1 (ENSRNOG00000028904) #30 Zfp276 (ENSRNOG00000016631) #31 Fanca (ENSRNOG00000016706) #32 Spire2 (ENSRNOG00000016920) #33 ENSRNOG00000062740 Tcf25 (ENSRNOG00000017023) #34 Mc1r (ENSRNOG00000038193) #35 Tubb3 (ENSRNOG00000017209) #36 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Golden Hamster MODERN SPECIES 700 Elavl3 (ENSMAUG00000016478) ENSMAUG00000008578 Cnn1 (ENSMAUG00000007541) Elof1 (ENSMAUG00000001142) Acp5 (ENSMAUG00000012370) Pigyl (ENSMAUG00000001605) ENSMAUG00000008928 Zfp599 (ENSMAUG00000000404) Zfp810 (ENSMAUG00000011262) Anln (ENSMAUG00000010570) ENSMAUG00000006644 9530077C05Rik (ENSMAUG00000018284) Rp9 (ENSMAUG00000006605) Bbs9 (ENSMAUG00000002422) Bmper (ENSMAUG00000017842) ENSMAUG00000016802 ##22 Npsr1 (ENSMAUG00000019292) Dpy19l1 (ENSMAUG00000019389) ENSMAUG00000015304 Dpy19l2 (ENSMAUG00000010798) Tbx20 (ENSMAUG00000007495) Herpud2 (ENSMAUG00000014475) ENSMAUG00000019492 Eepd1 (ENSMAUG00000003184) B3gat1 (ENSMAUG00000009593) Glb1l2 (ENSMAUG00000009296) ENSMAUG00000009095 Acad8 (ENSMAUG00000001610) Thyn1 (ENSMAUG00000000216) Vps26b (ENSMAUG00000010974) Ncapd3 (ENSMAUG00000014768) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.pb ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 15 Sphk1 (ENSMOCG00000014553) Ube2o (ENSMOCG00000014113) Aanat (ENSMOCG00000017216) Rhbdf2 (ENSMOCG00000012993) Cygb (ENSMOCG00000018159) ENSMOCG00000013636 St6galnac2 (ENSMOCG00000014576) Mxra7 (ENSMOCG00000013027) Jmjd6 (ENSMOCG00000015284) Mettl23 (ENSMOCG00000013930) ENSMOCG00000013608 Mfsd11 (ENSMOCG00000021977) Mgat5b (ENSMOCG00000014069) Sec14l1 (ENSMOCG00000017183) Septin9 (ENSMOCG00000019545) ENSMOCG00000021875 ##22 Tnrc6c (ENSMOCG00000015879) Tmc6 (ENSMOCG00000014633) Tmc8 (ENSMOCG00000017792) 6030468B19Rik (ENSMOCG00000013691) Syngr2 (ENSMOCG00000013728) ENSMOCG00000013626 Afmid (ENSMOCG00000015815) Birc5 (ENSMOCG00000016425) Tmem235 (ENSMOCG00000016117) Tha1 (ENSMOCG00000016182) Socs3 (ENSMOCG00000021679) Pgs1 (ENSMOCG00000013984) Dnah17 (ENSMOCG00000021106) Cyth1 (ENSMOCG00000021929) Usp36 (ENSMOCG00000015065) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 383 ENSJJAG00000000236 #22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 127 Snai3 (ENSJJAG00000019934) #8 Rnf166 (ENSJJAG00000022145) #9 Ctu2 (ENSJJAG00000023678) #10 Piezo1 (ENSJJAG00000014795) #11 Cdt1 (ENSJJAG00000023219) #12 Aprt (ENSJJAG00000018585) #13 Galns (ENSJJAG00000011252) #14 Trappc2l (ENSJJAG00000017487) #15 ENSJJAG00000017894 Pabpn1l (ENSJJAG00000006433) #16 Cbfa2t3 (ENSJJAG00000023795) #17 Acsf3 (ENSJJAG00000016704) #18 Cdh15 (ENSJJAG00000005187) #19 ENSJJAG00000015097 #20 Spg7 (ENSJJAG00000008061) #21 Rpl13 (ENSJJAG00000014012) #22 Cpne7 (ENSJJAG00000000879) #23 Kangaroo rat MODERN SPECIES 533 Cbfa2t3 (ENSDORG00000015966) #17 Acsf3 (ENSDORG00000012903) #18 Cdh15 (ENSDORG00000025114) #19 ENSDORG00000023552 #20 Spg7 (ENSDORG00000005698) #21 Rpl13 (ENSDORG00000028330) #22 Cpne7 (ENSDORG00000005124) #23 Sult5a1 (ENSDORG00000025066) #24 Dpep1 (ENSDORG00000008048) #25 Chmp1a (ENSDORG00000023731) #26 ENSDORG00000027254 #27 Cdk10 (ENSDORG00000015084) #28 Vps9d1 (ENSDORG00000014825) #30 ENSDORG00000012257 #31 Fanca (ENSDORG00000012259) #32 ENSDORG00000029115 Spire2 (ENSDORG00000007062) #33 Tcf25 (ENSDORG00000015303) #34 Tubb3 (ENSDORG00000015304) #36 Def8 (ENSDORG00000009220) #37 Afg3l1 (ENSDORG00000028343) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00980000200525 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 SNAI3 (ENSHGLG00000018681) #8 RNF166 (ENSHGLG00000014545) #9 CTU2 (ENSHGLG00000015988) #10 ENSHGLG00000036225 #11 ENSHGLG00000036618 #13 GALNS (ENSHGLG00000011517) #14 TRAPPC2L (ENSHGLG00000010329) #15 PABPN1L (ENSHGLG00000043697) #16 ENSHGLG00000032090 #17 ENSHGLG00000038565 #17 ENSHGLG00000044301 ENSHGLG00000037687 #18 ENSHGLG00000050558 #19 ENSHGLG00000045549 SPG7 (ENSHGLG00000012312) #21 RPL13 (ENSHGLG00000010880) #22 ENSHGLG00000042723 DPEP1 (ENSHGLG00000012033) #25 CHMP1A (ENSHGLG00000036077) #26 ENSHGLG00000013125 #27 CDK10 (ENSHGLG00000038945) #28 SPATA2L (ENSHGLG00000010915) #29 VPS9D1 (ENSHGLG00000009627) #30 ZNF276 (ENSHGLG00000011227) #31 FANCA (ENSHGLG00000010551) #32 SPIRE2 (ENSHGLG00000012720) #33 ENSHGLG00000044822 ENSHGLG00000018428 #34 MC1R (ENSHGLG00000020891) #35 ENSHGLG00000010365 #36 DEF8 (ENSHGLG00000006703) #37 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Guinea pig MODERN SPECIES 218 ACSF3 (ENSCPOG00000012945) #18 SLC22A31 (ENSCPOG00000019724) ANKRD11 (ENSCPOG00000006500) #20 SPG7 (ENSCPOG00000003104) #21 RPL13 (ENSCPOG00000027348) #22 CPNE7 (ENSCPOG00000025067) #23 ENSCPOG00000021466 #24 DPEP1 (ENSCPOG00000022907) #25 CHMP1A (ENSCPOG00000009844) #26 SPATA33 (ENSCPOG00000038142) #27 CDK10 (ENSCPOG00000032464) #28 SPATA2L (ENSCPOG00000002329) #29 VPS9D1 (ENSCPOG00000002331) #30 ZNF276 (ENSCPOG00000002334) #31 FANCA (ENSCPOG00000002341) #32 SPIRE2 (ENSCPOG00000000361) #33 TCF25 (ENSCPOG00000025156) #34 MC1R (ENSCPOG00000034209) #35 TUBB3 (ENSCPOG00000040330) #36 DEF8 (ENSCPOG00000030208) #37 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.d #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 248 SNAI3 (ENSCLAG00000000729) #8 RNF166 (ENSCLAG00000000806) #9 ENSCLAG00000000894 #10 PIEZO1 (ENSCLAG00000001688) #11 CDT1 (ENSCLAG00000002254) #12 APRT (ENSCLAG00000002341) #13 GALNS (ENSCLAG00000002856) #14 TRAPPC2L (ENSCLAG00000000646) #15 PABPN1L (ENSCLAG00000000704) #16 CBFA2T3 (ENSCLAG00000000863) #17 ACSF3 (ENSCLAG00000002959) #18 CDH15 (ENSCLAG00000001258) #19 ENSCLAG00000001462 ANKRD11 (ENSCLAG00000001054) #20 SPG7 (ENSCLAG00000001470) #21 RPL13 (ENSCLAG00000003801) #22 CPNE7 (ENSCLAG00000001931) #23 DPEP1 (ENSCLAG00000002340) #25 CHMP1A (ENSCLAG00000002472) #26 CDK10 (ENSCLAG00000002701) #28 SPATA2L (ENSCLAG00000002771) #29 VPS9D1 (ENSCLAG00000001120) #30 ZNF276 (ENSCLAG00000001566) #31 FANCA (ENSCLAG00000000722) #32 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#30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625 Bushbaby MODERN SPECIES 300 RNF166 (ENSOGAG00000030194) #9 CTU2 (ENSOGAG00000000420) #10 PIEZO1 (ENSOGAG00000025510) #11 CDT1 (ENSOGAG00000024919) #12 APRT (ENSOGAG00000033873) #13 GALNS (ENSOGAG00000000429) #14 TRAPPC2L (ENSOGAG00000000431) ##15 PABPN1L (ENSOGAG00000000433) #16 CBFA2T3 (ENSOGAG00000009704) #17 ACSF3 (ENSOGAG00000001315) #18 CDH15 (ENSOGAG00000031483) #19 ZNF778 (ENSOGAG00000027711) ANKRD11 (ENSOGAG00000027523) #20 ENSOGAG00000033895 SPG7 (ENSOGAG00000015790) #21 RPL13 (ENSOGAG00000026444) #22 CPNE7 (ENSOGAG00000001075) #23 DPEP1 (ENSOGAG00000004881) #25 ENSOGAG00000004883 #26 SPATA33 (ENSOGAG00000004885) #27 CDK10 (ENSOGAG00000004886) #28 SPATA2L (ENSOGAG00000028038) #29 VPS9D1 (ENSOGAG00000004889) #30 ZNF276 (ENSOGAG00000004891) #31 FANCA (ENSOGAG00000004893) #32 SPIRE2 (ENSOGAG00000004901) #33 TCF25 (ENSOGAG00000004904) #34 TUBB3 (ENSOGAG00000032833) #36 DEF8 (ENSOGAG00000004911) #37 ENSOGAG00000024894 DBNDD1 (ENSOGAG00000028679) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.c.b ##15 ENSGT00510000047505.c.a ##15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162638.A ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 169 ASB9 (ENSMICG00000003161) ASB11 (ENSMICG00000003169) PIGA (ENSMICG00000003170) VEGFD (ENSMICG00000003176) PIR (ENSMICG00000003180) BMX (ENSMICG00000003184) ACE2 (ENSMICG00000003198) ENSMICG00000034241 CLTRN (ENSMICG00000003210) ENSMICG00000003502 CA5B (ENSMICG00000047453) ZRSR2 (ENSMICG00000003211) ENSMICG00000037538 GRPR (ENSMICG00000026422) ENSMICG00000012169 ENSMICG00000043954 #22 CTPS2 (ENSMICG00000010839) S100G (ENSMICG00000034068) SYAP1 (ENSMICG00000000435) TXLNG (ENSMICG00000000438) RBBP7 (ENSMICG00000000440) REPS2 (ENSMICG00000003790) NHS (ENSMICG00000036975) ENSMICG00000027086 SCML2 (ENSMICG00000027531) CDKL5 (ENSMICG00000004179) RS1 (ENSMICG00000004198) PPEF1 (ENSMICG00000004203) PHKA2 (ENSMICG00000004212) ADGRG2 (ENSMICG00000004232) PDHA1 (ENSMICG00000004067) Mouse lemur MODERN SPECIES 12 SPATA2L (ENSMICG00000035332) #29 VPS9D1 (ENSMICG00000003280) #30 ZNF276 (ENSMICG00000003291) #31 ENSMICG00000028777 FANCA (ENSMICG00000003300) #32 SPIRE2 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ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625 ENSGT00390000018903 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 175 RNF166 (ENSPSMG00000009591) #9 CTU2 (ENSPSMG00000009614) #10 ENSPSMG00000009627 #11 ENSPSMG00000009632 #11 CDT1 (ENSPSMG00000009647) #12 APRT (ENSPSMG00000009665) #13 GALNS (ENSPSMG00000009716) #14 ENSPSMG00000009771 ##15 PABPN1L (ENSPSMG00000009791) #16 CBFA2T3 (ENSPSMG00000009813) #17 ACSF3 (ENSPSMG00000009839) #18 CDH15 (ENSPSMG00000009911) #19 ZNF778 (ENSPSMG00000009944) ANKRD11 (ENSPSMG00000010017) #20 SPG7 (ENSPSMG00000010197) #21 RPL13 (ENSPSMG00000010359) #22 CPNE7 (ENSPSMG00000010425) #23 DPEP1 (ENSPSMG00000010475) #25 CHMP1A (ENSPSMG00000010501) #26 SPATA33 (ENSPSMG00000010508) #27 CDK10 (ENSPSMG00000010584) #28 ENSPSMG00000010606 #29 VPS9D1 (ENSPSMG00000010618) #30 ENSPSMG00000010629 ZNF276 (ENSPSMG00000010649) #31 FANCA (ENSPSMG00000010673) #32 ENSPSMG00000010681 GAS8 (ENSPSMG00000010703) DBNDD1 (ENSPSMG00000010742) DEF8 (ENSPSMG00000010762) #37 TUBB3 (ENSPSMG00000011124) #36 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 691 ENSPCOG00000004893 #17 ACSF3 (ENSPCOG00000016026) #18 CDH15 (ENSPCOG00000025425) #19 ZNF778 (ENSPCOG00000014874) ANKRD11 (ENSPCOG00000028050) #20 SPG7 (ENSPCOG00000015112) #21 RPL13 (ENSPCOG00000024647) #22 CPNE7 (ENSPCOG00000015881) #23 DPEP1 (ENSPCOG00000022455) #25 CHMP1A (ENSPCOG00000013211) #26 SPATA33 (ENSPCOG00000027277) #27 CDK10 (ENSPCOG00000016730) #28 SPATA2L (ENSPCOG00000018121) #29 VPS9D1 (ENSPCOG00000024232) #30 ZNF276 (ENSPCOG00000028322) #31 FANCA (ENSPCOG00000020166) #32 SPIRE2 (ENSPCOG00000026681) #33 TCF25 (ENSPCOG00000017691) #34 TUBB3 (ENSPCOG00000014460) #36 DEF8 (ENSPCOG00000025405) #37 ENSPCOG00000021516 DBNDD1 (ENSPCOG00000023162) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.c.b ##15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000162638.A ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Tarsier MODERN SPECIES 1341 SPG7 (ENSTSYG00000036108) #21 RPL13 (ENSTSYG00000027423) #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505.c.b ##15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000162638.A ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00410000028565 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00910000147699 ENSGT00510000047505.c.b ##15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000162638.A ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115.q #36 ENSGT00940000159182 #37 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00410000028565 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00910000147699 ENSGT00510000047505.c.b ##15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000162638.A.e ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115.q #36 ENSGT00940000159182 #37 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00410000028565 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00910000147699 ENSGT00510000047505.c.b ##15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000162638.A.e ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115.q #36 ENSGT00940000159182 #37 Vervet Monkey MODERN SPECIES 3 STOM (ENSCSAG00000013314) ENSCSAG00000013306 GSN (ENSCSAG00000013301) RAB14 (ENSCSAG00000013289) CNTRL (ENSCSAG00000013276) C5 (ENSCSAG00000013241) TRAF1 (ENSCSAG00000013216) PHF19 (ENSCSAG00000013204) PSMD5 (ENSCSAG00000013195) FBXW2 (ENSCSAG00000013184) MEGF9 (ENSCSAG00000013180) CDK5RAP2 (ENSCSAG00000013169) ENSCSAG00000013154 ENSCSAG00000000477 BRINP1 (ENSCSAG00000013146) ENSCSAG00000000476 #22 TLR4 (ENSCSAG00000013135) ASTN2 (ENSCSAG00000013127) TRIM32 (ENSCSAG00000000475) PAPPA (ENSCSAG00000013073) ENSCSAG00000000474 TNC (ENSCSAG00000012989) TNFSF8 (ENSCSAG00000012974) TNFSF15 (ENSCSAG00000012970) TMEM268 (ENSCSAG00000012966) ATP6V1G1 (ENSCSAG00000012954) WHRN (ENSCSAG00000012951) AKNA (ENSCSAG00000012940) ORM1 (ENSCSAG00000012930) COL27A1 (ENSCSAG00000012833) KIF12 (ENSCSAG00000012590) Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00930000150941.x.a ENSGT00940000153541.C ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000004207 ENSGT00390000017273.B ENSGT00390000017273.A ENSGT00390000018626 ENSGT00940000159689 ENSGT00880000138014.b ENSGT01100000263545.a.b.d.b ENSGT00390000016206 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT00940000160827 ENSGT00530000064134.a.b ENSGT00390000007818.y.a #22 ENSGT00940000161464 ENSGT00940000159376 ENSGT00510000048078 ENSGT00940000159236 ENSGT00940000163620 ENSGT00940000153269.b.a ENSGT01030000234550.a.b ENSGT00390000012914 ENSGT00940000159430 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 Macaca ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00930000150941.x.a.h ENSGT00940000153541.C ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000004207 ENSGT00390000017273.B ENSGT00390000017273.A ENSGT00390000018626 ENSGT00940000159689 ENSGT00880000138014.b ENSGT01100000263545.a.b.d.b ENSGT00390000016206 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT00940000160827 ENSGT00530000064134.a.b ENSGT00390000007818.y.a #22 ENSGT00940000161464 ENSGT00940000159376 ENSGT00510000048078 ENSGT00940000159236 ENSGT00940000163620 ENSGT00940000153269.b.a ENSGT01030000234550.a.b ENSGT00390000012914 ENSGT00940000159430 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 232 ENSMNEG00000043386 TNNC2 (ENSMNEG00000038690) SNX21 (ENSMNEG00000043030) ACOT8 (ENSMNEG00000039351) ZSWIM3 (ENSMNEG00000044259) ZSWIM1 (ENSMNEG00000037345) SPATA25 (ENSMNEG00000041755) NEURL2 (ENSMNEG00000032805) CTSA (ENSMNEG00000039360) PLTP (ENSMNEG00000031357) PCIF1 (ENSMNEG00000045367) ZNF335 (ENSMNEG00000036600) MMP9 (ENSMNEG00000034882) SLC12A5 (ENSMNEG00000030937) NCOA5 (ENSMNEG00000035339) ENSMNEG00000030483 #22 CD40 (ENSMNEG00000010143) CDH22 (ENSMNEG00000040274) SLC35C2 (ENSMNEG00000035072) ELMO2 (ENSMNEG00000034360) ZNF334 (ENSMNEG00000044459) ENSMNEG00000029347 OCSTAMP (ENSMNEG00000036138) SLC13A3 (ENSMNEG00000006804) TP53RK (ENSMNEG00000035758) SLC2A10 (ENSMNEG00000043093) EYA2 (ENSMNEG00000038770) ZMYND8 (ENSMNEG00000033850) NCOA3 (ENSMNEG00000034970) SULF2 (ENSMNEG00000034419) ENSMNEG00000028585 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00930000150941.y ENSGT00940000153541.C ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000004207 ENSGT00390000017273.B ENSGT00390000017273.A ENSGT00390000018626 ENSGT00940000159689 ENSGT00880000138014.b ENSGT01100000263545.a.b.d.b ENSGT00390000016206 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT00940000160827 ENSGT00530000064134.a.b ENSGT00390000007818.y.a #22 ENSGT00940000161464 ENSGT00940000159376 ENSGT00510000048078 ENSGT00940000159236 ENSGT00940000163620 ENSGT00940000153269.b.a ENSGT01030000234550.a.b ENSGT00390000012914 ENSGT00940000159430 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00910000146894 ENSGT00940000159925 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00930000150941.y ENSGT00940000153541.C ENSGT00530000063759.b ENSGT00390000004207 ENSGT00390000017273.B ENSGT00390000017273.A ENSGT00390000018626 ENSGT00940000159689 ENSGT00880000138014.b ENSGT01100000263545.a.b.d.b ENSGT00390000016206 ENSGT00940000158508 ENSGT00940000157415 ENSGT00940000160827 ENSGT00530000064134.a.b ENSGT00390000007818.y.a #22 ENSGT00940000161464 ENSGT00940000159376 ENSGT00510000048078 ENSGT00940000159236 ENSGT00940000163620 ENSGT00940000153269.b.a ENSGT01030000234550.a.b ENSGT00390000012914 ENSGT00940000159430 ENSGT00950000182978.A.a.b.b ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 Sooty mangabey MODERN SPECIES 135 ENSCATG00000030842 TNNC2 (ENSCATG00000040942) SNX21 (ENSCATG00000041492) ACOT8 (ENSCATG00000039637) ZSWIM3 (ENSCATG00000041173) ZSWIM1 (ENSCATG00000042045) SPATA25 (ENSCATG00000043920) NEURL2 (ENSCATG00000012940) CTSA (ENSCATG00000026947) PLTP (ENSCATG00000032732) PCIF1 (ENSCATG00000032775) ZNF335 (ENSCATG00000039006) MMP9 (ENSCATG00000029916) SLC12A5 (ENSCATG00000043549) NCOA5 (ENSCATG00000040574) ENSCATG00000038806 #22 CD40 (ENSCATG00000025535) CDH22 (ENSCATG00000033624) SLC35C2 (ENSCATG00000045244) ELMO2 (ENSCATG00000022872) ZNF334 (ENSCATG00000043794) OCSTAMP (ENSCATG00000034906) SLC13A3 (ENSCATG00000044802) TP53RK (ENSCATG00000042243) SLC2A10 (ENSCATG00000039254) EYA2 (ENSCATG00000038546) ZMYND8 (ENSCATG00000044267) NCOA3 (ENSCATG00000036052) SULF2 (ENSCATG00000033778) Drill MODERN SPECIES 878 DNTTIP1 (ENSMLEG00000042577) ENSMLEG00000031981 TNNC2 (ENSMLEG00000043543) SNX21 (ENSMLEG00000042376) ACOT8 (ENSMLEG00000039502) ZSWIM3 (ENSMLEG00000031100) ZSWIM1 (ENSMLEG00000035927) NEURL2 (ENSMLEG00000033105) CTSA (ENSMLEG00000042328) PLTP (ENSMLEG00000037466) PCIF1 (ENSMLEG00000034021) ZNF335 (ENSMLEG00000034581) MMP9 (ENSMLEG00000041817) SLC12A5 (ENSMLEG00000042182) NCOA5 (ENSMLEG00000031587) ENSMLEG00000033776 #22 CD40 (ENSMLEG00000029747) CDH22 (ENSMLEG00000039057) SLC35C2 (ENSMLEG00000039379) ELMO2 (ENSMLEG00000033612) ZNF334 (ENSMLEG00000038557) OCSTAMP (ENSMLEG00000042340) SLC13A3 (ENSMLEG00000035565) TP53RK (ENSMLEG00000042123) SLC2A10 (ENSMLEG00000034917) EYA2 (ENSMLEG00000042072) ZMYND8 (ENSMLEG00000043231) NCOA3 (ENSMLEG00000023618) SULF2 (ENSMLEG00000028416) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.y.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.y.b #22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 150 RNF166 (ENSMNEG00000044549) #9 CTU2 (ENSMNEG00000040954) #10 PIEZO1 (ENSMNEG00000035161) #11 CDT1 (ENSMNEG00000041221) #12 APRT (ENSMNEG00000044786) #13 GALNS (ENSMNEG00000036303) #14 ENSMNEG00000043036 ##15 PABPN1L (ENSMNEG00000044808) #16 CBFA2T3 (ENSMNEG00000035238) #17 ACSF3 (ENSMNEG00000029172) #18 CDH15 (ENSMNEG00000031701) #19 SLC22A31 (ENSMNEG00000045155) ZNF778 (ENSMNEG00000040218) ANKRD11 (ENSMNEG00000035799) #20 SPG7 (ENSMNEG00000040301) #21 ENSMNEG00000033097 #22 CPNE7 (ENSMNEG00000029884) #23 DPEP1 (ENSMNEG00000039591) #25 CHMP1A (ENSMNEG00000034383) #26 SPATA33 (ENSMNEG00000035198) #27 CDK10 (ENSMNEG00000020078) #28 SPATA2L (ENSMNEG00000043570) #29 VPS9D1 (ENSMNEG00000032295) #30 ZNF276 (ENSMNEG00000043235) #31 FANCA (ENSMNEG00000012317) #32 SPIRE2 (ENSMNEG00000031209) #33 TCF25 (ENSMNEG00000037746) #34 MC1R (ENSMNEG00000022054) #35 ENSMNEG00000042492 #36 DEF8 (ENSMNEG00000032971) #37 ENSMNEG00000043269 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00410000028565 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00910000147699 ENSGT00510000047505.c.b ##15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000162638.A.e ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.z #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00960000192231 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115.q #36 ENSGT00940000159182 #37 Macaca ANCESTRAL SPECIES 8 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ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000162638.A.e ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.z #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115.q #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 12 MVD (ENSMFAG00000000591) #7 SNAI3 (ENSMFAG00000063008) #8 ENSMFAG00000039545 #9 CDT1 (ENSMFAG00000030941) #12 APRT (ENSMFAG00000003499) #13 GALNS (ENSMFAG00000041824) #14 ENSMFAG00000003395 PABPN1L (ENSMFAG00000002924) #16 CBFA2T3 (ENSMFAG00000003781) #17 ACSF3 (ENSMFAG00000044180) #18 CDH15 (ENSMFAG00000024502) #19 SLC22A31 (ENSMFAG00000031390) ZNF778 (ENSMFAG00000032442) ANKRD11 (ENSMFAG00000040263) #20 SPG7 (ENSMFAG00000001315) #21 RPL13 (ENSMFAG00000027717) #22 CPNE7 (ENSMFAG00000038027) #23 DPEP1 (ENSMFAG00000031442) #25 CHMP1A (ENSMFAG00000038083) #26 SPATA33 (ENSMFAG00000043387) #27 CDK10 (ENSMFAG00000039303) #28 SPATA2L (ENSMFAG00000041067) #29 VPS9D1 (ENSMFAG00000032869) #30 ZNF276 (ENSMFAG00000037319) #31 TCF25 (ENSMFAG00000041200) #34 ENSMFAG00000054156 MC1R (ENSMFAG00000037098) #35 ENSMFAG00000033629 #36 DEF8 (ENSMFAG00000031002) #37 DBNDD1 (ENSMFAG00000038151) GAS8 (ENSMFAG00000029755) Rhesus MODERN SPECIES 12 CTU2 (ENSMMUG00000007251) #10 PIEZO1 (ENSMMUG00000007254) #11 ENSMMUG00000061015 CDT1 (ENSMMUG00000013823) #12 GALNS (ENSMMUG00000012430) #14 TRAPPC2L (ENSMMUG00000053471) ##15 PABPN1L (ENSMMUG00000012438) #16 CBFA2T3 (ENSMMUG00000063909) #17 ENSMMUG00000063614 ACSF3 (ENSMMUG00000023245) #18 CDH15 (ENSMMUG00000012100) #19 SLC22A31 (ENSMMUG00000012102) ZNF778 (ENSMMUG00000037464) ANKRD11 (ENSMMUG00000017161) #20 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ENSGT00390000007818.e.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.e.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625.l.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.e.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625.l.a Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 5 CYBA (ENSOARG00020013046) MVD (ENSOARG00020013121) #7 SNAI3 (ENSOARG00020013184) #8 RNF166 (ENSOARG00020013239) #9 CTU2 (ENSOARG00020013427) #10 PIEZO1 (ENSOARG00020013792) #11 APRT (ENSOARG00020014302) #13 GALNS (ENSOARG00020014352) #14 TRAPPC2L (ENSOARG00020014414) #15 PABPN1L (ENSOARG00020014567) #16 CBFA2T3 (ENSOARG00020014844) #17 ACSF3 (ENSOARG00020014939) #18 CDH15 (ENSOARG00020015069) #19 SLC22A31 (ENSOARG00020016342) SPG7 (ENSOARG00020016742) #21 RPL13 (ENSOARG00020019871) #22 CPNE7 (ENSOARG00020019980) #23 DPEP1 (ENSOARG00020020121) #25 CHMP1A (ENSOARG00020020238) #26 ENSOARG00020020317 #27 CDK10 (ENSOARG00020020375) #28 SPATA2L (ENSOARG00020020418) #29 ZNF276 (ENSOARG00020003180) #31 TCF25 (ENSOARG00020003444) #34 MC1R (ENSOARG00020003524) #35 TUBB3 (ENSOARG00020003541) #36 DEF8 (ENSOARG00020003657) #37 ENSOARG00020003741 DBNDD1 (ENSOARG00020004128) GAS8 (ENSOARG00020004183) ENSOARG00020004215 Goat MODERN SPECIES 9 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ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.e.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000160625.l.b.b Bos ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.e.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.e.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b Domestic yak MODERN SPECIES 12 ENSBGRG00000026904 #9 CTU2 (ENSBGRG00000026899) #10 PIEZO1 (ENSBGRG00000026892) #11 CDT1 (ENSBGRG00000026890) #12 APRT (ENSBGRG00000026889) #13 GALNS (ENSBGRG00000026887) #14 ENSBGRG00000026885 TRAPPC2L (ENSBGRG00000026882) #15 ENSBGRG00000026880 #16 CBFA2T3 (ENSBGRG00000026878) #17 ACSF3 (ENSBGRG00000026875) #18 CDH15 (ENSBGRG00000026871) #19 ENSBGRG00000026870 ANKRD11 (ENSBGRG00000026866) #20 SPG7 (ENSBGRG00000026859) #21 ENSBGRG00000026855 #22 CPNE7 (ENSBGRG00000026854) #23 DPEP1 (ENSBGRG00000026852) #25 CHMP1A (ENSBGRG00000026824) #26 ENSBGRG00000026801 #27 CDK10 (ENSBGRG00000026766) #28 SPATA2L 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musk deer MODERN SPECIES 1191 RNF166 (ENSMMSG00000010404) #9 CTU2 (ENSMMSG00000004779) #10 ENSMMSG00000004869 #11 ENSMMSG00000004917 #11 CDT1 (ENSMMSG00000004961) #12 APRT (ENSMMSG00000005008) #13 GALNS (ENSMMSG00000005055) #14 TRAPPC2L (ENSMMSG00000005116) #15 ENSMMSG00000005265 #16 CBFA2T3 (ENSMMSG00000005338) #17 ACSF3 (ENSMMSG00000005451) #18 CDH15 (ENSMMSG00000005511) #19 SLC22A31 (ENSMMSG00000005632) ANKRD11 (ENSMMSG00000005681) #20 SPG7 (ENSMMSG00000005867) #21 ENSMMSG00000005970 #22 CPNE7 (ENSMMSG00000006025) #23 DPEP1 (ENSMMSG00000006071) #25 CHMP1A (ENSMMSG00000006103) #26 ENSMMSG00000006124 #27 CDK10 (ENSMMSG00000006144) #28 SPATA2L (ENSMMSG00000006179) #29 VPS9D1 (ENSMMSG00000006207) #30 ZNF276 (ENSMMSG00000006232) #31 FANCA (ENSMMSG00000006271) #32 SPIRE2 (ENSMMSG00000006330) #33 TCF25 (ENSMMSG00000006457) #34 MC1R (ENSMMSG00000006505) #35 ENSMMSG00000006528 #36 DEF8 (ENSMMSG00000006562) #37 ENSMMSG00000006649 Yarkand deer MODERN SPECIES 27 MVD (ENSCHYG00000003094) #7 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CDT1 (ENSBMSG00010020082) #12 APRT (ENSBMSG00010020108) #13 GALNS (ENSBMSG00010020134) #14 TRAPPC2L (ENSBMSG00010020167) #15 PABPN1L (ENSBMSG00010020243) #16 CBFA2T3 (ENSBMSG00010020288) #17 ACSF3 (ENSBMSG00010013451) #18 CDH15 (ENSBMSG00010013501) #19 SLC22A31 (ENSBMSG00010013543) ENSBMSG00010013563 #20 SPG7 (ENSBMSG00010013588) #21 ENSBMSG00010013625 #22 ENSBMSG00010013647 #23 DPEP1 (ENSBMSG00010013654) #25 CHMP1A (ENSBMSG00010013673) #26 SPATA33 (ENSBMSG00010013681) #27 CDK10 (ENSBMSG00010013700) #28 ENSBMSG00010013723 #29 VPS9D1 (ENSBMSG00010013738) #30 ZNF276 (ENSBMSG00010013759) #31 FANCA (ENSBMSG00010013942) #32 SPIRE2 (ENSBMSG00010014648) #33 TCF25 (ENSBMSG00010014797) #34 MC1R (ENSBMSG00010014863) #35 ENSBMSG00010014879 #36 DEF8 (ENSBMSG00010014923) #37 ENSBMSG00010014973 Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.e.b.a #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.e.b.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.e.b.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.e.b.a #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.e.b.a #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.e.b.a #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.e.b.a #22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 9 ENSBIXG00005000093 ENSBIXG00005015854 AMFR (ENSBIXG00005002477) NUDT21 (ENSBIXG00005015770) OGFOD1 (ENSBIXG00005015734) BBS2 (ENSBIXG00005015601) MT4 (ENSBIXG00005015553) ENSBIXG00005015541 MT3 (ENSBIXG00005005717) MT1A (ENSBIXG00005015522) ENSBIXG00005002306 ENSBIXG00005015498 ENSBIXG00005015450 ENSBIXG00005002256 ENSBIXG00005015357 ENSBIXG00005015326 #22 LPCAT2 (ENSBIXG00005015276) MMP2 (ENSBIXG00005005977) IRX6 (ENSBIXG00005002212) ENSBIXG00005015047 IRX5 (ENSBIXG00005015036) IRX3 (ENSBIXG00005002200) FTO (ENSBIXG00005002186) RPGRIP1L (ENSBIXG00005014864) AKTIP (ENSBIXG00005014732) RBL2 (ENSBIXG00005014700) CHD9 (ENSBIXG00005014635) CHD9NB (ENSBIXG00005014531) ENSBIXG00005014525 TOX3 (ENSBIXG00005014497) ENSBIXG00005014430 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000154606.mb ENSGT00940000154623.k.b ENSGT00940000161596 ENSGT00940000155883.a.b ENSGT00940000156482 ENSGT00390000015814 ENSGT00390000002349 ENSGT00390000017113 ENSGT00950000182967.b ENSGT00950000182967.a.b ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.c ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.a ENSGT00950000182967.a.a.a.a.a.a.n.d.b.b ENSGT00940000154623.k.a.a ENSGT00390000007818.e.b.a #22 ENSGT00940000154623.k.a.b ENSGT00940000158960 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158511 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000161299 ENSGT00390000017730 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000010125 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00940000155706 ENSGT00980000198839 ENSGT00910000148543 ENSGT00940000158043 Domestic yak MODERN SPECIES 12 ENSBGRG00000021192 ENSBGRG00000021254 ENSBGRG00000021341 CES5A (ENSBGRG00000021377) GNAO1 (ENSBGRG00000021516) AMFR (ENSBGRG00000021663) NUDT21 (ENSBGRG00000021769) OGFOD1 (ENSBGRG00000021866) BBS2 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ENSGT00940000155602.i.a ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00940000160209.e ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000007818.e.b.b #22 ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00390000018085.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B Bos_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155773.b.f ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155602.i.a ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00940000160209.e ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000007818.e.b.b #22 ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B ENSGT00390000000220.A Cow MODERN SPECIES 11 ENSBTAG00000049997 CCDC148 (ENSBTAG00000004267) UPP2 (ENSBTAG00000012801) ACVR1 (ENSBTAG00000011909) ACVR1C (ENSBTAG00000019337) CYTIP (ENSBTAG00000008329) ERMN (ENSBTAG00000012912) GALNT5 (ENSBTAG00000017376) ENSBTAG00000054211 GPD2 (ENSBTAG00000009770) NR4A2 (ENSBTAG00000003650) KCNJ3 (ENSBTAG00000006159) GALNT13 (ENSBTAG00000005562) ENSBTAG00000054139 RPRM (ENSBTAG00000021526) ENSBTAG00000033143 #22 ARL6IP6 (ENSBTAG00000001435) ENSBTAG00000047365 PRPF40A (ENSBTAG00000048151) FMNL2 (ENSBTAG00000026851) STAM2 (ENSBTAG00000001887) CACNB4 (ENSBTAG00000002297) ARL5A (ENSBTAG00000002293) NEB (ENSBTAG00000006907) RIF1 (ENSBTAG00000021020) TNFAIP6 (ENSBTAG00000007239) NMI 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SPECIES 4 ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000155773.b.f ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000161094 ENSGT00940000160160 ENSGT00940000158842 ENSGT00530000063734.a ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00940000159241 ENSGT00940000155602.i.a ENSGT00390000001718 ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00940000158904 ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00390000007818.e.b.b #22 ENSGT00390000009987 ENSGT00930000150980.a ENSGT00940000155515.a.b.b.l ENSGT00390000018085.a.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000154714 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00390000012204 ENSGT00940000157201 ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00940000157541 ENSGT00390000015050 ENSGT00390000000220.B Domestic yak MODERN SPECIES 11 CCDC148 (ENSBGRG00000009770) UPP2 (ENSBGRG00000009647) ACVR1 (ENSBGRG00000009529) ACVR1C (ENSBGRG00000009051) CYTIP (ENSBGRG00000008859) ERMN (ENSBGRG00000008771) GALNT5 (ENSBGRG00000008625) ENSBGRG00000008596 GPD2 (ENSBGRG00000008160) NR4A2 (ENSBGRG00000007951) KCNJ3 (ENSBGRG00000007869) ENSBGRG00000007847 ENSBGRG00000007820 GALNT13 (ENSBGRG00000007349) RPRM (ENSBGRG00000007262) ENSBGRG00000007210 #22 ENSBGRG00000016778 ARL6IP6 (ENSBGRG00000016671) PRPF40A (ENSBGRG00000015929) FMNL2 (ENSBGRG00000015350) STAM2 (ENSBGRG00000015223) CACNB4 (ENSBGRG00000008687) ARL5A (ENSBGRG00000008374) ENSBGRG00000008336 NEB (ENSBGRG00000006143) RIF1 (ENSBGRG00000005974) TNFAIP6 (ENSBGRG00000005909) ENSBGRG00000005896 NMI (ENSBGRG00000005853) ENSBGRG00000005845 RBM43 (ENSBGRG00000005796) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.e.b.b #22 Goat MODERN SPECIES 10 RASL10B (ENSCHIG00000018183) GAS2L2 (ENSCHIG00000026688) C17orf50 (ENSCHIG00000018412) MMP28 (ENSCHIG00000027070) ENSCHIG00000027235 HEATR9 (ENSCHIG00000021394) ENSCHIG00000016688 ENSCHIG00000004359 CCL14 (ENSCHIG00000015200) ENSCHIG00000021417 ENSCHIG00000003747 ENSCHIG00000017081 ENSCHIG00000026450 ENSCHIG00000014748 ENSCHIG00000017931 ENSCHIG00000026795 #22 HEATR6 (ENSCHIG00000020669) HNF1B (ENSCHIG00000016007) DDX52 (ENSCHIG00000006275) SYNRG (ENSCHIG00000018157) DUSP14 (ENSCHIG00000007892) ENSCHIG00000019766 C17orf78 (ENSCHIG00000025907) ACACA (ENSCHIG00000014642) AATF (ENSCHIG00000010438) LHX1 (ENSCHIG00000022067) MRM1 (ENSCHIG00000008558) DHRS11 (ENSCHIG00000014977) GGNBP2 (ENSCHIG00000018194) PIGW (ENSCHIG00000013107) MYO19 (ENSCHIG00000025193) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000017018.b ENSGT00940000157870 ENSGT00530000063548.A ENSGT00390000010355 ENSGT00940000161751 ENSGT00940000161759 ENSGT00530000064263 ENSGT01000000221117 ENSGT01030000234601.c.b.a ENSGT00390000013620 ENSGT00940000153372.A.e.a.a ENSGT00940000162425 ENSGT00390000007731 ENSGT00390000013339 ENSGT00940000157778 ENSGT00390000007818.e.b.b #22 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a ENSGT00940000160196 ENSGT00940000154827 ENSGT00950000183087.B ENSGT00940000156423 ENSGT00530000064292.e.a ENSGT00530000064292.f ENSGT00940000157298 ENSGT00940000163699 ENSGT00940000162130 ENSGT00940000159174 ENSGT00940000157548 ENSGT00940000155291 ENSGT00940000163834 ENSGT01000000214434.B.b.e.b Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000017018.b ENSGT00940000157870 ENSGT00530000063548.A ENSGT00390000010355 ENSGT00940000161751 ENSGT00940000161759 ENSGT00530000064263 ENSGT01000000221117 ENSGT01030000234601.c.b.a ENSGT00390000013620 ENSGT00940000153372.A.e.a.a ENSGT00940000162425 ENSGT00390000007731 ENSGT00390000013339 ENSGT00940000157778 ENSGT00390000007818.e.b.b #22 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a ENSGT00940000160196 ENSGT00940000154827 ENSGT00950000183087.B ENSGT00940000156423 ENSGT00530000064292.f ENSGT00940000157298 ENSGT00940000163699 ENSGT00940000162130 ENSGT00940000159174 ENSGT00940000157548 ENSGT00940000155291 ENSGT00940000163834 ENSGT01000000214434.B.b.e.b ENSGT00940000156320 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000017018.b ENSGT00940000157870 ENSGT00530000063548.A ENSGT00390000010355 ENSGT00940000161751 ENSGT00940000161759 ENSGT00530000064263 ENSGT01000000221117 ENSGT01030000234601.c.b.a ENSGT00390000013620 ENSGT00940000153372.A.e.a.a ENSGT00940000162425 ENSGT00390000007731 ENSGT00390000013339 ENSGT00940000157778 ENSGT00390000007818.e.b.b #22 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a ENSGT00940000160196 ENSGT00940000154827 ENSGT00950000183087.B ENSGT00940000156423 ENSGT00530000064292.f ENSGT00940000157298 ENSGT00940000163699 ENSGT00940000162130 ENSGT00940000159174 ENSGT00940000157548 ENSGT00940000155291 ENSGT00940000156320 ENSGT00890000139463.b.b.b ENSGT00940000158449 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000017018.b ENSGT00940000157870 ENSGT00530000063548.A ENSGT00390000010355 ENSGT00940000161751 ENSGT00940000161759 ENSGT00530000064263 ENSGT01000000221117 ENSGT01030000234601.c.b.a ENSGT00390000013620 ENSGT00940000153372.A.e.a.a ENSGT00940000162425 ENSGT00390000007731 ENSGT00390000013339 ENSGT00940000157778 ENSGT00390000007818.e.b.b #22 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a ENSGT00940000160196 ENSGT00940000154827 ENSGT00950000183087.B ENSGT00940000156423 ENSGT00530000064292.f ENSGT00940000157298 ENSGT00940000163699 ENSGT00940000162130 ENSGT00940000159174 ENSGT00940000157548 ENSGT00940000155291 ENSGT00940000156320 ENSGT00890000139463.b.b.b ENSGT00390000004965.v.a.b Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000017018.b ENSGT00940000157870 ENSGT00530000063548.A ENSGT00390000010355 ENSGT00940000161751 ENSGT00940000161759 ENSGT00530000064263 ENSGT01000000221117 ENSGT01030000234601.c.b.a ENSGT00390000013620 ENSGT00940000153372.A.e.a.a ENSGT00940000162425 ENSGT00390000007731 ENSGT00390000013339 ENSGT00940000157778 ENSGT00390000007818.e.b.b #22 ENSGT00950000183003.a.a.a.a.a ENSGT00940000160196 ENSGT00940000154827 ENSGT00950000183087.B ENSGT00940000156423 ENSGT00530000064292.f ENSGT00940000157298 ENSGT00940000163699 ENSGT00940000162130 ENSGT00940000159174 ENSGT00940000157548 ENSGT00940000155291 ENSGT01000000214434.B.b.e.b ENSGT00390000012840.t ENSGT00940000156320 Beluga whale MODERN SPECIES 53 ENSDLEG00000015612 ENSDLEG00000015624 NAAA (ENSDLEG00000015643) SDAD1 (ENSDLEG00000015669) CXCL9 (ENSDLEG00000015713) CXCL10 (ENSDLEG00000015725) CXCL11 (ENSDLEG00000015735) ART3 (ENSDLEG00000015742) ENSDLEG00000015751 NUP54 (ENSDLEG00000015760) SCARB2 (ENSDLEG00000015781) ENSDLEG00000015824 STBD1 (ENSDLEG00000015838) CCDC158 (ENSDLEG00000015849) SHROOM3 (ENSDLEG00000015932) ENSDLEG00000015970 #22 SOWAHB (ENSDLEG00000015980) ENSDLEG00000015993 CCNI (ENSDLEG00000016013) CCNG2 (ENSDLEG00000016020) ENSDLEG00000016035 CNOT6L (ENSDLEG00000016050) ENSDLEG00000016069 FRAS1 (ENSDLEG00000016106) ENSDLEG00000016269 ANXA3 (ENSDLEG00000016290) BMP2K (ENSDLEG00000016387) PAQR3 (ENSDLEG00000016440) ENSDLEG00000016454 ENSDLEG00000013142 ANTXR2 (ENSDLEG00000013156) Blue whale MODERN SPECIES 16 USO1 (ENSBMSG00010006165) PPEF2 (ENSBMSG00010006062) NAAA (ENSBMSG00010006027) SDAD1 (ENSBMSG00010006009) CXCL9 (ENSBMSG00010005941) CXCL10 (ENSBMSG00010005919) CXCL11 (ENSBMSG00010005907) ENSBMSG00010005890 ART3 (ENSBMSG00010005881) NUP54 (ENSBMSG00010005869) SCARB2 (ENSBMSG00010005840) ENSBMSG00010005808 STBD1 (ENSBMSG00010005782) CCDC158 (ENSBMSG00010005725) SHROOM3 (ENSBMSG00010005606) ENSBMSG00010005554 #22 SOWAHB (ENSBMSG00010005544) SEPTIN11 (ENSBMSG00010005525) CCNI (ENSBMSG00010005496) ENSBMSG00010005485 CCNG2 (ENSBMSG00010005470) ENSBMSG00010003506 CNOT6L (ENSBMSG00010003490) ENSBMSG00010003462 ENSBMSG00010003445 FRAS1 (ENSBMSG00010003407) ANXA3 (ENSBMSG00010003373) BMP2K (ENSBMSG00010003358) PAQR3 (ENSBMSG00010003341) ENSBMSG00010003336 GK2 (ENSBMSG00010003328) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.f #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.f #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b.f #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818.f #22 ENSGT00390000007818.e.a #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.f #22 Dolphin MODERN SPECIES 2618 SPG7 (ENSTTRG00000004355) #21 RPL13 (ENSTTRG00000004374) #22 ENSTTRG00000004377 #23 DPEP1 (ENSTTRG00000004383) #25 ENSTTRG00000004393 ENSTTRG00000004398 #27 CDK10 (ENSTTRG00000004402) #28 SPATA2L (ENSTTRG00000004407) #29 VPS9D1 (ENSTTRG00000004409) #30 ZNF276 (ENSTTRG00000004416) #31 FANCA (ENSTTRG00000004419) #32 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.f #22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.f #22 Beluga whale MODERN SPECIES 2 CHRDL2 (ENSDLEG00000002872) POLD3 (ENSDLEG00000002858) LIPT2 (ENSDLEG00000002850) ENSDLEG00000002840 KCNE3 (ENSDLEG00000002833) PGM2L1 (ENSDLEG00000002819) P4HA3 (ENSDLEG00000002804) PPME1 (ENSDLEG00000002797) C2CD3 (ENSDLEG00000002578) UCP3 (ENSDLEG00000002511) UCP2 (ENSDLEG00000002495) DNAJB13 (ENSDLEG00000002482) PAAF1 (ENSDLEG00000002470) COA4 (ENSDLEG00000002460) ENSDLEG00000002454 ENSDLEG00000002450 #22 ENSDLEG00000002441 RAB6A (ENSDLEG00000002432) PLEKHB1 (ENSDLEG00000002396) FAM168A (ENSDLEG00000002357) RELT (ENSDLEG00000002338) ARHGEF17 (ENSDLEG00000002164) P2RY6 (ENSDLEG00000002120) P2RY2 (ENSDLEG00000002113) FCHSD2 (ENSDLEG00000002069) ATG16L2 (ENSDLEG00000001882) STARD10 (ENSDLEG00000001848) ARAP1 (ENSDLEG00000000824) CLPB (ENSDLEG00000000504) PHOX2A (ENSDLEG00000000479) INPPL1 (ENSDLEG00000000346) Narwhal MODERN SPECIES 296 MVD (ENSMMNG00015001001) #7 SNAI3 (ENSMMNG00015000980) #8 ENSMMNG00015000928 #9 CTU2 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(ENSCHYG00000001642) ENSCHYG00000001665 RAD50 (ENSCHYG00000001711) IL5 (ENSCHYG00000001775) IRF1 (ENSCHYG00000001795) SLC22A5 (ENSCHYG00000001886) ENSCHYG00000001972 #22 ENSCHYG00000001987 ENSCHYG00000001999 PDLIM4 (ENSCHYG00000002022) P4HA2 (ENSCHYG00000002114) ENSCHYG00000002268 ENSCHYG00000002295 CSF2 (ENSCHYG00000002315) ENSCHYG00000002337 ACSL6 (ENSCHYG00000002450) MEIKIN (ENSCHYG00000002866) FNIP1 (ENSCHYG00000003026) RAPGEF6 (ENSCHYG00000003385) CDC42SE2 (ENSCHYG00000003616) ENSCHYG00000003645 ENSCHYG00000003664 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.f #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 70 SMAD6 (ENSMMSG00000001473) LCTL (ENSMMSG00000001442) ZWILCH (ENSMMSG00000001358) ENSMMSG00000001277 SNAPC5 (ENSMMSG00000001249) MAP2K1 (ENSMMSG00000001210) TIPIN (ENSMMSG00000001178) DIS3L (ENSMMSG00000001148) MEGF11 (ENSMMSG00000001023) ENSMMSG00000000971 DENND4A (ENSMMSG00000000845) ENSMMSG00000000783 SLC24A1 (ENSMMSG00000000735) INTS14 (ENSMMSG00000000581) HACD3 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#20 SPG7 (ENSBBBG00000016135) #21 RPL13 (ENSBBBG00000016199) #22 ENSBBBG00000016206 #23 DPEP1 (ENSBBBG00000016248) #25 CHMP1A (ENSBBBG00000016292) #26 ENSBBBG00000016308 #27 CDK10 (ENSBBBG00000016355) #28 SPATA2L (ENSBBBG00000016362) #29 ENSBBBG00000016371 #30 ZNF276 (ENSBBBG00000016385) #31 FANCA (ENSBBBG00000016425) #32 MC1R (ENSBBBG00000004068) #35 ENSBBBG00000016440 #36 ENSBBBG00000016448 DEF8 (ENSBBBG00000004077) #37 ENSBBBG00000016548 DBNDD1 (ENSBBBG00000016556) Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818.f #22 Goat MODERN SPECIES 23 PRKAR2B (ENSCHIG00000025667) PIK3CG (ENSCHIG00000010589) CCDC71L (ENSCHIG00000008047) NAMPT (ENSCHIG00000013574) ENSCHIG00000011071 SYPL1 (ENSCHIG00000006812) CDHR3 (ENSCHIG00000018239) ATXN7L1 (ENSCHIG00000016671) ENSCHIG00000009454 RINT1 (ENSCHIG00000010078) PUS7 (ENSCHIG00000021531) SRPK2 (ENSCHIG00000023372) ENSCHIG00000017505 KMT2E (ENSCHIG00000024475) ENSCHIG00000009888 ENSCHIG00000017227 #22 ENSCHIG00000025671 ORC5 (ENSCHIG00000016864) RELN (ENSCHIG00000016204) ENSCHIG00000014617 SLC26A5 (ENSCHIG00000023772) PSMC2 (ENSCHIG00000015309) DNAJC2 (ENSCHIG00000021376) PMPCB (ENSCHIG00000018035) NAPEPLD (ENSCHIG00000024375) ARMC10 (ENSCHIG00000019474) FBXL13 (ENSCHIG00000005856) LRRC17 (ENSCHIG00000020461) FAM185A (ENSCHIG00000023874) ENSCHIG00000011593 CCDC146 (ENSCHIG00000027160) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 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ENSCDRG00005010611 TERF1 (ENSCDRG00005010658) Arabian camel MODERN SPECIES 13 SNAI3 (ENSCDRG00005020562) #8 RNF166 (ENSCDRG00005020545) #9 CTU2 (ENSCDRG00005020514) #10 ENSCDRG00005020494 #11 CDT1 (ENSCDRG00005020480) #12 APRT (ENSCDRG00005020463) #13 GALNS (ENSCDRG00005020434) #14 TRAPPC2L (ENSCDRG00005020411) #15 PABPN1L (ENSCDRG00005020384) #16 CBFA2T3 (ENSCDRG00005020363) #17 ACSF3 (ENSCDRG00005020347) #18 CDH15 (ENSCDRG00005020247) #19 SLC22A31 (ENSCDRG00005020212) ANKRD11 (ENSCDRG00005020124) #20 ENSCDRG00005020079 #21 ENSCDRG00005020054 #22 ENSCDRG00005020032 #23 ENSCDRG00005020022 #23 DPEP1 (ENSCDRG00005019995) #25 CHMP1A (ENSCDRG00005019955) #26 CDK10 (ENSCDRG00005019898) #28 SPATA2L (ENSCDRG00005019883) #29 VPS9D1 (ENSCDRG00005019863) #30 ZNF276 (ENSCDRG00005019848) #31 FANCA (ENSCDRG00005019227) #32 SPIRE2 (ENSCDRG00005019147) #33 ENSCDRG00005019062 #36 DEF8 (ENSCDRG00005019010) #37 ENSCDRG00005018972 ENSCDRG00005018928 GAS8 (ENSCDRG00005018875) Suina ANCESTRAL SPECIES 36 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ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b Felidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b Cat MODERN SPECIES 246 CTU2 (ENSFCAG00000005923) #10 RNF166 (ENSFCAG00000008487) #9 ENSFCAG00000051259 #11 CDT1 (ENSFCAG00000013014) #12 APRT 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ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b Tiger DUPLICATION Tiger MODERN SPECIES 176 ZC3H18 (ENSPTIG00000007787) ENSPTIG00000000414 ENSPTIG00000021401 #7 ENSPTIG00000020476 #9 ENSPTIG00000018403 #12 APRT (ENSPTIG00000018170) #13 GALNS (ENSPTIG00000016468) #14 TRAPPC2L (ENSPTIG00000016089) #15 PABPN1L (ENSPTIG00000015606) #16 ENSPTIG00000015293 #18 CDH15 (ENSPTIG00000014799) #19 SLC22A31 (ENSPTIG00000013452) ENSPTIG00000013166 ENSPTIG00000012678 #20 SPG7 (ENSPTIG00000011736) #21 ENSPTIG00000010985 #22 CPNE7 (ENSPTIG00000007541) #23 ENSPTIG00000007183 #25 ENSPTIG00000006685 SPATA33 (ENSPTIG00000006262) #27 ENSPTIG00000005538 CDK10 (ENSPTIG00000000136) #28 ZNF276 (ENSPTIG00000021239) #31 FANCA (ENSPTIG00000019296) #32 Tiger MODERN SPECIES 222 BCORL1 (ENSPTIG00000015033) ELF4 (ENSPTIG00000015500) ENSPTIG00000016655 AIFM1 (ENSPTIG00000016948) RAB33A (ENSPTIG00000019544) ZNF280C (ENSPTIG00000019810) SLC25A14 (ENSPTIG00000020231) GPR119 (ENSPTIG00000003840) RBMX2 (ENSPTIG00000005563) ENOX2 (ENSPTIG00000006087) ARHGAP36 (ENSPTIG00000008958) IGSF1 (ENSPTIG00000011010) ENSPTIG00000004637 ENSPTIG00000004656 OR13H1 (ENSPTIG00000004670) ENSPTIG00000014719 #22 STK26 (ENSPTIG00000017016) FRMD7 (ENSPTIG00000019471) RAP2C (ENSPTIG00000020253) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442.`b #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b lion MODERN SPECIES 15 CTU2 (ENSPLOG00000008529) #10 ENSPLOG00000008656 #11 CDT1 (ENSPLOG00000008900) #12 APRT (ENSPLOG00000009279) #13 GALNS (ENSPLOG00000009345) #14 TRAPPC2L (ENSPLOG00000009396) #15 PABPN1L (ENSPLOG00000009491) #16 CBFA2T3 (ENSPLOG00000009563) #17 ACSF3 (ENSPLOG00000009585) #18 CDH15 (ENSPLOG00000009712) #19 SLC22A31 (ENSPLOG00000009830) ENSPLOG00000009869 ENSPLOG00000009890 ANKRD11 (ENSPLOG00000009987) #20 SPG7 (ENSPLOG00000010152) #21 RPL13 (ENSPLOG00000010753) #22 CPNE7 (ENSPLOG00000010878) #23 DPEP1 (ENSPLOG00000011157) #25 CHMP1A (ENSPLOG00000011262) #26 SPATA33 (ENSPLOG00000011398) #27 CDK10 (ENSPLOG00000011467) #28 SPATA2L (ENSPLOG00000011717) #29 VPS9D1 (ENSPLOG00000011815) #30 ZNF276 (ENSPLOG00000012330) #31 FANCA (ENSPLOG00000012518) #32 SPIRE2 (ENSPLOG00000013127) #33 TCF25 (ENSPLOG00000013374) #34 MC1R (ENSPLOG00000013572) #35 TUBB3 (ENSPLOG00000013597) #36 DEF8 (ENSPLOG00000013755) #37 ENSPLOG00000013845 leopard DUPLICATION leopard MODERN SPECIES 60 SNAI3 (ENSPPRG00000008511) #8 RNF166 (ENSPPRG00000008966) #9 CTU2 (ENSPPRG00000009232) #10 ENSPPRG00000009590 #11 CDT1 (ENSPPRG00000010026) #12 APRT (ENSPPRG00000010226) #13 GALNS (ENSPPRG00000010540) #14 TRAPPC2L (ENSPPRG00000013246) #15 PABPN1L (ENSPPRG00000015106) #16 CBFA2T3 (ENSPPRG00000024504) #17 ACSF3 (ENSPPRG00000023828) #18 CDH15 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ENSPPRG00000006057 #22 ENSPPRG00000009088 FRMD7 (ENSPPRG00000010188) RAP2C (ENSPPRG00000010637) MBNL3 (ENSPPRG00000012374) HS6ST2 (ENSPPRG00000013212) GPC4 (ENSPPRG00000014842) GPC3 (ENSPPRG00000018153) CCDC160 (ENSPPRG00000015682) PHF6 (ENSPPRG00000000820) ENSPPRG00000001079 PLAC1 (ENSPPRG00000015743) PABIR2 (ENSPPRG00000004252) MOSPD1 (ENSPPRG00000005185) SMIM10 (ENSPPRG00000015859) ENSPPRG00000005313 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 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ENSGT00940000163154.A.b Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 51 MVD (ENSVVUG00000003226) #7 SNAI3 (ENSVVUG00000003233) #8 ENSVVUG00000003239 #9 CTU2 (ENSVVUG00000003254) #10 PIEZO1 (ENSVVUG00000003475) #11 CDT1 (ENSVVUG00000003504) #12 APRT (ENSVVUG00000003521) #13 GALNS (ENSVVUG00000003542) #14 TRAPPC2L (ENSVVUG00000003588) #15 ENSVVUG00000003659 #16 CBFA2T3 (ENSVVUG00000003674) #17 ACSF3 (ENSVVUG00000003699) #18 CDH15 (ENSVVUG00000003736) #19 ANKRD11 (ENSVVUG00000003768) #20 SPG7 (ENSVVUG00000003819) #21 ENSVVUG00000003839 #22 CPNE7 (ENSVVUG00000003855) #23 DPEP1 (ENSVVUG00000003885) #25 CHMP1A (ENSVVUG00000003894) #26 ENSVVUG00000003913 #27 CDK10 (ENSVVUG00000003919) #28 SPATA2L (ENSVVUG00000003935) #29 ZNF276 (ENSVVUG00000003941) #31 VPS9D1 (ENSVVUG00000003950) #30 FANCA (ENSVVUG00000003998) #32 SPIRE2 (ENSVVUG00000004400) #33 TCF25 (ENSVVUG00000004433) #34 MC1R (ENSVVUG00000004444) #35 TUBB3 (ENSVVUG00000004450) #36 DEF8 (ENSVVUG00000004472) #37 DBNDD1 (ENSVVUG00000004886) Red fox MODERN SPECIES 46 YTHDC1 (ENSVVUG00000005387) TMPRSS11E (ENSVVUG00000005423) ENSVVUG00000005441 TMPRSS11F (ENSVVUG00000005460) ENSVVUG00000005470 TMPRSS11A (ENSVVUG00000005490) TMPRSS11D (ENSVVUG00000005505) ENSVVUG00000005529 GNRHR (ENSVVUG00000005544) UBA6 (ENSVVUG00000005554) STAP1 (ENSVVUG00000005660) CENPC (ENSVVUG00000005676) ENSVVUG00000005709 EPHA5 (ENSVVUG00000005740) ENSVVUG00000005771 ENSVVUG00000005779 #22 TECRL (ENSVVUG00000005794) ENSVVUG00000005812 ADGRL3 (ENSVVUG00000005842) ENSVVUG00000005897 ENSVVUG00000005913 ENSVVUG00000005920 ENSVVUG00000005944 ENSVVUG00000005965 ENSVVUG00000005970 POLR2B (ENSVVUG00000005979) NOA1 (ENSVVUG00000005990) REST (ENSVVUG00000005996) HOPX (ENSVVUG00000006003) THEGL (ENSVVUG00000006009) ARL9 (ENSVVUG00000006013) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000015359 #7 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00390000014546 #27 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT00940000159115.db #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b ENSGT00390000018903 Dog MODERN SPECIES 33 MVD (ENSCAFG00845003495) #7 SNAI3 (ENSCAFG00845003473) #8 RNF166 (ENSCAFG00845003452) #9 CTU2 (ENSCAFG00845003409) #10 PIEZO1 (ENSCAFG00845003243) #11 CDT1 (ENSCAFG00845003137) #12 APRT (ENSCAFG00845003116) #13 GALNS (ENSCAFG00845003078) #14 TRAPPC2L (ENSCAFG00845003021) #15 CBFA2T3 (ENSCAFG00845002914) #17 ACSF3 (ENSCAFG00845002712) #18 CDH15 (ENSCAFG00845002672) #19 SLC22A31 (ENSCAFG00845002643) ANKRD11 (ENSCAFG00845002586) #20 SPG7 (ENSCAFG00845002439) #21 RPL13 (ENSCAFG00845002331) #22 CPNE7 (ENSCAFG00845002287) #23 DPEP1 (ENSCAFG00845002242) #25 CHMP1A (ENSCAFG00845002191) #26 CDK10 (ENSCAFG00845002051) #28 SPATA2L (ENSCAFG00845002015) #29 VPS9D1 (ENSCAFG00845001981) #30 ZNF276 (ENSCAFG00845001927) #31 ENSCAFG00845001891 FANCA (ENSCAFG00845001750) #32 SPIRE2 (ENSCAFG00845001616) #33 TCF25 (ENSCAFG00845001268) #34 TCF25 (ENSCAFG00845001017) #36 CENPBD1 (ENSCAFG00845001002) DEF8 (ENSCAFG00845000978) #37 DBNDD1 (ENSCAFG00845000937) Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 41 ENSCAFG00020025208 GRXCR2 (ENSCAFG00020025202) SH3RF2 (ENSCAFG00020025197) ENSCAFG00020025194 PLAC8L1 (ENSCAFG00020025192) ENSCAFG00020025190 LARS1 (ENSCAFG00020025009) RBM27 (ENSCAFG00020024931) POU4F3 (ENSCAFG00020024927) TCERG1 (ENSCAFG00020024817) GPR151 (ENSCAFG00020024800) PPP2R2B (ENSCAFG00020024798) ENSCAFG00020024795 #22 STK32A (ENSCAFG00020024792) DPYSL3 (ENSCAFG00020024788) 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ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00940000163154.A.b Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007818 #22 Ferret MODERN SPECIES 266 TMPRSS11B (ENSMPUG00000001723) ENSMPUG00000001711 ENSMPUG00000001701 TMPRSS11F (ENSMPUG00000001691) ENSMPUG00000001688 TMPRSS11A (ENSMPUG00000001680) TMPRSS11D (ENSMPUG00000001673) ENSMPUG00000001649 UBA6 (ENSMPUG00000001636) STAP1 (ENSMPUG00000001601) CENPC (ENSMPUG00000001554) ENSMPUG00000001550 ENSMPUG00000001546 ENSMPUG00000001522 EPHA5 (ENSMPUG00000001506) ENSMPUG00000001481 #22 TECRL (ENSMPUG00000001474) ADGRL3 (ENSMPUG00000001363) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT01030000240269 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 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ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00950000186123 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT01030000234925 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000154511.a #8 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797.k #10 ENSGT00940000157348 #11 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ENSSHBG00005000428 ENSSHBG00005000439 ENSSHBG00005000441 Golden eagle MODERN SPECIES 25 MVD (ENSACCG00020002872) #7 SNAI3 (ENSACCG00020002858) #8 RNF166 (ENSACCG00020002844) #9 CTU2 (ENSACCG00020002823) #10 CDT1 (ENSACCG00020002531) #12 APRT (ENSACCG00020002510) #13 GALNS (ENSACCG00020002477) #14 TRAPPC2L (ENSACCG00020002461) #15 PABPN1L (ENSACCG00020002453) #16 CBFA2T3 (ENSACCG00020002396) #17 ACSF3 (ENSACCG00020002335) #18 CDH15 (ENSACCG00020002245) #19 SLC22A31 (ENSACCG00020002138) ANKRD11 (ENSACCG00020002114) #20 SPG7 (ENSACCG00020001490) #21 RPL13 (ENSACCG00020000873) #22 CPNE7 (ENSACCG00020000841) #23 ENSACCG00020000807 #24 DPEP1 (ENSACCG00020000768) #25 CHMP1A (ENSACCG00020000735) #26 CDK10 (ENSACCG00020000691) #28 SPATA2L (ENSACCG00020000663) #29 VPS9D1 (ENSACCG00020000628) #30 ENSACCG00020000598 #31 ENSACCG00020000553 #31 FANCA (ENSACCG00020000494) #32 SPIRE2 (ENSACCG00020000448) #33 TCF25 (ENSACCG00020000426) #34 MC1R (ENSACCG00020014608) #35 TUBB3 (ENSACCG00020014601) #36 DEF8 (ENSACCG00020014590) #37 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000015359 #7 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00390000018903 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000015359 #7 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 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(ENSAPLG00000023814) #22 Pink-footed goose MODERN SPECIES 125 MVD (ENSABRG00000021544) #7 CTU2 (ENSABRG00000021547) #10 RNF166 (ENSABRG00000021553) #9 PIEZO1 (ENSABRG00000021559) #11 CDT1 (ENSABRG00000021584) #12 APRT (ENSABRG00000021588) #13 CBFA2T3 (ENSABRG00000021590) #17 GALNS (ENSABRG00000021594) #14 TRAPPC2L (ENSABRG00000021602) #15 PABPN1L (ENSABRG00000000012) #16 ACSF3 (ENSABRG00000000020) #18 CDH15 (ENSABRG00000000025) #19 SLC22A31 (ENSABRG00000000055) ANKRD11 (ENSABRG00000000065) #20 SPG7 (ENSABRG00000000073) #21 RPL13 (ENSABRG00000000089) #22 CPNE7 (ENSABRG00000000092) #23 ENSABRG00000000116 #24 DPEP1 (ENSABRG00000000270) #25 CHMP1A (ENSABRG00000000311) #26 CDK10 (ENSABRG00000000380) #28 VPS9D1 (ENSABRG00000002042) #30 SPATA2L (ENSABRG00000002077) #29 ZNF276 (ENSABRG00000002098) #31 FANCA (ENSABRG00000002169) #32 SPIRE2 (ENSABRG00000002278) #33 TCF25 (ENSABRG00000002306) #34 MC1R (ENSABRG00000002355) #35 DEF8 (ENSABRG00000002386) #37 DBNDD1 (ENSABRG00000002473) GAS8 (ENSABRG00000002431) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966 #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00980000200525 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00950000186123 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00960000187029 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841 #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 tuatara MODERN SPECIES 59 CYBA (ENSSPUG00000007346) MVD (ENSSPUG00000007336) #7 SNAI3 (ENSSPUG00000007322) #8 CTU2 (ENSSPUG00000007293) #10 ENSSPUG00000007086 #11 CDT1 (ENSSPUG00000007063) #12 APRT (ENSSPUG00000007056) #13 GALNS (ENSSPUG00000007049) #14 ENSSPUG00000007047 PABPN1L (ENSSPUG00000007031) #16 CBFA2T3 (ENSSPUG00000007014) #17 ACSF3 (ENSSPUG00000007006) #18 ENSSPUG00000007001 ENSSPUG00000006959 #20 SPG7 (ENSSPUG00000006934) #21 RPL13 (ENSSPUG00000006904) #22 CPNE7 (ENSSPUG00000006873) #23 ENSSPUG00000006860 #24 DPEP1 (ENSSPUG00000006816) #25 ENSSPUG00000006787 #26 CDK10 (ENSSPUG00000006771) #28 SPATA2L (ENSSPUG00000006762) #29 ENSSPUG00000006735 VPS9D1 (ENSSPUG00000006702) #30 ENSSPUG00000006692 FANCA (ENSSPUG00000006627) #32 SPIRE2 (ENSSPUG00000006595) #33 TCF25 (ENSSPUG00000006559) #34 MC1R (ENSSPUG00000006544) #35 ENSSPUG00000006533 #36 DEF8 (ENSSPUG00000006449) #37 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e #17 ENSGT00940000157000 #18 ENSGT00940000160118 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#26 ENSGT00950000186123 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 Common wall lizard MODERN SPECIES 16 CTU2 (ENSPMRG00000009965) #10 PIEZO1 (ENSPMRG00000010137) #11 ENSPMRG00000010945 CDT1 (ENSPMRG00000010950) #12 APRT (ENSPMRG00000010959) #13 GALNS (ENSPMRG00000010964) #14 TRAPPC2L (ENSPMRG00000010973) #15 PABPN1L (ENSPMRG00000010979) #16 CBFA2T3 (ENSPMRG00000010990) #17 ACSF3 (ENSPMRG00000011014) #18 CDH15 (ENSPMRG00000011023) #19 SLC22A31 (ENSPMRG00000011030) ANKRD11 (ENSPMRG00000011041) #20 ENSPMRG00000011051 SPG7 (ENSPMRG00000011056) #21 RPL13 (ENSPMRG00000011066) #22 CPNE7 (ENSPMRG00000011078) #23 ENSPMRG00000011089 #24 DPEP1 (ENSPMRG00000011102) #25 CHMP1A (ENSPMRG00000011106) #26 ENSPMRG00000011110 CDK10 (ENSPMRG00000011113) #28 SPATA2L (ENSPMRG00000011122) #29 KIAA0513 (ENSPMRG00000011129) ENSPMRG00000011151 CIBAR2 (ENSPMRG00000011184) ENSPMRG00000011198 ENSPMRG00000011200 GSE1 (ENSPMRG00000011207) GINS2 (ENSPMRG00000011216) ENSPMRG00000011220 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 51 SNAI3 (ENSSMRG00000006819) #8 RNF166 (ENSSMRG00000006820) #9 CTU2 (ENSSMRG00000006821) #10 PIEZO1 (ENSSMRG00000006841) #11 SLC22A31 (ENSSMRG00000006876) CDH15 (ENSSMRG00000006887) #19 ACSF3 (ENSSMRG00000006898) #18 CBFA2T3 (ENSSMRG00000006920) #17 PABPN1L (ENSSMRG00000006941) #16 TRAPPC2L (ENSSMRG00000006943) #15 GALNS (ENSSMRG00000006944) #14 APRT (ENSSMRG00000006956) #13 CDT1 (ENSSMRG00000007029) #12 ANKRD11 (ENSSMRG00000007052) #20 SPG7 (ENSSMRG00000007056) #21 RPL13 (ENSSMRG00000007063) #22 CPNE7 (ENSSMRG00000007068) #23 ENSSMRG00000007082 #24 ENSSMRG00000007086 DPEP1 (ENSSMRG00000007089) #25 CHMP1A (ENSSMRG00000007095) #26 SPATA2L (ENSSMRG00000007100) #29 ENSSMRG00000007103 VPS9D1 (ENSSMRG00000007107) #30 ZNF276 (ENSSMRG00000007115) #31 FANCA (ENSSMRG00000007120) #32 SPIRE2 (ENSSMRG00000007135) #33 TCF25 (ENSSMRG00000007142) #34 MC1R (ENSSMRG00000007151) #35 TUBB3 (ENSSMRG00000007157) #36 DEF8 (ENSSMRG00000007158) #37 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 16 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#22 CPNE7 (ENSACAG00000017091) #23 ENSACAG00000023270 ENSACAG00000017162 #24 DPEP1 (ENSACAG00000017169) #25 CHMP1A (ENSACAG00000037286) #26 ENSACAG00000041996 CDK10 (ENSACAG00000017200) #28 SPATA2L (ENSACAG00000022713) #29 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e.i.a #17 ENSGT00940000157000.l #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966.s #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00980000200525 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841.e #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 ENSGT00390000018903 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 ENSGT00940000157787 #14 ENSGT00510000047505 #15 ENSGT00940000165912 ENSGT00940000161325 #16 ENSGT00950000183176.b.e.i.a #17 ENSGT00940000157000.l #18 ENSGT00940000160118 #19 ENSGT00940000162670 ENSGT00940000155966.s #20 ENSGT00940000156329 #21 ENSGT00390000007818 #22 ENSGT00940000160442 #23 ENSGT00940000163403 #24 ENSGT00940000159615 #25 ENSGT00950000182832.D.a #26 ENSGT00940000158102 #28 ENSGT00530000063956.b.a #29 ENSGT00390000015057 #30 ENSGT00940000158841.f #31 ENSGT00940000158841.e #31 ENSGT00390000007852 #32 ENSGT00390000003058.b.a.b #33 ENSGT00390000005563 #34 ENSGT01030000234510.b #35 ENSGT00940000159115 #36 ENSGT00940000159182 #37 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00950000182909.b.b.b #9 ENSGT00390000008797 #10 ENSGT00940000157348 #11 ENSGT00390000012337 #12 ENSGT00390000017259 #13 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