Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000010771	ENSGT00940000153818.a.a #7	ENSGT00940000158101 #8	ENSGT00940000158866 #9	ENSGT00390000014595.b #10	ENSGT00390000016504 #11	ENSGT00940000158555 #12	ENSGT00390000012331 #13	ENSGT00390000001731 #14	ENSGT00390000001654 #15	ENSGT00390000000378.d.b.l #17	ENSGT00940000156839 #18	ENSGT00390000018351 #19	ENSGT00940000162087 #20	ENSGT00940000154612.n #21	ENSGT00940000156515 #22	ENSGT00940000154885.A #23	ENSGT00940000158891 #24	ENSGT00940000158897 #25	ENSGT00390000017839.o.b.a.b.d #26	ENSGT00940000153612.B #27	ENSGT00940000158557 #28	ENSGT00940000157442 #29	ENSGT01030000234517.E #30	ENSGT00940000155307.b #31	ENSGT00940000162372 #32	ENSGT00390000015428 #33	ENSGT00940000160605 #34	ENSGT00730000111247 #35	ENSGT00910000144281 #36	ENSGT00940000155735 #37
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	162	HNF1A (ENSCLAG00000010469) #7	SPPL3 (ENSCLAG00000013014) #8	ACADS (ENSCLAG00000008872) #9	UNC119B (ENSCLAG00000010518) #10	MLEC (ENSCLAG00000010269) #11	ENSCLAG00000008163 #12	POP5 (ENSCLAG00000007808) #13	RNF10 (ENSCLAG00000017372) #14	COQ5 (ENSCLAG00000011645) #15	ENSCLAG00000010874 #16	DYNLL1 (ENSCLAG00000015769) #17	SRSF9 (ENSCLAG00000012289) #18	GATC (ENSCLAG00000011015) #19	TRIAP1 (ENSCLAG00000011307) #20	COX6A1 (ENSCLAG00000013008) #21	MSI1 (ENSCLAG00000011329) #22	PLA2G1B (ENSCLAG00000014353) #23	SIRT4 (ENSCLAG00000010770) #24	PXN (ENSCLAG00000016279) #25	ENSCLAG00000014722 #26	GCN1 (ENSCLAG00000010466) #27	RAB35 (ENSCLAG00000013339) #28	BICDL1 (ENSCLAG00000012595) #29	CIT (ENSCLAG00000014860) #30	PRKAB1 (ENSCLAG00000009053) #31	TMEM233 (ENSCLAG00000013093) #32	CCDC60 (ENSCLAG00000013673) #33	HSPB8 (ENSCLAG00000011079) #34	SRRM4 (ENSCLAG00000009764) #35	SUDS3 (ENSCLAG00000012870) #36	TAOK3 (ENSCLAG00000014513) #37
Degu	MODERN SPECIES	120	HNF1A (ENSODEG00000007197) #7	ENSODEG00000006851	SPPL3 (ENSODEG00000007014) #8	ACADS (ENSODEG00000008710) #9	UNC119B (ENSODEG00000006951) #10	MLEC (ENSODEG00000006857) #11	ENSODEG00000006509 #12	ENSODEG00000006549 #13	RNF10 (ENSODEG00000007815) #14	COQ5 (ENSODEG00000006329) #15	ENSODEG00000006171 #17	SRSF9 (ENSODEG00000006061) #18	GATC (ENSODEG00000005919) #19	ENSODEG00000005787 #20	ENSODEG00000005584 #21	MSI1 (ENSODEG00000006328) #22	PLA2G1B (ENSODEG00000006112) #23	SIRT4 (ENSODEG00000005972) #24	ENSODEG00000005742 #25	ENSODEG00000005457 #26	GCN1 (ENSODEG00000005719) #27	RAB35 (ENSODEG00000007219) #28	ENSODEG00000005856 #29	ENSODEG00000019184	CIT (ENSODEG00000006978) #30	PRKAB1 (ENSODEG00000006326) #31	TMEM233 (ENSODEG00000006179) #32	CCDC60 (ENSODEG00000005468) #33	HSPB8 (ENSODEG00000006631) #34	SRRM4 (ENSODEG00000006291) #35	SUDS3 (ENSODEG00000007364) #36