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Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36
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Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.l ##16	ENSGT00940000168203	ENSGT00990000208084	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a.f #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.l ##16	ENSGT00940000168203	ENSGT00990000208084	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a.f #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36
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Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00940000168203	ENSGT00990000208084	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000167414.e	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37
Stickleback	MODERN SPECIES	14	ENSGACG00000004000	NELL2 (ENSGACG00000004004) #7	TMEM117 (ENSGACG00000004020) #9	ENSGACG00000004026 #8	twf1a (ENSGACG00000004028) #10	irak4 (ENSGACG00000004050) #11	ADAMTS20 (ENSGACG00000004063) #12	prickle1a (ENSGACG00000004088) #14	ENSGACG00000004098	ENSGACG00000004099	YAF2 (ENSGACG00000004103) #16	GXYLT1 (ENSGACG00000004112) #17	PDZRN4 (ENSGACG00000004122) #18	CNTN1 (ENSGACG00000004129) #19	ENSGACG00000004140 #21	dnajb9a (ENSGACG00000004142) #22	dnm1l (ENSGACG00000004145) #23	tnnt2d (ENSGACG00000004200) #24	ENSGACG00000004208	bpgm (ENSGACG00000004215) #25	ENSGACG00000004229 #26	ENSGACG00000004247 #27	zgc:136858 (ENSGACG00000004250) #31	CNOT4 (ENSGACG00000004276) #32	KCNA1 (ENSGACG00000004302) #33	ENSGACG00000004310 #34	ENSGACG00000004313 #35	pthlhb (ENSGACG00000004317) #36	tmpob (ENSGACG00000004325) #37	ldhbb (ENSGACG00000004329)	golt1bb (ENSGACG00000004333)
Lumpfish	MODERN SPECIES	21	TMEM117 (ENSCLMG00005019977) #9	ENSCLMG00005019978 #8	twf1a (ENSCLMG00005019979) #10	irak4 (ENSCLMG00005020008) #11	ENSCLMG00005020012	ADAMTS20 (ENSCLMG00005020015) #12	ENSCLMG00005020028 #13	prickle1a (ENSCLMG00005020032) #14	PPHLN1 (ENSCLMG00005000074) #15	YAF2 (ENSCLMG00005000104) #16	GXYLT1 (ENSCLMG00005000113) #17	PDZRN4 (ENSCLMG00005000134) #18	CNTN1 (ENSCLMG00005000220) #19	ENSCLMG00005000608	ENSCLMG00005001196 #21	dnajb9a (ENSCLMG00005001306) #22	dnm1l (ENSCLMG00005001448) #23	tnnt2d (ENSCLMG00005001794) #24	bpgm (ENSCLMG00005001797) #25	ENSCLMG00005001800 #26	ENSCLMG00005001855 #27	ENSCLMG00005001915 #29	ENSCLMG00005001919 #30	zgc:136858 (ENSCLMG00005001925) #31	CNOT4 (ENSCLMG00005001931) #32	KCNA1 (ENSCLMG00005001965) #33	ENSCLMG00005001966 #34	pthlhb (ENSCLMG00005001967) #36	tmpob (ENSCLMG00005001968) #37	ldhbb (ENSCLMG00005001969)	golt1bb (ENSCLMG00005001976)
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a.f #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000164736	ENSGT00390000004933.k.b #36
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	15							ENSLBEG00000007381 #13	prickle1a (ENSLBEG00000007417) #14	ENSLBEG00000007482 #15	YAF2 (ENSLBEG00000007500) #16	GXYLT1 (ENSLBEG00000007556) #17	PDZRN4 (ENSLBEG00000007631) #18	CNTN1 (ENSLBEG00000007683) #19	NRCAM (ENSLBEG00000007863) #20	ENSLBEG00000008315 #21	dnajb9a (ENSLBEG00000008376) #22	dnm1l (ENSLBEG00000008434) #23	tnnt2d (ENSLBEG00000008713) #24	ENSLBEG00000009310	bpgm (ENSLBEG00000009382) #25	ENSLBEG00000009399 #26	ENSLBEG00000009423 #27	ENSLBEG00000009437	ENSLBEG00000009453 #28	ENSLBEG00000009522 #29	ENSLBEG00000009735 #30	zgc:136858 (ENSLBEG00000009831) #31	CNOT4 (ENSLBEG00000009999) #32	KCNA1 (ENSLBEG00000010081) #33	ENSLBEG00000010097 #34	ENSLBEG00000010135 #35
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37	ENSGT00940000153525.i.b
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01030000234621.E	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT01100000266314	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37	ENSGT00940000153525.i.b
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	17	ENSBSLG00000024815	TMEM117 (ENSBSLG00000024805) #9	twf1a (ENSBSLG00000024787) #10	irak4 (ENSBSLG00000024766) #11	ADAMTS20 (ENSBSLG00000024588) #12	ENSBSLG00000024536	ENSBSLG00000024532	prickle1a (ENSBSLG00000024530) #14	PPHLN1 (ENSBSLG00000024499) #15	YAF2 (ENSBSLG00000024491) #16	GXYLT1 (ENSBSLG00000024478) #17	PDZRN4 (ENSBSLG00000024471) #18	CNTN1 (ENSBSLG00000024323) #19	NRCAM (ENSBSLG00000020914) #20	PNPLA8 (ENSBSLG00000020857) #21	dnajb9a (ENSBSLG00000020854) #22	dnm1l (ENSBSLG00000020578) #23	tnnt2d (ENSBSLG00000020535) #24	CALD1 (ENSBSLG00000020532)	bpgm (ENSBSLG00000020529) #25	ENSBSLG00000020526 #26	ENSBSLG00000020517 #28	tnni4a (ENSBSLG00000020512) #29	ENSBSLG00000020505 #30	zgc:136858 (ENSBSLG00000020493) #31	CNOT4 (ENSBSLG00000020482) #32	KCNA1 (ENSBSLG00000020481) #33	ENSBSLG00000020479 #34	pthlhb (ENSBSLG00000020476) #36	tmpob (ENSBSLG00000020475) #37	ldhbb (ENSBSLG00000020458)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	20	ENSMAMG00000023168	NELL2 (ENSMAMG00000023170) #7	TMEM117 (ENSMAMG00000023171) #9	ENSMAMG00000023172 #8	twf1a (ENSMAMG00000023173) #10	irak4 (ENSMAMG00000023174) #11	ADAMTS20 (ENSMAMG00000023175) #12	ENSMAMG00000023176 #13	PRICKLE1 (ENSMAMG00000023177) #14	PPHLN1 (ENSMAMG00000023178) #15	YAF2 (ENSMAMG00000023180) #17	PDZRN4 (ENSMAMG00000023181) #18	CNTN1 (ENSMAMG00000023182) #19	NRCAM (ENSMAMG00000023183) #20	ENSMAMG00000023184 #21	dnajb9a (ENSMAMG00000023185) #22	dnm1l (ENSMAMG00000023186) #23	tnnt2d (ENSMAMG00000023187) #24	bpgm (ENSMAMG00000027408) #25	ENSMAMG00000027052 #26	ENSMAMG00000023191 #30	ENSMAMG00000023192 #29	zgc:136858 (ENSMAMG00000023193) #31	ENSMAMG00000023194 #32	ENSMAMG00000023195 #33	ENSMAMG00000023196 #34	pthlhb (ENSMAMG00000023197) #36	tmpob (ENSMAMG00000023198) #37	ldhbb (ENSMAMG00000023199)	ENSMAMG00000023200	golt1bb (ENSMAMG00000023201)
Turbot	MODERN SPECIES	1	ENSSMAG00000007703	NELL2 (ENSSMAG00000007710) #7	TMEM117 (ENSSMAG00000007827) #9	twf1a (ENSSMAG00000007848) #10	irak4 (ENSSMAG00000007871) #11	ADAMTS20 (ENSSMAG00000007900) #12	ENSSMAG00000008018 #13	PPHLN1 (ENSSMAG00000008043) #15	PRICKLE1 (ENSSMAG00000008028) #14	YAF2 (ENSSMAG00000008054) #16	GXYLT1 (ENSSMAG00000008062) #17	PDZRN4 (ENSSMAG00000008100) #18	CNTN1 (ENSSMAG00000008140) #19	NRCAM (ENSSMAG00000008243) #20	ENSSMAG00000008292 #21	dnajb9a (ENSSMAG00000030394) #22	dnm1l (ENSSMAG00000008336) #23	tnnt2d (ENSSMAG00000008403) #24	ENSSMAG00000028897	bpgm (ENSSMAG00000031971) #25	ENSSMAG00000022935 #26	ENSSMAG00000026823 #27	ENSSMAG00000008521 #28	ENSSMAG00000008539 #29	ENSSMAG00000008563 #30	zgc:136858 (ENSSMAG00000008577) #31	ENSSMAG00000008614 #32	ENSSMAG00000008668 #33	ENSSMAG00000037334 #34	ENSSMAG00000008686 #35	pthlhb (ENSSMAG00000008692) #36
Greater amberjack	MODERN SPECIES	86	NELL2 (ENSSDUG00000023061) #7	ENSSDUG00000023056 #8	TMEM117 (ENSSDUG00000023052) #9	twf1a (ENSSDUG00000023046) #10	irak4 (ENSSDUG00000023039) #11	ADAMTS20 (ENSSDUG00000022977) #12	ENSSDUG00000022967 #13	prickle1a (ENSSDUG00000022955) #14	PPHLN1 (ENSSDUG00000022947) #15	YAF2 (ENSSDUG00000022939) #16	GXYLT1 (ENSSDUG00000022929) #17	PDZRN4 (ENSSDUG00000022923) #18	CNTN1 (ENSSDUG00000022906) #19	NRCAM (ENSSDUG00000022888) #20	PNPLA8 (ENSSDUG00000022881) #21	dnajb9a (ENSSDUG00000022878) #22	dnm1l (ENSSDUG00000022859) #23	tnnt2d (ENSSDUG00000022739) #24	CALD1 (ENSSDUG00000022720)	bpgm (ENSSDUG00000022717) #25	ENSSDUG00000022704 #26	ENSSDUG00000022700 #27	ENSSDUG00000022691 #28	tnni4a (ENSSDUG00000022686) #29	ENSSDUG00000022674 #30	zgc:136858 (ENSSDUG00000022651) #31	CNOT4 (ENSSDUG00000022635) #32	KCNA1 (ENSSDUG00000022629) #33	ENSSDUG00000022622 #34	ENSSDUG00000022615 #35	pthlhb (ENSSDUG00000022610) #36
Barramundi perch	MODERN SPECIES	144	ENSLCAG00010023994	ENSLCAG00010023885 #8	TMEM117 (ENSLCAG00010023881) #9	twf1a (ENSLCAG00010023877) #10	irak4 (ENSLCAG00010023870) #11	ADAMTS20 (ENSLCAG00010023794) #12	ENSLCAG00010023754 #13	prickle1a (ENSLCAG00010023751) #14	PPHLN1 (ENSLCAG00010023747) #15	YAF2 (ENSLCAG00010023745) #16	GXYLT1 (ENSLCAG00010023741) #17	PDZRN4 (ENSLCAG00010023738) #18	CNTN1 (ENSLCAG00010023704) #19	NRCAM (ENSLCAG00010022373) #20	ENSLCAG00010021917 #21	dnajb9a (ENSLCAG00010021915) #22	dnm1l (ENSLCAG00010021454) #23	tnnt2d (ENSLCAG00010021309) #24	bpgm (ENSLCAG00010021300) #25	ENSLCAG00010021299 #26	ENSLCAG00010021296 #27	ENSLCAG00010021295 #27	ENSLCAG00010021291 #27	tnni4a (ENSLCAG00010021290) #29	ENSLCAG00010021288 #30	zgc:136858 (ENSLCAG00010021280) #31	CNOT4 (ENSLCAG00010021275) #32	KCNA1 (ENSLCAG00010021273) #33	ENSLCAG00010021271 #34	ENSLCAG00010021270	pthlhb (ENSLCAG00010021268) #36
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT01030000234621.E	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000164736	ENSGT00390000004933.k.b #36
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01030000234518.C.b	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT01030000234621.E	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000164736	ENSGT00390000004933.k.b #36
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01030000234518.C.b	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000164736	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37	ENSGT00940000153525.i.b
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	6							ADAMTS20 (ENSKMAG00000005969) #12	ENSKMAG00000005935 #13	prickle1a (ENSKMAG00000005861) #14	PPHLN1 (ENSKMAG00000005806) #15	YAF2 (ENSKMAG00000005787) #16	GXYLT1 (ENSKMAG00000005749) #17	PDZRN4 (ENSKMAG00000005705) #18	CNTN1 (ENSKMAG00000005644) #19	NRCAM (ENSKMAG00000005274) #20	dnajb9a (ENSKMAG00000005139) #22	ENSKMAG00000005089 #21	dnm1l (ENSKMAG00000004994) #23	tnnt2d (ENSKMAG00000004908) #24	ENSKMAG00000004875	bpgm (ENSKMAG00000004859) #25	ENSKMAG00000004834 #27	tnni4a (ENSKMAG00000004784) #29	ENSKMAG00000004737 #30	zgc:136858 (ENSKMAG00000004663) #31	CNOT4 (ENSKMAG00000004581) #32	KCNA1 (ENSKMAG00000004556) #33	ENSKMAG00000004550 #34	ENSKMAG00000004526	pthlhb (ENSKMAG00000004512) #36	tmpob (ENSKMAG00000004488) #37
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1622	NUAK1 (ENSNFUG00015024810)	NELL2 (ENSNFUG00015024744) #7	TMEM117 (ENSNFUG00015024705) #9	IRAK4 (ENSNFUG00015024700) #11	twf1a (ENSNFUG00015024697) #10	ADAMTS20 (ENSNFUG00015024443) #12	ENSNFUG00015024381 #13	YAF2 (ENSNFUG00015024379) #16	GXYLT1B (ENSNFUG00015024376) #17	ENSNFUG00015024374	PDZRN4 (ENSNFUG00015024360) #18	CNTN1 (ENSNFUG00015023371) #19	NRCAM (ENSNFUG00015022871) #20	ENSNFUG00015022817	PNPLA8 (ENSNFUG00015022803) #21	DNAJB9 (ENSNFUG00015022799) #22	dnm1l (ENSNFUG00015022771) #23	tnnt2d (ENSNFUG00015022764) #24	BPGM (ENSNFUG00015022761) #25	ENSNFUG00015022759 #27	tnni4a (ENSNFUG00015022701) #29	ENSNFUG00015022692 #30	zgc:136858 (ENSNFUG00015022688) #31	CNOT4 (ENSNFUG00015022672) #32	KCNA1 (ENSNFUG00015022665) #33	ENSNFUG00015022664 #34	PTHLH (ENSNFUG00015022661) #36	TMPOB (ENSNFUG00015022658) #37	LDHB (ENSNFUG00015022653)	GOLT1BB (ENSNFUG00015022644)	ENSNFUG00015022635
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234518.C.b	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT01030000234621.E	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000164736	ENSGT00390000004933.k.b #36
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01030000234518.C.b	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000164736	ENSGT00390000004933.k.b #36
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01030000234518.C.b	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000164736	ENSGT00390000004933.k.b #36
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	31	ENSGT01030000234518.C.b	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792.f #11	ENSGT00940000158792.e #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000164736	ENSGT00390000004933.k.b #36
Sailfin molly	MODERN SPECIES	138													CNTN1 (ENSPLAG00000001621) #19	NRCAM (ENSPLAG00000001644) #20	PNPLA8 (ENSPLAG00000001659) #21	dnajb9a (ENSPLAG00000001668) #22	dnm1l (ENSPLAG00000001690) #23	tnnt2d (ENSPLAG00000001701) #24	CALD1 (ENSPLAG00000001710)	bpgm (ENSPLAG00000001718) #25	ENSPLAG00000001729 #26	ENSPLAG00000001733 #28	ENSPLAG00000001740 #27	tnni4a (ENSPLAG00000001747) #29	ENSPLAG00000001751	zgc:136858 (ENSPLAG00000001763) #31	CNOT4 (ENSPLAG00000001780) #32	KCNA1 (ENSPLAG00000001790) #33	ENSPLAG00000001794 #34	mybpc3 (ENSPLAG00000001818)	lgr4 (ENSPLAG00000001871)
Amazon molly	MODERN SPECIES	269	TMEM117 (ENSPFOG00000007536) #9	twf1a (ENSPFOG00000007332) #10	irak4 (ENSPFOG00000007106) #11	irak4 (ENSPFOG00000007094) #11	ADAMTS20 (ENSPFOG00000005633) #12	ENSPFOG00000005594 #13	prickle1a (ENSPFOG00000005504) #14	PPHLN1 (ENSPFOG00000005469) #15	YAF2 (ENSPFOG00000005422) #16	GXYLT1 (ENSPFOG00000005277) #17	ENSPFOG00000023657	PDZRN4 (ENSPFOG00000005033) #18	CNTN1 (ENSPFOG00000004289) #19	NRCAM (ENSPFOG00000003287) #20	PNPLA8 (ENSPFOG00000003149) #21	dnajb9a (ENSPFOG00000003137) #22	dnm1l (ENSPFOG00000002801) #23	tnnt2d (ENSPFOG00000002210) #24	CALD1 (ENSPFOG00000002752)	bpgm (ENSPFOG00000002708) #25	ENSPFOG00000002702 #26	ENSPFOG00000002695 #27	ENSPFOG00000002692 #28	tnni4a (ENSPFOG00000002691) #29	ENSPFOG00000002689 #30	zgc:136858 (ENSPFOG00000002505) #31	CNOT4 (ENSPFOG00000002228) #32	KCNA1 (ENSPFOG00000023573) #33	ENSPFOG00000022058 #34	ENSPFOG00000020310	pthlhb (ENSPFOG00000002189) #36
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Platyfish	MODERN SPECIES	11	NELL2 (ENSXMAG00000017418) #7	TMEM117 (ENSXMAG00000029251) #9	twf1a (ENSXMAG00000017399) #10	irak4 (ENSXMAG00000028973) #11	ADAMTS20 (ENSXMAG00000017324) #12	ENSXMAG00000021158 #13	prickle1a (ENSXMAG00000017299) #14	ENSXMAG00000028228	PPHLN1 (ENSXMAG00000029948) #15	YAF2 (ENSXMAG00000025433) #16	GXYLT1 (ENSXMAG00000017282) #17	PDZRN4 (ENSXMAG00000029582) #18	CNTN1 (ENSXMAG00000017213) #19	NRCAM (ENSXMAG00000017134) #20	ENSXMAG00000021559 #21	dnajb9a (ENSXMAG00000028221) #22	dnm1l (ENSXMAG00000017047) #23	tnnt2d (ENSXMAG00000017044) #24	bpgm (ENSXMAG00000023031) #25	ENSXMAG00000026716 #26	ENSXMAG00000017021 #27	ENSXMAG00000024483 #28	tnni4a (ENSXMAG00000025114) #29	ENSXMAG00000025969 #30	zgc:136858 (ENSXMAG00000016998) #31	CNOT4 (ENSXMAG00000016984) #32	KCNA1 (ENSXMAG00000019897) #33	ENSXMAG00000019895 #34	ENSXMAG00000016904	pthlhb (ENSXMAG00000016979) #36	tmpob (ENSXMAG00000016975) #37
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Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a.e.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a.e.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37	ENSGT00940000153525.i.b
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00810000125439.B.c.b #7	ENSGT01100000263537.b.a.b #8	ENSGT00390000013052 #9	ENSGT00530000063868.b #10	ENSGT00940000158792 #11	ENSGT00940000158636 #12	ENSGT00940000170627 #13	ENSGT00940000157529.i.a #14	ENSGT00390000016228.a.b #15	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a.e.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37	ENSGT00940000153525.i.b
Eastern happy	MODERN SPECIES	19	TMEM117 (ENSACLG00000027085) #9	ENSACLG00000027109 #8	twf1a (ENSACLG00000027122) #10	irak4 (ENSACLG00000000097) #11	ADAMTS20 (ENSACLG00000000156) #12	ENSACLG00000000409 #13	prickle1a (ENSACLG00000000425) #14	PPHLN1 (ENSACLG00000000449) #15	YAF2 (ENSACLG00000000456) #16	GXYLT1 (ENSACLG00000000481) #17	ENSACLG00000000539	PDZRN4 (ENSACLG00000000551) #18	CNTN1 (ENSACLG00000000904) #19	NRCAM (ENSACLG00000000954) #20	ENSACLG00000001359 #21	dnajb9a (ENSACLG00000001384) #22	dnm1l (ENSACLG00000001401) #23	tnnt2d (ENSACLG00000001473) #24	bpgm (ENSACLG00000002071) #25	ENSACLG00000002089 #26	ENSACLG00000002341 #28	tnni4a (ENSACLG00000002420) #29	ENSACLG00000002447 #30	zgc:136858 (ENSACLG00000002477) #31	CNOT4 (ENSACLG00000002514) #32	KCNA1 (ENSACLG00000002552) #33	ENSACLG00000002561 #34	ENSACLG00000002585	pthlhb (ENSACLG00000002618) #36	tmpob (ENSACLG00000002624) #37	ldhbb (ENSACLG00000002635)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1110	NELL2 (ENSMZEG00005008701) #7	ENSMZEG00005008680 #8	TMEM117 (ENSMZEG00005008658) #9	twf1a (ENSMZEG00005008622) #10	irak4 (ENSMZEG00005008598) #11	ADAMTS20 (ENSMZEG00005008339) #12	ENSMZEG00005008290 #13	prickle1a (ENSMZEG00005008270) #14	YAF2 (ENSMZEG00005008258) #16	GXYLT1 (ENSMZEG00005008242) #17	PDZRN4 (ENSMZEG00005008227) #18	ENSMZEG00005008199 #19	CNTN1 (ENSMZEG00005008112) #19	NRCAM (ENSMZEG00005007891) #20	ENSMZEG00005007830 #21	dnajb9a (ENSMZEG00005007813) #22	dnm1l (ENSMZEG00005007753) #23	tnnt2d (ENSMZEG00005007504) #24	bpgm (ENSMZEG00005007479) #25	ENSMZEG00005007465 #26	ENSMZEG00005007456 #28	tnni4a (ENSMZEG00005007450) #29	ENSMZEG00005007402 #30	zgc:136858 (ENSMZEG00005007356) #31	CNOT4 (ENSMZEG00005007312) #32	KCNA1 (ENSMZEG00005007277) #33	ENSMZEG00005007273 #34	ENSMZEG00005007266 #35	pthlhb (ENSMZEG00005007256) #36	tmpob (ENSMZEG00005007239) #37	ldhbb (ENSMZEG00005007213)
P. nyererei	MODERN SPECIES	322	NELL2 (ENSPNYG00000006005) #7	ENSPNYG00000005989 #8	TMEM117 (ENSPNYG00000005964) #9	twf1a (ENSPNYG00000005936) #10	irak4 (ENSPNYG00000005723) #11	ADAMTS20 (ENSPNYG00000005239) #12	ENSPNYG00000005157 #13	prickle1a (ENSPNYG00000005140) #14	PPHLN1 (ENSPNYG00000005128) #15	YAF2 (ENSPNYG00000005107) #16	GXYLT1 (ENSPNYG00000005077) #17	PDZRN4 (ENSPNYG00000005050) #18	CNTN1 (ENSPNYG00000004847) #19	NRCAM (ENSPNYG00000004759) #20	ENSPNYG00000004741 #21	dnajb9a (ENSPNYG00000004724) #22	dnm1l (ENSPNYG00000004502) #23	tnnt2d (ENSPNYG00000004458) #24	bpgm (ENSPNYG00000004447) #25	ENSPNYG00000004430 #26	ENSPNYG00000004391 #28	ENSPNYG00000004373 #29	ENSPNYG00000004344 #30	zgc:136858 (ENSPNYG00000004314) #31	CNOT4 (ENSPNYG00000004276) #32	KCNA1 (ENSPNYG00000004255) #33	ENSPNYG00000004251 #34	pthlhb (ENSPNYG00000004239) #36	tmpob (ENSPNYG00000004229) #37	ldhbb (ENSPNYG00000002953)	golt1bb (ENSPNYG00000002882)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	542						ADAMTS20 (ENSHBUG00000001654) #12	ENSHBUG00000001665 #13	prickle1a (ENSHBUG00000001677) #14	PPHLN1 (ENSHBUG00000001684) #15	YAF2 (ENSHBUG00000001690) #16	GXYLT1 (ENSHBUG00000001705) #17	PDZRN4 (ENSHBUG00000001717) #18	CNTN1 (ENSHBUG00000001731) #19	NRCAM (ENSHBUG00000001859) #20	ENSHBUG00000001910 #21	dnajb9a (ENSHBUG00000001914) #22	dnm1l (ENSHBUG00000001952) #23	tnnt2d (ENSHBUG00000001979) #24	CALD1 (ENSHBUG00000000020)	bpgm (ENSHBUG00000002034) #25	ENSHBUG00000002040 #26	ENSHBUG00000000025 #28	ENSHBUG00000002059 #29	ENSHBUG00000002071 #30	zgc:136858 (ENSHBUG00000002096) #31	CNOT4 (ENSHBUG00000000027) #32	ENSHBUG00000002148 #34	pthlhb (ENSHBUG00000002154) #36	tmpob (ENSHBUG00000002160) #37	ldhbb (ENSHBUG00000002168)	golt1bb (ENSHBUG00000002179)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	293	NELL2 (ENSNBRG00000019731) #7	TMEM117 (ENSNBRG00000019772) #9	twf1a (ENSNBRG00000019791) #10	irak4 (ENSNBRG00000019813) #11	ADAMTS20 (ENSNBRG00000019988) #12	ENSNBRG00000020637 #13	prickle1a (ENSNBRG00000020651) #14	PPHLN1 (ENSNBRG00000020669) #15	YAF2 (ENSNBRG00000020680) #16	GXYLT1 (ENSNBRG00000020710) #17	PDZRN4 (ENSNBRG00000020749) #18	ENSNBRG00000020773	CNTN1 (ENSNBRG00000020792) #19	NRCAM (ENSNBRG00000020897) #20	ENSNBRG00000020948 #21	dnajb9a (ENSNBRG00000020956) #22	dnm1l (ENSNBRG00000020969) #23	tnnt2d (ENSNBRG00000020994) #24	ENSNBRG00000021005	bpgm (ENSNBRG00000021024) #25	ENSNBRG00000021031 #26	ENSNBRG00000021050 #28	tnni4a (ENSNBRG00000021067) #29	ENSNBRG00000021081 #30	zgc:136858 (ENSNBRG00000021096) #31	CNOT4 (ENSNBRG00000021144) #32	KCNA1 (ENSNBRG00000021172) #33	ENSNBRG00000021177 #34	ENSNBRG00000021178 #35	pthlhb (ENSNBRG00000021185) #36	tmpob (ENSNBRG00000021195) #37
Nile tilapia	MODERN SPECIES	19	ENSONIG00000042325	NELL2 (ENSONIG00000008749) #7	TMEM117 (ENSONIG00000008743) #9	twf1a (ENSONIG00000008739) #10	irak4 (ENSONIG00000008733) #11	ADAMTS20 (ENSONIG00000008715) #12	ENSONIG00000021092 #13	prickle1a (ENSONIG00000008712) #14	PPHLN1 (ENSONIG00000025900) #15	YAF2 (ENSONIG00000008709) #16	GXYLT1 (ENSONIG00000008707) #17	PDZRN4 (ENSONIG00000008705) #18	CNTN1 (ENSONIG00000008695) #19	NRCAM (ENSONIG00000008686) #20	ENSONIG00000008681 #21	dnajb9a (ENSONIG00000041184) #22	dnm1l (ENSONIG00000008672) #23	tnnt2d (ENSONIG00000008670) #24	bpgm (ENSONIG00000038991) #25	ENSONIG00000029190 #26	ENSONIG00000037691 #26	ENSONIG00000008665 #29	ENSONIG00000028524 #30	zgc:136858 (ENSONIG00000008662) #31	CNOT4 (ENSONIG00000008656) #32	ENSONIG00000021090 #34	ENSONIG00000021089 #35	pthlhb (ENSONIG00000042695) #36	tmpob (ENSONIG00000032413) #37	ldhbb (ENSONIG00000008643)	golt1bb (ENSONIG00000008642)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	108	szl (ENSACIG00000002353)	NELL2 (ENSACIG00000002376) #7	TMEM117 (ENSACIG00000002428) #9	twf1a (ENSACIG00000002443) #10	irak4 (ENSACIG00000002462) #11	ADAMTS20 (ENSACIG00000002491) #12	ENSACIG00000002579 #13	prickle1a (ENSACIG00000002591) #14	ENSACIG00000002610	YAF2 (ENSACIG00000002635) #16	GXYLT1 (ENSACIG00000002649) #17	PDZRN4 (ENSACIG00000002668) #18	CNTN1 (ENSACIG00000002688) #19	NRCAM (ENSACIG00000002744) #20	ENSACIG00000002797 #21	dnajb9a (ENSACIG00000002817) #22	dnm1l (ENSACIG00000002828) #23	tnnt2d (ENSACIG00000002862) #24	bpgm (ENSACIG00000002886) #25	ENSACIG00000002893 #26	ENSACIG00000002911 #28	ENSACIG00000002926 #29	ENSACIG00000002933 #30	zgc:136858 (ENSACIG00000002966) #31	CNOT4 (ENSACIG00000003011) #32	KCNA1 (ENSACIG00000003044) #33	ENSACIG00000003049 #34	ENSACIG00000003061 #35	pthlhb (ENSACIG00000003066) #36	tmpob (ENSACIG00000003078) #37	ldhbb (ENSACIG00000003094)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163982	ENSGT00940000172695	ENSGT00940000157682.B.b	ENSGT00390000010382	ENSGT00390000005941.d	ENSGT00530000063576.A	ENSGT00940000162677	ENSGT00390000007126	ENSGT00950000182857.a.a.b.b	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000163982	ENSGT00940000172695	ENSGT00940000157682.B.b	ENSGT00390000010382	ENSGT00390000005941.d	ENSGT00530000063576.A	ENSGT00940000162677	ENSGT00390000007126	ENSGT00950000182857.a.a.b.b	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.b #28	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000172695	ENSGT00940000157682.B.b	ENSGT00390000010382	ENSGT00390000005941.d	ENSGT00530000063576.A	ENSGT00940000162677	ENSGT00390000007126.e	ENSGT00950000182857.a.a.b.b	ENSGT00950000183129.a.f	ENSGT00390000013995.b.b.k.b #16	ENSGT00940000156242.c.a #17	ENSGT00950000183062.a.a.b.b.b #18	ENSGT00940000155915.a #19	ENSGT00940000155419.c.a #20	ENSGT00940000154738.a.q #21	ENSGT00940000156246.c.a #22	ENSGT00940000155504.k.a #23	ENSGT00940000154709.a.b.b.c #24	ENSGT00940000153901.a.a.a	ENSGT00950000182926.a #25	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.a.a #26	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.b #27	ENSGT01030000234588.b.b.b.a.a.b.b #29	ENSGT00940000159018.d #30	ENSGT00390000007427 #31	ENSGT00390000000068.a.b #32	ENSGT00940000158576.a.b #33	ENSGT00940000164299.b.b #34	ENSGT00940000159286.a.a #35	ENSGT00390000004933.k.b #36	ENSGT00940000154098.a.e #37
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Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1217															ENSSPAG00000012015 #21	dnajb9a (ENSSPAG00000012033) #22	dnm1l (ENSSPAG00000012049) #23	tnnt2d (ENSSPAG00000012090) #24	ENSSPAG00000012130	bpgm (ENSSPAG00000012146) #25	ENSSPAG00000012160 #26	ENSSPAG00000012175 #27	ENSSPAG00000012204 #28	ENSSPAG00000012226 #30	zgc:136858 (ENSSPAG00000012273) #31	CNOT4 (ENSSPAG00000012329) #32	KCNA1 (ENSSPAG00000012387) #33	ENSSPAG00000012390 #34	pthlhb (ENSSPAG00000012395) #36	tmpob (ENSSPAG00000012406) #37	ldhbb (ENSSPAG00000012436)
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	446															PNPLA8 (ENSHCOG00000015537) #21	dnajb9a (ENSHCOG00000015547) #22	ENSHCOG00000015552 ##23	tnnt2d (ENSHCOG00000015570) #24	ENSHCOG00000015641	bpgm (ENSHCOG00000015648) #25	ENSHCOG00000015652 #26	ENSHCOG00000015660 #28	ENSHCOG00000015702 #29	ENSHCOG00000015709	zgc:136858 (ENSHCOG00000015773) #31	CNOT4 (ENSHCOG00000015815) #32	wnt2 (ENSHCOG00000015861)	asz1 (ENSHCOG00000000444)	ENSHCOG00000015882	cftr (ENSHCOG00000015934)	ENSHCOG00000015945