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Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	14	LRRC4C (ENSHGLG00000042650) #9	ENSHGLG00000041917	ENSHGLG00000044878	IFTAP (ENSHGLG00000007037) #11	RAG2 (ENSHGLG00000020564) #12	RAG1 (ENSHGLG00000020565) #13	TRAF6 (ENSHGLG00000010513) #14	PRR5L (ENSHGLG00000006197) #15	COMMD9 (ENSHGLG00000039189) #16	LDLRAD3 (ENSHGLG00000009909) #17	ENSHGLG00000035280	TRIM44 (ENSHGLG00000006623) #18	FJX1 (ENSHGLG00000038500) #19	ENSHGLG00000038577	PAMR1 (ENSHGLG00000007733) #21	SLC1A2 (ENSHGLG00000010072) #22	CD44 (ENSHGLG00000011767) #23	ENSHGLG00000047526	ENSHGLG00000040571	ENSHGLG00000010978 #24	APIP (ENSHGLG00000011839) #26	EHF (ENSHGLG00000009758) #27	ELF5 (ENSHGLG00000011019) #28	CAT (ENSHGLG00000011741) #29	ENSHGLG00000016446 #31	NAT10 (ENSHGLG00000016891) #32	ENSHGLG00000018658 #33	ENSHGLG00000009842	ENSHGLG00000006506	ENSHGLG00000035097	ENSHGLG00000048933 #35
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Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000016821	ENSGT00940000157226	ENSGT00940000154860	ENSGT00390000006196	ENSGT00390000010991	ENSGT00940000157405 #9	ENSGT00390000013149 #11	ENSGT00390000012559 #12	ENSGT00390000008679 #13	ENSGT00940000155426 #14	ENSGT00530000063981.b #15	ENSGT00390000006218 #16	ENSGT00940000160574 #17	ENSGT00440000034605.f.a #18	ENSGT00940000154234.a #21	ENSGT00940000155379 #22	ENSGT00530000063822.a.a #23	ENSGT00940000156046 #24	ENSGT00390000001680 #26	ENSGT00940000159310 #27	ENSGT00940000160980 #28	ENSGT00390000018100 #29	ENSGT00940000157661 #31	ENSGT00390000009140.g #32	ENSGT00940000153438.a #33	ENSGT00940000160199 #35	ENSGT00940000153571.b #36	ENSGT00390000016309	ENSGT00390000002169	ENSGT00530000063472.b.b.a.b	ENSGT00940000155960.b
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	10	ALKBH3 (ENSUPAG00010001256)	HSD17B12 (ENSUPAG00010001237)	ENSUPAG00010001201	API5 (ENSUPAG00010001168)	ENSUPAG00010001157	LRRC4C (ENSUPAG00010001136) #9	IFTAP (ENSUPAG00010001086) #11	RAG2 (ENSUPAG00010001080) #12	RAG1 (ENSUPAG00010001077) #13	TRAF6 (ENSUPAG00010001061) #14	PRR5L (ENSUPAG00010001016) #15	COMMD9 (ENSUPAG00010001008) #16	LDLRAD3 (ENSUPAG00010000987) #17	ENSUPAG00010000969 #18	PAMR1 (ENSUPAG00010000955) #21	SLC1A2 (ENSUPAG00010000901) #22	CD44 (ENSUPAG00010000106) #23	PDHX (ENSUPAG00010000084) #24	APIP (ENSUPAG00010000057) #26	EHF (ENSUPAG00010019516) #27	ELF5 (ENSUPAG00010019491) #28	CAT (ENSUPAG00010019472) #29	ABTB2 (ENSUPAG00010019465) #31	NAT10 (ENSUPAG00010019438) #32	CAPRIN1 (ENSUPAG00010019403) #33	LMO2 (ENSUPAG00010019388) #35	FBXO3 (ENSUPAG00010019358) #36	ENSUPAG00010019350	C11orf91 (ENSUPAG00010019347)	KIAA1549L (ENSUPAG00010019291)	HIPK3 (ENSUPAG00010019217)
Squirrel	MODERN SPECIES	133							IFTAP (ENSSTOG00000029068) #11	RAG2 (ENSSTOG00000012558) #12	RAG1 (ENSSTOG00000025584) #13	TRAF6 (ENSSTOG00000007303) #14	PRR5L (ENSSTOG00000022180) #15	COMMD9 (ENSSTOG00000007267) #16	LDLRAD3 (ENSSTOG00000007228) #17	TRIM44 (ENSSTOG00000023760) #18	PAMR1 (ENSSTOG00000000826) #21	SLC1A2 (ENSSTOG00000000822) #22	ENSSTOG00000000813 #23	PDHX (ENSSTOG00000004403) #24	APIP (ENSSTOG00000004390) #26	ENSSTOG00000008622 #27	ELF5 (ENSSTOG00000008610) #28	CAT (ENSSTOG00000008595) #29	ABTB2 (ENSSTOG00000001839) #31	ENSSTOG00000001817 #32	CAPRIN1 (ENSSTOG00000006945) #33	LMO2 (ENSSTOG00000024319) #35	FBXO3 (ENSSTOG00000016405) #36	ENSSTOG00000011395	C11orf91 (ENSSTOG00000026942)	KIAA1549L (ENSSTOG00000011381)	HIPK3 (ENSSTOG00000009714)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	3	ALKBH3 (ENSMMMG00000011630)	ENSMMMG00000011626	HSD17B12 (ENSMMMG00000011610)	TTC17 (ENSMMMG00000011550)	API5 (ENSMMMG00000011483)	LRRC4C (ENSMMMG00000011362) #9	IFTAP (ENSMMMG00000011311) #11	RAG2 (ENSMMMG00000011304) #12	RAG1 (ENSMMMG00000011298) #13	TRAF6 (ENSMMMG00000011285) #14	PRR5L (ENSMMMG00000011238) #15	COMMD9 (ENSMMMG00000011235) #16	LDLRAD3 (ENSMMMG00000011216) #17	TRIM44 (ENSMMMG00000011195) #18	PAMR1 (ENSMMMG00000011162) #21	SLC1A2 (ENSMMMG00000011014) #22	CD44 (ENSMMMG00000010323) #23	PDHX (ENSMMMG00000010279) #24	APIP (ENSMMMG00000010262) #26	EHF (ENSMMMG00000010179) #27	ELF5 (ENSMMMG00000010124) #28	CAT (ENSMMMG00000010087) #29	ABTB2 (ENSMMMG00000010060) #31	NAT10 (ENSMMMG00000009992) #32	CAPRIN1 (ENSMMMG00000008164) #33	LMO2 (ENSMMMG00000008095) #35	FBXO3 (ENSMMMG00000008035) #36	ENSMMMG00000008026	C11orf91 (ENSMMMG00000008017)	KIAA1549L (ENSMMMG00000007942)	HIPK3 (ENSMMMG00000007810)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	2	TTC17 (ENSSVLG00005018176)	ENSSVLG00005018298	LRRC4C (ENSSVLG00005018979) #9	ENSSVLG00005019010	ENSSVLG00005019047 #11	RAG2 (ENSSVLG00005019171) #12	RAG1 (ENSSVLG00005019195) #13	TRAF6 (ENSSVLG00005019219) #14	PRR5L (ENSSVLG00005019340) #15	COMMD9 (ENSSVLG00005019522) #16	LDLRAD3 (ENSSVLG00005019672) #17	ENSSVLG00005019782 #18	ENSSVLG00005019851	FJX1 (ENSSVLG00005019889) #19	PAMR1 (ENSSVLG00005019988) #21	SLC1A2 (ENSSVLG00005020571) #22	CD44 (ENSSVLG00005021288) #23	PDHX (ENSSVLG00005021554) #24	APIP (ENSSVLG00005021719) #26	ENSSVLG00005021768 #27	ELF5 (ENSSVLG00005021853) #28	CAT (ENSSVLG00005022137) #29	ENSSVLG00005022214	ABTB2 (ENSSVLG00005004819) #31	NAT10 (ENSSVLG00005004900) #32	CAPRIN1 (ENSSVLG00005004951) #33	LMO2 (ENSSVLG00005005066) #35	FBXO3 (ENSSVLG00005005111) #36	ENSSVLG00005005193	C11orf91 (ENSSVLG00005005211)	KIAA1549L (ENSSVLG00005005254)