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Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000160065 #8	ENSGT00940000155609 #9	ENSGT00950000183092.a #10	ENSGT00940000161040 #11	ENSGT00390000002762.a.a #12	ENSGT00950000182883.b.a.b #13	ENSGT00940000157899.b #14	ENSGT01080000257420.C.b.a #15	ENSGT00390000006330.a.b #16	ENSGT00390000002174.a #17	ENSGT00940000160660 #18	ENSGT00390000000335 #19	ENSGT00940000160722 #20	ENSGT00940000154307.D #21	ENSGT00940000154118.a.a.a.a ##22	ENSGT00940000154118.b #22	ENSGT00940000161764	ENSGT00940000162028	ENSGT00390000011466	ENSGT00440000033468.c.a	ENSGT00940000154256	ENSGT00550000074800	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000155250	ENSGT00390000010463.a.a.a	ENSGT00940000159780	ENSGT00940000156260	ENSGT00390000015124	ENSGT00500000045104.h	ENSGT00500000045104.g	ENSGT01050000244905.C
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160065 #8	ENSGT00940000155609 #9	ENSGT00950000183092.a #10	ENSGT00940000161040 #11	ENSGT00390000002762.a.a #12	ENSGT00950000182883.b.a.b #13	ENSGT00940000157899.b #14	ENSGT01080000257420.C.b.a #15	ENSGT00390000006330.a.b #16	ENSGT00390000002174.a #17	ENSGT00940000160660 #18	ENSGT00390000000335 #19	ENSGT00940000160722 #20	ENSGT00940000154307.D #21	ENSGT00940000154118.a.a.a.a ##22	ENSGT00940000154118.b #22	ENSGT00940000161764	ENSGT00940000162028	ENSGT00390000011466	ENSGT00440000033468.c.a	ENSGT00940000154256	ENSGT00550000074800	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000155250	ENSGT00390000010463.a.a.a	ENSGT00940000159780	ENSGT00940000156260	ENSGT00390000015124	ENSGT00500000045104.h	ENSGT00500000045104.g	ENSGT01050000244905.C
Murinae	DUPLICATION
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160065 #8	ENSGT00940000155609 #9	ENSGT00950000183092.a #10	ENSGT00940000161040 #11	ENSGT00390000002762.a.a #12	ENSGT00950000182883.b.a.b #13	ENSGT00940000157899.b #14	ENSGT01080000257420.C.b.a #15	ENSGT00390000006330.a.b #16	ENSGT00390000002174.a #17	ENSGT00940000160660 #18	ENSGT00390000000335 #19	ENSGT00940000160722 #20	ENSGT00940000154307.D #21	ENSGT00940000154118.a.a.a.a ##22	ENSGT00940000154118.b.w #22	ENSGT00940000161764	ENSGT00940000162028	ENSGT00390000011466	ENSGT00440000033468.c.a	ENSGT00940000154256	ENSGT00550000074800	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000155250	ENSGT00390000010463.a.a.a	ENSGT00940000159780	ENSGT00940000156260	ENSGT00390000015124	ENSGT00500000045104.h	ENSGT00500000045104.g	ENSGT01050000244905.C
Mus	DUPLICATION
Mus	DUPLICATION
Mus	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000155609 #9	ENSGT00950000183092.a #10	ENSGT00940000161040 #11	ENSGT00390000002762.a.a #12	ENSGT00950000182883.b.a.b #13	ENSGT00940000157899.b #14	ENSGT01080000257420.C.b.a #15	ENSGT00390000006330.a.b #16	ENSGT00390000002174.a #17	ENSGT00940000160660 #18	ENSGT00390000000335 #19	ENSGT00940000160722 #20	ENSGT00940000154307.D #21	ENSGT00940000154118.b.w.b ##22	ENSGT00940000154118.b.w.a.a ##22	ENSGT00940000154118.b.w.a.b #22	ENSGT00940000154118.b.x ##22	ENSGT00940000161764	ENSGT00940000162028	ENSGT00390000011466	ENSGT00440000033468.c.a	ENSGT00940000154256	ENSGT00550000074800	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000155250	ENSGT00390000010463.a.a.a	ENSGT00940000159780	ENSGT00940000156260	ENSGT00390000015124	ENSGT00500000045104.h	ENSGT00500000045104.g
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155609 #9	ENSGT00950000183092.a #10	ENSGT00940000161040 #11	ENSGT00390000002762.a.a #12	ENSGT00950000182883.b.a.b #13	ENSGT00940000157899.b #14	ENSGT01080000257420.C.b.a #15	ENSGT00390000006330.a.b #16	ENSGT00390000002174.a #17	ENSGT00940000160660 #18	ENSGT00390000000335 #19	ENSGT00940000160722 #20	ENSGT00940000154307.D #21	ENSGT00940000154118.b.w.b ##22	ENSGT00940000154118.b.w.a.a ##22	ENSGT00940000154118.b.w.a.b #22	ENSGT00940000154118.b.x ##22	ENSGT00940000161764	ENSGT00940000162028	ENSGT00390000011466	ENSGT00440000033468.c.a	ENSGT00940000154256	ENSGT00550000074800	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000155250	ENSGT00390000010463.a.a.a	ENSGT00940000159780	ENSGT00940000156260	ENSGT00390000015124	ENSGT00500000045104.h	ENSGT00500000045104.g
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000162107 #7	ENSGT00940000160065 #8	ENSGT00940000155609 #9	ENSGT00950000183092.a #10	ENSGT00940000161040 #11	ENSGT00390000002762.a.a #12	ENSGT00950000182883.b.a.b #13	ENSGT00940000157899.b #14	ENSGT01080000257420.C.b.a #15	ENSGT00390000006330.a.b #16	ENSGT00390000002174.a #17	ENSGT00940000160660 #18	ENSGT00390000000335 #19	ENSGT00940000160722 #20	ENSGT00940000154307.D #21	ENSGT00940000154118.b.w.a.b #22	ENSGT00940000161764	ENSGT00390000011466	ENSGT00440000033468.c.a	ENSGT00940000154256	ENSGT00550000074800	ENSGT00940000159490	ENSGT00940000155250	ENSGT00390000010463.a.a.a	ENSGT00940000159780	ENSGT00940000156260	ENSGT00390000015124	ENSGT00500000045104.h	ENSGT00500000045104.g	ENSGT01050000244905.C	ENSGT00390000006482
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2596	Inhbe (ENSMSIG00000000566) #7	Inhbc (ENSMSIG00000000587) #8	R3hdm2 (ENSMSIG00000000757) #9	Stac3 (ENSMSIG00000002644) #10	Ndufa4l2 (ENSMSIG00000002715) #11	Shmt2 (ENSMSIG00000002744) #12	Nxph4 (ENSMSIG00000002804) #13	Lrp1 (ENSMSIG00000002847) #14	Stat6 (ENSMSIG00000003202) #15	Nab2 (ENSMSIG00000003392) #16	Nemp1 (ENSMSIG00000003480) #17	Myo1a (ENSMSIG00000003896) #18	Tac2 (ENSMSIG00000019140) #19	Zbtb39 (ENSMSIG00000019165) #20	Gpr182 (ENSMSIG00000019172) #21	Rdh16f2 (ENSMSIG00000019184) #22
spretus	DUPLICATION
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spretus	MODERN SPECIES	1	Inhbc (MGP_SPRETEiJ_G0016721) #8	R3hdm2 (MGP_SPRETEiJ_G0016722) #9	Stac3 (MGP_SPRETEiJ_G0016723) #10	Ndufa4l2 (MGP_SPRETEiJ_G0016724) #11	Shmt2 (MGP_SPRETEiJ_G0016725) #12	Nxph4 (MGP_SPRETEiJ_G0016726) #13	Lrp1 (MGP_SPRETEiJ_G0016727) #14	Stat6 (MGP_SPRETEiJ_G0016728) #15	Nab2 (MGP_SPRETEiJ_G0016729) #16	Myo1a (MGP_SPRETEiJ_G0016731) #18	Tac2 (MGP_SPRETEiJ_G0016732) #19	Zbtb39 (MGP_SPRETEiJ_G0016733) #20	Gpr182 (MGP_SPRETEiJ_G0016734) #21	MGP_SPRETEiJ_G0016735 #22	MGP_SPRETEiJ_G0016737 ##22	MGP_SPRETEiJ_G0016738 #22	Sdr9c7 (MGP_SPRETEiJ_G0016739)	Hsd17b6 (MGP_SPRETEiJ_G0016740)	Prim1 (MGP_SPRETEiJ_G0016741)	Naca (MGP_SPRETEiJ_G0016742)	Ptges3 (MGP_SPRETEiJ_G0016743)	Atp5b (MGP_SPRETEiJ_G0016744)	Baz2a (MGP_SPRETEiJ_G0016745)	Rbms2 (MGP_SPRETEiJ_G0016746)	Gls2 (MGP_SPRETEiJ_G0016747)	Spryd4 (MGP_SPRETEiJ_G0016748)	Mip (MGP_SPRETEiJ_G0016749)	Timeless (MGP_SPRETEiJ_G0016750)	Apon (MGP_SPRETEiJ_G0016751)	Apof (MGP_SPRETEiJ_G0016752)	Stat2 (MGP_SPRETEiJ_G0016753)
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Shrew mouse	DUPLICATION
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Mouse	MODERN SPECIES	1	Inhbe (ENSMUSG00000047492) #7	Inhbc (ENSMUSG00000025405) #8	R3hdm2 (ENSMUSG00000025404) #9	Stac3 (ENSMUSG00000040287) #10	Ndufa4l2 (ENSMUSG00000040280) #11	Shmt2 (ENSMUSG00000025403) #12	Nxph4 (ENSMUSG00000040258) #13	Lrp1 (ENSMUSG00000040249) #14	Stat6 (ENSMUSG00000002147) #15	Nab2 (ENSMUSG00000025402) #16	Nemp1 (ENSMUSG00000040195) #17	Myo1a (ENSMUSG00000025401) #18	Tac2 (ENSMUSG00000025400) #19	Zbtb39 (ENSMUSG00000044617) #20	Gpr182 (ENSMUSG00000058396) #21	Rdh1 (ENSMUSG00000089789) ##22	Rdh16f1 (ENSMUSG00000099009)	Rdh9 (ENSMUSG00000056148) ##22	Rdh16 (ENSMUSG00000069456) ##22	Rdh19 (ENSMUSG00000054052) ##22	Rdh16f2 (ENSMUSG00000074639) #22	Rdh7 (ENSMUSG00000040134) ##22	Sdr9c7 (ENSMUSG00000040127)	Hsd17b6 (ENSMUSG00000025396)	Prim1 (ENSMUSG00000025395)	Naca (ENSMUSG00000061315)	Ptges3 (ENSMUSG00000071072)	Atp5b (ENSMUSG00000025393)	Baz2a (ENSMUSG00000040054)	Rbms2 (ENSMUSG00000040043)	Gls2 (ENSMUSG00000044005)
Shrew mouse	DUPLICATION
Shrew mouse	MODERN SPECIES	22	Inhbe (MGP_PahariEiJ_G0031191) #7	Inhbc (MGP_PahariEiJ_G0031190) #8	R3hdm2 (MGP_PahariEiJ_G0031189) #9	Stac3 (MGP_PahariEiJ_G0031188) #10	Ndufa4l2 (MGP_PahariEiJ_G0031187) #11	Shmt2 (MGP_PahariEiJ_G0031186) #12	Nxph4 (MGP_PahariEiJ_G0031185) #13	Lrp1 (MGP_PahariEiJ_G0031184) #14	Stat6 (MGP_PahariEiJ_G0031183) #15	Nab2 (MGP_PahariEiJ_G0031182) #16	Nemp1 (MGP_PahariEiJ_G0031181) #17	Myo1a (MGP_PahariEiJ_G0031180) #18	Tac2 (MGP_PahariEiJ_G0031179) #19	Zbtb39 (MGP_PahariEiJ_G0031178) #20	Gpr182 (MGP_PahariEiJ_G0031177) #21	MGP_PahariEiJ_G0031176 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031175 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031174 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031173 ##22	Rdh16f2 (MGP_PahariEiJ_G0031172) #22	MGP_PahariEiJ_G0031171 ##22	Sdr9c7 (MGP_PahariEiJ_G0031170)	Hsd17b6 (MGP_PahariEiJ_G0031169)	Prim1 (MGP_PahariEiJ_G0031168)	Naca (MGP_PahariEiJ_G0031167)	Atp5b (MGP_PahariEiJ_G0031165)	Baz2a (MGP_PahariEiJ_G0031164)	Rbms2 (MGP_PahariEiJ_G0031163)	Gls2 (MGP_PahariEiJ_G0031162)	Spryd4 (MGP_PahariEiJ_G0031161)	Mip (MGP_PahariEiJ_G0031160)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	22	Inhbc (MGP_PahariEiJ_G0031190) #8	R3hdm2 (MGP_PahariEiJ_G0031189) #9	Stac3 (MGP_PahariEiJ_G0031188) #10	Ndufa4l2 (MGP_PahariEiJ_G0031187) #11	Shmt2 (MGP_PahariEiJ_G0031186) #12	Nxph4 (MGP_PahariEiJ_G0031185) #13	Lrp1 (MGP_PahariEiJ_G0031184) #14	Stat6 (MGP_PahariEiJ_G0031183) #15	Nab2 (MGP_PahariEiJ_G0031182) #16	Nemp1 (MGP_PahariEiJ_G0031181) #17	Myo1a (MGP_PahariEiJ_G0031180) #18	Tac2 (MGP_PahariEiJ_G0031179) #19	Zbtb39 (MGP_PahariEiJ_G0031178) #20	Gpr182 (MGP_PahariEiJ_G0031177) #21	MGP_PahariEiJ_G0031176 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031175 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031174 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031173 ##22	Rdh16f2 (MGP_PahariEiJ_G0031172) #22	MGP_PahariEiJ_G0031171 ##22	Sdr9c7 (MGP_PahariEiJ_G0031170)	Hsd17b6 (MGP_PahariEiJ_G0031169)	Prim1 (MGP_PahariEiJ_G0031168)	Naca (MGP_PahariEiJ_G0031167)	Atp5b (MGP_PahariEiJ_G0031165)	Baz2a (MGP_PahariEiJ_G0031164)	Rbms2 (MGP_PahariEiJ_G0031163)	Gls2 (MGP_PahariEiJ_G0031162)	Spryd4 (MGP_PahariEiJ_G0031161)	Mip (MGP_PahariEiJ_G0031160)	Timeless (MGP_PahariEiJ_G0031159)
Rat	MODERN SPECIES	17	Inhbe (ENSRNOG00000007601) #7	Inhbc (ENSRNOG00000007700) #8	R3hdm2 (ENSRNOG00000007801) #9	Stac3 (ENSRNOG00000008050) #10	Ndufa4l2 (ENSRNOG00000031851) #11	Shmt2 (ENSRNOG00000008106) #12	Nxph4 (ENSRNOG00000025059) #13	Lrp1 (ENSRNOG00000025053) #14	Stat6 (ENSRNOG00000025023) #15	Nemp1 (ENSRNOG00000046492) #17	Nab2 (ENSRNOG00000008415) #16	Myo1a (ENSRNOG00000004177) #18	Tac3 (ENSRNOG00000004229) #19	Zbtb39 (ENSRNOG00000004306) #20	Gpr182 (ENSRNOG00000004311) #21	Rdh16 (ENSRNOG00000029651) #22	ENSRNOG00000067654	Rdh7 (ENSRNOG00000004391) ##22	Sdr9c7 (ENSRNOG00000004459)	Uqcrb (ENSRNOG00000024967)	Mterf3 (ENSRNOG00000004492)	Ptdss1 (ENSRNOG00000052289)	AABR07057438.1 (ENSRNOG00000033952)	Sdc2 (ENSRNOG00000004936)	Cpq (ENSRNOG00000005931)	Tspyl5 (ENSRNOG00000006278)	RGD1562404 (ENSRNOG00000014169)	ENSRNOG00000066306	Mtdh (ENSRNOG00000006870)	ENSRNOG00000068626	Laptm4b (ENSRNOG00000006766)
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Mouse	MODERN SPECIES	1	Stat2 (ENSMUSG00000040033)	Apof (ENSMUSG00000047631)	Apon (ENSMUSG00000051716)	Timeless (ENSMUSG00000039994)	Mip (ENSMUSG00000025389)	Spryd4 (ENSMUSG00000051346)	Gls2 (ENSMUSG00000044005)	Rbms2 (ENSMUSG00000040043)	Baz2a (ENSMUSG00000040054)	Atp5b (ENSMUSG00000025393)	Ptges3 (ENSMUSG00000071072)	Naca (ENSMUSG00000061315)	Prim1 (ENSMUSG00000025395)	Hsd17b6 (ENSMUSG00000025396)	Sdr9c7 (ENSMUSG00000040127)	Rdh7 (ENSMUSG00000040134) ##22	Rdh16f2 (ENSMUSG00000074639) #22	Rdh19 (ENSMUSG00000054052) ##22	Rdh16 (ENSMUSG00000069456) ##22	Rdh9 (ENSMUSG00000056148) ##22	Rdh16f1 (ENSMUSG00000099009)	Rdh1 (ENSMUSG00000089789) ##22	Gpr182 (ENSMUSG00000058396) #21	Zbtb39 (ENSMUSG00000044617) #20	Tac2 (ENSMUSG00000025400) #19	Myo1a (ENSMUSG00000025401) #18	Nemp1 (ENSMUSG00000040195) #17	Nab2 (ENSMUSG00000025402) #16	Stat6 (ENSMUSG00000002147) #15	Lrp1 (ENSMUSG00000040249) #14	Nxph4 (ENSMUSG00000040258) #13
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	1	Il23a (MGP_CAROLIEiJ_G0015929)	Stat2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015928)	Apof (MGP_CAROLIEiJ_G0015927)	Apon (MGP_CAROLIEiJ_G0015926)	Timeless (MGP_CAROLIEiJ_G0015925)	Mip (MGP_CAROLIEiJ_G0015924)	Spryd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0015923)	Gls2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015922)	Rbms2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015921)	Baz2a (MGP_CAROLIEiJ_G0015920)	Atp5b (MGP_CAROLIEiJ_G0015919)	Naca (MGP_CAROLIEiJ_G0015917)	Prim1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015916)	MGP_CAROLIEiJ_G0015915	Sdr9c7 (MGP_CAROLIEiJ_G0015914)	Rdh7 (MGP_CAROLIEiJ_G0015913) ##22	MGP_CAROLIEiJ_G0015912 ##22	MGP_CAROLIEiJ_G0015911 ##22	Rdh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015909) ##22	Gpr182 (MGP_CAROLIEiJ_G0015908) #21	Zbtb39 (MGP_CAROLIEiJ_G0015907) #20	Tac2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015906) #19	Myo1a (MGP_CAROLIEiJ_G0015905) #18	Nemp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015904) #17	Nab2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015903) #16	Stat6 (MGP_CAROLIEiJ_G0015902) #15	Lrp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015901) #14	Nxph4 (MGP_CAROLIEiJ_G0015900) #13	Shmt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015899) #12	Ndufa4l2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015898) #11	Stac3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015897) #10
Shrew mouse	MODERN SPECIES	22	Il23a (MGP_PahariEiJ_G0031155)	MGP_PahariEiJ_G0031156	MGP_PahariEiJ_G0031157	MGP_PahariEiJ_G0031158	Timeless (MGP_PahariEiJ_G0031159)	Mip (MGP_PahariEiJ_G0031160)	Spryd4 (MGP_PahariEiJ_G0031161)	Gls2 (MGP_PahariEiJ_G0031162)	Rbms2 (MGP_PahariEiJ_G0031163)	Baz2a (MGP_PahariEiJ_G0031164)	Atp5b (MGP_PahariEiJ_G0031165)	Naca (MGP_PahariEiJ_G0031167)	Prim1 (MGP_PahariEiJ_G0031168)	Hsd17b6 (MGP_PahariEiJ_G0031169)	Sdr9c7 (MGP_PahariEiJ_G0031170)	MGP_PahariEiJ_G0031171 ##22	Rdh16f2 (MGP_PahariEiJ_G0031172) #22	MGP_PahariEiJ_G0031173 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031174 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031175 ##22	MGP_PahariEiJ_G0031176 ##22	Gpr182 (MGP_PahariEiJ_G0031177) #21	Zbtb39 (MGP_PahariEiJ_G0031178) #20	Tac2 (MGP_PahariEiJ_G0031179) #19	Myo1a (MGP_PahariEiJ_G0031180) #18	Nemp1 (MGP_PahariEiJ_G0031181) #17	Nab2 (MGP_PahariEiJ_G0031182) #16	Stat6 (MGP_PahariEiJ_G0031183) #15	Lrp1 (MGP_PahariEiJ_G0031184) #14	Nxph4 (MGP_PahariEiJ_G0031185) #13	Shmt2 (MGP_PahariEiJ_G0031186) #12
Rat	MODERN SPECIES	17	Erich5 (ENSRNOG00000005956)	Matn2 (ENSRNOG00000006060)	Laptm4b (ENSRNOG00000006766)	ENSRNOG00000068626	Mtdh (ENSRNOG00000006870)	ENSRNOG00000066306	RGD1562404 (ENSRNOG00000014169)	Tspyl5 (ENSRNOG00000006278)	Cpq (ENSRNOG00000005931)	Sdc2 (ENSRNOG00000004936)	AABR07057438.1 (ENSRNOG00000033952)	Ptdss1 (ENSRNOG00000052289)	Mterf3 (ENSRNOG00000004492)	Uqcrb (ENSRNOG00000024967)	Sdr9c7 (ENSRNOG00000004459)	Rdh7 (ENSRNOG00000004391) ##22	ENSRNOG00000067654	Rdh16 (ENSRNOG00000029651) #22	Gpr182 (ENSRNOG00000004311) #21	Zbtb39 (ENSRNOG00000004306) #20	Tac3 (ENSRNOG00000004229) #19	Myo1a (ENSRNOG00000004177) #18	Nab2 (ENSRNOG00000008415) #16	Nemp1 (ENSRNOG00000046492) #17	Stat6 (ENSRNOG00000025023) #15	Lrp1 (ENSRNOG00000025053) #14	Nxph4 (ENSRNOG00000025059) #13	Shmt2 (ENSRNOG00000008106) #12	Ndufa4l2 (ENSRNOG00000031851) #11	Stac3 (ENSRNOG00000008050) #10	R3hdm2 (ENSRNOG00000007801) #9
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Prairie vole	DUPLICATION
Prairie vole	DUPLICATION
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Northern American deer mouse	DUPLICATION
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Northern American deer mouse	DUPLICATION
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