Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011058.b #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00940000164175.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00940000164221.a.b ENSGT00940000164221.a.a ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.a Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000164175.a.a ENSGT00940000164175.a.b ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000161858 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ENSGT00940000156442 ENSGT01030000234960 ENSGT00940000161593 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00560000078510 ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT01030000234960 ENSGT00940000161593 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 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ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 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ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00900000143836 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 324 ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000011058.b #22 Squirrel MODERN SPECIES 496 ENSSTOG00000004745 #20 OSTN (ENSSTOG00000020025) #21 CCDC50 (ENSSTOG00000000219) #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 1066 CCDC50 (ENSUPAG00010019862) #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 65 SST (ENSMMMG00000009413) RTP2 (ENSMMMG00000009435) BCL6 (ENSMMMG00000009441) ENSMMMG00000009454 LPP (ENSMMMG00000009476) TPRG1 (ENSMMMG00000009493) TP63 (ENSMMMG00000009524) P3H2 (ENSMMMG00000010050) CLDN1 (ENSMMMG00000010077) CLDN16 (ENSMMMG00000010089) TMEM207 (ENSMMMG00000010116) IL1RAP (ENSMMMG00000010137) GMNC (ENSMMMG00000010205) #20 OSTN (ENSMMMG00000010224) #21 UTS2B (ENSMMMG00000010236) CCDC50 (ENSMMMG00000010258) #22 ENSMMMG00000010324 ENSMMMG00000010336 MB21D2 (ENSMMMG00000010348) PLAAT1 (ENSMMMG00000010364) ATP13A5 (ENSMMMG00000010381) ATP13A4 (ENSMMMG00000010493) OPA1 (ENSMMMG00000010558) HES1 (ENSMMMG00000010681) ENSMMMG00000010691 CPN2 (ENSMMMG00000010696) LRRC15 (ENSMMMG00000010700) GP5 (ENSMMMG00000010711) ENSMMMG00000010728 TMEM44 (ENSMMMG00000010743) LSG1 (ENSMMMG00000010772) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 1 ENSSVLG00005008392 ENSSVLG00005008361 LPP (ENSSVLG00005008318) TPRG1 (ENSSVLG00005008266) ENSSVLG00005008233 TP63 (ENSSVLG00005007416) P3H2 (ENSSVLG00005006989) CLDN1 (ENSSVLG00005006941) CLDN16 (ENSSVLG00005006918) TMEM207 (ENSSVLG00005006891) IL1RAP (ENSSVLG00005006739) GMNC (ENSSVLG00005006667) #20 OSTN (ENSSVLG00005006607) #21 UTS2B (ENSSVLG00005006554) ENSSVLG00005006532 CCDC50 (ENSSVLG00005006494) #22 FGF12 (ENSSVLG00005006414) MB21D2 (ENSSVLG00005006368) ENSSVLG00005006347 PLAAT1 (ENSSVLG00005006328) ATP13A5 (ENSSVLG00005006143) ATP13A4 (ENSSVLG00005005773) OPA1 (ENSSVLG00005005536) HES1 (ENSSVLG00005005416) CPN2 (ENSSVLG00005005406) LRRC15 (ENSSVLG00005005394) GP5 (ENSSVLG00005005382) ENSSVLG00005005145 TMEM44 (ENSSVLG00005005023) LSG1 (ENSSVLG00005004993) FAM43A (ENSSVLG00005004980) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00900000143836 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT01100000266402 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 ENSGT00940000156389.a Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT01100000266402 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 ENSGT00940000156389.a ENSGT00390000004757 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 127 RTP1 (ENSCLAG00000013765) MASP1 (ENSCLAG00000012518) SST (ENSCLAG00000015832) RTP2 (ENSCLAG00000014964) ENSCLAG00000017951 BCL6 (ENSCLAG00000012339) LPP (ENSCLAG00000015949) TPRG1 (ENSCLAG00000013300) TP63 (ENSCLAG00000012538) P3H2 (ENSCLAG00000012801) CLDN1 (ENSCLAG00000013178) CLDN16 (ENSCLAG00000012605) IL1RAP (ENSCLAG00000012363) GMNC (ENSCLAG00000011473) #20 OSTN (ENSCLAG00000013977) #21 CCDC50 (ENSCLAG00000014114) #22 FGF12 (ENSCLAG00000011409) MB21D2 (ENSCLAG00000014657) PLAAT1 (ENSCLAG00000012403) ATP13A5 (ENSCLAG00000012908) ATP13A4 (ENSCLAG00000012524) OPA1 (ENSCLAG00000012734) HES1 (ENSCLAG00000015321) CPN2 (ENSCLAG00000018106) LRRC15 (ENSCLAG00000018110) ATP13A3 (ENSCLAG00000012807) ENSCLAG00000013365 FAM43A (ENSCLAG00000011597) XXYLT1 (ENSCLAG00000011348) ACAP2 (ENSCLAG00000013413) ENSCLAG00000012941 Degu MODERN SPECIES 169 ENSODEG00000000479 SST (ENSODEG00000000486) RTP2 (ENSODEG00000000495) BCL6 (ENSODEG00000000516) LPP (ENSODEG00000000601) TPRG1 (ENSODEG00000000645) TP63 (ENSODEG00000000698) P3H2 (ENSODEG00000000751) CLDN1 (ENSODEG00000000775) CLDN16 (ENSODEG00000000787) TMEM207 (ENSODEG00000000814) IL1RAP (ENSODEG00000000880) ENSODEG00000000947 GMNC (ENSODEG00000000968) #20 OSTN (ENSODEG00000000984) #21 CCDC50 (ENSODEG00000001028) #22 ENSODEG00000018632 FGF12 (ENSODEG00000000898) ENSODEG00000000915 PLAAT1 (ENSODEG00000000928) ATP13A5 (ENSODEG00000000942) Guinea pig MODERN SPECIES 7 RTP1 (ENSCPOG00000001203) MASP1 (ENSCPOG00000015723) SST (ENSCPOG00000009662) RTP2 (ENSCPOG00000009665) BCL6 (ENSCPOG00000004090) ENSCPOG00000033304 LPP (ENSCPOG00000015584) TPRG1 (ENSCPOG00000007437) TP63 (ENSCPOG00000014770) P3H2 (ENSCPOG00000004329) CLDN1 (ENSCPOG00000037018) CLDN16 (ENSCPOG00000008643) IL1RAP (ENSCPOG00000008554) GMNC (ENSCPOG00000019517) #20 OSTN (ENSCPOG00000024963) #21 CCDC50 (ENSCPOG00000013365) #22 FGF12 (ENSCPOG00000038518) MB21D2 (ENSCPOG00000011028) PLAAT1 (ENSCPOG00000008871) ATP13A5 (ENSCPOG00000008873) ATP13A4 (ENSCPOG00000008886) OPA1 (ENSCPOG00000005925) HES1 (ENSCPOG00000036195) CPN2 (ENSCPOG00000037149) LRRC15 (ENSCPOG00000005131) ATP13A3 (ENSCPOG00000005136) TMEM44 (ENSCPOG00000021309) ENSCPOG00000002586 FAM43A (ENSCPOG00000021729) XXYLT1 (ENSCPOG00000009208) ACAP2 (ENSCPOG00000009213) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 27 TP63 (ENSHGLG00000016277) P3H2 (ENSHGLG00000019175) CLDN1 (ENSHGLG00000038289) CLDN16 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ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 Steppe mouse MODERN SPECIES 75 Tprg (ENSMSIG00000008932) Trp63 (ENSMSIG00000007986) P3h2 (ENSMSIG00000007958) Cldn1 (ENSMSIG00000007944) Cldn16 (ENSMSIG00000007933) Tmem207 (ENSMSIG00000007915) Il1rap (ENSMSIG00000007880) Gmnc (ENSMSIG00000007759) #20 Ostn (ENSMSIG00000007748) #21 Uts2b (ENSMSIG00000007715) Ccdc50 (ENSMSIG00000007628) #22 ENSMSIG00000007596 Fgf12 (ENSMSIG00000007454) Mb21d2 (ENSMSIG00000007424) Plaat1 (ENSMSIG00000007402) Atp13a5 (ENSMSIG00000007166) Atp13a4 (ENSMSIG00000006926) Opa1 (ENSMSIG00000006813) Hes1 (ENSMSIG00000006747) Cpn2 (ENSMSIG00000006697) Lrrc15 (ENSMSIG00000006684) Gp5 (ENSMSIG00000006670) Atp13a3 (ENSMSIG00000006391) ENSMSIG00000006328 Lsg1 (ENSMSIG00000006264) Fam43a (ENSMSIG00000006252) spretus MODERN SPECIES 7 Rtp4 (MGP_SPRETEiJ_G0021515) Sst 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Tmem207 (ENSDORG00000024124) Il1rap (ENSDORG00000014736) Gmnc (ENSDORG00000002326) #20 Ostn (ENSDORG00000008337) #21 ENSDORG00000006097 ENSDORG00000029288 #22 Fgf12 (ENSDORG00000004553) Mb21d2 (ENSDORG00000029028) Plaat1 (ENSDORG00000009577) Atp13a5 (ENSDORG00000009578) Atp13a4 (ENSDORG00000005640) Opa1 (ENSDORG00000014872) Hes1 (ENSDORG00000029830) Lrrc15 (ENSDORG00000015805) Atp13a3 (ENSDORG00000015806) ENSDORG00000027375 ENSDORG00000002947 Lsg1 (ENSDORG00000012354) Fam43a (ENSDORG00000002402) Xxylt1 (ENSDORG00000023273) Acap2 (ENSDORG00000016623) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 Rabbit MODERN SPECIES 5 ENSOCUG00000030680 LPP (ENSOCUG00000011764) TPRG1 (ENSOCUG00000015959) ENSOCUG00000038822 TP63 (ENSOCUG00000016465) P3H2 (ENSOCUG00000011014) CLDN1 (ENSOCUG00000011464) CLDN16 (ENSOCUG00000011471) TMEM207 (ENSOCUG00000029314) IL1RAP (ENSOCUG00000004870) GMNC (ENSOCUG00000009539) #20 OSTN (ENSOCUG00000007035) #21 UTS2B (ENSOCUG00000007038) ENSOCUG00000013247 ENSOCUG00000035755 CCDC50 (ENSOCUG00000012695) #22 ENSOCUG00000026253 FGF12 (ENSOCUG00000007581) MB21D2 (ENSOCUG00000015208) ENSOCUG00000039155 ENSOCUG00000011454 ENSOCUG00000011456 ENSOCUG00000029859 ENSOCUG00000032891 ENSOCUG00000015801 OPA1 (ENSOCUG00000015832) HES1 (ENSOCUG00000009363) CPN2 (ENSOCUG00000029332) LRRC15 (ENSOCUG00000008086) GP5 (ENSOCUG00000016530) ATP13A3 (ENSOCUG00000016532) Pika MODERN SPECIES 4247 CCDC50 (ENSOPRG00000017200) #22 Tree shrew MODERN SPECIES 2580 CCDC50 (ENSTBEG00000011962) #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00550000076399 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000161714.a ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00390000004871.b.n ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00970000194716 ENSGT00550000076399 ENSGT00940000156022.b ENSGT00440000039914.u.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00950000182991.B.yb.b ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000161714.a ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000155932.d ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00390000004871.b.n ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00970000194716 ENSGT00550000076399 ENSGT00940000156022.b ENSGT00440000039914.u.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00950000182991.B.yb.b ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a 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16 ENSGGOG00000041374 LPP (ENSGGOG00000016679) ENSGGOG00000040908 TPRG1 (ENSGGOG00000044070) TP63 (ENSGGOG00000005113) P3H2 (ENSGGOG00000009749) ENSGGOG00000039775 ENSGGOG00000037128 CLDN1 (ENSGGOG00000013999) ENSGGOG00000025366 TMEM207 (ENSGGOG00000015572) ENSGGOG00000012048 GMNC (ENSGGOG00000038407) #20 OSTN (ENSGGOG00000039295) #21 UTS2B (ENSGGOG00000034872) CCDC50 (ENSGGOG00000011521) #22 PYDC2 (ENSGGOG00000043904) ENSGGOG00000036293 MB21D2 (ENSGGOG00000038723) ENSGGOG00000025693 PLAAT1 (ENSGGOG00000016505) ATP13A5 (ENSGGOG00000007037) ATP13A4 (ENSGGOG00000007060) OPA1 (ENSGGOG00000006549) ENSGGOG00000042716 HES1 (ENSGGOG00000008521) CPN2 (ENSGGOG00000014916) LRRC15 (ENSGGOG00000007329) ATP13A3 (ENSGGOG00000011475) TMEM44 (ENSGGOG00000002921) LSG1 (ENSGGOG00000000520) Orangutan MODERN SPECIES 16 SST (ENSPPYG00000014393) RTP2 (ENSPPYG00000014394) BCL6 (ENSPPYG00000014395) LPP (ENSPPYG00000014398) TPRG1 (ENSPPYG00000014400) TP63 (ENSPPYG00000014401) P3H2 (ENSPPYG00000040690) CLDN1 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(ENSNLEG00000006769) #22 ENSNLEG00000006781 MB21D2 (ENSNLEG00000032215) ENSNLEG00000032196 ENSNLEG00000006785 ATP13A5 (ENSNLEG00000006787) ATP13A4 (ENSNLEG00000006795) OPA1 (ENSNLEG00000006807) ENSNLEG00000030587 LRRC15 (ENSNLEG00000008226) ATP13A3 (ENSNLEG00000008235) TMEM44 (ENSNLEG00000008286) LSG1 (ENSNLEG00000008293) FAM43A (ENSNLEG00000018711) XXYLT1 (ENSNLEG00000034040) ACAP2 (ENSNLEG00000008339) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00550000076399 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00950000183179.b.a.e ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000161714.a ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00390000004871.b.n ENSGT00940000159619.a 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Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 RTP2 (ENSMFAG00000043246) BCL6 (ENSMFAG00000001360) LPP (ENSMFAG00000041519) TPRG1 (ENSMFAG00000056922) TP63 (ENSMFAG00000035702) P3H2 (ENSMFAG00000036104) ENSMFAG00000060414 CLDN1 (ENSMFAG00000062691) CLDN16 (ENSMFAG00000043262) TMEM207 (ENSMFAG00000001349) IL1RAP (ENSMFAG00000039646) GMNC (ENSMFAG00000031832) #20 OSTN (ENSMFAG00000054957) #21 ENSMFAG00000048722 UTS2B (ENSMFAG00000037124) CCDC50 (ENSMFAG00000034097) #22 FGF12 (ENSMFAG00000036517) MB21D2 (ENSMFAG00000032253) PLAAT1 (ENSMFAG00000039474) ENSMFAG00000055991 ATP13A5 (ENSMFAG00000040211) ATP13A4 (ENSMFAG00000033333) OPA1 (ENSMFAG00000038307) HES1 (ENSMFAG00000050733) ENSMFAG00000065207 CPN2 (ENSMFAG00000065852) LRRC15 (ENSMFAG00000026569) ATP13A3 (ENSMFAG00000039232) TMEM44 (ENSMFAG00000029965) LSG1 (ENSMFAG00000039903) ENSMFAG00000045710 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 467 RTP2 (ENSMNEG00000035103) BCL6 (ENSMNEG00000034068) ENSMNEG00000026531 LPP (ENSMNEG00000044410) TPRG1 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ELOVL2 (ENSCCAG00000020667) SYCP2L (ENSCCAG00000027217) Marmoset MODERN SPECIES 6 BCL6 (ENSCJAG00000014375) ENSCJAG00000041964 ENSCJAG00000077902 ENSCJAG00000071140 LPP (ENSCJAG00000014354) TPRG1 (ENSCJAG00000014348) TP63 (ENSCJAG00000014256) P3H2 (ENSCJAG00000014239) ENSCJAG00000059304 CLDN1 (ENSCJAG00000046185) CLDN16 (ENSCJAG00000014218) TMEM207 (ENSCJAG00000046748) IL1RAP (ENSCJAG00000014191) GMNC (ENSCJAG00000074485) #20 OSTN (ENSCJAG00000064215) #21 CCDC50 (ENSCJAG00000014177) #22 ENSCJAG00000072839 FGF12 (ENSCJAG00000040892) MB21D2 (ENSCJAG00000057912) PLAAT1 (ENSCJAG00000014159) ATP13A5 (ENSCJAG00000014131) ATP13A4 (ENSCJAG00000014072) OPA1 (ENSCJAG00000014052) ENSCJAG00000072763 HES1 (ENSCJAG00000069910) CPN2 (ENSCJAG00000022226) LRRC15 (ENSCJAG00000014042) GP5 (ENSCJAG00000085892) ATP13A3 (ENSCJAG00000013996) TMEM44 (ENSCJAG00000013987) LSG1 (ENSCJAG00000013962) Mas night monkey MODERN SPECIES 536 TPRG1 (ENSANAG00000035411) TP63 (ENSANAG00000035266) P3H2 (ENSANAG00000021430) 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ENSGT00650000094113 ENSGT00720000110080 ENSGT00390000005823 ENSGT00440000033499 ENSGT00900000141094 ENSGT00940000160146.C Dingo MODERN SPECIES 317 SST (ENSCAFG00020019995) RTP2 (ENSCAFG00020019997) BCL6 (ENSCAFG00020020000) LPP (ENSCAFG00020020014) TPRG1 (ENSCAFG00020020027) TP63 (ENSCAFG00020020037) P3H2 (ENSCAFG00020020127) CLDN1 (ENSCAFG00020020148) CLDN16 (ENSCAFG00020020151) TMEM207 (ENSCAFG00020020153) ENSCAFG00020020157 GMNC (ENSCAFG00020020161) #20 OSTN (ENSCAFG00020020164) #21 UTS2B (ENSCAFG00020020166) CCDC50 (ENSCAFG00020020170) #22 FGF12 (ENSCAFG00020020175) MB21D2 (ENSCAFG00020020181) PLAAT1 (ENSCAFG00020020183) ATP13A5 (ENSCAFG00020020185) ENSCAFG00020020188 ATP13A4 (ENSCAFG00020020190) MFSD1 (ENSCAFG00020020193) ENSCAFG00020020195 SCHIP1 (ENSCAFG00020020205) ENSCAFG00020020210 IL12A (ENSCAFG00020020211) ENSCAFG00020020215 C3orf80 (ENSCAFG00020020219) IFT80 (ENSCAFG00020020227) ENSCAFG00020020486 Dog MODERN SPECIES 27 ENSCAFG00845022631 SST (ENSCAFG00845022661) BCL6 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ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000158744.n ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000158744.n ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000153112.E.f.a.a ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a leopard MODERN SPECIES 41 RTP2 (ENSPPRG00000000964) BCL6 (ENSPPRG00000000750) ENSPPRG00000017635 LPP (ENSPPRG00000000181) TPRG1 (ENSPPRG00000023849) TP63 (ENSPPRG00000024443) P3H2 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ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Equus ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162610 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 Horse MODERN SPECIES 10 SST (ENSECAG00000023368) RTP2 (ENSECAG00000000272) BCL6 (ENSECAG00000004556) LPP (ENSECAG00000014723) TPRG1 (ENSECAG00000016072) TP63 (ENSECAG00000018546) ENSECAG00000044253 P3H2 (ENSECAG00000008971) CLDN1 (ENSECAG00000021074) CLDN16 (ENSECAG00000021850) TMEM207 (ENSECAG00000033613) IL1RAP (ENSECAG00000005083) GMNC (ENSECAG00000027817) #20 OSTN (ENSECAG00000011502) #21 UTS2B (ENSECAG00000014512) CCDC50 (ENSECAG00000014753) #22 FGF12 (ENSECAG00000024399) MB21D2 (ENSECAG00000004811) PLAAT1 (ENSECAG00000024565) ATP13A5 (ENSECAG00000024692) ATP13A4 (ENSECAG00000013520) OPA1 (ENSECAG00000024248) HES1 (ENSECAG00000026945) CPN2 (ENSECAG00000004837) LRRC15 (ENSECAG00000004894) ENSECAG00000045784 GP5 (ENSECAG00000003252) ATP13A3 (ENSECAG00000006749) TMEM44 (ENSECAG00000014573) LSG1 (ENSECAG00000017659) FAM43A (ENSECAG00000014783) Donkey MODERN SPECIES 25 RTP2 (ENSEASG00005014113) BCL6 (ENSEASG00005014114) LPP (ENSEASG00005014117) TPRG1 (ENSEASG00005000079) TP63 (ENSEASG00005000161) P3H2 (ENSEASG00005000187) ENSEASG00005037818 CLDN1 (ENSEASG00005025461) CLDN16 (ENSEASG00005038191) TMEM207 (ENSEASG00005025466) ENSEASG00005000289 ENSEASG00005029545 GMNC (ENSEASG00005038756) #20 OSTN (ENSEASG00005000308) #21 UTS2B (ENSEASG00005027479) CCDC50 (ENSEASG00005000324) #22 FGF12 (ENSEASG00005025383) MB21D2 (ENSEASG00005000343) PLAAT1 (ENSEASG00005000347) ATP13A5 (ENSEASG00005000377) ATP13A4 (ENSEASG00005000615) ENSEASG00005003536 OPA1 (ENSEASG00005000628) HES1 (ENSEASG00005000638) CPN2 (ENSEASG00005000640) LRRC15 (ENSEASG00005038038) GP5 (ENSEASG00005000647) ATP13A3 (ENSEASG00005000655) TMEM44 (ENSEASG00005000666) LSG1 (ENSEASG00005000678) FAM43A (ENSEASG00005037609) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Megabat MODERN SPECIES 2966 OSTN (ENSPVAG00000006120) #21 UTS2B (ENSPVAG00000006126) CCDC50 (ENSPVAG00000006129) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 11 SST (ENSRFEG00010020558) RTP2 (ENSRFEG00010020536) ENSRFEG00010020523 BCL6 (ENSRFEG00010020473) LPP (ENSRFEG00010020443) TPRG1 (ENSRFEG00010020397) TP63 (ENSRFEG00010019772) P3H2 (ENSRFEG00010019654) CLDN1 (ENSRFEG00010019632) CLDN16 (ENSRFEG00010019557) TMEM207 (ENSRFEG00010019513) IL1RAP (ENSRFEG00010019458) GMNC (ENSRFEG00010019408) #20 OSTN (ENSRFEG00010019354) #21 UTS2B (ENSRFEG00010019299) CCDC50 (ENSRFEG00010019227) #22 FGF12 (ENSRFEG00010019116) MB21D2 (ENSRFEG00010019087) PLAAT1 (ENSRFEG00010019048) ATP13A5 (ENSRFEG00010018763) ATP13A4 (ENSRFEG00010018636) OPA1 (ENSRFEG00010018391) HES1 (ENSRFEG00010018315) ENSRFEG00010018282 CPN2 (ENSRFEG00010018270) LRRC15 (ENSRFEG00010018256) GP5 (ENSRFEG00010018243) ATP13A3 (ENSRFEG00010018125) TMEM44 (ENSRFEG00010017809) LSG1 (ENSRFEG00010017730) FAM43A (ENSRFEG00010017704) Microbat MODERN SPECIES 951 MASP1 (ENSMLUG00000006168) ENSMLUG00000006180 SST (ENSMLUG00000012903) RTP2 (ENSMLUG00000015480) BCL6 (ENSMLUG00000012905) LPP (ENSMLUG00000009198) TPRG1 (ENSMLUG00000009219) TP63 (ENSMLUG00000015597) P3H2 (ENSMLUG00000015613) CLDN1 (ENSMLUG00000015642) CLDN16 (ENSMLUG00000001753) IL1RAP (ENSMLUG00000005737) GMNC (ENSMLUG00000012539) #20 OSTN (ENSMLUG00000017299) #21 ENSMLUG00000024518 CCDC50 (ENSMLUG00000012788) #22 FGF12 (ENSMLUG00000010464) PLAAT1 (ENSMLUG00000008414) ATP13A5 (ENSMLUG00000010577) ATP13A4 (ENSMLUG00000008427) OPA1 (ENSMLUG00000008480) ENSMLUG00000008079 HES1 (ENSMLUG00000008549) CPN2 (ENSMLUG00000015542) LRRC15 (ENSMLUG00000028059) GP5 (ENSMLUG00000024852) ATP13A3 (ENSMLUG00000014164) ENSMLUG00000030450 LSG1 (ENSMLUG00000012548) FAM43A (ENSMLUG00000001955) ENSMLUG00000026353 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Suina ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 Chacoan peccary MODERN SPECIES 944 SST (ENSCWAG00000019978) RTP2 (ENSCWAG00000019985) BCL6 (ENSCWAG00000019996) ENSCWAG00000020023 LPP (ENSCWAG00000020035) TPRG1 (ENSCWAG00000020051) TP63 (ENSCWAG00000020115) P3H2 (ENSCWAG00000021197) CLDN1 (ENSCWAG00000021217) CLDN16 (ENSCWAG00000021225) TMEM207 (ENSCWAG00000021235) IL1RAP (ENSCWAG00000021249) GMNC (ENSCWAG00000021265) #20 OSTN (ENSCWAG00000021276) #21 UTS2B (ENSCWAG00000021288) CCDC50 (ENSCWAG00000021300) #22 FGF12 (ENSCWAG00000021322) MB21D2 (ENSCWAG00000011739) PLAAT1 (ENSCWAG00000011773) ATP13A5 (ENSCWAG00000011818) ATP13A4 (ENSCWAG00000012173) OPA1 (ENSCWAG00000012866) HES1 (ENSCWAG00000013483) CPN2 (ENSCWAG00000013513) LRRC15 (ENSCWAG00000013529) GP5 (ENSCWAG00000013542) ATP13A3 (ENSCWAG00000013581) TMEM44 (ENSCWAG00000013875) LSG1 (ENSCWAG00000014095) FAM43A (ENSCWAG00000014119) XXYLT1 (ENSCWAG00000014129) Pig MODERN SPECIES 4 RTP2 (ENSSSCG00000011809) BCL6 (ENSSSCG00000011810) ENSSSCG00000057877 LPP (ENSSSCG00000011811) ENSSSCG00000043849 TPRG1 (ENSSSCG00000011812) TP63 (ENSSSCG00000025592) P3H2 (ENSSSCG00000011813) CLDN1 (ENSSSCG00000040904) CLDN16 (ENSSSCG00000024788) TMEM207 (ENSSSCG00000022341) ENSSSCG00000021206 GMNC (ENSSSCG00000024420) #20 OSTN (ENSSSCG00000031478) #21 UTS2B (ENSSSCG00000053547) CCDC50 (ENSSSCG00000036423) #22 FGF12 (ENSSSCG00000038584) ENSSSCG00000044432 MB21D2 (ENSSSCG00000011819) ENSSSCG00000048327 PLAAT1 (ENSSSCG00000036094) ATP13A5 (ENSSSCG00000026260) ATP13A4 (ENSSSCG00000011821) OPA1 (ENSSSCG00000011822) HES1 (ENSSSCG00000031356) CPN2 (ENSSSCG00000025128) LRRC15 (ENSSSCG00000026868) GP5 (ENSSSCG00000031035) ATP13A3 (ENSSSCG00000011825) TMEM44 (ENSSSCG00000011826) LSG1 (ENSSSCG00000011827) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 Alpaca MODERN SPECIES 2852 LPP (ENSVPAG00000012347) TPRG1 (ENSVPAG00000012349) TP63 (ENSVPAG00000012350) P3H2 (ENSVPAG00000012351) CLDN1 (ENSVPAG00000012354) CLDN16 (ENSVPAG00000012355) TMEM207 (ENSVPAG00000012357) IL1RAP (ENSVPAG00000012359) ENSVPAG00000012360 GMNC (ENSVPAG00000012361) #20 OSTN (ENSVPAG00000012362) #21 UTS2B (ENSVPAG00000012364) CCDC50 (ENSVPAG00000012365) #22 Arabian camel MODERN SPECIES RTP2 (ENSCDRG00005007401) BCL6 (ENSCDRG00005007418) 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ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Pecora ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Yarkand deer MODERN SPECIES 10 SST (ENSCHYG00000017690) RTP2 (ENSCHYG00000017671) BCL6 (ENSCHYG00000017496) LPP (ENSCHYG00000017341) ENSCHYG00000017326 TPRG1 (ENSCHYG00000017253) TP63 (ENSCHYG00000016948) P3H2 (ENSCHYG00000016707) CLDN1 (ENSCHYG00000016635) CLDN16 (ENSCHYG00000016587) TMEM207 (ENSCHYG00000016540) IL1RAP (ENSCHYG00000016282) GMNC (ENSCHYG00000016158) #20 OSTN (ENSCHYG00000015998) #21 UTS2B (ENSCHYG00000015889) CCDC50 (ENSCHYG00000015774) #22 ENSCHYG00000015730 FGF12 (ENSCHYG00000015431) ENSCHYG00000015377 MB21D2 (ENSCHYG00000015341) PLAAT1 (ENSCHYG00000015170) ATP13A5 (ENSCHYG00000014857) ATP13A4 (ENSCHYG00000014600) ENSCHYG00000014541 OPA1 (ENSCHYG00000013079) ENSCHYG00000012812 CPN2 (ENSCHYG00000012772) LRRC15 (ENSCHYG00000012762) ENSCHYG00000012738 GP5 (ENSCHYG00000012706) ATP13A3 (ENSCHYG00000012061) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00860000135828 ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00940000156311 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a 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ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 Bos ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00970000194716 ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00950000182901.a.a.b.b.a.a.d ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT01100000263474.a.b.b.f.g.a.a.b ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851.n ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00960000190428 ENSGT00950000183153.c.b.a.a 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(ENSBMSG00010000324) HES1 (ENSBMSG00010000386) ENSBMSG00010000403 CPN2 (ENSBMSG00010000416) LRRC15 (ENSBMSG00010000438) GP5 (ENSBMSG00010000449) ATP13A3 (ENSBMSG00010000498) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000162172 ENSGT00560000078510 ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000161858 ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00940000162610 ENSGT00510000047914.b 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Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000161309 ENSGT00940000161858 ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718.c ENSGT00390000018718.d ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 koala MODERN SPECIES 154 P3H2 (ENSPCIG00000025321) CLDN1 (ENSPCIG00000025317) CLDN16 (ENSPCIG00000025316) ENSPCIG00000025315 IL1RAP (ENSPCIG00000025314) GMNC (ENSPCIG00000025312) #20 ENSPCIG00000037013 #21 CCDC50 (ENSPCIG00000002113) #22 FGF12 (ENSPCIG00000011186) MB21D2 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SPECIES 6 ENSMODG00000016620 MFSD1 (ENSMODG00000011438) ENSMODG00000011388 IQCJ (ENSMODG00000042671) SCHIP1 (ENSMODG00000011375) IL12A (ENSMODG00000011361) LPP (ENSMODG00000015050) TPRG1 (ENSMODG00000015053) TP63 (ENSMODG00000015060) P3H2 (ENSMODG00000015073) CLDN1 (ENSMODG00000047456) CLDN16 (ENSMODG00000015088) IL1RAP (ENSMODG00000015095) ENSMODG00000050076 #20 OSTN (ENSMODG00000015103) #21 CCDC50 (ENSMODG00000015112) #22 FGF12 (ENSMODG00000015116) ENSMODG00000015119 PLAAT1 (ENSMODG00000015123) ATP13A4 (ENSMODG00000015137) OPA1 (ENSMODG00000015156) ATG4B (ENSMODG00000008658) ENSMODG00000039725 ENSMODG00000008649 ING5 (ENSMODG00000008639) D2HGDH (ENSMODG00000008616) GAL3ST2 (ENSMODG00000008603) NEU4 (ENSMODG00000037347) ENSMODG00000029268 ENSMODG00000008563 RTP1 (ENSMODG00000008542) Platypus MODERN SPECIES 18 MROH2A (ENSOANG00000000863) RTP1 (ENSOANG00000000868) MASP1 (ENSOANG00000000869) SST (ENSOANG00000000871) BCL6 (ENSOANG00000000872) LPP (ENSOANG00000013793) TPRG1 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ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A Archosauria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00390000014757.h ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT00390000006126 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156850.a.b ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000161826.A ENSGT00940000163072 ENSGT00940000164427.a.b ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 Aves ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000164175.a.a ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00390000014757.h ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 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ENSGT00940000156850.a.b.b ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000164427.a.b.f ENSGT00940000161771 ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000156442 Chicken MODERN SPECIES 38 PDCD1 (ENSGALG00010014912) ENSGALG00010017527 MASP1 (ENSGALG00010013820) SST1 (ENSGALG00010013624) BCL6 (ENSGALG00010013635) LPP (ENSGALG00010014984) TP63 (ENSGALG00010014867) P3H2 (ENSGALG00010017579) CLDN1 (ENSGALG00010013646) CLDN16 (ENSGALG00010014643) TMEM207 (ENSGALG00010014596) IL1RAP (ENSGALG00010014572) GMNC (ENSGALG00010014326) #20 OSTN (ENSGALG00010014291) #21 UTS2B (ENSGALG00010014320) CCDC50 (ENSGALG00010014209) #22 FGF12 (ENSGALG00010014166) MB21D2 (ENSGALG00010017587) ENSGALG00010017736 ENSGALG00010017731 ENSGALG00010017719 ENSGALG00010017812 HRASLS (ENSGALG00010013808) ATP13A5 (ENSGALG00010013786) ATP13A4 (ENSGALG00010013759) OPA1 (ENSGALG00010013663) HES1 (ENSGALG00010014807) 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SPECIES 1 ENSACCG00020004564 MASP1 (ENSACCG00020004571) ENSACCG00020000387 SST (ENSACCG00020000401) BCL6 (ENSACCG00020000423) LPP (ENSACCG00020000459) TP63 (ENSACCG00020000594) P3H2 (ENSACCG00020000774) ENSACCG00020000829 CLDN1 (ENSACCG00020000847) CLDN16 (ENSACCG00020000869) IL1RAP (ENSACCG00020000934) GMNC (ENSACCG00020000980) #20 OSTN (ENSACCG00020000996) #21 UTS2B (ENSACCG00020001004) CCDC50 (ENSACCG00020001058) #22 FGF12 (ENSACCG00020001117) MB21D2 (ENSACCG00020001139) ENSACCG00020001220 PLAAT1 (ENSACCG00020001351) ATP13A5 (ENSACCG00020001406) ATP13A4 (ENSACCG00020001662) OPA1 (ENSACCG00020001985) HES1 (ENSACCG00020002107) ENSACCG00020002126 CPN2 (ENSACCG00020002137) LRRC15 (ENSACCG00020002150) GP5 (ENSACCG00020002168) ATP13A3 (ENSACCG00020002806) TMEM44 (ENSACCG00020003263) LSG1 (ENSACCG00020003307) African ostrich MODERN SPECIES 861 ENSSCUG00000013779 ENSSCUG00000013776 MASP1 (ENSSCUG00000013773) ENSSCUG00000013771 SST (ENSSCUG00000013770) BCL6 (ENSSCUG00000013769) LPP 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Chinese turtle MODERN SPECIES 2174 CLDN1 (ENSPSIG00000006441) CLDN16 (ENSPSIG00000006084) ENSPSIG00000000287 TMEM207 (ENSPSIG00000005915) IL1RAP (ENSPSIG00000005325) GMNC (ENSPSIG00000005264) #20 OSTN (ENSPSIG00000005213) #21 CCDC50 (ENSPSIG00000004923) #22 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162454 ENSGT00940000164175.a.b ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00510000047914.b ENSGT00390000014757.h ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.b.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000160327 ENSGT00940000159448 ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161771 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000156442 ENSGT01030000234960.a ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 ENSGT00940000156389.a Episquamata ANCESTRAL SPECIES 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SPECIES 8933 ENSLLTG00000008197 #22 Lizard MODERN SPECIES 999 ENSACAG00000043083 P3H2 (ENSACAG00000000462) CLDN1 (ENSACAG00000037457) ENSACAG00000044822 CLDN16 (ENSACAG00000000733) IL1RAP (ENSACAG00000000773) GMNC (ENSACAG00000038171) #20 CCDC50 (ENSACAG00000015518) #22 tuatara MODERN SPECIES 1248 ENSSPUG00000011245 SLC51A (ENSSPUG00000011183) PCYT1A (ENSSPUG00000011155) DYNLT2B (ENSSPUG00000011138) MASP1 (ENSSPUG00000011118) SST (ENSSPUG00000011104) BCL6 (ENSSPUG00000011070) LPP (ENSSPUG00000011048) TPRG1 (ENSSPUG00000011036) TP63 (ENSSPUG00000010988) P3H2 (ENSSPUG00000010809) CLDN1 (ENSSPUG00000010759) CLDN16 (ENSSPUG00000010738) IL1RAP (ENSSPUG00000010720) OSTN (ENSSPUG00000010683) #21 CCDC50 (ENSSPUG00000010663) #22 FGF12 (ENSSPUG00000010637) MB21D2 (ENSSPUG00000010624) Anura ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000164175.a.b ENSGT00940000164175.b ENSGT00950000183084.b.b ENSGT00510000047914.b ENSGT00940000156311 ENSGT00940000156022.b ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00940000159593 ENSGT00940000155387 ENSGT00730000111162 ENSGT01090000260076.a ENSGT00940000153270.b.b #20 ENSGT00390000001750 #21 ENSGT00390000003511 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155929 ENSGT01050000244976.a ENSGT00940000159448.c.b.a.a.a ENSGT00940000156634 ENSGT00940000159448.d ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000162953 ENSGT00940000155941.A ENSGT00390000018718 ENSGT00940000156442 ENSGT00940000161593 ENSGT00940000158154 ENSGT00940000156389.a ENSGT00390000004757 Frog MODERN SPECIES 5 lpp (ENSXETG00000012850) tprg1 (ENSXETG00000012849) ENSXETG00000042827 tp63 (ENSXETG00000026303) ENSXETG00000049458 p3h2 (ENSXETG00000012845) ENSXETG00000045057 cldn1 (ENSXETG00000015050) cldn16 (ENSXETG00000015045) ENSXETG00000048173 ENSXETG00000044157 il1rap (ENSXETG00000015044) gmnc (ENSXETG00000036029) #20 ostn (ENSXETG00000015042) #21 uts2b (ENSXETG00000034240) ccdc50 (ENSXETG00000002145) #22 ENSXETG00000046430 fgf12 (ENSXETG00000002144) mb21d2 (ENSXETG00000036961) 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ENSLLEG00000022304 Coelacanth MODERN SPECIES 348 ENSLACG00000007327 LPP (ENSLACG00000010877) TPRG1 (ENSLACG00000012858) TP63 (ENSLACG00000014214) P3H2 (ENSLACG00000014642) CLDN1 (ENSLACG00000015476) ENSLACG00000015580 ENSLACG00000015840 ENSLACG00000016008 CLDN16 (ENSLACG00000016096) IL1RAP (ENSLACG00000016241) GMNC (ENSLACG00000016600) #20 ENSLACG00000016731 ENSLACG00000016772 OSTN (ENSLACG00000016886) #21 CCDC50 (ENSLACG00000016970) #22 FGF12 (ENSLACG00000017275) ENSLACG00000017691 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000011058.b #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00940000157606 ENSGT00390000018026 ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960 ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000162953 ENSGT00940000164427.a.b ENSGT00940000163072 ENSGT00940000161826.A ENSGT00940000159619.a ENSGT00550000074851 ENSGT00990000204968 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00730000111162 ENSGT00940000155387 ENSGT00940000159593 ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311 ENSGT00390000016597 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000157606 ENSGT00390000018026 ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960 ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000161826.A ENSGT00940000162953 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000164427.a.b ENSGT00940000166731 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155387.c ENSGT00940000155387.d ENSGT00940000159593 ENSGT00950000183153.c.b.a.a ENSGT00390000001652.f.b ENSGT00940000156022.b ENSGT00940000156311.b.a ENSGT00390000016597 ENSGT00940000156202.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a ENSGT00940000157247.b ENSGT00940000166878 ENSGT00940000157247.a.a ENSGT00440000037733.f ENSGT00940000156577.a Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 330 ENSGT00940000158154 ENSGT00940000161593 ENSGT01030000234960 ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00550000074851 ENSGT00940000159619.a ENSGT00940000162953 ENSGT00940000161826.A ENSGT00940000164427.a.b ENSGT00940000166731.a ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155387.d ENSGT00940000159593 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000158821 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000155446 ENSGT00940000155152.f.b ENSGT00560000077332 ENSGT00940000154967.b.b.b ENSGT00940000154967.b.b.a ENSGT00940000155117.f.a ENSGT00940000164211 ENSGT00940000155195 ENSGT00940000157937.b ENSGT00940000158520.e.b ENSGT00940000158520.f ENSGT00940000166731.a ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155387.d ENSGT00940000159593 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000158821 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000155446 ENSGT00940000155152.f.b ENSGT00560000077332 ENSGT00940000154967.b.b.b ENSGT00940000155117.f.a ENSGT00940000164211 ENSGT00940000155195 ENSGT00940000157937.a ENSGT00940000157937.b ENSGT00940000158520.e.b ENSGT00940000158520.f ENSGT00940000166731.a ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155387.d ENSGT00940000159593 ENSGT00940000165728.h ENSGT00940000166572 ENSGT00940000153846.a.a.d ENSGT00940000156166.a.i.b ENSGT00390000018446.a ENSGT00390000008285 ENSGT00940000154382.a.a.k.a ENSGT00940000164497 ENSGT00940000156233 ENSGT00940000166414 ENSGT00530000063861.b.b ENSGT00940000158258.e ENSGT00940000158611 Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 10 ptgs2b (ENSDCDG00000029712) pdcb (ENSDCDG00000029696) ENSDCDG00000029672 scyl3 (ENSDCDG00000029670) crb1 (ENSDCDG00000029669) ENSDCDG00000029664 ENSDCDG00000029660 ENSDCDG00000029657 b3galt2 (ENSDCDG00000029655) glrx2 (ENSDCDG00000029653) uchl5 (ENSDCDG00000029647) ENSDCDG00000029646 RGS13 (ENSDCDG00000029645) ENSDCDG00000029636 ENSDCDG00000029622 ENSDCDG00000029611 #22 ENSDCDG00000029605 P3H2 (ENSDCDG00000029601) si:ch211-129c21.1 (ENSDCDG00000029588) scamp4 (ENSDCDG00000029579) EVI5 (ENSDCDG00000028906) gfi1ab (ENSDCDG00000028885) glmnb (ENSDCDG00000028881) C1orf146 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herring MODERN SPECIES 1 DENND1B (ENSCHAG00000016855) crb1 (ENSCHAG00000016749) aspm (ENSCHAG00000016578) cfhl4 (ENSCHAG00000016558) ENSCHAG00000016527 ENSCHAG00000016501 ENSCHAG00000016492 b3galt2 (ENSCHAG00000016481) glrx2 (ENSCHAG00000016407) uchl5 (ENSCHAG00000016316) rgs2 (ENSCHAG00000016310) RGS13 (ENSCHAG00000016294) ENSCHAG00000016276 ENSCHAG00000016170 ENSCHAG00000016150 ENSCHAG00000016131 #22 ENSCHAG00000016121 P3H2 (ENSCHAG00000016002) si:ch211-129c21.1 (ENSCHAG00000015792) scamp4 (ENSCHAG00000015771) EVI5 (ENSCHAG00000014035) gfi1ab (ENSCHAG00000013954) glmnb (ENSCHAG00000013948) C1orf146 (ENSCHAG00000013925) ENSCHAG00000013915 ENSCHAG00000013911 EPHX4 (ENSCHAG00000013899) brdt (ENSCHAG00000013886) tgfbr3 (ENSCHAG00000013793) ENSCHAG00000013781 ENSCHAG00000013767 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 146 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000155446 ENSGT00940000155152.f.b ENSGT00560000077332 ENSGT00940000154967.b.b.b ENSGT00940000154386 ENSGT00940000154967.b.b.a ENSGT00940000155117.f.a 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ENSOMYG00000067689 ENSOMYG00000013185 Salmo ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT01000000214413.b.a.a.o ENSGT00390000013727.d.a.d ENSGT00940000156634.a.d ENSGT00550000075004.e.b ENSGT01050000244814.a.a.b.b.b.a.b.c ENSGT00940000165115.a.a ENSGT01030000234559.a.a.a.h ENSGT00940000153617.A.a.a.k.a ENSGT00940000159248.a ENSGT00390000008296.a.r ENSGT00550000074851.e ENSGT00940000159619.a.c ENSGT00940000164427.a.b.m.b ENSGT00940000166731.a ENSGT01030000234774.d ENSGT00390000011058.b.j #22 ENSGT00940000159593.g ENSGT00390000018244 ENSGT00390000017311.k.a ENSGT00940000158538.k.a ENSGT00530000063484.b.b.d.a.c.b ENSGT00940000159499.g ENSGT00730000111176.a ENSGT00940000159969.a.a ENSGT00940000154067.c.v ENSGT00940000154756.B ENSGT00940000155815.p.h.b ENSGT00390000016573.c.a.b.b ENSGT00950000182983.A.a.b.t ENSGT00510000047220.q ENSGT01050000244838.B.a.a.a River trout MODERN SPECIES 14 actl6a (ENSSTUG00000027355) GNB4 (ENSSTUG00000027561) mfn1b (ENSSTUG00000027653) plaat1 (ENSSTUG00000030525) 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cichlid MODERN SPECIES 46 lpar3 (ENSACIG00000013001) mcoln2 (ENSACIG00000012976) ENSACIG00000012953 ftsj3 (ENSACIG00000012880) plaat1 (ENSACIG00000012853) mfn1b (ENSACIG00000012823) gnb4b (ENSACIG00000012802) aldh7a1 (ENSACIG00000012753) actl6a (ENSACIG00000012720) mrpl47 (ENSACIG00000012703) ndufb5 (ENSACIG00000012683) usp13 (ENSACIG00000012624) PEX5L (ENSACIG00000012595) ENSACIG00000012573 ENSACIG00000012560 ENSACIG00000012535 #22 P3H2 (ENSACIG00000012482) ENSACIG00000012464 cpox (ENSACIG00000012440) prrg1 (ENSACIG00000012435) tmem47 (ENSACIG00000012423) tab3 (ENSACIG00000012305) nexn (ENSACIG00000012274) ENSACIG00000012246 alkal1 (ENSACIG00000012220) ENSACIG00000012180 ENSACIG00000012168 ENSACIG00000012114 ENSACIG00000012044 guk1b (ENSACIG00000012028) RNF220 (ENSACIG00000012014) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00550000075004 ENSGT00940000156634.a ENSGT00390000013727.d.a ENSGT01000000214413.b.a.a ENSGT00940000154938 ENSGT00940000156305 ENSGT00390000002837 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ENSGT00530000063484.b.b.d.a ENSGT00940000159499 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000159600 ENSGT00940000159969.a ENSGT00940000168181 ENSGT00940000154067.c ENSGT00940000168428.b.b.b ENSGT00940000168428.b.a ENSGT00940000167421 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000165672 ENSGT00550000075004 ENSGT00940000156634.a ENSGT00390000013727.d.a ENSGT01000000214413.b.a.a ENSGT00940000154938 ENSGT00940000156305 ENSGT00390000002837 ENSGT00390000009980 ENSGT00940000157401 ENSGT00940000155931.a ENSGT00940000162953 ENSGT00940000159678 ENSGT00940000166731.a ENSGT01030000234774 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000159593 ENSGT00390000018244 ENSGT00390000017311 ENSGT00940000158538 ENSGT00530000063484.b.b.d.a ENSGT00940000159499 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000159600 ENSGT00940000159969.a ENSGT00940000154067.c ENSGT00940000154756.B.v ENSGT00940000155815.p ENSGT00390000016573.c.a ENSGT00390000016466 ENSGT00940000154595 Fugu MODERN SPECIES 12 plaat1 (ENSTRUG00000017562) mfn1b (ENSTRUG00000017563) 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ENSSAUG00010027033 ENSSAUG00010027032 ENSSAUG00010027031 ENSSAUG00010027029 ENSSAUG00010027025 #22 ENSSAUG00010027024 P3H2 (ENSSAUG00010027001) ENSSAUG00010026992 cpox (ENSSAUG00010026987) prrg1 (ENSSAUG00010026984) tmem47 (ENSSAUG00010026979) tab3 (ENSSAUG00010026975) nexn (ENSSAUG00010026953) ENSSAUG00010026946 ENSSAUG00010026941 zgc:153738 (ENSSAUG00010026938) ENSSAUG00010026935 ENSSAUG00010026933 ENSSAUG00010026930 guk1b (ENSSAUG00010026920) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000165672 ENSGT00550000075004 ENSGT00940000156634.a ENSGT00390000013727.d.a ENSGT01000000214413.b.a.a ENSGT00940000154938 ENSGT00940000156305 ENSGT00390000002837 ENSGT00390000009980 ENSGT00940000157401 ENSGT00940000155931.a ENSGT00940000162953 ENSGT00940000161826.A ENSGT00940000166731.a ENSGT01030000234774 ENSGT00390000011058.b #22 ENSGT00940000155387.d ENSGT00940000159593 ENSGT00390000018244 ENSGT00390000017311 ENSGT00940000158538 ENSGT00530000063484.b.b.d.a ENSGT00940000159499 ENSGT00730000111176 ENSGT00940000159600 ENSGT00940000159969.a ENSGT00940000154067.c ENSGT00940000154756.B.v ENSGT00940000155815.p ENSGT00390000016573.c.a ENSGT00390000016466 European seabass MODERN SPECIES 17 mcoln2 (ENSDLAG00005026024) ENSDLAG00005026036 ENSDLAG00005026040 ENSDLAG00005026042 MFN1 (ENSDLAG00005026049) GNB4 (ENSDLAG00005026071) ENSDLAG00005034805 actl6a (ENSDLAG00005026080) mrpl47 (ENSDLAG00005026094) usp13 (ENSDLAG00005026106) PEX5L (ENSDLAG00005026129) ENSDLAG00005012641 ENSDLAG00005026130 ENSDLAG00005006720 ENSDLAG00005006725 ENSDLAG00005006731 #22 ENSDLAG00005006756 ENSDLAG00005006760 ENSDLAG00005006857 cpox (ENSDLAG00005034795) prrg1 (ENSDLAG00005027771) tmem47 (ENSDLAG00005006885) tab3 (ENSDLAG00005006896) nexn (ENSDLAG00005006907) ENSDLAG00005007086 alkal1 (ENSDLAG00005007111) zgc:153738 (ENSDLAG00005007126) ENSDLAG00005029309 guk1b (ENSDLAG00005007285) ENSDLAG00005007340 dmap1 (ENSDLAG00005007370) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00550000075004 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