Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 18 SIMC1 (ENSMICG00000015305) #7 ENSMICG00000028441 #8 CPLX2 (ENSMICG00000047802) #9 HRH2 (ENSMICG00000003318) #10 ENSMICG00000030242 #11 DRD1 (ENSMICG00000042729) #12 GRM7 (ENSMICG00000010596) #13 CNTN4 (ENSMICG00000016581) #14 IL5RA (ENSMICG00000046178) #15 TRNT1 (ENSMICG00000016615) #16 CRBN (ENSMICG00000016619) #17 LRRN1 (ENSMICG00000038690) #18 ENSMICG00000030917 #19 ENSMICG00000032203 #20 SUMF1 (ENSMICG00000016631) #21 ITPR1 (ENSMICG00000004656) #22 BHLHE40 (ENSMICG00000043220) #23 ENSMICG00000029477 #24 EDEM1 (ENSMICG00000000246) #25 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.A #22 Microbat MODERN SPECIES 2391 ENSMLUG00000011987 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Lamprey MODERN SPECIES 457 ENSPMAG00000007060 ##22 ENSPMAG00000007049 ENSPMAG00000007041 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Elephant shark MODERN SPECIES 1592 ENSCMIG00000014484 CHL1 (ENSCMIG00000013989) trnt1 (ENSCMIG00000013799) #16 ENSCMIG00000013795 crbn (ENSCMIG00000013785) #17 ENSCMIG00000013774 lrrn1 (ENSCMIG00000013770) #18 sumf1 (ENSCMIG00000013754) #21 ITPR1 (ENSCMIG00000012625) ##22 arl8bb (ENSCMIG00000012230) #24 edem1 (ENSCMIG00000012120) #25 ENSCMIG00000011936 ##13 ENSCMIG00000011896 CHDH (ENSCMIG00000011886) cacna1da (ENSCMIG00000011699) DCP1A (ENSCMIG00000011651) tktb (ENSCMIG00000011571) BICD2 (ENSCMIG00000011547) FGD3 (ENSCMIG00000011536) ENSCMIG00000011532 ENSCMIG00000011530 ninj1 (ENSCMIG00000011529) ENSCMIG00000011528 ENSCMIG00000011526 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.B ##22 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1601 LRRN1 (ENSMLUG00000003543) #18 ENSMLUG00000027733 #20 SUMF1 (ENSMLUG00000015762) #21 ENSMLUG00000030685 ENSMLUG00000007717 ##22 Microbat MODERN SPECIES 821 ENSMLUG00000028822 ##22 Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT01010000222866 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000014353 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT01050000244882.b.c.a.b ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000162824 ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00530000063849.A.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000162824 ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B ENSGT00940000165239.b Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000162859.o ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00950000183080.a.a.f ENSGT00940000156107.e.b ENSGT00940000154281 ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00390000015972 ENSGT00940000158315 ENSGT00940000160254 ENSGT00390000018118 ENSGT00940000160455 ENSGT00940000160663 ENSGT00390000018547 ENSGT00390000005197.b ENSGT00940000157086.b Atlantic herring MODERN SPECIES 21 ppp4r2b (ENSCHAG00000025680) gxylt2 (ENSCHAG00000025668) shq1 (ENSCHAG00000025662) RYBP (ENSCHAG00000025660) prok2 (ENSCHAG00000025655) gpr27 (ENSCHAG00000025654) foxp1b (ENSCHAG00000025407) zgc:113054 (ENSCHAG00000025384) mitfa (ENSCHAG00000025374) FRMD4B (ENSCHAG00000025306) arl6ip5a (ENSCHAG00000025298) trnt1 (ENSCHAG00000025289) #16 ENSCHAG00000025284 lrrn1 (ENSCHAG00000025281) #18 setmar (ENSCHAG00000025278) #20 ITPR1 (ENSCHAG00000018029) ##22 bhlhe40 (ENSCHAG00000017831) #23 ARF3 (ENSCHAG00000017812) ERBB3 (ENSCHAG00000013607) pa2g4a (ENSCHAG00000013406) ENSCHAG00000013385 zc3h10 (ENSCHAG00000013378) ESYT1 (ENSCHAG00000012701) eif6 (ENSCHAG00000012670) MMP24 (ENSCHAG00000012095) fam83c (ENSCHAG00000012082) uqcc1 (ENSCHAG00000012054) GDF5 (ENSCHAG00000012012) sdc4 (ENSCHAG00000011995) oser1 (ENSCHAG00000011989) RBPJL (ENSCHAG00000011542) Denticle herring MODERN SPECIES 3 ppp4r2b (ENSDCDG00000034728) gxylt2 (ENSDCDG00000034731) shq1 (ENSDCDG00000034732) rybpb (ENSDCDG00000034734) prok2 (ENSDCDG00000034735) gpr27 (ENSDCDG00000034737) foxp1b (ENSDCDG00000034762) zgc:113054 (ENSDCDG00000034956) mitfa (ENSDCDG00000034964) FRMD4B (ENSDCDG00000034978) arl6ip5a (ENSDCDG00000034990) trnt1 (ENSDCDG00000034993) #16 ENSDCDG00000034996 lrrn1 (ENSDCDG00000002962) #18 setmar (ENSDCDG00000002977) #20 ENSDCDG00000003598 ##22 ENSDCDG00000013280 bhlhe40 (ENSDCDG00000013282) #23 arf3b (ENSDCDG00000013288) ERBB3 (ENSDCDG00000013741) pa2g4a (ENSDCDG00000024781) zc3h10 (ENSDCDG00000024787) ESYT1 (ENSDCDG00000024805) eif6 (ENSDCDG00000025528) MMP24 (ENSDCDG00000025557) fam83c (ENSDCDG00000025700) uqcc1 (ENSDCDG00000025703) GDF5 (ENSDCDG00000025709) sdc4 (ENSDCDG00000025712) oser1 (ENSDCDG00000025729) RBPJL (ENSDCDG00000025737) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 233 ENSGT00940000156015 ENSGT00930000151052 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736.b ENSGT01030000234637.a.a.a.b ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 ENSGT01030000234595.B.c.a.d ENSGT00390000016901.a ENSGT00940000165239.a ENSGT00390000011082 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b Characiphysae DUPLICATION Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00930000151052 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736.b ENSGT01030000234637.a.a.a.b ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 ENSGT01030000234595.B.c.a.d ENSGT00390000016901.a ENSGT00940000165239.a ENSGT00940000180975 ENSGT00390000011082 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C.a ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000155766.b ENSGT01100000263502.A.b.a.b ENSGT00940000154839.B ENSGT00940000155552.q.b ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.a Channel catfish MODERN SPECIES 13 CYB561D1 (ENSIPUG00000022102) atxn7l2 (ENSIPUG00000022081) Sypl1 (ENSIPUG00000022069) psma5 (ENSIPUG00000022043) sort1 (ENSIPUG00000022008) nfya (ENSIPUG00000021947) cav4a (ENSIPUG00000021943) ENSIPUG00000021941 rrp9 (ENSIPUG00000021918) grm2b (ENSIPUG00000021899) TEX264 (ENSIPUG00000021887) ENSIPUG00000021879 ENSIPUG00000021875 brk1 (ENSIPUG00000021866) setmar (ENSIPUG00000021862) #20 ITPR1 (ENSIPUG00000021797) ##22 BHLHE40 (ENSIPUG00000021779) #23 arl8bb (ENSIPUG00000021761) #24 Sema3f (ENSIPUG00000021126) camkv (ENSIPUG00000021099) MST1R (ENSIPUG00000021073) sand (ENSIPUG00000021060) Traip (ENSIPUG00000021041) inka1a (ENSIPUG00000021034) gnai2a (ENSIPUG00000021023) slc38a3 (ENSIPUG00000020967) ENSIPUG00000020959 ENSIPUG00000020924 cacna1da (ENSIPUG00000020039) BICD2 (ENSIPUG00000019989) card19 (ENSIPUG00000019980) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00930000151052 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736.b ENSGT01030000234637.a.a.a.b ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 ENSGT01030000234595.B.c.a.d ENSGT00390000016901.a ENSGT00940000165239.a ENSGT00940000180975 ENSGT00390000011082 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C.a ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000155766.b Electric eel MODERN SPECIES 514 ENSEEEG00000006347 ##22 bhlhe40 (ENSEEEG00000006346) #23 arl8bb (ENSEEEG00000006321) #24 SEMA3F (ENSEEEG00000006311) camkvb (ENSEEEG00000006306) ENSEEEG00000006300 mon1a (ENSEEEG00000006296) traip (ENSEEEG00000006280) pabpc1a (ENSEEEG00000006277) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00930000151052 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736.b ENSGT01030000234637.a.a.a.b ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 ENSGT01030000234595.B.c.a.d ENSGT00390000016901.a.a ENSGT00940000165239.a ENSGT00940000180975 ENSGT00390000011082 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C.a ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000155766.b ENSGT01100000263502.A.b.a.b ENSGT00940000154839.B ENSGT00940000155552.q.b ENSGT00940000154471.a.b.a.a.b.a Mexicana tetra MODERN SPECIES 14 arfgap1 (ENSAMXG00000038178) ELMO2 (ENSAMXG00000024695) ITGA7 (ENSAMXG00000024694) npffl (ENSAMXG00000033520) ENSAMXG00000030865 nckap1l (ENSAMXG00000024691) ENSAMXG00000040289 ENSAMXG00000039702 ENSAMXG00000042985 nr1d4b (ENSAMXG00000035331) TEX264 (ENSAMXG00000034798) ENSAMXG00000034328 ENSAMXG00000030605 BRK1 (ENSAMXG00000036652) setmar (ENSAMXG00000032934) #20 ITPR1 (ENSAMXG00000006873) ##22 bhlhe40 (ENSAMXG00000036916) #23 arl8bb (ENSAMXG00000032775) #24 ENSAMXG00000040787 SEMA3F (ENSAMXG00000007053) camkvb (ENSAMXG00000043166) ENSAMXG00000007117 mon1a (ENSAMXG00000040493) traip (ENSAMXG00000030724) inka1a (ENSAMXG00000041740) gnai2a (ENSAMXG00000007141) slc38a3a (ENSAMXG00000007148) zmp:0000001006 (ENSAMXG00000040523) zmp:0000001138 (ENSAMXG00000007162) ENSAMXG00000007164 parapinopsinb (ENSAMXG00000007169) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 6 ENSPNAG00000016242 cyb561d1 (ENSPNAG00000016252) atxn7l2a (ENSPNAG00000016270) sypl2a (ENSPNAG00000016293) psma5 (ENSPNAG00000016331) sort1a (ENSPNAG00000016351) cav4a (ENSPNAG00000016370) ENSPNAG00000016379 rrp9 (ENSPNAG00000005788) grm2b (ENSPNAG00000016434) TEX264 (ENSPNAG00000016442) ENSPNAG00000016445 ENSPNAG00000016467 BRK1 (ENSPNAG00000016475) setmar (ENSPNAG00000016483) #20 ITPR1 (ENSPNAG00000017264) ##22 bhlhe40 (ENSPNAG00000017319) #23 arl8bb (ENSPNAG00000017354) #24 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C.b ##22 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C.b ##22 Electric eel MODERN SPECIES 185 cyb561d1 (ENSEEEG00000009710) atxn7l2a (ENSEEEG00000009712) sypl2a (ENSEEEG00000009713) psma5 (ENSEEEG00000009714) sort1a (ENSEEEG00000009720) ENSEEEG00000009728 nfya (ENSEEEG00000009729) cav4a (ENSEEEG00000009730) ENSEEEG00000009731 rrp9 (ENSEEEG00000009740) grm2b (ENSEEEG00000009859) TEX264 (ENSEEEG00000009860) ENSEEEG00000009861 BRK1 (ENSEEEG00000009864) setmar (ENSEEEG00000009866) #20 ENSEEEG00000009870 ##22 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00930000151052 ENSGT00440000038072.d ENSGT00940000159736.b ENSGT01030000234637.a.a.a.b ENSGT00550000074958 ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b ENSGT00940000158328 ENSGT01030000234595.B.c.a.d ENSGT00390000016901.a ENSGT00940000170109 ENSGT00940000156150.w ENSGT00390000011082 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00390000013132.b.a ENSGT00940000166464 ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c Cyprininae DUPLICATION Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C.c.a ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C.c.a ##22 Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 1842 ITPR1 (ENSSGRG00000030210) ##22 bhlhe40 (ENSSGRG00000030134) #23 arl8bb (ENSSGRG00000030126) #24 ENSSGRG00000030125 Golden-line barbel MODERN SPECIES 43 USP48 (ENSSGRG00000038287) ENSSGRG00000038280 atxn7l2a (ENSSGRG00000038276) sypl2a (ENSSGRG00000038274) psma5 (ENSSGRG00000038247) sort1a (ENSSGRG00000037966) cav4a (ENSSGRG00000037957) nfya (ENSSGRG00000037954) ENSSGRG00000037953 rrp9 (ENSSGRG00000037952) grm2b (ENSSGRG00000037951) TEX264 (ENSSGRG00000037950) gpx1a (ENSSGRG00000037947) BRK1 (ENSSGRG00000037941) setmar (ENSSGRG00000037940) #20 ENSSGRG00000037938 ##22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00930000151052.d ENSGT00440000038072.d.g.a ENSGT00940000159736.b.a ENSGT01030000234637.a.a.a.b.b ENSGT00550000074958.`b ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b.b ENSGT00390000015714.o.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b.e ENSGT00940000158328.c ENSGT01030000234595.B.c.a.d.c ENSGT00390000016901.a.d ENSGT00940000170109 ENSGT00390000011082.rb ENSGT00940000162663.a #20 ENSGT00940000155071.C.c.b ##22 ENSGT00940000158384.d.a #23 ENSGT00940000154861.n.a.b #24 ENSGT00940000156703.e.a.d ENSGT00940000156468.f.b ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a.c ENSGT00390000007696.k ENSGT00530000063849.A.a.e ENSGT00940000155125.a.b.a ENSGT00940000157127.b.b ENSGT00390000013132.b.a.f ENSGT00940000166464.a ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154089.a.c.b ENSGT00950000182835.c.d.c.a.b Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00930000151052.d ENSGT00440000038072.d.g.a ENSGT00940000159736.b.a ENSGT01030000234637.a.a.a.b.b ENSGT00550000074958.`b ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b.b ENSGT00390000015714.o.b ENSGT00950000183006.A.a.a.b ENSGT00950000182998.C.b.b.e ENSGT00940000158328.c ENSGT01030000234595.B.c.a.d.c ENSGT00390000016901.a.d ENSGT00940000170109 ENSGT00390000011082.rb ENSGT00940000162663.a #20 ENSGT00940000155071.C.c.b ##22 ENSGT00940000158384.d.a #23 ENSGT00940000154861.n.a.b #24 ENSGT00940000156703.e.a.d ENSGT00940000156468.f.b ENSGT00940000157842.b.a ENSGT00390000006665.a.c ENSGT00390000007696.k ENSGT00530000063849.A.a.e ENSGT00940000155125.a.b.a ENSGT00940000157127.b.b ENSGT00390000013132.b.a.f ENSGT00940000166464.a ENSGT00940000174829 ENSGT00940000154089.a.c.b ENSGT00950000182835.c.d.c.a.b Common carp reference MODERN SPECIES 42 ENSCCRG00000042985 ENSCCRG00000061690 cyb561d1 (ENSCCRG00000059998) atxn7l2a (ENSCCRG00000008164) sypl2a (ENSCCRG00000008151) psma5 (ENSCCRG00000008130) sort1a (ENSCCRG00000029858) nfya (ENSCCRG00000029825) cav4a (ENSCCRG00000054690) ENSCCRG00000060193 rrp9 (ENSCCRG00000038199) grm2b (ENSCCRG00000040374) TEX264 (ENSCCRG00000080528) brk1 (ENSCCRG00000077197) setmar (ENSCCRG00000050849) #20 ITPR1 (ENSCCRG00000070404) ##22 ENSCCRG00000031281 bhlhe40 (ENSCCRG00000035683) #23 arl8bb (ENSCCRG00000063563) #24 ENSCCRG00000023758 ENSCCRG00000017394 mon1a (ENSCCRG00000017385) traip (ENSCCRG00000017325) inka1a (ENSCCRG00000058363) gnai2a (ENSCCRG00000050816) slc38a3a (ENSCCRG00000017772) chchd4a (ENSCCRG00000073866) ENSCCRG00000073157 ENSCCRG00000028910 mapkapk3 (ENSCCRG00000015875) pfkfb4a (ENSCCRG00000075495) Golden-line barbel MODERN SPECIES 3092 ENSSGRG00000001426 ##22 Goldfish MODERN SPECIES 29 USP48 (ENSCARG00000023200) cyb561d1 (ENSCARG00000023155) atxn7l2a (ENSCARG00000023151) sypl2a (ENSCARG00000023145) psma5 (ENSCARG00000023136) sort1a (ENSCARG00000022910) nfya (ENSCARG00000022872) cav4a (ENSCARG00000022861) ENSCARG00000022856 rrp9 (ENSCARG00000022696) grm2b (ENSCARG00000022680) TEX264 (ENSCARG00000022674) BRK1 (ENSCARG00000022667) setmar (ENSCARG00000022663) #20 ENSCARG00000022657 ITPR1 (ENSCARG00000021084) ##22 bhlhe40 (ENSCARG00000020963) #23 SEMA3F (ENSCARG00000020745) arl8bb (ENSCARG00000020699) #24 camkvb (ENSCARG00000020662) ENSCARG00000020654 ENSCARG00000020589 mon1a (ENSCARG00000020575) traip (ENSCARG00000020386) inka1a (ENSCARG00000020364) gnai2a (ENSCARG00000020348) slc38a3a (ENSCARG00000020239) chchd4a (ENSCARG00000020222) ENSCARG00000020209 ENSCARG00000020203 mapkapk3 (ENSCARG00000019644) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 310 ENSGT00940000156015.f ENSGT00930000151052.c ENSGT00440000038072.d.h ENSGT00940000159736.b.b ENSGT01030000234637.a.a.a.b.a ENSGT00550000074958.ab ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b.a ENSGT00390000015714.o.a ENSGT00950000182998.C.b.b.f ENSGT00940000158328.d ENSGT01030000234595.B.c.a.d.d ENSGT00390000016901.a.c ENSGT00940000156150.w ENSGT00390000011082.sb ENSGT00940000162663.b #20 ENSGT00940000155071.C.d ##22 ENSGT00940000158384.d.b #23 ENSGT00940000154861.n.a.a #24 ENSGT00940000156703.e.a.c ENSGT00940000156468.f.a ENSGT00390000006665.a.d ENSGT00390000007696.l ENSGT00530000063849.A.a.f ENSGT00940000155125.a.b.b ENSGT00940000157127.b.a ENSGT00390000013132.b.a.e ENSGT00940000166464.b ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c.a ENSGT00950000182835.c.d.c.a.a ENSGT00730000111202.c Goldfish MODERN SPECIES 2 ENSCARG00000028668 ENSCARG00000028673 atxn7l2a (ENSCARG00000028678) sypl2a (ENSCARG00000028691) psma5 (ENSCARG00000028695) sort1a (ENSCARG00000028745) nfya (ENSCARG00000029603) ENSCARG00000029641 rrp9 (ENSCARG00000029694) rrp9 (ENSCARG00000030370) grm2b (ENSCARG00000030453) TEX264 (ENSCARG00000046889) GPX1 (ENSCARG00000046893) BRK1 (ENSCARG00000046903) ENSCARG00000046931 ITPR1 (ENSCARG00000046994) ##22 bhlhe40 (ENSCARG00000048114) #23 arl8bb (ENSCARG00000048163) #24 SEMA3F (ENSCARG00000048336) camkvb (ENSCARG00000050361) mon1a (ENSCARG00000050500) traip (ENSCARG00000050526) inka1a (ENSCARG00000050696) gnai2a (ENSCARG00000050709) slc38a3a (ENSCARG00000050742) chchd4a (ENSCARG00000050794) ENSCARG00000050804 mapkapk3 (ENSCARG00000051298) pfkfb4a (ENSCARG00000053502) ZMAT3 (ENSCARG00000054299) PIK3CA (ENSCARG00000054357) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156015.f ENSGT00930000151052.c ENSGT00440000038072.d.h ENSGT00940000159736.b.b ENSGT01030000234637.a.a.a.b.a ENSGT00550000074958.ab ENSGT01030000234563.a.a.c.b.b.a ENSGT00390000015714.o.a ENSGT00950000182998.C.b.b.f ENSGT00940000158328.d ENSGT01030000234595.B.c.a.d.d ENSGT00390000016901.a.c ENSGT00940000165239.b.a ENSGT00390000011082.sb ENSGT00940000162663.b #20 ENSGT00940000155071.C.d ##22 ENSGT00940000158384.d.b #23 ENSGT00940000154861.n.a.a #24 ENSGT00940000156703.e.a.c ENSGT00940000156468.f.a ENSGT00940000157842.b.b ENSGT00390000006665.a.d ENSGT00390000007696.l ENSGT00530000063849.A.a.f ENSGT00940000155125.a.b.b ENSGT00940000157127.b.a ENSGT00390000013132.b.a.e ENSGT00940000166464.b ENSGT00940000154791 ENSGT00940000154089.a.c.a ENSGT00950000182835.c.d.c.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 13 cyb561d1 (ENSCCRG00000071586) ENSCCRG00000038917 atxn7l2a (ENSCCRG00000072879) psma5 (ENSCCRG00000038900) sypl2a (ENSCCRG00000056618) sort1a (ENSCCRG00000038107) nfya (ENSCCRG00000038066) cav4a (ENSCCRG00000070986) ENSCCRG00000060879 rrp9 (ENSCCRG00000068781) grm2b (ENSCCRG00000037972) TEX264 (ENSCCRG00000057102) gpx1a (ENSCCRG00000061411) ENSCCRG00000073213 setmar (ENSCCRG00000055297) #20 ITPR1 (ENSCCRG00000001660) ##22 bhlhe40 (ENSCCRG00000025691) #23 arl8bb (ENSCCRG00000058977) #24 ENSCCRG00000047445 camkvb (ENSCCRG00000023772) ENSCCRG00000045469 mon1a (ENSCCRG00000045456) traip (ENSCCRG00000081663) inka1a (ENSCCRG00000017906) gnai2a (ENSCCRG00000061973) slc38a3a (ENSCCRG00000080470) chchd4a (ENSCCRG00000064388) ENSCCRG00000077935 ENSCCRG00000003595 mapkapk3 (ENSCCRG00000028911) pfkfb4a (ENSCCRG00000013593) Golden-line barbel MODERN SPECIES 2 USP48 (ENSSGRG00000014327) USP48 (ENSSGRG00000014324) ENSSGRG00000014322 cyb561d1 (ENSSGRG00000014321) atxn7l2a (ENSSGRG00000014317) sypl2a (ENSSGRG00000014316) psma5 (ENSSGRG00000014314) sort1a (ENSSGRG00000014313) nfya (ENSSGRG00000014283) ENSSGRG00000014279 rrp9 (ENSSGRG00000014268) grm2b (ENSSGRG00000014267) TEX264 (ENSSGRG00000014256) gpx1a (ENSSGRG00000014248) BRK1 (ENSSGRG00000014246) ITPR1 (ENSSGRG00000010346) ##22 bhlhe40 (ENSSGRG00000010241) #23 arl8bb (ENSSGRG00000010088) #24 SEMA3F (ENSSGRG00000009419) camkvb (ENSSGRG00000009379) ENSSGRG00000009367 mon1a (ENSSGRG00000009358) traip (ENSSGRG00000009292) inka1a (ENSSGRG00000009288) gnai2a (ENSSGRG00000009287) slc38a3a (ENSSGRG00000009284) chchd4a (ENSSGRG00000009283) ENSSGRG00000009281 ENSSGRG00000009280 ENSSGRG00000009279 ENSSGRG00000009277 Zebrafish MODERN SPECIES 2 USP48 (ENSDARG00000090301) ENSDARG00000091762 cyb561d1 (ENSDARG00000055295) atxn7l2a (ENSDARG00000055300) sypl2a (ENSDARG00000055307) psma5 (ENSDARG00000003526) sort1a (ENSDARG00000029402) nfya (ENSDARG00000042004) cav4a (ENSDARG00000003632) ENSDARG00000012496 rrp9 (ENSDARG00000041991) grm2b (ENSDARG00000007195) gpx1a (ENSDARG00000018146) brk1 (ENSDARG00000041974) setmar (ENSDARG00000074836) #20 ITPR1 (ENSDARG00000074149) ##22 bhlhe40 (ENSDARG00000004060) #23 arl8bb (ENSDARG00000070318) #24 SEMA3F (ENSDARG00000055373) camkvb (ENSDARG00000005141) ENSDARG00000004871 mon1a (ENSDARG00000078585) traip (ENSDARG00000011262) inka1a (ENSDARG00000070360) gnai2a (ENSDARG00000018174) slc38a3a (ENSDARG00000027065) chchd4a (ENSDARG00000033376) ENSDARG00000061260 DNAH1 (ENSDARG00000100115) mapkapk3 (ENSDARG00000111612) pfkfb4a (ENSDARG00000055540) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000004409.b ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392.c ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00940000177762 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138.a ENSGT00890000139436.A.a.b ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b.c ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309.e.a ENSGT00940000156326.a.b.c ENSGT01020000230354.A.a.a.d ENSGT00390000008631.a.o.a.b ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.c ENSGT00940000157154.d.f #18 ENSGT00940000162663.c #20 ENSGT00940000155071.C.e ##22 ENSGT00940000158384.d.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00980000202247 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000155877 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000177762 ENSGT00390000013995.b.a.ab ENSGT00940000167138.a ENSGT00890000139436.A.a.b ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b.c ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309.e.a ENSGT00940000156326.a.b.c ENSGT01020000230354.A.a.a.d ENSGT00390000008631.a.o.a.b ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.c ENSGT00940000157154.d.f #18 ENSGT00940000162663.c #20 ENSGT00940000155071.C.e ##22 ENSGT00940000158384.d.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00980000202247 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000155877 Salmo ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000177762 ENSGT00390000013995.b.a.ab ENSGT00940000167138.a ENSGT00890000139436.A.a.b ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b.c ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309.e.a ENSGT00940000156326.a.b.c ENSGT01020000230354.A.a.a.d ENSGT00390000008631.a.o.a.b ENSGT00390000009678.e #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.c ENSGT00940000157154.d.f #18 ENSGT00940000162663.c #20 ENSGT00940000155071.C.e ##22 ENSGT00940000158384.d.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00390000006665.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00730000111044 ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000155877 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 3 prok2 (ENSSSAG00000077970) gpr27 (ENSSSAG00000090342) EIF4E3 (ENSSSAG00000118265) ENSSSAG00000111237 foxp1b (ENSSSAG00000077724) mdfic2 (ENSSSAG00000077706) zgc:113054 (ENSSSAG00000077695) mitfa (ENSSSAG00000077659) FRMD4B (ENSSSAG00000077601) arl6ip5a (ENSSSAG00000077595) TRNT1 (ENSSSAG00000077584) #16 ENSSSAG00000077580 lrrn1 (ENSSSAG00000098200) #18 setmar (ENSSSAG00000077574) #20 ENSSSAG00000112671 ITPR1 (ENSSSAG00000054019) ##22 BHLH2 (ENSSSAG00000052801) #23 arl8bb (ENSSSAG00000116454) #24 ENSSSAG00000043762 camkvb (ENSSSAG00000043153) ENSSSAG00000043080 mon1a (ENSSSAG00000043049) grm6b (ENSSSAG00000093082) ##13 comtb (ENSSSAG00000042490) ENSSSAG00000036227 ccdc120b (ENSSSAG00000035547) mbd1b (ENSSSAG00000035232) ENSSSAG00000092788 ENSSSAG00000020016 tfe3b (ENSSSAG00000015673) ENSSSAG00000118599 River trout MODERN SPECIES 5 ENSSTUG00000014447 RYBP (ENSSTUG00000014455) prok2 (ENSSTUG00000014470) gpr27 (ENSSTUG00000014479) EIF4E3 (ENSSTUG00000014483) foxp1b (ENSSTUG00000014503) mdfic2 (ENSSTUG00000014882) zgc:113054 (ENSSTUG00000014888) mitfa (ENSSTUG00000014914) FRMD4B (ENSSTUG00000015084) arl6ip5a (ENSSTUG00000015266) trnt1 (ENSSTUG00000015279) #16 ENSSTUG00000015291 lrrn1 (ENSSTUG00000015297) #18 setmar (ENSSTUG00000015300) #20 ITPR1 (ENSSTUG00000015338) ##22 bhlhe40 (ENSSTUG00000015789) #23 arl8bb (ENSSTUG00000015812) #24 SEMA3F (ENSSTUG00000015849) camkvb (ENSSTUG00000016452) ENSSTUG00000016484 mon1a (ENSSTUG00000016521) traip (ENSSTUG00000016538) grm6b (ENSSTUG00000016561) ##13 comtb (ENSSTUG00000016606) SRPK3 (ENSSTUG00000016695) ccdc120b (ENSSTUG00000016723) ENSSTUG00000016732 mbd1b (ENSSTUG00000016736) CXXC1 (ENSSTUG00000016765) tfe3b (ENSSTUG00000017011) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000177762 ENSGT00390000013995.b.a.ab ENSGT00940000167138.a ENSGT00890000139436.A.a.b ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b.c ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309.e.a ENSGT00940000156326.a.b.c ENSGT01020000230354.A.a.a.d ENSGT00390000008631.a.o.a.b ENSGT00390000009678.h #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.c ENSGT00940000157154.d.f #18 ENSGT00940000162663.c #20 ENSGT00940000155071.C.e ##22 ENSGT00940000158384.d.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00980000202247 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000155877 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158065.f ENSGT00940000177762 ENSGT00390000013995.b.a.ab ENSGT00890000139436.A.a.b ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b.c ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309.e.a ENSGT00940000156326.a.b.c ENSGT01020000230354.A.a.a.d ENSGT00390000008631.a.o.a.b ENSGT00390000009678.h #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.c ENSGT00940000157154.d.f #18 ENSGT00940000162663.c #20 ENSGT00940000155071.C.e ##22 ENSGT00940000158384.d.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a.a ENSGT00940000156468.f.d ENSGT00940000157842.b.e ENSGT00390000006665.a.a ENSGT00980000202247 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.e ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.b ENSGT00940000157877.b.h.g ENSGT00940000154102.b.a.a.d ENSGT00950000183005.a.a.d ENSGT00940000166392.c.a ENSGT00940000157503.i.b.d ENSGT00940000155877 Chinook salmon MODERN SPECIES 11 pdzrn3b (ENSOTSG00005004234) ppp4r2b (ENSOTSG00005004231) gxylt2 (ENSOTSG00005004230) RYBP (ENSOTSG00005004229) gpr27 (ENSOTSG00005004228) EIF4E3 (ENSOTSG00005004227) foxp1b (ENSOTSG00005002056) zgc:113054 (ENSOTSG00005002048) mitfa (ENSOTSG00005001922) FRMD4B (ENSOTSG00005001893) arl6ip5a (ENSOTSG00005001888) trnt1 (ENSOTSG00005001883) #16 ENSOTSG00005001880 lrrn1 (ENSOTSG00005001879) #18 setmar (ENSOTSG00005001878) #20 ITPR1 (ENSOTSG00005001228) ##22 bhlhe40 (ENSOTSG00005001151) #23 arl8bb (ENSOTSG00005001141) #24 SEMA3F (ENSOTSG00005000749) camkvb (ENSOTSG00005000406) MST1R (ENSOTSG00005045214) mon1a (ENSOTSG00005045213) ENSOTSG00005045212 grm6b (ENSOTSG00005045198) ##13 comtb (ENSOTSG00005045196) SRPK3 (ENSOTSG00005043456) ccdc120b (ENSOTSG00005043438) mbd1b (ENSOTSG00005043437) cxxc1b (ENSOTSG00005043374) tfe3b (ENSOTSG00005043372) gnl3l (ENSOTSG00005043179) Coho salmon MODERN SPECIES ENSOKIG00005011034 RYBP (ENSOKIG00005011042) ENSOKIG00005011059 gpr27 (ENSOKIG00005011072) EIF4E3 (ENSOKIG00005011081) foxp1b (ENSOKIG00005011174) mdfic2 (ENSOKIG00005012150) zgc:113054 (ENSOKIG00005012160) mitfa (ENSOKIG00005012208) FRMD4B (ENSOKIG00005012358) arl6ip5a (ENSOKIG00005012491) trnt1 (ENSOKIG00005012500) #16 ENSOKIG00005012512 lrrn1 (ENSOKIG00005012515) #18 setmar (ENSOKIG00005012520) #20 ITPR1 (ENSOKIG00005012584) ##22 bhlhe40 (ENSOKIG00005012956) #23 arl8bb (ENSOKIG00005012969) #24 SEMA3F (ENSOKIG00005013005) camkvb (ENSOKIG00005013204) ENSOKIG00005013243 ENSOKIG00005013248 MST1R (ENSOKIG00005013256) mon1a (ENSOKIG00005013313) ENSOKIG00005013355 grm6b (ENSOKIG00005013474) ##13 comtb (ENSOKIG00005013536) SRPK3 (ENSOKIG00005013561) ccdc120b (ENSOKIG00005013610) mbd1b (ENSOKIG00005013620) cxxc1b (ENSOKIG00005013660) Rainbow trout MODERN SPECIES 8 EIF4E3 (ENSOMYG00000026861) ENSOMYG00000026823 ENSOMYG00000068868 foxp1b (ENSOMYG00000026154) mdfic2 (ENSOMYG00000026023) zgc:113054 (ENSOMYG00000025999) mitfa (ENSOMYG00000025566) ENSOMYG00000049451 FRMD4B (ENSOMYG00000025031) arl6ip5a (ENSOMYG00000024815) trnt1 (ENSOMYG00000024790) #16 ENSOMYG00000024756 lrrn1 (ENSOMYG00000024735) #18 setmar (ENSOMYG00000024725) #20 ENSOMYG00000024717 ITPR1 (ENSOMYG00000023613) ##22 bhlhe40 (ENSOMYG00000022729) #23 arl8bb (ENSOMYG00000022701) #24 ENSOMYG00000022540 camkvb (ENSOMYG00000022384) ENSOMYG00000022319 mon1a (ENSOMYG00000022263) ENSOMYG00000075273 grm6b (ENSOMYG00000021991) ##13 comtb (ENSOMYG00000021878) ENSOMYG00000020776 ccdc120b (ENSOMYG00000020609) mbd1b (ENSOMYG00000020593) cxxc1b (ENSOMYG00000020532) tfe3b (ENSOMYG00000020367) gnl3l (ENSOMYG00000019850) Huchen MODERN SPECIES 664 mdfic2 (ENSHHUG00000017355) zgc:113054 (ENSHHUG00000017316) mitfa (ENSHHUG00000017254) FRMD4B (ENSHHUG00000017226) arl6ip5a (ENSHHUG00000017210) trnt1 (ENSHHUG00000017207) #16 ENSHHUG00000017197 lrrn1 (ENSHHUG00000017192) #18 setmar (ENSHHUG00000017189) #20 ENSHHUG00000017182 ITPR1 (ENSHHUG00000016364) ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183062.a.a.a.a ENSGT00940000162859.o.e ENSGT00940000158065.e ENSGT00390000007605 ENSGT00940000167138.b ENSGT00890000139436.A.a.a ENSGT00940000165920.b.d ENSGT00940000165309.e.b ENSGT00940000156326.a.b.d ENSGT01020000230354.A.a.a.c ENSGT00390000008631.a.o.a.a ENSGT01010000224106 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.d ENSGT00940000157154.d.e #18 ENSGT00940000162663.d #20 ENSGT00940000155071.C.f ##22 ENSGT00940000158384.d.c #23 ENSGT00940000156703.e.a.b ENSGT00940000156468.f.c ENSGT00940000157842.b.f ENSGT00390000006665.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.f ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.a ENSGT00940000157877.b.h.h ENSGT00940000154102.b.a.a.c ENSGT00950000183005.a.a.c ENSGT00730000111044 ENSGT00940000166392.c.b ENSGT00940000157503.i.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000162859.o.e ENSGT00940000158065.e ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a.`b ENSGT00940000167138.b ENSGT00890000139436.A.a.a ENSGT00940000165920.b.d ENSGT00940000165309.e.b ENSGT00940000156326.a.b.d ENSGT01020000230354.A.a.a.c ENSGT00390000008631.a.o.a.a ENSGT01010000224106 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.d ENSGT00940000157154.d.e #18 ENSGT00940000162663.d #20 ENSGT00940000155071.C.f ##22 ENSGT00940000158384.d.c #23 ENSGT00940000156703.e.a.b ENSGT00940000156468.f.c ENSGT00940000157842.b.f ENSGT00390000006665.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.f ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.a ENSGT00940000157877.b.h.h ENSGT00940000154102.b.a.a.c ENSGT00950000183005.a.a.c ENSGT00730000111044 ENSGT00940000166392.c.b ENSGT00940000157503.i.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158065.e ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a.`b ENSGT00940000167138.b ENSGT00890000139436.A.a.a ENSGT00940000165920.b.d ENSGT00940000165309.e.b ENSGT00940000156326.a.b.d ENSGT01020000230354.A.a.a.c ENSGT00390000008631.a.o.a.a ENSGT00390000009678.f #16 ENSGT01010000224106 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.d ENSGT00940000157154.d.e #18 ENSGT00940000162663.d #20 ENSGT00940000155071.C.f ##22 ENSGT00940000158384.d.c #23 ENSGT00940000156703.e.a.b ENSGT00940000156468.f.c ENSGT00940000157842.b.f ENSGT00390000006665.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.f ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.a ENSGT00940000157877.b.h.h ENSGT00940000154102.b.a.a.c ENSGT00950000183005.a.a.c ENSGT00940000166392.c.b ENSGT00940000157503.i.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.b ENSGT00940000161383.d.a.a Atlantic salmon MODERN SPECIES 14 ENSSSAG00000103273 RYBP (ENSSSAG00000105530) prok2 (ENSSSAG00000077791) gpr27 (ENSSSAG00000093272) foxp1b (ENSSSAG00000077820) ENSSSAG00000121941 zgc:113054 (ENSSSAG00000078317) mitfa (ENSSSAG00000078323) FRMD4B (ENSSSAG00000078356) arl6ip5a (ENSSSAG00000098089) trnt1 (ENSSSAG00000078413) #16 ENSSSAG00000087334 ENSSSAG00000078424 lrrn1 (ENSSSAG00000085844) #18 setmar (ENSSSAG00000078434) #20 ENSSSAG00000078769 ##22 BHLH2 (ENSSSAG00000081153) #23 ENSSSAG00000081205 camkvb (ENSSSAG00000095316) ENSSSAG00000081274 ENSSSAG00000117917 ENSSSAG00000081275 mon1a (ENSSSAG00000081282) traip (ENSSSAG00000051195) grm6b (ENSSSAG00000105405) ##13 comtb (ENSSSAG00000095832) ENSSSAG00000081305 ccdc120b (ENSSSAG00000107262) mbd1b (ENSSSAG00000081317) cxxc1b (ENSSSAG00000081321) tfe3b (ENSSSAG00000081340) River trout MODERN SPECIES 7 gxylt2 (ENSSTUG00000035198) shq1 (ENSSTUG00000035153) RYBP (ENSSTUG00000035141) prok2 (ENSSTUG00000035134) gpr27 (ENSSTUG00000035129) foxp1b (ENSSTUG00000034974) zgc:113054 (ENSSTUG00000034952) mitfa (ENSSTUG00000034903) FRMD4B (ENSSTUG00000034835) arl6ip5a (ENSSTUG00000034827) ENSSTUG00000034824 ENSSTUG00000034758 lrrn1 (ENSSTUG00000034747) #18 ENSSTUG00000034740 setmar (ENSSTUG00000034728) #20 ITPR1 (ENSSTUG00000034046) ##22 bhlhe40 (ENSSTUG00000037370) #23 SEMA3F (ENSSTUG00000036160) camkvb (ENSSTUG00000036070) ENSSTUG00000036057 ENSSTUG00000035987 mon1a (ENSSTUG00000035963) traip (ENSSTUG00000035875) grm6b (ENSSTUG00000035821) ##13 comtb (ENSSTUG00000035786) ccdc120b (ENSSTUG00000035764) mbd1b (ENSSTUG00000035673) cxxc1b (ENSSTUG00000035005) tfe3b (ENSSTUG00000034951) ENSSTUG00000034912 HCFC1 (ENSSTUG00000034680) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162859.o.e ENSGT00940000158065.e ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a.`b ENSGT00940000167138.b ENSGT00890000139436.A.a.a ENSGT00940000165920.b.d ENSGT00940000165309.e.b ENSGT00940000156326.a.b.d ENSGT01020000230354.A.a.a.c ENSGT00390000008631.a.o.a.a ENSGT01010000224106 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.d ENSGT00940000157154.d.e #18 ENSGT00940000162663.d #20 ENSGT00940000155071.C.f ##22 ENSGT00940000158384.d.c #23 ENSGT00940000156703.e.a.b ENSGT00940000156468.f.c ENSGT00940000157842.b.f ENSGT00390000006665.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.f ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.a ENSGT00940000157877.b.h.h ENSGT00940000154102.b.a.a.c ENSGT00950000183005.a.a.c ENSGT00730000111044 ENSGT00940000159667.a.f ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000166392.c.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162859.o.e ENSGT00940000158065.e ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a.`b ENSGT00940000167138.b ENSGT00890000139436.A.a.a ENSGT00940000165920.b.d ENSGT00940000165309.e.b ENSGT00940000156326.a.b.d ENSGT01020000230354.A.a.a.c ENSGT00390000008631.a.o.a.a ENSGT01010000224106 ENSGT01050000244882.b.c.a.a.d ENSGT00940000157154.d.e #18 ENSGT00940000162663.d #20 ENSGT00940000155071.C.f ##22 ENSGT00940000158384.d.c #23 ENSGT00940000156703.e.a.b ENSGT00940000156468.f.c ENSGT00940000175393 ENSGT00940000157842.b.f ENSGT00390000006665.a.b ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b.f ##13 ENSGT00940000155317.a.a.q.a ENSGT00940000157877.b.h.h ENSGT00940000154102.b.a.a.c ENSGT00950000183005.a.a.c ENSGT00730000111044 ENSGT00940000166392.c.b ENSGT00940000157503.i.b.c Chinook salmon MODERN SPECIES 31 gxylt2 (ENSOTSG00005029433) shq1 (ENSOTSG00005029435) ENSOTSG00005029445 RYBP (ENSOTSG00005029447) prok2 (ENSOTSG00005029448) gpr27 (ENSOTSG00005029449) foxp1b (ENSOTSG00005029453) zgc:113054 (ENSOTSG00005029466) mitfa (ENSOTSG00005029470) FRMD4B (ENSOTSG00005029474) arl6ip5a (ENSOTSG00005029485) ENSOTSG00005029486 ENSOTSG00005029487 lrrn1 (ENSOTSG00005029488) #18 setmar (ENSOTSG00005029489) #20 ITPR1 (ENSOTSG00005029499) ##22 bhlhe40 (ENSOTSG00005029834) #23 SEMA3F (ENSOTSG00005029841) camkvb (ENSOTSG00005030318) ENSOTSG00005030346 ENSOTSG00005030348 MST1R (ENSOTSG00005030351) mon1a (ENSOTSG00005030356) traip (ENSOTSG00005030396) grm6b (ENSOTSG00005030440) ##13 comtb (ENSOTSG00005030442) SRPK3 (ENSOTSG00005030443) ccdc120b (ENSOTSG00005030445) mbd1b (ENSOTSG00005030447) cxxc1b (ENSOTSG00005030449) tfe3b (ENSOTSG00005030461) Coho salmon MODERN SPECIES 25 pdzrn3b (ENSOKIG00005049640) ppp4r2b (ENSOKIG00005049651) gxylt2 (ENSOKIG00005049658) shq1 (ENSOKIG00005049664) RYBP (ENSOKIG00005049678) prok2 (ENSOKIG00005049681) gpr27 (ENSOKIG00005049684) ENSOKIG00005049689 foxp1b (ENSOKIG00005049705) mitfa (ENSOKIG00005049743) FRMD4B (ENSOKIG00005049789) arl6ip5a (ENSOKIG00005000004) ENSOKIG00005000022 ENSOKIG00005000039 lrrn1 (ENSOKIG00005000048) #18 ITPR1 (ENSOKIG00005000297) ##22 bhlhe40 (ENSOKIG00005000439) #23 SEMA3F (ENSOKIG00005000482) camkvb (ENSOKIG00005000557) ENSOKIG00005000585 ENSOKIG00005000597 ENSOKIG00005000607 ENSOKIG00005000620 mon1a (ENSOKIG00005000633) traip (ENSOKIG00005000674) grm6b (ENSOKIG00005000710) ##13 comtb (ENSOKIG00005000717) SRPK3 (ENSOKIG00005000728) ccdc120b (ENSOKIG00005000738) mbd1b (ENSOKIG00005000756) CXXC1 (ENSOKIG00005000830) Rainbow trout MODERN SPECIES 28 shq1 (ENSOMYG00000017934) ENSOMYG00000077625 RYBP (ENSOMYG00000018018) ENSOMYG00000063847 prok2 (ENSOMYG00000018025) gpr27 (ENSOMYG00000018032) foxp1b (ENSOMYG00000018060) ENSOMYG00000018605 mitfa (ENSOMYG00000018633) FRMD4B (ENSOMYG00000018705) praf3 (ENSOMYG00000018762) ENSOMYG00000018779 lrrn1 (ENSOMYG00000018787) #18 setmar (ENSOMYG00000018797) #20 ENSOMYG00000058313 ENSOMYG00000018924 ##22 ENSOMYG00000019279 bhlhe40 (ENSOMYG00000019293) #23 ENSOMYG00000019619 camkvb (ENSOMYG00000021343) ENSOMYG00000073574 ENSOMYG00000021362 MST1R (ENSOMYG00000021410) mon1a (ENSOMYG00000021436) traip (ENSOMYG00000021463) grm6b (ENSOMYG00000021486) ##13 comtb (ENSOMYG00000021507) ENSOMYG00000021549 ccdc120b (ENSOMYG00000021563) ENSOMYG00000064320 mbd1b (ENSOMYG00000021578) Huchen MODERN SPECIES 341 ENSHHUG00000041849 ENSHHUG00000041852 ENSHHUG00000041856 ENSHHUG00000041860 mitfa (ENSHHUG00000041864) FRMD4B (ENSHHUG00000041948) arl6ip5a (ENSHHUG00000041989) ENSHHUG00000041993 ENSHHUG00000042000 lrrn1 (ENSHHUG00000042003) #18 setmar (ENSHHUG00000042006) #20 ITPR1 (ENSHHUG00000042039) ##22 bhlhe40 (ENSHHUG00000043019) #23 SEMA3F (ENSHHUG00000043022) camkvb (ENSHHUG00000043047) Northern pike MODERN SPECIES 16 gxylt2 (ENSELUG00000003451) shq1 (ENSELUG00000003476) rybpa (ENSELUG00000003503) prok2 (ENSELUG00000003525) EIF4E3 (ENSELUG00000003543) foxp1b (ENSELUG00000003572) mdfic2 (ENSELUG00000003599) zgc:113054 (ENSELUG00000003610) mitfa (ENSELUG00000003651) FRMD4B (ENSELUG00000003740) praf3 (ENSELUG00000003790) trnt1 (ENSELUG00000003802) #16 ENSELUG00000028972 lrrn1 (ENSELUG00000003813) #18 setmar (ENSELUG00000003826) #20 ITPR1 (ENSELUG00000003888) ##22 bhlhe40 (ENSELUG00000001165) #23 arl8bb (ENSELUG00000003984) #24 SEMA3F (ENSELUG00000004030) camkvb (ENSELUG00000004070) ENSELUG00000004107 ENSELUG00000033830 ENSELUG00000004158 mon1a (ENSELUG00000004180) ENSELUG00000004204 grm6b (ENSELUG00000004228) ##13 comtb (ENSELUG00000004237) SRPK3 (ENSELUG00000001310) ccdc120b (ENSELUG00000004322) mbd1b (ENSELUG00000004375) cxxc1b (ENSELUG00000004423) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000181580 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000181580 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000181580 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Climbing perch MODERN SPECIES 18 shq1 (ENSATEG00000008475) RYBP (ENSATEG00000029830) prok2 (ENSATEG00000008492) gpr27 (ENSATEG00000008522) EIF4E3 (ENSATEG00000008530) foxp1b (ENSATEG00000008561) zgc:113054 (ENSATEG00000008721) zgc:113054 (ENSATEG00000008772) mitfa (ENSATEG00000008837) FRMD4B (ENSATEG00000008872) arl6ip5a (ENSATEG00000008916) trnt1 (ENSATEG00000008928) #16 ENSATEG00000008955 lrrn1 (ENSATEG00000008988) #18 setmar (ENSATEG00000008998) #20 ITPR1 (ENSATEG00000009014) ##22 bhlhe40 (ENSATEG00000009176) #23 ENSATEG00000009196 arl8bb (ENSATEG00000028465) #24 ENSATEG00000009213 camkvb (ENSATEG00000009278) ENSATEG00000009407 mon1a (ENSATEG00000009424) traip (ENSATEG00000009440) grm6b (ENSATEG00000009522) ##13 comtb (ENSATEG00000009551) ENSATEG00000009561 ccdc120b (ENSATEG00000009583) mbd1b (ENSATEG00000009608) cxxc1b (ENSATEG00000009642) tfe3b (ENSATEG00000009661) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 gxylt2 (ENSBSLG00000021059) shq1 (ENSBSLG00000021007) rybpa (ENSBSLG00000020783) prok2 (ENSBSLG00000020780) gpr27 (ENSBSLG00000020778) EIF4E3 (ENSBSLG00000020777) foxp1b (ENSBSLG00000020745) zgc:113054 (ENSBSLG00000020737) mitfa (ENSBSLG00000020732) FRMD4B (ENSBSLG00000020719) arl6ip5a (ENSBSLG00000020715) trnt1 (ENSBSLG00000020713) #16 ENSBSLG00000020712 lrrn1 (ENSBSLG00000020709) #18 setmar (ENSBSLG00000020708) #20 ITPR1 (ENSBSLG00000013775) ##22 bhlhe40 (ENSBSLG00000013372) #23 NAAA (ENSBSLG00000013286) arl8bb (ENSBSLG00000013136) #24 SEMA3F (ENSBSLG00000010913) camkvb (ENSBSLG00000010678) ENSBSLG00000010560 mon1a (ENSBSLG00000010555) traip (ENSBSLG00000010544) grm6b (ENSBSLG00000010337) ##13 comtb (ENSBSLG00000010327) SRPK3 (ENSBSLG00000009779) ccdc120b (ENSBSLG00000009387) mbd1b (ENSBSLG00000009328) cxxc1b (ENSBSLG00000008835) tfe3b (ENSBSLG00000008528) Zig-zag eel MODERN SPECIES 19 gxylt2 (ENSMAMG00000023433) shq1 (ENSMAMG00000023432) RYBP (ENSMAMG00000024392) prok2 (ENSMAMG00000023429) gpr27 (ENSMAMG00000023427) EIF4E3 (ENSMAMG00000023426) foxp1b (ENSMAMG00000023423) zgc:113054 (ENSMAMG00000023417) mitfa (ENSMAMG00000023414) FRMD4B (ENSMAMG00000023408) arl6ip5a (ENSMAMG00000023405) trnt1 (ENSMAMG00000023401) #16 ENSMAMG00000023400 lrrn1 (ENSMAMG00000023397) #18 setmar (ENSMAMG00000023395) #20 ITPR1 (ENSMAMG00000023390) ##22 ENSMAMG00000024536 bhlhe40 (ENSMAMG00000023386) #23 ENSMAMG00000023384 ENSMAMG00000023382 arl8bb (ENSMAMG00000027917) #24 ENSMAMG00000023374 camkvb (ENSMAMG00000023367) ENSMAMG00000023360 traip (ENSMAMG00000023357) mon1a (ENSMAMG00000023358) grm6b (ENSMAMG00000023356) ##13 comtb (ENSMAMG00000023349) ENSMAMG00000023345 ccdc120b (ENSMAMG00000024568) ENSMAMG00000027411 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.C ##22 Tongue sole MODERN SPECIES 2 ptpra (ENSCSEG00000017739) gnrh2 (ENSCSEG00000017724) ENSCSEG00000017716 aldh1l1 (ENSCSEG00000017684) ENSCSEG00000017670 MTMR14 (ENSCSEG00000017658) ENSCSEG00000017588 ENSCSEG00000017520 fezf2 (ENSCSEG00000017502) ENSCSEG00000017480 LDLRAD2 (ENSCSEG00000017469) ENSCSEG00000017456 USP48 (ENSCSEG00000017261) setmar (ENSCSEG00000017235) #20 ENSCSEG00000017230 ##22 ENSCSEG00000017181 ##22 hdac11 (ENSCSEG00000017168) ENSCSEG00000017156 ENSCSEG00000017146 IQSEC1 (ENSCSEG00000017123) acad9 (ENSCSEG00000017056) ENSCSEG00000017040 CFAP57 (ENSCSEG00000016999) nuf2 (ENSCSEG00000016956) ap5b1 (ENSCSEG00000016947) zgc:112255 (ENSCSEG00000016938) P3H1 (ENSCSEG00000016927) ENSCSEG00000016925 ##13 nudt3b (ENSCSEG00000016923) rps10 (ENSCSEG00000016916) pacsin1b (ENSCSEG00000016896) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a.n ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Greater amberjack MODERN SPECIES 37 ENSSDUG00000012021 prok2 (ENSSDUG00000012033) gpr27 (ENSSDUG00000012040) EIF4E3 (ENSSDUG00000012045) foxp1b (ENSSDUG00000012073) mdfic2 (ENSSDUG00000012140) zgc:113054 (ENSSDUG00000012153) ENSSDUG00000012183 mitfa (ENSSDUG00000012198) FRMD4B (ENSSDUG00000012222) arl6ip5a (ENSSDUG00000012308) trnt1 (ENSSDUG00000012320) #16 ENSSDUG00000012333 lrrn1 (ENSSDUG00000012348) #18 setmar (ENSSDUG00000012353) #20 ITPR1 (ENSSDUG00000012375) ##22 bhlhe40 (ENSSDUG00000012494) #23 NAAA (ENSSDUG00000012503) arl8bb (ENSSDUG00000012529) #24 ENSSDUG00000012547 SEMA3F (ENSSDUG00000012565) camkvb (ENSSDUG00000012707) MST1R (ENSSDUG00000012803) mon1a (ENSSDUG00000012873) traip (ENSSDUG00000012887) grm6b (ENSSDUG00000012908) ##13 comtb (ENSSDUG00000012936) SRPK3 (ENSSDUG00000012949) ccdc120b (ENSSDUG00000012978) mbd1b (ENSSDUG00000012996) cxxc1b (ENSSDUG00000013022) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2631 mitfa (ENSSLDG00000009140) FRMD4B (ENSSLDG00000009202) arl6ip5a (ENSSLDG00000009316) trnt1 (ENSSLDG00000009325) #16 ENSSLDG00000009355 lrrn1 (ENSSLDG00000009364) #18 setmar (ENSSLDG00000009370) #20 ITPR1 (ENSSLDG00000009407) ##22 bhlhe40 (ENSSLDG00000009545) #23 NAAA (ENSSLDG00000009564) arl8bb (ENSSLDG00000009588) #24 SEMA3F (ENSSLDG00000009613) camkvb (ENSSLDG00000009673) MST1R (ENSSLDG00000009798) mon1a (ENSSLDG00000009834) traip (ENSSLDG00000009865) grm6b (ENSSLDG00000009921) ##13 comtb (ENSSLDG00000009969) ENSSLDG00000009983 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 150 shq1 (ENSLCAG00010025985) rybpa (ENSLCAG00010025986) prok2 (ENSLCAG00010025987) gpr27 (ENSLCAG00010025988) EIF4E3 (ENSLCAG00010025989) foxp1b (ENSLCAG00010026063) mdfic2 (ENSLCAG00010026283) zgc:113054 (ENSLCAG00010026285) mitfa (ENSLCAG00010026304) FRMD4B (ENSLCAG00010026341) arl6ip5a (ENSLCAG00010026345) trnt1 (ENSLCAG00010026346) #16 ENSLCAG00010026347 lrrn1 (ENSLCAG00010026349) #18 setmar (ENSLCAG00010026350) #20 ITPR1 (ENSLCAG00010026357) ##22 Barramundi perch MODERN SPECIES 1905 ENSLCAG00010027368 ##22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000178117 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162859.o ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000155198.A ##14 ENSGT00940000165371.a ENSGT00940000167414.f ENSGT00940000164786.a ENSGT00940000158442 ENSGT01100000263545.a.b.c.a ENSGT00940000165667 ENSGT00940000169850 ENSGT00390000002635 ENSGT00940000156091.b ENSGT00390000011581.c ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Fugu MODERN SPECIES 10 ppp4r2b (ENSTRUG00000009646) pdzrn3b (ENSTRUG00000009749) ENSTRUG00000009896 ##14 ENSTRUG00000010466 ENSTRUG00000011022 cntn4 (ENSTRUG00000011158) ENSTRUG00000015256 cdk5rap1 (ENSTRUG00000015201) ENSTRUG00000022153 rpn2 (ENSTRUG00000014997) mybl2b (ENSTRUG00000021040) ift52 (ENSTRUG00000014953) ENSTRUG00000027705 lrrn1 (ENSTRUG00000014946) #18 setmar (ENSTRUG00000021227) #20 ITPR1 (ENSTRUG00000023819) ##22 bhlhe40 (ENSTRUG00000020385) #23 NAAA (ENSTRUG00000014493) arl8bb (ENSTRUG00000011496) #24 SEMA3F (ENSTRUG00000014242) camkvb (ENSTRUG00000014152) ENSTRUG00000013975 mon1a (ENSTRUG00000013941) traip (ENSTRUG00000013872) grm6b (ENSTRUG00000013670) ##13 comtb (ENSTRUG00000013666) SRPK3 (ENSTRUG00000029636) ccdc120b (ENSTRUG00000013456) mbd1b (ENSTRUG00000013422) cxxc1b (ENSTRUG00000013293) tfe3b (ENSTRUG00000013198) Tetraodon MODERN SPECIES 2 shq1 (ENSTNIG00000007354) gxylt2 (ENSTNIG00000007353) ppp4r2b (ENSTNIG00000007352) pdzrn3b (ENSTNIG00000007351) ENSTNIG00000007350 ##14 ENSTNIG00000007349 ENSTNIG00000007348 cntn4 (ENSTNIG00000007347) EPB41L1 (ENSTNIG00000007346) ENSTNIG00000007345 cdk5rap1 (ENSTNIG00000007344) ENSTNIG00000007343 rpn2 (ENSTNIG00000007342) mybl2b (ENSTNIG00000007341) lrrn1 (ENSTNIG00000007340) #18 ITPR1 (ENSTNIG00000007339) ##22 bhlhe40 (ENSTNIG00000007338) #23 NAAA (ENSTNIG00000007337) arl8bb (ENSTNIG00000007336) #24 SEMA3F (ENSTNIG00000007335) camkvb (ENSTNIG00000007334) MST1R (ENSTNIG00000007333) mon1a (ENSTNIG00000007332) traip (ENSTNIG00000007331) grm6b (ENSTNIG00000007330) ##13 comtb (ENSTNIG00000007329) SRPK3 (ENSTNIG00000007328) ccdc120b (ENSTNIG00000007327) ENSTNIG00000007326 cxxc1b (ENSTNIG00000007325) tfe3b (ENSTNIG00000007324) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000178117 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Ballan wrasse MODERN SPECIES 61 foxp1b (ENSLBEG00000019691) zgc:113054 (ENSLBEG00000019640) ENSLBEG00000019618 mitfa (ENSLBEG00000019594) FRMD4B (ENSLBEG00000019520) arl6ip5a (ENSLBEG00000019488) trnt1 (ENSLBEG00000019457) #16 ENSLBEG00000019439 lrrn1 (ENSLBEG00000019424) #18 setmar (ENSLBEG00000019413) #20 ITPR1 (ENSLBEG00000019256) ##22 bhlhe40 (ENSLBEG00000019219) #23 NAAA (ENSLBEG00000019157) arl8bb (ENSLBEG00000019016) #24 SEMA3F (ENSLBEG00000018957) camkvb (ENSLBEG00000018889) MST1R (ENSLBEG00000018750) mon1a (ENSLBEG00000018702) traip (ENSLBEG00000018662) grm6b (ENSLBEG00000018623) ##13 comtb (ENSLBEG00000018603) SRPK3 (ENSLBEG00000018572) ccdc120b (ENSLBEG00000018545) ENSLBEG00000018506 cxxc1b (ENSLBEG00000018337) tfe3b (ENSLBEG00000018288) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000178117 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000178117 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b European seabass MODERN SPECIES 10 shq1 (ENSDLAG00005029441) RYBP (ENSDLAG00005024156) prok2 (ENSDLAG00005024161) EIF4E3 (ENSDLAG00005027715) gpr27 (ENSDLAG00005024164) foxp1b (ENSDLAG00005024201) ENSDLAG00005024437 zgc:113054 (ENSDLAG00005024440) ENSDLAG00005028768 mitfa (ENSDLAG00005024449) FRMD4B (ENSDLAG00005024483) arl6ip5a (ENSDLAG00005024563) trnt1 (ENSDLAG00005026509) #16 LRRN1 (ENSDLAG00005032471) #18 setmar (ENSDLAG00005032118) #20 ITPR1 (ENSDLAG00005024685) ##22 bhlhe40 (ENSDLAG00005025285) #23 ENSDLAG00005025286 ARL8B (ENSDLAG00005034963) #24 ENSDLAG00005025304 CAMKV (ENSDLAG00005025437) ENSDLAG00005025454 traip (ENSDLAG00005025462) grm6b (ENSDLAG00005025480) ##13 ENSDLAG00005025559 ccdc120b (ENSDLAG00005025677) mbd1b (ENSDLAG00005025679) ENSDLAG00005025682 tfe3b (ENSDLAG00005025703) gnl3l (ENSDLAG00005025705) opn1lw1 (ENSDLAG00005025724) Large yellow croaker MODERN SPECIES SLC26A2 (ENSLCRG00005022159) HTR4 (ENSLCRG00005022161) lman2 (ENSLCRG00005022165) SLITRK4 (ENSLCRG00005022181) IQSEC1 (ENSLCRG00005022191) acad9 (ENSLCRG00005022380) ENSLCRG00005022410 EFCC1 (ENSLCRG00005022411) CFAP57 (ENSLCRG00005022412) nuf2 (ENSLCRG00005022415) FRMD4B (ENSLCRG00005022417) arl6ip5a (ENSLCRG00005022419) trnt1 (ENSLCRG00005022420) #16 ENSLCRG00005022421 setmar (ENSLCRG00005022422) #20 ITPR1 (ENSLCRG00005022437) ##22 bhlhe40 (ENSLCRG00005022605) #23 NAAA (ENSLCRG00005022608) ENSLCRG00005022610 arl8bb (ENSLCRG00005022612) #24 ENSLCRG00005022615 SEMA3F (ENSLCRG00005022633) camkvb (ENSLCRG00005022967) ENSLCRG00005022968 mon1a (ENSLCRG00005022969) traip (ENSLCRG00005022970) grm6b (ENSLCRG00005022971) ##13 comtb (ENSLCRG00005023001) SRPK3 (ENSLCRG00005000084) ccdc120b (ENSLCRG00005000159) mbd1b (ENSLCRG00005000194) Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 shq1 (ENSSAUG00010020992) rybpa (ENSSAUG00010020990) prok2 (ENSSAUG00010020989) gpr27 (ENSSAUG00010020987) EIF4E3 (ENSSAUG00010020986) foxp1b (ENSSAUG00010020403) ENSSAUG00010020379 zgc:113054 (ENSSAUG00010020378) mitfa (ENSSAUG00010020177) FRMD4B (ENSSAUG00010020175) arl6ip5a (ENSSAUG00010020174) trnt1 (ENSSAUG00010020172) #16 ENSSAUG00010020169 lrrn1 (ENSSAUG00010020168) #18 setmar (ENSSAUG00010020167) #20 ITPR1 (ENSSAUG00010018947) ##22 bhlhe40 (ENSSAUG00010018934) #23 ENSSAUG00010018932 arl8bb (ENSSAUG00010018930) #24 SEMA3F (ENSSAUG00010017498) camkvb (ENSSAUG00010017420) ENSSAUG00010017412 mon1a (ENSSAUG00010017406) traip (ENSSAUG00010017395) grm6b (ENSSAUG00010017188) ##13 comtb (ENSSAUG00010017170) SRPK3 (ENSSAUG00010014567) ccdc120b (ENSSAUG00010014546) mbd1b (ENSSAUG00010014539) cxxc1b (ENSSAUG00010014492) tfe3b (ENSSAUG00010014478) Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000181969 Stickleback MODERN SPECIES 17 gxylt2 (ENSGACG00000011788) shq1 (ENSGACG00000011797) RYBP (ENSGACG00000011809) prok2 (ENSGACG00000011815) gpr27 (ENSGACG00000011823) EIF4E3 (ENSGACG00000011825) foxp1b (ENSGACG00000011839) zgc:113054 (ENSGACG00000011845) ENSGACG00000011871 mitfa (ENSGACG00000011875) FRMD4B (ENSGACG00000011892) arl6ip5a (ENSGACG00000011898) trnt1 (ENSGACG00000011903) #16 lrrn1 (ENSGACG00000011915) #18 setmar (ENSGACG00000011919) #20 ITPR1 (ENSGACG00000011921) ##22 bhlhe40 (ENSGACG00000011940) #23 ENSGACG00000011962 NAAA (ENSGACG00000011964) arl8bb (ENSGACG00000011972) #24 SEMA3F (ENSGACG00000011989) camkvb (ENSGACG00000011998) ENSGACG00000012007 mon1a (ENSGACG00000012037) traip (ENSGACG00000012044) grm6b (ENSGACG00000012070) ##13 comtb (ENSGACG00000012090) SRPK3 (ENSGACG00000012098) ccdc120b (ENSGACG00000012102) ENSGACG00000012106 cxxc1b (ENSGACG00000012117) Lumpfish MODERN SPECIES 20 gxylt2 (ENSCLMG00005020518) shq1 (ENSCLMG00005020519) rybpa (ENSCLMG00005020520) prok2 (ENSCLMG00005020521) gpr27 (ENSCLMG00005020522) EIF4E3 (ENSCLMG00005000065) foxp1b (ENSCLMG00005000158) zgc:113054 (ENSCLMG00005000299) mitfa (ENSCLMG00005000306) FRMD4B (ENSCLMG00005000334) arl6ip5a (ENSCLMG00005000354) trnt1 (ENSCLMG00005000360) #16 ENSCLMG00005000366 lrrn1 (ENSCLMG00005000418) #18 setmar (ENSCLMG00005000422) #20 ENSCLMG00005000519 ##22 bhlhe40 (ENSCLMG00005003585) #23 ENSCLMG00005003609 MX1 (ENSCLMG00005007189) thoc7 (ENSCLMG00005007730) ATXN7 (ENSCLMG00005007731) psmd6 (ENSCLMG00005007733) slc2a9l1 (ENSCLMG00005007738) prickle2b (ENSCLMG00005007739) ADAMTS9 (ENSCLMG00005007866) magi1b (ENSCLMG00005007870) slc25a26 (ENSCLMG00005007874) ENSCLMG00005007876 ENSCLMG00005007877 LRIG1 (ENSCLMG00005007878) kbtbd8 (ENSCLMG00005007999) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a Pike perch MODERN SPECIES 11 gxylt2 (ENSSLUG00000010399) shq1 (ENSSLUG00000010395) rybpa (ENSSLUG00000010391) prok2 (ENSSLUG00000010387) gpr27 (ENSSLUG00000010385) EIF4E3 (ENSSLUG00000010383) foxp1b (ENSSLUG00000010380) zgc:113054 (ENSSLUG00000010375) mitfa (ENSSLUG00000010357) FRMD4B (ENSSLUG00000010314) arl6ip5a (ENSSLUG00000010291) trnt1 (ENSSLUG00000010274) #16 ENSSLUG00000010265 lrrn1 (ENSSLUG00000010263) #18 setmar (ENSSLUG00000010262) #20 ITPR1 (ENSSLUG00000007574) ##22 bhlhe40 (ENSSLUG00000007397) #23 NAAA (ENSSLUG00000007391) arl8bb (ENSSLUG00000007380) #24 SEMA3F (ENSSLUG00000005295) camkvb (ENSSLUG00000005084) ENSSLUG00000022410 mon1a (ENSSLUG00000022403) traip (ENSSLUG00000022387) grm6b (ENSSLUG00000022374) ##13 comtb (ENSSLUG00000022361) SRPK3 (ENSSLUG00000022192) ccdc120b (ENSSLUG00000022153) mbd1b (ENSSLUG00000022140) CXXC1 (ENSSLUG00000022049) tfe3b (ENSSLUG00000022004) Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 NXPE3 (ENSCGOG00000020414) ENSCGOG00000020418 ENSCGOG00000020419 prok2 (ENSCGOG00000020420) gpr27 (ENSCGOG00000020421) EIF4E3 (ENSCGOG00000020423) foxp1b (ENSCGOG00000020445) zgc:113054 (ENSCGOG00000021042) mitfa (ENSCGOG00000021055) FRMD4B (ENSCGOG00000021135) arl6ip5a (ENSCGOG00000021199) trnt1 (ENSCGOG00000021203) #16 ENSCGOG00000021223 lrrn1 (ENSCGOG00000021224) #18 setmar (ENSCGOG00000021226) #20 ITPR1 (ENSCGOG00000021328) ##22 ENSCGOG00000023674 bhlhe40 (ENSCGOG00000023677) #23 NAAA (ENSCGOG00000023679) arl8bb (ENSCGOG00000023683) #24 SEMA3F (ENSCGOG00000000535) camkvb (ENSCGOG00000000660) ENSCGOG00000000720 mon1a (ENSCGOG00000000725) traip (ENSCGOG00000000727) grm6b (ENSCGOG00000000769) ##13 comtb (ENSCGOG00000000932) SRPK3 (ENSCGOG00000000936) ccdc120b (ENSCGOG00000000963) ENSCGOG00000000965 ENSCGOG00000000992 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000181580 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000181580 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000181580 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h.c ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000181580 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h.c ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000007605 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000181580 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000163250.B.b.a.a ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h.c ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a Clown anemonefish MODERN SPECIES 1008 lrrn1 (ENSAOCG00000024471) #18 setmar (ENSAOCG00000024469) #20 ITPR1 (ENSAOCG00000024461) ##22 ENSAOCG00000024439 bhlhe40 (ENSAOCG00000001778) #23 NAAA (ENSAOCG00000024424) ENSAOCG00000024421 arl8bb (ENSAOCG00000024419) #24 SEMA3F (ENSAOCG00000024410) Orange clownfish MODERN SPECIES 20 gxylt2 (ENSAPEG00000021661) shq1 (ENSAPEG00000021686) rybpa (ENSAPEG00000021704) prok2 (ENSAPEG00000021745) gpr27 (ENSAPEG00000021757) EIF4E3 (ENSAPEG00000021766) foxp1b (ENSAPEG00000021804) zgc:113054 (ENSAPEG00000021963) mitfa (ENSAPEG00000022061) FRMD4B (ENSAPEG00000022527) arl6ip5a (ENSAPEG00000022602) trnt1 (ENSAPEG00000022627) #16 ENSAPEG00000022640 lrrn1 (ENSAPEG00000022732) #18 setmar (ENSAPEG00000022737) #20 ITPR1 (ENSAPEG00000022750) ##22 ENSAPEG00000022812 bhlhe40 (ENSAPEG00000022818) #23 ENSAPEG00000022832 ENSAPEG00000022852 arl8bb (ENSAPEG00000022867) #24 SEMA3F (ENSAPEG00000022941) camkvb (ENSAPEG00000022969) ENSAPEG00000022994 mon1a (ENSAPEG00000023054) traip (ENSAPEG00000023069) grm6b (ENSAPEG00000023124) ##13 comtb (ENSAPEG00000023151) SRPK3 (ENSAPEG00000023166) ccdc120b (ENSAPEG00000023200) mbd1b (ENSAPEG00000023230) Spiny chromis MODERN SPECIES 5 gxylt2 (ENSAPOG00000014376) shq1 (ENSAPOG00000000397) rybpa (ENSAPOG00000014342) prok2 (ENSAPOG00000014310) gpr27 (ENSAPOG00000014287) EIF4E3 (ENSAPOG00000014276) foxp1b (ENSAPOG00000014209) zgc:113054 (ENSAPOG00000013829) mitfa (ENSAPOG00000013777) FRMD4B (ENSAPOG00000013741) arl6ip5a (ENSAPOG00000013701) trnt1 (ENSAPOG00000013687) #16 ENSAPOG00000013653 lrrn1 (ENSAPOG00000013646) #18 setmar (ENSAPOG00000013638) #20 ITPR1 (ENSAPOG00000013619) ##22 bhlhe40 (ENSAPOG00000013386) #23 NAAA (ENSAPOG00000013354) arl8bb (ENSAPOG00000013328) #24 SEMA3F (ENSAPOG00000013275) camkvb (ENSAPOG00000013178) ENSAPOG00000013161 mon1a (ENSAPOG00000000350) traip (ENSAPOG00000013037) grm6b (ENSAPOG00000012948) ##13 comtb (ENSAPOG00000012877) SRPK3 (ENSAPOG00000012864) ccdc120b (ENSAPOG00000012838) mbd1b (ENSAPOG00000012810) cxxc1b (ENSAPOG00000012779) tfe3b (ENSAPOG00000012695) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 386 prok2 (ENSSPAG00000021249) gpr27 (ENSSPAG00000021244) EIF4E3 (ENSSPAG00000021234) foxp1b (ENSSPAG00000021219) zgc:113054 (ENSSPAG00000021191) ENSSPAG00000021184 mitfa (ENSSPAG00000021146) FRMD4B (ENSSPAG00000021053) arl6ip5a (ENSSPAG00000021027) trnt1 (ENSSPAG00000021005) #16 ENSSPAG00000020992 lrrn1 (ENSSPAG00000020983) #18 setmar (ENSSPAG00000020978) #20 ITPR1 (ENSSPAG00000020866) ##22 bhlhe40 (ENSSPAG00000020842) #23 NAAA (ENSSPAG00000020825) arl8bb (ENSSPAG00000020792) #24 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 1043 setmar (ENSACIG00000009270) #20 ITPR1 (ENSACIG00000009297) ##22 ENSACIG00000009395 ENSACIG00000009416 ##22 bhlhe40 (ENSACIG00000009498) #23 NAAA (ENSACIG00000009524) arl8bb (ENSACIG00000009595) #24 SEMA3F (ENSACIG00000009744) camkvb (ENSACIG00000009801) MST1R (ENSACIG00000009876) mon1a (ENSACIG00000009986) traip (ENSACIG00000010020) grm6b (ENSACIG00000010172) ##13 comtb (ENSACIG00000010204) SRPK3 (ENSACIG00000010338) ccdc120b (ENSACIG00000010542) mbd1b (ENSACIG00000010590) cxxc1b (ENSACIG00000010624) tfe3b (ENSACIG00000010840) Midas cichlid MODERN SPECIES 1043 setmar (ENSACIG00000009270) #20 ITPR1 (ENSACIG00000009297) ##22 ENSACIG00000009395 ENSACIG00000009416 ##22 bhlhe40 (ENSACIG00000009498) #23 NAAA (ENSACIG00000009524) arl8bb (ENSACIG00000009595) #24 SEMA3F (ENSACIG00000009744) camkvb (ENSACIG00000009801) MST1R (ENSACIG00000009876) mon1a (ENSACIG00000009986) traip (ENSACIG00000010020) grm6b (ENSACIG00000010172) ##13 comtb (ENSACIG00000010204) SRPK3 (ENSACIG00000010338) ccdc120b (ENSACIG00000010542) mbd1b (ENSACIG00000010590) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000179368 ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00730000111641.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000179368 ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Eastern happy MODERN SPECIES 17 prok2 (ENSACLG00000023039) gpr27 (ENSACLG00000023012) EIF4E3 (ENSACLG00000022985) foxp1b (ENSACLG00000022616) mdfic2 (ENSACLG00000022587) zgc:113054 (ENSACLG00000022547) ENSACLG00000022536 mitfa (ENSACLG00000022427) FRMD4B (ENSACLG00000022299) arl6ip5a (ENSACLG00000022278) trnt1 (ENSACLG00000022227) #16 ENSACLG00000022206 ENSACLG00000022197 lrrn1 (ENSACLG00000022186) #18 setmar (ENSACLG00000022175) #20 ITPR1 (ENSACLG00000021949) ##22 bhlhe40 (ENSACLG00000021923) #23 ENSACLG00000021909 arl8bb (ENSACLG00000021872) #24 ENSACLG00000021860 SEMA3F (ENSACLG00000021730) ENSACLG00000021691 camkvb (ENSACLG00000021669) ENSACLG00000021639 mon1a (ENSACLG00000021606) traip (ENSACLG00000021544) grm6b (ENSACLG00000021488) ##13 comtb (ENSACLG00000021475) SRPK3 (ENSACLG00000021452) ccdc120b (ENSACLG00000021415) ENSACLG00000021406 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 shq1 (ENSMZEG00005008649) rybpa (ENSMZEG00005008698) prok2 (ENSMZEG00005008722) gpr27 (ENSMZEG00005008748) EIF4E3 (ENSMZEG00005008767) foxp1b (ENSMZEG00005008804) mdfic2 (ENSMZEG00005008892) zgc:113054 (ENSMZEG00005008911) mitfa (ENSMZEG00005008959) FRMD4B (ENSMZEG00005009091) arl6ip5a (ENSMZEG00005009134) trnt1 (ENSMZEG00005009141) #16 ENSMZEG00005009157 lrrn1 (ENSMZEG00005009199) #18 setmar (ENSMZEG00005009204) #20 ITPR1 (ENSMZEG00005009223) ##22 bhlhe40 (ENSMZEG00005009312) #23 ENSMZEG00005009336 ENSMZEG00005009383 ENSMZEG00005009393 ENSMZEG00005009403 ENSMZEG00005009430 chchd4a (ENSMZEG00005009465) SEC61A1 (ENSMZEG00005009480) ENSMZEG00005009503 ENSMZEG00005009517 ENSMZEG00005009526 ENSMZEG00005009538 ENSMZEG00005009568 ZMYND8 (ENSMZEG00005009629) NCOA3 (ENSMZEG00005009704) P. nyererei MODERN SPECIES 316 shq1 (ENSPNYG00000003878) rybpa (ENSPNYG00000003852) prok2 (ENSPNYG00000003818) gpr27 (ENSPNYG00000003739) EIF4E3 (ENSPNYG00000003711) foxp1b (ENSPNYG00000003448) mdfic2 (ENSPNYG00000003404) zgc:113054 (ENSPNYG00000003372) mitfa (ENSPNYG00000003348) FRMD4B (ENSPNYG00000003194) arl6ip5a (ENSPNYG00000003159) trnt1 (ENSPNYG00000003120) #16 ENSPNYG00000003083 lrrn1 (ENSPNYG00000003065) #18 setmar (ENSPNYG00000003058) #20 ITPR1 (ENSPNYG00000002900) ##22 bhlhe40 (ENSPNYG00000002765) #23 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 819 mitfa (ENSHBUG00000002744) FRMD4B (ENSHBUG00000002761) arl6ip5a (ENSHBUG00000002781) trnt1 (ENSHBUG00000002797) #16 ENSHBUG00000002807 lrrn1 (ENSHBUG00000002813) #18 setmar (ENSHBUG00000002829) #20 ITPR1 (ENSHBUG00000002972) ##22 bhlhe40 (ENSHBUG00000003130) #23 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 296 shq1 (ENSNBRG00000024004) rybpa (ENSNBRG00000023999) prok2 (ENSNBRG00000023996) gpr27 (ENSNBRG00000023989) EIF4E3 (ENSNBRG00000023984) foxp1b (ENSNBRG00000023949) zgc:113054 (ENSNBRG00000023930) ENSNBRG00000023889 mitfa (ENSNBRG00000023738) FRMD4B (ENSNBRG00000023651) arl6ip5a (ENSNBRG00000023616) trnt1 (ENSNBRG00000023606) #16 ENSNBRG00000023604 lrrn1 (ENSNBRG00000023596) #18 setmar (ENSNBRG00000023590) #20 ITPR1 (ENSNBRG00000023567) ##22 BHLHE40 (ENSNBRG00000023554) #23 ENSNBRG00000023549 arl8bb (ENSNBRG00000023542) #24 SEMA3F (ENSNBRG00000023532) camkvb (ENSNBRG00000023513) ENSNBRG00000023505 traip (ENSNBRG00000023496) grm6b (ENSNBRG00000023489) ##13 comtb (ENSNBRG00000023483) ENSNBRG00000023479 ccdc120b (ENSNBRG00000023464) cxxc1b (ENSNBRG00000023408) tfe3b (ENSNBRG00000023362) gnl3l (ENSNBRG00000023334) opn1lw1 (ENSNBRG00000023323) Nile tilapia MODERN SPECIES 17 prok2 (ENSONIG00000030565) gpr27 (ENSONIG00000040990) EIF4E3 (ENSONIG00000020266) foxp1b (ENSONIG00000020267) mdfic2 (ENSONIG00000035668) zgc:113054 (ENSONIG00000020268) ddx4 (ENSONIG00000030953) ENSONIG00000041875 mitfa (ENSONIG00000020270) FRMD4B (ENSONIG00000020271) arl6ip5a (ENSONIG00000029243) trnt1 (ENSONIG00000020273) #16 ENSONIG00000020274 lrrn1 (ENSONIG00000020810) #18 setmar (ENSONIG00000020275) #20 ITPR1 (ENSONIG00000020276) ##22 bhlhe40 (ENSONIG00000020277) #23 NAAA (ENSONIG00000020278) arl8bb (ENSONIG00000020279) #24 ENSONIG00000028560 SEMA3F (ENSONIG00000020280) camkvb (ENSONIG00000036268) ENSONIG00000020282 mon1a (ENSONIG00000020283) traip (ENSONIG00000020284) grm6b (ENSONIG00000020285) ##13 comtb (ENSONIG00000020286) SRPK3 (ENSONIG00000020287) ccdc120b (ENSONIG00000020288) cxxc1b (ENSONIG00000020290) tfe3b (ENSONIG00000020291) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000178117 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000181969 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000182939.b.a.a ENSGT00940000165705 ENSGT00950000183042.a.a ENSGT00940000166776.d ENSGT00940000159482 ENSGT00530000063320.A.i ENSGT00940000158900 ENSGT00940000166195 ENSGT00940000153414.B ENSGT00940000156266 ENSGT00940000158624 ENSGT00940000158725 ENSGT00390000003084 ENSGT00530000064721 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000161847.b.a.e.a.a ENSGT00390000000724.c.a ENSGT00390000001912.f ENSGT00950000183127.c.b.d.a.a.a.b ENSGT00940000177309 ENSGT00940000154663.a.b ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000156915.f.b ENSGT00940000156308 ENSGT00940000156047.a ENSGT00940000158523.c.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182939.b.a.a ENSGT00940000165705 ENSGT00950000183042.a.a ENSGT00940000166776.d ENSGT00940000159482 ENSGT00530000063320.A.i ENSGT00940000158900 ENSGT00940000166195 ENSGT00940000153414.B ENSGT00940000156266 ENSGT00940000158624 ENSGT00940000158725 ENSGT00390000003084 ENSGT00530000064721 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000161847.b.a.e.a.a ENSGT00390000000724.c.a ENSGT00390000001912.f ENSGT00950000183127.c.b.d.a.a.a.b ENSGT00940000177309 ENSGT00940000154663.a.b ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000156915.f.b ENSGT00940000156308.d ENSGT00940000156047.a ENSGT00940000158523.c.b Indian medaka MODERN SPECIES 8 kifc1 (ENSOMEG00000001064) znf384a (ENSOMEG00000001063) FLOT1 (ENSOMEG00000001061) ENSOMEG00000001060 ENSOMEG00000001058 ENSOMEG00000001057 ENSOMEG00000001055 ENSOMEG00000001054 nucks1a (ENSOMEG00000001053) ENSOMEG00000023838 cldn19 (ENSOMEG00000023840) P3H1 (ENSOMEG00000023842) zgc:112255 (ENSOMEG00000023844) ap5b1 (ENSOMEG00000023845) setmar (ENSOMEG00000023847) #20 ITPR1 (ENSOMEG00000023848) ##22 ENSOMEG00000023852 bhlhe40 (ENSOMEG00000023854) #23 ENSOMEG00000023855 arl8bb (ENSOMEG00000023857) #24 ENSOMEG00000023858 PMEPA1 (ENSOMEG00000023859) pck1 (ENSOMEG00000023861) ENSOMEG00000023864 ENSOMEG00000023865 ENSOMEG00000023866 ENSOMEG00000023867 ahcy (ENSOMEG00000023869) IQSEC1 (ENSOMEG00000023875) ENSOMEG00000023879 hdac11 (ENSOMEG00000023880) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182939.b.a.a ENSGT00940000165705 ENSGT00950000183042.a.a ENSGT00940000166776.d ENSGT00940000159482 ENSGT00530000063320.A.i ENSGT00940000158900 ENSGT00940000166195 ENSGT00940000153414.B ENSGT00940000156266 ENSGT00940000158624 ENSGT00940000158725 ENSGT00390000003084 ENSGT00530000064721 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000161847.b.a.e.a.a ENSGT00390000000724.c.a ENSGT00390000001912.f ENSGT00950000183127.c.b.d.a.a.a.b.e ENSGT00940000154663.a.b ENSGT00950000182981.a ENSGT00940000156915.f.b ENSGT00940000156308 ENSGT00940000156047.a ENSGT00940000158523.c.b ENSGT00940000164549.a.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 ENSORLG00000023213 slc41a1 (ENSORLG00000023129) ENSORLG00000012126 CDK18 (ENSORLG00000012176) mfsd4aa (ENSORLG00000012208) elk4 (ENSORLG00000012230) ENSORLG00000012237 ENSORLG00000024522 nucks1a (ENSORLG00000012276) ENSORLG00000012405 cldn19 (ENSORLG00000012418) P3H1 (ENSORLG00000012560) zgc:112255 (ENSORLG00000012573) ap5b1 (ENSORLG00000012579) setmar (ENSORLG00000028716) #20 ITPR1 (ENSORLG00000012718) ##22 ENSORLG00000030408 dec1a (ENSORLG00000022966) #23 ENSORLG00000012763 ARL8B (ENSORLG00000012782) #24 ENSORLG00000012794 pmepa1 (ENSORLG00000012800) ENSORLG00000012826 ENSORLG00000012822 ENSORLG00000012843 ahcy (ENSORLG00000012859) IQSEC1 (ENSORLG00000012890) ENSORLG00000024878 hdac11 (ENSORLG00000012909) FBLN2 (ENSORLG00000012935) wnt7aa (ENSORLG00000025013) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000178117 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 139 lrrn1 (ENSKMAG00000020176) #18 setmar (ENSKMAG00000020186) #20 ITPR1 (ENSKMAG00000020220) ##22 bhlhe40 (ENSKMAG00000020298) #23 ENSKMAG00000020310 arl8bb (ENSKMAG00000020329) #24 SEMA3F (ENSKMAG00000020412) camkvb (ENSKMAG00000020494) ENSKMAG00000020521 mon1a (ENSKMAG00000020581) traip (ENSKMAG00000020606) grm6b (ENSKMAG00000020636) ##13 comtb (ENSKMAG00000020662) ENSKMAG00000020685 SRPK3 (ENSKMAG00000020698) ccdc120b (ENSKMAG00000020721) mbd1b (ENSKMAG00000020760) cxxc1b (ENSKMAG00000020802) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000178117 ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00940000175464 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A.k ENSGT00530000063548.A.l ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000167138 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000155865.c.b ENSGT00940000165920.b ENSGT00940000165309 ENSGT00390000011238 ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00940000175464 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A.k ENSGT00530000063548.A.l ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 Mummichog MODERN SPECIES 313 gpr27 (ENSFHEG00000017617) EIF4E3 (ENSFHEG00000017632) foxp1b (ENSFHEG00000017865) zgc:113054 (ENSFHEG00000017918) ENSFHEG00000017933 mitfa (ENSFHEG00000019131) ENSFHEG00000019182 FRMD4B (ENSFHEG00000019218) arl6ip5a (ENSFHEG00000019240) ENSFHEG00000019257 trnt1 (ENSFHEG00000019294) #16 ENSFHEG00000019322 ENSFHEG00000019332 lrrn1 (ENSFHEG00000019336) #18 setmar (ENSFHEG00000019347) #20 ITPR1 (ENSFHEG00000019522) ##22 bhlhe40 (ENSFHEG00000019542) #23 NAAA (ENSFHEG00000019547) ENSFHEG00000019555 arl8bb (ENSFHEG00000019579) #24 ENSFHEG00000019608 SEMA3F (ENSFHEG00000019657) camkvb (ENSFHEG00000019743) ENSFHEG00000019818 mon1a (ENSFHEG00000019845) traip (ENSFHEG00000019960) grm6b (ENSFHEG00000019995) ##13 comtb (ENSFHEG00000020002) ENSFHEG00000020017 ccdc120b (ENSFHEG00000020101) mbd1b (ENSFHEG00000020120) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 163 ENSCVAG00000020009 EIF4E3 (ENSCVAG00000020000) foxp1b (ENSCVAG00000019977) zgc:113054 (ENSCVAG00000019960) ENSCVAG00000019895 mitfa (ENSCVAG00000019875) FRMD4B (ENSCVAG00000019832) arl6ip5a (ENSCVAG00000019799) ENSCVAG00000019782 trnt1 (ENSCVAG00000019770) #16 ENSCVAG00000019761 ENSCVAG00000019734 ENSCVAG00000019729 lrrn1 (ENSCVAG00000000510) #18 setmar (ENSCVAG00000000509) #20 ITPR1 (ENSCVAG00000019702) ##22 ENSCVAG00000019534 bhlhe40 (ENSCVAG00000019523) #23 ENSCVAG00000019514 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00390000007696 ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00940000175464 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A.k ENSGT00530000063548.A.l ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00740000115534.b ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a ENSGT00390000012914.i.a ENSGT00390000004215.a.b.a ENSGT00940000165995 ENSGT00940000157446 ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659.d.b Platyfish MODERN SPECIES 12 ENSXMAG00000002143 grm6b (ENSXMAG00000002147) ##13 traip (ENSXMAG00000002153) mon1a (ENSXMAG00000002162) ENSXMAG00000002163 camkvb (ENSXMAG00000002182) mitfa (ENSXMAG00000002200) ENSXMAG00000002210 arl6ip5a (ENSXMAG00000002223) ENSXMAG00000002226 trnt1 (ENSXMAG00000002227) #16 ENSXMAG00000027163 ENSXMAG00000028634 lrrn1 (ENSXMAG00000020066) #18 setmar (ENSXMAG00000029083) #20 ITPR1 (ENSXMAG00000008118) ##22 ENSXMAG00000021673 bhlhe40 (ENSXMAG00000025515) #23 ENSXMAG00000008105 ENSXMAG00000024098 arl8bb (ENSXMAG00000008092) #24 SEMA3F (ENSXMAG00000008023) ENSXMAG00000007918 ENSXMAG00000024152 ENSXMAG00000022161 ENSXMAG00000021002 tp53rk (ENSXMAG00000023174) nuf2 (ENSXMAG00000025007) ENSXMAG00000023455 ENSXMAG00000022472 ENSXMAG00000025657 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00390000007696 ENSGT00940000165164.b.j ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00940000175464 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A.k ENSGT00530000063548.A.l ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00740000115534.b ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a ENSGT00390000012914.i.a ENSGT00390000004215.a.b.a ENSGT00940000165995 ENSGT00940000157446 ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659.d.b ENSGT00940000164258 Guppy MODERN SPECIES 457 traip (ENSPREG00000021665) ENSPREG00000021636 mon1a (ENSPREG00000021632) ENSPREG00000021618 ENSPREG00000021586 camkvb (ENSPREG00000021561) mitfa (ENSPREG00000021528) FRMD4B (ENSPREG00000021492) arl6ip5a (ENSPREG00000021482) ENSPREG00000021478 trnt1 (ENSPREG00000021470) #16 ENSPREG00000021464 ENSPREG00000021460 lrrn1 (ENSPREG00000021458) #18 ENSPREG00000021441 ITPR1 (ENSPREG00000021387) ##22 bhlhe40 (ENSPREG00000021365) #23 ENSPREG00000021354 ENSPREG00000021335 arl8bb (ENSPREG00000021315) #24 SEMA3F (ENSPREG00000021291) ENSPREG00000021150 ENSPREG00000021095 ENSPREG00000021051 tp53rk (ENSPREG00000021035) ENSPREG00000021022 si:dkey-19e4.5 (ENSPREG00000021009) SETD5 (ENSPREG00000020959) MTMR14 (ENSPREG00000020904) CPNE9 (ENSPREG00000020881) ENSPREG00000020865 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00390000007696 ENSGT00940000165164.b.j ENSGT00390000006665.a ENSGT00940000157842.b ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000156326.a.b ENSGT01020000230354.A.a.a ENSGT00390000008631.a.o.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT00970000193381.a.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00530000063548.A.k ENSGT00530000063548.A.l ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.a.b.a.a ENSGT00740000115534.b ENSGT01030000234623.a.a.a.a.a ENSGT00390000012914.i.a ENSGT00390000004215.a.b.a ENSGT00940000165995 ENSGT00940000157446 ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659.d.b ENSGT00940000164258 Amazon molly MODERN SPECIES 430 grm6b (ENSPFOG00000007313) ##13 traip (ENSPFOG00000007180) ENSPFOG00000007170 mon1a (ENSPFOG00000007130) ENSPFOG00000006925 camkvb (ENSPFOG00000006783) mitfa (ENSPFOG00000006677) FRMD4B (ENSPFOG00000006321) arl6ip5a (ENSPFOG00000006253) arl6ip5a (ENSPFOG00000006251) trnt1 (ENSPFOG00000006194) #16 ENSPFOG00000006189 ENSPFOG00000006181 lrrn1 (ENSPFOG00000020409) #18 setmar (ENSPFOG00000006180) #20 ITPR1 (ENSPFOG00000004491) ##22 bhlhe40 (ENSPFOG00000004275) #23 ENSPFOG00000004036 arl8bb (ENSPFOG00000003916) #24 SEMA3F (ENSPFOG00000002849) ENSPFOG00000001682 Sailfin molly DUPLICATION Sailfin molly MODERN SPECIES 1818 lrrn1 (ENSPLAG00000014058) #18 setmar (ENSPLAG00000014064) #20 ENSPLAG00000014097 ##22 Sailfin molly MODERN SPECIES 3711 ENSPLAG00000014922 ITPR1 (ENSPLAG00000015046) ##22 bhlhe40 (ENSPLAG00000015125) #23 Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 280 pdzrn3b (ENSHCOG00000010837) ppp4r2b (ENSHCOG00000010808) gxylt2 (ENSHCOG00000010804) shq1 (ENSHCOG00000010799) RYBP (ENSHCOG00000010777) prok2 (ENSHCOG00000010773) EIF4E3 (ENSHCOG00000010757) ENSHCOG00000010745 foxp1b (ENSHCOG00000010731) mitfa (ENSHCOG00000010705) FRMD4B (ENSHCOG00000010682) arl6ip5a (ENSHCOG00000010626) trnt1 (ENSHCOG00000010618) #16 lrrn1 (ENSHCOG00000010606) #18 setmar (ENSHCOG00000010603) #20 ENSHCOG00000010596 ##22 ITPR1 (ENSHCOG00000010574) ##22 ENSHCOG00000000326 bhlhe40 (ENSHCOG00000010486) #23 ENSHCOG00000010474 arl8bb (ENSHCOG00000010468) #24 SEMA3F (ENSHCOG00000010442) camkvb (ENSHCOG00000010400) ENSHCOG00000010321 mon1a (ENSHCOG00000010263) traip (ENSHCOG00000010255) grm6b (ENSHCOG00000010199) ##13 comtb (ENSHCOG00000010157) SRPK3 (ENSHCOG00000009982) ccdc120b (ENSHCOG00000000314) mbd1b (ENSHCOG00000009952) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 280 ppp4r2b (ENSHCOG00000010808) gxylt2 (ENSHCOG00000010804) shq1 (ENSHCOG00000010799) RYBP (ENSHCOG00000010777) prok2 (ENSHCOG00000010773) EIF4E3 (ENSHCOG00000010757) ENSHCOG00000010745 foxp1b (ENSHCOG00000010731) mitfa (ENSHCOG00000010705) FRMD4B (ENSHCOG00000010682) arl6ip5a (ENSHCOG00000010626) trnt1 (ENSHCOG00000010618) #16 lrrn1 (ENSHCOG00000010606) #18 setmar (ENSHCOG00000010603) #20 ENSHCOG00000010596 ##22 ITPR1 (ENSHCOG00000010574) ##22 ENSHCOG00000000326 bhlhe40 (ENSHCOG00000010486) #23 ENSHCOG00000010474 arl8bb (ENSHCOG00000010468) #24 SEMA3F (ENSHCOG00000010442) camkvb (ENSHCOG00000010400) ENSHCOG00000010321 mon1a (ENSHCOG00000010263) traip (ENSHCOG00000010255) grm6b (ENSHCOG00000010199) ##13 comtb (ENSHCOG00000010157) SRPK3 (ENSHCOG00000009982) ccdc120b (ENSHCOG00000000314) mbd1b (ENSHCOG00000009952) cxxc1b (ENSHCOG00000009945) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 shq1 (ENSMMDG00005009217) rybpa (ENSMMDG00005009204) prok2 (ENSMMDG00005009188) gpr27 (ENSMMDG00005009185) EIF4E3 (ENSMMDG00005009182) foxp1b (ENSMMDG00005009108) zgc:113054 (ENSMMDG00005009107) mitfa (ENSMMDG00005009103) FRMD4B (ENSMMDG00005009095) arl6ip5a (ENSMMDG00005009086) trnt1 (ENSMMDG00005009082) #16 ENSMMDG00005009079 lrrn1 (ENSMMDG00005009074) #18 setmar (ENSMMDG00005009073) #20 ENSMMDG00005009072 ITPR1 (ENSMMDG00005009020) ##22 bhlhe40 (ENSMMDG00005009011) #23 NAAA (ENSMMDG00005009008) arl8bb (ENSMMDG00005008996) #24 SEMA3F (ENSMMDG00005008991) camkvb (ENSMMDG00005008983) ENSMMDG00005008960 mon1a (ENSMMDG00005008952) traip (ENSMMDG00005008941) grm6b (ENSMMDG00005008936) ##13 comtb (ENSMMDG00005008931) SRPK3 (ENSMMDG00005008906) ccdc120b (ENSMMDG00005008902) mbd1b (ENSMMDG00005008899) cxxc1b (ENSMMDG00005008061) tfe3b (ENSMMDG00005008031) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000011390 ENSGT00940000155327.g ENSGT00940000157922.b ENSGT00440000033958 ENSGT00390000014353 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404.h #17 ENSGT00940000157154.d.a #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.b.a ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00390000005780.b ENSGT00940000154932.B.m ENSGT00940000156150.w ENSGT00390000016970 Asian bonytongue MODERN SPECIES 14 RAB7A (ENSSFOG00015032975) rpn1 (ENSSFOG00015021160) gata2a (ENSSFOG00015021149) eefsec (ENSSFOG00015028518) itih3a.1 (ENSSFOG00015021085) MUSTN1 (ENSSFOG00015026222) SFMBT1 (ENSSFOG00015020972) RFT1 (ENSSFOG00015020939) PRKCD (ENSSFOG00015020920) ENSSFOG00015020883 ccdc174 (ENSSFOG00015020871) vhl (ENSSFOG00015032564) trnt1 (ENSSFOG00015020844) #16 lrrn1 (ENSSFOG00015031033) #18 setmar (ENSSFOG00015033243) #20 ITPR1 (ENSSFOG00015020288) ##22 BHLHE40 (ENSSFOG00015020159) #23 arl8bb (ENSSFOG00015025882) #24 SEMA3F (ENSSFOG00015020063) camkvb (ENSSFOG00015029096) MST1R (ENSSFOG00015020011) mon1a (ENSSFOG00015019990) traip (ENSSFOG00015019883) INKA1 (ENSSFOG00015019838) gnai2a (ENSSFOG00015019793) slc38a3a (ENSSFOG00015019721) RBM5 (ENSSFOG00015019645) ENSSFOG00015019624 emc3 (ENSSFOG00015019595) ENSSFOG00015019544 ENSSFOG00015027888 P. kingsleyae MODERN SPECIES 73 SFMBT1 (ENSPKIG00000020251) RFT1 (ENSPKIG00000020189) PRKCD (ENSPKIG00000020123) ENSPKIG00000020076 ccdc174 (ENSPKIG00000020044) trnt1 (ENSPKIG00000020015) #16 crbn (ENSPKIG00000019998) #17 lrrn1 (ENSPKIG00000019990) #18 setmar (ENSPKIG00000019979) #20 ENSPKIG00000019955 ITPR1 (ENSPKIG00000019872) ##22 BHLHE40 (ENSPKIG00000019834) #23 arl8bb (ENSPKIG00000019809) #24 SEMA3F (ENSPKIG00000019667) camkvb (ENSPKIG00000019579) ENSPKIG00000019529 mon1a (ENSPKIG00000019496) traip (ENSPKIG00000019437) ENSPKIG00000019423 gnai2a (ENSPKIG00000019398) slc38a3a (ENSPKIG00000019264) RBM5 (ENSPKIG00000019187) emc3 (ENSPKIG00000019158) ENSPKIG00000019082 GPX1 (ENSPKIG00000019013) fancd2 (ENSPKIG00000018927) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 773 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 921 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 Lamprey MODERN SPECIES 798 sumf1 (ENSPMAG00000003278) #21 ENSPMAG00000003274 ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 331 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154 #18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a #13 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.D ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.D ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.D ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00440000033958 ENSGT00940000155327.h ENSGT00940000157922.a ENSGT01010000222866 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000014353 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT01050000244882.b.c.a.b ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000162824 ENSGT00940000155125.a.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 515 ENSGT00940000166994 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 421 ENSGT00940000165984 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b ENSGT00730000110895.a ENSGT00390000015136 ENSGT00390000013132.a ENSGT00390000003721.d.a.g.b ENSGT00940000156310.o ENSGT00940000154368.t ENSGT01030000234518.A.b ENSGT00940000177126 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 663 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b ENSGT00730000110895.a ENSGT00390000015136 Atlantic herring MODERN SPECIES 21 shq1 (ENSCHAG00000025662) gxylt2 (ENSCHAG00000025668) ppp4r2b (ENSCHAG00000025680) pdzrn3b (ENSCHAG00000025689) ENSCHAG00000025710 ENSCHAG00000025815 ##14 ENSCHAG00000026930 ENSCHAG00000027584 ##14 cntn4 (ENSCHAG00000027695) rbm19 (ENSCHAG00000027761) epha2a (ENSCHAG00000027782) ENSCHAG00000027792 ENSCHAG00000027795 ENSCHAG00000027799 sumf1 (ENSCHAG00000027805) #21 ENSCHAG00000027829 ##22 pfkfb4b (ENSCHAG00000027850) ENSCHAG00000027863 arfgap1 (ENSCHAG00000027865) ELMO2 (ENSCHAG00000027870) ITGA7 (ENSCHAG00000027871) npffl (ENSCHAG00000027872) PPP1R1A (ENSCHAG00000027873) PDE1B (ENSCHAG00000027874) nckap1l (ENSCHAG00000027875) col2a1b (ENSCHAG00000027876) ENSCHAG00000027877 myg1 (ENSCHAG00000027878) MAP3K12 (ENSCHAG00000027879) PCBP2 (ENSCHAG00000000987) AMHR2 (ENSCHAG00000001324) Denticle herring MODERN SPECIES 3 ENSDCDG00000024016 top1a (ENSDCDG00000023981) ENSDCDG00000023946 fam83d (ENSDCDG00000023929) mafbb (ENSDCDG00000023928) ENSDCDG00000023924 adnpa (ENSDCDG00000023922) gata1a (ENSDCDG00000023920) si:dkey-13a21.4 (ENSDCDG00000023906) HCFC1 (ENSDCDG00000023838) MECP2 (ENSDCDG00000023819) opn1sw2 (ENSDCDG00000023817) opn1lw1 (ENSDCDG00000023816) gnl3l (ENSDCDG00000023810) tfe3b (ENSDCDG00000023742) ITPR1 (ENSDCDG00000023173) ##22 pfkfb4b (ENSDCDG00000015652) ENSDCDG00000015409 uroc1 (ENSDCDG00000015360) arl8bb (ENSDCDG00000015351) #24 ENSDCDG00000015348 SEMA3F (ENSDCDG00000021551) camkvb (ENSDCDG00000021439) ENSDCDG00000021427 mon1a (ENSDCDG00000021422) ENSDCDG00000021417 ENSDCDG00000021412 nelfcd (ENSDCDG00000021242) ctsz (ENSDCDG00000021228) npepl1 (ENSDCDG00000021220) STX16 (ENSDCDG00000021217) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT01090000259987.a.a.b.e ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.b.c ENSGT00940000155746 ENSGT01030000234570.d.b.a.a ENSGT00390000016293 ENSGT00530000063825.B ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b ENSGT00730000110895.a ENSGT00390000015136 ENSGT00390000013132.a ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e ENSGT00940000156310.o ENSGT01030000234518.A.b ENSGT00940000177126 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000165984 ENSGT00440000033958 ENSGT01010000222866 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000014353 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT01090000259987.a.a.b.e ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.b.c ENSGT00940000155746 ENSGT01030000234570.d.b.a.a ENSGT00390000016293 ENSGT00530000063825.B ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b ENSGT00730000110895.a ENSGT00390000015136 ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e ENSGT00940000156310.o ENSGT01030000234518.A.b ENSGT00940000177126 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000165984 ENSGT00440000033958 ENSGT01010000222866 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000014353 ENSGT00390000016404 #17 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154786 ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT01090000259987.a.a.b.e ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.b.c ENSGT00940000155746 ENSGT01030000234570.d.b.a.a ENSGT00390000016293 ENSGT00530000063825.B ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b ENSGT00390000015136 ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e ENSGT00940000177126 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000165984 ENSGT00440000033958 ENSGT01010000222866 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000014353 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000157922.a ENSGT00940000155327.h.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154786 ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT01090000259987.a.a.b.e ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.b.c ENSGT00940000155746 ENSGT01030000234570.d.b.a.a ENSGT00390000016293 ENSGT00530000063825.B ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b ENSGT00390000015136 ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e ENSGT00940000154368.t ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000165984 ENSGT00440000033958 ENSGT01010000222866 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000014353 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157922.a ENSGT00940000155327.h.a ENSGT00950000182999.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 9 ENSPNAG00000014339 atf7b (ENSPNAG00000014424) ENSPNAG00000014478 pfdn5 (ENSPNAG00000014506) ENSPNAG00000003160 ENSPNAG00000003167 ITGB7 (ENSPNAG00000014568) pfkmb (ENSPNAG00000014684) C1QL4 (ENSPNAG00000004905) SMARCC2 (ENSPNAG00000014730) myl6 (ENSPNAG00000014748) tsfm (ENSPNAG00000003241) endou (ENSPNAG00000014759) sumf1 (ENSPNAG00000014795) #21 ENSPNAG00000014809 ITPR1 (ENSPNAG00000014927) ##22 pfkfb4b (ENSPNAG00000014977) ENSPNAG00000014987 ENSPNAG00000015000 uroc1 (ENSPNAG00000015069) sec61a1 (ENSPNAG00000015082) ENSPNAG00000005579 ENSPNAG00000015111 ENSPNAG00000015471 ttll3 (ENSPNAG00000015497) SLC4A8 (ENSPNAG00000015593) ENSPNAG00000015612 ccdc174 (ENSPNAG00000015652) ghrl (ENSPNAG00000015674) tatdn2 (ENSPNAG00000015683) vhl (ENSPNAG00000015696) Mexicana tetra MODERN SPECIES 4 ENSAMXG00000039586 atf1 (ENSAMXG00000033737) ENSAMXG00000001503 atf7b (ENSAMXG00000001508) ENSAMXG00000001515 pfdn5 (ENSAMXG00000033056) ENSAMXG00000001539 ENSAMXG00000001590 pfkmb (ENSAMXG00000001634) C1QL4 (ENSAMXG00000040595) SMARCC2 (ENSAMXG00000001656) myl6 (ENSAMXG00000001694) tsfm (ENSAMXG00000001713) endou (ENSAMXG00000030730) sumf1 (ENSAMXG00000037078) #21 ITPR1 (ENSAMXG00000001795) ##22 pfkfb4b (ENSAMXG00000001899) uroc1 (ENSAMXG00000001906) sec61a1 (ENSAMXG00000001920) ENSAMXG00000041399 ENSAMXG00000001949 ENSAMXG00000002013 ENSAMXG00000032629 SLC4A8 (ENSAMXG00000002165) ENSAMXG00000002167 ccdc174 (ENSAMXG00000002171) ghrl (ENSAMXG00000002173) tatdn2 (ENSAMXG00000039000) vhl (ENSAMXG00000002179) crbn (ENSAMXG00000002182) #17 ENSAMXG00000034174 Electric eel MODERN SPECIES 113 atf1 (ENSEEEG00000013478) ENSEEEG00000013462 atf7b (ENSEEEG00000013456) ENSEEEG00000013451 pfdn5 (ENSEEEG00000013448) ENSEEEG00000013446 ENSEEEG00000013445 pfkmb (ENSEEEG00000010749) C1QL4 (ENSEEEG00000010626) SMARCC2 (ENSEEEG00000010625) myl6 (ENSEEEG00000010511) tsfm (ENSEEEG00000010502) endou (ENSEEEG00000010494) sumf1 (ENSEEEG00000010490) #21 ENSEEEG00000010488 ##22 pfkfb4b (ENSEEEG00000010398) uroc1 (ENSEEEG00000010375) sec61a1 (ENSEEEG00000009886) ENSEEEG00000009858 ENSEEEG00000009853 ENSEEEG00000009849 ttll3 (ENSEEEG00000009848) SLC4A8 (ENSEEEG00000009845) ENSEEEG00000009843 ccdc174 (ENSEEEG00000009842) ghrl (ENSEEEG00000009831) tatdn2 (ENSEEEG00000009830) vhl (ENSEEEG00000009827) crbn (ENSEEEG00000009825) #17 zgc:152986 (ENSEEEG00000009824) Channel catfish MODERN SPECIES 2 vdrb (ENSIPUG00000020135) ENSIPUG00000020128 scn8ab (ENSIPUG00000020075) ENSIPUG00000020069 krt18b (ENSIPUG00000020060) ENSIPUG00000020054 ENSIPUG00000020007 pfkmb (ENSIPUG00000019977) C1QL4 (ENSIPUG00000019967) SMARCC2 (ENSIPUG00000019879) myl6 (ENSIPUG00000019848) tsfm (ENSIPUG00000019836) endou (ENSIPUG00000019828) SUMF1 (ENSIPUG00000019802) #21 ENSIPUG00000019791 ENSIPUG00000019718 ##22 pfkfb4b (ENSIPUG00000019622) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154786 ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT01090000259987.a.a.b.e ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.b.c ENSGT00940000155746 ENSGT01030000234570.d.b.a.a ENSGT00390000016293 ENSGT00530000063825.B ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b ENSGT00730000110895.a ENSGT00390000015136 ENSGT00390000013132.a ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e.a ENSGT00940000156310.o ENSGT00940000154368.t ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000165984 ENSGT00440000033958 ENSGT01010000222866 ENSGT00940000155616 ENSGT00390000014353 ENSGT00390000016404 #17 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 167 ENSGT00940000154786.fb ENSGT00940000166625.j ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.i ENSGT00940000155261.a.b.e.a ENSGT00940000154409.eb.b.p ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT01090000259987.a.a.b.e.f ENSGT00940000155440.c.a.c ENSGT00940000155969.y.b.c.b ENSGT00940000155746.c ENSGT01030000234570.d.b.a.a.s.a ENSGT00390000016293.b ENSGT00530000063825.B.a ENSGT00390000008983.a.f #21 ENSGT00940000155071.D.a ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b.f ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e.a.a ENSGT00940000157802.t.a ENSGT01030000234518.A.b ENSGT00940000177126 ENSGT00940000154857.yb.a.e ENSGT00940000157422.u ENSGT00440000033958.p ENSGT01010000222866.d ENSGT00940000155616.m ENSGT00390000014353.bb.b ENSGT00390000016404.m #17 ENSGT00940000156246.d.b ENSGT00940000157922.a.c ENSGT00940000155327.h.d.a Goldfish MODERN SPECIES 24 krt18b (ENSCARG00000019730) scn8ab (ENSCARG00000019902) METTL7A (ENSCARG00000024129) atf1 (ENSCARG00000024142) DIP2B (ENSCARG00000024319) atf7b (ENSCARG00000030212) ENSCARG00000030239 pfdn5 (ENSCARG00000030368) ENSCARG00000030379 pfkmb (ENSCARG00000030637) C1QL4 (ENSCARG00000038495) SMARCC2 (ENSCARG00000038538) myl6 (ENSCARG00000038894) tsfm (ENSCARG00000038935) endou (ENSCARG00000038968) ITPR1 (ENSCARG00000039089) ##22 pfkfb4b (ENSCARG00000040176) sec61a1 (ENSCARG00000044440) ENSCARG00000044516 ENSCARG00000044530 ENSCARG00000044552 ENSCARG00000044802 ttll3 (ENSCARG00000044809) SLC4A8 (ENSCARG00000045364) ccdc174 (ENSCARG00000055389) ghrl (ENSCARG00000055447) tatdn2 (ENSCARG00000055478) vhl (ENSCARG00000055490) crbn (ENSCARG00000055520) #17 ENSCARG00000055566 prkcda (ENSCARG00000055638) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154786.fb ENSGT00940000166625.j ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.i ENSGT00940000155261.a.b.e.a ENSGT00940000154409.eb.b.p ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT01090000259987.a.a.b.e.f ENSGT00940000155440.c.a.c ENSGT00940000155969.y.b.c.b ENSGT00940000155746.c ENSGT01030000234570.d.b.a.a.s.a ENSGT00390000016293.b ENSGT00530000063825.B.a ENSGT00390000008983.a.f #21 ENSGT00940000155071.D.a ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b.f ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e.a.a ENSGT00940000157802.t.a ENSGT01030000234518.A.b ENSGT00940000177126 ENSGT00940000154857.yb.a.e ENSGT00940000157422.u ENSGT00440000033958.p ENSGT01010000222866.d ENSGT00940000155616.m ENSGT00390000014353.bb.b ENSGT00390000016404.m #17 ENSGT00940000156246.d.b ENSGT00940000157922.a.c ENSGT00940000155327.h.d.a Common carp reference MODERN SPECIES 16 scn8ab (ENSCCRG00000073561) ENSCCRG00000058496 atf1 (ENSCCRG00000017878) ENSCCRG00000017850 atf7b (ENSCCRG00000043132) ENSCCRG00000074575 pfdn5 (ENSCCRG00000043137) ENSCCRG00000052195 ENSCCRG00000052193 pfkmb (ENSCCRG00000052130) ENSCCRG00000063005 ENSCCRG00000032984 myl6 (ENSCCRG00000077139) endou (ENSCCRG00000022575) tsfm (ENSCCRG00000053491) ENSCCRG00000021455 ##22 ENSCCRG00000021037 chchd4b (ENSCCRG00000060804) sec61a1 (ENSCCRG00000066832) ENSCCRG00000074009 ENSCCRG00000070907 ENSCCRG00000033297 ttll3 (ENSCCRG00000033312) ENSCCRG00000033368 ENSCCRG00000065524 ENSCCRG00000056289 ENSCCRG00000063991 ghrl (ENSCCRG00000036365) tatdn2 (ENSCCRG00000055398) vhl (ENSCCRG00000053113) crbn (ENSCCRG00000036341) #17 Golden-line barbel MODERN SPECIES 46 scn8ab (ENSSGRG00000029908) ENSSGRG00000029850 ENSSGRG00000029849 atf1 (ENSSGRG00000029848) ENSSGRG00000025478 atf7b (ENSSGRG00000025405) ENSSGRG00000025404 ENSSGRG00000025403 ENSSGRG00000025402 pfkmb (ENSSGRG00000024681) SMARCC2 (ENSSGRG00000024098) myl6 (ENSSGRG00000024092) tsfm (ENSSGRG00000024091) endou (ENSSGRG00000024089) sumf1 (ENSSGRG00000024087) #21 ITPR1 (ENSSGRG00000023722) ##22 pfkfb4b (ENSSGRG00000020409) ENSSGRG00000020379 ENSSGRG00000020378 ENSSGRG00000020377 ENSSGRG00000020376 ttll3 (ENSSGRG00000020372) SLC4A8 (ENSSGRG00000018671) ccdc174 (ENSSGRG00000018562) ghrl (ENSSGRG00000018557) tatdn2 (ENSSGRG00000018556) vhl (ENSSGRG00000018554) crbn (ENSSGRG00000018552) #17 ENSSGRG00000018551 prkcda (ENSSGRG00000016832) tomm6 (ENSSGRG00000016807) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 203 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.j.b ENSGT00940000154786.gb ENSGT00940000166625.i ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.j ENSGT00940000155261.a.b.e.b ENSGT00940000154409.eb.b.o ENSGT01090000259987.a.a.b.e.e ENSGT00940000155440.c.a.d ENSGT00940000155969.y.b.c.a ENSGT00940000155746.d ENSGT01030000234570.d.b.a.a.s.b ENSGT00390000016293.a ENSGT00530000063825.B.b ENSGT00390000008983.a.e #21 ENSGT00940000155071.D.b ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b.e ENSGT00730000110895.a ENSGT00390000015136 ENSGT00390000013132.a ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e.a.b ENSGT00940000157802.t.b ENSGT00940000166602.A ENSGT00940000154368.t ENSGT00940000154857.yb.a.f ENSGT00940000157422.v ENSGT00940000165984 ENSGT00440000033958.o ENSGT01010000222866.c ENSGT00940000155616.n ENSGT00390000014353.bb.a Goldfish MODERN SPECIES 46 scn8ab (ENSCARG00000029051) ENSCARG00000035633 atf1 (ENSCARG00000035650) ENSCARG00000035972 atf7b (ENSCARG00000039922) ENSCARG00000039950 pfdn5 (ENSCARG00000039956) ENSCARG00000040113 pfkmb (ENSCARG00000040137) C1QL4 (ENSCARG00000040211) ENSCARG00000040246 myl6 (ENSCARG00000040688) tsfm (ENSCARG00000040868) endou (ENSCARG00000040886) sumf1 (ENSCARG00000040919) #21 ENSCARG00000041124 ##22 pfkfb4b (ENSCARG00000041740) uroc1 (ENSCARG00000043477) chchd4b (ENSCARG00000044754) sec61a1 (ENSCARG00000044785) ENSCARG00000045007 ENSCARG00000045040 ttll3 (ENSCARG00000045447) SLC4A8 (ENSCARG00000045979) ENSCARG00000053928 ccdc174 (ENSCARG00000053957) ghrl (ENSCARG00000054031) tatdn2 (ENSCARG00000054071) vhl (ENSCARG00000054091) crbn (ENSCARG00000054106) #17 zgc:152986 (ENSCARG00000054139) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 203 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.j.b ENSGT00940000154786.gb ENSGT00940000166625.i ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.j ENSGT00940000155261.a.b.e.b ENSGT00940000154409.eb.b.o ENSGT01090000259987.a.a.b.e.e ENSGT00940000155440.c.a.d ENSGT00940000155969.y.b.c.a ENSGT00940000155746.d ENSGT01030000234570.d.b.a.a.s.b ENSGT00390000016293.a ENSGT00530000063825.B.b ENSGT00390000008983.a.e #21 ENSGT00940000155071.D.b ##22 ENSGT00950000182835.c.d.c.b.e ENSGT00730000110895.a ENSGT00390000015136 ENSGT00390000013132.a ENSGT00390000003721.d.a.g.b.e.a.b ENSGT00940000157802.t.b ENSGT00940000164736 ENSGT00940000154857.yb.a.f ENSGT00940000157422.v ENSGT00940000165984 ENSGT00440000033958.o ENSGT01010000222866.c ENSGT00940000155616.n ENSGT00390000014353.bb.a ENSGT00390000016404.n #17 Common carp reference MODERN SPECIES 10 krt4 (ENSCCRG00000020969) zgc:158846 (ENSCCRG00000024306) krt18b (ENSCCRG00000024310) ENSCCRG00000060349 scn8ab (ENSCCRG00000024374) ENSCCRG00000061652 ENSCCRG00000003962 ENSCCRG00000052198 ENSCCRG00000043121 pfkmb (ENSCCRG00000067083) ENSCCRG00000070298 ENSCCRG00000044259 myl6 (ENSCCRG00000044031) endou (ENSCCRG00000043997) sumf1 (ENSCCRG00000043975) #21 ENSCCRG00000023305 ##22 pfkfb4b (ENSCCRG00000032689) ENSCCRG00000056074 uroc1 (ENSCCRG00000033373) chchd4b (ENSCCRG00000033379) sec61a1 (ENSCCRG00000033381) ENSCCRG00000012203 ENSCCRG00000054660 ENSCCRG00000067199 ttll3 (ENSCCRG00000034138) ENSCCRG00000034490 ENSCCRG00000034121 ccdc174 (ENSCCRG00000052019) ghrl (ENSCCRG00000052022) tatdn2 (ENSCCRG00000072698) vhl (ENSCCRG00000052030) Golden-line barbel MODERN SPECIES 66 METTL7A (ENSSGRG00000052793) ENSSGRG00000052791 atf1 (ENSSGRG00000052790) ENSSGRG00000052784 atf7b (ENSSGRG00000052780) ENSSGRG00000052777 pfdn5 (ENSSGRG00000052774) ENSSGRG00000052767 pfkmb (ENSSGRG00000052619) C1QL4 (ENSSGRG00000052609) SMARCC2 (ENSSGRG00000051771) myl6 (ENSSGRG00000051750) tsfm (ENSSGRG00000051749) endou (ENSSGRG00000051748) sumf1 (ENSSGRG00000051735) #21 ENSSGRG00000051674 ##22 pfkfb4b (ENSSGRG00000051655) uroc1 (ENSSGRG00000051612) ENSSGRG00000051610 ENSSGRG00000051607 ENSSGRG00000051599 ttll3 (ENSSGRG00000051596) SLC4A8 (ENSSGRG00000051017) ccdc174 (ENSSGRG00000051003) ghrl (ENSSGRG00000050997) tatdn2 (ENSSGRG00000050993) crbn (ENSSGRG00000050988) #17 zgc:152986 (ENSSGRG00000050987) ENSSGRG00000050984 Zebrafish MODERN SPECIES 21 mettl7a.3 (ENSDARG00000060889) ENSDARG00000016348 ENSDARG00000114880 atf7b (ENSDARG00000055481) ENSDARG00000074979 pfdn5 (ENSDARG00000035043) ENSDARG00000075354 ENSDARG00000044318 pfkmb (ENSDARG00000060797) C1QL4 (ENSDARG00000055317) SMARCC2 (ENSDARG00000077946) myl6 (ENSDARG00000008494) tsfm (ENSDARG00000060748) endou (ENSDARG00000044204) sumf1 (ENSDARG00000044203) #21 ITPR1 (ENSDARG00000014655) ##22 pfkfb4b (ENSDARG00000029075) ENSDARG00000090628 ENSDARG00000096949 uroc1 (ENSDARG00000070394) chchd4b (ENSDARG00000040707) sec61a1 (ENSDARG00000021669) ip6k2b (ENSDARG00000019613) ENSDARG00000021720 ttll3 (ENSDARG00000053728) SLC4A8 (ENSDARG00000015531) ENSDARG00000097193 ccdc174 (ENSDARG00000023858) ghrl (ENSDARG00000054239) tatdn2 (ENSDARG00000070618) vhl (ENSDARG00000070617) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000158313.a.a ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00940000155261.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00390000004990 ENSGT01090000259987.a.a.b.e ENSGT00940000155440.c.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.a.a.b ENSGT00940000156458.e.a.a.a ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.a.a ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000161971 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.ab.b ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00940000155261.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00390000003017.c.a.k ENSGT00550000074884 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 537 ENSGT00940000175117 ENSGT00940000157154.c.a ##18 ENSGT00940000155071.D.c ##22 ENSGT00940000158384.c.a #23 ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l.d ENSGT00940000154786.ab.b.a ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT00940000166625.b ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.h ENSGT00940000155261.a.b.c ENSGT00940000154409.eb.b.n ENSGT00390000003017.c.a.k.b ENSGT00550000074884.l.a ENSGT00940000154899.fb.a.c ENSGT00940000153709.A.e.c ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.g Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 2701 ENSHHUG00000045993 ##18 ENSHHUG00000045995 ITPR1 (ENSHHUG00000046020) ##22 Huchen MODERN SPECIES 3579 ENSHHUG00000040824 ##22 BHLHE40 (ENSHHUG00000040823) #23 ENSHHUG00000040820 ENSHHUG00000040817 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000161087.f.b ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.e ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.a.b ENSGT00940000155250.q.b.c ENSGT00940000157899.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a.b ENSGT00940000156561.a.b.a.b ENSGT00950000182897.A.h ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000175117 ENSGT00990000209847 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c.a ##18 ENSGT00940000155071.D.c ##22 ENSGT00940000158384.c.a #23 ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l.d ENSGT01060000251739 ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT00940000166625.b ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.h ENSGT00940000155261.a.b.c ENSGT00940000154409.eb.b.n ENSGT00390000003017.c.a.k.b ENSGT00390000003017.c.a.l ENSGT00550000074884.l.a ENSGT00940000154899.fb.a.c ENSGT00940000153709.A.e.c Salmo ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000161307.r.b ENSGT00940000161087.f.b ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.e ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.a.b ENSGT00940000155250.q.b.c ENSGT00940000157899.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a.b ENSGT00940000156561.a.b.a.b ENSGT00950000182897.A.h ENSGT00990000209847 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c.a ##18 ENSGT00390000008983.a.d #21 ENSGT00940000155071.D.c ##22 ENSGT00940000158384.c.a #23 ENSGT00940000157422 ENSGT01040000240375.D.s.a.a.a.b.a.a.a.a.a.b.b.b.a.b.b ENSGT00940000156263.l.d ENSGT01060000251739 ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT00940000166625.b ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.h ENSGT00940000155261.a.b.c ENSGT00940000154409.eb.b.n ENSGT00390000003017.c.a.k.b ENSGT00390000003017.c.a.l ENSGT00550000074884.l.a ENSGT00940000154899.fb.a.c ENSGT00940000153709.A.e.c River trout MODERN SPECIES 7 HOXC13 (ENSSTUG00000003518) calcoco1b (ENSSTUG00000003530) RARG (ENSSTUG00000003589) nr1d4b (ENSSTUG00000003632) ENSSTUG00000003643 RBMS2 (ENSSTUG00000003682) LRP1 (ENSSTUG00000004415) ENSSTUG00000005337 ENSSTUG00000005352 zc3h10 (ENSSTUG00000005409) ENSSTUG00000005422 ENSSTUG00000005426 ENSSTUG00000005447 ENSSTUG00000005456 ENSSTUG00000005459 ##18 ITPR1 (ENSSTUG00000005581) ##22 BHLHE40 (ENSSTUG00000008191) #23 SLC4A8 (ENSSTUG00000008208) ENSSTUG00000008435 ENSSTUG00000008454 ENSSTUG00000008592 ENSSTUG00000008599 METTL7A (ENSSTUG00000008616) atf1 (ENSSTUG00000008619) ENSSTUG00000008757 atf7b (ENSSTUG00000014579) ENSSTUG00000014602 ENSSTUG00000014638 ENSSTUG00000014662 cse1l (ENSSTUG00000014707) KCNB1 (ENSSTUG00000014931) Atlantic salmon MODERN SPECIES 14 hoxc13 (ENSSSAG00000066797) calcoco1 (ENSSSAG00000081131) nr1d4b (ENSSSAG00000081117) ENSSSAG00000081123 ENSSSAG00000081114 ENSSSAG00000081075 ENSSSAG00000080916 ENSSSAG00000080817 ENSSSAG00000080784 ENSSSAG00000109410 ENSSSAG00000094058 ENSSSAG00000109985 ENSSSAG00000100149 ##18 SUMF1 (ENSSSAG00000080774) #21 SUMF1 (ENSSSAG00000091500) #21 ITPR1 (ENSSSAG00000092543) ##22 BHLHE40 (ENSSSAG00000097244) #23 ENSSSAG00000076075 ENSSSAG00000107331 ENSSSAG00000076059 ENSSSAG00000049640 ENSSSAG00000048686 ENSSSAG00000085447 atf1 (ENSSSAG00000048676) ENSSSAG00000097027 atf7b (ENSSSAG00000044840) ENSSSAG00000044820 ENSSSAG00000044811 ENSSSAG00000044801 ENSSSAG00000044784 ENSSSAG00000042266 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161087.f.b ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.e ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.a.b ENSGT00940000155250.q.b.c ENSGT00940000157899.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a.b ENSGT00940000156561.a.b.a.b ENSGT00950000182897.A.h ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000175117 ENSGT00990000209847 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c.a ##18 ENSGT00940000155071.D.c ##22 ENSGT00940000158384.c.a #23 ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l.d ENSGT01060000253399 ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT00940000166625.b ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.h ENSGT00940000155261.a.b.c ENSGT00940000154409.eb.b.n ENSGT00390000003017.c.a.k.b ENSGT00390000003017.c.a.l ENSGT00550000074884.l.a ENSGT00940000154899.fb.a.c ENSGT00940000153709.A.e.c Rainbow trout MODERN SPECIES 28 HOXC13 (ENSOMYG00000063208) calcoco1b (ENSOMYG00000047246) ENSOMYG00000047242 nr1d4b (ENSOMYG00000047239) ENSOMYG00000047235 ENSOMYG00000047227 ENSOMYG00000047217 ENSOMYG00000047205 ENSOMYG00000051675 ENSOMYG00000047196 ENSOMYG00000047187 ENSOMYG00000047185 ENSOMYG00000047184 ENSOMYG00000047181 ##18 ENSOMYG00000063383 ENSOMYG00000047077 ##22 ENSOMYG00000046933 #23 ENSOMYG00000046213 ENSOMYG00000045955 ENSOMYG00000045162 ENSOMYG00000062421 ENSOMYG00000045012 atf1 (ENSOMYG00000045007) ENSOMYG00000031353 atf7b (ENSOMYG00000027943) ENSOMYG00000027716 ENSOMYG00000064549 ENSOMYG00000027647 ENSOMYG00000027583 ENSOMYG00000062642 ENSOMYG00000027520 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160009.i.b ENSGT00940000161307.r.b ENSGT00940000161087.f.b ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.e ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.a.b ENSGT00940000155250.q.b.c ENSGT00940000157899.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a.b ENSGT00940000156561.a.b.a.b ENSGT00950000182897.A.h ENSGT00990000209847 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c.a ##18 ENSGT00940000155071.D.c ##22 ENSGT00940000158384.c.a #23 ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l.d ENSGT01060000253399 ENSGT00940000154786.ab.a ENSGT00940000166625.b ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.h ENSGT00940000155261.a.b.c ENSGT00940000154409.eb.b.n ENSGT00390000003017.c.a.k.b ENSGT00390000003017.c.a.l ENSGT00550000074884.l.a ENSGT00940000154899.fb.a.c ENSGT00940000153709.A.e.c Coho salmon MODERN SPECIES 25 hoxc12b (ENSOKIG00005029549) HOXC13 (ENSOKIG00005029541) calcoco1b (ENSOKIG00005029519) ENSOKIG00005029409 nr1d4b (ENSOKIG00005029392) ENSOKIG00005038463 ENSOKIG00005038301 ENSOKIG00005038282 LRP1 (ENSOKIG00005034205) ENSOKIG00005033877 ENSOKIG00005033717 ZC3H10 (ENSOKIG00005033682) ENSOKIG00005033672 ENSOKIG00005033653 ENSOKIG00005033639 ##18 ITPR1 (ENSOKIG00005031528) ##22 BHLHE40 (ENSOKIG00005031192) #23 SLC4A8 (ENSOKIG00005028849) ENSOKIG00005028634 ENSOKIG00005026169 ENSOKIG00005026017 ENSOKIG00005026009 atf1 (ENSOKIG00005025980) ENSOKIG00005020283 atf7b (ENSOKIG00005019944) ENSOKIG00005019880 ENSOKIG00005019858 CSE1L (ENSOKIG00005019688) KCNB1 (ENSOKIG00005019655) PTGIS (ENSOKIG00005019570) SRGAP3 (ENSOKIG00005015081) Chinook salmon MODERN SPECIES 31 HOXC11 (ENSOTSG00005029788) hoxc12b (ENSOTSG00005029786) HOXC13 (ENSOTSG00005029785) calcoco1b (ENSOTSG00005029783) RARG (ENSOTSG00005029782) nr1d4b (ENSOTSG00005040183) ENSOTSG00005040182 ENSOTSG00005040104 LRP1 (ENSOTSG00005039789) ENSOTSG00005039757 ENSOTSG00005039756 zc3h10 (ENSOTSG00005039755) ENSOTSG00005039753 ENSOTSG00005039751 ENSOTSG00005039748 ##18 ITPR1 (ENSOTSG00005037809) ##22 BHLHE40 (ENSOTSG00005037777) #23 SLC4A8 (ENSOTSG00005033559) ENSOTSG00005033548 ENSOTSG00005033547 ENSOTSG00005033546 ENSOTSG00005033545 atf1 (ENSOTSG00005033544) DIP2B (ENSOTSG00005023002) atf7b (ENSOTSG00005022933) ENSOTSG00005022932 ENSOTSG00005022930 ENSOTSG00005022929 cse1l (ENSOTSG00005022802) KCNB1 (ENSOTSG00005022791) PTGIS (ENSOTSG00005022574) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160855.h ENSGT00940000160009.i.a ENSGT00940000161307.r.a ENSGT00940000161087.f.a ENSGT00940000156458.e.a.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.f ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.a.a ENSGT00940000155250.q.b.d ENSGT00940000157899.a.a.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a.a ENSGT00940000156561.a.b.a.a ENSGT00950000182897.A.g ENSGT00940000157154.c.b ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D.d ##22 ENSGT00940000158384.c.b #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000161971.r ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000166625.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00530000063557.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160009.i.a ENSGT00940000161307.r.a ENSGT00940000161087.f.a ENSGT00940000156458.e.a.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.f ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.b ENSGT00940000155250.q.b.d ENSGT00940000157899.a.a.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a.a ENSGT00940000156561.a.b.a.a ENSGT00950000182897.A.g ENSGT01020000230665.a.b ENSGT00940000157154.c.b ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D.d ##22 ENSGT00940000158384.c.b #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000161971.r ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000166625.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00530000063557.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h Salmo ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160009.i.a ENSGT00940000161307.r.a ENSGT00940000161087.f.a ENSGT00940000156458.e.a.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.f ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.a.a ENSGT00940000155250.q.b.d ENSGT00940000157899.a.a.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a.a ENSGT00940000156561.a.b.a.a ENSGT00950000182897.A.g ENSGT01020000230665.a.b ENSGT00940000157154.c.b ##18 ENSGT00390000008983.a.c #21 ENSGT00940000155071.D.d ##22 ENSGT00940000158384.c.b #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000161971.r ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000166625.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00530000063557.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h River trout MODERN SPECIES 5 HOXC10 (ENSSTUG00000029490) HOXC11 (ENSSTUG00000029481) hoxc12b (ENSSTUG00000029478) HOXC13 (ENSSTUG00000029469) RARG (ENSSTUG00000029287) nr1d4b (ENSSTUG00000029258) FAIM2 (ENSSTUG00000029227) ENSSTUG00000028736 LRP1 (ENSSTUG00000025937) ENSSTUG00000025777 ENSSTUG00000025550 zc3h10 (ENSSTUG00000025526) ENSSTUG00000025498 ENSSTUG00000025485 ##18 sumf1 (ENSSTUG00000024952) #21 ITPR1 (ENSSTUG00000021085) ##22 BHLHE40 (ENSSTUG00000020757) #23 ttll3 (ENSSTUG00000020694) ENSSTUG00000040212 ENSSTUG00000039904 ENSSTUG00000039882 atf1 (ENSSTUG00000039864) ENSSTUG00000037187 atf7b (ENSSTUG00000036972) ENSSTUG00000036881 PBRM1 (ENSSTUG00000036219) cse1l (ENSSTUG00000035641) KCNB1 (ENSSTUG00000035574) PTGIS (ENSSTUG00000035492) thumpd3 (ENSSTUG00000035415) SRGAP3 (ENSSTUG00000034144) Atlantic salmon MODERN SPECIES 3 hoxc12ba (ENSSSAG00000066791) ENSSSAG00000066824 nr1d4b (ENSSSAG00000067342) ENSSSAG00000067343 ENSSSAG00000004375 ENSSSAG00000104570 ENSSSAG00000006727 ENSSSAG00000045449 ENSSSAG00000116708 ENSSSAG00000045558 ENSSSAG00000047881 ENSSSAG00000047887 ENSSSAG00000115625 ENSSSAG00000047905 ##18 sumf1 (ENSSSAG00000047919) #21 ITPR1 (ENSSSAG00000097016) ##22 BHLHE40 (ENSSSAG00000069806) #23 ENSSSAG00000069809 ENSSSAG00000094905 ENSSSAG00000070160 ENSSSAG00000077210 atf1 (ENSSSAG00000077213) ENSSSAG00000119026 ENSSSAG00000098839 ENSSSAG00000079782 ENSSSAG00000079810 ENSSSAG00000112393 ENSSSAG00000119669 ENSSSAG00000042011 ENSSSAG00000084657 thumpd3 (ENSSSAG00000080100) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160009.i.a ENSGT00940000161307.r.a ENSGT00940000161087.f.a ENSGT00940000156458.e.a.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.f ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.b ENSGT00940000155250.q.b.d ENSGT00940000157899.a.a.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a.a ENSGT00940000156561.a.b.a.a ENSGT00950000182897.A.g ENSGT01020000230665.a.b ENSGT00940000157154.c.b ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D.d ##22 ENSGT00940000158384.c.b #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000166625.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00530000063557.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h ENSGT00390000011230.m Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160855.h ENSGT00940000160009.i.a ENSGT00940000161307.r.a ENSGT00940000161087.f.a ENSGT00940000156458.e.a.a.a.b ENSGT00940000164283.b.b.f ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a.b ENSGT00940000155250.q.b.d ENSGT00940000157899.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a.a ENSGT00940000156561.a.b.a.a ENSGT00950000182897.A.g ENSGT01020000230665.a.b ENSGT00940000157154.c.b ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D.d ##22 ENSGT00940000158384.c.b #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000156263.l.c ENSGT00940000154786.ab.b.b ENSGT00940000166625.a ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b.g ENSGT00940000155261.a.b.d ENSGT00940000154409.eb.b.m ENSGT00390000003017.c.a.k.a ENSGT00550000074884.l.b ENSGT00940000154899.fb.a.d ENSGT00940000153709.A.e.d ENSGT00530000063557.a ENSGT00950000182824.a.b.a.j.a.h ENSGT00390000011230.m Coho salmon MODERN SPECIES HOXC10 (ENSOKIG00005003203) HOXC11 (ENSOKIG00005003196) hoxc12b (ENSOKIG00005003188) HOXC13 (ENSOKIG00005003185) RARG (ENSOKIG00005003174) nr1d4b (ENSOKIG00005003164) ENSOKIG00005003152 ENSOKIG00005002868 ENSOKIG00005002570 ENSOKIG00005002307 zc3h10 (ENSOKIG00005002219) ENSOKIG00005002200 ENSOKIG00005002193 ##18 ENSOKIG00005002183 sumf1 (ENSOKIG00005001895) #21 ITPR1 (ENSOKIG00005000980) ##22 BHLHE40 (ENSOKIG00005000624) #23 TTLL3 (ENSOKIG00005000611) ENSOKIG00005000483 METTL7A (ENSOKIG00005000447) atf1 (ENSOKIG00005000436) ENSOKIG00005000303 atf7b (ENSOKIG00005000245) ENSOKIG00005000219 PBRM1 (ENSOKIG00005000157) cse1l (ENSOKIG00005019347) KCNB1 (ENSOKIG00005019285) PTGIS (ENSOKIG00005019174) thumpd3 (ENSOKIG00005018941) SRGAP3 (ENSOKIG00005016624) rad18 (ENSOKIG00005016510) Chinook salmon MODERN SPECIES 11 HOXC10 (ENSOTSG00005003803) HOXC11 (ENSOTSG00005003806) hoxc12b (ENSOTSG00005003808) HOXC13 (ENSOTSG00005003811) RARG (ENSOTSG00005003820) nr1d4b (ENSOTSG00005004076) ENSOTSG00005004078 ENSOTSG00005004083 LRP1 (ENSOTSG00005004145) ENSOTSG00005004268 ENSOTSG00005004297 zc3h10 (ENSOTSG00005004435) ENSOTSG00005004436 ENSOTSG00005004437 ##18 sumf1 (ENSOTSG00005004447) #21 ITPR1 (ENSOTSG00005005249) ##22 BHLHE40 (ENSOTSG00005005893) #23 ttll3 (ENSOTSG00005005894) ENSOTSG00005005913 METTL7A (ENSOTSG00005006258) atf1 (ENSOTSG00005006261) ENSOTSG00005006303 atf7b (ENSOTSG00005010880) ENSOTSG00005010885 PBRM1 (ENSOTSG00005011089) cse1l (ENSOTSG00005011605) KCNB1 (ENSOTSG00005012227) PTGIS (ENSOTSG00005012234) thumpd3 (ENSOTSG00005012331) SRGAP3 (ENSOTSG00005012340) rad18 (ENSOTSG00005014422) Rainbow trout MODERN SPECIES 8 HOXC10 (ENSOMYG00000065214) HOXC11 (ENSOMYG00000034848) hoxc12b (ENSOMYG00000034861) HOXC13 (ENSOMYG00000047249) ENSOMYG00000034900 nr1d4b (ENSOMYG00000034948) ENSOMYG00000034954 ENSOMYG00000035077 ENSOMYG00000036165 ENSOMYG00000037362 ENSOMYG00000037369 ENSOMYG00000037588 ENSOMYG00000038987 ENSOMYG00000039008 ##18 SUMF1 (ENSOMYG00000039103) #21 ITPR1 (ENSOMYG00000041400) ##22 BHLHE40 (ENSOMYG00000047219) #23 ENSOMYG00000047221 ENSOMYG00000047319 ENSOMYG00000047373 atf1 (ENSOMYG00000047379) atf7b (ENSOMYG00000047538) ENSOMYG00000047542 ENSOMYG00000047576 ENSOMYG00000047614 ENSOMYG00000062267 ENSOMYG00000047645 THUMPD3 (ENSOMYG00000047650) SRGAP3 (ENSOMYG00000047758) rad18 (ENSOMYG00000047793) ENSOMYG00000068127 Huchen MODERN SPECIES 43 HOXC11 (ENSHHUG00000010282) hoxc12b (ENSHHUG00000010270) HOXC13 (ENSHHUG00000010233) RARG (ENSHHUG00000010056) nr1d4b (ENSHHUG00000010042) ENSHHUG00000010031 ENSHHUG00000009827 ENSHHUG00000009810 ENSHHUG00000009331 ENSHHUG00000008975 zc3h10 (ENSHHUG00000008964) ENSHHUG00000008958 ENSHHUG00000008956 ##18 ENSHHUG00000008954 sumf1 (ENSHHUG00000008804) #21 ITPR1 (ENSHHUG00000007848) ##22 BHLHE40 (ENSHHUG00000007797) #23 ttll3 (ENSHHUG00000007778) ENSHHUG00000007673 SCN8A (ENSHHUG00000004969) METTL7A (ENSHHUG00000004956) atf1 (ENSHHUG00000004928) ENSHHUG00000003734 atf7b (ENSHHUG00000003713) ENSHHUG00000003682 PBRM1 (ENSHHUG00000003622) cse1l (ENSHHUG00000003547) ENSHHUG00000003493 KCNB1 (ENSHHUG00000003484) PTGIS (ENSHHUG00000003391) thumpd3 (ENSHHUG00000003374) Northern pike MODERN SPECIES 16 hoxc12b (ENSELUG00000019981) HOXC13 (ENSELUG00000001535) calcoco1b (ENSELUG00000019949) RARG (ENSELUG00000019908) nr1d4b (ENSELUG00000019859) FAIM2 (ENSELUG00000019816) RBMS2 (ENSELUG00000019834) LRP1 (ENSELUG00000019756) ENSELUG00000019592 ENSELUG00000019556 zc3h10 (ENSELUG00000029867) ENSELUG00000019457 ENSELUG00000019445 ENSELUG00000019326 ##18 sumf1 (ENSELUG00000019407) #21 ITPR1 (ENSELUG00000019313) ##22 BHLHE40 (ENSELUG00000019179) #23 ttll3 (ENSELUG00000019143) SLC4A8 (ENSELUG00000019116) ENSELUG00000029701 SCN8A (ENSELUG00000019010) mettl7a.1 (ENSELUG00000018938) atf1 (ENSELUG00000018901) DIP2B (ENSELUG00000018868) atf7b (ENSELUG00000018713) LARP4 (ENSELUG00000018650) PBRM1 (ENSELUG00000018567) cse1l (ENSELUG00000001309) KCNB1 (ENSELUG00000018306) PTGIS (ENSELUG00000018290) thumpd3 (ENSELUG00000018246) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.f ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000162340 ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 4 ENSGMOG00000022649 ENSGMOG00000026196 ENSGMOG00000029595 ENSGMOG00000002291 ENSGMOG00000017824 ENSGMOG00000027046 ENSGMOG00000010099 ENSGMOG00000003994 ENSGMOG00000026220 ENSGMOG00000004194 ENSGMOG00000031565 ENSGMOG00000004246 ENSGMOG00000004305 ENSGMOG00000004340 ##18 SUMF1 (ENSGMOG00000004349) #21 ITPR1 (ENSGMOG00000004370) ##22 ENSGMOG00000031472 BHLHE40 (ENSGMOG00000022699) #23 ENSGMOG00000004517 ENSGMOG00000015637 ENSGMOG00000002635 mettl7a.3 (ENSGMOG00000002688) ENSGMOG00000002697 atf1 (ENSGMOG00000002707) ENSGMOG00000002726 atf7b (ENSGMOG00000000592) ENSGMOG00000023729 ENSGMOG00000009536 pfdn5 (ENSGMOG00000000600) ENSGMOG00000000612 ENSGMOG00000000684 Cod MODERN SPECIES 4 akr7a3 (ENSGMOG00000001441) ENSGMOG00000001422 ENSGMOG00000001401 ENSGMOG00000035002 PPARG (ENSGMOG00000001375) syn2b (ENSGMOG00000014094) TIMP4 (ENSGMOG00000023986) tamm41 (ENSGMOG00000010587) ENSGMOG00000023751 ENSGMOG00000010454 vgll4b (ENSGMOG00000010444) ATG7 (ENSGMOG00000010427) HRH1 (ENSGMOG00000034842) LRRN1 (ENSGMOG00000020177) #18 setmar (ENSGMOG00000034115) #20 ITPR1 (ENSGMOG00000002239) ##22 bhlhe40 (ENSGMOG00000031170) #23 ENSGMOG00000002389 arl8bb (ENSGMOG00000002416) #24 ENSGMOG00000002430 camkvb (ENSGMOG00000002479) ENSGMOG00000032890 mon1a (ENSGMOG00000024519) traip (ENSGMOG00000002576) grm6b (ENSGMOG00000002607) ##13 ENSGMOG00000002636 ENSGMOG00000020337 ENSGMOG00000011937 ENSGMOG00000002647 ccdc120b (ENSGMOG00000029914) ENSGMOG00000036759 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157046.E ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 rargb (ENSMMDG00005022343) nr1d4b (ENSMMDG00005022340) FAIM2 (ENSMMDG00005022329) ENSMMDG00005022324 ENSMMDG00005022318 LRP1 (ENSMMDG00005022266) ENSMMDG00005022252 ENSMMDG00005022251 ESYT1 (ENSMMDG00005022245) zc3h10 (ENSMMDG00005022242) ENSMMDG00005022239 ENSMMDG00005022236 ENSMMDG00005022233 ##18 sumf1 (ENSMMDG00005022205) #21 ENSMMDG00005022203 ITPR1 (ENSMMDG00005021192) ##22 BHLHE40 (ENSMMDG00005021140) #23 ttll3 (ENSMMDG00005021139) SLC4A8 (ENSMMDG00005021136) ENSMMDG00005021134 ENSMMDG00005021131 METTL7A (ENSMMDG00005021128) METTL7A (ENSMMDG00005021127) atf1 (ENSMMDG00005021125) ENSMMDG00005000842 atf7b (ENSMMDG00005000254) ENSMMDG00005000218 pfdn5 (ENSMMDG00005000184) ENSMMDG00005000151 pfkmb (ENSMMDG00005023107) C1QL4 (ENSMMDG00005023098) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 Tiger tail seahorse DUPLICATION Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 295 ENSHCOG00000019875 ENSHCOG00000019920 SMUG1 (ENSHCOG00000019942) ENSHCOG00000019952 rargb (ENSHCOG00000020011) nr1d4b (ENSHCOG00000020031) FAIM2 (ENSHCOG00000020062) ENSHCOG00000020072 ENSHCOG00000020086 LRP1 (ENSHCOG00000020223) ENSHCOG00000020318 zc3h10 (ENSHCOG00000020331) ENSHCOG00000020335 ENSHCOG00000000799 ##18 sumf1 (ENSHCOG00000020346) #21 ITPR1 (ENSHCOG00000020407) ##22 ENSHCOG00000020490 ##22 BHLHE40 (ENSHCOG00000020508) #23 ttll3 (ENSHCOG00000020568) SLC4A8 (ENSHCOG00000020612) ENSHCOG00000020621 SCN8A (ENSHCOG00000020660) METTL7A (ENSHCOG00000020671) METTL7A (ENSHCOG00000020690) atf1 (ENSHCOG00000020766) DIP2B (ENSHCOG00000020840) atf7b (ENSHCOG00000020852) ENSHCOG00000020857 pfdn5 (ENSHCOG00000020867) ENSHCOG00000020882 PFKM (ENSHCOG00000020895) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 295 ENSHCOG00000019920 SMUG1 (ENSHCOG00000019942) ENSHCOG00000019952 rargb (ENSHCOG00000020011) nr1d4b (ENSHCOG00000020031) FAIM2 (ENSHCOG00000020062) ENSHCOG00000020072 ENSHCOG00000020086 LRP1 (ENSHCOG00000020223) ENSHCOG00000020318 zc3h10 (ENSHCOG00000020331) ENSHCOG00000020335 ENSHCOG00000000799 ##18 sumf1 (ENSHCOG00000020346) #21 ITPR1 (ENSHCOG00000020407) ##22 ENSHCOG00000020490 ##22 BHLHE40 (ENSHCOG00000020508) #23 ttll3 (ENSHCOG00000020568) SLC4A8 (ENSHCOG00000020612) ENSHCOG00000020621 SCN8A (ENSHCOG00000020660) METTL7A (ENSHCOG00000020671) METTL7A (ENSHCOG00000020690) atf1 (ENSHCOG00000020766) DIP2B (ENSHCOG00000020840) atf7b (ENSHCOG00000020852) ENSHCOG00000020857 pfdn5 (ENSHCOG00000020867) ENSHCOG00000020882 PFKM (ENSHCOG00000020895) C1QL4 (ENSHCOG00000020923) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000159286.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000166625 ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000165559 ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00390000004897 ENSGT00940000157046.E ENSGT00940000167488 ENSGT00940000158675.b ENSGT00940000160528.a ENSGT00940000156890.a.a ENSGT00940000158956.d ENSGT00940000154770 Fugu MODERN SPECIES 10 atf7b (ENSTRUG00000007560) ENSTRUG00000024017 atf1 (ENSTRUG00000008032) ENSTRUG00000019590 METTL7A (ENSTRUG00000022562) nr1d4b (ENSTRUG00000008195) ENSTRUG00000008492 ENSTRUG00000029863 ENSTRUG00000030681 ENSTRUG00000009321 zc3h10 (ENSTRUG00000009733) ENSTRUG00000026602 ENSTRUG00000022879 ENSTRUG00000009777 ##18 sumf1 (ENSTRUG00000009817) #21 ITPR1 (ENSTRUG00000009941) ##22 BHLHE40 (ENSTRUG00000024300) #23 SLC4A8 (ENSTRUG00000011573) ENSTRUG00000025210 ENSTRUG00000018547 rargb (ENSTRUG00000018545) ENSTRUG00000018540 SMUG1 (ENSTRUG00000024244) ENSTRUG00000018537 ENSTRUG00000029283 ENSTRUG00000018534 SPRYD3 (ENSTRUG00000018531) ENSTRUG00000020314 PIP4K2C (ENSTRUG00000018528) AGAP2 (ENSTRUG00000018522) cdk4 (ENSTRUG00000033363) Tetraodon MODERN SPECIES 2 DIP2B (ENSTNIG00000014569) atf1 (ENSTNIG00000014568) ENSTNIG00000014567 ENSTNIG00000014566 nr1d4b (ENSTNIG00000014565) ENSTNIG00000014564 RBMS2 (ENSTNIG00000014563) LRP1 (ENSTNIG00000014562) ENSTNIG00000014561 ENSTNIG00000014560 ESYT1 (ENSTNIG00000014559) zc3h10 (ENSTNIG00000014558) ENSTNIG00000014557 ENSTNIG00000014556 ##18 sumf1 (ENSTNIG00000014555) #21 ITPR1 (ENSTNIG00000014554) ##22 BHLHE40 (ENSTNIG00000014553) #23 ttll3 (ENSTNIG00000014552) SLC4A8 (ENSTNIG00000014551) ENSTNIG00000001229 ENSTNIG00000013615 RARG (ENSTNIG00000001994) calcoco1b (ENSTNIG00000006416) SMUG1 (ENSTNIG00000006417) ENSTNIG00000006418 ENSTNIG00000006508 ENSTNIG00000006509 SPRYD3 (ENSTNIG00000018237) PIP4K2C (ENSTNIG00000018238) AGAP2 (ENSTNIG00000018239) cdk4 (ENSTNIG00000018240) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000159286.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a Ballan wrasse MODERN SPECIES 232 calcoco1b (ENSLBEG00000017448) rargb (ENSLBEG00000017506) nr1d4b (ENSLBEG00000017596) ENSLBEG00000017666 ENSLBEG00000017716 LRP1 (ENSLBEG00000017816) ENSLBEG00000018029 ENSLBEG00000018077 ENSLBEG00000018141 ENSLBEG00000018224 zc3h10 (ENSLBEG00000018281) ENSLBEG00000018295 ENSLBEG00000018316 ENSLBEG00000018349 ##18 sumf1 (ENSLBEG00000018381) #21 ITPR1 (ENSLBEG00000018574) ##22 ENSLBEG00000018717 BHLHE40 (ENSLBEG00000018751) #23 SLC4A8 (ENSLBEG00000018801) SCN8A (ENSLBEG00000018924) ENSLBEG00000019006 ENSLBEG00000019021 METTL7A (ENSLBEG00000019053) atf1 (ENSLBEG00000019071) ENSLBEG00000019121 atf7b (ENSLBEG00000019236) ENSLBEG00000019306 pfdn5 (ENSLBEG00000019358) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000159286.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000159286.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a.c ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a ENSGT00940000155746 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a.d ENSGT00940000154857.yb.a.c ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a European seabass MODERN SPECIES 10 ENSDLAG00005009615 ENSDLAG00005034518 calcoco1b (ENSDLAG00005027592) rargb (ENSDLAG00005009737) nr1d4b (ENSDLAG00005009921) ENSDLAG00005009930 ENSDLAG00005009983 ENSDLAG00005010802 ENSDLAG00005018801 ENSDLAG00005018805 ENSDLAG00005018818 ENSDLAG00005018878 ENSDLAG00005031876 ENSDLAG00005020834 ##18 ENSDLAG00005020840 #21 ENSDLAG00005021097 ##22 ENSDLAG00005027494 ENSDLAG00005025171 ENSDLAG00005025215 ENSDLAG00005025591 ENSDLAG00005034577 ENSDLAG00005026262 atf1 (ENSDLAG00005026263) ENSDLAG00005026284 atf7b (ENSDLAG00005026295) pfdn5 (ENSDLAG00005027726) ENSDLAG00005000520 pfkmb (ENSDLAG00005000678) ENSDLAG00005001263 ENSDLAG00005001316 ENSDLAG00005001611 Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 SMUG1 (ENSLCRG00005021887) ENSLCRG00005021886 rargb (ENSLCRG00005021837) nr1d4b (ENSLCRG00005021836) ENSLCRG00005021834 ENSLCRG00005021830 ENSLCRG00005021828 LRP1 (ENSLCRG00005021397) ENSLCRG00005021347 ESYT1 (ENSLCRG00005021346) zc3h10 (ENSLCRG00005021344) ENSLCRG00005021343 ENSLCRG00005021341 lrrn1 (ENSLCRG00005021339) ##18 sumf1 (ENSLCRG00005021265) #21 ITPR1 (ENSLCRG00005015737) ##22 BHLHE40 (ENSLCRG00005015681) #23 ttll3 (ENSLCRG00005015679) ttll3 (ENSLCRG00005015678) SLC4A8 (ENSLCRG00005007755) SCN8A (ENSLCRG00005007553) mettl7a.3 (ENSLCRG00005007532) atf1 (ENSLCRG00005007527) DIP2B (ENSLCRG00005006700) ATF7 (ENSLCRG00005006682) ENSLCRG00005003910 ncoa5 (ENSLCRG00005003882) ncoa5 (ENSLCRG00005003880) MOV10 (ENSLCRG00005003323) ENSLCRG00005003307 ENSLCRG00005003284 Gilthead seabream MODERN SPECIES 20 calcoco1b (ENSSAUG00010024290) rargb (ENSSAUG00010024248) nr1d4b (ENSSAUG00010024243) ENSSAUG00010024239 ENSSAUG00010024164 LRP1 (ENSSAUG00010024106) ENSSAUG00010024092 ENSSAUG00010024090 ENSSAUG00010024089 ESYT1 (ENSSAUG00010023977) zc3h10 (ENSSAUG00010023971) ENSSAUG00010023969 ENSSAUG00010023967 ENSSAUG00010023966 ##18 sumf1 (ENSSAUG00010023964) #21 ITPR1 (ENSSAUG00010023820) ##22 BHLHE40 (ENSSAUG00010023810) #23 ttll3 (ENSSAUG00010023809) SLC4A8 (ENSSAUG00010023012) SCN8A (ENSSAUG00010022650) METTL7A (ENSSAUG00010022638) METTL7A (ENSSAUG00010022636) atf1 (ENSSAUG00010022635) ENSSAUG00010014281 atf7b (ENSSAUG00010014182) ENSSAUG00010014179 pfdn5 (ENSSAUG00010014167) ENSSAUG00010014165 pfkmb (ENSSAUG00010000876) C1QL4 (ENSSAUG00010000634) SMARCC2 (ENSSAUG00010000608) Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176484 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a ENSGT00940000155746 Pike perch MODERN SPECIES 11 SMUG1 (ENSSLUG00000025926) calcoco1b (ENSSLUG00000025924) rargb (ENSSLUG00000025919) nr1d4b (ENSSLUG00000025918) ENSSLUG00000025917 ENSSLUG00000025912 ENSSLUG00000025909 LRP1 (ENSSLUG00000025739) ENSSLUG00000025581 ESYT1 (ENSSLUG00000025542) zc3h10 (ENSSLUG00000025489) ENSSLUG00000025487 ENSSLUG00000025482 ENSSLUG00000025479 ##18 sumf1 (ENSSLUG00000025466) #21 ITPR1 (ENSSLUG00000025419) ##22 BHLHE40 (ENSSLUG00000025371) #23 ttll3 (ENSSLUG00000025360) ENSSLUG00000025337 ENSSLUG00000025246 METTL7A (ENSSLUG00000025203) ENSSLUG00000025201 atf1 (ENSSLUG00000025199) ENSSLUG00000024172 atf7b (ENSSLUG00000023881) ENSSLUG00000023873 pfdn5 (ENSSLUG00000023867) ENSSLUG00000023861 pfkmb (ENSSLUG00000018589) C1QL4 (ENSSLUG00000018355) SMARCC2 (ENSSLUG00000017992) Channel bull blenny MODERN SPECIES 19 SMUG1 (ENSCGOG00000023473) calcoco1b (ENSCGOG00000023469) rargb (ENSCGOG00000023461) nr1d4b (ENSCGOG00000023460) ENSCGOG00000023458 ENSCGOG00000023447 ENSCGOG00000023446 ENSCGOG00000023400 ENSCGOG00000023398 ENSCGOG00000023397 ESYT1 (ENSCGOG00000023236) zc3h10 (ENSCGOG00000023224) ENSCGOG00000023223 ENSCGOG00000023222 ##18 sumf1 (ENSCGOG00000023206) #21 ITPR1 (ENSCGOG00000021922) ##22 BHLHE40 (ENSCGOG00000021844) #23 ttll3 (ENSCGOG00000021840) SLC4A8 (ENSCGOG00000021394) SCN8A (ENSCGOG00000020443) ENSCGOG00000020408 ENSCGOG00000020406 METTL7A (ENSCGOG00000020401) atf1 (ENSCGOG00000020398) ENSCGOG00000020387 DIP2B (ENSCGOG00000015420) atf7b (ENSCGOG00000015258) ENSCGOG00000015247 pfdn5 (ENSCGOG00000015234) ENSCGOG00000015223 pfkmb (ENSCGOG00000008420) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Lumpfish MODERN SPECIES 20 ENSCLMG00005003928 rargb (ENSCLMG00005003930) nr1d4b (ENSCLMG00005003968) ENSCLMG00005003970 ENSCLMG00005003972 ENSCLMG00005003973 LRP1 (ENSCLMG00005003974) ENSCLMG00005003999 ENSCLMG00005004000 ESYT1 (ENSCLMG00005004011) zc3h10 (ENSCLMG00005008014) ENSCLMG00005008015 ENSCLMG00005008016 ENSCLMG00005008017 ##18 sumf1 (ENSCLMG00005008022) #21 ITPR1 (ENSCLMG00005008378) ##22 ENSCLMG00005009196 BHLHE40 (ENSCLMG00005009198) #23 ttll3 (ENSCLMG00005009199) SLC4A8 (ENSCLMG00005009202) ENSCLMG00005009207 METTL7A (ENSCLMG00005009213) METTL7A (ENSCLMG00005009215) atf1 (ENSCLMG00005009218) ENSCLMG00005009231 atf7b (ENSCLMG00005010134) ENSCLMG00005010136 pfdn5 (ENSCLMG00005010137) pfkmb (ENSCLMG00005010139) C1QL4 (ENSCLMG00005010142) SMARCC2 (ENSCLMG00005010143) Stickleback MODERN SPECIES 281 SMUG1 (ENSGACG00000000609) ENSGACG00000000610 rargb (ENSGACG00000000612) nr1d4b (ENSGACG00000000614) ENSGACG00000000615 ENSGACG00000000617 LRP1 (ENSGACG00000000618) ENSGACG00000000629 ENSGACG00000000630 ENSGACG00000000632 ESYT1 (ENSGACG00000000633) zc3h10 (ENSGACG00000000638) ENSGACG00000000641 ENSGACG00000000643 ##18 sumf1 (ENSGACG00000000644) #21 ITPR1 (ENSGACG00000000653) ##22 BHLHE40 (ENSGACG00000000659) #23 ttll3 (ENSGACG00000000661) SLC4A8 (ENSGACG00000000663) SCN8A (ENSGACG00000000664) ENSGACG00000000665 METTL7A (ENSGACG00000000666) atf1 (ENSGACG00000000667) DIP2B (ENSGACG00000000671) atf7b (ENSGACG00000000679) ENSGACG00000000680 pfdn5 (ENSGACG00000000681) ENSGACG00000000685 pfkmb (ENSGACG00000000687) C1QL4 (ENSGACG00000000692) SMARCC2 (ENSGACG00000000694) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000159286.b ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000175117 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a Zig-zag eel MODERN SPECIES 19 calcoco1b (ENSMAMG00000024425) rargb (ENSMAMG00000003975) nr1d4b (ENSMAMG00000003916) ENSMAMG00000003884 ENSMAMG00000003821 ENSMAMG00000003523 ENSMAMG00000003798 ENSMAMG00000003426 ENSMAMG00000003483 ENSMAMG00000003308 ENSMAMG00000003284 ENSMAMG00000003264 ENSMAMG00000003248 ENSMAMG00000003234 ##18 SUMF1 (ENSMAMG00000003212) #21 ITPR1 (ENSMAMG00000003091) ##22 BHLHE40 (ENSMAMG00000027117) #23 ENSMAMG00000003005 ENSMAMG00000028423 ENSMAMG00000002919 ENSMAMG00000002838 ENSMAMG00000002914 ENSMAMG00000002826 ENSMAMG00000002804 atf1 (ENSMAMG00000002754) ENSMAMG00000002658 atf7b (ENSMAMG00000002633) ENSMAMG00000002616 pfdn5 (ENSMAMG00000002596) ENSMAMG00000002483 pfkmb (ENSMAMG00000002379) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000159286.b ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Climbing perch MODERN SPECIES 18 ENSATEG00000024681 calcoco1b (ENSATEG00000024683) rargb (ENSATEG00000024688) nr1d4b (ENSATEG00000024697) ENSATEG00000024710 ENSATEG00000027510 ENSATEG00000024728 ENSATEG00000028047 ENSATEG00000024745 ENSATEG00000024749 ENSATEG00000024754 ENSATEG00000024756 ENSATEG00000024757 ENSATEG00000000041 ##18 SUMF1 (ENSATEG00000000078) #21 ITPR1 (ENSATEG00000000134) ##22 ENSATEG00000000399 BHLHE40 (ENSATEG00000000419) #23 ENSATEG00000000438 ENSATEG00000000492 ENSATEG00000000605 METTL7A (ENSATEG00000000748) ENSATEG00000000757 atf1 (ENSATEG00000000810) ENSATEG00000000843 atf7b (ENSATEG00000000979) ENSATEG00000001018 pfdn5 (ENSATEG00000025765) ENSATEG00000001063 pfkmb (ENSATEG00000001293) ENSATEG00000001394 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Seriola ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3054 rargb (ENSSLDG00000003597) nr1d4b (ENSSLDG00000003537) ENSSLDG00000003509 ENSSLDG00000003484 ENSSLDG00000003394 ENSSLDG00000003359 LRP1 (ENSSLDG00000002997) ENSSLDG00000002950 ENSSLDG00000002741 zc3h10 (ENSSLDG00000002721) ENSSLDG00000002703 ENSSLDG00000002690 ENSSLDG00000002673 ##18 sumf1 (ENSSLDG00000002625) #21 ENSSLDG00000002574 ITPR1 (ENSSLDG00000002413) ##22 BHLHE40 (ENSSLDG00000002367) #23 ttll3 (ENSSLDG00000002254) SLC4A8 (ENSSLDG00000002171) ENSSLDG00000002161 ENSSLDG00000002051 METTL7A (ENSSLDG00000002028) ENSSLDG00000001971 atf1 (ENSSLDG00000001956) DIP2B (ENSSLDG00000001851) atf7b (ENSSLDG00000001805) ENSSLDG00000001791 pfdn5 (ENSSLDG00000001752) ENSSLDG00000001721 pfkmb (ENSSLDG00000001619) C1QL4 (ENSSLDG00000001588) Greater amberjack MODERN SPECIES 37 calcoco1b (ENSSDUG00000005450) rargb (ENSSDUG00000005479) nr1d4b (ENSSDUG00000005570) ENSSDUG00000005599 ENSSDUG00000005616 ENSSDUG00000005666 LRP1 (ENSSDUG00000005752) ENSSDUG00000005926 ENSSDUG00000005939 ENSSDUG00000005970 zc3h10 (ENSSDUG00000006067) ENSSDUG00000006078 ENSSDUG00000006088 ENSSDUG00000006101 ##18 sumf1 (ENSSDUG00000006107) #21 ITPR1 (ENSSDUG00000006154) ##22 BHLHE40 (ENSSDUG00000006259) #23 ttll3 (ENSSDUG00000006280) SLC4A8 (ENSSDUG00000006304) ENSSDUG00000006339 ENSSDUG00000006351 METTL7A (ENSSDUG00000006402) ENSSDUG00000006421 atf1 (ENSSDUG00000006429) DIP2B (ENSSDUG00000006481) atf7b (ENSSDUG00000006620) ENSSDUG00000006655 pfdn5 (ENSSDUG00000006677) ENSSDUG00000006692 pfkmb (ENSSDUG00000006745) C1QL4 (ENSSDUG00000006802) Barramundi perch MODERN SPECIES 361 calcoco1b (ENSLCAG00010022453) rargb (ENSLCAG00010022459) nr1d4b (ENSLCAG00010022466) ENSLCAG00010022470 ENSLCAG00010022481 LRP1 (ENSLCAG00010022509) ENSLCAG00010022667 ENSLCAG00010022670 ENSLCAG00010022672 ENSLCAG00010022681 zc3h10 (ENSLCAG00010022714) ENSLCAG00010022715 ENSLCAG00010022718 ENSLCAG00010022721 ##18 sumf1 (ENSLCAG00010022723) #21 ITPR1 (ENSLCAG00010022826) ##22 BHLHE40 (ENSLCAG00010023159) #23 ttll3 (ENSLCAG00010023162) SLC4A8 (ENSLCAG00010023262) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000164512.d ENSGT00940000165559 ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000162340 ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a ENSGT00940000155746 Tongue sole MODERN SPECIES 2 ENSCSEG00000003770 ENSCSEG00000003766 ENSCSEG00000003752 ENSCSEG00000003742 ENSCSEG00000003736 ENSCSEG00000003733 ENSCSEG00000003727 ENSCSEG00000003718 ENSCSEG00000003712 ENSCSEG00000003692 zc3h10 (ENSCSEG00000003687) ENSCSEG00000003680 lrrn1 (ENSCSEG00000003677) ##18 sumf1 (ENSCSEG00000003670) #21 ENSCSEG00000003664 ITPR1 (ENSCSEG00000003632) ##22 BHLHE40 (ENSCSEG00000003589) #23 ttll3 (ENSCSEG00000003579) SLC4A8 (ENSCSEG00000003568) fkbp11 (ENSCSEG00000003560) rps26 (ENSCSEG00000003556) IKZF4 (ENSCSEG00000003540) rhebl1 (ENSCSEG00000003537) prkag1 (ENSCSEG00000003526) ACVR1B (ENSCSEG00000003519) ANKRD33 (ENSCSEG00000003516) ENSCSEG00000003507 B4GALNT1 (ENSCSEG00000003497) os9 (ENSCSEG00000003486) ENSCSEG00000003482 ENSCSEG00000003475 Turbot MODERN SPECIES 18 ENSSMAG00000003787 ENSSMAG00000003776 calcoco1b (ENSSMAG00000031294) rargb (ENSSMAG00000003735) nr1d4b (ENSSMAG00000003727) ENSSMAG00000003713 ENSSMAG00000003683 ENSSMAG00000003670 ENSSMAG00000003493 ENSSMAG00000003413 ENSSMAG00000003388 ENSSMAG00000003382 ENSSMAG00000003353 ENSSMAG00000003349 ##18 SUMF1 (ENSSMAG00000003328) #21 ITPR1 (ENSSMAG00000003185) ##22 BHLHE40 (ENSSMAG00000003177) #23 ENSSMAG00000003104 ENSSMAG00000003057 ENSSMAG00000002994 ENSSMAG00000002992 ENSSMAG00000002967 ENSSMAG00000026998 atf1 (ENSSMAG00000002951) ENSSMAG00000002901 atf7b (ENSSMAG00000002864) ENSSMAG00000002838 pfdn5 (ENSSMAG00000002767) ENSSMAG00000002717 pfkmb (ENSSMAG00000002590) ENSSMAG00000002577 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155460.i.a ENSGT00940000157899.b.i ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000165559 ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.l ENSGT01100000263697 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000165559 ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157046.E ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000165559 ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00980000198987 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Clown anemonefish MODERN SPECIES 1463 gch1 (ENSAOCG00000018136) wdhd1 (ENSAOCG00000018123) socs4 (ENSAOCG00000001283) dennd4a (ENSAOCG00000018094) SLC24A1 (ENSAOCG00000001271) HACD3 (ENSAOCG00000017961) slc22a18 (ENSAOCG00000001258) NR2E3 (ENSAOCG00000017874) ENSAOCG00000017812 ##18 sumf1 (ENSAOCG00000017802) #21 ITPR1 (ENSAOCG00000017775) ##22 BHLHE40 (ENSAOCG00000017607) #23 ttll3 (ENSAOCG00000017591) Orange clownfish MODERN SPECIES 20 ENSAPEG00000010123 SMUG1 (ENSAPEG00000010234) calcoco1b (ENSAPEG00000010245) rargb (ENSAPEG00000010265) nr1d4b (ENSAPEG00000010304) ENSAPEG00000010340 ENSAPEG00000010379 LRP1 (ENSAPEG00000010395) ENSAPEG00000010739 ENSAPEG00000010768 ENSAPEG00000010807 zc3h10 (ENSAPEG00000010972) ENSAPEG00000010984 ENSAPEG00000011019 ##18 sumf1 (ENSAPEG00000011031) #21 ITPR1 (ENSAPEG00000011081) ##22 BHLHE40 (ENSAPEG00000011327) #23 ttll3 (ENSAPEG00000011362) SLC4A8 (ENSAPEG00000011398) ENSAPEG00000011472 ENSAPEG00000011878 METTL7A (ENSAPEG00000015243) ENSAPEG00000015252 atf1 (ENSAPEG00000015264) DIP2B (ENSAPEG00000015294) atf7b (ENSAPEG00000015401) ENSAPEG00000015441 pfdn5 (ENSAPEG00000015512) ENSAPEG00000015543 pfkmb (ENSAPEG00000015642) C1QL4 (ENSAPEG00000015692) Spiny chromis MODERN SPECIES 845 ITPR1 (ENSAPOG00000011888) ##22 ENSAPOG00000011913 ENSAPOG00000011967 ENSAPOG00000011985 ENSAPOG00000011995 ENSAPOG00000012002 TOMM34 (ENSAPOG00000012119) YWHAB (ENSAPOG00000012162) ENSAPOG00000012179 RIMS4 (ENSAPOG00000012204) ENSAPOG00000012221 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 287 SMUG1 (ENSSPAG00000000450) calcoco1b (ENSSPAG00000000455) rargb (ENSSPAG00000000478) nr1d4b (ENSSPAG00000000572) FAIM2 (ENSSPAG00000000607) ENSSPAG00000000639 LRP1 (ENSSPAG00000000714) ENSSPAG00000001020 ENSSPAG00000001039 ENSSPAG00000001074 zc3h10 (ENSSPAG00000001210) ENSSPAG00000001218 ENSSPAG00000001239 ENSSPAG00000001270 ##18 sumf1 (ENSSPAG00000001295) #21 ITPR1 (ENSSPAG00000001353) ##22 ENSSPAG00000001533 BHLHE40 (ENSSPAG00000001550) #23 ttll3 (ENSSPAG00000001590) SLC4A8 (ENSSPAG00000001763) ENSSPAG00000001812 ENSSPAG00000001829 ENSSPAG00000001880 METTL7A (ENSSPAG00000001883) ENSSPAG00000001886 atf1 (ENSSPAG00000001901) ENSSPAG00000001939 atf7b (ENSSPAG00000002108) ENSSPAG00000002172 pfdn5 (ENSSPAG00000002202) ENSSPAG00000002233 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT01100000263697 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT01100000263697 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 336 ENSHBUG00000023586 SMUG1 (ENSHBUG00000023504) calcoco1b (ENSHBUG00000023483) rargb (ENSHBUG00000023416) nr1d4b (ENSHBUG00000023324) FAIM2 (ENSHBUG00000000712) ENSHBUG00000023230 LRP1 (ENSHBUG00000023175) ENSHBUG00000022917 ENSHBUG00000022899 ESYT1 (ENSHBUG00000022844) ENSHBUG00000022708 ENSHBUG00000022698 ENSHBUG00000022660 ##18 sumf1 (ENSHBUG00000022655) #21 ITPR1 (ENSHBUG00000022621) ##22 BHLHE40 (ENSHBUG00000022464) #23 ttll3 (ENSHBUG00000022421) SLC4A8 (ENSHBUG00000022255) SCN8A (ENSHBUG00000022167) METTL7A (ENSHBUG00000022097) ENSHBUG00000022094 atf1 (ENSHBUG00000022079) ENSHBUG00000022045 atf7b (ENSHBUG00000021977) ENSHBUG00000021947 ENSHBUG00000021929 pfdn5 (ENSHBUG00000021901) ENSHBUG00000021862 pfkmb (ENSHBUG00000021839) C1QL4 (ENSHBUG00000021812) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a P. nyererei MODERN SPECIES 387 calcoco1b (ENSPNYG00000020722) rargb (ENSPNYG00000020749) nr1d4b (ENSPNYG00000020770) FAIM2 (ENSPNYG00000020800) ENSPNYG00000020829 LRP1 (ENSPNYG00000020856) ENSPNYG00000021012 ENSPNYG00000021026 ENSPNYG00000021055 ESYT1 (ENSPNYG00000021094) zc3h10 (ENSPNYG00000021193) ENSPNYG00000021211 ENSPNYG00000021220 ENSPNYG00000021244 ##18 sumf1 (ENSPNYG00000021256) #21 ITPR1 (ENSPNYG00000021288) ##22 BHLHE40 (ENSPNYG00000021442) #23 ttll3 (ENSPNYG00000021473) SLC4A8 (ENSPNYG00000021516) ENSPNYG00000021539 SCN8A (ENSPNYG00000022365) ENSPNYG00000023285 METTL7A (ENSPNYG00000023287) METTL7A (ENSPNYG00000023291) atf1 (ENSPNYG00000000715) ENSPNYG00000000747 atf7b (ENSPNYG00000000868) ENSPNYG00000000915 pfdn5 (ENSPNYG00000000959) pfkmb (ENSPNYG00000001012) C1QL4 (ENSPNYG00000001109) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Eastern happy MODERN SPECIES 17 SMUG1 (ENSACLG00000003023) calcoco1b (ENSACLG00000003006) nr1d4b (ENSACLG00000002967) rargb (ENSACLG00000002935) FAIM2 (ENSACLG00000002751) ENSACLG00000002393 ENSACLG00000002371 LRP1 (ENSACLG00000002066) ENSACLG00000002044 ENSACLG00000001918 zc3h10 (ENSACLG00000001913) ENSACLG00000001911 ENSACLG00000001884 ENSACLG00000001875 ##18 sumf1 (ENSACLG00000001859) #21 ITPR1 (ENSACLG00000001694) ##22 BHLHE40 (ENSACLG00000001627) #23 ttll3 (ENSACLG00000001577) SLC4A8 (ENSACLG00000001431) ENSACLG00000001414 ENSACLG00000001287 ENSACLG00000001271 METTL7A (ENSACLG00000001264) atf1 (ENSACLG00000001227) ENSACLG00000000889 atf7b (ENSACLG00000000829) ENSACLG00000000812 ENSACLG00000000777 pfdn5 (ENSACLG00000000764) ENSACLG00000000716 pfkmb (ENSACLG00000000634) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1108 ENSMZEG00005001506 SMUG1 (ENSMZEG00005001517) calcoco1b (ENSMZEG00005001536) rargb (ENSMZEG00005001619) nr1d4b (ENSMZEG00005006759) FAIM2 (ENSMZEG00005006808) ENSMZEG00005006839 LRP1 (ENSMZEG00005006900) ENSMZEG00005007083 ENSMZEG00005007098 ESYT1 (ENSMZEG00005007130) ENSMZEG00005007235 ENSMZEG00005007243 ENSMZEG00005007261 ##18 sumf1 (ENSMZEG00005007271) #21 ITPR1 (ENSMZEG00005007310) ##22 BHLHE40 (ENSMZEG00005007442) #23 ttll3 (ENSMZEG00005007478) SLC4A8 (ENSMZEG00005007540) SCN8A (ENSMZEG00005007579) ENSMZEG00005007625 METTL7A (ENSMZEG00005007635) ENSMZEG00005007644 atf1 (ENSMZEG00005007653) ENSMZEG00005007678 atf7b (ENSMZEG00005007737) ENSMZEG00005007762 ENSMZEG00005007771 pfdn5 (ENSMZEG00005007785) ENSMZEG00005007798 pfkmb (ENSMZEG00005007860) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 537 calcoco1b (ENSNBRG00000019137) rargb (ENSNBRG00000019309) nr1d4b (ENSNBRG00000019475) ENSNBRG00000019561 ENSNBRG00000019651 LRP1 (ENSNBRG00000019930) ENSNBRG00000020445 ENSNBRG00000020607 ENSNBRG00000020684 zc3h10 (ENSNBRG00000020931) ENSNBRG00000020959 ENSNBRG00000021001 ENSNBRG00000021070 ##18 sumf1 (ENSNBRG00000021099) #21 ITPR1 (ENSNBRG00000021240) ##22 BHLHE40 (ENSNBRG00000021664) #23 ttll3 (ENSNBRG00000021734) SLC4A8 (ENSNBRG00000022208) Nile tilapia MODERN SPECIES 17 calcoco1b (ENSONIG00000019166) rargb (ENSONIG00000019165) nr1d4b (ENSONIG00000019164) ENSONIG00000019163 ENSONIG00000032603 ENSONIG00000019161 LRP1 (ENSONIG00000019160) ENSONIG00000040848 ENSONIG00000041556 ENSONIG00000019159 ENSONIG00000019155 zc3h10 (ENSONIG00000031123) ENSONIG00000019153 ENSONIG00000021174 ##18 sumf1 (ENSONIG00000035017) #21 ITPR1 (ENSONIG00000019149) ##22 BHLHE40 (ENSONIG00000019148) #23 ttll3 (ENSONIG00000019147) SLC4A8 (ENSONIG00000019142) ENSONIG00000032792 ENSONIG00000019136 METTL7A (ENSONIG00000019135) METTL7A (ENSONIG00000019134) atf1 (ENSONIG00000031865) ENSONIG00000019126 atf7b (ENSONIG00000027466) ENSONIG00000034427 ENSONIG00000019124 pfdn5 (ENSONIG00000037897) ENSONIG00000019117 pfkmb (ENSONIG00000019109) Midas cichlid MODERN SPECIES 1126 ENSACIG00000021627 RBMS2 (ENSACIG00000021779) LRP1 (ENSACIG00000022074) ENSACIG00000022202 ENSACIG00000022232 ENSACIG00000022248 ESYT1 (ENSACIG00000022275) zc3h10 (ENSACIG00000022311) ENSACIG00000022318 ENSACIG00000022325 ENSACIG00000022339 ##18 sumf1 (ENSACIG00000022344) #21 ITPR1 (ENSACIG00000022367) ##22 BHLHE40 (ENSACIG00000022457) #23 ttll3 (ENSACIG00000022517) SLC4A8 (ENSACIG00000022538) ENSACIG00000022562 METTL7A (ENSACIG00000022587) METTL7A (ENSACIG00000022596) atf1 (ENSACIG00000000197) DIP2B (ENSACIG00000000227) atf7b (ENSACIG00000000336) ENSACIG00000000370 pfdn5 (ENSACIG00000000390) pfkmb (ENSACIG00000000412) ENSACIG00000000494 C1QL4 (ENSACIG00000000507) SMARCC2 (ENSACIG00000000535) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155460.i.a ENSGT00940000157899.b.i ENSGT00940000179600 ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j ENSGT00390000001799 ENSGT00940000155569.a.a.e ENSGT00530000063255.A ENSGT00950000182908.B.c.a ENSGT00940000154578.A.c.a.h ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j ENSGT00390000001799 ENSGT00940000155569.a.a.e ENSGT00530000063255.A ENSGT00950000182908.B.c.a ENSGT00940000154578.A.c.a.h ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000156246.d ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 19 rabif (ENSORLG00000030550) kdm5ba (ENSORLG00000014767) nelfcd (ENSORLG00000014746) ENSORLG00000024294 ctsz (ENSORLG00000025883) npepl1 (ENSORLG00000014706) ENSORLG00000014666 ENSORLG00000014615 ENSORLG00000014612 zc3h10 (ENSORLG00000014596) ENSORLG00000024075 ENSORLG00000014588 lrrn1 (ENSORLG00000014579) ##18 sumf1 (ENSORLG00000014571) #21 ENSORLG00000029017 ITPR1 (ENSORLG00000014557) ##22 bhlhe40 (ENSORLG00000014397) #23 tomm34 (ENSORLG00000014386) ENSORLG00000014370 camkvb (ENSORLG00000014299) ENSORLG00000014291 mon1a (ENSORLG00000014273) traip (ENSORLG00000014261) grm6b (ENSORLG00000014253) ##13 comtb (ENSORLG00000014228) ENSORLG00000014212 ccdc120b (ENSORLG00000014183) mbd1b (ENSORLG00000029390) cxxc1b (ENSORLG00000014161) ENSORLG00000029478 tfe3b (ENSORLG00000014134) Chinese medaka MODERN SPECIES 655 GPR25 (ENSOSIG00000018261) inavab (ENSOSIG00000000675) adipor1a (ENSOSIG00000000679) rabif (ENSOSIG00000000689) kdm5ba (ENSOSIG00000000748) nelfcd (ENSOSIG00000001011) ctsz (ENSOSIG00000001028) npepl1 (ENSOSIG00000001035) ENSOSIG00000001253 ESYT1 (ENSOSIG00000001259) zc3h10 (ENSOSIG00000001956) ENSOSIG00000001961 ENSOSIG00000001970 lrrn1 (ENSOSIG00000001976) ##18 sumf1 (ENSOSIG00000002024) #21 ITPR1 (ENSOSIG00000004278) ##22 BHLHE40 (ENSOSIG00000004561) #23 tomm34 (ENSOSIG00000004563) camkvb (ENSOSIG00000006258) ENSOSIG00000006262 mon1a (ENSOSIG00000006264) traip (ENSOSIG00000006266) grm6b (ENSOSIG00000006276) ##13 comtb (ENSOSIG00000006338) SRPK3 (ENSOSIG00000006352) ccdc120b (ENSOSIG00000008730) ENSOSIG00000008731 cxxc1b (ENSOSIG00000008735) tfe3b (ENSOSIG00000008770) gnl3l (ENSOSIG00000008975) ENSOSIG00000009264 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154102.a.h ENSGT00940000154563 ENSGT00390000016889 ENSGT00940000157076.j ENSGT00390000001799 ENSGT00940000155569.a.a.e ENSGT00530000063255.A ENSGT00950000182908.B.c.a ENSGT00940000154578.A.c.a.h ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT01030000234648.a.b.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155317.a.a ENSGT00940000157877.b.h ENSGT00940000154102.b.a.a ENSGT00950000183005.a.a ENSGT00940000166392 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 Indian medaka MODERN SPECIES 8 adipor1a (ENSOMEG00000022844) rabif (ENSOMEG00000022863) kdm5ba (ENSOMEG00000022909) nelfcd (ENSOMEG00000022950) ctsz (ENSOMEG00000022959) npepl1 (ENSOMEG00000000620) ANKRD52 (ENSOMEG00000023020) ENSOMEG00000023050 ENSOMEG00000023063 ESYT1 (ENSOMEG00000023104) zc3h10 (ENSOMEG00000023135) ENSOMEG00000023139 ENSOMEG00000023179 lrrn1 (ENSOMEG00000023199) ##18 sumf1 (ENSOMEG00000023220) #21 ITPR1 (ENSOMEG00000023274) ##22 BHLHE40 (ENSOMEG00000023321) #23 tomm34 (ENSOMEG00000023382) SEMA3F (ENSOMEG00000023448) ENSOMEG00000023475 ormdl1 (ENSOMEG00000023479) camkvb (ENSOMEG00000023496) ENSOMEG00000023525 mon1a (ENSOMEG00000023547) traip (ENSOMEG00000023576) grm6b (ENSOMEG00000023604) ##13 comtb (ENSOMEG00000023614) ENSOMEG00000023630 ENSOMEG00000023641 ccdc120b (ENSOMEG00000023649) mbd1b (ENSOMEG00000023660) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000155460.i.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a ENSGT00940000155746 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.g.a Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000179600 ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a ENSGT00940000155746 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.g.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 34 calcoco1b (ENSKMAG00000017105) rargb (ENSKMAG00000017151) nr1d4b (ENSKMAG00000017198) ENSKMAG00000017226 ENSKMAG00000017246 ENSKMAG00000017377 LRP1 (ENSKMAG00000017429) ENSKMAG00000017755 ENSKMAG00000017762 ESYT1 (ENSKMAG00000017809) zc3h10 (ENSKMAG00000017905) ENSKMAG00000017921 ENSKMAG00000017932 ENSKMAG00000017952 ##18 sumf1 (ENSKMAG00000017964) #21 ITPR1 (ENSKMAG00000018031) ##22 BHLHE40 (ENSKMAG00000018189) #23 SLC4A8 (ENSKMAG00000018228) ENSKMAG00000018319 METTL7A (ENSKMAG00000018368) ENSKMAG00000018387 atf1 (ENSKMAG00000018393) ENSKMAG00000018428 atf7b (ENSKMAG00000018515) ENSKMAG00000018556 pfdn5 (ENSKMAG00000018591) ENSKMAG00000018624 pfkmb (ENSKMAG00000018722) C1QL4 (ENSKMAG00000018817) SMARCC2 (ENSKMAG00000018841) ENSKMAG00000018879 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1618 ENSNFUG00015022581 chrng (ENSNFUG00015022399) ENSNFUG00015022387 ENSNFUG00015022384 ALG3 (ENSNFUG00015022371) MUL1A (ENSNFUG00015022369) ENSNFUG00015022364 ENSNFUG00015022358 mterf4 (ENSNFUG00015022352) BX323035.1 (ENSNFUG00015022345) klhl24a (ENSNFUG00015022336) YEATS2 (ENSNFUG00015022318) MAP6D1 (ENSNFUG00015022307) LRRN1 (ENSNFUG00015022305) ##18 SUMF1 (ENSNFUG00015022298) #21 ITPR1 (ENSNFUG00015022201) ##22 DEC1B (ENSNFUG00015022192) #23 SCN8A (ENSNFUG00015021148) Nfu_g_1_020373 (ENSNFUG00015021061) METTL7A (ENSNFUG00015021059) atf1 (ENSNFUG00015021042) DIP2B (ENSNFUG00015013370) atf7b (ENSNFUG00015013064) ENSNFUG00015013021 pfdn5 (ENSNFUG00015013005) Nfu_g_1_020532 (ENSNFUG00015012999) pfkmb (ENSNFUG00015011281) rap2b (ENSNFUG00015011014) mbnl1 (ENSNFUG00015010941) ENSNFUG00015010907 CUL3 (ENSNFUG00015010799) Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000155460.i.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000157899.a.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a.e ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000004897 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a.f ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a.e ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783.wb ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000183025.b.b.e.b ENSGT00940000156458.e.b ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a.f ENSGT00940000154578.A.c.a.f ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a.e ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783.wb ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a ENSGT00940000155746 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000157899.a.a.f ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a.e.e.b ENSGT00940000154578.A.c.a.f ENSGT00940000154578.A.c.a.e.e.a ENSGT00940000154578.A.c.a.e.f ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783.wb ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a ENSGT00940000155746 Amazon molly MODERN SPECIES 436 nr1d4b (ENSPFOG00000002389) ENSPFOG00000002539 ENSPFOG00000002734 LRP1 (ENSPFOG00000003159) ENSPFOG00000020432 ENSPFOG00000023508 ENSPFOG00000005443 ENSPFOG00000022803 ENSPFOG00000024772 ENSPFOG00000005486 zc3h10 (ENSPFOG00000006164) ENSPFOG00000023050 ENSPFOG00000006183 ENSPFOG00000020284 ##18 sumf1 (ENSPFOG00000006227) #21 ITPR1 (ENSPFOG00000006391) ##22 BHLHE40 (ENSPFOG00000007800) #23 SLC4A8 (ENSPFOG00000007843) SLC4A8 (ENSPFOG00000022041) ENSPFOG00000023583 ENSPFOG00000024830 ENSPFOG00000008334 METTL7A (ENSPFOG00000008735) atf1 (ENSPFOG00000008765) METTL7A (ENSPFOG00000009520) ENSPFOG00000023894 atf7b (ENSPFOG00000009541) ENSPFOG00000009764 pfdn5 (ENSPFOG00000009905) pfdn5 (ENSPFOG00000022611) ENSPFOG00000009979 Sailfin molly MODERN SPECIES 410 RBMS2 (ENSPLAG00000001303) LRP1 (ENSPLAG00000001295) ENSPLAG00000001274 ENSPLAG00000001271 ENSPLAG00000001269 ENSPLAG00000001268 ENSPLAG00000001265 ENSPLAG00000001261 ENSPLAG00000001259 ENSPLAG00000001252 zc3h10 (ENSPLAG00000001248) ENSPLAG00000001247 ENSPLAG00000001243 ENSPLAG00000001238 ##18 sumf1 (ENSPLAG00000001236) #21 ITPR1 (ENSPLAG00000001231) ##22 BHLHE40 (ENSPLAG00000001223) #23 Guppy MODERN SPECIES 457 rargb (ENSPREG00000014967) nr1d4b (ENSPREG00000014985) ENSPREG00000015003 RBMS2 (ENSPREG00000015038) LRP1 (ENSPREG00000015074) ENSPREG00000015217 ENSPREG00000015221 ENSPREG00000015237 ENSPREG00000015250 ESYT1 (ENSPREG00000015274) zc3h10 (ENSPREG00000015323) ENSPREG00000015328 ENSPREG00000015347 ENSPREG00000015389 ##18 sumf1 (ENSPREG00000015396) #21 ITPR1 (ENSPREG00000015441) ##22 BHLHE40 (ENSPREG00000015542) #23 SLC4A8 (ENSPREG00000015577) ENSPREG00000015653 ENSPREG00000015761 METTL7A (ENSPREG00000015888) METTL7A (ENSPREG00000015892) atf1 (ENSPREG00000015905) DIP2B (ENSPREG00000015947) atf7b (ENSPREG00000016109) ENSPREG00000016238 ENSPREG00000016263 pfdn5 (ENSPREG00000016313) ENSPREG00000016334 pfkmb (ENSPREG00000016366) C1QL4 (ENSPREG00000016402) Platyfish MODERN SPECIES 12 rargb (ENSXMAG00000002360) nr1d4b (ENSXMAG00000002339) FAIM2 (ENSXMAG00000002327) RBMS2 (ENSXMAG00000002318) ENSXMAG00000009799 LRP1 (ENSXMAG00000009715) ENSXMAG00000024354 ENSXMAG00000024397 ENSXMAG00000002315 ENSXMAG00000023991 ESYT1 (ENSXMAG00000002295) zc3h10 (ENSXMAG00000002294) ENSXMAG00000022403 ENSXMAG00000020273 ##18 sumf1 (ENSXMAG00000002286) #21 ITPR1 (ENSXMAG00000002253) ##22 BHLHE40 (ENSXMAG00000002248) #23 SLC4A8 (ENSXMAG00000015486) ENSXMAG00000027781 ENSXMAG00000025337 ENSXMAG00000002228 METTL7A (ENSXMAG00000002224) METTL7A (ENSXMAG00000021758) atf1 (ENSXMAG00000002218) ENSXMAG00000002169 atf7b (ENSXMAG00000026180) ENSXMAG00000002156 pfdn5 (ENSXMAG00000002155) ENSXMAG00000002146 pfkmb (ENSXMAG00000002114) C1QL4 (ENSXMAG00000002112) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000155460.i.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166603.d ENSGT00900000141555 ENSGT00940000154578.A.c.a.e ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a ENSGT00940000155746 Mummichog MODERN SPECIES 2397 ENSFHEG00000022417 ENSFHEG00000022377 LRP1 (ENSFHEG00000022320) ENSFHEG00000022053 ENSFHEG00000022041 ENSFHEG00000022024 ENSFHEG00000022010 ESYT1 (ENSFHEG00000021986) zc3h10 (ENSFHEG00000021836) ENSFHEG00000021831 ENSFHEG00000021812 ENSFHEG00000021803 ##18 sumf1 (ENSFHEG00000021785) #21 ITPR1 (ENSFHEG00000021740) ##22 BHLHE40 (ENSFHEG00000021573) #23 SLC4A8 (ENSFHEG00000021528) ENSFHEG00000021455 SCN8A (ENSFHEG00000021302) ENSFHEG00000014018 METTL7A (ENSFHEG00000014015) atf1 (ENSFHEG00000014008) DIP2B (ENSFHEG00000013978) atf7b (ENSFHEG00000013866) ENSFHEG00000013854 pfdn5 (ENSFHEG00000013843) ENSFHEG00000013815 pfkmb (ENSFHEG00000013727) C1QL4 (ENSFHEG00000013618) SMARCC2 (ENSFHEG00000013608) Sheepshead minnow MODERN SPECIES 159 ENSCVAG00000001635 ENSCVAG00000001624 ENSCVAG00000001619 ENSCVAG00000001604 ENSCVAG00000001600 ENSCVAG00000001587 ENSCVAG00000001582 ENSCVAG00000001577 ESYT1 (ENSCVAG00000001564) zc3h10 (ENSCVAG00000001548) ENSCVAG00000001544 ENSCVAG00000001539 ENSCVAG00000001531 ##18 sumf1 (ENSCVAG00000001529) #21 ENSCVAG00000001522 ##22 ITPR1 (ENSCVAG00000001518) ##22 BHLHE40 (ENSCVAG00000001505) #23 SLC4A8 (ENSCVAG00000001496) ENSCVAG00000001491 SCN8A (ENSCVAG00000001487) METTL7A (ENSCVAG00000001480) METTL7A (ENSCVAG00000001477) atf1 (ENSCVAG00000000055) ENSCVAG00000001463 atf7b (ENSCVAG00000001440) ENSCVAG00000001411 pfdn5 (ENSCVAG00000001409) ENSCVAG00000001404 ENSCVAG00000001380 ENSCVAG00000001372 C1QL4 (ENSCVAG00000001364) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Hagfish DUPLICATION Hagfish DUPLICATION Hagfish DUPLICATION Hagfish MODERN SPECIES 960 ENSEBUG00000008050 ENSEBUG00000000513 VKORC1 (ENSEBUG00000002817) ENSEBUG00000015426 ENSEBUG00000016682 ENSEBUG00000010473 CHDH (ENSEBUG00000014498) ENSEBUG00000004829 KDM5A (ENSEBUG00000008683) ENSEBUG00000007798 ENSEBUG00000002491 ENSEBUG00000015967 ENSEBUG00000011272 ENSEBUG00000005231 ##22 ENSEBUG00000017044 ##22 ENSEBUG00000007795 ##22 rras2 (ENSEBUG00000011510) copb1 (ENSEBUG00000010985) ENSEBUG00000011627 ENSEBUG00000005271 Hagfish MODERN SPECIES 960 ENSEBUG00000014882 ENSEBUG00000008863 ENSEBUG00000008050 ENSEBUG00000000513 VKORC1 (ENSEBUG00000002817) ENSEBUG00000015426 ENSEBUG00000016682 ENSEBUG00000010473 CHDH (ENSEBUG00000014498) ENSEBUG00000004829 KDM5A (ENSEBUG00000008683) ENSEBUG00000007798 ENSEBUG00000002491 ENSEBUG00000015967 ENSEBUG00000011272 ENSEBUG00000005231 ##22 ENSEBUG00000017044 ##22 ENSEBUG00000007795 ##22 rras2 (ENSEBUG00000011510) copb1 (ENSEBUG00000010985) ENSEBUG00000011627 ENSEBUG00000005271 Hagfish MODERN SPECIES 960 ENSEBUG00000008863 ENSEBUG00000008050 ENSEBUG00000000513 VKORC1 (ENSEBUG00000002817) ENSEBUG00000015426 ENSEBUG00000016682 ENSEBUG00000010473 CHDH (ENSEBUG00000014498) ENSEBUG00000004829 KDM5A (ENSEBUG00000008683) ENSEBUG00000007798 ENSEBUG00000002491 ENSEBUG00000015967 ENSEBUG00000011272 ENSEBUG00000005231 ##22 ENSEBUG00000017044 ##22 ENSEBUG00000007795 ##22 rras2 (ENSEBUG00000011510) copb1 (ENSEBUG00000010985) ENSEBUG00000011627 ENSEBUG00000005271 Hagfish MODERN SPECIES 269 ENSEBUG00000015563 ENSEBUG00000000333 ENSEBUG00000006720 ENSEBUG00000007577 ENSEBUG00000008860 ##22 ENSEBUG00000006185 ENSEBUG00000004441 ENSEBUG00000009328 #23 ENSEBUG00000007240 ENSEBUG00000012073 TAFA5 (ENSEBUG00000006851) atp5f1e (ENSEBUG00000013718) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000008631.a ENSGT00940000159731 ENSGT01020000230354.A.a ENSGT00940000156326 ENSGT00730000111641 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000166994 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159892 ENSGT00940000155865 ENSGT00890000139436.A.a ENSGT00940000167138 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000155616 Coelacanth MODERN SPECIES 2130 SUMF1 (ENSLACG00000008546) #21 ITPR1 (ENSLACG00000003176) ##22 bhlhe40 (ENSLACG00000001814) #23 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 Anura ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00940000153541.A ENSGT00940000161454.i.a.b ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.B.f.b.b.a ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 11 ENSLLEG00000029572 ENSLLEG00000029582 ENSLLEG00000029655 ENSLLEG00000029737 ENSLLEG00000029755 ENSLLEG00000029766 ENSLLEG00000029776 ENSLLEG00000029788 CNTN4 (ENSLLEG00000029791) #14 ENSLLEG00000029830 #15 TRNT1 (ENSLLEG00000029877) #16 CRBN (ENSLLEG00000030072) #17 LRRN1 (ENSLLEG00000030088) #18 ENSLLEG00000030102 #20 SUMF1 (ENSLLEG00000014064) #21 ITPR1 (ENSLLEG00000014236) ##22 ENSLLEG00000017319 BHLHE40 (ENSLLEG00000017398) #23 ARL8B (ENSLLEG00000017797) #24 EDEM1 (ENSLLEG00000017941) #25 GRM7 (ENSLLEG00000018177) #13 LMCD1 (ENSLLEG00000018847) ENSLLEG00000019021 ENSLLEG00000019153 ENSLLEG00000019332 OXTR (ENSLLEG00000019366) RAD18 (ENSLLEG00000019425) ENSLLEG00000019942 SRGAP3 (ENSLLEG00000019969) TPR (ENSLLEG00000020224) ODR4 (ENSLLEG00000021599) Frog MODERN SPECIES 4 brk1 (ENSXETG00000027883) pick1 (ENSXETG00000010815) tnnc1 (ENSXETG00000010816) ENSXETG00000025093 ENSXETG00000048206 ENSXETG00000045593 ENSXETG00000042663 cntn4 (ENSXETG00000031338) #14 il5ra (ENSXETG00000032117) trnt1 (ENSXETG00000025091) #16 crbn (ENSXETG00000005146) #17 lrrn1 (ENSXETG00000005147) #18 setmar (ENSXETG00000032592) #20 ENSXETG00000039434 sumf1 (ENSXETG00000005149) #21 itpr1 (ENSXETG00000005153) ##22 bhlhe40 (ENSXETG00000035212) #23 arl8b (ENSXETG00000034571) #24 edem1 (ENSXETG00000005217) #25 ENSXETG00000043187 grm7 (ENSXETG00000015711) #13 ENSXETG00000045616 lmcd1 (ENSXETG00000015748) ENSXETG00000035465 XB5956430 [provisional:ssuh2] (ENSXETG00000015781) ENSXETG00000046985 oxtr (ENSXETG00000001441) cav3.1 (ENSXETG00000046990) rad18 (ENSXETG00000033878) ENSXETG00000049418 srgap3 (ENSXETG00000001445) Amniota ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873 ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Platypus MODERN SPECIES 84 SLC6A11 (ENSOANG00000039168) SLC6A1 (ENSOANG00000015178) HRH1 (ENSOANG00000000983) ATG7 (ENSOANG00000002182) VGLL4 (ENSOANG00000014429) CNTN3 (ENSOANG00000021376) CHL1 (ENSOANG00000003342) CNTN6 (ENSOANG00000012175) CNTN4 (ENSOANG00000011370) #14 IL5RA (ENSOANG00000015382) #15 TRNT1 (ENSOANG00000007514) #16 CRBN (ENSOANG00000007513) #17 LRRN1 (ENSOANG00000010239) #18 ENSOANG00000003769 #20 SUMF1 (ENSOANG00000019838) #21 ITPR1 (ENSOANG00000003765) ##22 BHLHE40 (ENSOANG00000038785) #23 ARL8B (ENSOANG00000051209) #24 EDEM1 (ENSOANG00000003763) #25 ENSOANG00000012380 #13 ENSOANG00000002636 ENSOANG00000013668 #13 ENSOANG00000041232 LMCD1 (ENSOANG00000041669) SSUH2 (ENSOANG00000011551) CAV3 (ENSOANG00000044650) OXTR (ENSOANG00000007720) ENSOANG00000046474 SRGAP3 (ENSOANG00000014483) THUMPD3 (ENSOANG00000014481) SETD5 (ENSOANG00000015208) Theria ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Opossum MODERN SPECIES 5 CNTN3 (ENSMODG00000003991) ENSMODG00000049888 ENSMODG00000046603 CHL1 (ENSMODG00000004153) CNTN6 (ENSMODG00000004198) ENSMODG00000051590 ENSMODG00000048583 ENSMODG00000028686 CNTN4 (ENSMODG00000004323) #14 ENSMODG00000004351 #15 TRNT1 (ENSMODG00000004368) #16 CRBN (ENSMODG00000004403) #17 LRRN1 (ENSMODG00000024416) #18 ENSMODG00000004437 #20 SUMF1 (ENSMODG00000045035) #21 ITPR1 (ENSMODG00000004495) ##22 BHLHE40 (ENSMODG00000004516) #23 ARL8B (ENSMODG00000004530) #24 EDEM1 (ENSMODG00000004556) #25 ENSMODG00000042609 ENSMODG00000004592 #13 GRM7 (ENSMODG00000004605) #13 LMCD1 (ENSMODG00000004651) SSUH2 (ENSMODG00000004659) ENSMODG00000045708 OXTR (ENSMODG00000004673) RAD18 (ENSMODG00000004679) SRGAP3 (ENSMODG00000004712) THUMPD3 (ENSMODG00000004715) SETD5 (ENSMODG00000004781) ENSMODG00000039324 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000013359 SHQ1 (ENSSHAG00000015077) GXYLT2 (ENSSHAG00000015594) PPP4R2 (ENSSHAG00000015837) PDZRN3 (ENSSHAG00000016709) ENSSHAG00000010121 ENSSHAG00000010125 CNTN6 (ENSSHAG00000015764) CNTN4 (ENSSHAG00000018520) #14 IL5RA (ENSSHAG00000018837) #15 TRNT1 (ENSSHAG00000018861) #16 CRBN (ENSSHAG00000029768) #17 LRRN1 (ENSSHAG00000027597) #18 ENSSHAG00000030072 #20 SUMF1 (ENSSHAG00000022459) #21 ENSSHAG00000012663 ##22 BHLHE40 (ENSSHAG00000023494) #23 ARL8B (ENSSHAG00000031008) #24 EDEM1 (ENSSHAG00000005432) #25 ENSSHAG00000026569 GRM7 (ENSSHAG00000024593) #13 LMCD1 (ENSSHAG00000008779) SSUH2 (ENSSHAG00000010057) CAV3 (ENSSHAG00000021107) OXTR (ENSSHAG00000011374) RAD18 (ENSSHAG00000012472) SRGAP3 (ENSSHAG00000012943) THUMPD3 (ENSSHAG00000014467) SETD5 (ENSSHAG00000014669) LHFPL4 (ENSSHAG00000030288) MTMR14 (ENSSHAG00000015131) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00940000160159.b ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 koala MODERN SPECIES 180 ENSPCIG00000023089 CNTN4 (ENSPCIG00000000132) #14 IL5RA (ENSPCIG00000030437) #15 TRNT1 (ENSPCIG00000030436) #16 CRBN (ENSPCIG00000030435) #17 ENSPCIG00000015780 LRRN1 (ENSPCIG00000015777) #18 ENSPCIG00000027892 #20 SUMF1 (ENSPCIG00000027894) #21 ITPR1 (ENSPCIG00000027965) ##22 BHLHE40 (ENSPCIG00000035444) #23 ARL8B (ENSPCIG00000028258) #24 EDEM1 (ENSPCIG00000028260) #25 Common wonbat MODERN SPECIES 1012 PDZRN3 (ENSVURG00010008505) ENSVURG00010008548 CNTN3 (ENSVURG00010008586) CHL1 (ENSVURG00010008642) ENSVURG00010008727 CNTN6 (ENSVURG00010008756) ENSVURG00010008843 ENSVURG00010008854 CNTN4 (ENSVURG00010008887) #14 IL5RA (ENSVURG00010008982) #15 TRNT1 (ENSVURG00010008997) #16 CRBN (ENSVURG00010009020) #17 LRRN1 (ENSVURG00010009042) #18 ENSVURG00010009062 #20 SUMF1 (ENSVURG00010009079) #21 ITPR1 (ENSVURG00010009114) ##22 BHLHE40 (ENSVURG00010009249) #23 ARL8B (ENSVURG00010009259) #24 EDEM1 (ENSVURG00010009274) #25 ENSVURG00010009302 ENSVURG00010009325 #13 GRM7 (ENSVURG00010009382) #13 ENSVURG00010009435 ENSVURG00010009440 LMCD1 (ENSVURG00010009459) SSUH2 (ENSVURG00010009470) CAV3 (ENSVURG00010009478) OXTR (ENSVURG00010009486) RAD18 (ENSVURG00010009498) SRGAP3 (ENSVURG00010009588) THUMPD3 (ENSVURG00010010790) Wallaby MODERN SPECIES 5701 ITPR1 (ENSMEUG00000010170) ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 434 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 Sloth MODERN SPECIES 4085 ITPR1 (ENSCHOG00000013309) ##22 Armadillo MODERN SPECIES 4527 CNTN4 (ENSDNOG00000008784) #14 IL5RA (ENSDNOG00000008818) #15 TRNT1 (ENSDNOG00000008837) #16 CRBN (ENSDNOG00000008855) #17 LRRN1 (ENSDNOG00000013430) #18 ENSDNOG00000047048 ENSDNOG00000037330 #20 SUMF1 (ENSDNOG00000004539) #21 ITPR1 (ENSDNOG00000000458) ##22 BHLHE40 (ENSDNOG00000035717) #23 ARL8B (ENSDNOG00000046163) #24 ENSDNOG00000043504 #25 ENSDNOG00000032647 #25 ENSDNOG00000043736 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Elephant MODERN SPECIES 49 GXYLT2 (ENSLAFG00000017357) PPP4R2 (ENSLAFG00000000513) PDZRN3 (ENSLAFG00000014734) ENSLAFG00000026536 ENSLAFG00000031602 CNTN3 (ENSLAFG00000008082) CHL1 (ENSLAFG00000000179) CNTN6 (ENSLAFG00000008927) CNTN4 (ENSLAFG00000011631) #14 IL5RA (ENSLAFG00000011644) #15 TRNT1 (ENSLAFG00000023191) #16 CRBN (ENSLAFG00000017627) #17 LRRN1 (ENSLAFG00000010287) #18 ENSLAFG00000026765 #20 SUMF1 (ENSLAFG00000010276) #21 ITPR1 (ENSLAFG00000002957) ##22 BHLHE40 (ENSLAFG00000004896) #23 ARL8B (ENSLAFG00000007764) #24 EDEM1 (ENSLAFG00000007772) #25 GRM7 (ENSLAFG00000002333) #13 LMCD1 (ENSLAFG00000015653) SSUH2 (ENSLAFG00000010680) CAV3 (ENSLAFG00000030253) OXTR (ENSLAFG00000005307) RAD18 (ENSLAFG00000004667) SRGAP3 (ENSLAFG00000005453) THUMPD3 (ENSLAFG00000005103) SETD5 (ENSLAFG00000008849) LHFPL4 (ENSLAFG00000008855) MTMR14 (ENSLAFG00000010144) ENSLAFG00000029305 Hyrax MODERN SPECIES 3746 ITPR1 (ENSPCAG00000003512) ##22 Tenrec MODERN SPECIES 4477 ITPR1 (ENSETEG00000007311) ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Suina ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Chacoan peccary MODERN SPECIES 950 SHQ1 (ENSCWAG00000020894) GXYLT2 (ENSCWAG00000020910) PPP4R2 (ENSCWAG00000020926) PDZRN3 (ENSCWAG00000020942) CNTN3 (ENSCWAG00000020972) CHL1 (ENSCWAG00000021043) CNTN6 (ENSCWAG00000021190) ENSCWAG00000021205 CNTN4 (ENSCWAG00000021224) #14 IL5RA (ENSCWAG00000021262) #15 TRNT1 (ENSCWAG00000021303) #16 CRBN (ENSCWAG00000021315) #17 LRRN1 (ENSCWAG00000021333) #18 ENSCWAG00000021337 #20 SUMF1 (ENSCWAG00000021351) #21 ITPR1 (ENSCWAG00000021394) ##22 BHLHE40 (ENSCWAG00000021441) #23 ARL8B (ENSCWAG00000021449) #24 EDEM1 (ENSCWAG00000021462) #25 GRM7 (ENSCWAG00000021475) #13 LMCD1 (ENSCWAG00000021516) ENSCWAG00000021523 SSUH2 (ENSCWAG00000021528) CAV3 (ENSCWAG00000021533) OXTR (ENSCWAG00000021536) RAD18 (ENSCWAG00000021543) SRGAP3 (ENSCWAG00000021560) THUMPD3 (ENSCWAG00000021592) SETD5 (ENSCWAG00000021607) LHFPL4 (ENSCWAG00000021645) MTMR14 (ENSCWAG00000021653) Pig MODERN SPECIES 4 ENSSSCG00000048746 ENSSSCG00000058117 ENSSSCG00000048446 ENSSSCG00000050663 CHL1 (ENSSSCG00000011524) CNTN6 (ENSSSCG00000038152) ENSSSCG00000050505 CNTN4 (ENSSSCG00000011527) #14 IL5RA (ENSSSCG00000011528) #15 TRNT1 (ENSSSCG00000011529) #16 CRBN (ENSSSCG00000011530) #17 ENSSSCG00000041465 LRRN1 (ENSSSCG00000023806) #18 ENSSSCG00000011531 #20 SUMF1 (ENSSSCG00000011532) #21 ITPR1 (ENSSSCG00000023437) ##22 BHLHE40 (ENSSSCG00000036136) #23 ARL8B (ENSSSCG00000011535) #24 ENSSSCG00000044623 EDEM1 (ENSSSCG00000034197) #25 GRM7 (ENSSSCG00000023891) #13 LMCD1 (ENSSSCG00000011538) SSUH2 (ENSSSCG00000023082) CAV3 (ENSSSCG00000056902) OXTR (ENSSSCG00000021585) RAD18 (ENSSSCG00000026158) SRGAP3 (ENSSSCG00000033624) THUMPD3 (ENSSSCG00000011542) SETD5 (ENSSSCG00000011540) LHFPL4 (ENSSSCG00000011543) MTMR14 (ENSSSCG00000011546) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Arabian camel MODERN SPECIES 8 PPP4R2 (ENSCDRG00005005747) PDZRN3 (ENSCDRG00005005789) CNTN3 (ENSCDRG00005005902) ENSCDRG00005005931 CHL1 (ENSCDRG00005005966) CNTN6 (ENSCDRG00005006079) ENSCDRG00005006107 CNTN4 (ENSCDRG00005006128) #14 TRNT1 (ENSCDRG00005006181) #16 IL5RA (ENSCDRG00005006219) #15 CRBN (ENSCDRG00005006474) #17 LRRN1 (ENSCDRG00005006616) #18 ENSCDRG00005006638 #20 ENSCDRG00005006687 SUMF1 (ENSCDRG00005006754) #21 ITPR1 (ENSCDRG00005006971) ##22 BHLHE40 (ENSCDRG00005007592) #23 ARL8B (ENSCDRG00005007624) #24 EDEM1 (ENSCDRG00005007706) #25 ENSCDRG00005007733 GRM7 (ENSCDRG00005007785) #13 LMCD1 (ENSCDRG00005008646) SSUH2 (ENSCDRG00005008739) CAV3 (ENSCDRG00005008785) OXTR (ENSCDRG00005008802) RAD18 (ENSCDRG00005008867) SRGAP3 (ENSCDRG00005009310) THUMPD3 (ENSCDRG00005009741) SETD5 (ENSCDRG00005009836) LHFPL4 (ENSCDRG00005010279) MTMR14 (ENSCDRG00005010357) Alpaca MODERN SPECIES 1118 ITPR1 (ENSVPAG00000007446) ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Pecora ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00960000191185 Bos ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.a.b.a.b.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606.b ENSGT00940000160606.a.a ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000162732 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.b #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00960000191185 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.a.b.a.b.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606.a.a ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000162732 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.b #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00960000191185 Cow MODERN SPECIES 14 GXYLT2 (ENSBTAG00000020481) PPP4R2 (ENSBTAG00000002147) PDZRN3 (ENSBTAG00000018644) CNTN3 (ENSBTAG00000007615) CHL1 (ENSBTAG00000002471) ENSBTAG00000006727 CNTN6 (ENSBTAG00000003592) CNTN4 (ENSBTAG00000033225) #14 IL5RA (ENSBTAG00000000273) #15 TRNT1 (ENSBTAG00000019534) #16 CRBN (ENSBTAG00000019536) #17 LRRN1 (ENSBTAG00000001176) #18 SETMAR (ENSBTAG00000018935) #20 ENSBTAG00000034496 SUMF1 (ENSBTAG00000039855) #21 ITPR1 (ENSBTAG00000020455) ##22 BHLHE40 (ENSBTAG00000009863) #23 ARL8B (ENSBTAG00000012902) #24 ENSBTAG00000052329 #24 EDEM1 (ENSBTAG00000012904) #25 GRM7 (ENSBTAG00000013047) #13 LMCD1 (ENSBTAG00000005431) SSUH2 (ENSBTAG00000005433) CAV3 (ENSBTAG00000022699) OXTR (ENSBTAG00000019772) RAD18 (ENSBTAG00000012142) SRGAP3 (ENSBTAG00000004685) THUMPD3 (ENSBTAG00000003112) SETD5 (ENSBTAG00000019193) LHFPL4 (ENSBTAG00000010916) ENSBTAG00000048523 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 14 PDZRN3 (ENSBIXG00005031380) CNTN3 (ENSBIXG00005031394) ENSBIXG00005031401 CHL1 (ENSBIXG00005031410) ENSBIXG00005031428 CNTN6 (ENSBIXG00005031434) CNTN4 (ENSBIXG00005031442) #14 IL5RA (ENSBIXG00005031445) #15 TRNT1 (ENSBIXG00005031446) #16 CRBN (ENSBIXG00005031447) #17 LRRN1 (ENSBIXG00005031456) #18 ENSBIXG00005031458 SUMF1 (ENSBIXG00005031466) #21 ENSBIXG00005031470 #20 ENSBIXG00005031471 ITPR1 (ENSBIXG00005031482) ##22 BHLHE40 (ENSBIXG00005031493) #23 ARL8B (ENSBIXG00005031495) #24 EDEM1 (ENSBIXG00005001970) #25 ENSBIXG00005029056 GRM7 (ENSBIXG00005028996) #13 LMCD1 (ENSBIXG00005005060) SSUH2 (ENSBIXG00005028895) CAV3 (ENSBIXG00005002263) OXTR (ENSBIXG00005028862) RAD18 (ENSBIXG00005002314) SRGAP3 (ENSBIXG00005005347) THUMPD3 (ENSBIXG00005028624) SETD5 (ENSBIXG00005028549) LHFPL4 (ENSBIXG00005004877) MTMR14 (ENSBIXG00005028344) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT01100000263481.n.a.a.a.b.a.b.a.b.a.a.b.b.b.b ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606.b ENSGT00940000160606.a.a ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000162732 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.b #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Domestic yak MODERN SPECIES 14 CHL1 (ENSBGRG00000022502) CNTN6 (ENSBGRG00000022913) ENSBGRG00000022946 ENSBGRG00000022956 CNTN4 (ENSBGRG00000023008) #14 IL5RA (ENSBGRG00000023363) #15 TRNT1 (ENSBGRG00000023414) #16 ENSBGRG00000023555 CRBN (ENSBGRG00000023591) #17 LRRN1 (ENSBGRG00000023800) #18 ENSBGRG00000023820 ENSBGRG00000023834 ENSBGRG00000023871 #20 ENSBGRG00000023884 SUMF1 (ENSBGRG00000023916) #21 ITPR1 (ENSBGRG00000024500) ##22 BHLHE40 (ENSBGRG00000026121) #23 ARL8B (ENSBGRG00000026129) #24 EDEM1 (ENSBGRG00000026138) #25 GRM7 (ENSBGRG00000026154) #13 ENSBGRG00000026180 ENSBGRG00000026184 LMCD1 (ENSBGRG00000006947) SSUH2 (ENSBGRG00000007163) CAV3 (ENSBGRG00000007247) OXTR (ENSBGRG00000007298) RAD18 (ENSBGRG00000007350) SRGAP3 (ENSBGRG00000007703) ENSBGRG00000008258 THUMPD3 (ENSBGRG00000008275) SETD5 (ENSBGRG00000008315) Wild yak MODERN SPECIES 787 LRRN1 (ENSBMUG00000014171) #18 ENSBMUG00000014196 #20 ENSBMUG00000014207 SUMF1 (ENSBMUG00000014275) #21 ITPR1 (ENSBMUG00000015280) ##22 BHLHE40 (ENSBMUG00000015950) #23 ARL8B (ENSBMUG00000015997) #24 EDEM1 (ENSBMUG00000016011) #25 American bison MODERN SPECIES 3113 TRNT1 (ENSBBBG00000006767) #16 CRBN (ENSBBBG00000014614) #17 LRRN1 (ENSBBBG00000007132) #18 ENSBBBG00000014591 #20 SUMF1 (ENSBBBG00000014575) #21 ITPR1 (ENSBBBG00000003374) ##22 BHLHE40 (ENSBBBG00000001529) #23 ARL8B (ENSBBBG00000013693) #24 EDEM1 (ENSBBBG00000006878) #25 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 10 SHQ1 (ENSOARG00020017477) GXYLT2 (ENSOARG00020017381) PPP4R2 (ENSOARG00020017177) PDZRN3 (ENSOARG00020016919) CNTN3 (ENSOARG00020016622) CHL1 (ENSOARG00020015831) CNTN6 (ENSOARG00020015543) ENSOARG00020015490 CNTN4 (ENSOARG00020015064) #14 TRNT1 (ENSOARG00020014826) #16 CRBN (ENSOARG00020014355) #17 ENSOARG00020014311 LRRN1 (ENSOARG00020014291) #18 ENSOARG00020014205 #20 SUMF1 (ENSOARG00020014038) #21 ITPR1 (ENSOARG00020012519) ##22 BHLHE40 (ENSOARG00020012417) #23 ARL8B (ENSOARG00020012288) #24 EDEM1 (ENSOARG00020012137) #25 ENSOARG00020012075 GRM7 (ENSOARG00020011716) #13 LMCD1 (ENSOARG00020011551) SSUH2 (ENSOARG00020011381) CAV3 (ENSOARG00020011348) OXTR (ENSOARG00020011329) RAD18 (ENSOARG00020011184) SRGAP3 (ENSOARG00020010228) THUMPD3 (ENSOARG00020025485) SETD5 (ENSOARG00020025409) LHFPL4 (ENSOARG00020025385) MTMR14 (ENSOARG00020025368) Goat MODERN SPECIES 14 GXYLT2 (ENSCHIG00000011713) PPP4R2 (ENSCHIG00000006838) PDZRN3 (ENSCHIG00000018984) ENSCHIG00000022511 CNTN3 (ENSCHIG00000015485) CHL1 (ENSCHIG00000015409) CNTN6 (ENSCHIG00000024913) CNTN4 (ENSCHIG00000018077) #14 IL5RA (ENSCHIG00000011708) #15 TRNT1 (ENSCHIG00000007030) #16 CRBN (ENSCHIG00000022897) #17 ENSCHIG00000017211 LRRN1 (ENSCHIG00000009563) #18 ENSCHIG00000019739 #20 SUMF1 (ENSCHIG00000026539) #21 ITPR1 (ENSCHIG00000018318) ##22 BHLHE40 (ENSCHIG00000014557) #23 ARL8B (ENSCHIG00000011960) #24 EDEM1 (ENSCHIG00000011192) #25 ENSCHIG00000008494 #13 ENSCHIG00000021691 GRM7 (ENSCHIG00000000474) #13 LMCD1 (ENSCHIG00000012706) SSUH2 (ENSCHIG00000021708) CAV3 (ENSCHIG00000010009) OXTR (ENSCHIG00000007774) RAD18 (ENSCHIG00000007965) ENSCHIG00000016941 SRGAP3 (ENSCHIG00000019201) THUMPD3 (ENSCHIG00000024037) ENSCHIG00000010782 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1217 CNTN6 (ENSMMSG00000023002) ENSMMSG00000023026 CNTN4 (ENSMMSG00000023037) #14 IL5RA (ENSMMSG00000023050) #15 TRNT1 (ENSMMSG00000023102) #16 CRBN (ENSMMSG00000023112) #17 LRRN1 (ENSMMSG00000023149) #18 ENSMMSG00000023154 #20 SUMF1 (ENSMMSG00000023161) #21 ITPR1 (ENSMMSG00000023236) ##22 BHLHE40 (ENSMMSG00000023362) #23 ARL8B (ENSMMSG00000023368) #24 EDEM1 (ENSMMSG00000023381) #25 GRM7 (ENSMMSG00000023416) #13 ENSMMSG00000023445 LMCD1 (ENSMMSG00000023464) SSUH2 (ENSMMSG00000023483) CAV3 (ENSMMSG00000023491) OXTR (ENSMMSG00000023495) RAD18 (ENSMMSG00000023505) SRGAP3 (ENSMMSG00000023532) THUMPD3 (ENSMMSG00000023573) SETD5 (ENSMMSG00000023589) LHFPL4 (ENSMMSG00000023624) MTMR14 (ENSMMSG00000023637) Yarkand deer MODERN SPECIES 16 PDZRN3 (ENSCHYG00000026403) CNTN3 (ENSCHYG00000026470) CHL1 (ENSCHYG00000026559) ENSCHYG00000026610 CNTN6 (ENSCHYG00000026622) ENSCHYG00000026685 ENSCHYG00000026687 CNTN4 (ENSCHYG00000026696) #14 IL5RA (ENSCHYG00000026716) #15 TRNT1 (ENSCHYG00000026731) #16 CRBN (ENSCHYG00000026738) #17 ENSCHYG00000026754 ENSCHYG00000026764 ENSCHYG00000026769 #20 SUMF1 (ENSCHYG00000026779) #21 ITPR1 (ENSCHYG00000026821) ##22 BHLHE40 (ENSCHYG00000026844) #23 ARL8B (ENSCHYG00000026850) #24 EDEM1 (ENSCHYG00000026855) #25 ENSCHYG00000026863 GRM7 (ENSCHYG00000026874) #13 LMCD1 (ENSCHYG00000026896) SSUH2 (ENSCHYG00000026901) CAV3 (ENSCHYG00000026911) OXTR (ENSCHYG00000026918) RAD18 (ENSCHYG00000026923) SRGAP3 (ENSCHYG00000013878) THUMPD3 (ENSCHYG00000014272) SETD5 (ENSCHYG00000014430) LHFPL4 (ENSCHYG00000015163) MTMR14 (ENSCHYG00000015234) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00940000156539.r ENSGT00390000018852 Blue whale MODERN SPECIES 2 PPP4R2 (ENSBMSG00010021970) PDZRN3 (ENSBMSG00010021981) ENSBMSG00010021985 ENSBMSG00010021989 CNTN3 (ENSBMSG00010021994) ENSBMSG00010022002 CHL1 (ENSBMSG00010022027) CNTN6 (ENSBMSG00010022054) CNTN4 (ENSBMSG00010022067) #14 IL5RA (ENSBMSG00010022077) #15 TRNT1 (ENSBMSG00010022089) #16 CRBN (ENSBMSG00010022093) #17 LRRN1 (ENSBMSG00010022098) #18 ENSBMSG00010022101 #20 SUMF1 (ENSBMSG00010022107) #21 ENSBMSG00010022122 ##22 BHLHE40 (ENSBMSG00010022124) #23 ARL8B (ENSBMSG00010022125) #24 EDEM1 (ENSBMSG00010022127) #25 GRM7 (ENSBMSG00010022139) #13 ENSBMSG00010022144 LMCD1 (ENSBMSG00010022145) SSUH2 (ENSBMSG00010022152) CAV3 (ENSBMSG00010022159) OXTR (ENSBMSG00010022161) RAD18 (ENSBMSG00010022168) SRGAP3 (ENSBMSG00010022181) THUMPD3 (ENSBMSG00010022188) SETD5 (ENSBMSG00010022193) LHFPL4 (ENSBMSG00010022197) ENSBMSG00010022205 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00940000156539.r ENSGT00390000018852 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00940000156539.r ENSGT00390000018852 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000160975 ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000168733 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00940000156539.r ENSGT00390000018852 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160975 ENSGT00390000012652.ab.a.k ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000168733 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT01000000221469 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00940000154194.kb.b ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00940000156539.r ENSGT00390000018852 Narwhal MODERN SPECIES 310 PDZRN3 (ENSMMNG00015020829) ENSMMNG00015020925 ENSMMNG00015020932 CNTN3 (ENSMMNG00015020954) ENSMMNG00015020993 CHL1 (ENSMMNG00015021112) CNTN6 (ENSMMNG00015021308) ENSMMNG00015021339 CNTN4 (ENSMMNG00015021354) #14 IL5RA (ENSMMNG00015021373) #15 TRNT1 (ENSMMNG00015021404) #16 CRBN (ENSMMNG00015021425) #17 LRRN1 (ENSMMNG00015021441) #18 ENSMMNG00015021455 #20 SUMF1 (ENSMMNG00015021480) #21 ITPR1 (ENSMMNG00015021764) ##22 BHLHE40 (ENSMMNG00015021940) #23 EDEM1 (ENSMMNG00015021945) #25 ENSMMNG00015021948 GRM7 (ENSMMNG00015021949) #13 ENSMMNG00015021951 LMCD1 (ENSMMNG00015021953) SSUH2 (ENSMMNG00015021955) CAV3 (ENSMMNG00015021970) OXTR (ENSMMNG00015021973) RAD18 (ENSMMNG00015021977) SRGAP3 (ENSMMNG00015021982) THUMPD3 (ENSMMNG00015021984) SETD5 (ENSMMNG00015009941) ENSMMNG00015010075 MTMR14 (ENSMMNG00015010221) Beluga whale MODERN SPECIES 28 ENSDLEG00000007621 PDZRN3 (ENSDLEG00000007615) ENSDLEG00000007610 CNTN3 (ENSDLEG00000007338) ENSDLEG00000007271 CHL1 (ENSDLEG00000007131) CNTN6 (ENSDLEG00000004824) ENSDLEG00000004457 CNTN4 (ENSDLEG00000004410) #14 IL5RA (ENSDLEG00000004345) #15 TRNT1 (ENSDLEG00000004312) #16 CRBN (ENSDLEG00000004288) #17 LRRN1 (ENSDLEG00000004270) #18 ENSDLEG00000004264 #20 SUMF1 (ENSDLEG00000004213) #21 ITPR1 (ENSDLEG00000003511) ##22 BHLHE40 (ENSDLEG00000003345) #23 ARL8B (ENSDLEG00000003337) #24 EDEM1 (ENSDLEG00000003247) #25 ENSDLEG00000003215 Vaquita MODERN SPECIES 2 ENSPSNG00000021970 PDZRN3 (ENSPSNG00000021932) ENSPSNG00000021907 CNTN3 (ENSPSNG00000021869) ENSPSNG00000021840 CHL1 (ENSPSNG00000021694) CNTN6 (ENSPSNG00000021579) ENSPSNG00000021554 CNTN4 (ENSPSNG00000021522) #14 IL5RA (ENSPSNG00000021430) #15 TRNT1 (ENSPSNG00000021385) #16 CRBN (ENSPSNG00000021316) #17 LRRN1 (ENSPSNG00000021271) #18 ENSPSNG00000021260 #20 SUMF1 (ENSPSNG00000021203) #21 ITPR1 (ENSPSNG00000020755) ##22 BHLHE40 (ENSPSNG00000020577) #23 ARL8B (ENSPSNG00000020515) #24 EDEM1 (ENSPSNG00000020473) #25 ENSPSNG00000020429 ENSPSNG00000020416 GRM7 (ENSPSNG00000020266) #13 LMCD1 (ENSPSNG00000020193) SSUH2 (ENSPSNG00000020116) CAV3 (ENSPSNG00000020071) OXTR (ENSPSNG00000020047) RAD18 (ENSPSNG00000019957) SRGAP3 (ENSPSNG00000019609) THUMPD3 (ENSPSNG00000019527) SETD5 (ENSPSNG00000019261) LHFPL4 (ENSPSNG00000019162) Dolphin MODERN SPECIES 1040 ITPR1 (ENSTTRG00000014451) ##22 Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 9 ENSPCTG00005017078 PDZRN3 (ENSPCTG00005016884) ENSPCTG00005016762 CNTN3 (ENSPCTG00005016649) ENSPCTG00005016580 CHL1 (ENSPCTG00005016433) ENSPCTG00005016393 CNTN6 (ENSPCTG00005016124) CNTN4 (ENSPCTG00005011901) #14 IL5RA (ENSPCTG00005011305) #15 TRNT1 (ENSPCTG00005011251) #16 CRBN (ENSPCTG00005011120) #17 LRRN1 (ENSPCTG00005011097) #18 ENSPCTG00005011064 #20 SUMF1 (ENSPCTG00005010949) #21 ENSPCTG00005010893 ##22 BHLHE40 (ENSPCTG00005010857) #23 ARL8B (ENSPCTG00005010834) #24 EDEM1 (ENSPCTG00005010722) #25 ENSPCTG00005010694 ENSPCTG00005010665 GRM7 (ENSPCTG00005010372) #13 ENSPCTG00005010301 ENSPCTG00005010267 CAV3 (ENSPCTG00005010229) OXTR (ENSPCTG00005010180) RAD18 (ENSPCTG00005009968) THUMPD3 (ENSPCTG00005009829) SETD5 (ENSPCTG00005009250) LHFPL4 (ENSPCTG00005009157) ENSPCTG00005009141 Sperm whale MODERN SPECIES 179 ENSPCTG00005013131 ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606.d ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852.c.a ENSGT00390000018852.d Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606.d ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852.c.a ENSGT00390000018852.d Ursidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00390000000263.fb.a ENSGT00940000160080.b ENSGT00940000160606.d ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852.c.a ENSGT00390000018852.d Ursus DUPLICATION Ursus ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E.e ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852.c.a ENSGT00390000018852.d Polar bear MODERN SPECIES 210 LRRN1 (ENSUMAG00000024226) #18 ENSUMAG00000024224 ENSUMAG00000024223 #20 SUMF1 (ENSUMAG00000024222) #21 ITPR1 (ENSUMAG00000020523) ##22 BHLHE40 (ENSUMAG00000019582) #23 ARL8B (ENSUMAG00000019574) #24 EDEM1 (ENSUMAG00000019393) #25 ENSUMAG00000019361 GRM7 (ENSUMAG00000019342) #13 LMCD1 (ENSUMAG00000019308) SSUH2 (ENSUMAG00000019301) CAV3 (ENSUMAG00000019292) ENSUMAG00000019289 RAD18 (ENSUMAG00000019279) ENSUMAG00000019260 THUMPD3 (ENSUMAG00000019241) SETD5 (ENSUMAG00000019048) LHFPL4 (ENSUMAG00000019006) ENSUMAG00000019000 American black bear MODERN SPECIES 4704 ENSUAMG00000009519 ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E.f ##22 American black bear MODERN SPECIES 1096 ENSUAMG00000024275 #20 SUMF1 (ENSUAMG00000024276) #21 ENSUAMG00000024337 ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 14 SHQ1 (ENSAMEG00000015140) GXYLT2 (ENSAMEG00000015150) PPP4R2 (ENSAMEG00000015164) PDZRN3 (ENSAMEG00000025975) ENSAMEG00000011395 ENSAMEG00000023576 ENSAMEG00000013402 CNTN6 (ENSAMEG00000014259) CNTN4 (ENSAMEG00000014387) #14 IL5RA (ENSAMEG00000014490) #15 TRNT1 (ENSAMEG00000014520) #16 CRBN (ENSAMEG00000014541) #17 LRRN1 (ENSAMEG00000018835) #18 ENSAMEG00000015893 #20 SUMF1 (ENSAMEG00000015897) #21 ITPR1 (ENSAMEG00000015900) ##22 BHLHE40 (ENSAMEG00000016060) #23 ARL8B (ENSAMEG00000026834) #24 EDEM1 (ENSAMEG00000016099) #25 ENSAMEG00000028093 GRM7 (ENSAMEG00000027634) #13 LMCD1 (ENSAMEG00000012319) SSUH2 (ENSAMEG00000012342) CAV3 (ENSAMEG00000026850) RAD18 (ENSAMEG00000012375) SRGAP3 (ENSAMEG00000012398) THUMPD3 (ENSAMEG00000011321) SETD5 (ENSAMEG00000011307) LHFPL4 (ENSAMEG00000029596) MTMR14 (ENSAMEG00000016362) CPNE9 (ENSAMEG00000016320) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606.d ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852.d ENSGT00940000159659 ENSGT00940000157794 American mink MODERN SPECIES 259 C9JHK2 (ENSNVIG00000014801) #20 SUMF1 (ENSNVIG00000014740) #21 ENSNVIG00000014725 ITPR1 (ENSNVIG00000013256) ##22 BHLHE40 (ENSNVIG00000013166) #23 ARL8B (ENSNVIG00000013147) #24 EDEM1 (ENSNVIG00000013114) #25 Ferret MODERN SPECIES 163 CNTN3 (ENSMPUG00000017011) ENSMPUG00000020109 ENSMPUG00000017012 CHL1 (ENSMPUG00000017013) ENSMPUG00000020110 CNTN6 (ENSMPUG00000017014) CNTN4 (ENSMPUG00000017015) #14 IL5RA (ENSMPUG00000017016) #15 TRNT1 (ENSMPUG00000017017) #16 CRBN (ENSMPUG00000017018) #17 LRRN1 (ENSMPUG00000020111) #18 ENSMPUG00000017019 ENSMPUG00000017021 #20 SUMF1 (ENSMPUG00000017022) #21 ENSMPUG00000017028 ITPR1 (ENSMPUG00000017024) ##22 BHLHE40 (ENSMPUG00000017029) #23 ENSMPUG00000017030 ARL8B (ENSMPUG00000017035) #24 EDEM1 (ENSMPUG00000017042) #25 ENSMPUG00000017055 ENSMPUG00000020112 GRM7 (ENSMPUG00000017057) #13 ENSMPUG00000020113 LMCD1 (ENSMPUG00000017058) SSUH2 (ENSMPUG00000017059) CAV3 (ENSMPUG00000017061) OXTR (ENSMPUG00000017062) RAD18 (ENSMPUG00000017063) SRGAP3 (ENSMPUG00000017064) ENSMPUG00000017065 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606.d ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852.c.a ENSGT00390000018852.d Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 5 PPP4R2 (ENSVVUG00000013896) ENSVVUG00000013883 ENSVVUG00000013879 CNTN3 (ENSVVUG00000013866) ENSVVUG00000013836 CHL1 (ENSVVUG00000013809) CNTN6 (ENSVVUG00000013018) CNTN4 (ENSVVUG00000012913) #14 IL5RA (ENSVVUG00000012836) #15 TRNT1 (ENSVVUG00000012810) #16 CRBN (ENSVVUG00000012661) #17 LRRN1 (ENSVVUG00000012640) #18 ENSVVUG00000012624 ENSVVUG00000012619 #20 SUMF1 (ENSVVUG00000012610) #21 ENSVVUG00000011191 ##22 ENSVVUG00000009857 ##22 BHLHE40 (ENSVVUG00000009777) #23 ARL8B (ENSVVUG00000009760) #24 EDEM1 (ENSVVUG00000009660) #25 ENSVVUG00000009583 ##13 Red fox MODERN SPECIES 5 ENSVVUG00000013883 ENSVVUG00000013879 CNTN3 (ENSVVUG00000013866) ENSVVUG00000013836 CHL1 (ENSVVUG00000013809) CNTN6 (ENSVVUG00000013018) CNTN4 (ENSVVUG00000012913) #14 IL5RA (ENSVVUG00000012836) #15 TRNT1 (ENSVVUG00000012810) #16 CRBN (ENSVVUG00000012661) #17 LRRN1 (ENSVVUG00000012640) #18 ENSVVUG00000012624 ENSVVUG00000012619 #20 SUMF1 (ENSVVUG00000012610) #21 ENSVVUG00000011191 ##22 ENSVVUG00000009857 ##22 BHLHE40 (ENSVVUG00000009777) #23 ARL8B (ENSVVUG00000009760) #24 EDEM1 (ENSVVUG00000009660) #25 ENSVVUG00000009583 ##13 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606.d ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00550000074855.u.a.a.a.a.b ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852.c.a Dog MODERN SPECIES 12 PDZRN3 (ENSCAFG00845006843) CNTN3 (ENSCAFG00845006575) ENSCAFG00845006474 ENSCAFG00845006445 ENSCAFG00845006097 CNTN6 (ENSCAFG00845005936) CNTN4 (ENSCAFG00845012710) #14 IL5RA (ENSCAFG00845012603) #15 TRNT1 (ENSCAFG00845012496) #16 CRBN (ENSCAFG00845012410) #17 ENSCAFG00845012385 LRRN1 (ENSCAFG00845012344) #18 SETMAR (ENSCAFG00845012243) #20 ENSCAFG00845012212 SUMF1 (ENSCAFG00845012121) #21 ITPR1 (ENSCAFG00845011583) ##22 BHLHE40 (ENSCAFG00845011295) #23 ARL8B (ENSCAFG00845011245) #24 EDEM1 (ENSCAFG00845011142) #25 ENSCAFG00845011042 GRM7 (ENSCAFG00845010858) #13 LMCD1 (ENSCAFG00845010761) SSUH2 (ENSCAFG00845010670) PSMA1 (ENSCAFG00845010623) CAV3 (ENSCAFG00845010595) OXTR (ENSCAFG00845010546) RAD18 (ENSCAFG00845010415) SRGAP3 (ENSCAFG00845010252) THUMPD3 (ENSCAFG00845010175) SETD5 (ENSCAFG00845009873) LHFPL4 (ENSCAFG00845009723) Dingo MODERN SPECIES 236 PDZRN3 (ENSCAFG00020015173) CNTN3 (ENSCAFG00020015151) CHL1 (ENSCAFG00020015069) ENSCAFG00020015018 ENSCAFG00020015005 CNTN4 (ENSCAFG00020014776) #14 IL5RA (ENSCAFG00020014747) #15 TRNT1 (ENSCAFG00020014746) #16 CRBN (ENSCAFG00020014744) #17 LRRN1 (ENSCAFG00020014742) #18 ENSCAFG00020014740 #20 SUMF1 (ENSCAFG00020014738) #21 ITPR1 (ENSCAFG00020009780) ##22 BHLHE40 (ENSCAFG00020009373) #23 ARL8B (ENSCAFG00020009368) #24 EDEM1 (ENSCAFG00020009305) #25 ENSCAFG00020009301 ENSCAFG00020009294 #13 GRM7 (ENSCAFG00020009277) #13 LMCD1 (ENSCAFG00020009259) SSUH2 (ENSCAFG00020009247) ENSCAFG00020009244 CAV3 (ENSCAFG00020009240) OXTR (ENSCAFG00020009232) ENSCAFG00020009230 RAD18 (ENSCAFG00020009228) SRGAP3 (ENSCAFG00020008925) ENSCAFG00020008895 Felidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00390000008694.b.b.d ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Panthera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00390000008694.b.b.d ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000010799.u.b.a.b.a.b ENSGT00390000018852 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000010799.u.b.a.b.a.b ENSGT00390000018852 leopard MODERN SPECIES 119 CNTN6 (ENSPPRG00000002135) CNTN4 (ENSPPRG00000002020) #14 IL5RA (ENSPPRG00000001745) #15 TRNT1 (ENSPPRG00000001327) #16 CRBN (ENSPPRG00000001273) #17 LRRN1 (ENSPPRG00000011605) #18 ENSPPRG00000001161 #20 SUMF1 (ENSPPRG00000001097) #21 ITPR1 (ENSPPRG00000000604) ##22 BHLHE40 (ENSPPRG00000022800) #23 ARL8B (ENSPPRG00000022808) #24 EDEM1 (ENSPPRG00000022849) #25 ENSPPRG00000022876 ENSPPRG00000022899 lion MODERN SPECIES 2 GXYLT2 (ENSPLOG00000002888) PPP4R2 (ENSPLOG00000002914) PDZRN3 (ENSPLOG00000003033) CNTN3 (ENSPLOG00000003083) CHL1 (ENSPLOG00000003228) ENSPLOG00000003473 CNTN6 (ENSPLOG00000003490) ENSPLOG00000003587 CNTN4 (ENSPLOG00000003617) #14 IL5RA (ENSPLOG00000003728) #15 TRNT1 (ENSPLOG00000003771) #16 CRBN (ENSPLOG00000003808) #17 LRRN1 (ENSPLOG00000003838) #18 ENSPLOG00000003853 #20 SUMF1 (ENSPLOG00000003874) #21 ITPR1 (ENSPLOG00000003942) ##22 BHLHE40 (ENSPLOG00000004020) #23 ARL8B (ENSPLOG00000004035) #24 EDEM1 (ENSPLOG00000004057) #25 GRM7 (ENSPLOG00000004096) #13 LMCD1 (ENSPLOG00000004127) SSUH2 (ENSPLOG00000004153) CAV3 (ENSPLOG00000004164) OXTR (ENSPLOG00000004169) RAD18 (ENSPLOG00000004183) SRGAP3 (ENSPLOG00000004214) THUMPD3 (ENSPLOG00000004248) SETD5 (ENSPLOG00000004271) MTMR14 (ENSPLOG00000004371) CPNE9 (ENSPLOG00000004451) BRPF1 (ENSPLOG00000004482) Tiger MODERN SPECIES 83 ENSPTIG00000011266 #20 SUMF1 (ENSPTIG00000011135) #21 ITPR1 (ENSPTIG00000010372) ##22 BHLHE40 (ENSPTIG00000010250) #23 ARL8B (ENSPTIG00000010204) #24 EDEM1 (ENSPTIG00000010198) #25 ENSPTIG00000010162 Cat MODERN SPECIES 1 PPP4R2 (ENSFCAG00000029481) PDZRN3 (ENSFCAG00000040417) CNTN3 (ENSFCAG00000012778) ENSFCAG00000005652 CHL1 (ENSFCAG00000011105) ENSFCAG00000034166 CNTN6 (ENSFCAG00000015456) ENSFCAG00000052641 CNTN4 (ENSFCAG00000000649) #14 IL5RA (ENSFCAG00000000652) #15 TRNT1 (ENSFCAG00000026805) #16 CRBN (ENSFCAG00000026512) #17 LRRN1 (ENSFCAG00000029530) #18 ENSFCAG00000037787 #20 SUMF1 (ENSFCAG00000011512) #21 ITPR1 (ENSFCAG00000002477) ##22 BHLHE40 (ENSFCAG00000034238) #23 ARL8B (ENSFCAG00000000736) #24 EDEM1 (ENSFCAG00000000737) #25 ENSFCAG00000029757 GRM7 (ENSFCAG00000029003) #13 LMCD1 (ENSFCAG00000014723) SSUH2 (ENSFCAG00000014724) CAV3 (ENSFCAG00000035688) OXTR (ENSFCAG00000014726) RAD18 (ENSFCAG00000025747) SRGAP3 (ENSFCAG00000008390) THUMPD3 (ENSFCAG00000006171) SETD5 (ENSFCAG00000005610) LHFPL4 (ENSFCAG00000029519) MTMR14 (ENSFCAG00000014190) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Equus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT01090000263390 ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 Donkey MODERN SPECIES 13 SHQ1 (ENSEASG00005002237) GXYLT2 (ENSEASG00005002247) PPP4R2 (ENSEASG00005002252) PDZRN3 (ENSEASG00005002263) ENSEASG00005002280 ENSEASG00005002560 ENSEASG00005032406 CNTN6 (ENSEASG00005003549) CNTN4 (ENSEASG00005003558) #14 IL5RA (ENSEASG00005003564) #15 TRNT1 (ENSEASG00005003577) #16 CRBN (ENSEASG00005003584) #17 LRRN1 (ENSEASG00005003592) #18 ENSEASG00005032131 #20 SUMF1 (ENSEASG00005003601) #21 ITPR1 (ENSEASG00005004852) ##22 BHLHE40 (ENSEASG00005034761) #23 ARL8B (ENSEASG00005023967) #24 EDEM1 (ENSEASG00005013107) #25 ENSEASG00005031999 GRM7 (ENSEASG00005013291) #13 ENSEASG00005013295 LMCD1 (ENSEASG00005013302) SSUH2 (ENSEASG00005013304) CAV3 (ENSEASG00005033820) OXTR (ENSEASG00005013312) RAD18 (ENSEASG00005013316) SRGAP3 (ENSEASG00005013321) THUMPD3 (ENSEASG00005013327) ENSEASG00005027715 SETD5 (ENSEASG00005013335) Horse MODERN SPECIES 7 SHQ1 (ENSECAG00000015673) GXYLT2 (ENSECAG00000008483) PPP4R2 (ENSECAG00000000689) PDZRN3 (ENSECAG00000014864) CNTN3 (ENSECAG00000013575) CHL1 (ENSECAG00000024808) ENSECAG00000027842 CNTN6 (ENSECAG00000015975) CNTN4 (ENSECAG00000009769) #14 IL5RA (ENSECAG00000022503) #15 TRNT1 (ENSECAG00000014420) #16 CRBN (ENSECAG00000015422) #17 LRRN1 (ENSECAG00000002874) #18 ENSECAG00000011514 #20 SUMF1 (ENSECAG00000020242) #21 ITPR1 (ENSECAG00000020933) ##22 BHLHE40 (ENSECAG00000015069) #23 ARL8B (ENSECAG00000013084) #24 EDEM1 (ENSECAG00000023369) #25 ENSECAG00000056332 ENSECAG00000048581 GRM7 (ENSECAG00000016171) #13 LMCD1 (ENSECAG00000010791) SSUH2 (ENSECAG00000039589) CAV3 (ENSECAG00000020701) OXTR (ENSECAG00000017844) ENSECAG00000056983 RAD18 (ENSECAG00000010746) SRGAP3 (ENSECAG00000010118) THUMPD3 (ENSECAG00000002016) ENSECAG00000057920 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 Megabat MODERN SPECIES 1339 ITPR1 (ENSPVAG00000010641) ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00530000063868.a ENSGT00940000162493 ENSGT00940000156030 ENSGT00940000157494 ENSGT00940000157262 ENSGT00390000007084.c.b ENSGT00940000155631 ENSGT00940000161296 ENSGT00940000159388 ENSGT00940000159711 ENSGT00950000182998.D ENSGT00940000158855 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 8 PDZRN3 (ENSRFEG00010011914) ENSRFEG00010011970 CNTN3 (ENSRFEG00010012552) CHL1 (ENSRFEG00010012636) CNTN6 (ENSRFEG00010012827) CNTN4 (ENSRFEG00010012870) #14 IL5RA (ENSRFEG00010012950) #15 TRNT1 (ENSRFEG00010013326) #16 CRBN (ENSRFEG00010013551) #17 LRRN1 (ENSRFEG00010013770) #18 SUMF1 (ENSRFEG00010013803) #21 ENSRFEG00010014043 #20 ITPR1 (ENSRFEG00010014134) ##22 BHLHE40 (ENSRFEG00010014606) #23 ARL8B (ENSRFEG00010014676) #24 EDEM1 (ENSRFEG00010014776) #25 TWF2 (ENSRFEG00010014959) TLR9 (ENSRFEG00010015047) ALAS1 (ENSRFEG00010015102) POC1A (ENSRFEG00010015173) DUSP7 (ENSRFEG00010015305) ENSRFEG00010015354 ACY1 (ENSRFEG00010015466) ABHD14A (ENSRFEG00010015875) ABHD14B (ENSRFEG00010015992) PCBP4 (ENSRFEG00010016071) ENSRFEG00010016188 ENSRFEG00010016203 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Tree shrew MODERN SPECIES 4060 SUMF1 (ENSTBEG00000005007) #21 LRRN1 (ENSTBEG00000005658) #18 ITPR1 (ENSTBEG00000006551) ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 169 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b Rabbit MODERN SPECIES 436 ENSOCUG00000023199 CHL1 (ENSOCUG00000004486) ENSOCUG00000037666 CNTN6 (ENSOCUG00000012763) CNTN4 (ENSOCUG00000011025) #14 ENSOCUG00000015601 #15 TRNT1 (ENSOCUG00000008580) #16 CRBN (ENSOCUG00000025795) #17 LRRN1 (ENSOCUG00000023697) #18 ENSOCUG00000036915 ENSOCUG00000036153 ENSOCUG00000026652 #20 SUMF1 (ENSOCUG00000012348) #21 ITPR1 (ENSOCUG00000012148) ##22 ENSOCUG00000015177 #23 ENSOCUG00000014090 #24 EDEM1 (ENSOCUG00000014098) #25 ENSOCUG00000039475 #13 GRM7 (ENSOCUG00000017426) #13 ENSOCUG00000024911 LMCD1 (ENSOCUG00000010136) SSUH2 (ENSOCUG00000014613) CAV3 (ENSOCUG00000005950) RAD18 (ENSOCUG00000000013) Pika MODERN SPECIES 1243 ITPR1 (ENSOPRG00000000696) ##22 BHLHE40 (ENSOPRG00000000735) #23 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 23 CNTN4 (ENSUPAG00010022747) #14 IL5RA (ENSUPAG00010022771) #15 TRNT1 (ENSUPAG00010022775) #16 CRBN (ENSUPAG00010022777) #17 LRRN1 (ENSUPAG00010022779) #18 ENSUPAG00010022780 #20 SUMF1 (ENSUPAG00010022782) #21 ITPR1 (ENSUPAG00010022789) ##22 BHLHE40 (ENSUPAG00010022838) #23 ARL8B (ENSUPAG00010022842) #24 EDEM1 (ENSUPAG00010022843) #25 GRM7 (ENSUPAG00010022847) #13 ENSUPAG00010022848 LMCD1 (ENSUPAG00010022849) SSUH2 (ENSUPAG00010022850) CAV3 (ENSUPAG00010022852) OXTR (ENSUPAG00010022853) RAD18 (ENSUPAG00010022854) SRGAP3 (ENSUPAG00010022863) THUMPD3 (ENSUPAG00010022869) SETD5 (ENSUPAG00010022873) LHFPL4 (ENSUPAG00010022879) MTMR14 (ENSUPAG00010022881) Squirrel MODERN SPECIES 177 CHL1 (ENSSTOG00000003470) CNTN6 (ENSSTOG00000010495) CNTN4 (ENSSTOG00000000147) #14 IL5RA (ENSSTOG00000007367) #15 TRNT1 (ENSSTOG00000000150) #16 CRBN (ENSSTOG00000028102) #17 LRRN1 (ENSSTOG00000020406) #18 ENSSTOG00000025520 #20 SUMF1 (ENSSTOG00000022603) #21 ITPR1 (ENSSTOG00000012015) ##22 BHLHE40 (ENSSTOG00000000793) #23 ARL8B (ENSSTOG00000009294) #24 EDEM1 (ENSSTOG00000009304) #25 ENSSTOG00000024514 #13 Alpin marmot MODERN SPECIES 40 RYBP (ENSMMMG00000006873) SHQ1 (ENSMMMG00000006887) GXYLT2 (ENSMMMG00000006933) ENSMMMG00000006977 PDZRN3 (ENSMMMG00000006989) CNTN3 (ENSMMMG00000007027) CHL1 (ENSMMMG00000007097) CNTN6 (ENSMMMG00000007205) CNTN4 (ENSMMMG00000007297) #14 IL5RA (ENSMMMG00000007442) #15 TRNT1 (ENSMMMG00000007463) #16 CRBN (ENSMMMG00000007485) #17 LRRN1 (ENSMMMG00000007534) #18 ENSMMMG00000007561 #20 SUMF1 (ENSMMMG00000007589) #21 ITPR1 (ENSMMMG00000007640) ##22 BHLHE40 (ENSMMMG00000007823) #23 ARL8B (ENSMMMG00000007850) #24 EDEM1 (ENSMMMG00000007881) #25 GRM7 (ENSMMMG00000008319) #13 LMCD1 (ENSMMMG00000008370) SSUH2 (ENSMMMG00000008390) CAV3 (ENSMMMG00000008414) OXTR (ENSMMMG00000008417) RAD18 (ENSMMMG00000008426) SRGAP3 (ENSMMMG00000008489) THUMPD3 (ENSMMMG00000008539) SETD5 (ENSMMMG00000008559) LHFPL4 (ENSMMMG00000008628) ENSMMMG00000008637 CPNE9 (ENSMMMG00000008660) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 10 GXYLT2 (ENSSVLG00005010448) ENSSVLG00005010375 PDZRN3 (ENSSVLG00005010337) ENSSVLG00005010270 CNTN3 (ENSSVLG00005025887) CHL1 (ENSSVLG00005025877) CNTN6 (ENSSVLG00005025861) CNTN4 (ENSSVLG00005025842) #14 IL5RA (ENSSVLG00005025823) #15 TRNT1 (ENSSVLG00005025808) #16 CRBN (ENSSVLG00005025805) #17 ENSSVLG00005025803 LRRN1 (ENSSVLG00005025801) #18 ENSSVLG00005025798 #20 SUMF1 (ENSSVLG00005025792) #21 ITPR1 (ENSSVLG00005025774) ##22 BHLHE40 (ENSSVLG00005025741) #23 ENSSVLG00005025728 ARL8B (ENSSVLG00005025718) #24 EDEM1 (ENSSVLG00005025704) #25 ENSSVLG00005025696 ENSSVLG00005025690 ENSSVLG00005025685 GRM7 (ENSSVLG00005025662) #13 LMCD1 (ENSSVLG00005025633) SSUH2 (ENSSVLG00005025613) CAV3 (ENSSVLG00005025604) OXTR (ENSSVLG00005025596) RAD18 (ENSSVLG00005025578) SRGAP3 (ENSSVLG00005025521) THUMPD3 (ENSSVLG00005025481) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000154607.b.a.n ENSGT00940000162395 ENSGT01030000234626.C.i.b ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d ENSGT00940000156503 ENSGT00730000111139 ENSGT00530000063564.a ENSGT00800000124177 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000154607.b.a.n ENSGT00940000162395 ENSGT01030000234626.C.i.b ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d ENSGT00940000156503 ENSGT00730000111139 ENSGT00530000063564.a ENSGT00800000124177 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000154607.b.a.n ENSGT00940000162395 ENSGT01030000234626.C.i.b ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d ENSGT00940000156503 ENSGT00730000111139 ENSGT00530000063564.a ENSGT00800000124177 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 128 RYBP (ENSCLAG00000006008) SHQ1 (ENSCLAG00000004206) GXYLT2 (ENSCLAG00000003908) PPP4R2 (ENSCLAG00000003231) PDZRN3 (ENSCLAG00000010964) CNTN3 (ENSCLAG00000009614) CHL1 (ENSCLAG00000006459) CNTN6 (ENSCLAG00000008602) CNTN4 (ENSCLAG00000006463) #14 IL5RA (ENSCLAG00000005656) #15 TRNT1 (ENSCLAG00000005186) #16 CRBN (ENSCLAG00000004930) #17 LRRN1 (ENSCLAG00000004896) #18 ENSCLAG00000005640 #20 SUMF1 (ENSCLAG00000004509) #21 ITPR1 (ENSCLAG00000009445) ##22 BHLHE40 (ENSCLAG00000003841) #23 ARL8B (ENSCLAG00000003184) #24 EDEM1 (ENSCLAG00000004922) #25 GRM7 (ENSCLAG00000004216) #13 ENSCLAG00000003666 SLC22A14 (ENSCLAG00000003320) ENSCLAG00000003124 DLEC1 (ENSCLAG00000006229) PLCD1 (ENSCLAG00000005079) VILL (ENSCLAG00000005376) CTDSPL (ENSCLAG00000004547) ITGA9 (ENSCLAG00000004058) GOLGA4 (ENSCLAG00000005913) LRRFIP2 (ENSCLAG00000003180) MLH1 (ENSCLAG00000004334) Degu MODERN SPECIES 71 CNTN3 (ENSODEG00000006512) ENSODEG00000019392 CHL1 (ENSODEG00000010169) ENSODEG00000019383 ENSODEG00000007284 CNTN6 (ENSODEG00000006499) CNTN4 (ENSODEG00000007155) #14 IL5RA (ENSODEG00000006715) #15 TRNT1 (ENSODEG00000007597) #16 ENSODEG00000008720 #17 ENSODEG00000006737 LRRN1 (ENSODEG00000007430) #18 ENSODEG00000007585 ENSODEG00000006593 #20 SUMF1 (ENSODEG00000007677) #21 ITPR1 (ENSODEG00000007250) ##22 ENSODEG00000008843 #23 ARL8B (ENSODEG00000009293) #24 EDEM1 (ENSODEG00000009933) #25 ENSODEG00000019586 Guinea pig MODERN SPECIES 16 SHQ1 (ENSCPOG00000011443) GXYLT2 (ENSCPOG00000000442) ENSCPOG00000030150 PPP4R2 (ENSCPOG00000036245) PDZRN3 (ENSCPOG00000030488) CNTN3 (ENSCPOG00000003218) CHL1 (ENSCPOG00000014986) CNTN6 (ENSCPOG00000001124) CNTN4 (ENSCPOG00000026863) #14 Il5ra (ENSCPOG00000007845) #15 TRNT1 (ENSCPOG00000007849) #16 CRBN (ENSCPOG00000007851) #17 LRRN1 (ENSCPOG00000006583) #18 ENSCPOG00000019854 #20 SUMF1 (ENSCPOG00000014854) #21 ITPR1 (ENSCPOG00000005053) ##22 BHLHE40 (ENSCPOG00000004014) #23 ENSCPOG00000002434 ENSCPOG00000020709 ARL8B (ENSCPOG00000031098) #24 EDEM1 (ENSCPOG00000031536) #25 GRM7 (ENSCPOG00000001886) #13 DLEC1 (ENSCPOG00000008859) PLCD1 (ENSCPOG00000000596) VILL (ENSCPOG00000029985) CTDSPL (ENSCPOG00000000592) ITGA9 (ENSCPOG00000014650) GOLGA4 (ENSCPOG00000008525) LRRFIP2 (ENSCPOG00000038703) MLH1 (ENSCPOG00000003928) EPM2AIP1 (ENSCPOG00000022371) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 28 ENSHGLG00000003660 ENSHGLG00000032578 ENSHGLG00000002080 ENSHGLG00000042664 ENSHGLG00000003621 CNTN6 (ENSHGLG00000003847) ENSHGLG00000038160 CNTN4 (ENSHGLG00000006279) #14 IL5RA (ENSHGLG00000003211) #15 ENSHGLG00000003649 #16 CRBN (ENSHGLG00000003957) #17 ENSHGLG00000002667 LRRN1 (ENSHGLG00000002701) #18 ENSHGLG00000049868 #20 ENSHGLG00000003230 #21 ENSHGLG00000004549 ##22 ENSHGLG00000003679 #23 ENSHGLG00000033324 ENSHGLG00000048183 ENSHGLG00000042322 ENSHGLG00000039470 ENSHGLG00000002002 ENSHGLG00000001846 #24 ENSHGLG00000002073 #25 ENSHGLG00000050895 ENSHGLG00000044283 ENSHGLG00000042623 ENSHGLG00000046070 ENSHGLG00000040264 ENSHGLG00000002591 ENSHGLG00000032624 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Kangaroo rat MODERN SPECIES 331 Rybp (ENSDORG00000015021) ENSDORG00000029850 Gxylt2 (ENSDORG00000010918) ENSDORG00000023761 Pdzrn3 (ENSDORG00000002686) Cntn3 (ENSDORG00000000121) Chl1 (ENSDORG00000010546) Cntn6 (ENSDORG00000005702) Cntn4 (ENSDORG00000014028) #14 Il5ra (ENSDORG00000014033) #15 Trnt1 (ENSDORG00000014035) #16 Crbn (ENSDORG00000014038) #17 Lrrn1 (ENSDORG00000023814) #18 Setmar (ENSDORG00000026212) #20 Sumf1 (ENSDORG00000006695) #21 Itpr1 (ENSDORG00000005966) ##22 Bhlhe40 (ENSDORG00000028127) #23 Arl8b (ENSDORG00000023904) #24 Edem1 (ENSDORG00000002004) #25 Grm7 (ENSDORG00000007450) #13 Lmcd1 (ENSDORG00000003932) Ssu2 (ENSDORG00000009888) Cav3 (ENSDORG00000023359) Oxtr (ENSDORG00000007711) ENSDORG00000029722 Rad18 (ENSDORG00000001099) ENSDORG00000001101 Thumpd3 (ENSDORG00000003257) Setd5 (ENSDORG00000003260) Lhfpl4 (ENSDORG00000009115) Mtmr14 (ENSDORG00000011006) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00960000189964 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00960000189964 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Golden Hamster MODERN SPECIES 622 Rad54b (ENSMAUG00000013586) Gem (ENSMAUG00000006962) Cdh17 (ENSMAUG00000009983) Tmem67 (ENSMAUG00000001046) ENSMAUG00000021752 Cibar1 (ENSMAUG00000009551) Triqk (ENSMAUG00000012998) Cntn4 (ENSMAUG00000009508) #14 Il5ra (ENSMAUG00000021101) #15 Trnt1 (ENSMAUG00000020707) #16 Crbn (ENSMAUG00000001100) #17 Lrrn1 (ENSMAUG00000005827) #18 ENSMAUG00000009893 Setmar (ENSMAUG00000020081) #20 Sumf1 (ENSMAUG00000014146) #21 Itpr1 (ENSMAUG00000016842) ##22 Bhlhe40 (ENSMAUG00000009803) #23 Arl8b (ENSMAUG00000016691) #24 Edem1 (ENSMAUG00000008525) #25 ENSMAUG00000019900 Grm7 (ENSMAUG00000021392) #13 Lmcd1 (ENSMAUG00000014020) Ssu2 (ENSMAUG00000020801) Cav3 (ENSMAUG00000019157) Oxtr (ENSMAUG00000020582) Rad18 (ENSMAUG00000020642) Srgap3 (ENSMAUG00000020606) Thumpd3 (ENSMAUG00000012250) Setd5 (ENSMAUG00000016093) Lhfpl4 (ENSMAUG00000017801) ENSMAUG00000018733 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 144 Pdzrn3 (ENSCGRG00001017365) ENSCGRG00001003940 Cntn3 (ENSCGRG00001013551) ENSCGRG00001015607 ENSCGRG00001015306 Chl1 (ENSCGRG00001021609) Cntn6 (ENSCGRG00001012547) Cntn4 (ENSCGRG00001005552) #14 Il5ra (ENSCGRG00001023890) #15 Trnt1 (ENSCGRG00001009998) #16 Crbn (ENSCGRG00001014850) #17 Lrrn1 (ENSCGRG00001000760) #18 ENSCGRG00001003904 Setmar (ENSCGRG00001005415) #20 Sumf1 (ENSCGRG00001010527) #21 Itpr1 (ENSCGRG00001019657) ##22 Bhlhe40 (ENSCGRG00001015526) #23 Arl8b (ENSCGRG00001018115) #24 Edem1 (ENSCGRG00001020705) #25 ENSCGRG00001023368 Grm7 (ENSCGRG00001005305) #13 Lmcd1 (ENSCGRG00001009463) Ssu2 (ENSCGRG00001012512) Cav3 (ENSCGRG00001014266) Oxtr (ENSCGRG00001014988) ENSCGRG00001015311 ENSCGRG00001018154 ENSCGRG00001021718 Srgap3 (ENSCGRG00001010935) Thumpd3 (ENSCGRG00001024117) Setd5 (ENSCGRG00001006430) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00960000189964 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 ENSPEMG00000028366 ENSPEMG00000017621 Shq1 (ENSPEMG00000000251) Gxylt2 (ENSPEMG00000005596) Pdzrn3 (ENSPEMG00000019769) Cntn3 (ENSPEMG00000014200) Chl1 (ENSPEMG00000023675) Cntn6 (ENSPEMG00000019384) Cntn4 (ENSPEMG00000020085) #14 Il5ra (ENSPEMG00000000193) #15 Trnt1 (ENSPEMG00000019845) #16 Crbn (ENSPEMG00000020177) #17 Lrrn1 (ENSPEMG00000019903) #18 Setmar (ENSPEMG00000023423) #20 Sumf1 (ENSPEMG00000012549) #21 Itpr1 (ENSPEMG00000018533) ##22 ENSPEMG00000025770 Bhlhe40 (ENSPEMG00000028508) #23 Arl8b (ENSPEMG00000029131) #24 Edem1 (ENSPEMG00000005304) #25 Grm7 (ENSPEMG00000029693) #13 Lmcd1 (ENSPEMG00000013048) Ssu2 (ENSPEMG00000022560) Cav3 (ENSPEMG00000029098) Oxtr (ENSPEMG00000027376) Rad18 (ENSPEMG00000022129) Srgap3 (ENSPEMG00000022268) Thumpd3 (ENSPEMG00000022411) Setd5 (ENSPEMG00000022422) Lhfpl4 (ENSPEMG00000009516) Mtmr14 (ENSPEMG00000007108) Prairie vole MODERN SPECIES 84 ENSMOCG00000009808 Cntn3 (ENSMOCG00000007453) ENSMOCG00000021562 ENSMOCG00000002512 ENSMOCG00000020899 ENSMOCG00000016932 ENSMOCG00000009333 Cntn6 (ENSMOCG00000005399) Cntn4 (ENSMOCG00000013257) #14 Il5ra (ENSMOCG00000015311) #15 Trnt1 (ENSMOCG00000004539) #16 Crbn (ENSMOCG00000019318) #17 Lrrn1 (ENSMOCG00000001702) #18 Setmar (ENSMOCG00000003026) #20 Sumf1 (ENSMOCG00000014598) #21 Itpr1 (ENSMOCG00000002247) ##22 Bhlhe40 (ENSMOCG00000014385) #23 Arl8b (ENSMOCG00000018769) #24 Edem1 (ENSMOCG00000020129) #25 ENSMOCG00000009387 ENSMOCG00000016285 ENSMOCG00000020138 Grm7 (ENSMOCG00000016029) #13 Lmcd1 (ENSMOCG00000013328) Ssu2 (ENSMOCG00000006487) Cav3 (ENSMOCG00000002186) OXTR (ENSMOCG00000002867) Rad18 (ENSMOCG00000009114) Srgap3 (ENSMOCG00000001918) Thumpd3 (ENSMOCG00000020148) Setd5 (ENSMOCG00000021198) Murinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00960000189964 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 Mus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Mouse MODERN SPECIES 15 Rybp (ENSMUSG00000072872) Shq1 (ENSMUSG00000035378) Gxylt2 (ENSMUSG00000030074) Ppp4r2 (ENSMUSG00000052144) Pdzrn3 (ENSMUSG00000035357) Cntn3 (ENSMUSG00000030075) Chl1 (ENSMUSG00000030077) Cntn6 (ENSMUSG00000030092) Cntn4 (ENSMUSG00000064293) #14 Il5ra (ENSMUSG00000005364) #15 Trnt1 (ENSMUSG00000013736) #16 Crbn (ENSMUSG00000005362) #17 Lrrn1 (ENSMUSG00000034648) #18 Setmar (ENSMUSG00000034639) #20 Sumf1 (ENSMUSG00000030101) #21 Itpr1 (ENSMUSG00000030102) ##22 Bhlhe40 (ENSMUSG00000030103) #23 Arl8b (ENSMUSG00000030105) #24 Edem1 (ENSMUSG00000030104) #25 Grm7 (ENSMUSG00000056755) #13 Lmcd1 (ENSMUSG00000057604) Ssu2 (ENSMUSG00000034387) Cav3 (ENSMUSG00000062694) Oxtr (ENSMUSG00000049112) Rad18 (ENSMUSG00000030254) Srgap3 (ENSMUSG00000030257) Thumpd3 (ENSMUSG00000030264) Setd5 (ENSMUSG00000034269) Lhfpl4 (ENSMUSG00000042873) Mtmr14 (ENSMUSG00000030269) Cpne9 (ENSMUSG00000030270) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Steppe mouse MODERN SPECIES 2978 ENSMSIG00000009208 #20 Sumf1 (ENSMSIG00000009243) #21 Itpr1 (ENSMSIG00000009395) ##22 Bhlhe40 (ENSMSIG00000009908) #23 Arl8b (ENSMSIG00000009944) #24 Edem1 (ENSMSIG00000010010) #25 ENSMSIG00000010037 spretus MODERN SPECIES 15 Rybp (MGP_SPRETEiJ_G0029716) Shq1 (MGP_SPRETEiJ_G0029717) Gxylt2 (MGP_SPRETEiJ_G0029718) Ppp4r2 (MGP_SPRETEiJ_G0029719) Pdzrn3 (MGP_SPRETEiJ_G0029720) Cntn3 (MGP_SPRETEiJ_G0029721) Chl1 (MGP_SPRETEiJ_G0029722) Cntn6 (MGP_SPRETEiJ_G0029723) Cntn4 (MGP_SPRETEiJ_G0029724) #14 Il5ra (MGP_SPRETEiJ_G0029725) #15 Trnt1 (MGP_SPRETEiJ_G0029726) #16 Crbn (MGP_SPRETEiJ_G0029727) #17 Lrrn1 (MGP_SPRETEiJ_G0029728) #18 Setmar (MGP_SPRETEiJ_G0029729) #20 Sumf1 (MGP_SPRETEiJ_G0029730) #21 Itpr1 (MGP_SPRETEiJ_G0029731) ##22 Bhlhe40 (MGP_SPRETEiJ_G0029732) #23 Arl8b (MGP_SPRETEiJ_G0029733) #24 Edem1 (MGP_SPRETEiJ_G0029734) #25 Grm7 (MGP_SPRETEiJ_G0029735) #13 Lmcd1 (MGP_SPRETEiJ_G0029736) Ssu2 (MGP_SPRETEiJ_G0029737) Cav3 (MGP_SPRETEiJ_G0029738) Oxtr (MGP_SPRETEiJ_G0029739) Rad18 (MGP_SPRETEiJ_G0029740) Srgap3 (MGP_SPRETEiJ_G0029741) Thumpd3 (MGP_SPRETEiJ_G0029742) Setd5 (MGP_SPRETEiJ_G0029743) Lhfpl4 (MGP_SPRETEiJ_G0029744) Mtmr14 (MGP_SPRETEiJ_G0029745) Cpne9 (MGP_SPRETEiJ_G0029746) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 15 Rybp (MGP_CAROLIEiJ_G0028688) Shq1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028689) Gxylt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028690) Ppp4r2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028691) Pdzrn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028692) Cntn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028693) Chl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028694) Cntn6 (MGP_CAROLIEiJ_G0028695) Cntn4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028696) #14 Il5ra (MGP_CAROLIEiJ_G0028697) #15 Trnt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028698) #16 Crbn (MGP_CAROLIEiJ_G0028699) #17 Lrrn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028700) #18 Setmar (MGP_CAROLIEiJ_G0028701) #20 Sumf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028702) #21 Itpr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028703) ##22 Bhlhe40 (MGP_CAROLIEiJ_G0028704) #23 Arl8b (MGP_CAROLIEiJ_G0028705) #24 Edem1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028706) #25 Grm7 (MGP_CAROLIEiJ_G0028707) #13 Lmcd1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028708) Ssu2 (MGP_CAROLIEiJ_G0028709) Cav3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028710) Oxtr (MGP_CAROLIEiJ_G0028711) Rad18 (MGP_CAROLIEiJ_G0028712) Srgap3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028713) MGP_CAROLIEiJ_G0028714 Setd5 (MGP_CAROLIEiJ_G0028715) Lhfpl4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028716) Mtmr14 (MGP_CAROLIEiJ_G0028717) Cpne9 (MGP_CAROLIEiJ_G0028718) Shrew mouse MODERN SPECIES 11 Rybp (MGP_PahariEiJ_G0022439) Shq1 (MGP_PahariEiJ_G0022440) Gxylt2 (MGP_PahariEiJ_G0022441) Ppp4r2 (MGP_PahariEiJ_G0022442) Pdzrn3 (MGP_PahariEiJ_G0022443) Cntn3 (MGP_PahariEiJ_G0022444) Chl1 (MGP_PahariEiJ_G0022445) Cntn6 (MGP_PahariEiJ_G0022446) MGP_PahariEiJ_G0022447 #14 Il5ra (MGP_PahariEiJ_G0022448) #15 Trnt1 (MGP_PahariEiJ_G0022449) #16 Crbn (MGP_PahariEiJ_G0022450) #17 Lrrn1 (MGP_PahariEiJ_G0022451) #18 Setmar (MGP_PahariEiJ_G0022452) #20 Sumf1 (MGP_PahariEiJ_G0022453) #21 Itpr1 (MGP_PahariEiJ_G0022454) ##22 Bhlhe40 (MGP_PahariEiJ_G0022455) #23 Arl8b (MGP_PahariEiJ_G0022456) #24 Edem1 (MGP_PahariEiJ_G0022457) #25 Grm7 (MGP_PahariEiJ_G0022458) #13 Lmcd1 (MGP_PahariEiJ_G0022459) Ssu2 (MGP_PahariEiJ_G0022460) Cav3 (MGP_PahariEiJ_G0022461) Oxtr (MGP_PahariEiJ_G0022462) Rad18 (MGP_PahariEiJ_G0022463) Srgap3 (MGP_PahariEiJ_G0022464) Thumpd3 (MGP_PahariEiJ_G0022465) Setd5 (MGP_PahariEiJ_G0022466) Lhfpl4 (MGP_PahariEiJ_G0022467) Mtmr14 (MGP_PahariEiJ_G0022468) Cpne9 (MGP_PahariEiJ_G0022469) Rat MODERN SPECIES 14 Gxylt2 (ENSRNOG00000005621) Ppp4r2 (ENSRNOG00000024647) Pdzrn3 (ENSRNOG00000057556) Cntn3 (ENSRNOG00000006144) Chl1 (ENSRNOG00000045771) ENSRNOG00000065903 AABR07061614.1 (ENSRNOG00000032820) Cntn6 (ENSRNOG00000032517) Cntn4 (ENSRNOG00000005652) #14 Il5ra (ENSRNOG00000005954) #15 Trnt1 (ENSRNOG00000006432) #16 Crbn (ENSRNOG00000006534) #17 Lrrn1 (ENSRNOG00000006802) #18 Setmar (ENSRNOG00000006806) #20 Sumf1 (ENSRNOG00000006813) #21 Itpr1 (ENSRNOG00000007104) ##22 AABR07061707.1 (ENSRNOG00000052718) Bhlhe40 (ENSRNOG00000007152) #23 Arl8b (ENSRNOG00000055860) #24 Edem1 (ENSRNOG00000055365) #25 Grm7 (ENSRNOG00000005662) #13 LOC120102505 (ENSRNOG00000042804) ENSRNOG00000064122 Lmcd1 (ENSRNOG00000005690) Ssuh2 (ENSRNOG00000005734) Cav3 (ENSRNOG00000005798) Oxtr (ENSRNOG00000005806) Rad18 (ENSRNOG00000005907) Srgap3 (ENSRNOG00000006509) Thumpd3 (ENSRNOG00000006941) Setd5 (ENSRNOG00000007472) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1692 ENSNGAG00000000188 Cntn4 (ENSNGAG00000000209) #14 Il5ra (ENSNGAG00000008379) #15 Trnt1 (ENSNGAG00000000537) #16 Crbn (ENSNGAG00000005594) #17 ENSNGAG00000016208 Lrrn1 (ENSNGAG00000000839) #18 Setmar (ENSNGAG00000012182) #20 Sumf1 (ENSNGAG00000015609) #21 Itpr1 (ENSNGAG00000010432) ##22 Bhlhe40 (ENSNGAG00000000305) #23 Arl8b (ENSNGAG00000012594) #24 Edem1 (ENSNGAG00000017076) #25 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 45 Pdzrn3 (ENSJJAG00000000291) Cntn3 (ENSJJAG00000012448) ENSJJAG00000000622 Chl1 (ENSJJAG00000020689) ENSJJAG00000017679 Cntn6 (ENSJJAG00000013679) ENSJJAG00000010075 Cntn4 (ENSJJAG00000023102) #14 Il5ra (ENSJJAG00000010396) #15 Trnt1 (ENSJJAG00000018561) #16 Crbn (ENSJJAG00000011234) #17 ENSJJAG00000004639 Lrrn1 (ENSJJAG00000021670) #18 Setmar (ENSJJAG00000024359) #20 Sumf1 (ENSJJAG00000014950) #21 Itpr1 (ENSJJAG00000021325) ##22 ENSJJAG00000015303 ENSJJAG00000022672 #23 Arl8b (ENSJJAG00000017608) #24 Edem1 (ENSJJAG00000007371) #25 ENSJJAG00000015222 ENSJJAG00000017538 Grm7 (ENSJJAG00000023200) #13 ENSJJAG00000016367 Lmcd1 (ENSJJAG00000016825) Ssu2 (ENSJJAG00000023516) Cav3 (ENSJJAG00000024313) Oxtr (ENSJJAG00000016459) ENSJJAG00000021410 Rad18 (ENSJJAG00000001484) ENSJJAG00000000240 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000161421 ENSGT00730000111286 ENSGT00940000160255 ENSGT00730000111360 ENSGT00390000005780.b ENSGT00390000016970 ENSGT00390000000631 ENSGT00390000011082 ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616.c.a ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 78 JAGN1 (ENSPCOG00000023783) IL17RE (ENSPCOG00000020006) IL17RC (ENSPCOG00000021923) CRELD1 (ENSPCOG00000025122) PRRT3 (ENSPCOG00000015921) EMC3 (ENSPCOG00000026029) FANCD2 (ENSPCOG00000014162) BRK1 (ENSPCOG00000020671) VHL (ENSPCOG00000019013) IRAK2 (ENSPCOG00000021515) TATDN2 (ENSPCOG00000025647) GHRL (ENSPCOG00000026754) SEC13 (ENSPCOG00000008292) ENSPCOG00000019692 #20 SUMF1 (ENSPCOG00000014210) #21 ITPR1 (ENSPCOG00000024735) ##22 BHLHE40 (ENSPCOG00000013862) #23 ARL8B (ENSPCOG00000013027) #24 EDEM1 (ENSPCOG00000022489) #25 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 457 IL17RE (ENSPSMG00000009642) IL17RC (ENSPSMG00000009834) CRELD1 (ENSPSMG00000010041) PRRT3 (ENSPSMG00000010092) EMC3 (ENSPSMG00000010117) FANCD2 (ENSPSMG00000010216) ENSPSMG00000010241 ENSPSMG00000010243 ENSPSMG00000010255 VHL (ENSPSMG00000010269) IRAK2 (ENSPSMG00000010285) TATDN2 (ENSPSMG00000010305) GHRL (ENSPSMG00000010345) SEC13 (ENSPSMG00000010410) SUMF1 (ENSPSMG00000010527) #21 ITPR1 (ENSPSMG00000011255) ##22 BHLHE40 (ENSPSMG00000011729) #23 ARL8B (ENSPSMG00000011797) #24 EDEM1 (ENSPSMG00000011828) #25 GRM7 (ENSPSMG00000011892) #13 Bushbaby MODERN SPECIES 130 SHQ1 (ENSOGAG00000003898) GXYLT2 (ENSOGAG00000006647) PPP4R2 (ENSOGAG00000011001) PDZRN3 (ENSOGAG00000031641) CNTN3 (ENSOGAG00000017171) CHL1 (ENSOGAG00000012057) CNTN6 (ENSOGAG00000002731) CNTN4 (ENSOGAG00000007059) #14 IL5RA (ENSOGAG00000007069) #15 CRBN (ENSOGAG00000007077) #17 ENSOGAG00000033945 ENSOGAG00000030861 LRRN1 (ENSOGAG00000027599) #18 ENSOGAG00000024973 #20 SUMF1 (ENSOGAG00000003702) #21 ITPR1 (ENSOGAG00000003704) ##22 BHLHE40 (ENSOGAG00000029762) #23 ARL8B (ENSOGAG00000026863) #24 EDEM1 (ENSOGAG00000003714) #25 ENSOGAG00000025402 ENSOGAG00000034686 #13 ENSOGAG00000025792 GRM7 (ENSOGAG00000004355) #13 ENSOGAG00000027930 LMCD1 (ENSOGAG00000009965) SSUH2 (ENSOGAG00000009967) ENSOGAG00000032668 ENSOGAG00000027853 CAV3 (ENSOGAG00000027025) OXTR (ENSOGAG00000001407) ENSOGAG00000029283 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000162026 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 1731 ENSTSYG00000035437 ##22 Tarsier MODERN SPECIES 3671 ENSTSYG00000013441 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153510.a.f ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000169558 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000169558 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158065 ENSGT00490000044176.b.b ENSGT00940000160975.g ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00490000044176.b.b ENSGT00940000160975.g ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000153272.a.b.o.b.b ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00390000017443.q ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 Gorilla MODERN SPECIES 16 CHL1 (ENSGGOG00000008679) ENSGGOG00000025042 CNTN6 (ENSGGOG00000002403) ENSGGOG00000023041 CNTN4 (ENSGGOG00000001075) #14 IL5RA (ENSGGOG00000001078) #15 TRNT1 (ENSGGOG00000015286) #16 CRBN (ENSGGOG00000008850) #17 LRRN1 (ENSGGOG00000022843) #18 ENSGGOG00000041496 SETMAR (ENSGGOG00000004932) SUMF1 (ENSGGOG00000015942) #21 ITPR1 (ENSGGOG00000005486) ##22 BHLHE40 (ENSGGOG00000015864) #23 ARL8B (ENSGGOG00000004952) #24 EDEM1 (ENSGGOG00000002037) #25 ENSGGOG00000041394 ENSGGOG00000026240 GRM7 (ENSGGOG00000034996) #13 ENSGGOG00000036793 LMCD1 (ENSGGOG00000013915) SSUH2 (ENSGGOG00000025443) CAV3 (ENSGGOG00000000136) OXTR (ENSGGOG00000011995) ENSGGOG00000037974 RAD18 (ENSGGOG00000008391) SRGAP3 (ENSGGOG00000011175) THUMPD3 (ENSGGOG00000000604) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00390000017443.q ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 Pan ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160080 ENSGT00910000147531.a ENSGT00860000135570.a.a.d ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00390000017443.q ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 Chimpanzee MODERN SPECIES 16 CHL1 (ENSPTRG00000014558) ENSPTRG00000043272 ENSPTRG00000047628 CNTN6 (ENSPTRG00000014560) CNTN4 (ENSPTRG00000014562) #14 IL5RA (ENSPTRG00000014563) #15 TRNT1 (ENSPTRG00000014564) #16 CRBN (ENSPTRG00000014565) #17 LRRN1 (ENSPTRG00000014566) #18 ENSPTRG00000051411 SETMAR (ENSPTRG00000047540) SUMF1 (ENSPTRG00000014568) #21 ITPR1 (ENSPTRG00000014570) ##22 BHLHE40 (ENSPTRG00000014571) #23 ARL8B (ENSPTRG00000014572) #24 EDEM1 (ENSPTRG00000014573) #25 ENSPTRG00000043253 GRM7 (ENSPTRG00000014576) #13 LMCD1 (ENSPTRG00000014579) SSUH2 (ENSPTRG00000014580) CAV3 (ENSPTRG00000014581) OXTR (ENSPTRG00000014582) ENSPTRG00000044052 RAD18 (ENSPTRG00000014583) SRGAP3 (ENSPTRG00000023245) THUMPD3 (ENSPTRG00000014585) SETD5 (ENSPTRG00000014586) LHFPL4 (ENSPTRG00000014587) Bonobo MODERN SPECIES 16 CHL1 (ENSPPAG00000043754) ENSPPAG00000036787 ENSPPAG00000029596 CNTN6 (ENSPPAG00000030653) CNTN4 (ENSPPAG00000030378) #14 IL5RA (ENSPPAG00000043636) #15 TRNT1 (ENSPPAG00000043566) #16 CRBN (ENSPPAG00000043835) #17 LRRN1 (ENSPPAG00000019340) #18 ENSPPAG00000040514 SETMAR (ENSPPAG00000039860) SUMF1 (ENSPPAG00000031782) #21 ITPR1 (ENSPPAG00000040602) ##22 BHLHE40 (ENSPPAG00000033029) #23 ARL8B (ENSPPAG00000043156) #24 EDEM1 (ENSPPAG00000028465) #25 GRM7 (ENSPPAG00000031004) #13 ENSPPAG00000041288 ENSPPAG00000034040 SSUH2 (ENSPPAG00000034342) CAV3 (ENSPPAG00000041648) ENSPPAG00000028316 RAD18 (ENSPPAG00000035797) SRGAP3 (ENSPPAG00000038210) THUMPD3 (ENSPPAG00000025852) SETD5 (ENSPPAG00000040908) LHFPL4 (ENSPPAG00000041973) ENSPPAG00000003279 Human MODERN SPECIES 15 CHL1 (ENSG00000134121) CNTN6 (ENSG00000134115) CNTN4 (ENSG00000144619) #14 IL5RA (ENSG00000091181) #15 TRNT1 (ENSG00000072756) #16 CRBN (ENSG00000113851) #17 SUMF1 (ENSG00000144455) #21 LRRN1 (ENSG00000175928) #18 SETMAR (ENSG00000170364) ITPR1 (ENSG00000150995) ##22 BHLHE40 (ENSG00000134107) #23 ARL8B (ENSG00000134108) #24 EDEM1 (ENSG00000134109) #25 GRM7 (ENSG00000196277) #13 LMCD1 (ENSG00000071282) SSUH2 (ENSG00000125046) CAV3 (ENSG00000182533) OXTR (ENSG00000180914) RAD18 (ENSG00000070950) SRGAP3 (ENSG00000196220) THUMPD3 (ENSG00000134077) SETD5 (ENSG00000168137) LHFPL4 (ENSG00000156959) MTMR14 (ENSG00000163719) CPNE9 (ENSG00000144550) Orangutan MODERN SPECIES 16 GXYLT2 (ENSPPYG00000013716) PPP4R2 (ENSPPYG00000013715) PDZRN3 (ENSPPYG00000013713) CNTN3 (ENSPPYG00000013710) CHL1 (ENSPPYG00000013709) ENSPPYG00000013708 CNTN6 (ENSPPYG00000013706) ENSPPYG00000033051 CNTN4 (ENSPPYG00000013704) #14 IL5RA (ENSPPYG00000013703) #15 TRNT1 (ENSPPYG00000013702) #16 CRBN (ENSPPYG00000013701) #17 LRRN1 (ENSPPYG00000013700) #18 SETMAR (ENSPPYG00000038930) SUMF1 (ENSPPYG00000013698) #21 ITPR1 (ENSPPYG00000013697) ##22 BHLHE40 (ENSPPYG00000013696) #23 ENSPPYG00000037656 ARL8B (ENSPPYG00000013694) #24 EDEM1 (ENSPPYG00000013692) #25 GRM7 (ENSPPYG00000013691) #13 LMCD1 (ENSPPYG00000029530) SSUH2 (ENSPPYG00000034055) ENSPPYG00000032602 OXTR (ENSPPYG00000013689) RAD18 (ENSPPYG00000013688) SRGAP3 (ENSPPYG00000013687) THUMPD3 (ENSPPYG00000029461) ENSPPYG00000039709 SETD5 (ENSPPYG00000013685) LHFPL4 (ENSPPYG00000031280) Gibbon MODERN SPECIES 13 PDZRN3 (ENSNLEG00000002833) ENSNLEG00000036254 CNTN3 (ENSNLEG00000002884) CHL1 (ENSNLEG00000002952) CNTN6 (ENSNLEG00000003079) ENSNLEG00000029240 ENSNLEG00000034611 CNTN4 (ENSNLEG00000003113) #14 IL5RA (ENSNLEG00000003193) #15 TRNT1 (ENSNLEG00000003226) #16 CRBN (ENSNLEG00000003256) #17 LRRN1 (ENSNLEG00000003325) #18 ENSNLEG00000003327 SETMAR (ENSNLEG00000003331) SUMF1 (ENSNLEG00000003334) #21 ITPR1 (ENSNLEG00000003382) ##22 ENSNLEG00000003704 #23 ARL8B (ENSNLEG00000034641) #24 EDEM1 (ENSNLEG00000003738) #25 ENSNLEG00000036159 ENSNLEG00000032377 #13 ENSNLEG00000003761 #13 ENSNLEG00000034183 LMCD1 (ENSNLEG00000003766) SSUH2 (ENSNLEG00000003778) CAV3 (ENSNLEG00000003781) OXTR (ENSNLEG00000029699) ENSNLEG00000029940 RAD18 (ENSNLEG00000003789) SRGAP3 (ENSNLEG00000003842) ENSNLEG00000018950 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000169558 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00910000147697 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 Macaca ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c.f ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00950000182926.b.d.c.b.a.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00440000033232.c.f ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01100000263493.a.a.a.b.a.a.a.a.a.a.b.b ENSGT01030000236289.b ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 Rhesus MODERN SPECIES 11 PDZRN3 (ENSMMUG00000012661) ENSMMUG00000051810 CNTN3 (ENSMMUG00000021241) CHL1 (ENSMMUG00000001349) CNTN6 (ENSMMUG00000008549) ENSMMUG00000051943 ENSMMUG00000009425 ENSMMUG00000056158 CNTN4 (ENSMMUG00000001847) #14 IL5RA (ENSMMUG00000001849) #15 TRNT1 (ENSMMUG00000017983) #16 CRBN (ENSMMUG00000017986) #17 LRRN1 (ENSMMUG00000049373) #18 SETMAR (ENSMMUG00000017828) SUMF1 (ENSMMUG00000004734) #21 ITPR1 (ENSMMUG00000012574) ##22 BHLHE40 (ENSMMUG00000056699) #23 ARL8B (ENSMMUG00000008810) #24 EDEM1 (ENSMMUG00000065088) #25 ENSMMUG00000065004 ENSMMUG00000057502 ENSMMUG00000031947 GRM7 (ENSMMUG00000011231) #13 ENSMMUG00000062010 LMCD1 (ENSMMUG00000001814) SSUH2 (ENSMMUG00000009699) CAV3 (ENSMMUG00000053020) OXTR (ENSMMUG00000009703) ENSMMUG00000060249 RAD18 (ENSMMUG00000020013) SRGAP3 (ENSMMUG00000020014) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 ENSMFAG00000048279 SHQ1 (ENSMFAG00000039148) GXYLT2 (ENSMFAG00000044294) PPP4R2 (ENSMFAG00000042258) PDZRN3 (ENSMFAG00000000986) CNTN3 (ENSMFAG00000045446) CHL1 (ENSMFAG00000040804) CNTN6 (ENSMFAG00000001088) CNTN4 (ENSMFAG00000031919) #14 IL5RA (ENSMFAG00000006030) #15 TRNT1 (ENSMFAG00000045113) #16 CRBN (ENSMFAG00000031028) #17 LRRN1 (ENSMFAG00000020302) #18 ENSMFAG00000029288 SUMF1 (ENSMFAG00000040853) #21 ITPR1 (ENSMFAG00000044748) ##22 BHLHE40 (ENSMFAG00000040134) #23 ARL8B (ENSMFAG00000035233) #24 EDEM1 (ENSMFAG00000038359) #25 ENSMFAG00000061059 ENSMFAG00000048887 ENSMFAG00000063438 ENSMFAG00000047622 ENSMFAG00000029998 GRM7 (ENSMFAG00000027785) #13 LMCD1 (ENSMFAG00000033976) SSUH2 (ENSMFAG00000035455) CAV3 (ENSMFAG00000037376) OXTR (ENSMFAG00000037530) ENSMFAG00000030087 RAD18 (ENSMFAG00000028864) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 546 CNTN4 (ENSMNEG00000044169) #14 IL5RA (ENSMNEG00000043242) #15 TRNT1 (ENSMNEG00000037805) #16 CRBN (ENSMNEG00000044270) #17 LRRN1 (ENSMNEG00000021728) #18 ENSMNEG00000013018 SETMAR (ENSMNEG00000045183) SUMF1 (ENSMNEG00000003566) #21 ITPR1 (ENSMNEG00000034253) ##22 BHLHE40 (ENSMNEG00000038264) #23 ARL8B (ENSMNEG00000029717) #24 EDEM1 (ENSMNEG00000034041) #25 ENSMNEG00000021998 GRM7 (ENSMNEG00000031784) #13 LMCD1 (ENSMNEG00000039664) SSUH2 (ENSMNEG00000032764) CAV3 (ENSMNEG00000045110) OXTR (ENSMNEG00000037475) ENSMNEG00000027815 RAD18 (ENSMNEG00000013464) SRGAP3 (ENSMNEG00000028942) ENSMNEG00000032308 THUMPD3 (ENSMNEG00000030529) SETD5 (ENSMNEG00000045236) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 ENSGT00990000203541.a.b Olive baboon MODERN SPECIES 11 PDZRN3 (ENSPANG00000011423) CNTN3 (ENSPANG00000011424) ENSPANG00000049590 CHL1 (ENSPANG00000007743) ENSPANG00000050596 CNTN6 (ENSPANG00000010252) ENSPANG00000041415 #14 ENSPANG00000011250 #14 IL5RA (ENSPANG00000011489) #15 TRNT1 (ENSPANG00000025944) #16 CRBN (ENSPANG00000007745) #17 LRRN1 (ENSPANG00000007804) #18 ENSPANG00000043434 SETMAR (ENSPANG00000005127) SUMF1 (ENSPANG00000023714) #21 ITPR1 (ENSPANG00000016086) ##22 ENSPANG00000045181 #23 ENSPANG00000039685 #23 ARL8B (ENSPANG00000009815) #24 EDEM1 (ENSPANG00000016993) #25 GRM7 (ENSPANG00000005212) #13 LMCD1 (ENSPANG00000001206) SSUH2 (ENSPANG00000009185) CAV3 (ENSPANG00000046040) OXTR (ENSPANG00000005977) RAD18 (ENSPANG00000008855) SRGAP3 (ENSPANG00000008856) THUMPD3 (ENSPANG00000016253) SETD5 (ENSPANG00000005213) LHFPL4 (ENSPANG00000032875) MTMR14 (ENSPANG00000023051) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00910000147055 ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00910000148533 ENSGT00990000203541.a.b Drill MODERN SPECIES 1460 SETMAR (ENSMLEG00000040951) SUMF1 (ENSMLEG00000001562) #21 ITPR1 (ENSMLEG00000027444) ##22 BHLHE40 (ENSMLEG00000031386) #23 ARL8B (ENSMLEG00000038749) #24 EDEM1 (ENSMLEG00000031560) #25 Sooty mangabey MODERN SPECIES 650 SHQ1 (ENSCATG00000041238) GXYLT2 (ENSCATG00000041906) PPP4R2 (ENSCATG00000043982) PDZRN3 (ENSCATG00000011356) CNTN3 (ENSCATG00000034171) CHL1 (ENSCATG00000029263) CNTN6 (ENSCATG00000010690) CNTN4 (ENSCATG00000013943) #14 IL5RA (ENSCATG00000034457) #15 TRNT1 (ENSCATG00000031985) #16 CRBN (ENSCATG00000031208) #17 LRRN1 (ENSCATG00000022421) #18 ENSCATG00000036442 SETMAR (ENSCATG00000030348) SUMF1 (ENSCATG00000041356) #21 ITPR1 (ENSCATG00000041137) ##22 BHLHE40 (ENSCATG00000041297) #23 ARL8B (ENSCATG00000039869) #24 EDEM1 (ENSCATG00000042340) #25 GRM7 (ENSCATG00000039394) #13 ENSCATG00000022769 LMCD1 (ENSCATG00000021322) SSUH2 (ENSCATG00000015257) CAV3 (ENSCATG00000033700) OXTR (ENSCATG00000041051) ENSCATG00000022222 RAD18 (ENSCATG00000039277) SRGAP3 (ENSCATG00000039630) THUMPD3 (ENSCATG00000040999) SETD5 (ENSCATG00000039007) ENSCATG00000002330 Vervet Monkey MODERN SPECIES 14 RYBP (ENSCSAG00000011518) SHQ1 (ENSCSAG00000011514) GXYLT2 (ENSCSAG00000011498) PPP4R2 (ENSCSAG00000011489) PDZRN3 (ENSCSAG00000011455) CNTN3 (ENSCSAG00000011366) CHL1 (ENSCSAG00000011267) CNTN6 (ENSCSAG00000011221) CNTN4 (ENSCSAG00000011111) #14 IL5RA (ENSCSAG00000011082) #15 TRNT1 (ENSCSAG00000011052) #16 CRBN (ENSCSAG00000011049) #17 LRRN1 (ENSCSAG00000018805) #18 SETMAR (ENSCSAG00000011036) SUMF1 (ENSCSAG00000011018) #21 ITPR1 (ENSCSAG00000010951) ##22 BHLHE40 (ENSCSAG00000010905) #23 ARL8B (ENSCSAG00000010899) #24 EDEM1 (ENSCSAG00000010870) #25 ENSCSAG00000018808 GRM7 (ENSCSAG00000010821) #13 LMCD1 (ENSCSAG00000010812) SSUH2 (ENSCSAG00000010807) CAV3 (ENSCSAG00000010794) OXTR (ENSCSAG00000010788) RAD18 (ENSCSAG00000010783) SRGAP3 (ENSCSAG00000010768) THUMPD3 (ENSCSAG00000010753) SETD5 (ENSCSAG00000010734) LHFPL4 (ENSCSAG00000010717) MTMR14 (ENSCSAG00000010706) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 437 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00390000014001.b ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861.c #24 ENSGT00940000157717 #25 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 334 TRNT1 (ENSRBIG00000042632) #16 CRBN (ENSRBIG00000033574) #17 LRRN1 (ENSRBIG00000019182) #18 ENSRBIG00000030277 SETMAR (ENSRBIG00000031230) SUMF1 (ENSRBIG00000032133) #21 ITPR1 (ENSRBIG00000035266) ##22 BHLHE40 (ENSRBIG00000029593) #23 ARL8B (ENSRBIG00000040961) #24 EDEM1 (ENSRBIG00000027489) #25 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 620 LRRN1 (ENSRROG00000014167) #18 ENSRROG00000026881 SETMAR (ENSRROG00000042514) SUMF1 (ENSRROG00000041073) #21 ITPR1 (ENSRROG00000044641) ##22 BHLHE40 (ENSRROG00000039619) #23 ARL8B (ENSRROG00000010772) #24 EDEM1 (ENSRROG00000044401) #25 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160975 ENSGT00490000044176 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000169558 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00490000044176 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000169558 ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00440000033232.c ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00940000157446 ENSGT00990000203541.a.b ENSGT00390000018852 ENSGT00940000159659 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 62 ENSSBOG00000012697 CNTN6 (ENSSBOG00000005957) ENSSBOG00000025385 CNTN4 (ENSSBOG00000025686) #14 IL5RA (ENSSBOG00000020431) #15 TRNT1 (ENSSBOG00000021208) #16 CRBN (ENSSBOG00000024658) #17 LRRN1 (ENSSBOG00000018919) #18 SETMAR (ENSSBOG00000023556) SUMF1 (ENSSBOG00000031100) #21 ITPR1 (ENSSBOG00000021312) ##22 BHLHE40 (ENSSBOG00000026538) #23 ARL8B (ENSSBOG00000032344) #24 EDEM1 (ENSSBOG00000023180) #25 GRM7 (ENSSBOG00000000625) #13 LMCD1 (ENSSBOG00000022801) SSUH2 (ENSSBOG00000025696) CAV3 (ENSSBOG00000032317) OXTR (ENSSBOG00000031766) ENSSBOG00000008434 SRGAP3 (ENSSBOG00000028415) THUMPD3 (ENSSBOG00000023567) SETD5 (ENSSBOG00000034634) LHFPL4 (ENSSBOG00000004674) MTMR14 (ENSSBOG00000029274) CPNE9 (ENSSBOG00000026144) Capuchin MODERN SPECIES 474 SETMAR (ENSCCAG00000022390) SUMF1 (ENSCCAG00000038030) #21 ITPR1 (ENSCCAG00000027187) ##22 BHLHE40 (ENSCCAG00000023409) #23 ARL8B (ENSCCAG00000028492) #24 EDEM1 (ENSCCAG00000036158) #25 Marmoset MODERN SPECIES 6 CHL1 (ENSCJAG00000015257) ENSCJAG00000084962 CNTN6 (ENSCJAG00000015346) ENSCJAG00000023368 CNTN4 (ENSCJAG00000015394) #14 ENSCJAG00000086653 IL5RA (ENSCJAG00000015437) #15 ENSCJAG00000074141 TRNT1 (ENSCJAG00000015466) #16 ENSCJAG00000015479 #17 ENSCJAG00000058149 ENSCJAG00000070490 ENSCJAG00000071888 SETMAR (ENSCJAG00000015508) SUMF1 (ENSCJAG00000015516) #21 ITPR1 (ENSCJAG00000015544) ##22 BHLHE40 (ENSCJAG00000062049) #23 ARL8B (ENSCJAG00000046554) #24 EDEM1 (ENSCJAG00000015856) #25 ENSCJAG00000082150 ENSCJAG00000084935 GRM7 (ENSCJAG00000015891) #13 ENSCJAG00000065767 ENSCJAG00000078658 LMCD1 (ENSCJAG00000015896) ENSCJAG00000069303 ENSCJAG00000076915 ENSCJAG00000079210 ENSCJAG00000081179 ENSCJAG00000086606 CAV3 (ENSCJAG00000061163) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 792 ENSANAG00000030854 SUMF1 (ENSANAG00000021586) #21 ENSANAG00000028137 ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 1288 MSH3 (ENSANAG00000021323) ENSANAG00000023433 ANKRD34B (ENSANAG00000023584) FAM151B (ENSANAG00000033519) ZFYVE16 (ENSANAG00000034353) ENSANAG00000026923 ##22 BHLHE40 (ENSANAG00000030074) #23 ARL8B (ENSANAG00000021118) #24 EDEM1 (ENSANAG00000019764) #25 ENSANAG00000021694 ENSANAG00000021562 Sauria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445 ENSGT00940000161880 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 tuatara MODERN SPECIES 1077 ENSSPUG00000002766 #20 SUMF1 (ENSSPUG00000002756) #21 ITPR1 (ENSSPUG00000002645) ##22 BHLHE40 (ENSSPUG00000002630) #23 ARL8B (ENSSPUG00000002625) #24 EDEM1 (ENSSPUG00000002609) #25 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 Laterata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 Common wall lizard MODERN SPECIES 10 CNTN3 (ENSPMRG00000014964) ENSPMRG00000014911 ENSPMRG00000014875 CHL1 (ENSPMRG00000014819) ENSPMRG00000014808 CNTN6 (ENSPMRG00000014662) CNTN4 (ENSPMRG00000014619) #14 ENSPMRG00000014615 TRNT1 (ENSPMRG00000014610) #16 CRBN (ENSPMRG00000014605) #17 LRRN1 (ENSPMRG00000014601) #18 ENSPMRG00000014598 ENSPMRG00000014589 ENSPMRG00000014584 #20 SUMF1 (ENSPMRG00000014573) #21 ITPR1 (ENSPMRG00000006931) ##22 BHLHE40 (ENSPMRG00000005541) #23 ARL8B (ENSPMRG00000005530) #24 EDEM1 (ENSPMRG00000005413) #25 ENSPMRG00000005385 ENSPMRG00000005378 ENSPMRG00000005371 #13 ENSPMRG00000005362 #13 ENSPMRG00000005354 LMCD1 (ENSPMRG00000005344) SSUH2 (ENSPMRG00000005332) ENSPMRG00000005319 OXTR (ENSPMRG00000005313) RAD18 (ENSPMRG00000005296) ENSPMRG00000005292 SRGAP3 (ENSPMRG00000005264) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 30 CNTN3 (ENSSMRG00000003298) ENSSMRG00000010160 ENSSMRG00000010165 ENSSMRG00000010173 ENSSMRG00000010180 CHL1 (ENSSMRG00000010197) CNTN6 (ENSSMRG00000013978) ENSSMRG00000017841 CNTN4 (ENSSMRG00000017856) #14 ENSSMRG00000017860 TRNT1 (ENSSMRG00000017861) #16 CRBN (ENSSMRG00000017863) #17 LRRN1 (ENSSMRG00000017865) #18 ENSSMRG00000017868 #20 SUMF1 (ENSSMRG00000017869) #21 ITPR1 (ENSSMRG00000017870) ##22 BHLHE40 (ENSSMRG00000017876) #23 ARL8B (ENSSMRG00000017877) #24 EDEM1 (ENSSMRG00000017878) #25 ENSSMRG00000017879 ENSSMRG00000017881 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT01030000235965 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 Lizard MODERN SPECIES 1 CHL1 (ENSACAG00000001405) ENSACAG00000041579 ENSACAG00000040802 CNTN6 (ENSACAG00000010425) ENSACAG00000036977 ENSACAG00000005659 #14 ENSACAG00000037414 ENSACAG00000036932 TRNT1 (ENSACAG00000005657) #16 CRBN (ENSACAG00000005582) #17 ENSACAG00000045387 LRRN1 (ENSACAG00000026715) #18 ENSACAG00000045524 #20 SUMF1 (ENSACAG00000010294) #21 ENSACAG00000035619 ITPR1 (ENSACAG00000009987) ##22 ENSACAG00000037777 BHLHE40 (ENSACAG00000012577) #23 ARL8B (ENSACAG00000045374) #24 EDEM1 (ENSACAG00000012377) #25 ENSACAG00000029600 ENSACAG00000040711 ENSACAG00000043925 #13 ENSACAG00000045588 ENSACAG00000034877 ENSACAG00000009849 #13 trh (ENSACAG00000043370) ENSACAG00000012305 ENSACAG00000012285 NR2C2 (ENSACAG00000012082) FGD5 (ENSACAG00000011946) Elapidae DUPLICATION Elapidae DUPLICATION Elapidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a.s ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E.m.a ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT01030000235965 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616 Indian cobra DUPLICATION Indian cobra MODERN SPECIES 1 ENSNNAG00000001713 ENSNNAG00000001725 GXYLT2 (ENSNNAG00000001742) ENSNNAG00000001768 PDZRN3 (ENSNNAG00000001782) ENSNNAG00000001814 CNTN3 (ENSNNAG00000001838) CHL1 (ENSNNAG00000001897) CNTN6 (ENSNNAG00000002047) CNTN4 (ENSNNAG00000002367) #14 TRNT1 (ENSNNAG00000002400) #16 ENSNNAG00000002424 #17 LRRN1 (ENSNNAG00000002516) #18 ENSNNAG00000002521 #20 SUMF1 (ENSNNAG00000002532) #21 ENSNNAG00000004054 ##22 BHLHE40 (ENSNNAG00000018438) #23 ARL8B (ENSNNAG00000018443) #24 EDEM1 (ENSNNAG00000018450) #25 ENSNNAG00000018468 #13 GRM7 (ENSNNAG00000018473) #13 LMCD1 (ENSNNAG00000018484) SSUH2 (ENSNNAG00000018487) ENSNNAG00000018494 OXTR (ENSNNAG00000018500) ENSNNAG00000018503 SRGAP3 (ENSNNAG00000018519) THUMPD3 (ENSNNAG00000018537) ENSNNAG00000018544 ENSNNAG00000018550 TATDN2 (ENSNNAG00000018553) Indian cobra MODERN SPECIES 55 ENSNNAG00000011925 ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a.s ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E.m.a ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.c ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616.e ENSGT00940000153393.B Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a.s ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E.m.a ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.k ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.c ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000155616.e ENSGT00940000153393.B Eastern brown snake MODERN SPECIES 3 PROK2 (ENSPTXG00000004037) RYBP (ENSPTXG00000004041) SHQ1 (ENSPTXG00000000044) GXYLT2 (ENSPTXG00000000072) ENSPTXG00000000107 PDZRN3 (ENSPTXG00000000135) CNTN3 (ENSPTXG00000000180) CHL1 (ENSPTXG00000000274) ENSPTXG00000000362 CNTN4 (ENSPTXG00000000390) #14 TRNT1 (ENSPTXG00000000410) #16 CRBN (ENSPTXG00000000440) #17 LRRN1 (ENSPTXG00000000450) #18 ENSPTXG00000000457 #20 SUMF1 (ENSPTXG00000000467) #21 ITPR1 (ENSPTXG00000000808) ##22 ENSPTXG00000002883 BHLHE40 (ENSPTXG00000002885) #23 ARL8B (ENSPTXG00000002887) #24 EDEM1 (ENSPTXG00000002889) #25 GRM7 (ENSPTXG00000002895) #13 LMCD1 (ENSPTXG00000002903) SSUH2 (ENSPTXG00000002904) ENSPTXG00000002905 OXTR (ENSPTXG00000002906) RAD18 (ENSPTXG00000002908) SRGAP3 (ENSPTXG00000002911) THUMPD3 (ENSPTXG00000002916) ENSPTXG00000002920 IRAK2 (ENSPTXG00000002922) ENSPTXG00000002923 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 2 GXYLT2 (ENSNSUG00000006994) ENSNSUG00000006992 PDZRN3 (ENSNSUG00000006989) ENSNSUG00000006988 CNTN3 (ENSNSUG00000006618) ENSNSUG00000006605 CHL1 (ENSNSUG00000006603) CNTN6 (ENSNSUG00000006539) CNTN4 (ENSNSUG00000006531) #14 TRNT1 (ENSNSUG00000006530) #16 CRBN (ENSNSUG00000006528) #17 LRRN1 (ENSNSUG00000006527) #18 ENSNSUG00000006524 #20 SUMF1 (ENSNSUG00000006522) #21 ENSNSUG00000006519 ITPR1 (ENSNSUG00000006516) ##22 BHLHE40 (ENSNSUG00000006512) #23 ARL8B (ENSNSUG00000006508) #24 EDEM1 (ENSNSUG00000006360) #25 ENSNSUG00000006357 #13 GRM7 (ENSNSUG00000006356) #13 LMCD1 (ENSNSUG00000006355) SSUH2 (ENSNSUG00000006353) ENSNSUG00000006350 OXTR (ENSNSUG00000006347) ENSNSUG00000006346 SRGAP3 (ENSNSUG00000006301) THUMPD3 (ENSNSUG00000006295) ENSNSUG00000006287 IRAK2 (ENSNSUG00000006285) ENSNSUG00000006283 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 511 ENSLLTG00000001456 ##22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E.m.b ##22 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E.m.b ##22 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 8080 ENSLLTG00000004269 ##22 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E.n ##22 Indian cobra MODERN SPECIES 219 ENSNNAG00000011259 ##22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000003964.b ENSGT00390000014353 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT01030000238841 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000003964.b Emydidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT01030000238841 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000003964.b Three-toed box turtle MODERN SPECIES 33 SHQ1 (ENSTMTG00000017994) GXYLT2 (ENSTMTG00000018007) PPP4R2 (ENSTMTG00000018024) PDZRN3 (ENSTMTG00000018055) CNTN3 (ENSTMTG00000018117) CHL1 (ENSTMTG00000018260) ENSTMTG00000018456 CNTN6 (ENSTMTG00000018470) CNTN4 (ENSTMTG00000018539) #14 IL5RA (ENSTMTG00000018639) #15 TRNT1 (ENSTMTG00000018738) #16 CRBN (ENSTMTG00000018758) #17 LRRN1 (ENSTMTG00000018782) #18 SUMF1 (ENSTMTG00000018795) #21 ENSTMTG00000018826 #20 ITPR1 (ENSTMTG00000018838) ##22 ENSTMTG00000018932 BHLHE40 (ENSTMTG00000018947) #23 ARL8B (ENSTMTG00000018960) #24 EDEM1 (ENSTMTG00000018977) #25 GRM7 (ENSTMTG00000019012) #13 LMCD1 (ENSTMTG00000019124) SSUH2 (ENSTMTG00000019142) ENSTMTG00000019174 ENSTMTG00000019192 CAV3 (ENSTMTG00000019214) OXTR (ENSTMTG00000019224) RAD18 (ENSTMTG00000019261) SRGAP3 (ENSTMTG00000019297) THUMPD3 (ENSTMTG00000019533) ENSTMTG00000019550 painted turtle MODERN SPECIES 699 CNTN6 (ENSCPBG00000017663) CNTN4 (ENSCPBG00000017643) #14 IL5RA (ENSCPBG00000017639) #15 TRNT1 (ENSCPBG00000017636) #16 CRBN (ENSCPBG00000017633) #17 LRRN1 (ENSCPBG00000017631) #18 ENSCPBG00000017630 #20 SUMF1 (ENSCPBG00000017623) #21 ITPR1 (ENSCPBG00000015066) ##22 BHLHE40 (ENSCPBG00000014940) #23 ARL8B (ENSCPBG00000014937) #24 EDEM1 (ENSCPBG00000014836) #25 GRM7 (ENSCPBG00000014825) #13 ENSCPBG00000014823 LMCD1 (ENSCPBG00000014818) SSUH2 (ENSCPBG00000014808) ENSCPBG00000014803 ENSCPBG00000014800 CAV3 (ENSCPBG00000014797) OXTR (ENSCPBG00000014795) RAD18 (ENSCPBG00000014787) SRGAP3 (ENSCPBG00000014775) THUMPD3 (ENSCPBG00000014771) ENSCPBG00000014768 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT01030000238841 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 Goode s thornscrub tortoise DUPLICATION Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 21 PDZRN3 (ENSGEVG00005018672) ENSGEVG00005018629 CNTN3 (ENSGEVG00005018336) CHL1 (ENSGEVG00005018075) CNTN6 (ENSGEVG00005017681) ENSGEVG00005017608 CNTN4 (ENSGEVG00005017523) #14 IL5RA (ENSGEVG00005017497) #15 ENSGEVG00005017472 TRNT1 (ENSGEVG00005017461) #16 CRBN (ENSGEVG00005017441) #17 LRRN1 (ENSGEVG00005017431) #18 ENSGEVG00005017420 #20 SUMF1 (ENSGEVG00005017395) #21 ENSGEVG00005017380 ##22 ENSGEVG00005011014 ##22 BHLHE40 (ENSGEVG00005010114) #23 ARL8B (ENSGEVG00005010089) #24 EDEM1 (ENSGEVG00005009852) #25 GRM7 (ENSGEVG00005009564) #13 LMCD1 (ENSGEVG00005009447) SSUH2 (ENSGEVG00005009363) ENSGEVG00005009300 ENSGEVG00005009228 CAV3 (ENSGEVG00005009176) OXTR (ENSGEVG00005009121) RAD18 (ENSGEVG00005009041) SRGAP3 (ENSGEVG00005007925) THUMPD3 (ENSGEVG00005007694) ENSGEVG00005007674 IRAK2 (ENSGEVG00005007624) Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 21 PPP4R2 (ENSGEVG00005018720) PDZRN3 (ENSGEVG00005018672) ENSGEVG00005018629 CNTN3 (ENSGEVG00005018336) CHL1 (ENSGEVG00005018075) CNTN6 (ENSGEVG00005017681) ENSGEVG00005017608 CNTN4 (ENSGEVG00005017523) #14 IL5RA (ENSGEVG00005017497) #15 ENSGEVG00005017472 TRNT1 (ENSGEVG00005017461) #16 CRBN (ENSGEVG00005017441) #17 LRRN1 (ENSGEVG00005017431) #18 ENSGEVG00005017420 #20 SUMF1 (ENSGEVG00005017395) #21 ENSGEVG00005017380 ##22 ENSGEVG00005011014 ##22 BHLHE40 (ENSGEVG00005010114) #23 ARL8B (ENSGEVG00005010089) #24 EDEM1 (ENSGEVG00005009852) #25 GRM7 (ENSGEVG00005009564) #13 LMCD1 (ENSGEVG00005009447) SSUH2 (ENSGEVG00005009363) ENSGEVG00005009300 ENSGEVG00005009228 CAV3 (ENSGEVG00005009176) OXTR (ENSGEVG00005009121) RAD18 (ENSGEVG00005009041) SRGAP3 (ENSGEVG00005007925) THUMPD3 (ENSGEVG00005007694) ENSGEVG00005007674 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 1018 CNTN4 (ENSCABG00000017322) #14 IL5RA (ENSCABG00000017331) #15 TRNT1 (ENSCABG00000017350) #16 CRBN (ENSCABG00000017369) #17 LRRN1 (ENSCABG00000017472) #18 ENSCABG00000017474 #20 SUMF1 (ENSCABG00000017480) #21 ITPR1 (ENSCABG00000017505) ##22 ENSCABG00000017520 BHLHE40 (ENSCABG00000017522) #23 ARL8B (ENSCABG00000017525) #24 EDEM1 (ENSCABG00000017541) #25 GRM7 (ENSCABG00000017790) #13 LMCD1 (ENSCABG00000017807) SSUH2 (ENSCABG00000017809) CAV3 (ENSCABG00000017812) OXTR (ENSCABG00000017814) RAD18 (ENSCABG00000017818) SRGAP3 (ENSCABG00000000091) THUMPD3 (ENSCABG00000000193) ENSCABG00000000206 IRAK2 (ENSCABG00000000217) TATDN2 (ENSCABG00000000234) Chinese turtle MODERN SPECIES 1835 ENSPSIG00000017232 #14 IL5RA (ENSPSIG00000017240) #15 TRNT1 (ENSPSIG00000017356) #16 CRBN (ENSPSIG00000017465) #17 ENSPSIG00000000072 LRRN1 (ENSPSIG00000000527) #18 ENSPSIG00000017734 #20 SUMF1 (ENSPSIG00000017744) #21 ITPR1 (ENSPSIG00000017904) ##22 BHLHE40 (ENSPSIG00000018157) #23 ARL8B (ENSPSIG00000005943) #24 EDEM1 (ENSPSIG00000005957) #25 ENSPSIG00000000535 GRM7 (ENSPSIG00000006085) #13 LMCD1 (ENSPSIG00000006716) SSUH2 (ENSPSIG00000006779) ENSPSIG00000006832 ENSPSIG00000006837 ENSPSIG00000006843 CAV3 (ENSPSIG00000006848) OXTR (ENSPSIG00000006867) RAD18 (ENSPSIG00000006928) SRGAP3 (ENSPSIG00000007033) THUMPD3 (ENSPSIG00000007370) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT01030000237821 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00940000163873.l ENSGT00940000163873.k ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 37 PDZRN3 (ENSCPRG00005015721) CNTN3 (ENSCPRG00005015706) ENSCPRG00005015700 CHL1 (ENSCPRG00005015694) CNTN6 (ENSCPRG00005015511) ENSCPRG00005015470 ENSCPRG00005015468 CNTN4 (ENSCPRG00005015455) #14 IL5RA (ENSCPRG00005015437) #15 TRNT1 (ENSCPRG00005015429) #16 CRBN (ENSCPRG00005015422) #17 LRRN1 (ENSCPRG00005015420) #18 ENSCPRG00005015416 #20 SUMF1 (ENSCPRG00005015401) #21 ENSCPRG00005015393 ITPR1 (ENSCPRG00005013420) ##22 BHLHE40 (ENSCPRG00005013082) #23 ARL8B (ENSCPRG00005013015) #24 EDEM1 (ENSCPRG00005012826) #25 ENSCPRG00005012786 ##13 GRM7 (ENSCPRG00005012779) #13 ENSCPRG00005012767 LMCD1 (ENSCPRG00005012738) ENSCPRG00005012724 ENSCPRG00005012717 CAV3 (ENSCPRG00005012711) OXTR (ENSCPRG00005012696) RAD18 (ENSCPRG00005012686) SRGAP3 (ENSCPRG00005012679) THUMPD3 (ENSCPRG00005012665) ENSCPRG00005012662 Aves ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B African ostrich DUPLICATION African ostrich MODERN SPECIES 1076 GXYLT2 (ENSSCUG00000015407) PPP4R2 (ENSSCUG00000015403) PDZRN3 (ENSSCUG00000015402) ENSSCUG00000015400 CNTN3 (ENSSCUG00000015390) CHL1 (ENSSCUG00000015369) CNTN6 (ENSSCUG00000015354) ENSSCUG00000015349 CNTN4 (ENSSCUG00000015339) #14 IL5RA (ENSSCUG00000015330) #15 TRNT1 (ENSSCUG00000015323) #16 CRBN (ENSSCUG00000015318) #17 LRRN1 (ENSSCUG00000015306) #18 ENSSCUG00000015304 #20 SUMF1 (ENSSCUG00000015300) #21 ENSSCUG00000015218 ##22 African ostrich MODERN SPECIES 671 ENSSCUG00000008234 ##22 BHLHE40 (ENSSCUG00000008239) #23 ARL8B (ENSSCUG00000008242) #24 EDEM1 (ENSSCUG00000008253) #25 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B Anatidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B Pink-footed goose MODERN SPECIES 49 RYBP (ENSABRG00000016768) SHQ1 (ENSABRG00000016761) GXYLT2 (ENSABRG00000016756) PPP4R2 (ENSABRG00000016753) PDZRN3 (ENSABRG00000016746) CNTN3 (ENSABRG00000016737) CHL1 (ENSABRG00000016703) CNTN6 (ENSABRG00000015653) CNTN4 (ENSABRG00000014569) #14 IL5RA (ENSABRG00000014471) #15 TRNT1 (ENSABRG00000014416) #16 CRBN (ENSABRG00000014371) #17 LRRN1 (ENSABRG00000014369) #18 ENSABRG00000014367 #20 SUMF1 (ENSABRG00000014365) #21 ITPR1 (ENSABRG00000010195) ##22 BHLHE40 (ENSABRG00000009713) #23 ARL8B (ENSABRG00000009711) #24 EDEM1 (ENSABRG00000009573) #25 GRM7 (ENSABRG00000009502) #13 LMCD1 (ENSABRG00000009469) SSUH2 (ENSABRG00000009453) CAV3 (ENSABRG00000009447) OXTR (ENSABRG00000009437) RAD18 (ENSABRG00000009421) SRGAP3 (ENSABRG00000009392) THUMPD3 (ENSABRG00000009373) ENSABRG00000009365 IRAK2 (ENSABRG00000009344) GHRL (ENSABRG00000009307) SEC13 (ENSABRG00000009259) Duck MODERN SPECIES 4 RYBP (ENSAPLG00000013882) SHQ1 (ENSAPLG00000013926) GXYLT2 (ENSAPLG00000013945) PPP4R2 (ENSAPLG00000014045) PDZRN3 (ENSAPLG00000014073) CNTN3 (ENSAPLG00000009693) CHL1 (ENSAPLG00000007000) CNTN6 (ENSAPLG00000005639) CNTN4 (ENSAPLG00000004320) #14 IL5RA (ENSAPLG00000004282) #15 TRNT1 (ENSAPLG00000004258) #16 CRBN (ENSAPLG00000003897) #17 LRRN1 (ENSAPLG00000001694) #18 ENSAPLG00000001691 #20 SUMF1 (ENSAPLG00000003538) #21 ITPR1 (ENSAPLG00000016350) ##22 BHLHE40 (ENSAPLG00000016313) #23 ARL8B (ENSAPLG00000016295) #24 EDEM1 (ENSAPLG00000027743) #25 GRM7 (ENSAPLG00000002555) #13 LMCD1 (ENSAPLG00000002970) SSUH2 (ENSAPLG00000003015) CAV3 (ENSAPLG00000003098) OXTR (ENSAPLG00000003100) RAD18 (ENSAPLG00000003138) SRGAP3 (ENSAPLG00000003289) THUMPD3 (ENSAPLG00000003598) ENSAPLG00000003676 IRAK2 (ENSAPLG00000003679) GHRL (ENSAPLG00000003792) SEC13 (ENSAPLG00000003815) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.e ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000165570 ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a.e ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00390000004064 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b Chicken MODERN SPECIES 3 SHQ1 (ENSGALG00010020307) GXYLT2 (ENSGALG00010020309) PPP4R2 (ENSGALG00010020329) PDZRN3 (ENSGALG00010020350) ENSGALG00010020359 CNTN3 (ENSGALG00010020369) CHL1 (ENSGALG00010020396) CNTN6 (ENSGALG00010020425) CNTN4 (ENSGALG00010020436) #14 IL5RA (ENSGALG00010020457) #15 TRNT1 (ENSGALG00010020484) #16 CRBN (ENSGALG00010020509) #17 LRRN1 (ENSGALG00010020562) #18 ENSGALG00010020580 #20 SUMF1 (ENSGALG00010020596) #21 ITPR1 (ENSGALG00010021688) ##22 BHLHE40 (ENSGALG00010021719) #23 ARL8B (ENSGALG00010021730) #24 EDEM1 (ENSGALG00010021736) #25 GRM7 (ENSGALG00010019426) #13 LMCD1 (ENSGALG00010019441) CAV3 (ENSGALG00010019451) OXTR (ENSGALG00010019473) RAD18 (ENSGALG00010019584) SRGAP3 (ENSGALG00010019624) THUMPD3 (ENSGALG00010018999) ENSGALG00010019006 IRAK2 (ENSGALG00010019017) GHRL (ENSGALG00010019047) SEC13 (ENSGALG00010022642) CAND2 (ENSGALG00010019065) Turkey MODERN SPECIES 5 GXYLT2 (ENSMGAG00000009655) ENSMGAG00000018290 PDZRN3 (ENSMGAG00000009691) ENSMGAG00000017393 ENSMGAG00000021720 ENSMGAG00000009709 CHL1 (ENSMGAG00000009762) CNTN6 (ENSMGAG00000009812) CNTN4 (ENSMGAG00000009910) #14 IL5RA (ENSMGAG00000009996) #15 CRBN (ENSMGAG00000010013) #17 TRNT1 (ENSMGAG00000009971) #16 LRRN1 (ENSMGAG00000009988) #18 ENSMGAG00000018225 #20 SUMF1 (ENSMGAG00000010033) #21 ITPR1 (ENSMGAG00000010046) ##22 BHLHE40 (ENSMGAG00000018338) #23 ARL8B (ENSMGAG00000017811) #24 EDEM1 (ENSMGAG00000010070) #25 GRM7 (ENSMGAG00000010102) #13 ENSMGAG00000018916 ENSMGAG00000019285 ENSMGAG00000010131 OXTR (ENSMGAG00000010127) ENSMGAG00000010109 ENSMGAG00000010119 ENSMGAG00000010182 IRAK2 (ENSMGAG00000010194) ENSMGAG00000010214 SEC13 (ENSMGAG00000010222) ENSMGAG00000010238 Japanese quail MODERN SPECIES 3 GXYLT2 (ENSCJPG00005018661) ENSCJPG00005018662 PDZRN3 (ENSCJPG00005018664) CNTN3 (ENSCJPG00005018668) CHL1 (ENSCJPG00005018669) ENSCJPG00005018674 ENSCJPG00005018675 CNTN6 (ENSCJPG00005018676) CNTN4 (ENSCJPG00005018679) #14 IL5RA (ENSCJPG00005018680) #15 TRNT1 (ENSCJPG00005018681) #16 CRBN (ENSCJPG00005018682) #17 LRRN1 (ENSCJPG00005018683) #18 ENSCJPG00005018684 #20 SUMF1 (ENSCJPG00005018685) #21 ITPR1 (ENSCJPG00005018726) ##22 ENSCJPG00005020532 BHLHE40 (ENSCJPG00005020534) #23 ARL8B (ENSCJPG00005020535) #24 EDEM1 (ENSCJPG00005020536) #25 ENSCJPG00005020539 #13 ENSCJPG00005020540 #13 LMCD1 (ENSCJPG00005020541) CAV3 (ENSCJPG00005020542) OXTR (ENSCJPG00005020543) RAD18 (ENSCJPG00005020544) SRGAP3 (ENSCJPG00005020553) THUMPD3 (ENSCJPG00005020742) ENSCJPG00005020743 IRAK2 (ENSCJPG00005020747) GHRL (ENSCJPG00005020750) Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00440000038003 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b Golden eagle MODERN SPECIES 12 GXYLT2 (ENSACCG00020008596) PPP4R2 (ENSACCG00020008614) PDZRN3 (ENSACCG00020008644) CNTN3 (ENSACCG00020008678) CHL1 (ENSACCG00020009287) CNTN6 (ENSACCG00020009592) CNTN4 (ENSACCG00020009634) #14 ENSACCG00020009645 IL5RA (ENSACCG00020009685) #15 TRNT1 (ENSACCG00020009728) #16 CRBN (ENSACCG00020009742) #17 ENSACCG00020009755 LRRN1 (ENSACCG00020009768) #18 ENSACCG00020009779 #20 SUMF1 (ENSACCG00020009793) #21 ITPR1 (ENSACCG00020009868) ##22 BHLHE40 (ENSACCG00020009955) #23 ARL8B (ENSACCG00020009966) #24 EDEM1 (ENSACCG00020009983) #25 GRM7 (ENSACCG00020010003) #13 LMCD1 (ENSACCG00020010014) SSUH2 (ENSACCG00020010024) CAV3 (ENSACCG00020010035) OXTR (ENSACCG00020010045) RAD18 (ENSACCG00020010080) SRGAP3 (ENSACCG00020010374) THUMPD3 (ENSACCG00020010551) ENSACCG00020010562 IRAK2 (ENSACCG00020010579) SEC13 (ENSACCG00020010591) CAND2 (ENSACCG00020010611) Kakapo MODERN SPECIES 3 SHQ1 (ENSSHBG00005010752) GXYLT2 (ENSSHBG00005010727) ENSSHBG00005010670 PDZRN3 (ENSSHBG00005010639) ENSSHBG00005010579 CNTN3 (ENSSHBG00005000965) CHL1 (ENSSHBG00005021241) CNTN6 (ENSSHBG00005021239) CNTN4 (ENSSHBG00005021238) #14 IL5RA (ENSSHBG00005021237) #15 TRNT1 (ENSSHBG00005021236) #16 CRBN (ENSSHBG00005021235) #17 LRRN1 (ENSSHBG00005021234) #18 ENSSHBG00005021232 #20 SUMF1 (ENSSHBG00005021231) #21 ITPR1 (ENSSHBG00005021182) ##22 BHLHE40 (ENSSHBG00005021165) #23 ARL8B (ENSSHBG00005021164) #24 EDEM1 (ENSSHBG00005021161) #25 GRM7 (ENSSHBG00005021159) #13 LMCD1 (ENSSHBG00005021158) SSUH2 (ENSSHBG00005021156) CAV3 (ENSSHBG00005021155) OXTR (ENSSHBG00005021154) RAD18 (ENSSHBG00005021151) SRGAP3 (ENSSHBG00005021150) THUMPD3 (ENSSHBG00005021147) ENSSHBG00005021145 IRAK2 (ENSSHBG00005021143) ENSSHBG00005021139 ABHD6 (ENSSHBG00005021137) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 Great tit MODERN SPECIES 3 RYBP (ENSPMJG00000005603) SHQ1 (ENSPMJG00000005611) GXYLT2 (ENSPMJG00000005617) ENSPMJG00000005654 PDZRN3 (ENSPMJG00000005657) ENSPMJG00000005665 CNTN3 (ENSPMJG00000005671) CHL1 (ENSPMJG00000005688) CNTN6 (ENSPMJG00000005736) CNTN4 (ENSPMJG00000005757) #14 IL5RA (ENSPMJG00000005764) #15 TRNT1 (ENSPMJG00000005765) #16 CRBN (ENSPMJG00000005773) #17 ENSPMJG00000005792 #20 SUMF1 (ENSPMJG00000005794) #21 ITPR1 (ENSPMJG00000005801) ##22 BHLHE40 (ENSPMJG00000005858) #23 ARL8B (ENSPMJG00000005862) #24 EDEM1 (ENSPMJG00000005863) #25 GRM7 (ENSPMJG00000005895) #13 LMCD1 (ENSPMJG00000005956) CAV3 (ENSPMJG00000005958) OXTR (ENSPMJG00000005959) RAD18 (ENSPMJG00000005960) ENSPMJG00000005966 SRGAP3 (ENSPMJG00000005970) THUMPD3 (ENSPMJG00000005977) ENSPMJG00000005978 IRAK2 (ENSPMJG00000005988) SEC13 (ENSPMJG00000006004) CAND2 (ENSPMJG00000006009) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00530000063647.A.a.d ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C.l #14 ENSGT00940000155198.C.k #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 Medium ground finch MODERN SPECIES 123 CNTN6 (ENSGFOG00000006749) CNTN4 (ENSGFOG00000007641) #14 IL5RA (ENSGFOG00000007674) #15 TRNT1 (ENSGFOG00000007738) #16 CRBN (ENSGFOG00000007741) #17 LRRN1 (ENSGFOG00000007754) #18 ENSGFOG00000007761 #20 SUMF1 (ENSGFOG00000007775) #21 ITPR1 (ENSGFOG00000007908) ##22 BHLHE40 (ENSGFOG00000008912) #23 ARL8B (ENSGFOG00000008921) #24 EDEM1 (ENSGFOG00000008936) #25 GRM7 (ENSGFOG00000008966) #13 LMCD1 (ENSGFOG00000008974) ENSGFOG00000008981 CAV3 (ENSGFOG00000008983) OXTR (ENSGFOG00000008986) RAD18 (ENSGFOG00000008990) SRGAP3 (ENSGFOG00000009033) THUMPD3 (ENSGFOG00000009508) ENSGFOG00000009517 IRAK2 (ENSGFOG00000009530) SEC13 (ENSGFOG00000009539) CAND2 (ENSGFOG00000009552) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000160975 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000160282 ENSGT00940000160080 ENSGT00940000160606 ENSGT00940000155198.C.l #14 ENSGT00940000155198.C.k #14 ENSGT00940000160890 #15 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 ENSGT00950000183006.B.f.b.b ENSGT01050000244882.a.a.b ENSGT00390000011230 ENSGT00950000182824.a.b.a ENSGT00530000063557.a ENSGT00390000014353 ENSGT00940000159835 ENSGT00940000153393.B ENSGT00390000017740.a.b ENSGT00940000158890 Zebra finch MODERN SPECIES 3 PROK2 (ENSTGUG00000026872) RYBP (ENSTGUG00000020831) SHQ1 (ENSTGUG00000009933) ENSTGUG00000009943 PDZRN3 (ENSTGUG00000014523) CNTN3 (ENSTGUG00000009960) CHL1 (ENSTGUG00000009997) CNTN6 (ENSTGUG00000010053) CNTN4 (ENSTGUG00000010102) #14 IL5RA (ENSTGUG00000010171) #15 TRNT1 (ENSTGUG00000010192) #16 CRBN (ENSTGUG00000010200) #17 LRRN1 (ENSTGUG00000010215) #18 ENSTGUG00000019447 #20 SUMF1 (ENSTGUG00000010221) #21 ITPR1 (ENSTGUG00000010241) ##22 BHLHE40 (ENSTGUG00000010301) #23 ARL8B (ENSTGUG00000022959) #24 EDEM1 (ENSTGUG00000010316) #25 GRM7 (ENSTGUG00000010358) #13 LMCD1 (ENSTGUG00000010388) CAV3 (ENSTGUG00000010401) OXTR (ENSTGUG00000020441) RAD18 (ENSTGUG00000010405) SRGAP3 (ENSTGUG00000010415) THUMPD3 (ENSTGUG00000010440) ENSTGUG00000024732 IRAK2 (ENSTGUG00000010449) SEC13 (ENSTGUG00000010453) CAND2 (ENSTGUG00000010461) MBD4 (ENSTGUG00000010478) Common canary MODERN SPECIES 70 LRRN1 (ENSSCAG00000016036) #18 ENSSCAG00000016034 #20 SUMF1 (ENSSCAG00000016032) #21 ENSSCAG00000016024 ITPR1 (ENSSCAG00000013652) ##22 BHLHE40 (ENSSCAG00000012457) #23 ARL8B (ENSSCAG00000012450) #24 EDEM1 (ENSSCAG00000012366) #25 CNTN6 (ENSSCAG00000012325) ENSSCAG00000012309 #14 ENSSCAG00000012298 #14 IL5RA (ENSSCAG00000012281) #15 TRNT1 (ENSSCAG00000012278) #16 CRBN (ENSSCAG00000012252) #17 Flycatcher MODERN SPECIES 3 GXYLT2 (ENSFALG00000024120) PPP4R2 (ENSFALG00000013436) PDZRN3 (ENSFALG00000013445) ENSFALG00000027072 CNTN3 (ENSFALG00000013457) CHL1 (ENSFALG00000013463) CNTN6 (ENSFALG00000013472) CNTN4 (ENSFALG00000013504) #14 ENSFALG00000025220 IL5RA (ENSFALG00000013534) #15 TRNT1 (ENSFALG00000013539) #16 CRBN (ENSFALG00000013540) #17 LRRN1 (ENSFALG00000014525) #18 ENSFALG00000023036 #20 SUMF1 (ENSFALG00000013555) #21 ITPR1 (ENSFALG00000013566) ##22 ENSFALG00000023539 ENSFALG00000027473 #23 ARL8B (ENSFALG00000013578) #24 EDEM1 (ENSFALG00000013588) #25 ENSFALG00000024020 GRM7 (ENSFALG00000013602) #13 ENSFALG00000025075 LMCD1 (ENSFALG00000013612) CAV3 (ENSFALG00000024966) OXTR (ENSFALG00000013622) RAD18 (ENSFALG00000013625) SRGAP3 (ENSFALG00000013628) ENSFALG00000023660 ENSFALG00000026425 THUMPD3 (ENSFALG00000013631) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 257 ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000166994 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT01030000234648.a.a.d #13 ENSGT00940000158813 Reedfish MODERN SPECIES 9 appl1 (ENSECRG00000017314) ASB14 (ENSECRG00000017394) DNAH12 (ENSECRG00000017507) rps23 (ENSECRG00000017688) ENSECRG00000017709 ghrl (ENSECRG00000017728) ENSECRG00000017747 vhl (ENSECRG00000017772) trnt1 (ENSECRG00000017785) #16 ENSECRG00000017808 crbn (ENSECRG00000017838) #17 ENSECRG00000017858 lrrn1 (ENSECRG00000017870) #18 setmar (ENSECRG00000017884) #20 sumf1 (ENSECRG00000017899) #21 ITPR1 (ENSECRG00000017959) ##22 bhlhe40 (ENSECRG00000018114) #23 arl8bb (ENSECRG00000018149) #24 edem1 (ENSECRG00000018184) #25 GRM7 (ENSECRG00000018263) #13 ENSECRG00000018374 lmcd1 (ENSECRG00000018390) abhd6b (ENSECRG00000018412) DNASE1L3 (ENSECRG00000018431) ENSECRG00000018457 FLNB (ENSECRG00000018485) slmapa (ENSECRG00000018695) dennd6aa (ENSECRG00000018889) ARF4 (ENSECRG00000018935) pde12 (ENSECRG00000019009) atp6ap1lb (ENSECRG00000019045) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00390000013995.b.a ENSGT00390000007605 ENSGT00940000158065 ENSGT00940000162859 ENSGT00950000183062.a.a.a ENSGT00940000155198.A ##14 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000166994 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384 #23 ENSGT00940000154861 #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00940000160395 ENSGT00940000156703 ENSGT00940000166798 ENSGT00940000156468 ENSGT00940000157842 ENSGT00390000006665.a Spotted gar MODERN SPECIES 671 RBSN (ENSLOCG00000011180) mrps25 (ENSLOCG00000011170) nr2c2 (ENSLOCG00000011160) FGD5 (ENSLOCG00000011142) ccdc174 (ENSLOCG00000011131) tatdn2 (ENSLOCG00000011120) vhl (ENSLOCG00000011111) trnt1 (ENSLOCG00000011105) #16 ENSLOCG00000011096 crbn (ENSLOCG00000011083) #17 ENSLOCG00000011076 ENSLOCG00000011067 lrrn1 (ENSLOCG00000018250) #18 setmar (ENSLOCG00000011063) #20 sumf1 (ENSLOCG00000011045) #21 ITPR1 (ENSLOCG00000010973) ##22 bhlhe40 (ENSLOCG00000010962) #23 arl8bb (ENSLOCG00000010957) #24 edem1 (ENSLOCG00000010944) #25 gnat1 (ENSLOCG00000010938) sema3fa (ENSLOCG00000010911) ENSLOCG00000010900 mon1a (ENSLOCG00000010888) MST1R (ENSLOCG00000010867) ENSLOCG00000018249 camkvb (ENSLOCG00000010856) traip (ENSLOCG00000010841) ENSLOCG00000010829 inka1a (ENSLOCG00000018248) ENSLOCG00000010818 gnai2a (ENSLOCG00000010798) Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00390000014353 ENSGT00390000009678 #16 ENSGT01050000244882.b.c.a.a ENSGT01050000244882.b.c.a.b ENSGT00390000016404 #17 ENSGT00940000157154.d #18 ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000162663 #20 ENSGT00940000177280 ENSGT00940000155071.C ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.a #24 ENSGT00940000156703.e.a ENSGT00940000156468.f ENSGT00940000157842.b ENSGT00390000006665.a ENSGT00390000007696 ENSGT00530000063849.A.a ENSGT00940000162824 ENSGT00940000155125.a.b ENSGT00940000157127.b ENSGT00940000156617.e.b ENSGT00530000063849.A.b ENSGT00940000155125.a.a ENSGT00940000155125.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000155460.i.a ENSGT00940000157899.b.i ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00990000212460 ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000154857.yb.a ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000155460.i.a ENSGT00940000157899.b.i ENSGT00940000179600 ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166355.a ENSGT01090000260051.b.a.a.a.b ENSGT00940000154578.A.c.a ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000179168 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT01100000263697 ENSGT00940000156263.l ENSGT01050000245203 ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000164283.b.b ENSGT01050000244890.a.b.b.c.a ENSGT00940000155250.q.b ENSGT00940000155460.i.a ENSGT01070000253744.a.a.a.a ENSGT00940000157899.a.a ENSGT00940000166603.d ENSGT00900000141555 ENSGT00940000154578.A.c.a.e ENSGT00940000156561.a.b.b ENSGT00950000182897.A ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.c ##18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000155071.D ##22 ENSGT00940000158384.c #23 ENSGT00940000157422 ENSGT00940000164472.a.a.b.b.a.a.a.b ENSGT00940000156263.l ENSGT00940000154786.`b ENSGT00940000154786.ab ENSGT00940000166625 ENSGT00950000182997.a.b.b.b.b ENSGT00940000155261.a.b ENSGT00940000154409.eb.b ENSGT00390000008783 ENSGT00390000004990 ENSGT00940000155440.c.a ENSGT00940000155969.y.a Sheepshead minnow MODERN SPECIES 159 ENSCVAG00000001648 ENSCVAG00000001635 ENSCVAG00000001624 ENSCVAG00000001619 ENSCVAG00000001604 ENSCVAG00000001600 ENSCVAG00000001587 ENSCVAG00000001582 ENSCVAG00000001577 ESYT1 (ENSCVAG00000001564) zc3h10 (ENSCVAG00000001548) ENSCVAG00000001544 ENSCVAG00000001539 ENSCVAG00000001531 ##18 sumf1 (ENSCVAG00000001529) #21 ENSCVAG00000001522 ##22 ITPR1 (ENSCVAG00000001518) ##22 BHLHE40 (ENSCVAG00000001505) #23 SLC4A8 (ENSCVAG00000001496) ENSCVAG00000001491 SCN8A (ENSCVAG00000001487) METTL7A (ENSCVAG00000001480) METTL7A (ENSCVAG00000001477) atf1 (ENSCVAG00000000055) ENSCVAG00000001463 atf7b (ENSCVAG00000001440) ENSCVAG00000001411 pfdn5 (ENSCVAG00000001409) ENSCVAG00000001404 ENSCVAG00000001380 ENSCVAG00000001372 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155071.E ##22 Tongue sole MODERN SPECIES 2 idh3b (ENSCSEG00000017767) ptpra (ENSCSEG00000017739) gnrh2 (ENSCSEG00000017724) ENSCSEG00000017716 aldh1l1 (ENSCSEG00000017684) ENSCSEG00000017670 MTMR14 (ENSCSEG00000017658) ENSCSEG00000017588 ENSCSEG00000017520 fezf2 (ENSCSEG00000017502) ENSCSEG00000017480 LDLRAD2 (ENSCSEG00000017469) ENSCSEG00000017456 USP48 (ENSCSEG00000017261) setmar (ENSCSEG00000017235) #20 ENSCSEG00000017230 ##22 ENSCSEG00000017181 ##22 hdac11 (ENSCSEG00000017168) ENSCSEG00000017156 ENSCSEG00000017146 IQSEC1 (ENSCSEG00000017123) acad9 (ENSCSEG00000017056) ENSCSEG00000017040 CFAP57 (ENSCSEG00000016999) nuf2 (ENSCSEG00000016956) ap5b1 (ENSCSEG00000016947) zgc:112255 (ENSCSEG00000016938) P3H1 (ENSCSEG00000016927) ENSCSEG00000016925 ##13 nudt3b (ENSCSEG00000016923) rps10 (ENSCSEG00000016916) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000156315.e.a ENSGT00940000153556.A ENSGT00940000153920.a.b.a ENSGT00940000153920.b ENSGT00940000157363 ENSGT00940000155327.h ENSGT00940000157922.a ENSGT01010000222866 ENSGT00940000155616 ENSGT01050000244882.b.c.a.b ENSGT00390000016404.g #17 ENSGT00940000176938 ENSGT00940000165984 ENSGT00940000157154.d.b #18 ENSGT00390000008983.a #21 ENSGT00940000155071.E ##22 ENSGT00940000158384.d #23 ENSGT00940000154861.n.b #24 ENSGT00940000157717 #25 ENSGT00940000160395 ENSGT00940000156703.e.b ENSGT00940000166798 ENSGT00940000156468.e ENSGT00940000157842.a ENSGT00940000166002 ENSGT00530000063849.A.b.b ENSGT00940000155125.b ENSGT00940000157127.a ENSGT00940000156617.f ENSGT00390000011082 ENSGT00940000165239.a.a P. kingsleyae MODERN SPECIES 79 mustn1a (ENSPKIG00000025285) stimate (ENSPKIG00000025280) SFMBT1 (ENSPKIG00000025255) prkcda (ENSPKIG00000025236) ENSPKIG00000025226 ENSPKIG00000025218 ghrl (ENSPKIG00000025212) ENSPKIG00000025206 crbn (ENSPKIG00000025188) #17 ENSPKIG00000025177 ENSPKIG00000025171 lrrn1 (ENSPKIG00000025164) #18 ENSPKIG00000025159 sumf1 (ENSPKIG00000025148) #21 ENSPKIG00000025137 ITPR1 (ENSPKIG00000025108) ##22 bhlhe40 (ENSPKIG00000025093) #23 arl8ba (ENSPKIG00000025083) #24 edem1 (ENSPKIG00000025073) #25 gnat1 (ENSPKIG00000024997) sema3fa (ENSPKIG00000024940) ENSPKIG00000024917 CAMKV (ENSPKIG00000024911) ENSPKIG00000024903 ENSPKIG00000024888 inka1b (ENSPKIG00000024879) GNAI2 (ENSPKIG00000024873) SLC38A3 (ENSPKIG00000024862) RBM5 (ENSPKIG00000024837) BRK1 (ENSPKIG00000024826) ENSPKIG00000024783 Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 ENSSFOG00015019989 GATA2 (ENSSFOG00015019978) ruvbl1 (ENSSFOG00015019948) mustn1a (ENSSFOG00015025456) stimate (ENSSFOG00015019920) SFMBT1 (ENSSFOG00015019899) prkcda (ENSSFOG00015019846) FGD5 (ENSSFOG00015019804) ENSSFOG00015019787 ENSSFOG00015029961 crbn (ENSSFOG00015019757) #17 ENSSFOG00015019749 ENSSFOG00015019709 lrrn1 (ENSSFOG00015025870) #18 sumf1 (ENSSFOG00015019671) #21 ITPR1 (ENSSFOG00015019501) ##22 bhlhe40 (ENSSFOG00015024843) #23 arl8ba (ENSSFOG00015019411) #24 edem1 (ENSSFOG00015019359) #25 gnat1 (ENSSFOG00015019335) sema3fa (ENSSFOG00015019289) ENSSFOG00015019241 CAMKV (ENSSFOG00015020033) ENSSFOG00015019189 ENSSFOG00015019167 inka1b (ENSSFOG00015019162) GNAI2 (ENSSFOG00015019141) SLC38A3 (ENSSFOG00015019093) RBM5 (ENSSFOG00015019052) BRK1 (ENSSFOG00015019041) ENSSFOG00015030838