Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183189.a.b.a	ENSGT00940000154384	ENSGT00940000160614	ENSGT00940000156162.C	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00950000182930.B	ENSGT00940000155531.a.a	ENSGT00730000111202	ENSGT00940000154507.t	ENSGT00940000178727	ENSGT00460000041630	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00390000004674.j	ENSGT00940000157064.a.b.a #22	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22	ENSGT01050000244823.d.b.b.b	ENSGT00390000004798	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00390000015318.b	ENSGT01030000234590.A.b.b	ENSGT00940000165445	ENSGT01030000234590.A.b.a.a	ENSGT00940000155866	ENSGT00940000160228.i.a.b	ENSGT00390000003197	ENSGT00940000157074	ENSGT00390000001143	ENSGT00940000159265
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00950000183189.a.b.a	ENSGT00940000154384	ENSGT00940000160614	ENSGT00940000156162.C	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00950000182930.B	ENSGT00940000155531.a.a	ENSGT00730000111202	ENSGT00940000154507.t	ENSGT00940000178727	ENSGT00460000041630	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00390000004674.j	ENSGT00940000157064.a.b.a #22	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22	ENSGT01050000244823.d.b.b.b	ENSGT00390000004798	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00390000015318.b	ENSGT01030000234590.A.b.b	ENSGT00940000165445	ENSGT01030000234590.A.b.a.a	ENSGT00940000155866	ENSGT00940000160228.i.a.b	ENSGT00390000003197	ENSGT00940000157074	ENSGT00390000001143	ENSGT00940000159265
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	1212							mccc1 (ENSSPAG00000011206)	ENSSPAG00000011189	ENSSPAG00000011176	PIK3CA (ENSSPAG00000011095)	ZMAT3 (ENSSPAG00000011062)	ENSSPAG00000011052	ENSSPAG00000011023	stxbp3 (ENSSPAG00000010967)	ENSSPAG00000010939	ENSSPAG00000010928 #22	ENSSPAG00000010922	ENSSPAG00000010908 ##22	ENSSPAG00000010896	henmt1 (ENSSPAG00000010827)	fam102bb (ENSSPAG00000010766)	tmem69 (ENSSPAG00000010747)	slc25a24 (ENSSPAG00000010712)
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1100	RC3H1 (ENSMZEG00005025514)	zgc:110366 (ENSMZEG00005025516)	extl2 (ENSMZEG00005025517)	parla (ENSMZEG00005025518)	fgf12a (ENSMZEG00005025520)	ENSMZEG00005025521	COL4A4 (ENSMZEG00005025522)	NYAP2 (ENSMZEG00005025523)	ENSMZEG00005025524	gpc1b (ENSMZEG00005025525)	EPHB1 (ENSMZEG00005025526)	ENSMZEG00005025527	ENSMZEG00005025529	ENSMZEG00005025531	ENSMZEG00005025533	ENSMZEG00005025534 #22	prpf38b (ENSMZEG00005025536)	eeig2a (ENSMZEG00005025539)	ENSMZEG00005025543	PRKAB2 (ENSMZEG00005025544)	ENSMZEG00005025546	ENSMZEG00005025548	ENSMZEG00005025549	tm6sf2a (ENSMZEG00005025551)	ENSMZEG00005025554	SLC25A42 (ENSMZEG00005025562)	ARMC6 (ENSMZEG00005025567)	MAU2 (ENSMZEG00005025570)	ENSMZEG00005025575	NDUFA13 (ENSMZEG00005025576)	ENSMZEG00005025577
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	306	ENSHBUG00000023069	chrng (ENSHBUG00000023051)	ENSHBUG00000022981	eif4e2 (ENSHBUG00000022968)	CAPN10 (ENSHBUG00000022951)	ENSHBUG00000022940	ENSHBUG00000022903	ENSHBUG00000022868	ENSHBUG00000022857	CAMSAP2 (ENSHBUG00000022846)	WDR47 (ENSHBUG00000022815)	ENSHBUG00000022748	ENSHBUG00000022672	ENSHBUG00000022656	FNDC7 (ENSHBUG00000022563)	ENSHBUG00000022551 #22	prpf38b (ENSHBUG00000022496)	eeig2a (ENSHBUG00000022488)	ENSHBUG00000000689	PRKAB2 (ENSHBUG00000022443)	ENSHBUG00000022430	ENSHBUG00000022408	ENSHBUG00000022373	tm6sf2a (ENSHBUG00000022363)	ENSHBUG00000022299	SLC25A42 (ENSHBUG00000022280)	ARMC6 (ENSHBUG00000022237)	MAU2 (ENSHBUG00000001179)	GATAD2A (ENSHBUG00000022153)	NDUFA13 (ENSHBUG00000022075)	cirbpa (ENSHBUG00000022060)
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000013701	ENSGT00950000183189.a.b.a	ENSGT00940000154384	ENSGT00940000160614	ENSGT00940000156162.C	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00950000182930.B	ENSGT00940000155531.a.a	ENSGT00730000111202	ENSGT00940000154507.t	ENSGT00940000178727	ENSGT00460000041630	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00940000157064.a.b.a #22	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22	ENSGT00390000004798	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00390000015318.b	ENSGT01030000234590.A.b.b	ENSGT00940000165445	ENSGT01030000234590.A.b.a.a	ENSGT00940000155866	ENSGT00940000160228.i.a.b	ENSGT00390000003197	ENSGT00940000157074	ENSGT00390000001143	ENSGT00940000159265	ENSGT00940000164867.b
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000013701	ENSGT00950000183189.a.b.a	ENSGT00940000154384	ENSGT00940000160614	ENSGT00940000156162.C	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00950000182930.B	ENSGT00940000155531.a.a	ENSGT00730000111202	ENSGT00940000154507.t	ENSGT00940000178727	ENSGT00460000041630	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00940000157064.a.b.a #22	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22	ENSGT00390000004798	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00390000015318.b	ENSGT01030000234590.A.b.b	ENSGT00940000165445	ENSGT01030000234590.A.b.a.a	ENSGT00940000155866	ENSGT00940000160228.i.a.b	ENSGT00390000003197	ENSGT00940000157074	ENSGT00390000001143	ENSGT00940000159265	ENSGT00940000164867.b
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000013701	ENSGT00950000183189.a.b.a	ENSGT00940000154384	ENSGT00940000160614	ENSGT00940000156162.C	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00950000182930.B	ENSGT00940000155531.a.a	ENSGT00730000111202	ENSGT00940000154507.t	ENSGT00940000178727	ENSGT00460000041630	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00940000157064.a.b.a #22	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22	ENSGT00390000004798	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00390000015318.b	ENSGT01030000234590.A.b.b	ENSGT00940000165445	ENSGT01030000234590.A.b.a.a	ENSGT00940000155866	ENSGT00940000160228.i.a.b	ENSGT00390000003197	ENSGT00940000157074	ENSGT00390000001143	ENSGT00940000159265	ENSGT00940000164867.b
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1626	ENSNFUG00015017098	ENSNFUG00015017106	ATP11B (ENSNFUG00015017152)	MCCC1 (ENSNFUG00015017726)	ENSNFUG00015019482	ENSNFUG00015019487	KNG1 (ENSNFUG00015019491)	PIK3CA (ENSNFUG00015019503)	BX548160.2 (ENSNFUG00015019542)	ENSNFUG00015019547	ENSNFUG00015019556	ENSNFUG00015019560	ENSNFUG00015019565	STXBP3 (ENSNFUG00015019624)	FNDC7 (ENSNFUG00015020481)	ENSNFUG00015020496 #22	ENSNFUG00015020505 ##22	henmt1 (ENSNFUG00015020514)	FAM102BB (ENSNFUG00015020518)	SLC25A24 (ENSNFUG00015020534)	TMEM69 (ENSNFUG00015021076)	tm4sf4 (ENSNFUG00015021079)	ENSNFUG00015021086	TM4SF18 (ENSNFUG00015021091)	CP (ENSNFUG00015021159)	Nfu_g_1_002524 (ENSNFUG00015023093)	NCBP2 (ENSNFUG00015024096)	FKBP2 (ENSNFUG00015024102)	NCBP2AS2 (ENSNFUG00015024105)	MELTF (ENSNFUG00015024114)	ENSNFUG00015024260
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00390000013701	ENSGT00950000183189.a.b.a	ENSGT00940000154384	ENSGT00940000160614	ENSGT00940000156162.C	ENSGT00940000156941	ENSGT00950000182899.C.a	ENSGT00950000182930.B	ENSGT00940000155531.a.a	ENSGT00730000111202	ENSGT00940000154507.t	ENSGT00460000041630	ENSGT00940000157607	ENSGT00390000004674.i.b	ENSGT00390000004674.j	ENSGT00940000157064.a.b.a #22	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22	ENSGT00390000004798	ENSGT00940000156132.h	ENSGT00940000164927.a	ENSGT00390000015318.b	ENSGT01030000234590.A.b.b	ENSGT00940000165445	ENSGT01030000234590.A.b.a.a	ENSGT00940000155866	ENSGT00940000160228.i.a.b	ENSGT00390000003197	ENSGT00940000157074	ENSGT00390000001143	ENSGT00940000159265	ENSGT00940000164867.b
Mummichog	MODERN SPECIES	2395	ENSFHEG00000003734	fxr1 (ENSFHEG00000003714)	dnajc19 (ENSFHEG00000003702)	sox2 (ENSFHEG00000003675)	ATP11B (ENSFHEG00000003653)	mccc1 (ENSFHEG00000003581)	ENSFHEG00000003270	ENSFHEG00000003260	PIK3CA (ENSFHEG00000003251)	ZMAT3 (ENSFHEG00000003221)	ENSFHEG00000003207	ENSFHEG00000003197	stxbp3 (ENSFHEG00000003185)	ENSFHEG00000003177	ENSFHEG00000003168	ENSFHEG00000003159 #22	ENSFHEG00000003137 ##22	henmt1 (ENSFHEG00000003127)	fam102bb (ENSFHEG00000003122)	slc25a24 (ENSFHEG00000003104)	tmem69 (ENSFHEG00000003075)	tm4sf4 (ENSFHEG00000003069)	ENSFHEG00000003061	ENSFHEG00000003052	cp (ENSFHEG00000003044)	ENSFHEG00000002995	ncbp2 (ENSFHEG00000002308)	fkbp2 (ENSFHEG00000002303)	NCBP2AS2 (ENSFHEG00000002289)	MELTF (ENSFHEG00000002267)	ENSFHEG00000002202
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000157064.a.b.a #22
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000157096	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000166623	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT01020000230600	ENSGT00940000172979	ENSGT00940000163706	ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155561.m	ENSGT00940000154667.b.b	ENSGT00940000154254.b	ENSGT00390000004674.i.a	ENSGT00940000157064.a.b.a #22	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22	ENSGT00940000169454	ENSGT00390000004674.j	ENSGT00730000111085.B	ENSGT00940000156132.g	ENSGT00940000164927.b	ENSGT00940000159284	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000012913.a.a	ENSGT00940000158649.a.b	ENSGT00940000158163.b	ENSGT00390000002913	ENSGT00390000012198.b.a	ENSGT00390000004097.a.f	ENSGT00390000000719
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000013904	ENSGT00940000157096	ENSGT00940000157183.b	ENSGT00940000160041	ENSGT00940000166623	ENSGT00940000154694	ENSGT00940000159706	ENSGT01020000230600	ENSGT00940000172979	ENSGT00940000163706	ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b	ENSGT00940000155561.m	ENSGT00940000154667.b.b	ENSGT00940000154254.b	ENSGT00390000004674.i.a	ENSGT00940000157064.a.b.a #22	ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22	ENSGT00730000111085.B	ENSGT00940000156132.g	ENSGT00940000164927.b	ENSGT00940000159284	ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b	ENSGT00390000012913.a.a	ENSGT00940000158649.a.b	ENSGT00940000158163.b	ENSGT00390000002913	ENSGT00390000012198.b.a	ENSGT00390000004097.a.f	ENSGT00390000000719	ENSGT00940000165622.f	ENSGT00510000049027.d
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