Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 424 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT01010000229257 ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000157064 #22 ENSGT00390000012439 Euteleostomi DUPLICATION Euteleostomi DUPLICATION Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000157936 ENSGT00940000153391.c.b.a ENSGT00940000161534 ENSGT01060000248575.C ENSGT00940000156834 ENSGT00940000158639 ENSGT00950000182975.a.a.a.b ENSGT00940000155561 ENSGT00940000165672 ENSGT00940000154667.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674 #20 ENSGT00940000157064.a.b #22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132 #24 ENSGT00940000158786 ENSGT00940000164927 #25 ENSGT00400000023530 ENSGT00940000155252 ENSGT00940000153601.a.b ENSGT00940000160961 ENSGT00940000154802 ENSGT00530000063786.a ENSGT00940000154535.D ENSGT00940000156998 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000157936 ENSGT00940000153391.c.b.a ENSGT00940000161534 ENSGT01060000248575.C ENSGT00940000156834 ENSGT00940000158639 ENSGT00950000182975.a.a.a.b ENSGT00940000155561 ENSGT00940000165672 ENSGT00940000154667.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674 #20 ENSGT00940000157064.a.b #22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132 #24 ENSGT00940000164927 #25 ENSGT00400000023530 ENSGT00940000155252 ENSGT00940000153601.a.b ENSGT00940000160961 ENSGT00940000163532 ENSGT00940000163518 ENSGT00940000154802 ENSGT00530000063786.a ENSGT00940000154535.D ENSGT00940000156998 ENSGT00950000182886.a.a.a Neopterygii DUPLICATION Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 126 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00990000204320 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ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT00940000156539 ENSGT00390000016650.c.a #15 ENSGT00940000163309 ENSGT00390000002659 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.a ENSGT00390000003156.b ENSGT01060000248556.B ENSGT00940000154327.b.f ENSGT00940000160740 ENSGT00940000156073.c.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00990000211775 ENSGT01030000234635.a.a.a.a ENSGT00940000156924 ENSGT00950000183036.a.a.g ENSGT00940000154667.b.a ENSGT00950000182930.D ENSGT00940000155297.hb.b #12 ENSGT01050000244897.a.a.b.b #13 ENSGT01050000244955.b.c #14 ENSGT00390000016650.c.a #15 ENSGT00940000167241 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 ENSGT00940000156262 #37 Cod DUPLICATION Cod MODERN SPECIES 3 cfap144 (ENSGMOG00000031988) #7 EBNA1BP2 (ENSGMOG00000004150) #8 TMEM125 (ENSGMOG00000030092) #9 ap1m3 (ENSGMOG00000004130) #10 ENSGMOG00000009824 #11 ENSGMOG00000004733 #12 ENSGMOG00000004711 #13 ENSGMOG00000031193 #14 ENSGMOG00000008773 #15 ENSGMOG00000023155 #16 ENSGMOG00000008740 #17 ENSGMOG00000008719 #18 ENSGMOG00000008701 #19 ENSGMOG00000031127 #20 ENSGMOG00000029375 #21 ENSGMOG00000025844 #22 HENMT1 (ENSGMOG00000008674) #23 ENSGMOG00000008658 #24 ENSGMOG00000008646 #25 ENSGMOG00000024513 #26 tm4sf4 (ENSGMOG00000008633) #27 ENSGMOG00000008625 #28 ENSGMOG00000008617 #29 cp (ENSGMOG00000008595) #30 ENSGMOG00000027679 #31 NCBP2 (ENSGMOG00000018657) #32 ENSGMOG00000018655 #33 NCBP2AS2 (ENSGMOG00000030915) #34 MELTF (ENSGMOG00000018637) #35 ENSGMOG00000028710 #36 ENSGMOG00000003860 #37 Cod MODERN SPECIES 3 lrp8 (ENSGMOG00000002561) cfap144 (ENSGMOG00000031988) #7 EBNA1BP2 (ENSGMOG00000004150) #8 TMEM125 (ENSGMOG00000030092) #9 ap1m3 (ENSGMOG00000004130) #10 ENSGMOG00000009824 #11 ENSGMOG00000004733 #12 ENSGMOG00000004711 #13 ENSGMOG00000031193 #14 ENSGMOG00000008773 #15 ENSGMOG00000023155 #16 ENSGMOG00000008740 #17 ENSGMOG00000008719 #18 ENSGMOG00000008701 #19 ENSGMOG00000031127 #20 ENSGMOG00000029375 #21 ENSGMOG00000025844 #22 HENMT1 (ENSGMOG00000008674) #23 ENSGMOG00000008658 #24 ENSGMOG00000008646 #25 ENSGMOG00000024513 #26 tm4sf4 (ENSGMOG00000008633) #27 ENSGMOG00000008625 #28 ENSGMOG00000008617 #29 cp (ENSGMOG00000008595) #30 ENSGMOG00000027679 #31 NCBP2 (ENSGMOG00000018657) #32 ENSGMOG00000018655 #33 NCBP2AS2 (ENSGMOG00000030915) #34 MELTF (ENSGMOG00000018637) #35 ENSGMOG00000028710 #36 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000169454 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000169454 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f ENSGT00390000000719 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.f ENSGT00510000049027.d Gilthead seabream MODERN SPECIES 13 alg3 (ENSSAUG00010023502) ENSSAUG00010016830 ENSSAUG00010016834 chrng (ENSSAUG00010016835) ENSSAUG00010016837 eif4e2 (ENSSAUG00010016839) CAPN10 (ENSSAUG00010016851) ENSSAUG00010016972 ENSSAUG00010016973 ENSSAUG00010016976 CAMSAP2 (ENSSAUG00010016981) WDR47 (ENSSAUG00010016988) ENSSAUG00010017008 ENSSAUG00010017015 FNDC7 (ENSSAUG00010017017) ##20 ENSSAUG00010017020 #22 ENSSAUG00010017021 ##22 ENSSAUG00010017022 eeig2a (ENSSAUG00010017023) ##24 ENSSAUG00010017028 ##25 PRKAB2 (ENSSAUG00010017078) ENSSAUG00010017087 tm6sf2a (ENSSAUG00010017095) ENSSAUG00010017099 SLC25A42 (ENSSAUG00010017105) ARMC6 (ENSSAUG00010017108) MAU2 (ENSSAUG00010017124) ENSSAUG00010017786 NDUFA13 (ENSSAUG00010017787) cirbpa (ENSSAUG00010017789) ENSSAUG00010017792 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1212 mccc1 (ENSSPAG00000011206) ENSSPAG00000011189 ENSSPAG00000011176 PIK3CA (ENSSPAG00000011095) ZMAT3 (ENSSPAG00000011062) ENSSPAG00000011052 ENSSPAG00000011023 #17 stxbp3 (ENSSPAG00000010967) #18 ENSSPAG00000010939 #19 ENSSPAG00000010928 #22 ENSSPAG00000010922 ENSSPAG00000010908 ##22 ENSSPAG00000010896 henmt1 (ENSSPAG00000010827) #23 fam102bb (ENSSPAG00000010766) #24 tmem69 (ENSSPAG00000010747) #26 slc25a24 (ENSSPAG00000010712) #25 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.a #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1100 RC3H1 (ENSMZEG00005025514) zgc:110366 (ENSMZEG00005025516) extl2 (ENSMZEG00005025517) parla (ENSMZEG00005025518) fgf12a (ENSMZEG00005025520) ENSMZEG00005025521 COL4A4 (ENSMZEG00005025522) NYAP2 (ENSMZEG00005025523) ENSMZEG00005025524 ##14 gpc1b (ENSMZEG00005025525) ##13 EPHB1 (ENSMZEG00005025526) ##12 ENSMZEG00005025527 ##13 ENSMZEG00005025529 ENSMZEG00005025531 ##20 ENSMZEG00005025533 ENSMZEG00005025534 #22 prpf38b (ENSMZEG00005025536) eeig2a (ENSMZEG00005025539) ##24 ENSMZEG00005025543 ##25 PRKAB2 (ENSMZEG00005025544) ENSMZEG00005025546 ENSMZEG00005025548 ENSMZEG00005025549 tm6sf2a (ENSMZEG00005025551) ENSMZEG00005025554 SLC25A42 (ENSMZEG00005025562) ARMC6 (ENSMZEG00005025567) MAU2 (ENSMZEG00005025570) ENSMZEG00005025575 NDUFA13 (ENSMZEG00005025576) ENSMZEG00005025577 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 306 ENSHBUG00000023069 chrng (ENSHBUG00000023051) ENSHBUG00000022981 eif4e2 (ENSHBUG00000022968) CAPN10 (ENSHBUG00000022951) ENSHBUG00000022940 ENSHBUG00000022903 ENSHBUG00000022868 ENSHBUG00000022857 CAMSAP2 (ENSHBUG00000022846) WDR47 (ENSHBUG00000022815) ENSHBUG00000022748 ENSHBUG00000022672 ENSHBUG00000022656 FNDC7 (ENSHBUG00000022563) ##20 ENSHBUG00000022551 #22 prpf38b (ENSHBUG00000022496) eeig2a (ENSHBUG00000022488) ##24 ENSHBUG00000000689 ##25 PRKAB2 (ENSHBUG00000022443) ENSHBUG00000022430 ENSHBUG00000022408 ENSHBUG00000022373 tm6sf2a (ENSHBUG00000022363) ENSHBUG00000022299 SLC25A42 (ENSHBUG00000022280) ARMC6 (ENSHBUG00000022237) MAU2 (ENSHBUG00000001179) GATAD2A (ENSHBUG00000022153) NDUFA13 (ENSHBUG00000022075) cirbpa (ENSHBUG00000022060) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013701 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000013701 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000013701 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1626 ENSNFUG00015017098 ENSNFUG00015017106 ATP11B (ENSNFUG00015017152) MCCC1 (ENSNFUG00015017726) ENSNFUG00015019482 ENSNFUG00015019487 KNG1 (ENSNFUG00015019491) PIK3CA (ENSNFUG00015019503) BX548160.2 (ENSNFUG00015019542) ENSNFUG00015019547 ENSNFUG00015019556 ENSNFUG00015019560 #17 ENSNFUG00015019565 #17 STXBP3 (ENSNFUG00015019624) #18 FNDC7 (ENSNFUG00015020481) #19 ENSNFUG00015020496 #22 ENSNFUG00015020505 ##22 henmt1 (ENSNFUG00015020514) 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ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Mummichog MODERN SPECIES 2395 ENSFHEG00000003734 fxr1 (ENSFHEG00000003714) dnajc19 (ENSFHEG00000003702) sox2 (ENSFHEG00000003675) ATP11B (ENSFHEG00000003653) mccc1 (ENSFHEG00000003581) ENSFHEG00000003270 ENSFHEG00000003260 PIK3CA (ENSFHEG00000003251) ZMAT3 (ENSFHEG00000003221) ENSFHEG00000003207 ENSFHEG00000003197 #17 stxbp3 (ENSFHEG00000003185) #18 ENSFHEG00000003177 #19 ENSFHEG00000003168 #20 ENSFHEG00000003159 #22 ENSFHEG00000003137 ##22 henmt1 (ENSFHEG00000003127) #23 fam102bb (ENSFHEG00000003122) #24 slc25a24 (ENSFHEG00000003104) #25 tmem69 (ENSFHEG00000003075) #26 tm4sf4 (ENSFHEG00000003069) #27 ENSFHEG00000003061 #28 ENSFHEG00000003052 #29 cp (ENSFHEG00000003044) #30 ENSFHEG00000002995 ncbp2 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(ENSOKIG00005025081) MAU2 (ENSOKIG00005024928) ENSOKIG00005024908 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 724 zgc:65873 (ENSHHUG00000006998) SYDE2 (ENSHHUG00000007007) DNAI3 (ENSHHUG00000007013) MCOLN3 (ENSHHUG00000007031) gpsm2l (ENSHHUG00000007060) stxbp3 (ENSHHUG00000007080) #18 ENSHHUG00000007118 #22 ENSHHUG00000007121 ENSHHUG00000007127 #22 ENSHHUG00000007132 ENSHHUG00000007138 ##22 henmt1 (ENSHHUG00000007146) #23 fam102bb (ENSHHUG00000007155) #24 slc25a24 (ENSHHUG00000007181) #25 tmem69 (ENSHHUG00000007322) #26 GPBP1L1 (ENSHHUG00000007326) nasp (ENSHHUG00000007355) #15 akr1a1b (ENSHHUG00000007436) aldh9a1a.1 (ENSHHUG00000007690) tmco1 (ENSHHUG00000008072) uck2a (ENSHHUG00000008166) magoh (ENSHHUG00000008271) cpt2 (ENSHHUG00000008282) scp2b (ENSHHUG00000008310) Huchen MODERN SPECIES 724 zgc:65873 (ENSHHUG00000006998) SYDE2 (ENSHHUG00000007007) DNAI3 (ENSHHUG00000007013) MCOLN3 (ENSHHUG00000007031) gpsm2l (ENSHHUG00000007060) stxbp3 (ENSHHUG00000007080) #18 ENSHHUG00000007118 #22 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ENSGT01030000235096 ENSGT00940000155482 ENSGT00940000157723.d Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000012141.a.b ENSGT00390000013904.b ENSGT00940000157096.s ENSGT00940000157183.b.g.a ENSGT00940000160041.a ENSGT00940000166623.b ENSGT00940000154694.d ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b.p.a.a ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b.f ENSGT00940000155561.m.a ENSGT01060000248903.a.b ENSGT00940000159520.h.k.b.a.a.b ENSGT00940000154667.b.b.a.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a.c ##20 ENSGT00940000157064.a.b.a.a #22 ENSGT00730000111085.B.h ENSGT00940000154667.b.b.a.a ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.r.a ##22 ENSGT00730000111085.B.g.a.a ENSGT00940000156132.g.b ##24 ENSGT00940000156504.i.b.b.a ENSGT00940000155954.a.h ENSGT00390000010895.b.b ENSGT00970000193372.b.a.a.b.c ENSGT00940000166397 ENSGT00940000155066.e.a.b.d ENSGT00950000182897.B.a.a.d.c.c ENSGT01090000260029.a.b.b.b.a.a.a.a.b.b.b.a.a ENSGT00940000158085.a.a.a ENSGT00390000018381.n Goldfish MODERN SPECIES 2372 FNDC7 (ENSCARG00000055856) ##20 ENSCARG00000055847 #22 ENSCARG00000055839 ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 495 ENSGT00940000154667.b.b.a.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a.c ##20 ENSGT00940000157064.a.b.a.a #22 ENSGT00730000111085.B.h ENSGT00940000156132.g.a.b ##24 ENSGT01050000244955.b.d.a.a ##14 ENSGT01050000244897.a.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155297.hb.a.g.a ##12 ENSGT00940000163883.B ENSGT00980000199383 ENSGT00940000156504.i.b.b.b.b ENSGT00940000155954.a.g ENSGT00390000010895.b.a ENSGT00970000193372.b.a.a.b.d Golden-line barbel DUPLICATION Golden-line barbel MODERN SPECIES 1274 ENSSGRG00000041344 ENSSGRG00000041341 ENSSGRG00000041338 ENSSGRG00000041336 ENSSGRG00000041254 FNDC7 (ENSSGRG00000041248) ##20 ENSSGRG00000041239 #22 ENSSGRG00000041233 #22 ENSSGRG00000041228 ##22 ENSSGRG00000041217 eeig2a (ENSSGRG00000041215) ##24 ENSSGRG00000041214 ENSSGRG00000041213 ##14 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1274 ENSSGRG00000041344 ENSSGRG00000041341 ENSSGRG00000041338 ENSSGRG00000041336 ENSSGRG00000041254 FNDC7 (ENSSGRG00000041248) ##20 ENSSGRG00000041239 #22 ENSSGRG00000041233 #22 ENSSGRG00000041228 ##22 ENSSGRG00000041217 eeig2a (ENSSGRG00000041215) ##24 ENSSGRG00000041214 ENSSGRG00000041213 ##14 Common carp reference MODERN SPECIES 29 ENSCCRG00000052962 ENSCCRG00000000213 ENSCCRG00000016441 ENSCCRG00000032451 ENSCCRG00000057825 ENSCCRG00000047240 ENSCCRG00000060928 ENSCCRG00000079044 ENSCCRG00000073776 ENSCCRG00000067384 ENSCCRG00000072887 ENSCCRG00000030276 ENSCCRG00000082768 ENSCCRG00000030370 ENSCCRG00000030366 ##20 ENSCCRG00000016494 #22 ENSCCRG00000030355 ENSCCRG00000030352 ##24 ENSCCRG00000061841 ##14 gpc1b (ENSCCRG00000000255) ##13 ENSCCRG00000070934 ##12 ENSCCRG00000050224 ENSCCRG00000050219 pax3a (ENSCCRG00000024914) acsl3b (ENSCCRG00000074544) scg2b (ENSCCRG00000003208) ap1s3b (ENSCCRG00000003196) ENSCCRG00000003174 cul3a (ENSCCRG00000032585) mbnl1 (ENSCCRG00000069077) ENSCCRG00000033921 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 805 ENSGT01100000263547.a.a.a.c.a ENSGT00550000075121.a ENSGT00940000157607.c #18 ENSGT00390000004674.i.b.a #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a.b #22 ENSGT00950000183204.b.b.a.g ENSGT00940000153467.a.a.fc.b.a ENSGT00950000183177.a.b.a.f Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 621 ENSGT01100000263547.a.a.a.c.a ENSGT00550000075121.a ENSGT00940000157607.c #18 ENSGT00390000004674.i.b.a #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a.b #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.q.a ##22 ENSGT00950000183204.b.b.a.g ENSGT00940000153467.a.a.fc.b.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 1035 ENSSGRG00000054848 klf3 (ENSSGRG00000054852) fam114a1 (ENSSGRG00000054855) klhl5 (ENSSGRG00000054857) ENSSGRG00000054858 ENSSGRG00000054861 ENSSGRG00000054862 rabggta (ENSSGRG00000054863) stxbp3 (ENSSGRG00000054872) #18 ENSSGRG00000054900 #19 ENSSGRG00000054902 #20 ENSSGRG00000054903 #22 ENSSGRG00000054905 ##22 fbxo30b (ENSSGRG00000054906) ENSSGRG00000054907 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 137 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ENSGT00390000015219 ENSGT00390000003680.a.a.a ENSGT00940000163212.A ENSGT00940000157783 ENSGT01030000234556.a.b.b ENSGT00940000159936 ENSGT00390000000566 ENSGT00940000159779.c ENSGT00940000155795.e ENSGT00940000155561.m ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b.p ENSGT00990000204320 Electric eel MODERN SPECIES 30 ENSEEEG00000003131 RAI2 (ENSEEEG00000003133) ENSEEEG00000003136 CDKL5 (ENSEEEG00000003142) ENSEEEG00000003174 AP1S2 (ENSEEEG00000003177) syap1 (ENSEEEG00000003202) fbxl5 (ENSEEEG00000003205) ENSEEEG00000003209 ENSEEEG00000003210 ENSEEEG00000003211 ENSEEEG00000003213 rabggta (ENSEEEG00000003219) stxbp3 (ENSEEEG00000003230) #18 ENSEEEG00000003236 #19 ENSEEEG00000003239 #22 fbxo30b (ENSEEEG00000003242) EPM2A (ENSEEEG00000003244) UTRN (ENSEEEG00000003274) psmb11b (ENSEEEG00000003364) ENSEEEG00000003366 slc34a2b (ENSEEEG00000003367) CELA3A (ENSEEEG00000003369) prdm5 (ENSEEEG00000003370) ndnf (ENSEEEG00000003371) NBEAL1 (ENSEEEG00000003376) ENSEEEG00000003378 TRAK2 (ENSEEEG00000003382) SEMA5B (ENSEEEG00000003388) unc50 (ENSEEEG00000003390) slc25a12 (ENSEEEG00000003399) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000156952.a.b ENSGT00950000183214.a.a.a.a ENSGT00940000155270.j ENSGT01090000259987.a.b.d.b.a.k ENSGT01090000259987.a.b.d.b.a.l ENSGT00940000155003.f ENSGT00940000165563.b ENSGT00940000154801.m.b ENSGT00950000182860.a.a.b.a.a.a.b ENSGT00950000183208.B.f.b ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00390000015219 ENSGT00390000003680.a.a.a ENSGT00940000163212.A ENSGT00940000154906.C.d ENSGT00940000153968.a.a.f ENSGT00940000156635 ENSGT00940000166901 ENSGT00390000007694 ENSGT00390000015361 ENSGT00530000063557.b ENSGT00940000155483.f ENSGT00940000163420 ENSGT00390000006619 Mexicana tetra MODERN SPECIES 52 ENSAMXG00000029225 ENSAMXG00000009308 ENSAMXG00000040074 ENSAMXG00000011804 ENSAMXG00000025543 SEMA6B (ENSAMXG00000003192) abhd17aa (ENSAMXG00000042048) cdc34b (ENSAMXG00000041885) chmp5b (ENSAMXG00000033472) ENSAMXG00000024969 ENSAMXG00000029828 ENSAMXG00000038453 ENSAMXG00000040295 ENSAMXG00000043098 ##20 ENSAMXG00000039598 #20 ENSAMXG00000014326 #22 ENSAMXG00000039494 eeig2a (ENSAMXG00000014288) ##24 dnaaf6 (ENSAMXG00000037030) PIP4P1 (ENSAMXG00000014236) ENSAMXG00000035599 zgc:152670 (ENSAMXG00000014215) lig1 (ENSAMXG00000014178) mpz (ENSAMXG00000032091) atp1a2a (ENSAMXG00000014095) sdhc (ENSAMXG00000031375) cadm3 (ENSAMXG00000030593) kirrel1b (ENSAMXG00000041455) WDR47 (ENSAMXG00000040612) Red-bellied piranha DUPLICATION Red-bellied piranha MODERN SPECIES 510 itgb1b (ENSPNAG00000016842) itgb1b.1 (ENSPNAG00000016909) epc1b (ENSPNAG00000016937) ENSPNAG00000016956 KIF5B (ENSPNAG00000017013) arhgap12a (ENSPNAG00000017260) ZEB1 (ENSPNAG00000017288) ENSPNAG00000017374 ENSPNAG00000017404 FNDC7 (ENSPNAG00000017431) ##20 ENSPNAG00000017449 #22 ENSPNAG00000017467 #22 ENSPNAG00000017484 eeig2a (ENSPNAG00000017504) ##24 dnaaf6 (ENSPNAG00000017520) PIP4P1 (ENSPNAG00000017529) ENSPNAG00000017536 ENSPNAG00000017550 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 510 itgb1b (ENSPNAG00000016842) itgb1b.1 (ENSPNAG00000016909) epc1b (ENSPNAG00000016937) ENSPNAG00000016956 KIF5B (ENSPNAG00000017013) arhgap12a (ENSPNAG00000017260) ZEB1 (ENSPNAG00000017288) ENSPNAG00000017374 ENSPNAG00000017404 FNDC7 (ENSPNAG00000017431) ##20 ENSPNAG00000017449 #22 ENSPNAG00000017467 #22 ENSPNAG00000017484 eeig2a (ENSPNAG00000017504) ##24 dnaaf6 (ENSPNAG00000017520) PIP4P1 (ENSPNAG00000017529) ENSPNAG00000017536 ENSPNAG00000017550 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 178 ENSGT00940000154667.b.a ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.q ##22 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00950000183190.a.a.b.c.b ENSGT00940000159466 ENSGT00390000014886 ENSGT00390000008371.a ENSGT00390000003574.a ENSGT00940000154149.b.a.g.b ENSGT00530000063646.a ENSGT00390000001254 ENSGT00940000155635 ENSGT00940000154614 ENSGT00940000154654.a.b.h ENSGT01030000234606.b.e.b Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 270 ENSDCDG00000012296 gpsm2l (ENSDCDG00000010764) stxbp3 (ENSDCDG00000010797) #18 ENSDCDG00000012363 #19 ENSDCDG00000012379 #20 ENSDCDG00000012389 #22 ENSDCDG00000012401 ##22 fam102bb (ENSDCDG00000012430) #24 slc25a24 (ENSDCDG00000012454) #25 ENSDCDG00000012503 ENSDCDG00000012529 ENSDCDG00000012581 prrx1b (ENSDCDG00000012595) ENSDCDG00000012670 gorab (ENSDCDG00000012674) ntmt2 (ENSDCDG00000012679) kifap3a (ENSDCDG00000012684) niban1a (ENSDCDG00000013239) TRMT1L (ENSDCDG00000012707) ENSDCDG00000013314 ENSDCDG00000013317 Denticle herring MODERN SPECIES 14 chrng (ENSDCDG00000017130) ENSDCDG00000017133 eif4e2 (ENSDCDG00000017134) CAPN10 (ENSDCDG00000017145) ENSDCDG00000017446 ccl20a.3 (ENSDCDG00000017448) ENSDCDG00000017450 CAMSAP2 (ENSDCDG00000017458) WDR47 (ENSDCDG00000017504) ENSDCDG00000017573 ENSDCDG00000017579 ENSDCDG00000017634 ENSDCDG00000018540 ENSDCDG00000018543 ##20 ENSDCDG00000018551 ENSDCDG00000018585 #22 ENSDCDG00000018625 eeig2a (ENSDCDG00000018655) ##24 HOMER3 (ENSDCDG00000018684) upf1 (ENSDCDG00000018778) pgpep1 (ENSDCDG00000018895) jund (ENSDCDG00000018897) loxl5b (ENSDCDG00000018906) nmrk2 (ENSDCDG00000018931) cplx4c (ENSDCDG00000018929) ATCAY (ENSDCDG00000018937) rx2 (ENSDCDG00000018940) ENSDCDG00000018941 ENSDCDG00000018959 ENSDCDG00000019569 ap1m1 (ENSDCDG00000019589) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000001114 ENSGT00940000155117.f.a ENSGT00940000158746 ENSGT00550000075080 ENSGT00940000155152.f.a ENSGT00940000158821.i ENSGT00940000156725.b ENSGT00940000153391.c.b.b.i.a.a ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.k ENSGT00940000165672 ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000177587 ENSGT00940000157607.m.a #18 ENSGT00390000004674.k.a #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00730000111085.B.k ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b.a.a ENSGT00950000183190.a.a.a.b ENSGT00940000159466 ENSGT00390000014886 ENSGT00390000003574.c ENSGT00940000154149.b.a.g.a ENSGT00940000155635.db ENSGT00940000154654.a.b ENSGT01030000234606.b.e.a ENSGT00390000010743.a.b ENSGT00940000156236.b ENSGT00390000012568 P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 75 nr5a2 (ENSPKIG00000004087) ENSPKIG00000004169 kif14 (ENSPKIG00000004304) ddx59 (ENSPKIG00000004361) camsap2a (ENSPKIG00000004415) WDR47 (ENSPKIG00000004492) ENSPKIG00000004539 stxbp3 (ENSPKIG00000004597) #18 FNDC7 (ENSPKIG00000004693) #20 ENSPKIG00000004743 #22 ENSPKIG00000004762 #20 ENSPKIG00000004783 ENSPKIG00000004794 ##22 ENSPKIG00000004815 henmt1 (ENSPKIG00000004845) #23 fam102bb (ENSPKIG00000004892) #24 slc25a24 (ENSPKIG00000004963) #25 ENSPKIG00000005176 prrx1b (ENSPKIG00000005726) ntmt2 (ENSPKIG00000005754) KIFAP3 (ENSPKIG00000005784) NIBAN1 (ENSPKIG00000005832) rnf2 (ENSPKIG00000005901) TRMT1L (ENSPKIG00000005941) ENSPKIG00000005979 P. kingsleyae MODERN SPECIES 81 uchl5 (ENSPKIG00000018255) ro60 (ENSPKIG00000018217) b3galt2 (ENSPKIG00000018205) cdc73 (ENSPKIG00000018155) ZBTB41 (ENSPKIG00000018092) ENSPKIG00000018060 LHX9 (ENSPKIG00000018033) nek7 (ENSPKIG00000018005) nr5a2 (ENSPKIG00000017971) CAMSAP2 (ENSPKIG00000017872) WDR47 (ENSPKIG00000017780) ENSPKIG00000017723 ENSPKIG00000017633 ENSPKIG00000017591 FNDC7 (ENSPKIG00000017510) #20 ENSPKIG00000017437 #22 stxbp3 (ENSPKIG00000017341) #18 ENSPKIG00000017291 EEIG2 (ENSPKIG00000017219) ##24 PRKAB2 (ENSPKIG00000017163) ENSPKIG00000017136 ENSPKIG00000017105 prrx1a (ENSPKIG00000017092) gorab (ENSPKIG00000017073) kifap3b (ENSPKIG00000017032) ENSPKIG00000016968 ivns1abpb (ENSPKIG00000016869) arpc5a (ENSPKIG00000016790) pla2g4aa (ENSPKIG00000016752) ptgs2a (ENSPKIG00000016720) PDC (ENSPKIG00000016703) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000158821 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000161534 ENSGT00940000156834 ENSGT00940000158639 ENSGT00950000182975.a.a.a.b ENSGT00940000155561 ENSGT00940000165672 ENSGT00940000154667.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674 #20 ENSGT00940000157064.a.b.b ##22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132 #24 ENSGT00940000164927 #25 ENSGT00400000023530 ENSGT00940000155252 ENSGT00940000153601.a.b ENSGT00940000160961 ENSGT00940000163532 ENSGT00940000163518 ENSGT00940000154802 ENSGT00530000063786.a ENSGT00940000154535.D ENSGT00940000156998 ENSGT00950000182886.a.a.a Spotted gar MODERN SPECIES 648 DENND1B (ENSLOCG00000007556) si:dkey-121a9.3 (ENSLOCG00000007585) lhx9 (ENSLOCG00000007595) nek7 (ENSLOCG00000007624) PTPRC (ENSLOCG00000007650) nr5a2 (ENSLOCG00000007670) kif14 (ENSLOCG00000007678) ddx59 (ENSLOCG00000007710) camsap2a (ENSLOCG00000007726) wdr47b (ENSLOCG00000007751) ENSLOCG00000007765 gpsm2l (ENSLOCG00000007781) ENSLOCG00000007805 stxbp3 (ENSLOCG00000007816) #18 FNDC7 (ENSLOCG00000007830) #20 ENSLOCG00000007844 ##22 prpf38b (ENSLOCG00000007860) henmt1 (ENSLOCG00000007885) #23 fam102bb (ENSLOCG00000007897) #24 slc25a24 (ENSLOCG00000007910) #25 selenoj (ENSLOCG00000007922) vav3b (ENSLOCG00000007934) NTNG1 (ENSLOCG00000007954) prmt6 (ENSLOCG00000017743) AMY1C (ENSLOCG00000007972) rnpc3 (ENSLOCG00000007986) col11a1a (ENSLOCG00000008000) olfm3a (ENSLOCG00000008015) tecrl2b (ENSLOCG00000008031) ENSLOCG00000008047 ENSLOCG00000008060 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000161534 ENSGT00940000156834 ENSGT00940000158639 ENSGT00950000182975.a.a.a.b ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561 ENSGT00940000165672 ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00940000154667.b.a ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674 #20 ENSGT00940000157064.a.b.b ##22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927 #25 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 743 ENSGT00390000004674.l #20 ENSGT00940000157064.a.b.b ##22 P. kingsleyae MODERN SPECIES 75 nr5a2 (ENSPKIG00000004087) ENSPKIG00000004169 kif14 (ENSPKIG00000004304) ddx59 (ENSPKIG00000004361) camsap2a (ENSPKIG00000004415) WDR47 (ENSPKIG00000004492) ENSPKIG00000004539 stxbp3 (ENSPKIG00000004597) #18 FNDC7 (ENSPKIG00000004693) #20 ENSPKIG00000004743 #22 ENSPKIG00000004762 #20 ENSPKIG00000004783 ENSPKIG00000004794 ##22 ENSPKIG00000004815 henmt1 (ENSPKIG00000004845) #23 fam102bb (ENSPKIG00000004892) #24 slc25a24 (ENSPKIG00000004963) #25 ENSPKIG00000005176 prrx1b (ENSPKIG00000005726) ntmt2 (ENSPKIG00000005754) KIFAP3 (ENSPKIG00000005784) NIBAN1 (ENSPKIG00000005832) rnf2 (ENSPKIG00000005901) TRMT1L (ENSPKIG00000005941) ENSPKIG00000005979 IVNS1ABP (ENSPKIG00000006021) HMCN1 (ENSPKIG00000006151) ARPC5 (ENSPKIG00000006321) Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 126 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(ENSOMYG00000054722) ENSOMYG00000072958 ENSOMYG00000074834 SYDE2 (ENSOMYG00000002580) DNAI3 (ENSOMYG00000002501) MCOLN3 (ENSOMYG00000002152) ENSOMYG00000001936 STXBP3 (ENSOMYG00000001744) #18 ENSOMYG00000061737 ENSOMYG00000001442 #22 ENSOMYG00000068656 ##22 ENSOMYG00000001357 ##22 ENSOMYG00000001285 #23 EEIG2 (ENSOMYG00000001254) #24 ENSOMYG00000001190 #25 tmem69 (ENSOMYG00000001156) #26 GPBP1L1 (ENSOMYG00000001147) nasp (ENSOMYG00000039721) #15 akr1a1b (ENSOMYG00000039689) ENSOMYG00000052179 aldh9a1a.1 (ENSOMYG00000038572) tmco1 (ENSOMYG00000038320) ENSOMYG00000074828 ENSOMYG00000038336 uck2a (ENSOMYG00000038302) magoh (ENSOMYG00000038275) Rainbow trout MODERN SPECIES 26 ccn1 (ENSOMYG00000002715) ENSOMYG00000002703 ENSOMYG00000071353 DDAH1 (ENSOMYG00000002691) zgc:65873 (ENSOMYG00000054722) ENSOMYG00000072958 ENSOMYG00000074834 SYDE2 (ENSOMYG00000002580) DNAI3 (ENSOMYG00000002501) MCOLN3 (ENSOMYG00000002152) ENSOMYG00000001936 STXBP3 (ENSOMYG00000001744) #18 ENSOMYG00000061737 ENSOMYG00000001442 #22 ENSOMYG00000068656 ##22 ENSOMYG00000001357 ##22 ENSOMYG00000001285 #23 EEIG2 (ENSOMYG00000001254) #24 ENSOMYG00000001190 #25 tmem69 (ENSOMYG00000001156) #26 GPBP1L1 (ENSOMYG00000001147) nasp (ENSOMYG00000039721) #15 akr1a1b (ENSOMYG00000039689) ENSOMYG00000052179 aldh9a1a.1 (ENSOMYG00000038572) tmco1 (ENSOMYG00000038320) ENSOMYG00000074828 ENSOMYG00000038336 uck2a (ENSOMYG00000038302) magoh (ENSOMYG00000038275) cpt2 (ENSOMYG00000038256) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000007658 ENSGT00530000063790.a.a.d ENSGT00940000154682.C.w ENSGT00940000163583.z ENSGT00940000163583.y.b ENSGT00390000017201 ENSGT00940000155151.b.d.e ENSGT01060000249603 ENSGT00940000157892.m ENSGT00390000017398.y ENSGT01030000234635.a.a.a.a.f ENSGT00940000156924 ENSGT00950000183036.a.a.g ENSGT00940000154667.b.a.f ENSGT00940000157607.k.b #18 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT00420000029753.b.ab ENSGT00390000016650.c.a.d #15 ENSGT00940000156539.w ENSGT00940000163309 ENSGT00390000002659 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.a.d ENSGT00390000003156.b.f ENSGT01060000248556.B ENSGT00940000160740.e ENSGT00940000156073.c.b ENSGT00940000161304.a.a Coho salmon MODERN SPECIES 4 lurap1 (ENSOKIG00005014311) clca1 (ENSOKIG00005014337) ENSOKIG00005014479 ENSOKIG00005014513 ZNHIT6 (ENSOKIG00005014528) ccn1 (ENSOKIG00005014545) ENSOKIG00005014572 DDAH1 (ENSOKIG00005014579) zgc:65873 (ENSOKIG00005014589) SYDE2 (ENSOKIG00005014599) DNAI3 (ENSOKIG00005014634) MCOLN3 (ENSOKIG00005015107) gpsm2l (ENSOKIG00005015185) STXBP3 (ENSOKIG00005015333) #18 ENSOKIG00005015747 ##22 ENSOKIG00005015758 ##22 henmt1 (ENSOKIG00005015785) #23 fam102bb (ENSOKIG00005015797) #24 slc25a24 (ENSOKIG00005015831) #25 tmem69 (ENSOKIG00005015906) #26 GPBP1L1 (ENSOKIG00005015911) nasp (ENSOKIG00005015929) #15 akr1a1b (ENSOKIG00005016001) aldh9a1a.1 (ENSOKIG00005016229) tmco1 (ENSOKIG00005017243) uck2a 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(ENSELUG00000023997) cpt2 (ENSELUG00000024049) scp2b (ENSELUG00000030034) PODN (ENSELUG00000024073) slc1a7b (ENSELUG00000024118) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT01030000234635.a.a.a.a ENSGT00940000156924 ENSGT00950000183036.a.a.g ENSGT00940000154667.b.a ENSGT00950000182930.D ENSGT00940000155297.hb.b #12 ENSGT01050000244897.a.a.b.b #13 ENSGT01050000244955.b.c #14 ENSGT00390000016650.c.a #15 ENSGT00940000167241 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 ENSGT00940000156262 #37 ENSGT00940000154507.t Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000169454 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 ENSGT01060000249321 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 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ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 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#36 ENSGT01060000249321 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 ENSGT01060000249321 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a 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#19 ENSSPAG00000010928 #22 ENSSPAG00000010922 ENSSPAG00000010908 ##22 ENSSPAG00000010896 henmt1 (ENSSPAG00000010827) #23 fam102bb (ENSSPAG00000010766) #24 tmem69 (ENSSPAG00000010747) #26 slc25a24 (ENSSPAG00000010712) #25 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00980000198596.B ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00980000198596.B ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013701 ENSGT00950000183189.a.b.a.h ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C.f ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00980000198596.B ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Fugu MODERN SPECIES 12 dnajc19 (ENSTRUG00000004352) sox2 (ENSTRUG00000004861) ENSTRUG00000031205 ATP11B (ENSTRUG00000002878) ENSTRUG00000033406 mccc1 (ENSTRUG00000003436) ENSTRUG00000024510 ENSTRUG00000003951 PIK3CA (ENSTRUG00000004021) ENSTRUG00000031285 ENSTRUG00000020845 ENSTRUG00000005137 #17 stxbp3 (ENSTRUG00000005412) #18 FNDC7 (ENSTRUG00000006252) #19 ENSTRUG00000029469 ENSTRUG00000030298 ##22 ENSTRUG00000030385 ENSTRUG00000028319 ENSTRUG00000032789 ENSTRUG00000029768 ENSTRUG00000030627 ENSTRUG00000031390 ENSTRUG00000030511 henmt1 (ENSTRUG00000018279) #23 fam102bb (ENSTRUG00000030064) #24 slc25a24 (ENSTRUG00000018295) #25 tmem69 (ENSTRUG00000018308) #26 tm4sf4 (ENSTRUG00000018310) #27 ENSTRUG00000018318 #28 cp (ENSTRUG00000018329) #30 ENSTRUG00000018339 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01060000252104 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000178727 ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000013701 ENSGT01060000252104 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000013701 ENSGT01060000252104 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 ENSGT00940000156262 #37 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.a.a.a ENSGT00390000013701 ENSGT01060000252104 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 ENSGT00940000156262 #37 Pike perch MODERN SPECIES 59 ENSSLUG00000013012 ttc14 (ENSSLUG00000009678) ENSSLUG00000009681 fxr1 (ENSSLUG00000009708) dnajc19 (ENSSLUG00000010014) ATP11B (ENSSLUG00000010144) mccc1 (ENSSLUG00000013622) ENSSLUG00000014011 kng1 (ENSSLUG00000014020) PIK3CA (ENSSLUG00000014031) ZMAT3 (ENSSLUG00000014062) ENSSLUG00000014164 ENSSLUG00000014175 #17 stxbp3 (ENSSLUG00000014209) #18 ENSSLUG00000014440 #19 ENSSLUG00000014445 ##22 henmt1 (ENSSLUG00000014450) #23 fam102bb (ENSSLUG00000014456) #24 slc25a24 (ENSSLUG00000014480) #25 tmem69 (ENSSLUG00000014578) #26 ENSSLUG00000014582 ENSSLUG00000014591 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.a.a.a ENSGT00390000013701 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT01050000244823.d.b.b.b ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 Gilthead seabream MODERN SPECIES 2 Tim14 (ENSSAUG00010007093) ENSSAUG00010007090 sox2 (ENSSAUG00010007089) ATP11B (ENSSAUG00010006965) mccc1 (ENSSAUG00010002097) ENSSAUG00010001984 ENSSAUG00010001979 PIK3CA (ENSSAUG00010001967) ENSSAUG00010001961 ENSSAUG00010001957 ENSSAUG00010001956 #17 ENSSAUG00010001893 stxbp3 (ENSSAUG00010001436) #18 FNDC7 (ENSSAUG00010001386) #19 ENSSAUG00010001377 ENSSAUG00010001364 ##22 ENSSAUG00010001354 ENSSAUG00010001347 ENSSAUG00010001334 henmt1 (ENSSAUG00010026592) #23 fam102bb (ENSSAUG00010026591) #24 slc25a24 (ENSSAUG00010026551) #25 tmem69 (ENSSAUG00010026549) #26 tm4sf4 (ENSSAUG00010026548) #27 ENSSAUG00010026546 #28 ENSSAUG00010026545 #29 cp (ENSSAUG00010026525) #30 ENSSAUG00010026215 ncbp2 (ENSSAUG00010026196) #32 fkbp2 (ENSSAUG00010026195) #33 NCBP2AS2 (ENSSAUG00010026194) #34 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182865.b.a.b.b.a.a.a ENSGT00390000013701 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 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Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00980000203290 ENSGT00390000013701 ENSGT00950000183189.a.b.a ENSGT00940000154384 ENSGT00940000160614 ENSGT00940000156162.C ENSGT00940000156941 ENSGT00950000182899.C.a ENSGT00950000182930.B ENSGT00940000155531.a.a ENSGT00730000111202 ENSGT00940000154507.t ENSGT00460000041630 #17 ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674.i.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132.h #24 ENSGT00940000164927.a #25 ENSGT00390000015318.b #26 ENSGT01030000234590.A.b.b #27 ENSGT00940000165445 #28 ENSGT01030000234590.A.b.a.a #29 ENSGT00940000155866 #30 ENSGT00940000160228.i.a.b ENSGT00390000003197 #32 ENSGT00940000157074 #33 ENSGT00390000001143 #34 ENSGT00940000159265 #35 ENSGT00940000164867.b #36 ENSGT00940000156262 #37 Climbing perch MODERN SPECIES 17 ENSATEG00000000123 ENSATEG00000000110 ttc14 (ENSATEG00000000101) fxr1 (ENSATEG00000022488) dnajc19 (ENSATEG00000000021) ATP11B (ENSATEG00000022414) mccc1 (ENSATEG00000022375) 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Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00980000198821.b.a.a ENSGT00940000171106.a ENSGT00940000161281.j ENSGT00940000156326.a.a.c ENSGT01020000230354.A.a.b.a ENSGT00940000160369.i ENSGT00950000182945.b.a.a.a.b.b.a.b ENSGT00940000155218.A.d.b.a ENSGT00940000155218.A.d.a.e ENSGT00940000161589.c ENSGT00940000163807 ENSGT01050000244939.a.a.b.a.b.d ENSGT00550000075121.b ENSGT00940000157607.d #18 ENSGT00390000004674.i.b.b #19 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.q.b ##22 ENSGT00950000183204.b.b.a.h ENSGT00390000010101 ENSGT00940000153467.a.a.fc.a ENSGT00940000162200.a.a ENSGT00940000167983 ENSGT00950000183177.a.b.a.f ENSGT00950000183177.a.b.a.e ENSGT00940000158340.h ENSGT00390000007586.a.b.b ENSGT00940000160357.e.b ENSGT00940000159588.f ENSGT00940000155482.a.a ENSGT00940000157723.d.d ENSGT00550000074878.nb ENSGT00390000000155.b.a.d Common carp reference MODERN SPECIES 49 ENSCCRG00000027847 ENSCCRG00000028008 ENSCCRG00000056339 rhoac (ENSCCRG00000080396) ENSCCRG00000051780 ENSCCRG00000023480 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ENSGT00940000164927.b ##25 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 540 ENSGT00980000198596.B.a ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.r ##22 ENSGT00730000111085.B Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 227 ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00980000198596.B.b ENSGT00980000198596.A ENSGT00980000198596.B.a ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.r ##22 ENSGT00730000111085.B Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000157183.b.g.a ENSGT00940000160041.a ENSGT00940000166623.b ENSGT00940000154694.d ENSGT00390000013973.A.a.c.b.b.p.a.a ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b.f ENSGT00940000155561.m.a ENSGT01060000248903.a.b ENSGT00940000159520.h.k.b.a.a.b ENSGT00940000154667.b.b.a.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a.c ##20 ENSGT00940000157064.a.b.a.a #22 ENSGT00730000111085.B.h ENSGT00940000154667.b.b.a.a ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.r.a ##22 ENSGT00730000111085.B.g.a.a ENSGT00940000156132.g.b ##24 ENSGT00940000156504.i.b.b.a ENSGT00940000155954.a.h ENSGT00390000010895.b.b ENSGT00970000193372.b.a.a.b.c ENSGT00940000166397 ENSGT00940000155066.e.a.b.d ENSGT00950000182897.B.a.a.d.c.c ENSGT01090000260029.a.b.b.b.a.a.a.a.b.b.b.a.a ENSGT00940000158085.a.a.a ENSGT00390000018381.n ENSGT00940000155002.b.f.b ENSGT00730000114072 ENSGT00940000156108.k.a Goldfish MODERN SPECIES 11 camk2n1a (ENSCARG00000005431) mul1a (ENSCARG00000005423) alg3 (ENSCARG00000005396) ENSCARG00000005373 ENSCARG00000005362 eif4e2 (ENSCARG00000005280) CAPN10 (ENSCARG00000005260) ENSCARG00000005255 ENSCARG00000005250 ccl20a.3 (ENSCARG00000005240) CAMSAP2 (ENSCARG00000005215) WDR47 (ENSCARG00000005203) ENSCARG00000005195 ENSCARG00000005184 ENSCARG00000005068 ENSCARG00000005037 ##22 prpf38b (ENSCARG00000005019) eeig2a (ENSCARG00000005008) ##24 KIF5B (ENSCARG00000004977) epc1b (ENSCARG00000004918) ITGB1 (ENSCARG00000004851) ITGB1 (ENSCARG00000004165) nrp1b (ENSCARG00000003966) pard3ab (ENSCARG00000003637) ENSCARG00000003600 ENSCARG00000003568 ENSCARG00000003547 KCNQ3 (ENSCARG00000003466) ENSCARG00000003453 efr3a (ENSCARG00000003446) tle2c (ENSCARG00000003432) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 168 ENSGT00940000154667.b.b.a.a ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.r.a ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00940000156132.g.a.a ##24 ENSGT01050000244955.b.d.a.b ##14 ENSGT01050000244897.a.a.b.a.a ##13 ENSGT00940000155297.hb.a.g.b ##12 ENSGT00940000164732.A ENSGT00940000156504.i.b.b.b.a ENSGT00940000155954.a.h ENSGT00970000193372.b.a.a.b.c ENSGT00940000166397 ENSGT00390000010895.b.b ENSGT00940000155066.e.a.b.d ENSGT00950000182897.B.a.a.d.c.c ENSGT01090000260029.a.b.b.b.a.a.a.a.b.b.b.a.a ENSGT00940000158085.a.a.a Common carp reference MODERN SPECIES 21 ENSCCRG00000056736 ENSCCRG00000075869 chrng (ENSCCRG00000046406) ENSCCRG00000046409 eif4e2 (ENSCCRG00000029776) ENSCCRG00000046473 ccl20a.3 (ENSCCRG00000047234) ENSCCRG00000046481 ENSCCRG00000025175 ENSCCRG00000061048 ENSCCRG00000039059 ENSCCRG00000039096 ENSCCRG00000062563 ENSCCRG00000030406 ENSCCRG00000030377 ENSCCRG00000016425 ##22 prpf38b (ENSCCRG00000000267) eeig2a (ENSCCRG00000000313) ##24 ENSCCRG00000030710 ##14 gpc1b (ENSCCRG00000045552) ##13 ENSCCRG00000064548 ##12 ENSCCRG00000048211 ENSCCRG00000077507 pax3a (ENSCCRG00000049692) acsl3b (ENSCCRG00000024262) scg2b (ENSCCRG00000007068) ap1s3b (ENSCCRG00000073317) ENSCCRG00000007077 cul3a (ENSCCRG00000007084) mbnl1 (ENSCCRG00000078519) ENSCCRG00000081042 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1274 ENSSGRG00000041344 ENSSGRG00000041341 ENSSGRG00000041338 ENSSGRG00000041336 ENSSGRG00000041254 FNDC7 (ENSSGRG00000041248) ##20 ENSSGRG00000041239 #22 ENSSGRG00000041233 #22 ENSSGRG00000041228 ##22 ENSSGRG00000041217 eeig2a (ENSSGRG00000041215) ##24 ENSSGRG00000041214 ENSSGRG00000041213 ##14 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 665 ENSGT00940000161257 ENSGT00390000004674.i.a.d ##20 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.r.b ##22 ENSGT00730000111085.B.g.b ENSGT00940000156132.g.a.b ##24 ENSGT01050000244955.b.d.a.a ##14 ENSGT01050000244897.a.a.b.a.b ##13 ENSGT00940000155297.hb.a.g.a ##12 ENSGT00940000156850.a.b ENSGT00980000199383 ENSGT00940000156504.i.b.b.b.b ENSGT00940000155954.a.g ENSGT00390000010895.b.a ENSGT00970000193372.b.a.a.b.d Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 2372 FNDC7 (ENSCARG00000055856) ##20 ENSCARG00000055847 #22 ENSCARG00000055839 ##22 Goldfish MODERN SPECIES 19 EEF1AKMT4 (ENSCARG00000005748) ncapd2 (ENSCARG00000005641) acsm3 (ENSCARG00000005595) ENSCARG00000005556 YEATS2 (ENSCARG00000005546) klhl24a (ENSCARG00000005540) ENSCARG00000005535 nrp1b (ENSCARG00000005502) WDR47 (ENSCARG00000005489) ENSCARG00000005484 ENSCARG00000005480 ENSCARG00000005465 ENSCARG00000005363 ENSCARG00000005345 FNDC7 (ENSCARG00000005318) ##20 ENSCARG00000005278 ##22 ENSCARG00000005265 eeig2a (ENSCARG00000005251) ##24 ITGB1 (ENSCARG00000004916) epc1b (ENSCARG00000004146) ENSCARG00000004025 ENSCARG00000003986 mterf4 (ENSCARG00000003964) ENSCARG00000003949 ENSCARG00000003934 ENSCARG00000003915 ENSCARG00000040810 neurod6b (ENSCARG00000040789) ENSCARG00000038669 viml (ENSCARG00000037820) ENSCARG00000032706 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 817 ENSGT00940000161257 ENSGT00390000004674.i.a.d ##20 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a.r.b ##22 ENSGT00730000111085.B.g.b Golden-line barbel MODERN SPECIES 276 ENSSGRG00000046285 eif4e2 (ENSSGRG00000046283) ENSSGRG00000046281 ENSSGRG00000046279 ENSSGRG00000046277 CAMSAP2 (ENSSGRG00000046273) WDR47 (ENSSGRG00000046272) ENSSGRG00000046271 ENSSGRG00000046270 ENSSGRG00000046268 ENSSGRG00000046267 ENSSGRG00000046266 ENSSGRG00000046265 gpsm2 (ENSSGRG00000046252) FNDC7 (ENSSGRG00000046250) ##20 ENSSGRG00000046249 ##22 ENSSGRG00000046247 gpc1b (ENSSGRG00000046243) ##13 ENSSGRG00000046242 ##12 Zebrafish MODERN SPECIES 11 ccl20a.3 (ENSDARG00000101040) CAMSAP2 (ENSDARG00000059965) ENSDARG00000102714 SAMD9 (ENSDARG00000102729) WDR47 (ENSDARG00000078136) ENSDARG00000091280 ENSDARG00000095634 ENSDARG00000088423 gpsm2 (ENSDARG00000017311) ENSDARG00000094414 FNDC7 (ENSDARG00000077096) ##20 ENSDARG00000092552 ENSDARG00000092469 ENSDARG00000115238 ENSDARG00000093150 ENSDARG00000092813 ##22 prpf38b (ENSDARG00000053101) eeig2a (ENSDARG00000053104) ##24 ENSDARG00000074082 ##14 ENSDARG00000091590 ENSDARG00000109342 gpc1b (ENSDARG00000090585) ##13 ENSDARG00000109215 ##12 EPHB1 (ENSDARG00000076757) ##12 ENSDARG00000094038 ENSDARG00000078489 pax3a (ENSDARG00000010192) acsl3b (ENSDARG00000014674) scg2b (ENSDARG00000038574) ap1s3b (ENSDARG00000027966) ENSDARG00000076970 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 126 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157155 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00990000204320 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.a ##22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b.d ENSGT00950000183190.a.a.a.a.b ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a ENSGT01100000263594 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157155 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00990000204320 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00980000198596.C ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b.d ENSGT00950000183190.a.a.a.a.b ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a ENSGT01100000263594 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157155.z ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT00990000204320 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00940000157064.a.b.a #22 ENSGT00980000198596.C ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g.c ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b.d ENSGT00950000183190.b ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f ENSGT00390000000719 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 239 ENSGT00990000204320 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b.b ENSGT00940000155561.m.c ENSGT00940000154667.b.b.f ENSGT00390000004674.i.a.g ##20 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00730000111085.B.j ENSGT00940000156132.g.d ##24 ENSGT00940000164927.b.f ##25 ENSGT00940000159284.n ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a.d ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b.m ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b.j ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a.b ENSGT00390000004097.a.f.c ENSGT00390000000719.u.b ENSGT00390000007227.b.ab ENSGT00940000165622.i.a.b Huchen MODERN SPECIES 1493 ENSHHUG00000036870 WDR47 (ENSHHUG00000036865) ENSHHUG00000036813 ENSHHUG00000036811 ##20 FNDC7 (ENSHHUG00000036804) ##20 ENSHHUG00000036801 ENSHHUG00000036798 ENSHHUG00000036791 ##22 prpf38b (ENSHHUG00000036778) eeig2a (ENSHHUG00000036770) ##24 ENSHHUG00000036758 ##25 ENSHHUG00000036747 ENSHHUG00000036679 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000157930 ENSGT00940000164140.c.a ENSGT00390000004940.a.a.a.a ENSGT00390000012141.a.f ENSGT00390000013904.d ENSGT00940000157183.b.f ENSGT00940000160041 ENSGT01000000216279.b ENSGT00990000204320 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b.b 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ENSSSAG00000080841 ENSSSAG00000083741 River trout MODERN SPECIES 13 ENSSTUG00000028298 acsm3 (ENSSTUG00000025129) ENSSTUG00000025001 camk2n1a (ENSSTUG00000024993) mul1a (ENSSTUG00000024982) alg3 (ENSSTUG00000024957) ENSSTUG00000024941 chrng (ENSSTUG00000023761) ENSSTUG00000023720 ccl20a.3 (ENSSTUG00000023659) ENSSTUG00000023608 WDR47 (ENSSTUG00000023363) ENSSTUG00000023287 FNDC7 (ENSSTUG00000023266) ##20 ENSSTUG00000044312 ENSSTUG00000044167 ##22 ENSSTUG00000044134 ENSSTUG00000044119 ##24 ENSSTUG00000044106 ##25 ENSSTUG00000044100 ENSSTUG00000044096 ENSSTUG00000044085 ENSSTUG00000044082 tm6sf2a (ENSSTUG00000044061) ENSSTUG00000044045 SLC25A42 (ENSSTUG00000044005) ARMC6 (ENSSTUG00000043983) MAU2 (ENSSTUG00000043866) GATAD2A (ENSSTUG00000043827) NDUFA13 (ENSSTUG00000043802) YJEFN3 (ENSSTUG00000043746) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000164140.c.a ENSGT00390000004940.a.a.a.a ENSGT00390000012141.a.f ENSGT00390000013904.d ENSGT00940000157183.b.f ENSGT00940000160041 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ENSOKIG00005025418 ##25 ENSOKIG00005025379 ENSOKIG00005025352 ENSOKIG00005025327 ENSOKIG00005025312 tm6sf2a (ENSOKIG00005025267) ENSOKIG00005025248 ENSOKIG00005025211 SLC25A42 (ENSOKIG00005025113) ARMC6 (ENSOKIG00005025081) MAU2 (ENSOKIG00005024928) ENSOKIG00005024908 NDUFA13 (ENSOKIG00005024891) Chinook salmon MODERN SPECIES 1 camk2n1a (ENSOTSG00005032101) mul1a (ENSOTSG00005032100) ENSOTSG00005032099 alg3 (ENSOTSG00005032098) ENSOTSG00005032096 chrng (ENSOTSG00005031652) ENSOTSG00005031650 ENSOTSG00005031649 ccl20a.3 (ENSOTSG00005031648) ccl20a.3 (ENSOTSG00005031647) ENSOTSG00005031646 WDR47 (ENSOTSG00005031580) ENSOTSG00005031578 FNDC7 (ENSOTSG00005031577) ##20 ENSOTSG00005015714 ENSOTSG00005015712 ##22 ENSOTSG00005015710 ENSOTSG00005015709 ##24 ENSOTSG00005015702 ##25 ENSOTSG00005015701 ENSOTSG00005015700 ENSOTSG00005015699 tm6sf2a (ENSOTSG00005015698) SLC25A42 (ENSOTSG00005015696) ARMC6 (ENSOTSG00005015695) MAU2 (ENSOTSG00005015650) ENSOTSG00005015646 NDUFA13 (ENSOTSG00005015643) YJEFN3 (ENSOTSG00005015641) ENSOTSG00005015639 ENSOTSG00005015412 Northern pike MODERN SPECIES 2 mul1a (ENSELUG00000011040) alg3 (ENSELUG00000011033) ENSELUG00000010990 ENSELUG00000010923 ENSELUG00000010905 chrng (ENSELUG00000010887) ENSELUG00000010806 eif4e2 (ENSELUG00000010780) CAPN10 (ENSELUG00000010751) ccl20 (ENSELUG00000010643) CAMSAP2 (ENSELUG00000000381) WDR47 (ENSELUG00000010569) ENSELUG00000010535 ENSELUG00000010503 ENSELUG00000010480 ##20 ENSELUG00000010438 ##22 ENSELUG00000010390 eeig2a (ENSELUG00000010383) ##24 ENSELUG00000010370 ##25 PRKAB2 (ENSELUG00000010339) ENSELUG00000010302 tm6sf2a (ENSELUG00000010244) ENSELUG00000010199 SLC25A42 (ENSELUG00000010136) ARMC6 (ENSELUG00000010104) MAU2 (ENSELUG00000010052) GATAD2A (ENSELUG00000009982) ndufa13 (ENSELUG00000009943) cirbpa (ENSELUG00000009891) ENSELUG00000009851 ENSELUG00000009593 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157155 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 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Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00980000198596.C ENSGT00980000198596.B ENSGT00980000198596.A ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b.d ENSGT00940000177606 ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT01100000263594.a ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b.f ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 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ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00980000198596.A ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000183190.a.a.a.a.b ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a ENSGT01100000263594.a ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT00940000172979 ENSGT01070000253760.b.a.a.a.b.d.a.b.b ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00980000198596.A ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 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(ENSTRUG00000010352) ARMC6 (ENSTRUG00000010295) ENSTRUG00000010208 NDUFA13 (ENSTRUG00000031395) cirbp (ENSTRUG00000010187) ENSTRUG00000010069 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00980000198596.C ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a ENSGT01100000263594.a ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f Ballan wrasse MODERN SPECIES 63 mul1a (ENSLBEG00000023524) alg3 (ENSLBEG00000023556) 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ENSSAUG00010017792 ENSSAUG00010017793 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013904 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000177587 ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00390000004674.j #20 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.e.a.a Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000004940.a.a ENSGT00390000012141.a ENSGT00390000013904 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00980000198596.C ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000004097.a.f ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622.e.a.a ENSGT00510000049027.d Stickleback MODERN SPECIES 2 ENSGACG00000015065 camk2n1a (ENSGACG00000015066) mul1a (ENSGACG00000015067) alg3 (ENSGACG00000015073) ENSGACG00000015077 ENSGACG00000015080 chrng (ENSGACG00000015082) ENSGACG00000015088 eif4e2 (ENSGACG00000015090) CAPN10 (ENSGACG00000015101) ENSGACG00000015108 CAMSAP2 (ENSGACG00000015109) WDR47 (ENSGACG00000015130) ENSGACG00000015136 FNDC7 (ENSGACG00000015145) ##20 ENSGACG00000015150 ##22 ENSGACG00000015153 prpf38b 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ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000177606 ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a ENSGT01100000263594.a ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013904 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000177606 ENSGT00950000183190.a.a.b.c.a ENSGT01100000263594.a ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f Greater amberjack MODERN SPECIES 83 alg3 (ENSSDUG00000017567) ENSSDUG00000017462 ENSSDUG00000017122 chrng (ENSSDUG00000017078) ENSSDUG00000017060 eif4e2 (ENSSDUG00000017033) CAPN10 (ENSSDUG00000017010) ENSSDUG00000016993 ENSSDUG00000016970 ticam1 (ENSSDUG00000016955) CAMSAP2 (ENSSDUG00000016904) WDR47 (ENSSDUG00000016816) ENSSDUG00000016774 ENSSDUG00000016710 FNDC7 (ENSSDUG00000016648) ##20 ENSSDUG00000016601 ##22 prpf38b (ENSSDUG00000016590) ENSSDUG00000016574 eeig2a (ENSSDUG00000016534) ##24 ENSSDUG00000016514 ##25 PRKAB2 (ENSSDUG00000016500) ENSSDUG00000016490 ENSSDUG00000016399 ENSSDUG00000016383 tm6sf2a (ENSSDUG00000016368) ENSSDUG00000016331 SLC25A42 (ENSSDUG00000016297) ARMC6 (ENSSDUG00000016271) MAU2 (ENSSDUG00000016192) ENSSDUG00000016139 NDUFA13 (ENSSDUG00000016119) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2718 ENSSLDG00000023224 ENSSLDG00000023230 chrng (ENSSLDG00000023245) ENSSLDG00000023259 eif4e2 (ENSSLDG00000023267) CAPN10 (ENSSLDG00000023280) ENSSLDG00000023287 ENSSLDG00000023294 ticam1 (ENSSLDG00000023309) CAMSAP2 (ENSSLDG00000023313) WDR47 (ENSSLDG00000023321) ENSSLDG00000023357 ENSSLDG00000023382 FNDC7 (ENSSLDG00000023394) ##20 ENSSLDG00000023419 ##22 ENSSLDG00000023487 eeig2a (ENSSLDG00000023525) ##24 ENSSLDG00000023551 ##25 PRKAB2 (ENSSLDG00000023583) ENSSLDG00000023596 ENSSLDG00000023611 ENSSLDG00000023656 tm6sf2a (ENSSLDG00000023660) ENSSLDG00000023679 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157096 ENSGT00940000157183.b ENSGT00940000160041 ENSGT00940000166623 ENSGT00940000154694 ENSGT00940000159706 ENSGT01020000230600 ENSGT00940000172979 ENSGT00940000163706 ENSGT00950000182975.a.a.a.a.b ENSGT00940000155561.m ENSGT00940000154667.b.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00390000004674.i.a ##20 ENSGT00980000198596.A ENSGT00940000157064.a.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000169454 ENSGT00730000111085.B ENSGT00940000156132.g ##24 ENSGT00940000164927.b ##25 ENSGT00940000159284 ENSGT00950000183190.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000012913.a.a ENSGT00940000158649.a.b ENSGT00940000158163.b ENSGT00390000002913 ENSGT00390000012198.b.a ENSGT00390000004097.a.f ENSGT00390000000719 ENSGT00940000165622 ENSGT00510000049027.d Turbot MODERN SPECIES 19 ENSSMAG00000001387 ENSSMAG00000001435 chrng (ENSSMAG00000001451) ENSSMAG00000001468 eif4e2 (ENSSMAG00000001480) ENSSMAG00000001494 ENSSMAG00000001522 ENSSMAG00000037126 ENSSMAG00000001531 ENSSMAG00000001542 ENSSMAG00000001614 ENSSMAG00000001681 ENSSMAG00000001709 ENSSMAG00000001716 ##20 ENSSMAG00000023482 ENSSMAG00000035900 ##22 prpf38b (ENSSMAG00000001776) ENSSMAG00000001781 eeig2a 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ENSHCOG00000001174 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Channel catfish MODERN SPECIES 6 ENSIPUG00000001753 stk35 (ENSIPUG00000001743) pdyn (ENSIPUG00000001727) gmeb2 (ENSIPUG00000001712) dad1 (ENSIPUG00000001694) ABHD4 (ENSIPUG00000001686) ENSIPUG00000001658 ENSIPUG00000001642 TGM1 (ENSIPUG00000001631) ENSIPUG00000001568 rabggta (ENSIPUG00000001558) stxbp3 (ENSIPUG00000001546) #18 ENSIPUG00000001525 #19 ENSIPUG00000001507 ENSIPUG00000001495 ENSIPUG00000001488 ##22 fbxo30b (ENSIPUG00000001481) epm2a (ENSIPUG00000001457) ENSIPUG00000001446 ENSIPUG00000001374 ENSIPUG00000001337 ENSIPUG00000001329 Slc34a2 (ENSIPUG00000001309) ENSIPUG00000001285 prdm5 (ENSIPUG00000001248) ndnf (ENSIPUG00000001233) CPEB2 (ENSIPUG00000001181) ENSIPUG00000001161 ENSIPUG00000001155 C1QTNF7 (ENSIPUG00000001148) cc2d2a (ENSIPUG00000001079) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Javanese ricefish MODERN SPECIES 18 ENSOJAG00000003787 ttc14 (ENSOJAG00000022381) fxr1 (ENSOJAG00000022030) dnajc19 (ENSOJAG00000021937) ENSOJAG00000021914 ATP11B (ENSOJAG00000021737) mccc1 (ENSOJAG00000021188) ENSOJAG00000021150 kng1 (ENSOJAG00000021146) PIK3CA (ENSOJAG00000021116) ENSOJAG00000021109 ENSOJAG00000021105 ENSOJAG00000021089 #17 stxbp3 (ENSOJAG00000020548) #18 FNDC7 (ENSOJAG00000020494) #19 ENSOJAG00000020464 ##22 ENSOJAG00000020449 henmt1 (ENSOJAG00000020437) #23 fam102bb (ENSOJAG00000020389) #24 slc25a24 (ENSOJAG00000020182) #25 tmem69 (ENSOJAG00000020157) #26 tm4sf4 (ENSOJAG00000020149) #27 TM4SF1 (ENSOJAG00000020132) #29 cp (ENSOJAG00000017873) #30 ENSOJAG00000017811 ENSOJAG00000017732 ncbp2 (ENSOJAG00000017672) #32 fkbp2 (ENSOJAG00000017663) #33 ENSOJAG00000017655 #34 MELTF (ENSOJAG00000017343) #35 ENSOJAG00000016528 #36 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157064.a.b.b.b ##22 Coho salmon MODERN SPECIES 4 TTC22 (ENSOKIG00005014214) lurap1 (ENSOKIG00005014311) clca1 (ENSOKIG00005014337) ENSOKIG00005014479 ENSOKIG00005014513 ZNHIT6 (ENSOKIG00005014528) ccn1 (ENSOKIG00005014545) ENSOKIG00005014572 DDAH1 (ENSOKIG00005014579) zgc:65873 (ENSOKIG00005014589) SYDE2 (ENSOKIG00005014599) DNAI3 (ENSOKIG00005014634) MCOLN3 (ENSOKIG00005015107) gpsm2l (ENSOKIG00005015185) STXBP3 (ENSOKIG00005015333) #18 ENSOKIG00005015747 ##22 ENSOKIG00005015758 ##22 henmt1 (ENSOKIG00005015785) #23 fam102bb (ENSOKIG00005015797) #24 slc25a24 (ENSOKIG00005015831) #25 tmem69 (ENSOKIG00005015906) #26 GPBP1L1 (ENSOKIG00005015911) nasp (ENSOKIG00005015929) #15 akr1a1b (ENSOKIG00005016001) aldh9a1a.1 (ENSOKIG00005016229) tmco1 (ENSOKIG00005017243) uck2a (ENSOKIG00005017275) magoh (ENSOKIG00005017308) cpt2 (ENSOKIG00005017324) PODN (ENSOKIG00005017379) slc1a7b (ENSOKIG00005017468) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000158821 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000160882 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000156834 ENSGT00940000158639 ENSGT00950000182975.a.a.a.b ENSGT00940000155561 ENSGT00940000165672 ENSGT00940000154667.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674 #20 ENSGT00940000157064.a.b #22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132 #24 ENSGT00940000158786 ENSGT00940000164927 #25 ENSGT00400000023530 ENSGT00940000155252 ENSGT00940000153601.a.b ENSGT00940000160961 ENSGT00940000154802 ENSGT00530000063786.a ENSGT00940000154535.D ENSGT00940000156998 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000158821 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000160882 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000156834 ENSGT00940000158639 ENSGT00950000182975.a.a.a.b ENSGT00940000155561 ENSGT00390000016611 ENSGT00940000154667.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674 #20 ENSGT00940000157064.a.b #22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000156132 #24 ENSGT00940000158786 ENSGT00940000155252 ENSGT00940000153601.a.b ENSGT00940000160961 ENSGT00940000154802 ENSGT00940000163518 ENSGT00940000163532 ENSGT00530000063786.a ENSGT00940000154535.D ENSGT00940000156998 ENSGT01050000244887.A.a.b ENSGT00940000164809 Anura ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000016548 ENSGT00940000158821 ENSGT00940000156725 ENSGT00940000160882 ENSGT00940000159457 ENSGT00940000153391.c.b.b ENSGT00940000156834 ENSGT00940000158639 ENSGT00950000182975.a.a.a.b ENSGT00940000155561 ENSGT00390000016611 ENSGT00940000154667.b ENSGT00940000154254.b ENSGT00940000157607 #18 ENSGT00390000004674 #20 ENSGT00940000157064.a.b #22 ENSGT00730000111085.B ENSGT00390000004798 #23 ENSGT00940000154967.b.l ENSGT00940000158746 ENSGT00390000001114.cb ENSGT00940000155117.f.a ENSGT00940000155635 ENSGT00940000162420 Frog MODERN SPECIES 4 lhx9 (ENSXETG00000009957) nek7 (ENSXETG00000009962) atp6v1g3 (ENSXETG00000009966) ptprc (ENSXETG00000000316) nr5a2 (ENSXETG00000000314) kif14 (ENSXETG00000000312) ddx59 (ENSXETG00000000311) wdr47 (ENSXETG00000000310) camsap2 (ENSXETG00000005227) clcc1 (ENSXETG00000005228) gpsm2 (ENSXETG00000005230) ENSXETG00000034978 ENSXETG00000038182 stxbp3 (ENSXETG00000005234) #18 fndc7 (ENSXETG00000005233) #20 ENSXETG00000039495 #22 prpf38b (ENSXETG00000035322) henmt1 (ENSXETG00000030501) #23 f13b (ENSXETG00000031728) ENSXETG00000036695 cfh (ENSXETG00000005261) ENSXETG00000035235 ENSXETG00000043100 ENSXETG00000047813 kcnt2 (ENSXETG00000030131) cdc73 (ENSXETG00000004533) b3galt2 (ENSXETG00000004532) glrx2 (ENSXETG00000004534) ivns1abp (ENSXETG00000004535) ENSXETG00000004536 trmt1l (ENSXETG00000004539) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 380 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 445 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000001520 ENSGT00940000160105 ENSGT00940000159295 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 ENSGT00390000007643 Amniota ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000001520 ENSGT00940000160105 ENSGT00940000159295 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 Sauria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160105 ENSGT00940000159295 ENSGT00940000159264 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00960000193123 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00960000187988 ENSGT00530000065390 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00960000193123 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00960000187988 ENSGT00530000065390 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00960000193123 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00960000187988 ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 Aves ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00960000187988 ENSGT00530000065390 ENSGT00390000007643 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00960000187988 ENSGT00530000065390 ENSGT00390000007643 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00960000187988 ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00960000187988 ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 ENSGT00390000007643 Pink-footed goose MODERN SPECIES 41 CTNNBIP1 (ENSABRG00000007922) LZIC (ENSABRG00000007930) NMNAT1 (ENSABRG00000007932) RBP7 (ENSABRG00000007940) UBE4B (ENSABRG00000007946) KIF1B (ENSABRG00000009152) DFFA (ENSABRG00000017316) PEX14 (ENSABRG00000017361) CASZ1 (ENSABRG00000017365) TARDBP (ENSABRG00000017381) MASP2 (ENSABRG00000017388) ENSABRG00000017396 SRM (ENSABRG00000017398) EXOSC10 (ENSABRG00000017456) MTOR (ENSABRG00000017820) ANGPTL7 (ENSABRG00000018294) ##22 UBIAD1 (ENSABRG00000018307) DISP3 (ENSABRG00000018313) FBXO2 (ENSABRG00000018439) FBXO44 (ENSABRG00000018450) MAD2L2 (ENSABRG00000018478) DRAXIN (ENSABRG00000018503) AGTRAP (ENSABRG00000018508) MTHFR (ENSABRG00000018519) CLCN6 (ENSABRG00000018611) NPPB (ENSABRG00000018980) ENSABRG00000018985 ENSABRG00000018994 ENSABRG00000018999 ENSABRG00000019002 KIAA2013 (ENSABRG00000019014) Duck MODERN SPECIES 13 ENSAPLG00000020926 RBP7 (ENSAPLG00000027050) UBE4B (ENSAPLG00000009105) KIF1B (ENSAPLG00000006535) PGD (ENSAPLG00000006367) CENPS (ENSAPLG00000006351) DFFA (ENSAPLG00000006310) PEX14 (ENSAPLG00000006216) CASZ1 (ENSAPLG00000006079) TARDBP (ENSAPLG00000006001) MASP2 (ENSAPLG00000006180) ENSAPLG00000006622 SRM (ENSAPLG00000006633) EXOSC10 (ENSAPLG00000006652) MTOR (ENSAPLG00000007266) ANGPTL7 (ENSAPLG00000008389) ##22 UBIAD1 (ENSAPLG00000008410) DISP3 (ENSAPLG00000008411) FBXO2 (ENSAPLG00000008803) FBXO44 (ENSAPLG00000009183) MAD2L2 (ENSAPLG00000009488) DRAXIN (ENSAPLG00000009594) AGTRAP (ENSAPLG00000009616) MTHFR (ENSAPLG00000009771) ENSAPLG00000028369 ENSAPLG00000010122 NPPB (ENSAPLG00000010661) ENSAPLG00000031057 ENSAPLG00000019351 ENSAPLG00000010669 ENSAPLG00000010750 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00390000015175 ENSGT00940000160016 ENSGT00500000045021 ENSGT00940000159003 ENSGT00940000157087.a.b ENSGT00940000159957 ENSGT00390000010674 ENSGT00940000164106 ENSGT00940000160786 ENSGT00390000006521 ENSGT00440000039706 ENSGT00390000005532 ENSGT00390000009359.b Japanese quail MODERN SPECIES 13 RBP7 (ENSCJPG00005012490) UBE4B (ENSCJPG00005012491) KIF1B (ENSCJPG00005012493) PGD (ENSCJPG00005016508) CENPS (ENSCJPG00005016509) DFFA (ENSCJPG00005016510) PEX14 (ENSCJPG00005016511) ENSCJPG00005016512 CASZ1 (ENSCJPG00005016514) TARDBP (ENSCJPG00005016516) MASP2 (ENSCJPG00005016517) ENSCJPG00005016518 SRM (ENSCJPG00005016519) EXOSC10 (ENSCJPG00005016520) MTOR (ENSCJPG00005016523) ANGPTL7 (ENSCJPG00005017512) ##22 UBIAD1 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(ENSGALG00010021800) FBLIM1 (ENSGALG00010016550) SPEN (ENSGALG00010016564) ZBTB17 (ENSGALG00010016577) ENSGALG00010016595 HSPB7 (ENSGALG00010016602) EPHA2 (ENSGALG00010016653) CPLANE2 (ENSGALG00010020268) FBXO42 (ENSGALG00010020283) SZRD1 (ENSGALG00010020321) NECAP2 (ENSGALG00010020338) CROCC (ENSGALG00010020351) MFAP2 (ENSGALG00010020382) Turkey MODERN SPECIES 15 ENSMGAG00000004953 ENSMGAG00000020144 ENSMGAG00000019120 MFAP2 (ENSMGAG00000021726) ENSMGAG00000004913 ENSMGAG00000004855 ENSMGAG00000004984 ENSMGAG00000005140 ENSMGAG00000005124 SPEN (ENSMGAG00000019942) ENSMGAG00000007642 ENSMGAG00000007632 ENSMGAG00000007597 UBIAD1 (ENSMGAG00000018148) ENSMGAG00000004758 ENSMGAG00000004820 ##22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b 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ENSGT00940000154513.A ENSGT00960000187988 ENSGT00530000065390 ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Golden eagle MODERN SPECIES 22 NMNAT1 (ENSACCG00020013463) RBP7 (ENSACCG00020013476) UBE4B (ENSACCG00020013577) KIF1B (ENSACCG00020013774) PGD (ENSACCG00020013871) CENPS (ENSACCG00020013884) DFFA (ENSACCG00020013902) PEX14 (ENSACCG00020013923) CASZ1 (ENSACCG00020013974) TARDBP (ENSACCG00020014002) ENSACCG00020014016 ENSACCG00020014029 SRM (ENSACCG00020014042) EXOSC10 (ENSACCG00020014062) MTOR (ENSACCG00020014103) ANGPTL7 (ENSACCG00020014171) ##22 UBIAD1 (ENSACCG00020014187) DISP3 (ENSACCG00020014207) FBXO2 (ENSACCG00020014232) FBXO44 (ENSACCG00020014248) MAD2L2 (ENSACCG00020014263) DRAXIN (ENSACCG00020014281) AGTRAP (ENSACCG00020014309) MTHFR (ENSACCG00020014326) CLCN6 (ENSACCG00020014351) NPPB (ENSACCG00020014377) ENSACCG00020014388 ENSACCG00020014397 KIAA2013 (ENSACCG00020014414) PLOD1 (ENSACCG00020014437) MFN2 (ENSACCG00020014460) Kakapo MODERN SPECIES 10 NMNAT1 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ENSGT00940000158725 ENSGT00940000158624 ENSGT00940000165186.C ENSGT00940000153341.b ENSGT00940000154721 ENSGT00940000161512 ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 ENSGT01030000234528.B.a.a.ab Great tit MODERN SPECIES 13 C1QC (ENSPMJG00000002789) C1QA (ENSPMJG00000002794) EPHA8 (ENSPMJG00000002838) WNT4 (ENSPMJG00000002870) CDC42 (ENSPMJG00000002876) C1orf50 (ENSPMJG00000002882) P3H1 (ENSPMJG00000002885) CLDN19 (ENSPMJG00000002897) ENSPMJG00000002905 YBX1 (ENSPMJG00000003046) PPIH (ENSPMJG00000003049) HIPK4 (ENSPMJG00000003053) SRM (ENSPMJG00000003054) EXOSC10 (ENSPMJG00000003115) MTOR (ENSPMJG00000003120) ANGPTL7 (ENSPMJG00000006018) ##22 UBIAD1 (ENSPMJG00000006024) DISP3 (ENSPMJG00000006053) FBXO2 (ENSPMJG00000006063) FBXO44 (ENSPMJG00000006066) MAD2L2 (ENSPMJG00000006068) DRAXIN (ENSPMJG00000006075) AGTRAP (ENSPMJG00000006076) ENSPMJG00000006078 MTHFR (ENSPMJG00000006086) CLCN6 (ENSPMJG00000006095) NPPB (ENSPMJG00000006123) ENSPMJG00000006129 ENSPMJG00000006131 KIAA2013 (ENSPMJG00000006182) PLOD1 (ENSPMJG00000006208) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000161091 ENSGT00940000161227 ENSGT00940000162143 ENSGT00940000160469 ENSGT00940000159654 ENSGT00940000153675.a.a.b ENSGT00390000003084 ENSGT00940000158725 ENSGT00940000158624 ENSGT00940000165186.C ENSGT00940000153341.b ENSGT00940000154721 ENSGT00940000161512 ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 ENSGT01030000234528.B.a.a.ab Flycatcher MODERN SPECIES 13 C1QA (ENSFALG00000010398) EPHA8 (ENSFALG00000010366) WNT4 (ENSFALG00000025820) CDC42 (ENSFALG00000023168) C1orf50 (ENSFALG00000024394) P3H1 (ENSFALG00000010338) CLDN19 (ENSFALG00000010331) ENSFALG00000010324 YBX1 (ENSFALG00000010305) UBIAD1 (ENSFALG00000025209) PPIH (ENSFALG00000010295) ENSFALG00000024127 SRM (ENSFALG00000010293) EXOSC10 (ENSFALG00000010287) MTOR (ENSFALG00000010184) ANGPTL7 (ENSFALG00000010279) ##22 DISP3 (ENSFALG00000010115) FBXO2 (ENSFALG00000028136) DRAXIN (ENSFALG00000010100) FBXO44 (ENSFALG00000025944) MAD2L2 (ENSFALG00000023044) AGTRAP (ENSFALG00000024802) MTHFR (ENSFALG00000010091) CLCN6 (ENSFALG00000010087) NPPB (ENSFALG00000010079) ENSFALG00000028311 ENSFALG00000010072 ENSFALG00000010060 KIAA2013 (ENSFALG00000028329) PLOD1 (ENSFALG00000010022) MFN2 (ENSFALG00000010006) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 ENSGT01030000234528.B.a.a.ab Medium ground finch MODERN SPECIES 149 SRM (ENSGFOG00000012441) EXOSC10 (ENSGFOG00000012433) ANGPTL7 (ENSGFOG00000012430) ##22 MTOR (ENSGFOG00000012401) UBIAD1 (ENSGFOG00000012387) DISP3 (ENSGFOG00000012380) FBXO2 (ENSGFOG00000012372) FBXO44 (ENSGFOG00000012327) MAD2L2 (ENSGFOG00000012316) DRAXIN (ENSGFOG00000012309) AGTRAP (ENSGFOG00000012308) MTHFR (ENSGFOG00000012305) CLCN6 (ENSGFOG00000012299) ENSGFOG00000012293 ENSGFOG00000012290 ENSGFOG00000012274 KIAA2013 (ENSGFOG00000012270) PLOD1 (ENSGFOG00000010560) Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183063.d ENSGT00940000156015.p ENSGT01030000234528.B.b.b ENSGT00940000154169.B ENSGT00390000006113 ENSGT00940000158433 ENSGT00940000156275 ENSGT00940000160840 ENSGT00940000156792 ENSGT00390000004248 ENSGT00950000182834.C ENSGT00940000165031 ENSGT00940000154436.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00940000172665 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.A ENSGT00530000065390 ENSGT00940000165284 ENSGT01030000234528.B.a.a.ab Zebra finch MODERN SPECIES 14 ENSTGUG00000028928 ENSTGUG00000029040 ENSTGUG00000023474 ENSTGUG00000026937 ZNF362 (ENSTGUG00000019467) PHC2 (ENSTGUG00000014064) ENSTGUG00000029041 SLC2A1 (ENSTGUG00000002201) ZMYND12 (ENSTGUG00000002211) PPCS (ENSTGUG00000002212) ENSTGUG00000002214 ENSTGUG00000026713 SRM (ENSTGUG00000025368) EXOSC10 (ENSTGUG00000002231) ENSTGUG00000027075 ANGPTL7 (ENSTGUG00000002257) ##22 ENSTGUG00000002263 UBIAD1 (ENSTGUG00000024374) DISP3 (ENSTGUG00000002310) FBXO2 (ENSTGUG00000002320) FBXO44 (ENSTGUG00000002327) MAD2L2 (ENSTGUG00000002334) DRAXIN (ENSTGUG00000002343) AGTRAP (ENSTGUG00000024872) ENSTGUG00000027079 MTHFR (ENSTGUG00000002350) CLCN6 (ENSTGUG00000002366) NPPB (ENSTGUG00000015836) ENSTGUG00000016586 ENSTGUG00000002385 ENSTGUG00000002394 Common canary MODERN SPECIES 34 USP48 (ENSSCAG00000003719) ENSSCAG00000003428 ENSSCAG00000003427 SVBP (ENSSCAG00000003422) TRIM62 (ENSSCAG00000003416) ZNF362 (ENSSCAG00000003408) PHC2 (ENSSCAG00000003395) SLC2A1 (ENSSCAG00000003384) ENSSCAG00000003374 ENSSCAG00000003368 ENSSCAG00000003363 ENSSCAG00000003346 ENSSCAG00000003338 SRM (ENSSCAG00000003300) EXOSC10 (ENSSCAG00000003279) ANGPTL7 (ENSSCAG00000003269) ##22 MTOR (ENSSCAG00000003234) UBIAD1 (ENSSCAG00000003222) DISP3 (ENSSCAG00000003148) FBXO2 (ENSSCAG00000003128) FBXO44 (ENSSCAG00000003125) MAD2L2 (ENSSCAG00000003121) DRAXIN (ENSSCAG00000003115) AGTRAP (ENSSCAG00000003110) MTHFR (ENSSCAG00000003101) CLCN6 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ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B.a ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 3 NMNAT1 (ENSOARG00020017352) RBP7 (ENSOARG00020017280) UBE4B (ENSOARG00020016855) KIF1B (ENSOARG00020015439) PGD (ENSOARG00020015231) CENPS (ENSOARG00020015180) CORT (ENSOARG00020015142) DFFA (ENSOARG00020015065) PEX14 (ENSOARG00020015026) ENSOARG00020014980 ENSOARG00020014921 TARDBP (ENSOARG00020014777) MASP2 (ENSOARG00020014599) SRM (ENSOARG00020014558) EXOSC10 (ENSOARG00020014377) ANGPTL7 (ENSOARG00020014304) ##22 MTOR (ENSOARG00020013823) UBIAD1 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ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B.a ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B.a ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 7 LZIC (ENSBIXG00005006812) NMNAT1 (ENSBIXG00005019328) RBP7 (ENSBIXG00005019345) UBE4B (ENSBIXG00005003203) KIF1B (ENSBIXG00005020084) PGD (ENSBIXG00005007299) CENPS (ENSBIXG00005020182) CORT (ENSBIXG00005020193) ENSBIXG00005020207 PEX14 (ENSBIXG00005020223) CASZ1 (ENSBIXG00005020269) TARDBP (ENSBIXG00005020357) MASP2 (ENSBIXG00005020385) SRM (ENSBIXG00005003443) EXOSC10 (ENSBIXG00005007152) ANGPTL7 (ENSBIXG00005020491) ##22 MTOR (ENSBIXG00005020540) UBIAD1 (ENSBIXG00005020561) DISP3 (ENSBIXG00005020586) FBXO2 (ENSBIXG00005020610) FBXO44 (ENSBIXG00005020679) FBXO6 (ENSBIXG00005020705) MAD2L2 (ENSBIXG00005020765) DRAXIN (ENSBIXG00005020785) AGTRAP (ENSBIXG00005020831) 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ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B.a ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Wild yak MODERN SPECIES 1269 TARDBP (ENSBMUG00000000900) MASP2 (ENSBMUG00000000934) SRM (ENSBMUG00000000947) EXOSC10 (ENSBMUG00000001009) MTOR (ENSBMUG00000001073) ANGPTL7 (ENSBMUG00000001104) ##22 UBIAD1 (ENSBMUG00000001109) DISP3 (ENSBMUG00000001118) FBXO2 (ENSBMUG00000001142) FBXO44 (ENSBMUG00000001158) Domestic yak MODERN SPECIES 5 ENSBGRG00000013461 UBE4B (ENSBGRG00000013253) KIF1B (ENSBGRG00000012948) PGD (ENSBGRG00000012798) CENPS (ENSBGRG00000012743) CORT (ENSBGRG00000012703) ENSBGRG00000012650 PEX14 (ENSBGRG00000012564) ENSBGRG00000012535 ENSBGRG00000012478 ENSBGRG00000012456 TARDBP (ENSBGRG00000012329) MASP2 (ENSBGRG00000012113) SRM (ENSBGRG00000011920) EXOSC10 (ENSBGRG00000011128) ANGPTL7 (ENSBGRG00000010987) ##22 MTOR (ENSBGRG00000010134) UBIAD1 (ENSBGRG00000010083) DISP3 (ENSBGRG00000009914) FBXO2 (ENSBGRG00000009742) FBXO44 (ENSBGRG00000009645) FBXO6 (ENSBGRG00000009566) MAD2L2 (ENSBGRG00000009470) DRAXIN (ENSBGRG00000009399) ENSBGRG00000009307 MTHFR (ENSBGRG00000009177) CLCN6 (ENSBGRG00000008810) NPPA (ENSBGRG00000008736) ENSBGRG00000008719 KIAA2013 (ENSBGRG00000008665) PLOD1 (ENSBGRG00000008467) American bison MODERN SPECIES 3204 LZIC (ENSBBBG00000021067) NMNAT1 (ENSBBBG00000021088) RBP7 (ENSBBBG00000021101) UBE4B (ENSBBBG00000021187) ENSBBBG00000021205 KIF1B (ENSBBBG00000005718) PGD 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(ENSFCAG00000000068) NPPB (ENSFCAG00000000072) KIAA2013 (ENSFCAG00000030474) PLOD1 (ENSFCAG00000000074) MFN2 (ENSFCAG00000000076) Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00410000029218 ENSGT00390000000617 ENSGT00990000213907 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00410000029218 ENSGT00390000000617 ENSGT00990000213907 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00390000013727.c Microbat MODERN SPECIES 1435 TARDBP (ENSMLUG00000004263) MASP2 (ENSMLUG00000004267) ENSMLUG00000017585 EXOSC10 (ENSMLUG00000004276) ENSMLUG00000004295 ANGPTL7 (ENSMLUG00000004337) ##22 UBIAD1 (ENSMLUG00000004344) DISP3 (ENSMLUG00000012547) FBXO2 (ENSMLUG00000012682) FBXO44 (ENSMLUG00000012687) FBXO6 (ENSMLUG00000006843) MAD2L2 (ENSMLUG00000006852) ENSMLUG00000006870 ENSMLUG00000011718 MTHFR (ENSMLUG00000011756) CLCN6 (ENSMLUG00000011768) ENSMLUG00000026091 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 27 LZIC (ENSRFEG00010013894) NMNAT1 (ENSRFEG00010013938) RBP7 (ENSRFEG00010013995) UBE4B (ENSRFEG00010014058) KIF1B (ENSRFEG00010014209) PGD (ENSRFEG00010014553) CENPS (ENSRFEG00010014608) DFFA (ENSRFEG00010014657) PEX14 (ENSRFEG00010014773) CASZ1 (ENSRFEG00010014835) TARDBP (ENSRFEG00010014931) MASP2 (ENSRFEG00010015036) SRM (ENSRFEG00010015211) EXOSC10 (ENSRFEG00010015288) MTOR (ENSRFEG00010015400) ANGPTL7 (ENSRFEG00010015529) ##22 UBIAD1 (ENSRFEG00010015581) DISP3 (ENSRFEG00010015640) FBXO2 (ENSRFEG00010015695) FBXO44 (ENSRFEG00010015745) FBXO6 (ENSRFEG00010015823) MAD2L2 (ENSRFEG00010015865) DRAXIN (ENSRFEG00010015906) ENSRFEG00010015984 AGTRAP (ENSRFEG00010016016) MTHFR (ENSRFEG00010016116) CLCN6 (ENSRFEG00010016408) NPPA (ENSRFEG00010017062) ENSRFEG00010017172 ENSRFEG00010017230 KIAA2013 (ENSRFEG00010017254) Megabat MODERN SPECIES 234 TARDBP (ENSPVAG00000014773) MASP2 (ENSPVAG00000014774) SRM (ENSPVAG00000014776) EXOSC10 (ENSPVAG00000014780) MTOR (ENSPVAG00000014783) ANGPTL7 (ENSPVAG00000014787) ##22 UBIAD1 (ENSPVAG00000014788) Equus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187.gb ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00410000029218 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A Horse MODERN SPECIES 11 LZIC (ENSECAG00000022235) NMNAT1 (ENSECAG00000020988) RBP7 (ENSECAG00000020250) UBE4B (ENSECAG00000008307) KIF1B (ENSECAG00000020336) PGD (ENSECAG00000019711) ENSECAG00000033471 ENSECAG00000019483 DFFA (ENSECAG00000017582) PEX14 (ENSECAG00000012139) CASZ1 (ENSECAG00000014410) TARDBP (ENSECAG00000008338) MASP2 (ENSECAG00000021756) SRM (ENSECAG00000019713) EXOSC10 (ENSECAG00000011639) ANGPTL7 (ENSECAG00000010887) ##22 MTOR (ENSECAG00000015638) ENSECAG00000049061 UBIAD1 (ENSECAG00000015176) DISP3 (ENSECAG00000013274) FBXO2 (ENSECAG00000011143) FBXO44 (ENSECAG00000031888) FBXO6 (ENSECAG00000009631) MAD2L2 (ENSECAG00000006087) DRAXIN (ENSECAG00000043288) ENSECAG00000022839 ENSECAG00000028307 MTHFR (ENSECAG00000020032) CLCN6 (ENSECAG00000015463) NPPA (ENSECAG00000014892) NPPB (ENSECAG00000014282) Donkey MODERN SPECIES 25 RBP7 (ENSEASG00005021144) UBE4B (ENSEASG00005021132) KIF1B (ENSEASG00005019472) PGD (ENSEASG00005019084) ENSEASG00005019078 CORT (ENSEASG00005031268) DFFA (ENSEASG00005019069) PEX14 (ENSEASG00005019064) ENSEASG00005029919 ENSEASG00005019042 TARDBP (ENSEASG00005019017) MASP2 (ENSEASG00005019001) SRM (ENSEASG00005018995) EXOSC10 (ENSEASG00005018716) MTOR (ENSEASG00005018049) ANGPTL7 (ENSEASG00005018664) ##22 UBIAD1 (ENSEASG00005024497) DISP3 (ENSEASG00005017803) FBXO2 (ENSEASG00005017800) ENSEASG00005017796 FBXO6 (ENSEASG00005017789) MAD2L2 (ENSEASG00005017785) DRAXIN (ENSEASG00005017783) AGTRAP (ENSEASG00005027594) MTHFR (ENSEASG00005017771) CLCN6 (ENSEASG00005017761) NPPA (ENSEASG00005034677) NPPB (ENSEASG00005017752) KIAA2013 (ENSEASG00005017748) PLOD1 (ENSEASG00005016643) MFN2 (ENSEASG00005016485) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Primates ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183179.b.a.f ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183179.b.a.f ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343.e.b ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521.h ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023.j 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MASP2 (ENSGGOG00000015360) ENSGGOG00000014385 EXOSC10 (ENSGGOG00000010572) MTOR (ENSGGOG00000010597) ANGPTL7 (ENSGGOG00000010647) ##22 UBIAD1 (ENSGGOG00000001270) ENSGGOG00000043306 DISP3 (ENSGGOG00000015501) ENSGGOG00000038044 FBXO2 (ENSGGOG00000002095) FBXO44 (ENSGGOG00000002097) FBXO6 (ENSGGOG00000009401) MAD2L2 (ENSGGOG00000009404) ENSGGOG00000006126 AGTRAP (ENSGGOG00000006136) C1orf167 (ENSGGOG00000034864) MTHFR (ENSGGOG00000012925) CLCN6 (ENSGGOG00000012934) NPPA (ENSGGOG00000038850) NPPB (ENSGGOG00000012954) Orangutan MODERN SPECIES LZIC (ENSPPYG00000038102) NMNAT1 (ENSPPYG00000033515) RBP7 (ENSPPYG00000001904) UBE4B (ENSPPYG00000001903) KIF1B (ENSPPYG00000001902) PGD (ENSPPYG00000001901) APITD1 (ENSPPYG00000001900) DFFA (ENSPPYG00000001899) PEX14 (ENSPPYG00000001898) ENSPPYG00000001897 C1orf127 (ENSPPYG00000001895) TARDBP (ENSPPYG00000001894) MASP2 (ENSPPYG00000001893) SRM (ENSPPYG00000001892) EXOSC10 (ENSPPYG00000001891) ANGPTL7 (ENSPPYG00000001890) ##22 MTOR 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ENSGT00390000009023.j ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00950000183000.c.a.a.i.a.a.a ENSGT00940000154343.e.b.a.a ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521.h ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023.j ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00950000183000.c.a.a.i.a.a.a ENSGT00940000154343.e.b.a.a ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521.h ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023.j ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00950000183000.c.a.a.i.a.a.a ENSGT00940000154343.e.b.a.a ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521.h ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 508 UBE4B (ENSMNEG00000045359) KIF1B (ENSMNEG00000042197) PGD (ENSMNEG00000033955) ENSMNEG00000035324 DFFA (ENSMNEG00000035536) PEX14 (ENSMNEG00000034632) CASZ1 (ENSMNEG00000036608) C1orf127 (ENSMNEG00000042499) ENSMNEG00000032417 TARDBP (ENSMNEG00000030163) MASP2 (ENSMNEG00000042023) SRM (ENSMNEG00000029904) EXOSC10 (ENSMNEG00000035812) MTOR (ENSMNEG00000029166) ANGPTL7 (ENSMNEG00000043525) ##22 UBIAD1 (ENSMNEG00000036235) DISP3 (ENSMNEG00000042472) FBXO2 (ENSMNEG00000041597) ENSMNEG00000044320 FBXO6 (ENSMNEG00000021684) MAD2L2 (ENSMNEG00000033726) DRAXIN (ENSMNEG00000041784) AGTRAP (ENSMNEG00000028571) C1orf167 (ENSMNEG00000030525) MTHFR (ENSMNEG00000042441) CLCN6 (ENSMNEG00000033126) NPPA (ENSMNEG00000036714) NPPB (ENSMNEG00000039556) KIAA2013 (ENSMNEG00000043292) PLOD1 (ENSMNEG00000038691) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023.j 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ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00950000183179.b.a.f.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023.j ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00950000183000.c.a.a.i.a.a.a ENSGT00940000154343.e.b.a.a ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521.h ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00910000148431 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A Drill MODERN SPECIES 1214 NMNAT1 (ENSMLEG00000007118) RBP7 (ENSMLEG00000031014) UBE4B (ENSMLEG00000032624) KIF1B (ENSMLEG00000041753) PGD (ENSMLEG00000032493) ENSMLEG00000029263 DFFA (ENSMLEG00000028775) PEX14 (ENSMLEG00000037454) CASZ1 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ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023.l ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047.c ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343.e.b.c ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521.h ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Marmoset MODERN SPECIES 19 RBP7 (ENSCJAG00000005470) UBE4B (ENSCJAG00000005351) KIF1B (ENSCJAG00000005184) PGD (ENSCJAG00000005090) APITD1 (ENSCJAG00000038779) CORT (ENSCJAG00000005085) DFFA (ENSCJAG00000005074) PEX14 (ENSCJAG00000005051) CASZ1 (ENSCJAG00000005043) C1orf127 (ENSCJAG00000005030) TARDBP (ENSCJAG00000002381) MASP2 (ENSCJAG00000002366) 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ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 122 OXSM (ENSSBOG00000021774) NGLY1 (ENSSBOG00000019504) TOP2B (ENSSBOG00000019988) RARB (ENSSBOG00000030974) ENSSBOG00000014589 THRB (ENSSBOG00000031465) NR1D2 (ENSSBOG00000035225) ENSSBOG00000030880 ENSSBOG00000028575 CASZ1 (ENSSBOG00000026409) C1orf127 (ENSSBOG00000015217) ENSSBOG00000028814 MASP2 (ENSSBOG00000023642) ENSSBOG00000013317 EXOSC10 (ENSSBOG00000020768) ANGPTL7 (ENSSBOG00000030206) ##22 MTOR (ENSSBOG00000034535) UBIAD1 (ENSSBOG00000030796) DISP3 (ENSSBOG00000026133) FBXO2 (ENSSBOG00000024844) FBXO44 (ENSSBOG00000025444) FBXO6 (ENSSBOG00000028980) MAD2L2 (ENSSBOG00000029456) DRAXIN (ENSSBOG00000019365) ENSSBOG00000026099 MTHFR (ENSSBOG00000030921) CLCN6 (ENSSBOG00000026226) NPPA (ENSSBOG00000035293) NPPB (ENSSBOG00000031865) KIAA2013 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sifaka MODERN SPECIES 900 RBP7 (ENSPCOG00000016758) UBE4B (ENSPCOG00000019887) KIF1B (ENSPCOG00000014922) PGD (ENSPCOG00000028410) CENPS (ENSPCOG00000028399) CORT (ENSPCOG00000028407) DFFA (ENSPCOG00000025471) PEX14 (ENSPCOG00000022753) CASZ1 (ENSPCOG00000024855) C1orf127 (ENSPCOG00000026742) ENSPCOG00000002367 TARDBP (ENSPCOG00000016073) MASP2 (ENSPCOG00000028155) SRM (ENSPCOG00000014753) EXOSC10 (ENSPCOG00000013742) ANGPTL7 (ENSPCOG00000015847) ##22 MTOR (ENSPCOG00000004612) UBIAD1 (ENSPCOG00000021044) ENSPCOG00000026152 DISP3 (ENSPCOG00000021151) FBXO2 (ENSPCOG00000023453) ENSPCOG00000020176 FBXO6 (ENSPCOG00000016176) MAD2L2 (ENSPCOG00000015657) DRAXIN (ENSPCOG00000017576) AGTRAP (ENSPCOG00000014710) MTHFR (ENSPCOG00000016874) CLCN6 (ENSPCOG00000022407) NPPA (ENSPCOG00000028247) NPPB (ENSPCOG00000027445) KIAA2013 (ENSPCOG00000016883) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1159 RBP7 (ENSPSMG00000023780) UBE4B (ENSPSMG00000023828) KIF1B (ENSPSMG00000024163) PGD (ENSPSMG00000024331) CENPS 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ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Muroidea ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Northern American deer mouse MODERN SPECIES 11 Nmnat1 (ENSPEMG00000009486) Rbp7 (ENSPEMG00000011825) Ube4b (ENSPEMG00000012816) Kif1b (ENSPEMG00000007705) Pgd (ENSPEMG00000011363) Cenps (ENSPEMG00000001445) Cort (ENSPEMG00000004509) Dffa (ENSPEMG00000006352) Pex14 (ENSPEMG00000010246) Casz1 (ENSPEMG00000012351) ENSPEMG00000013358 Tardbp (ENSPEMG00000015154) Masp2 (ENSPEMG00000017820) Exosc10 (ENSPEMG00000007753) Mtor (ENSPEMG00000013439) Angptl7 (ENSPEMG00000016277) ##22 Ubiad1 (ENSPEMG00000027609) Disp3 (ENSPEMG00000001917) Fbxo2 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ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Mus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00940000167357 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Mus_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00940000167357 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Mus_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00730000111752 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00940000167357 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 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LOC691354 (ENSRNOG00000023452) Tardbp (ENSRNOG00000012455) Masp2 (ENSRNOG00000011258) Srm (ENSRNOG00000011078) Exosc10 (ENSRNOG00000010719) Angptl7 (ENSRNOG00000009589) ##22 Mtor (ENSRNOG00000009615) Ubiad1 (ENSRNOG00000009575) Disp3 (ENSRNOG00000026447) Fbxo2 (ENSRNOG00000009409) Fbxo44 (ENSRNOG00000009298) Fbxo6 (ENSRNOG00000009217) Mad2l2 (ENSRNOG00000009134) Rpl35a (ENSRNOG00000031641) Draxin (ENSRNOG00000008911) Agtrap (ENSRNOG00000008619) Mthfr (ENSRNOG00000008553) Clcn6 (ENSRNOG00000008345) Nppa (ENSRNOG00000008176) Nppb (ENSRNOG00000008141) Kiaa2013 (ENSRNOG00000007968) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 410 Lzic (ENSNGAG00000012566) Nmnat1 (ENSNGAG00000002682) ENSNGAG00000021096 Ube4b (ENSNGAG00000016430) Kif1b (ENSNGAG00000024095) Pgd (ENSNGAG00000023790) Cenps (ENSNGAG00000022670) Cort (ENSNGAG00000010127) Dffa (ENSNGAG00000007947) Pex14 (ENSNGAG00000018625) ENSNGAG00000021274 ENSNGAG00000023416 Masp2 (ENSNGAG00000018127) Srm (ENSNGAG00000021914) Exosc10 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(ENSUPAG00010003632) ENSUPAG00010003642 MTHFR (ENSUPAG00010003678) CLCN6 (ENSUPAG00010003705) NPPA (ENSUPAG00010003768) ENSUPAG00010003781 KIAA2013 (ENSUPAG00010003792) PLOD1 (ENSUPAG00010003800) MFN2 (ENSUPAG00010003824) MIIP (ENSUPAG00010003861) Alpin marmot MODERN SPECIES 73 CTNNBIP1 (ENSMMMG00000017185) LZIC (ENSMMMG00000017165) ENSMMMG00000017149 NMNAT1 (ENSMMMG00000017133) RBP7 (ENSMMMG00000017130) UBE4B (ENSMMMG00000017109) KIF1B (ENSMMMG00000017016) PGD (ENSMMMG00000017011) CENPS (ENSMMMG00000016987) DFFA (ENSMMMG00000016965) PEX14 (ENSMMMG00000016957) CASZ1 (ENSMMMG00000016947) TARDBP (ENSMMMG00000016883) MASP2 (ENSMMMG00000016862) EXOSC10 (ENSMMMG00000016839) ANGPTL7 (ENSMMMG00000016833) ##22 MTOR (ENSMMMG00000016791) UBIAD1 (ENSMMMG00000016787) DISP3 (ENSMMMG00000016764) FBXO2 (ENSMMMG00000016755) FBXO44 (ENSMMMG00000016734) FBXO6 (ENSMMMG00000016731) MAD2L2 (ENSMMMG00000016711) DRAXIN (ENSMMMG00000016699) AGTRAP (ENSMMMG00000016693) MTHFR (ENSMMMG00000016671) CLCN6 (ENSMMMG00000016637) NPPA (ENSMMMG00000016626) ENSMMMG00000016621 PLOD1 (ENSMMMG00000016602) MFN2 (ENSMMMG00000016567) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES ENSSVLG00005004861 KIF1B (ENSSVLG00005004941) PGD (ENSSVLG00005005031) CENPS (ENSSVLG00005005079) CORT (ENSSVLG00005005105) DFFA (ENSSVLG00005005128) ENSSVLG00005005147 PEX14 (ENSSVLG00005005171) CASZ1 (ENSSVLG00005005230) ENSSVLG00005005484 ENSSVLG00005005604 MASP2 (ENSSVLG00005005634) SRM (ENSSVLG00005005741) EXOSC10 (ENSSVLG00005005780) ENSSVLG00005005854 ANGPTL7 (ENSSVLG00005005951) ##22 UBIAD1 (ENSSVLG00005005985) DISP3 (ENSSVLG00005006030) FBXO2 (ENSSVLG00005006137) FBXO44 (ENSSVLG00005006188) FBXO6 (ENSSVLG00005006238) MAD2L2 (ENSSVLG00005006268) DRAXIN (ENSSVLG00005006297) AGTRAP (ENSSVLG00005006342) MTHFR (ENSSVLG00005006411) CLCN6 (ENSSVLG00005006533) NPPA (ENSSVLG00005006599) NPPB (ENSSVLG00005006653) KIAA2013 (ENSSVLG00005006695) PLOD1 (ENSSVLG00005006729) MFN2 (ENSSVLG00005006764) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000161133 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00940000160527.f ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000161133 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00940000160527.f ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000161133 ENSGT00940000159001 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00940000160527.f ENSGT00390000017402 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00390000007643 ENSGT01030000234558.A.a.a.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 193 CTNNBIP1 (ENSCLAG00000005897) LZIC (ENSCLAG00000004800) NMNAT1 (ENSCLAG00000011134) UBE4B (ENSCLAG00000006318) KIF1B (ENSCLAG00000006135) PGD (ENSCLAG00000005028) CENPS (ENSCLAG00000007803) CORT (ENSCLAG00000007470) PEX14 (ENSCLAG00000006671) ENSCLAG00000005368 C1orf127 (ENSCLAG00000005018) TARDBP (ENSCLAG00000014547) ENSCLAG00000013688 SRM (ENSCLAG00000006477) EXOSC10 (ENSCLAG00000005283) ANGPTL7 (ENSCLAG00000004999) ##22 MTOR (ENSCLAG00000009558) UBIAD1 (ENSCLAG00000008367) DISP3 (ENSCLAG00000007721) FBXO2 (ENSCLAG00000006915) FBXO44 (ENSCLAG00000006164) FBXO6 (ENSCLAG00000004528) MAD2L2 (ENSCLAG00000004348) DRAXIN (ENSCLAG00000005857) ENSCLAG00000005422 AGTRAP (ENSCLAG00000005252) MTHFR (ENSCLAG00000004974) CLCN6 (ENSCLAG00000008993) NPPA (ENSCLAG00000011401) PLOD1 (ENSCLAG00000013276) KIAA2013 (ENSCLAG00000012083) Degu MODERN SPECIES 154 ENSODEG00000020404 KIF1B (ENSODEG00000012480) ENSODEG00000020011 PGD (ENSODEG00000012566) CENPS (ENSODEG00000015597) DFFA (ENSODEG00000013449) PEX14 (ENSODEG00000012538) CASZ1 (ENSODEG00000015077) ENSODEG00000012561 ENSODEG00000013739 ENSODEG00000014886 MASP2 (ENSODEG00000012547) ENSODEG00000013268 EXOSC10 (ENSODEG00000013285) MTOR (ENSODEG00000013301) ANGPTL7 (ENSODEG00000014472) ##22 UBIAD1 (ENSODEG00000012730) DISP3 (ENSODEG00000013940) FBXO2 (ENSODEG00000014000) FBXO44 (ENSODEG00000013642) FBXO6 (ENSODEG00000012870) MAD2L2 (ENSODEG00000014183) AGTRAP (ENSODEG00000014964) MTHFR (ENSODEG00000013407) CLCN6 (ENSODEG00000013643) ENSODEG00000012795 NPPA (ENSODEG00000013314) KIAA2013 (ENSODEG00000013918) PLOD1 (ENSODEG00000013340) MFN2 (ENSODEG00000015359) MIIP (ENSODEG00000012969) Guinea pig MODERN SPECIES 25 CTNNBIP1 (ENSCPOG00000036076) LZIC (ENSCPOG00000003980) NMNAT1 (ENSCPOG00000032350) UBE4B (ENSCPOG00000015429) KIF1B (ENSCPOG00000007858) PGD (ENSCPOG00000024139) CENPS (ENSCPOG00000030243) DFFA (ENSCPOG00000008787) PEX14 (ENSCPOG00000014580) CASZ1 (ENSCPOG00000020168) ENSCPOG00000038631 TARDBP (ENSCPOG00000011619) ENSCPOG00000011622 SRM (ENSCPOG00000013039) EXOSC10 (ENSCPOG00000011628) ANGPTL7 (ENSCPOG00000036774) ##22 MTOR (ENSCPOG00000011641) UBIAD1 (ENSCPOG00000034388) DISP3 (ENSCPOG00000007061) FBXO2 (ENSCPOG00000012611) FBXO44 (ENSCPOG00000026240) MAD2L2 (ENSCPOG00000022099) FBXO6 (ENSCPOG00000037191) DRAXIN (ENSCPOG00000014214) ENSCPOG00000004934 AGTRAP (ENSCPOG00000030800) MTHFR (ENSCPOG00000002899) CLCN6 (ENSCPOG00000003508) NPPA (ENSCPOG00000019564) KIAA2013 (ENSCPOG00000022694) PLOD1 (ENSCPOG00000020909) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 26 UBE4B (ENSHGLG00000004405) KIF1B (ENSHGLG00000004293) ENSHGLG00000041522 PGD (ENSHGLG00000004199) ENSHGLG00000041176 DFFA (ENSHGLG00000050406) ENSHGLG00000032802 PEX14 (ENSHGLG00000014084) ENSHGLG00000013841 C1orf127 (ENSHGLG00000019469) TARDBP (ENSHGLG00000049503) MASP2 (ENSHGLG00000012346) SRM (ENSHGLG00000038425) EXOSC10 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(ENSOPRG00000012194) ##22 UBIAD1 (ENSOPRG00000012204) DISP3 (ENSOPRG00000012210) FBXO2 (ENSOPRG00000012239) ENSOPRG00000012256 FBXO6 (ENSOPRG00000012266) MAD2L2 (ENSOPRG00000012281) Tree shrew MODERN SPECIES 675 ENSTBEG00000017471 MTOR (ENSTBEG00000017662) ANGPTL7 (ENSTBEG00000010156) ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000167357 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 303 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000157064.a.a ##22 Tenrec MODERN SPECIES 8302 MTOR (ENSETEG00000012044) ANGPTL7 (ENSETEG00000012051) ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00390000018596.B ENSGT00390000015047 ENSGT00390000008187 ENSGT00940000167357 ENSGT00390000003592 ENSGT00940000154343 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000157931 ENSGT00940000160929 ENSGT00940000159408 ENSGT00940000159980 ENSGT00940000153395.b ENSGT00390000013828 ENSGT00390000017402 ENSGT00390000000617 ENSGT00390000012490 ENSGT00940000159291 ENSGT00940000154513.B ENSGT00940000154513.A ENSGT00390000007643 Hyrax MODERN SPECIES 7007 MTOR (ENSPCAG00000009617) ANGPTL7 (ENSPCAG00000009963) ##22 Elephant MODERN SPECIES 270 LZIC (ENSLAFG00000006759) NMNAT1 (ENSLAFG00000008033) 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KIAA2013 (ENSMODG00000010897) PLOD1 (ENSMODG00000010880) Platypus MODERN SPECIES 16 LZIC (ENSOANG00000020718) NMNAT1 (ENSOANG00000030814) RBP7 (ENSOANG00000049634) UBE4B (ENSOANG00000021342) KIF1B (ENSOANG00000002802) PGD (ENSOANG00000002801) ENSOANG00000042095 DFFA (ENSOANG00000002798) PEX14 (ENSOANG00000044150) CASZ1 (ENSOANG00000005859) ENSOANG00000050888 TARDBP (ENSOANG00000013320) MASP2 (ENSOANG00000013321) SRM (ENSOANG00000030356) EXOSC10 (ENSOANG00000013322) ANGPTL7 (ENSOANG00000046990) ##22 MTOR (ENSOANG00000021332) UBIAD1 (ENSOANG00000048630) DISP3 (ENSOANG00000010835) FBXO2 (ENSOANG00000049872) FBXO6 (ENSOANG00000041756) MAD2L2 (ENSOANG00000045455) DRAXIN (ENSOANG00000031005) ENSOANG00000048483 MTHFR (ENSOANG00000002743) CLCN6 (ENSOANG00000002741) NPPA (ENSOANG00000002739) ENSOANG00000050191 KIAA2013 (ENSOANG00000036754) PLOD1 (ENSOANG00000004585) MFN2 (ENSOANG00000001700) Anura ANCESTRAL SPECIES 81 ENSGT00940000162218 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 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##22 UBIAD1 (ENSLLEG00000022234) DISP3 (ENSLLEG00000022309) ENSLLEG00000022706 FBXO2 (ENSLLEG00000022785) ENSLLEG00000023182 ENSLLEG00000023224 MAD2L2 (ENSLLEG00000023276) DRAXIN (ENSLLEG00000023362) AGTRAP (ENSLLEG00000023448) MTHFR (ENSLLEG00000023511) CLCN6 (ENSLLEG00000023794) NPPA (ENSLLEG00000024557) ENSLLEG00000024569 ENSLLEG00000024591 ENSLLEG00000024619 Frog MODERN SPECIES 7 lzic (ENSXETG00000022153) ube4b (ENSXETG00000022157) kif1b (ENSXETG00000022163) ENSXETG00000044036 cenps (ENSXETG00000041529) dffa (ENSXETG00000006306) pex14 (ENSXETG00000006309) casz1 (ENSXETG00000006312) ENSXETG00000046027 c1orf127 (ENSXETG00000048809) tardbp (ENSXETG00000006317) masp2 (ENSXETG00000006314) srm (ENSXETG00000028025) exosc10 (ENSXETG00000006318) mtor (ENSXETG00000017426) angptl7 (ENSXETG00000017425) ##22 ubiad1 (ENSXETG00000017414) ENSXETG00000048671 ENSXETG00000045543 disp3.2 (ENSXETG00000017412) ENSXETG00000045369 ENSXETG00000048198 fbxo2 (ENSXETG00000036844) FBXO44 (ENSXETG00000042947) ENSXETG00000037397 mad2l2 (ENSXETG00000013095) draxin (ENSXETG00000031404) agtrap (ENSXETG00000013094) mthfr (ENSXETG00000013086) clcn6 (ENSXETG00000013083) nppa (ENSXETG00000013082) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 224 ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000158097 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000159351 ENSGT00520000060938 ENSGT00390000013792 ENSGT01000000214413.b.a.b.b.b ENSGT00940000163135 ENSGT00730000111432 ENSGT00900000141054 ENSGT00940000160122 ENSGT00390000014794.a Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00950000182805.a.a.b.b ENSGT00940000160105 ENSGT00940000159295 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00510000048007 ENSGT00940000154343 ENSGT00390000003592 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000015047 ENSGT00390000018596.B ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00390000012439 ENSGT00940000158097 ENSGT00940000161187 ENSGT00940000158459 ENSGT00940000159351 ENSGT00520000060938 ENSGT00390000013792 ENSGT01000000214413.b.a.b.b.b ENSGT00940000163135 ENSGT00730000111432 ENSGT00900000141054 ENSGT00940000160122 ENSGT00390000014794.a ENSGT00510000048586 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00940000155114 ENSGT00940000153761.A ENSGT00940000159306.b.b ENSGT00940000158465 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00940000154343.gb ENSGT00390000003592 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000015047 ENSGT00390000018596.B ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00940000167398 ENSGT00390000009300.a ENSGT01030000235249 ENSGT00940000159295 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00940000154343.gb ENSGT00390000003592 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000015047 ENSGT00390000018596.B ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000164703.b ENSGT00940000165371.b ENSGT00940000164786.b ENSGT00940000155617.A ENSGT00950000183053.C.b ENSGT00940000159879 ENSGT00940000154543.c ENSGT00940000161921.e.b ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000157562.q.b ENSGT00390000018558 ENSGT00940000165527 ENSGT00530000063759.b ENSGT00940000155448.c.b Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00390000001400 ENSGT01010000222287.A ENSGT00940000168345 ENSGT00390000018003.a ENSGT00390000016950 ENSGT00950000182839.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00390000014494 ENSGT00940000156361.B ENSGT00390000003344 ENSGT00940000166498 ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00760000119531 ENSGT00940000158337 ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B.e ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136 ENSGT00510000047137 ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692 ENSGT00390000013727.c ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a ENSGT00930000151037 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00940000154757.xb.a.b ENSGT00940000158337 ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000159925 ENSGT00940000160093.b ENSGT00940000159329 ENSGT00390000000732 ENSGT00940000155167.a ENSGT00940000162635 ENSGT00950000182970.A.b ENSGT01030000234597.a.b.b.f.j ENSGT00410000025596.a.a ENSGT00950000183149.B Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00390000017213.B.e ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136.cb ENSGT00510000047137.x ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692.e ENSGT00390000013727.c ENSGT01030000234558.A.a.a.b 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ENSSSAG00000044169 ENSSSAG00000043978 ENSSSAG00000101675 Huchen MODERN SPECIES 806 ENSHHUG00000045163 ENSHHUG00000045158 angptl7 (ENSHHUG00000045151) ##22 ITLN1 (ENSHHUG00000045148) ENSHHUG00000045140 agrn (ENSHHUG00000044704) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 163 ENSGT00940000160408.c.a ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B.e ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136.cb ENSGT00510000047137.x ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692.e ENSGT00390000013727.c ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a.c ENSGT00940000157064.a.a.d ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000157064.a.a.c ##22 ENSGT00940000154757.xb.a.b ENSGT00940000158337.f ENSGT00940000153876.A.f ENSGT00940000163259.b.e ENSGT00700000104550.a.j.b.c.b ENSGT00940000159925.d Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160408.c.a ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B.e ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136.cb ENSGT00510000047137.x ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692.e ENSGT00390000013727.c ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a.c ENSGT00940000157064.a.a.d ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000158337.e ENSGT00940000153876.A.e ENSGT00940000163259.b.f ENSGT00700000104550.a.j.b.c.a ENSGT00940000159925.c ENSGT00940000160093.b ENSGT00940000159329 ENSGT01100000263529.a.a.a.a.b.c.b.g.b ENSGT00940000156407.a ENSGT00940000166655.i ENSGT01030000234597.a.b.b.f.i.b ENSGT00940000160694.g.a ENSGT00940000158197.c.e ENSGT00390000006008 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160408.c.a ENSGT00940000155229 ENSGT00390000017213.B.e ENSGT00730000111482 ENSGT00940000156136.cb ENSGT00510000047137.x ENSGT00950000183153.c.b.a.b ENSGT00390000003623 ENSGT00390000001652.f.a ENSGT00940000164692.e ENSGT00390000013727.c ENSGT01030000234558.A.a.a.b ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a.c 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seahorse MODERN SPECIES 90 angptl7 (ENSHCOG00000003442) ##22 mtor (ENSHCOG00000003681) agrn (ENSHCOG00000003829) ptpn11b (ENSHCOG00000003885) RNF223 (ENSHCOG00000003924) DENND2C (ENSHCOG00000003932) ampd1 (ENSHCOG00000003972) ENSHCOG00000004041 csde1 (ENSHCOG00000004158) SIKE1 (ENSHCOG00000004187) ENSHCOG00000004202 HTR6 (ENSHCOG00000004211) TMCO4 (ENSHCOG00000004214) vwa1 (ENSHCOG00000004227) ENSHCOG00000004319 PREX1 (ENSHCOG00000004400) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158459 ENSGT01030000234841 ENSGT00390000005532.l ENSGT00940000159714 ENSGT00390000013558.a.b ENSGT00730000111059.b ENSGT00400000023987.d ENSGT00390000016392 ENSGT00390000014494 ENSGT00940000156361.B ENSGT00390000003344 ENSGT00940000166498 ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000158337 ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182839.B.a.b 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ENSGT00940000158459 ENSGT01030000234841 ENSGT00390000005532.l ENSGT00940000159714.e ENSGT00390000013558.a.b ENSGT00400000023987.d ENSGT00390000016392 ENSGT00390000014494 ENSGT00940000156361.B ENSGT00390000003344 ENSGT00940000166498 ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a ENSGT00930000151037 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00940000158337 ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182839.B.a.b ENSGT00390000016950 ENSGT00390000018003.a ENSGT00940000168345 ENSGT01010000222287.A ENSGT00390000001400 ENSGT00940000160734.d ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000159925 ENSGT00940000160093.b Mummichog MODERN SPECIES 2191 cdk11b (ENSFHEG00000012616) ENSFHEG00000012499 szrd1 (ENSFHEG00000012478) atp13a2 (ENSFHEG00000012465) SDHB (ENSFHEG00000012444) TMEM240 (ENSFHEG00000012433) otud3 (ENSFHEG00000012416) bcas2 (ENSFHEG00000012410) trim33 (ENSFHEG00000012379) slc66a1 (ENSFHEG00000012317) nr1h5 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ENSCVAG00000001317 ENSCVAG00000001316 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160682.a ENSGT00930000151037.f ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037.e ENSGT00940000158337 ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182839.B.a.b ENSGT00390000016950.pb ENSGT00390000018003.a ENSGT00940000168345 ENSGT01010000222287.A ENSGT00390000001400 ENSGT00940000160734.d ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000159925 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00930000151037.f ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037.e ENSGT00940000158337 ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182839.B.a.b ENSGT00390000016950.pb ENSGT00390000018003.a ENSGT00940000168345 ENSGT01010000222287.A ENSGT00390000001400 ENSGT00940000160734.d ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000159925 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 701 ENSGT00930000151037.f ENSGT00940000157064.a.a ##22 Amazon molly MODERN SPECIES 256 oard1 (ENSPFOG00000023558) mtor (ENSPFOG00000008483) ENSPFOG00000024817 angptl7 (ENSPFOG00000008574) ##22 ENSPFOG00000020237 nrbf2b (ENSPFOG00000008621) reep3b (ENSPFOG00000008670) JMJD1C (ENSPFOG00000009146) cyp26a1 (ENSPFOG00000009240) exoc6 (ENSPFOG00000009842) ENSPFOG00000009869 trub1 (ENSPFOG00000009950) LRRC45 (ENSPFOG00000010153) rac3b (ENSPFOG00000021912) dcxr (ENSPFOG00000010173) rfng (ENSPFOG00000010243) atp6v0a1b (ENSPFOG00000010533) ENSPFOG00000024842 cavin1b (ENSPFOG00000010568) Sailfin molly MODERN SPECIES 1396 mtor (ENSPLAG00000011000) angptl7 (ENSPLAG00000010942) ##22 Guppy MODERN SPECIES 459 ENSPREG00000010700 ENSPREG00000010737 ENSPREG00000010763 dffb (ENSPREG00000010769) ENSPREG00000010784 b3gnt7l (ENSPREG00000010802) CEP104 (ENSPREG00000010810) lrrc47 (ENSPREG00000010823) ENSPREG00000010851 zgpat (ENSPREG00000010919) TTI1 (ENSPREG00000010927) VSTM2L (ENSPREG00000010941) ctnnbl1 (ENSPREG00000010964) ENSPREG00000011028 mtor (ENSPREG00000011061) 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ENSGT00390000005532.l ENSGT00940000159714 ENSGT00390000013558.a.b ENSGT00730000111059.b ENSGT00400000023987.d ENSGT00390000016392 ENSGT00390000014494 ENSGT00940000156361.B ENSGT00390000003344 ENSGT00940000166498 ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000158337 ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182839.B.a.b ENSGT00390000016950 ENSGT00390000018003.a ENSGT00940000168345 ENSGT01010000222287.A ENSGT00390000001400 ENSGT00940000160734.d ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000159925 European seabass MODERN SPECIES 14 ENSDLAG00005033030 szrd1 (ENSDLAG00005030755) atp13a2 (ENSDLAG00005014127) ENSDLAG00005016007 ENSDLAG00005016300 ENSDLAG00005026527 ENSDLAG00005016579 ENSDLAG00005030653 trim33 (ENSDLAG00005016596) slc66a1 (ENSDLAG00005016846) nr1h5 (ENSDLAG00005016862) ENSDLAG00005016886 ENSDLAG00005016904 ENSDLAG00005017053 ENSDLAG00005034287 ENSDLAG00005019287 ##22 ENSDLAG00005019363 ENSDLAG00005022089 ENSDLAG00005034563 DENND2C (ENSDLAG00005032504) ENSDLAG00005022825 ENSDLAG00005023188 CSDE1 (ENSDLAG00005023227) ENSDLAG00005031029 ENSDLAG00005023929 ENSDLAG00005033304 ENSDLAG00005023937 vwa1 (ENSDLAG00005023969) ENSDLAG00005024005 ENSDLAG00005024474 ENSDLAG00005024925 Large yellow croaker MODERN SPECIES 487 ENSLCRG00005006490 szrd1 (ENSLCRG00005006491) atp13a2 (ENSLCRG00005006502) SDHB (ENSLCRG00005006667) ATAD3A (ENSLCRG00005006903) TMEM240 (ENSLCRG00005006946) otud3 (ENSLCRG00005006947) bcas2 (ENSLCRG00005006950) trim33 (ENSLCRG00005006953) slc66a1 (ENSLCRG00005006958) nr1h5 (ENSLCRG00005006959) BRPF3 (ENSLCRG00005006963) MAPK13 (ENSLCRG00005006968) ENSLCRG00005006978 mtor (ENSLCRG00005006997) angptl7 (ENSLCRG00005007070) ##22 agrn (ENSLCRG00005007112) ENSLCRG00005010078 RNF223 (ENSLCRG00005011444) DENND2C (ENSLCRG00005011454) ampd1 (ENSLCRG00005011483) ENSLCRG00005012205 csde1 (ENSLCRG00005012246) 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(ENSSAUG00010023528) PREX1 (ENSSAUG00010023706) kcnq2a (ENSSAUG00010024701) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158459 ENSGT01030000234841 ENSGT00390000005532.l ENSGT00940000159714 ENSGT00390000013558.a.b ENSGT00730000111059.b ENSGT00400000023987.d ENSGT00390000016392 ENSGT00390000014494 ENSGT00940000156361.B ENSGT00390000003344 ENSGT00940000166498 ENSGT00940000155056.a ENSGT00940000159584 ENSGT00940000160682.a ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000158337 ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182839.B.a.b ENSGT00390000016950 ENSGT00390000018003.a ENSGT00940000168345 ENSGT01010000222287.A ENSGT00390000001400 ENSGT00940000160734.d ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000159925 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158459 ENSGT01030000234841 ENSGT00390000005532.l ENSGT00940000159714 ENSGT00390000013558.a.b ENSGT00730000111059.b ENSGT00400000023987.d ENSGT00390000016392 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ENSGT00940000153876.A ENSGT00940000163259.b ENSGT00950000182931.B.a.b ENSGT00950000183011.c.a.a ENSGT00950000182839.B.a.b ENSGT00390000016950 ENSGT00390000018003.a ENSGT00940000168345 ENSGT00940000154484.A ENSGT00390000001400 ENSGT00940000160734.d ENSGT00700000104550.a.j.b ENSGT00940000159925 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 18 MMP23B (ENSBSLG00000004757) cdk11b (ENSBSLG00000005431) ENSBSLG00000006563 szrd1 (ENSBSLG00000006588) atp13a2 (ENSBSLG00000006876) TMEM240 (ENSBSLG00000007724) otud3 (ENSBSLG00000007756) bcas2 (ENSBSLG00000007797) trim33 (ENSBSLG00000007990) slc66a1 (ENSBSLG00000009440) nr1h5 (ENSBSLG00000009457) BRPF3 (ENSBSLG00000009470) MAPK13 (ENSBSLG00000009510) ENSBSLG00000010242 mtor (ENSBSLG00000010259) angptl7 (ENSBSLG00000010382) ##22 agrn (ENSBSLG00000010997) ENSBSLG00000013935 ptpn11b (ENSBSLG00000014153) RNF223 (ENSBSLG00000014746) DENND2C (ENSBSLG00000014757) ampd1 (ENSBSLG00000014875) ENSBSLG00000016455 csde1 (ENSBSLG00000016489) SIKE1 (ENSBSLG00000019070) ENSBSLG00000019084 ENSBSLG00000019100 TMCO4 (ENSBSLG00000019142) vwa1 (ENSBSLG00000019304) RALGAPB (ENSBSLG00000019309) PREX1 (ENSBSLG00000019588) Climbing perch MODERN SPECIES 20 ENSATEG00000005073 cdk11b (ENSATEG00000005002) ENSATEG00000004960 szrd1 (ENSATEG00000027903) atp13a2 (ENSATEG00000004898) ENSATEG00000004854 ENSATEG00000029392 ENSATEG00000004825 ENSATEG00000026999 trim33 (ENSATEG00000004717) slc66a1 (ENSATEG00000004697) nr1h5 (ENSATEG00000004649) ENSATEG00000004586 ENSATEG00000004520 ENSATEG00000004494 ENSATEG00000004456 ##22 ENSATEG00000004175 ENSATEG00000004139 ENSATEG00000004060 ENSATEG00000004040 DENND2C (ENSATEG00000004030) ENSATEG00000003961 ENSATEG00000029204 CSDE1 (ENSATEG00000003864) ENSATEG00000003841 ENSATEG00000003796 ENSATEG00000026807 ENSATEG00000003731 vwa1 (ENSATEG00000003719) ENSATEG00000003680 ENSATEG00000003472 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 21 sult1st5 (ENSMMDG00005023609) tmem82 (ENSMMDG00005023607) szrd1 (ENSMMDG00005023604) atp13a2 (ENSMMDG00005023590) SDHB (ENSMMDG00005023562) ATAD3A (ENSMMDG00005023550) TMEM240 (ENSMMDG00005023544) otud3 (ENSMMDG00005023542) bcas2 (ENSMMDG00005023541) trim33 (ENSMMDG00005023394) slc66a1 (ENSMMDG00005023377) nr1h5 (ENSMMDG00005023371) BRPF3 (ENSMMDG00005023365) MAPK13 (ENSMMDG00005023359) ENSMMDG00005023357 angptl7 (ENSMMDG00005023356) ##22 mtor (ENSMMDG00005022828) agrn (ENSMMDG00005022344) ptpn11b (ENSMMDG00005022326) RNF223 (ENSMMDG00005022323) ENSMMDG00005022321 DENND2C (ENSMMDG00005022313) ampd1 (ENSMMDG00005021870) ENSMMDG00005021853 csde1 (ENSMMDG00005018036) SIKE1 (ENSMMDG00005017938) ENSMMDG00005017936 ENSMMDG00005017934 TMCO4 (ENSMMDG00005017921) vwa1 (ENSMMDG00005017916) RALGAPB (ENSMMDG00005017888) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000009300.a ENSGT01030000234629.A ENSGT00940000160860 ENSGT00940000159295 ENSGT00940000157445 ENSGT00390000009023 ENSGT00940000154343.gb ENSGT00390000003592 ENSGT00390000008187 ENSGT00390000015047 ENSGT00390000018596.B ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00940000162859.p ENSGT00940000164703.b ENSGT00940000165371.b ENSGT00940000164786.b ENSGT00940000155617.A ENSGT00950000183053.C.b ENSGT00940000159879 ENSGT00940000154543.c ENSGT00940000161921.e.b ENSGT00530000063859.b ENSGT00940000157562.q.b ENSGT00390000018558 ENSGT00940000165527 ENSGT00530000063759.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 247 ENSGT00940000159001.h ENSGT00950000183179.b.a ENSGT00940000159001.g ENSGT00940000167398 ENSGT00390000009300.a ENSGT00940000157445 ENSGT00940000179490 ENSGT00940000154343.gb ENSGT00390000008187 ENSGT00390000015047 ENSGT00390000018596.B ENSGT00950000183084.b.a.b ENSGT00510000047914.a.b ENSGT00870000136521 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 Denticle herring MODERN SPECIES 1 ctnnbip1 (ENSDCDG00000024247) clstn1 (ENSDCDG00000023609) LZIC (ENSDCDG00000023555) rbp7a (ENSDCDG00000023466) ube4b (ENSDCDG00000023199) kif1b (ENSDCDG00000022587) ENSDCDG00000022412 tardbpa (ENSDCDG00000022378) CASZ1 (ENSDCDG00000022350) PEX14 (ENSDCDG00000022337) dffa (ENSDCDG00000022334) masp2 (ENSDCDG00000022312) sst7 (ENSDCDG00000022307) srm (ENSDCDG00000022294) exosc10 (ENSDCDG00000022283) angptl7 (ENSDCDG00000022277) ##22 mtor (ENSDCDG00000022253) ENSDCDG00000015310 ENSDCDG00000004797 EPB41L1 (ENSDCDG00000003402) edn3b (ENSDCDG00000003085) ttll9 (ENSDCDG00000003040) ENSDCDG00000002981 ppp1r3da (ENSDCDG00000002960) ENSDCDG00000002940 phactr3a (ENSDCDG00000032610) PIGT (ENSDCDG00000032609) wfdc2 (ENSDCDG00000032607) snx21 (ENSDCDG00000032605) ENSDCDG00000032604 L3MBTL1 (ENSDCDG00000032599) Atlantic herring MODERN SPECIES 20 selenok (ENSCHAG00000024927) ENSCHAG00000024923 actr8 (ENSCHAG00000024806) ENSCHAG00000024793 CHDH (ENSCHAG00000024789) CACNA1D (ENSCHAG00000021153) dcp1a (ENSCHAG00000021064) TKT (ENSCHAG00000019820) CASZ1 (ENSCHAG00000019729) PEX14 (ENSCHAG00000019709) dffa (ENSCHAG00000019704) masp2 (ENSCHAG00000019509) sst7 (ENSCHAG00000019494) srm (ENSCHAG00000019481) exosc10 (ENSCHAG00000017191) angptl7 (ENSCHAG00000017095) ##22 mtor (ENSCHAG00000016530) ENSCHAG00000014829 ube4b (ENSCHAG00000013830) rbp7a (ENSCHAG00000013782) nmnat1 (ENSCHAG00000013768) lzic (ENSCHAG00000013752) clstn1 (ENSCHAG00000010482) ctnnbip1 (ENSCHAG00000010387) pik3cd (ENSCHAG00000009772) foxl2l (ENSCHAG00000009739) tmem201 (ENSCHAG00000009734) BSN (ENSCHAG00000009686) RAD54L2 (ENSCHAG00000008067) osbpl2b (ENSCHAG00000006262) adrm1 (ENSCHAG00000005973) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 220 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00550000074972 ENSGT00640000091554 ENSGT00730000111360.a ENSGT00940000163342.a.a.b ENSGT00390000007075 ENSGT00940000161798 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT01020000230394.e.b.a ENSGT00930000152979 ENSGT00960000189798 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000154886.a.a.f ENSGT00390000006553 ENSGT00940000156136.eb ENSGT00940000156136.db ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.n.a ENSGT00940000161602.n.b ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000172767 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00550000074972 ENSGT00640000091554 ENSGT00730000111360.a ENSGT00940000163342.a.a.a ENSGT00940000163342.a.a.b.a ENSGT00940000163342.a.a.b.b ENSGT00390000007075 ENSGT00940000161798 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT01020000230394.e.b.a Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000154886.a.a.f ENSGT00390000006553 ENSGT00940000156136.eb ENSGT00940000156136.db ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.n.a ENSGT00940000161602.n.b ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000172767 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00550000074972 ENSGT00640000091554 ENSGT00730000111360.a ENSGT00940000163342.a.a.a ENSGT00940000163342.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.a.b.a.a ENSGT00390000007075 ENSGT00940000161798 ENSGT00940000158393 ENSGT00640000091558 ENSGT00390000007159 ENSGT00390000016951 ENSGT00940000155189.pb.b ENSGT01020000230394.e.b.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 137 ENSGT00940000154886.a.a.f ENSGT00390000006553 ENSGT00940000156136.eb ENSGT00940000156136.db ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.n.b.b ENSGT00940000161602.n.b.a ENSGT00940000160408 ENSGT01030000234571.a.b ENSGT00940000153341 ENSGT00940000154721 ENSGT00940000172767 ENSGT00390000015408 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00550000074972 ENSGT00640000091554 ENSGT00730000111360.a ENSGT00940000163342.a.a.a ENSGT00940000163342.a.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000163342.a.a.b.a.a.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 113 kank3 (ENSPNAG00000027782) ndufa7 (ENSPNAG00000027786) ENSPNAG00000028160 tas1r2.1 (ENSPNAG00000006970) her3 (ENSPNAG00000028430) GPR153 (ENSPNAG00000005282) acot7 (ENSPNAG00000028450) hes2.1 (ENSPNAG00000028472) hes2.1 (ENSPNAG00000028557) espn (ENSPNAG00000006281) arhgef16 (ENSPNAG00000004432) ybx1 (ENSPNAG00000028799) ENSPNAG00000028833 ppih (ENSPNAG00000006568) exosc10 (ENSPNAG00000028864) angptl7 (ENSPNAG00000005287) ##22 mtor (ENSPNAG00000006286) qars1 (ENSPNAG00000029441) ogg1 (ENSPNAG00000029459) ENSPNAG00000029467 ENSPNAG00000029498 ENSPNAG00000029502 ENSPNAG00000007390 ENSPNAG00000000158 ENSPNAG00000007391 ENSPNAG00000007392 ENSPNAG00000000159 wdr46 (ENSPNAG00000007393) B3GALT4 (ENSPNAG00000007394) nr2c2 (ENSPNAG00000007395) mrps25 (ENSPNAG00000000160) Mexicana tetra MODERN SPECIES 21 ENSAMXG00000014366 tas1r2.1 (ENSAMXG00000014380) her3 (ENSAMXG00000037134) GPR153 (ENSAMXG00000014413) acot7 (ENSAMXG00000037583) hes2.1 (ENSAMXG00000042324) hes2.1 (ENSAMXG00000014429) espn (ENSAMXG00000014440) arhgef16 (ENSAMXG00000014452) ybx1 (ENSAMXG00000014478) ppih (ENSAMXG00000041871) ENSAMXG00000032726 ENSAMXG00000014500 exosc10 (ENSAMXG00000014510) mtor (ENSAMXG00000014520) angptl7 (ENSAMXG00000014537) ##22 qars1 (ENSAMXG00000014553) ogg1 (ENSAMXG00000033292) ENSAMXG00000039341 ENSAMXG00000040516 ENSAMXG00000032196 ENSAMXG00000036379 ENSAMXG00000014611 ENSAMXG00000029204 ENSAMXG00000032514 ENSAMXG00000019945 pcbp2 (ENSAMXG00000037819) map3k12 (ENSAMXG00000014645) aaas (ENSAMXG00000014649) ENSAMXG00000014650 si:dkey-56i24.1 (ENSAMXG00000034002) Electric eel MODERN SPECIES 382 arhgef16 (ENSEEEG00000019436) ybx1 (ENSEEEG00000019438) ppih (ENSEEEG00000019439) ENSEEEG00000019442 exosc10 (ENSEEEG00000019443) mtor (ENSEEEG00000019515) angptl7 (ENSEEEG00000021451) ##22 qars1 (ENSEEEG00000000275) ogg1 (ENSEEEG00000000432) ENSEEEG00000000443 ENSEEEG00000000457 ENSEEEG00000000489 ENSEEEG00000000507 ENSEEEG00000000522 wdr46 (ENSEEEG00000000550) ENSEEEG00000000697 nr2c2 (ENSEEEG00000000716) mrps25 (ENSEEEG00000000773) RBSN (ENSEEEG00000000780) TMCC1 (ENSEEEG00000000801) PLXND1 (ENSEEEG00000000830) exorh (ENSEEEG00000000876) Channel catfish MODERN SPECIES 24 ndufa7 (ENSIPUG00000021303) ENSIPUG00000021312 ENSIPUG00000021330 tas1r2.1 (ENSIPUG00000021386) GPR153 (ENSIPUG00000021432) acot7 (ENSIPUG00000021445) hes2.2 (ENSIPUG00000021473) hes2.1 (ENSIPUG00000021478) espn (ENSIPUG00000021497) arhgef16 (ENSIPUG00000021551) ybx1 (ENSIPUG00000021584) ppih (ENSIPUG00000021904) ENSIPUG00000021960 exosc10 (ENSIPUG00000021971) mtor (ENSIPUG00000022002) angptl7 (ENSIPUG00000022088) ##22 qars1 (ENSIPUG00000022101) Ogg1 (ENSIPUG00000022146) prrt3 (ENSIPUG00000022168) ENSIPUG00000022172 ENSIPUG00000022192 ENSIPUG00000022361 ENSIPUG00000022375 st1s3 (ENSIPUG00000022384) wdr46 (ENSIPUG00000022420) ENSIPUG00000022431 nr2c2 (ENSIPUG00000022437) mrps25 (ENSIPUG00000022462) trh (ENSIPUG00000022493) tmcc1 (ENSIPUG00000022503) plxnd1 (ENSIPUG00000022519) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 160 ENSGT00940000157064.a.a ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00550000074972 ENSGT00640000091554 ENSGT00730000111360.a ENSGT00940000163342.a.a.b.c.a.a ENSGT00940000156136.db.b.a ENSGT00940000156136.db.a ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B ENSGT00940000155229 ENSGT00940000161602.n.a ENSGT00940000161602.n.b ENSGT00940000160408.a ENSGT00940000153341 ENSGT00940000154721.ac Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 276 ENSGT00940000157064.a.a.e ##22 ENSGT01050000244855.A.b.p.db.a.a.b.b ENSGT00550000074972.k ENSGT00640000091554 ENSGT00730000111360.a.b ENSGT00940000163342.a.a.b.c.a.a.b.b ENSGT00940000156136.db.a.b ENSGT00730000111482 ENSGT00390000017213.B.c.a ENSGT00940000155229.ib ENSGT00940000161602.n.a ENSGT00940000161602.n.b ENSGT00940000160408.a.b ENSGT01030000234571.a.b.b ENSGT00940000153341.c ENSGT00940000154721.`c.b Goldfish MODERN SPECIES 48 ENSCARG00000024371 ENSCARG00000024278 ENSCARG00000024263 ENSCARG00000024257 ENSCARG00000024247 ENSCARG00000024243 ENSCARG00000024240 actr8 (ENSCARG00000024193) ENSCARG00000024177 LRTM1 (ENSCARG00000024169) CACNA2D3 (ENSCARG00000023834) wnt5a (ENSCARG00000023772) ENSCARG00000023756 ENSCARG00000023754 ENSCARG00000023746 angptl7 (ENSCARG00000023717) ##22 ENSCARG00000023709 qars1 (ENSCARG00000023013) ogg1 (ENSCARG00000022967) ENSCARG00000022965 ENSCARG00000022898 tas1r2.2 (ENSCARG00000022874) her3 (ENSCARG00000022866) ENSCARG00000022863 GPR153 (ENSCARG00000022848) acot7 (ENSCARG00000022825) hes2.2 (ENSCARG00000022814) hes2.1 (ENSCARG00000022808) espn (ENSCARG00000022792) arhgef16 (ENSCARG00000022735) ybx1 (ENSCARG00000022694) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 350 ENSGT00940000157064.a.a.e ##22 ENSGT00550000074972.k ENSGT00640000091554 ENSGT00730000111360.a.b ENSGT00940000163342.a.a.b.c.a.a.b.b ENSGT00940000156136.db.a.b ENSGT00730000111482.c ENSGT00390000017213.B.c.a ENSGT00940000155229.ib ENSGT00940000161602.n.a ENSGT00940000161602.n.b ENSGT00940000160408.a.b ENSGT01030000234571.a.b.b ENSGT00940000153341.c ENSGT00940000154721.`c.b ENSGT00940000172767.a Common carp reference MODERN SPECIES 23 ENSCCRG00000075412 CHDH (ENSCCRG00000064884) CACNA1D (ENSCCRG00000035647) DCP1A (ENSCCRG00000038283) ENSCCRG00000052275 gnb1a (ENSCCRG00000052254) ENSCCRG00000066513 ENSCCRG00000073256 ENSCCRG00000021261 mrps25 (ENSCCRG00000061250) nr2c2 (ENSCCRG00000043684) ENSCCRG00000065409 wdr46 (ENSCCRG00000043753) ENSCCRG00000059544 ENSCCRG00000069263 ENSCCRG00000059163 ##22 ENSCCRG00000063940 qars1 (ENSCCRG00000082161) ENSCCRG00000061211 ENSCCRG00000020752 tas1r2.2 (ENSCCRG00000038293) her3 (ENSCCRG00000038290) GPR153 (ENSCCRG00000038288) acot7 (ENSCCRG00000000265) hes2.2 (ENSCCRG00000000261) hes2.1 (ENSCCRG00000070850) hes2.1 (ENSCCRG00000000276) espn (ENSCCRG00000077959) arhgef16 (ENSCCRG00000050316) ybx1 (ENSCCRG00000076621) ENSCCRG00000067326 Golden-line barbel MODERN SPECIES 193 ENSSGRG00000009975 selenok (ENSSGRG00000009973) actr8 (ENSSGRG00000009941) ENSSGRG00000009939 CHDH (ENSSGRG00000009937) CACNA1D (ENSSGRG00000006708) dcp1a (ENSSGRG00000006629) BICD2 (ENSSGRG00000006551) gnb1a (ENSSGRG00000006538) GABRD (ENSSGRG00000006534) mrps25 (ENSSGRG00000006529) RBSN (ENSSGRG00000006262) nr2c2 (ENSSGRG00000005358) wdr46 (ENSSGRG00000005278) NADK (ENSSGRG00000002431) angptl7 (ENSSGRG00000002419) ##22 mtor (ENSSGRG00000001912) qars1 (ENSSGRG00000001806) ogg1 (ENSSGRG00000001803) ENSSGRG00000001799 ENSSGRG00000001782 ENSSGRG00000001778 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 435 ENSGT00940000157064.a.a.f ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00550000074972.l ENSGT00730000111360.a.a ENSGT00940000163342.a.a.b.c.a.a.b.a ENSGT00940000156136.db.b.a ENSGT00940000156136.db.a.a ENSGT00390000017213.B.c.b ENSGT00940000155229.hb ENSGT00940000160408.a.a ENSGT01030000234571.a.b.a ENSGT00940000153341.d ENSGT00940000154721.ac ENSGT00940000172767.b ENSGT00940000154721.`c.a ENSGT00390000006553.a.b Goldfish MODERN SPECIES 2851 mtor (ENSCARG00000061627) angptl7 (ENSCARG00000061922) ##22 qars1 (ENSCARG00000062005) ENSCARG00000062848 ENSCARG00000062858 ENSCARG00000062863 ENSCARG00000062909 ENSCARG00000063018 ENSCARG00000063023 si:dkeyp-104h9.5 (ENSCARG00000063036) plod1a (ENSCARG00000063205) mfn2 (ENSCARG00000065892) ENSCARG00000065955 ENSCARG00000066365 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 608 ENSGT00940000157064.a.a.f ##22 ENSGT00930000151037 ENSGT00550000074972.l ENSGT00730000111360.a.a ENSGT00940000163342.a.a.b.c.a.a.b.a ENSGT00940000156136.db.b.a ENSGT00940000156136.db.a.a ENSGT00730000111482.d ENSGT00390000017213.B.d Common carp reference MODERN SPECIES 17 ENSCCRG00000065532 ENSCCRG00000046674 ENSCCRG00000064723 ENSCCRG00000017100 gnb1a (ENSCCRG00000053128) ENSCCRG00000038378 ENSCCRG00000030229 ENSCCRG00000026154 mrps25 (ENSCCRG00000061150) nr2c2 (ENSCCRG00000047474) ENSCCRG00000070323 wdr46 (ENSCCRG00000007638) ENSCCRG00000053571 ENSCCRG00000080665 ENSCCRG00000053157 angptl7 (ENSCCRG00000074090) ##22 mtor 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