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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.a ##8	ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #8	ENSGT00530000063534.b #9	ENSGT01050000244827.D.b.b #10	ENSGT00940000162030 #11	ENSGT00940000155351 #12	ENSGT00530000064714 #13	ENSGT00390000018550 #14	ENSGT00940000161242 #15	ENSGT00940000156184 #16	ENSGT00390000000909 #17	ENSGT00940000157732 #18	ENSGT00940000156696.B #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #20	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #21	ENSGT01030000234610.b.a.a #22	ENSGT00390000012228 #23	ENSGT00390000015489 #24	ENSGT00940000153342.a #25	ENSGT00940000158034 #26	ENSGT00940000154418.a.a #27	ENSGT00940000163289.b	ENSGT00940000162369 #28	ENSGT00940000159034 #29	ENSGT00390000001742.a #30	ENSGT00390000015849 #31	ENSGT00940000155588.b #32	ENSGT00950000183109.c.a.a #33	ENSGT01030000234641.b.a.a #34	ENSGT00940000155737.b #35	ENSGT00940000157919 #36
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	76		ENSGT01030000234563.b.a.b.b.b #8	ENSGT00530000063534.b #9	ENSGT01050000244827.D.b.b #10	ENSGT00940000162030 #11	ENSGT00940000155351 #12	ENSGT00530000064714 #13	ENSGT00390000018550 #14	ENSGT00940000161242 #15	ENSGT00940000156184 #16	ENSGT00390000000909 #17	ENSGT00940000157732 #18	ENSGT00940000156696.B #19	ENSGT01030000234610.b.a.b.b #20	ENSGT01030000234610.b.a.b.a #21	ENSGT01030000234610.b.a.a #22	ENSGT00390000012228 #23	ENSGT00390000015489 #24	ENSGT00940000153342.a #25	ENSGT00940000158034 #26	ENSGT00940000154418.a.a #27	ENSGT00940000163289.b	ENSGT00940000162369 #28	ENSGT00940000159034 #29	ENSGT00390000001742.a #30	ENSGT00390000015849 #31	ENSGT00940000155588.b #32	ENSGT00950000183109.c.a.a #33	ENSGT01030000234641.b.a.a #34	ENSGT00940000155737.b #35	ENSGT00940000157919 #36
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	239		SORCS3 (ENSUPAG00010020130) #8	CFAP58 (ENSUPAG00010020153) #9	ITPRIP (ENSUPAG00010020162) #10	GSTO2 (ENSUPAG00010020166) #11	GSTO1 (ENSUPAG00010020173) #12	ENSUPAG00010020178 #13	SFR1 (ENSUPAG00010020181) #14	COL17A1 (ENSUPAG00010020186) #15	SLK (ENSUPAG00010020310) #16	STN1 (ENSUPAG00010020348) #17	SH3PXD2A (ENSUPAG00010020358) #18	NEURL1 (ENSUPAG00010020402) #19	CALHM3 (ENSUPAG00010020411) #20	CALHM1 (ENSUPAG00010020414) #21	CALHM2 (ENSUPAG00010020415) #22	PDCD11 (ENSUPAG00010020419) #23	ATP5MK (ENSUPAG00010020448) #24	TAF5 (ENSUPAG00010020451) #25	PCGF6 (ENSUPAG00010020458) #26	INA (ENSUPAG00010020463) #27	NT5C2 (ENSUPAG00010020468) #28	CNNM2 (ENSUPAG00010020490) #29	AS3MT (ENSUPAG00010020500) #30	BORCS7 (ENSUPAG00010020508) #31	CYP17A1 (ENSUPAG00010020514) #32	WBP1L (ENSUPAG00010020520) #33	SFXN2 (ENSUPAG00010020522) #34	ARL3 (ENSUPAG00010020532) #35	TRIM8 (ENSUPAG00010020545) #36	SUFU (ENSUPAG00010020560) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	200		SORCS3 (ENSSTOG00000015559) #8	CFAP58 (ENSSTOG00000004618) #9	ITPRIP (ENSSTOG00000020489) #10	GSTO2 (ENSSTOG00000013405) #11	GSTO1 (ENSSTOG00000013401) #12	ENSSTOG00000013381 #13	SFR1 (ENSSTOG00000013376) #14	COL17A1 (ENSSTOG00000013352) #15	SLK (ENSSTOG00000013329) #16	STN1 (ENSSTOG00000011905) #17	SH3PXD2A (ENSSTOG00000007057) #18	NEURL1 (ENSSTOG00000023895) #19	CALHM3 (ENSSTOG00000025172) #20	CALHM1 (ENSSTOG00000014605) #21	CALHM2 (ENSSTOG00000014597) #22	PDCD11 (ENSSTOG00000014553) #23	ATP5MK (ENSSTOG00000029901) #24	TAF5 (ENSSTOG00000014536) #25	PCGF6 (ENSSTOG00000014511) #26	INA (ENSSTOG00000026141) #27	ENSSTOG00000012380	CNNM2 (ENSSTOG00000014497) #29	AS3MT (ENSSTOG00000014490) #30	BORCS7 (ENSSTOG00000019613) #31	CYP17A1 (ENSSTOG00000014469) #32	ENSSTOG00000026185 #33	SFXN2 (ENSSTOG00000014456) #34	ARL3 (ENSSTOG00000014453) #35	TRIM8 (ENSSTOG00000008270) #36	SUFU (ENSSTOG00000026796) #37
Alpin marmot	MODERN SPECIES	39	SORCS3 (ENSMMMG00000001241) #8	CFAP58 (ENSMMMG00000001204) #9	ITPRIP (ENSMMMG00000001191) #10	GSTO2 (ENSMMMG00000001167) #11	GSTO1 (ENSMMMG00000001145) #12	ENSMMMG00000001103	CFAP43 (ENSMMMG00000000749) #13	SFR1 (ENSMMMG00000000727) #14	COL17A1 (ENSMMMG00000000492) #15	SLK (ENSMMMG00000000361) #16	STN1 (ENSMMMG00000000299) #17	SH3PXD2A (ENSMMMG00000000203) #18	NEURL1 (ENSMMMG00000000158) #19	CALHM3 (ENSMMMG00000000131) #20	CALHM1 (ENSMMMG00000000112) #21	CALHM2 (ENSMMMG00000000103) #22	PDCD11 (ENSMMMG00000000038) #23	ENSMMMG00000023417 #24	TAF5 (ENSMMMG00000023414) #25	ENSMMMG00000023410 #26	INA (ENSMMMG00000023409) #27	NT5C2 (ENSMMMG00000023399) #28	CNNM2 (ENSMMMG00000023389) #29	AS3MT (ENSMMMG00000023383) #30	BORCS7 (ENSMMMG00000023381) #31	CYP17A1 (ENSMMMG00000023378) #32	ENSMMMG00000023372 #33	SFXN2 (ENSMMMG00000023370) #34	ENSMMMG00000023361 #35	TRIM8 (ENSMMMG00000023360) #36	SUFU (ENSMMMG00000023355) #37
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	13	ENSSVLG00005001899	ENSSVLG00005001943	SORCS1 (ENSSVLG00005002050) ##8	SORCS3 (ENSSVLG00005002348) #8	CFAP58 (ENSSVLG00005002434) #9	ITPRIP (ENSSVLG00005002474) #10	CFAP43 (ENSSVLG00005002510) #13	ENSSVLG00005002622 #14	COL17A1 (ENSSVLG00005002694) #15	SLK (ENSSVLG00005002929) #16	STN1 (ENSSVLG00005002979) #17	ENSSVLG00005003038 #18	NEURL1 (ENSSVLG00005003109) #19	CALHM3 (ENSSVLG00005003127) #20	CALHM1 (ENSSVLG00005003146) #21	CALHM2 (ENSSVLG00005003154) #22	PDCD11 (ENSSVLG00005003201) #23	ENSSVLG00005003328	ENSSVLG00005003341 #24	TAF5 (ENSSVLG00005003365) #25	PCGF6 (ENSSVLG00005003419) #26	INA (ENSSVLG00005003457) #27	NT5C2 (ENSSVLG00005003493) #28	CNNM2 (ENSSVLG00005003556) #29	AS3MT (ENSSVLG00005003598) #30	BORCS7 (ENSSVLG00005003641) #31	CYP17A1 (ENSSVLG00005003699) #32	ENSSVLG00005003793 #33	SFXN2 (ENSSVLG00005003816) #34	ARL3 (ENSSVLG00005003847) #35	TRIM8 (ENSSVLG00005003874) #36