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Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	149	KLHL22 (ENSCLAG00000016767)	SCARF2 (ENSCLAG00000015409)	ZNF74 (ENSCLAG00000015439)	ENSCLAG00000017009	DGCR2 (ENSCLAG00000014962)	ESS2 (ENSCLAG00000015255)	GSC2 (ENSCLAG00000016210)	SLC25A1 (ENSCLAG00000016306)	CLTCL1 (ENSCLAG00000016811)	HIRA (ENSCLAG00000015724) #14	MRPL40 (ENSCLAG00000016629) #15	C22orf39 (ENSCLAG00000016842) #16	UFD1 (ENSCLAG00000015265) #17	CDC45 (ENSCLAG00000015752) #18	CLDN5 (ENSCLAG00000018017) #19	GP1BB (ENSCLAG00000016703) #22	SEPTIN5 (ENSCLAG00000015333) #21	TBX1 (ENSCLAG00000014504) #23	ENSCLAG00000013592	TXNRD2 (ENSCLAG00000014718) #25	COMT (ENSCLAG00000013891) #26	ARVCF (ENSCLAG00000015864) #27	TANGO2 (ENSCLAG00000016523) #28	DGCR8 (ENSCLAG00000013910) #29	TRMT2A (ENSCLAG00000015094)	RANBP1 (ENSCLAG00000014666) #31	ZDHHC8 (ENSCLAG00000014913) #32	ENSCLAG00000014259 #34	RTN4R (ENSCLAG00000015372)	ENSCLAG00000016071 #36	ENSCLAG00000015292 #35
Degu	MODERN SPECIES	62	ENSODEG00000016373	SCARF2 (ENSODEG00000016305)	ENSODEG00000016287	DGCR2 (ENSODEG00000016687)	ENSODEG00000020381	ENSODEG00000016401	SLC25A1 (ENSODEG00000016493)	CLTCL1 (ENSODEG00000016517)	HIRA (ENSODEG00000016444) #14	MRPL40 (ENSODEG00000017051) #15	C22orf39 (ENSODEG00000017124) #16	ENSODEG00000016396 #17	CDC45 (ENSODEG00000016658) #18	CLDN5 (ENSODEG00000020395) #19	SEPTIN5 (ENSODEG00000016498) #21	GP1BB (ENSODEG00000016559) #22	TBX1 (ENSODEG00000016676) #23	GNB1L (ENSODEG00000016226) #24	TXNRD2 (ENSODEG00000016336) #25	COMT (ENSODEG00000016382) #26	ARVCF (ENSODEG00000016204) #27	TANGO2 (ENSODEG00000016106) #28	DGCR8 (ENSODEG00000016402) #29	TRMT2A (ENSODEG00000016053)	ENSODEG00000015935 #31	ZDHHC8 (ENSODEG00000016037) #32	ENSODEG00000015917 #34	RTN4R (ENSODEG00000015875)	ENSODEG00000016154 #36	ENSODEG00000015809 #35	HIC2 (ENSODEG00000016054)
Guinea pig	MODERN SPECIES	4	MED15 (ENSCPOG00000005558)	KLHL22 (ENSCPOG00000024005)	SCARF2 (ENSCPOG00000027465)	DGCR2 (ENSCPOG00000002706)	ESS2 (ENSCPOG00000004596)	GSC2 (ENSCPOG00000015708)	SLC25A1 (ENSCPOG00000001754)	CLTCL1 (ENSCPOG00000002261)	HIRA (ENSCPOG00000002264) #14	MRPL40 (ENSCPOG00000026802) #15	C22orf39 (ENSCPOG00000039279) #16	UFD1 (ENSCPOG00000002267) #17	CDC45 (ENSCPOG00000002270) #18	CLDN5 (ENSCPOG00000002274) #19	SEPTIN5 (ENSCPOG00000010483) #21	GP1BB (ENSCPOG00000021659) #22	TBX1 (ENSCPOG00000012532) #23	GNB1L (ENSCPOG00000020237) #24	TXNRD2 (ENSCPOG00000011013) #25	COMT (ENSCPOG00000004445) #26	ARVCF (ENSCPOG00000014606) #27	TANGO2 (ENSCPOG00000002949) #28	DGCR8 (ENSCPOG00000002952) #29	ENSCPOG00000040089	TRMT2A (ENSCPOG00000002959)	RANBP1 (ENSCPOG00000030388) #31	ZDHHC8 (ENSCPOG00000000580) #32	ENSCPOG00000033882 #34	RTN4R (ENSCPOG00000020767)	ENSCPOG00000021534 #36	ENSCPOG00000001902 #35
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Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919 #14	ENSGT00390000010239 #15	ENSGT00390000002511 #16	ENSGT00390000002408 #17	ENSGT00390000009662 #18	ENSGT00940000161769 #19	ENSGT00940000159913 #21	ENSGT00530000064244.b #22	ENSGT00940000154816.a.b #23	ENSGT00940000166811	ENSGT00390000018606 #24	ENSGT00940000158832 #25	ENSGT00940000155317.b #26	ENSGT00940000157027 #27	ENSGT00390000012733 #28	ENSGT00390000015977 #29	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00940000154389.b	ENSGT00970000193655 #30	ENSGT00900000141073 #31	ENSGT00940000158044.a #32	ENSGT00940000153380.D #34	ENSGT00940000160711
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000162972	ENSGT00390000017655	ENSGT00940000163130	ENSGT00940000162226	ENSGT00390000009387	ENSGT00940000162536	ENSGT00550000074856	ENSGT00950000183166.a.b	ENSGT00550000074919 #14	ENSGT00390000010239 #15	ENSGT00390000002511 #16	ENSGT00390000002408 #17	ENSGT00390000009662 #18	ENSGT00940000161769 #19	ENSGT00940000159913 #21	ENSGT00530000064244.b #22	ENSGT00940000154816.a.b #23	ENSGT00940000166811	ENSGT00390000018606 #24	ENSGT00940000158832 #25	ENSGT00940000155317.b #26	ENSGT00940000157027 #27	ENSGT00390000012733 #28	ENSGT00390000015977 #29	ENSGT00530000063723.a	ENSGT00900000141073 #31	ENSGT00940000158044.a #32	ENSGT00940000153380.D #34	ENSGT00940000160711	ENSGT00390000006265.b #36	ENSGT00390000017663 #35
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	252	ENSUPAG00010011913	ENSUPAG00010011898	DGCR2 (ENSUPAG00010011875)	TSSK1B (ENSUPAG00010011872)	TSSK2 (ENSUPAG00010011870)	ESS2 (ENSUPAG00010011854)	GSC2 (ENSUPAG00010011849)	SLC25A1 (ENSUPAG00010011833)	CLTCL1 (ENSUPAG00010011775)	HIRA (ENSUPAG00010011725) #14	MRPL40 (ENSUPAG00010011716) #15	C22orf39 (ENSUPAG00010011693) #16	UFD1 (ENSUPAG00010011672) #17	CDC45 (ENSUPAG00010011643) #18	CLDN5 (ENSUPAG00010011641) #19	GP1BB (ENSUPAG00010011635) #22	SEPTIN5 (ENSUPAG00010011595) #21	TBX1 (ENSUPAG00010011554) #23	RTL10 (ENSUPAG00010011551)	ENSUPAG00010011513 #24	TXNRD2 (ENSUPAG00010011325) #25	COMT (ENSUPAG00010011294) #26	ARVCF (ENSUPAG00010011258) #27	TANGO2 (ENSUPAG00010011235) #28	DGCR8 (ENSUPAG00010011207) #29	TRMT2A (ENSUPAG00010011153)	ENSUPAG00010011129	ZDHHC8 (ENSUPAG00010011116) #32	ENSUPAG00010011111 #34	RTN4R (ENSUPAG00010011108)	ENSUPAG00010011098 #36
Squirrel	MODERN SPECIES	219	DGCR2 (ENSSTOG00000002774)	TSSK1B (ENSSTOG00000027168)	TSSK2 (ENSSTOG00000027876)	ESS2 (ENSSTOG00000002817)	GSC2 (ENSSTOG00000021301)	SLC25A1 (ENSSTOG00000002825)	CLTCL1 (ENSSTOG00000002838)	HIRA (ENSSTOG00000002864) #14	MRPL40 (ENSSTOG00000002887) #15	C22orf39 (ENSSTOG00000023959) #16	UFD1 (ENSSTOG00000002896) #17	CDC45 (ENSSTOG00000002917) #18	CLDN5 (ENSSTOG00000023943) #19	ENSSTOG00000019936	SEPTIN5 (ENSSTOG00000010725) #21	GP1BB (ENSSTOG00000028299) #22	TBX1 (ENSSTOG00000004505) #23	GNB1L (ENSSTOG00000022761) #24	ENSSTOG00000022331	TXNRD2 (ENSSTOG00000011425) #25	ENSSTOG00000019977	COMT (ENSSTOG00000027573) #26	ARVCF (ENSSTOG00000014869) #27	TANGO2 (ENSSTOG00000014461) #28	DGCR8 (ENSSTOG00000023936) #29	TRMT2A (ENSSTOG00000014487)	ENSSTOG00000026840 #31	ZDHHC8 (ENSSTOG00000021349) #32	ENSSTOG00000023515 #34	RTN4R (ENSSTOG00000021308)	ENSSTOG00000006384 #36
Alpin marmot	MODERN SPECIES	67	ENSMMMG00000002612	DGCR2 (ENSMMMG00000002630)	TSSK1B (ENSMMMG00000002708)	TSSK2 (ENSMMMG00000002712)	ESS2 (ENSMMMG00000002719)	GSC2 (ENSMMMG00000002737)	SLC25A1 (ENSMMMG00000002744)	CLTCL1 (ENSMMMG00000002805)	HIRA (ENSMMMG00000003121) #14	MRPL40 (ENSMMMG00000003198) #15	C22orf39 (ENSMMMG00000003206) #16	UFD1 (ENSMMMG00000003233) #17	CDC45 (ENSMMMG00000003340) #18	CLDN5 (ENSMMMG00000003401) #19	SEPTIN5 (ENSMMMG00000003410) #21	GP1BB (ENSMMMG00000003456) #22	TBX1 (ENSMMMG00000003469) #23	GNB1L (ENSMMMG00000003491) #24	RTL10 (ENSMMMG00000003536)	ENSMMMG00000003551	TXNRD2 (ENSMMMG00000003687) #25	COMT (ENSMMMG00000004274) #26	ENSMMMG00000004301	ARVCF (ENSMMMG00000004311) #27	ENSMMMG00000004324 #27	TANGO2 (ENSMMMG00000004334) #28	DGCR8 (ENSMMMG00000004386) #29	TRMT2A (ENSMMMG00000004427)	ENSMMMG00000004537 #30	RANBP1 (ENSMMMG00000004542) #31	ZDHHC8 (ENSMMMG00000004564) #32
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	17	TSSK1B (ENSSVLG00005009495)	TSSK2 (ENSSVLG00005009517)	ESS2 (ENSSVLG00005009535)	GSC2 (ENSSVLG00005009577)	SLC25A1 (ENSSVLG00005009628)	CLTCL1 (ENSSVLG00005009761)	ENSSVLG00005009831	HIRA (ENSSVLG00005009905) #14	MRPL40 (ENSSVLG00005010046) #15	C22orf39 (ENSSVLG00005010097) #16	ENSSVLG00005010133 #17	CDC45 (ENSSVLG00005010179) #18	CLDN5 (ENSSVLG00005007073) #19	ENSSVLG00005007086	SEPTIN5 (ENSSVLG00005007153) #21	GP1BB (ENSSVLG00005007231) #22	TBX1 (ENSSVLG00005007283) #23	GNB1L (ENSSVLG00005007359) #24	RTL10 (ENSSVLG00005007389)	TXNRD2 (ENSSVLG00005007580) #25	COMT (ENSSVLG00005008169) #26	ARVCF (ENSSVLG00005008262) #27	TANGO2 (ENSSVLG00005008385) #28	DGCR8 (ENSSVLG00005008519) #29	TRMT2A (ENSSVLG00005008593)	RANBP1 (ENSSVLG00005008780) #31	ZDHHC8 (ENSSVLG00005008895) #32	CCDC188 (ENSSVLG00005008983) #34	RTN4R (ENSSVLG00005009047)	ENSSVLG00005009088 #36	ENSSVLG00005009216 #35