Bilateria DUPLICATION Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.b #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.b #22 Vertebrata DUPLICATION Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 425 ENSGT00390000012174 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00940000159245 ENSGT00940000157240 ENSGT00390000011821 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00550000074981 #24 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 219 ENSGT00390000011821 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000003874 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 889 ENSGT00390000003874 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 144 ENSGT00940000160841 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00940000175678 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821 ENSGT00390000003874 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 Amniota ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158589 ENSGT00940000160841 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821 ENSGT00390000003874 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00940000155202.j ENSGT00940000154517 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000166930 ENSGT00940000166107 ENSGT00940000160514 ENSGT00940000155600.b ENSGT00990000203619.A.a Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160841 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00940000154517 ENSGT00530000063528.B ENSGT00390000004304 ENSGT00940000161545 ENSGT00940000160514 ENSGT00990000203619.A.a ENSGT01060000248589.C ENSGT00940000155600.b Theria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000155202.i.b ENSGT00940000154517 ENSGT00530000063528.B ENSGT00390000004304 ENSGT00940000161545 ENSGT00940000160514 ENSGT00990000203619.A.a ENSGT01060000248589.C ENSGT00940000155600.b Eutheria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000163258 ENSGT00940000158193 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000158579 ENSGT00940000155183 ENSGT00940000158193 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000163258 ENSGT00940000158193 Primates ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000163258 ENSGT00940000158193 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163258.j ENSGT00940000164049 ENSGT00940000163527 ENSGT00940000158579 Tarsier MODERN SPECIES 4156 AGPAT3 (ENSTSYG00000013680) #22 TRAPPC10 (ENSTSYG00000009018) #23 PWP2 (ENSTSYG00000009022) #24 GATD3 (ENSTSYG00000013874) #25 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579.l.b.b.a ENSGT00940000163258.j ENSGT00940000158579.l.b.b.b ENSGT00940000163258.i.b Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826.qb ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00910000147401 ENSGT01020000234487 ENSGT00390000003873.v #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000158579.k ENSGT00940000158579.l.a ENSGT00940000163258.i.b Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 417 ENSANAG00000031608 #22 ENSANAG00000019650 NPAS2 (ENSANAG00000029045) ENSANAG00000023888 TBC1D8 (ENSANAG00000003815) ENSANAG00000031938 CNOT11 (ENSANAG00000028092) RNF149 (ENSANAG00000031925) CREG2 (ENSANAG00000036025) Mas night monkey MODERN SPECIES 1376 SLC37A1 (ENSANAG00000028307) PDE9A (ENSANAG00000037833) WDR4 (ENSANAG00000026274) NDUFV3 (ENSANAG00000026013) PKNOX1 (ENSANAG00000022045) CBS (ENSANAG00000032848) ENSANAG00000026034 CRYAA (ENSANAG00000021687) SIK1 (ENSANAG00000038083) HSF2BP (ENSANAG00000037216) RRP1B (ENSANAG00000034889) ENSANAG00000033810 PDXK (ENSANAG00000019464) ENSANAG00000038089 RRP1 (ENSANAG00000037815) ENSANAG00000036034 #22 ENSANAG00000035921 TRAPPC10 (ENSANAG00000032975) #23 PWP2 (ENSANAG00000034845) #24 GATD3 (ENSANAG00000032510) #25 ENSANAG00000031721 DNMT3L (ENSANAG00000027897) AIRE (ENSANAG00000031045) PFKL (ENSANAG00000022126) CFAP410 (ENSANAG00000021390) TRPM2 (ENSANAG00000034661) TSPEAR (ENSANAG00000032724) ENSANAG00000032475 ENSANAG00000028487 ENSANAG00000027667 ENSANAG00000027010 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.qb ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826.pb ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT01020000234487 ENSGT00390000003873.v #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000158579.k ENSGT00940000158579.l.a ENSGT00940000163258.i.b ENSGT00940000163845.c Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196.m ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.qb ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826.pb ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000016927.z ENSGT00390000003873.v #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000158579.k ENSGT00940000158579.l.a ENSGT00940000163258.i.b ENSGT00940000163845.c ENSGT00940000158579.l.b.b.a.b Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 66 PDE9A (ENSSBOG00000027099) WDR4 (ENSSBOG00000026351) NDUFV3 (ENSSBOG00000019466) ENSSBOG00000004329 PKNOX1 (ENSSBOG00000018950) CBS (ENSSBOG00000022215) U2AF1 (ENSSBOG00000027084) CRYAA (ENSSBOG00000026135) SIK1 (ENSSBOG00000033825) HSF2BP (ENSSBOG00000031228) RRP1B (ENSSBOG00000034727) ENSSBOG00000033475 PDXK (ENSSBOG00000023925) ENSSBOG00000021578 RRP1 (ENSSBOG00000034689) AGPAT3 (ENSSBOG00000026342) #22 TRAPPC10 (ENSSBOG00000018376) #23 PWP2 (ENSSBOG00000034554) #24 GATD3 (ENSSBOG00000033759) #25 ICOSLG (ENSSBOG00000031169) DNMT3L (ENSSBOG00000030998) AIRE (ENSSBOG00000027491) PFKL (ENSSBOG00000024155) CFAP410 (ENSSBOG00000022331) TRPM2 (ENSSBOG00000023964) ENSSBOG00000030908 ENSSBOG00000029917 ENSSBOG00000025216 ENSSBOG00000027330 ENSSBOG00000034072 ENSSBOG00000033182 Capuchin MODERN SPECIES 112 ENSCCAG00000033172 PDE9A (ENSCCAG00000001044) WDR4 (ENSCCAG00000022755) ENSCCAG00000022392 PKNOX1 (ENSCCAG00000022902) CBS (ENSCCAG00000032722) U2AF1 (ENSCCAG00000036938) CRYAA (ENSCCAG00000030217) SIK1 (ENSCCAG00000028295) HSF2BP (ENSCCAG00000031814) RRP1B (ENSCCAG00000029384) ENSCCAG00000001912 PDXK (ENSCCAG00000035149) ENSCCAG00000030098 RRP1 (ENSCCAG00000029828) AGPAT3 (ENSCCAG00000035106) #22 ENSCCAG00000022399 TRAPPC10 (ENSCCAG00000028731) #23 PWP2 (ENSCCAG00000034616) #24 GATD3 (ENSCCAG00000023616) #25 ICOSLG (ENSCCAG00000034711) DNMT3L (ENSCCAG00000028251) AIRE (ENSCCAG00000033062) PFKL (ENSCCAG00000023028) CFAP410 (ENSCCAG00000019718) TRPM2 (ENSCCAG00000035480) ENSCCAG00000022693 ENSCCAG00000031995 ENSCCAG00000012157 ENSCCAG00000027045 ENSCCAG00000032996 Marmoset MODERN SPECIES 13 RSPH1 (ENSCJAG00000005333) SLC37A1 (ENSCJAG00000005291) PDE9A (ENSCJAG00000085834) WDR4 (ENSCJAG00000015778) NDUFV3 (ENSCJAG00000015786) PKNOX1 (ENSCJAG00000040086) CBS (ENSCJAG00000015824) U2AF1 (ENSCJAG00000015843) CRYAA (ENSCJAG00000070733) SIK1 (ENSCJAG00000015879) HSF2BP (ENSCJAG00000059885) RRP1B (ENSCJAG00000017077) ENSCJAG00000043205 ENSCJAG00000071745 ENSCJAG00000052744 AGPAT3 (ENSCJAG00000086643) #22 ENSCJAG00000080531 TRAPPC10 (ENSCJAG00000005608) #23 PWP2 (ENSCJAG00000005570) #24 GATD3 (ENSCJAG00000005560) #25 ICOSLG (ENSCJAG00000003576) DNMT3L (ENSCJAG00000087076) AIRE (ENSCJAG00000013748) PFKL (ENSCJAG00000017630) CFAP410 (ENSCJAG00000017611) TRPM2 (ENSCJAG00000073600) LRRC3 (ENSCJAG00000081918) TSPEAR (ENSCJAG00000015329) ENSCJAG00000046358 KRTAP10-3 (ENSCJAG00000077838) ENSCJAG00000041374 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT01000000215029 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00910000147401 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00900000140979.a.a.`b.a.o.a ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579.l.b.b.a ENSGT00940000163258.j Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000012196 ENSGT01000000215029 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a.ge ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.nb ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826.ob ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00910000147401 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00900000140979.a.a.`b.a.o.a ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579.l.b.a ENSGT00940000158579.l.b.b.a.f Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 270 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00910000147958 ENSGT00860000135708 ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.ob ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579.l.b.a ENSGT00940000158579.l.b.b.a.f Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 924 HSF2BP (ENSRBIG00000038854) RRP1B (ENSRBIG00000041689) ENSRBIG00000028564 ENSRBIG00000024778 PDXK (ENSRBIG00000022396) ENSRBIG00000032395 RRP1 (ENSRBIG00000032082) AGPAT3 (ENSRBIG00000029812) #22 TRAPPC10 (ENSRBIG00000029157) #23 PWP2 (ENSRBIG00000034365) #24 GATD3 (ENSRBIG00000040907) #25 ICOSLG (ENSRBIG00000042775) DNMT3L (ENSRBIG00000029101) AIRE (ENSRBIG00000034675) PFKL (ENSRBIG00000024591) CFAP410 (ENSRBIG00000036434) TRPM2 (ENSRBIG00000042457) LRRC3 (ENSRBIG00000013619) ENSRBIG00000013411 KRTAP10-2 (ENSRBIG00000029279) ENSRBIG00000039496 ENSRBIG00000029901 ENSRBIG00000040008 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1362 HSF2BP (ENSRROG00000032823) RRP1B (ENSRROG00000031499) PDXK (ENSRROG00000044416) ENSRROG00000030459 ENSRROG00000042411 CSTB (ENSRROG00000038574) RRP1 (ENSRROG00000039799) AGPAT3 (ENSRROG00000031040) #22 ENSRROG00000032758 TRAPPC10 (ENSRROG00000043895) #23 PWP2 (ENSRROG00000031946) #24 GATD3 (ENSRROG00000034542) #25 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000012196 ENSGT01000000215029 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a.ge ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.nb.a.b 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ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579.l.a ENSGT00940000163845.c Macaca ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01000000215029.c ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a.ge ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00910000147350 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.ob ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826.nb.b ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000158579.l.a ENSGT00940000158579.l.b.b.a.e ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579.l.b.a ENSGT00940000163845.c Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 503 WDR4 (ENSMNEG00000033682) NDUFV3 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ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.ob ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000163845.d ENSGT00940000158579.l.b.b.a.e ENSGT00940000158579.l.b.a ENSGT00940000163258.i.b ENSGT00940000164049.b.a Rhesus MODERN SPECIES 13 SLC37A1 (ENSMMUG00000018085) PDE9A (ENSMMUG00000022107) WDR4 (ENSMMUG00000062729) NDUFV3 (ENSMMUG00000001553) ENSMMUG00000044879 PKNOX1 (ENSMMUG00000009288) CBS (ENSMMUG00000009289) U2AF1 (ENSMMUG00000022769) CRYAA (ENSMMUG00000020271) SIK1 (ENSMMUG00000020050) HSF2BP (ENSMMUG00000022791) RRP1B (ENSMMUG00000000104) PDXK (ENSMMUG00000062457) CSTB (ENSMMUG00000012303) RRP1 (ENSMMUG00000012304) AGPAT3 (ENSMMUG00000045179) #22 TRAPPC10 (ENSMMUG00000005269) #23 PWP2 (ENSMMUG00000005271) #24 GATD3 (ENSMMUG00000005272) #25 ICOSLG (ENSMMUG00000010647) DNMT3L (ENSMMUG00000010648) AIRE (ENSMMUG00000004168) PFKL (ENSMMUG00000004173) CFAP410 (ENSMMUG00000049578) TRPM2 (ENSMMUG00000004175) LRRC3 (ENSMMUG00000049755) KRTAP10-10 (ENSMMUG00000022559) ENSMMUG00000022558 ENSMMUG00000030497 KRTAP10-8 (ENSMMUG00000048049) KRTAP10-9 (ENSMMUG00000043221) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 13 ENSMFAG00000051957 PKNOX1 (ENSMFAG00000039213) ENSMFAG00000063594 CBS (ENSMFAG00000038794) ENSMFAG00000032317 CRYAA (ENSMFAG00000036551) SIK1 (ENSMFAG00000032324) ENSMFAG00000063691 HSF2BP (ENSMFAG00000041607) RRP1B (ENSMFAG00000039152) ENSMFAG00000056006 PDXK (ENSMFAG00000042485) CSTB (ENSMFAG00000061351) RRP1 (ENSMFAG00000003202) ENSMFAG00000057571 ENSMFAG00000053688 #22 TRAPPC10 (ENSMFAG00000041704) #23 PWP2 (ENSMFAG00000044448) #24 GATD3 (ENSMFAG00000046334) #25 ICOSLG (ENSMFAG00000040533) DNMT3L (ENSMFAG00000046145) AIRE (ENSMFAG00000001488) PFKL (ENSMFAG00000037062) CFAP410 (ENSMFAG00000049270) TRPM2 (ENSMFAG00000001773) LRRC3 (ENSMFAG00000028969) KRTAP10-4 (ENSMFAG00000031679) KRTAP10-9 (ENSMFAG00000053657) KRTAP10-7 (ENSMFAG00000051280) TSPEAR (ENSMFAG00000001348) UBE2G2 (ENSMFAG00000057431) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT01000000215029.c ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a.ge ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00910000147350 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826.ob ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00910000147401 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00900000140979.a.a.`b.a.o.a ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579.l.a ENSGT00940000158579.l.b.a Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT01000000215029.c ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a.ge ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00910000147350 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00860000135708 ENSGT00940000154826.ob ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00910000147401 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00900000140979.a.a.`b.a.o.a ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579.l.b.a ENSGT00940000158579.l.b.b.a.f Drill MODERN SPECIES 1420 WDR4 (ENSMLEG00000042177) NDUFV3 (ENSMLEG00000042871) ERVH48-1 (ENSMLEG00000001600) PKNOX1 (ENSMLEG00000037117) CBS (ENSMLEG00000041980) ENSMLEG00000029446 CRYAA (ENSMLEG00000039416) SIK1 (ENSMLEG00000030826) ENSMLEG00000034490 HSF2BP (ENSMLEG00000042323) RRP1B 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ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000163527.a ENSGT00940000158579 ENSGT00940000163258 ENSGT00940000163441.f.a.a.a ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000163527.a ENSGT00940000158579 ENSGT00940000163258 ENSGT00940000163441.f.a.a.a ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 860 ENSPCOG00000017034 #22 TRAPPC10 (ENSPCOG00000023846) #23 PWP2 (ENSPCOG00000012856) #24 GATD3 (ENSPCOG00000007721) #25 ICOSLG 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SPECIES 2 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000155183 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j ENSGT00390000004977 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 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ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a.db #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 443 RSPH1 (ENSUPAG00010003495) SLC37A1 (ENSUPAG00010003472) PDE9A (ENSUPAG00010003388) WDR4 (ENSUPAG00010003363) ENSUPAG00010003358 PKNOX1 (ENSUPAG00010003344) CBS (ENSUPAG00010003327) U2AF1 (ENSUPAG00010003308) CRYAA (ENSUPAG00010003295) SIK1 (ENSUPAG00010003268) HSF2BP (ENSUPAG00010003260) RRP1B (ENSUPAG00010003249) PDXK (ENSUPAG00010003236) ENSUPAG00010003225 RRP1 (ENSUPAG00010003195) AGPAT3 (ENSUPAG00010003091) #22 TRAPPC10 (ENSUPAG00010003060) #23 PWP2 (ENSUPAG00010003026) #24 GATD3 (ENSUPAG00010003022) #25 ICOSLG (ENSUPAG00010003013) DNMT3L (ENSUPAG00010003002) AIRE (ENSUPAG00010002765) PFKL (ENSUPAG00010002724) CFAP410 (ENSUPAG00010002705) TRPM2 (ENSUPAG00010002652) 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(ENSSVLG00005024913) ENSSVLG00005024890 ENSSVLG00005024861 HSF2BP (ENSSVLG00005024842) ENSSVLG00005024819 PDXK (ENSSVLG00005024785) CSTB (ENSSVLG00005024758) RRP1 (ENSSVLG00005024724) AGPAT3 (ENSSVLG00005024678) #22 TRAPPC10 (ENSSVLG00005024638) #23 PWP2 (ENSSVLG00005024557) #24 GATD3 (ENSSVLG00005024474) #25 ICOSLG (ENSSVLG00005024369) ENSSVLG00005024326 AIRE (ENSSVLG00005023997) PFKL (ENSSVLG00005023925) CFAP410 (ENSSVLG00005023882) TRPM2 (ENSSVLG00005023598) LRRC3 (ENSSVLG00005023556) ENSSVLG00005023369 ENSSVLG00005023080 ENSSVLG00005022707 ENSSVLG00005022624 TSPEAR (ENSSVLG00005022529) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j ENSGT00940000158193 ENSGT00940000155183 ENSGT00510000047718 ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00530000064267 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00940000159548 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000155686.n.b Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.b.j ENSGT00940000158193 ENSGT00940000155183 ENSGT00510000047718 ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00530000064267 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00940000159548 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000155686.n.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000162185 ENSGT00950000183022.b ENSGT00940000158212.B ENSGT00390000007989 ENSGT00940000155992 ENSGT00390000015709 ENSGT01090000259987.a.a.a ENSGT00390000004977 ENSGT00950000182895.a.a.a.b.f ENSGT00940000158193 ENSGT00940000155183 ENSGT00510000047718 ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00530000064267 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00940000159548 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000155686.n.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 114 SLX9 (ENSCLAG00000015540) ITGB2 (ENSCLAG00000011530) PTTG1IP (ENSCLAG00000008686) ENSCLAG00000006914 UBE2G2 (ENSCLAG00000006675) ENSCLAG00000006283 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(ENSCPOG00000019868) PFKL (ENSCPOG00000019438) CFAP410 (ENSCPOG00000009611) TRPM2 (ENSCPOG00000023512) LRRC3 (ENSCPOG00000030436) PCP4 (ENSCPOG00000039173) DSCAM (ENSCPOG00000005367) BACE2 (ENSCPOG00000007403) ENSCPOG00000025373 ENSCPOG00000013108 ENSCPOG00000021489 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 11 SLX9 (ENSHGLG00000045493) ITGB2 (ENSHGLG00000013472) ENSHGLG00000049629 PTTG1IP (ENSHGLG00000033185) ENSHGLG00000037860 ENSHGLG00000009258 ENSHGLG00000014199 ENSHGLG00000005505 ENSHGLG00000043957 ENSHGLG00000038544 ENSHGLG00000007283 ENSHGLG00000015985 ENSHGLG00000046004 CSTB (ENSHGLG00000047009) RRP1 (ENSHGLG00000050109) AGPAT3 (ENSHGLG00000048529) #22 TRAPPC10 (ENSHGLG00000013176) #23 PWP2 (ENSHGLG00000017401) #24 ENSHGLG00000018104 #25 ENSHGLG00000013877 ENSHGLG00000009448 AIRE (ENSHGLG00000016716) PFKL (ENSHGLG00000017234) ENSHGLG00000016027 TRPM2 (ENSHGLG00000018785) ENSHGLG00000042683 PCP4 (ENSHGLG00000043480) ENSHGLG00000005193 ENSHGLG00000008616 ENSHGLG00000006993 ENSHGLG00000041834 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000155183 ENSGT00940000161526.b ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000155183 ENSGT00940000161526.b ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j Muroidea ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000155183 ENSGT00940000161526.b ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989.t ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000155183.e ENSGT00940000161526.b ENSGT00940000155183.f ENSGT00940000158193 Murinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505.x ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989.t ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01050000248522 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000155183.e ENSGT00940000161526.b ENSGT00940000155183.f ENSGT00940000158193 Mus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183216.d.j.b.a ENSGT00940000153523.b.b ENSGT00950000183216.d.j.b.b ENSGT00940000162084 ENSGT00940000159972 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000162117 ENSGT00940000162852.a ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000158035 ENSGT00940000154227.b ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01050000248522 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000161526.b.r.b.b ENSGT00940000155183.e.c ENSGT00940000155183.f.a ENSGT00940000155183.e.d.a ENSGT00510000047718 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183216.d.j.b.a ENSGT00940000153523.b.b ENSGT00950000183216.d.j.b.b ENSGT00940000162084 ENSGT00940000159972 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000162117 ENSGT00940000162852.a ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000158035 ENSGT00940000154227.b ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01050000248522 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000155183.e.c.b.a ENSGT00940000155183.e.c.b.b.a ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j Mus_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183216.d.j.b.a ENSGT00940000153523.b.b ENSGT00950000183216.d.j.b.b ENSGT00940000162084 ENSGT00940000159972 ENSGT00390000003207 ENSGT00940000162117 ENSGT00940000162852.a ENSGT01030000234635.a.a.a.b ENSGT00940000158035 ENSGT00940000154227.b ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01050000248522 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j ENSGT00390000004977 ENSGT01090000259987.a.a.a.c Mouse MODERN SPECIES 1 Or7a42 (ENSMUSG00000094080) Or7a38 (ENSMUSG00000094673) Or7a39 (ENSMUSG00000062873) Or7c70 (ENSMUSG00000051190) Slc1a6 (ENSMUSG00000005357) Ccdc105 (ENSMUSG00000078442) Casp14 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Hamster MODERN SPECIES 641 Tmprss3 (ENSMAUG00000020969) Ubash3a (ENSMAUG00000019578) Rsph1 (ENSMAUG00000014285) Slc37a1 (ENSMAUG00000021076) Pde9a (ENSMAUG00000001943) Wdr4 (ENSMAUG00000020696) Ndufv3 (ENSMAUG00000020188) Pknox1 (ENSMAUG00000015669) Cbs (ENSMAUG00000020960) U2af1 (ENSMAUG00000020528) Cryaa (ENSMAUG00000017095) Sik1 (ENSMAUG00000018473) Hsf2bp (ENSMAUG00000018607) Rrp1b (ENSMAUG00000021508) Rrp1 (ENSMAUG00000017653) Agpat3 (ENSMAUG00000019017) #22 Trappc10 (ENSMAUG00000021971) #23 Pwp2 (ENSMAUG00000020265) #24 Icosl (ENSMAUG00000019140) Dnmt3l (ENSMAUG00000019680) Aire (ENSMAUG00000021943) Pfkl (ENSMAUG00000017741) Cfap410 (ENSMAUG00000018378) Trpm2 (ENSMAUG00000005011) Lrrc3 (ENSMAUG00000021907) Tspear (ENSMAUG00000011883) ENSMAUG00000012939 ENSMAUG00000007884 ENSMAUG00000021981 ENSMAUG00000002462 ENSMAUG00000021040 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 204 ENSCGRG00001003985 ENSCGRG00001010889 ENSCGRG00001019133 ENSCGRG00001016759 ENSCGRG00001005047 ENSCGRG00001023882 ENSCGRG00001021534 Cstb (ENSCGRG00001023703) Rrp1 (ENSCGRG00001011920) Agpat3 (ENSCGRG00001023999) #22 Trappc10 (ENSCGRG00001019791) #23 Pwp2 (ENSCGRG00001020074) #24 Gatd3a (ENSCGRG00001019921) #25 Icosl (ENSCGRG00001009599) Dnmt3l (ENSCGRG00001016841) Aire (ENSCGRG00001021441) Pfkl (ENSCGRG00001015753) Cfap410 (ENSCGRG00001007084) Trpm2 (ENSCGRG00001014379) Lrrc3 (ENSCGRG00001011603) Tspear (ENSCGRG00001017931) ENSCGRG00001013139 ENSCGRG00001017382 Gm36176 (ENSCGRG00001022992) ENSCGRG00001000038 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 557 Rsph1 (ENSNGAG00000005022) Slc37a1 (ENSNGAG00000022440) Pde9a (ENSNGAG00000014370) Wdr4 (ENSNGAG00000017117) Ndufv3 (ENSNGAG00000011220) Pknox1 (ENSNGAG00000015912) Cbs (ENSNGAG00000011354) U2af1 (ENSNGAG00000021641) Cryaa (ENSNGAG00000024156) Sik1 (ENSNGAG00000015397) Hsf2bp (ENSNGAG00000002647) Rrp1b (ENSNGAG00000021073) Pdxk (ENSNGAG00000011007) Cstb (ENSNGAG00000001985) ENSNGAG00000022344 Agpat3 (ENSNGAG00000023781) #22 ENSNGAG00000020131 #23 Pwp2 (ENSNGAG00000021106) #24 Gatd3a (ENSNGAG00000023649) #25 ENSNGAG00000007536 Dnmt3l (ENSNGAG00000004497) Aire (ENSNGAG00000006411) Pfkl (ENSNGAG00000023632) Cfap410 (ENSNGAG00000008743) Trpm2 (ENSNGAG00000015763) Lrrc3 (ENSNGAG00000024059) Tspear (ENSNGAG00000022570) ENSNGAG00000012871 ENSNGAG00000023342 ENSNGAG00000000805 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 54 Slc37a1 (ENSJJAG00000009176) Pde9a (ENSJJAG00000022814) Wdr4 (ENSJJAG00000016232) ENSJJAG00000012928 ENSJJAG00000022210 Pknox1 (ENSJJAG00000003326) Cbs (ENSJJAG00000019675) U2af1 (ENSJJAG00000000485) Cryaa (ENSJJAG00000008890) Sik1 (ENSJJAG00000021978) Hsf2bp (ENSJJAG00000011558) Rrp1b (ENSJJAG00000021279) Pdxk (ENSJJAG00000016609) ENSJJAG00000019836 Rrp1 (ENSJJAG00000018886) Agpat3 (ENSJJAG00000019770) #22 Lbh (ENSJJAG00000023694) Lclat1 (ENSJJAG00000015441) ##22 Capn13 (ENSJJAG00000015680) Galnt14 (ENSJJAG00000020390) Ehd3 (ENSJJAG00000013415) Xdh (ENSJJAG00000017980) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 Pika MODERN SPECIES 2592 AGPAT3 (ENSOPRG00000013786) #22 Tree shrew MODERN SPECIES 8189 AGPAT3 (ENSTBEG00000011207) #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000163845 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j ENSGT00390000004977 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT01020000234487 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000163845 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j ENSGT00390000004977 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000163845 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j ENSGT00390000004977 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00940000163441.f.b.a.a ENSGT00940000155183 ENSGT00940000158193 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00940000163441.f.b.a.a.b ENSGT00940000163441.f.b.a.a.a ENSGT00940000155183.a Canidae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 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(ENSPLOG00000018848) PFKL (ENSPLOG00000018958) CFAP410 (ENSPLOG00000019187) TRPM2 (ENSPLOG00000019220) LRRC3 (ENSPLOG00000019285) leopard MODERN SPECIES 148 RSPH1 (ENSPPRG00000008318) SLC37A1 (ENSPPRG00000008368) PDE9A (ENSPPRG00000008728) WDR4 (ENSPPRG00000008824) ENSPPRG00000008831 PKNOX1 (ENSPPRG00000008876) CBS (ENSPPRG00000009520) U2AF1 (ENSPPRG00000009721) CRYAA (ENSPPRG00000009838) SIK1 (ENSPPRG00000010102) HSF2BP (ENSPPRG00000010297) RRP1B (ENSPPRG00000010356) PDXK (ENSPPRG00000010569) CSTB (ENSPPRG00000010619) RRP1 (ENSPPRG00000010656) AGPAT3 (ENSPPRG00000010943) #22 TRAPPC10 (ENSPPRG00000010959) #23 PWP2 (ENSPPRG00000011088) #24 GATD3 (ENSPPRG00000011216) #25 ICOSLG (ENSPPRG00000011258) DNMT3L (ENSPPRG00000011340) AIRE (ENSPPRG00000011376) PFKL (ENSPPRG00000011485) CFAP410 (ENSPPRG00000011592) TRPM2 (ENSPPRG00000011778) LRRC3 (ENSPPRG00000012330) TSPEAR (ENSPPRG00000011892) Cat MODERN SPECIES 240 RSPH1 (ENSFCAG00000012707) SLC37A1 (ENSFCAG00000012708) PDE9A 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ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000163845 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j ENSGT00390000004977 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163441.f.b.b ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j Megabat MODERN SPECIES 1683 AGPAT3 (ENSPVAG00000002310) #22 TRAPPC10 (ENSPVAG00000002311) #23 PWP2 (ENSPVAG00000002312) #24 GATD3 (ENSPVAG00000002313) #25 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163441.f.b.b ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j Microbat MODERN SPECIES 1228 ENSMLUG00000030154 ENSMLUG00000022457 RRP1 (ENSMLUG00000017788) AGPAT3 (ENSMLUG00000004785) #22 TRAPPC10 (ENSMLUG00000004810) #23 PWP2 (ENSMLUG00000004823) #24 GATD3 (ENSMLUG00000004837) #25 DNMT3L (ENSMLUG00000013954) ENSMLUG00000010968 PFKL (ENSMLUG00000010992) CFAP410 (ENSMLUG00000011059) TRPM2 (ENSMLUG00000011096) LRRC3 (ENSMLUG00000011171) TSPEAR (ENSMLUG00000011225) ENSMLUG00000017019 ENSMLUG00000010897 ENSMLUG00000011524 UBE2G2 (ENSMLUG00000011264) ENSMLUG00000028601 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 11 RSPH1 (ENSRFEG00010004627) SLC37A1 (ENSRFEG00010004677) PDE9A (ENSRFEG00010004823) WDR4 (ENSRFEG00010004938) NDUFV3 (ENSRFEG00010004952) PKNOX1 (ENSRFEG00010000147) CBS (ENSRFEG00010000170) U2AF1 (ENSRFEG00010000191) CRYAA (ENSRFEG00010000206) SIK1 (ENSRFEG00010000222) HSF2BP (ENSRFEG00010000255) RRP1B (ENSRFEG00010000288) PDXK (ENSRFEG00010000337) CSTB (ENSRFEG00010000380) RRP1 (ENSRFEG00010000411) AGPAT3 (ENSRFEG00010000500) #22 TRAPPC10 (ENSRFEG00010000559) #23 PWP2 (ENSRFEG00010000602) #24 GATD3 (ENSRFEG00010000628) #25 ICOSLG (ENSRFEG00010000645) DNMT3L (ENSRFEG00010000669) AIRE (ENSRFEG00010000735) PFKL (ENSRFEG00010000776) CFAP410 (ENSRFEG00010000827) TRPM2 (ENSRFEG00010000872) LRRC3 (ENSRFEG00010000940) TSPEAR (ENSRFEG00010000980) ENSRFEG00010001026 ENSRFEG00010001114 ENSRFEG00010001158 UBE2G2 (ENSRFEG00010001187) Equus ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027.h ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00510000047027.g ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.xb ENSGT00940000154826.yb ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00940000163845 ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b.j Horse MODERN SPECIES 18 PDE9A (ENSECAG00000017519) WDR4 (ENSECAG00000019212) NDUFV3 (ENSECAG00000003055) PKNOX1 (ENSECAG00000010284) ENSECAG00000046444 ENSECAG00000022794 U2AF1 (ENSECAG00000015558) ENSECAG00000021749 SIK1 (ENSECAG00000006288) HSF2BP (ENSECAG00000017282) RRP1B (ENSECAG00000018018) PDXK (ENSECAG00000022301) ENSECAG00000034000 ENSECAG00000032188 RRP1 (ENSECAG00000015703) AGPAT3 (ENSECAG00000022861) #22 TRAPPC10 (ENSECAG00000015123) #23 PWP2 (ENSECAG00000006090) #24 ENSECAG00000051827 DNMT3L (ENSECAG00000009690) AIRE (ENSECAG00000012924) PFKL (ENSECAG00000017863) TRPM2 (ENSECAG00000023430) TSPEAR (ENSECAG00000008057) LRRC3 (ENSECAG00000005082) TSPEAR (ENSECAG00000051756) ENSECAG00000029396 ENSECAG00000051909 ENSECAG00000051879 ENSECAG00000015117 ENSECAG00000047135 Donkey MODERN SPECIES 9 WDR4 (ENSEASG00005003766) NDUFV3 (ENSEASG00005003763) 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ENSGT00940000163441.f.b.b.c.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES ENSBIXG00005021172 WDR4 (ENSBIXG00005007357) ENSBIXG00005003567 ENSBIXG00005021053 PKNOX1 (ENSBIXG00005021038) CBS (ENSBIXG00005020947) U2AF1 (ENSBIXG00005020822) CRYAA (ENSBIXG00005020745) ENSBIXG00005020712 SIK1 (ENSBIXG00005003495) HSF2BP (ENSBIXG00005020613) RRP1B (ENSBIXG00005020578) PDXK (ENSBIXG00005020496) ENSBIXG00005020433 RRP1 (ENSBIXG00005020372) AGPAT3 (ENSBIXG00005020333) #22 TRAPPC10 (ENSBIXG00005003407) #23 PWP2 (ENSBIXG00005003368) #24 ENSBIXG00005020156 #25 ICOSLG (ENSBIXG00005003278) DNMT3L (ENSBIXG00005003270) AIRE (ENSBIXG00005019950) ENSBIXG00005019827 PFKL (ENSBIXG00005000029) CFAP410 (ENSBIXG00005019772) TRPM2 (ENSBIXG00005003229) LRRC3 (ENSBIXG00005019626) TSPEAR (ENSBIXG00005006878) ENSBIXG00005019546 ENSBIXG00005019524 ENSBIXG00005019504 Cow MODERN SPECIES SLC37A1 (ENSBTAG00000021286) PDE9A (ENSBTAG00000021899) WDR4 (ENSBTAG00000021490) NDUFV3 (ENSBTAG00000021491) PKNOX1 (ENSBTAG00000014153) CBS 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#22 TRAPPC10 (ENSMMSG00000011550) #23 PWP2 (ENSMMSG00000011700) #24 GATD3 (ENSMMSG00000011811) #25 DNMT3L (ENSMMSG00000011908) ENSMMSG00000012064 AIRE (ENSMMSG00000012088) PFKL (ENSMMSG00000012144) CFAP410 (ENSMMSG00000012203) TRPM2 (ENSMMSG00000012263) LRRC3 (ENSMMSG00000012592) TSPEAR (ENSMMSG00000012606) ENSMMSG00000012645 ENSMMSG00000012659 ENSMMSG00000012695 ENSMMSG00000012713 Yarkand deer MODERN SPECIES 10 RSPH1 (ENSCHYG00000008397) SLC37A1 (ENSCHYG00000008438) PDE9A (ENSCHYG00000008513) WDR4 (ENSCHYG00000008871) NDUFV3 (ENSCHYG00000008999) PKNOX1 (ENSCHYG00000009096) CBS (ENSCHYG00000009317) ENSCHYG00000009600 CRYAA (ENSCHYG00000009789) SIK1 (ENSCHYG00000009832) HSF2BP (ENSCHYG00000009993) RRP1B (ENSCHYG00000010070) PDXK (ENSCHYG00000010189) ENSCHYG00000010380 RRP1 (ENSCHYG00000010447) AGPAT3 (ENSCHYG00000010566) #22 TRAPPC10 (ENSCHYG00000010651) #23 PWP2 (ENSCHYG00000010992) #24 GATD3 (ENSCHYG00000011221) #25 ENSCHYG00000011375 DNMT3L (ENSCHYG00000011454) AIRE (ENSCHYG00000011590) ENSCHYG00000011682 PFKL (ENSCHYG00000011737) ENSCHYG00000012006 TRPM2 (ENSCHYG00000012131) LRRC3 (ENSCHYG00000012591) TSPEAR (ENSCHYG00000012613) ENSCHYG00000012689 ENSCHYG00000012727 ENSCHYG00000012743 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163441.f.a.a.b ENSGT00940000163441.f.a.b.c.a.a ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.a.a.b.f Arabian camel MODERN SPECIES SLC37A1 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ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.hb ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000163845 ENSGT00940000158579 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.hb ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b ENSGT00390000004977 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.hb ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00940000161104 ENSGT00940000159292 ENSGT00390000018807 ENSGT00940000156404 ENSGT00940000154360.A.b ENSGT00510000047718 ENSGT00940000158579 ENSGT00940000158193 ENSGT00950000182895.a.b ENSGT00390000004977 Elephant MODERN SPECIES 513 SLC37A1 (ENSLAFG00000005842) PDE9A (ENSLAFG00000028539) WDR4 (ENSLAFG00000021675) NDUFV3 (ENSLAFG00000002098) PKNOX1 (ENSLAFG00000011377) CBS (ENSLAFG00000009950) U2AF1 (ENSLAFG00000011460) CRYAA (ENSLAFG00000017392) ENSLAFG00000031722 SIK1 (ENSLAFG00000000960) HSF2BP (ENSLAFG00000000763) RRP1B (ENSLAFG00000000766) PDXK (ENSLAFG00000010740) CSTB (ENSLAFG00000002664) RRP1 (ENSLAFG00000022901) AGPAT3 (ENSLAFG00000018615) #22 TRAPPC10 (ENSLAFG00000003863) #23 PWP2 (ENSLAFG00000003871) #24 GATD3 (ENSLAFG00000003876) #25 ENSLAFG00000016007 DNMT3L (ENSLAFG00000031621) AIRE (ENSLAFG00000008582) PFKL (ENSLAFG00000021471) CFAP410 (ENSLAFG00000000609) TRPM2 (ENSLAFG00000007900) LRRC3 (ENSLAFG00000005181) TSPEAR (ENSLAFG00000012959) ENSLAFG00000020961 ENSLAFG00000012968 ENSLAFG00000003471 ENSLAFG00000032616 Hyrax MODERN SPECIES 9053 AGPAT3 (ENSPCAG00000015260) #22 Tenrec MODERN SPECIES 5135 AGPAT3 (ENSETEG00000000898) #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1177 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 Armadillo MODERN SPECIES 4100 ENSDNOG00000038285 #22 TRAPPC10 (ENSDNOG00000012294) #23 PWP2 (ENSDNOG00000012128) #24 GATD3 (ENSDNOG00000024270) #25 Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160841 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00530000063946.a ENSGT00940000155551 ENSGT00940000156294 ENSGT00940000153577.A ENSGT00510000046499 ENSGT00940000159255 ENSGT00940000159602 ENSGT00940000159870 ENSGT00940000154497.A ENSGT00390000010669 ENSGT01100000263796 ENSGT00940000154497.B ENSGT00940000161679 ENSGT00390000014606 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160841 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a.a #22 ENSGT00500000044950 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00950000183107.a.b.a ENSGT00950000182802.D ENSGT00390000008610.a.b.a.a.b ENSGT00560000077266.b ENSGT00940000159847 ENSGT00940000160964 ENSGT00530000064267 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00940000159548 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000155207.a.b ENSGT00940000159908 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000160841 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826 ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a.a #22 ENSGT00500000044950 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00950000183107.a.b.a ENSGT00390000008610.a.b.a.a.b ENSGT00560000077266.b ENSGT00940000159847 ENSGT00940000160964 ENSGT00530000064267 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00940000159548 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000155207.a.b ENSGT00940000159908 ENSGT00870000136508.c.b Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000160841 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159.a ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821.a ENSGT00390000003874 ENSGT00940000154826.bc ENSGT00390000011821.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a.a #22 ENSGT00500000044950 ENSGT00940000156253 ENSGT00940000158923 ENSGT00950000183107.a.b.a ENSGT00390000008610.a.b.a.a.b ENSGT00560000077266.b ENSGT00940000159847 ENSGT00940000160964.i ENSGT00530000064267 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00940000159548 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000155207.a.b ENSGT00940000159908 ENSGT00870000136508.c.b Common wonbat MODERN SPECIES 1120 PDE9A (ENSVURG00010023297) WDR4 (ENSVURG00010023283) ENSVURG00010023279 PKNOX1 (ENSVURG00010023276) CBS (ENSVURG00010023271) U2AF1 (ENSVURG00010023269) ENSVURG00010023267 SIK1 (ENSVURG00010023263) ENSVURG00010023260 HSF2BP (ENSVURG00010023259) RRP1B (ENSVURG00010023255) ENSVURG00010023251 PDXK (ENSVURG00010023250) ENSVURG00010023249 ENSVURG00010023247 ENSVURG00010023246 #22 PSMG1 (ENSVURG00010023242) GRIK1 (ENSVURG00010022936) BACH1 (ENSVURG00010022808) ENSVURG00010022806 BRWD1 (ENSVURG00010020972) GET1 (ENSVURG00010020815) LCA5L (ENSVURG00010020810) SH3BGR (ENSVURG00010020806) ENSVURG00010020804 ENSVURG00010020802 PCP4 (ENSVURG00010020798) DSCAM (ENSVURG00010020750) ENSVURG00010020735 BACE2 (ENSVURG00010020728) FAM3B (ENSVURG00010020723) koala MODERN SPECIES 249 SLC37A1 (ENSPCIG00000003787) PDE9A (ENSPCIG00000002353) WDR4 (ENSPCIG00000002223) ENSPCIG00000002205 PKNOX1 (ENSPCIG00000007865) CBS (ENSPCIG00000028095) U2AF1 (ENSPCIG00000028098) ENSPCIG00000028100 ENSPCIG00000036347 SIK1 (ENSPCIG00000008860) HSF2BP (ENSPCIG00000015503) RRP1B (ENSPCIG00000015513) PDXK (ENSPCIG00000015519) ENSPCIG00000015522 ENSPCIG00000015523 ENSPCIG00000028254 #22 PSMG1 (ENSPCIG00000028255) GRIK1 (ENSPCIG00000028259) BACH1 (ENSPCIG00000028263) BRWD1 (ENSPCIG00000028266) ENSPCIG00000033358 ENSPCIG00000028274 LCA5L (ENSPCIG00000028277) SH3BGR (ENSPCIG00000028279) ENSPCIG00000014296 ENSPCIG00000014298 PCP4 (ENSPCIG00000028281) DSCAM (ENSPCIG00000028291) Tasmanian devil MODERN SPECIES 2 UBASH3A (ENSSHAG00000015152) SLC37A1 (ENSSHAG00000015601) PDE9A (ENSSHAG00000016254) WDR4 (ENSSHAG00000016450) ENSSHAG00000026320 PKNOX1 (ENSSHAG00000016846) CBS (ENSSHAG00000017100) U2AF1 (ENSSHAG00000017185) CRYAA (ENSSHAG00000017366) SIK1 (ENSSHAG00000017494) HSF2BP (ENSSHAG00000017635) RRP1B (ENSSHAG00000017789) PDXK (ENSSHAG00000017888) CSTB (ENSSHAG00000025634) ENSSHAG00000010304 ENSSHAG00000008796 #22 ENSSHAG00000008206 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(ENSSPUG00000003087) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160841 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027.n ENSGT00510000047027.m ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000011821 ENSGT00390000003874 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 ENSGT00940000161590 ENSGT00940000162228 ENSGT00520000055625.a ENSGT00940000155202.j ENSGT00940000154517 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000166930 ENSGT00940000166107 ENSGT00940000160514 ENSGT00940000155600.b ENSGT00990000203619.A.a ENSGT01060000248589.C Archosauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160841 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00510000047027.n ENSGT00510000047027.m ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00940000160159 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ENSLLEG00000002114 ENSLLEG00000002089 ENSLLEG00000002074 ENSLLEG00000002050 ENSLLEG00000001953 Frog MODERN SPECIES 2 timmdc1 (ENSXETG00000041609) ENSXETG00000041110 ENSXETG00000042310 ENSXETG00000041442 ENSXETG00000045526 icoslg (ENSXETG00000047833) ENSXETG00000045493 #25 u2af1 (ENSXETG00000040592) cryaa (ENSXETG00000020802) ENSXETG00000044072 ENSXETG00000045504 ENSXETG00000044642 hsf2bp (ENSXETG00000045215) rrp1b (ENSXETG00000013683) pdxk (ENSXETG00000038974) agpat3 (ENSXETG00000044392) #22 trappc10 (ENSXETG00000018000) #23 pwp2 (ENSXETG00000047683) #24 ENSXETG00000044125 ENSXETG00000044998 XB5894678 [provisional:btnl10] (ENSXETG00000046927) vtcn1 (ENSXETG00000039560) ENSXETG00000041646 ENSXETG00000018007 ENSXETG00000045978 fstl1 (ENSXETG00000042356) lrrc58 (ENSXETG00000045906) gpr156 (ENSXETG00000035001) pla1a (ENSXETG00000045043) gsk3b (ENSXETG00000047929) ENSXETG00000048690 Coelacanth MODERN SPECIES 359 PDXK (ENSLACG00000022240) AGPAT3 (ENSLACG00000017316) #22 SIK1 (ENSLACG00000017075) CRYAA (ENSLACG00000016822) TRAPPC10 (ENSLACG00000016449) #23 PRDM15 (ENSLACG00000016206) zgc:112083 (ENSLACG00000016085) RIPK4 (ENSLACG00000015865) TMPRSS2 (ENSLACG00000015538) ENSLACG00000015439 FAM3B (ENSLACG00000015233) BACE2 (ENSLACG00000015003) ENSLACG00000013522 DSCAM (ENSLACG00000005272) PCP4 (ENSLACG00000022631) ENSLACG00000001489 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT00390000011821 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00510000047027 ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000003874 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 ENSGT00390000003706.a.a #25 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 261 ENSGT00990000204624 ENSGT00530000063970.e ENSGT00530000063970.f ENSGT00940000164706 ENSGT01030000235355 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00510000047027 ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000003874 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00520000055635.c.a.a.b ENSGT00940000161118 ENSGT00390000003024 ENSGT00940000164706.b ENSGT00990000204624 ENSGT00530000063970.e ENSGT00530000063970.f ENSGT00940000164706.a ENSGT01030000235355 ENSGT00950000183152.B.c.a ENSGT00510000047027.c ENSGT00940000160159 ENSGT00940000154989 ENSGT00390000008490 ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 328 ENSGT00390000011821 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000008902.kb ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00940000158589.b.a ENSGT00940000159393 ENSGT00940000159775.d ENSGT00390000016547 ENSGT00940000158449 ENSGT00890000139463.b.b.b.a ENSGT00390000003874.a.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000003873 #23 ENSGT00550000074981 #24 Asian bonytongue MODERN SPECIES 5 ENSSFOG00015000387 ENSSFOG00015025471 ENSSFOG00015000478 cpox (ENSSFOG00015000500) prrg1 (ENSSFOG00015024994) ENSSFOG00015000545 ENSSFOG00015025496 ENSSFOG00015003932 PDE9A (ENSSFOG00015024742) wdr4 (ENSSFOG00015025663) si:ch211-140m22.7 (ENSSFOG00015003867) ENSSFOG00015032139 pknox1.1 (ENSSFOG00015003790) ENSSFOG00015003689 pdxkb (ENSSFOG00015003619) agpat3 (ENSSFOG00015027195) #22 TRAPPC10 (ENSSFOG00015003451) #23 pwp2h (ENSSFOG00015003316) #24 ENSSFOG00015028038 ENSSFOG00015003266 zgc:172295 (ENSSFOG00015003129) FAM124A (ENSSFOG00015003098) serpine3 (ENSSFOG00015003064) ints6 (ENSSFOG00015002988) wdfy2 (ENSSFOG00015002927) dhrs12 (ENSSFOG00015002871) ENSSFOG00015002862 ATP7B (ENSSFOG00015002792) RUBCNL (ENSSFOG00015002750) LRCH1 (ENSSFOG00015002580) ENSSFOG00015028179 P. kingsleyae MODERN SPECIES 467 gjb8 (ENSPKIG00000003687) gja3 (ENSPKIG00000003667) ZMYM2 (ENSPKIG00000003622) pspc1 (ENSPKIG00000003578) mphosph8 (ENSPKIG00000003488) ENSPKIG00000003454 ENSPKIG00000003422 PDE9A (ENSPKIG00000003345) wdr4 (ENSPKIG00000003403) ENSPKIG00000003314 ENSPKIG00000003299 pknox1.1 (ENSPKIG00000003263) TMPRSS3 (ENSPKIG00000003233) ENSPKIG00000003013 pdxkb (ENSPKIG00000002898) agpat3 (ENSPKIG00000002841) #22 TRAPPC10 (ENSPKIG00000002787) #23 pwp2h (ENSPKIG00000002693) #24 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000158231.k ENSGT00940000158406 ENSGT00510000051617 ENSGT00940000155131 ENSGT00390000011821 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000008902.kb ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00940000158589.b.a ENSGT00940000173884 ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00940000163587.a.b.a.d.b ENSGT01000000214434.B.a.a ENSGT00590000083134.a.a ENSGT00940000160941 ENSGT00390000016655.a.a.b ENSGT00940000169295 ENSGT00940000158527 ENSGT00940000163978 ENSGT00940000160585 ENSGT00940000159528 ENSGT01040000240539.b ENSGT00390000011864 ENSGT01050000244937.a.a ENSGT00390000010170.a.b ENSGT00390000003338 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000158231.k ENSGT00940000158406 ENSGT00510000051617 ENSGT00940000155131 ENSGT00390000011821 ENSGT00940000157240 ENSGT00940000159245 ENSGT00940000155587.a.b ENSGT00390000012174 ENSGT00390000008902.kb ENSGT00390000012196 ENSGT00940000159505 ENSGT00940000158589.b.a ENSGT00940000173884 ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00940000162556.A.b ENSGT00940000154486.b.b.a.b ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.a ENSGT00390000016151 ENSGT00510000049102 ENSGT00940000160532.h ENSGT00390000013151.a.a.b ENSGT00940000160639.b.a.b.a ENSGT00940000181338 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000006631 ENSGT00950000183208.A.c.b ENSGT00940000157233.d ENSGT00940000158526 ENSGT00940000158539.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00390000002862.tb ENSGT00940000159262 ENSGT01050000244848.C.a ENSGT01030000234618.F ENSGT01050000244890.a.b.a.i.b 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ENSACIG00000009796 ENSACIG00000009811 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159677.a.b ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00390000002862.tb ENSGT00940000159262 ENSGT01050000244848.C.a ENSGT01030000234618.F ENSGT01050000244890.a.b.a.i.b ENSGT00940000158887 ENSGT01030000234748 ENSGT00940000157018 ENSGT00940000159052 ENSGT01050000244857.B.b ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00940000162556.A.b ENSGT00950000183023.A.f.a.b.a.a.a ENSGT00950000183023.A.f.a.a.a ENSGT01030000234640.a.a.c.a ENSGT00950000183023.A.e.a ENSGT00950000183023.A.e.b ENSGT00940000158239.a.a.b ENSGT00940000155861.C.f ENSGT00940000162467.a.a ENSGT00940000159144.A.e.b ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051.b ENSGT00390000006051 ENSGT00940000154389.a Oryzias ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159677.a.b ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00390000002862.tb ENSGT00940000159262 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ENSATEG00000002509 ENSATEG00000027556 ENSATEG00000002439 ENSATEG00000025725 ENSATEG00000028963 ENSATEG00000029980 ENSATEG00000029854 ENSATEG00000026483 ENSATEG00000028331 ENSATEG00000027586 ENSATEG00000027532 ENSATEG00000026565 ENSATEG00000026073 ENSATEG00000027432 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 11 NXPH2 (ENSBSLG00000019840) spoplb (ENSBSLG00000019786) HNMT (ENSBSLG00000019759) ENSBSLG00000019479 hnmt (ENSBSLG00000019428) THSD7B (ENSBSLG00000018975) cxcr4a (ENSBSLG00000018918) TMBIM1 (ENSBSLG00000018889) pnkd (ENSBSLG00000018723) ENSBSLG00000018719 gmppaa (ENSBSLG00000018682) dars1 (ENSBSLG00000018054) asic4a (ENSBSLG00000017887) CHPF (ENSBSLG00000017868) pdxka (ENSBSLG00000017152) agpat3 (ENSBSLG00000017041) #22 ENSBSLG00000017021 ENSBSLG00000017005 ENSBSLG00000016992 ENSBSLG00000016976 ENSBSLG00000016961 ENSBSLG00000016953 ENSBSLG00000016944 ENSBSLG00000016921 ENSBSLG00000016912 ENSBSLG00000016904 ENSBSLG00000016885 ENSBSLG00000016873 ENSBSLG00000016865 ENSBSLG00000016857 ENSBSLG00000016848 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159677.a.b ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00390000002862.tb ENSGT00940000159262 ENSGT01050000244848.C.a ENSGT01030000234618.F ENSGT01050000244890.a.b.a.i.b ENSGT00940000158887 ENSGT00940000157018 ENSGT01030000234748 ENSGT00940000159052 ENSGT01050000244857.B.b ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00950000183023.A.f.a.b.a.a.a ENSGT00950000183023.A.f.a.a.a ENSGT01030000234640.a.a.c.a ENSGT00950000183023.A.e.a ENSGT00950000183023.A.e.b ENSGT00940000158239.a.a.b ENSGT00940000155861.C.f ENSGT00390000006051 ENSGT00940000162467.a.a ENSGT00940000159144.A.e.b ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051.b ENSGT00940000154389.a.o.a ENSGT00940000153518.d.b.b.w.a Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159677.a.b ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00390000002862.tb ENSGT00940000159262 ENSGT01050000244848.C.a 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ENSSDUG00000013051 tsc22d1 (ENSSDUG00000013067) gtf2f2b (ENSSDUG00000013087) kctd4 (ENSSDUG00000013143) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2542 asic4a (ENSSLDG00000022741) CHPF (ENSSLDG00000022733) pdxka (ENSSLDG00000022697) agpat3 (ENSSLDG00000022654) #22 ENSSLDG00000022616 ENSSLDG00000022590 ENSSLDG00000022571 ENSSLDG00000022554 ENSSLDG00000022546 ENSSLDG00000022529 ENSSLDG00000022516 ENSSLDG00000022505 ALS2 (ENSSLDG00000022428) tpt1 (ENSSLDG00000022402) ENSSLDG00000022398 tsc22d1 (ENSSLDG00000022390) kctd4 (ENSSLDG00000022382) gtf2f2b (ENSSLDG00000022352) Barramundi perch MODERN SPECIES 204 ugt1b1 (ENSLCAG00010011173) ENSLCAG00010011175 NXPH2 (ENSLCAG00010011178) spoplb (ENSLCAG00010011182) HNMT (ENSLCAG00010011193) hnmt (ENSLCAG00010011195) THSD7B (ENSLCAG00010011213) cxcr4a (ENSLCAG00010011228) dars1 (ENSLCAG00010011290) pnkd (ENSLCAG00010011550) gmppaa (ENSLCAG00010011601) ENSLCAG00010011644 asic4a (ENSLCAG00010011647) CHPF (ENSLCAG00010011654) pdxka (ENSLCAG00010011671) agpat3 (ENSLCAG00010011701) #22 ENSLCAG00010011713 ENSLCAG00010011720 ENSLCAG00010011726 ENSLCAG00010011729 ENSLCAG00010011731 FZD7 (ENSLCAG00010011736) ALS2 (ENSLCAG00010011744) tpt1 (ENSLCAG00010011749) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00910000144271.C ENSGT00940000159677.a.b ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00940000159262 ENSGT01050000244848.C.a ENSGT01030000234618.F ENSGT01050000244890.a.b.a.i.b ENSGT00940000158887 ENSGT00940000157018 ENSGT01030000234748 ENSGT00940000159052 ENSGT01050000244857.B.b ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00950000183023.A.f.a.b.a.a.a ENSGT00950000183023.A.f.a.a.a ENSGT01030000234640.a.a.c.a ENSGT00950000183023.A.e.a ENSGT00950000183023.A.e.b ENSGT00940000158239.a.a.b ENSGT00940000155861.C.f ENSGT00390000006051 ENSGT00940000162467.a.a ENSGT00940000159144.A.e.b ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051.b ENSGT00940000154389.a.o.a ENSGT00940000178293 Tongue sole MODERN SPECIES 7 NXPH2 (ENSCSEG00000014974) spoplb (ENSCSEG00000014860) ENSCSEG00000014850 HNMT (ENSCSEG00000014836) THSD7B (ENSCSEG00000014629) ENSCSEG00000014599 cxcr4a (ENSCSEG00000013981) dars1 (ENSCSEG00000013966) ENSCSEG00000013961 pnkd (ENSCSEG00000013958) ENSCSEG00000013951 gmppaa (ENSCSEG00000013921) asic4a (ENSCSEG00000013878) CHPF (ENSCSEG00000013861) pdxka (ENSCSEG00000013844) agpat3 (ENSCSEG00000013831) #22 ENSCSEG00000013817 ENSCSEG00000013813 ENSCSEG00000013802 ENSCSEG00000013794 ENSCSEG00000013770 ENSCSEG00000013746 ENSCSEG00000013741 ENSCSEG00000013737 fzd7b (ENSCSEG00000013735) ENSCSEG00000013644 tpt1 (ENSCSEG00000013637) ENSCSEG00000013630 stxbp5l (ENSCSEG00000013403) poglut2 (ENSCSEG00000013373) ENSCSEG00000013366 Turbot MODERN SPECIES 5 ENSSMAG00000002168 ENSSMAG00000002426 NXPH2 (ENSSMAG00000023910) SPOPL (ENSSMAG00000002460) ENSSMAG00000002525 THSD7B (ENSSMAG00000002557) CXCR4 (ENSSMAG00000006700) dars1 (ENSSMAG00000006714) ENSSMAG00000006792 ENSSMAG00000006812 gmppaa (ENSSMAG00000006829) ENSSMAG00000006899 asic4a (ENSSMAG00000006912) CHPF (ENSSMAG00000033841) ENSSMAG00000006966 ENSSMAG00000007002 #22 ENSSMAG00000031335 ENSSMAG00000027464 ENSSMAG00000007025 ENSSMAG00000007065 ENSSMAG00000037976 ENSSMAG00000007095 ENSSMAG00000028695 ENSSMAG00000007144 ENSSMAG00000007166 tpt1 (ENSSMAG00000026887) ENSSMAG00000007293 ENSSMAG00000037836 ENSSMAG00000023827 ENSSMAG00000007317 kctd4 (ENSSMAG00000007327) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159677.a.b ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00390000002862.tb ENSGT00940000159262 ENSGT01050000244848.C.a ENSGT01030000234618.F ENSGT01050000244890.a.b.a.i.b ENSGT00940000158887 ENSGT00940000157018 ENSGT01030000234748 ENSGT00940000159052 ENSGT01050000244857.B.b ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00940000162556.A.b ENSGT00950000183023.A.f.a.b.a.a.a ENSGT00950000183023.A.f.a.a.a ENSGT01030000234640.a.a.c.a ENSGT00950000183023.A.e.a ENSGT00950000183023.A.e.b ENSGT00950000183048.b.b.b ENSGT00940000158239.a.a.b ENSGT00940000155861.C.f ENSGT00940000162467.a.a ENSGT00940000159144.A.e.b ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051.b ENSGT00390000006051 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000159677.a.b ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00390000002862.tb ENSGT00940000159262 ENSGT01050000244848.C.a ENSGT01030000234618.F ENSGT01050000244890.a.b.a.i.b ENSGT00940000158887 ENSGT01030000234748 ENSGT00940000157018 ENSGT00940000159052 ENSGT01050000244857.B.b ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00950000183023.A.f.a.b.a.a.a ENSGT00950000183023.A.f.a.a.a.y.a ENSGT01030000234640.a.a.c.a ENSGT00950000183023.A.e.a ENSGT00950000183023.A.e.b ENSGT00950000183048.b.b.b ENSGT00940000158239.a.a.b ENSGT00940000155861.C.f ENSGT00940000162467.a.a ENSGT00940000159144.A.e.b ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051.b ENSGT00390000006051 ENSGT00940000154389.a ENSGT00940000153518.d.b.a.a Fugu MODERN SPECIES ugt1b1 (ENSTRUG00000007992) NXPH2 (ENSTRUG00000008270) spoplb (ENSTRUG00000008272) HNMT (ENSTRUG00000008584) hnmt (ENSTRUG00000008598) THSD7B (ENSTRUG00000008734) cxcr4a (ENSTRUG00000009000) dars1 (ENSTRUG00000009030) TMBIM1 (ENSTRUG00000009154) pnkd (ENSTRUG00000009399) ENSTRUG00000021998 gmppaa (ENSTRUG00000009542) asic4a (ENSTRUG00000009778) CHPF (ENSTRUG00000009970) pdxka (ENSTRUG00000010041) agpat3 (ENSTRUG00000021005) #22 ENSTRUG00000025642 ENSTRUG00000032432 ENSTRUG00000029291 ENSTRUG00000031223 ENSTRUG00000028183 ENSTRUG00000027979 ENSTRUG00000028600 ENSTRUG00000030906 ENSTRUG00000028132 ENSTRUG00000029013 ENSTRUG00000028200 ENSTRUG00000029468 ENSTRUG00000031072 ENSTRUG00000025861 ENSTRUG00000033090 Tetraodon MODERN SPECIES 13 UGT1A1 (ENSTNIG00000013253) ENSTNIG00000002406 NXPH2 (ENSTNIG00000010985) spoplb (ENSTNIG00000010986) HNMT (ENSTNIG00000010987) hnmt (ENSTNIG00000010988) THSD7B (ENSTNIG00000010989) cxcr4a (ENSTNIG00000000918) dars1 (ENSTNIG00000010990) ENSTNIG00000010991 pnkd (ENSTNIG00000010992) gmppaa (ENSTNIG00000010993) asic4a (ENSTNIG00000010994) CHPF (ENSTNIG00000005621) pdxka (ENSTNIG00000005620) agpat3 (ENSTNIG00000005619) #22 ENSTNIG00000002973 ENSTNIG00000006121 ENSTNIG00000000688 ENSTNIG00000001245 ENSTNIG00000000335 ENSTNIG00000004008 ENSTNIG00000000480 ENSTNIG00000003782 fzd7b (ENSTNIG00000003781) ALS2 (ENSTNIG00000003780) SERP2 (ENSTNIG00000019747) tsc22d1 (ENSTNIG00000003779) GTF2F2 (ENSTNIG00000004440) tpt1 (ENSTNIG00000004439) ENSTNIG00000000318 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159677.a.b ENSGT00950000182883.b.a.a ENSGT00940000155953 ENSGT00390000002862.ub ENSGT00390000002862.tb ENSGT00940000159262 ENSGT01050000244848.C.a ENSGT01030000234618.F ENSGT01050000244890.a.b.a.i.b ENSGT00940000158887 ENSGT00940000157018 ENSGT01030000234748 ENSGT00940000159052 ENSGT01050000244857.B.b ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00940000162556.A.b 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ENSGT00940000158887 ENSGT00940000157018 ENSGT01030000234748 ENSGT00940000159052 ENSGT01050000244857.B.b ENSGT00390000003874.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00950000183023.A.f.a.b.a.a.a ENSGT00950000183023.A.f.a.a.a ENSGT01030000234640.a.a.c.a ENSGT00950000183023.A.e.a ENSGT00950000183048.b.b.b ENSGT00940000158239.a.a.b ENSGT00940000155861.C.f ENSGT00940000162467.a.a ENSGT00940000159144.A.e.b ENSGT00940000159144.B ENSGT00940000159552 ENSGT00390000016051.b ENSGT00390000006051 ENSGT00940000154389.a ENSGT00940000153518.d.b.b.w.a Stickleback MODERN SPECIES 16 gzm3.3 (ENSGACG00000007370) ugt1b1 (ENSGACG00000007337) NXPH2 (ENSGACG00000007335) spoplb (ENSGACG00000007330) HNMT (ENSGACG00000007323) hnmt (ENSGACG00000007299) THSD7B (ENSGACG00000007289) cxcr4a (ENSGACG00000007282) dars1 (ENSGACG00000007146) TMBIM1 (ENSGACG00000007137) pnkd (ENSGACG00000007119) gmppaa (ENSGACG00000007062) asic4a (ENSGACG00000007052) CHPF (ENSGACG00000007044) pdxka (ENSGACG00000007013) agpat3 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#22 ENSSSAG00000095490 ENSSSAG00000081478 ENSSSAG00000081480 ENSSSAG00000081479 ENSSSAG00000081481 ENSSSAG00000081482 ENSSSAG00000081485 ndufa10 (ENSSSAG00000081486) ENSSSAG00000081497 ENSSSAG00000081555 ENSSSAG00000069294 sh3bp4 (ENSSSAG00000081600) ENSSSAG00000109819 ENSSSAG00000102975 adprh (ENSSSAG00000081606) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182897.B.a.b.b.a.a ENSGT01030000234621.F.d ENSGT00950000183071.a.a.a.e.a.b ENSGT00390000004600.b.b ENSGT00940000165805 ENSGT00940000155232.t.a.b.a.l ENSGT00940000166809 ENSGT00940000155232.t.b.b.d.b ENSGT00940000153931.b.a ENSGT00940000162795.e ENSGT00940000156856.d ENSGT01050000244897.a.b.b.a.a.f ENSGT00940000158589.b.a ENSGT00940000158449.f ENSGT00390000003874.a.a.b ENSGT00950000182836.b.b.b.a.k.a #22 ENSGT01090000259985.b.a.a.a ENSGT00940000162556.A.b ENSGT00940000154486.b.b.a.b.b ENSGT00940000154486.b.a.a.b.e.a.a.a.d ENSGT00390000016151.g ENSGT00940000160532.h.c.a ENSGT00940000160532.h.c.b ENSGT00390000013151.a.a.b.c 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ENSGT00940000157233.d.g ENSGT00530000064137.a.b.u.a Coho salmon MODERN SPECIES 11 RAP2A (ENSOKIG00005031425) MBNL2 (ENSOKIG00005031458) OXGR1 (ENSOKIG00005031560) HS6ST3 (ENSOKIG00005031565) UGGT2 (ENSOKIG00005031772) dnajc3a (ENSOKIG00005036383) ENSOKIG00005036780 cldn10b (ENSOKIG00005036788) ABCC4 (ENSOKIG00005036926) sox21b (ENSOKIG00005039048) DCT (ENSOKIG00005039083) gpc6b (ENSOKIG00005039314) TMPRSS3 (ENSOKIG00005039458) ENSOKIG00005039511 pdxka (ENSOKIG00005039540) agpat3 (ENSOKIG00005040043) #22 ENSOKIG00005040088 ENSOKIG00005040287 ENSOKIG00005040348 ENSOKIG00005040376 ENSOKIG00005040875 ndufa10 (ENSOKIG00005041173) ENSOKIG00005041362 ENSOKIG00005043752 sh3bp4 (ENSOKIG00005046356) ENSOKIG00005046369 ARL4C (ENSOKIG00005046372) ADPRH (ENSOKIG00005046379) arhgap15 (ENSOKIG00005046394) gtdc1 (ENSOKIG00005046420) zeb2a (ENSOKIG00005046434) Chinook salmon MODERN SPECIES 22 RAP2A (ENSOTSG00005019336) MBNL2 (ENSOTSG00005019337) OXGR1 (ENSOTSG00005019338) HS6ST3 (ENSOTSG00005019339) UGGT2 (ENSOTSG00005019373) dnajc3a (ENSOTSG00005026434) CLDN10 (ENSOTSG00005026435) ENSOTSG00005026436 cldn10b (ENSOTSG00005026438) ABCC4 (ENSOTSG00005026446) sox21b (ENSOTSG00005026763) dct (ENSOTSG00005026771) gpc6b (ENSOTSG00005026775) TMPRSS3 (ENSOTSG00005026778) pdxka (ENSOTSG00005026779) agpat3 (ENSOTSG00005026782) #22 ENSOTSG00005026783 ENSOTSG00005026784 ENSOTSG00005026785 ENSOTSG00005026786 ENSOTSG00005026787 ENSOTSG00005026789 ndufa10 (ENSOTSG00005026790) ENSOTSG00005001354 ENSOTSG00005009276 sh3bp4 (ENSOTSG00005010245) ARL4C (ENSOTSG00005010246) ADPRH (ENSOTSG00005010248) arhgap15 (ENSOTSG00005010259) gtdc1 (ENSOTSG00005010262) zeb2a (ENSOTSG00005010263) Rainbow trout MODERN SPECIES 21 ENSOMYG00000069937 OXGR1 (ENSOMYG00000050579) HS6ST3 (ENSOMYG00000041768) UGGT2 (ENSOMYG00000041825) dnajc3a (ENSOMYG00000042251) CLDN10 (ENSOMYG00000042315) ENSOMYG00000042320 cldn10b (ENSOMYG00000042324) ABCC4 (ENSOMYG00000042353) sox21b (ENSOMYG00000042388) ENSOMYG00000042409 gpc6b 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(ENSOTSG00005031364) Salmo ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155972.B.cb ENSGT00940000155318.b.a.b.d ENSGT01050000244823.d.a.b.a.a.b.a.b.a.b.b.a.b ENSGT01050000244823.d.a.b.a.a.b.b.b ENSGT01050000244823.d.a.b.a.a.a.b ENSGT00940000160594.h ENSGT00950000182897.B.a.b.b.a.b ENSGT00990000211313 ENSGT00950000183071.a.a.a.e.a.a ENSGT00940000155232.t.a.b.a.k ENSGT00940000155232.t.b.b.d.a ENSGT00940000162795.f ENSGT00940000156856.c.b ENSGT01050000244897.a.b.b.a.a.e ENSGT00390000003874.a.a.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a.k.b #22 ENSGT01100000263531.G.n ENSGT00990000212594 ENSGT00940000154486.b.b.a.a ENSGT00390000016151.h ENSGT00940000160532.h.d.a ENSGT00950000182977.B.b.b.d ENSGT00940000160532.h.d.b ENSGT00530000065251.m.a ENSGT00390000013151.a.a.b.d ENSGT00940000160639.b.a.b.b.b.b ENSGT00940000166921.a ENSGT00950000182860.a.b.b.d ENSGT00950000183208.A.c.b.f ENSGT00940000157233.d.h ENSGT00530000064137.a.b.u.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 13 ENSSSAG00000110345 ENSSSAG00000113440 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(ENSHHUG00000025212) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00520000055635.c.a.a.b.e.b ENSGT00940000156556.h.d ENSGT00940000157784.c.d ENSGT01050000244864.D.t ENSGT01050000244864.C.f.a ENSGT00730000110915.b.c.a ENSGT00510000046499.r.a ENSGT00940000153577.A ENSGT00390000013113.u ENSGT00940000157065.y.a.a ENSGT00990000205068.b ENSGT00940000157065.y.b ENSGT00940000159505.v.a ENSGT00940000158589.b.b.d.a.a ENSGT00390000003874.a.b.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a.l.b #22 ENSGT00940000159094.e.c ENSGT00940000153470.a.a.a.a.d ENSGT00940000153470.a.a.a.a.c.a ENSGT00390000001170.a.b.a ENSGT00940000159160.h ENSGT00550000075118.k.b ENSGT00390000009001 ENSGT00940000156552.c.b ENSGT00940000178309.a.a.a ENSGT00940000178309.a.b ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00530000063410.b.i ENSGT00940000154394.b.a.b.p.b ENSGT00940000154394.b.a.b.p.a.b ENSGT00940000164110.e Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 66 ENSGT00520000055635.c.a.a.b.e.a ENSGT00940000156556.h.c ENSGT00940000157784.c.d.f.b ENSGT01050000244864.D.t.b ENSGT01050000244864.C.f.a ENSGT00730000110915.b.c.a ENSGT00510000046499.r.a ENSGT00940000153577.A ENSGT00390000013113.u ENSGT00940000157065.y.b ENSGT00940000157065.y.a.a ENSGT00990000205068.b ENSGT00940000159505.v.a ENSGT00940000158589.b.b.d.a.a ENSGT00390000003874.a.b.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a.l.b #22 ENSGT00940000159094.e.c ENSGT00940000153470.a.a.a.a.c.a ENSGT00390000001170.a.b.a ENSGT00940000159160.h ENSGT00550000075118.k.b ENSGT00390000009001 ENSGT00940000156552.c.b.i ENSGT00940000178309.a.b ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00530000063410.b.j ENSGT00940000154394.b.a.b.p.a.b ENSGT00530000063410.b.i.a ENSGT00940000164110.e ENSGT00950000183019.f.b.b.d.c.b ENSGT00390000000862.g Salmo ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000010372.o.b.a ENSGT00520000055635.c.a.a.b.e.a ENSGT00940000156556.h.c ENSGT00940000157784.c.d.f.b ENSGT01050000244864.D.t.b ENSGT01050000244864.C.f.a ENSGT00730000110915.b.c.a ENSGT00510000046499.r.a ENSGT00940000153577.A ENSGT00390000013113.u ENSGT00940000157065.y.a.a 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(ENSSSAG00000060346) retreg2 (ENSSSAG00000060269) ENSSSAG00000060198 abcb6a (ENSSSAG00000059269) ENSSSAG00000056169 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT01000000220200 ENSGT00520000055635.c.a.a.b.e.a ENSGT00940000156556.h.c ENSGT00940000157784.c.d.f.b ENSGT00940000157784.c.d.e ENSGT01050000244864.D.t.b ENSGT01050000244864.C.f.a ENSGT00730000110915.b.c.a ENSGT00510000046499.r.a ENSGT00940000153577.A ENSGT00390000013113.u ENSGT00940000157065.y.b ENSGT00940000159505.v.a ENSGT00940000158589.b.b.d.a.a ENSGT00390000003874.a.b.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a.l.b #22 ENSGT00940000159094.e.c ENSGT00940000153470.a.a.a.a.c.a ENSGT00390000001170.a.b.a ENSGT00550000075118.k.b ENSGT00390000009001 ENSGT00940000156552.c.b.i ENSGT00940000178309.a.b.a ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00530000063410.b.j ENSGT00940000154394.b.a.b.p.a.b ENSGT00940000164110.e ENSGT00950000183019.f.b.b.d.c.b ENSGT00390000000862.g ENSGT00940000156160.b.a.e.b.b ENSGT00940000155270.i.b.c Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00390000003873.n.a #23 ENSGT01000000220200 ENSGT00520000055635.c.a.a.b.e.a ENSGT00940000156556.h.c ENSGT00940000157784.c.d.e.a ENSGT01050000244864.D.t.b ENSGT01050000244864.C.f.a ENSGT00730000110915.b.c.a ENSGT00510000046499.r.a ENSGT00940000153577.A ENSGT00390000013113.u ENSGT00940000157065.y.b ENSGT00940000159505.v.a ENSGT00940000158589.b.b.d.a.a ENSGT00390000003874.a.b.a ENSGT00950000182836.b.b.b.a.l.b #22 ENSGT00940000159094.e.c ENSGT00940000153470.a.a.a.a.c.a ENSGT00390000001170.a.b.a ENSGT00550000075118.k.b ENSGT00390000009001 ENSGT00940000156552.c.b.i ENSGT00940000178309.a.b.a ENSGT01030000234607.A.b ENSGT00940000171355 ENSGT00530000063410.b.j ENSGT00940000154394.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000164110.e ENSGT00950000183019.f.b.b.d.c.b ENSGT00390000000862.g ENSGT00940000156160.b.a.e.b.b Chinook salmon MODERN SPECIES 31 TRAPPC10 (ENSOTSG00005029982) #23 ENSOTSG00005029995 gsk3ba (ENSOTSG00005029996) lrrc58a (ENSOTSG00005033118) fstl1a (ENSOTSG00005033119) gja8b 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ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00940000171515 ENSGT00390000011048.w ENSGT01050000244891.C.c.b.q ENSGT00530000063715.b ENSGT00940000166383 ENSGT00940000155814 ENSGT00940000153676.b ENSGT00390000004360.a.b.a.a.b ENSGT00940000157874.q.a ENSGT00940000157872 ENSGT00940000157849.n ENSGT00940000162479.a ENSGT00940000155360.B.k ENSGT00940000163243 ENSGT00390000008846 Mexicana tetra MODERN SPECIES 3 lrrc58a (ENSAMXG00000032041) fstl1a (ENSAMXG00000040246) gja8b (ENSAMXG00000025640) gja5b (ENSAMXG00000025639) bcl9 (ENSAMXG00000012514) ENSAMXG00000034978 ENSAMXG00000034746 cbr1 (ENSAMXG00000012487) setd4 (ENSAMXG00000032640) cryzl1 (ENSAMXG00000037451) ITSN1 (ENSAMXG00000012436) ENSAMXG00000012433 ENSAMXG00000012410 ENSAMXG00000012377 pdxkb (ENSAMXG00000012352) agpat3 (ENSAMXG00000041421) #22 ENSAMXG00000025823 dleu7 (ENSAMXG00000037461) spryd7a (ENSAMXG00000040876) ENSAMXG00000041792 kpna3 (ENSAMXG00000012307) ebpl (ENSAMXG00000041654) arl11 (ENSAMXG00000012281) rcbtb1 (ENSAMXG00000042184) cdadc1 (ENSAMXG00000012223) cab39l (ENSAMXG00000012212) ATP11A (ENSAMXG00000018350) SOX1 (ENSAMXG00000035402) ENSAMXG00000030734 ENSAMXG00000039391 arhgef7b (ENSAMXG00000035958) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 59 fstl1a (ENSPNAG00000000939) gja8b (ENSPNAG00000008349) gja5b (ENSPNAG00000006802) bcl9 (ENSPNAG00000029561) ENSPNAG00000005001 ENSPNAG00000029487 cbr1 (ENSPNAG00000029439) cbr1 (ENSPNAG00000029415) setd4 (ENSPNAG00000029275) cryzl1 (ENSPNAG00000004544) ITSN1 (ENSPNAG00000004518) ENSPNAG00000025611 ENSPNAG00000025605 ENSPNAG00000025569 pdxkb (ENSPNAG00000025536) agpat3 (ENSPNAG00000004913) #22 dleu7 (ENSPNAG00000006544) spryd7a (ENSPNAG00000025399) kpna3 (ENSPNAG00000025361) ebpl (ENSPNAG00000025238) arl11 (ENSPNAG00000025213) rcbtb1 (ENSPNAG00000025189) cdadc1 (ENSPNAG00000025112) cab39l (ENSPNAG00000025105) MCF2L (ENSPNAG00000025029) tubgcp3 (ENSPNAG00000024841) ATP11A (ENSPNAG00000005022) SOX1 (ENSPNAG00000024384) arhgef7b (ENSPNAG00000023914) ENSPNAG00000023852 lipt1 (ENSPNAG00000023826) Electric eel MODERN SPECIES 149 lrrc58a (ENSEEEG00000023552) fstl1a (ENSEEEG00000023550) GJA8 (ENSEEEG00000023549) gja5b (ENSEEEG00000023548) GJA5 (ENSEEEG00000023547) bcl9 (ENSEEEG00000023546) morc3b (ENSEEEG00000023545) cbr1 (ENSEEEG00000023544) setd4 (ENSEEEG00000023543) cryzl1 (ENSEEEG00000023542) ITSN1 (ENSEEEG00000023539) ENSEEEG00000023531 ENSEEEG00000023530 ENSEEEG00000023529 pdxkb (ENSEEEG00000023528) agpat3 (ENSEEEG00000023524) #22 dleu7 (ENSEEEG00000023520) spryd7a (ENSEEEG00000023517) kpna3 (ENSEEEG00000023036) ebpl (ENSEEEG00000023013) arl11 (ENSEEEG00000023012) rcbtb1 (ENSEEEG00000023011) cdadc1 (ENSEEEG00000023010) cab39l (ENSEEEG00000023007) MCF2L (ENSEEEG00000023002) tubgcp3 (ENSEEEG00000023000) ATP11A (ENSEEEG00000022995) sox1b (ENSEEEG00000022994) Channel catfish MODERN SPECIES 18 lrrc58a (ENSIPUG00000020001) fstl1a (ENSIPUG00000020011) gja8b (ENSIPUG00000020046) GJA5 (ENSIPUG00000020050) bcl9 (ENSIPUG00000020056) ENSIPUG00000020078 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ENSECRG00000003858 ENSECRG00000003862 ENSECRG00000003872 ENSECRG00000003883 sap18 (ENSECRG00000003892) lats2 (ENSECRG00000003898) xpo4 (ENSECRG00000003966) Elephant shark MODERN SPECIES 1595 abcg1 (ENSCMIG00000017429) ENSCMIG00000017444 ADAMTS5 (ENSCMIG00000017456) ADAMTS1 (ENSCMIG00000017460) appb (ENSCMIG00000017578) WDR4 (ENSCMIG00000017823) ENSCMIG00000017830 ENSCMIG00000017832 slc37a1 (ENSCMIG00000017837) RSPH1 (ENSCMIG00000017856) RRP1 (ENSCMIG00000017860) ENSCMIG00000017863 pdxka (ENSCMIG00000017870) ENSCMIG00000017877 TRAPPC10 (ENSCMIG00000017905) #23 agpat3 (ENSCMIG00000017972) #22 pwp2h (ENSCMIG00000017979) #24 GBE1 (ENSCMIG00000017987) cadm2a (ENSCMIG00000018019) gatd3 (ENSCMIG00000018055) #25 ROBO1 (ENSCMIG00000018180) robo2 (ENSCMIG00000018396) PARD3 (ENSCMIG00000018447) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 197 ENSGT00950000182836.b.b.b.a #22 ENSGT00390000010799 ENSGT00390000003873 #23 Lamprey MODERN SPECIES 127 ENSPMAG00000006334 agpat3 (ENSPMAG00000006339) #22 rpl13a (ENSPMAG00000006362) ENSPMAG00000006472 #23 ENSPMAG00000006485 pdxkb (ENSPMAG00000006494) bves (ENSPMAG00000006517) ENSPMAG00000006523 Hagfish MODERN SPECIES 995 ENSEBUG00000007638 zgc:101858 (ENSEBUG00000003770) ENSEBUG00000004260 #22 rpl13a (ENSEBUG00000007234) ENSEBUG00000012056 #23 ENSEBUG00000009064 #23 txnl4b (ENSEBUG00000006810) ENSEBUG00000006632 ENSEBUG00000015332 ENSEBUG00000005092 mettl14 (ENSEBUG00000006504) ENSEBUG00000007946 ENSEBUG00000015125 ENSEBUG00000002568 nudc (ENSEBUG00000001914) ENSEBUG00000009860 ENSEBUG00000014722 ENSEBUG00000004361 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 305 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310 ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000155089 ENSGT00390000013943 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 156 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00420000030417 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT01060000248589.D ENSGT00390000012569.a ENSGT00940000165091 ENSGT00940000153511.a ENSGT01010000222287.B.b.a.b.a ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000155089 ENSGT00390000013943 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 209 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00420000030417 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00390000013943 Coelacanth MODERN SPECIES 2517 AGPAT4 (ENSLACG00000022103) ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 79 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00420000030417 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00390000013943 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00940000160610 Amniota ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00420000030417 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000162065 ENSGT00940000155089 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Sauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000162065 ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063927.a.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000168209 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a.c.a.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Laterata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00960000189534 ENSGT00940000168209 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a.c.a.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Common wall lizard MODERN SPECIES 11 CCR6 (ENSPMRG00000004939) CEP43 (ENSPMRG00000004931) RNASET2 (ENSPMRG00000004913) RPS6KA2 (ENSPMRG00000002868) MPC1 (ENSPMRG00000002351) SFT2D1 (ENSPMRG00000002343) PRR18 (ENSPMRG00000002338) ENSPMRG00000002328 TBXT (ENSPMRG00000002319) PDE10A (ENSPMRG00000002283) C6orf118 (ENSPMRG00000002274) QKI (ENSPMRG00000002260) PACRG (ENSPMRG00000002251) ENSPMRG00000002245 PRKN (ENSPMRG00000002228) AGPAT4 (ENSPMRG00000002221) ##22 ENSPMRG00000002214 MAP3K4 (ENSPMRG00000002197) ENSPMRG00000002175 SLC22A3 (ENSPMRG00000002162) ENSPMRG00000002157 ENSPMRG00000002151 IGF2R (ENSPMRG00000001320) ENSPMRG00000000891 PNLDC1 (ENSPMRG00000000755) ENSPMRG00000000709 TCP1 (ENSPMRG00000000681) ACAT2 (ENSPMRG00000000659) WTAP (ENSPMRG00000000645) SOD2 (ENSPMRG00000000626) ENSPMRG00000000612 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 2 CEP43 (ENSSMRG00000022175) RNASET2 (ENSSMRG00000022176) RPS6KA2 (ENSSMRG00000022178) MPC1 (ENSSMRG00000022180) SFT2D1 (ENSSMRG00000022182) PRR18 (ENSSMRG00000022183) TBXT (ENSSMRG00000022186) PDE10A (ENSSMRG00000022188) C6orf118 (ENSSMRG00000022189) ENSSMRG00000022193 ENSSMRG00000022194 QKI (ENSSMRG00000022196) PACRG (ENSSMRG00000022198) ENSSMRG00000022199 PRKN (ENSSMRG00000022201) AGPAT4 (ENSSMRG00000022202) ##22 MAP3K4 (ENSSMRG00000022204) ENSSMRG00000022205 SLC22A3 (ENSSMRG00000022213) ENSSMRG00000022214 ENSSMRG00000022215 IGF2R (ENSSMRG00000022216) ENSSMRG00000022217 ENSSMRG00000022218 PNLDC1 (ENSSMRG00000022220) TCP1 (ENSSMRG00000022221) ACAT2 (ENSSMRG00000022224) WTAP (ENSSMRG00000022225) SOD2 (ENSSMRG00000022226) FNDC1 (ENSSMRG00000022228) TAGAP (ENSSMRG00000022230) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00530000063927.a.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 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ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208.r ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a.d ENSGT01030000234639.A.a.c.b ENSGT01030000234639.A.a.c.a.a ENSGT01030000234639.A.a.c.a.b ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208.r ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a.d ENSGT01030000234639.A.a.c.b ENSGT01030000234639.A.a.c.a.a ENSGT01030000234639.A.a.c.a.b ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B Eastern brown snake MODERN SPECIES 26 ENSPTXG00000008546 ENSPTXG00000008545 CEP43 (ENSPTXG00000008544) RNASET2 (ENSPTXG00000008543) RPS6KA2 (ENSPTXG00000008542) MPC1 (ENSPTXG00000008541) SFT2D1 (ENSPTXG00000008540) PRR18 (ENSPTXG00000008539) TBXT (ENSPTXG00000008538) PDE10A (ENSPTXG00000008485) C6orf118 (ENSPTXG00000008484) QKI (ENSPTXG00000008483) PACRG (ENSPTXG00000008482) ENSPTXG00000008481 PRKN (ENSPTXG00000008480) AGPAT4 (ENSPTXG00000008479) ##22 ENSPTXG00000008478 MAP3K4 (ENSPTXG00000007968) ENSPTXG00000007960 SLC22A3 (ENSPTXG00000007958) ENSPTXG00000007957 ENSPTXG00000007955 IGF2R (ENSPTXG00000001694) ENSPTXG00000001528 ENSPTXG00000001525 ENSPTXG00000001522 PNLDC1 (ENSPTXG00000001515) MRPL18 (ENSPTXG00000001509) ACAT2 (ENSPTXG00000001498) TCP1 (ENSPTXG00000001496) WTAP (ENSPTXG00000001493) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 70 CEP43 (ENSNSUG00000014936) RNASET2 (ENSNSUG00000014993) RPS6KA2 (ENSNSUG00000014994) MPC1 (ENSNSUG00000014995) SFT2D1 (ENSNSUG00000014996) TBXT (ENSNSUG00000014997) PDE10A (ENSNSUG00000014998) C6orf118 (ENSNSUG00000015018) QKI (ENSNSUG00000015021) ENSNSUG00000015022 PACRG (ENSNSUG00000015023) ENSNSUG00000015024 PRKN (ENSNSUG00000015025) ENSNSUG00000015026 ENSNSUG00000015027 AGPAT4 (ENSNSUG00000015028) ##22 MAP3K4 (ENSNSUG00000015033) ENSNSUG00000015519 ENSNSUG00000015529 SLC22A3 (ENSNSUG00000015711) ENSNSUG00000015712 ENSNSUG00000015713 IGF2R (ENSNSUG00000015715) ENSNSUG00000015717 ENSNSUG00000015718 ENSNSUG00000015719 ENSNSUG00000015720 MRPL18 (ENSNSUG00000015722) TCP1 (ENSNSUG00000015723) ACAT2 (ENSNSUG00000015727) WTAP (ENSNSUG00000015728) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 1041 AGPAT4 (ENSLLTG00000005502) ##22 Indian cobra MODERN SPECIES ENSNNAG00000009035 CEP43 (ENSNNAG00000009119) RNASET2 (ENSNNAG00000009189) RPS6KA2 (ENSNNAG00000009365) MPC1 (ENSNNAG00000012739) SFT2D1 (ENSNNAG00000012757) PRR18 (ENSNNAG00000012767) TBXT (ENSNNAG00000012781) PDE10A (ENSNNAG00000012894) ENSNNAG00000013280 C6orf118 (ENSNNAG00000013295) QKI (ENSNNAG00000013315) PACRG (ENSNNAG00000013371) ENSNNAG00000013395 PRKN (ENSNNAG00000013405) AGPAT4 (ENSNNAG00000013435) ##22 MAP3K4 (ENSNNAG00000013454) ENSNNAG00000013607 ENSNNAG00000013630 ENSNNAG00000013701 ENSNNAG00000013719 SLC22A3 (ENSNNAG00000013742) ENSNNAG00000013839 ENSNNAG00000013902 IGF2R (ENSNNAG00000013937) ENSNNAG00000014108 ENSNNAG00000014119 PNLDC1 (ENSNNAG00000014137) MRPL18 (ENSNNAG00000014226) TCP1 (ENSNNAG00000014238) ACAT2 (ENSNNAG00000014276) Lizard MODERN SPECIES SASH1 (ENSACAG00000007050) UST (ENSACAG00000007028) ENSACAG00000034580 ENSACAG00000039144 ENSACAG00000041987 ENSACAG00000038505 QKI (ENSACAG00000003270) ENSACAG00000037263 PACRG (ENSACAG00000003319) ENSACAG00000035215 ENSACAG00000040389 PRKN (ENSACAG00000002888) ENSACAG00000035210 ENSACAG00000044906 ENSACAG00000038927 AGPAT4 (ENSACAG00000002997) ##22 MAP3K4 (ENSACAG00000003094) ENSACAG00000044185 ENSACAG00000003225 SLC22A3 (ENSACAG00000003423) ENSACAG00000003452 ENSACAG00000003650 IGF2R (ENSACAG00000003664) ENSACAG00000035532 ENSACAG00000004224 ENSACAG00000045067 PNLDC1 (ENSACAG00000013667) ENSACAG00000043187 MRPL18 (ENSACAG00000004244) TCP1 (ENSACAG00000004253) ENSACAG00000041299 tuatara MODERN SPECIES 319 ENSSPUG00000003293 ENSSPUG00000003309 ENSSPUG00000003321 AGPAT4 (ENSSPUG00000003332) ##22 ENSSPUG00000003356 ENSSPUG00000003382 ENSSPUG00000003393 ENSSPUG00000003402 ENSSPUG00000003415 ENSSPUG00000003552 SLC22A3 (ENSSPUG00000004269) ENSSPUG00000004297 ENSSPUG00000004340 IGF2R (ENSSPUG00000004409) ENSSPUG00000004551 ENSSPUG00000004560 ENSSPUG00000004594 PNLDC1 (ENSSPUG00000004627) MRPL18 (ENSSPUG00000004732) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT00940000168209 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT00940000168209 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208.v ENSGT00940000155208.u.b ENSGT00940000155208.u.a ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000162065 ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B Aves ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 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ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00530000063359.A ENSGT00530000063927.a.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00990000212037 ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208.u.b.b ENSGT00940000155208.u.b.a.b ENSGT00940000155208.u.a ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000162065 ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00960000189534 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00990000212037 ENSGT00940000159956.j ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208.u.b.b ENSGT00940000155208.u.b.a.b ENSGT00940000155208.u.a ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089.g ENSGT00940000155089.h ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931 ENSGT00390000011877 Golden eagle MODERN SPECIES 24 ENSACCG00020001063 ENSACCG00020001075 ENSACCG00020001090 CCR6 (ENSACCG00020001101) CEP43 (ENSACCG00020001119) RNASET2 (ENSACCG00020001160) ENSACCG00020001176 RPS6KA2 (ENSACCG00020001205) MPC1 (ENSACCG00020001249) SFT2D1 (ENSACCG00020001265) TBXT (ENSACCG00020001297) PDE10A (ENSACCG00020001331) QKI (ENSACCG00020001360) PACRG (ENSACCG00020001381) PRKN (ENSACCG00020001423) AGPAT4 (ENSACCG00020001461) ##22 MAP3K4 (ENSACCG00020001556) ENSACCG00020001718 SLC22A3 (ENSACCG00020001790) 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ENSGT00530000063359.A ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT00940000161879 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 Naked mole-rat female MODERN SPECIES ENSHGLG00000040761 ENSHGLG00000041990 TBXT (ENSHGLG00000002638) PDE10A (ENSHGLG00000003609) C6orf118 (ENSHGLG00000040311) ENSHGLG00000002800 ENSHGLG00000033943 ENSHGLG00000020018 QKI (ENSHGLG00000003074) ENSHGLG00000040590 PACRG (ENSHGLG00000048524) ENSHGLG00000041594 ENSHGLG00000050950 PRKN 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ENSGT00550000074878 ENSGT00940000161879 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 Guinea pig MODERN SPECIES 60 ENSCPOG00000009004 GPR31 (ENSCPOG00000001786) CCR6 (ENSCPOG00000034828) CEP43 (ENSCPOG00000036620) RNASET2 (ENSCPOG00000007899) RPS6KA2 (ENSCPOG00000005210) MPC1 (ENSCPOG00000005208) SFT2D1 (ENSCPOG00000031625) ENSCPOG00000000167 TBXT (ENSCPOG00000001358) PDE10A (ENSCPOG00000008783) C6orf118 (ENSCPOG00000008774) QKI (ENSCPOG00000003424) PACRG (ENSCPOG00000013410) PRKN (ENSCPOG00000006136) AGPAT4 (ENSCPOG00000006135) ##22 MAP3K4 (ENSCPOG00000013392) ENSCPOG00000011605 SLC22A3 (ENSCPOG00000010127) SLC22A2 (ENSCPOG00000001527) IGF2R (ENSCPOG00000013207) MAS1 (ENSCPOG00000000027) PNLDC1 (ENSCPOG00000019565) MRPL18 (ENSCPOG00000040103) TCP1 (ENSCPOG00000001676) ACAT2 (ENSCPOG00000001672) WTAP (ENSCPOG00000001669) SOD2 (ENSCPOG00000036439) ENSCPOG00000040324 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000155237 ENSGT00530000063359.A ENSGT00530000063927.a.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT00940000161879 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 146 AFDN (ENSCLAG00000003013) UNC93A (ENSCLAG00000004396) ENSCLAG00000004820 CCR6 (ENSCLAG00000005134) CEP43 (ENSCLAG00000005200) RNASET2 (ENSCLAG00000005811) RPS6KA2 (ENSCLAG00000002285) MPC1 (ENSCLAG00000002442) SFT2D1 (ENSCLAG00000002586) TBXT (ENSCLAG00000002632) PDE10A (ENSCLAG00000004872) C6orf118 (ENSCLAG00000006108) ENSCLAG00000006238 PACRG (ENSCLAG00000008105) PRKN (ENSCLAG00000008284) AGPAT4 (ENSCLAG00000008421) ##22 MAP3K4 (ENSCLAG00000008769) ENSCLAG00000002399 SLC22A3 (ENSCLAG00000002492) SLC22A2 (ENSCLAG00000002562) SLC22A1 (ENSCLAG00000002646) IGF2R (ENSCLAG00000002642) MAS1 (ENSCLAG00000017515) PNLDC1 (ENSCLAG00000003228) MRPL18 (ENSCLAG00000012045) ENSCLAG00000012133 ENSCLAG00000009354 ACAT2 (ENSCLAG00000009441) WTAP (ENSCLAG00000009722) SOD2 (ENSCLAG00000010198) Degu MODERN SPECIES 153 ENSODEG00000019798 ENSODEG00000019307 QKI (ENSODEG00000007408) PACRG (ENSODEG00000009517) PRKN (ENSODEG00000006701) AGPAT4 (ENSODEG00000007571) ##22 ENSODEG00000006672 ENSODEG00000006392 ENSODEG00000019262 ENSODEG00000006455 ENSODEG00000009894 SLC22A3 (ENSODEG00000006460) ENSODEG00000006583 ENSODEG00000007010 SLC22A2 (ENSODEG00000007315) SLC22A1 (ENSODEG00000007862) ENSODEG00000019312 IGF2R (ENSODEG00000007106) ENSODEG00000019599 MAS1 (ENSODEG00000019418) ENSODEG00000019381 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 18 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ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Muroidea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00400000024673 ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00400000024673 ENSGT00640000091563.a ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00510000046988.r ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00690000103860 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000153773.a.a.b.e.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00400000024673 ENSGT00640000091563.a ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00510000046988.r ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00690000103860 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ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 ENSCGRG00001000721 Gpr31b (ENSCGRG00001006182) ENSCGRG00001024787 Rps6ka2 (ENSCGRG00001024721) ENSCGRG00001024749 ENSCGRG00001024881 ENSCGRG00001024817 ENSCGRG00001024700 Pde10a (ENSCGRG00001016395) 1700010I14Rik (ENSCGRG00001014965) Pabpc6 (ENSCGRG00001007983) Qki (ENSCGRG00001012114) Pacrg (ENSCGRG00001010865) ENSCGRG00001009195 Prkn (ENSCGRG00001011980) Agpat4 (ENSCGRG00001024340) ##22 Map3k4 (ENSCGRG00001023770) Plg (ENSCGRG00001023181) ENSCGRG00001022809 Slc22a3 (ENSCGRG00001024404) Slc22a2 (ENSCGRG00001023859) Slc22a1 (ENSCGRG00001023484) Igf2r (ENSCGRG00001022921) Mas1 (ENSCGRG00001007652) ENSCGRG00001007470 Mrpl18 (ENSCGRG00001010667) TCP1 (ENSCGRG00001007629) ENSCGRG00001024850 ENSCGRG00001024790 Wtap (ENSCGRG00001003444) Sod2 (ENSCGRG00001001155) Golden Hamster MODERN SPECIES 830 Pacrg (ENSMAUG00000001701) ENSMAUG00000002219 Agpat4 (ENSMAUG00000003994) ##22 ENSMAUG00000005277 ENSMAUG00000002757 Plg (ENSMAUG00000003213) Slc22a3 (ENSMAUG00000004349) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00510000046988.r ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00690000103860 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000153773.a.a.b.e.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Prairie vole MODERN SPECIES 358 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##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a ENSGT00390000011877 Mus ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00400000024673 ENSGT00640000091563.a ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00510000046988.q.b ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00690000103860 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000153773.a.a.b.e.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.a ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00400000024673 ENSGT00640000091563.a ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00510000046988.q.b ENSGT00390000018525.a.a.j ENSGT00390000002164 ENSGT00690000103860 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000153773.a.a.b.e.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.a ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000007441 ENSGT01030000234667.b ENSGT00510000046988.q.b.b.a ENSGT00390000018525.a.a.j ENSGT00390000002164 ENSGT00690000103860 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000154721.db.a ENSGT00700000105447.b.a ENSGT00940000153773.a.a.b.e.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065.d ENSGT00940000162065.c.a ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B.p ENSGT01030000234626.B.o ENSGT00390000013931.a.b.b Mouse MODERN SPECIES 8 Rnaset2a (ENSMUSG00000095687) Cep43 (ENSMUSG00000069135) Ccr6 (ENSMUSG00000040899) Mpc1 (ENSMUSG00000023861) Sft2d1 (ENSMUSG00000073468) Prr18 (ENSMUSG00000055945) T2 (ENSMUSG00000058159) T (ENSMUSG00000062327) Pde10a (ENSMUSG00000023868) 1700010I14Rik (ENSMUSG00000023873) Gm17728 (ENSMUSG00000072968) Pabpc6 (ENSMUSG00000046173) Qki (ENSMUSG00000062078) Pacrg (ENSMUSG00000037196) Prkn (ENSMUSG00000023826) Agpat4 (ENSMUSG00000023827) ##22 Map3k4 (ENSMUSG00000014426) Plg (ENSMUSG00000059481) Slc22a3 (ENSMUSG00000023828) Slc22a2 (ENSMUSG00000040966) Slc22a1 (ENSMUSG00000023829) Igf2r (ENSMUSG00000023830) Mas1 (ENSMUSG00000068037) Mrgprh (ENSMUSG00000059408) Pnldc1 (ENSMUSG00000073460) Mrpl18 (ENSMUSG00000057388) Tcp1 (ENSMUSG00000068039) Acat3 (ENSMUSG00000062480) Acat2 (ENSMUSG00000023832) Wtap (ENSMUSG00000060475) Sod2 (ENSMUSG00000006818) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000154721.db.a ENSGT00700000105447.b.a ENSGT00940000153773.a.a.b.e.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065.d ENSGT00940000162065.c.a ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B.p ENSGT01030000234626.B.o ENSGT00390000013931.a.a Steppe mouse MODERN SPECIES 2567 ENSMSIG00000014440 ENSMSIG00000014425 Agpat4 (ENSMSIG00000014411) ##22 ENSMSIG00000014386 Map3k4 (ENSMSIG00000014264) spretus MODERN SPECIES 8 MGP_SPRETEiJ_G0021951 Cep43 (MGP_SPRETEiJ_G0021952) Ccr6 (MGP_SPRETEiJ_G0021953) MGP_SPRETEiJ_G0021954 Sft2d1 (MGP_SPRETEiJ_G0021955) MGP_SPRETEiJ_G0021956 Prr18 (MGP_SPRETEiJ_G0021957) T (MGP_SPRETEiJ_G0021958) MGP_SPRETEiJ_G0021959 MGP_SPRETEiJ_G0021960 Gm17728 (MGP_SPRETEiJ_G0021961) Pabpc6 (MGP_SPRETEiJ_G0021962) Qki (MGP_SPRETEiJ_G0021963) Pacrg (MGP_SPRETEiJ_G0021964) Prkn (MGP_SPRETEiJ_G0021965) Agpat4 (MGP_SPRETEiJ_G0021966) ##22 Map3k4 (MGP_SPRETEiJ_G0021967) Plg (MGP_SPRETEiJ_G0021968) Slc22a3 (MGP_SPRETEiJ_G0021969) Slc22a2 (MGP_SPRETEiJ_G0021970) Slc22a1 (MGP_SPRETEiJ_G0021971) Igf2r (MGP_SPRETEiJ_G0021972) Mas1 (MGP_SPRETEiJ_G0021973) Mrgprh (MGP_SPRETEiJ_G0021974) Pnldc1 (MGP_SPRETEiJ_G0021975) Mrpl18 (MGP_SPRETEiJ_G0021976) Tcp1 (MGP_SPRETEiJ_G0021977) Acat3 (MGP_SPRETEiJ_G0021978) MGP_SPRETEiJ_G0021979 MGP_SPRETEiJ_G0021980 Sod2 (MGP_SPRETEiJ_G0021981) Ryukyu mouse MODERN SPECIES 8 MGP_CAROLIEiJ_G0021069 MGP_CAROLIEiJ_G0021068 Cep43 (MGP_CAROLIEiJ_G0021067) Ccr6 (MGP_CAROLIEiJ_G0021066) MGP_CAROLIEiJ_G0021065 MGP_CAROLIEiJ_G0021064 Prr18 (MGP_CAROLIEiJ_G0021063) Sft2d1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021062) T (MGP_CAROLIEiJ_G0021061) Pde10a (MGP_CAROLIEiJ_G0021060) 1700010I14Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0021059) Pabpc6 (MGP_CAROLIEiJ_G0021058) Qki (MGP_CAROLIEiJ_G0021057) Pacrg (MGP_CAROLIEiJ_G0021056) Prkn (MGP_CAROLIEiJ_G0021055) Agpat4 (MGP_CAROLIEiJ_G0021054) ##22 Map3k4 (MGP_CAROLIEiJ_G0021053) Plg (MGP_CAROLIEiJ_G0021052) Slc22a3 (MGP_CAROLIEiJ_G0021051) Slc22a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021050) Slc22a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021049) MGP_CAROLIEiJ_G0021048 Mas1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021047) Mrgprh (MGP_CAROLIEiJ_G0021046) Pnldc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021045) Mrpl18 (MGP_CAROLIEiJ_G0021044) Tcp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0021043) MGP_CAROLIEiJ_G0021042 MGP_CAROLIEiJ_G0021041 MGP_CAROLIEiJ_G0021040 Sod2 (MGP_CAROLIEiJ_G0021039) Shrew mouse MODERN SPECIES 13 MGP_PahariEiJ_G0023385 Cep43 (MGP_PahariEiJ_G0023384) Ccr6 (MGP_PahariEiJ_G0023383) MGP_PahariEiJ_G0023382 MGP_PahariEiJ_G0023381 Prr18 (MGP_PahariEiJ_G0023380) MGP_PahariEiJ_G0023379 T (MGP_PahariEiJ_G0023378) MGP_PahariEiJ_G0023377 Pde10a (MGP_PahariEiJ_G0023376) MGP_PahariEiJ_G0023375 MGP_PahariEiJ_G0023374 Qki (MGP_PahariEiJ_G0023373) Pacrg (MGP_PahariEiJ_G0023372) Prkn (MGP_PahariEiJ_G0023371) Agpat4 (MGP_PahariEiJ_G0023370) ##22 Map3k4 (MGP_PahariEiJ_G0023369) Plg (MGP_PahariEiJ_G0023368) Slc22a3 (MGP_PahariEiJ_G0023367) Slc22a2 (MGP_PahariEiJ_G0023366) Slc22a1 (MGP_PahariEiJ_G0023365) Igf2r (MGP_PahariEiJ_G0023364) Mas1 (MGP_PahariEiJ_G0023363) Mrgprh (MGP_PahariEiJ_G0023362) Pnldc1 (MGP_PahariEiJ_G0023361) Mrpl18 (MGP_PahariEiJ_G0023360) Tcp1 (MGP_PahariEiJ_G0023359) MGP_PahariEiJ_G0023358 MGP_PahariEiJ_G0023357 MGP_PahariEiJ_G0023356 Sod2 (MGP_PahariEiJ_G0023355) Rat MODERN SPECIES Rnaset2 (ENSRNOG00000013190) Cep43 (ENSRNOG00000055093) Ccr6 (ENSRNOG00000012964) Mpc1 (ENSRNOG00000012415) Sft2d1 (ENSRNOG00000024140) Prr18 (ENSRNOG00000070586) ENSRNOG00000066810 T2 (ENSRNOG00000024172) Tbxt (ENSRNOG00000012229) Pde10a (ENSRNOG00000011310) MGC94891 (ENSRNOG00000011243) Pabpc6 (ENSRNOG00000017367) Qki (ENSRNOG00000048297) Pacrg (ENSRNOG00000068261) Prkn (ENSRNOG00000055547) Agpat4 (ENSRNOG00000017731) ##22 Map3k4 (ENSRNOG00000017419) AABR07001512.1 (ENSRNOG00000017412) Plg (ENSRNOG00000017223) Slc22a3 (ENSRNOG00000022946) Slc22a2 (ENSRNOG00000016625) Slc22a1 (ENSRNOG00000016337) Igf2r (ENSRNOG00000014997) Mas1 (ENSRNOG00000014971) Pnldc1 (ENSRNOG00000023140) Mrpl18 (ENSRNOG00000014582) Tcp1 (ENSRNOG00000014160) ENSRNOG00000069754 Acat2l1 (ENSRNOG00000013975) Acat2 (ENSRNOG00000019189) Wtap (ENSRNOG00000019091) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 431 Prkn (ENSNGAG00000016401) Agpat4 (ENSNGAG00000013433) ##22 ENSNGAG00000019626 ENSNGAG00000017848 Plg (ENSNGAG00000004331) Slc22a3 (ENSNGAG00000016887) Slc22a2 (ENSNGAG00000013335) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 44 Cep43 (ENSJJAG00000024342) ENSJJAG00000013485 Rps6ka2 (ENSJJAG00000005765) ENSJJAG00000020707 ENSJJAG00000023581 ENSJJAG00000022568 Pde10a (ENSJJAG00000010428) ENSJJAG00000005686 ENSJJAG00000010987 ENSJJAG00000017023 Pabpc6 (ENSJJAG00000019230) Qki (ENSJJAG00000022765) Pacrg (ENSJJAG00000013819) ENSJJAG00000022340 Prkn (ENSJJAG00000011282) Agpat4 (ENSJJAG00000024380) ##22 ENSJJAG00000017984 ENSJJAG00000016960 Plg (ENSJJAG00000023805) Slc22a3 (ENSJJAG00000015842) Slc22a2 (ENSJJAG00000020676) Slc22a1 (ENSJJAG00000017119) Igf2r (ENSJJAG00000019554) Mas1 (ENSJJAG00000011567) Pnldc1 (ENSJJAG00000009937) ENSJJAG00000019850 ENSJJAG00000022555 Wtap (ENSJJAG00000017886) Sod2 (ENSJJAG00000018002) Fndc1 (ENSJJAG00000019101) ENSJJAG00000002202 Kangaroo rat MODERN SPECIES 396 Thbs2 (ENSDORG00000005713) Smoc2 (ENSDORG00000006153) ENSDORG00000003713 Afdn (ENSDORG00000010887) ENSDORG00000012694 Ccr6 (ENSDORG00000012594) Cep43 (ENSDORG00000004815) ENSDORG00000011636 Rps6ka2 (ENSDORG00000007779) ENSDORG00000010309 ENSDORG00000012736 Pde10a (ENSDORG00000005783) Qki (ENSDORG00000008151) ENSDORG00000026934 ENSDORG00000027142 Agpat4 (ENSDORG00000015627) ##22 ENSDORG00000025664 Plg (ENSDORG00000024248) Slc22a3 (ENSDORG00000008402) Slc22a2 (ENSDORG00000008400) Slc22a1 (ENSDORG00000011523) Igf2r (ENSDORG00000009527) Mas1 (ENSDORG00000003320) Pnldc1 (ENSDORG00000011517) ENSDORG00000011510 ENSDORG00000011505 ENSDORG00000026059 Sod2 (ENSDORG00000001358) Ezr (ENSDORG00000015424) ENSDORG00000014053 ENSDORG00000014045 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 ENSGT00390000004172 Pika MODERN SPECIES 4080 AGPAT4 (ENSOPRG00000014367) ##22 Rabbit MODERN SPECIES 3 TBXT (ENSOCUG00000000660) PDE10A (ENSOCUG00000009218) ENSOCUG00000016006 ENSOCUG00000034613 ENSOCUG00000030844 QKI (ENSOCUG00000004117) PACRG (ENSOCUG00000013289) ENSOCUG00000031144 ENSOCUG00000025750 ENSOCUG00000035966 ENSOCUG00000033664 ##22 ENSOCUG00000032142 MAP3K4 (ENSOCUG00000017154) ENSOCUG00000001766 SLC22A3 (ENSOCUG00000004222) SLC22A2 (ENSOCUG00000002542) SLC22A1 (ENSOCUG00000002539) IGF2R (ENSOCUG00000008785) MGRA (ENSOCUG00000001493) PNLDC1 (ENSOCUG00000013867) MRPL18 (ENSOCUG00000013858) ACAT2 (ENSOCUG00000013836) TCP1 (ENSOCUG00000013847) WTAP (ENSOCUG00000035527) ENSOCUG00000024780 FNDC1 (ENSOCUG00000015039) Primates ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00400000024673 ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063359.A ENSGT00940000162752 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Coquerels sifaka MODERN SPECIES 358 ENSPCOG00000022276 QKI (ENSPCOG00000007664) PACRG (ENSPCOG00000013888) PRKN (ENSPCOG00000019988) AGPAT4 (ENSPCOG00000013535) ##22 MAP3K4 (ENSPCOG00000015288) ENSPCOG00000026308 SLC22A3 (ENSPCOG00000017815) SLC22A2 (ENSPCOG00000023545) SLC22A1 (ENSPCOG00000021330) IGF2R (ENSPCOG00000018469) PNLDC1 (ENSPCOG00000025722) MRPL18 (ENSPCOG00000025100) ENSPCOG00000017935 ACAT2 (ENSPCOG00000011643) WTAP (ENSPCOG00000014167) SOD2 (ENSPCOG00000014692) FNDC1 (ENSPCOG00000003224) ENSPCOG00000019827 RSPH3 (ENSPCOG00000007389) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 990 ENSPSMG00000018587 AGPAT4 (ENSPSMG00000018610) ##22 MAP3K4 (ENSPSMG00000018873) ENSPSMG00000019164 ENSPSMG00000019187 SLC22A3 (ENSPSMG00000019195) ENSPSMG00000019196 ENSPSMG00000019203 ENSPSMG00000019218 IGF2R (ENSPSMG00000019256) ENSPSMG00000019267 MAS1 (ENSPSMG00000019268) PNLDC1 (ENSPSMG00000019276) MRPL18 (ENSPSMG00000019284) TCP1 (ENSPSMG00000019332) ACAT2 (ENSPSMG00000019357) WTAP (ENSPSMG00000019381) Mouse lemur MODERN SPECIES 28 UNC93A (ENSMICG00000004803) TTLL2 (ENSMICG00000047984) CCR6 (ENSMICG00000028385) CEP43 (ENSMICG00000014198) RNASET2 (ENSMICG00000014184) RPS6KA2 (ENSMICG00000003856) MPC1 (ENSMICG00000003851) SFT2D1 (ENSMICG00000034411) PRR18 (ENSMICG00000042137) TBXT (ENSMICG00000016122) PDE10A (ENSMICG00000008121) C6orf118 (ENSMICG00000046277) QKI (ENSMICG00000009220) PACRG (ENSMICG00000009209) PRKN (ENSMICG00000009200) AGPAT4 (ENSMICG00000009184) ##22 MAP3K4 (ENSMICG00000007663) ENSMICG00000034395 SLC22A3 (ENSMICG00000007647) SLC22A2 (ENSMICG00000007636) SLC22A1 (ENSMICG00000007625) IGF2R (ENSMICG00000007582) PNLDC1 (ENSMICG00000008021) MRPL18 (ENSMICG00000044845) ENSMICG00000007998 ACAT2 (ENSMICG00000007988) ENSMICG00000042830 WTAP (ENSMICG00000033919) SOD2 (ENSMICG00000035793) FNDC1 (ENSMICG00000010483) TAGAP (ENSMICG00000031485) Bushbaby MODERN SPECIES 171 TTLL2 (ENSOGAG00000033615) ENSOGAG00000033331 CCR6 (ENSOGAG00000025164) CEP43 (ENSOGAG00000006310) RNASET2 (ENSOGAG00000006308) ENSOGAG00000033842 RPS6KA2 (ENSOGAG00000006306) SFT2D1 (ENSOGAG00000006302) PRR18 (ENSOGAG00000030765) TBXT (ENSOGAG00000007863) PDE10A (ENSOGAG00000007629) C6orf118 (ENSOGAG00000007625) QKI (ENSOGAG00000003634) PACRG (ENSOGAG00000004947) PRKN (ENSOGAG00000010979) AGPAT4 (ENSOGAG00000004567) ##22 MAP3K4 (ENSOGAG00000004556) ENSOGAG00000030352 SLC22A3 (ENSOGAG00000004550) SLC22A2 (ENSOGAG00000005281) ENSOGAG00000005280 SLC22A1 (ENSOGAG00000005276) IGF2R (ENSOGAG00000005270) MAS1 (ENSOGAG00000005268) ENSOGAG00000031154 ENSOGAG00000031607 PNLDC1 (ENSOGAG00000007331) MRPL18 (ENSOGAG00000007327) TCP1 (ENSOGAG00000007320) ACAT2 (ENSOGAG00000007315) ENSOGAG00000007311 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00400000024673 ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Tarsier MODERN SPECIES 4805 ENSTSYG00000007825 AGPAT4 (ENSTSYG00000010911) ##22 MAP3K4 (ENSTSYG00000002616) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00400000024673 ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543.f.b ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543.e ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877.h ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543.f.b ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543.e ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877.h ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543.f.b ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543.e ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877.h ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 101 CCR6 (ENSSBOG00000026892) CEP43 (ENSSBOG00000021544) RNASET2 (ENSSBOG00000022586) RPS6KA2 (ENSSBOG00000023209) MPC1 (ENSSBOG00000030115) SFT2D1 (ENSSBOG00000020053) TBXT (ENSSBOG00000023313) ENSSBOG00000030891 ENSSBOG00000030466 C6orf118 (ENSSBOG00000024744) QKI (ENSSBOG00000036267) PACRG (ENSSBOG00000036098) PRKN (ENSSBOG00000019735) AGPAT4 (ENSSBOG00000023179) ##22 MAP3K4 (ENSSBOG00000022969) PLG (ENSSBOG00000033802) SLC22A3 (ENSSBOG00000024841) SLC22A2 (ENSSBOG00000035664) SLC22A1 (ENSSBOG00000029054) IGF2R (ENSSBOG00000024078) MAS1 (ENSSBOG00000019912) PNLDC1 (ENSSBOG00000019135) MRPL18 (ENSSBOG00000017384) TCP1 (ENSSBOG00000022736) ACAT2 (ENSSBOG00000035773) ENSSBOG00000017833 ENSSBOG00000033881 FNDC1 (ENSSBOG00000027676) TAGAP (ENSSBOG00000030452) Capuchin MODERN SPECIES 6 QKI (ENSCCAG00000025230) PACRG (ENSCCAG00000034067) PRKN (ENSCCAG00000024514) AGPAT4 (ENSCCAG00000022357) ##22 MAP3K4 (ENSCCAG00000028977) PLG (ENSCCAG00000034420) SLC22A3 (ENSCCAG00000035674) SLC22A2 (ENSCCAG00000020700) SLC22A1 (ENSCCAG00000030320) IGF2R (ENSCCAG00000010739) MAS1 (ENSCCAG00000012059) PNLDC1 (ENSCCAG00000026232) MRPL18 (ENSCCAG00000027672) TCP1 (ENSCCAG00000028316) ACAT2 (ENSCCAG00000034076) WTAP (ENSCCAG00000021303) SOD2 (ENSCCAG00000025254) FNDC1 (ENSCCAG00000021952) TAGAP (ENSCCAG00000036010) Marmoset MODERN SPECIES 16 ENSCJAG00000073948 ENSCJAG00000053408 ENSCJAG00000000469 ENSCJAG00000077718 RPS6KA2 (ENSCJAG00000000462) ENSCJAG00000012552 SFT2D1 (ENSCJAG00000012533) PRR18 (ENSCJAG00000012527) TBXT (ENSCJAG00000012508) PDE10A (ENSCJAG00000012410) ENSCJAG00000075058 ENSCJAG00000077202 QKI (ENSCJAG00000012368) PACRG (ENSCJAG00000012365) PRKN (ENSCJAG00000012355) AGPAT4 (ENSCJAG00000012323) ##22 MAP3K4 (ENSCJAG00000012176) ENSCJAG00000084439 PLG (ENSCJAG00000012132) SLC22A3 (ENSCJAG00000012093) SLC22A2 (ENSCJAG00000012056) IGF2R (ENSCJAG00000011908) ENSCJAG00000081097 PNLDC1 (ENSCJAG00000011865) MRPL18 (ENSCJAG00000011859) TCP1 (ENSCJAG00000011792) ACAT2 (ENSCJAG00000011777) WTAP (ENSCJAG00000011722) SOD2 (ENSCJAG00000011664) FNDC1 (ENSCJAG00000011622) TAGAP (ENSCJAG00000011616) Mas night monkey MODERN SPECIES 265 ENSANAG00000037901 ENSANAG00000019760 C6orf118 (ENSANAG00000023807) QKI (ENSANAG00000029669) PACRG (ENSANAG00000020727) ENSANAG00000019305 PRKN (ENSANAG00000032287) AGPAT4 (ENSANAG00000037521) ##22 MAP3K4 (ENSANAG00000030551) PLG (ENSANAG00000030380) SLC22A3 (ENSANAG00000030361) SLC22A2 (ENSANAG00000030328) SLC22A1 (ENSANAG00000038334) IGF2R (ENSANAG00000031865) MAS1 (ENSANAG00000019902) PNLDC1 (ENSANAG00000034713) MRPL18 (ENSANAG00000033398) TCP1 (ENSANAG00000033987) ACAT2 (ENSANAG00000030553) WTAP (ENSANAG00000027064) SOD2 (ENSANAG00000024525) FNDC1 (ENSANAG00000028811) TAGAP (ENSANAG00000023564) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00400000024673 ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00910000148333 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000157183.a.a ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00400000024673 ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00910000148333 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000157183.a.a ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w ENSGT00390000013931.a.b.b Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 403 ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 295 RPS6KA2 (ENSRBIG00000018635) MPC1 (ENSRBIG00000036142) SFT2D1 (ENSRBIG00000036071) TBXT (ENSRBIG00000037010) PDE10A (ENSRBIG00000023020) ENSRBIG00000036166 C6orf118 (ENSRBIG00000004596) QKI (ENSRBIG00000043656) PACRG (ENSRBIG00000005726) PRKN (ENSRBIG00000027594) AGPAT4 (ENSRBIG00000031711) ##22 MAP3K4 (ENSRBIG00000036975) PLG (ENSRBIG00000042750) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1712 PDE10A (ENSRROG00000034670) C6orf118 (ENSRROG00000040200) QKI (ENSRROG00000040592) PACRG (ENSRROG00000039063) PRKN (ENSRROG00000029447) AGPAT4 (ENSRROG00000038839) ##22 MAP3K4 (ENSRROG00000042666) PLG (ENSRROG00000042779) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00400000024673 ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00910000148333 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000157183.a.a.b ENSGT00940000155208 ENSGT00940000157183.a.a.a ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 4 CCR6 (ENSCSAG00000012111) CEP43 (ENSCSAG00000012128) RNASET2 (ENSCSAG00000012144) ENSCSAG00000012150 RPS6KA2 (ENSCSAG00000012167) SFT2D1 (ENSCSAG00000012180) PRR18 (ENSCSAG00000012184) TBXT (ENSCSAG00000012200) ENSCSAG00000012208 PDE10A (ENSCSAG00000012225) C6orf118 (ENSCSAG00000012234) ENSCSAG00000012244 QKI (ENSCSAG00000012257) PRKN (ENSCSAG00000012267) ENSCSAG00000018983 AGPAT4 (ENSCSAG00000012273) ##22 MAP3K4 (ENSCSAG00000012282) PLG (ENSCSAG00000012290) LPA (ENSCSAG00000012297) SLC22A3 (ENSCSAG00000012348) SLC22A2 (ENSCSAG00000012370) SLC22A1 (ENSCSAG00000012377) IGF2R (ENSCSAG00000012403) MAS1 (ENSCSAG00000012417) ENSCSAG00000012433 PNLDC1 (ENSCSAG00000012478) MRPL18 (ENSCSAG00000012516) TCP1 (ENSCSAG00000012567) ENSCSAG00000012584 WTAP (ENSCSAG00000012594) SOD2 (ENSCSAG00000012601) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00910000148333 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000157183.a.a.a ENSGT00940000157183.a.a.b ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000155310.b ENSGT01090000260381 ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034.`c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00910000148333 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000157183.a.a.a ENSGT00940000157183.a.a.b ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a Olive baboon MODERN SPECIES 16 ENSPANG00000041620 RPS6KA2 (ENSPANG00000018198) MPC1 (ENSPANG00000030766) SFT2D1 (ENSPANG00000000460) PRR18 (ENSPANG00000035337) TBXT (ENSPANG00000005068) PDE10A (ENSPANG00000019045) C6orf118 (ENSPANG00000010211) ENSPANG00000047222 QKI (ENSPANG00000006711) ENSPANG00000043294 ENSPANG00000040612 PACRG (ENSPANG00000030883) ENSPANG00000048628 PRKN (ENSPANG00000022007) AGPAT4 (ENSPANG00000043829) ##22 ENSPANG00000050992 MAP3K4 (ENSPANG00000013261) PLG (ENSPANG00000007072) ENSPANG00000038033 ENSPANG00000042063 ENSPANG00000048497 ENSPANG00000033663 SLC22A3 (ENSPANG00000025907) SLC22A2 (ENSPANG00000008238) SLC22A1 (ENSPANG00000012323) IGF2R (ENSPANG00000018547) MAS1 (ENSPANG00000024549) PNLDC1 (ENSPANG00000022009) MRPL18 (ENSPANG00000023667) ENSPANG00000011086 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00520000056310.A.d ENSGT00940000153307.c.a.h.k.a.a ENSGT00940000155310.b ENSGT01090000260381 ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034.`c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000157183.a.a.a ENSGT00940000157183.a.a.b ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a Drill MODERN SPECIES 370 ENSMLEG00000028291 AGPAT4 (ENSMLEG00000032130) ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 220 SFT2D1 (ENSCATG00000034006) TBXT (ENSCATG00000038841) ENSCATG00000038207 ENSCATG00000035247 PDE10A (ENSCATG00000039033) ENSCATG00000040268 C6orf118 (ENSCATG00000034818) ENSCATG00000016910 ENSCATG00000037623 ENSCATG00000038866 PACRG (ENSCATG00000036404) PRKN (ENSCATG00000033190) AGPAT4 (ENSCATG00000012223) ##22 MAP3K4 (ENSCATG00000038027) ENSCATG00000034269 PLG (ENSCATG00000039756) Macaca ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000157183.a.a.a ENSGT00940000157183.a.a.b ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394.i.a ENSGT00550000074878.`b.a.a.a ENSGT01030000234626.B.w.a ENSGT00390000013931.a.b.b.`b.a ENSGT00940000163505.a.b.a.b Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00530000063359.A ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 14 ENSMFAG00000049160 RNASET2 (ENSMFAG00000039774) ENSMFAG00000051223 RPS6KA2 (ENSMFAG00000032453) MPC1 (ENSMFAG00000003954) SFT2D1 (ENSMFAG00000039956) ENSMFAG00000059048 ENSMFAG00000049559 TBXT (ENSMFAG00000030026) PDE10A (ENSMFAG00000046132) C6orf118 (ENSMFAG00000031329) QKI (ENSMFAG00000044069) ENSMFAG00000057576 PACRG (ENSMFAG00000039741) PRKN (ENSMFAG00000002107) AGPAT4 (ENSMFAG00000041781) ##22 MAP3K4 (ENSMFAG00000036572) ENSMFAG00000061670 PLG (ENSMFAG00000050264) ENSMFAG00000051812 ENSMFAG00000063217 ENSMFAG00000064690 SLC22A3 (ENSMFAG00000002893) SLC22A2 (ENSMFAG00000031849) SLC22A1 (ENSMFAG00000033700) IGF2R (ENSMFAG00000034342) MAS1 (ENSMFAG00000004332) ENSMFAG00000062218 ENSMFAG00000051722 PNLDC1 (ENSMFAG00000041296) ENSMFAG00000065624 Rhesus MODERN SPECIES 14 CCR6 (ENSMMUG00000005676) CEP43 (ENSMMUG00000005674) RNASET2 (ENSMMUG00000005673) RPS6KA2 (ENSMMUG00000005670) MPC1 (ENSMMUG00000011739) SFT2D1 (ENSMMUG00000011736) PRR18 (ENSMMUG00000011700) TBXT (ENSMMUG00000017047) PDE10A (ENSMMUG00000023614) C4H6orf118 (ENSMMUG00000023613) ENSMMUG00000055955 QKI (ENSMMUG00000000428) ENSMMUG00000054834 PACRG (ENSMMUG00000020412) PRKN (ENSMMUG00000020410) AGPAT4 (ENSMMUG00000006147) ##22 MAP3K4 (ENSMMUG00000006143) ENSMMUG00000057619 PLG (ENSMMUG00000016945) ENSMMUG00000016201 SLC22A3 (ENSMMUG00000005717) SLC22A2 (ENSMMUG00000005715) SLC22A1 (ENSMMUG00000015662) IGF2R (ENSMMUG00000015658) MAS1 (ENSMMUG00000016217) PNLDC1 (ENSMMUG00000004181) ENSMMUG00000052876 MRPL18 (ENSMMUG00000063964) TCP1 (ENSMMUG00000012846) ENSMMUG00000012843 WTAP (ENSMMUG00000012837) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 139 CEP43 (ENSMNEG00000044780) RNASET2 (ENSMNEG00000033732) RPS6KA2 (ENSMNEG00000028453) MPC1 (ENSMNEG00000030001) SFT2D1 (ENSMNEG00000034299) TBXT (ENSMNEG00000040011) ENSMNEG00000037990 ENSMNEG00000022920 ENSMNEG00000038868 PDE10A (ENSMNEG00000027445) C6orf118 (ENSMNEG00000036512) ENSMNEG00000026836 ENSMNEG00000043724 PACRG (ENSMNEG00000042289) PRKN (ENSMNEG00000027725) AGPAT4 (ENSMNEG00000037275) ##22 MAP3K4 (ENSMNEG00000032311) PLG (ENSMNEG00000042095) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000154957.B.s.b ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00910000148333 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208.o.a ENSGT00940000157183.a.a ENSGT00940000155208.p ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a ENSGT01030000234626.B Hominidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000154957.B.s.b ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00910000148333 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208.o.a ENSGT00940000157183.a.a ENSGT00940000155208.p ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00940000154629.B.db.b.a ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878.`b.a.a ENSGT01030000234626.B Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a.a ENSGT00940000154957.B.s.b ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00910000146857 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00910000148333 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ENSPPAG00000038059 PACRG (ENSPPAG00000000755) PRKN (ENSPPAG00000034661) AGPAT4 (ENSPPAG00000041903) ##22 ENSPPAG00000006234 MAP3K4 (ENSPPAG00000037745) PLG (ENSPPAG00000042434) ENSPPAG00000034032 ENSPPAG00000026664 SLC22A3 (ENSPPAG00000009760) SLC22A2 (ENSPPAG00000012601) SLC22A1 (ENSPPAG00000017979) ENSPPAG00000029247 IGF2R (ENSPPAG00000022058) MAS1 (ENSPPAG00000003542) PNLDC1 (ENSPPAG00000026651) MRPL18 (ENSPPAG00000001652) TCP1 (ENSPPAG00000030713) ACAT2 (ENSPPAG00000043658) Human MODERN SPECIES 18 ENSG00000272980 CEP43 (ENSG00000213066) RNASET2 (ENSG00000026297) ENSG00000249141 RAMACL (ENSG00000235272) RPS6KA2 (ENSG00000071242) MPC1 (ENSG00000060762) SFT2D1 (ENSG00000198818) PRR18 (ENSG00000176381) TBXT (ENSG00000164458) PDE10A (ENSG00000112541) C6orf118 (ENSG00000112539) QKI (ENSG00000112531) PACRG (ENSG00000112530) PRKN (ENSG00000185345) AGPAT4 (ENSG00000026652) ##22 MAP3K4 (ENSG00000085511) PLG (ENSG00000122194) LPA (ENSG00000198670) SLC22A3 (ENSG00000146477) SLC22A2 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(ENSPPYG00000017146) ACAT2 (ENSPPYG00000017145) WTAP (ENSPPYG00000017144) Gibbon MODERN SPECIES 18 ENSNLEG00000011641 CCR6 (ENSNLEG00000032795) CEP43 (ENSNLEG00000011605) RNASET2 (ENSNLEG00000027795) ENSNLEG00000034042 RPS6KA2 (ENSNLEG00000011560) ENSNLEG00000032002 SFT2D1 (ENSNLEG00000031636) TBXT (ENSNLEG00000011552) ENSNLEG00000033543 ENSNLEG00000011508 C6orf118 (ENSNLEG00000011493) ENSNLEG00000011478 PACRG (ENSNLEG00000011474) PRKN (ENSNLEG00000011473) ENSNLEG00000011464 ##22 MAP3K4 (ENSNLEG00000011428) ENSNLEG00000011380 ENSNLEG00000011373 SLC22A2 (ENSNLEG00000011367) ENSNLEG00000035654 ENSNLEG00000035869 IGF2R (ENSNLEG00000011313) PNLDC1 (ENSNLEG00000011282) MRPL18 (ENSNLEG00000011269) TCP1 (ENSNLEG00000011178) ACAT2 (ENSNLEG00000011115) WTAP (ENSNLEG00000028233) SOD2 (ENSNLEG00000011061) FNDC1 (ENSNLEG00000011059) TAGAP (ENSNLEG00000010995) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a 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ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Suina ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155237 ENSGT00530000063359.A ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Pig MODERN SPECIES CCR6 (ENSSSCG00000024562) ENSSSCG00000034196 CEP43 (ENSSSCG00000004023) ENSSSCG00000004024 RPS6KA2 (ENSSSCG00000004022) ENSSSCG00000032916 SFT2D1 (ENSSSCG00000004020) TBXT (ENSSSCG00000036609) PDE10A (ENSSSCG00000004027) ENSSSCG00000051306 QKI (ENSSSCG00000004029) PACRG (ENSSSCG00000038153) ENSSSCG00000047165 PRKN (ENSSSCG00000004032) ENSSSCG00000053549 AGPAT4 (ENSSSCG00000004033) ##22 MAP3K4 (ENSSSCG00000004037) PLG (ENSSSCG00000004038) SLC22A3 (ENSSSCG00000004039) SLC22A2 (ENSSSCG00000004040) SLC22A1 (ENSSSCG00000004041) IGF2R (ENSSSCG00000004044) MAS1 (ENSSSCG00000059431) PNLDC1 (ENSSSCG00000004046) MRPL18 (ENSSSCG00000004047) TCP1 (ENSSSCG00000004048) ACAT2 (ENSSSCG00000004049) WTAP (ENSSSCG00000004050) SOD2 (ENSSSCG00000040317) FNDC1 (ENSSSCG00000004052) TAGAP (ENSSSCG00000004053) Chacoan peccary MODERN SPECIES 58 ENSCWAG00000002429 AGPAT4 (ENSCWAG00000002443) ##22 MAP3K4 (ENSCWAG00000002506) ENSCWAG00000002821 SLC22A3 (ENSCWAG00000002861) SLC22A2 (ENSCWAG00000002880) SLC22A1 (ENSCWAG00000002901) IGF2R (ENSCWAG00000002925) MAS1 (ENSCWAG00000002975) ENSCWAG00000002985 PNLDC1 (ENSCWAG00000003002) MRPL18 (ENSCWAG00000003059) TCP1 (ENSCWAG00000003074) ACAT2 (ENSCWAG00000003116) WTAP (ENSCWAG00000003142) SOD2 (ENSCWAG00000003162) FNDC1 (ENSCWAG00000003188) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00530000063359.A ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Alpaca MODERN SPECIES 988 PRKN (ENSVPAG00000003286) ENSVPAG00000003284 ##22 MAP3K4 (ENSVPAG00000003283) SLC22A3 (ENSVPAG00000003282) Arabian camel MODERN SPECIES 34 UNC93A (ENSCDRG00005007860) GPR31 (ENSCDRG00005007976) CCR6 (ENSCDRG00005007993) CEP43 (ENSCDRG00005008019) RNASET2 (ENSCDRG00005008141) RPS6KA2 (ENSCDRG00005008268) ENSCDRG00005008762 SFT2D1 (ENSCDRG00005008896) ENSCDRG00005009017 TBXT (ENSCDRG00005009061) PDE10A (ENSCDRG00005009275) C6orf118 (ENSCDRG00005010197) QKI (ENSCDRG00005010246) PACRG (ENSCDRG00005010327) PRKN (ENSCDRG00005010399) AGPAT4 (ENSCDRG00005011648) ##22 MAP3K4 (ENSCDRG00005011806) ENSCDRG00005013803 SLC22A3 (ENSCDRG00005014054) SLC22A2 (ENSCDRG00005014141) SLC22A1 (ENSCDRG00005014227) IGF2R (ENSCDRG00005014304) MAS1 (ENSCDRG00005014532) PNLDC1 (ENSCDRG00005014558) MRPL18 (ENSCDRG00005014810) TCP1 (ENSCDRG00005014875) ACAT2 (ENSCDRG00005015012) WTAP (ENSCDRG00005015081) MnSOD (ENSCDRG00005015180) FNDC1 (ENSCDRG00005015292) TAGAP (ENSCDRG00005015381) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000017281.j ENSGT00530000063558.B Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00530000063359.A ENSGT00990000203619.A.b.b.a 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ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000017281.j ENSGT00530000063558.B Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000186343 ENSGT00940000153877.h.c.b.b ENSGT00940000154508.a.a.h ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00390000018085.a.b.b ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B 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PDE10A (ENSDLEG00000014196) C6orf118 (ENSDLEG00000014153) QKI (ENSDLEG00000014103) ENSDLEG00000014088 ENSDLEG00000014077 ENSDLEG00000014063 ENSDLEG00000014046 ENSDLEG00000014031 AGPAT4 (ENSDLEG00000013962) ##22 MAP3K4 (ENSDLEG00000013778) PLG (ENSDLEG00000013736) SLC22A3 (ENSDLEG00000013670) SLC22A2 (ENSDLEG00000013647) SLC22A1 (ENSDLEG00000013591) IGF2R (ENSDLEG00000013373) MAS1 (ENSDLEG00000013351) PNLDC1 (ENSDLEG00000013298) MRPL18 (ENSDLEG00000013282) TCP1 (ENSDLEG00000013249) ACAT2 (ENSDLEG00000013224) WTAP (ENSDLEG00000013205) SOD2 (ENSDLEG00000013188) ENSDLEG00000013163 ENSDLEG00000013131 Narwhal MODERN SPECIES 301 AFDN (ENSMMNG00015012415) UNC93A (ENSMMNG00015012361) GPR31 (ENSMMNG00015012351) CCR6 (ENSMMNG00015012341) CEP43 (ENSMMNG00015012318) RNASET2 (ENSMMNG00015012292) RPS6KA2 (ENSMMNG00015012184) MPC1 (ENSMMNG00015012133) SFT2D1 (ENSMMNG00015012112) TBXT (ENSMMNG00015012069) PDE10A (ENSMMNG00015011925) C6orf118 (ENSMMNG00015011860) QKI (ENSMMNG00015011839) PACRG 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(ENSBMSG00010010709) ENSBMSG00010010741 SLC22A3 (ENSBMSG00010010779) SLC22A2 (ENSBMSG00010010814) SLC22A1 (ENSBMSG00010010839) ENSBMSG00010010858 IGF2R (ENSBMSG00010010889) MAS1 (ENSBMSG00010010947) PNLDC1 (ENSBMSG00010010984) MRPL18 (ENSBMSG00010011042) TCP1 (ENSBMSG00010011064) ACAT2 (ENSBMSG00010011102) ENSBMSG00010011125 ENSBMSG00010011159 ENSBMSG00010011186 Pecora ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a.c ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Yarkand deer MODERN SPECIES 18 ENSCHYG00000026568 GPR31 (ENSCHYG00000026561) CCR6 (ENSCHYG00000026557) ENSCHYG00000026541 RNASET2 (ENSCHYG00000026522) RPS6KA2 (ENSCHYG00000026381) MPC1 (ENSCHYG00000026331) SFT2D1 (ENSCHYG00000026311) TBXT (ENSCHYG00000026275) ENSCHYG00000026255 PDE10A (ENSCHYG00000026108) C6orf118 (ENSCHYG00000026045) QKI (ENSCHYG00000026014) PACRG (ENSCHYG00000025979) PRKN (ENSCHYG00000025824) AGPAT4 (ENSCHYG00000025772) ##22 MAP3K4 (ENSCHYG00000025579) ENSCHYG00000025465 SLC22A3 (ENSCHYG00000025420) SLC22A2 (ENSCHYG00000025351) SLC22A1 (ENSCHYG00000025285) IGF2R (ENSCHYG00000023202) MAS1 (ENSCHYG00000022925) PNLDC1 (ENSCHYG00000022800) MRPL18 (ENSCHYG00000022773) TCP1 (ENSCHYG00000022554) ACAT2 (ENSCHYG00000022487) WTAP (ENSCHYG00000022403) ENSCHYG00000022090 FNDC1 (ENSCHYG00000021187) ENSCHYG00000021069 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a.c ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Siberian musk deer MODERN SPECIES 61 TTLL2 (ENSMMSG00000004233) GPR31 (ENSMMSG00000004230) CCR6 (ENSMMSG00000004222) CEP43 (ENSMMSG00000004190) RNASET2 (ENSMMSG00000004161) RPS6KA2 (ENSMMSG00000004107) MPC1 (ENSMMSG00000004070) ENSMMSG00000004063 TBXT (ENSMMSG00000004018) PDE10A (ENSMMSG00000003706) C6orf118 (ENSMMSG00000003599) QKI (ENSMMSG00000003545) PACRG (ENSMMSG00000003517) ENSMMSG00000003500 PRKN (ENSMMSG00000003365) AGPAT4 (ENSMMSG00000003318) ##22 MAP3K4 (ENSMMSG00000002913) ENSMMSG00000002739 ENSMMSG00000002676 SLC22A3 (ENSMMSG00000002642) SLC22A2 (ENSMMSG00000002601) SLC22A1 (ENSMMSG00000002522) IGF2R (ENSMMSG00000002420) MAS1 (ENSMMSG00000002388) PNLDC1 (ENSMMSG00000002313) MRPL18 (ENSMMSG00000002291) TCP1 (ENSMMSG00000002241) ENSMMSG00000002220 WTAP (ENSMMSG00000002177) ENSMMSG00000002137 FNDC1 (ENSMMSG00000002110) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a.c.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a.c.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b.d ENSGT00390000011877 ENSGT00390000006208.a.f Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 24 GPR31 (ENSOARG00020026138) CCR6 (ENSOARG00020026137) CEP43 (ENSOARG00020026135) RNASET2 (ENSOARG00020026133) RPS6KA2 (ENSOARG00020026129) MPC1 (ENSOARG00020026121) ENSOARG00020026119 T (ENSOARG00020026117) ENSOARG00020026114 PDE10A (ENSOARG00020026110) C6orf118 (ENSOARG00020026106) QKI (ENSOARG00020026100) ENSOARG00020026099 PACRG (ENSOARG00020026098) PRKN (ENSOARG00020026093) AGPAT4 (ENSOARG00020026075) ##22 MAP3K4 (ENSOARG00020025996) ENSOARG00020025929 SLC22A3 (ENSOARG00020025917) SLC22A2 (ENSOARG00020025906) SLC22A1 (ENSOARG00020025899) IGF2R (ENSOARG00020007810) MAS1 (ENSOARG00020006641) PNLDC1 (ENSOARG00020006365) MRPL18 (ENSOARG00020006305) TCP1 (ENSOARG00020006218) ENSOARG00020006176 WTAP (ENSOARG00020006133) SOD2 (ENSOARG00020006059) ENSOARG00020006017 ENSOARG00020005992 Goat MODERN SPECIES 28 ENSCHIG00000010788 TBXT (ENSCHIG00000011143) ENSCHIG00000021177 ENSCHIG00000005334 ENSCHIG00000021845 PDE10A (ENSCHIG00000022822) C6orf118 (ENSCHIG00000013027) ENSCHIG00000012121 QKI (ENSCHIG00000018891) ENSCHIG00000015636 ENSCHIG00000022840 ENSCHIG00000010884 ENSCHIG00000016416 ENSCHIG00000025260 ENSCHIG00000020982 AGPAT4 (ENSCHIG00000016729) ##22 ENSCHIG00000024395 MAP3K4 (ENSCHIG00000009330) ENSCHIG00000011198 SLC22A3 (ENSCHIG00000021136) SLC22A2 (ENSCHIG00000006824) SLC22A1 (ENSCHIG00000014819) IGF2R (ENSCHIG00000010830) MAS1 (ENSCHIG00000012964) PNLDC1 (ENSCHIG00000003141) ENSCHIG00000023286 TCP1 (ENSCHIG00000016503) ENSCHIG00000017426 ENSCHIG00000026430 SOD2 (ENSCHIG00000009947) ENSCHIG00000010882 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a.c.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 American bison MODERN SPECIES 2999 C6orf118 (ENSBBBG00000015578) ENSBBBG00000015582 QKI (ENSBBBG00000015623) PACRG (ENSBBBG00000015645) PRKN (ENSBBBG00000015746) ENSBBBG00000015762 ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00960000189610 ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a.c.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00960000189610 ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a.c.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00390000006208.a.f Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 28 GPR31 (ENSBIXG00005012976) CCR6 (ENSBIXG00005007110) CEP43 (ENSBIXG00005013080) RNASET2 (ENSBIXG00005013120) RPS6KA2 (ENSBIXG00005013242) MPC1 (ENSBIXG00005006802) SFT2D1 (ENSBIXG00005013324) TBXT (ENSBIXG00005013358) PDE10A (ENSBIXG00005013474) C6orf118 (ENSBIXG00005013567) ENSBIXG00005001665 QKI (ENSBIXG00005007533) ENSBIXG00005013801 PACRG (ENSBIXG00005013833) PRKN (ENSBIXG00005007712) AGPAT4 (ENSBIXG00005014474) ##22 ENSBIXG00005006130 MAP3K4 (ENSBIXG00005002084) ENSBIXG00005007542 SLC22A3 (ENSBIXG00005014926) SLC22A2 (ENSBIXG00005006381) SLC22A1 (ENSBIXG00005015034) IGF2R (ENSBIXG00005015279) MAS1 (ENSBIXG00005015332) PNLDC1 (ENSBIXG00005015403) MRPL18 (ENSBIXG00005015451) TCP1 (ENSBIXG00005015526) ENSBIXG00005006136 ENSBIXG00005015570 WTAP (ENSBIXG00005015616) ENSBIXG00005005505 Cow MODERN SPECIES 28 TTLL2 (ENSBTAG00000031481) GPR31 (ENSBTAG00000014497) CCR6 (ENSBTAG00000014496) ENSBTAG00000054087 CEP43 (ENSBTAG00000014495) RNASET2 (ENSBTAG00000014494) RPS6KA2 (ENSBTAG00000021741) MPC1 (ENSBTAG00000027879) SFT2D1 (ENSBTAG00000002993) TBXT (ENSBTAG00000018681) PDE10A (ENSBTAG00000007758) C9H6orf118 (ENSBTAG00000015485) QKI (ENSBTAG00000011593) PACRG (ENSBTAG00000011106) PRKN (ENSBTAG00000018996) AGPAT4 (ENSBTAG00000007668) ##22 ENSBTAG00000052236 MAP3K4 (ENSBTAG00000020079) PLG (ENSBTAG00000001271) SLC22A3 (ENSBTAG00000039080) SLC22A2 (ENSBTAG00000009583) SLC22A1 (ENSBTAG00000008540) IGF2R (ENSBTAG00000002402) MAS1 (ENSBTAG00000031724) PNLDC1 (ENSBTAG00000015166) MRPL18 (ENSBTAG00000001289) TCP1 (ENSBTAG00000002829) ACAT2 (ENSBTAG00000002827) WTAP (ENSBTAG00000007974) SOD2 (ENSBTAG00000006523) ENSBTAG00000052316 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00960000189610 ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a.c.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.a.a.b ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Domestic yak MODERN SPECIES 1 CCR6 (ENSBGRG00000012482) CEP43 (ENSBGRG00000012562) ENSBGRG00000012908 RPS6KA2 (ENSBGRG00000013026) MPC1 (ENSBGRG00000013665) ENSBGRG00000013792 TBXT (ENSBGRG00000013963) ENSBGRG00000014027 PDE10A (ENSBGRG00000014116) C6orf118 (ENSBGRG00000014805) QKI (ENSBGRG00000015040) ENSBGRG00000015527 PACRG (ENSBGRG00000015551) PRKN (ENSBGRG00000015642) ENSBGRG00000016774 AGPAT4 (ENSBGRG00000016794) ##22 MAP3K4 (ENSBGRG00000017036) ENSBGRG00000020575 ENSBGRG00000020646 SLC22A3 (ENSBGRG00000020975) SLC22A2 (ENSBGRG00000021163) SLC22A1 (ENSBGRG00000021387) IGF2R (ENSBGRG00000021970) ENSBGRG00000026486 MAS1 (ENSBGRG00000026489) PNLDC1 (ENSBGRG00000026494) MRPL18 (ENSBGRG00000026525) TCP1 (ENSBGRG00000026527) ENSBGRG00000026550 ENSBGRG00000026557 ENSBGRG00000026563 Wild yak MODERN SPECIES 1168 ENSBMUG00000003343 ##22 ENSBMUG00000003268 MAP3K4 (ENSBMUG00000003212) ENSBMUG00000003160 SLC22A3 (ENSBMUG00000003131) SLC22A2 (ENSBMUG00000003107) SLC22A1 (ENSBMUG00000003078) IGF2R (ENSBMUG00000003027) MAS1 (ENSBMUG00000002956) PNLDC1 (ENSBMUG00000002939) MRPL18 (ENSBMUG00000002874) TCP1 (ENSBMUG00000002835) ACAT2 (ENSBMUG00000002762) ENSBMUG00000002743 SOD2 (ENSBMUG00000002696) ENSBMUG00000002680 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162752 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988.i.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063359.A ENSGT00940000162752 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988.j ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Megabat MODERN SPECIES 3507 AGPAT4 (ENSPVAG00000017059) ##22 MAP3K4 (ENSPVAG00000017058) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063359.A ENSGT00940000162752 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988.j ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 QKI (ENSRFEG00010008753) PACRG (ENSRFEG00010008690) PRKN (ENSRFEG00010008431) AGPAT4 (ENSRFEG00010008317) ##22 MAP3K4 (ENSRFEG00010007347) ENSRFEG00010007176 SLC22A3 (ENSRFEG00010007045) ENSRFEG00010007005 SLC22A2 (ENSRFEG00010006879) SLC22A1 (ENSRFEG00010006710) IGF2R (ENSRFEG00010006536) MAS1 (ENSRFEG00010006507) PNLDC1 (ENSRFEG00010006385) MRPL18 (ENSRFEG00010006349) ENSRFEG00010006182 ACAT2 (ENSRFEG00010006101) ENSRFEG00010006054 SOD2 (ENSRFEG00010005963) FNDC1 (ENSRFEG00010005884) Microbat MODERN SPECIES 1670 AGPAT4 (ENSMLUG00000023974) ##22 MAP3K4 (ENSMLUG00000014478) ENSMLUG00000010626 SLC22A3 (ENSMLUG00000005566) Equus ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988.i.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00690000103860 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000013931.a.a.b ENSGT00390000011877 Horse MODERN SPECIES 24 ENSECAG00000003447 GPR31 (ENSECAG00000005409) CCR6 (ENSECAG00000005185) CEP43 (ENSECAG00000019040) RNASET2 (ENSECAG00000038762) RPS6KA2 (ENSECAG00000020508) MPC1 (ENSECAG00000020275) SFT2D1 (ENSECAG00000019479) ENSECAG00000028989 TBXT (ENSECAG00000007994) PDE10A (ENSECAG00000008004) C31H6orf118 (ENSECAG00000000126) QKI (ENSECAG00000017504) PACRG (ENSECAG00000014308) PRKN (ENSECAG00000004645) AGPAT4 (ENSECAG00000001189) ##22 MAP3K4 (ENSECAG00000012724) ENSECAG00000031093 ENSECAG00000007979 SLC22A3 (ENSECAG00000004372) SLC22A2 (ENSECAG00000021017) SLC22A1 (ENSECAG00000016404) ENSECAG00000044529 IGF2R (ENSECAG00000019509) MAS1 (ENSECAG00000028126) PNLDC1 (ENSECAG00000012898) MRPL18 (ENSECAG00000012515) TCP1 (ENSECAG00000017953) WTAP (ENSECAG00000003471) SOD2 (ENSECAG00000011797) FNDC1 (ENSECAG00000000239) Donkey MODERN SPECIES 20 ENSEASG00005027533 CCR6 (ENSEASG00005028790) CEP43 (ENSEASG00005000363) RNASET2 (ENSEASG00005000345) RPS6KA2 (ENSEASG00005000339) ENSEASG00005029716 SFT2D1 (ENSEASG00005028687) ENSEASG00005011917 ENSEASG00005000239 TBXT (ENSEASG00005000114) PDE10A (ENSEASG00005019729) C6orf118 (ENSEASG00005019727) QKI (ENSEASG00005019724) PACRG (ENSEASG00005019723) PRKN (ENSEASG00005019721) ENSEASG00005019711 ##22 ENSEASG00005019709 MAP3K4 (ENSEASG00005019701) ENSEASG00005019697 SLC22A3 (ENSEASG00005019679) SLC22A2 (ENSEASG00005019670) SLC22A1 (ENSEASG00005019667) IGF2R (ENSEASG00005019232) MAS1 (ENSEASG00005019033) PNLDC1 (ENSEASG00005019029) ENSEASG00005028667 TCP1 (ENSEASG00005019021) ACAT2 (ENSEASG00005019019) WTAP (ENSEASG00005024385) ENSEASG00005023660 ENSEASG00005019012 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Caniformia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000171186 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000171186 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT01030000234985 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B American mink MODERN SPECIES 4 ENSNVIG00000010918 AGPAT4 (ENSNVIG00000010903) ##22 ENSNVIG00000010894 MAP3K4 (ENSNVIG00000010747) ENSNVIG00000010704 SLC22A3 (ENSNVIG00000010693) SLC22A2 (ENSNVIG00000010662) SLC22A1 (ENSNVIG00000010572) IGF2R (ENSNVIG00000010447) MAS1 (ENSNVIG00000010425) PNLDC1 (ENSNVIG00000010375) RM18 (ENSNVIG00000010351) TCP1 (ENSNVIG00000010276) ACAT2 (ENSNVIG00000010262) WTAP (ENSNVIG00000010202) SODM (ENSNVIG00000010142) ENSNVIG00000010133 Ferret MODERN SPECIES 321 ENSMPUG00000004593 ENSMPUG00000004595 ENSMPUG00000004601 AGPAT4 (ENSMPUG00000004604) ##22 MAP3K4 (ENSMPUG00000004612) ENSMPUG00000004632 SLC22A3 (ENSMPUG00000004654) SLC22A2 (ENSMPUG00000004670) SLC22A1 (ENSMPUG00000004685) IGF2R (ENSMPUG00000004888) ENSMPUG00000019615 MAS1 (ENSMPUG00000019617) PNLDC1 (ENSMPUG00000004920) MRPL18 (ENSMPUG00000005009) TCP1 (ENSMPUG00000005020) ACAT2 (ENSMPUG00000005030) WTAP (ENSMPUG00000005036) SOD2 (ENSMPUG00000005045) FNDC1 (ENSMPUG00000005104) Ursidae ANCESTRAL SPECIES 22 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ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 American black bear MODERN SPECIES 693 ENSUAMG00000005980 AGPAT4 (ENSUAMG00000005982) ##22 MAP3K4 (ENSUAMG00000006056) ENSUAMG00000006178 SLC22A3 (ENSUAMG00000006181) Polar bear MODERN SPECIES 150 MPC1 (ENSUMAG00000011553) ENSUMAG00000011556 TBXT (ENSUMAG00000011569) ENSUMAG00000011603 PDE10A (ENSUMAG00000011612) C6orf118 (ENSUMAG00000011626) ENSUMAG00000011639 QKI (ENSUMAG00000011658) ENSUMAG00000011678 ENSUMAG00000011681 ENSUMAG00000011688 ENSUMAG00000011694 ENSUMAG00000011702 ENSUMAG00000011710 ENSUMAG00000011729 AGPAT4 (ENSUMAG00000011739) ##22 MAP3K4 (ENSUMAG00000011760) ENSUMAG00000011793 SLC22A3 (ENSUMAG00000011813) SLC22A2 (ENSUMAG00000011818) SLC22A1 (ENSUMAG00000011827) IGF2R (ENSUMAG00000011876) MAS1 (ENSUMAG00000011898) PNLDC1 (ENSUMAG00000011903) MRPL18 (ENSUMAG00000011916) TCP1 (ENSUMAG00000011924) ACAT2 (ENSUMAG00000011942) ENSUMAG00000011954 WTAP (ENSUMAG00000011957) SOD2 (ENSUMAG00000011961) FNDC1 (ENSUMAG00000011974) Giant Panda MODERN SPECIES 1 CCR6 (ENSAMEG00000028123) ENSAMEG00000009406 ENSAMEG00000009382 ENSAMEG00000009376 RPS6KA2 (ENSAMEG00000009322) MPC1 (ENSAMEG00000009318) SFT2D1 (ENSAMEG00000009311) TBXT (ENSAMEG00000009278) PDE10A (ENSAMEG00000008225) C6orf118 (ENSAMEG00000008271) ENSAMEG00000028308 ENSAMEG00000027289 QKI (ENSAMEG00000008459) PACRG (ENSAMEG00000008449) PRKN (ENSAMEG00000015876) ENSAMEG00000015885 ##22 MAP3K4 (ENSAMEG00000015908) ENSAMEG00000015960 SLC22A3 (ENSAMEG00000015037) SLC22A2 (ENSAMEG00000015045) SLC22A1 (ENSAMEG00000015110) IGF2R (ENSAMEG00000015172) MAS1 (ENSAMEG00000019584) PNLDC1 (ENSAMEG00000015371) MRPL18 (ENSAMEG00000015398) TCP1 (ENSAMEG00000015405) ACAT2 (ENSAMEG00000015430) WTAP (ENSAMEG00000025264) ENSAMEG00000015466 FNDC1 (ENSAMEG00000003564) TAGAP (ENSAMEG00000009357) Canidae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00530000063927.a.a ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000157912 ENSGT00940000171186 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 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(ENSFCAG00000002851) IGF2R (ENSFCAG00000002850) MAS1 (ENSFCAG00000002849) PNLDC1 (ENSFCAG00000002848) MRPL18 (ENSFCAG00000002847) TCP1 (ENSFCAG00000002846) ACAT2 (ENSFCAG00000002845) WTAP (ENSFCAG00000002844) SOD2 (ENSFCAG00000002843) FNDC1 (ENSFCAG00000022317) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00690000103860 ENSGT00940000157912 ENSGT00420000030417 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00940000168329 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 113 ENSGT00940000162166 ENSGT00940000155237 ENSGT00940000162752 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00940000168329 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 116 ENSGT00940000162166 ENSGT00940000155237 ENSGT00940000162752 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00940000168329 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B ENSGT00940000157993 Elephant MODERN SPECIES 520 TTLL2 (ENSLAFG00000011626) GPR31 (ENSLAFG00000022903) CCR6 (ENSLAFG00000020827) CEP43 (ENSLAFG00000008016) RNASET2 (ENSLAFG00000003359) RPS6KA2 (ENSLAFG00000027838) MPC1 (ENSLAFG00000025901) ENSLAFG00000027160 TBXT (ENSLAFG00000012505) ENSLAFG00000001674 C6orf118 (ENSLAFG00000001672) QKI (ENSLAFG00000021654) PACRG (ENSLAFG00000002732) ENSLAFG00000003358 ENSLAFG00000031170 AGPAT4 (ENSLAFG00000021414) ##22 MAP3K4 (ENSLAFG00000012768) ENSLAFG00000004237 SLC22A3 (ENSLAFG00000005825) SLC22A2 (ENSLAFG00000011288) SLC22A1 (ENSLAFG00000011681) IGF2R (ENSLAFG00000017191) MAS1 (ENSLAFG00000001539) PNLDC1 (ENSLAFG00000030189) MRPL18 (ENSLAFG00000002501) TCP1 (ENSLAFG00000007909) ACAT2 (ENSLAFG00000007904) WTAP (ENSLAFG00000007335) SOD2 (ENSLAFG00000007331) ENSLAFG00000022877 TAGAP (ENSLAFG00000026460) Hyrax MODERN SPECIES 7621 ENSPCAG00000002038 ##22 MAP3K4 (ENSPCAG00000001937) Tenrec MODERN SPECIES 6870 AGPAT4 (ENSETEG00000011059) ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 318 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00390000013931.a.b.b ENSGT00390000011877 Armadillo MODERN SPECIES 652 ENSDNOG00000043706 ENSDNOG00000037179 AGPAT4 (ENSDNOG00000047534) ##22 MAP3K4 (ENSDNOG00000007023) ENSDNOG00000041736 SLC22A3 (ENSDNOG00000015801) SLC22A2 (ENSDNOG00000016557) SLC22A1 (ENSDNOG00000036200) IGF2R (ENSDNOG00000000201) MAS1 (ENSDNOG00000006126) ENSDNOG00000044887 ENSDNOG00000037005 PNLDC1 (ENSDNOG00000013709) MRPL18 (ENSDNOG00000036148) ENSDNOG00000049693 SOD2 (ENSDNOG00000040082) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00940000168329 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a.ab ENSGT01030000234639.A.a.`b.a.b ENSGT01030000234639.A.a.`b.a.a.b ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.a Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00990000203619.A.b.b.a ENSGT01030000234667.b ENSGT00390000007441 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00940000168329 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT01030000234985 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a.ab ENSGT01030000234639.A.a.`b.a.b ENSGT01030000234639.A.a.`b.a.a.b ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.a Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00940000168329 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a.ab ENSGT01030000234639.A.a.`b.a.a.b ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.a ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00940000168329 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 ENSGT00940000155089 ENSGT00940000162065 ENSGT00390000013943 ENSGT01030000234639.A.a.ab ENSGT01030000234639.A.a.`b.a.a.b ENSGT00940000153167.A.a ENSGT00390000006394 ENSGT00550000074878 ENSGT01030000234626.B ENSGT00390000013931.a.a ENSGT00390000011877 ENSGT00530000063558.B Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1190 ENSVURG00010018440 ENSVURG00010018398 ENSVURG00010018380 ENSVURG00010018374 ENSVURG00010018366 ENSVURG00010018363 ENSVURG00010018358 ENSVURG00010018354 ENSVURG00010018341 ENSVURG00010018331 ENSVURG00010018324 ENSVURG00010018319 ENSVURG00010018316 ENSVURG00010018308 ENSVURG00010018305 ENSVURG00010018293 ##22 ENSVURG00010018264 ENSVURG00010018243 ENSVURG00010018231 ENSVURG00010018225 ENSVURG00010018160 ENSVURG00010018143 ENSVURG00010018103 ENSVURG00010018091 ENSVURG00010018086 ENSVURG00010018079 ENSVURG00010018062 ENSVURG00010018050 ENSVURG00010018037 ENSVURG00010018030 ENSVURG00010017990 Common wonbat MODERN SPECIES 1190 ENSVURG00010019252 ENSVURG00010019245 ENSVURG00010019237 ENSVURG00010019227 ENSVURG00010019224 ENSVURG00010019222 ENSVURG00010019218 ENSVURG00010019215 ENSVURG00010019211 ##22 ENSVURG00010019181 ENSVURG00010019170 ENSVURG00010019160 ENSVURG00010019143 ENSVURG00010019132 ENSVURG00010019080 ENSVURG00010019063 ENSVURG00010019059 ENSVURG00010019052 ENSVURG00010019037 ENSVURG00010019031 ENSVURG00010019020 ENSVURG00010019015 ENSVURG00010019008 ENSVURG00010019003 koala MODERN SPECIES 25 QKI (ENSPCIG00000020191) ENSPCIG00000031508 ENSPCIG00000034977 ENSPCIG00000006522 ENSPCIG00000006520 ENSPCIG00000022936 ENSPCIG00000019683 AGPAT4 (ENSPCIG00000019684) ##22 MAP3K4 (ENSPCIG00000019688) ENSPCIG00000019697 SLC22A3 (ENSPCIG00000019698) SLC22A2 (ENSPCIG00000004270) SLC22A1 (ENSPCIG00000019702) IGF2R (ENSPCIG00000019709) MAS1 (ENSPCIG00000019932) ENSPCIG00000007796 PNLDC1 (ENSPCIG00000023412) MRPL18 (ENSPCIG00000003362) TCP1 (ENSPCIG00000029421) ACAT2 (ENSPCIG00000029405) ENSPCIG00000029403 SOD2 (ENSPCIG00000029402) FNDC1 (ENSPCIG00000029395) Wallaby MODERN SPECIES 490 AGPAT4 (ENSMEUG00000004334) ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 ENSSHAG00000013247 ENSSHAG00000021292 CCR6 (ENSSHAG00000012662) CEP43 (ENSSHAG00000011825) RNASET2 (ENSSHAG00000011073) RPS6KA2 (ENSSHAG00000006398) ENSSHAG00000022097 SFT2D1 (ENSSHAG00000027257) ENSSHAG00000025239 TBXT (ENSSHAG00000018904) ENSSHAG00000024973 PDE10A (ENSSHAG00000018469) ENSSHAG00000018375 QKI (ENSSHAG00000028391) PACRG (ENSSHAG00000024668) AGPAT4 (ENSSHAG00000005957) ##22 ENSSHAG00000029251 ENSSHAG00000025577 ENSSHAG00000004375 ENSSHAG00000021967 ENSSHAG00000000112 SLC22A3 (ENSSHAG00000016633) SLC22A2 (ENSSHAG00000016344) SLC22A1 (ENSSHAG00000016135) IGF2R (ENSSHAG00000015828) MAS1 (ENSSHAG00000001441) ENSSHAG00000022705 ENSSHAG00000026410 ENSSHAG00000031794 PNLDC1 (ENSSHAG00000015192) TCP1 (ENSSHAG00000002185) Opossum MODERN SPECIES 1 SFT2D1 (ENSMODG00000025689) TBXT (ENSMODG00000006318) ENSMODG00000006322 PDE10A (ENSMODG00000006355) ENSMODG00000006367 QKI (ENSMODG00000006434) ENSMODG00000049428 ENSMODG00000023273 ENSMODG00000040616 ENSMODG00000047373 ENSMODG00000043631 ENSMODG00000023274 ENSMODG00000006493 ENSMODG00000029680 ENSMODG00000027665 AGPAT4 (ENSMODG00000006531) ##22 MAP3K4 (ENSMODG00000006594) ENSMODG00000006692 SLC22A3 (ENSMODG00000006771) SLC22A2 (ENSMODG00000006806) SLC22A1 (ENSMODG00000006918) IGF2R (ENSMODG00000007100) ENSMODG00000048306 MAS1 (ENSMODG00000007377) ENSMODG00000023275 ENSMODG00000007388 PNLDC1 (ENSMODG00000007420) MRPL18 (ENSMODG00000007428) TCP1 (ENSMODG00000007478) ACAT2 (ENSMODG00000007156) ENSMODG00000045208 Anura ANCESTRAL SPECIES 240 ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000163882.a.a ENSGT00940000155310.b ENSGT00940000157330 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155208 ENSGT00940000160810 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 ENSLLEG00000013843 ENSLLEG00000014174 ENSLLEG00000014215 TAAR1 (ENSLLEG00000014417) ENSLLEG00000014439 ENSLLEG00000014454 ENSLLEG00000014505 ENSLLEG00000014525 ENSLLEG00000014550 STX7 (ENSLLEG00000014610) MOXD1 (ENSLLEG00000014697) QKI (ENSLLEG00000014886) ENSLLEG00000015474 ENSLLEG00000015527 ENSLLEG00000015637 ENSLLEG00000015794 ##22 MAP3K4 (ENSLLEG00000015990) ENSLLEG00000016901 ENSLLEG00000017052 ENSLLEG00000017118 SLC22A3 (ENSLLEG00000018138) ENSLLEG00000018342 NUP43 (ENSLLEG00000018391) LATS1 (ENSLLEG00000018651) KATNA1 (ENSLLEG00000018727) GINM1 (ENSLLEG00000019103) PPIL4 (ENSLLEG00000019229) TAB2 (ENSLLEG00000019418) UST (ENSLLEG00000014517) ENSLLEG00000014629 ENSLLEG00000014695 Frog MODERN SPECIES 5 cebpz (ENSXETG00000000654) rps6ka2 (ENSXETG00000025994) trim50 (ENSXETG00000041526) mpc1 (ENSXETG00000025990) ENSXETG00000036896 sft2d1 (ENSXETG00000026578) PRR18 (ENSXETG00000037784) tbxt (ENSXETG00000026572) ENSXETG00000042559 pde10a (ENSXETG00000005369) c6orf118 (ENSXETG00000005368) ENSXETG00000005367 qki (ENSXETG00000015705) pacrg (ENSXETG00000010781) ENSXETG00000047260 agpat4 (ENSXETG00000013131) ##22 scaf8 (ENSXETG00000013132) cnksr3 (ENSXETG00000023302) unc93a.1 (ENSXETG00000044848) afdn (ENSXETG00000023305) XB22065091 [provisional:unc93a] (ENSXETG00000034497) capn9 (ENSXETG00000023310) taf5l (ENSXETG00000023330) urb2 (ENSXETG00000023331) galnt2 (ENSXETG00000023332) pgbd5 (ENSXETG00000023336) pdgfrl.2 (ENSXETG00000023338) pigh (ENSXETG00000032968) cog2 (ENSXETG00000023340) ENSXETG00000045614 tmem181 (ENSXETG00000023341) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000157057 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000159956 ENSGT00510000046988 ENSGT00530000064569.b ENSGT00530000064569.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00390000002164.a ENSGT00940000157912 ENSGT00420000030417 ENSGT00940000156543 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000155310.a.b ENSGT01030000236263 ENSGT00390000011034 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00390000003939 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.C.b.a ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000177029 ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433 ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00880000138034 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787 ENSGT00950000183181.A.a ENSGT00390000018436.a.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000176000 ENSGT00940000158952 ENSGT00940000163749 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00940000177029.b ENSGT00940000177029.a.b ENSGT00940000159080 ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000165701 ENSGT00900000143203 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00950000183181.A.a ENSGT00390000000411 ENSGT00390000018436.a.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00730000111139 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00940000154292.a.b ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00990000204854 ENSGT00940000165701 ENSGT00900000143203 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00950000183136.b.a.a Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00390000008727.a.a.d.j ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308 ENSGT00940000179915 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00950000183136.b.a.a ENSGT00940000163741 ENSGT00940000160615.a.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 138 ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00990000204854 ENSGT00940000165701 ENSGT00390000008727.a.a.d.j ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00950000183136.b.a.a ENSGT00940000165329 ENSGT00940000155080 ENSGT00950000183045.A.a.b ENSGT00940000157134 Denticle herring MODERN SPECIES 18 pdlim1 (ENSDCDG00000029959) neurog3 (ENSDCDG00000029958) sgpl1 (ENSDCDG00000029583) pcbd1 (ENSDCDG00000029543) ENSDCDG00000029537 ret (ENSDCDG00000029480) ENSDCDG00000029471 bag2 (ENSDCDG00000029470) rab23 (ENSDCDG00000029469) prim2 (ENSDCDG00000029451) khdrbs2 (ENSDCDG00000029444) ENSDCDG00000029443 ENSDCDG00000029441 ENSDCDG00000029433 THBS2 (ENSDCDG00000026108) agpat4 (ENSDCDG00000026056) ##22 ENSDCDG00000022901 kcnk1b (ENSDCDG00000022861) SLC35F3 (ENSDCDG00000022850) TARBP1 (ENSDCDG00000022839) zgc:172136 (ENSDCDG00000022833) ENSDCDG00000022830 ENSDCDG00000022827 ENSDCDG00000022824 smc2 (ENSDCDG00000022793) exoc1l (ENSDCDG00000022783) ppp1r21 (ENSDCDG00000022775) STON1 (ENSDCDG00000022768) gtf2a1l (ENSDCDG00000022763) LHCGR (ENSDCDG00000022642) nrxn1b (ENSDCDG00000017362) Atlantic herring MODERN SPECIES 4 ENSCHAG00000018968 ENSCHAG00000018924 ENSCHAG00000018917 ENSCHAG00000018901 ENSCHAG00000018893 KLHDC3 (ENSCHAG00000018840) ntpcr (ENSCHAG00000018718) ENSCHAG00000018713 SIPA1L2 (ENSCHAG00000018366) disc1 (ENSCHAG00000018320) tsnax (ENSCHAG00000018291) EGLN1 (ENSCHAG00000018286) las1l (ENSCHAG00000018125) ENSCHAG00000018089 THBS2 (ENSCHAG00000014817) agpat4 (ENSCHAG00000014770) ##22 ENSCHAG00000014747 ENSCHAG00000011519 kcnk1b (ENSCHAG00000011473) ENSCHAG00000011465 SLC35F3 (ENSCHAG00000011448) TARBP1 (ENSCHAG00000011158) zgc:172136 (ENSCHAG00000011137) fam135a (ENSCHAG00000010730) ENSCHAG00000010430 ENSCHAG00000010410 lmbrd1 (ENSCHAG00000009648) ADGRB3 (ENSCHAG00000007746) zgc:171579 (ENSCHAG00000007666) ENSCHAG00000007565 ENSCHAG00000007525 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 290 ENSGT00390000008727.a.a.d.j ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939.d ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00390000003939.c ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308 ENSGT00940000159722 ENSGT00950000183015.E ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00950000183136.b.a.a ENSGT00940000163741 ENSGT00940000160615.a.b ENSGT00940000155080 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 184 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00990000204854 ENSGT00940000165701 ENSGT00390000008727.a.a.d.j ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939.c ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00950000183136.b.a.a ENSGT00940000163741 Channel catfish MODERN SPECIES 21 fam135a (ENSIPUG00000006232) col9a1b (ENSIPUG00000006205) ENSIPUG00000006133 ENSIPUG00000006037 ENSIPUG00000006013 lmbrd1 (ENSIPUG00000005952) ENSIPUG00000005945 ENSIPUG00000005931 adgrb3 (ENSIPUG00000005725) ENSIPUG00000005703 ENSIPUG00000005689 ENSIPUG00000005673 ENSIPUG00000005652 phf3 (ENSIPUG00000005640) ENSIPUG00000005623 agpat4 (ENSIPUG00000005567) ##22 ENSIPUG00000005543 map3k4 (ENSIPUG00000005397) ENSIPUG00000005363 ENSIPUG00000005249 gsg2 (ENSIPUG00000005225) ENSIPUG00000005213 fam184b (ENSIPUG00000005146) ENSIPUG00000005124 tasp1 (ENSIPUG00000005087) memo1 (ENSIPUG00000005003) ENSIPUG00000004914 cntnap2a (ENSIPUG00000004904) clrn2 (ENSIPUG00000004899) kitb (ENSIPUG00000004870) clockb (ENSIPUG00000004843) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00530000063669.a ENSGT00990000210864 ENSGT00390000013015 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00990000204854 ENSGT00940000165701 ENSGT00390000008727.a.a.d.j ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939.c ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000162809 ENSGT00950000183136.b.a.a ENSGT00940000163741 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT00390000013015 ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00990000204854 ENSGT00940000165701 ENSGT00390000008727.a.a.d.j ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939.c ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00950000183136.b.a.a ENSGT00940000163741 ENSGT00940000160615.a.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1344 ENSPNAG00000000137 agpat4 (ENSPNAG00000007350) ##22 ENSPNAG00000007351 ENSPNAG00000000138 Mexicana tetra MODERN SPECIES 13 clrn2 (ENSAMXG00000037433) ENSAMXG00000036145 ENSAMXG00000036980 btr12 (ENSAMXG00000038643) ENSAMXG00000032084 znf219 (ENSAMXG00000018227) ENSAMXG00000018215 exoc1l (ENSAMXG00000033109) smc2 (ENSAMXG00000008142) ecpas (ENSAMXG00000018201) FBXO10 (ENSAMXG00000018193) polr1e (ENSAMXG00000018181) tmem192 (ENSAMXG00000030933) apela (ENSAMXG00000035843) ENSAMXG00000042812 agpat4 (ENSAMXG00000018114) ##22 ENSAMXG00000018100 kcnk1b (ENSAMXG00000042820) SLC35F3 (ENSAMXG00000031229) ENSAMXG00000034261 ENSAMXG00000018028 zgc:172136 (ENSAMXG00000036110) fam135a (ENSAMXG00000035633) col9a1b (ENSAMXG00000009370) ENSAMXG00000009334 ENSAMXG00000032856 ENSAMXG00000009317 lmbrd1 (ENSAMXG00000030194) ADGRB3 (ENSAMXG00000009253) zgc:171579 (ENSAMXG00000024891) ENSAMXG00000009251 Electric eel MODERN SPECIES 262 ENSEEEG00000024188 ENSEEEG00000024187 sfrp2 (ENSEEEG00000024186) arfip1 (ENSEEEG00000024185) FHDC1 (ENSEEEG00000024184) ENSEEEG00000024183 ENSEEEG00000024182 ENSEEEG00000024181 ENSEEEG00000024178 ENSEEEG00000024175 agpat4 (ENSEEEG00000024172) ##22 ENSEEEG00000024170 ENSEEEG00000024112 kcnk1b (ENSEEEG00000024098) SLC35F3 (ENSEEEG00000024097) ENSEEEG00000024096 TARBP1 (ENSEEEG00000024095) zgc:172136 (ENSEEEG00000024094) fam135a (ENSEEEG00000024089) ENSEEEG00000024084 ENSEEEG00000024081 lmbrd1 (ENSEEEG00000024058) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00950000183045.B ENSGT00940000159062 ENSGT00940000158513 ENSGT00940000156461 ENSGT00940000166212 ENSGT00390000016400 ENSGT00390000007214 ENSGT00950000182886.b.a.a ENSGT00390000006408 ENSGT00390000012017.f ENSGT00390000012017.e ENSGT00940000157846.c ENSGT00390000011433.s.a ENSGT00390000007723 ENSGT00530000063603.B ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000165701 ENSGT00990000204854 ENSGT00940000158858 ENSGT00940000158613.l ENSGT00390000005318.b.b.b.a ENSGT01030000234567.A.a.a.a.a.a ENSGT00940000154641.B.b ENSGT01100000263652 ENSGT00940000154782.d ENSGT00940000157417 ENSGT00390000017666 ENSGT00940000161472 ENSGT00940000158243 ENSGT00940000157547 ENSGT00520000055955 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000157404.d ENSGT00950000183045.B.j ENSGT00940000159062.c.b ENSGT00940000158513.p ENSGT00940000156461.h ENSGT00940000166212.s.b ENSGT00390000016400.c ENSGT00390000007214.a ENSGT00950000182886.b.a.a.b ENSGT00390000006408.yb ENSGT00390000012017.e.b ENSGT00940000157846.c.a.a ENSGT00390000011433.s.a.b ENSGT00390000007723.e ENSGT00530000063603.B.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b.c ##22 ENSGT00940000165701.i ENSGT00940000155293.a.a.p.b ENSGT00940000158858.s ENSGT00940000158613.l.d ENSGT00390000005318.b.b.b.a.c ENSGT00940000154641.B.b.j ENSGT01100000263652.a ENSGT00940000154782.d.j.b ENSGT00940000157417.h ENSGT00390000017666.d ENSGT00940000161472.f ENSGT00940000158243.e ENSGT00940000157547.f ENSGT00520000055955.l ENSGT00940000155548.db Goldfish MODERN SPECIES 4 macrod2 (ENSCARG00000017197) tasp1 (ENSCARG00000016866) ism1 (ENSCARG00000016848) sptlc3 (ENSCARG00000016473) BTBD3 (ENSCARG00000016457) ENSCARG00000016449 jag1b (ENSCARG00000015951) slx4ip (ENSCARG00000015887) mkks (ENSCARG00000015881) srd5a2b (ENSCARG00000015876) memo1 (ENSCARG00000015855) ENSCARG00000015827 THBS2 (ENSCARG00000015197) PSME4 (ENSCARG00000013923) GPR75 (ENSCARG00000013856) agpat4 (ENSCARG00000013845) ##22 ENSCARG00000009930 ENSCARG00000009828 kcnk1b (ENSCARG00000009825) tacc3 (ENSCARG00000009814) mycla (ENSCARG00000009810) ENSCARG00000009805 mfsd2aa (ENSCARG00000009759) ENSCARG00000009746 ENSCARG00000009738 lgmn (ENSCARG00000008988) PCNX1 (ENSCARG00000007190) med6 (ENSCARG00000007037) TTC9 (ENSCARG00000007024) MAP3K9 (ENSCARG00000006874) slc8a3 (ENSCARG00000006857) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000157404.d ENSGT00950000183045.B.j ENSGT00940000159062.c.b ENSGT00940000158513.p ENSGT00940000156461.h ENSGT00940000166212.s.b ENSGT00390000016400.c ENSGT00390000007214.a ENSGT00950000182886.b.a.a.b ENSGT00390000006408.yb ENSGT00390000012017.e.b ENSGT00940000157846.c.a.a ENSGT00390000011433.s.a.b ENSGT00390000007723.e ENSGT00530000063603.B.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b.c ##22 ENSGT00940000165701.i ENSGT00990000204854 ENSGT00940000155293.a.a.p.b ENSGT00940000158858.s ENSGT00940000158613.l.d ENSGT00390000005318.b.b.b.a.c ENSGT00940000154641.B.b.j ENSGT01100000263652.a ENSGT00940000154782.d.j.b ENSGT00940000157417.h ENSGT00390000017666.d ENSGT00940000161472.f ENSGT00940000158243.e ENSGT00940000157547.f ENSGT00520000055955.l Common carp reference MODERN SPECIES 18 ENSCCRG00000075666 tasp1 (ENSCCRG00000024736) ism1 (ENSCCRG00000021140) sptlc3 (ENSCCRG00000070477) BTBD3 (ENSCCRG00000074403) jag1b (ENSCCRG00000018272) slx4ip (ENSCCRG00000078555) 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tasp1 (ENSCARG00000049659) ism1 (ENSCARG00000050343) sptlc3 (ENSCARG00000050374) BTBD3 (ENSCARG00000050841) jag1b (ENSCARG00000050888) slx4ip (ENSCARG00000051581) mkks (ENSCARG00000051601) srd5a2b (ENSCARG00000051672) memo1 (ENSCARG00000051685) ENSCARG00000051770 ENSCARG00000051875 PSME4 (ENSCARG00000053232) GPR75 (ENSCARG00000053908) erlec1 (ENSCARG00000053935) agpat4 (ENSCARG00000054151) ##22 ENSCARG00000054371 ENSCARG00000059045 kcnk1b (ENSCARG00000059057) tacc3 (ENSCARG00000059065) mycla (ENSCARG00000053201) mfsd2aa (ENSCARG00000053382) si:ch211-67f13.7 (ENSCARG00000054248) ENSCARG00000054260 ENSCARG00000054274 ENSCARG00000054303 lgmn (ENSCARG00000054344) PCNX1 (ENSCARG00000054813) med6 (ENSCARG00000057006) ENSCARG00000057187 MAP3K9 (ENSCARG00000057231) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 167 ENSGT00940000162838.g.b ENSGT00950000183045.B.i ENSGT00940000159062.c.a ENSGT00940000158513.o ENSGT00940000156461.g ENSGT00940000166212.s.a ENSGT00390000016400.d ENSGT00950000182886.b.a.a.a ENSGT00390000006408.`c ENSGT00390000012017.e.a.a ENSGT00390000012017.f ENSGT00940000157846.c.a.b ENSGT00390000011433.s.a.a ENSGT00390000007723.f ENSGT00530000063603.B.d ENSGT00950000182836.b.b.b.b.d ##22 ENSGT00940000165701.j ENSGT00940000155293.a.a.p.a ENSGT00940000158858.t ENSGT00940000158613.l.c ENSGT00390000005318.b.b.b.a.d ENSGT01030000234567.A.a.a.a.a.a ENSGT00940000154641.B.b.i ENSGT01100000263652.b ENSGT00940000154782.d.j.a ENSGT00940000157417.g ENSGT00390000017666.c ENSGT00940000161472.e ENSGT00940000158243.f ENSGT00940000157547.e ENSGT00520000055955.k Common carp reference MODERN SPECIES 48 flrt3 (ENSCCRG00000076283) tasp1 (ENSCCRG00000059408) KIF16B (ENSCCRG00000024733) ism1 (ENSCCRG00000024737) sptlc3 (ENSCCRG00000021300) BTBD3 (ENSCCRG00000069327) jag1b (ENSCCRG00000023729) srd5a2b (ENSCCRG00000023679) memo1 (ENSCCRG00000075241) ENSCCRG00000063034 ENSCCRG00000058068 ENSCCRG00000031090 PSME4 (ENSCCRG00000031275) ENSCCRG00000053798 erlec1 (ENSCCRG00000034613) agpat4 (ENSCCRG00000008078) ##22 ENSCCRG00000034742 ENSCCRG00000039474 kcnk1b (ENSCCRG00000077242) tacc3 (ENSCCRG00000004094) mycla (ENSCCRG00000004114) mfsd2aa (ENSCCRG00000004166) si:ch211-67f13.7 (ENSCCRG00000005476) ENSCCRG00000004993 ENSCCRG00000005494 ENSCCRG00000066742 lgmn (ENSCCRG00000057942) ENSCCRG00000003956 med6 (ENSCCRG00000060643) ENSCCRG00000082127 MAP3K9 (ENSCCRG00000040674) Golden-line barbel MODERN SPECIES 337 jag1b (ENSSGRG00000001565) slx4ip (ENSSGRG00000007966) srd5a2b (ENSSGRG00000007970) memo1 (ENSSGRG00000007974) ENSSGRG00000007977 ENSSGRG00000007979 ENSSGRG00000007994 PSME4 (ENSSGRG00000009040) GPR75 (ENSSGRG00000009345) erlec1 (ENSSGRG00000009346) agpat4 (ENSSGRG00000009351) ##22 ENSSGRG00000009638 kcnk1b (ENSSGRG00000009720) tacc3 (ENSSGRG00000009721) mfsd2aa (ENSSGRG00000009727) ENSSGRG00000009824 lgmn (ENSSGRG00000009826) PCNX1 (ENSSGRG00000010187) med6 (ENSSGRG00000011207) ENSSGRG00000011222 MAP3K9 (ENSSGRG00000011225) slc8a3 (ENSSGRG00000011236) cox16 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ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a.i ENSGT00940000159308.kb ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 ENSGT00940000177911 Yellowtail amberjack DUPLICATION Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2884 msh6 (ENSSLDG00000021628) ENSSLDG00000021561 FOXN2 (ENSSLDG00000021540) ppp1r21 (ENSSLDG00000021448) STON1 (ENSSLDG00000021433) gtf2a1l (ENSSLDG00000021374) LHCGR (ENSSLDG00000021349) nrxn1b (ENSSLDG00000021098) ENSSLDG00000021040 erlec1 (ENSSLDG00000020984) GPR75 (ENSSLDG00000020978) PSME4 (ENSSLDG00000020757) ENSSLDG00000020712 ENSSLDG00000020689 THBS2 (ENSSLDG00000020615) agpat4 (ENSSLDG00000020579) ##22 agpat4 (ENSSLDG00000020541) ##22 ENSSLDG00000020518 ENSSLDG00000020326 kcnk1b (ENSSLDG00000020290) SLC35F3 (ENSSLDG00000020267) ENSSLDG00000020256 TARBP1 (ENSSLDG00000020200) zgc:172136 (ENSSLDG00000020181) fam135a (ENSSLDG00000020061) col9a1b (ENSSLDG00000019991) ENSSLDG00000019849 lmbrd1 (ENSSLDG00000019780) ADGRB3 (ENSSLDG00000019515) 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zgc:172136 (ENSAOCG00000009972) fam135a (ENSAOCG00000010024) col9a1b (ENSAOCG00000010103) ENSAOCG00000010163 ENSAOCG00000010191 lmbrd1 (ENSAOCG00000010242) ADGRB3 (ENSAOCG00000010270) Spiny chromis MODERN SPECIES 222 ENSAPOG00000015938 ENSAPOG00000015959 THBS2 (ENSAPOG00000016058) agpat4 (ENSAPOG00000016101) ##22 ENSAPOG00000016131 ENSAPOG00000016326 kcnk1b (ENSAPOG00000016347) SLC35F3 (ENSAPOG00000016394) ENSAPOG00000016408 TARBP1 (ENSAPOG00000016419) zgc:172136 (ENSAPOG00000016440) fam135a (ENSAPOG00000016458) col9a1b (ENSAPOG00000016590) ENSAPOG00000016673 ENSAPOG00000016701 lmbrd1 (ENSAPOG00000000459) ADGRB3 (ENSAPOG00000016807) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 442 nrxn1b (ENSSPAG00000022027) erlec1 (ENSSPAG00000022060) GPR75 (ENSSPAG00000022074) PSME4 (ENSSPAG00000022078) ENSSPAG00000022133 ENSSPAG00000022145 THBS2 (ENSSPAG00000022165) agpat4 (ENSSPAG00000022207) ##22 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 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ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00900000143203 ENSGT00940000165701 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308.kb ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 ENSGT00940000160615.a.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00940000154292.a.b.d ENSGT00940000177029.b ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a ENSGT00390000012017.o ENSGT00390000012017.p ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000165701 ENSGT00900000143203 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308.kb ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 ENSGT00940000160615.a.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00940000154292.a.b.d ENSGT00940000177029.b ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a ENSGT00390000012017.o ENSGT00390000012017.p ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000165701 ENSGT00900000143203 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308.kb ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 ENSGT00940000160615.a.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 279 msh6 (ENSHBUG00000009824) ENSHBUG00000009802 FOXN2 (ENSHBUG00000009734) ppp1r21 (ENSHBUG00000009707) STON1 (ENSHBUG00000009606) ENSHBUG00000009599 LHCGR (ENSHBUG00000009591) nrxn1b (ENSHBUG00000009549) ENSHBUG00000009473 erlec1 (ENSHBUG00000009455) GPR75 (ENSHBUG00000009399) PSME4 (ENSHBUG00000009387) ENSHBUG00000009271 ENSHBUG00000009241 THBS2 (ENSHBUG00000009211) agpat4 (ENSHBUG00000009061) ##22 ENSHBUG00000009033 ENSHBUG00000008953 kcnk1b (ENSHBUG00000008933) SLC35F3 (ENSHBUG00000008916) ENSHBUG00000008890 TARBP1 (ENSHBUG00000008877) zgc:172136 (ENSHBUG00000008861) fam135a (ENSHBUG00000008772) col9a1b (ENSHBUG00000008750) ENSHBUG00000008672 lmbrd1 (ENSHBUG00000008559) ADGRB3 (ENSHBUG00000008450) ENSHBUG00000008103 ENSHBUG00000008092 PHF3 (ENSHBUG00000008057) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00940000154292.a.b.d ENSGT00940000177029.b ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a ENSGT00390000012017.o ENSGT00390000012017.p ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000165701 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308.kb ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 ENSGT00940000160615.a.b ENSGT00940000155080 P. nyererei MODERN SPECIES 368 msh6 (ENSPNYG00000018307) ENSPNYG00000018356 FOXN2 (ENSPNYG00000018415) ppp1r21 (ENSPNYG00000018432) STON1 (ENSPNYG00000018501) gtf2a1l (ENSPNYG00000018511) LHCGR (ENSPNYG00000018542) nrxn1b (ENSPNYG00000018576) ENSPNYG00000018620 erlec1 (ENSPNYG00000018639) GPR75 (ENSPNYG00000018685) PSME4 (ENSPNYG00000018711) ENSPNYG00000018847 ENSPNYG00000018875 THBS2 (ENSPNYG00000018915) agpat4 (ENSPNYG00000018995) ##22 ENSPNYG00000019026 kcnk1b (ENSPNYG00000019085) SLC35F3 (ENSPNYG00000019101) ENSPNYG00000019119 TARBP1 (ENSPNYG00000019135) zgc:172136 (ENSPNYG00000019202) fam135a (ENSPNYG00000019229) col9a1b (ENSPNYG00000019285) ENSPNYG00000019355 lmbrd1 (ENSPNYG00000019383) ADGRB3 (ENSPNYG00000019418) ENSPNYG00000019480 ENSPNYG00000019490 PHF3 (ENSPNYG00000019506) ENSPNYG00000019531 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00940000154292.a.b.d ENSGT00940000177029.b ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a ENSGT00390000012017.o ENSGT00390000012017.p ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000165701 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308.kb ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000163741 ENSGT00940000160615.a.b ENSGT00940000155080 Eastern happy MODERN SPECIES 4 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SPECIES 16 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00940000177029.b ENSGT00940000154292.a.b.d ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00900000143203 ENSGT00940000165701 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00940000157565 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158302.d.a ENSGT00940000159308.kb ENSGT00940000179915 ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D Oryzias ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000111139 ENSGT00940000161424 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00940000154292.a.b.d ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 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ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000158276 ENSGT00390000002581 ENSGT00940000155081.D ENSGT00940000160615.a.b ENSGT00940000169924 ENSGT00940000155080 Indian medaka MODERN SPECIES 27 GOLGA4 (ENSOMEG00000001329) KCNK12 (ENSOMEG00000001334) msh6 (ENSOMEG00000001336) ENSOMEG00000001341 FOXN2 (ENSOMEG00000001346) ppp1r21 (ENSOMEG00000001353) STON1 (ENSOMEG00000001360) gtf2a1l (ENSOMEG00000001365) LHCGR (ENSOMEG00000001366) nrxn1b (ENSOMEG00000001387) erlec1 (ENSOMEG00000001405) GPR75 (ENSOMEG00000001409) PSME4 (ENSOMEG00000001423) ENSOMEG00000001433 THBS2 (ENSOMEG00000001451) agpat4 (ENSOMEG00000001462) ##22 ENSOMEG00000001494 kcnk1b (ENSOMEG00000001508) SLC35F3 (ENSOMEG00000001511) ENSOMEG00000001515 ENSOMEG00000001519 zgc:172136 (ENSOMEG00000001523) fam135a (ENSOMEG00000001537) col9a1b (ENSOMEG00000001556) ENSOMEG00000001566 lmbrd1 (ENSOMEG00000001573) ADGRB3 (ENSOMEG00000001623) ENSOMEG00000001646 ENSOMEG00000001654 ENSOMEG00000001659 ENSOMEG00000001671 Javanese ricefish MODERN SPECIES 6 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ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b ENSGT00940000159118.h ENSGT00390000006820.d ENSGT00940000158817.f ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B.c ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b ENSGT00530000063603.B.g ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a.e ENSGT00940000157846.c.d ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k ##22 ENSGT00990000204854.c ENSGT00940000165701.h ENSGT00940000155293.a.a.j ENSGT00390000008727.a.a.d.e River trout MODERN SPECIES 9 ENSSTUG00000031680 gtf2a1l (ENSSTUG00000031656) LHCGR (ENSSTUG00000031622) ENSSTUG00000031614 ENSSTUG00000031598 ENSSTUG00000031581 ENSSTUG00000031573 NRXN1 (ENSSTUG00000029529) ENSSTUG00000029465 erlec1 (ENSSTUG00000029257) GPR75 (ENSSTUG00000029230) PSME4 (ENSSTUG00000028118) ENSSTUG00000028059 ENSSTUG00000028029 ENSSTUG00000027697 agpat4 (ENSSTUG00000027647) ##22 ENSSTUG00000027638 ENSSTUG00000021823 kcnk1b (ENSSTUG00000021658) ENSSTUG00000021648 SLC35F3 (ENSSTUG00000021596) ENSSTUG00000021589 ENSSTUG00000021549 ENSSTUG00000021467 zgc:172136 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ENSGT00940000156503.v.a.a ENSGT00730000111139.n ENSGT00940000161424.k.b ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b ENSGT00940000159118.h ENSGT00390000006820.d ENSGT00940000158817.f ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B.c ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b ENSGT00940000154292.a.b.d.h.b.a ENSGT00530000063603.B.g ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a.e ENSGT00940000157846.c.d ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k ##22 ENSGT00990000204854.c ENSGT00940000165701.h ENSGT00940000155293.a.a.j Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156503.v.a.a ENSGT00730000111139.n ENSGT00940000161424.k.b ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b ENSGT00940000159118.h ENSGT00390000006820.d ENSGT00940000158817.f ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B.c ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b ENSGT00940000154292.a.b.d.h.b.a ENSGT00530000063603.B.g ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a.e ENSGT00940000157846.c.d ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k ##22 ENSGT00990000204854.c ENSGT00940000165701.h ENSGT00940000155293.a.a.j Chinook salmon MODERN SPECIES 247 THBS2 (ENSOTSG00005046618) ENSOTSG00005046613 agpat4 (ENSOTSG00005046611) ##22 ENSOTSG00005046609 ENSOTSG00005044509 kcnk1b (ENSOTSG00005044493) Coho salmon MODERN SPECIES 2 GOLGA4 (ENSOKIG00005046116) KCNK12 (ENSOKIG00005046107) ENSOKIG00005045208 ENSOKIG00005045119 PPP1R21 (ENSOKIG00005044830) GTF2A1L (ENSOKIG00005044798) LHCGR (ENSOKIG00005044786) ENSOKIG00005044777 ENSOKIG00005044766 NRXN1 (ENSOKIG00005042525) erlec1 (ENSOKIG00005042325) GPR75 (ENSOKIG00005042312) PSME4 (ENSOKIG00005036846) ENSOKIG00005036450 ENSOKIG00005036434 agpat4 (ENSOKIG00005036311) ##22 ENSOKIG00005032275 kcnk1b (ENSOKIG00005032111) Rainbow trout MODERN SPECIES 15 ENSOMYG00000054114 ENSOMYG00000027535 ENSOMYG00000055620 erlec1 (ENSOMYG00000026232) ENSOMYG00000026216 ENSOMYG00000077387 PSME4 (ENSOMYG00000025175) ENSOMYG00000057002 ENSOMYG00000053929 ENSOMYG00000051807 ENSOMYG00000075183 ENSOMYG00000072637 ENSOMYG00000024583 ENSOMYG00000024407 ENSOMYG00000052981 agpat4 (ENSOMYG00000024323) ##22 ENSOMYG00000017912 ENSOMYG00000024398 kcnk1b (ENSOMYG00000017403) ENSOMYG00000047935 ENSOMYG00000052628 ENSOMYG00000063374 ENSOMYG00000070525 ENSOMYG00000050151 ENSOMYG00000052782 zgc:172136 (ENSOMYG00000035204) ENSOMYG00000049304 fam135a (ENSOMYG00000027568) col9a1b (ENSOMYG00000051034) ENSOMYG00000061236 ENSOMYG00000049984 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 885 ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b.l ##22 ENSGT00940000165701.g ENSGT00990000204854.d ENSGT00940000155293.a.a.i ENSGT00940000165757.c.b.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000156503.u ENSGT00730000111139.m ENSGT00940000161424.k.a ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.a ENSGT00940000159118.g ENSGT00390000006820.c ENSGT00940000158817.e ENSGT00940000157364.B.d ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.a ENSGT00940000177029.b ENSGT00530000063603.B.h ENSGT00390000011433.s.a.f ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b.l ##22 ENSGT00940000165701.g ENSGT00990000204854.d ENSGT00940000155293.a.a.i ENSGT00940000165757.c.b.b ENSGT00940000163723.A.f.a ENSGT00510000049375.g ENSGT00390000010434.b.d.b ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b.h ENSGT00530000064017.a.f ENSGT00940000157049.c.b.b ENSGT00940000165452.a.h ENSGT00940000157556.a.b.f ENSGT00950000183082.b.b.a.a.d.b.a.b ENSGT00950000183082.b.b.a.a.d.b.b ENSGT00940000157525.b.d Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000156503.u ENSGT00730000111139.m ENSGT00940000161424.k.a ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.a ENSGT00940000159118.g ENSGT00390000006820.c ENSGT00940000158817.e ENSGT00940000157364.B.d ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.a ENSGT00940000177029.b ENSGT00530000063603.B.h ENSGT00390000011433.s.a.f ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b.l ##22 ENSGT00940000165701.g ENSGT00940000155293.a.a.i ENSGT00940000165757.c.a.b ENSGT01060000253683 ENSGT00510000049375.g ENSGT00390000010434.b.d.b ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b.h ENSGT00530000064017.a.f ENSGT00940000157049.c.b.b ENSGT00940000165452.a.h ENSGT00940000157556.a.b.f ENSGT00950000183082.b.b.a.a.d.b.b ENSGT00940000157525.b.d ENSGT00390000004874.a.a.ub ENSGT00940000165889 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156503.u ENSGT00730000111139.m ENSGT00940000161424.k.a ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.a ENSGT00940000159118.g ENSGT00390000006820.c ENSGT00940000158817.e ENSGT00940000157364.B.d ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.a ENSGT00940000177029.b ENSGT00530000063603.B.h ENSGT00390000011433.s.a.f ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b.l ##22 ENSGT00940000165701.g ENSGT00940000155293.a.a.i ENSGT00940000165757.c.a.b ENSGT01060000253683 ENSGT00510000049375.g ENSGT00390000010434.b.d.b ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b.h ENSGT00530000064017.a.f ENSGT00940000157049.c.b.b ENSGT00940000165452.a.h ENSGT00940000157556.a.b.f ENSGT00950000183082.b.b.a.a.d.b.b ENSGT00940000157525.b.d ENSGT00390000004874.a.a.ub ENSGT00940000165889 Chinook salmon MODERN SPECIES 17 KCNK12 (ENSOTSG00005017576) msh6 (ENSOTSG00005017579) ENSOTSG00005021282 FOXN2 (ENSOTSG00005021516) ppp1r21 (ENSOTSG00005021526) STON1 (ENSOTSG00005023892) LHCGR (ENSOTSG00005023894) NRXN1 (ENSOTSG00005023915) ENSOTSG00005025370 ENSOTSG00005025372 erlec1 (ENSOTSG00005025375) PSME4 (ENSOTSG00005026777) ENSOTSG00005027450 ENSOTSG00005027451 THBS2 (ENSOTSG00005027465) agpat4 (ENSOTSG00005029064) ##22 ENSOTSG00005029107 kcnk1b (ENSOTSG00005034403) nkx3.3 (ENSOTSG00005034405) nkx2.3 (ENSOTSG00005034407) got1 (ENSOTSG00005034411) CNNM1 (ENSOTSG00005034416) HPSE2 (ENSOTSG00005034422) ENSOTSG00005034426 st3gal7 (ENSOTSG00005034429) morn4 (ENSOTSG00005034430) ENSOTSG00005034432 slit1a (ENSOTSG00005034436) XPO5 (ENSOTSG00005034518) ENSOTSG00005034611 cpn1 (ENSOTSG00005034612) Coho salmon MODERN SPECIES 17 itga9 (ENSOKIG00005020483) GOLGA4 (ENSOKIG00005020615) KCNK12 (ENSOKIG00005020653) msh6 (ENSOKIG00005006274) ENSOKIG00005006542 FOXN2 (ENSOKIG00005006794) ppp1r21 (ENSOKIG00005006947) STON1 (ENSOKIG00005009449) LHCGR (ENSOKIG00005009460) NRXN1 (ENSOKIG00005009580) ERLEC1 (ENSOKIG00005011136) PSME4 (ENSOKIG00005012067) ENSOKIG00005012249 ENSOKIG00005012263 THBS2 (ENSOKIG00005012323) agpat4 (ENSOKIG00005012600) ##22 ENSOKIG00005012935 ENSOKIG00005018075 kcnk1b (ENSOKIG00005018080) ENSOKIG00005018083 ENSOKIG00005018091 MARVELD1 (ENSOKIG00005018097) ENSOKIG00005018101 ENSOKIG00005018154 ENSOKIG00005018168 slc25a28 (ENSOKIG00005018176) nkx3.3 (ENSOKIG00005018199) nkx2.3 (ENSOKIG00005018206) got1 (ENSOKIG00005018218) CNNM1 (ENSOKIG00005018273) HPSE2 (ENSOKIG00005018314) Rainbow trout MODERN SPECIES 12 ENSOMYG00000029262 ENSOMYG00000029486 ENSOMYG00000030467 ENSOMYG00000032741 PPP1R21 (ENSOMYG00000033214) ENSOMYG00000035787 LHCGR (ENSOMYG00000035803) ENSOMYG00000035998 ENSOMYG00000052965 ENSOMYG00000058306 ENSOMYG00000049636 ERLEC1 (ENSOMYG00000036803) ENSOMYG00000036954 ENSOMYG00000037387 ENSOMYG00000037486 agpat4 (ENSOMYG00000037674) ##22 ENSOMYG00000038592 kcnk1b (ENSOMYG00000043033) ENSOMYG00000048427 ENSOMYG00000071543 ENSOMYG00000043047 ENSOMYG00000043052 ENSOMYG00000043076 ENSOMYG00000055904 slc25a28 (ENSOMYG00000043085) nkx3.3 (ENSOMYG00000043095) nkx2.3 (ENSOMYG00000043096) got1 (ENSOMYG00000043106) ENSOMYG00000043114 CNNM1 (ENSOMYG00000043115) HPSE2 (ENSOMYG00000043124) Salmo ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000157396.jc ENSGT00940000156503.u ENSGT00730000111139.m ENSGT00940000161424.k.a ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.a ENSGT00940000159118.g ENSGT00390000006820.c ENSGT00940000158817.e ENSGT00940000157364.B.d ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.a ENSGT00530000063603.B.h ENSGT00390000011433.s.a.f ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b.l ##22 ENSGT00940000165701.g ENSGT00990000204854.d ENSGT00940000155293.a.a.i ENSGT00940000165757.c.b.b ENSGT00940000163723.A.f.a ENSGT00510000049375.g ENSGT00390000010434.b.d.b ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b.h ENSGT00530000064017.a.f ENSGT00940000157049.c.b.a.a ENSGT00940000165452.a.h ENSGT00940000157556.a.b.f ENSGT00950000183082.b.b.a.a.d.b.a.b ENSGT00950000183082.b.b.a.a.d.b.b ENSGT00940000157525.b.d Atlantic salmon MODERN SPECIES 20 itga9 (ENSSSAG00000040941) ENSSSAG00000041544 ENSSSAG00000042206 ENSSSAG00000042313 ENSSSAG00000045454 ENSSSAG00000049879 ENSSSAG00000100373 ppp1r21 (ENSSSAG00000054096) ENSSSAG00000057485 LHCGR (ENSSSAG00000057492) NRXN1 (ENSSSAG00000057796) ERLEC1 (ENSSSAG00000071732) PSME4 (ENSSSAG00000071799) ENSSSAG00000071904 thbs2 (ENSSSAG00000071980) agpat4 (ENSSSAG00000072273) ##22 ENSSSAG00000072418 ENSSSAG00000075436 kcnk1b (ENSSSAG00000075442) ENSSSAG00000110104 ENSSSAG00000099101 ENSSSAG00000088446 ENSSSAG00000083955 ENSSSAG00000075553 ENSSSAG00000101173 ENSSSAG00000122151 ENSSSAG00000105715 slc25a28 (ENSSSAG00000075557) ENSSSAG00000090773 nkx3.3 (ENSSSAG00000111355) nkx2.3 (ENSSSAG00000091368) River trout MODERN SPECIES 1 ENSSTUG00000010533 FOXN2 (ENSSTUG00000012050) ppp1r21 (ENSSTUG00000012084) STON1 (ENSSTUG00000013233) LHCGR (ENSSTUG00000013262) nrxn1b (ENSSTUG00000013680) ENSSTUG00000015938 ENSSTUG00000015951 ENSSTUG00000015961 erlec1 (ENSSTUG00000015971) ENSSTUG00000016069 ENSSTUG00000016224 ENSSTUG00000016231 THBS2 (ENSSTUG00000016312) ENSSTUG00000018109 agpat4 (ENSSTUG00000018116) ##22 ENSSTUG00000018149 ENSSTUG00000018776 kcnk1b (ENSSTUG00000018792) zgc:171482 (ENSSTUG00000018804) ENSSTUG00000018821 ENSSTUG00000018828 marveld1 (ENSSTUG00000018853) pi4k2a (ENSSTUG00000018858) ENSSTUG00000018882 ENSSTUG00000018905 slc25a28 (ENSSTUG00000018986) nkx3.3 (ENSSTUG00000019026) nkx2.3 (ENSSTUG00000019037) got1 (ENSSTUG00000019061) CNNM1 (ENSSTUG00000019181) Huchen MODERN SPECIES 4729 ENSHHUG00000001329 agpat4 (ENSHHUG00000001300) ##22 Northern pike MODERN SPECIES 4 mfsd13a (ENSELUG00000010231) ENSELUG00000010344 msh6 (ENSELUG00000010431) ENSELUG00000010499 FOXN2 (ENSELUG00000010538) ppp1r21 (ENSELUG00000010645) STON1 (ENSELUG00000010706) gtf2a1l (ENSELUG00000034256) LHCGR (ENSELUG00000010744) nrxn1b (ENSELUG00000011068) erlec1 (ENSELUG00000011166) GPR75 (ENSELUG00000011209) PSME4 (ENSELUG00000011276) ENSELUG00000001497 THBS2 (ENSELUG00000000425) agpat4 (ENSELUG00000011759) ##22 ENSELUG00000011781 ENSELUG00000011854 kcnk1b (ENSELUG00000000431) SLC35F3 (ENSELUG00000012062) ENSELUG00000012116 ENSELUG00000012130 TARBP1 (ENSELUG00000012193) zgc:172136 (ENSELUG00000001042) fam135a (ENSELUG00000012515) col9a1b (ENSELUG00000012591) ENSELUG00000012656 lmbrd1 (ENSELUG00000012697) ADGRB3 (ENSELUG00000012763) zgc:171579 (ENSELUG00000012792) ENSELUG00000012900 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000018245.j ENSGT00940000161424 ENSGT00550000075024 ENSGT00530000063425.a.a.a.a ENSGT00940000159118 ENSGT00390000006820 ENSGT00940000158817 ENSGT00940000163055 ENSGT00940000157364.B ENSGT00390000003855.a ENSGT00530000063603.B ENSGT00390000007723 ENSGT00390000011433.s.a.g ENSGT00390000012017 ENSGT00940000157846.c ENSGT00950000182836.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000165701 ENSGT00900000143203 ENSGT00940000155293.a.a ENSGT00390000008727.a.a.d ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000003939 ENSGT00940000162787.c ENSGT00950000183181.A.a ENSGT00390000018436.a.b ENSGT00390000000411 ENSGT00940000162996.c.b ENSGT00940000155245 ENSGT00940000163216 ENSGT00990000204198 ENSGT00940000158288 Asian bonytongue MODERN SPECIES 23 KCNK12 (ENSSFOG00015001638) msh6 (ENSSFOG00015001648) ENSSFOG00015001698 FOXN2 (ENSSFOG00015001820) ppp1r21 (ENSSFOG00015001831) STON1 (ENSSFOG00015001840) ENSSFOG00015026862 LHCGR (ENSSFOG00015001859) nrxn1b (ENSSFOG00015001893) chac2 (ENSSFOG00015001968) erlec1 (ENSSFOG00015001975) GPR75 (ENSSFOG00015002045) PSME4 (ENSSFOG00015002060) ENSSFOG00015002220 ENSSFOG00015002253 agpat4 (ENSSFOG00015002397) ##22 ENSSFOG00015002445 kcnk1b (ENSSFOG00015002601) SLC35F3 (ENSSFOG00015002610) ENSSFOG00015026660 TARBP1 (ENSSFOG00015002660) zgc:172136 (ENSSFOG00015002811) dact2 (ENSSFOG00015002843) SMOC2 (ENSSFOG00015002962) ENSSFOG00015024709 ENSSFOG00015024416 eif3s6ip (ENSSFOG00015003021) vsir (ENSSFOG00015002981) ENSSFOG00015002998 cdh23 (ENSSFOG00015002723) PLPP4 (ENSSFOG00015003004) P. kingsleyae MODERN SPECIES 254 erlec1 (ENSPKIG00000015930) GPR75 (ENSPKIG00000015985) PSME4 (ENSPKIG00000016022) ENSPKIG00000016115 THBS2 (ENSPKIG00000016268) agpat4 (ENSPKIG00000016403) ##22 ENSPKIG00000016485 ENSPKIG00000016618 kcnk1b (ENSPKIG00000016633) SLC35F3 (ENSPKIG00000016654) ENSPKIG00000016696 TARBP1 (ENSPKIG00000016716) zgc:172136 (ENSPKIG00000016819) dact2 (ENSPKIG00000016903) SMOC2 (ENSPKIG00000016937) eif3s6ip (ENSPKIG00000016998) ENSPKIG00000017084 NDST2 (ENSPKIG00000017220) CAMK2G (ENSPKIG00000017435) Spotted gar MODERN SPECIES 654 msh6 (ENSLOCG00000016298) FBXO11 (ENSLOCG00000016294) foxn2b (ENSLOCG00000016292) ppp1r21 (ENSLOCG00000016286) STON1 (ENSLOCG00000016284) ENSLOCG00000016282 fshr (ENSLOCG00000016280) nrxn1b (ENSLOCG00000016276) ASB3 (ENSLOCG00000016273) chac2 (ENSLOCG00000016270) erlec1 (ENSLOCG00000016265) GPR75 (ENSLOCG00000017362) psme4b (ENSLOCG00000016250) ENSLOCG00000016248 THBS2 (ENSLOCG00000016241) agpat4 (ENSLOCG00000016235) ##22 MAP3K4 (ENSLOCG00000016223) kcnk1a (ENSLOCG00000016222) slc35f3a (ENSLOCG00000016220) TARBP1 (ENSLOCG00000016214) ENSLOCG00000016209 dact2 (ENSLOCG00000016207) SMOC2 (ENSLOCG00000016200) eif3s6ip (ENSLOCG00000016195) asrgl1 (ENSLOCG00000016189) RIMS1 (ENSLOCG00000016181) KCNQ5 (ENSLOCG00000016173) ddx43 (ENSLOCG00000016170) CGAS (ENSLOCG00000016169) eef1a1b (ENSLOCG00000016168) slc17a5 (ENSLOCG00000016166) Reedfish MODERN SPECIES 6 ENSECRG00000020082 psme4b (ENSECRG00000020210) ENSECRG00000020492 GPR75 (ENSECRG00000020497) erlec1 (ENSECRG00000020509) sft2d1 (ENSECRG00000020525) PRR18 (ENSECRG00000020536) TBXT (ENSECRG00000020538) pde10a (ENSECRG00000020597) C6orf118 (ENSECRG00000020742) QKI (ENSECRG00000020754) ENSECRG00000020765 ENSECRG00000020775 ENSECRG00000020783 PRKN (ENSECRG00000020796) agpat4 (ENSECRG00000020821) ##22 MAP3K4 (ENSECRG00000020843) kcnk1a (ENSECRG00000020915) SLC35F3 (ENSECRG00000020926) kat14 (ENSECRG00000020944) dzank1 (ENSECRG00000020966) polr3f (ENSECRG00000020993) rbbp9 (ENSECRG00000021024) ENSECRG00000012893 ENSECRG00000012900 ENSECRG00000012908 EPHX1 (ENSECRG00000012922) mad2l1bp (ENSECRG00000012943) gtpbp2b (ENSECRG00000012982) polh (ENSECRG00000013060) tp53bp2a (ENSECRG00000013093) Elephant shark MODERN SPECIES 1486 tmem30ab (ENSCMIG00000004191) FILIP1 (ENSCMIG00000004228) ENSCMIG00000004255 ENSCMIG00000004304 myo6a (ENSCMIG00000004379) ENSCMIG00000004509 HTR1B (ENSCMIG00000004578) ENSCMIG00000004581 ENSCMIG00000004585 ENSCMIG00000004599 QKI (ENSCMIG00000004620) pacrg (ENSCMIG00000004628) ENSCMIG00000004638 ENSCMIG00000004644 ENSCMIG00000004649 agpat4 (ENSCMIG00000004652) ##22 MAP3K4 (ENSCMIG00000004797) ENSCMIG00000005096 ENSCMIG00000005172 ENSCMIG00000005330 ENSCMIG00000005336 ENSCMIG00000005344 ENSCMIG00000005346 slc22a2 (ENSCMIG00000005349) ENSCMIG00000005352 igf2r (ENSCMIG00000005356) mbnl1 (ENSCMIG00000005365) P2RY1 (ENSCMIG00000005374) ARHGEF26 (ENSCMIG00000005402) dhx36 (ENSCMIG00000005505) GPR149 (ENSCMIG00000005572) Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.b.a ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES 1276 ENSGT00950000182836.b.b.a ##22 ENSGT00390000018525.a.a Lamprey MODERN SPECIES 586 slc5a1 (ENSPMAG00000005357) ENSPMAG00000005353 ENSPMAG00000005339 DEPDC5 (ENSPMAG00000005297) ENSPMAG00000005294 ENSPMAG00000005289 ##22 ENSPMAG00000005263 Hagfish MODERN SPECIES 46 ENSEBUG00000004319 ENSEBUG00000000380 SLC35F1 (ENSEBUG00000006214) ENSEBUG00000013887 ENSEBUG00000011917 PTCHD1 (ENSEBUG00000003708) ENSEBUG00000010171 ENSEBUG00000001289 ENSEBUG00000004313 ENSEBUG00000016478 ##22 sft2d1 (ENSEBUG00000013631) ENSEBUG00000001652 ENSEBUG00000006077 Ciona DUPLICATION Ciona ANCESTRAL SPECIES 393 ENSGT00530000067374 ENSGT00950000182836.b.b.c #22 ENSGT00950000183028 ENSGT00530000068754 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 3 ENSCING00000003931 ENSCING00000022070 ENSCING00000021387 ENSCING00000003928 ENSCING00000003943 ENSCING00000014183 ENSCING00000014176 ENSCING00000014177 ENSCING00000025158 ENSCING00000010102 ENSCING00000014178 ENSCING00000020987 ENSCING00000018157 ENSCING00000014179 ENSCING00000010101 #22 ENSCING00000014180 #22 fhl1/2/3 (ENSCING00000003946) ENSCING00000021541 ENSCING00000021812 pdedelta (ENSCING00000003961) ENSCING00000018020 ENSCING00000003967 ENSCING00000003970 ENSCING00000023057 ENSCING00000019551 ENSCING00000002145 ENSCING00000021756 ENSCING00000003256 ENSCING00000021140 ENSCING00000021505 ENSCING00000024496 Ciona savignyi MODERN SPECIES 253 ENSCSAVG00000006061 ENSCSAVG00000006069 ENSCSAVG00000006089 ENSCSAVG00000006092 ENSCSAVG00000006113 ENSCSAVG00000006136 ENSCSAVG00000006248 ENSCSAVG00000006253 ENSCSAVG00000006257 ENSCSAVG00000006262 ENSCSAVG00000006266 ENSCSAVG00000006281 ENSCSAVG00000006285 ENSCSAVG00000006288 ENSCSAVG00000006292 ENSCSAVG00000006296 #22 ENSCSAVG00000006300 ENSCSAVG00000006419 ENSCSAVG00000006421 ENSCSAVG00000006426 ENSCSAVG00000006496 ENSCSAVG00000006497 ENSCSAVG00000006500 ENSCSAVG00000006520 ENSCSAVG00000006524 ENSCSAVG00000006527 ENSCSAVG00000006590 ENSCSAVG00000006593 ENSCSAVG00000006596 ENSCSAVG00000007059 ENSCSAVG00000007066 Ciona ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.b.d #22 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 3 ENSCING00000014190 ENSCING00000003931 ENSCING00000022070 ENSCING00000021387 ENSCING00000003928 ENSCING00000003943 ENSCING00000014183 ENSCING00000014176 ENSCING00000014177 ENSCING00000025158 ENSCING00000010102 ENSCING00000014178 ENSCING00000020987 ENSCING00000018157 ENSCING00000014179 ENSCING00000010101 #22 ENSCING00000014180 #22 fhl1/2/3 (ENSCING00000003946) ENSCING00000021541 ENSCING00000021812 pdedelta (ENSCING00000003961) ENSCING00000018020 ENSCING00000003967 ENSCING00000003970 ENSCING00000023057 ENSCING00000019551 ENSCING00000002145 ENSCING00000021756 ENSCING00000003256 ENSCING00000021140 ENSCING00000021505 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.b #22 Fruitfly DUPLICATION Fruitfly MODERN SPECIES 18 CG13033 (FBgn0036638) st (FBgn0003515) CG43373 (FBgn0263131) CG42514 (FBgn0260388) aos (FBgn0004569) dsx-c73A (FBgn0261799) CG33158 (FBgn0053158) TyrRS (FBgn0027080) GluRS-m (FBgn0036629) Serinc (FBgn0028399) fax (FBgn0014163) Gagr (FBgn0036627) CG44836 (FBgn0266099) RAF2 (FBgn0036624) Agpat3 (FBgn0036623) #22 Agpat4 (FBgn0036622) #22 roq (FBgn0036621) CG18814 (FBgn0042137) CG4842 (FBgn0036620) Cpr72Ec (FBgn0036619) Cpr72Eb (FBgn0036618) Cpr72Ea (FBgn0036617) ringer (FBgn0266417) Pdh (FBgn0011693) Tcs3 (FBgn0283681) Golgin104 (FBgn0036614) mRpS34 (FBgn0285951) CG33257 (FBgn0053257) CG4998 (FBgn0036612) CG13056 (FBgn0040794) retinin (FBgn0040074) Fruitfly MODERN SPECIES 18 CG4229 (FBgn0036639) CG13033 (FBgn0036638) st (FBgn0003515) CG43373 (FBgn0263131) CG42514 (FBgn0260388) aos (FBgn0004569) dsx-c73A (FBgn0261799) CG33158 (FBgn0053158) TyrRS (FBgn0027080) GluRS-m (FBgn0036629) Serinc (FBgn0028399) fax (FBgn0014163) Gagr (FBgn0036627) CG44836 (FBgn0266099) RAF2 (FBgn0036624) Agpat3 (FBgn0036623) #22 Agpat4 (FBgn0036622) #22 roq (FBgn0036621) CG18814 (FBgn0042137) CG4842 (FBgn0036620) Cpr72Ec (FBgn0036619) Cpr72Eb (FBgn0036618) Cpr72Ea (FBgn0036617) ringer (FBgn0266417) Pdh (FBgn0011693) Tcs3 (FBgn0283681) Golgin104 (FBgn0036614) mRpS34 (FBgn0285951) CG33257 (FBgn0053257) CG4998 (FBgn0036612) CG13056 (FBgn0040794) Bilateria DUPLICATION Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 Ciona DUPLICATION Ciona ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.a.a ##22 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 6 ENSCING00000015055 ENSCING00000015058 rbj (ENSCING00000000917) ENSCING00000000913 ENSCING00000011630 ENSCING00000025157 ENSCING00000010088 ENSCING00000019329 ENSCING00000018191 ENSCING00000018926 ENSCING00000000202 ENSCING00000000919 ENSCING00000010089 ENSCING00000024174 ENSCING00000017964 ENSCING00000011632 ##22 ENSCING00000011633 ENSCING00000000922 ENSCING00000022734 ENSCING00000023459 ENSCING00000000921 ENSCING00000011634 ENSCING00000020649 ENSCING00000021700 ENSCING00000011636 ENSCING00000018690 ENSCING00000018872 ENSCING00000022075 ENSCING00000021805 ENSCING00000020180 ENSCING00000023767 Ciona savignyi MODERN SPECIES 93 ENSCSAVG00000005394 ENSCSAVG00000005472 ENSCSAVG00000005479 ENSCSAVG00000005604 ENSCSAVG00000005606 ENSCSAVG00000005620 ENSCSAVG00000005624 ENSCSAVG00000005625 ENSCSAVG00000005631 ENSCSAVG00000005641 ENSCSAVG00000005642 ENSCSAVG00000005644 ENSCSAVG00000005683 ENSCSAVG00000005700 ENSCSAVG00000005703 ENSCSAVG00000005884 ##22 ENSCSAVG00000005917 ENSCSAVG00000006335 ENSCSAVG00000006342 ENSCSAVG00000006354 ENSCSAVG00000006379 ENSCSAVG00000006399 ENSCSAVG00000006403 ENSCSAVG00000006409 ENSCSAVG00000006461 ENSCSAVG00000006462 ENSCSAVG00000006466 ENSCSAVG00000006469 ENSCSAVG00000006474 ENSCSAVG00000006477 ENSCSAVG00000006522 Ciona ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.a.b ##22 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 5 ENSCING00000019408 ENSCING00000021657 ENSCING00000014443 ENSCING00000002278 ENSCING00000018704 ENSCING00000019743 ENSCING00000002273 ENSCING00000019184 ENSCING00000002274 ENSCING00000009955 dusp8.16 (ENSCING00000003538) ENSCING00000024949 ENSCING00000010358 ENSCING00000023934 ENSCING00000022513 ENSCING00000024428 ##22 ENSCING00000014445 ENSCING00000003530 ENSCING00000003531 ENSCING00000003527 ENSCING00000021637 ENSCING00000022663 ENSCING00000014452 ENSCING00000014451 ENSCING00000014448 ENSCING00000021445 ENSCING00000023770 ENSCING00000003493 ENSCING00000024640 ENSCING00000003499 ENSCING00000016958 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 400 ENSGT00390000018842 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162690 ENSGT00510000048137 ENSGT00940000154607.a ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889 ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00970000197581 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00510000048137 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889 ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00510000048137 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00940000161065 ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889 ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 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ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158351 ENSGT00510000048137 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01030000234936 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000154526.h ENSGT00940000167375 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000161065 ENSGT00940000157889 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162505 ENSGT00940000158351 ENSGT00510000048137 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000167375 ENSGT00940000154526.h ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000161065 ENSGT00940000157889 Aves ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162505 ENSGT00940000158351 ENSGT00510000048137 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000167375 ENSGT00940000154526.h ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b 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ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000167375 ENSGT00940000154526.h.ab ENSGT00940000154526.h.`b ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000161065 Japanese quail MODERN SPECIES 21 ALKAL2 (ENSCJPG00005008184) ACP1 (ENSCJPG00005008182) SH3YL1 (ENSCJPG00005008181) FAM110C (ENSCJPG00005008179) FBXO25 (ENSCJPG00005008178) TDRP (ENSCJPG00005008177) ERICH1 (ENSCJPG00005008171) DLGAP2 (ENSCJPG00005008169) ENSCJPG00005008157 ENSCJPG00005008155 ARHGEF10 (ENSCJPG00005008152) MYOM2 (ENSCJPG00005008148) CSMD1 (ENSCJPG00005008081) ANGPT2 (ENSCJPG00005007988) MCPH1 (ENSCJPG00005007987) AGPAT5 (ENSCJPG00005007976) ##22 TMEM14A (ENSCJPG00005007974) ENSCJPG00005007965 ENSCJPG00005007935 ENSCJPG00005007914 ENSCJPG00005007886 ENSCJPG00005007859 ENSCJPG00005007857 CILK1 (ENSCJPG00005007855) FBXO9 (ENSCJPG00005007854) GCM1 (ENSCJPG00005007853) ELOVL5 (ENSCJPG00005007852) GCLC (ENSCJPG00005007850) KLHL31 (ENSCJPG00005007849) ENSCJPG00005007848 LRRC1 (ENSCJPG00005007828) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162505 ENSGT00940000158351 ENSGT00510000048137 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000167375 ENSGT00940000154526.h.ab ENSGT00940000154526.h.`b ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 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MODERN SPECIES 688 ANGPT2 (ENSSCUG00000009149) MCPH1 (ENSSCUG00000009144) AGPAT5 (ENSSCUG00000009128) ##22 TMEM14A (ENSSCUG00000009124) ENSSCUG00000009120 ENSSCUG00000009117 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 38 ENSCPRG00005008993 SH3YL1 (ENSCPRG00005009008) FAM110C (ENSCPRG00005009030) FBXO25 (ENSCPRG00005009039) TDRP (ENSCPRG00005009046) ERICH1 (ENSCPRG00005009050) DLGAP2 (ENSCPRG00005009062) ENSCPRG00005009074 ENSCPRG00005009077 ARHGEF10 (ENSCPRG00005009112) KBTBD11 (ENSCPRG00005009142) MYOM2 (ENSCPRG00005009233) CSMD1 (ENSCPRG00005009923) MCPH1 (ENSCPRG00005010276) ANGPT2 (ENSCPRG00005010301) AGPAT5 (ENSCPRG00005010342) ##22 TMEM14A (ENSCPRG00005010346) ENSCPRG00005010349 ENSCPRG00005010362 ENSCPRG00005010497 ENSCPRG00005010569 ENSCPRG00005010601 ENSCPRG00005010637 ENSCPRG00005010643 CILK1 (ENSCPRG00005010652) FBXO9 (ENSCPRG00005010667) GCM1 (ENSCPRG00005010674) ELOVL5 (ENSCPRG00005010679) GCLC (ENSCPRG00005010687) ENSCPRG00005010697 KLHL31 (ENSCPRG00005010699) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162690 ENSGT00510000048137 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01030000234936.d ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000167375 ENSGT00940000154526.h ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889 ENSGT01070000253744.a.a.b.b Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183056.A.b ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01030000234936.d.a.b ENSGT01030000234936.d.a.a.a ENSGT01030000234936.d.b ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 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ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00910000148658 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00390000015930.y.a.b ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.i.a ENSGT00940000153268.j.a.b ENSGT00940000153268.j.a.a.a ENSGT00940000153268.j.a.a.b ENSGT00940000153268.i.b ENSGT00400000023423 ENSGT00940000160995.a ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00910000148658 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 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ENSGT00390000007772.b.a Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00910000148658 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057.d ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00390000015930.y.a.b ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.i.a ENSGT00940000153268.j.a.b ENSGT00940000153268.j.a.a.b ENSGT00940000153268.i.b Gorilla MODERN SPECIES 21 ZNF596 (ENSGGOG00000038523) ENSGGOG00000006030 FBXO25 (ENSGGOG00000014174) TDRP (ENSGGOG00000027280) ERICH1 (ENSGGOG00000011781) ENSGGOG00000039861 DLGAP2 (ENSGGOG00000007585) CLN8 (ENSGGOG00000043731) ARHGEF10 (ENSGGOG00000011064) ENSGGOG00000022674 MYOM2 (ENSGGOG00000002794) CSMD1 (ENSGGOG00000000361) ENSGGOG00000024738 MCPH1 (ENSGGOG00000010024) ANGPT2 (ENSGGOG00000010038) AGPAT5 (ENSGGOG00000014835) ##22 XKR5 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##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.i.a ENSGT00940000153268.j.a.b ENSGT00940000153268.j.a.a.b ENSGT00940000153268.i.b ENSGT00510000047003.i.a.b.a ENSGT00860000136287.a.a ENSGT00940000157066 ENSGT00390000006975 ENSGT00940000158928 ENSGT00530000063205.B ENSGT00940000159475 ENSGT00910000148662 ENSGT00940000156161.B Chimpanzee MODERN SPECIES 21 TDRP (ENSPTRG00000019935) ERICH1 (ENSPTRG00000019937) ENSPTRG00000043189 DLGAP2 (ENSPTRG00000023452) CLN8 (ENSPTRG00000019941) ARHGEF10 (ENSPTRG00000019942) KBTBD11 (ENSPTRG00000031045) MYOM2 (ENSPTRG00000019944) CSMD1 (ENSPTRG00000019945) ENSPTRG00000052747 ENSPTRG00000045015 ENSPTRG00000050887 MCPH1 (ENSPTRG00000019946) ENSPTRG00000051977 ANGPT2 (ENSPTRG00000019947) AGPAT5 (ENSPTRG00000019949) ##22 XKR5 (ENSPTRG00000019950) DEFB1 (ENSPTRG00000019951) DEFA6 (ENSPTRG00000051516) DEFA4 (ENSPTRG00000034369) DEFA5 (ENSPTRG00000049316) ENSPTRG00000042326 ENSPTRG00000028924 PRAG1 (ENSPTRG00000019968) CLDN23 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ENSGT00940000153268.j.a.a.a.b.b ENSGT00940000153268.j.a.a.b ENSGT00940000153268.i.b.b.a.b ENSGT00940000153268.i.b.a ENSGT00400000023423 ENSGT00940000165346 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 526 ENSGT00390000018842 ENSGT00390000015930.y.a.b ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.j.a.a.a.a ENSGT00940000153268.j.a.a.a.b.b ENSGT00940000153268.j.a.a.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2272 MCPH1 (ENSRROG00000027588) ENSRROG00000035256 ANGPT2 (ENSRROG00000044321) AGPAT5 (ENSRROG00000044683) ##22 XKR5 (ENSRROG00000040285) DEFB1 (ENSRROG00000031781) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1682 MCPH1 (ENSRBIG00000033915) ANGPT2 (ENSRBIG00000043592) AGPAT5 (ENSRBIG00000039798) ##22 XKR5 (ENSRBIG00000012282) DEFB1 (ENSRBIG00000035580) ENSRBIG00000027532 ENSRBIG00000029592 ENSRBIG00000030149 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000017888 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ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00910000148658 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00860000136037 ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000157057 ENSGT00950000182802.A.a.a.e.a.a.b ENSGT00940000155701.D ENSGT01100000263915.A ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b.t.b ENSGT00390000018842 ENSGT00390000015930.y.a.b.b ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.i.a ENSGT00940000153268.j.a.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000153268.j.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000153268.j.a.a.b ENSGT00940000153268.i.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000165346.b.a.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00390000007772.b.a Rhesus MODERN SPECIES 18 ZNF596 (ENSMMUG00000020598) FBXO25 (ENSMMUG00000011105) TDRP (ENSMMUG00000043506) ERICH1 (ENSMMUG00000007764) DLGAP2 (ENSMMUG00000057265) ENSMMUG00000055393 CLN8 (ENSMMUG00000009470) ARHGEF10 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ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.i.a ENSGT00940000153268.j.a.a.a.a ENSGT00940000153268.j.a.a.a.b.b.a.b.b ENSGT00940000153268.j.a.a.a.b.b.a.b.a.b ENSGT00940000153268.j.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000153268.j.a.a.b ENSGT00940000153268.i.b.a.b ENSGT00400000023423 ENSGT00940000165346.b.b ENSGT00940000153268.i.b.b.b.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 Olive baboon MODERN SPECIES 18 ARHGEF10 (ENSPANG00000010202) KBTBD11 (ENSPANG00000023887) MYOM2 (ENSPANG00000022911) ENSPANG00000030862 CSMD1 (ENSPANG00000022093) ENSPANG00000044833 ENSPANG00000031792 GLUD1 (ENSPANG00000051254) ENSPANG00000043141 ENSPANG00000045781 ENSPANG00000049241 ENSPANG00000041513 ENSPANG00000044175 MCPH1 (ENSPANG00000007439) ANGPT2 (ENSPANG00000006769) AGPAT5 (ENSPANG00000022332) ##22 BTDA (ENSPANG00000049195) ENSPANG00000013424 BTDC (ENSPANG00000046278) DEFA6 (ENSPANG00000006175) DEFB1 (ENSPANG00000000904) XKR5 (ENSPANG00000011032) ENSPANG00000022331 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bamboo lemur MODERN SPECIES 779 ANGPT2 (ENSPSMG00000017538) MCPH1 (ENSPSMG00000017496) AGPAT5 (ENSPSMG00000017472) ##22 XKR5 (ENSPSMG00000017441) DEFB1 (ENSPSMG00000017436) Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 12 IKBKB (ENSMICG00000006581) PLAT (ENSMICG00000009222) AP3M2 (ENSMICG00000009218) KAT6A (ENSMICG00000006961) ENSMICG00000007250 TDRP (ENSMICG00000016699) ENSMICG00000016447 DLGAP2 (ENSMICG00000016450) CLN8 (ENSMICG00000038560) ARHGEF10 (ENSMICG00000013765) KBTBD11 (ENSMICG00000013577) MYOM2 (ENSMICG00000013602) CSMD1 (ENSMICG00000003389) MCPH1 (ENSMICG00000038616) ANGPT2 (ENSMICG00000011303) ENSMICG00000030194 ##22 ENSMICG00000046233 DEFB1 (ENSMICG00000047324) ENSMICG00000037248 ENSMICG00000027124 ENSMICG00000042443 ENSMICG00000046780 ENSMICG00000042461 ENSMICG00000012407 ENSMICG00000012410 ENSMICG00000012418 ENSMICG00000034034 ENSMICG00000043266 ENSMICG00000010475 ENSMICG00000034784 DEFB134 (ENSMICG00000044548) Mouse lemur MODERN SPECIES 9 MMP24 (ENSMICG00000005999) PROCR (ENSMICG00000038532) EDEM2 (ENSMICG00000046463) TRPC4AP (ENSMICG00000005010) MYH7B (ENSMICG00000004956) GSS (ENSMICG00000004941) ACSS2 (ENSMICG00000004916) GGT7 (ENSMICG00000004896) NCOA6 (ENSMICG00000032033) TP53INP2 (ENSMICG00000042490) PIGU (ENSMICG00000003257) MAP1LC3A (ENSMICG00000028466) DYNLRB1 (ENSMICG00000003253) ITCH (ENSMICG00000003238) ENSMICG00000034345 ENSMICG00000032740 ##22 AHCY (ENSMICG00000003232) ASIP (ENSMICG00000044506) ENSMICG00000006944 RALY (ENSMICG00000039074) ENSMICG00000042802 ZNF341 (ENSMICG00000047832) ENSMICG00000028174 E2F1 (ENSMICG00000006921) NECAB3 (ENSMICG00000006906) ENSMICG00000006895 SNTA1 (ENSMICG00000004936) CDK5RAP1 (ENSMICG00000004382) BPIFB1 (ENSMICG00000004357) BPIFA1 (ENSMICG00000004348) BPIFA2 (ENSMICG00000013403) Bushbaby MODERN SPECIES 229 IMP4 (ENSOGAG00000007312) CCDC115 (ENSOGAG00000000166) ENSOGAG00000032292 ZNF596 (ENSOGAG00000013897) FBXO25 (ENSOGAG00000015240) TDRP (ENSOGAG00000011322) ENSOGAG00000013900 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(ENSTBEG00000013024) AGPAT5 (ENSTBEG00000013084) ##22 XKR5 (ENSTBEG00000013229) ENSTBEG00000013364 Glires ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00940000160995.a ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 445 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 Pika MODERN SPECIES 2383 AGPAT5 (ENSOPRG00000014343) ##22 XKR5 (ENSOPRG00000014358) Rabbit MODERN SPECIES 446 ENSOCUG00000014354 ENSOCUG00000034663 ENSOCUG00000024691 ENSOCUG00000004828 ANGPT2 (ENSOCUG00000015377) MCPH1 (ENSOCUG00000012808) ENSOCUG00000009429 ##22 XKR5 (ENSOCUG00000009435) ENSOCUG00000021273 ENSOCUG00000014572 ENSOCUG00000011335 ENSOCUG00000022651 ENSOCUG00000023668 ENSOCUG00000021307 ENSOCUG00000029975 ENSOCUG00000025488 ENSOCUG00000022335 ENSOCUG00000033616 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.n ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00940000160995.a ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00940000168770 ENSGT00390000009472 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000166542 ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000005938 ENSGT00960000190076 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a ENSGT00400000023630 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023423 ENSGT00940000153268.n ENSGT00390000017014 Kangaroo rat MODERN SPECIES 393 Fbxo25 (ENSDORG00000002666) Tdrp (ENSDORG00000013637) Erich1 (ENSDORG00000015172) Dlgap2 (ENSDORG00000010653) Cln8 (ENSDORG00000029313) Arhgef10 (ENSDORG00000007643) Myom2 (ENSDORG00000014989) Csmd1 (ENSDORG00000011948) Angpt2 (ENSDORG00000005066) Mcph1 (ENSDORG00000005061) Agpat5 (ENSDORG00000008708) ##22 Gm6040 (ENSDORG00000027103) Defb14 (ENSDORG00000001667) Spag11a (ENSDORG00000009515) ENSDORG00000029585 Defb43 (ENSDORG00000002260) Defb42 (ENSDORG00000011750) Ctsb (ENSDORG00000012477) Fdft1 (ENSDORG00000012478) Neil2 (ENSDORG00000023924) ENSDORG00000003801 Blk (ENSDORG00000006806) ENSDORG00000004605 Tdh (ENSDORG00000004604) Mtmr9 (ENSDORG00000004601) Xkr6 (ENSDORG00000004067) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000166542 ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000005938 ENSGT00960000190076 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a ENSGT00400000023630 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023423 ENSGT00940000153268.n ENSGT00390000017014 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 97 Tdrp (ENSJJAG00000015542) ENSJJAG00000020777 ENSJJAG00000024351 Dlgap2 (ENSJJAG00000015120) Cln8 (ENSJJAG00000015895) Arhgef10 (ENSJJAG00000018730) Kbtbd11 (ENSJJAG00000024333) Myom2 (ENSJJAG00000011312) ENSJJAG00000017412 ENSJJAG00000022771 Csmd1 (ENSJJAG00000012366) ENSJJAG00000006116 ENSJJAG00000009703 ENSJJAG00000010042 Angpt2 (ENSJJAG00000023501) Agpat5 (ENSJJAG00000018338) ##22 Xkr5 (ENSJJAG00000015137) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000166542 ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000005938 ENSGT00960000190076 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a ENSGT00400000023630 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023423 ENSGT00940000153268.n ENSGT00940000153268.m Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1372 Mcph1 (ENSNGAG00000002140) Angpt2 (ENSNGAG00000010084) Agpat5 (ENSNGAG00000021853) ##22 Xkr5 (ENSNGAG00000021648) Defb1 (ENSNGAG00000020804) ENSNGAG00000017618 ENSNGAG00000024262 Gm6040 (ENSNGAG00000023934) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00950000182950.B ENSGT00390000017146.b ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000166542 ENSGT00940000153268.m ENSGT00940000153268.n ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 ENSGT00950000183398.a ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000161432.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a ENSGT00400000023630 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023423 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000182950.B ENSGT00390000017146.b ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000166542 ENSGT00940000153268.m ENSGT00940000153268.n ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00940000160995.a ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000153137.a.b.b.b ENSGT00940000155749.d Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182950.B ENSGT00390000017146.b ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000166542 ENSGT00940000153268.m ENSGT00940000153268.n ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00940000160995.a ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000153137.a.b.b.b ENSGT00940000155749.d Golden Hamster MODERN SPECIES 749 ENSMAUG00000020512 Cdc16 (ENSMAUG00000001347) ENSMAUG00000017013 Champ1 (ENSMAUG00000004917) ENSMAUG00000009100 Fbxo25 (ENSMAUG00000014440) Tdrp (ENSMAUG00000004442) Erich1 (ENSMAUG00000021681) Dlgap2 (ENSMAUG00000017371) ENSMAUG00000012376 Arhgef10 (ENSMAUG00000021122) Kbtbd11 (ENSMAUG00000007983) Myom2 (ENSMAUG00000006729) Csmd1 (ENSMAUG00000010260) Angpt2 (ENSMAUG00000014702) Agpat5 (ENSMAUG00000013653) ##22 Xkr5 (ENSMAUG00000001799) Defb1 (ENSMAUG00000015973) ENSMAUG00000008726 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 121 Champ1 (ENSCGRG00001010456) Coprs (ENSCGRG00001021740) Fbxo25 (ENSCGRG00001022186) Tdrp (ENSCGRG00001009331) Erich1 (ENSCGRG00001014658) ENSCGRG00001015988 Dlgap2 (ENSCGRG00001024911) Cln8 (ENSCGRG00001005528) Arhgef10 (ENSCGRG00001004556) Kbtbd11 (ENSCGRG00001010506) Myom2 (ENSCGRG00001017603) ENSCGRG00001007648 Csmd1 (ENSCGRG00001000546) Mcph1 (ENSCGRG00001003438) Angpt2 (ENSCGRG00001023150) Agpat5 (ENSCGRG00001018734) ##22 Xkr5 (ENSCGRG00001023928) ENSCGRG00001023090 ENSCGRG00001016206 Defb1 (ENSCGRG00001004865) ENSCGRG00001007419 ENSCGRG00001009981 ENSCGRG00001012324 ENSCGRG00001009098 ENSCGRG00001009002 ENSCGRG00001001579 ENSCGRG00001012550 ENSCGRG00001021216 ENSCGRG00001003278 ENSCGRG00001006148 ENSCGRG00001012132 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182950.B ENSGT00390000017146.b ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000169287 ENSGT00940000153268.m ENSGT00940000153268.n ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00940000160995.a ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000153137.a.b.b.b ENSGT00940000155749.d Prairie vole MODERN SPECIES 90 Champ1 (ENSMOCG00000001969) ENSMOCG00000000667 ENSMOCG00000015168 Fbxo25 (ENSMOCG00000020397) Tdrp (ENSMOCG00000016926) Erich1 (ENSMOCG00000001747) Dlgap2 (ENSMOCG00000013444) Cln8 (ENSMOCG00000018067) Arhgef10 (ENSMOCG00000013908) Myom2 (ENSMOCG00000015394) ENSMOCG00000016060 Csmd1 (ENSMOCG00000019589) ENSMOCG00000007664 Angpt2 (ENSMOCG00000001083) Mcph1 (ENSMOCG00000020421) Agpat5 (ENSMOCG00000018414) ##22 Xkr5 (ENSMOCG00000002190) Defb50 (ENSMOCG00000020718) ENSMOCG00000000803 ENSMOCG00000011857 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 8 Cdc16 (ENSPEMG00000020029) Upf3a (ENSPEMG00000019968) Champ1 (ENSPEMG00000019715) ENSPEMG00000030218 Fbxo25 (ENSPEMG00000019484) Tdrp (ENSPEMG00000024535) Erich1 (ENSPEMG00000017352) Dlgap2 (ENSPEMG00000024199) Cln8 (ENSPEMG00000027459) Arhgef10 (ENSPEMG00000023366) Kbtbd11 (ENSPEMG00000023808) Myom2 (ENSPEMG00000022162) Csmd1 (ENSPEMG00000024066) Angpt2 (ENSPEMG00000012005) Mcph1 (ENSPEMG00000011879) Agpat5 (ENSPEMG00000027850) ##22 Xkr5 (ENSPEMG00000011310) Defb37 (ENSPEMG00000012924) Defb1 (ENSPEMG00000011579) ENSPEMG00000029202 ENSPEMG00000030768 ENSPEMG00000028138 ENSPEMG00000025039 ENSPEMG00000030903 ENSPEMG00000028492 ENSPEMG00000025895 ENSPEMG00000029536 ENSPEMG00000024415 ENSPEMG00000029914 ENSPEMG00000030513 Gm6040 (ENSPEMG00000004466) Murinae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00950000182950.B ENSGT00390000017146.b ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000165539 ENSGT01100000264193 ENSGT01100000264031.B ENSGT01100000264031.A ENSGT00910000144208.d ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 ENSGT00950000183398.a ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000161432.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a ENSGT00400000023630 ENSGT00420000030484 Rat MODERN SPECIES 7 Champ1 (ENSRNOG00000000112) Coprs (ENSRNOG00000000111) Fbxo25 (ENSRNOG00000042464) Tdrp (ENSRNOG00000027245) Erich1 (ENSRNOG00000042114) Dlgap2 (ENSRNOG00000012573) Cln8 (ENSRNOG00000012565) Arhgef10 (ENSRNOG00000012561) Kbtbd11 (ENSRNOG00000012333) Myom2 (ENSRNOG00000011754) Csmd1 (ENSRNOG00000030719) ENSRNOG00000070631 Angpt2 (ENSRNOG00000016696) Mcph1 (ENSRNOG00000028586) Map1lc3b2 (ENSRNOG00000038106) Agpat5 (ENSRNOG00000028623) ##22 Xkr5 (ENSRNOG00000028636) LOC100362738 (ENSRNOG00000047276) Defb40 (ENSRNOG00000033538) Defb37 (ENSRNOG00000038115) Defb38 (ENSRNOG00000032089) Defb39 (ENSRNOG00000034275) Defb12 (ENSRNOG00000065258) LOC120097516 (ENSRNOG00000065710) Spag11b (ENSRNOG00000070256) Spag11a (ENSRNOG00000013957) Defb14 (ENSRNOG00000032304) Defb4 (ENSRNOG00000013939) Defb5 (ENSRNOG00000038126) Defb33 (ENSRNOG00000038128) Defb52 (ENSRNOG00000038129) Mus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT00900000143792 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00860000135440 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000165539.a ENSGT01100000264193 ENSGT01100000264031.B ENSGT00940000165539.b ENSGT01100000264031.A ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317.c ENSGT00390000002317.d ENSGT00950000183398.a ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000161432.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a.e ENSGT00400000023630 Shrew mouse MODERN SPECIES 10 Coprs (MGP_PahariEiJ_G0021313) Fbxo25 (MGP_PahariEiJ_G0021314) Tdrp (MGP_PahariEiJ_G0021315) Erich1 (MGP_PahariEiJ_G0021316) MGP_PahariEiJ_G0021317 Dlgap2 (MGP_PahariEiJ_G0021318) MGP_PahariEiJ_G0021319 Cln8 (MGP_PahariEiJ_G0021320) Arhgef10 (MGP_PahariEiJ_G0021321) Kbtbd11 (MGP_PahariEiJ_G0021322) MGP_PahariEiJ_G0021323 Myom2 (MGP_PahariEiJ_G0021324) Csmd1 (MGP_PahariEiJ_G0021325) Mcph1 (MGP_PahariEiJ_G0021326) Angpt2 (MGP_PahariEiJ_G0021327) Agpat5 (MGP_PahariEiJ_G0021328) ##22 Xkr5 (MGP_PahariEiJ_G0021329) Defb40 (MGP_PahariEiJ_G0021330) Defb37 (MGP_PahariEiJ_G0021331) MGP_PahariEiJ_G0021332 MGP_PahariEiJ_G0021333 Defb39 (MGP_PahariEiJ_G0021334) MGP_PahariEiJ_G0021335 Defb12 (MGP_PahariEiJ_G0021336) MGP_PahariEiJ_G0021337 MGP_PahariEiJ_G0021338 Spag11b (MGP_PahariEiJ_G0021339) Spag11a (MGP_PahariEiJ_G0021340) Defb14 (MGP_PahariEiJ_G0021341) Defb33 (MGP_PahariEiJ_G0021342) Gm15056 (MGP_PahariEiJ_G0021343) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT00900000143792 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00860000135440 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000165539.a ENSGT01100000264193 ENSGT01100000264031.B ENSGT00940000165539.b ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317.c ENSGT00390000002317.d ENSGT00950000183398.a ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000161432.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a.e ENSGT00940000160995.a.f ENSGT00400000023630 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 17 Upf3a (MGP_CAROLIEiJ_G0030848) Champ1 (MGP_CAROLIEiJ_G0030849) Coprs (MGP_CAROLIEiJ_G0030850) MGP_CAROLIEiJ_G0030851 MGP_CAROLIEiJ_G0030852 MGP_CAROLIEiJ_G0030853 MGP_CAROLIEiJ_G0030855 Cln8 (MGP_CAROLIEiJ_G0030856) MGP_CAROLIEiJ_G0030857 Kbtbd11 (MGP_CAROLIEiJ_G0030858) MGP_CAROLIEiJ_G0030859 MGP_CAROLIEiJ_G0030860 MGP_CAROLIEiJ_G0030861 MGP_CAROLIEiJ_G0030862 Angpt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0030863) MGP_CAROLIEiJ_G0030864 ##22 Xkr5 (MGP_CAROLIEiJ_G0030865) Defb40 (MGP_CAROLIEiJ_G0030866) Defb37 (MGP_CAROLIEiJ_G0030867) Defb38 (MGP_CAROLIEiJ_G0030868) Defb39 (MGP_CAROLIEiJ_G0030869) Defb12 (MGP_CAROLIEiJ_G0030870) MGP_CAROLIEiJ_G0030871 MGP_CAROLIEiJ_G0030872 MGP_CAROLIEiJ_G0030873 Spag11b (MGP_CAROLIEiJ_G0030874) Spag11a (MGP_CAROLIEiJ_G0030875) Defb14 (MGP_CAROLIEiJ_G0030876) MGP_CAROLIEiJ_G0030877 Gm15056 (MGP_CAROLIEiJ_G0030878) Gm6040 (MGP_CAROLIEiJ_G0030879) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT00900000143792 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00860000135440 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000165539.a ENSGT01100000264193 ENSGT01100000264031.B ENSGT00940000165539.b ENSGT00390000002317.c.a ENSGT00950000183398.a.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000161432.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a.e ENSGT01030000235924.b ENSGT00860000136196 ENSGT00940000160995.a.f ENSGT00400000023630 Mouse MODERN SPECIES 17 Semp2l2a (ENSMUSG00000057116) Champ1 (ENSMUSG00000047710) Coprs (ENSMUSG00000031458) Fbxo25 (ENSMUSG00000038365) Tdrp (ENSMUSG00000050052) Erich1 (ENSMUSG00000051978) Dlgap2 (ENSMUSG00000047495) Cln8 (ENSMUSG00000026317) Arhgef10 (ENSMUSG00000071176) Kbtbd11 (ENSMUSG00000055675) BB014433 (ENSMUSG00000049008) Myom2 (ENSMUSG00000031461) Csmd1 (ENSMUSG00000060924) Mcph1 (ENSMUSG00000039842) Angpt2 (ENSMUSG00000031465) Agpat5 (ENSMUSG00000031467) ##22 Xkr5 (ENSMUSG00000039814) Defb40 (ENSMUSG00000053678) Defb37 (ENSMUSG00000053695) Defb38 (ENSMUSG00000053790) Defb39 (ENSMUSG00000061847) Defb12 (ENSMUSG00000043787) Defb34 (ENSMUSG00000052554) Spag11b (ENSMUSG00000059463) Gm45826 (ENSMUSG00000110641) Spag11a (ENSMUSG00000079842) Defb14 (ENSMUSG00000046354) Defb4 (ENSMUSG00000059230) Defb6 (ENSMUSG00000050756) Defb46 (ENSMUSG00000071169) Defb5 (ENSMUSG00000039785) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000111351 ENSGT00390000007384 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT00900000143792 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00860000135440 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000165539.a ENSGT01100000264193 ENSGT01100000264031.B ENSGT00940000165539.b ENSGT00390000002317.c.a ENSGT00950000183398.a.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000161432.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a.e ENSGT01030000235924.b ENSGT00860000136196 ENSGT00940000160995.a.f ENSGT00400000023630 Steppe mouse MODERN SPECIES 2504 Mcph1 (ENSMSIG00000029615) Angpt2 (ENSMSIG00000029639) Agpat5 (ENSMSIG00000029640) ##22 Xkr5 (ENSMSIG00000029646) Defb40 (ENSMSIG00000029651) Defb37 (ENSMSIG00000029654) Defb38 (ENSMSIG00000029655) ENSMSIG00000029658 Defb12 (ENSMSIG00000029659) Defb34 (ENSMSIG00000029661) Spag11b (ENSMSIG00000029664) Spag11a (ENSMSIG00000029666) Defb14 (ENSMSIG00000029670) Defb4 (ENSMSIG00000000011) ENSMSIG00000000013 Defb6 (ENSMSIG00000000016) Defb3 (ENSMSIG00000000019) spretus MODERN SPECIES 17 Coprs (MGP_SPRETEiJ_G0031960) Fbxo25 (MGP_SPRETEiJ_G0031961) Tdrp (MGP_SPRETEiJ_G0031962) Erich1 (MGP_SPRETEiJ_G0031963) MGP_SPRETEiJ_G0031964 Dlgap2 (MGP_SPRETEiJ_G0031965) MGP_SPRETEiJ_G0031966 Cln8 (MGP_SPRETEiJ_G0031967) Arhgef10 (MGP_SPRETEiJ_G0031968) Kbtbd11 (MGP_SPRETEiJ_G0031969) MGP_SPRETEiJ_G0031970 Myom2 (MGP_SPRETEiJ_G0031971) Csmd1 (MGP_SPRETEiJ_G0031972) Mcph1 (MGP_SPRETEiJ_G0031973) Angpt2 (MGP_SPRETEiJ_G0031974) Agpat5 (MGP_SPRETEiJ_G0031975) ##22 Xkr5 (MGP_SPRETEiJ_G0031976) Defb40 (MGP_SPRETEiJ_G0031977) Defb37 (MGP_SPRETEiJ_G0031978) Defb38 (MGP_SPRETEiJ_G0031979) Defb39 (MGP_SPRETEiJ_G0031980) Defb12 (MGP_SPRETEiJ_G0031981) MGP_SPRETEiJ_G0031982 Spag11b (MGP_SPRETEiJ_G0031983) Spag11a (MGP_SPRETEiJ_G0031984) Defb14 (MGP_SPRETEiJ_G0031985) Defb4 (MGP_SPRETEiJ_G0031986) Defb6 (MGP_SPRETEiJ_G0031987) Defb46 (MGP_SPRETEiJ_G0031988) Defb3 (MGP_SPRETEiJ_G0031989) Defb33 (MGP_SPRETEiJ_G0031990) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.n ENSGT00940000153268.m ENSGT00400000023423 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00940000168770 ENSGT00390000009472 ENSGT00940000160995.b Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000166542 ENSGT00940000153268.n ENSGT00940000153268.m ENSGT00400000023423 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000001862 ENSGT00940000158680 ENSGT00390000016034 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 ENSHGLG00000050365 ENSHGLG00000043011 ENSHGLG00000018999 ENSHGLG00000003073 ENSHGLG00000003492 ENSHGLG00000041229 ARHGEF10 (ENSHGLG00000003965) KBTBD11 (ENSHGLG00000035008) MYOM2 (ENSHGLG00000000341) ENSHGLG00000049125 CSMD1 (ENSHGLG00000000508) ENSHGLG00000048727 ANGPT2 (ENSHGLG00000002482) ENSHGLG00000048261 ENSHGLG00000002310 ENSHGLG00000040104 ##22 ENSHGLG00000002668 ENSHGLG00000000880 ENSHGLG00000032308 ENSHGLG00000044335 ENSHGLG00000034021 ENSHGLG00000042547 ENSHGLG00000046844 ENSHGLG00000000054 ENSHGLG00000050883 ENSHGLG00000043681 DEFB103B (ENSHGLG00000048217) ENSHGLG00000035370 ENSHGLG00000018660 ENSHGLG00000037870 ENSHGLG00000048117 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000153268.n ENSGT00940000153268.m ENSGT00400000023423 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00390000002317 ENSGT00390000001862 ENSGT00940000158680 ENSGT00390000016034 ENSGT00940000153230.B ENSGT00940000158349 ENSGT00940000159864 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000153268.n ENSGT00940000153268.m ENSGT00400000023423 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00390000002317 ENSGT00390000001862 ENSGT00940000158680 ENSGT00390000016034 ENSGT00940000153230.B ENSGT00940000158349 ENSGT00940000159864 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 110 ENSCLAG00000016074 FBXO25 (ENSCLAG00000016923) TDRP (ENSCLAG00000016320) ENSCLAG00000015334 DLGAP2 (ENSCLAG00000015401) CLN8 (ENSCLAG00000014557) ENSCLAG00000017976 ARHGEF10 (ENSCLAG00000016199) MYOM2 (ENSCLAG00000015871) CSMD1 (ENSCLAG00000015760) ENSCLAG00000015633 ANGPT2 (ENSCLAG00000013588) AGPAT5 (ENSCLAG00000014732) ##22 XKR5 (ENSCLAG00000014261) ENSCLAG00000013848 ENSCLAG00000014338 ENSCLAG00000014284 ENSCLAG00000015427 ENSCLAG00000014949 DEFB1 (ENSCLAG00000016003) ENSCLAG00000016856 ENSCLAG00000015670 ENSCLAG00000014084 ENSCLAG00000014231 DEFB136 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Squirrel MODERN SPECIES 215 ENSSTOG00000023833 FBXO25 (ENSSTOG00000006897) TDRP (ENSSTOG00000002604) ENSSTOG00000008478 DLGAP2 (ENSSTOG00000009663) CLN8 (ENSSTOG00000024824) ARHGEF10 (ENSSTOG00000020506) KBTBD11 (ENSSTOG00000034350) MYOM2 (ENSSTOG00000016466) CSMD1 (ENSSTOG00000011625) MCPH1 (ENSSTOG00000003089) ANGPT2 (ENSSTOG00000003106) AGPAT5 (ENSSTOG00000027004) ##22 XKR5 (ENSSTOG00000026044) ENSSTOG00000032979 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 FBXO25 (ENSSVLG00005002724) TDRP (ENSSVLG00005002814) ENSSVLG00005002861 DLGAP2 (ENSSVLG00005002943) CLN8 (ENSSVLG00005003012) ARHGEF10 (ENSSVLG00005003090) KBTBD11 (ENSSVLG00005003293) MYOM2 (ENSSVLG00005003314) CSMD1 (ENSSVLG00005003921) MCPH1 (ENSSVLG00005004943) ANGPT2 (ENSSVLG00005005007) AGPAT5 (ENSSVLG00005005026) ##22 XKR5 (ENSSVLG00005005071) DEFB1 (ENSSVLG00005005140) ENSSVLG00005005166 ENSSVLG00005005183 ENSSVLG00005005200 ENSSVLG00005005223 ENSSVLG00005005250 ENSSVLG00005005267 ENSSVLG00005005284 ENSSVLG00005005304 ENSSVLG00005005323 ENSSVLG00005005346 ENSSVLG00005005368 ENSSVLG00005005388 ENSSVLG00005005410 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000162665 ENSGT00940000163552.a Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000172974 ENSGT00940000161948 ENSGT00940000163552.b ENSGT00940000163552.a ENSGT00390000009472 ENSGT00990000204018 ENSGT00940000160995.b ENSGT00390000006915.d ENSGT00940000158602 ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000159851 ENSGT00390000009223 ENSGT00940000156167.b ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00480000043221 ENSGT01090000260492 ENSGT00940000160995.a ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00480000043221 ENSGT01090000260492 ENSGT00940000160995.a ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 Equus ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00940000153268.t.a.a ENSGT00940000153268.t.b.a ENSGT00940000153268.t.a.b.a ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT01090000260492.a.a ENSGT01090000260492.b.a ENSGT00480000043221.b ENSGT01090000260492.a.b ENSGT00530000064280.m ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a Horse MODERN SPECIES 19 ZNF596 (ENSECAG00000012566) FBXO25 (ENSECAG00000023166) TDRP (ENSECAG00000043336) ERICH1 (ENSECAG00000022877) ENSECAG00000042298 DLGAP2 (ENSECAG00000020427) CLN8 (ENSECAG00000037808) ARHGEF10 (ENSECAG00000015384) ENSECAG00000031450 ENSECAG00000056286 MYOM2 (ENSECAG00000017592) ENSECAG00000016730 CSMD1 (ENSECAG00000024680) ANGPT2 (ENSECAG00000015894) MCPH1 (ENSECAG00000018517) AGPAT5 (ENSECAG00000016106) ##22 XKR5 (ENSECAG00000012521) DEFB1 (ENSECAG00000034702) DEFA5L (ENSECAG00000043705) ENSECAG00000028505 ENSECAG00000027869 DEFA23 (ENSECAG00000049963) DEFA16 (ENSECAG00000039434) DEFA36L (ENSECAG00000033357) ENSECAG00000032644 ENSECAG00000038575 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ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00960000190076 ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 Megabat MODERN SPECIES 1519 AGPAT5 (ENSPVAG00000016156) ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00390000009472 ENSGT00940000163552.b ENSGT00940000161948 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 Microbat MODERN SPECIES 327 ENSMLUG00000005325 ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 22 ZNF596 (ENSRFEG00010008830) FBXO25 (ENSRFEG00010008929) TDRP (ENSRFEG00010009156) ENSRFEG00010009195 DLGAP2 (ENSRFEG00010009246) ENSRFEG00010009452 CLN8 (ENSRFEG00010009471) ARHGEF10 (ENSRFEG00010009540) KBTBD11 (ENSRFEG00010009628) MYOM2 (ENSRFEG00010009702) CSMD1 (ENSRFEG00010010053) MCPH1 (ENSRFEG00010013796) ANGPT2 (ENSRFEG00010013872) AGPAT5 (ENSRFEG00010014092) ##22 XKR5 (ENSRFEG00010014239) DEFB1 (ENSRFEG00010014272) ENSRFEG00010014402 ENSRFEG00010014455 ENSRFEG00010014509 ENSRFEG00010014591 ENSRFEG00010014683 ENSRFEG00010014746 ENSRFEG00010014801 ENSRFEG00010014873 ENSRFEG00010014921 LHFPL6 (ENSRFEG00010014955) SIAH3 (ENSRFEG00010015030) CBY2 (ENSRFEG00010015067) COG3 (ENSRFEG00010015220) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00480000043221 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000162665 ENSGT00940000163626 Felidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.b ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000162665.m.a ENSGT00940000163626 ENSGT00940000154559.B Panthera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.b ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000162665.m.a ENSGT00940000163626 Tiger MODERN SPECIES 298 FBXO25 (ENSPTIG00000011743) ENSPTIG00000011722 DLGAP2 (ENSPTIG00000011694) CLN8 (ENSPTIG00000011681) ARHGEF10 (ENSPTIG00000011504) MYOM2 (ENSPTIG00000011286) CSMD1 (ENSPTIG00000011206) MCPH1 (ENSPTIG00000010962) ANGPT2 (ENSPTIG00000010865) AGPAT5 (ENSPTIG00000010840) ##22 XKR5 (ENSPTIG00000010824) DEFB1 (ENSPTIG00000010821) ENSPTIG00000010813 ENSPTIG00000010810 ENSPTIG00000010796 ENSPTIG00000010751 ENSPTIG00000010741 ENSPTIG00000010735 ENSPTIG00000007911 ENSPTIG00000010282 ENSPTIG00000010272 ENSPTIG00000010263 ENSPTIG00000010172 ENSPTIG00000010148 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.b ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000162665.m.a ENSGT00940000163626 ENSGT00940000163552.b leopard MODERN SPECIES 256 ENSPPRG00000010467 AGPAT5 (ENSPPRG00000010342) ##22 XKR5 (ENSPPRG00000010319) DEFB1 (ENSPPRG00000010287) ENSPPRG00000010069 ENSPPRG00000009907 ENSPPRG00000009893 ENSPPRG00000009888 ENSPPRG00000009824 ENSPPRG00000009819 ENSPPRG00000009761 ENSPPRG00000009665 ENSPPRG00000009632 ENSPPRG00000009611 ENSPPRG00000009593 ENSPPRG00000009561 ENSPPRG00000009545 lion MODERN SPECIES 4 FBXO25 (ENSPLOG00000020180) TDRP (ENSPLOG00000020246) ENSPLOG00000020281 DLGAP2 (ENSPLOG00000020361) CLN8 (ENSPLOG00000020771) ARHGEF10 (ENSPLOG00000020590) KBTBD11 (ENSPLOG00000020791) MYOM2 (ENSPLOG00000020803) ENSPLOG00000020835 CSMD1 (ENSPLOG00000020877) MCPH1 (ENSPLOG00000021163) ANGPT2 (ENSPLOG00000021252) AGPAT5 (ENSPLOG00000010723) ##22 XKR5 (ENSPLOG00000010787) DEFB1 (ENSPLOG00000010903) ENSPLOG00000010930 ENSPLOG00000010960 ENSPLOG00000010985 ENSPLOG00000011008 ENSPLOG00000011036 ENSPLOG00000011077 ENSPLOG00000011128 ENSPLOG00000011150 ENSPLOG00000011179 ENSPLOG00000011225 ENSPLOG00000011257 ENSPLOG00000011312 ENSPLOG00000011358 Cat MODERN SPECIES 235 ENSFCAG00000047344 FBXO25 (ENSFCAG00000024002) TDRP (ENSFCAG00000044407) ERICH1 (ENSFCAG00000002456) DLGAP2 (ENSFCAG00000000631) ENSFCAG00000051391 CLN8 (ENSFCAG00000022324) ARHGEF10 (ENSFCAG00000012553) KBTBD11 (ENSFCAG00000041464) MYOM2 (ENSFCAG00000004727) CSMD1 (ENSFCAG00000015539) ENSFCAG00000049030 MCPH1 (ENSFCAG00000052276) ENSFCAG00000038856 ANGPT2 (ENSFCAG00000014372) AGPAT5 (ENSFCAG00000013854) ##22 XKR5 (ENSFCAG00000013856) DEFB1 (ENSFCAG00000032191) ENSFCAG00000026740 ENSFCAG00000037196 ENSFCAG00000036782 ENSFCAG00000046761 ENSFCAG00000033074 ENSFCAG00000032713 ENSFCAG00000047984 ENSFCAG00000052770 ENSFCAG00000039131 ENSFCAG00000047204 ENSFCAG00000046076 ENSFCAG00000046328 ENSFCAG00000047469 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154559.C ENSGT00940000163095.a ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000172974 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00480000043221 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000165413 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00940000168770 ENSGT00940000163626 Canidae ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000172974 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00390000017014 ENSGT00400000023423 ENSGT00420000030484 ENSGT00400000023630 ENSGT00480000043221 ENSGT00530000064280 ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a 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ENSCDRG00005021308 ENSCDRG00005021305 ENSCDRG00005021304 ENSCDRG00005021301 ENSCDRG00005021297 ENSCDRG00005021296 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000172974 ENSGT00940000154559.B ENSGT00940000163552.b ENSGT00390000013953 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000005938 ENSGT00940000164302 ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000161432.b ENSGT00530000064280 ENSGT00940000160995.a ENSGT00400000023630 ENSGT00400000023423 ENSGT00390000017014 ENSGT00940000163552.a.a.b Cetacea ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158376 ENSGT00940000162234 ENSGT00410000025556.a.a.a.b ENSGT00940000154559.C ENSGT00390000004915.b ENSGT00390000017888 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a 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Vaquita MODERN SPECIES 13 FBXO25 (ENSPSNG00000019424) TDRP (ENSPSNG00000019346) ENSPSNG00000019324 DLGAP2 (ENSPSNG00000018986) CLN8 (ENSPSNG00000018888) ENSPSNG00000018867 ENSPSNG00000018821 ARHGEF10 (ENSPSNG00000018635) KBTBD11 (ENSPSNG00000018504) MYOM2 (ENSPSNG00000018252) ENSPSNG00000018190 CSMD1 (ENSPSNG00000015011) ANGPT2 (ENSPSNG00000014365) MCPH1 (ENSPSNG00000014315) ENSPSNG00000014248 AGPAT5 (ENSPSNG00000014167) ##22 XKR5 (ENSPSNG00000014053) ENSPSNG00000013954 ENSPSNG00000013784 ENSPSNG00000013719 ENSPSNG00000013657 ENSPSNG00000013627 ENSPSNG00000013568 ENSPSNG00000013511 ENSPSNG00000013468 DEFB1 (ENSPSNG00000013427) ENSPSNG00000013332 ENSPSNG00000013292 GPM6A (ENSPSNG00000013103) WDR17 (ENSPSNG00000012956) SPATA4 (ENSPSNG00000012798) Dolphin MODERN SPECIES 947 MCPH1 (ENSTTRG00000017075) ANGPT2 (ENSTTRG00000017076) AGPAT5 (ENSTTRG00000017077) ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 12 ENSPCTG00005010748 WWC2 (ENSPCTG00005010891) ZNF596 (ENSPCTG00005011048) FBXO25 (ENSPCTG00005011146) 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ENSBTAG00000051728 CLN8 (ENSBTAG00000008584) ARHGEF10 (ENSBTAG00000008585) KBTBD11 (ENSBTAG00000018284) MYOM2 (ENSBTAG00000009387) CSMD1 (ENSBTAG00000009739) ENSBTAG00000048648 ENSBTAG00000035021 MCPH1 (ENSBTAG00000011032) ANGPT2 (ENSBTAG00000011034) AGPAT5 (ENSBTAG00000004922) ##22 XKR5 (ENSBTAG00000007473) ENSBTAG00000050611 TAP (ENSBTAG00000048171) ENSBTAG00000052579 ENSBTAG00000049568 SPAG11B (ENSBTAG00000034952) ENSBTAG00000048847 ENSBTAG00000049070 ENSBTAG00000052911 ENSBTAG00000054607 ZNF705A (ENSBTAG00000046204) ENSBTAG00000053110 ENSBTAG00000051223 LAP (ENSBTAG00000053889) ENSBTAG00000046937 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 19 ENSBIXG00005021124 DLGAP2 (ENSBIXG00005021085) CLN8 (ENSBIXG00005021015) ARHGEF10 (ENSBIXG00005020957) MYOM2 (ENSBIXG00005020817) ENSBIXG00005020787 ENSBIXG00005020775 CSMD1 (ENSBIXG00005005536) ENSBIXG00005017932 ENSBIXG00005017923 ENSBIXG00005006241 ANGPT2 (ENSBIXG00005006586) AGPAT5 (ENSBIXG00005002898) ##22 XKR5 (ENSBIXG00005017819) ENSBIXG00005017803 ENSBIXG00005002885 ENSBIXG00005017757 ENSBIXG00005017731 ENSBIXG00005017723 ENSBIXG00005017711 ENSBIXG00005017697 ENSBIXG00005017684 ENSBIXG00005017639 ENSBIXG00005017622 ENSBIXG00005017596 ENSBIXG00005002854 ENSBIXG00005002849 ENSBIXG00005017497 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00390000005606 ENSGT00940000157913 ENSGT01010000222313.A.a ENSGT00940000153798.A.a ENSGT00940000161983 ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT01070000253766.A.a.a.b ENSGT00940000163552.a.b.b.b ENSGT00910000144208 ENSGT00530000064280.h.b ENSGT00940000161432.b ENSGT00940000161432.a ENSGT00940000164302 ENSGT00390000005938 ENSGT00390000002317 ENSGT00390000013953 ENSGT00940000163552.b ENSGT00940000154559.B ENSGT00940000163552.a.b.a ENSGT00390000009472.f ENSGT01020000230640.b Domestic yak MODERN SPECIES 20 ZNF385D (ENSBGRG00000009302) ENSBGRG00000009279 ENSBGRG00000009218 ENSBGRG00000009162 DLGAP2 (ENSBGRG00000008911) CLN8 (ENSBGRG00000008855) ENSBGRG00000008817 KBTBD11 (ENSBGRG00000008792) ENSBGRG00000008775 MYOM2 (ENSBGRG00000008535) CSMD1 (ENSBGRG00000008311) ENSBGRG00000008242 ENSBGRG00000008211 ANGPT2 (ENSBGRG00000008142) MCPH1 (ENSBGRG00000007575) AGPAT5 (ENSBGRG00000007402) ##22 ENSBGRG00000007348 ENSBGRG00000007307 ENSBGRG00000007258 ENSBGRG00000007236 ENSBGRG00000007195 ENSBGRG00000007136 ENSBGRG00000007100 ENSBGRG00000007073 ENSBGRG00000007047 ENSBGRG00000007023 ENSBGRG00000006999 ENSBGRG00000006981 ENSBGRG00000021580 ENSBGRG00000021538 ENSBGRG00000021525 Wild yak MODERN SPECIES 33 ENSBMUG00000025039 ANGPT2 (ENSBMUG00000025037) MCPH1 (ENSBMUG00000025033) AGPAT5 (ENSBMUG00000025025) ##22 XKR5 (ENSBMUG00000025014) ENSBMUG00000025006 American bison MODERN SPECIES 3250 SH2D1A (ENSBBBG00000004539) TENM1 (ENSBBBG00000004522) MCPH1 (ENSBBBG00000004508) ANGPT2 (ENSBBBG00000018414) AGPAT5 (ENSBBBG00000004497) ##22 XKR5 (ENSBBBG00000008457) ENSBBBG00000018339 ENSBBBG00000018326 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 4970 AGPAT5 (ENSEEUG00000010399) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 449 ENSSARG00000001643 ##22 Platypus MODERN SPECIES 84 TMEM18 (ENSOANG00000021301) ENSOANG00000042205 ENSOANG00000002272 ENSOANG00000036842 ENSOANG00000046287 FBXO25 (ENSOANG00000004690) TDRP (ENSOANG00000041396) DLGAP2 (ENSOANG00000014126) CLN8 (ENSOANG00000046035) ARHGEF10 (ENSOANG00000014123) KBTBD11 (ENSOANG00000014122) MYOM2 (ENSOANG00000014120) CSMD1 (ENSOANG00000013772) ENSOANG00000005388 ANGPT2 (ENSOANG00000005391) AGPAT5 (ENSOANG00000037958) ##22 TMEM14A (ENSOANG00000038300) ENSOANG00000029989 FAM98A (ENSOANG00000012516) CRIM1 (ENSOANG00000009476) FEZ2 (ENSOANG00000009477) ENSOANG00000009478 ENSOANG00000047510 ENSOANG00000009479 STRN (ENSOANG00000009481) HEATR5B (ENSOANG00000008081) GPATCH11 (ENSOANG00000036426) ENSOANG00000003939 CEBPZOS (ENSOANG00000048845) CEBPZ (ENSOANG00000005120) NDUFAF7 (ENSOANG00000012178) Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 7 DLGAP2 (ENSLLEG00000013027) ENSLLEG00000012989 ENSLLEG00000012923 CLN8 (ENSLLEG00000012881) ARHGEF10 (ENSLLEG00000011395) ENSLLEG00000011128 MYOM2 (ENSLLEG00000010908) CSMD1 (ENSLLEG00000009506) ENSLLEG00000009340 ENSLLEG00000009297 ENSLLEG00000009258 ENSLLEG00000009157 ANGPT2 (ENSLLEG00000009083) ENSLLEG00000009055 ENSLLEG00000008932 AGPAT5 (ENSLLEG00000008854) ##22 ENSLLEG00000008832 TMEM14A (ENSLLEG00000008779) ENSLLEG00000008701 ENSLLEG00000008684 ENSLLEG00000008637 ENSLLEG00000008609 ENSLLEG00000008537 ENSLLEG00000008504 CILK1 (ENSLLEG00000008407) FBXO9 (ENSLLEG00000008281) GCM1 (ENSLLEG00000008240) ENSLLEG00000008082 GCLC (ENSLLEG00000007881) KLHL31 (ENSLLEG00000007809) ENSLLEG00000007555 Coelacanth MODERN SPECIES 1302 ENSLACG00000003196 ANGPT2 (ENSLACG00000009657) AGPAT5 (ENSLACG00000011220) ##22 TMEM14A (ENSLACG00000012581) ENSLACG00000012663 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00420000030417 ENSGT00940000157912 ENSGT00390000002164.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00530000064569.a ENSGT00530000064569.b ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889 ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00420000030417 ENSGT00940000157912 ENSGT00390000002164.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00530000064569.a ENSGT00530000064569.b ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057 ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT00390000006777.a ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889 ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000157396 ENSGT01030000234543.E ENSGT00940000161907 ENSGT00990000204590 ENSGT00510000052164 ENSGT00530000064569.b ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057.f ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889 ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00830000128368.b ENSGT00940000157396 ENSGT01030000234543.E ENSGT00990000204590 ENSGT00510000052164.a ENSGT00530000064569.b ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057.f ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00390000002164.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00530000064569.a.o ENSGT00530000064569.b ENSGT00510000046988 ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a 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ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Denticle herring MODERN SPECIES 18 ENSDCDG00000028236 memo1 (ENSDCDG00000028225) ENSDCDG00000028219 VIT (ENSDCDG00000028212) ENSDCDG00000028210 ENSDCDG00000028209 ddx21 (ENSDCDG00000027479) irf1a (ENSDCDG00000027456) mpc1 (ENSDCDG00000027452) RPS6KA2 (ENSDCDG00000016429) rnaset2 (ENSDCDG00000016228) MYOM2 (ENSDCDG00000014845) CSMD1 (ENSDCDG00000012892) angpt2a (ENSDCDG00000012740) mcph1 (ENSDCDG00000012737) agpat5 (ENSDCDG00000012734) ##22 tmem14a (ENSDCDG00000012729) CILK1 (ENSDCDG00000012712) fbxo9 (ENSDCDG00000011831) elovl5 (ENSDCDG00000011799) gclc (ENSDCDG00000011735) ENSDCDG00000011723 lrrc1 (ENSDCDG00000011713) ENSDCDG00000011701 FAM83B (ENSDCDG00000011690) hcrtr2 (ENSDCDG00000011683) hmgcll1 (ENSDCDG00000009583) bmp5 (ENSDCDG00000009487) ENSDCDG00000009466 ENSDCDG00000009450 pcgf6 (ENSDCDG00000007916) Atlantic herring MODERN SPECIES 4 VIT (ENSCHAG00000001728) ENSCHAG00000001984 ENSCHAG00000002002 ENSCHAG00000002033 irf1a (ENSCHAG00000002319) ENSCHAG00000002378 GCNT3 (ENSCHAG00000002782) mpc1 (ENSCHAG00000002826) RPS6KA2 (ENSCHAG00000003421) rnaset2 (ENSCHAG00000013034) MYOM2 (ENSCHAG00000013062) ENSCHAG00000013787 CSMD1 (ENSCHAG00000013841) mcph1 (ENSCHAG00000016202) angpt2a (ENSCHAG00000016210) agpat5 (ENSCHAG00000016289) ##22 tmem14a (ENSCHAG00000016392) ENSCHAG00000016409 ENSCHAG00000016432 fbxo9 (ENSCHAG00000016462) elovl5 (ENSCHAG00000016788) gclc (ENSCHAG00000016809) klhl31 (ENSCHAG00000016928) lrrc1 (ENSCHAG00000016983) ENSCHAG00000017155 FAM83B (ENSCHAG00000017163) hcrtr2 (ENSCHAG00000017187) ENSCHAG00000017196 HMGCL (ENSCHAG00000017227) bmp5 (ENSCHAG00000017736) COL21A1 (ENSCHAG00000017810) Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000177213 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000181303 ENSGT00390000002164.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057.f ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000156965 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000166657 ENSGT00940000157885 ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b.f ENSGT00940000156530.c.`b.b.e.b ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000177213 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000181303 ENSGT00390000002164.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057.f ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000156965 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000166657 ENSGT00940000157885 ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b.f ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00550000075035 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000177213 ENSGT00390000009877 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000181303 ENSGT00390000002164.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057.f ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000156965 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000166657 ENSGT00940000157885 ENSGT00390000004284.e ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00940000156530.c.`b.b.f ENSGT00390000018052 ENSGT00550000075035 ENSGT00530000063484.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 93 ENSGT00940000157528 ENSGT00940000157851 ENSGT00390000008798.d.b ENSGT00940000177213 ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000181303 ENSGT00390000002164.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057.f ENSGT00940000155701.D ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000157048 ENSGT00940000155636.b.b ENSGT00950000182767.b.a.b.b.a ENSGT00940000156965 ENSGT00390000016976 ENSGT00940000166657 ENSGT00940000157885 ENSGT00390000004284.e ENSGT00940000156530.c.`b.b.f ENSGT00390000018052 ENSGT00950000183091.A.b ENSGT00550000075035 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 31 mrps6 (ENSPNAG00000027225) nolc1 (ENSPNAG00000004192) micu1 (ENSPNAG00000027109) mcu (ENSPNAG00000027082) OIT3 (ENSPNAG00000027020) pla2g12b (ENSPNAG00000006146) pde10a (ENSPNAG00000026924) sft2d1 (ENSPNAG00000026707) RPS6KA2 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pcsk2 (ENSEEEG00000009002) prokr1b (ENSEEEG00000008998) plek (ENSEEEG00000008997) cnrip1b (ENSEEEG00000008996) pno1 (ENSEEEG00000008995) dnaaf10 (ENSEEEG00000008989) psmb1 (ENSEEEG00000008988) perp (ENSEEEG00000008987) TNFAIP3 (ENSEEEG00000008986) olig3 (ENSEEEG00000008985) Channel catfish MODERN SPECIES 22 micu1 (ENSIPUG00000017739) mcu (ENSIPUG00000017715) Oit3 (ENSIPUG00000017687) pla2g12b (ENSIPUG00000017669) c3h6orf118 (ENSIPUG00000017651) pde10a (ENSIPUG00000017463) t (ENSIPUG00000017439) PRR18 (ENSIPUG00000017436) sft2d1 (ENSIPUG00000017398) rps6ka2 (ENSIPUG00000017338) rnaset2 (ENSIPUG00000017307) myom2 (ENSIPUG00000017263) CSMD1 (ENSIPUG00000017149) ANGPT2 (ENSIPUG00000017065) mcph1 (ENSIPUG00000017026) agpat5 (ENSIPUG00000016988) ##22 tmem14a (ENSIPUG00000016975) gsta.1 (ENSIPUG00000016941) polh (ENSIPUG00000016919) GTPBP2 (ENSIPUG00000016892) OTOR (ENSIPUG00000016881) pcsk2 (ENSIPUG00000016823) bfsp1 (ENSIPUG00000016800) prokr1b (ENSIPUG00000016791) PLEK (ENSIPUG00000016759) cnrip1b (ENSIPUG00000016747) Ppp3r1 (ENSIPUG00000016713) pno1 (ENSIPUG00000016673) dnaaf10 (ENSIPUG00000016659) psmb1 (ENSIPUG00000016641) perp (ENSIPUG00000016580) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157851 ENSGT00390000008798.d.b ENSGT00940000156543 ENSGT00940000157912 ENSGT00940000181303 ENSGT00390000002164.a ENSGT00390000018525.a.a ENSGT00940000159956 ENSGT00640000091563.a ENSGT00940000157057.f ENSGT00940000155701.D ENSGT00940000166312.b.a ENSGT00940000164318 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000153408.A ENSGT00390000004068 ENSGT00940000158288 ENSGT00940000161285.a ENSGT00940000168267 ENSGT00530000064150 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.a.k ##22 Goldfish MODERN SPECIES 635 ENSCARG00000069069 csmd1a (ENSCARG00000069060) ENSCARG00000069055 agpat5 (ENSCARG00000069050) ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.a.k ##22 Golden-line barbel MODERN SPECIES 967 ENSSGRG00000034784 csmd1a (ENSSGRG00000034785) agpat5 (ENSSGRG00000034787) ##22 Common carp reference MODERN SPECIES 18 mcu (ENSCCRG00000068125) OIT3 (ENSCCRG00000031678) pla2g12b (ENSCCRG00000031674) ENSCCRG00000080237 pde10a (ENSCCRG00000072605) TBXT (ENSCCRG00000047094) PRR18 (ENSCCRG00000028149) sft2d1 (ENSCCRG00000060269) RPS6KA2 (ENSCCRG00000032318) RNASET2 (ENSCCRG00000072261) ENSCCRG00000026964 ENSCCRG00000062453 ENSCCRG00000000834 ENSCCRG00000078363 ENSCCRG00000061606 ENSCCRG00000080704 ##22 ENSCCRG00000057988 ENSCCRG00000061390 ENSCCRG00000062015 ENSCCRG00000077011 ENSCCRG00000056096 fbxo9 (ENSCCRG00000020573) elovl5 (ENSCCRG00000071270) gclc (ENSCCRG00000054722) klhl31 (ENSCCRG00000020075) lrrc1 (ENSCCRG00000012821) ENSCCRG00000024844 ENSCCRG00000079801 hcrtr2 (ENSCCRG00000069172) ENSCCRG00000024418 ENSCCRG00000082835 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00390000014606.b ENSGT00940000168294 ENSGT00950000183079.B.k.a ENSGT00940000157528.l ENSGT00940000157851.f ENSGT00390000008798.d.b.g ENSGT00940000156543.b ENSGT00940000157912.d ENSGT00390000018525.a.a.n ENSGT00940000159956.b.b ENSGT00640000091563.a.o ENSGT00940000157057.f.b ENSGT00940000155701.D.n.b ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a.l ##22 ENSGT00940000153408.A.q ENSGT00390000004068.b ENSGT00940000158288 ENSGT00940000161285.a ENSGT00940000168267 ENSGT00530000064150.d ENSGT00390000014256.j ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908.u ENSGT00390000011908.v ENSGT00940000158352.d ENSGT00390000002428.b.b ENSGT00940000154025.b.g ENSGT00940000157889.g.a.b ENSGT01070000253744.a.a.b.b.n Goldfish MODERN SPECIES 533 ENSCARG00000058643 CSMD1 (ENSCARG00000058817) ENSCARG00000060281 ENSCARG00000060286 mcph1 (ENSCARG00000060298) angpt2a (ENSCARG00000060340) agpat5 (ENSCARG00000060436) ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 767 ENSGT00940000155701.D.n.b ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a.l ##22 Common carp reference MODERN SPECIES 48 micu1 (ENSCCRG00000054638) mcu (ENSCCRG00000018214) OIT3 (ENSCCRG00000018222) pla2g12b (ENSCCRG00000072202) pde10a (ENSCCRG00000068909) ENSCCRG00000075553 sft2d1 (ENSCCRG00000035689) RPS6KA2 (ENSCCRG00000081628) rnaset2 (ENSCCRG00000080169) MYOM2 (ENSCCRG00000026449) CSMD1 (ENSCCRG00000077742) ENSCCRG00000054497 angpt2a (ENSCCRG00000032371) mcph1 (ENSCCRG00000065763) ENSCCRG00000076828 agpat5 (ENSCCRG00000038564) ##22 ENSCCRG00000042625 ENSCCRG00000060254 wdr11 (ENSCCRG00000074884) ENSCCRG00000058962 ENSCCRG00000057088 ENSCCRG00000062990 lhb (ENSCCRG00000050461) ENSCCRG00000050361 fbxo9 (ENSCCRG00000050256) klhl31 (ENSCCRG00000065353) ENSCCRG00000056388 lrrc1 (ENSCCRG00000020071) ENSCCRG00000051466 FAM83B (ENSCCRG00000051468) ENSCCRG00000053990 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1289 ENSSGRG00000053082 angpt2a (ENSSGRG00000053084) agpat5 (ENSSGRG00000053087) ##22 Zebrafish MODERN SPECIES 4 ENSDARG00000093267 ENSDARG00000102319 ENSDARG00000058160 exoc3l4 (ENSDARG00000058180) ENSDARG00000061714 ENSDARG00000108535 AIFM2 (ENSDARG00000077549) ninl (ENSDARG00000098414) gins1 (ENSDARG00000007624) RPS6KA2 (ENSDARG00000028469) rnaset2 (ENSDARG00000036282) ENSDARG00000110698 csmd1a (ENSDARG00000044414) angpt2a (ENSDARG00000014946) mcph1 (ENSDARG00000058372) agpat5 (ENSDARG00000063187) ##22 tuba4l (ENSDARG00000074289) apmap (ENSDARG00000017422) si:zfos-1056e6.1 (ENSDARG00000101651) ppm1g (ENSDARG00000075559) fam120b (ENSDARG00000030804) dld (ENSDARG00000020219) ENSDARG00000101795 phf10 (ENSDARG00000070084) actr2b (ENSDARG00000070076) spred2b (ENSDARG00000008372) ENSDARG00000093874 meis1b (ENSDARG00000012078) ENSDARG00000078166 SLC29A3 (ENSDARG00000077828) abcg2c (ENSDARG00000058574) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183064.a.b.b ENSGT00940000178989 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ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 233 ENSGT00950000183064.a.b.b.ib.a ENSGT00940000178989.d ENSGT00390000013819.k ENSGT00940000156288.b.d ENSGT00940000155043.c ENSGT00990000204590 ENSGT00510000052164.a.b ENSGT00530000064569.b.d ENSGT00510000046988.ib ENSGT00940000159956.d ENSGT00640000091563.a.r ENSGT00940000157057.f.d ENSGT00940000155701.D.d ENSGT00390000018842.r ENSGT00940000158430.d ENSGT00950000182836.b.a.a.m ##22 ENSGT00940000158206.b ENSGT00940000161750.dd ENSGT00940000158807.i ENSGT00390000014256.f ENSGT01050000244838.C.b.p ENSGT00390000011908.r ENSGT00940000158352.h ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b.d ENSGT00940000174758 ENSGT00940000157889.g.a.c ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a.d ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00950000183064.a.b.b.ib.a ENSGT00940000178989.d ENSGT00390000013819.k ENSGT00940000156288.b.d ENSGT00940000155043.c ENSGT00990000204590 ENSGT00510000052164.a.b ENSGT00530000064569.b.d ENSGT00510000046988.ib ENSGT00940000159956.d ENSGT00640000091563.a.r ENSGT00940000157057.f.d ENSGT00940000155701.D.d ENSGT00390000018842.r ENSGT00940000158430.d ENSGT00950000182836.b.a.a.m ##22 ENSGT00940000158206.b ENSGT00940000161750.dd ENSGT00940000158807.i ENSGT00390000014256.f ENSGT01050000244838.C.b.p ENSGT00390000011908.r ENSGT00940000158352.h ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b.d ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a.d ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467.f ENSGT00940000158644.c Salmo ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00950000183064.a.b.b.ib.a ENSGT00940000178989.d ENSGT00390000013819.k ENSGT00940000156288.b.d ENSGT00940000155043.c ENSGT00990000204590 ENSGT00510000052164.a.b ENSGT00530000064569.b.d ENSGT00510000046988.ib ENSGT00940000159956.d ENSGT00640000091563.a.r ENSGT00940000157057.f.d ENSGT00940000155701.D.d ENSGT00390000018842.r ENSGT00940000158430.d ENSGT00950000182836.b.a.a.m ##22 ENSGT00940000158206.b ENSGT00940000161750.dd ENSGT00940000158807.i ENSGT00390000014256.f ENSGT01050000244838.C.b.p ENSGT00390000011908.r ENSGT00940000158352.h ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b.d ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a.d ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467.f ENSGT00940000158644.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 20 ENSSSAG00000057209 kifbp (ENSSSAG00000098195) irf1a (ENSSSAG00000113088) DDX21 (ENSSSAG00000056480) ENSSSAG00000056466 ENSSSAG00000056459 ENSSSAG00000056440 MPC1 (ENSSSAG00000056414) ENSSSAG00000015372 rnaset2 (ENSSSAG00000011705) MYOM2 (ENSSSAG00000010629) ENSSSAG00000083216 CSMD1 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ENSGT00940000159467 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 Clown anemonefish MODERN SPECIES 2049 erlin1 (ENSAOCG00000003477) CHUK (ENSAOCG00000000089) ENSAOCG00000003423 vcla (ENSAOCG00000003392) ap3m1 (ENSAOCG00000003310) adka (ENSAOCG00000003296) ENSAOCG00000003269 dusp13a (ENSAOCG00000003233) ENSAOCG00000003227 si:ch211-223p8.8 (ENSAOCG00000003223) samd8 (ENSAOCG00000003217) ENSAOCG00000003210 npy4r (ENSAOCG00000003206) mcph1 (ENSAOCG00000003201) angpt2a (ENSAOCG00000003191) agpat5 (ENSAOCG00000003179) ##22 tmem14a (ENSAOCG00000003166) ENSAOCG00000003160 Spiny chromis MODERN SPECIES 635 CHUK (ENSAPOG00000003676) plaua (ENSAPOG00000003655) vcla (ENSAPOG00000003639) ap3m1 (ENSAPOG00000000940) adka (ENSAPOG00000003485) ENSAPOG00000003447 ENSAPOG00000003431 dusp13a (ENSAPOG00000003426) ENSAPOG00000003415 si:ch211-223p8.8 (ENSAPOG00000003401) samd8 (ENSAPOG00000003390) ENSAPOG00000003370 npy4r (ENSAPOG00000003352) mcph1 (ENSAPOG00000000068) angpt2a (ENSAPOG00000003322) agpat5 (ENSAPOG00000003287) ##22 tmem14a (ENSAPOG00000003265) ENSAPOG00000003246 ENSAPOG00000003207 ENSAPOG00000000877 fbxo9 (ENSAPOG00000003120) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1453 erlin1 (ENSSPAG00000007045) CHUK (ENSSPAG00000007002) plaua (ENSSPAG00000006973) vcla (ENSSPAG00000006836) ap3m1 (ENSSPAG00000006770) adka (ENSSPAG00000006739) ENSSPAG00000006726 dusp13a (ENSSPAG00000006718) ENSSPAG00000006707 si:ch211-223p8.8 (ENSSPAG00000006698) samd8 (ENSSPAG00000006653) ENSSPAG00000006630 npy4r (ENSSPAG00000006620) angpt2a (ENSSPAG00000006596) mcph1 (ENSSPAG00000006557) agpat5 (ENSSPAG00000006524) ##22 tmem14a (ENSSPAG00000006497) ENSSPAG00000006481 CILK1 (ENSSPAG00000006434) fbxo9 (ENSSPAG00000006387) elovl5 (ENSSPAG00000006359) gclc (ENSSPAG00000006317) klhl31 (ENSSPAG00000006305) lrrc1 (ENSSPAG00000006282) ENSSPAG00000006262 FAM83B (ENSSPAG00000006245) hcrtr2 (ENSSPAG00000006234) ENSSPAG00000006219 hmgcll1 (ENSSPAG00000006201) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C 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ENSGT00940000161750.ad ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750.bd ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750.ad ENSGT00940000161750.bd ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750.ad ENSGT00940000161750.bd ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1041 erlin1 (ENSHBUG00000022470) CHUK (ENSHBUG00000022539) plaua (ENSHBUG00000000692) vcla (ENSHBUG00000022712) ap3m1 (ENSHBUG00000022764) adka (ENSHBUG00000022875) ENSHBUG00000022895 dusp13a (ENSHBUG00000022911) ENSHBUG00000022918 si:ch211-223p8.8 (ENSHBUG00000022928) samd8 (ENSHBUG00000022948) ENSHBUG00000022974 npy4r (ENSHBUG00000022980) angpt2a (ENSHBUG00000023026) mcph1 (ENSHBUG00000023055) agpat5 (ENSHBUG00000023071) ##22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750.ad ENSGT00940000161750.bd ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 P. nyererei MODERN SPECIES 368 erlin1 (ENSPNYG00000021425) CHUK (ENSPNYG00000021407) plaua (ENSPNYG00000021384) vcla (ENSPNYG00000021319) ap3m1 (ENSPNYG00000021283) adka (ENSPNYG00000021240) ENSPNYG00000021218 dusp13a (ENSPNYG00000021210) ENSPNYG00000021198 si:ch211-223p8.8 (ENSPNYG00000021057) samd8 (ENSPNYG00000021016) ENSPNYG00000021003 npy4r (ENSPNYG00000020969) angpt2a (ENSPNYG00000020956) mcph1 (ENSPNYG00000020931) agpat5 (ENSPNYG00000020921) ##22 ENSPNYG00000020910 tmem14a (ENSPNYG00000020902) ENSPNYG00000020875 CILK1 (ENSPNYG00000020866) fbxo9 (ENSPNYG00000020840) elovl5 (ENSPNYG00000020821) gclc (ENSPNYG00000020777) klhl31 (ENSPNYG00000020773) ENSPNYG00000020760 lrrc1 (ENSPNYG00000020718) ENSPNYG00000020678 FAM83B (ENSPNYG00000020645) hcrtr2 (ENSPNYG00000020624) ENSPNYG00000020602 hmgcll1 (ENSPNYG00000020585) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750.ad ENSGT00940000161750.bd ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 Eastern happy MODERN SPECIES 4 spef1 (ENSACLG00000006345) erlin1 (ENSACLG00000006324) CHUK (ENSACLG00000006237) plaua (ENSACLG00000006220) adka (ENSACLG00000006215) ENSACLG00000006210 vcla (ENSACLG00000006176) dusp13a (ENSACLG00000006162) ENSACLG00000006154 si:ch211-223p8.8 (ENSACLG00000006147) samd8 (ENSACLG00000006133) ENSACLG00000006116 npy4r 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ENSNBRG00000012313 FAM83B (ENSNBRG00000012329) hcrtr2 (ENSNBRG00000012348) ENSNBRG00000012368 hmgcll1 (ENSNBRG00000012384) bmp5 (ENSNBRG00000012531) Nile tilapia MODERN SPECIES 4 spef1 (ENSONIG00000034185) erlin1 (ENSONIG00000009623) CHUK (ENSONIG00000009627) plaua (ENSONIG00000009640) vcla (ENSONIG00000009645) ap3m1 (ENSONIG00000009649) adka (ENSONIG00000009651) ENSONIG00000009656 dusp13a (ENSONIG00000032850) si:ch211-223p8.8 (ENSONIG00000009661) fbxo9 (ENSONIG00000009692) ENSONIG00000031247 ENSONIG00000030006 mcph1 (ENSONIG00000037268) angpt2 (ENSONIG00000009668) agpat5 (ENSONIG00000009672) ##22 tmem14a (ENSONIG00000009675) gsta (ENSONIG00000030580) ENSONIG00000009676 ENSONIG00000029640 CILK1 (ENSONIG00000009686) elovl5 (ENSONIG00000009696) ENSONIG00000039712 gclc (ENSONIG00000009700) klhl31 (ENSONIG00000009705) ENSONIG00000009707 lrrc1 (ENSONIG00000009708) ENSONIG00000040749 ENSONIG00000042530 ENSONIG00000035692 hcrtr2 (ENSONIG00000009721) Midas cichlid MODERN SPECIES 1196 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ENSGT00940000164226.b ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000160190.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000164226.b ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 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ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000160190.b ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Fugu MODERN SPECIES 16 adam8a (ENSTRUG00000013948) erlin1 (ENSTRUG00000014128) ENSTRUG00000014210 ENSTRUG00000014454 vcla (ENSTRUG00000014534) ap3m1 (ENSTRUG00000019674) adka (ENSTRUG00000014646) DUSP29 (ENSTRUG00000014727) ENSTRUG00000014736 ENSTRUG00000014747 si:ch211-223p8.8 (ENSTRUG00000014750) samd8 (ENSTRUG00000014755) npy4r (ENSTRUG00000014788) mcph1 (ENSTRUG00000014818) angpt2a (ENSTRUG00000014844) agpat5 (ENSTRUG00000014885) ##22 tmem14a (ENSTRUG00000033487) ENSTRUG00000020882 CILK1 (ENSTRUG00000014950) fbxo9 (ENSTRUG00000015024) elovl5 (ENSTRUG00000015079) gclc (ENSTRUG00000015144) klhl31 (ENSTRUG00000015226) ENSTRUG00000015236 lrrc1 (ENSTRUG00000015250) ENSTRUG00000025043 FAM83B (ENSTRUG00000025049) hcrtr2 (ENSTRUG00000015329) ENSTRUG00000031437 hmgcll1 (ENSTRUG00000015377) bmp5 (ENSTRUG00000015401) Tetraodon MODERN SPECIES 9 ERLIN1 (ENSTNIG00000016541) ENSTNIG00000016542 plaua (ENSTNIG00000016543) vcla (ENSTNIG00000016544) ap3m1 (ENSTNIG00000016545) adka (ENSTNIG00000016546) ENSTNIG00000016547 ENSTNIG00000016548 dusp13a (ENSTNIG00000016549) ENSTNIG00000016550 si:ch211-223p8.8 (ENSTNIG00000016551) samd8 (ENSTNIG00000016552) npy4r (ENSTNIG00000016553) angpt2a (ENSTNIG00000016555) mcph1 (ENSTNIG00000016554) agpat5 (ENSTNIG00000016556) ##22 tmem14a (ENSTNIG00000000827) ENSTNIG00000016557 CILK1 (ENSTNIG00000016558) fbxo9 (ENSTNIG00000016559) elovl5 (ENSTNIG00000016560) gclc (ENSTNIG00000016561) klhl31 (ENSTNIG00000016562) ENSTNIG00000016563 lrrc1 (ENSTNIG00000016564) ENSTNIG00000016565 ENSTNIG00000016566 hcrtr2 (ENSTNIG00000016567) ENSTNIG00000000508 hmgcll1 (ENSTNIG00000016568) bmp5 (ENSTNIG00000016569) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Ballan wrasse MODERN SPECIES 590 mcph1 (ENSLBEG00000001644) angpt2a (ENSLBEG00000001666) agpat5 (ENSLBEG00000001734) ##22 ENSLBEG00000001799 tmem14a (ENSLBEG00000001812) CILK1 (ENSLBEG00000001896) fbxo9 (ENSLBEG00000001915) elovl5 (ENSLBEG00000001946) ENSLBEG00000001974 gclc (ENSLBEG00000001997) klhl31 (ENSLBEG00000002054) ENSLBEG00000002074 lrrc1 (ENSLBEG00000002099) ENSLBEG00000002177 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000160190.b ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Large yellow croaker MODERN SPECIES 2 erlin1 (ENSLCRG00005018503) CHUK (ENSLCRG00005016682) plaua (ENSLCRG00005016654) vcla (ENSLCRG00005016641) ap3m1 (ENSLCRG00005016637) adka (ENSLCRG00005015174) DUSP29 (ENSLCRG00005015159) ENSLCRG00005015157 ENSLCRG00005015155 si:ch211-223p8.8 (ENSLCRG00005015154) samd8 (ENSLCRG00005015153) ENSLCRG00005015152 ENSLCRG00005015151 angpt2a (ENSLCRG00005015118) mcph1 (ENSLCRG00005015115) agpat5 (ENSLCRG00005015113) ##22 tmem14a (ENSLCRG00005015112) ENSLCRG00005015110 CILK1 (ENSLCRG00005015108) fbxo9 (ENSLCRG00005014971) elovl5 (ENSLCRG00005014967) gclc (ENSLCRG00005013959) klhl31 (ENSLCRG00005013955) ENSLCRG00005013952 lrrc1 (ENSLCRG00005013462) ENSLCRG00005013444 ENSLCRG00005013439 hcrtr2 (ENSLCRG00005013438) ENSLCRG00005013436 hmgcll1 (ENSLCRG00005013173) bmp5 (ENSLCRG00005013170) European seabass MODERN SPECIES 1 spef1 (ENSDLAG00005001119) erlin1 (ENSDLAG00005001040) ENSDLAG00005000915 plaua (ENSDLAG00005000905) vcla (ENSDLAG00005000860) ap3m1 (ENSDLAG00005000833) adka (ENSDLAG00005000426) ENSDLAG00005033198 dusp13a (ENSDLAG00005000321) si:ch211-223p8.8 (ENSDLAG00005000318) samd8 (ENSDLAG00005000315) ENSDLAG00005000312 npy4r (ENSDLAG00005029763) angpt2a (ENSDLAG00005000307) ENSDLAG00005000299 agpat5 (ENSDLAG00005000291) ##22 TMEM14A (ENSDLAG00005000286) ENSDLAG00005000282 CILK1 (ENSDLAG00005000269) fbxo9 (ENSDLAG00005000144) elovl5 (ENSDLAG00005000080) gclc (ENSDLAG00005023649) klhl31 (ENSDLAG00005031785) ENSDLAG00005023642 lrrc1 (ENSDLAG00005023595) ENSDLAG00005023586 ENSDLAG00005033749 FAM83B (ENSDLAG00005023571) hcrtr2 (ENSDLAG00005023564) GFRAL (ENSDLAG00005023559) hmgcll1 (ENSDLAG00005023421) Gilthead seabream MODERN SPECIES 6 erlin1 (ENSSAUG00010025349) CHUK (ENSSAUG00010025378) plaua (ENSSAUG00010025656) vcla (ENSSAUG00010025667) ap3m1 (ENSSAUG00010025904) adka (ENSSAUG00010025912) ENSSAUG00010025940 dusp13a (ENSSAUG00010025942) ENSSAUG00010025945 si:ch211-223p8.8 (ENSSAUG00010025947) samd8 (ENSSAUG00010025949) ENSSAUG00010025951 npy4r (ENSSAUG00010025954) mcph1 (ENSSAUG00010025958) angpt2a (ENSSAUG00010025960) agpat5 (ENSSAUG00010025962) ##22 tmem14a (ENSSAUG00010025963) GST3 (ENSSAUG00010025964) ENSSAUG00010025967 CILK1 (ENSSAUG00010025969) fbxo9 (ENSSAUG00010025973) elovl5 (ENSSAUG00010025976) gclc (ENSSAUG00010025986) klhl31 (ENSSAUG00010025998) ENSSAUG00010026000 lrrc1 (ENSSAUG00010026003) ENSSAUG00010026007 ENSSAUG00010026010 FAM83B (ENSSAUG00010026012) hcrtr2 (ENSSAUG00010013201) hmgcll1 (ENSSAUG00010013204) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000160190.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000164226.b ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00940000174758 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000160190.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000164226.b ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00940000174758 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Lumpfish MODERN SPECIES 6 adam8a (ENSCLMG00005020550) spef1 (ENSCLMG00005020540) erlin1 (ENSCLMG00005020534) CHUK (ENSCLMG00005019460) plaua (ENSCLMG00005019441) vcla (ENSCLMG00005019438) ap3m1 (ENSCLMG00005019429) adka (ENSCLMG00005019422) DUSP29 (ENSCLMG00005019352) ENSCLMG00005019349 ENSCLMG00005019348 ENSCLMG00005019347 ENSCLMG00005019345 ENSCLMG00005019344 angpt2a (ENSCLMG00005019293) agpat5 (ENSCLMG00005019291) ##22 tmem14a (ENSCLMG00005019290) ENSCLMG00005019289 ENSCLMG00005019287 CILK1 (ENSCLMG00005019285) fbxo9 (ENSCLMG00005018587) elovl5 (ENSCLMG00005018575) gclc (ENSCLMG00005018553) klhl31 (ENSCLMG00005018551) lrrc1 (ENSCLMG00005018542) ENSCLMG00005018541 ENSCLMG00005018540 hcrtr2 (ENSCLMG00005018539) hmgcll1 (ENSCLMG00005018538) bmp5 (ENSCLMG00005018537) COL21A1 (ENSCLMG00005018536) Stickleback MODERN SPECIES 6 msx3 (ENSGACG00000006773) ENSGACG00000006768 adam8a (ENSGACG00000006750) spef1 (ENSGACG00000006746) erlin1 (ENSGACG00000006721) CHUK (ENSGACG00000006698) plaua (ENSGACG00000006694) vcla (ENSGACG00000006671) ap3m1 (ENSGACG00000006647) adka (ENSGACG00000006579) ENSGACG00000006568 ENSGACG00000006565 samd8 (ENSGACG00000006560) angpt2a (ENSGACG00000006549) mcph1 (ENSGACG00000006537) agpat5 (ENSGACG00000006526) ##22 tmem14a (ENSGACG00000006522) ENSGACG00000006489 CILK1 (ENSGACG00000006468) fbxo9 (ENSGACG00000006449) elovl5 (ENSGACG00000006416) gclc (ENSGACG00000006384) klhl31 (ENSGACG00000006367) ENSGACG00000006356 lrrc1 (ENSGACG00000006327) hcrtr2 (ENSGACG00000006310) ENSGACG00000006299 hmgcll1 (ENSGACG00000006272) bmp5 (ENSGACG00000006266) COL21A1 (ENSGACG00000006250) DST (ENSGACG00000006193) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00940000174758 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Channel bull blenny MODERN SPECIES 6 spef1 (ENSCGOG00000023653) erlin1 (ENSCGOG00000023211) CHUK (ENSCGOG00000022913) plaua (ENSCGOG00000022881) vcla (ENSCGOG00000022455) ap3m1 (ENSCGOG00000022375) adka (ENSCGOG00000022214) ENSCGOG00000022369 dusp13a (ENSCGOG00000022203) ENSCGOG00000022202 samd8 (ENSCGOG00000022199) ENSCGOG00000022198 npy4r (ENSCGOG00000022196) angpt2a (ENSCGOG00000022145) mcph1 (ENSCGOG00000022140) agpat5 (ENSCGOG00000022122) ##22 tmem14a (ENSCGOG00000022112) ENSCGOG00000022114 CILK1 (ENSCGOG00000022110) fbxo9 (ENSCGOG00000022042) elovl5 (ENSCGOG00000021993) gclc (ENSCGOG00000021274) klhl31 (ENSCGOG00000021253) ENSCGOG00000021251 lrrc1 (ENSCGOG00000021147) ENSCGOG00000021136 hcrtr2 (ENSCGOG00000021131) hmgcll1 (ENSCGOG00000020977) bmp5 (ENSCGOG00000020971) ENSCGOG00000020969 DST (ENSCGOG00000019368) Pike perch MODERN SPECIES 10 erlin1 (ENSSLUG00000020948) ENSSLUG00000020213 plaua (ENSSLUG00000020176) vcla (ENSSLUG00000020152) ap3m1 (ENSSLUG00000020141) adka (ENSSLUG00000020056) ENSSLUG00000020039 dusp13a (ENSSLUG00000020010) si:ch211-223p8.8 (ENSSLUG00000019997) samd8 (ENSSLUG00000019988) ENSSLUG00000019980 ENSSLUG00000019975 ENSSLUG00000019972 angpt2a (ENSSLUG00000019966) mcph1 (ENSSLUG00000019960) agpat5 (ENSSLUG00000019955) ##22 tmem14a (ENSSLUG00000019951) ENSSLUG00000019945 CILK1 (ENSSLUG00000019940) fbxo9 (ENSSLUG00000019886) elovl5 (ENSSLUG00000019877) gclc (ENSSLUG00000019836) klhl31 (ENSSLUG00000019828) ENSSLUG00000019822 lrrc1 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ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Seriola ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000014666.b ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00940000164426.d ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000175945 ENSGT00940000161766 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00950000182836.b.a.a ##22 ENSGT00940000158206 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158807 ENSGT00390000014256 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000011908 ENSGT00940000158352 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000015862 ENSGT00940000157889.g.a ENSGT01070000253744.a.a.b.b ENSGT00730000111274 ENSGT00940000159467 ENSGT00940000158644 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2790 ENSSLDG00000001927 dusp13a (ENSSLDG00000001895) ENSSLDG00000001779 ENSSLDG00000001761 si:ch211-223p8.8 (ENSSLDG00000001672) samd8 (ENSSLDG00000001625) ENSSLDG00000001603 ENSSLDG00000001594 angpt2a (ENSSLDG00000001541) mcph1 (ENSSLDG00000001522) agpat5 (ENSSLDG00000001467) ##22 ENSSLDG00000001369 tmem14a (ENSSLDG00000001415) CILK1 (ENSSLDG00000001352) fbxo9 (ENSSLDG00000001273) elovl5 (ENSSLDG00000001241) gclc (ENSSLDG00000001177) klhl31 (ENSSLDG00000001147) ENSSLDG00000001102 lrrc1 (ENSSLDG00000001031) ENSSLDG00000001014 FAM83B (ENSSLDG00000000986) hcrtr2 (ENSSLDG00000000943) ENSSLDG00000000927 hmgcll1 (ENSSLDG00000000861) bmp5 (ENSSLDG00000000843) Greater amberjack MODERN SPECIES 9 CHUK (ENSSDUG00000023116) plaua (ENSSDUG00000023127) vcla (ENSSDUG00000023133) ap3m1 (ENSSDUG00000023156) adka (ENSSDUG00000023164) ENSSDUG00000023174 ENSSDUG00000023177 dusp13a (ENSSDUG00000023190) ENSSDUG00000023196 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Turbot MODERN SPECIES 6 erlin1 (ENSSMAG00000004924) ENSSMAG00000004961 plaua (ENSSMAG00000005046) vcla (ENSSMAG00000005062) ap3m1 (ENSSMAG00000005201) adka (ENSSMAG00000005234) ENSSMAG00000005313 dusp13a (ENSSMAG00000005275) ENSSMAG00000005324 si:ch211-223p8.8 (ENSSMAG00000005333) ENSSMAG00000005340 ENSSMAG00000030036 ENSSMAG00000005347 MCPH1 (ENSSMAG00000005371) angpt2a (ENSSMAG00000005390) AGPAT5 (ENSSMAG00000005420) ##22 TMEM14A (ENSSMAG00000030592) ENSSMAG00000005453 CILK1 (ENSSMAG00000005490) fbxo9 (ENSSMAG00000005528) LRRC1 (ENSSMAG00000005697) ELO (ENSSMAG00000005574) gclc (ENSSMAG00000005620) klhl31 (ENSSMAG00000005670) ENSSMAG00000005685 ENSSMAG00000030442 FAM83B (ENSSMAG00000005786) hcrtr2 (ENSSMAG00000005815) ENSSMAG00000005837 hmgcll1 (ENSSMAG00000005868) bmp5 (ENSSMAG00000005900) Tongue sole MODERN SPECIES 3 spef1 (ENSCSEG00000008866) erlin1 (ENSCSEG00000008896) CHUK (ENSCSEG00000009009) plaua (ENSCSEG00000009061) vcla (ENSCSEG00000009077) ap3m1 (ENSCSEG00000009106) adka 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ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00390000004585 ENSGT00940000159665 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000157671 ENSGT00940000161139 ENSGT00390000011405 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000170599 ENSGT00390000016465 ENSGT00390000006681 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000159665 ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT00940000160610 ENSGT01090000260082.d.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT00940000163755 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000167629 ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00950000182848.c.b.b.b ENSGT00900000143764 ENSGT00950000182848.d ENSGT01030000234626.A.b ENSGT00940000154677 ENSGT00530000063834.e.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 60 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ENSGT00940000156484.b.f ENSGT00960000186817 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00940000162013 ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT00940000160610 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b.f ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 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ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b.f ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000169554 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000169554 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000169554 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157159.f ENSGT00940000155362.db.b ENSGT00940000165207 ENSGT00940000156249 ENSGT00940000157913.b.b ENSGT00940000153592.A.a ENSGT00390000005242 ENSGT00390000004313 ENSGT00940000157359 ENSGT00390000004172.h ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d Fugu MODERN SPECIES 7 rgs6 (ENSTRUG00000017842) ENSTRUG00000027007 ENSTRUG00000024235 ENSTRUG00000017857 ENSTRUG00000032649 PTPRK (ENSTRUG00000017880) grcc10 (ENSTRUG00000017936) saysd1 (ENSTRUG00000017938) bpnt1 (ENSTRUG00000017939) rsph3 (ENSTRUG00000017942) tagapb (ENSTRUG00000031531) opn8c (ENSTRUG00000017948) PPP2R5A (ENSTRUG00000017956) dtl (ENSTRUG00000017966) ints7 (ENSTRUG00000017976) lpgat1 (ENSTRUG00000027415) ##22 nek2 (ENSTRUG00000017989) ENSTRUG00000022475 slc30a1 (ENSTRUG00000029267) rd3 (ENSTRUG00000027917) rhag (ENSTRUG00000018004) ENSTRUG00000033202 ENSTRUG00000018021 ENSTRUG00000018037 nrbp1 (ENSTRUG00000018045) CAPN3 (ENSTRUG00000018064) ENSTRUG00000026845 churc1 (ENSTRUG00000018096) ttbk2b (ENSTRUG00000032745) mideasa (ENSTRUG00000018103) kcns3b (ENSTRUG00000018106) Tetraodon MODERN SPECIES 5 sipa1l1 (ENSTNIG00000016415) rgs6 (ENSTNIG00000016416) LAMA2 (ENSTNIG00000016417) ENSTNIG00000010746 PTPRK (ENSTNIG00000010747) DLGAP2 (ENSTNIG00000010748) ENSTNIG00000010749 grcc10 (ENSTNIG00000010750) bpnt1 (ENSTNIG00000010751) rsph3 (ENSTNIG00000010752) tagapb (ENSTNIG00000010753) opn8c (ENSTNIG00000000925) PPP2R5A (ENSTNIG00000010754) dtl (ENSTNIG00000010755) ints7 (ENSTNIG00000010756) lpgat1 (ENSTNIG00000010757) ##22 nek2 (ENSTNIG00000010758) slc30a1a (ENSTNIG00000010759) rd3 (ENSTNIG00000004184) rhag (ENSTNIG00000004183) ENSTNIG00000004182 ENSTNIG00000004181 nrbp1 (ENSTNIG00000004180) CAPN3 (ENSTNIG00000003670) ENSTNIG00000003669 churc1 (ENSTNIG00000003668) ttbk2b (ENSTNIG00000003667) ENSTNIG00000000380 mideasa (ENSTNIG00000003666) kcns3b (ENSTNIG00000003665) ENSTNIG00000003664 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000169554 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Ballan wrasse MODERN SPECIES 20 ENSLBEG00000010110 taf1a (ENSLBEG00000010067) DUSP10 (ENSLBEG00000010040) hlx1 (ENSLBEG00000010016) slc35f6 (ENSLBEG00000009966) kcnk3a 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ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Perciformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000169554 ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d ENSGT00940000163503.B.c Stickleback MODERN SPECIES 18 ENSGACG00000010071 taf1a (ENSGACG00000010065) DUSP10 (ENSGACG00000010062) hlx1 (ENSGACG00000010057) slc35f6 (ENSGACG00000010044) kcnk3a (ENSGACG00000010038) enpp1 (ENSGACG00000010030) ENSGACG00000010022 ezrb (ENSGACG00000010010) rsph3 (ENSGACG00000010006) tagapb (ENSGACG00000009991) opn8c (ENSGACG00000009990) PPP2R5A (ENSGACG00000009984) dtl (ENSGACG00000009980) ints7 (ENSGACG00000009942) lpgat1 (ENSGACG00000009925) ##22 nek2 (ENSGACG00000009916) slc30a1a 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ENSGT00940000156989 ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00950000183246 ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.d.e ENSGT00940000162013 ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a Gilthead seabream MODERN SPECIES 14 taf1a (ENSSAUG00010006209) ENSSAUG00010006215 DUSP10 (ENSSAUG00010006217) hlx1 (ENSSAUG00010006220) slc35f6 (ENSSAUG00010006225) kcnk3a (ENSSAUG00010006227) enpp1 (ENSSAUG00010006245) ENSSAUG00010008034 ezrb (ENSSAUG00010008053) rsph3 (ENSSAUG00010010774) tagapb (ENSSAUG00010010781) opn8c (ENSSAUG00010010788) PPP2R5A (ENSSAUG00010010804) dtl (ENSSAUG00010010831) ints7 (ENSSAUG00010011471) lpgat1 (ENSSAUG00010011591) ##22 nek2 (ENSSAUG00010011594) slc30a1a (ENSSAUG00010011597) rd3 (ENSSAUG00010011599) rhag (ENSSAUG00010011609) ENSSAUG00010011899 CRISP2 (ENSSAUG00010011901) CRISP3 (ENSSAUG00010011907) CRISP3 (ENSSAUG00010011915) nrbp1 (ENSSAUG00010011945) CAPN3 (ENSSAUG00010012311) ENSSAUG00010012927 churc1 (ENSSAUG00010012932) ttbk2b (ENSSAUG00010012935) mideasa (ENSSAUG00010012940) kcns3b (ENSSAUG00010012951) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00950000183246 ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000162013 ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h European seabass MODERN SPECIES 7 rnf8 (ENSDLAG00005004455) aida (ENSDLAG00005030594) ENSDLAG00005004856 taf1a (ENSDLAG00005004912) DUSP10 (ENSDLAG00005034812) HLX (ENSDLAG00005032543) ENSDLAG00005004979 kcnk3a (ENSDLAG00005004994) enpp1 (ENSDLAG00005005029) ENSDLAG00005005762 tagapb (ENSDLAG00005005816) opn8c (ENSDLAG00005005851) PPP2R5A (ENSDLAG00005005992) DTL (ENSDLAG00005010236) ints7 (ENSDLAG00005010957) lpgat1 (ENSDLAG00005031470) ##22 nek2 (ENSDLAG00005011025) slc30a1a (ENSDLAG00005011054) ENSDLAG00005011065 rd3 (ENSDLAG00005011072) rhag (ENSDLAG00005011083) ENSDLAG00005011360 ENSDLAG00005011367 nrbp1 (ENSDLAG00005011381) ENSDLAG00005011625 ENSDLAG00005012851 churc1 (ENSDLAG00005032581) ttbk2b (ENSDLAG00005012888) mideasa (ENSDLAG00005013043) ENSDLAG00005029362 ENSDLAG00005013056 Large yellow croaker MODERN SPECIES 482 taf1a (ENSLCRG00005014887) DUSP10 (ENSLCRG00005014886) hlx1 (ENSLCRG00005014884) slc35f6 (ENSLCRG00005014882) kcnk3a (ENSLCRG00005014881) enpp1 (ENSLCRG00005014796) ENSLCRG00005014786 ezrb 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ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00940000162013 ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000162013 ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d Zig-zag eel MODERN SPECIES 16 taf1a (ENSMAMG00000004872) ENSMAMG00000004879 HLX (ENSMAMG00000004901) ENSMAMG00000004912 kcnk3a (ENSMAMG00000027319) enpp1 (ENSMAMG00000004963) ENSMAMG00000005065 ENSMAMG00000028323 ezrb (ENSMAMG00000005100) rsph3 (ENSMAMG00000005158) tagapb (ENSMAMG00000005163) opn8c (ENSMAMG00000005172) PPP2R5A (ENSMAMG00000005183) DTL (ENSMAMG00000005233) ints7 (ENSMAMG00000005247) lpgat1 (ENSMAMG00000005304) ##22 nek2 (ENSMAMG00000005319) slc30a1a (ENSMAMG00000005346) rd3 (ENSMAMG00000026093) rhag (ENSMAMG00000005388) ENSMAMG00000005415 ENSMAMG00000005457 nrbp1 (ENSMAMG00000005667) ENSMAMG00000005712 ENSMAMG00000025637 churc1 (ENSMAMG00000028489) ttbk2b (ENSMAMG00000005848) mideasa (ENSMAMG00000005880) ENSMAMG00000005896 ENSMAMG00000005910 ttc32 (ENSMAMG00000006019) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d ENSGT00940000163503.B.c Siamese fighting fish MODERN SPECIES 13 rnf8 (ENSBSLG00000024001) aida (ENSBSLG00000023936) ENSBSLG00000023915 taf1a (ENSBSLG00000023900) DUSP10 (ENSBSLG00000023882) hlx1 (ENSBSLG00000023874) slc35f6 (ENSBSLG00000023855) kcnk3a (ENSBSLG00000023839) ENSBSLG00000023548 ezrb (ENSBSLG00000022493) rsph3 (ENSBSLG00000022357) tagapb (ENSBSLG00000022330) PPP2R5A (ENSBSLG00000022000) dtl (ENSBSLG00000021732) ints7 (ENSBSLG00000021260) 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ENSATEG00000016187 nrbp1 (ENSATEG00000016104) ENSATEG00000016039 ENSATEG00000016010 churc1 (ENSATEG00000027312) ttbk2b (ENSATEG00000015975) mideasa (ENSATEG00000015945) ENSATEG00000015927 ENSATEG00000015290 zpax1 (ENSATEG00000015158) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.e.a ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a Turbot MODERN SPECIES 12 aida (ENSSMAG00000019181) ENSSMAG00000019165 taf1a (ENSSMAG00000019150) DUSP10 (ENSSMAG00000037886) HLX (ENSSMAG00000019132) ENSSMAG00000021590 kcnk3a (ENSSMAG00000025509) enpp1 (ENSSMAG00000019089) ezrb (ENSSMAG00000019057) rsph3 (ENSSMAG00000019041) tagapb (ENSSMAG00000019031) 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(ENSCSEG00000020864) PPP2R5A (ENSCSEG00000020858) opn8c (ENSCSEG00000020857) tagapb (ENSCSEG00000020825) rsph3 (ENSCSEG00000020820) ezrb (ENSCSEG00000020818) ENSCSEG00000020817 enpp1 (ENSCSEG00000020813) ENSCSEG00000020811 slc35f6 (ENSCSEG00000020809) hlx1 (ENSCSEG00000020806) DUSP10 (ENSCSEG00000020802) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000162013 ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d Barramundi perch MODERN SPECIES 335 ezrb (ENSLCAG00010020689) rsph3 (ENSLCAG00010020696) tagapb (ENSLCAG00010020703) opn8c (ENSLCAG00010020712) PPP2R5A (ENSLCAG00010020736) dtl (ENSLCAG00010020815) ints7 (ENSLCAG00010020896) lpgat1 (ENSLCAG00010020951) ##22 nek2 (ENSLCAG00010020958) slc30a1a (ENSLCAG00010020960) rd3 (ENSLCAG00010020963) rhag (ENSLCAG00010020975) ENSLCAG00010020994 ENSLCAG00010021001 nrbp1 (ENSLCAG00010021026) CAPN3 (ENSLCAG00010021080) ENSLCAG00010021098 churc1 (ENSLCAG00010021110) ttbk2b (ENSLCAG00010021115) mideasa (ENSLCAG00010021121) kcns3b (ENSLCAG00010021132) ENSLCAG00010021144 zpax1 (ENSLCAG00010021178) Seriola ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000162013 ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2936 ENSSLDG00000024681 taf1a (ENSSLDG00000024734) DUSP10 (ENSSLDG00000024746) hlx1 (ENSSLDG00000024751) slc35f6 (ENSSLDG00000024760) kcnk3a (ENSSLDG00000024770) enpp1 (ENSSLDG00000024775) ENSSLDG00000024830 ezrb (ENSSLDG00000024844) rsph3 (ENSSLDG00000024863) tagapb (ENSSLDG00000024885) opn8c (ENSSLDG00000024890) PPP2R5A (ENSSLDG00000024894) dtl (ENSSLDG00000024903) ints7 (ENSSLDG00000024913) lpgat1 (ENSSLDG00000024937) ##22 nek2 (ENSSLDG00000000083) ENSSLDG00000000129 slc30a1a (ENSSLDG00000000158) rd3 (ENSSLDG00000000169) rhag (ENSSLDG00000000187) ENSSLDG00000000247 ENSSLDG00000000313 nrbp1 (ENSSLDG00000000428) CAPN3 (ENSSLDG00000000506) ENSSLDG00000000524 churc1 (ENSSLDG00000000533) ttbk2b (ENSSLDG00000000565) mideasa (ENSSLDG00000000670) kcns3b (ENSSLDG00000000679) ENSSLDG00000000690 Greater amberjack MODERN SPECIES 10 ENSSDUG00000003557 taf1a (ENSSDUG00000003526) DUSP10 (ENSSDUG00000003523) hlx1 (ENSSDUG00000003500) slc35f6 (ENSSDUG00000003469) kcnk3a (ENSSDUG00000003460) enpp1 (ENSSDUG00000003432) ENSSDUG00000003410 ezrb (ENSSDUG00000003348) rsph3 (ENSSDUG00000003327) tagapb (ENSSDUG00000003290) opn8c (ENSSDUG00000003268) PPP2R5A (ENSSDUG00000003233) dtl (ENSSDUG00000003217) ints7 (ENSSDUG00000003130) lpgat1 (ENSSDUG00000003098) ##22 nek2 (ENSSDUG00000003064) slc30a1a (ENSSDUG00000003054) rd3 (ENSSDUG00000003038) rhag (ENSSDUG00000003011) CRISP3 (ENSSDUG00000002995) ENSSDUG00000002975 nrbp1 (ENSSDUG00000002869) ENSSDUG00000002257 churc1 (ENSSDUG00000002192) ttbk2b (ENSSDUG00000002162) mideasa (ENSSDUG00000002088) KCNS3 (ENSSDUG00000002073) kcns3b (ENSSDUG00000002071) ENSSDUG00000001994 zpax1 (ENSSDUG00000001910) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000169554.e.b ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000179293 ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000169554.e.b ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.f ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000179293 ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000169554.e.b ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.f ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000179293 ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000169554.e.b ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d ENSGT00940000163503.B.c Mangrove rivulus MODERN SPECIES 20 aida (ENSKMAG00000018441) ENSKMAG00000018416 ENSKMAG00000018405 taf1a (ENSKMAG00000018394) DUSP10 (ENSKMAG00000018361) hlx1 (ENSKMAG00000018350) slc35f6 (ENSKMAG00000018320) kcnk3a (ENSKMAG00000018311) enpp1 (ENSKMAG00000018263) ezrb (ENSKMAG00000018208) rsph3 (ENSKMAG00000018140) tagapb (ENSKMAG00000018113) PPP2R5A (ENSKMAG00000018045) dtl (ENSKMAG00000017969) ints7 (ENSKMAG00000017909) lpgat1 (ENSKMAG00000017879) ##22 nek2 (ENSKMAG00000017860) slc30a1a (ENSKMAG00000017855) rd3 (ENSKMAG00000017845) rhag (ENSKMAG00000017826) ENSKMAG00000017803 nrbp1 (ENSKMAG00000017747) CAPN3 (ENSKMAG00000017627) ENSKMAG00000017549 churc1 (ENSKMAG00000017527) ttbk2b (ENSKMAG00000017500) mideasa (ENSKMAG00000017459) kcns3b (ENSKMAG00000017445) ENSKMAG00000017411 zpax1 (ENSKMAG00000017380) ttc32 (ENSKMAG00000017366) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1613 RNF8 (ENSNFUG00015000344) aida (ENSNFUG00015000321) MIA3 (ENSNFUG00015000172) TAF1A (ENSNFUG00015000084) DUSP10 (ENSNFUG00015000077) HLX1 (ENSNFUG00015000069) SLC35F6 (ENSNFUG00015018572) ENSNFUG00015018569 KCNK3 (ENSNFUG00015018563) enpp1 (ENSNFUG00015018408) ENSNFUG00015018397 ezrb (ENSNFUG00015017950) TAGAP (ENSNFUG00015017912) PPP2R5A (ENSNFUG00015017882) DTL (ENSNFUG00015017791) LPGAT1 (ENSNFUG00015017705) ##22 nek2 (ENSNFUG00015017665) ENSNFUG00015017653 SLC30A1A (ENSNFUG00015017647) RD3 (ENSNFUG00015017642) rhag (ENSNFUG00015017288) Nfu_g_1_018698 (ENSNFUG00015017263) nrbp1 (ENSNFUG00015017247) CAPN3 (ENSNFUG00015016963) ENSNFUG00015016912 ZFP106 (ENSNFUG00015016903) CHURC1 (ENSNFUG00015016897) ttbk2b (ENSNFUG00015016884) mideasa (ENSNFUG00015016873) KCNS3 (ENSNFUG00015016870) ENSNFUG00015016640 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000169554.e.b ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 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ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000179293 ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a Poecilia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000169554.e.b ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172.e.a ENSGT00940000157993 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00730000112900 ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000179293 ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00590000083139.d.a Guppy MODERN SPECIES 452 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mideasa (ENSFHEG00000021719) ENSFHEG00000021709 ENSFHEG00000021627 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 521 taf1a (ENSCVAG00000003350) DUSP10 (ENSCVAG00000003375) hlx1 (ENSCVAG00000003408) slc35f6 (ENSCVAG00000003450) kcnk3a (ENSCVAG00000003470) enpp1 (ENSCVAG00000003521) ENSCVAG00000003535 ezrb (ENSCVAG00000003597) rsph3 (ENSCVAG00000003620) tagapb (ENSCVAG00000003646) PPP2R5A (ENSCVAG00000003723) ENSCVAG00000003754 ints7 (ENSCVAG00000003960) lpgat1 (ENSCVAG00000004045) ##22 nek2 (ENSCVAG00000004095) ENSCVAG00000004113 slc30a1a (ENSCVAG00000004123) ENSCVAG00000004134 rd3 (ENSCVAG00000004151) rhag (ENSCVAG00000004178) CRISP3 (ENSCVAG00000006874) ENSCVAG00000007232 nrbp1 (ENSCVAG00000007348) CAPN3 (ENSCVAG00000007834) ENSCVAG00000007953 churc1 (ENSCVAG00000007985) ttbk2b (ENSCVAG00000008046) mideasa (ENSCVAG00000008103) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000169554.e.b ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 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ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT01100000263861 ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163.d ENSGT00390000011163.c.a ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Indian medaka MODERN SPECIES 22 aida (ENSOMEG00000023290) ENSOMEG00000023340 taf1a (ENSOMEG00000023358) DUSP10 (ENSOMEG00000023371) hlx1 (ENSOMEG00000023389) slc35f6 (ENSOMEG00000023401) kcnk3a (ENSOMEG00000023410) enpp1 (ENSOMEG00000023438) ENSOMEG00000023459 ezrb (ENSOMEG00000023480) tagapb (ENSOMEG00000023505) opn8c (ENSOMEG00000023519) PPP2R5A (ENSOMEG00000023558) dtl (ENSOMEG00000023567) ints7 (ENSOMEG00000023609) lpgat1 (ENSOMEG00000023628) ##22 nek2 (ENSOMEG00000023633) slc30a1a (ENSOMEG00000023643) ENSOMEG00000005251 rd3 (ENSOMEG00000005258) rhag (ENSOMEG00000005287) ENSOMEG00000005312 ENSOMEG00000005321 nrbp1 (ENSOMEG00000005374) ENSOMEG00000005387 ENSOMEG00000005425 ENSOMEG00000005464 churc1 (ENSOMEG00000005505) ENSOMEG00000005519 mideasa (ENSOMEG00000005549) kcns3b (ENSOMEG00000005571) Javanese ricefish MODERN SPECIES 16 RNF8 (ENSOJAG00000019370) aida (ENSOJAG00000019393) ENSOJAG00000019469 ENSOJAG00000019482 taf1a (ENSOJAG00000019506) DUSP10 (ENSOJAG00000019550) hlx1 (ENSOJAG00000019566) slc35f6 (ENSOJAG00000019577) kcnk3a (ENSOJAG00000019591) enpp1 (ENSOJAG00000019621) ENSOJAG00000019867 ezrb (ENSOJAG00000019889) opn8c (ENSOJAG00000020009) PPP2R5A (ENSOJAG00000020034) dtl (ENSOJAG00000020135) lpgat1 (ENSOJAG00000020317) ##22 nek2 (ENSOJAG00000020342) slc30a1a (ENSOJAG00000020350) ENSOJAG00000020361 rd3 (ENSOJAG00000020367) rhag (ENSOJAG00000020376) ENSOJAG00000020395 ENSOJAG00000020408 nrbp1 (ENSOJAG00000020453) CAPN3 (ENSOJAG00000020571) churc1 (ENSOJAG00000020629) ttbk2b (ENSOJAG00000020640) mideasa (ENSOJAG00000020650) kcns3b (ENSOJAG00000020683) ENSOJAG00000020689 zpax1 (ENSOJAG00000020798) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000016465 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01100000263861 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163.c.a ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 16 ENSORLG00000012031 ENSORLG00000012034 taf1a (ENSORLG00000012043) DUSP10 (ENSORLG00000012052) hlx1 (ENSORLG00000012055) slc35f6 (ENSORLG00000012067) kcnk3a (ENSORLG00000012076) enpp1 (ENSORLG00000012085) ENSORLG00000012091 ezrb (ENSORLG00000012128) tagapb (ENSORLG00000012139) opn8c (ENSORLG00000012144) PPP2R5A (ENSORLG00000012149) dtl (ENSORLG00000012152) ints7 (ENSORLG00000012191) lpgat1 (ENSORLG00000012213) ##22 nek2 (ENSORLG00000012239) ENSORLG00000027799 slc30a1a (ENSORLG00000030357) rd3 (ENSORLG00000028166) ENSORLG00000022361 rhag (ENSORLG00000012284) ENSORLG00000026479 ENSORLG00000012321 nrbp1 (ENSORLG00000012341) ENSORLG00000012402 ENSORLG00000012412 churc1 (ENSORLG00000012430) ttbk2b (ENSORLG00000012483) mideasa (ENSORLG00000012495) kcns3b (ENSORLG00000012504) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000179293 ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT01030000234625.B.d.c.b ENSGT00940000159745 ENSGT00440000038430 ENSGT00940000173326 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299.a ENSGT00390000013853 ENSGT00940000160284 ENSGT00550000075009 ENSGT00390000017252 ENSGT00950000183212.B ENSGT00940000158687.a.a ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000162013 ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.d Bicolor damselfish MODERN SPECIES 901 CHRNA2 (ENSSPAG00000012908) ENSSPAG00000012929 nme6 (ENSSPAG00000012937) eif2b4 (ENSSPAG00000012973) atraid (ENSSPAG00000013030) snx17 (ENSSPAG00000013077) znf513a (ENSSPAG00000013127) PPP2R5A (ENSSPAG00000013143) dtl (ENSSPAG00000013186) ints7 (ENSSPAG00000013246) lpgat1 (ENSSPAG00000013324) ##22 nek2 (ENSSPAG00000013336) ENSSPAG00000013359 slc30a1a (ENSSPAG00000013372) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT01030000234625.B.d.c.b ENSGT00940000159745 ENSGT00440000038430 ENSGT00940000173326 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299.a ENSGT00390000013853 ENSGT00940000160284 ENSGT00550000075009 ENSGT00390000017252 ENSGT00950000183212.B ENSGT00940000158687.a.a ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00950000183246 ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a.d ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000156778.l ENSGT00510000048701.a ENSGT00950000182906.b.a.i.b ENSGT00390000014904 ENSGT00940000162477.c ENSGT01030000234595.A.b.a.b ENSGT00950000183204.b.b.a ENSGT00940000156796.c.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT01030000234625.B.d.c.b ENSGT00940000159745 ENSGT00440000038430 ENSGT00940000173326 ENSGT00940000157269.a.a ENSGT00940000158299.a ENSGT00390000013853 ENSGT00940000160284 ENSGT00550000075009 ENSGT00390000017252 ENSGT00950000183212.B ENSGT00940000158687.a.a ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00950000183246 ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a.d ENSGT00530000063408.A ENSGT00940000156778.l ENSGT00510000048701.a ENSGT00950000182906.b.a.i.b ENSGT00510000047616.a.a ENSGT00510000047616.a.b ENSGT00940000155141.w.a ENSGT00940000175851 ENSGT00940000158349 ENSGT00390000016034 Clown anemonefish MODERN SPECIES 3192 zc3h14 (ENSAOCG00000024218) ptk2bb (ENSAOCG00000024168) CHRNA2 (ENSAOCG00000024092) ENSAOCG00000024082 ENSAOCG00000024074 nme6 (ENSAOCG00000024061) eif2b4 (ENSAOCG00000024037) atraid (ENSAOCG00000024009) snx17 (ENSAOCG00000023999) znf513a (ENSAOCG00000023963) PPP2R5A (ENSAOCG00000023949) dtl (ENSAOCG00000023941) ints7 (ENSAOCG00000023924) lpgat1 (ENSAOCG00000023892) ##22 nek2 (ENSAOCG00000023881) slc30a1a (ENSAOCG00000023862) ENSAOCG00000001748 rd3 (ENSAOCG00000023853) rhag (ENSAOCG00000023842) ENSAOCG00000023823 Orange clownfish MODERN SPECIES 2 FLVCR2 (ENSAPEG00000001849) batf (ENSAPEG00000001859) zc3h14 (ENSAPEG00000001867) ENSAPEG00000001895 ptk2bb (ENSAPEG00000001933) CHRNA2 (ENSAPEG00000002072) ENSAPEG00000002186 nme6 (ENSAPEG00000002211) eif2b4 (ENSAPEG00000002245) atraid (ENSAPEG00000002265) snx17 (ENSAPEG00000002283) znf513a (ENSAPEG00000002344) PPP2R5A (ENSAPEG00000002381) dtl (ENSAPEG00000002413) ints7 (ENSAPEG00000002472) lpgat1 (ENSAPEG00000002569) ##22 nek2 (ENSAPEG00000002624) slc30a1a (ENSAPEG00000002663) ENSAPEG00000002668 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ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993 ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00950000183246 ENSGT00940000156484.b.e.b ENSGT00390000002089.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a ENSGT00940000156439.c ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a ENSGT00940000179293 ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163 ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Midas cichlid MODERN SPECIES 307 lpgat1 (ENSACIG00000020272) ##22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000167198 ENSGT01090000260082.d.b.b 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ENSGT00940000165020.a ENSGT00940000157459.a ENSGT00940000155979.h Lyretail cichlid MODERN SPECIES 314 DUSP10 (ENSNBRG00000021944) hlx1 (ENSNBRG00000021898) slc35f6 (ENSNBRG00000021881) kcnk3a (ENSNBRG00000021869) ENSNBRG00000021858 ENSNBRG00000021844 ENSNBRG00000021824 ENSNBRG00000021807 ezrb (ENSNBRG00000021747) rsph3 (ENSNBRG00000021675) tagapb (ENSNBRG00000021657) opn8c (ENSNBRG00000021640) PPP2R5A (ENSNBRG00000021626) dtl (ENSNBRG00000021541) ints7 (ENSNBRG00000021483) lpgat1 (ENSNBRG00000021463) ##22 nek2 (ENSNBRG00000021440) ENSNBRG00000021427 slc30a1a (ENSNBRG00000021418) rd3 (ENSNBRG00000021408) rhag (ENSNBRG00000021403) ENSNBRG00000021378 ENSNBRG00000021309 nrbp1 (ENSNBRG00000021255) CAPN3 (ENSNBRG00000021210) ENSNBRG00000021193 churc1 (ENSNBRG00000021181) ttbk2b (ENSNBRG00000021158) mideasa (ENSNBRG00000021127) kcns3b (ENSNBRG00000021113) ENSNBRG00000020939 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182767.a ENSGT00390000011405 ENSGT00940000157671 ENSGT00950000183093.C 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Salmo ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00950000182767.a.g ENSGT00940000157671.g ENSGT00950000183093.C.f ENSGT00390000017237.c ENSGT00940000158248.b.a ENSGT00940000156034.a.n ENSGT00940000160610.t ENSGT01060000250095.a ENSGT01090000260082.d.b.b.d ENSGT00390000004172 ENSGT00940000157993.x ENSGT01100000263524.F ENSGT01030000234620.a.b.b.b.g ENSGT00530000064210.d ENSGT00390000011724.h ENSGT00950000182836.b.a.b.c ##22 ENSGT00940000156989.k ENSGT00960000186817.b ENSGT00940000156484.b.e.b.c ENSGT00390000002089.a.a.a.a ENSGT00950000182844.b.a.e.a.a ENSGT00390000016613.d ENSGT00940000155605.a.a.e ENSGT00940000156092.a.a ENSGT00940000157336.p ENSGT00390000011163.e.a.b ENSGT00940000165020.a.h ENSGT00940000157459.a.g ENSGT00940000155979.h ENSGT00940000163503.B.c.k ENSGT00390000011905 Atlantic salmon MODERN SPECIES 6 MIA3 (ENSSSAG00000039536) ENSSSAG00000113566 hlx (ENSSSAG00000039444) ENSSSAG00000119745 kcnk3a (ENSSSAG00000087835) enpp1 (ENSSSAG00000075865) SYTL3 (ENSSSAG00000075812) ENSSSAG00000117114 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ENSSTUG00000047685 Northern pike MODERN SPECIES 13 ENSELUG00000013328 taf1a (ENSELUG00000013392) DUSP10 (ENSELUG00000013415) hlx1 (ENSELUG00000000492) slc35f6 (ENSELUG00000013461) kcnk3a (ENSELUG00000013478) enpp1 (ENSELUG00000013530) SYTL3 (ENSELUG00000013557) ezrb (ENSELUG00000013589) rsph3 (ENSELUG00000013616) tagapb (ENSELUG00000013675) opn8c (ENSELUG00000013700) PPP2R5A (ENSELUG00000013822) dtl (ENSELUG00000013921) ints7 (ENSELUG00000014047) lpgat1 (ENSELUG00000014074) ##22 nek2 (ENSELUG00000014120) slc30a1a (ENSELUG00000014145) ENSELUG00000026494 ENSELUG00000014162 nrbp1 (ENSELUG00000014337) CAPN3 (ENSELUG00000014459) ENSELUG00000014554 churc1 (ENSELUG00000014590) ttbk2b (ENSELUG00000014621) mideasa (ENSELUG00000014652) kcns3b (ENSELUG00000014664) ENSELUG00000014721 zpax1 (ENSELUG00000014772) ttc32 (ENSELUG00000026723) ENSELUG00000014816 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 209 ENSGT00390000017237 ENSGT00940000158248.b ENSGT00940000156034.a ENSGT00940000160610 ENSGT01090000260082.d.b.b 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(ENSECRG00000015747) disp1 (ENSECRG00000015843) TLR5 (ENSECRG00000015865) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.b ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00390000004585 ENSGT00940000159665 ENSGT00950000183093.C ENSGT00940000157671 ENSGT00940000161139 ENSGT00390000011405 ENSGT00950000182767.a ENSGT00940000170599 ENSGT00390000016465 ENSGT00390000006681 ENSGT00390000016736.b Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.b ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 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ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000162058 ENSGT00940000157303 ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000160303.b Frog MODERN SPECIES 5 vash2 (ENSXETG00000014363) flvcr1 (ENSXETG00000014366) ENSXETG00000031526 tatdn3 (ENSXETG00000042429) nsl1 (ENSXETG00000030886) BATF3 (ENSXETG00000043512) atf3 (ENSXETG00000044220) ENSXETG00000046226 pacc1 (ENSXETG00000014356) nenf (ENSXETG00000014379) ENSXETG00000044881 ppp2r5a (ENSXETG00000014382) ENSXETG00000048053 dtl (ENSXETG00000014394) ints7 (ENSXETG00000014409) lpgat1 (ENSXETG00000014416) ##22 nek2 (ENSXETG00000025008) ENSXETG00000040473 slc30a1 (ENSXETG00000042450) rd3 (ENSXETG00000045435) mrpl57 (ENSXETG00000038041) traf5 (ENSXETG00000014444) ENSXETG00000043169 bicral (ENSXETG00000031648) trerf1 (ENSXETG00000000198) ubr2 (ENSXETG00000000201) ENSXETG00000037891 prph2 (ENSXETG00000000215) utp25 (ENSXETG00000000216) syt14 (ENSXETG00000000217) sertad4 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ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154790.a.a.b ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT00940000163755 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00950000182834.B ENSGT00940000153634.b ENSGT00950000182834.A.a.b.c ENSGT00390000000412 ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b ENSGT00940000157376 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ENSABRG00000014842 SLC30A1 (ENSABRG00000014840) RD3 (ENSABRG00000014837) TRAF5 (ENSABRG00000014827) RCOR3 (ENSABRG00000014791) KCNH1 (ENSABRG00000014780) HHAT (ENSABRG00000014772) SERTAD4 (ENSABRG00000014769) SYT14 (ENSABRG00000014758) UTP25 (ENSABRG00000014743) MRPS10 (ENSABRG00000014739) TRERF1 (ENSABRG00000014735) UBR2 (ENSABRG00000011635) PRPH2 (ENSABRG00000011421) Duck MODERN SPECIES 21 DEGS1 (ENSAPLG00000012629) NVL (ENSAPLG00000012723) CNIH4 (ENSAPLG00000012950) WDR26 (ENSAPLG00000013139) CNIH3 (ENSAPLG00000013264) ENSAPLG00000024602 LBR (ENSAPLG00000013563) ENAH (ENSAPLG00000014191) SRP9 (ENSAPLG00000015368) EPHX1 (ENSAPLG00000015369) ENSAPLG00000022272 PACC1 (ENSAPLG00000015557) PPP2R5A (ENSAPLG00000015734) DTL (ENSAPLG00000016053) INTS7 (ENSAPLG00000016233) LPGAT1 (ENSAPLG00000010836) ##22 NEK2 (ENSAPLG00000010876) SLC30A1 (ENSAPLG00000000775) RD3 (ENSAPLG00000020251) TRAF5 (ENSAPLG00000006555) ENSAPLG00000007210 KCNH1 (ENSAPLG00000007453) ENSAPLG00000029050 ENSAPLG00000007807 SERTAD4 (ENSAPLG00000020952) SYT14 (ENSAPLG00000007935) UTP25 (ENSAPLG00000007948) KCNK1 (ENSAPLG00000008119) SLC35F3 (ENSAPLG00000008027) COA6 (ENSAPLG00000022615) TARBP1 (ENSAPLG00000007666) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154790.a.a.b ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT00940000163755 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Japanese quail MODERN SPECIES 21 PROX1 (ENSCJPG00005007447) RPS6KC1 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ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000163755 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 ENSGT00940000162058 Turkey MODERN SPECIES 11 PTPN14 (ENSMGAG00000009571) SMYD2 (ENSMGAG00000009603) PROX1 (ENSMGAG00000009635) ENSMGAG00000022837 ANGEL2 (ENSMGAG00000009662) VASH2 (ENSMGAG00000009679) FLVCR1 (ENSMGAG00000009696) NSL1 (ENSMGAG00000016643) BATF3 (ENSMGAG00000020333) ATF3 (ENSMGAG00000009708) PACC1 (ENSMGAG00000009719) ENSMGAG00000009712 PPP2R5A (ENSMGAG00000009729) DTL (ENSMGAG00000009764) INTS7 (ENSMGAG00000009791) LPGAT1 (ENSMGAG00000009816) ##22 NEK2 (ENSMGAG00000009820) RD3 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ENSGT00940000154790.a.a.b ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Golden eagle MODERN SPECIES 4 SMYD2 (ENSACCG00020014807) PROX1 (ENSACCG00020014825) RPS6KC1 (ENSACCG00020014884) ANGEL2 (ENSACCG00020014925) VASH2 (ENSACCG00020014981) FLVCR1 (ENSACCG00020014999) TATDN3 (ENSACCG00020015033) NSL1 (ENSACCG00020015051) BATF3 (ENSACCG00020015065) ATF3 (ENSACCG00020008599) PACC1 (ENSACCG00020008621) NENF 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(ENSSHBG00005006157) ENSSHBG00005006186 SLC30A1 (ENSSHBG00005006207) RD3 (ENSSHBG00005006233) TRAF5 (ENSSHBG00005006335) RCOR3 (ENSSHBG00005006373) KCNH1 (ENSSHBG00005006442) HHAT (ENSSHBG00005006525) SERTAD4 (ENSSHBG00005006545) SYT14 (ENSSHBG00005006667) UTP25 (ENSSHBG00005006715) MRPS10 (ENSSHBG00005006737) TRERF1 (ENSSHBG00005006750) UBR2 (ENSSHBG00005006802) PRPH2 (ENSSHBG00005006918) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154790.a.a.b ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT00940000163755 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Great tit MODERN SPECIES 22 SMYD2 (ENSPMJG00000013517) PROX1 (ENSPMJG00000013542) RPS6KC1 (ENSPMJG00000013553) ANGEL2 (ENSPMJG00000013560) VASH2 (ENSPMJG00000013561) FLVCR1 (ENSPMJG00000013562) TATDN3 (ENSPMJG00000013563) NSL1 (ENSPMJG00000013564) BATF3 (ENSPMJG00000013565) ATF3 (ENSPMJG00000013569) NENF (ENSPMJG00000013572) PACC1 (ENSPMJG00000013573) PPP2R5A (ENSPMJG00000013574) DTL (ENSPMJG00000013575) INTS7 (ENSPMJG00000013576) LPGAT1 (ENSPMJG00000013577) ##22 NEK2 (ENSPMJG00000013580) ENSPMJG00000013581 SLC30A1 (ENSPMJG00000013582) RD3 (ENSPMJG00000013584) TRAF5 (ENSPMJG00000013586) RCOR3 (ENSPMJG00000013587) KCNH1 (ENSPMJG00000013591) HHAT (ENSPMJG00000013611) SERTAD4 (ENSPMJG00000013615) SYT14 (ENSPMJG00000013617) UTP25 (ENSPMJG00000013618) MRPS10 (ENSPMJG00000013630) TRERF1 (ENSPMJG00000013639) UBR2 (ENSPMJG00000013641) PRPH2 (ENSPMJG00000013643) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154790.a.a.b ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376.d ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT00940000163755 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Flycatcher MODERN SPECIES 21 SMYD2 (ENSFALG00000012334) PROX1 (ENSFALG00000012357) RPS6KC1 (ENSFALG00000012366) ANGEL2 (ENSFALG00000012373) VASH2 (ENSFALG00000012378) FLVCR1 (ENSFALG00000012381) TATDN3 (ENSFALG00000012386) NSL1 (ENSFALG00000012399) BATF3 (ENSFALG00000012404) ATF3 (ENSFALG00000012408) NENF (ENSFALG00000024990) PACC1 (ENSFALG00000012420) PPP2R5A (ENSFALG00000012423) DTL (ENSFALG00000012431) INTS7 (ENSFALG00000012450) LPGAT1 (ENSFALG00000012463) ##22 NEK2 (ENSFALG00000012477) SLC30A1 (ENSFALG00000012492) RD3 (ENSFALG00000023228) TRAF5 (ENSFALG00000012507) ENSFALG00000012532 KCNH1 (ENSFALG00000012557) HHAT (ENSFALG00000012571) SERTAD4 (ENSFALG00000012574) SYT14 (ENSFALG00000012577) UTP25 (ENSFALG00000012581) MRPS10 (ENSFALG00000023584) TRERF1 (ENSFALG00000012590) UBR2 (ENSFALG00000012597) PRPH2 (ENSFALG00000012604) BICRAL (ENSFALG00000012610) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154790.a.a.b ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376.d ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT00940000163755 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 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finch MODERN SPECIES 23 PTPN14 (ENSTGUG00000002916) SMYD2 (ENSTGUG00000002951) PROX1 (ENSTGUG00000002974) RPS6KC1 (ENSTGUG00000002977) ANGEL2 (ENSTGUG00000002995) VASH2 (ENSTGUG00000003006) FLVCR1 (ENSTGUG00000003013) TATDN3 (ENSTGUG00000003025) NSL1 (ENSTGUG00000003044) ATF3 (ENSTGUG00000003050) NENF (ENSTGUG00000022854) PACC1 (ENSTGUG00000003056) PPP2R5A (ENSTGUG00000003063) DTL (ENSTGUG00000003109) INTS7 (ENSTGUG00000003120) LPGAT1 (ENSTGUG00000019484) ##22 NEK2 (ENSTGUG00000003146) ENSTGUG00000003167 SLC30A1 (ENSTGUG00000029172) RD3 (ENSTGUG00000025500) TRAF5 (ENSTGUG00000021131) RCOR3 (ENSTGUG00000003186) KCNH1 (ENSTGUG00000003202) HHAT (ENSTGUG00000003218) SERTAD4 (ENSTGUG00000021627) SYT14 (ENSTGUG00000003225) UTP25 (ENSTGUG00000003232) MRPS10 (ENSTGUG00000003245) TRERF1 (ENSTGUG00000003250) UBR2 (ENSTGUG00000003261) PRPH2 (ENSTGUG00000023472) Common canary MODERN SPECIES 41 PROX1 (ENSSCAG00000005837) RPS6KC1 (ENSSCAG00000005853) ANGEL2 (ENSSCAG00000005862) VASH2 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ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155656 ENSGT00390000002443 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00960000188973 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Elapidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155656.d ENSGT00390000002443 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a 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ENSGT01000000220805 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a.f ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000002443 ENSGT01000000221346 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00960000188973 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT01030000235236 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a.f ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Eastern brown snake MODERN SPECIES 5 ENSPTXG00000013166 ANGEL2 (ENSPTXG00000013167) VASH2 (ENSPTXG00000013171) FLVCR1 (ENSPTXG00000013174) ENSPTXG00000013176 TATDN3 (ENSPTXG00000013177) ENSPTXG00000013178 ENSPTXG00000013179 BATF3 (ENSPTXG00000013182) ATF3 (ENSPTXG00000013183) NENF (ENSPTXG00000013184) PACC1 (ENSPTXG00000013186) PPP2R5A (ENSPTXG00000013187) DTL (ENSPTXG00000000027) INTS7 (ENSPTXG00000000097) LPGAT1 (ENSPTXG00000000115) ##22 NEK2 (ENSPTXG00000000164) ENSPTXG00000000191 SLC30A1 (ENSPTXG00000000199) RD3 (ENSPTXG00000000208) TRAF5 (ENSPTXG00000000226) RCOR3 (ENSPTXG00000000243) KCNH1 (ENSPTXG00000000347) ENSPTXG00000000720 SERTAD4 (ENSPTXG00000000723) SYT14 (ENSPTXG00000000727) UTP25 (ENSPTXG00000000730) MRPS10 (ENSPTXG00000000734) TRERF1 (ENSPTXG00000000753) UBR2 (ENSPTXG00000000761) PRPH2 (ENSPTXG00000000770) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 3 ANGEL2 (ENSNSUG00000012816) VASH2 (ENSNSUG00000012817) ENSNSUG00000012818 ENSNSUG00000012819 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ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00390000009045 ENSGT00940000160303.b ENSGT00950000183075.a.a.a.a ENSGT00940000157303 Common wall lizard MODERN SPECIES 11 ANGEL2 (ENSPMRG00000004428) VASH2 (ENSPMRG00000004436) FLVCR1 (ENSPMRG00000004448) ENSPMRG00000004454 ENSPMRG00000004462 TATDN3 (ENSPMRG00000004468) NSL1 (ENSPMRG00000004477) BATF3 (ENSPMRG00000004483) ATF3 (ENSPMRG00000004496) NENF (ENSPMRG00000004502) PACC1 (ENSPMRG00000004508) PPP2R5A (ENSPMRG00000004514) DTL (ENSPMRG00000004523) INTS7 (ENSPMRG00000004535) ENSPMRG00000004550 LPGAT1 (ENSPMRG00000004552) ##22 NEK2 (ENSPMRG00000004558) ENSPMRG00000004565 SLC30A1 (ENSPMRG00000004570) RD3 (ENSPMRG00000004574) TRAF5 (ENSPMRG00000004577) RCOR3 (ENSPMRG00000004587) KCNH1 (ENSPMRG00000004598) HHAT (ENSPMRG00000004612) SERTAD4 (ENSPMRG00000004633) SYT14 (ENSPMRG00000004648) ENSPMRG00000004681 ENSPMRG00000004684 UTP25 (ENSPMRG00000004693) MRPS10 (ENSPMRG00000004706) TRERF1 (ENSPMRG00000004713) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 7 ANGEL2 (ENSSMRG00000018609) VASH2 (ENSSMRG00000018607) FLVCR1 (ENSSMRG00000018606) ENSSMRG00000018605 TATDN3 (ENSSMRG00000018604) NSL1 (ENSSMRG00000018603) BATF3 (ENSSMRG00000018602) ATF3 (ENSSMRG00000018601) NENF (ENSSMRG00000018599) ENSSMRG00000018598 PACC1 (ENSSMRG00000018597) PPP2R5A (ENSSMRG00000018595) DTL (ENSSMRG00000018593) INTS7 (ENSSMRG00000018590) ENSSMRG00000018589 LPGAT1 (ENSSMRG00000018588) ##22 NEK2 (ENSSMRG00000018587) ENSSMRG00000018586 SLC30A1 (ENSSMRG00000018585) RD3 (ENSSMRG00000018584) TRAF5 (ENSSMRG00000018582) RCOR3 (ENSSMRG00000018581) KCNH1 (ENSSMRG00000018579) HHAT (ENSSMRG00000018574) SERTAD4 (ENSSMRG00000018573) SYT14 (ENSSMRG00000018571) UTP25 (ENSSMRG00000018570) MRPS10 (ENSSMRG00000018568) TRERF1 (ENSSMRG00000018567) UBR2 (ENSSMRG00000018565) TBCC (ENSSMRG00000018564) tuatara MODERN SPECIES 583 NENF (ENSSPUG00000015216) PACC1 (ENSSPUG00000015193) PPP2R5A (ENSSPUG00000015178) DTL (ENSSPUG00000015154) INTS7 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(ENSMODG00000002520) G0S2 (ENSMODG00000024755) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 ENSGT00390000005294 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000163755 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 184 ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000163755 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b Elephant MODERN SPECIES 105 SPATA45 (ENSLAFG00000012233) TATDN3 (ENSLAFG00000012226) NSL1 (ENSLAFG00000012223) BATF3 (ENSLAFG00000027351) GARIN4 (ENSLAFG00000021976) ATF3 (ENSLAFG00000032487) ENSLAFG00000022517 PACC1 (ENSLAFG00000017776) PPP2R5A (ENSLAFG00000010472) DTL (ENSLAFG00000009649) INTS7 (ENSLAFG00000009461) LPGAT1 (ENSLAFG00000017446) ##22 NEK2 (ENSLAFG00000015115) SLC30A1 (ENSLAFG00000016715) RD3 (ENSLAFG00000018126) Hyrax MODERN SPECIES 1819 LPGAT1 (ENSPCAG00000006601) ##22 Tenrec MODERN SPECIES 2245 LPGAT1 (ENSETEG00000007282) ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 725 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 Sloth MODERN SPECIES 2031 LPGAT1 (ENSCHOG00000006855) ##22 Armadillo MODERN SPECIES 4227 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ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00860000134882 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 Primates ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00860000134882 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00860000134882 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 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(ENSNLEG00000001955) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374.f ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00860000134882 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000154666.d.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00390000001347.vb.b.b ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 139 ENSGT00390000017528.b ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00390000018018.tb 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ENSRBIG00000044233 ENSRBIG00000023591 KCNH1 (ENSRBIG00000039615) ENSRBIG00000035378 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374.f ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00860000134882 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000154666.d.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00390000001347.vb.b.b ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 Vervet Monkey MODERN SPECIES 17 RPS6KC1 (ENSCSAG00000015524) ANGEL2 (ENSCSAG00000015513) VASH2 (ENSCSAG00000015494) FLVCR1 (ENSCSAG00000015440) ENSCSAG00000015430 TATDN3 (ENSCSAG00000015424) 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ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374.f ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 ENSGT00390000005294 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 204 PROX1 (ENSMNEG00000031336) RPS6KC1 (ENSMNEG00000029897) ANGEL2 (ENSMNEG00000027131) VASH2 (ENSMNEG00000020215) FLVCR1 (ENSMNEG00000029472) TATDN3 (ENSMNEG00000033507) NSL1 (ENSMNEG00000034616) ENSMNEG00000021942 BATF3 (ENSMNEG00000012965) ATF3 (ENSMNEG00000044528) NENF (ENSMNEG00000036836) PACC1 (ENSMNEG00000040751) PPP2R5A (ENSMNEG00000044046) DTL (ENSMNEG00000029309) INTS7 (ENSMNEG00000031972) LPGAT1 (ENSMNEG00000038962) ##22 NEK2 (ENSMNEG00000028653) SLC30A1 (ENSMNEG00000045198) RD3 (ENSMNEG00000035032) ENSMNEG00000039735 TRAF5 (ENSMNEG00000039191) RCOR3 (ENSMNEG00000028882) HTR3A (ENSMNEG00000031796) HTR3B (ENSMNEG00000031591) USP28 (ENSMNEG00000043630) ZW10 (ENSMNEG00000027148) ENSMNEG00000043213 TMPRSS5 (ENSMNEG00000033735) DRD2 (ENSMNEG00000041852) ANKK1 (ENSMNEG00000038963) TTC12 (ENSMNEG00000032462) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 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UTP25 (ENSCATG00000040125) IRF6 (ENSCATG00000039683) C1orf74 (ENSCATG00000014920) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 ENSGT00390000005294 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 ENSGT00390000005294 Marmoset MODERN SPECIES 10 SYT14 (ENSCJAG00000000322) SERTAD4 (ENSCJAG00000042537) HHAT (ENSCJAG00000000310) KCNH1 (ENSCJAG00000038943) RCOR3 (ENSCJAG00000000282) TRAF5 (ENSCJAG00000000257) ENSCJAG00000015904 RD3 (ENSCJAG00000074339) ENSCJAG00000070569 PACC1 (ENSCJAG00000015742) PPP2R5A (ENSCJAG00000015748) ENSCJAG00000072106 DTL (ENSCJAG00000015774) INTS7 (ENSCJAG00000015814) ENSCJAG00000085462 LPGAT1 (ENSCJAG00000015870) ##22 NEK2 (ENSCJAG00000015883) SLC30A1 (ENSCJAG00000015892) ENSCJAG00000082707 ENSCJAG00000015738 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SPECIES 38 ENSCCAG00000022699 ENSCCAG00000016999 ENSCCAG00000025916 ENSCCAG00000036863 ENSCCAG00000026377 NSL1 (ENSCCAG00000027522) BATF3 (ENSCCAG00000014441) FAM71A (ENSCCAG00000027975) ATF3 (ENSCCAG00000033084) NENF (ENSCCAG00000020239) PACC1 (ENSCCAG00000025595) PPP2R5A (ENSCCAG00000027109) DTL (ENSCCAG00000033276) INTS7 (ENSCCAG00000018548) ENSCCAG00000033361 LPGAT1 (ENSCCAG00000033798) ##22 NEK2 (ENSCCAG00000030464) SLC30A1 (ENSCCAG00000024546) RD3 (ENSCCAG00000026634) ENSCCAG00000034878 TRAF5 (ENSCCAG00000037715) RCOR3 (ENSCCAG00000028558) ENSCCAG00000011709 KCNH1 (ENSCCAG00000027676) HHAT (ENSCCAG00000029174) SERTAD4 (ENSCCAG00000032361) ENSCCAG00000024990 SYT14 (ENSCCAG00000038093) ENSCCAG00000022724 UTP25 (ENSCCAG00000036745) IRF6 (ENSCCAG00000021079) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 79 RPS6KC1 (ENSSBOG00000018202) ENSSBOG00000024418 ANGEL2 (ENSSBOG00000023625) VASH2 (ENSSBOG00000003716) FLVCR1 (ENSSBOG00000034630) TATDN3 (ENSSBOG00000026391) SPATA45 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ENSGT00940000160097 Mouse lemur MODERN SPECIES 19 PROX1 (ENSMICG00000011593) ENSMICG00000029442 ANGEL2 (ENSMICG00000014726) VASH2 (ENSMICG00000014703) FLVCR1 (ENSMICG00000027099) TATDN3 (ENSMICG00000014664) NSL1 (ENSMICG00000037746) BATF3 (ENSMICG00000027907) GARIN4 (ENSMICG00000037119) ATF3 (ENSMICG00000033583) NENF (ENSMICG00000028060) PACC1 (ENSMICG00000015461) PPP2R5A (ENSMICG00000015435) DTL (ENSMICG00000015416) INTS7 (ENSMICG00000015396) LPGAT1 (ENSMICG00000007842) ##22 NEK2 (ENSMICG00000007833) SLC30A1 (ENSMICG00000034511) RD3 (ENSMICG00000000426) ENSMICG00000043120 TRAF5 (ENSMICG00000010432) RCOR3 (ENSMICG00000010429) ENSMICG00000028409 KCNH1 (ENSMICG00000017331) HHAT (ENSMICG00000017324) SERTAD4 (ENSMICG00000031959) SYT14 (ENSMICG00000001258) UTP25 (ENSMICG00000001242) IRF6 (ENSMICG00000001233) TRAF3IP3 (ENSMICG00000001216) HSD11B1 (ENSMICG00000001213) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c.m 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ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451.a ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 Cow MODERN SPECIES 7 PROX1 (ENSBTAG00000010978) RPS6KC1 (ENSBTAG00000001181) ANGEL2 (ENSBTAG00000003702) VASH2 (ENSBTAG00000003701) FLVCR1 (ENSBTAG00000015974) SPATA45 (ENSBTAG00000010016) TATDN3 (ENSBTAG00000024443) NSL1 (ENSBTAG00000011340) BATF3 (ENSBTAG00000011982) ATF3 (ENSBTAG00000008545) NENF (ENSBTAG00000000759) PACC1 (ENSBTAG00000000758) PPP2R5A (ENSBTAG00000000754) DTL (ENSBTAG00000018142) INTS7 (ENSBTAG00000018548) LPGAT1 (ENSBTAG00000005137) ##22 NEK2 (ENSBTAG00000009618) ENSBTAG00000048992 SLC30A1 (ENSBTAG00000010909) RD3 (ENSBTAG00000024453) TRAF5 (ENSBTAG00000012020) RCOR3 (ENSBTAG00000007110) KCNH1 (ENSBTAG00000008710) HHAT (ENSBTAG00000048628) SERTAD4 (ENSBTAG00000010850) SYT14 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G0S2 (ENSBIXG00005022672) American bison MODERN SPECIES 3236 RPS6KC1 (ENSBBBG00000023896) ANGEL2 (ENSBBBG00000006232) VASH2 (ENSBBBG00000024010) FLVCR1 (ENSBBBG00000024087) SPATA45 (ENSBBBG00000006263) TATDN3 (ENSBBBG00000008996) NSL1 (ENSBBBG00000024348) BATF3 (ENSBBBG00000008830) GARIN4 (ENSBBBG00000006342) ATF3 (ENSBBBG00000024444) NENF (ENSBBBG00000006377) PACC1 (ENSBBBG00000006382) PPP2R5A (ENSBBBG00000024543) DTL (ENSBBBG00000024611) INTS7 (ENSBBBG00000024708) LPGAT1 (ENSBBBG00000006504) ##22 NEK2 (ENSBBBG00000006513) ENSBBBG00000006520 SLC30A1 (ENSBBBG00000006526) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00860000134882 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00960000191639 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00960000191639 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 Caniformia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 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ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00950000186332 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00960000191639 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 Ursus ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000163755 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00950000186332 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00960000191639 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 Polar bear MODERN SPECIES 230 RPS6KC1 (ENSUMAG00000017947) ANGEL2 (ENSUMAG00000017991) VASH2 (ENSUMAG00000018002) FLVCR1 (ENSUMAG00000018014) SPATA45 (ENSUMAG00000018025) TATDN3 (ENSUMAG00000018034) NSL1 (ENSUMAG00000018042) BATF3 (ENSUMAG00000018055) ENSUMAG00000018059 ATF3 (ENSUMAG00000018064) ENSUMAG00000018069 PACC1 (ENSUMAG00000018077) PPP2R5A (ENSUMAG00000018579) DTL (ENSUMAG00000020974) INTS7 (ENSUMAG00000021062) LPGAT1 (ENSUMAG00000021072) ##22 NEK2 (ENSUMAG00000021075) RD3 (ENSUMAG00000021077) TRAF5 (ENSUMAG00000021086) RCOR3 (ENSUMAG00000021112) KCNH1 (ENSUMAG00000021246) ENSUMAG00000021274 HHAT (ENSUMAG00000021278) SERTAD4 (ENSUMAG00000021282) SYT14 (ENSUMAG00000021287) UTP25 (ENSUMAG00000021297) IRF6 (ENSUMAG00000021303) C1orf74 (ENSUMAG00000021308) TRAF3IP3 (ENSUMAG00000021311) HSD11B1 (ENSUMAG00000021315) G0S2 (ENSUMAG00000021318) American black bear MODERN SPECIES 1733 LPGAT1 (ENSUAMG00000007498) ##22 NEK2 (ENSUAMG00000007503) ENSUAMG00000007517 SLC30A1 (ENSUAMG00000007518) RD3 (ENSUAMG00000007519) Giant Panda MODERN SPECIES 18 RPS6KC1 (ENSAMEG00000015771) ANGEL2 (ENSAMEG00000001436) VASH2 (ENSAMEG00000001425) FLVCR1 (ENSAMEG00000001394) SPATA45 (ENSAMEG00000001391) TATDN3 (ENSAMEG00000001364) NSL1 (ENSAMEG00000023537) BATF3 (ENSAMEG00000001350) GARIN4 (ENSAMEG00000020024) ATF3 (ENSAMEG00000001342) NENF (ENSAMEG00000031283) PACC1 (ENSAMEG00000001326) PPP2R5A (ENSAMEG00000001284) DTL (ENSAMEG00000001259) INTS7 (ENSAMEG00000001226) LPGAT1 (ENSAMEG00000001208) ##22 NEK2 (ENSAMEG00000001187) ENSAMEG00000026554 SLC30A1 (ENSAMEG00000001179) ENSAMEG00000025973 RD3 (ENSAMEG00000031055) TRAF5 (ENSAMEG00000001120) RCOR3 (ENSAMEG00000001095) KCNH1 (ENSAMEG00000001083) ENSAMEG00000028194 HHAT (ENSAMEG00000001075) SERTAD4 (ENSAMEG00000003428) SYT14 (ENSAMEG00000003414) UTP25 (ENSAMEG00000017972) IRF6 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ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 Equus ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00950000183198.c.b.a.u.a ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00960000186787 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 Donkey MODERN SPECIES 17 ANGEL2 (ENSEASG00005002856) VASH2 (ENSEASG00005002846) FLVCR1 (ENSEASG00005002836) ENSEASG00005002833 SPATA45 (ENSEASG00005024302) TATDN3 (ENSEASG00005002825) NSL1 (ENSEASG00005002819) BATF3 (ENSEASG00005038008) GARIN4 (ENSEASG00005002812) ATF3 (ENSEASG00005002809) NENF (ENSEASG00005034192) PACC1 (ENSEASG00005002801) PPP2R5A (ENSEASG00005002799) DTL (ENSEASG00005002794) INTS7 (ENSEASG00005002785) LPGAT1 (ENSEASG00005002780) ##22 NEK2 (ENSEASG00005002743) ENSEASG00005002740 SLC30A1 (ENSEASG00005024608) RD3 (ENSEASG00005035553) TRAF5 (ENSEASG00005002734) RCOR3 (ENSEASG00005002731) KCNH1 (ENSEASG00005002723) HHAT (ENSEASG00005002714) SERTAD4 (ENSEASG00005002712) SYT14 (ENSEASG00005002709) UTP25 (ENSEASG00005002702) IRF6 (ENSEASG00005002698) TRAF3IP3 (ENSEASG00005002677) C1orf74 (ENSEASG00005029649) HSD11B1 (ENSEASG00005002669) Horse MODERN SPECIES 26 ANGEL2 (ENSECAG00000010723) FLVCR1 (ENSECAG00000017787) ENSECAG00000033183 SPATA45 (ENSECAG00000038528) TATDN3 (ENSECAG00000008513) NSL1 (ENSECAG00000009355) BATF3 (ENSECAG00000011042) GARIN4 (ENSECAG00000011089) ATF3 (ENSECAG00000011486) NENF (ENSECAG00000014943) PACC1 (ENSECAG00000018726) PPP2R5A (ENSECAG00000007665) ENSECAG00000046910 DTL (ENSECAG00000011878) INTS7 (ENSECAG00000018806) LPGAT1 (ENSECAG00000013187) ##22 NEK2 (ENSECAG00000020920) ENSECAG00000029157 SLC30A1 (ENSECAG00000003051) RD3 (ENSECAG00000037071) TRAF5 (ENSECAG00000007165) RCOR3 (ENSECAG00000013308) KCNH1 (ENSECAG00000000431) ENSECAG00000055405 ENSECAG00000060378 ENSECAG00000030219 HHAT (ENSECAG00000013905) SERTAD4 (ENSECAG00000015692) SYT14 (ENSECAG00000017972) UTP25 (ENSECAG00000022381) IRF6 (ENSECAG00000007482) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00860000134882 ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 Megabat MODERN SPECIES 5484 LPGAT1 (ENSPVAG00000011246) ##22 NEK2 (ENSPVAG00000011245) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000155656 ENSGT00940000157391 ENSGT00390000012703.a ENSGT01030000234625.B.c ENSGT00390000018676 ENSGT00720000108846.a ENSGT00390000001374 ENSGT00940000161120 ENSGT00940000162770 ENSGT00940000156376 ENSGT00940000162504 ENSGT00390000017528 ENSGT01030000234620.a.b.b.b ENSGT00530000064210 ENSGT00390000011724 ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 ENSGT00940000156989 ENSGT00940000156484.b ENSGT00390000002089.a.b ENSGT00940000160954 ENSGT00940000154196.b ENSGT00940000155793 ENSGT00530000063629.a ENSGT00530000063876.a ENSGT00940000159420 ENSGT00390000000709 ENSGT00940000157451 ENSGT00390000002240 ENSGT00940000160260 ENSGT00940000160097 ENSGT00390000005294 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 14 VASH2 (ENSRFEG00010014636) FLVCR1 (ENSRFEG00010015101) SPATA45 (ENSRFEG00010015162) TATDN3 (ENSRFEG00010015243) ENSRFEG00010015432 NSL1 (ENSRFEG00010015474) BATF3 (ENSRFEG00010015564) ENSRFEG00010015625 ATF3 (ENSRFEG00010015691) NENF (ENSRFEG00010015882) PACC1 (ENSRFEG00010015931) PPP2R5A (ENSRFEG00010015983) ENSRFEG00010016189 DTL (ENSRFEG00010016398) INTS7 (ENSRFEG00010016808) LPGAT1 (ENSRFEG00010016994) ##22 NEK2 (ENSRFEG00010017066) SLC30A1 (ENSRFEG00010017164) RD3 (ENSRFEG00010017212) TRAF5 (ENSRFEG00010017255) RCOR3 (ENSRFEG00010017308) KCNH1 (ENSRFEG00010017428) HHAT (ENSRFEG00010017513) SERTAD4 (ENSRFEG00010017836) SYT14 (ENSRFEG00010017864) UTP25 (ENSRFEG00010018023) IRF6 (ENSRFEG00010018083) C1orf74 (ENSRFEG00010018142) TRAF3IP3 (ENSRFEG00010018169) HSD11B1 (ENSRFEG00010018491) G0S2 (ENSRFEG00010018526) Microbat MODERN SPECIES 1002 RPS6KC1 (ENSMLUG00000002406) ANGEL2 (ENSMLUG00000002393) ENSMLUG00000002386 FLVCR1 (ENSMLUG00000009724) SPATA45 (ENSMLUG00000009716) TATDN3 (ENSMLUG00000009692) NSL1 (ENSMLUG00000009680) BATF3 (ENSMLUG00000025827) GARIN4 (ENSMLUG00000015054) ATF3 (ENSMLUG00000015048) ENSMLUG00000009603 PACC1 (ENSMLUG00000009572) PPP2R5A (ENSMLUG00000009549) DTL (ENSMLUG00000011353) INTS7 (ENSMLUG00000011317) LPGAT1 (ENSMLUG00000011302) ##22 ENSMLUG00000011281 SLC30A1 (ENSMLUG00000016166) ENSMLUG00000029402 TRAF5 (ENSMLUG00000008886) RCOR3 (ENSMLUG00000008866) KCNH1 (ENSMLUG00000015015) HHAT (ENSMLUG00000015008) SERTAD4 (ENSMLUG00000014998) SYT14 (ENSMLUG00000008259) UTP25 (ENSMLUG00000004515) IRF6 (ENSMLUG00000004509) C1orf74 (ENSMLUG00000004506) TRAF3IP3 (ENSMLUG00000004499) HSD11B1 (ENSMLUG00000004496) G0S2 (ENSMLUG00000004495) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 Hedgehog MODERN SPECIES 2339 LPGAT1 (ENSEEUG00000000990) ##22 Common shrew MODERN SPECIES 1719 LPGAT1 (ENSSARG00000002799) ##22 Platypus MODERN SPECIES 10 PROX1 (ENSOANG00000008518) RPS6KC1 (ENSOANG00000008515) ANGEL2 (ENSOANG00000008513) VASH2 (ENSOANG00000008512) FLVCR1 (ENSOANG00000008510) ENSOANG00000043660 TATDN3 (ENSOANG00000008509) NSL1 (ENSOANG00000049937) BATF3 (ENSOANG00000045778) PACC1 (ENSOANG00000037820) ATF3 (ENSOANG00000040285) ENSOANG00000008500 PPP2R5A (ENSOANG00000008492) DTL (ENSOANG00000008486) INTS7 (ENSOANG00000008482) LPGAT1 (ENSOANG00000008481) ##22 NEK2 (ENSOANG00000008480) SLC30A1 (ENSOANG00000008479) ENSOANG00000045447 RD3 (ENSOANG00000046905) TRAF5 (ENSOANG00000008477) RCOR3 (ENSOANG00000008476) KCNH1 (ENSOANG00000008475) HHAT (ENSOANG00000008473) SERTAD4 (ENSOANG00000008472) SYT14 (ENSOANG00000008471) UTP25 (ENSOANG00000008470) MRPS10 (ENSOANG00000046701) TRERF1 (ENSOANG00000008467) UBR2 (ENSOANG00000008465) PRPH2 (ENSOANG00000008464) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 Lamprey MODERN SPECIES 3284 lpgat1 (ENSPMAG00000005804) ##22 Hagfish MODERN SPECIES 1376 ENSEBUG00000014899 snw1 (ENSEBUG00000003160) dio2 (ENSEBUG00000016572) ppp5c (ENSEBUG00000010920) ENSEBUG00000010675 ENSEBUG00000001272 ENSEBUG00000007158 chac2 (ENSEBUG00000016237) glrx5 (ENSEBUG00000010332) ENSEBUG00000012369 PACC1 (ENSEBUG00000007937) ENSEBUG00000002366 ENSEBUG00000010748 lpgat1 (ENSEBUG00000011481) ##22 ENSEBUG00000010811 ENSEBUG00000014895 ENSEBUG00000008764 aspg (ENSEBUG00000010114) Ciona ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 Ciona intestinalis MODERN SPECIES 5 ENSCING00000020201 ENSCING00000001305 ENSCING00000017531 ENSCING00000002319 ENSCING00000014357 ENSCING00000002322 ENSCING00000014359 ENSCING00000014361 ENSCING00000017528 ENSCING00000021347 ENSCING00000002329 ENSCING00000014363 ENSCING00000021732 ENSCING00000002344 ENSCING00000014364 ENSCING00000020617 ##22 ENSCING00000016841 ENSCING00000024307 ENSCING00000019066 ENSCING00000020298 ENSCING00000014368 ENSCING00000014369 ENSCING00000014370 ENSCING00000002349 ENSCING00000014371 ENSCING00000002358 ENSCING00000014373 ENSCING00000014372 ENSCING00000010123 ENSCING00000018164 ENSCING00000002361 Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182836.b.a.b ##22 Caenorhabditis elegans DUPLICATION Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 5 E02C12.19 (WBGene00271797) E02C12.9 (WBGene00017094) E02C12.8 (WBGene00017093) E02C12.6 (WBGene00017092) gpa-3 (WBGene00001665) ttr-49 (WBGene00023485) ttr-40 (WBGene00017091) srx-46 (WBGene00005937) srx-47 (WBGene00005938) try-5 (WBGene00006623) K07B1.7 (WBGene00019467) tos-1 (WBGene00019466) coq-6 (WBGene00000766) ucp-4 (WBGene00006729) K07B1.4 (WBGene00019464) acl-14 (WBGene00019465) ##22 tag-153 (WBGene00006499) F44A2.7 (WBGene00018406) kvs-3 (WBGene00018402) F44A2.3 (WBGene00018403) nhr-39 (WBGene00018404) F44A2.5 (WBGene00018405) ZK682.7 (WBGene00022790) lron-2 (WBGene00022789) hlh-10 (WBGene00001954) slc-17.7 (WBGene00022788) nhr-36 (WBGene00017198) F07C3.16 (WBGene00202511) F07C3.9 (WBGene00017197) ptd-2 (WBGene00004211) str-94 (WBGene00006152) Caenorhabditis elegans DUPLICATION Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 6 glb-16 (WBGene00018486) dpy-7 (WBGene00001069) ceh-14 (WBGene00000438) F46C8.3 (WBGene00018485) F48E3.8 (WBGene00018607) lgc-11 (WBGene00000061) F48E3.6 (WBGene00018606) uggt-1 (WBGene00018604) F48E3.4 (WBGene00018605) F48E3.2 (WBGene00018603) gly-12 (WBGene00001637) F48E3.9 (WBGene00018608) mek-1 (WBGene00003185) coh-1 (WBGene00000591) sox-2 (WBGene00004949) acl-12 (WBGene00015295) ##22 C01C10.2 (WBGene00015294) clc-5 (WBGene00000526) clc-2 (WBGene00000523) mnm-2 (WBGene00003380) C10A4.9 (WBGene00045456) C10A4.1 (WBGene00015662) C10A4.7 (WBGene00015668) C10A4.2 (WBGene00015663) C10A4.3 (WBGene00015664) C10A4.4 (WBGene00015665) C10A4.10 (WBGene00050957) C10A4.13 (WBGene00206485) gad-2 (WBGene00015666) C10A4.6 (WBGene00015667) npr-8 (WBGene00016984) Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 3 best-22 (WBGene00013921) sec-24.2 (WBGene00004756) ccr-4 (WBGene00000376) ZC518.8 (WBGene00235129) wdr-46 (WBGene00009211) atz-1 (WBGene00009212) thn-1 (WBGene00009213) thn-2 (WBGene00009215) F28D1.6 (WBGene00009216) spe-45 (WBGene00009217) rps-23 (WBGene00004492) dpm-3 (WBGene00009219) acs-20 (WBGene00009218) gex-3 (WBGene00001580) dsb-1 (WBGene00008580) acl-13 (WBGene00008581) ##22 F08G5.3 (WBGene00008582) ugt-65 (WBGene00008583) col-130 (WBGene00000704) clec-184 (WBGene00023502) irg-4 (WBGene00008584) clec-185 (WBGene00007729) C25G4.17 (WBGene00255469) C25G4.2 (WBGene00007730) C25G4.3 (WBGene00007731) dpy-26 (WBGene00001085) spe-44 (WBGene00007732) smz-1 (WBGene00007733) C25G4.7 (WBGene00007734) C25G4.8 (WBGene00007735) igdb-2 (WBGene00007736)