Chordata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484 #22
Vertebrata	DUPLICATION
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b #22
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Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00390000004585	ENSGT00940000159665	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00940000157671	ENSGT00940000161139	ENSGT00390000011405	ENSGT00950000182767.a	ENSGT00940000170599	ENSGT00390000016465	ENSGT00390000006681	ENSGT00390000016736.b	ENSGT00940000157407	ENSGT00390000017147
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00390000004585	ENSGT00940000159665	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00940000157671	ENSGT00940000161139	ENSGT00390000011405	ENSGT00950000182767.a	ENSGT00940000170599	ENSGT00390000016465	ENSGT00390000006681	ENSGT00390000016736.b	ENSGT00940000157407	ENSGT00940000167009	ENSGT00390000017253
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00390000008171	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766
Theria	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Primates	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000154666.d.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00390000001347.vb.b.b	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.f	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000154666.d.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00390000001347.vb.b.b	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	139										ENSGT00390000017528.b #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00390000018018.tb #24	ENSGT00950000183172.A	ENSGT00940000154512.b	ENSGT00390000012669.fb	ENSGT00390000005767.b	ENSGT00390000011937	ENSGT00570000079101.a.b	ENSGT00940000159403	ENSGT00940000153472.a.a	ENSGT00940000153116.B	ENSGT00940000155578	ENSGT00910000147330	ENSGT00940000160241	ENSGT00940000162791
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1676									PACC1 (ENSRROG00000033809) #15	PPP2R5A (ENSRROG00000025443) #16	DTL (ENSRROG00000029896) #17	INTS7 (ENSRROG00000039254) #18	LPGAT1 (ENSRROG00000036627) #19	ENSRROG00000023261 #20	NEK2 (ENSRROG00000030544) #21	SLC30A1 (ENSRROG00000045714) #22	RD3 (ENSRROG00000041409) #23	ENSRROG00000033555 #24	ENSRROG00000000056 #25	TRAF5 (ENSRROG00000035255) #26	RCOR3 (ENSRROG00000040449) #27	KCNH1 (ENSRROG00000012202) #28	ENSRROG00000043551 #29
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1608										PPP2R5A (ENSRBIG00000038466) #16	DTL (ENSRBIG00000039793) #17	INTS7 (ENSRBIG00000029039) #18	LPGAT1 (ENSRBIG00000014571) #19	ENSRBIG00000029644 ##20	NEK2 (ENSRBIG00000028940) #21	SLC30A1 (ENSRBIG00000037622) #22	RD3 (ENSRBIG00000005095) #23	ENSRBIG00000032375 #24	TRAF5 (ENSRBIG00000028676) #26	RCOR3 (ENSRBIG00000010046) #27	ENSRBIG00000044233	ENSRBIG00000023591	KCNH1 (ENSRBIG00000039615) #28	ENSRBIG00000035378
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.f	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000154666.d.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00390000001347.vb.b.b	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	17	VASH2 (ENSCSAG00000015494)	FLVCR1 (ENSCSAG00000015440)	ENSCSAG00000015430	TATDN3 (ENSCSAG00000015424)	NSL1 (ENSCSAG00000015419)	BATF3 (ENSCSAG00000015412)	GARIN4 (ENSCSAG00000000263)	ATF3 (ENSCSAG00000015405)	NENF (ENSCSAG00000015395)	PACC1 (ENSCSAG00000015392) #15	PPP2R5A (ENSCSAG00000015387) #16	DTL (ENSCSAG00000015380) #17	INTS7 (ENSCSAG00000015377) #18	LPGAT1 (ENSCSAG00000015369) #19	NEK2 (ENSCSAG00000015362) #21	SLC30A1 (ENSCSAG00000015358) #22	RD3 (ENSCSAG00000015354) #23	ENSCSAG00000015348	TRAF5 (ENSCSAG00000015311) #26	RCOR3 (ENSCSAG00000015305) #27	ENSCSAG00000000262	KCNH1 (ENSCSAG00000015297) #28	HHAT (ENSCSAG00000015291)	SERTAD4 (ENSCSAG00000015282)	SYT14 (ENSCSAG00000015278)	UTP25 (ENSCSAG00000015271)	IRF6 (ENSCSAG00000015263)	C1orf74 (ENSCSAG00000000261)	TRAF3IP3 (ENSCSAG00000015258)	HSD11B1 (ENSCSAG00000015252)	G0S2 (ENSCSAG00000015250)
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.f	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Macaca	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.f	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.f	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.b.a.a.a.a.a.a.a.b.b.a.b.b.b.b.b.a.a.a.b.a.a.b.a	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Rhesus	MODERN SPECIES		ENSMMUG00000051591	TATDN3 (ENSMMUG00000031430)	NSL1 (ENSMMUG00000019287)	BATF3 (ENSMMUG00000015056)	GARIN4 (ENSMMUG00000052576)	ATF3 (ENSMMUG00000012185)	NENF (ENSMMUG00000002142)	PACC1 (ENSMMUG00000002141) #15	PPP2R5A (ENSMMUG00000019771) #16	DTL (ENSMMUG00000010176) #17	INTS7 (ENSMMUG00000010174) #18	LPGAT1 (ENSMMUG00000020560) #19	NEK2 (ENSMMUG00000005216) #21	ENSMMUG00000054466	ENSMMUG00000000868	SLC30A1 (ENSMMUG00000056449) #22	ENSMMUG00000053531	RD3 (ENSMMUG00000057510) #23	TRAF5 (ENSMMUG00000031427) #26	ENSMMUG00000064326	RCOR3 (ENSMMUG00000020383) #27	ENSMMUG00000052871	KCNH1 (ENSMMUG00000016102) #28	HHAT (ENSMMUG00000016099)	SERTAD4 (ENSMMUG00000009967)	SYT14 (ENSMMUG00000016349)	UTP25 (ENSMMUG00000022066)	IRF6 (ENSMMUG00000022065)	C1H1orf74 (ENSMMUG00000063359)	TRAF3IP3 (ENSMMUG00000022062)	HSD11B1 (ENSMMUG00000059587)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES		TATDN3 (ENSMFAG00000041006)	NSL1 (ENSMFAG00000042309)	ENSMFAG00000031859	GARIN4 (ENSMFAG00000001230)	ENSMFAG00000033392	ENSMFAG00000058853	NENF (ENSMFAG00000061910)	PACC1 (ENSMFAG00000042534) #15	ENSMFAG00000065004	PPP2R5A (ENSMFAG00000034643) #16	DTL (ENSMFAG00000045273) #17	INTS7 (ENSMFAG00000034220) #18	ENSMFAG00000053520	LPGAT1 (ENSMFAG00000001051) #19	NEK2 (ENSMFAG00000041966) #21	SLC30A1 (ENSMFAG00000039946) #22	RD3 (ENSMFAG00000062628) #23	TRAF5 (ENSMFAG00000040124) #26	ENSMFAG00000047969	RCOR3 (ENSMFAG00000000464) #27	KCNH1 (ENSMFAG00000000121) #28	HHAT (ENSMFAG00000003760)	ENSMFAG00000053350	SERTAD4 (ENSMFAG00000056663)	SYT14 (ENSMFAG00000036849)	UTP25 (ENSMFAG00000001353)	IRF6 (ENSMFAG00000033961)	C1orf74 (ENSMFAG00000030051)	TRAF3IP3 (ENSMFAG00000003810)	HSD11B1 (ENSMFAG00000036386)	G0S2 (ENSMFAG00000024733)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	204	ANGEL2 (ENSMNEG00000027131)	VASH2 (ENSMNEG00000020215)	FLVCR1 (ENSMNEG00000029472)	TATDN3 (ENSMNEG00000033507)	NSL1 (ENSMNEG00000034616)	ENSMNEG00000021942	BATF3 (ENSMNEG00000012965)	ATF3 (ENSMNEG00000044528)	NENF (ENSMNEG00000036836)	PACC1 (ENSMNEG00000040751) #15	PPP2R5A (ENSMNEG00000044046) #16	DTL (ENSMNEG00000029309) #17	INTS7 (ENSMNEG00000031972) #18	LPGAT1 (ENSMNEG00000038962) #19	NEK2 (ENSMNEG00000028653) #21	SLC30A1 (ENSMNEG00000045198) #22	RD3 (ENSMNEG00000035032) #23	ENSMNEG00000039735 #24	TRAF5 (ENSMNEG00000039191) #26	RCOR3 (ENSMNEG00000028882) #27	HTR3A (ENSMNEG00000031796)	HTR3B (ENSMNEG00000031591)	USP28 (ENSMNEG00000043630)	ZW10 (ENSMNEG00000027148)	ENSMNEG00000043213	TMPRSS5 (ENSMNEG00000033735)	DRD2 (ENSMNEG00000041852)	ANKK1 (ENSMNEG00000038963)	TTC12 (ENSMNEG00000032462)	NCAM1 (ENSMNEG00000037984)	ENSMNEG00000029485
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.f	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Olive baboon	MODERN SPECIES		ENSPANG00000037410	ENSPANG00000044876	BATF3 (ENSPANG00000046484)	GARIN4 (ENSPANG00000008984)	ATF3 (ENSPANG00000021687)	NENF (ENSPANG00000007781)	ENSPANG00000039397	PACC1 (ENSPANG00000007782) #15	PPP2R5A (ENSPANG00000016373) #16	DTL (ENSPANG00000016819) #17	INTS7 (ENSPANG00000004475) #18	ENSPANG00000040809	LPGAT1 (ENSPANG00000009885) #19	NEK2 (ENSPANG00000005932) #21	ENSPANG00000015346	SLC30A1 (ENSPANG00000047623) #22	RD3 (ENSPANG00000045503) #23	TRAF5 (ENSPANG00000012288) #26	RCOR3 (ENSPANG00000026077) #27	ENSPANG00000048243	KCNH1 (ENSPANG00000014604) #28	HHAT (ENSPANG00000001254)	SERTAD4 (ENSPANG00000001255)	SYT14 (ENSPANG00000020300)	UTP25 (ENSPANG00000011483)	IRF6 (ENSPANG00000011328)	C1orf74 (ENSPANG00000000320)	TRAF3IP3 (ENSPANG00000001376)	HSD11B1 (ENSPANG00000018823)	LAMB3 (ENSPANG00000024004)	CAMK1G (ENSPANG00000016717)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	67	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.f	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00940000154666.d.b	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Drill	MODERN SPECIES	541						ENSMLEG00000013581	BATF3 (ENSMLEG00000012036)	ATF3 (ENSMLEG00000016166)	ENSMLEG00000036972	PACC1 (ENSMLEG00000041089) #15	PPP2R5A (ENSMLEG00000028053) #16	DTL (ENSMLEG00000033216) #17	INTS7 (ENSMLEG00000028363) #18	LPGAT1 (ENSMLEG00000035548) #19	NEK2 (ENSMLEG00000042663) #21	SLC30A1 (ENSMLEG00000039125) #22	RD3 (ENSMLEG00000029087) #23	TRAF5 (ENSMLEG00000041032) #26	RCOR3 (ENSMLEG00000041034) #27	ENSMLEG00000044230	KCNH1 (ENSMLEG00000035002) #28	ENSMLEG00000042453	HHAT (ENSMLEG00000043074)	ENSMLEG00000022837	SERTAD4 (ENSMLEG00000040039)	SYT14 (ENSMLEG00000034919)	UTP25 (ENSMLEG00000037539)	IRF6 (ENSMLEG00000002414)	C1orf74 (ENSMLEG00000025825)	TRAF3IP3 (ENSMLEG00000044307)	HSD11B1 (ENSMLEG00000030597)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	513	ANGEL2 (ENSCATG00000031702)	VASH2 (ENSCATG00000042912)	FLVCR1 (ENSCATG00000040192)	SPATA45 (ENSCATG00000015825)	TATDN3 (ENSCATG00000045213)	NSL1 (ENSCATG00000045286)	BATF3 (ENSCATG00000037195)	ATF3 (ENSCATG00000037360)	NENF (ENSCATG00000044551)	PACC1 (ENSCATG00000012633) #15	PPP2R5A (ENSCATG00000045120) #16	DTL (ENSCATG00000040087) #17	INTS7 (ENSCATG00000034492) #18	LPGAT1 (ENSCATG00000030005) #19	NEK2 (ENSCATG00000008240) #21	SLC30A1 (ENSCATG00000012887) #22	RD3 (ENSCATG00000036854) #23	ENSCATG00000020661 #24	TRAF5 (ENSCATG00000041513) #26	RCOR3 (ENSCATG00000040462) #27	ENSCATG00000041313	KCNH1 (ENSCATG00000040059) #28	ENSCATG00000041099	HHAT (ENSCATG00000033754)	SERTAD4 (ENSCATG00000029809)	SYT14 (ENSCATG00000039035)	UTP25 (ENSCATG00000040125)	IRF6 (ENSCATG00000039683)	C1orf74 (ENSCATG00000014920)	TRAF3IP3 (ENSCATG00000031459)	HSD11B1 (ENSCATG00000042915)
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989.a #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000154666.d.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00390000001347.vb.b.b	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097
Gibbon	MODERN SPECIES	20	TTC4 (ENSNLEG00000003044)	PARS2 (ENSNLEG00000003040)	SPATA45 (ENSNLEG00000018668)	TATDN3 (ENSNLEG00000002972)	NSL1 (ENSNLEG00000002951)	BATF3 (ENSNLEG00000035858)	ATF3 (ENSNLEG00000002916)	NENF (ENSNLEG00000029503)	PACC1 (ENSNLEG00000002853) #15	PPP2R5A (ENSNLEG00000002787) #16	ENSNLEG00000028464	DTL (ENSNLEG00000002775) #17	INTS7 (ENSNLEG00000002662) #18	LPGAT1 (ENSNLEG00000028666) #19	NEK2 (ENSNLEG00000002587) #21	SLC30A1 (ENSNLEG00000002583) #22	RD3 (ENSNLEG00000030459) #23	TRAF5 (ENSNLEG00000002534) #26	RCOR3 (ENSNLEG00000002428) #27	ENSNLEG00000032185	ENSNLEG00000033303	KCNH1 (ENSNLEG00000002388) #28	HHAT (ENSNLEG00000002205)	ENSNLEG00000033497	SERTAD4 (ENSNLEG00000030774)	ENSNLEG00000002083	UTP25 (ENSNLEG00000002020)	IRF6 (ENSNLEG00000001962)	C1orf74 (ENSNLEG00000001955)	TRAF3IP3 (ENSNLEG00000001747)	HSD11B1 (ENSNLEG00000001713)
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989.a #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000154666.d.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Orangutan	MODERN SPECIES		FLVCR1 (ENSPPYG00000000229)	SPATA45 (ENSPPYG00000000231)	TATDN3 (ENSPPYG00000000232)	NSL1 (ENSPPYG00000000233)	BATF3 (ENSPPYG00000000234)	GARIN4 (ENSPPYG00000040057)	ATF3 (ENSPPYG00000000235)	NENF (ENSPPYG00000000236)	PACC1 (ENSPPYG00000029432) #15	PPP2R5A (ENSPPYG00000000237) #16	ENSPPYG00000011541	DTL (ENSPPYG00000000238) #17	INTS7 (ENSPPYG00000000239) #18	ENSPPYG00000000240 #19	NEK2 (ENSPPYG00000000241) #21	SLC30A1 (ENSPPYG00000032496) #22	RD3 (ENSPPYG00000000243) #23	ENSPPYG00000011112 #24	TRAF5 (ENSPPYG00000000244) #26	RCOR3 (ENSPPYG00000000245) #27	KCNH1 (ENSPPYG00000000247) #28	HHAT (ENSPPYG00000000248)	SERTAD4 (ENSPPYG00000037342)	ENSPPYG00000000251	UTP25 (ENSPPYG00000000252)	IRF6 (ENSPPYG00000000253)	C1H1orf74 (ENSPPYG00000000255)	TRAF3IP3 (ENSPPYG00000040196)	HSD11B1 (ENSPPYG00000000256)	G0S2 (ENSPPYG00000000257)	LAMB3 (ENSPPYG00000000258)
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00950000182901.a.a.b.a.a	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989.a #21	ENSGT00900000141074.e.a.b.b.a	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000154666.d.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00950000182901.a.a.b.a.a	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989.a #21	ENSGT00900000141074.e.a.b.b.a	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Pan	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00950000182901.a.a.b.a.a	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989.a #21	ENSGT00900000141074.e.a.b.b.a	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000004856.w.a.a.b.b.a.a	ENSGT00940000154666.c	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Chimpanzee	MODERN SPECIES		ENSPTRG00000001967	TATDN3 (ENSPTRG00000030168)	NSL1 (ENSPTRG00000001966)	BATF3 (ENSPTRG00000001965)	GARIN4 (ENSPTRG00000001964)	ATF3 (ENSPTRG00000001962)	NENF (ENSPTRG00000001961)	PACC1 (ENSPTRG00000001960) #15	ENSPTRG00000029329	PPP2R5A (ENSPTRG00000001958) #16	DTL (ENSPTRG00000001956) #17	INTS7 (ENSPTRG00000001955) #18	LPGAT1 (ENSPTRG00000001954) #19	ENSPTRG00000050852	NEK2 (ENSPTRG00000001953) #21	SLC30A1 (ENSPTRG00000049467) #22	RD3 (ENSPTRG00000001951) #23	ENSPTRG00000045429 #24	TRAF5 (ENSPTRG00000001949) #26	RCOR3 (ENSPTRG00000001948) #27	ENSPTRG00000049116	ENSPTRG00000044803	KCNH1 (ENSPTRG00000001946) #28	HHAT (ENSPTRG00000001945)	SERTAD4 (ENSPTRG00000046911)	SYT14 (ENSPTRG00000001943)	UTP25 (ENSPTRG00000001942)	IRF6 (ENSPTRG00000001941)	C1H1orf74 (ENSPTRG00000001940)	TRAF3IP3 (ENSPTRG00000001939)	HSD11B1 (ENSPTRG00000001938)
Bonobo	MODERN SPECIES		SPATA45 (ENSPPAG00000034742)	TATDN3 (ENSPPAG00000036534)	NSL1 (ENSPPAG00000002209)	BATF3 (ENSPPAG00000028294)	GARIN4 (ENSPPAG00000013681)	ATF3 (ENSPPAG00000029919)	ENSPPAG00000040317	PACC1 (ENSPPAG00000027044) #15	ENSPPAG00000029595	PPP2R5A (ENSPPAG00000015631) #16	DTL (ENSPPAG00000030472) #17	INTS7 (ENSPPAG00000043208) #18	LPGAT1 (ENSPPAG00000034252) #19	NEK2 (ENSPPAG00000034163) #21	ENSPPAG00000040694	ENSPPAG00000042308 #22	RD3 (ENSPPAG00000038952) #23	ENSPPAG00000002161 #24	TRAF5 (ENSPPAG00000030959) #26	RCOR3 (ENSPPAG00000035122) #27	ENSPPAG00000043928	ENSPPAG00000042260	KCNH1 (ENSPPAG00000042648) #28	HHAT (ENSPPAG00000042196)	SERTAD4 (ENSPPAG00000037327)	ENSPPAG00000030614	UTP25 (ENSPPAG00000043680)	IRF6 (ENSPPAG00000032756)	C1orf74 (ENSPPAG00000021693)	TRAF3IP3 (ENSPPAG00000035769)	HSD11B1 (ENSPPAG00000043176)
Human	MODERN SPECIES		VASH2 (ENSG00000143494)	FLVCR1 (ENSG00000162769)	SPATA45 (ENSG00000185523)	TATDN3 (ENSG00000203705)	NSL1 (ENSG00000117697)	BATF3 (ENSG00000123685)	GARIN4 (ENSG00000162771)	ATF3 (ENSG00000162772)	NENF (ENSG00000117691)	PACC1 (ENSG00000065600) #15	PPP2R5A (ENSG00000066027) #16	DTL (ENSG00000143476) #17	INTS7 (ENSG00000143493) #18	LPGAT1 (ENSG00000123684) #19	NEK2 (ENSG00000117650) #21	SLC30A1 (ENSG00000170385) #22	RD3 (ENSG00000198570) #23	TRAF5 (ENSG00000082512) #26	RCOR3 (ENSG00000117625) #27	ENSG00000283952	KCNH1 (ENSG00000143473) #28	HHAT (ENSG00000054392)	SERTAD4 (ENSG00000082497)	SYT14 (ENSG00000143469)	UTP25 (ENSG00000117597)	IRF6 (ENSG00000117595)	ENSG00000289700	C1orf74 (ENSG00000162757)	TRAF3IP3 (ENSG00000009790)	HSD11B1 (ENSG00000117594)	G0S2 (ENSG00000123689)
Gorilla	MODERN SPECIES		SPATA45 (ENSGGOG00000037749)	TATDN3 (ENSGGOG00000027473)	NSL1 (ENSGGOG00000003473)	BATF3 (ENSGGOG00000042619)	GARIN4 (ENSGGOG00000002765)	ATF3 (ENSGGOG00000014206)	NENF (ENSGGOG00000025197)	PACC1 (ENSGGOG00000008925) #15	ENSGGOG00000025513	PPP2R5A (ENSGGOG00000014986) #16	DTL (ENSGGOG00000012154) #17	INTS7 (ENSGGOG00000012133) #18	LPGAT1 (ENSGGOG00000040931) #19	ENSGGOG00000039680	NEK2 (ENSGGOG00000005439) #21	ENSGGOG00000026199 #22	RD3 (ENSGGOG00000004384) #23	TRAF5 (ENSGGOG00000012794) #26	RCOR3 (ENSGGOG00000008610) #27	ENSGGOG00000027704	ENSGGOG00000026484	KCNH1 (ENSGGOG00000034927) #28	HHAT (ENSGGOG00000040724)	SERTAD4 (ENSGGOG00000013792)	ENSGGOG00000026680	UTP25 (ENSGGOG00000006217)	IRF6 (ENSGGOG00000006214)	C1orf74 (ENSGGOG00000006210)	TRAF3IP3 (ENSGGOG00000006197)	HSD11B1 (ENSGGOG00000006192)	G0S2 (ENSGGOG00000040132)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872	ENSGT01050000244850.C.b
Capuchin	MODERN SPECIES	38	ENSCCAG00000025916	ENSCCAG00000036863	ENSCCAG00000026377	NSL1 (ENSCCAG00000027522)	BATF3 (ENSCCAG00000014441)	FAM71A (ENSCCAG00000027975)	ATF3 (ENSCCAG00000033084)	NENF (ENSCCAG00000020239)	PACC1 (ENSCCAG00000025595) #15	PPP2R5A (ENSCCAG00000027109) #16	DTL (ENSCCAG00000033276) #17	INTS7 (ENSCCAG00000018548) #18	ENSCCAG00000033361	LPGAT1 (ENSCCAG00000033798) #19	NEK2 (ENSCCAG00000030464) #21	SLC30A1 (ENSCCAG00000024546) #22	RD3 (ENSCCAG00000026634) #23	ENSCCAG00000034878	TRAF5 (ENSCCAG00000037715) #26	RCOR3 (ENSCCAG00000028558) #27	ENSCCAG00000011709	KCNH1 (ENSCCAG00000027676) #28	HHAT (ENSCCAG00000029174)	SERTAD4 (ENSCCAG00000032361)	ENSCCAG00000024990	SYT14 (ENSCCAG00000038093)	ENSCCAG00000022724	UTP25 (ENSCCAG00000036745)	IRF6 (ENSCCAG00000021079)	C1orf74 (ENSCCAG00000019533)	TRAF3IP3 (ENSCCAG00000037546)
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	79	ANGEL2 (ENSSBOG00000023625)	VASH2 (ENSSBOG00000003716)	FLVCR1 (ENSSBOG00000034630)	TATDN3 (ENSSBOG00000026391)	SPATA45 (ENSSBOG00000031495)	NSL1 (ENSSBOG00000018022)	BATF3 (ENSSBOG00000028690)	ATF3 (ENSSBOG00000030879)	ENSSBOG00000031457	PACC1 (ENSSBOG00000022283) #15	PPP2R5A (ENSSBOG00000031243) #16	DTL (ENSSBOG00000020769) #17	INTS7 (ENSSBOG00000023687) #18	LPGAT1 (ENSSBOG00000034328) #19	NEK2 (ENSSBOG00000034232) #21	SLC30A1 (ENSSBOG00000023733) #22	RD3 (ENSSBOG00000034844) #23	ENSSBOG00000020190	TRAF5 (ENSSBOG00000027194) #26	RCOR3 (ENSSBOG00000015131) #27	ENSSBOG00000035382	KCNH1 (ENSSBOG00000032494) #28	ENSSBOG00000020043	HHAT (ENSSBOG00000035340)	ENSSBOG00000020597	ENSSBOG00000026679	SERTAD4 (ENSSBOG00000035607)	ENSSBOG00000026801	SYT14 (ENSSBOG00000029111)	UTP25 (ENSSBOG00000022281)	IRF6 (ENSSBOG00000003627)
Marmoset	MODERN SPECIES	10	HHAT (ENSCJAG00000000310)	KCNH1 (ENSCJAG00000038943) #28	RCOR3 (ENSCJAG00000000282) #27	TRAF5 (ENSCJAG00000000257) #26	ENSCJAG00000015904	RD3 (ENSCJAG00000074339) #23	ENSCJAG00000070569	PACC1 (ENSCJAG00000015742) #15	PPP2R5A (ENSCJAG00000015748) #16	ENSCJAG00000072106	DTL (ENSCJAG00000015774) #17	INTS7 (ENSCJAG00000015814) #18	ENSCJAG00000085462	LPGAT1 (ENSCJAG00000015870) #19	NEK2 (ENSCJAG00000015883) #21	SLC30A1 (ENSCJAG00000015892) #22	ENSCJAG00000082707	ENSCJAG00000015738	ENSCJAG00000087037	ATF3 (ENSCJAG00000047183)	BATF3 (ENSCJAG00000077626)	NSL1 (ENSCJAG00000015718)	TATDN3 (ENSCJAG00000015712)	SPATA45 (ENSCJAG00000015706)	FLVCR1 (ENSCJAG00000015690)	VASH2 (ENSCJAG00000042796)	ANGEL2 (ENSCJAG00000015618)	ENSCJAG00000080375	RPS6KC1 (ENSCJAG00000015526)	ENSCJAG00000075052	PROX1 (ENSCJAG00000015514)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	958	VASH2 (ENSANAG00000032216)	FLVCR1 (ENSANAG00000029598)	ENSANAG00000036696	TATDN3 (ENSANAG00000034556)	NSL1 (ENSANAG00000034470)	BATF3 (ENSANAG00000036250)	ATF3 (ENSANAG00000037037)	NENF (ENSANAG00000028745)	PACC1 (ENSANAG00000035062) #15	PPP2R5A (ENSANAG00000030090) #16	DTL (ENSANAG00000034442) #17	INTS7 (ENSANAG00000036266) #18	ENSANAG00000016648	LPGAT1 (ENSANAG00000029780) #19	NEK2 (ENSANAG00000034853) #21	SLC30A1 (ENSANAG00000034176) #22	RD3 (ENSANAG00000034784) #23	ASPM (ENSANAG00000026812)	ZBTB41 (ENSANAG00000037287)	ENSANAG00000037639	CRB1 (ENSANAG00000037265)	DENND1B (ENSANAG00000036867)	ENSANAG00000037198	C1orf53 (ENSANAG00000020587)	LHX9 (ENSANAG00000037654)	ENSANAG00000034881	NEK7 (ENSANAG00000025514)	ATP6V1G3 (ENSANAG00000024122)	PTPRC (ENSANAG00000020442)	ENSANAG00000037698	ENSANAG00000020364
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c.m	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT01030000234625.B.c.m	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234625.B.c.m	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	136	VASH2 (ENSPCOG00000018323)	FLVCR1 (ENSPCOG00000023146)	SPATA45 (ENSPCOG00000011584)	ENSPCOG00000013500	NSL1 (ENSPCOG00000023360)	BATF3 (ENSPCOG00000020309)	GARIN4 (ENSPCOG00000023922)	ATF3 (ENSPCOG00000014411)	ENSPCOG00000025541	PACC1 (ENSPCOG00000019194) #15	PPP2R5A (ENSPCOG00000023720) #16	DTL (ENSPCOG00000023467) #17	ENSPCOG00000017872	LPGAT1 (ENSPCOG00000015306) #19	NEK2 (ENSPCOG00000017389) #21	SLC30A1 (ENSPCOG00000015383) #22	RD3 (ENSPCOG00000024826) #23	TRAF5 (ENSPCOG00000028307) #26	ENSPCOG00000026914	KCNH1 (ENSPCOG00000020124) #28	HHAT (ENSPCOG00000016561)	SERTAD4 (ENSPCOG00000022803)	SYT14 (ENSPCOG00000023091)	UTP25 (ENSPCOG00000012806)	IRF6 (ENSPCOG00000019062)	TRAF3IP3 (ENSPCOG00000010555)	HSD11B1 (ENSPCOG00000021680)	LAMB3 (ENSPCOG00000016013)	CAMK1G (ENSPCOG00000025846)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	542	FLVCR1 (ENSPSMG00000024687)	SPATA45 (ENSPSMG00000024684)	TATDN3 (ENSPSMG00000024676)	NSL1 (ENSPSMG00000024661)	BATF3 (ENSPSMG00000024644)	ENSPSMG00000024639	ATF3 (ENSPSMG00000024632)	NENF (ENSPSMG00000024628)	PACC1 (ENSPSMG00000024623) #15	PPP2R5A (ENSPSMG00000024611) #16	DTL (ENSPSMG00000024600) #17	INTS7 (ENSPSMG00000024557) #18	LPGAT1 (ENSPSMG00000024513) #19	NEK2 (ENSPSMG00000024505) #21	ENSPSMG00000024497	SLC30A1 (ENSPSMG00000024492) #22	RD3 (ENSPSMG00000024485) #23	ENSPSMG00000024481	TRAF5 (ENSPSMG00000024478) #26	ENSPSMG00000024466	RCOR3 (ENSPSMG00000024461) #27	ENSPSMG00000024436	KCNH1 (ENSPSMG00000024429) #28	HHAT (ENSPSMG00000024393)	SERTAD4 (ENSPSMG00000024348)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	19	ANGEL2 (ENSMICG00000014726)	VASH2 (ENSMICG00000014703)	FLVCR1 (ENSMICG00000027099)	TATDN3 (ENSMICG00000014664)	NSL1 (ENSMICG00000037746)	BATF3 (ENSMICG00000027907)	GARIN4 (ENSMICG00000037119)	ATF3 (ENSMICG00000033583)	NENF (ENSMICG00000028060)	PACC1 (ENSMICG00000015461) #15	PPP2R5A (ENSMICG00000015435) #16	DTL (ENSMICG00000015416) #17	INTS7 (ENSMICG00000015396) #18	LPGAT1 (ENSMICG00000007842) #19	NEK2 (ENSMICG00000007833) #21	SLC30A1 (ENSMICG00000034511) #22	RD3 (ENSMICG00000000426) #23	ENSMICG00000043120	TRAF5 (ENSMICG00000010432) #26	RCOR3 (ENSMICG00000010429) #27	ENSMICG00000028409	KCNH1 (ENSMICG00000017331) #28	HHAT (ENSMICG00000017324)	SERTAD4 (ENSMICG00000031959)	SYT14 (ENSMICG00000001258)	UTP25 (ENSMICG00000001242)	IRF6 (ENSMICG00000001233)	TRAF3IP3 (ENSMICG00000001216)	HSD11B1 (ENSMICG00000001213)	LAMB3 (ENSMICG00000001196)	CAMK1G (ENSMICG00000001192)
Bushbaby	MODERN SPECIES	293	ANGEL2 (ENSOGAG00000000276)	VASH2 (ENSOGAG00000000274)	FLVCR1 (ENSOGAG00000000271)	TATDN3 (ENSOGAG00000024369)	NSL1 (ENSOGAG00000028889)	BATF3 (ENSOGAG00000008684)	GARIN4 (ENSOGAG00000034742)	ATF3 (ENSOGAG00000005803)	ENSOGAG00000014684	PACC1 (ENSOGAG00000014681) #15	PPP2R5A (ENSOGAG00000009023) #16	DTL (ENSOGAG00000000071) #17	INTS7 (ENSOGAG00000000069) #18	LPGAT1 (ENSOGAG00000000081) #19	NEK2 (ENSOGAG00000000080) #21	SLC30A1 (ENSOGAG00000027345) #22	RD3 (ENSOGAG00000000079) #23	TRAF5 (ENSOGAG00000005638) #26	RCOR3 (ENSOGAG00000005633) #27	KCNH1 (ENSOGAG00000006555) #28	HHAT (ENSOGAG00000006551)	SERTAD4 (ENSOGAG00000006546)	ENSOGAG00000027111	SYT14 (ENSOGAG00000006543)	UTP25 (ENSOGAG00000010710)	IRF6 (ENSOGAG00000010708)	C1orf74 (ENSOGAG00000010706)	TRAF3IP3 (ENSOGAG00000010700)	HSD11B1 (ENSOGAG00000027828)	G0S2 (ENSOGAG00000029349)	LAMB3 (ENSOGAG00000032977)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Tree shrew	MODERN SPECIES	8527																SLC30A1 (ENSTBEG00000000174) #22
Glires	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Rabbit	MODERN SPECIES	7	VASH2 (ENSOCUG00000008579)	FLVCR1 (ENSOCUG00000004804)	SPATA45 (ENSOCUG00000004799)	ENSOCUG00000004792	NSL1 (ENSOCUG00000004789)	GARIN4 (ENSOCUG00000017415)	ATF3 (ENSOCUG00000017424)	PACC1 (ENSOCUG00000009061) #15	NENF (ENSOCUG00000010810)	PPP2R5A (ENSOCUG00000017572) #16	ENSOCUG00000023322	DTL (ENSOCUG00000000437) #17	INTS7 (ENSOCUG00000004204) #18	LPGAT1 (ENSOCUG00000004201) #19	NEK2 (ENSOCUG00000009715) #21	SLC30A1 (ENSOCUG00000012398) #22	ENSOCUG00000004603 #23	TRAF5 (ENSOCUG00000009132) #26	RCOR3 (ENSOCUG00000009121) #27	KCNH1 (ENSOCUG00000000657) #28	ENSOCUG00000030106	HHAT (ENSOCUG00000000655)	ENSOCUG00000012833	UTP25 (ENSOCUG00000004040)	IRF6 (ENSOCUG00000004035)	C1orf74 (ENSOCUG00000004033)	TRAF3IP3 (ENSOCUG00000004027)	HSD11B1 (ENSOCUG00000004024)	G0S2 (ENSOCUG00000004023)	LAMB3 (ENSOCUG00000004013)	CAMK1G (ENSOCUG00000003999)
Pika	MODERN SPECIES	4722															ENSOPRG00000009102 #21	SLC30A1 (ENSOPRG00000009088) #22	RD3 (ENSOPRG00000009083) #23	ENSOPRG00000009061 #26
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	345	Vash2 (ENSDORG00000000751)	Flvcr1 (ENSDORG00000002942)	Spata45 (ENSDORG00000014481)	Tatdn3 (ENSDORG00000014148)	Nsl1 (ENSDORG00000028451)	Batf3 (ENSDORG00000025907)	Garin4 (ENSDORG00000006027)	Atf3 (ENSDORG00000025141)	Nenf (ENSDORG00000027260)	Pacc1 (ENSDORG00000007633) #15	Ppp2r5a (ENSDORG00000007631) #16	Dtl (ENSDORG00000004346) #17	Ints7 (ENSDORG00000004343) #18	Lpgat1 (ENSDORG00000025440) #19	Nek2 (ENSDORG00000030036) #21	Slc30a1 (ENSDORG00000028201) #22	Rd3 (ENSDORG00000006538) #23	Traf5 (ENSDORG00000006546) #26	Rcor3 (ENSDORG00000012726) #27	ENSDORG00000030102	Kcnh1 (ENSDORG00000005642) #28	Hhat (ENSDORG00000016124)	Sertad4 (ENSDORG00000026519)	Syt14 (ENSDORG00000010099)	Utp25 (ENSDORG00000008892)	Irf6 (ENSDORG00000008891)	A130010J15Rik (ENSDORG00000008890)	ENSDORG00000028685	ENSDORG00000008886	Hsd11b1 (ENSDORG00000028793)	Lamb3 (ENSDORG00000003991)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Prairie vole	MODERN SPECIES	14	Flvcr1 (ENSMOCG00000013229)	Spata45 (ENSMOCG00000017094)	Tatdn3 (ENSMOCG00000019831)	Nsl1 (ENSMOCG00000020317)	Batf3 (ENSMOCG00000020540)	Garin4 (ENSMOCG00000017084)	Atf3 (ENSMOCG00000019538)	Nenf (ENSMOCG00000010741)	Pacc1 (ENSMOCG00000015297) #15	Ppp2r5a (ENSMOCG00000018187) #16	ENSMOCG00000021658 #17	Ints7 (ENSMOCG00000015050) #18	Lpgat1 (ENSMOCG00000016824) #19	Nek2 (ENSMOCG00000012191) #21	ENSMOCG00000015595	ENSMOCG00000007231 #22	Rd3 (ENSMOCG00000015661) #23	Traf5 (ENSMOCG00000017302) #26	Rcor3 (ENSMOCG00000009813) #27	Kcnh1 (ENSMOCG00000001718) #28	Hhat (ENSMOCG00000017999)	Sertad4 (ENSMOCG00000021162)	Syt14 (ENSMOCG00000000936)	Utp25 (ENSMOCG00000018890)	Irf6 (ENSMOCG00000016987)	A130010J15Rik (ENSMOCG00000003288)	Traf3ip3 (ENSMOCG00000010371)	Hsd11b1 (ENSMOCG00000002294)	G0s2 (ENSMOCG00000002733)	Lamb3 (ENSMOCG00000016300)	Camk1g (ENSMOCG00000018302)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	2	Flvcr1 (ENSPEMG00000014742)	Spata45 (ENSPEMG00000015887)	Tatdn3 (ENSPEMG00000016778)	Nsl1 (ENSPEMG00000001946)	Batf3 (ENSPEMG00000007835)	ENSPEMG00000029759	Garin4 (ENSPEMG00000027162)	ENSPEMG00000024914	Nenf (ENSPEMG00000004190)	Ppp2r5a (ENSPEMG00000007353) #16	Dtl (ENSPEMG00000009566) #17	Ints7 (ENSPEMG00000014500) #18	Lpgat1 (ENSPEMG00000016230) #19	Nek2 (ENSPEMG00000011480) #21	ENSPEMG00000031137	Slc30a1 (ENSPEMG00000002874) #22	Rd3 (ENSPEMG00000020626) #23	Traf5 (ENSPEMG00000022373) #26	Rcor3 (ENSPEMG00000007457) #27	Kcnh1 (ENSPEMG00000010427) #28	Hhat (ENSPEMG00000001916)	Sertad4 (ENSPEMG00000010470)	Syt14 (ENSPEMG00000000255)	ENSPEMG00000029864	Utp25 (ENSPEMG00000000712)	Irf6 (ENSPEMG00000020332)	A130010J15Rik (ENSPEMG00000022277)	Traf3ip3 (ENSPEMG00000021211)	Hsd11b1 (ENSPEMG00000009872)	G0s2 (ENSPEMG00000029839)	Lamb3 (ENSPEMG00000017689)
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	2	Flvcr1 (ENSCGRG00001021256)	Spata45 (ENSCGRG00001020534)	Tatdn3 (ENSCGRG00001019330)	Nsl1 (ENSCGRG00001017667)	Batf3 (ENSCGRG00001017448)	Garin4 (ENSCGRG00001010554)	Atf3 (ENSCGRG00001013063)	Nenf (ENSCGRG00001012055)	Pacc1 (ENSCGRG00001006900) #15	Ppp2r5a (ENSCGRG00001002484) #16	Dtl (ENSCGRG00001023163) #17	ENSCGRG00001020112 #18	Lpgat1 (ENSCGRG00001001129) #19	Nek2 (ENSCGRG00001023977) #21	ENSCGRG00001017398	Slc30a1 (ENSCGRG00001025069) #22	Rd3 (ENSCGRG00001024990) #23	Traf5 (ENSCGRG00001022795) #26	Rcor3 (ENSCGRG00001020719) #27	Kcnh1 (ENSCGRG00001014833) #28	Hhat (ENSCGRG00001018458)	Sertad4 (ENSCGRG00001015220)	Syt14 (ENSCGRG00001011845)	Utp25 (ENSCGRG00001019879)	Irf6 (ENSCGRG00001005349)	A130010J15Rik (ENSCGRG00001002638)	ENSCGRG00001004266	Hsd11b1 (ENSCGRG00001024469)	G0s2 (ENSCGRG00001010736)	Lamb3 (ENSCGRG00001012912)	Camk1g (ENSCGRG00001011909)
Golden Hamster	MODERN SPECIES	755	Spata45 (ENSMAUG00000016023)	Tatdn3 (ENSMAUG00000018308)	Nsl1 (ENSMAUG00000016792)	Batf3 (ENSMAUG00000014205)	Garin4 (ENSMAUG00000013757)	Atf3 (ENSMAUG00000011123)	Nenf (ENSMAUG00000010743)	Pacc1 (ENSMAUG00000009322) #15	Ppp2r5a (ENSMAUG00000000319) #16	ENSMAUG00000021059 #17	Ints7 (ENSMAUG00000002724) #18	ENSMAUG00000000601	Lpgat1 (ENSMAUG00000000283) #19	Nek2 (ENSMAUG00000007374) #21	ENSMAUG00000001247	Slc30a1 (ENSMAUG00000021127) #22	Rd3 (ENSMAUG00000019032) #23	Traf5 (ENSMAUG00000001323) #26	Rcor3 (ENSMAUG00000000503) #27	Kcnh1 (ENSMAUG00000019709) #28	Hhat (ENSMAUG00000008212)	Sertad4 (ENSMAUG00000000932)	ENSMAUG00000000396	Syt14 (ENSMAUG00000001868)	Utp25 (ENSMAUG00000017463)	Irf6 (ENSMAUG00000019003)	Traf3ip3 (ENSMAUG00000000850)	Hsd11b1 (ENSMAUG00000012170)	G0s2 (ENSMAUG00000010676)	Lamb3 (ENSMAUG00000011370)	Camk1g (ENSMAUG00000001022)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Mus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Mouse	MODERN SPECIES		Vash2 (ENSMUSG00000037568)	Flvcr1 (ENSMUSG00000066595)	Spata45 (ENSMUSG00000057072)	Tatdn3 (ENSMUSG00000026632)	Nsl1 (ENSMUSG00000062510)	Batf3 (ENSMUSG00000026630)	Garin4 (ENSMUSG00000091017)	Atf3 (ENSMUSG00000026628)	Nenf (ENSMUSG00000037499)	Pacc1 (ENSMUSG00000026627) #15	Ppp2r5a (ENSMUSG00000026626) #16	Dtl (ENSMUSG00000037474) #17	Ints7 (ENSMUSG00000037461) #18	Lpgat1 (ENSMUSG00000026623) #19	Nek2 (ENSMUSG00000026622) #21	Slc30a1 (ENSMUSG00000037434) #22	Rd3 (ENSMUSG00000049353) #23	Traf5 (ENSMUSG00000026637) #26	Rcor3 (ENSMUSG00000037395) #27	Kcnh1 (ENSMUSG00000058248) #28	Hhat (ENSMUSG00000037375)	Sertad4 (ENSMUSG00000016262)	Syt14 (ENSMUSG00000016200)	Utp25 (ENSMUSG00000016181)	Irf6 (ENSMUSG00000026638)	A130010J15Rik (ENSMUSG00000079144)	Traf3ip3 (ENSMUSG00000037318)	Lamb3 (ENSMUSG00000026639)	Hsd11b1 (ENSMUSG00000016194)	G0s2 (ENSMUSG00000009633)	Camk1g (ENSMUSG00000016179)
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Steppe mouse	MODERN SPECIES	2667													ENSMSIG00000026735 #19	Nek2 (ENSMSIG00000026753) #21	ENSMSIG00000026779	Slc30a1 (ENSMSIG00000026786) #22	ENSMSIG00000026792	Rd3 (ENSMSIG00000026807) #23	ENSMSIG00000026824	Traf5 (ENSMSIG00000026837) #26	Rcor3 (ENSMSIG00000026869) #27	Kcnh1 (ENSMSIG00000027136) #28	ENSMSIG00000027154 #29
spretus	MODERN SPECIES		Vash2 (MGP_SPRETEiJ_G0015841)	Flvcr1 (MGP_SPRETEiJ_G0015842)	Spata45 (MGP_SPRETEiJ_G0015843)	Tatdn3 (MGP_SPRETEiJ_G0015844)	Nsl1 (MGP_SPRETEiJ_G0015845)	Batf3 (MGP_SPRETEiJ_G0015846)	Garin4 (MGP_SPRETEiJ_G0015847)	Atf3 (MGP_SPRETEiJ_G0015848)	Nenf (MGP_SPRETEiJ_G0015849)	Pacc1 (MGP_SPRETEiJ_G0015850) #15	Ppp2r5a (MGP_SPRETEiJ_G0015851) #16	Dtl (MGP_SPRETEiJ_G0015852) #17	Ints7 (MGP_SPRETEiJ_G0015853) #18	Lpgat1 (MGP_SPRETEiJ_G0015854) #19	Nek2 (MGP_SPRETEiJ_G0015855) #21	Slc30a1 (MGP_SPRETEiJ_G0015856) #22	Rd3 (MGP_SPRETEiJ_G0015857) #23	MGP_SPRETEiJ_G0015858 #26	Rcor3 (MGP_SPRETEiJ_G0015859) #27	Kcnh1 (MGP_SPRETEiJ_G0015860) #28	Hhat (MGP_SPRETEiJ_G0015861)	Sertad4 (MGP_SPRETEiJ_G0015862)	MGP_SPRETEiJ_G0015863	Utp25 (MGP_SPRETEiJ_G0015864)	Irf6 (MGP_SPRETEiJ_G0015865)	A130010J15Rik (MGP_SPRETEiJ_G0015866)	Traf3ip3 (MGP_SPRETEiJ_G0015867)	Lamb3 (MGP_SPRETEiJ_G0015868)	Hsd11b1 (MGP_SPRETEiJ_G0015869)	G0s2 (MGP_SPRETEiJ_G0015870)	Camk1g (MGP_SPRETEiJ_G0015871)
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES		Vash2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015041)	Flvcr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015042)	Spata45 (MGP_CAROLIEiJ_G0015043)	Tatdn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015044)	Nsl1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015045)	Batf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015046)	Garin4 (MGP_CAROLIEiJ_G0015047)	Atf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015048)	Nenf (MGP_CAROLIEiJ_G0015049)	Pacc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015050) #15	Ppp2r5a (MGP_CAROLIEiJ_G0015051) #16	Dtl (MGP_CAROLIEiJ_G0015052) #17	Ints7 (MGP_CAROLIEiJ_G0015053) #18	Lpgat1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015054) #19	Nek2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015055) #21	Slc30a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015056) #22	Rd3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015057) #23	MGP_CAROLIEiJ_G0015058 #26	Rcor3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015059) #27	Kcnh1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015060) #28	Hhat (MGP_CAROLIEiJ_G0015061)	Sertad4 (MGP_CAROLIEiJ_G0015062)	MGP_CAROLIEiJ_G0015063	Utp25 (MGP_CAROLIEiJ_G0015064)	Irf6 (MGP_CAROLIEiJ_G0015065)	A130010J15Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0015066)	Traf3ip3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015067)	Lamb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0015068)	Hsd11b1 (MGP_CAROLIEiJ_G0015069)	G0s2 (MGP_CAROLIEiJ_G0015070)	Camk1g (MGP_CAROLIEiJ_G0015071)
Shrew mouse	MODERN SPECIES	18	Vash2 (MGP_PahariEiJ_G0028273)	Flvcr1 (MGP_PahariEiJ_G0028274)	Spata45 (MGP_PahariEiJ_G0028275)	MGP_PahariEiJ_G0028276	Nsl1 (MGP_PahariEiJ_G0028277)	Batf3 (MGP_PahariEiJ_G0028278)	Garin4 (MGP_PahariEiJ_G0028279)	Atf3 (MGP_PahariEiJ_G0028280)	Nenf (MGP_PahariEiJ_G0028281)	Pacc1 (MGP_PahariEiJ_G0028282) #15	Ppp2r5a (MGP_PahariEiJ_G0028283) #16	Dtl (MGP_PahariEiJ_G0028284) #17	Ints7 (MGP_PahariEiJ_G0028285) #18	Lpgat1 (MGP_PahariEiJ_G0028286) #19	Nek2 (MGP_PahariEiJ_G0028287) #21	Slc30a1 (MGP_PahariEiJ_G0028288) #22	Rd3 (MGP_PahariEiJ_G0028289) #23	MGP_PahariEiJ_G0028290 #26	Rcor3 (MGP_PahariEiJ_G0028291) #27	Kcnh1 (MGP_PahariEiJ_G0028292) #28	Hhat (MGP_PahariEiJ_G0028293)	Sertad4 (MGP_PahariEiJ_G0028294)	MGP_PahariEiJ_G0028295	Utp25 (MGP_PahariEiJ_G0028296)	Irf6 (MGP_PahariEiJ_G0028297)	A130010J15Rik (MGP_PahariEiJ_G0028298)	Traf3ip3 (MGP_PahariEiJ_G0028299)	MGP_PahariEiJ_G0028300	Hsd11b1 (MGP_PahariEiJ_G0028301)	G0s2 (MGP_PahariEiJ_G0028302)	Camk1g (MGP_PahariEiJ_G0028303)
Rat	MODERN SPECIES	4	SPATA45 (ENSRNOG00000048659)	Tatdn3 (ENSRNOG00000046460)	Nsl1 (ENSRNOG00000042286)	Batf3 (ENSRNOG00000003716)	Garin4 (ENSRNOG00000029371)	Atf3 (ENSRNOG00000003745)	Nenf (ENSRNOG00000003833)	Pacc1 (ENSRNOG00000003915) #15	Ppp2r5a (ENSRNOG00000000068) #16	Dtl (ENSRNOG00000004195) #17	Ints7 (ENSRNOG00000004263) #18	RGD1560186 (ENSRNOG00000031098)	Lpgat1 (ENSRNOG00000004402) #19	Nek2l1 (ENSRNOG00000004487) #21	AABR07022168.1 (ENSRNOG00000059863)	Slc30a1 (ENSRNOG00000004749) #22	Rd3 (ENSRNOG00000050766) #23	Traf5 (ENSRNOG00000047957) #26	Rcor3 (ENSRNOG00000046445) #27	Kcnh1 (ENSRNOG00000003841) #28	Hhat (ENSRNOG00000003925)	Sertad4 (ENSRNOG00000060773)	Syt14 (ENSRNOG00000046139)	Utp25 (ENSRNOG00000004789)	Irf6 (ENSRNOG00000005082)	LOC100125367 (ENSRNOG00000005558)	Traf3ip3 (ENSRNOG00000005565)	Hsd11b1 (ENSRNOG00000005861)	G0s2 (ENSRNOG00000006019)	Lamb3 (ENSRNOG00000006025)	Camk1g (ENSRNOG00000006470)
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1872	Angel2 (ENSNGAG00000009708)	Vash2 (ENSNGAG00000000617)	Flvcr1 (ENSNGAG00000009986)	Spata45 (ENSNGAG00000001409)	Tatdn3 (ENSNGAG00000015819)	Nsl1 (ENSNGAG00000021030)	Batf3 (ENSNGAG00000012341)	Atf3 (ENSNGAG00000017384)	Nenf (ENSNGAG00000015999)	Pacc1 (ENSNGAG00000001036) #15	Ppp2r5a (ENSNGAG00000011634) #16	Dtl (ENSNGAG00000015330) #17	Ints7 (ENSNGAG00000011793) #18	Lpgat1 (ENSNGAG00000020207) #19	Nek2 (ENSNGAG00000016403) #21	Slc30a1 (ENSNGAG00000018380) #22	Rd3 (ENSNGAG00000016374) #23	Traf5 (ENSNGAG00000014232) #26	Rcor3 (ENSNGAG00000010546) #27	Kcnh1 (ENSNGAG00000007409) #28	Hhat (ENSNGAG00000000647)	ENSNGAG00000014711	Syt14 (ENSNGAG00000008408)	Utp25 (ENSNGAG00000014664)	Irf6 (ENSNGAG00000006422)	A130010J15Rik (ENSNGAG00000010551)	ENSNGAG00000000822	ENSNGAG00000000847	Hsd11b1 (ENSNGAG00000011047)	G0s2 (ENSNGAG00000006335)	Lamb3 (ENSNGAG00000002418)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420.a.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420.a.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Squirrel	MODERN SPECIES	157	VASH2 (ENSSTOG00000001090)	FLVCR1 (ENSSTOG00000021795)	SPATA45 (ENSSTOG00000034873)	TATDN3 (ENSSTOG00000007141)	NSL1 (ENSSTOG00000023856)	BATF3 (ENSSTOG00000007136)	GARIN4 (ENSSTOG00000007130)	ATF3 (ENSSTOG00000007121)	ENSSTOG00000022293	PACC1 (ENSSTOG00000023262) #15	PPP2R5A (ENSSTOG00000013569) #16	DTL (ENSSTOG00000013557) #17	INTS7 (ENSSTOG00000013543) #18	LPGAT1 (ENSSTOG00000019588) #19	NEK2 (ENSSTOG00000014117) #21	SLC30A1 (ENSSTOG00000019654) #22	RD3 (ENSSTOG00000024456) #23	TRAF5 (ENSSTOG00000011997) #26	RCOR3 (ENSSTOG00000011987) #27	KCNH1 (ENSSTOG00000011975) #28	HHAT (ENSSTOG00000011967)	SERTAD4 (ENSSTOG00000012625)	SYT14 (ENSSTOG00000022494)	UTP25 (ENSSTOG00000016545)	IRF6 (ENSSTOG00000028204)	C1orf74 (ENSSTOG00000016543)	TRAF3IP3 (ENSSTOG00000016542)	HSD11B1 (ENSSTOG00000016541)	G0S2 (ENSSTOG00000020915)	LAMB3 (ENSSTOG00000023256)	CAMK1G (ENSSTOG00000016540)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	49	FLVCR1 (ENSUPAG00010017304)	SPATA45 (ENSUPAG00010017301)	TATDN3 (ENSUPAG00010017273)	NSL1 (ENSUPAG00010017261)	BATF3 (ENSUPAG00010017257)	ENSUPAG00010017246	ATF3 (ENSUPAG00010017228)	NENF (ENSUPAG00010017224)	PACC1 (ENSUPAG00010017213) #15	PPP2R5A (ENSUPAG00010017203) #16	DTL (ENSUPAG00010017177) #17	INTS7 (ENSUPAG00010017150) #18	LPGAT1 (ENSUPAG00010017120) #19	NEK2 (ENSUPAG00010017077) #21	ENSUPAG00010017072	SLC30A1 (ENSUPAG00010017069) #22	RD3 (ENSUPAG00010017064) #23	TRAF5 (ENSUPAG00010017058) #26	RCOR3 (ENSUPAG00010016853) #27	KCNH1 (ENSUPAG00010016824) #28	HHAT (ENSUPAG00010016783)	SERTAD4 (ENSUPAG00010016763)	SYT14 (ENSUPAG00010016724)	UTP25 (ENSUPAG00010016705)	IRF6 (ENSUPAG00010016697)	C1orf74 (ENSUPAG00010016689)	TRAF3IP3 (ENSUPAG00010016581)	HSD11B1 (ENSUPAG00010016557)	G0S2 (ENSUPAG00010016551)	LAMB3 (ENSUPAG00010016498)	CAMK1G (ENSUPAG00010016438)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	3	SPATA45 (ENSSVLG00005016084)	TATDN3 (ENSSVLG00005016168)	ENSSVLG00005016573	NSL1 (ENSSVLG00005016609)	BATF3 (ENSSVLG00005016663)	GARIN4 (ENSSVLG00005016703)	ENSSVLG00005016732	NENF (ENSSVLG00005016898)	PACC1 (ENSSVLG00005016932) #15	PPP2R5A (ENSSVLG00005017066) #16	ENSSVLG00005017261	DTL (ENSSVLG00005017356) #17	INTS7 (ENSSVLG00005017717) #18	LPGAT1 (ENSSVLG00005017852) #19	NEK2 (ENSSVLG00005017885) #21	SLC30A1 (ENSSVLG00005018112) #22	ENSSVLG00005018155	RD3 (ENSSVLG00005018174) #23	TRAF5 (ENSSVLG00005018217) #26	RCOR3 (ENSSVLG00005018255) #27	ENSSVLG00005018344	KCNH1 (ENSSVLG00005018426) #28	HHAT (ENSSVLG00005018844)	SERTAD4 (ENSSVLG00005019187)	ENSSVLG00005019238	ENSSVLG00005019515	UTP25 (ENSSVLG00005019768)	IRF6 (ENSSVLG00005019827)	C1orf74 (ENSSVLG00005019960)	TRAF3IP3 (ENSSVLG00005020051)	HSD11B1 (ENSSVLG00005020474)
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.d	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00940000157923	ENSGT00950000183059.b.a.b	ENSGT00940000155103.a.b	ENSGT00730000111198	ENSGT00940000157060.t	ENSGT00940000155092.b	ENSGT00390000017364	ENSGT00390000015553.a.a.b	ENSGT00940000162691	ENSGT00730000111005	ENSGT00390000016158	ENSGT00940000156546	ENSGT00940000160590	ENSGT00940000156992	ENSGT00940000156766
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.d	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00940000157923	ENSGT00950000183059.b.a.b	ENSGT00940000155103.a.b	ENSGT00730000111198	ENSGT00940000157060.t	ENSGT00940000155092.b	ENSGT00390000017364	ENSGT00390000015553.a.a.b	ENSGT00940000162691	ENSGT00730000111005	ENSGT00390000016158	ENSGT00940000156546	ENSGT00940000160590	ENSGT00940000156992	ENSGT00940000156766
Guinea pig	MODERN SPECIES	13	VASH2 (ENSCPOG00000003871)	ENSCPOG00000023888	FLVCR1 (ENSCPOG00000011300)	SPATA45 (ENSCPOG00000002457)	TATDN3 (ENSCPOG00000002454)	NSL1 (ENSCPOG00000002451)	BATF3 (ENSCPOG00000032323)	ATF3 (ENSCPOG00000034947)	ENSCPOG00000033847	PACC1 (ENSCPOG00000009329) #15	PPP2R5A (ENSCPOG00000040049) #16	DTL (ENSCPOG00000014965) #17	INTS7 (ENSCPOG00000014960) #18	LPGAT1 (ENSCPOG00000011269) #19	NEK2 (ENSCPOG00000011264) #21	SLC30A1 (ENSCPOG00000013692) #22	PSEN2 (ENSCPOG00000001827)	PLD5 (ENSCPOG00000033411)	ENSCPOG00000002221	ENSCPOG00000002683	ENSCPOG00000034860	SDCCAG8 (ENSCPOG00000015503)	AKT3 (ENSCPOG00000015504)	ZBTB18 (ENSCPOG00000035384)	C1orf100 (ENSCPOG00000002339)	ADSS2 (ENSCPOG00000002342)	DESI2 (ENSCPOG00000002091)	COX20 (ENSCPOG00000032295)	HNRNPU (ENSCPOG00000011887)	EFCAB2 (ENSCPOG00000024335)	KIF26B (ENSCPOG00000001048)
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.d	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00940000157923	ENSGT00950000183059.b.a.b	ENSGT00660000097201	ENSGT00940000155103.a.b	ENSGT00730000111198	ENSGT00940000157060.t	ENSGT00940000155092.b	ENSGT00390000017364	ENSGT00390000015553.a.a.b	ENSGT00940000162691	ENSGT00730000111005	ENSGT00390000016158	ENSGT00940000156546	ENSGT00940000160590	ENSGT00940000156992
Degu	MODERN SPECIES	58	FLVCR1 (ENSODEG00000013456)	SPATA45 (ENSODEG00000014271)	TATDN3 (ENSODEG00000013799)	NSL1 (ENSODEG00000014696)	ENSODEG00000013720	GARIN4 (ENSODEG00000013574)	ATF3 (ENSODEG00000013598)	NENF (ENSODEG00000016432)	PACC1 (ENSODEG00000013328) #15	PPP2R5A (ENSODEG00000014272) #16	DTL (ENSODEG00000016385) #17	INTS7 (ENSODEG00000013809) #18	LPGAT1 (ENSODEG00000013429) #19	ENSODEG00000014021 #21	ENSODEG00000013939	SLC30A1 (ENSODEG00000014581) #22	PSEN2 (ENSODEG00000013898)	PLD5 (ENSODEG00000013817)	ENSODEG00000014152	ENSODEG00000014979	ENSODEG00000013620	ENSODEG00000016144	ENSODEG00000014847	SDCCAG8 (ENSODEG00000013437)	ENSODEG00000013767	AKT3 (ENSODEG00000013255)	ZBTB18 (ENSODEG00000014080)	C1orf100 (ENSODEG00000012902)	ADSS2 (ENSODEG00000015411)	ENSODEG00000013295	ENSODEG00000013410
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	113	RPS6KC1 (ENSCLAG00000008718)	ANGEL2 (ENSCLAG00000007133)	VASH2 (ENSCLAG00000008864)	FLVCR1 (ENSCLAG00000012241)	SPATA45 (ENSCLAG00000008856)	TATDN3 (ENSCLAG00000008909)	NSL1 (ENSCLAG00000015217)	ATF3 (ENSCLAG00000013767)	ENSCLAG00000007912	PACC1 (ENSCLAG00000009570) #15	PPP2R5A (ENSCLAG00000012816) #16	DTL (ENSCLAG00000014236) #17	INTS7 (ENSCLAG00000011748) #18	LPGAT1 (ENSCLAG00000011509) #19	NEK2 (ENSCLAG00000010880) #21	SLC30A1 (ENSCLAG00000009695) #22	PSEN2 (ENSCLAG00000013788)	PLD5 (ENSCLAG00000014400)	ENSCLAG00000010377	CEP170 (ENSCLAG00000015564)	SDCCAG8 (ENSCLAG00000011676)	ENSCLAG00000009649	ZBTB18 (ENSCLAG00000015788)	C1orf100 (ENSCLAG00000007599)	ADSS2 (ENSCLAG00000008748)	CATSPERE (ENSCLAG00000009169)	DESI2 (ENSCLAG00000011829)	HNRNPU (ENSCLAG00000007100)	ENSCLAG00000007770	EFCAB2 (ENSCLAG00000008343)	KIF26B (ENSCLAG00000012108)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	16	PTPN14 (ENSHGLG00000006819)	SMYD2 (ENSHGLG00000005014)	PROX1 (ENSHGLG00000004005)	ENSHGLG00000011298	ANGEL2 (ENSHGLG00000009577)	ENSHGLG00000007863	ENSHGLG00000006406	NENF (ENSHGLG00000005390)	PACC1 (ENSHGLG00000004632) #15	ENSHGLG00000003379 #16	DTL (ENSHGLG00000006063) #17	INTS7 (ENSHGLG00000005372) #18	LPGAT1 (ENSHGLG00000008115) #19	NEK2 (ENSHGLG00000004280) #21	ENSHGLG00000028910	ENSHGLG00000037874 #22	ENSHGLG00000005464	ENSHGLG00000032112	MAP1LC3C (ENSHGLG00000037027)	ENSHGLG00000004656	ENSHGLG00000040176	ENSHGLG00000006833	ENSHGLG00000043505	ENSHGLG00000011191	ENSHGLG00000006465	ENSHGLG00000038674	ENSHGLG00000004271	AKT3 (ENSHGLG00000006424)	ENSHGLG00000043051	ZBTB18 (ENSHGLG00000003880)	ADSS (ENSHGLG00000007672)
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Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	10509																ENSEEUG00000010743 #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Suina	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Pig	MODERN SPECIES	17	SPATA45 (ENSSSCG00000015591)	TATDN3 (ENSSSCG00000015592)	NSL1 (ENSSSCG00000015593)	BATF3 (ENSSSCG00000026587)	ENSSSCG00000059329	ATF3 (ENSSSCG00000015595)	PACC1 (ENSSSCG00000015598) #15	ENSSSCG00000045561	NENF (ENSSSCG00000038614)	PPP2R5A (ENSSSCG00000015599) #16	ENSSSCG00000045296	DTL (ENSSSCG00000015600) #17	INTS7 (ENSSSCG00000015602) #18	LPGAT1 (ENSSSCG00000015603) #19	NEK2 (ENSSSCG00000015604) #21	SLC30A1 (ENSSSCG00000039472) #22	RD3 (ENSSSCG00000035369) #23	ENSSSCG00000021631	TRAF5 (ENSSSCG00000021068) #26	RCOR3 (ENSSSCG00000028293) #27	KCNH1 (ENSSSCG00000040650) #28	HHAT (ENSSSCG00000015607)	SERTAD4 (ENSSSCG00000026404)	SYT14 (ENSSSCG00000015610)	UTP25 (ENSSSCG00000015611)	IRF6 (ENSSSCG00000015612)	C1orf74 (ENSSSCG00000015613)	TRAF3IP3 (ENSSSCG00000032721)	HSD11B1 (ENSSSCG00000015616)	G0S2 (ENSSSCG00000015617)	LAMB3 (ENSSSCG00000015618)
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	102	VASH2 (ENSCWAG00000021305)	FLVCR1 (ENSCWAG00000021319)	SPATA45 (ENSCWAG00000021330)	TATDN3 (ENSCWAG00000021346)	NSL1 (ENSCWAG00000021373)	BATF3 (ENSCWAG00000007743)	ENSCWAG00000007772	ATF3 (ENSCWAG00000007808)	NENF (ENSCWAG00000007956)	PACC1 (ENSCWAG00000007977) #15	PPP2R5A (ENSCWAG00000008090) #16	DTL (ENSCWAG00000008314) #17	INTS7 (ENSCWAG00000008597) #18	LPGAT1 (ENSCWAG00000008746) #19	NEK2 (ENSCWAG00000008791) #21	SLC30A1 (ENSCWAG00000009013) #22	RD3 (ENSCWAG00000009042) #23	TRAF5 (ENSCWAG00000009078) #26	RCOR3 (ENSCWAG00000009137) #27	KCNH1 (ENSCWAG00000009270) #28	HHAT (ENSCWAG00000010086)	SERTAD4 (ENSCWAG00000010226)	SYT14 (ENSCWAG00000010292)	UTP25 (ENSCWAG00000010558)	IRF6 (ENSCWAG00000010597)	C1orf74 (ENSCWAG00000010653)	TRAF3IP3 (ENSCWAG00000010682)	HSD11B1 (ENSCWAG00000011222)	G0S2 (ENSCWAG00000011287)	LAMB3 (ENSCWAG00000011311)	CAMK1G (ENSCWAG00000011506)
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	52	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00960000186787	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00940000160731	ENSGT00390000005294
Arabian camel	MODERN SPECIES	15	VASH2 (ENSCDRG00005017896)	FLVCR1 (ENSCDRG00005017954)	SPATA45 (ENSCDRG00005017983)	TATDN3 (ENSCDRG00005018011)	NSL1 (ENSCDRG00005018177)	BATF3 (ENSCDRG00005018273)	GARIN4 (ENSCDRG00005018296)	ATF3 (ENSCDRG00005018313)	NENF (ENSCDRG00005018397)	PACC1 (ENSCDRG00005018426) #15	PPP2R5A (ENSCDRG00005018461) #16	DTL (ENSCDRG00005018574) #17	INTS7 (ENSCDRG00005018750) #18	LPGAT1 (ENSCDRG00005018848) #19	NEK2 (ENSCDRG00005018887) #21	SLC30A1 (ENSCDRG00005018912) #22	ENSCDRG00005018933	RD3 (ENSCDRG00005018942) #23	TRAF5 (ENSCDRG00005018973) #26	RCOR3 (ENSCDRG00005019000) #27	KCNH1 (ENSCDRG00005019055) #28	HHAT (ENSCDRG00005019106)	SERTAD4 (ENSCDRG00005019140)	SYT14 (ENSCDRG00005019164)	UTP25 (ENSCDRG00005019236)	IRF6 (ENSCDRG00005019267)	C1orf74 (ENSCDRG00005006685)	TRAF3IP3 (ENSCDRG00005006709)	HSD11B1 (ENSCDRG00005006991)	LAMB3 (ENSCDRG00005007050)	ENSCDRG00005007162
Alpaca	MODERN SPECIES	1903														LPGAT1 (ENSVPAG00000000789) #19	NEK2 (ENSVPAG00000000788) #21	SLC30A1 (ENSVPAG00000000787) #22
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Yarkand deer	MODERN SPECIES	5	TATDN3 (ENSCHYG00000013409)	NSL1 (ENSCHYG00000014242)	BATF3 (ENSCHYG00000014453)	GARIN4 (ENSCHYG00000014489)	ATF3 (ENSCHYG00000014511)	NENF (ENSCHYG00000014643)	PACC1 (ENSCHYG00000014712) #15	ENSCHYG00000014785	PPP2R5A (ENSCHYG00000014835) #16	DTL (ENSCHYG00000015630) #17	INTS7 (ENSCHYG00000016045) #18	LPGAT1 (ENSCHYG00000016569) #19	ENSCHYG00000016743	NEK2 (ENSCHYG00000016778) #21	ENSCHYG00000016984	SLC30A1 (ENSCHYG00000017005) #22	RD3 (ENSCHYG00000017041) #23	ENSCHYG00000017071	TRAF5 (ENSCHYG00000017106) #26	RCOR3 (ENSCHYG00000017267) #27	KCNH1 (ENSCHYG00000018244) #28	HHAT (ENSCHYG00000018477)	ENSCHYG00000018823	SERTAD4 (ENSCHYG00000018890)	SYT14 (ENSCHYG00000018953)	UTP25 (ENSCHYG00000019141)	IRF6 (ENSCHYG00000019355)	C1orf74 (ENSCHYG00000019456)	TRAF3IP3 (ENSCHYG00000019520)	HSD11B1 (ENSCHYG00000020326)	G0S2 (ENSCHYG00000020378)
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451.a	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451.a	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Goat	MODERN SPECIES	7	FLVCR1 (ENSCHIG00000024444)	SPATA45 (ENSCHIG00000012564)	TATDN3 (ENSCHIG00000012673)	NSL1 (ENSCHIG00000015806)	BATF3 (ENSCHIG00000019379)	GARIN4 (ENSCHIG00000011288)	ATF3 (ENSCHIG00000015367)	NENF (ENSCHIG00000025026)	PACC1 (ENSCHIG00000025983) #15	PPP2R5A (ENSCHIG00000017773) #16	DTL (ENSCHIG00000018130) #17	INTS7 (ENSCHIG00000021252) #18	LPGAT1 (ENSCHIG00000018432) #19	NEK2 (ENSCHIG00000009433) #21	ENSCHIG00000020896	SLC30A1 (ENSCHIG00000011934) #22	RD3 (ENSCHIG00000007804) #23	TRAF5 (ENSCHIG00000016771) #26	RCOR3 (ENSCHIG00000016198) #27	KCNH1 (ENSCHIG00000014356) #28	HHAT (ENSCHIG00000010450)	SERTAD4 (ENSCHIG00000023210)	SYT14 (ENSCHIG00000018118)	UTP25 (ENSCHIG00000021738)	ENSCHIG00000015540	TRAF3IP3 (ENSCHIG00000021484)	C1orf74 (ENSCHIG00000021606)	HSD11B1 (ENSCHIG00000021082)	LAMB3 (ENSCHIG00000000495)	CAMK1G (ENSCHIG00000014884)	PLXNA2 (ENSCHIG00000018998)
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	3	TRMT1L (ENSOARG00020006285)	IVNS1ABP (ENSOARG00020006631)	HMCN1 (ENSOARG00020007150)	ENSOARG00020015135	TPR (ENSOARG00020015200)	ODR4 (ENSOARG00020015548)	PDC (ENSOARG00020015837)	ENSOARG00020015900	PTGS2 (ENSOARG00020015961)	PLA2G4A (ENSOARG00020016112)	KCNK2 (ENSOARG00020016271)	CSNK1A1 (ENSOARG00020016517)	PTPN14 (ENSOARG00020016706)	SMYD2 (ENSOARG00020016785)	PROX1 (ENSOARG00020016871)	SLC30A1 (ENSOARG00020016940) #22	RD3 (ENSOARG00020016974) #23	TRAF5 (ENSOARG00020017026) #26	RCOR3 (ENSOARG00020017402) #27	ENSOARG00020018204	KCNH1 (ENSOARG00020018286) #28	SERTAD4 (ENSOARG00020019447)	SYT14 (ENSOARG00020019477)	UTP25 (ENSOARG00020019628)	ENSOARG00020019761	C1orf74 (ENSOARG00020019909)	TRAF3IP3 (ENSOARG00020019992)	HSD11B1 (ENSOARG00020020417)	G0S2 (ENSOARG00020020456)	LAMB3 (ENSOARG00020020472)	CAMK1G (ENSOARG00020020528)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451.a	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Bos	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451.a	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451.a	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	7	TATDN3 (ENSBIXG00005024928)	NSL1 (ENSBIXG00005007082)	BATF3 (ENSBIXG00005024775)	GARIN4 (ENSBIXG00005024742)	ATF3 (ENSBIXG00005024730)	PPP2R5A (ENSBIXG00005024585) #16	NENF (ENSBIXG00005024408)	PACC1 (ENSBIXG00005004164) #15	ENSBIXG00005024328	DTL (ENSBIXG00005024306) #17	INTS7 (ENSBIXG00005004136) #18	ENSBIXG00005024110	LPGAT1 (ENSBIXG00005024095) #19	NEK2 (ENSBIXG00005004109) #21	ENSBIXG00005023951	SLC30A1 (ENSBIXG00005023934) #22	RD3 (ENSBIXG00005006907) #23	TRAF5 (ENSBIXG00005023876) #26	RCOR3 (ENSBIXG00005023789) #27	KCNH1 (ENSBIXG00005023628) #28	HHAT (ENSBIXG00005004016)	SERTAD4 (ENSBIXG00005023354)	SYT14 (ENSBIXG00005006053)	UTP25 (ENSBIXG00005023119)	IRF6 (ENSBIXG00005023060)	TRAF3IP3 (ENSBIXG00005022969)	HSD11B1 (ENSBIXG00005022685)	G0S2 (ENSBIXG00005022672)	LAMB3 (ENSBIXG00005022653)	CAMK1G (ENSBIXG00005003853)	PLXNA2 (ENSBIXG00005022456)
Cow	MODERN SPECIES	7	VASH2 (ENSBTAG00000003701)	FLVCR1 (ENSBTAG00000015974)	SPATA45 (ENSBTAG00000010016)	TATDN3 (ENSBTAG00000024443)	NSL1 (ENSBTAG00000011340)	BATF3 (ENSBTAG00000011982)	ATF3 (ENSBTAG00000008545)	NENF (ENSBTAG00000000759)	PACC1 (ENSBTAG00000000758) #15	PPP2R5A (ENSBTAG00000000754) #16	DTL (ENSBTAG00000018142) #17	INTS7 (ENSBTAG00000018548) #18	LPGAT1 (ENSBTAG00000005137) #19	NEK2 (ENSBTAG00000009618) #21	ENSBTAG00000048992	SLC30A1 (ENSBTAG00000010909) #22	RD3 (ENSBTAG00000024453) #23	TRAF5 (ENSBTAG00000012020) #26	RCOR3 (ENSBTAG00000007110) #27	KCNH1 (ENSBTAG00000008710) #28	HHAT (ENSBTAG00000048628)	SERTAD4 (ENSBTAG00000010850)	SYT14 (ENSBTAG00000046723)	UTP25 (ENSBTAG00000020886)	IRF6 (ENSBTAG00000002849)	C16H1orf74 (ENSBTAG00000002848)	TRAF3IP3 (ENSBTAG00000002846)	HSD11B1 (ENSBTAG00000015086)	LAMB3 (ENSBTAG00000016542)	CAMK1G (ENSBTAG00000016541)	PLXNA2 (ENSBTAG00000001173)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451.a	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Domestic yak	MODERN SPECIES	5	VASH2 (ENSBGRG00000020510)	FLVCR1 (ENSBGRG00000020614)	SPATA45 (ENSBGRG00000020720)	TATDN3 (ENSBGRG00000020764)	NSL1 (ENSBGRG00000021044)	ENSBGRG00000021111	GARIN4 (ENSBGRG00000021184)	ATF3 (ENSBGRG00000021213)	NENF (ENSBGRG00000021350)	PACC1 (ENSBGRG00000021413) #15	PPP2R5A (ENSBGRG00000021515) #16	DTL (ENSBGRG00000021712) #17	INTS7 (ENSBGRG00000021952) #18	LPGAT1 (ENSBGRG00000022090) #19	NEK2 (ENSBGRG00000022174) #21	SLC30A1 (ENSBGRG00000022277) #22	RD3 (ENSBGRG00000022288) #23	TRAF5 (ENSBGRG00000022326) #26	RCOR3 (ENSBGRG00000022443) #27	ENSBGRG00000022661 #28	HHAT (ENSBGRG00000022727)	ENSBGRG00000023033	SERTAD4 (ENSBGRG00000023064)	SYT14 (ENSBGRG00000023137)	UTP25 (ENSBGRG00000023209)	IRF6 (ENSBGRG00000023313)	C1orf74 (ENSBGRG00000023393)	TRAF3IP3 (ENSBGRG00000023456)	HSD11B1 (ENSBGRG00000023799)	LAMB3 (ENSBGRG00000023890)	G0S2 (ENSBGRG00000024151)
Wild yak	MODERN SPECIES	163	FLVCR1 (ENSBMUG00000005684)	SPATA45 (ENSBMUG00000005696)	TATDN3 (ENSBMUG00000005864)	NSL1 (ENSBMUG00000005926)	BATF3 (ENSBMUG00000005942)	GARIN4 (ENSBMUG00000005948)	ATF3 (ENSBMUG00000005996)	ENSBMUG00000006020	PACC1 (ENSBMUG00000006033) #15	PPP2R5A (ENSBMUG00000006053) #16	ENSBMUG00000006067	DTL (ENSBMUG00000006121) #17	INTS7 (ENSBMUG00000006182) #18	LPGAT1 (ENSBMUG00000006250) #19	NEK2 (ENSBMUG00000006280) #21	SLC30A1 (ENSBMUG00000006316) #22	RD3 (ENSBMUG00000006323) #23	TRAF5 (ENSBMUG00000006340) #26	RCOR3 (ENSBMUG00000006369) #27	KCNH1 (ENSBMUG00000006418) #28	HHAT (ENSBMUG00000006557)	SERTAD4 (ENSBMUG00000006666)	ENSBMUG00000006670
American bison	MODERN SPECIES	3236	FLVCR1 (ENSBBBG00000024087)	SPATA45 (ENSBBBG00000006263)	TATDN3 (ENSBBBG00000008996)	NSL1 (ENSBBBG00000024348)	BATF3 (ENSBBBG00000008830)	GARIN4 (ENSBBBG00000006342)	ATF3 (ENSBBBG00000024444)	NENF (ENSBBBG00000006377)	PACC1 (ENSBBBG00000006382) #15	PPP2R5A (ENSBBBG00000024543) #16	DTL (ENSBBBG00000024611) #17	INTS7 (ENSBBBG00000024708) #18	LPGAT1 (ENSBBBG00000006504) #19	NEK2 (ENSBBBG00000006513) #21	ENSBBBG00000006520	SLC30A1 (ENSBBBG00000006526) #22
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	386	FLVCR1 (ENSMMSG00000011847)	SPATA45 (ENSMMSG00000011823)	TATDN3 (ENSMMSG00000011638)	NSL1 (ENSMMSG00000011548)	BATF3 (ENSMMSG00000011505)	GARIN4 (ENSMMSG00000011480)	ATF3 (ENSMMSG00000011403)	NENF (ENSMMSG00000011361)	PACC1 (ENSMMSG00000011323) #15	PPP2R5A (ENSMMSG00000011202) #16	DTL (ENSMMSG00000011101) #17	INTS7 (ENSMMSG00000010916) #18	LPGAT1 (ENSMMSG00000010874) #19	NEK2 (ENSMMSG00000010798) #21	ENSMMSG00000010776	SLC30A1 (ENSMMSG00000010754) #22	RD3 (ENSMMSG00000010720) #23	TRAF5 (ENSMMSG00000010615) #26	RCOR3 (ENSMMSG00000010523) #27	KCNH1 (ENSMMSG00000010407) #28	HHAT (ENSMMSG00000010183)	SERTAD4 (ENSMMSG00000010142)	SYT14 (ENSMMSG00000009993)	UTP25 (ENSMMSG00000009904)	IRF6 (ENSMMSG00000009854)	C1orf74 (ENSMMSG00000009837)	TRAF3IP3 (ENSMMSG00000009617)	HSD11B1 (ENSMMSG00000009574)	G0S2 (ENSMMSG00000009554)	LAMB3 (ENSMMSG00000009509)	CAMK1G (ENSMMSG00000009399)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.b	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000014620.l	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.b	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000014620.l	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.b	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000014620.l	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709.a	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Dolphin	MODERN SPECIES	4581																SLC30A1 (ENSTTRG00000016218) #22
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000164345.b	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.b	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770.d.a.b.a	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000014620.l	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709.a	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT00940000164345.b	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374.b	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000014620.l	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709.a	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Narwhal	MODERN SPECIES	304	ANGEL2 (ENSMMNG00015019589)	VASH2 (ENSMMNG00015019521)	FLVCR1 (ENSMMNG00015019473)	TATDN3 (ENSMMNG00015019427)	NSL1 (ENSMMNG00015019362)	BATF3 (ENSMMNG00015019336)	ATF3 (ENSMMNG00015019269)	NENF (ENSMMNG00015019225)	PACC1 (ENSMMNG00015019197) #15	PPP2R5A (ENSMMNG00015019141) #16	DTL (ENSMMNG00015019067) #17	INTS7 (ENSMMNG00015018987) #18	LPGAT1 (ENSMMNG00015018946) #19	NEK2 (ENSMMNG00015018881) #21	ENSMMNG00015018864	SLC30A1 (ENSMMNG00015018850) #22	RD3 (ENSMMNG00015018832) #23	TRAF5 (ENSMMNG00015018804) #26	RCOR3 (ENSMMNG00015018748) #27	ENSMMNG00015018716	KCNH1 (ENSMMNG00015018528) #28	HHAT (ENSMMNG00015018367)	SERTAD4 (ENSMMNG00015018323)	SYT14 (ENSMMNG00015018155)	UTP25 (ENSMMNG00015018105)	IRF6 (ENSMMNG00015018064)	C1orf74 (ENSMMNG00015018047)	TRAF3IP3 (ENSMMNG00015017982)	HSD11B1 (ENSMMNG00015017948)	G0S2 (ENSMMNG00015017934)	LAMB3 (ENSMMNG00015017881)
Beluga whale	MODERN SPECIES	27	ANGEL2 (ENSDLEG00000005172)	VASH2 (ENSDLEG00000005184)	ENSDLEG00000005192	FLVCR1 (ENSDLEG00000005195)	TATDN3 (ENSDLEG00000005209)	NSL1 (ENSDLEG00000005221)	BATF3 (ENSDLEG00000005232)	ATF3 (ENSDLEG00000005236)	NENF (ENSDLEG00000005240)	TMEM206 (ENSDLEG00000005248) #15	PPP2R5A (ENSDLEG00000005259) #16	DTL (ENSDLEG00000005279) #17	INTS7 (ENSDLEG00000005323) #18	LPGAT1 (ENSDLEG00000005334) #19	NEK2 (ENSDLEG00000005342) #21	SLC30A1 (ENSDLEG00000005356) #22	ENSDLEG00000005360	RD3 (ENSDLEG00000005361) #23	TRAF5 (ENSDLEG00000005364) #26	RCOR3 (ENSDLEG00000005369) #27	ENSDLEG00000005376	KCNH1 (ENSDLEG00000005381) #28	HHAT (ENSDLEG00000005391)	SERTAD4 (ENSDLEG00000005406)	SYT14 (ENSDLEG00000005416)	UTP25 (ENSDLEG00000005441)	ENSDLEG00000005460	IRF6 (ENSDLEG00000005475)	ENSDLEG00000005492	C1orf74 (ENSDLEG00000005504)	ENSDLEG00000005517
Vaquita	MODERN SPECIES		ENSPSNG00000004972	FLVCR1 (ENSPSNG00000004997)	TATDN3 (ENSPSNG00000005047)	NSL1 (ENSPSNG00000005089)	BATF3 (ENSPSNG00000005108)	ENSPSNG00000005121	ENSPSNG00000005129	ATF3 (ENSPSNG00000005166)	NENF (ENSPSNG00000009776)	PACC1 (ENSPSNG00000009896) #15	PPP2R5A (ENSPSNG00000009955) #16	DTL (ENSPSNG00000010167) #17	INTS7 (ENSPSNG00000010384) #18	LPGAT1 (ENSPSNG00000010487) #19	NEK2 (ENSPSNG00000010537) #21	SLC30A1 (ENSPSNG00000010578) #22	ENSPSNG00000010611	RD3 (ENSPSNG00000010651) #23	ENSPSNG00000010690	TRAF5 (ENSPSNG00000010718) #26	RCOR3 (ENSPSNG00000010773) #27	ENSPSNG00000010861	KCNH1 (ENSPSNG00000010951) #28	HHAT (ENSPSNG00000011618)	SERTAD4 (ENSPSNG00000011759)	SYT14 (ENSPSNG00000011829)	ENSPSNG00000012209	IRF6 (ENSPSNG00000012250)	C1orf74 (ENSPSNG00000012285)	TRAF3IP3 (ENSPSNG00000012331)	HSD11B1 (ENSPSNG00000012538)
Sperm whale	MODERN SPECIES	15	ANGEL2 (ENSPCTG00005003641)	VASH2 (ENSPCTG00005003680)	FLVCR1 (ENSPCTG00005003708)	SPATA45 (ENSPCTG00005003721)	TATDN3 (ENSPCTG00005003740)	NSL1 (ENSPCTG00005003768)	BATF3 (ENSPCTG00005003779)	ATF3 (ENSPCTG00005003791)	TMEM206 (ENSPCTG00005003816) #15	PPP2R5A (ENSPCTG00005003839) #16	DTL (ENSPCTG00005003869) #17	INTS7 (ENSPCTG00005003928) #18	LPGAT1 (ENSPCTG00005004002) #19	NEK2 (ENSPCTG00005004014) #21	ENSPCTG00005004023	SLC30A1 (ENSPCTG00005008495) #22	RD3 (ENSPCTG00005008525) #23	TRAF5 (ENSPCTG00005008546) #26	RCOR3 (ENSPCTG00005008595) #27	KCNH1 (ENSPCTG00005008756) #28	HHAT (ENSPCTG00005009194)	ENSPCTG00005009472	SERTAD4 (ENSPCTG00005009523)	SYT14 (ENSPCTG00005009579)	UTP25 (ENSPCTG00005009852)	TRAF3IP3 (ENSPCTG00005009911)	HSD11B1 (ENSPCTG00005010101)	ENSPCTG00005010177	CD34 (ENSPCTG00005010258)	ENSPCTG00005010353	ENSPCTG00005010533
Blue whale	MODERN SPECIES		ENSBMSG00010002385	FLVCR1 (ENSBMSG00010002424)	SPATA45 (ENSBMSG00010002443)	TATDN3 (ENSBMSG00010002497)	ENSBMSG00010002561	BATF3 (ENSBMSG00010002581)	ATF3 (ENSBMSG00010002626)	NENF (ENSBMSG00010002661)	PACC1 (ENSBMSG00010002673) #15	PPP2R5A (ENSBMSG00010002700) #16	DTL (ENSBMSG00010002763) #17	INTS7 (ENSBMSG00010002812) #18	ENSBMSG00010002840	LPGAT1 (ENSBMSG00010002856) #19	NEK2 (ENSBMSG00010002888) #21	SLC30A1 (ENSBMSG00010002897) #22	ENSBMSG00010002913	RD3 (ENSBMSG00010002930) #23	TRAF5 (ENSBMSG00010002947) #26	RCOR3 (ENSBMSG00010002971) #27	ENSBMSG00010002987	KCNH1 (ENSBMSG00010003070) #28	HHAT (ENSBMSG00010003334)	SERTAD4 (ENSBMSG00010003446)	SYT14 (ENSBMSG00010003483)	UTP25 (ENSBMSG00010003519)	IRF6 (ENSBMSG00010003530)	C1orf74 (ENSBMSG00010003543)	ENSBMSG00010003559	ENSBMSG00010003571	HSD11B1 (ENSBMSG00010003605)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00860000134882	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	14	SPATA45 (ENSRFEG00010015162)	TATDN3 (ENSRFEG00010015243)	ENSRFEG00010015432	NSL1 (ENSRFEG00010015474)	BATF3 (ENSRFEG00010015564)	ENSRFEG00010015625	ATF3 (ENSRFEG00010015691)	NENF (ENSRFEG00010015882)	PACC1 (ENSRFEG00010015931) #15	PPP2R5A (ENSRFEG00010015983) #16	ENSRFEG00010016189	DTL (ENSRFEG00010016398) #17	INTS7 (ENSRFEG00010016808) #18	LPGAT1 (ENSRFEG00010016994) #19	NEK2 (ENSRFEG00010017066) #21	SLC30A1 (ENSRFEG00010017164) #22	RD3 (ENSRFEG00010017212) #23	TRAF5 (ENSRFEG00010017255) #26	RCOR3 (ENSRFEG00010017308) #27	KCNH1 (ENSRFEG00010017428) #28	HHAT (ENSRFEG00010017513)	SERTAD4 (ENSRFEG00010017836)	SYT14 (ENSRFEG00010017864)	UTP25 (ENSRFEG00010018023)	IRF6 (ENSRFEG00010018083)	C1orf74 (ENSRFEG00010018142)	TRAF3IP3 (ENSRFEG00010018169)	HSD11B1 (ENSRFEG00010018491)	G0S2 (ENSRFEG00010018526)	LAMB3 (ENSRFEG00010018541)	CAMK1G (ENSRFEG00010018590)
Microbat	MODERN SPECIES	1002	ENSMLUG00000002386	FLVCR1 (ENSMLUG00000009724)	SPATA45 (ENSMLUG00000009716)	TATDN3 (ENSMLUG00000009692)	NSL1 (ENSMLUG00000009680)	BATF3 (ENSMLUG00000025827)	GARIN4 (ENSMLUG00000015054)	ATF3 (ENSMLUG00000015048)	ENSMLUG00000009603	PACC1 (ENSMLUG00000009572) #15	PPP2R5A (ENSMLUG00000009549) #16	DTL (ENSMLUG00000011353) #17	INTS7 (ENSMLUG00000011317) #18	LPGAT1 (ENSMLUG00000011302) #19	ENSMLUG00000011281 #21	SLC30A1 (ENSMLUG00000016166) #22	ENSMLUG00000029402 #23	TRAF5 (ENSMLUG00000008886) #26	RCOR3 (ENSMLUG00000008866) #27	KCNH1 (ENSMLUG00000015015) #28	HHAT (ENSMLUG00000015008)	SERTAD4 (ENSMLUG00000014998)	SYT14 (ENSMLUG00000008259)	UTP25 (ENSMLUG00000004515)	IRF6 (ENSMLUG00000004509)	C1orf74 (ENSMLUG00000004506)	TRAF3IP3 (ENSMLUG00000004499)	HSD11B1 (ENSMLUG00000004496)	G0S2 (ENSMLUG00000004495)	LAMB3 (ENSMLUG00000004488)	CAMK1G (ENSMLUG00000004485)
Equus	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00950000183198.c.b.a.u.a	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Donkey	MODERN SPECIES	17	ENSEASG00005002833	SPATA45 (ENSEASG00005024302)	TATDN3 (ENSEASG00005002825)	NSL1 (ENSEASG00005002819)	BATF3 (ENSEASG00005038008)	GARIN4 (ENSEASG00005002812)	ATF3 (ENSEASG00005002809)	NENF (ENSEASG00005034192)	PACC1 (ENSEASG00005002801) #15	PPP2R5A (ENSEASG00005002799) #16	DTL (ENSEASG00005002794) #17	INTS7 (ENSEASG00005002785) #18	LPGAT1 (ENSEASG00005002780) #19	NEK2 (ENSEASG00005002743) #21	ENSEASG00005002740	SLC30A1 (ENSEASG00005024608) #22	RD3 (ENSEASG00005035553) #23	TRAF5 (ENSEASG00005002734) #26	RCOR3 (ENSEASG00005002731) #27	KCNH1 (ENSEASG00005002723) #28	HHAT (ENSEASG00005002714)	SERTAD4 (ENSEASG00005002712)	SYT14 (ENSEASG00005002709)	UTP25 (ENSEASG00005002702)	IRF6 (ENSEASG00005002698)	TRAF3IP3 (ENSEASG00005002677)	C1orf74 (ENSEASG00005029649)	HSD11B1 (ENSEASG00005002669)	G0S2 (ENSEASG00005036253)	LAMB3 (ENSEASG00005002659)	CAMK1G (ENSEASG00005002656)
Horse	MODERN SPECIES	26	SPATA45 (ENSECAG00000038528)	TATDN3 (ENSECAG00000008513)	NSL1 (ENSECAG00000009355)	BATF3 (ENSECAG00000011042)	GARIN4 (ENSECAG00000011089)	ATF3 (ENSECAG00000011486)	NENF (ENSECAG00000014943)	PACC1 (ENSECAG00000018726) #15	PPP2R5A (ENSECAG00000007665) #16	ENSECAG00000046910	DTL (ENSECAG00000011878) #17	INTS7 (ENSECAG00000018806) #18	LPGAT1 (ENSECAG00000013187) #19	NEK2 (ENSECAG00000020920) #21	ENSECAG00000029157	SLC30A1 (ENSECAG00000003051) #22	RD3 (ENSECAG00000037071) #23	TRAF5 (ENSECAG00000007165) #26	RCOR3 (ENSECAG00000013308) #27	KCNH1 (ENSECAG00000000431) #28	ENSECAG00000055405	ENSECAG00000060378	ENSECAG00000030219	HHAT (ENSECAG00000013905)	SERTAD4 (ENSECAG00000015692)	SYT14 (ENSECAG00000017972)	UTP25 (ENSECAG00000022381)	IRF6 (ENSECAG00000007482)	C5H1orf74 (ENSECAG00000003211)	TRAF3IP3 (ENSECAG00000011355)	HSD11B1 (ENSECAG00000019243)
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00950000186332	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00950000186332	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	77	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000163755	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00950000186332	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00960000191639	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294
American black bear	MODERN SPECIES	1733													LPGAT1 (ENSUAMG00000007498) #19	NEK2 (ENSUAMG00000007503) #21	ENSUAMG00000007517	SLC30A1 (ENSUAMG00000007518) #22	RD3 (ENSUAMG00000007519) #23
Giant Panda	MODERN SPECIES	18	FLVCR1 (ENSAMEG00000001394)	SPATA45 (ENSAMEG00000001391)	TATDN3 (ENSAMEG00000001364)	NSL1 (ENSAMEG00000023537)	BATF3 (ENSAMEG00000001350)	GARIN4 (ENSAMEG00000020024)	ATF3 (ENSAMEG00000001342)	NENF (ENSAMEG00000031283)	PACC1 (ENSAMEG00000001326) #15	PPP2R5A (ENSAMEG00000001284) #16	DTL (ENSAMEG00000001259) #17	INTS7 (ENSAMEG00000001226) #18	LPGAT1 (ENSAMEG00000001208) #19	NEK2 (ENSAMEG00000001187) #21	ENSAMEG00000026554	SLC30A1 (ENSAMEG00000001179) #22	ENSAMEG00000025973	RD3 (ENSAMEG00000031055) #23	TRAF5 (ENSAMEG00000001120) #26	RCOR3 (ENSAMEG00000001095) #27	KCNH1 (ENSAMEG00000001083) #28	ENSAMEG00000028194	HHAT (ENSAMEG00000001075)	SERTAD4 (ENSAMEG00000003428)	SYT14 (ENSAMEG00000003414)	UTP25 (ENSAMEG00000017972)	IRF6 (ENSAMEG00000017984)	C1orf74 (ENSAMEG00000018852)	TRAF3IP3 (ENSAMEG00000017989)	HSD11B1 (ENSAMEG00000017997)	ENSAMEG00000030724
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	88	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000157923	ENSGT00940000156810	ENSGT01030000234517.H.b	ENSGT00390000018900	ENSGT00940000163104	ENSGT00390000004799	ENSGT00390000005861	ENSGT00950000183142.a.b.a.b	ENSGT00940000156766	ENSGT00940000156992	ENSGT00940000160590	ENSGT00940000156546	ENSGT00390000016158
American mink	MODERN SPECIES	43	VASH2 (ENSNVIG00000005082)	FLVCR1 (ENSNVIG00000005037)	CA227 (ENSNVIG00000005023)	TATDN3 (ENSNVIG00000004850)	NSL1 (ENSNVIG00000004815)	BATF3 (ENSNVIG00000004806)	ATF3 (ENSNVIG00000004753)	NENF (ENSNVIG00000004737)	TM206 (ENSNVIG00000004730) #15	PPP2R5A (ENSNVIG00000004688) #16	DTL (ENSNVIG00000004646) #17	INT7 (ENSNVIG00000004452) #18	LGAT1 (ENSNVIG00000004432) #19	NEK2 (ENSNVIG00000004418) #21	ENSNVIG00000004408	ZNT1 (ENSNVIG00000004401) #22	RD3 (ENSNVIG00000004395) #23	TRAF5 (ENSNVIG00000004351) #26	PSEN2 (ENSNVIG00000004312)	COQ8A (ENSNVIG00000004266)	CDC42BPA (ENSNVIG00000003776)	AHCTF1 (ENSNVIG00000003655)	ENSNVIG00000003647	SCCPDH (ENSNVIG00000003629)	CNST (ENSNVIG00000003578)	TFB2M (ENSNVIG00000003533)	SMYD3 (ENSNVIG00000003474)	KIF26B (ENSNVIG00000003416)	EFCAB2 (ENSNVIG00000003367)	HNRNPU (ENSNVIG00000003228)	COX20 (ENSNVIG00000003195)
Ferret	MODERN SPECIES	217								ATF3 (ENSMPUG00000015864)	PACC1 (ENSMPUG00000015863) #15	PPP2R5A (ENSMPUG00000015862) #16	DTL (ENSMPUG00000015861) #17	INTS7 (ENSMPUG00000015857) #18	ENSMPUG00000015855	LPGAT1 (ENSMPUG00000015854) #19	NEK2 (ENSMPUG00000015853) #21	SLC30A1 (ENSMPUG00000015852) #22	RD3 (ENSMPUG00000015851) #23	TRAF5 (ENSMPUG00000015850) #26	PSEN2 (ENSMPUG00000015849)	COQ8A (ENSMPUG00000015827)	CDC42BPA (ENSMPUG00000015826)	ENSMPUG00000015825	AHCTF1 (ENSMPUG00000015820)	ENSMPUG00000015819	ENSMPUG00000015818	ENSMPUG00000015817	SCCPDH (ENSMPUG00000015815)	CNST (ENSMPUG00000015813)	TFB2M (ENSMPUG00000015810)	ENSMPUG00000015808	SMYD3 (ENSMPUG00000015806)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00940000158890.p.b	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00510000047030.u.a.b	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Dingo	MODERN SPECIES	271	SPATA45 (ENSCAFG00020013949)	TATDN3 (ENSCAFG00020013945)	ENSCAFG00020013943	BATF3 (ENSCAFG00020013939)	ENSCAFG00020013926	ATF3 (ENSCAFG00020013925)	NENF (ENSCAFG00020013923)	PACC1 (ENSCAFG00020013915) #15	PPP2R5A (ENSCAFG00020013910) #16	ENSCAFG00020013907	DTL (ENSCAFG00020013894) #17	INTS7 (ENSCAFG00020013434) #18	LPGAT1 (ENSCAFG00020013398) #19	NEK2 (ENSCAFG00020013390) #21	ENSCAFG00020013378	SLC30A1 (ENSCAFG00020013375) #22	RD3 (ENSCAFG00020013372) #23	TRAF5 (ENSCAFG00020013369) #26	RCOR3 (ENSCAFG00020013361) #27	KCNH1 (ENSCAFG00020013345) #28	HHAT (ENSCAFG00020013317)	SERTAD4 (ENSCAFG00020013297)	SYT14 (ENSCAFG00020013281)	ENSCAFG00020013259	UTP25 (ENSCAFG00020013258)	IRF6 (ENSCAFG00020013241)	C1orf74 (ENSCAFG00020013238)	TRAF3IP3 (ENSCAFG00020013209)	HSD11B1 (ENSCAFG00020013207)	G0S2 (ENSCAFG00020013204)	LAMB3 (ENSCAFG00020013199)
Dog	MODERN SPECIES	35	ENSCAFG00845003831	NSL1 (ENSCAFG00845003808)	BATF3 (ENSCAFG00845003785)	ENSCAFG00845003779	GARIN4 (ENSCAFG00845003772)	ATF3 (ENSCAFG00845003749)	NENF (ENSCAFG00845003726)	PACC1 (ENSCAFG00845003695) #15	PPP2R5A (ENSCAFG00845003647) #16	ENSCAFG00845003622	DTL (ENSCAFG00845003601) #17	INTS7 (ENSCAFG00845003540) #18	LPGAT1 (ENSCAFG00845003454) #19	NEK2 (ENSCAFG00845003393) #21	ENSCAFG00845003364	SLC30A1 (ENSCAFG00845003355) #22	RD3 (ENSCAFG00845003339) #23	TRAF5 (ENSCAFG00845003309) #26	RCOR3 (ENSCAFG00845003256) #27	KCNH1 (ENSCAFG00845003207) #28	HHAT (ENSCAFG00845003133)	SERTAD4 (ENSCAFG00845003084)	SYT14 (ENSCAFG00845002980)	ENSCAFG00845002955	UTP25 (ENSCAFG00845002933)	IRF6 (ENSCAFG00845002898)	C7H1orf74 (ENSCAFG00845002876)	HSD11B1 (ENSCAFG00845002797)	HSD11B1 (ENSCAFG00845002717)	G0S2 (ENSCAFG00845002694)	LAMB3 (ENSCAFG00845002662)
Red fox	MODERN SPECIES	169											DTL (ENSVVUG00000009832) #17	INTS7 (ENSVVUG00000009774) #18	LPGAT1 (ENSVVUG00000009748) #19	NEK2 (ENSVVUG00000009737) #21	ENSVVUG00000009732	SLC30A1 (ENSVVUG00000009730) #22	RD3 (ENSVVUG00000009719)	TRAF5 (ENSVVUG00000009706) #26	RCOR3 (ENSVVUG00000009579) #27	KCNH1 (ENSVVUG00000009530) #28	HHAT (ENSVVUG00000009486)	SERTAD4 (ENSVVUG00000009468)	SYT14 (ENSVVUG00000009461)	UTP25 (ENSVVUG00000009447)	IRF6 (ENSVVUG00000009446)	C1orf74 (ENSVVUG00000009443)	TRAF3IP3 (ENSVVUG00000009437)	HSD11B1 (ENSVVUG00000009432)	ENSVVUG00000009428	LAMB3 (ENSVVUG00000009414)	CAMK1G (ENSVVUG00000009405)
Felidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Panthera	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
Tiger	MODERN SPECIES	521	VASH2 (ENSPTIG00000012122)	FLVCR1 (ENSPTIG00000010910)	SPATA45 (ENSPTIG00000010479)	TATDN3 (ENSPTIG00000008310)	NSL1 (ENSPTIG00000006400)	BATF3 (ENSPTIG00000005700)	ENSPTIG00000004611	ATF3 (ENSPTIG00000019609)	NENF (ENSPTIG00000019040)	PACC1 (ENSPTIG00000017660) #15	PPP2R5A (ENSPTIG00000014125) #16	DTL (ENSPTIG00000011890) #17	INTS7 (ENSPTIG00000006122) #18	LPGAT1 (ENSPTIG00000004763) #19	NEK2 (ENSPTIG00000002038) #21	SLC30A1 (ENSPTIG00000000982) #22	RD3 (ENSPTIG00000022107) #23	TRAF5 (ENSPTIG00000022091) #26	RCOR3 (ENSPTIG00000021961) #27	KCNH1 (ENSPTIG00000020776) #28	HHAT (ENSPTIG00000016498)	SERTAD4 (ENSPTIG00000015833)	SYT14 (ENSPTIG00000007847)	UTP25 (ENSPTIG00000006959)	IRF6 (ENSPTIG00000005579)	C1orf74 (ENSPTIG00000001704)	TRAF3IP3 (ENSPTIG00000017995)	HSD11B1 (ENSPTIG00000017565)	G0S2 (ENSPTIG00000001408)	LAMB3 (ENSPTIG00000012672)	CAMK1G (ENSPTIG00000009212)
Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00390000005569.x.a.a.a.b	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731
lion	MODERN SPECIES	17	VASH2 (ENSPLOG00000017598)	FLVCR1 (ENSPLOG00000017866)	SPATA45 (ENSPLOG00000017903)	TATDN3 (ENSPLOG00000017946)	NSL1 (ENSPLOG00000018060)	BATF3 (ENSPLOG00000018177)	ENSPLOG00000018205	ATF3 (ENSPLOG00000018263)	NENF (ENSPLOG00000018345)	PACC1 (ENSPLOG00000018379) #15	PPP2R5A (ENSPLOG00000018428) #16	DTL (ENSPLOG00000018578) #17	INTS7 (ENSPLOG00000018844) #18	LPGAT1 (ENSPLOG00000019332) #19	NEK2 (ENSPLOG00000019397) #21	SLC30A1 (ENSPLOG00000019453) #22	ENSPLOG00000019472	RD3 (ENSPLOG00000019480) #23	TRAF5 (ENSPLOG00000019506) #26	RCOR3 (ENSPLOG00000019556) #27	KCNH1 (ENSPLOG00000019902) #28	HHAT (ENSPLOG00000020137)	SERTAD4 (ENSPLOG00000020299)	SYT14 (ENSPLOG00000020341)	UTP25 (ENSPLOG00000020442)	IRF6 (ENSPLOG00000020500)	C1orf74 (ENSPLOG00000020545)	TRAF3IP3 (ENSPLOG00000020588)	HSD11B1 (ENSPLOG00000020783)	G0S2 (ENSPLOG00000020804)	LAMB3 (ENSPLOG00000020818)
leopard	MODERN SPECIES	4	VASH2 (ENSPPRG00000005999)	FLVCR1 (ENSPPRG00000005353)	SPATA45 (ENSPPRG00000005103)	TATDN3 (ENSPPRG00000004462)	NSL1 (ENSPPRG00000002797)	BATF3 (ENSPPRG00000002718)	ATF3 (ENSPPRG00000002289)	NENF (ENSPPRG00000000821)	PACC1 (ENSPPRG00000000785) #15	PPP2R5A (ENSPPRG00000000673) #16	DTL (ENSPPRG00000022900) #17	INTS7 (ENSPPRG00000023594) #18	LPGAT1 (ENSPPRG00000023949) #19	NEK2 (ENSPPRG00000024027) #21	ENSPPRG00000022520	SLC30A1 (ENSPPRG00000022135) #22	RD3 (ENSPPRG00000021993) #23	TRAF5 (ENSPPRG00000021762) #26	RCOR3 (ENSPPRG00000020950) #27	ENSPPRG00000016076	KCNH1 (ENSPPRG00000015068) #28	HHAT (ENSPPRG00000013699)	SERTAD4 (ENSPPRG00000012897)	SYT14 (ENSPPRG00000012744)	UTP25 (ENSPPRG00000012503)	IRF6 (ENSPPRG00000012322)	C1orf74 (ENSPPRG00000021598)	TRAF3IP3 (ENSPPRG00000012046)	HSD11B1 (ENSPPRG00000010503)	G0S2 (ENSPPRG00000021496)	LAMB3 (ENSPPRG00000010426)
Cat	MODERN SPECIES	248	VASH2 (ENSFCAG00000019311)	FLVCR1 (ENSFCAG00000000207)	ENSFCAG00000044441	TATDN3 (ENSFCAG00000015401)	NSL1 (ENSFCAG00000026230)	BATF3 (ENSFCAG00000040785)	GARIN4 (ENSFCAG00000029432)	ATF3 (ENSFCAG00000029636)	PACC1 (ENSFCAG00000014609) #15	NENF (ENSFCAG00000044045)	PPP2R5A (ENSFCAG00000025917) #16	DTL (ENSFCAG00000009064) #17	INTS7 (ENSFCAG00000009059) #18	LPGAT1 (ENSFCAG00000032094) #19	NEK2 (ENSFCAG00000023718) #21	SLC30A1 (ENSFCAG00000043708) #22	RD3 (ENSFCAG00000037771) #23	TRAF5 (ENSFCAG00000002126) #26	RCOR3 (ENSFCAG00000025437) #27	ENSFCAG00000025296	KCNH1 (ENSFCAG00000023833) #28	HHAT (ENSFCAG00000011034)	SERTAD4 (ENSFCAG00000023962)	SYT14 (ENSFCAG00000009054)	UTP25 (ENSFCAG00000015140)	IRF6 (ENSFCAG00000015138)	CF1H1orf74 (ENSFCAG00000015137)	TRAF3IP3 (ENSFCAG00000015135)	HSD11B1 (ENSFCAG00000030682)	G0S2 (ENSFCAG00000045691)	LAMB3 (ENSFCAG00000015132)
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	183			ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000163755	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	184			ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000162770	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000163755	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23
Elephant	MODERN SPECIES	105			SPATA45 (ENSLAFG00000012233)	TATDN3 (ENSLAFG00000012226)	NSL1 (ENSLAFG00000012223)	BATF3 (ENSLAFG00000027351)	GARIN4 (ENSLAFG00000021976)	ATF3 (ENSLAFG00000032487)	ENSLAFG00000022517	PACC1 (ENSLAFG00000017776) #15	PPP2R5A (ENSLAFG00000010472) #16	DTL (ENSLAFG00000009649) #17	INTS7 (ENSLAFG00000009461) #18	LPGAT1 (ENSLAFG00000017446) #19	NEK2 (ENSLAFG00000015115) #21	SLC30A1 (ENSLAFG00000016715) #22	RD3 (ENSLAFG00000018126) #23
Hyrax	MODERN SPECIES	8315																SLC30A1 (ENSPCAG00000016647) #22
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	1206																ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27
Sloth	MODERN SPECIES	11356																SLC30A1 (ENSCHOG00000008174) #22
Armadillo	MODERN SPECIES	756																SLC30A1 (ENSDNOG00000007891) #22	RD3 (ENSDNOG00000031468) #23	TRAF5 (ENSDNOG00000003782) #26	RCOR3 (ENSDNOG00000036780) #27
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186787	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000157451	ENSGT00390000002240	ENSGT00940000160260	ENSGT00940000160097	ENSGT00390000005294	ENSGT00940000160731	ENSGT00940000156872
koala	MODERN SPECIES	125	ANGEL2 (ENSPCIG00000030021)	VASH2 (ENSPCIG00000030028)	FLVCR1 (ENSPCIG00000030030)	ENSPCIG00000030031	TATDN3 (ENSPCIG00000030033)	NSL1 (ENSPCIG00000030035)	BATF3 (ENSPCIG00000030036)	ATF3 (ENSPCIG00000013371)	NENF (ENSPCIG00000013369)	PACC1 (ENSPCIG00000013367) #15	PPP2R5A (ENSPCIG00000013362) #16	DTL (ENSPCIG00000007249) #17	INTS7 (ENSPCIG00000006326) #18	ENSPCIG00000006133 #21	ENSPCIG00000006129	SLC30A1 (ENSPCIG00000006127) #22	RD3 (ENSPCIG00000034054) #23	TRAF5 (ENSPCIG00000006121) #26	RCOR3 (ENSPCIG00000008777) #27	KCNH1 (ENSPCIG00000013340) #28	HHAT (ENSPCIG00000028240)	SERTAD4 (ENSPCIG00000028241)	SYT14 (ENSPCIG00000028242)	UTP25 (ENSPCIG00000028244)	IRF6 (ENSPCIG00000028245)	ENSPCIG00000028246	TRAF3IP3 (ENSPCIG00000028247)	HSD11B1 (ENSPCIG00000028249)	ENSPCIG00000028250	LAMB3 (ENSPCIG00000028251)	CAMK1G (ENSPCIG00000028252)
Common wonbat	MODERN SPECIES	1035	FLVCR1 (ENSVURG00010011238)	TATDN3 (ENSVURG00010011308)	NSL1 (ENSVURG00010011350)	BATF3 (ENSVURG00010011366)	ATF3 (ENSVURG00010011382)	NENF (ENSVURG00010011416)	PACC1 (ENSVURG00010011432) #15	ENSVURG00010011442	PPP2R5A (ENSVURG00010011454) #16	ENSVURG00010011491	DTL (ENSVURG00010011506) #17	INTS7 (ENSVURG00010011544) #18	LPGAT1 (ENSVURG00010011595) #19	NEK2 (ENSVURG00010011613) #21	ENSVURG00010011639	SLC30A1 (ENSVURG00010011647) #22	RD3 (ENSVURG00010011654) #23	TRAF5 (ENSVURG00010011666) #26	RCOR3 (ENSVURG00010011693) #27	KCNH1 (ENSVURG00010011729) #28	HHAT (ENSVURG00010011759)	SERTAD4 (ENSVURG00010011777)	SYT14 (ENSVURG00010011804)	UTP25 (ENSVURG00010011872)	IRF6 (ENSVURG00010011882)	C1orf74 (ENSVURG00010011892)	TRAF3IP3 (ENSVURG00010011903)	HSD11B1 (ENSVURG00010011927)	G0S2 (ENSVURG00010011933)	LAMB3 (ENSVURG00010011948)	CAMK1G (ENSVURG00010011963)
Wallaby	MODERN SPECIES	14622																SLC30A1 (ENSMEUG00000004584) #22
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	3	RPS6KC1 (ENSSHAG00000013922)	ANGEL2 (ENSSHAG00000012912)	VASH2 (ENSSHAG00000012677)	FLVCR1 (ENSSHAG00000030976)	TATDN3 (ENSSHAG00000029907)	NSL1 (ENSSHAG00000031501)	ENSSHAG00000021860	ENSSHAG00000030030	PACC1 (ENSSHAG00000007950) #15	PPP2R5A (ENSSHAG00000007280) #16	DTL (ENSSHAG00000004304) #17	INTS7 (ENSSHAG00000001809) #18	LPGAT1 (ENSSHAG00000025369) #19	NEK2 (ENSSHAG00000023705) #21	ENSSHAG00000022411	SLC30A1 (ENSSHAG00000015056) #22	RD3 (ENSSHAG00000020730) #23	TRAF5 (ENSSHAG00000014289) #26	RCOR3 (ENSSHAG00000014006) #27	KCNH1 (ENSSHAG00000029794) #28	HHAT (ENSSHAG00000006396)	SERTAD4 (ENSSHAG00000026265)	SYT14 (ENSSHAG00000026173)	UTP25 (ENSSHAG00000030819)	IRF6 (ENSSHAG00000001714)	C1orf74 (ENSSHAG00000029419)	TRAF3IP3 (ENSSHAG00000011020)	HSD11B1 (ENSSHAG00000028213)	G0S2 (ENSSHAG00000024852)	LAMB3 (ENSSHAG00000010013)	CAMK1G (ENSSHAG00000009646)
Opossum	MODERN SPECIES	1	VASH2 (ENSMODG00000003103)	FLVCR1 (ENSMODG00000039454)	ENSMODG00000048923	TATDN3 (ENSMODG00000003075)	NSL1 (ENSMODG00000003069)	BATF3 (ENSMODG00000044517)	ATF3 (ENSMODG00000024736)	ENSMODG00000044731	NENF (ENSMODG00000002982)	PACC1 (ENSMODG00000002976) #15	PPP2R5A (ENSMODG00000002945) #16	DTL (ENSMODG00000002910) #17	INTS7 (ENSMODG00000002883) #18	LPGAT1 (ENSMODG00000002797) #19	NEK2 (ENSMODG00000002788) #21	SLC30A1 (ENSMODG00000040578) #22	RD3 (ENSMODG00000048589) #23	TRAF5 (ENSMODG00000002723) #26	RCOR3 (ENSMODG00000002688) #27	KCNH1 (ENSMODG00000002636) #28	ENSMODG00000043400	HHAT (ENSMODG00000002621)	SERTAD4 (ENSMODG00000040460)	SYT14 (ENSMODG00000002602)	ENSMODG00000048554	UTP25 (ENSMODG00000002563)	IRF6 (ENSMODG00000002539)	TRAF3IP3 (ENSMODG00000002520)	G0S2 (ENSMODG00000024755)	LAMB3 (ENSMODG00000002485)	CAMK1G (ENSMODG00000002455)
Platypus	MODERN SPECIES	10	ANGEL2 (ENSOANG00000008513)	VASH2 (ENSOANG00000008512)	FLVCR1 (ENSOANG00000008510)	ENSOANG00000043660	TATDN3 (ENSOANG00000008509)	NSL1 (ENSOANG00000049937)	BATF3 (ENSOANG00000045778)	PACC1 (ENSOANG00000037820) #15	ATF3 (ENSOANG00000040285)	ENSOANG00000008500	PPP2R5A (ENSOANG00000008492) #16	DTL (ENSOANG00000008486) #17	INTS7 (ENSOANG00000008482) #18	LPGAT1 (ENSOANG00000008481) #19	NEK2 (ENSOANG00000008480) #21	SLC30A1 (ENSOANG00000008479) #22	ENSOANG00000045447	RD3 (ENSOANG00000046905) #23	TRAF5 (ENSOANG00000008477) #26	RCOR3 (ENSOANG00000008476) #27	KCNH1 (ENSOANG00000008475) #28	HHAT (ENSOANG00000008473)	SERTAD4 (ENSOANG00000008472)	SYT14 (ENSOANG00000008471)	UTP25 (ENSOANG00000008470)	MRPS10 (ENSOANG00000046701)	TRERF1 (ENSOANG00000008467)	UBR2 (ENSOANG00000008465)	PRPH2 (ENSOANG00000008464)	BICRAL (ENSOANG00000008462)	TBCC (ENSOANG00000045116)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Aves	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Neognathae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT00940000163755	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
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Golden eagle	MODERN SPECIES	4	ANGEL2 (ENSACCG00020014925)	VASH2 (ENSACCG00020014981)	FLVCR1 (ENSACCG00020014999)	TATDN3 (ENSACCG00020015033)	NSL1 (ENSACCG00020015051)	BATF3 (ENSACCG00020015065)	ATF3 (ENSACCG00020008599)	PACC1 (ENSACCG00020008621) #15	NENF (ENSACCG00020008643)	PPP2R5A (ENSACCG00020008659) #16	DTL (ENSACCG00020008681) #17	INTS7 (ENSACCG00020008723) #18	LPGAT1 (ENSACCG00020008768) #19	NEK2 (ENSACCG00020008781) #21	ENSACCG00020008801	SLC30A1 (ENSACCG00020008810) #22	RD3 (ENSACCG00020008824) #23	TRAF5 (ENSACCG00020008854) #26	RCOR3 (ENSACCG00020008875) #27	KCNH1 (ENSACCG00020008975) #28	ENSACCG00020009020	HHAT (ENSACCG00020009039)	SERTAD4 (ENSACCG00020009059)	SYT14 (ENSACCG00020009082)	UTP25 (ENSACCG00020009101)	MRPS10 (ENSACCG00020009116)	TRERF1 (ENSACCG00020009144)	UBR2 (ENSACCG00020009199)	PRPH2 (ENSACCG00020009229)	TBCC (ENSACCG00020009236)	BICRAL (ENSACCG00020009246)
Kakapo	MODERN SPECIES	2	ANGEL2 (ENSSHBG00005005783)	VASH2 (ENSSHBG00005005806)	FLVCR1 (ENSSHBG00005005819)	TATDN3 (ENSSHBG00005005845)	ENSSHBG00005005869	BATF3 (ENSSHBG00005005898)	ATF3 (ENSSHBG00005005920)	NENF (ENSSHBG00005005957)	PACC1 (ENSSHBG00005005980) #15	PPP2R5A (ENSSHBG00005006014) #16	DTL (ENSSHBG00005006047) #17	INTS7 (ENSSHBG00005006098) #18	LPGAT1 (ENSSHBG00005006133) #19	NEK2 (ENSSHBG00005006157) #21	ENSSHBG00005006186	SLC30A1 (ENSSHBG00005006207) #22	RD3 (ENSSHBG00005006233) #23	TRAF5 (ENSSHBG00005006335) #26	RCOR3 (ENSSHBG00005006373) #27	KCNH1 (ENSSHBG00005006442) #28	HHAT (ENSSHBG00005006525)	SERTAD4 (ENSSHBG00005006545)	SYT14 (ENSSHBG00005006667)	UTP25 (ENSSHBG00005006715)	MRPS10 (ENSSHBG00005006737)	TRERF1 (ENSSHBG00005006750)	UBR2 (ENSSHBG00005006802)	PRPH2 (ENSSHBG00005006918)	TBCC (ENSSHBG00005006942)	BICRAL (ENSSHBG00005006971)	PKDCC (ENSSHBG00005007003)
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Passeriformes_g	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376.d	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT00940000163755	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Passeroidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376.c	ENSGT00940000156376.d	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Zebra finch	MODERN SPECIES	23	RPS6KC1 (ENSTGUG00000002977)	ANGEL2 (ENSTGUG00000002995)	VASH2 (ENSTGUG00000003006)	FLVCR1 (ENSTGUG00000003013)	TATDN3 (ENSTGUG00000003025)	NSL1 (ENSTGUG00000003044)	ATF3 (ENSTGUG00000003050)	NENF (ENSTGUG00000022854)	PACC1 (ENSTGUG00000003056) #15	PPP2R5A (ENSTGUG00000003063) #16	DTL (ENSTGUG00000003109) #17	INTS7 (ENSTGUG00000003120) #18	LPGAT1 (ENSTGUG00000019484) #19	NEK2 (ENSTGUG00000003146) #21	ENSTGUG00000003167	SLC30A1 (ENSTGUG00000029172) #22	RD3 (ENSTGUG00000025500) #23	TRAF5 (ENSTGUG00000021131) #26	RCOR3 (ENSTGUG00000003186) #27	KCNH1 (ENSTGUG00000003202) #28	HHAT (ENSTGUG00000003218)	SERTAD4 (ENSTGUG00000021627)	SYT14 (ENSTGUG00000003225)	UTP25 (ENSTGUG00000003232)	MRPS10 (ENSTGUG00000003245)	TRERF1 (ENSTGUG00000003250)	UBR2 (ENSTGUG00000003261)	PRPH2 (ENSTGUG00000023472)	TBCC (ENSTGUG00000003366)	BICRAL (ENSTGUG00000003367)	PKDCC (ENSTGUG00000003379)
Common canary	MODERN SPECIES	41	VASH2 (ENSSCAG00000005868)	FLVCR1 (ENSSCAG00000005885)	TATDN3 (ENSSCAG00000005926)	NSL1 (ENSSCAG00000005931)	BATF3 (ENSSCAG00000005934)	ENSSCAG00000005938	ENSSCAG00000005940	ENSSCAG00000005944	PACC1 (ENSSCAG00000005947) #15	PPP2R5A (ENSSCAG00000005950) #16	DTL (ENSSCAG00000005955) #17	INTS7 (ENSSCAG00000005962) #18	LPGAT1 (ENSSCAG00000005968) #19	NEK2 (ENSSCAG00000005972) #21	ENSSCAG00000005978	SLC30A1 (ENSSCAG00000005981) #22	RD3 (ENSSCAG00000005989) #23	TRAF5 (ENSSCAG00000005995) #26	RCOR3 (ENSSCAG00000005998) #27	KCNH1 (ENSSCAG00000006019) #28	ENSSCAG00000006052	SERTAD4 (ENSSCAG00000006084)	SYT14 (ENSSCAG00000006087)	UTP25 (ENSSCAG00000006092)	MRPS10 (ENSSCAG00000006100)	TRERF1 (ENSSCAG00000006105)	ENSSCAG00000006111
Galloanserae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT00940000163755	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Phasianidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT00940000163755	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Phasianidae_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000155656	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000163755	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Chicken	MODERN SPECIES	22	ANGEL2 (ENSGALG00010019183)	VASH2 (ENSGALG00010019221)	FLVCR1 (ENSGALG00010021615)	TATDN3 (ENSGALG00010019252)	NSL1 (ENSGALG00010019268)	BATF3 (ENSGALG00010019285)	ATF3 (ENSGALG00010019307)	TMEM206 (ENSGALG00010019403) #15	NENF (ENSGALG00010019515)	PPP2R5A (ENSGALG00010019534) #16	DTL (ENSGALG00010020574) #17	INTS7 (ENSGALG00010020590) #18	LPGAT1 (ENSGALG00010020611) #19	ENSGALG00010020618	NEK2 (ENSGALG00010020623) #21	SLC30A1 (ENSGALG00010020625) #22	RD3 (ENSGALG00010018807) #23	TRAF5 (ENSGALG00010018822) #26	RCOR3 (ENSGALG00010018837)	KCNH1 (ENSGALG00010018849) #28	HHAT (ENSGALG00010018882)	SERTAD4 (ENSGALG00010018894)	SYT14 (ENSGALG00010018936)	DIEXF (ENSGALG00010018969)	MRPS10 (ENSGALG00010018987)	TRERF1 (ENSGALG00010019000)	UBR2 (ENSGALG00010018529)	PRPH2 (ENSGALG00010018541)	TBCC (ENSGALG00010018557)	BICRAL (ENSGALG00010018594)	PKDCC (ENSGALG00010018672)
Japanese quail	MODERN SPECIES	21	VASH2 (ENSCJPG00005007462)	FLVCR1 (ENSCJPG00005007463)	TATDN3 (ENSCJPG00005007464)	NSL1 (ENSCJPG00005007465)	BATF3 (ENSCJPG00005007466)	ATF3 (ENSCJPG00005007468)	NENF (ENSCJPG00005007470)	PACC1 (ENSCJPG00005007471) #15	PPP2R5A (ENSCJPG00005007473) #16	ENSCJPG00005007482	DTL (ENSCJPG00005007484) #17	INTS7 (ENSCJPG00005007485) #18	LPGAT1 (ENSCJPG00005007486) #19	NEK2 (ENSCJPG00005007488) #21	ENSCJPG00005007489	SLC30A1 (ENSCJPG00005007490) #22	RD3 (ENSCJPG00005007491) #23	TRAF5 (ENSCJPG00005007503) #26	RCOR3 (ENSCJPG00005007504) #27	KCNH1 (ENSCJPG00005007508) #28	HHAT (ENSCJPG00005007517)	SERTAD4 (ENSCJPG00005007526)	SYT14 (ENSCJPG00005007527)	UTP25 (ENSCJPG00005007548)	MRPS10 (ENSCJPG00005007557)	TRERF1 (ENSCJPG00005007560)	UBR2 (ENSCJPG00005007728)	PRPH2 (ENSCJPG00005008434)	ENSCJPG00005008435	BICRAL (ENSCJPG00005008436)	PKDCC (ENSCJPG00005008549)
Anatidae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000153634.b	ENSGT00950000182834.A.a.b.c	ENSGT00390000000412	ENSGT00390000000417.a.a.b.a.b	ENSGT00940000157376	ENSGT00390000018505	ENSGT00390000002210.d	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00950000185540	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Pink-footed goose	MODERN SPECIES	3	CNIH4 (ENSABRG00000014980)	WDR26 (ENSABRG00000014906)	CNIH3 (ENSABRG00000014873)	LBR (ENSABRG00000014869)	ENAH (ENSABRG00000014862)	SRP9 (ENSABRG00000014859)	EPHX1 (ENSABRG00000014856)	NENF (ENSABRG00000014855)	PACC1 (ENSABRG00000014853) #15	PPP2R5A (ENSABRG00000014850) #16	DTL (ENSABRG00000014849) #17	INTS7 (ENSABRG00000014847) #18	LPGAT1 (ENSABRG00000014845) #19	NEK2 (ENSABRG00000014844) #21	ENSABRG00000014842	SLC30A1 (ENSABRG00000014840) #22	RD3 (ENSABRG00000014837) #23	TRAF5 (ENSABRG00000014827) #26	RCOR3 (ENSABRG00000014791) #27	KCNH1 (ENSABRG00000014780) #28	HHAT (ENSABRG00000014772)	SERTAD4 (ENSABRG00000014769)	SYT14 (ENSABRG00000014758)	UTP25 (ENSABRG00000014743)	MRPS10 (ENSABRG00000014739)	TRERF1 (ENSABRG00000014735)	UBR2 (ENSABRG00000011635)	PRPH2 (ENSABRG00000011421)	ENSABRG00000011419	BICRAL (ENSABRG00000011398)	PKDCC (ENSABRG00000011387)
Duck	MODERN SPECIES	21	CNIH4 (ENSAPLG00000012950)	WDR26 (ENSAPLG00000013139)	CNIH3 (ENSAPLG00000013264)	ENSAPLG00000024602	LBR (ENSAPLG00000013563)	ENAH (ENSAPLG00000014191)	SRP9 (ENSAPLG00000015368)	EPHX1 (ENSAPLG00000015369)	ENSAPLG00000022272	PACC1 (ENSAPLG00000015557) #15	PPP2R5A (ENSAPLG00000015734) #16	DTL (ENSAPLG00000016053) #17	INTS7 (ENSAPLG00000016233) #18	LPGAT1 (ENSAPLG00000010836) #19	NEK2 (ENSAPLG00000010876) #21	SLC30A1 (ENSAPLG00000000775) #22	RD3 (ENSAPLG00000020251) #23	TRAF5 (ENSAPLG00000006555) #26	ENSAPLG00000007210	KCNH1 (ENSAPLG00000007453) #28	ENSAPLG00000029050	ENSAPLG00000007807	SERTAD4 (ENSAPLG00000020952)	SYT14 (ENSAPLG00000007935)	UTP25 (ENSAPLG00000007948)	KCNK1 (ENSAPLG00000008119)	SLC35F3 (ENSAPLG00000008027)	COA6 (ENSAPLG00000022615)	TARBP1 (ENSAPLG00000007666)	TOMM20 (ENSAPLG00000004030)	RBM34 (ENSAPLG00000004344)
African ostrich	MODERN SPECIES	401	ANGEL2 (ENSSCUG00000006827)	VASH2 (ENSSCUG00000006823)	FLVCR1 (ENSSCUG00000006821)	ENSSCUG00000006819	TATDN3 (ENSSCUG00000006817)	NSL1 (ENSSCUG00000006816)	BATF3 (ENSSCUG00000006815)	ATF3 (ENSSCUG00000006812)	ENSSCUG00000006808	PACC1 (ENSSCUG00000006803) #15	PPP2R5A (ENSSCUG00000006769) #16	DTL (ENSSCUG00000006750) #17	INTS7 (ENSSCUG00000006722) #18	LPGAT1 (ENSSCUG00000006696) #19	NEK2 (ENSSCUG00000006691) #21	SLC30A1 (ENSSCUG00000006687) #22	RD3 (ENSSCUG00000006684) #23	TRAF5 (ENSSCUG00000006676) #26	RCOR3 (ENSSCUG00000006674) #27	KCNH1 (ENSSCUG00000006671) #28	HHAT (ENSSCUG00000006670)	SERTAD4 (ENSSCUG00000006667)	SYT14 (ENSSCUG00000006666)	UTP25 (ENSSCUG00000006662)	MRPS10 (ENSSCUG00000006659)	TRERF1 (ENSSCUG00000006653)	UBR2 (ENSSCUG00000006648)	PRPH2 (ENSSCUG00000006646)	BICRAL (ENSSCUG00000006641)	PKDCC (ENSSCUG00000006636)	EML4 (ENSSCUG00000006616)
Australian saltwater crocodile	MODERN SPECIES	60	VASH2 (ENSCPRG00005000563)	FLVCR1 (ENSCPRG00005000556)	ENSCPRG00005000527	TATDN3 (ENSCPRG00005000521)	NSL1 (ENSCPRG00005000512)	BATF3 (ENSCPRG00005000509)	ATF3 (ENSCPRG00005000494)	NENF (ENSCPRG00005000447)	PACC1 (ENSCPRG00005000440) #15	PPP2R5A (ENSCPRG00005000419) #16	DTL (ENSCPRG00005000390) #17	INTS7 (ENSCPRG00005000314) #18	LPGAT1 (ENSCPRG00005000299) #19	NEK2 (ENSCPRG00005000292) #21	ENSCPRG00005000233	SLC30A1 (ENSCPRG00005000229) #22	ENSCPRG00005000223	RD3 (ENSCPRG00005000202) #23	TRAF5 (ENSCPRG00005000156) #26	RCOR3 (ENSCPRG00005015680) #27	KCNH1 (ENSCPRG00005015665) #28	HHAT (ENSCPRG00005015655)	SERTAD4 (ENSCPRG00005015648)	SYT14 (ENSCPRG00005015646)	UTP25 (ENSCPRG00005015642)	MRPS10 (ENSCPRG00005015640)	TRERF1 (ENSCPRG00005015638)	UBR2 (ENSCPRG00005015618)	PRPH2 (ENSCPRG00005015610)	ENSCPRG00005015604	BICRAL (ENSCPRG00005015601)
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00950000185540	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00950000185540	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00950000185540	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
painted turtle	MODERN SPECIES	2402							ENSCPBG00000015457	NENF (ENSCPBG00000015468)	PACC1 (ENSCPBG00000015469) #15	PPP2R5A (ENSCPBG00000015472) #16	DTL (ENSCPBG00000015475) #17	INTS7 (ENSCPBG00000015481) #18	LPGAT1 (ENSCPBG00000015486) #19	NEK2 (ENSCPBG00000015492) #21	ENSCPBG00000015493	SLC30A1 (ENSCPBG00000015495) #22	RD3 (ENSCPBG00000015496) #23	TRAF5 (ENSCPBG00000015501) #26	RCOR3 (ENSCPBG00000015504) #27	KCNH1 (ENSCPBG00000015506) #28	HHAT (ENSCPBG00000015512)	SERTAD4 (ENSCPBG00000015516)	SYT14 (ENSCPBG00000015519)	UTP25 (ENSCPBG00000015521)	MRPS10 (ENSCPBG00000015528)	TRERF1 (ENSCPBG00000015530)	UBR2 (ENSCPBG00000015536)	PRPH2 (ENSCPBG00000015538)	ENSCPBG00000015539	ENSCPBG00000015541	BICRAL (ENSCPBG00000015545)
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	55	FLVCR1 (ENSTMTG00000000689)	ENSTMTG00000000706	ENSTMTG00000000718	TATDN3 (ENSTMTG00000000733)	NSL1 (ENSTMTG00000000746)	BATF3 (ENSTMTG00000000752)	ATF3 (ENSTMTG00000000758)	NENF (ENSTMTG00000000774)	PACC1 (ENSTMTG00000000815) #15	PPP2R5A (ENSTMTG00000000847) #16	DTL (ENSTMTG00000000901) #17	INTS7 (ENSTMTG00000000974) #18	LPGAT1 (ENSTMTG00000001005) #19	NEK2 (ENSTMTG00000001021) #21	ENSTMTG00000001038	SLC30A1 (ENSTMTG00000001044) #22	RD3 (ENSTMTG00000001052) #23	TRAF5 (ENSTMTG00000001063) #26	RCOR3 (ENSTMTG00000001087) #27	KCNH1 (ENSTMTG00000001179) #28	ENSTMTG00000001313	HHAT (ENSTMTG00000001333)	SERTAD4 (ENSTMTG00000001349)	SYT14 (ENSTMTG00000001356)	UTP25 (ENSTMTG00000001369)	MRPS10 (ENSTMTG00000001380)	TRERF1 (ENSTMTG00000001396)	UBR2 (ENSTMTG00000001422)	PRPH2 (ENSTMTG00000001460)	ENSTMTG00000001468	BICRAL (ENSTMTG00000001484)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00950000185540	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	2786				KCTD21 (ENSCABG00000000667)	ALG8 (ENSCABG00000000675)	NDUFC2 (ENSCABG00000000818)	THRSP (ENSCABG00000000819)	KCTD14 (ENSCABG00000000823)	INTS4 (ENSCABG00000000838)	AAMDC (ENSCABG00000001198)	RSF1 (ENSCABG00000001219)	CLNS1A (ENSCABG00000001639)	AQP11 (ENSCABG00000001641)	ENSCABG00000001647	ENSCABG00000001651	SLC30A1 (ENSCABG00000001652) #22
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	17	FLVCR1 (ENSGEVG00005003222)	ENSGEVG00005003271	ENSGEVG00005003282	TATDN3 (ENSGEVG00005003294)	NSL1 (ENSGEVG00005003308)	BATF3 (ENSGEVG00005003315)	ATF3 (ENSGEVG00005003323)	NENF (ENSGEVG00005003335)	PACC1 (ENSGEVG00005003344) #15	PPP2R5A (ENSGEVG00005003359) #16	DTL (ENSGEVG00005003388) #17	INTS7 (ENSGEVG00005003412) #18	LPGAT1 (ENSGEVG00005003430) #19	NEK2 (ENSGEVG00005003443) #21	ENSGEVG00005003451	SLC30A1 (ENSGEVG00005003457) #22	RD3 (ENSGEVG00005003464) #23	TRAF5 (ENSGEVG00005003476) #26	RCOR3 (ENSGEVG00005003544) #27	KCNH1 (ENSGEVG00005003596) #28	HHAT (ENSGEVG00005003677)	SERTAD4 (ENSGEVG00005003691)	SYT14 (ENSGEVG00005003699)	UTP25 (ENSGEVG00005003709)	MRPS10 (ENSGEVG00005003729)	TRERF1 (ENSGEVG00005003742)	UBR2 (ENSGEVG00005003786)	PRPH2 (ENSGEVG00005003862)	ENSGEVG00005003869	BICRAL (ENSGEVG00005003883)	PKDCC (ENSGEVG00005003901)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	1156															NEK2 (ENSPSIG00000007636) #21	SLC30A1 (ENSPSIG00000009946) #22
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01000000220805	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a.f	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a.f	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	5	FLVCR1 (ENSPTXG00000013174)	ENSPTXG00000013176	TATDN3 (ENSPTXG00000013177)	ENSPTXG00000013178	ENSPTXG00000013179	BATF3 (ENSPTXG00000013182)	ATF3 (ENSPTXG00000013183)	NENF (ENSPTXG00000013184)	PACC1 (ENSPTXG00000013186) #15	PPP2R5A (ENSPTXG00000013187) #16	DTL (ENSPTXG00000000027) #17	INTS7 (ENSPTXG00000000097) #18	LPGAT1 (ENSPTXG00000000115) #19	NEK2 (ENSPTXG00000000164) #21	ENSPTXG00000000191	SLC30A1 (ENSPTXG00000000199) #22	RD3 (ENSPTXG00000000208) #23	TRAF5 (ENSPTXG00000000226) #26	RCOR3 (ENSPTXG00000000243) #27	KCNH1 (ENSPTXG00000000347) #28	ENSPTXG00000000720	SERTAD4 (ENSPTXG00000000723)	SYT14 (ENSPTXG00000000727)	UTP25 (ENSPTXG00000000730)	MRPS10 (ENSPTXG00000000734)	TRERF1 (ENSPTXG00000000753)	UBR2 (ENSPTXG00000000761)	PRPH2 (ENSPTXG00000000770)	ENSPTXG00000000771	BICRAL (ENSPTXG00000000775)	PKDCC (ENSPTXG00000000780)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	3	ENSNSUG00000012821	ENSNSUG00000012822	TATDN3 (ENSNSUG00000012823)	NSL1 (ENSNSUG00000012825)	BATF3 (ENSNSUG00000012826)	ATF3 (ENSNSUG00000012827)	NENF (ENSNSUG00000012828)	PACC1 (ENSNSUG00000012829) #15	PPP2R5A (ENSNSUG00000012873) #16	DTL (ENSNSUG00000012930) #17	INTS7 (ENSNSUG00000012931) #18	LPGAT1 (ENSNSUG00000012932) #19	NEK2 (ENSNSUG00000012933) #21	ENSNSUG00000012934	ENSNSUG00000012935	SLC30A1 (ENSNSUG00000012936) #22	TRAF5 (ENSNSUG00000012939) #26	RCOR3 (ENSNSUG00000012940) #27	KCNH1 (ENSNSUG00000012941) #28	HHAT (ENSNSUG00000012956)	SERTAD4 (ENSNSUG00000012957)	SYT14 (ENSNSUG00000012958)	UTP25 (ENSNSUG00000012959)	MRPS10 (ENSNSUG00000012960)	TRERF1 (ENSNSUG00000012961)	UBR2 (ENSNSUG00000013064)	PRPH2 (ENSNSUG00000014472)	TBCC (ENSNSUG00000014473)	BICRAL (ENSNSUG00000014475)	PKDCC (ENSNSUG00000014476)	EML4 (ENSNSUG00000014477)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	303															ENSLLTG00000009344	SLC30A1 (ENSLLTG00000009336) #22
Indian cobra	MODERN SPECIES		VASH2 (ENSNNAG00000004597)	FLVCR1 (ENSNNAG00000004570)	ENSNNAG00000004540	TATDN3 (ENSNNAG00000004506)	NSL1 (ENSNNAG00000004462)	BATF3 (ENSNNAG00000004447)	ATF3 (ENSNNAG00000004429)	ENSNNAG00000004411	PACC1 (ENSNNAG00000004337) #15	PPP2R5A (ENSNNAG00000004222) #16	DTL (ENSNNAG00000004150) #17	INTS7 (ENSNNAG00000004100) #18	LPGAT1 (ENSNNAG00000004068) #19	NEK2 (ENSNNAG00000004029) #21	ENSNNAG00000004015	SLC30A1 (ENSNNAG00000004000) #22	RD3 (ENSNNAG00000003988) #23	TRAF5 (ENSNNAG00000003905) #26	RCOR3 (ENSNNAG00000003867) #27	KCNH1 (ENSNNAG00000003670) #28	ENSNNAG00000003613 #29	HHAT (ENSNNAG00000003591)	SERTAD4 (ENSNNAG00000003573)	SYT14 (ENSNNAG00000003556)	UTP25 (ENSNNAG00000003528)	MRPS10 (ENSNNAG00000003514)	TRERF1 (ENSNNAG00000003445)	UBR2 (ENSNNAG00000001877)	PRPH2 (ENSNNAG00000001387)	ENSNNAG00000001374	BICRAL (ENSNNAG00000001348)
Lizard	MODERN SPECIES		ENSACAG00000042552	TATDN3 (ENSACAG00000006315)	NSL1 (ENSACAG00000038951)	BATF3 (ENSACAG00000006345)	ATF3 (ENSACAG00000006353)	ENSACAG00000006366	PACC1 (ENSACAG00000006381) #15	ENSACAG00000037416	PPP2R5A (ENSACAG00000029680) #16	DTL (ENSACAG00000006628) #17	INTS7 (ENSACAG00000006668) #18	ENSACAG00000038796	LPGAT1 (ENSACAG00000016289) #19	NEK2 (ENSACAG00000016319) #21	ENSACAG00000040124	SLC30A1 (ENSACAG00000016353) #22	RD3 (ENSACAG00000042507) #23	TRAF5 (ENSACAG00000016371) #26	RCOR3 (ENSACAG00000016406) #27	KCNH1 (ENSACAG00000001495) #28	HHAT (ENSACAG00000001446)	SERTAD4 (ENSACAG00000001441)	ENSACAG00000041017	ENSACAG00000044010	SYT14 (ENSACAG00000001401)	UTP25 (ENSACAG00000001292)	ENSACAG00000001234	TRERF1 (ENSACAG00000001080)	UBR2 (ENSACAG00000000759)	PRPH2 (ENSACAG00000000732)	TBCC (ENSACAG00000000725)
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00960000188973	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00390000009045	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000157303	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000159766	ENSGT00390000001205.a
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	7	ENSSMRG00000018605	TATDN3 (ENSSMRG00000018604)	NSL1 (ENSSMRG00000018603)	BATF3 (ENSSMRG00000018602)	ATF3 (ENSSMRG00000018601)	NENF (ENSSMRG00000018599)	ENSSMRG00000018598	PACC1 (ENSSMRG00000018597) #15	PPP2R5A (ENSSMRG00000018595) #16	DTL (ENSSMRG00000018593) #17	INTS7 (ENSSMRG00000018590) #18	ENSSMRG00000018589	LPGAT1 (ENSSMRG00000018588) #19	NEK2 (ENSSMRG00000018587) #21	ENSSMRG00000018586	SLC30A1 (ENSSMRG00000018585) #22	RD3 (ENSSMRG00000018584) #23	TRAF5 (ENSSMRG00000018582) #26	RCOR3 (ENSSMRG00000018581) #27	KCNH1 (ENSSMRG00000018579) #28	HHAT (ENSSMRG00000018574)	SERTAD4 (ENSSMRG00000018573)	SYT14 (ENSSMRG00000018571)	UTP25 (ENSSMRG00000018570)	MRPS10 (ENSSMRG00000018568)	TRERF1 (ENSSMRG00000018567)	UBR2 (ENSSMRG00000018565)	TBCC (ENSSMRG00000018564)	BICRAL (ENSSMRG00000018563)	PKDCC (ENSSMRG00000018561)	EML4 (ENSSMRG00000018558)
Common wall lizard	MODERN SPECIES	11	ENSPMRG00000004454	ENSPMRG00000004462	TATDN3 (ENSPMRG00000004468)	NSL1 (ENSPMRG00000004477)	BATF3 (ENSPMRG00000004483)	ATF3 (ENSPMRG00000004496)	NENF (ENSPMRG00000004502)	PACC1 (ENSPMRG00000004508) #15	PPP2R5A (ENSPMRG00000004514) #16	DTL (ENSPMRG00000004523) #17	INTS7 (ENSPMRG00000004535) #18	ENSPMRG00000004550	LPGAT1 (ENSPMRG00000004552) #19	NEK2 (ENSPMRG00000004558) #21	ENSPMRG00000004565	SLC30A1 (ENSPMRG00000004570) #22	RD3 (ENSPMRG00000004574) #23	TRAF5 (ENSPMRG00000004577) #26	RCOR3 (ENSPMRG00000004587) #27	KCNH1 (ENSPMRG00000004598) #28	HHAT (ENSPMRG00000004612)	SERTAD4 (ENSPMRG00000004633)	SYT14 (ENSPMRG00000004648)	ENSPMRG00000004681	ENSPMRG00000004684	UTP25 (ENSPMRG00000004693)	MRPS10 (ENSPMRG00000004706)	TRERF1 (ENSPMRG00000004713)	ENSPMRG00000004733	ENSPMRG00000004780	PRPH2 (ENSPMRG00000004781)
Anura	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157391	ENSGT00390000012703.a	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00390000008171	ENSGT00940000160954 #26	ENSGT00940000154196.b #27	ENSGT00940000155793 #28	ENSGT00530000063629.a	ENSGT00530000063876.a	ENSGT00940000159420	ENSGT00390000000709	ENSGT00940000162058	ENSGT00940000157303	ENSGT00950000183075.a.a.a.a	ENSGT00940000160303.b	ENSGT00390000009045
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	7	BATF3 (ENSLLEG00000008988)	ATF3 (ENSLLEG00000009021)	ENSLLEG00000009079	NENF (ENSLLEG00000009097)	ENSLLEG00000009137	PACC1 (ENSLLEG00000009187) #15	ENSLLEG00000009502	PPP2R5A (ENSLLEG00000009569) #16	ENSLLEG00000010072	DTL (ENSLLEG00000010123) #17	INTS7 (ENSLLEG00000010296) #18	ENSLLEG00000010797	LPGAT1 (ENSLLEG00000010826) #19	NEK2 (ENSLLEG00000010941) #21	ENSLLEG00000011010	SLC30A1 (ENSLLEG00000011060) #22	ENSLLEG00000011086 #23	MRPL57 (ENSLLEG00000011111)	TRAF5 (ENSLLEG00000011138) #26	ENSLLEG00000011298	RCOR3 (ENSLLEG00000011367) #27	KCNH1 (ENSLLEG00000011761) #28	ENSLLEG00000012124	HHAT (ENSLLEG00000012170)	SERTAD4 (ENSLLEG00000012571)	SYT14 (ENSLLEG00000012646)	UTP25 (ENSLLEG00000012831)	TBCC (ENSLLEG00000012916)	PRPH2 (ENSLLEG00000012937)	UBR2 (ENSLLEG00000013085)	TRERF1 (ENSLLEG00000014132)
Frog	MODERN SPECIES	5	tatdn3 (ENSXETG00000042429)	nsl1 (ENSXETG00000030886)	BATF3 (ENSXETG00000043512)	atf3 (ENSXETG00000044220)	ENSXETG00000046226	pacc1 (ENSXETG00000014356) #15	nenf (ENSXETG00000014379)	ENSXETG00000044881	ppp2r5a (ENSXETG00000014382) #16	ENSXETG00000048053	dtl (ENSXETG00000014394) #17	ints7 (ENSXETG00000014409) #18	lpgat1 (ENSXETG00000014416) #19	nek2 (ENSXETG00000025008) #21	ENSXETG00000040473	slc30a1 (ENSXETG00000042450) #22	rd3 (ENSXETG00000045435) #23	mrpl57 (ENSXETG00000038041)	traf5 (ENSXETG00000014444) #26	ENSXETG00000043169	bicral (ENSXETG00000031648)	trerf1 (ENSXETG00000000198)	ubr2 (ENSXETG00000000201)	ENSXETG00000037891	prph2 (ENSXETG00000000215)	utp25 (ENSXETG00000000216)	syt14 (ENSXETG00000000217)	sertad4 (ENSXETG00000038324)	hhat (ENSXETG00000000222)	kcnh1 (ENSXETG00000000225) #28	rcor3 (ENSXETG00000005989) #27
Coelacanth	MODERN SPECIES	1017												ENSLACG00000001607	DTL (ENSLACG00000007596) #17	INTS7 (ENSLACG00000008229) #18	NEK2 (ENSLACG00000011174) #21	SLC30A1 (ENSLACG00000011878) #22	ENSLACG00000012861 #23	ENSLACG00000013332	ENSLACG00000013677
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	68	ENSGT01030000234625.B.c	ENSGT00390000018676	ENSGT00720000108846.b	ENSGT00720000108846.a	ENSGT00390000001374	ENSGT00940000161120	ENSGT00940000156376	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00390000002089.a.b #23	ENSGT00390000004585	ENSGT00940000159665	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00940000157671	ENSGT00940000161139	ENSGT00390000011405	ENSGT00950000182767.a	ENSGT00940000170599	ENSGT00390000016465	ENSGT00390000006681	ENSGT00390000016736.b	ENSGT00940000157407	ENSGT00390000000417.a.a.b.a.a
Reedfish	DUPLICATION
Reedfish	MODERN SPECIES	6	ENSECRG00000015933	susd4 (ENSECRG00000015893)	TLR5 (ENSECRG00000015865)	disp1 (ENSECRG00000015843)	FAM177B (ENSECRG00000015747)	brox (ENSECRG00000015673)	aida (ENSECRG00000015589)	ENSECRG00000015469	taf1a (ENSECRG00000015412)	HHIPL2 (ENSECRG00000015302)	DUSP10 (ENSECRG00000015272)	hlx1 (ENSECRG00000015241)	MTARC2 (ENSECRG00000015207)	C1orf115 (ENSECRG00000015182)	RD3 (ENSECRG00000015153) #23	slc30a1a (ENSECRG00000015132) #22	nek2 (ENSECRG00000015091) #21	lpgat1 (ENSECRG00000015060) #19	ints7 (ENSECRG00000014961) #18	dtl (ENSECRG00000014895) #17	PPP2R5A (ENSECRG00000014821) #16	pacc1 (ENSECRG00000014790) #15	nenf (ENSECRG00000014763)	atf3 (ENSECRG00000014748)	batf3 (ENSECRG00000014732)	NSL1 (ENSECRG00000014702)	TATDN3 (ENSECRG00000014664)	tatdn3 (ENSECRG00000014581)	ENSECRG00000014549	flvcr1 (ENSECRG00000014534)	VASH2 (ENSECRG00000014477)
Reedfish	MODERN SPECIES	4	ENSECRG00000021513	plekhf2 (ENSECRG00000021506)	ENSECRG00000021435	CFAP418 (ENSECRG00000021400)	gdf6b (ENSECRG00000021391)	uqcrb (ENSECRG00000021382)	mterf3 (ENSECRG00000021372)	ptdss1a (ENSECRG00000021349)	ENSECRG00000021327	sdc2 (ENSECRG00000021311)	CPQ (ENSECRG00000021297)	mtdha (ENSECRG00000021287)	laptm4b (ENSECRG00000021265)	MATN2 (ENSECRG00000021239)	rpl30 (ENSECRG00000021220)	ENSECRG00000021204 #22	ccdc127a (ENSECRG00000021187)	sdha (ENSECRG00000021166)	ENSECRG00000021150	ENSECRG00000021143	mrpl32 (ENSECRG00000021136)	psma2b (ENSECRG00000021101)	wdyhv1 (ENSECRG00000021075)	ATAD2 (ENSECRG00000021029)	ENSECRG00000021000	ENSECRG00000020987	ENSECRG00000020970	cndp2 (ENSECRG00000020940)	cndp1 (ENSECRG00000020772)	CNDP1 (ENSECRG00000020687)	ENSECRG00000020651
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT00940000163755	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000167629	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00900000143764	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s	ENSGT00940000177261
Spotted gar	MODERN SPECIES	647	kcnk3a (ENSLOCG00000016383)	ENSLOCG00000016382	enpp1 (ENSLOCG00000016378)	SYTL3 (ENSLOCG00000016375)	ezra (ENSLOCG00000016372)	rsph3 (ENSLOCG00000016370)	tagapb (ENSLOCG00000016367)	opn8c (ENSLOCG00000016365)	nenf (ENSLOCG00000016364)	pacc1 (ENSLOCG00000016363) #15	PPP2R5A (ENSLOCG00000016361) #16	dtl (ENSLOCG00000016359) #17	ints7 (ENSLOCG00000016358) #18	lpgat1 (ENSLOCG00000016357) #19	nek2 (ENSLOCG00000016356) #21	slc30a1a (ENSLOCG00000016355) #22	rd3 (ENSLOCG00000016354) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSLOCG00000016352)	rhag (ENSLOCG00000016348)	CRISP1 (ENSLOCG00000016346)	ENSLOCG00000016342	ENSLOCG00000016341	tfap2b (ENSLOCG00000016338)	tfap2d (ENSLOCG00000016336)	hadhb (ENSLOCG00000016333)	hadhab (ENSLOCG00000016329)	GAREM2 (ENSLOCG00000016328)	rab10 (ENSLOCG00000016323)	KIF3C (ENSLOCG00000016321)	ASXL2 (ENSLOCG00000016319)	dtnbb (ENSLOCG00000016318)
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000162013	ENSGT00940000167629	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00900000143764	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975	ENSGT00940000153739.a.b.s
Osteoglossiformes	DUPLICATION
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000160301	ENSGT00940000155428.b	ENSGT00940000158104	ENSGT00950000182863.B.b	ENSGT00390000007341.b	ENSGT00940000160421	ENSGT00940000174492	ENSGT00940000167312	ENSGT00940000161139	ENSGT00950000183093.C.h	ENSGT00940000159665	ENSGT00940000158248.a	ENSGT01090000260082.d.b.a	ENSGT00940000162504	ENSGT00390000017528 #15	ENSGT00940000156484.b.c #22	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156975.d.a	ENSGT00940000153897.b.a.a.b	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.i	ENSGT00940000155086.A.g	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156248.oc.a	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00940000176900	ENSGT01030000234944.B	ENSGT00940000154481.a.b.a	ENSGT00940000158133	ENSGT00390000012924.a
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	6	ENSSFOG00015015314	ENSSFOG00015015236	ENSSFOG00015015203	ENSSFOG00015030624	ENSSFOG00015026453	ENSSFOG00015029731	HHIPL2 (ENSSFOG00015015157)	ENSSFOG00015029683	ENSSFOG00015015141	ENSSFOG00015015092	ezra (ENSSFOG00015015054)	tagapa (ENSSFOG00015015035)	nenf (ENSSFOG00015028126)	pacc1 (ENSSFOG00015015014) #15	ENSSFOG00015030842	ENSSFOG00015031571 #22	hadhab (ENSSFOG00015014954)	rab10 (ENSSFOG00015014932)	ENSSFOG00015014919	dnmt3ab (ENSSFOG00015014853)	MAPRE3 (ENSSFOG00015014816)	OTOF (ENSSFOG00015014727)	orc3 (ENSSFOG00015014381)	akirin2 (ENSSFOG00015014031)	CNR1 (ENSSFOG00015013994)	GABRR1 (ENSSFOG00015013972)	gabrr2a (ENSSFOG00015013943)	rragd (ENSSFOG00015013913)	ANKRD6 (ENSSFOG00015013830)	gja10a (ENSSFOG00015031485)	BACH2 (ENSSFOG00015026786)
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	96	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01030000235236	ENSGT00940000156484.b.d #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00950000182848.c.b.b.b	ENSGT00900000143764	ENSGT00950000182848.d	ENSGT01030000234626.A.b	ENSGT00940000154677.b.b	ENSGT00530000063834.e.b	ENSGT00940000156975.c	ENSGT00940000177261	ENSGT00940000156975.d.b	ENSGT00940000153739.a.b.s	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b
Asian bonytongue	MODERN SPECIES		kcnk3a (ENSSFOG00015007334)	enpp1 (ENSSFOG00015007214)	ENSSFOG00015026961	ezrb (ENSSFOG00015007139)	rsph3 (ENSSFOG00015007102)	rsph3 (ENSSFOG00015007023)	tagapb (ENSSFOG00015006564)	opn8c (ENSSFOG00015026570)	PPP2R5A (ENSSFOG00015006942) #16	dtl (ENSSFOG00015006892) #17	ints7 (ENSSFOG00015006821) #18	lpgat1 (ENSSFOG00015027445) #19	ENSSFOG00015027071	nek2 (ENSSFOG00015006772) #21	ENSSFOG00015006757	slc30a1a (ENSSFOG00015027996) #22	rd3 (ENSSFOG00015027647) ##23	rhag (ENSSFOG00015006691)	ENSSFOG00015006673	tfap2b (ENSSFOG00015006654)	ENSSFOG00015027405	tfap2d (ENSSFOG00015006620)	hadhb (ENSSFOG00015006603)	hadhaa (ENSSFOG00015006508)	GAREM2 (ENSSFOG00015006462)	rab10 (ENSSFOG00015027492)	KIF3C (ENSSFOG00015006428)	ASXL2 (ENSSFOG00015006380)	hspb9l (ENSSFOG00015006397)	dtnbb (ENSSFOG00015006252)	DNMT3A (ENSSFOG00015006003)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	340		hlx1 (ENSPKIG00000020979)	slc35f6 (ENSPKIG00000020998)	kcnk3a (ENSPKIG00000021013)	enpp1 (ENSPKIG00000021026)	SYTL3 (ENSPKIG00000021064)	ezrb (ENSPKIG00000021097)	rsph3 (ENSPKIG00000021155)	tagapb (ENSPKIG00000021199)	PPP2R5A (ENSPKIG00000021218) #16	dtl (ENSPKIG00000021256) #17	ints7 (ENSPKIG00000021288) #18	lpgat1 (ENSPKIG00000021349) #19	nek2 (ENSPKIG00000021375) #21	ENSPKIG00000021399	slc30a1a (ENSPKIG00000021406) #22	rd3 (ENSPKIG00000021412) ##23	rhag (ENSPKIG00000021430)	ENSPKIG00000021468	ENSPKIG00000021516	tfap2b (ENSPKIG00000021538)	tfap2d (ENSPKIG00000021570)
Clupeocephala	DUPLICATION
Clupeocephala	DUPLICATION
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	104															ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00960000191541	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000164272	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00940000156509	ENSGT00940000156674	ENSGT00940000155913.c	ENSGT00390000011642.f	ENSGT00940000154481.a.a
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	272									ENSGT00940000155086.A	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00970000197437	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000161107	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000159896	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159456	ENSGT00940000155076.a.d	ENSGT00390000010899.a.a	ENSGT01030000234573.B.c.a	ENSGT00940000158683.a.a.a.a	ENSGT00940000164671
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	293									ENSGT00940000155086.A	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00390000013337	ENSGT00940000158401.f	ENSGT00730000111244.a.a	ENSGT01050000244948.c.b.b	ENSGT00940000153467.a.a	ENSGT00950000183204.b.b.b	ENSGT00730000111123	ENSGT01030000234595.A.b.a.a	ENSGT00950000182906.b.a.i.a	ENSGT00940000156778.k	ENSGT00530000063408.A	ENSGT00940000160723
Atlantic herring	MODERN SPECIES	5	ENSCHAG00000018268	ENSCHAG00000018276	SYT16 (ENSCHAG00000018284)	snapc1b (ENSCHAG00000018292)	ENSCHAG00000018304	ENSCHAG00000018321	ENSCHAG00000018346	OTOF (ENSCHAG00000000406)	mapre3a (ENSCHAG00000000501)	dpysl5a (ENSCHAG00000000568)	dnmt3ab (ENSCHAG00000001499)	ENSCHAG00000006987	dtnbb (ENSCHAG00000007033)	ENSCHAG00000008222	kif3cb (ENSCHAG00000008255)	slc30a1b (ENSCHAG00000008322) #22	rmnd1 (ENSCHAG00000008338)	ZBTB2 (ENSCHAG00000008565)	ENSCHAG00000008579	stx11a (ENSCHAG00000008606)	ENSCHAG00000008612	fbxo30a (ENSCHAG00000008643)	SHPRH (ENSCHAG00000008680)	GRM1 (ENSCHAG00000009878)	STXBP5 (ENSCHAG00000010273)	ENSCHAG00000010722	UST (ENSCHAG00000010759)	ddo (ENSCHAG00000010884)	zbtb24 (ENSCHAG00000010892)	ENSCHAG00000010899	foxo3a (ENSCHAG00000010925)
Otophysi	DUPLICATION
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000154030.a.b	ENSGT00940000161652.b.b	ENSGT00940000164359.b	ENSGT00940000159468	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b	ENSGT00530000063503.a.b.g.b	ENSGT00940000156078.c	ENSGT00940000155724.q	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000178910	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #22	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00390000016216	ENSGT00940000156793	ENSGT00940000157459.b	ENSGT00940000164671	ENSGT00940000158683.a.a.a.a	ENSGT01030000234573.B.c.a	ENSGT00390000010899.a.a	ENSGT00940000155076.a.d	ENSGT00940000159456	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161652.b.b	ENSGT00940000164359.b	ENSGT00940000159468	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b	ENSGT00940000154484.B.a.b	ENSGT00530000063503.a.b.g.b	ENSGT00940000156078.c	ENSGT00940000155724.q	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000178910	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #22	ENSGT01080000259636	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00390000016216	ENSGT00940000156793	ENSGT00940000157459.b	ENSGT00940000164671	ENSGT00940000158683.a.a.a.a	ENSGT01030000234573.B.c.a	ENSGT00390000010899.a.a	ENSGT00940000155076.a.d	ENSGT00940000159456	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610
Channel catfish	MODERN SPECIES	28	adam17a (ENSIPUG00000023481)	rnf144aa (ENSIPUG00000023528)	rsad2 (ENSIPUG00000023544)	cmpk2 (ENSIPUG00000023548)	sox11 (ENSIPUG00000023551)	colec11 (ENSIPUG00000023552)	HTR1B (ENSIPUG00000023556)	myo6b (ENSIPUG00000023558)	ENSIPUG00000023566	mapre3a (ENSIPUG00000023574)	dpysl5 (ENSIPUG00000023577)	dnmt3ab (ENSIPUG00000023584)	dtnb (ENSIPUG00000023593)	asxl2 (ENSIPUG00000023610)	kif3cb (ENSIPUG00000023614)	slc30a1b (ENSIPUG00000023619) #22	ENSIPUG00000023621	hadhab (ENSIPUG00000023622)	ENSIPUG00000023629	tmem62 (ENSIPUG00000023636)	ptgr2 (ENSIPUG00000023638)	elmsan1 (ENSIPUG00000023646)	crip1 (ENSIPUG00000023649)	crip2 (ENSIPUG00000023653)	mta1 (ENSIPUG00000023660)	tmem229b (ENSIPUG00000023676)	ZFP36L1 (ENSIPUG00000023681)	plekhh1 (ENSIPUG00000023683)	SLC25A21 (ENSIPUG00000023687)	pax9 (ENSIPUG00000023700)	nkx2-8 (ENSIPUG00000023703)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000161652.b.a	ENSGT00940000164359.b	ENSGT00940000159468	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b	ENSGT00940000154484.B.a.b	ENSGT00530000063503.a.b.g.b	ENSGT00940000156078.c	ENSGT00940000155724.q	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000178910	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #22	ENSGT01080000259636	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00390000016216	ENSGT00940000156793	ENSGT00940000157459.b	ENSGT00940000164671	ENSGT00940000158683.a.a.a.a	ENSGT01030000234573.B.c.a	ENSGT00390000010899.a.a	ENSGT00940000155076.a.d	ENSGT00940000159456	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610
Electric eel	MODERN SPECIES	508						colec11 (ENSEEEG00000001964)	HTR1B (ENSEEEG00000001967)	myo6b (ENSEEEG00000001977)	ENSEEEG00000001985	mapre3a (ENSEEEG00000001988)	dpysl5a (ENSEEEG00000001992)	dnmt3ab (ENSEEEG00000002024)	dtnbb (ENSEEEG00000003204)	ASXL2 (ENSEEEG00000003206)	ENSEEEG00000003207	slc30a1b (ENSEEEG00000003208) #22	hadhab (ENSEEEG00000003245)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	32	ENSGT00530000063877.b.a	ENSGT00940000159377	ENSGT00940000164359.b	ENSGT00940000159468	ENSGT00940000154484.B.a.b	ENSGT00530000063503.a.b.g.b	ENSGT00940000156078.c	ENSGT00940000155724.q	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000178910	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #22	ENSGT01080000259636	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000156975.e.b	ENSGT00390000016216	ENSGT00940000156793	ENSGT00940000157459.b	ENSGT00940000164671	ENSGT00940000158683.a.a.a.a	ENSGT01030000234573.B.c.a	ENSGT00390000010899.a.a	ENSGT00940000155076.a.d	ENSGT00940000159456	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000182318
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	33	CMPK2 (ENSPNAG00000017162)	ENSPNAG00000003468	ENSPNAG00000017132	ENSPNAG00000017107	colec11 (ENSPNAG00000017024)	htr1b (ENSPNAG00000017017)	ENSPNAG00000016997	myo6b (ENSPNAG00000016938)	ENSPNAG00000016660	mapre3a (ENSPNAG00000016644)	dpysl5a (ENSPNAG00000016614)	dnmt3ab (ENSPNAG00000016534)	dtnbb (ENSPNAG00000016352)	ASXL2 (ENSPNAG00000016179)	kif3cb (ENSPNAG00000016169)	slc30a1b (ENSPNAG00000016132) #22	ENSPNAG00000016125	hadhab (ENSPNAG00000016106)	ENSPNAG00000015996	TMEM62 (ENSPNAG00000015959)	ptgr2 (ENSPNAG00000015939)	ENSPNAG00000015910	crip1 (ENSPNAG00000015879)	crip2 (ENSPNAG00000015866)	MTA1 (ENSPNAG00000015822)	tmem229b (ENSPNAG00000015730)	zfp36l1a (ENSPNAG00000015712)	ENSPNAG00000015709	plekhh1 (ENSPNAG00000015669)	slc25a21 (ENSPNAG00000015603)	pax9 (ENSPNAG00000015572)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	24	ENSAMXG00000037587	colec11 (ENSAMXG00000039363)	htr1b (ENSAMXG00000025153)	ENSAMXG00000035833	ENSAMXG00000038125	myo6b (ENSAMXG00000017107)	ENSAMXG00000031248	mapre3a (ENSAMXG00000035032)	dpysl5a (ENSAMXG00000017057)	dnmt3ab (ENSAMXG00000030597)	ENSAMXG00000034971	dtnbb (ENSAMXG00000039786)	ASXL2 (ENSAMXG00000040278)	kif3cb (ENSAMXG00000016963)	ENSAMXG00000038010	slc30a1b (ENSAMXG00000033624) #22	hadhab (ENSAMXG00000016894)	ENSAMXG00000033253	TMEM62 (ENSAMXG00000016834)	ptgr2 (ENSAMXG00000016801)	ENSAMXG00000016770	crip1 (ENSAMXG00000033153)	crip2 (ENSAMXG00000032936)	MTA1 (ENSAMXG00000002214)	tmem229b (ENSAMXG00000041935)	zfp36l1a (ENSAMXG00000036093)	plekhh1 (ENSAMXG00000002175)	slc25a21 (ENSAMXG00000039088)	pax9 (ENSAMXG00000031250)	ENSAMXG00000002158	nkx2.1 (ENSAMXG00000002155)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000013670	ENSGT00940000154030.a.b	ENSGT00940000164359.b	ENSGT00940000159468	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b	ENSGT00530000063503.a.b.g.b	ENSGT00940000156078.c	ENSGT00940000155724.q	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000178910	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #22	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00390000016216	ENSGT00940000156793	ENSGT00940000157459.b	ENSGT00940000164671	ENSGT00940000158683.a.a.a.a	ENSGT01030000234573.B.c.a	ENSGT00390000010899.a.a	ENSGT00940000155076.a.d	ENSGT00940000159456	ENSGT00730000111119	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107.t	ENSGT00510000047831
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	132										ENSGT00490000043329.a.b.g.a.b	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.b	ENSGT00940000155459.x.b.b	ENSGT00940000153897.b.a.b.a	ENSGT00520000055578.a.b.a	ENSGT00940000153739.a.b.t.c	ENSGT00940000156484.b.e.a.a #22	ENSGT00940000154677.b.a.c	ENSGT00390000016216.b	ENSGT00940000156793	ENSGT00940000157459.b.b	ENSGT00940000164671	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.f	ENSGT01030000234573.B.c.a.t	ENSGT00390000010899.a.a.f	ENSGT00940000155076.a.d.b	ENSGT00940000159456.a	ENSGT00730000111119.e.a	ENSGT00940000159896.g	ENSGT00940000161610.w.b	ENSGT00940000161107.t.b	ENSGT00510000047831.a
Cyprininae_a	DUPLICATION
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	74	ENSGT00390000003990.r	ENSGT00940000155443.c.b	ENSGT00940000157701.f.b.b	ENSGT00940000154030.a.b.a	ENSGT00390000013670.j	ENSGT00940000154030.a.b.b	ENSGT00940000159468.d	ENSGT01010000222287.B.b.a.b.b.b.c	ENSGT00530000063503.a.b.g.b.b	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.b	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.b	ENSGT00940000155459.x.b.b	ENSGT00940000153897.b.a.b.a	ENSGT00520000055578.a.b.a	ENSGT00940000153739.a.b.t.c	ENSGT00940000156484.b.e.a.a.a #22	ENSGT00940000154677.b.a.c	ENSGT00390000016216.b	ENSGT00940000156793.m	ENSGT00940000157459.b.b	ENSGT00940000164671	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.e.a.b	ENSGT00940000158683.a.b.b	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.f	ENSGT01030000234573.B.c.a.t	ENSGT00390000010899.a.a.f	ENSGT00940000155076.a.d.b	ENSGT00940000159456.a	ENSGT00730000111119.e.a	ENSGT00940000159896.g	ENSGT00940000161610.w.b
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	188			sox11a (ENSSGRG00000031279)	colec11 (ENSSGRG00000031280)	HTR1B (ENSSGRG00000031281)	ENSSGRG00000031282	myo6b (ENSSGRG00000031310)	mapre3a (ENSSGRG00000034213)	dpysl5a (ENSSGRG00000034222)	dnmt3ab (ENSSGRG00000034588)	dtnbb (ENSSGRG00000034708)	ASXL2 (ENSSGRG00000034746)	kif3cb (ENSSGRG00000034747)	kif3cb (ENSSGRG00000034748)	ENSSGRG00000034749	slc30a1b (ENSSGRG00000034750) #22	hadhab (ENSSGRG00000034752)	TMEM62 (ENSSGRG00000034754)	ptgr2 (ENSSGRG00000034756)	ENSSGRG00000034928	crip1 (ENSSGRG00000034938)	crip2 (ENSSGRG00000034941)	MTA1 (ENSSGRG00000034959)	tmem229b (ENSSGRG00000035924)	plekhh1 (ENSSGRG00000035927)	slc25a21 (ENSSGRG00000035962)	ENSSGRG00000036031
Common carp reference	MODERN SPECIES	4	ENSCCRG00000068064	sox11a (ENSCCRG00000060391)	colec11 (ENSCCRG00000041025)	HTR1B (ENSCCRG00000049481)	ENSCCRG00000063432	ENSCCRG00000078826	myo6b (ENSCCRG00000028622)	mapre3a (ENSCCRG00000026813)	dpysl5a (ENSCCRG00000058101)	dnmt3ab (ENSCCRG00000008419)	dtnbb (ENSCCRG00000029912)	ENSCCRG00000076338	ENSCCRG00000063534	ENSCCRG00000018140	kif3cb (ENSCCRG00000079903)	slc30a1b (ENSCCRG00000074185) #22	hadhab (ENSCCRG00000078184)	ENSCCRG00000014613	ptgr2 (ENSCCRG00000067372)	ENSCCRG00000070712	ENSCCRG00000024868	ENSCCRG00000062562	crip2 (ENSCCRG00000048564)	ENSCCRG00000021347	tmem229b (ENSCCRG00000066937)	zfp36l1a (ENSCCRG00000075538)	plekhh1 (ENSCCRG00000021579)	slc25a21 (ENSCCRG00000033343)	pax9 (ENSCCRG00000033350)	NKX2-8 (ENSCCRG00000033353)	mbip (ENSCCRG00000012894)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	465																ENSGT00940000156484.b.e.a.a.b #22	ENSGT00940000154677.b.a.d	ENSGT00390000016216.a	ENSGT00940000156793.n	ENSGT00940000157459.b.a	ENSGT00940000162342	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.e.b	ENSGT01030000234573.B.c.a.s	ENSGT00390000010899.a.a.e	ENSGT00940000155076.a.d.a	ENSGT00940000159456.b	ENSGT00730000111119.e.b	ENSGT00940000159896.h	ENSGT00940000161610.w.a	ENSGT00940000161107.t.a	ENSGT00510000047831.b
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	292			sox11a (ENSSGRG00000011051)	ENSSGRG00000011050	colec11 (ENSSGRG00000011028)	HTR1B (ENSSGRG00000011024)	ENSSGRG00000008713	mapre3a (ENSSGRG00000008697)	ENSSGRG00000008696	dpysl5a (ENSSGRG00000008679)	dnmt3ab (ENSSGRG00000006603)	dtnbb (ENSSGRG00000006519)	ASXL2 (ENSSGRG00000006518)	ENSSGRG00000006517	ENSSGRG00000006516	slc30a1b (ENSSGRG00000006515) #22	hadhab (ENSSGRG00000002835)	TMEM62 (ENSSGRG00000002418)	ptgr2 (ENSSGRG00000002415)	ENSSGRG00000002410	crip1 (ENSSGRG00000002361)	crip2 (ENSSGRG00000002353)	MTA1 (ENSSGRG00000002266)	zfp36l1a (ENSSGRG00000002264)	plekhh1 (ENSSGRG00000002262)	slc25a21 (ENSSGRG00000002255)	ENSSGRG00000002252	NKX2-8 (ENSSGRG00000002251)	ENSSGRG00000002250	ENSSGRG00000002248	mbip (ENSSGRG00000002247)
Goldfish	MODERN SPECIES	8	rnf144aa (ENSCARG00000050309)	ENSCARG00000050341	ENSCARG00000050358	colec11 (ENSCARG00000050371)	HTR1B (ENSCARG00000050392)	ENSCARG00000050407	myo6b (ENSCARG00000050475)	ENSCARG00000050835	mapre3a (ENSCARG00000050854)	dpysl5a (ENSCARG00000050873)	dnmt3ab (ENSCARG00000050968)	dtnbb (ENSCARG00000053334)	ENSCARG00000055965	kif3cb (ENSCARG00000056090)	ENSCARG00000056126	slc30a1b (ENSCARG00000056146) #22	hadhab (ENSCARG00000056328)	TMEM62 (ENSCARG00000060601)	ptgr2 (ENSCARG00000060665)	ENSCARG00000060693	crip1 (ENSCARG00000060728)	crip2 (ENSCARG00000060777)	MTA1 (ENSCARG00000060844)	tmem229b (ENSCARG00000062716)	zfp36l1a (ENSCARG00000062720)	plekhh1 (ENSCARG00000062727)	slc25a21 (ENSCARG00000062792)	pax9 (ENSCARG00000062808)	NKX2-8 (ENSCARG00000062822)	nkx2.1 (ENSCARG00000062837)	mbip (ENSCARG00000062846)
Zebrafish	MODERN SPECIES	8	ENSDARG00000111789	sox11a (ENSDARG00000077811)	ENSDARG00000103264	colec11 (ENSDARG00000013266)	htr1b (ENSDARG00000053987)	ENSDARG00000074839	myo6b (ENSDARG00000042141)	ENSDARG00000079992	mapre3a (ENSDARG00000020231)	dpysl5a (ENSDARG00000011141)	ENSDARG00000109649	dnmt3ab (ENSDARG00000015566)	dtnbb (ENSDARG00000013020)	ASXL2 (ENSDARG00000076501)	kif3cb (ENSDARG00000079500)	slc30a1b (ENSDARG00000053896) #22	hadhab (ENSDARG00000060594)	ENSDARG00000117189	TMEM62 (ENSDARG00000053890)	ptgr2 (ENSDARG00000070673)	ENSDARG00000053864	ENSDARG00000096902	crip1 (ENSDARG00000053858)	crip2 (ENSDARG00000070670)	MTA1 (ENSDARG00000007198)	tmem229b (ENSDARG00000060569)	zfp36l1a (ENSDARG00000016154)	plekhh1 (ENSDARG00000053835)	slc25a21 (ENSDARG00000060564)	pax9 (ENSDARG00000053829)	nkx2.9 (ENSDARG00000020332)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	338										ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00390000010770	ENSGT00390000007015.x	ENSGT00730000111019.e.b	ENSGT01020000230401.a.a.a	ENSGT00940000157927	ENSGT00940000159120.f	ENSGT00390000013762.b.a.a.a	ENSGT00940000159341	ENSGT00400000022349	ENSGT00940000157993	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00960000186817	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000157913.b.b	ENSGT00940000153592.A.a	ENSGT00390000005242	ENSGT00390000004313	ENSGT00940000158992	ENSGT00940000157359
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00390000010770	ENSGT00390000007015.x	ENSGT00730000111019.e.b	ENSGT01020000230401.a.a.a	ENSGT00940000157927	ENSGT00940000159120.f	ENSGT00390000013762.b.a.a.a	ENSGT00940000159341	ENSGT00400000022349	ENSGT00940000157993	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000157913.b.b	ENSGT00940000153592.A.a	ENSGT00390000005242	ENSGT00390000004313	ENSGT00940000158992	ENSGT00940000157359	ENSGT00940000154644.jb.b.h	ENSGT00530000063883	ENSGT00940000154800.g.a
Electric eel	MODERN SPECIES	53													zdhhc17 (ENSEEEG00000008140)	OSBPL8 (ENSEEEG00000008131)	nek2 (ENSEEEG00000008096) #21	SLC30A1 (ENSEEEG00000008092) #22	slc30a1a (ENSEEEG00000008089) #22	rd3 (ENSEEEG00000008088) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSEEEG00000008085)	rhag (ENSEEEG00000008059)	ENSEEEG00000008056	DLGAP2 (ENSEEEG00000008017)	ENSEEEG00000008016	grcc10 (ENSEEEG00000008015)	saysd1 (ENSEEEG00000008014)	ENSEEEG00000008012	bpnt1 (ENSEEEG00000008011)	ENSEEEG00000007555	ENSEEEG00000007526	ypel5 (ENSEEEG00000007523)	ZFAND3 (ENSEEEG00000007521)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	167								ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000163503.B.c.m	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000157913.b.b.a	ENSGT00390000005242	ENSGT00390000004313	ENSGT00940000157913.b.b.b
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	46						ENSGT00390000011724.f #18	ENSGT00530000064210.b #17	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.j #16	ENSGT00940000158248.b.h	ENSGT00940000156034.a.q	ENSGT01090000260082.d.b.b.h	ENSGT00940000157993.`b.b	ENSGT00950000182836.b.a.b.f #19	ENSGT00940000156989.i #21	ENSGT00960000186817.f	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT00940000156484.b.e.b.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.d ##23	ENSGT00730000112900.b	ENSGT00950000182844.b.a.h	ENSGT00940000163503.B.c.m.c	ENSGT00940000155979.h.c	ENSGT00940000157913.b.b.b	ENSGT00390000005242.b	ENSGT00390000004313.a	ENSGT00940000157359.a	ENSGT00440000039837.i.a	ENSGT00940000158876.p	ENSGT00940000156775.f.c	ENSGT00940000166942	ENSGT00390000017767.b.a.s.a
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	918														ENSGT00940000156989.i #21	ENSGT00960000186817.f	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	373										enpp1 (ENSSGRG00000017175)	ezrb (ENSSGRG00000017999)	ENSSGRG00000020490	ENSSGRG00000020491	nek2 (ENSSGRG00000020492) #21	ENSSGRG00000020494	ENSSGRG00000020496 #22	slc30a1a (ENSSGRG00000020498) #22	rd3 (ENSSGRG00000020500) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSSGRG00000020502)	rhag (ENSSGRG00000020505)	kcns3b (ENSSGRG00000020921)	DLGAP2 (ENSSGRG00000020922)	grcc10 (ENSSGRG00000020924)	bpnt1 (ENSSGRG00000020936)	ENSSGRG00000021077	kcnk5b (ENSSGRG00000021104)	syt14b (ENSSGRG00000021105)	ENSSGRG00000021106	si:dkey-174m14.3 (ENSSGRG00000021107)	rdh14b (ENSSGRG00000021108)	crip2l (ENSSGRG00000021109)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	828															ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.a #22
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT01030000234573.B.d	ENSGT00940000162342	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.a	ENSGT01030000234573.B.c.a	ENSGT00390000010899.a.a	ENSGT00940000155076.a.d	ENSGT00940000159456	ENSGT00730000111119.c	ENSGT00940000159896	ENSGT00940000161610	ENSGT00940000161107	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D	ENSGT00940000154677.b.a	ENSGT00940000153739.a.b.t	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00940000166633	ENSGT00520000055578.a.b	ENSGT00940000153897.b.a.b	ENSGT00940000155459.x.b	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a	ENSGT00490000043329.a.b.g.a	ENSGT00940000155086.A	ENSGT00940000153804.A	ENSGT00940000155086.B	ENSGT00530000063558.B.k	ENSGT00390000011877	ENSGT00390000013931	ENSGT01030000234626.B.ub	ENSGT00950000182941.a.a.a.b	ENSGT00940000167949
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	205	ENSGT00940000161107.u	ENSGT00510000047831	ENSGT00940000156886.D.h	ENSGT00940000157459.b.d	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.b	ENSGT01030000234573.B.d	ENSGT01030000234573.B.c.a.r	ENSGT00390000010899.a.a.h	ENSGT00940000155076.a.d.d	ENSGT00940000159456.d	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c
Huchen	DUPLICATION
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	3531													ENSHHUG00000024111	ENSHHUG00000024115	ENSHHUG00000024118 #22	ENSHHUG00000024122 #22	hadhab (ENSHHUG00000024131)	ENSHHUG00000024173	ENSHHUG00000035587	dtnbb (ENSHHUG00000035590)
Huchen	MODERN SPECIES	989										slc25a21 (ENSHHUG00000040153)	pax9 (ENSHHUG00000040170)	NKX2-8 (ENSHHUG00000040177)	nkx2.1 (ENSHHUG00000040179)	mbip (ENSHHUG00000040184)	ENSHHUG00000040227	ENSHHUG00000040431 #22	hadhab (ENSHHUG00000040455)	kif3cb (ENSHHUG00000040472)	ENSHHUG00000040474	ENSHHUG00000040477	ENSHHUG00000040482	dtnbb (ENSHHUG00000040508)	ENSHHUG00000041441
Huchen	MODERN SPECIES	3531														ENSHHUG00000024111	ENSHHUG00000024115	ENSHHUG00000024118 #22	ENSHHUG00000024122 #22	hadhab (ENSHHUG00000024131)	ENSHHUG00000024173	ENSHHUG00000035587	dtnbb (ENSHHUG00000035590)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000164613.d	ENSGT00940000163117.c.b	ENSGT00940000165020.b.d	ENSGT00940000157459.b.d	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.b	ENSGT01030000234573.B.d	ENSGT01030000234573.B.c.a.r	ENSGT00390000010899.a.a.h	ENSGT00940000155076.a.d.d	ENSGT00940000159456.d	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00730000111244.a.a.c
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00940000165020.b.d	ENSGT00940000157459.b.d	ENSGT01060000252721	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.b	ENSGT01030000234573.B.d	ENSGT01030000234573.B.c.a.r	ENSGT00390000010899.a.a.h	ENSGT00940000155076.a.d.d	ENSGT00940000159456.d	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT01000000220414	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	60	ENSGT00940000158908.l	ENSGT00940000173788	ENSGT00940000165020.b.d	ENSGT00940000157459.b.d	ENSGT01060000252721	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.b	ENSGT01030000234573.B.d	ENSGT01030000234573.B.c.a.r	ENSGT00390000010899.a.a.h	ENSGT00940000155076.a.d.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT01000000220414	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00730000111244.a.a.c	ENSGT01050000244948.c.b.b.l
Coho salmon	MODERN SPECIES	5	ENSOKIG00005049250	ENSOKIG00005049237	crip2 (ENSOKIG00005049220)	ENSOKIG00005048582	tmem229b (ENSOKIG00005048473)	zfp36l1a (ENSOKIG00005048464)	ENSOKIG00005048461	plekhh1 (ENSOKIG00005048296)	slc25a21 (ENSOKIG00005048242)	ENSOKIG00005048236	pax9 (ENSOKIG00005048217)	NKX2-8 (ENSOKIG00005048212)	nkx2.1 (ENSOKIG00005048207)	ENSOKIG00005048203	ENSOKIG00005047400	slc30a1b (ENSOKIG00005047249) #22	hadhab (ENSOKIG00005047072)	ENSOKIG00005047031	ENSOKIG00005047024	dtnbb (ENSOKIG00005046666)	dnmt3ab (ENSOKIG00005044965)	dpysl5a (ENSOKIG00005044657)	mapre3a (ENSOKIG00005044633)	OTOF (ENSOKIG00005044164)	ENSOKIG00005044070	slc18b1 (ENSOKIG00005044003)	TULP4 (ENSOKIG00005043960)	ENSOKIG00005031763	rmnd1 (ENSOKIG00005030139)	ENSOKIG00005030050	stx11a (ENSOKIG00005030036)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	32	galcb (ENSOTSG00005004493)	vrk1 (ENSOTSG00005005089)	ENSOTSG00005006896	ENSOTSG00005006902	crip2 (ENSOTSG00005006905)	ENSOTSG00005006909	ENSOTSG00005006911	ENSOTSG00005006914	zfp36l1a (ENSOTSG00005006915)	ENSOTSG00005006917	scd (ENSOTSG00005006924)	SEC31B (ENSOTSG00005006930)	ENSOTSG00005007042	ENSOTSG00005007052	ENSOTSG00005007053	slc30a1b (ENSOTSG00005007056) #22	hadhab (ENSOTSG00005007086)	ENSOTSG00005007390	ENSOTSG00005007391	ENSOTSG00005007402	dtnbb (ENSOTSG00005007406)	dnmt3ab (ENSOTSG00005008875)	dpysl5a (ENSOTSG00005012629)	mapre3a (ENSOTSG00005012643)	OTOF (ENSOTSG00005012647)	ENSOTSG00005012656	slc18b1 (ENSOTSG00005012658)	TULP4 (ENSOTSG00005012663)	ENSOTSG00005012700	rmnd1 (ENSOTSG00005014460)	ENSOTSG00005014470
Rainbow trout	MODERN SPECIES	17	ENSOMYG00000036768	ENSOMYG00000068526	crip2 (ENSOMYG00000063172)	ENSOMYG00000070136	ENSOMYG00000036966	ENSOMYG00000045253	tmem229b (ENSOMYG00000037278)	zfp36l1a (ENSOMYG00000037283)	plekhh1 (ENSOMYG00000037325)	ENSOMYG00000064585	pax9 (ENSOMYG00000037381)	ENSOMYG00000074485	nkx2.1 (ENSOMYG00000073717)	ENSOMYG00000037410	ENSOMYG00000037419	ENSOMYG00000037431 #22	ENSOMYG00000037527	ENSOMYG00000037633	ENSOMYG00000037643	dtnbb (ENSOMYG00000037701)	dnmt3ab (ENSOMYG00000038364)	dpysl5a (ENSOMYG00000041717)	mapre3a (ENSOMYG00000041724)	ENSOMYG00000041751	ENSOMYG00000041814	slc18b1 (ENSOMYG00000041820)	ENSOMYG00000041842	ENSOMYG00000042603	ENSOMYG00000062881	rmnd1 (ENSOMYG00000043676)	ENSOMYG00000076892
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000182843.a.a.a.a.qb	ENSGT00940000158908.l	ENSGT00940000163117.c.b	ENSGT00940000165020.b.d	ENSGT00940000157459.b.d	ENSGT00940000158683.a.a.a.a.b	ENSGT01030000234573.B.c.a.r	ENSGT00390000010899.a.a.h	ENSGT00940000155076.a.d.d	ENSGT00940000159456.d	ENSGT00730000111119.d	ENSGT00940000159896.d	ENSGT00940000161610.d	ENSGT00940000161107.v	ENSGT00940000156886.D.g	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00940000154677.b.a.f	ENSGT00940000166633.b	ENSGT00520000055578.a.b.h	ENSGT00940000153897.b.a.b.g.b	ENSGT00940000155459.x.b.f	ENSGT01030000234527.A.a.a.b.a.h	ENSGT00490000043329.a.b.g.a.h	ENSGT00940000155086.A.d	ENSGT00950000182941.a.a.a.b.c	ENSGT00940000167949	ENSGT00940000156674.b	ENSGT00940000155913.c.c	ENSGT00940000154481.a.a.b	ENSGT00390000013337.d	ENSGT00730000111244.a.a.c
River trout	MODERN SPECIES	17	ENSSTUG00000021971	sptb (ENSSTUG00000020176)	ENSSTUG00000020071	ENSSTUG00000020054	ENSSTUG00000020016	crip2 (ENSSTUG00000019947)	MTA1 (ENSSTUG00000016073)	ENSSTUG00000015977	zfp36l1a (ENSSTUG00000015974)	plekhh1 (ENSSTUG00000015313)	slc25a21 (ENSSTUG00000015281)	pax9 (ENSSTUG00000015263)	NKX2-8 (ENSSTUG00000015255)	nkx2.1 (ENSSTUG00000015240)	ENSSTUG00000014643	slc30a1b (ENSSTUG00000014514) #22	hadhab (ENSSTUG00000013353)	ENSSTUG00000013322	ENSSTUG00000013306	dtnbb (ENSSTUG00000011764)	dnmt3ab (ENSSTUG00000010296)	dpysl5a (ENSSTUG00000010182)	mapre3a (ENSSTUG00000010175)	OTOF (ENSSTUG00000009829)	ENSSTUG00000009800	slc18b1 (ENSSTUG00000009727)	TULP4 (ENSSTUG00000009697)	ENSSTUG00000005129	rmnd1 (ENSSTUG00000004950)	ENSSTUG00000004899	stx11a (ENSSTUG00000004826)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	28	ENSSSAG00000063824	ENSSSAG00000063848	ENSSSAG00000063855	crip2 (ENSSSAG00000063864)	ENSSSAG00000063876	tmem229b (ENSSSAG00000095394)	ENSSSAG00000115222	zfp36l1a (ENSSSAG00000093103)	plekhh1 (ENSSSAG00000063941)	ENSSSAG00000064377	pax9 (ENSSSAG00000117660)	ENSSSAG00000064399	nkx2.1 (ENSSSAG00000064404)	ENSSSAG00000064453	ENSSSAG00000066302	ENSSSAG00000068367 #22	ENSSSAG00000068422	dtnbb (ENSSSAG00000093448)	ENSSSAG00000093955	dnmt3ab (ENSSSAG00000068527)	dpyl5 (ENSSSAG00000069192)	mapre3a (ENSSSAG00000009963)	ENSSSAG00000069241	ENSSSAG00000069398	ENSSSAG00000069411	slc18b1 (ENSSSAG00000113603)	ENSSSAG00000069434	ENSSSAG00000070134	rmnd1 (ENSSSAG00000071238)	ENSSSAG00000071313	stx11a (ENSSSAG00000113883)
Northern pike	MODERN SPECIES	14	ptgr2 (ENSELUG00000022820)	ENSELUG00000022738	ENSELUG00000022690	crip2 (ENSELUG00000022624)	MTA1 (ENSELUG00000022518)	tmem229b (ENSELUG00000021511)	zfp36l1a (ENSELUG00000021506)	plekhh1 (ENSELUG00000021484)	slc25a21 (ENSELUG00000021444)	pax9 (ENSELUG00000021362)	NKX2-8 (ENSELUG00000032728)	nkx2.1 (ENSELUG00000021339)	mbip (ENSELUG00000021316)	RPS6KA5 (ENSELUG00000021270)	ENSELUG00000021187	slc30a1b (ENSELUG00000021161) #22	hadhab (ENSELUG00000001109)	kif3cb (ENSELUG00000021061)	ASXL2 (ENSELUG00000021024)	dtnbb (ENSELUG00000020995)	dnmt3ab (ENSELUG00000020827)	dpysl5a (ENSELUG00000020654)	mapre3a (ENSELUG00000020621)	OTOF (ENSELUG00000020563)	ENSELUG00000020480	ENSELUG00000020462	ENSELUG00000020442	ahi1 (ENSELUG00000020418)	slc18b1 (ENSELUG00000020386)	TULP4 (ENSELUG00000020361)	ENSELUG00000020284
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b.e.a #22
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b.e.a #22
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b.e.a #22
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	308															ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.a #22
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	246															ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.a #22
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	188															ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.a #22
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	177															ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.a #22
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Turbot	MODERN SPECIES	12	DUSP10 (ENSSMAG00000037886)	HLX (ENSSMAG00000019132)	ENSSMAG00000021590	kcnk3a (ENSSMAG00000025509)	enpp1 (ENSSMAG00000019089)	ezrb (ENSSMAG00000019057)	rsph3 (ENSSMAG00000019041)	tagapb (ENSSMAG00000019031)	opn8c (ENSSMAG00000019012)	PPP2R5A (ENSSMAG00000018977) #16	DTL (ENSSMAG00000018964) #17	ints7 (ENSSMAG00000018907) #18	lpgat1 (ENSSMAG00000018885) #19	nek2 (ENSSMAG00000018884) #21	ENSSMAG00000018874	ENSSMAG00000032720 #22	rd3 (ENSSMAG00000018860) ##23	rhag (ENSSMAG00000018802)	ENSSMAG00000018766	ENSSMAG00000018726	nrbp1 (ENSSMAG00000018671)	ENSSMAG00000018521	ENSSMAG00000018513	churc1 (ENSSMAG00000018509)	ttbk2b (ENSSMAG00000018490)	mideasa (ENSSMAG00000018488)	ENSSMAG00000018481	ENSSMAG00000018396	ttc32 (ENSSMAG00000018362)	MATN3 (ENSSMAG00000018350)	laptm4a (ENSSMAG00000018324)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.f #22	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000162013	ENSGT00940000167629	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	209		ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000167629	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.c.m	ENSGT00940000163503.B.c.n
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	338								ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00730000111019.e.b	ENSGT01020000230401.a.a.a	ENSGT00940000157927	ENSGT00940000159120.f	ENSGT00390000013762.b.a.a.a	ENSGT00940000159341	ENSGT00400000022349	ENSGT00940000157993	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00960000186817	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000157913.b.b	ENSGT00940000153592.A.a	ENSGT00390000005242	ENSGT00390000004313	ENSGT00940000158992	ENSGT00940000157359
Channel catfish	MODERN SPECIES	17	eif2s1b (ENSIPUG00000021013)	rbm25b (ENSIPUG00000021051)	hsp90ab1 (ENSIPUG00000021071)	slc35b2 (ENSIPUG00000021155)	nfkbie (ENSIPUG00000021162)	tmem151b (ENSIPUG00000021167)	ENSIPUG00000021175	TCTE1 (ENSIPUG00000021758)	rnf8 (ENSIPUG00000021771)	tagapb (ENSIPUG00000021794)	Ppp2r5a (ENSIPUG00000021816) #16	dtl (ENSIPUG00000021844) #17	ints7 (ENSIPUG00000021865) #18	lpgat1 (ENSIPUG00000021893) #19	nek2 (ENSIPUG00000021927) #21	Slc30a1 (ENSIPUG00000021968) #22	ENSIPUG00000021972	rd3 (ENSIPUG00000021975) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSIPUG00000021979)	rhag (ENSIPUG00000021992)	ENSIPUG00000022016	saysd1 (ENSIPUG00000022029)	bpnt1 (ENSIPUG00000022034)	MDGA2 (ENSIPUG00000022087)	rps29 (ENSIPUG00000022139)	mgat2 (ENSIPUG00000022156)	ENSIPUG00000022161	ENSIPUG00000022166	ENSIPUG00000022175	hsp90aa1.1 (ENSIPUG00000022194)	hsp90a.1 (ENSIPUG00000022238)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00730000111019.e.b	ENSGT01020000230401.a.a.a	ENSGT00940000157927	ENSGT00940000159120.f	ENSGT00390000013762.b.a.a.a	ENSGT00940000159341	ENSGT00400000022349	ENSGT00940000157993	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000157913.b.b	ENSGT00940000153592.A.a	ENSGT00390000005242	ENSGT00390000004313	ENSGT00940000158992	ENSGT00940000157359	ENSGT00940000154644.jb.b.h	ENSGT00530000063883	ENSGT00940000154800.g.a
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00390000007015.x	ENSGT00730000111019.e.b	ENSGT01020000230401.a.a.a	ENSGT00940000157927	ENSGT00940000159120.f	ENSGT00390000013762.b.a.a.a	ENSGT00940000159341	ENSGT00400000022349	ENSGT00940000157993	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000157913.b.b	ENSGT00940000153592.A.a	ENSGT00390000005242	ENSGT00390000004313	ENSGT00940000158992	ENSGT00940000157359	ENSGT00940000154644.jb.b.h	ENSGT00940000154800.h	ENSGT00390000014679.d.b
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	40	eif2s1b (ENSPNAG00000012003)	rbm25b (ENSPNAG00000012024)	hsp90ab1 (ENSPNAG00000002080)	slc35b2 (ENSPNAG00000012061)	nfkbie (ENSPNAG00000012083)	tmem151ba (ENSPNAG00000012090)	TCTE1 (ENSPNAG00000002103)	rnf8 (ENSPNAG00000012148)	tagapb (ENSPNAG00000002124)	PPP2R5A (ENSPNAG00000002154) #16	dtl (ENSPNAG00000012221) #17	ints7 (ENSPNAG00000012281) #18	lpgat1 (ENSPNAG00000012330) #19	nek2 (ENSPNAG00000002215) #21	ENSPNAG00000002229	slc30a1a (ENSPNAG00000002238) #22	rd3 (ENSPNAG00000012409) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSPNAG00000012420)	rhag (ENSPNAG00000012455)	DLGAP2 (ENSPNAG00000007033)	ENSPNAG00000012511	grcc10 (ENSPNAG00000012522)	saysd1 (ENSPNAG00000012552)	DNAH8 (ENSPNAG00000012731)	bpnt1 (ENSPNAG00000012790)	ENSPNAG00000002428	ENSPNAG00000012875	YPEL5 (ENSPNAG00000012886)	ZFAND3 (ENSPNAG00000012889)	BTBD9 (ENSPNAG00000012920)	GLO1 (ENSPNAG00000002472)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	18	eif2s1b (ENSAMXG00000034687)	rbm25b (ENSAMXG00000024525)	hsp90ab1 (ENSAMXG00000024526)	slc35b2 (ENSAMXG00000034080)	nfkbie (ENSAMXG00000029672)	tmem151ba (ENSAMXG00000025081)	TCTE1 (ENSAMXG00000024529)	rnf8 (ENSAMXG00000024530)	tagapb (ENSAMXG00000024531)	PPP2R5A (ENSAMXG00000024532) #16	dtl (ENSAMXG00000024533) #17	ints7 (ENSAMXG00000024534) #18	lpgat1 (ENSAMXG00000036624) #19	nek2 (ENSAMXG00000024536) #21	ENSAMXG00000040391	slc30a1a (ENSAMXG00000024537) #22	rd3 (ENSAMXG00000029600) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSAMXG00000042406)	ENSAMXG00000030324	rhag (ENSAMXG00000039076)	DLGAP2 (ENSAMXG00000024541)	ENSAMXG00000030149	grcc10 (ENSAMXG00000043984)	saysd1 (ENSAMXG00000039775)	bpnt1 (ENSAMXG00000038148)	PPP1CB (ENSAMXG00000038907)	YPEL5 (ENSAMXG00000041006)	ENSAMXG00000029702	LRFN2 (ENSAMXG00000009204)	zgc:112001 (ENSAMXG00000024898)	spint1b (ENSAMXG00000030170)
Electric eel	MODERN SPECIES	53												zdhhc17 (ENSEEEG00000008140)	OSBPL8 (ENSEEEG00000008131)	nek2 (ENSEEEG00000008096) #21	SLC30A1 (ENSEEEG00000008092) #22	slc30a1a (ENSEEEG00000008089) #22	rd3 (ENSEEEG00000008088) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSEEEG00000008085)	rhag (ENSEEEG00000008059)	ENSEEEG00000008056	DLGAP2 (ENSEEEG00000008017)	ENSEEEG00000008016	grcc10 (ENSEEEG00000008015)	saysd1 (ENSEEEG00000008014)	ENSEEEG00000008012	bpnt1 (ENSEEEG00000008011)	ENSEEEG00000007555	ENSEEEG00000007526	ypel5 (ENSEEEG00000007523)	ZFAND3 (ENSEEEG00000007521)	btbd9 (ENSEEEG00000007507)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	167							ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.a.b #22	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000163503.B.c.m	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000157913.b.b.a	ENSGT00390000005242	ENSGT00390000004313	ENSGT00940000157913.b.b.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	491	ENSGT00940000154071.B.d	ENSGT01020000231212	ENSGT00520000055570.B.k.e	ENSGT00390000011724.e #18	ENSGT00530000064210.a #17	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.i #16	ENSGT00940000158248.b.g	ENSGT00940000156034.a.r	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b.g	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993.`b.a	ENSGT00950000182836.b.a.b.e #19	ENSGT00940000156989.j #21	ENSGT00960000186817.e	ENSGT00940000156484.b.e.b.a #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.c ##23	ENSGT00730000112900.a	ENSGT00950000182844.b.a.g	ENSGT00940000163503.B.c.m.d	ENSGT00940000157913.b.b.a	ENSGT00390000005242.a.a
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Golden-line barbel	DUPLICATION
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	373									enpp1 (ENSSGRG00000017175)	ezrb (ENSSGRG00000017999)	ENSSGRG00000020490	ENSSGRG00000020491	nek2 (ENSSGRG00000020492) #21	ENSSGRG00000020494	ENSSGRG00000020496 #22	slc30a1a (ENSSGRG00000020498) #22	rd3 (ENSSGRG00000020500) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSSGRG00000020502)	rhag (ENSSGRG00000020505)	kcns3b (ENSSGRG00000020921)	DLGAP2 (ENSSGRG00000020922)	grcc10 (ENSSGRG00000020924)	bpnt1 (ENSSGRG00000020936)	ENSSGRG00000021077	kcnk5b (ENSSGRG00000021104)	syt14b (ENSSGRG00000021105)	ENSSGRG00000021106	si:dkey-174m14.3 (ENSSGRG00000021107)	rdh14b (ENSSGRG00000021108)	crip2l (ENSSGRG00000021109)	ENSSGRG00000021113
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	815				tbc1d16 (ENSSGRG00000047304)	cbx4 (ENSSGRG00000047302)	aqp8b (ENSSGRG00000047301)	ENSSGRG00000047299	dtl (ENSSGRG00000046858) #17	kcnk3a (ENSSGRG00000046849)	enpp1 (ENSSGRG00000045134)	SYTL3 (ENSSGRG00000045093)	ezrb (ENSSGRG00000045014)	ENSSGRG00000045004	lpgat1 (ENSSGRG00000044996) #19	ENSSGRG00000044995	ENSSGRG00000044993 #22	slc30a1a (ENSSGRG00000044991) #22	nek2 (ENSSGRG00000044987) #21	rd3 (ENSSGRG00000044985) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSSGRG00000044982)	rhag (ENSSGRG00000044477)	kcns3b (ENSSGRG00000044463)	ENSSGRG00000044460
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Denticle herring	MODERN SPECIES	5	ENSDCDG00000030224	rnf144ab (ENSDCDG00000030226)	ENSDCDG00000030231	fbxo25 (ENSDCDG00000030233)	ENSDCDG00000030250	FAM110C (ENSDCDG00000030253)	ACP1 (ENSDCDG00000030261)	ENSDCDG00000030277	tmem18 (ENSDCDG00000030282)	ENSDCDG00000030290	ENSDCDG00000030294	PPP2R5A (ENSDCDG00000030404) #16	dtl (ENSDCDG00000033015) #17	ints7 (ENSDCDG00000033030) #18	lpgat1 (ENSDCDG00000033041) #19	slc30a1a (ENSDCDG00000033045) #22	ENSDCDG00000033046	rd3 (ENSDCDG00000033048) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSDCDG00000033049)	rhag (ENSDCDG00000033067)	ENSDCDG00000033140	nrbp1 (ENSDCDG00000033160)	ENSDCDG00000033322	churc1 (ENSDCDG00000033609)	ttbk2b (ENSDCDG00000033610)	mideasa (ENSDCDG00000033613)	kcns3b (ENSDCDG00000033614)	ENSDCDG00000033620	ttc32 (ENSDCDG00000033629)	ENSDCDG00000033636	hnrnpub (ENSDCDG00000033646)
Atlantic herring	MODERN SPECIES	6	ENSCHAG00000023959	slc35f6 (ENSCHAG00000023842)	kcnk3a (ENSCHAG00000023836)	enpp1 (ENSCHAG00000021672)	SYTL3 (ENSCHAG00000021579)	ezrb (ENSCHAG00000021133)	rsph3 (ENSCHAG00000021105)	ENSCHAG00000021100	tagapb (ENSCHAG00000021089)	opn8c (ENSCHAG00000021073)	PPP2R5A (ENSCHAG00000020626) #16	dtl (ENSCHAG00000020537) #17	ints7 (ENSCHAG00000020434) #18	lpgat1 (ENSCHAG00000020413) #19	nek2 (ENSCHAG00000020396) #21	slc30a1a (ENSCHAG00000020388) #22	rd3 (ENSCHAG00000020380) ##23	ENSCHAG00000020369	ENSCHAG00000020359	STX7 (ENSCHAG00000020337)	taar13b (ENSCHAG00000020325)	taar10 (ENSCHAG00000020310)	leg1.1 (ENSCHAG00000020302)	themis (ENSCHAG00000020296)	ENSCHAG00000020241	PTPRK (ENSCHAG00000016248)	ENSCHAG00000016109	ENSCHAG00000014375	ARHGAP18 (ENSCHAG00000013657)	tmem244 (ENSCHAG00000013629)	l3mbtl3 (ENSCHAG00000013306)
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.f #22	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00940000162013	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c
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Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.f #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.f #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.f #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000157671	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163.c.a	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00390000011405	ENSGT00940000157671	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163.d	ENSGT00390000011163.c.a	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	16	ENSOJAG00000019469	ENSOJAG00000019482	taf1a (ENSOJAG00000019506)	DUSP10 (ENSOJAG00000019550)	hlx1 (ENSOJAG00000019566)	slc35f6 (ENSOJAG00000019577)	kcnk3a (ENSOJAG00000019591)	enpp1 (ENSOJAG00000019621)	ENSOJAG00000019867	ezrb (ENSOJAG00000019889)	opn8c (ENSOJAG00000020009)	PPP2R5A (ENSOJAG00000020034) #16	dtl (ENSOJAG00000020135) #17	lpgat1 (ENSOJAG00000020317) #19	nek2 (ENSOJAG00000020342) #21	slc30a1a (ENSOJAG00000020350) #22	ENSOJAG00000020361	rd3 (ENSOJAG00000020367) ##23	rhag (ENSOJAG00000020376)	ENSOJAG00000020395	ENSOJAG00000020408	nrbp1 (ENSOJAG00000020453)	CAPN3 (ENSOJAG00000020571)	churc1 (ENSOJAG00000020629)	ttbk2b (ENSOJAG00000020640)	mideasa (ENSOJAG00000020650)	kcns3b (ENSOJAG00000020683)	ENSOJAG00000020689	zpax1 (ENSOJAG00000020798)	ttc32 (ENSOJAG00000020895)	matn3a (ENSOJAG00000020898)
Indian medaka	MODERN SPECIES	22	taf1a (ENSOMEG00000023358)	DUSP10 (ENSOMEG00000023371)	hlx1 (ENSOMEG00000023389)	slc35f6 (ENSOMEG00000023401)	kcnk3a (ENSOMEG00000023410)	enpp1 (ENSOMEG00000023438)	ENSOMEG00000023459	ezrb (ENSOMEG00000023480)	tagapb (ENSOMEG00000023505)	opn8c (ENSOMEG00000023519)	PPP2R5A (ENSOMEG00000023558) #16	dtl (ENSOMEG00000023567) #17	ints7 (ENSOMEG00000023609) #18	lpgat1 (ENSOMEG00000023628) #19	nek2 (ENSOMEG00000023633) #21	slc30a1a (ENSOMEG00000023643) #22	ENSOMEG00000005251	rd3 (ENSOMEG00000005258) ##23	rhag (ENSOMEG00000005287)	ENSOMEG00000005312	ENSOMEG00000005321	nrbp1 (ENSOMEG00000005374)	ENSOMEG00000005387	ENSOMEG00000005425	ENSOMEG00000005464	churc1 (ENSOMEG00000005505)	ENSOMEG00000005519	mideasa (ENSOMEG00000005549)	kcns3b (ENSOMEG00000005571)	ENSOMEG00000005612	zpax1 (ENSOMEG00000005636)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157671	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163.c.a	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	16	DUSP10 (ENSORLG00000012052)	hlx1 (ENSORLG00000012055)	slc35f6 (ENSORLG00000012067)	kcnk3a (ENSORLG00000012076)	enpp1 (ENSORLG00000012085)	ENSORLG00000012091	ezrb (ENSORLG00000012128)	tagapb (ENSORLG00000012139)	opn8c (ENSORLG00000012144)	PPP2R5A (ENSORLG00000012149) #16	dtl (ENSORLG00000012152) #17	ints7 (ENSORLG00000012191) #18	lpgat1 (ENSORLG00000012213) #19	nek2 (ENSORLG00000012239) #21	ENSORLG00000027799	slc30a1a (ENSORLG00000030357) #22	rd3 (ENSORLG00000028166) ##23	ENSORLG00000022361	rhag (ENSORLG00000012284)	ENSORLG00000026479	ENSORLG00000012321	nrbp1 (ENSORLG00000012341)	ENSORLG00000012402	ENSORLG00000012412	churc1 (ENSORLG00000012430)	ttbk2b (ENSORLG00000012483)	mideasa (ENSORLG00000012495)	kcns3b (ENSORLG00000012504)	ENSORLG00000012527	zpax1 (ENSORLG00000012471)	ENSORLG00000012535
Chinese medaka	MODERN SPECIES	676	taf1a (ENSOSIG00000000981)	DUSP10 (ENSOSIG00000000980)	hlx1 (ENSOSIG00000000976)	slc35f6 (ENSOSIG00000000971)	kcnk3a (ENSOSIG00000000968)	enpp1 (ENSOSIG00000000691)	ENSOSIG00000019517	ezrb (ENSOSIG00000019493)	tagapb (ENSOSIG00000019482)	opn8c (ENSOSIG00000019480)	PPP2R5A (ENSOSIG00000019142) #16	dtl (ENSOSIG00000019107) #17	ints7 (ENSOSIG00000019092) #18	nek2 (ENSOSIG00000019083) #21	ENSOSIG00000019081	slc30a1a (ENSOSIG00000019080) #22	rd3 (ENSOSIG00000019077) ##23	rhag (ENSOSIG00000019073)	ENSOSIG00000019067	ENSOSIG00000019062	nrbp1 (ENSOSIG00000019041)	CAPN3 (ENSOSIG00000018964)	ENSOSIG00000018927	churc1 (ENSOSIG00000018919)	ttbk2b (ENSOSIG00000018917)	mideasa (ENSOSIG00000018900)	kcns3b (ENSOSIG00000018895)	ENSOSIG00000018885	matn3a (ENSOSIG00000018883)	laptm4a (ENSOSIG00000018880)	RHOB (ENSOSIG00000018876)
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157671	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.f #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	27	ENSGT00940000157671	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b	ENSGT00940000153446.b
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	20	ENSKMAG00000018405	taf1a (ENSKMAG00000018394)	DUSP10 (ENSKMAG00000018361)	hlx1 (ENSKMAG00000018350)	slc35f6 (ENSKMAG00000018320)	kcnk3a (ENSKMAG00000018311)	enpp1 (ENSKMAG00000018263)	ezrb (ENSKMAG00000018208)	rsph3 (ENSKMAG00000018140)	tagapb (ENSKMAG00000018113)	PPP2R5A (ENSKMAG00000018045) #16	dtl (ENSKMAG00000017969) #17	ints7 (ENSKMAG00000017909) #18	lpgat1 (ENSKMAG00000017879) #19	nek2 (ENSKMAG00000017860) #21	slc30a1a (ENSKMAG00000017855) #22	rd3 (ENSKMAG00000017845) ##23	rhag (ENSKMAG00000017826)	ENSKMAG00000017803	nrbp1 (ENSKMAG00000017747)	CAPN3 (ENSKMAG00000017627)	ENSKMAG00000017549	churc1 (ENSKMAG00000017527)	ttbk2b (ENSKMAG00000017500)	mideasa (ENSKMAG00000017459)	kcns3b (ENSKMAG00000017445)	ENSKMAG00000017411	zpax1 (ENSKMAG00000017380)	ttc32 (ENSKMAG00000017366)	matn3a (ENSKMAG00000017354)	laptm4a (ENSKMAG00000017330)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1613	TAF1A (ENSNFUG00015000084)	DUSP10 (ENSNFUG00015000077)	HLX1 (ENSNFUG00015000069)	SLC35F6 (ENSNFUG00015018572)	ENSNFUG00015018569	KCNK3 (ENSNFUG00015018563)	enpp1 (ENSNFUG00015018408)	ENSNFUG00015018397	ezrb (ENSNFUG00015017950)	TAGAP (ENSNFUG00015017912)	PPP2R5A (ENSNFUG00015017882) #16	DTL (ENSNFUG00015017791) #17	LPGAT1 (ENSNFUG00015017705) #19	nek2 (ENSNFUG00015017665) #21	ENSNFUG00015017653	SLC30A1A (ENSNFUG00015017647) #22	RD3 (ENSNFUG00015017642) ##23	rhag (ENSNFUG00015017288)	Nfu_g_1_018698 (ENSNFUG00015017263)	nrbp1 (ENSNFUG00015017247)	CAPN3 (ENSNFUG00015016963)	ENSNFUG00015016912	ZFP106 (ENSNFUG00015016903)	CHURC1 (ENSNFUG00015016897)	ttbk2b (ENSNFUG00015016884)	mideasa (ENSNFUG00015016873)	KCNS3 (ENSNFUG00015016870)	ENSNFUG00015016640	ttc32 (ENSNFUG00015016630)	matn3a (ENSNFUG00015016620)	LAPTM4A (ENSNFUG00015016614)
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Mummichog	MODERN SPECIES	2259	DUSP10 (ENSFHEG00000022967)	hlx1 (ENSFHEG00000022948)	slc35f6 (ENSFHEG00000022943)	kcnk3a (ENSFHEG00000022927)	enpp1 (ENSFHEG00000022910)	ENSFHEG00000022761	ezrb (ENSFHEG00000022748)	rsph3 (ENSFHEG00000022704)	tagapb (ENSFHEG00000022670)	PPP2R5A (ENSFHEG00000022652) #16	dtl (ENSFHEG00000022626) #17	ints7 (ENSFHEG00000022206) #18	lpgat1 (ENSFHEG00000022122) #19	nek2 (ENSFHEG00000022086) #21	ENSFHEG00000022033	slc30a1a (ENSFHEG00000022025) #22	rd3 (ENSFHEG00000022022) ##23	rhag (ENSFHEG00000022014)	CRISP2 (ENSFHEG00000022008)	ENSFHEG00000021978	nrbp1 (ENSFHEG00000021932)	CAPN3 (ENSFHEG00000021865)	ENSFHEG00000021854	churc1 (ENSFHEG00000021840)	ttbk2b (ENSFHEG00000021748)	mideasa (ENSFHEG00000021719)	ENSFHEG00000021709	ENSFHEG00000021627	RHOB (ENSFHEG00000021612)	PUM2 (ENSFHEG00000021596)	laptm4a (ENSFHEG00000021543)
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Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000011405	ENSGT00940000157671	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172.e.a	ENSGT00940000157993	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00590000083139.d.a	ENSGT00940000177475	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b
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Amazon molly	MODERN SPECIES	253	taf1a (ENSPFOG00000018902)	DUSP10 (ENSPFOG00000018913)	hlx1 (ENSPFOG00000018919)	slc35f6 (ENSPFOG00000018934)	kcnk3a (ENSPFOG00000018940)	enpp1 (ENSPFOG00000018956)	ENSPFOG00000019004	ezrb (ENSPFOG00000019019)	rsph3 (ENSPFOG00000021986)	tagapb (ENSPFOG00000019037)	PPP2R5A (ENSPFOG00000019051) #16	dtl (ENSPFOG00000024786) #17	ints7 (ENSPFOG00000019082) #18	lpgat1 (ENSPFOG00000019088) #19	nek2 (ENSPFOG00000019095) #21	slc30a1a (ENSPFOG00000019100) #22	rd3 (ENSPFOG00000019102) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSPFOG00000019104)	rhag (ENSPFOG00000019114)	ENSPFOG00000024241	ENSPFOG00000019124	nrbp1 (ENSPFOG00000019129)	CAPN3 (ENSPFOG00000019159)	ENSPFOG00000019181	churc1 (ENSPFOG00000019186)	ttbk2b (ENSPFOG00000019189)	mideasa (ENSPFOG00000019192)	ENSPFOG00000019199	RHOB (ENSPFOG00000020611)	PUM2 (ENSPFOG00000019208)	laptm4a (ENSPFOG00000019214)
Sailfin molly	MODERN SPECIES	720							ENSPLAG00000001515	ezrb (ENSPLAG00000001511)	rsph3 (ENSPLAG00000023920)	tagapb (ENSPLAG00000023740)	PPP2R5A (ENSPLAG00000023724) #16	dtl (ENSPLAG00000023664) #17	ints7 (ENSPLAG00000023653) #18	lpgat1 (ENSPLAG00000023575) #19	nek2 (ENSPLAG00000023540) #21	slc30a1a (ENSPLAG00000023532) #22	ENSPLAG00000023525	ENSPLAG00000023505
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Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00440000038430	ENSGT00940000173326	ENSGT00940000157269.a.a	ENSGT00940000158299.a	ENSGT00390000013853	ENSGT00940000160284	ENSGT00550000075009	ENSGT00390000017252	ENSGT00950000183212.B	ENSGT00940000158687.a.a	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00950000183246	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a.d	ENSGT00530000063408.A	ENSGT00940000156778.l	ENSGT00510000048701.a	ENSGT00950000182906.b.a.i.b	ENSGT00390000014904	ENSGT00940000162477.c	ENSGT01030000234595.A.b.a.b	ENSGT00950000183204.b.b.a	ENSGT00940000156796.c.b
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Clown anemonefish	MODERN SPECIES	3192	zc3h14 (ENSAOCG00000024218)	ptk2bb (ENSAOCG00000024168)	CHRNA2 (ENSAOCG00000024092)	ENSAOCG00000024082	ENSAOCG00000024074	nme6 (ENSAOCG00000024061)	eif2b4 (ENSAOCG00000024037)	atraid (ENSAOCG00000024009)	snx17 (ENSAOCG00000023999)	znf513a (ENSAOCG00000023963)	PPP2R5A (ENSAOCG00000023949) #16	dtl (ENSAOCG00000023941) #17	ints7 (ENSAOCG00000023924) #18	lpgat1 (ENSAOCG00000023892) #19	nek2 (ENSAOCG00000023881) #21	slc30a1a (ENSAOCG00000023862) #22	ENSAOCG00000001748	rd3 (ENSAOCG00000023853) ##23	rhag (ENSAOCG00000023842)	ENSAOCG00000023823
Spiny chromis	MODERN SPECIES	32					ENSAPOG00000019867	ENSAPOG00000019858	eif2b4 (ENSAPOG00000019798)	atraid (ENSAPOG00000019782)	snx17 (ENSAPOG00000019761)	znf513a (ENSAPOG00000019661)	PPP2R5A (ENSAPOG00000019652) #16	dtl (ENSAPOG00000019641) #17	ints7 (ENSAPOG00000019631) #18	lpgat1 (ENSAPOG00000019546) #19	nek2 (ENSAPOG00000000549) #21	slc30a1a (ENSAPOG00000019482) #22	ENSAPOG00000019474	rd3 (ENSAPOG00000019455) ##23	rhag (ENSAPOG00000019442)	ENSAPOG00000019415	usta (ENSAPOG00000019394)	sash1a (ENSAPOG00000019332)	stxbp5a (ENSAPOG00000019145)	ENSAPOG00000019020	rab32a (ENSAPOG00000018994)	GRM1 (ENSAPOG00000018979)	fbxo30b (ENSAPOG00000018934)	ENSAPOG00000018929	ENSAPOG00000018861
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	901			CHRNA2 (ENSSPAG00000012908)	ENSSPAG00000012929	nme6 (ENSSPAG00000012937)	eif2b4 (ENSSPAG00000012973)	atraid (ENSSPAG00000013030)	snx17 (ENSSPAG00000013077)	znf513a (ENSSPAG00000013127)	PPP2R5A (ENSSPAG00000013143) #16	dtl (ENSSPAG00000013186) #17	ints7 (ENSSPAG00000013246) #18	lpgat1 (ENSSPAG00000013324) #19	nek2 (ENSSPAG00000013336) #21	ENSSPAG00000013359	slc30a1a (ENSSPAG00000013372) #22
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724.j #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	312	hlx1 (ENSHBUG00000000878)	slc35f6 (ENSHBUG00000017956)	kcnk3a (ENSHBUG00000017922)	enpp1 (ENSHBUG00000017900)	ENSHBUG00000017853	ezrb (ENSHBUG00000017839)	rsph3 (ENSHBUG00000017765)	tagapb (ENSHBUG00000017689)	opn8c (ENSHBUG00000017671)	PPP2R5A (ENSHBUG00000017662) #16	dtl (ENSHBUG00000017617) #17	ints7 (ENSHBUG00000017601) #18	lpgat1 (ENSHBUG00000017548) #19	nek2 (ENSHBUG00000017539) #21	ENSHBUG00000017513	slc30a1a (ENSHBUG00000017495) #22	rd3 (ENSHBUG00000017485) ##23	rhag (ENSHBUG00000017476)	ENSHBUG00000017444	CRISP2 (ENSHBUG00000017430)	nrbp1 (ENSHBUG00000017423)	CAPN3 (ENSHBUG00000017348)	ENSHBUG00000017231	churc1 (ENSHBUG00000017213)	ttbk2b (ENSHBUG00000017197)	mideasa (ENSHBUG00000017149)	kcns3b (ENSHBUG00000017093)	ENSHBUG00000017077	zpax1 (ENSHBUG00000016589)	matn3a (ENSHBUG00000016568)	laptm4a (ENSHBUG00000016541)
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724.j #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
P. nyererei	MODERN SPECIES	336	hlx1 (ENSPNYG00000023230)	slc35f6 (ENSPNYG00000023224)	kcnk3a (ENSPNYG00000023221)	enpp1 (ENSPNYG00000023212)	ENSPNYG00000023204	ezrb (ENSPNYG00000023196)	rsph3 (ENSPNYG00000023187)	tagapb (ENSPNYG00000023180)	opn8c (ENSPNYG00000023178)	PPP2R5A (ENSPNYG00000023171) #16	dtl (ENSPNYG00000023162) #17	ints7 (ENSPNYG00000023154) #18	lpgat1 (ENSPNYG00000023149) #19	nek2 (ENSPNYG00000023145) #21	ENSPNYG00000023140	slc30a1a (ENSPNYG00000023135) #22	rd3 (ENSPNYG00000023130) ##23	rhag (ENSPNYG00000023122)	CRISP2 (ENSPNYG00000023117)	ENSPNYG00000023106	nrbp1 (ENSPNYG00000023078)	CAPN3 (ENSPNYG00000023051)	ENSPNYG00000023040	churc1 (ENSPNYG00000023035)	ttbk2b (ENSPNYG00000023027)	mideasa (ENSPNYG00000023021)	kcns3b (ENSPNYG00000023014)	ENSPNYG00000023008	ENSPNYG00000022992	ttc32 (ENSPNYG00000022984)	matn3a (ENSPNYG00000022980)
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724.j #18	ENSGT01000000215783	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	132												lpgat1 (ENSMZEG00005027999) #19	nek2 (ENSMZEG00005028003) #21	nek2 (ENSMZEG00005028004) #21	ENSMZEG00005028008	slc30a1a (ENSMZEG00005028009) #22	rd3 (ENSMZEG00005028011) ##23	rhag (ENSMZEG00005028014)	CRISP2 (ENSMZEG00005028016)	ENSMZEG00005028019	nrbp1 (ENSMZEG00005028022)	ENSMZEG00005028023	CAPN3 (ENSMZEG00005028024)	churc1 (ENSMZEG00005028026)	ttbk2b (ENSMZEG00005028027)	mideasa (ENSMZEG00005028028)	kcns3b (ENSMZEG00005028029)
Eastern happy	MODERN SPECIES	6	ENSACLG00000023783	ezrb (ENSACLG00000023751)	rsph3 (ENSACLG00000023687)	tagapb (ENSACLG00000023677)	opn8c (ENSACLG00000023613)	PPP2R5A (ENSACLG00000023543) #16	ENSACLG00000023530 #17	ints7 (ENSACLG00000023494) #18	dtl (ENSACLG00000023466) #17	ENSACLG00000023461	ENSACLG00000023457	lpgat1 (ENSACLG00000023437) #19	nek2 (ENSACLG00000023419) #21	nek2 (ENSACLG00000023388) #21	ENSACLG00000023372	slc30a1a (ENSACLG00000023367) #22	rd3 (ENSACLG00000023362) ##23	rhag (ENSACLG00000023344)	CRISP2 (ENSACLG00000023325)	ENSACLG00000023310	nrbp1 (ENSACLG00000023217)	CAPN3 (ENSACLG00000023081)	ENSACLG00000023032	churc1 (ENSACLG00000023022)	ttbk2b (ENSACLG00000022993)	mideasa (ENSACLG00000022937)	kcns3b (ENSACLG00000022930)	ENSACLG00000022895	zpax1 (ENSACLG00000022859)	ttc32 (ENSACLG00000022848)	matn3a (ENSACLG00000022789)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	314	kcnk3a (ENSNBRG00000021869)	ENSNBRG00000021858	ENSNBRG00000021844	ENSNBRG00000021824	ENSNBRG00000021807	ezrb (ENSNBRG00000021747)	rsph3 (ENSNBRG00000021675)	tagapb (ENSNBRG00000021657)	opn8c (ENSNBRG00000021640)	PPP2R5A (ENSNBRG00000021626) #16	dtl (ENSNBRG00000021541) #17	ints7 (ENSNBRG00000021483) #18	lpgat1 (ENSNBRG00000021463) #19	nek2 (ENSNBRG00000021440) #21	ENSNBRG00000021427	slc30a1a (ENSNBRG00000021418) #22	rd3 (ENSNBRG00000021408) ##23	rhag (ENSNBRG00000021403)	ENSNBRG00000021378	ENSNBRG00000021309	nrbp1 (ENSNBRG00000021255)	CAPN3 (ENSNBRG00000021210)	ENSNBRG00000021193	churc1 (ENSNBRG00000021181)	ttbk2b (ENSNBRG00000021158)	mideasa (ENSNBRG00000021127)	kcns3b (ENSNBRG00000021113)	ENSNBRG00000020939	zpax1 (ENSNBRG00000020845)	ttc32 (ENSNBRG00000020824)	matn3a (ENSNBRG00000020810)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	6	hlx1 (ENSONIG00000005980)	slc35f6 (ENSONIG00000028863)	kcnk3a (ENSONIG00000005986)	enpp1 (ENSONIG00000005988)	ENSONIG00000005998	ezrb (ENSONIG00000006005)	rsph3 (ENSONIG00000006011)	tagapb (ENSONIG00000006014)	opn8c (ENSONIG00000006017)	PPP2R5A (ENSONIG00000006018) #16	dtl (ENSONIG00000006028) #17	ints7 (ENSONIG00000006035) #18	lpgat1 (ENSONIG00000006041) #19	nek2 (ENSONIG00000006043) #21	ENSONIG00000034832	slc30a1 (ENSONIG00000040437) #22	rhag (ENSONIG00000006052)	ENSONIG00000038990	rd3 (ENSONIG00000006049) ##23	CRISP2 (ENSONIG00000006063)	ENSONIG00000006064	nrbp1 (ENSONIG00000006068)	ENSONIG00000006073	ENSONIG00000006086	churc1 (ENSONIG00000006088)	ttbk2b (ENSONIG00000039162)	mideasa (ENSONIG00000006090)	kcns3b (ENSONIG00000020447)	ENSONIG00000006091	zpax1 (ENSONIG00000006100)	ttc32 (ENSONIG00000006108)
Midas cichlid	MODERN SPECIES	271														nek2 (ENSACIG00000011816) #21	ENSACIG00000011809	slc30a1a (ENSACIG00000011783) #22	rd3 (ENSACIG00000011774) ##23	rhag (ENSACIG00000011753)	ENSACIG00000011739	ENSACIG00000011705	nrbp1 (ENSACIG00000011664)	CAPN3 (ENSACIG00000011615)	churc1 (ENSACIG00000011596)	ttbk2b (ENSACIG00000011568)	mideasa (ENSACIG00000011542)	kcns3b (ENSACIG00000011532)	ENSACIG00000011503	zpax1 (ENSACIG00000011384)	ttc32 (ENSACIG00000011356)	matn3a (ENSACIG00000011343)	laptm4a (ENSACIG00000011325)
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	164															ENSLBEG00000021577	slc30a1a (ENSLBEG00000021498) #22	rd3 (ENSLBEG00000021468) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSLBEG00000021439)	rhag (ENSLBEG00000021393)	ENSLBEG00000021361	ENSLBEG00000021336	ENSLBEG00000021285	ENSLBEG00000021248	nrbp1 (ENSLBEG00000021166)	CAPN3 (ENSLBEG00000021037)	ENSLBEG00000020931	churc1 (ENSLBEG00000020891)	ttbk2b (ENSLBEG00000020849)	mideasa (ENSLBEG00000020814)	kcns3b (ENSLBEG00000020801)	ENSLBEG00000020765
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b	ENSGT00940000153446.b
Lumpfish	MODERN SPECIES	16	DUSP10 (ENSCLMG00005017892)	hlx1 (ENSCLMG00005017891)	slc35f6 (ENSCLMG00005017890)	kcnk3a (ENSCLMG00005017888)	enpp1 (ENSCLMG00005016671)	ENSCLMG00005016662	rsph3 (ENSCLMG00005016659)	tagapb (ENSCLMG00005016655)	opn8c (ENSCLMG00005016653)	PPP2R5A (ENSCLMG00005015488) #16	dtl (ENSCLMG00005015483) #17	ints7 (ENSCLMG00005015443) #18	lpgat1 (ENSCLMG00005015439) #19	nek2 (ENSCLMG00005015438) #21	ENSCLMG00005015434	slc30a1a (ENSCLMG00005015433) #22	rd3 (ENSCLMG00005015431) ##23	rhag (ENSCLMG00005015072)	ENSCLMG00005015066	nrbp1 (ENSCLMG00005015039)	CAPN3 (ENSCLMG00005015033)	churc1 (ENSCLMG00005015032)	ttbk2b (ENSCLMG00005015031)	mideasa (ENSCLMG00005015028)	kcns3b (ENSCLMG00005015024)	ENSCLMG00005015020	ENSCLMG00005015011	fbxo30b (ENSCLMG00005015003)	GRM1 (ENSCLMG00005014043)	rab32a (ENSCLMG00005014032)	ENSCLMG00005014028
Stickleback	MODERN SPECIES	18	DUSP10 (ENSGACG00000010062)	hlx1 (ENSGACG00000010057)	slc35f6 (ENSGACG00000010044)	kcnk3a (ENSGACG00000010038)	enpp1 (ENSGACG00000010030)	ENSGACG00000010022	ezrb (ENSGACG00000010010)	rsph3 (ENSGACG00000010006)	tagapb (ENSGACG00000009991)	opn8c (ENSGACG00000009990)	PPP2R5A (ENSGACG00000009984) #16	dtl (ENSGACG00000009980) #17	ints7 (ENSGACG00000009942) #18	lpgat1 (ENSGACG00000009925) #19	nek2 (ENSGACG00000009916) #21	slc30a1a (ENSGACG00000009913) #22	rd3 (ENSGACG00000009909) ##23	rhag (ENSGACG00000009865)	ENSGACG00000009860	nrbp1 (ENSGACG00000009847)	CAPN3 (ENSGACG00000009830)	ENSGACG00000009824	churc1 (ENSGACG00000009818)	ENSGACG00000009817	ttbk2b (ENSGACG00000009811)	ENSGACG00000009809	ENSGACG00000009798	kcns3b (ENSGACG00000009796)	ENSGACG00000009788	zpax1 (ENSGACG00000009775)	zpax1 (ENSGACG00000009750)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Pike perch	MODERN SPECIES	4	slc35f6 (ENSSLUG00000000080)	kcnk3a (ENSSLUG00000000085)	enpp1 (ENSSLUG00000000120)	ENSSLUG00000000150	ENSSLUG00000000153	ENSSLUG00000000156	ezrb (ENSSLUG00000000168)	rsph3 (ENSSLUG00000000178)	tagapb (ENSSLUG00000000184)	opn8c (ENSSLUG00000000192)	PPP2R5A (ENSSLUG00000000369) #16	dtl (ENSSLUG00000000749) #17	ints7 (ENSSLUG00000000857) #18	lpgat1 (ENSSLUG00000000863) #19	nek2 (ENSSLUG00000000866) #21	slc30a1a (ENSSLUG00000000870) #22	ENSSLUG00000000875	rd3 (ENSSLUG00000000878) ##23	rhag (ENSSLUG00000000931)	ENSSLUG00000001055	nrbp1 (ENSSLUG00000001067)	CAPN3 (ENSSLUG00000001116)	ENSSLUG00000001177	churc1 (ENSSLUG00000001185)	ttbk2b (ENSSLUG00000001188)	mideasa (ENSSLUG00000001198)	kcns3b (ENSSLUG00000001206)	ENSSLUG00000001231	zpax1 (ENSSLUG00000001319)	ttc32 (ENSSLUG00000001350)	matn3a (ENSSLUG00000001355)
Channel bull blenny	MODERN SPECIES	16	slc35f6 (ENSCGOG00000020121)	ENSCGOG00000020124	kcnk3a (ENSCGOG00000020133)	enpp1 (ENSCGOG00000020190)	ENSCGOG00000020876	ezrb (ENSCGOG00000020941)	rsph3 (ENSCGOG00000021701)	tagapb (ENSCGOG00000021702)	opn8c (ENSCGOG00000021708)	PPP2R5A (ENSCGOG00000021811) #16	dtl (ENSCGOG00000023431) #17	ints7 (ENSCGOG00000023490) #18	lpgat1 (ENSCGOG00000023591) #19	nek2 (ENSCGOG00000023593) #21	ENSCGOG00000023598	slc30a1a (ENSCGOG00000023600) #22	rd3 (ENSCGOG00000023601) ##23	si:ch211-22i13.2 (ENSCGOG00000023603)	rhag (ENSCGOG00000023630)	ENSCGOG00000023802	ENSCGOG00000023804	nrbp1 (ENSCGOG00000023821)	CAPN3 (ENSCGOG00000023894)	churc1 (ENSCGOG00000024024)	ttbk2b (ENSCGOG00000024034)	mideasa (ENSCGOG00000024036)	kcns3b (ENSCGOG00000024042)	ENSCGOG00000024063	ENSCGOG00000024083	zpax1 (ENSCGOG00000024097)	ENSCGOG00000024132
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00950000183246	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.d.e	ENSGT00940000162013	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	14	DUSP10 (ENSSAUG00010006217)	hlx1 (ENSSAUG00010006220)	slc35f6 (ENSSAUG00010006225)	kcnk3a (ENSSAUG00010006227)	enpp1 (ENSSAUG00010006245)	ENSSAUG00010008034	ezrb (ENSSAUG00010008053)	rsph3 (ENSSAUG00010010774)	tagapb (ENSSAUG00010010781)	opn8c (ENSSAUG00010010788)	PPP2R5A (ENSSAUG00010010804) #16	dtl (ENSSAUG00010010831) #17	ints7 (ENSSAUG00010011471) #18	lpgat1 (ENSSAUG00010011591) #19	nek2 (ENSSAUG00010011594) #21	slc30a1a (ENSSAUG00010011597) #22	rd3 (ENSSAUG00010011599) ##23	rhag (ENSSAUG00010011609)	ENSSAUG00010011899	CRISP2 (ENSSAUG00010011901)	CRISP3 (ENSSAUG00010011907)	CRISP3 (ENSSAUG00010011915)	nrbp1 (ENSSAUG00010011945)	CAPN3 (ENSSAUG00010012311)	ENSSAUG00010012927	churc1 (ENSSAUG00010012932)	ttbk2b (ENSSAUG00010012935)	mideasa (ENSSAUG00010012940)	kcns3b (ENSSAUG00010012951)	ENSSAUG00010012984	ENSSAUG00010013539
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00950000183246	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000162013	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
European seabass	MODERN SPECIES	7	ENSDLAG00005004856	taf1a (ENSDLAG00005004912)	DUSP10 (ENSDLAG00005034812)	HLX (ENSDLAG00005032543)	ENSDLAG00005004979	kcnk3a (ENSDLAG00005004994)	enpp1 (ENSDLAG00005005029)	ENSDLAG00005005762	tagapb (ENSDLAG00005005816)	opn8c (ENSDLAG00005005851)	PPP2R5A (ENSDLAG00005005992) #16	DTL (ENSDLAG00005010236) #17	ints7 (ENSDLAG00005010957) #18	lpgat1 (ENSDLAG00005031470) #19	nek2 (ENSDLAG00005011025) #21	slc30a1a (ENSDLAG00005011054) #22	ENSDLAG00005011065	rd3 (ENSDLAG00005011072) ##23	rhag (ENSDLAG00005011083)	ENSDLAG00005011360	ENSDLAG00005011367	nrbp1 (ENSDLAG00005011381)	ENSDLAG00005011625	ENSDLAG00005012851	churc1 (ENSDLAG00005032581)	ttbk2b (ENSDLAG00005012888)	mideasa (ENSDLAG00005013043)	ENSDLAG00005029362	ENSDLAG00005013056	zpax1 (ENSDLAG00005013242)	ttc32 (ENSDLAG00005013442)
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	482	slc35f6 (ENSLCRG00005014882)	kcnk3a (ENSLCRG00005014881)	enpp1 (ENSLCRG00005014796)	ENSLCRG00005014786	ezrb (ENSLCRG00005014072)	rsph3 (ENSLCRG00005014068)	ENSLCRG00005014067	tagapb (ENSLCRG00005014066)	opn8c (ENSLCRG00005014065)	PPP2R5A (ENSLCRG00005013962) #16	dtl (ENSLCRG00005013430) #17	ints7 (ENSLCRG00005013420) #18	lpgat1 (ENSLCRG00005013418) #19	nek2 (ENSLCRG00005013416) #21	ENSLCRG00005013415	slc30a1a (ENSLCRG00005013414) #22	rd3 (ENSLCRG00005013412) ##23	rhag (ENSLCRG00005012979)	ENSLCRG00005012968	ENSLCRG00005012966	ENSLCRG00005012960	ENSLCRG00005012957	nrbp1 (ENSLCRG00005012868)	TRIM67 (ENSLCRG00005012855)	ENSLCRG00005012849	GNPAT (ENSLCRG00005012143)	ENSLCRG00005012125	ENSLCRG00005012123	ENSLCRG00005012121	ENSLCRG00005012120	ENSLCRG00005012118
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156249	ENSGT00940000157913.b.b	ENSGT00940000153592.A.a	ENSGT00390000005242	ENSGT00390000004313	ENSGT00940000157359	ENSGT00390000004172.h	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Tetraodon	MODERN SPECIES	5	LAMA2 (ENSTNIG00000016417)	ENSTNIG00000010746	PTPRK (ENSTNIG00000010747)	DLGAP2 (ENSTNIG00000010748)	ENSTNIG00000010749	grcc10 (ENSTNIG00000010750)	bpnt1 (ENSTNIG00000010751)	rsph3 (ENSTNIG00000010752)	tagapb (ENSTNIG00000010753)	opn8c (ENSTNIG00000000925)	PPP2R5A (ENSTNIG00000010754) #16	dtl (ENSTNIG00000010755) #17	ints7 (ENSTNIG00000010756) #18	lpgat1 (ENSTNIG00000010757) #19	nek2 (ENSTNIG00000010758) #21	slc30a1a (ENSTNIG00000010759) #22	rd3 (ENSTNIG00000004184) ##23	rhag (ENSTNIG00000004183)	ENSTNIG00000004182	ENSTNIG00000004181	nrbp1 (ENSTNIG00000004180)	CAPN3 (ENSTNIG00000003670)	ENSTNIG00000003669	churc1 (ENSTNIG00000003668)	ttbk2b (ENSTNIG00000003667)	ENSTNIG00000000380	mideasa (ENSTNIG00000003666)	kcns3b (ENSTNIG00000003665)	ENSTNIG00000003664	zpax1 (ENSTNIG00000003663)	matn3a (ENSTNIG00000003118)
Fugu	MODERN SPECIES	7	ENSTRUG00000017857	ENSTRUG00000032649	PTPRK (ENSTRUG00000017880)	grcc10 (ENSTRUG00000017936)	saysd1 (ENSTRUG00000017938)	bpnt1 (ENSTRUG00000017939)	rsph3 (ENSTRUG00000017942)	tagapb (ENSTRUG00000031531)	opn8c (ENSTRUG00000017948)	PPP2R5A (ENSTRUG00000017956) #16	dtl (ENSTRUG00000017966) #17	ints7 (ENSTRUG00000017976) #18	lpgat1 (ENSTRUG00000027415) #19	nek2 (ENSTRUG00000017989) #21	ENSTRUG00000022475	slc30a1 (ENSTRUG00000029267) #22	rd3 (ENSTRUG00000027917) ##23	rhag (ENSTRUG00000018004)	ENSTRUG00000033202	ENSTRUG00000018021	ENSTRUG00000018037	nrbp1 (ENSTRUG00000018045)	CAPN3 (ENSTRUG00000018064)	ENSTRUG00000026845	churc1 (ENSTRUG00000018096)	ttbk2b (ENSTRUG00000032745)	mideasa (ENSTRUG00000018103)	kcns3b (ENSTRUG00000018106)	ENSTRUG00000018109	zpax1 (ENSTRUG00000018126)	ttc32 (ENSTRUG00000020709)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00940000162013	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000162013	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b	ENSGT00940000153446.b
Climbing perch	MODERN SPECIES	15	HLX (ENSATEG00000017038)	ENSATEG00000017020	kcnk3a (ENSATEG00000017011)	enpp1 (ENSATEG00000016939)	ENSATEG00000026406	ezrb (ENSATEG00000016839)	rsph3 (ENSATEG00000016723)	tagapb (ENSATEG00000016630)	opn8c (ENSATEG00000016579)	PPP2R5A (ENSATEG00000016533) #16	DTL (ENSATEG00000016504) #17	ints7 (ENSATEG00000016464) #18	lpgat1 (ENSATEG00000016453) #19	nek2 (ENSATEG00000016432) #21	ENSATEG00000016422	slc30a1a (ENSATEG00000016412) #22	rd3 (ENSATEG00000025390) ##23	rhag (ENSATEG00000016362)	ENSATEG00000016187	nrbp1 (ENSATEG00000016104)	ENSATEG00000016039	ENSATEG00000016010	churc1 (ENSATEG00000027312)	ttbk2b (ENSATEG00000015975)	mideasa (ENSATEG00000015945)	ENSATEG00000015927	ENSATEG00000015290	zpax1 (ENSATEG00000015158)	ttc32 (ENSATEG00000015145)	matn3a (ENSATEG00000015129)	laptm4a (ENSATEG00000029888)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	13	ENSBSLG00000023915	taf1a (ENSBSLG00000023900)	DUSP10 (ENSBSLG00000023882)	hlx1 (ENSBSLG00000023874)	slc35f6 (ENSBSLG00000023855)	kcnk3a (ENSBSLG00000023839)	ENSBSLG00000023548	ezrb (ENSBSLG00000022493)	rsph3 (ENSBSLG00000022357)	tagapb (ENSBSLG00000022330)	PPP2R5A (ENSBSLG00000022000) #16	dtl (ENSBSLG00000021732) #17	ints7 (ENSBSLG00000021260) #18	lpgat1 (ENSBSLG00000021141) #19	nek2 (ENSBSLG00000021078) #21	slc30a1a (ENSBSLG00000020994) #22	rd3 (ENSBSLG00000020927) ##23	rhag (ENSBSLG00000019895)	ENSBSLG00000019779	nrbp1 (ENSBSLG00000019447)	ENSBSLG00000018922	churc1 (ENSBSLG00000018897)	ttbk2b (ENSBSLG00000018825)	mideasa (ENSBSLG00000018751)	kcns3b (ENSBSLG00000018484)	ENSBSLG00000018377	zpax1 (ENSBSLG00000018280)	ttc32 (ENSBSLG00000018271)	matn3a (ENSBSLG00000018212)	laptm4a (ENSBSLG00000018165)	PUM2 (ENSBSLG00000017389)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	16	HLX (ENSMAMG00000004901)	ENSMAMG00000004912	kcnk3a (ENSMAMG00000027319)	enpp1 (ENSMAMG00000004963)	ENSMAMG00000005065	ENSMAMG00000028323	ezrb (ENSMAMG00000005100)	rsph3 (ENSMAMG00000005158)	tagapb (ENSMAMG00000005163)	opn8c (ENSMAMG00000005172)	PPP2R5A (ENSMAMG00000005183) #16	DTL (ENSMAMG00000005233) #17	ints7 (ENSMAMG00000005247) #18	lpgat1 (ENSMAMG00000005304) #19	nek2 (ENSMAMG00000005319) #21	slc30a1a (ENSMAMG00000005346) #22	rd3 (ENSMAMG00000026093) ##23	rhag (ENSMAMG00000005388)	ENSMAMG00000005415	ENSMAMG00000005457	nrbp1 (ENSMAMG00000005667)	ENSMAMG00000005712	ENSMAMG00000025637	churc1 (ENSMAMG00000028489)	ttbk2b (ENSMAMG00000005848)	mideasa (ENSMAMG00000005880)	ENSMAMG00000005896	ENSMAMG00000005910	ttc32 (ENSMAMG00000006019)	MATN3 (ENSMAMG00000006026)	laptm4a (ENSMAMG00000006046)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.e.a #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c
Tongue sole	MODERN SPECIES	17	kcns3b (ENSCSEG00000020891)	mideasa (ENSCSEG00000020890)	ttbk2b (ENSCSEG00000020889)	churc1 (ENSCSEG00000020888)	ENSCSEG00000020887	CAPN3 (ENSCSEG00000020886)	nrbp1 (ENSCSEG00000020885)	ENSCSEG00000020884	ENSCSEG00000020883	rhag (ENSCSEG00000020882)	rd3 (ENSCSEG00000020881) ##23	ints7 (ENSCSEG00000020878) #18	lpgat1 (ENSCSEG00000020876) #19	nek2 (ENSCSEG00000020874) #21	ENSCSEG00000020872	slc30a1a (ENSCSEG00000020867) #22	dtl (ENSCSEG00000020864) #17	PPP2R5A (ENSCSEG00000020858) #16	opn8c (ENSCSEG00000020857)	tagapb (ENSCSEG00000020825)	rsph3 (ENSCSEG00000020820)	ezrb (ENSCSEG00000020818)	ENSCSEG00000020817	enpp1 (ENSCSEG00000020813)	ENSCSEG00000020811	slc35f6 (ENSCSEG00000020809)	hlx1 (ENSCSEG00000020806)	DUSP10 (ENSCSEG00000020802)	taf1a (ENSCSEG00000020793)	ENSCSEG00000020789	ENSCSEG00000020776
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000162013	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000162013	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Greater amberjack	MODERN SPECIES	10	DUSP10 (ENSSDUG00000003523)	hlx1 (ENSSDUG00000003500)	slc35f6 (ENSSDUG00000003469)	kcnk3a (ENSSDUG00000003460)	enpp1 (ENSSDUG00000003432)	ENSSDUG00000003410	ezrb (ENSSDUG00000003348)	rsph3 (ENSSDUG00000003327)	tagapb (ENSSDUG00000003290)	opn8c (ENSSDUG00000003268)	PPP2R5A (ENSSDUG00000003233) #16	dtl (ENSSDUG00000003217) #17	ints7 (ENSSDUG00000003130) #18	lpgat1 (ENSSDUG00000003098) #19	nek2 (ENSSDUG00000003064) #21	slc30a1a (ENSSDUG00000003054) #22	rd3 (ENSSDUG00000003038) ##23	rhag (ENSSDUG00000003011)	CRISP3 (ENSSDUG00000002995)	ENSSDUG00000002975	nrbp1 (ENSSDUG00000002869)	ENSSDUG00000002257	churc1 (ENSSDUG00000002192)	ttbk2b (ENSSDUG00000002162)	mideasa (ENSSDUG00000002088)	KCNS3 (ENSSDUG00000002073)	kcns3b (ENSSDUG00000002071)	ENSSDUG00000001994	zpax1 (ENSSDUG00000001910)	ttc32 (ENSSDUG00000001884)	matn3a (ENSSDUG00000001868)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2936	hlx1 (ENSSLDG00000024751)	slc35f6 (ENSSLDG00000024760)	kcnk3a (ENSSLDG00000024770)	enpp1 (ENSSLDG00000024775)	ENSSLDG00000024830	ezrb (ENSSLDG00000024844)	rsph3 (ENSSLDG00000024863)	tagapb (ENSSLDG00000024885)	opn8c (ENSSLDG00000024890)	PPP2R5A (ENSSLDG00000024894) #16	dtl (ENSSLDG00000024903) #17	ints7 (ENSSLDG00000024913) #18	lpgat1 (ENSSLDG00000024937) #19	nek2 (ENSSLDG00000000083) #21	ENSSLDG00000000129	slc30a1a (ENSSLDG00000000158) #22	rd3 (ENSSLDG00000000169) ##23	rhag (ENSSLDG00000000187)	ENSSLDG00000000247	ENSSLDG00000000313	nrbp1 (ENSSLDG00000000428)	CAPN3 (ENSSLDG00000000506)	ENSSLDG00000000524	churc1 (ENSSLDG00000000533)	ttbk2b (ENSSLDG00000000565)	mideasa (ENSSLDG00000000670)	kcns3b (ENSSLDG00000000679)	ENSSLDG00000000690	zpax1 (ENSSLDG00000000764)	ttc32 (ENSSLDG00000000891)	matn3a (ENSSLDG00000000904)
Barramundi perch	MODERN SPECIES	335							ezrb (ENSLCAG00010020689)	rsph3 (ENSLCAG00010020696)	tagapb (ENSLCAG00010020703)	opn8c (ENSLCAG00010020712)	PPP2R5A (ENSLCAG00010020736) #16	dtl (ENSLCAG00010020815) #17	ints7 (ENSLCAG00010020896) #18	lpgat1 (ENSLCAG00010020951) #19	nek2 (ENSLCAG00010020958) #21	slc30a1a (ENSLCAG00010020960) #22	rd3 (ENSLCAG00010020963) ##23	rhag (ENSLCAG00010020975)	ENSLCAG00010020994	ENSLCAG00010021001	nrbp1 (ENSLCAG00010021026)	CAPN3 (ENSLCAG00010021080)	ENSLCAG00010021098	churc1 (ENSLCAG00010021110)	ttbk2b (ENSLCAG00010021115)	mideasa (ENSLCAG00010021121)	kcns3b (ENSLCAG00010021132)	ENSLCAG00010021144	zpax1 (ENSLCAG00010021178)	ttc32 (ENSLCAG00010021231)	ENSLCAG00010021232
Pinecone sodierfish	MODERN SPECIES	16	DUSP10 (ENSMMDG00005020735)	hlx1 (ENSMMDG00005020736)	slc35f6 (ENSMMDG00005020738)	kcnk3a (ENSMMDG00005020739)	enpp1 (ENSMMDG00005020752)	ENSMMDG00005021190	ezrb (ENSMMDG00005021202)	rsph3 (ENSMMDG00005021375)	tagapb (ENSMMDG00005021380)	opn8c (ENSMMDG00005021384)	PPP2R5A (ENSMMDG00005002901) #16	dtl (ENSMMDG00005007793) #17	ints7 (ENSMMDG00005008105) #18	lpgat1 (ENSMMDG00005008152) #19	nek2 (ENSMMDG00005008155) #21	slc30a1a (ENSMMDG00005008163) #22	ENSMMDG00005008166	ENSMMDG00005008168	si:ch211-22i13.2 (ENSMMDG00005008171)	rhag (ENSMMDG00005008182)	ENSMMDG00005008205	ENSMMDG00005008232	nrbp1 (ENSMMDG00005008257)	CAPN3 (ENSMMDG00005008285)	ENSMMDG00005008302	churc1 (ENSMMDG00005008309)	ttbk2b (ENSMMDG00005008311)	mideasa (ENSMMDG00005008316)	kcns3b (ENSMMDG00005008319)	ENSMMDG00005008353	zpax1 (ENSMMDG00005010026)
Cod	MODERN SPECIES	13	AIG1 (ENSGMOG00000026416)	adat2 (ENSGMOG00000004244)	pex3 (ENSGMOG00000004257)	atf3 (ENSGMOG00000033542)	nsl1 (ENSGMOG00000016276)	flvcr1 (ENSGMOG00000016293)	ENSGMOG00000028494	ENSGMOG00000023698	ENSGMOG00000035235	PPP2R5A (ENSGMOG00000000268) #16	DTL (ENSGMOG00000000255) #17	ints7 (ENSGMOG00000000248) #18	lpgat1 (ENSGMOG00000000241) #19	ENSGMOG00000032380	nek2 (ENSGMOG00000000237) #21	slc30a1a (ENSGMOG00000035797) #22	ENSGMOG00000035602	rd3 (ENSGMOG00000029833) ##23	rhag (ENSGMOG00000000218)	ENSGMOG00000024171	ENSGMOG00000000212	nrbp1 (ENSGMOG00000000204)	ENSGMOG00000028394	ENSGMOG00000000192	ENSGMOG00000000179	churc1 (ENSGMOG00000000176)	ttbk2b (ENSGMOG00000000171)	mideasa (ENSGMOG00000033850)	ENSGMOG00000029401	ENSGMOG00000010685	ENSGMOG00000010704
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT00390000011405	ENSGT00940000157671	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000179620	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	108	ENSGT00950000183093.C.f	ENSGT00390000017237.c	ENSGT00940000158248.b.a	ENSGT00940000156034.a.n	ENSGT00940000160610.t	ENSGT01090000260082.d.b.b.d	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993.x	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.g #16	ENSGT00530000064210.d #17	ENSGT00390000011724.h #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.c #19	ENSGT00940000156989.k #21	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.b.c #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a.e.b	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a.e	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163.f	ENSGT00940000165020.a.h	ENSGT00940000157459.a.g	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.c.k	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b	ENSGT00940000153446.b.x	ENSGT00940000161171
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00950000183093.C.f	ENSGT00390000017237.c	ENSGT00940000158248.b.a	ENSGT00940000156034.a.n	ENSGT00940000160610.t	ENSGT01090000260082.d.b.b.d	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993.x	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.g #16	ENSGT00530000064210.d #17	ENSGT00390000011724.h #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.c #19	ENSGT00940000156989.k #21	ENSGT00960000186817.a	ENSGT00940000156484.b.e.b.c #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a.e.b	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a.e	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163.f	ENSGT00940000165020.a.h	ENSGT00940000157459.a.g	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.c.k	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b	ENSGT00940000153446.b.x	ENSGT00940000161171
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00950000183093.C.f	ENSGT00390000017237.c	ENSGT00940000158248.b.a	ENSGT00940000156034.a.n	ENSGT00940000160610.t	ENSGT01090000260082.d.b.b.d	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993.x	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.g #16	ENSGT00530000064210.d #17	ENSGT00390000011724.h #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.c #19	ENSGT00940000156989.k #21	ENSGT00960000186817.a	ENSGT00940000156484.b.e.b.c #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a.e.b	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a.e	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163.f	ENSGT00940000165020.a.h	ENSGT00940000157459.a.g	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.c.k	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b	ENSGT00940000153446.b.x	ENSGT00940000161171
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	50	ENSGT00950000183093.C.f	ENSGT00390000017237.c	ENSGT00940000158248.b.a	ENSGT00940000156034.a.n	ENSGT00940000160610.t	ENSGT01090000260082.d.b.b.d	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993.x	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.g #16	ENSGT00530000064210.d #17	ENSGT00390000011724.h #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.c #19	ENSGT00940000156989.k #21	ENSGT00960000186817.a	ENSGT00940000156484.b.e.b.c #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.a ##23	ENSGT00950000182844.b.a.e.b	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a.e	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163.f	ENSGT00940000165020.a.h	ENSGT00940000157459.a.g	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.c.k	ENSGT00390000011905	ENSGT00940000157581.b	ENSGT00940000153446.b.x	ENSGT00940000161171
Coho salmon	MODERN SPECIES	3	HLX (ENSOKIG00005015948)	SLC35F6 (ENSOKIG00005015937)	kcnk3a (ENSOKIG00005015926)	enpp1 (ENSOKIG00005013803)	SYTL3 (ENSOKIG00005013592)	ENSOKIG00005013568	ezrb (ENSOKIG00005013516)	rsph3 (ENSOKIG00005013486)	ENSOKIG00005013463	opn8c (ENSOKIG00005013323)	PPP2R5A (ENSOKIG00005013103) #16	dtl (ENSOKIG00005013017) #17	ints7 (ENSOKIG00005012962) #18	lpgat1 (ENSOKIG00005012953) #19	nek2 (ENSOKIG00005012940) #21	slc30a1a (ENSOKIG00005012933) #22	rd3 (ENSOKIG00005012927) ##23	rhag (ENSOKIG00005012532)	ENSOKIG00005012488	nrbp1 (ENSOKIG00005012412)	CAPN3 (ENSOKIG00005010921)	ENSOKIG00005010777	churc1 (ENSOKIG00005010750)	ttbk2b (ENSOKIG00005010741)	mideasa (ENSOKIG00005010729)	kcns3b (ENSOKIG00005010724)	zpax1 (ENSOKIG00005010609)	MATN3 (ENSOKIG00005010560)	laptm4a (ENSOKIG00005010543)	ENSOKIG00005010537	RHOB (ENSOKIG00005010534)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	29	DUSP10 (ENSOTSG00005029718)	hlx1 (ENSOTSG00005029717)	slc35f6 (ENSOTSG00005029716)	kcnk3a (ENSOTSG00005029714)	enpp1 (ENSOTSG00005025173)	SYTL3 (ENSOTSG00005025141)	ezrb (ENSOTSG00005025138)	rsph3 (ENSOTSG00005025132)	TAGAP (ENSOTSG00005025128)	opn8c (ENSOTSG00005025113)	PPP2R5A (ENSOTSG00005024894) #16	dtl (ENSOTSG00005024822) #17	lpgat1 (ENSOTSG00005024820) #19	nek2 (ENSOTSG00005024818) #21	ENSOTSG00005024817	slc30a1a (ENSOTSG00005024815) #22	rd3 (ENSOTSG00005024814) ##23	ENSOTSG00005024812	rhag (ENSOTSG00005024078)	ENSOTSG00005024073	nrbp1 (ENSOTSG00005024009)	CAPN3 (ENSOTSG00005024006)	ENSOTSG00005024005	churc1 (ENSOTSG00005024004)	ttbk2b (ENSOTSG00005024003)	kcns3b (ENSOTSG00005008034)	zpax1 (ENSOTSG00005007934)	ttc32 (ENSOTSG00005007926)	matn3a (ENSOTSG00005007922)	laptm4a (ENSOTSG00005007918)	ENSOTSG00005007916
Rainbow trout	MODERN SPECIES	29	ENSOMYG00000039694	kcnk3a (ENSOMYG00000039686)	ENSOMYG00000067089	enpp1 (ENSOMYG00000033685)	SYTL3 (ENSOMYG00000033056)	ezrb (ENSOMYG00000030834)	rsph3 (ENSOMYG00000030396)	TAGAP (ENSOMYG00000030381)	opn8c (ENSOMYG00000030365)	PPP2R5A (ENSOMYG00000029168) #16	DTL (ENSOMYG00000028691) #17	ENSOMYG00000028615	lpgat1 (ENSOMYG00000028570) #19	nek2 (ENSOMYG00000028556) #21	ENSOMYG00000028533	slc30a1a (ENSOMYG00000028520) #22	ENSOMYG00000077420	rd3 (ENSOMYG00000028497) ##23	rhag (ENSOMYG00000027922)	ENSOMYG00000027819	ENSOMYG00000054728	nrbp1 (ENSOMYG00000027812)	ENSOMYG00000027788	ENSOMYG00000027736	churc1 (ENSOMYG00000027708)	ttbk2b (ENSOMYG00000012408)	mideasa (ENSOMYG00000058735)	ENSOMYG00000012404	zpax1 (ENSOMYG00000012339)	ENSOMYG00000012318	ENSOMYG00000012309
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River trout	MODERN SPECIES	28	slc35f6 (ENSSTUG00000043181)	kcnk3a (ENSSTUG00000043204)	enpp1 (ENSSTUG00000043301)	SYTL3 (ENSSTUG00000045355)	ENSSTUG00000045364	rsph3 (ENSSTUG00000045368)	TAGAP (ENSSTUG00000045380)	ENSSTUG00000045390	opn8c (ENSSTUG00000045395)	PPP2R5A (ENSSTUG00000045427) #16	dtl (ENSSTUG00000045837) #17	ENSSTUG00000046078	lpgat1 (ENSSTUG00000046085) #19	nek2 (ENSSTUG00000046102) #21	ENSSTUG00000046124	slc30a1a (ENSSTUG00000046134) #22	rd3 (ENSSTUG00000046138) ##23	rhag (ENSSTUG00000046152)	ENSSTUG00000046431	nrbp1 (ENSSTUG00000046458)	CAPN3 (ENSSTUG00000046556)	ENSSTUG00000046568	churc1 (ENSSTUG00000046590)	ttbk2b (ENSSTUG00000046603)	mideasa (ENSSTUG00000046617)	kcns3b (ENSSTUG00000046631)	zpax1 (ENSSTUG00000046641)	zpax1 (ENSSTUG00000046847)	ttc32 (ENSSTUG00000047091)	matn3a (ENSSTUG00000047101)	laptm4a (ENSSTUG00000047106)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	6	ENSSSAG00000113566	hlx (ENSSSAG00000039444)	ENSSSAG00000119745	kcnk3a (ENSSSAG00000087835)	enpp1 (ENSSSAG00000075865)	SYTL3 (ENSSSAG00000075812)	ENSSSAG00000117114	ezr (ENSSSAG00000110492)	rsph3 (ENSSSAG00000074669)	TAGAP (ENSSSAG00000074662)	opn8c (ENSSSAG00000074632)	PPP2R5A (ENSSSAG00000093166) #16	DTL (ENSSSAG00000074405) #17	ints7 (ENSSSAG00000116796) #18	LPGAT1 (ENSSSAG00000103088) #19	ENSSSAG00000120396 #22	nek2 (ENSSSAG00000106767) #21	rd3 (ENSSSAG00000086114) ##23	rhag (ENSSSAG00000056040)	ENSSSAG00000097382	ENSSSAG00000074385	nrbp1 (ENSSSAG00000074178)	can3 (ENSSSAG00000074137)	churc1 (ENSSSAG00000073490)	ENSSSAG00000073534	ttbk2b (ENSSSAG00000116648)	ENSSSAG00000104445	ENSSSAG00000073482	ENSSSAG00000073325	ENSSSAG00000073270	ENSSSAG00000073261
Huchen	MODERN SPECIES	1100						ezrb (ENSHHUG00000032809)	rsph3 (ENSHHUG00000032805)	TAGAP (ENSHHUG00000032778)	opn8c (ENSHHUG00000032777)	PPP2R5A (ENSHHUG00000032707) #16	dtl (ENSHHUG00000032695) #17	ENSHHUG00000032684 #18	ENSHHUG00000032678 #18	lpgat1 (ENSHHUG00000032669) #19	nek2 (ENSHHUG00000032666) #21	slc30a1a (ENSHHUG00000032662) #22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	376	ENSGT00390000011405	ENSGT00940000157671.h	ENSGT00950000183093.C.e	ENSGT00390000017237.d	ENSGT00940000158248.b.b	ENSGT00940000156034.a.m	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610.s	ENSGT01090000260082.d.b.b.c	ENSGT00940000157993.w	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.h #16	ENSGT00530000064210.c #17	ENSGT00390000011724.g #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.d #19	ENSGT00940000156989.l #21	ENSGT00940000156484.b.e.b.d #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.b ##23	ENSGT00950000182844.b.a.f	ENSGT00940000162013
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	104	ENSGT00390000011405	ENSGT00940000157671.h	ENSGT00950000183093.C.e	ENSGT00390000017237.d	ENSGT00940000158248.b.b	ENSGT00940000156034.a.m	ENSGT00940000160610.s	ENSGT01090000260082.d.b.b.c	ENSGT00940000157993.w	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.h #16	ENSGT00530000064210.c #17	ENSGT00390000011724.g #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.d #19	ENSGT00940000156989.l #21	ENSGT00960000186817.b	ENSGT00940000156484.b.e.b.d #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.b ##23	ENSGT00950000182844.b.a.f	ENSGT00940000162013	ENSGT00940000155605.a.a.f	ENSGT00390000011163.e.a	ENSGT00940000165020.a.g	ENSGT00940000157459.a.h	ENSGT00940000163503.B.c.l	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000153446.b.w	ENSGT00940000157575	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.u	ENSGT00940000154645.A.e.b	ENSGT00940000155646.l	ENSGT01030000234517.C.f
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000169554	ENSGT00390000011405	ENSGT00940000157671.h	ENSGT00950000183093.C.e	ENSGT00390000017237.d	ENSGT00940000158248.b.b	ENSGT00940000156034.a.m	ENSGT00940000160610.s	ENSGT00940000157993.w	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.h #16	ENSGT00530000064210.c #17	ENSGT00390000011724.g #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.d #19	ENSGT00940000156989.l #21	ENSGT00960000186817.b	ENSGT00940000156484.b.e.b.d #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.b ##23	ENSGT00950000182844.b.a.f	ENSGT00940000165020.a.g	ENSGT00940000157459.a.h	ENSGT00940000163503.B.d.e	ENSGT00940000153446.b.w	ENSGT00940000157575	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.u	ENSGT00940000154645.A.e.b	ENSGT00940000155646.l	ENSGT01030000234517.C.f	ENSGT00940000154164.c.b.h	ENSGT00940000161952.d	ENSGT00940000156143.a.b.b	ENSGT00940000155610.o.a.b
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00950000182767.a.h	ENSGT00390000011405	ENSGT00940000157671.h	ENSGT00950000183093.C.e	ENSGT00390000017237.d	ENSGT00940000158248.b.b	ENSGT00940000156034.a.m	ENSGT00940000160610.s	ENSGT00940000157993.w	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.h #16	ENSGT00530000064210.c #17	ENSGT00390000011724.g #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.d #19	ENSGT00940000156989.l #21	ENSGT00960000186817.b	ENSGT00940000156484.b.e.b.d #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.b ##23	ENSGT00950000182844.b.a.f	ENSGT01010000229120	ENSGT00940000165020.a.g	ENSGT00940000157459.a.h	ENSGT00940000158024.A.c.b	ENSGT00950000183036.a.b	ENSGT01050000244941.B.d	ENSGT00940000163785.b	ENSGT00390000007688.a.a	ENSGT00940000175306	ENSGT00390000012891	ENSGT00390000003298	ENSGT00940000153229.B	ENSGT00940000163111.a.b.z
Chinook salmon	MODERN SPECIES	9	rnf8 (ENSOTSG00005002084)	aida (ENSOTSG00005044414)	ENSOTSG00005044413	taf1a (ENSOTSG00005044412)	DUSP10 (ENSOTSG00005044411)	hlx1 (ENSOTSG00005044410)	slc35f6 (ENSOTSG00005044409)	slc22a2 (ENSOTSG00005044408)	kcnk3a (ENSOTSG00005044407)	enpp1 (ENSOTSG00005044305)	ENSOTSG00005044303	ENSOTSG00005044300	PPP2R5A (ENSOTSG00005044298) #16	nek2 (ENSOTSG00005044296) #21	ENSOTSG00005044295	slc30a1a (ENSOTSG00005044294) #22	rd3 (ENSOTSG00005044292) ##23	rhag (ENSOTSG00005044265)	ENSOTSG00005044259	ttbk2b (ENSOTSG00005044258)	ENSOTSG00005044257	EPHB3 (ENSOTSG00005044256)	ENSOTSG00005044255	mcoln2 (ENSOTSG00005044254)	lpar3 (ENSOTSG00005044253)	ENSOTSG00005044252	SSX2IP (ENSOTSG00005044251)	ENSOTSG00005044250	ctbs (ENSOTSG00005044248)	SPATA1 (ENSOTSG00005044246)	uox (ENSOTSG00005044245)
Coho salmon	MODERN SPECIES	13	DUSP10 (ENSOKIG00005030931)	hlx1 (ENSOKIG00005030917)	slc35f6 (ENSOKIG00005030900)	kcnk3a (ENSOKIG00005030865)	ENSOKIG00005030853	ENSOKIG00005027525	ENSOKIG00005027319	ENSOKIG00005027290	ENSOKIG00005027273	PPP2R5A (ENSOKIG00005026858) #16	DTL (ENSOKIG00005026623) #17	ints7 (ENSOKIG00005025776) #18	lpgat1 (ENSOKIG00005025717) #19	nek2 (ENSOKIG00005025708) #21	ENSOKIG00005025686	slc30a1a (ENSOKIG00005025673) #22	rd3 (ENSOKIG00005025664) ##23	rhag (ENSOKIG00005024825)	ENSOKIG00005024794	ENSOKIG00005024778	ENSOKIG00005024767	ENSOKIG00005024755	ENSOKIG00005024725	EPHB3 (ENSOKIG00005024637)	mcoln2 (ENSOKIG00005024486)	lpar3 (ENSOKIG00005049414)	ENSOKIG00005049391	SSX2IP (ENSOKIG00005049331)	ENSOKIG00005049308	ctbs (ENSOKIG00005049302)	SPATA1 (ENSOKIG00005049285)
Rainbow trout	MODERN SPECIES	25	ENSOMYG00000073024	DUSP10 (ENSOMYG00000001851)	ENSOMYG00000059662	HLX (ENSOMYG00000001814)	ENSOMYG00000001780	kcnk3a (ENSOMYG00000001766)	ENSOMYG00000001722	ENSOMYG00000001664	ENSOMYG00000001642	PPP2R5A (ENSOMYG00000001528) #16	DTL (ENSOMYG00000001142) #17	ints7 (ENSOMYG00000000992) #18	lpgat1 (ENSOMYG00000000933) #19	nek2 (ENSOMYG00000000907) #21	ENSOMYG00000059202	slc30a1a (ENSOMYG00000000887) #22	rd3 (ENSOMYG00000000881) ##23	rhag (ENSOMYG00000000865)	ENSOMYG00000000814	ENSOMYG00000000809	ENSOMYG00000067773	ENSOMYG00000049925	ENSOMYG00000071086	ENSOMYG00000055230	ENSOMYG00000049693	ENSOMYG00000053012	ENSOMYG00000070869	ENSOMYG00000054611	ENSOMYG00000072969	LAPTM4A (ENSOMYG00000058908)	ENSOMYG00000052559
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00390000016465	ENSGT00390000011405	ENSGT00940000157671.h	ENSGT00950000183093.C.e	ENSGT00390000017237.d	ENSGT00940000158248.b.b	ENSGT00940000156034.a.m	ENSGT00940000160610.s	ENSGT01090000260082.d.b.b.c	ENSGT00940000157993.w	ENSGT01030000234620.a.b.b.b.h #16	ENSGT00530000064210.c #17	ENSGT00390000011724.g #18	ENSGT00950000182836.b.a.b.d #19	ENSGT00940000156989.l #21	ENSGT00940000156484.b.e.b.d #22	ENSGT00390000002089.a.a.a.b ##23	ENSGT00950000182844.b.a.f	ENSGT00940000162013	ENSGT00940000155605.a.a.f	ENSGT00390000011163.e.a.a	ENSGT00940000165020.a.g	ENSGT00940000157459.a.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000153446.b.w	ENSGT00940000157575	ENSGT00950000182945.b.a.a.b.b.b.u	ENSGT00940000154645.A.e.b	ENSGT00940000155646.l	ENSGT01030000234517.C.f	ENSGT00940000154164.c.b.h
River trout	MODERN SPECIES		aida (ENSSTUG00000002596)	taf1a (ENSSTUG00000002585)	DUSP10 (ENSSTUG00000002573)	hlx1 (ENSSTUG00000002397)	slc35f6 (ENSSTUG00000002384)	kcnk3a (ENSSTUG00000002375)	enpp1 (ENSSTUG00000001863)	SYTL3 (ENSSTUG00000049441)	ezrb (ENSSTUG00000049387)	TAGAP (ENSSTUG00000049378)	PPP2R5A (ENSSTUG00000049239) #16	dtl (ENSSTUG00000049103) #17	ints7 (ENSSTUG00000049017) #18	lpgat1 (ENSSTUG00000049002) #19	nek2 (ENSSTUG00000048999) #21	slc30a1a (ENSSTUG00000048993) #22	rd3 (ENSSTUG00000048991) ##23	rhag (ENSSTUG00000048956)	ENSSTUG00000048794	nrbp1 (ENSSTUG00000048730)	churc1 (ENSSTUG00000048725)	ttbk2b (ENSSTUG00000048718)	mideasa (ENSSTUG00000048714)	ENSSTUG00000048602	ENSSTUG00000048520	ENSSTUG00000048194	ENSSTUG00000047810	ENSSTUG00000047742	ENSSTUG00000047685	laptm4a (ENSSTUG00000047662)	PUM2 (ENSSTUG00000047362)
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	25	taf1a (ENSSSAG00000106442)	DUSP10 (ENSSSAG00000065276)	HLX (ENSSSAG00000065263)	ENSSSAG00000083988	kcnk3a (ENSSSAG00000114420)	ENSSSAG00000115957	enpp1 (ENSSSAG00000065057)	SYTL3 (ENSSSAG00000065004)	ezrb (ENSSSAG00000102161)	ENSSSAG00000061533	PPP2R5A (ENSSSAG00000060240) #16	dtl (ENSSSAG00000058407) #17	ints7 (ENSSSAG00000056142) #18	lpgat1 (ENSSSAG00000093312) #19	nek2 (ENSSSAG00000056109) #21	slc30a1a (ENSSSAG00000056106) #22	ENSSSAG00000108710	rd3 (ENSSSAG00000083526) ##23	rhag (ENSSSAG00000085719)	ENSSSAG00000055798	ENSSSAG00000055785	ENSSSAG00000055707	ENSSSAG00000055662	ENSSSAG00000113664	mideasa (ENSSSAG00000055632)	ttbk2b (ENSSSAG00000055639)	ENSSSAG00000103782	ENSSSAG00000012028	ENSSSAG00000114579	ENSSSAG00000007590	ENSSSAG00000005767
Huchen	MODERN SPECIES	633										ENSHHUG00000034834	PPP2R5A (ENSHHUG00000034685) #16	dtl (ENSHHUG00000034587) #17	ints7 (ENSHHUG00000034293) #18	lpgat1 (ENSHHUG00000034281) #19	nek2 (ENSHHUG00000034272) #21	slc30a1a (ENSHHUG00000034271) #22	rd3 (ENSHHUG00000034259) ##23	rhag (ENSHHUG00000033948)	ENSHHUG00000033908	ENSHHUG00000033870
Northern pike	MODERN SPECIES	13	DUSP10 (ENSELUG00000013415)	hlx1 (ENSELUG00000000492)	slc35f6 (ENSELUG00000013461)	kcnk3a (ENSELUG00000013478)	enpp1 (ENSELUG00000013530)	SYTL3 (ENSELUG00000013557)	ezrb (ENSELUG00000013589)	rsph3 (ENSELUG00000013616)	tagapb (ENSELUG00000013675)	opn8c (ENSELUG00000013700)	PPP2R5A (ENSELUG00000013822) #16	dtl (ENSELUG00000013921) #17	ints7 (ENSELUG00000014047) #18	lpgat1 (ENSELUG00000014074) #19	nek2 (ENSELUG00000014120) #21	slc30a1a (ENSELUG00000014145) #22	ENSELUG00000026494	ENSELUG00000014162	nrbp1 (ENSELUG00000014337)	CAPN3 (ENSELUG00000014459)	ENSELUG00000014554	churc1 (ENSELUG00000014590)	ttbk2b (ENSELUG00000014621)	mideasa (ENSELUG00000014652)	kcns3b (ENSELUG00000014664)	ENSELUG00000014721	zpax1 (ENSELUG00000014772)	ttc32 (ENSELUG00000026723)	ENSELUG00000014816	ENSELUG00000014829	matn3a (ENSELUG00000014863)
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00950000183093.C	ENSGT00390000017237	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT00940000160610	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00940000156484.b.f #22	ENSGT00960000186817	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000162013	ENSGT00940000167629	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a
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Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b.f #22
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b.f #22
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000158248.b	ENSGT00940000156034.a	ENSGT00940000167198	ENSGT01090000260082.d.b.b	ENSGT00390000004172	ENSGT00940000157993	ENSGT01100000263524.F	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #16	ENSGT00530000064210 #17	ENSGT00390000011724 #18	ENSGT00950000182836.b.a.b #19	ENSGT00940000156989 #21	ENSGT00950000183246	ENSGT00940000156484.b.e.b #22	ENSGT01100000263861	ENSGT00940000156484.b.f #22	ENSGT00390000002089.a.a.a ##23	ENSGT00730000112900	ENSGT00950000182844.b.a	ENSGT00940000156439.c	ENSGT00390000016613.d	ENSGT00940000155605.a.a	ENSGT00940000179293	ENSGT00940000156092.a.a	ENSGT00940000157336.p	ENSGT00390000011163	ENSGT00940000165020.a	ENSGT00940000157459.a	ENSGT00940000155979.h	ENSGT00940000163503.B.d	ENSGT00940000163503.B.c
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Poecilia	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b.f #22
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Elephant shark	MODERN SPECIES	1619	smyd2a (ENSCMIG00000012031)	prox1a (ENSCMIG00000012020)	RPS6KC1 (ENSCMIG00000011943)	angel2 (ENSCMIG00000011929)	VASH2 (ENSCMIG00000011924)	flvcr1 (ENSCMIG00000011919)	TATDN3 (ENSCMIG00000011882)	ENSCMIG00000011867	atf3 (ENSCMIG00000011864)	nenf (ENSCMIG00000011860)	pacc1 (ENSCMIG00000011833) #15	PPP2R5A (ENSCMIG00000011705) #16	ENSCMIG00000011653 #17	ints7 (ENSCMIG00000011505) #18	nek2 (ENSCMIG00000011460) #21	slc30a1a (ENSCMIG00000011452) #22	RD3 (ENSCMIG00000011449) #23	ENSCMIG00000011447	DUSP10 (ENSCMIG00000011441)	HHIPL2 (ENSCMIG00000011423)	TAF1A (ENSCMIG00000011416)	fshr (ENSCMIG00000011410)	ENSCMIG00000011405	ENSCMIG00000011402	ENSCMIG00000011396
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.b #22
Lamprey	MODERN SPECIES	276						ENSPMAG00000008565	BTBD3 (ENSPMAG00000008562)	ENSPMAG00000008557	armt1 (ENSPMAG00000008547)	ENSPMAG00000008544	ENSPMAG00000008542	ENSPMAG00000008530	ENSPMAG00000008375	rhoj (ENSPMAG00000008361)	PPP2R5E (ENSPMAG00000008342) ##16	slc30a1b (ENSPMAG00000008341) #22	ENSPMAG00000008335	ENSPMAG00000008298	ENSPMAG00000008285	HHIPL1 (ENSPMAG00000008278)	DUSP10 (ENSPMAG00000008274)
Hagfish	MODERN SPECIES	1216																slc30a1b (ENSEBUG00000007523) #22	disp1 (ENSEBUG00000008084)	ENSEBUG00000012624
Vertebrata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.a ##22
Gnathostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.a ##22
Euteleostomi	ANCESTRAL SPECIES	322				ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT01080000257562	ENSGT00940000156119	ENSGT00390000000417.a.a.b.b	ENSGT00390000007686.a	ENSGT00500000044869.a.a	ENSGT00390000017045	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22
Actinopterygii	ANCESTRAL SPECIES	671													ENSGT01030000234773	ENSGT00940000174023	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22
Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	73	ENSGT00960000186719	ENSGT00940000158221	ENSGT00390000010423	ENSGT00390000008624	ENSGT00390000004599	ENSGT00940000155786	ENSGT00940000163359	ENSGT00940000156927	ENSGT00940000162083	ENSGT00940000159071	ENSGT00940000156384	ENSGT00940000153577.B	ENSGT00940000161060	ENSGT00940000155554	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000154598	ENSGT00390000015102.b	ENSGT00390000003303	ENSGT00940000158937	ENSGT00940000160877	ENSGT00940000160635	ENSGT00940000156287	ENSGT00940000159056.h	ENSGT00440000039367	ENSGT00550000075082	ENSGT00700000106116	ENSGT01030000234534.A.c.b.b	ENSGT00990000204015	ENSGT01030000234534.A.c.b.a	ENSGT01030000234534.A.c.a
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES	82	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154553.a.a	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00940000162930	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT01080000257562	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00390000003107.b.i	ENSGT00940000175813	ENSGT00940000159183	ENSGT00530000063583.a.a.b	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT01030000234819	ENSGT00940000154618	ENSGT00960000186719	ENSGT00940000158221	ENSGT00390000008624	ENSGT00390000004599	ENSGT00940000155786.l	ENSGT00940000163359.a.b	ENSGT00940000162083	ENSGT00940000159071.y.b	ENSGT00940000156384.p	ENSGT00940000153577.B	ENSGT00940000161060	ENSGT00940000155554	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000015102.a.b	ENSGT00390000003303	ENSGT00940000158937.a	ENSGT00940000160635	ENSGT00940000156287	ENSGT00940000159056.h	ENSGT00440000039367	ENSGT00940000156864.c	ENSGT00950000183031.A.a.b	ENSGT00940000155887.a	ENSGT01090000260070.D.b	ENSGT00940000158228.b	ENSGT00550000075082	ENSGT00700000106116.a.a	ENSGT01030000234534.A.c.b.b.b
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	186													ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000011725.d.ab	ENSGT00390000003912	ENSGT00390000002172.A.a.f	ENSGT00940000156831	ENSGT00940000161226.a	ENSGT00940000160511.b	ENSGT00940000155481	ENSGT00940000160889	ENSGT00940000158201	ENSGT00940000161449	ENSGT00390000001015.d	ENSGT00940000156517	ENSGT00940000158872	ENSGT00510000048154	ENSGT00940000153313.A
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	346													ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000011725.d.ab	ENSGT00390000003912	ENSGT00390000002172.A.a.f	ENSGT00940000156831	ENSGT00940000161226.a	ENSGT00940000160511.b	ENSGT00940000155481
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	143	ENSGT00670000099465	ENSGT00940000157114	ENSGT00730000110915.a	ENSGT01050000244848.B.a.a	ENSGT00900000141067	ENSGT00390000006949	ENSGT00940000156933.d.a	ENSGT00390000007968	ENSGT00950000183204.a.b	ENSGT00940000158183	ENSGT00940000155492.a.b	ENSGT00940000159713	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000011725.d.ab	ENSGT00390000003912	ENSGT00390000002172.A.a.f	ENSGT00940000156831	ENSGT00940000161226.a	ENSGT00940000160511.b	ENSGT00940000155481
Channel catfish	MODERN SPECIES	23									cntn5 (ENSIPUG00000003638)	ENSIPUG00000003714	ARHGAP42 (ENSIPUG00000003747)	pgr (ENSIPUG00000003898)	gemin7 (ENSIPUG00000004094)	bmp16 (ENSIPUG00000004106)	ppp1r37 (ENSIPUG00000004115)	ENSIPUG00000004126 ##22	selenot1b (ENSIPUG00000004134)	Arf5 (ENSIPUG00000004159)	arf5 (ENSIPUG00000004215)	ENSIPUG00000004385	terb1 (ENSIPUG00000004409)	ENSIPUG00000004481	ENSIPUG00000004598	bbs10 (ENSIPUG00000004627)	ENSIPUG00000004635	glipr1b (ENSIPUG00000004641)	caps2 (ENSIPUG00000004653)	cers3b (ENSIPUG00000004664)	ANO2 (ENSIPUG00000004688)	ENSIPUG00000004711	ENSIPUG00000004721
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	130	ENSGT00670000099465	ENSGT00940000157114	ENSGT00730000110915.a	ENSGT01050000244848.B.a.a	ENSGT00900000141067	ENSGT00390000006949	ENSGT00940000156933.d.a	ENSGT00390000007968	ENSGT00950000183204.a.b	ENSGT00940000158183	ENSGT00940000155492.a.b	ENSGT00940000159713	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000011725.d.ab	ENSGT01050000244883.A.a.a.b.d	ENSGT00390000003912	ENSGT00390000002172.A.a.f	ENSGT00940000156831	ENSGT00940000161226.a	ENSGT00940000160511.b	ENSGT00940000155481
Electric eel	MODERN SPECIES	147										cntn5 (ENSEEEG00000022776)	ARHGAP42 (ENSEEEG00000022781)	pgr (ENSEEEG00000022786)	gemin7 (ENSEEEG00000022788)	bmp16 (ENSEEEG00000022792)	ppp1r37 (ENSEEEG00000022835)	ENSEEEG00000022845 ##22	selenot1b (ENSEEEG00000022846)	prss1 (ENSEEEG00000022848)	tsen34 (ENSEEEG00000022849)	bcl7bb (ENSEEEG00000022850)	baz1b (ENSEEEG00000022851)	fzd9b (ENSEEEG00000022853)	rnf7 (ENSEEEG00000022855)	ENSEEEG00000022857	cfap45 (ENSEEEG00000022860)	tbrg1 (ENSEEEG00000022862)	ENSEEEG00000022869	snrpa (ENSEEEG00000022870)	zgc:153119 (ENSEEEG00000022872)	ENSEEEG00000022890	KCNJ1 (ENSEEEG00000022892)
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	158	ENSGT00670000099465	ENSGT00940000157114	ENSGT00730000110915.a	ENSGT01050000244848.B.a.a	ENSGT00900000141067	ENSGT00390000006949	ENSGT00940000156933.d.a	ENSGT00390000007968	ENSGT00950000183204.a.b	ENSGT00940000158183	ENSGT00940000155492.a.b	ENSGT00940000159713	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000011725.d.ab	ENSGT01050000244883.A.a.a.b.d	ENSGT00390000003912	ENSGT00390000002172.A.a.f	ENSGT00940000156831	ENSGT00940000161226.a	ENSGT00940000160511.b	ENSGT00940000155481
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	79							NECTIN1 (ENSPNAG00000009406)	ttc36 (ENSPNAG00000009396)	FBXO40 (ENSPNAG00000006231)	cntn5 (ENSPNAG00000029496)	ARHGAP42 (ENSPNAG00000029320)	pgr (ENSPNAG00000029105)	gemin7 (ENSPNAG00000029101)	bmp16 (ENSPNAG00000006174)	ppp1r37 (ENSPNAG00000029048)	ENSPNAG00000029035 ##22	selenot1b (ENSPNAG00000029028)	prss1 (ENSPNAG00000028990)	tsen34 (ENSPNAG00000028698)	bcl7bb (ENSPNAG00000028692)	baz1b (ENSPNAG00000004401)	fzd9b (ENSPNAG00000005284)	grk7b (ENSPNAG00000028573)	rnf7 (ENSPNAG00000028554)	ENSPNAG00000004374	ENSPNAG00000004938	ENSPNAG00000005526	cfap45 (ENSPNAG00000028452)	tbrg1 (ENSPNAG00000028332)	ENSPNAG00000028236	ENSPNAG00000028226
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	9	ENSAMXG00000043618	ENSAMXG00000041991	ENSAMXG00000042239	NECTIN1 (ENSAMXG00000019492)	ttc36 (ENSAMXG00000033239)	FBXO40 (ENSAMXG00000005736)	pgr (ENSAMXG00000032804)	ENSAMXG00000036986	ENSAMXG00000033917	ARHGAP42 (ENSAMXG00000005790)	cntn5 (ENSAMXG00000005969)	ENSAMXG00000036878	gemin7 (ENSAMXG00000025854)	bmp16 (ENSAMXG00000040784)	ppp1r37 (ENSAMXG00000017578)	ENSAMXG00000041433 ##22	selenot1b (ENSAMXG00000034878)	prss1 (ENSAMXG00000038312)	tsen34 (ENSAMXG00000017568)	bcl7bb (ENSAMXG00000037935)	baz1b (ENSAMXG00000017565)	fzd9b (ENSAMXG00000025852)	grk7b (ENSAMXG00000017560)	rnf7 (ENSAMXG00000029464)	ENSAMXG00000017551	ENSAMXG00000031757	cfap45 (ENSAMXG00000036939)	ENSAMXG00000038747	ENSAMXG00000035319	tbrg1 (ENSAMXG00000008381)	ENSAMXG00000038521
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000156649.c.a	ENSGT00940000164937.a.a	ENSGT00870000136493.d	ENSGT00940000159663	ENSGT00940000157126.e	ENSGT00950000182818.C.a	ENSGT00940000159519	ENSGT00940000158261	ENSGT00990000203615.b.b.b	ENSGT01080000257365.b.a.b.a.b	ENSGT00940000158893	ENSGT00510000048428	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000153881.b	ENSGT00940000167036	ENSGT00940000158234	ENSGT00980000199080	ENSGT00940000164056	ENSGT00390000009423.b	ENSGT00530000064359.c.a	ENSGT00940000155076.b.a.a.b	ENSGT00940000164973	ENSGT00940000160004.e	ENSGT01050000244956.a.a.m.b	ENSGT00940000157577.c.b	ENSGT00940000161080	ENSGT00910000144204.b.g	ENSGT00940000154641.C.b
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	217	ENSGT00950000183181.B.b.l.b.c	ENSGT00940000156649.c.a.i	ENSGT00940000164937.a.a.c	ENSGT00870000136493.d.b	ENSGT00940000159663.c.a	ENSGT00940000157126.e.c.b	ENSGT00950000182818.C.a.b	ENSGT00940000159519.e.a	ENSGT00990000203615.b.b.b.j	ENSGT01080000257365.b.a.b.a.b.h.a	ENSGT00940000158893.m	ENSGT00510000048428.e	ENSGT00390000018039.l	ENSGT00940000155666.d.c	ENSGT00940000157454.m.a	ENSGT00940000156484.a.a ##22	ENSGT00940000153881.b.o.b	ENSGT00940000167036	ENSGT00940000158234.u	ENSGT00980000199080	ENSGT00940000164056.a.a.a	ENSGT00390000009423.b.k	ENSGT00530000064359.c.a.i	ENSGT00940000155076.b.a.a.b.a	ENSGT00940000164973.q.b	ENSGT00940000160004.e.a	ENSGT01050000244956.a.a.m.a	ENSGT00940000157577.c.b.a	ENSGT00940000161080.d	ENSGT00910000144204.b.g.a	ENSGT00940000154641.C.b.l
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	105	ENSGT00940000159663.c.b	ENSGT00940000157126.e.c.a	ENSGT00950000182818.C.a.a	ENSGT00940000159519.e.b	ENSGT00940000159519.f	ENSGT00940000158261.r	ENSGT00990000203615.b.b.b.i	ENSGT01080000257365.b.a.b.a.b.h.b	ENSGT00940000158893.n	ENSGT00510000048428.f	ENSGT00390000018039.k	ENSGT00940000155666.d.d	ENSGT00940000157454.m.b	ENSGT00940000156484.a.b ##22	ENSGT00940000153881.b.o.a	ENSGT00940000156484.a.a ##22	ENSGT00940000153881.b.o.b	ENSGT00940000167036	ENSGT00940000158234.v	ENSGT00980000199080.a	ENSGT00940000164056.b	ENSGT00390000009423.b.l	ENSGT00530000064359.c.a.j	ENSGT00940000155076.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164973.q.a	ENSGT00940000160004.e.b	ENSGT01050000244956.a.a.m.b.a	ENSGT00940000156626.x	ENSGT00940000157577.c.b.b	ENSGT00940000161080.c	ENSGT00910000144204.b.g.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	19	ENSCCRG00000068230	rbm7 (ENSCCRG00000028774)	ENSCCRG00000077434	KIRREL3 (ENSCCRG00000044345)	smtla (ENSCCRG00000007925)	ets1 (ENSCCRG00000004213)	fli1 (ENSCCRG00000017909)	KCNJ1 (ENSCCRG00000040981)	KCNJ5 (ENSCCRG00000052814)	ENSCCRG00000062570	st3gal4 (ENSCCRG00000027634)	ENSCCRG00000003013	bmp16 (ENSCCRG00000025775)	ppp1r37 (ENSCCRG00000025710)	ENSCCRG00000065515	ENSCCRG00000056622 ##22	ENSCCRG00000041142	ENSCCRG00000042971	ENSCCRG00000060088	ENSCCRG00000065029	yif1b (ENSCCRG00000058117)	ENSCCRG00000033620	ENSCCRG00000068889	ENSCCRG00000014796	ENSCCRG00000048609	ENSCCRG00000071621	mob2b (ENSCCRG00000058141)	ENSCCRG00000081846	ENSCCRG00000026060	loxl1 (ENSCCRG00000076775)	insyn1 (ENSCCRG00000081289)
Goldfish	MODERN SPECIES	9	NECTIN1 (ENSCARG00000017606)	ENSCARG00000017629	FBXO40 (ENSCARG00000017634)	ENSCARG00000017643	smtla (ENSCARG00000017646)	ets1 (ENSCARG00000017681)	fli1 (ENSCARG00000017851)	KCNJ1 (ENSCARG00000017868)	KCNJ5 (ENSCARG00000017875)	st3gal4 (ENSCARG00000017885)	ENSCARG00000017955	ENSCARG00000017969	ENSCARG00000017977	bmp16 (ENSCARG00000017981)	ppp1r37 (ENSCARG00000018020)	ENSCARG00000018197 ##22	SHKBP1 (ENSCARG00000018216)	ENSCARG00000018616	ENSCARG00000018654	ENSCARG00000018822	ENSCARG00000018825	ENSCARG00000018827	yif1b (ENSCARG00000018834)	ENSCARG00000018847	ENSCARG00000018851	si:cabz01090165.1 (ENSCARG00000018858)	ENSCARG00000018875	ENSCARG00000018915	P2RY1 (ENSCARG00000018927)	rap2b (ENSCARG00000018932)	ENSCARG00000018942
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	689						ENSGT00950000182818.C.a.a	ENSGT00940000159519.e.b	ENSGT00940000158261.q.a	ENSGT00990000203615.b.b.b.i	ENSGT01080000257365.b.a.b.a.b.h.b	ENSGT00940000158893.n	ENSGT00510000048428.f	ENSGT00390000018039.k	ENSGT00940000155666.d.d	ENSGT00940000157454.m.b	ENSGT00940000156484.a.b ##22	ENSGT00940000153881.b.o.a	ENSGT00940000158234.v
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	105	ENSGT00940000164937.a.a.d	ENSGT00870000136493.d.a	ENSGT00940000159663.c.b	ENSGT00940000157126.e.c.a	ENSGT00950000182818.C.a.a	ENSGT00940000159519.e.b	ENSGT00940000159519.f	ENSGT00940000158261.r	ENSGT00990000203615.b.b.b.i	ENSGT01080000257365.b.a.b.a.b.h.b	ENSGT00940000158893.n	ENSGT00510000048428.f	ENSGT00390000018039.k	ENSGT00940000155666.d.d	ENSGT00940000157454.m.b	ENSGT00940000156484.a.b ##22	ENSGT00940000153881.b.o.a	ENSGT00940000156484.a.a ##22	ENSGT00940000153881.b.o.b	ENSGT00940000167036	ENSGT00940000158234.v	ENSGT00980000199080.a	ENSGT00940000164056.b	ENSGT00390000009423.b.l	ENSGT00530000064359.c.a.j	ENSGT00940000155076.b.a.a.b.b	ENSGT00940000164973.q.a	ENSGT00940000160004.e.b	ENSGT01050000244956.a.a.m.b.a	ENSGT00940000156626.x	ENSGT00940000157577.c.b.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	9	ENSCCRG00000071253	rbm7 (ENSCCRG00000042084)	ENSCCRG00000059349	ENSCCRG00000065375	KIRREL3 (ENSCCRG00000044482)	smtla (ENSCCRG00000067121)	ets1 (ENSCCRG00000037742)	fli1 (ENSCCRG00000040993)	KCNJ1 (ENSCCRG00000070562)	KCNJ5 (ENSCCRG00000025196)	st3gal4 (ENSCCRG00000072731)	ENSCCRG00000016953	gemin7 (ENSCCRG00000042941)	bmp16 (ENSCCRG00000071794)	ppp1r37 (ENSCCRG00000029308)	ENSCCRG00000029376 ##22	ENSCCRG00000047124	ENSCCRG00000033305	ENSCCRG00000029282	ENSCCRG00000033628	ENSCCRG00000033624	yif1b (ENSCCRG00000033572)	ENSCCRG00000020202	ENSCCRG00000018416	ENSCCRG00000022085	ENSCCRG00000022087	ENSCCRG00000021112	mob2b (ENSCCRG00000062446)	ENSCCRG00000072630	loxl1 (ENSCCRG00000076765)	insyn1 (ENSCCRG00000056222)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	647						smtla (ENSSGRG00000044937)	ENSSGRG00000044936	ets1 (ENSSGRG00000044935)	FLI1 (ENSSGRG00000044932)	KCNJ1 (ENSSGRG00000044930)	KCNJ5 (ENSSGRG00000044929)	st3gal4 (ENSSGRG00000044924)	ENSSGRG00000044919	gemin7 (ENSSGRG00000044918)	ppp1r37 (ENSSGRG00000044916)	ENSSGRG00000044914 ##22	ENSSGRG00000044913	ENSSGRG00000044912	ENSSGRG00000044908	ENSSGRG00000044907
Goldfish	MODERN SPECIES	37	ENSCARG00000069495	ENSCARG00000069497	irf8 (ENSCARG00000069499)	ENSCARG00000069507	smtla (ENSCARG00000069509)	ets1 (ENSCARG00000069512)	fli1 (ENSCARG00000069536)	KCNJ1 (ENSCARG00000069543)	KCNJ5 (ENSCARG00000069547)	st3gal4 (ENSCARG00000069550)	ENSCARG00000023623	TIRAP (ENSCARG00000023628)	gemin7 (ENSCARG00000023631)	bmp16 (ENSCARG00000023639)	ppp1r37 (ENSCARG00000023666)	ENSCARG00000023793 ##22	SHKBP1 (ENSCARG00000023814)	LTBP4 (ENSCARG00000024170)	ENSCARG00000024241	yif1b (ENSCARG00000024279)	ENSCARG00000024300	ENSCARG00000024302	si:cabz01090165.1 (ENSCARG00000024318)	DUSP8 (ENSCARG00000024323)	mob2b (ENSCARG00000024356)	ENSCARG00000024375	SCAMP5 (ENSCARG00000024385)	loxl1 (ENSCARG00000024396)	insyn1 (ENSCARG00000024406)	cd276 (ENSCARG00000024415)	ubl7b (ENSCARG00000024432)
Zebrafish	MODERN SPECIES	9	ets1 (ENSDARG00000024431)	fli1 (ENSDARG00000054632)	kcnj1a.6 (ENSDARG00000088484)	kcnj1a.2 (ENSDARG00000090866)	kcnj1a.5 (ENSDARG00000089060)	kcnj1a.4 (ENSDARG00000090635)	kcnj1a.3 (ENSDARG00000086248)	kcnj1a.1 (ENSDARG00000091232)	KCNJ5 (ENSDARG00000061014)	ENSDARG00000117008	st3gal4 (ENSDARG00000041006)	TIRAP (ENSDARG00000074371)	gemin7 (ENSDARG00000041011)	bmp16 (ENSDARG00000103679)	ppp1r37 (ENSDARG00000078458)	ENSDARG00000054584 ##22	SHKBP1 (ENSDARG00000105050)	ENSDARG00000111043	ENSDARG00000015064	ENSDARG00000099137	ENSDARG00000060927	yif1b (ENSDARG00000040505)	ENSDARG00000054363	ENSDARG00000040503	si:cabz01090165.1 (ENSDARG00000039500)	mob2b (ENSDARG00000012005)	ABCC8 (ENSDARG00000077007)	SCAMP5 (ENSDARG00000040274)	loxl1 (ENSDARG00000054451)	insyn1 (ENSDARG00000026247)	cd276 (ENSDARG00000003061)
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	501														ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000003912	ENSGT00390000002172.A.a.f	ENSGT00940000156831	ENSGT00940000161226.a	ENSGT00940000160511.b
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Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000160655	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00940000162930	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00940000159183	ENSGT00530000063583.a.a.b	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000160655	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000154553.a.a.c	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00970000195560	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.a.b	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00970000195560	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.a.b	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00970000195560	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
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Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161295	ENSGT00940000154553.a.a.c	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	40												ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Mummichog	MODERN SPECIES	2460												gemin7 (ENSFHEG00000006645)	bmp16 (ENSFHEG00000006627)	ENSFHEG00000006604	ppp1r37 (ENSFHEG00000006595)	ENSFHEG00000006554 ##22	mrpl28 (ENSFHEG00000006545)	ENSFHEG00000006528	clptm1 (ENSFHEG00000006518)	tbcb (ENSFHEG00000006511)	six5 (ENSFHEG00000006483)	six9 (ENSFHEG00000006455)	qpctla (ENSFHEG00000006441)	rrm1 (ENSFHEG00000006424)	SIPA1L3 (ENSFHEG00000006398)	ENSFHEG00000006383	si:ch211-160d20.3 (ENSFHEG00000006375)	ENSFHEG00000006350	fosb (ENSFHEG00000006330)	ENSFHEG00000006314	znf296 (ENSFHEG00000006291)
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	765												gemin7 (ENSCVAG00000005214)	bmp16 (ENSCVAG00000005189)	ENSCVAG00000005165	ppp1r37 (ENSCVAG00000005154)	ENSCVAG00000005135 ##22	mrpl28 (ENSCVAG00000005123)	ENSCVAG00000005114	clptm1 (ENSCVAG00000005098)	tbcb (ENSCVAG00000000697)	six5 (ENSCVAG00000005028)	six9 (ENSCVAG00000005019)	qpctla (ENSCVAG00000005007)	rrm1 (ENSCVAG00000004996)	SIPA1L3 (ENSCVAG00000004984)	MAP3K10 (ENSCVAG00000004957)	ttc9b (ENSCVAG00000004945)
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000156728	ENSGT00910000144274	ENSGT00390000013159	ENSGT00940000154482.b.b.b	ENSGT00940000154618	ENSGT00940000158221	ENSGT00390000008624	ENSGT00390000004599	ENSGT00940000158993	ENSGT00940000160181.i	ENSGT00940000153168.C.a.b	ENSGT00940000153577.B	ENSGT00940000161060	ENSGT00940000155554	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000015102.a.b	ENSGT00390000003303	ENSGT01100000263483.E.b.a.a.b	ENSGT01100000263483.E.b.a.a.a	ENSGT00390000011980.a.j	ENSGT00940000158937.a	ENSGT00940000160635	ENSGT00940000156287	ENSGT00940000159056.h	ENSGT00440000039367	ENSGT00940000156864.c	ENSGT00940000155887.a	ENSGT01030000235133.a.b	ENSGT01090000260070.D.b	ENSGT00940000158228.b
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000156728.w	ENSGT00910000144274	ENSGT00390000013159	ENSGT00940000154482.b.b.b	ENSGT00940000154618	ENSGT00940000158221	ENSGT00390000008624	ENSGT00390000004599	ENSGT00940000158993	ENSGT00940000160181.i	ENSGT00940000153168.C.a.b	ENSGT00940000153577.B	ENSGT00940000161060	ENSGT00940000155554	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000015102.a.b	ENSGT00390000003303	ENSGT01100000263483.E.b.a.a.b	ENSGT01100000263483.E.b.a.a.a	ENSGT00390000011980.a.j	ENSGT00940000158937.a	ENSGT00940000160635	ENSGT00940000156287	ENSGT00940000159056.h	ENSGT00440000039367	ENSGT00940000156864.c	ENSGT00940000155887.a	ENSGT01090000260070.D.b	ENSGT00940000158228.b	ENSGT00940000169464
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	75	ENSGT00940000161295	ENSGT00940000154553.a.a.c	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900.b	ENSGT00940000165900.a	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00740000115816.A	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Amazon molly	MODERN SPECIES	283	ENSPFOG00000008993	ap2s1 (ENSPFOG00000009059)	rab4b (ENSPFOG00000009095)	rhoub (ENSPFOG00000009162)	rhoub (ENSPFOG00000009174)	rtn2a (ENSPFOG00000009216)	ppm1na (ENSPFOG00000009223)	ENSPFOG00000024064	PTGIR (ENSPFOG00000009272)	ENSPFOG00000009278	ENSPFOG00000024002	ENSPFOG00000022404	gemin7 (ENSPFOG00000009309)	bmp16 (ENSPFOG00000009315)	ppp1r37 (ENSPFOG00000009326)	ENSPFOG00000009466 ##22	mrpl28 (ENSPFOG00000009485)	ENSPFOG00000022538	clptm1 (ENSPFOG00000009570)	tbcb (ENSPFOG00000009743)	six5 (ENSPFOG00000009796)	six9 (ENSPFOG00000009821)	qpctla (ENSPFOG00000009835)	rrm1 (ENSPFOG00000009903)	SIPA1L3 (ENSPFOG00000009920)	MAP3K10 (ENSPFOG00000009993)	ttc9b (ENSPFOG00000010209)	si:ch211-160d20.3 (ENSPFOG00000010239)	fosb (ENSPFOG00000010300)	ENSPFOG00000010342	ENSPFOG00000010569
Sailfin molly	MODERN SPECIES	85												gemin7 (ENSPLAG00000020214)	bmp16 (ENSPLAG00000020206)	ENSPLAG00000020171	ppp1r37 (ENSPLAG00000020124)	ENSPLAG00000020072 ##22	mrpl28 (ENSPLAG00000020059)	ENSPLAG00000020036	clptm1 (ENSPLAG00000020018)	tbcb (ENSPLAG00000020007)	six5 (ENSPLAG00000019984)	six9 (ENSPLAG00000019964)	qpctla (ENSPLAG00000019951)	rrm1 (ENSPLAG00000000790)	SIPA1L3 (ENSPLAG00000019921)	MAP3K10 (ENSPLAG00000019815)	ttc9b (ENSPLAG00000019756)	si:ch211-160d20.3 (ENSPLAG00000019740)	fosb (ENSPLAG00000019687)	ENSPLAG00000019658	znf296 (ENSPLAG00000019623)
Guppy	MODERN SPECIES	149																ENSPREG00000014066 ##22
Platyfish	MODERN SPECIES	9	tmem160 (ENSXMAG00000004210)	NPAS1 (ENSXMAG00000028521)	ENSXMAG00000004221	ap2s1 (ENSXMAG00000004235)	rab4b (ENSXMAG00000004238)	rhoub (ENSXMAG00000022375)	rtn2a (ENSXMAG00000022638)	ppm1na (ENSXMAG00000001773)	ENSXMAG00000023012	PTGIR (ENSXMAG00000025943)	calm3b (ENSXMAG00000004263)	gemin7 (ENSXMAG00000019556)	bmp16 (ENSXMAG00000026621)	ENSXMAG00000019557	ppp1r37 (ENSXMAG00000020834)	ENSXMAG00000026593 ##22	mrpl28 (ENSXMAG00000004293)	ENSXMAG00000004297	clptm1 (ENSXMAG00000004298)	tbcb (ENSXMAG00000004309)	six5 (ENSXMAG00000025473)	six9 (ENSXMAG00000004316)	qpctla (ENSXMAG00000004319)	rrm1 (ENSXMAG00000004335)	SIPA1L3 (ENSXMAG00000021118)	MAP3K10 (ENSXMAG00000018686)	ttc9b (ENSXMAG00000029324)	si:ch211-160d20.3 (ENSXMAG00000018670)	fosb (ENSXMAG00000018663)	ENSXMAG00000018623	znf296 (ENSXMAG00000026001)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161295	ENSGT00940000154553.a.a.c	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	79					rtn2a (ENSKMAG00000021396)	ENSKMAG00000021390	ppm1na (ENSKMAG00000021386)	ENSKMAG00000021377	PTGIR (ENSKMAG00000021374)	ENSKMAG00000021362	ENSKMAG00000021341	gemin7 (ENSKMAG00000021331)	bmp16 (ENSKMAG00000021322)	ENSKMAG00000021310	ppp1r37 (ENSKMAG00000021296)	ENSKMAG00000021287 ##22	mrpl28 (ENSKMAG00000021277)	ENSKMAG00000021271	clptm1 (ENSKMAG00000021262)	tbcb (ENSKMAG00000021257)	six5 (ENSKMAG00000021248)	six9 (ENSKMAG00000021242)	qpctla (ENSKMAG00000021237)	rrm1 (ENSKMAG00000021216)	SIPA1L3 (ENSKMAG00000021136)	MAP3K10 (ENSKMAG00000021097)	ENSKMAG00000021089	si:ch211-160d20.3 (ENSKMAG00000021074)	fosb (ENSKMAG00000021052)	ENSKMAG00000021028	znf296 (ENSKMAG00000021016)
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295.s	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295.s	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Indian medaka	MODERN SPECIES	12	EGLN2 (ENSOMEG00000014031)	tmem160 (ENSOMEG00000014008)	NPAS1 (ENSOMEG00000013988)	ARHGAP35 (ENSOMEG00000013962)	ap2s1 (ENSOMEG00000000353)	rab4b (ENSOMEG00000013881)	rhoub (ENSOMEG00000013845)	rtn2a (ENSOMEG00000000735)	ppm1na (ENSOMEG00000013743)	ENSOMEG00000013732	PTGIR (ENSOMEG00000013711)	calm3a (ENSOMEG00000013695)	bmp16 (ENSOMEG00000013665)	ENSOMEG00000013642	ppp1r37 (ENSOMEG00000013594)	ENSOMEG00000013567 ##22	mrpl28 (ENSOMEG00000013553)	ENSOMEG00000013536	clptm1 (ENSOMEG00000013516)	tbcb (ENSOMEG00000013486)	six5 (ENSOMEG00000013459)	six9 (ENSOMEG00000013448)	qpctla (ENSOMEG00000013429)	rrm1 (ENSOMEG00000013415)	SIPA1L3 (ENSOMEG00000013380)	MAP3K10 (ENSOMEG00000013309)	ttc9b (ENSOMEG00000013281)	si:ch211-160d20.3 (ENSOMEG00000013265)	fosb (ENSOMEG00000013238)	ENSOMEG00000013205	znf296 (ENSOMEG00000013130)
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	4	tmem160 (ENSOJAG00000002613)	NPAS1 (ENSOJAG00000002620)	ARHGAP35 (ENSOJAG00000002635)	ap2s1 (ENSOJAG00000002643)	rab4b (ENSOJAG00000002672)	rhoub (ENSOJAG00000002693)	rtn2a (ENSOJAG00000002700)	ppm1na (ENSOJAG00000002711)	ENSOJAG00000002717	PTGIR (ENSOJAG00000002721)	ENSOJAG00000002765	gemin7 (ENSOJAG00000002917)	bmp16 (ENSOJAG00000002922)	ENSOJAG00000002927	ppp1r37 (ENSOJAG00000002937)	ENSOJAG00000002968 ##22	mrpl28 (ENSOJAG00000002974)	ENSOJAG00000002987	clptm1 (ENSOJAG00000003041)	tbcb (ENSOJAG00000003330)	six5 (ENSOJAG00000003337)	six9 (ENSOJAG00000003343)	qpctla (ENSOJAG00000003352)	rrm1 (ENSOJAG00000003362)	SIPA1L3 (ENSOJAG00000003375)	MAP3K10 (ENSOJAG00000003506)	ttc9b (ENSOJAG00000003617)	si:ch211-160d20.3 (ENSOJAG00000003626)	fosb (ENSOJAG00000003654)	ENSOJAG00000003703	znf296 (ENSOJAG00000003749)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295.s	ENSGT00940000154553.a.a.c	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Chinese medaka	MODERN SPECIES	925	ENSOSIG00000007624	ENSOSIG00000007628	ap2s1 (ENSOSIG00000007633)	rab4b (ENSOSIG00000007645)	rhoub (ENSOSIG00000007721)	rtn2a (ENSOSIG00000007725)	ppm1na (ENSOSIG00000007732)	ENSOSIG00000007736	ENSOSIG00000007740	PTGIR (ENSOSIG00000007743)	calm3b (ENSOSIG00000007750)	gemin7 (ENSOSIG00000007912)	bmp16 (ENSOSIG00000007914)	ENSOSIG00000007915	ppp1r37 (ENSOSIG00000007921)	ENSOSIG00000007924 ##22	mrpl28 (ENSOSIG00000007927)	ENSOSIG00000007928	clptm1 (ENSOSIG00000007940)	tbcb (ENSOSIG00000008853)	six5 (ENSOSIG00000008854)	six9 (ENSOSIG00000008855)	qpctla (ENSOSIG00000008857)	rrm1 (ENSOSIG00000008860)	SIPA1L3 (ENSOSIG00000008864)	ENSOSIG00000008894	ttc9b (ENSOSIG00000008895)	si:ch211-160d20.3 (ENSOSIG00000008896)	fosb (ENSOSIG00000008897)	ENSOSIG00000008898	znf296 (ENSOSIG00000008899)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	4	NPAS1 (ENSORLG00000006935)	ENSORLG00000006927	ENSORLG00000022767	ap2s1 (ENSORLG00000006912)	rab4b (ENSORLG00000006902)	rhoub (ENSORLG00000024468)	rtn2a (ENSORLG00000027944)	ppm1na (ENSORLG00000006866)	ENSORLG00000006854	PTGIR (ENSORLG00000006848)	ENSORLG00000006842	gemin7 (ENSORLG00000006826)	bmp16 (ENSORLG00000028570)	ENSORLG00000006822	ppp1r37 (ENSORLG00000006817)	ENSORLG00000006812 ##22	mrpl28 (ENSORLG00000006806)	ENSORLG00000006786	ENSORLG00000029281	clptm1 (ENSORLG00000006781)	tbcb (ENSORLG00000006774)	six5 (ENSORLG00000006762)	six9 (ENSORLG00000006757)	qpctla (ENSORLG00000006752)	ENSORLG00000006731	ENSORLG00000006721	MAP3K10 (ENSORLG00000006697)	ttc9b (ENSORLG00000006685)	si:ch211-160d20.3 (ENSORLG00000006678)	fosb (ENSORLG00000028302)	ENSORLG00000006650
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161716	ENSGT00940000162506	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000163742	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00510000048685.g.a	ENSGT00390000014737	ENSGT01030000234627.a.a.c	ENSGT00940000162428.g.b	ENSGT00940000162428.g.a	ENSGT00990000203749	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000159399	ENSGT00970000193421.A	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161295	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000160655	ENSGT00940000159485	ENSGT00390000017583
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000161716	ENSGT00940000162506	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000163742	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00510000048685.g.a	ENSGT00390000014737	ENSGT01030000234627.a.a.c	ENSGT00940000162428.g.b	ENSGT00940000162428.g.a	ENSGT00990000203749	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000159399	ENSGT00970000193421.A	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161295	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000160655	ENSGT00940000159485	ENSGT00390000017583
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000161716	ENSGT00940000162506	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000163742	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00510000048685.g.a	ENSGT00390000014737	ENSGT01030000234627.a.a.c	ENSGT00940000162428.g.b	ENSGT00940000162428.g.a	ENSGT00990000203749	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000159399	ENSGT00970000193421.A	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161295	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000160655	ENSGT00940000159485	ENSGT00390000017583
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161716	ENSGT00940000162506	ENSGT00940000159751	ENSGT00940000163742	ENSGT00950000183191.a.b	ENSGT00510000048685.g.a	ENSGT00390000014737	ENSGT01030000234627.a.a.c	ENSGT00940000162428.g.b	ENSGT00940000162428.g.a	ENSGT00990000203749	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000159399	ENSGT00970000193421.A	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000161295	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000160655	ENSGT00940000159485	ENSGT00390000017583
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Eastern happy	MODERN SPECIES	5	COL26A1 (ENSACLG00000016801)	FUT4 (ENSACLG00000016843)	cux1b (ENSACLG00000016849)	ENSACLG00000016889	SH2B2 (ENSACLG00000016927)	dnajc30b (ENSACLG00000016979)	bud23 (ENSACLG00000016987)	STX1A (ENSACLG00000017056)	ENSACLG00000017079	ENSACLG00000017123	ENSACLG00000017145	gemin7 (ENSACLG00000017160)	bmp16 (ENSACLG00000017170)	ENSACLG00000017247	ppp1r37 (ENSACLG00000017303)	ENSACLG00000017369 ##22	mrpl28 (ENSACLG00000017376)	ENSACLG00000017402	ENSACLG00000017412	ENSACLG00000017450	PTGIR (ENSACLG00000017460)	rtn2a (ENSACLG00000017475)	ppm1na (ENSACLG00000017560)	rhoub (ENSACLG00000017582)	rab4b (ENSACLG00000017589)	ap2s1 (ENSACLG00000017617)	ARHGAP35 (ENSACLG00000017654)	NPAS1 (ENSACLG00000017707)	tmem160 (ENSACLG00000017722)	EGLN2 (ENSACLG00000017731)	slc1a5 (ENSACLG00000017764)
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	382	COL26A1 (ENSHBUG00000000031)	FUT4 (ENSHBUG00000002156)	ENSHBUG00000002162	cux1b (ENSHBUG00000002182)	SH2B2 (ENSHBUG00000002198)	dnajc30b (ENSHBUG00000002207)	bud23 (ENSHBUG00000002214)	STX1A (ENSHBUG00000002244)	ENSHBUG00000002267	ENSHBUG00000002277	ENSHBUG00000002279	gemin7 (ENSHBUG00000002286)	bmp16 (ENSHBUG00000002300)	ENSHBUG00000002315	ppp1r37 (ENSHBUG00000002336)	ENSHBUG00000000748 ##22	mrpl28 (ENSHBUG00000002357)
Nile tilapia	MODERN SPECIES	5	tmem160 (ENSONIG00000041394)	NPAS1 (ENSONIG00000036145)	ENSONIG00000005995	ap2s1 (ENSONIG00000030333)	rab4b (ENSONIG00000005987)	rhoub (ENSONIG00000033189)	rtn2a (ENSONIG00000041725)	ppm1na (ENSONIG00000005977)	ENSONIG00000005976	PTGIR (ENSONIG00000005975)	ENSONIG00000032840	ENSONIG00000035108	bmp16 (ENSONIG00000036110)	ENSONIG00000005959	ppp1r37 (ENSONIG00000005960)	ENSONIG00000030433 ##22	mrpl28 (ENSONIG00000005965)	ENSONIG00000032366	ENSONIG00000030880	ENSONIG00000003818	STX1A (ENSONIG00000003808)	bud23 (ENSONIG00000003804)	dnajc30b (ENSONIG00000041035)	SH2B2 (ENSONIG00000003802)	cux1b (ENSONIG00000003797)	FUT4 (ENSONIG00000020639)	ENSONIG00000003792	srprb (ENSONIG00000029022)	WDR53 (ENSONIG00000003789)	neu4 (ENSONIG00000003782)	lxn (ENSONIG00000003780)
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359
Orange clownfish	MODERN SPECIES	23	ap2s1 (ENSAPEG00000011184)	rab4b (ENSAPEG00000011130)	ENSAPEG00000011109	rhoub (ENSAPEG00000011089)	rtn2a (ENSAPEG00000011030)	ENSAPEG00000011018	ppm1na (ENSAPEG00000010976)	ENSAPEG00000010941	PTGIR (ENSAPEG00000010934)	calm3a (ENSAPEG00000010897)	ENSAPEG00000010879	gemin7 (ENSAPEG00000010856)	bmp16 (ENSAPEG00000010826)	ENSAPEG00000010782	ppp1r37 (ENSAPEG00000010771)	ENSAPEG00000010737 ##22	mrpl28 (ENSAPEG00000010705)	camkk1b (ENSAPEG00000010616)	YWHAG (ENSAPEG00000010597)	DHRS11 (ENSAPEG00000010562)	tlcd1 (ENSAPEG00000010552)	rab34a (ENSAPEG00000010503)	zgc:174895 (ENSAPEG00000010474)	ENSAPEG00000010427	ENSAPEG00000010409	DHRS11 (ENSAPEG00000010377)	DHRS11 (ENSAPEG00000010354)	nek8 (ENSAPEG00000010295)	traf4a (ENSAPEG00000010262)	tada2a (ENSAPEG00000010194)	dusp14 (ENSAPEG00000010169)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1106												gemin7 (ENSAOCG00000024101)	bmp16 (ENSAOCG00000024110)	ENSAOCG00000024116	ppp1r37 (ENSAOCG00000024125)	ENSAOCG00000024136 ##22	mrpl28 (ENSAOCG00000024148)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	48	NPAS1 (ENSAPOG00000017306)	ARHGAP35 (ENSAPOG00000017295)	ap2s1 (ENSAPOG00000017271)	rab4b (ENSAPOG00000017258)	rhoub (ENSAPOG00000017216)	rtn2a (ENSAPOG00000017202)	ppm1na (ENSAPOG00000017178)	ENSAPOG00000017041	PTGIR (ENSAPOG00000000955)	calm3a (ENSAPOG00000016996)	ENSAPOG00000016975	gemin7 (ENSAPOG00000016954)	bmp16 (ENSAPOG00000016950)	ENSAPOG00000016927	ppp1r37 (ENSAPOG00000016897)	ENSAPOG00000000460 ##22	mrpl28 (ENSAPOG00000016883)	ENSAPOG00000016851	clptm1 (ENSAPOG00000016825)	tbcb (ENSAPOG00000016810)	six5 (ENSAPOG00000016780)	six9 (ENSAPOG00000016776)	qpctla (ENSAPOG00000016752)	rrm1 (ENSAPOG00000016739)	SIPA1L3 (ENSAPOG00000016721)	MAP3K10 (ENSAPOG00000016712)	ttc9b (ENSAPOG00000016707)	si:ch211-160d20.3 (ENSAPOG00000016700)	fosb (ENSAPOG00000016692)	ENSAPOG00000016662	ENSAPOG00000016595
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161295	ENSGT00940000154553.a.a.c	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667	ENSGT00940000153892.A
Tetraodon	MODERN SPECIES	8	slc1a5 (ENSTNIG00000000523)	EGLN2 (ENSTNIG00000007758)	tmem160 (ENSTNIG00000007757)	NPAS1 (ENSTNIG00000007756)	ENSTNIG00000007755	ap2s1 (ENSTNIG00000007754)	rab4b (ENSTNIG00000007753)	rhoub (ENSTNIG00000007752)	rtn2a (ENSTNIG00000000564)	ppm1na (ENSTNIG00000007751)	PTGIR (ENSTNIG00000001391)	calm3b (ENSTNIG00000007750)	bmp16 (ENSTNIG00000007749)	ENSTNIG00000007748	ppp1r37 (ENSTNIG00000007747)	ENSTNIG00000000961 ##22	mrpl28 (ENSTNIG00000007746)	RELB (ENSTNIG00000007745)	clptm1 (ENSTNIG00000007744)	tbcb (ENSTNIG00000007743)	six5 (ENSTNIG00000007742)	qpctla (ENSTNIG00000007741)	rrm1 (ENSTNIG00000007740)	SIPA1L3 (ENSTNIG00000007739)	MAP3K10 (ENSTNIG00000007738)	ttc9b (ENSTNIG00000007737)	si:ch211-160d20.3 (ENSTNIG00000007736)	fosb (ENSTNIG00000007735)	znf296 (ENSTNIG00000001568)	clasrp (ENSTNIG00000007734)	ENSTNIG00000007733
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	85												gemin7 (ENSLBEG00000020367)	bmp16 (ENSLBEG00000020398)	ENSLBEG00000020425	ppp1r37 (ENSLBEG00000020442)	ENSLBEG00000020482 ##22	mrpl28 (ENSLBEG00000020499)	ENSLBEG00000020525	clptm1 (ENSLBEG00000020545)	tbcb (ENSLBEG00000020576)	six5 (ENSLBEG00000020607)	six9 (ENSLBEG00000020636)	qpctla (ENSLBEG00000020656)	rrm1 (ENSLBEG00000020680)	SIPA1L3 (ENSLBEG00000020711)	MAP3K10 (ENSLBEG00000020790)	ttc9b (ENSLBEG00000020881)	si:ch211-160d20.3 (ENSLBEG00000020892)	fosb (ENSLBEG00000020922)	ENSLBEG00000020968	znf296 (ENSLBEG00000021012)
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	479	ARHGAP35 (ENSLCRG00005002362)	ap2s1 (ENSLCRG00005002386)	rab4b (ENSLCRG00005002663)	rhoub (ENSLCRG00005002675)	rtn2a (ENSLCRG00005002680)	ppm1na (ENSLCRG00005002684)	ENSLCRG00005002688	ENSLCRG00005002691	PTGIR (ENSLCRG00005002699)	calm3a (ENSLCRG00005002706)	ENSLCRG00005002799	gemin7 (ENSLCRG00005002804)	bmp16 (ENSLCRG00005002805)	ENSLCRG00005002809	ppp1r37 (ENSLCRG00005002828)	ENSLCRG00005002964 ##22	mrpl28 (ENSLCRG00005002966)	ENSLCRG00005002970	clptm1 (ENSLCRG00005002992)	tbcb (ENSLCRG00005003612)	six5 (ENSLCRG00005003615)	six9 (ENSLCRG00005003617)	qpctla (ENSLCRG00005003621)	rrm1 (ENSLCRG00005003624)	SIPA1L3 (ENSLCRG00005003625)	MAP3K10 (ENSLCRG00005003626)	ttc9b (ENSLCRG00005003637)	si:ch211-160d20.3 (ENSLCRG00005003638)	fosb (ENSLCRG00005003639)	ENSLCRG00005003641	znf296 (ENSLCRG00005003645)
European seabass	MODERN SPECIES	3	ENSDLAG00005027965	ARHGAP35 (ENSDLAG00005000707)	ap2s1 (ENSDLAG00005030226)	rab4b (ENSDLAG00005000714)	rhoub (ENSDLAG00005000718)	rtn2a (ENSDLAG00005000721)	ppm1na (ENSDLAG00005027240)	ENSDLAG00005000727	ENSDLAG00005000729	calm3a (ENSDLAG00005000735)	ENSDLAG00005000747	gemin7 (ENSDLAG00005000753)	bmp16 (ENSDLAG00005000755)	ENSDLAG00005000758	ppp1r37 (ENSDLAG00005000772)	ENSDLAG00005000818 ##22	mrpl28 (ENSDLAG00005000825)	ENSDLAG00005000830	clptm1 (ENSDLAG00005000842)	ENSDLAG00005029683	ENSDLAG00005030159	six9 (ENSDLAG00005000868)	ENSDLAG00005000877	ENSDLAG00005000900	ENSDLAG00005000951	ttc9b (ENSDLAG00005034348)	si:ch211-160d20.3 (ENSDLAG00005000954)	fosb (ENSDLAG00005000957)	ENSDLAG00005000961	znf296 (ENSDLAG00005000969)	clasrp (ENSDLAG00005000998)
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	11	ARHGAP35 (ENSSAUG00010014039)	ap2s1 (ENSSAUG00010013923)	rab4b (ENSSAUG00010013905)	rhoub (ENSSAUG00010013901)	rtn2a (ENSSAUG00010013899)	ppm1na (ENSSAUG00010013895)	ENSSAUG00010013893	PTGIR (ENSSAUG00010013890)	calm3a (ENSSAUG00010013755)	ENSSAUG00010013752	gemin7 (ENSSAUG00010013748)	bmp16 (ENSSAUG00010013747)	ENSSAUG00010013745	ppp1r37 (ENSSAUG00010013635)	ENSSAUG00010013630	ENSSAUG00010013629 ##22	mrpl28 (ENSSAUG00010013627)	ENSSAUG00010013594	clptm1 (ENSSAUG00010013398)	tbcb (ENSSAUG00010013393)	six5 (ENSSAUG00010013392)	six9 (ENSSAUG00010013391)	qpctla (ENSSAUG00010013389)	rrm1 (ENSSAUG00010013384)	SIPA1L3 (ENSSAUG00010013365)	MAP3K10 (ENSSAUG00010013359)	ttc9b (ENSSAUG00010013357)	si:ch211-160d20.3 (ENSSAUG00010013355)	fosb (ENSSAUG00010013351)	ENSSAUG00010013339	znf296 (ENSSAUG00010013335)
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00970000198420
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00970000198420
Stickleback	MODERN SPECIES		tmem160 (ENSGACG00000009491)	NPAS1 (ENSGACG00000009494)	ENSGACG00000009502	ap2s1 (ENSGACG00000009507)	rab4b (ENSGACG00000009539)	rhoub (ENSGACG00000009566)	rtn2a (ENSGACG00000009589)	ppm1na (ENSGACG00000009594)	PTGIR (ENSGACG00000009600)	ENSGACG00000009604	ENSGACG00000009610	gemin7 (ENSGACG00000009619)	bmp16 (ENSGACG00000009621)	ENSGACG00000009625	ppp1r37 (ENSGACG00000009629)	ENSGACG00000009639 ##22	mrpl28 (ENSGACG00000009641)	RELB (ENSGACG00000009656)	clptm1 (ENSGACG00000009668)	tbcb (ENSGACG00000009693)	six5 (ENSGACG00000009721)	six9 (ENSGACG00000009726)	qpctla (ENSGACG00000009732)	rrm1 (ENSGACG00000009741)	SIPA1L3 (ENSGACG00000009761)	MAP3K10 (ENSGACG00000009773)	ttc9b (ENSGACG00000009784)	si:ch211-160d20.3 (ENSGACG00000009786)	fosb (ENSGACG00000009792)	ENSGACG00000009801	clasrp (ENSGACG00000009826)
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000154553.a.a.c	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000177307	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00970000198420
Pike perch	MODERN SPECIES	133	ENSSLUG00000011551	ap2s1 (ENSSLUG00000011496)	rab4b (ENSSLUG00000011423)	rhoub (ENSSLUG00000011408)	rtn2a (ENSSLUG00000011403)	ENSSLUG00000011400	ppm1na (ENSSLUG00000011397)	ENSSLUG00000011393	PTGIR (ENSSLUG00000011390)	calm3a (ENSSLUG00000011325)	ENSSLUG00000011318	gemin7 (ENSSLUG00000011316)	bmp16 (ENSSLUG00000011313)	ENSSLUG00000011311	ppp1r37 (ENSSLUG00000011048)	ENSSLUG00000011033 ##22	mrpl28 (ENSSLUG00000011031)	RELB (ENSSLUG00000011027)	clptm1 (ENSSLUG00000011013)	tbcb (ENSSLUG00000011003)	six5 (ENSSLUG00000010996)	six9 (ENSSLUG00000010982)	qpctla (ENSSLUG00000010967)	rrm1 (ENSSLUG00000010952)	SIPA1L3 (ENSSLUG00000010903)	MAP3K10 (ENSSLUG00000010889)	ttc9b (ENSSLUG00000010887)	si:ch211-160d20.3 (ENSSLUG00000010883)	fosb (ENSSLUG00000010881)	ENSSLUG00000010871	clasrp (ENSSLUG00000010852)
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Climbing perch	MODERN SPECIES	4	tmem160 (ENSATEG00000012679)	NPAS1 (ENSATEG00000012695)	ARHGAP35 (ENSATEG00000012799)	ap2s1 (ENSATEG00000012831)	rab4b (ENSATEG00000012855)	rhoub (ENSATEG00000026799)	rtn2a (ENSATEG00000026895)	ppm1na (ENSATEG00000012925)	ENSATEG00000012941	ENSATEG00000012953	ENSATEG00000012960	gemin7 (ENSATEG00000012989)	bmp16 (ENSATEG00000013021)	ENSATEG00000013043	ppp1r37 (ENSATEG00000013054)	ENSATEG00000013073 ##22	mrpl28 (ENSATEG00000013085)	ENSATEG00000013107	clptm1 (ENSATEG00000013128)	tbcb (ENSATEG00000013182)	six5 (ENSATEG00000013199)	six9 (ENSATEG00000013202)	qpctla (ENSATEG00000013220)	ENSATEG00000013255	ENSATEG00000013302	ENSATEG00000013453	ttc9b (ENSATEG00000029383)	si:ch211-160d20.3 (ENSATEG00000013540)	fosb (ENSATEG00000013600)	ENSATEG00000013640	znf296 (ENSATEG00000013683)
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	4	NPAS1 (ENSBSLG00000007346)	ARHGAP35 (ENSBSLG00000007336)	ap2s1 (ENSBSLG00000007305)	rab4b (ENSBSLG00000007254)	gemin7 (ENSBSLG00000007242)	rhoub (ENSBSLG00000007238)	rtn2a (ENSBSLG00000007224)	ppm1na (ENSBSLG00000007209)	ENSBSLG00000007206	PTGIR (ENSBSLG00000007204)	ENSBSLG00000007117	gemin7 (ENSBSLG00000007092)	bmp16 (ENSBSLG00000007088)	ENSBSLG00000007081	ppp1r37 (ENSBSLG00000006589)	ENSBSLG00000005898 ##22	mrpl28 (ENSBSLG00000005893)	clptm1 (ENSBSLG00000005653)	tbcb (ENSBSLG00000005608)	six5 (ENSBSLG00000005593)	six9 (ENSBSLG00000005576)	qpctla (ENSBSLG00000005566)	rrm1 (ENSBSLG00000005518)	SIPA1L3 (ENSBSLG00000005425)	MAP3K10 (ENSBSLG00000005369)	ttc9b (ENSBSLG00000005299)	si:ch211-160d20.3 (ENSBSLG00000005276)	fosb (ENSBSLG00000005252)	ENSBSLG00000005190	znf296 (ENSBSLG00000005171)	clasrp (ENSBSLG00000004885)
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	4	ENSMAMG00000010860	ENSMAMG00000010943	ap2s1 (ENSMAMG00000027708)	rab4b (ENSMAMG00000011009)	rhoub (ENSMAMG00000011031)	rtn2a (ENSMAMG00000011037)	ppm1na (ENSMAMG00000011076)	ENSMAMG00000025723	ENSMAMG00000011109	ENSMAMG00000011128	ENSMAMG00000011135	gemin7 (ENSMAMG00000011153)	bmp16 (ENSMAMG00000011163)	ENSMAMG00000011197	ppp1r37 (ENSMAMG00000011469)	ENSMAMG00000011482 ##22	mrpl28 (ENSMAMG00000011487)	ENSMAMG00000011497	clptm1 (ENSMAMG00000011513)	tbcb (ENSMAMG00000011522)	six5 (ENSMAMG00000011533)	six9 (ENSMAMG00000027159)	qpctla (ENSMAMG00000011548)	ENSMAMG00000011554	ENSMAMG00000011563	ENSMAMG00000011570	ttc9b (ENSMAMG00000011608)	si:ch211-160d20.3 (ENSMAMG00000011610)	fosb (ENSMAMG00000024892)	ENSMAMG00000011649	znf296 (ENSMAMG00000011681)
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Barramundi perch	MODERN SPECIES	316	NPAS1 (ENSLCAG00010018893)	ARHGAP35 (ENSLCAG00010018908)	ap2s1 (ENSLCAG00010018929)	rab4b (ENSLCAG00010018968)	rhoub (ENSLCAG00010019007)	ENSLCAG00010019017	ppm1na (ENSLCAG00010019028)	ENSLCAG00010019034	PTGIR (ENSLCAG00010019043)	calm3a (ENSLCAG00010019063)	ENSLCAG00010019159	gemin7 (ENSLCAG00010019160)	bmp16 (ENSLCAG00010019164)	ENSLCAG00010019168	ppp1r37 (ENSLCAG00010019178)	ENSLCAG00010019207 ##22	mrpl28 (ENSLCAG00010019213)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00970000195560	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359
Greater amberjack	MODERN SPECIES	256	NPAS1 (ENSSDUG00000005432)	ARHGAP35 (ENSSDUG00000005456)	ap2s1 (ENSSDUG00000005475)	rab4b (ENSSDUG00000005481)	rhoub (ENSSDUG00000005508)	rtn2a (ENSSDUG00000005515)	ppm1na (ENSSDUG00000005546)	ENSSDUG00000005617	PTGIR (ENSSDUG00000005631)	calm3a (ENSSDUG00000005643)	ENSSDUG00000005665	gemin7 (ENSSDUG00000005677)	bmp16 (ENSSDUG00000005681)	ENSSDUG00000005700	ppp1r37 (ENSSDUG00000005737)	ENSSDUG00000005754 ##22	mrpl28 (ENSSDUG00000005764)
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2765	NPAS1 (ENSSLDG00000022197)	ARHGAP35 (ENSSLDG00000022208)	ap2s1 (ENSSLDG00000022219)	rab4b (ENSSLDG00000022231)	rhoub (ENSSLDG00000022253)	rtn2a (ENSSLDG00000022267)	ppm1na (ENSSLDG00000022294)	ENSSLDG00000022309	PTGIR (ENSSLDG00000022322)	calm3a (ENSSLDG00000000103)	ENSSLDG00000000157	gemin7 (ENSSLDG00000000173)	bmp16 (ENSSLDG00000000217)	ENSSLDG00000000257	ENSSLDG00000000394	ENSSLDG00000000398 ##22	mrpl28 (ENSSLDG00000000409)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b	ENSGT00940000166868.b	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000153118	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00910000144246.b.c.a	ENSGT00940000159183	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00970000198420	ENSGT00940000176186
Tongue sole	MODERN SPECIES	14	ENSCSEG00000008286	ARHGAP35 (ENSCSEG00000008279)	ap2s1 (ENSCSEG00000008268)	rab4b (ENSCSEG00000008253)	rhoub (ENSCSEG00000008236)	rtn2a (ENSCSEG00000008206)	ppm1na (ENSCSEG00000008195)	ENSCSEG00000008188	PTGIR (ENSCSEG00000008173)	calm3a (ENSCSEG00000008164)	ENSCSEG00000008160	gemin7 (ENSCSEG00000008152)	bmp16 (ENSCSEG00000008137)	ENSCSEG00000008130	ppp1r37 (ENSCSEG00000008118)	ENSCSEG00000008107 ##22	mrpl28 (ENSCSEG00000008095)	ENSCSEG00000008061	clptm1 (ENSCSEG00000008044)	tbcb (ENSCSEG00000008024)	six5 (ENSCSEG00000008012)	prpf8 (ENSCSEG00000007905)	ENSCSEG00000007880	SCARF1 (ENSCSEG00000007859)	vtna (ENSCSEG00000007841)	sarm1 (ENSCSEG00000007819)	slc46a1 (ENSCSEG00000007800)	SLC13A2 (ENSCSEG00000007787)	foxn1 (ENSCSEG00000007772)	crybb1l3 (ENSCSEG00000007768)	UNC119 (ENSCSEG00000007728)
Turbot	MODERN SPECIES	15	NPAS1 (ENSSMAG00000014307)	ARHGAP35 (ENSSMAG00000014276)	ap2s1 (ENSSMAG00000014249)	rab4b (ENSSMAG00000014221)	rhoub (ENSSMAG00000035260)	ppm1na (ENSSMAG00000014095)	ENSSMAG00000014108	ENSSMAG00000023018	ENSSMAG00000014044	calm3a (ENSSMAG00000034840)	ENSSMAG00000032057	gemin7 (ENSSMAG00000014017)	bmp16 (ENSSMAG00000014001)	ENSSMAG00000013968	ppp1r37 (ENSSMAG00000013943)	ENSSMAG00000013935 ##22	mrpl28 (ENSSMAG00000013912)	ENSSMAG00000013895	clptm1 (ENSSMAG00000013869)	tbcb (ENSSMAG00000013857)	six5 (ENSSMAG00000013852)	qpctla (ENSSMAG00000013839)	ENSSMAG00000013821	ENSSMAG00000013788	ENSSMAG00000013747	ttc9b (ENSSMAG00000013743)	si:ch211-160d20.3 (ENSSMAG00000033549)	fosb (ENSSMAG00000022859)	ENSSMAG00000013458	ENSSMAG00000021608	ENSSMAG00000013310
Cod	MODERN SPECIES	7	fkrp (ENSGMOG00000009856)	STRN4 (ENSGMOG00000008035)	PRKD2 (ENSGMOG00000008026)	gpr184 (ENSGMOG00000000230)	si:dkey-202l22.3 (ENSGMOG00000000225)	ENSGMOG00000034590	ENSGMOG00000010582	ENSGMOG00000010567	ENSGMOG00000036580	ENSGMOG00000012847	ENSGMOG00000023554	ENSGMOG00000012826	ENSGMOG00000031594	ENSGMOG00000005342	ENSGMOG00000034125	ENSGMOG00000032994 ##22	ENSGMOG00000010597	ENSGMOG00000019844	ENSGMOG00000024738	ENSGMOG00000031932	ENSGMOG00000035455	ENSGMOG00000033173	ENSGMOG00000030980	ENSGMOG00000029893	ENSGMOG00000006365	ENSGMOG00000034095	ndufb11 (ENSGMOG00000037189)	tpk2 (ENSGMOG00000011924)	ENSGMOG00000001449	si:dkey-6n6.1 (ENSGMOG00000027343)	bgna (ENSGMOG00000005613)
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160655	ENSGT00390000012863	ENSGT00940000161295	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399.c.b	ENSGT00940000165900	ENSGT00940000167260	ENSGT00940000164695.a	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000017359	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b	ENSGT00390000003107.b.j	ENSGT00940000159183	ENSGT00530000063583.a.a.b	ENSGT00940000160518	ENSGT00940000161494	ENSGT00390000005773	ENSGT00940000160358	ENSGT00940000166395	ENSGT00940000160667
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00390000012863.c	ENSGT00940000161295.n.a	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.a	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.b	ENSGT00970000193421.A	ENSGT00940000159399.c.b.b	ENSGT00940000165900.d	ENSGT00940000167260.c	ENSGT00940000164695.a.g	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d.e	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.b	ENSGT00390000018039.p	ENSGT00940000155666.d.a	ENSGT00940000157454.rc.b	ENSGT00940000156484.a.c ##22	ENSGT00390000017359.k	ENSGT00940000160230.m.b	ENSGT00530000063461.B.a	ENSGT01010000224936	ENSGT00940000167410	ENSGT00940000158292.b.f	ENSGT00390000003107.b.j.g	ENSGT00940000159183.u.a	ENSGT00530000063583.a.a.b	ENSGT00940000160518.b	ENSGT00940000161494.i.b	ENSGT00390000005773.d	ENSGT00940000160358.l.a	ENSGT00940000166395.d	ENSGT00940000166395.c.a.a
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000012863.c	ENSGT00940000161295.o	ENSGT00940000161295.n.b	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.b	ENSGT00970000193421.A.cb	ENSGT00940000159399.c.b.b	ENSGT00940000165900.d	ENSGT00940000167260.c	ENSGT00940000164695.a.g	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d.e	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.b	ENSGT00390000018039.p	ENSGT00940000155666.d.a	ENSGT00940000157454.rc.b	ENSGT00940000156484.a.c ##22	ENSGT00390000017359.k	ENSGT00940000160230.m.a.a	ENSGT00530000063461.B.a	ENSGT01010000224936	ENSGT00940000167410	ENSGT00940000166238.a.d	ENSGT00940000158292.b.f	ENSGT00390000003107.b.j.g	ENSGT00940000159183.u.a	ENSGT00530000063583.a.a.b	ENSGT00940000160518.b	ENSGT00940000161494.j	ENSGT00390000005773.d	ENSGT00940000160358.k.b	ENSGT00940000166395.c.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000159485.j	ENSGT00940000160655.w.b	ENSGT00940000161295.n.b	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.b	ENSGT00970000193421.A.cb	ENSGT00940000159399.c.b.b	ENSGT00940000165900.d	ENSGT00940000167260.c	ENSGT00940000164695.a.g	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d.e	ENSGT00940000164310	ENSGT00390000018039.p	ENSGT00940000155666.d.a	ENSGT00940000157454.rc.b	ENSGT00940000156484.a.c ##22	ENSGT00390000017359.k	ENSGT00940000160230.m.b	ENSGT00530000063461.B.a	ENSGT01010000224936	ENSGT00940000167410	ENSGT00940000158292.b.f	ENSGT00390000003107.b.j.g	ENSGT00940000159183.u.a	ENSGT00530000063583.a.a.b	ENSGT00940000160518.b	ENSGT00940000161494.i.b	ENSGT00390000005773.d	ENSGT00940000160358.k.b	ENSGT00940000160358.l.a	ENSGT00940000166395.c.a.a
River trout	MODERN SPECIES	18	slc1a5 (ENSSTUG00000009863)	ENSSTUG00000009822	NPAS1 (ENSSTUG00000009791)	ARHGAP35 (ENSSTUG00000009783)	ap2s1 (ENSSTUG00000009713)	rab4b (ENSSTUG00000009675)	rhoub (ENSSTUG00000009647)	ppm1na (ENSSTUG00000009641)	rtn2a (ENSSTUG00000009580)	ENSSTUG00000009568	PTGIR (ENSSTUG00000009559)	ENSSTUG00000009441	gemin7 (ENSSTUG00000009400)	bmp16 (ENSSTUG00000009389)	ppp1r37 (ENSSTUG00000009279)	ENSSTUG00000009266 ##22	mrpl28 (ENSSTUG00000009251)	ENSSTUG00000009239	clptm1 (ENSSTUG00000008777)	ENSSTUG00000008698	ENSSTUG00000008690	six9 (ENSSTUG00000008686)	qpctla (ENSSTUG00000008678)	SIPA1L3 (ENSSTUG00000008489)	MAP3K10 (ENSSTUG00000008456)	ttc9b (ENSSTUG00000008447)	si:ch211-160d20.3 (ENSSTUG00000008436)	fosb (ENSSTUG00000008418)	ENSSTUG00000008312	znf296 (ENSSTUG00000008298)	ENSSTUG00000008294
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	12	ENSSSAG00000118656	ENSSSAG00000094430	ap2s1 (ENSSSAG00000083309)	ARHGAP35 (ENSSSAG00000049601)	rab4b (ENSSSAG00000049780)	rhoub (ENSSSAG00000050214)	ppm1na (ENSSSAG00000094609)	rtn2a (ENSSSAG00000108689)	ENSSSAG00000083390	ENSSSAG00000096827	ENSSSAG00000005656	ENSSSAG00000097830	gemin7 (ENSSSAG00000099823)	bmp16 (ENSSSAG00000108574)	ppp1r37 (ENSSSAG00000120388)	ENSSSAG00000119715 ##22	RM28 (ENSSSAG00000120657)	ENSSSAG00000092258	ENSSSAG00000121301	clptm1 (ENSSSAG00000099001)	ENSSSAG00000118598	ENSSSAG00000089760	six9 (ENSSSAG00000005368)	qpctla (ENSSSAG00000105705)	ENSSSAG00000092226	ENSSSAG00000111446	ENSSSAG00000086137	ttc9b (ENSSSAG00000102019)	si:ch211-160d20.3 (ENSSSAG00000110319)	fosb (ENSSSAG00000082224)	ENSSSAG00000105572
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	24	ENSGT00940000160655.w.b	ENSGT00390000012863.c	ENSGT00940000161295.n.a	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.b	ENSGT00970000193421.A.cb	ENSGT00940000159399.c.b.b	ENSGT00940000165900.d	ENSGT00940000167260.c	ENSGT00940000164695.a.g	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d.e	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.b	ENSGT00390000018039.p	ENSGT00940000155666.d.a	ENSGT00940000157454.rc.b	ENSGT00940000156484.a.c ##22	ENSGT00390000017359.k	ENSGT00940000160230.m.a.a	ENSGT00530000063461.B.a	ENSGT01010000224936	ENSGT00940000166238.a.d	ENSGT00940000158292.b.f	ENSGT00390000003107.b.j.g	ENSGT00940000159183.u.a	ENSGT00940000174677	ENSGT00940000160518.b	ENSGT00940000161494.j.b	ENSGT00390000005773.d	ENSGT00940000160358.k.b	ENSGT00940000166395.c.b	ENSGT00940000166395.c.a.a
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00390000012863.c	ENSGT00940000161295.n.a	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.a	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.b	ENSGT00970000193421.A.cb	ENSGT00940000159399.c.b.b	ENSGT00940000165900.d	ENSGT00940000167260.c	ENSGT00940000164695.a.g	ENSGT00940000167255	ENSGT01050000244902.b.d.e	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.b	ENSGT00390000018039.p	ENSGT00940000155666.d.a	ENSGT00940000157454.rc.b	ENSGT00940000156484.a.c ##22	ENSGT00390000017359.k	ENSGT00940000160230.m.a.a	ENSGT00530000063461.B.a	ENSGT01010000224936	ENSGT00940000166238.a.d	ENSGT00940000158292.b.f	ENSGT00390000003107.b.j.g	ENSGT00940000159183.u.a	ENSGT00940000174677	ENSGT00940000160518.b	ENSGT00940000161494.j.b	ENSGT00390000005773.d	ENSGT00940000160358.k.b	ENSGT00940000166395.c.b	ENSGT00940000166395.c.a.a
Coho salmon	MODERN SPECIES	6	tmem160 (ENSOKIG00005010444)	NPAS1 (ENSOKIG00005010441)	ARHGAP35 (ENSOKIG00005010433)	ap2s1 (ENSOKIG00005010352)	rab4b (ENSOKIG00005010321)	rhoub (ENSOKIG00005010309)	rtn2a (ENSOKIG00005010286)	ppm1na (ENSOKIG00005010273)	ENSOKIG00005010262	PTGIR (ENSOKIG00005010261)	ENSOKIG00005010225	ENSOKIG00005010216	gemin7 (ENSOKIG00005010213)	bmp16 (ENSOKIG00005010205)	ppp1r37 (ENSOKIG00005010148)	ENSOKIG00005010132 ##22	mrpl28 (ENSOKIG00005010118)	ENSOKIG00005010103	clptm1 (ENSOKIG00005009484)	ENSOKIG00005009406	six5 (ENSOKIG00005009396)	six9 (ENSOKIG00005009386)	qpctla (ENSOKIG00005009379)	SIPA1L3 (ENSOKIG00005009109)	MAP3K10 (ENSOKIG00005009084)	ttc9b (ENSOKIG00005009081)	si:ch211-160d20.3 (ENSOKIG00005009070)	fosb (ENSOKIG00005009064)	ENSOKIG00005008926	ENSOKIG00005008881	znf296 (ENSOKIG00005008863)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	2890												wdr89 (ENSOTSG00005024157)	gemin7 (ENSOTSG00005024156)	bmp16 (ENSOTSG00005024153)	ppp1r37 (ENSOTSG00005024088)	ENSOTSG00005024087 ##22	mrpl28 (ENSOTSG00005024086)	ENSOTSG00005024084	clptm1 (ENSOTSG00005022668)	ENSOTSG00005022660	six5 (ENSOTSG00005022659)	six9 (ENSOTSG00005022658)	qpctla (ENSOTSG00005022656)	SIPA1L3 (ENSOTSG00005022371)	ENSOTSG00005022369	MAP3K10 (ENSOTSG00005022368)	ttc9b (ENSOTSG00005022366)	si:ch211-160d20.3 (ENSOTSG00005022365)	fosb (ENSOTSG00005022364)	ENSOTSG00005022362	ENSOTSG00005022361
Rainbow trout	MODERN SPECIES	19	tmem160 (ENSOMYG00000022620)	ENSOMYG00000065488	NPAS1 (ENSOMYG00000069164)	ARHGAP35 (ENSOMYG00000022615)	ap2s1 (ENSOMYG00000022579)	rab4b (ENSOMYG00000022476)	rhoub (ENSOMYG00000022411)	RTN2 (ENSOMYG00000022377)	ppm1na (ENSOMYG00000022344)	ENSOMYG00000022332	ENSOMYG00000022323	ENSOMYG00000022241	gemin7 (ENSOMYG00000022172)	bmp16 (ENSOMYG00000022166)	ppp1r37 (ENSOMYG00000022054)	ENSOMYG00000021974 ##22	mrpl28 (ENSOMYG00000021960)	ENSOMYG00000021944	ENSOMYG00000052183	clptm1 (ENSOMYG00000021855)	six5 (ENSOMYG00000021802)	six9 (ENSOMYG00000021795)	qpctla (ENSOMYG00000021787)	ENSOMYG00000021727	ENSOMYG00000048634	ENSOMYG00000021615	ttc9b (ENSOMYG00000021609)	si:ch211-160d20.3 (ENSOMYG00000021601)	fosb (ENSOMYG00000021583)	ENSOMYG00000021494	ENSOMYG00000067445
Huchen	MODERN SPECIES	31	ENSHHUG00000004554	tmem160 (ENSHHUG00000004544)	ARHGAP35 (ENSHHUG00000004527)	ENSHHUG00000004517	ap2s1 (ENSHHUG00000004485)	rab4b (ENSHHUG00000004327)	rhoub (ENSHHUG00000004325)	rtn2a (ENSHHUG00000004319)	ppm1na (ENSHHUG00000004316)	ENSHHUG00000004312	PTGIR (ENSHHUG00000004308)	ENSHHUG00000003845	gemin7 (ENSHHUG00000003837)	bmp16 (ENSHHUG00000003835)	ppp1r37 (ENSHHUG00000003826)	ENSHHUG00000003816 ##22	mrpl28 (ENSHHUG00000003803)	ENSHHUG00000003796	clptm1 (ENSHHUG00000003638)	ENSHHUG00000003632	ENSHHUG00000003630	six9 (ENSHHUG00000003626)	qpctla (ENSHHUG00000003623)	SIPA1L3 (ENSHHUG00000003454)	ENSHHUG00000003419	MAP3K10 (ENSHHUG00000003138)	ttc9b (ENSHHUG00000003130)	si:ch211-160d20.3 (ENSHHUG00000003122)	ENSHHUG00000003119	fosb (ENSHHUG00000003106)	ENSHHUG00000003030
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	228							ENSGT00940000159399.c.b.a	ENSGT00940000165900.c	ENSGT00940000167260.d	ENSGT00940000164695.a.h	ENSGT01050000244902.b.d.f	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.a	ENSGT00390000018039.o	ENSGT00940000155666.d.b	ENSGT00940000157454.rc.a	ENSGT00940000156484.a.d ##22	ENSGT00390000017359.l	ENSGT00940000160230.m.a.b	ENSGT00530000063461.B.b	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a	ENSGT00940000158292.b.e	ENSGT00390000003107.b.j.h	ENSGT00940000159183.u.b	ENSGT00940000160518.a	ENSGT00940000161494.j	ENSGT00940000161494.i.a	ENSGT00390000005773.c	ENSGT00940000160358.k	ENSGT00940000166395.c.b	ENSGT00940000160358.l.b
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000159485.i	ENSGT00940000160655.w.a	ENSGT00390000012863.d	ENSGT00940000161295.n.a	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.a	ENSGT00970000193421.A.bb	ENSGT00940000159399.c.b.a	ENSGT00940000165900.c	ENSGT00940000167260.d	ENSGT00940000164695.a.h	ENSGT01050000244902.b.d.f	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.a	ENSGT00390000018039.o	ENSGT00940000155666.d.b	ENSGT00940000157454.rc.a	ENSGT00940000156484.a.d ##22	ENSGT00390000017359.l	ENSGT00940000160230.m.a.b	ENSGT00530000063461.B.b	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a.c	ENSGT00940000158292.b.e	ENSGT00390000003107.b.j.h	ENSGT00940000159183.u.b	ENSGT00940000160518.a	ENSGT00940000161494.i.a	ENSGT00390000005773.c	ENSGT00940000160358.k.a	ENSGT00940000166395.c.a.b	ENSGT00940000160667.e.b	ENSGT00940000153892.A.g.b
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.a.r	ENSGT00390000017583.f	ENSGT00940000159485.i	ENSGT00940000160655.w.a	ENSGT00390000012863.d	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.a	ENSGT00970000193421.A.bb	ENSGT00940000159399.c.b.a	ENSGT00940000165900.c	ENSGT00940000167260.d	ENSGT00940000164695.a.h	ENSGT01050000244902.b.d.f	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.a	ENSGT00940000155666.d.b	ENSGT00940000157454.rc.a	ENSGT00940000156484.a.d ##22	ENSGT00390000017359.l	ENSGT00940000160230.m.a.b	ENSGT00530000063461.B.b	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a.c	ENSGT00940000158292.b.e	ENSGT00390000003107.b.j.h	ENSGT00940000159183.u.b	ENSGT00940000160518.a	ENSGT00940000161494.j.a	ENSGT00390000005773.c	ENSGT00940000160358.k.a	ENSGT00940000166395.c.a.b	ENSGT00940000160667.e.b	ENSGT00940000153892.A.g.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	16	ENSOMYG00000049025	ENSOMYG00000029220	ap2s1 (ENSOMYG00000029325)	rab4b (ENSOMYG00000029382)	ENSOMYG00000058206	ENSOMYG00000058174	rhoub (ENSOMYG00000029397)	rtn2a (ENSOMYG00000029432)	ppm1na (ENSOMYG00000029447)	ENSOMYG00000029461	ENSOMYG00000029527	ENSOMYG00000074800	ENSOMYG00000057538	bmp16 (ENSOMYG00000029577)	ENSOMYG00000029724	ENSOMYG00000029779 ##22	mrpl28 (ENSOMYG00000029790)	ENSOMYG00000029822	clptm1 (ENSOMYG00000020917)	tbcb (ENSOMYG00000020812)	six5 (ENSOMYG00000020805)	six9 (ENSOMYG00000020796)	qpctla (ENSOMYG00000052763)	ENSOMYG00000020470	ENSOMYG00000054962	ENSOMYG00000020429	ttc9b (ENSOMYG00000020420)	ENSOMYG00000049426	si:ch211-160d20.3 (ENSOMYG00000020409)	fosb (ENSOMYG00000020392)	ENSOMYG00000020371
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00950000183024.a.b.b.j.a	ENSGT00950000183095.a.b.a.b.a.r	ENSGT00390000017583.f	ENSGT00940000159485.i	ENSGT00940000160655.w.a	ENSGT00390000012863.d	ENSGT00970000193421.A.bb	ENSGT00940000159399.c.b.a	ENSGT00940000165900.c	ENSGT00940000167260.d	ENSGT00940000164695.a.h	ENSGT01050000244902.b.d.f	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.a	ENSGT00940000155666.d.b	ENSGT00940000157454.rc.a	ENSGT00940000156484.a.d ##22	ENSGT00390000017359.l	ENSGT00940000160230.m.a.b	ENSGT00530000063461.B.b	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a.c	ENSGT00940000158292.b.e	ENSGT00940000159183.u.b	ENSGT00940000160518.a	ENSGT00940000161494.j.a	ENSGT00390000005773.c	ENSGT00940000160358.k.a	ENSGT00940000166395.c.a.b	ENSGT00940000160667.e.b	ENSGT00940000153892.A.g.b	ENSGT00940000166445.a.b
Coho salmon	MODERN SPECIES	9	slc1a5 (ENSOKIG00005047738)	ENSOKIG00005047770	tmem160 (ENSOKIG00005047779)	ENSOKIG00005047792	NPAS1 (ENSOKIG00005047796)	ap2s1 (ENSOKIG00005047804)	rab4b (ENSOKIG00005047835)	rhoub (ENSOKIG00005047880)	rtn2a (ENSOKIG00005047889)	ppm1na (ENSOKIG00005047912)	PTGIR (ENSOKIG00005047918)	ENSOKIG00005047928	bmp16 (ENSOKIG00005047983)	ENSOKIG00005047993	ppp1r37 (ENSOKIG00005048009)	ENSOKIG00005048077 ##22	mrpl28 (ENSOKIG00005048088)	ENSOKIG00005048105	ENSOKIG00005048109	clptm1 (ENSOKIG00005048128)	tbcb (ENSOKIG00005048314)	six5 (ENSOKIG00005048319)	six9 (ENSOKIG00005048324)	SIPA1L3 (ENSOKIG00005048335)	MAP3K10 (ENSOKIG00005048350)	ttc9b (ENSOKIG00005048353)	si:ch211-160d20.3 (ENSOKIG00005021548)	fosb (ENSOKIG00005021556)	ENSOKIG00005021587	znf296 (ENSOKIG00005021706)	clasrp (ENSOKIG00005021718)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	5	slc1a5 (ENSOTSG00005015561)	ENSOTSG00005015560	ENSOTSG00005015559	ARHGAP35 (ENSOTSG00005015557)	ap2s1 (ENSOTSG00005015531)	rab4b (ENSOTSG00005015530)	rhoub (ENSOTSG00005015528)	rtn2a (ENSOTSG00005015526)	ppm1na (ENSOTSG00005015525)	PTGIR (ENSOTSG00005015523)	ENSOTSG00005015521	ENSOTSG00005015328	ENSOTSG00005015326	bmp16 (ENSOTSG00005015323)	ppp1r37 (ENSOTSG00005015319)	ENSOTSG00005015316 ##22	mrpl28 (ENSOTSG00005015315)	ENSOTSG00005015314	ENSOTSG00005015313	eomesa (ENSOTSG00005015312)	SLC4A7 (ENSOTSG00005013377)	ENSOTSG00005012867	HERPUD2 (ENSOTSG00005012859)	ADGRB1 (ENSOTSG00005012277)	ENSOTSG00005012261	ENSOTSG00005011733	dnajc8 (ENSOTSG00005011501)	clk2a (ENSOTSG00005010267)	ENSOTSG00005010266	cers2a (ENSOTSG00005010239)	celf3a (ENSOTSG00005010230)
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000160655.w.a	ENSGT00390000012863.d	ENSGT00940000161295.n.a.b	ENSGT00940000161295.n.a.a	ENSGT01030000234635.a.b.a.b.b.a.b.a	ENSGT00970000193421.A.bb	ENSGT00940000159399.c.b.a	ENSGT00940000165900.c	ENSGT00940000167260.d	ENSGT00940000164695.a.h	ENSGT01050000244902.b.d.f	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b.b.c.b	ENSGT00390000018039.o	ENSGT00940000155666.d.b	ENSGT00940000157454.rc.a	ENSGT00940000156484.a.d ##22	ENSGT00390000017359.l	ENSGT00940000160230.m.a.b	ENSGT00530000063461.B.b	ENSGT00940000156119	ENSGT00940000166238.a.c	ENSGT00940000158292.b.e	ENSGT00940000159183.u.b	ENSGT00940000160518.a	ENSGT00940000161494.i.a	ENSGT00390000005773.c	ENSGT00940000160358.k.a	ENSGT00940000166395.c.a.b	ENSGT00940000160667.e.b	ENSGT00940000153892.A.g.b	ENSGT00940000166445.a.b
River trout	MODERN SPECIES	4	ENSSTUG00000001486	tmem160 (ENSSTUG00000001468)	NPAS1 (ENSSTUG00000001462)	ARHGAP35 (ENSSTUG00000001456)	ap2s1 (ENSSTUG00000001378)	rab4b (ENSSTUG00000001302)	rhoub (ENSSTUG00000001068)	rtn2a (ENSSTUG00000023138)	ppm1na (ENSSTUG00000023117)	PTGIR (ENSSTUG00000023110)	ENSSTUG00000022999	ENSSTUG00000022993	gemin7 (ENSSTUG00000022970)	bmp16 (ENSSTUG00000022832)	ppp1r37 (ENSSTUG00000022547)	ENSSTUG00000022525 ##22	mrpl28 (ENSSTUG00000022510)	ENSSTUG00000022496	clptm1 (ENSSTUG00000022422)	tbcb (ENSSTUG00000022404)	six5 (ENSSTUG00000022386)	six9 (ENSSTUG00000022381)	SIPA1L3 (ENSSTUG00000021779)	MAP3K10 (ENSSTUG00000021747)	ttc9b (ENSSTUG00000021742)	si:ch211-160d20.3 (ENSSTUG00000021735)	fosb (ENSSTUG00000021724)	ENSSTUG00000021695	znf296 (ENSSTUG00000021687)	clasrp (ENSSTUG00000021655)	ENSSTUG00000021641
Huchen	MODERN SPECIES	645					ap2s1 (ENSHHUG00000041863)	rab4b (ENSHHUG00000041633)	rhoub (ENSHHUG00000041624)	rtn2a (ENSHHUG00000041595)	ppm1na (ENSHHUG00000041586)	PTGIR (ENSHHUG00000041583)	ENSHHUG00000041429	gemin7 (ENSHHUG00000041427)	bmp16 (ENSHHUG00000041353)	ppp1r37 (ENSHHUG00000041350)	ENSHHUG00000041349	ENSHHUG00000041348 ##22	mrpl28 (ENSHHUG00000041331)	ENSHHUG00000041319
Northern pike	MODERN SPECIES		ENSELUG00000013701	tmem160 (ENSELUG00000013720)	NPAS1 (ENSELUG00000034542)	ARHGAP35 (ENSELUG00000013772)	ap2s1 (ENSELUG00000013793)	rab4b (ENSELUG00000013817)	rhoub (ENSELUG00000013830)	rtn2a (ENSELUG00000013859)	ppm1na (ENSELUG00000013890)	ENSELUG00000013934	PTGIR (ENSELUG00000013943)	ENSELUG00000014007	gemin7 (ENSELUG00000014034)	bmp16 (ENSELUG00000014051)	ppp1r37 (ENSELUG00000000513)	ENSELUG00000014075 ##22	mrpl28 (ENSELUG00000014104)	ENSELUG00000000515	clptm1 (ENSELUG00000014159)	tbcb (ENSELUG00000014206)	six5 (ENSELUG00000014235)	six9 (ENSELUG00000014253)	qpctla (ENSELUG00000014266)	ENSELUG00000028314	SIPA1L3 (ENSELUG00000014332)	ENSELUG00000014393	MAP3K10 (ENSELUG00000014411)	ttc9b (ENSELUG00000014424)	si:ch211-160d20.3 (ENSELUG00000014444)	fosb (ENSELUG00000014466)	ENSELUG00000014512
Reedfish	DUPLICATION
Reedfish	MODERN SPECIES		ENSECRG00000006557	rps6ka4 (ENSECRG00000006542)	ENSECRG00000006526	prdx5 (ENSECRG00000006502)	trmt112 (ENSECRG00000006493)	esrra (ENSECRG00000006484)	ENSECRG00000006474	KCNK4 (ENSECRG00000006443)	ENSECRG00000006405	zgc:162144 (ENSECRG00000006394) ##23	stx5al (ENSECRG00000006383)	wdr74 (ENSECRG00000006370)	cnih2 (ENSECRG00000006362)	ENSECRG00000006355	ubxn1 (ENSECRG00000006345)	ENSECRG00000006328 ##22	FAU (ENSECRG00000006317)	SCYL1 (ENSECRG00000006287)	ENSECRG00000006279	ENSECRG00000006265	ENSECRG00000006252	znhit2 (ENSECRG00000006245)	tm7sf2 (ENSECRG00000006237)	ENSECRG00000006229	vps51 (ENSECRG00000006211)	zfpl1 (ENSECRG00000006191)	CDCA5 (ENSECRG00000006178)	SLC25A45 (ENSECRG00000006172)	frmd8 (ENSECRG00000009199)	slc8a4b (ENSECRG00000009191)	map4k2 (ENSECRG00000009164)
Reedfish	MODERN SPECIES	447																ENSECRG00000021763 ##22
Sarcopterygii	ANCESTRAL SPECIES	508													ENSGT00390000018039	ENSGT00940000155666.d	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B
Coelacanth	MODERN SPECIES	1560													ENSLACG00000005059	ENSLACG00000007286	ENSLACG00000009151	ENSLACG00000022179 ##22	POLR2I (ENSLACG00000009590)	ENSLACG00000011327
Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	520															ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	56					ENSGT00940000159914	ENSGT00940000154348.c.a.b.a	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000159921	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00390000007539	ENSGT01060000249020	ENSGT00940000173994	ENSGT00940000162660.b.e.b	ENSGT00940000154853	ENSGT00940000158566	ENSGT00940000157482	ENSGT00600000084617	ENSGT00940000166053	ENSGT00940000155031	ENSGT00940000154196.a ##27	ENSGT00390000014903	ENSGT00390000006979.a	ENSGT00940000159375	ENSGT00940000161450
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	65		ENSGT00390000012589	ENSGT00390000007539	ENSGT01060000249020	ENSGT00940000173994	ENSGT00940000159914	ENSGT00940000154348.c.a.b.a	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00390000007552	ENSGT00940000154902
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	72														ENSGT01010000222658	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00390000007552	ENSGT00940000154902
Cryptodira	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT01000000214440.C	ENSGT00390000015119	ENSGT00510000048151	ENSGT00640000091486.a	ENSGT00940000159914	ENSGT00940000154348.c.a.b.a	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT01010000222658	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00390000007552	ENSGT00940000154902
Testudinoidea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000015119	ENSGT00510000048151	ENSGT00640000091486.a	ENSGT00940000159914	ENSGT00940000154348.c.a.b.a	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT00950000186207	ENSGT01010000222658	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00390000007552	ENSGT00390000018085.a.b.a	ENSGT00940000154902.k	ENSGT00940000154902.j.a
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000015119	ENSGT00510000048151	ENSGT00640000091486.a	ENSGT00940000159914	ENSGT00940000154348.c.a.b.a	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT00950000186207	ENSGT01010000222658	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00980000201892	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00390000007552	ENSGT00390000018085.a.b.a	ENSGT00940000154902.k	ENSGT00940000154902.j.a
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	142	WDR74 (ENSCABG00000021798)	TMEM179B (ENSCABG00000021812)	TAF6L (ENSCABG00000021814)	TUT1 (ENSCABG00000021822)	ENSCABG00000021823	MTA2 (ENSCABG00000021826)	EML3 (ENSCABG00000021840)	B3GAT3 (ENSCABG00000021841)	GANAB (ENSCABG00000021857)	INTS5 (ENSCABG00000021899)	C11orf98 (ENSCABG00000021900)	ENSCABG00000021902	CSKMT (ENSCABG00000021903)	ENSCABG00000021904	UBXN1 (ENSCABG00000021905)	ENSCABG00000021907 ##22	ENSCABG00000021908	BSCL2 (ENSCABG00000021909)	ENSCABG00000021910	GNG3 (ENSCABG00000021911)	HNRNPUL2 (ENSCABG00000021912)	TTC9C (ENSCABG00000021913)	ENSCABG00000021914	ENSCABG00000021915	ENSCABG00000021916	ENSCABG00000021917	POLR2G (ENSCABG00000021918)	EEF1G (ENSCABG00000021919)	ENSCABG00000021921	ENSCABG00000021922	ENSCABG00000021923
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	21	WDR74 (ENSGEVG00005008071)	TMEM179B (ENSGEVG00005007930)	TAF6L (ENSGEVG00005007893)	TUT1 (ENSGEVG00005007871)	ENSGEVG00005007847	MTA2 (ENSGEVG00005007814)	EML3 (ENSGEVG00005007774)	B3GAT3 (ENSGEVG00005007748)	GANAB (ENSGEVG00005007671)	INTS5 (ENSGEVG00005007629)	C11orf98 (ENSGEVG00005007609)	CSKMT (ENSGEVG00005007592)	ENSGEVG00005007583	ENSGEVG00005007540	UBXN1 (ENSGEVG00005007492)	ENSGEVG00005007440 ##22	ENSGEVG00005007419	BSCL2 (ENSGEVG00005007400)	GNG3 (ENSGEVG00005007379)	ENSGEVG00005007352	HNRNPUL2 (ENSGEVG00005007313)	TTC9C (ENSGEVG00005007294)	ENSGEVG00005007283	ENSGEVG00005007267	ENSGEVG00005007247	ENSGEVG00005007197	POLR2G (ENSGEVG00005007177)	EEF1G (ENSGEVG00005007153)	RPL36AL (ENSGEVG00005007124)	AHNAK (ENSGEVG00005007107)	FAM120A (ENSGEVG00005006605)
Emydidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT01000000214440.C	ENSGT00390000015119	ENSGT00510000048151	ENSGT00640000091486.a	ENSGT00940000159914	ENSGT00940000154348.c.a.b.a	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT00950000186207	ENSGT01010000222658	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00390000007552	ENSGT00390000018085.a.b.a	ENSGT00940000154902.k	ENSGT00940000154902.j.a
Three-toed box turtle	MODERN SPECIES	33	WDR74 (ENSTMTG00000006826)	TMEM179B (ENSTMTG00000006929)	TAF6L (ENSTMTG00000006942)	TUT1 (ENSTMTG00000006969)	ENSTMTG00000006998	MTA2 (ENSTMTG00000007011)	EML3 (ENSTMTG00000007398)	B3GAT3 (ENSTMTG00000012733)	GANAB (ENSTMTG00000012757)	INTS5 (ENSTMTG00000012890)	C11orf98 (ENSTMTG00000012896)	CSKMT (ENSTMTG00000012912)	ENSTMTG00000012924	ENSTMTG00000012942	UBXN1 (ENSTMTG00000012978)	ENSTMTG00000012995 ##22	LRRN4CL (ENSTMTG00000013015)	BSCL2 (ENSTMTG00000013029)	GNG3 (ENSTMTG00000013041)	ENSTMTG00000013079	HNRNPUL2 (ENSTMTG00000013466)	TTC9C (ENSTMTG00000013495)	ENSTMTG00000013508	ENSTMTG00000013525	ZBTB3 (ENSTMTG00000013561)	ENSTMTG00000013589	POLR2G (ENSTMTG00000013614)	EEF1G (ENSTMTG00000013633)	ENSTMTG00000013656	ENSTMTG00000013689	FAM120A (ENSTMTG00000013895)
painted turtle	MODERN SPECIES	884	TMEM179B (ENSCPBG00000017900)	TAF6L (ENSCPBG00000017904)	TUT1 (ENSCPBG00000017909)	ENSCPBG00000017912	MTA2 (ENSCPBG00000017916)	EML3 (ENSCPBG00000017920)	B3GAT3 (ENSCPBG00000017924)	GANAB (ENSCPBG00000017927)	INTS5 (ENSCPBG00000017934)	C11orf98 (ENSCPBG00000017935)	CSKMT (ENSCPBG00000017939)	ENSCPBG00000017942	ENSCPBG00000017944	ENSCPBG00000017947	UBXN1 (ENSCPBG00000017949)	ENSCPBG00000017952 ##22	LRRN4CL (ENSCPBG00000017956)	BSCL2 (ENSCPBG00000017959)	GNG3 (ENSCPBG00000017960)	ENSCPBG00000017961	HNRNPUL2 (ENSCPBG00000017963)	ENSCPBG00000017964	ENSCPBG00000017965	ENSCPBG00000017967	ENSCPBG00000017968	ZBTB3 (ENSCPBG00000017969)	ENSCPBG00000017970	POLR2G (ENSCPBG00000017972)	EEF1G (ENSCPBG00000017974)	ENSCPBG00000017976	ENSCPBG00000017978
Chinese turtle	MODERN SPECIES	694	STX5 (ENSPSIG00000005809)	WDR74 (ENSPSIG00000005622)	TMEM179B (ENSPSIG00000005615)	TAF6L (ENSPSIG00000005345)	TUT1 (ENSPSIG00000004972)	ENSPSIG00000004939	MTA2 (ENSPSIG00000018020)	EML3 (ENSPSIG00000017346)	B3GAT3 (ENSPSIG00000017329)	GANAB (ENSPSIG00000015069)	INTS5 (ENSPSIG00000000996)	C11orf98 (ENSPSIG00000014951)	CSKMT (ENSPSIG00000014942)	ENSPSIG00000014741	UBXN1 (ENSPSIG00000014601)	ENSPSIG00000014053 ##22	LRRN4CL (ENSPSIG00000000989)	BSCL2 (ENSPSIG00000012994)	ENSPSIG00000012259	HNRNPUL2 (ENSPSIG00000012181)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	47	ENSGT00950000182980.a.b.b.a.b	ENSGT00940000156646	ENSGT00390000012589	ENSGT00390000007539	ENSGT01000000214440.C	ENSGT00390000015119	ENSGT00940000159914	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00390000007552	ENSGT00940000154902
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00940000156646	ENSGT00390000012589	ENSGT00390000007539	ENSGT01000000214440.C	ENSGT00390000015119	ENSGT00940000159914	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT01010000222658	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000156646	ENSGT00390000012589	ENSGT00390000007539	ENSGT01000000214440.C	ENSGT00390000015119	ENSGT00940000159914	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159589	ENSGT00940000156954	ENSGT00940000159139	ENSGT00390000008374	ENSGT00390000002615	ENSGT00510000049875	ENSGT01010000222658	ENSGT00940000156457	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00960000190638	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00390000001092	ENSGT00390000000566	ENSGT01030000234556.a.b.b	ENSGT00530000064299
Common wall lizard	MODERN SPECIES	7	SLC3A2 (ENSPMRG00000017758)	TMEM223 (ENSPMRG00000017751)	ENSPMRG00000017478	STX5 (ENSPMRG00000017441)	WDR74 (ENSPMRG00000017386)	TUT1 (ENSPMRG00000017357)	MTA2 (ENSPMRG00000017151)	EML3 (ENSPMRG00000016408)	B3GAT3 (ENSPMRG00000016275)	GANAB (ENSPMRG00000016257)	INTS5 (ENSPMRG00000016252)	ENSPMRG00000016249	CSKMT (ENSPMRG00000016229)	ENSPMRG00000016216	UBXN1 (ENSPMRG00000016202)	ENSPMRG00000016194 ##22	LRRN4CL (ENSPMRG00000016189)	BSCL2 (ENSPMRG00000016172)	GNG3 (ENSPMRG00000016165)	ENSPMRG00000015788	HNRNPUL2 (ENSPMRG00000015717)	TTC9C (ENSPMRG00000015711)	ENSPMRG00000015709	ENSPMRG00000015706	ZBTB3 (ENSPMRG00000015698)	ENSPMRG00000017922	POLR2G (ENSPMRG00000017906)	ENSPMRG00000017900	SDHC (ENSPMRG00000017895)	MPZ (ENSPMRG00000017888)	ENSPMRG00000017884
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	78	TMEM223 (ENSSMRG00000010379)	ENSSMRG00000010380	STX5 (ENSSMRG00000010381)	WDR74 (ENSSMRG00000010384)	TUT1 (ENSSMRG00000010391)	MTA2 (ENSSMRG00000010393)	EML3 (ENSSMRG00000011094)	B3GAT3 (ENSSMRG00000011096)	GANAB (ENSSMRG00000011097)	INTS5 (ENSSMRG00000011099)	C11orf98 (ENSSMRG00000011100)	CSKMT (ENSSMRG00000011102)	ENSSMRG00000011103	ENSSMRG00000011105	UBXN1 (ENSSMRG00000011123)	ENSSMRG00000011125 ##22	LRRN4CL (ENSSMRG00000011126)	BSCL2 (ENSSMRG00000011127)	GNG3 (ENSSMRG00000011130)	ENSSMRG00000011131	HNRNPUL2 (ENSSMRG00000011133)	TTC9C (ENSSMRG00000011140)	ENSSMRG00000011141	ENSSMRG00000011145	ZBTB3 (ENSSMRG00000011146)	ENSSMRG00000011149	POLR2G (ENSSMRG00000011153)	ENSSMRG00000011163	SDHC (ENSSMRG00000011165)	MPZ (ENSSMRG00000011167)	PCP4L1 (ENSSMRG00000011171)
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	51																ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00940000159589	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159914	ENSGT00390000015119
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000155078.a.b.b	ENSGT00960000189653	ENSGT00940000160966	ENSGT00940000164842	ENSGT00940000158549	ENSGT00390000008744	ENSGT00940000155545.a	ENSGT00390000008196	ENSGT00390000003308.b	ENSGT00940000160641.g	ENSGT00530000064299	ENSGT00940000168190	ENSGT01030000234556.a.b.b	ENSGT00390000000566	ENSGT00990000213065	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161805	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z.a	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a.f	ENSGT00950000183059.a.e.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00940000159589	ENSGT01030000234573.B.c.b.b	ENSGT00940000159914
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	83	ENSGT00950000183209.a	ENSGT00940000161973	ENSGT00940000155078.a.b.b	ENSGT00940000160966	ENSGT00940000158549	ENSGT00390000008744	ENSGT00940000155545.a	ENSGT00390000008196	ENSGT00390000003308.b	ENSGT00940000160641.g	ENSGT00530000064299	ENSGT00940000168190	ENSGT01030000234556.a.b.b	ENSGT00390000000566	ENSGT00990000213065	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000162696	ENSGT00390000011639	ENSGT01100000263497.B	ENSGT00390000015553.a.a.a	ENSGT00940000160376	ENSGT00940000161472.h	ENSGT00950000183059.a.e.a	ENSGT00390000008975	ENSGT00950000183181.A.b	ENSGT00940000161852.z.a	ENSGT00940000161486	ENSGT00950000183059.a.f
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.a ##22
Eastern brown snake	DUPLICATION
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	831																ENSPTXG00000017021 ##22
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	833																ENSPTXG00000017057 ##22
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	711												ENSNSUG00000017280	ENSNSUG00000017279	ENSNSUG00000017278	UBXN1 (ENSNSUG00000017277)	ENSNSUG00000017276 ##22
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	5540																ENSLLTG00000006299 ##22	LRRN4CL (ENSLLTG00000006308)	BSCL2 (ENSLLTG00000006321)	GNG3 (ENSLLTG00000006339)
Indian cobra	MODERN SPECIES	17	ENSNNAG00000005507	ENSNNAG00000005495	KLC2 (ENSNNAG00000005462)	RAB1B (ENSNNAG00000005436)	ENSNNAG00000005427	YIF1A (ENSNNAG00000005407)	ADAMTS4 (ENSNNAG00000005390)	ENSNNAG00000005347	B4GALT3 (ENSNNAG00000005333)	USP21 (ENSNNAG00000005227)	UFC1 (ENSNNAG00000005207)	TOMM40L (ENSNNAG00000005049)	ENSNNAG00000004967	PCP4L1 (ENSNNAG00000004941)	ENSNNAG00000004924	ENSNNAG00000004913 ##22	LRRN4CL (ENSNNAG00000004878)	BSCL2 (ENSNNAG00000004856)	GNG3 (ENSNNAG00000004845)	ENSNNAG00000004818	HNRNPUL2 (ENSNNAG00000004797)	TTC9C (ENSNNAG00000004780)	ENSNNAG00000004773	ENSNNAG00000004712	ENSNNAG00000004696	POLR2G (ENSNNAG00000004665)	C11orf98 (ENSNNAG00000004644)	INTS5 (ENSNNAG00000004637)	EML3 (ENSNNAG00000004618)	ENSNNAG00000004599	ENSNNAG00000004408
Lizard	MODERN SPECIES	204																ENSACAG00000023901 ##22	ENSACAG00000023953
Anura	ANCESTRAL SPECIES	86									ENSGT00940000153892.A	ENSGT00940000162258.a.a	ENSGT00650000093443	ENSGT00390000008756	ENSGT00390000012948.a	ENSGT00390000018039	ENSGT00940000157454	ENSGT00940000156484.a ##22	ENSGT00940000160230	ENSGT00530000063461.B	ENSGT00950000183135.A.a	ENSGT00940000154133.B	ENSGT01030000234517.F	ENSGT00500000044869.b	ENSGT00390000017045	ENSGT00450000040421	ENSGT00940000161740	ENSGT01030000234613.b.b	ENSGT00940000159555	ENSGT00950000182772.A.a.a.b	ENSGT00950000182970.C	ENSGT00940000160551	ENSGT00450000040362
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	12	ENSLLEG00000018394	ENSLLEG00000018561	ENSLLEG00000018677	ENSLLEG00000018699	ENSLLEG00000018839	TBCB (ENSLLEG00000019327)	ENSLLEG00000019448	ENSLLEG00000019531	ENSLLEG00000019553	CLASRP (ENSLLEG00000019629)	ENSLLEG00000020362	ENSLLEG00000020529	NKPD1 (ENSLLEG00000020565)	ENSLLEG00000020605	PPP1R37 (ENSLLEG00000020642)	ENSLLEG00000020767 ##22	RELB (ENSLLEG00000020791)	CLPTM1 (ENSLLEG00000020915)	NANOS2 (ENSLLEG00000021141)	ENSLLEG00000021180	ENSLLEG00000021328	ENSLLEG00000021857	SYMPK (ENSLLEG00000021981)	ENSLLEG00000022748	MYPOP (ENSLLEG00000022786)	ENSLLEG00000022829	ENSLLEG00000022901	MARK4 (ENSLLEG00000023164)	CKM (ENSLLEG00000023579)	ENSLLEG00000023902	ERCC2 (ENSLLEG00000023926)
Cyclostomata	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484.a ##22
Hagfish	MODERN SPECIES	1376													aspg (ENSEBUG00000010114)	ENSEBUG00000008764	ENSEBUG00000014895 #23	ENSEBUG00000010811 ##22	lpgat1 (ENSEBUG00000011481) #19	ENSEBUG00000010748	ENSEBUG00000002366	PACC1 (ENSEBUG00000007937) #15	ENSEBUG00000012369	glrx5 (ENSEBUG00000010332)	chac2 (ENSEBUG00000016237)	ENSEBUG00000007158	ENSEBUG00000001272	ENSEBUG00000010675	ppp5c (ENSEBUG00000010920)	dio2 (ENSEBUG00000016572)	snw1 (ENSEBUG00000003160)	ENSEBUG00000014899
Ciona	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000156484 #22
Ciona intestinalis	DUPLICATION
Ciona intestinalis	MODERN SPECIES	5	ENSCING00000003881	ENSCING00000003972	ENSCING00000014440	ENSCING00000019835	ENSCING00000017394	ENSCING00000017395	ENSCING00000003924	ENSCING00000022669	ENSCING00000003912	ENSCING00000003901	ENSCING00000003899	ENSCING00000003888	ENSCING00000018567	ENSCING00000003884	ENSCING00000025123	ENSCING00000003950 #22	ENSCING00000009249	ENSCING00000003984	ENSCING00000003974	ENSCING00000002281	ENSCING00000002298	ENSCING00000022502	ENSCING00000020880	ENSCING00000024363	ENSCING00000023003	ENSCING00000019846	ENSCING00000014441	ENSCING00000024210	ENSCING00000019408	ENSCING00000021657	ENSCING00000014443
Ciona intestinalis	MODERN SPECIES	568												ENSCING00000015675	ENSCING00000007115	ENSCING00000007114	ENSCING00000019076	ENSCING00000007113 #22	ENSCING00000019785	ENSCING00000007110	ENSCING00000016623	ENSCING00000016624
Ciona savignyi	MODERN SPECIES	74	ENSCSAVG00000005383	ENSCSAVG00000005379	ENSCSAVG00000005374	ENSCSAVG00000005243	ENSCSAVG00000005198	ENSCSAVG00000005189	ENSCSAVG00000005063	ENSCSAVG00000005058	ENSCSAVG00000005056	ENSCSAVG00000005002	ENSCSAVG00000004998	ENSCSAVG00000004987	ENSCSAVG00000004817	ENSCSAVG00000004811	ENSCSAVG00000004807	ENSCSAVG00000004804 #22	ENSCSAVG00000004803	ENSCSAVG00000004800	ENSCSAVG00000004797	ENSCSAVG00000004796	ENSCSAVG00000004731	ENSCSAVG00000004728	ENSCSAVG00000004721	ENSCSAVG00000004717	ENSCSAVG00000004701	ENSCSAVG00000004688	ENSCSAVG00000004685	ENSCSAVG00000004667	ENSCSAVG00000004664	ENSCSAVG00000004645	ENSCSAVG00000004641