Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 309 ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 ENSGT00940000154457.a.b #21 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 247 ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 ENSGT00940000154457.a.b #21 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 209 ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 ENSGT00940000154457.a.b #21 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 210 ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 ENSGT00940000154457.a.b #21 Eupecaria_B DUPLICATION Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 190 ENSGT00940000154457.a.a.a.a.c #22 ENSGT00940000154457.a.b #21 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 196 ENSGT00940000154457.a.a.a.a.c #22 ENSGT00940000154457.a.b #21 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 291 ENSGT00940000154457.a.a.a.a.c #22 ENSGT00940000154457.a.b #21 Pike perch DUPLICATION Pike perch DUPLICATION Pike perch MODERN SPECIES 103 ENSSLUG00000002866 #10 ENSSLUG00000002861 #11 ccn5 (ENSSLUG00000002859) #12 ada (ENSSLUG00000002481) #13 pkig (ENSSLUG00000002403) #14 ttpal (ENSSLUG00000002394) #15 hnf4a (ENSSLUG00000002372) #16 R3HDML 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MODERN SPECIES 11 ZBTB39 (ENSGACG00000011765) agap2 (ENSGACG00000011751) #37 tspan31 (ENSGACG00000011730) #36 MARCHF9 (ENSGACG00000011728) #35 SLC11A2 (ENSGACG00000011691) #34 ctdsp2 (ENSGACG00000011678) #33 TMBIM6 (ENSGACG00000011650) #32 ENSGACG00000011642 #31 kansl2 (ENSGACG00000011630) #30 ccnt1 (ENSGACG00000011626) #29 sarnp (ENSGACG00000011615) #28 pmelb (ENSGACG00000011605) #27 TUBA4B (ENSGACG00000011595) ##21 tuba2 (ENSGACG00000011587) ##21 tuba1c (ENSGACG00000011552) ##26 TUBA4B (ENSGACG00000011524) ##21 jph2 (ENSGACG00000011519) #20 GDAP1L1 (ENSGACG00000011509) #19 fitm2 (ENSGACG00000011502) #18 hnf4a (ENSGACG00000011485) #16 ttpal (ENSGACG00000011479) #15 pkig (ENSGACG00000011477) #14 ada (ENSGACG00000011456) #13 ccn5 (ENSGACG00000011453) #12 ENSGACG00000011450 #10 ugt5e1 (ENSGACG00000011442) pfkfb1 (ENSGACG00000011410) ENSGACG00000011406 gdi1 (ENSGACG00000011384) atp6ap1b (ENSGACG00000011378) taf8 (ENSGACG00000011366) Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.a.a ##21 Channel bull blenny MODERN SPECIES 21 ugt5e1 (ENSCGOG00000005172) ENSCGOG00000005171 #10 pfkfb1 (ENSCGOG00000004986) ENSCGOG00000004977 #10 ccn5 (ENSCGOG00000004975) #12 ada (ENSCGOG00000004781) #13 pkig (ENSCGOG00000004774) #14 ttpal (ENSCGOG00000004769) #15 hnf4a (ENSCGOG00000004571) #16 R3HDML (ENSCGOG00000004549) #17 fitm2 (ENSCGOG00000004544) #18 GDAP1L1 (ENSCGOG00000004529) #19 jph2 (ENSCGOG00000004527) #20 ENSCGOG00000004524 ENSCGOG00000004523 ##26 tuba2 (ENSCGOG00000003903) ##21 ENSCGOG00000016764 ENSCGOG00000016692 ##21 pmelb (ENSCGOG00000016690) #27 sarnp (ENSCGOG00000016688) #28 ccnt1 (ENSCGOG00000016683) #29 kansl2 (ENSCGOG00000016654) #30 ENSCGOG00000016646 #31 TMBIM6 (ENSCGOG00000016617) #32 ctdsp2 (ENSCGOG00000016612) #33 ENSCGOG00000016611 SLC11A2 (ENSCGOG00000013880) #34 MARCHF9 (ENSCGOG00000013837) #35 tspan31 (ENSCGOG00000013833) #36 agap2 (ENSCGOG00000013687) #37 ENSCGOG00000013677 Perciformes DUPLICATION Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000182994.B.a.a.a ENSGT00940000162980 ENSGT00950000182835.c.c.g.b ENSGT00940000166720 ENSGT00940000155094.b #10 ENSGT00940000160207.b #12 ENSGT00950000183113.a.b #13 ENSGT00390000002707 #14 ENSGT00940000155407 #15 ENSGT00940000157965.d #16 ENSGT00940000161086 #17 ENSGT00530000063693.b #18 ENSGT00940000160178 #19 ENSGT00940000159411.b #20 ENSGT00950000183165.b.a.f ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.a.b.a ##21 ENSGT00950000183188.A.a.b #27 ENSGT00390000002944 #28 ENSGT00940000159544 #29 ENSGT00940000155808 #30 ENSGT00530000063607.a #31 ENSGT01050000244940.a.a #32 ENSGT01040000240451.a.b.a #33 ENSGT00940000155330.b #34 ENSGT00940000158208.a.a #35 ENSGT00940000160351 #36 ENSGT00940000158956.c #37 ENSGT00940000160722 ENSGT00940000154307.D ENSGT00940000156890.a.b ENSGT00940000160528.b Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.a.b.a ##21 Lumpfish MODERN SPECIES 22 TFCP2 (ENSCLMG00005019199) CSRNP2 (ENSCLMG00005019271) itga5 (ENSCLMG00005019276) RAPGEF3 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ENSGT00530000063693.b #18 ENSGT00940000160178 #19 ENSGT00940000159411.b #20 ENSGT00950000183165.b.a.f ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.a.b.a ##21 ENSGT00950000183188.A.a.b #27 ENSGT00390000002944 #28 ENSGT00940000159544 #29 ENSGT00940000155808 #30 ENSGT00530000063607.a #31 ENSGT01050000244940.a.a #32 ENSGT01040000240451.a.b.a #33 ENSGT00940000155330.b #34 ENSGT00940000158208.a.a #35 ENSGT00940000160351 #36 ENSGT00940000158956.c #37 ENSGT00940000160722 ENSGT00940000154307.D ENSGT00940000156890.a.b ENSGT00940000160528.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 21 pfkfb1 (ENSCGOG00000004986) ENSCGOG00000004977 #10 ccn5 (ENSCGOG00000004975) #12 ada (ENSCGOG00000004781) #13 pkig (ENSCGOG00000004774) #14 ttpal (ENSCGOG00000004769) #15 hnf4a (ENSCGOG00000004571) #16 R3HDML (ENSCGOG00000004549) #17 fitm2 (ENSCGOG00000004544) #18 GDAP1L1 (ENSCGOG00000004529) #19 jph2 (ENSCGOG00000004527) #20 ENSCGOG00000004524 ENSCGOG00000004523 ##26 tuba2 (ENSCGOG00000003903) ##21 ENSCGOG00000016764 ENSCGOG00000016692 ##21 pmelb (ENSCGOG00000016690) #27 sarnp (ENSCGOG00000016688) #28 ccnt1 (ENSCGOG00000016683) #29 kansl2 (ENSCGOG00000016654) #30 ENSCGOG00000016646 #31 TMBIM6 (ENSCGOG00000016617) #32 ctdsp2 (ENSCGOG00000016612) #33 ENSCGOG00000016611 SLC11A2 (ENSCGOG00000013880) #34 MARCHF9 (ENSCGOG00000013837) #35 tspan31 (ENSCGOG00000013833) #36 agap2 (ENSCGOG00000013687) #37 ENSCGOG00000013677 gpr182 (ENSCGOG00000013673) ENSCGOG00000012697 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.a.b.b ##21 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.a.b.b ##21 Lumpfish MODERN SPECIES 22 ENSCLMG00005016975 pfkfb1 (ENSCLMG00005017017) ugt5e1 (ENSCLMG00005017018) ENSCLMG00005017024 #10 ccn5 (ENSCLMG00005017030) #12 ada (ENSCLMG00005017044) #13 pkig (ENSCLMG00005017544) #14 ttpal (ENSCLMG00005017546) #15 hnf4a (ENSCLMG00005017552) #16 fitm2 (ENSCLMG00005017624) #18 GDAP1L1 (ENSCLMG00005017626) #19 jph2 (ENSCLMG00005017627) #20 ENSCLMG00005017628 ENSCLMG00005017631 ##26 TUBA4B (ENSCLMG00005017632) ##21 ENSCLMG00005017705 ##21 tuba1c (ENSCLMG00005017706) #26 pmelb (ENSCLMG00005017707) #27 sarnp (ENSCLMG00005017708) #28 ccnt1 (ENSCLMG00005017710) #29 kansl2 (ENSCLMG00005017711) #30 ENSCLMG00005017713 #31 TMBIM6 (ENSCLMG00005017714) #32 ctdsp2 (ENSCLMG00005017716) #33 SLC11A2 (ENSCLMG00005017747) #34 MARCHF9 (ENSCLMG00005019571) #35 tspan31 (ENSCLMG00005019572) #36 agap2 (ENSCLMG00005019577) #37 ENSCLMG00005019755 gpr182 (ENSCLMG00005019756) ENSCLMG00005019758 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.a ##21 Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 cd63 (ENSSAUG00010011797) letmd1 (ENSSAUG00010011791) zgc:56699 (ENSSAUG00010011789) nr4a1 (ENSSAUG00010011787) tamalin (ENSSAUG00010011779) dgkaa (ENSSAUG00010009293) rnf41 (ENSSAUG00010009251) ankrd52a (ENSSAUG00010008730) ENSSAUG00010008712 tuba1a (ENSSAUG00010008710) ##26 pmelb (ENSSAUG00010008705) #27 sarnp (ENSSAUG00010008698) #28 ENSSAUG00010008697 ENSSAUG00010008695 #24 ENSSAUG00010008690 ##21 TUBA4B (ENSSAUG00010008679) ##21 jph2 (ENSSAUG00010008678) #20 GDAP1L1 (ENSSAUG00010008676) #19 fitm2 (ENSSAUG00010008674) #18 R3HDML (ENSSAUG00010008670) #17 hnf4a (ENSSAUG00010008665) #16 ttpal (ENSSAUG00010008662) #15 pkig (ENSSAUG00010008661) #14 ada (ENSSAUG00010008446) #13 ccn5 (ENSSAUG00010008438) #12 ENSSAUG00010008437 #10 ENSSAUG00010008435 #10 ENSSAUG00010008434 #10 ENSSAUG00010008432 #10 ENSSAUG00010008430 #10 ENSSAUG00010008429 #10 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.b ##21 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a.d.b ##21 Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 nemp1 (ENSSAUG00010011798) cd63 (ENSSAUG00010011797) letmd1 (ENSSAUG00010011791) zgc:56699 (ENSSAUG00010011789) nr4a1 (ENSSAUG00010011787) tamalin (ENSSAUG00010011779) dgkaa (ENSSAUG00010009293) rnf41 (ENSSAUG00010009251) ankrd52a (ENSSAUG00010008730) ENSSAUG00010008712 tuba1a (ENSSAUG00010008710) ##26 pmelb (ENSSAUG00010008705) #27 sarnp (ENSSAUG00010008698) #28 ENSSAUG00010008697 ENSSAUG00010008695 #24 ENSSAUG00010008690 ##21 TUBA4B (ENSSAUG00010008679) ##21 jph2 (ENSSAUG00010008678) #20 GDAP1L1 (ENSSAUG00010008676) #19 fitm2 (ENSSAUG00010008674) #18 R3HDML (ENSSAUG00010008670) #17 hnf4a (ENSSAUG00010008665) #16 ttpal (ENSSAUG00010008662) #15 pkig (ENSSAUG00010008661) #14 ada (ENSSAUG00010008446) #13 ccn5 (ENSSAUG00010008438) #12 ENSSAUG00010008437 #10 ENSSAUG00010008435 #10 ENSSAUG00010008434 #10 ENSSAUG00010008432 #10 ENSSAUG00010008430 #10 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 899 adamts3 (ENSCVAG00000002061) NPFFR2 (ENSCVAG00000002068) ENSCVAG00000002074 ENSCVAG00000002078 olfml2ba (ENSCVAG00000002082) atf6 (ENSCVAG00000002095) ENSCVAG00000002107 lmx1a (ENSCVAG00000002116) ENSCVAG00000002120 #22 ENSCVAG00000002128 sele (ENSCVAG00000002142) si:dkey-51e6.1 (ENSCVAG00000002147) si:dkey-97o5.1 (ENSCVAG00000002156) scyl3 (ENSCVAG00000000849) ENSCVAG00000002169 trabd2b (ENSCVAG00000002179) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1616 IGDCC4 (ENSNFUG00015004491) SCAMP5 (ENSNFUG00015004482) LOXL1 (ENSNFUG00015004478) ENSNFUG00015004474 C18H15ORF59 (ENSNFUG00015004469) cd276 (ENSNFUG00015004464) UBL7 (ENSNFUG00015004456) tent4b (ENSNFUG00015004422) HEATR3 (ENSNFUG00015004394) SDR42E1 (ENSNFUG00015004380) WTIP (ENSNFUG00015004367) GPI (ENSNFUG00015004311) KIAA0355 (ENSNFUG00015004264) ss18l2 (ENSNFUG00015004246) lsm14ab (ENSNFUG00015023333) ENSNFUG00015023298 #22 ENSNFUG00015023286 kctd15a (ENSNFUG00015023278) ENSNFUG00015023277 PEPD (ENSNFUG00015023263) ADAMTSL7 (ENSNFUG00015023225) ENSNFUG00015023203 larp6a (ENSNFUG00015023196) TM2D3 (ENSNFUG00015023191) TARSL2 (ENSNFUG00015023046) ulk3 (ENSNFUG00015023023) ENSNFUG00015023019 CPLX3 (ENSNFUG00015023016) CSK (ENSNFUG00015022989) ENSNFUG00015022980 EDC3 (ENSNFUG00015022976) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00810000125541 ENSGT00940000155289.C ENSGT00940000162649.e.b ENSGT00940000162649.f.b ENSGT00730000111029.b ENSGT00940000155698.C ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00390000014595.a.b ENSGT00940000165851 ENSGT00940000154318.B ENSGT00390000015505 ENSGT01010000222360.D.a ENSGT00940000153222.a.b.a ENSGT00940000160292 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.a ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 ENSGT00940000160271 ENSGT00940000176920 ENSGT00940000158693.A ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t Bicolor damselfish MODERN SPECIES 894 ENSSPAG00000007924 rnps1 (ENSSPAG00000009383) ENSSPAG00000009404 ENSSPAG00000009425 ENSSPAG00000009452 tspan4b (ENSSPAG00000009466) ENSSPAG00000009497 nosip (ENSSPAG00000009511) rcn3 (ENSSPAG00000009539) lin7b (ENSSPAG00000009551) snrnp70 (ENSSPAG00000009563) ENSSPAG00000009578 ENSSPAG00000009602 #22 ABCC1 (ENSSPAG00000009624) ENSSPAG00000009679 trpm4a (ENSSPAG00000009692) zgc:86896 (ENSSPAG00000009751) wipi1 (ENSSPAG00000009786) SLC16A6 (ENSSPAG00000009813) ENSSPAG00000009842 ENSSPAG00000009859 dhps (ENSSPAG00000009870) NHERF2 (ENSSPAG00000009924) sstr5 (ENSSPAG00000009935) ENSSPAG00000009943 ENSSPAG00000009958 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 105 ENSGT00810000125541 ENSGT00940000155289.C ENSGT00940000162649.e.b ENSGT00940000162649.f.b.c ENSGT00730000111029.b ENSGT00940000155698.C ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00390000014595.a.b ENSGT00940000165851 ENSGT00940000154318.B ENSGT00390000015505 ENSGT01010000222360.D.a ENSGT00940000153222.a.b.a ENSGT00940000160292 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.a ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 ENSGT00940000160271 ENSGT00940000176920 ENSGT00940000158693.A ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00810000125541 ENSGT00940000155289.C ENSGT00940000162649.e.b ENSGT00940000162649.f.b.c ENSGT00730000111029.b ENSGT00940000155698.C ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a ENSGT00390000014595.a.b ENSGT00940000165851 ENSGT00940000154318.B ENSGT00390000015505 ENSGT01010000222360.D.a ENSGT00940000153222.a.b.a ENSGT00940000160292 ENSGT00950000183205.b.a.b.a.a ENSGT00940000154457.a.a.a.a #22 ENSGT00940000160271 ENSGT00940000176920 ENSGT00940000158693.A ENSGT00950000183183.a ENSGT00940000156833.b ENSGT00940000155575.i.b ENSGT00940000157054.c.a ENSGT00940000156505.t Clown anemonefish MODERN SPECIES 2894 rcn3 (ENSAOCG00000000728) lin7b (ENSAOCG00000011692) snrnp70 (ENSAOCG00000011672) ENSAOCG00000011616 ENSAOCG00000002287 #22 ABCC1 (ENSAOCG00000011529) ENSAOCG00000011393