Neopterygii	ANCESTRAL SPECIES	175		ENSGT00940000156138	ENSGT00940000156792 #32	ENSGT00940000154964.y.a	ENSGT00940000160840	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503 #22	ENSGT00940000163979	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421 #25	ENSGT00940000153798.A.b #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153217
Osteoglossocephalai	DUPLICATION
Osteoglossocephalai	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155503.b #22
Clupeocephala	ANCESTRAL SPECIES	131	ENSGT00940000155203.a	ENSGT00940000155203.b	ENSGT00940000158192	ENSGT00940000160817	ENSGT00510000049583	ENSGT00390000011058.a	ENSGT00940000166327	ENSGT00950000182903.b.a.z	ENSGT00390000001509.b	ENSGT00390000012802	ENSGT00940000156138.c	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00940000154436.c	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.a	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.b	ENSGT00940000163190.h.a.a	ENSGT00940000166394
Euteleosteomorpha	ANCESTRAL SPECIES	170	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00940000156211.b	ENSGT00390000009842	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.b	ENSGT00940000163190.h.a.a	ENSGT00940000166394
Acanthomorphata	ANCESTRAL SPECIES	90	ENSGT00920000149138	ENSGT00940000157929	ENSGT00940000154508.a.a.s.b	ENSGT00390000015511	ENSGT00940000153232.a.b.b	ENSGT00940000159063	ENSGT00950000182856.a.a.b	ENSGT00940000177201	ENSGT01090000260076.b.a	ENSGT00940000163421.a.d.b	ENSGT00950000183196.D.b	ENSGT00940000159795	ENSGT00940000165542	ENSGT00940000154436.c	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000159942.b	ENSGT00940000160863	ENSGT00950000183189.a.b.b	ENSGT00950000182974.a.a.a.a	ENSGT00940000156803	ENSGT00390000003924	ENSGT00940000163031.b.b	ENSGT00440000033329.b.a.b	ENSGT00390000013770	ENSGT00440000033895	ENSGT00390000000436	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00940000153986.b.b	ENSGT00940000157743
Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	67							ENSGT00950000182856.a.a.b	ENSGT00940000177201	ENSGT01090000260076.b.a	ENSGT00940000163421.a.d.b	ENSGT00950000183196.D.b	ENSGT00940000159795	ENSGT00940000165542	ENSGT00940000154436.c	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000159942.b	ENSGT00940000160863	ENSGT00950000183189.a.b.b	ENSGT00950000182974.a.a.a.a	ENSGT00940000156803	ENSGT00390000003924	ENSGT00940000163031.b.b	ENSGT00440000033329.b.a.b	ENSGT00390000013770	ENSGT00440000033895	ENSGT00390000000436	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00940000153986.b.b	ENSGT00940000157743
Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	94	ENSGT00940000162660.a	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00940000154436.c	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000162660.a	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000162660.a	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000179033 #8	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	55	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000179033 #8	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37
Barramundi perch	MODERN SPECIES	180	kcnab2b (ENSLCAG00010008146) #7	efhd2 (ENSLCAG00010008139) #9	ENSLCAG00010008137 #8	PAX7 (ENSLCAG00010007938) #10	mfn2 (ENSLCAG00010007812) #11	ENSLCAG00010007771 #12	ENSLCAG00010007754 #13	MYT1 (ENSLCAG00010007719) #14	porcnl (ENSLCAG00010007693) #15	ENSLCAG00010007681 #16	suv39h1b (ENSLCAG00010007678) #17	gpr173 (ENSLCAG00010007674) #18	ENSLCAG00010007664 #19	trappc6b (ENSLCAG00010007652) #20	ENSLCAG00010007645 #21	ENSLCAG00010007512 #22	LRRC38 (ENSLCAG00010007460) #23	igsf21b (ENSLCAG00010007424) #25	ARHGEF10L (ENSLCAG00010007377) #26	nppa (ENSLCAG00010007357) #27	nppb (ENSLCAG00010007355) #28	nppal (ENSLCAG00010007351) #29	CLCN6 (ENSLCAG00010007030) #30	mthfr (ENSLCAG00010006938) #31	slc2a1a (ENSLCAG00010006920) #32	slc38a5b (ENSLCAG00010006900) #33	dennd2da (ENSLCAG00010006878)	stk38a (ENSLCAG00010006866)	MTCH1 (ENSLCAG00010006858)	stk35 (ENSLCAG00010006854)
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00960000186992	ENSGT00940000159439.a	ENSGT00530000064137.a.a	ENSGT00950000183092.a.d.b	ENSGT00950000182883.b.a.b.b	ENSGT00390000002762.a.a.b.b	ENSGT00940000161040.b	ENSGT00720000108866	ENSGT00490000043380.b	ENSGT01100000263545.a.b.c.b	ENSGT00950000182810.A.a.a.b	ENSGT00940000167348	ENSGT00940000164142	ENSGT00940000156300.j	ENSGT00940000155769.`b.a	ENSGT00940000155503.b #22
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	3155	stac3 (ENSSLDG00000023417)	ENSSLDG00000023402	KLHL10 (ENSSLDG00000023396)	NXPH4 (ENSSLDG00000023389)	SHMT2 (ENSSLDG00000023367)	NDUFA4L2 (ENSSLDG00000023358)	actr5 (ENSSLDG00000023340)	SLC32A1 (ENSSLDG00000023335)	ENSSLDG00000023323	PRELID3B (ENSSLDG00000023315)	atp5f1e (ENSSLDG00000023311)	ENSSLDG00000023291	ENSSLDG00000023283	GNAS (ENSSLDG00000023252)	VAPB (ENSSLDG00000023239)	EPHB2 (ENSSLDG00000023221) #22	ENSSLDG00000023207 #21	ENSSLDG00000023196	CHDH (ENSSLDG00000023175)	ENSSLDG00000023163	CACNA1D (ENSSLDG00000023106)	dcp1a (ENSSLDG00000023089)	TKT (ENSSLDG00000023062)	ENSSLDG00000023058	nsun5 (ENSSLDG00000023045)	ENSSLDG00000023009	sgk2a (ENSSLDG00000022988)	L3MBTL1 (ENSSLDG00000022918)	srsf6a (ENSSLDG00000022841)	eif2s2 (ENSSLDG00000022805)	chmp4bb (ENSSLDG00000022782)
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	41	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000179033 #8	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000169392	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34
Tongue sole	MODERN SPECIES	1	gpr173 (ENSCSEG00000004594) #18	suv39h1b (ENSCSEG00000004595) #17	ENSCSEG00000004598	ENSCSEG00000004602 #16	porcnl (ENSCSEG00000004604) #15	MYT1 (ENSCSEG00000004621) #14	ENSCSEG00000004640 #13	ENSCSEG00000004641 #12	mfn2 (ENSCSEG00000004648) #11	PAX7 (ENSCSEG00000004672) #10	efhd2 (ENSCSEG00000004680) #9	ENSCSEG00000004682 #8	ENSCSEG00000004694	trappc6b (ENSCSEG00000004686) #20	ENSCSEG00000004696 #21	EPHB2 (ENSCSEG00000004708) #22	ENSCSEG00000004729	ENSCSEG00000004732 #23	VPS13D (ENSCSEG00000004736) #24	igsf21b (ENSCSEG00000004772) #25	ARHGEF10L (ENSCSEG00000004776) #26	ENSCSEG00000004793	nppb (ENSCSEG00000004800) #28	nppal (ENSCSEG00000004805) #29	CLCN6 (ENSCSEG00000004816) #30	mthfr (ENSCSEG00000004829) #31	LHFPL4 (ENSCSEG00000004833)	tnnc1b (ENSCSEG00000004835)	ccdc22 (ENSCSEG00000004843) #34	slc38a5b (ENSCSEG00000004849) #33	slc2a1a (ENSCSEG00000004852) #32
Turbot	MODERN SPECIES	2	ENSSMAG00000003108 #8	ENSSMAG00000026671 #9	ENSSMAG00000003148 #10	ENSSMAG00000003167 #11	ENSSMAG00000027972	ENSSMAG00000003207 #12	ENSSMAG00000022278 #13	ENSSMAG00000003257 #14	ENSSMAG00000003314 #15	ENSSMAG00000003347 #16	suv39h1a (ENSSMAG00000003370) #17	gpr173 (ENSSMAG00000003408) #18	ENSSMAG00000003417 #19	ENSSMAG00000003514	ENSSMAG00000003520 #21	ENSSMAG00000003543 #22	ENSSMAG00000003559 #24	ENSSMAG00000003660 #27	ENSSMAG00000003694 #28	ENSSMAG00000003730 #29	ENSSMAG00000003745 #30	ENSSMAG00000003808 #31	ENSSMAG00000003837 #32	ENSSMAG00000003864 #34	ENSSMAG00000003888	ENSSMAG00000035182	ENSSMAG00000030907	ENSSMAG00000024493	ENSSMAG00000030893	ENSSMAG00000034578	SNPH (ENSSMAG00000022090)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00940000178343	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000178343	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000157506.f	ENSGT00950000182835.c.c.g.a	ENSGT00940000164454	ENSGT00940000167069	ENSGT00390000018621	ENSGT00940000156650.j	ENSGT00940000156358	ENSGT00490000043329.a.a.a.vb.a	ENSGT00940000166923	ENSGT00980000202258	ENSGT00940000156928	ENSGT00390000012419	ENSGT00940000157729	ENSGT00940000164033	ENSGT00940000161218
Climbing perch	MODERN SPECIES	20	ENSATEG00000026364	ENSATEG00000024827	ENSATEG00000024829	ENSATEG00000026196 #9	ENSATEG00000024837 #10	ENSATEG00000024839 #11	ENSATEG00000024844 #12	ENSATEG00000000035 #13	ENSATEG00000000118 #14	ENSATEG00000000320 #15	suv39h1a (ENSATEG00000000404) #17	ENSATEG00000000417 #18	ENSATEG00000000422 #19	ENSATEG00000000429	ENSATEG00000025979 #20	ENSATEG00000000441 #22	ENSATEG00000000530	ENSATEG00000001232	ENSATEG00000029306	ENSATEG00000001296	ENSATEG00000001465
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Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156504.j	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000000950.c.a	ENSGT00940000157025	ENSGT00940000167901	ENSGT00940000177826	ENSGT00940000155445	ENSGT00940000165254.d	ENSGT00940000155170	ENSGT00530000063168.a.a.b	ENSGT01050000244882.b.c.b.b	ENSGT00940000159233	ENSGT00940000163908	ENSGT00650000094883	ENSGT00940000157665.a
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Tetraodon	MODERN SPECIES	24		kcnab2b (ENSTNIG00000002486) #7	dedd (ENSTNIG00000002487)	tnnc1b (ENSTNIG00000002488)	efhd2 (ENSTNIG00000002489) #9	mfn2 (ENSTNIG00000004357) #11	ENSTNIG00000004356 #12	asxl1 (ENSTNIG00000004355) #13	MYT1 (ENSTNIG00000004354) #14	PORCN (ENSTNIG00000004840) #15	ENSTNIG00000000497 #16	suv39h1b (ENSTNIG00000004839) #17	ENSTNIG00000004837 #19	trappc6b (ENSTNIG00000004836) #20	ENSTNIG00000004835 #21	EPHB2 (ENSTNIG00000006519) #22	LRRC38 (ENSTNIG00000006518) #23	VPS13D (ENSTNIG00000006517) #24	sephs3 (ENSTNIG00000006516)	ap4b1 (ENSTNIG00000006515)	zgc:101663 (ENSTNIG00000006514)	ccnq (ENSTNIG00000006513)	ENSTNIG00000006512	hsd17b10 (ENSTNIG00000012405)	FAM120C (ENSTNIG00000012406)	AVPR2 (ENSTNIG00000012407)	edem2 (ENSTNIG00000012408)	SYT6 (ENSTNIG00000012409)	olfml3a (ENSTNIG00000012410)	c1qtnf12 (ENSTNIG00000012411)	HIPK1 (ENSTNIG00000012412)
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Ballan wrasse	MODERN SPECIES	31	dedd (ENSLBEG00000012209)	kcnab2b (ENSLBEG00000012255) #7	ENSLBEG00000012297 #10	mfn2 (ENSLBEG00000012337) #11	ENSLBEG00000012385 #12	ENSLBEG00000012396 #13	ENSLBEG00000012443	PORCN (ENSLBEG00000012514) #15	ENSLBEG00000012557 #16	suv39h1b (ENSLBEG00000012573) #17	gpr173 (ENSLBEG00000012593) #18	ENSLBEG00000012603 #19	trappc6b (ENSLBEG00000012645) #20	ENSLBEG00000012665 #21	ENSLBEG00000012679	ENSLBEG00000013099 #22	LRRC38 (ENSLBEG00000014360) #23	VPS13D (ENSLBEG00000014414) #24	igsf21b (ENSLBEG00000014564) #25	ARHGEF10L (ENSLBEG00000014599) #26	ENSLBEG00000014653	nppb (ENSLBEG00000014682) #28	nppal (ENSLBEG00000014701) #29	CLCN6 (ENSLBEG00000014749) #30	mthfr (ENSLBEG00000014875) #31	slc2a1a (ENSLBEG00000014921) #32	slc38a5b (ENSLBEG00000014954) #33	ccdc22 (ENSLBEG00000015028) #34	tbc1d25 (ENSLBEG00000015071) #35	ndufb11 (ENSLBEG00000015115) #36	rtel1 (ENSLBEG00000015158) #37
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000011228.b.a.f	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00960000186977	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37
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Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00960000186977	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000169392	ENSGT00940000171201	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37	ENSGT00390000017394
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Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00390000011228.b.a.f	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00960000186977	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000169392	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34
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Large yellow croaker	MODERN SPECIES	487	ENSLCRG00005021689 #10	mfn2 (ENSLCRG00005021864) #11	ENSLCRG00005021909 #12	asxl1 (ENSLCRG00005021910) #13	ENSLCRG00005021918 #13	ENSLCRG00005021920 #13	MYT1 (ENSLCRG00005021923) #14	porcnl (ENSLCRG00005021971) #15	ENSLCRG00005022004 #16	suv39h1b (ENSLCRG00005022024) #17	gpr173 (ENSLCRG00005022028) #18	ENSLCRG00005022051 #19	trappc6b (ENSLCRG00005022080) #20	ENSLCRG00005022098	ENSLCRG00005022103 #21	ENSLCRG00005022141 #22	ENSLCRG00005022185	SPDEF (ENSLCRG00005022189)	pacsin1a (ENSLCRG00005022218)	SMIM29 (ENSLCRG00005003415)	ENSLCRG00005003421	GRM4 (ENSLCRG00005003603)	ENSLCRG00005004592	ENSLCRG00005004608	ENSLCRG00005004624	SYT2 (ENSLCRG00005004649)	oard1 (ENSLCRG00005004663)	guca1b (ENSLCRG00005004667)	ppp4r2a (ENSLCRG00005004700)	eif4e3 (ENSLCRG00005004729)	ENSLCRG00005004742
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	21	tmed4 (ENSSAUG00010002684)	plpbp (ENSSAUG00010002695)	snrpg (ENSSAUG00010002701)	ENSSAUG00010002706	TBC1D22B (ENSSAUG00010002754)	MYT1 (ENSSAUG00010004691) ##14	PCMTD2 (ENSSAUG00010004712)	kif3b (ENSSAUG00010004715)	pofut1 (ENSSAUG00010004719)	plagl2 (ENSSAUG00010004721) ##12	tm9sf4 (ENSSAUG00010004728)	HCK (ENSSAUG00010004842)	ENSSAUG00010009382	gata5 (ENSSAUG00010009386)	ENSSAUG00010009389	EPHB2 (ENSSAUG00010009411) #22	LRRC38 (ENSSAUG00010010625) #23	rcc2 (ENSSAUG00010010629)	rpl22 (ENSSAUG00010010635)	icmt (ENSSAUG00010010644)	rtel1 (ENSSAUG00010010664) #37	NDUFA11 (ENSSAUG00010012559) #36	tbc1d25 (ENSSAUG00010012561) #35	ccdc22 (ENSSAUG00010012571) #34	stk38a (ENSSAUG00010012621)	dennd2da (ENSSAUG00010012643)	ENSSAUG00010012655	ENSSAUG00010012657	ENSSAUG00010012658	igsf21b (ENSSAUG00010012661) #25	VPS13D (ENSSAUG00010012745) #24
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00390000012490 #31	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000166636 #33	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37
Oryzias	DUPLICATION
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Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	106				ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839.c.a	ENSGT00940000167069	ENSGT00940000164454	ENSGT00950000182835.c.c.g.a	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b.c #22
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Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	82			ENSGT00940000156537	ENSGT00390000013839.c.a	ENSGT00940000167069	ENSGT00940000164454	ENSGT00950000182835.c.c.g.a	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b.c #22	ENSGT00940000155503.b.d #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24
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Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	149															ENSGT00940000163892.C.b	ENSGT00940000155503.b.d #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24
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NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	309													ENSGT00940000162818.c.a.g.a.b.a	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000169392	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000157506.f
Mummichog	MODERN SPECIES	720											ENSFHEG00000007918	ENSFHEG00000007921	ENSFHEG00000007932	dedd (ENSFHEG00000007958)	tnnc1b (ENSFHEG00000007967)	ENSFHEG00000008015 #22	VPS13D (ENSFHEG00000008413) #24	igsf21b (ENSFHEG00000008470) #25
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	421	ptpn1 (ENSCVAG00000020932)	cebpb (ENSCVAG00000020954)	peds1 (ENSCVAG00000020995)	ube2v1 (ENSCVAG00000021011)	slc52a3 (ENSCVAG00000021024)	scrt2 (ENSCVAG00000021038)	SRXN1 (ENSCVAG00000021043)	tcf15 (ENSCVAG00000021048)	ENSCVAG00000021057	slc13a3 (ENSCVAG00000021097)	ocstamp (ENSCVAG00000021113)	ENSCVAG00000021130	ENSCVAG00000021139	dedd (ENSCVAG00000021170)	tnnc1b (ENSCVAG00000021177)	EPHB2 (ENSCVAG00000022311) #22	VPS13D (ENSCVAG00000022433) #24	igsf21b (ENSCVAG00000022516) #25	ENSCVAG00000022522	nppb (ENSCVAG00000022563) #28	nppal (ENSCVAG00000022568) #29	ENSCVAG00000022591
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	62	ENSGT00550000075050	ENSGT00940000160485.m	ENSGT00390000005780.a	ENSGT00940000159667.a	ENSGT01030000235519	ENSGT01100000263473.a.b.g.a.a.a.a.a	ENSGT01100000263473.a.b.h.b.c	ENSGT00940000159291 #30	ENSGT00940000154285.a.a.c.b.b.a.a	ENSGT00990000203979.d	ENSGT00940000154285.a.a.c.a.a.a	ENSGT00940000164599.j.a.a.b	ENSGT00940000162818.c.a.g.a.b.a	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000169392	ENSGT00940000154513.B #27	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000157506.f	ENSGT00950000182835.c.c.g.a	ENSGT00940000164454	ENSGT00390000018621	ENSGT00940000156650.j	ENSGT00990000203979.c	ENSGT00940000156358	ENSGT00490000043329.a.a.a.vb.a
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	271									ENSGT00990000203979.d	ENSGT00940000154285.a.a.c.a.a.a	ENSGT00940000162818.c.a.g.a.b.a.a	ENSGT00940000164599.j.a.a.b	ENSGT00940000162818.c.a.g.a.b.a.b	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000169392	ENSGT00940000154513.A #28	ENSGT00530000065390 #29	ENSGT00940000157506.f	ENSGT00950000182835.c.c.g.a	ENSGT00940000164454	ENSGT00390000018621	ENSGT00940000156650.j	ENSGT00940000154285.a.a.c.a.a.b
Amazon molly	MODERN SPECIES	601	ENSPFOG00000005212	ENSPFOG00000005177	ENSPFOG00000022745	CLCN6 (ENSPFOG00000004696) #30	ENSPFOG00000004592	ENSPFOG00000004586	ENSPFOG00000023843	ENSPFOG00000022220	ENSPFOG00000004553	ENSPFOG00000004460	ENSPFOG00000004439	ENSPFOG00000004350	dedd (ENSPFOG00000004296)	tnnc1b (ENSPFOG00000004237)	tnnc1b (ENSPFOG00000004162)	EPHB2 (ENSPFOG00000003909) #22	VPS13D (ENSPFOG00000002265) #24	igsf21b (ENSPFOG00000001972) #25	ENSPFOG00000022863	nppb (ENSPFOG00000001895) #28	nppal (ENSPFOG00000001874) #29	ENSPFOG00000001563	ENSPFOG00000001292	PFKFB1 (ENSPFOG00000000964)	ndnl2 (ENSPFOG00000000753)	tafazzin (ENSPFOG00000000651)	atp6ap1a (ENSPFOG00000000549)	ENSPFOG00000023107
Guppy	MODERN SPECIES	459	ENSPREG00000003311	ENSPREG00000003299	ENSPREG00000003287	ENSPREG00000003237	ENSPREG00000003184	ENSPREG00000003170	CLCN6 (ENSPREG00000003103) #30	ENSPREG00000003020	ENSPREG00000002990	ENSPREG00000002927	ENSPREG00000002666	ENSPREG00000002564	ENSPREG00000002497	dedd (ENSPREG00000002472)	tnnc1b (ENSPREG00000002450)	EPHB2 (ENSPREG00000002411) #22	VPS13D (ENSPREG00000002268) #24	igsf21b (ENSPREG00000002209) #25	nppa (ENSPREG00000002191) #27	nppb (ENSPREG00000002166) #28	nppal (ENSPREG00000002157) #29	ENSPREG00000002129	ENSPREG00000002063	ndnl2 (ENSPREG00000002045)	tafazzin (ENSPREG00000002014)	atp6ap1a (ENSPREG00000002003)	ENSPREG00000001970	acss2 (ENSPREG00000001940)	ENSPREG00000001925	mapre1b (ENSPREG00000001892)	slc25a55b (ENSPREG00000001854)
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155503.b #22
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157929	ENSGT00920000149138	ENSGT00390000016876	ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.b	ENSGT00940000155374.g.b	ENSGT00940000163551.i.a	ENSGT00950000182856.a.a.b	ENSGT00940000177201	ENSGT01090000260076.b.a	ENSGT00940000163421.a.d.b	ENSGT00950000183196.D.b.t	ENSGT00950000183196.D.b.s.b	ENSGT00950000183196.D.b.s.a	ENSGT00940000159795	ENSGT00940000160487	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000165542.d	ENSGT00940000159942.b	ENSGT00940000160863	ENSGT00950000183189.a.b.b	ENSGT00950000182974.a.a.a.a	ENSGT00940000156803	ENSGT00390000003924	ENSGT00940000163031.b.b	ENSGT00440000033329.b.a.b	ENSGT00390000013770	ENSGT00440000033895	ENSGT00390000000436	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00940000153986.b.b
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154508.a.a.s.b	ENSGT00940000157929	ENSGT00920000149138	ENSGT00390000016876	ENSGT00950000183097.a.a.a.f.a.b	ENSGT00940000155374.g.b	ENSGT00940000163551.i.a	ENSGT00950000182856.a.a.b	ENSGT00940000177201	ENSGT01090000260076.b.a	ENSGT00940000163421.a.d.b	ENSGT00950000183196.D.b.s.a	ENSGT00940000159795	ENSGT00940000160487	ENSGT00940000159942.b.j.a	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000165542.d	ENSGT00940000159942.b.j.b	ENSGT00940000160863	ENSGT00950000183189.a.b.b	ENSGT00950000182974.a.a.a.a	ENSGT00940000156803	ENSGT00390000003924	ENSGT00940000163031.b.b	ENSGT00440000033329.b.a.b	ENSGT00390000013770	ENSGT00440000033895	ENSGT00390000000436	ENSGT00950000183059.a	ENSGT00940000153986.b.b
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	5			ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000153314.b.a.a	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000165284	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00390000007643
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000165254.d	ENSGT00390000016589	ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000178101	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000153314.b.a.a	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000165284
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000155445	ENSGT01010000222540	ENSGT00940000165254.d	ENSGT00390000016589	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000178101	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000153314.b.a.a	ENSGT00940000156151
P. nyererei	MODERN SPECIES	646					mfn2 (ENSPNYG00000024126) #11	ENSPNYG00000024125 #12	asxl1 (ENSPNYG00000024124) #13	MYT1 (ENSPNYG00000024123) #14	PORCN (ENSPNYG00000024122) #15	suv39h1b (ENSPNYG00000024121) #17	gpr173 (ENSPNYG00000024120) #18	ENSPNYG00000024119 #19	trappc6b (ENSPNYG00000024118) #20	ENSPNYG00000024117 #21	ENSPNYG00000024116	EPHB2 (ENSPNYG00000024114) #22
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES	66						ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000178101	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00390000003809 #34	ENSGT00390000008714.a	ENSGT00390000012058.c.b #9	ENSGT00940000159173 #35	ENSGT00390000003022 #36	ENSGT00950000182970.A.b #37	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000153541.B	ENSGT00940000153314.b.a.a	ENSGT00940000156151
Eastern happy	MODERN SPECIES	12	KCNAB2 (ENSACLG00000004822) #7	ENSACLG00000004579	ENSACLG00000004569	PAX7 (ENSACLG00000004538) #10	ENSACLG00000004525	mfn2 (ENSACLG00000004451) #11	ENSACLG00000004370 #12	asxl1 (ENSACLG00000004333) #13	MYT1 (ENSACLG00000004223) #14	porcnl (ENSACLG00000004168) #15	suv39h1b (ENSACLG00000004163) #17	gpr173 (ENSACLG00000004155) #18	ENSACLG00000004094 #19	trappc6b (ENSACLG00000004077) #20	ENSACLG00000004063 #21	EPHB2 (ENSACLG00000003642) #22	ENSACLG00000003600 #23	ENSACLG00000003594	ENSACLG00000003586	VPS13D (ENSACLG00000003425) #24	igsf21b (ENSACLG00000003378) #25	ARHGEF10L (ENSACLG00000003322) #26	ccdc22 (ENSACLG00000003274) #34	dedd (ENSACLG00000003238)	efhd2 (ENSACLG00000003218) #9	tbc1d25 (ENSACLG00000003195) #35	ndufb11 (ENSACLG00000003176) #36	rtel1 (ENSACLG00000003097) #37	icmt (ENSACLG00000003080)	tnnc1b (ENSACLG00000003043)	rpl22 (ENSACLG00000002652)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	6				ENSMZEG00005018606	ENSMZEG00005018596	mfn2 (ENSMZEG00005018589) #11	ENSMZEG00005018586 #12	asxl1 (ENSMZEG00005018578) #13	ENSMZEG00005018555 #14	PORCN (ENSMZEG00005018538) #15	suv39h1b (ENSMZEG00005018531) #17	gpr173 (ENSMZEG00005018529) #18	ENSMZEG00005018522 #19	trappc6b (ENSMZEG00005018514) #20	ENSMZEG00005018512 #21	EPHB2 (ENSMZEG00005007692) #22	ENSMZEG00005007576 #23	ENSMZEG00005007571	VPS13D (ENSMZEG00005007452) #24	igsf21b (ENSMZEG00005007401) #25	ARHGEF10L (ENSMZEG00005007354) #26	ccdc22 (ENSMZEG00005007309) #34	dedd (ENSMZEG00005007283)	efhd2 (ENSMZEG00005007249) #9	tbc1d25 (ENSMZEG00005007225) #35	ndufb11 (ENSMZEG00005007216) #36	rtel1 (ENSMZEG00005007169) #37	icmt (ENSMZEG00005007136)	tnnc1b (ENSMZEG00005007111)	rpl22 (ENSMZEG00005007093)	rcc2 (ENSMZEG00005007062)
Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	471		ENSNBRG00000021425 #7	ENSNBRG00000021471 #10	mfn2 (ENSNBRG00000021503) #11	ENSNBRG00000021555 #12	ENSNBRG00000021565 #13	asxl1 (ENSNBRG00000021579) #13	MYT1 (ENSNBRG00000021588) #14	PORCN (ENSNBRG00000021619) #15	ENSNBRG00000021662 #16	suv39h1b (ENSNBRG00000021674) #17	gpr173 (ENSNBRG00000021741) #18	ENSNBRG00000021792 #19	TRAPPC6B (ENSNBRG00000021823) #20	ENSNBRG00000021840 #21	ENSNBRG00000022081 #22	ENSNBRG00000022677	VPS13D (ENSNBRG00000022695) #24	igsf21b (ENSNBRG00000022759) #25	ARHGEF10L (ENSNBRG00000022771) #26
Nile tilapia	MODERN SPECIES	12				PAX7 (ENSONIG00000001596) #10	asxl1 (ENSONIG00000033920) #13	MYT1 (ENSONIG00000011639) #14	PORCN (ENSONIG00000011643) #15	ENSONIG00000011647 #16	suv39h1b (ENSONIG00000011649) #17	gpr173 (ENSONIG00000020531) #18	ENSONIG00000034186	foxp3 (ENSONIG00000016969) #19	ENSONIG00000035601	trappc6b (ENSONIG00000016967) #20	ENSONIG00000016964 #21	ENSONIG00000016953 #22	ENSONIG00000028065	ENSONIG00000040954	ENSONIG00000028096	ENSONIG00000035144	KCNAB2 (ENSONIG00000034514) #7	tbc1d25 (ENSONIG00000018001) #35	ndufb11 (ENSONIG00000034686) #36	rtel1 (ENSONIG00000017994) #37	icmt (ENSONIG00000017993)	efhd2 (ENSONIG00000017990) #9	rpl22 (ENSONIG00000033200)	rcc2 (ENSONIG00000017984)	ENSONIG00000036768	ENSONIG00000031185	ENSONIG00000036580
Midas cichlid	DUPLICATION
Midas cichlid	MODERN SPECIES	211				ENSACIG00000013853 #10	mfn2 (ENSACIG00000013827) #11	ENSACIG00000013817 #12	ENSACIG00000013802 #13	MYT1 (ENSACIG00000013712) #14	porcnl (ENSACIG00000013683) #15	ENSACIG00000013671 #16	suv39h1b (ENSACIG00000013660) #17	gpr173 (ENSACIG00000013648) #18	ENSACIG00000013631 #19	trappc6b (ENSACIG00000013621) #20	ENSACIG00000013595 #21	ENSACIG00000013583 #22	tfam (ENSACIG00000013568)	ENSACIG00000013529 #22	ENSACIG00000013522 #23	VPS13D (ENSACIG00000013412) #24	igsf21b (ENSACIG00000013377) #25
Midas cichlid	MODERN SPECIES	211		ENSACIG00000013853 #10	mfn2 (ENSACIG00000013827) #11	ENSACIG00000013817 #12	ENSACIG00000013802 #13	MYT1 (ENSACIG00000013712) #14	porcnl (ENSACIG00000013683) #15	ENSACIG00000013671 #16	suv39h1b (ENSACIG00000013660) #17	gpr173 (ENSACIG00000013648) #18	ENSACIG00000013631 #19	trappc6b (ENSACIG00000013621) #20	ENSACIG00000013595 #21	ENSACIG00000013583 #22	tfam (ENSACIG00000013568)	ENSACIG00000013529 #22	ENSACIG00000013522 #23	VPS13D (ENSACIG00000013412) #24	igsf21b (ENSACIG00000013377) #25
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	55			ENSGT00940000157867.a.b #7	ENSGT00940000156759.a.a #10	ENSGT00390000013727.c #11	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000153544.a.i.b	ENSGT00510000048446	ENSGT00940000158374.c	ENSGT00940000163942.b	ENSGT00940000160546	ENSGT00610000087015	ENSGT00940000153497.A	ENSGT00940000155851.c.a	ENSGT00940000159698	ENSGT00940000154285.a.a.c.b.b.a.b	ENSGT00530000063489.b	ENSGT00390000013405	ENSGT00940000165603	ENSGT00390000016496
Bicolor damselfish	DUPLICATION
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	799									ENSSPAG00000006890 #16	PORCN (ENSSPAG00000006944) #15	suv39h1b (ENSSPAG00000007512) #17	gpr173 (ENSSPAG00000007534) #18	ENSSPAG00000007568 #19	trappc6b (ENSSPAG00000007598) #20	ENSSPAG00000007621 #21	ENSSPAG00000007645 #22	EPHB2 (ENSSPAG00000007821) #22	LRRC38 (ENSSPAG00000007977) #23	stk38a (ENSSPAG00000007994)	pex10 (ENSSPAG00000008046)	plch2a (ENSSPAG00000008063)	si:ch211-251b21.1 (ENSSPAG00000008123)
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	799								ENSSPAG00000006890 #16	PORCN (ENSSPAG00000006944) #15	suv39h1b (ENSSPAG00000007512) #17	gpr173 (ENSSPAG00000007534) #18	ENSSPAG00000007568 #19	trappc6b (ENSSPAG00000007598) #20	ENSSPAG00000007621 #21	ENSSPAG00000007645 #22	EPHB2 (ENSSPAG00000007821) #22	LRRC38 (ENSSPAG00000007977) #23	stk38a (ENSSPAG00000007994)	pex10 (ENSSPAG00000008046)	plch2a (ENSSPAG00000008063)	si:ch211-251b21.1 (ENSSPAG00000008123)
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	35												ENSGT00940000177655	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000153544.a.i.b	ENSGT00510000048446	ENSGT00940000179945	ENSGT00940000158374.c	ENSGT00940000163942.b	ENSGT00940000160546	ENSGT00610000087015	ENSGT00940000153497.A	ENSGT00940000155851.c.a	ENSGT00940000159698	ENSGT00940000154285.a.a.c.b.b.a.b	ENSGT00530000063489.b	ENSGT00390000013405	ENSGT00940000165603
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	46											ENSGT00420000029923	ENSGT00940000160077	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00940000153544.a.i.b	ENSGT00510000048446	ENSGT00940000179945	ENSGT00940000158374.c	ENSGT00940000163942.b	ENSGT00940000160546	ENSGT00940000153497.A	ENSGT00940000155851.c.a	ENSGT00940000159698	ENSGT00940000154285.a.a.c.b.b.a.b	ENSGT00530000063489.b	ENSGT00390000013405	ENSGT00940000165603	ENSGT00390000016496
Orange clownfish	MODERN SPECIES	22	ENSAPEG00000014087	igsf21b (ENSAPEG00000014056) #25	ARHGEF10L (ENSAPEG00000013955) #26	nppa (ENSAPEG00000013939) #27	nppb (ENSAPEG00000013903) #28	nppal (ENSAPEG00000013883) #29	CLCN6 (ENSAPEG00000013728) #30	mthfr (ENSAPEG00000013663) #31	ENSAPEG00000013651	wdr6 (ENSAPEG00000013631)	CELSR3 (ENSAPEG00000013510)	ENSAPEG00000013423	ENSAPEG00000013399 #19	trappc6b (ENSAPEG00000013371) #20	ENSAPEG00000013363 #21	EPHB2 (ENSAPEG00000011903) #22	LRRC38 (ENSAPEG00000011714) #23	stk38a (ENSAPEG00000011654)	pex10 (ENSAPEG00000011636)	ENSAPEG00000011607	plch2a (ENSAPEG00000011519)	si:ch211-251b21.1 (ENSAPEG00000011474)	ENSAPEG00000011452	ENSAPEG00000011427	ENSAPEG00000011385	skia (ENSAPEG00000011354)	prkcz (ENSAPEG00000011266)	DNAJC16 (ENSAPEG00000011037)	casp9 (ENSAPEG00000010977)	ENSAPEG00000010918	lrrc47 (ENSAPEG00000010882)
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	1545												ENSAOCG00000004056	ENSAOCG00000004070 #19	trappc6b (ENSAOCG00000004084) #20	ENSAOCG00000004110 #21	EPHB2 (ENSAOCG00000004136) #22	LRRC38 (ENSAOCG00000004144) #23	stk38a (ENSAOCG00000004161)	pex10 (ENSAOCG00000004173)	ENSAOCG00000004176
Spiny chromis	MODERN SPECIES	1989															ENSAPOG00000016770 #21	EPHB2 (ENSAPOG00000016800) #22	LRRC38 (ENSAPOG00000016820) #23
Cod	MODERN SPECIES		ENSGMOG00000009096 #13	ENSGMOG00000031150	ENSGMOG00000002721	ENSGMOG00000009083 #14	ENSGMOG00000009071 #15	ENSGMOG00000009042 #16	suv39h1a (ENSGMOG00000009035) #17	gpr173 (ENSGMOG00000019870) #18	ENSGMOG00000033391	sema3gb (ENSGMOG00000001255)	ENSGMOG00000035943 #20	slc2a1a (ENSGMOG00000001236) #32	phc2a (ENSGMOG00000033691)	ENSGMOG00000033431	ENSGMOG00000009028 #21	ENSGMOG00000003073 #22	ENSGMOG00000002083	ENSGMOG00000008937 #24	ENSGMOG00000036323	igsf21b (ENSGMOG00000036542) #25	ENSGMOG00000013595	ENSGMOG00000027531	ENSGMOG00000013560	ENSGMOG00000029822	ENSGMOG00000004015	ENSGMOG00000022956	ENSGMOG00000026226	ENSGMOG00000003980	ENSGMOG00000003962	ENSGMOG00000036372	ENSGMOG00000027462
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	87	ENSGT00940000165955 #19	ENSGT00890000139436.A.b.a #18	ENSGT00940000160063.h #17	ENSGT00940000166825 #16	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e #15	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00940000164771.b #12	ENSGT00940000156211.b	ENSGT00390000009842	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.a	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000163346.b	ENSGT00940000163190.h.a.a	ENSGT00940000166394	ENSGT00510000046803.a	ENSGT00940000164033
Salmoninae	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	419				MYT1 (ENSHHUG00000024961) #14	pcmtd2a (ENSHHUG00000025060)	asxl1 (ENSHHUG00000025070) #13	ENSHHUG00000025107 #12	tpx2 (ENSHHUG00000025109)	trappc6b (ENSHHUG00000025139) #20	slc2a1a (ENSHHUG00000025288) #32	ENSHHUG00000025479	ENSHHUG00000025487	phc2a (ENSHHUG00000025492)	ENSHHUG00000025495	ENSHHUG00000025505 #21	ENSHHUG00000025511 #22	LRRC38 (ENSHHUG00000025752) #23	ENSHHUG00000025756	ENSHHUG00000025768	ENSHHUG00000025773	ENSHHUG00000025779	dhrs3a (ENSHHUG00000025784)	igsf21b (ENSHHUG00000025792) #25	ENSHHUG00000025799 #26	rcc2 (ENSHHUG00000025807)	rcc2 (ENSHHUG00000025823)	rpl22 (ENSHHUG00000025835)	rnf207b (ENSHHUG00000025917)	icmt (ENSHHUG00000025930)	ENSHHUG00000025938	her12 (ENSHHUG00000025941)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000165955.c.b #19	ENSGT00890000139436.A.b.a.g #18	ENSGT00940000160063.h.d #17	ENSGT00940000166825.f.a #16	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e.d #15	ENSGT00940000156364.a.b.i #14	ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b.d	ENSGT00520000055578.a.a.c.ob #13	ENSGT00940000164771.b.e #12	ENSGT00390000009842.m	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00940000156792.g.b.a #32	ENSGT00940000154964.y.b.e	ENSGT00990000210317	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b.i #22	ENSGT00940000162571.g.a #23	ENSGT00940000158724.b.c	ENSGT00390000002421.a.d #25	ENSGT00940000156151.q.b	ENSGT00940000153314.b.a.a.c.a	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394.j	ENSGT00940000163346.b.r	ENSGT00940000163190.h.a.a.fb	ENSGT00940000166394.g	ENSGT00950000182856.b.d	ENSGT00940000163496.b.b.a	ENSGT00940000155479.d	ENSGT00510000046803.a.s.a	ENSGT00940000161518
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	39	ENSGT00940000165056.a.d	ENSGT00940000165955.c.b #19	ENSGT00890000139436.A.b.a.g #18	ENSGT00940000160063.h.d #17	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e.d #15	ENSGT00940000156364.a.b.i #14	ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b.d	ENSGT00520000055578.a.a.c.ob #13	ENSGT00940000164771.b.e #12	ENSGT00390000009842.m	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00940000156792.g.b.a #32	ENSGT00940000154964.y.b.e	ENSGT00990000210317	ENSGT00450000040404.b.h #21	ENSGT00940000155503.b.i #22	ENSGT00940000162571.g.a #23	ENSGT00940000158724.b.c	ENSGT00390000002421.a.d #25	ENSGT00940000156151.q.b	ENSGT00940000153314.b.a.a.c.a	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394.j	ENSGT00940000163346.b.r	ENSGT00940000163190.h.a.a.fb	ENSGT00940000166394.g	ENSGT00950000182856.b.d	ENSGT00940000163496.b.b.a	ENSGT00940000155479.d	ENSGT00510000046803.a.s.a	ENSGT00940000161518
River trout	MODERN SPECIES	20	ENSSTUG00000021957 #19	gpr173 (ENSSTUG00000021951) #18	SUV39H1 (ENSSTUG00000021941) #17	porcnl (ENSSTUG00000021920) #15	MYT1 (ENSSTUG00000021873) #14	pcmtd2a (ENSSTUG00000021858)	asxl1 (ENSSTUG00000021821) #13	ENSSTUG00000021816 #12	trappc6b (ENSSTUG00000021799) #20	tpx2 (ENSSTUG00000021497)	trappc6b (ENSSTUG00000021472) #20	slc2a1a (ENSSTUG00000021128) #32	phc2a (ENSSTUG00000021091)	ENSSTUG00000021066	ENSSTUG00000021048 #21	ENSSTUG00000020482 #22	LRRC38 (ENSSTUG00000020454) #23	dhrs3a (ENSSTUG00000020443)	igsf21b (ENSSTUG00000042769) #25	rcc2 (ENSSTUG00000042545)	rpl22 (ENSSTUG00000042420)	rnf207b (ENSSTUG00000042320)	icmt (ENSSTUG00000042276)	ENSSTUG00000042262	her12 (ENSSTUG00000042247)	tas1r1 (ENSSTUG00000042231)	snx19a (ENSSTUG00000042058)	gig2o (ENSSTUG00000042048)	timm8b (ENSSTUG00000042037)	IFFO2 (ENSSTUG00000042015)	srms (ENSSTUG00000041994)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000165955.c.b #19	ENSGT00890000139436.A.b.a.g #18	ENSGT00940000160063.h.d #17	ENSGT00940000166825.f.a #16	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e.d #15	ENSGT00940000156364.a.b.i #14	ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b.d	ENSGT00520000055578.a.a.c.ob #13	ENSGT00940000164771.b.e #12	ENSGT00390000009842.m	ENSGT00390000012948.b #20	ENSGT00940000156792.g.b.a #32	ENSGT00940000154964.y.b.e	ENSGT00990000210317	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b.i #22	ENSGT00940000162571.g.a #23	ENSGT00940000158724.b.c	ENSGT00390000002421.a.d #25	ENSGT00940000156151.q.b	ENSGT00940000153314.b.a.a.d	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394.j	ENSGT00940000163346.b.r	ENSGT00940000163190.h.a.a.fb	ENSGT00940000166394.g	ENSGT00950000182856.b.d	ENSGT00940000163496.b.b.a	ENSGT00940000155479.d	ENSGT00510000046803.a.s.a	ENSGT00940000161518.d
Chinook salmon	MODERN SPECIES	7	ENSOTSG00005023951 #19	gpr173 (ENSOTSG00005023948) #18	SUV39H1 (ENSOTSG00005023945) #17	porcnl (ENSOTSG00005023937) #15	ENSOTSG00005023737 #14	pcmtd2a (ENSOTSG00005023736)	asxl1 (ENSOTSG00005023735) #13	plagx (ENSOTSG00005023734) #12	tpx2 (ENSOTSG00005023727)	trappc6b (ENSOTSG00005023726) #20	slc2a1a (ENSOTSG00005023722) #32	ENSOTSG00005023708	phc2a (ENSOTSG00005035590)	ENSOTSG00005035588	ENSOTSG00005035586 #21	ENSOTSG00005034721 #22	LRRC38 (ENSOTSG00005034717) #23	dhrs3a (ENSOTSG00005034716)	igsf21b (ENSOTSG00005034714) #25	rcc2 (ENSOTSG00005034712)	rpl22 (ENSOTSG00005034709)	rnf207b (ENSOTSG00005034688)	icmt (ENSOTSG00005034687)	ENSOTSG00005034686	her12 (ENSOTSG00005034685)	tas1r1 (ENSOTSG00005034478)	snx19a (ENSOTSG00005034475)	gig2o (ENSOTSG00005034474)	timm8b (ENSOTSG00005034472)	IFFO2 (ENSOTSG00005034471)	srms (ENSOTSG00005034468)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	44	ENSOTSG00005041096 #19	gpr173 (ENSOTSG00005041098) #18	SUV39H1 (ENSOTSG00005041100) #17	ENSOTSG00005041101	ENSOTSG00005041106 #14	pcmtd2a (ENSOTSG00005041222)	asxl1 (ENSOTSG00005041223) #13	ENSOTSG00005041224 #12	tpx2 (ENSOTSG00005041226)	trappc6b (ENSOTSG00005041227) #20	slc2a1a (ENSOTSG00005041228) #32	ENSOTSG00005041322	phc2a (ENSOTSG00005041323)	ENSOTSG00005041324	ENSOTSG00005041325 #21	ENSOTSG00005041329 #22	LRRC38 (ENSOTSG00005041850) #23	dhrs3a (ENSOTSG00005041851)	igsf21b (ENSOTSG00005041853) #25	rcc2 (ENSOTSG00005041857)	rpl22 (ENSOTSG00005041933)	rnf207b (ENSOTSG00005041942)	icmt (ENSOTSG00005041953)	ENSOTSG00005041954	her12 (ENSOTSG00005041955)	tas1r1 (ENSOTSG00005041956)	snx19a (ENSOTSG00005041957)	gig2o (ENSOTSG00005041958)	timm8b (ENSOTSG00005041960)	IFFO2 (ENSOTSG00005041979)	srms (ENSOTSG00005041980)
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	26	ENSGT00940000166636.e #33	ENSGT00940000165056.a.c	ENSGT00940000165955.c.a #19	ENSGT00890000139436.A.b.a.h #18	ENSGT00940000160063.h.c #17	ENSGT00940000166825.f.b #16	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e.c #15	ENSGT00940000156364.a.b.j #14	ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b.c	ENSGT00520000055578.a.a.c.nb #13	ENSGT00940000164771.b.f #12	ENSGT00940000156211.b	ENSGT00390000009842.n	ENSGT00940000156792.g.b.b #32	ENSGT00940000154964.y.b.f	ENSGT00940000155503.b.j #22	ENSGT00940000162571.g.b #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b.d	ENSGT00390000002421.a.c #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151.r	ENSGT00940000153314.b.a.a.d	ENSGT00390000017394.i	ENSGT00940000163346.b.q	ENSGT00940000163190.h.a.a.gb	ENSGT00940000166394.h	ENSGT00510000046803.a.s.b	ENSGT00940000164033	ENSGT00940000157729.m.b	ENSGT00390000012419.t
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	4	ENSSSAG00000056415	sema3gb (ENSSSAG00000056473)	ENSSSAG00000059169 #19	gpr173 (ENSSSAG00000093105) #18	ENSSSAG00000075737 #17	ENSSSAG00000059194 #16	ENSSSAG00000059211 #15	ENSSSAG00000059417 #14	ENSSSAG00000092193	asxl1 (ENSSSAG00000059630) #13	ENSSSAG00000105435 #12	ENSSSAG00000059664	ENSSSAG00000059693	slc2a1a (ENSSSAG00000059973) #32	phc2a (ENSSSAG00000102306)	ENSSSAG00000063990 #22	ENSSSAG00000121786 #23	ENSSSAG00000069473	vps13d (ENSSSAG00000067286) #24	dhrs3a (ENSSSAG00000069479)	igsf21b (ENSSSAG00000069490) #25	ENSSSAG00000069519 #26	rcc2 (ENSSSAG00000069766)	ENSSSAG00000069798	icmt (ENSSSAG00000100914)	ENSSSAG00000069992	her12 (ENSSSAG00000069995)	tas1r1 (ENSSSAG00000073721)	ENSSSAG00000092783	ENSSSAG00000099086	nol4lb (ENSSSAG00000070019)
River trout	MODERN SPECIES	23	sema3gb (ENSSTUG00000024027)	ENSSTUG00000024213 #19	gpr173 (ENSSTUG00000024259) #18	SUV39H1 (ENSSTUG00000024268) #17	ENSSTUG00000024276 #16	porcnl (ENSSTUG00000024294) #15	MYT1 (ENSSTUG00000024478) #14	pcmtd2a (ENSSTUG00000024584)	asxl1 (ENSSTUG00000024590) #13	ENSSTUG00000024628 #12	ENSSTUG00000024635	tpx2 (ENSSTUG00000024771)	slc2a1a (ENSSTUG00000025353) #32	phc2a (ENSSTUG00000027862)	ENSSTUG00000027871 #21	ENSSTUG00000027890 #22	LRRC38 (ENSSTUG00000028393) #23	VPS13D (ENSSTUG00000028423) #24	dhrs3a (ENSSTUG00000028581)	igsf21b (ENSSTUG00000028602) #25	ARHGEF10L (ENSSTUG00000028678) #26	rcc2 (ENSSTUG00000029931)	rpl22 (ENSSTUG00000030036)	icmt (ENSSTUG00000030064)	ENSSTUG00000030101	her12 (ENSSTUG00000030111)	tas1r1 (ENSSTUG00000030130)	IFFO2 (ENSSTUG00000030255)	ENSSTUG00000030269	nol4lb (ENSSTUG00000030282)	commd7 (ENSSTUG00000030305)
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000166636.e #33	ENSGT00940000165056.a.c	ENSGT00940000165955.c.a #19	ENSGT00890000139436.A.b.a.h #18	ENSGT00940000160063.h.c #17	ENSGT00940000166825.f.b #16	ENSGT01030000234564.a.a.b.a.e.c #15	ENSGT00940000156364.a.b.j #14	ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b.c	ENSGT00520000055578.a.a.c.nb #13	ENSGT00940000164771.b.f #12	ENSGT00940000156211.b	ENSGT00390000009842.n	ENSGT00940000156792.g.b.b #32	ENSGT00940000154964.y.b.f	ENSGT00940000155503.b.j #22	ENSGT00940000162571.g.b #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b.d	ENSGT00390000002421.a.c #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151.r	ENSGT00940000153314.b.a.a.c.b	ENSGT00390000017394.i	ENSGT00940000163346.b.q	ENSGT00940000163190.h.a.a.gb	ENSGT00940000166394.h	ENSGT00510000046803.a.s.b	ENSGT00940000164033	ENSGT00940000157729.m.b	ENSGT00390000012419.t
Rainbow trout	MODERN SPECIES	7	sema3gb (ENSOMYG00000015925)	foxp3-2 (ENSOMYG00000016663) #19	gpr173 (ENSOMYG00000016683) #18	ENSOMYG00000016688 #17	ENSOMYG00000016704 #16	ENSOMYG00000016737 #15	ENSOMYG00000017010 #14	ENSOMYG00000049099	asxl1 (ENSOMYG00000017127) #13	ENSOMYG00000017144 #12	ENSOMYG00000017158	ENSOMYG00000017226	slc2a1a (ENSOMYG00000017540) #32	ENSOMYG00000022710	phc2a (ENSOMYG00000059473)	ENSOMYG00000018728 #22	ENSOMYG00000068709 #23	ENSOMYG00000022073 #24	ENSOMYG00000057740	dhrs3a (ENSOMYG00000022115)	igsf21b (ENSOMYG00000022128) #25	ENSOMYG00000022301 #26	rcc2 (ENSOMYG00000023690)	ENSOMYG00000023796	icmt (ENSOMYG00000023868)	ENSOMYG00000023882	her12 (ENSOMYG00000055467)	tas1r1 (ENSOMYG00000023953)	ENSOMYG00000024050	ENSOMYG00000072393	ENSOMYG00000024062
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	138	ENSGT00940000167132	ENSGT00940000155203.a	ENSGT00390000011058.a.c	ENSGT00940000166327	ENSGT00950000182903.b.a.z	ENSGT00950000182903.b.a.y.b	ENSGT00390000001509.b	ENSGT00390000012802	ENSGT00940000156138.c	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000154436.c	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571.d #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.a.b	ENSGT00940000153314.a.b.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000169993	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.b	ENSGT00940000163190.h.a.a	ENSGT00940000166394
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000156364.a.b #14	ENSGT00950000183032.A.b.b.b.a.b	ENSGT00520000055578.a.a.c #13	ENSGT00860000133842.n	ENSGT00940000167132	ENSGT00940000155203.a	ENSGT00390000011058.a.c	ENSGT00950000182903.b.a.y.b	ENSGT00390000001509.b	ENSGT00390000012802	ENSGT00940000156138.c	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00940000154436.c.b	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571.d #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00940000169993	ENSGT00940000163346.b	ENSGT00940000163190.h.a.a	ENSGT00940000166394	ENSGT00510000046803.a	ENSGT00600000084471
Atlantic herring	MODERN SPECIES	20	CAMTA1 (ENSCHAG00000009617)	ENSCHAG00000010535	ENSCHAG00000010549	ENSCHAG00000010578	DVL1 (ENSCHAG00000010594)	mxra8b (ENSCHAG00000010705)	aurkaip1 (ENSCHAG00000010712)	rap1gapa (ENSCHAG00000010735)	ENSCHAG00000010838	slc2a1a (ENSCHAG00000010876) #32	ENSCHAG00000011160	phc2a (ENSCHAG00000011193)	ENSCHAG00000011241	ENSCHAG00000012799	ENSCHAG00000012814 #21	EPHB2 (ENSCHAG00000012864) #22	LRRC38 (ENSCHAG00000013788) #23	dhrs3a (ENSCHAG00000013794)	VPS13D (ENSCHAG00000013866) #24	ENSCHAG00000016535 #26	rcc2 (ENSCHAG00000016647)	rpl22 (ENSCHAG00000016763)	rnf207b (ENSCHAG00000016822)	icmt (ENSCHAG00000017071)	ENSCHAG00000017078	ENSCHAG00000017083	ENSCHAG00000017098	ENSCHAG00000017121	ENSCHAG00000017134	ENSCHAG00000017171	her12 (ENSCHAG00000000114)
Denticle herring	MODERN SPECIES	1	asxl1 (ENSDCDG00000018352) #13	dnajc11a (ENSDCDG00000018266)	ENSDCDG00000018252	CAMTA1 (ENSDCDG00000018246)	ENSDCDG00000018244	ENSDCDG00000018240	DVL1 (ENSDCDG00000018196)	hykk.2 (ENSDCDG00000018180)	mxra8b (ENSDCDG00000018176)	aurkaip1 (ENSDCDG00000018175)	rap1gapa (ENSDCDG00000018129)	slc2a1a (ENSDCDG00000018015) #32	phc2a (ENSDCDG00000017971)	ENSDCDG00000005206	ENSDCDG00000004993 #21	EPHB2 (ENSDCDG00000004922) #22	ENSDCDG00000004899	VPS13D (ENSDCDG00000003460) #24	dhrs3a (ENSDCDG00000002997)	igsf21b (ENSDCDG00000002966) #25	ARHGEF10L (ENSDCDG00000030050) #26	rcc2 (ENSDCDG00000029930)	ENSDCDG00000029928	icmt (ENSDCDG00000029927)	ENSDCDG00000029926	rnf207b (ENSDCDG00000029922)	ENSDCDG00000029919	ENSDCDG00000029918	her12 (ENSDCDG00000029915)	her12 (ENSDCDG00000029913)	tas1r1 (ENSDCDG00000029911)
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	111	ENSGT00390000010057	ENSGT00940000160830	ENSGT00940000153615.a.a.a	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160409	ENSGT00940000156846	ENSGT00390000012992	ENSGT01030000234629.B	ENSGT00940000156138.c	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000154436.c	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571.d #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.a.b	ENSGT00940000153314.a.b.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00390000013828.j	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.b	ENSGT00940000163190.h.a.a	ENSGT00940000166394
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	48	ENSGT00940000155360.A	ENSGT00940000157635	ENSGT00390000010057	ENSGT00940000160830	ENSGT00940000153615.a.a.a	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160409	ENSGT00940000156846	ENSGT00390000012992	ENSGT01030000234629.B	ENSGT00940000156138.c	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00940000154436.c	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571.d #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.a.b	ENSGT00940000153314.a.b.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00390000013828.j	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.b	ENSGT00940000163190.h.a.a	ENSGT00940000166394
Channel catfish	MODERN SPECIES	6	klhl17 (ENSIPUG00000020945)	noc2l (ENSIPUG00000020920)	samd11 (ENSIPUG00000020906)	RERE (ENSIPUG00000020890)	eno1 (ENSIPUG00000020859)	CA6 (ENSIPUG00000020847)	slc2a5 (ENSIPUG00000020829)	gpr157 (ENSIPUG00000020818)	spsb1 (ENSIPUG00000020811)	rap1gapa (ENSIPUG00000020744)	slc2a1a (ENSIPUG00000020722) #32	phc2 (ENSIPUG00000020698)	eif4g3 (ENSIPUG00000020618)	ENSIPUG00000020614	ENSIPUG00000020605 #21	EPHB2 (ENSIPUG00000020588) #22	LRRC38 (ENSIPUG00000020580) #23	VPS13D (ENSIPUG00000020369) #24	DHRS3 (ENSIPUG00000020319)	igsf21b (ENSIPUG00000020298) #25	ARHGEF10L (ENSIPUG00000020174) #26	rcc2 (ENSIPUG00000020110)	RPL22 (ENSIPUG00000020085)	rnf207 (ENSIPUG00000020036)	icmt (ENSIPUG00000020010)	si:ch73-21g5.7 (ENSIPUG00000020005)	ENSIPUG00000020003	ENSIPUG00000019994	ENSIPUG00000019988	her12 (ENSIPUG00000019985)	tas1r1 (ENSIPUG00000019941)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	35	ENSGT00940000155360.A	ENSGT00940000157635	ENSGT00390000010057	ENSGT00940000160830	ENSGT00940000153615.a.a.a	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160409	ENSGT00940000156846	ENSGT00390000012992	ENSGT01030000234629.B	ENSGT00940000156138.c	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00960000186977.b	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571.d #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.a.b	ENSGT00940000153314.a.b.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00390000013828.j	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.b	ENSGT00940000163190.h.a.a	ENSGT00940000166394
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	532																ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571.d #23
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	5	KLHL17 (ENSPNAG00000019874)	noc2l (ENSPNAG00000019855)	SAMD11 (ENSPNAG00000019840)	RERE (ENSPNAG00000019815)	eno1a (ENSPNAG00000019755)	CA6 (ENSPNAG00000019716)	slc2a5 (ENSPNAG00000019705)	gpr157 (ENSPNAG00000019652)	spsb1 (ENSPNAG00000019615)	rap1gapa (ENSPNAG00000019562)	slc2a1a (ENSPNAG00000019452) #32	phc2a (ENSPNAG00000019430)	EIF4G3 (ENSPNAG00000019346)	ENSPNAG00000019077	ENSPNAG00000003569 #21	EPHB2 (ENSPNAG00000019056) #22	LRRC38 (ENSPNAG00000018980) #23	VPS13D (ENSPNAG00000005791) #24	dhrs3a (ENSPNAG00000018773)	igsf21b (ENSPNAG00000018738) #25	ARHGEF10L (ENSPNAG00000003548) #26	rcc2 (ENSPNAG00000018630)	RPL22 (ENSPNAG00000018554)	rnf207b (ENSPNAG00000018536)	icmt (ENSPNAG00000018481)	ENSPNAG00000018458	si:ch73-21g5.7 (ENSPNAG00000018436)	ENSPNAG00000018430	IFFO2 (ENSPNAG00000018414)	ENSPNAG00000018398	tas1r1 (ENSPNAG00000018349)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	943																EPHB2 (ENSAMXG00000030383) #22	LRRC38 (ENSAMXG00000040716) #23
Electric eel	MODERN SPECIES	27					nrg1 (ENSEEEG00000008856)	WRN (ENSEEEG00000008853)	PURG (ENSEEEG00000008849)	ppp2cb (ENSEEEG00000008796)	ubxn8 (ENSEEEG00000008794)	ENSEEEG00000008793	ROBO1 (ENSEEEG00000008791)	ENSEEEG00000008790	slc2a1a (ENSEEEG00000008776) #32	phc2a (ENSEEEG00000008771)	ENSEEEG00000008555	EPHB2 (ENSEEEG00000008532) #22	ENSEEEG00000008530 #23	VPS13D (ENSEEEG00000008527) #24	dhrs3a (ENSEEEG00000008526)	igsf21b (ENSEEEG00000008524) #25	ARHGEF10L (ENSEEEG00000008522) #26	rcc2 (ENSEEEG00000008515)	RPL22 (ENSEEEG00000008512)	rnf207b (ENSEEEG00000008509)	icmt (ENSEEEG00000008506)	ENSEEEG00000008505	ENSEEEG00000008498	ENSEEEG00000008497	ENSEEEG00000008496	ENSEEEG00000008494	ENSEEEG00000008492
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01090000260154	ENSGT00940000155360.A	ENSGT00940000157635.i.a.a	ENSGT00390000010057	ENSGT00940000160830	ENSGT00940000153615.a.a.a	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b	ENSGT00940000160409	ENSGT00940000156846	ENSGT00390000012992	ENSGT01030000234629.B	ENSGT00940000156138.c	ENSGT00940000156792.g.b #32	ENSGT00940000154964.y.b	ENSGT00450000040404.b #21	ENSGT00940000155503.b #22	ENSGT00940000162571.d #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.b.c	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT01070000253959	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.a.a	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394	ENSGT00390000013828.j	ENSGT00940000175890
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000157635.i.a.a	ENSGT00940000157635.i.a.b	ENSGT00390000010057	ENSGT00940000160830.c	ENSGT00940000153615.a.a.a.c	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b.d	ENSGT00940000160409.s	ENSGT00940000156846	ENSGT00390000012992.d	ENSGT01030000234629.B.e	ENSGT00940000156138.c.b	ENSGT00940000156792.g.b.e #32	ENSGT00940000154964.y.b.c	ENSGT00940000156454.t.a.a	ENSGT00450000040404.b.a #21	ENSGT00940000155503.b.a #22	ENSGT00940000162571.d.b #23	ENSGT00950000183083.b.g #24	ENSGT00940000158724.b.a	ENSGT00390000002421.a.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h.f #26	ENSGT00940000156151.o	ENSGT00940000153314.b.b.c	ENSGT00510000046803.a.c.a	ENSGT00600000084471.bb
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	146	ENSGT00940000157635.i.a.b	ENSGT00390000010057.d	ENSGT00940000160830.c	ENSGT00940000153615.a.a.a.c	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b.d	ENSGT00940000160409.s	ENSGT00940000156846	ENSGT00390000012992.d	ENSGT01030000234629.B.e	ENSGT00940000156138.c.b	ENSGT00940000156792.g.b.e #32	ENSGT01060000252085	ENSGT00940000154964.y.b.c	ENSGT00940000156454.t.a.a	ENSGT00450000040404.b.a #21	ENSGT00940000155503.b.a #22	ENSGT00940000162571.d.b #23	ENSGT00950000183083.b.g #24	ENSGT00940000158724.b.a	ENSGT00390000002421.a.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h.f #26	ENSGT00940000156151.o	ENSGT00940000153314.b.b.c	ENSGT00510000048612.r.b	ENSGT00390000017394.n	ENSGT00390000017394.m	ENSGT00940000169993	ENSGT00940000163346.b.m.a	ENSGT00940000163190.h.a.a.c.b	ENSGT00940000163346.b.m.b	ENSGT00940000163190.h.a.a.d
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	169			noc2l (ENSSGRG00000005705)	SAMD11 (ENSSGRG00000005716)	RERE (ENSSGRG00000005786)	eno1a (ENSSGRG00000006975)	CA6 (ENSSGRG00000012134)	slc2a5 (ENSSGRG00000012152)	gpr157 (ENSSGRG00000012330)	spsb1 (ENSSGRG00000012334)	rap1gapa (ENSSGRG00000012336)	slc2a1a (ENSSGRG00000012363) #32	ENSSGRG00000014745	phc2a (ENSSGRG00000014747)	ENSSGRG00000014754	EPHB2 (ENSSGRG00000014931) #22	ENSSGRG00000015681 #21	VPS13D (ENSSGRG00000015708) #24	dhrs3a (ENSSGRG00000016478)	igsf21b (ENSSGRG00000016500) #25	ARHGEF10L (ENSSGRG00000016503) #26	rcc2 (ENSSGRG00000016508)	RPL22 (ENSSGRG00000016532)	rnf207b (ENSSGRG00000016535)	icmt (ENSSGRG00000016555)	ENSSGRG00000016557	ENSSGRG00000016559	ENSSGRG00000016560	ENSSGRG00000016561	her12 (ENSSGRG00000016564)	tas1r1 (ENSSGRG00000016565)
Common carp reference	MODERN SPECIES	11	KLHL17 (ENSCCRG00000030337)	noc2l (ENSCCRG00000020728)	SAMD11 (ENSCCRG00000060887)	RERE (ENSCCRG00000030972)	eno1a (ENSCCRG00000005902)	CA6 (ENSCCRG00000015506)	slc2a5 (ENSCCRG00000015389)	gpr157 (ENSCCRG00000015374)	spsb1 (ENSCCRG00000015367)	rap1gapa (ENSCCRG00000009719)	ENSCCRG00000001434	slc2a1a (ENSCCRG00000007895) #32	phc2a (ENSCCRG00000002044)	ENSCCRG00000029041	ENSCCRG00000071008 #21	ENSCCRG00000045891 #22	ENSCCRG00000042474 #23	ENSCCRG00000017764 #24	dhrs3a (ENSCCRG00000017739)	igsf21b (ENSCCRG00000080750) #25	ENSCCRG00000016783 #26	rcc2 (ENSCCRG00000015056)	ENSCCRG00000015162	rnf207b (ENSCCRG00000014826)	ENSCCRG00000071107	ENSCCRG00000029143	ENSCCRG00000029142	ENSCCRG00000061674	her12 (ENSCCRG00000053172)	tas1r1 (ENSCCRG00000014782)	IFFO2 (ENSCCRG00000014777)
Goldfish	MODERN SPECIES	55	KLHL17 (ENSCARG00000039509)	noc2l (ENSCARG00000039461)	SAMD11 (ENSCARG00000039411)	RERE (ENSCARG00000039126)	eno1a (ENSCARG00000038970)	CA6 (ENSCARG00000038907)	slc2a5 (ENSCARG00000038438)	gpr157 (ENSCARG00000038364)	spsb1 (ENSCARG00000038320)	rap1gapa (ENSCARG00000033846)	ENSCARG00000033640	slc2a1a (ENSCARG00000033049) #32	phc2a (ENSCARG00000033016)	EIF4G3 (ENSCARG00000030897)	ENSCARG00000030824 #21	ENSCARG00000029761 #22	LRRC38 (ENSCARG00000029732) #23	VPS13D (ENSCARG00000029590) #24	dhrs3a (ENSCARG00000029531)	igsf21b (ENSCARG00000029493) #25	ARHGEF10L (ENSCARG00000028226) #26	rcc2 (ENSCARG00000028154)	ENSCARG00000028140	icmt (ENSCARG00000028128)	ENSCARG00000028113	ENSCARG00000028107	ENSCARG00000028105	her12 (ENSCARG00000028099)	tas1r1 (ENSCARG00000028052)	IFFO2 (ENSCARG00000028015)	UBR4 (ENSCARG00000025664)
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	320				ENSGT00940000171631	ENSGT00940000160830.d	ENSGT00940000153615.a.a.a.d	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b.c	ENSGT00940000160409.t	ENSGT00390000012992.c	ENSGT01030000234629.B.f	ENSGT00940000156138.c.a	ENSGT00940000156792.g.b.f #32	ENSGT00940000154964.y.b.d	ENSGT00940000156454.t.a.b	ENSGT00450000040404.b.b #21	ENSGT00940000155503.b.b #22	ENSGT00940000162571.d.a #23	ENSGT00950000183083.b.h #24	ENSGT00940000158724.b.b	ENSGT00390000002421.a.b #25	ENSGT00940000153798.A.b.h.e #26	ENSGT00940000156151.p	ENSGT00940000153314.b.b.d	ENSGT00510000048612.r	ENSGT00390000017394.m	ENSGT00940000169993	ENSGT00940000163346.b.m.a	ENSGT00390000017394.n	ENSGT00390000013828.j	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.b.n
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Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT01090000260154.a	ENSGT00940000155360.A.b	ENSGT00940000157635.i.a.a	ENSGT00390000010057.c	ENSGT00940000160830.d	ENSGT00940000153615.a.a.a.d	ENSGT00950000182805.a.a.a.a.b.c	ENSGT00940000160409.t	ENSGT00390000012992.c	ENSGT01030000234629.B.f	ENSGT00940000156138.c.a	ENSGT00940000156792.g.b.f #32	ENSGT00940000154964.y.b.d	ENSGT00940000156454.t.a.b	ENSGT00450000040404.b.b #21	ENSGT00940000155503.b.b #22	ENSGT00940000162571.d.a #23	ENSGT00950000183083.b.h #24	ENSGT00940000158724.b.b	ENSGT00390000002421.a.b #25	ENSGT00940000153798.A.b.h.e #26	ENSGT00940000156151.p	ENSGT00940000153314.b.b.d	ENSGT00510000048612.r.a	ENSGT00940000163190.h.a.a.c.a	ENSGT00940000166394.b	ENSGT00510000046803.a.c.b	ENSGT00600000084471.cb	ENSGT00390000002461.k	ENSGT00940000156971.B.e.b	ENSGT00940000157867.a.b.b #7
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Euacanthomorphacea	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT01060000248901
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Percomorphaceae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a
Tiger tail seahorse	MODERN SPECIES	82	ora1 (ENSHCOG00000001794)	phtf1 (ENSHCOG00000001801)	PFKFB2 (ENSHCOG00000001812)	yod1 (ENSHCOG00000001818)	zgc:158258 (ENSHCOG00000001821)	ENSHCOG00000001829	SH2D5 (ENSHCOG00000001836)	hp1bp3 (ENSHCOG00000001850)	EIF4G3 (ENSHCOG00000001899)	ece1 (ENSHCOG00000001919)	alpl (ENSHCOG00000001952)	ENSHCOG00000001960	ENSHCOG00000001964	ENSHCOG00000001970	LACTBL1 (ENSHCOG00000001972) ##21	ephb2b (ENSHCOG00000001981) ##22	ENSHCOG00000001991	cacna2d2a (ENSHCOG00000002098)	abhd14b (ENSHCOG00000002156)	mst1 (ENSHCOG00000002166)	ENSHCOG00000002177	C3orf18 (ENSHCOG00000002182)	gnb1b (ENSHCOG00000002212)	tardbpb (ENSHCOG00000002224)	ENSHCOG00000002233	foxl3 (ENSHCOG00000002243)	tom1l2 (ENSHCOG00000002262)	atpaf2 (ENSHCOG00000002277)	GID4 (ENSHCOG00000002297)	noxo1b (ENSHCOG00000002329)	ENSHCOG00000002349
Percomorphaceae_B	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b
Percomorphaceae_C	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b.b
Eupercaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
Tetraodontidae	ANCESTRAL SPECIES	62			ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT01000000215408	ENSGT00940000155314.p	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b.b.a	ENSGT00950000183062.a.b.a	ENSGT00940000166455	ENSGT00950000182986.a.a
Fugu	MODERN SPECIES	10	ippk (ENSTRUG00000032010)	ENSTRUG00000027780	ENSTRUG00000030180	PFKFB2 (ENSTRUG00000031546)	yod1 (ENSTRUG00000011325)	ENSTRUG00000019802	sh2d5 (ENSTRUG00000021223)	hp1bp3 (ENSTRUG00000011361)	EIF4G3 (ENSTRUG00000011593)	ece1 (ENSTRUG00000012021)	alpl (ENSTRUG00000004463)	ENSTRUG00000019541	ENSTRUG00000025583	ENSTRUG00000005202	LACTBL1 (ENSTRUG00000023247) ##21	ephb2b (ENSTRUG00000005498) ##22	ENSTRUG00000006571	dhrs3b (ENSTRUG00000006594)	KLHDC7A (ENSTRUG00000006930)	igsf21a (ENSTRUG00000006952) ##25	ENSTRUG00000026478	ENSTRUG00000026397	ARHGEF10L (ENSTRUG00000007101) ##26	ENSTRUG00000007623	rpl22 (ENSTRUG00000007876)	zpr1 (ENSTRUG00000032549)	RNF207 (ENSTRUG00000002614)	agtrap (ENSTRUG00000022633)	draxina (ENSTRUG00000002640)	PANK4 (ENSTRUG00000002683)	ENSTRUG00000029779
Tetraodon	MODERN SPECIES	26	hectd3 (ENSTNIG00000006381)	rps8a (ENSTNIG00000006382)	acadm (ENSTNIG00000006383)	rabggtb (ENSTNIG00000006384)	ak5 (ENSTNIG00000006387)	ENSTNIG00000006386	usp33 (ENSTNIG00000003985)	fubp1 (ENSTNIG00000003986)	dnajb4 (ENSTNIG00000006137)	gipc2 (ENSTNIG00000006138)	alpl (ENSTNIG00000012197)	ENSTNIG00000012198	ENSTNIG00000012199	ENSTNIG00000012200	LACTBL1 (ENSTNIG00000012201) ##21	ephb2b (ENSTNIG00000012202) ##22	ENSTNIG00000012203	dhrs3b (ENSTNIG00000012204)	ARHGEF10L (ENSTNIG00000012205) ##26	rpl22 (ENSTNIG00000003756)	zpr1 (ENSTNIG00000003757)	zpr1 (ENSTNIG00000001378)	ENSTNIG00000006238	ENSTNIG00000006239	PANK4 (ENSTNIG00000006240)	agtrap (ENSTNIG00000006241)	zc3h18 (ENSTNIG00000004767)	ENSTNIG00000004768	KLHL25 (ENSTNIG00000004769)	lrp5 (ENSTNIG00000004770)	ANO1 (ENSTNIG00000004771)
Eupecaria_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
Ballan wrasse	MODERN SPECIES	198	ENSLBEG00000006760	ENSLBEG00000006742	PFKFB2 (ENSLBEG00000006587)	yod1 (ENSLBEG00000006515)	zgc:158258 (ENSLBEG00000006498)	kif17 (ENSLBEG00000006463)	sh2d5 (ENSLBEG00000006417)	hp1bp3 (ENSLBEG00000006306)	EIF4G3 (ENSLBEG00000005966)	ece1 (ENSLBEG00000005859)	alpl (ENSLBEG00000005807)	ENSLBEG00000005739	ENSLBEG00000005704	ENSLBEG00000005686	LACTBL1 (ENSLBEG00000005658) ##21	ephb2b (ENSLBEG00000005594) ##22	ENSLBEG00000005576
Eupecaria_B	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
Eupecaria_C	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
Eupercaria_incertae_sedis	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
European seabass	MODERN SPECIES	10	ENSDLAG00005009284	ENSDLAG00005013824	ENSDLAG00005013845	ENSDLAG00005014306	yod1 (ENSDLAG00005014537)	zgc:158258 (ENSDLAG00005030627)	kif17 (ENSDLAG00005014551)	hp1bp3 (ENSDLAG00005014584)	EIF4G3 (ENSDLAG00005014710)	ece1 (ENSDLAG00005016556)	alpl (ENSDLAG00005019855)	ENSDLAG00005021134	ENSDLAG00005021139	ENSDLAG00005032215	ENSDLAG00005027496 ##21	ephb2b (ENSDLAG00005021187) ##22	LRRC38 (ENSDLAG00005032567)	DHRS3 (ENSDLAG00005030839)	aadacl4 (ENSDLAG00005021751)	ENSDLAG00005029953	KLHDC7A (ENSDLAG00005028339)	igsf21a (ENSDLAG00005021779) ##25	ARHGEF10L (ENSDLAG00005021842) ##26	ENSDLAG00005022270	ENSDLAG00005023360	ENSDLAG00005028230	agtrap (ENSDLAG00005023371)	ENSDLAG00005033777	ENSDLAG00005023388	ENSDLAG00005023440	ENSDLAG00005026823
Large yellow croaker	MODERN SPECIES	478	opn1sw2 (ENSLCRG00005022440)	opn1lw1 (ENSLCRG00005022441)	gnl3l (ENSLCRG00005022442)	tfe3b (ENSLCRG00005022462)	cxxc1b (ENSLCRG00005002269)	ap5b1 (ENSLCRG00005004025)	zgc:112255 (ENSLCRG00005004027)	P3H1 (ENSLCRG00005004095)	cldn19 (ENSLCRG00005004160)	ENSLCRG00005004286	nucks1a (ENSLCRG00005004986)	slc45a3 (ENSLCRG00005005000)	ENSLCRG00005005013	elk4 (ENSLCRG00005005023)	ENSLCRG00005005096	ephb2b (ENSLCRG00005005574) ##22	ENSLCRG00005006550	dhrs3b (ENSLCRG00005006559)	aadacl4 (ENSLCRG00005006570)	ENSLCRG00005006583	KLHDC7A (ENSLCRG00005006603)	igsf21a (ENSLCRG00005006618) ##25	ARHGEF10L (ENSLCRG00005006871) ##26	ENSLCRG00005010614	RPL22 (ENSLCRG00005019417)	RNF207 (ENSLCRG00005019435)	ENSLCRG00005019445	agtrap (ENSLCRG00005019447)	draxina (ENSLCRG00005019449)	PANK4 (ENSLCRG00005019451)	ENSLCRG00005019506
Gilthead seabream	MODERN SPECIES	20	ora1 (ENSSAUG00010025391)	phtf1 (ENSSAUG00010025390)	PFKFB2 (ENSSAUG00010025191)	yod1 (ENSSAUG00010025175)	zgc:158258 (ENSSAUG00010025174)	kif17 (ENSSAUG00010025171)	sh2d5 (ENSSAUG00010025167)	hp1bp3 (ENSSAUG00010025165)	EIF4G3 (ENSSAUG00010023300)	ece1 (ENSSAUG00010020842)	alpl (ENSSAUG00010020743)	ENSSAUG00010020740	ENSSAUG00010020739	ENSSAUG00010020738	LACTBL1 (ENSSAUG00010020737) ##21	ephb2b (ENSSAUG00010019558) ##22	ENSSAUG00010019542	dhrs3b (ENSSAUG00010019540)	aadacl4 (ENSSAUG00010019538)	ENSSAUG00010019537	KLHDC7A (ENSSAUG00010019535)	igsf21a (ENSSAUG00010019532) ##25	ARHGEF10L (ENSSAUG00010019396) ##26	ENSSAUG00010004831	RPL22 (ENSSAUG00010004477)	ENSSAUG00010004472	RNF207 (ENSSAUG00010004451)	agtrap (ENSSAUG00010004444)	draxina (ENSSAUG00010004441)	PANK4 (ENSSAUG00010004296)	ENSSAUG00010004230
Perciformes	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
Cottioidei	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.g.b	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896
Lumpfish	MODERN SPECIES	20	ora1 (ENSCLMG00005000652)	phtf1 (ENSCLMG00005000665)	PFKFB2 (ENSCLMG00005000806)	yod1 (ENSCLMG00005001303)	zgc:158258 (ENSCLMG00005001316)	ENSCLMG00005001338	sh2d5 (ENSCLMG00005001364)	hp1bp3 (ENSCLMG00005001385)	EIF4G3 (ENSCLMG00005001840)	ece1 (ENSCLMG00005011073)	alpl (ENSCLMG00005017563)	ENSCLMG00005017727	ENSCLMG00005017733	ENSCLMG00005017735	LACTBL1 (ENSCLMG00005017736) ##21	ephb2b (ENSCLMG00005017741) ##22	ENSCLMG00005017790	dhrs3b (ENSCLMG00005017791)	aadacl4 (ENSCLMG00005017794)	ENSCLMG00005017796	KLHDC7A (ENSCLMG00005017798)	igsf21a (ENSCLMG00005017800) ##25	ARHGEF10L (ENSCLMG00005017806) ##26	ENSCLMG00005018693	RPL22 (ENSCLMG00005018696)	RNF207 (ENSCLMG00005018705)	ENSCLMG00005018706	agtrap (ENSCLMG00005018707)	draxina (ENSCLMG00005018708)	PANK4 (ENSCLMG00005018709)	ENSCLMG00005018722
Stickleback	MODERN SPECIES	17	ENSGACG00000004752	PLXNA2 (ENSGACG00000004738)	ora1 (ENSGACG00000004736)	phtf1 (ENSGACG00000004705)	PFKFB2 (ENSGACG00000004651)	yod1 (ENSGACG00000004647)	ENSGACG00000004645	kif17 (ENSGACG00000004633)	ENSGACG00000004630	hp1bp3 (ENSGACG00000004622)	EIF4G3 (ENSGACG00000004607)	ece1 (ENSGACG00000004590)	alpl (ENSGACG00000004517)	ENSGACG00000004514	LACTBL1 (ENSGACG00000004509) ##21	ephb2b (ENSGACG00000004496) ##22	ENSGACG00000004494	dhrs3b (ENSGACG00000004448)	aadacl4 (ENSGACG00000004441)	igsf21a (ENSGACG00000004433) ##25	ARHGEF10L (ENSGACG00000004412) ##26	CHD5 (ENSGACG00000004389)	RPL22 (ENSGACG00000004372)	zpr1 (ENSGACG00000004366)	ENSGACG00000004352	draxina (ENSGACG00000004342)	PANK4 (ENSGACG00000004331)	ENSGACG00000004330	ENSGACG00000004327	ENSGACG00000004326	ENSGACG00000004322
Perciformes_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
Pike perch	MODERN SPECIES	17	ora1 (ENSSLUG00000006546)	phtf1 (ENSSLUG00000006571)	PFKFB2 (ENSSLUG00000007098)	yod1 (ENSSLUG00000009146)	zgc:158258 (ENSSLUG00000009150)	kif17 (ENSSLUG00000009152)	SH2D5 (ENSSLUG00000009159)	hp1bp3 (ENSSLUG00000009171)	EIF4G3 (ENSSLUG00000009487)	ece1 (ENSSLUG00000016356)	alpl (ENSSLUG00000019894)	ENSSLUG00000020338	ENSSLUG00000020342	ENSSLUG00000020355	LACTBL1 (ENSSLUG00000020366) ##21	ephb2b (ENSSLUG00000020437) ##22	ENSSLUG00000020946	dhrs3b (ENSSLUG00000020950)	aadacl4 (ENSSLUG00000020956)	ENSSLUG00000020961	KLHDC7A (ENSSLUG00000020965)	igsf21a (ENSSLUG00000020972) ##25	ENSSLUG00000020987	ENSSLUG00000021022	ARHGEF10L (ENSSLUG00000021058) ##26	ENSSLUG00000021778	ENSSLUG00000021911	RPL22 (ENSSLUG00000022484)	RNF207 (ENSSLUG00000022504)	ENSSLUG00000022551	agtrap (ENSSLUG00000022556)
Channel bull blenny	DUPLICATION
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Channel bull blenny	MODERN SPECIES	19	PFKFB2 (ENSCGOG00000004782)	yod1 (ENSCGOG00000010173)	zgc:158258 (ENSCGOG00000010176)	kif17 (ENSCGOG00000010179)	ENSCGOG00000010194	SH2D5 (ENSCGOG00000010198)	hp1bp3 (ENSCGOG00000010202)	EIF4G3 (ENSCGOG00000010278)	ece1 (ENSCGOG00000013555)	alpl (ENSCGOG00000016553)	ENSCGOG00000017419	ENSCGOG00000017420	ENSCGOG00000017421	LACTBL1 (ENSCGOG00000017422) ##21	ephb2b (ENSCGOG00000017424) ##22	ENSCGOG00000017452 ##22	ENSCGOG00000017454	dhrs3b (ENSCGOG00000017457)	aadacl4 (ENSCGOG00000017480)	ENSCGOG00000017481	ENSCGOG00000017482	igsf21a (ENSCGOG00000017483) ##25	ARHGEF10L (ENSCGOG00000017503) ##26	ENSCGOG00000018269	RPL22 (ENSCGOG00000021511)	ENSCGOG00000021535	ENSCGOG00000021537	agtrap (ENSCGOG00000021539)	draxina (ENSCGOG00000021543)	PANK4 (ENSCGOG00000021555)	ENSCGOG00000021828
Percomorphaceae_D	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
Carangaria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896
Carangaria_A	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b.b
Seriola	ANCESTRAL SPECIES	61	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b.b.e.b
Yellowtail amberjack	MODERN SPECIES	2919				yod1 (ENSSLDG00000018719)	zgc:158258 (ENSSLDG00000018733)	ENSSLDG00000018754	sh2d5 (ENSSLDG00000018806)	hp1bp3 (ENSSLDG00000018821)	EIF4G3 (ENSSLDG00000018945)	ece1 (ENSSLDG00000019403)	alpl (ENSSLDG00000019465)	ENSSLDG00000019489	ENSSLDG00000019499	ENSSLDG00000019508	LACTBL1 (ENSSLDG00000019519) ##21	ephb2b (ENSSLDG00000019542) ##22	ENSSLDG00000019604	dhrs3b (ENSSLDG00000019617)	aadacl4 (ENSSLDG00000019630)	ENSSLDG00000019638	KLHDC7A (ENSSLDG00000019652)	igsf21a (ENSSLDG00000019670) ##25	ARHGEF10L (ENSSLDG00000019703) ##26	ENSSLDG00000019750	ENSSLDG00000019980	RNF207 (ENSSLDG00000019997)	zpr1 (ENSSLDG00000020074)	agtrap (ENSSLDG00000020077)	draxina (ENSSLDG00000020078)	PANK4 (ENSSLDG00000020098)	ENSSLDG00000020158
Greater amberjack	MODERN SPECIES	129	ora1 (ENSSDUG00000018410)	phtf1 (ENSSDUG00000018385)	PFKFB2 (ENSSDUG00000018361)	yod1 (ENSSDUG00000018328)	zgc:158258 (ENSSDUG00000018318)	kif17 (ENSSDUG00000018294)	SH2D5 (ENSSDUG00000018264)	hp1bp3 (ENSSDUG00000018218)	EIF4G3 (ENSSDUG00000018177)	ece1 (ENSSDUG00000018097)	alpl (ENSSDUG00000018072)	ENSSDUG00000018036	ENSSDUG00000018024	ENSSDUG00000018012	LACTBL1 (ENSSDUG00000018003) ##21	ephb2b (ENSSDUG00000017949) ##22	ENSSDUG00000017939	dhrs3b (ENSSDUG00000017918)	aadacl4 (ENSSDUG00000017910)	ENSSDUG00000017885	KLHDC7A (ENSSDUG00000017874)	igsf21a (ENSSDUG00000017845) ##25	ARHGEF10L (ENSSDUG00000017767) ##26	CHD5 (ENSSDUG00000017526)	RPL22 (ENSSDUG00000017503)	zpr1 (ENSSDUG00000017496)	RNF207 (ENSSDUG00000017457)	agtrap (ENSSDUG00000017445)	draxina (ENSSDUG00000017435)	PANK4 (ENSSDUG00000017362)	ENSSDUG00000017350
Barramundi perch	MODERN SPECIES	387				zgc:158258 (ENSLCAG00010008662)	ENSLCAG00010008666	ENSLCAG00010008670	SH2D5 (ENSLCAG00010008672)	hp1bp3 (ENSLCAG00010008676)	EIF4G3 (ENSLCAG00010009082)	ece1 (ENSLCAG00010010767)	alpl (ENSLCAG00010011539)	ENSLCAG00010011869	ENSLCAG00010011872	ENSLCAG00010011879	LACTBL1 (ENSLCAG00010011886) ##21	ephb2b (ENSLCAG00010011944) ##22	ENSLCAG00010012074
Pleuronectoidei	ANCESTRAL SPECIES	31						ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b.b
Turbot	MODERN SPECIES	18				ENSSMAG00000023578	ENSSMAG00000027335	ENSSMAG00000002062	HP1BP3 (ENSSMAG00000002048)	EIF4G3 (ENSSMAG00000002016)	ece1 (ENSSMAG00000001956)	alpl (ENSSMAG00000000834)	ENSSMAG00000000821	ENSSMAG00000000812	ENSSMAG00000000799	ENSSMAG00000000788 ##21	ENSSMAG00000036650	ephb2b (ENSSMAG00000018173) ##22	ENSSMAG00000021606	ENSSMAG00000018170	dhrs3b (ENSSMAG00000018155)	aadacl4 (ENSSMAG00000018151)	igsf21a (ENSSMAG00000018140) ##25	ENSSMAG00000035408	ENSSMAG00000018032 ##26	ENSSMAG00000017926	ENSSMAG00000017872	ENSSMAG00000017899	agtrap (ENSSMAG00000025082)	ENSSMAG00000017860	ENSSMAG00000017786	ENSSMAG00000017114	ENSSMAG00000037522
Tongue sole	MODERN SPECIES	2	zgc:162255 (ENSCSEG00000012936)	nfs1 (ENSCSEG00000012954)	cpne1 (ENSCSEG00000012963)	ENSCSEG00000012980	ENSCSEG00000013010	ENSCSEG00000013020	SH2D5 (ENSCSEG00000013031)	HP1BP3 (ENSCSEG00000013048)	EIF4G3 (ENSCSEG00000013061)	ece1 (ENSCSEG00000013093)	alpl (ENSCSEG00000013107)	ENSCSEG00000013114	ENSCSEG00000013117	ENSCSEG00000013297	LACTBL1 (ENSCSEG00000013329) ##21	ephb2b (ENSCSEG00000013341) ##22	ENSCSEG00000013365	cstf1 (ENSCSEG00000013372)	pdrg1 (ENSCSEG00000013376)	phf2 (ENSCSEG00000013392)	barx1 (ENSCSEG00000013430)	ENSCSEG00000013439	ptpdc1a (ENSCSEG00000013446)	ENSCSEG00000013457	stk35l (ENSCSEG00000013485)	ENSCSEG00000013505	arfrp1 (ENSCSEG00000013577)	chia.1 (ENSCSEG00000013647)	chia.3 (ENSCSEG00000014104)	cntn2 (ENSCSEG00000014123)	nfasca (ENSCSEG00000014178)
Anabantaria	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b.a.a
Zig-zag eel	MODERN SPECIES	19	ENSMAMG00000003303	ENSMAMG00000003275	ENSMAMG00000003172	yod1 (ENSMAMG00000003157)	zgc:158258 (ENSMAMG00000003146)	kif17 (ENSMAMG00000003131)	sh2d5 (ENSMAMG00000003119)	hp1bp3 (ENSMAMG00000003083)	EIF4G3 (ENSMAMG00000002783)	ece1 (ENSMAMG00000002669)	alpl (ENSMAMG00000002650)	ENSMAMG00000002647	ENSMAMG00000002618	ENSMAMG00000002555	ENSMAMG00000002526 ##21	ephb2b (ENSMAMG00000002456) ##22	ENSMAMG00000002414	dhrs3b (ENSMAMG00000002387)	aadacl4 (ENSMAMG00000002373)	ENSMAMG00000002360	KLHDC7A (ENSMAMG00000002350)	igsf21a (ENSMAMG00000002315) ##25	ARHGEF10L (ENSMAMG00000002238) ##26	ENSMAMG00000002137	ENSMAMG00000002105	ENSMAMG00000002085	ENSMAMG00000002035	agtrap (ENSMAMG00000002029)	ENSMAMG00000002010	ENSMAMG00000001898	ENSMAMG00000001880
Anabantoidei	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00530000064100	ENSGT00390000010053	ENSGT00940000159941	ENSGT00940000157444	ENSGT00940000157238.a	ENSGT00390000011897	ENSGT00390000004860	ENSGT01100000263518.B.b.a.b	ENSGT00940000154527.a.a.a	ENSGT00390000004933.l	ENSGT00950000183117.a.b.b	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a
Siamese fighting fish	MODERN SPECIES	16	ECM2 (ENSBSLG00000003168)	aspn (ENSBSLG00000003165)	ogna (ENSBSLG00000003163)	cenpp (ENSBSLG00000003162)	GPR37L1 (ENSBSLG00000003160)	ENSBSLG00000003158	atp2b4 (ENSBSLG00000002077)	ENSBSLG00000002061	cept1b (ENSBSLG00000002047)	ENSBSLG00000002033	ENSBSLG00000002031	ENSBSLG00000002030	ENSBSLG00000002029	ENSBSLG00000002028	LACTBL1 (ENSBSLG00000002027) ##21	ephb2b (ENSBSLG00000001834) ##22	ENSBSLG00000001704	aadacl4 (ENSBSLG00000001694)	ENSBSLG00000001688	KLHDC7A (ENSBSLG00000001677)	igsf21a (ENSBSLG00000001659) ##25	ENSBSLG00000001648	ENSBSLG00000001647	ENSBSLG00000001639	ARHGEF10L (ENSBSLG00000001383) ##26	ENSBSLG00000000909	ENSBSLG00000000796	ENSBSLG00000000792	RNF207 (ENSBSLG00000000785)	agtrap (ENSBSLG00000000774)	draxina (ENSBSLG00000000769)
Climbing perch	MODERN SPECIES	18	ENSATEG00000002200	ippk (ENSATEG00000002187)	ECM2 (ENSATEG00000002173)	aspn (ENSATEG00000002163)	ogna (ENSATEG00000002159)	cenpp (ENSATEG00000026253)	ENSATEG00000028719	ENSATEG00000028458	ENSATEG00000001984	ENSATEG00000001964	ENSATEG00000001916	ENSATEG00000001863	ENSATEG00000001845	ENSATEG00000001748	ENSATEG00000001715 ##21	ephb2b (ENSATEG00000001637) ##22	ENSATEG00000001628	dhrs3b (ENSATEG00000001586)	aadacl4 (ENSATEG00000001560)	ENSATEG00000001537	KLHDC7A (ENSATEG00000001529)	igsf21a (ENSATEG00000001481) ##25	ARHGEF10L (ENSATEG00000001356) ##26	ENSATEG00000000976	ENSATEG00000000964	ENSATEG00000000942	ENSATEG00000000882	agtrap (ENSATEG00000000856)	ENSATEG00000000825	ENSATEG00000000770	ENSATEG00000028416
Ovalentaria	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896
Atherinomorphae	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a	ENSGT00940000163346.a.b
Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a	ENSGT00940000163346.a.b
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b	ENSGT00940000163346.a.a
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	11	phtf1 (ENSKMAG00000017047)	PFKFB2 (ENSKMAG00000017077)	yod1 (ENSKMAG00000017127)	zgc:158258 (ENSKMAG00000017136)	kif17 (ENSKMAG00000017144)	sh2d5 (ENSKMAG00000017153)	hp1bp3 (ENSKMAG00000017174)	EIF4G3 (ENSKMAG00000017233)	ece1 (ENSKMAG00000017413)	alpl (ENSKMAG00000017464)	alpl (ENSKMAG00000017490)	ENSKMAG00000017516	ENSKMAG00000017526	ENSKMAG00000017539	LACTBL1 (ENSKMAG00000017557) ##21	ephb2b (ENSKMAG00000017603) ##22	ENSKMAG00000017654	dhrs3b (ENSKMAG00000017664)	ENSKMAG00000017683	KLHDC7A (ENSKMAG00000017691)	igsf21a (ENSKMAG00000017745) ##25	ARHGEF10L (ENSKMAG00000017777) ##26	ENSKMAG00000017827	RPL22 (ENSKMAG00000017901)	RNF207 (ENSKMAG00000017931)	zpr1 (ENSKMAG00000018008)	ENSKMAG00000018019	agtrap (ENSKMAG00000018034)	draxina (ENSKMAG00000018056)	PANK4 (ENSKMAG00000018097)	ENSKMAG00000018150
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1619	ddx27 (ENSNFUG00015012929)	ENSNFUG00015013012	ENSNFUG00015013016	KHK (ENSNFUG00015013047)	ENSNFUG00015013163	SH2D5 (ENSNFUG00015013175)	HP1BP3 (ENSNFUG00015013184)	EIF4G3 (ENSNFUG00015013415)	ece1 (ENSNFUG00015020041)	ALPL (ENSNFUG00015020541)	ENSNFUG00015021374	ENSNFUG00015021382	ENSNFUG00015021386	ENSNFUG00015021392	LACTBL1B (ENSNFUG00015021394) ##21	ephb2b (ENSNFUG00015021481) ##22	LRRC38 (ENSNFUG00015022811)	DHRS3 (ENSNFUG00015022813)	ENSNFUG00015022819	igsf21a (ENSNFUG00015022829) ##25	ENSNFUG00015022840	ENSNFUG00015022842	ARHGEF10L (ENSNFUG00015022931) ##26	ENSNFUG00015023476	ENSNFUG00015023540	RNF207 (ENSNFUG00015023565)	ENSNFUG00015023577	agtrap (ENSNFUG00015023580)	DRAXIN (ENSNFUG00015023585)	PANK4 (ENSNFUG00015023598)	ENSNFUG00015023626
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.a.a.z	ENSGT00940000163346.a.b
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a.y.a	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.a.a.z
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a.y.a	ENSGT00940000175890	ENSGT00940000163346.a.a.z
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Platyfish	MODERN SPECIES	12	ora1 (ENSXMAG00000029217)	phtf1 (ENSXMAG00000017756)	PFKFB2 (ENSXMAG00000017729)	yod1 (ENSXMAG00000017727)	zgc:158258 (ENSXMAG00000023589)	ENSXMAG00000017723	sh2d5 (ENSXMAG00000017721)	hp1bp3 (ENSXMAG00000017715)	EIF4G3 (ENSXMAG00000017701)	ece1 (ENSXMAG00000017683)	alpl (ENSXMAG00000017668)	ENSXMAG00000027285	ENSXMAG00000017666	ENSXMAG00000017664	LACTBL1 (ENSXMAG00000017663) ##21	ephb2b (ENSXMAG00000017602) ##22	ENSXMAG00000022255	dhrs3b (ENSXMAG00000021912)	KLHDC7A (ENSXMAG00000023754)	igsf21a (ENSXMAG00000017576) ##25	ARHGEF10L (ENSXMAG00000002919) ##26	ENSXMAG00000014686	ENSXMAG00000014707	RNF207 (ENSXMAG00000014726)	zpr1 (ENSXMAG00000019854)	agtrap (ENSXMAG00000029470)	draxina (ENSXMAG00000006235)	PANK4 (ENSXMAG00000006201)	ENSXMAG00000006198	si:ch73-21g5.7 (ENSXMAG00000019843)	ENSXMAG00000026037
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Mummichog	MODERN SPECIES	2475			PFKFB2 (ENSFHEG00000013035)	yod1 (ENSFHEG00000012934)	zgc:158258 (ENSFHEG00000012909)	kif17 (ENSFHEG00000012917)	sh2d5 (ENSFHEG00000012884)	hp1bp3 (ENSFHEG00000012840)	EIF4G3 (ENSFHEG00000012583)	ece1 (ENSFHEG00000012526)	alpl (ENSFHEG00000012366)	ENSFHEG00000012332	ENSFHEG00000012322	ENSFHEG00000012314	LACTBL1 (ENSFHEG00000012295) ##21	ephb2b (ENSFHEG00000012264) ##22	ENSFHEG00000000704	dhrs3b (ENSFHEG00000012198)	ENSFHEG00000012178	igsf21a (ENSFHEG00000012157) ##25
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	229	phtf1 (ENSCVAG00000017096)	PFKFB2 (ENSCVAG00000017067)	yod1 (ENSCVAG00000017018)	zgc:158258 (ENSCVAG00000017014)	ENSCVAG00000017006	ENSCVAG00000016989	sh2d5 (ENSCVAG00000016966)	hp1bp3 (ENSCVAG00000016945)	EIF4G3 (ENSCVAG00000016918)	ece1 (ENSCVAG00000016834)	alpl (ENSCVAG00000016782)	ENSCVAG00000016761	ENSCVAG00000000426	ENSCVAG00000016752	LACTBL1 (ENSCVAG00000016722) ##21	ephb2b (ENSCVAG00000016683) ##22	ENSCVAG00000016625	dhrs3b (ENSCVAG00000016619)	KLHDC7A (ENSCVAG00000016595)	igsf21a (ENSCVAG00000016582) ##25	ARHGEF10L (ENSCVAG00000016541) ##26	ENSCVAG00000016412	ENSCVAG00000016334	RNF207 (ENSCVAG00000016313)	zpr1 (ENSCVAG00000016212)	zpr1 (ENSCVAG00000016206)	ENSCVAG00000016198
Oryzias	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000155864.a.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT01100000264530	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.b	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.b.j.b	ENSGT00390000006658.a.a
Oryzias_b	ANCESTRAL SPECIES	64	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT01100000264530	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.b	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.b.j.b	ENSGT00390000006658.a.a
Javanese ricefish	MODERN SPECIES	19	ENSOJAG00000017908	cmah (ENSOJAG00000017695)	ENSOJAG00000017662	SEC61A1 (ENSOJAG00000017464)	chchd4a (ENSOJAG00000017441)	SH2D5 (ENSOJAG00000017417)	HP1BP3 (ENSOJAG00000017405)	EIF4G3 (ENSOJAG00000013950)	ece1 (ENSOJAG00000010707)	alpl (ENSOJAG00000009091)	ENSOJAG00000008953	ENSOJAG00000008943	ENSOJAG00000008905	ENSOJAG00000008885	LACTBL1 (ENSOJAG00000008871) ##21	ephb2b (ENSOJAG00000007955) ##22	ENSOJAG00000007856	dhrs3b (ENSOJAG00000007838)	ENSOJAG00000007814	igsf21a (ENSOJAG00000007803) ##25	ENSOJAG00000007795	ARHGEF10L (ENSOJAG00000005380) ##26	ENSOJAG00000004096	ENSOJAG00000003930	zpr1 (ENSOJAG00000003909)	RNF207 (ENSOJAG00000003536)	agtrap (ENSOJAG00000003480)	draxina (ENSOJAG00000003466)	PANK4 (ENSOJAG00000003433)	ENSOJAG00000003423	mtss1 (ENSOJAG00000003414)
Indian medaka	MODERN SPECIES	8	PFKFB2 (ENSOMEG00000016102)	ENSOMEG00000016080	yod1 (ENSOMEG00000016065)	ENSOMEG00000016051	ENSOMEG00000016033	ENSOMEG00000016008	sh2d5 (ENSOMEG00000015949)	hp1bp3 (ENSOMEG00000015881)	EIF4G3 (ENSOMEG00000015799)	ece1 (ENSOMEG00000015749)	alpl (ENSOMEG00000015701)	ENSOMEG00000015682	ENSOMEG00000015672	ENSOMEG00000000396	LACTBL1 (ENSOMEG00000015628) ##21	ephb2b (ENSOMEG00000015580) ##22	ENSOMEG00000015491	dhrs3b (ENSOMEG00000015466)	KLHDC7A (ENSOMEG00000015443)	igsf21a (ENSOMEG00000015413) ##25	ARHGEF10L (ENSOMEG00000015342) ##26	ENSOMEG00000015297	fbxl16 (ENSOMEG00000015263)	ENSOMEG00000015245	ENSOMEG00000015220	ENSOMEG00000015210	hao1 (ENSOMEG00000015190)	rpl23 (ENSOMEG00000000388)	ENSOMEG00000015161	ENSOMEG00000015144	nsfa (ENSOMEG00000015131)
Oryzias_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000155864.a.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT01000000215408	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT01100000264530	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00950000183156.a.b.b.b.b.b	ENSGT00970000193381.a.b.a.b.a.b.a.b.j.b	ENSGT00390000006658.a.a
Chinese medaka	MODERN SPECIES	12	phtf1 (ENSOSIG00000004411)	PFKFB2 (ENSOSIG00000005264)	yod1 (ENSOSIG00000012248)	ENSOSIG00000012249	ENSOSIG00000012250	ENSOSIG00000012252	SH2D5 (ENSOSIG00000012253)	hp1bp3 (ENSOSIG00000012256)	EIF4G3 (ENSOSIG00000012270)	ece1 (ENSOSIG00000012548)	alpl (ENSOSIG00000013006)	ENSOSIG00000015426	ENSOSIG00000015428	ENSOSIG00000015430	LACTBL1 (ENSOSIG00000015433) ##21	ephb2b (ENSOSIG00000015447) ##22	ENSOSIG00000015620	dhrs3b (ENSOSIG00000015622)	KLHDC7A (ENSOSIG00000015623)	igsf21a (ENSOSIG00000015625) ##25	ARHGEF10L (ENSOSIG00000015642) ##26	ENSOSIG00000017539	ENSOSIG00000017884	RNF207 (ENSOSIG00000017904)	ENSOSIG00000017906	agtrap (ENSOSIG00000017908)	draxina (ENSOSIG00000017909)	PANK4 (ENSOSIG00000017912)	mtss1 (ENSOSIG00000018076)	ENSOSIG00000018080	osgn1 (ENSOSIG00000018087)
Japanese Medaka HdrR	MODERN SPECIES	19	rab7a (ENSORLG00000029090)	phtf1 (ENSORLG00000016901)	PFKFB2 (ENSORLG00000016925)	yod1 (ENSORLG00000023946)	ENSORLG00000024489	ENSORLG00000025706	sh2d5 (ENSORLG00000016951)	hp1bp3 (ENSORLG00000016963)	EIF4G3 (ENSORLG00000017007)	ece1 (ENSORLG00000017044)	alpl (ENSORLG00000017066)	ENSORLG00000017075	ENSORLG00000029961	ENSORLG00000017078	LACTBL1 (ENSORLG00000017083) ##21	ephb2b (ENSORLG00000017097) ##22	ENSORLG00000017102	dhrs3b (ENSORLG00000017121)	KLHDC7A (ENSORLG00000017128)	igsf21a (ENSORLG00000017131) ##25	ENSORLG00000025613	ARHGEF10L (ENSORLG00000017150) ##26	ENSORLG00000024401	ENSORLG00000017190	RPL22 (ENSORLG00000028557)	RNF207 (ENSORLG00000017207)	zpr1 (ENSORLG00000017211)	agtrap (ENSORLG00000024798)	ENSORLG00000029769	PANK4 (ENSORLG00000004961)	ENSORLG00000029289
Ovalentaria_B	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.b
Cichlidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a.x.a
Pseudocrenilabrinae	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a.x.a
Nile tilapia	MODERN SPECIES	17	yod1 (ENSONIG00000041186)	ENSONIG00000034574	ENSONIG00000028511	yod1 (ENSONIG00000037612)	kif17 (ENSONIG00000000709)	SH2D5 (ENSONIG00000034595)	hp1bp3 (ENSONIG00000000705)	EIF4G3 (ENSONIG00000000697)	ece1 (ENSONIG00000000694)	alpl (ENSONIG00000000682)	ENSONIG00000027581	ENSONIG00000032733	ENSONIG00000000676	LACTBL1 (ENSONIG00000000675) ##21	ENSONIG00000041288	ephb2b (ENSONIG00000000648) ##22	ENSONIG00000035184	dhrs3b (ENSONIG00000000642)	aadacl4 (ENSONIG00000000640)	ENSONIG00000043102	ENSONIG00000034038	igsf21a (ENSONIG00000000637) ##25	ARHGEF10L (ENSONIG00000000627) ##26	CHD5 (ENSONIG00000000619)	RNF207 (ENSONIG00000000612)	zpr1 (ENSONIG00000035822)	agtrap (ENSONIG00000031816)	draxina (ENSONIG00000000605)	PANK4 (ENSONIG00000000594)	ENSONIG00000000592	ENSONIG00000041040
Pseudocrenilabrinae_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a.x.a
Lyretail cichlid	DUPLICATION
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Lyretail cichlid	MODERN SPECIES	294	phtf1 (ENSNBRG00000010204)	PFKFB2 (ENSNBRG00000010224)	yod1 (ENSNBRG00000010242)	zgc:158258 (ENSNBRG00000010255)	kif17 (ENSNBRG00000010274)	SH2D5 (ENSNBRG00000010301)	hp1bp3 (ENSNBRG00000010341)	EIF4G3 (ENSNBRG00000010386)	ece1 (ENSNBRG00000010451)	alpl (ENSNBRG00000010524)	ENSNBRG00000010572	ENSNBRG00000010600	ENSNBRG00000010617	LACTBL1 (ENSNBRG00000010646) ##21	ephb2b (ENSNBRG00000010699) ##22	ephb2b (ENSNBRG00000010956) ##22	ENSNBRG00000011141	dhrs3b (ENSNBRG00000011159)	aadacl4 (ENSNBRG00000011184)	ENSNBRG00000011211	KLHDC7A (ENSNBRG00000011226)	igsf21a (ENSNBRG00000011251) ##25	ARHGEF10L (ENSNBRG00000011289) ##26	ENSNBRG00000011387	RPL22 (ENSNBRG00000011493)	zpr1 (ENSNBRG00000011519)	RNF207 (ENSNBRG00000011578)	agtrap (ENSNBRG00000011665)	draxina (ENSNBRG00000011715)	PANK4 (ENSNBRG00000011751)	ENSNBRG00000011814
Haplochromini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a.x.a
Haplochromini_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a.x.a
Haplochromini_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000005306	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.a.x.a
Eastern happy	MODERN SPECIES	17	ora1 (ENSACLG00000001676)	phtf1 (ENSACLG00000001688)	PFKFB2 (ENSACLG00000001735)	yod1 (ENSACLG00000001781)	zgc:158258 (ENSACLG00000001799)	kif17 (ENSACLG00000001827)	SH2D5 (ENSACLG00000001922)	hp1bp3 (ENSACLG00000001943)	EIF4G3 (ENSACLG00000002006)	ece1 (ENSACLG00000002056)	alpl (ENSACLG00000002175)	ENSACLG00000002189	ENSACLG00000002220	ENSACLG00000002224	LACTBL1 (ENSACLG00000002228) ##21	ephb2b (ENSACLG00000002529) ##22	ENSACLG00000002622	dhrs3b (ENSACLG00000002634)	aadacl4 (ENSACLG00000002663)	ENSACLG00000002673	KLHDC7A (ENSACLG00000002684)	igsf21a (ENSACLG00000002737) ##25	ENSACLG00000002814	ENSACLG00000002827	ARHGEF10L (ENSACLG00000002923) ##26	CHD5 (ENSACLG00000003012)	RPL22 (ENSACLG00000003093)	zpr1 (ENSACLG00000003107)	RNF207 (ENSACLG00000003119)	agtrap (ENSACLG00000003213)	draxina (ENSACLG00000003223)
Zebra mbuna	MODERN SPECIES	1108	phtf1 (ENSMZEG00005001666)	PFKFB2 (ENSMZEG00005001625)	yod1 (ENSMZEG00005001616)	zgc:158258 (ENSMZEG00005001604)	kif17 (ENSMZEG00005001593)	SH2D5 (ENSMZEG00005001582)	ENSMZEG00005001566	hp1bp3 (ENSMZEG00005001543)	EIF4G3 (ENSMZEG00005001359)	ece1 (ENSMZEG00005001292)	alpl (ENSMZEG00005001246)	ENSMZEG00005001222	ENSMZEG00005001216	ENSMZEG00005001200	LACTBL1 (ENSMZEG00005001184) ##21	ephb2b (ENSMZEG00005001146) ##22	ENSMZEG00005001136	dhrs3b (ENSMZEG00005001119)	aadacl4 (ENSMZEG00005001102)	ENSMZEG00005001080	KLHDC7A (ENSMZEG00005001066)	igsf21a (ENSMZEG00005001029) ##25	ARHGEF10L (ENSMZEG00005000967) ##26	CHD5 (ENSMZEG00005000841)	RPL22 (ENSMZEG00005000812)	zpr1 (ENSMZEG00005000802)	RNF207 (ENSMZEG00005000795)	agtrap (ENSMZEG00005000787)	draxina (ENSMZEG00005000760)	PANK4 (ENSMZEG00005000656)	ENSMZEG00005000601
P. nyererei	MODERN SPECIES	329	ora1 (ENSPNYG00000004260)	phtf1 (ENSPNYG00000004248)	PFKFB2 (ENSPNYG00000004204)	yod1 (ENSPNYG00000004187)	zgc:158258 (ENSPNYG00000004171)	kif17 (ENSPNYG00000004103)	sh2d5 (ENSPNYG00000004082)	hp1bp3 (ENSPNYG00000004052)	EIF4G3 (ENSPNYG00000003941)	ece1 (ENSPNYG00000003897)	alpl (ENSPNYG00000003826)	ENSPNYG00000003791	ENSPNYG00000003771	ENSPNYG00000003752	LACTBL1 (ENSPNYG00000003690) ##21	ephb2b (ENSPNYG00000003628) ##22	ENSPNYG00000003615	dhrs3b (ENSPNYG00000003592)	aadacl4 (ENSPNYG00000003573)	ENSPNYG00000003545	KLHDC7A (ENSPNYG00000003522)	igsf21a (ENSPNYG00000003495) ##25	ARHGEF10L (ENSPNYG00000003438) ##26	CHD5 (ENSPNYG00000003183)	RPL22 (ENSPNYG00000003137)	zpr1 (ENSPNYG00000003124)	RNF207 (ENSPNYG00000003018)	agtrap (ENSPNYG00000003006)	draxina (ENSPNYG00000002983)	PANK4 (ENSPNYG00000002928)	ENSPNYG00000002868
Burton s mouthbrooder	MODERN SPECIES	290	ora1 (ENSHBUG00000012070)	phtf1 (ENSHBUG00000012109)	PFKFB2 (ENSHBUG00000012129)	yod1 (ENSHBUG00000012135)	zgc:158258 (ENSHBUG00000012157)	kif17 (ENSHBUG00000012165)	sh2d5 (ENSHBUG00000012181)	hp1bp3 (ENSHBUG00000012191)	EIF4G3 (ENSHBUG00000012960)	ece1 (ENSHBUG00000013032)	alpl (ENSHBUG00000013045)	ENSHBUG00000013072	ENSHBUG00000013086	ENSHBUG00000013096	LACTBL1 (ENSHBUG00000000379) ##21	ephb2b (ENSHBUG00000013185) ##22	ENSHBUG00000013196	dhrs3b (ENSHBUG00000013247)	aadacl4 (ENSHBUG00000013258)	ENSHBUG00000013272	KLHDC7A (ENSHBUG00000013291)	igsf21a (ENSHBUG00000013331) ##25	ARHGEF10L (ENSHBUG00000013379) ##26	CHD5 (ENSHBUG00000013453)	RPL22 (ENSHBUG00000013477)	zpr1 (ENSHBUG00000013492)	RNF207 (ENSHBUG00000013511)	agtrap (ENSHBUG00000013521)	draxina (ENSHBUG00000000401)	PANK4 (ENSHBUG00000013640)	ENSHBUG00000013653
Midas cichlid	MODERN SPECIES	867	ora1 (ENSACIG00000011608)	phtf1 (ENSACIG00000011614)	PFKFB2 (ENSACIG00000011647)	yod1 (ENSACIG00000011690)	zgc:158258 (ENSACIG00000011699)	kif17 (ENSACIG00000011723)	SH2D5 (ENSACIG00000011812)	hp1bp3 (ENSACIG00000011836)	EIF4G3 (ENSACIG00000011915)	ece1 (ENSACIG00000012205)	alpl (ENSACIG00000012255)	ENSACIG00000012284	ENSACIG00000012344	ENSACIG00000012376	LACTBL1 (ENSACIG00000012405) ##21	ephb2b (ENSACIG00000012424) ##22	ENSACIG00000012459	dhrs3b (ENSACIG00000012470)	ENSACIG00000012488	aadacl4 (ENSACIG00000012500)	KLHDC7A (ENSACIG00000012506)	igsf21a (ENSACIG00000012509) ##25	ENSACIG00000012538 ##26	CHD5 (ENSACIG00000012582)	RPL22 (ENSACIG00000012777)	RNF207 (ENSACIG00000012803)	zpr1 (ENSACIG00000012865)	agtrap (ENSACIG00000012872)	draxina (ENSACIG00000012896)	PANK4 (ENSACIG00000012957)	ENSACIG00000013010
Pomacentridae	ANCESTRAL SPECIES	56	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00980000202817	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.p	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896
Pomacentridae_A	ANCESTRAL SPECIES	72	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.p	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000178714	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT01060000248901
Amphiprion	ANCESTRAL SPECIES	150					ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000177237.C.b	ENSGT00940000177256.B	ENSGT00940000177256.A	ENSGT01010000222588	ENSGT00980000198685	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000155088.a	ENSGT00940000159249.b.h	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000005306	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896
Orange clownfish	MODERN SPECIES	20	ENSAPEG00000019651	ENSAPEG00000019662	ENSAPEG00000019671	ENSAPEG00000019689	ENSAPEG00000019719	ENSAPEG00000019732	ENSAPEG00000019749	ENSAPEG00000019762	ENSAPEG00000019778	ENSAPEG00000019807	ENSAPEG00000019842	ENSAPEG00000019897	ENSAPEG00000019915	ENSAPEG00000019957	LACTBL1 (ENSAPEG00000019981) ##21	ephb2b (ENSAPEG00000020015) ##22	ENSAPEG00000020076	dhrs3b (ENSAPEG00000020086)	aadacl4 (ENSAPEG00000020108)	ENSAPEG00000020119	KLHDC7A (ENSAPEG00000020134)	igsf21a (ENSAPEG00000020166) ##25	ARHGEF10L (ENSAPEG00000020222) ##26	ENSAPEG00000020306	RPL22 (ENSAPEG00000020428)	RNF207 (ENSAPEG00000020458)	zpr1 (ENSAPEG00000020534)	agtrap (ENSAPEG00000020536)	draxina (ENSAPEG00000020618)	PANK4 (ENSAPEG00000020675)	ENSAPEG00000020728
Clown anemonefish	MODERN SPECIES	822	hp1bp3 (ENSAOCG00000001796)	EIF4G3 (ENSAOCG00000011942)	ece1 (ENSAOCG00000012038)	alpl (ENSAOCG00000002145)	ENSAOCG00000012082	ENSAOCG00000012091	ENSAOCG00000012100	ENSAOCG00000012116	ENSAOCG00000012127	ENSAOCG00000012134	ENSAOCG00000000747	ENSAOCG00000012152	ENSAOCG00000012165	ENSAOCG00000012178	LACTBL1 (ENSAOCG00000012198) ##21	ephb2b (ENSAOCG00000000756) ##22	ENSAOCG00000012304	INSM2 (ENSAOCG00000012374)
Spiny chromis	MODERN SPECIES	917														ENSAPOG00000009529	LACTBL1 (ENSAPOG00000009520) ##21	ephb2b (ENSAPOG00000009493) ##22
Bicolor damselfish	MODERN SPECIES	285	nupr1a (ENSSPAG00000018090)	znhit3 (ENSSPAG00000018160)	MYO19 (ENSSPAG00000018111)	pigw (ENSSPAG00000018170)	ggnbp2 (ENSSPAG00000018182)	dhrs11a (ENSSPAG00000018245)	ENSSPAG00000018281	flot2a (ENSSPAG00000018320)	eral1 (ENSSPAG00000018370)	fam222ba (ENSSPAG00000018429)	trpv1 (ENSSPAG00000018443)	ENSSPAG00000018465	ENSSPAG00000018482	ENSSPAG00000018502	LACTBL1 (ENSSPAG00000018526) ##21	ephb2b (ENSSPAG00000018544) ##22	ENSSPAG00000018570	dhrs3b (ENSSPAG00000018587)	aadacl4 (ENSSPAG00000018608)	KLHDC7A (ENSSPAG00000018625)	ENSSPAG00000018638	igsf21a (ENSSPAG00000018650) ##25	ARHGEF10L (ENSSPAG00000018676) ##26	CHD5 (ENSSPAG00000018749)	ENSSPAG00000019073	RNF207 (ENSSPAG00000019088)	agtrap (ENSSPAG00000019131)	draxina (ENSSPAG00000019144)	PANK4 (ENSSPAG00000019192)	ENSSPAG00000019272	ENSSPAG00000019291
Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00940000177901	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402.f	ENSGT00390000013828	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000163346.a.i.a	ENSGT01060000248883
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	DUPLICATION
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	116	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b.d	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.f	ENSGT00390000009989.l	ENSGT00390000017874.a.h	ENSGT01030000238086	ENSGT00940000155314.p.d	ENSGT00940000155314.o.c	ENSGT00940000156454.cb.a	ENSGT00940000156050.k.b	ENSGT00950000183063.d.h	ENSGT01010000222588	ENSGT00960000186977.f.b	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.c	ENSGT00450000040404.a.f ##21	ENSGT00940000155503.a.e.a.a ##22	ENSGT00940000155503.a.e.b ##22	ENSGT00940000163979.h	ENSGT00940000158724.a.d	ENSGT00940000163565.j	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724.i	ENSGT00390000002421.b.a ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.b ##26	ENSGT00940000159249.b.f	ENSGT00940000153798.A.b.g.d ##26	ENSGT00940000159249.b.e	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394.j	ENSGT00940000163346.b.r
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155503.a.e.a.a ##22
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b.d	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.f	ENSGT00390000009989.l	ENSGT00390000017874.a.h	ENSGT00940000155314.p.d	ENSGT00940000155314.o.c	ENSGT00940000156454.cb.a	ENSGT00940000156050.k.b	ENSGT00950000183063.d.h.d	ENSGT00950000183063.d.h.c	ENSGT00940000166278.B.b.b.b	ENSGT00960000186977.e	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.c	ENSGT00450000040404.a.f ##21	ENSGT00940000155503.a.e.a.a ##22	ENSGT00940000163979.h	ENSGT00940000158724.a.d	ENSGT00940000163565.j	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724.i	ENSGT00390000002421.b.a ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.b ##26	ENSGT00940000159249.b.f	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402.e	ENSGT00390000013828.g	ENSGT00940000158896.d	ENSGT00940000163346.a.i.b.a.b.a	ENSGT01060000248883.a.a.a.b	ENSGT00940000163346.a.i.b.a.a.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	3	ENSSSAG00000063687	ENSSSAG00000063599	ENSSSAG00000059913	ENSSSAG00000106703	zgc:158258 (ENSSSAG00000059782)	ENSSSAG00000083751	hp1bp3 (ENSSSAG00000059690)	EIF4G3 (ENSSSAG00000010055)	ece1 (ENSSSAG00000004876)	alpl (ENSSSAG00000004223)	alpl (ENSSSAG00000004567)	ENSSSAG00000098418	ENSSSAG00000074719	ENSSSAG00000074717	ENSSSAG00000089815 ##21	ephb2b (ENSSSAG00000074141) ##22	ENSSSAG00000083297	dhrs3 (ENSSSAG00000074105)	aadacl4 (ENSSSAG00000074094)	ENSSSAG00000097047	KLHDC7A (ENSSSAG00000074087)	igsf21a (ENSSSAG00000074074) ##25	ARHGEF10L (ENSSSAG00000073755) ##26	ENSSSAG00000069188	ENSSSAG00000069022	ENSSSAG00000102733	agtrap (ENSSSAG00000118776)	ENSSSAG00000069005	ENSSSAG00000070746	ENSSSAG00000110743	ENSSSAG00000111689
River trout	MODERN SPECIES	5	ora1 (ENSSTUG00000050279)	phtf1 (ENSSTUG00000050284)	PFKFB2 (ENSSTUG00000050373)	yod1 (ENSSTUG00000050406)	sh2d5 (ENSSTUG00000050408)	hp1bp3 (ENSSTUG00000050410)	EIF4G3 (ENSSTUG00000050552)	ece1 (ENSSTUG00000051083)	alpl (ENSSTUG00000051116)	ENSSTUG00000051141	alpl (ENSSTUG00000051142)	ENSSTUG00000051143	ENSSTUG00000051144	ENSSTUG00000051145	LACTBL1 (ENSSTUG00000051146) ##21	ephb2b (ENSSTUG00000051147) ##22	ENSSTUG00000051148	dhrs3b (ENSSTUG00000051149)	aadacl4 (ENSSTUG00000051150)	ENSSTUG00000051151	KLHDC7A (ENSSTUG00000051152)	igsf21a (ENSSTUG00000051153) ##25	ARHGEF10L (ENSSTUG00000051154) ##26	CHD5 (ENSSTUG00000051156)	ENSSTUG00000051240	agtrap (ENSSTUG00000051241)	draxina (ENSSTUG00000051242)	ENSSTUG00000001663	ENSSTUG00000002401	ENSSTUG00000002409	ENSSTUG00000002416
Huchen	MODERN SPECIES	1035	PFKFB2 (ENSHHUG00000038455)	yod1 (ENSHHUG00000039793)	zgc:158258 (ENSHHUG00000039798)	ENSHHUG00000039806	sh2d5 (ENSHHUG00000039823)	hp1bp3 (ENSHHUG00000039883)	EIF4G3 (ENSHHUG00000039912)	ENSHHUG00000040640	ece1 (ENSHHUG00000040647)	alpl (ENSHHUG00000040833)	alpl (ENSHHUG00000041035)	ENSHHUG00000041682	ENSHHUG00000041689	ENSHHUG00000041699	LACTBL1 (ENSHHUG00000041708) ##21	ephb2b (ENSHHUG00000041729) ##22	ENSHHUG00000041738	ENSHHUG00000041748	ENSHHUG00000041764
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155503.a.e.a.b ##22
Huchen	DUPLICATION
Huchen	DUPLICATION
Huchen	MODERN SPECIES	5582														ephb2b (ENSHHUG00000013744) ##22	ENSHHUG00000013751 ##22	ephb2b (ENSHHUG00000013765) ##22
Huchen	MODERN SPECIES	5582															ephb2b (ENSHHUG00000013744) ##22	ENSHHUG00000013751 ##22	ephb2b (ENSHHUG00000013765) ##22
Huchen	MODERN SPECIES	5582														ephb2b (ENSHHUG00000013765) ##22	ENSHHUG00000013751 ##22	ephb2b (ENSHHUG00000013744) ##22
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	116	ENSGT00390000011648.b.d	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.f	ENSGT00390000009989.l	ENSGT00390000017874.a.h	ENSGT01030000238086	ENSGT00940000155314.p.d	ENSGT00940000155314.o.c	ENSGT00940000156454.cb.a	ENSGT00940000156050.k.b	ENSGT00950000183063.d.h	ENSGT01010000222588	ENSGT00960000186977.f.b	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.c	ENSGT00450000040404.a.f ##21	ENSGT00940000155503.a.e.a.a ##22	ENSGT00940000155503.a.e.b ##22	ENSGT00940000163979.h	ENSGT00940000158724.a.d	ENSGT00940000163565.j	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724.i	ENSGT00390000002421.b.a ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.b ##26	ENSGT00940000159249.b.f	ENSGT00940000153798.A.b.g.d ##26	ENSGT00940000159249.b.e	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394.j	ENSGT00940000163346.b.r	ENSGT00940000163190.h.a.a.fb
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b.d	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.f	ENSGT00390000009989.l	ENSGT00390000017874.a.h	ENSGT01030000238086	ENSGT00940000155314.p.d	ENSGT00940000155314.o.c	ENSGT00940000156454.cb.a	ENSGT00940000156050.k.b	ENSGT00950000183063.d.h	ENSGT00940000154436.c	ENSGT00960000186977.f.b	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.c	ENSGT00450000040404.a.f ##21	ENSGT00940000155503.a.e.b ##22	ENSGT00940000163979.h	ENSGT00940000158724.a.d	ENSGT00940000163565.j	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724.i	ENSGT00390000002421.b.a ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.b ##26	ENSGT00940000159249.b.f	ENSGT00940000153314.a.b.a	ENSGT00390000017402.e	ENSGT00390000013828.g	ENSGT00940000158896.d	ENSGT00940000163346.a.i.b.a.a.a	ENSGT00940000163190.h.a.b.gb	ENSGT00940000163190.g.b.d
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT01030000234553.a	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b.d	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.f	ENSGT00390000009989.l	ENSGT00390000017874.a.h	ENSGT01030000238086	ENSGT00940000155314.p.d	ENSGT00940000155314.o.c	ENSGT00940000156454.cb.a	ENSGT00940000156050.k.b	ENSGT00950000183063.d.h	ENSGT00940000154436.c	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.c	ENSGT00450000040404.a.f ##21	ENSGT00940000155503.a.e.b ##22	ENSGT00940000163979.h	ENSGT00940000158724.a.d	ENSGT00940000163565.j	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724.i	ENSGT00390000002421.b.a ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.b ##26	ENSGT00940000159249.b.f	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402.f	ENSGT00390000013828.g	ENSGT00940000158896.d	ENSGT00940000163346.a.i.b.a.a.a	ENSGT00940000163190.h.a.b.gb	ENSGT00940000163190.g.b.d
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT01030000234553.a	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b.d	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.f	ENSGT00390000009989.l	ENSGT00390000017874.a.h	ENSGT01030000238086	ENSGT00940000155314.p.d	ENSGT00940000155314.o.c	ENSGT00940000156454.cb.a	ENSGT00940000156050.k.b	ENSGT00950000183063.d.h	ENSGT00940000154436.c	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.c	ENSGT00450000040404.a.f ##21	ENSGT00940000155503.a.e.b ##22	ENSGT00940000163979.h	ENSGT00940000158724.a.d	ENSGT00940000163565.j	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724.i	ENSGT00390000002421.b.a ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.b ##26	ENSGT00940000159249.b.f	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402.f	ENSGT00390000013828.g	ENSGT00940000158896.d	ENSGT00940000163346.a.i.b.a.a.a	ENSGT00940000163190.h.a.b.gb	ENSGT00940000163190.g.b.d
Coho salmon	MODERN SPECIES		PLXNA2 (ENSOKIG00005035900)	ENSOKIG00005037984	ENSOKIG00005038017	ora1-2 (ENSOKIG00005038021)	phtf1 (ENSOKIG00005038043)	PFKFB2 (ENSOKIG00005038252)	zgc:158258 (ENSOKIG00005038601)	ENSOKIG00005025297	hp1bp3 (ENSOKIG00005025317)	EIF4G3 (ENSOKIG00005025588)	ece1 (ENSOKIG00005027418)	alpl (ENSOKIG00005029322)	ENSOKIG00005029823	ENSOKIG00005029834	LACTBL1 (ENSOKIG00005029841) ##21	ephb2b (ENSOKIG00005029863) ##22	LRRC38 (ENSOKIG00005030308) #23	dhrs3b (ENSOKIG00005030322)	aadacl4 (ENSOKIG00005030373)	ENSOKIG00005030423	KLHDC7A (ENSOKIG00005030436)	igsf21a (ENSOKIG00005030450) ##25	ARHGEF10L (ENSOKIG00005030589) ##26	CHD5 (ENSOKIG00005031737)	ENSOKIG00005038176	agtrap (ENSOKIG00005038223)	draxina (ENSOKIG00005038247)	PANK4 (ENSOKIG00005038375)	ENSOKIG00005039246	ENSOKIG00005039260	her2 (ENSOKIG00005039276)
Chinook salmon	MODERN SPECIES	11	PLXNA2 (ENSOTSG00005040426)	ENSOTSG00005040414	ora1 (ENSOTSG00005040413)	phtf1 (ENSOTSG00005040214)	yod1 (ENSOTSG00005040209)	zgc:158258 (ENSOTSG00005040208)	ENSOTSG00005040206	sh2d5 (ENSOTSG00005040204)	hp1bp3 (ENSOTSG00005040203)	EIF4G3 (ENSOTSG00005039494)	ece1 (ENSOTSG00005029884)	alpl (ENSOTSG00005028581)	ENSOTSG00005028578	ENSOTSG00005028577	LACTBL1 (ENSOTSG00005028576) ##21	ephb2b (ENSOTSG00005028082) ##22	ENSOTSG00005028080	dhrs3b (ENSOTSG00005028079)	aadacl4 (ENSOTSG00005028078)	ENSOTSG00005028077	KLHDC7A (ENSOTSG00005028076)	igsf21a (ENSOTSG00005028075) ##25	ARHGEF10L (ENSOTSG00005027955) ##26	CHD5 (ENSOTSG00005011318)	ENSOTSG00005011271	agtrap (ENSOTSG00005011269)	draxina (ENSOTSG00005011263)	PANK4 (ENSOTSG00005010450)	ENSOTSG00005010443	ENSOTSG00005010441	ENSOTSG00005010440
Rainbow trout	MODERN SPECIES	8	ENSOMYG00000042738	ENSOMYG00000042737	ENSOMYG00000042727	ENSOMYG00000042682	yod1 (ENSOMYG00000042650)	zgc:158258 (ENSOMYG00000042648)	SH2D5 (ENSOMYG00000042645)	hp1bp3 (ENSOMYG00000042641)	EIF4G3 (ENSOMYG00000036905)	ece1 (ENSOMYG00000031040)	ENSOMYG00000072669	alpl (ENSOMYG00000027581)	ENSOMYG00000027392	ENSOMYG00000027380	ENSOMYG00000027371 ##21	ephb2b (ENSOMYG00000024862) ##22	ENSOMYG00000024200	dhrs3b (ENSOMYG00000024195)	ENSOMYG00000024181	KLHDC7A (ENSOMYG00000024175)	igsf21a (ENSOMYG00000024161) ##25	ENSOMYG00000066711	ARHGEF10L (ENSOMYG00000023931) ##26	ENSOMYG00000015681	ENSOMYG00000066568	agtrap (ENSOMYG00000015085)	ENSOMYG00000015062	ENSOMYG00000013797	ENSOMYG00000013677	ENSOMYG00000013671	ENSOMYG00000013666
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	433	ENSGT00390000011648.b.c	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.e	ENSGT00390000009989.k	ENSGT00390000017874.a.g	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p.c	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o.d	ENSGT00940000156454.cb.b	ENSGT00940000156050.k.a	ENSGT00950000183063.d.g	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977.f.a	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.d	ENSGT00450000040404.a.e ##21	ENSGT00940000155503.a.f ##22	ENSGT00940000163979.g	ENSGT00940000158724.a.c	ENSGT00940000163565.i	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724.j	ENSGT00390000002421.b.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.a ##26
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00390000011648.b.c	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.e	ENSGT00390000009989.k	ENSGT00390000017874.a.g	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p.c	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o.d	ENSGT00940000156454.cb.b	ENSGT00940000156050.k.a	ENSGT00950000183063.d.g	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977.f.a	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.d	ENSGT00450000040404.a.e ##21	ENSGT00940000155503.a.f ##22	ENSGT00940000163979.g	ENSGT00940000158724.a.c	ENSGT00940000163565.i	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724.j	ENSGT00390000002421.b.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.a ##26	ENSGT00940000159249.b.e	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402.f	ENSGT00390000013828.h	ENSGT00940000158896.c	ENSGT00940000163346.a.i.a.a	ENSGT00940000163346.a.i.a.b	ENSGT01060000248883.a.b
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River trout	MODERN SPECIES	7	ENSSTUG00000027672	ENSSTUG00000027565	phtf1 (ENSSTUG00000027535)	PFKFB2 (ENSSTUG00000027227)	yod1 (ENSSTUG00000027204)	zgc:158258 (ENSSTUG00000027194)	kif17 (ENSSTUG00000027117)	hp1bp3 (ENSSTUG00000027101)	EIF4G3 (ENSSTUG00000022483)	ece1 (ENSSTUG00000017317)	alpl (ENSSTUG00000015054)	ENSSTUG00000014968	ENSSTUG00000014961	ENSSTUG00000014875	LACTBL1 (ENSSTUG00000014805) ##21	ephb2b (ENSSTUG00000014210) ##22	ENSSTUG00000014187	dhrs3b (ENSSTUG00000014179)	aadacl4 (ENSSTUG00000014172)	ENSSTUG00000014168	KLHDC7A (ENSSTUG00000014162)	igsf21a (ENSSTUG00000014138) ##25	ENSSTUG00000014134	ARHGEF10L (ENSSTUG00000013520) ##26	CHD5 (ENSSTUG00000011056)	RPL22 (ENSSTUG00000010992)	RNF207 (ENSSTUG00000010752)	agtrap (ENSSTUG00000010730)	draxina (ENSSTUG00000010698)	PANK4 (ENSSTUG00000010142)	ENSSTUG00000010125
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	14	ENSSSAG00000086662	cd34 (ENSSSAG00000079346)	ENSSSAG00000079487	ENSSSAG00000080689	ENSSSAG00000080735	yod1 (ENSSSAG00000111797)	zgc:158258 (ENSSSAG00000094334)	kif17 (ENSSSAG00000080862)	hp1bp3 (ENSSSAG00000106347)	EIF4G3 (ENSSSAG00000080942)	ece1 (ENSSSAG00000081046)	ppb (ENSSSAG00000081220)	ENSSSAG00000081261	ENSSSAG00000085467	ENSSSAG00000121243 ##21	ephb2b (ENSSSAG00000073864) ##22	ENSSSAG00000081358	dhrs3b (ENSSSAG00000088298)	aadacl4 (ENSSSAG00000081362)	KLHDC7A (ENSSSAG00000081367)	igsf21a (ENSSSAG00000081369) ##25	ARHGEF10L (ENSSSAG00000081396) ##26	ENSSSAG00000052234	ENSSSAG00000070637	ENSSSAG00000070650	ENSSSAG00000087804	agtrap (ENSSSAG00000070716)	ENSSSAG00000070721	ENSSSAG00000068619	ENSSSAG00000112667	ENSSSAG00000112505
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00390000011648.b.c	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.e	ENSGT00390000009989.k	ENSGT00390000017874.a.g	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p.c	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o.d	ENSGT00940000156454.cb.b	ENSGT00940000156050.k.a	ENSGT00950000183063.d.g	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977.f.a	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.d	ENSGT00450000040404.a.e ##21	ENSGT00940000155503.a.f ##22	ENSGT00940000163979.g	ENSGT00940000158724.a.c	ENSGT00940000163565.i	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724.j	ENSGT00390000002421.b.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.a ##26	ENSGT00940000159249.b.e	ENSGT00390000013828.h	ENSGT00940000158896.c	ENSGT00940000163346.a.i.a.a	ENSGT00940000163346.a.i.a.b	ENSGT00940000163190.g.a	ENSGT00940000163190.h.a.b.fb.e.a	ENSGT00940000163190.h.a.b.fb.e.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	28	ENSOMYG00000067501	yod1 (ENSOMYG00000025312)	ENSOMYG00000052249	zgc:158258 (ENSOMYG00000025332)	kif17 (ENSOMYG00000025397)	ENSOMYG00000070947	ENSOMYG00000025440	hp1bp3 (ENSOMYG00000025578)	EIF4G3 (ENSOMYG00000026700)	ece1 (ENSOMYG00000032607)	alpl (ENSOMYG00000035100)	ENSOMYG00000037478	ENSOMYG00000037485	ENSOMYG00000037491	ENSOMYG00000037498 ##21	ephb2b (ENSOMYG00000037539) ##22	ENSOMYG00000037580	dhrs3b (ENSOMYG00000037587)	aadacl4 (ENSOMYG00000037601)	KLHDC7A (ENSOMYG00000053996)	igsf21a (ENSOMYG00000037616) ##25	ARHGEF10L (ENSOMYG00000024238) ##26	ENSOMYG00000075616	CHD5 (ENSOMYG00000024504)	ENSOMYG00000024793	RNF207 (ENSOMYG00000024921)	ENSOMYG00000025130	ENSOMYG00000025540	ENSOMYG00000027847	ENSOMYG00000057120	ENSOMYG00000061562
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT01050000244850.C.b.u.b.c	ENSGT00390000011648.b.c	ENSGT00950000182835.d.a.k.a.e	ENSGT00390000009989.k	ENSGT00390000017874.a.g	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p.c	ENSGT00940000155314.o.d	ENSGT00940000156454.cb.b	ENSGT00940000156050.k.a	ENSGT00950000183063.d.g	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977.f.a	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.d	ENSGT00450000040404.a.e ##21	ENSGT00940000155503.a.f ##22	ENSGT00940000163979.g	ENSGT00940000158724.a.c	ENSGT00940000163565.i	ENSGT00940000177901	ENSGT00940000162724.j	ENSGT00390000002421.b.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.c.a ##26	ENSGT00940000159249.b.e	ENSGT00390000013828.h	ENSGT00940000158896.c	ENSGT00940000163346.a.i.a.a	ENSGT00940000163346.a.i.a.b	ENSGT00940000163190.g.a	ENSGT00940000163190.h.a.b.fb.e.a	ENSGT00940000163190.h.a.b.fb.e.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES	31	PLXNA2 (ENSOTSG00005009242)	phtf1 (ENSOTSG00005015234)	PFKFB2 (ENSOTSG00005015249)	yod1 (ENSOTSG00005016018)	zgc:158258 (ENSOTSG00005016019)	kif17 (ENSOTSG00005016020)	sh2d5 (ENSOTSG00005016021)	hp1bp3 (ENSOTSG00005016023)	EIF4G3 (ENSOTSG00005016064)	ece1 (ENSOTSG00005017661)	alpl (ENSOTSG00005024161)	ENSOTSG00005025509	ENSOTSG00005025512	ENSOTSG00005025514	LACTBL1 (ENSOTSG00005025517) ##21	ephb2b (ENSOTSG00005025532) ##22	ENSOTSG00005026761	dhrs3b (ENSOTSG00005026762)	aadacl4 (ENSOTSG00005026764)	ENSOTSG00005026765	igsf21a (ENSOTSG00005026769) ##25	ARHGEF10L (ENSOTSG00005026776) ##26	CHD5 (ENSOTSG00005027219)	ENSOTSG00005027743	RPL22 (ENSOTSG00005027745)	RNF207 (ENSOTSG00005027752)	draxina (ENSOTSG00005027755)	ENSOTSG00005027765	ENSOTSG00005028084	ENSOTSG00005028085	ENSOTSG00005028086
Coho salmon	MODERN SPECIES	25	PLXNA2 (ENSOKIG00005032182)	PHTF1 (ENSOKIG00005033957)	PFKFB2 (ENSOKIG00005034167)	yod1 (ENSOKIG00005034695)	zgc:158258 (ENSOKIG00005034713)	kif17 (ENSOKIG00005034726)	ENSOKIG00005034750	hp1bp3 (ENSOKIG00005034751)	EIF4G3 (ENSOKIG00005035003)	ece1 (ENSOKIG00005040402)	alpl (ENSOKIG00005044045)	ENSOKIG00005045386	ENSOKIG00005045399	ENSOKIG00005045409	LACTBL1 (ENSOKIG00005045415) ##21	ephb2b (ENSOKIG00005045453) ##22	ENSOKIG00005045841	dhrs3b (ENSOKIG00005045849)	aadacl4 (ENSOKIG00005045859)	ENSOKIG00005045864	KLHDC7A (ENSOKIG00005045872)	igsf21a (ENSOKIG00005045893) ##25	ENSOKIG00005045905	ARHGEF10L (ENSOKIG00005045942) ##26	CHD5 (ENSOKIG00005046539)	RPL22 (ENSOKIG00005046576)	RNF207 (ENSOKIG00005046592)	ENSOKIG00005046609	ENSOKIG00005046618	PANK4 (ENSOKIG00005046652)	ENSOKIG00005046836
Huchen	MODERN SPECIES	130	ENSHHUG00000015688	phtf1 (ENSHHUG00000015531)	PFKFB2 (ENSHHUG00000014185)	yod1 (ENSHHUG00000014165)	zgc:158258 (ENSHHUG00000014157)	kif17 (ENSHHUG00000014144)	sh2d5 (ENSHHUG00000014125)	hp1bp3 (ENSHHUG00000014108)	EIF4G3 (ENSHHUG00000013185)	ece1 (ENSHHUG00000012236)	alpl (ENSHHUG00000010759)	ENSHHUG00000010707	ENSHHUG00000010697	ENSHHUG00000010633	LACTBL1 (ENSHHUG00000010614) ##21	ephb2b (ENSHHUG00000010143) ##22	ENSHHUG00000010138	dhrs3b (ENSHHUG00000010127)	aadacl4 (ENSHHUG00000010120)	KLHDC7A (ENSHHUG00000010110)	igsf21a (ENSHHUG00000010094) ##25	ENSHHUG00000010087	ENSHHUG00000010079	ENSHHUG00000010075	ENSHHUG00000010050 ##26
Northern pike	MODERN SPECIES	16	PLXNA2 (ENSELUG00000001371)	ENSELUG00000009583	ora1 (ENSELUG00000009589)	phtf1 (ENSELUG00000009614)	PFKFB2 (ENSELUG00000009669)	yod1 (ENSELUG00000001090)	zgc:158258 (ENSELUG00000009728)	kif17 (ENSELUG00000001532)	sh2d5 (ENSELUG00000009815)	hp1bp3 (ENSELUG00000009837)	EIF4G3 (ENSELUG00000009920)	ece1 (ENSELUG00000010010)	alpl (ENSELUG00000010091)	ENSELUG00000010123	LACTBL1 (ENSELUG00000010144) ##21	ephb2b (ENSELUG00000010203) ##22	ENSELUG00000010228	ENSELUG00000030264	ENSELUG00000010239	KLHDC7A (ENSELUG00000000370)	aadacl4 (ENSELUG00000010255)	igsf21a (ENSELUG00000010268) ##25	ARHGEF10L (ENSELUG00000010328) ##26	CHD5 (ENSELUG00000010742)	agtrap (ENSELUG00000010846)	draxina (ENSELUG00000010868)	PANK4 (ENSELUG00000010957)	ENSELUG00000010982	ENSELUG00000010992	aldh4a1 (ENSELUG00000011090)	mrto4 (ENSELUG00000026390)
Otomorpha	ANCESTRAL SPECIES	76	ENSGT01030000234553.a	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00940000155314.p	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828.i	ENSGT00940000158896	ENSGT01060000248901	ENSGT00940000163346.a	ENSGT01060000248883
Clupeiformes	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT01030000234553.b.b	ENSGT00390000011648.b	ENSGT00950000182835.d.a.k.a	ENSGT00390000009989	ENSGT00390000017874.a	ENSGT00940000158776	ENSGT00510000048936	ENSGT00940000155314.o	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00940000154436.c.a	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828.i	ENSGT00940000158896	ENSGT01060000248901	ENSGT00940000163346.a	ENSGT01060000248883
Atlantic herring	MODERN SPECIES	21	PFKFB2 (ENSCHAG00000008207)	yod1 (ENSCHAG00000009252)	zgc:158258 (ENSCHAG00000009257)	ENSCHAG00000009280	ENSCHAG00000009291	sh2d5 (ENSCHAG00000009340)	hp1bp3 (ENSCHAG00000009356)	EIF4G3 (ENSCHAG00000009429)	ece1 (ENSCHAG00000011765)	alpl (ENSCHAG00000016970)	ENSCHAG00000018682	ENSCHAG00000018689	ENSCHAG00000018695	ENSCHAG00000018709	LACTBL1 (ENSCHAG00000018983) ##21	ephb2b (ENSCHAG00000019006) ##22	ENSCHAG00000020011	ENSCHAG00000020047	dhrs3b (ENSCHAG00000020060)	aadacl4 (ENSCHAG00000020118)	ENSCHAG00000020130	KLHDC7A (ENSCHAG00000020135)	igsf21a (ENSCHAG00000020164) ##25	ARHGEF10L (ENSCHAG00000020218) ##26	ENSCHAG00000021050	CHD5 (ENSCHAG00000021182)	RNF207 (ENSCHAG00000024587)	agtrap (ENSCHAG00000024597)	draxina (ENSCHAG00000024606)	PANK4 (ENSCHAG00000024661)	ENSCHAG00000024815
Denticle herring	MODERN SPECIES	3	ora1 (ENSDCDG00000027689)	phtf1 (ENSDCDG00000027691)	PFKFB2 (ENSDCDG00000027715)	yod1 (ENSDCDG00000029977)	zgc:158258 (ENSDCDG00000029980)	kif17 (ENSDCDG00000029985)	SH2D5 (ENSDCDG00000029987)	hp1bp3 (ENSDCDG00000029990)	EIF4G3 (ENSDCDG00000030046)	ece1 (ENSDCDG00000030615)	alpl (ENSDCDG00000033139)	ENSDCDG00000033456	ENSDCDG00000033457	ENSDCDG00000033458	LACTBL1 (ENSDCDG00000033459) ##21	ephb2b (ENSDCDG00000033489) ##22	ENSDCDG00000033977	dhrs3b (ENSDCDG00000033980)	aadacl4 (ENSDCDG00000033983)	ENSDCDG00000033985	igsf21a (ENSDCDG00000033996) ##25	ARHGEF10L (ENSDCDG00000034046) ##26	CHD5 (ENSDCDG00000034432)	RPL22 (ENSDCDG00000034772)	agtrap (ENSDCDG00000034773)	draxina (ENSDCDG00000034774)	PANK4 (ENSDCDG00000034778)	ENSDCDG00000034802	ENSDCDG00000034803	ENSDCDG00000034805	ENSDCDG00000034806
Otophysi	ANCESTRAL SPECIES	91	ENSGT00940000156308	ENSGT00940000156047.a	ENSGT00940000158523.c.b	ENSGT00940000164549.a.b	ENSGT00940000160218	ENSGT00940000158148	ENSGT00530000063168.a.a.a	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00910000144253	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828.i	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000165619.b	ENSGT00530000063849.B	ENSGT00940000158400
Characiphysae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000156047.a	ENSGT00940000158523.c.b	ENSGT00940000164549.a.b	ENSGT00940000160218	ENSGT00940000158148	ENSGT00530000063168.a.a.a	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00910000144253	ENSGT00940000156454.p	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977.a	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828.i	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000165619.b	ENSGT00530000063849.B	ENSGT00940000158400
Channel catfish	MODERN SPECIES	13	Wnt7a (ENSIPUG00000013689)	ptpdc1 (ENSIPUG00000013661)	barx1 (ENSIPUG00000013651)	phf2 (ENSIPUG00000013581)	FAM120A (ENSIPUG00000013522)	cass4 (ENSIPUG00000013490)	cstf1 (ENSIPUG00000013457)	EIF4G3 (ENSIPUG00000013302)	ece1 (ENSIPUG00000013220)	alpl (ENSIPUG00000013180)	ENSIPUG00000013159	ENSIPUG00000013138	si:ch211-220m17.5 (ENSIPUG00000013124)	ENSIPUG00000013116	lactbl1 (ENSIPUG00000013099) ##21	Ephb2 (ENSIPUG00000012991) ##22	MCRS1 (ENSIPUG00000012827)	suox (ENSIPUG00000012790)	ENSIPUG00000012771	tuba1a (ENSIPUG00000012754)	PLST (ENSIPUG00000012706)	asb17 (ENSIPUG00000012695)	timeless (ENSIPUG00000012622)	ENSIPUG00000012612	MMP19 (ENSIPUG00000012600)	pmel (ENSIPUG00000012583)	cdk2 (ENSIPUG00000012551)	Sarnp (ENSIPUG00000012503)	gdf11 (ENSIPUG00000012483)	iars (ENSIPUG00000012333)	atp2b2 (ENSIPUG00000012098)
Characiphysae_b	ANCESTRAL SPECIES	34	ENSGT00940000156047.a	ENSGT00940000158523.c.b	ENSGT00940000164549.a.b	ENSGT00940000160218	ENSGT00940000158148	ENSGT00530000063168.a.a.a	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00910000144253	ENSGT00940000156454.p	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977.a	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00940000159249.b	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828.i	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000165619.b	ENSGT00530000063849.B	ENSGT00940000158400
Characoidei	ANCESTRAL SPECIES	77	ENSGT00940000156047.a.c	ENSGT00940000158523.c.b	ENSGT00940000164549.a.b	ENSGT00940000160218	ENSGT00940000158148	ENSGT00530000063168.a.a.a	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00910000144253	ENSGT00940000156454.p	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977.a	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g ##26	ENSGT00390000017402	ENSGT00390000013828.i	ENSGT00940000158896	ENSGT00940000165619.b	ENSGT00530000063849.B	ENSGT00940000158400	ENSGT00940000155343.a.a	ENSGT00940000159166	ENSGT00940000156024.i.a
Mexicana tetra	DUPLICATION
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	14	zgc:171566 (ENSAMXG00000031950)	mcm2 (ENSAMXG00000004474)	ccdc51 (ENSAMXG00000039839)	tma7 (ENSAMXG00000004518)	ENSAMXG00000030524	dnase1l4.2 (ENSAMXG00000036786)	ENSAMXG00000038993	BCDIN3D (ENSAMXG00000004546)	ENSAMXG00000025806	cers5 (ENSAMXG00000004553)	gpd1b (ENSAMXG00000029979)	smarcd1 (ENSAMXG00000004577)	ENSAMXG00000029622	ENSAMXG00000043590	LACTBL1 (ENSAMXG00000004600) ##21	ENSAMXG00000024789 ##22	PLCH2 (ENSAMXG00000006425)	ENSAMXG00000031120	BRPF3 (ENSAMXG00000041882)	MON1B (ENSAMXG00000006415)	grm6b (ENSAMXG00000006398)	ccdc120b (ENSAMXG00000042805)	cxxc1b (ENSAMXG00000006383)	tfe3b (ENSAMXG00000020781)	gnl3l (ENSAMXG00000006376)	opn1lw1 (ENSAMXG00000006368)	opn1sw2 (ENSAMXG00000037260)	si:dkey-13a21.4 (ENSAMXG00000032663)	gata1a (ENSAMXG00000040272)	adnpa (ENSAMXG00000006355)	fam83d (ENSAMXG00000036827)
Mexicana tetra	MODERN SPECIES	14																ephb2b (ENSAMXG00000006326) ##22	fam83d (ENSAMXG00000036827)	adnpa (ENSAMXG00000006355)	gata1a (ENSAMXG00000040272)	si:dkey-13a21.4 (ENSAMXG00000032663)	opn1sw2 (ENSAMXG00000037260)	opn1lw1 (ENSAMXG00000006368)	gnl3l (ENSAMXG00000006376)	tfe3b (ENSAMXG00000020781)	cxxc1b (ENSAMXG00000006383)	ccdc120b (ENSAMXG00000042805)	grm6b (ENSAMXG00000006398)	MON1B (ENSAMXG00000006415)	BRPF3 (ENSAMXG00000041882)	ENSAMXG00000031120	PLCH2 (ENSAMXG00000006425)
Red-bellied piranha	MODERN SPECIES	313								ENSPNAG00000020098	cstf1 (ENSPNAG00000020115)	ENSPNAG00000020215	alpl (ENSPNAG00000020255)	ENSPNAG00000005413	ENSPNAG00000020296	ENSPNAG00000020301	LACTBL1 (ENSPNAG00000020328) ##21	ephb2b (ENSPNAG00000020381) ##22	ENSPNAG00000020398	ENSPNAG00000020402	dhrs3b (ENSPNAG00000020421)	aadacl4 (ENSPNAG00000020435)
Electric eel	MODERN SPECIES	17		wnt7aa (ENSEEEG00000015279)	ptpdc1a (ENSEEEG00000015278)	barx1 (ENSEEEG00000015277)	phf2 (ENSEEEG00000015169)	ENSEEEG00000015164	FAM120A (ENSEEEG00000015153)	ENSEEEG00000015149	cstf1 (ENSEEEG00000015147)	EIF4G3 (ENSEEEG00000015146)	ece1 (ENSEEEG00000013918)	alpl (ENSEEEG00000013392)	ENSEEEG00000013348	ENSEEEG00000013329	LACTBL1 (ENSEEEG00000013323) ##21	ephb2b (ENSEEEG00000013316) ##22	LRRC38 (ENSEEEG00000013314) #23	dhrs3b (ENSEEEG00000013311)	aadacl4 (ENSEEEG00000013309)	ENSEEEG00000013307	KLHDC7A (ENSEEEG00000013306)	igsf21a (ENSEEEG00000013304) ##25	ENSEEEG00000013303	ARHGEF10L (ENSEEEG00000013300) ##26	CHD5 (ENSEEEG00000013292)	ENSEEEG00000013289	RNF207 (ENSEEEG00000013285)	agtrap (ENSEEEG00000013283)	draxina (ENSEEEG00000013282)	PANK4 (ENSEEEG00000013280)	rap1ab (ENSEEEG00000013259)
Cyprinoidei	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT00940000156047.a	ENSGT00940000158523.c.b	ENSGT00940000164549.a.b	ENSGT00940000160218	ENSGT00940000158148	ENSGT00530000063168.a.a.a	ENSGT00950000183008.a.a.a.a	ENSGT00910000144253	ENSGT00940000156454	ENSGT00940000156050	ENSGT00950000183063.d	ENSGT00940000154436.d	ENSGT00960000186977	ENSGT01100000263484.A.c.a.b	ENSGT00450000040404.a ##21	ENSGT00940000155503.a ##22	ENSGT00940000163979	ENSGT00940000158724.a	ENSGT00940000163565	ENSGT00390000014553	ENSGT00940000162724	ENSGT00390000002421.b ##25	ENSGT00390000015719.d.c	ENSGT00940000162114	ENSGT00940000155850	ENSGT00940000155009.b	ENSGT00940000166110	ENSGT00390000003231.b	ENSGT01100000263512.b.b.a	ENSGT00940000159726	ENSGT01030000235512
Cyprininae	DUPLICATION
Cyprininae	ANCESTRAL SPECIES	471					ENSGT00940000158148.b	ENSGT00530000063168.a.a.a.h	ENSGT00950000183008.a.a.a.a.d	ENSGT00910000144253.n	ENSGT00940000156454.t.b.a	ENSGT00940000156050.c	ENSGT00950000183063.d.k	ENSGT00940000154436.d.b	ENSGT00960000186977	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.b	ENSGT00450000040404.a.b ##21	ENSGT00940000155503.a.i ##22	ENSGT00940000163979.c	ENSGT00940000158724.a.a	ENSGT00940000163565.g	ENSGT00390000014553.e	ENSGT00940000162724.h.a	ENSGT00390000002421.b.d ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.a ##26	ENSGT01070000253959.a.a	ENSGT01070000253959.b	ENSGT00940000159249.b.a	ENSGT00940000153314.b.a.a.b.a
Goldfish	DUPLICATION
Goldfish	MODERN SPECIES	2801				phf2 (ENSCARG00000067653)	FAM120A (ENSCARG00000044724)	ENSCARG00000046817	cstf1 (ENSCARG00000046822)	EIF4G3 (ENSCARG00000046904)	ece1 (ENSCARG00000048632)	alpl (ENSCARG00000052872)	ENSCARG00000054689	ENSCARG00000054694	ENSCARG00000054729	ENSCARG00000054750	LACTBL1 (ENSCARG00000054762) ##21	ephb2b (ENSCARG00000054854) ##22	ENSCARG00000057189	dhrs3b (ENSCARG00000057199)
Goldfish	MODERN SPECIES	1989																ephb2b (ENSCARG00000038053) ##22	ENSCARG00000038037	dhrs3b (ENSCARG00000037988)	aadacl4 (ENSCARG00000037962)	ENSCARG00000037950	KLHDC7A (ENSCARG00000037935)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156047.a.e	ENSGT00940000158523.c.b.b	ENSGT00940000164549.a.b.a.b	ENSGT00940000160218.g.b	ENSGT00940000158148.b	ENSGT00530000063168.a.a.a.h	ENSGT00950000183008.a.a.a.a.d	ENSGT00910000144253.n	ENSGT00940000156454.t.b.a	ENSGT00940000156050.c	ENSGT00950000183063.d.k	ENSGT00990000208951.a	ENSGT00940000154436.c.c	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.b	ENSGT00450000040404.a.b ##21	ENSGT00940000155503.a.i ##22	ENSGT00940000163979.c	ENSGT00940000158724.a.a	ENSGT00940000163565.g	ENSGT00390000014553.e	ENSGT00940000162724.h.a	ENSGT00390000002421.b.d ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.a ##26	ENSGT01070000253959.a.a	ENSGT01070000253959.b	ENSGT00940000159249.b.a	ENSGT00940000153314.b.a.a.b.a	ENSGT00510000048612.q.b	ENSGT00390000015719.d.c.b	ENSGT00940000162114.c	ENSGT00940000155850.ub
Common carp reference	MODERN SPECIES	42	wnt7aa (ENSCCRG00000047812)	ptpdc1a (ENSCCRG00000047808)	barx1 (ENSCCRG00000045902)	phf2 (ENSCCRG00000046148)	FAM120A (ENSCCRG00000082415)	ENSCCRG00000046081	cstf1 (ENSCCRG00000009874)	EIF4G3 (ENSCCRG00000059114)	ece1 (ENSCCRG00000021951)	alpl (ENSCCRG00000002421)	ENSCCRG00000051327	ENSCCRG00000051330	ENSCCRG00000065314	ENSCCRG00000035381	ENSCCRG00000035385 ##21	ephb2b (ENSCCRG00000027163) ##22	ENSCCRG00000073824	dhrs3b (ENSCCRG00000039347)	aadacl4 (ENSCCRG00000065475)	ENSCCRG00000067900	KLHDC7A (ENSCCRG00000044918)	igsf21a (ENSCCRG00000044910) ##25	ENSCCRG00000081974	ARHGEF10L (ENSCCRG00000023577) ##26	ENSCCRG00000077660	ENSCCRG00000045309	ENSCCRG00000053185	nr0b1 (ENSCCRG00000039151)	ENSCCRG00000072348	plekha3 (ENSCCRG00000060786)	rpgrb (ENSCCRG00000039169)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	19			wnt7aa (ENSSGRG00000017414)	ptpdc1a (ENSSGRG00000017478)	barx1 (ENSSGRG00000017480)	phf2 (ENSSGRG00000017489)	FAM120A (ENSSGRG00000017820)	ENSSGRG00000017925	cstf1 (ENSSGRG00000017927)	EIF4G3 (ENSSGRG00000017938)	ece1 (ENSSGRG00000018270)	alpl (ENSSGRG00000018625)	ENSSGRG00000018669	ENSSGRG00000018673	ENSSGRG00000018674	ephb2b (ENSSGRG00000018684) ##22	ENSSGRG00000019189	dhrs3b (ENSSGRG00000019190)	aadacl4 (ENSSGRG00000019211)	ENSSGRG00000019212	KLHDC7A (ENSSGRG00000019213)	igsf21a (ENSSGRG00000019217) ##25	ARHGEF10L (ENSSGRG00000019233) ##26	ENSSGRG00000019236	ENSSGRG00000019238	ENSSGRG00000019240	CHD5 (ENSSGRG00000019242)	rpl22 (ENSSGRG00000019244)	nr0b1 (ENSSGRG00000019255)	ENSSGRG00000019259	plekha3 (ENSSGRG00000019260)
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Goldfish	MODERN SPECIES	2	wnt7aa (ENSCARG00000027395)	ptpdc1a (ENSCARG00000027368)	barx1 (ENSCARG00000027352)	phf2 (ENSCARG00000025343)	FAM120A (ENSCARG00000023984)	ENSCARG00000023898	cstf1 (ENSCARG00000023869)	EIF4G3 (ENSCARG00000015968)	ece1 (ENSCARG00000015269)	ENSCARG00000015241	alpl (ENSCARG00000014810)	ENSCARG00000014791	ENSCARG00000014787	ENSCARG00000014781	LACTBL1 (ENSCARG00000014775) ##21	ephb2b (ENSCARG00000013763) ##22	ENSCARG00000013711	dhrs3b (ENSCARG00000013696)	ENSCARG00000013682	KLHDC7A (ENSCARG00000013679)	ENSCARG00000013670	igsf21a (ENSCARG00000013657) ##25	ARHGEF10L (ENSCARG00000011898) ##26	CHD5 (ENSCARG00000011787)	rpl22 (ENSCARG00000011757)	RNF207 (ENSCARG00000011727)	nr0b1 (ENSCARG00000011710)	ENSCARG00000011263	plekha3 (ENSCARG00000011213)	dynlt3 (ENSCARG00000011197)	cybb (ENSCARG00000011142)
Cyprininae_a	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000156047.a.f	ENSGT00940000158523.c.b.a	ENSGT00940000164549.a.b.b	ENSGT00940000160218.g.a	ENSGT00940000158148.a	ENSGT00530000063168.a.a.a.g	ENSGT00950000183008.a.a.a.a.c	ENSGT00910000144253.m	ENSGT00940000156454.t.b.b	ENSGT00940000156050.d	ENSGT00950000183063.d.l	ENSGT00940000154436.d.a	ENSGT00940000154436.c.d	ENSGT01100000263484.A.c.a.b.a	ENSGT00450000040404.a.a ##21	ENSGT00940000155503.a.j ##22	ENSGT00940000163979.d	ENSGT00940000158724.a.b	ENSGT00940000163565.h	ENSGT00390000014553.f	ENSGT00940000162724.h.b	ENSGT00390000002421.b.c ##25	ENSGT00940000153798.A.b.g.b ##26	ENSGT01070000253959.a.b	ENSGT00940000159249.b.b	ENSGT00940000153314.a.a	ENSGT00510000048612.q.a	ENSGT00390000015719.d.c.a	ENSGT00940000162114.d	ENSGT00940000155850.tb	ENSGT00940000159616.pc.b
Common carp reference	MODERN SPECIES	13	FBLN2 (ENSCCRG00000030138)	wnt7aa (ENSCCRG00000002571)	ptpdc1a (ENSCCRG00000002589)	barx1 (ENSCCRG00000002611)	phf2 (ENSCCRG00000002691)	FAM120A (ENSCCRG00000082541)	ENSCCRG00000009940	cstf1 (ENSCCRG00000009927)	EIF4G3 (ENSCCRG00000009906)	ece1 (ENSCCRG00000006396)	alpl (ENSCCRG00000064370)	ENSCCRG00000074067	ENSCCRG00000081307	ENSCCRG00000010710	ENSCCRG00000071449 ##21	ephb2b (ENSCCRG00000065338) ##22	dhrs3b (ENSCCRG00000058669)	ENSCCRG00000053028	ENSCCRG00000057987	aadacl4 (ENSCCRG00000057238)	KLHDC7A (ENSCCRG00000027058)	igsf21a (ENSCCRG00000051942) ##25	ARHGEF10L (ENSCCRG00000023008) ##26	ENSCCRG00000023541	ENSCCRG00000039105	ENSCCRG00000047974	ENSCCRG00000047957	nr0b1 (ENSCCRG00000057756)	ENSCCRG00000065637	ENSCCRG00000015539	plekha3 (ENSCCRG00000039156)
Golden-line barbel	MODERN SPECIES	2	hdac11 (ENSSGRG00000053845)	FBLN2 (ENSSGRG00000053847)	wnt7aa (ENSSGRG00000053860)	ENSSGRG00000053863	phf2 (ENSSGRG00000053866)	FAM120A (ENSSGRG00000054022)	ENSSGRG00000054050	cstf1 (ENSSGRG00000054052)	EIF4G3 (ENSSGRG00000054059)	ece1 (ENSSGRG00000054147)	alpl (ENSSGRG00000054157)	ENSSGRG00000054194	ENSSGRG00000054196	ENSSGRG00000054197	LACTBL1 (ENSSGRG00000054199) ##21	ephb2b (ENSSGRG00000054214) ##22	ENSSGRG00000054382	dhrs3b (ENSSGRG00000054385)	aadacl4 (ENSSGRG00000054386)	ENSSGRG00000054388	igsf21a (ENSSGRG00000054389) ##25	ARHGEF10L (ENSSGRG00000054391) ##26	ENSSGRG00000054393	ENSSGRG00000054407	RNF207 (ENSSGRG00000054512)	nr0b1 (ENSSGRG00000054516)	ENSSGRG00000054517	plekha3 (ENSSGRG00000054519)	rpgrb (ENSSGRG00000054524)	dynlt3 (ENSSGRG00000054527)	cybb (ENSSGRG00000054534)
Zebrafish	MODERN SPECIES	2	hdac11 (ENSDARG00000087573)	FBLN2 (ENSDARG00000015156)	wnt7aa (ENSDARG00000044827)	ptpdc1a (ENSDARG00000061656)	barx1 (ENSDARG00000007407)	phf2 (ENSDARG00000018691)	FAM120A (ENSDARG00000075021)	ENSDARG00000006775	cstf1 (ENSDARG00000044820)	EIF4G3 (ENSDARG00000077215)	ece1 (ENSDARG00000061737)	alpl (ENSDARG00000015546)	ENSDARG00000102602	ENSDARG00000022570	LACTBL1 (ENSDARG00000070467) ##21	ephb2b (ENSDARG00000021539) ##22	ENSDARG00000087745	dhrs3b (ENSDARG00000044803)	aadacl4 (ENSDARG00000044802)	ENSDARG00000032885	KLHDC7A (ENSDARG00000105322)	igsf21a (ENSDARG00000031049) ##25	ARHGEF10L (ENSDARG00000088630) ##26	ENSDARG00000070709	CHD5 (ENSDARG00000105083)	rpl22 (ENSDARG00000070437)	ENSDARG00000091126	nr0b1 (ENSDARG00000056541)	ENSDARG00000103556	ENSDARG00000056591	plekha3 (ENSDARG00000056601)
Osteoglossiformes	DUPLICATION
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P. kingsleyae	MODERN SPECIES	232	phc2b (ENSPKIG00000010632)	ENSPKIG00000010710	ENSPKIG00000010745	sh2d5 (ENSPKIG00000010781)	hp1bp3 (ENSPKIG00000010808)	EIF4G3 (ENSPKIG00000010849)	ENSPKIG00000010906	ENSPKIG00000010922	ENSPKIG00000010932	ece1 (ENSPKIG00000010988)	alpl (ENSPKIG00000011103)	ENSPKIG00000011120	ENSPKIG00000011140	ENSPKIG00000011156	LACTBL1 (ENSPKIG00000011202) ##21	ephb2b (ENSPKIG00000011256) ##22	ENSPKIG00000011290	ENSPKIG00000011307	dhrs3b (ENSPKIG00000011346)	aadacl4 (ENSPKIG00000011392)	ENSPKIG00000011404	KLHDC7A (ENSPKIG00000011433)	igsf21a (ENSPKIG00000011451) ##25
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	14	padi2 (ENSSFOG00015004761)	RAP1GAP (ENSSFOG00015004812)	SLC2A1 (ENSSFOG00015004883) ##32	phc2b (ENSSFOG00015004915)	kif17 (ENSSFOG00015005002)	SH2D5 (ENSSFOG00015005134)	hp1bp3 (ENSSFOG00015005166)	EIF4G3 (ENSSFOG00015005193)	ece1 (ENSSFOG00015005487)	alpl (ENSSFOG00015005556)	ENSSFOG00015026625	ENSSFOG00015006004	ENSSFOG00015006009	ENSSFOG00015006016	LACTBL1 (ENSSFOG00015006028) ##21	ephb2b (ENSSFOG00015028207) ##22	ENSSFOG00015006112	dhrs3b (ENSSFOG00015006122)	aadacl4 (ENSSFOG00015006135)	ENSSFOG00015006150	KLHDC7A (ENSSFOG00015006181)	igsf21a (ENSSFOG00015006197) ##25	ARHGEF10L (ENSSFOG00015006258) ##26	CHD5 (ENSSFOG00015006296)	rpl22 (ENSSFOG00015006425)	icmt (ENSSFOG00015006441)	agtrap (ENSSFOG00015006473)	draxina (ENSSFOG00015006483)	PANK4 (ENSSFOG00015006524)	ENSSFOG00015006604	ENSSFOG00015033092
Osteoglossiformes	ANCESTRAL SPECIES	206					ENSGT00940000162344	ENSGT00860000133842.n	ENSGT00940000155203.b.f	ENSGT00950000182903.b.a.y.a.d	ENSGT00390000001509.b	ENSGT00390000012802	ENSGT00940000156138.c	ENSGT00940000156792.g.a.i ##32	ENSGT00940000154964.y.a.r	ENSGT00940000160840	ENSGT00950000183063.d.n	ENSGT00940000155503.a.l ##22	ENSGT00940000162571 #23	ENSGT00950000183083.b #24	ENSGT00940000158724.b	ENSGT00390000002421.a #25	ENSGT00940000153798.A.b.h #26	ENSGT00940000156151	ENSGT00940000153314.b.a.b	ENSGT00510000048612	ENSGT00390000017394.e	ENSGT00390000017402.h	ENSGT00390000013828.f	ENSGT00940000166394	ENSGT00510000046803.a	ENSGT00600000084471	ENSGT00390000002461
Asian bonytongue	MODERN SPECIES	11	ENSSFOG00015014550	THAP3 (ENSSFOG00015014540)	dnajc11a (ENSSFOG00015014502)	CAMTA1 (ENSSFOG00015016227)	tnfrsf9a (ENSSFOG00015016270)	DVL1 (ENSSFOG00015016282)	MXRA8 (ENSSFOG00015025211)	aurkaip1 (ENSSFOG00015016363)	RAP1GAP (ENSSFOG00015016410)	SLC2A1 (ENSSFOG00015016582) ##32	ENSSFOG00015016608	ENSSFOG00015016631	EIF4G3 (ENSSFOG00015016664)	alpl (ENSSFOG00015016876)	ENSSFOG00015017403	ephb2b (ENSSFOG00015027254) ##22	ENSSFOG00015017488	VPS13D (ENSSFOG00015017530) #24	dhrs3a (ENSSFOG00015017778)	igsf21b (ENSSFOG00015017798) #25	ARHGEF10L (ENSSFOG00015017842) #26	rcc2 (ENSSFOG00015017887)	rpl22 (ENSSFOG00015030571)	rnf207b (ENSSFOG00015017990)	icmt (ENSSFOG00015030685)	AGTRAP (ENSSFOG00015027590)	ENSSFOG00015025581	tas1r1 (ENSSFOG00015018095)	IFFO2 (ENSSFOG00015018120)	UBR4 (ENSSFOG00015018176)	EMC1 (ENSSFOG00015018426)
P. kingsleyae	MODERN SPECIES	37						tnfrsf9a (ENSPKIG00000009839)	dvl1b (ENSPKIG00000009880)	mxra8b (ENSPKIG00000009945)	aurkaip1 (ENSPKIG00000009988)	rap1gapa (ENSPKIG00000010069)	SLC2A1 (ENSPKIG00000010233) ##32	ENSPKIG00000010288	ENSPKIG00000010376	ENSPKIG00000010429	alpl (ENSPKIG00000010443)	ephb2b (ENSPKIG00000010481) ##22	LRRC38 (ENSPKIG00000010525) #23	ENSPKIG00000010536	VPS13D (ENSPKIG00000010575) #24	dhrs3a (ENSPKIG00000010699)	ARHGEF10L (ENSPKIG00000010753) #26	rcc2 (ENSPKIG00000010853)	RPL22 (ENSPKIG00000010915)	rnf207b (ENSPKIG00000010985)	icmt (ENSPKIG00000011083)	AGTRAP (ENSPKIG00000011116)	ENSPKIG00000011138	ENSPKIG00000011157	si:ch73-21g5.7 (ENSPKIG00000011171)	tas1r1 (ENSPKIG00000011191)	IFFO2 (ENSPKIG00000011221)
Spotted gar	MODERN SPECIES	664	pax7b (ENSLOCG00000003864) #10	park7 (ENSLOCG00000003827)	KCNAB2 (ENSLOCG00000003792) ##7	rap1gapa (ENSLOCG00000003744)	slc2a1a (ENSLOCG00000003724) #32	phc2a (ENSLOCG00000003682)	ENSLOCG00000003655	SH2D5 (ENSLOCG00000003629)	hp1bp3 (ENSLOCG00000003600)	EIF4G3 (ENSLOCG00000003549)	ece1 (ENSLOCG00000003479)	alpl (ENSLOCG00000003451)	GUCA2A (ENSLOCG00000003438)	ENSLOCG00000003425	LACTBL1 (ENSLOCG00000003404) ##21	ephb2b (ENSLOCG00000003331) #22	ENSLOCG00000003320	VPS13D (ENSLOCG00000003214) #24	dhrs3a (ENSLOCG00000003190)	aadacl4 (ENSLOCG00000003171)	CFAP107 (ENSLOCG00000003160)	KLHDC7A (ENSLOCG00000003121)	igsf21a (ENSLOCG00000003096) #25	ENSLOCG00000018083	ARHGEF10L (ENSLOCG00000003027) #26	rcc2 (ENSLOCG00000003000)	padi2 (ENSLOCG00000002953)	aurkaip1 (ENSLOCG00000002935)	mxra8b (ENSLOCG00000002916)	dvl1b (ENSLOCG00000002858)	PLEKHG5 (ENSLOCG00000002820)