Mammalia ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000164144 ENSGT00940000165070 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000182962.a.b ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178 #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.f ENSGT00940000159055 ENSGT00990000203589.a.b.a.b ENSGT01060000248594.e.a ENSGT00940000159922.b ENSGT00510000047493 ENSGT00950000183232 ENSGT00940000161570 ENSGT00940000156128.b ENSGT00950000182988.a.b.b.b ENSGT00940000160983 ENSGT00390000010397.a ENSGT00390000007430 Theria ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000153902.b ENSGT00530000063529.B ENSGT00940000154103.b ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000182962.a.b ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178 #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00950000183593 ENSGT00940000155097 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000163063 ENSGT00940000160311 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b #22 Cetacea DUPLICATION Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.b #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.b #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000013305.a.a ENSGT00940000154645.A ENSGT00950000182995.e.a.a.a.db.b #7 ENSGT00390000007900 #8 ENSGT00390000004263.b #9 ENSGT00940000155646 #10 ENSGT00940000160213 #11 ENSGT00940000153916.B #12 ENSGT01030000234517.D #13 ENSGT00940000155734 #14 ENSGT00940000168548 #15 ENSGT00390000008041.C.f ##16 ENSGT01100000263518.A.a.a.b #17 ENSGT00940000157219 #18 ENSGT00950000182986.a.b.a #20 ENSGT00390000012178.g.b.a.b.b #22 ENSGT00940000161165 #23 ENSGT00390000012474 #24 ENSGT00940000155678 #25 ENSGT00950000185177 #26 ENSGT00940000158432 #27 ENSGT00950000185985 #28 ENSGT00390000015159.a.b #29 ENSGT00470000042500 #30 ENSGT00940000156513 #31 ENSGT00550000074816.A.a #32 ENSGT00940000159266 #33 ENSGT00530000063712.a.b #34 ENSGT00940000155979 #35 ENSGT00940000160181 #36 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ENSDLEG00000004566 #13 ENSDLEG00000004551 ENSDLEG00000004536 #13 E2F6 (ENSDLEG00000004522) #14 GREB1 (ENSDLEG00000004506) ##16 NTSR2 (ENSDLEG00000004495) #17 LPIN1 (ENSDLEG00000004420) #18 ENSDLEG00000004406 #19 TRIB2 (ENSDLEG00000004400) #20 ENSDLEG00000004393 #21 ENSDLEG00000004388 #22 FAM84A (ENSDLEG00000004385) #23 NBAS (ENSDLEG00000004320) #24 DDX1 (ENSDLEG00000004022) #25 ENSDLEG00000003947 #26 ENSDLEG00000003941 #28 MYCN (ENSDLEG00000003931) #27 FAM49A (ENSDLEG00000003918) #29 RAD51AP2 (ENSDLEG00000003910) #30 VSNL1 (ENSDLEG00000003903) #31 SMC6 (ENSDLEG00000003874) #32 GEN1 (ENSDLEG00000003850) #33 MSGN1 (ENSDLEG00000003842) #34 KCNS3 (ENSDLEG00000003837) #35 RDH14 (ENSDLEG00000003827) #36 NT5C1B (ENSDLEG00000003811) #37 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01060000248564.b.b ENSGT00890000139472 ENSGT00390000006788.a.a ENSGT00940000153904.b ENSGT00940000163100.a ENSGT01090000260045.C.e.b ENSGT01100000263478.b.a.a ENSGT01090000260024.A.a.b.b ENSGT01100000263572.a.a.a.a.a.b.d.b 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ATXN7L3B (ENSVVUG00000008201) ENSVVUG00000008213 #22 ENSVVUG00000008215 TRHDE (ENSVVUG00000008252) TPH2 (ENSVVUG00000008519) ENSVVUG00000008561 ENSVVUG00000008565 TBC1D15 (ENSVVUG00000008586) TMEM19 (ENSVVUG00000008629) THAP2 (ENSVVUG00000008651) ZFC3H1 (ENSVVUG00000008655) ENSVVUG00000008688 ENSVVUG00000008702 ENSVVUG00000008707 ENSVVUG00000008710 TSPAN8 (ENSVVUG00000008726) PTPRR (ENSVVUG00000008764) Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000166485.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a #22 ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 246 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a.b #22 ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b American black bear MODERN SPECIES 1827 ENSUAMG00000021488 #22 ATP7A (ENSUAMG00000021478) PGK1 (ENSUAMG00000021471) TAF9B (ENSUAMG00000021467) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 181 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b American mink MODERN SPECIES 401 FGF16 (ENSNVIG00000023507) ATRX (ENSNVIG00000023512) MAGT1 (ENSNVIG00000023527) ENSNVIG00000023530 #22 ATP7A (ENSNVIG00000023535) PGK1 (ENSNVIG00000023554) TAF9B (ENSNVIG00000023558) ENSNVIG00000023564 CYSLTR1 (ENSNVIG00000023584) Canidae DUPLICATION Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a.a #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000166485.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333.r.a ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a.b #22 ENSGT00950000185204 ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000153288.a.b.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000161429 ENSGT00730000111075.b Dog MODERN SPECIES 144 RLIM (ENSCAFG00845030030) NEXMIF (ENSCAFG00845030052) ENSCAFG00845030063 ABCB7 (ENSCAFG00845030100) UPRT (ENSCAFG00845030172) ZDHHC15 (ENSCAFG00845030214) MAGEE2 (ENSCAFG00845030260) PBDC1 (ENSCAFG00845030268) ENSCAFG00845030276 RPL31 (ENSCAFG00845030299) ENSCAFG00845030304 FGF16 (ENSCAFG00845030312) ATRX (ENSCAFG00845030352) MAGT1 (ENSCAFG00845019924) ENSCAFG00845020008 ENSCAFG00845020039 #22 ATP7A (ENSCAFG00845020199) ENSCAFG00845020708 PGK1 (ENSCAFG00845020758) TAF9B (ENSCAFG00845020868) CYSLTR1 (ENSCAFG00845020915) ENSCAFG00845020948 ENSCAFG00845020985 LPAR4 (ENSCAFG00845021017) ENSCAFG00845021038 P2RY10 (ENSCAFG00845021084) GPR174 (ENSCAFG00845021116) TENT5D (ENSCAFG00845021138) BRWD3 (ENSCAFG00845021308) ENSCAFG00845022233 SH3BGRL (ENSCAFG00845022327) Dingo MODERN SPECIES 223 EIF2AK2 (ENSCAFG00020022842) GPATCH11 (ENSCAFG00020022847) HEATR5B (ENSCAFG00020022854) STRN (ENSCAFG00020022876) VIT (ENSCAFG00020022889) FEZ2 (ENSCAFG00020022913) CRIM1 (ENSCAFG00020022922) ENSCAFG00020022982 ENSCAFG00020022999 ENSCAFG00020023002 FAM98A (ENSCAFG00020023008) RASGRP3 (ENSCAFG00020023024) LTBP1 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ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333.r ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a.b #22 ENSGT00950000185204 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00940000165353 ENSGT00940000161429 ENSGT00730000111075.b Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000166485.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333.r.a ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a.b #22 ENSGT00950000185204 ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000153288.a.b.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00940000165353 Dingo MODERN SPECIES 265 RLIM (ENSCAFG00020024549) NEXMIF (ENSCAFG00020024551) ABCB7 (ENSCAFG00020024573) UPRT (ENSCAFG00020024656) ZDHHC15 (ENSCAFG00020024662) MAGEE2 (ENSCAFG00020024664) ENSCAFG00020024666 ENSCAFG00020024668 ENSCAFG00020024670 ENSCAFG00020024676 FGF16 (ENSCAFG00020024678) ATRX (ENSCAFG00020024682) ENSCAFG00020024699 ENSCAFG00020024701 MAGT1 (ENSCAFG00020024703) ENSCAFG00020024706 #22 ENSCAFG00020024708 ATP7A (ENSCAFG00020024712) PGK1 (ENSCAFG00020024764) TAF9B (ENSCAFG00020024984) CYSLTR1 (ENSCAFG00020024986) ENSCAFG00020024987 ENSCAFG00020024988 LPAR4 (ENSCAFG00020024989) ENSCAFG00020024991 P2RY10 (ENSCAFG00020024995) ENSCAFG00020024996 GPR174 (ENSCAFG00020024998) TENT5D (ENSCAFG00020025000) BRWD3 (ENSCAFG00020025005) ENSCAFG00020025022 Caniformia DUPLICATION Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a #22 Dingo MODERN SPECIES 30 NPBWR1 (ENSCAFG00020015443) ENSCAFG00020015442 ENSCAFG00020015441 ENSCAFG00020015440 RB1CC1 (ENSCAFG00020015438) ALKAL1 (ENSCAFG00020015436) ST18 (ENSCAFG00020015423) PCMTD1 (ENSCAFG00020015421) PXDNL (ENSCAFG00020015420) SNTG1 (ENSCAFG00020015399) ENSCAFG00020015388 SNAI2 (ENSCAFG00020015384) CLXN (ENSCAFG00020015379) ENSCAFG00020015372 UBE2V2 (ENSCAFG00020015367) ENSCAFG00020015365 #22 MCM4 (ENSCAFG00020015359) PRKDC (ENSCAFG00020015315) Dog MODERN SPECIES 21 OPRK1 (ENSCAFG00845024764) NPBWR1 (ENSCAFG00845024737) RPSA (ENSCAFG00845024673) ENSCAFG00845024539 RB1CC1 (ENSCAFG00845024092) ENSCAFG00845024001 ST18 (ENSCAFG00845029327) PCMTD1 (ENSCAFG00845029271) PXDNL (ENSCAFG00845029236) ENSCAFG00845029197 SNTG1 (ENSCAFG00845028965) PPDPFL (ENSCAFG00845028586) SNAI2 (ENSCAFG00845028533) EFCAB1 (ENSCAFG00845028482) ENSCAFG00845028428 ENSCAFG00845028412 #22 UBE2V2 (ENSCAFG00845028369) MCM4 (ENSCAFG00845028253) PRKDC (ENSCAFG00845027748) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a #22 ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT01030000239825 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b.e.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 Ursus DUPLICATION Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a.a #22 American black bear MODERN SPECIES 2199 ENSUAMG00000002127 #22 Polar bear MODERN SPECIES 500 ENSUMAG00000015313 #22 SLCO4C1 (ENSUMAG00000015315) SLCO6A1 (ENSUMAG00000015316) PAM (ENSUMAG00000015342) GIN1 (ENSUMAG00000015363) PPIP5K2 (ENSUMAG00000015386) MACIR (ENSUMAG00000015475) ENSUMAG00000015479 NUDT12 (ENSUMAG00000015498) Ursus ANCESTRAL SPECIES 246 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a.b #22 ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.a #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b Polar bear MODERN SPECIES 266 ATRX (ENSUMAG00000017404) MAGT1 (ENSUMAG00000018638) ENSUMAG00000018667 #22 ATP7A (ENSUMAG00000018795) PGK1 (ENSUMAG00000019727) TAF9B (ENSUMAG00000019735) ENSUMAG00000019746 CYSLTR1 (ENSUMAG00000019766) ENSUMAG00000019770 LPAR4 (ENSUMAG00000019773) Giant Panda MODERN SPECIES 2288 SLC16A2 (ENSAMEG00000002832) RLIM (ENSAMEG00000002826) NEXMIF (ENSAMEG00000002822) ABCB7 (ENSAMEG00000001785) UPRT (ENSAMEG00000001806) ENSAMEG00000023973 ZDHHC15 (ENSAMEG00000017414) ENSAMEG00000026155 MAGEE2 (ENSAMEG00000019120) PBDC1 (ENSAMEG00000011521) ENSAMEG00000028402 FGF16 (ENSAMEG00000031057) ATRX (ENSAMEG00000001904) ENSAMEG00000030323 MAGT1 (ENSAMEG00000006102) COX7B (ENSAMEG00000028958) #22 ATP7A (ENSAMEG00000017631) ENSAMEG00000017619 TAF9B (ENSAMEG00000017613) CYSLTR1 (ENSAMEG00000019893) ENSAMEG00000024348 LPAR4 (ENSAMEG00000020009) P2RY10 (ENSAMEG00000020169) GPR174 (ENSAMEG00000020171) ITM2A (ENSAMEG00000006587) TENT5D (ENSAMEG00000018974) BRWD3 (ENSAMEG00000008691) HMGN5 (ENSAMEG00000030368) SH3BGRL (ENSAMEG00000027788) POU3F4 (ENSAMEG00000019562) CYLC1 (ENSAMEG00000002561) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.a #22 American mink MODERN SPECIES 195 RP1 (ENSNVIG00000003995) SOX17 (ENSNVIG00000003990) ENSNVIG00000003981 #22 MRPL15 (ENSNVIG00000003963) LYPLA1 (ENSNVIG00000003898) ENSNVIG00000003892 TCEA1 (ENSNVIG00000003798) RGS20 (ENSNVIG00000003730) ATP6V1H (ENSNVIG00000003634) TRIQK (ENSNVIG00000003571) RUNX1T1 (ENSNVIG00000003144) ENSNVIG00000003105 SLC26A7 (ENSNVIG00000003049) LRRC69 (ENSNVIG00000003020) OTUD6B (ENSNVIG00000003004) TM55A (ENSNVIG00000002974) C8orf88 (ENSNVIG00000002953) ENSNVIG00000002940 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.b #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000000706.d ENSGT00940000162104 ENSGT00940000156328.b ENSGT00940000158092 ENSGT00940000157394 ENSGT00940000154872.C ENSGT00940000155961.c.a ENSGT00940000157738 ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.b #22 ENSGT00940000155013 ENSGT00940000154774 ENSGT00940000154516.b ENSGT00390000016016.A ENSGT00650000093445 ENSGT01030000234571.b.b.b.a.a ENSGT00940000153255.a.l ENSGT00940000153255.a.k ENSGT00940000161677.c.b ENSGT00940000153255.b.a.b.b ENSGT00940000153255.b.a.b.a ENSGT00940000153255.b.a.a.a ENSGT00940000153255.b.a.a.b ENSGT00940000161677.c.a ENSGT00940000153255.b.b Dog MODERN SPECIES 7 ENSCAFG00845009577 ENSCAFG00845009802 TNS3 (ENSCAFG00845010444) IGFBP3 (ENSCAFG00845011212) IGFBP1 (ENSCAFG00845011343) ENSCAFG00845011766 ENSCAFG00845011832 ENSCAFG00845011896 ENSCAFG00845011934 ENSCAFG00845011952 #22 EZH2 (ENSCAFG00845012096) CUL1 (ENSCAFG00845012432) CNTNAP2 (ENSCAFG00845012836) ENSCAFG00845012954 TPK1 (ENSCAFG00845013044) ENSCAFG00845013135 NOBOX (ENSCAFG00845013154) ARHGEF5 (ENSCAFG00845013215) OR2A9B (ENSCAFG00845013318) OR2A9 (ENSCAFG00845013334) OR2A7 (ENSCAFG00845013349) OR2A58 (ENSCAFG00845013360) OR2A13 (ENSCAFG00845013372) OR2A14 (ENSCAFG00845013380) OR2A12 (ENSCAFG00845013394) Dingo MODERN SPECIES 389 ENSCAFG00020020411 PKD1L1 (ENSCAFG00020020412) TNS3 (ENSCAFG00020020437) IGFBP3 (ENSCAFG00020020474) IGFBP1 (ENSCAFG00020020480) ADCY1 (ENSCAFG00020020482) ENSCAFG00020020497 ENSCAFG00020020500 ENSCAFG00020020504 PDIA4 (ENSCAFG00020020510) ENSCAFG00020020512 #22 EZH2 (ENSCAFG00020020525) CUL1 (ENSCAFG00020020532) ENSCAFG00020020541 ENSCAFG00020020544 ENSCAFG00020020560 ENSCAFG00020020580 ARHGEF5 (ENSCAFG00020020593) ENSCAFG00020020605 ENSCAFG00020020613 ENSCAFG00020020615 OR2A2 (ENSCAFG00020020621) ENSCAFG00020020627 ENSCAFG00020020633 OR2A12 (ENSCAFG00020020638) OR2A25 (ENSCAFG00020020641) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.b #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.b #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.b.d.b.b #22 American black bear MODERN SPECIES 3971 ENSUAMG00000015834 #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00390000009110.ab ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00950000182992.a.b.b.b ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00390000009110.ab ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00950000182992.a.b.b.b ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00980000203089 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000164489 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b Sperm whale MODERN SPECIES 13 ENSPCTG00005013715 SLC16A2 (ENSPCTG00005013786) RLIM (ENSPCTG00005013848) NEXMIF (ENSPCTG00005013886) ENSPCTG00005013967 ABCB7 (ENSPCTG00005014159) UPRT (ENSPCTG00005014811) ZDHHC15 (ENSPCTG00005014875) ENSPCTG00005015177 MAGEE2 (ENSPCTG00005015233) PBDC1 (ENSPCTG00005015248) ENSPCTG00005015275 FGF16 (ENSPCTG00005015353) ATRX (ENSPCTG00005015436) MAGT1 (ENSPCTG00005015692) ENSPCTG00005015887 ##22 ENSPCTG00005015993 ATP7A (ENSPCTG00005016014) ENSPCTG00005016116 PGK1 (ENSPCTG00005016156) TAF9B (ENSPCTG00005016200) LPAR4 (ENSPCTG00005016476) P2RY10 (ENSPCTG00005016500) ENSPCTG00005016517 GPR174 (ENSPCTG00005016529) ITM2A (ENSPCTG00005016548) TBX22 (ENSPCTG00005016705) ENSPCTG00005016800 ENSPCTG00005016832 TENT5D (ENSPCTG00005016891) BRWD3 (ENSPCTG00005016926) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00390000009110.ab ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00950000182992.a.b.b.b ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00980000203089 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000164489 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b Dolphin MODERN SPECIES 2961 ATRX (ENSTTRG00000004342) MAGT1 (ENSTTRG00000004379) COX7B (ENSTTRG00000004387) ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00390000009110.ab ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00950000182992.a.b.b.b ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00980000203089 ENSGT00940000159568 ENSGT01090000260912.A ENSGT00940000164489 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00960000186788.c ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00950000182992.a.b.b.b ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT01090000260912.A ENSGT00940000164489 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b Narwhal MODERN SPECIES 309 ENSMMNG00015011664 SLC16A2 (ENSMMNG00015011721) RLIM (ENSMMNG00015011741) NEXMIF (ENSMMNG00015011752) ENSMMNG00015011764 ABCB7 (ENSMMNG00015011807) UPRT (ENSMMNG00015011908) ZDHHC15 (ENSMMNG00015011945) MAGEE2 (ENSMMNG00015011964) ENSMMNG00015011974 PBDC1 (ENSMMNG00015011993) ENSMMNG00015012016 FGF16 (ENSMMNG00015009354) ATRX (ENSMMNG00015009368) MAGT1 (ENSMMNG00015009385) ENSMMNG00015009397 ##22 ATP7A (ENSMMNG00015009419) ENSMMNG00015009432 PGK1 (ENSMMNG00015009442) TAF9B (ENSMMNG00015009451) RTL3 (ENSMMNG00015009461) LPAR4 (ENSMMNG00015009468) P2RY10 (ENSMMNG00015009475) ENSMMNG00015009482 ITM2A (ENSMMNG00015009496) ENSMMNG00015009510 TBX22 (ENSMMNG00015009523) ENSMMNG00015009536 TENT5D (ENSMMNG00015009540) BRWD3 (ENSMMNG00015009554) ENSMMNG00015009577 Beluga whale MODERN SPECIES 15 ENSDLEG00000002853 SLC16A2 (ENSDLEG00000002823) RLIM (ENSDLEG00000002817) NEXMIF (ENSDLEG00000002812) ENSDLEG00000002805 ENSDLEG00000002793 ABCB7 (ENSDLEG00000002777) UPRT (ENSDLEG00000002766) ZDHHC15 (ENSDLEG00000002756) ENSDLEG00000002753 PBDC1 (ENSDLEG00000002743) FGF16 (ENSDLEG00000002733) ENSDLEG00000002727 ATRX (ENSDLEG00000002566) MAGT1 (ENSDLEG00000002529) ENSDLEG00000002519 ##22 ATP7A (ENSDLEG00000002484) ENSDLEG00000002475 ENSDLEG00000002472 PGK1 (ENSDLEG00000002462) TAF9B (ENSDLEG00000002449) RTL3 (ENSDLEG00000002439) LPAR4 (ENSDLEG00000002433) P2RY10 (ENSDLEG00000002430) ENSDLEG00000002427 GPR174 (ENSDLEG00000002420) ITM2A (ENSDLEG00000002408) TBX22 (ENSDLEG00000002390) ENSDLEG00000002378 FAM46D (ENSDLEG00000002371) ENSDLEG00000002366 Vaquita MODERN SPECIES 34 CDX4 (ENSPSNG00000021015) CHIC1 (ENSPSNG00000021038) ZCCHC13 (ENSPSNG00000021100) ENSPSNG00000021128 SLC16A2 (ENSPSNG00000021147) RLIM (ENSPSNG00000021171) NEXMIF (ENSPSNG00000021191) ABCB7 (ENSPSNG00000021266) UPRT (ENSPSNG00000021463) ZDHHC15 (ENSPSNG00000021505) MAGEE2 (ENSPSNG00000021558) PBDC1 (ENSPSNG00000021568) FGF16 (ENSPSNG00000021608) ATRX (ENSPSNG00000021664) MAGT1 (ENSPSNG00000021746) ENSPSNG00000021781 ##22 ENSPSNG00000021803 ATP7A (ENSPSNG00000013495) ENSPSNG00000013610 ENSPSNG00000013679 PGK1 (ENSPSNG00000013773) TAF9B (ENSPSNG00000013833) RTL3 (ENSPSNG00000013887) LPAR4 (ENSPSNG00000013916) P2RY10 (ENSPSNG00000013950) ENSPSNG00000013978 GPR174 (ENSPSNG00000014042) ITM2A (ENSPSNG00000014072) TBX22 (ENSPSNG00000014253) TENT5D (ENSPSNG00000014369) BRWD3 (ENSPSNG00000014395) Blue whale MODERN SPECIES 40 ZCCHC13 (ENSBMSG00010020707) ENSBMSG00010020715 SLC16A2 (ENSBMSG00010020722) ENSBMSG00010020729 RLIM (ENSBMSG00010020736) NEXMIF (ENSBMSG00010020750) ENSBMSG00010020759 ABCB7 (ENSBMSG00010020772) UPRT (ENSBMSG00010020790) ZDHHC15 (ENSBMSG00010020818) MAGEE2 (ENSBMSG00010020865) PBDC1 (ENSBMSG00010020886) FGF16 (ENSBMSG00010020906) ATRX (ENSBMSG00010020930) MAGT1 (ENSBMSG00010020956) ENSBMSG00010020983 ##22 ATP7A (ENSBMSG00010020999) ENSBMSG00010021016 PGK1 (ENSBMSG00010021023) TAF9B (ENSBMSG00010021035) LPAR4 (ENSBMSG00010021050) GPR174 (ENSBMSG00010016108) ITM2A (ENSBMSG00010016249) TBX22 (ENSBMSG00010016318) ENSBMSG00010016362 ENSBMSG00010016407 ENSBMSG00010016435 SH3BGRL (ENSBMSG00010016502) ENSBMSG00010016527 ENSBMSG00010016538 POU3F4 (ENSBMSG00010016551) Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 Pig MODERN SPECIES 300 ENSSSCG00000051237 NEXMIF (ENSSSCG00000035689) ABCB7 (ENSSSCG00000012424) UPRT (ENSSSCG00000012425) ZDHHC15 (ENSSSCG00000012426) ENSSSCG00000012427 MAGEE2 (ENSSSCG00000062125) PBDC1 (ENSSSCG00000030577) ENSSSCG00000045569 ENSSSCG00000061476 ENSSSCG00000031428 ENSSSCG00000044504 FGF16 (ENSSSCG00000022833) ATRX (ENSSSCG00000012434) MAGT1 (ENSSSCG00000012435) COX7B (ENSSSCG00000032129) ##22 ATP7A (ENSSSCG00000012437) ENSSSCG00000030886 PGK1 (ENSSSCG00000012440) TAF9B (ENSSSCG00000026714) CYSLTR1 (ENSSSCG00000039203) ENSSSCG00000052341 ENSSSCG00000052427 LPAR4 (ENSSSCG00000012445) P2RY10 (ENSSSCG00000012446) GPR174 (ENSSSCG00000021734) ENSSSCG00000045237 ITM2A (ENSSSCG00000012448) TBX22 (ENSSSCG00000012449) TENT5D (ENSSSCG00000012450) BRWD3 (ENSSSCG00000025156) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00390000012178.g.b.a.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000166485.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00390000012178.g.b.a.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 Felidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000166485.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Panthera ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00970000193421.B.c.b ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00940000159568 Tiger MODERN SPECIES 336 ENSPTIG00000021338 FGF16 (ENSPTIG00000021358) ATRX (ENSPTIG00000021388) MAGT1 (ENSPTIG00000021447) COX7B (ENSPTIG00000021523) ##22 ATP7A (ENSPTIG00000021533) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00970000193421.B.c.b ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 ENSGT00940000159568 lion MODERN SPECIES 88 ALAS2 (ENSPLOG00000018064) APEX2 (ENSPLOG00000017994) PFKFB1 (ENSPLOG00000017772) ENSPLOG00000017485 ENSPLOG00000017426 MAGED2 (ENSPLOG00000017329) GNL3L (ENSPLOG00000017251) FGD1 (ENSPLOG00000017101) TSR2 (ENSPLOG00000017069) WNK3 (ENSPLOG00000016605) FAM120C (ENSPLOG00000016518) PHF8 (ENSPLOG00000016412) FGF16 (ENSPLOG00000016349) ATRX (ENSPLOG00000016232) MAGT1 (ENSPLOG00000016070) COX7B (ENSPLOG00000015994) ##22 ATP7A (ENSPLOG00000015884) MAGEE2 (ENSPLOG00000015837) ZDHHC15 (ENSPLOG00000015678) UPRT (ENSPLOG00000015614) ABCB7 (ENSPLOG00000015472) NEXMIF (ENSPLOG00000015399) RLIM (ENSPLOG00000015386) SLC16A2 (ENSPLOG00000015313) ZCCHC13 (ENSPLOG00000015295) ENSPLOG00000015275 CHIC1 (ENSPLOG00000015214) CDX4 (ENSPLOG00000015137) VSIG4 (ENSPLOG00000014903) HEPH (ENSPLOG00000014754) ENSPLOG00000014722 leopard MODERN SPECIES 191 ENSPPRG00000024213 FGF16 (ENSPPRG00000024226) ATRX (ENSPPRG00000024247) MAGT1 (ENSPPRG00000024285) COX7B (ENSPPRG00000024301) ##22 ATP7A (ENSPPRG00000024314) ENSPPRG00000024369 Cat MODERN SPECIES 252 SLC16A2 (ENSFCAG00000008075) RLIM (ENSFCAG00000003136) ABCB7 (ENSFCAG00000009557) ENSFCAG00000025696 UPRT (ENSFCAG00000015059) ENSFCAG00000049082 ENSFCAG00000034660 ENSFCAG00000042637 ZDHHC15 (ENSFCAG00000014128) MAGEE2 (ENSFCAG00000027322) PBDC1 (ENSFCAG00000027255) ENSFCAG00000025177 FGF16 (ENSFCAG00000029609) ATRX (ENSFCAG00000030040) MAGT1 (ENSFCAG00000024932) COX7B (ENSFCAG00000033601) ##22 ATP7A (ENSFCAG00000022051) ENSFCAG00000053752 ENSFCAG00000034406 ENSFCAG00000013209 TAF9B (ENSFCAG00000025493) ENSFCAG00000022156 CYSLTR1 (ENSFCAG00000024786) P2RY10 (ENSFCAG00000035535) ITM2A (ENSFCAG00000007957) TBX22 (ENSFCAG00000002301) ENSFCAG00000018360 TENT5D (ENSFCAG00000031837) BRWD3 (ENSFCAG00000022198) ENSFCAG00000037632 SH3BGRL (ENSFCAG00000030770) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.a.a ##22 American mink MODERN SPECIES 161 IFI44L (ENSNVIG00000020622) IFI44 (ENSNVIG00000020590) ADGRL4 (ENSNVIG00000020565) ENSNVIG00000020549 ENSNVIG00000020530 ##22 ADGRL2 (ENSNVIG00000019994) ENSNVIG00000019882 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 Suina ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163487 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00940000161429 Chacoan peccary MODERN SPECIES 22 CDX4 (ENSCWAG00000002816) CHIC1 (ENSCWAG00000002797) ZCCHC13 (ENSCWAG00000002770) SLC16A2 (ENSCWAG00000002764) RLIM (ENSCWAG00000002752) NEXMIF (ENSCWAG00000002739) ABCB7 (ENSCWAG00000002270) UPRT (ENSCWAG00000002203) ZDHHC15 (ENSCWAG00000002160) MAGEE2 (ENSCWAG00000002135) PBDC1 (ENSCWAG00000002124) ENSCWAG00000002111 FGF16 (ENSCWAG00000002091) ATRX (ENSCWAG00000002015) MAGT1 (ENSCWAG00000001949) COX7B (ENSCWAG00000001934) ##22 ATP7A (ENSCWAG00000001849) ENSCWAG00000001817 PGK1 (ENSCWAG00000001796) TAF9B (ENSCWAG00000001780) ENSCWAG00000001774 CYSLTR1 (ENSCWAG00000001770) LPAR4 (ENSCWAG00000001749) P2RY10 (ENSCWAG00000001742) GPR174 (ENSCWAG00000001736) ITM2A (ENSCWAG00000001718) ENSCWAG00000001703 TBX22 (ENSCWAG00000001694) TENT5D (ENSCWAG00000001683) BRWD3 (ENSCWAG00000001634) ENSCWAG00000001613 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b Camelidae ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 Arabian camel MODERN SPECIES 204 CHIC1 (ENSCDRG00005020723) ENSCDRG00005020728 ZCCHC13 (ENSCDRG00005020743) SLC16A2 (ENSCDRG00005020750) RLIM (ENSCDRG00005020761) NEXMIF (ENSCDRG00005020765) ABCB7 (ENSCDRG00005020791) UPRT (ENSCDRG00005020970) ZDHHC15 (ENSCDRG00005020979) MAGEE2 (ENSCDRG00005020988) PBDC1 (ENSCDRG00005020992) FGF16 (ENSCDRG00005020998) ATRX (ENSCDRG00005021010) ENSCDRG00005021046 MAGT1 (ENSCDRG00005021053) COX7B (ENSCDRG00005021062) ##22 ATP7A (ENSCDRG00005021074) PGK1 (ENSCDRG00005021108) TAF9B (ENSCDRG00005021113) CYSLTR1 (ENSCDRG00005021119) RTL3 (ENSCDRG00005021121) LPAR4 (ENSCDRG00005021124) P2RY10 (ENSCDRG00005021126) ENSCDRG00005021132 GPR174 (ENSCDRG00005021134) ITM2A (ENSCDRG00005021142) TBX22 (ENSCDRG00005021148) ENSCDRG00005021154 TENT5D (ENSCDRG00005021162) BRWD3 (ENSCDRG00005021171) ENSCDRG00005021186 Alpaca MODERN SPECIES 3276 MAGT1 (ENSVPAG00000001323) COX7B (ENSVPAG00000001324) ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 Pecora DUPLICATION Pecora DUPLICATION Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a ##22 Caprinae DUPLICATION Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00510000047710 ENSGT00390000018525.a.a.c.b.a ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00390000006243 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000158562 ENSGT00390000015280 ENSGT00940000158321 ENSGT00950000183171.A.b.a.a ENSGT00940000159526 ENSGT00730000110872.a ENSGT01030000235193 ENSGT00940000156399 ENSGT00940000161183 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a.a.a ##22 ENSGT00940000155553 ENSGT00940000155754 ENSGT00940000154586.j ENSGT00390000009578 ENSGT00390000017443.k.b ENSGT00940000155179 ENSGT00440000039958 ENSGT00390000015930 ENSGT00940000155097.f ENSGT00440000039046 ENSGT00940000155771 ENSGT00730000110989 ENSGT00490000043395 ENSGT00940000163559 ENSGT00940000153352.A Goat MODERN SPECIES 12 ENSCHIG00000007977 CWC27 (ENSCHIG00000016233) ADAMTS6 (ENSCHIG00000024306) CENPK (ENSCHIG00000017610) PPWD1 (ENSCHIG00000012297) TRIM23 (ENSCHIG00000011866) TRAPPC13 (ENSCHIG00000023801) SGTB (ENSCHIG00000015161) NLN (ENSCHIG00000024544) ERBIN (ENSCHIG00000014468) ENSCHIG00000025052 ENSCHIG00000013372 ENSCHIG00000008624 MAST4 (ENSCHIG00000016352) CD180 (ENSCHIG00000012138) ENSCHIG00000007869 ##22 PIK3R1 (ENSCHIG00000021158) ENSCHIG00000004863 SLC30A5 (ENSCHIG00000021792) ENSCHIG00000016273 CENPH (ENSCHIG00000014036) ENSCHIG00000026342 CDK7 (ENSCHIG00000023847) CCDC125 (ENSCHIG00000017643) ENSCHIG00000012429 AK6 (ENSCHIG00000017952) RAD17 (ENSCHIG00000020796) MARVELD2 (ENSCHIG00000016241) OCLN (ENSCHIG00000001852) ENSCHIG00000012368 NAIP (ENSCHIG00000018493) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 7 SHISAL2B (ENSOARG00020005809) SREK1IP1 (ENSOARG00020005791) ENSOARG00020005769 CWC27 (ENSOARG00020005744) ADAMTS6 (ENSOARG00020005687) CENPK (ENSOARG00020005638) PPWD1 (ENSOARG00020005575) TRIM23 (ENSOARG00020005534) TRAPPC13 (ENSOARG00020005467) SGTB (ENSOARG00020005415) NLN (ENSOARG00020005037) ERBIN (ENSOARG00020004686) SREK1 (ENSOARG00020004539) MAST4 (ENSOARG00020004329) CD180 (ENSOARG00020004248) ENSOARG00020004229 ##22 PIK3R1 (ENSOARG00020004041) ENSOARG00020004005 SLC30A5 (ENSOARG00020003947) ENSOARG00020003927 CENPH (ENSOARG00020003855) MRPS36 (ENSOARG00020003822) CDK7 (ENSOARG00020003717) TAF9 (ENSOARG00020003593) AK6 (ENSOARG00020003479) RAD17 (ENSOARG00020003355) MARVELD2 (ENSOARG00020003236) OCLN (ENSOARG00020023936) ENSOARG00020023910 NAIP (ENSOARG00020023784) ENSOARG00020023678 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000001376.gb.b.a ENSGT00940000155962 ENSGT00390000012929.q ENSGT00940000153231.A ENSGT00940000162860 ENSGT00940000167875 ENSGT00940000160622 ENSGT00390000005140.b.b.d ENSGT00390000013989.a.ab ENSGT00950000183071.a.a.b ENSGT00390000004600.b.a ENSGT00440000037733 ENSGT00900000141068.e.a.h ENSGT00390000010397.b ENSGT00390000004912 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a.a.b ##22 ENSGT00730000111130 ENSGT00390000018525.b ENSGT00940000153518.d.a ENSGT01100000263537.b.a.a.b.a ENSGT00940000157247 ENSGT00720000108834 ENSGT00940000154474.C ENSGT00940000156884 ENSGT00390000002204 ENSGT00950000182905.a.b ENSGT00950000182882.A.b.b ENSGT00970000194549 ENSGT01020000230389.b.a.a.b ENSGT00390000006330.a.a ENSGT00390000002174.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 CYFIP1 (ENSOARG00020020376) ENSOARG00020020815 TUBGCP5 (ENSOARG00020020859) ENSOARG00020021205 IMP4 (ENSOARG00020021252) ENSOARG00020021317 FAM168B (ENSOARG00020021435) PLEKHB2 (ENSOARG00020021480) ENSOARG00020021651 HS6ST1 (ENSOARG00020021735) UGGT1 (ENSOARG00020021792) SAP130 (ENSOARG00020022426) ENSOARG00020022687 AMMECR1L (ENSOARG00020006543) POLR2D (ENSOARG00020006571) ENSOARG00020006654 ##22 WDR33 (ENSOARG00020006732) SFT2D3 (ENSOARG00020007219) LIMS2 (ENSOARG00020007250) GPR17 (ENSOARG00020007349) MYO7B (ENSOARG00020007427) IWS1 (ENSOARG00020008014) ENSOARG00020008263 ENSOARG00020008323 MAP3K2 (ENSOARG00020008364) ERCC3 (ENSOARG00020008449) BIN1 (ENSOARG00020008621) ENSOARG00020009130 ENSOARG00020009156 NAB1 (ENSOARG00020009187) MFSD6 (ENSOARG00020009267) Goat MODERN SPECIES 11 ENSCHIG00000025882 ENSCHIG00000012973 ENSCHIG00000018690 FAM168B (ENSCHIG00000023919) ENSCHIG00000007457 PLEKHB2 (ENSCHIG00000020463) ENSCHIG00000009789 ENSCHIG00000016781 ENSCHIG00000025950 ##29 HS6ST1 (ENSCHIG00000016130) UGGT1 (ENSCHIG00000017321) SAP130 (ENSCHIG00000019417) ENSCHIG00000011826 AMMECR1L (ENSCHIG00000011778) POLR2D (ENSCHIG00000025995) ENSCHIG00000007698 ##22 WDR33 (ENSCHIG00000019104) SFT2D3 (ENSCHIG00000009475) GPR17 (ENSCHIG00000009894) LIMS2 (ENSCHIG00000017089) MYO7B (ENSCHIG00000010823) IWS1 (ENSCHIG00000008783) ENSCHIG00000018775 MAP3K2 (ENSCHIG00000024378) ERCC3 (ENSCHIG00000014551) CYP27C1 (ENSCHIG00000022529) BIN1 (ENSCHIG00000017866) ENSCHIG00000019254 NAB1 (ENSCHIG00000022201) NEMP2 (ENSCHIG00000019525) MFSD6 (ENSCHIG00000012721) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00950000186410 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.kb ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 205 CDX4 (ENSOARG00020019400) CHIC1 (ENSOARG00020019334) ZCCHC13 (ENSOARG00020019179) SLC16A2 (ENSOARG00020019109) RLIM (ENSOARG00020019056) NEXMIF (ENSOARG00020019011) ABCB7 (ENSOARG00020018131) ENSOARG00020018053 ENSOARG00020018033 UPRT (ENSOARG00020017941) ZDHHC15 (ENSOARG00020017751) MAGEE2 (ENSOARG00020017729) PBDC1 (ENSOARG00020017659) FGF16 (ENSOARG00020017605) MAGT1 (ENSOARG00020017197) ENSOARG00020017129 ##22 ENSOARG00020017092 ATP7A (ENSOARG00020016877) PGK1 (ENSOARG00020016769) TAF9B (ENSOARG00020016750) CYSLTR1 (ENSOARG00020016671) LPAR4 (ENSOARG00020016628) P2RY10 (ENSOARG00020016610) ENSOARG00020016579 ENSOARG00020016548 GPR174 (ENSOARG00020016533) ITM2A (ENSOARG00020016499) TBX22 (ENSOARG00020016413) TENT5D (ENSOARG00020016386) BRWD3 (ENSOARG00020015617) HMGN5 (ENSOARG00020015488) Goat MODERN SPECIES 141 ENSCHIG00000000050 ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00510000047710 ENSGT00390000018525.a.a.c.b.a ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 ENSGT00390000006243 ENSGT00940000158733 ENSGT00940000158562 ENSGT00530000065159 ENSGT00390000015280 ENSGT00940000158321 ENSGT00950000183171.A.b.a.a ENSGT00940000159526 ENSGT00730000110872.a ENSGT00940000156399 ENSGT00940000161183 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.a ##22 ENSGT00940000155553 ENSGT00940000155754 ENSGT00940000154586.j.g ENSGT00390000009578 ENSGT00390000017443.k.b ENSGT00940000155179 ENSGT00440000039958 ENSGT00940000155097.f ENSGT00390000015930 ENSGT00440000039046 ENSGT00940000155771 ENSGT00730000110989 ENSGT00490000043395 ENSGT00940000163559.m ENSGT00940000153352.A Cow MODERN SPECIES 12 CWC27 (ENSBTAG00000000037) ADAMTS6 (ENSBTAG00000016963) CENPK (ENSBTAG00000044175) PPWD1 (ENSBTAG00000009514) TRIM23 (ENSBTAG00000009519) SHLD3 (ENSBTAG00000047828) TRAPPC13 (ENSBTAG00000016900) SGTB (ENSBTAG00000016902) NLN (ENSBTAG00000016903) ERBIN (ENSBTAG00000000415) SREK1 (ENSBTAG00000007321) ENSBTAG00000053341 ENSBTAG00000049964 MAST4 (ENSBTAG00000025964) CD180 (ENSBTAG00000006360) ENSBTAG00000055154 ##22 ENSBTAG00000034170 PIK3R1 (ENSBTAG00000010989) SLC30A5 (ENSBTAG00000001013) CCNB1 (ENSBTAG00000014239) CENPH (ENSBTAG00000014246) MRPS36 (ENSBTAG00000011045) CDK7 (ENSBTAG00000011046) CCDC125 (ENSBTAG00000017011) TAF9 (ENSBTAG00000027980) AK6 (ENSBTAG00000046192) RAD17 (ENSBTAG00000002073) MARVELD2 (ENSBTAG00000040001) OCLN (ENSBTAG00000000561) GTF2H2 (ENSBTAG00000027983) ENSBTAG00000051768 American bison MODERN SPECIES 3135 SHISAL2B (ENSBBBG00000003043) SREK1IP1 (ENSBBBG00000003042) CWC27 (ENSBBBG00000003037) ENSBBBG00000013931 ADAMTS6 (ENSBBBG00000003025) CENPK (ENSBBBG00000013900) PPWD1 (ENSBBBG00000002975) TRIM23 (ENSBBBG00000013840) TRAPPC13 (ENSBBBG00000013812) SGTB (ENSBBBG00000013762) NLN (ENSBBBG00000013750) ERBIN (ENSBBBG00000002910) SREK1 (ENSBBBG00000013313) MAST4 (ENSBBBG00000002690) CD180 (ENSBBBG00000002607) ENSBBBG00000013048 ##22 ENSBBBG00000007451 ENSBBBG00000013044 Pecora ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.kb ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00940000165353 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00410000029400 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.kb ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00390000011425.A Bovidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000163063 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 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ENSBIXG00005026786 GCSAML (ENSBIXG00005026826) ENSBIXG00005026848 OR2G2 (ENSBIXG00005026861) ENSBIXG00005026865 ##22 OR2G3 (ENSBIXG00005026871) ENSBIXG00005026891 ENSBIXG00005026899 OR13G1 (ENSBIXG00005004596) OR6F1 (ENSBIXG00005026921) ENSBIXG00005026930 ENSBIXG00005026950 TRIM58 (ENSBIXG00005026978) OR2W3 (ENSBIXG00005026994) ENSBIXG00005027017 ENSBIXG00005027022 ENSBIXG00005027048 ENSBIXG00005027079 ENSBIXG00005004652 OR2AJ1 (ENSBIXG00005027175) Cow DUPLICATION Cow DUPLICATION Cow MODERN SPECIES 8 TMEM233 (ENSBTAG00000048560) CCDC60 (ENSBTAG00000004693) HSPB8 (ENSBTAG00000001303) SRRM4 (ENSBTAG00000008676) SUDS3 (ENSBTAG00000019757) TAOK3 (ENSBTAG00000012550) PEBP1 (ENSBTAG00000018115) WSB2 (ENSBTAG00000007139) RFC5 (ENSBTAG00000007137) KSR2 (ENSBTAG00000044119) NOS1 (ENSBTAG00000002023) FBXO21 (ENSBTAG00000032097) TESC (ENSBTAG00000044078) ENSBTAG00000053074 FBXW8 (ENSBTAG00000036183) ENSBTAG00000037415 ##22 RNFT2 (ENSBTAG00000043976) SPRING1 (ENSBTAG00000047139) MED13L (ENSBTAG00000001888) TBX3 (ENSBTAG00000021706) TBX5 (ENSBTAG00000011384) RBM19 (ENSBTAG00000031824) LHX5 (ENSBTAG00000003107) SDSL (ENSBTAG00000008945) SDS (ENSBTAG00000031814) PLBD2 (ENSBTAG00000019040) DTX1 (ENSBTAG00000016738) RASAL1 (ENSBTAG00000016739) CFAP73 (ENSBTAG00000011924) DDX54 (ENSBTAG00000011930) RITA1 (ENSBTAG00000011937) Cow MODERN SPECIES 26 TRIM52 (ENSBTAG00000019651) ENSBTAG00000004815 IFI47 (ENSBTAG00000015727) ENSBTAG00000050157 ZNF496 (ENSBTAG00000049098) NLRP3 (ENSBTAG00000001273) ENSBTAG00000051477 OR2H10 (ENSBTAG00000039986) OR2B11 (ENSBTAG00000039422) OR2W53 (ENSBTAG00000048813) OR2C3 (ENSBTAG00000048315) OR2C3B (ENSBTAG00000048069) GCSAML (ENSBTAG00000052663) OR2G27 (ENSBTAG00000039484) OR2G28 (ENSBTAG00000039930) ENSBTAG00000030735 ##22 OR2G3 (ENSBTAG00000027911) OR9E2 (ENSBTAG00000039804) OR5AE4 (ENSBTAG00000052311) OR5AE3 (ENSBTAG00000054452) OR6F1 (ENSBTAG00000031412) OR14P2 (ENSBTAG00000045691) OR6AA1 (ENSBTAG00000001761) OR6AN1 (ENSBTAG00000040109) OR11L1 (ENSBTAG00000017725) TRIM58 (ENSBTAG00000007470) OR2W3 (ENSBTAG00000025293) OR2W3D (ENSBTAG00000039797) OR2AO1 (ENSBTAG00000039805) OR2T54 (ENSBTAG00000053872) OR2AK3 (ENSBTAG00000007557) Cow MODERN SPECIES 177 SLC16A2 (ENSBTAG00000002585) ENSBTAG00000051929 RLIM (ENSBTAG00000015630) NEXMIF (ENSBTAG00000000300) ABCB7 (ENSBTAG00000011028) UPRT (ENSBTAG00000004549) ZDHHC15 (ENSBTAG00000008047) MAGEE2 (ENSBTAG00000025062) PBDC1 (ENSBTAG00000003609) ENSBTAG00000051706 ENSBTAG00000046806 FGF16 (ENSBTAG00000006722) ATRX (ENSBTAG00000038434) ENSBTAG00000053487 MAGT1 (ENSBTAG00000045931) COX7B (ENSBTAG00000047768) ##22 ATP7A (ENSBTAG00000010018) PGK1 (ENSBTAG00000000894) TAF9B (ENSBTAG00000000895) ENSBTAG00000026025 ENSBTAG00000051877 CYSLTR1 (ENSBTAG00000024675) ENSBTAG00000035882 LPAR4 (ENSBTAG00000003299) P2RY10 (ENSBTAG00000008555) ENSBTAG00000050883 ENSBTAG00000054002 GPR174 (ENSBTAG00000021437) ENSBTAG00000045678 TBX22 (ENSBTAG00000048060) TENT5D (ENSBTAG00000045653) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00940000154426.b.b.h ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.a ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.kb ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT00550000074618.a.b.ab.a.a.a.a ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00390000009948.c.l ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT00390000007560.k.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00390000015224.c.a.a.a.t.a.b.a.a ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b Domestic yak MODERN SPECIES 69 SLC16A2 (ENSBGRG00000024018) RLIM (ENSBGRG00000023991) NEXMIF (ENSBGRG00000023961) ENSBGRG00000023925 ABCB7 (ENSBGRG00000023373) UPRT (ENSBGRG00000023239) ENSBGRG00000023226 ZDHHC15 (ENSBGRG00000023027) MAGEE2 (ENSBGRG00000022989) ENSBGRG00000022974 PBDC1 (ENSBGRG00000022890) FGF16 (ENSBGRG00000022814) ATRX (ENSBGRG00000016038) ENSBGRG00000015557 MAGT1 (ENSBGRG00000015408) ENSBGRG00000015336 ##22 ATP7A (ENSBGRG00000015150) PGK1 (ENSBGRG00000014778) TAF9B (ENSBGRG00000014722) ENSBGRG00000014446 CYSLTR1 (ENSBGRG00000014355) ENSBGRG00000014334 LPAR4 (ENSBGRG00000014316) P2RY10 (ENSBGRG00000014291) GPR174 (ENSBGRG00000014278) ENSBGRG00000014249 ENSBGRG00000014224 TBX22 (ENSBGRG00000014109) TENT5D (ENSBGRG00000014080) BRWD3 (ENSBGRG00000013595) ENSBGRG00000013533 Wild yak MODERN SPECIES 172 FGF16 (ENSBMUG00000017116) ATRX (ENSBMUG00000017099) ENSBMUG00000017021 MAGT1 (ENSBMUG00000017005) ENSBMUG00000016989 ##22 ATP7A (ENSBMUG00000016980) PGK1 (ENSBMUG00000016916) TAF9B (ENSBMUG00000016896) ENSBMUG00000016872 ENSBMUG00000016853 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.b.a.a.b.b.a.b ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00940000156607.a.a ENSGT00390000014753 ENSGT00940000161153 ENSGT00940000162022 ENSGT00440000033720.a ENSGT00940000153421.a.a.a.a.b ENSGT00390000016722 ENSGT00940000155212 ENSGT00960000190178 ENSGT00980000198921.a.a ENSGT00410000025556.a.b ENSGT00940000158265 ENSGT00940000155821 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00390000004175 ENSGT00940000153904.a ENSGT00390000009151.i ENSGT01000000214694.A.b ENSGT00950000182965.b ENSGT00950000183035.a.b.a ENSGT00950000182803.B.d.a.j ENSGT00940000159771 ENSGT00940000160879 ENSGT00930000150973.A ENSGT00940000162067.a.a ENSGT00940000158619 ENSGT00510000047168 ENSGT00390000001798.i ENSGT00390000006915.c.c.b Bos_a ANCESTRAL SPECIES 143 ENSGT00980000198921.a.a ENSGT00410000025556.a.b ENSGT00940000158265 ENSGT00940000155821 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.b ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 70 AKAP17A (ENSBGRG00000019461) P2RY8 (ENSBGRG00000019508) ASMTL (ENSBGRG00000007075) SLC25A6 (ENSBGRG00000007164) 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ENSGT00960000190178 ENSGT00980000198921.a.a ENSGT00410000025556.a.b ENSGT00940000158265 ENSGT00940000155821 ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b.b ##22 ENSGT00390000004175 ENSGT00940000153904.a ENSGT00390000009151.i ENSGT01000000214694.A.b ENSGT00950000183035.a.b.a ENSGT00950000182803.B.d.a.j ENSGT00940000159771 ENSGT00940000160879 ENSGT00930000150973.A ENSGT00940000162067.a.a ENSGT00940000158619 ENSGT00510000047168 ENSGT00390000001798.i ENSGT00390000006915.c.c.b ENSGT00390000013608 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 315 ENSBIXG00005011152 STS (ENSBIXG00005011080) PNPLA4 (ENSBIXG00005011002) ANOS1 (ENSBIXG00005010908) ENSBIXG00005010818 GPR143 (ENSBIXG00005010743) SHROOM2 (ENSBIXG00005000636) ENSBIXG00005010661 ENSBIXG00005010650 ENSBIXG00005010631 ENSBIXG00005010460 WWC3 (ENSBIXG00005010425) CLCN4 (ENSBIXG00005010373) MID1 (ENSBIXG00005010309) ENSBIXG00005010237 ENSBIXG00005010228 ##22 ARHGAP6 (ENSBIXG00005010176) HCCS (ENSBIXG00005010146) AMELX (ENSBIXG00005010091) ENSBIXG00005010072 MSL3 (ENSBIXG00005010008) FRMPD4 (ENSBIXG00005009833) ENSBIXG00005009647 TLR7 (ENSBIXG00005009598) TLR8 (ENSBIXG00005009578) ENSBIXG00005009560 ENSBIXG00005009511 ENSBIXG00005009503 EGFL6 (ENSBIXG00005006708) ENSBIXG00005009392 RAB9A (ENSBIXG00005009378) Cow MODERN SPECIES 176 ENSBTAG00000050071 ##22 HCCS (ENSBTAG00000012113) ARHGAP6 (ENSBTAG00000002626) AMELX (ENSBTAG00000012089) ENSBTAG00000051129 American bison MODERN SPECIES 2435 ENSBBBG00000005552 ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.a.b ##22 Goat MODERN SPECIES 21 ENSCHIG00000020228 ENSCHIG00000019709 ENSCHIG00000026949 ALDH3B2 (ENSCHIG00000016769) UNC93B1 (ENSCHIG00000026943) ENSCHIG00000026059 ENSCHIG00000013308 TCIRG1 (ENSCHIG00000021975) CHKA (ENSCHIG00000014786) KMT5B (ENSCHIG00000025585) ENSCHIG00000016165 LRP5 (ENSCHIG00000019530) PPP6R3 (ENSCHIG00000020367) GAL (ENSCHIG00000024788) TESMIN (ENSCHIG00000026439) ENSCHIG00000019619 ##22 CPT1A (ENSCHIG00000015344) MRPL21 (ENSCHIG00000020757) IGHMBP2 (ENSCHIG00000011703) ENSCHIG00000008487 MRGPRF (ENSCHIG00000024512) TPCN2 (ENSCHIG00000024724) CCND1 (ENSCHIG00000010534) LTO1 (ENSCHIG00000016576) FGF19 (ENSCHIG00000012980) FGF4 (ENSCHIG00000010447) FGF3 (ENSCHIG00000001606) ANO1 (ENSCHIG00000025110) FADD (ENSCHIG00000008257) ENSCHIG00000020155 PPFIA1 (ENSCHIG00000006687) Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 1323 ENSCHYG00000013216 SLC16A2 (ENSCHYG00000013135) RLIM (ENSCHYG00000013107) NEXMIF (ENSCHYG00000013048) ENSCHYG00000013033 ABCB7 (ENSCHYG00000012079) UPRT (ENSCHYG00000011786) ZDHHC15 (ENSCHYG00000011470) MAGEE2 (ENSCHYG00000011410) ENSCHYG00000011362 ENSCHYG00000011310 FGF16 (ENSCHYG00000011260) ENSCHYG00000011219 ATRX (ENSCHYG00000011090) MAGT1 (ENSCHYG00000010961) ENSCHYG00000010895 ##22 ATP7A (ENSCHYG00000010379) ENSCHYG00000010341 ENSCHYG00000010325 ENSCHYG00000010187 TAF9B (ENSCHYG00000010082) ENSCHYG00000009821 CYSLTR1 (ENSCHYG00000009807) LPAR4 (ENSCHYG00000009794) P2RY10 (ENSCHYG00000009753) GPR174 (ENSCHYG00000009735) ITM2A (ENSCHYG00000009688) TBX22 (ENSCHYG00000009606) ENSCHYG00000009550 TENT5D (ENSCHYG00000009524) ENSCHYG00000009482 Yarkand deer MODERN SPECIES 14 LAG3 (ENSCHYG00000024522) ENSCHYG00000024584 MLF2 (ENSCHYG00000024596) COPS7A (ENSCHYG00000024633) PIANP (ENSCHYG00000024684) ZNF384 (ENSCHYG00000024746) ING4 (ENSCHYG00000024855) ACRBP (ENSCHYG00000024938) LPAR5 (ENSCHYG00000024995) CHD4 (ENSCHYG00000025019) NOP2 (ENSCHYG00000025184) IFFO1 (ENSCHYG00000025348) ENSCHYG00000025387 NCAPD2 (ENSCHYG00000025563) MRPL51 (ENSCHYG00000025676) ENSCHYG00000025696 ##22 ENSCHYG00000025715 TAPBPL (ENSCHYG00000025766) ENSCHYG00000025783 CD27 (ENSCHYG00000025790) LTBR (ENSCHYG00000025819) SCNN1A (ENSCHYG00000025885) TNFRSF1A (ENSCHYG00000025998) PLEKHG6 (ENSCHYG00000026050) CD9 (ENSCHYG00000026113) VWF (ENSCHYG00000026172) ANO2 (ENSCHYG00000026287) NTF3 (ENSCHYG00000026438) KCNA5 (ENSCHYG00000026449) ENSCHYG00000011432 KCNA1 (ENSCHYG00000011459) Yarkand deer MODERN SPECIES 3 RNF212B (ENSCHYG00000014629) HOMEZ (ENSCHYG00000014595) PPP1R3E (ENSCHYG00000014529) PABPN1 (ENSCHYG00000014202) SLC22A17 (ENSCHYG00000013916) EFS (ENSCHYG00000013648) IL25 (ENSCHYG00000013553) ENSCHYG00000013291 ENSCHYG00000013203 MYH7 (ENSCHYG00000012682) NGDN (ENSCHYG00000012516) ZFHX2 (ENSCHYG00000012435) THTPA (ENSCHYG00000012365) AP1G2 (ENSCHYG00000012260) JPH4 (ENSCHYG00000012168) ENSCHYG00000012150 ##22 ENSCHYG00000012105 ENSCHYG00000012084 ENSCHYG00000012053 ENSCHYG00000012023 ENSCHYG00000011583 CARMIL3 (ENSCHYG00000011429) CPNE6 (ENSCHYG00000011191) NRL (ENSCHYG00000011152) PCK2 (ENSCHYG00000010885) DCAF11 (ENSCHYG00000010574) FITM1 (ENSCHYG00000010518) PSME1 (ENSCHYG00000010154) EMC9 (ENSCHYG00000010055) ENSCHYG00000009594 RNF31 (ENSCHYG00000009118) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.b ##22 Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 9 ZCCHC13 (ENSMMSG00000001254) SLC16A2 (ENSMMSG00000001236) RLIM (ENSMMSG00000001223) NEXMIF (ENSMMSG00000001198) ENSMMSG00000001187 ABCB7 (ENSMMSG00000001025) UPRT (ENSMMSG00000000982) ZDHHC15 (ENSMMSG00000000902) MAGEE2 (ENSMMSG00000000878) ENSMMSG00000000865 PBDC1 (ENSMMSG00000000843) ENSMMSG00000000830 FGF16 (ENSMMSG00000000801) ATRX (ENSMMSG00000000633) MAGT1 (ENSMMSG00000000570) ENSMMSG00000000541 ##22 ATP7A (ENSMMSG00000000479) ENSMMSG00000000439 ENSMMSG00000000413 TAF9B (ENSMMSG00000000384) ENSMMSG00000000301 CYSLTR1 (ENSMMSG00000000289) ENSMMSG00000000270 LPAR4 (ENSMMSG00000000242) P2RY10 (ENSMMSG00000000233) GPR174 (ENSMMSG00000000217) ENSMMSG00000000211 TENT5D (ENSMMSG00000000196) ENSMMSG00000000165 BRWD3 (ENSMMSG00000000027) HMGN5 (ENSMMSG00000000002) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1194 MSRB2 (ENSMMSG00000009568) ARMC3 (ENSMMSG00000009602) ENSMMSG00000009832 PIP4K2A (ENSMMSG00000009845) SPAG6 (ENSMMSG00000009939) BMI1 (ENSMMSG00000010401) COMMD3 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(ENSMMSG00000013609) ENSMMSG00000013651 DIRAS2 (ENSMMSG00000013671) GADD45G (ENSMMSG00000013683) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000182899.A ENSGT00940000156426 ENSGT00940000155428.f ENSGT00940000160301 ENSGT00950000186311 ENSGT00390000018717.b.a.a ENSGT00940000155666.c ENSGT00390000013444.a.b.a ENSGT00940000161448 ENSGT00390000001607 ENSGT01090000260080.a ENSGT00390000008327 ENSGT00390000014165.c.a.a.h.f.b.a ENSGT00940000154206.b ENSGT00390000014969 ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00440000033970 ENSGT00940000154544.b ENSGT00940000158877 ENSGT00390000004965 ENSGT00390000008694.b.b.c.a ENSGT00950000182953.C.c ENSGT00940000158546 ENSGT00390000017668 ENSGT00510000049083.b ENSGT00940000160795 ENSGT00940000157511 ENSGT00940000159443 ENSGT00940000157626 ENSGT00510000049120 ENSGT00390000013178 Dingo MODERN SPECIES 343 LAMP5 (ENSCAFG00020027564) PLCB4 (ENSCAFG00020027572) PLCB1 (ENSCAFG00020027584) ENSCAFG00020027586 TMX4 (ENSCAFG00020000183) ENSCAFG00020000262 HAO1 (ENSCAFG00020000270) BMP2 (ENSCAFG00020000368) FERMT1 (ENSCAFG00020000398) CRLS1 (ENSCAFG00020000734) MCM8 (ENSCAFG00020000771) TRMT6 (ENSCAFG00020000777) ENSCAFG00020000781 CHGB (ENSCAFG00020000789) SHLD1 (ENSCAFG00020000822) ENSCAFG00020000827 ##22 GPCPD1 (ENSCAFG00020000839) PROKR2 (ENSCAFG00020000846) CDS2 (ENSCAFG00020000922) PCNA (ENSCAFG00020001289) ENSCAFG00020001296 SLC23A2 (ENSCAFG00020001322) RASSF2 (ENSCAFG00020001561) PRND (ENSCAFG00020001574) PRNP (ENSCAFG00020001602) ADRA1D (ENSCAFG00020001611) SMOX (ENSCAFG00020001635) ENSCAFG00020001682 RNF24 (ENSCAFG00020001686) PANK2 (ENSCAFG00020001695) MAVS (ENSCAFG00020001723) Dog MODERN SPECIES 16 PAK5 (ENSCAFG00845024949) LAMP5 (ENSCAFG00845025200) PLCB4 (ENSCAFG00845025366) PLCB1 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ENSGT00940000155902 ENSGT00980000202753 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00980000202753 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00390000015224.c.a.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Microchiroptera DUPLICATION Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00980000202753 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.b.c ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 Microbat MODERN SPECIES 941 ARHGEF9 (ENSMLUG00000002051) ENSMLUG00000027999 ENSMLUG00000023405 SPIN4 (ENSMLUG00000007170) ENSMLUG00000000361 ENSMLUG00000008292 ENSMLUG00000024793 ENSMLUG00000029783 ENSMLUG00000005846 ENSMLUG00000027225 FGF16 (ENSMLUG00000011190) ENSMLUG00000027761 ENSMLUG00000028355 ENSMLUG00000027763 MAGT1 (ENSMLUG00000008595) ENSMLUG00000022443 ##22 ATP7A (ENSMLUG00000025990) ENSMLUG00000026413 PGK1 (ENSMLUG00000017791) TAF9B (ENSMLUG00000014581) RTL3 (ENSMLUG00000002371) LPAR4 (ENSMLUG00000006096) P2RY10 (ENSMLUG00000010499) ENSMLUG00000025815 GPR174 (ENSMLUG00000005162) ENSMLUG00000025668 ITM2A (ENSMLUG00000010431) TBX22 (ENSMLUG00000016826) ENSMLUG00000024811 TENT5D (ENSMLUG00000000409) BRWD3 (ENSMLUG00000005607) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES ZC4H2 (ENSRFEG00010000420) ENSRFEG00010000382 ENSRFEG00010000366 MTMR8 (ENSRFEG00010000342) AMER1 (ENSRFEG00010000332) ENSRFEG00010000325 ARHGEF9 (ENSRFEG00010000258) ENSRFEG00010000214 SPIN4 (ENSRFEG00010000198) ENSRFEG00010000193 FGF16 (ENSRFEG00010000182) ATRX (ENSRFEG00010000118) ENSRFEG00010000095 ENSRFEG00010005487 MAGT1 (ENSRFEG00010005458) ENSRFEG00010005435 ##22 ATP7A (ENSRFEG00010005348) ENSRFEG00010005309 ENSRFEG00010005300 ENSRFEG00010005289 TAF9B (ENSRFEG00010005277) ENSRFEG00010005274 ENSRFEG00010005262 ENSRFEG00010005245 CYSLTR1 (ENSRFEG00010005241) ENSRFEG00010005233 RTL3 (ENSRFEG00010005225) LPAR4 (ENSRFEG00010005218) P2RY10 (ENSRFEG00010005207) GPR174 (ENSRFEG00010005200) ITM2A (ENSRFEG00010005189) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b.b.d ##22 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 6 DACT3 (ENSRFEG00010011826) PRKD2 (ENSRFEG00010011924) STRN4 (ENSRFEG00010012035) FKRP (ENSRFEG00010012506) SLC1A5 (ENSRFEG00010012525) AP2S1 (ENSRFEG00010012755) ARHGAP35 (ENSRFEG00010013104) NPAS1 (ENSRFEG00010013143) TMEM160 (ENSRFEG00010013212) ZC3H4 (ENSRFEG00010013266) SAE1 (ENSRFEG00010013378) ENSRFEG00010013509 CCDC9 (ENSRFEG00010013812) ENSRFEG00010013918 C5AR1 (ENSRFEG00010013939) ENSRFEG00010013958 ##22 C5AR2 (ENSRFEG00010013977) DHX34 (ENSRFEG00010014000) MEIS3 (ENSRFEG00010014079) SLC8A2 (ENSRFEG00010014268) KPTN (ENSRFEG00010014307) NAPA (ENSRFEG00010014363) ZNF541 (ENSRFEG00010014459) BICRA (ENSRFEG00010014745) EHD2 (ENSRFEG00010015006) NOP53 (ENSRFEG00010015079) SELENOW (ENSRFEG00010005319) CRX (ENSRFEG00010005332) SULT2A1 (ENSRFEG00010005353) ENSRFEG00010005368 CABP5 (ENSRFEG00010005387) Microbat MODERN SPECIES 1284 SCUBE3 (ENSMLUG00000008561) ZNF76 (ENSMLUG00000008610) DEF6 (ENSMLUG00000008624) PPARD (ENSMLUG00000010594) ENSMLUG00000023455 ENSMLUG00000024807 FKBP5 (ENSMLUG00000011255) ARMC12 (ENSMLUG00000005100) ENSMLUG00000022424 ##22 ENSMLUG00000010934 CLPS (ENSMLUG00000010948) LHFPL5 (ENSMLUG00000010960) SRPK1 (ENSMLUG00000010974) SLC26A8 (ENSMLUG00000003668) MAPK14 (ENSMLUG00000005967) ENSMLUG00000024504 BRPF3 (ENSMLUG00000002418) PNPLA1 (ENSMLUG00000000853) BNIP5 (ENSMLUG00000000855) ENSMLUG00000000866 KCTD20 (ENSMLUG00000007139) STK38 (ENSMLUG00000007149) Megabat MODERN SPECIES 3736 MAGT1 (ENSPVAG00000003236) COX7B (ENSPVAG00000003237) ##22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b #22 Common shrew MODERN SPECIES 10144 COX7B (ENSSARG00000005701) #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Glires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Rodentia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00520000061207 ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000185117 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00520000061207 ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000185117 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1166 Jak2 (ENSNGAG00000000096) Rcl1 (ENSNGAG00000015327) Ak3 (ENSNGAG00000016647) Cdc37l1 (ENSNGAG00000018155) Spata6l 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ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b.t.a ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00520000061207 ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000164586.b ENSGT00390000008820.e.b.t.a.a ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 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ENSMOCG00000016097 ENSMOCG00000015369 Magt1 (ENSMOCG00000005129) Cox7b (ENSMOCG00000000328) #22 Atp7a (ENSMOCG00000002028) ENSMOCG00000010730 ENSMOCG00000000983 ENSMOCG00000017397 ENSMOCG00000015345 ENSMOCG00000011961 Cysltr1 (ENSMOCG00000001518) Rtl3 (ENSMOCG00000017247) Lpar4 (ENSMOCG00000015702) P2ry10 (ENSMOCG00000014359) P2ry10b (ENSMOCG00000012027) Murinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000003601.a ENSGT00520000061207 ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00950000183593 ENSGT00940000164586.b ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 16 Gpx2 (ENSRNOG00000055672) Fntb (ENSRNOG00000007660) Sptb (ENSRNOG00000006911) Plekhg3 (ENSRNOG00000006570) RGD1562381 (ENSRNOG00000029835) Ppp1r36 (ENSRNOG00000038480) Hspa2 (ENSRNOG00000006472) Zbtb1 (ENSRNOG00000058593) Zbtb25 (ENSRNOG00000006441) Akap5 (ENSRNOG00000006410) Mthfd1 (ENSRNOG00000005602) Tex21 (ENSRNOG00000038496) Esr2 (ENSRNOG00000005343) Syne2 (ENSRNOG00000005323) Sgpp1 (ENSRNOG00000005175) ENSRNOG00000069102 #22 Wdr89 (ENSRNOG00000021628) Ppp2r5e (ENSRNOG00000005045) Gphb5 (ENSRNOG00000021885) Rhoj (ENSRNOG00000021919) Kcnh5 (ENSRNOG00000009542) LOC102551114 (ENSRNOG00000069640) Syt16 (ENSRNOG00000056012) Snapc1 (ENSRNOG00000009296) Hif1a (ENSRNOG00000008292) Prkch (ENSRNOG00000004873) Tmem30b (ENSRNOG00000008046) Slc38a6 (ENSRNOG00000022622) Trmt5 (ENSRNOG00000007785) Mnat1 (ENSRNOG00000007267) Six4 (ENSRNOG00000007250) Rat MODERN SPECIES 46 LOC102546324 (ENSRNOG00000062346) Slc16a2 (ENSRNOG00000002832) LOC680353 (ENSRNOG00000033484) Rlim (ENSRNOG00000045695) LOC103690100 (ENSRNOG00000065591) Nexmif (ENSRNOG00000021589) Abcb7 (ENSRNOG00000002790) Uprt (ENSRNOG00000063275) Zdhhc15 (ENSRNOG00000002751) Magee2 (ENSRNOG00000021400) Pbdc1 (ENSRNOG00000002662) Magee1 (ENSRNOG00000002660) Fgf16 (ENSRNOG00000061530) Atrx (ENSRNOG00000056703) Magt1 (ENSRNOG00000051408) Cox7b (ENSRNOG00000054689) #22 ENSRNOG00000055485 Atp7a (ENSRNOG00000061367) Tlr13 (ENSRNOG00000061403) Pgk1 (ENSRNOG00000058249) Taf9b (ENSRNOG00000061102) LOC100359505 (ENSRNOG00000032807) ENSRNOG00000069323 LOC120099223 (ENSRNOG00000068306) Fndc3c1 (ENSRNOG00000002451) Cysltr1 (ENSRNOG00000037845) LOC100359656 (ENSRNOG00000029090) RGD1560821 (ENSRNOG00000023733) Rtl3 (ENSRNOG00000002429) Lpar4 (ENSRNOG00000002428) P2ry10 (ENSRNOG00000037839) Mus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000003601.a ENSGT00520000061207 ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00950000183593 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592.c ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Shrew mouse MODERN SPECIES 23 Chic1 (MGP_PahariEiJ_G0031846) Tsx (MGP_PahariEiJ_G0031847) Zcchc13 (MGP_PahariEiJ_G0031848) Slc16a2 (MGP_PahariEiJ_G0031849) Rlim (MGP_PahariEiJ_G0031850) Nexmif (MGP_PahariEiJ_G0031851) Abcb7 (MGP_PahariEiJ_G0031852) Uprt (MGP_PahariEiJ_G0031853) Zdhhc15 (MGP_PahariEiJ_G0031854) Magee2 (MGP_PahariEiJ_G0031855) Pbdc1 (MGP_PahariEiJ_G0031856) Magee1 (MGP_PahariEiJ_G0031857) Fgf16 (MGP_PahariEiJ_G0031858) Atrx (MGP_PahariEiJ_G0031859) Magt1 (MGP_PahariEiJ_G0031860) Cox7b (MGP_PahariEiJ_G0031861) #22 Atp7a (MGP_PahariEiJ_G0031862) MGP_PahariEiJ_G0031863 MGP_PahariEiJ_G0031864 Taf9b (MGP_PahariEiJ_G0031865) Fndc3c1 (MGP_PahariEiJ_G0031866) Cysltr1 (MGP_PahariEiJ_G0031867) Gm5127 (MGP_PahariEiJ_G0031868) Rtl3 (MGP_PahariEiJ_G0031869) Lpar4 (MGP_PahariEiJ_G0031870) P2ry10 (MGP_PahariEiJ_G0031871) P2ry10b (MGP_PahariEiJ_G0031872) Gpr174 (MGP_PahariEiJ_G0031873) Itm2a (MGP_PahariEiJ_G0031874) Tbx22 (MGP_PahariEiJ_G0031875) Chmp1b2 (MGP_PahariEiJ_G0031876) Mus_A DUPLICATION Mus_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00900000143788 ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00390000016779.b.a.a.b ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.k #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00950000183593 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592.c ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Ryukyu mouse MODERN SPECIES 19 Tsx (MGP_CAROLIEiJ_G0033309) MGP_CAROLIEiJ_G0033310 Zcchc13 (MGP_CAROLIEiJ_G0033311) Slc16a2 (MGP_CAROLIEiJ_G0033312) Nexmif (MGP_CAROLIEiJ_G0033314) Abcb7 (MGP_CAROLIEiJ_G0033315) Uprt (MGP_CAROLIEiJ_G0033316) Zdhhc15 (MGP_CAROLIEiJ_G0033317) Magee2 (MGP_CAROLIEiJ_G0033318) Pbdc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0033319) Magee1 (MGP_CAROLIEiJ_G0033320) Cypt2 (MGP_CAROLIEiJ_G0033321) Fgf16 (MGP_CAROLIEiJ_G0033322) Atrx (MGP_CAROLIEiJ_G0033323) Magt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0033324) Cox7b (MGP_CAROLIEiJ_G0033325) #22 Atp7a (MGP_CAROLIEiJ_G0033326) MGP_CAROLIEiJ_G0033327 MGP_CAROLIEiJ_G0033328 Taf9b (MGP_CAROLIEiJ_G0033329) Fndc3c1 (MGP_CAROLIEiJ_G0033330) Cysltr1 (MGP_CAROLIEiJ_G0033331) Gm5127 (MGP_CAROLIEiJ_G0033332) Rtl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0033333) Lpar4 (MGP_CAROLIEiJ_G0033334) P2ry10 (MGP_CAROLIEiJ_G0033335) P2ry10b (MGP_CAROLIEiJ_G0033336) Gpr174 (MGP_CAROLIEiJ_G0033337) Itm2a (MGP_CAROLIEiJ_G0033338) Tbx22 (MGP_CAROLIEiJ_G0033339) Chmp1b2 (MGP_CAROLIEiJ_G0033340) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00900000143788 ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00390000016779.b.a.a.b ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.k #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00950000183593 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592.c ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Mus_C ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00520000061207 ENSGT00900000143788 ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b.k #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00950000183593 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 spretus MODERN SPECIES 19 Tsx (MGP_SPRETEiJ_G0034473) MGP_SPRETEiJ_G0034474 Zcchc13 (MGP_SPRETEiJ_G0034475) Slc16a2 (MGP_SPRETEiJ_G0034476) Rlim (MGP_SPRETEiJ_G0034477) Nexmif (MGP_SPRETEiJ_G0034478) Abcb7 (MGP_SPRETEiJ_G0034479) Uprt (MGP_SPRETEiJ_G0034480) Zdhhc15 (MGP_SPRETEiJ_G0034481) Magee2 (MGP_SPRETEiJ_G0034482) Pbdc1 (MGP_SPRETEiJ_G0034483) Magee1 (MGP_SPRETEiJ_G0034484) Fgf16 (MGP_SPRETEiJ_G0034486) Atrx (MGP_SPRETEiJ_G0034487) Magt1 (MGP_SPRETEiJ_G0034488) Cox7b (MGP_SPRETEiJ_G0034489) #22 Atp7a (MGP_SPRETEiJ_G0034490) Tlr13 (MGP_SPRETEiJ_G0034491) Pgk1 (MGP_SPRETEiJ_G0034492) Taf9b (MGP_SPRETEiJ_G0034493) Cysltr1 (MGP_SPRETEiJ_G0034495) Gm5127 (MGP_SPRETEiJ_G0034496) Rtl3 (MGP_SPRETEiJ_G0034497) Lpar4 (MGP_SPRETEiJ_G0034498) P2ry10 (MGP_SPRETEiJ_G0034499) P2ry10b (MGP_SPRETEiJ_G0034500) Gpr174 (MGP_SPRETEiJ_G0034501) Itm2a (MGP_SPRETEiJ_G0034502) Tbx22 (MGP_SPRETEiJ_G0034503) Chmp1b2 (MGP_SPRETEiJ_G0034504) Tent5d (MGP_SPRETEiJ_G0034505) Steppe mouse MODERN SPECIES 1932 Magt1 (ENSMSIG00000014043) Cox7b (ENSMSIG00000014063) #22 Mouse MODERN SPECIES 37 Gm26992 (ENSMUSG00000098078) Zcchc13 (ENSMUSG00000031330) Slc16a2 (ENSMUSG00000033965) Rlim (ENSMUSG00000056537) Nexmif 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(ENSJJAG00000022359) ENSJJAG00000022057 Zdhhc15 (ENSJJAG00000021898) ENSJJAG00000020303 Magee1 (ENSJJAG00000020183) Fgf16 (ENSJJAG00000019619) Atrx (ENSJJAG00000014930) Magt1 (ENSJJAG00000010395) ENSJJAG00000005456 #22 Atp7a (ENSJJAG00000021103) ENSJJAG00000000513 ENSJJAG00000013279 ENSJJAG00000000081 Pgk1 (ENSJJAG00000023664) ENSJJAG00000023542 ENSJJAG00000023347 ENSJJAG00000016547 Cysltr1 (ENSJJAG00000015881) Rtl3 (ENSJJAG00000014790) Lpar4 (ENSJJAG00000014526) P2ry10 (ENSJJAG00000013101) Gpr174 (ENSJJAG00000013177) Itm2a (ENSJJAG00000017652) Tbx22 (ENSJJAG00000013684) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 69 Stxbp3 (ENSJJAG00000021474) ENSJJAG00000020918 ENSJJAG00000017126 ENSJJAG00000001447 ENSJJAG00000007204 ENSJJAG00000015323 ENSJJAG00000011856 Cfap276 (ENSJJAG00000022243) Elapor1 (ENSJJAG00000021851) Sars (ENSJJAG00000000280) Celsr2 (ENSJJAG00000023065) Psrc1 (ENSJJAG00000022234) Mybphl (ENSJJAG00000023157) Sort1 (ENSJJAG00000021428) Psma5 (ENSJJAG00000012469) ENSJJAG00000021098 #22 Sypl2 (ENSJJAG00000020422) ENSJJAG00000013439 Cyb561d1 (ENSJJAG00000001813) Amigo1 (ENSJJAG00000019400) Gpr61 (ENSJJAG00000005794) Gnai3 (ENSJJAG00000023865) Gnat2 (ENSJJAG00000019561) Ampd2 (ENSJJAG00000022303) Gstm4 (ENSJJAG00000021199) Gstm2 (ENSJJAG00000019194) ENSJJAG00000019730 ENSJJAG00000010910 Gstm7 (ENSJJAG00000015165) Gstm5 (ENSJJAG00000014315) ENSJJAG00000022854 Kangaroo rat MODERN SPECIES 435 Nap1l2 (ENSDORG00000026810) Cdx4 (ENSDORG00000014418) Chic1 (ENSDORG00000014421) ENSDORG00000016070 Zcchc13 (ENSDORG00000028312) Slc16a2 (ENSDORG00000025453) Rlim (ENSDORG00000005714) Nexmif (ENSDORG00000005387) Abcb7 (ENSDORG00000013872) Uprt (ENSDORG00000015956) Zdhhc15 (ENSDORG00000028824) Magee1 (ENSDORG00000026617) Fgf16 (ENSDORG00000028103) Atrx (ENSDORG00000027540) Magt1 (ENSDORG00000027252) Cox7b (ENSDORG00000025171) #22 Atp7a (ENSDORG00000025464) Pgk1 (ENSDORG00000025747) ENSDORG00000029555 Cysltr1 (ENSDORG00000025755) Gm5127 (ENSDORG00000026330) Rtl3 (ENSDORG00000029995) Lpar4 (ENSDORG00000025204) P2ry10 (ENSDORG00000004365) P2ry10b (ENSDORG00000028974) Gpr174 (ENSDORG00000011385) Itm2a (ENSDORG00000003742) Tbx22 (ENSDORG00000009980) ENSDORG00000014964 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00390000015009.h ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 TBK1 (ENSSVLG00005011016) RASSF3 (ENSSVLG00005011138) GNS (ENSSVLG00005011208) ENSSVLG00005011581 TBC1D30 (ENSSVLG00005011647) ENSSVLG00005011893 WIF1 (ENSSVLG00005011932) LEMD3 (ENSSVLG00005011973) MSRB3 (ENSSVLG00005012047) HMGA2 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#22 TRIB2 (ENSSVLG00005016251) #20 LPIN1 (ENSSVLG00005016318) #18 NTSR2 (ENSSVLG00005017070) #17 GREB1 (ENSSVLG00005017159) #16 ENSSVLG00005017788 #14 ENSSVLG00005017989 ROCK2 (ENSSVLG00005018051) #13 SLC66A3 (ENSSVLG00005018165) #12 C2orf50 (ENSSVLG00005018240) KCNF1 (ENSSVLG00005018274) #11 PDIA6 (ENSSVLG00005018305) #10 ATP6V1C2 (ENSSVLG00005018543) #9 ENSSVLG00005018931 NOL10 (ENSSVLG00005018977) #8 ENSSVLG00005019056 #7 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 156 ABCB7 (ENSSVLG00005014285) UPRT (ENSSVLG00005014152) ZDHHC15 (ENSSVLG00005014065) MAGEE2 (ENSSVLG00005014015) ENSSVLG00005013933 PBDC1 (ENSSVLG00005013885) ENSSVLG00005013840 MAGEE1 (ENSSVLG00005013812) ENSSVLG00005013720 ENSSVLG00005013671 ENSSVLG00005013604 #15 ENSSVLG00005013555 FGF16 (ENSSVLG00005013490) ATRX (ENSSVLG00005013376) ENSSVLG00005012812 ENSSVLG00005012706 #22 ENSSVLG00005012657 ENSSVLG00005012574 ENSSVLG00005012533 ATP7A (ENSSVLG00005012051) ENSSVLG00005011999 ENSSVLG00005011883 TAF9B (ENSSVLG00005011826) ENSSVLG00005011533 ENSSVLG00005011494 CYSLTR1 (ENSSVLG00005011474) ENSSVLG00005011444 ENSSVLG00005011426 RTL3 (ENSSVLG00005011379) LPAR4 (ENSSVLG00005011359) ENSSVLG00005011328 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 CEP44 (ENSSVLG00005002394) ENSSVLG00005002353 HAND2 (ENSSVLG00005002329) SCRG1 (ENSSVLG00005002314) SAP30 (ENSSVLG00005002302) ENSSVLG00005002287 GALNT7 (ENSSVLG00005002249) GALNTL6 (ENSSVLG00005002203) AADAT (ENSSVLG00005002134) MFAP3L (ENSSVLG00005002117) HPF1 (ENSSVLG00005002099) CLCN3 (ENSSVLG00005002005) NEK1 (ENSSVLG00005001904) SH3RF1 (ENSSVLG00005001800) ENSSVLG00005001764 ENSSVLG00005001751 #22 PALLD (ENSSVLG00005001640) ENSSVLG00005001553 ANXA10 (ENSSVLG00005001520) SPOCK3 (ENSSVLG00005001298) ENSSVLG00005001107 TLL1 (ENSSVLG00005001039) ENSSVLG00005000996 CPE (ENSSVLG00005000975) MSMO1 (ENSSVLG00005000949) KLHL2 (ENSSVLG00005000822) ENSSVLG00005000719 TRIM75 (ENSSVLG00005000696) ENSSVLG00005000680 ENSSVLG00005000666 ENSSVLG00005000652 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00390000015009.h ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00940000160940.e.a Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 180 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00390000015009.h ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.b #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00940000160940.e.a Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 321 NEXMIF (ENSUPAG00010020020) ABCB7 (ENSUPAG00010020026) UPRT (ENSUPAG00010020039) ZDHHC15 (ENSUPAG00010020042) MAGEE2 (ENSUPAG00010020054) PBDC1 (ENSUPAG00010020059) MAGEE1 (ENSUPAG00010020065) ENSUPAG00010020066 FGF16 (ENSUPAG00010020071) ATRX (ENSUPAG00010020076) MAGT1 (ENSUPAG00010020141) ENSUPAG00010020152 #22 ATP7A (ENSUPAG00010020160) ENSUPAG00010020210 ENSUPAG00010020212 Squirrel MODERN SPECIES 283 SLC16A2 (ENSSTOG00000026933) RLIM (ENSSTOG00000023752) NEXMIF (ENSSTOG00000029557) ABCB7 (ENSSTOG00000011334) ENSSTOG00000025861 UPRT (ENSSTOG00000007045) ZDHHC15 (ENSSTOG00000001592) MAGEE2 (ENSSTOG00000026571) ENSSTOG00000033839 PBDC1 (ENSSTOG00000000892) MAGEE1 (ENSSTOG00000010904) ENSSTOG00000028105 FGF16 (ENSSTOG00000014766) ATRX (ENSSTOG00000027917) MAGT1 (ENSSTOG00000010870) COX7B (ENSSTOG00000030127) #22 ATP7A (ENSSTOG00000002640) ENSSTOG00000007716 Alpin marmot MODERN SPECIES 107 ENSMMMG00000017402 ABCB7 (ENSMMMG00000017382) UPRT (ENSMMMG00000017368) ZDHHC15 (ENSMMMG00000017360) MAGEE2 (ENSMMMG00000017354) ENSMMMG00000017347 ENSMMMG00000017343 PBDC1 (ENSMMMG00000017337) ENSMMMG00000017334 ENSMMMG00000017328 ENSMMMG00000017325 ENSMMMG00000017322 ENSMMMG00000017309 ATRX (ENSMMMG00000013466) MAGT1 (ENSMMMG00000013407) ENSMMMG00000013403 #22 ATP7A (ENSMMMG00000013343) ENSMMMG00000013340 ENSMMMG00000013331 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.b #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 ENSHGLG00000050470 ENSHGLG00000019778 ENSHGLG00000001633 ENSHGLG00000042291 ENSHGLG00000033611 ENSHGLG00000038189 ENSHGLG00000020015 ENSHGLG00000008784 ENSHGLG00000046583 ENSHGLG00000034122 ENSHGLG00000044823 ENSHGLG00000000860 ENSHGLG00000002433 ENSHGLG00000032788 ENSHGLG00000002294 ENSHGLG00000002255 #22 ATP7A (ENSHGLG00000001804) ENSHGLG00000033714 ENSHGLG00000002230 ENSHGLG00000039396 PGK1 (ENSHGLG00000033746) ENSHGLG00000037603 ENSHGLG00000005962 ENSHGLG00000045054 CYSLTR1 (ENSHGLG00000036741) ENSHGLG00000018958 ENSHGLG00000009342 ENSHGLG00000045192 HDAC8 (ENSHGLG00000015554) CITED1 (ENSHGLG00000013001) ENSHGLG00000009172 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000160311.g.b ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 120 GZMA (ENSOGAG00000007119) CDC20B (ENSOGAG00000007120) GPX8 (ENSOGAG00000007129) MCIDAS (ENSOGAG00000034851) CCNO (ENSOGAG00000007131) DHX29 (ENSOGAG00000002880) MTREX (ENSOGAG00000002886) PLPP1 (ENSOGAG00000002887) ENSOGAG00000030919 SLC38A9 (ENSOGAG00000007583) DDX4 (ENSOGAG00000007588) IL31RA (ENSOGAG00000007597) IL6ST (ENSOGAG00000007603) ANKRD55 (ENSOGAG00000007609) ENSOGAG00000034660 ENSOGAG00000031677 ##22 MAP3K1 (ENSOGAG00000002694) SETD9 (ENSOGAG00000002699) MIER3 (ENSOGAG00000002702) GPBP1 (ENSOGAG00000013991) ACTBL2 (ENSOGAG00000004810) PLK2 (ENSOGAG00000003248) GAPT (ENSOGAG00000014464) RAB3C (ENSOGAG00000014467) PDE4D (ENSOGAG00000011831) ENSOGAG00000029733 DEPDC1B (ENSOGAG00000013881) ELOVL7 (ENSOGAG00000013885) ENSOGAG00000027326 ERCC8 (ENSOGAG00000013889) NDUFAF2 (ENSOGAG00000010937) Bushbaby MODERN SPECIES 127 RBBP8 (ENSOGAG00000007908) CABLES1 (ENSOGAG00000007911) TMEM241 (ENSOGAG00000014500) RIOK3 (ENSOGAG00000014502) RMC1 (ENSOGAG00000014511) NPC1 (ENSOGAG00000014516) ANKRD29 (ENSOGAG00000014521) LAMA3 (ENSOGAG00000014522) TTC39C (ENSOGAG00000015961) ENSOGAG00000015965 OSBPL1A (ENSOGAG00000015970) IMPACT (ENSOGAG00000009485) HRH4 (ENSOGAG00000008382) ZNF521 (ENSOGAG00000007195) ENSOGAG00000024844 ENSOGAG00000028907 ##22 SS18 (ENSOGAG00000003180) PSMA8 (ENSOGAG00000011233) TAF4B (ENSOGAG00000014592) ENSOGAG00000014600 AQP4 (ENSOGAG00000003911) CHST9 (ENSOGAG00000003913) ENSOGAG00000033936 CDH2 (ENSOGAG00000002381) DSC3 (ENSOGAG00000012204) DSC2 (ENSOGAG00000010189) DSC1 (ENSOGAG00000010195) DSG1 (ENSOGAG00000028967) DSG4 (ENSOGAG00000009937) DSG3 (ENSOGAG00000008454) DSG2 (ENSOGAG00000016775) Bushbaby MODERN SPECIES 290 MAGEE1 (ENSOGAG00000027776) ENSOGAG00000017179 FGF16 (ENSOGAG00000009694) ATRX (ENSOGAG00000029849) MAGT1 (ENSOGAG00000011100) ENSOGAG00000011105 ##22 ENSOGAG00000025503 PGK1 (ENSOGAG00000011104) TAF9B (ENSOGAG00000011107) ENSOGAG00000029217 CYSLTR1 (ENSOGAG00000012586) P2RY10 (ENSOGAG00000032331) GPR174 (ENSOGAG00000009013) ENSOGAG00000033994 TBX22 (ENSOGAG00000002759) ENSOGAG00000025542 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Tarsier MODERN SPECIES 6877 ENSTSYG00000025844 ATRX (ENSTSYG00000004744) MAGT1 (ENSTSYG00000029346) ENSTSYG00000026035 ##22 ATP7A (ENSTSYG00000002025) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 101 CYP20A1 (ENSCCAG00000036341) ENSCCAG00000031449 NBEAL1 (ENSCCAG00000021158) CARF (ENSCCAG00000019881) WDR12 (ENSCCAG00000005461) ICA1L (ENSCCAG00000027883) FAM117B (ENSCCAG00000031732) ENSCCAG00000026090 BMPR2 (ENSCCAG00000025039) ENSCCAG00000029316 NOP58 (ENSCCAG00000021573) ENSCCAG00000036402 HARS1 (ENSCCAG00000024213) DND1 (ENSCCAG00000020065) WDR55 (ENSCCAG00000032739) ENSCCAG00000027098 ##22 IK (ENSCCAG00000022729) ENSCCAG00000036213 TMCO6 (ENSCCAG00000019619) CD14 (ENSCCAG00000022555) ENSCCAG00000020715 ENSCCAG00000030910 APBB3 (ENSCCAG00000038002) SRA1 (ENSCCAG00000029225) ANKHD1 (ENSCCAG00000036565) SLC4A9 (ENSCCAG00000030814) HBEGF (ENSCCAG00000033786) ENSCCAG00000033578 CYSTM1 (ENSCCAG00000026489) IGIP (ENSCCAG00000019928) NRG2 (ENSCCAG00000022353) Marmoset MODERN SPECIES 11 ENSCJAG00000080951 PCDHB6 (ENSCJAG00000039993) PCDHB5 (ENSCJAG00000046665) PCDHB4 (ENSCJAG00000082856) PCDHB3 (ENSCJAG00000084247) ENSCJAG00000043731 ENSCJAG00000077557 ENSCJAG00000072316 PCDHA9 (ENSCJAG00000016159) ENSCJAG00000075741 ENSCJAG00000016231 HARS2 (ENSCJAG00000016237) HARS1 (ENSCJAG00000016282) DND1 (ENSCJAG00000016345) WDR55 (ENSCJAG00000016359) ENSCJAG00000087247 ##22 IK (ENSCJAG00000016366) TMCO6 (ENSCJAG00000016529) CD14 (ENSCJAG00000052964) ENSCJAG00000076026 SLC35A4 (ENSCJAG00000038978) ENSCJAG00000074508 APBB3 (ENSCJAG00000016553) ENSCJAG00000016613 EIF4EBP3 (ENSCJAG00000041408) ANKHD1 (ENSCJAG00000016624) SLC4A9 (ENSCJAG00000016762) HBEGF (ENSCJAG00000016803) PFDN1 (ENSCJAG00000043672) CYSTM1 (ENSCJAG00000047318) IGIP (ENSCJAG00000043302) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 13 EIF3D (ENSPPYG00000011774) FOXRED2 (ENSPPYG00000011773) TXN2 (ENSPPYG00000011772) MYH9 (ENSPPYG00000011770) APOL4 (ENSPPYG00000011768) APOL3 (ENSPPYG00000011767) ENSPPYG00000011766 ENSPPYG00000030122 APOL6 (ENSPPYG00000036229) MB (ENSPPYG00000040455) RASD2 (ENSPPYG00000041733) MCM5 (ENSPPYG00000011763) HMOX1 (ENSPPYG00000011762) TOM1 (ENSPPYG00000011761) HMGXB4 (ENSPPYG00000011760) ENSPPYG00000036048 ##22 ISX (ENSPPYG00000011759) LARGE1 (ENSPPYG00000011758) ENSPPYG00000031824 TIMP3 (ENSPPYG00000031652) SYN3 (ENSPPYG00000011756) FBXO7 (ENSPPYG00000011755) BPIFC (ENSPPYG00000011753) RTCB (ENSPPYG00000011752) ENSPPYG00000036647 ENSPPYG00000011749 ENSPPYG00000012003 SLC5A4 (ENSPPYG00000011746) ENSPPYG00000039152 RFPL2 (ENSPPYG00000038393) ENSPPYG00000041426 Orangutan MODERN SPECIES ENSPPYG00000035321 ZSWIM5 (ENSPPYG00000001418) HPDL (ENSPPYG00000001416) MUTYH (ENSPPYG00000001415) TOE1 (ENSPPYG00000001414) TESK2 (ENSPPYG00000001413) MMACHC (ENSPPYG00000001412) ENSPPYG00000001411 AKR1A1 (ENSPPYG00000001410) NASP (ENSPPYG00000001409) CCDC17 (ENSPPYG00000001408) GPBP1L1 (ENSPPYG00000001407) ENSPPYG00000034708 IPP (ENSPPYG00000001404) MAST2 (ENSPPYG00000001403) ENSPPYG00000040360 ##22 PIK3R3 (ENSPPYG00000001402) P3R3URF (ENSPPYG00000032806) TSPAN1 (ENSPPYG00000001401) POMGNT1 (ENSPPYG00000001400) LURAP1 (ENSPPYG00000039509) RAD54L (ENSPPYG00000001398) LRRC41 (ENSPPYG00000001397) ENSPPYG00000025831 NSUN4 (ENSPPYG00000001396) FAAH (ENSPPYG00000001395) DMBX1 (ENSPPYG00000001394) TMEM275 (ENSPPYG00000032094) ENSPPYG00000001393 MKNK1 (ENSPPYG00000001392) MOB3C (ENSPPYG00000029604) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 522 ENSPTRG00000046207 ##22 Gorilla MODERN SPECIES 14 ENSGGOG00000039755 ENSGGOG00000038744 NPHP1 (ENSGGOG00000002880) MALL (ENSGGOG00000043991) ENSGGOG00000043496 ENSGGOG00000041106 ENSGGOG00000037791 ENSGGOG00000037616 SOWAHC (ENSGGOG00000042109) SEPTIN10 (ENSGGOG00000013659) SH3RF3 (ENSGGOG00000034870) EDAR (ENSGGOG00000010851) CCDC138 (ENSGGOG00000034976) ENSGGOG00000011125 ENSGGOG00000022756 ENSGGOG00000039420 ##22 ENSGGOG00000012512 ENSGGOG00000040710 GCC2 (ENSGGOG00000022411) SULT1C4 (ENSGGOG00000007837) SULT1C2 (ENSGGOG00000006731) SULT1C3 (ENSGGOG00000008271) SLC5A7 (ENSGGOG00000007818) ENSGGOG00000039918 ST6GAL2 (ENSGGOG00000039277) ENSGGOG00000039828 ENSGGOG00000023429 UXS1 (ENSGGOG00000034951) ECRG4 (ENSGGOG00000011015) NCK2 (ENSGGOG00000014764) ENSGGOG00000012919 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000153167.B ENSGT00940000158765 ENSGT00940000165040 ENSGT00390000003464 ENSGT00940000154277.a.b.b ENSGT00940000156539 ENSGT00390000016650 ENSGT00900000143563 ENSGT00390000006459 ENSGT00420000029753.b ENSGT00390000015318 ENSGT00940000158629 ENSGT01050000245298 ENSGT00940000155705.b ENSGT00910000147102 ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 ENSGT00940000156259.b ENSGT00700000106049 ENSGT00940000158851 ENSGT00530000063632.A ENSGT00530000063790.a ENSGT00940000156897 ENSGT00390000015908 ENSGT00390000003860.h.a.a ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00940000161237 ENSGT00940000163316 ENSGT00940000155505.a ENSGT00390000008086 ENSGT00400000024146 ENSGT00940000162886 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 329 ENSGT00530000063474.A ENSGT00510000047220 ENSGT00940000153167.B ENSGT00940000158765 ENSGT00390000003464 ENSGT00940000154277.a.b.a.a ENSGT00940000156539.g ENSGT00390000016650 ENSGT00900000143563 ENSGT00390000006459 ENSGT00420000029753.b ENSGT00390000015318 ENSGT00940000158629 ENSGT00940000155705.b ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 ENSGT00940000156259.b Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 693 ZSWIM5 (ENSRBIG00000032015) ENSRBIG00000043783 HPDL (ENSRBIG00000023806) MUTYH (ENSRBIG00000027534) TOE1 (ENSRBIG00000031463) TESK2 (ENSRBIG00000038409) MMACHC (ENSRBIG00000010274) ENSRBIG00000028267 ENSRBIG00000044745 NASP (ENSRBIG00000038388) CCDC17 (ENSRBIG00000044458) GPBP1L1 (ENSRBIG00000040924) TMEM69 (ENSRBIG00000029272) IPP (ENSRBIG00000031821) MAST2 (ENSRBIG00000039234) ENSRBIG00000014916 ##22 PIK3R3 (ENSRBIG00000010667) ENSRBIG00000007567 P3R3URF (ENSRBIG00000029879) TSPAN1 (ENSRBIG00000028021) POMGNT1 (ENSRBIG00000025961) LURAP1 (ENSRBIG00000044781) RAD54L (ENSRBIG00000043495) LRRC41 (ENSRBIG00000032151) ENSRBIG00000026841 NSUN4 (ENSRBIG00000033827) FAAH (ENSRBIG00000033681) DMBX1 (ENSRBIG00000044024) KNCN (ENSRBIG00000026528) MKNK1 (ENSRBIG00000033459) MOB3C (ENSRBIG00000027087) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1055 HPDL (ENSRROG00000009648) MUTYH (ENSRROG00000028711) TOE1 (ENSRROG00000026371) TESK2 (ENSRROG00000030783) MMACHC (ENSRROG00000043790) ENSRROG00000042920 ENSRROG00000044891 ENSRROG00000043765 NASP (ENSRROG00000026624) CCDC17 (ENSRROG00000041688) GPBP1L1 (ENSRROG00000008564) TMEM69 (ENSRROG00000037598) IPP (ENSRROG00000031961) MAST2 (ENSRROG00000040137) ENSRROG00000012128 ##22 PIK3R3 (ENSRROG00000039135) ENSRROG00000015879 P3R3URF (ENSRROG00000038849) TSPAN1 (ENSRROG00000037921) POMGNT1 (ENSRROG00000045345) LURAP1 (ENSRROG00000045648) RAD54L (ENSRROG00000020844) LRRC41 (ENSRROG00000040000) ENSRROG00000041043 NSUN4 (ENSRROG00000000359) FAAH (ENSRROG00000042930) DMBX1 (ENSRROG00000013894) KNCN (ENSRROG00000036847) MKNK1 (ENSRROG00000039899) MOB3C (ENSRROG00000038186) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Cercopithecinae_b DUPLICATION Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a.e ##22 Olive baboon MODERN SPECIES TADA1 (ENSPANG00000010530) POGK (ENSPANG00000013790) FAM78B (ENSPANG00000012825) UCK2 (ENSPANG00000016507) TMCO1 (ENSPANG00000032900) ENSPANG00000047258 ENSPANG00000021905 LRRC52 (ENSPANG00000009794) RXRG (ENSPANG00000008314) LMX1A (ENSPANG00000008915) PBX1 (ENSPANG00000012912) ENSPANG00000042217 NUF2 (ENSPANG00000015339) RGS5 (ENSPANG00000006547) RGS4 (ENSPANG00000015543) ENSPANG00000033732 ##22 CCDC190 (ENSPANG00000005960) RHOU (ENSPANG00000042094) ENSPANG00000035259 RAB4A (ENSPANG00000021029) CCSAP (ENSPANG00000010018) ENSPANG00000046770 ACTA1 (ENSPANG00000005524) NUP133 (ENSPANG00000019885) ENSPANG00000045446 ABCB10 (ENSPANG00000018733) TAF5L (ENSPANG00000006215) URB2 (ENSPANG00000002245) ENSPANG00000037909 GALNT2 (ENSPANG00000014846) PGBD5 (ENSPANG00000036150) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000153167.B ENSGT00940000158765 ENSGT00940000165040 ENSGT00390000003464 ENSGT00940000154277.a.b.b ENSGT00940000156539 ENSGT00390000016650 ENSGT00900000143563 ENSGT00390000006459 ENSGT00420000029753.b ENSGT00390000015318 ENSGT00940000158629 ENSGT01050000245298 ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000156259.b ENSGT00390000012178.g.a.a.f ##22 ENSGT00700000106049 ENSGT00940000158851 ENSGT00530000063632.A ENSGT00530000063790.a ENSGT00940000156897 ENSGT00390000015908 ENSGT00390000003860.h.a.b ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00940000161237 ENSGT00940000155505.a ENSGT00390000008086 ENSGT00400000024146 ENSGT00940000162886 ENSGT01050000244898.a.a.b ENSGT00620000089223 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000165040 ENSGT00390000003464 ENSGT00940000154277.a.b.b ENSGT00940000156539 ENSGT00390000016650 ENSGT00900000143563 ENSGT00390000006459 ENSGT00420000029753.b ENSGT00390000015318 ENSGT00940000158629 ENSGT01050000245298 ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000156259.b ENSGT00910000147102 ENSGT00390000012178.g.a.a.f ##22 ENSGT00700000106049 ENSGT00940000158851 ENSGT00530000063632.A ENSGT00530000063790.a ENSGT00940000156897 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Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 98 ENSODEG00000004158 ENSODEG00000004370 NFIA (ENSODEG00000005024) TM2D1 (ENSODEG00000004635) PATJ (ENSODEG00000004922) ENSODEG00000006862 ENSODEG00000007065 DOCK7 (ENSODEG00000004836) ENSODEG00000005344 ANGPTL3 (ENSODEG00000005471) ENSODEG00000019085 ATG4C (ENSODEG00000005462) ENSODEG00000005048 ITGB3BP (ENSODEG00000005479) ENSODEG00000019103 ##22 ENSODEG00000005465 PGM1 (ENSODEG00000005752) ENSODEG00000005033 ROR1 (ENSODEG00000004832) ENSODEG00000004610 CACHD1 (ENSODEG00000004991) RAVER2 (ENSODEG00000005253) JAK1 (ENSODEG00000004472) ENSODEG00000006541 ENSODEG00000006986 ENSODEG00000006173 LEPROT (ENSODEG00000006321) ENSODEG00000019195 LEPR (ENSODEG00000005568) PDE4B (ENSODEG00000004887) Degu MODERN SPECIES 262 KLHL9 (ENSODEG00000002552) ENSODEG00000002561 ENSODEG00000002716 TDRD7 (ENSODEG00000002889) TMOD1 (ENSODEG00000003115) TSTD2 (ENSODEG00000003152) NCBP1 (ENSODEG00000003232) XPA (ENSODEG00000001712) ENSODEG00000018738 ##22 TRMO 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Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 49 ENSODEG00000018180 IP6K2 (ENSODEG00000018212) NCKIPSD (ENSODEG00000018165) CELSR3 (ENSODEG00000018319) SLC26A6 (ENSODEG00000018141) UQCRC1 (ENSODEG00000018299) ENSODEG00000018336 PFKFB4 (ENSODEG00000018219) CAV3 (ENSODEG00000018263) OXTR (ENSODEG00000018131) ENSODEG00000018124 RAD18 (ENSODEG00000018158) SRGAP3 (ENSODEG00000018235) THUMPD3 (ENSODEG00000018242) SETD5 (ENSODEG00000018265) ENSODEG00000020522 ##22 LHFPL4 (ENSODEG00000018130) ENSODEG00000018249 MTMR14 (ENSODEG00000018300) CPNE9 (ENSODEG00000018383) BRPF1 (ENSODEG00000018200) OGG1 (ENSODEG00000018217) CAMK1 (ENSODEG00000018146) TADA3 (ENSODEG00000018173) ARPC4 (ENSODEG00000018185) ENSODEG00000018188 RPUSD3 (ENSODEG00000018137) CIDEC (ENSODEG00000018117) ENSODEG00000018255 IL17RE (ENSODEG00000018313) IL17RC (ENSODEG00000018144) Degu MODERN SPECIES 42 MAP3K1 (ENSODEG00000017328) SETD9 (ENSODEG00000016730) MIER3 (ENSODEG00000017718) GPBP1 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(ENSODEG00000000540) ENSODEG00000002202 Degu MODERN SPECIES 71 ENSODEG00000008843 ITPR1 (ENSODEG00000007250) SUMF1 (ENSODEG00000007677) ENSODEG00000006593 ENSODEG00000007585 LRRN1 (ENSODEG00000007430) ENSODEG00000006737 ENSODEG00000008720 TRNT1 (ENSODEG00000007597) IL5RA (ENSODEG00000006715) CNTN4 (ENSODEG00000007155) CNTN6 (ENSODEG00000006499) ENSODEG00000007284 ENSODEG00000019383 CHL1 (ENSODEG00000010169) ENSODEG00000019392 ##22 CNTN3 (ENSODEG00000006512) PDZRN3 (ENSODEG00000008618) ENSODEG00000006984 ENSODEG00000006618 ENSODEG00000007939 ENSODEG00000007497 ENSODEG00000019359 GXYLT2 (ENSODEG00000008178) SHQ1 (ENSODEG00000009192) RYBP (ENSODEG00000008699) PROK2 (ENSODEG00000007144) GPR27 (ENSODEG00000006497) EIF4E3 (ENSODEG00000006191) FOXP1 (ENSODEG00000007047) MDFIC2 (ENSODEG00000006638) Degu MODERN SPECIES 106 HOXD10 (ENSODEG00000010382) HOXD9 (ENSODEG00000008626) ENSODEG00000010496 HOXD4 (ENSODEG00000010297) HOXD3 (ENSODEG00000009722) HOXD1 (ENSODEG00000008961) ENSODEG00000008879 MTX2 (ENSODEG00000008062) ENSODEG00000009697 ENSODEG00000009265 NFE2L2 (ENSODEG00000010043) AGPS (ENSODEG00000008272) ENSODEG00000020058 ENSODEG00000019592 PDE11A (ENSODEG00000010682) ENSODEG00000019574 ##22 RBM45 (ENSODEG00000007959) ENSODEG00000019659 OSBPL6 (ENSODEG00000009667) ENSODEG00000008743 PJVK (ENSODEG00000008177) ENSODEG00000008149 PLEKHA3 (ENSODEG00000007880) ENSODEG00000008948 ENSODEG00000008370 ENSODEG00000007812 ENSODEG00000009000 ENSODEG00000007954 ENSODEG00000008314 CCDC141 (ENSODEG00000007955) SESTD1 (ENSODEG00000009240) Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 66 CLK1 (ENSODEG00000009021) PPIL3 (ENSODEG00000007592) NIF3L1 (ENSODEG00000008894) ORC2 (ENSODEG00000008853) ENSODEG00000007860 HYCC2 (ENSODEG00000008316) NDUFB3 (ENSODEG00000010233) CFLAR (ENSODEG00000009559) CASP8 (ENSODEG00000009065) TRAK2 (ENSODEG00000007402) STRADB (ENSODEG00000010540) TMEM237 (ENSODEG00000009685) MPP4 (ENSODEG00000009252) ALS2 (ENSODEG00000007275) ENSODEG00000008122 ENSODEG00000019906 ##22 ENSODEG00000010587 Degu MODERN SPECIES 75 ENSODEG00000006416 ENSODEG00000019248 ENSODEG00000004519 ENSODEG00000004379 TBC1D32 (ENSODEG00000004851) MAN1A1 (ENSODEG00000004631) FAM184A (ENSODEG00000004943) ENSODEG00000005478 MCM9 (ENSODEG00000005446) PLN (ENSODEG00000019260) CEP85L (ENSODEG00000005733) SLC35F1 (ENSODEG00000005040) ENSODEG00000019196 NUS1 (ENSODEG00000005194) GOPC (ENSODEG00000005332) ENSODEG00000004793 ##22 ROS1 (ENSODEG00000006047) VGLL2 (ENSODEG00000005506) RFX6 (ENSODEG00000006706) ENSODEG00000019159 RSPH4A (ENSODEG00000005270) ZUP1 (ENSODEG00000004926) Degu MODERN SPECIES 52 ENSODEG00000020547 TMEM170A (ENSODEG00000015044) ENSODEG00000013385 BCAR1 (ENSODEG00000014208) ENSODEG00000013237 ENSODEG00000014533 ZFP1 (ENSODEG00000014404) LDHD (ENSODEG00000013403) ENSODEG00000013782 WDR59 (ENSODEG00000014115) FA2H (ENSODEG00000015464) ENSODEG00000013539 RFWD3 (ENSODEG00000013462) GLG1 (ENSODEG00000014011) PDPR (ENSODEG00000014206) ENSODEG00000020359 ##22 ENSODEG00000014787 EXOSC6 (ENSODEG00000020448) ENSODEG00000014435 DDX19B (ENSODEG00000014050) DDX19A (ENSODEG00000014238) ST3GAL2 (ENSODEG00000013892) ENSODEG00000020190 FCSK (ENSODEG00000014046) ENSODEG00000014686 SF3B3 (ENSODEG00000014154) IL34 (ENSODEG00000014364) MTSS2 (ENSODEG00000013647) VAC14 (ENSODEG00000014293) ENSODEG00000014323 ENSODEG00000014592 Degu MODERN SPECIES 271 ENSODEG00000004008 SLC5A4 (ENSODEG00000004033) SLC5A1 (ENSODEG00000004082) ENSODEG00000004097 DEPDC5 (ENSODEG00000002525) PISD (ENSODEG00000002874) SFI1 (ENSODEG00000003157) ENSODEG00000003485 ENSODEG00000003511 ENSODEG00000003534 ENSODEG00000003560 PATZ1 (ENSODEG00000003589) PIK3IP1 (ENSODEG00000003614) LIMK2 (ENSODEG00000003660) RNF185 (ENSODEG00000003704) ENSODEG00000018944 ##22 PLA2G3 (ENSODEG00000003732) INPP5J (ENSODEG00000003778) SELENOM (ENSODEG00000003856) ENSODEG00000003954 MORC2 (ENSODEG00000002290) OSBP2 (ENSODEG00000002568) ENSODEG00000002826 ENSODEG00000002838 SLC35E4 (ENSODEG00000002849) TCN2 (ENSODEG00000002875) PES1 (ENSODEG00000003187) GAL3ST1 (ENSODEG00000003253) SEC14L4 (ENSODEG00000002018) SEC14L3 (ENSODEG00000002302) MTFP1 (ENSODEG00000002338) Degu MODERN SPECIES 134 ENSODEG00000010130 ENSODEG00000010432 ENSODEG00000009993 MYLK3 (ENSODEG00000010367) ENSODEG00000010804 ENSODEG00000010211 ENSODEG00000012398 ENSODEG00000011171 KCNH3 (ENSODEG00000010379) MCRS1 (ENSODEG00000010219) ENSODEG00000010921 ENSODEG00000010201 FMNL3 (ENSODEG00000011056) ENSODEG00000010356 TMBIM6 (ENSODEG00000009820) ENSODEG00000019759 ##22 NCKAP5L (ENSODEG00000009975) BCDIN3D (ENSODEG00000009705) ENSODEG00000019768 ENSODEG00000010974 ENSODEG00000011097 FAIM2 (ENSODEG00000009571) ENSODEG00000012970 AQP2 (ENSODEG00000010450) AQP5 (ENSODEG00000011095) AQP6 (ENSODEG00000009870) RACGAP1 (ENSODEG00000010159) ASIC1 (ENSODEG00000009913) SMARCD1 (ENSODEG00000010234) ENSODEG00000010634 GPD1 (ENSODEG00000011334) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 264 MAGEE1 (ENSCLAG00000017388) FGF16 (ENSCLAG00000000096) ATRX (ENSCLAG00000000229) MAGT1 (ENSCLAG00000000546) ENSCLAG00000000296 ##22 ATP7A (ENSCLAG00000000444) ENSCLAG00000000146 TAF9B (ENSCLAG00000000199) P2RY10 (ENSCLAG00000000218) ENSCLAG00000000222 GPR174 (ENSCLAG00000000259) ITM2A (ENSCLAG00000000574) Guinea pig MODERN SPECIES 26 HDAC8 (ENSCPOG00000005671) PHKA1 (ENSCPOG00000005675) ENSCPOG00000009525 CHIC1 (ENSCPOG00000035632) SLC16A2 (ENSCPOG00000000465) RLIM (ENSCPOG00000031438) NEXMIF (ENSCPOG00000014831) ABCB7 (ENSCPOG00000010708) UPRT (ENSCPOG00000035232) ZDHHC15 (ENSCPOG00000006742) PBDC1 (ENSCPOG00000006794) MAGEE1 (ENSCPOG00000039465) FGF16 (ENSCPOG00000007870) ATRX (ENSCPOG00000007873) MAGT1 (ENSCPOG00000027554) ENSCPOG00000036844 ##22 ATP7A (ENSCPOG00000020377) PGK1 (ENSCPOG00000038840) TAF9B (ENSCPOG00000002098) CYSLTR1 (ENSCPOG00000002100) P2RY10 (ENSCPOG00000010882) GPR174 (ENSCPOG00000013180) ENSCPOG00000026660 BRWD3 (ENSCPOG00000009894) SH3BGRL (ENSCPOG00000012267) POU3F4 (ENSCPOG00000003372) HDX (ENSCPOG00000014501) APOOL (ENSCPOG00000036938) ZNF711 (ENSCPOG00000009467) POF1B (ENSCPOG00000009472) CHM (ENSCPOG00000039732) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000015228 ENSGT00390000003590 ENSGT00940000153189.B ENSGT00940000159722 ENSGT00390000012561.b.v ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.b ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a.v ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 Alpin marmot MODERN SPECIES 8 NIF3L1 (ENSMMMG00000012077) PPIL3 (ENSMMMG00000012069) CLK1 (ENSMMMG00000012051) ENSMMMG00000012026 ENSMMMG00000011976 ENSMMMG00000011959 ENSMMMG00000011912 AOX1 (ENSMMMG00000011886) ENSMMMG00000011877 KCTD18 (ENSMMMG00000011839) SPATS2L (ENSMMMG00000011689) MAIP1 (ENSMMMG00000011679) TYW5 (ENSMMMG00000011668) C2orf69 (ENSMMMG00000011660) FTCDNL1 (ENSMMMG00000011655) ENSMMMG00000011650 ##22 SATB2 (ENSMMMG00000011551) ENSMMMG00000011481 PLCL1 (ENSMMMG00000011429) BOLL (ENSMMMG00000011354) MARS2 (ENSMMMG00000011347) RFTN2 (ENSMMMG00000011220) ENSMMMG00000011174 ENSMMMG00000011161 ENSMMMG00000011138 ENSMMMG00000011101 SF3B1 (ENSMMMG00000011081) ANKRD44 (ENSMMMG00000010980) PGAP1 (ENSMMMG00000010912) GTF3C3 (ENSMMMG00000010874) ENSMMMG00000010858 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00950000183114.a.b.b.f.a.a ENSGT00950000183114.a.b.b.f.b ENSGT00940000154107.b ENSGT00530000064234 ENSGT00390000001138.b ENSGT00390000004145 ENSGT00940000158493 ENSGT00390000005550 ENSGT00390000005581.b ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 ENSGT00390000008096.B ENSGT00940000158407 ENSGT00530000063480.a ENSGT00550000075136 ENSGT00530000063609.a ENSGT01050000244956.b.d ENSGT00390000006350.m.a.c.a.v ENSGT00390000005727.a.b.b ENSGT00940000155367 ENSGT00390000018393 ENSGT00950000182908.D ENSGT00390000016484 ENSGT00390000016929 ENSGT00390000005285 ENSGT00940000167666 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 210 ENSUPAG00010015923 AOX1 (ENSUPAG00010015861) SGO2 (ENSUPAG00010015843) KCTD18 (ENSUPAG00010015819) SPATS2L (ENSUPAG00010015777) MAIP1 (ENSUPAG00010015760) TYW5 (ENSUPAG00010015739) C2orf69 (ENSUPAG00010015730) FTCDNL1 (ENSUPAG00010015721) ENSUPAG00010015718 ##22 SATB2 (ENSUPAG00010015643) PLCL1 (ENSUPAG00010015612) BOLL (ENSUPAG00010015589) MARS2 (ENSUPAG00010015585) RFTN2 (ENSUPAG00010015580) ENSUPAG00010015569 ENSUPAG00010015563 COQ10B (ENSUPAG00010015540) SF3B1 (ENSUPAG00010015518) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT00390000015252.z Horse MODERN SPECIES 480 CHIC1 (ENSECAG00000016317) SLC16A2 (ENSECAG00000019968) RLIM (ENSECAG00000020600) NEXMIF (ENSECAG00000023442) ABCB7 (ENSECAG00000000643) UPRT 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ENSEASG00005038290 MAGT1 (ENSEASG00005007135) ENSEASG00005026470 ##22 ATP7A (ENSEASG00005005867) PGK1 (ENSEASG00005006468) TAF9B (ENSEASG00005006471) ENSEASG00005033851 CYSLTR1 (ENSEASG00005033616) RTL3 (ENSEASG00005024251) LPAR4 (ENSEASG00005032556) P2RY10 (ENSEASG00005024071) ENSEASG00005025689 GPR174 (ENSEASG00005033902) ITM2A (ENSEASG00005021993) TBX22 (ENSEASG00005034364) ENSEASG00005035394 TENT5D (ENSEASG00005036140) ENSEASG00005007773 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT01000000221721 ENSGT00530000063695.b ENSGT00950000183168.B.b ENSGT00390000000663 ENSGT00940000159826 ENSGT00390000013227.a.a ENSGT00940000153609.b.`b.a ENSGT00940000156693 ENSGT00390000012341 ENSGT00390000001965 ENSGT01000000221220 ENSGT00940000157463.y.b ENSGT00940000157463.z ENSGT00950000186137 ENSGT00940000154164.c ENSGT00390000012178.g.a.a ##22 ENSGT00940000153498.B.b ENSGT00390000010827 ENSGT00390000009366.l.a ENSGT00390000018829.g.a ENSGT00550000074866 ENSGT00880000138028.b.b ENSGT00900000143654 ENSGT00940000155695 ENSGT00390000004856.w.b ENSGT00390000004766 ENSGT00940000154798.a.d.a ENSGT00940000158987.d ENSGT00530000063426.b.b ENSGT00390000002563.b.a.a ENSGT00390000002563.a Beluga whale MODERN SPECIES 80 CEP57L1 (ENSDLEG00000018058) SESN1 (ENSDLEG00000017985) ARMC2 (ENSDLEG00000017871) FOXO3 (ENSDLEG00000017844) AFG1L (ENSDLEG00000017823) SNX3 (ENSDLEG00000017815) NR2E1 (ENSDLEG00000017794) ENSDLEG00000017771 ENSDLEG00000017753 SEC63 (ENSDLEG00000017708) ENSDLEG00000017689 ENSDLEG00000017674 SCML4 (ENSDLEG00000017668) ENSDLEG00000017650 SOBP (ENSDLEG00000017615) ENSDLEG00000017596 ##22 PDSS2 (ENSDLEG00000017583) BEND3 (ENSDLEG00000017572) CUNH6orf203 (ENSDLEG00000017561) ENSDLEG00000017555 QRSL1 (ENSDLEG00000017520) RTN4IP1 (ENSDLEG00000017504) ENSDLEG00000017491 ENSDLEG00000017458 CRYBG1 (ENSDLEG00000017426) ENSDLEG00000017411 ATG5 (ENSDLEG00000017390) PRDM1 (ENSDLEG00000017371) ENSDLEG00000017350 PREP (ENSDLEG00000017313) POPDC3 (ENSDLEG00000017299) Narwhal MODERN SPECIES 301 ENSMMNG00015011053 CEP57L1 (ENSMMNG00015011010) SESN1 (ENSMMNG00015010978) ARMC2 (ENSMMNG00015010951) ENSMMNG00015010936 ENSMMNG00015010931 AFG1L (ENSMMNG00015010921) SNX3 (ENSMMNG00015010894) NR2E1 (ENSMMNG00015010867) ENSMMNG00015010843 OSTM1 (ENSMMNG00015010828) SEC63 (ENSMMNG00015010793) ENSMMNG00015010768 SCML4 (ENSMMNG00015010744) SOBP (ENSMMNG00015010729) ENSMMNG00015010718 ##22 PDSS2 (ENSMMNG00015010632) BEND3 (ENSMMNG00015010606) ENSMMNG00015010593 ENSMMNG00015010579 QRSL1 (ENSMMNG00015010552) RTN4IP1 (ENSMMNG00015010517) ENSMMNG00015010497 CRYBG1 (ENSMMNG00015010430) ENSMMNG00015010395 ENSMMNG00015010386 PRDM1 (ENSMMNG00015010356) ATG5 (ENSMMNG00015010296) ENSMMNG00015010265 PREP (ENSMMNG00015010230) POPDC3 (ENSMMNG00015010209) Vaquita MODERN SPECIES 3 CEP57L1 (ENSPSNG00000012071) SESN1 (ENSPSNG00000012128) ARMC2 (ENSPSNG00000012236) ENSPSNG00000012269 ENSPSNG00000012289 AFG1L (ENSPSNG00000012339) SNX3 (ENSPSNG00000012388) NR2E1 (ENSPSNG00000012471) OSTM1 (ENSPSNG00000012562) ENSPSNG00000012614 SEC63 (ENSPSNG00000012696) ENSPSNG00000012847 SCML4 (ENSPSNG00000012885) SOBP (ENSPSNG00000013126) PDSS2 (ENSPSNG00000013250) ENSPSNG00000013296 ##22 BEND3 (ENSPSNG00000013346) MTRES1 (ENSPSNG00000013378) ENSPSNG00000013443 QRSL1 (ENSPSNG00000013527) RTN4IP1 (ENSPSNG00000013614) CRYBG1 (ENSPSNG00000013720) ENSPSNG00000013855 ENSPSNG00000013913 ATG5 (ENSPSNG00000014006) ENSPSNG00000014192 PRDM1 (ENSPSNG00000014233) PREP (ENSPSNG00000014450) POPDC3 (ENSPSNG00000014548) BVES (ENSPSNG00000014643) LIN28B (ENSPSNG00000014731) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b ##22 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00910000146948 ENSGT00390000001523 ENSGT00390000003156.a.a.y.b ENSGT00910000148099 ENSGT00940000154819.a.a ENSGT00940000161912 ENSGT00940000159218.b ENSGT00390000014590 ENSGT00390000010157.a ENSGT00940000154482.b.a ENSGT00390000012620 ENSGT00390000002727 ENSGT00390000008557 ENSGT00390000008279.a ENSGT00390000014384 ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 ENSGT00940000158291 ENSGT00910000147825 ENSGT00920000149170 ENSGT00390000000867 ENSGT00950000183049.B ENSGT00940000156460.C ENSGT00530000063681.b.b ENSGT00940000161775 ENSGT00510000049371.a ENSGT00390000010922 ENSGT00390000007658.h ENSGT00390000015471 ENSGT00390000008338 ENSGT00390000007464 ENSGT00390000008549 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT01060000248556.B.t ENSGT00910000146948 ENSGT00390000001523 ENSGT00390000003156.a.a.y.b ENSGT00940000154819.a.a ENSGT00940000161912 ENSGT00940000159218.b ENSGT00390000014590 ENSGT00390000010157.a ENSGT00940000154482.b.a ENSGT00390000012620 ENSGT00390000002727 ENSGT00390000008557 ENSGT00390000008279.a ENSGT00390000014384 ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 ENSGT00940000158291 ENSGT00920000149170 ENSGT00390000000867 ENSGT00950000183049.B ENSGT00940000156460.C ENSGT00530000063681.b.b ENSGT00940000161593 ENSGT00940000156442 ENSGT00390000018718 ENSGT00940000155941.A ENSGT00940000161771 ENSGT00860000135828 ENSGT00940000159619.a ENSGT00390000004871.b.n ENSGT00550000074851 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 671 CZIB (ENSRROG00000035166) ENSRROG00000031579 MAGOH (ENSRROG00000030236) LRP8 (ENSRROG00000033930) DMRTB1 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BSND (ENSCATG00000044349) PCSK9 (ENSCATG00000039450) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00910000146948 ENSGT00390000001523 ENSGT00390000003156.a.a.y.b ENSGT00940000154819.a.a ENSGT00940000161912 ENSGT00940000159218.b ENSGT00390000014590 ENSGT00390000010157.a ENSGT00940000154482.b.a ENSGT00390000012620 ENSGT00390000002727 ENSGT00940000154808.a.a ENSGT00390000008557 ENSGT00390000008279.a ENSGT00390000014384 ENSGT00390000012178.g.a.b.a ##22 ENSGT00940000158291 ENSGT00920000149170 ENSGT00390000000867 ENSGT00950000183049.B ENSGT00940000156460.C ENSGT00530000063681.b.b ENSGT00940000161775 ENSGT00510000049371.a ENSGT00390000010922 ENSGT00390000007658.h ENSGT00390000015471 ENSGT00390000008338 ENSGT00390000007464 ENSGT00390000008549 ENSGT00490000043472 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 217 CZIB (ENSMNEG00000042957) ENSMNEG00000028178 MAGOH (ENSMNEG00000031942) LRP8 (ENSMNEG00000042542) DMRTB1 (ENSMNEG00000038638) GLIS1 (ENSMNEG00000033380) NDC1 (ENSMNEG00000029764) YIPF1 (ENSMNEG00000045022) DIO1 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ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000183107.a.b.b Lemuriformes DUPLICATION Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00940000160311.g.b ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00940000156017.t.b ENSGT00940000171348 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 1 RFX3 (ENSMICG00000011871) ENSMICG00000041775 ENSMICG00000031277 SLC1A1 (ENSMICG00000005171) SPATA6L (ENSMICG00000017688) CDC37L1 (ENSMICG00000017690) ENSMICG00000013112 RCL1 (ENSMICG00000015562) JAK2 (ENSMICG00000003885) INSL6 (ENSMICG00000044551) ENSMICG00000043730 PLGRKT (ENSMICG00000031798) CD274 (ENSMICG00000035171) PDCD1LG2 (ENSMICG00000004284) RIC1 (ENSMICG00000016293) ENSMICG00000030745 ##22 ERMP1 (ENSMICG00000016329) MLANA (ENSMICG00000048054) KIAA2026 (ENSMICG00000032366) ENSMICG00000026566 IL33 (ENSMICG00000009247) ENSMICG00000035564 ENSMICG00000033153 TPD52L3 (ENSMICG00000000600) UHRF2 (ENSMICG00000036338) GLDC (ENSMICG00000000602) KDM4C (ENSMICG00000010464) DMAC1 (ENSMICG00000035725) ENSMICG00000035188 ENSMICG00000031481 PTPRD (ENSMICG00000006128) Mouse lemur MODERN SPECIES 5 ARHGEF3 (ENSMICG00000011589) IL17RD (ENSMICG00000001723) HESX1 (ENSMICG00000010826) APPL1 (ENSMICG00000005574) ASB14 (ENSMICG00000005591) DNAH12 (ENSMICG00000005596) ENSMICG00000027587 ENSMICG00000043347 PDE12 (ENSMICG00000005723) ENSMICG00000002015 DENND6A (ENSMICG00000002018) ENSMICG00000046167 SLMAP (ENSMICG00000013367) FLNB (ENSMICG00000014477) ENSMICG00000029847 ENSMICG00000037059 ##22 ENSMICG00000032703 DNASE1L3 (ENSMICG00000026978) ABHD6 (ENSMICG00000014529) RPP14 (ENSMICG00000036730) PXK (ENSMICG00000014548) PDHB (ENSMICG00000014571) KCTD6 (ENSMICG00000030849) ACOX2 (ENSMICG00000015557) FAM107A (ENSMICG00000046093) DUSP22 (ENSMICG00000011713) IRF4 (ENSMICG00000037072) EXOC2 (ENSMICG00000007997) ENSMICG00000043294 FOXF2 (ENSMICG00000029665) ENSMICG00000030022 Mouse lemur MODERN SPECIES 7 ENSMICG00000046974 ENSMICG00000010016 CD79B (ENSMICG00000031356) SCN4A (ENSMICG00000010028) PRR29 (ENSMICG00000028288) ICAM2 (ENSMICG00000042703) ERN1 (ENSMICG00000010050) TEX2 (ENSMICG00000005725) ENSMICG00000036867 PECAM1 (ENSMICG00000032975) MILR1 (ENSMICG00000009257) POLG2 (ENSMICG00000046718) DDX5 (ENSMICG00000009267) CEP95 (ENSMICG00000009285) SMURF2 (ENSMICG00000009294) ENSMICG00000014521 ##22 ENSMICG00000011357 ENSMICG00000043805 ENSMICG00000012046 BPTF (ENSMICG00000012004) NOL11 (ENSMICG00000017576) PITPNC1 (ENSMICG00000012923) PSMD12 (ENSMICG00000027720) HELZ (ENSMICG00000013321) CACNG1 (ENSMICG00000042613) CACNG4 (ENSMICG00000034646) CACNG5 (ENSMICG00000013293) PRKCA (ENSMICG00000013271) APOH (ENSMICG00000013257) CEP112 (ENSMICG00000013222) AXIN2 (ENSMICG00000044460) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00940000160311.h ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00940000156017.t.b Coquerels sifaka MODERN SPECIES 971 ENSPCOG00000018492 SLC16A2 (ENSPCOG00000024179) RLIM (ENSPCOG00000022086) NEXMIF (ENSPCOG00000022624) ENSPCOG00000021894 ENSPCOG00000020385 ABCB7 (ENSPCOG00000017530) UPRT (ENSPCOG00000027342) ZDHHC15 (ENSPCOG00000015378) PBDC1 (ENSPCOG00000015464) ENSPCOG00000023864 FGF16 (ENSPCOG00000004992) ATRX (ENSPCOG00000019721) ENSPCOG00000000509 MAGT1 (ENSPCOG00000016418) ENSPCOG00000019240 ##22 ATP7A (ENSPCOG00000023408) ENSPCOG00000018553 PGK1 (ENSPCOG00000027264) TAF9B (ENSPCOG00000008362) RTL3 (ENSPCOG00000016711) LPAR4 (ENSPCOG00000010534) ENSPCOG00000013558 ITM2A (ENSPCOG00000015645) TBX22 (ENSPCOG00000022867) BRWD3 (ENSPCOG00000017411) SH3BGRL (ENSPCOG00000014464) ENSPCOG00000020173 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 119 ENSPSMG00000025324 ENSPSMG00000025326 ENSPSMG00000025330 MAGT1 (ENSPSMG00000025342) ENSPSMG00000025345 ENSPSMG00000025349 ##22 ATP7A (ENSPSMG00000025358) ENSPSMG00000025363 PGK1 (ENSPSMG00000025369) TAF9B (ENSPSMG00000000050) ENSPSMG00000000098 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b.a.b ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b.a.b ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 124 DUS4L (ENSPSMG00000015165) BCAP29 (ENSPSMG00000015150) SLC26A4 (ENSPSMG00000015111) ENSPSMG00000015080 CBLL1 (ENSPSMG00000015070) SLC26A3 (ENSPSMG00000015024) DLD (ENSPSMG00000014890) LAMB1 (ENSPSMG00000014745) LAMB4 (ENSPSMG00000014698) NRCAM (ENSPSMG00000012972) PNPLA8 (ENSPSMG00000011999) THAP5 (ENSPSMG00000011959) DNAJB9 (ENSPSMG00000011951) ENSPSMG00000011939 BEX4 (ENSPSMG00000011916) ENSPSMG00000011880 ##22 NXF3 (ENSPSMG00000011874) ENSPSMG00000011858 ENSPSMG00000011855 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.b ENSGT00390000008820.e.b.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281.i ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00390000011425.A Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 974 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1971 MAGT1 (ENSRBIG00000035051) ENSRBIG00000031130 ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1683 MAGT1 (ENSRROG00000032173) ENSRROG00000003675 ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 86 ENSGT00940000156170 ENSGT00940000155301 ENSGT00940000154979.s.b ENSGT01030000234535.E ENSGT00950000183103.d.a.b ENSGT00910000147117 ENSGT00390000012178.g.a.b.b.b ##22 ENSGT00390000016258 ENSGT01030000234618.E ENSGT00940000158002 ENSGT00910000147364 ENSGT00940000156873 ENSGT00940000160524 ENSGT00390000018044.b.a ENSGT00940000154437.mc.b ENSGT00390000015600.c.b ENSGT00390000004950.k.a ENSGT00940000154470.a ENSGT00940000162144 ENSGT00950000182938.b.b.b.b.b.b ENSGT00940000159146 ENSGT00390000014907.B Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1804 ST8SIA3 (ENSRROG00000029098) ONECUT2 (ENSRROG00000035951) ENSRROG00000013183 ENSRROG00000022117 ##22 FECH (ENSRROG00000030561) NARS1 (ENSRROG00000042302) ATP8B1 (ENSRROG00000045446) ENSRROG00000044218 NEDD4L (ENSRROG00000045729) ALPK2 (ENSRROG00000036786) MALT1 (ENSRROG00000038022) MAFB (ENSRROG00000025352) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1013 TXNL1 (ENSRBIG00000035017) WDR7 (ENSRBIG00000020679) BOD1L2 (ENSRBIG00000037710) ST8SIA3 (ENSRBIG00000030936) ONECUT2 (ENSRBIG00000024925) ENSRBIG00000015293 ENSRBIG00000001152 ##22 FECH (ENSRBIG00000038117) NARS1 (ENSRBIG00000028813) ATP8B1 (ENSRBIG00000035681) ENSRBIG00000043735 NEDD4L (ENSRBIG00000037432) ALPK2 (ENSRBIG00000041653) MALT1 (ENSRBIG00000032078) ZNF532 (ENSRBIG00000039248) SEC11C (ENSRBIG00000025516) ENSRBIG00000031651 GRP (ENSRBIG00000031803) RAX (ENSRBIG00000031446) CPLX4 (ENSRBIG00000039168) LMAN1 (ENSRBIG00000044275) CCBE1 (ENSRBIG00000031340) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281.i ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT00940000155351.bb.d ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281.i ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155266.lb ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00950000183070.a.a.i.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.a.q.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT00940000155351.bb.d ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000003601.a ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281.i ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155266.lb ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00390000017839.o.b.b.b.f ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00950000183070.a.a.i.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.a.q.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT00940000155351.bb.d ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 85 PBDC1 (ENSMNEG00000018878) MAGEE1 (ENSMNEG00000039780) ENSMNEG00000028125 FGF16 (ENSMNEG00000036453) ATRX (ENSMNEG00000033171) MAGT1 (ENSMNEG00000039288) ENSMNEG00000033259 ##22 ATP7A (ENSMNEG00000018557) ENSMNEG00000034194 TAF9B (ENSMNEG00000040165) CYSLTR1 (ENSMNEG00000013446) ENSMNEG00000030251 ENSMNEG00000034394 LPAR4 (ENSMNEG00000026886) ENSMNEG00000039449 P2RY10 (ENSMNEG00000001678) ENSMNEG00000004426 GPR174 (ENSMNEG00000015097) ITM2A (ENSMNEG00000028333) TBX22 (ENSMNEG00000002289) BRWD3 (ENSMNEG00000028960) ENSMNEG00000003904 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 479 SLC13A4 (ENSMNEG00000036754) FAM180A (ENSMNEG00000030484) MTPN (ENSMNEG00000045193) CHRM2 (ENSMNEG00000004416) PTN (ENSMNEG00000015808) DGKI (ENSMNEG00000011223) CREB3L2 (ENSMNEG00000040567) AKR1D1 (ENSMNEG00000042294) ENSMNEG00000039796 TRIM24 (ENSMNEG00000039890) SVOPL (ENSMNEG00000042274) ATP6V0A4 (ENSMNEG00000031434) ENSMNEG00000019599 TMEM213 (ENSMNEG00000041279) KIAA1549 (ENSMNEG00000041043) ENSMNEG00000021543 ##22 ZC3HAV1L (ENSMNEG00000038394) ZC3HAV1 (ENSMNEG00000036256) TTC26 (ENSMNEG00000036716) UBN2 (ENSMNEG00000037231) FMC1 (ENSMNEG00000041725) LUC7L2 (ENSMNEG00000042011) KLRG2 (ENSMNEG00000031887) ENSMNEG00000045317 CLEC2L (ENSMNEG00000044275) HIPK2 (ENSMNEG00000039195) TBXAS1 (ENSMNEG00000027928) PARP12 (ENSMNEG00000028999) KDM7A (ENSMNEG00000028468) SLC37A3 (ENSMNEG00000044880) RAB19 (ENSMNEG00000043765) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281.i ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155266.lb ENSGT00940000158214 ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT01030000236289.a.b ENSGT00390000016333 ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00950000183070.a.a.j.a.a.a ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT00940000155351.bb.d ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000166733 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b.s Rhesus MODERN SPECIES 327 ENSMMUG00000055216 ENSMMUG00000017660 NEXMIF (ENSMMUG00000011440) ABCB7 (ENSMMUG00000015619) UPRT (ENSMMUG00000021204) ENSMMUG00000064959 ZDHHC15 (ENSMMUG00000021207) ENSMMUG00000009671 MAGEE2 (ENSMMUG00000023635) ENSMMUG00000060005 PBDC1 (ENSMMUG00000019569) MAGEE1 (ENSMMUG00000049351) FGF16 (ENSMMUG00000011744) ATRX (ENSMMUG00000022574) MAGT1 (ENSMMUG00000014407) COX7B (ENSMMUG00000015861) ##22 ATP7A (ENSMMUG00000012871) PGK1 (ENSMMUG00000012874) TAF9B (ENSMMUG00000012875) CYSLTR1 (ENSMMUG00000013387) ENSMMUG00000029246 LPAR4 (ENSMMUG00000052823) P2RY10 (ENSMMUG00000052164) ENSMMUG00000032415 GPR174 (ENSMMUG00000047442) ENSMMUG00000056870 ITM2A (ENSMMUG00000003564) TBX22 (ENSMMUG00000054447) ENSMMUG00000063550 TENT5D (ENSMMUG00000043822) BRWD3 (ENSMMUG00000010763) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 175 UPRT (ENSMFAG00000049237) ENSMFAG00000062687 ZDHHC15 (ENSMFAG00000041334) ENSMFAG00000056999 MAGEE2 (ENSMFAG00000022309) ENSMFAG00000053334 PBDC1 (ENSMFAG00000039912) ENSMFAG00000052737 ENSMFAG00000054114 ENSMFAG00000033199 ENSMFAG00000064327 FGF16 (ENSMFAG00000044477) ATRX (ENSMFAG00000031719) ENSMFAG00000053041 MAGT1 (ENSMFAG00000031612) COX7B (ENSMFAG00000002971) ##22 ATP7A (ENSMFAG00000037371) ENSMFAG00000031271 TAF9B (ENSMFAG00000045420) CYSLTR1 (ENSMFAG00000053095) ENSMFAG00000031310 LPAR4 (ENSMFAG00000025015) P2RY10 (ENSMFAG00000065797) ENSMFAG00000058091 GPR174 (ENSMFAG00000048513) ITM2A (ENSMFAG00000037997) ENSMFAG00000050209 TBX22 (ENSMFAG00000000575) ENSMFAG00000058505 TENT5D (ENSMFAG00000059694) BRWD3 (ENSMFAG00000043437) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f.b ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00950000183070.a.a.i.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.a.q.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT00940000155351.bb.d ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 792 MAGEE2 (ENSPANG00000005315) ENSPANG00000013474 ENSPANG00000041868 CDX4 (ENSPANG00000044820) ENSPANG00000011549 ENSPANG00000035979 ENSPANG00000048671 ENSPANG00000046739 PHKA1 (ENSPANG00000014929) HDAC8 (ENSPANG00000006122) ENSPANG00000038920 ENSPANG00000043866 FGF16 (ENSPANG00000002965) ATRX (ENSPANG00000024984) MAGT1 (ENSPANG00000012904) ENSPANG00000008508 ##22 ATP7A (ENSPANG00000019286) ENSPANG00000011695 TAF9B (ENSPANG00000006121) ENSPANG00000051297 ENSPANG00000041600 ENSPANG00000038489 LPAR4 (ENSPANG00000014311) P2RY10 (ENSPANG00000010847) ENSPANG00000043750 GPR174 (ENSPANG00000001913) ENSPANG00000037018 ITM2A (ENSPANG00000004635) TBX22 (ENSPANG00000025094) TENT5D (ENSPANG00000047561) ENSPANG00000045458 Olive baboon MODERN SPECIES 3 POLA2 (ENSPANG00000023360) CDC42EP2 (ENSPANG00000019253) DPF2 (ENSPANG00000004688) TIGD3 (ENSPANG00000006957) SLC25A45 (ENSPANG00000004415) FRMD8 (ENSPANG00000013649) SCYL1 (ENSPANG00000011369) LTBP3 (ENSPANG00000007731) ZNRD2 (ENSPANG00000013678) FAM89B (ENSPANG00000031618) KCNK7 (ENSPANG00000031772) MAP3K11 (ENSPANG00000006544) PCNX3 (ENSPANG00000023501) SIPA1 (ENSPANG00000012185) RELA (ENSPANG00000013650) ENSPANG00000013663 ##22 KAT5 (ENSPANG00000021813) RNASEH2C (ENSPANG00000015965) AP5B1 (ENSPANG00000005284) OVOL1 (ENSPANG00000002371) SNX32 (ENSPANG00000025890) ENSPANG00000023333 MUS81 (ENSPANG00000001162) EFEMP2 (ENSPANG00000001161) CTSW (ENSPANG00000013728) FIBP (ENSPANG00000016131) CCDC85B (ENSPANG00000003185) FOSL1 (ENSPANG00000016424) C11orf68 (ENSPANG00000043297) DRAP1 (ENSPANG00000013679) TSGA10IP (ENSPANG00000010860) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 198 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.a.b ENSGT00940000161697.f.b ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00950000183070.a.a.i.a.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT00950000182907.a.b.b.a.q.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 Drill MODERN SPECIES 1581 FGF16 (ENSMLEG00000033398) ATRX (ENSMLEG00000036012) MAGT1 (ENSMLEG00000033555) COX7B (ENSMLEG00000039336) ##22 ATP7A (ENSMLEG00000033064) ENSMLEG00000042534 TAF9B (ENSMLEG00000031736) Sooty mangabey MODERN SPECIES 242 ENSCATG00000029417 MAGT1 (ENSCATG00000033861) COX7B (ENSCATG00000034438) ##22 ATP7A (ENSCATG00000014632) ENSCATG00000033928 ENSCATG00000023495 CYSLTR1 (ENSCATG00000016128) ENSCATG00000020191 LPAR4 (ENSCATG00000043259) ENSCATG00000031897 P2RY10 (ENSCATG00000043256) GPR174 (ENSCATG00000017558) ITM2A (ENSCATG00000033243) TBX22 (ENSCATG00000035150) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155268.f.b.a.a.a ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00940000165353 Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 259 ENSNLEG00000034443 ##22 Gibbon MODERN SPECIES 7 ZNRF2 (ENSNLEG00000027608) ENSNLEG00000027614 ENSNLEG00000015141 NOD1 (ENSNLEG00000015142) GGCT (ENSNLEG00000015148) GARS1 (ENSNLEG00000015152) CRHR2 (ENSNLEG00000015171) INMT (ENSNLEG00000015185) MINDY4 (ENSNLEG00000015188) AQP1 (ENSNLEG00000035862) GHRHR (ENSNLEG00000015214) ADCYAP1R1 (ENSNLEG00000030573) NEUROD6 (ENSNLEG00000015231) ITPRID1 (ENSNLEG00000015233) PDE1C (ENSNLEG00000015246) ENSNLEG00000033028 ##22 LSM5 (ENSNLEG00000015268) AVL9 (ENSNLEG00000015273) KBTBD2 (ENSNLEG00000012407) ENSNLEG00000035994 FKBP9 (ENSNLEG00000015401) NT5C3A (ENSNLEG00000015415) ENSNLEG00000035208 RP9 (ENSNLEG00000015421) ENSNLEG00000028717 BBS9 (ENSNLEG00000015425) ENSNLEG00000032278 BMPER (ENSNLEG00000015455) NPSR1 (ENSNLEG00000015478) DPY19L1 (ENSNLEG00000015491) DPY19L2 (ENSNLEG00000015504) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155268.f.b.a.a.a ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.b ENSGT00390000008820.e.b.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Orangutan MODERN SPECIES 242 ENSPPYG00000040239 SLC16A2 (ENSPPYG00000020479) RLIM (ENSPPYG00000020481) NEXMIF (ENSPPYG00000020482) ABCB7 (ENSPPYG00000020483) UPRT (ENSPPYG00000020484) ZDHHC15 (ENSPPYG00000020485) ENSPPYG00000020486 MAGEE2 (ENSPPYG00000020487) ENSPPYG00000031391 PBDC1 (ENSPPYG00000020488) MAGEE1 (ENSPPYG00000020489) FGF16 (ENSPPYG00000036906) ATRX (ENSPPYG00000020491) MAGT1 (ENSPPYG00000020493) COX7B (ENSPPYG00000020494) ##22 ATP7A (ENSPPYG00000020495) PGK1 (ENSPPYG00000020496) TAF9B (ENSPPYG00000020497) CYSLTR1 (ENSPPYG00000020498) LPAR4 (ENSPPYG00000020500) P2RY10 (ENSPPYG00000020501) GPR174 (ENSPPYG00000020502) ITM2A (ENSPPYG00000020503) TBX22 (ENSPPYG00000020504) BRWD3 (ENSPPYG00000020507) HMGN5 (ENSPPYG00000020508) SH3BGRL (ENSPPYG00000020509) POU3F4 (ENSPPYG00000020510) CYLC1 (ENSPPYG00000020512) RPS6KA6 (ENSPPYG00000020513) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155268.f.b.a.a.a ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.b ENSGT00390000008820.e.b.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 Gorilla MODERN SPECIES 523 RLIM (ENSGGOG00000000885) NEXMIF (ENSGGOG00000005315) ABCB7 (ENSGGOG00000015678) UPRT (ENSGGOG00000011666) ENSGGOG00000024158 ZDHHC15 (ENSGGOG00000004488) ENSGGOG00000040631 ENSGGOG00000024006 MAGEE2 (ENSGGOG00000004206) PBDC1 (ENSGGOG00000013084) ENSGGOG00000027341 ENSGGOG00000025599 FGF16 (ENSGGOG00000002237) ATRX (ENSGGOG00000024999) MAGT1 (ENSGGOG00000010342) COX7B (ENSGGOG00000023347) ##22 ATP7A (ENSGGOG00000025640) PGK1 (ENSGGOG00000017111) TAF9B (ENSGGOG00000002470) CYSLTR1 (ENSGGOG00000003276) GPR174 (ENSGGOG00000024322) ITM2A (ENSGGOG00000026998) TBX22 (ENSGGOG00000008990) ENSGGOG00000043041 ENSGGOG00000015916 BRWD3 (ENSGGOG00000004108) ENSGGOG00000039837 ENSGGOG00000037044 ENSGGOG00000039492 HMGN5 (ENSGGOG00000016479) SH3BGRL (ENSGGOG00000009664) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155268.f.b.a.a.a ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT00940000163808 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 ENSGT00940000156017 ENSGT00940000153314.b Pan ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155753.g ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000155268.f.b.a.a.a ENSGT00940000158214 ENSGT00940000156154.b ENSGT00940000154465.C.p ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000153525.g.a ENSGT00940000163182 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g.a.b.b ##22 ENSGT00940000159568 ENSGT00390000008820.e.b.b ENSGT00390000008820.e.b.a.b ENSGT00940000161697.f ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00940000162488 ENSGT00940000162350.b.b ENSGT00940000162350.b.a ENSGT00950000182787.C.d ENSGT00950000183107.a.b.b Bonobo MODERN SPECIES 369 SLC16A2 (ENSPPAG00000038613) RLIM (ENSPPAG00000027958) NEXMIF (ENSPPAG00000015470) ABCB7 (ENSPPAG00000031273) UPRT (ENSPPAG00000035587) ZDHHC15 (ENSPPAG00000017721) ENSPPAG00000036584 ENSPPAG00000042832 MAGEE2 (ENSPPAG00000000336) PBDC1 (ENSPPAG00000031758) ENSPPAG00000028661 MAGEE1 (ENSPPAG00000023414) FGF16 (ENSPPAG00000033879) ATRX (ENSPPAG00000043806) MAGT1 (ENSPPAG00000037154) COX7B (ENSPPAG00000038135) ##22 ATP7A (ENSPPAG00000041943) ENSPPAG00000039675 TAF9B (ENSPPAG00000042950) CYSLTR1 (ENSPPAG00000008752) GPR174 (ENSPPAG00000016269) ITM2A (ENSPPAG00000031833) TBX22 (ENSPPAG00000040549) ENSPPAG00000042789 ENSPPAG00000019114 ENSPPAG00000038929 BRWD3 (ENSPPAG00000036225) ENSPPAG00000037661 ENSPPAG00000037242 SH3BGRL (ENSPPAG00000035293) ENSPPAG00000037558 Chimpanzee MODERN SPECIES 972 RLIM 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ENSGT00940000156017 ENSGT00940000161429 Marmoset MODERN SPECIES 78 ABCB7 (ENSCJAG00000016979) UPRT (ENSCJAG00000017056) ZDHHC15 (ENSCJAG00000017070) ENSCJAG00000080941 MAGEE2 (ENSCJAG00000044553) ENSCJAG00000087258 ENSCJAG00000078093 ENSCJAG00000018571 ENSCJAG00000085876 ENSCJAG00000075745 FGF16 (ENSCJAG00000085860) ENSCJAG00000080384 ENSCJAG00000072662 MAGT1 (ENSCJAG00000018916) ENSCJAG00000071546 COX7B (ENSCJAG00000078536) ##22 ENSCJAG00000085677 ENSCJAG00000023354 ATP7A (ENSCJAG00000004052) PGK1 (ENSCJAG00000021082) TAF9B (ENSCJAG00000019520) CYSLTR1 (ENSCJAG00000023257) ENSCJAG00000075214 ENSCJAG00000082269 ENSCJAG00000081982 LPAR4 (ENSCJAG00000042770) P2RY10 (ENSCJAG00000009576) ENSCJAG00000085348 GPR174 (ENSCJAG00000009588) ITM2A (ENSCJAG00000009591) TBX22 (ENSCJAG00000009617) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000159450 ENSGT00390000000020.a.f.a ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 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ENSOCUG00000030310 ADCY8 (ENSOCUG00000002685) ASAP1 (ENSOCUG00000002414) ENSOCUG00000013690 ##29 ENSOCUG00000021577 ENSOCUG00000024677 ENSOCUG00000038124 ENSOCUG00000025215 ENSOCUG00000000506 MYC (ENSOCUG00000014289) LRATD2 (ENSOCUG00000003500) ENSOCUG00000037909 TRIB1 (ENSOCUG00000024295) ##20 ENSOCUG00000030414 ##22 NSMCE2 (ENSOCUG00000008539) WASHC5 (ENSOCUG00000015785) SQLE (ENSOCUG00000015771) ZNF572 (ENSOCUG00000039324) ENSOCUG00000030136 MTSS1 (ENSOCUG00000008102) NDUFB9 (ENSOCUG00000025074) TATDN1 (ENSOCUG00000017403) RNF139 (ENSOCUG00000017399) TRMT12 (ENSOCUG00000026379) ENSOCUG00000029848 FER1L6 (ENSOCUG00000026113) ENSOCUG00000038185 ENSOCUG00000037623 FAM91A1 (ENSOCUG00000011804) Rabbit MODERN SPECIES 18 KCTD18 (ENSOCUG00000011556) SPATS2L (ENSOCUG00000011549) ENSOCUG00000017946 ENSOCUG00000035705 ENSOCUG00000016464 C2orf69 (ENSOCUG00000016473) SATB2 (ENSOCUG00000009700) PLCL1 (ENSOCUG00000013978) BOLL (ENSOCUG00000013979) MARS2 (ENSOCUG00000017798) RFTN2 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ENSECAG00000029674 ENSECAG00000027797 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01030000234518.D ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT01000000215268 ENSGT00950000183107.a.b.b Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.k ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT01000000215268 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000163372 ENSGT00940000162554 ENSGT00390000003601.a ENSGT00950000183041.A.f ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753.k ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214 ENSGT00940000163487 ENSGT00390000016333 ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00940000163576 ENSGT00390000008820.e.b ENSGT00940000161697 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b ENSGT00940000162488 ENSGT01000000215268 ENSGT00950000183107.a.b.b ENSGT00730000111570 Elephant MODERN SPECIES 251 CDX4 (ENSLAFG00000016806) CHIC1 (ENSLAFG00000018579) ZCCHC13 (ENSLAFG00000029278) SLC16A2 (ENSLAFG00000004618) RLIM (ENSLAFG00000004774) NEXMIF (ENSLAFG00000015430) ABCB7 (ENSLAFG00000008784) UPRT (ENSLAFG00000004685) ZDHHC15 (ENSLAFG00000008568) MAGEE2 (ENSLAFG00000000647) PBDC1 (ENSLAFG00000026665) ENSLAFG00000030374 FGF16 (ENSLAFG00000010821) ATRX (ENSLAFG00000020570) MAGT1 (ENSLAFG00000012886) COX7B (ENSLAFG00000022996) #22 ATP7A (ENSLAFG00000020866) ENSLAFG00000025903 PGK1 (ENSLAFG00000011954) TAF9B (ENSLAFG00000011956) CYSLTR1 (ENSLAFG00000022602) LPAR4 (ENSLAFG00000008857) P2RY10 (ENSLAFG00000017615) ENSLAFG00000025887 ITM2A (ENSLAFG00000009973) TBX22 (ENSLAFG00000001881) ENSLAFG00000026457 TENT5D (ENSLAFG00000027086) ENSLAFG00000032363 BRWD3 (ENSLAFG00000002711) ENSLAFG00000017956 Tenrec MODERN SPECIES 16023 COX7B (ENSETEG00000016695) #22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1891 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178.g #22 Armadillo MODERN SPECIES 4248 FGF16 (ENSDNOG00000036657) ENSDNOG00000043529 MAGT1 (ENSDNOG00000048406) COX7B (ENSDNOG00000044803) #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.h ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT01100000263481 ENSGT00940000162286.a.a ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000177939 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 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ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00990000212839 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT01100000263481 ENSGT00940000162286.a.a ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00990000212839 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00990000212839 ENSGT00950000183159.a Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b 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(ENSPCTG00005000844) TMEM192 (ENSPCTG00005000934) ENSPCTG00005000991 HSD17B13 (ENSPCTG00005001010) KLHL8 (ENSPCTG00005001049) AFF1 (ENSPCTG00005001103) C7H4orf36 (ENSPCTG00005001168) Blue whale MODERN SPECIES 16 ZAR1 (ENSBMSG00010002777) SLC10A4 (ENSBMSG00010002788) SLAIN2 (ENSBMSG00010002807) TEC (ENSBMSG00010002868) ENSBMSG00010002879 TXK (ENSBMSG00010002895) NIPAL1 (ENSBMSG00010002941) CNGA1 (ENSBMSG00010003040) NFXL1 (ENSBMSG00010003069) CORIN (ENSBMSG00010003199) ATP10D (ENSBMSG00010003602) COMMD8 (ENSBMSG00010003628) GABRB1 (ENSBMSG00010003647) GABRA4 (ENSBMSG00010003669) ENSBMSG00010003693 COX7B2 (ENSBMSG00010003701) ##22 GABRA2 (ENSBMSG00010003721) GABRG1 (ENSBMSG00010003850) ENSBMSG00010003887 GNPDA2 (ENSBMSG00010003908) GUF1 (ENSBMSG00010003949) YIPF7 (ENSBMSG00010004073) KCTD8 (ENSBMSG00010004089) GRXCR1 (ENSBMSG00010004112) ATP8A1 (ENSBMSG00010004178) ENSBMSG00010004311 SHISA3 (ENSBMSG00010004322) BEND4 (ENSBMSG00010004338) SLC30A9 (ENSBMSG00010004377) TMEM33 (ENSBMSG00010004410) PHOX2B (ENSBMSG00010004426) Pecora ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121.a ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00990000212839 Yarkand deer MODERN SPECIES 8 TXK (ENSCHYG00000005752) NIPAL1 (ENSCHYG00000005689) CNGA1 (ENSCHYG00000005657) NFXL1 (ENSCHYG00000005584) CORIN (ENSCHYG00000005415) ATP10D (ENSCHYG00000005220) ENSCHYG00000005171 GABRB1 (ENSCHYG00000005132) GABRA4 (ENSCHYG00000005082) COX7B2 (ENSCHYG00000005065) ##22 GABRA2 (ENSCHYG00000005037) GABRG1 (ENSCHYG00000005002) GNPDA2 (ENSCHYG00000004957) GUF1 (ENSCHYG00000024555) YIPF7 (ENSCHYG00000024530) KCTD8 (ENSCHYG00000024505) GRXCR1 (ENSCHYG00000024476) ATP8A1 (ENSCHYG00000024091) ENSCHYG00000024032 SHISA3 (ENSCHYG00000024018) BEND4 (ENSCHYG00000023999) SLC30A9 (ENSCHYG00000023943) TMEM33 (ENSCHYG00000023907) ENSCHYG00000023886 PHOX2B (ENSCHYG00000023863) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121.a ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Bovidae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121.a ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000018318.u.b.a.a ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121.a ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00940000162764.A.b ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00950000185438 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000018318.u.b.a.a Bos ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b.b.b.a.a.b.a.b ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121.a ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 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ENSGT00390000018318.u.b.a.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 25 TEC (ENSBIXG00005010856) TXK (ENSBIXG00005010905) NIPAL1 (ENSBIXG00005005914) CNGA1 (ENSBIXG00005000558) NFXL1 (ENSBIXG00005010994) ENSBIXG00005000993 ENSBIXG00005011024 CORIN (ENSBIXG00005011067) ENSBIXG00005011101 ENSBIXG00005011120 ATP10D (ENSBIXG00005001039) COMMD8 (ENSBIXG00005011246) GABRB1 (ENSBIXG00005001070) GABRA4 (ENSBIXG00005011330) ENSBIXG00005011349 COX7B2 (ENSBIXG00005011354) ##22 GABRA2 (ENSBIXG00005011447) GABRG1 (ENSBIXG00005011487) ENSBIXG00005001123 GUF1 (ENSBIXG00005011580) ENSBIXG00005011659 KCTD8 (ENSBIXG00005011699) GRXCR1 (ENSBIXG00005011742) ENSBIXG00005011778 ENSBIXG00005011788 ATP8A1 (ENSBIXG00005011872) SHISA3 (ENSBIXG00005011897) BEND4 (ENSBIXG00005011932) SLC30A9 (ENSBIXG00005006425) TMEM33 (ENSBIXG00005012025) PHOX2B (ENSBIXG00005012048) Cow MODERN SPECIES 25 SLC10A4 (ENSBTAG00000004888) SLAIN2 (ENSBTAG00000021963) ENSBTAG00000051457 TEC (ENSBTAG00000005062) TXK (ENSBTAG00000005055) NIPAL1 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ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00940000162764.A.b ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185438 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 Wild yak MODERN SPECIES 519 ENSBMUG00000013342 CORIN (ENSBMUG00000013536) ATP10D (ENSBMUG00000013718) ENSBMUG00000013746 GABRB1 (ENSBMUG00000013757) GABRA4 (ENSBMUG00000013785) COX7B2 (ENSBMUG00000013798) ##22 Domestic yak MODERN SPECIES 25 ZAR1 (ENSBGRG00000000826) SLC10A4 (ENSBGRG00000000935) SLAIN2 (ENSBGRG00000000952) TEC (ENSBGRG00000000984) ENSBGRG00000001028 TXK (ENSBGRG00000001037) NIPAL1 (ENSBGRG00000001082) CNGA1 (ENSBGRG00000001119) NFXL1 (ENSBGRG00000001143) ENSBGRG00000001248 CORIN (ENSBGRG00000001280) ATP10D (ENSBGRG00000001458) ENSBGRG00000001531 GABRB1 (ENSBGRG00000001566) GABRA4 (ENSBGRG00000001620) COX7B2 (ENSBGRG00000001660) ##22 GABRA2 (ENSBGRG00000001680) GABRG1 (ENSBGRG00000001712) ENSBGRG00000001754 GNPDA2 (ENSBGRG00000001777) GUF1 (ENSBGRG00000001851) KCTD8 (ENSBGRG00000001931) GRXCR1 (ENSBGRG00000001939) ATP8A1 (ENSBGRG00000001965) ENSBGRG00000002087 ENSBGRG00000002096 SHISA3 (ENSBGRG00000002113) BEND4 (ENSBGRG00000002120) SLC30A9 (ENSBGRG00000002141) TMEM33 (ENSBGRG00000002211) PHOX2B (ENSBGRG00000002236) American bison MODERN SPECIES 3311 ENSBBBG00000018563 SLC10A4 (ENSBBBG00000008458) SLAIN2 (ENSBBBG00000018594) TEC (ENSBBBG00000018619) TXK (ENSBBBG00000018635) NIPAL1 (ENSBBBG00000018650) CNGA1 (ENSBBBG00000018689) NFXL1 (ENSBBBG00000018752) ENSBBBG00000008354 ENSBBBG00000004703 CORIN (ENSBBBG00000018963) ATP10D (ENSBBBG00000019001) COMMD8 (ENSBBBG00000019012) GABRB1 (ENSBBBG00000019051) GABRA4 (ENSBBBG00000004881) COX7B2 (ENSBBBG00000019069) ##22 GABRA2 (ENSBBBG00000019140) GABRG1 (ENSBBBG00000019154) ENSBBBG00000019160 GNPDA2 (ENSBBBG00000004940) 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(ENSCHIG00000013825) NFXL1 (ENSCHIG00000021507) CORIN (ENSCHIG00000007759) ATP10D (ENSCHIG00000017299) ENSCHIG00000026952 ENSCHIG00000014623 ENSCHIG00000019267 GABRA4 (ENSCHIG00000011129) ENSCHIG00000024388 COX7B2 (ENSCHIG00000009371) ##22 GABRA2 (ENSCHIG00000026398) GABRG1 (ENSCHIG00000017957) GNPDA2 (ENSCHIG00000022756) GUF1 (ENSCHIG00000010231) YIPF7 (ENSCHIG00000017840) KCTD8 (ENSCHIG00000025477) ENSCHIG00000013200 GRXCR1 (ENSCHIG00000022310) ATP8A1 (ENSCHIG00000008265) SHISA3 (ENSCHIG00000018900) SLC30A9 (ENSCHIG00000006762) ENSCHIG00000011864 TMEM33 (ENSCHIG00000026524) PHOX2B (ENSCHIG00000017591) ENSCHIG00000027062 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1266 ENSMMSG00000022145 FRYL (ENSMMSG00000022278) ZAR1 (ENSMMSG00000022742) SLC10A4 (ENSMMSG00000022798) SLAIN2 (ENSMMSG00000022812) TEC (ENSMMSG00000022841) TXK (ENSMMSG00000022866) NIPAL1 (ENSMMSG00000022887) CNGA1 (ENSMMSG00000022893) NFXL1 (ENSMMSG00000022906) CORIN (ENSMMSG00000022956) ATP10D (ENSMMSG00000023395) ENSMMSG00000023418 GABRB1 (ENSMMSG00000023423) GABRA4 (ENSMMSG00000023435) COX7B2 (ENSMMSG00000023441) ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00990000212839 ENSGT00950000183159.a Arabian camel MODERN SPECIES 11 OCIAD1 (ENSCDRG00005002829) FRYL (ENSCDRG00005002927) ZAR1 (ENSCDRG00005002960) SLC10A4 (ENSCDRG00005003027) SLAIN2 (ENSCDRG00005003049) TEC (ENSCDRG00005003076) 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ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000177939 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT01050000247111 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b 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(ENSAMEG00000029604) CNGA1 (ENSAMEG00000003224) NFXL1 (ENSAMEG00000003238) CORIN (ENSAMEG00000003272) ATP10D (ENSAMEG00000003322) COMMD8 (ENSAMEG00000003384) ENSAMEG00000003395 ENSAMEG00000029631 GABRA4 (ENSAMEG00000003403) COX7B2 (ENSAMEG00000018659) ##22 GABRA2 (ENSAMEG00000003435) GABRG1 (ENSAMEG00000016041) ENSAMEG00000024774 GNPDA2 (ENSAMEG00000016070) GUF1 (ENSAMEG00000016084) YIPF7 (ENSAMEG00000016096) KCTD8 (ENSAMEG00000012775) GRXCR1 (ENSAMEG00000012829) ATP8A1 (ENSAMEG00000012833) ENSAMEG00000027697 SHISA3 (ENSAMEG00000030334) ENSAMEG00000027469 ENSAMEG00000013012 SLC30A9 (ENSAMEG00000013013) TMEM33 (ENSAMEG00000013043) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00530000063690.a.b.a.b ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 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(ENSVVUG00000023098) ENSVVUG00000023097 ENSVVUG00000023096 ENSVVUG00000023091 Felidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT01050000247111 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00390000010491.lb.b.b ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Panthera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 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LIMCH1 (ENSPLOG00000000891) leopard MODERN SPECIES 2 ZAR1 (ENSPPRG00000025041) ENSPPRG00000025049 ENSPPRG00000021184 SLAIN2 (ENSPPRG00000020572) TEC (ENSPPRG00000019278) TXK (ENSPPRG00000018223) NIPAL1 (ENSPPRG00000016505) CNGA1 (ENSPPRG00000015670) NFXL1 (ENSPPRG00000014939) CORIN (ENSPPRG00000014127) ATP10D (ENSPPRG00000011749) COMMD8 (ENSPPRG00000010563) ENSPPRG00000022108 GABRB1 (ENSPPRG00000010093) GABRA4 (ENSPPRG00000009969) COX7B2 (ENSPPRG00000022077) ##22 GABRA2 (ENSPPRG00000009651) GABRG1 (ENSPPRG00000008774) GNPDA2 (ENSPPRG00000007930) GUF1 (ENSPPRG00000007366) YIPF7 (ENSPPRG00000007052) KCTD8 (ENSPPRG00000006883) GRXCR1 (ENSPPRG00000006616) ENSPPRG00000006533 ATP8A1 (ENSPPRG00000006177) SHISA3 (ENSPPRG00000003785) BEND4 (ENSPPRG00000003662) SLC30A9 (ENSPPRG00000003050) TMEM33 (ENSPPRG00000002750) PHOX2B (ENSPPRG00000002711) LIMCH1 (ENSPPRG00000001941) Tiger MODERN SPECIES 71 ENSPTIG00000018205 ENSPTIG00000011485 SLC10A4 (ENSPTIG00000012275) SLAIN2 (ENSPTIG00000013819) TEC 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ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121.d ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121.c ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 23 OCIAD1 (ENSRFEG00010000361) FRYL (ENSRFEG00010000583) ZAR1 (ENSRFEG00010000867) SLC10A4 (ENSRFEG00010000879) SLAIN2 (ENSRFEG00010000907) TEC (ENSRFEG00010000982) TXK (ENSRFEG00010001040) NIPAL1 (ENSRFEG00010001063) CNGA1 (ENSRFEG00010001086) NFXL1 (ENSRFEG00010001130) CORIN (ENSRFEG00010001293) ATP10D (ENSRFEG00010001499) COMMD8 (ENSRFEG00010001543) GABRB1 (ENSRFEG00010001568) GABRA4 (ENSRFEG00010001585) COX7B2 (ENSRFEG00010001622) ##22 GABRA2 (ENSRFEG00010001647) GABRG1 (ENSRFEG00010001696) GNPDA2 (ENSRFEG00010001727) GUF1 (ENSRFEG00010001765) YIPF7 (ENSRFEG00010001813) KCTD8 (ENSRFEG00010001837) GRXCR1 (ENSRFEG00010001855) ATP8A1 (ENSRFEG00010001910) SHISA3 (ENSRFEG00010002074) BEND4 (ENSRFEG00010002093) SLC30A9 (ENSRFEG00010002130) TMEM33 (ENSRFEG00010002167) PHOX2B (ENSRFEG00010002185) LIMCH1 (ENSRFEG00010002441) UCHL1 (ENSRFEG00010002861) Microbat MODERN SPECIES 985 ENSMLUG00000022253 GABRA4 (ENSMLUG00000006648) COX7B2 (ENSMLUG00000029805) ##22 GABRA2 (ENSMLUG00000011304) GABRG1 (ENSMLUG00000012175) ENSMLUG00000030735 GNPDA2 (ENSMLUG00000011288) GUF1 (ENSMLUG00000002116) YIPF7 (ENSMLUG00000007205) KCTD8 (ENSMLUG00000010892) ENSMLUG00000009520 ENSMLUG00000029519 GRXCR1 (ENSMLUG00000024049) ATP8A1 (ENSMLUG00000007793) ENSMLUG00000026182 BEND4 (ENSMLUG00000002615) SLC30A9 (ENSMLUG00000002605) TMEM33 (ENSMLUG00000006119) Megabat MODERN SPECIES 7436 COX7B2 (ENSPVAG00000012089) ##22 Equus DUPLICATION Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.h.a ##22 Donkey MODERN SPECIES SLC25A40 (ENSEASG00005001287) RUNDC3B (ENSEASG00005001300) ABCB1 (ENSEASG00005001470) CROT (ENSEASG00005002345) TMEM243 (ENSEASG00005002366) DMTF1 (ENSEASG00005002390) ENSEASG00005002583 GRM3 (ENSEASG00005002690) SEMA3D (ENSEASG00005002742) SEMA3A (ENSEASG00005003396) SEMA3E (ENSEASG00005003478) ENSEASG00005033246 ENSEASG00005025382 ENSEASG00005027920 ENSEASG00005003491 ENSEASG00005030242 ##22 ENSEASG00005003522 ENSEASG00005003612 ENSEASG00005008865 ENSEASG00005030806 ENSEASG00005031406 ENSEASG00005028854 ENSEASG00005032637 ENSEASG00005008897 ENSEASG00005008877 ENSEASG00005037710 ENSEASG00005038775 ENSEASG00005027962 ENSEASG00005024012 LRP11 (ENSEASG00005033810) PCMT1 (ENSEASG00005008914) Equus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00940000154713.B ENSGT00390000018121.d ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h.b ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a ENSGT00940000157306 Horse MODERN SPECIES 22 SLC10A4 (ENSECAG00000021654) SLAIN2 (ENSECAG00000023466) TEC (ENSECAG00000024389) TXK (ENSECAG00000057449) NIPAL1 (ENSECAG00000019455) CNGA1 (ENSECAG00000020953) ENSECAG00000020915 NFXL1 (ENSECAG00000022401) CORIN (ENSECAG00000005039) ENSECAG00000037545 ATP10D (ENSECAG00000012518) ENSECAG00000052249 COMMD8 (ENSECAG00000020380) GABRB1 (ENSECAG00000022268) GABRA4 (ENSECAG00000023424) ENSECAG00000057080 ##22 ENSECAG00000046244 GABRA2 (ENSECAG00000000924) GABRG1 (ENSECAG00000011123) GNPDA2 (ENSECAG00000016016) GUF1 (ENSECAG00000019296) ENSECAG00000051708 ENSECAG00000053437 YIPF7 (ENSECAG00000021919) KCTD8 (ENSECAG00000027962) ENSECAG00000059163 GRXCR1 (ENSECAG00000022751) ATP8A1 (ENSECAG00000022873) ENSECAG00000052200 BEND4 (ENSECAG00000021008) SLC30A9 (ENSECAG00000000595) Donkey MODERN SPECIES 22 OCIAD1 (ENSEASG00005014321) FRYL (ENSEASG00005009561) ZAR1 (ENSEASG00005026845) SLC10A4 (ENSEASG00005009010) SLAIN2 (ENSEASG00005009008) TEC (ENSEASG00005008963) TXK (ENSEASG00005008912) NIPAL1 (ENSEASG00005029308) CNGA1 (ENSEASG00005008890) NFXL1 (ENSEASG00005008883) ENSEASG00005038414 CORIN (ENSEASG00005008798) ATP10D (ENSEASG00005008750) ENSEASG00005008742 GABRA4 (ENSEASG00005008735) ENSEASG00005033328 ##22 ENSEASG00005008729 ENSEASG00005008726 ENSEASG00005020568 IL7 (ENSEASG00005020566) ZC2HC1A (ENSEASG00005020562) PKIA (ENSEASG00005030730) PEX2 (ENSEASG00005030892) ZFHX4 (ENSEASG00005020537) HNF4G (ENSEASG00005020499) CRISPLD1 (ENSEASG00005020269) PI15 (ENSEASG00005020227) GDAP1 (ENSEASG00005020221) JPH1 (ENSEASG00005020211) ENSEASG00005030588 ENSEASG00005020206 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Primates ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a 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##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Pan ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b.m ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00910000144184.q.b.b.a.a ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00950000183015.D ENSGT00940000153692.A ENSGT00940000155133.b ENSGT00950000182808.a.a.a.a.b ENSGT00940000169357 ENSGT00390000015549 ENSGT00950000183183.b.a.y.b ENSGT00950000182974.a.b ENSGT00940000157583 ENSGT00940000153112.A ENSGT00940000161743 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ENSNLEG00000030271 BEND4 (ENSNLEG00000017262) SLC30A9 (ENSNLEG00000017245) ENSNLEG00000035036 TMEM33 (ENSNLEG00000017242) PHOX2B (ENSNLEG00000029231) LIMCH1 (ENSNLEG00000017187) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 19 OCIAD1 (ENSCSAG00000017208) FRYL (ENSCSAG00000017204) ZAR1 (ENSCSAG00000017185) SLC10A4 (ENSCSAG00000017179) SLAIN2 (ENSCSAG00000017177) TEC (ENSCSAG00000017174) TXK (ENSCSAG00000017171) NIPAL1 (ENSCSAG00000017165) CNGA1 (ENSCSAG00000017161) NFXL1 (ENSCSAG00000017157) CORIN (ENSCSAG00000017154) ATP10D (ENSCSAG00000017150) COMMD8 (ENSCSAG00000017147) GABRB1 (ENSCSAG00000017141) GABRA4 (ENSCSAG00000017136) COX7B2 (ENSCSAG00000019687) ##22 GABRA2 (ENSCSAG00000017135) GABRG1 (ENSCSAG00000017132) GNPDA2 (ENSCSAG00000017128) GUF1 (ENSCSAG00000017118) YIPF7 (ENSCSAG00000017113) KCTD8 (ENSCSAG00000019688) GRXCR1 (ENSCSAG00000017111) ATP8A1 (ENSCSAG00000017108) SHISA3 (ENSCSAG00000017105) BEND4 (ENSCSAG00000017101) SLC30A9 (ENSCSAG00000017099) DCAF4L1 (ENSCSAG00000019689) TMEM33 (ENSCSAG00000017098) PHOX2B (ENSCSAG00000017089) LIMCH1 (ENSCSAG00000017086) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155722.m.b.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00390000014293.a ENSGT00940000162313 ENSGT00940000161376 ENSGT00940000154194 ENSGT00940000158205 ENSGT00940000155196.q.a ENSGT00940000162645 ENSGT00940000163645 ENSGT00910000146913 ENSGT00940000155234.b.k.a.a ENSGT00940000162708 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 171 ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155722.m.b.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00390000016988.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 Drill MODERN SPECIES 707 GABRA4 (ENSMLEG00000035420) COX7B2 (ENSMLEG00000027322) ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 241 SLC10A4 (ENSCATG00000036979) ENSCATG00000036193 SLAIN2 (ENSCATG00000032868) TEC (ENSCATG00000008966) ENSCATG00000041789 TXK (ENSCATG00000040104) NIPAL1 (ENSCATG00000038035) CNGA1 (ENSCATG00000007300) NFXL1 (ENSCATG00000032998) CORIN (ENSCATG00000033250) ATP10D (ENSCATG00000035358) COMMD8 (ENSCATG00000032205) ENSCATG00000032344 GABRB1 (ENSCATG00000033572) GABRA4 (ENSCATG00000031039) COX7B2 (ENSCATG00000042585) ##22 GABRA2 (ENSCATG00000031075) Macaca ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 141 SLAIN2 (ENSMNEG00000037824) TEC (ENSMNEG00000031110) ENSMNEG00000024816 TXK (ENSMNEG00000039791) NIPAL1 (ENSMNEG00000018934) CNGA1 (ENSMNEG00000032099) NFXL1 (ENSMNEG00000035889) CORIN (ENSMNEG00000008872) ATP10D (ENSMNEG00000034293) COMMD8 (ENSMNEG00000041504) ENSMNEG00000004109 GABRB1 (ENSMNEG00000029965) GABRA4 (ENSMNEG00000030907) COX7B2 (ENSMNEG00000023624) ##22 GABRA2 (ENSMNEG00000029333) GABRG1 (ENSMNEG00000045534) GNPDA2 (ENSMNEG00000036979) GUF1 (ENSMNEG00000008365) YIPF7 (ENSMNEG00000036390) KCTD8 (ENSMNEG00000027200) GRXCR1 (ENSMNEG00000000445) ATP8A1 (ENSMNEG00000033798) SHISA3 (ENSMNEG00000030546) BEND4 (ENSMNEG00000043661) SLC30A9 (ENSMNEG00000041452) TMEM33 (ENSMNEG00000007879) PHOX2B (ENSMNEG00000029523) LIMCH1 (ENSMNEG00000036281) UCHL1 (ENSMNEG00000034568) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 591 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2546 GABRB1 (ENSRROG00000038373) GABRA4 (ENSRROG00000043632) COX7B2 (ENSRROG00000001929) ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 420 CORIN (ENSRBIG00000031285) ATP10D (ENSRBIG00000027709) COMMD8 (ENSRBIG00000029719) ENSRBIG00000007352 GABRB1 (ENSRBIG00000031405) GABRA4 (ENSRBIG00000036992) COX7B2 (ENSRBIG00000019567) ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00940000154632.q.a.a ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00940000166990 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00940000154632.q.a.a ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Marmoset MODERN SPECIES 15 ENSCJAG00000085981 ZAR1 (ENSCJAG00000018797) SLC10A4 (ENSCJAG00000018818) SLAIN2 (ENSCJAG00000042883) TEC (ENSCJAG00000018849) ENSCJAG00000071494 TXK (ENSCJAG00000018872) NIPAL1 (ENSCJAG00000060232) CNGA1 (ENSCJAG00000018878) NFXL1 (ENSCJAG00000018893) CORIN (ENSCJAG00000018936) ATP10D (ENSCJAG00000018950) COMMD8 (ENSCJAG00000018967) ENSCJAG00000018976 GABRA4 (ENSCJAG00000018992) COX7B2 (ENSCJAG00000076426) ##22 GABRA2 (ENSCJAG00000018998) ENSCJAG00000019029 GNPDA2 (ENSCJAG00000019049) GUF1 (ENSCJAG00000019056) YIPF7 (ENSCJAG00000019090) KCTD8 (ENSCJAG00000019097) ENSCJAG00000019100 GRXCR1 (ENSCJAG00000019104) ENSCJAG00000061038 ATP8A1 (ENSCJAG00000019105) SHISA3 (ENSCJAG00000084799) ENSCJAG00000087388 BEND4 (ENSCJAG00000019212) SLC30A9 (ENSCJAG00000019226) TMEM33 (ENSCJAG00000038683) Tarsier MODERN SPECIES 5659 COMMD8 (ENSTSYG00000011901) GABRB1 (ENSTSYG00000011888) GABRA4 (ENSTSYG00000003937) COX7B2 (ENSTSYG00000009905) ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Glires ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 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ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00990000212839 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00860000136278 ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110.j ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00950000183159.a Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b 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Murinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00860000136278 ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 ENSGT00990000212839 Mus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00860000136278 ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 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ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00860000136278 ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00860000135940 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00860000136278 ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00860000135940 ENSGT00940000157110 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Steppe mouse MODERN SPECIES 3162 Nfxl1 (ENSMSIG00000009436) Corin (ENSMSIG00000009052) Atp10d (ENSMSIG00000008994) Commd8 (ENSMSIG00000008971) Gabrb1 (ENSMSIG00000008860) Gabra4 (ENSMSIG00000008802) Cox7b2 (ENSMSIG00000008791) ##22 Gabra2 (ENSMSIG00000008755) Gabrg1 (ENSMSIG00000008710) Mouse MODERN SPECIES 14 Slc10a4 (ENSMUSG00000029219) Gm10135 (ENSMUSG00000063656) Slain2 (ENSMUSG00000036087) Tec (ENSMUSG00000029217) Txk (ENSMUSG00000054892) Nipal1 (ENSMUSG00000067219) Cnga1 (ENSMUSG00000067220) Slc10a4-ps (ENSMUSG00000060204) Zar1 (ENSMUSG00000063935) Nfxl1 (ENSMUSG00000072889) Corin (ENSMUSG00000005220) Atp10d (ENSMUSG00000046808) Commd8 (ENSMUSG00000029213) Gabrb1 (ENSMUSG00000029212) Gabra4 (ENSMUSG00000029211) Cox7b2 (ENSMUSG00000049387) ##22 Gabra2 (ENSMUSG00000000560) Gabrg1 (ENSMUSG00000001260) Gnpda2 (ENSMUSG00000029209) Guf1 (ENSMUSG00000029208) Yipf7 (ENSMUSG00000029158) Kctd8 (ENSMUSG00000037653) Grxcr1 (ENSMUSG00000068082) Atp8a1 (ENSMUSG00000037685) Shisa3 (ENSMUSG00000050010) Bend4 (ENSMUSG00000092060) Slc30a9 (ENSMUSG00000029221) Tmem33 (ENSMUSG00000037720) Phox2b (ENSMUSG00000012520) Limch1 (ENSMUSG00000037736) Uchl1 (ENSMUSG00000029223) Rat MODERN SPECIES 5 Slc10a4 (ENSRNOG00000026091) Slain2 (ENSRNOG00000002271) Gm10135 (ENSRNOG00000064628) Tec (ENSRNOG00000002278) Txk (ENSRNOG00000025925) Nipal1 (ENSRNOG00000025882) Cnga1 (ENSRNOG00000004778) Nfxl1 (ENSRNOG00000058588) Corin (ENSRNOG00000002302) ENSRNOG00000069538 Atp10d (ENSRNOG00000002312) Commd8 (ENSRNOG00000002320) ENSRNOG00000066731 Gabrb1 (ENSRNOG00000002327) Gabra4 (ENSRNOG00000002336) Cox7b2 (ENSRNOG00000057953) ##22 Gabra2 (ENSRNOG00000002349) Gabrg1 (ENSRNOG00000002360) ENSRNOG00000063124 Gnpda2 (ENSRNOG00000002177) Guf1 (ENSRNOG00000002207) Yipf7 (ENSRNOG00000002224) Kctd8 (ENSRNOG00000063710) ENSRNOG00000067037 AABR07015525.1 (ENSRNOG00000056900) Rtraf-ps2 (ENSRNOG00000029734) ENSRNOG00000070341 Grxcr1 (ENSRNOG00000038891) Atp8a1 (ENSRNOG00000034200) Shisa3 (ENSRNOG00000025670) ENSRNOG00000067394 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154713.B ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.h ##22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 1 SLAIN2 (ENSHGLG00000019447) ENSHGLG00000043919 ENSHGLG00000042797 TEC (ENSHGLG00000015780) ENSHGLG00000013808 NIPAL1 (ENSHGLG00000044376) CNGA1 (ENSHGLG00000018977) NFXL1 (ENSHGLG00000014142) CORIN (ENSHGLG00000006527) ATP10D (ENSHGLG00000017944) ENSHGLG00000042447 COMMD8 (ENSHGLG00000050189) ENSHGLG00000048776 ENSHGLG00000018631 GABRA4 (ENSHGLG00000013999) ENSHGLG00000034561 ##22 ENSHGLG00000043084 GABRA2 (ENSHGLG00000018532) GABRG1 (ENSHGLG00000017802) ENSHGLG00000045930 GNPDA2 (ENSHGLG00000014149) GUF1 (ENSHGLG00000014421) YIPF7 (ENSHGLG00000041371) KCTD8 (ENSHGLG00000018812) ENSHGLG00000018236 ENSHGLG00000018524 ENSHGLG00000044739 ENSHGLG00000021380 ENSHGLG00000018558 ENSHGLG00000015195 ENSHGLG00000015230 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 3 HDHD3 (ENSHGLG00000036149) ENSHGLG00000003486 ALAD (ENSHGLG00000013865) ENSHGLG00000013710 ENSHGLG00000044954 RGS3 (ENSHGLG00000013220) ENSHGLG00000050240 ENSHGLG00000012702 ENSHGLG00000044454 ZNF618 (ENSHGLG00000016960) AMBP (ENSHGLG00000044795) KIF12 (ENSHGLG00000016739) ENSHGLG00000016684 ENSHGLG00000016666 WHRN (ENSHGLG00000016648) ENSHGLG00000033853 ##22 ENSHGLG00000040119 ENSHGLG00000019108 TMEM268 (ENSHGLG00000014124) ENSHGLG00000040174 TNFSF15 (ENSHGLG00000049474) TNFSF8 (ENSHGLG00000050949) TNC (ENSHGLG00000019404) PAPPA (ENSHGLG00000019341) TRIM32 (ENSHGLG00000018840) ENSHGLG00000038993 ASTN2 (ENSHGLG00000014933) TLR4 (ENSHGLG00000014838) ENSHGLG00000043535 BRINP1 (ENSHGLG00000032697) ENSHGLG00000046150 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00900000143503 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 ENSGT00940000159219 ENSGT00940000157110 ENSGT00950000185160 ENSGT00940000161360 ENSGT00950000185498 ENSGT00390000014963 ENSGT00390000008346 ENSGT00390000011368 ENSGT00940000159958 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121.i ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 ENSGT00940000157266 ENSGT00940000160193 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000153168.C.a.b ENSGT00940000161041 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ENSUPAG00010020074 SLAIN2 (ENSUPAG00010020060) TEC (ENSUPAG00010020011) TXK (ENSUPAG00010019947) NIPAL1 (ENSUPAG00010019941) CNGA1 (ENSUPAG00010019928) NFXL1 (ENSUPAG00010019911) CORIN (ENSUPAG00010019864) ATP10D (ENSUPAG00010019845) COMMD8 (ENSUPAG00010019840) GABRB1 (ENSUPAG00010019831) GABRA4 (ENSUPAG00010019816) COX7B2 (ENSUPAG00010019814) ##22 GABRA2 (ENSUPAG00010019805) GABRG1 (ENSUPAG00010019790) GNPDA2 (ENSUPAG00010019785) GUF1 (ENSUPAG00010019766) YIPF7 (ENSUPAG00010019754) KCTD8 (ENSUPAG00010019752) GRXCR1 (ENSUPAG00010019743) ATP8A1 (ENSUPAG00010019653) SHISA3 (ENSUPAG00010019642) ENSUPAG00010019638 BEND4 (ENSUPAG00010019629) SLC30A9 (ENSUPAG00010019599) TMEM33 (ENSUPAG00010019588) PHOX2B (ENSUPAG00010019582) LIMCH1 (ENSUPAG00010019176) Alpin marmot MODERN SPECIES 9 FRYL (ENSMMMG00000019781) ENSMMMG00000019771 ENSMMMG00000019763 SLAIN2 (ENSMMMG00000019758) TEC (ENSMMMG00000019700) TXK (ENSMMMG00000019614) NIPAL1 (ENSMMMG00000019609) CNGA1 (ENSMMMG00000019576) NFXL1 (ENSMMMG00000019525) CORIN (ENSMMMG00000019455) ENSMMMG00000019438 ENSMMMG00000019428 COMMD8 (ENSMMMG00000019422) GABRB1 (ENSMMMG00000019411) GABRA4 (ENSMMMG00000019399) COX7B2 (ENSMMMG00000019389) ##22 GABRA2 (ENSMMMG00000019373) GABRG1 (ENSMMMG00000019360) ENSMMMG00000019343 ENSMMMG00000019324 GUF1 (ENSMMMG00000019298) YIPF7 (ENSMMMG00000019289) ENSMMMG00000019277 GRXCR1 (ENSMMMG00000019269) ATP8A1 (ENSMMMG00000019070) SHISA3 (ENSMMMG00000019019) BEND4 (ENSMMMG00000018996) SLC30A9 (ENSMMMG00000018947) TMEM33 (ENSMMMG00000018883) ENSMMMG00000018876 LIMCH1 (ENSMMMG00000018696) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 18 FRYL (ENSSVLG00005023963) ZAR1 (ENSSVLG00005023995) SLC10A4 (ENSSVLG00005024018) SLAIN2 (ENSSVLG00005024044) TEC (ENSSVLG00005024112) TXK (ENSSVLG00005024163) ENSSVLG00005024245 CNGA1 (ENSSVLG00005024292) NFXL1 (ENSSVLG00005024329) CORIN (ENSSVLG00005024434) ATP10D (ENSSVLG00005024815) COMMD8 (ENSSVLG00005024853) ENSSVLG00005024866 GABRB1 (ENSSVLG00005024897) GABRA4 (ENSSVLG00005024936) COX7B2 (ENSSVLG00005024964) ##22 ENSSVLG00005024980 GABRA2 (ENSSVLG00005025024) GABRG1 (ENSSVLG00005025083) GNPDA2 (ENSSVLG00005025106) GUF1 (ENSSVLG00005025124) YIPF7 (ENSSVLG00005025175) KCTD8 (ENSSVLG00005025188) GRXCR1 (ENSSVLG00005025198) ATP8A1 (ENSSVLG00005025263) ENSSVLG00005025339 SHISA3 (ENSSVLG00005025344) BEND4 (ENSSVLG00005025355) SLC30A9 (ENSSVLG00005025379) TMEM33 (ENSSVLG00005007360) PHOX2B (ENSSVLG00005007398) Tree shrew MODERN SPECIES 7330 COX7B2 (ENSTBEG00000013579) ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00530000063690.a.b.a.a ENSGT00610000086058.a ENSGT00390000012305.a ENSGT00950000182808.a.a.b.b ENSGT00390000017860.b ENSGT00940000155951.b ENSGT00940000160857 ENSGT00940000160022 ENSGT00940000156074 ENSGT00940000157059 ENSGT00940000157103 ENSGT00940000156728 ENSGT00390000018121 ENSGT00940000154245.B ENSGT00940000159024 ENSGT00390000012178.h ##22 Elephant MODERN SPECIES 363 FRYL (ENSLAFG00000003254) ENSLAFG00000003251 SLC10A4 (ENSLAFG00000003247) SLAIN2 (ENSLAFG00000002270) TEC (ENSLAFG00000014056) TXK (ENSLAFG00000014047) NIPAL1 (ENSLAFG00000000555) CNGA1 (ENSLAFG00000014036) NFXL1 (ENSLAFG00000014027) ENSLAFG00000031883 ENSLAFG00000014013 ATP10D (ENSLAFG00000014000) COMMD8 (ENSLAFG00000009119) GABRB1 (ENSLAFG00000030534) GABRA4 (ENSLAFG00000022571) COX7B2 (ENSLAFG00000009333) ##22 Tenrec MODERN SPECIES 17924 COX7B2 (ENSETEG00000007433) ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000012178.h ##22 Armadillo MODERN SPECIES 3400 ARPC3 (ENSDNOG00000045767) ANAPC7 (ENSDNOG00000004986) ATP2A2 (ENSDNOG00000013601) ENSDNOG00000040393 ##22 IFT81 (ENSDNOG00000047364) P2RX7 (ENSDNOG00000014586) P2RX4 (ENSDNOG00000011612) CAMKK2 (ENSDNOG00000047080) ANAPC5 (ENSDNOG00000018634) PDS5A (ENSDNOG00000019832) UBE2K (ENSDNOG00000019830) ENSDNOG00000044112 SMIM14 (ENSDNOG00000033192) UGDH (ENSDNOG00000018242) LIAS (ENSDNOG00000007417) ENSDNOG00000007411 KLB (ENSDNOG00000007404) RFC1 (ENSDNOG00000004694) ENSDNOG00000004680 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00950000182962.a.b ENSGT00940000159450 ENSGT00940000155753 ENSGT00940000159746 ENSGT00940000156281 ENSGT00940000157399.m ENSGT01020000230412.D ENSGT00940000158214.e ENSGT00940000160087 ENSGT00940000155902 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00390000012178 #22 ENSGT00940000159568 ENSGT00950000183593 ENSGT00390000008820.e.a ENSGT00940000155097.a ENSGT00940000163592 ENSGT01100000263536.B.c.b ENSGT01050000245003 ENSGT01040000240444.A.a.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.b ENSGT01100000263536.A.a.a.a ENSGT01100000263536.A.a.b ENSGT00950000183115.b.b ENSGT00940000161206 ENSGT00950000182832.D.b.uc ENSGT00940000162488 Opossum MODERN SPECIES 627 POF1B (ENSMODG00000014360) ENSMODG00000014364 ENSMODG00000049021 ENSMODG00000049990 ENSMODG00000014370 ENSMODG00000014379 ENSMODG00000010130 ENSMODG00000037297 UPRT (ENSMODG00000027579) ZDHHC15 (ENSMODG00000003871) ENSMODG00000043274 ENSMODG00000003877 FGF16 (ENSMODG00000003900) ATRX (ENSMODG00000003920) MAGT1 (ENSMODG00000003944) ENSMODG00000003953 #22 ATP7A (ENSMODG00000004010) ENSMODG00000028942 ENSMODG00000004055 ENSMODG00000004077 ENSMODG00000004142 CYSLTR1 (ENSMODG00000004207) ENSMODG00000045736 LPAR4 (ENSMODG00000022866) 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