Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 493 ENSGT00940000159508 ENSGT00940000165407 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.b ##31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 458 ENSGT00940000159508 ENSGT00940000165407 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.b ##31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003443 ENSGT00940000166088 ENSGT00940000159852 ENSGT00940000159918.b ENSGT00940000160365 ENSGT00390000005388 ENSGT00940000157164 ENSGT00390000015016 ENSGT00940000153377.A ENSGT00940000158990 ENSGT00940000154318.A ENSGT00940000159508 ENSGT00940000165407 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 Amniota ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000163296 ENSGT00940000163139 #18 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00390000007427 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00940000177916 ENSGT00390000001536 #14 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000163296 ENSGT00940000163139 #18 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00390000007427 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000004044 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158803 ENSGT00590000083189 #7 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ENSGT00940000155961 #36 Glires ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158803 ENSGT00590000083189 #7 ENSGT00940000154961 #8 ENSGT00390000015299.a.b.b.a #9 ENSGT00390000011401 #10 ENSGT00940000156154 #12 ENSGT00390000004044 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.a.a ##16 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00940000163139 #18 ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00940000162503 #23 ENSGT00940000162997 #24 ENSGT00950000183213.a.a.a #25 ENSGT00390000012258 #26 ENSGT00940000155858 #27 ENSGT00390000000159 #28 ENSGT00940000162001 #29 ENSGT00710000106871 #30 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00960000190763 ENSGT00390000014153 #32 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000158803 ENSGT00590000083189 #7 ENSGT00940000154961 #8 ENSGT00390000015299.a.b.b.a #9 ENSGT00390000011401 #10 ENSGT00940000156154 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MODERN SPECIES 1840 Dennd11 (ENSNGAG00000011955) #7 Agk (ENSNGAG00000007692) #8 ENSNGAG00000021460 #9 Mrps33 (ENSNGAG00000014172) #10 ENSNGAG00000011360 Braf (ENSNGAG00000014000) #12 Ndufb2 (ENSNGAG00000016898) Adck2 (ENSNGAG00000010919) #14 Dennd2a (ENSNGAG00000016156) #15 Mkrn1 (ENSNGAG00000019077) ##16 Rab19 (ENSNGAG00000017844) #17 ENSNGAG00000007888 Kdm7a (ENSNGAG00000010381) #19 Parp12 (ENSNGAG00000015925) #20 Tbxas1 (ENSNGAG00000016895) #21 Hipk2 (ENSNGAG00000010345) #22 Clec2l (ENSNGAG00000004829) #23 Klrg2 (ENSNGAG00000016229) #24 Luc7l2 (ENSNGAG00000015693) #25 Fmc1 (ENSNGAG00000006841) #26 Ubn2 (ENSNGAG00000019334) #27 Ttc26 (ENSNGAG00000011531) #28 Zc3hav1 (ENSNGAG00000016695) #29 Zc3hav1l (ENSNGAG00000001243) #30 D630045J12Rik (ENSNGAG00000014130) #31 Tmem213 (ENSNGAG00000010544) #32 Atp6v0a4 (ENSNGAG00000008702) #33 Svopl (ENSNGAG00000016317) #34 Trim24 (ENSNGAG00000013084) #35 Akr1d1 (ENSNGAG00000013625) #36 Creb3l2 (ENSNGAG00000001317) #37 Lesser Egyptian jerboa MODERN 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Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 217 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00940000163296 ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00940000162503 #23 ENSGT00390000003316.d.w.b ENSGT00940000162997 #24 ENSGT00950000183213.a.a.a #25 ENSGT00940000155858 #27 ENSGT00390000000159 #28 ENSGT00940000162001 #29 ENSGT00710000106871 #30 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00390000014153 #32 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000154156.d.n.b.a.a.a ENSGT01060000249459 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3061 RAB19 (ENSRROG00000035786) #17 SLC37A3 (ENSRROG00000041046) KDM7A (ENSRROG00000030856) #19 PARP12 (ENSRROG00000036363) #20 TBXAS1 (ENSRROG00000039262) #21 HIPK2 (ENSRROG00000029536) #22 CLEC2L (ENSRROG00000033915) #23 ENSRROG00000032831 KLRG2 (ENSRROG00000003075) #24 LUC7L2 (ENSRROG00000044820) #25 UBN2 (ENSRROG00000023896) #27 TTC26 (ENSRROG00000031325) #28 ZC3HAV1 (ENSRROG00000042287) 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ENSGT00590000083189 #7 ENSGT00940000154961 #8 ENSGT00390000015299.a.b.b.a #9 ENSGT00390000011401 #10 ENSGT00940000156154 #12 ENSGT00390000004044 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b #16 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00940000163296 ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00940000162503 #23 ENSGT00950000183213.a.a.a #25 ENSGT00390000012258 #26 ENSGT00940000155858 #27 ENSGT00390000000159 #28 ENSGT00940000162001 #29 ENSGT00710000106871 #30 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00390000014153 #32 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000157659 #37 ENSGT00940000158094 Hyrax MODERN SPECIES 4199 HIPK2 (ENSPCAG00000013294) #22 Elephant MODERN SPECIES 578 WEE2 (ENSLAFG00000011523) DENND11 (ENSLAFG00000011516) #7 AGK (ENSLAFG00000002479) #8 ENSLAFG00000026888 #9 MRPS33 (ENSLAFG00000002433) #10 BRAF 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ENSGT00390000004984 ENSGT00390000006088 ENSGT00390000010777 ENSGT00390000014084 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000006747 ENSGT00390000000062 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00940000158254 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000163296 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00390000007427 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000004044 ENSGT00940000156154 #12 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182885.B ENSGT00950000182885.C.b ENSGT00940000159081 ENSGT00390000004984 ENSGT00390000006088 ENSGT00390000010777 ENSGT00390000014084 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000006747 ENSGT00390000000062 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00940000158254 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000163296 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00390000007427 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000004044 ENSGT00940000156154 #12 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000182885.B ENSGT00950000182885.C.b ENSGT00940000159081 ENSGT00390000004984 ENSGT00390000006088 ENSGT00390000010777 ENSGT00390000014084 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000006747 ENSGT00390000000062 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00940000158254 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000163296 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00390000007427 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000004044 ENSGT00940000156154 #12 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000182885.B ENSGT00950000182885.C.b ENSGT00940000159081 ENSGT00390000004984 ENSGT00390000006088 ENSGT00390000010777 ENSGT00390000014084 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000006747 ENSGT00390000000062 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00940000158254 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000163296 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00390000007427 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000012348 ENSGT00390000004044 Pink-footed goose MODERN SPECIES 24 WASHC3 (ENSABRG00000007874) DRAM1 (ENSABRG00000007867) GNPTAB (ENSABRG00000007785) ENSABRG00000007770 CHPT1 (ENSABRG00000007749) MYBPC1 (ENSABRG00000006470) SPIC (ENSABRG00000006376) PARP12 (ENSABRG00000006361) #20 TBXAS1 (ENSABRG00000006299) #21 HIPK2 (ENSABRG00000006197) #22 KIAA1549 (ENSABRG00000006155) #31 ATP6V0A4 (ENSABRG00000005595) #33 SVOPL (ENSABRG00000005492) #34 TRIM24 (ENSABRG00000005474) #35 AKR1D1 (ENSABRG00000005459) #36 ENSABRG00000005418 KDM7A (ENSABRG00000005332) #19 SLC37A3 (ENSABRG00000005274) RAB19 (ENSABRG00000005252) #17 ENSABRG00000005237 #16 DENND2A (ENSABRG00000004815) #15 ADCK2 (ENSABRG00000004766) #14 NDUFB2 (ENSABRG00000004762) BRAF (ENSABRG00000003775) #12 MRPS33 (ENSABRG00000003738) #10 Duck MODERN SPECIES PAH (ENSAPLG00000011061) ENSAPLG00000010733 IGF1 (ENSAPLG00000010676) PMCH (ENSAPLG00000010619) PARPBP (ENSAPLG00000010548) NUP37 (ENSAPLG00000013225) WASHC3 (ENSAPLG00000018769) DRAM1 (ENSAPLG00000016221) GNPTAB (ENSAPLG00000016228) ENSAPLG00000001471 CHPT1 (ENSAPLG00000001976) MYBPC1 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ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000163139 #18 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00390000007427 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000004044 ENSGT00940000156154 #12 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156566 ENSGT00940000162483 ENSGT00950000182885.B ENSGT00950000182885.C.b ENSGT00940000159081 ENSGT00390000010777 ENSGT00390000014084 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000006747 ENSGT00390000000062 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00940000158254 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903.c #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000163139 #18 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00390000007427 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000004044 ENSGT00940000156154 #12 Chicken MODERN SPECIES PAH (ENSGALG00010010222) ENSGALG00010010248 IGF1 (ENSGALG00010010259) PARPBP (ENSGALG00010011316) PMCH (ENSGALG00010011331) NUP37 (ENSGALG00010011361) WASHC3 (ENSGALG00010011425) DRAM1 (ENSGALG00010011431) GNPTAB (ENSGALG00010011453) ENSGALG00010011457 CHPT1 (ENSGALG00010011484) MYBPC1 (ENSGALG00010011558) SPIC (ENSGALG00010011308) PARP12 (ENSGALG00010013063) #20 TBXAS1 (ENSGALG00010013152) #21 HIPK2 (ENSGALG00010013175) #22 KIAA1549 (ENSGALG00010013209) #31 ATP6V0A4 (ENSGALG00010013224) #33 SVOPL (ENSGALG00010013237) #34 TRIM24 (ENSGALG00010013244) #35 AKR1D1 (ENSGALG00010013290) #36 ENSGALG00010013309 KDM7A (ENSGALG00010013316) #19 SLC37A3 (ENSGALG00010013328) #18 RAB19 (ENSGALG00010013337) #17 MKRN4P (ENSGALG00010013348) #16 ENSGALG00010013362 DENND2A (ENSGALG00010013381) #15 ADCK2 (ENSGALG00010013393) #14 ENSGALG00010013404 NDUFB2 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ENSGT00940000155504 ENSGT00390000013709.b Zebra finch MODERN SPECIES 11 PAH (ENSTGUG00000011254) ENSTGUG00000011270 IGF1 (ENSTGUG00000028086) PMCH (ENSTGUG00000011291) PARPBP (ENSTGUG00000011294) NUP37 (ENSTGUG00000011296) WASHC3 (ENSTGUG00000027168) DRAM1 (ENSTGUG00000011306) GNPTAB (ENSTGUG00000011324) ENSTGUG00000011340 CHPT1 (ENSTGUG00000011346) MYBPC1 (ENSTGUG00000011307) SPIC (ENSTGUG00000011352) PARP12 (ENSTGUG00000011354) #20 TBXAS1 (ENSTGUG00000011367) #21 HIPK2 (ENSTGUG00000011378) #22 KIAA1549 (ENSTGUG00000011403) #31 ATP6V0A4 (ENSTGUG00000011411) #33 SVOPL (ENSTGUG00000011429) #34 TMTC1 (ENSTGUG00000011441) IPO8 (ENSTGUG00000011446) CAPRIN2 (ENSTGUG00000011456) SINHCAF (ENSTGUG00000023818) DENND5B (ENSTGUG00000011468) ENSTGUG00000011478 AMN1 (ENSTGUG00000011480) ENSTGUG00000019341 BICD1 (ENSTGUG00000011484) FGD4 (ENSTGUG00000011490) DNM1L (ENSTGUG00000011505) YARS2 (ENSTGUG00000029195) Common canary MODERN SPECIES 26 PAH (ENSSCAG00000010292) ENSSCAG00000010278 IGF1 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ENSGT00940000177916 ENSGT00390000001536 #14 Laterata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000182885.B ENSGT00950000182885.C.b ENSGT00940000159081 ENSGT00390000004984 ENSGT00390000006088 ENSGT00390000010777 ENSGT00390000014084 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000006747 ENSGT00390000000062 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00940000158254 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a #31 ENSGT00950000182881.a.a.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000165307.c ENSGT00940000158039 #19 ENSGT00940000165554 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000004044 ENSGT00940000156154 #12 Common wall lizard MODERN SPECIES 1 ASCL1 (ENSPMRG00000010946) ENSPMRG00000010949 IGF1 (ENSPMRG00000010957) PMCH (ENSPMRG00000010963) PARPBP (ENSPMRG00000010971) NUP37 (ENSPMRG00000010984) WASHC3 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ENSLLTG00000008050 #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182885.B ENSGT00950000182885.C.b ENSGT00940000159081 ENSGT00390000004984 ENSGT00390000006088 ENSGT00390000010777 ENSGT00390000014084 ENSGT01030000234578.B.a ENSGT00390000006747 ENSGT00390000000062 ENSGT00950000183117.a.a ENSGT00940000158254 ENSGT00940000155067.a ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742 #22 ENSGT00530000063472.b.b.a.a.c #31 ENSGT00950000182881.a.a.a.r.a #33 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000155961 #36 ENSGT00940000165307.d ENSGT00940000165307.c ENSGT00940000158039.c #19 ENSGT00940000165554 ENSGT00940000156717 #17 ENSGT00950000183077.a.a #16 ENSGT00950000182931.B.a.a #15 ENSGT00940000177916 ENSGT00390000001536 #14 ENSGT00390000004044 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 6 ENSNSUG00000013528 IGF1 (ENSNSUG00000013529) PMCH (ENSNSUG00000013530) ENSNSUG00000013531 NUP37 (ENSNSUG00000013532) WASHC3 (ENSNSUG00000013533) DRAM1 (ENSNSUG00000013534) 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Clown anemonefish DUPLICATION Clown anemonefish MODERN SPECIES 1605 ENSAOCG00000013937 krr1 (ENSAOCG00000013865) ENSAOCG00000013831 ENSAOCG00000013809 phlda1 (ENSAOCG00000013780) nap1l1 (ENSAOCG00000002705) OSBPL8 (ENSAOCG00000013668) ENSAOCG00000013534 #22 ENSAOCG00000013509 #22 ENSAOCG00000013489 Clown anemonefish MODERN SPECIES 1605 ENSAOCG00000013937 krr1 (ENSAOCG00000013865) ENSAOCG00000013831 ENSAOCG00000013809 phlda1 (ENSAOCG00000013780) nap1l1 (ENSAOCG00000002705) OSBPL8 (ENSAOCG00000013668) ENSAOCG00000013534 #22 ENSAOCG00000013509 #22 ENSAOCG00000013489 Orange clownfish MODERN SPECIES 13 psmc2 (ENSAPEG00000019951) dnajc2 (ENSAPEG00000019999) pmpcb (ENSAPEG00000020049) phax (ENSAPEG00000020069) kcnc2 (ENSAPEG00000020114) ENSAPEG00000020371 GLIPR1 (ENSAPEG00000020406) krr1 (ENSAPEG00000020418) ENSAPEG00000020456 ENSAPEG00000020462 ENSAPEG00000020474 phlda1 (ENSAPEG00000020497) nap1l1 (ENSAPEG00000020509) OSBPL8 (ENSAPEG00000020552) ENSAPEG00000020637 ENSAPEG00000020841 #22 zdhhc17 (ENSAPEG00000020859) csrp2 (ENSAPEG00000020971) e2f7 (ENSAPEG00000020994) ENSAPEG00000021053 ENSAPEG00000021090 ENSAPEG00000021144 ENSAPEG00000021157 nav3 (ENSAPEG00000021186) ENSAPEG00000021336 ENSAPEG00000021351 ENSAPEG00000021383 si:ch211-214j24.10 (ENSAPEG00000021403) osgep (ENSAPEG00000021415) apex1 (ENSAPEG00000021453) ENSAPEG00000021476 Spiny chromis MODERN SPECIES 1376 gas2l3 (ENSAPOG00000006912) ENSAPOG00000006899 #22 TM7SF3 (ENSAPOG00000006849) fgfr1op2 (ENSAPOG00000006839) med21 (ENSAPOG00000006813) stk38l (ENSAPOG00000001084) BMAL2 (ENSAPOG00000006715) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1238 ENSSPAG00000019331 ENSSPAG00000019347 EIF2AK4 (ENSSPAG00000019379) ENSSPAG00000019514 #22 ENSSPAG00000019627 arhgap11a (ENSSPAG00000019640) GREM1 (ENSSPAG00000019661) ENSSPAG00000019666 ENSSPAG00000019683 ENSSPAG00000019718 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 376 ENSGT00940000176916.a.b ENSGT00940000157742.a #22 Midas cichlid DUPLICATION Midas cichlid MODERN SPECIES 194 josd1 (ENSACIG00000021386) mrtfab (ENSACIG00000021331) ENSACIG00000021313 desi1b (ENSACIG00000021296) xrcc6 (ENSACIG00000021277) get4 (ENSACIG00000021253) vps35l (ENSACIG00000021198) zdhhc16b (ENSACIG00000021174) mms19 (ENSACIG00000021123) ubtd1b (ENSACIG00000021104) ENSACIG00000021047 rbp3 (ENSACIG00000021020) RBP3 (ENSACIG00000021015) gdf2 (ENSACIG00000021008) gdf10b (ENSACIG00000020952) ENSACIG00000020917 #22 ENSACIG00000020902 ENSACIG00000020893 FRMPD2 (ENSACIG00000020853) mapk8b (ENSACIG00000020826) ARHGAP22 (ENSACIG00000020811) LRRC18 (ENSACIG00000020798) VSTM4 (ENSACIG00000020780) ENSACIG00000020776 ENSACIG00000020747 sox9a (ENSACIG00000020721) ENSACIG00000020715 ENSACIG00000020712 RNPS1 (ENSACIG00000020701) cox19 (ENSACIG00000020671) ENSACIG00000020651 Midas cichlid MODERN SPECIES 1256 ENSACIG00000019155 ENSACIG00000019149 ENSACIG00000018663 KLHL25 (ENSACIG00000018615) ANO1 (ENSACIG00000018582) bcar1 (ENSACIG00000018562) cfdp1 (ENSACIG00000018553) CHST1 (ENSACIG00000018539) ENSACIG00000017830 ENSACIG00000017766 ripor1 (ENSACIG00000017608) ctcf (ENSACIG00000017577) carmil2 (ENSACIG00000017518) ENSACIG00000017507 #22 ric8a (ENSACIG00000017482) ppp6r3 (ENSACIG00000017446) si:ch73-130a3.4 (ENSACIG00000017428) tmem170a (ENSACIG00000017419) ENSACIG00000017412 lrp5 (ENSACIG00000017339) CCND1 (ENSACIG00000017197) PRR5L (ENSACIG00000017175) commd9 (ENSACIG00000017148) zgc:114188 (ENSACIG00000017108) cart3 (ENSACIG00000017102) ENSACIG00000017086 ENSACIG00000017061 ENSACIG00000017020 Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 439 ENSGT00940000176916.a.b ENSGT00940000157742.a.e.a #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 436 ENSGT00940000176916.a.b ENSGT00940000157742.a.e.a #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.a #22 Haplochromini_A DUPLICATION Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.a.a #22 Haplochromini_B DUPLICATION Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.a.a.a #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1091 pcnp (ENSMZEG00005005901) stk16 (ENSMZEG00005005886) mnx2b (ENSMZEG00005005877) atic (ENSMZEG00005005847) fn1b (ENSMZEG00005005743) psmd14 (ENSMZEG00005005683) RBMS1 (ENSMZEG00005005661) ENSMZEG00005005647 ITGB6 (ENSMZEG00005005630) PLA2R1 (ENSMZEG00005005605) LY75 (ENSMZEG00005005515) ENSMZEG00005005449 ENSMZEG00005005412 ENSMZEG00005005386 wdsub1 (ENSMZEG00005005345) ENSMZEG00005005114 #22 ENSMZEG00005004985 gtf2f2a (ENSMZEG00005004903) gpalpp1 (ENSMZEG00005004885) ercc3 (ENSMZEG00005004854) cyp27c1 (ENSMZEG00005004827) RBM26 (ENSMZEG00005004751) ENSMZEG00005004702 pou4f1 (ENSMZEG00005004676) PCDH9 (ENSMZEG00005004655) ENSMZEG00005004605 ENSMZEG00005004591 PCDH20 (ENSMZEG00005004582) tdrd3 (ENSMZEG00005004551) diaph3 (ENSMZEG00005003495) ENSMZEG00005003447 Eastern happy MODERN SPECIES stk16 (ENSACLG00000021059) mnx2b (ENSACLG00000021083) atic (ENSACLG00000021113) fn1b (ENSACLG00000021227) psmd14 (ENSACLG00000021453) RBMS1 (ENSACLG00000021512) ITGB6 (ENSACLG00000021596) PLA2R1 (ENSACLG00000021697) LY75 (ENSACLG00000021794) marchf7 (ENSACLG00000022077) ENSACLG00000022093 ENSACLG00000022132 ENSACLG00000022183 wdsub1 (ENSACLG00000022190) ENSACLG00000022217 ENSACLG00000022286 #22 gtf2f2a (ENSACLG00000022401) ENSACLG00000022461 gpalpp1 (ENSACLG00000022470) ercc3 (ENSACLG00000022508) cyp27c1 (ENSACLG00000022556) RBM26 (ENSACLG00000022597) ENSACLG00000022733 pou4f1 (ENSACLG00000022751) ENSACLG00000022824 PCDH9 (ENSACLG00000022872) ENSACLG00000022894 ENSACLG00000022918 PCDH20 (ENSACLG00000022951) tdrd3 (ENSACLG00000022962) diaph3 (ENSACLG00000023006) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.a.a.b #22 Eastern happy MODERN SPECIES 16 polr3h (ENSACLG00000014650) CSDC2 (ENSACLG00000014697) PMM1 (ENSACLG00000014718) ENSACLG00000014751 ENSACLG00000014802 ENSACLG00000014890 ENSACLG00000015406 plbd1a (ENSACLG00000015422) plbd1a (ENSACLG00000015459) pick1 (ENSACLG00000015506) ENSACLG00000015526 ENSACLG00000015536 ENSACLG00000015549 ENSACLG00000015557 ENSACLG00000015584 ENSACLG00000015602 #22 ENSACLG00000015628 ENSACLG00000015655 ENSACLG00000015749 CSNK1E (ENSACLG00000015792) TMEM184B (ENSACLG00000015828) DDX17 (ENSACLG00000015882) GGA1 (ENSACLG00000015957) ENSACLG00000016082 ENSACLG00000016102 polr2f (ENSACLG00000016129) sox10 (ENSACLG00000016156) ENSACLG00000016199 kdelr3 (ENSACLG00000016207) ENSACLG00000016235 ENSACLG00000016285 P. nyererei MODERN SPECIES 376 MAST1 (ENSPNYG00000000851) ATG4D (ENSPNYG00000000837) smarca4a (ENSPNYG00000000717) ldlra (ENSPNYG00000000697) kri1 (ENSPNYG00000000553) spc24 (ENSPNYG00000000511) s1pr5a (ENSPNYG00000000501) foxd7 (ENSPNYG00000000490) si:dkeyp-69e1.8 (ENSPNYG00000000483) hmgxb4a (ENSPNYG00000000445) ankrd54 (ENSPNYG00000000428) foxred2 (ENSPNYG00000000407) ENSPNYG00000000401 hmox1a (ENSPNYG00000000397) ENSPNYG00000000388 ENSPNYG00000000385 #22 gcat (ENSPNYG00000021324) ENSPNYG00000021311 zgc:171844 (ENSPNYG00000021295) mfsd6l (ENSPNYG00000021280) ENSPNYG00000021262 PIK3R5 (ENSPNYG00000021225) ntn1b (ENSPNYG00000021195) USP43 (ENSPNYG00000021150) MCHR1 (ENSPNYG00000021129) grb2b (ENSPNYG00000021107) ENSPNYG00000021063 ENSPNYG00000021044 kpna2 (ENSPNYG00000021019) smurf2 (ENSPNYG00000020944) ddx5 (ENSPNYG00000020909) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.a.b #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.a.b #22 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 604 ENSMZEG00005026182 ENSMZEG00005026183 #22 ENSMZEG00005026187 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1097 klhl26 (ENSMZEG00005016993) CRTC1 (ENSMZEG00005016977) comp (ENSMZEG00005016957) tmem38a (ENSMZEG00005016951) smim7 (ENSMZEG00005016944) MED26 (ENSMZEG00005016936) slc35e1 (ENSMZEG00005016929) ENSMZEG00005016905 ENSMZEG00005016892 ENSMZEG00005016875 pex11g (ENSMZEG00005016873) APBA3 (ENSMZEG00005016866) ABCA7 (ENSMZEG00005016854) r3hdm4 (ENSMZEG00005016849) ENSMZEG00005016845 ENSMZEG00005016842 #22 ENSMZEG00005016835 ENSMZEG00005016832 ENSMZEG00005016831 ENSMZEG00005016821 ENSMZEG00005016799 ndufs7 (ENSMZEG00005016790) gamt (ENSMZEG00005016774) dazap1 (ENSMZEG00005016739) dpp9 (ENSMZEG00005016729) kank3 (ENSMZEG00005016722) PIK3R2 (ENSMZEG00005016715) ENSMZEG00005016600 ENSMZEG00005016516 mpv17l2 (ENSMZEG00005016485) RAB3A (ENSMZEG00005016480) Pseudocrenilabrinae DUPLICATION Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.a #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.a #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.a #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.a #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.a #22 Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna DUPLICATION Zebra mbuna MODERN SPECIES 521 ENSMZEG00005025528 #22 ENSMZEG00005025530 Zebra mbuna MODERN SPECIES 621 ENSMZEG00005010082 #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 162 ENSMZEG00005013893 ENSMZEG00005013898 ENSMZEG00005013904 ENSMZEG00005013909 #22 ENSMZEG00005013926 Nile tilapia MODERN SPECIES 14 ENSONIG00000030631 aamp (ENSONIG00000000959) HDAC4 (ENSONIG00000000966) PRPS1L1 (ENSONIG00000000991) TCEANC (ENSONIG00000020944) rab9a (ENSONIG00000020945) gpm6ba (ENSONIG00000000993) ENSONIG00000006630 ENSONIG00000041359 ENSONIG00000035365 ENSONIG00000027592 ENSONIG00000037761 ENSONIG00000036782 ENSONIG00000001006 gemin8 (ENSONIG00000001003) ENSONIG00000037392 #22 ENSONIG00000037987 ENSONIG00000042034 ENSONIG00000035867 ENSONIG00000015306 ENSONIG00000028752 GPR180 (ENSONIG00000015303) ENSONIG00000015300 ENSONIG00000015293 SLC5A3 (ENSONIG00000035996) ENSONIG00000036064 ENSONIG00000015288 ENSONIG00000030818 ENSONIG00000033357 ENSONIG00000015285 ENSONIG00000029903 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.b #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.b #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.b #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.b #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.e.b.b #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1095 ENSMZEG00005018253 ENSMZEG00005018240 ENSMZEG00005018235 ENSMZEG00005018229 RIMS1 (ENSMZEG00005018210) asrgl1 (ENSMZEG00005018203) OGFRL1 (ENSMZEG00005018195) b3gat2 (ENSMZEG00005018189) smap1 (ENSMZEG00005018180) slc1a4 (ENSMZEG00005018175) sertad2b (ENSMZEG00005018172) inaa (ENSMZEG00005018170) pcgf6 (ENSMZEG00005018168) ENSMZEG00005018165 XPO1 (ENSMZEG00005018158) ENSMZEG00005018155 #22 SANBR (ENSMZEG00005018150) pex13 (ENSMZEG00005018148) rel (ENSMZEG00005018144) papolg (ENSMZEG00005018140) haao (ENSMZEG00005018135) ENSMZEG00005018133 OXER1 (ENSMZEG00005018131) zfp36l2 (ENSMZEG00005018129) ENSMZEG00005018122 PLEKHH2 (ENSMZEG00005018115) epcam (ENSMZEG00005018110) epcam (ENSMZEG00005018107) ENSMZEG00005018104 calm2a (ENSMZEG00005018099) si:ch211-93n23.7 (ENSMZEG00005018098) Eastern happy MODERN SPECIES 4 ENSACLG00000014086 ENSACLG00000014137 RIMS1 (ENSACLG00000014225) asrgl1 (ENSACLG00000014731) ENSACLG00000014736 OGFRL1 (ENSACLG00000014776) b3gat2 (ENSACLG00000014794) smap1 (ENSACLG00000014878) slc1a4 (ENSACLG00000014962) sertad2b (ENSACLG00000015019) inaa (ENSACLG00000015027) pcgf6 (ENSACLG00000015043) ENSACLG00000015079 XPO1 (ENSACLG00000015192) SANBR (ENSACLG00000015345) ENSACLG00000015401 #22 pex13 (ENSACLG00000015531) rel (ENSACLG00000015545) papolg (ENSACLG00000015592) haao (ENSACLG00000015648) ENSACLG00000015704 ENSACLG00000015716 OXER1 (ENSACLG00000015728) zfp36l2 (ENSACLG00000015842) ENSACLG00000015898 PLEKHH2 (ENSACLG00000016220) epcam (ENSACLG00000016376) ENSACLG00000016402 epcam (ENSACLG00000016452) ENSACLG00000016464 ENSACLG00000016501 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.f #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.f #22 Haplochromini DUPLICATION Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.f.a #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.f.a #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.f.a #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1093 rnf19a (ENSMZEG00005025419) pabpc1a (ENSMZEG00005025416) ENSMZEG00005025415 ZNF706 (ENSMZEG00005025414) ENSMZEG00005025413 ncalda (ENSMZEG00005025412) id4 (ENSMZEG00005025411) cep76 (ENSMZEG00005025408) ptpn2a (ENSMZEG00005025406) seh1l (ENSMZEG00005025403) ENSMZEG00005025401 ldlrad4b (ENSMZEG00005025398) fam210ab (ENSMZEG00005025397) mc5rb (ENSMZEG00005025396) mc2r (ENSMZEG00005025395) ENSMZEG00005025394 #22 ENSMZEG00005025392 ENSMZEG00005025391 zdhhc3a (ENSMZEG00005025390) tmem42a (ENSMZEG00005025388) zgc:77056 (ENSMZEG00005025387) stt3b (ENSMZEG00005025382) GADL1 (ENSMZEG00005025381) ENSMZEG00005025379 ENSMZEG00005025375 TGFBR2 (ENSMZEG00005025371) enpp2 (ENSMZEG00005025368) ENSMZEG00005025367 ENSMZEG00005025363 ENSMZEG00005025361 NOD1 (ENSMZEG00005025357) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 267 ENSHBUG00000014791 #22 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.f.b #22 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.f.b #22 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.f.b #22 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1093 preb (ENSMZEG00005025152) ENSMZEG00005025154 ENSMZEG00005025155 ADCY3 (ENSMZEG00005025158) WDR26 (ENSMZEG00005025165) CNIH4 (ENSMZEG00005025169) kpna5 (ENSMZEG00005025170) rwdd1 (ENSMZEG00005025171) rrp15 (ENSMZEG00005025172) ENSMZEG00005025174 ENSMZEG00005025176 GRIK2 (ENSMZEG00005025179) ENSMZEG00005025183 ENSMZEG00005025186 enpp2 (ENSMZEG00005025192) ENSMZEG00005025205 #22 taf2 (ENSMZEG00005025215) aldh2.2 (ENSMZEG00005025227) rbm42 (ENSMZEG00005025234) ppox (ENSMZEG00005025237) dyrk1b (ENSMZEG00005025241) fbl (ENSMZEG00005025246) sacm1lb (ENSMZEG00005025248) SLC6A20 (ENSMZEG00005025253) ggctb (ENSMZEG00005025256) gpd1l (ENSMZEG00005025259) TCAIM (ENSMZEG00005025260) calhm5.1 (ENSMZEG00005025261) calhm6 (ENSMZEG00005025263) cnot10 (ENSMZEG00005025264) bves (ENSMZEG00005025266) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 980 ENSNBRG00000009360 #22 Atherinomorphae DUPLICATION Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.g #22 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.g #22 Oryzias_a DUPLICATION Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000155558 ENSGT00390000005923 ENSGT00940000154443.f ENSGT00940000157742.a.g.a #22 ENSGT00940000160782 ENSGT00940000155600.a.b ENSGT01060000248589.C.g.a ENSGT00940000166446 ENSGT00940000166292 ENSGT00530000063528.B ENSGT00940000154517.mb ENSGT00940000165507 ENSGT00940000156472.d ENSGT00940000157043 ENSGT00390000013151.a.a.b ENSGT00940000160639.b.b ENSGT01100000263489.a.a.b.b.f.b.e ENSGT01050000244823.d.b.b.a.a.a.b.a.b.b.a.k.d.b ENSGT01050000244823.d.b.b.a.a.a.b.a.b.b.a.k.d.a Chinese medaka MODERN SPECIES 1133 dnajc10 (ENSOSIG00000011888) nup35 (ENSOSIG00000011865) ddx3xa (ENSOSIG00000011022) ENSOSIG00000011021 #22 nyx (ENSOSIG00000011020) gpr34b (ENSOSIG00000010994) ENSOSIG00000010947 ENSOSIG00000010942 ENSOSIG00000010941 ENSOSIG00000010939 efhc2 (ENSOSIG00000010938) fundc1 (ENSOSIG00000010937) frzb (ENSOSIG00000010935) ENSOSIG00000010933 sh3bp4 (ENSOSIG00000010932) arl4cb (ENSOSIG00000010931) ENSOSIG00000010930 ENSOSIG00000010928 ENSOSIG00000010927 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 13 eef1akmt1 (ENSORLG00000013078) xpo4 (ENSORLG00000013136) lats2 (ENSORLG00000013186) ska3 (ENSORLG00000013197) DGKH (ENSORLG00000013255) vwa8 (ENSORLG00000013350) rgcc (ENSORLG00000013360) f5 (ENSORLG00000013399) slc35a5 (ENSORLG00000013434) ccdc80 (ENSORLG00000013452) ENSORLG00000013473 ENSORLG00000027619 dnajc10 (ENSORLG00000013572) nup35 (ENSORLG00000013588) ddx3xa (ENSORLG00000013621) ENSORLG00000023599 #22 nyx (ENSORLG00000013634) CASK (ENSORLG00000013662) gpr34b (ENSORLG00000013677) mao (ENSORLG00000013721) ENSORLG00000028882 efhc2 (ENSORLG00000013742) fundc1 (ENSORLG00000013751) frzb (ENSORLG00000013782) dusp19a (ENSORLG00000013789) ENSORLG00000026705 ENSORLG00000013825 sh3bp4 (ENSORLG00000013830) arl4cb (ENSORLG00000013843) ENSORLG00000013863 ENSORLG00000013850 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.g.b #22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 10 ENSORLG00000029384 ENSORLG00000007037 mybpc2b (ENSORLG00000007015) ENSORLG00000023038 ENSORLG00000006976 ENSORLG00000030276 ENSORLG00000027192 PPFIA3 (ENSORLG00000006970) ENSORLG00000027052 ENSORLG00000030122 kcnc3b (ENSORLG00000006919) REXO4 (ENSORLG00000006904) pigp (ENSORLG00000006889) ENSORLG00000027501 ENSORLG00000006880 ENSORLG00000028436 #22 ENSORLG00000029435 zgc:56095 (ENSORLG00000025196) syt5b (ENSORLG00000006860) dnaaf3 (ENSORLG00000006843) TNNT1 (ENSORLG00000006832) ENSORLG00000006807 ENSORLG00000006753 ENSORLG00000026683 irf3 (ENSORLG00000006703) ENSORLG00000006692 am5 (ENSORLG00000027886) trpm4b.2 (ENSORLG00000006658) ENSORLG00000029954 ENSORLG00000006612 ca15b (ENSORLG00000006603) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.g #22 Indian medaka MODERN SPECIES 23 krt8 (ENSOMEG00000013377) krt18a.1 (ENSOMEG00000013343) krt18a.2 (ENSOMEG00000013289) ENSOMEG00000013256 tmem106c (ENSOMEG00000013187) ENSOMEG00000013155 sars1 (ENSOMEG00000013121) ENSOMEG00000013104 fam50a (ENSOMEG00000013066) ENSOMEG00000013030 ARHGAP4 (ENSOMEG00000013006) zgc:103759 (ENSOMEG00000012912) ENSOMEG00000012889 gss (ENSOMEG00000012881) pim1 (ENSOMEG00000012860) ENSOMEG00000012819 #22 ENSOMEG00000000325 ENSOMEG00000012681 ENSOMEG00000012648 ENSOMEG00000012635 USP19 (ENSOMEG00000012597) ENSOMEG00000000316 lamb2 (ENSOMEG00000012499) ENSOMEG00000012451 ENSOMEG00000012293 ENSOMEG00000012276 TNNC2 (ENSOMEG00000000307) tnnc2.2 (ENSOMEG00000012226) ENSOMEG00000012200 cox4i2 (ENSOMEG00000012194) bcl2l1 (ENSOMEG00000012180) Atherinomorphae DUPLICATION Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a #22 Oryzias DUPLICATION Oryzias DUPLICATION Oryzias DUPLICATION Oryzias DUPLICATION Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.a.a #22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.a.a #22 Indian medaka DUPLICATION Indian medaka DUPLICATION Indian medaka DUPLICATION Indian medaka MODERN SPECIES 11 ENSOMEG00000004991 ENSOMEG00000004947 #22 ENSOMEG00000004718 ENSOMEG00000004708 ENSOMEG00000004694 brd3b (ENSOMEG00000004686) ENSOMEG00000004655 QSOX2 (ENSOMEG00000004633) ENSOMEG00000004610 ENSOMEG00000004600 ENSOMEG00000004570 ENSOMEG00000004556 ENSOMEG00000004550 #22 ENSOMEG00000004542 CEL (ENSOMEG00000004525) ENSOMEG00000004507 GRIN1 (ENSOMEG00000004485) ENSOMEG00000004415 lhx2b (ENSOMEG00000004399) ENSOMEG00000004385 ADGRD2 (ENSOMEG00000004377) nr5a1a (ENSOMEG00000004343) ENSOMEG00000004335 nr6a1a (ENSOMEG00000004316) olfml2a (ENSOMEG00000004267) ENSOMEG00000004253 rpl35 (ENSOMEG00000004245) golga1 (ENSOMEG00000004228) Indian medaka MODERN SPECIES 11 GRIN1 (ENSOMEG00000004485) ENSOMEG00000004507 CEL (ENSOMEG00000004525) ENSOMEG00000004542 ENSOMEG00000004550 #22 ENSOMEG00000004556 ENSOMEG00000004570 ENSOMEG00000004600 ENSOMEG00000004610 QSOX2 (ENSOMEG00000004633) ENSOMEG00000004655 brd3b (ENSOMEG00000004686) ENSOMEG00000004694 ENSOMEG00000004708 ENSOMEG00000004718 ENSOMEG00000004947 #22 ENSOMEG00000004991 Indian medaka MODERN SPECIES 11 ENSOMEG00000019271 arvcfb (ENSOMEG00000019562) TXNRD2 (ENSOMEG00000019734) gnb1l (ENSOMEG00000019769) tbx1 (ENSOMEG00000019809) ENSOMEG00000019830 sema4c (ENSOMEG00000019914) ENSOMEG00000019955 kat6a (ENSOMEG00000019969) ap3m2 (ENSOMEG00000020004) tet3 (ENSOMEG00000020122) kcnk5a (ENSOMEG00000020170) ENSOMEG00000020185 NPFFR1 (ENSOMEG00000020203) hk2 (ENSOMEG00000020282) ENSOMEG00000020305 #22 ENSOMEG00000020314 figla (ENSOMEG00000020352) add2 (ENSOMEG00000020441) snrnp27 (ENSOMEG00000020477) ENSOMEG00000020545 zgc:65851 (ENSOMEG00000020571) cds2 (ENSOMEG00000020600) arhgap25 (ENSOMEG00000020639) bmp10 (ENSOMEG00000020667) ENSOMEG00000020684 ERLIN2 (ENSOMEG00000020793) znf703 (ENSOMEG00000020827) TIA1 (ENSOMEG00000020931) tmem175 (ENSOMEG00000020978) ENSOMEG00000021032 Indian medaka MODERN SPECIES 22 ENSOMEG00000019658 ENSOMEG00000019629 ENSOMEG00000019426 coq8aa (ENSOMEG00000019391) ENSOMEG00000019335 stum (ENSOMEG00000019326) ENSOMEG00000000508 ENSOMEG00000019302 ENSOMEG00000019287 ehd3 (ENSOMEG00000000506) ENSOMEG00000019253 med23 (ENSOMEG00000019223) ENSOMEG00000019174 ENSOMEG00000019152 ENSOMEG00000019143 ENSOMEG00000019123 #22 ENSOMEG00000019103 nkain2 (ENSOMEG00000019055) rnf217 (ENSOMEG00000019017) tpd52l1 (ENSOMEG00000018972) hddc2 (ENSOMEG00000000492) ENSOMEG00000018833 ENSOMEG00000018816 rnf146 (ENSOMEG00000018805) SOGA3 (ENSOMEG00000018798) ENSOMEG00000018791 SNX9 (ENSOMEG00000018748) zgc:194202 (ENSOMEG00000018662) ENSOMEG00000018637 ENSOMEG00000000479 ENSOMEG00000018613 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.a.a #22 Chinese medaka MODERN SPECIES 103 ACAP3 (ENSOSIG00000016143) TUBA4B (ENSOSIG00000016069) agmat (ENSOSIG00000016066) pink1 (ENSOSIG00000016064) ENSOSIG00000016061 ENSOSIG00000016060 fam43b (ENSOSIG00000016058) ENSOSIG00000016057 mul1b (ENSOSIG00000016056) VWA5B1 (ENSOSIG00000016055) ENSOSIG00000016054 ints11 (ENSOSIG00000016051) cptp (ENSOSIG00000016047) ENSOSIG00000016046 ddx19a (ENSOSIG00000016045) ENSOSIG00000016041 #22 tmem269 (ENSOSIG00000015972) ENSOSIG00000015971 RSBN1 (ENSOSIG00000015963) ptpn22 (ENSOSIG00000015962) ENSOSIG00000015961 ENSOSIG00000015960 PLXNA2 (ENSOSIG00000011786) Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.a.b #22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.a.b #22 Indian medaka MODERN SPECIES 27 ENSOMEG00000001709 ENSOMEG00000001703 macroh2a2 (ENSOMEG00000001698) GBF1 (ENSOMEG00000001687) GBF1 (ENSOMEG00000001669) pitx3 (ENSOMEG00000001662) hspa12a (ENSOMEG00000001644) eno4 (ENSOMEG00000001627) shtn1 (ENSOMEG00000001619) atp6v1ba (ENSOMEG00000001604) vax1 (ENSOMEG00000001595) ciao2b (ENSOMEG00000001588) ENSOMEG00000001578 ENSOMEG00000001574 ENSOMEG00000001567 ENSOMEG00000001557 #22 ENSOMEG00000001550 ENSOMEG00000001546 ENSOMEG00000001542 TMEM41A (ENSOMEG00000001535) GPR155 (ENSOMEG00000001524) mtx2 (ENSOMEG00000001512) ENSOMEG00000001507 ENSOMEG00000001501 ENSOMEG00000001496 chrna1 (ENSOMEG00000001489) cdh11 (ENSOMEG00000001478) ENSOMEG00000001464 MCM8 (ENSOMEG00000001455) CRLS1 (ENSOMEG00000001438) ENSOMEG00000001434 Javanese ricefish MODERN SPECIES 10 ENSOJAG00000014747 ENSOJAG00000014775 ENSOJAG00000014811 llgl2 (ENSOJAG00000015042) galk1 (ENSOJAG00000015969) PLCD3 (ENSOJAG00000015987) acbd4 (ENSOJAG00000016225) ENSOJAG00000016237 ENSOJAG00000016342 g6pc1a.2 (ENSOJAG00000016454) g6pc1a.1 (ENSOJAG00000016527) psme3 (ENSOJAG00000016537) nbr1a (ENSOJAG00000016764) tmem106a (ENSOJAG00000016860) arl4d (ENSOJAG00000016870) ENSOJAG00000016892 #22 ENSOJAG00000016983 ENSOJAG00000016988 SOST (ENSOJAG00000017000) ENSOJAG00000017003 meox1 (ENSOJAG00000017008) etv4 (ENSOJAG00000017017) DHX8 (ENSOJAG00000017063) ENSOJAG00000017812 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.b #22 Oryzias_a DUPLICATION Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000166515 ENSGT00390000011769 ENSGT00940000157179 ENSGT00940000158485 ENSGT00390000018094 ENSGT00920000149145 ENSGT00390000005711 ENSGT00940000155236 ENSGT00940000153269.b.b ENSGT01030000234527.A.a.a.a ENSGT00940000153634.b.a ENSGT00940000166924 ENSGT00940000158416.q.a ENSGT00940000154686.b ENSGT00390000000781.a ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.b.a #22 ENSGT00940000162435 ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.k ENSGT00390000003465.b.b.b ENSGT01090000260040.b.b.a.c.b ENSGT00940000160311.a.a ENSGT00940000158703.t ENSGT00940000154697.a.a.a.a ENSGT00530000063692.a ENSGT00500000044936 ENSGT00940000154684 ENSGT00940000160530 ENSGT00940000160344 ENSGT00940000159321 ENSGT00390000017478 Japanese Medaka HdrR DUPLICATION Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 7 CTHRC1 (ENSORLG00000002330) slc25a32b (ENSORLG00000002345) dcaf13 (ENSORLG00000002363) RIMS2 (ENSORLG00000002417) 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(ENSORLG00000002520) ENSORLG00000002497 ENSORLG00000023098 #22 ENSORLG00000023839 ADCY3 (ENSORLG00000002488) ENSORLG00000026922 dpys (ENSORLG00000002467) DCSTAMP (ENSORLG00000002427) RIMS2 (ENSORLG00000002417) dcaf13 (ENSORLG00000002363) slc25a32b (ENSORLG00000002345) CTHRC1 (ENSORLG00000002330) fzd6 (ENSORLG00000002321) klhl32 (ENSORLG00000002313) mms22l (ENSORLG00000002254) ENSORLG00000002233 pou3f2b (ENSORLG00000028857) ENSORLG00000022593 Chinese medaka MODERN SPECIES 116 zufsp (ENSOSIG00000017334) gprc6a (ENSOSIG00000017331) ptpn2a (ENSOSIG00000017329) cep76 (ENSOSIG00000017076) ENSOSIG00000016838 #22 id4 (ENSOSIG00000016815) ncalda (ENSOSIG00000016792) ENSOSIG00000016784 ZNF706 (ENSOSIG00000016777) ENSOSIG00000016773 pabpc1a (ENSOSIG00000013218) ENSOSIG00000013182 FBXO43 (ENSOSIG00000013181) VPS13B (ENSOSIG00000013176) osr2 (ENSOSIG00000013173) KCNS2 (ENSOSIG00000013171) NIPAL2 (ENSOSIG00000013169) POP1 (ENSOSIG00000013167) rida (ENSOSIG00000013165) MATN2 (ENSOSIG00000013123) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.b.b #22 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 7 ENSORLG00000026866 ENSORLG00000026783 ENSORLG00000029989 ENSORLG00000024409 ENSORLG00000028583 ENSORLG00000025713 ENSORLG00000023311 ENSORLG00000026390 ENSORLG00000029927 ENSORLG00000028039 zgc:91890 (ENSORLG00000020715) ENSORLG00000020716 SALL3 (ENSORLG00000020718) ENSORLG00000025065 ENSORLG00000024127 ENSORLG00000025678 #22 ENSORLG00000020724 GALR1 (ENSORLG00000022653) mbpb (ENSORLG00000020727) ENSORLG00000030561 ENSORLG00000029270 ZNF516 (ENSORLG00000020731) TSHZ1 (ENSORLG00000020732) PTGR3 (ENSORLG00000023224) ENSORLG00000020738 has2 (ENSORLG00000024353) ENSORLG00000026963 zhx2a (ENSORLG00000020740) derl1 (ENSORLG00000020742) ENSORLG00000006293 ENSORLG00000020746 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.a.a.b #22 Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 13 ENSOJAG00000007534 RANBP2 (ENSOJAG00000007583) tpt1 (ENSOJAG00000008002) gtf2f2b (ENSOJAG00000008025) kctd4 (ENSOJAG00000008058) tsc22d1 (ENSOJAG00000008069) SERP2 (ENSOJAG00000008099) fzd7b (ENSOJAG00000008598) ENSOJAG00000008649 ENSOJAG00000008697 ENSOJAG00000008733 ENSOJAG00000008741 ENSOJAG00000008749 LACC1 (ENSOJAG00000008762) ENSOJAG00000009152 ENSOJAG00000009191 #22 ENSOJAG00000009288 ENSOJAG00000009297 ENSOJAG00000009312 si:dkey-69o16.5 (ENSOJAG00000009325) itgav (ENSOJAG00000009577) med4 (ENSOJAG00000012533) SUCLA2 (ENSOJAG00000012571) ENSOJAG00000012808 HTR2A (ENSOJAG00000012816) esd (ENSOJAG00000012843) ENSOJAG00000012858 RUBCNL (ENSOJAG00000012921) ENSOJAG00000012941 ENSOJAG00000012986 ENSOJAG00000013000 Javanese ricefish MODERN SPECIES 21 ENSOJAG00000014667 dffb (ENSOJAG00000014732) ENSOJAG00000014759 b3gnt7l (ENSOJAG00000014785) CEP104 (ENSOJAG00000014809) plekhm2 (ENSOJAG00000014983) ENSOJAG00000015239 ARHGEF19 (ENSOJAG00000015303) ENSOJAG00000015856 ENSOJAG00000015867 #22 ubiad1 (ENSOJAG00000015887) MMP23B 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ENSORLG00000003693 tnni4a (ENSORLG00000030419) Chinese medaka MODERN SPECIES 3770 ENSOSIG00000003715 #22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.b.a.a #22 Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 5 ENSOJAG00000014855 ENSOJAG00000014589 slc43a2b (ENSOJAG00000014507) ENSOJAG00000014495 INPP5K (ENSOJAG00000014468) slc25a1a (ENSOJAG00000014364) ENSOJAG00000014355 ENSOJAG00000014297 ENSOJAG00000014288 smfn (ENSOJAG00000014278) ENSOJAG00000014260 akt2l (ENSOJAG00000014170) ENSOJAG00000014143 CBLB (ENSOJAG00000014021) ENSOJAG00000013903 ENSOJAG00000013888 #22 ddx52 (ENSOJAG00000013479) ENSOJAG00000013363 dynll2b (ENSOJAG00000013356) ENSOJAG00000013332 pigs (ENSOJAG00000013322) aldocb (ENSOJAG00000013186) ENSOJAG00000013068 cct8 (ENSOJAG00000012880) ENSOJAG00000012859 ENSOJAG00000012848 ENSOJAG00000012845 ENSOJAG00000012821 ENSOJAG00000012787 HLCS (ENSOJAG00000012777) ENSOJAG00000012738 Javanese ricefish MODERN SPECIES 104 ENSOJAG00000008991 #22 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.b.a.b #22 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.h.a.b.a.b #22 Javanese ricefish DUPLICATION Javanese ricefish MODERN SPECIES 14 ENSOJAG00000021328 #22 supt7l (ENSOJAG00000021342) SLC4A1AP (ENSOJAG00000021346) ENSOJAG00000021380 mrpl33 (ENSOJAG00000021385) RBKS (ENSOJAG00000021388) babam2 (ENSOJAG00000021399) fosl2 (ENSOJAG00000021445) wdr35 (ENSOJAG00000021462) ENSOJAG00000021500 noto (ENSOJAG00000021544) emx1 (ENSOJAG00000021548) ENSOJAG00000021552 ENSOJAG00000021564 ENSOJAG00000021569 pank2 (ENSOJAG00000021580) Javanese ricefish MODERN SPECIES 14 mrpl33 (ENSOJAG00000021385) RBKS (ENSOJAG00000021388) babam2 (ENSOJAG00000021399) fosl2 (ENSOJAG00000021445) wdr35 (ENSOJAG00000021462) ENSOJAG00000021500 noto (ENSOJAG00000021544) emx1 (ENSOJAG00000021548) ENSOJAG00000021552 ENSOJAG00000021564 ENSOJAG00000021569 pank2 (ENSOJAG00000021580) loxl3b (ENSOJAG00000021607) mrps26 (ENSOJAG00000021636) ENSOJAG00000021643 ENSOJAG00000021656 #22 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ENSORLG00000027875 ENSORLG00000014128 ENSORLG00000023095 ENSORLG00000028037 ENSORLG00000029929 ENSORLG00000028925 ENSORLG00000025646 ENSORLG00000023891 abca1a (ENSORLG00000014109) ENSORLG00000029467 ENSORLG00000025862 SGCZ (ENSORLG00000026418) tusc3 (ENSORLG00000014026) ENSORLG00000024360 #22 ENSORLG00000027091 #22 ENSORLG00000025357 #22 tppp2 (ENSORLG00000025593) ENSORLG00000013971 ENSORLG00000013962 ENSORLG00000030220 ENSORLG00000013949 ENSORLG00000028654 ENSORLG00000028976 ENSORLG00000026083 psmd12 (ENSORLG00000013934) helz (ENSORLG00000013894) cacng1a (ENSORLG00000013870) CACNG4 (ENSORLG00000021830) cacng5a (ENSORLG00000013856) PRKCA (ENSORLG00000013842) Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES ENSORLG00000027875 ENSORLG00000014128 ENSORLG00000023095 ENSORLG00000028037 ENSORLG00000029929 ENSORLG00000028925 ENSORLG00000025646 ENSORLG00000023891 abca1a (ENSORLG00000014109) ENSORLG00000029467 ENSORLG00000025862 SGCZ (ENSORLG00000026418) tusc3 (ENSORLG00000014026) ENSORLG00000024360 #22 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(ENSSAUG00010015406) aire (ENSSAUG00010015405) rab6bb (ENSSAUG00010015367) KIF1A (ENSSAUG00010008275) agxtb (ENSSAUG00010008185) thap4 (ENSSAUG00010008179) bokb (ENSSAUG00010008177) elovl1a (ENSSAUG00010008176) cdc20 (ENSSAUG00010008175) ENSSAUG00010008174 #22 ppp1r7 (ENSSAUG00010008173) ubxn7 (ENSSAUG00010008169) Tf (ENSSAUG00010008015) eif4g1a (ENSSAUG00010003320) fam131aa (ENSSAUG00010003213) zp2l2 (ENSSAUG00010002837) CLCN2 (ENSSAUG00010027262) ENSSAUG00010027259 ENSSAUG00010027202 per2 (ENSSAUG00010027189) hes6 (ENSSAUG00010027187) itm2cb (ENSSAUG00010027186) GPR55 (ENSSAUG00010027185) gigyf2 (ENSSAUG00010027184) kncn (ENSSAUG00010027180) Gilthead seabream MODERN SPECIES 18 psmb1 (ENSSAUG00010004197) phf10 (ENSSAUG00010004242) ENSSAUG00010004550 rab4a (ENSSAUG00010004587) ccsapb (ENSSAUG00010004619) ABCB10 (ENSSAUG00010004640) urb2 (ENSSAUG00010006071) galnt2 (ENSSAUG00010006101) smyd2a (ENSSAUG00010008014) ENSSAUG00010008050 KCNK2 (ENSSAUG00010008052) ENSSAUG00010008055 ENSSAUG00010008057 ENSSAUG00010008060 ENSSAUG00010008062 ENSSAUG00010008065 #22 CTSB (ENSSAUG00010008071) ENSSAUG00010008161 ENSSAUG00010008162 itsn2b (ENSSAUG00010008172) gcfc2 (ENSSAUG00010008198) sccpdha.1 (ENSSAUG00010008206) tfb2m (ENSSAUG00010008225) ENSSAUG00010008228 SMYD3 (ENSSAUG00010008233) KIF26B (ENSSAUG00010008259) ENSSAUG00010008262 ENSSAUG00010008269 ENSSAUG00010008294 KRTCAP3 (ENSSAUG00010008299) NRBP1 (ENSSAUG00010008317) Gilthead seabream DUPLICATION Gilthead seabream MODERN SPECIES 23 gja3 (ENSSAUG00010006014) ZMYM2 (ENSSAUG00010006018) mphosph8 (ENSSAUG00010006024) ENSSAUG00010006096 ENSSAUG00010006514 ENSSAUG00010006524 ENSSAUG00010006541 ENSSAUG00010006712 ENSSAUG00010010047 ENSSAUG00010010048 ENSSAUG00010010054 ENSSAUG00010010059 IL-1RII (ENSSAUG00010010063) ENSSAUG00010010134 LONRF2 (ENSSAUG00010014559) ENSSAUG00010014561 #22 ENSSAUG00010014564 PDCL3 (ENSSAUG00010014568) TBC1D8 (ENSSAUG00010014571) NEB (ENSSAUG00010014596) arl5a (ENSSAUG00010014726) CACNB4 (ENSSAUG00010014802) stam2 (ENSSAUG00010018342) hacd2 (ENSSAUG00010019006) adcy5 (ENSSAUG00010019016) sec22a (ENSSAUG00010019528) pdia5 (ENSSAUG00010019555) SEMA5B (ENSSAUG00010020834) slc49a4 (ENSSAUG00010021301) hspbap1 (ENSSAUG00010021304) slc15a2 (ENSSAUG00010021311) Gilthead seabream MODERN SPECIES 22 MGAT4C (ENSSAUG00010002576) borcs5 (ENSSAUG00010002580) ENSSAUG00010002594 cpa4 (ENSSAUG00010002666) ENSSAUG00010002950 KIF21A (ENSSAUG00010003249) slc2a13b (ENSSAUG00010006537) lrrk2 (ENSSAUG00010006560) SLC6A15 (ENSSAUG00010006786) ENSSAUG00010006792 alx1 (ENSSAUG00010006795) RASSF9 (ENSSAUG00010006799) NTS (ENSSAUG00010006801) MGAT4C (ENSSAUG00010006804) ENSSAUG00010006808 ENSSAUG00010006816 #22 fen1 (ENSSAUG00010006834) ENSSAUG00010006838 tm9sf1 (ENSSAUG00010006844) ENSSAUG00010006851 ENSSAUG00010006852 eif4g2b (ENSSAUG00010006867) ENSSAUG00010007336 zgc:103499 (ENSSAUG00010007339) cep290 (ENSSAUG00010007356) TMTC3 (ENSSAUG00010007374) kitlga (ENSSAUG00010007389) ENSSAUG00010007397 ENSSAUG00010007416 dusp6 (ENSSAUG00010008668) ENSSAUG00010008671 Gilthead seabream MODERN SPECIES 14 ARHGAP18 (ENSSAUG00010023895) sel1l (ENSSAUG00010023902) ENSSAUG00010024503 ccn2a (ENSSAUG00010024504) STX7 (ENSSAUG00010024507) ENSSAUG00010024508 dpf3 (ENSSAUG00010024509) wdr21 (ENSSAUG00010024523) ZFYVE1 (ENSSAUG00010024528) pigh (ENSSAUG00010024530) rhov (ENSSAUG00010024531) vps18 (ENSSAUG00010024532) ino80 (ENSSAUG00010024536) chac1 (ENSSAUG00010024636) dll4 (ENSSAUG00010024641) ENSSAUG00010024644 #22 syndig1l (ENSSAUG00010024647) vrtn (ENSSAUG00010024651) slc25a29 (ENSSAUG00010024653) slc25a47a (ENSSAUG00010024655) dio3 (ENSSAUG00010024659) ppp2r5cb (ENSSAUG00010024693) hsp90aa1.2 (ENSSAUG00010025665) WDR20 (ENSSAUG00010025803) mgat2 (ENSSAUG00010025805) ENSSAUG00010025807 MDGA2 (ENSSAUG00010025823) ENSSAUG00010026029 FKBP3 (ENSSAUG00010026030) faua (ENSSAUG00010026031) prpf39 (ENSSAUG00010026033) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Large yellow croaker DUPLICATION Large yellow croaker MODERN SPECIES 482 ENSLCRG00005002455 ENSLCRG00005002466 ENSLCRG00005002479 crnkl1 (ENSLCRG00005002522) naa20 (ENSLCRG00005003557) mfsd4b (ENSLCRG00005003558) REV3L (ENSLCRG00005003560) ENSLCRG00005003564 ENSLCRG00005003565 FYN (ENSLCRG00005003575) ENSLCRG00005003657 tube1 (ENSLCRG00005003661) ccn6 (ENSLCRG00005003662) ENSLCRG00005003676 ENSLCRG00005004175 ENSLCRG00005004180 #22 ENSLCRG00005004182 ENSLCRG00005004185 marcksa (ENSLCRG00005004187) HDAC2 (ENSLCRG00005004219) ENSLCRG00005006339 HS3ST5 (ENSLCRG00005006340) FRK (ENSLCRG00005006342) nt5dc1 (ENSLCRG00005006346) COL10A1 (ENSLCRG00005006363) dse (ENSLCRG00005006365) NDUFAF4 (ENSLCRG00005006369) GPR63 (ENSLCRG00005006370) ufl1 (ENSLCRG00005006384) epha7 (ENSLCRG00005006440) map3k7 (ENSLCRG00005011095) Large yellow croaker MODERN SPECIES 480 mns1 (ENSLCRG00005016737) ENSLCRG00005016734 ENSLCRG00005016731 TCF12 (ENSLCRG00005016681) CGNL1 (ENSLCRG00005016675) MYZAP (ENSLCRG00005016673) polr2m (ENSLCRG00005016672) aldh1a2 (ENSLCRG00005013302) aqp9b (ENSLCRG00005013275) lipca (ENSLCRG00005013272) adam10a (ENSLCRG00005013143) MINDY2 (ENSLCRG00005013131) sltm (ENSLCRG00005013119) rnf111 (ENSLCRG00005013108) MYO1E (ENSLCRG00005009209) ENSLCRG00005009176 #22 mtmr10 (ENSLCRG00005008603) ENSLCRG00005008595 ap1g1 (ENSLCRG00005008468) ENSLCRG00005008451 PHLPP2 (ENSLCRG00005008306) marveld3 (ENSLCRG00005008300) USP10 (ENSLCRG00005007949) CRISPLD2 (ENSLCRG00005007927) ENSLCRG00005007922 zfhx3b (ENSLCRG00005007920) ENSLCRG00005007918 dhx38 (ENSLCRG00005007715) cyb5b (ENSLCRG00005007708) zgc:162592 (ENSLCRG00005007707) ENSLCRG00005007706 Ballan wrasse DUPLICATION Ballan wrasse MODERN SPECIES 127 ENSLBEG00000023803 ENSLBEG00000023780 ENSLBEG00000023768 ENSLBEG00000023758 ENSLBEG00000023694 GFRA1 (ENSLBEG00000023657) ENSLBEG00000023626 si:ch1073-126c3.2 (ENSLBEG00000023604) ENSLBEG00000023596 ENSLBEG00000023584 ENSLBEG00000023564 cbr1 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Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Zig-zag eel MODERN SPECIES 15 ENSMAMG00000023428 ENSMAMG00000023425 ENSMAMG00000023422 ENSMAMG00000023415 ENSMAMG00000023411 ankrd16 (ENSMAMG00000023407) gdi2 (ENSMAMG00000023403) asb13a.1 (ENSMAMG00000023394) net1 (ENSMAMG00000023392) ENSMAMG00000023389 ENSMAMG00000023387 ENSMAMG00000023381 ENSMAMG00000023378 ENSMAMG00000023372 ENSMAMG00000023370 ENSMAMG00000028395 #22 ENSMAMG00000023368 msrb3 (ENSMAMG00000025581) lemd3 (ENSMAMG00000023362) tmbim4 (ENSMAMG00000023359) ENSMAMG00000023355 ENSMAMG00000023354 NFYB (ENSMAMG00000023353) chst11 (ENSMAMG00000023351) SLC41A2 (ENSMAMG00000023340) nopchap1 (ENSMAMG00000023335) ALDH1L2 (ENSMAMG00000023330) samm50l (ENSMAMG00000023327) scube1 (ENSMAMG00000023323) MPPED1 (ENSMAMG00000023321) sult4a1 (ENSMAMG00000023316) Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Tongue sole DUPLICATION Tongue sole MODERN SPECIES 9 fndc5b (ENSCSEG00000011906) ldlrap1a (ENSCSEG00000011890) maco1a (ENSCSEG00000011871) ENSCSEG00000011789 e2f3 (ENSCSEG00000011783) sox4a (ENSCSEG00000011777) nrsn1l (ENSCSEG00000011766) lpcat1 (ENSCSEG00000011757) ENSCSEG00000011751 ndufs6 (ENSCSEG00000011739) irx4b (ENSCSEG00000011716) irx1b (ENSCSEG00000011711) ENSCSEG00000011698 med10 (ENSCSEG00000011689) UBE2QL1 (ENSCSEG00000011665) ENSCSEG00000011513 #22 ENSCSEG00000011494 srd5a1 (ENSCSEG00000011484) TENT4A (ENSCSEG00000011470) med30 (ENSCSEG00000011459) SLC30A8 (ENSCSEG00000011449) ENSCSEG00000011444 rad21b (ENSCSEG00000011414) utp23 (ENSCSEG00000011409) RNF5 (ENSCSEG00000011404) slc44a4 (ENSCSEG00000011388) ehmt2 (ENSCSEG00000011369) zbtb12.2 (ENSCSEG00000011365) nelfe (ENSCSEG00000011352) skic2 (ENSCSEG00000011326) ENSCSEG00000011318 Tongue sole MODERN SPECIES 4 cep76 (ENSCSEG00000013384) id4 (ENSCSEG00000013378) ncalda (ENSCSEG00000013364) grhl2a (ENSCSEG00000013351) ENSCSEG00000013338 pabpc1a (ENSCSEG00000013324) rnf19a (ENSCSEG00000013313) ENSCSEG00000013303 ENSCSEG00000013298 ENSCSEG00000013266 fam210ab (ENSCSEG00000013259) mc5rb (ENSCSEG00000013252) mc2r (ENSCSEG00000013247) zdhhc3a (ENSCSEG00000013228) ENSCSEG00000013214 ENSCSEG00000012987 #22 stt3b (ENSCSEG00000012945) ENSCSEG00000012931 popdc3 (ENSCSEG00000012927) bves (ENSCSEG00000012920) HACE1 (ENSCSEG00000012879) GRIK2 (ENSCSEG00000012858) ASCC3 (ENSCSEG00000012811) sim1a (ENSCSEG00000012800) cyb5r4 (ENSCSEG00000012790) cep162 (ENSCSEG00000012708) si:ch211-198c19.1 (ENSCSEG00000012692) ADGRB1 (ENSCSEG00000012463) ENSCSEG00000012398 ENSCSEG00000012388 cdk14 (ENSCSEG00000012376) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a #22 Seriola DUPLICATION Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157742.a.q #22 Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3287 npr3 (ENSSLDG00000010853) ENSSLDG00000010910 golph3a (ENSSLDG00000010963) ENSSLDG00000010988 isl1a (ENSSLDG00000011001) ccdc125 (ENSSLDG00000011028) rad17 (ENSSLDG00000011082) zgc:86811 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ENSSGRG00000029673 ENSSGRG00000029671 Goldfish MODERN SPECIES 9 CMIP (ENSCARG00000002515) plcg2 (ENSCARG00000002418) meak7 (ENSCARG00000002355) cotl1 (ENSCARG00000002341) klhl36 (ENSCARG00000002326) tat (ENSCARG00000002075) ENSCARG00000002015 ENSCARG00000001998 zgc:112052 (ENSCARG00000001988) UQCRFS1 (ENSCARG00000019476) rxylt1 (ENSCARG00000019461) ENSCARG00000019454 SRGAP1 (ENSCARG00000018400) parp12a (ENSCARG00000018278) #20 tbxas1 (ENSCARG00000016708) #21 hipk2 (ENSCARG00000016609) #22 ENSCARG00000016570 ##31 fam107b (ENSCARG00000016548) nup205 (ENSCARG00000016407) ENSCARG00000014770 BICD1 (ENSCARG00000014690) slc23a4 (ENSCARG00000014613) TMTC2 (ENSCARG00000014555) CRACR2A (ENSCARG00000014484) PRMT8 (ENSCARG00000014373) TSPAN9 (ENSCARG00000014345) tspan33b (ENSCARG00000014335) ENSCARG00000014325 mical3a (ENSCARG00000014225) rbm28 (ENSCARG00000014198) lepa (ENSCARG00000014191) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 371 ENSGT00390000018220.h ENSGT00940000157517.i.b ENSGT00940000157517.i.a.b 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mical3a (ENSSGRG00000035233) rbm28 (ENSSGRG00000035461) lepa (ENSSGRG00000035479) Zebrafish MODERN SPECIES 9 CDH13 (ENSDARG00000014215) CMIP (ENSDARG00000062933) ENSDARG00000092862 meak7 (ENSDARG00000062951) plcg2 (ENSDARG00000068763) cotl1 (ENSDARG00000026829) klhl36 (ENSDARG00000030251) zgc:56622 (ENSDARG00000099728) tat (ENSDARG00000069630) C7H19orf12 (ENSDARG00000058857) GAN (ENSDARG00000100875) rxylt1 (ENSDARG00000063414) SRGAP1 (ENSDARG00000007461) parp12a (ENSDARG00000042496) #20 tbxas1 (ENSDARG00000002249) #21 hipk2 (ENSDARG00000042518) #22 ENSDARG00000063361 ##31 fam107b (ENSDARG00000026865) nup205 (ENSDARG00000042530) fgd4a (ENSDARG00000101471) BICD1 (ENSDARG00000079496) slc23a4 (ENSDARG00000052497) ENSDARG00000093811 TMTC2 (ENSDARG00000035273) CRACR2A (ENSDARG00000068231) PRMT8 (ENSDARG00000040633) TSPAN9 (ENSDARG00000025299) tspan33b (ENSDARG00000042189) ttc38 (ENSDARG00000042188) ENSDARG00000021979 mical3a (ENSDARG00000097017) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 114 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ENSCHAG00000027048 ##31 mical3a (ENSCHAG00000027092) ttc38 (ENSCHAG00000027233) tspan33b (ENSCHAG00000027264) TSPAN9 (ENSCHAG00000027267) PRMT8 (ENSCHAG00000027322) CRACR2A (ENSCHAG00000000728) TMTC2 (ENSCHAG00000000956) ENSCHAG00000001222 slc23a4 (ENSCHAG00000001275) BICD1 (ENSCHAG00000001554) ENSCHAG00000001605 fgd4a (ENSCHAG00000001717) nup205 (ENSCHAG00000003103) agk (ENSCHAG00000011320) #8 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000015442 ENSGT00940000153972.C ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00940000164603 ENSGT00440000033504.B.a 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Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160652 ENSGT00940000166578 ENSGT00550000074924 ENSGT00940000156978 ENSGT00940000155581.B ENSGT00390000003374 ENSGT00940000158707.a.b ENSGT00520000055637.A.b ENSGT00940000154158 ENSGT00390000005224 ENSGT00940000158257.c ENSGT00510000047030.d ENSGT00510000047791 ENSGT00530000063853.a.b.c ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160652 ENSGT00940000166578 ENSGT00550000074924 ENSGT00940000156978 ENSGT00940000155581.B ENSGT00390000003374 ENSGT00940000158707.a.b ENSGT00520000055637.A.b ENSGT00940000154158 ENSGT00390000005224 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ENSGT00940000170767 ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Indian medaka MODERN SPECIES 15 trabd (ENSOMEG00000023028) selenoo1 (ENSOMEG00000023016) mapk12a (ENSOMEG00000023005) mtss1la (ENSOMEG00000022970) ENSOMEG00000022921 ENSOMEG00000022907 ENSOMEG00000022882 ENSOMEG00000022873 uri1 (ENSOMEG00000022862) rxylt1 (ENSOMEG00000022836) UQCRFS1 (ENSOMEG00000022814) SRGAP1 (ENSOMEG00000022797) ENSOMEG00000022746 parp12a (ENSOMEG00000022731) #20 tbxas1 (ENSOMEG00000022710) #21 hipk2 (ENSOMEG00000022676) #22 ENSOMEG00000022660 ENSOMEG00000022654 ENSOMEG00000022615 ##31 ENSOMEG00000022588 ENSOMEG00000022574 ENSOMEG00000022553 ENSOMEG00000022545 ttc38 (ENSOMEG00000022534) tspan33b (ENSOMEG00000000884) TSPAN9 (ENSOMEG00000022503) ENSOMEG00000022478 PRMT8 (ENSOMEG00000022455) ENSOMEG00000022427 TMTC2 (ENSOMEG00000022383) ENSOMEG00000022293 Javanese ricefish MODERN SPECIES 20 mlc1 (ENSOJAG00000001891) panx2 (ENSOJAG00000001950) trabd (ENSOJAG00000001969) mtss1la (ENSOJAG00000002645) ENSOJAG00000002848 ENSOJAG00000002928 ENSOJAG00000002940 uri1 (ENSOJAG00000002949) zgc:112052 (ENSOJAG00000002957) UQCRFS1 (ENSOJAG00000002965) rxylt1 (ENSOJAG00000002970) SRGAP1 (ENSOJAG00000003281) ENSOJAG00000006110 parp12a (ENSOJAG00000006130) #20 tbxas1 (ENSOJAG00000006173) #21 hipk2 (ENSOJAG00000006728) #22 mical3a (ENSOJAG00000009133) ttc38 (ENSOJAG00000009690) tspan33b (ENSOJAG00000009957) TSPAN9 (ENSOJAG00000009972) PRMT8 (ENSOJAG00000010088) CRACR2A (ENSOJAG00000011003) TMTC2 (ENSOJAG00000011035) ENSOJAG00000011212 slc23a4 (ENSOJAG00000011280) ENSOJAG00000011957 BICD1 (ENSOJAG00000011962) fgd4a (ENSOJAG00000012177) ENSOJAG00000012940 agk (ENSOJAG00000013549) #8 dennd11 (ENSOJAG00000013724) #7 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00770000121709.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000177757 ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000177757 ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903.k #21 ENSGT00940000157903.l #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000177757 ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903.k #21 ENSGT00940000157903.l.b #21 ENSGT00940000157903.l.a.a #21 ENSGT00940000157903.l.a.b #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000177757 ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903.k #21 ENSGT00940000157903.l.b #21 ENSGT00940000157903.l.a.a #21 ENSGT00940000157903.l.a.b #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000177757 ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903.k #21 ENSGT00940000157903.l.a.a #21 ENSGT00940000157903.l.a.b #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 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ENSGT00940000177757 ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903.k #21 ENSGT00940000157903.l.a.a #21 ENSGT00940000157903.l.a.b #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Eastern happy MODERN SPECIES 19 ENSACLG00000004953 ENSACLG00000004984 ENSACLG00000004992 ENSACLG00000004994 uri1 (ENSACLG00000005007) zgc:112052 (ENSACLG00000005022) UQCRFS1 (ENSACLG00000005027) rxylt1 (ENSACLG00000005033) SRGAP1 (ENSACLG00000005406) ENSACLG00000005480 parp12a (ENSACLG00000005503) #20 tbxas1 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##31 mical3a (ENSAPEG00000002384) ttc38 (ENSAPEG00000002363) tspan33b (ENSAPEG00000002328) TSPAN9 (ENSAPEG00000002300) PRMT8 (ENSAPEG00000002259) CRACR2A (ENSAPEG00000002244) TMTC2 (ENSAPEG00000002184) ENSAPEG00000002137 slc23a4 (ENSAPEG00000002099) BICD1 (ENSAPEG00000002079) fgd4a (ENSAPEG00000002060) ENSAPEG00000002013 nup205 (ENSAPEG00000001900) agk (ENSAPEG00000001877) #8 Spiny chromis MODERN SPECIES 18 ENSAPOG00000024001 MAPK8IP2 (ENSAPOG00000023989) ENSAPOG00000023898 arsa (ENSAPOG00000023874) SHANK3 (ENSAPOG00000000807) rabl2 (ENSAPOG00000023708) odf3b (ENSAPOG00000023699) zgc:77752 (ENSAPOG00000023688) ARF5 (ENSAPOG00000000667) UQCRFS1 (ENSAPOG00000023644) rxylt1 (ENSAPOG00000023629) SRGAP1 (ENSAPOG00000023609) ccdc113 (ENSAPOG00000023529) parp12a (ENSAPOG00000023485) #20 tbxas1 (ENSAPOG00000023465) #21 hipk2 (ENSAPOG00000023416) #22 ENSAPOG00000023297 ##31 ENSAPOG00000023216 ENSAPOG00000023188 ENSAPOG00000023176 CARMIL1 (ENSAPOG00000023149) SCGN (ENSAPOG00000023098) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1010 parp12a (ENSSPAG00000020097) #20 ENSSPAG00000020113 ENSSPAG00000020122 tbxas1 (ENSSPAG00000020167) #21 hipk2 (ENSSPAG00000020527) #22 ENSSPAG00000020596 ##31 mical3a (ENSSPAG00000020781) ttc38 (ENSSPAG00000020853) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00770000121709.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00940000164603 ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 ENSGT00590000083189.c #7 Zig-zag eel MODERN SPECIES 20 trabd (ENSMAMG00000002162) selenoo1 (ENSMAMG00000002133) mapk12a (ENSMAMG00000002080) mtss1la (ENSMAMG00000001995) ENSMAMG00000001982 ENSMAMG00000001971 ENSMAMG00000026253 uri1 (ENSMAMG00000001930) zgc:112052 (ENSMAMG00000001918) ENSMAMG00000001906 rxylt1 (ENSMAMG00000001897) ENSMAMG00000001821 ENSMAMG00000001797 parp12a (ENSMAMG00000001755) #20 tbxas1 (ENSMAMG00000001669) #21 hipk2 (ENSMAMG00000001570) #22 ENSMAMG00000001533 ##31 mical3a (ENSMAMG00000001453) ttc38 (ENSMAMG00000001422) tspan33b (ENSMAMG00000001409) ENSMAMG00000001372 ENSMAMG00000001327 ENSMAMG00000001270 ENSMAMG00000001220 ENSMAMG00000025974 slc23a4 (ENSMAMG00000001156) ENSMAMG00000001119 fgd4a (ENSMAMG00000001069) nup205 (ENSMAMG00000000939) agk (ENSMAMG00000000631) #8 dennd11 (ENSMAMG00000000601) #7 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 ENSGT00590000083189.c #7 ENSGT00940000158803 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 17 trabd (ENSBSLG00000013867) selenoo1 (ENSBSLG00000013882) mapk12a (ENSBSLG00000013965) mtss1la (ENSBSLG00000015248) ENSBSLG00000016706 ENSBSLG00000017059 ENSBSLG00000017081 uri1 (ENSBSLG00000017104) zgc:112052 (ENSBSLG00000017136) ENSBSLG00000017154 rxylt1 (ENSBSLG00000017166) SRGAP1 (ENSBSLG00000017254) ENSBSLG00000018430 parp12a (ENSBSLG00000018452) #20 tbxas1 (ENSBSLG00000018507) #21 hipk2 (ENSBSLG00000018661) #22 ENSBSLG00000019352 ##31 mical3a (ENSBSLG00000019372) ttc38 (ENSBSLG00000020054) tspan33b (ENSBSLG00000020409) TSPAN9 (ENSBSLG00000020416) PRMT8 (ENSBSLG00000020432) CRACR2A (ENSBSLG00000020616) ENSBSLG00000020663 TMTC2 (ENSBSLG00000021080) slc23a4 (ENSBSLG00000021314) BICD1 (ENSBSLG00000021725) fgd4a (ENSBSLG00000021817) nup205 (ENSBSLG00000022094) agk (ENSBSLG00000022254) #8 dennd11 (ENSBSLG00000022481) #7 Climbing perch MODERN SPECIES 19 trabd (ENSATEG00000018262) selenoo1 (ENSATEG00000018247) mapk12a (ENSATEG00000018208) mtss1la (ENSATEG00000018176) ENSATEG00000030181 ENSATEG00000018154 ENSATEG00000018139 uri1 (ENSATEG00000018125) zgc:112052 (ENSATEG00000018112) ENSATEG00000018103 rxylt1 (ENSATEG00000018096) ENSATEG00000018036 ENSATEG00000018023 parp12a (ENSATEG00000017986) #20 tbxas1 (ENSATEG00000017935) #21 hipk2 (ENSATEG00000017882) #22 ENSATEG00000017857 ##31 mical3a (ENSATEG00000017606) ttc38 (ENSATEG00000017553) tspan33b (ENSATEG00000017524) ENSATEG00000017474 ENSATEG00000017435 ENSATEG00000017411 ENSATEG00000017360 slc23a4 (ENSATEG00000017330) ENSATEG00000027305 fgd4a (ENSATEG00000017242) nup205 (ENSATEG00000017093) agk (ENSATEG00000017053) #8 dennd11 (ENSATEG00000017022) #7 wee2 (ENSATEG00000016971) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a 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#20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Turbot MODERN SPECIES 1 PANX (ENSSMAG00000010213) trabd (ENSSMAG00000010224) selenoo1 (ENSSMAG00000010268) mapk12a (ENSSMAG00000010338) mtss1la (ENSSMAG00000010358) ENSSMAG00000010554 ENSSMAG00000010572 uri1 (ENSSMAG00000010594) zgc:112052 (ENSSMAG00000010602) ENSSMAG00000010608 rxylt1 (ENSSMAG00000010617) ENSSMAG00000010623 ENSSMAG00000010688 parp12a (ENSSMAG00000010702) #20 tbxas1 (ENSSMAG00000010721) #21 hipk2 (ENSSMAG00000010740) #22 ENSSMAG00000010804 ##31 mical3a (ENSSMAG00000010863) ttc38 (ENSSMAG00000011103) tspan33b (ENSSMAG00000011134) ENSSMAG00000011149 ENSSMAG00000011186 ENSSMAG00000011200 ENSSMAG00000011220 ENSSMAG00000022353 slc23a4 (ENSSMAG00000011261) ENSSMAG00000023761 ENSSMAG00000011291 fgd4a (ENSSMAG00000011326) nup205 (ENSSMAG00000011396) agk (ENSSMAG00000011507) #8 Tongue sole MODERN SPECIES 16 selenoo1 (ENSCSEG00000009527) mapk12a (ENSCSEG00000009503) mtss1la (ENSCSEG00000009429) ENSCSEG00000009386 ENSCSEG00000009372 ENSCSEG00000009361 uri1 (ENSCSEG00000009324) UQCRFS1 (ENSCSEG00000009313) zgc:112052 (ENSCSEG00000009305) rxylt1 (ENSCSEG00000009296) SRGAP1 (ENSCSEG00000009265) ENSCSEG00000009245 parp12a (ENSCSEG00000009223) #20 tbxas1 (ENSCSEG00000009189) #21 ENSCSEG00000009180 hipk2 (ENSCSEG00000009141) #22 ENSCSEG00000009086 ##31 mical3a (ENSCSEG00000009042) ENSCSEG00000009030 ENSCSEG00000009012 kcnj11 (ENSCSEG00000009004) mob2a (ENSCSEG00000008980) dusp8a (ENSCSEG00000008955) PTPN5 (ENSCSEG00000008920) ENSCSEG00000008893 OSBPL5 (ENSCSEG00000008867) ENSCSEG00000008861 phlda2 (ENSCSEG00000008851) nap1l4a (ENSCSEG00000008814) th (ENSCSEG00000008767) igf2 (ENSCSEG00000008746) Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526.n ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 ENSGT00590000083189.c #7 Barramundi perch MODERN SPECIES 373 tbxas1 (ENSLCAG00010014318) #21 hipk2 (ENSLCAG00010014354) #22 ENSLCAG00010014508 ##31 mical3a (ENSLCAG00010014586) ttc38 (ENSLCAG00010014681) tspan33b (ENSLCAG00010014729) TSPAN9 (ENSLCAG00010014749) Seriola ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526.n ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 Greater amberjack MODERN SPECIES 82 selenoo1 (ENSSDUG00000020498) mapk12a (ENSSDUG00000020510) mtss1la (ENSSDUG00000020575) ENSSDUG00000020633 ENSSDUG00000020692 ENSSDUG00000020697 uri1 (ENSSDUG00000020706) zgc:112052 (ENSSDUG00000000077) UQCRFS1 (ENSSDUG00000000124) rxylt1 (ENSSDUG00000000144) ENSSDUG00000000154 SRGAP1 (ENSSDUG00000000168) ENSSDUG00000000289 parp12a (ENSSDUG00000000297) #20 tbxas1 (ENSSDUG00000000314) #21 hipk2 (ENSSDUG00000000364) #22 ENSSDUG00000000431 ##31 mical3a (ENSSDUG00000000490) ttc38 (ENSSDUG00000000724) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2945 panx2 (ENSSLDG00000010427) trabd (ENSSLDG00000010402) selenoo1 (ENSSLDG00000010376) mapk12a (ENSSLDG00000010324) mtss1la (ENSSLDG00000010218) ENSSLDG00000010170 ENSSLDG00000010155 ENSSLDG00000010139 uri1 (ENSSLDG00000010119) zgc:112052 (ENSSLDG00000010101) UQCRFS1 (ENSSLDG00000010090) rxylt1 (ENSSLDG00000010075) SRGAP1 (ENSSLDG00000009963) parp12a (ENSSLDG00000009897) #20 tbxas1 (ENSSLDG00000009881) #21 hipk2 (ENSSLDG00000009830) #22 ENSSLDG00000009781 ##31 mical3a (ENSSLDG00000009684) ttc38 (ENSSLDG00000009637) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00770000121709.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a ENSGT00940000154521.B ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00940000163529 ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00940000164603 ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000157742.b #22 ENSGT00530000063472.b.a ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00940000163529 ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961 #8 Tetraodon MODERN SPECIES 4 zgc:162879 (ENSTNIG00000019239) sema4ba (ENSTNIG00000019240) idh2 (ENSTNIG00000019241) ENSTNIG00000019242 ENSTNIG00000019243 RASGRF1 (ENSTNIG00000019244) ctsh (ENSTNIG00000019245) BLM (ENSTNIG00000019246) FRMD5 (ENSTNIG00000019247) ENSTNIG00000019248 ENSTNIG00000019249 slc28a1 (ENSTNIG00000019250) znf592 (ENSTNIG00000019251) kti12 (ENSTNIG00000019252) si:dkey-24l11.2 (ENSTNIG00000019253) hipk2 (ENSTNIG00000019254) #22 ENSTNIG00000019255 ##31 mical3a (ENSTNIG00000000566) ENSTNIG00000000532 ttc38 (ENSTNIG00000019256) tspan33b (ENSTNIG00000019257) TSPAN9 (ENSTNIG00000019258) ENSTNIG00000006816 ENSTNIG00000008783 ENSTNIG00000008784 CRACR2A (ENSTNIG00000008785) TMTC2 (ENSTNIG00000008786) ENSTNIG00000008787 slc23a4 (ENSTNIG00000008788) BICD1 (ENSTNIG00000008789) fgd4a (ENSTNIG00000008790) Fugu MODERN SPECIES 21 dkk3b (ENSTRUG00000007047) mical2b (ENSTRUG00000006568) parvaa (ENSTRUG00000006255) tead1a (ENSTRUG00000005940) RASSF10 (ENSTRUG00000031601) prmt7 (ENSTRUG00000005405) ciapin1 (ENSTRUG00000005102) coq9 (ENSTRUG00000004954) polr2c (ENSTRUG00000004676) wwp2 (ENSTRUG00000003922) adat1 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ENSGT00940000155580.b.a.a ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b ENSGT00940000155867.a.a ENSGT00940000164603 ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.a.a ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i ENSGT00940000165209 ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a ENSGT00940000155765.s.a ENSGT00390000004003 Ballan wrasse MODERN SPECIES 385 tigara (ENSLBEG00000026688) ENSLBEG00000026699 FGF6 (ENSLBEG00000000089) zgc:77158 (ENSLBEG00000000108) zgc:154077 (ENSLBEG00000000131) E2F5 (ENSLBEG00000000158) ELMO3 (ENSLBEG00000000163) ENSLBEG00000000180 ENSLBEG00000000216 ENSLBEG00000000558 hipk2 (ENSLBEG00000000595) #22 ENSLBEG00000000685 ##31 mical3a (ENSLBEG00000000822) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000005508.a.a ENSGT00940000156189.a.a ENSGT00950000183156.a.a ENSGT00770000121709.a ENSGT00940000164020.d ENSGT00950000183051.b.b ENSGT00940000156397.b ENSGT00390000002362 ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000001014.`b.b ENSGT00390000003526 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#8 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000015442.e ENSGT00940000153972.C.c ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a.f ENSGT00940000156189.a.a.c ENSGT00950000183156.a.a.c ENSGT00940000164020.d.b ENSGT00950000183051.b.b.f ENSGT00940000156397.b.c ENSGT00390000002362.t ENSGT00390000009077.d ENSGT00390000003526.k ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000154649.B.m #20 ENSGT00940000157903.f #21 ENSGT00940000157742.b.c #22 ENSGT00530000063472.b.a.e ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a.h ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b.e ENSGT00940000155867.a.a.f ENSGT00440000033504.B.a.c ENSGT00940000156144.a.a.k ENSGT00950000182953.B.a.i.b ENSGT00940000165209.f.b ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a.c ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.b.a ENSGT00940000155765.s.a.f ENSGT00390000004003.f.a ENSGT00940000154961.q #8 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000015442.e ENSGT00940000153972.C.c ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a.f ENSGT00940000156189.a.a.c 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(ENSOKIG00005030568) SRGAP1 (ENSOKIG00005030869) parp12a (ENSOKIG00005034284) #20 tbxas1 (ENSOKIG00005034310) #21 hipk2 (ENSOKIG00005034403) #22 ENSOKIG00005035524 ENSOKIG00005035531 ##31 mical3a (ENSOKIG00005035663) ttc38 (ENSOKIG00005036292) TSPAN9 (ENSOKIG00005036408) PRMT8 (ENSOKIG00005036565) CRACR2A (ENSOKIG00005037978) TMTC2 (ENSOKIG00005038114) ENSOKIG00005038235 slc23a4 (ENSOKIG00005038264) ENSOKIG00005038300 BICD1 (ENSOKIG00005038308) ENSOKIG00005038324 fgd4a (ENSOKIG00005038349) nup205 (ENSOKIG00005038624) Chinook salmon MODERN SPECIES 30 RASSF8 (ENSOTSG00005016636) bhlhe41 (ENSOTSG00005016637) sspn (ENSOTSG00005016638) ENSOTSG00005016639 mapk12a (ENSOTSG00005016640) mtss1la (ENSOTSG00005016641) ENSOTSG00005017133 ENSOTSG00005017136 ENSOTSG00005017138 uri1 (ENSOTSG00005017140) zgc:112052 (ENSOTSG00005017143) rxylt1 (ENSOTSG00005017146) SRGAP1 (ENSOTSG00005017172) parp12a (ENSOTSG00005029997) #20 tbxas1 (ENSOTSG00005029999) #21 hipk2 (ENSOTSG00005030001) #22 ENSOTSG00005030761 ##31 mical3a (ENSOTSG00005030762) ttc38 (ENSOTSG00005030784) TSPAN9 (ENSOTSG00005030785) PRMT8 (ENSOTSG00005030788) CRACR2A (ENSOTSG00005032636) TMTC2 (ENSOTSG00005032641) slc23a4 (ENSOTSG00005032670) ENSOTSG00005032676 BICD1 (ENSOTSG00005032678) ENSOTSG00005032680 fgd4a (ENSOTSG00005032690) nup205 (ENSOTSG00005032781) agk (ENSOTSG00005042422) #8 dennd11 (ENSOTSG00005042425) #7 Rainbow trout MODERN SPECIES trabd (ENSOMYG00000000670) ENSOMYG00000065487 mapk12a (ENSOMYG00000000785) mtss1la (ENSOMYG00000000985) ENSOMYG00000052823 ENSOMYG00000059148 ENSOMYG00000001088 ENSOMYG00000001092 uri1 (ENSOMYG00000001101) zgc:112052 (ENSOMYG00000001114) rxylt1 (ENSOMYG00000001132) ENSOMYG00000001992 parp12a (ENSOMYG00000002356) #20 ENSOMYG00000059363 tbxas1 (ENSOMYG00000002386) #21 hipk2 (ENSOMYG00000002409) #22 ENSOMYG00000070053 ENSOMYG00000002447 ##31 ENSOMYG00000073497 ENSOMYG00000077380 mical3a (ENSOMYG00000003073) ttc38 (ENSOMYG00000003959) tspan33b (ENSOMYG00000004001) ENSOMYG00000004074 ENSOMYG00000004931 ENSOMYG00000005766 ENSOMYG00000005981 ENSOMYG00000055074 ENSOMYG00000060783 slc23a4 (ENSOMYG00000006127) ENSOMYG00000000384 Salmo ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000156419.a.g ENSGT00390000015442.e ENSGT00940000153972.C.c ENSGT00390000009067 ENSGT00390000005508.a.a.f ENSGT00940000156189.a.a.c ENSGT00950000183156.a.a.c ENSGT00940000164020.d.b ENSGT00950000183051.b.b.f ENSGT00940000156397.b.c ENSGT00390000002362.t ENSGT00390000003526.k ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.e ENSGT00940000154649.B.m #20 ENSGT00940000157903.f #21 ENSGT00940000157742.b.c #22 ENSGT00530000063472.b.a.e ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a.h ENSGT00390000002669 ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.b.e ENSGT00940000155867.a.a.f ENSGT00440000033504.B.a.c ENSGT00940000156144.a.a.k ENSGT00950000182953.B.a.i.b ENSGT00940000165209.f.b ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a.c ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.b.a ENSGT00940000155765.s.a.f ENSGT00390000004003 ENSGT00940000154961.q #8 Atlantic salmon MODERN SPECIES 7 trabd (ENSSSAG00000076990) selenoo1 (ENSSSAG00000109786) ENSSSAG00000105146 mapk12a (ENSSSAG00000076668) mtss1la (ENSSSAG00000076530) ENSSSAG00000076501 ENSSSAG00000076471 ENSSSAG00000111360 ENSSSAG00000076442 uri1 (ENSSSAG00000076436) rxylt1 (ENSSSAG00000076433) ENSSSAG00000076090 PRP12 (ENSSSAG00000076045) #20 thas (ENSSSAG00000075921) #21 ENSSSAG00000050659 hipk2 (ENSSSAG00000075873) #22 ENSSSAG00000096708 ENSSSAG00000075858 ##31 mical3a (ENSSSAG00000075434) ttc38 (ENSSSAG00000075231) tspan33b (ENSSSAG00000075222) ENSSSAG00000075214 ENSSSAG00000119251 ENSSSAG00000074547 ENSSSAG00000074448 ENSSSAG00000074402 ENSSSAG00000074386 slc23a4 (ENSSSAG00000074377) ENSSSAG00000074375 ENSSSAG00000120730 ENSSSAG00000083661 River trout MODERN SPECIES 8 ABTB3 (ENSSTUG00000050371) mlc1 (ENSSTUG00000050413) panx2 (ENSSTUG00000050425) trabd (ENSSTUG00000050432) mapk12a (ENSSTUG00000002270) mtss1la (ENSSTUG00000002460) ENSSTUG00000002765 ENSSTUG00000002772 ENSSTUG00000002789 ENSSTUG00000002808 uri1 (ENSSTUG00000002826) rxylt1 (ENSSTUG00000002852) SRGAP1 (ENSSTUG00000002927) parp12a (ENSSTUG00000003949) #20 tbxas1 (ENSSTUG00000003996) #21 hipk2 (ENSSTUG00000004433) #22 ENSSTUG00000004600 ##31 mical3a (ENSSTUG00000004719) ttc38 (ENSSTUG00000005633) tspan33b (ENSSTUG00000006133) TSPAN9 (ENSSTUG00000006152) PRMT8 (ENSSTUG00000006176) CRACR2A (ENSSTUG00000006381) TMTC2 (ENSSTUG00000006433) ENSSTUG00000006526 slc23a4 (ENSSTUG00000006533) ENSSTUG00000006646 BICD1 (ENSSTUG00000006657) ENSSTUG00000006665 fgd4a (ENSSTUG00000006681) nup205 (ENSSTUG00000006962) Huchen MODERN SPECIES 702 ENSHHUG00000047835 ENSHHUG00000047840 uri1 (ENSHHUG00000047850) zgc:112052 (ENSHHUG00000047856) rxylt1 (ENSHHUG00000047861) SRGAP1 (ENSHHUG00000047898) parp12a (ENSHHUG00000048563) #20 tbxas1 (ENSHHUG00000048574) #21 hipk2 (ENSHHUG00000048644) #22 ENSHHUG00000048766 ##31 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00940000156419.a.h ENSGT00390000015442.f ENSGT00940000153972.C.d ENSGT00390000005508.a.a.e ENSGT00940000156189.a.a.d ENSGT00950000183156.a.a.d ENSGT00940000164020.d.a ENSGT00950000183051.b.b.e ENSGT00940000156397.b.d ENSGT00390000002362.s ENSGT00390000001014.`b.a.h ENSGT00390000003526.l ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f ENSGT00940000154649.B.n #20 ENSGT00940000157903.e #21 ENSGT00940000157742.b.d #22 ENSGT00530000063472.b.a.f ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a.g ENSGT00940000158225.i.b.f ENSGT00940000155867.a.a.e ENSGT00440000033504.B.a.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000156144.a.a.l ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i.a ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a.d ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000155765.s.a.e ENSGT00940000154961.r #8 ENSGT00590000083189.c.c #7 ENSGT00940000158803 Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 6548 ENSHHUG00000004995 hipk2 (ENSHHUG00000004998) #22 Huchen MODERN SPECIES 3680 ENSHHUG00000025380 ENSHHUG00000025402 #22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156419.a.h ENSGT00390000015442.f ENSGT00940000153972.C.d ENSGT00390000005508.a.a.e ENSGT00940000156189.a.a.d ENSGT00950000183156.a.a.d ENSGT00940000164020.d.a ENSGT00950000183051.b.b.e ENSGT00940000156397.b.d ENSGT00390000002362.s ENSGT00390000001014.`b.a.h ENSGT00390000003526.l ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f ENSGT00940000154649.B.n #20 ENSGT00940000157903.e #21 ENSGT00940000157742.b.d #22 ENSGT00530000063472.b.a.f ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a.g ENSGT00940000158225.i.b.f ENSGT00940000155867.a.a.e ENSGT00440000033504.B.a.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000156144.a.a.l ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i.a ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a.d ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000155765.s.a.e ENSGT00940000154961.r #8 ENSGT00590000083189.c.c #7 ENSGT00940000158803 Salmo ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156419.a.h ENSGT00390000015442.f ENSGT00940000153972.C.d ENSGT00390000005508.a.a.e ENSGT00940000156189.a.a.d ENSGT00950000183156.a.a.d ENSGT00940000164020.d.a ENSGT00950000183051.b.b.e ENSGT00940000156397.b.d ENSGT00390000002362.s ENSGT00390000001014.`b.a.h ENSGT00390000003526.l ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f ENSGT00940000154649.B.n #20 ENSGT00940000157903.e #21 ENSGT00940000157742.b.d #22 ENSGT00530000063472.b.a.f ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a.g ENSGT00940000158225.i.b.f ENSGT00940000155867.a.a.e ENSGT00440000033504.B.a.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000156144.a.a.l ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i.a ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a.d ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000155765.s.a.e ENSGT00940000154961.r #8 ENSGT00590000083189.c.c #7 ENSGT00940000158803 Atlantic salmon MODERN SPECIES 1 mlc1 (ENSSSAG00000071981) panx2 (ENSSSAG00000086268) selenoo1 (ENSSSAG00000003932) mapk12a (ENSSSAG00000003974) mtss1la (ENSSSAG00000004185) ENSSSAG00000004764 ENSSSAG00000004842 ENSSSAG00000121469 uri1 (ENSSSAG00000004857) ENSSSAG00000004878 rxylt1 (ENSSSAG00000004890) ENSSSAG00000004979 ENSSSAG00000106367 parp12a (ENSSSAG00000005381) #20 tbxas1 (ENSSSAG00000005440) #21 hipk2 (ENSSSAG00000005908) #22 ENSSSAG00000094798 ENSSSAG00000006893 ##31 ENSSSAG00000006937 ENSSSAG00000007828 ENSSSAG00000007836 ENSSSAG00000089624 ENSSSAG00000098832 ENSSSAG00000008264 ENSSSAG00000008276 ENSSSAG00000008290 ENSSSAG00000082567 fam180a (ENSSSAG00000008407) slc23a4 (ENSSSAG00000008421) ENSSSAG00000008517 ENSSSAG00000108425 River trout MODERN SPECIES 37 ABTB3 (ENSSTUG00000008770) mlc1 (ENSSTUG00000009122) panx2 (ENSSTUG00000009191) selenoo1 (ENSSTUG00000009203) mapk12a (ENSSTUG00000009296) mtss1la (ENSSTUG00000011314) ENSSTUG00000011599 ENSSTUG00000011663 ENSSTUG00000011670 uri1 (ENSSTUG00000011686) uqcrfs1 (ENSSTUG00000011706) rxylt1 (ENSSTUG00000011719) SRGAP1 (ENSSTUG00000012057) parp12a (ENSSTUG00000016632) #20 tbxas1 (ENSSTUG00000016725) #21 hipk2 (ENSSTUG00000017457) #22 ENSSTUG00000018194 ##31 mical3a (ENSSTUG00000018472) TSPAN9 (ENSSTUG00000021093) ENSSTUG00000021104 PRMT8 (ENSSTUG00000021133) CRACR2A (ENSSTUG00000021673) TMTC2 (ENSSTUG00000021776) ENSSTUG00000021841 slc23a4 (ENSSTUG00000021856) ENSSTUG00000021864 ENSSTUG00000021897 fgd4a (ENSSTUG00000021916) agk (ENSSTUG00000023350) #8 dennd11 (ENSSTUG00000023397) #7 wee2 (ENSSTUG00000023523) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155455.h.d ENSGT00940000156419.a.h ENSGT00940000153972.C.d ENSGT00390000005508.a.a.e ENSGT00940000156189.a.a.d ENSGT00950000183156.a.a.d ENSGT00940000164020.d.a ENSGT00950000183051.b.b.e ENSGT00940000156397.b.d ENSGT00390000002362.s ENSGT00390000001014.`b.a.h ENSGT00390000003526.l ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f ENSGT00940000154649.B.n #20 ENSGT00940000157903.e #21 ENSGT00940000157742.b.d #22 ENSGT00530000063472.b.a.f ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a.g ENSGT00940000158225.i.b.f ENSGT00940000155867.a.a.e ENSGT00440000033504.B.a.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000156144.a.a.l ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i.a ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a.d ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000155765.s.a.e ENSGT00390000004003.f.b ENSGT00940000154961.r #8 ENSGT00590000083189.c.c #7 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155455.h.d ENSGT00940000156419.a.h ENSGT00940000153972.C.d ENSGT00390000005508.a.a.e ENSGT00940000156189.a.a.d ENSGT00950000183156.a.a.d ENSGT00940000164020.d.a ENSGT00950000183051.b.b.e ENSGT00940000156397.b.d ENSGT00390000002362.s ENSGT00390000001014.`b.a.h ENSGT00390000003526.l ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.f ENSGT00940000154649.B.n #20 ENSGT00940000157903.e #21 ENSGT00940000157742.b.d #22 ENSGT00530000063472.b.a.f ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a.g ENSGT00940000158225.i.b.f ENSGT00940000155867.a.a.e ENSGT00440000033504.B.a.d ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000156144.a.a.l ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i.a ENSGT00940000154471.a.b.a.b.u.a.d ENSGT01040000240385.A.b.b.a.b.b.b ENSGT00940000155765.s.a.e ENSGT00390000004003.f.b ENSGT00940000154961.r #8 ENSGT00590000083189.c.c #7 Coho salmon MODERN SPECIES 14 panx2 (ENSOKIG00005007333) selenoo1 (ENSOKIG00005007322) mapk12a (ENSOKIG00005007366) mtss1la (ENSOKIG00005007702) ENSOKIG00005007998 ENSOKIG00005008087 ENSOKIG00005008092 ENSOKIG00005008097 uri1 (ENSOKIG00005008110) ENSOKIG00005008120 UQCRFS1 (ENSOKIG00005008126) rxylt1 (ENSOKIG00005008139) SRGAP1 (ENSOKIG00005008355) parp12a (ENSOKIG00005012261) #20 tbxas1 (ENSOKIG00005012320) #21 hipk2 (ENSOKIG00005013298) #22 ENSOKIG00005013936 ENSOKIG00005013947 ##31 mical3a (ENSOKIG00005014137) TSPAN9 (ENSOKIG00005015316) PRMT8 (ENSOKIG00005015388) CRACR2A (ENSOKIG00005016142) ENSOKIG00005016161 TMTC2 (ENSOKIG00005016174) ENSOKIG00005016208 slc23a4 (ENSOKIG00005016213) ENSOKIG00005016219 ENSOKIG00005016237 fgd4a (ENSOKIG00005016257) ENSOKIG00005016403 agk (ENSOKIG00005016422) #8 Chinook salmon MODERN SPECIES 10 ABTB3 (ENSOTSG00005040135) panx2 (ENSOTSG00005040172) selenoo1 (ENSOTSG00005040174) mapk12a (ENSOTSG00005040175) mtss1la (ENSOTSG00005040176) ENSOTSG00005040236 ENSOTSG00005040238 ENSOTSG00005040240 uri1 (ENSOTSG00005040241) ENSOTSG00005040243 uqcrfs1 (ENSOTSG00005040244) ENSOTSG00005040246 SRGAP1 (ENSOTSG00005040267) parp12a (ENSOTSG00005044338) #20 tbxas1 (ENSOTSG00005044349) #21 hipk2 (ENSOTSG00005044416) #22 ENSOTSG00005044446 ##31 mical3a (ENSOTSG00005033017) TSPAN9 (ENSOTSG00005033396) PRMT8 (ENSOTSG00005033402) CRACR2A (ENSOTSG00005034954) ENSOTSG00005034957 TMTC2 (ENSOTSG00005034961) ENSOTSG00005034965 slc23a4 (ENSOTSG00005034968) ENSOTSG00005034972 ENSOTSG00005034975 fgd4a (ENSOTSG00005034981) ENSOTSG00005035051 agk (ENSOTSG00005035054) #8 dennd11 (ENSOTSG00005036669) #7 Rainbow trout MODERN SPECIES 11 cry1b (ENSOMYG00000007326) ENSOMYG00000008112 ENSOMYG00000008627 panx2 (ENSOMYG00000008700) selenoo1 (ENSOMYG00000008723) mapk12a (ENSOMYG00000009070) mtss1la (ENSOMYG00000009663) ENSOMYG00000009746 ENSOMYG00000009782 ENSOMYG00000009812 uri1 (ENSOMYG00000009826) rxylt1 (ENSOMYG00000009856) ENSOMYG00000010832 parp12a (ENSOMYG00000016113) #20 tbxas1 (ENSOMYG00000016166) #21 hipk2 (ENSOMYG00000017352) #22 ENSOMYG00000017865 ##31 ENSOMYG00000064981 ENSOMYG00000018004 ENSOMYG00000076032 ENSOMYG00000018652 ENSOMYG00000057229 ENSOMYG00000018690 ENSOMYG00000018760 ENSOMYG00000018818 ENSOMYG00000018834 ENSOMYG00000053134 ENSOMYG00000075199 slc23a4 (ENSOMYG00000018894) ENSOMYG00000032212 ENSOMYG00000018908 Northern pike MODERN SPECIES 18 selenoo1 (ENSELUG00000020066) mapk12a (ENSELUG00000020003) mtss1la (ENSELUG00000019952) ENSELUG00000019804 ENSELUG00000019722 ENSELUG00000024725 ENSELUG00000019711 ENSELUG00000019703 uri1 (ENSELUG00000019669) zgc:112052 (ENSELUG00000019631) rxylt1 (ENSELUG00000019619) SRGAP1 (ENSELUG00000019581) parp12a (ENSELUG00000019421) #20 tbxas1 (ENSELUG00000019402) #21 ENSELUG00000029601 hipk2 (ENSELUG00000019334) #22 ENSELUG00000019290 ##31 mical3a (ENSELUG00000001046) ttc38 (ENSELUG00000019080) tspan33b (ENSELUG00000019015) TSPAN9 (ENSELUG00000001319) PRMT8 (ENSELUG00000018946) CRACR2A (ENSELUG00000018918) ENSELUG00000018888 TMTC2 (ENSELUG00000018780) slc23a4 (ENSELUG00000018671) BICD1 (ENSELUG00000018640) ENSELUG00000018613 fgd4a (ENSELUG00000018572) nup205 (ENSELUG00000018467) agk (ENSELUG00000018420) #8 Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 78 ENSGT00940000159852.b.a ENSGT00390000013709.b.j ENSGT00940000157097 ENSGT00940000158861.A.f ENSGT00940000156642.b.d ENSGT00940000159863 #35 ENSGT00940000157170 ENSGT00940000157478.b ENSGT00940000154932.A ENSGT00390000013286 ENSGT01050000244882.a.a.a.a.b ENSGT00390000003526 ENSGT00950000182824.a.a.a.a.a.h ENSGT00940000154649.B #20 ENSGT00940000157903 #21 ENSGT00940000157742.b.e #22 ENSGT00530000063472.b.a.b ##31 ENSGT00940000155580.b.a.a.j ENSGT00390000002669.db ENSGT00940000166236 ENSGT00940000158225.i.a.a ENSGT00940000155867.a.a.b ENSGT00440000033504.B.a ENSGT00940000156144.b.a.b Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 11 pparaa (ENSSFOG00015026702) WNT7B (ENSSFOG00015006751) fbln1 (ENSSFOG00015006783) trim24 (ENSSFOG00015006817) #35 KDM5A (ENSSFOG00015006880) SLC6A13 (ENSSFOG00015007001) USP15 (ENSSFOG00015007077) MON2 (ENSSFOG00015007168) ppm1h (ENSSFOG00015007269) avpr1ab (ENSSFOG00015032382) SRGAP1 (ENSSFOG00015007315) kics2 (ENSSFOG00015007433) ENSSFOG00015007395 gas8 (ENSSFOG00015007456) parp12b (ENSSFOG00015007487) hipk2 (ENSSFOG00015007506) #22 ENSSFOG00015007653 ##31 svopl (ENSSFOG00015007854) #34 mical3a (ENSSFOG00015008013) TTC38 (ENSSFOG00015008395) tspan9b (ENSSFOG00015008459) tspan11 (ENSSFOG00015032000) PRMT8 (ENSSFOG00015032213) CRACR2A (ENSSFOG00015008628) ccdc59 (ENSSFOG00015028437) mettl25 (ENSSFOG00015008702) TMTC2 (ENSSFOG00015008721) ENSSFOG00015008798 slc23a4 (ENSSFOG00015008834) ENSSFOG00015008907 ENSSFOG00015008953 Asian bonytongue MODERN SPECIES 20 ENSSFOG00015033244 yars2 (ENSSFOG00015002490) cdpf1 (ENSSFOG00015002515) WNT7B 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#22 ENSGT00530000063472.b.a.a ##31 ENSGT00940000158632 #34 ENSGT00940000155580.b.a.a.i ENSGT00390000002669.eb ENSGT00940000158225.i.a.b ENSGT00940000161249 ENSGT00940000155867.a.a.a ENSGT00440000033504.B.b ENSGT00390000006546 ENSGT00530000063745.b ENSGT00940000156144.b.b ENSGT00940000154479.a.a.a ENSGT00950000182953.B.a.i.e ENSGT00940000155765.r ENSGT00390000004003 P. kingsleyae MODERN SPECIES 44 ENSPKIG00000021726 WNT7B (ENSPKIG00000021706) fbln1 (ENSPKIG00000021644) trim24 (ENSPKIG00000021540) #35 KDM5A (ENSPKIG00000021456) SLC6A13 (ENSPKIG00000021423) USP15 (ENSPKIG00000021258) MON2 (ENSPKIG00000021175) ppm1h (ENSPKIG00000021136) avpr1ab (ENSPKIG00000021118) ENSPKIG00000021094 ENSPKIG00000021031 kics2 (ENSPKIG00000021002) ENSPKIG00000020960 parp12b (ENSPKIG00000020927) hipk2 (ENSPKIG00000020871) #22 ENSPKIG00000020820 ##31 svopl (ENSPKIG00000020783) #34 mical3a (ENSPKIG00000020184) TTC38 (ENSPKIG00000019897) tspan9b (ENSPKIG00000019820) tspan11 (ENSPKIG00000019765) PRMT8 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#20 kics2 (ENSLOCG00000016974)