Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Cercopithecinae DUPLICATION Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.b #22 Rhesus MODERN SPECIES 2 NXPH4 (ENSMMUG00000021784) #7 LRP1 (ENSMMUG00000021782) #8 STAT6 (ENSMMUG00000017527) #9 NAB2 (ENSMMUG00000017525) #10 NEMP1 (ENSMMUG00000019783) #11 MYO1A (ENSMMUG00000013518) #12 TAC3 (ENSMMUG00000003203) #13 GPR182 (ENSMMUG00000021114) #14 ENSMMUG00000003763 #15 ZBTB39 (ENSMMUG00000043411) #16 RDH16 (ENSMMUG00000060449) #17 SDR9C7 (ENSMMUG00000057714) #18 ENSMMUG00000051454 #19 HSD17B6 (ENSMMUG00000057617) #20 PRIM1 (ENSMMUG00000004522) #21 NACA (ENSMMUG00000003073) #22 PTGES3 (ENSMMUG00000013766) #23 ATP5F1B (ENSMMUG00000001027) #24 BAZ2A (ENSMMUG00000019332) #25 RBMS2 (ENSMMUG00000019330) #26 SPRYD4 (ENSMMUG00000053986) #27 GLS2 (ENSMMUG00000000860) #28 MIP (ENSMMUG00000010334) #29 TIMELESS (ENSMMUG00000021878) #30 ENSMMUG00000053460 #31 APOF (ENSMMUG00000063898) #32 ENSMMUG00000052144 #33 STAT2 (ENSMMUG00000000803) #34 IL23A (ENSMMUG00000031831) #35 PAN2 (ENSMMUG00000013482) #36 CS (ENSMMUG00000002483) #37 Vervet Monkey MODERN SPECIES 2 SHMT2 (ENSCSAG00000004929) NXPH4 (ENSCSAG00000004932) #7 LRP1 (ENSCSAG00000004953) #8 STAT6 (ENSCSAG00000004973) #9 NAB2 (ENSCSAG00000004977) #10 NEMP1 (ENSCSAG00000004982) #11 MYO1A (ENSCSAG00000004990) #12 TAC3 (ENSCSAG00000004995) #13 ZBTB39 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ENSGT00940000165945 ENSGT00940000155690 ENSGT00390000010822.o ENSGT00940000157382 ENSGT00390000013520 Macaca ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00510000046704.a ENSGT00940000154173.A.a.c.b ENSGT00390000018533 ENSGT00940000156673 ENSGT00940000159010 ENSGT00940000158902 ENSGT00950000183166.a.a.a.a ENSGT00390000015991 ENSGT00390000007230 ENSGT00940000157069 ENSGT00940000154203 ENSGT00940000156740 ENSGT00390000013680.b ENSGT00390000011888 ENSGT00950000182970.A.a ENSGT00440000033468.d.a.a ##22 ENSGT00940000158882 ENSGT00860000135714 ENSGT00940000158439 ENSGT00390000006454 ENSGT00940000155672 ENSGT00390000010722 ENSGT00390000003769 ENSGT00940000155797 ENSGT00940000165945 ENSGT00940000155690 ENSGT00390000010822.o ENSGT00940000157382 ENSGT00390000013520 ENSGT00390000009552 ENSGT00840000129887 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 541 ENSMNEG00000038245 SMG8 (ENSMNEG00000044030) GDPD1 (ENSMNEG00000031028) YPEL2 (ENSMNEG00000033354) DHX40 (ENSMNEG00000043921) CLTC (ENSMNEG00000022607) PTRH2 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ENSNLEG00000035696 TRIM75 (ENSNLEG00000018930) TMEM192 (ENSNLEG00000006475) KLHL2 (ENSNLEG00000006478) ENSNLEG00000033748 MSMO1 (ENSNLEG00000032156) ENSNLEG00000031432 CPE (ENSNLEG00000006506) ENSNLEG00000034714 ENSNLEG00000028854 TLL1 (ENSNLEG00000006519) SPOCK3 (ENSNLEG00000006528) ANXA10 (ENSNLEG00000006535) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Pan ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000003290 ENSGT01000000215340 ENSGT00390000007888.c.b.h ENSGT00940000156334 ENSGT00940000158165 ENSGT00390000005848 ENSGT00940000157275 ENSGT00940000154003.A ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.a.b.a.b ENSGT00900000143786 ENSGT00390000014448 ENSGT00940000157983 ENSGT00390000010491 ENSGT00540000070023.d ENSGT00940000155210.a.b ENSGT00440000033468.d #22 ENSGT00940000156910 ENSGT00510000046843.b ENSGT00430000032851 ENSGT00410000029301 ENSGT00950000182952.C ENSGT00940000158382 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SPECIES 3 VEZT (ENSPTRG00000005312) ENSPTRG00000043616 FGD6 (ENSPTRG00000005309) NR2C1 (ENSPTRG00000005307) NDUFA12 (ENSPTRG00000005306) TMCC3 (ENSPTRG00000005304) ENSPTRG00000049511 CEP83 (ENSPTRG00000005302) PLXNC1 (ENSPTRG00000005301) ENSPTRG00000047060 CRADD (ENSPTRG00000005300) SOCS2 (ENSPTRG00000005299) MRPL42 (ENSPTRG00000022791) UBE2N (ENSPTRG00000005297) NUDT4 (ENSPTRG00000005296) ENSPTRG00000048686 #22 EEA1 (ENSPTRG00000005295) PLEKHG7 (ENSPTRG00000005292) C12H12orf74 (ENSPTRG00000033711) ENSPTRG00000029605 BTG1 (ENSPTRG00000050131) DCN (ENSPTRG00000005290) LUM (ENSPTRG00000005289) KERA (ENSPTRG00000005288) EPYC (ENSPTRG00000005287) CCER1 (ENSPTRG00000023775) ENSPTRG00000046703 ATP2B1 (ENSPTRG00000005286) ENSPTRG00000046518 POC1B (ENSPTRG00000005284) DUSP6 (ENSPTRG00000005282) Chimpanzee MODERN SPECIES 3 NDUFA4L2 (ENSPTRG00000045465) SHMT2 (ENSPTRG00000005124) NXPH4 (ENSPTRG00000005123) #7 LRP1 (ENSPTRG00000005122) #8 STAT6 (ENSPTRG00000005121) #9 NAB2 (ENSPTRG00000005120) #10 NEMP1 (ENSPTRG00000005119) #11 MYO1A (ENSPTRG00000005118) #12 TAC3 (ENSPTRG00000048234) #13 ZBTB39 (ENSPTRG00000044060) #16 ENSPTRG00000047240 GPR182 (ENSPTRG00000005114) #14 RDH16 (ENSPTRG00000005113) #15 SDR9C7 (ENSPTRG00000005112) #18 PRIM1 (ENSPTRG00000022987) #21 ENSPTRG00000049588 #22 PTGES3 (ENSPTRG00000005108) #23 ATP5F1B (ENSPTRG00000005107) #24 BAZ2A (ENSPTRG00000005106) #25 RBMS2 (ENSPTRG00000005104) #26 ENSPTRG00000043291 GLS2 (ENSPTRG00000005101) #28 SPRYD4 (ENSPTRG00000005100) #27 MIP (ENSPTRG00000005099) #29 TIMELESS (ENSPTRG00000022963) #30 APOF (ENSPTRG00000005096) #32 STAT2 (ENSPTRG00000005095) #34 IL23A (ENSPTRG00000005093) #35 PAN2 (ENSPTRG00000052054) #36 CNPY2 (ENSPTRG00000046892) CS (ENSPTRG00000005090) #37 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 674 ENSTSYG00000028737 #22 ENSTSYG00000027913 TAS2R39 (ENSTSYG00000034624) Tarsier MODERN SPECIES 5999 ENSTSYG00000028875 CARD8 (ENSTSYG00000007210) ENSTSYG00000009333 #22 ENSTSYG00000008342 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 21 ENSMICG00000043784 MAPK10 (ENSMICG00000014359) ARHGAP24 (ENSMICG00000028999) WDFY3 (ENSMICG00000004962) ENSMICG00000047148 #22 ENSMICG00000000970 NKX6-1 (ENSMICG00000042480) ENSMICG00000005904 ENSMICG00000047779 TAFA4 (ENSMICG00000042440) EOGT (ENSMICG00000047274) TMF1 (ENSMICG00000035913) ENSMICG00000003407 ENSMICG00000042511 ENSMICG00000046450 FRMD4B (ENSMICG00000045910) PROP1 (ENSMICG00000027568) ZNF354B (ENSMICG00000035274) TRIM52 (ENSMICG00000043353) RACK1 (ENSMICG00000014201) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 967 ENSPSMG00000006054 #22 ENSPSMG00000006057 IGFL1 (ENSPSMG00000006068) HIF3A (ENSPSMG00000006129) PPP5C (ENSPSMG00000006234) PNMA8A (ENSPSMG00000006391) PNMA8C (ENSPSMG00000006395) PNMA8B (ENSPSMG00000006398) CALM3 (ENSPSMG00000006412) PTGIR (ENSPSMG00000006434) GNG8 (ENSPSMG00000006435) DACT3 (ENSPSMG00000006455) PRKD2 (ENSPSMG00000006485) STRN4 (ENSPSMG00000006556) FKRP (ENSPSMG00000006706) SLC1A5 (ENSPSMG00000006768) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 71 ENSPSMG00000007303 ENSPSMG00000007292 GK5 (ENSPSMG00000007275) ENSPSMG00000007251 ENSPSMG00000007238 ENSPSMG00000007236 #22 XRN1 (ENSPSMG00000007127) ATR (ENSPSMG00000006948) PLS1 (ENSPSMG00000006858) TRPC1 (ENSPSMG00000006833) ENSPSMG00000006785 PCOLCE2 (ENSPSMG00000006776) PAQR9 (ENSPSMG00000006758) U2SURP (ENSPSMG00000006545) CHST2 (ENSPSMG00000006433) SLC9A9 (ENSPSMG00000006417) DIPK2A (ENSPSMG00000006404) Euarchontoglires_A DUPLICATION Euarchontoglires_A DUPLICATION Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Ufsp2 (ENSCGRG00001016637) 1700029J07Rik (ENSCGRG00001013769) Ccdc110 (ENSCGRG00001005516) Pdlim3 (ENSCGRG00001008240) Sorbs2 (ENSCGRG00001012795) Tlr3 (ENSCGRG00001014027) Fam149a (ENSCGRG00001012179) Cyp4v3 (ENSCGRG00001013032) Klkb1 (ENSCGRG00001013789) F11 (ENSCGRG00001014058) ENSCGRG00001024702 Mtnr1a (ENSCGRG00001002715) Fat1 (ENSCGRG00001020269) ENSCGRG00001006783 ENSCGRG00001008161 ENSCGRG00001023820 #22 Zfp42 (ENSCGRG00001024253) Triml2 (ENSCGRG00001000515) Triml1 (ENSCGRG00001014182) Frg1 (ENSCGRG00001014998) Asah1 (ENSCGRG00001018918) Pcm1 (ENSCGRG00001020402) Fgl1 (ENSCGRG00001023635) ENSCGRG00001024241 Pdgfrl (ENSCGRG00001024745) Slc7a2 (ENSCGRG00001017279) ENSCGRG00001014016 Adam24 (ENSCGRG00001004936) Mtmr7 (ENSCGRG00001021013) Vps37a (ENSCGRG00001011654) Cnot7 (ENSCGRG00001011174) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.a #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 156 KLHL4 (ENSSVLG00005023401) DACH2 (ENSSVLG00005023583) ENSSVLG00005023891 POF1B (ENSSVLG00005023983) ZNF711 (ENSSVLG00005024106) ENSSVLG00005024140 ENSSVLG00005024204 APOOL (ENSSVLG00005024251) ENSSVLG00005024287 ENSSVLG00005024295 ENSSVLG00005024315 HDX (ENSSVLG00005024346) RPS6KA6 (ENSSVLG00005024442) CYLC1 (ENSSVLG00005024602) POU3F4 (ENSSVLG00005024640) ENSSVLG00005024677 #22 ENSSVLG00005010323 ENSSVLG00005010356 ENSSVLG00005010369 SH3BGRL (ENSSVLG00005010419) ENSSVLG00005010444 BRWD3 (ENSSVLG00005010574) ENSSVLG00005010912 TENT5D (ENSSVLG00005010945) ENSSVLG00005010961 ENSSVLG00005010993 TBX22 (ENSSVLG00005011035) ITM2A (ENSSVLG00005011136) GPR174 (ENSSVLG00005011269) ENSSVLG00005011291 P2RY10 (ENSSVLG00005011313) Tree shrew MODERN SPECIES 9342 ENSTBEG00000011329 #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Rabbit MODERN SPECIES 6 ENSOCUG00000009004 PCDH18 (ENSOCUG00000009057) ENSOCUG00000032687 ENSOCUG00000026992 ENSOCUG00000030197 ENSOCUG00000035926 ENSOCUG00000036673 ENSOCUG00000038661 PABPC4L (ENSOCUG00000028226) ENSOCUG00000033772 PRSS12 (ENSOCUG00000013625) NDST3 (ENSOCUG00000009952) ENSOCUG00000038669 TRAM1L1 (ENSOCUG00000003846) ENSOCUG00000003691 ENSOCUG00000002295 #22 NDST4 (ENSOCUG00000007796) UGT8 (ENSOCUG00000015037) ENSOCUG00000030939 CAMK2D (ENSOCUG00000023650) ENSOCUG00000035520 ANK2 (ENSOCUG00000010618) ENSOCUG00000021222 LARP7 (ENSOCUG00000007073) ZGRF1 (ENSOCUG00000007057) NEUROG2 (ENSOCUG00000007063) ENSOCUG00000010848 ALPK1 (ENSOCUG00000024991) TIFA (ENSOCUG00000017578) AP1AR (ENSOCUG00000004413) FAM241A (ENSOCUG00000011383) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.i.b #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 2 Ankmy2 (ENSCGRG00001009172) ENSCGRG00001013113 Tspan13 (ENSCGRG00001023940) Agr2 (ENSCGRG00001001104) Agr3 (ENSCGRG00001002325) Ahr (ENSCGRG00001005179) ENSCGRG00001007669 Snx13 (ENSCGRG00001000684) Prps1l1 (ENSCGRG00001011587) Hdac9 (ENSCGRG00001012600) ENSCGRG00001016294 ENSCGRG00001014414 Twist1 (ENSCGRG00001010741) Ferd3l (ENSCGRG00001003018) ENSCGRG00001021716 ENSCGRG00001022667 #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 25 ENSHGLG00000049940 SMIM31 (ENSHGLG00000004408) ENSHGLG00000010125 ENSHGLG00000020521 TRIM60 (ENSHGLG00000044107) ENSHGLG00000042682 TMEM192 (ENSHGLG00000042804) KLHL2 (ENSHGLG00000006484) ENSHGLG00000005109 CPE (ENSHGLG00000044272) ENSHGLG00000050964 ENSHGLG00000038708 ENSHGLG00000041799 ENSHGLG00000043287 ENSHGLG00000006655 ENSHGLG00000049226 #22 ENSHGLG00000034446 ENSHGLG00000047271 ENSHGLG00000039306 ENSHGLG00000035113 ANXA10 (ENSHGLG00000001262) ENSHGLG00000050525 ENSHGLG00000013790 ENSHGLG00000034493 PALLD (ENSHGLG00000015506) ENSHGLG00000032370 SH3RF1 (ENSHGLG00000016975) NEK1 (ENSHGLG00000012517) CLCN3 (ENSHGLG00000007901) HPF1 (ENSHGLG00000009625) ENSHGLG00000047060 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 ENSHGLG00000041421 BRWD3 (ENSHGLG00000002063) ENSHGLG00000037295 ENSHGLG00000007722 ENSHGLG00000007062 ENSHGLG00000020488 ENSHGLG00000020202 ENSHGLG00000005940 ENSHGLG00000050061 ENSHGLG00000050316 ENSHGLG00000040597 ENSHGLG00000037398 RPS6KA6 (ENSHGLG00000004511) HDX (ENSHGLG00000003945) ENSHGLG00000045926 ENSHGLG00000035970 #22 APOOL (ENSHGLG00000003635) ENSHGLG00000003516 ZNF711 (ENSHGLG00000003254) POF1B (ENSHGLG00000003095) ENSHGLG00000033497 ENSHGLG00000041349 CHM (ENSHGLG00000002772) DACH2 (ENSHGLG00000008869) ENSHGLG00000020892 ENSHGLG00000034462 ENSHGLG00000002543 ENSHGLG00000049697 ENSHGLG00000014839 ENSHGLG00000046264 ENSHGLG00000000569 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 3 ENSHGLG00000004959 ENSHGLG00000011793 ENSHGLG00000005602 ENSHGLG00000000210 ENSHGLG00000035491 ENSHGLG00000041847 ENSHGLG00000006616 ENSHGLG00000020314 ENSHGLG00000008650 ENSHGLG00000034314 CDKN2B (ENSHGLG00000038311) ENSHGLG00000040016 DMRTA1 (ENSHGLG00000051021) ELAVL2 (ENSHGLG00000005423) ENSHGLG00000047261 ENSHGLG00000001616 #22 ENSHGLG00000020416 TUSC1 (ENSHGLG00000039095) ENSHGLG00000036016 ENSHGLG00000034551 PLAA (ENSHGLG00000010977) LRRC19 (ENSHGLG00000040675) ENSHGLG00000032796 IFT74 (ENSHGLG00000007564) ENSHGLG00000037234 TEK (ENSHGLG00000017418) MOB3B (ENSHGLG00000005405) ENSHGLG00000020201 ENSHGLG00000008527 ENSHGLG00000039277 ENSHGLG00000039388 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 622 Lrtm2 (ENSMAUG00000018872) Cacna2d4 (ENSMAUG00000010863) Adipor2 (ENSMAUG00000009923) Wnt5b (ENSMAUG00000021552) Erc1 (ENSMAUG00000004622) Rad52 (ENSMAUG00000017264) ENSMAUG00000004175 ENSMAUG00000014503 Ninj2 (ENSMAUG00000014145) B4galnt3 (ENSMAUG00000009442) ENSMAUG00000016800 Ccdc77 (ENSMAUG00000015602) ENSMAUG00000012905 Il17ra (ENSMAUG00000021439) Hdhd5 (ENSMAUG00000000662) ENSMAUG00000015523 #22 Cecr2 (ENSMAUG00000019396) Slc25a18 (ENSMAUG00000006541) Atp6v1e1 (ENSMAUG00000010551) Bcl2l13 (ENSMAUG00000001418) ENSMAUG00000016061 ENSMAUG00000010804 Pex26 (ENSMAUG00000021306) Tuba8 (ENSMAUG00000016003) ENSMAUG00000010948 Slc6a13 (ENSMAUG00000002527) Slc6a12 (ENSMAUG00000016005) Iqsec3 (ENSMAUG00000014844) A2m (ENSMAUG00000016738) ENSMAUG00000017104 ENSMAUG00000010289 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 112 Tmem98 (ENSJJAG00000017013) Spaca3 (ENSJJAG00000023074) ENSJJAG00000022033 Asic2 (ENSJJAG00000016957) Ccl12 (ENSJJAG00000003016) ENSJJAG00000016181 Tmem132e (ENSJJAG00000018290) Cct6b (ENSJJAG00000014826) Zfp830 (ENSJJAG00000010210) Lig3 (ENSJJAG00000003848) Rffl (ENSJJAG00000020929) Rad51d (ENSJJAG00000014931) Fndc8 (ENSJJAG00000018336) Nle1 (ENSJJAG00000008356) Unc45b (ENSJJAG00000018066) ENSJJAG00000016743 #22 ENSJJAG00000020087 ENSJJAG00000024250 ENSJJAG00000018288 Slfn14 (ENSJJAG00000016028) ENSJJAG00000008010 Ap2b1 (ENSJJAG00000023688) Rasl10b (ENSJJAG00000011469) ENSJJAG00000020015 1700020L24Rik (ENSJJAG00000011369) Mmp28 (ENSJJAG00000009319) Taf15 (ENSJJAG00000010606) Heatr9 (ENSJJAG00000012557) Ccl5 (ENSJJAG00000024069) Ccl3 (ENSJJAG00000022032) Ccl4 (ENSJJAG00000011404) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d.j #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 9 ENSOCUG00000029316 ENSOCUG00000035024 ENSOCUG00000027361 ENSOCUG00000011354 ENSOCUG00000038810 ENSOCUG00000033019 ENSOCUG00000030221 ENSOCUG00000035303 ENSOCUG00000034459 ENSOCUG00000024510 ENSOCUG00000033921 ENSOCUG00000031416 ENSOCUG00000034049 ENSOCUG00000032917 ENSOCUG00000029733 ENSOCUG00000010552 #22 ENSOCUG00000026637 ENSOCUG00000038198 ENSOCUG00000036428 ENSOCUG00000037482 ENSOCUG00000021588 ENSOCUG00000027147 ENSOCUG00000025363 ENSOCUG00000029654 ENSOCUG00000026012 ENSOCUG00000029758 ENSOCUG00000022083 ENSOCUG00000030276 ENSOCUG00000029159 ENSOCUG00000029476 ENSOCUG00000028023 Rabbit MODERN SPECIES 1154 ENSOCUG00000003678 #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000161040 ENSGT00390000002762.a.a ENSGT00950000182883.b.a.b #7 ENSGT00940000157899.b #8 ENSGT01080000257420.C.b.a #9 ENSGT00390000006330.a.b #10 ENSGT00390000002174.a #11 ENSGT00940000160660 #12 ENSGT00390000000335 #13 ENSGT00940000160722 #16 ENSGT00940000154307.D #14 ENSGT00940000154118.b #15 ENSGT00940000162028 #20 ENSGT00940000161764 #18 ENSGT00390000011466 #21 ENSGT00440000033468.d #22 ENSGT00440000033468.c.a ##22 ENSGT00940000154256 #23 ENSGT00550000074800 #24 ENSGT00940000159490 #25 ENSGT00940000155250 #26 ENSGT00390000010463.a.a.a #28 ENSGT00940000159780 #27 ENSGT00940000156260 #29 ENSGT00390000015124 #30 ENSGT00500000045104.h ##32 ENSGT00500000045104.g #32 ENSGT01050000244905.C #34 ENSGT00390000006482 #35 ENSGT00390000013978.d #36 ENSGT00940000161158 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 2351 ENSGT00390000011466 #21 ENSGT00440000033468.d #22 Common shrew MODERN SPECIES 6380 PRIM1 (ENSSARG00000001610) #21 ENSSARG00000001573 #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Donkey MODERN SPECIES 14 ZBTB39 (ENSEASG00005025709) #16 GPR182 (ENSEASG00005036945) #14 ENSEASG00005034579 #20 ENSEASG00005006331 #15 ENSEASG00005006326 #20 ENSEASG00005006334 #15 ENSEASG00005031913 ENSEASG00005006346 #15 ENSEASG00005006329 #20 ENSEASG00005025949 #15 ENSEASG00005006341 SDR9C7 (ENSEASG00005006337) #18 ENSEASG00005032791 #15 HSD17B6 (ENSEASG00005027419) #20 PRIM1 (ENSEASG00005006308) #21 ENSEASG00005035244 #22 PTGES3 (ENSEASG00005006299) #23 ATP5F1B (ENSEASG00005006269) #24 ENSEASG00005035823 #25 RBMS2 (ENSEASG00005005834) #26 ENSEASG00005006215 #25 GLS2 (ENSEASG00005005782) #28 SPRYD4 (ENSEASG00005037318) #27 MIP (ENSEASG00005005765) #29 TIMELESS (ENSEASG00005005617) #30 APOF (ENSEASG00005026252) #32 STAT2 (ENSEASG00005005423) #34 IL23A (ENSEASG00005035882) #35 PAN2 (ENSEASG00005005235) #36 CNPY2 (ENSEASG00005005179) CS (ENSEASG00005005030) #37 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 NDUFA4L2 (ENSRFEG00010013025) SHMT2 (ENSRFEG00010012928) NXPH4 (ENSRFEG00010012875) #7 LRP1 (ENSRFEG00010011635) #8 STAT6 (ENSRFEG00010011526) #9 NAB2 (ENSRFEG00010011442) #10 ENSRFEG00010011417 NEMP1 (ENSRFEG00010011322) #11 MYO1A (ENSRFEG00010011248) #12 TAC3 (ENSRFEG00010011154) #13 ZBTB39 (ENSRFEG00010011129) #16 GPR182 (ENSRFEG00010011107) #14 RDH16 (ENSRFEG00010010987) #15 SDR9C7 (ENSRFEG00010010912) #18 PRIM1 (ENSRFEG00010010857) #21 ENSRFEG00010010764 #22 ENSRFEG00010010712 ENSRFEG00010010659 #23 ATP5F1B (ENSRFEG00010010570) #24 BAZ2A (ENSRFEG00010009982) #25 RBMS2 (ENSRFEG00010009809) #26 GLS2 (ENSRFEG00010009734) #28 SPRYD4 (ENSRFEG00010009705) #27 ENSRFEG00010009680 MIP (ENSRFEG00010009638) #29 TIMELESS (ENSRFEG00010009600) #30 APOF (ENSRFEG00010009558) #32 STAT2 (ENSRFEG00010009437) #34 IL23A (ENSRFEG00010009379) #35 PAN2 (ENSRFEG00010009344) #36 CS (ENSRFEG00010009145) #37 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 2 ENSRFEG00010018641 TH (ENSRFEG00010018664) ASCL2 (ENSRFEG00010018749) ENSRFEG00010018769 CD81 (ENSRFEG00010018819) ENSRFEG00010018863 TRPM5 (ENSRFEG00010018900) KCNQ1 (ENSRFEG00010018942) CDKN1C (ENSRFEG00010019122) SLC22A18 (ENSRFEG00010019147) PHLDA2 (ENSRFEG00010019209) NAP1L4 (ENSRFEG00010019235) CARS1 (ENSRFEG00010019344) ENSRFEG00010019461 OSBPL5 (ENSRFEG00010019508) ENSRFEG00010019649 #22 ENSRFEG00010019667 MRGPRG (ENSRFEG00010019682) ENSRFEG00010019689 NADSYN1 (ENSRFEG00010019709) DHCR7 (ENSRFEG00010019782) SHANK2 (ENSRFEG00010019833) CTTN (ENSRFEG00010020070) PPFIA1 (ENSRFEG00010020279) FADD (ENSRFEG00010020342) ANO1 (ENSRFEG00010020393) FGF3 (ENSRFEG00010020546) FGF4 (ENSRFEG00010020567) FGF19 (ENSRFEG00010020594) LTO1 (ENSRFEG00010020618) CCND1 (ENSRFEG00010020663) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00940000161040 ENSGT00390000002762.a.a ENSGT00950000182883.b.a.b #7 ENSGT00940000157899.b #8 ENSGT01080000257420.C.b.a #9 ENSGT00390000006330.a.b #10 ENSGT00390000002174.a #11 ENSGT00940000160660 #12 ENSGT00390000000335 #13 ENSGT00940000160722 #16 ENSGT00940000154307.D #14 ENSGT00940000154118.b #15 ENSGT00940000161764 #18 ENSGT00940000162028.b #20 ENSGT00390000011466 #21 ENSGT00440000033468.d #22 ENSGT00440000033468.c.a ##22 ENSGT00940000154256 #23 ENSGT00550000074800 #24 ENSGT00940000159490 #25 ENSGT00940000155250 #26 ENSGT00390000010463.a.a.a #28 ENSGT00940000159780 #27 ENSGT00940000156260 #29 ENSGT00390000015124 #30 ENSGT01050000245459 ENSGT00500000045104.g #32 ENSGT01050000244905.C #34 ENSGT00390000006482 #35 ENSGT00390000013978.d #36 ENSGT00940000161158 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Dog MODERN SPECIES 1 NDUFA4L2 (ENSCAFG00845010422) SHMT2 (ENSCAFG00845010365) NXPH4 (ENSCAFG00845010342) #7 LRP1 (ENSCAFG00845010106) #8 STAT6 (ENSCAFG00845009828) #9 NAB2 (ENSCAFG00845009686) #10 NEMP1 (ENSCAFG00845009633) #11 TAC3 (ENSCAFG00845009491) #12 ENSCAFG00845009429 #13 ZBTB39 (ENSCAFG00845009407) #16 GPR182 (ENSCAFG00845009393) #14 RDH16 (ENSCAFG00845009333) #15 SDR9C7 (ENSCAFG00845009288) #18 HSD17B6 (ENSCAFG00845009238) #20 PRIM1 (ENSCAFG00845009163) #21 NACA (ENSCAFG00845009133) #22 ATP5F1B (ENSCAFG00845008893) #24 RBMS2 (ENSCAFG00845008621) #26 ENSCAFG00845008578 GLS2 (ENSCAFG00845008418) #28 SPRYD4 (ENSCAFG00845008355) #27 ENSCAFG00845008341 MIP (ENSCAFG00845008298) #29 TIMELESS (ENSCAFG00845008229) APOF (ENSCAFG00845008198) #32 STAT2 (ENSCAFG00845008098) #34 IL23A (ENSCAFG00845008036) #35 PAN2 (ENSCAFG00845007965) #36 CNPY2 (ENSCAFG00845007911) CS (ENSCAFG00845007644) #37 COQ10A (ENSCAFG00845007484) Red fox MODERN SPECIES 38 SHMT2 (ENSVVUG00000018132) NXPH4 (ENSVVUG00000018138) #7 LRP1 (ENSVVUG00000018159) #8 STAT6 (ENSVVUG00000018501) #9 NAB2 (ENSVVUG00000019302) #10 NEMP1 (ENSVVUG00000019316) #11 MYO1A (ENSVVUG00000019418) #12 ENSVVUG00000020802 #13 ZBTB39 (ENSVVUG00000020803) #16 GPR182 (ENSVVUG00000020804) #14 ENSVVUG00000020807 #20 ENSVVUG00000020809 #15 SDR9C7 (ENSVVUG00000020813) #18 HSD17B6 (ENSVVUG00000020818) #20 PRIM1 (ENSVVUG00000020823) #21 ENSVVUG00000020829 #22 ENSVVUG00000020831 #23 ATP5F1B (ENSVVUG00000020852) #24 BAZ2A (ENSVVUG00000020881) #25 RBMS2 (ENSVVUG00000021554) #26 GLS2 (ENSVVUG00000021555) #28 SPRYD4 (ENSVVUG00000021557) #27 ENSVVUG00000021558 MIP (ENSVVUG00000021559) #29 TIMELESS (ENSVVUG00000021563) #30 STAT2 (ENSVVUG00000021580) #34 IL23A (ENSVVUG00000021877) #35 PAN2 (ENSVVUG00000021878) #36 CNPY2 (ENSVVUG00000021880) CS (ENSVVUG00000021881) #37 COQ10A (ENSVVUG00000021958) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 American mink MODERN SPECIES 28 FLRT3 (ENSNVIG00000017394) ENSNVIG00000017400 SEL1L2 (ENSNVIG00000017421) NDUFAF5 (ENSNVIG00000017538) ESF1 (ENSNVIG00000017569) TASP1 (ENSNVIG00000017586) ISM1 (ENSNVIG00000017629) SPTC3 (ENSNVIG00000017652) BTBD3 (ENSNVIG00000017698) ENSNVIG00000017739 JAG1 (ENSNVIG00000017758) MKKS (ENSNVIG00000017843) SNAP25 (ENSNVIG00000017860) ENSNVIG00000017897 #22 ANKEF1 (ENSNVIG00000017906) ENSNVIG00000017920 PAK7 (ENSNVIG00000017934) LAMP5 (ENSNVIG00000017969) PLCB4 (ENSNVIG00000018037) PLCB1 (ENSNVIG00000018320) TMX4 (ENSNVIG00000018532) HAO1 (ENSNVIG00000018550) BMP2 (ENSNVIG00000018558) FERMT1 (ENSNVIG00000018576) LRRN4 (ENSNVIG00000018602) CRLS1 (ENSNVIG00000018610) MCM8 (ENSNVIG00000018649) TRM6 (ENSNVIG00000018778) CHGB (ENSNVIG00000018787) Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 American black bear MODERN SPECIES 6076 ENSUAMG00000012623 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1040 ENSAMEG00000027235 #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Suina ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000002762.a.a ENSGT00950000182883.b.a.b #7 ENSGT00940000157899.b #8 ENSGT01080000257420.C.b.a #9 ENSGT00390000006330.a.b #10 ENSGT00390000002174.a #11 ENSGT00940000160660 #12 ENSGT00390000000335 #13 ENSGT00940000160722 #16 ENSGT00940000154307.D #14 ENSGT00940000154118.b #15 ENSGT00940000162028.a.a #20 ENSGT00940000161764 #18 ENSGT00940000162028.b #20 ENSGT00390000011466 #21 ENSGT00440000033468.d #22 ENSGT00440000033468.c.a ##22 ENSGT00940000154256 #23 ENSGT00550000074800.u #24 ENSGT00940000159490 #25 ENSGT00940000155250 #26 ENSGT00390000010463.a.a.a #28 ENSGT00940000159780 #27 ENSGT00940000156260 #29 ENSGT00390000015124 #30 ENSGT00500000045104.h ##32 ENSGT00500000045104.g #32 ENSGT01050000244905.C #34 ENSGT00390000006482 #35 ENSGT00390000013978.d #36 ENSGT00940000161158 Chacoan peccary MODERN SPECIES 204 IL5 (ENSCWAG00000000297) RAD50 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ENSGT00440000033468.d #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 24 NEMP1 (ENSCHIG00000015757) #11 MYO1A (ENSCHIG00000011774) #12 TAC3 (ENSCHIG00000026341) #13 ZBTB39 (ENSCHIG00000001253) #16 GPR182 (ENSCHIG00000008110) #14 ENSCHIG00000012307 ENSCHIG00000024299 #15 ENSCHIG00000010628 #15 ENSCHIG00000025887 #15 ENSCHIG00000022462 #15 SDR9C7 (ENSCHIG00000026773) #18 ENSCHIG00000008219 ENSCHIG00000027068 #15 HSD17B6 (ENSCHIG00000012163) #20 PRIM1 (ENSCHIG00000026915) #21 ENSCHIG00000013646 #22 ENSCHIG00000011269 #23 ATP5F1B (ENSCHIG00000010757) #24 BAZ2A (ENSCHIG00000025797) #25 RBMS2 (ENSCHIG00000020791) #26 ENSCHIG00000017636 GLS2 (ENSCHIG00000009891) #28 SPRYD4 (ENSCHIG00000021196) #27 MIP (ENSCHIG00000013963) #29 TIMELESS (ENSCHIG00000010689) #30 ENSCHIG00000002500 ##32 APOF (ENSCHIG00000022892) #32 STAT2 (ENSCHIG00000016058) #34 IL23A (ENSCHIG00000010965) #35 PAN2 (ENSCHIG00000026935) #36 CNPY2 (ENSCHIG00000011857) Goat MODERN SPECIES 22 TRABD2B (ENSCHIG00000016346) ENSCHIG00000008212 FOXD2 (ENSCHIG00000000964) FOXE3 (ENSCHIG00000005171) CMPK1 (ENSCHIG00000009857) STIL (ENSCHIG00000018306) TAL1 (ENSCHIG00000023704) PDZK1IP1 (ENSCHIG00000010100) CYP4X1 (ENSCHIG00000017002) CYP4A42 (ENSCHIG00000025289) ENSCHIG00000022081 ENSCHIG00000002358 ENSCHIG00000017193 CYP4A41 (ENSCHIG00000013010) ENSCHIG00000008252 ENSCHIG00000006577 #22 CYP4B1 (ENSCHIG00000010220) EFCAB14 (ENSCHIG00000021934) TEX38 (ENSCHIG00000019654) ENSCHIG00000024752 MOB3C (ENSCHIG00000017303) MKNK1 (ENSCHIG00000025017) KNCN (ENSCHIG00000012933) DMBX1 (ENSCHIG00000018374) FAAH (ENSCHIG00000022289) NSUN4 (ENSCHIG00000024189) ENSCHIG00000013936 LRRC41 (ENSCHIG00000027187) RAD54L (ENSCHIG00000020118) LURAP1 (ENSCHIG00000013931) POMGNT1 (ENSCHIG00000014882) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Hyrax MODERN SPECIES 6763 PRIM1 (ENSPCAG00000007103) #21 ENSPCAG00000007067 #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00440000033468.d #22 Opossum MODERN SPECIES 369 ENSMODG00000041974 ENSMODG00000019856 #22 PTGES3 (ENSMODG00000019855) #23 ATP5F1B (ENSMODG00000019853) #24