Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00390000017595	ENSGT00940000157720	ENSGT00940000155595	ENSGT00780000122010 #7	ENSGT00940000157520 #9	ENSGT00940000158935 #11	ENSGT00530000063672.a #12	ENSGT00520000055589.c #13	ENSGT00940000155901.b #14	ENSGT00940000155043 #15	ENSGT00390000013819 #16	ENSGT00390000000885 #18	ENSGT00950000183064.a.b.b #19	ENSGT00390000003100 #20	ENSGT00950000182787.B #21	ENSGT00950000182787.A #22	ENSGT00940000155512 #23	ENSGT00940000157973 #25	ENSGT00940000163077 #26	ENSGT00940000154340.B #27	ENSGT00940000154865 #28	ENSGT00940000158120 #29	ENSGT00390000004582 #30	ENSGT00390000014627 #31	ENSGT00910000146657	ENSGT00940000155276 #32	ENSGT00390000017004.a.b #33	ENSGT01070000253744.b.a.b #34	ENSGT00730000111199 #35	ENSGT00940000155342 #37	ENSGT00940000160223
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	13	DNA2 (ENSSVLG00005004528) #7	ENSSVLG00005004490 #8	SLC25A16 (ENSSVLG00005004417) #9	ENSSVLG00005004373 #10	TET1 (ENSSVLG00005004334) #11	CCAR1 (ENSSVLG00005004161) #12	STOX1 (ENSSVLG00005004061) #13	DDX50 (ENSSVLG00005004023) #14	ENSSVLG00005003965 #15	ENSSVLG00005003906 #16	ENSSVLG00005003878 #17	SRGN (ENSSVLG00005003868) #18	VPS26A (ENSSVLG00005003836) #19	ENSSVLG00005003789 #20	HKDC1 (ENSSVLG00005003724) #21	HK1 (ENSSVLG00005003638) #22	TACR2 (ENSSVLG00005003553) #23	ENSSVLG00005003530 #24	TSPAN15 (ENSSVLG00005003495) #25	NEUROG3 (ENSSVLG00005003460) #26	FAM241B (ENSSVLG00005003439) #27	COL13A1 (ENSSVLG00005001757) #28	MACROH2A2 (ENSSVLG00005000480) #29	AIFM2 (ENSSVLG00005000439) #30	TYSND1 (ENSSVLG00005000412) #31	SAR1A (ENSSVLG00005000375) #32	PPA1 (ENSSVLG00005000334) #33	NPFFR1 (ENSSVLG00005000275) #34	LRRC20 (ENSSVLG00005000247) #35	ENSSVLG00005000204 #36	EIF4EBP2 (ENSSVLG00005000187) #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	44	ENSGT00390000017595	ENSGT00940000157720	ENSGT00940000155595	ENSGT00780000122010 #7	ENSGT00940000157520 #9	ENSGT00940000158935 #11	ENSGT00530000063672.a #12	ENSGT00520000055589.c #13	ENSGT00940000155901.b #14	ENSGT00940000155043 #15	ENSGT00390000013819 #16	ENSGT00390000000885 #18	ENSGT00950000183064.a.b.b #19	ENSGT00390000003100 #20	ENSGT00950000182787.B #21	ENSGT00950000182787.A #22	ENSGT00940000155512 #23	ENSGT00940000157973 #25	ENSGT00940000163077 #26	ENSGT00940000154340.B #27	ENSGT00940000154865 #28	ENSGT00940000158120 #29	ENSGT00390000004582 #30	ENSGT00390000014627 #31	ENSGT00910000146657	ENSGT00940000155276 #32	ENSGT00390000017004.a.b #33	ENSGT01070000253744.b.a.b #34	ENSGT00730000111199 #35	ENSGT00940000155342 #37	ENSGT00940000160223
Alpin marmot	MODERN SPECIES	68	PBLD (ENSMMMG00000009871)	ENSMMMG00000009862	RUFY2 (ENSMMMG00000009654)	DNA2 (ENSMMMG00000009618) #7	SLC25A16 (ENSMMMG00000009602) #9	TET1 (ENSMMMG00000009420) #11	CCAR1 (ENSMMMG00000009330) #12	STOX1 (ENSMMMG00000009300) #13	DDX50 (ENSMMMG00000009272) #14	DDX21 (ENSMMMG00000007829) #15	KIFBP (ENSMMMG00000007778) #16	SRGN (ENSMMMG00000007773) #18	VPS26A (ENSMMMG00000007747) #19	SUPV3L1 (ENSMMMG00000007708) #20	HKDC1 (ENSMMMG00000007657) #21	HK1 (ENSMMMG00000007466) #22	TACR2 (ENSMMMG00000007437) #23	TSPAN15 (ENSMMMG00000007427) #25	NEUROG3 (ENSMMMG00000007424) #26	FAM241B (ENSMMMG00000007408) #27	MACROH2A2 (ENSMMMG00000007272) #29	AIFM2 (ENSMMMG00000007255) #30	TYSND1 (ENSMMMG00000007246) #31	ENSMMMG00000007241	SAR1A (ENSMMMG00000007230) #32	PPA1 (ENSMMMG00000007219) #33	NPFFR1 (ENSMMMG00000007206) #34	LRRC20 (ENSMMMG00000007191) #35	EIF4EBP2 (ENSMMMG00000007182) #37	NODAL (ENSMMMG00000007178)	PALD1 (ENSMMMG00000007147)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	53	ENSGT00940000161556	ENSGT00390000017595	ENSGT00940000157720	ENSGT00940000155595	ENSGT00780000122010 #7	ENSGT00940000157520 #9	ENSGT00940000158935 #11	ENSGT00530000063672.a #12	ENSGT00520000055589.c #13	ENSGT00940000155901.b #14	ENSGT00940000155043 #15	ENSGT00390000013819 #16	ENSGT00950000183064.a.b.b #19	ENSGT00390000003100 #20	ENSGT00950000182787.B #21	ENSGT00950000182787.A #22	ENSGT00940000155512 #23	ENSGT00940000157973 #25	ENSGT00940000163077 #26	ENSGT00940000154340.B #27	ENSGT00940000154865 #28	ENSGT00940000158120 #29	ENSGT00390000004582 #30	ENSGT00390000014627 #31	ENSGT00910000146657	ENSGT00940000155276 #32	ENSGT00390000017004.a.b #33	ENSGT01070000253744.b.a.b #34	ENSGT00730000111199 #35	ENSGT00940000155342 #37	ENSGT00940000160223
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	142	ATOH7 (ENSUPAG00010008383)	PBLD (ENSUPAG00010008386)	HNRNPH3 (ENSUPAG00010008390)	RUFY2 (ENSUPAG00010008404)	DNA2 (ENSUPAG00010008465) #7	SLC25A16 (ENSUPAG00010008501) #9	TET1 (ENSUPAG00010008514) #11	CCAR1 (ENSUPAG00010008541) #12	STOX1 (ENSUPAG00010008608) #13	DDX50 (ENSUPAG00010008631) #14	DDX21 (ENSUPAG00010008654) #15	KIFBP (ENSUPAG00010008678) #16	VPS26A (ENSUPAG00010008718) #19	SUPV3L1 (ENSUPAG00010008745) #20	HKDC1 (ENSUPAG00010008781) #21	HK1 (ENSUPAG00010008819) #22	TACR2 (ENSUPAG00010008910) #23	TSPAN15 (ENSUPAG00010008923) #25	NEUROG3 (ENSUPAG00010008933) #26	FAM241B (ENSUPAG00010008938) #27	ENSUPAG00010008989	COL13A1 (ENSUPAG00010009002) #28
Squirrel	MODERN SPECIES	121	ATOH7 (ENSSTOG00000023613)	PBLD (ENSSTOG00000006239)	HNRNPH3 (ENSSTOG00000011676)	RUFY2 (ENSSTOG00000011678)	DNA2 (ENSSTOG00000011694) #7	SLC25A16 (ENSSTOG00000005718) #9	TET1 (ENSSTOG00000001527) #11	CCAR1 (ENSSTOG00000001539) #12	STOX1 (ENSSTOG00000026910) #13	DDX50 (ENSSTOG00000021852) #14	DDX21 (ENSSTOG00000011572) #15	KIFBP (ENSSTOG00000007759) #16	VPS26A (ENSSTOG00000009077) #19	SUPV3L1 (ENSSTOG00000000503) #20	HKDC1 (ENSSTOG00000000509) #21	HK1 (ENSSTOG00000023877) #22	TACR2 (ENSSTOG00000003412) #23	TSPAN15 (ENSSTOG00000002523) #25	NEUROG3 (ENSSTOG00000026959) #26	FAM241B (ENSSTOG00000021554) #27	COL13A1 (ENSSTOG00000012691) #28	MACROH2A2 (ENSSTOG00000012745) #29	AIFM2 (ENSSTOG00000012754) #30	TYSND1 (ENSSTOG00000019783) #31	SAR1A (ENSSTOG00000012780) #32	PPA1 (ENSSTOG00000030397) #33	NPFFR1 (ENSSTOG00000021939) #34	LRRC20 (ENSSTOG00000025273) #35	EIF4EBP2 (ENSSTOG00000012937) #37	NODAL (ENSSTOG00000012946)	PALD1 (ENSSTOG00000012949)