Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000017595 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.b ENSGT00940000155043 ENSGT00390000013819 ENSGT00390000000885 ENSGT00950000183064.a.b.b ENSGT00390000003100 ENSGT00950000182787.B #21 ENSGT00950000182787.A #22 ENSGT00940000155512 #23 ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000170705 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00910000146657 ENSGT00940000155276 #33 ENSGT00390000017004.a.b #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342 Primates ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000017595 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.b ENSGT00940000155043 ENSGT00390000013819 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#29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a #33 ENSGT00390000017004.a.b #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342 ENSGT00980000202026 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000017595 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.a.b ENSGT00940000155043 ENSGT00390000013819 ENSGT00390000000885 ENSGT00950000183064.a.b.b ENSGT00390000003100 ENSGT00950000182787.B #21 ENSGT00950000182787.A #22 ENSGT00940000155512 #23 ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00860000135785 #28 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.a ##33 ENSGT00390000017004.a.b #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342.k ENSGT00980000202026 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000017595 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.a.b ENSGT00940000155043 ENSGT00390000013819 ENSGT00390000000885 ENSGT00950000183064.a.b.b ENSGT00390000003100 ENSGT00950000182787.B #21 ENSGT00950000182787.A #22 ENSGT00940000155512 #23 ENSGT00940000159720.w.a #24 ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00860000135785 #28 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.b #33 ENSGT00390000017004.a.b.m.a #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342.k.b Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.a.b ENSGT00940000155043 ENSGT00390000013819 ENSGT00390000000885 ENSGT00950000183064.a.b.b ENSGT00390000003100 ENSGT00910000146854.a ENSGT00950000182787.B #21 ENSGT00950000182787.A #22 ENSGT00940000155512 #23 ENSGT00940000159720.w.a #24 ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00860000135785 #28 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.b #33 ENSGT00390000017004.a.b.m.a #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342.k.b Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000155901.b ENSGT00940000155043.k ENSGT00390000013819 ENSGT00390000000885 ENSGT00950000183064.a.b.b ENSGT00390000003100 ENSGT00910000146854.a ENSGT00950000182787.B #21 ENSGT00950000182787.A #22 ENSGT00940000155512 #23 ENSGT00940000159720.w.a #24 ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00860000135785 #28 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.b #33 ENSGT00390000017004.a.b.m.a #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342.k.b ENSGT00940000160223 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 443 HIVEP3 (ENSRBIG00000032985) #7 GUCA2B (ENSRBIG00000016693) #8 GUCA2A (ENSRBIG00000005852) #9 FOXJ3 (ENSRBIG00000029803) #10 RIMKLA (ENSRBIG00000038553) #11 ZMYND12 (ENSRBIG00000028691) #12 PPCS (ENSRBIG00000031175) #13 ENSRBIG00000031979 #14 ENSRBIG00000021392 #15 CCDC30 (ENSRBIG00000036949) #16 PPIH (ENSRBIG00000044851) #17 ENSRBIG00000035792 #18 CLDN19 (ENSRBIG00000037856) #19 P3H1 (ENSRBIG00000034851) #20 HKDC1 (ENSRBIG00000027725) #21 HK1 (ENSRBIG00000041955) #22 TACR2 (ENSRBIG00000044764) #23 ENSRBIG00000039585 #24 TSPAN15 (ENSRBIG00000027537) #25 ENSRBIG00000008898 #26 FAM241B (ENSRBIG00000032853) #27 ENSRBIG00000039926 #28 COL13A1 (ENSRBIG00000044467) #29 MACROH2A2 (ENSRBIG00000037767) #30 AIFM2 (ENSRBIG00000034212) #31 TYSND1 (ENSRBIG00000033276) #32 ENSRBIG00000031590 #33 PPA1 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ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.b #33 ENSGT00390000017004.a.b.m.a #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342.k.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.a.b ENSGT00940000155043 ENSGT00390000013819 ENSGT00390000000885 ENSGT00950000183064.a.b.b ENSGT00390000003100 ENSGT00910000146854.a ENSGT00950000182787.B #21 ENSGT00950000182787.A #22 ENSGT00940000155512 #23 ENSGT00940000159720.w.a #24 ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00860000135785 #28 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.b #33 ENSGT00390000017004.a.b.m.a #34 ENSGT00940000164233.b ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342.k.b Sooty mangabey MODERN SPECIES 260 RUFY2 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Crab-eating macaque MODERN SPECIES 19 RUFY2 (ENSMFAG00000008200) DNA2 (ENSMFAG00000036094) SLC25A16 (ENSMFAG00000059947) TET1 (ENSMFAG00000044392) CCAR1 (ENSMFAG00000035410) STOX1 (ENSMFAG00000033672) ENSMFAG00000052995 DDX50 (ENSMFAG00000044067) DDX21 (ENSMFAG00000044838) KIFBP (ENSMFAG00000044367) ENSMFAG00000050001 SRGN (ENSMFAG00000040348) VPS26A (ENSMFAG00000042937) SUPV3L1 (ENSMFAG00000003566) HKDC1 (ENSMFAG00000044430) #21 HK1 (ENSMFAG00000036059) #22 TACR2 (ENSMFAG00000045771) #23 TSPAN15 (ENSMFAG00000043589) #25 FAM241B (ENSMFAG00000032357) #27 ENSMFAG00000054348 #28 ENSMFAG00000054268 COL13A1 (ENSMFAG00000038649) #29 MACROH2A2 (ENSMFAG00000035957) #30 AIFM2 (ENSMFAG00000004041) #31 TYSND1 (ENSMFAG00000040775) #32 ENSMFAG00000039894 #33 PPA1 (ENSMFAG00000043098) #34 NPFFR1 (ENSMFAG00000043253) #35 LRRC20 (ENSMFAG00000041994) #37 ENSMFAG00000057854 EIF4EBP2 (ENSMFAG00000000143) Rhesus MODERN SPECIES 19 ENSMMUG00000015130 PBLD (ENSMMUG00000015125) HNRNPH3 (ENSMMUG00000009792) 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ENSGT00390000000885 ENSGT00950000183064.a.b.b.t.a ENSGT00390000003100 ENSGT00950000182787.B #21 ENSGT00950000182787.A #22 ENSGT00940000155512 #23 ENSGT00940000159720.w.a #24 ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00860000135785 #28 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.a.a ##33 ENSGT00390000017004.a.b.m.a.a #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00530000063695.b.a.b Chimpanzee MODERN SPECIES 1 PBLD (ENSPTRG00000002552) HNRNPH3 (ENSPTRG00000002553) RUFY2 (ENSPTRG00000002554) DNA2 (ENSPTRG00000002556) SLC25A16 (ENSPTRG00000002557) TET1 (ENSPTRG00000002558) CCAR1 (ENSPTRG00000002560) STOX1 (ENSPTRG00000002561) DDX50 (ENSPTRG00000002562) DDX21 (ENSPTRG00000002563) KIFBP (ENSPTRG00000024353) SRGN (ENSPTRG00000002565) VPS26A (ENSPTRG00000002567) SUPV3L1 (ENSPTRG00000002568) HKDC1 (ENSPTRG00000002570) #21 HK1 (ENSPTRG00000002572) #22 TACR2 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ENSPPAG00000032393 NEUROG3 (ENSPPAG00000013680) FAM241B (ENSPPAG00000034218) #27 ENSPPAG00000042212 #28 COL13A1 (ENSPPAG00000043840) #29 MACROH2A2 (ENSPPAG00000028027) #30 AIFM2 (ENSPPAG00000043435) #31 TYSND1 (ENSPPAG00000029085) #32 SAR1A (ENSPPAG00000031193) ##33 PPA1 (ENSPPAG00000031831) #34 ENSPPAG00000040679 #35 LRRC20 (ENSPPAG00000040023) #37 Human MODERN SPECIES 1 PBLD (ENSG00000108187) HNRNPH3 (ENSG00000096746) RUFY2 (ENSG00000204130) DNA2 (ENSG00000138346) SLC25A16 (ENSG00000122912) TET1 (ENSG00000138336) CCAR1 (ENSG00000060339) STOX1 (ENSG00000165730) DDX50 (ENSG00000107625) DDX21 (ENSG00000165732) KIFBP (ENSG00000198954) SRGN (ENSG00000122862) VPS26A (ENSG00000122958) SUPV3L1 (ENSG00000156502) HKDC1 (ENSG00000156510) #21 HK1 (ENSG00000156515) #22 TACR2 (ENSG00000075073) #23 TSPAN15 (ENSG00000099282) #25 NEUROG3 (ENSG00000122859) FAM241B (ENSG00000171224) #27 COL13A1 (ENSG00000197467) #29 MACROH2A2 (ENSG00000099284) #30 AIFM2 (ENSG00000042286) #31 TYSND1 (ENSG00000156521) 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(ENSGGOG00000014113) #37 ENSGGOG00000042114 EIF4EBP2 (ENSGGOG00000036271) Orangutan MODERN SPECIES 1 HNRNPH3 (ENSPPYG00000002397) RUFY2 (ENSPPYG00000002396) DNA2 (ENSPPYG00000002395) SLC25A16 (ENSPPYG00000002394) TET1 (ENSPPYG00000002393) CCAR1 (ENSPPYG00000002392) STOX1 (ENSPPYG00000002391) DDX50 (ENSPPYG00000002390) DDX21 (ENSPPYG00000002389) KIFBP (ENSPPYG00000002388) SRGN (ENSPPYG00000002387) VPS26A (ENSPPYG00000002386) SUPV3L1 (ENSPPYG00000002385) HKDC1 (ENSPPYG00000002384) #21 TACR2 (ENSPPYG00000002382) #23 HK1 (ENSPPYG00000002383) #22 TSPAN15 (ENSPPYG00000002381) #25 NEUROG3 (ENSPPYG00000002380) ENSPPYG00000002379 #27 COL13A1 (ENSPPYG00000002378) #29 MACROH2A2 (ENSPPYG00000002377) #30 AIFM2 (ENSPPYG00000002376) #31 TYSND1 (ENSPPYG00000002375) #32 SAR1A (ENSPPYG00000002374) ##33 PPA1 (ENSPPYG00000029405) #34 NPFFR1 (ENSPPYG00000002373) #35 LRRC20 (ENSPPYG00000002372) #37 ENSPPYG00000038976 EIF4EBP2 (ENSPPYG00000002371) NODAL (ENSPPYG00000002370) PALD1 (ENSPPYG00000002369) Gibbon MODERN SPECIES 8 HNRNPH3 (ENSNLEG00000011843) RUFY2 (ENSNLEG00000011835) ENSNLEG00000030777 ENSNLEG00000011828 SLC25A16 (ENSNLEG00000034221) TET1 (ENSNLEG00000011782) CCAR1 (ENSNLEG00000011679) STOX1 (ENSNLEG00000011670) DDX50 (ENSNLEG00000011631) DDX21 (ENSNLEG00000011591) KIFBP (ENSNLEG00000011578) SRGN (ENSNLEG00000011575) VPS26A (ENSNLEG00000011548) SUPV3L1 (ENSNLEG00000011521) HKDC1 (ENSNLEG00000026747) #21 HK1 (ENSNLEG00000011439) #22 TACR2 (ENSNLEG00000011432) #23 TSPAN15 (ENSNLEG00000011425) #25 FAM241B (ENSNLEG00000030107) #27 ENSNLEG00000027659 #28 COL13A1 (ENSNLEG00000011295) #29 MACROH2A2 (ENSNLEG00000011286) #30 AIFM2 (ENSNLEG00000011281) #31 TYSND1 (ENSNLEG00000011278) #32 SAR1A (ENSNLEG00000011243) ##33 ENSNLEG00000028181 ENSNLEG00000034925 ENSNLEG00000011224 ENSNLEG00000011116 ENSNLEG00000035808 ENSNLEG00000035798 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000017595 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 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ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000163077 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00860000135785 #28 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.a ##33 ENSGT00390000017004.a.b.k #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342.l ENSGT00940000160223 Cebidae_a DUPLICATION Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00390000017595 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.a.b ENSGT00940000155043 ENSGT00390000013819 ENSGT00390000000885 ENSGT00950000183064.a.b.b ENSGT00390000003100 ENSGT00950000182787.B #21 ENSGT00950000182787.A.c #22 ENSGT00940000155512 #23 ENSGT00940000157973 #25 ENSGT00940000154340.B #27 ENSGT00860000135785 #28 ENSGT00940000154865 #29 ENSGT00940000158120 #30 ENSGT00390000004582 #31 ENSGT00390000014627 #32 ENSGT00940000155276.x.a.a ##33 ENSGT00390000017004.a.b.k #34 ENSGT01070000253744.b.a.b #35 ENSGT00730000111199 #37 ENSGT00940000155342.l ENSGT00940000160223 ENSGT00390000005448 Capuchin MODERN SPECIES 215 TET1 (ENSCCAG00000024112) CCAR1 (ENSCCAG00000020659) STOX1 (ENSCCAG00000028086) DDX50 (ENSCCAG00000030543) DDX21 (ENSCCAG00000026288) ENSCCAG00000008148 KIFBP (ENSCCAG00000029878) SRGN (ENSCCAG00000037221) VPS26A (ENSCCAG00000021117) SUPV3L1 (ENSCCAG00000033975) HKDC1 (ENSCCAG00000027269) #21 ENSCCAG00000032765 #22 TACR2 (ENSCCAG00000022336) #23 TSPAN15 (ENSCCAG00000029490) #25 FAM241B (ENSCCAG00000032184) #27 COL13A1 (ENSCCAG00000035276) #29 MACROH2A2 (ENSCCAG00000034612) #30 AIFM2 (ENSCCAG00000037129) #31 TYSND1 (ENSCCAG00000028714) #32 SAR1A (ENSCCAG00000019722) ##33 PPA1 (ENSCCAG00000032333) #34 NPFFR1 (ENSCCAG00000022929) #35 LRRC20 (ENSCCAG00000023860) #37 ENSCCAG00000008526 EIF4EBP2 (ENSCCAG00000037637) NODAL (ENSCCAG00000032672) PALD1 (ENSCCAG00000030277) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 72 RUFY2 (ENSSBOG00000026822) DNA2 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Squirrel MODERN SPECIES 121 ATOH7 (ENSSTOG00000023613) PBLD (ENSSTOG00000006239) HNRNPH3 (ENSSTOG00000011676) RUFY2 (ENSSTOG00000011678) DNA2 (ENSSTOG00000011694) SLC25A16 (ENSSTOG00000005718) TET1 (ENSSTOG00000001527) CCAR1 (ENSSTOG00000001539) STOX1 (ENSSTOG00000026910) DDX50 (ENSSTOG00000021852) DDX21 (ENSSTOG00000011572) KIFBP (ENSSTOG00000007759) VPS26A (ENSSTOG00000009077) SUPV3L1 (ENSSTOG00000000503) HKDC1 (ENSSTOG00000000509) #21 HK1 (ENSSTOG00000023877) #22 TACR2 (ENSSTOG00000003412) #23 TSPAN15 (ENSSTOG00000002523) #25 NEUROG3 (ENSSTOG00000026959) FAM241B (ENSSTOG00000021554) #27 COL13A1 (ENSSTOG00000012691) #29 MACROH2A2 (ENSSTOG00000012745) #30 AIFM2 (ENSSTOG00000012754) #31 TYSND1 (ENSSTOG00000019783) #32 SAR1A (ENSSTOG00000012780) #33 PPA1 (ENSSTOG00000030397) #34 NPFFR1 (ENSSTOG00000021939) #35 LRRC20 (ENSSTOG00000025273) #37 EIF4EBP2 (ENSSTOG00000012937) NODAL (ENSSTOG00000012946) PALD1 (ENSSTOG00000012949) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 DNA2 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