Tetrapoda	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000166322	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.b	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257	ENSGT00390000006883
Amniota	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000166322	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Mammalia	ANCESTRAL SPECIES	28														ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Theria	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Eutheria	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Boreoeutheria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006
Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Glires	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Lagomorpha	ANCESTRAL SPECIES	84	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999.f	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00940000155050
Pika	MODERN SPECIES	5434																TJP1 (ENSOPRG00000000139) #22
Rabbit	MODERN SPECIES	8									LRRK1 (ENSOCUG00000008730)	CHSY1 (ENSOCUG00000012017)	ENSOCUG00000022773	ENSOCUG00000017417	PCSK6 (ENSOCUG00000017423)	TM2D3 (ENSOCUG00000010730)	TARS3 (ENSOCUG00000010740)	TJP1 (ENSOCUG00000004338) #22	NSMCE3 (ENSOCUG00000007912)	ENTREP2 (ENSOCUG00000012443)	APBA2 (ENSOCUG00000012437)	ENSOCUG00000008055	MPHOSPH10 (ENSOCUG00000025115)	FAN1 (ENSOCUG00000004306)	MTMR10 (ENSOCUG00000023083)	TRPM1 (ENSOCUG00000004314)	ENSOCUG00000035146	OTUD7A (ENSOCUG00000013856)	ENSOCUG00000025900	CHRNA7 (ENSOCUG00000002580)	ENSOCUG00000031359	MKRN3 (ENSOCUG00000012822)	ENSOCUG00000024436
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	334	ENSDORG00000011292	Mef2a (ENSDORG00000015216)	Lysmd4 (ENSDORG00000015221)	Adamts17 (ENSDORG00000001554)	Cers3 (ENSDORG00000008447)	Lins1 (ENSDORG00000008450)	Asb7 (ENSDORG00000008451)	Aldh1a3 (ENSDORG00000000437)	Lrrk1 (ENSDORG00000012588)	Chsy1 (ENSDORG00000000921)	Selenos (ENSDORG00000000922)	Snrpa1 (ENSDORG00000000924)	Pcsk6 (ENSDORG00000000370)	Tm2d3 (ENSDORG00000009651)	Tarsl2 (ENSDORG00000009653)	Tjp1 (ENSDORG00000013416) #22	Entrep2 (ENSDORG00000004962)	ENSDORG00000014998	Nsmce3 (ENSDORG00000004984)	Apba2 (ENSDORG00000004960)	Mcee (ENSDORG00000006006)	Mphosph10 (ENSDORG00000006007)	ENSDORG00000014623	ENSDORG00000024136	ENSDORG00000014624	ENSDORG00000026264	ENSDORG00000023169	Otud7a (ENSDORG00000029796)	Chrna7 (ENSDORG00000010785)	Mkrn3 (ENSDORG00000027697)	Snurf (ENSDORG00000006871)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Lesser Egyptian jerboa	MODERN SPECIES	65	Igf1r (ENSJJAG00000012323)	ENSJJAG00000015758	Ttc23 (ENSJJAG00000024024)	Lrrc28 (ENSJJAG00000015208)	Mef2a (ENSJJAG00000002371)	Adamts17 (ENSJJAG00000023730)	Cers3 (ENSJJAG00000000723)	Lins1 (ENSJJAG00000015527)	Asb7 (ENSJJAG00000004197)	Aldh1a3 (ENSJJAG00000004688)	Lrrk1 (ENSJJAG00000021788)	ENSJJAG00000014263	Snrpa1 (ENSJJAG00000002769)	Pcsk6 (ENSJJAG00000018978)	Tm2d3 (ENSJJAG00000010106)	Tjp1 (ENSJJAG00000016703) #22	Nsmce3 (ENSJJAG00000006681)	ENSJJAG00000022341	Mcee (ENSJJAG00000019373)	Mphosph10 (ENSJJAG00000015017)	ENSJJAG00000020014	ENSJJAG00000009888	ENSJJAG00000013096	ENSJJAG00000014501	Klf13 (ENSJJAG00000009193)	Otud7a (ENSJJAG00000006860)	Chrna7 (ENSJJAG00000010489)	Mkrn3 (ENSJJAG00000007520)	Ndn (ENSJJAG00000002618)
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Upper Galilee mountains blind mole rat	MODERN SPECIES	1493	Mef2a (ENSNGAG00000000879)	Lysmd4 (ENSNGAG00000013974)	Adamts17 (ENSNGAG00000014108)	Cers3 (ENSNGAG00000010966)	Lins1 (ENSNGAG00000013666)	Asb7 (ENSNGAG00000014776)	Aldh1a3 (ENSNGAG00000017800)	Lrrk1 (ENSNGAG00000003967)	Chsy1 (ENSNGAG00000010613)	Selenos (ENSNGAG00000015323)	ENSNGAG00000018606	Pcsk6 (ENSNGAG00000019875)	Tm2d3 (ENSNGAG00000021108)	Tarsl2 (ENSNGAG00000020451)	ENSNGAG00000012775	Tjp1 (ENSNGAG00000020850) #22
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000165193	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	101	Adamts17 (ENSCGRG00001015416)	Cers3 (ENSCGRG00001019177)	Lins1 (ENSCGRG00001016676)	Asb7 (ENSCGRG00001013196)	Aldh1a3 (ENSCGRG00001010590)	ENSCGRG00001008545	Lrrk1 (ENSCGRG00001013893)	Chsy1 (ENSCGRG00001021727)	Selenos (ENSCGRG00001011589)	Snrpa1 (ENSCGRG00001008779)	Pcsk6 (ENSCGRG00001018811)	ENSCGRG00001008890	Tm2d3 (ENSCGRG00001000383)	Tarsl2 (ENSCGRG00001020827)	ENSCGRG00001019466	Tjp1 (ENSCGRG00001006076) #22	Entrep2 (ENSCGRG00001021998)	Apba2 (ENSCGRG00001018432)	Mcee (ENSCGRG00001014675)	Mphosph10 (ENSCGRG00001008929)	Fan1 (ENSCGRG00001003086)	Mtmr10 (ENSCGRG00001019972)	Trpm1 (ENSCGRG00001014455)	ENSCGRG00001012379	Klf13 (ENSCGRG00001011758)	Cks1brt (ENSCGRG00001022286)	Otud7a (ENSCGRG00001017521)	Chrna7 (ENSCGRG00001013144)	ENSCGRG00001012028	ENSCGRG00001010545	ENSCGRG00001009285
Golden Hamster	MODERN SPECIES	784						Lins1 (ENSMAUG00000003116)	Asb7 (ENSMAUG00000002152)	Aldh1a3 (ENSMAUG00000001172)	ENSMAUG00000017174	Chsy1 (ENSMAUG00000016433)	Selenos (ENSMAUG00000016380)	Snrpa1 (ENSMAUG00000015339)	Pcsk6 (ENSMAUG00000014453)	Tm2d3 (ENSMAUG00000013075)	Tarsl2 (ENSMAUG00000015756)	Tjp1 (ENSMAUG00000013900) #22	ENSMAUG00000011696	ENSMAUG00000011467	ENSMAUG00000013244	Apba2 (ENSMAUG00000011250)	Mcee (ENSMAUG00000010668)	Mphosph10 (ENSMAUG00000012089)	Fan1 (ENSMAUG00000010947)	Mtmr10 (ENSMAUG00000009670)	Trpm1 (ENSMAUG00000008477)	ENSMAUG00000007909	Otud7a (ENSMAUG00000006111)	Chrna7 (ENSMAUG00000005544)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Prairie vole	MODERN SPECIES	9	Lrrc28 (ENSMOCG00000011205)	Mef2a (ENSMOCG00000020513)	Lysmd4 (ENSMOCG00000012052)	Adamts17 (ENSMOCG00000020471)	Cers3 (ENSMOCG00000014900)	Lins1 (ENSMOCG00000020979)	Asb7 (ENSMOCG00000022928)	Aldh1a3 (ENSMOCG00000002659)	Lrrk1 (ENSMOCG00000004090)	ENSMOCG00000022634	Selenos (ENSMOCG00000004767)	Snrpa1 (ENSMOCG00000008501)	Pcsk6 (ENSMOCG00000003355)	Tm2d3 (ENSMOCG00000020623)	Tarsl2 (ENSMOCG00000014909)	Tjp1 (ENSMOCG00000018692) #22	ENSMOCG00000009123	Nsmce3 (ENSMOCG00000020910)	ENSMOCG00000005919	Apba2 (ENSMOCG00000014547)	Mcee (ENSMOCG00000019465)	ENSMOCG00000015775	ENSMOCG00000022132	Fan1 (ENSMOCG00000013083)	Mtmr10 (ENSMOCG00000001956)	ENSMOCG00000001787	ENSMOCG00000011916	ENSMOCG00000015650	Klf13 (ENSMOCG00000022022)	ENSMOCG00000010298	Otud7a (ENSMOCG00000004122)
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES		Lrrc28 (ENSPEMG00000003238)	Mef2a (ENSPEMG00000031349)	ENSPEMG00000000590	Adamts17 (ENSPEMG00000010644)	Cers3 (ENSPEMG00000023207)	Lins1 (ENSPEMG00000023050)	Asb7 (ENSPEMG00000022462)	Aldh1a3 (ENSPEMG00000021611)	Lrrk1 (ENSPEMG00000019367)	Chsy1 (ENSPEMG00000019829)	Selenos (ENSPEMG00000019545)	ENSPEMG00000019673	Pcsk6 (ENSPEMG00000019946)	Tm2d3 (ENSPEMG00000009183)	Tarsl2 (ENSPEMG00000019852)	Tjp1 (ENSPEMG00000020140) #22	Entrep2 (ENSPEMG00000019895)	Apba2 (ENSPEMG00000000431)	Mcee (ENSPEMG00000013474)	Mphosph10 (ENSPEMG00000019667)	Fan1 (ENSPEMG00000019876)	Mtmr10 (ENSPEMG00000019517)	Trpm1 (ENSPEMG00000019795)	ENSPEMG00000027285	ENSPEMG00000024613	Otud7a (ENSPEMG00000019881)	ENSPEMG00000031364	Chrna7 (ENSPEMG00000015506)	ENSPEMG00000027042	ENSPEMG00000024469	Mkrn3 (ENSPEMG00000009895)
Murinae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00390000007081.b.b	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Rat	MODERN SPECIES		Lysmd4 (ENSRNOG00000050624)	Adamts17 (ENSRNOG00000037080)	Cers3 (ENSRNOG00000013823)	Lins1 (ENSRNOG00000042776)	Asb7 (ENSRNOG00000013795)	Aldh1a3 (ENSRNOG00000052070)	Lrrk1 (ENSRNOG00000012730)	Chsy1 (ENSRNOG00000012698)	Selenos (ENSRNOG00000012576)	Snrpa1 (ENSRNOG00000011932)	ENSRNOG00000070428	Pcsk6 (ENSRNOG00000011526)	AABR07004134.1 (ENSRNOG00000056928)	Tm2d3 (ENSRNOG00000011290)	Tars3 (ENSRNOG00000024460)	Tjp1 (ENSRNOG00000011077) #22	AABR07004112.1 (ENSRNOG00000016498)	Entrep2 (ENSRNOG00000023496)	Apba2 (ENSRNOG00000016358)	Mcee (ENSRNOG00000016327)	Mphosph10 (ENSRNOG00000016266)	Fan1 (ENSRNOG00000023985)	Mtmr10 (ENSRNOG00000016090)	Trpm1 (ENSRNOG00000015829)	ENSRNOG00000064709	Klf13 (ENSRNOG00000015822)	LOC120097335 (ENSRNOG00000065214)	Otud7a (ENSRNOG00000015503)	Chrna7 (ENSRNOG00000010853)	LOC102548067 (ENSRNOG00000051782)	ENSRNOG00000066862
Mus	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000169314	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00860000135847	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00390000007081.b.b	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006
Shrew mouse	MODERN SPECIES		Mef2a (MGP_PahariEiJ_G0013073)	Lysmd4 (MGP_PahariEiJ_G0013072)	Adamts17 (MGP_PahariEiJ_G0013071)	Cers3 (MGP_PahariEiJ_G0013070)	Lins1 (MGP_PahariEiJ_G0013069)	Asb7 (MGP_PahariEiJ_G0013068)	Aldh1a3 (MGP_PahariEiJ_G0013067)	Lrrk1 (MGP_PahariEiJ_G0013066)	Chsy1 (MGP_PahariEiJ_G0013065)	Selenos (MGP_PahariEiJ_G0013064)	Snrpa1 (MGP_PahariEiJ_G0013063)	MGP_PahariEiJ_G0013062	Pcsk6 (MGP_PahariEiJ_G0013061)	Tm2d3 (MGP_PahariEiJ_G0013060)	Tarsl2 (MGP_PahariEiJ_G0013059)	Tjp1 (MGP_PahariEiJ_G0013058) #22	Nsmce3 (MGP_PahariEiJ_G0013057)	Entrep2 (MGP_PahariEiJ_G0013056)	Apba2 (MGP_PahariEiJ_G0013055)	Mcee (MGP_PahariEiJ_G0013054)	Mphosph10 (MGP_PahariEiJ_G0013053)	Fan1 (MGP_PahariEiJ_G0013052)	Mtmr10 (MGP_PahariEiJ_G0013051)	Trpm1 (MGP_PahariEiJ_G0013050)	MGP_PahariEiJ_G0013049	Klf13 (MGP_PahariEiJ_G0013048)	Otud7a (MGP_PahariEiJ_G0013047)	Chrna7 (MGP_PahariEiJ_G0013046)	Peg12 (MGP_PahariEiJ_G0013045)	Mkrn3 (MGP_PahariEiJ_G0013044)	Magel2 (MGP_PahariEiJ_G0013043)
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000169314	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00860000135847	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00390000007081.b.b	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006
Ryukyu mouse	MODERN SPECIES	16	Mef2a (MGP_CAROLIEiJ_G0029848)	Lysmd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0029847)	Adamts17 (MGP_CAROLIEiJ_G0029846)	Cers3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029845)	Lins1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029844)	Asb7 (MGP_CAROLIEiJ_G0029843)	Aldh1a3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029842)	Lrrk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029841)	Chsy1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029840)	Selenos (MGP_CAROLIEiJ_G0029839)	Snrpa1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029838)	MGP_CAROLIEiJ_G0029837	Pcsk6 (MGP_CAROLIEiJ_G0029836)	Tm2d3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029835)	Tarsl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029834)	MGP_CAROLIEiJ_G0029833 #22	Nsmce3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029832)	Entrep2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029831)	Apba2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029830)	Mcee (MGP_CAROLIEiJ_G0029829)	Mphosph10 (MGP_CAROLIEiJ_G0029828)	Fan1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029827)	Mtmr10 (MGP_CAROLIEiJ_G0029826)	Trpm1 (MGP_CAROLIEiJ_G0029825)	MGP_CAROLIEiJ_G0029824	Klf13 (MGP_CAROLIEiJ_G0029823)	Otud7a (MGP_CAROLIEiJ_G0029822)	Chrna7 (MGP_CAROLIEiJ_G0029821)	Peg12 (MGP_CAROLIEiJ_G0029820)	Mkrn3 (MGP_CAROLIEiJ_G0029819)	Magel2 (MGP_CAROLIEiJ_G0029818)
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000169314	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00860000135847	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00390000007081.b.b	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000169314	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627.d.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00860000135847	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00390000007081.b.b	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006
spretus	MODERN SPECIES	16	Mef2a (MGP_SPRETEiJ_G0030951)	Lysmd4 (MGP_SPRETEiJ_G0030950)	Adamts17 (MGP_SPRETEiJ_G0030949)	Cers3 (MGP_SPRETEiJ_G0030948)	Lins1 (MGP_SPRETEiJ_G0030947)	Asb7 (MGP_SPRETEiJ_G0030946)	Aldh1a3 (MGP_SPRETEiJ_G0030945)	Lrrk1 (MGP_SPRETEiJ_G0030944)	Chsy1 (MGP_SPRETEiJ_G0030943)	Selenos (MGP_SPRETEiJ_G0030942)	Snrpa1 (MGP_SPRETEiJ_G0030941)	MGP_SPRETEiJ_G0030940	Pcsk6 (MGP_SPRETEiJ_G0030939)	Tarsl2 (MGP_SPRETEiJ_G0030938)	Tm2d3 (MGP_SPRETEiJ_G0030937)	Tjp1 (MGP_SPRETEiJ_G0030936) #22	Nsmce3 (MGP_SPRETEiJ_G0030935)	Entrep2 (MGP_SPRETEiJ_G0030934)	Apba2 (MGP_SPRETEiJ_G0030933)	Mcee (MGP_SPRETEiJ_G0030932)	Mphosph10 (MGP_SPRETEiJ_G0030931)	Fan1 (MGP_SPRETEiJ_G0030930)	Mtmr10 (MGP_SPRETEiJ_G0030929)	Trpm1 (MGP_SPRETEiJ_G0030928)	E030018B13Rik (MGP_SPRETEiJ_G0030927)	Klf13 (MGP_SPRETEiJ_G0030926)	Otud7a (MGP_SPRETEiJ_G0030925)	Chrna7 (MGP_SPRETEiJ_G0030924)	Peg12 (MGP_SPRETEiJ_G0030923)	Mkrn3 (MGP_SPRETEiJ_G0030922)	Magel2 (MGP_SPRETEiJ_G0030921)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3311	Adamts17 (ENSMSIG00000022658)	Cers3 (ENSMSIG00000022609)	Lins1 (ENSMSIG00000022573)	Asb7 (ENSMSIG00000022550)	Aldh1a3 (ENSMSIG00000022507)	Lrrk1 (ENSMSIG00000022433)	Chsy1 (ENSMSIG00000022418)	Selenos (ENSMSIG00000022389)	Snrpa1 (ENSMSIG00000022376)	Pcsk6 (ENSMSIG00000022295)	ENSMSIG00000022283	ENSMSIG00000022279	Tm2d3 (ENSMSIG00000022212)	Tarsl2 (ENSMSIG00000022170)	ENSMSIG00000022163	Tjp1 (ENSMSIG00000021781) #22	Entrep2 (ENSMSIG00000021764)	Apba2 (ENSMSIG00000021699)	Mcee (ENSMSIG00000021673)	Mphosph10 (ENSMSIG00000021637)	Fan1 (ENSMSIG00000021618)	Mtmr10 (ENSMSIG00000021602)	Trpm1 (ENSMSIG00000021252)	E030018B13Rik (ENSMSIG00000021234)	Klf13 (ENSMSIG00000021220)	ENSMSIG00000021099	Chrna7 (ENSMSIG00000021069)
Mouse	MODERN SPECIES	16	Lysmd4 (ENSMUSG00000043831)	Adamts17 (ENSMUSG00000058145)	Cers3 (ENSMUSG00000030510)	Lins1 (ENSMUSG00000053091)	Asb7 (ENSMUSG00000030509)	Aldh1a3 (ENSMUSG00000015134)	Gm10974 (ENSMUSG00000078677)	Lrrk1 (ENSMUSG00000015133)	Chsy1 (ENSMUSG00000032640)	Selenos (ENSMUSG00000075701)	Snrpa1 (ENSMUSG00000030512)	Gm45213 (ENSMUSG00000108793)	Pcsk6 (ENSMUSG00000030513)	Tm2d3 (ENSMUSG00000078681)	Tarsl2 (ENSMUSG00000030515)	Tjp1 (ENSMUSG00000030516) #22	Nsmce3 (ENSMUSG00000070520)	Entrep2 (ENSMUSG00000030518)	Apba2 (ENSMUSG00000030519)	Mcee (ENSMUSG00000033429)	Mphosph10 (ENSMUSG00000030521)	Fan1 (ENSMUSG00000033458)	Mtmr10 (ENSMUSG00000030522)	Trpm1 (ENSMUSG00000030523)	E030018B13Rik (ENSMUSG00000095061)	Klf13 (ENSMUSG00000052040)	Otud7a (ENSMUSG00000033510)	Chrna7 (ENSMUSG00000030525)	Peg12 (ENSMUSG00000070526)	Mkrn3 (ENSMUSG00000070527)	Magel2 (ENSMUSG00000056972)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	25	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	123	ENSCLAG00000013280	MEF2A (ENSCLAG00000010314)	LYSMD4 (ENSCLAG00000008806)	ADAMTS17 (ENSCLAG00000011560)	CERS3 (ENSCLAG00000010671)	LINS1 (ENSCLAG00000010190)	ASB7 (ENSCLAG00000009854)	ALDH1A3 (ENSCLAG00000010903)	LRRK1 (ENSCLAG00000015781)	CHSY1 (ENSCLAG00000010522)	SELENOS (ENSCLAG00000014232)	SNRPA1 (ENSCLAG00000016402)	PCSK6 (ENSCLAG00000013888)	TM2D3 (ENSCLAG00000012439)	TARS3 (ENSCLAG00000016873)	TJP1 (ENSCLAG00000017350) #22	ENTREP2 (ENSCLAG00000012714)	APBA2 (ENSCLAG00000009202)	MCEE (ENSCLAG00000011216)	MPHOSPH10 (ENSCLAG00000012756)	FAN1 (ENSCLAG00000011069)	MTMR10 (ENSCLAG00000011407)	TRPM1 (ENSCLAG00000013295)	ENSCLAG00000014699	ENSCLAG00000010350	ENSCLAG00000009342	ENSCLAG00000009898	CHRNA7 (ENSCLAG00000010378)	MKRN3 (ENSCLAG00000010927)	MAGEL2 (ENSCLAG00000017742)	NDN (ENSCLAG00000017784)
Degu	MODERN SPECIES	43	LYSMD4 (ENSODEG00000014842)	ADAMTS17 (ENSODEG00000014089)	CERS3 (ENSODEG00000014221)	ENSODEG00000014357	LINS1 (ENSODEG00000015320)	ASB7 (ENSODEG00000014474)	ALDH1A3 (ENSODEG00000015012)	LRRK1 (ENSODEG00000014764)	ENSODEG00000014373	ENSODEG00000014481	SELENOS (ENSODEG00000014112)	SNRPA1 (ENSODEG00000014103)	PCSK6 (ENSODEG00000013651)	TM2D3 (ENSODEG00000014026)	TARS3 (ENSODEG00000014454)	TJP1 (ENSODEG00000015556) #22	ENTREP2 (ENSODEG00000013447)	APBA2 (ENSODEG00000015323)	MCEE (ENSODEG00000014489)	ENSODEG00000013751	FAN1 (ENSODEG00000013994)	ENSODEG00000013732	ENSODEG00000014974	ENSODEG00000014086	ENSODEG00000013964	ENSODEG00000013811	OTUD7A (ENSODEG00000013975)	Chrna7 (ENSODEG00000013998)	MAGEL2 (ENSODEG00000014234)	ENSODEG00000013159	ENSODEG00000013478
Guinea pig	MODERN SPECIES	10	TTC23 (ENSCPOG00000003733)	LRRC28 (ENSCPOG00000007104)	MEF2A (ENSCPOG00000008716)	LYSMD4 (ENSCPOG00000035578)	ADAMTS17 (ENSCPOG00000009337)	LINS1 (ENSCPOG00000002249)	ASB7 (ENSCPOG00000038812)	ENSCPOG00000032250	LRRK1 (ENSCPOG00000008329)	CHSY1 (ENSCPOG00000039485)	SELENOS (ENSCPOG00000022558)	SNRPA1 (ENSCPOG00000005735)	PCSK6 (ENSCPOG00000005722)	TM2D3 (ENSCPOG00000008845)	TARS3 (ENSCPOG00000008850)	TJP1 (ENSCPOG00000010928) #22	ENTREP2 (ENSCPOG00000002510)	APBA2 (ENSCPOG00000002505)	MCEE (ENSCPOG00000035430)	MPHOSPH10 (ENSCPOG00000013444)	FAN1 (ENSCPOG00000013317)	MTMR10 (ENSCPOG00000013322)	TRPM1 (ENSCPOG00000013326)	ENSCPOG00000030034	OTUD7A (ENSCPOG00000023179)	CHRNA7 (ENSCPOG00000040021)	MAGEL2 (ENSCPOG00000035142)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	6	ENSHGLG00000036552	ENSHGLG00000038548	ADAMTS17 (ENSHGLG00000014955)	CERS3 (ENSHGLG00000014885)	LINS (ENSHGLG00000034641)	ASB7 (ENSHGLG00000039786)	ENSHGLG00000005801	ALDH1A3 (ENSHGLG00000013998)	LRRK1 (ENSHGLG00000013404)	ENSHGLG00000013695	VIMP (ENSHGLG00000013427)	SNRPA1 (ENSHGLG00000012987)	PCSK6 (ENSHGLG00000012908)	TM2D3 (ENSHGLG00000012566)	ENSHGLG00000011618	ENSHGLG00000011310 #22	ENSHGLG00000010825	ENSHGLG00000010225	MCEE (ENSHGLG00000009474)	ENSHGLG00000009125	FAN1 (ENSHGLG00000020643)	ENSHGLG00000008430	ENSHGLG00000008099	KLF13 (ENSHGLG00000044507)	OTUD7A (ENSHGLG00000008007)	ENSHGLG00000007956	ENSHGLG00000034954	ENSHGLG00000041264	ENSHGLG00000012821	ENSHGLG00000020818	NDN (ENSHGLG00000048511)
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	11	ENSSVLG00005001603	CERS3 (ENSSVLG00005001575)	LINS1 (ENSSVLG00005001550)	ASB7 (ENSSVLG00005001524)	ENSSVLG00005001507	ALDH1A3 (ENSSVLG00005001477)	LRRK1 (ENSSVLG00005001450)	CHSY1 (ENSSVLG00005001428)	SELENOS (ENSSVLG00005001411)	ENSSVLG00005001395	ENSSVLG00005001386	SNRPA1 (ENSSVLG00005001365)	PCSK6 (ENSSVLG00005001247)	TM2D3 (ENSSVLG00005001095)	TARS3 (ENSSVLG00005001030)	TJP1 (ENSSVLG00005000933) #22	ENSSVLG00005000860	ENTREP2 (ENSSVLG00005000828)	APBA2 (ENSSVLG00005000759)	ENSSVLG00005000712	ENSSVLG00005000687	MCEE (ENSSVLG00005000669)	MPHOSPH10 (ENSSVLG00005000639)	FAN1 (ENSSVLG00005000605)	MTMR10 (ENSSVLG00005000571)	TRPM1 (ENSSVLG00005000435)	KLF13 (ENSSVLG00005000287)	OTUD7A (ENSSVLG00005000272)	ENSSVLG00005000226	ENSSVLG00005000200	ENSSVLG00005000184
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	46	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999
Alpin marmot	MODERN SPECIES	33	ADAMTS17 (ENSMMMG00000021021)	ENSMMMG00000021070	CERS3 (ENSMMMG00000021095)	LINS1 (ENSMMMG00000021112)	ASB7 (ENSMMMG00000021137)	ENSMMMG00000021145	ALDH1A3 (ENSMMMG00000021150)	LRRK1 (ENSMMMG00000021169)	CHSY1 (ENSMMMG00000021189)	SELENOS (ENSMMMG00000021199)	SNRPA1 (ENSMMMG00000021206)	PCSK6 (ENSMMMG00000021221)	TM2D3 (ENSMMMG00000021261)	TARS3 (ENSMMMG00000021271)	ENSMMMG00000021280	TJP1 (ENSMMMG00000021295) #22	ENTREP2 (ENSMMMG00000021334)	APBA2 (ENSMMMG00000021344)	MCEE (ENSMMMG00000021367)	MPHOSPH10 (ENSMMMG00000021375)	FAN1 (ENSMMMG00000021382)	MTMR10 (ENSMMMG00000021458)	ENSMMMG00000021473	ENSMMMG00000021489	OTUD7A (ENSMMMG00000021494)	ENSMMMG00000021501	CHRNA7 (ENSMMMG00000021504)	NANP (ENSMMMG00000021513)	ENSMMMG00000021516	NINL (ENSMMMG00000021519)	GINS1 (ENSMMMG00000021538)
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b.a	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999
Squirrel	MODERN SPECIES	83	LYSMD4 (ENSSTOG00000005427)	ADAMTS17 (ENSSTOG00000004497)	CERS3 (ENSSTOG00000004541)	LINS1 (ENSSTOG00000004562)	ASB7 (ENSSTOG00000024134)	ALDH1A3 (ENSSTOG00000008968)	LRRK1 (ENSSTOG00000008982)	ENSSTOG00000022852	CHSY1 (ENSSTOG00000009033)	SELENOS (ENSSTOG00000009048)	ENSSTOG00000009055	ENSSTOG00000031974	PCSK6 (ENSSTOG00000009068)	TM2D3 (ENSSTOG00000009090)	TARS3 (ENSSTOG00000032725)	TJP1 (ENSSTOG00000011142) #22	ENSSTOG00000030901	NSMCE3 (ENSSTOG00000000177)	ENTREP2 (ENSSTOG00000000176)	APBA2 (ENSSTOG00000000174)	MCEE (ENSSTOG00000027689)	MPHOSPH10 (ENSSTOG00000004999)	FAN1 (ENSSTOG00000008830)	MTMR10 (ENSSTOG00000008851)	TRPM1 (ENSSTOG00000012791)	KLF13 (ENSSTOG00000022758)	OTUD7A (ENSSTOG00000012807)
Arctic ground squirrel	DUPLICATION
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	347																TJP1 (ENSUPAG00010008691) #22	ENTREP2 (ENSUPAG00010008657)	APBA2 (ENSUPAG00010008598)	MCEE (ENSUPAG00010008580)	MPHOSPH10 (ENSUPAG00010008570)	FAN1 (ENSUPAG00010008548)	MTMR10 (ENSUPAG00010008530)	ENSUPAG00010008511	KLF13 (ENSUPAG00010008505)	OTUD7A (ENSUPAG00010008486)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	66													TMEM252 (ENSUPAG00010023485)	PIP5K1B (ENSUPAG00010023486)	FXN (ENSUPAG00010023488)	ENSUPAG00010023490 #22	ENSUPAG00010023493	ENTREP1 (ENSUPAG00010023494)	APBA1 (ENSUPAG00010023495)	PTAR1 (ENSUPAG00010023497)	ENSUPAG00010023498	CFAP95 (ENSUPAG00010023499)	ENSUPAG00010023500	MAMDC2 (ENSUPAG00010023501)	ENSUPAG00010023502	SMC5 (ENSUPAG00010023503)	KLF9 (ENSUPAG00010023504)	TRPM3 (ENSUPAG00010023505)	CEMIP2 (ENSUPAG00010023510)	ABHD17B (ENSUPAG00010023511)	C9orf85 (ENSUPAG00010023512)
Tree shrew	MODERN SPECIES	8																TJP1 (ENSTBEG00000015117) #22
Primates	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00910000146870	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	49	ENSGT00910000146870	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	28	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00910000146969	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000164524
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	20																ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00910000147908	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT00940000154289.A.b
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	20															ENSGT00950000182935.B.a.q.a.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00910000147908	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT00940000154289.A.b	ENSGT00940000153380.B
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	22															ENSGT00950000182935.B.a.q.a.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000159607.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT00940000154289.A.b	ENSGT00940000153380.B
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	22													ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.e	ENSGT00940000163338.b.b.c	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.f.a.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000159607.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00950000182976.b.a.l.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT00940000154289.A.b
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	21															ENSGT00950000182935.B.a.q.a.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00950000182976.b.a.l.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.f.a.b.a	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT00940000154289.A.b
Pan	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00950000186460	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222	ENSGT00940000164524	ENSGT00940000155050.c.a	ENSGT00940000157895	ENSGT00390000003791.h	ENSGT00940000154713.A	ENSGT00940000156234	ENSGT00940000155607	ENSGT01030000234550.b	ENSGT00940000154975	ENSGT00950000182935.B.a.q.a.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00950000182976.b.a.l.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154289.A.b	ENSGT00940000155507.b	ENSGT00390000003299
Bonobo	MODERN SPECIES	6	SNRPN (ENSPPAG00000027650)	SNURF (ENSPPAG00000030924)	ENSPPAG00000035186	ENSPPAG00000043325	UBE3A (ENSPPAG00000037743)	ATP10A (ENSPPAG00000007479)	ENSPPAG00000037400	GABRB3 (ENSPPAG00000039754)	GABRA5 (ENSPPAG00000037305)	GABRG3 (ENSPPAG00000036643)	OCA2 (ENSPPAG00000036995)	HERC2 (ENSPPAG00000031770)	ENSPPAG00000032441	ENSPPAG00000037540	ENSPPAG00000011211	TJP1 (ENSPPAG00000040608) #22	ENSPPAG00000035869	ENTREP2 (ENSPPAG00000042380)	NSMCE3 (ENSPPAG00000037064)	APBA2 (ENSPPAG00000031729)	FAN1 (ENSPPAG00000042025)	MTMR10 (ENSPPAG00000029044)	TRPM1 (ENSPPAG00000031509)	ENSPPAG00000029553	ENSPPAG00000003385	ENSPPAG00000041500	CHRNA7 (ENSPPAG00000026369)	ARHGAP11A (ENSPPAG00000028182)	SCG5 (ENSPPAG00000041306)	FMN1 (ENSPPAG00000040177)	RYR3 (ENSPPAG00000030728)
Chimpanzee	MODERN SPECIES	6	ENSPTRG00000046808	UBE3A (ENSPTRG00000006829)	ATP10A (ENSPTRG00000030356)	ENSPTRG00000047058	GABRB3 (ENSPTRG00000006831)	GABRA5 (ENSPTRG00000006832)	GABRG3 (ENSPTRG00000052476)	OCA2 (ENSPTRG00000006834)	ENSPTRG00000050016	ENSPTRG00000046635	ENSPTRG00000006850	ENSPTRG00000030350	ENSPTRG00000043911	ENSPTRG00000041722	ENSPTRG00000033952	TJP1 (ENSPTRG00000006846) #22	ENSPTRG00000049709	ENSPTRG00000048730	ENTREP2 (ENSPTRG00000006843)	APBA2 (ENSPTRG00000006842)	ENSPTRG00000043841	ENSPTRG00000007519	ENSPTRG00000030342	FAN1 (ENSPTRG00000006854)	MTMR10 (ENSPTRG00000006858)	TRPM1 (ENSPTRG00000006859)	KLF13 (ENSPTRG00000043659)	ENSPTRG00000048834	ENSPTRG00000051792	OTUD7A (ENSPTRG00000006863)	ENSPTRG00000048046
Human	MODERN SPECIES	6	GOLGA8K (ENSG00000249931)	CHRNA7 (ENSG00000175344)	OTUD7A (ENSG00000169918)	KLF13 (ENSG00000169926)	TRPM1 (ENSG00000134160)	MTMR10 (ENSG00000166912)	FAN1 (ENSG00000198690)	ENSG00000284906	ARHGAP11B (ENSG00000285077)	GOLGA8H (ENSG00000261794)	GOLGA8Q (ENSG00000178115)	GOLGA8R (ENSG00000186399)	CHRFAM7A (ENSG00000166664)	GOLGA8T (ENSG00000261247)	GOLGA8J (ENSG00000179938)	TJP1 (ENSG00000104067) #22	NSMCE3 (ENSG00000185115)	ENTREP2 (ENSG00000104059)	APBA2 (ENSG00000034053)	GOLGA6L7 (ENSG00000261649)	GOLGA8M (ENSG00000188626)	GOLGA6L25 (ENSG00000227717)	GOLGA8G (ENSG00000183629)	GOLGA8F (ENSG00000153684)	GOLGA6L24 (ENSG00000237850)	HERC2 (ENSG00000128731)	OCA2 (ENSG00000104044)	GABRG3 (ENSG00000182256)	GABRA5 (ENSG00000186297)	GABRB3 (ENSG00000166206)	ATP10A (ENSG00000206190)
Gorilla	MODERN SPECIES	6	RYR3 (ENSGGOG00000009119)	FMN1 (ENSGGOG00000001109)	ENSGGOG00000005327	SCG5 (ENSGGOG00000016369)	ARHGAP11A (ENSGGOG00000016353)	CHRNA7 (ENSGGOG00000026588)	ENSGGOG00000036787	OTUD7A (ENSGGOG00000008369)	ENSGGOG00000028432	KLF13 (ENSGGOG00000007907)	TRPM1 (ENSGGOG00000016762)	MTMR10 (ENSGGOG00000001943)	FAN1 (ENSGGOG00000001940)	CHRFAM7A (ENSGGOG00000028541)	ENSGGOG00000041887	ENSGGOG00000022637 #22	ENSGGOG00000012146	APBA2 (ENSGGOG00000005676)	ENSGGOG00000027053	ENSGGOG00000026476	HERC2 (ENSGGOG00000012785)	ENSGGOG00000039106	OCA2 (ENSGGOG00000005900)	GABRG3 (ENSGGOG00000036478)	GABRA5 (ENSGGOG00000036809)	GABRB3 (ENSGGOG00000011207)	ENSGGOG00000037903	ATP10A (ENSGGOG00000001775)	UBE3A (ENSGGOG00000003955)	SNRPN (ENSGGOG00000003988)	SNURF (ENSGGOG00000042638)
Orangutan	MODERN SPECIES	6	ATP10A (ENSPPYG00000006273)	UBE3A (ENSPPYG00000006272)	ENSPPYG00000032699	SNURF (ENSPPYG00000006269)	NPAP1 (ENSPPYG00000006268)	NDN (ENSPPYG00000006267)	MAGEL2 (ENSPPYG00000033115)	ENSPPYG00000031637	ENSPPYG00000006284	ENSPPYG00000033109	ENSPPYG00000032068	ENSPPYG00000030048	ENSPPYG00000032030	ENSPPYG00000034029	ENSPPYG00000038719	TJP1 (ENSPPYG00000006283) #22	ENTREP2 (ENSPPYG00000006281)	APBA2 (ENSPPYG00000006280)	ENSPPYG00000006249	FAN1 (ENSPPYG00000006288)	MTMR10 (ENSPPYG00000006289)	TRPM1 (ENSPPYG00000006290)	KLF13 (ENSPPYG00000040736)	ENSPPYG00000036299	OTUD7A (ENSPPYG00000006293)	CHRNA7 (ENSPPYG00000006295)	ENSPPYG00000019917	ENSPPYG00000040501	ARHGAP11A (ENSPPYG00000006299)	SCG5 (ENSPPYG00000006300)	ENSPPYG00000006301
Gibbon	MODERN SPECIES	21	AVEN (ENSNLEG00000010751)	RYR3 (ENSNLEG00000010690)	FMN1 (ENSNLEG00000010682)	ENSNLEG00000010680	SCG5 (ENSNLEG00000010645)	ARHGAP11A (ENSNLEG00000010589)	ENSNLEG00000030683	ENSNLEG00000007557	ENSNLEG00000007556	ENSNLEG00000007555	TRPM1 (ENSNLEG00000007538)	MTMR10 (ENSNLEG00000007537)	ENSNLEG00000030565	FAN1 (ENSNLEG00000007533)	ENSNLEG00000012458	TJP1 (ENSNLEG00000012450) #22	ENTREP2 (ENSNLEG00000012443)	APBA2 (ENSNLEG00000012430)	HERC2 (ENSNLEG00000010563)	OCA2 (ENSNLEG00000010539)	GABRG3 (ENSNLEG00000010534)	GABRA5 (ENSNLEG00000032139)	GABRB3 (ENSNLEG00000001628)	ENSNLEG00000035717	ATP10A (ENSNLEG00000001532)	UBE3A (ENSNLEG00000001407)	ENSNLEG00000001404	ENSNLEG00000032294	SNRPN (ENSNLEG00000001376)	ENSNLEG00000001365	ENSNLEG00000028122
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	21																ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00910000147908	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES	2																ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00910000147908	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000163084	ENSGT00940000163006	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163338.b.b.a	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000161911	ENSGT00910000146953	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00910000147908	ENSGT00390000018637	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00910000147983	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT00940000154289.A.b	ENSGT00940000155507.b	ENSGT00390000003299	ENSGT00940000158450	ENSGT00390000017490	ENSGT00940000164464	ENSGT00390000012351	ENSGT00390000006970	ENSGT01100000263737
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	30	ENSGT00940000163338.b.a.a	ENSGT00940000159067	ENSGT00940000155651	ENSGT00500000044831.a.b	ENSGT00940000155962	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000161911	ENSGT00910000146953	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00910000147908	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00910000147983	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154158.k.b.b.a.a	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT00940000154289.A.b	ENSGT00940000155507.b	ENSGT00390000003299	ENSGT00940000158450	ENSGT00390000017490	ENSGT00940000164464	ENSGT00390000012351	ENSGT00390000006970
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	250															ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b.b	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00910000147983	ENSGT00940000158943
Drill	MODERN SPECIES	1189															ENSMLEG00000030074	TJP1 (ENSMLEG00000026365) #22	ENTREP2 (ENSMLEG00000030092)	ENSMLEG00000043228	APBA2 (ENSMLEG00000027803)
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	262																TJP1 (ENSCATG00000035268) #22	ENSCATG00000019322	ENTREP2 (ENSCATG00000033378)	ENSCATG00000020514	APBA2 (ENSCATG00000030411)
Olive baboon	MODERN SPECIES	17	HERC2 (ENSPANG00000048246)	ENSPANG00000020047	NIPA1 (ENSPANG00000020062)	NIPA2 (ENSPANG00000020065)	CYFIP1 (ENSPANG00000020068)	TUBGCP5 (ENSPANG00000020044)	CHRNA7 (ENSPANG00000019953)	OTUD7A (ENSPANG00000019951)	KLF13 (ENSPANG00000044647)	TRPM1 (ENSPANG00000020025)	MTMR10 (ENSPANG00000020027)	FAN1 (ENSPANG00000020031)	ENSPANG00000040119	ENSPANG00000040815	ENSPANG00000050588	TJP1 (ENSPANG00000020052) #22	ENSPANG00000038984	ENTREP2 (ENSPANG00000020051)	ENSPANG00000043826	APBA2 (ENSPANG00000020050)	ARHGAP11A (ENSPANG00000019871)	GREM1 (ENSPANG00000003456)	FMN1 (ENSPANG00000019875)	ENSPANG00000047014	ENSPANG00000038173	RYR3 (ENSPANG00000019876)	AVEN (ENSPANG00000019877)	CHRM5 (ENSPANG00000003218)	EMC7 (ENSPANG00000019866)	PGBD4 (ENSPANG00000019855)	KATNBL1 (ENSPANG00000019856)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00910000147623	ENSGT00940000163084	ENSGT00940000163006	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163338.b.a.b	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000161911	ENSGT00910000146953	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00910000147983	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT00940000154158.k.b.b.a.a	ENSGT00940000154289.A.b	ENSGT00940000155507.b	ENSGT00390000003299	ENSGT00940000158450	ENSGT00390000017490	ENSGT00940000164464	ENSGT00390000012351	ENSGT00390000006970
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000153253.b.a.h	ENSGT00940000153104.e.b.a.b	ENSGT00940000163084	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163338.b.b.a	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000161911	ENSGT00910000146953	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.b.b.a	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000161627.a.a.a.b.a.b.b.a.a.b.a	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000167556.b.b.a.b.a.a.a.b.a.b.a.a.a.b	ENSGT00940000163627	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000155312	ENSGT00390000009816.g	ENSGT00940000154209.a.a	ENSGT01100000263543.a.g.b.a.b.b.b	ENSGT00940000154289.A.b	ENSGT00940000155507.b	ENSGT00390000003299	ENSGT00940000158450	ENSGT00390000017490	ENSGT00940000164464
Rhesus	MODERN SPECIES	17	ENSMMUG00000063268	ENSMMUG00000060334	ENSMMUG00000061747	ENSMMUG00000060774	CHRNA7 (ENSMMUG00000022577)	ENSMMUG00000056012	ENSMMUG00000055731	ENSMMUG00000055120	OTUD7A (ENSMMUG00000012838)	KLF13 (ENSMMUG00000049198)	ENSMMUG00000053369	TRPM1 (ENSMMUG00000009430)	MTMR10 (ENSMMUG00000009428)	FAN1 (ENSMMUG00000009426)	ENSMMUG00000056650	TJP1 (ENSMMUG00000017878) #22	ENSMMUG00000051607	ENTREP2 (ENSMMUG00000019340)	ENSMMUG00000059797	APBA2 (ENSMMUG00000019339)	ENSMMUG00000061013	ARHGAP11A (ENSMMUG00000012276)	SCG5 (ENSMMUG00000012283)	GREM1 (ENSMMUG00000001810)	ENSMMUG00000054910	FMN1 (ENSMMUG00000029785)	RYR3 (ENSMMUG00000005270)	AVEN (ENSMMUG00000005278)	CHRM5 (ENSMMUG00000014227)	EMC7 (ENSMMUG00000000010)	PGBD4 (ENSMMUG00000045684)
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	17	ENSMFAG00000059685	ENSMFAG00000051242	ENSMFAG00000060699	ENSMFAG00000057119	ENSMFAG00000045338	ENSMFAG00000048954	CHRFAM7A (ENSMFAG00000001387)	ENSMFAG00000052082	OTUD7A (ENSMFAG00000037629)	ENSMFAG00000043427	ENSMFAG00000059199	ENSMFAG00000053160	TRPM1 (ENSMFAG00000003445)	MTMR10 (ENSMFAG00000038584)	FAN1 (ENSMFAG00000032666)	TJP1 (ENSMFAG00000037125) #22	ENSMFAG00000055422	ENSMFAG00000060363	ENTREP2 (ENSMFAG00000001681)	ENSMFAG00000057948	ENSMFAG00000058292	APBA2 (ENSMFAG00000040758)	ENSMFAG00000062848	ARHGAP11A (ENSMFAG00000032131)	ENSMFAG00000032414	GREM1 (ENSMFAG00000065206)	ENSMFAG00000052496	FMN1 (ENSMFAG00000036844)	RYR3 (ENSMFAG00000036819)	AVEN (ENSMFAG00000037922)	CHRM5 (ENSMFAG00000012509)
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	256					ENSMNEG00000034368	ENSMNEG00000031936	CHRNA7 (ENSMNEG00000038717)	ENSMNEG00000017597	OTUD7A (ENSMNEG00000039651)	ENSMNEG00000037286	KLF13 (ENSMNEG00000036903)	TRPM1 (ENSMNEG00000033301)	MTMR10 (ENSMNEG00000035201)	FAN1 (ENSMNEG00000032261)	ENSMNEG00000034895	TJP1 (ENSMNEG00000030677) #22	ENSMNEG00000035469	ENTREP2 (ENSMNEG00000020619)	ENSMNEG00000033543	APBA2 (ENSMNEG00000028455)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	18	TUBGCP5 (ENSCSAG00000006573)	SYCE1 (ENSCSAG00000006600)	CYP2E1 (ENSCSAG00000006614)	SPRN (ENSCSAG00000019759)	MTG1 (ENSCSAG00000006621)	ENSCSAG00000019758	PAOX (ENSCSAG00000006627)	ECHS1 (ENSCSAG00000006631)	FUOM (ENSCSAG00000006637)	PRAP1 (ENSCSAG00000006642)	CALY (ENSCSAG00000006648)	ZNF511 (ENSCSAG00000006656)	TUBGCP2 (ENSCSAG00000006663)	ADAM8 (ENSCSAG00000006676)	ENSCSAG00000006709	TJP1 (ENSCSAG00000006729) #22	NSMCE3 (ENSCSAG00000019757)	ENTREP2 (ENSCSAG00000006737)	APBA2 (ENSCSAG00000006747)	FAN1 (ENSCSAG00000006754)	MTMR10 (ENSCSAG00000006762)	TRPM1 (ENSCSAG00000006822)	KLF13 (ENSCSAG00000006853)	OTUD7A (ENSCSAG00000006858)	CHRNA7 (ENSCSAG00000006863)	ARHGAP11A (ENSCSAG00000006867)	SCG5 (ENSCSAG00000006872)	GREM1 (ENSCSAG00000019756)	FMN1 (ENSCSAG00000006888)	ENSCSAG00000006897	RYR3 (ENSCSAG00000007004)
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	129	ENSGT00390000011644	ENSGT00950000183058.A.a	ENSGT00390000003645	ENSGT00940000160248	ENSGT00940000159723	ENSGT00940000157831	ENSGT00390000018208	ENSGT00390000005914.a	ENSGT00910000146947	ENSGT00940000153997.b.a.b	ENSGT01030000234556.a.b.a	ENSGT00910000146993	ENSGT00390000001322	ENSGT00510000047120	ENSGT00530000062932.c.a.a.a.a.a.b.a.a.a.a.a	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00950000182900.C	ENSGT00940000157829	ENSGT00390000006659	ENSGT00390000018525.a.b	ENSGT00940000160000	ENSGT00550000074866.j	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.b	ENSGT01100000263557.A.b.b.e.a	ENSGT00390000010760	ENSGT00950000183030.m.a.b.a.b.b
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	729																TJP1 (ENSRROG00000038036) #22
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	227															ENSRBIG00000042175	TJP1 (ENSRBIG00000036659) #22	ENSRBIG00000000521	ENTREP2 (ENSRBIG00000029502)	APBA2 (ENSRBIG00000028293)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00910000146870	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00910000146969	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000164524.c.b	ENSGT00940000158222
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000156205	ENSGT00910000146870	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222	ENSGT00940000155050.d	ENSGT00940000157895
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES	86	ENSGT00940000156205	ENSGT00910000146870	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000153253.b.a.h	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222	ENSGT00940000164524.c.a
Capuchin	MODERN SPECIES	19	MEF2A (ENSCCAG00000036413)	ENSCCAG00000027834	LYSMD4 (ENSCCAG00000022661)	ADAMTS17 (ENSCCAG00000037999)	CERS3 (ENSCCAG00000020766)	LINS1 (ENSCCAG00000029271)	ASB7 (ENSCCAG00000029646)	ALDH1A3 (ENSCCAG00000028268)	LRRK1 (ENSCCAG00000030657)	CHSY1 (ENSCCAG00000030422)	SELENOS (ENSCCAG00000025586)	ENSCCAG00000023765	PCSK6 (ENSCCAG00000029734)	TM2D3 (ENSCCAG00000033979)	TARS3 (ENSCCAG00000030068)	TJP1 (ENSCCAG00000036081) #22	ENSCCAG00000028933
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	171	MEF2A (ENSSBOG00000020776)	ENSSBOG00000032207	LYSMD4 (ENSSBOG00000030181)	ADAMTS17 (ENSSBOG00000030629)	CERS3 (ENSSBOG00000024850)	LINS1 (ENSSBOG00000024548)	ASB7 (ENSSBOG00000031530)	ALDH1A3 (ENSSBOG00000024642)	LRRK1 (ENSSBOG00000033278)	CHSY1 (ENSSBOG00000028161)	SELENOS (ENSSBOG00000026383)	SNRPA1 (ENSSBOG00000010939)	PCSK6 (ENSSBOG00000021859)	TM2D3 (ENSSBOG00000022550)	TARS3 (ENSSBOG00000029807)	TJP1 (ENSSBOG00000018738) #22	ENTREP2 (ENSSBOG00000020757)	APBA2 (ENSSBOG00000024456)	FAN1 (ENSSBOG00000022330)	MTMR10 (ENSSBOG00000033433)	TRPM1 (ENSSBOG00000022117)	ENSSBOG00000031915	OTUD7A (ENSSBOG00000024331)	CHRNA7 (ENSSBOG00000024950)	ENSSBOG00000021375
Marmoset	MODERN SPECIES	18	MEF2A (ENSCJAG00000017029)	LYSMD4 (ENSCJAG00000046782)	ADAMTS17 (ENSCJAG00000017094)	CERS3 (ENSCJAG00000017114)	LINS1 (ENSCJAG00000017135)	ASB7 (ENSCJAG00000017150)	ENSCJAG00000074763	ALDH1A3 (ENSCJAG00000017159)	LRRK1 (ENSCJAG00000017202)	CHSY1 (ENSCJAG00000058237)	SELENOS (ENSCJAG00000017258)	ENSCJAG00000017268	PCSK6 (ENSCJAG00000017309)	TM2D3 (ENSCJAG00000017340)	TARS3 (ENSCJAG00000017350)	TJP1 (ENSCJAG00000017370) #22	ENSCJAG00000083661	ENSCJAG00000073911	ENSCJAG00000076541	ENTREP2 (ENSCJAG00000082089)	APBA2 (ENSCJAG00000017493)	ENSCJAG00000017520	MTMR10 (ENSCJAG00000017528)	TRPM1 (ENSCJAG00000017565)	KLF13 (ENSCJAG00000017617)	OTUD7A (ENSCJAG00000017621)	ENSCJAG00000069970	ENSCJAG00000070281	CHRNA7 (ENSCJAG00000021542)	ENSCJAG00000076248	ENSCJAG00000045017
Mas night monkey	MODERN SPECIES	1106															ENSANAG00000027932	TJP1 (ENSANAG00000021487) #22	NSMCE3 (ENSANAG00000024729)	ENTREP2 (ENSANAG00000022901)	APBA2 (ENSANAG00000031920)	FAN1 (ENSANAG00000022816)	MTMR10 (ENSANAG00000021817)	TRPM1 (ENSANAG00000012864)	KLF13 (ENSANAG00000029588)	OTUD7A (ENSANAG00000033308)	CHRNA7 (ENSANAG00000027442)
Tarsier	MODERN SPECIES	4059																TJP1 (ENSTSYG00000005865) #22
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156205	ENSGT00910000146870	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000154617.B
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000156205	ENSGT00910000146870	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000154617.B
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	59	ENSGT00940000156205	ENSGT00910000146870	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00910000147744	ENSGT00940000154617.B
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	266				ENSPCOG00000023224	CERS3 (ENSPCOG00000019634)	LINS1 (ENSPCOG00000024522)	ASB7 (ENSPCOG00000014092)	ALDH1A3 (ENSPCOG00000017094)	LRRK1 (ENSPCOG00000014106)	CHSY1 (ENSPCOG00000013861)	SELENOS (ENSPCOG00000020828)	SNRPA1 (ENSPCOG00000023397)	PCSK6 (ENSPCOG00000023960)	TM2D3 (ENSPCOG00000000142)	TARS3 (ENSPCOG00000026095)	TJP1 (ENSPCOG00000017607) #22	ENSPCOG00000028232	ENTREP2 (ENSPCOG00000023045)	APBA2 (ENSPCOG00000028736)	MCEE (ENSPCOG00000016879)	ENSPCOG00000016310	FAN1 (ENSPCOG00000026344)	ENSPCOG00000021237	MTMR10 (ENSPCOG00000009965)	TRPM1 (ENSPCOG00000027573)	KLF13 (ENSPCOG00000013408)	OTUD7A (ENSPCOG00000021100)	CHRNA7 (ENSPCOG00000024027)	ENSPCOG00000015145	SNRPN (ENSPCOG00000014231)
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	400	MEF2A (ENSPSMG00000008190)	LYSMD4 (ENSPSMG00000008005)	ADAMTS17 (ENSPSMG00000007996)	CERS3 (ENSPSMG00000007972)	ENSPSMG00000007947	ASB7 (ENSPSMG00000007939)	ALDH1A3 (ENSPSMG00000007915)	LRRK1 (ENSPSMG00000007866)	CHSY1 (ENSPSMG00000007798)	SELENOS (ENSPSMG00000007785)	SNRPA1 (ENSPSMG00000007736)	PCSK6 (ENSPSMG00000007699)	TM2D3 (ENSPSMG00000007576)	TARS3 (ENSPSMG00000007528)	ENSPSMG00000007467	TJP1 (ENSPSMG00000007148) #22	ENTREP2 (ENSPSMG00000006909)	APBA2 (ENSPSMG00000006809)	MCEE (ENSPSMG00000006734)	MPHOSPH10 (ENSPSMG00000006696)	FAN1 (ENSPSMG00000006644)	ENSPSMG00000006619	MTMR10 (ENSPSMG00000006559)	TRPM1 (ENSPSMG00000006431)	ENSPSMG00000006329	OTUD7A (ENSPSMG00000006322)	ENSPSMG00000006296	ENSPSMG00000006292	CHRNA7 (ENSPSMG00000006255)
Mouse lemur	MODERN SPECIES	31	MEF2A (ENSMICG00000034803)	LYSMD4 (ENSMICG00000033077)	ADAMTS17 (ENSMICG00000014739)	CERS3 (ENSMICG00000041869)	LINS1 (ENSMICG00000014778)	ASB7 (ENSMICG00000048035)	ALDH1A3 (ENSMICG00000014808)	LRRK1 (ENSMICG00000014823)	ENSMICG00000032515	CHSY1 (ENSMICG00000012976)	SELENOS (ENSMICG00000034165)	SNRPA1 (ENSMICG00000034886)	PCSK6 (ENSMICG00000013008)	TM2D3 (ENSMICG00000013029)	TARS3 (ENSMICG00000013039)	TJP1 (ENSMICG00000006875) #22	ENTREP2 (ENSMICG00000006458)	APBA2 (ENSMICG00000006447)	MCEE (ENSMICG00000003827)	MPHOSPH10 (ENSMICG00000036069)	FAN1 (ENSMICG00000012572)	MTMR10 (ENSMICG00000012591)	TRPM1 (ENSMICG00000012612)	ENSMICG00000003889	KLF13 (ENSMICG00000047540)	OTUD7A (ENSMICG00000012656)	CHRNA7 (ENSMICG00000032002)	ENSMICG00000035704	ST8SIA2 (ENSMICG00000012129)	SLCO3A1 (ENSMICG00000010035)	SV2B (ENSMICG00000017792)
Bushbaby	MODERN SPECIES	309														TM2D3 (ENSOGAG00000010190)	TARS3 (ENSOGAG00000014311)	TJP1 (ENSOGAG00000005267) #22	ENTREP2 (ENSOGAG00000015966)	APBA2 (ENSOGAG00000015959)	MCEE (ENSOGAG00000003174)	ENSOGAG00000003177	FAN1 (ENSOGAG00000016367)	MTMR10 (ENSOGAG00000016373)	TRPM1 (ENSOGAG00000016383)	KLF13 (ENSOGAG00000026529)	OTUD7A (ENSOGAG00000003417)	CHRFAM7A (ENSOGAG00000008878)
Laurasiatheria	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320
Eulipotyphla	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000155164 #22
Hedgehog	MODERN SPECIES	742																TJP1 (ENSEEUG00000005474) #22
Common shrew	MODERN SPECIES	374																TJP1 (ENSSARG00000005679) #22
Laurasiatheria_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320
Artiodactyla	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Suina	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00920000149172	ENSGT00950000183051.a.a	ENSGT00940000160839	ENSGT00940000156787	ENSGT00390000014772	ENSGT01050000244841.A.b.a.b.a.a	ENSGT00940000159356.a.a	ENSGT00940000157071	ENSGT00940000157616	ENSGT00940000155163.b	ENSGT00390000015641	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00950000185118	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00940000155050
Chacoan peccary	MODERN SPECIES	788	PTGR3 (ENSCWAG00000016684)	TSHZ1 (ENSCWAG00000016715)	ZNF516 (ENSCWAG00000016750)	ZNF236 (ENSCWAG00000016772)	MBP (ENSCWAG00000016987)	GALR1 (ENSCWAG00000018025)	SALL3 (ENSCWAG00000018066)	ATP9B (ENSCWAG00000018143)	ENSCWAG00000018247	NFATC1 (ENSCWAG00000018287)	CTDP1 (ENSCWAG00000019223)	ENSCWAG00000019305	PCSK6 (ENSCWAG00000019381)	TM2D3 (ENSCWAG00000019709)	TARS3 (ENSCWAG00000019788)	TJP1 (ENSCWAG00000019855) #22	ENTREP2 (ENSCWAG00000020038)	APBA2 (ENSCWAG00000020072)	MCEE (ENSCWAG00000020119)	MPHOSPH10 (ENSCWAG00000020133)	FAN1 (ENSCWAG00000020161)	MTMR10 (ENSCWAG00000020192)	TRPM1 (ENSCWAG00000020237)	KLF13 (ENSCWAG00000020457)	OTUD7A (ENSCWAG00000020470)	CHRNA7 (ENSCWAG00000020502)	ENSCWAG00000020766	MAGEL2 (ENSCWAG00000020777)	NDN (ENSCWAG00000020785)	ENSCWAG00000020788	SNURF (ENSCWAG00000006805)
Pig	MODERN SPECIES		ZNF236 (ENSSSCG00000023533)	MBP (ENSSSCG00000038767)	GALR1 (ENSSSCG00000036984)	ENSSSCG00000054407	SALL3 (ENSSSCG00000004858)	ENSSSCG00000040521	ATP9B (ENSSSCG00000004857)	NFATC1 (ENSSSCG00000004856)	ENSSSCG00000040252	CTDP1 (ENSSSCG00000005787)	SNRPA1 (ENSSSCG00000005786)	PCSK6 (ENSSSCG00000005785)	TM2D3 (ENSSSCG00000005782)	TARS3 (ENSSSCG00000005781)	ENSSSCG00000033540	TJP1 (ENSSSCG00000004854) #22	ENTREP2 (ENSSSCG00000004850)	APBA2 (ENSSSCG00000004849)	MCEE (ENSSSCG00000035696)	MPHOSPH10 (ENSSSCG00000004847)	FAN1 (ENSSSCG00000004845)	MTMR10 (ENSSSCG00000004844)	TRPM1 (ENSSSCG00000004843)	KLF13 (ENSSSCG00000026006)	OTUD7A (ENSSSCG00000004840)	CHRNA7 (ENSSSCG00000004839)	ENSSSCG00000004836	NDN (ENSSSCG00000004834)	UBE3A (ENSSSCG00000004832)	ENSSSCG00000054906	ENSSSCG00000004830
Artiodactyla_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00900000143686	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Camelidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320
Arabian camel	MODERN SPECIES	19	MEF2A (ENSCDRG00005019509)	LYSMD4 (ENSCDRG00005019481)	ADAMTS17 (ENSCDRG00005018609)	CERS3 (ENSCDRG00005018454)	ENSCDRG00005018433	ENSCDRG00005018378	ASB7 (ENSCDRG00005018331)	ALDH1A3 (ENSCDRG00005018258)	LRRK1 (ENSCDRG00005018052)	CHSY1 (ENSCDRG00005018015)	ENSCDRG00005017960	SNRPA1 (ENSCDRG00005017916)	PCSK6 (ENSCDRG00005017712)	TM2D3 (ENSCDRG00005017633)	TARS3 (ENSCDRG00005005662)	TJP1 (ENSCDRG00005005213) #22	ENTREP2 (ENSCDRG00005005159)	APBA2 (ENSCDRG00005004934)	MCEE (ENSCDRG00005004885)	MPHOSPH10 (ENSCDRG00005004863)	FAN1 (ENSCDRG00005004716)	MTMR10 (ENSCDRG00005004648)	TRPM1 (ENSCDRG00005004213)	ENSCDRG00005004149	ENSCDRG00005004122	OTUD7A (ENSCDRG00005004081)	CHRNA7 (ENSCDRG00005003957)	MKRN3 (ENSCDRG00005003937)	MAGEL2 (ENSCDRG00005003920)	NDN (ENSCDRG00005003906)	ENSCDRG00005003879
Alpaca	MODERN SPECIES	3333																TJP1 (ENSVPAG00000011651) #22
Artiodactyla_b	ANCESTRAL SPECIES	34												ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00910000146953
Pecora	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000155707	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000159819	ENSGT01030000234518.B.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00390000014309.cb	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000161911	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT01050000244942.a	ENSGT00940000159159	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335
Percora_a	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000159819	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT01030000234518.B.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00390000014309.cb	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000153289.b.s.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000161911	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT01050000244942.a	ENSGT00940000159159	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993
Bovidae	ANCESTRAL SPECIES	20	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000159819	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT01030000234518.B.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00390000014309.cb	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000153289.b.s.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000174015.b	ENSGT00940000161911	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT01050000244942.a	ENSGT00940000159159	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335
Caprinae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00940000155707.bc	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000159819	ENSGT01030000234518.B.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00390000014309.cb	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000153289.b.t	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000174015.b	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT01050000244942.a	ENSGT00940000159159	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993
Rambouillet Sheep	MODERN SPECIES	9	ENSOARG00020018726	IDH3A (ENSOARG00020018600)	CIB2 (ENSOARG00020018425)	SH2D7 (ENSOARG00020018375)	TBC1D2B (ENSOARG00020018231)	ADAMTS7 (ENSOARG00020018031)	ENSOARG00020018012	OTUD7A (ENSOARG00020017907)	ENSOARG00020017779	ENSOARG00020017757	ENSOARG00020017698	CHRNA7 (ENSOARG00020017406)	PCSK6 (ENSOARG00020013445)	TM2D3 (ENSOARG00020013167)	TARS3 (ENSOARG00020012812)	TJP1 (ENSOARG00020012167) #22	ENTREP2 (ENSOARG00020011989)	APBA2 (ENSOARG00020011746)	ENSOARG00020011702	ENSOARG00020011639	KLF13 (ENSOARG00020011605)	TRPM1 (ENSOARG00020010441)	MTMR10 (ENSOARG00020010104)	ENSOARG00020023889	MPHOSPH10 (ENSOARG00020023868)	MCEE (ENSOARG00020023847)	TMC3 (ENSOARG00020023774)	STARD5 (ENSOARG00020023749)	IL16 (ENSOARG00020023691)	CFAP161 (ENSOARG00020023620)	TLNRD1 (ENSOARG00020023596)
Goat	MODERN SPECIES	13	IDH3A (ENSCHIG00000014252)	CIB2 (ENSCHIG00000023624)	SH2D7 (ENSCHIG00000014046)	TBC1D2B (ENSCHIG00000016175)	ADAMTS7 (ENSCHIG00000009784)	OTUD7A (ENSCHIG00000016906)	ENSCHIG00000016255	ENSCHIG00000023680	ENSCHIG00000009012	CHRNA7 (ENSCHIG00000009600)	ENSCHIG00000019516	SNRPA1 (ENSCHIG00000016313)	PCSK6 (ENSCHIG00000016761)	TM2D3 (ENSCHIG00000016740)	TARS3 (ENSCHIG00000015264)	TJP1 (ENSCHIG00000017162) #22	ENTREP2 (ENSCHIG00000022699)	APBA2 (ENSCHIG00000020156)	ENSCHIG00000015732	KLF13 (ENSCHIG00000007281)	TRPM1 (ENSCHIG00000008973)	MTMR10 (ENSCHIG00000020354)	FAN1 (ENSCHIG00000021105)	MPHOSPH10 (ENSCHIG00000023646)	MCEE (ENSCHIG00000020324)	TMC3 (ENSCHIG00000021444)	STARD5 (ENSCHIG00000004895)	ENSCHIG00000008571	ENSCHIG00000020577	CFAP161 (ENSCHIG00000013714)	TLNRD1 (ENSCHIG00000004554)
Bovinae	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000159819	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT01030000234518.B.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00390000014309.cb	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000165655.b	ENSGT00940000153289.b.s.a	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000174015.b	ENSGT00940000161911	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359.b.b	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT01050000244942.a	ENSGT00940000159159	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488
Bos	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000159819	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT01030000234518.B.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00390000014309.cb	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000165655.b	ENSGT00940000153289.b.s.a	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000168934.b	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000174015.b	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359.b.b	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT01050000244942.a	ENSGT00940000159159	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335
Bos_b	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000159819	ENSGT01030000234518.B.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00390000014309.cb	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000165655.b	ENSGT00940000153289.b.s.a	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000168934.b	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00950000183010.a.a.a.b.a.a.b.a.a	ENSGT00940000174015.b	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359.b.b	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT01050000244942.a	ENSGT00940000159159	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335
Cow	DUPLICATION
Cow	MODERN SPECIES	13	SH2D7 (ENSBTAG00000047166)	TBC1D2B (ENSBTAG00000012022)	ADAMTS7 (ENSBTAG00000001396)	ENSBTAG00000049380	OTUD7A (ENSBTAG00000006868)	ENSBTAG00000048580	ENSBTAG00000053412	CHRNA7 (ENSBTAG00000015775)	ENSBTAG00000003957	SNRPA1 (ENSBTAG00000013593)	PCSK6 (ENSBTAG00000006675)	ENSBTAG00000053962	TM2D3 (ENSBTAG00000007649)	TARS3 (ENSBTAG00000007651)	ENSBTAG00000049368 #22	TJP1 (ENSBTAG00000015398) #22	ENTREP2 (ENSBTAG00000003435)	APBA2 (ENSBTAG00000020413)	ENSBTAG00000025764	ENSBTAG00000051487	KLF13 (ENSBTAG00000051090)	ENSBTAG00000052208	TRPM1 (ENSBTAG00000001639)	MTMR10 (ENSBTAG00000014422)	FAN1 (ENSBTAG00000009855)	MPHOSPH10 (ENSBTAG00000009854)	MCEE (ENSBTAG00000035247)	TMC3 (ENSBTAG00000012166)	STARD5 (ENSBTAG00000010964)	IL16 (ENSBTAG00000010963)	ENSBTAG00000049620
Cow	MODERN SPECIES	13	CIB2 (ENSBTAG00000010981)	SH2D7 (ENSBTAG00000047166)	TBC1D2B (ENSBTAG00000012022)	ADAMTS7 (ENSBTAG00000001396)	ENSBTAG00000049380	OTUD7A (ENSBTAG00000006868)	ENSBTAG00000048580	ENSBTAG00000053412	CHRNA7 (ENSBTAG00000015775)	ENSBTAG00000003957	SNRPA1 (ENSBTAG00000013593)	PCSK6 (ENSBTAG00000006675)	ENSBTAG00000053962	TM2D3 (ENSBTAG00000007649)	TARS3 (ENSBTAG00000007651)	ENSBTAG00000049368 #22	TJP1 (ENSBTAG00000015398) #22	ENTREP2 (ENSBTAG00000003435)	APBA2 (ENSBTAG00000020413)	ENSBTAG00000025764	ENSBTAG00000051487	KLF13 (ENSBTAG00000051090)	ENSBTAG00000052208	TRPM1 (ENSBTAG00000001639)	MTMR10 (ENSBTAG00000014422)	FAN1 (ENSBTAG00000009855)	MPHOSPH10 (ENSBTAG00000009854)	MCEE (ENSBTAG00000035247)	TMC3 (ENSBTAG00000012166)	STARD5 (ENSBTAG00000010964)	IL16 (ENSBTAG00000010963)
Hybrid Bos Indicus	MODERN SPECIES	13	SH2D7 (ENSBIXG00005005386)	TBC1D2B (ENSBIXG00005001464)	ADAMTS7 (ENSBIXG00005013062)	OTUD7A (ENSBIXG00005013135)	ENSBIXG00005013161	ENSBIXG00005006338	CHRNA7 (ENSBIXG00005013292)	ENSBIXG00005013321	ENSBIXG00005013369	PCSK6 (ENSBIXG00005013674)	ENSBIXG00005013742	ENSBIXG00005001693	TM2D3 (ENSBIXG00005013802)	TARS3 (ENSBIXG00005013886)	ENSBIXG00005001743	TJP1 (ENSBIXG00005014183) #22	ENTREP2 (ENSBIXG00005014257)	APBA2 (ENSBIXG00005014334)	ENSBIXG00005014392	KLF13 (ENSBIXG00005014412)	TRPM1 (ENSBIXG00005014505)	MTMR10 (ENSBIXG00005014548)	FAN1 (ENSBIXG00005014628)	ENSBIXG00005014698	MCEE (ENSBIXG00005002062)	TMC3 (ENSBIXG00005014742)	STARD5 (ENSBIXG00005014761)	IL16 (ENSBIXG00005005585)	CFAP161 (ENSBIXG00005014844)	TLNRD1 (ENSBIXG00005014868)	MESD (ENSBIXG00005014897)
Bos_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000155707.bc	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000157737	ENSGT00940000159819	ENSGT01030000234534.B.a.b	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000153289.b.s.a	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000168934.b	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000174015.b	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000156900	ENSGT00390000018637	ENSGT00390000011359.b.b	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT01050000244942.a	ENSGT00940000159159	ENSGT00940000156178.A	ENSGT00390000018488	ENSGT00910000144335	ENSGT00390000000993
Wild yak	MODERN SPECIES	328										ENSBMUG00000014123	SNRPA1 (ENSBMUG00000014114)	PCSK6 (ENSBMUG00000013846)	ENSBMUG00000013653	TM2D3 (ENSBMUG00000013642)	TARS3 (ENSBMUG00000013631)	TJP1 (ENSBMUG00000013588) #22	ENTREP2 (ENSBMUG00000013480)	APBA2 (ENSBMUG00000013458)
Domestic yak	MODERN SPECIES	8	IDH3A (ENSBGRG00000017674)	CIB2 (ENSBGRG00000017178)	SH2D7 (ENSBGRG00000017059)	TBC1D2B (ENSBGRG00000016776)	ADAMTS7 (ENSBGRG00000016622)	ENSBGRG00000016593	OTUD7A (ENSBGRG00000016479)	CHRNA7 (ENSBGRG00000016143)	ENSBGRG00000016093	ENSBGRG00000015903	ENSBGRG00000015736	ENSBGRG00000015565	ENSBGRG00000015509	TM2D3 (ENSBGRG00000015299)	TARS3 (ENSBGRG00000014717)	TJP1 (ENSBGRG00000012231) #22	ENTREP2 (ENSBGRG00000011993)	APBA2 (ENSBGRG00000011196)	ENSBGRG00000011097	KLF13 (ENSBGRG00000010998)	TRPM1 (ENSBGRG00000009546)	MTMR10 (ENSBGRG00000008983)	FAN1 (ENSBGRG00000008601)	ENSBGRG00000008537	MCEE (ENSBGRG00000008496)	ENSBGRG00000008476	TMC3 (ENSBGRG00000008194)	STARD5 (ENSBGRG00000008046)	ENSBGRG00000007989	ENSBGRG00000007919	ENSBGRG00000007874
American bison	MODERN SPECIES	3102	DNAJA4 (ENSBBBG00000010573)	ACSBG1 (ENSBBBG00000010591)	IDH3A (ENSBBBG00000010606)	CIB2 (ENSBBBG00000010616)	SH2D7 (ENSBBBG00000001862)	TBC1D2B (ENSBBBG00000010632)	ADAMTS7 (ENSBBBG00000010780)	OTUD7A (ENSBBBG00000010808)	ENSBBBG00000010811	CHRNA7 (ENSBBBG00000010844)	ENSBBBG00000001903	ENSBBBG00000010864	PCSK6 (ENSBBBG00000010952)	TM2D3 (ENSBBBG00000001955)	TARS3 (ENSBBBG00000001971)	TJP1 (ENSBBBG00000011074) #22	ENTREP2 (ENSBBBG00000011093)	APBA2 (ENSBBBG00000011142)	ENSBBBG00000011152	ENSBBBG00000011154	ENSBBBG00000011156	ENSBBBG00000007589	TRPM1 (ENSBBBG00000011174)	MTMR10 (ENSBBBG00000011191)	FAN1 (ENSBBBG00000002035)	ENSBBBG00000011224	MCEE (ENSBBBG00000011229)	TMC3 (ENSBBBG00000011275)	STARD5 (ENSBBBG00000011284)	IL16 (ENSBBBG00000011313)	CFAP161 (ENSBBBG00000011320)
Siberian musk deer	MODERN SPECIES	1277									ENSMMSG00000021987	CHRNA7 (ENSMMSG00000021997)	ENSMMSG00000022036	ENSMMSG00000022057	PCSK6 (ENSMMSG00000022137)	TM2D3 (ENSMMSG00000022468)	TARS3 (ENSMMSG00000022494)	TJP1 (ENSMMSG00000022548) #22	ENTREP2 (ENSMMSG00000022719)	APBA2 (ENSMMSG00000022753)	ENSMMSG00000022794	KLF13 (ENSMMSG00000022801)	TRPM1 (ENSMMSG00000022825)	MTMR10 (ENSMMSG00000022957)	FAN1 (ENSMMSG00000022979)	MPHOSPH10 (ENSMMSG00000022988)	ENSMMSG00000023000	TMC3 (ENSMMSG00000021108)	STARD5 (ENSMMSG00000021205)	IL16 (ENSMMSG00000021248)	CFAP161 (ENSMMSG00000021401)	TLNRD1 (ENSMMSG00000021441)	ENSMMSG00000021452
Yarkand deer	MODERN SPECIES	4	ACSBG1 (ENSCHYG00000012005)	IDH3A (ENSCHYG00000011792)	CIB2 (ENSCHYG00000011665)	SH2D7 (ENSCHYG00000011577)	TBC1D2B (ENSCHYG00000011416)	ADAMTS7 (ENSCHYG00000010963)	ENSCHYG00000010931	OTUD7A (ENSCHYG00000010873)	ENSCHYG00000010822	CHRNA7 (ENSCHYG00000010639)	ENSCHYG00000010580	SNRPA1 (ENSCHYG00000010439)	ENSCHYG00000010389	PCSK6 (ENSCHYG00000010113)	TARS3 (ENSCHYG00000009924)	TJP1 (ENSCHYG00000009413) #22	NSMCE3 (ENSCHYG00000009331)	ENTREP2 (ENSCHYG00000009240)	APBA2 (ENSCHYG00000009035)	ENSCHYG00000008969	ENSCHYG00000008864	TRPM1 (ENSCHYG00000008380)	MTMR10 (ENSCHYG00000008225)	FAN1 (ENSCHYG00000008062)	MPHOSPH10 (ENSCHYG00000007991)	MCEE (ENSCHYG00000007942)	ENSCHYG00000007910	TMC3 (ENSCHYG00000007808)	IL16 (ENSCHYG00000007610)	CFAP161 (ENSCHYG00000007549)	TLNRD1 (ENSCHYG00000007531)
Cetacea	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018381	ENSGT00940000155002.b	ENSGT00940000157252	ENSGT00930000150950.a	ENSGT00390000008527.k.a	ENSGT00390000018475	ENSGT00940000157755	ENSGT00950000186015	ENSGT00950000182997.a.a	ENSGT00940000156942	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT01010000228784	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00950000182901.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183206.b.c.a.b.b	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h	ENSGT00940000160227	ENSGT00940000157599	ENSGT00880000138051.b	ENSGT00940000159833.b
Blue whale	MODERN SPECIES	11	KLF6 (ENSBMSG00010006377)	PITRM1 (ENSBMSG00010006419)	PFKP (ENSBMSG00010006459)	ADARB2 (ENSBMSG00010006478)	WDR37 (ENSBMSG00010006516)	IDI1 (ENSBMSG00010006542)	GTPBP4 (ENSBMSG00010006563)	LARP4B (ENSBMSG00010006600)	DIP2C (ENSBMSG00010006705)	ZMYND11 (ENSBMSG00010006872)	SNRPA1 (ENSBMSG00010007003)	PCSK6 (ENSBMSG00010007080)	ENSBMSG00010007246	TM2D3 (ENSBMSG00010007253)	TARS3 (ENSBMSG00010007271)	TJP1 (ENSBMSG00010007327) #22	ENSBMSG00010007474	ENSBMSG00010007483	ENTREP2 (ENSBMSG00010007491)	APBA2 (ENSBMSG00010007516)	MCEE (ENSBMSG00010007551)	ENSBMSG00010007557	MPHOSPH10 (ENSBMSG00010007566)	FAN1 (ENSBMSG00010007593)	MTMR10 (ENSBMSG00010007611)	TRPM1 (ENSBMSG00010007636)	ENSBMSG00010007665	MORF4L1 (ENSBMSG00010007681)	CTSH (ENSBMSG00010007698)	RASGRF1 (ENSBMSG00010007726)	ANKRD34C (ENSBMSG00010007785)
Odontoceti	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018381	ENSGT00940000155002.b	ENSGT00940000157252	ENSGT00930000150950.a	ENSGT00390000008527.k.a	ENSGT00390000018475	ENSGT00940000157755	ENSGT00950000186015	ENSGT00950000182997.a.a	ENSGT00940000156942	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT01010000228784	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00950000182901.a.a.b.a.a	ENSGT00950000183206.b.c.a.b.b	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h	ENSGT00940000160227	ENSGT00940000157599	ENSGT00880000138051.b	ENSGT00940000159833.b
Sperm whale	MODERN SPECIES	2	ENSPCTG00005000665	PITRM1 (ENSPCTG00005000744)	PFKP (ENSPCTG00005000894)	ADARB2 (ENSPCTG00005000932)	WDR37 (ENSPCTG00005000970)	IDI1 (ENSPCTG00005001004)	GTPBP4 (ENSPCTG00005001018)	LARP4B (ENSPCTG00005001066)	DIP2C (ENSPCTG00005002504)	ZMYND11 (ENSPCTG00005016432)	ENSPCTG00005017049	SNRPA1 (ENSPCTG00005017070)	PCSK6 (ENSPCTG00005017267)	TM2D3 (ENSPCTG00005017966)	TARS3 (ENSPCTG00005018147)	TJP1 (ENSPCTG00005018630) #22	ENSPCTG00005019010	ENSPCTG00005019074	ENTREP2 (ENSPCTG00005019223)	APBA2 (ENSPCTG00005019353)	MCEE (ENSPCTG00005019555)	MPHOSPH10 (ENSPCTG00005019581)	FAN1 (ENSPCTG00005019619)	MTMR10 (ENSPCTG00005019736)	ENSPCTG00005019850	ENSPCTG00005019875	ENSPCTG00005019911	ENSPCTG00005020045	ENSPCTG00005020071	CTSH (ENSPCTG00005020280)	ANKRD34C (ENSPCTG00005020376)
Odontoceti_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018381	ENSGT00940000155002.b	ENSGT00940000157252	ENSGT00930000150950.a	ENSGT00390000008527.k.a	ENSGT00390000018475	ENSGT00940000157755	ENSGT00950000186015	ENSGT00950000182997.a.a	ENSGT00940000156942	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT01010000228784	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00950000183206.b.c.a.b.b	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00910000146953	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h	ENSGT00940000160227	ENSGT00940000157599	ENSGT00880000138051.b	ENSGT00940000159833.b
Dolphin	MODERN SPECIES	3220																TJP1 (ENSTTRG00000014712) #22
Odontoceti_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000018381	ENSGT00940000155002.b	ENSGT00940000157252	ENSGT00930000150950.a	ENSGT00390000008527.k.a	ENSGT00390000018475	ENSGT00940000157755	ENSGT00950000186015	ENSGT00950000182997.a.a	ENSGT00940000156942	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT01010000228784	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00950000183206.b.c.a.b.b	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h	ENSGT00940000160227	ENSGT00940000157599	ENSGT00880000138051.b	ENSGT00940000159833.b	ENSGT00530000063851.a
Vaquita	MODERN SPECIES	11	PFKP (ENSPSNG00000001414)	ADARB2 (ENSPSNG00000001459)	WDR37 (ENSPSNG00000001509)	IDI1 (ENSPSNG00000001554)	GTPBP4 (ENSPSNG00000001584)	LARP4B (ENSPSNG00000001619)	ENSPSNG00000001647	DIP2C (ENSPSNG00000001710)	ENSPSNG00000001778	ZMYND11 (ENSPSNG00000001863)	ENSPSNG00000001947	PCSK6 (ENSPSNG00000002050)	ENSPSNG00000002174	TM2D3 (ENSPSNG00000002201)	TARS3 (ENSPSNG00000002258)	TJP1 (ENSPSNG00000002312) #22	ENSPSNG00000002398	ENTREP2 (ENSPSNG00000002416)	APBA2 (ENSPSNG00000002459)	MCEE (ENSPSNG00000002496)	MPHOSPH10 (ENSPSNG00000002518)	FAN1 (ENSPSNG00000002540)	MTMR10 (ENSPSNG00000002574)	TRPM1 (ENSPSNG00000002616)	KLF13 (ENSPSNG00000002670)	ENSPSNG00000002702	CTSH (ENSPSNG00000002744)	RASGRF1 (ENSPSNG00000002792)	ANKRD34C (ENSPSNG00000002859)	TMED3 (ENSPSNG00000002882)	MINAR1 (ENSPSNG00000002913)
Monodontidae	ANCESTRAL SPECIES	22	ENSGT00390000018381	ENSGT00940000155002.b	ENSGT00940000157252	ENSGT00930000150950.a	ENSGT00390000008527.k.a	ENSGT00390000018475	ENSGT00940000157755	ENSGT00950000182997.a.a	ENSGT00940000156942	ENSGT00950000182995.e.a.a.a.db.a.b	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT01010000228784	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00950000183206.b.c.a.b.b	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00390000007560.o.a	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00910000146953	ENSGT00950000182965.a.b.b.b.h	ENSGT00940000163894	ENSGT00940000160227	ENSGT00940000157599
Narwhal	MODERN SPECIES	308	PITRM1 (ENSMMNG00015018053)	PFKP (ENSMMNG00015018117)	ADARB2 (ENSMMNG00015018174)	WDR37 (ENSMMNG00015018302)	IDI1 (ENSMMNG00015018339)	GTPBP4 (ENSMMNG00015018360)	ENSMMNG00015018415	DIP2C (ENSMMNG00015018575)	ZMYND11 (ENSMMNG00015018963)	ENSMMNG00015019126	SNRPA1 (ENSMMNG00015019148)	PCSK6 (ENSMMNG00015019239)	ENSMMNG00015019474	TM2D3 (ENSMMNG00015019508)	TARS3 (ENSMMNG00015019564)	TJP1 (ENSMMNG00015019601) #22	ENSMMNG00015019699	ENTREP2 (ENSMMNG00015019726)	APBA2 (ENSMMNG00015019801)	ENSMMNG00015019869	MCEE (ENSMMNG00015019878)	MPHOSPH10 (ENSMMNG00015019899)	FAN1 (ENSMMNG00015019931)	MTMR10 (ENSMMNG00015019967)	TRPM1 (ENSMMNG00015020195)	KLF13 (ENSMMNG00015020554)	ENSMMNG00015020568	MORF4L1 (ENSMMNG00015020596)	ENSMMNG00015020628	CTSH (ENSMMNG00015020640)	RASGRF1 (ENSMMNG00015020726)
Beluga whale	DUPLICATION
Beluga whale	MODERN SPECIES	52	PFKP (ENSDLEG00000007420)	ENSDLEG00000007449	ENSDLEG00000007466	WDR37 (ENSDLEG00000007475)	IDI1 (ENSDLEG00000007483)	GTPBP4 (ENSDLEG00000007514)	LARP4B (ENSDLEG00000007760)	DIP2C (ENSDLEG00000008850)	ZMYND11 (ENSDLEG00000019510)	ENSDLEG00000019529	SNRPA1 (ENSDLEG00000019537)	PCSK6 (ENSDLEG00000019549)	ENSDLEG00000019601	TM2D3 (ENSDLEG00000019606)	TARS3 (ENSDLEG00000019699)	TJP1 (ENSDLEG00000020324) #22	ENSDLEG00000020376	ENTREP2 (ENSDLEG00000020385)	APBA2 (ENSDLEG00000020399)	ENSDLEG00000020415	MCEE (ENSDLEG00000020419)	MPHOSPH10 (ENSDLEG00000020425)	FAN1 (ENSDLEG00000020439)	MTMR10 (ENSDLEG00000020447)	TRPM1 (ENSDLEG00000020467)	KLF13 (ENSDLEG00000020647)	ENSDLEG00000020649	MORF4L1 (ENSDLEG00000020654)	ENSDLEG00000020674	CTSH (ENSDLEG00000020683)	RASGRF1 (ENSDLEG00000020700)
Beluga whale	MODERN SPECIES	50	ENSDLEG00000019303	DMRT2 (ENSDLEG00000019289)	ENSDLEG00000019284	DMRT3 (ENSDLEG00000019280)	DMRT1 (ENSDLEG00000019261)	KANK1 (ENSDLEG00000019090)	DOCK8 (ENSDLEG00000012329)	ENSDLEG00000011652	ENSDLEG00000011631	PGM5 (ENSDLEG00000011615)	TMEM252 (ENSDLEG00000011598)	PABIR1 (ENSDLEG00000011588)	PIP5K1B (ENSDLEG00000011558)	FXN (ENSDLEG00000011543)	ENSDLEG00000011517	ENSDLEG00000010351 #22	ENTREP1 (ENSDLEG00000010006)	APBA1 (ENSDLEG00000009910)	PTAR1 (ENSDLEG00000009863)	CUNH9orf135 (ENSDLEG00000009843)	MAMDC2 (ENSDLEG00000009814)	ENSDLEG00000009679	ENSDLEG00000009653	KLF9 (ENSDLEG00000009644)	ENSDLEG00000009607	TRPM3 (ENSDLEG00000009392)	TMEM2 (ENSDLEG00000009313)	ABHD17B (ENSDLEG00000009276)	C9orf85 (ENSDLEG00000009257)	GDA (ENSDLEG00000009197)	ZFAND5 (ENSDLEG00000009173)
Laurasiatheria_b	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Carnivora	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320
Caniformia	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320
Caniformia_b	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222
Ursidae	ANCESTRAL SPECIES	40	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT01090000261322	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000185118	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320.gb	ENSGT00940000158222
Ursus	ANCESTRAL SPECIES	397																ENSGT00940000155164 #22	ENSGT01000000218638
American black bear	MODERN SPECIES	2534																TJP1 (ENSUAMG00000015190) #22	ENSUAMG00000015186
Polar bear	MODERN SPECIES	143	MEF2A (ENSUMAG00000025083)	LYSMD4 (ENSUMAG00000025081)	ADAMTS17 (ENSUMAG00000025080)	CERS3 (ENSUMAG00000025078)	LINS1 (ENSUMAG00000025077)	ASB7 (ENSUMAG00000025076)	ALDH1A3 (ENSUMAG00000024498)	LRRK1 (ENSUMAG00000024490)	CHSY1 (ENSUMAG00000024487)	SELENOS (ENSUMAG00000024486)	SNRPA1 (ENSUMAG00000024485)	PCSK6 (ENSUMAG00000024481)	TM2D3 (ENSUMAG00000024478)	TARS3 (ENSUMAG00000024371)	ENSUMAG00000024350	TJP1 (ENSUMAG00000023575) #22	ENSUMAG00000023535	ENSUMAG00000023529	APBA2 (ENSUMAG00000023494)	MCEE (ENSUMAG00000023490)	MPHOSPH10 (ENSUMAG00000023489)	FAN1 (ENSUMAG00000023488)	MTMR10 (ENSUMAG00000023466)	TRPM1 (ENSUMAG00000023370)	ENSUMAG00000023354	OTUD7A (ENSUMAG00000023339)	CHRNA7 (ENSUMAG00000023326)	ENSUMAG00000023322	ENSUMAG00000023314	ENSUMAG00000023311	ENSUMAG00000023310
Giant Panda	MODERN SPECIES	19	LYSMD4 (ENSAMEG00000029222)	ADAMTS17 (ENSAMEG00000014487)	CERS3 (ENSAMEG00000014447)	LINS1 (ENSAMEG00000014445)	ASB7 (ENSAMEG00000014437)	ENSAMEG00000026618	ALDH1A3 (ENSAMEG00000014337)	LRRK1 (ENSAMEG00000014302)	CHSY1 (ENSAMEG00000014296)	SELENOS (ENSAMEG00000007115)	ENSAMEG00000007128	PCSK6 (ENSAMEG00000003004)	TM2D3 (ENSAMEG00000003063)	ENSAMEG00000003074	ENSAMEG00000024112	ENSAMEG00000003123 #22	ENSAMEG00000015319	ENSAMEG00000015316	ENSAMEG00000015370	ENSAMEG00000015372	ENSAMEG00000015396	ENSAMEG00000015406	TRPM1 (ENSAMEG00000015437)	ENSAMEG00000019549	OTUD7A (ENSAMEG00000015494)	ENSAMEG00000026159	ENSAMEG00000028113	ENSAMEG00000019852	ENSAMEG00000023575	ENSAMEG00000024276	ENSAMEG00000012505
Mustelinae	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363.b	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084
Ferret	MODERN SPECIES	235	ENSMPUG00000010893	CERS3 (ENSMPUG00000010895)	LINS1 (ENSMPUG00000010901)	ASB7 (ENSMPUG00000010907)	ALDH1A3 (ENSMPUG00000010914)	ENSMPUG00000010919	ENSMPUG00000010924	ENSMPUG00000010925	ENSMPUG00000010926	CHSY1 (ENSMPUG00000010931)	SELENOS (ENSMPUG00000010935)	SNRPA1 (ENSMPUG00000010938)	PCSK6 (ENSMPUG00000010974)	TM2D3 (ENSMPUG00000010985)	TARS3 (ENSMPUG00000011032)	TJP1 (ENSMPUG00000011043) #22	ENTREP2 (ENSMPUG00000011061)	APBA2 (ENSMPUG00000011067)	MCEE (ENSMPUG00000011083)	MPHOSPH10 (ENSMPUG00000011089)	FAN1 (ENSMPUG00000011100)	MTMR10 (ENSMPUG00000011109)	TRPM1 (ENSMPUG00000011117)	ENSMPUG00000011297	ENSMPUG00000011299	OTUD7A (ENSMPUG00000011304)
American mink	MODERN SPECIES	134	LRRC28 (ENSNVIG00000007079)	MEF2A (ENSNVIG00000006952)	LYSM4 (ENSNVIG00000006927)	ADAMTS17 (ENSNVIG00000006898)	CERS3 (ENSNVIG00000006870)	LINS1 (ENSNVIG00000006824)	ASB7 (ENSNVIG00000006801)	ALDH1A3 (ENSNVIG00000006746)	LRRK1 (ENSNVIG00000006642)	CHSY1 (ENSNVIG00000006623)	SELENOS (ENSNVIG00000006582)	SNRPA1 (ENSNVIG00000006530)	PCSK6 (ENSNVIG00000006442)	TM2D3 (ENSNVIG00000006409)	TARS3 (ENSNVIG00000006378)	TJP1 (ENSNVIG00000006179) #22	ENTREP2 (ENSNVIG00000006142)	APBA2 (ENSNVIG00000005991)	MCEE (ENSNVIG00000005968)	MPP10 (ENSNVIG00000005923)	FAN1 (ENSNVIG00000005901)	MTMR10 (ENSNVIG00000005855)	TRPM1 (ENSNVIG00000005495)	ENSNVIG00000005475	OTUD7A (ENSNVIG00000005449)	CHRNA7 (ENSNVIG00000005283)
Canidae	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790.k	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b.eb	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00940000155050
Canis_lupus	ANCESTRAL SPECIES	23	ENSGT01090000260046.e.b.b.a.b.a.a.b.a.a.a.b.b.b	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790.k	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b.eb	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153288.a.b.a.a	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00390000013931.a.a.a.a.a	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006
Dingo	MODERN SPECIES	138	MEF2A (ENSCAFG00020019905)	LYSMD4 (ENSCAFG00020019914)	ADAMTS17 (ENSCAFG00020019920)	CERS3 (ENSCAFG00020019956)	LINS1 (ENSCAFG00020019963)	ASB7 (ENSCAFG00020019968)	ALDH1A3 (ENSCAFG00020020018)	LRRK1 (ENSCAFG00020020272)	CHSY1 (ENSCAFG00020020449)	ENSCAFG00020020451	SELENOS (ENSCAFG00020020453)	ENSCAFG00020020462	PCSK6 (ENSCAFG00020020483)	TM2D3 (ENSCAFG00020020812)	TARS3 (ENSCAFG00020020868)	TJP1 (ENSCAFG00020021329) #22	ENSCAFG00020023821	ENTREP2 (ENSCAFG00020023826)	ENSCAFG00020023827	APBA2 (ENSCAFG00020023828)	ENSCAFG00020023833	MCEE (ENSCAFG00020023834)	MPHOSPH10 (ENSCAFG00020023836)	FAN1 (ENSCAFG00020023840)	MTMR10 (ENSCAFG00020023862)	ENSCAFG00020023965	TRPM1 (ENSCAFG00020023986)	ENSCAFG00020024007	ENSCAFG00020024010	KLF13 (ENSCAFG00020024015)	OTUD7A (ENSCAFG00020024024)
Dog	MODERN SPECIES	22	LYSMD4 (ENSCAFG00845001356)	ADAMTS17 (ENSCAFG00845001303)	CERS3 (ENSCAFG00845001223)	LINS1 (ENSCAFG00845001173)	ASB7 (ENSCAFG00845001149)	ALDH1A3 (ENSCAFG00845001112)	LRRK1 (ENSCAFG00845000977)	ENSCAFG00845000925	CHSY1 (ENSCAFG00845000910)	SELENOS (ENSCAFG00845000893)	ENSCAFG00845000873	ENSCAFG00845000855	PCSK6 (ENSCAFG00845000759)	TM2D3 (ENSCAFG00845000657)	ENSCAFG00845000546	TJP1 (ENSCAFG00845000384) #22	ENSCAFG00845000277	ENSCAFG00845000242	APBA2 (ENSCAFG00845021792)	ENSCAFG00845021727	ENSCAFG00845021660	ENSCAFG00845021580	FAN1 (ENSCAFG00845021476)	MTMR10 (ENSCAFG00845021318)	TRPM1 (ENSCAFG00845020749)	KLF13 (ENSCAFG00845020614)	ENSCAFG00845020458	OTUD7A (ENSCAFG00845020217)	ENSCAFG00845020142	CHRNA7 (ENSCAFG00845019829)	ENSCAFG00845019775
Red fox	MODERN SPECIES	1	ENSVVUG00000014251	MEF2A (ENSVVUG00000014258)	LYSMD4 (ENSVVUG00000014281)	ADAMTS17 (ENSVVUG00000014291)	CERS3 (ENSVVUG00000014395)	ENSVVUG00000014447	ASB7 (ENSVVUG00000014453)	ALDH1A3 (ENSVVUG00000014482)	LRRK1 (ENSVVUG00000014496)	CHSY1 (ENSVVUG00000014518)	SELENOS (ENSVVUG00000014525)	SNRPA1 (ENSVVUG00000014562)	PCSK6 (ENSVVUG00000014669)	TM2D3 (ENSVVUG00000014697)	TARS3 (ENSVVUG00000014742)	TJP1 (ENSVVUG00000019842) #22	ENTREP2 (ENSVVUG00000019897)	APBA2 (ENSVVUG00000019909)	ENSVVUG00000019932
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Panthera_a	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b.bb.a	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00960000190734	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT01000000220998	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359.c	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320.bb
lion	MODERN SPECIES	6	MEF2A (ENSPLOG00000001260)	LYSMD4 (ENSPLOG00000001315)	ADAMTS17 (ENSPLOG00000001341)	CERS3 (ENSPLOG00000001374)	LINS1 (ENSPLOG00000001395)	ASB7 (ENSPLOG00000001405)	ALDH1A3 (ENSPLOG00000001423)	LRRK1 (ENSPLOG00000001478)	CHSY1 (ENSPLOG00000001571)	SELENOS (ENSPLOG00000001590)	SNRPA1 (ENSPLOG00000001692)	PCSK6 (ENSPLOG00000001748)	TM2D3 (ENSPLOG00000001911)	TARS3 (ENSPLOG00000002019)	ENSPLOG00000002112	TJP1 (ENSPLOG00000002196) #22	ENSPLOG00000002440	ENTREP2 (ENSPLOG00000002504)	APBA2 (ENSPLOG00000002596)	MCEE (ENSPLOG00000002632)	ENSPLOG00000002717	FAN1 (ENSPLOG00000002745)	MTMR10 (ENSPLOG00000002797)	TRPM1 (ENSPLOG00000002947)	KLF13 (ENSPLOG00000003239)	OTUD7A (ENSPLOG00000003320)	CHRNA7 (ENSPLOG00000003375)	MKRN3 (ENSPLOG00000003450)	ENSPLOG00000003460	NDN (ENSPLOG00000003466)	ENSPLOG00000003472
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Tiger	MODERN SPECIES	510	MEF2A (ENSPTIG00000012384)	LYSMD4 (ENSPTIG00000015532)	ADAMTS17 (ENSPTIG00000015799)	CERS3 (ENSPTIG00000017954)	LINS1 (ENSPTIG00000019042)	ASB7 (ENSPTIG00000020501)	ALDH1A3 (ENSPTIG00000020879)	LRRK1 (ENSPTIG00000021943)	CHSY1 (ENSPTIG00000004486)	SELENOS (ENSPTIG00000005783)	ENSPTIG00000007565	ENSPTIG00000009442	ENSPTIG00000012806	TM2D3 (ENSPTIG00000013716)	TARS3 (ENSPTIG00000015184)	TJP1 (ENSPTIG00000016789) #22	ENTREP2 (ENSPTIG00000007810)	APBA2 (ENSPTIG00000010141)	MCEE (ENSPTIG00000016474)	MPHOSPH10 (ENSPTIG00000016872)	FAN1 (ENSPTIG00000017410)	MTMR10 (ENSPTIG00000018920)	TRPM1 (ENSPTIG00000021520)	ENSPTIG00000012205	OTUD7A (ENSPTIG00000012755)	CHRNA7 (ENSPTIG00000013649)
Cat	MODERN SPECIES	237	LRRC28 (ENSFCAG00000013343)	MEF2A (ENSFCAG00000022495)	LYSMD4 (ENSFCAG00000015285)	ADAMTS17 (ENSFCAG00000015286)	CERS3 (ENSFCAG00000007543)	LINS1 (ENSFCAG00000036635)	ASB7 (ENSFCAG00000025849)	ALDH1A3 (ENSFCAG00000010734)	LRRK1 (ENSFCAG00000001973)	CHSY1 (ENSFCAG00000037350)	SELENOS (ENSFCAG00000028822)	SNRPA1 (ENSFCAG00000018594)	PCSK6 (ENSFCAG00000013386)	TM2D3 (ENSFCAG00000029210)	TARS3 (ENSFCAG00000008836)	TJP1 (ENSFCAG00000012043) #22	ENSFCAG00000004346	ENSFCAG00000051704	ENTREP2 (ENSFCAG00000008069)	APBA2 (ENSFCAG00000008067)	MCEE (ENSFCAG00000038444)	MPHOSPH10 (ENSFCAG00000026780)	ENSFCAG00000052273	FAN1 (ENSFCAG00000005498)	MTMR10 (ENSFCAG00000003271)	TRPM1 (ENSFCAG00000003436)	KLF13 (ENSFCAG00000028152)	OTUD7A (ENSFCAG00000011528)	CHRNA7 (ENSFCAG00000036300)	MKRN3 (ENSFCAG00000009688)	MAGEL2 (ENSFCAG00000025882)
Laurasiatheria_c	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320
Equus	ANCESTRAL SPECIES	4	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00390000009320	ENSGT00940000158222	ENSGT00940000155050
Donkey	MODERN SPECIES	11	LRRC28 (ENSEASG00005017658)	MEF2A (ENSEASG00005017659)	LYSMD4 (ENSEASG00005036183)	ADAMTS17 (ENSEASG00005017668)	CERS3 (ENSEASG00005017687)	LINS1 (ENSEASG00005036218)	ASB7 (ENSEASG00005017690)	ALDH1A3 (ENSEASG00005017694)	LRRK1 (ENSEASG00005017696)	CHSY1 (ENSEASG00005017701)	SELENOS (ENSEASG00005017704)	SNRPA1 (ENSEASG00005017706)	PCSK6 (ENSEASG00005017712)	TM2D3 (ENSEASG00005017716)	ENSEASG00005017718	ENSEASG00005017725 #22	ENSEASG00005017731	ENSEASG00005017737	ENSEASG00005017743	ENSEASG00005017746	ENSEASG00005017777	ENSEASG00005017788	TRPM1 (ENSEASG00005017807)	KLF13 (ENSEASG00005017839)	OTUD7A (ENSEASG00005017841)	ENSEASG00005017852	ENSEASG00005024022	ENSEASG00005028965	ENSEASG00005023766	SNURF (ENSEASG00005017866)	SNRPN (ENSEASG00005017871)
Horse	MODERN SPECIES		LRRC28 (ENSECAG00000010529)	MEF2A (ENSECAG00000011593)	LYSMD4 (ENSECAG00000000376)	ADAMTS17 (ENSECAG00000000579)	CERS3 (ENSECAG00000013052)	LINS1 (ENSECAG00000018867)	ASB7 (ENSECAG00000003905)	ALDH1A3 (ENSECAG00000008871)	LRRK1 (ENSECAG00000024161)	CHSY1 (ENSECAG00000010914)	SELENOS (ENSECAG00000012386)	SNRPA1 (ENSECAG00000049484)	PCSK6 (ENSECAG00000001688)	TM2D3 (ENSECAG00000022561)	TARS3 (ENSECAG00000024315)	TJP1 (ENSECAG00000020528) #22	ENTREP2 (ENSECAG00000012223)	APBA2 (ENSECAG00000015516)	MCEE (ENSECAG00000005917)	MPHOSPH10 (ENSECAG00000005944)	FAN1 (ENSECAG00000010387)	MTMR10 (ENSECAG00000013765)	TRPM1 (ENSECAG00000007539)	KLF13 (ENSECAG00000029677)	ENSECAG00000028882	OTUD7A (ENSECAG00000022071)	CHRNA7 (ENSECAG00000024757)	ENSECAG00000001383	MAGEL2 (ENSECAG00000013555)	NDN (ENSECAG00000001491)	SNURF (ENSECAG00000051267)
Chiroptera	ANCESTRAL SPECIES	43	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00940000158222
Microchiroptera	ANCESTRAL SPECIES	42	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00940000163627	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00950000183077.a.a.a.b	ENSGT00940000163006	ENSGT00940000163084	ENSGT00940000158222
Greater horseshoe bat	MODERN SPECIES	20	LRRC28 (ENSRFEG00010012612)	MEF2A (ENSRFEG00010012816)	LYSMD4 (ENSRFEG00010013232)	ADAMTS17 (ENSRFEG00010013302)	CERS3 (ENSRFEG00010013357)	LINS1 (ENSRFEG00010013393)	ASB7 (ENSRFEG00010013431)	ALDH1A3 (ENSRFEG00010013510)	LRRK1 (ENSRFEG00010013669)	CHSY1 (ENSRFEG00010013762)	SELENOS (ENSRFEG00010013825)	SNRPA1 (ENSRFEG00010013941)	PCSK6 (ENSRFEG00010014200)	TM2D3 (ENSRFEG00010015298)	TARS3 (ENSRFEG00010015547)	TJP1 (ENSRFEG00010016082) #22	ENTREP2 (ENSRFEG00010016590)	APBA2 (ENSRFEG00010016756)	MCEE (ENSRFEG00010016873)	MPHOSPH10 (ENSRFEG00010016930)	FAN1 (ENSRFEG00010016986)	MTMR10 (ENSRFEG00010017311)	TRPM1 (ENSRFEG00010017381)	KLF13 (ENSRFEG00010018216)	OTUD7A (ENSRFEG00010018255)	CHRNA7 (ENSRFEG00010018290)	ENSRFEG00010018465	MKRN3 (ENSRFEG00010018503)	MAGEL2 (ENSRFEG00010018582)	NDN (ENSRFEG00010018594)	SNRPN (ENSRFEG00010018624)
Microbat	MODERN SPECIES	1669														TM2D3 (ENSMLUG00000012867)	ENSMLUG00000012870	TJP1 (ENSMLUG00000004865) #22	NSMCE3 (ENSMLUG00000001939)	ENTREP2 (ENSMLUG00000015644)	APBA2 (ENSMLUG00000015628)	ENSMLUG00000023506
Megabat	MODERN SPECIES	3788																TJP1 (ENSPVAG00000016581) #22
Atlantogenata	ANCESTRAL SPECIES	67														ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.B.a.b	ENSGT00940000156820.a.a	ENSGT00390000017892	ENSGT00390000014593	ENSGT00940000156117	ENSGT01100000263667	ENSGT00940000160905	ENSGT00940000157366	ENSGT00940000153636.b	ENSGT00940000157611	ENSGT00440000033805	ENSGT00410000028408	ENSGT00390000017130	ENSGT00940000156165	ENSGT01050000244942.b.a.a
Afrotheria	ANCESTRAL SPECIES	75														ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.B.a.b	ENSGT00940000156820.a.a	ENSGT00390000017892	ENSGT00940000156117	ENSGT01100000263667	ENSGT00940000160905	ENSGT00940000157366	ENSGT00940000153636.b	ENSGT00940000157611	ENSGT00440000033805	ENSGT00410000028408	ENSGT00390000017130	ENSGT00940000156165	ENSGT01050000244942.b.a.a	ENSGT00940000154609
Tenrec	MODERN SPECIES	698																TJP1 (ENSETEG00000012548) #22
Afrotheria_a	ANCESTRAL SPECIES	74														ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.B.a.b	ENSGT00940000156820.a.a	ENSGT00390000017892	ENSGT00940000156117	ENSGT01100000263667	ENSGT00940000160905	ENSGT00940000157366	ENSGT00940000153636.b	ENSGT00940000157611	ENSGT00440000033805	ENSGT00410000028408	ENSGT00390000017130	ENSGT00940000156165	ENSGT01050000244942.b.a.a	ENSGT00940000154609.ob.a
Hyrax	MODERN SPECIES	515																TJP1 (ENSPCAG00000013310) #22
Elephant	DUPLICATION
Elephant	MODERN SPECIES	618														TM2D3 (ENSLAFG00000011938)	TARS3 (ENSLAFG00000011941)	TJP1 (ENSLAFG00000002222) #22	ENSLAFG00000031989	NSMCE3 (ENSLAFG00000002523)	ENSLAFG00000000765	APBA2 (ENSLAFG00000028972)	MCEE (ENSLAFG00000004477)	MPHOSPH10 (ENSLAFG00000011341)	FAN1 (ENSLAFG00000018373)	MTMR10 (ENSLAFG00000018374)	TRPM1 (ENSLAFG00000018381)	ENSLAFG00000030149	OTUD7A (ENSLAFG00000000988)	ENSLAFG00000008943	MKRN3 (ENSLAFG00000017075)	ENSLAFG00000030286	NDN (ENSLAFG00000005577)
Elephant	MODERN SPECIES	472	ENSLAFG00000017327	TTF1 (ENSLAFG00000001119)	CFAP77 (ENSLAFG00000015373)	BARHL1 (ENSLAFG00000015377)	DDX31 (ENSLAFG00000015379)	GTF3C4 (ENSLAFG00000015395)	AK8 (ENSLAFG00000015400)	SPACA9 (ENSLAFG00000015404)	TSC1 (ENSLAFG00000008433)	GFI1B (ENSLAFG00000022367)	GTF3C5 (ENSLAFG00000003053)	ENSLAFG00000004056	GBGT1 (ENSLAFG00000005668)	FXN (ENSLAFG00000009606)	CEL (ENSLAFG00000003263)	ENSLAFG00000009356 #22	ENTREP1 (ENSLAFG00000001072)	APBA1 (ENSLAFG00000004384)	PTAR1 (ENSLAFG00000001293)	MAMDC2 (ENSLAFG00000005018)	ENSLAFG00000005022	ENSLAFG00000021378	KLF9 (ENSLAFG00000027506)	TRPM3 (ENSLAFG00000006930)	CEMIP2 (ENSLAFG00000015624)	ABHD17B (ENSLAFG00000015120)	C9orf85 (ENSLAFG00000028929)	ENSLAFG00000021493	GDA (ENSLAFG00000001187)	ZFAND5 (ENSLAFG00000008217)	TMC1 (ENSLAFG00000023116)
Xenarthra	ANCESTRAL SPECIES	357													ENSGT00390000015476.d.b	ENSGT00940000156639	ENSGT00390000005811	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.B.a.b	ENSGT00940000156820.a.a	ENSGT00390000017892	ENSGT00390000014593	ENSGT00940000156117	ENSGT01100000263667	ENSGT00940000160905	ENSGT00940000157366
Sloth	MODERN SPECIES	572																TJP1 (ENSCHOG00000013149) #22
Armadillo	DUPLICATION
Armadillo	MODERN SPECIES	2084																TJP1 (ENSDNOG00000002461) #22
Armadillo	MODERN SPECIES	1188													PABIR1 (ENSDNOG00000023644)	PIP5K1B (ENSDNOG00000003904)	FXN (ENSDNOG00000024066)	ENSDNOG00000012624 #22	ENTREP1 (ENSDNOG00000004848)	ENSDNOG00000047098	APBA1 (ENSDNOG00000044531)	ENSDNOG00000031390	ENSDNOG00000015500	MAMDC2 (ENSDNOG00000015048)	ENSDNOG00000024544	KLF9 (ENSDNOG00000018839)	ENSDNOG00000034480	TRPM3 (ENSDNOG00000016209)
Marsupialia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257.g	ENSGT00390000006883
Opossum	DUPLICATION
Opossum	MODERN SPECIES		ENSMODG00000012734	MEF2A (ENSMODG00000012725)	LYSMD4 (ENSMODG00000012716)	ADAMTS17 (ENSMODG00000012713)	CERS3 (ENSMODG00000012165)	LINS1 (ENSMODG00000012160)	ASB7 (ENSMODG00000038455)	ALDH1A3 (ENSMODG00000012141)	LRRK1 (ENSMODG00000012068)	CHSY1 (ENSMODG00000012037)	SELENOS (ENSMODG00000012032)	SNRPA1 (ENSMODG00000012020)	PCSK6 (ENSMODG00000012001)	TM2D3 (ENSMODG00000011956)	TARS3 (ENSMODG00000011941)	TJP1 (ENSMODG00000011885) #22	ENSMODG00000041272	ENTREP2 (ENSMODG00000011845)	ENSMODG00000046838	APBA2 (ENSMODG00000011835)	ENSMODG00000043188	MCEE (ENSMODG00000051000)	MPHOSPH10 (ENSMODG00000011803)	ENSMODG00000011795	ENSMODG00000047395	ENSMODG00000011784	TRPM1 (ENSMODG00000011776)	KLF13 (ENSMODG00000039665)	ENSMODG00000047909	ENSMODG00000048736	OTUD7A (ENSMODG00000011729)
Opossum	MODERN SPECIES	5	ENSMODG00000024673	DMRT2 (ENSMODG00000003430)	DMRT3 (ENSMODG00000003407)	DMRT1 (ENSMODG00000003401)	KANK1 (ENSMODG00000003387)	ENSMODG00000003306	ENSMODG00000045417	ENSMODG00000044962	ENSMODG00000039961	ENSMODG00000044468	ENSMODG00000024854	PGM5 (ENSMODG00000003131)	TMEM252 (ENSMODG00000003092)	PIP5K1B (ENSMODG00000003063)	ENSMODG00000002952	ENSMODG00000002938 #22	ENTREP1 (ENSMODG00000002869)	APBA1 (ENSMODG00000002848)	PTAR1 (ENSMODG00000002821)	ENSMODG00000027611	ENSMODG00000037614	CFAP95 (ENSMODG00000024861)	MAMDC2 (ENSMODG00000002812)	ENSMODG00000028650	ENSMODG00000024862	SMC5 (ENSMODG00000002801)	KLF9 (ENSMODG00000002760)	TRPM3 (ENSMODG00000002750)	ENSMODG00000044608	CEMIP2 (ENSMODG00000002710)	ENSMODG00000039345
Marsupialia_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257.g	ENSGT00390000006883
Diprotodontia	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257.g	ENSGT00390000006883
Diprotodontia_a	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00940000157771	ENSGT00940000156205	ENSGT00940000160583	ENSGT00940000158773	ENSGT01030000234515.a.b.a.b	ENSGT00390000001790	ENSGT00940000158068	ENSGT00940000158815	ENSGT00940000160363	ENSGT01050000244857.C.a.a	ENSGT00390000015688	ENSGT00940000153289.b	ENSGT00940000159506	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257.g	ENSGT00390000006883
koala	MODERN SPECIES	6	ENSPCIG00000016215	MEF2A (ENSPCIG00000033941)	LYSMD4 (ENSPCIG00000016226)	ADAMTS17 (ENSPCIG00000024064)	CERS3 (ENSPCIG00000024074)	ENSPCIG00000024079	ASB7 (ENSPCIG00000024081)	ALDH1A3 (ENSPCIG00000011711)	LRRK1 (ENSPCIG00000010171)	CHSY1 (ENSPCIG00000011094)	SELENOS (ENSPCIG00000030872)	SNRPA1 (ENSPCIG00000027264)	PCSK6 (ENSPCIG00000027014)	TM2D3 (ENSPCIG00000022485)	TARS3 (ENSPCIG00000022481)	TJP1 (ENSPCIG00000022463) #22
Common wonbat	MODERN SPECIES	581	LRRC28 (ENSVURG00010008740)	MEF2A (ENSVURG00010008788)	LYSMD4 (ENSVURG00010009029)	ADAMTS17 (ENSVURG00010009093)	CERS3 (ENSVURG00010009458)	ENSVURG00010009474	ASB7 (ENSVURG00010009488)	ALDH1A3 (ENSVURG00010009507)	LRRK1 (ENSVURG00010009533)	CHSY1 (ENSVURG00010009566)	SELENOS (ENSVURG00010009570)	SNRPA1 (ENSVURG00010009577)	PCSK6 (ENSVURG00010009599)	TM2D3 (ENSVURG00010009626)	TARS3 (ENSVURG00010009741)	TJP1 (ENSVURG00010014693) #22	ENTREP2 (ENSVURG00010015413)	APBA2 (ENSVURG00010015428)	MCEE (ENSVURG00010015487)	MPHOSPH10 (ENSVURG00010015493)	FAN1 (ENSVURG00010015508)	MTMR10 (ENSVURG00010015528)	TRPM1 (ENSVURG00010015575)	KLF13 (ENSVURG00010015669)	OTUD7A (ENSVURG00010015679)	GCNT3 (ENSVURG00010015692)	GTF2A2 (ENSVURG00010015706)	BNIP2 (ENSVURG00010015734)	FOXB1 (ENSVURG00010015763)	ENSVURG00010015777	ICE2 (ENSVURG00010015808)
Wallaby	MODERN SPECIES	1322																TJP1 (ENSMEUG00000007837) #22
Tasmanian devil	DUPLICATION
Tasmanian devil	MODERN SPECIES	1	LRRC28 (ENSSHAG00000016134)	MEF2A (ENSSHAG00000016994)	LYSMD4 (ENSSHAG00000026967)	ADAMTS17 (ENSSHAG00000017515)	CERS3 (ENSSHAG00000002330)	LINS1 (ENSSHAG00000005100)	ASB7 (ENSSHAG00000005887)	ALDH1A3 (ENSSHAG00000009473)	LRRK1 (ENSSHAG00000009850)	CHSY1 (ENSSHAG00000023490)	SELENOS (ENSSHAG00000029939)	SNRPA1 (ENSSHAG00000006364)	PCSK6 (ENSSHAG00000006838)	TM2D3 (ENSSHAG00000030739)	ENSSHAG00000010266	ENSSHAG00000012218 #22	ENSSHAG00000025894	ENSSHAG00000028460	ENSSHAG00000015470	ENSSHAG00000029415	ENSSHAG00000016579	ENSSHAG00000016629	MTMR10 (ENSSHAG00000016702)	TRPM1 (ENSSHAG00000016828)	KLF13 (ENSSHAG00000032091)	ENSSHAG00000026327	ENSSHAG00000011674	GTF2A2 (ENSSHAG00000031153)	BNIP2 (ENSSHAG00000012090)	FOXB1 (ENSSHAG00000029618)	ANXA2 (ENSSHAG00000015232)
Tasmanian devil	MODERN SPECIES		LINGO2 (ENSSHAG00000006298)	C9orf72 (ENSSHAG00000003147)	TEK (ENSSHAG00000022716)	IFT74 (ENSSHAG00000002400)	ENSSHAG00000023351	PLAA (ENSSHAG00000005541)	TUSC1 (ENSSHAG00000022638)	ENSSHAG00000000769	ELAVL2 (ENSSHAG00000026984)	ENSSHAG00000024754	ENSSHAG00000002809	ENSSHAG00000004333	ENSSHAG00000005400	ENSSHAG00000026121	FXN (ENSSHAG00000032150)	ENSSHAG00000009848 #22	ENTREP1 (ENSSHAG00000008936)	APBA1 (ENSSHAG00000029098)	PTAR1 (ENSSHAG00000005070)	CFAP95 (ENSSHAG00000001352)	MAMDC2 (ENSSHAG00000012246)	SMC5 (ENSSHAG00000011901)	KLF9 (ENSSHAG00000023394)	TRPM3 (ENSSHAG00000009271)	CEMIP2 (ENSSHAG00000005697)	ABHD17B (ENSSHAG00000024316)	C9orf85 (ENSSHAG00000001633)	ENSSHAG00000029743	GDA (ENSSHAG00000001275)	ZFAND5 (ENSSHAG00000027724)	ENSSHAG00000001209
Platypus	MODERN SPECIES	16	ENSOANG00000043975	ENSOANG00000022143	ENSOANG00000037711	C1orf159 (ENSOANG00000021823)	RNF223 (ENSOANG00000048509)	ENSOANG00000011559	AGRN (ENSOANG00000013792)	HES4 (ENSOANG00000049111)	ENSOANG00000036022	ENSOANG00000042419	KLHL17 (ENSOANG00000000374)	NOC2L (ENSOANG00000050178)	SAMD11 (ENSOANG00000009527)	TM2D3 (ENSOANG00000036918)	ENSOANG00000013263	TJP1 (ENSOANG00000006832) #22	ENSOANG00000010371	APBA2 (ENSOANG00000010369)	MCEE (ENSOANG00000010368)	MPHOSPH10 (ENSOANG00000010367)	FAN1 (ENSOANG00000010366)	MTMR10 (ENSOANG00000010364)	TRPM1 (ENSOANG00000010363)	KLF13 (ENSOANG00000044436)	OTUD7A (ENSOANG00000011103)	GCNT3 (ENSOANG00000006004)	GTF2A2 (ENSOANG00000013776)	BNIP2 (ENSOANG00000003500)	ENSOANG00000048817	ANXA2 (ENSOANG00000012341)	ICE2 (ENSOANG00000012343)
Sauria	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000157602	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522
Archelosauria	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157602	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199511	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000181447	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522
Archosauria	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000157602	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000181447	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Aves	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000157602	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000181447	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
African ostrich	MODERN SPECIES	834	ADAM10 (ENSSCUG00000014747)	MINDY2 (ENSSCUG00000014754)	SLTM (ENSSCUG00000014764)	RNF111 (ENSSCUG00000014769)	CCNB2 (ENSSCUG00000014772)	MYO1E (ENSSCUG00000014780)	FAM81A (ENSSCUG00000014814)	ENSSCUG00000014822	ENSSCUG00000014824	THSD4 (ENSSCUG00000014830)	LRRC49 (ENSSCUG00000014845)	LARP6 (ENSSCUG00000014858)	ADAL (ENSSCUG00000014865)	TM2D3 (ENSSCUG00000014869)	TARS3 (ENSSCUG00000014877)	TJP1 (ENSSCUG00000014899) #22	ENSSCUG00000014950	APBA2 (ENSSCUG00000014957)	MCEE (ENSSCUG00000014963)	MPHOSPH10 (ENSSCUG00000014973)	FAN1 (ENSSCUG00000014993)	ENSSCUG00000014999	ENSSCUG00000015007	TRPM1 (ENSSCUG00000015019)	KLF13 (ENSSCUG00000015052)	OTUD7A (ENSSCUG00000015055)	ENSSCUG00000015058	ENSSCUG00000015059	GCNT3 (ENSSCUG00000015063)	GTF2A2 (ENSSCUG00000015065)	BNIP2 (ENSSCUG00000015068)
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Neognathae_b	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00940000157602	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257	ENSGT00390000006883
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Medium ground finch	MODERN SPECIES	16	LIPC (ENSGFOG00000011709)	ADAM10 (ENSGFOG00000011720)	MINDY2 (ENSGFOG00000011738)	SLTM (ENSGFOG00000011769)	RNF111 (ENSGFOG00000011985)	CCNB2 (ENSGFOG00000011997)	MYO1E (ENSGFOG00000012007)	FAM81A (ENSGFOG00000012019)	ENSGFOG00000012024	THSD4 (ENSGFOG00000012032)	LRRC49 (ENSGFOG00000012037)	LARP6 (ENSGFOG00000012041)	ADAL (ENSGFOG00000012044)	TM2D3 (ENSGFOG00000012048)	TARS3 (ENSGFOG00000012098)	TJP1 (ENSGFOG00000012759) #22	ENTREP2 (ENSGFOG00000012797)	APBA2 (ENSGFOG00000012815)	MCEE (ENSGFOG00000012820)	MPHOSPH10 (ENSGFOG00000012821)	FAN1 (ENSGFOG00000012829)	MTMR10 (ENSGFOG00000012841)	TRPM1 (ENSGFOG00000013008)	CA12 (ENSGFOG00000013852)	USP3 (ENSGFOG00000013866)	FBXL22 (ENSGFOG00000013873)	HERC1 (ENSGFOG00000013876)	DAPK2 (ENSGFOG00000013878)	ENSGFOG00000013880	TBC1D2B (ENSGFOG00000013882)	CIB2 (ENSGFOG00000013885)
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Great tit	MODERN SPECIES	1	LIPC (ENSPMJG00000016726)	ADAM10 (ENSPMJG00000016725)	MINDY2 (ENSPMJG00000016724)	SLTM (ENSPMJG00000016582)	RNF111 (ENSPMJG00000016570)	CCNB2 (ENSPMJG00000016564)	MYO1E (ENSPMJG00000015983)	FAM81A (ENSPMJG00000015957)	CHRFAM7A (ENSPMJG00000015956)	THSD4 (ENSPMJG00000015955)	LRRC49 (ENSPMJG00000015954)	LARP6 (ENSPMJG00000015953)	ADAL (ENSPMJG00000015952)	TM2D3 (ENSPMJG00000015951)	TARS3 (ENSPMJG00000015950)	TJP1 (ENSPMJG00000015946) #22	ENTREP2 (ENSPMJG00000015944)	APBA2 (ENSPMJG00000015942)	MCEE (ENSPMJG00000015941)	MPHOSPH10 (ENSPMJG00000015940)	FAN1 (ENSPMJG00000015939)	MTMR10 (ENSPMJG00000015938)	TRPM1 (ENSPMJG00000015936)	KLF13 (ENSPMJG00000015933)	OTUD7A (ENSPMJG00000015932)	GCNT3 (ENSPMJG00000015928)	GTF2A2 (ENSPMJG00000015927)	BNIP2 (ENSPMJG00000015926)	FOXB1 (ENSPMJG00000015925)	ANXA2 (ENSPMJG00000015923)	ICE2 (ENSPMJG00000015922)
Neognathae_c	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157602	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257	ENSGT00390000006883
Kakapo	MODERN SPECIES	1	LIPC (ENSSHBG00005020219)	ADAM10 (ENSSHBG00005020223)	MINDY2 (ENSSHBG00005020225)	SLTM (ENSSHBG00005020230)	RNF111 (ENSSHBG00005020234)	CCNB2 (ENSSHBG00005020237)	MYO1E (ENSSHBG00005020280)	FAM81A (ENSSHBG00005020350)	ENSSHBG00005020354	THSD4 (ENSSHBG00005020365)	LRRC49 (ENSSHBG00005020392)	LARP6 (ENSSHBG00005020407)	ADAL (ENSSHBG00005020410)	TM2D3 (ENSSHBG00005020416)	TARS3 (ENSSHBG00005020419)	TJP1 (ENSSHBG00005020432) #22	ENTREP2 (ENSSHBG00005020454)	APBA2 (ENSSHBG00005020461)	MCEE (ENSSHBG00005020465)	MPHOSPH10 (ENSSHBG00005020469)	FAN1 (ENSSHBG00005020475)	MTMR10 (ENSSHBG00005020483)	TRPM1 (ENSSHBG00005020495)	KLF13 (ENSSHBG00005020514)	OTUD7A (ENSSHBG00005020517)	GCNT3 (ENSSHBG00005020519)	GTF2A2 (ENSSHBG00005020522)	BNIP2 (ENSSHBG00005000936)	FOXB1 (ENSSHBG00005010273)	ANXA2 (ENSSHBG00005010321)	ICE2 (ENSSHBG00005010337)
Golden eagle	MODERN SPECIES	21	LIPC (ENSACCG00020005327)	ADAM10 (ENSACCG00020005313)	MINDY2 (ENSACCG00020005299)	SLTM (ENSACCG00020005275)	RNF111 (ENSACCG00020005250)	CCNB2 (ENSACCG00020005235)	MYO1E (ENSACCG00020005196)	FAM81A (ENSACCG00020005161)	ENSACCG00020005149	THSD4 (ENSACCG00020005122)	LRRC49 (ENSACCG00020005084)	LARP6 (ENSACCG00020005075)	ADAL (ENSACCG00020005067)	TM2D3 (ENSACCG00020005060)	TARS3 (ENSACCG00020004893)	TJP1 (ENSACCG00020004652) #22	ENTREP2 (ENSACCG00020004606)	APBA2 (ENSACCG00020004579)	MCEE (ENSACCG00020004567)	MPHOSPH10 (ENSACCG00020004552)	FAN1 (ENSACCG00020004537)	MTMR10 (ENSACCG00020004503)	TRPM1 (ENSACCG00020004421)	KLF13 (ENSACCG00020004318)	OTUD7A (ENSACCG00020004306)	GCNT3 (ENSACCG00020004293)	GTF2A2 (ENSACCG00020004287)	BNIP2 (ENSACCG00020004276)	FOXB1 (ENSACCG00020004266)	ANXA2 (ENSACCG00020004261)	ICE2 (ENSACCG00020004246)
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Duck	MODERN SPECIES	2	ADAM10 (ENSAPLG00000013495)	MINDY2 (ENSAPLG00000013166)	SLTM (ENSAPLG00000013025)	RNF111 (ENSAPLG00000012549)	CCNB2 (ENSAPLG00000011947)	MYO1E (ENSAPLG00000010820)	FAM81A (ENSAPLG00000010722)	ENSAPLG00000010434	THSD4 (ENSAPLG00000010423)	LRRC49 (ENSAPLG00000009920)	ENSAPLG00000030560	LARP6 (ENSAPLG00000009914)	ADAL (ENSAPLG00000009775)	TM2D3 (ENSAPLG00000009696)	TARS3 (ENSAPLG00000008485)	TJP1 (ENSAPLG00000007911) #22	ENTREP2 (ENSAPLG00000007880)	APBA2 (ENSAPLG00000007575)	MCEE (ENSAPLG00000007573)	FAN1 (ENSAPLG00000007284)	MTMR10 (ENSAPLG00000006723)	ENSAPLG00000025093	ENSAPLG00000005599	ENSAPLG00000023866	KLF13 (ENSAPLG00000006681)	OTUD7A (ENSAPLG00000006607)	GCNT3 (ENSAPLG00000025980)	GTF2A2 (ENSAPLG00000006577)	BNIP2 (ENSAPLG00000006267)	FOXB1 (ENSAPLG00000028441)	ANXA2 (ENSAPLG00000006103)
Pink-footed goose	DUPLICATION
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Turkey	DUPLICATION
Turkey	DUPLICATION
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painted turtle	MODERN SPECIES	2410	MINDY2 (ENSCPBG00000005835)	SLTM (ENSCPBG00000006045)	RNF111 (ENSCPBG00000010682)	CCNB2 (ENSCPBG00000010694)	MYO1E (ENSCPBG00000010702)	FAM81A (ENSCPBG00000010724)	ENSCPBG00000010732	ENSCPBG00000010741	ENSCPBG00000010742	THSD4 (ENSCPBG00000010747)	LRRC49 (ENSCPBG00000010765)	LARP6 (ENSCPBG00000010771)	ADAL (ENSCPBG00000010776)	TM2D3 (ENSCPBG00000010781)	TARS3 (ENSCPBG00000010792)	TJP1 (ENSCPBG00000010820) #22	ENTREP2 (ENSCPBG00000010857)	APBA2 (ENSCPBG00000010888)	MCEE (ENSCPBG00000010926)	MPHOSPH10 (ENSCPBG00000010930)	FAN1 (ENSCPBG00000010941)	MTMR10 (ENSCPBG00000010954)	TRPM1 (ENSCPBG00000011125)	KLF13 (ENSCPBG00000017133)	OTUD7A (ENSCPBG00000017134)	ENSCPBG00000017137	GCNT3 (ENSCPBG00000017139)	GTF2A2 (ENSCPBG00000017140)	BNIP2 (ENSCPBG00000017141)	FOXB1 (ENSCPBG00000017142)	ANXA2 (ENSCPBG00000017143)
Testudinidae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00940000157602	ENSGT00940000160579	ENSGT00390000016607.a.b	ENSGT00940000156573	ENSGT00940000157691	ENSGT00940000155405	ENSGT00940000157461	ENSGT00390000004985.b	ENSGT00940000154617.B	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024.k	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257	ENSGT00390000006883
Goode s thornscrub tortoise	MODERN SPECIES	1	ADAM10 (ENSGEVG00005006648)	MINDY2 (ENSGEVG00005006676)	SLTM (ENSGEVG00005006854)	RNF111 (ENSGEVG00005007444)	CCNB2 (ENSGEVG00005007484)	MYO1E (ENSGEVG00005007601)	FAM81A (ENSGEVG00005007916)	ENSGEVG00005007968	ENSGEVG00005007998	THSD4 (ENSGEVG00005008026)	LRRC49 (ENSGEVG00005008116)	LARP6 (ENSGEVG00005008172)	ADAL (ENSGEVG00005008188)	TM2D3 (ENSGEVG00005008215)	TARS3 (ENSGEVG00005008239)	TJP1 (ENSGEVG00005008329) #22	ENTREP2 (ENSGEVG00005008482)	APBA2 (ENSGEVG00005008523)	MCEE (ENSGEVG00005008574)	MPHOSPH10 (ENSGEVG00005008583)	FAN1 (ENSGEVG00005008622)	MTMR10 (ENSGEVG00005008694)	ENSGEVG00005008735	ENSGEVG00005008816	KLF13 (ENSGEVG00005008850)	OTUD7A (ENSGEVG00005008869)	GCNT3 (ENSGEVG00005008941)	GTF2A2 (ENSGEVG00005008992)	BNIP2 (ENSGEVG00005009019)	FOXB1 (ENSGEVG00005009058)	ANXA2 (ENSGEVG00005009073)
Abingdon island giant tortoise	MODERN SPECIES	55											LRRC49 (ENSCABG00000008436)	LARP6 (ENSCABG00000008432)	ADAL (ENSCABG00000008430)	TM2D3 (ENSCABG00000008408)	TARS3 (ENSCABG00000008403)	TJP1 (ENSCABG00000008389) #22	ENSCABG00000008385
Chinese turtle	DUPLICATION
Chinese turtle	MODERN SPECIES	2156							ENSPSIG00000009549	ENSPSIG00000009536	ENSPSIG00000009517	ENSPSIG00000009484	LRRC49 (ENSPSIG00000009082)	LARP6 (ENSPSIG00000009071)	ADAL (ENSPSIG00000008435)	TM2D3 (ENSPSIG00000008431)	TARS3 (ENSPSIG00000008419)	TJP1 (ENSPSIG00000005399) #22	ENTREP2 (ENSPSIG00000017937)	APBA2 (ENSPSIG00000017923)	MCEE (ENSPSIG00000017918)	MPHOSPH10 (ENSPSIG00000017642)	FAN1 (ENSPSIG00000017524)	ENSPSIG00000017401	MTMR10 (ENSPSIG00000016934)	TRPM1 (ENSPSIG00000015045)	KLF13 (ENSPSIG00000014849)	OTUD7A (ENSPSIG00000014649)	GCNT3 (ENSPSIG00000000701)	GTF2A2 (ENSPSIG00000014538)	BNIP2 (ENSPSIG00000013831)	ANXA2 (ENSPSIG00000012686)	ICE2 (ENSPSIG00000012216)
Chinese turtle	MODERN SPECIES	2218	WDR4 (ENSPSIG00000017237)	PDE9A (ENSPSIG00000015118)	SLC37A1 (ENSPSIG00000013862)	RSPH1 (ENSPSIG00000013753)	ENSPSIG00000000453	DMRT2 (ENSPSIG00000013575)	ENSPSIG00000000444	DMRT1 (ENSPSIG00000013048)	KANK1 (ENSPSIG00000012412)	ENSPSIG00000012215	DOCK8 (ENSPSIG00000010032)	ENSPSIG00000017206	PGM5 (ENSPSIG00000016282)	PIP5K1B (ENSPSIG00000014991)	FXN (ENSPSIG00000014478)	ENSPSIG00000011823 #22	ENTREP1 (ENSPSIG00000011516)	APBA1 (ENSPSIG00000010992)	PTAR1 (ENSPSIG00000010871)	ENSPSIG00000010622	CFAP95 (ENSPSIG00000010429)	MAMDC2 (ENSPSIG00000009692)	ENSPSIG00000009487	KLF9 (ENSPSIG00000009426)	TRPM3 (ENSPSIG00000006659)	CEMIP2 (ENSPSIG00000017444)	ENSPSIG00000000438	ABHD17B (ENSPSIG00000017145)	C9orf85 (ENSPSIG00000017025)	GDA (ENSPSIG00000014988)	ZFAND5 (ENSPSIG00000014868)
Lepidosauria	ANCESTRAL SPECIES	46									ENSGT00940000154617.B.v	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.a.a	ENSGT00940000153941.b	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00950000185579	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531
tuatara	MODERN SPECIES	542													TM2D3 (ENSSPUG00000001555)	TARS3 (ENSSPUG00000001523)	ENSSPUG00000001515	TJP1 (ENSSPUG00000001329) #22
Episquamata	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000155491.c	ENSGT00940000159422	ENSGT00940000153533.a	ENSGT00940000155707	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000154617.B.v	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.b	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Toxicofera	ANCESTRAL SPECIES	15	ENSGT00940000157447	ENSGT00940000155491.c	ENSGT00940000159422	ENSGT00940000153533.a	ENSGT00940000155707	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000154617.B.v	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011.d	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.b	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199886	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Lizard	DUPLICATION
Lizard	MODERN SPECIES	1250													ENSACAG00000000191	ENSACAG00000000192	ENSACAG00000000199	ENSACAG00000000216 #22	ENSACAG00000000275
Lizard	MODERN SPECIES	1	KCNV2 (ENSACAG00000003138)	VLDLR (ENSACAG00000003015)	SMARCA2 (ENSACAG00000002423)	DMRT2 (ENSACAG00000002411)	DMRT3 (ENSACAG00000002401)	DMRT1 (ENSACAG00000002356)	KANK1 (ENSACAG00000002270)	ENSACAG00000036574	DOCK8 (ENSACAG00000001924)	ENSACAG00000001658	ENSACAG00000008130	PGM5 (ENSACAG00000001410)	TMEM252 (ENSACAG00000029180)	PIP5K1B (ENSACAG00000001281)	FXN (ENSACAG00000043698)	ENSACAG00000001252 #22	ENTREP1 (ENSACAG00000001191)	APBA1 (ENSACAG00000001040)	PTAR1 (ENSACAG00000027513)	CFAP95 (ENSACAG00000001025)	MAMDC2 (ENSACAG00000000946)	SMC5 (ENSACAG00000000931)	KLF9 (ENSACAG00000000916)	TRPM3 (ENSACAG00000008993)	ENSACAG00000035100	CEMIP2 (ENSACAG00000012861)	ABHD17B (ENSACAG00000037327)	C9orf85 (ENSACAG00000012828)	GDA (ENSACAG00000012708)	ZFAND5 (ENSACAG00000012653)	TMC1 (ENSACAG00000012478)
Elapidae	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000155491.c	ENSGT00940000159422	ENSGT00940000153533.a	ENSGT00940000155707	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000154617.B.v	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011.d	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000154969.a	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.b	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199511	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Indian cobra	MODERN SPECIES	14	SIN3A (ENSNNAG00000006108)	CRABP1 (ENSNNAG00000006051)	SKIC8 (ENSNNAG00000006023)	DNAJA4 (ENSNNAG00000006011)	ACSBG1 (ENSNNAG00000005632)	ENSNNAG00000005533	ENSNNAG00000005513	ENSNNAG00000005491	ENSNNAG00000005469	ENSNNAG00000005452	THSD4 (ENSNNAG00000005421)	LARP6 (ENSNNAG00000005403)	ADAL (ENSNNAG00000005366)	TM2D3 (ENSNNAG00000005352)	ENSNNAG00000005322	TJP1 (ENSNNAG00000005105) #22	ENSNNAG00000005062	APBA2 (ENSNNAG00000005039)	ENSNNAG00000005023	MPHOSPH10 (ENSNNAG00000004974)	MTMR10 (ENSNNAG00000004919)	TRPM1 (ENSNNAG00000004567)	KLF13 (ENSNNAG00000004522)	OTUD7A (ENSNNAG00000004508)	GCNT3 (ENSNNAG00000004470)	GTF2A2 (ENSNNAG00000004440)	BNIP2 (ENSNNAG00000003933)	ANXA2 (ENSNNAG00000003810)	ICE2 (ENSNNAG00000003778)	RORA (ENSNNAG00000018906)	VPS13C (ENSNNAG00000018404)
Elapidae_a	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155491.c	ENSGT00940000159422	ENSGT00940000153533.a	ENSGT00940000155707.m	ENSGT00940000155707.n	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000154617.B.v	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011.d	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.b	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199511	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Blue-lipped sea krait	DUPLICATION
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	3444																TJP1 (ENSLLTG00000006133) #22	ENTREP2 (ENSLLTG00000006124)	APBA2 (ENSLLTG00000006111)
Blue-lipped sea krait	MODERN SPECIES	239																ENSLLTG00000001774 #22	ENTREP1 (ENSLLTG00000001789)
Acanthophiinae	ANCESTRAL SPECIES	17	ENSGT00940000155491.c	ENSGT00940000159422	ENSGT00940000153533.a	ENSGT00940000155707.m	ENSGT00940000155707.n	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000154617.B.v	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011.d	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.b	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00980000199511	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257
Eastern brown snake	DUPLICATION
Eastern brown snake	DUPLICATION
Eastern brown snake	DUPLICATION
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	786																ENSPTXG00000017334 #22
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	785																ENSPTXG00000017281 #22
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	44	CRABP1 (ENSPTXG00000010361)	SKIC8 (ENSPTXG00000010362)	ENSPTXG00000010363	ENSPTXG00000010364	ENSPTXG00000010365	ENSPTXG00000010367	IDH3A (ENSPTXG00000010368)	ENSPTXG00000010369	ENSPTXG00000010370	ENSPTXG00000010371	ENSPTXG00000010372	ENSPTXG00000010373	LARP6 (ENSPTXG00000010374)	TM2D3 (ENSPTXG00000010375)	TARS3 (ENSPTXG00000010396)	ENSPTXG00000012634 #22	ENTREP2 (ENSPTXG00000012635)	ENSPTXG00000012638	ENSPTXG00000012639	ENSPTXG00000012641	FAN1 (ENSPTXG00000012645)	MTMR10 (ENSPTXG00000012647)	ENSPTXG00000012652	ENSPTXG00000012780	KLF13 (ENSPTXG00000012781)	ENSPTXG00000012782	OTUD7A (ENSPTXG00000012783)	GCNT3 (ENSPTXG00000012785)	ENSPTXG00000012786	BNIP2 (ENSPTXG00000012787)	ENSPTXG00000012789
Eastern brown snake	MODERN SPECIES	23	PUM3 (ENSPTXG00000018794)	KCNV2 (ENSPTXG00000018795)	VLDLR (ENSPTXG00000018796)	SMARCA2 (ENSPTXG00000018801)	DMRT2 (ENSPTXG00000018805)	DMRT3 (ENSPTXG00000018806)	DMRT1 (ENSPTXG00000018807)	KANK1 (ENSPTXG00000018808)	DOCK8 (ENSPTXG00000018810)	ENSPTXG00000018860	ENSPTXG00000018861	PGM5 (ENSPTXG00000018862)	TMEM252 (ENSPTXG00000018863)	PIP5K1B (ENSPTXG00000018864)	FXN (ENSPTXG00000018865)	ENSPTXG00000018866 #22	ENTREP1 (ENSPTXG00000019200)	APBA1 (ENSPTXG00000019201)	PTAR1 (ENSPTXG00000019202)	CFAP95 (ENSPTXG00000019203)	MAMDC2 (ENSPTXG00000019204)	SMC5 (ENSPTXG00000019212)	KLF9 (ENSPTXG00000019213)	TRPM3 (ENSPTXG00000019214)	CEMIP2 (ENSPTXG00000019216)	ABHD17B (ENSPTXG00000019217)	C9orf85 (ENSPTXG00000019218)	GDA (ENSPTXG00000019219)	ZFAND5 (ENSPTXG00000019220)	ENSPTXG00000005164	ALDH1A1 (ENSPTXG00000005166)
Mainland tiger snake	DUPLICATION
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	168											ENSNSUG00000019038	LARP6 (ENSNSUG00000019037)	ADAL (ENSNSUG00000019036)	TM2D3 (ENSNSUG00000019035)	ENSNSUG00000018957	TJP1 (ENSNSUG00000017754) #22	ENSNSUG00000017742	ENSNSUG00000017741	ENSNSUG00000017740	ENSNSUG00000017739	ENSNSUG00000017738	MPHOSPH10 (ENSNSUG00000017737)	FAN1 (ENSNSUG00000017736)	MTMR10 (ENSNSUG00000017691)	ENSNSUG00000017653	ENSNSUG00000017650	ENSNSUG00000017649	KLF13 (ENSNSUG00000017648)	ENSNSUG00000017647	OTUD7A (ENSNSUG00000017645)	GCNT3 (ENSNSUG00000017642)
Mainland tiger snake	MODERN SPECIES	1	PUM3 (ENSNSUG00000019917)	KCNV2 (ENSNSUG00000019916)	VLDLR (ENSNSUG00000019901)	SMARCA2 (ENSNSUG00000018108)	DMRT2 (ENSNSUG00000018057)	DMRT3 (ENSNSUG00000018056)	DMRT1 (ENSNSUG00000018051)	KANK1 (ENSNSUG00000018050)	DOCK8 (ENSNSUG00000018049)	ENSNSUG00000018048	ENSNSUG00000018047	PGM5 (ENSNSUG00000018044)	TMEM252 (ENSNSUG00000018038)	PIP5K1B (ENSNSUG00000018035)	FXN (ENSNSUG00000018034)	ENSNSUG00000017855 #22	ENTREP1 (ENSNSUG00000017854)	APBA1 (ENSNSUG00000017853)	PTAR1 (ENSNSUG00000017852)	CFAP95 (ENSNSUG00000017851)	MAMDC2 (ENSNSUG00000017850)	ENSNSUG00000017849	SMC5 (ENSNSUG00000017848)	KLF9 (ENSNSUG00000017847)	TRPM3 (ENSNSUG00000017810)	ENSNSUG00000017808	CEMIP2 (ENSNSUG00000017755)	ABHD17B (ENSNSUG00000017753)	C9orf85 (ENSNSUG00000017752)	GDA (ENSNSUG00000017751)	ZFAND5 (ENSNSUG00000017750)
Laterata	ANCESTRAL SPECIES	33	ENSGT00940000155491.c	ENSGT00940000159422	ENSGT00940000153533.a	ENSGT00940000155707	ENSGT00940000160380	ENSGT00950000182989.A	ENSGT00940000157327	ENSGT00940000160977	ENSGT00940000154617.B.v	ENSGT00940000156594	ENSGT00940000157011	ENSGT00940000159103	ENSGT00950000183113.b.a	ENSGT00940000158389	ENSGT00940000159348.f	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.A	ENSGT00940000158943	ENSGT00940000153941.b	ENSGT00390000011359	ENSGT00390000018637	ENSGT00940000156900	ENSGT00940000155024	ENSGT00940000161911	ENSGT00940000158999	ENSGT00940000159331.b	ENSGT00390000014572	ENSGT00940000158531	ENSGT00940000160522	ENSGT00940000154257	ENSGT00390000006883
Argentine black and white tegu	MODERN SPECIES	96	SIN3A (ENSSMRG00000007437)	CRABP1 (ENSSMRG00000007447)	SKIC8 (ENSSMRG00000007456)	DNAJA4 (ENSSMRG00000007464)	ACSBG1 (ENSSMRG00000007466)	IDH3A (ENSSMRG00000007476)	CIB2 (ENSSMRG00000007483)	ENSSMRG00000007485	ENSSMRG00000007495	THSD4 (ENSSMRG00000007504)	LRRC49 (ENSSMRG00000007511)	LARP6 (ENSSMRG00000007520)	ADAL (ENSSMRG00000007522)	TM2D3 (ENSSMRG00000007534)	TARS3 (ENSSMRG00000007537)	TJP1 (ENSSMRG00000007550) #22	ENTREP2 (ENSSMRG00000007573)	APBA2 (ENSSMRG00000007579)	ENSSMRG00000007587	MPHOSPH10 (ENSSMRG00000007591)	FAN1 (ENSSMRG00000007596)	MTMR10 (ENSSMRG00000007602)	TRPM1 (ENSSMRG00000007972)	KLF13 (ENSSMRG00000017639)	OTUD7A (ENSSMRG00000017640)
Common wall lizard	DUPLICATION
Common wall lizard	MODERN SPECIES	5	ACSBG1 (ENSPMRG00000018833)	IDH3A (ENSPMRG00000018931)	CIB2 (ENSPMRG00000018940)	SH2D7 (ENSPMRG00000018944)	ENSPMRG00000018951	ENSPMRG00000018955	ENSPMRG00000018966	ENSPMRG00000018971	THSD4 (ENSPMRG00000018976)	ENSPMRG00000018986	LRRC49 (ENSPMRG00000018992)	LARP6 (ENSPMRG00000019000)	ADAL (ENSPMRG00000019005)	TM2D3 (ENSPMRG00000019013)	TARS3 (ENSPMRG00000019020)	TJP1 (ENSPMRG00000019063) #22	ENTREP2 (ENSPMRG00000019315)	APBA2 (ENSPMRG00000019327)	ENSPMRG00000019343	MPHOSPH10 (ENSPMRG00000019350)	FAN1 (ENSPMRG00000019356)	MTMR10 (ENSPMRG00000019361)	TRPM1 (ENSPMRG00000019686)	KLF13 (ENSPMRG00000021647)	OTUD7A (ENSPMRG00000021652)	ENSPMRG00000021656	GCNT3 (ENSPMRG00000021658)	GTF2A2 (ENSPMRG00000021660)	BNIP2 (ENSPMRG00000021671)	FOXB1 (ENSPMRG00000021714)	ANXA2 (ENSPMRG00000021720)
Common wall lizard	MODERN SPECIES	2			ENSPMRG00000022372	ENSPMRG00000022370	ENSPMRG00000016448	ENSPMRG00000015517	ENSPMRG00000015511	ENSPMRG00000015509	PGM5 (ENSPMRG00000015499)	TMEM252 (ENSPMRG00000015490)	ENSPMRG00000015483	ENSPMRG00000015478	ENSPMRG00000015472	ENSPMRG00000015470	ENSPMRG00000015467	ENSPMRG00000015441 #22	ENSPMRG00000015427	ENSPMRG00000015422	ENTREP1 (ENSPMRG00000015407)	ENSPMRG00000015402	APBA1 (ENSPMRG00000015386)	PTAR1 (ENSPMRG00000015366)	CFAP95 (ENSPMRG00000015356)	MAMDC2 (ENSPMRG00000015333)	ENSPMRG00000015326	SMC5 (ENSPMRG00000015313)	KLF9 (ENSPMRG00000015299)	TRPM3 (ENSPMRG00000014666)	ENSPMRG00000014545	CEMIP2 (ENSPMRG00000014526)	ENSPMRG00000014519
Anura	ANCESTRAL SPECIES	29	ENSGT00940000154821.b	ENSGT00940000156282.a.a	ENSGT00940000160420	ENSGT00940000156489	ENSGT00940000154886.a.a	ENSGT00940000155876	ENSGT00640000091523	ENSGT00940000164556	ENSGT00940000163497	ENSGT00940000157140.a	ENSGT00940000158126	ENSGT00390000005250	ENSGT00940000156639	ENSGT00390000005811	ENSGT00940000158634	ENSGT00940000155164 #22	ENSGT00530000063335.B.a.b.d	ENSGT00940000156820.a.a	ENSGT00390000017892	ENSGT00390000014593	ENSGT00940000156117	ENSGT00550000074816.B	ENSGT00940000160905	ENSGT00940000157366	ENSGT00940000153636.b	ENSGT00940000157611	ENSGT00440000033805	ENSGT00390000017130	ENSGT00940000156165	ENSGT01050000244942.b.a.a	ENSGT01050000244942.b.a.b.d
Leishan spiny toad	DUPLICATION
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES	6	ENSLLEG00000005974	CGNL1 (ENSLLEG00000005559)	ENSLLEG00000005491	ENSLLEG00000005459	ENSLLEG00000005217	ENSLLEG00000005160	THSD4 (ENSLLEG00000005118)	LRRC49 (ENSLLEG00000005071)	LARP6 (ENSLLEG00000005044)	ENSLLEG00000005036	ADAL (ENSLLEG00000005011)	TM2D3 (ENSLLEG00000004985)	ENSLLEG00000004958	ENSLLEG00000004944	ENSLLEG00000004939	TJP1 (ENSLLEG00000004837) #22	ENSLLEG00000004807	ENSLLEG00000004799	ENSLLEG00000004791	ENTREP2 (ENSLLEG00000004772)	APBA2 (ENSLLEG00000004715)	ENSLLEG00000004678	MCEE (ENSLLEG00000004667)	MPHOSPH10 (ENSLLEG00000004653)	FAN1 (ENSLLEG00000004632)	MTMR10 (ENSLLEG00000004609)	ENSLLEG00000004593	TRPM1 (ENSLLEG00000004501)	KLF13 (ENSLLEG00000004439)	ENSLLEG00000004432	ENSLLEG00000004426
Leishan spiny toad	MODERN SPECIES		DMRT1 (ENSLLEG00000000180)	ENSLLEG00000000168	KANK1 (ENSLLEG00000000147)	DOCK8 (ENSLLEG00000000077)	ENSLLEG00000022440	ENSLLEG00000022376	ENSLLEG00000022271	ENSLLEG00000022237	ENSLLEG00000022171	TMEM252 (ENSLLEG00000022093)	ENSLLEG00000021820	ENSLLEG00000021785	PIP5K1B (ENSLLEG00000021296)	FXN (ENSLLEG00000021154)	ENSLLEG00000020793	ENSLLEG00000020437 #22	ENSLLEG00000020378	ENTREP1 (ENSLLEG00000020161)	ENSLLEG00000020127	APBA1 (ENSLLEG00000019817)	ENSLLEG00000019753	ENSLLEG00000019734	ENSLLEG00000019706	PTAR1 (ENSLLEG00000019621)	ENSLLEG00000019605	CFAP95 (ENSLLEG00000019552)	ENSLLEG00000019506	MAMDC2 (ENSLLEG00000019197)	ENSLLEG00000019161	ENSLLEG00000019142	ENSLLEG00000019120
Frog	DUPLICATION
Frog	MODERN SPECIES	3	sltm (ENSXETG00000010840)	ENSXETG00000043724	ENSXETG00000048015	ENSXETG00000042363	myo1e.1 (ENSXETG00000016402)	ENSXETG00000043220	chrna7 (ENSXETG00000016395)	bmp7.2 (ENSXETG00000016386)	thsd4 (ENSXETG00000016384)	lrrc49 (ENSXETG00000020342)	zdhhc12 (ENSXETG00000024739)	larp6 (ENSXETG00000020340)	adal (ENSXETG00000020337)	tars3 (ENSXETG00000020313)	ENSXETG00000040381	tjp1 (ENSXETG00000020296) #22	ENSXETG00000035499	fam189a1 (ENSXETG00000016511)	apba2 (ENSXETG00000016503)	mcee (ENSXETG00000024734)	mphosph10 (ENSXETG00000016497)	fan1 (ENSXETG00000016496)	mtmr10 (ENSXETG00000016494)	ENSXETG00000041894	trpm1 (ENSXETG00000016479)	ENSXETG00000047606	klf13 (ENSXETG00000016478)	ENSXETG00000037766	otud7a (ENSXETG00000017722)	gcnt3 (ENSXETG00000017715)	ENSXETG00000032293
Frog	MODERN SPECIES		smarca2 (ENSXETG00000015299)	dmrt2 (ENSXETG00000033983)	dmrt3 (ENSXETG00000015285)	dmrt1 (ENSXETG00000002277)	kank1 (ENSXETG00000002278)	dock8 (ENSXETG00000001648)	cbwd2 (ENSXETG00000001656)	cbwd1.1 (ENSXETG00000001666)	XB5815362 [provisional:cyp2j6] (ENSXETG00000001660)	foxd4l1.1 (ENSXETG00000001667)	foxd4l1.2 (ENSXETG00000001668)	pgm5 (ENSXETG00000001670)	tmem252 (ENSXETG00000035157)	ENSXETG00000001676	pip5k1b (ENSXETG00000001678)	tjp2 (ENSXETG00000001683) #22	fam189a2 (ENSXETG00000033309)	apba1 (ENSXETG00000033427)	ptar1 (ENSXETG00000031102)	cfap95 (ENSXETG00000037188)	mamdc2 (ENSXETG00000001688)	smc5 (ENSXETG00000030157)	klf9 (ENSXETG00000019051)	trpm3 (ENSXETG00000031546)	cemip2 (ENSXETG00000033367)	abhd17b (ENSXETG00000027472)	c9orf85 (ENSXETG00000014376)	gda (ENSXETG00000014370)	zfand5 (ENSXETG00000014368)	TMC1 (ENSXETG00000019616)	ENSXETG00000031532