Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00940000163762.b ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Primates DUPLICATION Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155946 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642.g.a #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT01030000234866 #10 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642.g.a #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Mouse lemur MODERN SPECIES 1 ZBTB34 (ENSMICG00000036866) #7 ZBTB43 (ENSMICG00000047892) #8 LMX1B (ENSMICG00000010287) #9 ENSMICG00000037534 #10 MVB12B (ENSMICG00000010281) #11 PBX3 (ENSMICG00000036972) #12 MAPKAP1 (ENSMICG00000002956) #13 GAPVD1 (ENSMICG00000002953) #14 HSPA5 (ENSMICG00000002950) #15 RABEPK (ENSMICG00000029186) #16 PPP6C (ENSMICG00000030309) #17 SCAI (ENSMICG00000002936) #18 ENSMICG00000002934 #19 GOLGA1 (ENSMICG00000002928) #20 ARPC5L (ENSMICG00000002925) #21 RPL35 (ENSMICG00000002922) #22 WDR38 (ENSMICG00000038127) #23 OLFML2A (ENSMICG00000002915) #24 NR6A1 (ENSMICG00000002911) #25 NR5A1 (ENSMICG00000002907) #26 ADGRD2 (ENSMICG00000046284) #27 PSMB7 (ENSMICG00000043101) #28 NEK6 (ENSMICG00000009990) #29 LHX2 (ENSMICG00000009968) #30 DENND1A (ENSMICG00000000554) #31 CRB2 (ENSMICG00000000551) #32 STRBP (ENSMICG00000000832) #33 RABGAP1 (ENSMICG00000000821) #34 ZBTB26 (ENSMICG00000037770) #35 ZBTB6 (ENSMICG00000047456) #36 RC3H2 (ENSMICG00000003227) #37 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT01030000234866 #10 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642.g.a #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 168 RALGPS1 (ENSPCOG00000027079) ANGPTL2 (ENSPCOG00000028374) ZBTB34 (ENSPCOG00000010113) #7 ZBTB43 (ENSPCOG00000013176) #8 LMX1B (ENSPCOG00000016360) #9 MVB12B (ENSPCOG00000018046) #11 PBX3 (ENSPCOG00000023976) #12 MAPKAP1 (ENSPCOG00000022924) #13 GAPVD1 (ENSPCOG00000009430) #14 ENSPCOG00000025856 #15 RABEPK (ENSPCOG00000023004) #16 PPP6C (ENSPCOG00000025430) #17 SCAI (ENSPCOG00000002768) #18 GOLGA1 (ENSPCOG00000013519) #20 ARPC5L (ENSPCOG00000013587) #21 RPL35 (ENSPCOG00000026733) #22 WDR38 (ENSPCOG00000016069) #23 OLFML2A (ENSPCOG00000020707) #24 NR6A1 (ENSPCOG00000027156) #25 NR5A1 (ENSPCOG00000025859) #26 ADGRD2 (ENSPCOG00000021058) #27 ENSPCOG00000027275 #28 NEK6 (ENSPCOG00000021556) #29 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 519 SCAI (ENSPSMG00000022368) #18 GOLGA1 (ENSPSMG00000022419) #20 ENSPSMG00000022444 #21 RPL35 (ENSPSMG00000022453) #22 WDR38 (ENSPSMG00000022469) #23 OLFML2A (ENSPSMG00000022484) #24 NR6A1 (ENSPSMG00000022523) #25 NR5A1 (ENSPSMG00000022550) #26 ADGRD2 (ENSPSMG00000022563) #27 PSMB7 (ENSPSMG00000022579) #28 NEK6 (ENSPSMG00000022654) #29 ENSPSMG00000022686 LHX2 (ENSPSMG00000022690) #30 DENND1A (ENSPSMG00000022823) #31 CRB2 (ENSPSMG00000022863) #32 STRBP (ENSPSMG00000022889) #33 RABGAP1 (ENSPSMG00000022917) #34 ZBTB26 (ENSPSMG00000022920) #35 ZBTB6 (ENSPSMG00000022921) #36 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763.n #16 ENSGT00940000158763.m #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00390000001319.z ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 172 ZBTB43 (ENSSBOG00000019137) #8 LMX1B (ENSSBOG00000029735) #9 MVB12B (ENSSBOG00000024924) #11 PBX3 (ENSSBOG00000031379) #12 MAPKAP1 (ENSSBOG00000024685) #13 ENSSBOG00000020739 ENSSBOG00000021840 GAPVD1 (ENSSBOG00000027606) #14 HSPA5 (ENSSBOG00000022955) #15 RABEPK (ENSSBOG00000032682) #16 PPP6C (ENSSBOG00000018030) #17 SCAI (ENSSBOG00000029441) #18 ENSSBOG00000033641 GOLGA1 (ENSSBOG00000035730) #20 ARPC5L (ENSSBOG00000026457) #21 RPL35 (ENSSBOG00000030899) #22 WDR38 (ENSSBOG00000030562) #23 OLFML2A (ENSSBOG00000032661) #24 NR6A1 (ENSSBOG00000031223) #25 NR5A1 (ENSSBOG00000026963) #26 ADGRD2 (ENSSBOG00000025524) #27 PSMB7 (ENSSBOG00000028132) #28 NEK6 (ENSSBOG00000028368) #29 LHX2 (ENSSBOG00000012275) #30 DENND1A (ENSSBOG00000033627) #31 CRB2 (ENSSBOG00000026890) #32 STRBP (ENSSBOG00000003663) #33 RABGAP1 (ENSSBOG00000019849) #34 ENSSBOG00000028995 ZBTB26 (ENSSBOG00000018243) #35 ZBTB6 (ENSSBOG00000017105) #36 Capuchin MODERN SPECIES 39 ENSCCAG00000024252 MICAL2 (ENSCCAG00000024846) DKK3 (ENSCCAG00000023063) USP47 (ENSCCAG00000036809) GALNT18 (ENSCCAG00000034911) KATNIP (ENSCCAG00000027874) GSG1L (ENSCCAG00000031700) XPO6 (ENSCCAG00000036360) SBK1 (ENSCCAG00000030783) LAT (ENSCCAG00000029693) SPNS1 (ENSCCAG00000036198) NFATC2IP (ENSCCAG00000023222) CD19 (ENSCCAG00000003282) RABEP2 (ENSCCAG00000031826) ATP2A1 (ENSCCAG00000020602) ENSCCAG00000003524 #22 SH2B1 (ENSCCAG00000035021) TUFM (ENSCCAG00000033296) ATXN2L (ENSCCAG00000033928) ENSCCAG00000023257 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00390000016384.f.i.a.b ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261.g #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 491 ZBTB34 (ENSRBIG00000036908) #7 ZBTB43 (ENSRBIG00000023571) #8 LMX1B (ENSRBIG00000023660) #9 MVB12B (ENSRBIG00000033987) #11 ENSRBIG00000033076 PBX3 (ENSRBIG00000027497) #12 MAPKAP1 (ENSRBIG00000044095) #13 GAPVD1 (ENSRBIG00000042745) #14 HSPA5 (ENSRBIG00000044773) #15 RABEPK (ENSRBIG00000023800) #16 PPP6C (ENSRBIG00000044351) #17 ENSRBIG00000036429 SCAI (ENSRBIG00000026974) #18 GOLGA1 (ENSRBIG00000026783) #20 ARPC5L (ENSRBIG00000042947) #21 RPL35 (ENSRBIG00000036679) #22 WDR38 (ENSRBIG00000042146) #23 OLFML2A (ENSRBIG00000029375) #24 NR6A1 (ENSRBIG00000034563) #25 NR5A1 (ENSRBIG00000034857) #26 ADGRD2 (ENSRBIG00000002924) #27 PSMB7 (ENSRBIG00000024252) #28 NEK6 (ENSRBIG00000032831) #29 ENSRBIG00000042581 LHX2 (ENSRBIG00000035554) #30 DENND1A (ENSRBIG00000022086) #31 CRB2 (ENSRBIG00000040048) #32 ENSRBIG00000040405 STRBP (ENSRBIG00000044535) #33 ENSRBIG00000006154 RABGAP1 (ENSRBIG00000034532) #34 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Vervet Monkey MODERN SPECIES 17 TEDDM1 (ENSCSAG00000000242) RGSL1 (ENSCSAG00000012503) RNASEL (ENSCSAG00000012514) RGS16 (ENSCSAG00000012520) RGS8 (ENSCSAG00000012525) NPL (ENSCSAG00000012535) DHX9 (ENSCSAG00000012549) SHCBP1L (ENSCSAG00000012580) LAMC1 (ENSCSAG00000012606) LAMC2 (ENSCSAG00000012624) NMNAT2 (ENSCSAG00000012635) SMG7 (ENSCSAG00000012654) NCF2 (ENSCSAG00000012663) ARPC5 (ENSCSAG00000012676) APOBEC4 (ENSCSAG00000000243) ENSCSAG00000000244 #22 RGL1 (ENSCSAG00000012682) COLGALT2 (ENSCSAG00000012787) TSEN15 (ENSCSAG00000012819) C1orf21 (ENSCSAG00000012828) ENSCSAG00000000245 EDEM3 (ENSCSAG00000012843) NIBAN1 (ENSCSAG00000012855) RNF2 (ENSCSAG00000012868) TRMT1L (ENSCSAG00000012880) SWT1 (ENSCSAG00000012895) IVNS1ABP (ENSCSAG00000012909) ENSCSAG00000000246 HMCN1 (ENSCSAG00000013167) PRG4 (ENSCSAG00000013272) TPR (ENSCSAG00000013292) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Rhesus MODERN SPECIES 11 CPNE9 (ENSMMUG00000006115) MTMR14 (ENSMMUG00000007808) LHFPL4 (ENSMMUG00000063958) ENSMMUG00000055011 SETD5 (ENSMMUG00000003943) THUMPD3 (ENSMMUG00000017307) SRGAP3 (ENSMMUG00000020014) RAD18 (ENSMMUG00000020013) ENSMMUG00000060249 OXTR (ENSMMUG00000009703) CAV3 (ENSMMUG00000053020) SSUH2 (ENSMMUG00000009699) LMCD1 (ENSMMUG00000001814) ENSMMUG00000062010 GRM7 (ENSMMUG00000011231) ENSMMUG00000031947 #22 ENSMMUG00000057502 ENSMMUG00000065004 EDEM1 (ENSMMUG00000065088) ARL8B (ENSMMUG00000008810) BHLHE40 (ENSMMUG00000056699) ITPR1 (ENSMMUG00000012574) SUMF1 (ENSMMUG00000004734) SETMAR (ENSMMUG00000017828) LRRN1 (ENSMMUG00000049373) CRBN (ENSMMUG00000017986) TRNT1 (ENSMMUG00000017983) IL5RA (ENSMMUG00000001849) CNTN4 (ENSMMUG00000001847) ENSMMUG00000056158 ENSMMUG00000009425 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 540 SPIN4 (ENSMNEG00000005547) ENSMNEG00000035460 ARHGEF9 (ENSMNEG00000002090) AMER1 (ENSMNEG00000031267) ASB12 (ENSMNEG00000034040) MTMR8 (ENSMNEG00000031573) ZC4H2 (ENSMNEG00000044839) ENSMNEG00000023794 #22 ZC3H12B (ENSMNEG00000043003) LAS1L (ENSMNEG00000039412) MSN (ENSMNEG00000041403) ENSMNEG00000039922 VSIG4 (ENSMNEG00000033230) ENSMNEG00000045354 ENSMNEG00000037421 HEPH (ENSMNEG00000042841) ENSMNEG00000042166 EDA2R (ENSMNEG00000026933) AR (ENSMNEG00000029492) ENSMNEG00000038110 ENSMNEG00000027991 ENSMNEG00000031590 OPHN1 (ENSMNEG00000031303) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Olive baboon MODERN SPECIES 4 RALGPS1 (ENSPANG00000024825) ZBTB43 (ENSPANG00000000295) #8 LMX1B (ENSPANG00000024818) #9 MVB12B (ENSPANG00000049397) #11 ENSPANG00000050841 PBX3 (ENSPANG00000024812) #12 ENSPANG00000051227 MAPKAP1 (ENSPANG00000024814) #13 GAPVD1 (ENSPANG00000024816) #14 HSPA5 (ENSPANG00000024811) #15 ENSPANG00000024810 #16 PPP6C (ENSPANG00000024802) #17 SCAI (ENSPANG00000011266) #18 GOLGA1 (ENSPANG00000017415) #20 ARPC5L (ENSPANG00000044193) #21 RPL35 (ENSPANG00000032631) #22 WDR38 (ENSPANG00000007029) #23 OLFML2A (ENSPANG00000025860) #24 NR6A1 (ENSPANG00000025861) #25 NR5A1 (ENSPANG00000025862) #26 ADGRD2 (ENSPANG00000025863) #27 NEK6 (ENSPANG00000025854) #29 PSMB7 (ENSPANG00000025855) #28 LHX2 (ENSPANG00000025852) #30 DENND1A (ENSPANG00000025853) #31 CRB2 (ENSPANG00000025851) #32 STRBP (ENSPANG00000025850) #33 RABGAP1 (ENSPANG00000025838) #34 ZBTB26 (ENSPANG00000025839) #35 ZBTB6 (ENSPANG00000016323) #36 RC3H2 (ENSPANG00000025840) #37 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Sooty mangabey MODERN SPECIES 489 ZBTB34 (ENSCATG00000018802) #7 LMX1B (ENSCATG00000026158) #9 MVB12B (ENSCATG00000012830) #11 ENSCATG00000044919 PBX3 (ENSCATG00000044996) #12 MAPKAP1 (ENSCATG00000001243) #13 GAPVD1 (ENSCATG00000029396) #14 HSPA5 (ENSCATG00000044680) #15 RABEPK (ENSCATG00000042136) #16 PPP6C (ENSCATG00000031273) #17 ENSCATG00000029331 SCAI (ENSCATG00000011189) #18 GOLGA1 (ENSCATG00000044682) #20 ENSCATG00000034300 ARPC5L (ENSCATG00000037319) #21 RPL35 (ENSCATG00000020241) #22 WDR38 (ENSCATG00000041965) #23 OLFML2A (ENSCATG00000026827) #24 NR6A1 (ENSCATG00000030436) #25 NR5A1 (ENSCATG00000032967) #26 ADGRD2 (ENSCATG00000044429) #27 PSMB7 (ENSCATG00000033885) #28 NEK6 (ENSCATG00000044368) #29 ENSCATG00000044723 LHX2 (ENSCATG00000018508) #30 DENND1A (ENSCATG00000034371) #31 CRB2 (ENSCATG00000033470) #32 ENSCATG00000043981 STRBP (ENSCATG00000038868) #33 ENSCATG00000037945 RABGAP1 (ENSCATG00000012197) #34 Drill MODERN SPECIES 986 MVB12B (ENSMLEG00000032595) #11 PBX3 (ENSMLEG00000041125) #12 MAPKAP1 (ENSMLEG00000043978) #13 GAPVD1 (ENSMLEG00000037587) #14 HSPA5 (ENSMLEG00000035604) #15 RABEPK (ENSMLEG00000035953) #16 ENSMLEG00000037267 PPP6C (ENSMLEG00000031102) #17 ENSMLEG00000010445 SCAI (ENSMLEG00000037841) #18 GOLGA1 (ENSMLEG00000040538) #20 ARPC5L (ENSMLEG00000032105) #21 RPL35 (ENSMLEG00000034655) #22 WDR38 (ENSMLEG00000044214) #23 OLFML2A (ENSMLEG00000042186) #24 NR6A1 (ENSMLEG00000033021) #25 NR5A1 (ENSMLEG00000030657) #26 ADGRD2 (ENSMLEG00000031066) #27 PSMB7 (ENSMLEG00000034459) #28 NEK6 (ENSMLEG00000034890) #29 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Gibbon MODERN SPECIES 11 ENSNLEG00000033349 SEMA6A (ENSNLEG00000011779) ENSNLEG00000035368 ENSNLEG00000031042 ENSNLEG00000030536 DTWD2 (ENSNLEG00000011825) DMXL1 (ENSNLEG00000011838) TNFAIP8 (ENSNLEG00000011925) HSD17B4 (ENSNLEG00000011926) FAM170A (ENSNLEG00000011943) ENSNLEG00000034199 PRR16 (ENSNLEG00000011947) ENSNLEG00000031918 ENSNLEG00000027706 FTMT (ENSNLEG00000018895) ENSNLEG00000032909 #22 SRFBP1 (ENSNLEG00000011949) LOX (ENSNLEG00000011966) ENSNLEG00000011997 SNCAIP (ENSNLEG00000011998) ENSNLEG00000029668 ENSNLEG00000031106 SNX24 (ENSNLEG00000012059) PPIC (ENSNLEG00000012061) PRDM6 (ENSNLEG00000012064) CEP120 (ENSNLEG00000012069) CSNK1G3 (ENSNLEG00000012089) ZNF608 (ENSNLEG00000012117) ENSNLEG00000028602 GRAMD2B (ENSNLEG00000012129) ALDH7A1 (ENSNLEG00000012180) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Human MODERN SPECIES 21 ANGPTL2 (ENSG00000136859) RALGPS1 (ENSG00000136828) ZBTB34 (ENSG00000177125) #7 ZBTB43 (ENSG00000169155) #8 LMX1B (ENSG00000136944) #9 MVB12B (ENSG00000196814) #11 PBX3 (ENSG00000167081) #12 MAPKAP1 (ENSG00000119487) #13 GAPVD1 (ENSG00000165219) #14 HSPA5 (ENSG00000044574) #15 RABEPK (ENSG00000136933) #16 PPP6C (ENSG00000119414) #17 SCAI (ENSG00000173611) #18 GOLGA1 (ENSG00000136935) #20 ARPC5L (ENSG00000136950) #21 RPL35 (ENSG00000136942) #22 WDR38 (ENSG00000136918) #23 OLFML2A (ENSG00000185585) #24 NR6A1 (ENSG00000148200) #25 NR5A1 (ENSG00000136931) #26 ADGRD2 (ENSG00000180264) #27 PSMB7 (ENSG00000136930) #28 NEK6 (ENSG00000119408) #29 LHX2 (ENSG00000106689) #30 DENND1A (ENSG00000119522) #31 CRB2 (ENSG00000148204) #32 STRBP (ENSG00000165209) #33 GPR21 (ENSG00000188394) RABGAP1 (ENSG00000011454) #34 ZBTB26 (ENSG00000171448) #35 ZBTB6 (ENSG00000186130) #36 Orangutan MODERN SPECIES 22 ANGPTL2 (ENSPPYG00000019618) RALGPS1 (ENSPPYG00000019617) ZBTB34 (ENSPPYG00000019616) #7 ZBTB43 (ENSPPYG00000019615) #8 LMX1B (ENSPPYG00000035802) #9 MVB12B (ENSPPYG00000019613) #11 PBX3 (ENSPPYG00000019612) #12 MAPKAP1 (ENSPPYG00000019611) #13 GAPVD1 (ENSPPYG00000019610) #14 HSPA5 (ENSPPYG00000019609) #15 RABEPK (ENSPPYG00000019608) #16 PPP6C (ENSPPYG00000019607) #17 SCAI (ENSPPYG00000019606) #18 GOLGA1 (ENSPPYG00000019605) #20 ARPC5L (ENSPPYG00000019604) #21 RPL35 (ENSPPYG00000019603) #22 WDR38 (ENSPPYG00000019602) #23 OLFML2A (ENSPPYG00000019601) #24 NR6A1 (ENSPPYG00000019600) #25 NR5A1 (ENSPPYG00000019599) #26 ADGRD2 (ENSPPYG00000019598) #27 PSMB7 (ENSPPYG00000019596) #28 NEK6 (ENSPPYG00000019594) #29 LHX2 (ENSPPYG00000019593) #30 DENND1A (ENSPPYG00000019592) #31 CRB2 (ENSPPYG00000019880) #32 STRBP (ENSPPYG00000019589) #33 ENSPPYG00000031287 RABGAP1 (ENSPPYG00000019586) #34 ZBTB26 (ENSPPYG00000037988) #35 ZBTB6 (ENSPPYG00000030463) #36 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000167867 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000167867 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000167867 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000007883 ENSGT00730000111142 ENSGT00390000011475 ENSGT00940000155122.a ENSGT00940000155165.a ENSGT00390000007237 ENSGT00940000162236 ENSGT00390000008994 ENSGT00390000018074 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000002172.B ENSGT00390000013370 ENSGT00390000004147 ENSGT00390000016384.f.i.a.a ##22 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a ENSGT00940000158903 ENSGT00390000007848.b ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d ENSGT00940000154717 ENSGT00390000012719.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000161828 ENSGT01020000230351.D.b ENSGT01020000230351.D.a.a.b.l ENSGT00510000046406.f.a.b ENSGT00390000010771 ENSGT00940000153818.a.a Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2521 LRRC43 (ENSRBIG00000043574) IL31 (ENSRBIG00000040252) MLXIP (ENSRBIG00000020678) CFAP251 (ENSRBIG00000037496) PSMD9 (ENSRBIG00000040944) ENSRBIG00000006404 ##22 HPD (ENSRBIG00000033579) SETD1B (ENSRBIG00000034516) RHOF (ENSRBIG00000042834) TMEM120B (ENSRBIG00000040025) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1385 ENSRROG00000032502 KNTC1 (ENSRROG00000035417) RSRC2 (ENSRROG00000035154) ZCCHC8 (ENSRROG00000030441) CLIP1 (ENSRROG00000034853) ENSRROG00000024193 DIABLO (ENSRROG00000032357) B3GNT4 (ENSRROG00000043829) LRRC43 (ENSRROG00000033440) IL31 (ENSRROG00000033370) MLXIP (ENSRROG00000040708) BCL7A (ENSRROG00000009008) CFAP251 (ENSRROG00000043740) ENSRROG00000044846 PSMD9 (ENSRROG00000042445) ENSRROG00000004163 ##22 HPD (ENSRROG00000032476) SETD1B (ENSRROG00000011844) RHOF (ENSRROG00000023702) TMEM120B (ENSRROG00000011126) MORN3 (ENSRROG00000037539) ORAI1 (ENSRROG00000009142) KDM2B (ENSRROG00000044761) RNF34 (ENSRROG00000040453) ANAPC5 (ENSRROG00000033275) CAMKK2 (ENSRROG00000044900) P2RX4 (ENSRROG00000041741) P2RX7 (ENSRROG00000007262) ENSRROG00000043416 OASL (ENSRROG00000035890) C12orf43 (ENSRROG00000030517) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00390000016384.f.i.a.b ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261.g #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1251 ZBTB43 (ENSRROG00000024398) #8 LMX1B (ENSRROG00000035482) #9 MVB12B (ENSRROG00000027519) #11 PBX3 (ENSRROG00000045788) #12 MAPKAP1 (ENSRROG00000023703) #13 ENSRROG00000030764 GAPVD1 (ENSRROG00000032873) #14 HSPA5 (ENSRROG00000028741) #15 RABEPK (ENSRROG00000014112) #16 ENSRROG00000031506 ENSRROG00000032403 PPP6C (ENSRROG00000031327) #17 SCAI (ENSRROG00000042786) #18 GOLGA1 (ENSRROG00000029321) #20 ARPC5L (ENSRROG00000041093) #21 ENSRROG00000041830 ##22 WDR38 (ENSRROG00000036886) #23 OLFML2A (ENSRROG00000035091) #24 ENSRROG00000044077 NR6A1 (ENSRROG00000030167) #25 NR5A1 (ENSRROG00000044475) #26 ADGRD2 (ENSRROG00000034601) #27 PSMB7 (ENSRROG00000043335) #28 NEK6 (ENSRROG00000040996) #29 ENSRROG00000045603 LHX2 (ENSRROG00000037178) #30 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 474 SLC5A4 (ENSCATG00000040639) ENSCATG00000043014 RTCB (ENSCATG00000033424) FBXO7 (ENSCATG00000039724) BPIFC (ENSCATG00000032658) SYN3 (ENSCATG00000044956) TIMP3 (ENSCATG00000042645) ENSCATG00000041580 LARGE1 (ENSCATG00000044223) ENSCATG00000000038 ISX (ENSCATG00000029244) HMGXB4 (ENSCATG00000033136) TOM1 (ENSCATG00000031195) HMOX1 (ENSCATG00000044656) MCM5 (ENSCATG00000043913) ENSCATG00000017285 ##22 RASD2 (ENSCATG00000030322) MB (ENSCATG00000041983) ENSCATG00000034942 APOL6 (ENSCATG00000035231) APOL5 (ENSCATG00000039209) RBFOX2 (ENSCATG00000038655) ENSCATG00000032033 APOL4 (ENSCATG00000038892) APOL2 (ENSCATG00000042649) APOL1 (ENSCATG00000037560) MYH9 (ENSCATG00000030452) TXN2 (ENSCATG00000040632) FOXRED2 (ENSCATG00000041844) EIF3D (ENSCATG00000045003) CACNG2 (ENSCATG00000034369) Sooty mangabey MODERN SPECIES 570 GAD1 (ENSCATG00000021159) ENSCATG00000021621 SP5 (ENSCATG00000041697) MYO3B (ENSCATG00000039840) UBR3 (ENSCATG00000016590) METTL5 (ENSCATG00000030294) SSB (ENSCATG00000036701) KLHL23 (ENSCATG00000031017) PHOSPHO2 (ENSCATG00000003608) CFAP210 (ENSCATG00000035489) PPIG (ENSCATG00000032109) FASTKD1 (ENSCATG00000031285) KLHL41 (ENSCATG00000034135) BBS5 (ENSCATG00000031242) LRP2 (ENSCATG00000041163) ENSCATG00000003335 ##22 DHRS9 (ENSCATG00000044301) ABCB11 (ENSCATG00000030168) SPC25 (ENSCATG00000030113) NOSTRIN (ENSCATG00000033960) CERS6 (ENSCATG00000021693) Macaca ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961.j #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961.j #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT01100000263577.a.a.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Rhesus MODERN SPECIES 6 LMX1B (ENSMMUG00000002236) #9 ENSMMUG00000053490 MVB12B (ENSMMUG00000000871) #11 PBX3 (ENSMMUG00000013763) #12 ENSMMUG00000049448 MAPKAP1 (ENSMMUG00000016826) #13 ENSMMUG00000053791 GAPVD1 (ENSMMUG00000003668) #14 HSPA5 (ENSMMUG00000005217) #15 RABEPK (ENSMMUG00000005215) #16 PPP6C (ENSMMUG00000020549) #17 SCAI (ENSMMUG00000020633) #18 ENSMMUG00000064277 GOLGA1 (ENSMMUG00000020631) #20 ARPC5L (ENSMMUG00000043892) #21 RPL35 (ENSMMUG00000005260) ##22 WDR38 (ENSMMUG00000005259) #23 ENSMMUG00000061871 OLFML2A (ENSMMUG00000011183) #24 NR6A1 (ENSMMUG00000011185) #25 NR5A1 (ENSMMUG00000014111) #26 ADGRD2 (ENSMMUG00000014110) #27 PSMB7 (ENSMMUG00000060033) #28 NEK6 (ENSMMUG00000007354) #29 LHX2 (ENSMMUG00000003671) #30 ENSMMUG00000049804 DENND1A (ENSMMUG00000006348) #31 CRB2 (ENSMMUG00000006345) #32 STRBP (ENSMMUG00000022919) #33 RABGAP1 (ENSMMUG00000000670) #34 ZBTB26 (ENSMMUG00000000495) #35 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 317 ZBTB43 (ENSMNEG00000014226) #8 LMX1B (ENSMNEG00000033189) #9 MVB12B (ENSMNEG00000044373) #11 PBX3 (ENSMNEG00000037976) #12 MAPKAP1 (ENSMNEG00000035440) #13 GAPVD1 (ENSMNEG00000030972) #14 HSPA5 (ENSMNEG00000023579) #15 RABEPK (ENSMNEG00000042468) #16 ENSMNEG00000044210 PPP6C (ENSMNEG00000035583) #17 ENSMNEG00000038470 SCAI (ENSMNEG00000039438) #18 ENSMNEG00000010083 GOLGA1 (ENSMNEG00000015755) #20 ARPC5L (ENSMNEG00000021442) #21 ENSMNEG00000044108 ##22 WDR38 (ENSMNEG00000036703) #23 OLFML2A (ENSMNEG00000013543) #24 NR6A1 (ENSMNEG00000032193) #25 NR5A1 (ENSMNEG00000037300) #26 ADGRD2 (ENSMNEG00000034810) #27 PSMB7 (ENSMNEG00000034519) #28 NEK6 (ENSMNEG00000034029) #29 LHX2 (ENSMNEG00000038576) #30 DENND1A (ENSMNEG00000035856) #31 CRB2 (ENSMNEG00000040807) #32 STRBP (ENSMNEG00000045088) #33 ENSMNEG00000039714 RABGAP1 (ENSMNEG00000039246) #34 ZBTB26 (ENSMNEG00000028386) #35 ZBTB6 (ENSMNEG00000026626) #36 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000167867 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Gibbon MODERN SPECIES 23 LMX1B (ENSNLEG00000017412) #9 MVB12B (ENSNLEG00000017403) #11 ENSNLEG00000032471 PBX3 (ENSNLEG00000034849) #12 ENSNLEG00000035312 MAPKAP1 (ENSNLEG00000017378) #13 GAPVD1 (ENSNLEG00000017358) #14 HSPA5 (ENSNLEG00000017348) #15 RABEPK (ENSNLEG00000017333) #16 ENSNLEG00000035575 PPP6C (ENSNLEG00000017324) #17 ENSNLEG00000030118 SCAI (ENSNLEG00000017321) #18 GOLGA1 (ENSNLEG00000017311) #20 ARPC5L (ENSNLEG00000017306) #21 ENSNLEG00000031655 ##22 WDR38 (ENSNLEG00000017294) #23 OLFML2A (ENSNLEG00000017289) #24 ENSNLEG00000033577 ENSNLEG00000035190 NR6A1 (ENSNLEG00000017287) #25 NR5A1 (ENSNLEG00000017282) #26 ENSNLEG00000033335 #27 PSMB7 (ENSNLEG00000036020) #28 NEK6 (ENSNLEG00000017263) #29 LHX2 (ENSNLEG00000028123) #30 ENSNLEG00000034780 DENND1A (ENSNLEG00000017247) #31 ENSNLEG00000017244 #32 STRBP (ENSNLEG00000017223) #33 ENSNLEG00000030097 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00910000148777 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Gorilla MODERN SPECIES 22 ZBTB34 (ENSGGOG00000039553) #7 ZBTB43 (ENSGGOG00000017180) #8 ENSGGOG00000003629 #9 MVB12B (ENSGGOG00000015432) #11 ENSGGOG00000009025 ENSGGOG00000025432 MAPKAP1 (ENSGGOG00000005950) #13 GAPVD1 (ENSGGOG00000001564) #14 HSPA5 (ENSGGOG00000026879) #15 RABEPK (ENSGGOG00000003250) #16 PPP6C (ENSGGOG00000028356) #17 SCAI (ENSGGOG00000034880) #18 ENSGGOG00000037553 GOLGA1 (ENSGGOG00000004117) #20 ARPC5L (ENSGGOG00000004115) #21 ENSGGOG00000004111 ##22 WDR38 (ENSGGOG00000004105) #23 OLFML2A (ENSGGOG00000004100) #24 NR6A1 (ENSGGOG00000009250) #25 NR5A1 (ENSGGOG00000008994) #26 ADGRD2 (ENSGGOG00000008978) #27 PSMB7 (ENSGGOG00000012164) #28 NEK6 (ENSGGOG00000012155) #29 LHX2 (ENSGGOG00000008475) #30 ENSGGOG00000036998 DENND1A (ENSGGOG00000016611) #31 CRB2 (ENSGGOG00000016601) #32 ENSGGOG00000039044 STRBP (ENSGGOG00000003901) #33 ENSGGOG00000042134 RABGAP1 (ENSGGOG00000003890) #34 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00910000148777 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Pan ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00900000141073.s ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00910000148777 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Chimpanzee MODERN SPECIES 22 ZBTB43 (ENSPTRG00000044334) #8 LMX1B (ENSPTRG00000021377) #9 MVB12B (ENSPTRG00000021375) #11 PBX3 (ENSPTRG00000021374) #12 ENSPTRG00000051457 MAPKAP1 (ENSPTRG00000021373) #13 GAPVD1 (ENSPTRG00000048411) #14 HSPA5 (ENSPTRG00000000563) #15 RABEPK (ENSPTRG00000021369) #16 ENSPTRG00000045320 PPP6C (ENSPTRG00000021368) #17 ENSPTRG00000047006 SCAI (ENSPTRG00000021366) #18 GOLGA1 (ENSPTRG00000021364) #20 ARPC5L (ENSPTRG00000021362) #21 RPL35 (ENSPTRG00000021361) ##22 WDR38 (ENSPTRG00000021360) #23 OLFML2A (ENSPTRG00000021359) #24 ENSPTRG00000050508 NR6A1 (ENSPTRG00000051156) #25 NR5A1 (ENSPTRG00000021357) #26 ADGRD2 (ENSPTRG00000021356) #27 PSMB7 (ENSPTRG00000021354) #28 NEK6 (ENSPTRG00000021352) #29 LHX2 (ENSPTRG00000021351) #30 ENSPTRG00000044471 DENND1A (ENSPTRG00000021349) #31 CRB2 (ENSPTRG00000021348) #32 STRBP (ENSPTRG00000021346) #33 ENSPTRG00000044284 RABGAP1 (ENSPTRG00000021342) #34 Bonobo MODERN SPECIES 22 ZBTB43 (ENSPPAG00000014749) #8 LMX1B (ENSPPAG00000041838) #9 MVB12B (ENSPPAG00000037997) #11 PBX3 (ENSPPAG00000030889) #12 ENSPPAG00000010777 MAPKAP1 (ENSPPAG00000039077) #13 GAPVD1 (ENSPPAG00000029864) #14 HSPA5 (ENSPPAG00000042964) #15 RABEPK (ENSPPAG00000020419) #16 ENSPPAG00000024179 PPP6C (ENSPPAG00000005408) #17 ENSPPAG00000042181 SCAI (ENSPPAG00000035611) #18 GOLGA1 (ENSPPAG00000039343) #20 ARPC5L (ENSPPAG00000033849) #21 ENSPPAG00000026463 ##22 WDR38 (ENSPPAG00000009033) #23 OLFML2A (ENSPPAG00000036204) #24 ENSPPAG00000042042 NR6A1 (ENSPPAG00000027363) #25 NR5A1 (ENSPPAG00000033832) #26 ADGRD2 (ENSPPAG00000029184) #27 PSMB7 (ENSPPAG00000043451) #28 NEK6 (ENSPPAG00000042047) #29 LHX2 (ENSPPAG00000034417) #30 ENSPPAG00000028123 DENND1A (ENSPPAG00000038800) #31 CRB2 (ENSPPAG00000030633) #32 STRBP (ENSPPAG00000000242) #33 ENSPPAG00000034339 RABGAP1 (ENSPPAG00000013688) #34 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763.n #16 ENSGT00940000158763.m #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763.n #16 ENSGT00940000158763.m #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 206 ENSCCAG00000028456 TMEM215 (ENSCCAG00000004298) APTX (ENSCCAG00000036783) ENSCCAG00000034216 SMU1 (ENSCCAG00000025287) B4GALT1 (ENSCCAG00000009730) SPINK4 (ENSCCAG00000028805) ENSCCAG00000026996 CHMP5 (ENSCCAG00000027032) SCAI (ENSCCAG00000031567) #18 ENSCCAG00000018226 ENSCCAG00000034325 GOLGA1 (ENSCCAG00000025942) #20 ENSCCAG00000032926 ENSCCAG00000003039 #21 ENSCCAG00000026875 ##22 WDR38 (ENSCCAG00000024912) #23 OLFML2A (ENSCCAG00000023075) #24 NR6A1 (ENSCCAG00000024096) #25 NR5A1 (ENSCCAG00000024659) #26 ADGRD2 (ENSCCAG00000033790) #27 PSMB7 (ENSCCAG00000025367) #28 NEK6 (ENSCCAG00000019309) #29 LHX2 (ENSCCAG00000022112) #30 DENND1A (ENSCCAG00000020125) #31 CRB2 (ENSCCAG00000033115) #32 STRBP (ENSCCAG00000027357) #33 RABGAP1 (ENSCCAG00000024911) #34 ENSCCAG00000033724 ZBTB26 (ENSCCAG00000003111) #35 ZBTB6 (ENSCCAG00000020024) #36 Marmoset MODERN SPECIES LMX1B (ENSCJAG00000072150) #9 MVB12B (ENSCJAG00000042322) #11 ENSCJAG00000070779 PBX3 (ENSCJAG00000007020) #12 MAPKAP1 (ENSCJAG00000006963) #13 GAPVD1 (ENSCJAG00000006913) #14 HSPA5 (ENSCJAG00000006880) #15 ENSCJAG00000052894 RABEPK (ENSCJAG00000006849) #16 PPP6C (ENSCJAG00000006827) #17 ENSCJAG00000082314 ENSCJAG00000077976 SCAI (ENSCJAG00000006789) #18 GOLGA1 (ENSCJAG00000006745) #20 ENSCJAG00000006730 #21 ENSCJAG00000006724 ##22 WDR38 (ENSCJAG00000006695) #23 ENSCJAG00000077082 OLFML2A (ENSCJAG00000006668) #24 ENSCJAG00000078726 NR6A1 (ENSCJAG00000006631) #25 NR5A1 (ENSCJAG00000006624) #26 ADGRD2 (ENSCJAG00000040439) #27 PSMB7 (ENSCJAG00000006541) #28 NEK6 (ENSCJAG00000006507) #29 LHX2 (ENSCJAG00000006496) #30 ENSCJAG00000085719 DENND1A (ENSCJAG00000006461) #31 CRB2 (ENSCJAG00000006432) #32 STRBP (ENSCJAG00000019997) #33 RABGAP1 (ENSCJAG00000020027) #34 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 129 RALGPS1 (ENSOGAG00000003986) ZBTB34 (ENSOGAG00000007730) #7 ZBTB43 (ENSOGAG00000002029) #8 LMX1B (ENSOGAG00000001158) #9 MVB12B (ENSOGAG00000008766) #11 PBX3 (ENSOGAG00000031460) #12 MAPKAP1 (ENSOGAG00000008854) #13 ENSOGAG00000029276 #14 ENSOGAG00000008849 #14 HSPA5 (ENSOGAG00000006786) #15 RABEPK (ENSOGAG00000027730) #16 PPP6C (ENSOGAG00000025294) #17 SCAI (ENSOGAG00000008529) #18 GOLGA1 (ENSOGAG00000008519) #20 ARPC5L (ENSOGAG00000030099) #21 ENSOGAG00000008513 ##22 WDR38 (ENSOGAG00000008507) #23 OLFML2A (ENSOGAG00000008504) #24 NR6A1 (ENSOGAG00000030677) #25 NR5A1 (ENSOGAG00000017023) #26 ADGRD2 (ENSOGAG00000003517) #27 PSMB7 (ENSOGAG00000003513) #28 NEK6 (ENSOGAG00000003510) #29 LHX2 (ENSOGAG00000003505) #30 ENSOGAG00000024358 DENND1A (ENSOGAG00000013851) #31 CRB2 (ENSOGAG00000031205) #32 STRBP (ENSOGAG00000014739) #33 RABGAP1 (ENSOGAG00000014722) #34 ZBTB26 (ENSOGAG00000010685) #35 ZBTB6 (ENSOGAG00000010682) #36 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 644 ENSPSMG00000004305 PTPRD (ENSPSMG00000002973) DMAC1 (ENSPSMG00000002164) KDM4C (ENSPSMG00000002067) ENSPSMG00000001956 ##22 GLDC (ENSPSMG00000001778) UHRF2 (ENSPSMG00000001619) TPD52L3 (ENSPSMG00000001557) IL33 (ENSPSMG00000001541) Mouse lemur MODERN SPECIES 5 ENSMICG00000017765 RNF144B (ENSMICG00000015478) DEK (ENSMICG00000015469) KDM1B (ENSMICG00000015441) TPMT (ENSMICG00000015432) ENSMICG00000033170 KIF13A (ENSMICG00000013830) NUP153 (ENSMICG00000006089) FAM8A1 (ENSMICG00000045527) CAP2 (ENSMICG00000014446) RBM24 (ENSMICG00000032332) STMND1 (ENSMICG00000044225) ATXN1 (ENSMICG00000011875) GMPR (ENSMICG00000011868) MYLIP (ENSMICG00000011860) ENSMICG00000035463 ##22 DTNBP1 (ENSMICG00000010679) JARID2 (ENSMICG00000010642) CD83 (ENSMICG00000042608) RNF182 (ENSMICG00000045818) ENSMICG00000000183 RANBP9 (ENSMICG00000000179) NOL7 (ENSMICG00000044935) SIRT5 (ENSMICG00000000174) GFOD1 (ENSMICG00000000170) TBC1D7 (ENSMICG00000000168) PHACTR1 (ENSMICG00000000165) EDN1 (ENSMICG00000035008) ENSMICG00000042252 HIVEP1 (ENSMICG00000032151) TMEM170B (ENSMICG00000042371) Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 306 ENSMNEG00000012862 ENSMNEG00000027304 HHIP (ENSMNEG00000031761) ENSMNEG00000031612 ANAPC10 (ENSMNEG00000032727) ENSMNEG00000006010 ##22 ABCE1 (ENSMNEG00000030227) OTUD4 (ENSMNEG00000027757) ENSMNEG00000028387 SMAD1 (ENSMNEG00000026959) MMAA (ENSMNEG00000034928) ENSMNEG00000034188 C4orf51 (ENSMNEG00000035392) ZNF827 (ENSMNEG00000002738) LSM6 (ENSMNEG00000034820) REELD1 (ENSMNEG00000028815) SLC10A7 (ENSMNEG00000033881) POU4F2 (ENSMNEG00000036356) TTC29 (ENSMNEG00000034118) ENSMNEG00000025155 EDNRA (ENSMNEG00000002624) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 593 ANAPC10 (ENSRROG00000022239) ENSRROG00000029310 ##22 ABCE1 (ENSRROG00000033945) OTUD4 (ENSRROG00000035696) ENSRROG00000044373 ENSRROG00000045571 SMAD1 (ENSRROG00000042440) MMAA (ENSRROG00000028820) C4orf51 (ENSRROG00000035262) ZNF827 (ENSRROG00000018716) LSM6 (ENSRROG00000024868) REELD1 (ENSRROG00000045752) SLC10A7 (ENSRROG00000044034) POU4F2 (ENSRROG00000040033) Tarsier MODERN SPECIES 5756 ENSTSYG00000030923 ENSTSYG00000028307 ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 19 TEAD3 (ENSGGOG00000001847) RPL10A (ENSGGOG00000028140) PPARD (ENSGGOG00000016781) DEF6 (ENSGGOG00000016204) ZNF76 (ENSGGOG00000014188) SCUBE3 (ENSGGOG00000016378) TCP11 (ENSGGOG00000016087) ANKS1A (ENSGGOG00000007973) TAF11 (ENSGGOG00000012371) BLTP3A (ENSGGOG00000014664) SNRPC (ENSGGOG00000012499) ILRUN (ENSGGOG00000000388) SPDEF (ENSGGOG00000000383) PACSIN1 (ENSGGOG00000023013) NUDT3 (ENSGGOG00000039407) ENSGGOG00000038559 ##22 ENSGGOG00000024443 ENSGGOG00000025804 GRM4 (ENSGGOG00000005313) MLN (ENSGGOG00000008134) LEMD2 (ENSGGOG00000008126) IP6K3 (ENSGGOG00000016288) UQCC2 (ENSGGOG00000043321) ENSGGOG00000023740 ITPR3 (ENSGGOG00000016235) BAK1 (ENSGGOG00000022462) ENSGGOG00000025210 ZBTB9 (ENSGGOG00000040099) SYNGAP1 (ENSGGOG00000009923) CUTA (ENSGGOG00000000265) PHF1 (ENSGGOG00000000264) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 546 CPNE9 (ENSMNEG00000032338) MTMR14 (ENSMNEG00000036145) LHFPL4 (ENSMNEG00000032394) ENSMNEG00000026054 SETD5 (ENSMNEG00000045236) THUMPD3 (ENSMNEG00000030529) ENSMNEG00000032308 SRGAP3 (ENSMNEG00000028942) RAD18 (ENSMNEG00000013464) ENSMNEG00000027815 OXTR (ENSMNEG00000037475) CAV3 (ENSMNEG00000045110) SSUH2 (ENSMNEG00000032764) LMCD1 (ENSMNEG00000039664) GRM7 (ENSMNEG00000031784) ENSMNEG00000021998 ##22 EDEM1 (ENSMNEG00000034041) ARL8B (ENSMNEG00000029717) BHLHE40 (ENSMNEG00000038264) ITPR1 (ENSMNEG00000034253) SUMF1 (ENSMNEG00000003566) SETMAR (ENSMNEG00000045183) ENSMNEG00000013018 LRRN1 (ENSMNEG00000021728) CRBN (ENSMNEG00000044270) TRNT1 (ENSMNEG00000037805) IL5RA (ENSMNEG00000043242) CNTN4 (ENSMNEG00000044169) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 3865 PPP6C (ENSTSYG00000008875) #17 SCAI (ENSTSYG00000001473) #18 GOLGA1 (ENSTSYG00000010641) #20 ENSTSYG00000032048 ENSTSYG00000009744 #21 RPL35 (ENSTSYG00000010719) ##22 WDR38 (ENSTSYG00000030561) #23 ENSTSYG00000033974 OLFML2A (ENSTSYG00000004316) #24 NR6A1 (ENSTSYG00000004262) #25 Tarsier MODERN SPECIES 3832 ENSTSYG00000031513 ##22 C2orf74 (ENSTSYG00000035356) ENSTSYG00000031434 ENSTSYG00000006652 USP34 (ENSTSYG00000006659) XPO1 (ENSTSYG00000004330) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157288.e ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00910000147051 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00410000028196 ENSGT00950000183087.A.a.b.a.g.b.b ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a.o ENSGT00940000155255 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000162533 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ENSGT00570000080653 ENSGT00390000009854 Gorilla DUPLICATION Gorilla MODERN SPECIES 20 PLEKHA8 (ENSGGOG00000006031) FKBP14 (ENSGGOG00000014543) SCRN1 (ENSGGOG00000005731) WIPF3 (ENSGGOG00000005723) ENSGGOG00000037179 PRR15 (ENSGGOG00000041768) CHN2 (ENSGGOG00000012719) CPVL (ENSGGOG00000009483) TRIL (ENSGGOG00000026471) ENSGGOG00000024472 CREB5 (ENSGGOG00000043819) ENSGGOG00000026228 JAZF1 (ENSGGOG00000011408) TAX1BP1 (ENSGGOG00000022253) HIBADH (ENSGGOG00000013267) ENSGGOG00000026869 ##22 EVX1 (ENSGGOG00000016143) ENSGGOG00000005309 HOXA11 (ENSGGOG00000002226) HOXA10 (ENSGGOG00000002225) HOXA9 (ENSGGOG00000002222) HOXA7 (ENSGGOG00000002220) HOXA6 (ENSGGOG00000002218) HOXA5 (ENSGGOG00000002217) ENSGGOG00000002215 HOXA3 (ENSGGOG00000002213) HOXA2 (ENSGGOG00000002211) HOXA1 (ENSGGOG00000002209) ENSGGOG00000027198 ENSGGOG00000012668 ENSGGOG00000027139 Gorilla MODERN SPECIES GGPS1 (ENSGGOG00000008897) TBCE (ENSGGOG00000013627) B3GALNT2 (ENSGGOG00000013638) GNG4 (ENSGGOG00000007898) LYST (ENSGGOG00000009620) ENSGGOG00000043118 NID1 (ENSGGOG00000000381) GPR137B (ENSGGOG00000005990) ERO1B (ENSGGOG00000026132) EDARADD (ENSGGOG00000002149) ENSGGOG00000043831 LGALS8 (ENSGGOG00000006907) HEATR1 (ENSGGOG00000006913) ACTN2 (ENSGGOG00000011905) MTR (ENSGGOG00000016123) ENSGGOG00000023434 ##22 RYR2 (ENSGGOG00000012582) ZP4 (ENSGGOG00000011614) ENSGGOG00000040425 FMN2 (ENSGGOG00000001014) ENSGGOG00000043876 GREM2 (ENSGGOG00000038654) RGS7 (ENSGGOG00000010969) ENSGGOG00000040302 FH (ENSGGOG00000009996) KMO (ENSGGOG00000013897) ENSGGOG00000042072 CHML (ENSGGOG00000016322) WDR64 (ENSGGOG00000015532) EXO1 (ENSGGOG00000013563) BECN2 (ENSGGOG00000008172) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000157288.e ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00410000028196 ENSGT00950000183087.A.a.b.a.g.b.b ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a.o ENSGT00940000155255 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000162533 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ENSGT00570000080653 ENSGT00390000009854 Pan ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000157288.e ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00410000028196 ENSGT00950000183087.A.a.b.a.g.b.b ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a.o ENSGT00940000155255 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000162533 ENSGT00940000157315 ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.b.c.a.b ENSGT00940000153299.c.b.a.b.a.a.a ENSGT00390000017856.a Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 20 FKBP14 (ENSPPAG00000019048) SCRN1 (ENSPPAG00000020473) WIPF3 (ENSPPAG00000005537) ENSPPAG00000024726 ENSPPAG00000005671 PRR15 (ENSPPAG00000002015) CHN2 (ENSPPAG00000031517) CPVL (ENSPPAG00000039137) TRIL (ENSPPAG00000024310) ENSPPAG00000037283 CREB5 (ENSPPAG00000030641) ENSPPAG00000038768 JAZF1 (ENSPPAG00000036331) TAX1BP1 (ENSPPAG00000022824) HIBADH (ENSPPAG00000042554) ENSPPAG00000036088 ##22 EVX1 (ENSPPAG00000024119) ENSPPAG00000043323 HOXA11 (ENSPPAG00000038132) HOXA10 (ENSPPAG00000028221) HOXA9 (ENSPPAG00000030004) HOXA7 (ENSPPAG00000034362) HOXA6 (ENSPPAG00000039975) HOXA5 (ENSPPAG00000044047) ENSPPAG00000043774 HOXA3 (ENSPPAG00000032603) HOXA2 (ENSPPAG00000035694) HOXA1 (ENSPPAG00000000155) ENSPPAG00000038834 ENSPPAG00000000147 ENSPPAG00000033310 Bonobo MODERN SPECIES ENSPPAG00000020240 B3GALNT2 (ENSPPAG00000035839) GNG4 (ENSPPAG00000033594) LYST (ENSPPAG00000037311) ENSPPAG00000030475 NID1 (ENSPPAG00000034176) GPR137B (ENSPPAG00000031164) ERO1B (ENSPPAG00000043582) EDARADD (ENSPPAG00000038427) ENSPPAG00000030182 ENSPPAG00000034870 HEATR1 (ENSPPAG00000036487) ACTN2 (ENSPPAG00000032972) ENSPPAG00000030376 MTR (ENSPPAG00000001371) ENSPPAG00000030831 ##22 MT1HL1 (ENSPPAG00000025438) RYR2 (ENSPPAG00000043978) ZP4 (ENSPPAG00000030466) ENSPPAG00000024258 ENSPPAG00000034197 ENSPPAG00000026720 ENSPPAG00000004891 ENSPPAG00000025320 ENSPPAG00000036597 ENSPPAG00000041841 ENSPPAG00000029823 GREM2 (ENSPPAG00000011100) RGS7 (ENSPPAG00000031922) FH (ENSPPAG00000029968) KMO (ENSPPAG00000030870) Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 20 MTURN (ENSPTRG00000041737) PLEKHA8 (ENSPTRG00000019036) FKBP14 (ENSPTRG00000019035) SCRN1 (ENSPTRG00000019034) WIPF3 (ENSPTRG00000019033) PRR15 (ENSPTRG00000044744) CHN2 (ENSPTRG00000019030) CPVL (ENSPTRG00000019029) TRIL (ENSPTRG00000043675) ENSPTRG00000050877 CREB5 (ENSPTRG00000019028) ENSPTRG00000045009 JAZF1 (ENSPTRG00000019027) TAX1BP1 (ENSPTRG00000019025) HIBADH (ENSPTRG00000019024) ENSPTRG00000052529 ##22 EVX1 (ENSPTRG00000019022) HOXA13 (ENSPTRG00000028643) HOXA11 (ENSPTRG00000019020) HOXA10 (ENSPTRG00000019019) ENSPTRG00000049485 HOXA7 (ENSPTRG00000019017) HOXA6 (ENSPTRG00000039535) ENSPTRG00000019015 HOXA4 (ENSPTRG00000023597) HOXA3 (ENSPTRG00000019012) HOXA2 (ENSPTRG00000019011) HOXA1 (ENSPTRG00000019010) ENSPTRG00000049011 ENSPTRG00000044997 ENSPTRG00000049392 Chimpanzee MODERN SPECIES 586 ENSPTRG00000049297 ENSPTRG00000042926 ENSPTRG00000046220 ##22 ENSPTRG00000048607 ENSPTRG00000050384 ENSPTRG00000047456 ENSPTRG00000052537 ENSPTRG00000047890 ENSPTRG00000047796 ENSPTRG00000049275 ENSPTRG00000048699 ENSPTRG00000048614 ENSPTRG00000047399 ENSPTRG00000052389 ENSPTRG00000048196 ENSPTRG00000050430 ENSPTRG00000045640 ENSPTRG00000047411 Chimpanzee MODERN SPECIES GGPS1 (ENSPTRG00000002130) TBCE (ENSPTRG00000002131) B3GALNT2 (ENSPTRG00000002132) GNG4 (ENSPTRG00000002133) LYST (ENSPTRG00000002134) ENSPTRG00000049072 NID1 (ENSPTRG00000002135) GPR137B (ENSPTRG00000002136) ERO1B (ENSPTRG00000002137) EDARADD (ENSPTRG00000033991) ENSPTRG00000052416 LGALS8 (ENSPTRG00000002140) HEATR1 (ENSPTRG00000002141) ACTN2 (ENSPTRG00000002144) MTR (ENSPTRG00000002145) ENSPTRG00000044356 ##22 MT1HL1 (ENSPTRG00000043308) RYR2 (ENSPTRG00000002149) ZP4 (ENSPTRG00000002151) ENSPTRG00000043824 ENSPTRG00000044090 CHRM3 (ENSPTRG00000002155) ENSPTRG00000002157 ENSPTRG00000047391 ENSPTRG00000045511 GREM2 (ENSPTRG00000049478) RGS7 (ENSPTRG00000002161) FH (ENSPTRG00000002163) KMO (ENSPTRG00000002164) OPN3 (ENSPTRG00000002165) WDR64 (ENSPTRG00000002166) Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 10 ENSNLEG00000008581 SCUBE3 (ENSNLEG00000008527) TCP11 (ENSNLEG00000008486) ANKS1A (ENSNLEG00000008483) TAF11 (ENSNLEG00000008457) BLTP3A (ENSNLEG00000008400) SNRPC (ENSNLEG00000034810) ENSNLEG00000027593 ENSNLEG00000031071 ENSNLEG00000035761 SPDEF (ENSNLEG00000008374) PACSIN1 (ENSNLEG00000008343) ENSNLEG00000008336 ENSNLEG00000033500 NUDT3 (ENSNLEG00000029692) ENSNLEG00000033901 ##22 SMIM29 (ENSNLEG00000032266) HMGA1 (ENSNLEG00000031539) ENSNLEG00000034916 GRM4 (ENSNLEG00000008487) MLN (ENSNLEG00000008478) ENSNLEG00000008472 IP6K3 (ENSNLEG00000008448) UQCC2 (ENSNLEG00000035324) ITPR3 (ENSNLEG00000008373) BAK1 (ENSNLEG00000028170) ZBTB9 (ENSNLEG00000008348) ENSNLEG00000033973 PHF1 (ENSNLEG00000008320) KIFC1 (ENSNLEG00000008288) ZBTB22 (ENSNLEG00000030172) Gibbon MODERN SPECIES 11 ENSNLEG00000018598 ZFYVE16 (ENSNLEG00000012945) ENSNLEG00000034030 FAM151B (ENSNLEG00000012975) ENSNLEG00000012989 MSH3 (ENSNLEG00000012994) ENSNLEG00000030277 RASGRF2 (ENSNLEG00000013038) CKMT2 (ENSNLEG00000013077) ZCCHC9 (ENSNLEG00000029214) ACOT12 (ENSNLEG00000013095) SSBP2 (ENSNLEG00000013116) ATG10 (ENSNLEG00000013189) RPS23 (ENSNLEG00000013203) ENSNLEG00000013214 ENSNLEG00000027406 ##22 TMEM167A (ENSNLEG00000013231) XRCC4 (ENSNLEG00000013239) ENSNLEG00000032670 VCAN (ENSNLEG00000013300) HAPLN1 (ENSNLEG00000013393) ENSNLEG00000035592 EDIL3 (ENSNLEG00000013418) ENSNLEG00000032525 ENSNLEG00000013459 ENSNLEG00000027612 ENSNLEG00000033043 RASA1 (ENSNLEG00000013467) CCNH (ENSNLEG00000013604) TMEM161B (ENSNLEG00000013645) MEF2C (ENSNLEG00000013673) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 549 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00910000147379 ENSGT00940000160682.b ENSGT00910000147090 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1755 IL17REL (ENSRROG00000021598) CRELD2 (ENSRROG00000032099) ALG12 (ENSRROG00000034060) ZBED4 (ENSRROG00000037491) BRD1 (ENSRROG00000032777) ENSRROG00000029780 ##22 ENSRROG00000009143 ENSRROG00000011163 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1665 CRELD2 (ENSRBIG00000032974) ALG12 (ENSRBIG00000032623) ZBED4 (ENSRBIG00000025613) BRD1 (ENSRBIG00000035751) ENSRBIG00000038766 ##22 ENSRBIG00000030497 TAFA5 (ENSRBIG00000036620) ENSRBIG00000034535 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01100000263482.C.c.a.i.c.a ENSGT00390000016675 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00550000074863 ENSGT00390000010789 ENSGT00940000160675 ENSGT00940000156751 ENSGT00390000008122 ENSGT00940000156706 ENSGT00390000000288 ENSGT00940000160834 ENSGT00910000146895 ENSGT00390000018761 ENSGT00840000129887 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000156189 ENSGT00940000160061 ENSGT00940000157810 ENSGT00390000005508.a ENSGT00390000009067 ENSGT00940000153972.C ENSGT00940000160150 ENSGT00390000015442 ENSGT00940000162265 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000160682.b ENSGT00940000159840 ENSGT00940000156976.z ENSGT00390000010968 ENSGT00940000159839 ENSGT00390000014323 ENSGT00940000154189.B ENSGT00560000078631 ENSGT00390000002669 ENSGT00390000007925 ENSGT00910000146905 ENSGT00940000157097 ENSGT00390000007658.g ENSGT00940000158861.A ENSGT00390000010377 Sooty mangabey MODERN SPECIES 662 MAPK12 (ENSCATG00000034080) HDAC10 (ENSCATG00000027781) TUBGCP6 (ENSCATG00000035873) SELENOO (ENSCATG00000041757) TRABD (ENSCATG00000032558) PANX2 (ENSCATG00000042207) MOV10L1 (ENSCATG00000038537) MLC1 (ENSCATG00000033856) TTLL8 (ENSCATG00000027450) IL17REL (ENSCATG00000034232) PIM3 (ENSCATG00000041309) CRELD2 (ENSCATG00000027994) ALG12 (ENSCATG00000031565) ZBED4 (ENSCATG00000019780) BRD1 (ENSCATG00000037891) ENSCATG00000044288 ##22 TAFA5 (ENSCATG00000033512) TBC1D22A (ENSCATG00000031288) CERK (ENSCATG00000037136) GRAMD4 (ENSCATG00000045204) CELSR1 (ENSCATG00000036632) TRMU (ENSCATG00000032800) GTSE1 (ENSCATG00000043031) ENSCATG00000022718 TTC38 (ENSCATG00000029194) CDPF1 (ENSCATG00000000958) PPARA (ENSCATG00000037415) ENSCATG00000030288 WNT7B (ENSCATG00000045374) ATXN10 (ENSCATG00000042259) FBLN1 (ENSCATG00000030058) Drill DUPLICATION Drill MODERN SPECIES 1262 ENSMLEG00000032129 ##22 ENSMLEG00000041572 Drill MODERN SPECIES 1036 ENSMLEG00000036090 ENSMLEG00000044192 ##22 HNF1B (ENSMLEG00000028966) DDX52 (ENSMLEG00000017518) SYNRG (ENSMLEG00000037827) DUSP14 (ENSMLEG00000037053) TADA2A (ENSMLEG00000034264) ACACA (ENSMLEG00000028181) C17orf78 (ENSMLEG00000032526) AATF (ENSMLEG00000033672) LHX1 (ENSMLEG00000030942) ENSMLEG00000033898 MRM1 (ENSMLEG00000031933) DHRS11 (ENSMLEG00000028362) GGNBP2 (ENSMLEG00000041128) MYO19 (ENSMLEG00000035545) ZNHIT3 (ENSMLEG00000041589) Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 6 ENSPANG00000050058 ENSPANG00000043242 LMO7 (ENSPANG00000004997) COMMD6 (ENSPANG00000029712) TBC1D4 (ENSPANG00000006285) ENSPANG00000014125 KLF12 (ENSPANG00000007736) PIBF1 (ENSPANG00000007392) DIS3 (ENSPANG00000010053) BORA (ENSPANG00000023338) MZT1 (ENSPANG00000017952) ENSPANG00000050278 ENSPANG00000039637 DACH1 (ENSPANG00000020947) ENSPANG00000042380 ENSPANG00000043385 ##22 KLHL1 (ENSPANG00000034699) ENSPANG00000048424 ENSPANG00000047922 ENSPANG00000035598 ENSPANG00000049759 ENSPANG00000043843 PCDH9 (ENSPANG00000012913) ENSPANG00000036914 ENSPANG00000047743 ENSPANG00000042731 ENSPANG00000002589 ENSPANG00000037622 PCDH20 (ENSPANG00000009662) ENSPANG00000049074 TDRD3 (ENSPANG00000019138) Olive baboon MODERN SPECIES 8 RASL10B (ENSPANG00000046564) GAS2L2 (ENSPANG00000022978) C17orf50 (ENSPANG00000022929) MMP28 (ENSPANG00000022977) TAF15 (ENSPANG00000022930) HEATR9 (ENSPANG00000022932) ENSPANG00000030339 RDM1 (ENSPANG00000022933) LYZL6 (ENSPANG00000022934) CCL16 (ENSPANG00000022935) CCL14 (ENSPANG00000022936) CCL15 (ENSPANG00000022937) ENSPANG00000022938 CCL18 (ENSPANG00000041083) HEATR6 (ENSPANG00000009798) ENSPANG00000032216 ##22 HNF1B (ENSPANG00000022102) DDX52 (ENSPANG00000022101) SYNRG (ENSPANG00000022120) DUSP14 (ENSPANG00000003448) TADA2A (ENSPANG00000022118) ACACA (ENSPANG00000022130) ENSPANG00000047347 AATF (ENSPANG00000022128) LHX1 (ENSPANG00000022127) GGNBP2 (ENSPANG00000022124) PIGW (ENSPANG00000008702) MYO19 (ENSPANG00000022136) ZNHIT3 (ENSPANG00000050701) CA4 (ENSPANG00000022142) ENSPANG00000022153 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 6 MVB12B (ENSMFAG00000034269) #11 ENSMFAG00000054813 PBX3 (ENSMFAG00000027078) #12 ENSMFAG00000050988 MAPKAP1 (ENSMFAG00000032616) #13 GAPVD1 (ENSMFAG00000003434) #14 HSPA5 (ENSMFAG00000039748) #15 RABEPK (ENSMFAG00000042018) #16 PPP6C (ENSMFAG00000030045) #17 SCAI (ENSMFAG00000002648) #18 ENSMFAG00000051574 ENSMFAG00000064534 ENSMFAG00000049005 GOLGA1 (ENSMFAG00000031129) #20 ARPC5L (ENSMFAG00000033396) #21 RPL35 (ENSMFAG00000044075) ##22 WDR38 (ENSMFAG00000038461) #23 ENSMFAG00000062053 OLFML2A (ENSMFAG00000002383) #24 NR6A1 (ENSMFAG00000045408) #25 ENSMFAG00000059108 ENSMFAG00000055757 ENSMFAG00000050682 NR5A1 (ENSMFAG00000044244) #26 PSMB7 (ENSMFAG00000002588) #28 NEK6 (ENSMFAG00000043882) #29 ENSMFAG00000053849 LHX2 (ENSMFAG00000028670) #30 ENSMFAG00000057010 DENND1A (ENSMFAG00000031585) #31 ENSMFAG00000058067 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 CAMK1 (ENSMFAG00000040953) OGG1 (ENSMFAG00000041077) BRPF1 (ENSMFAG00000045669) CPNE9 (ENSMFAG00000035676) MTMR14 (ENSMFAG00000038577) LHFPL4 (ENSMFAG00000033316) THUMPD3 (ENSMFAG00000044884) ENSMFAG00000033455 RAD18 (ENSMFAG00000028864) ENSMFAG00000030087 OXTR (ENSMFAG00000037530) CAV3 (ENSMFAG00000037376) SSUH2 (ENSMFAG00000035455) LMCD1 (ENSMFAG00000033976) GRM7 (ENSMFAG00000027785) ENSMFAG00000029998 ##22 ENSMFAG00000047622 ENSMFAG00000063438 ENSMFAG00000048887 ENSMFAG00000061059 EDEM1 (ENSMFAG00000038359) ARL8B (ENSMFAG00000035233) BHLHE40 (ENSMFAG00000040134) ITPR1 (ENSMFAG00000044748) SUMF1 (ENSMFAG00000040853) ENSMFAG00000029288 LRRN1 (ENSMFAG00000020302) CRBN (ENSMFAG00000031028) TRNT1 (ENSMFAG00000045113) IL5RA (ENSMFAG00000006030) CNTN4 (ENSMFAG00000031919) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 768 MVB12B (ENSANAG00000021467) #11 PBX3 (ENSANAG00000026691) #12 MAPKAP1 (ENSANAG00000038007) #13 ENSANAG00000006107 GAPVD1 (ENSANAG00000026547) #14 ENSANAG00000002903 HSPA5 (ENSANAG00000038513) #15 ENSANAG00000029634 #16 ENSANAG00000002363 PPP6C (ENSANAG00000033545) #17 ENSANAG00000035375 ENSANAG00000005773 SCAI (ENSANAG00000024288) #18 GOLGA1 (ENSANAG00000020513) #20 ENSANAG00000021654 #21 RPL35 (ENSANAG00000032849) ##22 WDR38 (ENSANAG00000033407) #23 OLFML2A (ENSANAG00000028567) #24 NR6A1 (ENSANAG00000036986) #25 NR5A1 (ENSANAG00000027136) #26 ADGRD2 (ENSANAG00000036641) #27 PSMB7 (ENSANAG00000030640) #28 NEK6 (ENSANAG00000029360) #29 LHX2 (ENSANAG00000018858) #30 DENND1A (ENSANAG00000034989) #31 CRB2 (ENSANAG00000030431) #32 ENSANAG00000004458 STRBP (ENSANAG00000021993) #33 ENSANAG00000021222 ENSANAG00000001745 RABGAP1 (ENSANAG00000022667) #34 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 192 FBXW9 (ENSSBOG00000029356) ENSSBOG00000029032 DHPS (ENSSBOG00000033113) WDR83 (ENSSBOG00000030461) WDR83OS (ENSSBOG00000029116) MAN2B1 (ENSSBOG00000025631) ZNF791 (ENSSBOG00000024486) ZNF490 (ENSSBOG00000035661) ZNF564 (ENSSBOG00000025431) ENSSBOG00000030106 ZNF709 (ENSSBOG00000036040) ENSSBOG00000020200 ZNF442 (ENSSBOG00000024751) ZNF44 (ENSSBOG00000033041) ENSSBOG00000028467 ENSSBOG00000019079 ##22 ZNF136 (ENSSBOG00000032363) ZNF625 (ENSSBOG00000028089) ZNF20 (ENSSBOG00000031445) ENSSBOG00000032669 ZNF878 (ENSSBOG00000021067) ZNF433 (ENSSBOG00000016800) ZNF700 (ENSSBOG00000029518) ZNF441 (ENSSBOG00000025902) ZNF823 (ENSSBOG00000032287) ENSSBOG00000029320 ZNF627 (ENSSBOG00000031561) ACP5 (ENSSBOG00000033072) ELOF1 (ENSSBOG00000029523) CNN1 (ENSSBOG00000031551) ECSIT (ENSSBOG00000032854) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00940000163762.b ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Tree shrew MODERN SPECIES 2388 SCAI (ENSTBEG00000000436) #18 GOLGA1 (ENSTBEG00000008817) #20 ARPC5L (ENSTBEG00000008398) #21 RPL35 (ENSTBEG00000008246) #22 WDR38 (ENSTBEG00000007945) #23 OLFML2A (ENSTBEG00000007469) #24 NR6A1 (ENSTBEG00000007008) #25 Glires ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00940000163762.b ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.a #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.e.a #22 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B.c #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.e.a #22 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B.c #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.e.a #22 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B.c #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 ENSGT00940000163938 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 115 DR1 (ENSODEG00000006106) ENSODEG00000019300 CCDC18 (ENSODEG00000005096) ENSODEG00000004565 TMED5 (ENSODEG00000005461) MTF2 (ENSODEG00000005685) ENSODEG00000019282 DIPK1A (ENSODEG00000006544) ENSODEG00000005413 ENSODEG00000006057 ENSODEG00000006410 ENSODEG00000004664 ENSODEG00000004891 GLMN (ENSODEG00000005188) C1orf146 (ENSODEG00000005893) ENSODEG00000019394 #22 BTBD8 (ENSODEG00000006488) ENSODEG00000007844 ENSODEG00000005277 EPHX4 (ENSODEG00000005661) BRDT (ENSODEG00000006335) ENSODEG00000005197 ENSODEG00000019153 TGFBR3 (ENSODEG00000005656) CDC7 (ENSODEG00000007352) ENSODEG00000006243 ENSODEG00000007491 ENSODEG00000007680 ZNF644 (ENSODEG00000007732) ENSODEG00000019117 ENSODEG00000005537 Degu MODERN SPECIES 130 COL6A3 (ENSODEG00000008236) COPS8 (ENSODEG00000008319) ACKR3 (ENSODEG00000019748) IQCA1 (ENSODEG00000009201) ASB18 (ENSODEG00000008270) GBX2 (ENSODEG00000008224) AGAP1 (ENSODEG00000009204) SH3BP4 (ENSODEG00000008911) ARL4C (ENSODEG00000019668) SPP2 (ENSODEG00000008199) TRPM8 (ENSODEG00000012967) MROH2A (ENSODEG00000008630) UGT1A6 (ENSODEG00000009095) ENSODEG00000008578 ENSODEG00000007995 ENSODEG00000019500 #22 DGKD (ENSODEG00000008384) SAG (ENSODEG00000008121) ATG16L1 (ENSODEG00000008154) ENSODEG00000019603 INPP5D (ENSODEG00000008216) NEU2 (ENSODEG00000008947) ENSODEG00000019569 ENSODEG00000008563 ENSODEG00000008286 NGEF (ENSODEG00000008182) SNORC (ENSODEG00000007643) ENSODEG00000008808 KCNJ13 (ENSODEG00000007933) GIGYF2 (ENSODEG00000009987) EFHD1 (ENSODEG00000009395) Degu MODERN SPECIES 179 ENSODEG00000004733 ENSODEG00000019095 PBX3 (ENSODEG00000003566) #12 ENSODEG00000003600 ENSODEG00000019075 MAPKAP1 (ENSODEG00000003644) #13 ENSODEG00000018962 GAPVD1 (ENSODEG00000003684) #14 HSPA5 (ENSODEG00000003702) #15 RABEPK (ENSODEG00000003723) #16 ENSODEG00000003752 ENSODEG00000003771 #17 SCAI (ENSODEG00000003843) #18 GOLGA1 (ENSODEG00000003980) #20 ENSODEG00000004095 #21 ENSODEG00000004120 #22 OLFML2A (ENSODEG00000004138) #24 NR6A1 (ENSODEG00000004183) #25 ENSODEG00000004234 NR5A1 (ENSODEG00000004244) #26 ENSODEG00000004257 #28 ENSODEG00000019019 NEK6 (ENSODEG00000004126) #29 ENSODEG00000004179 LHX2 (ENSODEG00000004212) #30 DENND1A (ENSODEG00000004310) #31 CRB2 (ENSODEG00000004481) #32 ENSODEG00000019097 ENSODEG00000004632 #33 RABGAP1 (ENSODEG00000004811) #34 ENSODEG00000019246 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 139 ENSODEG00000017297 PELP1 (ENSODEG00000017225) ENSODEG00000017329 ENSODEG00000017890 ENSODEG00000017037 ALOX12 (ENSODEG00000017256) RNASEK (ENSODEG00000017378) ENSODEG00000017485 BCL6B (ENSODEG00000017360) SLC16A13 (ENSODEG00000017767) SLC16A11 (ENSODEG00000017518) ENSODEG00000017420 CLEC10A (ENSODEG00000017450) ENSODEG00000017527 ASGR2 (ENSODEG00000017289) ENSODEG00000020478 #22 ASGR1 (ENSODEG00000017268) DLG4 (ENSODEG00000017252) ACADVL (ENSODEG00000017418) DVL2 (ENSODEG00000017448) PHF23 (ENSODEG00000017333) GABARAP (ENSODEG00000017476) ENSODEG00000017490 ELP5 (ENSODEG00000017304) CLDN7 (ENSODEG00000017387) ENSODEG00000020514 SLC2A4 (ENSODEG00000017582) YBX2 (ENSODEG00000017530) ENSODEG00000017377 GPS2 (ENSODEG00000017752) NEURL4 (ENSODEG00000017430) Degu MODERN SPECIES 153 ENSODEG00000019381 PNLDC1 (ENSODEG00000008047) ENSODEG00000019385 #22 ENSODEG00000007318 ENSODEG00000007990 ENSODEG00000008372 ACAT2 (ENSODEG00000008431) ENSODEG00000008023 ENSODEG00000019351 SOD2 (ENSODEG00000007052) ENSODEG00000019438 METRNL (ENSODEG00000008002) B3GNTL1 (ENSODEG00000011917) TBCD (ENSODEG00000009094) ZNF750 (ENSODEG00000008866) ENSODEG00000019653 #22 ENSODEG00000009328 FN3KRP (ENSODEG00000012467) ENSODEG00000020021 RAB40B (ENSODEG00000007441) WDR45B (ENSODEG00000007809) FOXK2 (ENSODEG00000008321) NARF (ENSODEG00000007704) CYBC1 (ENSODEG00000008201) HEXD (ENSODEG00000009299) OGFOD3 (ENSODEG00000007453) ENSODEG00000007186 ENSODEG00000019459 ENSODEG00000007569 ENSODEG00000007855 ENSODEG00000008173 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 153 ENSODEG00000006392 ENSODEG00000019262 ENSODEG00000006455 ENSODEG00000009894 SLC22A3 (ENSODEG00000006460) ENSODEG00000006583 ENSODEG00000007010 SLC22A2 (ENSODEG00000007315) SLC22A1 (ENSODEG00000007862) ENSODEG00000019312 IGF2R (ENSODEG00000007106) ENSODEG00000019599 MAS1 (ENSODEG00000019418) ENSODEG00000019381 PNLDC1 (ENSODEG00000008047) ENSODEG00000019385 #22 ENSODEG00000007318 ENSODEG00000007990 ENSODEG00000008372 ACAT2 (ENSODEG00000008431) ENSODEG00000008023 ENSODEG00000019351 SOD2 (ENSODEG00000007052) ENSODEG00000019438 METRNL (ENSODEG00000008002) B3GNTL1 (ENSODEG00000011917) TBCD (ENSODEG00000009094) ZNF750 (ENSODEG00000008866) ENSODEG00000019653 #22 ENSODEG00000009328 FN3KRP (ENSODEG00000012467) Degu MODERN SPECIES 50 PIK3C2B (ENSODEG00000012433) PPP1R15B (ENSODEG00000014053) PLEKHA6 (ENSODEG00000011957) GOLT1A (ENSODEG00000013193) KISS1 (ENSODEG00000015011) REN (ENSODEG00000013805) ETNK2 (ENSODEG00000011893) SOX13 (ENSODEG00000014124) ENSODEG00000020001 ENSODEG00000013517 ENSODEG00000019942 SNRPE (ENSODEG00000013393) ENSODEG00000012788 ZBED6 (ENSODEG00000019959) ATP2B4 (ENSODEG00000013312) ENSODEG00000020037 #22 OPTC (ENSODEG00000011941) PRELP (ENSODEG00000013597) FMOD (ENSODEG00000012164) BTG2 (ENSODEG00000012528) CHIT1 (ENSODEG00000012946) CHI3L1 (ENSODEG00000011673) MYBPH (ENSODEG00000011869) ADORA1 (ENSODEG00000012258) MYOG (ENSODEG00000011506) PPFIA4 (ENSODEG00000011585) ENSODEG00000012180 ENSODEG00000012157 ENSODEG00000011458 ENSODEG00000019825 CYB5R1 (ENSODEG00000012060) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 126 RALGPS1 (ENSCLAG00000009365) ANGPTL2 (ENSCLAG00000012007) ZBTB34 (ENSCLAG00000012109) #7 ZBTB43 (ENSCLAG00000017099) #8 LMX1B (ENSCLAG00000012490) #9 MVB12B (ENSCLAG00000010176) #11 PBX3 (ENSCLAG00000009335) #12 MAPKAP1 (ENSCLAG00000011818) #13 GAPVD1 (ENSCLAG00000010577) #14 HSPA5 (ENSCLAG00000009815) #15 RABEPK (ENSCLAG00000011734) #16 PPP6C (ENSCLAG00000013734) #17 SCAI (ENSCLAG00000013682) #18 GOLGA1 (ENSCLAG00000011649) #20 ARPC5L (ENSCLAG00000009936) #21 RPL35 (ENSCLAG00000013142) #22 OLFML2A (ENSCLAG00000014121) #24 NR6A1 (ENSCLAG00000012774) #25 NR5A1 (ENSCLAG00000012090) #26 PSMB7 (ENSCLAG00000013548) #28 NEK6 (ENSCLAG00000009797) #29 LHX2 (ENSCLAG00000010277) #30 DENND1A (ENSCLAG00000010455) #31 CRB2 (ENSCLAG00000015580) #32 STRBP (ENSCLAG00000010826) #33 RABGAP1 (ENSCLAG00000010301) #34 ZBTB26 (ENSCLAG00000016744) #35 ZBTB6 (ENSCLAG00000016422) #36 RC3H2 (ENSCLAG00000013261) #37 PDCL (ENSCLAG00000014566) ENSCLAG00000017880 Guinea pig MODERN SPECIES 27 RALGPS1 (ENSCPOG00000012308) ANGPTL2 (ENSCPOG00000002360) ZBTB34 (ENSCPOG00000003791) #7 ZBTB43 (ENSCPOG00000038507) #8 LMX1B (ENSCPOG00000023429) #9 MVB12B (ENSCPOG00000036809) #11 PBX3 (ENSCPOG00000004530) #12 MAPKAP1 (ENSCPOG00000004526) #13 GAPVD1 (ENSCPOG00000004285) #14 ENSCPOG00000012520 #15 RABEPK (ENSCPOG00000026070) #16 PPP6C (ENSCPOG00000004898) #17 SCAI (ENSCPOG00000001406) #18 GOLGA1 (ENSCPOG00000014706) #20 ARPC5L (ENSCPOG00000036902) #21 RPL35 (ENSCPOG00000022811) #22 OLFML2A (ENSCPOG00000003516) #24 NR6A1 (ENSCPOG00000005970) #25 NR5A1 (ENSCPOG00000022305) #26 ADGRD2 (ENSCPOG00000027184) #27 PSMB7 (ENSCPOG00000007839) #28 NEK6 (ENSCPOG00000007827) #29 LHX2 (ENSCPOG00000022927) #30 DENND1A (ENSCPOG00000014548) #31 CRB2 (ENSCPOG00000010074) #32 STRBP (ENSCPOG00000009817) #33 RABGAP1 (ENSCPOG00000009811) #34 ZBTB26 (ENSCPOG00000032601) #35 ZBTB6 (ENSCPOG00000039487) #36 RC3H2 (ENSCPOG00000008511) #37 PDCL (ENSCPOG00000009509) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Degu MODERN SPECIES 59 ENSODEG00000016065 ALX4 (ENSODEG00000016139) EXT2 (ENSODEG00000016764) ACCS (ENSODEG00000016512) ENSODEG00000020538 C11orf96 (ENSODEG00000020497) ALKBH3 (ENSODEG00000017204) HSD17B12 (ENSODEG00000016636) ENSODEG00000016649 TTC17 (ENSODEG00000016728) ENSODEG00000016280 ENSODEG00000016521 ENSODEG00000020406 ENSODEG00000020370 LRRC4C (ENSODEG00000020475) ENSODEG00000020466 #22 IFTAP (ENSODEG00000016540) RAG2 (ENSODEG00000020447) RAG1 (ENSODEG00000020338) TRAF6 (ENSODEG00000017071) PRR5L (ENSODEG00000016913) COMMD9 (ENSODEG00000017403) LDLRAD3 (ENSODEG00000017384) ENSODEG00000016381 FJX1 (ENSODEG00000016768) ENSODEG00000016254 PAMR1 (ENSODEG00000016795) SLC1A2 (ENSODEG00000016926) ENSODEG00000016446 PDHX (ENSODEG00000016591) ENSODEG00000016598 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Rat MODERN SPECIES 16 Lratd1 (ENSRNOG00000004084) Trib2 (ENSRNOG00000004110) Lpin1 (ENSRNOG00000004377) Ntsr2 (ENSRNOG00000049054) Greb1 (ENSRNOG00000024651) E2f6 (ENSRNOG00000004449) Rock2 (ENSRNOG00000004496) Slc66a3 (ENSRNOG00000005126) C6h2orf50 (ENSRNOG00000024338) Kcnf1 (ENSRNOG00000024310) Pdia6 (ENSRNOG00000050197) Atp6v1c2 (ENSRNOG00000050553) Nol10 (ENSRNOG00000005344) AABR07063703.1 (ENSRNOG00000046279) Odc1 (ENSRNOG00000005424) LOC120093238 (ENSRNOG00000032523) #22 Hpcal1 (ENSRNOG00000005492) Asap2 (ENSRNOG00000061519) Itgb1bp1 (ENSRNOG00000059402) Cpsf3 (ENSRNOG00000052418) Iah1 (ENSRNOG00000060853) Adam17 (ENSRNOG00000060694) Ywhaq (ENSRNOG00000051650) Taf1b (ENSRNOG00000061415) Rbm34-ps1 (ENSRNOG00000065550) Grhl1 (ENSRNOG00000054989) Klf11 (ENSRNOG00000054259) Cys1 (ENSRNOG00000058891) Rrm2 (ENSRNOG00000054286) Mboat2 (ENSRNOG00000061050) Kidins220 (ENSRNOG00000023176) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00940000163762.b ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990.j #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 6 ZBTB34 (ENSSVLG00005011114) #7 ZBTB43 (ENSSVLG00005011093) #8 LMX1B (ENSSVLG00005010935) #9 MVB12B (ENSSVLG00005023376) #11 PBX3 (ENSSVLG00005023289) #12 MAPKAP1 (ENSSVLG00005022966) #13 GAPVD1 (ENSSVLG00005022773) #14 HSPA5 (ENSSVLG00005022700) #15 RABEPK (ENSSVLG00005022664) #16 ENSSVLG00005022620 #17 ENSSVLG00005022574 ENSSVLG00005022544 SCAI (ENSSVLG00005022411) #18 GOLGA1 (ENSSVLG00005022372) #20 ARPC5L (ENSSVLG00005022345) #21 RPL35 (ENSSVLG00005022293) #22 WDR38 (ENSSVLG00005022161) #23 OLFML2A (ENSSVLG00005022068) #24 ENSSVLG00005022017 NR6A1 (ENSSVLG00005021745) #25 NR5A1 (ENSSVLG00005021643) #26 ADGRD2 (ENSSVLG00005021497) #27 PSMB7 (ENSSVLG00005021459) #28 NEK6 (ENSSVLG00005021363) #29 LHX2 (ENSSVLG00005021337) #30 ENSSVLG00005021279 DENND1A (ENSSVLG00005021227) #31 CRB2 (ENSSVLG00005021075) #32 STRBP (ENSSVLG00005021011) #33 RABGAP1 (ENSSVLG00005020789) #34 ZBTB26 (ENSSVLG00005020757) #35 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990.j #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Alpin marmot MODERN SPECIES 47 ENSMMMG00000017708 LMX1B (ENSMMMG00000017718) #9 MVB12B (ENSMMMG00000017733) #11 PBX3 (ENSMMMG00000017764) #12 ENSMMMG00000017816 ENSMMMG00000017820 MAPKAP1 (ENSMMMG00000017830) #13 GAPVD1 (ENSMMMG00000017880) #14 HSPA5 (ENSMMMG00000017949) #15 ENSMMMG00000017965 #16 PPP6C (ENSMMMG00000017971) #17 SCAI (ENSMMMG00000017999) #18 ENSMMMG00000018021 GOLGA1 (ENSMMMG00000018029) #20 ARPC5L (ENSMMMG00000018071) #21 RPL35 (ENSMMMG00000018074) #22 WDR38 (ENSMMMG00000018077) #23 OLFML2A (ENSMMMG00000018107) #24 NR6A1 (ENSMMMG00000018148) #25 NR5A1 (ENSMMMG00000018155) #26 PSMB7 (ENSMMMG00000018175) #28 NEK6 (ENSMMMG00000018189) #29 ENSMMMG00000018209 #30 DENND1A (ENSMMMG00000018266) #31 ENSMMMG00000018296 CRB2 (ENSMMMG00000018308) #32 STRBP (ENSMMMG00000018353) #33 RABGAP1 (ENSMMMG00000018398) #34 ZBTB26 (ENSMMMG00000018454) #35 ZBTB6 (ENSMMMG00000018466) #36 RC3H2 (ENSMMMG00000018470) #37 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155946 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990.j #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Squirrel MODERN SPECIES 87 ANGPTL2 (ENSSTOG00000028602) RALGPS1 (ENSSTOG00000032069) ZBTB34 (ENSSTOG00000009103) #7 ZBTB43 (ENSSTOG00000007435) #8 LMX1B (ENSSTOG00000026973) #9 MVB12B (ENSSTOG00000021458) #11 PBX3 (ENSSTOG00000013679) #12 MAPKAP1 (ENSSTOG00000011275) #13 GAPVD1 (ENSSTOG00000011260) #14 Hspa5 (ENSSTOG00000011243) #15 RABEPK (ENSSTOG00000011234) #16 PPP6C (ENSSTOG00000007971) #17 SCAI (ENSSTOG00000007948) #18 GOLGA1 (ENSSTOG00000007917) #20 ARPC5L (ENSSTOG00000007907) #21 RPL35 (ENSSTOG00000007901) #22 WDR38 (ENSSTOG00000007867) #23 OLFML2A (ENSSTOG00000007852) #24 NR6A1 (ENSSTOG00000022764) #25 NR5A1 (ENSSTOG00000000396) #26 PSMB7 (ENSSTOG00000013826) #28 NEK6 (ENSSTOG00000013817) #29 LHX2 (ENSSTOG00000000794) #30 DENND1A (ENSSTOG00000023765) #31 CRB2 (ENSSTOG00000021477) #32 STRBP (ENSSTOG00000004790) #33 GPR21 (ENSSTOG00000030817) RABGAP1 (ENSSTOG00000004750) #34 ZBTB26 (ENSSTOG00000004739) #35 RC3H2 (ENSSTOG00000010655) #37 PDCL (ENSSTOG00000010651) Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 44 RALGPS1 (ENSUPAG00010013847) ENSUPAG00010013834 #8 ENSUPAG00010013827 LMX1B (ENSUPAG00010013815) #9 MVB12B (ENSUPAG00010013802) #11 PBX3 (ENSUPAG00010013778) #12 MAPKAP1 (ENSUPAG00010013693) #13 GAPVD1 (ENSUPAG00010013640) #14 HSPA5 (ENSUPAG00010013632) #15 RABEPK (ENSUPAG00010013628) #16 PPP6C (ENSUPAG00010013600) #17 SCAI (ENSUPAG00010013570) #18 GOLGA1 (ENSUPAG00010013479) #20 ARPC5L (ENSUPAG00010013460) #21 WDR38 (ENSUPAG00010013438) #23 RPL35 (ENSUPAG00010013420) #22 OLFML2A (ENSUPAG00010013389) #24 NR6A1 (ENSUPAG00010013329) #25 NR5A1 (ENSUPAG00010013310) #26 ADGRD2 (ENSUPAG00010013284) #27 PSMB7 (ENSUPAG00010013273) #28 NEK6 (ENSUPAG00010013255) #29 LHX2 (ENSUPAG00010013245) #30 DENND1A (ENSUPAG00010013123) #31 CRB2 (ENSUPAG00010013102) #32 STRBP (ENSUPAG00010012985) #33 RABGAP1 (ENSUPAG00010012857) #34 ZBTB26 (ENSUPAG00010012848) #35 ZBTB6 (ENSUPAG00010012844) #36 RC3H2 (ENSUPAG00010012762) #37 PDCL (ENSUPAG00010012754) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 150 COL24A1 (ENSODEG00000003113) ENSODEG00000003023 ODF2L (ENSODEG00000002955) CLCA2 (ENSODEG00000002864) ENSODEG00000002790 ENSODEG00000002712 ENSODEG00000002677 ENSODEG00000002661 SH3GLB1 (ENSODEG00000003003) ENSODEG00000002911 ENSODEG00000002901 HS2ST1 (ENSODEG00000002834) ENSODEG00000018964 LMO4 (ENSODEG00000002768) ENSODEG00000002725 #22 ENSODEG00000002715 #22 PKN2 (ENSODEG00000006053) ENSODEG00000005921 ENSODEG00000005859 ENSODEG00000005800 ENSODEG00000019217 ENSODEG00000005607 Degu MODERN SPECIES 150 ZNHIT6 (ENSODEG00000003486) COL24A1 (ENSODEG00000003113) ENSODEG00000003023 ODF2L (ENSODEG00000002955) CLCA2 (ENSODEG00000002864) ENSODEG00000002790 ENSODEG00000002712 ENSODEG00000002677 ENSODEG00000002661 SH3GLB1 (ENSODEG00000003003) ENSODEG00000002911 ENSODEG00000002901 HS2ST1 (ENSODEG00000002834) ENSODEG00000018964 LMO4 (ENSODEG00000002768) ENSODEG00000002725 #22 ENSODEG00000002715 #22 PKN2 (ENSODEG00000006053) ENSODEG00000005921 ENSODEG00000005859 ENSODEG00000005800 ENSODEG00000019217 ENSODEG00000005607 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 31 ENSHGLG00000045337 ENSHGLG00000046871 ENSHGLG00000040335 ENSHGLG00000033454 ENSHGLG00000040623 TMLHE (ENSHGLG00000000101) ENSHGLG00000043926 RAB39B (ENSHGLG00000036840) VBP1 (ENSHGLG00000044108) ENSHGLG00000047377 ENSHGLG00000001061 MTCP1 (ENSHGLG00000001243) FUNDC2 (ENSHGLG00000001278) ENSHGLG00000035621 ENSHGLG00000037924 ENSHGLG00000048533 #22 F8 (ENSHGLG00000034300) ENSHGLG00000000581 MPP1 (ENSHGLG00000000629) DKC1 (ENSHGLG00000000649) ENSHGLG00000000701 ENSHGLG00000049532 ENSHGLG00000046464 ENSHGLG00000049566 ENSHGLG00000047737 ENSHGLG00000002010 ENSHGLG00000035389 ENSHGLG00000043323 IDS (ENSHGLG00000049970) AFF2 (ENSHGLG00000000634) ENSHGLG00000028863 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 3 ZBTB34 (ENSHGLG00000032761) #7 ZBTB43 (ENSHGLG00000044018) #8 LMX1B (ENSHGLG00000035542) #9 MVB12B (ENSHGLG00000011104) #11 ENSHGLG00000043708 PBX3 (ENSHGLG00000011457) #12 MAPKAP1 (ENSHGLG00000011921) #13 ENSHGLG00000012167 GAPVD1 (ENSHGLG00000012368) #14 HSPA5 (ENSHGLG00000045279) #15 RABEPK (ENSHGLG00000010878) #16 PPP6C (ENSHGLG00000037108) #17 SCAI (ENSHGLG00000011703) #18 GOLGA1 (ENSHGLG00000012081) #20 ARPC5L (ENSHGLG00000012246) #21 ENSHGLG00000035609 #22 OLFML2A (ENSHGLG00000012516) #24 NR6A1 (ENSHGLG00000012869) #25 NR5A1 (ENSHGLG00000042870) #26 PSMB7 (ENSHGLG00000013424) #28 NEK6 (ENSHGLG00000013776) #29 LHX2 (ENSHGLG00000014024) #30 DENND1A (ENSHGLG00000014439) #31 CRB2 (ENSHGLG00000014737) #32 ENSHGLG00000014962 #33 RABGAP1 (ENSHGLG00000010853) #34 GPR21 (ENSHGLG00000033657) ZBTB26 (ENSHGLG00000011691) #35 ZBTB6 (ENSHGLG00000011851) #36 RC3H2 (ENSHGLG00000012014) #37 ENSHGLG00000020904 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Kangaroo rat MODERN SPECIES 374 Angptl2 (ENSDORG00000005301) Ralgps1 (ENSDORG00000005296) Zbtb34 (ENSDORG00000010756) #7 Zbtb43 (ENSDORG00000028519) #8 Lmx1b (ENSDORG00000002371) #9 Mvb12b (ENSDORG00000027922) #11 ENSDORG00000024134 Mapkap1 (ENSDORG00000013292) #13 Gapvd1 (ENSDORG00000013673) #14 Hspa5 (ENSDORG00000014419) #15 Rabepk (ENSDORG00000014417) #16 ENSDORG00000028487 Scai (ENSDORG00000012138) #18 Golga1 (ENSDORG00000012132) #20 Arpc5l (ENSDORG00000027899) #21 ENSDORG00000012125 #22 Wdr38 (ENSDORG00000012116) #23 Olfml2a (ENSDORG00000013607) #24 Nr6a1 (ENSDORG00000013606) #25 Nr5a1 (ENSDORG00000028222) #26 Psmb7 (ENSDORG00000014519) #28 Nek6 (ENSDORG00000014518) #29 ENSDORG00000025549 Lhx2 (ENSDORG00000025403) #30 Dennd1a (ENSDORG00000002817) #31 Crb2 (ENSDORG00000002814) #32 ENSDORG00000012137 #33 Gpr21 (ENSDORG00000012136) Rabgap1 (ENSDORG00000012123) #34 Zbtb26 (ENSDORG00000006402) #35 Zbtb6 (ENSDORG00000025398) #36 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 94 ENSJJAG00000023751 Mapkap1 (ENSJJAG00000014299) #13 Gapvd1 (ENSJJAG00000010351) #14 Hspa5 (ENSJJAG00000023256) #15 Rabepk (ENSJJAG00000023084) #16 ENSJJAG00000011633 ENSJJAG00000000698 Scai (ENSJJAG00000020518) #18 Golga1 (ENSJJAG00000024183) #20 Arpc5l (ENSJJAG00000013733) #21 ENSJJAG00000014897 #22 Wdr38 (ENSJJAG00000008331) #23 Olfml2a (ENSJJAG00000017354) #24 Nr6a1 (ENSJJAG00000016130) #25 Nr5a1 (ENSJJAG00000023318) #26 ENSJJAG00000020212 #28 Nek6 (ENSJJAG00000015974) #29 Lhx2 (ENSJJAG00000015440) #30 ENSJJAG00000018640 #31 Crb2 (ENSJJAG00000019604) #32 Strbp (ENSJJAG00000008449) #33 Gpr21 (ENSJJAG00000010982) Rabgap1 (ENSJJAG00000014056) #34 ENSJJAG00000002859 #35 Zbtb6 (ENSJJAG00000007276) #36 Rc3h2 (ENSJJAG00000022376) #37 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 513 Angptl2 (ENSNGAG00000013329) Ralgps1 (ENSNGAG00000011874) Zbtb34 (ENSNGAG00000016663) #7 Zbtb43 (ENSNGAG00000009744) #8 Lmx1b (ENSNGAG00000013286) #9 Mvb12b (ENSNGAG00000012640) #11 Pbx3 (ENSNGAG00000020873) #12 Mapkap1 (ENSNGAG00000002676) #13 Gapvd1 (ENSNGAG00000016173) #14 Hspa5 (ENSNGAG00000016525) #15 Rabepk (ENSNGAG00000009850) #16 ENSNGAG00000000167 #17 Scai (ENSNGAG00000009532) #18 Golga1 (ENSNGAG00000017928) #20 Arpc5l (ENSNGAG00000004816) #21 ENSNGAG00000012132 #22 ENSNGAG00000016210 Olfml2a (ENSNGAG00000006763) #24 Nr6a1 (ENSNGAG00000019760) #25 Nr5a1 (ENSNGAG00000018329) #26 Psmb7 (ENSNGAG00000016549) #28 Nek6 (ENSNGAG00000017493) #29 Lhx2 (ENSNGAG00000013721) #30 ENSNGAG00000003822 #31 ENSNGAG00000011495 #31 Crb2 (ENSNGAG00000004692) #32 Strbp (ENSNGAG00000014638) #33 Gpr21 (ENSNGAG00000009678) Rabgap1 (ENSNGAG00000017183) #34 Zbtb26 (ENSNGAG00000001562) #35 Zbtb6 (ENSNGAG00000021046) #36 Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Murinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 ENSGT00950000183208.A.c.a ENSGT00390000006631 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000008033 ENSGT00940000157521.b ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Mus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 ENSGT00950000183208.A.c.a ENSGT00390000006631 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000008033 ENSGT00940000157521.b ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Shrew mouse MODERN SPECIES 16 Lypd6b (MGP_PahariEiJ_G0024998) Kif5c (MGP_PahariEiJ_G0024997) Epc2 (MGP_PahariEiJ_G0024996) Mbd5 (MGP_PahariEiJ_G0024995) Orc4 (MGP_PahariEiJ_G0024994) Acvr2a (MGP_PahariEiJ_G0024993) Zeb2 (MGP_PahariEiJ_G0024992) Gtdc1 (MGP_PahariEiJ_G0024991) Arhgap15 (MGP_PahariEiJ_G0024990) Kynu (MGP_PahariEiJ_G0024989) Lrp1b (MGP_PahariEiJ_G0024988) Ppp6c (MGP_PahariEiJ_G0024987) #17 Scai (MGP_PahariEiJ_G0024986) #18 Golga1 (MGP_PahariEiJ_G0024985) #20 Arpc5l (MGP_PahariEiJ_G0024984) #21 MGP_PahariEiJ_G0024983 #22 Olfml2a (MGP_PahariEiJ_G0024982) #24 Nr6a1 (MGP_PahariEiJ_G0024981) #25 Nr5a1 (MGP_PahariEiJ_G0024980) #26 Psmb7 (MGP_PahariEiJ_G0024979) #28 Nek6 (MGP_PahariEiJ_G0024978) #29 Lhx2 (MGP_PahariEiJ_G0024977) #30 Dennd1a (MGP_PahariEiJ_G0024976) #31 Crb2 (MGP_PahariEiJ_G0024975) #32 Gpr21 (MGP_PahariEiJ_G0024974) Strbp (MGP_PahariEiJ_G0024973) #33 Rabgap1 (MGP_PahariEiJ_G0024972) #34 Zbtb26 (MGP_PahariEiJ_G0024971) #35 Zbtb6 (MGP_PahariEiJ_G0024970) #36 Rc3h2 (MGP_PahariEiJ_G0024969) #37 Pdcl (MGP_PahariEiJ_G0024968) Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 ENSGT00950000183208.A.c.a ENSGT00390000006631 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000008033 ENSGT00940000157521.b ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 11 Kif5c (MGP_CAROLIEiJ_G0023546) Epc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023545) Mbd5 (MGP_CAROLIEiJ_G0023544) Orc4 (MGP_CAROLIEiJ_G0023543) Acvr2a (MGP_CAROLIEiJ_G0023542) Zeb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023541) Gtdc1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023540) Arhgap15 (MGP_CAROLIEiJ_G0023539) MGP_CAROLIEiJ_G0023538 Lrp1b (MGP_CAROLIEiJ_G0023537) MGP_CAROLIEiJ_G0023536 Ppp6c (MGP_CAROLIEiJ_G0023535) #17 Scai (MGP_CAROLIEiJ_G0023534) #18 Golga1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023533) #20 Arpc5l (MGP_CAROLIEiJ_G0023532) #21 MGP_CAROLIEiJ_G0023531 #22 Wdr38 (MGP_CAROLIEiJ_G0023530) #23 Olfml2a (MGP_CAROLIEiJ_G0023529) #24 Nr6a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023528) #25 Nr5a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023527) #26 Psmb7 (MGP_CAROLIEiJ_G0023526) #28 Nek6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023525) #29 Lhx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023524) #30 Dennd1a (MGP_CAROLIEiJ_G0023523) #31 Crb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023522) #32 Gpr21 (MGP_CAROLIEiJ_G0023521) Strbp (MGP_CAROLIEiJ_G0023520) #33 Rabgap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023519) #34 Zbtb26 (MGP_CAROLIEiJ_G0023518) #35 Zbtb6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023517) #36 Rc3h2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023516) #37 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 ENSGT00950000183208.A.c.a ENSGT00390000006631 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000008033 ENSGT00940000157521.b ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Mouse DUPLICATION Mouse MODERN SPECIES 11 Lypd6b (ENSMUSG00000026765) Kif5c (ENSMUSG00000026764) Epc2 (ENSMUSG00000069495) Mbd5 (ENSMUSG00000036792) Orc4 (ENSMUSG00000026761) Acvr2a (ENSMUSG00000052155) Zeb2 (ENSMUSG00000026872) Gtdc1 (ENSMUSG00000036890) Arhgap15 (ENSMUSG00000049744) Kynu (ENSMUSG00000026866) Lrp1b (ENSMUSG00000049252) Ppp6c (ENSMUSG00000026753) #17 Scai (ENSMUSG00000035236) #18 Golga1 (ENSMUSG00000026754) #20 Arpc5l (ENSMUSG00000026755) #21 Rpl35 (ENSMUSG00000062997) #22 Wdr38 (ENSMUSG00000035295) #23 Olfml2a (ENSMUSG00000046618) #24 Nr6a1 (ENSMUSG00000063972) #25 Nr5a1 (ENSMUSG00000026751) #26 Psmb7 (ENSMUSG00000026750) #28 Nek6 (ENSMUSG00000026749) #29 Lhx2 (ENSMUSG00000000247) #30 Dennd1a (ENSMUSG00000035392) #31 Crb2 (ENSMUSG00000035403) #32 Gpr21 (ENSMUSG00000053164) Strbp (ENSMUSG00000026915) #33 Rabgap1 (ENSMUSG00000035437) #34 Zbtb26 (ENSMUSG00000050714) #35 Zbtb6 (ENSMUSG00000066798) #36 Rc3h2 (ENSMUSG00000075376) #37 Mouse MODERN SPECIES Ier5 (ENSMUSG00000056708) Mr1 (ENSMUSG00000026471) Stx6 (ENSMUSG00000026470) BC034090 (ENSMUSG00000033722) Xpr1 (ENSMUSG00000026469) Acbd6 (ENSMUSG00000033701) Lhx4 (ENSMUSG00000026468) Qsox1 (ENSMUSG00000033684) Cep350 (ENSMUSG00000033671) Tor1aip1 (ENSMUSG00000026466) Tor1aip2 (ENSMUSG00000050565) Fam163a (ENSMUSG00000015484) Tdrd5 (ENSMUSG00000060985) Nphs2 (ENSMUSG00000026602) Axdnd1 (ENSMUSG00000026601) Gm2000 (ENSMUSG00000078193) #22 Soat1 (ENSMUSG00000026600) Abl2 (ENSMUSG00000026596) Tor3a (ENSMUSG00000060519) Fam20b (ENSMUSG00000033557) Ralgps2 (ENSMUSG00000026594) Angptl1 (ENSMUSG00000033544) Tex35 (ENSMUSG00000026592) Rasal2 (ENSMUSG00000070565) Cryzl2 (ENSMUSG00000033488) Sec16b (ENSMUSG00000026589) Brinp2 (ENSMUSG00000004031) Astn1 (ENSMUSG00000026587) Pappa2 (ENSMUSG00000073530) Cop1 (ENSMUSG00000040782) Tnr (ENSMUSG00000015829) Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 ENSGT00950000183208.A.c.a ENSGT00390000006631 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000008033 ENSGT00940000157521.b ENSGT00390000012037.x ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Steppe mouse MODERN SPECIES 3157 Ppp6c (ENSMSIG00000026363) #17 Scai (ENSMSIG00000026395) #18 Golga1 (ENSMSIG00000026434) #20 Arpc5l (ENSMSIG00000026537) #21 ENSMSIG00000026549 #22 Wdr38 (ENSMSIG00000026555) #23 Olfml2a (ENSMSIG00000026578) #24 Nr6a1 (ENSMSIG00000000135) #25 Nr5a1 (ENSMSIG00000000273) #26 Psmb7 (ENSMSIG00000000365) #28 Nek6 (ENSMSIG00000000470) #29 Lhx2 (ENSMSIG00000000576) #30 Dennd1a (ENSMSIG00000000638) #31 Crb2 (ENSMSIG00000000810) #32 Strbp (ENSMSIG00000000857) #33 Rabgap1 (ENSMSIG00000000948) #34 Zbtb26 (ENSMSIG00000001038) #35 Zbtb6 (ENSMSIG00000001048) #36 Rc3h2 (ENSMSIG00000001099) #37 Pdcl (ENSMSIG00000001175) spretus MODERN SPECIES 11 Epc2 (MGP_SPRETEiJ_G0024466) MGP_SPRETEiJ_G0024465 Mbd5 (MGP_SPRETEiJ_G0024464) Orc4 (MGP_SPRETEiJ_G0024463) Acvr2a (MGP_SPRETEiJ_G0024462) Zeb2 (MGP_SPRETEiJ_G0024461) Gtdc1 (MGP_SPRETEiJ_G0024460) Arhgap15 (MGP_SPRETEiJ_G0024459) Kynu (MGP_SPRETEiJ_G0024458) Lrp1b (MGP_SPRETEiJ_G0024457) MGP_SPRETEiJ_G0024456 Ppp6c (MGP_SPRETEiJ_G0024455) #17 Scai (MGP_SPRETEiJ_G0024454) #18 Golga1 (MGP_SPRETEiJ_G0024453) #20 Arpc5l (MGP_SPRETEiJ_G0024452) #21 MGP_SPRETEiJ_G0024451 #22 Wdr38 (MGP_SPRETEiJ_G0024450) #23 Olfml2a (MGP_SPRETEiJ_G0024449) #24 Nr6a1 (MGP_SPRETEiJ_G0024448) #25 Nr5a1 (MGP_SPRETEiJ_G0024447) #26 Psmb7 (MGP_SPRETEiJ_G0024446) #28 Nek6 (MGP_SPRETEiJ_G0024445) #29 Lhx2 (MGP_SPRETEiJ_G0024444) #30 Dennd1a (MGP_SPRETEiJ_G0024443) #31 Crb2 (MGP_SPRETEiJ_G0024442) #32 Gpr21 (MGP_SPRETEiJ_G0024441) MGP_SPRETEiJ_G0024440 #33 Rabgap1 (MGP_SPRETEiJ_G0024439) #34 Zbtb26 (MGP_SPRETEiJ_G0024438) #35 Zbtb6 (MGP_SPRETEiJ_G0024437) #36 Rc3h2 (MGP_SPRETEiJ_G0024436) #37 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 401 Myrf (ENSCGRG00001021116) ENSCGRG00001013240 Fen1 (ENSCGRG00001009889) Fads1 (ENSCGRG00001018831) Fads2 (ENSCGRG00001013858) Fads3 (ENSCGRG00001017095) Rab3il1 (ENSCGRG00001015063) ENSCGRG00001014139 FTH1 (ENSCGRG00001020220) Incenp (ENSCGRG00001019028) Scgb2a2 (ENSCGRG00001015765) Asrgl1 (ENSCGRG00001019390) Scgb1a1 (ENSCGRG00001017835) Ahnak (ENSCGRG00001009772) ENSCGRG00001013631 ENSCGRG00001010100 #22 Tut1 (ENSCGRG00001017583) Mta2 (ENSCGRG00001005728) Eml3 (ENSCGRG00001015050) Rom1 (ENSCGRG00001013656) B3GAT3 (ENSCGRG00001023184) Ganab (ENSCGRG00001021832) Ints5 (ENSCGRG00001020963) 1810009A15Rik (ENSCGRG00001020427) ENSCGRG00001017126 Uqcc3 (ENSCGRG00001016702) Ubxn1 (ENSCGRG00001006327) Lrrn4cl (ENSCGRG00001009869) Bscl2 (ENSCGRG00001015829) Gng3 (ENSCGRG00001014012) Hnrnpul2 (ENSCGRG00001017076) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Ppp6c (ENSPEMG00000013119) #17 Scai (ENSPEMG00000017936) #18 Golga1 (ENSPEMG00000014526) #20 Arpc5l (ENSPEMG00000022681) #21 ENSPEMG00000021500 #22 Wdr38 (ENSPEMG00000010623) #23 Olfml2a (ENSPEMG00000029944) #24 Nr6a1 (ENSPEMG00000021698) #25 Nr5a1 (ENSPEMG00000018185) #26 Psmb7 (ENSPEMG00000011436) #28 Nek6 (ENSPEMG00000023305) #29 Lhx2 (ENSPEMG00000023994) #30 Dennd1a (ENSPEMG00000001409) #31 Crb2 (ENSPEMG00000023678) #32 Strbp (ENSPEMG00000022984) #33 Rabgap1 (ENSPEMG00000022679) #34 ENSPEMG00000029320 #35 Zbtb6 (ENSPEMG00000031005) #36 Rc3h2 (ENSPEMG00000023441) #37 Pdcl (ENSPEMG00000031426) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Tpm1 (ENSPEMG00000020869) ENSPEMG00000025721 ENSPEMG00000024299 Tln2 (ENSPEMG00000021042) ENSPEMG00000031152 C2cd4b (ENSPEMG00000016908) C2cd4a (ENSPEMG00000013754) Vps13c (ENSPEMG00000016724) Rora (ENSPEMG00000021178) Ice2 (ENSPEMG00000023148) Anxa2 (ENSPEMG00000020921) Foxb1 (ENSPEMG00000026372) Bnip2 (ENSPEMG00000008159) Gtf2a2 (ENSPEMG00000012295) Gcnt3 (ENSPEMG00000009036) ENSPEMG00000026494 #22 Fam81a (ENSPEMG00000020609) Myo1e (ENSPEMG00000020628) Ccnb2 (ENSPEMG00000010693) Rnf111 (ENSPEMG00000011827) Sltm (ENSPEMG00000013263) Mindy2 (ENSPEMG00000030187) ENSPEMG00000028321 Adam10 (ENSPEMG00000023786) Lipc (ENSPEMG00000021222) Aqp9 (ENSPEMG00000020420) Aldh1a2 (ENSPEMG00000017997) Polr2m (ENSPEMG00000027979) ENSPEMG00000029794 Myzap (ENSPEMG00000021267) Cgnl1 (ENSPEMG00000021122) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 14 Mtarc2 (ENSMOCG00000016564) C130074G19Rik (ENSMOCG00000017582) Mark1 (ENSMOCG00000010578) Rab3gap2 (ENSMOCG00000022853) Iars2 (ENSMOCG00000017822) Bpnt1 (ENSMOCG00000011708) Eprs (ENSMOCG00000012748) ENSMOCG00000016971 Slc30a10 (ENSMOCG00000018487) Lyplal1 (ENSMOCG00000019697) Tgfb2 (ENSMOCG00000022415) Rrp15 (ENSMOCG00000019339) D1Pas1 (ENSMOCG00000002596) Spata17 (ENSMOCG00000006657) Gpatch2 (ENSMOCG00000020821) ENSMOCG00000008935 #22 Esrrg (ENSMOCG00000013956) Kctd3 (ENSMOCG00000021391) Kcnk2 (ENSMOCG00000018400) Cenpf (ENSMOCG00000012377) Ptpn14 (ENSMOCG00000010851) Smyd2 (ENSMOCG00000000847) Prox1 (ENSMOCG00000003310) ENSMOCG00000014377 Rps6kc1 (ENSMOCG00000021401) Angel2 (ENSMOCG00000022027) Vash2 (ENSMOCG00000002399) Flvcr1 (ENSMOCG00000013229) Spata45 (ENSMOCG00000017094) Tatdn3 (ENSMOCG00000019831) Nsl1 (ENSMOCG00000020317) Prairie vole MODERN SPECIES 103 Lama1 (ENSMOCG00000019094) Lrrc30 (ENSMOCG00000022722) Ptprm (ENSMOCG00000001682) Themis3 (ENSMOCG00000009480) Rab12 (ENSMOCG00000000452) Mtcl1 (ENSMOCG00000007848) Arhgap28 (ENSMOCG00000002311) ENSMOCG00000016924 ENSMOCG00000020294 Tmem200c (ENSMOCG00000011720) Epb41l3 (ENSMOCG00000000728) ENSMOCG00000003079 #22 Zbtb14 (ENSMOCG00000010611) Akain1 (ENSMOCG00000012989) Dlgap1 (ENSMOCG00000003521) ENSMOCG00000017885 Myl12b (ENSMOCG00000018029) Myl12a (ENSMOCG00000005742) Myom1 (ENSMOCG00000008094) Lpin2 (ENSMOCG00000005299) Emilin2 (ENSMOCG00000000131) Smchd1 (ENSMOCG00000013945) Ndc80 (ENSMOCG00000012221) ENSMOCG00000000095 ENSMOCG00000022549 Prairie vole MODERN SPECIES 12 Mrrf (ENSMOCG00000018514) Ptgs1 (ENSMOCG00000022225) ENSMOCG00000013164 ENSMOCG00000009975 ENSMOCG00000010474 ENSMOCG00000022412 ENSMOCG00000021040 Or1j21 (ENSMOCG00000001660) Or1j1 (ENSMOCG00000010522) Or1n1b (ENSMOCG00000006950) Or1n2 (ENSMOCG00000001876) Ppp6c (ENSMOCG00000002091) #17 Scai (ENSMOCG00000021543) #18 Golga1 (ENSMOCG00000001056) #20 Arpc5l (ENSMOCG00000012044) #21 ENSMOCG00000010619 #22 Wdr38 (ENSMOCG00000016384) #23 Olfml2a (ENSMOCG00000006167) #24 Nr6a1 (ENSMOCG00000013647) #25 ENSMOCG00000000723 Nr5a1 (ENSMOCG00000022516) #26 ENSMOCG00000019583 #28 Nek6 (ENSMOCG00000020840) #29 Lhx2 (ENSMOCG00000018166) #30 ENSMOCG00000005120 #31 ENSMOCG00000020847 #31 Crb2 (ENSMOCG00000017592) #32 Strbp (ENSMOCG00000022231) #33 Gpr21 (ENSMOCG00000019492) Rabgap1 (ENSMOCG00000015881) #34 Zbtb26 (ENSMOCG00000005785) #35 Prairie vole MODERN SPECIES 302 ENSMOCG00000000128 #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 spretus DUPLICATION spretus MODERN SPECIES 6 Shisa8 (MGP_SPRETEiJ_G0020974) Srebf2 (MGP_SPRETEiJ_G0020973) Ccdc134 (MGP_SPRETEiJ_G0020972) Mei1 (MGP_SPRETEiJ_G0020971) 4930407I10Rik (MGP_SPRETEiJ_G0020970) MGP_SPRETEiJ_G0020969 Desi1 (MGP_SPRETEiJ_G0020968) Xrcc6 (MGP_SPRETEiJ_G0020967) Pmm1 (MGP_SPRETEiJ_G0020966) Csdc2 (MGP_SPRETEiJ_G0020965) Polr3h (MGP_SPRETEiJ_G0020964) Aco2 (MGP_SPRETEiJ_G0020963) Phf5a (MGP_SPRETEiJ_G0020962) Tob2 (MGP_SPRETEiJ_G0020961) MGP_SPRETEiJ_G0020960 MGP_SPRETEiJ_G0020959 #22 MGP_SPRETEiJ_G0020958 #22 Tef (MGP_SPRETEiJ_G0020957) Zc3h7b (MGP_SPRETEiJ_G0020956) Rangap1 (MGP_SPRETEiJ_G0020955) Chadl (MGP_SPRETEiJ_G0020954) L3mbtl2 (MGP_SPRETEiJ_G0020953) Ep300 (MGP_SPRETEiJ_G0020952) Rbx1 (MGP_SPRETEiJ_G0020951) Dnajb7 (MGP_SPRETEiJ_G0020950) Xpnpep3 (MGP_SPRETEiJ_G0020949) St13 (MGP_SPRETEiJ_G0020948) Slc25a17 (MGP_SPRETEiJ_G0020947) Mchr1 (MGP_SPRETEiJ_G0020946) Mrtfa (MGP_SPRETEiJ_G0020945) MGP_SPRETEiJ_G0020944 spretus MODERN SPECIES 6 Srebf2 (MGP_SPRETEiJ_G0020973) Ccdc134 (MGP_SPRETEiJ_G0020972) Mei1 (MGP_SPRETEiJ_G0020971) 4930407I10Rik (MGP_SPRETEiJ_G0020970) MGP_SPRETEiJ_G0020969 Desi1 (MGP_SPRETEiJ_G0020968) Xrcc6 (MGP_SPRETEiJ_G0020967) Pmm1 (MGP_SPRETEiJ_G0020966) Csdc2 (MGP_SPRETEiJ_G0020965) Polr3h (MGP_SPRETEiJ_G0020964) Aco2 (MGP_SPRETEiJ_G0020963) Phf5a (MGP_SPRETEiJ_G0020962) Tob2 (MGP_SPRETEiJ_G0020961) MGP_SPRETEiJ_G0020960 MGP_SPRETEiJ_G0020959 #22 MGP_SPRETEiJ_G0020958 #22 Tef (MGP_SPRETEiJ_G0020957) Zc3h7b (MGP_SPRETEiJ_G0020956) Rangap1 (MGP_SPRETEiJ_G0020955) Chadl (MGP_SPRETEiJ_G0020954) L3mbtl2 (MGP_SPRETEiJ_G0020953) Ep300 (MGP_SPRETEiJ_G0020952) Rbx1 (MGP_SPRETEiJ_G0020951) Dnajb7 (MGP_SPRETEiJ_G0020950) Xpnpep3 (MGP_SPRETEiJ_G0020949) St13 (MGP_SPRETEiJ_G0020948) Slc25a17 (MGP_SPRETEiJ_G0020947) Mchr1 (MGP_SPRETEiJ_G0020946) Mrtfa (MGP_SPRETEiJ_G0020945) MGP_SPRETEiJ_G0020944 MGP_SPRETEiJ_G0020943 Steppe mouse MODERN SPECIES 3310 Srgap1 (ENSMSIG00000020811) Kics2 (ENSMSIG00000020776) ENSMSIG00000020773 #22 D930020B18Rik (ENSMSIG00000020731) Xpot (ENSMSIG00000020621) Tbk1 (ENSMSIG00000020585) ENSMSIG00000020582 ENSMSIG00000020569 Gns (ENSMSIG00000020549) Tbc1d30 (ENSMSIG00000020500) Wif1 (ENSMSIG00000020472) Lemd3 (ENSMSIG00000020397) ENSMSIG00000020368 ENSMSIG00000020350 ENSMSIG00000020338 ENSMSIG00000020313 Hmga2 (ENSMSIG00000020285) Llph (ENSMSIG00000020273) Rat MODERN SPECIES 9 Tex51 (ENSRNOG00000061675) Bin1 (ENSRNOG00000012852) Ercc3 (ENSRNOG00000013180) Map3k2 (ENSRNOG00000014089) Proc (ENSRNOG00000014376) Iws1 (ENSRNOG00000014630) Myo7b (ENSRNOG00000015035) Gpr17 (ENSRNOG00000065480) Lims2 (ENSRNOG00000016021) Sft2d3 (ENSRNOG00000016216) Wdr33 (ENSRNOG00000011382) Polr2d (ENSRNOG00000016231) Ammecr1l (ENSRNOG00000016250) Sap130 (ENSRNOG00000016773) Slc25a46 (ENSRNOG00000017091) LOC686074 (ENSRNOG00000030364) #22 Syt4 (ENSRNOG00000017333) Rit2 (ENSRNOG00000017568) Pik3c3 (ENSRNOG00000017840) ENSRNOG00000064251 LOC102547344 (ENSRNOG00000030156) Celf4 (ENSRNOG00000014503) RGD1562608 (ENSRNOG00000029466) Tpgs2 (ENSRNOG00000054118) Fhod3 (ENSRNOG00000027230) Mocos (ENSRNOG00000015113) Elp2 (ENSRNOG00000015301) Slc39a6 (ENSRNOG00000028703) Rprd1a (ENSRNOG00000016036) MGC116121 (ENSRNOG00000015546) AABR07031505.1 (ENSRNOG00000030439) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 739 Rabepk (ENSMAUG00000001453) #16 Fbxw2 (ENSMAUG00000010752) Psmd5 (ENSMAUG00000008700) Cutal (ENSMAUG00000012653) Phf19 (ENSMAUG00000018644) Traf1 (ENSMAUG00000018192) Cwf19l2 (ENSMAUG00000013819) Alkbh8 (ENSMAUG00000022157) ENSMAUG00000011357 ENSMAUG00000022145 ENSMAUG00000021988 Ppp6c (ENSMAUG00000019280) #17 Scai (ENSMAUG00000016374) #18 Golga1 (ENSMAUG00000017375) #20 Arpc5l (ENSMAUG00000020262) #21 ENSMAUG00000001728 #22 Wdr38 (ENSMAUG00000005054) #23 Olfml2a (ENSMAUG00000014419) #24 Nr6a1 (ENSMAUG00000020320) #25 Nr5a1 (ENSMAUG00000011097) #26 Psmb7 (ENSMAUG00000009541) #28 Nek6 (ENSMAUG00000014034) #29 Lhx2 (ENSMAUG00000000473) #30 ENSMAUG00000016980 #31 ENSMAUG00000015217 #31 Crb2 (ENSMAUG00000017538) #32 Strbp (ENSMAUG00000016102) #33 Rabgap1 (ENSMAUG00000014606) #34 Zbtb26 (ENSMAUG00000001114) #35 Zbtb6 (ENSMAUG00000000804) #36 Rc3h2 (ENSMAUG00000003117) #37 Golden Hamster MODERN SPECIES 778 Slc36a4 (ENSMAUG00000001281) Deup1 (ENSMAUG00000001957) Smco4 (ENSMAUG00000000425) Taf1d (ENSMAUG00000002515) 4931406C07Rik (ENSMAUG00000000356) Med17 (ENSMAUG00000000493) Vstm5 (ENSMAUG00000000333) Hephl1 (ENSMAUG00000017278) ENSMAUG00000015499 ENSMAUG00000015032 Izumo1r (ENSMAUG00000018564) Gpr83 (ENSMAUG00000017943) ENSMAUG00000016290 Ankrd49 (ENSMAUG00000014988) 1700012B09Rik (ENSMAUG00000014010) ENSMAUG00000015824 #22 Fut4 (ENSMAUG00000015849) Piwil4 (ENSMAUG00000011382) Amotl1 (ENSMAUG00000012162) Cwc15 (ENSMAUG00000011686) Kdm4d (ENSMAUG00000010975) Endod1 (ENSMAUG00000010649) Sesn3 (ENSMAUG00000009718) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 318 Or1n1 (ENSCGRG00001013478) Or1j21 (ENSCGRG00001013564) Or1j19 (ENSCGRG00001013808) ENSCGRG00001013960 ENSCGRG00001005684 Ptgs1 (ENSCGRG00001012828) Mrrf (ENSCGRG00001014100) Rbm18 (ENSCGRG00001014593) Lhx6 (ENSCGRG00001015355) Morn5 (ENSCGRG00001017200) Ndufa8 (ENSCGRG00001010433) Ttll11 (ENSCGRG00001010972) Scai (ENSCGRG00001011822) #18 Golga1 (ENSCGRG00001013164) #20 Arpc5l (ENSCGRG00001015810) #21 ENSCGRG00001016006 #22 Wdr38 (ENSCGRG00001016663) #23 Olfml2a (ENSCGRG00001016979) #24 Nr6a1 (ENSCGRG00001017242) #25 Nr5a1 (ENSCGRG00001017535) #26 Psmb7 (ENSCGRG00001020058) #28 Nek6 (ENSCGRG00001000656) #29 Lhx2 (ENSCGRG00001001336) #30 Dennd1a (ENSCGRG00001003432) #31 ENSCGRG00001013652 ENSCGRG00001004172 Crb2 (ENSCGRG00001004582) #32 Strbp (ENSCGRG00001006354) #33 Rabgap1 (ENSCGRG00001008620) #34 Zbtb26 (ENSCGRG00001009545) #35 ENSCGRG00001013848 #36 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.f #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.f #22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.f #22 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 2 Ankrd45 (ENSPEMG00000001617) Tex50 (ENSPEMG00000027839) ENSPEMG00000027768 ENSPEMG00000000906 ENSPEMG00000025021 Tnfsf4 (ENSPEMG00000000194) Tnfsf18 (ENSPEMG00000000142) ENSPEMG00000000037 Fasl (ENSPEMG00000018529) Suco (ENSPEMG00000018224) 4930558K02Rik (ENSPEMG00000025431) Pigc (ENSPEMG00000019430) Dnm3 (ENSPEMG00000019627) Mettl13 (ENSPEMG00000019591) Vamp4 (ENSPEMG00000019730) ENSPEMG00000028765 #22 Myoc (ENSPEMG00000007518) Prrc2c (ENSPEMG00000019636) Fmo4 (ENSPEMG00000019385) Fmo1 (ENSPEMG00000019514) Fmo2 (ENSPEMG00000019654) Fmo6 (ENSPEMG00000019873) Fmo3 (ENSPEMG00000020171) Mroh9 (ENSPEMG00000019648) Prrx1 (ENSPEMG00000019719) Gorab (ENSPEMG00000019525) Mettl11b (ENSPEMG00000026229) Kifap3 (ENSPEMG00000020030) Scyl3 (ENSPEMG00000019752) BC055324 (ENSPEMG00000006940) Mettl18 (ENSPEMG00000019435) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.f #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.f #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.f #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.f #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.f #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 149 Rasa4 (ENSMSIG00000011823) Upk3bl (ENSMSIG00000011930) Upk3b (ENSMSIG00000011952) Dtx2 (ENSMSIG00000011974) Zp3 (ENSMSIG00000012053) Ssc4d (ENSMSIG00000012082) Hspb1 (ENSMSIG00000012191) ENSMSIG00000012220 Srrm3 (ENSMSIG00000012244) Mdh2 (ENSMSIG00000012322) Styxl1 (ENSMSIG00000012359) Tmem120a (ENSMSIG00000012392) Por (ENSMSIG00000012432) ENSMSIG00000012471 Rhbdd2 (ENSMSIG00000012475) ENSMSIG00000012490 #22 Ccl24 (ENSMSIG00000012496) ENSMSIG00000012522 Hip1 (ENSMSIG00000012530) Pom121 (ENSMSIG00000012657) Nsun5 (ENSMSIG00000012692) Trim50 (ENSMSIG00000012728) Fkbp6 (ENSMSIG00000012752) Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 18 Ddx25 (ENSRNOG00000012260) Vsig10l2 (ENSRNOG00000055680) Cdon (ENSRNOG00000011789) Rpusd4 (ENSRNOG00000011567) Fam118b (ENSRNOG00000011543) Srpra (ENSRNOG00000010543) Foxred1 (ENSRNOG00000060379) Tirap (ENSRNOG00000021420) ENSRNOG00000069075 Dcps (ENSRNOG00000009850) Kirrel3 (ENSRNOG00000009772) Ets1 (ENSRNOG00000008941) Fli1 (ENSRNOG00000008904) Kcnj1 (ENSRNOG00000059005) Kcnj5 (ENSRNOG00000033796) LOC367050 (ENSRNOG00000027052) #22 Arhgap32 (ENSRNOG00000008709) LOC100362981 (ENSRNOG00000034226) Cct6a-ps7 (ENSRNOG00000069794) Barx2 (ENSRNOG00000008592) ENSRNOG00000063771 ENSRNOG00000068702 Tmem45b (ENSRNOG00000008515) Nfrkb (ENSRNOG00000008278) RGD1563958 (ENSRNOG00000028869) Prdm10 (ENSRNOG00000007853) Aplp2 (ENSRNOG00000047179) St14 (ENSRNOG00000005903) Zbtb44 (ENSRNOG00000005578) Adamts8 (ENSRNOG00000005574) Adamts15 (ENSRNOG00000009892) Rat MODERN SPECIES 46 Smptb (ENSRNOG00000066859) ENSRNOG00000067767 LOC120099275 (ENSRNOG00000030417) LOC302576 (ENSRNOG00000066885) Mycs (ENSRNOG00000003085) ENSRNOG00000063942 ENSRNOG00000069398 RGD1565862 (ENSRNOG00000068201) Spin2b (ENSRNOG00000062360) ENSRNOG00000068286 Spin2a (ENSRNOG00000031286) LOC102551133 (ENSRNOG00000063966) LOC681355 (ENSRNOG00000069375) Ubqln2 (ENSRNOG00000003099) Klf8 (ENSRNOG00000065004) Rpl35-ps8 (ENSRNOG00000003158) #22 RragB (ENSRNOG00000062421) Foxr2 (ENSRNOG00000030619) Mageh1 (ENSRNOG00000003178) Usp51 (ENSRNOG00000021434) LOC102546830 (ENSRNOG00000059783) Rpgr-ps1 (ENSRNOG00000062329) ENSRNOG00000070642 Fam104b (ENSRNOG00000049908) Alas2 (ENSRNOG00000000167) Apex2 (ENSRNOG00000000166) Pfkfb1 (ENSRNOG00000000165) Tro (ENSRNOG00000067844) AABR07037520.1 (ENSRNOG00000047491) Maged2 (ENSRNOG00000002449) Itih6-ps1 (ENSRNOG00000069211) Rat MODERN SPECIES 18 Ccnb2 (ENSRNOG00000063216) Rnf111 (ENSRNOG00000060750) Sltm (ENSRNOG00000054446) Mindy2 (ENSRNOG00000061337) AABR07070609.1 (ENSRNOG00000061240) Adam10 (ENSRNOG00000054257) Lipc (ENSRNOG00000060338) AABR07038881.1 (ENSRNOG00000038181) ENSRNOG00000070532 Aqp9 (ENSRNOG00000061883) Aldh1a2 (ENSRNOG00000055049) Polr2m (ENSRNOG00000057676) Cgnl1 (ENSRNOG00000054080) Tcf12 (ENSRNOG00000057754) Zfp280d (ENSRNOG00000055631) ENSRNOG00000070052 #22 Mns1 (ENSRNOG00000057867) Tex9 (ENSRNOG00000059702) Rfx7 (ENSRNOG00000060367) Nedd4 (ENSRNOG00000058898) AABR07070669.1 (ENSRNOG00000056409) ENSRNOG00000064605 Prtg (ENSRNOG00000055251) Pygo1 (ENSRNOG00000066086) Dnaaf4 (ENSRNOG00000056654) Pierce2 (ENSRNOG00000052869) Ccpg1 (ENSRNOG00000053428) Pigb (ENSRNOG00000059622) Pigbos1 (ENSRNOG00000067122) Rab27a (ENSRNOG00000052499) Khdc3 (ENSRNOG00000054460) Rat MODERN SPECIES 13 Orc4 (ENSRNOG00000005021) Acvr2a (ENSRNOG00000005334) ENSRNOG00000062624 ENSRNOG00000067798 Zeb2 (ENSRNOG00000004677) Gtdc1 (ENSRNOG00000031038) Arhgap15 (ENSRNOG00000031168) Kynu (ENSRNOG00000029993) Lrp1b (ENSRNOG00000030243) LOC100362366 (ENSRNOG00000028690) AABR07051831.1 (ENSRNOG00000015854) Ppp6c (ENSRNOG00000015145) #17 Scai (ENSRNOG00000025278) #18 Golga1 (ENSRNOG00000014493) #20 Arpc5l (ENSRNOG00000014317) #21 Rpl35 (ENSRNOG00000014272) #22 Wdr38 (ENSRNOG00000014102) #23 Olfml2a (ENSRNOG00000014034) #24 Nr6a1 (ENSRNOG00000013232) #25 Nr5a1 (ENSRNOG00000012682) #26 Rps20 (ENSRNOG00000029627) ENSRNOG00000066446 Psmb7 (ENSRNOG00000011732) #28 Nek6 (ENSRNOG00000010897) #29 Lhx2 (ENSRNOG00000010551) #30 Dennd1a (ENSRNOG00000010526) #31 Crb2 (ENSRNOG00000025498) #32 RGD1561137 (ENSRNOG00000030143) Strbp (ENSRNOG00000010150) #33 Gpr21 (ENSRNOG00000042269) Rabgap1 (ENSRNOG00000009402) #34 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 Pika MODERN SPECIES 4096 SCAI (ENSOPRG00000000422) #18 GOLGA1 (ENSOPRG00000000411) #20 ENSOPRG00000000409 #21 RPL35 (ENSOPRG00000000406) #22 WDR38 (ENSOPRG00000000401) #23 OLFML2A (ENSOPRG00000000397) #24 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 432 RALGPS1 (ENSOCUG00000007683) ANGPTL2 (ENSOCUG00000007685) ZBTB34 (ENSOCUG00000025964) #7 ZBTB43 (ENSOCUG00000009799) #8 ENSOCUG00000023786 #9 MVB12B (ENSOCUG00000014336) #11 PBX3 (ENSOCUG00000012302) #12 MAPKAP1 (ENSOCUG00000001574) #13 GAPVD1 (ENSOCUG00000003136) #14 HSPA5 (ENSOCUG00000011636) #15 RABEPK (ENSOCUG00000016229) #16 PPP6C (ENSOCUG00000009375) #17 SCAI (ENSOCUG00000012963) #18 GOLGA1 (ENSOCUG00000003976) #20 ARPC5L (ENSOCUG00000002997) #21 ENSOCUG00000002996 #22 WDR38 (ENSOCUG00000002992) #23 OLFML2A (ENSOCUG00000002473) #24 ENSOCUG00000036292 NR6A1 (ENSOCUG00000007599) #25 NR5A1 (ENSOCUG00000007848) #26 ADGRD2 (ENSOCUG00000006271) #27 PSMB7 (ENSOCUG00000009114) #28 ENSOCUG00000009108 #29 LHX2 (ENSOCUG00000007757) #30 DENND1A (ENSOCUG00000005351) #31 ENSOCUG00000037812 ENSOCUG00000031599 STRBP (ENSOCUG00000009397) #33 RABGAP1 (ENSOCUG00000009382) #34 ZBTB26 (ENSOCUG00000008815) #35 Rabbit MODERN SPECIES 20 MAPK4 (ENSOCUG00000013016) SKA1 (ENSOCUG00000007927) CXXC1 (ENSOCUG00000025756) MBD1 (ENSOCUG00000006554) ENSOCUG00000017123 ENSOCUG00000037569 MYO5B (ENSOCUG00000009547) ACAA2 (ENSOCUG00000016540) LIPG (ENSOCUG00000013471) ENSOCUG00000012485 ENSOCUG00000027094 ENSOCUG00000038051 DYM (ENSOCUG00000015851) SMAD7 (ENSOCUG00000024309) CTIF (ENSOCUG00000024842) ENSOCUG00000026631 #22 ZBTB7C (ENSOCUG00000022348) SMAD2 (ENSOCUG00000011290) ENSOCUG00000027573 IER3IP1 (ENSOCUG00000012555) HDHD2 (ENSOCUG00000006979) ENSOCUG00000035984 ENSOCUG00000006940 KATNAL2 (ENSOCUG00000006971) PIAS2 (ENSOCUG00000006900) ENSOCUG00000033989 RNF165 (ENSOCUG00000011801) C18orf25 (ENSOCUG00000009573) HAUS1 (ENSOCUG00000017483) ENSOCUG00000003967 PSTPIP2 (ENSOCUG00000000324) Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 11 SIX2 (ENSOCUG00000027205) CAMKMT (ENSOCUG00000005476) PREPL (ENSOCUG00000005471) SLC3A1 (ENSOCUG00000005464) PPM1B (ENSOCUG00000005461) LRPPRC (ENSOCUG00000015046) ENSOCUG00000037787 ABCG8 (ENSOCUG00000015038) ABCG5 (ENSOCUG00000005300) DYNC2LI1 (ENSOCUG00000005293) PLEKHH2 (ENSOCUG00000024266) THADA (ENSOCUG00000001048) ZFP36L2 (ENSOCUG00000029169) HAAO (ENSOCUG00000015827) MTA3 (ENSOCUG00000012310) ENSOCUG00000027683 #22 KCNG3 (ENSOCUG00000002674) ENSOCUG00000027189 EML4 (ENSOCUG00000015526) PKDCC (ENSOCUG00000002998) ENSOCUG00000038990 SLC8A1 (ENSOCUG00000010854) ENSOCUG00000030843 ENSOCUG00000029945 THUMPD2 (ENSOCUG00000003257) TMEM178A (ENSOCUG00000009872) MAP4K3 (ENSOCUG00000016679) CDKL4 (ENSOCUG00000001117) SOS1 (ENSOCUG00000007844) ARHGEF33 (ENSOCUG00000025920) ENSOCUG00000001075 Rabbit MODERN SPECIES 8 FEM1B (ENSOCUG00000026586) CLN6 (ENSOCUG00000017533) PIAS1 (ENSOCUG00000000618) MAP2K5 (ENSOCUG00000009024) IQCH (ENSOCUG00000006647) AAGAB (ENSOCUG00000006644) ENSOCUG00000039204 SMAD3 (ENSOCUG00000029601) ENSOCUG00000014186 ENSOCUG00000006134 LCTL (ENSOCUG00000021771) ZWILCH (ENSOCUG00000008800) ENSOCUG00000008794 SNAPC5 (ENSOCUG00000039231) MAP2K1 (ENSOCUG00000008782) ENSOCUG00000023060 #22 TIPIN (ENSOCUG00000002212) DIS3L (ENSOCUG00000002206) MEGF11 (ENSOCUG00000014760) RAB11A (ENSOCUG00000014755) DENND4A (ENSOCUG00000007953) ENSOCUG00000027844 INTS14 (ENSOCUG00000007520) HACD3 (ENSOCUG00000007513) DPP8 (ENSOCUG00000011751) IGDCC4 (ENSOCUG00000000312) IGDCC3 (ENSOCUG00000000310) PARP16 (ENSOCUG00000007306) CILP (ENSOCUG00000007302) CLPX (ENSOCUG00000007293) PDCD7 (ENSOCUG00000007292)