Mammalia ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000163762.b ENSGT00940000164541 ENSGT00940000160293 ENSGT00390000002471 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384 #22 ENSGT00940000172233 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Theria ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000163762.b ENSGT00940000164541 ENSGT00940000160293 ENSGT00390000002471 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384 #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160997 ENSGT00940000155371 ENSGT00940000154993 ENSGT00940000161821 ENSGT00940000154723.b ENSGT00940000162353 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 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ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00940000163762.b ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Primates DUPLICATION Primates DUPLICATION Primates ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155946 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642.g.a #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT01030000234866 #10 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642.g.a #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Mouse lemur MODERN SPECIES 1 ZBTB34 (ENSMICG00000036866) #7 ZBTB43 (ENSMICG00000047892) #8 LMX1B (ENSMICG00000010287) #9 ENSMICG00000037534 #10 MVB12B (ENSMICG00000010281) #11 PBX3 (ENSMICG00000036972) #12 MAPKAP1 (ENSMICG00000002956) #13 GAPVD1 (ENSMICG00000002953) #14 HSPA5 (ENSMICG00000002950) #15 RABEPK (ENSMICG00000029186) #16 PPP6C (ENSMICG00000030309) #17 SCAI (ENSMICG00000002936) #18 ENSMICG00000002934 #19 GOLGA1 (ENSMICG00000002928) #20 ARPC5L (ENSMICG00000002925) #21 RPL35 (ENSMICG00000002922) #22 WDR38 (ENSMICG00000038127) #23 OLFML2A (ENSMICG00000002915) #24 NR6A1 (ENSMICG00000002911) #25 NR5A1 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MAPKAP1 (ENSRBIG00000044095) #13 GAPVD1 (ENSRBIG00000042745) #14 HSPA5 (ENSRBIG00000044773) #15 RABEPK (ENSRBIG00000023800) #16 PPP6C (ENSRBIG00000044351) #17 ENSRBIG00000036429 SCAI (ENSRBIG00000026974) #18 GOLGA1 (ENSRBIG00000026783) #20 ARPC5L (ENSRBIG00000042947) #21 RPL35 (ENSRBIG00000036679) #22 WDR38 (ENSRBIG00000042146) #23 OLFML2A (ENSRBIG00000029375) #24 NR6A1 (ENSRBIG00000034563) #25 NR5A1 (ENSRBIG00000034857) #26 ADGRD2 (ENSRBIG00000002924) #27 PSMB7 (ENSRBIG00000024252) #28 NEK6 (ENSRBIG00000032831) #29 ENSRBIG00000042581 LHX2 (ENSRBIG00000035554) #30 DENND1A (ENSRBIG00000022086) #31 CRB2 (ENSRBIG00000040048) #32 ENSRBIG00000040405 STRBP (ENSRBIG00000044535) #33 ENSRBIG00000006154 RABGAP1 (ENSRBIG00000034532) #34 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Vervet Monkey MODERN SPECIES 17 TEDDM1 (ENSCSAG00000000242) RGSL1 (ENSCSAG00000012503) RNASEL (ENSCSAG00000012514) RGS16 (ENSCSAG00000012520) RGS8 (ENSCSAG00000012525) NPL (ENSCSAG00000012535) DHX9 (ENSCSAG00000012549) SHCBP1L (ENSCSAG00000012580) LAMC1 (ENSCSAG00000012606) LAMC2 (ENSCSAG00000012624) NMNAT2 (ENSCSAG00000012635) SMG7 (ENSCSAG00000012654) NCF2 (ENSCSAG00000012663) ARPC5 (ENSCSAG00000012676) APOBEC4 (ENSCSAG00000000243) 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ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Rhesus MODERN SPECIES 11 CPNE9 (ENSMMUG00000006115) MTMR14 (ENSMMUG00000007808) LHFPL4 (ENSMMUG00000063958) ENSMMUG00000055011 SETD5 (ENSMMUG00000003943) THUMPD3 (ENSMMUG00000017307) SRGAP3 (ENSMMUG00000020014) RAD18 (ENSMMUG00000020013) ENSMMUG00000060249 OXTR (ENSMMUG00000009703) CAV3 (ENSMMUG00000053020) SSUH2 (ENSMMUG00000009699) LMCD1 (ENSMMUG00000001814) ENSMMUG00000062010 GRM7 (ENSMMUG00000011231) ENSMMUG00000031947 #22 ENSMMUG00000057502 ENSMMUG00000065004 EDEM1 (ENSMMUG00000065088) ARL8B (ENSMMUG00000008810) BHLHE40 (ENSMMUG00000056699) ITPR1 (ENSMMUG00000012574) SUMF1 (ENSMMUG00000004734) SETMAR (ENSMMUG00000017828) LRRN1 (ENSMMUG00000049373) CRBN (ENSMMUG00000017986) TRNT1 (ENSMMUG00000017983) IL5RA (ENSMMUG00000001849) CNTN4 (ENSMMUG00000001847) ENSMMUG00000056158 ENSMMUG00000009425 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 540 SPIN4 (ENSMNEG00000005547) ENSMNEG00000035460 ARHGEF9 (ENSMNEG00000002090) AMER1 (ENSMNEG00000031267) ASB12 (ENSMNEG00000034040) MTMR8 (ENSMNEG00000031573) ZC4H2 (ENSMNEG00000044839) ENSMNEG00000023794 #22 ZC3H12B (ENSMNEG00000043003) LAS1L (ENSMNEG00000039412) MSN (ENSMNEG00000041403) ENSMNEG00000039922 VSIG4 (ENSMNEG00000033230) ENSMNEG00000045354 ENSMNEG00000037421 HEPH (ENSMNEG00000042841) ENSMNEG00000042166 EDA2R (ENSMNEG00000026933) AR (ENSMNEG00000029492) ENSMNEG00000038110 ENSMNEG00000027991 ENSMNEG00000031590 OPHN1 (ENSMNEG00000031303) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Olive baboon MODERN SPECIES 4 RALGPS1 (ENSPANG00000024825) ZBTB43 (ENSPANG00000000295) #8 LMX1B (ENSPANG00000024818) #9 MVB12B (ENSPANG00000049397) #11 ENSPANG00000050841 PBX3 (ENSPANG00000024812) #12 ENSPANG00000051227 MAPKAP1 (ENSPANG00000024814) #13 GAPVD1 (ENSPANG00000024816) #14 HSPA5 (ENSPANG00000024811) #15 ENSPANG00000024810 #16 PPP6C (ENSPANG00000024802) #17 SCAI (ENSPANG00000011266) #18 GOLGA1 (ENSPANG00000017415) #20 ARPC5L (ENSPANG00000044193) #21 RPL35 (ENSPANG00000032631) #22 WDR38 (ENSPANG00000007029) #23 OLFML2A (ENSPANG00000025860) #24 NR6A1 (ENSPANG00000025861) #25 NR5A1 (ENSPANG00000025862) #26 ADGRD2 (ENSPANG00000025863) #27 NEK6 (ENSPANG00000025854) #29 PSMB7 (ENSPANG00000025855) #28 LHX2 (ENSPANG00000025852) #30 DENND1A (ENSPANG00000025853) #31 CRB2 (ENSPANG00000025851) #32 STRBP (ENSPANG00000025850) #33 RABGAP1 (ENSPANG00000025838) #34 ZBTB26 (ENSPANG00000025839) #35 ZBTB6 (ENSPANG00000016323) #36 RC3H2 (ENSPANG00000025840) #37 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Sooty mangabey MODERN SPECIES 489 ZBTB34 (ENSCATG00000018802) #7 LMX1B (ENSCATG00000026158) #9 MVB12B (ENSCATG00000012830) #11 ENSCATG00000044919 PBX3 (ENSCATG00000044996) #12 MAPKAP1 (ENSCATG00000001243) #13 GAPVD1 (ENSCATG00000029396) #14 HSPA5 (ENSCATG00000044680) #15 RABEPK (ENSCATG00000042136) #16 PPP6C (ENSCATG00000031273) #17 ENSCATG00000029331 SCAI (ENSCATG00000011189) #18 GOLGA1 (ENSCATG00000044682) #20 ENSCATG00000034300 ARPC5L (ENSCATG00000037319) #21 RPL35 (ENSCATG00000020241) #22 WDR38 (ENSCATG00000041965) #23 OLFML2A (ENSCATG00000026827) #24 NR6A1 (ENSCATG00000030436) #25 NR5A1 (ENSCATG00000032967) #26 ADGRD2 (ENSCATG00000044429) #27 PSMB7 (ENSCATG00000033885) #28 NEK6 (ENSCATG00000044368) #29 ENSCATG00000044723 LHX2 (ENSCATG00000018508) #30 DENND1A (ENSCATG00000034371) #31 CRB2 (ENSCATG00000033470) #32 ENSCATG00000043981 STRBP (ENSCATG00000038868) #33 ENSCATG00000037945 RABGAP1 (ENSCATG00000012197) #34 Drill MODERN SPECIES 986 MVB12B (ENSMLEG00000032595) #11 PBX3 (ENSMLEG00000041125) #12 MAPKAP1 (ENSMLEG00000043978) #13 GAPVD1 (ENSMLEG00000037587) #14 HSPA5 (ENSMLEG00000035604) #15 RABEPK (ENSMLEG00000035953) #16 ENSMLEG00000037267 PPP6C (ENSMLEG00000031102) #17 ENSMLEG00000010445 SCAI (ENSMLEG00000037841) #18 GOLGA1 (ENSMLEG00000040538) #20 ARPC5L (ENSMLEG00000032105) #21 RPL35 (ENSMLEG00000034655) #22 WDR38 (ENSMLEG00000044214) #23 OLFML2A (ENSMLEG00000042186) #24 NR6A1 (ENSMLEG00000033021) #25 NR5A1 (ENSMLEG00000030657) #26 ADGRD2 (ENSMLEG00000031066) #27 PSMB7 (ENSMLEG00000034459) #28 NEK6 (ENSMLEG00000034890) #29 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Gibbon MODERN SPECIES 11 ENSNLEG00000033349 SEMA6A (ENSNLEG00000011779) ENSNLEG00000035368 ENSNLEG00000031042 ENSNLEG00000030536 DTWD2 (ENSNLEG00000011825) DMXL1 (ENSNLEG00000011838) TNFAIP8 (ENSNLEG00000011925) HSD17B4 (ENSNLEG00000011926) FAM170A (ENSNLEG00000011943) ENSNLEG00000034199 PRR16 (ENSNLEG00000011947) ENSNLEG00000031918 ENSNLEG00000027706 FTMT (ENSNLEG00000018895) ENSNLEG00000032909 #22 SRFBP1 (ENSNLEG00000011949) LOX (ENSNLEG00000011966) ENSNLEG00000011997 SNCAIP (ENSNLEG00000011998) ENSNLEG00000029668 ENSNLEG00000031106 SNX24 (ENSNLEG00000012059) PPIC (ENSNLEG00000012061) PRDM6 (ENSNLEG00000012064) CEP120 (ENSNLEG00000012069) CSNK1G3 (ENSNLEG00000012089) ZNF608 (ENSNLEG00000012117) ENSNLEG00000028602 GRAMD2B (ENSNLEG00000012129) ALDH7A1 (ENSNLEG00000012180) Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.b #22 Human MODERN SPECIES 21 ANGPTL2 (ENSG00000136859) RALGPS1 (ENSG00000136828) ZBTB34 (ENSG00000177125) #7 ZBTB43 (ENSG00000169155) #8 LMX1B (ENSG00000136944) #9 MVB12B (ENSG00000196814) #11 PBX3 (ENSG00000167081) #12 MAPKAP1 (ENSG00000119487) #13 GAPVD1 (ENSG00000165219) #14 HSPA5 (ENSG00000044574) #15 RABEPK (ENSG00000136933) #16 PPP6C (ENSG00000119414) #17 SCAI (ENSG00000173611) #18 GOLGA1 (ENSG00000136935) #20 ARPC5L (ENSG00000136950) #21 RPL35 (ENSG00000136942) #22 WDR38 (ENSG00000136918) #23 OLFML2A (ENSG00000185585) #24 NR6A1 (ENSG00000148200) #25 NR5A1 (ENSG00000136931) #26 ADGRD2 (ENSG00000180264) #27 PSMB7 (ENSG00000136930) #28 NEK6 (ENSG00000119408) #29 LHX2 (ENSG00000106689) #30 DENND1A (ENSG00000119522) #31 CRB2 (ENSG00000148204) #32 STRBP (ENSG00000165209) #33 GPR21 (ENSG00000188394) RABGAP1 (ENSG00000011454) #34 ZBTB26 (ENSG00000171448) #35 ZBTB6 (ENSG00000186130) #36 Orangutan MODERN SPECIES 22 ANGPTL2 (ENSPPYG00000019618) RALGPS1 (ENSPPYG00000019617) ZBTB34 (ENSPPYG00000019616) #7 ZBTB43 (ENSPPYG00000019615) #8 LMX1B (ENSPPYG00000035802) #9 MVB12B (ENSPPYG00000019613) #11 PBX3 (ENSPPYG00000019612) #12 MAPKAP1 (ENSPPYG00000019611) #13 GAPVD1 (ENSPPYG00000019610) #14 HSPA5 (ENSPPYG00000019609) #15 RABEPK (ENSPPYG00000019608) #16 PPP6C (ENSPPYG00000019607) #17 SCAI (ENSPPYG00000019606) #18 GOLGA1 (ENSPPYG00000019605) #20 ARPC5L (ENSPPYG00000019604) #21 RPL35 (ENSPPYG00000019603) #22 WDR38 (ENSPPYG00000019602) #23 OLFML2A (ENSPPYG00000019601) #24 NR6A1 (ENSPPYG00000019600) #25 NR5A1 (ENSPPYG00000019599) #26 ADGRD2 (ENSPPYG00000019598) #27 PSMB7 (ENSPPYG00000019596) #28 NEK6 (ENSPPYG00000019594) #29 LHX2 (ENSPPYG00000019593) #30 DENND1A (ENSPPYG00000019592) #31 CRB2 (ENSPPYG00000019880) #32 STRBP (ENSPPYG00000019589) #33 ENSPPYG00000031287 RABGAP1 (ENSPPYG00000019586) #34 ZBTB26 (ENSPPYG00000037988) #35 ZBTB6 (ENSPPYG00000030463) #36 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000167867 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000167867 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000167867 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000007883 ENSGT00730000111142 ENSGT00390000011475 ENSGT00940000155122.a ENSGT00940000155165.a ENSGT00390000007237 ENSGT00940000162236 ENSGT00390000008994 ENSGT00390000018074 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000002172.B ENSGT00390000013370 ENSGT00390000004147 ENSGT00390000016384.f.i.a.a ##22 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a ENSGT00940000158903 ENSGT00390000007848.b ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d ENSGT00940000154717 ENSGT00390000012719.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000161828 ENSGT01020000230351.D.b ENSGT01020000230351.D.a.a.b.l ENSGT00510000046406.f.a.b ENSGT00390000010771 ENSGT00940000153818.a.a Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2521 LRRC43 (ENSRBIG00000043574) IL31 (ENSRBIG00000040252) MLXIP (ENSRBIG00000020678) CFAP251 (ENSRBIG00000037496) PSMD9 (ENSRBIG00000040944) ENSRBIG00000006404 ##22 HPD (ENSRBIG00000033579) SETD1B (ENSRBIG00000034516) RHOF (ENSRBIG00000042834) TMEM120B (ENSRBIG00000040025) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1385 ENSRROG00000032502 KNTC1 (ENSRROG00000035417) RSRC2 (ENSRROG00000035154) ZCCHC8 (ENSRROG00000030441) CLIP1 (ENSRROG00000034853) ENSRROG00000024193 DIABLO (ENSRROG00000032357) B3GNT4 (ENSRROG00000043829) LRRC43 (ENSRROG00000033440) IL31 (ENSRROG00000033370) MLXIP (ENSRROG00000040708) BCL7A (ENSRROG00000009008) CFAP251 (ENSRROG00000043740) ENSRROG00000044846 PSMD9 (ENSRROG00000042445) ENSRROG00000004163 ##22 HPD (ENSRROG00000032476) SETD1B (ENSRROG00000011844) RHOF (ENSRROG00000023702) TMEM120B (ENSRROG00000011126) MORN3 (ENSRROG00000037539) ORAI1 (ENSRROG00000009142) KDM2B (ENSRROG00000044761) RNF34 (ENSRROG00000040453) ANAPC5 (ENSRROG00000033275) CAMKK2 (ENSRROG00000044900) P2RX4 (ENSRROG00000041741) P2RX7 (ENSRROG00000007262) ENSRROG00000043416 OASL (ENSRROG00000035890) C12orf43 (ENSRROG00000030517) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.b #22 ENSGT00390000016384.f.i.a.b ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000153288.a.b.a.b.l.a ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261.g #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00910000147294 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1251 ZBTB43 (ENSRROG00000024398) #8 LMX1B (ENSRROG00000035482) #9 MVB12B (ENSRROG00000027519) #11 PBX3 (ENSRROG00000045788) #12 MAPKAP1 (ENSRROG00000023703) #13 ENSRROG00000030764 GAPVD1 (ENSRROG00000032873) #14 HSPA5 (ENSRROG00000028741) #15 RABEPK (ENSRROG00000014112) #16 ENSRROG00000031506 ENSRROG00000032403 PPP6C (ENSRROG00000031327) #17 SCAI (ENSRROG00000042786) #18 GOLGA1 (ENSRROG00000029321) #20 ARPC5L (ENSRROG00000041093) #21 ENSRROG00000041830 ##22 WDR38 (ENSRROG00000036886) #23 OLFML2A (ENSRROG00000035091) #24 ENSRROG00000044077 NR6A1 (ENSRROG00000030167) #25 NR5A1 (ENSRROG00000044475) #26 ADGRD2 (ENSRROG00000034601) #27 PSMB7 (ENSRROG00000043335) #28 NEK6 (ENSRROG00000040996) #29 ENSRROG00000045603 LHX2 (ENSRROG00000037178) #30 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 474 SLC5A4 (ENSCATG00000040639) ENSCATG00000043014 RTCB (ENSCATG00000033424) FBXO7 (ENSCATG00000039724) BPIFC (ENSCATG00000032658) SYN3 (ENSCATG00000044956) TIMP3 (ENSCATG00000042645) ENSCATG00000041580 LARGE1 (ENSCATG00000044223) ENSCATG00000000038 ISX (ENSCATG00000029244) HMGXB4 (ENSCATG00000033136) TOM1 (ENSCATG00000031195) HMOX1 (ENSCATG00000044656) MCM5 (ENSCATG00000043913) ENSCATG00000017285 ##22 RASD2 (ENSCATG00000030322) MB (ENSCATG00000041983) ENSCATG00000034942 APOL6 (ENSCATG00000035231) APOL5 (ENSCATG00000039209) RBFOX2 (ENSCATG00000038655) ENSCATG00000032033 APOL4 (ENSCATG00000038892) APOL2 (ENSCATG00000042649) APOL1 (ENSCATG00000037560) MYH9 (ENSCATG00000030452) TXN2 (ENSCATG00000040632) FOXRED2 (ENSCATG00000041844) EIF3D (ENSCATG00000045003) CACNG2 (ENSCATG00000034369) Sooty mangabey MODERN SPECIES 570 GAD1 (ENSCATG00000021159) ENSCATG00000021621 SP5 (ENSCATG00000041697) MYO3B (ENSCATG00000039840) UBR3 (ENSCATG00000016590) METTL5 (ENSCATG00000030294) SSB (ENSCATG00000036701) KLHL23 (ENSCATG00000031017) PHOSPHO2 (ENSCATG00000003608) CFAP210 (ENSCATG00000035489) PPIG (ENSCATG00000032109) FASTKD1 (ENSCATG00000031285) KLHL41 (ENSCATG00000034135) BBS5 (ENSCATG00000031242) LRP2 (ENSCATG00000041163) ENSCATG00000003335 ##22 DHRS9 (ENSCATG00000044301) ABCB11 (ENSCATG00000030168) SPC25 (ENSCATG00000030113) NOSTRIN (ENSCATG00000033960) CERS6 (ENSCATG00000021693) Macaca ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961.j #17 ENSGT00950000182803.B.d.a.i.b ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00860000136276 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT01100000263539.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00910000147509 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787.y #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961.j #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT01100000263577.a.a.b.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Rhesus MODERN SPECIES 6 LMX1B (ENSMMUG00000002236) #9 ENSMMUG00000053490 MVB12B (ENSMMUG00000000871) #11 PBX3 (ENSMMUG00000013763) #12 ENSMMUG00000049448 MAPKAP1 (ENSMMUG00000016826) #13 ENSMMUG00000053791 GAPVD1 (ENSMMUG00000003668) #14 HSPA5 (ENSMMUG00000005217) #15 RABEPK (ENSMMUG00000005215) #16 PPP6C (ENSMMUG00000020549) #17 SCAI (ENSMMUG00000020633) #18 ENSMMUG00000064277 GOLGA1 (ENSMMUG00000020631) #20 ARPC5L (ENSMMUG00000043892) #21 RPL35 (ENSMMUG00000005260) ##22 WDR38 (ENSMMUG00000005259) #23 ENSMMUG00000061871 OLFML2A (ENSMMUG00000011183) #24 NR6A1 (ENSMMUG00000011185) #25 NR5A1 (ENSMMUG00000014111) #26 ADGRD2 (ENSMMUG00000014110) #27 PSMB7 (ENSMMUG00000060033) #28 NEK6 (ENSMMUG00000007354) #29 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ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763.n #16 ENSGT00940000158763.m #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763.n #16 ENSGT00940000158763.m #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00390000005811.w.b ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Capuchin MODERN SPECIES 206 ENSCCAG00000028456 TMEM215 (ENSCCAG00000004298) APTX (ENSCCAG00000036783) ENSCCAG00000034216 SMU1 (ENSCCAG00000025287) B4GALT1 (ENSCCAG00000009730) SPINK4 (ENSCCAG00000028805) ENSCCAG00000026996 CHMP5 (ENSCCAG00000027032) SCAI (ENSCCAG00000031567) #18 ENSCCAG00000018226 ENSCCAG00000034325 GOLGA1 (ENSCCAG00000025942) #20 ENSCCAG00000032926 ENSCCAG00000003039 #21 ENSCCAG00000026875 ##22 WDR38 (ENSCCAG00000024912) #23 OLFML2A (ENSCCAG00000023075) #24 NR6A1 (ENSCCAG00000024096) #25 NR5A1 (ENSCCAG00000024659) #26 ADGRD2 (ENSCCAG00000033790) #27 PSMB7 (ENSCCAG00000025367) #28 NEK6 (ENSCCAG00000019309) #29 LHX2 (ENSCCAG00000022112) #30 DENND1A (ENSCCAG00000020125) #31 CRB2 (ENSCCAG00000033115) #32 STRBP (ENSCCAG00000027357) #33 RABGAP1 (ENSCCAG00000024911) #34 ENSCCAG00000033724 ZBTB26 (ENSCCAG00000003111) #35 ZBTB6 (ENSCCAG00000020024) #36 Marmoset MODERN SPECIES LMX1B (ENSCJAG00000072150) #9 MVB12B (ENSCJAG00000042322) #11 ENSCJAG00000070779 PBX3 (ENSCJAG00000007020) #12 MAPKAP1 (ENSCJAG00000006963) #13 GAPVD1 (ENSCJAG00000006913) #14 HSPA5 (ENSCJAG00000006880) #15 ENSCJAG00000052894 RABEPK (ENSCJAG00000006849) #16 PPP6C (ENSCJAG00000006827) #17 ENSCJAG00000082314 ENSCJAG00000077976 SCAI (ENSCJAG00000006789) #18 GOLGA1 (ENSCJAG00000006745) #20 ENSCJAG00000006730 #21 ENSCJAG00000006724 ##22 WDR38 (ENSCJAG00000006695) #23 ENSCJAG00000077082 OLFML2A (ENSCJAG00000006668) #24 ENSCJAG00000078726 NR6A1 (ENSCJAG00000006631) #25 NR5A1 (ENSCJAG00000006624) #26 ADGRD2 (ENSCJAG00000040439) #27 PSMB7 (ENSCJAG00000006541) #28 NEK6 (ENSCJAG00000006507) #29 LHX2 (ENSCJAG00000006496) #30 ENSCJAG00000085719 DENND1A (ENSCJAG00000006461) #31 CRB2 (ENSCJAG00000006432) #32 STRBP (ENSCJAG00000019997) #33 RABGAP1 (ENSCJAG00000020027) #34 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.i.a ##22 Bushbaby MODERN SPECIES 129 RALGPS1 (ENSOGAG00000003986) ZBTB34 (ENSOGAG00000007730) #7 ZBTB43 (ENSOGAG00000002029) #8 LMX1B (ENSOGAG00000001158) #9 MVB12B (ENSOGAG00000008766) #11 PBX3 (ENSOGAG00000031460) #12 MAPKAP1 (ENSOGAG00000008854) #13 ENSOGAG00000029276 #14 ENSOGAG00000008849 #14 HSPA5 (ENSOGAG00000006786) #15 RABEPK (ENSOGAG00000027730) #16 PPP6C (ENSOGAG00000025294) #17 SCAI (ENSOGAG00000008529) #18 GOLGA1 (ENSOGAG00000008519) #20 ARPC5L (ENSOGAG00000030099) #21 ENSOGAG00000008513 ##22 WDR38 (ENSOGAG00000008507) #23 OLFML2A (ENSOGAG00000008504) #24 NR6A1 (ENSOGAG00000030677) #25 NR5A1 (ENSOGAG00000017023) #26 ADGRD2 (ENSOGAG00000003517) #27 PSMB7 (ENSOGAG00000003513) #28 NEK6 (ENSOGAG00000003510) #29 LHX2 (ENSOGAG00000003505) #30 ENSOGAG00000024358 DENND1A (ENSOGAG00000013851) #31 CRB2 (ENSOGAG00000031205) #32 STRBP (ENSOGAG00000014739) #33 RABGAP1 (ENSOGAG00000014722) #34 ZBTB26 (ENSOGAG00000010685) #35 ZBTB6 (ENSOGAG00000010682) #36 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 644 ENSPSMG00000004305 PTPRD (ENSPSMG00000002973) DMAC1 (ENSPSMG00000002164) KDM4C (ENSPSMG00000002067) ENSPSMG00000001956 ##22 GLDC (ENSPSMG00000001778) UHRF2 (ENSPSMG00000001619) TPD52L3 (ENSPSMG00000001557) IL33 (ENSPSMG00000001541) Mouse lemur MODERN SPECIES 5 ENSMICG00000017765 RNF144B (ENSMICG00000015478) DEK (ENSMICG00000015469) KDM1B (ENSMICG00000015441) TPMT (ENSMICG00000015432) ENSMICG00000033170 KIF13A (ENSMICG00000013830) NUP153 (ENSMICG00000006089) FAM8A1 (ENSMICG00000045527) CAP2 (ENSMICG00000014446) RBM24 (ENSMICG00000032332) STMND1 (ENSMICG00000044225) ATXN1 (ENSMICG00000011875) GMPR (ENSMICG00000011868) MYLIP (ENSMICG00000011860) ENSMICG00000035463 ##22 DTNBP1 (ENSMICG00000010679) JARID2 (ENSMICG00000010642) CD83 (ENSMICG00000042608) RNF182 (ENSMICG00000045818) ENSMICG00000000183 RANBP9 (ENSMICG00000000179) NOL7 (ENSMICG00000044935) SIRT5 (ENSMICG00000000174) GFOD1 (ENSMICG00000000170) TBC1D7 (ENSMICG00000000168) PHACTR1 (ENSMICG00000000165) EDN1 (ENSMICG00000035008) ENSMICG00000042252 HIVEP1 (ENSMICG00000032151) TMEM170B (ENSMICG00000042371) Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini DUPLICATION Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 306 ENSMNEG00000012862 ENSMNEG00000027304 HHIP (ENSMNEG00000031761) ENSMNEG00000031612 ANAPC10 (ENSMNEG00000032727) ENSMNEG00000006010 ##22 ABCE1 (ENSMNEG00000030227) OTUD4 (ENSMNEG00000027757) ENSMNEG00000028387 SMAD1 (ENSMNEG00000026959) MMAA (ENSMNEG00000034928) ENSMNEG00000034188 C4orf51 (ENSMNEG00000035392) ZNF827 (ENSMNEG00000002738) LSM6 (ENSMNEG00000034820) REELD1 (ENSMNEG00000028815) SLC10A7 (ENSMNEG00000033881) POU4F2 (ENSMNEG00000036356) TTC29 (ENSMNEG00000034118) ENSMNEG00000025155 EDNRA (ENSMNEG00000002624) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.a ##22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 593 ANAPC10 (ENSRROG00000022239) ENSRROG00000029310 ##22 ABCE1 (ENSRROG00000033945) OTUD4 (ENSRROG00000035696) ENSRROG00000044373 ENSRROG00000045571 SMAD1 (ENSRROG00000042440) MMAA (ENSRROG00000028820) C4orf51 (ENSRROG00000035262) ZNF827 (ENSRROG00000018716) LSM6 (ENSRROG00000024868) REELD1 (ENSRROG00000045752) SLC10A7 (ENSRROG00000044034) POU4F2 (ENSRROG00000040033) Tarsier MODERN SPECIES 5756 ENSTSYG00000030923 ENSTSYG00000028307 ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Gorilla MODERN SPECIES 19 TEAD3 (ENSGGOG00000001847) RPL10A (ENSGGOG00000028140) PPARD (ENSGGOG00000016781) DEF6 (ENSGGOG00000016204) ZNF76 (ENSGGOG00000014188) SCUBE3 (ENSGGOG00000016378) TCP11 (ENSGGOG00000016087) ANKS1A (ENSGGOG00000007973) TAF11 (ENSGGOG00000012371) BLTP3A (ENSGGOG00000014664) SNRPC (ENSGGOG00000012499) ILRUN (ENSGGOG00000000388) SPDEF (ENSGGOG00000000383) PACSIN1 (ENSGGOG00000023013) NUDT3 (ENSGGOG00000039407) ENSGGOG00000038559 ##22 ENSGGOG00000024443 ENSGGOG00000025804 GRM4 (ENSGGOG00000005313) MLN (ENSGGOG00000008134) LEMD2 (ENSGGOG00000008126) IP6K3 (ENSGGOG00000016288) UQCC2 (ENSGGOG00000043321) ENSGGOG00000023740 ITPR3 (ENSGGOG00000016235) BAK1 (ENSGGOG00000022462) ENSGGOG00000025210 ZBTB9 (ENSGGOG00000040099) SYNGAP1 (ENSGGOG00000009923) CUTA (ENSGGOG00000000265) PHF1 (ENSGGOG00000000264) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.a.b ##22 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 546 CPNE9 (ENSMNEG00000032338) MTMR14 (ENSMNEG00000036145) LHFPL4 (ENSMNEG00000032394) ENSMNEG00000026054 SETD5 (ENSMNEG00000045236) THUMPD3 (ENSMNEG00000030529) ENSMNEG00000032308 SRGAP3 (ENSMNEG00000028942) RAD18 (ENSMNEG00000013464) ENSMNEG00000027815 OXTR (ENSMNEG00000037475) CAV3 (ENSMNEG00000045110) SSUH2 (ENSMNEG00000032764) LMCD1 (ENSMNEG00000039664) GRM7 (ENSMNEG00000031784) ENSMNEG00000021998 ##22 EDEM1 (ENSMNEG00000034041) ARL8B (ENSMNEG00000029717) BHLHE40 (ENSMNEG00000038264) ITPR1 (ENSMNEG00000034253) SUMF1 (ENSMNEG00000003566) SETMAR (ENSMNEG00000045183) ENSMNEG00000013018 LRRN1 (ENSMNEG00000021728) CRBN (ENSMNEG00000044270) TRNT1 (ENSMNEG00000037805) IL5RA (ENSMNEG00000043242) CNTN4 (ENSMNEG00000044169) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 3865 PPP6C (ENSTSYG00000008875) #17 SCAI (ENSTSYG00000001473) #18 GOLGA1 (ENSTSYG00000010641) #20 ENSTSYG00000032048 ENSTSYG00000009744 #21 RPL35 (ENSTSYG00000010719) ##22 WDR38 (ENSTSYG00000030561) #23 ENSTSYG00000033974 OLFML2A (ENSTSYG00000004316) #24 NR6A1 (ENSTSYG00000004262) #25 Tarsier MODERN SPECIES 3832 ENSTSYG00000031513 ##22 C2orf74 (ENSTSYG00000035356) ENSTSYG00000031434 ENSTSYG00000006652 USP34 (ENSTSYG00000006659) XPO1 (ENSTSYG00000004330) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157288.e ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00910000147051 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00410000028196 ENSGT00950000183087.A.a.b.a.g.b.b ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a.o ENSGT00940000155255 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000162533 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ENSGT00570000080653 ENSGT00390000009854 Gorilla DUPLICATION Gorilla MODERN SPECIES 20 PLEKHA8 (ENSGGOG00000006031) FKBP14 (ENSGGOG00000014543) SCRN1 (ENSGGOG00000005731) WIPF3 (ENSGGOG00000005723) ENSGGOG00000037179 PRR15 (ENSGGOG00000041768) CHN2 (ENSGGOG00000012719) CPVL (ENSGGOG00000009483) TRIL (ENSGGOG00000026471) ENSGGOG00000024472 CREB5 (ENSGGOG00000043819) ENSGGOG00000026228 JAZF1 (ENSGGOG00000011408) TAX1BP1 (ENSGGOG00000022253) HIBADH (ENSGGOG00000013267) ENSGGOG00000026869 ##22 EVX1 (ENSGGOG00000016143) ENSGGOG00000005309 HOXA11 (ENSGGOG00000002226) HOXA10 (ENSGGOG00000002225) HOXA9 (ENSGGOG00000002222) HOXA7 (ENSGGOG00000002220) HOXA6 (ENSGGOG00000002218) HOXA5 (ENSGGOG00000002217) ENSGGOG00000002215 HOXA3 (ENSGGOG00000002213) HOXA2 (ENSGGOG00000002211) HOXA1 (ENSGGOG00000002209) ENSGGOG00000027198 ENSGGOG00000012668 ENSGGOG00000027139 Gorilla MODERN SPECIES GGPS1 (ENSGGOG00000008897) TBCE (ENSGGOG00000013627) B3GALNT2 (ENSGGOG00000013638) GNG4 (ENSGGOG00000007898) LYST (ENSGGOG00000009620) ENSGGOG00000043118 NID1 (ENSGGOG00000000381) GPR137B (ENSGGOG00000005990) ERO1B (ENSGGOG00000026132) EDARADD (ENSGGOG00000002149) ENSGGOG00000043831 LGALS8 (ENSGGOG00000006907) HEATR1 (ENSGGOG00000006913) ACTN2 (ENSGGOG00000011905) MTR (ENSGGOG00000016123) ENSGGOG00000023434 ##22 RYR2 (ENSGGOG00000012582) ZP4 (ENSGGOG00000011614) ENSGGOG00000040425 FMN2 (ENSGGOG00000001014) ENSGGOG00000043876 GREM2 (ENSGGOG00000038654) RGS7 (ENSGGOG00000010969) ENSGGOG00000040302 FH (ENSGGOG00000009996) KMO (ENSGGOG00000013897) ENSGGOG00000042072 CHML (ENSGGOG00000016322) WDR64 (ENSGGOG00000015532) EXO1 (ENSGGOG00000013563) BECN2 (ENSGGOG00000008172) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000157288.e ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00410000028196 ENSGT00950000183087.A.a.b.a.g.b.b ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a.o ENSGT00940000155255 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000162533 ENSGT00940000157315 ENSGT00390000017856.a ENSGT00570000080653 ENSGT00390000009854 Pan ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00500000045044 ENSGT00940000157288.e ENSGT00940000157858 ENSGT00390000013474.b.b ENSGT00940000160267 ENSGT00940000154534.b.b ENSGT01030000234635.a.b.a.a ENSGT00940000159498 ENSGT00940000161975 ENSGT00940000156420 ENSGT00410000028196 ENSGT00950000183087.A.a.b.a.g.b.b ENSGT00390000003635 ENSGT00950000183025.b.a.o ENSGT00940000155255 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000159854 ENSGT00940000162322 ENSGT00940000158311 ENSGT00940000162440 ENSGT00940000161864 ENSGT00940000161013 ENSGT00940000161585 ENSGT00940000159894 ENSGT00940000158988.a.a ENSGT00940000159522 ENSGT00940000162533 ENSGT00940000157315 ENSGT01030000234542.b.a.a.a.b.a.b.c.a.b ENSGT00940000153299.c.b.a.b.a.a.a ENSGT00390000017856.a Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 20 FKBP14 (ENSPPAG00000019048) SCRN1 (ENSPPAG00000020473) WIPF3 (ENSPPAG00000005537) ENSPPAG00000024726 ENSPPAG00000005671 PRR15 (ENSPPAG00000002015) CHN2 (ENSPPAG00000031517) CPVL (ENSPPAG00000039137) TRIL (ENSPPAG00000024310) ENSPPAG00000037283 CREB5 (ENSPPAG00000030641) ENSPPAG00000038768 JAZF1 (ENSPPAG00000036331) TAX1BP1 (ENSPPAG00000022824) HIBADH (ENSPPAG00000042554) ENSPPAG00000036088 ##22 EVX1 (ENSPPAG00000024119) ENSPPAG00000043323 HOXA11 (ENSPPAG00000038132) HOXA10 (ENSPPAG00000028221) HOXA9 (ENSPPAG00000030004) HOXA7 (ENSPPAG00000034362) HOXA6 (ENSPPAG00000039975) HOXA5 (ENSPPAG00000044047) ENSPPAG00000043774 HOXA3 (ENSPPAG00000032603) HOXA2 (ENSPPAG00000035694) HOXA1 (ENSPPAG00000000155) ENSPPAG00000038834 ENSPPAG00000000147 ENSPPAG00000033310 Bonobo MODERN SPECIES ENSPPAG00000020240 B3GALNT2 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(ENSPTRG00000043675) ENSPTRG00000050877 CREB5 (ENSPTRG00000019028) ENSPTRG00000045009 JAZF1 (ENSPTRG00000019027) TAX1BP1 (ENSPTRG00000019025) HIBADH (ENSPTRG00000019024) ENSPTRG00000052529 ##22 EVX1 (ENSPTRG00000019022) HOXA13 (ENSPTRG00000028643) HOXA11 (ENSPTRG00000019020) HOXA10 (ENSPTRG00000019019) ENSPTRG00000049485 HOXA7 (ENSPTRG00000019017) HOXA6 (ENSPTRG00000039535) ENSPTRG00000019015 HOXA4 (ENSPTRG00000023597) HOXA3 (ENSPTRG00000019012) HOXA2 (ENSPTRG00000019011) HOXA1 (ENSPTRG00000019010) ENSPTRG00000049011 ENSPTRG00000044997 ENSPTRG00000049392 Chimpanzee MODERN SPECIES 586 ENSPTRG00000049297 ENSPTRG00000042926 ENSPTRG00000046220 ##22 ENSPTRG00000048607 ENSPTRG00000050384 ENSPTRG00000047456 ENSPTRG00000052537 ENSPTRG00000047890 ENSPTRG00000047796 ENSPTRG00000049275 ENSPTRG00000048699 ENSPTRG00000048614 ENSPTRG00000047399 ENSPTRG00000052389 ENSPTRG00000048196 ENSPTRG00000050430 ENSPTRG00000045640 ENSPTRG00000047411 Chimpanzee MODERN SPECIES GGPS1 (ENSPTRG00000002130) TBCE (ENSPTRG00000002131) B3GALNT2 (ENSPTRG00000002132) GNG4 (ENSPTRG00000002133) LYST (ENSPTRG00000002134) ENSPTRG00000049072 NID1 (ENSPTRG00000002135) GPR137B (ENSPTRG00000002136) ERO1B (ENSPTRG00000002137) EDARADD (ENSPTRG00000033991) ENSPTRG00000052416 LGALS8 (ENSPTRG00000002140) HEATR1 (ENSPTRG00000002141) ACTN2 (ENSPTRG00000002144) MTR (ENSPTRG00000002145) ENSPTRG00000044356 ##22 MT1HL1 (ENSPTRG00000043308) RYR2 (ENSPTRG00000002149) ZP4 (ENSPTRG00000002151) ENSPTRG00000043824 ENSPTRG00000044090 CHRM3 (ENSPTRG00000002155) ENSPTRG00000002157 ENSPTRG00000047391 ENSPTRG00000045511 GREM2 (ENSPTRG00000049478) RGS7 (ENSPTRG00000002161) FH (ENSPTRG00000002163) KMO (ENSPTRG00000002164) OPN3 (ENSPTRG00000002165) WDR64 (ENSPTRG00000002166) Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 10 ENSNLEG00000008581 SCUBE3 (ENSNLEG00000008527) TCP11 (ENSNLEG00000008486) ANKS1A (ENSNLEG00000008483) TAF11 (ENSNLEG00000008457) BLTP3A (ENSNLEG00000008400) SNRPC (ENSNLEG00000034810) ENSNLEG00000027593 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(ENSRBIG00000025613) BRD1 (ENSRBIG00000035751) ENSRBIG00000038766 ##22 ENSRBIG00000030497 TAFA5 (ENSRBIG00000036620) ENSRBIG00000034535 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT01100000263482.C.c.a.i.c.a ENSGT00390000016675 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000153818.a.b.a.b ENSGT00550000074863 ENSGT00390000010789 ENSGT00940000160675 ENSGT00940000156751 ENSGT00390000008122 ENSGT00940000156706 ENSGT00390000000288 ENSGT00940000160834 ENSGT00910000146895 ENSGT00390000018761 ENSGT00840000129887 ENSGT00390000009552 ENSGT00390000013520 ENSGT00940000157382 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000156189 ENSGT00940000160061 ENSGT00940000157810 ENSGT00390000005508.a ENSGT00390000009067 ENSGT00940000153972.C ENSGT00940000160150 ENSGT00390000015442 ENSGT00940000162265 ENSGT00940000162605 ENSGT00940000153394.c.b ENSGT00940000160071 ENSGT00950000183090.B ENSGT00940000161365 ENSGT00940000157236 ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 ENSGT00940000160682.b ENSGT00940000159840 ENSGT00940000156976.z ENSGT00390000010968 ENSGT00940000159839 ENSGT00390000014323 ENSGT00940000154189.B ENSGT00560000078631 ENSGT00390000002669 ENSGT00390000007925 ENSGT00910000146905 ENSGT00940000157097 ENSGT00390000007658.g ENSGT00940000158861.A ENSGT00390000010377 Sooty mangabey MODERN SPECIES 662 MAPK12 (ENSCATG00000034080) HDAC10 (ENSCATG00000027781) TUBGCP6 (ENSCATG00000035873) SELENOO (ENSCATG00000041757) TRABD (ENSCATG00000032558) PANX2 (ENSCATG00000042207) MOV10L1 (ENSCATG00000038537) MLC1 (ENSCATG00000033856) TTLL8 (ENSCATG00000027450) IL17REL (ENSCATG00000034232) PIM3 (ENSCATG00000041309) CRELD2 (ENSCATG00000027994) ALG12 (ENSCATG00000031565) ZBED4 (ENSCATG00000019780) BRD1 (ENSCATG00000037891) ENSCATG00000044288 ##22 TAFA5 (ENSCATG00000033512) TBC1D22A (ENSCATG00000031288) CERK (ENSCATG00000037136) GRAMD4 (ENSCATG00000045204) CELSR1 (ENSCATG00000036632) TRMU (ENSCATG00000032800) GTSE1 (ENSCATG00000043031) ENSCATG00000022718 TTC38 (ENSCATG00000029194) CDPF1 (ENSCATG00000000958) PPARA (ENSCATG00000037415) ENSCATG00000030288 WNT7B (ENSCATG00000045374) ATXN10 (ENSCATG00000042259) FBLN1 (ENSCATG00000030058) Drill DUPLICATION Drill MODERN SPECIES 1262 ENSMLEG00000032129 ##22 ENSMLEG00000041572 Drill MODERN SPECIES 1036 ENSMLEG00000036090 ENSMLEG00000044192 ##22 HNF1B (ENSMLEG00000028966) DDX52 (ENSMLEG00000017518) SYNRG (ENSMLEG00000037827) DUSP14 (ENSMLEG00000037053) TADA2A (ENSMLEG00000034264) ACACA (ENSMLEG00000028181) C17orf78 (ENSMLEG00000032526) AATF (ENSMLEG00000033672) LHX1 (ENSMLEG00000030942) ENSMLEG00000033898 MRM1 (ENSMLEG00000031933) DHRS11 (ENSMLEG00000028362) GGNBP2 (ENSMLEG00000041128) MYO19 (ENSMLEG00000035545) ZNHIT3 (ENSMLEG00000041589) Olive baboon DUPLICATION Olive baboon MODERN SPECIES 6 ENSPANG00000050058 ENSPANG00000043242 LMO7 (ENSPANG00000004997) COMMD6 (ENSPANG00000029712) TBC1D4 (ENSPANG00000006285) ENSPANG00000014125 KLF12 (ENSPANG00000007736) PIBF1 (ENSPANG00000007392) DIS3 (ENSPANG00000010053) BORA (ENSPANG00000023338) MZT1 (ENSPANG00000017952) ENSPANG00000050278 ENSPANG00000039637 DACH1 (ENSPANG00000020947) ENSPANG00000042380 ENSPANG00000043385 ##22 KLHL1 (ENSPANG00000034699) ENSPANG00000048424 ENSPANG00000047922 ENSPANG00000035598 ENSPANG00000049759 ENSPANG00000043843 PCDH9 (ENSPANG00000012913) ENSPANG00000036914 ENSPANG00000047743 ENSPANG00000042731 ENSPANG00000002589 ENSPANG00000037622 PCDH20 (ENSPANG00000009662) ENSPANG00000049074 TDRD3 (ENSPANG00000019138) Olive baboon MODERN SPECIES 8 RASL10B (ENSPANG00000046564) GAS2L2 (ENSPANG00000022978) C17orf50 (ENSPANG00000022929) MMP28 (ENSPANG00000022977) TAF15 (ENSPANG00000022930) HEATR9 (ENSPANG00000022932) ENSPANG00000030339 RDM1 (ENSPANG00000022933) LYZL6 (ENSPANG00000022934) CCL16 (ENSPANG00000022935) CCL14 (ENSPANG00000022936) CCL15 (ENSPANG00000022937) ENSPANG00000022938 CCL18 (ENSPANG00000041083) HEATR6 (ENSPANG00000009798) ENSPANG00000032216 ##22 HNF1B (ENSPANG00000022102) DDX52 (ENSPANG00000022101) SYNRG (ENSPANG00000022120) DUSP14 (ENSPANG00000003448) TADA2A (ENSPANG00000022118) ACACA (ENSPANG00000022130) ENSPANG00000047347 AATF (ENSPANG00000022128) LHX1 (ENSPANG00000022127) GGNBP2 (ENSPANG00000022124) PIGW (ENSPANG00000008702) MYO19 (ENSPANG00000022136) ZNHIT3 (ENSPANG00000050701) CA4 (ENSPANG00000022142) ENSPANG00000022153 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 6 MVB12B (ENSMFAG00000034269) #11 ENSMFAG00000054813 PBX3 (ENSMFAG00000027078) #12 ENSMFAG00000050988 MAPKAP1 (ENSMFAG00000032616) #13 GAPVD1 (ENSMFAG00000003434) #14 HSPA5 (ENSMFAG00000039748) #15 RABEPK (ENSMFAG00000042018) #16 PPP6C (ENSMFAG00000030045) #17 SCAI (ENSMFAG00000002648) #18 ENSMFAG00000051574 ENSMFAG00000064534 ENSMFAG00000049005 GOLGA1 (ENSMFAG00000031129) #20 ARPC5L (ENSMFAG00000033396) #21 RPL35 (ENSMFAG00000044075) ##22 WDR38 (ENSMFAG00000038461) #23 ENSMFAG00000062053 OLFML2A (ENSMFAG00000002383) #24 NR6A1 (ENSMFAG00000045408) #25 ENSMFAG00000059108 ENSMFAG00000055757 ENSMFAG00000050682 NR5A1 (ENSMFAG00000044244) #26 PSMB7 (ENSMFAG00000002588) #28 NEK6 (ENSMFAG00000043882) #29 ENSMFAG00000053849 LHX2 (ENSMFAG00000028670) #30 ENSMFAG00000057010 DENND1A (ENSMFAG00000031585) #31 ENSMFAG00000058067 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 11 CAMK1 (ENSMFAG00000040953) OGG1 (ENSMFAG00000041077) BRPF1 (ENSMFAG00000045669) CPNE9 (ENSMFAG00000035676) MTMR14 (ENSMFAG00000038577) LHFPL4 (ENSMFAG00000033316) THUMPD3 (ENSMFAG00000044884) ENSMFAG00000033455 RAD18 (ENSMFAG00000028864) ENSMFAG00000030087 OXTR (ENSMFAG00000037530) CAV3 (ENSMFAG00000037376) SSUH2 (ENSMFAG00000035455) LMCD1 (ENSMFAG00000033976) GRM7 (ENSMFAG00000027785) ENSMFAG00000029998 ##22 ENSMFAG00000047622 ENSMFAG00000063438 ENSMFAG00000048887 ENSMFAG00000061059 EDEM1 (ENSMFAG00000038359) ARL8B (ENSMFAG00000035233) BHLHE40 (ENSMFAG00000040134) ITPR1 (ENSMFAG00000044748) SUMF1 (ENSMFAG00000040853) ENSMFAG00000029288 LRRN1 (ENSMFAG00000020302) CRBN (ENSMFAG00000031028) TRNT1 (ENSMFAG00000045113) IL5RA (ENSMFAG00000006030) CNTN4 (ENSMFAG00000031919) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Mas night monkey MODERN SPECIES 768 MVB12B (ENSANAG00000021467) #11 PBX3 (ENSANAG00000026691) #12 MAPKAP1 (ENSANAG00000038007) #13 ENSANAG00000006107 GAPVD1 (ENSANAG00000026547) #14 ENSANAG00000002903 HSPA5 (ENSANAG00000038513) #15 ENSANAG00000029634 #16 ENSANAG00000002363 PPP6C (ENSANAG00000033545) #17 ENSANAG00000035375 ENSANAG00000005773 SCAI (ENSANAG00000024288) #18 GOLGA1 (ENSANAG00000020513) #20 ENSANAG00000021654 #21 RPL35 (ENSANAG00000032849) ##22 WDR38 (ENSANAG00000033407) #23 OLFML2A (ENSANAG00000028567) #24 NR6A1 (ENSANAG00000036986) #25 NR5A1 (ENSANAG00000027136) #26 ADGRD2 (ENSANAG00000036641) #27 PSMB7 (ENSANAG00000030640) #28 NEK6 (ENSANAG00000029360) #29 LHX2 (ENSANAG00000018858) #30 DENND1A (ENSANAG00000034989) #31 CRB2 (ENSANAG00000030431) #32 ENSANAG00000004458 STRBP (ENSANAG00000021993) #33 ENSANAG00000021222 ENSANAG00000001745 RABGAP1 (ENSANAG00000022667) #34 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.j.b ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 192 FBXW9 (ENSSBOG00000029356) ENSSBOG00000029032 DHPS (ENSSBOG00000033113) WDR83 (ENSSBOG00000030461) WDR83OS (ENSSBOG00000029116) MAN2B1 (ENSSBOG00000025631) ZNF791 (ENSSBOG00000024486) ZNF490 (ENSSBOG00000035661) ZNF564 (ENSSBOG00000025431) ENSSBOG00000030106 ZNF709 (ENSSBOG00000036040) ENSSBOG00000020200 ZNF442 (ENSSBOG00000024751) ZNF44 (ENSSBOG00000033041) ENSSBOG00000028467 ENSSBOG00000019079 ##22 ZNF136 (ENSSBOG00000032363) ZNF625 (ENSSBOG00000028089) ZNF20 (ENSSBOG00000031445) ENSSBOG00000032669 ZNF878 (ENSSBOG00000021067) ZNF433 (ENSSBOG00000016800) ZNF700 (ENSSBOG00000029518) ZNF441 (ENSSBOG00000025902) ZNF823 (ENSSBOG00000032287) ENSSBOG00000029320 ZNF627 (ENSSBOG00000031561) ACP5 (ENSSBOG00000033072) ELOF1 (ENSSBOG00000029523) CNN1 (ENSSBOG00000031551) ECSIT (ENSSBOG00000032854) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00940000163762.b ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Tree shrew MODERN SPECIES 2388 SCAI (ENSTBEG00000000436) #18 GOLGA1 (ENSTBEG00000008817) #20 ARPC5L (ENSTBEG00000008398) #21 RPL35 (ENSTBEG00000008246) #22 WDR38 (ENSTBEG00000007945) #23 OLFML2A (ENSTBEG00000007469) #24 NR6A1 (ENSTBEG00000007008) #25 Glires ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00940000163762.b ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.a #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.a #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.e.a #22 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B.c #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 5 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ENSODEG00000019394 #22 BTBD8 (ENSODEG00000006488) ENSODEG00000007844 ENSODEG00000005277 EPHX4 (ENSODEG00000005661) BRDT (ENSODEG00000006335) ENSODEG00000005197 ENSODEG00000019153 TGFBR3 (ENSODEG00000005656) CDC7 (ENSODEG00000007352) ENSODEG00000006243 ENSODEG00000007491 ENSODEG00000007680 ZNF644 (ENSODEG00000007732) ENSODEG00000019117 ENSODEG00000005537 Degu MODERN SPECIES 130 COL6A3 (ENSODEG00000008236) COPS8 (ENSODEG00000008319) ACKR3 (ENSODEG00000019748) IQCA1 (ENSODEG00000009201) ASB18 (ENSODEG00000008270) GBX2 (ENSODEG00000008224) AGAP1 (ENSODEG00000009204) SH3BP4 (ENSODEG00000008911) ARL4C (ENSODEG00000019668) SPP2 (ENSODEG00000008199) TRPM8 (ENSODEG00000012967) MROH2A (ENSODEG00000008630) UGT1A6 (ENSODEG00000009095) ENSODEG00000008578 ENSODEG00000007995 ENSODEG00000019500 #22 DGKD (ENSODEG00000008384) SAG (ENSODEG00000008121) ATG16L1 (ENSODEG00000008154) ENSODEG00000019603 INPP5D (ENSODEG00000008216) NEU2 (ENSODEG00000008947) ENSODEG00000019569 ENSODEG00000008563 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DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 139 ENSODEG00000017297 PELP1 (ENSODEG00000017225) ENSODEG00000017329 ENSODEG00000017890 ENSODEG00000017037 ALOX12 (ENSODEG00000017256) RNASEK (ENSODEG00000017378) ENSODEG00000017485 BCL6B (ENSODEG00000017360) SLC16A13 (ENSODEG00000017767) SLC16A11 (ENSODEG00000017518) ENSODEG00000017420 CLEC10A (ENSODEG00000017450) ENSODEG00000017527 ASGR2 (ENSODEG00000017289) ENSODEG00000020478 #22 ASGR1 (ENSODEG00000017268) DLG4 (ENSODEG00000017252) ACADVL (ENSODEG00000017418) DVL2 (ENSODEG00000017448) PHF23 (ENSODEG00000017333) GABARAP (ENSODEG00000017476) ENSODEG00000017490 ELP5 (ENSODEG00000017304) CLDN7 (ENSODEG00000017387) ENSODEG00000020514 SLC2A4 (ENSODEG00000017582) YBX2 (ENSODEG00000017530) ENSODEG00000017377 GPS2 (ENSODEG00000017752) NEURL4 (ENSODEG00000017430) Degu MODERN SPECIES 153 ENSODEG00000019381 PNLDC1 (ENSODEG00000008047) ENSODEG00000019385 #22 ENSODEG00000007318 ENSODEG00000007990 ENSODEG00000008372 ACAT2 (ENSODEG00000008431) ENSODEG00000008023 ENSODEG00000019351 SOD2 (ENSODEG00000007052) ENSODEG00000019438 METRNL (ENSODEG00000008002) B3GNTL1 (ENSODEG00000011917) TBCD (ENSODEG00000009094) ZNF750 (ENSODEG00000008866) ENSODEG00000019653 #22 ENSODEG00000009328 FN3KRP (ENSODEG00000012467) ENSODEG00000020021 RAB40B (ENSODEG00000007441) WDR45B (ENSODEG00000007809) FOXK2 (ENSODEG00000008321) NARF (ENSODEG00000007704) CYBC1 (ENSODEG00000008201) HEXD (ENSODEG00000009299) OGFOD3 (ENSODEG00000007453) ENSODEG00000007186 ENSODEG00000019459 ENSODEG00000007569 ENSODEG00000007855 ENSODEG00000008173 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 153 ENSODEG00000006392 ENSODEG00000019262 ENSODEG00000006455 ENSODEG00000009894 SLC22A3 (ENSODEG00000006460) ENSODEG00000006583 ENSODEG00000007010 SLC22A2 (ENSODEG00000007315) SLC22A1 (ENSODEG00000007862) ENSODEG00000019312 IGF2R (ENSODEG00000007106) ENSODEG00000019599 MAS1 (ENSODEG00000019418) ENSODEG00000019381 PNLDC1 (ENSODEG00000008047) ENSODEG00000019385 #22 ENSODEG00000007318 ENSODEG00000007990 ENSODEG00000008372 ACAT2 (ENSODEG00000008431) ENSODEG00000008023 ENSODEG00000019351 SOD2 (ENSODEG00000007052) ENSODEG00000019438 METRNL (ENSODEG00000008002) B3GNTL1 (ENSODEG00000011917) TBCD (ENSODEG00000009094) ZNF750 (ENSODEG00000008866) ENSODEG00000019653 #22 ENSODEG00000009328 FN3KRP (ENSODEG00000012467) Degu MODERN SPECIES 50 PIK3C2B (ENSODEG00000012433) PPP1R15B (ENSODEG00000014053) PLEKHA6 (ENSODEG00000011957) GOLT1A (ENSODEG00000013193) KISS1 (ENSODEG00000015011) REN (ENSODEG00000013805) ETNK2 (ENSODEG00000011893) SOX13 (ENSODEG00000014124) ENSODEG00000020001 ENSODEG00000013517 ENSODEG00000019942 SNRPE (ENSODEG00000013393) ENSODEG00000012788 ZBED6 (ENSODEG00000019959) ATP2B4 (ENSODEG00000013312) ENSODEG00000020037 #22 OPTC (ENSODEG00000011941) PRELP (ENSODEG00000013597) FMOD (ENSODEG00000012164) BTG2 (ENSODEG00000012528) CHIT1 (ENSODEG00000012946) CHI3L1 (ENSODEG00000011673) MYBPH (ENSODEG00000011869) ADORA1 (ENSODEG00000012258) MYOG (ENSODEG00000011506) PPFIA4 (ENSODEG00000011585) ENSODEG00000012180 ENSODEG00000012157 ENSODEG00000011458 ENSODEG00000019825 CYB5R1 (ENSODEG00000012060) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 126 RALGPS1 (ENSCLAG00000009365) ANGPTL2 (ENSCLAG00000012007) ZBTB34 (ENSCLAG00000012109) #7 ZBTB43 (ENSCLAG00000017099) #8 LMX1B (ENSCLAG00000012490) #9 MVB12B (ENSCLAG00000010176) #11 PBX3 (ENSCLAG00000009335) #12 MAPKAP1 (ENSCLAG00000011818) #13 GAPVD1 (ENSCLAG00000010577) #14 HSPA5 (ENSCLAG00000009815) #15 RABEPK (ENSCLAG00000011734) #16 PPP6C (ENSCLAG00000013734) #17 SCAI (ENSCLAG00000013682) #18 GOLGA1 (ENSCLAG00000011649) #20 ARPC5L (ENSCLAG00000009936) #21 RPL35 (ENSCLAG00000013142) #22 OLFML2A (ENSCLAG00000014121) #24 NR6A1 (ENSCLAG00000012774) #25 NR5A1 (ENSCLAG00000012090) #26 PSMB7 (ENSCLAG00000013548) #28 NEK6 (ENSCLAG00000009797) #29 LHX2 (ENSCLAG00000010277) #30 DENND1A (ENSCLAG00000010455) #31 CRB2 (ENSCLAG00000015580) #32 STRBP (ENSCLAG00000010826) #33 RABGAP1 (ENSCLAG00000010301) #34 ZBTB26 (ENSCLAG00000016744) #35 ZBTB6 (ENSCLAG00000016422) #36 RC3H2 (ENSCLAG00000013261) #37 PDCL (ENSCLAG00000014566) ENSCLAG00000017880 Guinea pig MODERN SPECIES 27 RALGPS1 (ENSCPOG00000012308) ANGPTL2 (ENSCPOG00000002360) ZBTB34 (ENSCPOG00000003791) #7 ZBTB43 (ENSCPOG00000038507) #8 LMX1B (ENSCPOG00000023429) #9 MVB12B (ENSCPOG00000036809) #11 PBX3 (ENSCPOG00000004530) #12 MAPKAP1 (ENSCPOG00000004526) #13 GAPVD1 (ENSCPOG00000004285) #14 ENSCPOG00000012520 #15 RABEPK (ENSCPOG00000026070) #16 PPP6C (ENSCPOG00000004898) #17 SCAI (ENSCPOG00000001406) #18 GOLGA1 (ENSCPOG00000014706) #20 ARPC5L (ENSCPOG00000036902) #21 RPL35 (ENSCPOG00000022811) #22 OLFML2A (ENSCPOG00000003516) #24 NR6A1 (ENSCPOG00000005970) #25 NR5A1 (ENSCPOG00000022305) #26 ADGRD2 (ENSCPOG00000027184) #27 PSMB7 (ENSCPOG00000007839) #28 NEK6 (ENSCPOG00000007827) #29 LHX2 (ENSCPOG00000022927) #30 DENND1A (ENSCPOG00000014548) #31 CRB2 (ENSCPOG00000010074) #32 STRBP (ENSCPOG00000009817) #33 RABGAP1 (ENSCPOG00000009811) #34 ZBTB26 (ENSCPOG00000032601) #35 ZBTB6 (ENSCPOG00000039487) #36 RC3H2 (ENSCPOG00000008511) #37 PDCL (ENSCPOG00000009509) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Degu MODERN SPECIES 59 ENSODEG00000016065 ALX4 (ENSODEG00000016139) EXT2 (ENSODEG00000016764) ACCS (ENSODEG00000016512) ENSODEG00000020538 C11orf96 (ENSODEG00000020497) ALKBH3 (ENSODEG00000017204) HSD17B12 (ENSODEG00000016636) ENSODEG00000016649 TTC17 (ENSODEG00000016728) ENSODEG00000016280 ENSODEG00000016521 ENSODEG00000020406 ENSODEG00000020370 LRRC4C (ENSODEG00000020475) ENSODEG00000020466 #22 IFTAP (ENSODEG00000016540) RAG2 (ENSODEG00000020447) RAG1 (ENSODEG00000020338) TRAF6 (ENSODEG00000017071) PRR5L (ENSODEG00000016913) COMMD9 (ENSODEG00000017403) LDLRAD3 (ENSODEG00000017384) ENSODEG00000016381 FJX1 (ENSODEG00000016768) ENSODEG00000016254 PAMR1 (ENSODEG00000016795) SLC1A2 (ENSODEG00000016926) ENSODEG00000016446 PDHX (ENSODEG00000016591) ENSODEG00000016598 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.e.b #22 Rat MODERN SPECIES 16 Lratd1 (ENSRNOG00000004084) Trib2 (ENSRNOG00000004110) Lpin1 (ENSRNOG00000004377) Ntsr2 (ENSRNOG00000049054) Greb1 (ENSRNOG00000024651) E2f6 (ENSRNOG00000004449) Rock2 (ENSRNOG00000004496) Slc66a3 (ENSRNOG00000005126) C6h2orf50 (ENSRNOG00000024338) Kcnf1 (ENSRNOG00000024310) Pdia6 (ENSRNOG00000050197) Atp6v1c2 (ENSRNOG00000050553) Nol10 (ENSRNOG00000005344) AABR07063703.1 (ENSRNOG00000046279) Odc1 (ENSRNOG00000005424) LOC120093238 (ENSRNOG00000032523) #22 Hpcal1 (ENSRNOG00000005492) Asap2 (ENSRNOG00000061519) Itgb1bp1 (ENSRNOG00000059402) Cpsf3 (ENSRNOG00000052418) Iah1 (ENSRNOG00000060853) Adam17 (ENSRNOG00000060694) Ywhaq (ENSRNOG00000051650) Taf1b (ENSRNOG00000061415) Rbm34-ps1 (ENSRNOG00000065550) Grhl1 (ENSRNOG00000054989) Klf11 (ENSRNOG00000054259) Cys1 (ENSRNOG00000058891) Rrm2 (ENSRNOG00000054286) Mboat2 (ENSRNOG00000061050) Kidins220 (ENSRNOG00000023176) Rodentia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00940000163762.b ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155946 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990.j #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 6 ZBTB34 (ENSSVLG00005011114) #7 ZBTB43 (ENSSVLG00005011093) #8 LMX1B (ENSSVLG00005010935) #9 MVB12B (ENSSVLG00005023376) #11 PBX3 (ENSSVLG00005023289) #12 MAPKAP1 (ENSSVLG00005022966) #13 GAPVD1 (ENSSVLG00005022773) #14 HSPA5 (ENSSVLG00005022700) #15 RABEPK (ENSSVLG00005022664) #16 ENSSVLG00005022620 #17 ENSSVLG00005022574 ENSSVLG00005022544 SCAI (ENSSVLG00005022411) #18 GOLGA1 (ENSSVLG00005022372) #20 ARPC5L (ENSSVLG00005022345) #21 RPL35 (ENSSVLG00005022293) #22 WDR38 (ENSSVLG00005022161) #23 OLFML2A (ENSSVLG00005022068) #24 ENSSVLG00005022017 NR6A1 (ENSSVLG00005021745) #25 NR5A1 (ENSSVLG00005021643) #26 ADGRD2 (ENSSVLG00005021497) #27 PSMB7 (ENSSVLG00005021459) #28 NEK6 (ENSSVLG00005021363) #29 LHX2 (ENSSVLG00005021337) #30 ENSSVLG00005021279 DENND1A (ENSSVLG00005021227) #31 CRB2 (ENSSVLG00005021075) #32 STRBP (ENSSVLG00005021011) #33 RABGAP1 (ENSSVLG00005020789) #34 ZBTB26 (ENSSVLG00005020757) #35 Marmotini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 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ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990.j #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Squirrel MODERN SPECIES 87 ANGPTL2 (ENSSTOG00000028602) RALGPS1 (ENSSTOG00000032069) ZBTB34 (ENSSTOG00000009103) #7 ZBTB43 (ENSSTOG00000007435) #8 LMX1B (ENSSTOG00000026973) #9 MVB12B (ENSSTOG00000021458) #11 PBX3 (ENSSTOG00000013679) #12 MAPKAP1 (ENSSTOG00000011275) #13 GAPVD1 (ENSSTOG00000011260) #14 Hspa5 (ENSSTOG00000011243) #15 RABEPK (ENSSTOG00000011234) #16 PPP6C (ENSSTOG00000007971) #17 SCAI (ENSSTOG00000007948) #18 GOLGA1 (ENSSTOG00000007917) #20 ARPC5L (ENSSTOG00000007907) #21 RPL35 (ENSSTOG00000007901) #22 WDR38 (ENSSTOG00000007867) #23 OLFML2A (ENSSTOG00000007852) #24 NR6A1 (ENSSTOG00000022764) #25 NR5A1 (ENSSTOG00000000396) #26 PSMB7 (ENSSTOG00000013826) #28 NEK6 (ENSSTOG00000013817) #29 LHX2 (ENSSTOG00000000794) #30 DENND1A 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#31 CRB2 (ENSUPAG00010013102) #32 STRBP (ENSUPAG00010012985) #33 RABGAP1 (ENSUPAG00010012857) #34 ZBTB26 (ENSUPAG00010012848) #35 ZBTB6 (ENSUPAG00010012844) #36 RC3H2 (ENSUPAG00010012762) #37 PDCL (ENSUPAG00010012754) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 150 COL24A1 (ENSODEG00000003113) ENSODEG00000003023 ODF2L (ENSODEG00000002955) CLCA2 (ENSODEG00000002864) ENSODEG00000002790 ENSODEG00000002712 ENSODEG00000002677 ENSODEG00000002661 SH3GLB1 (ENSODEG00000003003) ENSODEG00000002911 ENSODEG00000002901 HS2ST1 (ENSODEG00000002834) ENSODEG00000018964 LMO4 (ENSODEG00000002768) ENSODEG00000002725 #22 ENSODEG00000002715 #22 PKN2 (ENSODEG00000006053) ENSODEG00000005921 ENSODEG00000005859 ENSODEG00000005800 ENSODEG00000019217 ENSODEG00000005607 Degu MODERN SPECIES 150 ZNHIT6 (ENSODEG00000003486) COL24A1 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ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 513 Angptl2 (ENSNGAG00000013329) Ralgps1 (ENSNGAG00000011874) Zbtb34 (ENSNGAG00000016663) #7 Zbtb43 (ENSNGAG00000009744) #8 Lmx1b (ENSNGAG00000013286) #9 Mvb12b (ENSNGAG00000012640) #11 Pbx3 (ENSNGAG00000020873) #12 Mapkap1 (ENSNGAG00000002676) #13 Gapvd1 (ENSNGAG00000016173) #14 Hspa5 (ENSNGAG00000016525) #15 Rabepk (ENSNGAG00000009850) #16 ENSNGAG00000000167 #17 Scai (ENSNGAG00000009532) #18 Golga1 (ENSNGAG00000017928) #20 Arpc5l (ENSNGAG00000004816) #21 ENSNGAG00000012132 #22 ENSNGAG00000016210 Olfml2a (ENSNGAG00000006763) #24 Nr6a1 (ENSNGAG00000019760) #25 Nr5a1 (ENSNGAG00000018329) #26 Psmb7 (ENSNGAG00000016549) #28 Nek6 (ENSNGAG00000017493) #29 Lhx2 (ENSNGAG00000013721) #30 ENSNGAG00000003822 #31 ENSNGAG00000011495 #31 Crb2 (ENSNGAG00000004692) #32 Strbp (ENSNGAG00000014638) #33 Gpr21 (ENSNGAG00000009678) Rabgap1 (ENSNGAG00000017183) #34 Zbtb26 (ENSNGAG00000001562) #35 Zbtb6 (ENSNGAG00000021046) #36 Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A DUPLICATION Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Murinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 ENSGT00950000183208.A.c.a ENSGT00390000006631 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000008033 ENSGT00940000157521.b ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Mus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 ENSGT00950000183208.A.c.a ENSGT00390000006631 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000008033 ENSGT00940000157521.b ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 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(MGP_CAROLIEiJ_G0023524) #30 Dennd1a (MGP_CAROLIEiJ_G0023523) #31 Crb2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023522) #32 Gpr21 (MGP_CAROLIEiJ_G0023521) Strbp (MGP_CAROLIEiJ_G0023520) #33 Rabgap1 (MGP_CAROLIEiJ_G0023519) #34 Zbtb26 (MGP_CAROLIEiJ_G0023518) #35 Zbtb6 (MGP_CAROLIEiJ_G0023517) #36 Rc3h2 (MGP_CAROLIEiJ_G0023516) #37 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000220.A ENSGT00940000158539 ENSGT00940000158526 ENSGT00530000064137.a.b ENSGT00390000016542 ENSGT00940000157233 ENSGT00950000183208.A.c.a ENSGT00390000006631 ENSGT00950000182860.a.b.b ENSGT00390000008033 ENSGT00940000157521.b ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Mouse DUPLICATION Mouse MODERN SPECIES 11 Lypd6b (ENSMUSG00000026765) Kif5c (ENSMUSG00000026764) Epc2 (ENSMUSG00000069495) Mbd5 (ENSMUSG00000036792) Orc4 (ENSMUSG00000026761) Acvr2a (ENSMUSG00000052155) Zeb2 (ENSMUSG00000026872) Gtdc1 (ENSMUSG00000036890) Arhgap15 (ENSMUSG00000049744) Kynu (ENSMUSG00000026866) Lrp1b (ENSMUSG00000049252) Ppp6c (ENSMUSG00000026753) #17 Scai (ENSMUSG00000035236) #18 Golga1 (ENSMUSG00000026754) #20 Arpc5l (ENSMUSG00000026755) #21 Rpl35 (ENSMUSG00000062997) #22 Wdr38 (ENSMUSG00000035295) #23 Olfml2a (ENSMUSG00000046618) #24 Nr6a1 (ENSMUSG00000063972) #25 Nr5a1 (ENSMUSG00000026751) #26 Psmb7 (ENSMUSG00000026750) #28 Nek6 (ENSMUSG00000026749) #29 Lhx2 (ENSMUSG00000000247) #30 Dennd1a (ENSMUSG00000035392) #31 Crb2 (ENSMUSG00000035403) #32 Gpr21 (ENSMUSG00000053164) Strbp (ENSMUSG00000026915) #33 Rabgap1 (ENSMUSG00000035437) #34 Zbtb26 (ENSMUSG00000050714) #35 Zbtb6 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#26 Psmb7 (MGP_SPRETEiJ_G0024446) #28 Nek6 (MGP_SPRETEiJ_G0024445) #29 Lhx2 (MGP_SPRETEiJ_G0024444) #30 Dennd1a (MGP_SPRETEiJ_G0024443) #31 Crb2 (MGP_SPRETEiJ_G0024442) #32 Gpr21 (MGP_SPRETEiJ_G0024441) MGP_SPRETEiJ_G0024440 #33 Rabgap1 (MGP_SPRETEiJ_G0024439) #34 Zbtb26 (MGP_SPRETEiJ_G0024438) #35 Zbtb6 (MGP_SPRETEiJ_G0024437) #36 Rc3h2 (MGP_SPRETEiJ_G0024436) #37 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 401 Myrf (ENSCGRG00001021116) ENSCGRG00001013240 Fen1 (ENSCGRG00001009889) Fads1 (ENSCGRG00001018831) Fads2 (ENSCGRG00001013858) Fads3 (ENSCGRG00001017095) Rab3il1 (ENSCGRG00001015063) ENSCGRG00001014139 FTH1 (ENSCGRG00001020220) Incenp (ENSCGRG00001019028) Scgb2a2 (ENSCGRG00001015765) Asrgl1 (ENSCGRG00001019390) Scgb1a1 (ENSCGRG00001017835) Ahnak (ENSCGRG00001009772) ENSCGRG00001013631 ENSCGRG00001010100 #22 Tut1 (ENSCGRG00001017583) Mta2 (ENSCGRG00001005728) Eml3 (ENSCGRG00001015050) Rom1 (ENSCGRG00001013656) B3GAT3 (ENSCGRG00001023184) Ganab (ENSCGRG00001021832) Ints5 (ENSCGRG00001020963) 1810009A15Rik (ENSCGRG00001020427) ENSCGRG00001017126 Uqcc3 (ENSCGRG00001016702) Ubxn1 (ENSCGRG00001006327) Lrrn4cl (ENSCGRG00001009869) Bscl2 (ENSCGRG00001015829) Gng3 (ENSCGRG00001014012) Hnrnpul2 (ENSCGRG00001017076) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.f.e.a #22 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(ENSPEMG00000031005) #36 Rc3h2 (ENSPEMG00000023441) #37 Pdcl (ENSPEMG00000031426) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 20 Tpm1 (ENSPEMG00000020869) ENSPEMG00000025721 ENSPEMG00000024299 Tln2 (ENSPEMG00000021042) ENSPEMG00000031152 C2cd4b (ENSPEMG00000016908) C2cd4a (ENSPEMG00000013754) Vps13c (ENSPEMG00000016724) Rora (ENSPEMG00000021178) Ice2 (ENSPEMG00000023148) Anxa2 (ENSPEMG00000020921) Foxb1 (ENSPEMG00000026372) Bnip2 (ENSPEMG00000008159) Gtf2a2 (ENSPEMG00000012295) Gcnt3 (ENSPEMG00000009036) ENSPEMG00000026494 #22 Fam81a (ENSPEMG00000020609) Myo1e (ENSPEMG00000020628) Ccnb2 (ENSPEMG00000010693) Rnf111 (ENSPEMG00000011827) Sltm (ENSPEMG00000013263) Mindy2 (ENSPEMG00000030187) ENSPEMG00000028321 Adam10 (ENSPEMG00000023786) Lipc (ENSPEMG00000021222) Aqp9 (ENSPEMG00000020420) Aldh1a2 (ENSPEMG00000017997) Polr2m (ENSPEMG00000027979) ENSPEMG00000029794 Myzap (ENSPEMG00000021267) Cgnl1 (ENSPEMG00000021122) Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 14 Mtarc2 (ENSMOCG00000016564) C130074G19Rik (ENSMOCG00000017582) Mark1 (ENSMOCG00000010578) Rab3gap2 (ENSMOCG00000022853) Iars2 (ENSMOCG00000017822) Bpnt1 (ENSMOCG00000011708) Eprs (ENSMOCG00000012748) ENSMOCG00000016971 Slc30a10 (ENSMOCG00000018487) Lyplal1 (ENSMOCG00000019697) Tgfb2 (ENSMOCG00000022415) Rrp15 (ENSMOCG00000019339) D1Pas1 (ENSMOCG00000002596) Spata17 (ENSMOCG00000006657) Gpatch2 (ENSMOCG00000020821) ENSMOCG00000008935 #22 Esrrg (ENSMOCG00000013956) Kctd3 (ENSMOCG00000021391) Kcnk2 (ENSMOCG00000018400) Cenpf (ENSMOCG00000012377) Ptpn14 (ENSMOCG00000010851) Smyd2 (ENSMOCG00000000847) Prox1 (ENSMOCG00000003310) ENSMOCG00000014377 Rps6kc1 (ENSMOCG00000021401) Angel2 (ENSMOCG00000022027) Vash2 (ENSMOCG00000002399) Flvcr1 (ENSMOCG00000013229) Spata45 (ENSMOCG00000017094) Tatdn3 (ENSMOCG00000019831) Nsl1 (ENSMOCG00000020317) Prairie vole MODERN SPECIES 103 Lama1 (ENSMOCG00000019094) Lrrc30 (ENSMOCG00000022722) Ptprm (ENSMOCG00000001682) Themis3 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Wdr38 (ENSMOCG00000016384) #23 Olfml2a (ENSMOCG00000006167) #24 Nr6a1 (ENSMOCG00000013647) #25 ENSMOCG00000000723 Nr5a1 (ENSMOCG00000022516) #26 ENSMOCG00000019583 #28 Nek6 (ENSMOCG00000020840) #29 Lhx2 (ENSMOCG00000018166) #30 ENSMOCG00000005120 #31 ENSMOCG00000020847 #31 Crb2 (ENSMOCG00000017592) #32 Strbp (ENSMOCG00000022231) #33 Gpr21 (ENSMOCG00000019492) Rabgap1 (ENSMOCG00000015881) #34 Zbtb26 (ENSMOCG00000005785) #35 Prairie vole MODERN SPECIES 302 ENSMOCG00000000128 #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.f.e.b #22 spretus DUPLICATION spretus MODERN SPECIES 6 Shisa8 (MGP_SPRETEiJ_G0020974) Srebf2 (MGP_SPRETEiJ_G0020973) Ccdc134 (MGP_SPRETEiJ_G0020972) Mei1 (MGP_SPRETEiJ_G0020971) 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Xrcc6 (MGP_SPRETEiJ_G0020967) Pmm1 (MGP_SPRETEiJ_G0020966) Csdc2 (MGP_SPRETEiJ_G0020965) Polr3h (MGP_SPRETEiJ_G0020964) Aco2 (MGP_SPRETEiJ_G0020963) Phf5a (MGP_SPRETEiJ_G0020962) Tob2 (MGP_SPRETEiJ_G0020961) MGP_SPRETEiJ_G0020960 MGP_SPRETEiJ_G0020959 #22 MGP_SPRETEiJ_G0020958 #22 Tef (MGP_SPRETEiJ_G0020957) Zc3h7b (MGP_SPRETEiJ_G0020956) Rangap1 (MGP_SPRETEiJ_G0020955) Chadl (MGP_SPRETEiJ_G0020954) L3mbtl2 (MGP_SPRETEiJ_G0020953) Ep300 (MGP_SPRETEiJ_G0020952) Rbx1 (MGP_SPRETEiJ_G0020951) Dnajb7 (MGP_SPRETEiJ_G0020950) Xpnpep3 (MGP_SPRETEiJ_G0020949) St13 (MGP_SPRETEiJ_G0020948) Slc25a17 (MGP_SPRETEiJ_G0020947) Mchr1 (MGP_SPRETEiJ_G0020946) Mrtfa (MGP_SPRETEiJ_G0020945) MGP_SPRETEiJ_G0020944 MGP_SPRETEiJ_G0020943 Steppe mouse MODERN SPECIES 3310 Srgap1 (ENSMSIG00000020811) Kics2 (ENSMSIG00000020776) ENSMSIG00000020773 #22 D930020B18Rik (ENSMSIG00000020731) Xpot (ENSMSIG00000020621) Tbk1 (ENSMSIG00000020585) ENSMSIG00000020582 ENSMSIG00000020569 Gns (ENSMSIG00000020549) Tbc1d30 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(ENSRNOG00000005578) Adamts8 (ENSRNOG00000005574) Adamts15 (ENSRNOG00000009892) Rat MODERN SPECIES 46 Smptb (ENSRNOG00000066859) ENSRNOG00000067767 LOC120099275 (ENSRNOG00000030417) LOC302576 (ENSRNOG00000066885) Mycs (ENSRNOG00000003085) ENSRNOG00000063942 ENSRNOG00000069398 RGD1565862 (ENSRNOG00000068201) Spin2b (ENSRNOG00000062360) ENSRNOG00000068286 Spin2a (ENSRNOG00000031286) LOC102551133 (ENSRNOG00000063966) LOC681355 (ENSRNOG00000069375) Ubqln2 (ENSRNOG00000003099) Klf8 (ENSRNOG00000065004) Rpl35-ps8 (ENSRNOG00000003158) #22 RragB (ENSRNOG00000062421) Foxr2 (ENSRNOG00000030619) Mageh1 (ENSRNOG00000003178) Usp51 (ENSRNOG00000021434) LOC102546830 (ENSRNOG00000059783) Rpgr-ps1 (ENSRNOG00000062329) ENSRNOG00000070642 Fam104b (ENSRNOG00000049908) Alas2 (ENSRNOG00000000167) Apex2 (ENSRNOG00000000166) Pfkfb1 (ENSRNOG00000000165) Tro (ENSRNOG00000067844) AABR07037520.1 (ENSRNOG00000047491) Maged2 (ENSRNOG00000002449) Itih6-ps1 (ENSRNOG00000069211) Rat MODERN SPECIES 18 Ccnb2 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ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 Pika MODERN SPECIES 4096 SCAI (ENSOPRG00000000422) #18 GOLGA1 (ENSOPRG00000000411) #20 ENSOPRG00000000409 #21 RPL35 (ENSOPRG00000000406) #22 WDR38 (ENSOPRG00000000401) #23 OLFML2A (ENSOPRG00000000397) #24 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 432 RALGPS1 (ENSOCUG00000007683) ANGPTL2 (ENSOCUG00000007685) ZBTB34 (ENSOCUG00000025964) #7 ZBTB43 (ENSOCUG00000009799) #8 ENSOCUG00000023786 #9 MVB12B 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(ENSOCUG00000013471) ENSOCUG00000012485 ENSOCUG00000027094 ENSOCUG00000038051 DYM (ENSOCUG00000015851) SMAD7 (ENSOCUG00000024309) CTIF (ENSOCUG00000024842) ENSOCUG00000026631 #22 ZBTB7C (ENSOCUG00000022348) SMAD2 (ENSOCUG00000011290) ENSOCUG00000027573 IER3IP1 (ENSOCUG00000012555) HDHD2 (ENSOCUG00000006979) ENSOCUG00000035984 ENSOCUG00000006940 KATNAL2 (ENSOCUG00000006971) PIAS2 (ENSOCUG00000006900) ENSOCUG00000033989 RNF165 (ENSOCUG00000011801) C18orf25 (ENSOCUG00000009573) HAUS1 (ENSOCUG00000017483) ENSOCUG00000003967 PSTPIP2 (ENSOCUG00000000324) Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 11 SIX2 (ENSOCUG00000027205) CAMKMT (ENSOCUG00000005476) PREPL (ENSOCUG00000005471) SLC3A1 (ENSOCUG00000005464) PPM1B (ENSOCUG00000005461) LRPPRC (ENSOCUG00000015046) ENSOCUG00000037787 ABCG8 (ENSOCUG00000015038) ABCG5 (ENSOCUG00000005300) DYNC2LI1 (ENSOCUG00000005293) PLEKHH2 (ENSOCUG00000024266) THADA (ENSOCUG00000001048) ZFP36L2 (ENSOCUG00000029169) HAAO (ENSOCUG00000015827) MTA3 (ENSOCUG00000012310) ENSOCUG00000027683 #22 KCNG3 (ENSOCUG00000002674) ENSOCUG00000027189 EML4 (ENSOCUG00000015526) PKDCC (ENSOCUG00000002998) ENSOCUG00000038990 SLC8A1 (ENSOCUG00000010854) ENSOCUG00000030843 ENSOCUG00000029945 THUMPD2 (ENSOCUG00000003257) TMEM178A (ENSOCUG00000009872) MAP4K3 (ENSOCUG00000016679) CDKL4 (ENSOCUG00000001117) SOS1 (ENSOCUG00000007844) ARHGEF33 (ENSOCUG00000025920) ENSOCUG00000001075 Rabbit MODERN SPECIES 8 FEM1B (ENSOCUG00000026586) CLN6 (ENSOCUG00000017533) PIAS1 (ENSOCUG00000000618) MAP2K5 (ENSOCUG00000009024) IQCH (ENSOCUG00000006647) AAGAB (ENSOCUG00000006644) ENSOCUG00000039204 SMAD3 (ENSOCUG00000029601) ENSOCUG00000014186 ENSOCUG00000006134 LCTL (ENSOCUG00000021771) ZWILCH (ENSOCUG00000008800) ENSOCUG00000008794 SNAPC5 (ENSOCUG00000039231) MAP2K1 (ENSOCUG00000008782) ENSOCUG00000023060 #22 TIPIN (ENSOCUG00000002212) DIS3L (ENSOCUG00000002206) MEGF11 (ENSOCUG00000014760) RAB11A (ENSOCUG00000014755) DENND4A (ENSOCUG00000007953) ENSOCUG00000027844 INTS14 (ENSOCUG00000007520) HACD3 (ENSOCUG00000007513) DPP8 (ENSOCUG00000011751) IGDCC4 (ENSOCUG00000000312) IGDCC3 (ENSOCUG00000000310) PARP16 (ENSOCUG00000007306) CILP (ENSOCUG00000007302) CLPX (ENSOCUG00000007293) PDCD7 (ENSOCUG00000007292) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 2087 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 Hedgehog MODERN SPECIES 14146 RPL35 (ENSEEUG00000012696) #22 WDR38 (ENSEEUG00000012711) #23 Common shrew MODERN SPECIES 2569 RPL35 (ENSSARG00000001607) #22 WDR38 (ENSSARG00000001583) #23 Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Sperm whale MODERN SPECIES 20 NCBP1 (ENSPCTG00005012790) XPA (ENSPCTG00005012752) ENSPCTG00005012741 FOXE1 (ENSPCTG00005012727) ENSPCTG00005012706 TRMO (ENSPCTG00005012657) HEMGN (ENSPCTG00005012629) ENSPCTG00005012572 NANS (ENSPCTG00005012522) ENSPCTG00005012512 CORO2A (ENSPCTG00005012032) ENSPCTG00005011983 GABBR2 (ENSPCTG00005011749) ANKS6 (ENSPCTG00005011527) GALNT12 (ENSPCTG00005011405) ENSPCTG00005011349 #22 COL15A1 (ENSPCTG00005010849) TGFBR1 (ENSPCTG00005010608) ALG2 (ENSPCTG00005010557) SEC61B (ENSPCTG00005010498) NR4A3 (ENSPCTG00005010285) STX17 (ENSPCTG00005010163) ERP44 (ENSPCTG00005010100) INVS (ENSPCTG00005009930) TEX10 (ENSPCTG00005009684) MSANTD3 (ENSPCTG00005009646) TMEFF1 (ENSPCTG00005009545) CAVIN4 (ENSPCTG00005009493) PLPPR1 (ENSPCTG00005009399) BAAT (ENSPCTG00005009322) MRPL50 (ENSPCTG00005009280) Blue whale MODERN SPECIES 18 ENSBMSG00010011216 TANC1 (ENSBMSG00010005741) DAPL1 (ENSBMSG00010005696) PKP4 (ENSBMSG00010005675) CCDC148 (ENSBMSG00010005632) UPP2 (ENSBMSG00010005599) ACVR1 (ENSBMSG00010005582) ACVR1C (ENSBMSG00010005515) CYTIP (ENSBMSG00010005488) ERMN (ENSBMSG00010005478) GALNT5 (ENSBMSG00010005462) ENSBMSG00010005448 GPD2 (ENSBMSG00010005434) NR4A2 (ENSBMSG00010005418) ENSBMSG00010005381 ENSBMSG00010005366 #22 GALNT13 (ENSBMSG00010005342) RPRM (ENSBMSG00010005320) ARL6IP6 (ENSBMSG00010005306) PRPF40A (ENSBMSG00010005288) FMNL2 (ENSBMSG00010005238) STAM2 (ENSBMSG00010005180) CACNB4 (ENSBMSG00010003258) ARL5A (ENSBMSG00010002880) NEB (ENSBMSG00010002643) RIF1 (ENSBMSG00010002436) ENSBMSG00010002399 TNFAIP6 (ENSBMSG00010002386) NMI (ENSBMSG00010002366) RBM43 (ENSBMSG00010002353) RND3 (ENSBMSG00010002335) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1221 MYL3 (ENSMMSG00000020101) PTH1R (ENSMMSG00000020124) CCDC12 (ENSMMSG00000020186) NBEAL2 (ENSMMSG00000020307) ENSMMSG00000020733 SETD2 (ENSMMSG00000020751) KIF9 (ENSMMSG00000020809) KLHL18 (ENSMMSG00000020935) ENSMMSG00000020970 PTPN23 (ENSMMSG00000020981) SCAP (ENSMMSG00000021044) ELP6 (ENSMMSG00000021159) CSPG5 (ENSMMSG00000021192) SMARCC1 (ENSMMSG00000021284) ENSMMSG00000021378 ENSMMSG00000021398 #22 DHX30 (ENSMMSG00000021457) ENSMMSG00000021669 CDC25A (ENSMMSG00000021780) ENSMMSG00000021869 ENSMMSG00000021876 ENSMMSG00000021889 ENSMMSG00000021896 ENSMMSG00000021916 ENSMMSG00000021940 NME6 (ENSMMSG00000021967) SPINK8 (ENSMMSG00000022039) ENSMMSG00000022058 PLXNB1 (ENSMMSG00000022078) ENSMMSG00000022157 TMA7 (ENSMMSG00000022180) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.a #22 Tiger MODERN SPECIES 473 ZBTB34 (ENSPTIG00000006352) #7 ZBTB43 (ENSPTIG00000006342) #8 LMX1B (ENSPTIG00000015206) #9 MVB12B (ENSPTIG00000014948) #11 PBX3 (ENSPTIG00000014417) #12 MAPKAP1 (ENSPTIG00000012826) #13 GAPVD1 (ENSPTIG00000010076) #14 ENSPTIG00000006297 HSPA5 (ENSPTIG00000009854) #15 RABEPK (ENSPTIG00000009569) #16 ENSPTIG00000009511 PPP6C (ENSPTIG00000007118) #17 SCAI (ENSPTIG00000006221) #18 GOLGA1 (ENSPTIG00000005468) #20 ENSPTIG00000004434 #21 ENSPTIG00000003358 #22 WDR38 (ENSPTIG00000001191) #23 OLFML2A (ENSPTIG00000000256) #24 NR6A1 (ENSPTIG00000019310) #25 NR5A1 (ENSPTIG00000018980) #26 ADGRD2 (ENSPTIG00000018740) #27 PSMB7 (ENSPTIG00000018529) #28 NEK6 (ENSPTIG00000018068) #29 LHX2 (ENSPTIG00000017789) #30 DENND1A (ENSPTIG00000017243) #31 CRB2 (ENSPTIG00000016442) #32 STRBP (ENSPTIG00000015831) #33 RABGAP1 (ENSPTIG00000015522) #34 ZBTB26 (ENSPTIG00000006045) #35 ZBTB6 (ENSPTIG00000006037) #36 RC3H2 (ENSPTIG00000014257) #37 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Yarkand deer MODERN SPECIES 12 CC2D1B (ENSCHYG00000011330) ZFYVE9 (ENSCHYG00000011418) BTF3L4 (ENSCHYG00000011776) TXNDC12 (ENSCHYG00000011889) RAB3B (ENSCHYG00000011948) NRDC (ENSCHYG00000012147) ENSCHYG00000016488 ENSCHYG00000016631 ENSCHYG00000018015 EPS15 (ENSCHYG00000018363) TTC39A (ENSCHYG00000019043) RNF11 (ENSCHYG00000020010) C1orf185 (ENSCHYG00000020169) CDKN2C (ENSCHYG00000020293) FAF1 (ENSCHYG00000020360) ENSCHYG00000020992 #22 ELAVL4 (ENSCHYG00000021125) AGBL4 (ENSCHYG00000021988) ENSCHYG00000022139 BEND5 (ENSCHYG00000022182) SPATA6 (ENSCHYG00000022292) SLC5A9 (ENSCHYG00000022514) ENSCHYG00000022669 ENSCHYG00000022715 ENSCHYG00000022779 TRABD2B (ENSCHYG00000022894) ENSCHYG00000022932 FOXD2 (ENSCHYG00000022949) CMPK1 (ENSCHYG00000022970) STIL (ENSCHYG00000023044) TAL1 (ENSCHYG00000023140) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 American bison MODERN SPECIES 2598 ENSBBBG00000024006 #22 ENSBBBG00000023998 CHD2 (ENSBBBG00000008637) ENSBBBG00000023723 ENSBBBG00000023711 ENSBBBG00000023707 FAM174B (ENSBBBG00000023692) ST8SIA2 (ENSBBBG00000023673) SLCO3A1 (ENSBBBG00000023617) SV2B (ENSBBBG00000023594) ENSBBBG00000007483 ENSBBBG00000023371 ENSBBBG00000006111 AGBL1 (ENSBBBG00000023350) NTRK3 (ENSBBBG00000023291) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1224 VSIG10L2 (ENSMMSG00000022093) DDX25 (ENSMMSG00000022122) PUS3 (ENSMMSG00000022148) HYLS1 (ENSMMSG00000022160) PATE3 (ENSMMSG00000022174) PATE2 (ENSMMSG00000022190) PATE1 (ENSMMSG00000022210) ENSMMSG00000022244 ENSMMSG00000022256 ENSMMSG00000022264 ENSMMSG00000022270 ACRV1 (ENSMMSG00000022284) CHEK1 (ENSMMSG00000022326) STT3A (ENSMMSG00000022380) EI24 (ENSMMSG00000022411) ENSMMSG00000022445 #22 FEZ1 (ENSMMSG00000022452) PKNOX2 (ENSMMSG00000022470) TMEM218 (ENSMMSG00000022499) SLC37A2 (ENSMMSG00000022511) ENSMMSG00000022545 HEPACAM (ENSMMSG00000022573) ROBO4 (ENSMMSG00000022601) ROBO3 (ENSMMSG00000022632) ENSMMSG00000022678 MSANTD2 (ENSMMSG00000022689) ESAM (ENSMMSG00000022704) VSIG2 (ENSMMSG00000022710) NRGN (ENSMMSG00000022718) SPA17 (ENSMMSG00000022728) SIAE (ENSMMSG00000022738) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Blue whale MODERN SPECIES 18 ENSBMSG00010002378 AP1S3 (ENSBMSG00010002408) WDFY1 (ENSBMSG00010002434) MRPL44 (ENSBMSG00010002449) SERPINE2 (ENSBMSG00010002471) FAM124B (ENSBMSG00010002493) ENSBMSG00010002507 CUL3 (ENSBMSG00010002528) CCDC195 (ENSBMSG00010002585) DOCK10 (ENSBMSG00010002723) ENSBMSG00010002929 NYAP2 (ENSBMSG00010002939) ENSBMSG00010002950 IRS1 (ENSBMSG00010002959) RHBDD1 (ENSBMSG00010002962) ENSBMSG00010002968 #22 COL4A4 (ENSBMSG00010002977) COL4A3 (ENSBMSG00010003041) ENSBMSG00010003122 TM4SF20 (ENSBMSG00010003234) AGFG1 (ENSBMSG00010003307) ENSBMSG00010003632 ENSBMSG00010003644 ENSBMSG00010003649 ENSBMSG00010003655 ENSBMSG00010003663 ENSBMSG00010003672 CCL20 (ENSBMSG00010003686) DAW1 (ENSBMSG00010003700) SPHKAP (ENSBMSG00010003729) PID1 (ENSBMSG00010003756) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.f.c.b #22 Horse MODERN SPECIES 17 RALGPS1 (ENSECAG00000013574) ZBTB34 (ENSECAG00000029669) #7 ZBTB43 (ENSECAG00000013239) #8 LMX1B (ENSECAG00000029610) #9 MVB12B (ENSECAG00000017566) #11 ENSECAG00000002719 PBX3 (ENSECAG00000016804) #12 MAPKAP1 (ENSECAG00000020453) #13 GAPVD1 (ENSECAG00000012787) #14 HSPA5 (ENSECAG00000024205) #15 RABEPK (ENSECAG00000021517) #16 PPP6C (ENSECAG00000015767) #17 SCAI (ENSECAG00000024008) #18 GOLGA1 (ENSECAG00000015124) #20 WDR38 (ENSECAG00000006383) #23 ENSECAG00000045439 #22 OLFML2A (ENSECAG00000023908) #24 NR6A1 (ENSECAG00000021324) #25 NR5A1 (ENSECAG00000013752) #26 ADGRD2 (ENSECAG00000009351) #27 PSMB7 (ENSECAG00000023415) #28 NEK6 (ENSECAG00000009941) #29 LHX2 (ENSECAG00000009405) #30 ENSECAG00000055062 ENSECAG00000027494 DENND1A (ENSECAG00000022391) #31 CRB2 (ENSECAG00000021531) #32 STRBP (ENSECAG00000008465) #33 GPR21 (ENSECAG00000053059) RABGAP1 (ENSECAG00000017729) #34 ZBTB26 (ENSECAG00000017397) #35 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.d #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 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#22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Chacoan peccary MODERN SPECIES 887 ZBTB34 (ENSCWAG00000014869) #7 ZBTB43 (ENSCWAG00000014897) #8 LMX1B (ENSCWAG00000014916) #9 MVB12B (ENSCWAG00000015058) #11 ENSCWAG00000015098 PBX3 (ENSCWAG00000015147) #12 MAPKAP1 (ENSCWAG00000015226) #13 ENSCWAG00000015419 GAPVD1 (ENSCWAG00000015492) #14 HSPA5 (ENSCWAG00000015743) #15 RABEPK (ENSCWAG00000015788) #16 PPP6C (ENSCWAG00000015841) #17 SCAI (ENSCWAG00000015880) #18 GOLGA1 (ENSCWAG00000015995) #20 ARPC5L (ENSCWAG00000016051) #21 ENSCWAG00000016078 #22 WDR38 (ENSCWAG00000016114) #23 OLFML2A (ENSCWAG00000016191) #24 NR6A1 (ENSCWAG00000016277) #25 NR5A1 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ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155946 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.d #22 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 Beluga whale MODERN SPECIES 19 RALGPS1 (ENSDLEG00000015117) ANGPTL2 (ENSDLEG00000015143) ZBTB34 (ENSDLEG00000015149) #7 ZBTB43 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ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 ENSGT00940000153683.b Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 2 THBS4 (ENSBGRG00000004748) SERINC5 (ENSBGRG00000004575) GNPNAT1 (ENSBGRG00000004543) STYX (ENSBGRG00000004422) ENSBGRG00000004401 PSMC6 (ENSBGRG00000004257) ERO1A (ENSBGRG00000004190) GPR137C (ENSBGRG00000004169) TXNDC16 (ENSBGRG00000004037) PTGER2 (ENSBGRG00000004014) SPG21 (ENSBGRG00000003878) MTFMT (ENSBGRG00000003791) SLC51B (ENSBGRG00000003756) RASL12 (ENSBGRG00000003705) KBTBD13 (ENSBGRG00000003675) ENSBGRG00000003640 #22 UBAP1L (ENSBGRG00000003616) PDCD7 (ENSBGRG00000025646) CLPX (ENSBGRG00000025615) CILP (ENSBGRG00000025584) PARP16 (ENSBGRG00000025545) IGDCC3 (ENSBGRG00000025511) IGDCC4 (ENSBGRG00000025454) DPP8 (ENSBGRG00000025360) 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(ENSPVAG00000008085) #23 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00620000088615 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f.d #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 3 RALGPS1 (ENSRFEG00010013214) ZBTB34 (ENSRFEG00010013147) #7 ZBTB43 (ENSRFEG00010013135) #8 LMX1B (ENSRFEG00010012903) #9 MVB12B 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ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 90 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 ENSGT00940000159569 Sloth MODERN SPECIES 2982 RPL35 (ENSCHOG00000002277) #22 Armadillo MODERN SPECIES 2027 PBX3 (ENSDNOG00000043756) #12 MAPKAP1 (ENSDNOG00000038808) #13 GAPVD1 (ENSDNOG00000009683) #14 HSPA5 (ENSDNOG00000031601) #15 RABEPK (ENSDNOG00000015327) #16 PPP6C (ENSDNOG00000045474) #17 SCAI (ENSDNOG00000000007) #18 GOLGA1 (ENSDNOG00000000005) #20 ENSDNOG00000033968 #22 WDR38 (ENSDNOG00000046480) #23 OLFML2A (ENSDNOG00000040474) #24 ENSDNOG00000033680 NR6A1 (ENSDNOG00000017832) #25 ENSDNOG00000032252 NR5A1 (ENSDNOG00000040922) #26 ADGRD2 (ENSDNOG00000015410) #27 PSMB7 (ENSDNOG00000015332) #28 NEK6 (ENSDNOG00000015320) #29 LHX2 (ENSDNOG00000000465) #30 ENSDNOG00000045998 DENND1A (ENSDNOG00000034926) #31 CRB2 (ENSDNOG00000038587) #32 STRBP (ENSDNOG00000043330) #33 RABGAP1 (ENSDNOG00000013366) #34 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000158795 ENSGT00940000159362 ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Tenrec MODERN SPECIES 10731 RPL35 (ENSETEG00000000876) #22 WDR38 (ENSETEG00000000879) #23 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155946 ENSGT00940000154079.b ENSGT00940000159944 #7 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384.f #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 ENSGT00940000157685 #37 Hyrax MODERN SPECIES 2694 HSPA5 (ENSPCAG00000014311) #15 RABEPK (ENSPCAG00000014265) #16 PPP6C (ENSPCAG00000014214) #17 SCAI (ENSPCAG00000014089) #18 GOLGA1 (ENSPCAG00000013961) #20 ARPC5L (ENSPCAG00000013936) #21 RPL35 (ENSPCAG00000013906) #22 WDR38 (ENSPCAG00000013811) #23 Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 301 ACVR1 (ENSLAFG00000006865) ENSLAFG00000028549 CCDC148 (ENSLAFG00000002906) PKP4 (ENSLAFG00000011403) DAPL1 (ENSLAFG00000004582) TANC1 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(ENSDNOG00000048304) CCNJL (ENSDNOG00000047995) C1QTNF2 (ENSDNOG00000037691) SLU7 (ENSDNOG00000048745) ENSDNOG00000024080 ATP10B (ENSDNOG00000013369) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Goat MODERN SPECIES 14 IL17RE (ENSCHIG00000006313) JAGN1 (ENSCHIG00000011838) CIDEC (ENSCHIG00000023951) RPUSD3 (ENSCHIG00000026027) ENSCHIG00000024138 ENSCHIG00000015904 ARPC4 (ENSCHIG00000015714) TADA3 (ENSCHIG00000012388) CAMK1 (ENSCHIG00000018171) OGG1 (ENSCHIG00000022673) BRPF1 (ENSCHIG00000013470) CPNE9 (ENSCHIG00000023346) MTMR14 (ENSCHIG00000016043) LHFPL4 (ENSCHIG00000018946) SETD5 (ENSCHIG00000025966) ENSCHIG00000010782 ##22 THUMPD3 (ENSCHIG00000024037) SRGAP3 (ENSCHIG00000019201) ENSCHIG00000016941 RAD18 (ENSCHIG00000007965) OXTR (ENSCHIG00000007774) CAV3 (ENSCHIG00000010009) SSUH2 (ENSCHIG00000021708) LMCD1 (ENSCHIG00000012706) GRM7 (ENSCHIG00000000474) ENSCHIG00000021691 ENSCHIG00000008494 EDEM1 (ENSCHIG00000011192) ARL8B (ENSCHIG00000011960) BHLHE40 (ENSCHIG00000014557) ITPR1 (ENSCHIG00000018318) Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Chacoan peccary MODERN SPECIES 216 MTUS2 (ENSCWAG00000017501) SLC46A3 (ENSCWAG00000017732) POMP (ENSCWAG00000017771) ENSCWAG00000017809 FLT1 (ENSCWAG00000017867) PAN3 (ENSCWAG00000018033) FLT3 (ENSCWAG00000018108) URAD (ENSCWAG00000018244) CDX2 (ENSCWAG00000018265) PDX1 (ENSCWAG00000018319) GSX1 (ENSCWAG00000018331) POLR1D (ENSCWAG00000018355) LNX2 (ENSCWAG00000018415) MTIF3 (ENSCWAG00000018433) GTF3A (ENSCWAG00000018454) ENSCWAG00000018472 ##22 RASL11A (ENSCWAG00000018481) RPL21 (ENSCWAG00000018513) USP12 (ENSCWAG00000018548) ENSCWAG00000018581 GPR12 (ENSCWAG00000018600) WASF3 (ENSCWAG00000018614) CDK8 (ENSCWAG00000018646) ENSCWAG00000018769 RNF6 (ENSCWAG00000018783) ENSCWAG00000018820 SHISA2 (ENSCWAG00000019042) ATP8A2 (ENSCWAG00000019075) NUP58 (ENSCWAG00000019230) MTMR6 (ENSCWAG00000019277) AMER2 (ENSCWAG00000019308) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.a ##22 Gorilla MODERN SPECIES 10 GADD45B (ENSGGOG00000028478) GNG7 (ENSGGOG00000042768) DIRAS1 (ENSGGOG00000004553) SLC39A3 (ENSGGOG00000039245) SGTA (ENSGGOG00000007913) THOP1 (ENSGGOG00000007922) ZNF554 (ENSGGOG00000026098) ENSGGOG00000001761 ZNF556 (ENSGGOG00000008748) ZNF57 (ENSGGOG00000006285) ZNF77 (ENSGGOG00000010217) TLE6 (ENSGGOG00000014760) TLE2 (ENSGGOG00000014765) ENSGGOG00000010731 GNA11 (ENSGGOG00000014995) ENSGGOG00000040253 ##22 GNA15 (ENSGGOG00000003077) NCLN (ENSGGOG00000010398) ENSGGOG00000041211 NFIC (ENSGGOG00000006557) ENSGGOG00000038229 SMIM44 (ENSGGOG00000036474) ENSGGOG00000011214 FZR1 (ENSGGOG00000002200) TEKTIP1 (ENSGGOG00000002202) MFSD12 (ENSGGOG00000002205) HMG20B (ENSGGOG00000014805) GIPC3 (ENSGGOG00000027202) TBXA2R (ENSGGOG00000013761) CACTIN (ENSGGOG00000012532) PIP5K1C (ENSGGOG00000012543) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Goat MODERN SPECIES 10 DDX42 (ENSCHIG00000014431) CCDC47 (ENSCHIG00000021368) STRADA (ENSCHIG00000005800) LIMD2 (ENSCHIG00000015899) MAP3K3 (ENSCHIG00000013641) TACO1 (ENSCHIG00000021422) DCAF7 (ENSCHIG00000004757) KCNH6 (ENSCHIG00000019165) ENSCHIG00000024353 ACE (ENSCHIG00000012043) CYB561 (ENSCHIG00000021375) TANC2 (ENSCHIG00000002001) ENSCHIG00000005073 MARCHF10 (ENSCHIG00000023431) MRC2 (ENSCHIG00000007519) ENSCHIG00000015998 ##22 TLK2 (ENSCHIG00000012645) ENSCHIG00000018396 EFCAB3 (ENSCHIG00000024214) ENSCHIG00000010095 ITGB3 (ENSCHIG00000017892) MYL4 (ENSCHIG00000015146) CDC27 (ENSCHIG00000019893) KANSL1 (ENSCHIG00000023974) MAPT (ENSCHIG00000026221) SPPL2C (ENSCHIG00000002390) CRHR1 (ENSCHIG00000019825) ENSCHIG00000027099 NSF (ENSCHIG00000012970) WNT3 (ENSCHIG00000018818) WNT9B (ENSCHIG00000027031) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000016384.e.b ##22 Armadillo MODERN SPECIES 1176 ENSDNOG00000040009 ##22 UCK2 (ENSDNOG00000012589) TMCO1 (ENSDNOG00000007020) ALDH9A1 (ENSDNOG00000017232) ENSDNOG00000006088 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000164541 ENSGT00940000160293 ENSGT00390000002471 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384 #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540 #30 ENSGT00940000156261 #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 ENSGT00940000161459 #36 Opossum MODERN SPECIES ZBTB43 (ENSMODG00000019790) #8 LMX1B (ENSMODG00000019789) #9 MVB12B (ENSMODG00000019787) #11 ENSMODG00000039977 PBX3 (ENSMODG00000019785) #12 ENSMODG00000049965 MAPKAP1 (ENSMODG00000019775) #13 GAPVD1 (ENSMODG00000019772) #14 HSPA5 (ENSMODG00000019764) #15 RABEPK (ENSMODG00000019763) #16 PPP6C (ENSMODG00000039439) #17 ENSMODG00000029560 SCAI (ENSMODG00000019760) #18 GOLGA1 (ENSMODG00000019758) #20 ARPC5L (ENSMODG00000019755) #21 RPL35 (ENSMODG00000019753) #22 ENSMODG00000019752 #23 OLFML2A (ENSMODG00000019750) #24 NR6A1 (ENSMODG00000019748) #25 NR5A1 (ENSMODG00000019746) #26 ENSMODG00000019744 #27 PSMB7 (ENSMODG00000019742) #28 NEK6 (ENSMODG00000019741) #29 LHX2 (ENSMODG00000019739) #30 DENND1A (ENSMODG00000019737) #31 ENSMODG00000019734 #32 STRBP (ENSMODG00000019732) #33 RABGAP1 (ENSMODG00000019729) #34 ZBTB26 (ENSMODG00000023552) #35 ZBTB6 (ENSMODG00000023551) #36 RC3H2 (ENSMODG00000019725) #37 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160616 #8 ENSGT00940000157955 #9 ENSGT00940000155945 #11 ENSGT00940000164541 ENSGT00940000160293 ENSGT00390000002471 ENSGT00940000154374.a #12 ENSGT00390000000642 #13 ENSGT00940000156611 #14 ENSGT00940000154787 #15 ENSGT00940000158763 #16 ENSGT00550000074961 #17 ENSGT00390000009566 #18 ENSGT00940000153772.B #20 ENSGT00940000158501 #21 ENSGT00390000016384 #22 ENSGT00940000162358 #23 ENSGT00940000157194 #24 ENSGT00940000157936 #25 ENSGT00940000153391.c.b.a #26 ENSGT00940000161534 #27 ENSGT00940000157419 #28 ENSGT00940000159990 #29 ENSGT00940000158540.a #30 ENSGT00940000158540.b #30 ENSGT00940000156261.d #31 ENSGT00950000183101.a.b.b #32 ENSGT00940000154687.B #33 ENSGT00940000163543 ENSGT00940000157216 #34 ENSGT00940000157920.a #35 Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 RALGPS1 (ENSSHAG00000013101) ENSSHAG00000031849 ZBTB43 (ENSSHAG00000030880) #8 ZBTB34 (ENSSHAG00000025162) #7 LMX1B (ENSSHAG00000009990) #9 MVB12B (ENSSHAG00000028126) #11 PBX3 (ENSSHAG00000023136) #12 MAPKAP1 (ENSSHAG00000005395) #13 GAPVD1 (ENSSHAG00000009639) #14 HSPA5 (ENSSHAG00000021738) #15 RABEPK (ENSSHAG00000008678) #16 PPP6C (ENSSHAG00000023513) #17 SCAI (ENSSHAG00000006233) #18 GOLGA1 (ENSSHAG00000005279) #20 ARPC5L (ENSSHAG00000031667) #21 RPL35 (ENSSHAG00000004756) #22 ENSSHAG00000004224 #23 OLFML2A (ENSSHAG00000028473) #24 NR6A1 (ENSSHAG00000030299) #25 NR5A1 (ENSSHAG00000025642) #26 ENSSHAG00000023389 #27 PSMB7 (ENSSHAG00000016059) #28 NEK6 (ENSSHAG00000015827) #29 ENSSHAG00000026980 LHX2 (ENSSHAG00000014985) #30 ENSSHAG00000029112 #31 ENSSHAG00000027671 #31 ENSSHAG00000011663 STRBP (ENSSHAG00000009918) #33 GPR21 (ENSSHAG00000026905) RABGAP1 (ENSSHAG00000008396) #34 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 4 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