Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000017343 #9	ENSGT01000000214413.b.a.b.a #10	ENSGT00940000159164 #11	ENSGT00390000017213.A #12	ENSGT00390000001745 #13	ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #14	ENSGT01030000234816 #15	ENSGT00390000005023.a #16	ENSGT00940000159873 #17	ENSGT00510000049460 #18	ENSGT00940000156904 #19	ENSGT01100000267007	ENSGT00940000159033 #20	ENSGT00390000000826 #21	ENSGT00950000183136.b.b	ENSGT00940000155088 #22	ENSGT00940000161554 #23	ENSGT00510000046803.b.b #24	ENSGT00940000153298.n #25	ENSGT00940000153566.a #26	ENSGT00390000018821 #27	ENSGT00940000161390 #28	ENSGT00940000160453 #29	ENSGT00510000049297 #30	ENSGT00940000162178 #31	ENSGT00940000160952 #32	ENSGT00940000159540 #33	ENSGT00940000161250 #34	ENSGT00940000155083.b	ENSGT00940000155810	ENSGT00940000155840.C
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000156036 #8	ENSGT00390000017343 #9	ENSGT01000000214413.b.a.b.a #10	ENSGT00940000159164 #11	ENSGT00390000017213.A #12	ENSGT00390000001745 #13	ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #14	ENSGT01030000234816 #15	ENSGT00390000005023.a #16	ENSGT00940000159873 #17	ENSGT00510000049460 #18	ENSGT00940000156904 #19	ENSGT00940000159033 #20	ENSGT00390000000826 #21	ENSGT00950000183136.b.b	ENSGT00940000155088 #22	ENSGT00940000161554 #23	ENSGT00510000046803.b.b #24	ENSGT00940000153298.n #25	ENSGT00940000153566.a #26	ENSGT00390000018821 #27	ENSGT00940000161390 #28	ENSGT00940000160453 #29	ENSGT00510000049297 #30	ENSGT00940000162178 #31	ENSGT00940000160952 #32	ENSGT00940000159540 #33	ENSGT00940000161250 #34	ENSGT00940000155083.b	ENSGT00940000155810	ENSGT00940000155840.C
Guinea pig	MODERN SPECIES	107	TPI1 (ENSCPOG00000012344) #7	USP5 (ENSCPOG00000012336) #8	CDCA3 (ENSCPOG00000012334) #9	GNB3 (ENSCPOG00000025068) #10	P3H3 (ENSCPOG00000012330) #11	GPR162 (ENSCPOG00000038691) #12	ENSCPOG00000012324 #13	LAG3 (ENSCPOG00000012321) #14	PTMS (ENSCPOG00000021676) #15	MLF2 (ENSCPOG00000035372) #16	COPS7A (ENSCPOG00000000315) #17	PIANP (ENSCPOG00000000349) #18	ZNF384 (ENSCPOG00000012313) #19	ING4 (ENSCPOG00000012311) #20	ACRBP (ENSCPOG00000012300) #21	CHD4 (ENSCPOG00000008504) #22	NOP2 (ENSCPOG00000020690) #23	IFFO1 (ENSCPOG00000001041) #24	Gapdh (ENSCPOG00000026350) #25	NCAPD2 (ENSCPOG00000008480) #26	MRPL51 (ENSCPOG00000008478) #27	VAMP1 (ENSCPOG00000008473) #28	TAPBPL (ENSCPOG00000008460) #29	CD27 (ENSCPOG00000008449) #30	LTBR (ENSCPOG00000035613) #31	SCNN1A (ENSCPOG00000006185) #32	TNFRSF1A (ENSCPOG00000031352) #33	PLEKHG6 (ENSCPOG00000000576) #34	TEX52 (ENSCPOG00000008276) #35	FOXM1 (ENSCPOG00000015373) #36	RHNO1 (ENSCPOG00000035546) #37
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000156036 #8	ENSGT00390000017343 #9	ENSGT01000000214413.b.a.b.a #10	ENSGT00940000159164 #11	ENSGT00390000017213.A #12	ENSGT00390000001745 #13	ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a #14	ENSGT01030000234816 #15	ENSGT00390000005023.a #16	ENSGT00940000159873 #17	ENSGT00510000049460 #18	ENSGT00940000156904 #19	ENSGT00940000159033 #20	ENSGT00390000000826 #21	ENSGT00950000183136.b.b	ENSGT00940000155088 #22	ENSGT00940000161554 #23	ENSGT00510000046803.b.b #24	ENSGT00940000153298.n #25	ENSGT00940000153566.a #26	ENSGT00390000018821 #27	ENSGT00940000161390 #28	ENSGT00940000160453 #29	ENSGT00510000049297 #30	ENSGT00940000162178 #31	ENSGT00940000160952 #32	ENSGT00940000159540 #33	ENSGT00940000161250 #34	ENSGT00940000155083.b	ENSGT00940000155810	ENSGT00940000155840.C
Degu	MODERN SPECIES	219	CDCA3 (ENSODEG00000003383) #9	GNB3 (ENSODEG00000003424) #10	P3H3 (ENSODEG00000003441) #11	GPR162 (ENSODEG00000003518) #12	ENSODEG00000018791	ENSODEG00000002251	LAG3 (ENSODEG00000002278) #14	ENSODEG00000002310 #15	MLF2 (ENSODEG00000002383) #16	COPS7A (ENSODEG00000002432) #17	ENSODEG00000002475	PIANP (ENSODEG00000002502) #18	ZNF384 (ENSODEG00000002585) #19	ING4 (ENSODEG00000002865) #20	ACRBP (ENSODEG00000002969) #21	CHD4 (ENSODEG00000003114) #22	ENSODEG00000003567	ENSODEG00000003579 #24	ENSODEG00000004114 #25	NCAPD2 (ENSODEG00000004156) #26	MRPL51 (ENSODEG00000004435) #27	VAMP1 (ENSODEG00000004453) #28	TAPBPL (ENSODEG00000004477) #29	CD27 (ENSODEG00000004529) #30	LTBR (ENSODEG00000004616) #31	SCNN1A (ENSODEG00000004767) #32	TNFRSF1A (ENSODEG00000004861) #33	PLEKHG6 (ENSODEG00000005186) #34	CD9 (ENSODEG00000005241)	VWF (ENSODEG00000002617)	ANO2 (ENSODEG00000002927)
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	120	USP5 (ENSCLAG00000015551) #8	CDCA3 (ENSCLAG00000013619) #9	GNB3 (ENSCLAG00000014669) #10	P3H3 (ENSCLAG00000012569) #11	GPR162 (ENSCLAG00000015020) #12	CD4 (ENSCLAG00000016197) #13	LAG3 (ENSCLAG00000014680) #14	PTMS (ENSCLAG00000016337) #15	MLF2 (ENSCLAG00000013739) #16	COPS7A (ENSCLAG00000014244) #17	PIANP (ENSCLAG00000016394) #18	ZNF384 (ENSCLAG00000015550) #19	ING4 (ENSCLAG00000014519) #20	ENSCLAG00000014500 #21	LPAR5 (ENSCLAG00000014166)	CHD4 (ENSCLAG00000012244) #22	NOP2 (ENSCLAG00000014440) #23	IFFO1 (ENSCLAG00000014944) #24	GAPDH (ENSCLAG00000013783) #25	NCAPD2 (ENSCLAG00000013118) #26	MRPL51 (ENSCLAG00000011881) #27	VAMP1 (ENSCLAG00000012860) #28	TAPBPL (ENSCLAG00000016184) #29	CD27 (ENSCLAG00000016154) #30	LTBR (ENSCLAG00000013106) #31	SCNN1A (ENSCLAG00000015244) #32	TNFRSF1A (ENSCLAG00000016084) #33	PLEKHG6 (ENSCLAG00000015229) #34	CD9 (ENSCLAG00000013477)	VWF (ENSCLAG00000014671)	ANO2 (ENSCLAG00000015450)
Naked mole-rat female	MODERN SPECIES	24	GNB3 (ENSHGLG00000005327) #10	P3H3 (ENSHGLG00000004948) #11	GPR162 (ENSHGLG00000004580) #12	CD4 (ENSHGLG00000004194) #13	LAG3 (ENSHGLG00000004095) #14	PTMS (ENSHGLG00000038669) #15	MLF2 (ENSHGLG00000003883) #16	COPS7A (ENSHGLG00000032684) #17	PIANP (ENSHGLG00000003689) #18	ZNF384 (ENSHGLG00000003572) #19	ENSHGLG00000039857	Ing4 (ENSHGLG00000003447) #20	ACRBP (ENSHGLG00000003358) #21	ENSHGLG00000047116	LPAR5 (ENSHGLG00000033434)	CHD4 (ENSHGLG00000003093) #22	NOP2 (ENSHGLG00000042932) #23	IFFO1 (ENSHGLG00000002934) #24	GAPDH (ENSHGLG00000002856) #25	ENSHGLG00000036344	NCAPD2 (ENSHGLG00000001934) #26	MRPL51 (ENSHGLG00000050005) #27	ENSHGLG00000001867 #28	TAPBPL (ENSHGLG00000001831) #29	CD27 (ENSHGLG00000046681) #30	LTBR (ENSHGLG00000032405) #31	SCNN1A (ENSHGLG00000001735) #32	TNFRSF1A (ENSHGLG00000001689) #33	PLEKHG6 (ENSHGLG00000001657) #34	CD9 (ENSHGLG00000001625)	VWF (ENSHGLG00000001451)