Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013354.d ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Eutheria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 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ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00910000146795 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Tarsier MODERN SPECIES 2399 CHD4 (ENSTSYG00000006069) #22 NOP2 (ENSTSYG00000006030) #23 ENSTSYG00000031266 #24 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a.d.b.a ENSGT00940000153566.a.g ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146645 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 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ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Capuchin MODERN SPECIES 187 PARP11 (ENSCCAG00000033980) ENSCCAG00000034059 CCND2 (ENSCCAG00000032243) TIGAR (ENSCCAG00000022810) FGF23 (ENSCCAG00000022167) FGF6 (ENSCCAG00000033191) C12orf4 (ENSCCAG00000020852) RAD51AP1 (ENSCCAG00000032881) DYRK4 (ENSCCAG00000030043) COPS7A (ENSCCAG00000028279) ENSCCAG00000031566 PIANP (ENSCCAG00000029227) ZNF384 (ENSCCAG00000032088) ING4 (ENSCCAG00000027875) ACRBP (ENSCCAG00000019365) CHD4 (ENSCCAG00000009686) #22 ENSCCAG00000037712 IFFO1 (ENSCCAG00000031460) #24 ENSCCAG00000036787 ENSCCAG00000037395 MRPL51 (ENSCCAG00000030846) VAMP1 (ENSCCAG00000030242) ENSCCAG00000030371 TAPBPL (ENSCCAG00000019333) CD27 (ENSCCAG00000032627) LTBR (ENSCCAG00000037636) SCNN1A (ENSCCAG00000024002) TNFRSF1A (ENSCCAG00000036380) PLEKHG6 (ENSCCAG00000024072) CD9 (ENSCCAG00000035576) VWF (ENSCCAG00000029371) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 197 ENSSBOG00000004230 ENSSBOG00000024104 COPS7A 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(ENSNLEG00000003743) MRPL51 (ENSNLEG00000033120) VAMP1 (ENSNLEG00000003714) ENSNLEG00000030784 TAPBPL (ENSNLEG00000003709) ENSNLEG00000032099 CD27 (ENSNLEG00000003696) ENSNLEG00000003663 ENSNLEG00000035453 TNFRSF1A (ENSNLEG00000034897) PLEKHG6 (ENSNLEG00000003548) CD9 (ENSNLEG00000003491) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00910000148152 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146645 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00910000146795 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821.n ENSGT00940000161390 ENSGT01030000240266 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2549 USP5 (ENSRROG00000043893) CDCA3 (ENSRROG00000042250) GNB3 (ENSRROG00000023776) P3H3 (ENSRROG00000030746) GPR162 (ENSRROG00000042378) CD4 (ENSRROG00000028161) LAG3 (ENSRROG00000030083) ENSRROG00000044634 MLF2 (ENSRROG00000038823) COPS7A (ENSRROG00000041726) PIANP (ENSRROG00000034978) ZNF384 (ENSRROG00000034990) ING4 (ENSRROG00000040119) ACRBP (ENSRROG00000036460) LPAR5 (ENSRROG00000018849) CHD4 (ENSRROG00000042446) #22 NOP2 (ENSRROG00000041019) #23 IFFO1 (ENSRROG00000039769) #24 ENSRROG00000030690 NCAPD2 (ENSRROG00000037510) ENSRROG00000033245 VAMP1 (ENSRROG00000035855) TAPBPL (ENSRROG00000045610) ENSRROG00000033196 CD27 (ENSRROG00000030539) LTBR (ENSRROG00000041807) SCNN1A (ENSRROG00000044856) TNFRSF1A (ENSRROG00000029169) PLEKHG6 (ENSRROG00000041873) CD9 (ENSRROG00000013322) VWF (ENSRROG00000042864) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1066 CDCA3 (ENSRBIG00000041965) GNB3 (ENSRBIG00000032871) P3H3 (ENSRBIG00000034982) GPR162 (ENSRBIG00000035479) CD4 (ENSRBIG00000039046) LAG3 (ENSRBIG00000034533) PTMS (ENSRBIG00000042120) MLF2 (ENSRBIG00000012695) COPS7A (ENSRBIG00000034305) ENSRBIG00000037587 PIANP (ENSRBIG00000036733) ZNF384 (ENSRBIG00000034371) ING4 (ENSRBIG00000029015) ACRBP (ENSRBIG00000029614) LPAR5 (ENSRBIG00000015246) CHD4 (ENSRBIG00000041491) #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00910000146795 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00910000148152 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146645 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 Vervet Monkey MODERN SPECIES 2 USP5 (ENSCSAG00000010215) CDCA3 (ENSCSAG00000010224) GNB3 (ENSCSAG00000010234) P3H3 (ENSCSAG00000010242) GPR162 (ENSCSAG00000010255) CD4 (ENSCSAG00000010263) LAG3 (ENSCSAG00000010305) ENSCSAG00000010328 MLF2 (ENSCSAG00000010338) COPS7A (ENSCSAG00000010346) PIANP (ENSCSAG00000010351) ZNF384 (ENSCSAG00000010379) ING4 (ENSCSAG00000010403) ACRBP (ENSCSAG00000010413) LPAR5 (ENSCSAG00000019222) CHD4 (ENSCSAG00000010429) #22 NOP2 (ENSCSAG00000010484) #23 IFFO1 (ENSCSAG00000010518) #24 ENSCSAG00000010531 NCAPD2 (ENSCSAG00000010550) MRPL51 (ENSCSAG00000010565) ENSCSAG00000010592 TAPBPL (ENSCSAG00000010603) CD27 (ENSCSAG00000010635) LTBR (ENSCSAG00000010660) SCNN1A (ENSCSAG00000010676) TNFRSF1A (ENSCSAG00000010687) PLEKHG6 (ENSCSAG00000010727) CD9 (ENSCSAG00000010749) VWF (ENSCSAG00000010786) ANO2 (ENSCSAG00000010915) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00910000146795 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00910000148152 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146645 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 Macaca ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00910000146795 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146645 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 593 USP5 (ENSMNEG00000029869) CDCA3 (ENSMNEG00000037981) GNB3 (ENSMNEG00000036587) P3H3 (ENSMNEG00000028584) GPR162 (ENSMNEG00000041385) CD4 (ENSMNEG00000043009) LAG3 (ENSMNEG00000024032) ENSMNEG00000033214 MLF2 (ENSMNEG00000034081) COPS7A (ENSMNEG00000031298) PIANP (ENSMNEG00000033631) ZNF384 (ENSMNEG00000029452) ING4 (ENSMNEG00000038607) ACRBP (ENSMNEG00000042749) LPAR5 (ENSMNEG00000011351) CHD4 (ENSMNEG00000044776) #22 ENSMNEG00000034027 IFFO1 (ENSMNEG00000039291) #24 GAPDH (ENSMNEG00000040437) NCAPD2 (ENSMNEG00000038279) MRPL51 (ENSMNEG00000032063) ENSMNEG00000040627 VAMP1 (ENSMNEG00000006897) ENSMNEG00000033079 TAPBPL (ENSMNEG00000013053) CD27 (ENSMNEG00000007757) LTBR (ENSMNEG00000030358) SCNN1A (ENSMNEG00000029812) TNFRSF1A (ENSMNEG00000030151) PLEKHG6 (ENSMNEG00000029942) ENSMNEG00000019715 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000017343 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NCAPD2 (ENSMLEG00000029348) MRPL51 (ENSMLEG00000033346) ENSMLEG00000037892 ENSMLEG00000040133 VAMP1 (ENSMLEG00000042043) ENSMLEG00000037220 TAPBPL (ENSMLEG00000029420) CD27 (ENSMLEG00000029295) LTBR (ENSMLEG00000029285) SCNN1A (ENSMLEG00000034622) TNFRSF1A (ENSMLEG00000041673) PLEKHG6 (ENSMLEG00000041883) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a.f ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.a.b ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Bushbaby MODERN SPECIES 219 ENSOGAG00000031254 USP5 (ENSOGAG00000010847) CDCA3 (ENSOGAG00000032007) GNB3 (ENSOGAG00000027119) P3H3 (ENSOGAG00000003025) GPR162 (ENSOGAG00000024660) CD4 (ENSOGAG00000014692) LAG3 (ENSOGAG00000033914) ACRBP (ENSOGAG00000010040) ENSOGAG00000005976 COPS7A (ENSOGAG00000005973) PIANP (ENSOGAG00000034013) ZNF384 (ENSOGAG00000010052) ING4 (ENSOGAG00000010044) LPAR5 (ENSOGAG00000010037) CHD4 (ENSOGAG00000010031) #22 ENSOGAG00000010028 IFFO1 (ENSOGAG00000010024) #24 NCAPD2 (ENSOGAG00000010019) MRPL51 (ENSOGAG00000031255) VAMP1 (ENSOGAG00000012088) TAPBPL (ENSOGAG00000012086) CD27 (ENSOGAG00000012085) LTBR (ENSOGAG00000025739) SCNN1A (ENSOGAG00000012078) TNFRSF1A (ENSOGAG00000012073) PLEKHG6 (ENSOGAG00000012066) ENSOGAG00000009557 VWF (ENSOGAG00000005948) ANO2 (ENSOGAG00000005943) NTF3 (ENSOGAG00000009496) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 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ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 605 TPI1 (ENSPSMG00000015802) USP5 (ENSPSMG00000015879) CDCA3 (ENSPSMG00000015938) GNB3 (ENSPSMG00000016055) P3H3 (ENSPSMG00000016162) GPR162 (ENSPSMG00000016191) CD4 (ENSPSMG00000016207) LAG3 (ENSPSMG00000016218) PTMS (ENSPSMG00000016228) MLF2 (ENSPSMG00000016257) COPS7A (ENSPSMG00000016330) PIANP (ENSPSMG00000016352) ZNF384 (ENSPSMG00000016435) ACRBP (ENSPSMG00000016571) LPAR5 (ENSPSMG00000016626) CHD4 (ENSPSMG00000016974) #22 NOP2 (ENSPSMG00000017335) #23 IFFO1 (ENSPSMG00000017410) #24 ENSPSMG00000017469 MRPL51 (ENSPSMG00000017485) VAMP1 (ENSPSMG00000017542) ENSPSMG00000017569 CD27 (ENSPSMG00000017574) LTBR (ENSPSMG00000017627) SCNN1A (ENSPSMG00000017657) TNFRSF1A (ENSPSMG00000017682) PLEKHG6 (ENSPSMG00000017750) CD9 (ENSPSMG00000017856) VWF (ENSPSMG00000018040) ANO2 (ENSPSMG00000018090) NTF3 (ENSPSMG00000018107) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 128 ENSPCOG00000028236 USP5 (ENSPCOG00000023120) CDCA3 (ENSPCOG00000012783) GNB3 (ENSPCOG00000028837) P3H3 (ENSPCOG00000024751) GPR162 (ENSPCOG00000018277) CD4 (ENSPCOG00000015849) LAG3 (ENSPCOG00000026047) ENSPCOG00000019129 MLF2 (ENSPCOG00000021173) COPS7A (ENSPCOG00000023849) PIANP (ENSPCOG00000015290) ZNF384 (ENSPCOG00000024423) ING4 (ENSPCOG00000011355) ACRBP (ENSPCOG00000018439) CHD4 (ENSPCOG00000018635) #22 ENSPCOG00000002562 IFFO1 (ENSPCOG00000019348) #24 ENSPCOG00000015049 NCAPD2 (ENSPCOG00000022291) ENSPCOG00000024470 VAMP1 (ENSPCOG00000024868) TAPBPL (ENSPCOG00000022121) CD27 (ENSPCOG00000025005) LTBR (ENSPCOG00000003892) SCNN1A (ENSPCOG00000010597) TNFRSF1A (ENSPCOG00000026430) PLEKHG6 (ENSPCOG00000025731) CD9 (ENSPCOG00000018215) VWF (ENSPCOG00000025072) ANO2 (ENSPCOG00000016390) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Tree shrew MODERN SPECIES 397 ACRBP (ENSTBEG00000011975) LPAR5 (ENSTBEG00000011959) CHD4 (ENSTBEG00000011379) #22 ENSTBEG00000010989 #23 Glires ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Rabbit MODERN SPECIES 19 TPI1 (ENSOCUG00000025649) USP5 (ENSOCUG00000003582) CDCA3 (ENSOCUG00000022434) GNB3 (ENSOCUG00000012934) P3H3 (ENSOCUG00000012916) GPR162 (ENSOCUG00000030705) ENSOCUG00000012911 LAG3 (ENSOCUG00000011196) ENSOCUG00000003750 COPS7A (ENSOCUG00000011187) PIANP (ENSOCUG00000003749) ZNF384 (ENSOCUG00000003747) ING4 (ENSOCUG00000003742) ACRBP (ENSOCUG00000003737) LPAR5 (ENSOCUG00000026551) CHD4 (ENSOCUG00000008215) #22 NOP2 (ENSOCUG00000008203) #23 ENSOCUG00000008198 #24 ENSOCUG00000029891 NCAPD2 (ENSOCUG00000008176) MRPL51 (ENSOCUG00000008170) VAMP1 (ENSOCUG00000021107) TAPBPL (ENSOCUG00000008163) CD27 (ENSOCUG00000008159) LTBR (ENSOCUG00000001292) SCNN1A (ENSOCUG00000010152) TNFRSF1A (ENSOCUG00000010146) PLEKHG6 (ENSOCUG00000010130) ENSOCUG00000010123 VWF (ENSOCUG00000006783) ENSOCUG00000006775 Pika MODERN SPECIES 233 ENO2 (ENSOPRG00000003940) LRRC23 (ENSOPRG00000003927) SPSB2 (ENSOPRG00000003916) TPI1 (ENSOPRG00000003895) USP5 (ENSOPRG00000003849) CDCA3 (ENSOPRG00000003837) GNB3 (ENSOPRG00000003814) P3H3 (ENSOPRG00000003768) CD4 (ENSOPRG00000003747) LAG3 (ENSOPRG00000003706) PTMS (ENSOPRG00000003690) MLF2 (ENSOPRG00000003657) COPS7A (ENSOPRG00000003640) ZNF384 (ENSOPRG00000003626) ACRBP (ENSOPRG00000003592) CHD4 (ENSOPRG00000003477) #22 NOP2 (ENSOPRG00000003412) #23 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Kangaroo rat MODERN SPECIES 388 Lrrc23 (ENSDORG00000008956) Tpi1 (ENSDORG00000013175) Usp5 (ENSDORG00000013174) Cdca3 (ENSDORG00000013173) Gnb3 (ENSDORG00000016512) P3h3 (ENSDORG00000011727) Gpr162 (ENSDORG00000019800) Lag3 (ENSDORG00000001547) ENSDORG00000024725 ENSDORG00000015958 ENSDORG00000025741 Pianp (ENSDORG00000024889) Zfp384 (ENSDORG00000015720) Ing4 (ENSDORG00000015718) Lpar5 (ENSDORG00000026918) Chd4 (ENSDORG00000001847) #22 ENSDORG00000027336 Ncapd2 (ENSDORG00000015992) Mrpl51 (ENSDORG00000028160) Vamp1 (ENSDORG00000015989) Scnn1a (ENSDORG00000003134) Plekhg6 (ENSDORG00000006748) Cd9 (ENSDORG00000013724) Vwf (ENSDORG00000026775) Ano2 (ENSDORG00000025195) Ntf3 (ENSDORG00000029285) Kcna1 (ENSDORG00000012602) Kcna6 (ENSDORG00000005125) Ndufa9 (ENSDORG00000001278) Akap3 (ENSDORG00000015855) ENSDORG00000030145 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 158 Usp5 (ENSJJAG00000022609) Cdca3 (ENSJJAG00000000372) Gnb3 (ENSJJAG00000000612) P3h3 (ENSJJAG00000002354) Gpr162 (ENSJJAG00000004130) Cd4 (ENSJJAG00000006130) Lag3 (ENSJJAG00000007735) ENSJJAG00000008935 Mlf2 (ENSJJAG00000009196) Cops7a (ENSJJAG00000010387) Pianp (ENSJJAG00000000549) Zfp384 (ENSJJAG00000003875) Ing4 (ENSJJAG00000009788) ENSJJAG00000010370 Lpar5 (ENSJJAG00000010456) Chd4 (ENSJJAG00000012394) #22 ENSJJAG00000015505 Iffo1 (ENSJJAG00000015968) #24 ENSJJAG00000017186 Ncapd2 (ENSJJAG00000017993) Mrpl51 (ENSJJAG00000018962) ENSJJAG00000019185 Tapbpl (ENSJJAG00000019548) Cd27 (ENSJJAG00000019993) Ltbr (ENSJJAG00000020376) Scnn1a (ENSJJAG00000021122) Plekhg6 (ENSJJAG00000022183) Cd9 (ENSJJAG00000022710) Vwf (ENSJJAG00000023254) Ano2 (ENSJJAG00000004730) Ntf3 (ENSJJAG00000004637) Muroidea ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1885 Tpi1 (ENSNGAG00000017109) Usp5 (ENSNGAG00000011453) Cdca3 (ENSNGAG00000016633) Gnb3 (ENSNGAG00000023501) P3h3 (ENSNGAG00000015076) Gpr162 (ENSNGAG00000002840) ENSNGAG00000022963 Lag3 (ENSNGAG00000009790) ENSNGAG00000021065 Mlf2 (ENSNGAG00000016666) Cops7a (ENSNGAG00000022873) Pianp (ENSNGAG00000013944) Zfp384 (ENSNGAG00000011316) Ing4 (ENSNGAG00000016704) Acrbp (ENSNGAG00000022774) Chd4 (ENSNGAG00000016920) #22 Nop2 (ENSNGAG00000019010) #23 Iffo1 (ENSNGAG00000013363) #24 ENSNGAG00000013476 Ncapd2 (ENSNGAG00000021912) Mrpl51 (ENSNGAG00000022754) Vamp1 (ENSNGAG00000011610) Tapbpl (ENSNGAG00000023020) Cd27 (ENSNGAG00000019654) Ltbr (ENSNGAG00000022402) Scnn1a (ENSNGAG00000019351) Tnfrsf1a (ENSNGAG00000019085) Plekhg6 (ENSNGAG00000011808) ENSNGAG00000022639 Cd9 (ENSNGAG00000014189) Vwf (ENSNGAG00000022403) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01100000264105 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Murinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01100000264105 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Rat MODERN SPECIES 14 Gnb3 (ENSRNOG00000015541) P3h3 (ENSRNOG00000071218) Gpr162 (ENSRNOG00000016143) ENSRNOG00000071219 Lag3 (ENSRNOG00000021334) Ptms (ENSRNOG00000060098) AC115420.4 (ENSRNOG00000060308) Mlf2 (ENSRNOG00000016589) Cops7a (ENSRNOG00000016778) Pianp (ENSRNOG00000017052) Zfp384 (ENSRNOG00000017066) ENSRNOG00000066393 Acrbp (ENSRNOG00000017399) Ing4 (ENSRNOG00000023363) Lpar5 (ENSRNOG00000021401) Chd4 (ENSRNOG00000018309) #22 Nop2 (ENSRNOG00000018453) #23 Iffo1 (ENSRNOG00000018533) #24 LOC108351137 (ENSRNOG00000018630) Ncapd2 (ENSRNOG00000055300) Mrpl51 (ENSRNOG00000019165) Vamp1 (ENSRNOG00000019219) Cd27 (ENSRNOG00000027466) Tuba3b (ENSRNOG00000031707) Ltbr (ENSRNOG00000019264) Scnn1a (ENSRNOG00000019368) Tnfrsf1a (ENSRNOG00000031312) Plekhg6 (ENSRNOG00000019528) ENSRNOG00000064217 Cd9 (ENSRNOG00000019556) Vwf (ENSRNOG00000019689) Mus ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01100000264105 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Shrew mouse MODERN SPECIES 11 Usp5 (MGP_PahariEiJ_G0022614) Cdca3 (MGP_PahariEiJ_G0022615) Gnb3 (MGP_PahariEiJ_G0022616) P3h3 (MGP_PahariEiJ_G0022617) Gpr162 (MGP_PahariEiJ_G0022618) MGP_PahariEiJ_G0022619 Lag3 (MGP_PahariEiJ_G0022620) MGP_PahariEiJ_G0022621 MGP_PahariEiJ_G0022622 Cops7a (MGP_PahariEiJ_G0022623) Pianp (MGP_PahariEiJ_G0022624) Zfp384 (MGP_PahariEiJ_G0022625) Ing4 (MGP_PahariEiJ_G0022626) Acrbp (MGP_PahariEiJ_G0022627) Lpar5 (MGP_PahariEiJ_G0022628) Chd4 (MGP_PahariEiJ_G0022629) #22 MGP_PahariEiJ_G0022630 Iffo1 (MGP_PahariEiJ_G0022631) #24 MGP_PahariEiJ_G0022632 Ncapd2 (MGP_PahariEiJ_G0022633) Mrpl51 (MGP_PahariEiJ_G0022634) Vamp1 (MGP_PahariEiJ_G0022635) Tapbpl (MGP_PahariEiJ_G0022636) Cd27 (MGP_PahariEiJ_G0022637) Ltbr (MGP_PahariEiJ_G0022638) Scnn1a (MGP_PahariEiJ_G0022639) Tnfrsf1a (MGP_PahariEiJ_G0022640) Plekhg6 (MGP_PahariEiJ_G0022641) Cd9 (MGP_PahariEiJ_G0022642) Vwf (MGP_PahariEiJ_G0022643) Ano2 (MGP_PahariEiJ_G0022644) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01100000264105 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Ryukyu mouse MODERN SPECIES 15 Tpi1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028853) Usp5 (MGP_CAROLIEiJ_G0028854) Cdca3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028855) Gnb3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028856) Gpr162 (MGP_CAROLIEiJ_G0028858) Cd4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028859) MGP_CAROLIEiJ_G0028860 MGP_CAROLIEiJ_G0028861 MGP_CAROLIEiJ_G0028862 Cops7a (MGP_CAROLIEiJ_G0028863) Pianp (MGP_CAROLIEiJ_G0028864) Zfp384 (MGP_CAROLIEiJ_G0028865) Ing4 (MGP_CAROLIEiJ_G0028866) MGP_CAROLIEiJ_G0028867 Lpar5 (MGP_CAROLIEiJ_G0028868) MGP_CAROLIEiJ_G0028869 #22 Iffo1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028870) #24 MGP_CAROLIEiJ_G0028872 MGP_CAROLIEiJ_G0028874 Tapbpl (MGP_CAROLIEiJ_G0028875) Cd27 (MGP_CAROLIEiJ_G0028876) MGP_CAROLIEiJ_G0028877 MGP_CAROLIEiJ_G0028878 Scnn1a (MGP_CAROLIEiJ_G0028879) Tnfrsf1a (MGP_CAROLIEiJ_G0028880) MGP_CAROLIEiJ_G0028881 MGP_CAROLIEiJ_G0028882 MGP_CAROLIEiJ_G0028883 Ntf3 (MGP_CAROLIEiJ_G0028884) Kcna5 (MGP_CAROLIEiJ_G0028885) Kcna1 (MGP_CAROLIEiJ_G0028886) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343.g ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01100000264105 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904.e.a ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.b.a.a.a.b.a.b 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(MGP_SPRETEiJ_G0029896) Cdca3 (MGP_SPRETEiJ_G0029897) Gnb3 (MGP_SPRETEiJ_G0029898) P3h3 (MGP_SPRETEiJ_G0029899) Gpr162 (MGP_SPRETEiJ_G0029900) Cd4 (MGP_SPRETEiJ_G0029901) Lag3 (MGP_SPRETEiJ_G0029902) MGP_SPRETEiJ_G0029903 MGP_SPRETEiJ_G0029904 Cops7a (MGP_SPRETEiJ_G0029905) Pianp (MGP_SPRETEiJ_G0029906) MGP_SPRETEiJ_G0029907 Ing4 (MGP_SPRETEiJ_G0029908) Acrbp (MGP_SPRETEiJ_G0029909) Lpar5 (MGP_SPRETEiJ_G0029910) Chd4 (MGP_SPRETEiJ_G0029911) #22 MGP_SPRETEiJ_G0029912 Iffo1 (MGP_SPRETEiJ_G0029913) #24 Ncapd2 (MGP_SPRETEiJ_G0029915) Mrpl51 (MGP_SPRETEiJ_G0029916) Vamp1 (MGP_SPRETEiJ_G0029917) Tapbpl (MGP_SPRETEiJ_G0029918) Cd27 (MGP_SPRETEiJ_G0029919) MGP_SPRETEiJ_G0029920 Ltbr (MGP_SPRETEiJ_G0029921) Scnn1a (MGP_SPRETEiJ_G0029922) Tnfrsf1a (MGP_SPRETEiJ_G0029923) Plekhg6 (MGP_SPRETEiJ_G0029924) Cd9 (MGP_SPRETEiJ_G0029925) Vwf (MGP_SPRETEiJ_G0029926) Ano2 (MGP_SPRETEiJ_G0029927) Steppe mouse MODERN SPECIES 2453 Cops7a (ENSMSIG00000005376) Pianp (ENSMSIG00000005454) Zfp384 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ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01100000264105 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00950000182825.B ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Golden Hamster MODERN SPECIES 511 ENSMAUG00000000892 #22 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 289 ENSCGRG00001003405 Cdca3 (ENSCGRG00001013882) Gnb3 (ENSCGRG00001016439) P3h3 (ENSCGRG00001000528) Gpr162 (ENSCGRG00001003162) Cd4 (ENSCGRG00001013261) Lag3 (ENSCGRG00001022458) Ptms (ENSCGRG00001001584) Mlf2 (ENSCGRG00001010430) Cops7a (ENSCGRG00001014256) Pianp (ENSCGRG00001015100) Zfp384 (ENSCGRG00001013065) Ing4 (ENSCGRG00001016033) Acrbp (ENSCGRG00001017982) Lpar5 (ENSCGRG00001014775) Chd4 (ENSCGRG00001020662) #22 Nop2 (ENSCGRG00001020970) #23 Iffo1 (ENSCGRG00001000162) #24 ENSCGRG00001006857 Ncapd2 (ENSCGRG00001002247) ENSCGRG00001010566 Vamp1 (ENSCGRG00001014055) ENSCGRG00001020124 Cd27 (ENSCGRG00001009970) ENSCGRG00001013937 Ltbr (ENSCGRG00001015407) Scnn1a (ENSCGRG00001020304) Tnfrsf1a (ENSCGRG00001021062) Plekhg6 (ENSCGRG00001021507) ENSCGRG00001015575 Cd9 (ENSCGRG00001022703) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01100000264105 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 Usp5 (ENSPEMG00000015362) Cdca3 (ENSPEMG00000016358) Gnb3 (ENSPEMG00000016368) P3h3 (ENSPEMG00000011450) Gpr162 (ENSPEMG00000017095) ENSPEMG00000024347 Lag3 (ENSPEMG00000018743) ENSPEMG00000016593 Mlf2 (ENSPEMG00000013094) Cops7a (ENSPEMG00000002860) Pianp (ENSPEMG00000013120) Zfp384 (ENSPEMG00000016282) Ing4 (ENSPEMG00000018496) Acrbp (ENSPEMG00000010165) Lpar5 (ENSPEMG00000019056) Chd4 (ENSPEMG00000010290) #22 Nop2 (ENSPEMG00000013138) #23 Iffo1 (ENSPEMG00000008539) #24 ENSPEMG00000001195 Ncapd2 (ENSPEMG00000016112) Mrpl51 (ENSPEMG00000008667) Vamp1 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Plekhg6 (ENSMOCG00000006971) Cd9 (ENSMOCG00000022019) Vwf (ENSMOCG00000005320) Ano2 (ENSMOCG00000000380) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Marmotini ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b.k ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 111 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b.k ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 287 CDCA3 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ENSSVLG00005014703 ENSSVLG00005014610 MRPL51 (ENSSVLG00005014541) VAMP1 (ENSSVLG00005014405) TAPBPL (ENSSVLG00005014372) CD27 (ENSSVLG00005014318) LTBR (ENSSVLG00005014074) ENSSVLG00005013962 SCNN1A (ENSSVLG00005013781) TNFRSF1A (ENSSVLG00005013664) PLEKHG6 (ENSSVLG00005013449) CD9 (ENSSVLG00005013052) VWF (ENSSVLG00005012648) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT01100000267007 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Naked mole-rat female MODERN SPECIES 24 GNB3 (ENSHGLG00000005327) P3H3 (ENSHGLG00000004948) GPR162 (ENSHGLG00000004580) CD4 (ENSHGLG00000004194) LAG3 (ENSHGLG00000004095) PTMS (ENSHGLG00000038669) MLF2 (ENSHGLG00000003883) COPS7A (ENSHGLG00000032684) PIANP (ENSHGLG00000003689) ZNF384 (ENSHGLG00000003572) ENSHGLG00000039857 Ing4 (ENSHGLG00000003447) ACRBP (ENSHGLG00000003358) ENSHGLG00000047116 LPAR5 (ENSHGLG00000033434) CHD4 (ENSHGLG00000003093) #22 NOP2 (ENSHGLG00000042932) #23 IFFO1 (ENSHGLG00000002934) #24 GAPDH (ENSHGLG00000002856) ENSHGLG00000036344 NCAPD2 (ENSHGLG00000001934) MRPL51 (ENSHGLG00000050005) ENSHGLG00000001867 TAPBPL (ENSHGLG00000001831) CD27 (ENSHGLG00000046681) LTBR (ENSHGLG00000032405) SCNN1A (ENSHGLG00000001735) TNFRSF1A (ENSHGLG00000001689) PLEKHG6 (ENSHGLG00000001657) CD9 (ENSHGLG00000001625) VWF (ENSHGLG00000001451) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a 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ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Degu MODERN SPECIES 219 CDCA3 (ENSODEG00000003383) GNB3 (ENSODEG00000003424) P3H3 (ENSODEG00000003441) GPR162 (ENSODEG00000003518) ENSODEG00000018791 ENSODEG00000002251 LAG3 (ENSODEG00000002278) ENSODEG00000002310 MLF2 (ENSODEG00000002383) COPS7A (ENSODEG00000002432) ENSODEG00000002475 PIANP (ENSODEG00000002502) ZNF384 (ENSODEG00000002585) ING4 (ENSODEG00000002865) ACRBP (ENSODEG00000002969) CHD4 (ENSODEG00000003114) #22 ENSODEG00000003567 ENSODEG00000003579 #24 ENSODEG00000004114 NCAPD2 (ENSODEG00000004156) MRPL51 (ENSODEG00000004435) VAMP1 (ENSODEG00000004453) TAPBPL (ENSODEG00000004477) CD27 (ENSODEG00000004529) LTBR (ENSODEG00000004616) SCNN1A (ENSODEG00000004767) TNFRSF1A (ENSODEG00000004861) PLEKHG6 (ENSODEG00000005186) CD9 (ENSODEG00000005241) VWF (ENSODEG00000002617) ANO2 (ENSODEG00000002927) Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 120 USP5 (ENSCLAG00000015551) CDCA3 (ENSCLAG00000013619) GNB3 (ENSCLAG00000014669) P3H3 (ENSCLAG00000012569) GPR162 (ENSCLAG00000015020) CD4 (ENSCLAG00000016197) LAG3 (ENSCLAG00000014680) PTMS (ENSCLAG00000016337) MLF2 (ENSCLAG00000013739) COPS7A (ENSCLAG00000014244) PIANP (ENSCLAG00000016394) ZNF384 (ENSCLAG00000015550) ING4 (ENSCLAG00000014519) ENSCLAG00000014500 LPAR5 (ENSCLAG00000014166) CHD4 (ENSCLAG00000012244) #22 NOP2 (ENSCLAG00000014440) #23 IFFO1 (ENSCLAG00000014944) #24 GAPDH (ENSCLAG00000013783) NCAPD2 (ENSCLAG00000013118) MRPL51 (ENSCLAG00000011881) VAMP1 (ENSCLAG00000012860) TAPBPL (ENSCLAG00000016184) CD27 (ENSCLAG00000016154) LTBR (ENSCLAG00000013106) SCNN1A (ENSCLAG00000015244) TNFRSF1A (ENSCLAG00000016084) PLEKHG6 (ENSCLAG00000015229) CD9 (ENSCLAG00000013477) VWF (ENSCLAG00000014671) ANO2 (ENSCLAG00000015450) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 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ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Arabian camel MODERN SPECIES 27 USP5 (ENSCDRG00005019114) CDCA3 (ENSCDRG00005019067) GNB3 (ENSCDRG00005019041) P3H3 (ENSCDRG00005018977) GPR162 (ENSCDRG00005018926) CD4 (ENSCDRG00005018894) LAG3 (ENSCDRG00005018858) PTMS (ENSCDRG00005018819) MLF2 (ENSCDRG00005018784) COPS7A (ENSCDRG00005018742) PIANP (ENSCDRG00005018699) ZNF384 (ENSCDRG00005018592) ING4 (ENSCDRG00005018381) ACRBP (ENSCDRG00005018263) LPAR5 (ENSCDRG00005018243) CHD4 (ENSCDRG00005012738) #22 NOP2 (ENSCDRG00005012504) #23 IFFO1 (ENSCDRG00005011863) #24 GAPDH (ENSCDRG00005011757) NCAPD2 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ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821.g ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a 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ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00910000146741 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Bovidae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q.a ENSGT00580000082664.a.a ENSGT00940000153298.n.q.b ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 19 USP5 (ENSOARG00020023279) CDCA3 (ENSOARG00020023351) GNB3 (ENSOARG00020023409) P3H3 (ENSOARG00020023431) GPR162 (ENSOARG00020004446) CD4 (ENSOARG00020004460) LAG3 (ENSOARG00020004514) PTMS (ENSOARG00020004551) MLF2 (ENSOARG00020004578) COPS7A (ENSOARG00020004603) PIANP (ENSOARG00020004619) ZNF384 (ENSOARG00020004680) ING4 (ENSOARG00020004785) ACRBP (ENSOARG00020004837) LPAR5 (ENSOARG00020004931) CHD4 (ENSOARG00020004976) #22 NOP2 (ENSOARG00020005339) #23 IFFO1 (ENSOARG00020005394) #24 ENSOARG00020005655 NCAPD2 (ENSOARG00020005706) MRPL51 (ENSOARG00020005788) VAMP1 (ENSOARG00020005818) ENSOARG00020005857 CD27 (ENSOARG00020005885) LTBR (ENSOARG00020005918) SCNN1A (ENSOARG00020006047) TNFRSF1A (ENSOARG00020006166) PLEKHG6 (ENSOARG00020006252) CD9 (ENSOARG00020006407) ENSOARG00020006562 VWF (ENSOARG00020006721) Goat MODERN SPECIES 24 ENSCHIG00000016031 USP5 (ENSCHIG00000012356) CDCA3 (ENSCHIG00000013074) GNB3 (ENSCHIG00000012696) P3H3 (ENSCHIG00000000989) GPR162 (ENSCHIG00000019485) CD4 (ENSCHIG00000010446) LAG3 (ENSCHIG00000012648) MLF2 (ENSCHIG00000014233) COPS7A (ENSCHIG00000013096) PIANP (ENSCHIG00000017399) ZNF384 (ENSCHIG00000012248) ING4 (ENSCHIG00000025231) ACRBP (ENSCHIG00000011452) LPAR5 (ENSCHIG00000004907) CHD4 (ENSCHIG00000020766) #22 NOP2 (ENSCHIG00000018560) #23 IFFO1 (ENSCHIG00000019031) #24 ENSCHIG00000022516 NCAPD2 (ENSCHIG00000015626) MRPL51 (ENSCHIG00000011385) VAMP1 (ENSCHIG00000014523) TAPBPL (ENSCHIG00000016665) CD27 (ENSCHIG00000021715) LTBR (ENSCHIG00000022975) SCNN1A (ENSCHIG00000009435) TNFRSF1A (ENSCHIG00000012735) PLEKHG6 (ENSCHIG00000013835) CD9 (ENSCHIG00000008887) ENSCHIG00000007426 VWF (ENSCHIG00000012979) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033.c.a ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Bos ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033.c.a ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Bos_b ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033.c.a ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000154384.h.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 24 GNB3 (ENSBIXG00005003143) P3H3 (ENSBIXG00005019389) GPR162 (ENSBIXG00005003161) CD4 (ENSBIXG00005019448) LAG3 (ENSBIXG00005019525) PTMS (ENSBIXG00005019569) MLF2 (ENSBIXG00005019632) ENSBIXG00005019647 COPS7A (ENSBIXG00005019728) ENSBIXG00005003230 PIANP (ENSBIXG00005003237) ZNF384 (ENSBIXG00005019825) ING4 (ENSBIXG00005019901) ACRBP (ENSBIXG00005019947) LPAR5 (ENSBIXG00005019955) CHD4 (ENSBIXG00005020206) #22 NOP2 (ENSBIXG00005020264) #23 IFFO1 (ENSBIXG00005003425) #24 GAPDH (ENSBIXG00005020359) NCAPD2 (ENSBIXG00005020400) MRPL51 (ENSBIXG00005006150) ENSBIXG00005003464 TAPBPL (ENSBIXG00005003468) CD27 (ENSBIXG00005020535) LTBR (ENSBIXG00005005674) SCNN1A (ENSBIXG00005003494) TNFRSF1A (ENSBIXG00005020704) PLEKHG6 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deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 14 USP5 (ENSCHYG00000023817) CDCA3 (ENSCHYG00000024020) GNB3 (ENSCHYG00000024150) P3H3 (ENSCHYG00000024241) GPR162 (ENSCHYG00000024446) CD4 (ENSCHYG00000024477) LAG3 (ENSCHYG00000024522) ENSCHYG00000024584 MLF2 (ENSCHYG00000024596) COPS7A (ENSCHYG00000024633) PIANP (ENSCHYG00000024684) ZNF384 (ENSCHYG00000024746) ING4 (ENSCHYG00000024855) ACRBP (ENSCHYG00000024938) LPAR5 (ENSCHYG00000024995) CHD4 (ENSCHYG00000025019) #22 NOP2 (ENSCHYG00000025184) #23 IFFO1 (ENSCHYG00000025348) #24 ENSCHYG00000025387 NCAPD2 (ENSCHYG00000025563) MRPL51 (ENSCHYG00000025676) ENSCHYG00000025696 ENSCHYG00000025715 TAPBPL (ENSCHYG00000025766) ENSCHYG00000025783 CD27 (ENSCHYG00000025790) LTBR (ENSCHYG00000025819) SCNN1A (ENSCHYG00000025885) TNFRSF1A (ENSCHYG00000025998) PLEKHG6 (ENSCHYG00000026050) CD9 (ENSCHYG00000026113) Yarkand deer MODERN SPECIES 20 CNR1 (ENSCHYG00000017842) RNGTT (ENSCHYG00000016761) SRSF12 (ENSCHYG00000016627) PM20D2 (ENSCHYG00000016435) 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ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q.g.b ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Donkey MODERN SPECIES 14 USP5 (ENSEASG00005016070) CDCA3 (ENSEASG00005016075) GNB3 (ENSEASG00005016089) P3H3 (ENSEASG00005016118) GPR162 (ENSEASG00005016119) CD4 (ENSEASG00005016122) LAG3 (ENSEASG00005016128) ENSEASG00005016131 MLF2 (ENSEASG00005016135) COPS7A (ENSEASG00005016138) PIANP (ENSEASG00005016141) ZNF384 (ENSEASG00005016142) ING4 (ENSEASG00005016144) ACRBP (ENSEASG00005025354) LPAR5 (ENSEASG00005033413) CHD4 (ENSEASG00005016150) #22 NOP2 (ENSEASG00005016153) #23 IFFO1 (ENSEASG00005016154) #24 ENSEASG00005016156 NCAPD2 (ENSEASG00005016158) MRPL51 (ENSEASG00005035991) ENSEASG00005035678 TAPBPL (ENSEASG00005016162) ENSEASG00005036568 VAMP1 (ENSEASG00005037737) LTBR (ENSEASG00005016171) SCNN1A (ENSEASG00005016173) TNFRSF1A (ENSEASG00005016176) PLEKHG6 (ENSEASG00005016179) CD9 (ENSEASG00005016182) VWF (ENSEASG00005016355) Horse MODERN SPECIES 27 SPSB2 (ENSECAG00000033679) USP5 (ENSECAG00000014532) CDCA3 (ENSECAG00000014517) P3H3 (ENSECAG00000021815) ENSECAG00000054174 CD4 (ENSECAG00000009049) LAG3 (ENSECAG00000002971) ENSECAG00000042372 MLF2 (ENSECAG00000022587) COPS7A (ENSECAG00000015911) PIANP (ENSECAG00000015893) ZNF384 (ENSECAG00000009490) ING4 (ENSECAG00000024784) LPAR5 (ENSECAG00000023339) ACRBP (ENSECAG00000023343) CHD4 (ENSECAG00000022005) #22 NOP2 (ENSECAG00000012639) #23 IFFO1 (ENSECAG00000010254) #24 GAPDH (ENSECAG00000022051) NCAPD2 (ENSECAG00000017796) ENSECAG00000040327 TAPBPL (ENSECAG00000012920) CD27 (ENSECAG00000011126) VAMP1 (ENSECAG00000014602) LTBR (ENSECAG00000000458) SCNN1A (ENSECAG00000001443) TNFRSF1A (ENSECAG00000016330) PLEKHG6 (ENSECAG00000012373) CD9 (ENSECAG00000003002) VWF (ENSECAG00000010778) ANO2 (ENSECAG00000024617) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Megabat MODERN SPECIES 3606 CHD4 (ENSPVAG00000012574) #22 NOP2 (ENSPVAG00000012572) #23 IFFO1 (ENSPVAG00000012571) #24 ENSPVAG00000012570 NCAPD2 (ENSPVAG00000012567) MRPL51 (ENSPVAG00000012566) VAMP1 (ENSPVAG00000012565) TAPBPL (ENSPVAG00000012563) CD27 (ENSPVAG00000012562) LTBR (ENSPVAG00000012560) SCNN1A (ENSPVAG00000012558) TNFRSF1A (ENSPVAG00000012556) PLEKHG6 (ENSPVAG00000012554) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Microbat MODERN SPECIES 947 USP5 (ENSMLUG00000013790) CDCA3 (ENSMLUG00000006726) GNB3 (ENSMLUG00000006739) P3H3 (ENSMLUG00000006754) GPR162 (ENSMLUG00000022349) CD4 (ENSMLUG00000024020) LAG3 (ENSMLUG00000013787) PTMS (ENSMLUG00000013783) MLF2 (ENSMLUG00000013779) COPS7A (ENSMLUG00000013776) PIANP (ENSMLUG00000004845) ZNF384 (ENSMLUG00000013771) ING4 (ENSMLUG00000029523) ACRBP (ENSMLUG00000025466) LPAR5 (ENSMLUG00000013768) CHD4 (ENSMLUG00000014343) #22 NOP2 (ENSMLUG00000014333) #23 IFFO1 (ENSMLUG00000014327) #24 ENSMLUG00000014320 NCAPD2 (ENSMLUG00000014309) VAMP1 (ENSMLUG00000014307) TAPBPL (ENSMLUG00000014300) CD27 (ENSMLUG00000014298) LTBR (ENSMLUG00000014294) SCNN1A (ENSMLUG00000014284) TNFRSF1A (ENSMLUG00000014278) PLEKHG6 (ENSMLUG00000014270) CD9 (ENSMLUG00000006901) VWF (ENSMLUG00000015993) ANO2 (ENSMLUG00000015973) NTF3 (ENSMLUG00000012482) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 1 CDCA3 (ENSRFEG00010003221) GNB3 (ENSRFEG00010003179) P3H3 (ENSRFEG00010003127) GPR162 (ENSRFEG00010003086) CD4 (ENSRFEG00010003064) LAG3 (ENSRFEG00010003036) PTMS (ENSRFEG00010003014) MLF2 (ENSRFEG00010002982) COPS7A (ENSRFEG00010002955) ENSRFEG00010002934 PIANP (ENSRFEG00010002897) ZNF384 (ENSRFEG00010002854) ING4 (ENSRFEG00010002769) ACRBP (ENSRFEG00010002675) LPAR5 (ENSRFEG00010002641) CHD4 (ENSRFEG00010002190) #22 NOP2 (ENSRFEG00010001957) #23 IFFO1 (ENSRFEG00010001885) #24 ENSRFEG00010001850 NCAPD2 (ENSRFEG00010001784) MRPL51 (ENSRFEG00010001755) TAPBPL (ENSRFEG00010001724) CD27 (ENSRFEG00010001691) LTBR (ENSRFEG00010001600) VAMP1 (ENSRFEG00010001570) SCNN1A (ENSRFEG00010001487) TNFRSF1A (ENSRFEG00010001395) PLEKHG6 (ENSRFEG00010001287) CD9 (ENSRFEG00010001199) VWF (ENSRFEG00010001025) ANO2 (ENSRFEG00010000920) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Felidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Cat MODERN SPECIES 238 USP5 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ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q.l ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00910000146741 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 Ferret MODERN SPECIES 284 CDCA3 (ENSMPUG00000016781) GNB3 (ENSMPUG00000016783) P3H3 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ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q.l ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b.j ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Ursus ANCESTRAL SPECIES 103 ENSGT00390000013354.d.b ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873.b ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00940000153298.n.q.k.b ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b.j ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C ENSGT00390000007725.A.a Polar bear MODERN SPECIES 484 LRRC23 (ENSUMAG00000004125) SPSB2 (ENSUMAG00000004129) TPI1 (ENSUMAG00000004130) USP5 (ENSUMAG00000004200) CDCA3 (ENSUMAG00000004864) GNB3 (ENSUMAG00000004881) P3H3 (ENSUMAG00000004936) CD4 (ENSUMAG00000004996) LAG3 (ENSUMAG00000005008) MLF2 (ENSUMAG00000005049) COPS7A (ENSUMAG00000005057) PIANP (ENSUMAG00000005067) ZNF384 (ENSUMAG00000005073) ING4 (ENSUMAG00000005092) ACRBP (ENSUMAG00000005096) CHD4 (ENSUMAG00000005336) #22 NOP2 (ENSUMAG00000007220) #23 GAPDH (ENSUMAG00000007239) NCAPD2 (ENSUMAG00000007255) MRPL51 (ENSUMAG00000007393) ENSUMAG00000007395 TAPBPL (ENSUMAG00000007397) CD27 (ENSUMAG00000007399) LTBR (ENSUMAG00000007402) SCNN1A (ENSUMAG00000007429) ENSUMAG00000007495 PLEKHG6 (ENSUMAG00000007501) CD9 (ENSUMAG00000007507) VWF (ENSUMAG00000007512) ANO2 (ENSUMAG00000007545) NTF3 (ENSUMAG00000007725) American black bear MODERN SPECIES 2013 MLF2 (ENSUAMG00000022896) COPS7A (ENSUAMG00000022895) PIANP (ENSUAMG00000022893) ZNF384 (ENSUAMG00000022892) ING4 (ENSUAMG00000022890) ACRBP (ENSUAMG00000022888) LPAR5 (ENSUAMG00000022887) CHD4 (ENSUAMG00000016452) #22 NOP2 (ENSUAMG00000016105) #23 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 7 USP5 (ENSAMEG00000013920) CDCA3 (ENSAMEG00000013985) GNB3 (ENSAMEG00000013993) P3H3 (ENSAMEG00000014022) GPR162 (ENSAMEG00000014035) CD4 (ENSAMEG00000014043) LAG3 (ENSAMEG00000014063) ENSAMEG00000014074 MLF2 (ENSAMEG00000014077) COPS7A (ENSAMEG00000014096) PIANP (ENSAMEG00000014112) ZNF384 (ENSAMEG00000014121) ING4 (ENSAMEG00000014135) ACRBP (ENSAMEG00000014163) LPAR5 (ENSAMEG00000031134) CHD4 (ENSAMEG00000014179) #22 NOP2 (ENSAMEG00000014268) #23 IFFO1 (ENSAMEG00000014300) #24 GAPDH (ENSAMEG00000014329) NCAPD2 (ENSAMEG00000014358) MRPL51 (ENSAMEG00000014426) VAMP1 (ENSAMEG00000014438) TAPBPL (ENSAMEG00000014448) CD27 (ENSAMEG00000014466) LTBR (ENSAMEG00000014476) SCNN1A (ENSAMEG00000014498) TNFRSF1A (ENSAMEG00000014569) ENSAMEG00000014597 CD9 (ENSAMEG00000014604) ENSAMEG00000006889 VWF (ENSAMEG00000011272) Giant Panda MODERN SPECIES 842 ENSAMEG00000026206 #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q.l.h.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Red fox MODERN SPECIES 18 ENSVVUG00000011024 USP5 (ENSVVUG00000011044) CDCA3 (ENSVVUG00000011065) GNB3 (ENSVVUG00000011081) P3H3 (ENSVVUG00000011231) GPR162 (ENSVVUG00000011261) CD4 (ENSVVUG00000011267) LAG3 (ENSVVUG00000011272) MLF2 (ENSVVUG00000011279) COPS7A (ENSVVUG00000011285) PIANP (ENSVVUG00000011301) ZNF384 (ENSVVUG00000011329) ING4 (ENSVVUG00000011352) ACRBP (ENSVVUG00000011379) LPAR5 (ENSVVUG00000011401) CHD4 (ENSVVUG00000011414) #22 NOP2 (ENSVVUG00000011466) #23 IFFO1 (ENSVVUG00000011850) #24 NCAPD2 (ENSVVUG00000011972) MRPL51 (ENSVVUG00000012022) ENSVVUG00000012024 TAPBPL (ENSVVUG00000012035) CD27 (ENSVVUG00000012048) LTBR (ENSVVUG00000012052) SCNN1A (ENSVVUG00000012062) ENSVVUG00000012070 PLEKHG6 (ENSVVUG00000012077) CD9 (ENSVVUG00000012181) VWF (ENSVVUG00000012603) ANO2 (ENSVVUG00000017708) NTF3 (ENSVVUG00000017711) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n.q.l.h.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Dingo MODERN SPECIES 56 USP5 (ENSCAFG00020003066) CDCA3 (ENSCAFG00020003055) GNB3 (ENSCAFG00020003050) P3H3 (ENSCAFG00020003004) GPR162 (ENSCAFG00020002990) CD4 (ENSCAFG00020002986) LAG3 (ENSCAFG00020002976) ENSCAFG00020002965 MLF2 (ENSCAFG00020002950) COPS7A (ENSCAFG00020002947) PIANP (ENSCAFG00020002942) ZNF384 (ENSCAFG00020002932) ING4 (ENSCAFG00020002927) ACRBP (ENSCAFG00020002916) LPAR5 (ENSCAFG00020002907) CHD4 (ENSCAFG00020002892) #22 NOP2 (ENSCAFG00020002884) #23 IFFO1 (ENSCAFG00020002877) #24 NCAPD2 (ENSCAFG00020002859) MRPL51 (ENSCAFG00020002857) VAMP1 (ENSCAFG00020002856) TAPBPL (ENSCAFG00020002854) CD27 (ENSCAFG00020002851) ENSCAFG00020002845 Dog MODERN SPECIES 19 USP5 (ENSCAFG00845027217) CDCA3 (ENSCAFG00845027345) GNB3 (ENSCAFG00845027447) P3H3 (ENSCAFG00845027539) GPR162 (ENSCAFG00845027631) CD4 (ENSCAFG00845027739) LAG3 (ENSCAFG00845027788) PTMS (ENSCAFG00845027847) MLF2 (ENSCAFG00845027898) COPS7A (ENSCAFG00845027958) PIANP (ENSCAFG00845028055) ZNF384 (ENSCAFG00845028247) ENSCAFG00845028378 ACRBP (ENSCAFG00845028419) LPAR5 (ENSCAFG00845028579) CHD4 (ENSCAFG00845028632) #22 NOP2 (ENSCAFG00845028743) #23 IFFO1 (ENSCAFG00845028853) #24 GAPDH (ENSCAFG00845028918) NCAPD2 (ENSCAFG00845028959) MRPL51 (ENSCAFG00845029018) VAMP1 (ENSCAFG00845029081) TAPBPL (ENSCAFG00845029155) CD27 (ENSCAFG00845029234) LTBR (ENSCAFG00845029256) SCNN1A (ENSCAFG00845029331) ENSCAFG00845029433 PLEKHG6 (ENSCAFG00845029568) CD9 (ENSCAFG00845029613) VWF (ENSCAFG00845029798) ANO2 (ENSCAFG00845030210) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 186 ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.b ENSGT00940000153566.a Common shrew MODERN SPECIES 885 ENSSARG00000012988 #22 Hedgehog MODERN SPECIES 490 ENSEEUG00000011777 #22 NOP2 (ENSEEUG00000011692) #23 IFFO1 (ENSEEUG00000011508) #24 GAPDH (ENSEEUG00000011444) ENSEEUG00000011280 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT01030000234816 ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.a ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00390000007725.A.a Armadillo MODERN SPECIES 508 USP5 (ENSDNOG00000002211) CDCA3 (ENSDNOG00000044971) GNB3 (ENSDNOG00000036546) P3H3 (ENSDNOG00000036097) GPR162 (ENSDNOG00000039746) CD4 (ENSDNOG00000002205) LAG3 (ENSDNOG00000002426) PTMS (ENSDNOG00000024120) ENSDNOG00000000758 COPS7A 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#22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Tenrec MODERN SPECIES 1332 LPAR5 (ENSETEG00000005915) CHD4 (ENSETEG00000005912) #22 NOP2 (ENSETEG00000005909) #23 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000013354.d ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343.a ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.n ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00940000160453 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Hyrax MODERN SPECIES 212 CHD4 (ENSPCAG00000007120) #22 NOP2 (ENSPCAG00000007033) #23 IFFO1 (ENSPCAG00000006972) #24 GAPDH (ENSPCAG00000006928) NCAPD2 (ENSPCAG00000006779) Elephant MODERN SPECIES 108 TPI1 (ENSLAFG00000032143) USP5 (ENSLAFG00000006569) ENSLAFG00000006567 GNB3 (ENSLAFG00000006559) P3H3 (ENSLAFG00000006551) GPR162 (ENSLAFG00000022632) CD4 (ENSLAFG00000029166) LAG3 (ENSLAFG00000032271) MLF2 (ENSLAFG00000013649) COPS7A (ENSLAFG00000004634) PIANP (ENSLAFG00000025728) ZNF384 (ENSLAFG00000008381) ING4 (ENSLAFG00000008379) ACRBP (ENSLAFG00000008377) LPAR5 (ENSLAFG00000022468) CHD4 (ENSLAFG00000022842) #22 NOP2 (ENSLAFG00000002784) #23 IFFO1 (ENSLAFG00000002782) #24 ENSLAFG00000002780 NCAPD2 (ENSLAFG00000016117) MRPL51 (ENSLAFG00000002106) VAMP1 (ENSLAFG00000002104) TAPBPL (ENSLAFG00000016109) CD27 (ENSLAFG00000021608) LTBR (ENSLAFG00000029559) SCNN1A (ENSLAFG00000000723) TNFRSF1A (ENSLAFG00000017153) PLEKHG6 (ENSLAFG00000021440) CD9 (ENSLAFG00000027050) VWF (ENSLAFG00000002327) ANO2 (ENSLAFG00000002320) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000013354.d ENSGT00940000156036 ENSGT00390000017343 ENSGT01000000214413.b.a.b.a ENSGT00940000159164 ENSGT00390000017213.A ENSGT00390000001745 ENSGT01090000259985.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000005023.a ENSGT00940000159873 ENSGT00510000049460 ENSGT00940000156904 ENSGT00940000159033 ENSGT00390000000826 ENSGT00950000183136.b.b ENSGT00940000155088 #22 ENSGT00940000161554 #23 ENSGT00510000046803.b.b #24 ENSGT00940000153298.m.b.a.b ENSGT00940000153298.m.b.a.a.g ENSGT00940000153566.a ENSGT00390000018821 ENSGT00940000161390 ENSGT00510000049297 ENSGT00940000162178 ENSGT00940000160952 ENSGT00940000159540 ENSGT00940000161250 ENSGT00940000155083.b ENSGT00940000155810 ENSGT00940000155840.C Opossum MODERN SPECIES 7 ENSMODG00000018151 USP5 (ENSMODG00000018148) ENSMODG00000018146 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