Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000154319.v	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00940000156449	ENSGT00950000183046.a.a #9	ENSGT00390000005530.a.a #10	ENSGT00930000150950.b #11	ENSGT00390000013916 #12	ENSGT00940000155041 #13	ENSGT00500000044939 #14	ENSGT00940000156089 #15	ENSGT00940000156552 #16	ENSGT00530000063873.A #17	ENSGT00530000063873.B #18	ENSGT00390000000801 #19	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #20	ENSGT00940000155270 #22	ENSGT00940000157974 #23	ENSGT00940000153514.b #24	ENSGT00950000183014.f.a.h #25	ENSGT00940000160642 #26	ENSGT00440000037606.b #27	ENSGT00940000158781 #28	ENSGT00390000015769.B #29	ENSGT00940000162403 #30	ENSGT00530000063410.b #32	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00940000161508 #34	ENSGT00940000155235 #35	ENSGT00940000155408 #36	ENSGT00940000157249 #37	ENSGT00940000154453.b.a.b
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154319.v	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00940000156449	ENSGT00950000183046.a.a #9	ENSGT00390000005530.a.a #10	ENSGT00930000150950.b #11	ENSGT00390000013916 #12	ENSGT00940000155041 #13	ENSGT00500000044939 #14	ENSGT00940000156089 #15	ENSGT00940000156552 #16	ENSGT00530000063873.A #17	ENSGT00530000063873.B #18	ENSGT00390000000801 #19	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #20	ENSGT00940000155270 #22	ENSGT00940000157974 #23	ENSGT00940000153514.b #24	ENSGT00950000183014.f.a.h.g #25	ENSGT00940000160642 #26	ENSGT00440000037606.b #27	ENSGT00940000158781 #28	ENSGT00390000015769.B #29	ENSGT00940000162403 #30	ENSGT00530000063410.b #32	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00940000161508 #34	ENSGT00940000155235 #35	ENSGT00940000155408 #36	ENSGT00940000157249 #37	ENSGT00940000154453.b.a.b
Alpin marmot	MODERN SPECIES	8	ENSMMMG00000013017 #7	ENSMMMG00000013051 #8	ENSMMMG00000013060 #9	ICA1L (ENSMMMG00000013064) #10	WDR12 (ENSMMMG00000013110) #11	CARF (ENSMMMG00000013161) #12	NBEAL1 (ENSMMMG00000013229) #13	CYP20A1 (ENSMMMG00000013312) #14	ABI2 (ENSMMMG00000013329) #15	ENSMMMG00000013568 #16	CD28 (ENSMMMG00000013599) #17	CTLA4 (ENSMMMG00000013609) #18	ICOS (ENSMMMG00000013624) #19	PARD3B (ENSMMMG00000013680) #20	ENSMMMG00000013911 #21	NRP2 (ENSMMMG00000013924) #22	INO80D (ENSMMMG00000014555) #23	NDUFS1 (ENSMMMG00000014566) #24	ENSMMMG00000014596 #25	CMKLR2 (ENSMMMG00000014632) #26	ZDBF2 (ENSMMMG00000014650) #27	ADAM23 (ENSMMMG00000014678) #28	FAM237A (ENSMMMG00000014819) #29	DYTN (ENSMMMG00000014828) #30	ENSMMMG00000014844 #31	MDH1B (ENSMMMG00000014852) #32	FASTKD2 (ENSMMMG00000014857) #33	CPO (ENSMMMG00000014874) #34	KLF7 (ENSMMMG00000014897) #35	CREB1 (ENSMMMG00000014914) #36	METTL21A (ENSMMMG00000015010) #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	103	ENSGT00940000154319.v	ENSGT00940000153534.A	ENSGT00940000156449	ENSGT00950000183046.a.a #9	ENSGT00390000005530.a.a #10	ENSGT00930000150950.b #11	ENSGT00390000013916 #12	ENSGT00940000155041 #13	ENSGT00500000044939 #14	ENSGT00940000156089 #15	ENSGT00940000156552 #16	ENSGT00530000063873.A #17	ENSGT00530000063873.B #18	ENSGT00390000000801 #19	ENSGT00950000183214.a.b.a.b #20	ENSGT00940000155270 #22	ENSGT00940000157974 #23	ENSGT00940000153514.b #24	ENSGT00950000183014.f.a.h.g #25	ENSGT00940000160642 #26	ENSGT00440000037606.b #27	ENSGT00940000158781 #28	ENSGT00390000015769.B #29	ENSGT00940000162403 #30	ENSGT00530000063410.b #32	ENSGT01030000234607.A.b #33	ENSGT00940000161508 #34	ENSGT00940000155235 #35	ENSGT00940000155408 #36	ENSGT00940000157249 #37	ENSGT00940000154453.b.a.b
Squirrel	MODERN SPECIES	231										ABI2 (ENSSTOG00000015888) #15	RAPH1 (ENSSTOG00000028594) #16	CD28 (ENSSTOG00000026213) #17	CTLA4 (ENSSTOG00000020540) #18	ICOS (ENSSTOG00000013542) #19	PARD3B (ENSSTOG00000010207) #20	NRP2 (ENSSTOG00000010229) #22	INO80D (ENSSTOG00000028419) #23	NDUFS1 (ENSSTOG00000010255) #24	EEF1B2 (ENSSTOG00000005437) #25	CMKLR2 (ENSSTOG00000005452) #26	ZDBF2 (ENSSTOG00000001663) #27	ADAM23 (ENSSTOG00000024094) #28	DYTN (ENSSTOG00000019822) #30	MDH1B (ENSSTOG00000003194) #32	FASTKD2 (ENSSTOG00000022821) #33	CPO (ENSSTOG00000013351) #34	KLF7 (ENSSTOG00000011069) #35	CREB1 (ENSSTOG00000016482) #36	METTL21A (ENSSTOG00000016483) #37	ENSSTOG00000021511	CCNYL1 (ENSSTOG00000016484)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	141								CYP20A1 (ENSUPAG00010007092) #14	ABI2 (ENSUPAG00010007107) #15	RAPH1 (ENSUPAG00010007232) #16	ENSUPAG00010007347	CD28 (ENSUPAG00010007360) #17	CTLA4 (ENSUPAG00010007371) #18	ICOS (ENSUPAG00010007386) #19	PARD3B (ENSUPAG00010007426) #20	NRP2 (ENSUPAG00010007567) #22	INO80D (ENSUPAG00010007624) #23	NDUFS1 (ENSUPAG00010007661) #24	EEF1B2 (ENSUPAG00010007678) #25	CMKLR2 (ENSUPAG00010007707) #26	ZDBF2 (ENSUPAG00010007725) #27	ADAM23 (ENSUPAG00010007731) #28	FAM237A (ENSUPAG00010007856) #29	DYTN (ENSUPAG00010007862) #30	MDH1B (ENSUPAG00010007886) #32	FASTKD2 (ENSUPAG00010007916) #33	CPO (ENSUPAG00010007941) #34	KLF7 (ENSUPAG00010007967) #35	CREB1 (ENSUPAG00010007984) #36	METTL21A (ENSUPAG00010008009) #37	CCNYL1 (ENSUPAG00010008021)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	12	ENSSVLG00005000362	BMPR2 (ENSSVLG00005000484)	ENSSVLG00005000534 #9	ENSSVLG00005000554	ENSSVLG00005000579 #10	WDR12 (ENSSVLG00005000598) #11	ENSSVLG00005000686 #12	ENSSVLG00005000784	NBEAL1 (ENSSVLG00005000853) #13	CYP20A1 (ENSSVLG00005000970) #14	ABI2 (ENSSVLG00005001071) #15	CD28 (ENSSVLG00005001473) #17	CTLA4 (ENSSVLG00005001529) #18	ICOS (ENSSVLG00005001570) #19	PARD3B (ENSSVLG00005001789) #20	NRP2 (ENSSVLG00005002141) #22	INO80D (ENSSVLG00005002283) #23	ENSSVLG00005002396 #24	ENSSVLG00005002606 #25	CMKLR2 (ENSSVLG00005002631) #26	ENSSVLG00005002653 #27	ADAM23 (ENSSVLG00005002721) #28	FAM237A (ENSSVLG00005002854) #29	DYTN (ENSSVLG00005002873) #30	MDH1B (ENSSVLG00005002924) #32	FASTKD2 (ENSSVLG00005002985) #33	CPO (ENSSVLG00005003015) #34	KLF7 (ENSSVLG00005003049) #35	CREB1 (ENSSVLG00005003093) #36	METTL21A (ENSSVLG00005003134) #37	ENSSVLG00005003181