Pecora DUPLICATION Pecora ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00730000111554 #13 ENSGT00730000111580 #14 ENSGT00940000165404 #15 ENSGT00940000163905 ENSGT00940000163498 ENSGT00940000161842.a ENSGT00940000162465 #16 ENSGT00940000154467.b.b.b #17 ENSGT00940000154467.b.b.a ##17 ENSGT00940000154467.a.h.a ##17 ENSGT00940000154467.b.a ##17 ENSGT00940000154467.a.h.b #18 ENSGT00940000154467.a.i #19 ENSGT00940000163983 ENSGT00940000162966 #21 ENSGT00940000154172.z #22 ENSGT00940000154197.b.b #23 ENSGT00940000160047 #26 ENSGT00940000161937 #27 ENSGT00940000163537 #28 ENSGT00940000161521 #29 ENSGT00940000162157 #30 ENSGT00940000159364 #31 ENSGT00940000161581 #33 ENSGT00390000008281 #34 ENSGT00390000003062 #35 ENSGT00940000154716 #36 ENSGT00950000183212.C ENSGT00950000183065.B ENSGT00940000162698 ENSGT00940000160649 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00730000111554 #13 ENSGT00730000111580 #14 ENSGT00940000165404 #15 ENSGT00940000163905 ENSGT00940000163498 ENSGT00940000162465 #16 ENSGT00940000154467.b.b.b #17 ENSGT00940000154467.a.h.b #18 ENSGT00940000154467.a.h.a ##17 ENSGT00940000154467.b.a ##17 ENSGT00940000154467.a.i.a.a ##17 ENSGT00940000154467.b.b.a ##17 ENSGT00940000154467.a.i.b #19 ENSGT00940000163983 ENSGT00940000162966 #21 ENSGT00940000154172.z #22 ENSGT00940000154197.a.a ##23 ENSGT00940000154197.b.b #23 ENSGT00940000160047 #26 ENSGT00940000161937 #27 ENSGT00940000163537 #28 ENSGT00940000161521 #29 ENSGT00940000162157 #30 ENSGT00940000159364 #31 ENSGT00940000161581 #33 ENSGT00390000008281 #34 ENSGT00390000003062 #35 ENSGT00940000154716 #36 ENSGT00950000183212.C ENSGT00950000182891.a.a.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000183065.B Bovidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183312 ENSGT00730000111554 #13 ENSGT00730000111580 #14 ENSGT00940000165404 #15 ENSGT00940000163905 ENSGT00940000162465 #16 ENSGT00940000154467.b.b.b #17 ENSGT00940000154467.b.b.a ##17 ENSGT00940000154467.a.h.a.a ##17 ENSGT00940000154467.a.h.a.b ##17 ENSGT00940000154467.b.a ##17 ENSGT00940000154467.a.h.b #18 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ENSGT00940000161521 #29 ENSGT00940000162157 #30 ENSGT00940000159364 #31 ENSGT00950000186450 #32 ENSGT00940000161581 #33 ENSGT00390000008281 #34 ENSGT00390000003062 #35 ENSGT00940000154716 #36 ENSGT00950000183212.C ENSGT00950000183065.B ENSGT00940000162698 Goat MODERN SPECIES 22 LELP1 (ENSCHIG00000001135) #7 ENSCHIG00000013514 #8 SPRR4 (ENSCHIG00000013052) #9 ENSCHIG00000024891 #10 ENSCHIG00000007657 #11 ENSCHIG00000017937 #12 KPRP (ENSCHIG00000023870) #13 C1orf68 (ENSCHIG00000011620) #14 LCE3B (ENSCHIG00000012019) #15 CRNN (ENSCHIG00000025673) #16 ENSCHIG00000020535 #17 ENSCHIG00000026233 #18 ENSCHIG00000018492 #19 ENSCHIG00000005102 #20 TCHHL1 (ENSCHIG00000010186) #21 S100A11 (ENSCHIG00000009234) #22 S100A10 (ENSCHIG00000017889) #23 ENSCHIG00000024791 #24 ENSCHIG00000023394 #25 THEM4 (ENSCHIG00000015398) #26 THEM5 (ENSCHIG00000021133) #27 C2CD4D (ENSCHIG00000010717) #28 RORC (ENSCHIG00000005408) #29 LINGO4 (ENSCHIG00000010031) #30 TDRKH (ENSCHIG00000025326) #31 ENSCHIG00000018414 #32 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(ENSOARG00020015459) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00440000039991 #11 ENSGT00950000183312 ENSGT00730000111554 #13 ENSGT00730000111580 #14 ENSGT00940000165404 #15 ENSGT00940000163905 ENSGT00940000162465 #16 ENSGT00940000154467.b.b.b #17 ENSGT00940000154467.b.b.a ##17 ENSGT00940000154467.a.h.a.a ##17 ENSGT00940000154467.b.a ##17 ENSGT00940000154467.a.h.b #18 ENSGT00940000154467.a.i.b #19 ENSGT00940000163983 ENSGT00940000162966 #21 ENSGT00940000154172.z #22 ENSGT00940000154197.b.b #23 ENSGT00940000160047 #26 ENSGT00940000161937 #27 ENSGT00940000163537 #28 ENSGT00940000161521 #29 ENSGT00940000162157 #30 ENSGT00940000159364 #31 ENSGT00950000186450 #32 ENSGT00940000161581 #33 ENSGT00390000008281 #34 ENSGT00390000003062 #35 ENSGT00940000154716 #36 ENSGT00950000183212.C ENSGT00950000182891.a.a.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00950000183065.B Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000183312 ENSGT00730000111554 #13 ENSGT00730000111580 #14 ENSGT00940000163498 ENSGT00970000197102 ENSGT01050000245143 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Domestic yak MODERN SPECIES 22 ENSBGRG00000003211 KPRP (ENSBGRG00000003208) #13 C1orf68 (ENSBGRG00000003205) #14 ENSBGRG00000003177 ENSBGRG00000003168 ENSBGRG00000003159 ENSBGRG00000003154 #16 ENSBGRG00000003149 #17 ENSBGRG00000003128 ##17 ENSBGRG00000003103 ##17 ENSBGRG00000003087 #18 ENSBGRG00000003077 #19 ENSBGRG00000003029 ENSBGRG00000003014 #21 ENSBGRG00000002999 ENSBGRG00000002990 #22 S100A10 (ENSBGRG00000002962) #23 ENSBGRG00000002950 THEM4 (ENSBGRG00000002939) #26 THEM5 (ENSBGRG00000002906) #27 RORC (ENSBGRG00000002783) #29 TDRKH (ENSBGRG00000002702) #31 ENSBGRG00000002678 #32 ENSBGRG00000002657 #33 ENSBGRG00000002612 #30 RIIAD1 (ENSBGRG00000002574) #35 CELF3 (ENSBGRG00000002490) #36 SNX27 (ENSBGRG00000002390) ENSBGRG00000002366 ENSBGRG00000002354 TUFT1 (ENSBGRG00000002325) Wild yak MODERN SPECIES 688 ENSBMUG00000024950 #10 ENSBMUG00000024947 #11 C1orf68 (ENSBMUG00000024927) #14 LCE3B (ENSBMUG00000024922) #15 ENSBMUG00000024916 ENSBMUG00000024912 ENSBMUG00000024905 #16 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