Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	3	ENSGT00420000029753.b #8	ENSGT00390000015318 #9	ENSGT00940000158629 #10	ENSGT00940000155705.b #11	ENSGT00940000156259.b #12	ENSGT00700000106049 #13	ENSGT00940000158851 #14	ENSGT00530000063632.A #15	ENSGT00530000063790.a #16	ENSGT00940000156897 #17	ENSGT00390000015908 #18	ENSGT00390000003860 #19	ENSGT00940000153665.b.a.b	ENSGT00500000045816	ENSGT00940000161237 #21	ENSGT00940000155505.a #22	ENSGT00390000008086 #23	ENSGT00400000024146 #24	ENSGT00940000154587.a.a #25	ENSGT01050000244898.a.a.b #26	ENSGT00390000012765 #27	ENSGT00390000016446	ENSGT00390000011196 #28	ENSGT00940000161441 #29	ENSGT00940000163570.c #33	ENSGT00940000155173.f.a.a #32	ENSGT00940000160927 #34	ENSGT00940000154660.b #35	ENSGT00940000159889 #36	ENSGT00390000007310 #37	ENSGT00940000160589
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000015318 #9	ENSGT00940000158629 #10	ENSGT00940000155705.b #11	ENSGT00940000156259.b #12	ENSGT00700000106049 #13	ENSGT00940000158851 #14	ENSGT00530000063632.A #15	ENSGT00530000063790.a #16	ENSGT00940000156897 #17	ENSGT00390000015908 #18	ENSGT00390000003860 #19	ENSGT00960000189628 #20	ENSGT00940000153665.b.a.b	ENSGT00500000045816	ENSGT00940000161237 #21	ENSGT00940000155505.a #22	ENSGT00390000008086 #23	ENSGT00400000024146 #24	ENSGT00940000154587.a.a #25	ENSGT01050000244898.a.a.b #26	ENSGT00390000012765 #27	ENSGT00390000016446	ENSGT00390000011196 #28	ENSGT00940000161441 #29	ENSGT00940000163570.c #33	ENSGT00940000163570.d #30	ENSGT00940000155173.f.a.a #32	ENSGT00940000160927 #34	ENSGT00940000154660.b #35	ENSGT00940000159889 #36	ENSGT00390000007310 #37
Alpin marmot	MODERN SPECIES	15	CCDC17 (ENSMMMG00000019165) #7	GPBP1L1 (ENSMMMG00000019162) #8	TMEM69 (ENSMMMG00000019157) #9	IPP (ENSMMMG00000019149) #10	MAST2 (ENSMMMG00000019002) #11	PIK3R3 (ENSMMMG00000018977) #12	P3R3URF (ENSMMMG00000018949) #13	TSPAN1 (ENSMMMG00000018942) #14	POMGNT1 (ENSMMMG00000018549) #15	LURAP1 (ENSMMMG00000018543) #16	RAD54L (ENSMMMG00000018505) #17	LRRC41 (ENSMMMG00000018495) #18	ENSMMMG00000018488 #19	ENSMMMG00000018486 #20	FAAH (ENSMMMG00000018402) #21	DMBX1 (ENSMMMG00000018386) #22	TMEM275 (ENSMMMG00000018381) #23	KNCN (ENSMMMG00000018376) #24	ENSMMMG00000018347 #25	MOB3C (ENSMMMG00000018342) #26	ATPAF1 (ENSMMMG00000018290) #27	EFCAB14 (ENSMMMG00000018258) #28	CYP4B1 (ENSMMMG00000018250) #29	ENSMMMG00000018229 #30	ENSMMMG00000018225 #31	ENSMMMG00000018214 #32	ENSMMMG00000018152 #33	CYP4X1 (ENSMMMG00000018100) #34	PDZK1IP1 (ENSMMMG00000018092) #35	ENSMMMG00000018085 #36	STIL (ENSMMMG00000018013) #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00390000015318 #9	ENSGT00940000158629 #10	ENSGT00940000155705.b #11	ENSGT00940000156259.b #12	ENSGT00700000106049 #13	ENSGT00940000158851 #14	ENSGT00530000063632.A #15	ENSGT00530000063790.a #16	ENSGT00940000156897 #17	ENSGT00390000015908 #18	ENSGT00390000003860 #19	ENSGT00960000189628 #20	ENSGT00940000153665.b.a.b	ENSGT00500000045816	ENSGT00940000161237 #21	ENSGT00940000155505.a #22	ENSGT00390000008086 #23	ENSGT00400000024146 #24	ENSGT00940000154587.a.a #25	ENSGT01050000244898.a.a.b #26	ENSGT00390000012765 #27	ENSGT00390000016446	ENSGT00390000011196 #28	ENSGT00940000161441 #29	ENSGT00940000163570.c #33	ENSGT00940000163570.d #30	ENSGT00940000155173.f.a.a #32	ENSGT00940000160927 #34	ENSGT00940000154660.b #35	ENSGT00940000159889 #36	ENSGT00390000007310 #37
Squirrel	MODERN SPECIES	74	GPBP1L1 (ENSSTOG00000013491) #8	TMEM69 (ENSSTOG00000032547) #9	IPP (ENSSTOG00000013503) #10	MAST2 (ENSSTOG00000006001) #11	PIK3R3 (ENSSTOG00000006051) #12	P3R3URF (ENSSTOG00000033389) #13	TSPAN1 (ENSSTOG00000026291) #14	POMGNT1 (ENSSTOG00000009283) #15	LURAP1 (ENSSTOG00000009276) #16	RAD54L (ENSSTOG00000029125) #17	LRRC41 (ENSSTOG00000029075) #18	ENSSTOG00000033129	NSUN4 (ENSSTOG00000009794)	ENSSTOG00000033959	FAAH (ENSSTOG00000011655) #21	DMBX1 (ENSSTOG00000011661) #22	KNCN (ENSSTOG00000026559) #24	ENSSTOG00000032933	MOB3C (ENSSTOG00000005399) #26	ATPAF1 (ENSSTOG00000005415) #27	ENSSTOG00000030628	EFCAB14 (ENSSTOG00000016250) #28	CYP4B1 (ENSSTOG00000001409) #29	ENSSTOG00000013550 #33	ENSSTOG00000028206 #32	ENSSTOG00000015913 #32	CYP4X1 (ENSSTOG00000013556) #34	PDZK1IP1 (ENSSTOG00000024038) #35	TAL1 (ENSSTOG00000008396) #36	STIL (ENSSTOG00000014333) #37	CMPK1 (ENSSTOG00000007706)
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	190	CCDC17 (ENSUPAG00010020667) #7	GPBP1L1 (ENSUPAG00010020630) #8	TMEM69 (ENSUPAG00010020622) #9	IPP (ENSUPAG00010020604) #10	MAST2 (ENSUPAG00010020550) #11	PIK3R3 (ENSUPAG00010020507) #12	P3R3URF (ENSUPAG00010020503) #13	TSPAN1 (ENSUPAG00010020497) #14	POMGNT1 (ENSUPAG00010020423) #15	LURAP1 (ENSUPAG00010020417) #16	RAD54L (ENSUPAG00010020396) #17	LRRC41 (ENSUPAG00010020390) #18	ENSUPAG00010020383 #19	ENSUPAG00010020379 #20	FAAH (ENSUPAG00010020365) #21	DMBX1 (ENSUPAG00010020359) #22	TMEM275 (ENSUPAG00010020356) #23	KNCN (ENSUPAG00010020353) #24	ENSUPAG00010020341 #25	MOB3C (ENSUPAG00010020338) #26	ATPAF1 (ENSUPAG00010020324) #27	EFCAB14 (ENSUPAG00010020294) #28	ENSUPAG00010020267 #33	ENSUPAG00010020244 #30	CYP4B1 (ENSUPAG00010020229) #29	ENSUPAG00010019981 #32
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES		ENSSVLG00005006933 #8	ENSSVLG00005006991 #9	IPP (ENSSVLG00005007023) #10	MAST2 (ENSSVLG00005007081) #11	PIK3R3 (ENSSVLG00005007240) #12	ENSSVLG00005007285	P3R3URF (ENSSVLG00005007305) #13	TSPAN1 (ENSSVLG00005007325) #14	POMGNT1 (ENSSVLG00005007377) #15	LURAP1 (ENSSVLG00005007410) #16	RAD54L (ENSSVLG00005007442) #17	LRRC41 (ENSSVLG00005007517) #18	ENSSVLG00005007591 #19	NSUN4 (ENSSVLG00005007637)	FAAH (ENSSVLG00005007733) #21	DMBX1 (ENSSVLG00005007784) #22	TMEM275 (ENSSVLG00005007823) #23	KNCN (ENSSVLG00005007856) #24	ENSSVLG00005007933 #25	MOB3C (ENSSVLG00005008013) #26	ATPAF1 (ENSSVLG00005008043) #27	EFCAB14 (ENSSVLG00005008138) #28	ENSSVLG00005008165	CYP4B1 (ENSSVLG00005008221) #29	ENSSVLG00005008487 #33	ENSSVLG00005008688	ENSSVLG00005008878 ##32	ENSSVLG00005009845 #32	ENSSVLG00005010122 #32	CYP4X1 (ENSSVLG00005010957) #34	PDZK1IP1 (ENSSVLG00005011099) #35