Cyprinodontiformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000164087	ENSGT00940000158424	ENSGT00940000157731	ENSGT00940000165979	ENSGT00970000193372.b.a.b	ENSGT00390000010895.a	ENSGT00390000013776	ENSGT00940000155954.b	ENSGT00530000063489.a	ENSGT00940000176917	ENSGT00940000159500	ENSGT00940000166595.b	ENSGT00940000156504.i.a	ENSGT00940000156948.j	ENSGT00390000016324 #21	ENSGT00940000154369.g.b #22	ENSGT01030000234629.C.b #23	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.a #24	ENSGT00950000183136.b.b.c #25	ENSGT00940000160165.a.b #26	ENSGT00900000141083.c.b #28	ENSGT00390000006095 #29	ENSGT00940000162075 #30	ENSGT00940000157522 #31	ENSGT00940000156342.d #32	ENSGT00940000161398.e	ENSGT00940000164578.a.a	ENSGT00390000004360.a.a	ENSGT00950000183115.a.a.a	ENSGT00950000183136.b.b.d ##25	ENSGT00940000160281
Cyprinodontoidei	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000164087	ENSGT00940000158424	ENSGT00940000157731	ENSGT00940000165979	ENSGT00970000193372.b.a.b	ENSGT00390000010895.a	ENSGT00390000013776	ENSGT00940000155954.b	ENSGT00530000063489.a	ENSGT00940000176917	ENSGT00940000159500	ENSGT00940000166595.b	ENSGT00940000156504.i.a	ENSGT00940000156948.j	ENSGT00390000016324 #21	ENSGT00940000154369.g.b #22	ENSGT01030000234629.C.b #23	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.a #24	ENSGT00950000183136.b.b.c #25	ENSGT00940000160165.a.b #26	ENSGT00900000141083.c.b #28	ENSGT00390000006095 #29	ENSGT00940000162075 #30	ENSGT00940000157522 #31	ENSGT00940000156342.d #32	ENSGT00940000161398.e	ENSGT00940000164578.a.a	ENSGT00390000004360.a.a	ENSGT00950000183115.a.a.a	ENSGT00950000183136.b.b.d ##25	ENSGT00940000160281
Poeciliinae	ANCESTRAL SPECIES	14	ENSGT00940000164087	ENSGT00940000158424	ENSGT00940000157731	ENSGT00940000165979	ENSGT00970000193372.b.a.b	ENSGT00390000010895.a	ENSGT00390000013776	ENSGT00940000155954.b	ENSGT00530000063489.a	ENSGT00940000176917	ENSGT00940000159500	ENSGT00940000166595.b	ENSGT00940000156504.i.a	ENSGT00940000156948.j	ENSGT00390000016324 #21	ENSGT00940000154369.g.b #22	ENSGT01030000234629.C.b #23	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.a #24	ENSGT00950000183136.b.b.c #25	ENSGT00940000160165.a.b #26	ENSGT00900000141083.c.b #28	ENSGT00390000006095 #29	ENSGT00940000162075 #30	ENSGT00940000157522 #31	ENSGT00940000156342.d #32	ENSGT00940000162556.C.c #33	ENSGT00940000161289 #34	ENSGT00530000063405.b.e #35	ENSGT00940000162996.y.a.b.a #36	ENSGT00510000047299.d	ENSGT00940000160721
Poecilia	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000164087	ENSGT00940000158424	ENSGT00940000157731	ENSGT00940000165979	ENSGT00970000193372.b.a.b	ENSGT00390000010895.a	ENSGT00390000013776	ENSGT00940000155954.b	ENSGT00530000063489.a	ENSGT00940000176917	ENSGT00940000159500	ENSGT00940000166595.b	ENSGT00940000156504.i.a	ENSGT00940000156948.j	ENSGT00390000016324 #21	ENSGT00940000154369.g.b #22	ENSGT01030000234629.C.b #23	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.a #24	ENSGT00950000183136.b.b.c #25	ENSGT00940000160165.a.b #26	ENSGT00900000141083.c.b #28	ENSGT00390000006095 #29	ENSGT00940000162075 #30	ENSGT00940000157522 #31	ENSGT00940000156342.d #32	ENSGT00940000162556.C.c #33	ENSGT00940000161289 #34	ENSGT00530000063405.b.e #35	ENSGT00940000162996.y.a.b.a #36	ENSGT00940000162996.y.a.a.c.a.a #37	ENSGT00510000047299.d
NAME_6	ANCESTRAL SPECIES	60															ENSGT00390000016324 #21	ENSGT00940000154369.g.b #22	ENSGT01030000234629.C.b #23	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.a #24	ENSGT00950000183136.b.b.c #25	ENSGT00940000160165.a.b #26	ENSGT00900000141083.c.b #28	ENSGT00390000006095 #29	ENSGT00940000162075 #30	ENSGT00940000157522 #31	ENSGT00940000156342.d #32	ENSGT00940000162556.C.c #33	ENSGT00940000161289 #34	ENSGT00530000063405.b.e #35	ENSGT00940000162996.y.a.b.a #36	ENSGT00940000162996.y.a.b.b.b ##36	ENSGT00940000162996.y.a.a.c.a.a #37
Amazon molly	MODERN SPECIES	325															pxylp1 (ENSPFOG00000008537) #21	SLC25A36 (ENSPFOG00000008439) #22	spsb4a (ENSPFOG00000008391) #23	CLSTN2 (ENSPFOG00000007669) #24	lpar5b (ENSPFOG00000020309) #25	rbp2a (ENSPFOG00000007568) #26	ENSPFOG00000007552 #27	COPB2 (ENSPFOG00000007284) #28	mrps22 (ENSPFOG00000007141) #29	foxl2b (ENSPFOG00000020308) #30	PIK3CB (ENSPFOG00000006566) #31	PER2 (ENSPFOG00000006138) #32	ENSPFOG00000006124 #33	usp2a (ENSPFOG00000005925) #34	tbcela (ENSPFOG00000005811) #35	ENSPFOG00000022258 #36	ENSPFOG00000004739 #37
Sailfin molly	MODERN SPECIES	695															pxylp1 (ENSPLAG00000008564) #21	SLC25A36 (ENSPLAG00000008595) #22	spsb4a (ENSPLAG00000008604) #23
Guppy	MODERN SPECIES	443	psmd2 (ENSPREG00000010322)	serpine2 (ENSPREG00000010402)	wdfy1 (ENSPREG00000010455)	dhrs12la (ENSPREG00000010484)	AP1S3 (ENSPREG00000010517)	ENSPREG00000010524	kcne4 (ENSPREG00000010533)	acsl3a (ENSPREG00000010542)	farsb (ENSPREG00000010583)	ENSPREG00000010621	SGPP2 (ENSPREG00000010631)	ENSPREG00000010649	pax3b (ENSPREG00000010656)	epha4a (ENSPREG00000010744)	pxylp1 (ENSPREG00000010798) #21	SLC25A36 (ENSPREG00000010816) #22	spsb4a (ENSPREG00000010844) #23	CLSTN2 (ENSPREG00000010875) #24	lpar5b (ENSPREG00000010933) #25	ENSPREG00000010948	rbp2a (ENSPREG00000010960) #26	ENSPREG00000010971	COPB2 (ENSPREG00000010996) #28	mrps22 (ENSPREG00000011070) #29	PIK3CB (ENSPREG00000011211) #31	PER2 (ENSPREG00000011271) #32	ENSPREG00000011295	usp2a (ENSPREG00000011319) #34	tbcela (ENSPREG00000011348) #35	ENSPREG00000011380 #36	ENSPREG00000011466 #37
Platyfish	MODERN SPECIES	9	prss16 (ENSXMAG00000008194)	serpine2 (ENSXMAG00000008196)	wdfy1 (ENSXMAG00000008220)	dhrs12la (ENSXMAG00000008246)	ENSXMAG00000008263	AP1S3 (ENSXMAG00000008255)	kcne4 (ENSXMAG00000008266)	acsl3a (ENSXMAG00000008269)	ENSXMAG00000029278	farsb (ENSXMAG00000008280)	ENSXMAG00000021789	SGPP2 (ENSXMAG00000008302)	pax3b (ENSXMAG00000008304)	epha4a (ENSXMAG00000008306)	pxylp1 (ENSXMAG00000008348) #21	SLC25A36 (ENSXMAG00000008353) #22	spsb4a (ENSXMAG00000008361) #23	CLSTN2 (ENSXMAG00000008362) #24	lpar5b (ENSXMAG00000020218) #25	rbp2a (ENSXMAG00000006544) #26	COPB2 (ENSXMAG00000006552) #28	mrps22 (ENSXMAG00000006580) #29	ENSXMAG00000029209	foxl2b (ENSXMAG00000020219) #30	PIK3CB (ENSXMAG00000006594) #31	PER2 (ENSXMAG00000006651) #32	ENSXMAG00000006705 #33	usp2a (ENSXMAG00000006708) #34	tbcela (ENSXMAG00000006724) #35	ENSXMAG00000006737 #36	PGAP2 (ENSXMAG00000006831)
NAME_4	ANCESTRAL SPECIES	102	ENSGT00940000153386.B	ENSGT00940000164087	ENSGT00940000158424	ENSGT00940000157731	ENSGT00940000165979	ENSGT00970000193372.b.a.b	ENSGT00390000010895.a	ENSGT00390000013776	ENSGT00940000155954.b	ENSGT00530000063489.a	ENSGT00940000159500	ENSGT00940000166595.b	ENSGT00940000156504.i.a	ENSGT00940000156948.j	ENSGT00390000016324 #21	ENSGT00940000154369.g.b #22	ENSGT01030000234629.C.b #23	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.a #24	ENSGT00950000183136.b.b.c #25	ENSGT00940000160165.a.b #26	ENSGT00900000141083.c.b #28	ENSGT00390000006095 #29	ENSGT00940000162075 #30	ENSGT00940000157522 #31	ENSGT00940000156342.d #32	ENSGT00940000161398.e	ENSGT00940000164578.a.a	ENSGT00940000163911.a.a.a.s	ENSGT00940000163911.a.a.b.a.a.a.b.d.a.a
Mummichog	MODERN SPECIES	2202	prss16 (ENSFHEG00000021150)	serpine2 (ENSFHEG00000021132)	wdfy1 (ENSFHEG00000021120)	dhrs12la (ENSFHEG00000021061)	AP1S3 (ENSFHEG00000021028)	ENSFHEG00000021018	kcne4 (ENSFHEG00000020998)	acsl3a (ENSFHEG00000020987)	farsb (ENSFHEG00000020939)	ENSFHEG00000020916	SGPP2 (ENSFHEG00000020896)	ENSFHEG00000020864	pax3b (ENSFHEG00000020858)	epha4a (ENSFHEG00000020823)	pxylp1 (ENSFHEG00000020749) #21	SLC25A36 (ENSFHEG00000020736) #22	spsb4a (ENSFHEG00000020702) #23	CLSTN2 (ENSFHEG00000020690) #24	lpar5b (ENSFHEG00000020648) #25	rbp2a (ENSFHEG00000020640) #26	ENSFHEG00000020604 #28	COPB2 (ENSFHEG00000020594) #28	mrps22 (ENSFHEG00000020557) #29	foxl2b (ENSFHEG00000020548) #30	ENSFHEG00000020532	PIK3CB (ENSFHEG00000020512) #31	PER2 (ENSFHEG00000020488) #32	ENSFHEG00000020468
Sheepshead minnow	MODERN SPECIES	73																SLC25A36 (ENSCVAG00000021401) #22
Aplocheiloidei	ANCESTRAL SPECIES	246																ENSGT00940000154369.g.b #22	ENSGT01030000234629.C.b #23	ENSGT00950000183086.a.a.b.h.a #24	ENSGT00950000183136.b.b.c #25	ENSGT00940000160165.a.b #26	ENSGT00390000006095 #29	ENSGT00940000157522.b #31	ENSGT00940000156342.d #32	ENSGT00940000161398.e
Mangrove rivulus	MODERN SPECIES	62	ENSKMAG00000003188	lhx1a (ENSKMAG00000003163)	bcas3 (ENSKMAG00000003039)	tbx2b (ENSKMAG00000002976)	tbx4 (ENSKMAG00000002942)	brip1 (ENSKMAG00000002856)	PPM1D (ENSKMAG00000002841)	appbp2 (ENSKMAG00000002779)	ENSKMAG00000002765	USP6 (ENSKMAG00000002625)	ENSKMAG00000002543	tmem97 (ENSKMAG00000002514)	ULK2 (ENSKMAG00000002479)	aldh3a2a (ENSKMAG00000002434)	ENSKMAG00000002417	SLC25A36 (ENSKMAG00000002380) #22	spsb4a (ENSKMAG00000002358) #23	ENSKMAG00000002334	CLSTN2 (ENSKMAG00000002240) #24	lpar5b (ENSKMAG00000002207) #25	rbp2a (ENSKMAG00000002179) #26	mrps22 (ENSKMAG00000002163) #29	foxl2b (ENSKMAG00000002135) #30	PIK3CB (ENSKMAG00000002028) #31	PER2 (ENSKMAG00000001995) #32	her13 (ENSKMAG00000001975)
Turquoise killifish	MODERN SPECIES	1085																SLC25A36 (ENSNFUG00015018450) #22