Vertebrata DUPLICATION Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 1120 ENSGT00940000157325 #21 ENSGT00940000162682.B #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 564 ENSGT00940000157325 #21 ENSGT00940000162682.B #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES 344 ENSGT00940000157325 #21 ENSGT00940000162682.B #22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00960000190099 ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 Aves ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00960000190099 ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 207 ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Flycatcher MODERN SPECIES 19 ENSFALG00000015314 #7 ENSFALG00000015309 #8 ENSFALG00000026798 #9 ENSFALG00000015304 #10 ENSFALG00000015289 #11 ENSFALG00000027660 #12 ENSFALG00000000887 #13 ENSFALG00000015275 #14 ENSFALG00000000713 #15 ENSFALG00000000865 #16 ENSFALG00000000842 #17 ENSFALG00000000854 #18 ENSFALG00000027972 #19 MPP3 (ENSFALG00000000834) #20 ENSFALG00000000831 #21 ENSFALG00000025201 #22 SOST (ENSFALG00000028970) #23 ENSFALG00000027829 #24 MEOX1 (ENSFALG00000000823) #25 ETV4 (ENSFALG00000024603) #26 DHX8 (ENSFALG00000000810) #27 NBR1 (ENSFALG00000000804) #28 BRCA1 (ENSFALG00000000796) #29 RND2 (ENSFALG00000000786) #30 VAT1 (ENSFALG00000025296) #31 ENSFALG00000000781 #32 RPL27 (ENSFALG00000000772) #33 RUNDC1 (ENSFALG00000000768) #34 PTGES3L (ENSFALG00000024118) #35 AARSD1 (ENSFALG00000000757) #36 ENSFALG00000000748 #37 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157746 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000157744 ENSGT00950000183046.a.b ENSGT00940000157900 ENSGT00940000154376.b ENSGT00950000182883.a.a ENSGT00730000110974 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.b #19 ENSGT00940000157190 #20 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000169006 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000172611 ENSGT00950000183070.a.b ENSGT00940000157416 ENSGT00390000007741.a ENSGT00940000161380 ENSGT01100000263525.b.a ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843.cb ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160279 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000157746 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000157744 ENSGT00950000183046.a.b ENSGT00940000157900 ENSGT00940000154376.b ENSGT00950000182883.a.a ENSGT00730000110974 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.b #19 ENSGT00940000157190 #20 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00950000183070.a.b ENSGT00940000157416 ENSGT00390000007741.a ENSGT00940000161380 ENSGT01100000263525.b.a ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843.cb ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a Turkey MODERN SPECIES 21 ENSMGAG00000021072 ENSMGAG00000016852 KCNH2 (ENSMGAG00000001566) ENSMGAG00000005716 ENSMGAG00000020767 KAT7 (ENSMGAG00000002025) FAM117A (ENSMGAG00000002048) SLC35B1 (ENSMGAG00000002063) SPOP (ENSMGAG00000002099) NXPH3 (ENSMGAG00000015642) NGFR (ENSMGAG00000002136) ENSMGAG00000002161 #19 MPP3 (ENSMGAG00000002179) #20 CFAP97D1 (ENSMGAG00000019614) ENSMGAG00000018689 #21 ENSMGAG00000002314 #22 SOST (ENSMGAG00000022809) #23 MEOX1 (ENSMGAG00000017287) #25 ETV4 (ENSMGAG00000002317) #26 DHX8 (ENSMGAG00000002343) #27 PHB1 (ENSMGAG00000002414) ZNF652 (ENSMGAG00000002434) PHOSPHO1 (ENSMGAG00000002447) ENSMGAG00000002455 GNGT2 (ENSMGAG00000022172) IGF2BP1 (ENSMGAG00000002497) ENSMGAG00000007094 SNF8 (ENSMGAG00000007078) UBE2Z (ENSMGAG00000007071) ENSMGAG00000007047 ENSMGAG00000002528 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 painted turtle MODERN SPECIES 2367 ENSCPBG00000027630 ENSCPBG00000027629 ##19 CFAP97D1 (ENSCPBG00000027628) MPP3 (ENSCPBG00000027623) #20 ENSCPBG00000027619 ENSCPBG00000027616 #22 GATA6 (ENSCPBG00000027614) MIB1 (ENSCPBG00000027607) ABHD3 (ENSCPBG00000027604) ESCO1 (ENSCPBG00000027599) GREB1L (ENSCPBG00000027577) ENSCPBG00000027568 ROCK1 (ENSCPBG00000027564) USP14 (ENSCPBG00000027561) THOC1 (ENSCPBG00000027558) COLEC12 (ENSCPBG00000027554) CLUL1 (ENSCPBG00000027553) TYMS (ENSCPBG00000027552) ENOSF1 (ENSCPBG00000027551) YES1 (ENSCPBG00000027548) ADCYAP1 (ENSCPBG00000027547) Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01100000263787 ENSGT00390000014069.b ENSGT00560000077692 ENSGT00940000160773 ENSGT00400000022305 ENSGT00940000160534.o ENSGT00950000183150.b ENSGT00390000006956 ENSGT00390000011938 ENSGT00390000005602 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000155348.B ENSGT00940000162429.a ENSGT00940000157190 #20 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000161341.b Polar bear MODERN SPECIES 185 UBTF (ENSUMAG00000013247) ATXN7L3 (ENSUMAG00000013180) ENSUMAG00000013176 TMUB2 (ENSUMAG00000013167) ENSUMAG00000013163 HROB (ENSUMAG00000013161) HDAC5 (ENSUMAG00000013017) G6PC3 (ENSUMAG00000012993) LSM12 (ENSUMAG00000012987) TMEM101 (ENSUMAG00000012979) PPY (ENSUMAG00000012971) MPP2 (ENSUMAG00000012961) ENSUMAG00000012954 MPP3 (ENSUMAG00000012838) #20 CFAP97D1 (ENSUMAG00000012821) ENSUMAG00000012817 #22 MEOX1 (ENSUMAG00000012807) #25 DHX8 (ENSUMAG00000012797) #27 ARL4D (ENSUMAG00000012795) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 12 SLC4A1 (ENSHGLG00000016913) UBTF (ENSHGLG00000006625) ENSHGLG00000013149 TMUB2 (ENSHGLG00000007515) ENSHGLG00000042379 G6PC3 (ENSHGLG00000043749) LSM12 (ENSHGLG00000050842) TMEM101 (ENSHGLG00000046440) NAGS (ENSHGLG00000010233) PYY (ENSHGLG00000033184) ENSHGLG00000011831 MPP2 (ENSHGLG00000009770) ENSHGLG00000034523 MPP3 (ENSHGLG00000011058) #20 CFAP97D1 (ENSHGLG00000013368) DUSP3 (ENSHGLG00000050495) #22 SOST (ENSHGLG00000012172) #23 MEOX1 (ENSHGLG00000013678) #25 ETV4 (ENSHGLG00000011286) #26 DHX8 (ENSHGLG00000011583) #27 ENSHGLG00000050278 NBR1 (ENSHGLG00000009707) #28 BRCA1 (ENSHGLG00000011797) #29 RND2 (ENSHGLG00000016847) #30 VAT1 (ENSHGLG00000010027) #31 IFI35 (ENSHGLG00000045338) ENSHGLG00000034738 ##33 RUNDC1 (ENSHGLG00000014121) #34 ENSHGLG00000014337 #35 ENSHGLG00000046073 #36 ENSHGLG00000033874 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Opossum MODERN SPECIES 1 ENSMODG00000016797 METTL25B (ENSMODG00000016796) MRPL24 (ENSMODG00000016790) HDGF (ENSMODG00000051437) PRCC (ENSMODG00000016779) ENSMODG00000016772 ENSMODG00000016749 INSRR (ENSMODG00000016712) NTRK1 (ENSMODG00000016703) PEAR1 (ENSMODG00000016694) LRRC71 (ENSMODG00000016683) ARHGEF11 (ENSMODG00000016676) ENSMODG00000016664 MPP3 (ENSMODG00000015212) #20 ENSMODG00000024203 ENSMODG00000015202 #22 SOST (ENSMODG00000037336) #23 MEOX1 (ENSMODG00000015190) #25 ETV4 (ENSMODG00000015187) #26 DHX8 (ENSMODG00000015181) #27 ARL4D (ENSMODG00000024202) TMEM106A (ENSMODG00000015160) NBR1 (ENSMODG00000015157) #28 BRCA1 (ENSMODG00000015150) #29 RND2 (ENSMODG00000015141) #30 VAT1 (ENSMODG00000038066) #31 IFI35 (ENSMODG00000015132) RPL27 (ENSMODG00000041619) #33 RUNDC1 (ENSMODG00000015121) #34 ENSMODG00000042194 #35 ENSMODG00000041581 Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 3 TCEA2 (ENSLLEG00000023434) ARFGEF2 (ENSLLEG00000023997) C20orf85 (ENSLLEG00000025622) ENSLLEG00000025661 ENSLLEG00000025908 SAMD10 (ENSLLEG00000026364) ENSLLEG00000026417 UCKL1 (ENSLLEG00000026545) DNAJC5 (ENSLLEG00000026714) TPD52L2 (ENSLLEG00000026803) ZBTB46 (ENSLLEG00000027353) SLC2A4RG (ENSLLEG00000027407) ZGPAT (ENSLLEG00000027650) ARFRP1 (ENSLLEG00000027729) RUNDC1 (ENSLLEG00000027777) #34 ENSLLEG00000027865 #22 RSAD1 (ENSLLEG00000027931) XYLT2 (ENSLLEG00000028018) MRPL27 (ENSLLEG00000028341) ENSLLEG00000028531 LRRC59 (ENSLLEG00000028591) ACSF2 (ENSLLEG00000028720) CHAD (ENSLLEG00000029152) ENSLLEG00000029173 RAB37 (ENSLLEG00000029201) ENSLLEG00000029369 ENSLLEG00000029516 NAT9 (ENSLLEG00000029538) TMEM104 (ENSLLEG00000029577) GRIN2C (ENSLLEG00000029760) FDXR (ENSLLEG00000029806) Coelacanth MODERN SPECIES 865 ENSLACG00000014572 ENSLACG00000012593 #19 MPP3 (ENSLACG00000011821) #20 ENSLACG00000022414 rab18b (ENSLACG00000011256) #21 dusp3b (ENSLACG00000010846) #22 SOST (ENSLACG00000010427) #23 MEOX1 (ENSLACG00000007651) #25 ETV4 (ENSLACG00000003651) #26 DHX8 (ENSLACG00000001765) #27 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000165576.b ENSGT00390000018386 #16 ENSGT00940000159914 ENSGT00940000160643 ENSGT00940000155348.B.d ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079 ENSGT00650000094974 ENSGT00940000157744 ENSGT00940000163448 #35 ENSGT00940000156241 #36 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155348.B.d ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a 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(ENSSLDG00000005556) #25 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157509.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510.g.b #27 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Fugu MODERN SPECIES ENSTRUG00000030895 LASP1 (ENSTRUG00000020251) plxdc1 (ENSTRUG00000004152) ENSTRUG00000020464 tectb (ENSTRUG00000008422) ENSTRUG00000008278 acsl5 (ENSTRUG00000007791) ANK3 (ENSTRUG00000032231) MFAP4 (ENSTRUG00000007704) g6pc (ENSTRUG00000006732) g6pc1a.1 (ENSTRUG00000006412) psme3 (ENSTRUG00000006170) nbr1a (ENSTRUG00000024001) #28 tmem106a 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(ENSTNIG00000004135) psmd11b (ENSTNIG00000004136) ENSTNIG00000006979 #26 ENSTNIG00000003353 wnt3 (ENSTNIG00000006063) nsfb (ENSTNIG00000006062) psmd11b (ENSTNIG00000006061) MYO1D (ENSTNIG00000019513) ENSTNIG00000019512 ENSTNIG00000016967 PDK2 (ENSTNIG00000016966) TBKBP1 (ENSTNIG00000016965) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Ballan wrasse MODERN SPECIES 229 ANK3 (ENSLBEG00000010602) ENSLBEG00000010749 g6pc1a.2 (ENSLBEG00000010785) g6pc1a.1 (ENSLBEG00000010833) psme3 (ENSLBEG00000010882) nbr1a (ENSLBEG00000010972) #28 ENSLBEG00000011111 #28 tmem106a (ENSLBEG00000011127) arl4d (ENSLBEG00000011152) ENSLBEG00000011201 #22 SOST (ENSLBEG00000011225) #23 meox1 (ENSLBEG00000011244) #25 etv4 (ENSLBEG00000011272) #26 ENSLBEG00000011490 #27 DHX8 (ENSLBEG00000012048) #27 ENSLBEG00000012113 ormdl3 (ENSLBEG00000012141) wnt3 (ENSLBEG00000012155) nsfb (ENSLBEG00000012216) psmd11b (ENSLBEG00000012351) cdk5r1b (ENSLBEG00000012401) MYO1D (ENSLBEG00000012431) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a 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ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b European seabass MODERN SPECIES 11 ENSDLAG00005015707 ENSDLAG00005035066 ENSDLAG00005015714 tectb (ENSDLAG00005015835) ENSDLAG00005015841 acsl5 (ENSDLAG00005015889) ENSDLAG00005016638 ENSDLAG00005016526 ENSDLAG00005020870 ENSDLAG00005032936 ENSDLAG00005031549 psme3 (ENSDLAG00005020891) nbr1a (ENSDLAG00005020930) #28 tmem106a (ENSDLAG00005020957) arl4d (ENSDLAG00005031914) ENSDLAG00005033736 #22 SOST (ENSDLAG00005033789) #23 meox1 (ENSDLAG00005020975) #25 etv4 (ENSDLAG00005020978) #26 DHX8 (ENSDLAG00005021007) #27 ENSDLAG00005021583 ORMDL3 (ENSDLAG00005028232) ENSDLAG00005022067 nsfb (ENSDLAG00005022119) psmd11b (ENSDLAG00005023007) cdk5r1b (ENSDLAG00005033472) ENSDLAG00005023075 PDK2 (ENSDLAG00005023763) TBKBP1 (ENSDLAG00005023823) tbx21 (ENSDLAG00005028790) osbpl7 (ENSDLAG00005023883) Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.a #22 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.a #22 Channel bull blenny MODERN SPECIES 10 plekhm1 (ENSCGOG00000002468) ENSCGOG00000002461 LASP1 (ENSCGOG00000002459) plxdc1 (ENSCGOG00000002393) ENSCGOG00000002382 tectb (ENSCGOG00000002372) ENSCGOG00000023158 acsl5 (ENSCGOG00000022999) ANK3 (ENSCGOG00000022654) ENSCGOG00000022624 g6pc1a.2 (ENSCGOG00000022618) g6pc1a.1 (ENSCGOG00000022613) psme3 (ENSCGOG00000022490) nbr1a (ENSCGOG00000022484) #28 tmem106a (ENSCGOG00000022477) ENSCGOG00000022475 #22 SOST (ENSCGOG00000022474) #23 meox1 (ENSCGOG00000022473) #25 etv4 (ENSCGOG00000022471) #26 DHX8 (ENSCGOG00000021929) #27 ENSCGOG00000021848 ormdl3 (ENSCGOG00000021821) wnt3 (ENSCGOG00000021819) nsfb (ENSCGOG00000021447) psmd11b (ENSCGOG00000021286) cdk5r1b (ENSCGOG00000021276) MYO1D (ENSCGOG00000020276) PDK2 (ENSCGOG00000019925) ENSCGOG00000019917 TBKBP1 (ENSCGOG00000019915) tbx21 (ENSCGOG00000019907) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 13 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(ENSNFUG00015012628) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014794.b.k ENSGT00940000160175.a ENSGT00940000160084.h ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00950000183187.B ENSGT00940000156993.c ENSGT00940000160739 ENSGT00940000157982.a.a ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.a #22 Javanese ricefish MODERN SPECIES 10 ENSOJAG00000014775 ENSOJAG00000014811 llgl2 (ENSOJAG00000015042) galk1 (ENSOJAG00000015969) PLCD3 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#27 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 10 llgl2 (ENSORLG00000018426) galk1 (ENSORLG00000018489) ENSORLG00000025549 ENSORLG00000029832 ENSORLG00000029999 ENSORLG00000018561 acbd4 (ENSORLG00000018591) ENSORLG00000030584 ENSORLG00000018681 ENSORLG00000021944 g6pc1a.2 (ENSORLG00000018711) g6pc1a.1 (ENSORLG00000018731) psme3 (ENSORLG00000018778) nbr1a (ENSORLG00000018851) #28 tmem106a (ENSORLG00000018866) ENSORLG00000025889 #22 SOST (ENSORLG00000028572) #23 meox1 (ENSORLG00000011858) #25 etv4 (ENSORLG00000011909) #26 DHX8 (ENSORLG00000011951) #27 thra (ENSORLG00000012005) ENSORLG00000025859 ormdl3 (ENSORLG00000027713) wnt3 (ENSORLG00000012027) nsfb (ENSORLG00000012044) psmd11b (ENSORLG00000012079) cdk5r1b (ENSORLG00000012086) MYO1D 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ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Spiny chromis MODERN SPECIES 361 ENSAPOG00000003923 ANK3 (ENSAPOG00000004281) g6pc1a.2 (ENSAPOG00000004330) ENSAPOG00000004343 g6pc1a.1 (ENSAPOG00000004366) psme3 (ENSAPOG00000004411) nbr1a (ENSAPOG00000004436) #28 tmem106a (ENSAPOG00000004454) ENSAPOG00000004518 #22 SOST (ENSAPOG00000004532) #23 meox1 (ENSAPOG00000004549) #25 Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Orange clownfish MODERN SPECIES 10 ENSAPEG00000006830 LASP1 (ENSAPEG00000006799) plxdc1 (ENSAPEG00000006782) ENSAPEG00000006767 tectb (ENSAPEG00000006715) ENSAPEG00000006554 acsl5 (ENSAPEG00000006470) MFAP4 (ENSAPEG00000006426) ANK3 (ENSAPEG00000006088) g6pc1a.2 (ENSAPEG00000006021) g6pc1a.1 (ENSAPEG00000006009) psme3 (ENSAPEG00000005989) ENSAPEG00000005969 #28 nbr1a (ENSAPEG00000005951) #28 tmem106a (ENSAPEG00000005942) ENSAPEG00000005889 #22 SOST (ENSAPEG00000005879) #23 meox1 (ENSAPEG00000005786) #25 etv4 (ENSAPEG00000005761) #26 ENSAPEG00000005739 DHX8 (ENSAPEG00000005641) #27 ENSAPEG00000005621 ormdl3 (ENSAPEG00000005565) wnt3 (ENSAPEG00000005543) nsfb (ENSAPEG00000005478) psmd11b (ENSAPEG00000005372) cdk5r1b (ENSAPEG00000005355) ENSAPEG00000005336 MYO1D (ENSAPEG00000005253) PDK2 (ENSAPEG00000005179) TBKBP1 (ENSAPEG00000005081) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1440 g6pc1a.1 (ENSSPAG00000002323) psme3 (ENSSPAG00000002270) nbr1a (ENSSPAG00000002213) #28 tmem106a (ENSSPAG00000002109) ENSSPAG00000002051 #22 SOST (ENSSPAG00000002037) #23 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 24 ENSHCOG00000011573 LASP1 (ENSHCOG00000011575) plxdc1 (ENSHCOG00000011579) ENSHCOG00000011596 tectb (ENSHCOG00000011611) ENSHCOG00000011648 acsl5 (ENSHCOG00000011715) ANK3 (ENSHCOG00000011789) g6pc1a.2 (ENSHCOG00000011811) g6pc1a.1 (ENSHCOG00000011827) psme3 (ENSHCOG00000011845) nbr1a (ENSHCOG00000011859) #28 tmem106a (ENSHCOG00000011868) arl4d (ENSHCOG00000011881) SOST (ENSHCOG00000011886) #23 ENSHCOG00000011893 #22 meox1 (ENSHCOG00000011913) #25 ENSHCOG00000011930 myoz1b (ENSHCOG00000011948) SYNPO2L (ENSHCOG00000011970) sec24c (ENSHCOG00000012113) 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ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00390000008812.b.b.a.a.b ENSGT00940000157411.j ENSGT00940000156038.a.b.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c.c ENSGT00940000166447.c Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00940000156497.b ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000163448.b #35 ENSGT00940000156241 #36 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ENSGT00950000183150.a.a.b.f ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00390000016335.h.g #28 ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000162682.B.a.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a #23 ENSGT00940000154018.a.b #25 ENSGT00940000158142.e #26 ENSGT00940000155510.u.b #27 ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00390000008812.b.b.a.a.b ENSGT00940000157411.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c.c ENSGT00940000166447.c ENSGT00940000157439.b.d Rainbow trout MODERN SPECIES 7 crygmx (ENSOMYG00000034544) aldh18a1 (ENSOMYG00000034822) ENSOMYG00000037769 ENSOMYG00000037784 ENSOMYG00000037797 ENSOMYG00000037942 ENSOMYG00000062509 ENSOMYG00000038169 ENSOMYG00000038664 #35 AARSD1 (ENSOMYG00000038701) #36 G6PC1 (ENSOMYG00000038810) psme3 (ENSOMYG00000038921) nbr1a (ENSOMYG00000039260) #28 tmem106a (ENSOMYG00000039279) arl4d (ENSOMYG00000039302) ENSOMYG00000039350 #22 SOST (ENSOMYG00000075023) #23 meox1 (ENSOMYG00000054849) #25 etv4 (ENSOMYG00000039467) #26 DHX8 (ENSOMYG00000040006) #27 ENSOMYG00000064442 ENSOMYG00000041692 ormdl3 (ENSOMYG00000042161) wnt3 (ENSOMYG00000042177) nsfb (ENSOMYG00000042291) psmd11b (ENSOMYG00000042895) cdk5r1b (ENSOMYG00000042908) ENSOMYG00000042956 ENSOMYG00000065805 ENSOMYG00000043223 ENSOMYG00000043255 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d 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(ENSOKIG00005007293) #36 g6pc1a.2 (ENSOKIG00005007383) g6pc1a.1 (ENSOKIG00005007401) psme3 (ENSOKIG00005007470) nbr1a (ENSOKIG00005007605) #28 tmem106a (ENSOKIG00005007624) arl4d (ENSOKIG00005007645) ENSOKIG00005007656 #22 SOST (ENSOKIG00005007662) #23 meox1 (ENSOKIG00005007673) #25 etv4 (ENSOKIG00005007686) #26 ENSOKIG00005007695 #27 DHX8 (ENSOKIG00005007738) #27 THRA (ENSOKIG00005008207) ENSOKIG00005008540 ormdl3 (ENSOKIG00005008553) wnt3 (ENSOKIG00005008567) nsfb (ENSOKIG00005008716) psmd11b (ENSOKIG00005010937) cdk5r1b (ENSOKIG00005011007) ENSOKIG00005011062 PDK2 (ENSOKIG00005012119) TBKBP1 (ENSOKIG00005012307) Salmo ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00940000156497.b ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000163448.b #35 ENSGT00940000156241 #36 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ENSGT00950000183150.a.a.b.f ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00390000016335.h.g #28 ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000162682.B.a.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a #23 ENSGT00940000154018.a.b #25 ENSGT00940000158142.e #26 ENSGT00940000155510.u.b #27 ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00390000008812.b.b.a.a.b ENSGT00940000157411.j ENSGT00940000156038.a.b.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c.c ENSGT00940000166447.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 10 grnb (ENSSSAG00000072084) ENSSSAG00000072093 ENSSSAG00000076426 ENSSSAG00000072108 ENSSSAG00000072239 ENSSSAG00000101634 TEBP (ENSSSAG00000075153) #35 aarsd1 (ENSSSAG00000075169) #36 G6PC1 (ENSSSAG00000075243) g6pc1a.1 (ENSSSAG00000094615) nbr1a (ENSSSAG00000075301) #28 psme3 (ENSSSAG00000075257) ENSSSAG00000092613 tmem106a (ENSSSAG00000075308) ARL4D (ENSSSAG00000116077) ENSSSAG00000075323 #22 SOST (ENSSSAG00000086336) #23 meox1 (ENSSSAG00000093864) #25 etv4 (ENSSSAG00000075346) #26 DHX8 (ENSSSAG00000075459) #27 ENSSSAG00000076909 ormdl3 (ENSSSAG00000105314) wnt3 (ENSSSAG00000077501) nsfb (ENSSSAG00000077571) psmd11b (ENSSSAG00000078688) cdk5r1b (ENSSSAG00000101629) ENSSSAG00000006495 ENSSSAG00000100824 ENSSSAG00000083346 TBKBP1 (ENSSSAG00000096340) tbx21 (ENSSSAG00000015324) Huchen MODERN SPECIES 150 grnb (ENSHHUG00000041550) ENSHHUG00000041558 ENSHHUG00000041572 SRCIN1 (ENSHHUG00000041602) FMNL1 (ENSHHUG00000041632) ptges3l (ENSHHUG00000041823) #35 aarsd1 (ENSHHUG00000041837) #36 g6pc1a.2 (ENSHHUG00000041921) g6pc1a.1 (ENSHHUG00000041928) psme3 (ENSHHUG00000041932) nbr1a (ENSHHUG00000042175) #28 tmem106a (ENSHHUG00000042190) arl4d (ENSHHUG00000042230) ENSHHUG00000042233 #22 SOST (ENSHHUG00000042239) #23 meox1 (ENSHHUG00000042244) #25 etv4 (ENSHHUG00000042254) #26 DHX8 (ENSHHUG00000042276) #27 THRA (ENSHHUG00000042494) ormdl3 (ENSHHUG00000043012) wnt3 (ENSHHUG00000043016) ENSHHUG00000043024 ptprfa (ENSHHUG00000043036) ENSHHUG00000044902 st3gal3a (ENSHHUG00000044967) ENSHHUG00000044975 rad54l (ENSHHUG00000044982) psma8 (ENSHHUG00000045008) ENSHHUG00000045034 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 532 ENSGT00940000157961.A.e ENSGT00940000156292.g.a.c ENSGT00940000163448.a #35 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.c ENSGT00950000183150.a.a.b.e ENSGT00950000183098.a.b.d ENSGT00390000016335.h.h #28 ENSGT00940000166248.a.c ENSGT00940000161341.a.a.e ENSGT00940000162682.B.a.b #22 ENSGT00390000014900.b.b.b.a #23 ENSGT00940000154018.a.a #25 ENSGT00940000158142.f #26 ENSGT00940000155510.u.a.b #27 ENSGT00940000155510.u.a.a #27 ENSGT00940000157917.a.a.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b.c.b ENSGT00940000157854.w.a ENSGT00530000064085.c.c Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00940000164940.a.c ENSGT00940000164940.b.g.b ENSGT00500000044903.b.f.b ENSGT00470000042293.a.b.a.b.c ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.d ENSGT00940000158710 ENSGT00940000157961.A.e ENSGT00940000156292.g.a.c ENSGT00940000163448.a #35 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.c 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ENSGT00940000162682.B.a.b #22 ENSGT00390000014900.b.b.b.a #23 ENSGT00940000154018.a.a #25 ENSGT00940000158142.f #26 ENSGT00940000155510.u.a.b #27 ENSGT00940000155510.u.a.a #27 ENSGT00940000157917.a.a.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b.c.b ENSGT00940000157854.w.a ENSGT00530000064085.c.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a.e ENSGT00390000008812.b.b.a.a.a ENSGT00940000157411.i ENSGT00940000153704.B.c.d ENSGT00940000166447.d ENSGT00940000157439.b.c River trout MODERN SPECIES 1 crygmx (ENSSTUG00000010575) aldh18a1 (ENSSTUG00000009324) grnb (ENSSTUG00000009264) ENSSTUG00000009261 GRB7 (ENSSTUG00000009196) ENSSTUG00000009061 FMNL1 (ENSSTUG00000008178) ptges3l (ENSSTUG00000008135) #35 ENSSTUG00000008122 g6pc1a.2 (ENSSTUG00000008105) g6pc1a.1 (ENSSTUG00000007950) psme3 (ENSSTUG00000007920) nbr1a (ENSSTUG00000007897) #28 tmem106a (ENSSTUG00000007891) arl4d (ENSSTUG00000007873) ENSSTUG00000007862 #22 SOST (ENSSTUG00000007854) #23 ENSSTUG00000007847 meox1 (ENSSTUG00000007839) #25 etv4 (ENSSTUG00000007794) #26 DHX8 (ENSSTUG00000006798) #27 THRA (ENSSTUG00000005628) ormdl3 (ENSSTUG00000005562) wnt3 (ENSSTUG00000005517) nsfb (ENSSTUG00000001411) psmd11b (ENSSTUG00000000973) cdk5r1b (ENSSTUG00000013467) MYO1D (ENSSTUG00000013020) TBKBP1 (ENSSTUG00000012972) tbx21 (ENSSTUG00000012960) osbpl7 (ENSSTUG00000012941) Atlantic salmon MODERN SPECIES 20 crygmx (ENSSSAG00000077442) aldh18a1 (ENSSSAG00000076472) grnb (ENSSSAG00000076429) arf1l (ENSSSAG00000117959) ENSSSAG00000076370 ENSSSAG00000076356 ENSSSAG00000076176 TEBP (ENSSSAG00000076157) #35 ENSSSAG00000076155 ENSSSAG00000083503 ENSSSAG00000097121 psme3 (ENSSSAG00000076091) nbr1a (ENSSSAG00000076083) #28 tmem106a (ENSSSAG00000076078) arl4d (ENSSSAG00000076073) ENSSSAG00000108015 #22 SOST (ENSSSAG00000088726) #23 meox1 (ENSSSAG00000076066) #25 DHX8 (ENSSSAG00000113538) #27 etv4 (ENSSSAG00000076063) #26 DHX8 (ENSSSAG00000075492) #27 ENSSSAG00000093701 ENSSSAG00000107678 ormdl3 (ENSSSAG00000098798) ENSSSAG00000074396 wnt3 (ENSSSAG00000105288) nsfb (ENSSSAG00000072516) psmd11b (ENSSSAG00000072465) cdk5r1b (ENSSSAG00000102378) ENSSSAG00000096896 ENSSSAG00000067488 Huchen MODERN SPECIES 273 SRCIN1 (ENSHHUG00000021885) FMNL1 (ENSHHUG00000022042) ptges3l (ENSHHUG00000022204) #35 g6pc1a.2 (ENSHHUG00000022249) g6pc1a.1 (ENSHHUG00000022253) psme3 (ENSHHUG00000022263) nbr1a (ENSHHUG00000022430) #28 tmem106a (ENSHHUG00000022450) arl4d (ENSHHUG00000022456) ENSHHUG00000022461 #22 SOST (ENSHHUG00000022466) #23 meox1 (ENSHHUG00000022469) #25 etv4 (ENSHHUG00000022473) #26 DHX8 (ENSHHUG00000022506) #27 DHX8 (ENSHHUG00000023175) #27 THRA (ENSHHUG00000023258) ormdl3 (ENSHHUG00000024655) wnt3 (ENSHHUG00000024661) nsfb (ENSHHUG00000024680) Northern pike MODERN SPECIES 4 aldh18a1 (ENSELUG00000007119) grnb (ENSELUG00000007190) ENSELUG00000007217 ENSELUG00000007225 GRB7 (ENSELUG00000007234) SRCIN1 (ENSELUG00000007338) FMNL1 (ENSELUG00000007411) ptges3l (ENSELUG00000007536) #35 aarsd1 (ENSELUG00000007588) #36 g6pc1a.2 (ENSELUG00000007558) g6pc1a.1 (ENSELUG00000007630) psme3 (ENSELUG00000000273) nbr1a (ENSELUG00000007695) #28 tmem106a (ENSELUG00000007708) arl4d (ENSELUG00000007727) ENSELUG00000007740 #22 SOST (ENSELUG00000000284) #23 meox1 (ENSELUG00000030379) #25 etv4 (ENSELUG00000007861) #26 DHX8 (ENSELUG00000007955) #27 THRA (ENSELUG00000008043) ormdl3 (ENSELUG00000008099) wnt3 (ENSELUG00000008126) nsfb (ENSELUG00000008162) psmd11b (ENSELUG00000008204) cdk5r1b (ENSELUG00000008224) MYO1D (ENSELUG00000008245) ENSELUG00000008271 PDK2 (ENSELUG00000008326) TBKBP1 (ENSELUG00000008379) ENSELUG00000027949 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000166841 ENSGT01030000234627.a.b.b ENSGT00950000183025.a ENSGT00390000007843 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000018292.c ENSGT00950000182832.A ENSGT00940000161032 ENSGT00940000157457 ENSGT00940000165637 ENSGT00390000017856.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161032 ENSGT00950000182832.A ENSGT00390000018292.c ENSGT00390000005121 ENSGT00950000183025.a ENSGT00390000007843 ENSGT00940000165065.b ENSGT00940000158354.c.a ENSGT00940000165637 ENSGT00940000159503 ENSGT00390000017856.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Atlantic herring MODERN SPECIES 15 arsg (ENSCHAG00000013856) snx11 (ENSCHAG00000013883) ENSCHAG00000013891 stx4 (ENSCHAG00000013907) ENSCHAG00000013917 hoxb6b (ENSCHAG00000014833) hoxb5b (ENSCHAG00000014851) ENSCHAG00000014869 hoxb1b (ENSCHAG00000014873) skap1 (ENSCHAG00000014938) psme3 (ENSCHAG00000014948) nbr1a (ENSCHAG00000015020) #28 tmem106a (ENSCHAG00000015026) arl4d (ENSCHAG00000015038) ENSCHAG00000015066 ENSCHAG00000015090 #22 thraa (ENSCHAG00000015123) SOST (ENSCHAG00000015693) #23 meox1 (ENSCHAG00000015699) #25 etv4 (ENSCHAG00000015717) #26 DHX8 (ENSCHAG00000015803) #27 ENSCHAG00000018519 ormdl3 (ENSCHAG00000018526) wnt3 (ENSCHAG00000018541) nsfb (ENSCHAG00000018607) psmd11b (ENSCHAG00000019372) cdk5r1b (ENSCHAG00000019504) MYO1D (ENSCHAG00000019547) PDK2 (ENSCHAG00000020213) TBKBP1 (ENSCHAG00000020823) tbx21 (ENSCHAG00000020835) Denticle herring MODERN SPECIES 18 ENSDCDG00000017775 stx4 (ENSDCDG00000017770) calcoco2 (ENSDCDG00000017767) snf8 (ENSDCDG00000017764) gip (ENSDCDG00000017762) ENSDCDG00000017756 chmp2a (ENSDCDG00000017755) ENSDCDG00000017752 ENSDCDG00000017744 ENSDCDG00000017739 HOXB5 (ENSDCDG00000017717) skap1 (ENSDCDG00000017706) PSME3 (ENSDCDG00000017700) tmem106a (ENSDCDG00000017695) arl4d (ENSDCDG00000017691) ENSDCDG00000017684 #22 SOST (ENSDCDG00000017681) #23 meox1 (ENSDCDG00000017678) #25 etv4 (ENSDCDG00000017668) #26 DHX8 (ENSDCDG00000017361) #27 thraa (ENSDCDG00000015512) ormdl3 (ENSDCDG00000015446) wnt3 (ENSDCDG00000015438) nsfb (ENSDCDG00000013146) cdk5r1b (ENSDCDG00000013097) MYO1D (ENSDCDG00000013011) PDK2 (ENSDCDG00000011078) TBKBP1 (ENSDCDG00000010966) tbx21 (ENSDCDG00000010837) osbpl7 (ENSDCDG00000010329) mrpl10 (ENSDCDG00000010282) Otophysi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000007843 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000018292.c ENSGT00950000182832.A ENSGT00940000161032 ENSGT00940000157457 ENSGT00940000165637 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ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00390000004836 ENSGT00960000186809 ENSGT00940000159664 ENSGT00940000156819.a.b ENSGT00390000005895 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000018292.c.b ENSGT00950000182832.A.g ENSGT00940000161032.e ENSGT00940000157457.c ENSGT00940000165637.d ENSGT00940000161529.v.b ENSGT00940000165065.b.b ENSGT00940000158354.c.a.a.a ENSGT00940000159503.j ENSGT00390000017856.b.a ENSGT00950000183098.a.b.a ENSGT00390000016335.h.j #28 ENSGT00940000166248.a.b ENSGT01060000253506 ENSGT00940000161341.a.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b.c #23 ENSGT00940000154018.a.c.a #25 ENSGT00940000158142.c #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00390000004836.a ENSGT00940000159664.d ENSGT00940000156819.a.b.d.a ENSGT00940000156819.a.b.c.b ENSGT00390000005895.a 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ENSGT00940000153704.B.c.a Common carp reference MODERN SPECIES 25 chmp2a (ENSCCRG00000026391) ENSCCRG00000026465 ENSCCRG00000056857 ttll6 (ENSCCRG00000026591) hoxb8b (ENSCCRG00000080068) hoxb1b (ENSCCRG00000066675) hoxb6b (ENSCCRG00000071784) hoxb5b (ENSCCRG00000067370) skap1 (ENSCCRG00000026624) psme3 (ENSCCRG00000061279) nbr1a (ENSCCRG00000064272) #28 tmem106a (ENSCCRG00000023144) ENSCCRG00000064812 arl4d (ENSCCRG00000067749) ENSCCRG00000076696 ENSCCRG00000081681 #22 SOST (ENSCCRG00000010772) #23 meox1 (ENSCCRG00000059426) #25 etv4 (ENSCCRG00000021484) #26 DHX8 (ENSCCRG00000065848) #27 ENSCCRG00000023174 ENSCCRG00000078541 ENSCCRG00000053281 ENSCCRG00000026002 ogfod3 (ENSCCRG00000070519) psmd11b (ENSCCRG00000024625) cdk5r1b (ENSCCRG00000068741) ENSCCRG00000076292 ENSCCRG00000027898 ENSCCRG00000063984 TBKBP1 (ENSCCRG00000077031) Golden-line barbel MODERN SPECIES 456 znf438 (ENSSGRG00000009266) ENSSGRG00000009269 chmp2a (ENSSGRG00000009273) ENSSGRG00000009293 ENSSGRG00000009308 ttll6 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tbx21 (ENSCCRG00000054449) Goldfish MODERN SPECIES 3 znf438 (ENSCARG00000016234) ENSCARG00000016223 chmp2a (ENSCARG00000016213) ENSCARG00000016160 ENSCARG00000015297 ttll6 (ENSCARG00000015173) hoxb8b (ENSCARG00000015146) hoxb6b (ENSCARG00000015140) hoxb5b (ENSCARG00000015132) hoxb1b (ENSCARG00000015115) skap1 (ENSCARG00000015074) psme3 (ENSCARG00000014694) nbr1a (ENSCARG00000014661) #28 tmem106a (ENSCARG00000014654) arl4d (ENSCARG00000014648) ENSCARG00000014643 #22 SOST (ENSCARG00000014639) #23 meox1 (ENSCARG00000014631) #25 etv4 (ENSCARG00000014605) #26 DHX8 (ENSCARG00000009308) #27 CACNA1G (ENSCARG00000005904) ENSCARG00000005702 ENSCARG00000005695 ogfod3 (ENSCARG00000005679) psmd11b (ENSCARG00000005665) cdk5r1b (ENSCARG00000005645) MYO1D (ENSCARG00000003148) PDK2 (ENSCARG00000002696) TBKBP1 (ENSCARG00000002654) tbx21 (ENSCARG00000002646) osbpl7 (ENSCARG00000002627) Zebrafish MODERN SPECIES 3 ENSDARG00000090223 chmp2a (ENSDARG00000053979) ENSDARG00000074688 ENSDARG00000005236 ttll6 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ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b ENSGT00390000000603 ENSGT00390000011219 ENSGT00940000154534.b.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 213 ENSGT00940000154507.t ENSGT00940000161341.a.b ENSGT00940000166248.b ENSGT00390000016335.g #28 ENSGT00950000183098.a.a.a ENSGT00950000183207.b #37 ENSGT00950000183150.a.a.a.d ENSGT00940000157744.c ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000165079.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a 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ENSGT00390000018541 ENSGT00940000159428.e.b ENSGT00730000111057.c ENSGT01030000235061.d ENSGT00940000157598 ENSGT00940000157195.m ENSGT01060000249533 ENSGT00940000159384 ENSGT00940000166194 ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000165079.b ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00390000005666 ENSGT00940000157513 ENSGT00940000159039.a ENSGT00390000004169 ENSGT00950000182961.a.a.d ENSGT00950000182983.A.a.a.a ENSGT01030000234586.B.a.a.b Electric eel MODERN SPECIES 131 ENSEEEG00000020991 ENSEEEG00000020992 nmrk1 (ENSEEEG00000020994) zgc:163143 (ENSEEEG00000020996) ENSEEEG00000020998 dlx4a (ENSEEEG00000021001) dusp3b (ENSEEEG00000021007) #22 DNAAF5 (ENSEEEG00000021009) prkar1b (ENSEEEG00000021011) pdgfab (ENSEEEG00000021013) ccdc137 (ENSEEEG00000021015) BTBD17 (ENSEEEG00000021016) KCNJ2 (ENSEEEG00000021017) zp3f.2 (ENSEEEG00000021020) cyp2k19 (ENSEEEG00000021031) ABCA3 (ENSEEEG00000021089) ccnf (ENSEEEG00000021364) CFAP70 (ENSEEEG00000021373) HMOX2 (ENSEEEG00000021395) dnaja3a (ENSEEEG00000021414) coro7 (ENSEEEG00000021531) vasnb (ENSEEEG00000021532) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT01100000263614 ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00940000160292 ENSGT00940000153222.a.b.a ENSGT00940000154700 ENSGT00950000182838.A.a.a ENSGT00940000167194 ENSGT00940000160972 ENSGT00940000158268.b ENSGT00440000037417.B.a ENSGT00390000014700.b.a.b.b.a Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 232 ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b 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SPECIES ENSGT00940000162682.B.b #22 Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.b.a.b ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a 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ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.b.a.b ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000163460.a.a.b ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000177241.e ENSGT00940000174883 ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000155311.A.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000163460.a.a.b ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000174883 ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 European seabass MODERN SPECIES 21 carhsp1 (ENSDLAG00005018917) nat15 (ENSDLAG00005018922) dnase1 (ENSDLAG00005027246) eci1 (ENSDLAG00005018955) ENSDLAG00005018972 ENSDLAG00005019012 ENSDLAG00005019052 aldh16a1 (ENSDLAG00005020092) fthl31 (ENSDLAG00005026383) syt5a (ENSDLAG00005020187) tnnt1 (ENSDLAG00005018111) pih1d1 (ENSDLAG00005034590) ENSDLAG00005020330 ENSDLAG00005021039 prl (ENSDLAG00005021555) dusp3b (ENSDLAG00005015143) #22 ENSDLAG00005015185 ENSDLAG00005032908 ENSDLAG00005016002 nsfa (ENSDLAG00005016019) ENSDLAG00005031697 ENSDLAG00005017138 ENSDLAG00005032181 ENSDLAG00005017346 ENSDLAG00005032733 ENSDLAG00005033811 ENSDLAG00005033367 ENSDLAG00005030687 ENSDLAG00005033637 ENSDLAG00005015851 ENSDLAG00005024545 Large yellow croaker MODERN SPECIES 483 oclnb (ENSLCRG00005014280) sdf2l1 (ENSLCRG00005014283) marveld2b (ENSLCRG00005014285) ENSLCRG00005014286 syt5a (ENSLCRG00005014287) fthl27 (ENSLCRG00005014290) aldh16a1 (ENSLCRG00005014294) ENSLCRG00005014300 ENSLCRG00005015490 ENSLCRG00005015492 eci1 (ENSLCRG00005015495) dnase1 (ENSLCRG00005015503) dnase1 (ENSLCRG00005015504) nat15 (ENSLCRG00005015506) carhsp1 (ENSLCRG00005015508) dusp3b (ENSLCRG00005015510) #22 thraa (ENSLCRG00005015522) nsfa (ENSLCRG00005015738) cdk5r1a (ENSLCRG00005017151) rpain (ENSLCRG00005017152) PSMD11 (ENSLCRG00005017156) DLX3 (ENSLCRG00005017174) ENSLCRG00005017175 nags (ENSLCRG00005017176) ENSLCRG00005017177 ENSLCRG00005017178 coa3b (ENSLCRG00005017181) col1a1a (ENSLCRG00005017192) ENSLCRG00005019213 ENSLCRG00005019214 ENSLCRG00005019215 Gilthead seabream MODERN SPECIES 15 nat15 (ENSSAUG00010021540) dnase1 (ENSSAUG00010021537) eci1 (ENSSAUG00010021536) ENSSAUG00010021370 ENSSAUG00010021365 ENSSAUG00010021362 ENSSAUG00010019937 aldh16a1 (ENSSAUG00010019869) fthl31 (ENSSAUG00010019861) syt5a (ENSSAUG00010019859) sTnT1 (ENSSAUG00010019858) pih1d1 (ENSSAUG00010019855) ENSSAUG00010018348 ENSSAUG00010018270 prl (ENSSAUG00010018269) dusp3b (ENSSAUG00010018268) #22 thraa (ENSSAUG00010017310) nsfa (ENSSAUG00010017283) cdk5r1a (ENSSAUG00010017277) rpain (ENSSAUG00010026054) PSMD11 (ENSSAUG00010026051) DLX3 (ENSSAUG00010026049) ENSSAUG00010026048 nags (ENSSAUG00010026047) ENSSAUG00010026046 ENSSAUG00010026045 coa3b (ENSSAUG00010026043) col1a1a (ENSSAUG00010019190) ENSSAUG00010018971 pex12 (ENSSAUG00010018968) HDAC5 (ENSSAUG00010017838) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.b.a.b ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 ENSGT00940000160534 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.b.a.b ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 ENSGT00940000160534 ENSGT00950000183197.a Pike perch MODERN SPECIES 186 ppm1f (ENSSLUG00000019793) ENSSLUG00000017966 ENSSLUG00000017855 prl (ENSSLUG00000017842) dusp3b (ENSSLUG00000017833) #22 thraa (ENSSLUG00000017093) nsfa (ENSSLUG00000015251) CDK5R1 (ENSSLUG00000015146) JUP (ENSSLUG00000011733) rbfox1 (ENSSLUG00000011578) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000005584 ENSGT00390000005605 ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00940000156887.a ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000157700.d ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00940000160152 ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.b ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00940000164506.b.b ENSGT00940000160257 ENSGT00940000167287 ENSGT00940000160315 ENSGT00940000157552.s.b ENSGT00390000016298.a ENSGT00390000000053.b ENSGT00940000159680 ENSGT01010000222313.A.b.a.c ENSGT00940000158145.b ENSGT00940000169385 Stickleback MODERN SPECIES 10 spc24 (ENSGACG00000006733) kri1 (ENSGACG00000006712) ldlra (ENSGACG00000006705) smarca4a (ENSGACG00000006691) ENSGACG00000006688 MAST1 (ENSGACG00000006669) rtbdn (ENSGACG00000006658) junbb (ENSGACG00000006654) hook2 (ENSGACG00000006640) syt5a (ENSGACG00000006630) tnnt1 (ENSGACG00000006626) pih1d1 (ENSGACG00000006615) ENSGACG00000006606 ENSGACG00000006598 prl (ENSGACG00000006561) dusp3b (ENSGACG00000006555) #22 ENSGACG00000006554 thraa (ENSGACG00000006540) nsfa (ENSGACG00000006514) CDK5R1 (ENSGACG00000006504) tspan35 (ENSGACG00000006494) ZNF653 (ENSGACG00000006483) swsap1 (ENSGACG00000006482) epor (ENSGACG00000006477) rab3db (ENSGACG00000006453) tmem205 (ENSGACG00000006448) elof1 (ENSGACG00000006444) CNN1 (ENSGACG00000006412) plppr2a (ENSGACG00000006409) ENSGACG00000006406 ENSGACG00000006401 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.b #22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.b #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00940000177154 ENSGT00970000198135 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 ENSGT00940000160534 ENSGT00950000183197.a ENSGT00940000156447.a.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000166711 ENSGT00390000003628.a.b ENSGT00940000164286.j.b.a.a.a ENSGT00940000163871.b ENSGT00940000155348.B.c ENSGT00940000160643.i ENSGT00940000168246 ENSGT01030000234785 Greater amberjack MODERN SPECIES 50 dnase1 (ENSSDUG00000007677) eci1 (ENSSDUG00000007662) ENSSDUG00000007480 ENSSDUG00000007430 ENSSDUG00000007417 ENSSDUG00000007362 aldh16a1 (ENSSDUG00000007340) fthl31 (ENSSDUG00000007323) syt5a (ENSSDUG00000007236) tnnt1 (ENSSDUG00000007148) pih1d1 (ENSSDUG00000007123) ENSSDUG00000007071 ENSSDUG00000007024 si:dkey-16p21.8 (ENSSDUG00000007015) prl (ENSSDUG00000006996) dusp3b (ENSSDUG00000006978) #22 thraa (ENSSDUG00000006951) nsfa (ENSSDUG00000006845) cdk5r1a (ENSSDUG00000006827) rpain (ENSSDUG00000006821) PSMD11 (ENSSDUG00000006787) DLX3 (ENSSDUG00000006765) ENSSDUG00000006757 ENSSDUG00000006740 rpl23 (ENSSDUG00000006698) ENSSDUG00000006658 smarce1 (ENSSDUG00000006627) ENSSDUG00000006614 ENSSDUG00000006592 mpp2a (ENSSDUG00000006569) pyya (ENSSDUG00000006560) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2955 dnase1 (ENSSLDG00000016089) eci1 (ENSSLDG00000016059) ENSSLDG00000015999 ENSSLDG00000015890 ENSSLDG00000015877 ENSSLDG00000015812 aldh16a1 (ENSSLDG00000015707) fthl31 (ENSSLDG00000015658) syt5a (ENSSLDG00000015628) tnnt1 (ENSSLDG00000015604) pih1d1 (ENSSLDG00000015582) ENSSLDG00000015534 ENSSLDG00000015474 si:dkey-16p21.8 (ENSSLDG00000015459) prl (ENSSLDG00000014273) dusp3b (ENSSLDG00000013974) #22 thraa (ENSSLDG00000013953) nsfa (ENSSLDG00000013833) cdk5r1a (ENSSLDG00000013777) rpain (ENSSLDG00000013756) PSMD11 (ENSSLDG00000013717) DLX3 (ENSSLDG00000013683) ENSSLDG00000013663 ENSSLDG00000013653 ENSSLDG00000013635 rpl23 (ENSSLDG00000013573) ENSSLDG00000013555 smarce1 (ENSSLDG00000013531) ENSSLDG00000013513 ENSSLDG00000013486 mpp2a (ENSSLDG00000013449) Barramundi perch MODERN SPECIES 435 ENSLCAG00010018294 ENSLCAG00010018168 prl (ENSLCAG00010018133) dusp3b (ENSLCAG00010018132) #22 thraa (ENSLCAG00010018125) nsfa (ENSLCAG00010017941) cdk5r1a (ENSLCAG00010017907) rpain (ENSLCAG00010017903) PSMD11 (ENSLCAG00010017874) DLX3 (ENSLCAG00010017862) ENSLCAG00010017861 nags (ENSLCAG00010017859) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.b #22 Zig-zag eel MODERN SPECIES 22 ENSMAMG00000017875 ENSMAMG00000017850 ENSMAMG00000017838 ENSMAMG00000017792 ENSMAMG00000017736 ENSMAMG00000017691 JMJD6 (ENSMAMG00000017683) ENSMAMG00000025844 ENSMAMG00000024527 ENSMAMG00000017633 ENSMAMG00000025220 ENSMAMG00000024437 ENSMAMG00000017598 ENSMAMG00000017590 ENSMAMG00000028217 ENSMAMG00000017579 #22 ENSMAMG00000017557 ENSMAMG00000017550 ENSMAMG00000017542 ENSMAMG00000017532 ENSMAMG00000017496 ENSMAMG00000017466 ENSMAMG00000017422 ENSMAMG00000024678 ENSMAMG00000017402 ENSMAMG00000017365 prl (ENSMAMG00000017357) ENSMAMG00000017315 ENSMAMG00000017238 pih1d1 (ENSMAMG00000017192) tnnt1 (ENSMAMG00000017171) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a.p ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT01100000263513.a.a.b.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 ENSGT00940000160534 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a.p ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT01100000263513.a.a.b.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000006679.b.n ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A.s ENSGT00950000182818.A.t ENSGT00940000162682.B.b #22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00950000182818.A.t ENSGT00940000162682.B.b #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00530000064157.b ENSGT00390000012078.a.b ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000013719 ENSGT00950000182917.a.b.b ENSGT00950000182841.a.o.a.c.a ENSGT01060000248575.D.c.b.b.a.l ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A.s ENSGT00950000182818.A.t ENSGT00940000162682.B.b #22 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ENSGT00390000006679.b.n.a.b ENSGT00390000006679.b.n.b.a ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154.c ENSGT00390000006679.b.n.a.a ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.a Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000157022 ENSGT00530000064157.b ENSGT00390000012078.a.b.i ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000013719 ENSGT00950000182917.a.b.b ENSGT01060000248575.D.c.b.b.a.l ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A.s ENSGT00950000182818.A.t ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b.m.a ENSGT00940000179732 ENSGT00390000006679.b.n.b.a ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154.c ENSGT00390000006679.b.n.a.a ENSGT00940000156584.e.b ENSGT01060000249103 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 31 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ENSACLG00000007402 ENSACLG00000007398 ENSACLG00000007357 si:dkey-16p21.8 (ENSACLG00000007348) prl (ENSACLG00000007341) prl (ENSACLG00000007323) ENSACLG00000007318 dusp3b (ENSACLG00000007299) #22 thraa (ENSACLG00000007247) nsfa (ENSACLG00000007069) cdk5r1a (ENSACLG00000007067) rpain (ENSACLG00000007056) PSMD11 (ENSACLG00000007023) DLX3 (ENSACLG00000007018) ENSACLG00000007015 nags (ENSACLG00000007000) ENSACLG00000006986 ENSACLG00000006981 ENSACLG00000006968 ENSACLG00000006958 ENSACLG00000006948 ENSACLG00000006944 ENSACLG00000006873 Zebra mbuna MODERN SPECIES 1107 ENSMZEG00005022729 ENSMZEG00005022723 ENSMZEG00005022719 smg1 (ENSMZEG00005022705) hao1 (ENSMZEG00005022689) ENSMZEG00005022683 ENSMZEG00005022677 ENSMZEG00005022675 ENSMZEG00005022671 ENSMZEG00005022667 ENSMZEG00005018971 ENSMZEG00005018859 si:dkey-16p21.8 (ENSMZEG00005018855) prl (ENSMZEG00005018848) prl (ENSMZEG00005018843) dusp3b (ENSMZEG00005018840) #22 thraa (ENSMZEG00005018835) nsfa (ENSMZEG00005018814) rpain 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(ENSACIG00000011276) thraa (ENSACIG00000011258) nsfa (ENSACIG00000011229) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a.p ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00940000173491 ENSGT00940000163460.a.a.b ENSGT00940000168246 ENSGT00940000160643.i ENSGT00940000155348.B.c ENSGT00940000163871.b ENSGT00390000003628.a.b ENSGT00940000166711 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a.p ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00940000173491 ENSGT00940000163460.a.a.b Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 272 ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 249 ENSKMAG00000012947 ENSKMAG00000012959 ENSKMAG00000012989 si:dkey-16p21.8 (ENSKMAG00000013074) prl (ENSKMAG00000013086) ENSKMAG00000013145 ENSKMAG00000013158 dusp3b (ENSKMAG00000013170) #22 ENSKMAG00000013200 ENSKMAG00000013256 GAL3ST2 (ENSKMAG00000013266) thraa (ENSKMAG00000013299) nsfa (ENSKMAG00000013366) cdk5r1a 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ENSORLG00000027877 ENSORLG00000023067 ENSORLG00000023280 ENSORLG00000022454 ENSORLG00000025689 ENSORLG00000016958 cyb561 (ENSORLG00000016966) HDAC5 (ENSORLG00000016994) pex12 (ENSORLG00000017001) ENSORLG00000017003 col1a1a (ENSORLG00000017013) ENSORLG00000022724 Chinese medaka MODERN SPECIES 2875 dusp3b (ENSOSIG00000001365) #22 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00930000151196.a.b ENSGT00940000161121 ENSGT01050000244900.a.b.f.b ENSGT00940000167425 ENSGT00940000164717.a ENSGT00940000164903.a.e ENSGT00940000167839 ENSGT00940000165368 ENSGT00940000167630 ENSGT00940000166481 ENSGT00390000002069 ENSGT00940000160609.e ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a.b ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00940000159275.b ENSGT00940000154664.h.j Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 767 ENSGT00940000164511.C.k.b.b ENSGT00950000182818.A.o ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a.b.b ENSGT00530000064085.d.b ENSGT00390000008812.b.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b ENSGT00940000158951.f.c ENSGT00940000165079.b.b ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 120 ENSGT00950000182841.a.m.b ENSGT00940000166981.e.a ENSGT00940000160609.f.e ENSGT00940000164511.C.k.b.b ENSGT00950000182818.A.o.a ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a.b.b ENSGT00530000064085.d.b ENSGT00390000008812.b.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b ENSGT00940000158951.f.c ENSGT00940000165079.b.b ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b ENSGT00940000159252.b.b.b ENSGT00940000160492.f ENSGT00950000183143.c.b.m ENSGT00390000002810.l ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b ENSGT01030000234629.E.a.b.c ENSGT00940000153496.a.a.r.b.a ENSGT00940000153496.a.a.r.a Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182841.a.m.b ENSGT00940000166981.e.a ENSGT00940000164511.C.k.b.b ENSGT00950000182818.A.o.a ENSGT00950000182818.A.o.b ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a.b.b ENSGT00530000064085.d.b ENSGT00390000008812.b.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b ENSGT00940000158951.f.c ENSGT00940000165079.b.b ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b ENSGT00940000160492.f ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b ENSGT01030000234629.E.a.b.c ENSGT00940000153496.a.a.r.b.a ENSGT00390000007652.c ENSGT00390000003337.f.b ENSGT00390000006617.f ENSGT00940000158837.g.b.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182841.a.m.b ENSGT00940000166981.e.a ENSGT00940000160609.f.e ENSGT00940000164511.C.k.b.b ENSGT00950000182818.A.o.a ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a.b.b ENSGT00530000064085.d.b ENSGT00390000008812.b.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b ENSGT00940000158951.f.c ENSGT00940000165079.b.b ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b ENSGT00940000160492.f ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b ENSGT01030000234629.E.a.b.c ENSGT00940000153496.a.a.r.b.a ENSGT00390000007652.c ENSGT00390000003337.f.b ENSGT00390000006617.f ENSGT00940000158837.g.b.b Chinook salmon MODERN SPECIES ENSOTSG00005010771 WDFY4 (ENSOTSG00005010761) vstm4a (ENSOTSG00005010759) drgx (ENSOTSG00005010758) ENSOTSG00005010757 sprn (ENSOTSG00005010756) ENSOTSG00005010755 ENSOTSG00005010754 SRF (ENSOTSG00005010753) ENSOTSG00005010751 ENSOTSG00005010749 syt5a (ENSOTSG00005010748) tnnt1 (ENSOTSG00005010747) ENSOTSG00005010733 prl2 (ENSOTSG00005010731) dusp3b (ENSOTSG00005010730) #22 THRA (ENSOTSG00005009816) nsfa (ENSOTSG00005009601) cdk5r1a (ENSOTSG00005009599) PSMD11 (ENSOTSG00005009598) DLX3 (ENSOTSG00005009596) dlx4a (ENSOTSG00005009595) ENSOTSG00005009594 SEZ6L2 (ENSOTSG00005009418) ATP6V0C (ENSOTSG00005009413) spsb3a (ENSOTSG00005009412) mapk8ip3 (ENSOTSG00005009375) CRAMP1 (ENSOTSG00005009373) tmem11 (ENSOTSG00005009371) ENSOTSG00005009357 ENSOTSG00005009356 Coho salmon MODERN SPECIES 1 COLGALT1 (ENSOKIG00005035949) ENSOKIG00005035844 ENSOKIG00005035795 atp13a1 (ENSOKIG00005035082) pbx4 (ENSOKIG00005034919) ENSOKIG00005034731 ENSOKIG00005034693 STXBP2 (ENSOKIG00005034430) ENSOKIG00005034389 XAB2 (ENSOKIG00005033079) ENSOKIG00005032994 ENSOKIG00005032824 ENSOKIG00005032481 ENSOKIG00005032442 ENSOKIG00005032418 dusp3b (ENSOKIG00005032411) #22 THRA (ENSOKIG00005032167) NSF (ENSOKIG00005030932) CDK5R1 (ENSOKIG00005030823) PSMD11 (ENSOKIG00005030783) DLX3 (ENSOKIG00005030773) ENSOKIG00005030742 ENSOKIG00005030686 SEZ6L2 (ENSOKIG00005030576) SPSB3 (ENSOKIG00005030546) mapk8ip3 (ENSOKIG00005029868) ENSOKIG00005029815 jpt2 (ENSOKIG00005029781) CRAMP1 (ENSOKIG00005029739) tmem11 (ENSOKIG00005029724) ENSOKIG00005029359 Rainbow trout MODERN SPECIES 22 ENSOMYG00000021406 ENSOMYG00000046940 ENSOMYG00000071216 ENSOMYG00000046921 ENSOMYG00000046919 #22 ENSOMYG00000053599 ENSOMYG00000046850 ENSOMYG00000046756 ENSOMYG00000063379 ENSOMYG00000053810 ENSOMYG00000051375 ENSOMYG00000046708 ENSOMYG00000046701 ENSOMYG00000046697 ENSOMYG00000046695 ENSOMYG00000046626 ENSOMYG00000046565 ENSOMYG00000046560 ENSOMYG00000057237 mapk8ip3 (ENSOMYG00000046505) Salmo ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000166981.e.a ENSGT00940000160609.f.e ENSGT00940000164511.C.k.b.b ENSGT00950000182818.A.o.a ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a.b.b ENSGT00530000064085.d.b ENSGT00390000008812.b.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b ENSGT00940000158951.f.c ENSGT00940000165079.b.b ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b ENSGT00940000159252.b.b.b ENSGT00940000160492.f ENSGT00950000183143.c.b.m ENSGT00390000002810.l ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b ENSGT01030000234629.E.a.b.c ENSGT00940000153496.a.a.r.a ENSGT00390000007652.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 15 ENSSSAG00000031377 ENSSSAG00000015328 ENSSSAG00000065652 ENSSSAG00000034084 ENSSSAG00000031162 ENSSSAG00000088009 #22 ENSSSAG00000057762 ENSSSAG00000102800 ENSSSAG00000041588 ENSSSAG00000083996 ENSSSAG00000120584 ENSSSAG00000082098 HEBP2 (ENSSSAG00000045682) ENSSSAG00000045730 ENSSSAG00000045889 ENSSSAG00000052647 ENSSSAG00000102969 ENSSSAG00000106267 ENSSSAG00000095306 ENSSSAG00000114586 mapk8ip3 (ENSSSAG00000053437) River trout MODERN SPECIES 33 C4orf54 (ENSSTUG00000021705) mttp (ENSSTUG00000021829) ENSSTUG00000023319 tspan5b (ENSSTUG00000023336) rps6 (ENSSTUG00000023472) ENSSTUG00000023560 dnaja1 (ENSSTUG00000023788) ENSSTUG00000023848 ENSSTUG00000023852 ENSSTUG00000023865 syt5a (ENSSTUG00000023918) tnnt1 (ENSSTUG00000023957) ENSSTUG00000024016 ENSSTUG00000024119 prl (ENSSTUG00000025286) dusp3b (ENSSTUG00000025300) #22 THRA (ENSSTUG00000025312) nsfa (ENSSTUG00000025460) cdk5r1a (ENSSTUG00000027621) PSMD11 (ENSSTUG00000027628) DLX3 (ENSSTUG00000027720) dlx4a (ENSSTUG00000027729) ENSSTUG00000027742 ENSSTUG00000027796 ENSSTUG00000027813 SEZ6L2 (ENSSTUG00000027824) kctd13 (ENSSTUG00000027924) xpo6 (ENSSTUG00000027955) ENSSTUG00000029153 ATP6V0C (ENSSTUG00000029160) spsb3a (ENSSTUG00000029182) Huchen MODERN SPECIES 148 ENSHHUG00000035952 ENSHHUG00000035967 cdipt (ENSHHUG00000035972) ENSHHUG00000035986 ENSHHUG00000036192 ENSHHUG00000036197 aldh16a1 (ENSHHUG00000036204) ENSHHUG00000036222 syt5a (ENSHHUG00000036574) tnnt1 (ENSHHUG00000036584) ENSHHUG00000036592 ENSHHUG00000036645 ENSHHUG00000036652 ENSHHUG00000036765 prl (ENSHHUG00000036766) dusp3b (ENSHHUG00000036821) #22 THRA (ENSHHUG00000036832) Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079 ENSGT00650000094974 ENSGT00940000157744 ENSGT00940000163448 #35 ENSGT00940000156241 #36 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183207.b #37 ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h #28 ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000154152.b.b ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00390000014900.b.b.b #23 ENSGT00940000154018.a #25 ENSGT00940000158142 #26 ENSGT00940000155510 #27 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b P. kingsleyae MODERN SPECIES 140 ptges3l (ENSPKIG00000001885) #35 aarsd1 (ENSPKIG00000001834) #36 g6pc1a.2 (ENSPKIG00000001818) g6pc1a.1 (ENSPKIG00000001796) aoc2 (ENSPKIG00000001770) #37 psme3 (ENSPKIG00000001731) nbr1a (ENSPKIG00000001662) #28 ENSPKIG00000001637 tmem106a (ENSPKIG00000001622) arl4d (ENSPKIG00000001594) ENSPKIG00000001572 cbx1b (ENSPKIG00000001532) dusp3b (ENSPKIG00000001501) #22 SOST (ENSPKIG00000001485) #23 meox1 (ENSPKIG00000001445) #25 etv4 (ENSPKIG00000001383) #26 DHX8 (ENSPKIG00000001290) #27 thraa (ENSPKIG00000001202) ormdl3 (ENSPKIG00000001166) wnt3 (ENSPKIG00000001145) nsfb (ENSPKIG00000001091) psmd11b (ENSPKIG00000001035) cdk5r1b (ENSPKIG00000001019) MYO1D (ENSPKIG00000000999) ENSPKIG00000000976 PDK2 (ENSPKIG00000000931) ENSPKIG00000000901 tbx21 (ENSPKIG00000000866) Asian bonytongue MODERN SPECIES 23 hoxb13a (ENSSFOG00015005110) ENSSFOG00015005153 atp5mc1 (ENSSFOG00015005177) igf2bp1 (ENSSFOG00015005197) ENSSFOG00015005236 nr1d1 (ENSSFOG00015005263) RAPGEFL1 (ENSSFOG00015005308) cdk5r1a (ENSSFOG00015005367) psmd11a (ENSSFOG00015005378) nsfa (ENSSFOG00015005423) THRA (ENSSFOG00015005613) ENSSFOG00015031465 rpl23 (ENSSFOG00015019980) kpnb1 (ENSSFOG00015020000) ENSSFOG00015020076 dusp3b (ENSSFOG00015020088) #22 ENSSFOG00015020100 #28 ccdc103 (ENSSFOG00015020113) FAM187A (ENSSFOG00015020122) mpp2a (ENSSFOG00015005697) psmd3 (ENSSFOG00015020181) PPP1R9B (ENSSFOG00015020237) col1a1a (ENSSFOG00015020268) gngt2a (ENSSFOG00015031596) nags (ENSSFOG00015020373) LSM12 (ENSSFOG00015020392) ENSSFOG00015020400 TANC2 (ENSSFOG00015032829) WNK4 (ENSSFOG00015020448) ENSSFOG00015027981 ENSSFOG00015020477 Elephant shark MODERN SPECIES 2856 dusp3b (ENSCMIG00000005393) #22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Lamprey MODERN SPECIES 235 glrba (ENSPMAG00000001254) mmab (ENSPMAG00000001252) dusp3b (ENSPMAG00000001249) #22 Hagfish MODERN SPECIES 408 ENSEBUG00000007743 ENSEBUG00000015376 ENSEBUG00000015384 lancl2 (ENSEBUG00000006738) ENSEBUG00000005526 ENSEBUG00000016794 ENSEBUG00000008359 ENSEBUG00000012378 ENSEBUG00000006213 dusp3b (ENSEBUG00000010681) #22 ENSEBUG00000015790 CCNY (ENSEBUG00000014815) ENSEBUG00000013532 ENSEBUG00000007494 MYD88 (ENSEBUG00000013287) mettl1 (ENSEBUG00000015021) ENSEBUG00000013481 ENSEBUG00000009231 ENSEBUG00000005508 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A ##22 Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A ##22 Lamprey MODERN SPECIES 1456 opa1 (ENSPMAG00000002100) ENSPMAG00000002098 ENSPMAG00000002075 ENSPMAG00000002071 ENSPMAG00000002067 ##22 ENSPMAG00000002062 Hagfish MODERN SPECIES 42 ST8SIA5 (ENSEBUG00000011408) ENSEBUG00000004787 arih1 (ENSEBUG00000012907) ENSEBUG00000007229 ENSEBUG00000003920 ENSEBUG00000014621 ENSEBUG00000011567 ENSEBUG00000011868 ##22 ENSEBUG00000005475 ENSEBUG00000004410 h1-0 (ENSEBUG00000004067) ENSEBUG00000008846 ENSEBUG00000013524 ENSEBUG00000013316 ENSEBUG00000004575 ENSEBUG00000013301 ENSEBUG00000014691 ENSEBUG00000012813 ENSEBUG00000002169 ENSEBUG00000007013 ENSEBUG00000008971 syt11b (ENSEBUG00000000978) ENSEBUG00000010112 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000160190 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.q.f ENSGT00940000155540.b.b.p ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00390000014320.c.a.g ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00390000014666.b.i ENSGT00940000158585.g.a.m ENSGT00940000156697 ENSGT00940000164982.b ENSGT00390000000483.a.b ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.f ENSGT00530000063534.b ENSGT00940000156696.B ENSGT00940000157732.f.a ENSGT00390000000909 Asian bonytongue MODERN SPECIES 16 rps24 (ENSSFOG00015014495) zmiz1a (ENSSFOG00015014538) ppifb (ENSSFOG00015014715) zcchc24 (ENSSFOG00015028700) anxa11b (ENSSFOG00015014756) dlg5a (ENSSFOG00015014789) KCNMA1 (ENSSFOG00015014902) ZNF503 (ENSSFOG00015031054) comtd1 (ENSSFOG00015014963) VDAC2 (ENSSFOG00015015102) SAMD8 (ENSSFOG00015015129) ENSSFOG00015015159 ##22 ENSSFOG00015027548 DUSP13 (ENSSFOG00015028570) ENSSFOG00015015198 ENSSFOG00015015346 ##22 KAT6B (ENSSFOG00015015355) adkb (ENSSFOG00015015386) vclb (ENSSFOG00015015428) tagln3b (ENSSFOG00015030501) SPATA13 (ENSSFOG00015015560) TMPRSS7 (ENSSFOG00015015588) ENSSFOG00015015655 flt1 (ENSSFOG00015015683) pan3 (ENSSFOG00015015792) urad (ENSSFOG00015015860) pdx1 (ENSSFOG00015026366) si:ch211-140b10.6 (ENSSFOG00015015872) lnx2a (ENSSFOG00015015882) gtf3aa (ENSSFOG00015030594) rpl21 (ENSSFOG00015029845) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003070.a.b.b ENSGT00940000160638 ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00390000003595 ENSGT00940000165559 ENSGT01080000257365.a.d ##19 ENSGT01030000234586.B.a.a.a Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Northern pike MODERN SPECIES 5 prkg1a (ENSELUG00000001205) dkk1a (ENSELUG00000007748) pcdh15a (ENSELUG00000008231) plek (ENSELUG00000001220) prokr1b (ENSELUG00000008451) BFSP1 (ENSELUG00000008462) pcsk2 (ENSELUG00000008495) OTOR (ENSELUG00000000317) GTPBP2 (ENSELUG00000008544) polh (ENSELUG00000008575) tp53bp2a (ENSELUG00000008659) fhip2a (ENSELUG00000008745) srfb (ENSELUG00000008785) PTK7 (ENSELUG00000008899) ENSELUG00000008976 ENSELUG00000025847 ##22 ap3m1 (ENSELUG00000009122) adka (ENSELUG00000009045) vcla (ENSELUG00000009248) plaua (ENSELUG00000009385) CHUK (ENSELUG00000009335) erlin1 (ENSELUG00000009418) spef1 (ENSELUG00000009447) adam8a (ENSELUG00000009481) znf511 (ENSELUG00000009616) msx3 (ENSELUG00000025958) fuom (ENSELUG00000032077) echs1 (ENSELUG00000009707) sprn (ENSELUG00000009722) mtg1 (ENSELUG00000009753) paox (ENSELUG00000009780) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003070.a.b.b ENSGT00940000160638 ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00390000003595 ENSGT01050000244841.A.b.a.b.b ENSGT00940000157836.b ENSGT00950000182983.A.a.a.b Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003070.a.b.b ENSGT00940000160638 ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00390000003595 ENSGT00940000165559 ENSGT01080000257365.a.d ##19 ENSGT01030000234586.B.a.a.a Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n.d ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000166115 ENSGT00940000163471.b.b.a.a ENSGT00940000163471.b.a ENSGT00390000009925.b ENSGT00940000154883.e.a ENSGT00940000163380 Mummichog MODERN SPECIES 2222 ZMIZ1 (ENSFHEG00000011828) ENSFHEG00000011680 ppifb (ENSFHEG00000011661) ZCCHC24 (ENSFHEG00000011642) anxa11b (ENSFHEG00000011631) DLG5 (ENSFHEG00000011549) KCNMA1 (ENSFHEG00000011518) ZNF503 (ENSFHEG00000011434) COMTD1 (ENSFHEG00000011416) VDAC2 (ENSFHEG00000011382) SAMD8 (ENSFHEG00000011356) ENSFHEG00000011349 ##22 ENSFHEG00000011344 DUSP13 (ENSFHEG00000011342) ENSFHEG00000011335 ENSFHEG00000011328 ##22 KAT6B (ENSFHEG00000011305) adkb (ENSFHEG00000011172) vclb (ENSFHEG00000011070) C1QL1 (ENSFHEG00000011005) dcakd (ENSFHEG00000010993) pus3 (ENSFHEG00000010984) ENSFHEG00000010974 coasy (ENSFHEG00000010959) zgc:174164 (ENSFHEG00000010946) ENSFHEG00000010918 ENSFHEG00000010909 RNF157 (ENSFHEG00000010896) srsf2a (ENSFHEG00000010835) ENSFHEG00000010819 ENSFHEG00000010813 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1621 ENSNFUG00015016277 ENSNFUG00015016289 ENSNFUG00015016317 ppifb (ENSNFUG00015016338) ZCCHC24 (ENSNFUG00015016351) ANXA11B (ENSNFUG00015016524) DLG5 (ENSNFUG00015020680) KCNMA1 (ENSNFUG00015020829) ENSNFUG00015021348 ZNF503 (ENSNFUG00015021353) COMTD1 (ENSNFUG00015021355) VDAC2 (ENSNFUG00015021359) Nfu_g_1_023359 (ENSNFUG00015021461) 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ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Chinese medaka 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ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 300 ZMIZ1 (ENSHBUG00000000529) PPIF (ENSHBUG00000017823) ppifb (ENSHBUG00000017418) ZCCHC24 (ENSHBUG00000017427) ENSHBUG00000001081 DLG5 (ENSHBUG00000017378) KCNMA1 (ENSHBUG00000017307) ZNF503 (ENSHBUG00000016947) COMTD1 (ENSHBUG00000016939) VDAC2 (ENSHBUG00000016923) SAMD8 (ENSHBUG00000016907) ENSHBUG00000000497 ##22 ENSHBUG00000016810 DUSP13 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(ENSPNYG00000019365) aldh18a1 (ENSPNYG00000019313) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008.hb ENSGT00940000156008.gb ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1111 PPIF (ENSMZEG00005000469) ppifb (ENSMZEG00005000427) ZCCHC24 (ENSMZEG00005000413) ENSMZEG00005000399 DLG5 (ENSMZEG00005000379) KCNMA1 (ENSMZEG00005000182) 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Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a 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ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b ENSGT00390000011708.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Stickleback MODERN SPECIES 5 ENSGACG00000002322 QRFPR (ENSGACG00000002317) polr3a (ENSGACG00000002304) ZMIZ1 (ENSGACG00000002299) ppifb (ENSGACG00000002292) ZCCHC24 (ENSGACG00000002284) anxa11b (ENSGACG00000002272) DLG5 (ENSGACG00000002262) KCNMA1 (ENSGACG00000002248) ZNF503 (ENSGACG00000002242) COMTD1 (ENSGACG00000002233) VDAC2 (ENSGACG00000002213) SAMD8 (ENSGACG00000002197) ENSGACG00000002195 ##22 ENSGACG00000002193 ENSGACG00000002187 ##22 KAT6B (ENSGACG00000002173) adkb (ENSGACG00000002159) vclb (ENSGACG00000002142) C1QL1 (ENSGACG00000002140) dcakd (ENSGACG00000002129) pus3 (ENSGACG00000002125) ENSGACG00000002123 coasy (ENSGACG00000002115) zdhhc6 (ENSGACG00000002103) ENSGACG00000002098 ENSGACG00000002097 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b ENSGT00390000011708.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 12 polr3a (ENSSAUG00010020971) ZMIZ1 (ENSSAUG00010020835) PPIF (ENSSAUG00010020798) ZCCHC24 (ENSSAUG00010020794) ENSSAUG00010017398 DLG5 (ENSSAUG00010017318) KCNMA1 (ENSSAUG00010016762) ZNF503 (ENSSAUG00010016729) COMTD1 (ENSSAUG00010016726) VDAC2 (ENSSAUG00010016326) SAMD8 (ENSSAUG00010016318) ENSSAUG00010016317 ##22 ENSSAUG00010016316 DUSP13 (ENSSAUG00010016315) ENSSAUG00010025774 ENSSAUG00010025773 ##22 KAT6B (ENSSAUG00010025772) ADK (ENSSAUG00010025591) vclb (ENSSAUG00010025582) C1QL1 (ENSSAUG00010025579) dcakd (ENSSAUG00010025578) pus3 (ENSSAUG00010025577) ENSSAUG00010025575 ENSSAUG00010025573 coasy (ENSSAUG00010025571) zdhhc6 (ENSSAUG00010025569) vti1a (ENSSAUG00010025566) tcf7l2 (ENSSAUG00010024204) crygmxl2 (ENSSAUG00010024174) crygmx (ENSSAUG00010024173) aldh18a1 (ENSSAUG00010024163) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b ENSGT00390000011708.b Tongue sole MODERN SPECIES 18 ENSCSEG00000008706 ENSCSEG00000008696 ENSCSEG00000008682 myoz1b (ENSCSEG00000008676) SYNPO2L (ENSCSEG00000008668) sec24c (ENSCSEG00000008658) ENSCSEG00000008652 CAMK2G (ENSCSEG00000008623) ZNF503 (ENSCSEG00000008616) COMTD1 (ENSCSEG00000008605) VDAC2 (ENSCSEG00000008597) SAMD8 (ENSCSEG00000008590) ENSCSEG00000008529 ##22 ENSCSEG00000008513 DUSP13 (ENSCSEG00000008512) ENSCSEG00000008505 ##22 ENSCSEG00000008469 KAT6B (ENSCSEG00000008413) adkb (ENSCSEG00000008074) vclb (ENSCSEG00000007999) ENSCSEG00000007988 dcakd (ENSCSEG00000007971) pus3 (ENSCSEG00000007948) ENSCSEG00000007924 coasy (ENSCSEG00000007894) zdhhc6 (ENSCSEG00000007866) vti1a (ENSCSEG00000007826) tcf7l2 (ENSCSEG00000007714) crygmxl2 (ENSCSEG00000007698) crygmx (ENSCSEG00000007683) PNMT (ENSCSEG00000007679) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 10 polr3a (ENSMAMG00000017497) ZMIZ1 (ENSMAMG00000017452) ppifb (ENSMAMG00000027460) ZCCHC24 (ENSMAMG00000026018) anxa11b (ENSMAMG00000017383) DLG5 (ENSMAMG00000017364) KCNMA1 (ENSMAMG00000017331) ZNF503 (ENSMAMG00000017328) COMTD1 (ENSMAMG00000017321) VDAC2 (ENSMAMG00000017292) SAMD8 (ENSMAMG00000016937) ENSMAMG00000016961 ##22 ENSMAMG00000016926 DUSP13 (ENSMAMG00000024325) ENSMAMG00000016922 ENSMAMG00000016910 ##22 KAT6B (ENSMAMG00000016883) ADK (ENSMAMG00000016841) VCL (ENSMAMG00000016786) ENSMAMG00000016775 ENSMAMG00000016766 ENSMAMG00000016741 ENSMAMG00000016729 ENSMAMG00000016702 zdhhc6 (ENSMAMG00000016682) vti1a (ENSMAMG00000027858) tcf7l2 (ENSMAMG00000016611) crygmxl2 (ENSMAMG00000016596) crygmx (ENSMAMG00000016587) aldh18a1 (ENSMAMG00000016534) ENSMAMG00000016518 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a ENSGT00940000164940.b ENSGT00500000044903.b Siamese fighting fish MODERN SPECIES 9 TBATA (ENSBSLG00000021596) ENSBSLG00000021584 polr3a (ENSBSLG00000021529) ZMIZ1 (ENSBSLG00000021193) ppifb (ENSBSLG00000020445) ZCCHC24 (ENSBSLG00000020441) anxa11b (ENSBSLG00000019386) DLG5 (ENSBSLG00000019245) ZNF503 (ENSBSLG00000017311) COMTD1 (ENSBSLG00000017300) VDAC2 (ENSBSLG00000016899) SAMD8 (ENSBSLG00000016846) ENSBSLG00000016830 ##22 ENSBSLG00000016813 ENSBSLG00000026406 ENSBSLG00000026403 ##22 KAT6B (ENSBSLG00000026400) ADK (ENSBSLG00000026392) vclb (ENSBSLG00000026334) C1QL1 (ENSBSLG00000026312) dcakd (ENSBSLG00000026311) pus3 (ENSBSLG00000026310) ENSBSLG00000026309 ENSBSLG00000026307 coasy (ENSBSLG00000026305) zdhhc6 (ENSBSLG00000026301) vti1a (ENSBSLG00000026295) tcf7l2 (ENSBSLG00000026145) crygmxl2 (ENSBSLG00000026027) aldh18a1 (ENSBSLG00000025995) PNMT (ENSBSLG00000025973) Climbing perch MODERN SPECIES 10 polr3a (ENSATEG00000023277) ZMIZ1 (ENSATEG00000023213) PPIF (ENSATEG00000023198) ZCCHC24 (ENSATEG00000029482) ENSATEG00000023178 DLG5 (ENSATEG00000023120) KCNMA1 (ENSATEG00000023038) ZNF503 (ENSATEG00000023016) COMTD1 (ENSATEG00000028410) VDAC2 (ENSATEG00000028651) SAMD8 (ENSATEG00000022974) ENSATEG00000022941 ##22 ENSATEG00000027129 DUSP13 (ENSATEG00000022927) ENSATEG00000022892 ENSATEG00000022922 ##22 KAT6B (ENSATEG00000022849) ADK (ENSATEG00000022815) VCL (ENSATEG00000022767) ENSATEG00000025812 ENSATEG00000022744 ENSATEG00000022731 ENSATEG00000022721 ENSATEG00000022703 ENSATEG00000022691 zdhhc6 (ENSATEG00000022671) vti1a (ENSATEG00000029195) tcf7l2 (ENSATEG00000022610) crygmxl2 (ENSATEG00000022591) crygmx (ENSATEG00000022582) aldh18a1 (ENSATEG00000022563) Cod MODERN SPECIES 9 ENSGMOG00000029053 polr3a (ENSGMOG00000000291) ZMIZ1 (ENSGMOG00000000277) PPIF (ENSGMOG00000000273) ZCCHC24 (ENSGMOG00000000271) ENSGMOG00000000260 DLG5 (ENSGMOG00000000247) KCNMA1 (ENSGMOG00000000234) ZNF503 (ENSGMOG00000000232) VDAC2 (ENSGMOG00000000228) SAMD8 (ENSGMOG00000000224) ENSGMOG00000000220 ##22 ENSGMOG00000036070 DUSP13 (ENSGMOG00000034188) ENSGMOG00000000215 ENSGMOG00000000213 ##22 KAT6B (ENSGMOG00000000202) ADK (ENSGMOG00000000194) VCL (ENSGMOG00000000184) ENSGMOG00000010751 HID1 (ENSGMOG00000010734) OTOP3 (ENSGMOG00000010723) USH1G (ENSGMOG00000010716) FADS6 (ENSGMOG00000010702) trim16 (ENSGMOG00000010687) ENSGMOG00000010659 ENSGMOG00000028252 ENSGMOG00000010652 ENSGMOG00000006833 ENSGMOG00000013117 ENSGMOG00000003141 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT01030000234539.b.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000155278 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372.y ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n Denticle herring DUPLICATION Denticle herring MODERN SPECIES 11 VDAC2 (ENSDCDG00000001032) SAMD8 (ENSDCDG00000000998) ENSDCDG00000000989 DUSP13 (ENSDCDG00000000986) ENSDCDG00000000978 ##22 KAT6B (ENSDCDG00000000970) adkb (ENSDCDG00000000964) DLG5 (ENSDCDG00000000929) KCNMA1 (ENSDCDG00000000531) ZNF503 (ENSDCDG00000000297) COMTD1 (ENSDCDG00000000256) VDAC2 (ENSDCDG00000000160) SAMD8 (ENSDCDG00000000134) ENSDCDG00000002298 DUSP13 (ENSDCDG00000002297) ENSDCDG00000002294 ##22 KAT6B (ENSDCDG00000002290) adkb (ENSDCDG00000002266) aarsd1 (ENSDCDG00000002244) #36 g6pc1a.2 (ENSDCDG00000002231) g6pc1a.1 (ENSDCDG00000002209) ptges3l (ENSDCDG00000002205) #35 kat7b (ENSDCDG00000002177) ENSDCDG00000002168 dlx4b (ENSDCDG00000002167) dlx3b (ENSDCDG00000002164) itga3b (ENSDCDG00000002157) ENSDCDG00000001753 ENSDCDG00000001738 fkbp10b (ENSDCDG00000001733) P3H4 (ENSDCDG00000001731) Denticle herring MODERN SPECIES 11 KCNH4 (ENSDCDG00000002796) ENSDCDG00000002760 ZNF385C (ENSDCDG00000002755) DNAJC7 (ENSDCDG00000002642) aclya (ENSDCDG00000002587) klhl11 (ENSDCDG00000002576) ENSDCDG00000001890 DLG5 (ENSDCDG00000001713) KCNMA1 (ENSDCDG00000001213) ZNF503 (ENSDCDG00000001117) COMTD1 (ENSDCDG00000001112) VDAC2 (ENSDCDG00000001032) SAMD8 (ENSDCDG00000000998) ENSDCDG00000000989 DUSP13 (ENSDCDG00000000986) ENSDCDG00000000978 ##22 KAT6B (ENSDCDG00000000970) adkb (ENSDCDG00000000964) DLG5 (ENSDCDG00000000929) KCNMA1 (ENSDCDG00000000531) ZNF503 (ENSDCDG00000000297) COMTD1 (ENSDCDG00000000256) VDAC2 (ENSDCDG00000000160) SAMD8 (ENSDCDG00000000134) ENSDCDG00000002298 DUSP13 (ENSDCDG00000002297) ENSDCDG00000002294 ##22 KAT6B (ENSDCDG00000002290) adkb (ENSDCDG00000002266) aarsd1 (ENSDCDG00000002244) #36 g6pc1a.2 (ENSDCDG00000002231) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003595 ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00940000160638 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Common carp reference DUPLICATION Common carp reference MODERN SPECIES 36 ENSCCRG00000062532 large1 (ENSCCRG00000058201) ENSCCRG00000081925 nup50 (ENSCCRG00000061295) ENSCCRG00000054462 ENSCCRG00000064668 ENSCCRG00000065856 ENSCCRG00000078700 ENSCCRG00000031637 ENSCCRG00000046783 ENSCCRG00000042329 ENSCCRG00000029671 ENSCCRG00000072580 ENSCCRG00000081275 ENSCCRG00000069296 ENSCCRG00000030323 ##22 ENSCCRG00000066681 ENSCCRG00000006086 ENSCCRG00000028366 ENSCCRG00000044670 ENSCCRG00000023261 ENSCCRG00000056613 ENSCCRG00000074503 ENSCCRG00000048127 ENSCCRG00000061505 ENSCCRG00000064214 ENSCCRG00000053954 ENSCCRG00000081927 ENSCCRG00000082400 ENSCCRG00000033499 ENSCCRG00000041598 Common carp reference MODERN SPECIES 36 cd36 (ENSCCRG00000010508) gnai1 (ENSCCRG00000033760) ENSCCRG00000033639 ENSCCRG00000035796 ndufb2 (ENSCCRG00000072248) ENSCCRG00000039177 orc5 (ENSCCRG00000001236) lhfpl3 (ENSCCRG00000058495) guca1a (ENSCCRG00000070485) ENSCCRG00000001214 hcls1 (ENSCCRG00000001201) llph (ENSCCRG00000057054) ppfia2 (ENSCCRG00000070855) ACSS3 (ENSCCRG00000072702) lin7a (ENSCCRG00000070932) ENSCCRG00000002290 ##22 myf5 (ENSCCRG00000031947) myf6 (ENSCCRG00000052812) ENSCCRG00000031955 ppp1r12a (ENSCCRG00000031966) pawr (ENSCCRG00000017856) syt1a (ENSCCRG00000060462) nav3 (ENSCCRG00000003878) ENSCCRG00000075007 ENSCCRG00000082448 ENSCCRG00000003610 ENSCCRG00000038194 ENSCCRG00000025696 ENSCCRG00000024630 ENSCCRG00000076072 ENSCCRG00000064902 Golden-line barbel MODERN SPECIES 3279 ENSSGRG00000006282 ##22 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 21 ENSCARG00000022765 large1 (ENSCARG00000022819) kiaa0930 (ENSCARG00000024010) nup50 (ENSCARG00000024274) PHF21B (ENSCARG00000024295) KCNA1 (ENSCARG00000024315) KCNA5 (ENSCARG00000024336) ENSCARG00000024342 ENSCARG00000024380 ENSCARG00000024390 ENSCARG00000024402 ENSCARG00000016604 trim24 (ENSCARG00000016620) rab21 (ENSCARG00000016685) ENSCARG00000016724 ENSCARG00000017711 ##22 nav3 (ENSCARG00000017765) ENSCARG00000018015 ENSCARG00000018031 ENSCARG00000018046 ints13 (ENSCARG00000018087) rassf8b (ENSCARG00000018184) cacna1c (ENSCARG00000018252) dcp1b (ENSCARG00000019355) LRTM2 (ENSCARG00000019365) stk38l (ENSCARG00000019367) ENSCARG00000019374 fgl2a (ENSCARG00000019383) lrrc17 (ENSCARG00000019387) CEP83 (ENSCARG00000019402) ENSCARG00000019470 Goldfish MODERN SPECIES 984 ENSCARG00000032196 ENSCARG00000032188 ENSCARG00000032184 ENSCARG00000032171 ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 362 ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 Channel catfish MODERN SPECIES 4 anxa11b (ENSIPUG00000001643) ENSIPUG00000001616 ENSIPUG00000001597 ENSIPUG00000001580 USH1G (ENSIPUG00000001552) ENSIPUG00000001544 FADS6 (ENSIPUG00000001522) ENSIPUG00000001506 comtd1 (ENSIPUG00000001497) VDAC2 (ENSIPUG00000001468) samd8 (ENSIPUG00000001453) ENSIPUG00000001445 ##22 ENSIPUG00000001437 DUSP13 (ENSIPUG00000001428) ENSIPUG00000001419 ENSIPUG00000001416 ##22 ndufb8 (ENSIPUG00000001392) scd (ENSIPUG00000001348) ENSIPUG00000001322 ENSIPUG00000001302 SDK2 (ENSIPUG00000001154) ENSIPUG00000001125 ENSIPUG00000001117 ENSIPUG00000001116 ADAMTS14 (ENSIPUG00000001097) pald1 (ENSIPUG00000001051) nodal (ENSIPUG00000001044) lrrc20 (ENSIPUG00000001031) ttyh2 (ENSIPUG00000000989) ENSIPUG00000000982 ENSIPUG00000000978 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003595 ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00940000160638.n Electric eel MODERN SPECIES 955 ENSEEEG00000008774 ENSEEEG00000008775 ##22 adkb (ENSEEEG00000008787) vclb (ENSEEEG00000009083) exoc7 (ENSEEEG00000009139) tvp23b (ENSEEEG00000010106) FADS6 (ENSEEEG00000010114) USH1G (ENSEEEG00000010117) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003595 ENSGT00390000004428.a.b Mexicana tetra MODERN SPECIES 116 ENSAMXG00000039222 ENSAMXG00000030320 ZNF503 (ENSAMXG00000031112) COMTD1 (ENSAMXG00000039488) VDAC2 (ENSAMXG00000035617) SAMD8 (ENSAMXG00000006691) ENSAMXG00000030855 ##22 ENSAMXG00000034948 DUSP13 (ENSAMXG00000006707) ENSAMXG00000041055 ENSAMXG00000030866 ##22 adkb (ENSAMXG00000013461) vclb (ENSAMXG00000042904) ENSAMXG00000034862 exoc7 (ENSAMXG00000035608) tvp23b (ENSAMXG00000040559) CHST15 (ENSAMXG00000030259) oat (ENSAMXG00000033395) lhpp (ENSAMXG00000001319) fam53b (ENSAMXG00000037052) hpdl (ENSAMXG00000032192) ENSAMXG00000001350 ENSAMXG00000001375 mmp21 (ENSAMXG00000035048) uros (ENSAMXG00000032720) drosha (ENSAMXG00000005582) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 200 ENSGT00940000161685.A.b 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ENSCMIG00000009033 ENSCMIG00000009030 znf503 (ENSCMIG00000009027) lrmda (ENSCMIG00000009021) kcnma1a (ENSCMIG00000007265) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000164426 ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00390000014666.b ENSGT00940000171460 ENSGT00940000158585 ENSGT00940000156697 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982 ENSGT00390000000483.a.b Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 846 ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B Neopterygii DUPLICATION Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000160190 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 91 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000160190.b ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00940000164982.b Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c Otophysi ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351 ENSGT00940000163896 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00940000166025.b Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00940000166025.a ENSGT00390000012228 ENSGT00940000166377.f Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714.f ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00940000166025.a ENSGT00390000012228 Electric eel MODERN SPECIES 287 cep68 (ENSEEEG00000002615) slc1a4 (ENSEEEG00000002605) sertad2b (ENSEEEG00000002596) lgalslb (ENSEEEG00000002594) echs1 (ENSEEEG00000002588) fuom (ENSEEEG00000002584) msx3 (ENSEEEG00000002582) znf511 (ENSEEEG00000002580) adam8a (ENSEEEG00000002577) spef1 (ENSEEEG00000002575) erlin1 (ENSEEEG00000002302) ENSEEEG00000002295 sfr1 (ENSEEEG00000002293) slka (ENSEEEG00000000739) si:ch211-223p8.8 (ENSEEEG00000000083) ##22 zgc:153981 (ENSEEEG00000000077) ##22 dusp13a (ENSEEEG00000000071) ENSEEEG00000000064 KAT6B (ENSEEEG00000000059) adka (ENSEEEG00000023791) ap3m1 (ENSEEEG00000023774) vcla (ENSEEEG00000023750) plaua (ENSEEEG00000023745) chuk (ENSEEEG00000023706) gsto2 (ENSEEEG00000023696) itprip (ENSEEEG00000023695) CALHM3 (ENSEEEG00000023694) CALHM1 (ENSEEEG00000023692) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714.e ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00940000166025.a ENSGT00390000012228 Red-bellied piranha MODERN SPECIES 45 slc1a4 (ENSPNAG00000013905) sertad2b (ENSPNAG00000013911) lgalslb (ENSPNAG00000013920) echs1 (ENSPNAG00000013935) fuom (ENSPNAG00000013958) msx3 (ENSPNAG00000013971) znf511 (ENSPNAG00000014006) adam8a (ENSPNAG00000014023) spef1 (ENSPNAG00000014042) erlin1 (ENSPNAG00000014087) CFAP43 (ENSPNAG00000014139) sfr1 (ENSPNAG00000014101) ENSPNAG00000014217 slka (ENSPNAG00000003068) si:ch211-223p8.8 (ENSPNAG00000003074) ##22 zgc:153981 (ENSPNAG00000003075) ##22 dusp13a (ENSPNAG00000014306) ENSPNAG00000014321 KAT6B (ENSPNAG00000003109) adka (ENSPNAG00000014449) ap3m1 (ENSPNAG00000014489) vcla (ENSPNAG00000014585) plaua (ENSPNAG00000014603) chuk (ENSPNAG00000014647) gsto2 (ENSPNAG00000014672) itprip (ENSPNAG00000014679) CALHM3 (ENSPNAG00000003213) CALHM1 (ENSPNAG00000014696) calhm2.1 (ENSPNAG00000014705) ENSPNAG00000014735 ENSPNAG00000014738 Channel catfish MODERN SPECIES 22 SLC1A4 (ENSIPUG00000020541) ENSIPUG00000020583 SERTAD2 (ENSIPUG00000020596) grpa (ENSIPUG00000020599) echs1 (ENSIPUG00000020612) fuom (ENSIPUG00000020642) msx3 (ENSIPUG00000020663) znf511 (ENSIPUG00000020651) adam8a (ENSIPUG00000020673) spef1 (ENSIPUG00000020768) erlin1 (ENSIPUG00000020783) cfap43 (ENSIPUG00000020810) ENSIPUG00000020873 slka (ENSIPUG00000020996) si:ch211-223p8.8 (ENSIPUG00000021038) ##22 zgc:153981 (ENSIPUG00000021042) ##22 DUSP13 (ENSIPUG00000021047) CALHM1 (ENSIPUG00000021054) kat6b (ENSIPUG00000021062) adk (ENSIPUG00000021067) AP3M1 (ENSIPUG00000021086) vcl (ENSIPUG00000021114) plau (ENSIPUG00000021154) chuk (ENSIPUG00000021170) gsto1 (ENSIPUG00000021201) itprip (ENSIPUG00000021212) CALHM3 (ENSIPUG00000021217) CALHM1 (ENSIPUG00000021223) calhm2.1 (ENSIPUG00000021233) ENSIPUG00000021238 atoh7 (ENSIPUG00000021250) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b.d ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351.a ENSGT00940000163896 ENSGT00940000155351.b ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a.f Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00810000125473.A.a ENSGT00940000157081.s.b ENSGT00530000063867.b.b.a ENSGT00940000155337.ab.b ENSGT00940000157609.l ENSGT00390000001197.d ENSGT00940000164982.a.a ENSGT00390000011381.k ENSGT00940000158585.g.a.a ENSGT00390000014666.b.e ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b.b ENSGT00940000156184.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a.b ENSGT00940000154628.A.a.b.c ENSGT00940000157372.w ENSGT00390000014320.c.b Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 152 si:ch211-223p8.8 (ENSCARG00000056929) ##22 zgc:153981 (ENSCARG00000056963) ##22 Goldfish MODERN SPECIES 31 slc1a4 (ENSCARG00000027186) sertad2b (ENSCARG00000027164) lgalslb (ENSCARG00000027152) echs1 (ENSCARG00000027102) fuom (ENSCARG00000027090) msx3 (ENSCARG00000027082) znf511 (ENSCARG00000027068) adam8a (ENSCARG00000026930) erlin1 (ENSCARG00000026791) ENSCARG00000026745 ENSCARG00000026729 sfr1 (ENSCARG00000026718) ENSCARG00000026661 slka (ENSCARG00000025373) si:ch211-223p8.8 (ENSCARG00000025305) ##22 zgc:153981 (ENSCARG00000025278) ##22 dusp13a (ENSCARG00000025220) KAT6B (ENSCARG00000025130) ENSCARG00000025085 ENSCARG00000025064 adka (ENSCARG00000024900) ap3m1 (ENSCARG00000024857) vcla (ENSCARG00000022981) plaua (ENSCARG00000024413) chuk (ENSCARG00000022486) gsto1 (ENSCARG00000022430) gsto2 (ENSCARG00000022424) itprip (ENSCARG00000022419) CALHM3 (ENSCARG00000022411) CALHM1 (ENSCARG00000022404) CALHM2 (ENSCARG00000022392) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000014666.b.e ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b.b ENSGT00940000156184.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b.d ENSGT00940000157372.x ENSGT00390000014320.c.b.f ENSGT00940000158184.p ENSGT01030000234543.D.m.b ENSGT00940000164426.d.b ENSGT00950000182937.A.a.o.d ENSGT00940000163896.j.b ENSGT01050000244827.D.b.b.a.c ENSGT01030000234610.b.a.b.b.e ENSGT01030000234610.b.a.b.a.n.b ENSGT01030000234610.b.a.a.f.a ENSGT01030000234610.b.a.a.e.b ENSGT00940000166025.b.d Golden-line barbel MODERN SPECIES 312 rab1ab (ENSSGRG00000052253) cep68 (ENSSGRG00000052284) slc1a4 (ENSSGRG00000052285) sertad2b (ENSSGRG00000052286) lgalslb (ENSSGRG00000052287) echs1 (ENSSGRG00000000116) fuom (ENSSGRG00000000179) msx3 (ENSSGRG00000000192) adam8a (ENSSGRG00000000237) spef1 (ENSSGRG00000000323) erlin1 (ENSSGRG00000000384) sfr1 (ENSSGRG00000000469) ENSSGRG00000000472 slka (ENSSGRG00000000567) si:ch211-223p8.8 (ENSSGRG00000005775) ##22 zgc:153981 (ENSSGRG00000005772) ##22 dusp13a (ENSSGRG00000005778) ENSSGRG00000005780 KAT6B (ENSSGRG00000005783) adka (ENSSGRG00000005813) ap3m1 (ENSSGRG00000007447) vcla (ENSSGRG00000007879) plaua (ENSSGRG00000008491) chuk (ENSSGRG00000008557) ENSSGRG00000010509 itprip (ENSSGRG00000010513) CALHM1 (ENSSGRG00000010516) CALHM2 (ENSSGRG00000010520) calhm2.1 (ENSSGRG00000010524) ENSSGRG00000010526 ENSSGRG00000010527 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00530000063867.b.b.a ENSGT00940000155337.ab.b ENSGT00940000157609.l ENSGT00390000001197.d ENSGT00940000164982.a.a ENSGT00390000011381.k ENSGT00940000158585.g.a.a ENSGT00390000014666.b.e ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b.b ENSGT00940000156184.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a.b ENSGT00940000154628.A.a.b.c ENSGT00940000157372.w ENSGT00390000014320.c.b Goldfish MODERN SPECIES 4 tbp (ENSCARG00000015997) rhoua (ENSCARG00000015988) pdlim1 (ENSCARG00000015982) neurog3 (ENSCARG00000015979) sertad2b (ENSCARG00000015963) lgalslb (ENSCARG00000015958) echs1 (ENSCARG00000015949) fuom (ENSCARG00000015933) msx3 (ENSCARG00000015926) znf511 (ENSCARG00000015914) adam8a (ENSCARG00000015848) spef1 (ENSCARG00000015833) erlin1 (ENSCARG00000015718) ENSCARG00000015678 slka (ENSCARG00000014935) zgc:153981 (ENSCARG00000014889) ##22 dusp13a (ENSCARG00000014880) ENSCARG00000014874 KAT6B (ENSCARG00000014842) plaua (ENSCARG00000014833) chuk (ENSCARG00000012537) ENSCARG00000012472 ENSCARG00000012462 itprip (ENSCARG00000012458) CALHM3 (ENSCARG00000012451) CALHM1 (ENSCARG00000012444) ENSCARG00000012424 bag3 (ENSCARG00000012416) tial1 (ENSCARG00000012293) inpp5f (ENSCARG00000012088) mcmbp (ENSCARG00000011957) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 694 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a.b ENSGT00940000154628.A.a.b.c ENSGT00940000157372.w ENSGT00390000014320.c.b.e.a Golden-line barbel MODERN SPECIES 460 tbp (ENSSGRG00000022282) cep68 (ENSSGRG00000022277) slc1a4 (ENSSGRG00000022270) sertad2b (ENSSGRG00000022268) lgalslb (ENSSGRG00000022267) echs1 (ENSSGRG00000022246) fuom (ENSSGRG00000022245) msx3 (ENSSGRG00000022244) znf511 (ENSSGRG00000022243) adam8a (ENSSGRG00000022241) spef1 (ENSSGRG00000022240) erlin1 (ENSSGRG00000022202) sfr1 (ENSSGRG00000022199) slka (ENSSGRG00000020295) si:ch211-223p8.8 (ENSSGRG00000020265) ##22 zgc:153981 (ENSSGRG00000020264) ##22 dusp13a (ENSSGRG00000020260) ENSSGRG00000020258 KAT6B (ENSSGRG00000019893) adka (ENSSGRG00000019890) Zebrafish MODERN SPECIES 4 sertad2b (ENSDARG00000055530) lgalslb (ENSDARG00000055525) echs1 (ENSDARG00000001578) fuom (ENSDARG00000039422) msx3 (ENSDARG00000015674) znf511 (ENSDARG00000000760) adam8a (ENSDARG00000001452) spef1 (ENSDARG00000022007) erlin1 (ENSDARG00000021991) CFAP43 (ENSDARG00000001825) sfr1 (ENSDARG00000021974) ENSDARG00000079011 slka (ENSDARG00000061525) si:ch211-223p8.8 (ENSDARG00000092650) ##22 ENSDARG00000111496 zgc:153981 (ENSDARG00000069529) ##22 dusp13a (ENSDARG00000061498) ENSDARG00000094665 KAT6B (ENSDARG00000055429) adka (ENSDARG00000039429) ap3m1 (ENSDARG00000029928) vcla (ENSDARG00000044968) chuk (ENSDARG00000011662) plaua (ENSDARG00000075265) gsto1 (ENSDARG00000022183) gsto2 (ENSDARG00000033285) itprip (ENSDARG00000015576) CALHM3 (ENSDARG00000079602) CALHM1 (ENSDARG00000077021) CALHM2 (ENSDARG00000074179) calhm2.1 (ENSDARG00000039482) Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 536 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT00940000155351 ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 Denticle herring MODERN SPECIES 6 gmppab (ENSDCDG00000029858) ENSDCDG00000029874 asic4b (ENSDCDG00000029886) ENSDCDG00000029933 CHPF (ENSDCDG00000029935) ENSDCDG00000029937 cdk5r2a (ENSDCDG00000029938) cryba2a (ENSDCDG00000029939) ENSDCDG00000029941 ENSDCDG00000029956 ENSDCDG00000030274 sft2d2b (ENSDCDG00000030283) TBX19 (ENSDCDG00000030291) iqcb1 (ENSDCDG00000030297) si:ch211-223p8.8 (ENSDCDG00000030304) ##22 zgc:153981 (ENSDCDG00000030306) ##22 znf341 (ENSDCDG00000030307) parp12b (ENSDCDG00000030309) atg9a (ENSDCDG00000030312) ENSDCDG00000030361 ENSDCDG00000030363 ENSDCDG00000030367 ENSDCDG00000030371 FAM171B (ENSDCDG00000030556) SLC19A1 (ENSDCDG00000030561) ENSDCDG00000030564 obsl1a (ENSDCDG00000030579) spega (ENSDCDG00000030634) inha (ENSDCDG00000030641) gjc4a.1 (ENSDCDG00000030643) stk11ip (ENSDCDG00000030644) Atlantic herring MODERN SPECIES 4 ARFGEF3 (ENSCHAG00000020159) ENSCHAG00000020106 ENSCHAG00000020099 cox20 (ENSCHAG00000020092) ENSCHAG00000020074 lhb (ENSCHAG00000020049) ENSCHAG00000020042 ENSCHAG00000020033 ENSCHAG00000020004 itprip (ENSCHAG00000019942) gsto2 (ENSCHAG00000019905) CFAP43 (ENSCHAG00000019817) sfr1 (ENSCHAG00000019792) slka (ENSCHAG00000019649) si:ch211-223p8.8 (ENSCHAG00000019634) ##22 zgc:153981 (ENSCHAG00000019625) ##22 ENSCHAG00000019613 pkdcca (ENSCHAG00000019596) EML4 (ENSCHAG00000018324) ENSCHAG00000018278 ENSCHAG00000018252 COX7A2L (ENSCHAG00000018246) KCNG3 (ENSCHAG00000018228) OXER1 (ENSCHAG00000018207) ENSCHAG00000018173 haao (ENSCHAG00000018131) zfp36l2 (ENSCHAG00000018110) THADA (ENSCHAG00000017933) PLEKHH2 (ENSCHAG00000016959) epcam (ENSCHAG00000016870) ENSCHAG00000016844 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00940000165789 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00940000154551.b ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154518.b ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000158120 ENSGT00940000167270 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000161927 ENSGT00940000154371.b ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a.h ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00390000014666.b.j ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a.n ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000001197 ENSGT00940000157609 ENSGT01030000238307 P. kingsleyae MODERN SPECIES 119 eno4 (ENSPKIG00000009937) hspa12a (ENSPKIG00000009974) PNLIPRP2 (ENSPKIG00000010033) ENSPKIG00000010075 pitx3 (ENSPKIG00000010100) GBF1 (ENSPKIG00000010267) macroh2a2 (ENSPKIG00000010711) ENSPKIG00000010729 ENSPKIG00000010748 ENSPKIG00000010771 ENSPKIG00000010806 ENSPKIG00000010820 hells (ENSPKIG00000010890) ENSPKIG00000011028 NPY4R2 (ENSPKIG00000011037) zgc:153981 (ENSPKIG00000011047) ##22 dusp13a (ENSPKIG00000011062) ENSPKIG00000011079 ENSPKIG00000011107 ADK (ENSPKIG00000011178) vdac2 (ENSPKIG00000011243) lrmda (ENSPKIG00000011274) kcnma1a (ENSPKIG00000011330) anxa11b (ENSPKIG00000011390) mmrn2a (ENSPKIG00000011431) sncga (ENSPKIG00000011494) glud1a (ENSPKIG00000011560) shld2 (ENSPKIG00000011616) nfkb2 (ENSPKIG00000011680) PSD (ENSPKIG00000011783) ENSPKIG00000011829 Neopterygii DUPLICATION Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 488 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000156914.o.b ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a.b ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000160190 ENSGT00390000014320.c.b Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00390000000153 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.c ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.q.f ENSGT00940000155540.b.b.p ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00390000014320.c.a.g ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00390000014666.b.i ENSGT00940000158585.g.a.m ENSGT00940000156697 ENSGT00940000164982.b ENSGT00390000000483.a.b ENSGT01030000234563.b.a.b.a.a ENSGT01030000234563.b.a.b.a.b.a.f Asian bonytongue MODERN SPECIES 16 ENSSFOG00015014276 ENSSFOG00015028421 QRFPR (ENSSFOG00015026498) polr3a (ENSSFOG00015014357) rps24 (ENSSFOG00015014495) zmiz1a (ENSSFOG00015014538) ppifb (ENSSFOG00015014715) zcchc24 (ENSSFOG00015028700) anxa11b (ENSSFOG00015014756) dlg5a (ENSSFOG00015014789) KCNMA1 (ENSSFOG00015014902) ZNF503 (ENSSFOG00015031054) comtd1 (ENSSFOG00015014963) VDAC2 (ENSSFOG00015015102) SAMD8 (ENSSFOG00015015129) ENSSFOG00015015159 ##22 ENSSFOG00015027548 DUSP13 (ENSSFOG00015028570) ENSSFOG00015015198 ENSSFOG00015015346 ##22 KAT6B (ENSSFOG00015015355) adkb (ENSSFOG00015015386) vclb (ENSSFOG00015015428) tagln3b (ENSSFOG00015030501) SPATA13 (ENSSFOG00015015560) TMPRSS7 (ENSSFOG00015015588) ENSSFOG00015015655 flt1 (ENSSFOG00015015683) pan3 (ENSSFOG00015015792) urad (ENSSFOG00015015860) pdx1 (ENSSFOG00015026366) P. kingsleyae MODERN SPECIES 116 ENSPKIG00000025655 ENSPKIG00000025687 VDAC2 (ENSPKIG00000025619) SAMD8 (ENSPKIG00000000002) ENSPKIG00000000010 ##22 ENSPKIG00000000016 DUSP13 (ENSPKIG00000000022) ENSPKIG00000000029 ENSPKIG00000000037 KAT6B (ENSPKIG00000000051) ADK (ENSPKIG00000000083) VCL (ENSPKIG00000000135) ENSPKIG00000000202 chuk (ENSPKIG00000000224) erlin1 (ENSPKIG00000000280) adam8a (ENSPKIG00000000344) tubgcp2 (ENSPKIG00000000389) ENSPKIG00000000429 caly (ENSPKIG00000000434) ENSPKIG00000000471 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c Otophysi ANCESTRAL SPECIES 148 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.a.a ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003595 ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00940000160638 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 136 ENSGT00940000174594 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.C ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003595 ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00940000160638.n Channel catfish MODERN SPECIES 4 QRFPR (ENSIPUG00000001747) ENSIPUG00000001736 polr3a (ENSIPUG00000001706) ppifb (ENSIPUG00000001679) anxa11b (ENSIPUG00000001643) ENSIPUG00000001616 ENSIPUG00000001597 ENSIPUG00000001580 USH1G (ENSIPUG00000001552) ENSIPUG00000001544 FADS6 (ENSIPUG00000001522) ENSIPUG00000001506 comtd1 (ENSIPUG00000001497) VDAC2 (ENSIPUG00000001468) samd8 (ENSIPUG00000001453) ENSIPUG00000001445 ##22 ENSIPUG00000001437 DUSP13 (ENSIPUG00000001428) ENSIPUG00000001419 ENSIPUG00000001416 ##22 ndufb8 (ENSIPUG00000001392) scd (ENSIPUG00000001348) ENSIPUG00000001322 ENSIPUG00000001302 SDK2 (ENSIPUG00000001154) ENSIPUG00000001125 ENSIPUG00000001117 ENSIPUG00000001116 ADAMTS14 (ENSIPUG00000001097) pald1 (ENSIPUG00000001051) nodal (ENSIPUG00000001044) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 140 ENSGT00940000174594 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003595 ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00940000160638.n Electric eel MODERN SPECIES 120 KBTBD11 (ENSEEEG00000023788) ppie (ENSEEEG00000023789) pabpc4 (ENSEEEG00000023793) ENSEEEG00000023802 tmem54a (ENSEEEG00000023804) lck (ENSEEEG00000023819) KCNMA1 (ENSEEEG00000023955) KCNMA1 (ENSEEEG00000023958) KCNMA1 (ENSEEEG00000024008) KCNMA1 (ENSEEEG00000024093) ZNF503 (ENSEEEG00000024225) COMTD1 (ENSEEEG00000024227) VDAC2 (ENSEEEG00000024229) SAMD8 (ENSEEEG00000024230) ENSEEEG00000024231 ##22 DUSP13 (ENSEEEG00000024232) ca10a (ENSEEEG00000024233) EME1 (ENSEEEG00000024234) mrpl27 (ENSEEEG00000024235) ENSEEEG00000024236 ENSEEEG00000024239 THRA (ENSEEEG00000024269) sar1b (ENSEEEG00000024306) JADE2 (ENSEEEG00000024308) cdkn2aipnl (ENSEEEG00000024309) UBE2B (ENSEEEG00000024310) Characoidei ANCESTRAL SPECIES 282 ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003595 ENSGT00390000004428.a.b Red-bellied piranha MODERN SPECIES 1759 ENSPNAG00000019404 ##22 ENSPNAG00000019397 ENSPNAG00000019385 ENSPNAG00000019373 Mexicana tetra MODERN SPECIES 116 ENSAMXG00000039222 ENSAMXG00000030320 ZNF503 (ENSAMXG00000031112) COMTD1 (ENSAMXG00000039488) VDAC2 (ENSAMXG00000035617) SAMD8 (ENSAMXG00000006691) ENSAMXG00000030855 ##22 ENSAMXG00000034948 DUSP13 (ENSAMXG00000006707) ENSAMXG00000041055 ENSAMXG00000030866 ##22 adkb (ENSAMXG00000013461) vclb (ENSAMXG00000042904) ENSAMXG00000034862 exoc7 (ENSAMXG00000035608) tvp23b (ENSAMXG00000040559) CHST15 (ENSAMXG00000030259) oat (ENSAMXG00000033395) lhpp (ENSAMXG00000001319) fam53b (ENSAMXG00000037052) hpdl (ENSAMXG00000032192) ENSAMXG00000001350 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000158426 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.a.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n.g ENSGT01050000244971.C ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003595 ENSGT00390000004428.a.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00390000003070.b Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 606 ENSGT00940000158426.c ENSGT00940000165645.a ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b.ub ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008.f ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a.c ENSGT00940000154935.c.b.a.a.b ENSGT00390000014618.a.a.f ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a.e Goldfish MODERN SPECIES 3 ndr2 (ENSCARG00000010137) pald1a (ENSCARG00000010017) ENSCARG00000010003 ENSCARG00000009991 QRFPR (ENSCARG00000009984) polr3a (ENSCARG00000009950) ZMIZ1 (ENSCARG00000009858) ppifb (ENSCARG00000009845) ZCCHC24 (ENSCARG00000009841) anxa11b (ENSCARG00000007363) ENSCARG00000007280 KCNMA1 (ENSCARG00000005537) ZNF503 (ENSCARG00000005427) COMTD1 (ENSCARG00000005419) SAMD8 (ENSCARG00000005410) ENSCARG00000005405 ##22 ENSCARG00000005399 DUSP29 (ENSCARG00000005346) adkb (ENSCARG00000004112) vclb (ENSCARG00000003340) exoc7 (ENSCARG00000002429) tvp23b (ENSCARG00000002267) trim16 (ENSCARG00000002260) FADS6 (ENSCARG00000002247) USH1G (ENSCARG00000002238) ENSCARG00000002163 ENSCARG00000002089 ENSCARG00000002042 pax2b (ENSCARG00000001957) ENSCARG00000001927 ENSCARG00000013839 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 100 ENSGT00940000158426 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.b ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000155278 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q.c ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372.y ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n Atlantic herring MODERN SPECIES 15 ndr2 (ENSCHAG00000024626) pald1a (ENSCHAG00000024561) ADAMTS14 (ENSCHAG00000023991) ENSCHAG00000023971 polr3a (ENSCHAG00000023943) ZMIZ1 (ENSCHAG00000023616) PPIF (ENSCHAG00000023601) zcchc24 (ENSCHAG00000023597) ENSCHAG00000023218 DLG5 (ENSCHAG00000022175) KCNMA1 (ENSCHAG00000017906) ZNF503 (ENSCHAG00000017800) ENSCHAG00000017531 ENSCHAG00000017474 exoc7 (ENSCHAG00000016947) ENSCHAG00000016914 ##22 ENSCHAG00000016907 ENSCHAG00000016898 ENSCHAG00000016853 ENSCHAG00000016843 KAT6B (ENSCHAG00000016785) vclb (ENSCHAG00000014927) ADK (ENSCHAG00000014552) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000158426 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000174594 ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c 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ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000164426.c ENSGT00390000003070.a.b.b ENSGT00940000160638 ENSGT00390000017548.b.b ENSGT00950000182990.b ENSGT00940000161116.w.b ENSGT00390000004428.a.b Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a 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ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.d ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000158426 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b 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(ENSATEG00000022671) vti1a (ENSATEG00000029195) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 9 pald1a (ENSBSLG00000022356) ADAMTS14 (ENSBSLG00000021809) ENSBSLG00000021699 TBATA (ENSBSLG00000021596) ENSBSLG00000021584 polr3a (ENSBSLG00000021529) ZMIZ1 (ENSBSLG00000021193) ppifb (ENSBSLG00000020445) ZCCHC24 (ENSBSLG00000020441) anxa11b (ENSBSLG00000019386) DLG5 (ENSBSLG00000019245) ZNF503 (ENSBSLG00000017311) COMTD1 (ENSBSLG00000017300) VDAC2 (ENSBSLG00000016899) SAMD8 (ENSBSLG00000016846) ENSBSLG00000016830 ##22 ENSBSLG00000016813 ENSBSLG00000026406 ENSBSLG00000026403 ##22 KAT6B (ENSBSLG00000026400) ADK (ENSBSLG00000026392) vclb (ENSBSLG00000026334) C1QL1 (ENSBSLG00000026312) dcakd (ENSBSLG00000026311) pus3 (ENSBSLG00000026310) ENSBSLG00000026309 ENSBSLG00000026307 coasy (ENSBSLG00000026305) zdhhc6 (ENSBSLG00000026301) vti1a (ENSBSLG00000026295) tcf7l2 (ENSBSLG00000026145) Zig-zag eel MODERN SPECIES 10 ADAMTS14 (ENSMAMG00000017594) ENSMAMG00000017574 TBATA (ENSMAMG00000017565) 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ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000158426 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000174594 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535.z Tetraodon MODERN SPECIES 17 QRFPR (ENSTNIG00000013150) polr3a (ENSTNIG00000013151) ZMIZ1 (ENSTNIG00000013152) ppifb (ENSTNIG00000013153) ZCCHC24 (ENSTNIG00000013154) anxa11b (ENSTNIG00000013155) ZCCHC24 (ENSTNIG00000013156) anxa11b (ENSTNIG00000013157) ENSTNIG00000013158 ENSTNIG00000013159 KCNMA1 (ENSTNIG00000013160) ZNF503 (ENSTNIG00000013161) COMTD1 (ENSTNIG00000013162) VDAC2 (ENSTNIG00000013163) SAMD8 (ENSTNIG00000013164) ENSTNIG00000013165 ##22 ENSTNIG00000013166 DUSP13 (ENSTNIG00000001572) ENSTNIG00000013167 KAT6B (ENSTNIG00000013168) ADK (ENSTNIG00000003562) dcakd (ENSTNIG00000004930) pus3 (ENSTNIG00000010307) ENSTNIG00000000456 ENSTNIG00000004928 coasy (ENSTNIG00000004927) ENSTNIG00000010312 vclb (ENSTNIG00000010311) C1QL1 (ENSTNIG00000010310) C1QL1 (ENSTNIG00000010309) dcakd (ENSTNIG00000010308) Fugu MODERN SPECIES polr3a (ENSTRUG00000013488) ZMIZ1 (ENSTRUG00000013650) ppifb (ENSTRUG00000024374) ZCCHC24 (ENSTRUG00000020525) ENSTRUG00000013880 DLG5 (ENSTRUG00000013924) KCNMA1 (ENSTRUG00000014048) ENSTRUG00000031771 ZNF503 (ENSTRUG00000014235) ENSTRUG00000002379 ENSTRUG00000029759 ENSTRUG00000028482 COMTD1 (ENSTRUG00000021772) VDAC2 (ENSTRUG00000022813) SAMD8 (ENSTRUG00000013638) ENSTRUG00000021856 ##22 ENSTRUG00000013616 DUSP13 (ENSTRUG00000013599) ENSTRUG00000021986 ENSTRUG00000013585 ##22 KAT6B (ENSTRUG00000013356) adkb (ENSTRUG00000013223) vclb (ENSTRUG00000013129) C1QL1 (ENSTRUG00000013104) dcakd (ENSTRUG00000013085) pus3 (ENSTRUG00000013050) ENSTRUG00000013016 coasy (ENSTRUG00000012957) zdhhc6 (ENSTRUG00000025263) vti1a (ENSTRUG00000020201) tcf7l2 (ENSTRUG00000012549) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 Ballan wrasse MODERN SPECIES 244 lrit1b (ENSLBEG00000008508) rgrb (ENSLBEG00000008476) slc18a3b (ENSLBEG00000008446) CHAT (ENSLBEG00000008379) ENSLBEG00000008289 zgc:174164 (ENSLBEG00000008205) ppifb (ENSLBEG00000008180) ZCCHC24 (ENSLBEG00000008158) anxa11b (ENSLBEG00000007751) DLG5 (ENSLBEG00000007462) KCNMA1 (ENSLBEG00000007350) ZNF503 (ENSLBEG00000007319) COMTD1 (ENSLBEG00000007194) VDAC2 (ENSLBEG00000007250) SAMD8 (ENSLBEG00000007177) ENSLBEG00000007140 ##22 ENSLBEG00000007122 DUSP13 (ENSLBEG00000007093) ENSLBEG00000007083 ENSLBEG00000007063 KAT6B (ENSLBEG00000006976) ADK (ENSLBEG00000006840) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 Perciformes ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158426 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 ENSGT00940000164940.a Channel bull blenny MODERN SPECIES 10 ADAMTS14 (ENSCGOG00000021503) ENSCGOG00000021633 TBATA (ENSCGOG00000021635) QRFPR (ENSCGOG00000021636) polr3a (ENSCGOG00000021643) ZMIZ1 (ENSCGOG00000021800) ppifb (ENSCGOG00000022041) ZCCHC24 (ENSCGOG00000022061) ENSCGOG00000022092 DLG5 (ENSCGOG00000022720) KCNMA1 (ENSCGOG00000022959) ZNF503 (ENSCGOG00000023147) COMTD1 (ENSCGOG00000023150) VDAC2 (ENSCGOG00000023154) SAMD8 (ENSCGOG00000023178) ENSCGOG00000023180 ##22 ENSCGOG00000023181 DUSP13 (ENSCGOG00000023182) ENSCGOG00000023183 ENSCGOG00000023184 KAT6B (ENSCGOG00000023188) adkb (ENSCGOG00000023271) vclb (ENSCGOG00000023554) C1QL1 (ENSCGOG00000023664) dcakd (ENSCGOG00000002374) pus3 (ENSCGOG00000002379) ENSCGOG00000002383 coasy (ENSCGOG00000002401) zdhhc6 (ENSCGOG00000002419) vti1a (ENSCGOG00000002529) tcf7l2 (ENSCGOG00000002583) Pike perch MODERN SPECIES 3 ADAMTS14 (ENSSLUG00000006807) ENSSLUG00000006934 ENSSLUG00000006961 QRFPR (ENSSLUG00000006974) polr3a (ENSSLUG00000007032) ZMIZ1 (ENSSLUG00000007136) PPIF (ENSSLUG00000007274) ZCCHC24 (ENSSLUG00000007291) ENSSLUG00000007492 DLG5 (ENSSLUG00000010463) KCNMA1 (ENSSLUG00000010731) ZNF503 (ENSSLUG00000011060) COMTD1 (ENSSLUG00000011065) VDAC2 (ENSSLUG00000011093) SAMD8 (ENSSLUG00000011512) ENSSLUG00000011523 ##22 ENSSLUG00000011534 DUSP13 (ENSSLUG00000011539) ENSSLUG00000011544 ENSSLUG00000011549 KAT6B (ENSSLUG00000011562) adkb (ENSSLUG00000011678) vclb (ENSSLUG00000013031) C1QL1 (ENSSLUG00000013120) dcakd (ENSSLUG00000013129) pus3 (ENSSLUG00000013137) ENSSLUG00000013145 ENSSLUG00000013152 coasy (ENSSLUG00000013157) zdhhc6 (ENSSLUG00000013163) vti1a (ENSSLUG00000013174) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000165645 ENSGT00940000174594 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Lumpfish MODERN SPECIES 10 ADAMTS14 (ENSCLMG00005013022) ENSCLMG00005013009 ENSCLMG00005013005 QRFPR (ENSCLMG00005013004) polr3a (ENSCLMG00005013000) ZMIZ1 (ENSCLMG00005012990) ppifb (ENSCLMG00005012973) ZCCHC24 (ENSCLMG00005012970) ENSCLMG00005011673 DLG5 (ENSCLMG00005011646) KCNMA1 (ENSCLMG00005007604) ZNF503 (ENSCLMG00005007572) COMTD1 (ENSCLMG00005007571) VDAC2 (ENSCLMG00005007570) SAMD8 (ENSCLMG00005007568) ENSCLMG00005007566 ##22 ENSCLMG00005007564 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ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000156914.o.a ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b ENSGT00940000155535 Large yellow croaker MODERN SPECIES 488 ADAMTS14 (ENSLCRG00005005498) ENSLCRG00005005974 TBATA (ENSLCRG00005005981) QRFPR (ENSLCRG00005005983) polr3a (ENSLCRG00005005989) ZMIZ1 (ENSLCRG00005006003) ppifb (ENSLCRG00005006020) ZCCHC24 (ENSLCRG00005006028) ENSLCRG00005006056 DLG5 (ENSLCRG00005008002) KCNMA1 (ENSLCRG00005008187) ZNF503 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ENSDLAG00005016242 ENSDLAG00005028287 KAT6B (ENSDLAG00005016101) ADK (ENSDLAG00005015959) VCL (ENSDLAG00005015598) C1QL1 (ENSDLAG00005030980) ENSDLAG00005015578 ENSDLAG00005015568 ENSDLAG00005015556 ENSDLAG00005015547 zdhhc6 (ENSDLAG00005015511) vti1a (ENSDLAG00005015460) tcf7l2 (ENSDLAG00005011822) Gilthead seabream MODERN SPECIES 12 ADAMTS14 (ENSSAUG00010021002) ENSSAUG00010020978 TBATA (ENSSAUG00010020976) QRFPR (ENSSAUG00010020973) polr3a (ENSSAUG00010020971) ZMIZ1 (ENSSAUG00010020835) PPIF (ENSSAUG00010020798) ZCCHC24 (ENSSAUG00010020794) ENSSAUG00010017398 DLG5 (ENSSAUG00010017318) KCNMA1 (ENSSAUG00010016762) ZNF503 (ENSSAUG00010016729) COMTD1 (ENSSAUG00010016726) VDAC2 (ENSSAUG00010016326) SAMD8 (ENSSAUG00010016318) ENSSAUG00010016317 ##22 ENSSAUG00010016316 DUSP13 (ENSSAUG00010016315) ENSSAUG00010025774 ENSSAUG00010025773 ##22 KAT6B (ENSSAUG00010025772) ADK (ENSSAUG00010025591) vclb (ENSSAUG00010025582) C1QL1 (ENSSAUG00010025579) dcakd (ENSSAUG00010025578) pus3 (ENSSAUG00010025577) ENSSAUG00010025575 ENSSAUG00010025573 coasy (ENSSAUG00010025571) zdhhc6 (ENSSAUG00010025569) vti1a (ENSSAUG00010025566) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b 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ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008.hb ENSGT00940000156008.gb ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a 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(ENSACIG00000024474) Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b.b ENSGT00940000154935.c.b.b.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000173647 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028.p.b.b ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b.a ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000166490.a ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000154628.A.a.a.b ENSGT00940000162682.A.a.a ##22 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT01030000234543.D.n ENSGT00940000162478 ENSGT00550000075038 ENSGT00950000183160.A ENSGT00940000178056 ENSGT00940000163949.a ENSGT00550000075078 ENSGT00940000155642 ENSGT00950000183192.b Orange clownfish MODERN SPECIES 10 ENSAPEG00000013248 ENSAPEG00000013269 ENSAPEG00000013294 QRFPR (ENSAPEG00000013309) polr3a (ENSAPEG00000013351) ZMIZ1 (ENSAPEG00000013474) PPIF (ENSAPEG00000013551) ZCCHC24 (ENSAPEG00000013587) ENSAPEG00000013594 DLG5 (ENSAPEG00000013628) KCNMA1 (ENSAPEG00000013824) ZNF503 (ENSAPEG00000014033) COMTD1 (ENSAPEG00000014051) VDAC2 (ENSAPEG00000014070) SAMD8 (ENSAPEG00000014108) ENSAPEG00000014151 ##22 ENSAPEG00000014301 DUSP13 (ENSAPEG00000014308) ENSAPEG00000014322 KAT6B (ENSAPEG00000014355) ENSAPEG00000014399 ##22 adkb (ENSAPEG00000014422) vclb (ENSAPEG00000014491) C1QL1 (ENSAPEG00000014575) dcakd (ENSAPEG00000014609) pus3 (ENSAPEG00000014617) ENSAPEG00000014629 ENSAPEG00000014652 coasy (ENSAPEG00000014674) zdhhc6 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(ENSAPOG00000021165) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 381 ENSSPAG00000019721 KCNMA1 (ENSSPAG00000019688) ZNF503 (ENSSPAG00000019682) COMTD1 (ENSSPAG00000019674) VDAC2 (ENSSPAG00000019634) SAMD8 (ENSSPAG00000019621) ENSSPAG00000019614 ##22 ENSSPAG00000019607 DUSP13 (ENSSPAG00000019597) ENSSPAG00000019586 ENSSPAG00000019577 ##22 KAT6B (ENSSPAG00000019489) adkb (ENSSPAG00000019418) vclb (ENSSPAG00000019345) C1QL1 (ENSSPAG00000019335) dcakd (ENSSPAG00000019326) pus3 (ENSSPAG00000019221) ENSSPAG00000019204 ENSSPAG00000019068 coasy (ENSSPAG00000019016) zdhhc6 (ENSSPAG00000018980) vti1a (ENSSPAG00000018961) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000158426 ENSGT00940000165645 ENSGT00510000048896 ENSGT01070000253744.a.b ENSGT00930000151028 ENSGT01030000234539.b.b.b.a.a ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264.d ENSGT00940000165077 ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b ENSGT00390000014618.a.a ENSGT00390000004409.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b 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ENSGT00390000017548.b.b.a ENSGT00950000182990.b.a.a ENSGT00940000161116.w.b.f ENSGT00390000004428.a.b.f ENSGT00390000003595.v ENSGT01090000260051.a.hd ENSGT01080000257365.a.d.i ##19 ENSGT01030000234586.B.a.a.a.h ENSGT00940000157836.b.c.b Huchen MODERN SPECIES 446 ENSHHUG00000029152 ZNF503 (ENSHHUG00000029134) VDAC2 (ENSHHUG00000028860) SAMD8 (ENSHHUG00000040423) ENSHHUG00000040417 ##22 DUSP13 (ENSHHUG00000040409) ENSHHUG00000040404 KAT6B (ENSHHUG00000040296) ADK (ENSHHUG00000040286) SLC26A6 (ENSHHUG00000040254) Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162838.g.b.d ENSGT00390000003812 ENSGT01000000217848 ENSGT00940000154755.q ENSGT01010000227566 ENSGT00950000183133.c.b ENSGT00390000003349.x ENSGT00940000154632.rb ENSGT00940000158015.k.a.d ENSGT00940000165077.b.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b.e ENSGT00390000014618.a.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r.b ENSGT00940000155540.b.b.h ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372.s ENSGT00390000014320.c.a.b.a ENSGT01030000234543.D.n.a.a.a.a ENSGT00390000003070.a.b.a.b ENSGT00390000017548.b.b.a ENSGT00950000182990.b.a.a ENSGT00940000161116.w.b.f ENSGT00390000004428.a.b.f ENSGT00390000003595.v ENSGT01090000260051.a.hd ENSGT01080000257365.a.d.i ##19 ENSGT01030000234586.B.a.a.a.h ENSGT00940000157836.b.c.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000162838.g.b.d ENSGT00390000003812 ENSGT01000000217848 ENSGT00940000154755.q ENSGT00950000183133.c.b ENSGT00390000003349.x ENSGT00940000154632.rb ENSGT00940000158015.k.a.d ENSGT00940000165077.b.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b.e ENSGT00390000014618.a.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r.b ENSGT00940000155540.b.b.h ENSGT00990000212911 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000154628.B.c ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372.s ENSGT00390000014320.c.a.b.a ENSGT01030000234543.D.n.a.a.a.a ENSGT00390000003070.a.b.a.b ENSGT00390000017548.b.b.a ENSGT00950000182990.b.a.a ENSGT00940000161116.w.b.f ENSGT00390000004428.a.b.f ENSGT00390000003595.v ENSGT01090000260051.a.hd ENSGT01080000257365.a.d.i ##19 ENSGT01030000234586.B.a.a.a.h ENSGT00940000157836.b.c.b Atlantic salmon MODERN SPECIES mad2l1bp (ENSSSAG00000111635) CYT (ENSSSAG00000071927) ENSSSAG00000119742 si:dkey-76k16.6 (ENSSSAG00000071919) ENSSSAG00000071915 snx5 (ENSSSAG00000077435) rrbp1a (ENSSSAG00000071894) ENSSSAG00000071876 DLG5 (ENSSSAG00000071416) KCNMA1 (ENSSSAG00000005176) ZNF503 (ENSSSAG00000003838) ENSSSAG00000089959 VDAC2 (ENSSSAG00000003819) SAMD8 (ENSSSAG00000103699) ENSSSAG00000003803 ENSSSAG00000101299 ##22 DUSP13 (ENSSSAG00000003795) ENSSSAG00000110860 KAT6B (ENSSSAG00000003755) ENSSSAG00000106089 ENSSSAG00000119061 adkb (ENSSSAG00000003683) VCL (ENSSSAG00000003524) ENSSSAG00000088087 ENSSSAG00000002725 ENSSSAG00000092776 ENSSSAG00000002632 ENSSSAG00000002622 trim16 (ENSSSAG00000002615) tvp23b (ENSSSAG00000002580) ENSSSAG00000094414 River trout MODERN SPECIES 9 ENSSTUG00000030485 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(ENSOMYG00000036083) ENSOMYG00000036077 ##22 DUSP13 (ENSOMYG00000035984) ENSOMYG00000035949 KAT6B (ENSOMYG00000035938) ADK (ENSOMYG00000047583) ENSOMYG00000049151 VCL (ENSOMYG00000047569) ENSOMYG00000047548 ENSOMYG00000047536 ENSOMYG00000047534 trim16 (ENSOMYG00000047532) tvp23b (ENSOMYG00000047526) exoc7 (ENSOMYG00000047477) ENSOMYG00000047441 ENSOMYG00000047437 ##19 kcnj2a (ENSOMYG00000047436) Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000162838.g.b.d ENSGT00390000003812 ENSGT01000000217848 ENSGT00940000154755.q ENSGT01010000227566 ENSGT00950000183133.c.b ENSGT00390000003349.x ENSGT00940000154632.rb ENSGT00940000158015.k.a.d ENSGT00940000165077.b.a ENSGT00940000155303.k ENSGT00940000154935.c.b.b.e ENSGT00390000014618.a.a.a ENSGT00950000182869.e.a.a.r.b ENSGT00940000155540.b.b.h ENSGT00940000162682.A.a.b.b.a ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190.a.a ENSGT00940000157372.s ENSGT00390000014320.c.a.b.a ENSGT01030000234543.D.n.a.a.b ENSGT00390000003070.a.b.a.b ENSGT00390000017548.b.b.a ENSGT00950000182990.b.a.a ENSGT00940000161116.w.b.f ENSGT00390000004428.a.b.f ENSGT00390000003595.v ENSGT01090000260051.a.hd ENSGT01080000257365.a.d.i ##19 ENSGT01030000234586.B.a.a.a.h ENSGT00940000157836.b.c.b Coho salmon MODERN SPECIES 2 ENSOKIG00005012081 ENSOKIG00005012090 mad2l1bp (ENSOKIG00005012145) ENSOKIG00005012173 ENSOKIG00005012182 si:dkey-76k16.6 (ENSOKIG00005012195) mgme1 (ENSOKIG00005012202) snx5 (ENSOKIG00005012251) rrbp1a (ENSOKIG00005012499) ENSOKIG00005012549 DLG5 (ENSOKIG00005013249) KCNMA1 (ENSOKIG00005013746) ZNF503 (ENSOKIG00005014532) VDAC2 (ENSOKIG00005014607) SAMD8 (ENSOKIG00005015677) ENSOKIG00005015695 ##22 DUSP13 (ENSOKIG00005015702) DUSP29 (ENSOKIG00005015713) KAT6B (ENSOKIG00005015722) ADK (ENSOKIG00005015841) vclb (ENSOKIG00005017544) HID1 (ENSOKIG00005017755) USH1G (ENSOKIG00005017890) FADS6 (ENSOKIG00005017903) trim16 (ENSOKIG00005017915) tvp23b (ENSOKIG00005017923) exoc7 (ENSOKIG00005017992) galr2a (ENSOKIG00005018341) ENSOKIG00005018416 ENSOKIG00005018424 ##19 kcnj2a (ENSOKIG00005018433) Chinook salmon MODERN SPECIES ENSOTSG00005008907 ENSOTSG00005008904 mad2l1bp (ENSOTSG00005008903) ENSOTSG00005008902 ENSOTSG00005008900 ENSOTSG00005008899 si:dkey-76k16.6 (ENSOTSG00005008897) mgme1 (ENSOTSG00005008894) snx5 (ENSOTSG00005008893) rrbp1a (ENSOTSG00005008892) DLG5 (ENSOTSG00005008105) ENSOTSG00005005834 ZNF503 (ENSOTSG00005005794) VDAC2 (ENSOTSG00005003562) SAMD8 (ENSOTSG00005003538) ENSOTSG00005003533 ##22 DUSP13 (ENSOTSG00005003532) DUSP29 (ENSOTSG00005003530) KAT6B (ENSOTSG00005003529) adkb (ENSOTSG00005000616) vclb (ENSOTSG00005000589) HID1 (ENSOTSG00005000571) USH1G (ENSOTSG00005000562) FADS6 (ENSOTSG00005000558) trim16 (ENSOTSG00005000556) tvp23b (ENSOTSG00005000554) ENSOTSG00005000553 exoc7 (ENSOTSG00005000447) galr2a (ENSOTSG00005000421) ENSOTSG00005000416 ##19 kcnj2a (ENSOTSG00005000414) Northern pike MODERN SPECIES 5 mgme1 (ENSELUG00000000462) snx5 (ENSELUG00000012556) rrbp1a 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(ENSLOCG00000004687) ifit8 (ENSLOCG00000004672) ENSLOCG00000004660 ENSLOCG00000004642 vdac2 (ENSLOCG00000004602) SAMD8 (ENSLOCG00000004590) ENSLOCG00000004576 ##22 DUSP13 (ENSLOCG00000004561) ENSLOCG00000004551 KAT6B (ENSLOCG00000004535) ADK (ENSLOCG00000004521) ap3m1 (ENSLOCG00000004509) ENSLOCG00000004496 vcla (ENSLOCG00000004474) plaua (ENSLOCG00000004467) chuk (ENSLOCG00000004432) erlin1 (ENSLOCG00000004418) ENSLOCG00000004406 adam8a (ENSLOCG00000004374) tubgcp2 (ENSLOCG00000004354) znf511 (ENSLOCG00000004344) msx3 (ENSLOCG00000004331) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156008 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156914 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00950000182869.e.a.a.q ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.r ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000160190 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000164426 ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585 ENSGT00940000156697 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982 ENSGT00390000000483.a.b ENSGT00390000001197 ENSGT00940000157609 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 191 ENSGT00940000153342.a ENSGT00940000166377.f ENSGT00390000012228 ENSGT00940000166025.a ENSGT00940000166025.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT00940000163896 ENSGT00940000155351 ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 536 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT00940000155351 ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 Atlantic herring MODERN SPECIES 4 perp (ENSCHAG00000022049) ARFGEF3 (ENSCHAG00000020159) ENSCHAG00000020106 ENSCHAG00000020099 cox20 (ENSCHAG00000020092) ENSCHAG00000020074 lhb (ENSCHAG00000020049) ENSCHAG00000020042 ENSCHAG00000020033 ENSCHAG00000020004 itprip (ENSCHAG00000019942) gsto2 (ENSCHAG00000019905) CFAP43 (ENSCHAG00000019817) sfr1 (ENSCHAG00000019792) slka (ENSCHAG00000019649) si:ch211-223p8.8 (ENSCHAG00000019634) ##22 zgc:153981 (ENSCHAG00000019625) ##22 ENSCHAG00000019613 pkdcca (ENSCHAG00000019596) EML4 (ENSCHAG00000018324) ENSCHAG00000018278 ENSCHAG00000018252 COX7A2L (ENSCHAG00000018246) KCNG3 (ENSCHAG00000018228) OXER1 (ENSCHAG00000018207) ENSCHAG00000018173 haao (ENSCHAG00000018131) zfp36l2 (ENSCHAG00000018110) THADA (ENSCHAG00000017933) PLEKHH2 (ENSCHAG00000016959) epcam (ENSCHAG00000016870) Denticle herring MODERN SPECIES 6 ENSDCDG00000029849 gmppab (ENSDCDG00000029858) ENSDCDG00000029874 asic4b (ENSDCDG00000029886) ENSDCDG00000029933 CHPF (ENSDCDG00000029935) ENSDCDG00000029937 cdk5r2a (ENSDCDG00000029938) cryba2a (ENSDCDG00000029939) ENSDCDG00000029941 ENSDCDG00000029956 ENSDCDG00000030274 sft2d2b (ENSDCDG00000030283) TBX19 (ENSDCDG00000030291) iqcb1 (ENSDCDG00000030297) si:ch211-223p8.8 (ENSDCDG00000030304) ##22 zgc:153981 (ENSDCDG00000030306) ##22 znf341 (ENSDCDG00000030307) parp12b (ENSDCDG00000030309) atg9a (ENSDCDG00000030312) ENSDCDG00000030361 ENSDCDG00000030363 ENSDCDG00000030367 ENSDCDG00000030371 FAM171B (ENSDCDG00000030556) SLC19A1 (ENSDCDG00000030561) ENSDCDG00000030564 obsl1a (ENSDCDG00000030579) spega (ENSDCDG00000030634) inha (ENSDCDG00000030641) gjc4a.1 (ENSDCDG00000030643) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351 ENSGT00940000163896 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00940000166025.a ENSGT00390000012228 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714.f ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00940000166025.a Characoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714.e ENSGT00390000018550 ENSGT00940000168136 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351 ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00940000166025.a Red-bellied piranha MODERN SPECIES 45 cep68 (ENSPNAG00000013870) slc1a4 (ENSPNAG00000013905) sertad2b (ENSPNAG00000013911) lgalslb (ENSPNAG00000013920) echs1 (ENSPNAG00000013935) fuom (ENSPNAG00000013958) msx3 (ENSPNAG00000013971) znf511 (ENSPNAG00000014006) adam8a (ENSPNAG00000014023) spef1 (ENSPNAG00000014042) erlin1 (ENSPNAG00000014087) CFAP43 (ENSPNAG00000014139) sfr1 (ENSPNAG00000014101) ENSPNAG00000014217 slka (ENSPNAG00000003068) si:ch211-223p8.8 (ENSPNAG00000003074) ##22 zgc:153981 (ENSPNAG00000003075) ##22 dusp13a (ENSPNAG00000014306) ENSPNAG00000014321 KAT6B (ENSPNAG00000003109) adka (ENSPNAG00000014449) ap3m1 (ENSPNAG00000014489) vcla (ENSPNAG00000014585) plaua (ENSPNAG00000014603) chuk (ENSPNAG00000014647) gsto2 (ENSPNAG00000014672) itprip (ENSPNAG00000014679) CALHM3 (ENSPNAG00000003213) CALHM1 (ENSPNAG00000014696) calhm2.1 (ENSPNAG00000014705) ENSPNAG00000014735 Mexicana tetra MODERN SPECIES 17 cep68 (ENSAMXG00000003594) slc1a4 (ENSAMXG00000003595) sertad2b (ENSAMXG00000025807) lgalslb (ENSAMXG00000034205) echs1 (ENSAMXG00000038646) rsph9 (ENSAMXG00000033656) fuom (ENSAMXG00000003603) msx3 (ENSAMXG00000037131) znf511 (ENSAMXG00000029807) adam8a (ENSAMXG00000003629) spef1 (ENSAMXG00000039640) erlin1 (ENSAMXG00000042976) sfr1 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(ENSIPUG00000021114) plau (ENSIPUG00000021154) chuk (ENSIPUG00000021170) gsto1 (ENSIPUG00000021201) itprip (ENSIPUG00000021212) CALHM3 (ENSIPUG00000021217) CALHM1 (ENSIPUG00000021223) calhm2.1 (ENSIPUG00000021233) ENSIPUG00000021238 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000157081 ENSGT00530000063867.b.b ENSGT00940000155337.ab ENSGT00940000157609 ENSGT00390000001197 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00910000144159.A ENSGT00390000014666.b ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b.d ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.o ENSGT00940000155351.a ENSGT00940000163896 ENSGT00940000155351.b ENSGT01050000244827.D.b.b.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.b.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00940000155078.a.b.a.b.a.a ENSGT00810000125473.A.a ENSGT00940000157081.s.b ENSGT00530000063867.b.b.a ENSGT00940000155337.ab.b ENSGT00940000157609.l ENSGT00390000001197.d ENSGT00940000164982.a.a ENSGT00390000011381.k ENSGT00940000158585.g.a.a ENSGT00390000014666.b.e ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b.b ENSGT00940000156184.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.b ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.b ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a.b ENSGT00940000154628.A.a.b.c ENSGT00940000157372.w ENSGT00390000014320.c.b Goldfish MODERN SPECIES 31 cep68 (ENSCARG00000027338) slc1a4 (ENSCARG00000027186) sertad2b (ENSCARG00000027164) lgalslb (ENSCARG00000027152) echs1 (ENSCARG00000027102) fuom (ENSCARG00000027090) msx3 (ENSCARG00000027082) znf511 (ENSCARG00000027068) adam8a (ENSCARG00000026930) erlin1 (ENSCARG00000026791) ENSCARG00000026745 ENSCARG00000026729 sfr1 (ENSCARG00000026718) ENSCARG00000026661 slka (ENSCARG00000025373) si:ch211-223p8.8 (ENSCARG00000025305) ##22 zgc:153981 (ENSCARG00000025278) ##22 dusp13a (ENSCARG00000025220) KAT6B (ENSCARG00000025130) ENSCARG00000025085 ENSCARG00000025064 adka (ENSCARG00000024900) ap3m1 (ENSCARG00000024857) vcla (ENSCARG00000022981) plaua (ENSCARG00000024413) chuk (ENSCARG00000022486) gsto1 (ENSCARG00000022430) gsto2 (ENSCARG00000022424) itprip (ENSCARG00000022419) CALHM3 (ENSCARG00000022411) CALHM1 (ENSCARG00000022404) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00390000014666.b.e ENSGT00530000064714 ENSGT00390000018550 ENSGT00940000156184.b.b ENSGT00940000156184.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b.a ##22 ENSGT00940000162682.A.a.b.a.a ##22 ENSGT00940000154628.A.a.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b.d ENSGT00940000157372.x ENSGT00390000014320.c.b.f ENSGT00940000158184.p ENSGT01030000234543.D.m.b ENSGT00940000164426.d.b ENSGT00950000182937.A.a.o.d ENSGT00940000163896.j.b ENSGT01050000244827.D.b.b.a.c ENSGT01030000234610.b.a.b.b.e ENSGT01030000234610.b.a.b.a.n.b ENSGT01030000234610.b.a.a.f.a ENSGT01030000234610.b.a.a.e.b Common carp reference MODERN SPECIES 18 rab1ab (ENSCCRG00000082099) cep68 (ENSCCRG00000045101) slc1a4 (ENSCCRG00000069178) sertad2b (ENSCCRG00000014391) lgalslb (ENSCCRG00000044728) echs1 (ENSCCRG00000070995) fuom (ENSCCRG00000074992) msx3 (ENSCCRG00000053428) znf511 (ENSCCRG00000014371) adam8a (ENSCCRG00000014358) spef1 (ENSCCRG00000014348) erlin1 (ENSCCRG00000046675) ENSCCRG00000013218 ENSCCRG00000072378 ENSCCRG00000010032 ENSCCRG00000010300 ##22 ENSCCRG00000010306 KAT6B (ENSCCRG00000073616) adka (ENSCCRG00000042385) ap3m1 (ENSCCRG00000020600) vcla (ENSCCRG00000005235) plaua (ENSCCRG00000016933) chuk (ENSCCRG00000008205) ENSCCRG00000009627 ENSCCRG00000072289 itprip (ENSCCRG00000058077) CALHM3 (ENSCCRG00000009658) ENSCCRG00000011579 CALHM2 (ENSCCRG00000011582) calhm2.1 (ENSCCRG00000009665) ENSCCRG00000056336 Golden-line barbel MODERN SPECIES 312 tbp (ENSSGRG00000052203) rab1ab (ENSSGRG00000052253) cep68 (ENSSGRG00000052284) slc1a4 (ENSSGRG00000052285) sertad2b (ENSSGRG00000052286) lgalslb (ENSSGRG00000052287) echs1 (ENSSGRG00000000116) fuom (ENSSGRG00000000179) msx3 (ENSSGRG00000000192) adam8a (ENSSGRG00000000237) spef1 (ENSSGRG00000000323) erlin1 (ENSSGRG00000000384) sfr1 (ENSSGRG00000000469) ENSSGRG00000000472 slka (ENSSGRG00000000567) si:ch211-223p8.8 (ENSSGRG00000005775) ##22 zgc:153981 (ENSSGRG00000005772) ##22 dusp13a (ENSSGRG00000005778) ENSSGRG00000005780 KAT6B (ENSSGRG00000005783) adka (ENSSGRG00000005813) ap3m1 (ENSSGRG00000007447) vcla (ENSSGRG00000007879) plaua (ENSSGRG00000008491) chuk (ENSSGRG00000008557) ENSSGRG00000010509 itprip (ENSSGRG00000010513) CALHM1 (ENSSGRG00000010516) CALHM2 (ENSSGRG00000010520) calhm2.1 (ENSSGRG00000010524) ENSSGRG00000010526 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00940000157081.s.b ENSGT00530000063867.b.b.a ENSGT00940000155337.ab.b 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(ENSDARG00000061498) ENSDARG00000094665 KAT6B (ENSDARG00000055429) adka (ENSDARG00000039429) ap3m1 (ENSDARG00000029928) vcla (ENSDARG00000044968) chuk (ENSDARG00000011662) plaua (ENSDARG00000075265) gsto1 (ENSDARG00000022183) gsto2 (ENSDARG00000033285) itprip (ENSDARG00000015576) CALHM3 (ENSDARG00000079602) CALHM1 (ENSDARG00000077021) Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 497 ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000014256 ENSGT00940000158807 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158206 ENSGT00950000182836.b.a.a ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000175945 ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 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ENSGT00940000164982.a ENSGT00530000068377 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000014256 ENSGT00940000158807 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158206 ENSGT00950000182836.b.a.a ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000175945 ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000001197 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000014256 ENSGT00940000158807 ENSGT00940000161750.bd ENSGT00940000163367 ENSGT00940000154526 ENSGT00940000161750.ad ENSGT00940000158206 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ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000001197 ENSGT00940000157609 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000014256 ENSGT00940000158807 ENSGT00940000161750.bd ENSGT00940000161750.ad ENSGT00940000158206 ENSGT00950000182836.b.a.a ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000175945 ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000001197 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ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A.h ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000001197 ENSGT00940000157609 Chinese medaka MODERN SPECIES 1045 lrrc1 (ENSOSIG00000010336) ENSOSIG00000010362 klhl31 (ENSOSIG00000010363) gclc (ENSOSIG00000010376) elovl5 (ENSOSIG00000010457) fbxo9 (ENSOSIG00000010460) CILK1 (ENSOSIG00000010509) ENSOSIG00000010511 tmem14a (ENSOSIG00000010518) agpat5 (ENSOSIG00000010532) ENSOSIG00000010534 angpt2a (ENSOSIG00000010536) ENSOSIG00000010539 npy4r (ENSOSIG00000010540) samd8 (ENSOSIG00000010542) si:ch211-223p8.8 (ENSOSIG00000010543) ##22 ENSOSIG00000010544 ENSOSIG00000010545 dusp13a (ENSOSIG00000010546) ap3m1 (ENSOSIG00000010547) vcla (ENSOSIG00000010548) plaua (ENSOSIG00000010552) ENSOSIG00000010568 erlin1 (ENSOSIG00000014888) spef1 (ENSOSIG00000014925) adam8a (ENSOSIG00000014926) znf511 (ENSOSIG00000014932) msx3 (ENSOSIG00000014933) fuom (ENSOSIG00000014935) echs1 (ENSOSIG00000014937) ENSOSIG00000014939 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 6 ENSORLG00000025665 lrrc1 (ENSORLG00000009846) ENSORLG00000009820 klhl31 (ENSORLG00000009811) gclc (ENSORLG00000009800) elovl5 (ENSORLG00000009752) fbxo9 (ENSORLG00000009741) CILK1 (ENSORLG00000009721) tmem14a (ENSORLG00000022220) ENSORLG00000009674 agpat5 (ENSORLG00000009650) angpt2a (ENSORLG00000009631) ENSORLG00000009570 npy4r (ENSORLG00000009534) ENSORLG00000009526 si:ch211-223p8.8 (ENSORLG00000009517) ##22 ENSORLG00000028720 ENSORLG00000026201 ENSORLG00000024834 dusp13a (ENSORLG00000009502) adka (ENSORLG00000009480) ap3m1 (ENSORLG00000009445) vcla (ENSORLG00000009418) plaua (ENSORLG00000009387) ENSORLG00000009381 erlin1 (ENSORLG00000009339) spef1 (ENSORLG00000024093) adam8a (ENSORLG00000009290) msx3 (ENSORLG00000009194) znf511 (ENSORLG00000009201) fuom (ENSORLG00000030462) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 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(ENSOMEG00000002147) ap3m1 (ENSOMEG00000002161) vcla (ENSOMEG00000002183) plaua (ENSOMEG00000002195) CHUK (ENSOMEG00000002205) erlin1 (ENSOMEG00000002213) spef1 (ENSOMEG00000002220) adam8a (ENSOMEG00000002242) znf511 (ENSOMEG00000002249) msx3 (ENSOMEG00000002254) fuom (ENSOMEG00000002263) echs1 (ENSOMEG00000002279) sprn (ENSOMEG00000002285) Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000014256 ENSGT00940000158807 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158206 ENSGT00950000182836.b.a.a ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000175945 ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000160190.b ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000014256 ENSGT00940000158807 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158206 ENSGT00950000182836.b.a.a ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000175945 ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.C ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00530000068377 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000014256 ENSGT00940000158807 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158206 ENSGT00950000182836.b.a.a ENSGT00940000158430 ENSGT00390000018842 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000175945 ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00530000068377 ENSGT00390000001197 Ballan wrasse MODERN SPECIES 955 ENSLBEG00000018116 npy4r (ENSLBEG00000018103) samd8 (ENSLBEG00000018073) si:ch211-223p8.8 (ENSLBEG00000018049) ##22 ENSLBEG00000018027 dusp13a (ENSLBEG00000017998) ENSLBEG00000017979 ENSLBEG00000017784 adka (ENSLBEG00000017661) ap3m1 (ENSLBEG00000017632) vcla (ENSLBEG00000017591) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b 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ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000160190.b ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00530000068377 ENSGT00390000001197 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 ENSGT01050000244838.C.b ENSGT00390000014256 ENSGT00940000158807 ENSGT00940000161750 ENSGT00940000158206 ENSGT00950000182836.b.a.a ENSGT00390000018842 ENSGT00940000158430 ENSGT00940000161766 ENSGT00940000175945 ENSGT00940000155540.b.a ENSGT00940000162682.A.a.b.b.b ##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000154628.C ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000001197 ENSGT00940000157609 Pike perch MODERN SPECIES 10 ENSSLUG00000019822 klhl31 (ENSSLUG00000019828) gclc (ENSSLUG00000019836) elovl5 (ENSSLUG00000019877) fbxo9 (ENSSLUG00000019886) CILK1 (ENSSLUG00000019940) ENSSLUG00000019945 tmem14a (ENSSLUG00000019951) agpat5 (ENSSLUG00000019955) mcph1 (ENSSLUG00000019960) angpt2a (ENSSLUG00000019966) ENSSLUG00000019972 ENSSLUG00000019975 ENSSLUG00000019980 samd8 (ENSSLUG00000019988) si:ch211-223p8.8 (ENSSLUG00000019997) ##22 dusp13a (ENSSLUG00000020010) ENSSLUG00000020039 adka (ENSSLUG00000020056) ap3m1 (ENSSLUG00000020141) vcla (ENSSLUG00000020152) plaua (ENSSLUG00000020176) ENSSLUG00000020213 erlin1 (ENSSLUG00000020948) spef1 (ENSSLUG00000021010) adam8a (ENSSLUG00000021014) znf511 (ENSSLUG00000021023) msx3 (ENSSLUG00000021025) fuom (ENSSLUG00000021026) echs1 (ENSSLUG00000021038) mtg1 (ENSSLUG00000021176) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154025.b ENSGT00390000002428.b ENSGT00940000158352 ENSGT00390000011908 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##22 ENSGT00940000166490.b ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000160190.b ENSGT00390000014320.c.b ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000164426.d ENSGT00950000182937.A.a.p ENSGT00390000014666.b ENSGT00910000144159.A ENSGT00940000158585.g.a ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982.a ENSGT00390000001197 ENSGT00940000157609 European seabass MODERN SPECIES 1 lrrc1 (ENSDLAG00005023595) ENSDLAG00005023642 klhl31 (ENSDLAG00005031785) gclc (ENSDLAG00005023649) elovl5 (ENSDLAG00005000080) fbxo9 (ENSDLAG00005000144) CILK1 (ENSDLAG00005000269) ENSDLAG00005000282 TMEM14A (ENSDLAG00005000286) agpat5 (ENSDLAG00005000291) ENSDLAG00005000299 angpt2a (ENSDLAG00005000307) npy4r (ENSDLAG00005029763) ENSDLAG00005000312 samd8 (ENSDLAG00005000315) si:ch211-223p8.8 (ENSDLAG00005000318) ##22 dusp13a (ENSDLAG00005000321) ENSDLAG00005033198 adka (ENSDLAG00005000426) ap3m1 (ENSDLAG00005000833) vcla (ENSDLAG00005000860) plaua (ENSDLAG00005000905) ENSDLAG00005000915 erlin1 (ENSDLAG00005001040) 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SPECIES eno4 (ENSOTSG00005010082) atp6v1ba (ENSOTSG00005010104) vax1 (ENSOTSG00005013057) ENSOTSG00005013059 kcnk18 (ENSOTSG00005013061) slc18a2 (ENSOTSG00005013064) PDZD8 (ENSOTSG00005013117) ENSOTSG00005013118 yipf4 (ENSOTSG00005013119) BIRC6 (ENSOTSG00005013120) LTBP1 (ENSOTSG00005013163) rasgrp3 (ENSOTSG00005013432) degs1 (ENSOTSG00005016628) fbxo28 (ENSOTSG00005016629) polr1c (ENSOTSG00005016630) si:ch211-223p8.8 (ENSOTSG00005016672) ##22 ENSOTSG00005016675 ENSOTSG00005016676 ENSOTSG00005016677 zswim8 (ENSOTSG00005016688) NDST2 (ENSOTSG00005019149) ENSOTSG00005021975 ENSOTSG00005023769 ENSOTSG00005023772 RIN2 (ENSOTSG00005023774) EEF1A1 (ENSOTSG00005023778) ENSOTSG00005023788 KCNQ5 (ENSOTSG00005023790) ENSOTSG00005023849 ENSOTSG00005023852 ENSOTSG00005023853 Rainbow trout MODERN SPECIES 15 SLC18A2 (ENSOMYG00000030075) PDZD8 (ENSOMYG00000030310) ENSOMYG00000030317 yipf4 (ENSOMYG00000073100) BIRC6 (ENSOMYG00000030671) ENSOMYG00000064187 ttc27 (ENSOMYG00000060512) ENSOMYG00000065147 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Reedfish MODERN SPECIES 10 rps24 (ENSECRG00000017729) ENSECRG00000017755 zmiz1a (ENSECRG00000017888) ppifb (ENSECRG00000018131) zcchc24 (ENSECRG00000018158) anxa11b (ENSECRG00000018183) dlg5a (ENSECRG00000018236) kcnma1a (ENSECRG00000018783) lrmda (ENSECRG00000021424) znf503 (ENSECRG00000021436) comtd1 (ENSECRG00000021456) ENSECRG00000021486 ENSECRG00000021497 vdac2 (ENSECRG00000021535) SAMD8 (ENSECRG00000021650) si:ch211-223p8.8 (ENSECRG00000021719) ##22 zgc:153981 (ENSECRG00000021771) ##22 ENSECRG00000021787 DUSP13 (ENSECRG00000021843) DUSP29 (ENSECRG00000021912) KAT6B (ENSECRG00000021928) adka (ENSECRG00000021964) ap3m1 (ENSECRG00000022006) vcla (ENSECRG00000022029) plaua (ENSECRG00000022051) chuk (ENSECRG00000022068) erlin1 (ENSECRG00000022096) spef1 (ENSECRG00000022110) adam8a (ENSECRG00000022126) tubgcp2 (ENSECRG00000022156) znf511 (ENSECRG00000022183) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a 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ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Theria ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Eutheria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 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(ENSLAFG00000004894) ZNF503 (ENSLAFG00000031176) COMTD1 (ENSLAFG00000009529) VDAC2 (ENSLAFG00000009526) SAMD8 (ENSLAFG00000013269) ENSLAFG00000026669 ##22 DUSP29 (ENSLAFG00000021406) KAT6B (ENSLAFG00000015357) ADK (ENSLAFG00000004737) AP3M1 (ENSLAFG00000018700) VCL (ENSLAFG00000022677) PLAU (ENSLAFG00000016662) CAMK2G (ENSLAFG00000017644) NDST2 (ENSLAFG00000008298) ZSWIM8 (ENSLAFG00000020554) CHCHD1 (ENSLAFG00000016311) FUT11 (ENSLAFG00000022417) ENSLAFG00000002364 SYNPO2L (ENSLAFG00000028703) MYOZ1 (ENSLAFG00000003632) USP54 (ENSLAFG00000011515) Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 ENSGT01090000263343 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 ENSGT01090000263343 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 ENSGT01090000263343 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a 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ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b Pecora ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Percora_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Bovidae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Caprinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00390000000076.o.a ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b Goat MODERN SPECIES 20 ZCCHC24 (ENSCHIG00000000203) PPIF (ENSCHIG00000000241) ZMIZ1 (ENSCHIG00000000282) ENSCHIG00000000315 POLR3A (ENSCHIG00000000352) DLG5 (ENSCHIG00000000389) ENSCHIG00000016306 KCNMA1 (ENSCHIG00000025127) LRMDA (ENSCHIG00000011904) ENSCHIG00000016052 ZNF503 (ENSCHIG00000020542) COMTD1 (ENSCHIG00000005405) VDAC2 (ENSCHIG00000013328) ENSCHIG00000023236 SAMD8 (ENSCHIG00000012189) ENSCHIG00000017421 ##22 DUSP13 (ENSCHIG00000024051) DUSP29 (ENSCHIG00000012654) KAT6B (ENSCHIG00000000073) ADK (ENSCHIG00000000113) ENSCHIG00000000178 AP3M1 (ENSCHIG00000000213) VCL (ENSCHIG00000000321) ENSCHIG00000019095 PLAU (ENSCHIG00000000480) CAMK2G (ENSCHIG00000010155) NDST2 (ENSCHIG00000021909) ZSWIM8 (ENSCHIG00000000068) CHCHD1 (ENSCHIG00000000211) FUT11 (ENSCHIG00000000250) SEC24C (ENSCHIG00000000319) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 ENSGT01090000263343 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Caniformia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Canidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000186316 ENSGT00950000184268 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ENSGT00980000203402 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b Dingo MODERN SPECIES 324 PPIF (ENSCAFG00020014441) ENSCAFG00020014445 ZMIZ1 (ENSCAFG00020014475) RPS24 (ENSCAFG00020014698) POLR3A (ENSCAFG00020014711) DLG5 (ENSCAFG00020014784) KCNMA1 (ENSCAFG00020014954) ENSCAFG00020016188 ENSCAFG00020016190 LRMDA (ENSCAFG00020016191) ENSCAFG00020016194 ZNF503 (ENSCAFG00020016201) COMTD1 (ENSCAFG00020016203) ENSCAFG00020016208 SAMD8 (ENSCAFG00020016213) ENSCAFG00020016224 ##22 DUSP13 (ENSCAFG00020016225) DUSP29 (ENSCAFG00020016226) KAT6B (ENSCAFG00020016239) ADK (ENSCAFG00020016273) AP3M1 (ENSCAFG00020016284) ENSCAFG00020016285 VCL (ENSCAFG00020016286) PLAU (ENSCAFG00020016293) ENSCAFG00020016383 ENSCAFG00020016387 NDST2 (ENSCAFG00020016436) ZSWIM8 (ENSCAFG00020018623) CHCHD1 (ENSCAFG00020020732) FUT11 (ENSCAFG00020020733) ENSCAFG00020020836 Red fox MODERN SPECIES 2 ZCCHC24 (ENSVVUG00000025548) ENSVVUG00000025546 PPIF (ENSVVUG00000025544) ZMIZ1 (ENSVVUG00000025540) RPS24 (ENSVVUG00000025527) POLR3A (ENSVVUG00000025523) DLG5 (ENSVVUG00000025517) KCNMA1 (ENSVVUG00000023686) ENSVVUG00000023502 ENSVVUG00000023498 LRMDA (ENSVVUG00000023484) ENSVVUG00000023479 ZNF503 (ENSVVUG00000023475) ENSVVUG00000023470 ENSVVUG00000023462 ENSVVUG00000023459 ##22 SAMD8 (ENSVVUG00000023455) DUSP13 (ENSVVUG00000023453) DUSP29 (ENSVVUG00000023450) KAT6B (ENSVVUG00000023402) ADK (ENSVVUG00000023279) AP3M1 (ENSVVUG00000023266) VCL (ENSVVUG00000023258) PLAU (ENSVVUG00000023250) CAMK2G (ENSVVUG00000023234) NDST2 (ENSVVUG00000023221) ZSWIM8 (ENSVVUG00000023201) CHCHD1 (ENSVVUG00000023197) FUT11 (ENSVVUG00000023196) SEC24C (ENSVVUG00000023183) SYNPO2L (ENSVVUG00000023179) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b 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ENSGT00950000183054.b American black bear MODERN SPECIES 735 ENSUAMG00000018325 COMTD1 (ENSUAMG00000018326) ENSUAMG00000018327 SAMD8 (ENSUAMG00000018328) ENSUAMG00000018330 ##22 DUSP13 (ENSUAMG00000018331) DUSP29 (ENSUAMG00000018333) ENSUAMG00000018337 Polar bear MODERN SPECIES 197 ENSUMAG00000014081 ENSUMAG00000014078 ANXA11 (ENSUMAG00000014068) ZCCHC24 (ENSUMAG00000014060) ENSUMAG00000014059 ZMIZ1 (ENSUMAG00000013958) ENSUMAG00000013927 POLR3A (ENSUMAG00000013913) DLG5 (ENSUMAG00000013627) KCNMA1 (ENSUMAG00000012880) ENSUMAG00000012754 LRMDA (ENSUMAG00000012748) ENSUMAG00000012715 ENSUMAG00000012714 VDAC2 (ENSUMAG00000012709) ENSUMAG00000012703 ##22 DUSP13 (ENSUMAG00000012700) DUSP29 (ENSUMAG00000012691) KAT6B (ENSUMAG00000012631) ADK (ENSUMAG00000012586) AP3M1 (ENSUMAG00000012566) VCL (ENSUMAG00000012555) PLAU (ENSUMAG00000012549) CAMK2G (ENSUMAG00000012519) NDST2 (ENSUMAG00000012511) ZSWIM8 (ENSUMAG00000012479) CHCHD1 (ENSUMAG00000012470) ENSUMAG00000010038 SYNPO2L 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ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a.eb ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 ENSGT01090000263343 Equus ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a.eb ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01090000263343 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b Donkey MODERN SPECIES 11 ENSEASG00005012065 ENSEASG00005034731 ENSEASG00005012068 ENSEASG00005012066 PGBD5 (ENSEASG00005012072) ENSEASG00005012074 COG2 (ENSEASG00005012075) ENSEASG00005012078 ENSEASG00005025433 ENSEASG00005028521 ENSEASG00005022998 ZNF503 (ENSEASG00005022995) COMTD1 (ENSEASG00005022994) VDAC2 (ENSEASG00005022993) SAMD8 (ENSEASG00005022992) ENSEASG00005022991 ##22 DUSP13 (ENSEASG00005035904) ENSEASG00005022989 KAT6B (ENSEASG00005022987) ENSEASG00005032108 ADK (ENSEASG00005022986) AP3M1 (ENSEASG00005022985) ENSEASG00005029002 VCL (ENSEASG00005022984) PLAU (ENSEASG00005022983) CAMK2G (ENSEASG00005021139) NDST2 (ENSEASG00005019996) ZSWIM8 (ENSEASG00005019037) ENSEASG00005029252 ENSEASG00005027171 FUT11 (ENSEASG00005018913) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 ENSGT00950000182924.A.b.a.a Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Microbat MODERN SPECIES 1006 ENSMLUG00000024102 POLR3A (ENSMLUG00000011522) DLG5 (ENSMLUG00000011460) KCNMA1 (ENSMLUG00000005723) ENSMLUG00000022493 LRMDA (ENSMLUG00000009477) ENSMLUG00000003304 ZNF503 (ENSMLUG00000012474) COMTD1 (ENSMLUG00000007523) VDAC2 (ENSMLUG00000007500) SAMD8 (ENSMLUG00000007486) ENSMLUG00000028391 ##22 DUSP13 (ENSMLUG00000007480) DUSP29 (ENSMLUG00000007469) KAT6B (ENSMLUG00000007438) ADK (ENSMLUG00000003709) AP3M1 (ENSMLUG00000003703) VCL (ENSMLUG00000009809) PLAU (ENSMLUG00000012801) CAMK2G (ENSMLUG00000012781) NDST2 (ENSMLUG00000012766) ZSWIM8 (ENSMLUG00000028244) CHCHD1 (ENSMLUG00000024022) FUT11 (ENSMLUG00000012762) SEC24C (ENSMLUG00000012749) SYNPO2L (ENSMLUG00000012739) MYOZ1 (ENSMLUG00000012733) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 ENSGT01090000263343 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00470000042622 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b Glires ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000165487 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 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ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 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ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 144 PLAC9 (ENSCLAG00000012966) ANXA11 (ENSCLAG00000009076) ZCCHC24 (ENSCLAG00000011227) PPIF (ENSCLAG00000014222) ZMIZ1 (ENSCLAG00000016557) ENSCLAG00000013936 POLR3A (ENSCLAG00000009629) DLG5 (ENSCLAG00000014620) KCNMA1 (ENSCLAG00000014554) LRMDA (ENSCLAG00000010070) ZNF503 (ENSCLAG00000013608) VDAC2 (ENSCLAG00000009384) COMTD1 (ENSCLAG00000010142) ENSCLAG00000012366 SAMD8 (ENSCLAG00000009370) ENSCLAG00000009800 ##22 DUSP13 (ENSCLAG00000009900) DUSP29 (ENSCLAG00000010412) KAT6B (ENSCLAG00000012921) ADK (ENSCLAG00000011462) AP3M1 (ENSCLAG00000010102) VCL (ENSCLAG00000009895) PLAU (ENSCLAG00000010993) CAMK2G (ENSCLAG00000009687) NDST2 (ENSCLAG00000010841) ZSWIM8 (ENSCLAG00000011062) CHCHD1 (ENSCLAG00000012183) FUT11 (ENSCLAG00000009545) ENSCLAG00000009991 SYNPO2L (ENSCLAG00000011472) MYOZ1 (ENSCLAG00000009444) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000165487 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f.b ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000155748.b ENSGT00940000165487 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a 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ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Golden Hamster MODERN SPECIES 767 ENSMAUG00000006948 Dlg5 (ENSMAUG00000013665) Kcnma1 (ENSMAUG00000014726) Lrmda (ENSMAUG00000015119) Zfp503 (ENSMAUG00000011074) Comtd1 (ENSMAUG00000012637) Vdac2 (ENSMAUG00000006909) Samd8 (ENSMAUG00000013507) ENSMAUG00000015679 ##22 ENSMAUG00000018670 Dusp29 (ENSMAUG00000004148) ENSMAUG00000020379 Adk (ENSMAUG00000001364) Ap3m1 (ENSMAUG00000015508) Vcl (ENSMAUG00000005028) Plau (ENSMAUG00000003240) ENSMAUG00000005138 Ndst2 (ENSMAUG00000018479) Zswim8 (ENSMAUG00000009221) Chchd1 (ENSMAUG00000019607) Fut11 (ENSMAUG00000021926) ENSMAUG00000012603 Synpo2l (ENSMAUG00000020245) Usp54 (ENSMAUG00000013098) Primates ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b 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ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT00910000147651 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00390000017469 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00910000147265 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00910000146898 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT00910000147651 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00390000017469 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00910000147265 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00910000148289 ENSGT00910000147360 ENSGT00910000146898 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT01100000263897 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00390000017469 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154368.k ENSGT00940000156653 ENSGT00390000008264 ENSGT00910000147265 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.a ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 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ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT01060000248649 Vervet Monkey MODERN SPECIES 28 ENSCSAG00000009340 ENSCSAG00000009335 ENSCSAG00000009329 ZCCHC24 (ENSCSAG00000009325) PPIF (ENSCSAG00000009321) ZMIZ1 (ENSCSAG00000009314) ENSCSAG00000009299 POLR3A (ENSCSAG00000009292) DLG5 (ENSCSAG00000009267) KCNMA1 (ENSCSAG00000009242) LRMDA (ENSCSAG00000009213) ZNF503 (ENSCSAG00000009170) COMTD1 (ENSCSAG00000009151) VDAC2 (ENSCSAG00000009105) SAMD8 (ENSCSAG00000009093) ENSCSAG00000009082 ##22 DUSP13 (ENSCSAG00000009077) DUSP29 (ENSCSAG00000009070) KAT6B (ENSCSAG00000009056) ADK (ENSCSAG00000009045) AP3M1 (ENSCSAG00000009029) VCL (ENSCSAG00000009004) PLAU (ENSCSAG00000008982) ENSCSAG00000008976 CAMK2G (ENSCSAG00000008967) NDST2 (ENSCSAG00000008945) ZSWIM8 (ENSCSAG00000008933) CHCHD1 (ENSCSAG00000008922) FUT11 (ENSCSAG00000008916) SEC24C (ENSCSAG00000008901) SYNPO2L (ENSCSAG00000008893) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000016042 ENSGT00390000017848 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.a.cb ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a.f ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT00910000147651 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00390000017469 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a Bushbaby MODERN SPECIES 123 ENSOGAG00000032884 RPS24 (ENSOGAG00000011005) POLR3A (ENSOGAG00000010995) ENSOGAG00000025837 DLG5 (ENSOGAG00000016435) ENSOGAG00000027548 KCNMA1 (ENSOGAG00000007370) LRMDA (ENSOGAG00000015046) ENSOGAG00000026163 ZNF503 (ENSOGAG00000014304) ENSOGAG00000031665 ENSOGAG00000029180 COMTD1 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ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT01050000244971.C.d ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b Common wonbat MODERN SPECIES 39 ENSVURG00010014270 ZCCHC24 (ENSVURG00010014255) PPIF (ENSVURG00010014243) ZMIZ1 (ENSVURG00010014184) ENSVURG00010014156 ENSVURG00010014100 POLR3A (ENSVURG00010014062) DLG5 (ENSVURG00010014017) ENSVURG00010014006 KCNMA1 (ENSVURG00010013967) LRMDA (ENSVURG00010013934) ZNF503 (ENSVURG00010013917) COMTD1 (ENSVURG00010013912) VDAC2 (ENSVURG00010013882) SAMD8 (ENSVURG00010013872) ENSVURG00010013837 ##22 ENSVURG00010013777 ENSVURG00010013756 DUSP29 (ENSVURG00010013750) KAT6B (ENSVURG00010013732) ADK (ENSVURG00010013704) AP3M1 (ENSVURG00010013688) VCL 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ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000164426 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000166242.b ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a Aves ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b 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ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT01060000252496 ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000164426 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000166242.b ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158879 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 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ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000164426 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242.a ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ENSGT00950000183054.b Turkey MODERN SPECIES 28 OIT3 (ENSMGAG00000005538) PLA2G12B (ENSMGAG00000005546) P4HA1 (ENSMGAG00000005554) NUDT13 (ENSMGAG00000005611) ZCCHC24 (ENSMGAG00000021575) PPIF (ENSMGAG00000005640) ZMIZ1 (ENSMGAG00000005656) ENSMGAG00000005697 POLR3A (ENSMGAG00000005713) DLG5 (ENSMGAG00000005774) KCNMA1 (ENSMGAG00000005789) LRMDA (ENSMGAG00000006023) COMTD1 (ENSMGAG00000006025) VDAC2 (ENSMGAG00000006031) SAMD8 (ENSMGAG00000006065) ENSMGAG00000006074 ##22 ENSMGAG00000016410 DUSP29 (ENSMGAG00000006093) KAT6B (ENSMGAG00000006095) ADK (ENSMGAG00000006115) AP3M1 (ENSMGAG00000006136) VCL (ENSMGAG00000006167) ENSMGAG00000006225 CAMK2G (ENSMGAG00000006266) NDST2 (ENSMGAG00000006432) ZSWIM8 (ENSMGAG00000006483) ENSMGAG00000006507 CHCHD1 (ENSMGAG00000021620) FUT11 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ENSABRG00000016724 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00600000084626 ENSGT00940000170983 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372 ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000164426 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000166242.b ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00600000084626 ENSGT00940000170983 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935 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ENSTMTG00000008973 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156914 ENSGT00390000008264 ENSGT00940000156008 ENSGT01030000234539.b.b.b ENSGT00390000000153.l.b.c.b ENSGT00930000151028 ENSGT00940000155303 ENSGT00940000154935.db.b ENSGT00940000154935.eb ENSGT00950000184268 ENSGT00940000153289.a.a.a ENSGT00390000014618.a ENSGT00390000004409 ENSGT00950000182869.e.a.a ENSGT00940000155540.b.b ENSGT00940000162682.A.a.b ##22 ENSGT00940000154628.B ENSGT00940000160190 ENSGT00940000157372.c ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00940000164426.b ENSGT00950000182937.A.a ENSGT00390000014666.b ENSGT00940000158585 ENSGT00940000156697 ENSGT00390000011381 ENSGT00390000000483.a.b ENSGT00940000157609 ENSGT00730000113699 Abingdon island giant tortoise DUPLICATION Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 130 ZNF503 (ENSCABG00000020998) ENSCABG00000021002 VDAC2 (ENSCABG00000021023) SAMD8 (ENSCABG00000021040) ENSCABG00000021042 ##22 ENSCABG00000021044 ##22 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MODERN SPECIES 13 ENSPMRG00000002684 ZMIZ1 (ENSPMRG00000002657) ENSPMRG00000002638 POLR3A (ENSPMRG00000002618) ENSPMRG00000002608 ENSPMRG00000002268 ENSPMRG00000002204 KCNMA1 (ENSPMRG00000002147) LRMDA (ENSPMRG00000002138) ZNF503 (ENSPMRG00000002125) COMTD1 (ENSPMRG00000002115) VDAC2 (ENSPMRG00000002106) SAMD8 (ENSPMRG00000002095) ENSPMRG00000002091 ##22 ENSPMRG00000002087 ##22 ENSPMRG00000002080 ##22 ENSPMRG00000002076 DUSP13 (ENSPMRG00000002070) DUSP29 (ENSPMRG00000002065) KAT6B (ENSPMRG00000002036) ADK (ENSPMRG00000002011) AP3M1 (ENSPMRG00000002000) VCL (ENSPMRG00000001955) ENSPMRG00000001927 ENSPMRG00000001921 CAMK2G (ENSPMRG00000001904) NDST2 (ENSPMRG00000001889) ZSWIM8 (ENSPMRG00000001872) ENSPMRG00000001845 ENSPMRG00000001838 ENSPMRG00000001829 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 47 RPS24 (ENSSMRG00000006802) POLR3A (ENSSMRG00000006755) DLG5 (ENSSMRG00000006724) ENSSMRG00000006708 ENSSMRG00000006686 ENSSMRG00000002439 LRMDA (ENSSMRG00000002390) ENSSMRG00000002338 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ENSGT00390000014320 ENSGT00940000158184 ENSGT01030000234543.D ENSGT00910000144159.A.b ENSGT00940000158585 ENSGT00940000156697 ENSGT00390000011381 ENSGT00940000164982 ENSGT00390000000483.a.b ENSGT00390000001197 ENSGT00940000157609 ENSGT00500000044923 ENSGT00940000158274 Frog MODERN SPECIES 7 zmiz1 (ENSXETG00000018359) ENSXETG00000041587 rps24 (ENSXETG00000018137) polr3a (ENSXETG00000018101) ENSXETG00000043646 dlg5 (ENSXETG00000018090) ENSXETG00000048193 kcnma1 (ENSXETG00000018041) lrmda (ENSXETG00000009871) ENSXETG00000045575 ENSXETG00000042633 znf503 (ENSXETG00000009866) ENSXETG00000043219 vdac2 (ENSXETG00000009865) samd8 (ENSXETG00000009864) dusp13 (ENSXETG00000041222) ##22 dusp29 (ENSXETG00000040556) vcl (ENSXETG00000007084) zdhhc5 (ENSXETG00000030941) clp1 (ENSXETG00000007088) ctnnd1 (ENSXETG00000007089) ENSXETG00000041918 ENSXETG00000044732 ENSXETG00000034423 tmx2 (ENSXETG00000026417) med19 (ENSXETG00000032150) ENSXETG00000043237 clstn1 (ENSXETG00000000775) ENSXETG00000049386 ssrp1 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Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.b ##22 Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.b ##22 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.b ##22 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.b ##22 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.b ##22 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.b ##22 Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.A.b ##22 Spiny chromis MODERN SPECIES 635 fbxo9 (ENSAPOG00000003120) ENSAPOG00000000877 ENSAPOG00000003207 ENSAPOG00000003246 tmem14a (ENSAPOG00000003265) agpat5 (ENSAPOG00000003287) angpt2a (ENSAPOG00000003322) mcph1 (ENSAPOG00000000068) npy4r (ENSAPOG00000003352) ENSAPOG00000003370 samd8 (ENSAPOG00000003390) si:ch211-223p8.8 (ENSAPOG00000003401) ##22 ENSAPOG00000003415 dusp13a (ENSAPOG00000003426) ENSAPOG00000003431 ##22 ENSAPOG00000003447 adka (ENSAPOG00000003485) ap3m1 (ENSAPOG00000000940) vcla (ENSAPOG00000003639) plaua (ENSAPOG00000003655) CHUK (ENSAPOG00000003676) erlin1 (ENSAPOG00000003693) spef1 (ENSAPOG00000003703) adam8a (ENSAPOG00000003747) znf511 (ENSAPOG00000003762) msx3 (ENSAPOG00000000073) fuom (ENSAPOG00000003788) echs1 (ENSAPOG00000003819) sprn (ENSAPOG00000003829) mtg1 (ENSAPOG00000003960)