Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 1120 ENSGT00940000157325 #21 ENSGT00940000162682.B #22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 564 ENSGT00940000157325 #21 ENSGT00940000162682.B #22 Amniota ANCESTRAL SPECIES 344 ENSGT00940000157325 #21 ENSGT00940000162682.B #22 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 155 ENSGT00960000190099 ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 Aves ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00960000190099 ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157746 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000157744 ENSGT00950000183046.a.b ENSGT00940000157900 ENSGT00940000154376.b ENSGT00950000182883.a.a ENSGT00730000110974 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.b ENSGT00940000157190 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000169006 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000172611 ENSGT00950000183070.a.b ENSGT00940000157416 ENSGT00390000007741.a ENSGT00940000161380 ENSGT01100000263525.b.a ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843.cb ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000160279 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a ENSGT00940000157746 ENSGT00940000158951 ENSGT00940000165079 ENSGT00940000157744 ENSGT00950000183046.a.b ENSGT00940000157900 ENSGT00940000154376.b ENSGT00950000182883.a.a ENSGT00730000110974 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.b ENSGT00940000157190 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00950000183070.a.b ENSGT00940000157416 ENSGT00390000007741.a ENSGT00940000161380 ENSGT01100000263525.b.a ENSGT00940000160427 ENSGT00390000005121 ENSGT00390000007843.cb ENSGT00940000159091 ENSGT00940000154298.a.b ENSGT00950000183025.a Turkey MODERN SPECIES 21 ENSMGAG00000021072 ENSMGAG00000016852 KCNH2 (ENSMGAG00000001566) ENSMGAG00000005716 ENSMGAG00000020767 KAT7 (ENSMGAG00000002025) FAM117A (ENSMGAG00000002048) SLC35B1 (ENSMGAG00000002063) SPOP (ENSMGAG00000002099) NXPH3 (ENSMGAG00000015642) NGFR (ENSMGAG00000002136) ENSMGAG00000002161 MPP3 (ENSMGAG00000002179) CFAP97D1 (ENSMGAG00000019614) ENSMGAG00000018689 #21 ENSMGAG00000002314 #22 SOST (ENSMGAG00000022809) MEOX1 (ENSMGAG00000017287) ETV4 (ENSMGAG00000002317) DHX8 (ENSMGAG00000002343) PHB1 (ENSMGAG00000002414) ZNF652 (ENSMGAG00000002434) PHOSPHO1 (ENSMGAG00000002447) ENSMGAG00000002455 GNGT2 (ENSMGAG00000022172) IGF2BP1 (ENSMGAG00000002497) ENSMGAG00000007094 SNF8 (ENSMGAG00000007078) UBE2Z (ENSMGAG00000007071) ENSMGAG00000007047 ENSMGAG00000002528 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 207 ENSGT00940000157325.`b #21 ENSGT00940000162682.B #22 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Flycatcher MODERN SPECIES 19 ENSFALG00000015314 ENSFALG00000015309 ENSFALG00000026798 ENSFALG00000015304 ENSFALG00000015289 ENSFALG00000027660 ENSFALG00000000887 ENSFALG00000015275 ENSFALG00000000713 ENSFALG00000000865 ENSFALG00000000842 ENSFALG00000000854 ENSFALG00000027972 MPP3 (ENSFALG00000000834) ENSFALG00000000831 #21 ENSFALG00000025201 #22 SOST (ENSFALG00000028970) ENSFALG00000027829 MEOX1 (ENSFALG00000000823) ETV4 (ENSFALG00000024603) DHX8 (ENSFALG00000000810) NBR1 (ENSFALG00000000804) BRCA1 (ENSFALG00000000796) RND2 (ENSFALG00000000786) VAT1 (ENSFALG00000025296) ENSFALG00000000781 RPL27 (ENSFALG00000000772) RUNDC1 (ENSFALG00000000768) PTGES3L (ENSFALG00000024118) AARSD1 (ENSFALG00000000757) ENSFALG00000000748 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 painted turtle MODERN SPECIES 2367 ENSCPBG00000027630 ENSCPBG00000027629 CFAP97D1 (ENSCPBG00000027628) MPP3 (ENSCPBG00000027623) ENSCPBG00000027619 ENSCPBG00000027616 #22 GATA6 (ENSCPBG00000027614) MIB1 (ENSCPBG00000027607) ABHD3 (ENSCPBG00000027604) ESCO1 (ENSCPBG00000027599) GREB1L (ENSCPBG00000027577) ENSCPBG00000027568 ROCK1 (ENSCPBG00000027564) USP14 (ENSCPBG00000027561) THOC1 (ENSCPBG00000027558) COLEC12 (ENSCPBG00000027554) CLUL1 (ENSCPBG00000027553) TYMS (ENSCPBG00000027552) ENOSF1 (ENSCPBG00000027551) YES1 (ENSCPBG00000027548) ADCYAP1 (ENSCPBG00000027547) Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01100000263787 ENSGT00390000014069.b ENSGT00560000077692 ENSGT00940000160773 ENSGT00400000022305 ENSGT00940000160534.o ENSGT00950000183150.b ENSGT00390000006956 ENSGT00390000011938 ENSGT00390000005602 ENSGT00530000064295 ENSGT00940000155348.B ENSGT00940000162429.a ENSGT00940000157190 ENSGT00390000018148 ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000161341.b Polar bear MODERN SPECIES 185 UBTF (ENSUMAG00000013247) ATXN7L3 (ENSUMAG00000013180) ENSUMAG00000013176 TMUB2 (ENSUMAG00000013167) ENSUMAG00000013163 HROB (ENSUMAG00000013161) HDAC5 (ENSUMAG00000013017) G6PC3 (ENSUMAG00000012993) LSM12 (ENSUMAG00000012987) TMEM101 (ENSUMAG00000012979) PPY (ENSUMAG00000012971) MPP2 (ENSUMAG00000012961) ENSUMAG00000012954 MPP3 (ENSUMAG00000012838) CFAP97D1 (ENSUMAG00000012821) ENSUMAG00000012817 #22 MEOX1 (ENSUMAG00000012807) DHX8 (ENSUMAG00000012797) ARL4D (ENSUMAG00000012795) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 12 SLC4A1 (ENSHGLG00000016913) UBTF (ENSHGLG00000006625) ENSHGLG00000013149 TMUB2 (ENSHGLG00000007515) ENSHGLG00000042379 G6PC3 (ENSHGLG00000043749) LSM12 (ENSHGLG00000050842) TMEM101 (ENSHGLG00000046440) NAGS (ENSHGLG00000010233) PYY (ENSHGLG00000033184) ENSHGLG00000011831 MPP2 (ENSHGLG00000009770) ENSHGLG00000034523 MPP3 (ENSHGLG00000011058) CFAP97D1 (ENSHGLG00000013368) DUSP3 (ENSHGLG00000050495) #22 SOST (ENSHGLG00000012172) MEOX1 (ENSHGLG00000013678) ETV4 (ENSHGLG00000011286) DHX8 (ENSHGLG00000011583) ENSHGLG00000050278 NBR1 (ENSHGLG00000009707) BRCA1 (ENSHGLG00000011797) RND2 (ENSHGLG00000016847) VAT1 (ENSHGLG00000010027) IFI35 (ENSHGLG00000045338) ENSHGLG00000034738 RUNDC1 (ENSHGLG00000014121) ENSHGLG00000014337 ENSHGLG00000046073 ENSHGLG00000033874 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Opossum MODERN SPECIES 1 ENSMODG00000016797 METTL25B (ENSMODG00000016796) MRPL24 (ENSMODG00000016790) HDGF (ENSMODG00000051437) PRCC (ENSMODG00000016779) ENSMODG00000016772 ENSMODG00000016749 INSRR (ENSMODG00000016712) NTRK1 (ENSMODG00000016703) PEAR1 (ENSMODG00000016694) LRRC71 (ENSMODG00000016683) ARHGEF11 (ENSMODG00000016676) ENSMODG00000016664 MPP3 (ENSMODG00000015212) ENSMODG00000024203 ENSMODG00000015202 #22 SOST (ENSMODG00000037336) MEOX1 (ENSMODG00000015190) ETV4 (ENSMODG00000015187) DHX8 (ENSMODG00000015181) ARL4D (ENSMODG00000024202) TMEM106A (ENSMODG00000015160) NBR1 (ENSMODG00000015157) BRCA1 (ENSMODG00000015150) RND2 (ENSMODG00000015141) VAT1 (ENSMODG00000038066) IFI35 (ENSMODG00000015132) RPL27 (ENSMODG00000041619) RUNDC1 (ENSMODG00000015121) ENSMODG00000042194 ENSMODG00000041581 Anura ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 3 TCEA2 (ENSLLEG00000023434) ARFGEF2 (ENSLLEG00000023997) C20orf85 (ENSLLEG00000025622) ENSLLEG00000025661 ENSLLEG00000025908 SAMD10 (ENSLLEG00000026364) ENSLLEG00000026417 UCKL1 (ENSLLEG00000026545) DNAJC5 (ENSLLEG00000026714) TPD52L2 (ENSLLEG00000026803) ZBTB46 (ENSLLEG00000027353) SLC2A4RG (ENSLLEG00000027407) ZGPAT (ENSLLEG00000027650) ARFRP1 (ENSLLEG00000027729) RUNDC1 (ENSLLEG00000027777) ENSLLEG00000027865 #22 RSAD1 (ENSLLEG00000027931) XYLT2 (ENSLLEG00000028018) MRPL27 (ENSLLEG00000028341) ENSLLEG00000028531 LRRC59 (ENSLLEG00000028591) ACSF2 (ENSLLEG00000028720) CHAD (ENSLLEG00000029152) ENSLLEG00000029173 RAB37 (ENSLLEG00000029201) ENSLLEG00000029369 ENSLLEG00000029516 NAT9 (ENSLLEG00000029538) TMEM104 (ENSLLEG00000029577) GRIN2C (ENSLLEG00000029760) FDXR (ENSLLEG00000029806) Coelacanth MODERN SPECIES 865 ENSLACG00000014572 ENSLACG00000012593 MPP3 (ENSLACG00000011821) ENSLACG00000022414 rab18b (ENSLACG00000011256) #21 dusp3b (ENSLACG00000010846) #22 SOST (ENSLACG00000010427) MEOX1 (ENSLACG00000007651) ETV4 (ENSLACG00000003651) DHX8 (ENSLACG00000001765) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B #22 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00940000165576.b ENSGT00390000018386 ENSGT00940000159914 ENSGT00940000160643 ENSGT00940000155348.B.d ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079 ENSGT00650000094974 ENSGT00940000157744 ENSGT00940000163448 ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00940000162682.B #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Clupeocephala DUPLICATION Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000155348.B.d ENSGT00940000167052 ENSGT00940000163600 ENSGT00940000157746.e ENSGT00940000158951.e ENSGT00940000165079.a ENSGT00940000157744.d ENSGT00940000163448 ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b 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23 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d 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SPECIES 10 ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157509.b.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b 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ENSTRUG00000003867 meox1 (ENSTRUG00000005193) etv4 (ENSTRUG00000004727) ENSTRUG00000004063 ormdl3 (ENSTRUG00000033478) nsfb (ENSTRUG00000002989) wnt3 (ENSTRUG00000003564) psmd11b (ENSTRUG00000002031) cdk5r1b (ENSTRUG00000001984) MYO1D (ENSTRUG00000013296) ENSTRUG00000013295 PDK2 (ENSTRUG00000013086) TBKBP1 (ENSTRUG00000013045) tbx21 (ENSTRUG00000012995) osbpl7 (ENSTRUG00000012593) Tetraodon MODERN SPECIES 13 plekhm1 (ENSTNIG00000014420) ENSTNIG00000000599 ENSTNIG00000014419 ENSTNIG00000014418 plxdc1 (ENSTNIG00000000704) tectb (ENSTNIG00000014417) ENSTNIG00000014416 acsl5 (ENSTNIG00000014415) MFAP4 (ENSTNIG00000001172) ENSTNIG00000014414 g6pc1a.2 (ENSTNIG00000014413) g6pc1a.1 (ENSTNIG00000014412) psme3 (ENSTNIG00000014411) nbr1a (ENSTNIG00000014410) tmem106a (ENSTNIG00000014409) ENSTNIG00000014408 #22 SOST (ENSTNIG00000014407) meox1 (ENSTNIG00000014406) etv4 (ENSTNIG00000004134) cdk5r1b (ENSTNIG00000004135) psmd11b (ENSTNIG00000004136) ENSTNIG00000006979 ENSTNIG00000003353 wnt3 (ENSTNIG00000006063) nsfb (ENSTNIG00000006062) psmd11b (ENSTNIG00000006061) MYO1D (ENSTNIG00000019513) ENSTNIG00000019512 ENSTNIG00000016967 PDK2 (ENSTNIG00000016966) TBKBP1 (ENSTNIG00000016965) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Ballan wrasse MODERN SPECIES 229 ANK3 (ENSLBEG00000010602) ENSLBEG00000010749 g6pc1a.2 (ENSLBEG00000010785) g6pc1a.1 (ENSLBEG00000010833) psme3 (ENSLBEG00000010882) nbr1a (ENSLBEG00000010972) ENSLBEG00000011111 tmem106a (ENSLBEG00000011127) arl4d (ENSLBEG00000011152) ENSLBEG00000011201 #22 SOST (ENSLBEG00000011225) meox1 (ENSLBEG00000011244) etv4 (ENSLBEG00000011272) ENSLBEG00000011490 DHX8 (ENSLBEG00000012048) ENSLBEG00000012113 ormdl3 (ENSLBEG00000012141) wnt3 (ENSLBEG00000012155) nsfb (ENSLBEG00000012216) psmd11b (ENSLBEG00000012351) cdk5r1b (ENSLBEG00000012401) MYO1D (ENSLBEG00000012431) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183052.b.c.b.b.a.a.b.a.b.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c 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ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000177915 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a.l ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a.l 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ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Poecilia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a.l ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 NAME_6 ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069.a ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a.l ENSGT00940000154939.e.a.k.b ENSGT00940000177915 ENSGT00940000154939.e.a.k.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Sailfin molly MODERN SPECIES 1356 ENSPLAG00000019286 ENSPLAG00000019275 g6pc1a.2 (ENSPLAG00000019249) g6pc1a.1 (ENSPLAG00000019221) psme3 (ENSPLAG00000019206) nbr1a (ENSPLAG00000019187) tmem106a (ENSPLAG00000019179) arl4d (ENSPLAG00000019168) ENSPLAG00000019145 #22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B 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(ENSNFUG00015018609) arl4d (ENSNFUG00015018601) ENSNFUG00015018598 #22 SOST (ENSNFUG00015018593) meox1 (ENSNFUG00015018591) ENSNFUG00015018589 etv4 (ENSNFUG00015018587) DHX8 (ENSNFUG00015014267) ENSNFUG00015013421 ENSNFUG00015013394 ORMDL3 (ENSNFUG00015013386) WNT3 (ENSNFUG00015013372) nsfb (ENSNFUG00015013189) PSMD11B (ENSNFUG00015013143) CDK5R1B (ENSNFUG00015013133) ENSNFUG00015013131 MYO1D (ENSNFUG00015013217) PDK2 (ENSNFUG00015012628) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014794.b.k ENSGT00940000160175.a ENSGT00940000160084.h ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00950000183187.B ENSGT00940000156993.c ENSGT00940000160739 ENSGT00940000157982.a.a ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.a #22 Javanese ricefish MODERN SPECIES 10 ENSOJAG00000014775 ENSOJAG00000014811 llgl2 (ENSOJAG00000015042) galk1 (ENSOJAG00000015969) PLCD3 (ENSOJAG00000015987) acbd4 (ENSOJAG00000016225) ENSOJAG00000016237 ENSOJAG00000016342 g6pc1a.2 (ENSOJAG00000016454) g6pc1a.1 (ENSOJAG00000016527) psme3 (ENSOJAG00000016537) nbr1a (ENSOJAG00000016764) tmem106a (ENSOJAG00000016860) arl4d (ENSOJAG00000016870) ENSOJAG00000016892 ENSOJAG00000016983 #22 ENSOJAG00000016988 SOST (ENSOJAG00000017000) ENSOJAG00000017003 meox1 (ENSOJAG00000017008) etv4 (ENSOJAG00000017017) DHX8 (ENSOJAG00000017063) ENSOJAG00000017812 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000166756.t.b ENSGT00940000160595.a.b ENSGT00940000160175.a ENSGT00940000160084.h ENSGT00950000182906.a.a.b ENSGT00950000183187.B ENSGT00940000156993.c.d.a ENSGT00940000160739 ENSGT00940000157982.a.a ENSGT00930000151032.B ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 10 llgl2 (ENSORLG00000018426) galk1 (ENSORLG00000018489) ENSORLG00000025549 ENSORLG00000029832 ENSORLG00000029999 ENSORLG00000018561 acbd4 (ENSORLG00000018591) ENSORLG00000030584 ENSORLG00000018681 ENSORLG00000021944 g6pc1a.2 (ENSORLG00000018711) g6pc1a.1 (ENSORLG00000018731) psme3 (ENSORLG00000018778) nbr1a (ENSORLG00000018851) tmem106a (ENSORLG00000018866) ENSORLG00000025889 #22 SOST (ENSORLG00000028572) meox1 (ENSORLG00000011858) etv4 (ENSORLG00000011909) DHX8 (ENSORLG00000011951) thra (ENSORLG00000012005) ENSORLG00000025859 ormdl3 (ENSORLG00000027713) wnt3 (ENSORLG00000012027) nsfb (ENSORLG00000012044) psmd11b (ENSORLG00000012079) cdk5r1b (ENSORLG00000012086) MYO1D (ENSORLG00000012150) ENSORLG00000023453 PDK2 (ENSORLG00000012173) ENSORLG00000030262 Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Nile tilapia MODERN SPECIES 20 ENSONIG00000018297 ENSONIG00000018295 plxdc1 (ENSONIG00000018292) ENSONIG00000027818 tectb (ENSONIG00000018289) ENSONIG00000018285 acsl5 (ENSONIG00000018282) MFAP4 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ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT01100000263491.a.a.d ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00940000179946 ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b.j ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c Eastern happy MODERN SPECIES 20 ENSACLG00000025470 plxdc1 (ENSACLG00000025445) ENSACLG00000025441 tectb (ENSACLG00000025428) ENSACLG00000025409 acsl5 (ENSACLG00000025260) MFAP4 (ENSACLG00000025253) ANK3 (ENSACLG00000025143) 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ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Spiny chromis MODERN SPECIES 361 ENSAPOG00000003923 ANK3 (ENSAPOG00000004281) g6pc1a.2 (ENSAPOG00000004330) ENSAPOG00000004343 g6pc1a.1 (ENSAPOG00000004366) psme3 (ENSAPOG00000004411) nbr1a (ENSAPOG00000004436) tmem106a (ENSAPOG00000004454) ENSAPOG00000004518 #22 SOST (ENSAPOG00000004532) meox1 (ENSAPOG00000004549) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 59 ENSGT00940000155111 ENSGT00940000157509.b ENSGT00940000154775.c.a.a.a ENSGT00440000033408.b.b ENSGT00390000000221.B ENSGT00940000159064 ENSGT00940000163069 ENSGT00940000156651 ENSGT00940000154615.i.b ENSGT00940000154939.e.a ENSGT00950000183150.a.a.a.c ENSGT00950000183150.a.a.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Orange clownfish MODERN SPECIES 10 ENSAPEG00000006830 LASP1 (ENSAPEG00000006799) plxdc1 (ENSAPEG00000006782) ENSAPEG00000006767 tectb (ENSAPEG00000006715) ENSAPEG00000006554 acsl5 (ENSAPEG00000006470) MFAP4 (ENSAPEG00000006426) ANK3 (ENSAPEG00000006088) g6pc1a.2 (ENSAPEG00000006021) g6pc1a.1 (ENSAPEG00000006009) psme3 (ENSAPEG00000005989) ENSAPEG00000005969 nbr1a (ENSAPEG00000005951) tmem106a (ENSAPEG00000005942) ENSAPEG00000005889 #22 SOST (ENSAPEG00000005879) meox1 (ENSAPEG00000005786) etv4 (ENSAPEG00000005761) ENSAPEG00000005739 DHX8 (ENSAPEG00000005641) ENSAPEG00000005621 ormdl3 (ENSAPEG00000005565) wnt3 (ENSAPEG00000005543) nsfb (ENSAPEG00000005478) psmd11b (ENSAPEG00000005372) cdk5r1b (ENSAPEG00000005355) ENSAPEG00000005336 MYO1D (ENSAPEG00000005253) PDK2 (ENSAPEG00000005179) TBKBP1 (ENSAPEG00000005081) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 1440 g6pc1a.1 (ENSSPAG00000002323) psme3 (ENSSPAG00000002270) nbr1a (ENSSPAG00000002213) tmem106a (ENSSPAG00000002109) ENSSPAG00000002051 #22 SOST (ENSSPAG00000002037) Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 24 ENSHCOG00000011573 LASP1 (ENSHCOG00000011575) plxdc1 (ENSHCOG00000011579) ENSHCOG00000011596 tectb (ENSHCOG00000011611) ENSHCOG00000011648 acsl5 (ENSHCOG00000011715) ANK3 (ENSHCOG00000011789) g6pc1a.2 (ENSHCOG00000011811) g6pc1a.1 (ENSHCOG00000011827) psme3 (ENSHCOG00000011845) nbr1a (ENSHCOG00000011859) tmem106a (ENSHCOG00000011868) arl4d (ENSHCOG00000011881) SOST (ENSHCOG00000011886) ENSHCOG00000011893 #22 meox1 (ENSHCOG00000011913) ENSHCOG00000011930 myoz1b (ENSHCOG00000011948) SYNPO2L (ENSHCOG00000011970) sec24c (ENSHCOG00000012113) ENSHCOG00000012239 ENSHCOG00000000349 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ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.a.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a.a ENSGT00940000157411 ENSGT00940000156038.a.b.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00940000156497.b ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ENSGT00950000183150.a.a.b.f ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00390000016335.h.g ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000162682.B.a.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b.b ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00390000008812.b.b.a.a.b ENSGT00940000157411.j ENSGT00940000156038.a.b.b ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c.c ENSGT00940000166447.c Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00940000156497.b ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d ENSGT00950000183150.a.a.b.f ENSGT00950000183098.a.b.c ENSGT00390000016335.h.g ENSGT00940000166248.a.d ENSGT00940000161341.a.a.f ENSGT00940000162682.B.a.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b.b.a ENSGT00940000154018.a.b ENSGT00940000158142.e ENSGT00940000155510.u.b ENSGT00940000157917.a.a.a.a ENSGT00950000183178.b.b.b.c.a ENSGT00940000157854.w.b ENSGT00530000064085.c.d ENSGT00530000063301.a.a.c.a.f ENSGT00390000008812.b.b.a.a.b ENSGT00940000157411.j ENSGT00940000156038.a.b.b 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(ENSOMYG00000034822) ENSOMYG00000037769 ENSOMYG00000037784 ENSOMYG00000037797 ENSOMYG00000037942 ENSOMYG00000062509 ENSOMYG00000038169 ENSOMYG00000038664 AARSD1 (ENSOMYG00000038701) G6PC1 (ENSOMYG00000038810) psme3 (ENSOMYG00000038921) nbr1a (ENSOMYG00000039260) tmem106a (ENSOMYG00000039279) arl4d (ENSOMYG00000039302) ENSOMYG00000039350 #22 SOST (ENSOMYG00000075023) meox1 (ENSOMYG00000054849) etv4 (ENSOMYG00000039467) DHX8 (ENSOMYG00000040006) ENSOMYG00000064442 ENSOMYG00000041692 ormdl3 (ENSOMYG00000042161) wnt3 (ENSOMYG00000042177) nsfb (ENSOMYG00000042291) psmd11b (ENSOMYG00000042895) cdk5r1b (ENSOMYG00000042908) ENSOMYG00000042956 ENSOMYG00000065805 ENSOMYG00000043223 ENSOMYG00000043255 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000164940.b.g.a ENSGT00500000044903.b.f.a ENSGT00470000042293.a.b.a.b.d ENSGT00940000156497.b ENSGT00950000183080.a.b.b.a.b.c ENSGT00940000157961.A.f ENSGT00940000156292.g.a.d ENSGT00940000163448.b ENSGT00940000156241 ENSGT00950000183150.a.a.a.c.d 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ENSGT00940000166447.d ENSGT00940000157439.b.c River trout MODERN SPECIES 1 crygmx (ENSSTUG00000010575) aldh18a1 (ENSSTUG00000009324) grnb (ENSSTUG00000009264) ENSSTUG00000009261 GRB7 (ENSSTUG00000009196) ENSSTUG00000009061 FMNL1 (ENSSTUG00000008178) ptges3l (ENSSTUG00000008135) ENSSTUG00000008122 g6pc1a.2 (ENSSTUG00000008105) g6pc1a.1 (ENSSTUG00000007950) psme3 (ENSSTUG00000007920) nbr1a (ENSSTUG00000007897) tmem106a (ENSSTUG00000007891) arl4d (ENSSTUG00000007873) ENSSTUG00000007862 #22 SOST (ENSSTUG00000007854) ENSSTUG00000007847 meox1 (ENSSTUG00000007839) etv4 (ENSSTUG00000007794) DHX8 (ENSSTUG00000006798) THRA (ENSSTUG00000005628) ormdl3 (ENSSTUG00000005562) wnt3 (ENSSTUG00000005517) nsfb (ENSSTUG00000001411) psmd11b (ENSSTUG00000000973) cdk5r1b (ENSSTUG00000013467) MYO1D (ENSSTUG00000013020) TBKBP1 (ENSSTUG00000012972) tbx21 (ENSSTUG00000012960) osbpl7 (ENSSTUG00000012941) Atlantic salmon MODERN SPECIES 20 crygmx (ENSSSAG00000077442) aldh18a1 (ENSSSAG00000076472) grnb 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ENSGT00940000165065.b ENSGT00940000158354.c.a ENSGT00940000165637 ENSGT00940000159503 ENSGT00390000017856.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.a.b ENSGT00950000183178.b.b.b ENSGT00940000157854 ENSGT00530000064085.c ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 ENSGT01030000234646.B.a.a.a.a.a ENSGT00940000153704.B.c ENSGT00940000166447 ENSGT00940000157439.b Atlantic herring MODERN SPECIES 15 arsg (ENSCHAG00000013856) snx11 (ENSCHAG00000013883) ENSCHAG00000013891 stx4 (ENSCHAG00000013907) ENSCHAG00000013917 hoxb6b (ENSCHAG00000014833) hoxb5b (ENSCHAG00000014851) ENSCHAG00000014869 hoxb1b (ENSCHAG00000014873) skap1 (ENSCHAG00000014938) psme3 (ENSCHAG00000014948) nbr1a (ENSCHAG00000015020) tmem106a (ENSCHAG00000015026) arl4d (ENSCHAG00000015038) ENSCHAG00000015066 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ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183208.B.f.a ENSGT00390000014526 ENSGT00390000018292.c ENSGT00950000182832.A ENSGT00940000161032 ENSGT00940000157457 ENSGT00940000165637 ENSGT00940000161529.v ENSGT00940000165065.b ENSGT00940000158354.c.a ENSGT00940000159503 ENSGT00390000017856.b ENSGT00950000183098.a.b ENSGT00390000016335.h ENSGT00940000166248.a ENSGT00940000162682.B.a #22 ENSGT01060000253506 ENSGT00940000161341.a.a ENSGT00940000163612 ENSGT00390000014900.b.b.b ENSGT00940000154018.a ENSGT00940000158142 ENSGT00940000155510 ENSGT00390000004836 ENSGT00960000186809 ENSGT00940000159664 ENSGT00940000156819.a.b ENSGT00390000005895 ENSGT00530000063301.a.a.c.a ENSGT00390000008812.b.b.a ENSGT00940000157411 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00390000018292.c.b ENSGT00950000182832.A.g ENSGT00940000161032.e ENSGT00940000157457.c ENSGT00940000165637.d ENSGT00940000161529.v.b ENSGT00940000165065.b.b ENSGT00940000158354.c.a.a.a ENSGT00940000159503.j ENSGT00390000017856.b.a ENSGT00950000183098.a.b.a 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Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 152 ENSGT00390000005830 ENSGT01100000263525.a.b.a.b.a ENSGT00940000160377 ENSGT00390000010157.b ENSGT00390000018541 ENSGT00940000159428.e.b ENSGT00730000111057.c ENSGT01030000235061.d ENSGT00940000157598 ENSGT00940000157195.m ENSGT01060000249533 ENSGT00940000159384 ENSGT00940000166194 ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000165079.b ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00390000005666 ENSGT00940000157513 ENSGT00940000159039.a ENSGT00390000004169 ENSGT00950000182961.a.a.d ENSGT00950000182983.A.a.a.a ENSGT01030000234586.B.a.a.b Electric eel MODERN SPECIES 131 ENSEEEG00000020991 ENSEEEG00000020992 nmrk1 (ENSEEEG00000020994) zgc:163143 (ENSEEEG00000020996) ENSEEEG00000020998 dlx4a (ENSEEEG00000021001) dusp3b (ENSEEEG00000021007) #22 DNAAF5 (ENSEEEG00000021009) prkar1b (ENSEEEG00000021011) pdgfab (ENSEEEG00000021013) ccdc137 (ENSEEEG00000021015) BTBD17 (ENSEEEG00000021016) KCNJ2 (ENSEEEG00000021017) zp3f.2 (ENSEEEG00000021020) cyp2k19 (ENSEEEG00000021031) ABCA3 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ENSGT00940000173491 ENSGT00940000163460.a.a.b ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000177241.e ENSGT00940000174883 ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000155311.A.a Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000163460.a.a.b ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000174883 ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 European seabass MODERN SPECIES 21 carhsp1 (ENSDLAG00005018917) nat15 (ENSDLAG00005018922) 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(ENSSAUG00010026054) PSMD11 (ENSSAUG00010026051) DLX3 (ENSSAUG00010026049) ENSSAUG00010026048 nags (ENSSAUG00010026047) ENSSAUG00010026046 ENSSAUG00010026045 coa3b (ENSSAUG00010026043) col1a1a (ENSSAUG00010019190) ENSSAUG00010018971 pex12 (ENSSAUG00010018968) HDAC5 (ENSSAUG00010017838) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.b.a.b ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 ENSGT00940000160534 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000000022.a ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00390000006679.b ENSGT00940000173491 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.b.a.b ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 ENSGT00940000160534 ENSGT00950000183197.a Pike perch MODERN SPECIES 186 ppm1f (ENSSLUG00000019793) ENSSLUG00000017966 ENSSLUG00000017855 prl (ENSSLUG00000017842) dusp3b (ENSSLUG00000017833) #22 thraa (ENSSLUG00000017093) nsfa (ENSSLUG00000015251) CDK5R1 (ENSSLUG00000015146) JUP (ENSSLUG00000011733) rbfox1 (ENSSLUG00000011578) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000005584 ENSGT00390000005605 ENSGT00940000154819.a.b.c.a ENSGT00940000156887.a ENSGT00530000063000.a.a.b.i ENSGT00940000157700.d ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000161195.a.a ENSGT00940000160152 ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000155510 ENSGT00940000157917.b ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00940000164506.b.b ENSGT00940000160257 ENSGT00940000167287 ENSGT00940000160315 ENSGT00940000157552.s.b ENSGT00390000016298.a ENSGT00390000000053.b ENSGT00940000159680 ENSGT01010000222313.A.b.a.c ENSGT00940000158145.b ENSGT00940000169385 Stickleback MODERN SPECIES 10 spc24 (ENSGACG00000006733) kri1 (ENSGACG00000006712) ldlra (ENSGACG00000006705) smarca4a (ENSGACG00000006691) ENSGACG00000006688 MAST1 (ENSGACG00000006669) rtbdn (ENSGACG00000006658) junbb (ENSGACG00000006654) hook2 (ENSGACG00000006640) syt5a (ENSGACG00000006630) tnnt1 (ENSGACG00000006626) pih1d1 (ENSGACG00000006615) ENSGACG00000006606 ENSGACG00000006598 prl (ENSGACG00000006561) dusp3b (ENSGACG00000006555) #22 ENSGACG00000006554 thraa (ENSGACG00000006540) nsfa (ENSGACG00000006514) CDK5R1 (ENSGACG00000006504) tspan35 (ENSGACG00000006494) ZNF653 (ENSGACG00000006483) swsap1 (ENSGACG00000006482) epor (ENSGACG00000006477) rab3db (ENSGACG00000006453) tmem205 (ENSGACG00000006448) elof1 (ENSGACG00000006444) CNN1 (ENSGACG00000006412) plppr2a (ENSGACG00000006409) ENSGACG00000006406 ENSGACG00000006401 Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.b #22 Carangaria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162682.B.b #22 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f 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ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000004690.a.a ENSGT00940000166711 ENSGT00390000003628.a.b ENSGT00940000164286.j.b.a.a.a ENSGT00940000163871.b ENSGT00940000155348.B.c ENSGT00940000160643.i ENSGT00940000168246 ENSGT01030000234785 Greater amberjack MODERN SPECIES 50 dnase1 (ENSSDUG00000007677) eci1 (ENSSDUG00000007662) ENSSDUG00000007480 ENSSDUG00000007430 ENSSDUG00000007417 ENSSDUG00000007362 aldh16a1 (ENSSDUG00000007340) fthl31 (ENSSDUG00000007323) syt5a (ENSSDUG00000007236) tnnt1 (ENSSDUG00000007148) pih1d1 (ENSSDUG00000007123) ENSSDUG00000007071 ENSSDUG00000007024 si:dkey-16p21.8 (ENSSDUG00000007015) prl (ENSSDUG00000006996) dusp3b (ENSSDUG00000006978) #22 thraa (ENSSDUG00000006951) nsfa (ENSSDUG00000006845) cdk5r1a (ENSSDUG00000006827) rpain (ENSSDUG00000006821) PSMD11 (ENSSDUG00000006787) DLX3 (ENSSDUG00000006765) ENSSDUG00000006757 ENSSDUG00000006740 rpl23 (ENSSDUG00000006698) ENSSDUG00000006658 smarce1 (ENSSDUG00000006627) ENSSDUG00000006614 ENSSDUG00000006592 mpp2a (ENSSDUG00000006569) pyya (ENSSDUG00000006560) Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2955 dnase1 (ENSSLDG00000016089) eci1 (ENSSLDG00000016059) ENSSLDG00000015999 ENSSLDG00000015890 ENSSLDG00000015877 ENSSLDG00000015812 aldh16a1 (ENSSLDG00000015707) fthl31 (ENSSLDG00000015658) syt5a (ENSSLDG00000015628) tnnt1 (ENSSLDG00000015604) pih1d1 (ENSSLDG00000015582) ENSSLDG00000015534 ENSSLDG00000015474 si:dkey-16p21.8 (ENSSLDG00000015459) prl (ENSSLDG00000014273) dusp3b (ENSSLDG00000013974) #22 thraa (ENSSLDG00000013953) nsfa (ENSSLDG00000013833) cdk5r1a (ENSSLDG00000013777) rpain (ENSSLDG00000013756) PSMD11 (ENSSLDG00000013717) DLX3 (ENSSLDG00000013683) ENSSLDG00000013663 ENSSLDG00000013653 ENSSLDG00000013635 rpl23 (ENSSLDG00000013573) ENSSLDG00000013555 smarce1 (ENSSLDG00000013531) ENSSLDG00000013513 ENSSLDG00000013486 mpp2a (ENSSLDG00000013449) Barramundi perch MODERN SPECIES 435 ENSLCAG00010018294 ENSLCAG00010018168 prl (ENSLCAG00010018133) dusp3b (ENSLCAG00010018132) #22 thraa 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ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT01100000263513.a.a.b.b.b.b.b.a.b.b ENSGT00390000006679.b.n ENSGT00940000173491 ENSGT00940000177154 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164625.o.a ENSGT00940000155311.A.a ENSGT00390000016209 Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 117 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A.s ENSGT00950000182818.A.t ENSGT00940000162682.B.b #22 Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00950000182818.A.t ENSGT00940000162682.B.b #22 Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00530000064157.b ENSGT00390000012078.a.b ENSGT00950000182916.a.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00390000013719 ENSGT00950000182917.a.b.b ENSGT00950000182841.a.o.a.c.a ENSGT01060000248575.D.c.b.b.a.l ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 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ENSACIG00000011959 ENSACIG00000011943 ENSACIG00000011901 si:dkey-16p21.8 (ENSACIG00000011894) prl (ENSACIG00000011586) prl (ENSACIG00000011341) dusp3b (ENSACIG00000011305) #22 ENSACIG00000011295 KLHL10 (ENSACIG00000011276) thraa (ENSACIG00000011258) nsfa (ENSACIG00000011229) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00390000008314 ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a.p ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00530000064085.d ENSGT00390000008812.b.b.b ENSGT00390000006416 ENSGT00530000063301.a.a.c.b ENSGT00940000158951.f ENSGT00940000165079.b ENSGT00390000005602 ENSGT00940000173491 ENSGT00940000163460.a.a.b ENSGT00940000168246 ENSGT00940000160643.i ENSGT00940000155348.B.c ENSGT00940000163871.b ENSGT00390000003628.a.b 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Sheepshead minnow MODERN SPECIES 1971 ENSCVAG00000002443 dusp3b (ENSCVAG00000002437) #22 Oryzias ANCESTRAL SPECIES ENSGT00950000182846.b ENSGT00390000005678 ENSGT01100000263484.C.b.b ENSGT00650000094974.a ENSGT00940000157744.c ENSGT00940000161135 ENSGT00950000182841.a.p.c ENSGT00950000182841.a.p.d ENSGT00940000166981 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000156447.a.b ENSGT00950000183197.a ENSGT00940000160534 ENSGT00390000016209 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000161386 ENSGT00940000161529 ENSGT00940000165065.a ENSGT00940000158354.c.b ENSGT00940000162072 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000160609.f ENSGT00510000048192 ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.a ENSGT00940000164511.C ENSGT00980000198607 ENSGT00950000182818.A ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157742.a.h.b.d.a ENSGT00940000156447.a.b ENSGT00950000183197.a ENSGT00940000160534 ENSGT00390000016209 ENSGT00940000174909 ENSGT00940000156584.e.b ENSGT00940000164903.b ENSGT00940000159091 ENSGT00940000157981.a.b ENSGT00940000167564 ENSGT00940000159029 ENSGT00940000161386 ENSGT00940000161529 ENSGT00940000165065.a Indian medaka MODERN SPECIES 9 epor (ENSOMEG00000010366) swsap1 (ENSOMEG00000010382) ZNF653 (ENSOMEG00000010400) tspan35 (ENSOMEG00000010413) ENSOMEG00000010427 zgc:158403 (ENSOMEG00000010538) nfixb (ENSOMEG00000010862) rad23aa (ENSOMEG00000010957) gng13b (ENSOMEG00000010977) ENSOMEG00000010985 ENSOMEG00000011000 ENSOMEG00000011077 ENSOMEG00000011186 si:dkey-16p21.8 (ENSOMEG00000011207) prl (ENSOMEG00000011227) dusp3b (ENSOMEG00000011244) #22 thraa (ENSOMEG00000011291) ENSOMEG00000011319 TANC2 (ENSOMEG00000011411) cyb561 (ENSOMEG00000011454) HDAC5 (ENSOMEG00000011665) pex12 (ENSOMEG00000011719) ENSOMEG00000011759 eve1 (ENSOMEG00000011771) hoxb13a 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ENSOMYG00000063379 ENSOMYG00000053810 ENSOMYG00000051375 ENSOMYG00000046708 ENSOMYG00000046701 ENSOMYG00000046697 ENSOMYG00000046695 ENSOMYG00000046626 ENSOMYG00000046565 ENSOMYG00000046560 ENSOMYG00000057237 mapk8ip3 (ENSOMYG00000046505) Salmo ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00940000166981.e.a ENSGT00940000160609.f.e ENSGT00940000164511.C.k.b.b ENSGT00950000182818.A.o.a ENSGT00940000162682.B.b #22 ENSGT00940000157917.a.a.b.b ENSGT00530000064085.d.b ENSGT00390000008812.b.b.b.b ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b ENSGT00940000158951.f.c ENSGT00940000165079.b.b ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b ENSGT00940000159252.b.b.b ENSGT00940000160492.f ENSGT00950000183143.c.b.m ENSGT00390000002810.l ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b ENSGT01030000234629.E.a.b.c ENSGT00940000153496.a.a.r.a ENSGT00390000007652.c Atlantic salmon MODERN SPECIES 15 ENSSSAG00000031377 ENSSSAG00000015328 ENSSSAG00000065652 ENSSSAG00000034084 ENSSSAG00000031162 ENSSSAG00000088009 #22 ENSSSAG00000057762 ENSSSAG00000102800 ENSSSAG00000041588 ENSSSAG00000083996 ENSSSAG00000120584 ENSSSAG00000082098 HEBP2 (ENSSSAG00000045682) ENSSSAG00000045730 ENSSSAG00000045889 ENSSSAG00000052647 ENSSSAG00000102969 ENSSSAG00000106267 ENSSSAG00000095306 ENSSSAG00000114586 mapk8ip3 (ENSSSAG00000053437) River trout MODERN SPECIES 33 C4orf54 (ENSSTUG00000021705) mttp (ENSSTUG00000021829) ENSSTUG00000023319 tspan5b (ENSSTUG00000023336) rps6 (ENSSTUG00000023472) ENSSTUG00000023560 dnaja1 (ENSSTUG00000023788) ENSSTUG00000023848 ENSSTUG00000023852 ENSSTUG00000023865 syt5a (ENSSTUG00000023918) tnnt1 (ENSSTUG00000023957) ENSSTUG00000024016 ENSSTUG00000024119 prl (ENSSTUG00000025286) dusp3b (ENSSTUG00000025300) #22 THRA (ENSSTUG00000025312) nsfa (ENSSTUG00000025460) cdk5r1a (ENSSTUG00000027621) PSMD11 (ENSSTUG00000027628) DLX3 (ENSSTUG00000027720) dlx4a (ENSSTUG00000027729) ENSSTUG00000027742 ENSSTUG00000027796 ENSSTUG00000027813 SEZ6L2 (ENSSTUG00000027824) kctd13 (ENSSTUG00000027924) xpo6 (ENSSTUG00000027955) ENSSTUG00000029153 ATP6V0C 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