Protacanthopterygii	ANCESTRAL SPECIES	54	ENSGT00930000151196.a.b	ENSGT00940000161121	ENSGT01050000244900.a.b.f.b	ENSGT00940000167425	ENSGT00940000164717.a	ENSGT00940000164903.a.e	ENSGT00940000167839	ENSGT00940000165368	ENSGT00940000167630	ENSGT00940000166481	ENSGT00390000002069	ENSGT00940000160609.e	ENSGT01060000248595.b.a.b.b.a.b	ENSGT00940000164511.C #19	ENSGT00950000182818.A #21	ENSGT00940000162682.B.b #22	ENSGT00940000157917.a.a.b #24	ENSGT00530000064085.d #25	ENSGT00390000008812.b.b.b #26	ENSGT00530000063301.a.a.c.b #29	ENSGT00940000158951.f #30	ENSGT00940000165079.b #31	ENSGT00940000159275.b	ENSGT00940000154664.h.j
Salmoninae	ANCESTRAL SPECIES	767														ENSGT00940000164511.C.k.b.b #19	ENSGT00950000182818.A.o #21	ENSGT00940000162682.B.b #22	ENSGT00940000157917.a.a.b.b #24	ENSGT00530000064085.d.b #25	ENSGT00390000008812.b.b.b.b #26	ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b #29	ENSGT00940000158951.f.c #30	ENSGT00940000165079.b.b #31	ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b #32
Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	120											ENSGT00950000182841.a.m.b	ENSGT00940000166981.e.a #18	ENSGT00940000160609.f.e	ENSGT00940000164511.C.k.b.b #19	ENSGT00950000182818.A.o.a ##21	ENSGT00940000162682.B.b #22	ENSGT00940000157917.a.a.b.b #24	ENSGT00530000064085.d.b #25	ENSGT00390000008812.b.b.b.b #26	ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b #29	ENSGT00940000158951.f.c #30	ENSGT00940000165079.b.b #31	ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b #32	ENSGT00940000159252.b.b.b	ENSGT00940000160492.f #33	ENSGT00950000183143.c.b.m	ENSGT00390000002810.l	ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b #34	ENSGT01030000234629.E.a.b.c #35	ENSGT00940000153496.a.a.r.b.a #37	ENSGT00940000153496.a.a.r.a ##37
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES												ENSGT00950000182841.a.m.b	ENSGT00940000166981.e.a #18	ENSGT00940000164511.C.k.b.b #19	ENSGT00950000182818.A.o.a ##21	ENSGT00950000182818.A.o.b #21	ENSGT00940000162682.B.b #22	ENSGT00940000157917.a.a.b.b #24	ENSGT00530000064085.d.b #25	ENSGT00390000008812.b.b.b.b #26	ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b #29	ENSGT00940000158951.f.c #30	ENSGT00940000165079.b.b #31	ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b #32	ENSGT00940000160492.f #33	ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b #34	ENSGT01030000234629.E.a.b.c #35	ENSGT00940000153496.a.a.r.b.a #37	ENSGT00390000007652.c	ENSGT00390000003337.f.b	ENSGT00390000006617.f	ENSGT00940000158837.g.b.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	22												ENSOMYG00000021406 #18	ENSOMYG00000046940 #19	ENSOMYG00000071216 #20	ENSOMYG00000046921 #21	ENSOMYG00000046919 #22	ENSOMYG00000053599 #23	ENSOMYG00000046850 #24	ENSOMYG00000046756 #25	ENSOMYG00000063379 #26	ENSOMYG00000053810 #27	ENSOMYG00000051375 #28	ENSOMYG00000046708 #29	ENSOMYG00000046701 #30	ENSOMYG00000046697 #31	ENSOMYG00000046695 #32	ENSOMYG00000046626 #33	ENSOMYG00000046565 #34	ENSOMYG00000046560 #35	ENSOMYG00000057237 #36	mapk8ip3 (ENSOMYG00000046505) #37
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES												ENSGT00950000182841.a.m.b	ENSGT00940000166981.e.a #18	ENSGT00940000160609.f.e	ENSGT00940000164511.C.k.b.b #19	ENSGT00950000182818.A.o.a ##21	ENSGT00940000162682.B.b #22	ENSGT00940000157917.a.a.b.b #24	ENSGT00530000064085.d.b #25	ENSGT00390000008812.b.b.b.b #26	ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b #29	ENSGT00940000158951.f.c #30	ENSGT00940000165079.b.b #31	ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b #32	ENSGT00940000160492.f #33	ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b #34	ENSGT01030000234629.E.a.b.c #35	ENSGT00940000153496.a.a.r.b.a #37	ENSGT00390000007652.c	ENSGT00390000003337.f.b	ENSGT00390000006617.f	ENSGT00940000158837.g.b.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES		ENSOTSG00005010771	WDFY4 (ENSOTSG00005010761)	vstm4a (ENSOTSG00005010759)	drgx (ENSOTSG00005010758)	ENSOTSG00005010757	sprn (ENSOTSG00005010756)	ENSOTSG00005010755	ENSOTSG00005010754	SRF (ENSOTSG00005010753)	ENSOTSG00005010751	ENSOTSG00005010749	syt5a (ENSOTSG00005010748) #18	tnnt1 (ENSOTSG00005010747)	ENSOTSG00005010733 #19	prl2 (ENSOTSG00005010731) ##21	dusp3b (ENSOTSG00005010730) #22	THRA (ENSOTSG00005009816) #24	nsfa (ENSOTSG00005009601) #25	cdk5r1a (ENSOTSG00005009599) #26	PSMD11 (ENSOTSG00005009598) #29	DLX3 (ENSOTSG00005009596) #30	dlx4a (ENSOTSG00005009595) #31	ENSOTSG00005009594 #32	SEZ6L2 (ENSOTSG00005009418) #33	ATP6V0C (ENSOTSG00005009413) #34	spsb3a (ENSOTSG00005009412) #35	mapk8ip3 (ENSOTSG00005009375) #37	CRAMP1 (ENSOTSG00005009373)	tmem11 (ENSOTSG00005009371)	ENSOTSG00005009357	ENSOTSG00005009356
Coho salmon	MODERN SPECIES	1	COLGALT1 (ENSOKIG00005035949)	ENSOKIG00005035844	ENSOKIG00005035795	atp13a1 (ENSOKIG00005035082)	pbx4 (ENSOKIG00005034919)	ENSOKIG00005034731	ENSOKIG00005034693	STXBP2 (ENSOKIG00005034430)	ENSOKIG00005034389	XAB2 (ENSOKIG00005033079)	ENSOKIG00005032994 #18	ENSOKIG00005032824	ENSOKIG00005032481 #19	ENSOKIG00005032442	ENSOKIG00005032418 #21	dusp3b (ENSOKIG00005032411) #22	THRA (ENSOKIG00005032167) #24	NSF (ENSOKIG00005030932) #25	CDK5R1 (ENSOKIG00005030823) #26	PSMD11 (ENSOKIG00005030783) #29	DLX3 (ENSOKIG00005030773) #30	ENSOKIG00005030742 #31	ENSOKIG00005030686 #32	SEZ6L2 (ENSOKIG00005030576) #33	SPSB3 (ENSOKIG00005030546) #35	mapk8ip3 (ENSOKIG00005029868) #37	ENSOKIG00005029815 #34	jpt2 (ENSOKIG00005029781)	CRAMP1 (ENSOKIG00005029739)	tmem11 (ENSOKIG00005029724)	ENSOKIG00005029359
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	64												ENSGT00940000166981.e.a #18	ENSGT00940000160609.f.e	ENSGT00940000164511.C.k.b.b #19	ENSGT00950000182818.A.o.a ##21	ENSGT00940000162682.B.b #22	ENSGT00940000157917.a.a.b.b #24	ENSGT00530000064085.d.b #25	ENSGT00390000008812.b.b.b.b #26	ENSGT00530000063301.a.a.c.b.a.b #29	ENSGT00940000158951.f.c #30	ENSGT00940000165079.b.b #31	ENSGT00940000163377.a.b.b.a.b #32	ENSGT00940000159252.b.b.b	ENSGT00940000160492.f #33	ENSGT00950000183143.c.b.m	ENSGT00390000002810.l	ENSGT00550000074873.ob.a.a.b.b #34	ENSGT01030000234629.E.a.b.c #35	ENSGT00940000153496.a.a.r.a ##37	ENSGT00390000007652.c
Atlantic salmon	MODERN SPECIES	15											ENSSSAG00000031377 #18	ENSSSAG00000015328	ENSSSAG00000065652	ENSSSAG00000034084 #19	ENSSSAG00000031162 ##21	ENSSSAG00000088009 #22	ENSSSAG00000057762 #24	ENSSSAG00000102800	ENSSSAG00000041588 #25	ENSSSAG00000083996 #26	ENSSSAG00000120584 #29	ENSSSAG00000082098 #30	HEBP2 (ENSSSAG00000045682) #32	ENSSSAG00000045730	ENSSSAG00000045889 #33	ENSSSAG00000052647	ENSSSAG00000102969	ENSSSAG00000106267	ENSSSAG00000095306 #34	ENSSSAG00000114586 #35	mapk8ip3 (ENSSSAG00000053437) ##37
River trout	MODERN SPECIES	33	C4orf54 (ENSSTUG00000021705)	mttp (ENSSTUG00000021829)	ENSSTUG00000023319	tspan5b (ENSSTUG00000023336)	rps6 (ENSSTUG00000023472)	ENSSTUG00000023560	dnaja1 (ENSSTUG00000023788)	ENSSTUG00000023848	ENSSTUG00000023852	ENSSTUG00000023865	syt5a (ENSSTUG00000023918) #18	tnnt1 (ENSSTUG00000023957)	ENSSTUG00000024016	ENSSTUG00000024119 #19	prl (ENSSTUG00000025286) ##21	dusp3b (ENSSTUG00000025300) #22	THRA (ENSSTUG00000025312) #24	nsfa (ENSSTUG00000025460) #25	cdk5r1a (ENSSTUG00000027621) #26	PSMD11 (ENSSTUG00000027628) #29	DLX3 (ENSSTUG00000027720) #30	dlx4a (ENSSTUG00000027729) #31	ENSSTUG00000027742 #32	ENSSTUG00000027796	ENSSTUG00000027813	SEZ6L2 (ENSSTUG00000027824) #33	kctd13 (ENSSTUG00000027924)	xpo6 (ENSSTUG00000027955)	ENSSTUG00000029153	ATP6V0C (ENSSTUG00000029160) #34	spsb3a (ENSSTUG00000029182) #35
Huchen	MODERN SPECIES	148	ENSHHUG00000035952	ENSHHUG00000035967	cdipt (ENSHHUG00000035972)	ENSHHUG00000035986	ENSHHUG00000036192	ENSHHUG00000036197	aldh16a1 (ENSHHUG00000036204)	ENSHHUG00000036222	syt5a (ENSHHUG00000036574) #18	tnnt1 (ENSHHUG00000036584)	ENSHHUG00000036592	ENSHHUG00000036645	ENSHHUG00000036652 #19	ENSHHUG00000036765	prl (ENSHHUG00000036766) #21	dusp3b (ENSHHUG00000036821) #22	THRA (ENSHHUG00000036832) ##24