Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 49 ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182808.a.a.a.b ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652 ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 245 ENSGT00940000159954 #11 ENSGT00940000155150.a ENSGT00940000155279.C #13 ENSGT00940000154949.b #14 ENSGT00940000162335 #16 ENSGT00940000159753 #18 ENSGT00940000154589.b #19 ENSGT00390000002219 #20 ENSGT00940000154340.A #21 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000156946 #23 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627 #26 ENSGT01100000263524.I #27 ENSGT00730000111223 #28 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000165985 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652 ENSGT00940000159831 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652 ENSGT00940000159831 Amniota ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Theria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Glires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Murinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Mus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Mus_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 spretus DUPLICATION spretus MODERN SPECIES 12 MGP_SPRETEiJ_G0026559 #7 MGP_SPRETEiJ_G0026560 #8 Ndst4 (MGP_SPRETEiJ_G0026561) #9 Ugt8a (MGP_SPRETEiJ_G0026562) #10 Arsj (MGP_SPRETEiJ_G0026563) #11 Camk2d (MGP_SPRETEiJ_G0026564) #12 MGP_SPRETEiJ_G0026565 #13 MGP_SPRETEiJ_G0026566 #14 MGP_SPRETEiJ_G0026567 #15 Zgrf1 (MGP_SPRETEiJ_G0026568) #16 Neurog2 (MGP_SPRETEiJ_G0026569) #17 Alpk1 (MGP_SPRETEiJ_G0026570) #18 Tifa (MGP_SPRETEiJ_G0026571) #19 Ap1ar (MGP_SPRETEiJ_G0026572) #20 Fam241a (MGP_SPRETEiJ_G0026573) #21 Pitx2 (MGP_SPRETEiJ_G0026574) #22 Enpep (MGP_SPRETEiJ_G0026575) #23 Elovl6 (MGP_SPRETEiJ_G0026576) #24 Egf (MGP_SPRETEiJ_G0026577) #25 Lrit3 (MGP_SPRETEiJ_G0026578) #26 Rrh (MGP_SPRETEiJ_G0026579) #27 Gar1 (MGP_SPRETEiJ_G0026580) #28 MGP_SPRETEiJ_G0026581 #29 Pla2g12a (MGP_SPRETEiJ_G0026582) #30 Casp6 (MGP_SPRETEiJ_G0026583) #31 Mcub (MGP_SPRETEiJ_G0026584) #32 Sec24b (MGP_SPRETEiJ_G0026585) #33 Col25a1 (MGP_SPRETEiJ_G0026586) #34 Etnppl (MGP_SPRETEiJ_G0026587) #35 Ostc (MGP_SPRETEiJ_G0026588) #36 Rpl34 (MGP_SPRETEiJ_G0026589) #37 spretus MODERN SPECIES 4 Hnrnpa0 (MGP_SPRETEiJ_G0019473) Klhl3 (MGP_SPRETEiJ_G0019472) Spock1 (MGP_SPRETEiJ_G0019471) Trpc7 (MGP_SPRETEiJ_G0019470) Smad5 (MGP_SPRETEiJ_G0019469) Tgfbi (MGP_SPRETEiJ_G0019468) Lect2 (MGP_SPRETEiJ_G0019467) Fbxl21 (MGP_SPRETEiJ_G0019466) Il9 (MGP_SPRETEiJ_G0019465) Slc25a48 (MGP_SPRETEiJ_G0019464) MGP_SPRETEiJ_G0019463 Cxcl14 (MGP_SPRETEiJ_G0019462) Neurog1 (MGP_SPRETEiJ_G0019461) Tifab (MGP_SPRETEiJ_G0019460) ##19 Macroh2a1 (MGP_SPRETEiJ_G0019459) Pitx1 (MGP_SPRETEiJ_G0019458) ##22 Catsper3 (MGP_SPRETEiJ_G0019457) Pcbd2 (MGP_SPRETEiJ_G0019456) Txndc15 (MGP_SPRETEiJ_G0019455) MGP_SPRETEiJ_G0019454 Ddx46 (MGP_SPRETEiJ_G0019453) Caml (MGP_SPRETEiJ_G0019452) B4galt7 (MGP_SPRETEiJ_G0019451) Tmed9 (MGP_SPRETEiJ_G0019450) Fam193b (MGP_SPRETEiJ_G0019449) Ddx41 (MGP_SPRETEiJ_G0019448) Dok3 (MGP_SPRETEiJ_G0019447) Pdlim7 (MGP_SPRETEiJ_G0019446) Dbn1 (MGP_SPRETEiJ_G0019445) Prr7 (MGP_SPRETEiJ_G0019444) Grk6 (MGP_SPRETEiJ_G0019443) Steppe mouse MODERN SPECIES 3363 Trpc7 (ENSMSIG00000019854) Smim32 (ENSMSIG00000019832) Smad5 (ENSMSIG00000019822) Tgfbi (ENSMSIG00000019777) ENSMSIG00000019771 Lect2 (ENSMSIG00000019756) Fbxl21 (ENSMSIG00000019691) Il9 (ENSMSIG00000019669) Slc25a48 (ENSMSIG00000019652) ENSMSIG00000019638 Cxcl14 (ENSMSIG00000019603) Neurog1 (ENSMSIG00000019595) ENSMSIG00000019581 Tifab (ENSMSIG00000019578) ##19 Macroh2a1 (ENSMSIG00000019507) Pitx1 (ENSMSIG00000019484) #22 Catsper3 (ENSMSIG00000019447) ENSMSIG00000019438 ENSMSIG00000019428 Pcbd2 (ENSMSIG00000019409) Txndc15 (ENSMSIG00000019395) B230219D22Rik (ENSMSIG00000019391) Ddx46 (ENSMSIG00000019031) Caml (ENSMSIG00000019011) B4galt7 (ENSMSIG00000018964) ENSMSIG00000018954 Tmed9 (ENSMSIG00000018897) Fam193b (ENSMSIG00000018874) Ddx41 (ENSMSIG00000018747) Dok3 (ENSMSIG00000018717) Pdlim7 (ENSMSIG00000018669) Mouse DUPLICATION Mouse MODERN SPECIES 12 Tram1l1 (ENSMUSG00000044528) 1700006A11Rik (ENSMUSG00000027973) 1700003H04Rik (ENSMUSG00000039174) #8 Ndst4 (ENSMUSG00000027971) #9 Ugt8a (ENSMUSG00000032854) #10 Arsj (ENSMUSG00000046561) #11 Camk2d (ENSMUSG00000053819) #12 Ank2 (ENSMUSG00000032826) #13 Larp7 (ENSMUSG00000027968) #14 Zgrf1 (ENSMUSG00000051278) #16 Neurog2 (ENSMUSG00000027967) #17 Alpk1 (ENSMUSG00000028028) #18 Tifa (ENSMUSG00000046688) #19 Ap1ar (ENSMUSG00000074238) #20 Fam241a (ENSMUSG00000050549) #21 Pitx2 (ENSMUSG00000028023) #22 Enpep (ENSMUSG00000028024) #23 Elovl6 (ENSMUSG00000041220) #24 Egf (ENSMUSG00000028017) #25 Lrit3 (ENSMUSG00000093865) #26 Rrh (ENSMUSG00000028012) #27 Gar1 (ENSMUSG00000028010) #28 Cfi (ENSMUSG00000058952) #29 Pla2g12a (ENSMUSG00000027999) #30 Casp6 (ENSMUSG00000027997) #31 Mcub (ENSMUSG00000027994) #32 Sec24b (ENSMUSG00000001052) #33 Col25a1 (ENSMUSG00000058897) #34 Etnppl (ENSMUSG00000019232) #35 Ostc (ENSMUSG00000041084) #36 Rpl34 (ENSMUSG00000062006) #37 Mouse MODERN SPECIES 4 Hnrnpa0 (ENSMUSG00000007836) Klhl3 (ENSMUSG00000014164) Spock1 (ENSMUSG00000056222) Trpc7 (ENSMUSG00000021541) Smim32 (ENSMUSG00000110086) Smad5 (ENSMUSG00000021540) Tgfbi (ENSMUSG00000035493) Lect2 (ENSMUSG00000021539) Fbxl21 (ENSMUSG00000035509) Il9 (ENSMUSG00000021538) Slc25a48 (ENSMUSG00000021509) Cxcl14 (ENSMUSG00000021508) Neurog1 (ENSMUSG00000048904) Tifab (ENSMUSG00000049625) ##19 Macroh2a1 (ENSMUSG00000015937) Pitx1 (ENSMUSG00000021506) #22 Catsper3 (ENSMUSG00000021499) Pcbd2 (ENSMUSG00000021496) Txndc15 (ENSMUSG00000021497) B230219D22Rik (ENSMUSG00000045767) Ddx46 (ENSMUSG00000021500) Caml (ENSMUSG00000021501) B4galt7 (ENSMUSG00000021504) Tmed9 (ENSMUSG00000058569) Fam193b (ENSMUSG00000021495) Ddx41 (ENSMUSG00000021494) Dok3 (ENSMUSG00000035711) Pdlim7 (ENSMUSG00000021493) Dbn1 (ENSMUSG00000034675) Prr7 (ENSMUSG00000034686) Grk6 (ENSMUSG00000074886) Ryukyu mouse DUPLICATION Ryukyu mouse MODERN SPECIES 12 1700006A11Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0025606) MGP_CAROLIEiJ_G0025607 #8 Ndst4 (MGP_CAROLIEiJ_G0025608) #9 Ugt8a (MGP_CAROLIEiJ_G0025609) #10 Arsj (MGP_CAROLIEiJ_G0025610) #11 Camk2d (MGP_CAROLIEiJ_G0025611) #12 MGP_CAROLIEiJ_G0025612 #13 MGP_CAROLIEiJ_G0025613 #14 MGP_CAROLIEiJ_G0025614 #15 Zgrf1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025615) #16 Neurog2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025616) #17 Alpk1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025617) #18 Tifa (MGP_CAROLIEiJ_G0025618) #19 Ap1ar (MGP_CAROLIEiJ_G0025619) #20 Fam241a (MGP_CAROLIEiJ_G0025620) #21 Pitx2 (MGP_CAROLIEiJ_G0025621) #22 Enpep (MGP_CAROLIEiJ_G0025622) #23 Elovl6 (MGP_CAROLIEiJ_G0025623) #24 Egf (MGP_CAROLIEiJ_G0025624) #25 Lrit3 (MGP_CAROLIEiJ_G0025625) #26 Rrh (MGP_CAROLIEiJ_G0025626) #27 Gar1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025627) #28 Cfi (MGP_CAROLIEiJ_G0025628) #29 Pla2g12a (MGP_CAROLIEiJ_G0025629) #30 Casp6 (MGP_CAROLIEiJ_G0025630) #31 Mcub (MGP_CAROLIEiJ_G0025631) #32 Sec24b (MGP_CAROLIEiJ_G0025632) #33 Col25a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0025633) #34 Etnppl (MGP_CAROLIEiJ_G0025634) #35 Ostc (MGP_CAROLIEiJ_G0025635) #36 Rpl34 (MGP_CAROLIEiJ_G0025636) #37 Ryukyu mouse MODERN SPECIES 4 Hnrnpa0 (MGP_CAROLIEiJ_G0018593) Klhl3 (MGP_CAROLIEiJ_G0018592) Spock1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018591) Trpc7 (MGP_CAROLIEiJ_G0018590) Smad5 (MGP_CAROLIEiJ_G0018589) Tgfbi (MGP_CAROLIEiJ_G0018588) Lect2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018587) Fbxl21 (MGP_CAROLIEiJ_G0018586) Il9 (MGP_CAROLIEiJ_G0018585) Slc25a48 (MGP_CAROLIEiJ_G0018584) MGP_CAROLIEiJ_G0018583 Cxcl14 (MGP_CAROLIEiJ_G0018582) Neurog1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018581) Tifab (MGP_CAROLIEiJ_G0018580) ##19 Macroh2a1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018579) Pitx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018578) #22 Catsper3 (MGP_CAROLIEiJ_G0018577) Pcbd2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018576) Txndc15 (MGP_CAROLIEiJ_G0018575) B230219D22Rik (MGP_CAROLIEiJ_G0018574) Ddx46 (MGP_CAROLIEiJ_G0018573) Caml (MGP_CAROLIEiJ_G0018572) B4galt7 (MGP_CAROLIEiJ_G0018571) Tmed9 (MGP_CAROLIEiJ_G0018570) Fam193b (MGP_CAROLIEiJ_G0018569) Ddx41 (MGP_CAROLIEiJ_G0018568) Dok3 (MGP_CAROLIEiJ_G0018567) Pdlim7 (MGP_CAROLIEiJ_G0018566) Dbn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018565) Prr7 (MGP_CAROLIEiJ_G0018564) Grk6 (MGP_CAROLIEiJ_G0018563) Shrew mouse DUPLICATION Shrew mouse MODERN SPECIES 17 MGP_PahariEiJ_G0027053 MGP_PahariEiJ_G0027054 Ndst4 (MGP_PahariEiJ_G0027055) #9 Ugt8a (MGP_PahariEiJ_G0027056) #10 Arsj (MGP_PahariEiJ_G0027057) #11 Camk2d (MGP_PahariEiJ_G0027058) #12 MGP_PahariEiJ_G0027059 #13 MGP_PahariEiJ_G0027060 #14 MGP_PahariEiJ_G0027061 #14 Zgrf1 (MGP_PahariEiJ_G0027062) #16 Neurog2 (MGP_PahariEiJ_G0027063) #17 Alpk1 (MGP_PahariEiJ_G0027064) #18 Tifa (MGP_PahariEiJ_G0027065) #19 Ap1ar (MGP_PahariEiJ_G0027066) #20 Fam241a (MGP_PahariEiJ_G0027067) #21 Pitx2 (MGP_PahariEiJ_G0027068) #22 Enpep (MGP_PahariEiJ_G0027069) #23 MGP_PahariEiJ_G0027070 MGP_PahariEiJ_G0027071 Elovl6 (MGP_PahariEiJ_G0027072) #24 Egf (MGP_PahariEiJ_G0027073) #25 Lrit3 (MGP_PahariEiJ_G0027074) #26 Rrh (MGP_PahariEiJ_G0027075) #27 Gar1 (MGP_PahariEiJ_G0027076) #28 Cfi (MGP_PahariEiJ_G0027077) #29 Pla2g12a (MGP_PahariEiJ_G0027078) #30 Casp6 (MGP_PahariEiJ_G0027079) #31 Mcub (MGP_PahariEiJ_G0027080) #32 Sec24b (MGP_PahariEiJ_G0027081) #33 Col25a1 (MGP_PahariEiJ_G0027082) #34 Etnppl (MGP_PahariEiJ_G0027083) #35 Shrew mouse MODERN SPECIES 7 Idnk (MGP_PahariEiJ_G0019658) Hnrnpa0 (MGP_PahariEiJ_G0019657) Klhl3 (MGP_PahariEiJ_G0019656) Spock1 (MGP_PahariEiJ_G0019655) Trpc7 (MGP_PahariEiJ_G0019654) Smad5 (MGP_PahariEiJ_G0019653) Tgfbi (MGP_PahariEiJ_G0019652) Lect2 (MGP_PahariEiJ_G0019651) Fbxl21 (MGP_PahariEiJ_G0019650) Il9 (MGP_PahariEiJ_G0019649) MGP_PahariEiJ_G0019648 Cxcl14 (MGP_PahariEiJ_G0019647) Neurog1 (MGP_PahariEiJ_G0019646) Tifab (MGP_PahariEiJ_G0019645) ##19 Macroh2a1 (MGP_PahariEiJ_G0019644) Pitx1 (MGP_PahariEiJ_G0019643) #22 Catsper3 (MGP_PahariEiJ_G0019642) Pcbd2 (MGP_PahariEiJ_G0019641) Txndc15 (MGP_PahariEiJ_G0019640) B230219D22Rik (MGP_PahariEiJ_G0019639) Ddx46 (MGP_PahariEiJ_G0019638) Caml (MGP_PahariEiJ_G0019637) B4galt7 (MGP_PahariEiJ_G0019636) Tmed9 (MGP_PahariEiJ_G0019635) Fam193b (MGP_PahariEiJ_G0019634) Ddx41 (MGP_PahariEiJ_G0019633) Dok3 (MGP_PahariEiJ_G0019632) Pdlim7 (MGP_PahariEiJ_G0019631) Dbn1 (MGP_PahariEiJ_G0019630) Prr7 (MGP_PahariEiJ_G0019629) Grk6 (MGP_PahariEiJ_G0019628) Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 11 ENSRNOG00000069122 Ndst4 (ENSRNOG00000009577) #9 Ugt8 (ENSRNOG00000009345) #10 Arsj (ENSRNOG00000000001) #11 Camk2d (ENSRNOG00000011589) #12 Ank2 (ENSRNOG00000011076) #13 ENSRNOG00000062479 Larp7 (ENSRNOG00000048989) #14 Zgrf1 (ENSRNOG00000036980) #16 Neurog2 (ENSRNOG00000010972) #17 Alpk1 (ENSRNOG00000022636) #18 Tifa (ENSRNOG00000010941) #19 Ap1ar (ENSRNOG00000024492) #20 Fam241a (ENSRNOG00000010875) #21 LOC108350287 (ENSRNOG00000062474) Pitx2 (ENSRNOG00000010681) #22 Enpep (ENSRNOG00000051854) #23 Dcm5 (ENSRNOG00000048459) AABR07034008.1 (ENSRNOG00000001601) Elovl6 (ENSRNOG00000048949) #24 Egf (ENSRNOG00000053979) #25 Lrit3 (ENSRNOG00000061097) #26 Rrh (ENSRNOG00000053349) #27 Gar1 (ENSRNOG00000061146) #28 Cfi (ENSRNOG00000053400) #29 Pla2g12a (ENSRNOG00000057470) #30 Casp6 (ENSRNOG00000052613) #31 Mcub (ENSRNOG00000009433) #32 Sec24b (ENSRNOG00000023373) #33 Col25a1 (ENSRNOG00000050706) #34 Etnppl (ENSRNOG00000045743) #35 Rat MODERN SPECIES 8 Klhl3 (ENSRNOG00000019533) Spock1 (ENSRNOG00000012747) Trpc7 (ENSRNOG00000012727) Smad5 (ENSRNOG00000022870) Tgfbi (ENSRNOG00000012216) Lect2 (ENSRNOG00000012189) Fbxl21 (ENSRNOG00000012168) Il9 (ENSRNOG00000012131) Slc25a48 (ENSRNOG00000012040) RGD1562024 (ENSRNOG00000042749) Cxcl14 (ENSRNOG00000011984) Neurog1 (ENSRNOG00000022405) LOC100360522 (ENSRNOG00000063015) Tifab (ENSRNOG00000011947) ##19 Macroh2a1 (ENSRNOG00000011523) Pitx1 (ENSRNOG00000011423) #22 Catsper3 (ENSRNOG00000011374) Txndc15 (ENSRNOG00000000133) RGD1566359 (ENSRNOG00000063300) Ddx46 (ENSRNOG00000021637) Camlg (ENSRNOG00000021911) B4galt7 (ENSRNOG00000021886) Tmed9 (ENSRNOG00000021882) Fam193b (ENSRNOG00000039807) Ddx41 (ENSRNOG00000012771) Dok3 (ENSRNOG00000013564) Pdlim7 (ENSRNOG00000013653) Dbn1 (ENSRNOG00000014170) Prr7 (ENSRNOG00000021447) Grk6 (ENSRNOG00000014615) F12 (ENSRNOG00000015139) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Prairie vole MODERN SPECIES 3 Klhl3 (ENSMOCG00000009025) ENSMOCG00000022384 Spock1 (ENSMOCG00000020464) Trpc7 (ENSMOCG00000007497) Smim32 (ENSMOCG00000005510) Smad5 (ENSMOCG00000014515) Tgfbi (ENSMOCG00000016445) Lect2 (ENSMOCG00000010525) Fbxl21 (ENSMOCG00000017953) Il9 (ENSMOCG00000015389) Slc25a48 (ENSMOCG00000014485) ENSMOCG00000013166 Cxcl14 (ENSMOCG00000012248) Tifab (ENSMOCG00000006896) ##19 Macroh2a1 (ENSMOCG00000002242) Pitx1 (ENSMOCG00000012203) #22 Catsper3 (ENSMOCG00000005794) Pcbd2 (ENSMOCG00000017804) Txndc15 (ENSMOCG00000013179) B230219D22Rik (ENSMOCG00000008457) ENSMOCG00000004616 Ddx46 (ENSMOCG00000012141) Caml (ENSMOCG00000000620) B4galt7 (ENSMOCG00000012768) Tmed9 (ENSMOCG00000005540) Fam193b (ENSMOCG00000018868) Ddx41 (ENSMOCG00000010015) Dok3 (ENSMOCG00000021494) Pdlim7 (ENSMOCG00000022895) ENSMOCG00000022340 Prr7 (ENSMOCG00000022097) Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 19 Ndst4 (ENSPEMG00000020444) #9 Ugt8a (ENSPEMG00000016253) #10 ENSPEMG00000025456 ENSPEMG00000024508 Arsj (ENSPEMG00000013281) #11 ENSPEMG00000015780 Ank2 (ENSPEMG00000022242) #13 ENSPEMG00000013978 #14 ENSPEMG00000012463 ENSPEMG00000008182 #16 Neurog2 (ENSPEMG00000027945) #17 Alpk1 (ENSPEMG00000004361) #18 Tifa (ENSPEMG00000024630) #19 Ap1ar (ENSPEMG00000025779) #20 ENSPEMG00000026286 #21 Pitx2 (ENSPEMG00000026986) #22 Enpep (ENSPEMG00000012340) #23 Elovl6 (ENSPEMG00000030330) #24 Egf (ENSPEMG00000016237) #25 Lrit3 (ENSPEMG00000008291) #26 Rrh (ENSPEMG00000008715) #27 Gar1 (ENSPEMG00000015838) #28 Cfi (ENSPEMG00000017557) #29 Pla2g12a (ENSPEMG00000014433) #30 ENSPEMG00000011964 #31 Mcub (ENSPEMG00000008411) #32 Sec24b (ENSPEMG00000016956) #33 Col25a1 (ENSPEMG00000000474) #34 Etnppl (ENSPEMG00000009696) #35 Ostc (ENSPEMG00000001349) #36 ENSPEMG00000010540 ##37 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 Spock1 (ENSPEMG00000008714) ENSPEMG00000026613 Trpc7 (ENSPEMG00000012611) Smim32 (ENSPEMG00000012949) Smad5 (ENSPEMG00000015274) Tgfbi (ENSPEMG00000015916) Lect2 (ENSPEMG00000016650) Fbxl21 (ENSPEMG00000017408) Il9 (ENSPEMG00000017772) Slc25a48 (ENSPEMG00000018426) ENSPEMG00000000047 Cxcl14 (ENSPEMG00000030331) Neurog1 (ENSPEMG00000013088) Tifab (ENSPEMG00000028902) ##19 Macroh2a1 (ENSPEMG00000009591) Pitx1 (ENSPEMG00000010050) #22 Catsper3 (ENSPEMG00000010378) Pcbd2 (ENSPEMG00000011130) Txndc15 (ENSPEMG00000011451) B230219D22Rik (ENSPEMG00000013334) Ddx46 (ENSPEMG00000013593) Caml (ENSPEMG00000016565) B4galt7 (ENSPEMG00000017270) Tmed9 (ENSPEMG00000018272) Fam193b (ENSPEMG00000018711) Ddx41 (ENSPEMG00000000049) Dok3 (ENSPEMG00000000412) Pdlim7 (ENSPEMG00000001206) Dbn1 (ENSPEMG00000003983) Prr7 (ENSPEMG00000000234) Grk6 (ENSPEMG00000001288) Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Golden Hamster MODERN SPECIES 699 Klhl3 (ENSMAUG00000015096) Spock1 (ENSMAUG00000012855) Trpc7 (ENSMAUG00000008291) Smim32 (ENSMAUG00000017385) Smad5 (ENSMAUG00000014743) Tgfbi (ENSMAUG00000011927) Lect2 (ENSMAUG00000017197) Fbxl21 (ENSMAUG00000018152) Il9 (ENSMAUG00000015518) Slc25a48 (ENSMAUG00000008787) ENSMAUG00000003377 Cxcl14 (ENSMAUG00000014617) Neurog1 (ENSMAUG00000017119) Tifab (ENSMAUG00000019732) ##19 Macroh2a1 (ENSMAUG00000016646) Pitx1 (ENSMAUG00000007153) #22 Catsper3 (ENSMAUG00000000716) ENSMAUG00000008823 Txndc15 (ENSMAUG00000009665) B230219D22Rik (ENSMAUG00000007558) Ddx46 (ENSMAUG00000003267) Caml (ENSMAUG00000018505) B4galt7 (ENSMAUG00000005064) Tmed9 (ENSMAUG00000000498) Fam193b (ENSMAUG00000008948) Ddx41 (ENSMAUG00000008134) Dok3 (ENSMAUG00000005097) Pdlim7 (ENSMAUG00000015954) ENSMAUG00000000146 Prr7 (ENSMAUG00000018666) Grk6 (ENSMAUG00000005960) Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 66 Ugt8a (ENSCGRG00001022137) #10 ENSCGRG00001005264 ENSCGRG00001016787 Arsj (ENSCGRG00001016057) #11 Camk2d (ENSCGRG00001016320) #12 Ank2 (ENSCGRG00001000397) #13 ENSCGRG00001013985 ENSCGRG00001025050 #14 Neurog2 (ENSCGRG00001004256) #17 Zgrf1 (ENSCGRG00001021317) #16 Alpk1 (ENSCGRG00001007859) #18 Tifa (ENSCGRG00001002217) #19 Ap1ar (ENSCGRG00001002312) #20 ENSCGRG00001000195 Fam241a (ENSCGRG00001015267) #21 Pitx2 (ENSCGRG00001020811) #22 Enpep (ENSCGRG00001007343) #23 ELOVL6 (ENSCGRG00001016844) #24 Egf (ENSCGRG00001015336) #25 Lrit3 (ENSCGRG00001024786) #26 Rrh (ENSCGRG00001022555) #27 Gar1 (ENSCGRG00001003919) #28 Cfi (ENSCGRG00001008062) #29 Pla2g12a (ENSCGRG00001020911) #30 ENSCGRG00001021697 #31 Mcub (ENSCGRG00001013554) #32 Sec24b (ENSCGRG00001011377) #33 Col25a1 (ENSCGRG00001016091) #34 Etnppl (ENSCGRG00001001866) #35 ENSCGRG00001012885 #36 Rpl34 (ENSCGRG00001011923) #37 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 317 Spock1 (ENSCGRG00001004982) Trpc7 (ENSCGRG00001024128) Smim32 (ENSCGRG00001008174) Smad5 (ENSCGRG00001015176) Tgfbi (ENSCGRG00001015154) Lect2 (ENSCGRG00001015504) Fbxl21 (ENSCGRG00001015418) Il9 (ENSCGRG00001002786) Slc25a48 (ENSCGRG00001000435) ENSCGRG00001014109 ENSCGRG00001016030 Cxcl14 (ENSCGRG00001014024) Neurog1 (ENSCGRG00001006631) Tifab (ENSCGRG00001007136) ##19 Macroh2a1 (ENSCGRG00001011188) Pitx1 (ENSCGRG00001016356) #22 Catsper3 (ENSCGRG00001020986) Pcbd2 (ENSCGRG00001014123) Txndc15 (ENSCGRG00001006283) B230219D22Rik (ENSCGRG00001003088) Ddx46 (ENSCGRG00001024140) Caml (ENSCGRG00001012964) B4galt7 (ENSCGRG00001021578) Tmed9 (ENSCGRG00001015617) Fam193b (ENSCGRG00001009080) Ddx41 (ENSCGRG00001017112) Dok3 (ENSCGRG00001009102) Pdlim7 (ENSCGRG00001023731) Dbn1 (ENSCGRG00001022066) Prr7 (ENSCGRG00001013864) Grk6 (ENSCGRG00001018119) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 854 ENSNGAG00000017858 #13 ENSNGAG00000007368 #14 ENSNGAG00000000913 ENSNGAG00000013528 #16 Neurog2 (ENSNGAG00000012374) #17 Alpk1 (ENSNGAG00000014605) #18 Tifa (ENSNGAG00000012682) #19 Ap1ar (ENSNGAG00000010662) #20 Fam241a (ENSNGAG00000009560) #21 Pitx2 (ENSNGAG00000017029) #22 Enpep (ENSNGAG00000016059) #23 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 368 Lect2 (ENSNGAG00000021862) Fbxl21 (ENSNGAG00000021171) ENSNGAG00000010683 Il9 (ENSNGAG00000001244) Slc25a48 (ENSNGAG00000016697) ENSNGAG00000005835 Cxcl14 (ENSNGAG00000017521) Neurog1 (ENSNGAG00000011915) Tifab (ENSNGAG00000014665) ##19 Macroh2a1 (ENSNGAG00000002331) ENSNGAG00000019394 Pitx1 (ENSNGAG00000016736) #22 Catsper3 (ENSNGAG00000024239) Pcbd2 (ENSNGAG00000018561) Txndc15 (ENSNGAG00000002206) B230219D22Rik (ENSNGAG00000023211) Ddx46 (ENSNGAG00000020157) Caml (ENSNGAG00000005369) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 116 Dcp2 (ENSJJAG00000010518) Myot (ENSJJAG00000021663) Npy6r (ENSJJAG00000000646) Hnrnpa0 (ENSJJAG00000006954) Klhl3 (ENSJJAG00000021717) Spock1 (ENSJJAG00000009570) Trpc7 (ENSJJAG00000002420) Smad5 (ENSJJAG00000019065) Tgfbi (ENSJJAG00000014270) Lect2 (ENSJJAG00000012881) Fbxl21 (ENSJJAG00000010608) Il9 (ENSJJAG00000001064) Slc25a48 (ENSJJAG00000022548) Neurog1 (ENSJJAG00000021177) Macroh2a1 (ENSJJAG00000019844) Pitx1 (ENSJJAG00000019324) #22 Catsper3 (ENSJJAG00000017709) ENSJJAG00000016911 Txndc15 (ENSJJAG00000009566) B230219D22Rik (ENSJJAG00000014511) Ddx46 (ENSJJAG00000013906) Caml (ENSJJAG00000022839) B4galt7 (ENSJJAG00000016227) Tmed9 (ENSJJAG00000015615) Fam193b (ENSJJAG00000013182) Ddx41 (ENSJJAG00000010470) Dok3 (ENSJJAG00000006405) Pdlim7 (ENSJJAG00000003553) ENSJJAG00000021185 Prr7 (ENSJJAG00000019039) Grk6 (ENSJJAG00000011398) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 23 KLHL3 (ENSHGLG00000034412) SPOCK1 (ENSHGLG00000013253) TRPC7 (ENSHGLG00000014983) ENSHGLG00000048676 SMAD5 (ENSHGLG00000011690) TGFBI (ENSHGLG00000013550) LECT2 (ENSHGLG00000050741) ENSHGLG00000018360 IL9 (ENSHGLG00000015532) SLC25A48 (ENSHGLG00000015149) ENSHGLG00000031353 CXCL14 (ENSHGLG00000015249) NEUROG1 (ENSHGLG00000047301) MACROH2A1 (ENSHGLG00000017117) ENSHGLG00000039497 PITX1 (ENSHGLG00000041984) #22 CATSPER3 (ENSHGLG00000018485) ENSHGLG00000041033 TXNDC15 (ENSHGLG00000017229) C5orf24 (ENSHGLG00000006005) ENSHGLG00000010455 ENSHGLG00000008459 ENSHGLG00000012520 TMED9 (ENSHGLG00000048463) FAM193B (ENSHGLG00000014919) ENSHGLG00000015092 DOK3 (ENSHGLG00000015012) PDLIM7 (ENSHGLG00000014258) PRR7 (ENSHGLG00000007140) DBN1 (ENSHGLG00000006617) ENSHGLG00000008446 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 115 KLHL3 (ENSCLAG00000017134) SPOCK1 (ENSCLAG00000013455) TRPC7 (ENSCLAG00000015814) SMIM32 (ENSCLAG00000018092) SMAD5 (ENSCLAG00000015027) TGFBI (ENSCLAG00000014294) LECT2 (ENSCLAG00000015823) ENSCLAG00000014041 ENSCLAG00000015006 IL9 (ENSCLAG00000015426) SLC25A48 (ENSCLAG00000014537) ENSCLAG00000014077 CXCL14 (ENSCLAG00000014297) NEUROG1 (ENSCLAG00000018105) MACROH2A1 (ENSCLAG00000016530) PITX1 (ENSCLAG00000015955) #22 CATSPER3 (ENSCLAG00000014409) PCBD2 (ENSCLAG00000013683) TXNDC15 (ENSCLAG00000013852) C5orf24 (ENSCLAG00000017309) DDX46 (ENSCLAG00000014581) CAMLG (ENSCLAG00000014795) B4GALT7 (ENSCLAG00000014370) TMED9 (ENSCLAG00000015978) FAM193B (ENSCLAG00000014031) DDX41 (ENSCLAG00000015404) DOK3 (ENSCLAG00000015994) PDLIM7 (ENSCLAG00000013880) DBN1 (ENSCLAG00000015046) PRR7 (ENSCLAG00000015280) GRK6 (ENSCLAG00000015549) Degu MODERN SPECIES 89 KLHL3 (ENSODEG00000007574) SPOCK1 (ENSODEG00000007552) TRPC7 (ENSODEG00000009262) ENSODEG00000008153 SMAD5 (ENSODEG00000009350) TGFBI (ENSODEG00000007093) LECT2 (ENSODEG00000007874) ENSODEG00000008232 IL9 (ENSODEG00000008860) SLC25A48 (ENSODEG00000009314) CXCL14 (ENSODEG00000008019) NEUROG1 (ENSODEG00000019787) ENSODEG00000007481 MACROH2A1 (ENSODEG00000008031) ENSODEG00000009165 PITX1 (ENSODEG00000008093) #22 ENSODEG00000007938 PCBD2 (ENSODEG00000007717) TXNDC15 (ENSODEG00000008071) C5orf24 (ENSODEG00000008025) DDX46 (ENSODEG00000010023) CAMLG (ENSODEG00000007769) ENSODEG00000007985 B4GALT7 (ENSODEG00000009959) TMED9 (ENSODEG00000008016) FAM193B (ENSODEG00000008125) DDX41 (ENSODEG00000008505) DOK3 (ENSODEG00000008572) PDLIM7 (ENSODEG00000007773) ENSODEG00000009234 PRR7 (ENSODEG00000008439) Guinea pig DUPLICATION Guinea pig MODERN SPECIES 43 NDST4 (ENSCPOG00000006093) #9 UGT8 (ENSCPOG00000012039) #10 ARSJ (ENSCPOG00000009284) #11 ENSCPOG00000004133 #12 ANK2 (ENSCPOG00000003566) #13 LARP7 (ENSCPOG00000011830) #14 ENSCPOG00000038161 #16 ALPK1 (ENSCPOG00000008412) #18 TIFA (ENSCPOG00000036501) #19 AP1AR (ENSCPOG00000032660) #20 ENSCPOG00000005214 FAM241A (ENSCPOG00000013964) #21 ENSCPOG00000009459 #22 ENPEP (ENSCPOG00000000701) #23 ELOVL6 (ENSCPOG00000038802) #24 EGF (ENSCPOG00000000779) #25 LRIT3 (ENSCPOG00000000776) #26 RRH (ENSCPOG00000004217) #27 GAR1 (ENSCPOG00000004216) #28 CFI (ENSCPOG00000004214) #29 PLA2G12A (ENSCPOG00000004212) #30 CASP6 (ENSCPOG00000031434) #31 ENSCPOG00000002110 #32 ENSCPOG00000022594 SEC24B (ENSCPOG00000009212) #33 COL25A1 (ENSCPOG00000012595) #34 ETNPPL (ENSCPOG00000015368) #35 OSTC (ENSCPOG00000039456) #36 Guinea pig MODERN SPECIES 17 MYOT (ENSCPOG00000001651) HNRNPA0 (ENSCPOG00000026092) KLHL3 (ENSCPOG00000011147) SPOCK1 (ENSCPOG00000000622) TRPC7 (ENSCPOG00000004430) SMIM32 (ENSCPOG00000036996) SMAD5 (ENSCPOG00000005773) TGFBI (ENSCPOG00000005652) ENSCPOG00000036407 ENSCPOG00000001264 IL9 (ENSCPOG00000024096) SLC25A48 (ENSCPOG00000021211) CXCL14 (ENSCPOG00000020514) NEUROG1 (ENSCPOG00000020630) MACROH2A1 (ENSCPOG00000000450) PITX1 (ENSCPOG00000039251) #22 CATSPER3 (ENSCPOG00000012499) PCBD2 (ENSCPOG00000035507) TXNDC15 (ENSCPOG00000004131) C5orf24 (ENSCPOG00000031538) DDX46 (ENSCPOG00000011362) CAMLG (ENSCPOG00000014731) B4GALT7 (ENSCPOG00000034703) TMED9 (ENSCPOG00000004763) FAM193B (ENSCPOG00000002359) DDX41 (ENSCPOG00000008770) DOK3 (ENSCPOG00000008758) PDLIM7 (ENSCPOG00000002356) DBN1 (ENSCPOG00000020387) PRR7 (ENSCPOG00000004052) GRK6 (ENSCPOG00000004047) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Eurasian red squirrel DUPLICATION Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 18 UGT8 (ENSSVLG00005014683) #10 ENSSVLG00005014762 ARSJ (ENSSVLG00005014811) #11 ENSSVLG00005014849 CAMK2D (ENSSVLG00005014926) ANK2 (ENSSVLG00005021727) #13 ENSSVLG00005025975 ENSSVLG00005025976 #14 ZGRF1 (ENSSVLG00005025978) NEUROG2 (ENSSVLG00005025979) #17 ALPK1 (ENSSVLG00005025980) #18 ENSSVLG00005025981 #19 ENSSVLG00005025982 #20 FAM241A (ENSSVLG00005025983) #21 ENSSVLG00005025985 ENSSVLG00005025987 #22 ENPEP (ENSSVLG00005025988) #23 ENSSVLG00005025989 ENSSVLG00005025991 ELOVL6 (ENSSVLG00005025992) #24 EGF (ENSSVLG00005025994) #25 LRIT3 (ENSSVLG00005025995) #26 RRH (ENSSVLG00005025996) #27 GAR1 (ENSSVLG00005025997) #28 CFI (ENSSVLG00005025998) #29 PLA2G12A (ENSSVLG00005025999) #30 ENSSVLG00005026000 #31 MCUB (ENSSVLG00005026001) #32 SEC24B (ENSSVLG00005026003) #33 ENSSVLG00005026004 COL25A1 (ENSSVLG00005026005) #34 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 15 ENSSVLG00005009230 ENSSVLG00005008912 SMIM32 (ENSSVLG00005008793) ENSSVLG00005008755 TGFBI (ENSSVLG00005008702) LECT2 (ENSSVLG00005008626) ENSSVLG00005008590 IL9 (ENSSVLG00005008551) SLC25A48 (ENSSVLG00005008486) ENSSVLG00005008460 ENSSVLG00005008405 CXCL14 (ENSSVLG00005008358) NEUROG1 (ENSSVLG00005008342) TIFAB (ENSSVLG00005008329) ##19 MACROH2A1 (ENSSVLG00005008251) PITX1 (ENSSVLG00005008189) #22 CATSPER3 (ENSSVLG00005008074) PCBD2 (ENSSVLG00005008034) TXNDC15 (ENSSVLG00005007989) C5orf24 (ENSSVLG00005007960) DDX46 (ENSSVLG00005007905) ENSSVLG00005007868 CAMLG (ENSSVLG00005007799) ENSSVLG00005007752 B4GALT7 (ENSSVLG00005007711) TMED9 (ENSSVLG00005007671) FAM193B (ENSSVLG00005007601) DDX41 (ENSSVLG00005007527) DOK3 (ENSSVLG00005007485) PDLIM7 (ENSSVLG00005007414) DBN1 (ENSSVLG00005007346) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES 14 UGT8 (ENSMMMG00000011973) #10 ARSJ (ENSMMMG00000011955) #11 CAMK2D (ENSMMMG00000011571) ENSMMMG00000011465 ENSMMMG00000011445 #13 ENSMMMG00000011375 #13 LARP7 (ENSMMMG00000011295) #14 ENSMMMG00000011252 ENSMMMG00000011234 #16 NEUROG2 (ENSMMMG00000011232) #17 ALPK1 (ENSMMMG00000011177) #18 TIFA (ENSMMMG00000011166) #19 AP1AR (ENSMMMG00000011129) #20 ENSMMMG00000011118 #21 ENSMMMG00000011114 ENSMMMG00000011061 #22 ENPEP (ENSMMMG00000011011) #23 ENSMMMG00000011001 ELOVL6 (ENSMMMG00000010968) #24 EGF (ENSMMMG00000010685) #25 ENSMMMG00000010673 LRIT3 (ENSMMMG00000010663) #26 RRH (ENSMMMG00000010634) #27 GAR1 (ENSMMMG00000010623) #28 CFI (ENSMMMG00000010613) #29 PLA2G12A (ENSMMMG00000010605) #30 CASP6 (ENSMMMG00000010597) #31 SEC24B (ENSMMMG00000010546) #33 COL25A1 (ENSMMMG00000010402) #34 ETNPPL (ENSMMMG00000010343) #35 OSTC (ENSMMMG00000010326) #36 Alpin marmot MODERN SPECIES 23 ENSMMMG00000006399 KLHL3 (ENSMMMG00000006368) SPOCK1 (ENSMMMG00000006301) TRPC7 (ENSMMMG00000006121) SMIM32 (ENSMMMG00000006113) SMAD5 (ENSMMMG00000006090) TGFBI (ENSMMMG00000006053) LECT2 (ENSMMMG00000006038) ENSMMMG00000006022 IL9 (ENSMMMG00000006018) SLC25A48 (ENSMMMG00000005997) ENSMMMG00000005996 CXCL14 (ENSMMMG00000005958) TIFAB (ENSMMMG00000005944) ##19 MACROH2A1 (ENSMMMG00000005916) PITX1 (ENSMMMG00000005899) #22 CATSPER3 (ENSMMMG00000005868) PCBD2 (ENSMMMG00000005849) ENSMMMG00000005841 C5orf24 (ENSMMMG00000005822) DDX46 (ENSMMMG00000005700) ENSMMMG00000005688 B4GALT7 (ENSMMMG00000005663) TMED9 (ENSMMMG00000005653) ENSMMMG00000005633 FAM193B (ENSMMMG00000005606) DDX41 (ENSMMMG00000005561) DOK3 (ENSMMMG00000005538) PDLIM7 (ENSMMMG00000005469) DBN1 (ENSMMMG00000005401) ENSMMMG00000005383 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00940000157712 ENSGT00940000159747 ENSGT00390000000973.a.a ENSGT00940000156333 ENSGT00940000161724 ENSGT00940000159626 ENSGT00940000159431 ENSGT00950000183109.c.a.b ENSGT00940000158544 Arctic ground squirrel DUPLICATION Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 465 ENSUPAG00010013259 #22 ENPEP (ENSUPAG00010013286) #23 ELOVL6 (ENSUPAG00010015451) #24 EGF (ENSUPAG00010015469) #25 ENSUPAG00010015558 LRIT3 (ENSUPAG00010015564) #26 RRH (ENSUPAG00010015576) #27 GAR1 (ENSUPAG00010015610) #28 CFI (ENSUPAG00010015629) #29 PLA2G12A (ENSUPAG00010015645) #30 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 196 TRPC7 (ENSUPAG00010014483) SMAD5 (ENSUPAG00010014453) TGFBI (ENSUPAG00010014425) LECT2 (ENSUPAG00010014419) ENSUPAG00010014400 IL9 (ENSUPAG00010014388) SLC25A48 (ENSUPAG00010014369) ENSUPAG00010014367 CXCL14 (ENSUPAG00010014356) NEUROG1 (ENSUPAG00010014353) TIFAB (ENSUPAG00010014344) ##19 MACROH2A1 (ENSUPAG00010014298) PITX1 (ENSUPAG00010014293) #22 CATSPER3 (ENSUPAG00010014249) PCBD2 (ENSUPAG00010014239) TXNDC15 (ENSUPAG00010014224) C5orf24 (ENSUPAG00010014221) DDX46 (ENSUPAG00010014175) CAMLG (ENSUPAG00010014161) B4GALT7 (ENSUPAG00010014143) TMED9 (ENSUPAG00010014136) FAM193B (ENSUPAG00010014112) DDX41 (ENSUPAG00010014092) DOK3 (ENSUPAG00010014081) PDLIM7 (ENSUPAG00010014032) DBN1 (ENSUPAG00010013977) PRR7 (ENSUPAG00010013965) GRK6 (ENSUPAG00010013823) Squirrel DUPLICATION Squirrel MODERN SPECIES 163 ENSSTOG00000034598 NDST4 (ENSSTOG00000013994) #9 UGT8 (ENSSTOG00000005626) #10 ENSSTOG00000024888 ARSJ (ENSSTOG00000015417) #11 CAMK2D (ENSSTOG00000001689) ANK2 (ENSSTOG00000001648) #13 LARP7 (ENSSTOG00000011789) #14 ENSSTOG00000025752 ENSSTOG00000011761 #16 NEUROG2 (ENSSTOG00000011758) #17 ALPK1 (ENSSTOG00000023490) #18 TIFA (ENSSTOG00000024540) #19 AP1AR (ENSSTOG00000011726) #20 FAM241A (ENSSTOG00000026762) #21 ENSSTOG00000025728 #22 ENPEP (ENSSTOG00000019984) #23 ELOVL6 (ENSSTOG00000013096) #24 LRIT3 (ENSSTOG00000019825) #26 RRH (ENSSTOG00000026445) #27 GAR1 (ENSSTOG00000005577) #28 CFI (ENSSTOG00000013356) #29 PLA2G12A (ENSSTOG00000007365) #30 CASP6 (ENSSTOG00000022572) #31 MCUB (ENSSTOG00000012419) #32 SEC24B (ENSSTOG00000025309) #33 ENSSTOG00000030771 ETNPPL (ENSSTOG00000021812) #35 Squirrel MODERN SPECIES 197 ENSSTOG00000028543 KLHL3 (ENSSTOG00000004670) ENSSTOG00000002223 SPOCK1 (ENSSTOG00000007317) TRPC7 (ENSSTOG00000011806) SMIM32 (ENSSTOG00000021297) SMAD5 (ENSSTOG00000011799) TGFBI (ENSSTOG00000005802) LECT2 (ENSSTOG00000005650) ENSSTOG00000005640 IL9 (ENSSTOG00000034582) SLC25A48 (ENSSTOG00000025425) CXCL14 (ENSSTOG00000022730) NEUROG1 (ENSSTOG00000022759) MACROH2A1 (ENSSTOG00000014864) PITX1 (ENSSTOG00000027700) #22 CATSPER3 (ENSSTOG00000004050) PCBD2 (ENSSTOG00000004040) TXNDC15 (ENSSTOG00000024633) C5orf24 (ENSSTOG00000004019) DDX46 (ENSSTOG00000025564) CAMLG (ENSSTOG00000013148) B4GALT7 (ENSSTOG00000025953) FAM193B (ENSSTOG00000000526) DDX41 (ENSSTOG00000003171) DOK3 (ENSSTOG00000003144) PDLIM7 (ENSSTOG00000025526) DBN1 (ENSSTOG00000008438) PRR7 (ENSSTOG00000008432) GRK6 (ENSSTOG00000008405) ENSSTOG00000008389 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159795 ENSGT00940000163511 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Pika DUPLICATION Pika MODERN SPECIES 8215 ENSOPRG00000011424 #22 Pika MODERN SPECIES 338 MACROH2A1 (ENSOPRG00000006696) ENSOPRG00000006684 #22 CATSPER3 (ENSOPRG00000006679) PCBD2 (ENSOPRG00000006673) TXNDC15 (ENSOPRG00000006667) ENSOPRG00000019193 DDX46 (ENSOPRG00000006646) CAMLG (ENSOPRG00000006638) SEC24A (ENSOPRG00000006611) ##33 Tree shrew MODERN SPECIES 8960 PITX1 (ENSTBEG00000016830) #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996.f ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Bushbaby MODERN SPECIES 118 MYOT (ENSOGAG00000016522) HNRNPA0 (ENSOGAG00000025754) KLHL3 (ENSOGAG00000012830) SPOCK1 (ENSOGAG00000012825) TRPC7 (ENSOGAG00000009607) SMAD5 (ENSOGAG00000009601) TGFBI (ENSOGAG00000009587) LECT2 (ENSOGAG00000009586) IL9 (ENSOGAG00000009580) SLC25A48 (ENSOGAG00000031580) CXCL14 (ENSOGAG00000029678) NEUROG1 (ENSOGAG00000033152) TIFAB (ENSOGAG00000031815) ##19 MACROH2A1 (ENSOGAG00000009561) ENSOGAG00000028757 PITX1 (ENSOGAG00000033052) #22 TXNDC15 (ENSOGAG00000011697) C5orf24 (ENSOGAG00000011696) ENSOGAG00000011690 CAMLG (ENSOGAG00000003580) SEC24A (ENSOGAG00000013354) ##33 SAR1B (ENSOGAG00000013347) JADE2 (ENSOGAG00000016300) ENSOGAG00000024120 UBE2B (ENSOGAG00000016291) CDKL3 (ENSOGAG00000016285) PPP2CA (ENSOGAG00000009695) SKP1 (ENSOGAG00000028707) TCF7 (ENSOGAG00000024343) ENSOGAG00000030742 C5orf15 (ENSOGAG00000001273) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996.f ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Mouse lemur MODERN SPECIES 10 ENSMICG00000014457 KLHL3 (ENSMICG00000047430) SPOCK1 (ENSMICG00000000619) TRPC7 (ENSMICG00000007325) SMIM32 (ENSMICG00000026478) SMAD5 (ENSMICG00000007315) TGFBI (ENSMICG00000007294) LECT2 (ENSMICG00000032966) ENSMICG00000045038 IL9 (ENSMICG00000007283) SLC25A48 (ENSMICG00000007277) ENSMICG00000042724 CXCL14 (ENSMICG00000038499) NEUROG1 (ENSMICG00000043660) MACROH2A1 (ENSMICG00000005677) PITX1 (ENSMICG00000047012) #22 CATSPER3 (ENSMICG00000046332) PCBD2 (ENSMICG00000041651) TXNDC15 (ENSMICG00000043867) C5orf24 (ENSMICG00000046739) ENSMICG00000036509 DDX46 (ENSMICG00000028626) CAMLG (ENSMICG00000011682) SEC24A (ENSMICG00000011650) ##33 SAR1B (ENSMICG00000011638) JADE2 (ENSMICG00000032137) ENSMICG00000028986 UBE2B (ENSMICG00000047998) CDKL3 (ENSMICG00000004579) PPP2CA (ENSMICG00000045630) SKP1 (ENSMICG00000030106) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996.f ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 496 ENSPCOG00000025890 ENSPCOG00000019154 ENSPCOG00000014350 NEUROG1 (ENSPCOG00000028001) MACROH2A1 (ENSPCOG00000013464) PITX1 (ENSPCOG00000021171) #22 CATSPER3 (ENSPCOG00000025032) PCBD2 (ENSPCOG00000021501) TXNDC15 (ENSPCOG00000021382) C5orf24 (ENSPCOG00000024715) DDX46 (ENSPCOG00000018969) ENSPCOG00000015224 ENSPCOG00000026348 ##33 ENSPCOG00000013207 JADE2 (ENSPCOG00000018172) CDKN2AIPNL (ENSPCOG00000023139) UBE2B (ENSPCOG00000022801) CDKL3 (ENSPCOG00000024912) PPP2CA (ENSPCOG00000024928) SKP1 (ENSPCOG00000017179) TCF7 (ENSPCOG00000028391) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 725 SPOCK1 (ENSPSMG00000000602) TRPC7 (ENSPSMG00000000469) SMIM32 (ENSPSMG00000000364) SMAD5 (ENSPSMG00000000350) TGFBI (ENSPSMG00000000259) LECT2 (ENSPSMG00000000212) ENSPSMG00000000194 IL9 (ENSPSMG00000000189) SLC25A48 (ENSPSMG00000000160) ENSPSMG00000000128 CXCL14 (ENSPSMG00000000113) NEUROG1 (ENSPSMG00000000090) TIFAB (ENSPSMG00000000078) ##19 MACROH2A1 (ENSPSMG00000021213) PITX1 (ENSPSMG00000021103) #22 CATSPER3 (ENSPSMG00000021100) PCBD2 (ENSPSMG00000021087) TXNDC15 (ENSPSMG00000021083) C5orf24 (ENSPSMG00000021080) DDX46 (ENSPSMG00000021031) CAMLG (ENSPSMG00000020923) SEC24A (ENSPSMG00000020890) ##33 SAR1B (ENSPSMG00000020738) JADE2 (ENSPSMG00000020658) CDKN2AIPNL (ENSPSMG00000020559) ENSPSMG00000020551 CDKL3 (ENSPSMG00000020528) ENSPSMG00000020480 SKP1 (ENSPSMG00000020450) TCF7 (ENSPSMG00000020435) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Tarsier MODERN SPECIES 1987 PITX1 (ENSTSYG00000027819) #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437.ub ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.g ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a.i ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437.ub ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.g ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a.i ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Marmoset MODERN SPECIES 11 MYOT (ENSCJAG00000006134) ENSCJAG00000006131 KLHL3 (ENSCJAG00000006075) SPOCK1 (ENSCJAG00000006070) TRPC7 (ENSCJAG00000005983) SMIM32 (ENSCJAG00000005981) SMAD5 (ENSCJAG00000005968) TGFBI (ENSCJAG00000005930) LECT2 (ENSCJAG00000043329) ENSCJAG00000041175 IL9 (ENSCJAG00000005916) SLC25A48 (ENSCJAG00000005904) CXCL14 (ENSCJAG00000005888) TIFAB (ENSCJAG00000043900) ##19 MACROH2A1 (ENSCJAG00000005818) PITX1 (ENSCJAG00000086657) #22 CATSPER3 (ENSCJAG00000005799) ENSCJAG00000005793 TXNDC15 (ENSCJAG00000047658) C5orf24 (ENSCJAG00000005779) ENSCJAG00000074512 DDX46 (ENSCJAG00000005697) CAMLG (ENSCJAG00000005675) SEC24A (ENSCJAG00000005648) ##33 SAR1B (ENSCJAG00000004819) JADE2 (ENSCJAG00000004813) CDKN2AIPNL (ENSCJAG00000004787) UBE2B (ENSCJAG00000082590) CDKL3 (ENSCJAG00000004765) ENSCJAG00000080351 SPDL1 (ENSCJAG00000004745) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00910000146907 ENSGT00950000182810.A.b ENSGT00940000158849 ENSGT00940000160067 ENSGT00530000063666.a.n ENSGT00940000160864 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a.i ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 43 ENSSBOG00000033275 ENSSBOG00000017380 PRELID2 (ENSSBOG00000020144) GRXCR2 (ENSSBOG00000021802) SH3RF2 (ENSSBOG00000024803) ENSSBOG00000029875 ENSSBOG00000029526 ENSSBOG00000032714 ENSSBOG00000027112 IL9 (ENSSBOG00000030901) SLC25A48 (ENSSBOG00000033874) ENSSBOG00000021765 CXCL14 (ENSSBOG00000001404) NEUROG1 (ENSSBOG00000023798) MACROH2A1 (ENSSBOG00000034640) PITX1 (ENSSBOG00000035259) #22 CATSPER3 (ENSSBOG00000028973) PCBD2 (ENSSBOG00000022005) TXNDC15 (ENSSBOG00000023331) C5orf24 (ENSSBOG00000022311) DDX46 (ENSSBOG00000027666) CAMLG (ENSSBOG00000025639) SEC24A (ENSSBOG00000024973) ##33 SAR1B (ENSSBOG00000022930) JADE2 (ENSSBOG00000035045) ENSSBOG00000028786 CDKN2AIPNL (ENSSBOG00000011200) UBE2B (ENSSBOG00000024350) CDKL3 (ENSSBOG00000020404) ENSSBOG00000023243 ENSSBOG00000027260 Capuchin MODERN SPECIES 76 ENSCCAG00000000354 GRXCR2 (ENSCCAG00000031158) SH3RF2 (ENSCCAG00000028560) ENSCCAG00000031219 ENSCCAG00000037271 ENSCCAG00000022482 ENSCCAG00000035191 IL9 (ENSCCAG00000036482) SLC25A48 (ENSCCAG00000035217) ENSCCAG00000034499 CXCL14 (ENSCCAG00000026689) ENSCCAG00000025399 NEUROG1 (ENSCCAG00000024492) DCANP1 (ENSCCAG00000034427) MACROH2A1 (ENSCCAG00000007999) PITX1 (ENSCCAG00000026659) #22 CATSPER3 (ENSCCAG00000023730) PCBD2 (ENSCCAG00000029800) TXNDC15 (ENSCCAG00000030665) ENSCCAG00000033520 C5orf24 (ENSCCAG00000025876) DDX46 (ENSCCAG00000026721) CAMLG (ENSCCAG00000034675) SEC24A (ENSCCAG00000032334) ##33 SAR1B (ENSCCAG00000037282) ENSCCAG00000026527 JADE2 (ENSCCAG00000027715) CDKN2AIPNL (ENSCCAG00000021921) UBE2B (ENSCCAG00000026429) CDKL3 (ENSCCAG00000024762) ENSCCAG00000025572 Mas night monkey MODERN SPECIES 966 KLHL3 (ENSANAG00000035383) ENSANAG00000033736 SPOCK1 (ENSANAG00000026263) TRPC7 (ENSANAG00000032915) SMIM32 (ENSANAG00000018238) SMAD5 (ENSANAG00000036462) TGFBI (ENSANAG00000026967) ENSANAG00000035466 ENSANAG00000026235 IL9 (ENSANAG00000026296) SLC25A48 (ENSANAG00000036726) CXCL14 (ENSANAG00000030393) NEUROG1 (ENSANAG00000030948) TIFAB (ENSANAG00000018334) ##19 MACROH2A1 (ENSANAG00000028147) PITX1 (ENSANAG00000026563) #22 CATSPER3 (ENSANAG00000027001) PCBD2 (ENSANAG00000026831) TXNDC15 (ENSANAG00000033906) C5orf24 (ENSANAG00000030411) DDX46 (ENSANAG00000032116) ENSANAG00000028078 CAMLG (ENSANAG00000028441) SEC24A (ENSANAG00000033845) ##33 SAR1B (ENSANAG00000032734) JADE2 (ENSANAG00000031699) ENSANAG00000020456 ENSANAG00000026282 UBE2B (ENSANAG00000032856) ENSANAG00000037931 ENSANAG00000033828 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j.d ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 854 TRPC7 (ENSRROG00000031950) SMIM32 (ENSRROG00000016761) SMAD5 (ENSRROG00000036746) TGFBI (ENSRROG00000038251) LECT2 (ENSRROG00000038721) ENSRROG00000035988 IL9 (ENSRROG00000039554) SLC25A48 (ENSRROG00000041902) ENSRROG00000038760 CXCL14 (ENSRROG00000027023) ENSRROG00000043492 NEUROG1 (ENSRROG00000022480) DCANP1 (ENSRROG00000033604) MACROH2A1 (ENSRROG00000045755) PITX1 (ENSRROG00000035451) #22 CATSPER3 (ENSRROG00000035501) PCBD2 (ENSRROG00000035070) TXNDC15 (ENSRROG00000024591) C5orf24 (ENSRROG00000030678) DDX46 (ENSRROG00000029467) CAMLG (ENSRROG00000019981) SEC24A (ENSRROG00000045670) ##33 SAR1B (ENSRROG00000028843) JADE2 (ENSRROG00000032987) ENSRROG00000012329 UBE2B (ENSRROG00000041544) CDKL3 (ENSRROG00000036347) PPP2CA (ENSRROG00000036242) ENSRROG00000044330 TCF7 (ENSRROG00000042564) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 395 ENSRBIG00000035075 CXCL14 (ENSRBIG00000038279) NEUROG1 (ENSRBIG00000010591) DCANP1 (ENSRBIG00000038777) MACROH2A1 (ENSRBIG00000034425) PITX1 (ENSRBIG00000034654) #22 CATSPER3 (ENSRBIG00000034438) PCBD2 (ENSRBIG00000023562) TXNDC15 (ENSRBIG00000034542) C5orf24 (ENSRBIG00000008483) DDX46 (ENSRBIG00000041150) CAMLG (ENSRBIG00000031162) SEC24A (ENSRBIG00000043543) ##33 SAR1B (ENSRBIG00000036918) JADE2 (ENSRBIG00000011646) ENSRBIG00000018523 UBE2B (ENSRBIG00000039608) CDKL3 (ENSRBIG00000044694) PPP2CA (ENSRBIG00000044818) ENSRBIG00000041901 TCF7 (ENSRBIG00000029278) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Vervet Monkey MODERN SPECIES 15 ENSCSAG00000013323 HNRNPA0 (ENSCSAG00000000499) KLHL3 (ENSCSAG00000013329) ENSCSAG00000000500 SPOCK1 (ENSCSAG00000013337) SMAD5 (ENSCSAG00000013343) TGFBI (ENSCSAG00000013351) LECT2 (ENSCSAG00000013359) IL9 (ENSCSAG00000013366) ENSCSAG00000013374 ENSCSAG00000000501 CXCL14 (ENSCSAG00000013376) NEUROG1 (ENSCSAG00000000502) TIFAB (ENSCSAG00000013385) ##19 MACROH2A1 (ENSCSAG00000013390) PITX1 (ENSCSAG00000013399) #22 CATSPER3 (ENSCSAG00000013421) PCBD2 (ENSCSAG00000013439) TXNDC15 (ENSCSAG00000013446) ENSCSAG00000013451 CAMLG (ENSCSAG00000013460) SEC24A (ENSCSAG00000013554) ##33 SAR1B (ENSCSAG00000013578) JADE2 (ENSCSAG00000013584) CDKN2AIPNL (ENSCSAG00000013589) UBE2B (ENSCSAG00000013595) CDKL3 (ENSCSAG00000013620) PPP2CA (ENSCSAG00000013631) ENSCSAG00000013640 TCF7 (ENSCSAG00000013646) VDAC1 (ENSCSAG00000013649) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Macaca ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00690000102286.a.b.k.b.d.a.a.a.a ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b.tb Rhesus MODERN SPECIES 16 TRPC7 (ENSMMUG00000000342) SMIM32 (ENSMMUG00000059239) SMAD5 (ENSMMUG00000000340) TGFBI (ENSMMUG00000000332) LECT2 (ENSMMUG00000001947) FBXL21 (ENSMMUG00000001948) IL9 (ENSMMUG00000001950) SLC25A48 (ENSMMUG00000001951) ENSMMUG00000062707 ENSMMUG00000056250 ENSMMUG00000004772 CXCL14 (ENSMMUG00000004771) NEUROG1 (ENSMMUG00000004770) TIFAB (ENSMMUG00000053558) ##19 MACROH2A1 (ENSMMUG00000014465) PITX1 (ENSMMUG00000052860) #22 CATSPER3 (ENSMMUG00000005286) PCBD2 (ENSMMUG00000058022) TXNDC15 (ENSMMUG00000063014) C6H5orf24 (ENSMMUG00000004013) DDX46 (ENSMMUG00000012463) CAMLG (ENSMMUG00000056880) SEC24A (ENSMMUG00000004418) ##33 SAR1B (ENSMMUG00000004417) JADE2 (ENSMMUG00000000358) CDKN2AIPNL (ENSMMUG00000058096) ENSMMUG00000053384 UBE2B (ENSMMUG00000016641) ENSMMUG00000052256 ENSMMUG00000052915 SKP1 (ENSMMUG00000013047) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 383 ENSMNEG00000045468 TRPC7 (ENSMNEG00000040786) SMIM32 (ENSMNEG00000022167) SMAD5 (ENSMNEG00000042725) ENSMNEG00000031432 TGFBI (ENSMNEG00000039843) LECT2 (ENSMNEG00000037501) ENSMNEG00000041982 IL9 (ENSMNEG00000026598) SLC25A48 (ENSMNEG00000032307) ENSMNEG00000038760 CXCL14 (ENSMNEG00000016174) ENSMNEG00000036319 NEUROG1 (ENSMNEG00000012390) MACROH2A1 (ENSMNEG00000031666) PITX1 (ENSMNEG00000031589) #22 CATSPER3 (ENSMNEG00000025685) PCBD2 (ENSMNEG00000035154) TXNDC15 (ENSMNEG00000035748) C5orf24 (ENSMNEG00000041574) DDX46 (ENSMNEG00000029903) CAMLG (ENSMNEG00000038227) SEC24A (ENSMNEG00000044861) ##33 SAR1B (ENSMNEG00000045379) JADE2 (ENSMNEG00000031371) CDKN2AIPNL (ENSMNEG00000042298) UBE2B (ENSMNEG00000034858) CDKL3 (ENSMNEG00000032037) PPP2CA (ENSMNEG00000043537) ENSMNEG00000032488 TCF7 (ENSMNEG00000044025) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Olive baboon MODERN SPECIES 15 ENSPANG00000047422 SPOCK1 (ENSPANG00000003995) TRPC7 (ENSPANG00000003827) SMIM32 (ENSPANG00000034382) SMAD5 (ENSPANG00000005514) TGFBI (ENSPANG00000005113) ENSPANG00000033309 LECT2 (ENSPANG00000019400) IL9 (ENSPANG00000020836) ENSPANG00000030234 SLC25A48 (ENSPANG00000004440) CXCL14 (ENSPANG00000008617) NEUROG1 (ENSPANG00000004163) TIFAB (ENSPANG00000014817) ##19 MACROH2A1 (ENSPANG00000002758) PITX1 (ENSPANG00000042573) #22 CATSPER3 (ENSPANG00000005114) PCBD2 (ENSPANG00000010939) TXNDC15 (ENSPANG00000018501) C5orf24 (ENSPANG00000001914) ENSPANG00000046730 DDX46 (ENSPANG00000025084) CAMLG (ENSPANG00000010658) SEC24A (ENSPANG00000002425) ##33 SAR1B (ENSPANG00000005732) ENSPANG00000041180 ENSPANG00000051335 JADE2 (ENSPANG00000003278) CDKN2AIPNL (ENSPANG00000008879) UBE2B (ENSPANG00000010163) CDKL3 (ENSPANG00000010940) Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Drill MODERN SPECIES 1616 ENSMLEG00000033886 TRPC7 (ENSMLEG00000032319) SMAD5 (ENSMLEG00000033400) ENSMLEG00000037073 TGFBI (ENSMLEG00000025967) LECT2 (ENSMLEG00000038109) ENSMLEG00000032865 IL9 (ENSMLEG00000028337) SLC25A48 (ENSMLEG00000031432) ENSMLEG00000003686 CXCL14 (ENSMLEG00000028192) ENSMLEG00000043072 NEUROG1 (ENSMLEG00000018822) TIFAB (ENSMLEG00000025249) ##19 MACROH2A1 (ENSMLEG00000037795) PITX1 (ENSMLEG00000036919) #22 CATSPER3 (ENSMLEG00000029137) PCBD2 (ENSMLEG00000036945) TXNDC15 (ENSMLEG00000043371) C5orf24 (ENSMLEG00000037446) DDX46 (ENSMLEG00000033516) CAMLG (ENSMLEG00000006327) SEC24A (ENSMLEG00000037674) ##33 SAR1B (ENSMLEG00000038596) JADE2 (ENSMLEG00000043416) ENSMLEG00000032485 UBE2B (ENSMLEG00000000715) CDKL3 (ENSMLEG00000041033) PPP2CA (ENSMLEG00000031466) SKP1 (ENSMLEG00000028087) TCF7 (ENSMLEG00000037766) Sooty mangabey MODERN SPECIES 309 TRPC7 (ENSCATG00000009074) SMIM32 (ENSCATG00000021467) ENSCATG00000037977 SMAD5 (ENSCATG00000043843) TGFBI (ENSCATG00000041865) LECT2 (ENSCATG00000043784) IL9 (ENSCATG00000030102) SLC25A48 (ENSCATG00000030563) ENSCATG00000039970 ENSCATG00000042008 CXCL14 (ENSCATG00000030316) NEUROG1 (ENSCATG00000021940) TIFAB (ENSCATG00000022723) ##19 DCANP1 (ENSCATG00000034040) MACROH2A1 (ENSCATG00000036866) PITX1 (ENSCATG00000041824) #22 CATSPER3 (ENSCATG00000044756) PCBD2 (ENSCATG00000029213) TXNDC15 (ENSCATG00000033445) C5orf24 (ENSCATG00000025473) DDX46 (ENSCATG00000040891) CAMLG (ENSCATG00000044060) SEC24A (ENSCATG00000039411) ##33 SAR1B (ENSCATG00000022601) JADE2 (ENSCATG00000032327) CDKN2AIPNL (ENSCATG00000024426) UBE2B (ENSCATG00000032151) CDKL3 (ENSCATG00000039822) PPP2CA (ENSCATG00000039567) SKP1 (ENSCATG00000041858) TCF7 (ENSCATG00000044135) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Gorilla MODERN SPECIES 18 ENSGGOG00000023764 TRPC7 (ENSGGOG00000015741) SMIM32 (ENSGGOG00000040139) ENSGGOG00000022212 SMAD5 (ENSGGOG00000023966) TGFBI (ENSGGOG00000009517) LECT2 (ENSGGOG00000025981) IL9 (ENSGGOG00000014117) ENSGGOG00000014110 ENSGGOG00000040769 ENSGGOG00000041088 CXCL14 (ENSGGOG00000002842) NEUROG1 (ENSGGOG00000002841) TIFAB (ENSGGOG00000041837) ##19 MACROH2A1 (ENSGGOG00000001707) PITX1 (ENSGGOG00000004846) #22 ENSGGOG00000004842 ENSGGOG00000025134 TXNDC15 (ENSGGOG00000004588) ENSGGOG00000039515 DDX46 (ENSGGOG00000013843) CAMLG (ENSGGOG00000010224) SEC24A (ENSGGOG00000011050) ##33 ENSGGOG00000016284 JADE2 (ENSGGOG00000016982) CDKN2AIPNL (ENSGGOG00000004348) ENSGGOG00000037490 CDKL3 (ENSGGOG00000002228) PPP2CA (ENSGGOG00000000338) SKP1 (ENSGGOG00000022930) ENSGGOG00000008257 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Pan ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00480000043246 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00550000075626 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177.j ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Chimpanzee MODERN SPECIES 18 SMIM32 (ENSPTRG00000045064) ENSPTRG00000046980 SMAD5 (ENSPTRG00000050059) TGFBI (ENSPTRG00000017264) ENSPTRG00000044075 LECT2 (ENSPTRG00000017263) IL9 (ENSPTRG00000017261) SLC25A48 (ENSPTRG00000017260) ENSPTRG00000046106 CXCL14 (ENSPTRG00000017259) ENSPTRG00000047017 NEUROG1 (ENSPTRG00000017258) TIFAB (ENSPTRG00000044313) ##19 DCANP1 (ENSPTRG00000039046) MACROH2A1 (ENSPTRG00000017256) PITX1 (ENSPTRG00000017254) #22 CATSPER3 (ENSPTRG00000017253) PCBD2 (ENSPTRG00000017252) TXNDC15 (ENSPTRG00000017251) C5H5orf24 (ENSPTRG00000044708) DDX46 (ENSPTRG00000017248) CAMLG (ENSPTRG00000017247) SEC24A (ENSPTRG00000017246) ##33 SAR1B (ENSPTRG00000017244) ENSPTRG00000030400 JADE2 (ENSPTRG00000017242) CDKN2AIPNL (ENSPTRG00000017241) UBE2B (ENSPTRG00000017240) CDKL3 (ENSPTRG00000017239) PPP2CA (ENSPTRG00000052040) SKP1 (ENSPTRG00000045225) Bonobo MODERN SPECIES 18 TRPC7 (ENSPPAG00000030793) SMIM32 (ENSPPAG00000018722) ENSPPAG00000015074 SMAD5 (ENSPPAG00000037276) TGFBI (ENSPPAG00000035154) LECT2 (ENSPPAG00000002714) ENSPPAG00000042058 IL9 (ENSPPAG00000031800) SLC25A48 (ENSPPAG00000027653) ENSPPAG00000005601 CXCL14 (ENSPPAG00000039859) NEUROG1 (ENSPPAG00000000667) TIFAB (ENSPPAG00000003264) ##19 DCANP1 (ENSPPAG00000029210) MACROH2A1 (ENSPPAG00000029258) PITX1 (ENSPPAG00000021581) #22 CATSPER3 (ENSPPAG00000040666) PCBD2 (ENSPPAG00000037234) TXNDC15 (ENSPPAG00000034396) ENSPPAG00000042795 DDX46 (ENSPPAG00000037804) CAMLG (ENSPPAG00000042799) SEC24A (ENSPPAG00000030247) ##33 SAR1B (ENSPPAG00000033175) JADE2 (ENSPPAG00000039071) CDKN2AIPNL (ENSPPAG00000030689) UBE2B (ENSPPAG00000038729) CDKL3 (ENSPPAG00000034942) PPP2CA (ENSPPAG00000029799) SKP1 (ENSPPAG00000013599) ENSPPAG00000034368 Human MODERN SPECIES 17 HNRNPA0 (ENSG00000177733) KLHL3 (ENSG00000146021) SPOCK1 (ENSG00000152377) TRPC7 (ENSG00000069018) SMIM32 (ENSG00000271824) SMAD5 (ENSG00000113658) TGFBI (ENSG00000120708) LECT2 (ENSG00000145826) IL9 (ENSG00000145839) CXCL14 (ENSG00000145824) NEUROG1 (ENSG00000181965) SLC25A48 (ENSG00000145832) TIFAB (ENSG00000255833) ##19 DCANP1 (ENSG00000251380) MACROH2A1 (ENSG00000113648) PITX1 (ENSG00000069011) #22 CATSPER3 (ENSG00000152705) PCBD2 (ENSG00000132570) TXNDC15 (ENSG00000113621) C5orf24 (ENSG00000181904) DDX46 (ENSG00000145833) CAMLG (ENSG00000164615) SEC24A (ENSG00000113615) ##33 SAR1B (ENSG00000152700) JADE2 (ENSG00000043143) CDKN2AIPNL (ENSG00000237190) UBE2B (ENSG00000119048) CDKL3 (ENSG00000006837) PPP2CA (ENSG00000113575) ENSG00000272772 SKP1 (ENSG00000113558) Orangutan MODERN SPECIES 18 HNRNPA0 (ENSPPYG00000015814) KLHL3 (ENSPPYG00000015813) SPOCK1 (ENSPPYG00000015812) ENSPPYG00000003782 TRPC7 (ENSPPYG00000015810) SMIM32 (ENSPPYG00000037100) SMAD5 (ENSPPYG00000015808) TGFBI (ENSPPYG00000015807) ENSPPYG00000015805 LECT2 (ENSPPYG00000033905) IL9 (ENSPPYG00000015804) ENSPPYG00000015803 CXCL14 (ENSPPYG00000015802) TIFAB (ENSPPYG00000015800) ##19 MACROH2A1 (ENSPPYG00000015799) PITX1 (ENSPPYG00000015797) #22 CATSPER3 (ENSPPYG00000015796) PCBD2 (ENSPPYG00000015795) TXNDC15 (ENSPPYG00000015794) ENSPPYG00000039359 C5H5orf24 (ENSPPYG00000015793) DDX46 (ENSPPYG00000015792) CAMLG (ENSPPYG00000015791) SEC24A (ENSPPYG00000015790) ##33 SAR1B (ENSPPYG00000015789) JADE2 (ENSPPYG00000015788) ENSPPYG00000035303 CDKN2AIPNL (ENSPPYG00000015787) UBE2B (ENSPPYG00000015786) ENSPPYG00000015785 SKP1 (ENSPPYG00000015783) Gibbon MODERN SPECIES 11 SMIM32 (ENSNLEG00000027339) SMAD5 (ENSNLEG00000008403) ENSNLEG00000008402 TGFBI (ENSNLEG00000008314) LECT2 (ENSNLEG00000008308) ENSNLEG00000008304 IL9 (ENSNLEG00000008279) ENSNLEG00000008267 ENSNLEG00000029173 ENSNLEG00000030616 CXCL14 (ENSNLEG00000008261) NEUROG1 (ENSNLEG00000018460) TIFAB (ENSNLEG00000035195) ##19 ENSNLEG00000008258 MACROH2A1 (ENSNLEG00000034006) ENSNLEG00000008236 #22 CATSPER3 (ENSNLEG00000008209) PCBD2 (ENSNLEG00000028354) TXNDC15 (ENSNLEG00000008191) ENSNLEG00000008189 DDX46 (ENSNLEG00000008167) CAMLG (ENSNLEG00000008160) SEC24A (ENSNLEG00000008135) ##33 SAR1B (ENSNLEG00000008118) ENSNLEG00000008110 CDKN2AIPNL (ENSNLEG00000030191) UBE2B (ENSNLEG00000008093) CDKL3 (ENSNLEG00000008065) PPP2CA (ENSNLEG00000034485) ENSNLEG00000008051 ENSNLEG00000008042 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00390000012652.ab.b Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Suina ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Pig MODERN SPECIES 10 KLHL3 (ENSSSCG00000014321) SPOCK1 (ENSSSCG00000032423) TRPC7 (ENSSSCG00000014318) SMIM32 (ENSSSCG00000040031) SMAD5 (ENSSSCG00000014319) TGFBI (ENSSSCG00000014316) LECT2 (ENSSSCG00000014315) ENSSSCG00000014314 IL9 (ENSSSCG00000025818) SLC25A48 (ENSSSCG00000014311) ENSSSCG00000045734 CXCL14 (ENSSSCG00000014310) NEUROG1 (ENSSSCG00000014309) TIFAB (ENSSSCG00000038110) ##19 MACROH2A1 (ENSSSCG00000014307) PITX1 (ENSSSCG00000061433) #22 CATSPER3 (ENSSSCG00000028294) ENSSSCG00000026229 TXNDC15 (ENSSSCG00000026106) C5orf24 (ENSSSCG00000034954) DDX46 (ENSSSCG00000026644) CAMLG (ENSSSCG00000038955) SEC24A (ENSSSCG00000014304) ##33 SAR1B (ENSSSCG00000014305) JADE2 (ENSSSCG00000014303) CDKN2AIPNL (ENSSSCG00000037127) UBE2B (ENSSSCG00000038953) CDKL3 (ENSSSCG00000014302) PPP2CA (ENSSSCG00000014298) SKP1 (ENSSSCG00000038628) TCF7 (ENSSSCG00000030680) Chacoan peccary MODERN SPECIES 204 TRPC7 (ENSCWAG00000001937) SMIM32 (ENSCWAG00000001893) SMAD5 (ENSCWAG00000001881) TGFBI (ENSCWAG00000001833) LECT2 (ENSCWAG00000001804) ENSCWAG00000001792 IL9 (ENSCWAG00000001777) SLC25A48 (ENSCWAG00000001741) CXCL14 (ENSCWAG00000001727) NEUROG1 (ENSCWAG00000001720) TIFAB (ENSCWAG00000001711) ##19 MACROH2A1 (ENSCWAG00000001657) PITX1 (ENSCWAG00000001637) #22 CATSPER3 (ENSCWAG00000001628) PCBD2 (ENSCWAG00000001617) TXNDC15 (ENSCWAG00000001604) C5orf24 (ENSCWAG00000001594) ENSCWAG00000001585 DDX46 (ENSCWAG00000001555) CAMLG (ENSCWAG00000001526) SEC24A (ENSCWAG00000001484) ##33 SAR1B (ENSCWAG00000001466) JADE2 (ENSCWAG00000001373) CDKN2AIPNL (ENSCWAG00000001332) UBE2B (ENSCWAG00000001325) CDKL3 (ENSCWAG00000001280) PPP2CA (ENSCWAG00000001252) SKP1 (ENSCWAG00000001228) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000000483.b.d.b ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000000483.b.d.b ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Dolphin MODERN SPECIES 3497 PITX1 (ENSTTRG00000016876) #22 CATSPER3 (ENSTTRG00000016875) PCBD2 (ENSTTRG00000016874) TXNDC15 (ENSTTRG00000016873) C5orf24 (ENSTTRG00000016871) DDX46 (ENSTTRG00000016869) CAMLG (ENSTTRG00000016867) SEC24A (ENSTTRG00000016865) ##33 SAR1B (ENSTTRG00000016864) JADE2 (ENSTTRG00000016863) CDKN2AIPNL (ENSTTRG00000016862) UBE2B (ENSTTRG00000016861) CDKL3 (ENSTTRG00000016860) PPP2CA (ENSTTRG00000016859) SKP1 (ENSTTRG00000016858) TCF7 (ENSTTRG00000016857) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000000483.b.d.b ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541.f ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT00390000000483.b.d.b ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541.f ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Narwhal MODERN SPECIES 298 SPOCK1 (ENSMMNG00015003342) ENSMMNG00015003317 ENSMMNG00015003303 TRPC7 (ENSMMNG00015003185) SMIM32 (ENSMMNG00015003128) SMAD5 (ENSMMNG00015003109) TGFBI (ENSMMNG00015003062) ENSMMNG00015003043 ENSMMNG00015003023 IL9 (ENSMMNG00015003002) SLC25A48 (ENSMMNG00015002975) CXCL14 (ENSMMNG00015002952) NEUROG1 (ENSMMNG00015002940) TIFAB (ENSMMNG00015002923) ##19 ENSMMNG00015002866 PITX1 (ENSMMNG00015002829) #22 CATSPER3 (ENSMMNG00015002813) PCBD2 (ENSMMNG00015002795) TXNDC15 (ENSMMNG00015002779) C5orf24 (ENSMMNG00015002768) DDX46 (ENSMMNG00015002724) CAMLG (ENSMMNG00015002694) SEC24A (ENSMMNG00015002600) ##33 SAR1B (ENSMMNG00015002534) JADE2 (ENSMMNG00015002387) CDKN2AIPNL (ENSMMNG00015002305) ENSMMNG00015002289 CDKL3 (ENSMMNG00015002257) PPP2CA (ENSMMNG00015002212) ENSMMNG00015002197 TCF7 (ENSMMNG00015002150) Beluga whale MODERN SPECIES 34 ENSDLEG00000004441 TRPC7 (ENSDLEG00000004407) SMIM32 (ENSDLEG00000004390) SMAD5 (ENSDLEG00000004363) TGFBI (ENSDLEG00000004348) LECT2 (ENSDLEG00000004333) ENSDLEG00000004328 ENSDLEG00000004323 IL9 (ENSDLEG00000004316) SLC25A48 (ENSDLEG00000004309) CXCL14 (ENSDLEG00000004300) NEUROG1 (ENSDLEG00000004295) TIFAB (ENSDLEG00000004287) ##19 ENSDLEG00000004276 ENSDLEG00000004268 PITX1 (ENSDLEG00000004261) #22 CATSPER3 (ENSDLEG00000004249) PCBD2 (ENSDLEG00000004235) TXNDC15 (ENSDLEG00000004230) CUNH5orf24 (ENSDLEG00000004224) DDX46 (ENSDLEG00000004211) CAMLG (ENSDLEG00000004203) SEC24A (ENSDLEG00000004181) ##33 SAR1B (ENSDLEG00000004168) JADE2 (ENSDLEG00000004151) CDKN2AIPNL (ENSDLEG00000004140) UBE2B (ENSDLEG00000004135) CDKL3 (ENSDLEG00000004128) PPP2CA (ENSDLEG00000004119) ENSDLEG00000004108 TCF7 (ENSDLEG00000004087) Vaquita MODERN SPECIES 14 SPOCK1 (ENSPSNG00000017848) TRPC7 (ENSPSNG00000018203) ENSPSNG00000018616 SMIM32 (ENSPSNG00000018652) SMAD5 (ENSPSNG00000018681) TGFBI (ENSPSNG00000018763) LECT2 (ENSPSNG00000018834) ENSPSNG00000018891 IL9 (ENSPSNG00000018906) SLC25A48 (ENSPSNG00000018955) ENSPSNG00000019038 CXCL14 (ENSPSNG00000019101) NEUROG1 (ENSPSNG00000019154) TIFAB (ENSPSNG00000019169) ##19 ENSPSNG00000019193 PITX1 (ENSPSNG00000019302) #22 CATSPER3 (ENSPSNG00000019338) PCBD2 (ENSPSNG00000019393) TXNDC15 (ENSPSNG00000019414) C5orf24 (ENSPSNG00000019472) DDX46 (ENSPSNG00000019517) CAMLG (ENSPSNG00000019584) SEC24A (ENSPSNG00000019616) ##33 ENSPSNG00000019675 SAR1B (ENSPSNG00000019715) JADE2 (ENSPSNG00000019780) CDKN2AIPNL (ENSPSNG00000000056) ENSPSNG00000000064 CDKL3 (ENSPSNG00000000099) PPP2CA (ENSPSNG00000000125) ENSPSNG00000000142 Sperm whale MODERN SPECIES 19 ENSPCTG00005013370 SPOCK1 (ENSPCTG00005012989) ENSPCTG00005012932 TRPC7 (ENSPCTG00005012458) SMIM32 (ENSPCTG00005012417) SMAD5 (ENSPCTG00005012364) TGFBI (ENSPCTG00005012265) ENSPCTG00005012220 FBXL21P (ENSPCTG00005012162) IL9 (ENSPCTG00005012105) SLC25A48 (ENSPCTG00005011999) CXCL14 (ENSPCTG00005011924) NEUROG1 (ENSPCTG00005011906) TIFAB (ENSPCTG00005011900) ##19 MACROH2A1 (ENSPCTG00005011747) PITX1 (ENSPCTG00005011707) #22 CATSPER3 (ENSPCTG00005011602) PCBD2 (ENSPCTG00005011566) TXNDC15 (ENSPCTG00005011498) C8H5orf24 (ENSPCTG00005011452) DDX46 (ENSPCTG00005011383) CAMLG (ENSPCTG00005011326) SEC24A (ENSPCTG00005011267) ##33 SAR1B (ENSPCTG00005011214) JADE2 (ENSPCTG00005010764) CDKN2AIPNL (ENSPCTG00005010729) UBE2B (ENSPCTG00005010679) CDKL3 (ENSPCTG00005010526) PPP2CA (ENSPCTG00005010464) SKP1 (ENSPCTG00005010295) TCF7 (ENSPCTG00005010007) Blue whale MODERN SPECIES 14 ENSBMSG00010001896 SPOCK1 (ENSBMSG00010001782) ENSBMSG00010001747 TRPC7 (ENSBMSG00010001458) SMIM32 (ENSBMSG00010001401) SMAD5 (ENSBMSG00010001384) TGFBI (ENSBMSG00010001339) ENSBMSG00010001322 ENSBMSG00010001307 IL9 (ENSBMSG00010001286) SLC25A48 (ENSBMSG00010001267) CXCL14 (ENSBMSG00010001250) NEUROG1 (ENSBMSG00010001238) TIFAB (ENSBMSG00010001227) ##19 MACROH2A1 (ENSBMSG00010001156) PITX1 (ENSBMSG00010001121) #22 CATSPER3 (ENSBMSG00010001029) PCBD2 (ENSBMSG00010001020) TXNDC15 (ENSBMSG00010000989) C5orf24 (ENSBMSG00010000970) DDX46 (ENSBMSG00010000904) CAMLG (ENSBMSG00010000870) SEC24A (ENSBMSG00010000853) ##33 SAR1B (ENSBMSG00010000823) JADE2 (ENSBMSG00010000773) CDKN2AIPNL (ENSBMSG00010000756) ENSBMSG00010000743 CDKL3 (ENSBMSG00010000621) PPP2CA (ENSBMSG00010000599) ENSBMSG00010000571 TCF7 (ENSBMSG00010000497) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Yarkand deer MODERN SPECIES 32 SPOCK1 (ENSCHYG00000010089) TRPC7 (ENSCHYG00000009288) SMIM32 (ENSCHYG00000009222) SMAD5 (ENSCHYG00000009159) TGFBI (ENSCHYG00000019745) LECT2 (ENSCHYG00000019673) ENSCHYG00000019555 IL9 (ENSCHYG00000019467) SLC25A48 (ENSCHYG00000019244) ENSCHYG00000019202 CXCL14 (ENSCHYG00000019117) NEUROG1 (ENSCHYG00000019085) ENSCHYG00000019058 ##19 MACROH2A1 (ENSCHYG00000018836) ENSCHYG00000018788 PITX1 (ENSCHYG00000018743) #22 ENSCHYG00000018710 CATSPER3 (ENSCHYG00000018597) PCBD2 (ENSCHYG00000018515) TXNDC15 (ENSCHYG00000018453) C5orf24 (ENSCHYG00000018373) DDX46 (ENSCHYG00000017047) CAMLG (ENSCHYG00000016873) SEC24A (ENSCHYG00000016665) ##33 SAR1B (ENSCHYG00000016568) JADE2 (ENSCHYG00000016164) ENSCHYG00000016035 CDKN2AIPNL (ENSCHYG00000015984) UBE2B (ENSCHYG00000015868) CDKL3 (ENSCHYG00000015697) PPP2CA (ENSCHYG00000015535) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Bos ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 26 HNRNPA0 (ENSBIXG00005001134) KLHL3 (ENSBIXG00005001122) SPOCK1 (ENSBIXG00005011413) TRPC7 (ENSBIXG00005011328) SMIM32 (ENSBIXG00005001066) SMAD5 (ENSBIXG00005006207) TGFBI (ENSBIXG00005006782) LECT2 (ENSBIXG00005011180) IL9 (ENSBIXG00005011161) SLC25A48 (ENSBIXG00005001024) CXCL14 (ENSBIXG00005011118) NEUROG1 (ENSBIXG00005001019) TIFAB (ENSBIXG00005001016) ##19 MACROH2A1 (ENSBIXG00005011050) DDX46 (ENSBIXG00005000976) PITX1 (ENSBIXG00005000961) #22 CATSPER3 (ENSBIXG00005010842) TXNDC15 (ENSBIXG00005010781) C5orf24 (ENSBIXG00005000936) CAMLG (ENSBIXG00005010728) SEC24A (ENSBIXG00005000631) ##33 SAR1B (ENSBIXG00005010665) JADE2 (ENSBIXG00005000689) CDKN2AIPNL (ENSBIXG00005010473) UBE2B (ENSBIXG00005010452) CDKL3 (ENSBIXG00005000877) PPP2CA (ENSBIXG00005000838) ENSBIXG00005000834 TCF7 (ENSBIXG00005010211) VDAC1 (ENSBIXG00005010095) C5orf15 (ENSBIXG00005010062) Cow MODERN SPECIES 26 HNRNPA0 (ENSBTAG00000016929) KLHL3 (ENSBTAG00000002796) SPOCK1 (ENSBTAG00000003502) TRPC7 (ENSBTAG00000014638) SMIM32 (ENSBTAG00000054891) SMAD5 (ENSBTAG00000055062) TGFBI (ENSBTAG00000009513) LECT2 (ENSBTAG00000001247) FBXL21 (ENSBTAG00000025182) IL9 (ENSBTAG00000018290) SLC25A48 (ENSBTAG00000018287) CXCL14 (ENSBTAG00000006694) NEUROG1 (ENSBTAG00000003331) TIFAB (ENSBTAG00000017648) ##19 MACROH2A1 (ENSBTAG00000016105) PITX1 (ENSBTAG00000004602) #22 CATSPER3 (ENSBTAG00000014746) PCBD2 (ENSBTAG00000050621) TXNDC15 (ENSBTAG00000014744) C7H5orf24 (ENSBTAG00000012762) DDX46 (ENSBTAG00000021520) CAMLG (ENSBTAG00000021519) SEC24A (ENSBTAG00000018322) ##33 SAR1B (ENSBTAG00000021226) JADE2 (ENSBTAG00000021687) CDKN2AIPNL (ENSBTAG00000010984) UBE2B (ENSBTAG00000010982) CDKL3 (ENSBTAG00000010979) PPP2CA (ENSBTAG00000000469) SKP1 (ENSBTAG00000025191) TCF7 (ENSBTAG00000001002) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Domestic yak MODERN SPECIES 27 ENSBGRG00000002700 SPOCK1 (ENSBGRG00000002639) TRPC7 (ENSBGRG00000002601) SMIM32 (ENSBGRG00000002570) SMAD5 (ENSBGRG00000002538) TGFBI (ENSBGRG00000002438) LECT2 (ENSBGRG00000002403) ENSBGRG00000002392 IL9 (ENSBGRG00000002374) SLC25A48 (ENSBGRG00000002319) CXCL14 (ENSBGRG00000002284) ENSBGRG00000002264 ENSBGRG00000002254 ENSBGRG00000002232 ##19 MACROH2A1 (ENSBGRG00000002073) PITX1 (ENSBGRG00000002014) #22 CATSPER3 (ENSBGRG00000001979) PCBD2 (ENSBGRG00000001957) TXNDC15 (ENSBGRG00000001937) C5orf24 (ENSBGRG00000001916) DDX46 (ENSBGRG00000001771) CAMLG (ENSBGRG00000001715) SEC24A (ENSBGRG00000001631) ##33 SAR1B (ENSBGRG00000001569) JADE2 (ENSBGRG00000001448) CDKN2AIPNL (ENSBGRG00000001401) UBE2B (ENSBGRG00000001392) CDKL3 (ENSBGRG00000001365) PP2Acalpha (ENSBGRG00000001299) ENSBGRG00000001287 TCF7 (ENSBGRG00000001126) Wild yak MODERN SPECIES 320 TGFBI (ENSBMUG00000001194) LECT2 (ENSBMUG00000001209) ENSBMUG00000001217 IL9 (ENSBMUG00000001225) SLC25A48 (ENSBMUG00000001243) CXCL14 (ENSBMUG00000001258) TIFAB (ENSBMUG00000001270) ##19 MACROH2A1 (ENSBMUG00000001296) PITX1 (ENSBMUG00000001329) #22 CATSPER3 (ENSBMUG00000001351) PCBD2 (ENSBMUG00000001362) TXNDC15 (ENSBMUG00000001379) C5orf24 (ENSBMUG00000001409) DDX46 (ENSBMUG00000001553) CAMLG (ENSBMUG00000001593) SEC24A (ENSBMUG00000001651) ##33 SAR1B (ENSBMUG00000001674) JADE2 (ENSBMUG00000001907) CDKN2AIPNL (ENSBMUG00000002007) ENSBMUG00000002018 CDKL3 (ENSBMUG00000002116) PPP2CA (ENSBMUG00000002156) ENSBMUG00000002203 TCF7 (ENSBMUG00000002245) American bison MODERN SPECIES 3121 KLHL3 (ENSBBBG00000008389) ENSBBBG00000005343 SPOCK1 (ENSBBBG00000005154) TRPC7 (ENSBBBG00000007104) SMIM32 (ENSBBBG00000019638) SMAD5 (ENSBBBG00000019631) TGFBI (ENSBBBG00000019589) LECT2 (ENSBBBG00000005310) ENSBBBG00000019567 IL9 (ENSBBBG00000019556) ENSBBBG00000007276 CXCL14 (ENSBBBG00000019528) NEUROG1 (ENSBBBG00000005274) TIFAB (ENSBBBG00000005270) ##19 MACROH2A1 (ENSBBBG00000019502) PITX1 (ENSBBBG00000008610) #22 CATSPER3 (ENSBBBG00000005201) PCBD2 (ENSBBBG00000008779) TXNDC15 (ENSBBBG00000005147) C5orf24 (ENSBBBG00000019397) DDX46 (ENSBBBG00000008835) CAMLG (ENSBBBG00000009173) SEC24A (ENSBBBG00000019313) ##33 SAR1B (ENSBBBG00000004990) JADE2 (ENSBBBG00000004974) CDKN2AIPNL (ENSBBBG00000019190) ENSBBBG00000019187 CDKL3 (ENSBBBG00000009163) PPP2CA (ENSBBBG00000004914) SKP1 (ENSBBBG00000019111) TCF7 (ENSBBBG00000019088) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 21 SPOCK1 (ENSOARG00020011504) ENSOARG00020011445 TRPC7 (ENSOARG00020010463) SMIM32 (ENSOARG00020010400) SMAD5 (ENSOARG00020010293) TGFBI (ENSOARG00020010032) LECT2 (ENSOARG00020009943) ENSOARG00020009853 IL9 (ENSOARG00020009800) SLC25A48 (ENSOARG00020009641) CXCL14 (ENSOARG00020009588) NEUROG1 (ENSOARG00020009570) TIFAB (ENSOARG00020009552) ##19 H2AFY (ENSOARG00020009375) ENSOARG00020009347 PITX1 (ENSOARG00020009307) #22 CATSPER3 (ENSOARG00020009232) PCBD2 (ENSOARG00020009182) TXNDC15 (ENSOARG00020009129) C5orf24 (ENSOARG00020009076) DDX46 (ENSOARG00020008824) CAMLG (ENSOARG00020008740) SEC24A (ENSOARG00020008223) ##33 SAR1B (ENSOARG00020008125) JADE2 (ENSOARG00020007407) CDKN2AIPNL (ENSOARG00020007343) UBE2B (ENSOARG00020022616) CDKL3 (ENSOARG00020022325) ENSOARG00020022273 ENSOARG00020022204 TCF7 (ENSOARG00020021919) Goat MODERN SPECIES 26 ENSCHIG00000017448 HNRNPA0 (ENSCHIG00000002602) KLHL3 (ENSCHIG00000013138) SPOCK1 (ENSCHIG00000021668) TRPC7 (ENSCHIG00000013534) SMIM32 (ENSCHIG00000006529) SMAD5 (ENSCHIG00000014806) TGFBI (ENSCHIG00000004685) LECT2 (ENSCHIG00000020059) ENSCHIG00000026790 SLC25A48 (ENSCHIG00000012656) CXCL14 (ENSCHIG00000008797) NEUROG1 (ENSCHIG00000013410) TIFAB (ENSCHIG00000007979) ##19 MACROH2A1 (ENSCHIG00000021411) PITX1 (ENSCHIG00000005326) #22 CATSPER3 (ENSCHIG00000009543) PCBD2 (ENSCHIG00000023788) TXNDC15 (ENSCHIG00000010236) ENSCHIG00000016073 C5orf24 (ENSCHIG00000012125) DDX46 (ENSCHIG00000026009) CAMLG (ENSCHIG00000005820) SEC24A (ENSCHIG00000024982) ##33 SAR1B (ENSCHIG00000022509) JADE2 (ENSCHIG00000012699) CDKN2AIPNL (ENSCHIG00000027126) UBE2B (ENSCHIG00000017701) CDKL3 (ENSCHIG00000008858) PPP2CA (ENSCHIG00000023636) ENSCHIG00000015329 Siberian musk deer MODERN SPECIES 49 KLHL3 (ENSMMSG00000004514) SPOCK1 (ENSMMSG00000004601) TRPC7 (ENSMMSG00000004746) SMIM32 (ENSMMSG00000005715) SMAD5 (ENSMMSG00000005736) TGFBI (ENSMMSG00000005796) LECT2 (ENSMMSG00000005881) ENSMMSG00000005935 IL9 (ENSMMSG00000005966) SLC25A48 (ENSMMSG00000006020) CXCL14 (ENSMMSG00000006177) NEUROG1 (ENSMMSG00000006197) TIFAB (ENSMMSG00000006208) ##19 MACROH2A1 (ENSMMSG00000006223) ENSMMSG00000006307 PITX1 (ENSMMSG00000006325) #22 CATSPER3 (ENSMMSG00000013928) PCBD2 (ENSMMSG00000013960) TXNDC15 (ENSMMSG00000013982) C5orf24 (ENSMMSG00000014006) DDX46 (ENSMMSG00000014044) CAMLG (ENSMMSG00000014100) SEC24A (ENSMMSG00000014138) ##33 SAR1B (ENSMMSG00000014243) JADE2 (ENSMMSG00000014299) CDKN2AIPNL (ENSMMSG00000014743) ENSMMSG00000014776 CDKL3 (ENSMMSG00000014817) ENSMMSG00000015075 ENSMMSG00000015092 TCF7 (ENSMMSG00000015169) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154.k ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Arabian camel MODERN SPECIES 22 MYOT (ENSCDRG00005002030) SPOCK1 (ENSCDRG00005002050) TRPC7 (ENSCDRG00005002085) SMIM32 (ENSCDRG00005002110) SMAD5 (ENSCDRG00005002115) TGFBI (ENSCDRG00005002134) LECT2 (ENSCDRG00005002171) ENSCDRG00005002189 IL9 (ENSCDRG00005002202) SLC25A48 (ENSCDRG00005002220) ENSCDRG00005002254 ENSCDRG00005002269 NEUROG1 (ENSCDRG00005002289) TIFAB (ENSCDRG00005002293) ##19 MACROH2A1 (ENSCDRG00005002312) PITX1 (ENSCDRG00005002357) #22 CATSPER3 (ENSCDRG00005002372) PCBD2 (ENSCDRG00005002391) TXNDC15 (ENSCDRG00005002410) C5orf24 (ENSCDRG00005002423) DDX46 (ENSCDRG00005002451) CAMLG (ENSCDRG00005002484) SEC24A (ENSCDRG00005002533) ##33 SAR1B (ENSCDRG00005002739) JADE2 (ENSCDRG00005002781) CDKN2AIPNL (ENSCDRG00005002906) UBE2B (ENSCDRG00005002926) CDKL3 (ENSCDRG00005002942) PPP2CA (ENSCDRG00005003008) ENSCDRG00005003041 TCF7 (ENSCDRG00005003054) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Felidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00510000046986.v.b.b.a ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Cat MODERN SPECIES ENSFCAG00000047766 SPOCK1 (ENSFCAG00000015544) TRPC7 (ENSFCAG00000013246) SMIM32 (ENSFCAG00000034925) SMAD5 (ENSFCAG00000025329) TGFBI (ENSFCAG00000014342) LECT2 (ENSFCAG00000014555) FBXL21 (ENSFCAG00000035081) IL9 (ENSFCAG00000013931) SLC25A48 (ENSFCAG00000013930) ENSFCAG00000035334 CXCL14 (ENSFCAG00000013929) NEUROG1 (ENSFCAG00000038610) TIFAB (ENSFCAG00000040992) ##19 MACROH2A1 (ENSFCAG00000013924) PITX1 (ENSFCAG00000044399) #22 CATSPER3 (ENSFCAG00000006832) TXNDC15 (ENSFCAG00000025528) DDX46 (ENSFCAG00000026229) CAMLG (ENSFCAG00000026813) SEC24A (ENSFCAG00000013980) ##33 SAR1B (ENSFCAG00000000338) JADE2 (ENSFCAG00000029905) CDKN2AIPNL (ENSFCAG00000036907) UBE2B (ENSFCAG00000039904) CDKL3 (ENSFCAG00000024742) PPP2CA (ENSFCAG00000033613) ENSFCAG00000031140 TCF7 (ENSFCAG00000008424) VDAC1 (ENSFCAG00000008421) CA1H5orf15 (ENSFCAG00000022790) Panthera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00510000046986.v.b.b.a ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Tiger MODERN SPECIES 107 MYOT (ENSPTIG00000003486) KLHL3 (ENSPTIG00000021648) ENSPTIG00000000865 SPOCK1 (ENSPTIG00000018667) TRPC7 (ENSPTIG00000014175) SMAD5 (ENSPTIG00000013125) TGFBI (ENSPTIG00000010396) LECT2 (ENSPTIG00000010046) ENSPTIG00000009484 IL9 (ENSPTIG00000008376) SLC25A48 (ENSPTIG00000007726) ENSPTIG00000005256 CXCL14 (ENSPTIG00000020239) TIFAB (ENSPTIG00000000566) ##19 MACROH2A1 (ENSPTIG00000017758) PITX1 (ENSPTIG00000017080) #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 lion MODERN SPECIES KLHL3 (ENSPLOG00000000092) SPOCK1 (ENSPLOG00000000116) TRPC7 (ENSPLOG00000000196) SMIM32 (ENSPLOG00000000251) SMAD5 (ENSPLOG00000000264) TGFBI (ENSPLOG00000000292) LECT2 (ENSPLOG00000000342) ENSPLOG00000000357 IL9 (ENSPLOG00000000370) SLC25A48 (ENSPLOG00000000393) ENSPLOG00000000414 CXCL14 (ENSPLOG00000000428) NEUROG1 (ENSPLOG00000000439) TIFAB (ENSPLOG00000000446) ##19 MACROH2A1 (ENSPLOG00000000479) PITX1 (ENSPLOG00000000501) #22 CATSPER3 (ENSPLOG00000000516) PCBD2 (ENSPLOG00000000536) TXNDC15 (ENSPLOG00000000551) C5orf24 (ENSPLOG00000000632) DDX46 (ENSPLOG00000000678) CAMLG (ENSPLOG00000000745) SEC24A (ENSPLOG00000000780) ##33 SAR1B (ENSPLOG00000000835) JADE2 (ENSPLOG00000000897) CDKN2AIPNL (ENSPLOG00000000981) UBE2B (ENSPLOG00000000999) CDKL3 (ENSPLOG00000001036) PPP2CA (ENSPLOG00000001057) ENSPLOG00000001076 TCF7 (ENSPLOG00000001137) leopard MODERN SPECIES 89 TRPC7 (ENSPPRG00000024503) SMIM32 (ENSPPRG00000017516) SMAD5 (ENSPPRG00000019946) TGFBI (ENSPPRG00000019384) LECT2 (ENSPPRG00000018360) ENSPPRG00000018200 IL9 (ENSPPRG00000017376) SLC25A48 (ENSPPRG00000016284) CXCL14 (ENSPPRG00000014762) TIFAB (ENSPPRG00000017477) ##19 MACROH2A1 (ENSPPRG00000014201) PITX1 (ENSPPRG00000012900) #22 CATSPER3 (ENSPPRG00000012747) PCBD2 (ENSPPRG00000012520) TXNDC15 (ENSPPRG00000011247) C5orf24 (ENSPPRG00000010838) DDX46 (ENSPPRG00000010743) CAMLG (ENSPPRG00000009315) SEC24A (ENSPPRG00000009141) ##33 SAR1B (ENSPPRG00000008356) JADE2 (ENSPPRG00000008224) CDKN2AIPNL (ENSPPRG00000006924) UBE2B (ENSPPRG00000006222) CDKL3 (ENSPPRG00000005837) PPP2CA (ENSPPRG00000003724) ENSPPRG00000003239 TCF7 (ENSPPRG00000002477) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Ferret MODERN SPECIES 175 ENSMPUG00000009912 SPOCK1 (ENSMPUG00000009917) ENSMPUG00000009925 TRPC7 (ENSMPUG00000009931) SMAD5 (ENSMPUG00000009935) TGFBI (ENSMPUG00000009938) LECT2 (ENSMPUG00000009945) ENSMPUG00000009952 IL9 (ENSMPUG00000009959) SLC25A48 (ENSMPUG00000009981) ENSMPUG00000009992 CXCL14 (ENSMPUG00000009997) NEUROG1 (ENSMPUG00000019792) TIFAB (ENSMPUG00000010009) ##19 MACROH2A1 (ENSMPUG00000010011) PITX1 (ENSMPUG00000010019) #22 CATSPER3 (ENSMPUG00000010032) TXNDC15 (ENSMPUG00000010036) DDX46 (ENSMPUG00000010045) CAMLG (ENSMPUG00000010061) SEC24A (ENSMPUG00000010069) ##33 SAR1B (ENSMPUG00000010087) JADE2 (ENSMPUG00000010095) CDKN2AIPNL (ENSMPUG00000010101) UBE2B (ENSMPUG00000010112) CDKL3 (ENSMPUG00000010119) ENSMPUG00000019793 PPP2CA (ENSMPUG00000010169) TCF7 (ENSMPUG00000010174) ENSMPUG00000010220 C5orf15 (ENSMPUG00000010282) American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 23 ENSNVIG00000008883 #22 ENPEP (ENSNVIG00000008861) #23 ELOVL6 (ENSNVIG00000008824) #24 EGF (ENSNVIG00000008686) #25 LRIT3 (ENSNVIG00000008664) #26 RRH (ENSNVIG00000008643) #27 GAR1 (ENSNVIG00000008616) #28 ENSNVIG00000008605 #29 PLA2G12A (ENSNVIG00000008582) #30 CASP6 (ENSNVIG00000008531) #31 MCUB (ENSNVIG00000008506) #32 SEC24B (ENSNVIG00000007302) #33 COL25A1 (ENSNVIG00000006813) #34 ETNPPL (ENSNVIG00000006726) #35 OSTC (ENSNVIG00000006710) #36 ENSNVIG00000006689 ##37 American mink MODERN SPECIES 21 KLHL3 (ENSNVIG00000015704) ENSNVIG00000015795 SPOCK1 (ENSNVIG00000015810) TRPC7 (ENSNVIG00000015856) SMIM32 (ENSNVIG00000015959) SMAD5 (ENSNVIG00000015960) TGFBI (ENSNVIG00000015996) LECT2 (ENSNVIG00000016020) ENSNVIG00000016044 IL9 (ENSNVIG00000016058) SLC25A48 (ENSNVIG00000016069) CXCL14 (ENSNVIG00000016089) NEUROG1 (ENSNVIG00000016109) TIFAB (ENSNVIG00000016122) ##19 MACROH2A1 (ENSNVIG00000016130) PITX1 (ENSNVIG00000016229) #22 CTSR3 (ENSNVIG00000016243) PCBD2 (ENSNVIG00000016278) TXNDC15 (ENSNVIG00000016289) C5orf24 (ENSNVIG00000016304) DDX46 (ENSNVIG00000016315) CAMLG (ENSNVIG00000016384) SEC24A (ENSNVIG00000016430) ##33 ENSNVIG00000016531 SAR1B (ENSNVIG00000016537) JADE2 (ENSNVIG00000016580) CDKN2AIPNL (ENSNVIG00000016676) UBE2B (ENSNVIG00000016690) CDKL3 (ENSNVIG00000016706) PPP2CA (ENSNVIG00000016768) ENSNVIG00000016786 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000157891.q ENSGT00940000158371 ENSGT00920000150750 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a.d ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491.s ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Giant Panda MODERN SPECIES 13 KLHL3 (ENSAMEG00000016293) ENSAMEG00000030551 SPOCK1 (ENSAMEG00000016040) ENSAMEG00000026529 TRPC7 (ENSAMEG00000017948) SMIM32 (ENSAMEG00000017947) SMAD5 (ENSAMEG00000017941) ENSAMEG00000017907 LECT2 (ENSAMEG00000017902) ENSAMEG00000026123 IL9 (ENSAMEG00000017898) CXCL14 (ENSAMEG00000028305) SLC25A48 (ENSAMEG00000017895) TIFAB (ENSAMEG00000017890) ##19 ENSAMEG00000017887 PITX1 (ENSAMEG00000024712) #22 CATSPER3 (ENSAMEG00000017882) PCBD2 (ENSAMEG00000024638) TXNDC15 (ENSAMEG00000017879) C5orf24 (ENSAMEG00000018842) DDX46 (ENSAMEG00000017873) CAMLG (ENSAMEG00000017871) SEC24A (ENSAMEG00000017858) ##33 SAR1B (ENSAMEG00000017849) JADE2 (ENSAMEG00000017840) CDKN2AIPNL (ENSAMEG00000017839) UBE2B (ENSAMEG00000017829) CDKL3 (ENSAMEG00000017820) PPP2CA (ENSAMEG00000029106) ENSAMEG00000017810 TCF7 (ENSAMEG00000017798) Ursus ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157891.q ENSGT00940000158371 ENSGT00920000150750 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a.d ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491.s ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b.v ENSGT00390000012652.bb American black bear MODERN SPECIES 483 PITX1 (ENSUAMG00000017606) #22 CATSPER3 (ENSUAMG00000017608) PCBD2 (ENSUAMG00000017611) TXNDC15 (ENSUAMG00000017612) C5orf24 (ENSUAMG00000017614) Polar bear MODERN SPECIES 173 MYOT (ENSUMAG00000016460) ENSUMAG00000016473 KLHL3 (ENSUMAG00000016493) SPOCK1 (ENSUMAG00000016534) ENSUMAG00000016581 TRPC7 (ENSUMAG00000016596) SMAD5 (ENSUMAG00000016742) TGFBI (ENSUMAG00000016803) LECT2 (ENSUMAG00000017276) ENSUMAG00000017281 IL9 (ENSUMAG00000017288) SLC25A48 (ENSUMAG00000017303) CXCL14 (ENSUMAG00000017312) TIFAB (ENSUMAG00000017323) ##19 MACROH2A1 (ENSUMAG00000017330) PITX1 (ENSUMAG00000017343) #22 CATSPER3 (ENSUMAG00000017351) PCBD2 (ENSUMAG00000017358) TXNDC15 (ENSUMAG00000017361) C5orf24 (ENSUMAG00000017367) DDX46 (ENSUMAG00000017446) CAMLG (ENSUMAG00000017662) SEC24A (ENSUMAG00000017669) ##33 SAR1B (ENSUMAG00000017678) JADE2 (ENSUMAG00000017684) UBE2B (ENSUMAG00000017720) CDKL3 (ENSUMAG00000017727) PPP2CA (ENSUMAG00000017743) SKP1 (ENSUMAG00000017784) TCF7 (ENSUMAG00000017791) VDAC1 (ENSUMAG00000017808) Canidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000158371 ENSGT00940000154586.m.a.b ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Red fox MODERN SPECIES 17 ENSVVUG00000017185 ENSVVUG00000017208 ENSVVUG00000017215 TRPC7 (ENSVVUG00000017265) SMAD5 (ENSVVUG00000017350) TGFBI (ENSVVUG00000017365) LECT2 (ENSVVUG00000017373) ENSVVUG00000017399 IL9 (ENSVVUG00000017411) SLC25A48 (ENSVVUG00000017447) ENSVVUG00000017461 CXCL14 (ENSVVUG00000017464) NEUROG1 (ENSVVUG00000017479) TIFAB (ENSVVUG00000017484) ##19 MACROH2A1 (ENSVVUG00000017487) PITX1 (ENSVVUG00000017511) #22 CATSPER3 (ENSVVUG00000017514) PCBD2 (ENSVVUG00000017522) TXNDC15 (ENSVVUG00000017530) CUNH5orf24 (ENSVVUG00000017545) DDX46 (ENSVVUG00000017549) CAMLG (ENSVVUG00000017569) SEC24A (ENSVVUG00000017713) ##33 SAR1B (ENSVVUG00000021294) JADE2 (ENSVVUG00000021300) CDKN2AIPNL (ENSVVUG00000021312) UBE2B (ENSVVUG00000021319) CDKL3 (ENSVVUG00000021356) PPP2CA (ENSVVUG00000021365) SKP1 (ENSVVUG00000021377) TCF7 (ENSVVUG00000021387) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158371 ENSGT00940000154586.m.a.b ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b.v ENSGT00940000159831 Dingo MODERN SPECIES 308 ENSCAFG00020017349 ENSCAFG00020017345 ARSJ (ENSCAFG00020017341) #11 ENSCAFG00020017332 #12 ENSCAFG00020017278 #13 ENSCAFG00020017243 #13 LARP7 (ENSCAFG00020017225) #14 ENSCAFG00020017220 ENSCAFG00020017208 #16 NEUROG2 (ENSCAFG00020017205) #17 ALPK1 (ENSCAFG00020017196) #18 TIFA (ENSCAFG00020017192) #19 AP1AR (ENSCAFG00020017172) #20 FAM241A (ENSCAFG00020017167) #21 ENSCAFG00020017152 ENSCAFG00020017149 #22 ENSCAFG00020017147 ENPEP (ENSCAFG00020015734) #23 ENSCAFG00020015727 ELOVL6 (ENSCAFG00020015726) #24 ENSCAFG00020015724 EGF (ENSCAFG00020015579) #25 LRIT3 (ENSCAFG00020015570) #26 RRH (ENSCAFG00020015567) #27 GAR1 (ENSCAFG00020015566) #28 CFI (ENSCAFG00020015559) #29 PLA2G12A (ENSCAFG00020015557) #30 CASP6 (ENSCAFG00020015552) #31 MCUB (ENSCAFG00020015544) #32 SEC24B (ENSCAFG00020010198) #33 ENSCAFG00020010068 #35 Dog MODERN SPECIES 2 SPOCK1 (ENSCAFG00845016123) ENSCAFG00845016046 TRPC7 (ENSCAFG00845014533) SMIM32 (ENSCAFG00845014469) SMAD5 (ENSCAFG00845014450) TGFBI (ENSCAFG00845014380) LECT2 (ENSCAFG00845014355) ENSCAFG00845014341 IL9 (ENSCAFG00845014320) SLC25A48 (ENSCAFG00845014130) ENSCAFG00845014010 CXCL14 (ENSCAFG00845013971) NEUROG1 (ENSCAFG00845013951) TIFAB (ENSCAFG00845013938) ##19 MACROH2A1 (ENSCAFG00845013920) PITX1 (ENSCAFG00845013882) #22 CATSPER3 (ENSCAFG00845013828) PCBD2 (ENSCAFG00845013812) TXNDC15 (ENSCAFG00845013770) C5orf24 (ENSCAFG00845013744) DDX46 (ENSCAFG00845013658) CAMLG (ENSCAFG00845013583) SEC24A (ENSCAFG00845013374) ##33 SAR1B (ENSCAFG00845013299) JADE2 (ENSCAFG00845013059) CDKN2AIPNL (ENSCAFG00845012929) UBE2B (ENSCAFG00845012898) CDKL3 (ENSCAFG00845012747) PPP2CA (ENSCAFG00845012605) SKP1 (ENSCAFG00845012532) ENSCAFG00845012366 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Equus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00560000078590 ENSGT00390000000618 ENSGT00910000146804 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT01100000263508.A.d.e.a.a.a.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb Horse MODERN SPECIES 5 KLHL3 (ENSECAG00000022073) SPOCK1 (ENSECAG00000007511) TRPC7 (ENSECAG00000007659) SMAD5 (ENSECAG00000018506) TGFBI (ENSECAG00000020193) LECT2 (ENSECAG00000008324) FBXL21 (ENSECAG00000008980) IL9 (ENSECAG00000026985) SLC25A48 (ENSECAG00000009238) ENSECAG00000036708 ENSECAG00000032085 ENSECAG00000055766 NEUROG1 (ENSECAG00000010202) TIFAB (ENSECAG00000005282) ##19 MACROH2A1 (ENSECAG00000010224) PITX1 (ENSECAG00000014725) #22 PCBD2 (ENSECAG00000015810) ENSECAG00000049763 TXNDC15 (ENSECAG00000016199) C14H5orf24 (ENSECAG00000039558) DDX46 (ENSECAG00000018217) CAMLG (ENSECAG00000001757) SEC24A (ENSECAG00000002321) ##33 SAR1B (ENSECAG00000012409) JADE2 (ENSECAG00000013170) ENSECAG00000048044 CDKN2AIPNL (ENSECAG00000016203) UBE2B (ENSECAG00000032089) CDKL3 (ENSECAG00000018013) PPP2CA (ENSECAG00000052111) SKP1 (ENSECAG00000050063) Donkey MODERN SPECIES 3 KLHL3 (ENSEASG00005020585) SPOCK1 (ENSEASG00005020567) TRPC7 (ENSEASG00005020538) SMIM32 (ENSEASG00005020531) SMAD5 (ENSEASG00005020529) TGFBI (ENSEASG00005020514) LECT2 (ENSEASG00005026412) ENSEASG00005023760 IL9 (ENSEASG00005020504) SLC25A48 (ENSEASG00005020501) ENSEASG00005020496 ENSEASG00005036931 NEUROG1 (ENSEASG00005020492) TIFAB (ENSEASG00005020490) ##19 MACROH2A1 (ENSEASG00005020486) PITX1 (ENSEASG00005025464) #22 CATSPER3 (ENSEASG00005020475) ENSEASG00005020479 ENSEASG00005026102 TXNDC15 (ENSEASG00005020470) C5orf24 (ENSEASG00005035504) DDX46 (ENSEASG00005020329) CAMLG (ENSEASG00005027453) SEC24A (ENSEASG00005018668) ##33 SAR1B (ENSEASG00005018603) JADE2 (ENSEASG00005018548) ENSEASG00005031046 CDKN2AIPNL (ENSEASG00005026846) UBE2B (ENSEASG00005030009) CDKL3 (ENSEASG00005018501) PPP2CA (ENSEASG00005037929) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Megabat MODERN SPECIES 6388 PITX1 (ENSPVAG00000000388) #22 CATSPER3 (ENSPVAG00000000386) PCBD2 (ENSPVAG00000000384) Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT01090000260575 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b.u.b Microbat MODERN SPECIES 965 ENSMLUG00000010156 HNRNPA0 (ENSMLUG00000012683) KLHL3 (ENSMLUG00000007423) SPOCK1 (ENSMLUG00000008284) ENSMLUG00000028409 TRPC7 (ENSMLUG00000017617) SMAD5 (ENSMLUG00000002321) TGFBI (ENSMLUG00000015936) LECT2 (ENSMLUG00000015931) ENSMLUG00000015921 SLC25A48 (ENSMLUG00000014430) CXCL14 (ENSMLUG00000004574) NEUROG1 (ENSMLUG00000004571) TIFAB (ENSMLUG00000029584) ##19 MACROH2A1 (ENSMLUG00000012662) PITX1 (ENSMLUG00000012646) #22 CATSPER3 (ENSMLUG00000012640) PCBD2 (ENSMLUG00000012638) TXNDC15 (ENSMLUG00000012632) C5orf24 (ENSMLUG00000012625) DDX46 (ENSMLUG00000012607) SEC24A (ENSMLUG00000013536) ##33 SAR1B (ENSMLUG00000016342) JADE2 (ENSMLUG00000016330) CDKN2AIPNL (ENSMLUG00000012917) UBE2B (ENSMLUG00000012910) CDKL3 (ENSMLUG00000012902) PPP2CA (ENSMLUG00000016854) ENSMLUG00000022919 TCF7 (ENSMLUG00000006530) VDAC1 (ENSMLUG00000012467) Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 23 NWD2 (ENSRFEG00010000529) C4orf19 (ENSRFEG00010000507) RELL1 (ENSRFEG00010000481) PGM2 (ENSRFEG00010000444) TBC1D1 (ENSRFEG00010000328) KLF3 (ENSRFEG00010000276) TLR10 (ENSRFEG00010000243) TLR1 (ENSRFEG00010000229) TLR6 (ENSRFEG00010004901) FAM114A1 (ENSRFEG00010004887) TMEM156 (ENSRFEG00010004878) KLHL5 (ENSRFEG00010004840) WDR19 (ENSRFEG00010004764) RFC1 (ENSRFEG00010004720) ENSRFEG00010004700 ENSRFEG00010004682 #22 ENPEP (ENSRFEG00010004651) #23 ELOVL6 (ENSRFEG00010004640) #24 EGF (ENSRFEG00010004614) #25 LRIT3 (ENSRFEG00010004578) #26 RRH (ENSRFEG00010004533) #27 GAR1 (ENSRFEG00010004525) #28 ENSRFEG00010004517 CFI (ENSRFEG00010004410) #29 CASP6 (ENSRFEG00010004339) #31 MCUB (ENSRFEG00010004308) #32 SEC24B (ENSRFEG00010004287) #33 COL25A1 (ENSRFEG00010003938) #34 ETNPPL (ENSRFEG00010003723) #35 OSTC (ENSRFEG00010003698) #36 ENSRFEG00010003688 ##37 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 16 SPOCK1 (ENSRFEG00010006932) TRPC7 (ENSRFEG00010006658) SMIM32 (ENSRFEG00010006569) ENSRFEG00010006547 SMAD5 (ENSRFEG00010006500) TGFBI (ENSRFEG00010006430) LECT2 (ENSRFEG00010006386) ENSRFEG00010006367 IL9 (ENSRFEG00010006329) SLC25A48 (ENSRFEG00010006251) ENSRFEG00010006167 CXCL14 (ENSRFEG00010006142) NEUROG1 (ENSRFEG00010006123) TIFAB (ENSRFEG00010006105) ##19 MACROH2A1 (ENSRFEG00010006022) PITX1 (ENSRFEG00010005915) #22 CATSPER3 (ENSRFEG00010005873) TXNDC15 (ENSRFEG00010005814) C5orf24 (ENSRFEG00010005786) DDX46 (ENSRFEG00010019716) CAMLG (ENSRFEG00010019647) ENSRFEG00010019614 SAR1B (ENSRFEG00010019572) JADE2 (ENSRFEG00010019310) CDKN2AIPNL (ENSRFEG00010019255) UBE2B (ENSRFEG00010019234) CDKL3 (ENSRFEG00010019192) PPP2CA (ENSRFEG00010019120) ENSRFEG00010018983 TCF7 (ENSRFEG00010018892) VDAC1 (ENSRFEG00010018814) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES 1970 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 Common shrew MODERN SPECIES 8789 PITX1 (ENSSARG00000012726) #22 Hedgehog MODERN SPECIES 4781 PITX1 (ENSEEUG00000010498) #22 CATSPER3 (ENSEEUG00000010454) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00390000012652.ab.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT01090000260575 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b Armadillo MODERN SPECIES 3458 LECT2 (ENSDNOG00000042041) SLC25A48 (ENSDNOG00000040974) CXCL14 (ENSDNOG00000037894) NEUROG1 (ENSDNOG00000018026) ENSDNOG00000036986 TIFAB (ENSDNOG00000041880) ##19 MACROH2A1 (ENSDNOG00000047517) PITX1 (ENSDNOG00000034587) #22 CATSPER3 (ENSDNOG00000012508) PCBD2 (ENSDNOG00000044959) TXNDC15 (ENSDNOG00000017904) C5orf24 (ENSDNOG00000034721) DDX46 (ENSDNOG00000011448) CAMLG (ENSDNOG00000017271) ENSDNOG00000013795 SAR1B (ENSDNOG00000044440) JADE2 (ENSDNOG00000045101) CDKN2AIPNL (ENSDNOG00000044441) UBE2B (ENSDNOG00000015719) PPP2CA (ENSDNOG00000013011) ENSDNOG00000012999 TCF7 (ENSDNOG00000012979) VDAC1 (ENSDNOG00000045241) Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161122 ENSGT00940000159795 ENSGT00940000153147.n ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00390000012652.ab.a Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 17665 ENSETEG00000019990 #22 Tenrec MODERN SPECIES 5478 PITX1 (ENSETEG00000012631) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000161122 ENSGT00940000159795 ENSGT00940000153147.n ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00390000012652.ab.a ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 95 TRAM1L1 (ENSLAFG00000029932) NDST4 (ENSLAFG00000016988) #9 UGT8 (ENSLAFG00000000017) #10 ENSLAFG00000028997 ARSJ (ENSLAFG00000010599) #11 CAMK2D (ENSLAFG00000004718) ENSLAFG00000030524 #13 ENSLAFG00000028722 LARP7 (ENSLAFG00000015769) #14 ENSLAFG00000015144 ENSLAFG00000015140 #16 ALPK1 (ENSLAFG00000015129) #18 TIFA (ENSLAFG00000009392) #19 AP1AR (ENSLAFG00000009389) #20 FAM241A (ENSLAFG00000009717) #21 ENSLAFG00000021420 #22 ENPEP (ENSLAFG00000008127) #23 ELOVL6 (ENSLAFG00000021532) #24 EGF (ENSLAFG00000013803) #25 LRIT3 (ENSLAFG00000009373) #26 RRH (ENSLAFG00000009369) #27 CFI (ENSLAFG00000011698) #29 PLA2G12A (ENSLAFG00000000852) #30 CASP6 (ENSLAFG00000002727) #31 MCUB (ENSLAFG00000002726) #32 SEC24B (ENSLAFG00000013688) #33 ENSLAFG00000008674 #34 ETNPPL (ENSLAFG00000008666) #35 OSTC (ENSLAFG00000026381) #36 RPL34 (ENSLAFG00000032615) ##37 ENSLAFG00000025607 Elephant MODERN SPECIES 2 FAM13B (ENSLAFG00000011702) PKD2L2 (ENSLAFG00000011695) MYOT (ENSLAFG00000011688) ENSLAFG00000028290 KLHL3 (ENSLAFG00000006956) ENSLAFG00000017553 TRPC7 (ENSLAFG00000004342) SMAD5 (ENSLAFG00000004338) TGFBI (ENSLAFG00000003960) LECT2 (ENSLAFG00000002269) IL9 (ENSLAFG00000018404) SLC25A48 (ENSLAFG00000027125) CXCL14 (ENSLAFG00000016262) NEUROG1 (ENSLAFG00000010799) MACROH2A1 (ENSLAFG00000007410) PITX1 (ENSLAFG00000026039) #22 CATSPER3 (ENSLAFG00000008372) PCBD2 (ENSLAFG00000008369) TXNDC15 (ENSLAFG00000008364) C5orf24 (ENSLAFG00000010469) DDX46 (ENSLAFG00000010465) CAMLG (ENSLAFG00000005101) SEC24A (ENSLAFG00000005093) ##33 SAR1B (ENSLAFG00000001021) JADE2 (ENSLAFG00000001018) CDKN2AIPNL (ENSLAFG00000011476) UBE2B (ENSLAFG00000021714) CDKL3 (ENSLAFG00000011468) PPP2CA (ENSLAFG00000016840) ENSLAFG00000016832 TCF7 (ENSLAFG00000016828) Hyrax DUPLICATION Hyrax MODERN SPECIES 9665 ENSPCAG00000006124 #22 Hyrax MODERN SPECIES 1189 PITX1 (ENSPCAG00000005284) #22 CATSPER3 (ENSPCAG00000005185) PCBD2 (ENSPCAG00000005156) TXNDC15 (ENSPCAG00000005134) Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.f ENSGT00390000015484.e ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580.q.a ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00390000012652.ab.b Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES ENSMODG00000014528 EAPP (ENSMODG00000014525) SNX6 (ENSMODG00000014517) ENSMODG00000043319 GNPNAT1 (ENSMODG00000014505) STYX (ENSMODG00000029372) PSMC6 (ENSMODG00000014500) ENSMODG00000036920 GPR137C (ENSMODG00000014483) TXNDC16 (ENSMODG00000014477) PTGER2 (ENSMODG00000014473) SLC25A48 (ENSMODG00000014470) CXCL14 (ENSMODG00000014463) TIFAB (ENSMODG00000037601) ##19 MACROH2A1 (ENSMODG00000014397) PITX1 (ENSMODG00000048877) #22 PCBD2 (ENSMODG00000038053) TXNDC15 (ENSMODG00000047885) C5orf24 (ENSMODG00000014344) DDX46 (ENSMODG00000014331) CAMLG (ENSMODG00000036964) SEC24A (ENSMODG00000014243) ##33 SAR1B (ENSMODG00000014227) JADE2 (ENSMODG00000014214) ENSMODG00000050873 UBE2B (ENSMODG00000014209) CDKL3 (ENSMODG00000014201) PPP2CA (ENSMODG00000014168) TCF7 (ENSMODG00000014163) VDAC1 (ENSMODG00000014157) ENSMODG00000039397 Opossum MODERN SPECIES 4 ENSMODG00000046010 #12 ENSMODG00000037154 ENSMODG00000005317 #12 ENSMODG00000028257 ENSMODG00000046986 #13 ENSMODG00000005638 #13 LARP7 (ENSMODG00000005669) #14 ENSMODG00000005683 ENSMODG00000005703 #16 NEUROG2 (ENSMODG00000005712) #17 ALPK1 (ENSMODG00000005729) #18 ENSMODG00000025111 #19 AP1AR (ENSMODG00000023568) #20 FAM241A (ENSMODG00000051558) #21 ENSMODG00000028819 ENSMODG00000036668 #22 ENPEP (ENSMODG00000005847) #23 ENSMODG00000025546 #24 EGF (ENSMODG00000005870) #25 LRIT3 (ENSMODG00000005879) #26 ENSMODG00000005889 #27 ENSMODG00000042020 GAR1 (ENSMODG00000005897) #28 CFI (ENSMODG00000005914) #29 PLA2G12A (ENSMODG00000005928) #30 ENSMODG00000005948 #31 MCUB (ENSMODG00000005959) #32 ENSMODG00000020811 ANXA3 (ENSMODG00000020809) ENSMODG00000023534 BMP2K (ENSMODG00000020807) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154808.a.b.r ENSGT00940000157891 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.f ENSGT00390000015484.e ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580.q.a ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00390000012652.ab.b Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES 5 KLKB1 (ENSSHAG00000005594) F11 (ENSSHAG00000004878) MTNR1A (ENSSHAG00000001139) ENSSHAG00000011310 ENSSHAG00000003145 #9 UGT8 (ENSSHAG00000021199) #10 ARSJ (ENSSHAG00000032329) #11 ENSSHAG00000027716 ENSSHAG00000001917 #12 ANK2 (ENSSHAG00000004581) #13 LARP7 (ENSSHAG00000008153) #14 ENSSHAG00000007062 #16 ENSSHAG00000026477 #17 AP1AR (ENSSHAG00000002032) #20 ENSSHAG00000030119 ENSSHAG00000028404 #22 ENPEP (ENSSHAG00000000991) #23 ELOVL6 (ENSSHAG00000032032) #24 EGF (ENSSHAG00000001762) #25 LRIT3 (ENSSHAG00000001837) #26 GAR1 (ENSSHAG00000002161) #28 ENSSHAG00000024052 #27 CFI (ENSSHAG00000002786) #29 ENSSHAG00000004900 #31 MCUB (ENSSHAG00000005322) #32 SEC24B (ENSSHAG00000006487) #33 COL25A1 (ENSSHAG00000006570) #34 ENSSHAG00000029911 #36 ENSSHAG00000008320 ENSSHAG00000008658 ENSSHAG00000027128 Tasmanian devil MODERN SPECIES 1 ENSSHAG00000021669 KLHL3 (ENSSHAG00000001106) ENSSHAG00000027953 ENSSHAG00000029896 SPOCK1 (ENSSHAG00000001891) TRPC7 (ENSSHAG00000004450) ENSSHAG00000029964 SMAD5 (ENSSHAG00000006806) TGFBI (ENSSHAG00000003846) ENSSHAG00000021183 ENSSHAG00000027023 ENSSHAG00000028721 ENSSHAG00000032341 NEUROG1 (ENSSHAG00000006825) MACROH2A1 (ENSSHAG00000009340) PITX1 (ENSSHAG00000013488) #22 CATSPER3 (ENSSHAG00000024193) ENSSHAG00000025610 ENSSHAG00000014172 DDX46 (ENSSHAG00000014408) CAMLG (ENSSHAG00000014673) SEC24A (ENSSHAG00000014775) ##33 SAR1B (ENSSHAG00000014991) JADE2 (ENSSHAG00000020756) ENSSHAG00000023696 CDKL3 (ENSSHAG00000016286) PPP2CA (ENSSHAG00000016632) SKP1 (ENSSHAG00000027320) ENSSHAG00000016841 VDAC1 (ENSSHAG00000017502) C5orf15 (ENSSHAG00000023664) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000154808.a.b.r ENSGT00940000157891 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.f ENSGT00390000015484.e ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580.q.a ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Wallaby MODERN SPECIES 7557 PITX1 (ENSMEUG00000008851) #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000186323 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT00950000183227 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.f ENSGT00390000015484.e ENSGT00970000197312 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000154589.a ##19 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580.q.a ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1057 ENSVURG00010006144 ENSVURG00010006132 ENSVURG00010006101 #9 UGT8 (ENSVURG00010006063) #10 ARSJ (ENSVURG00010006021) #11 ENSVURG00010005941 #12 ENSVURG00010005649 #13 LARP7 (ENSVURG00010005534) #14 ENSVURG00010005523 ENSVURG00010005502 #16 NEUROG2 (ENSVURG00010005498) #17 ALPK1 (ENSVURG00010005462) #18 TIFA (ENSVURG00010005432) #19 AP1AR (ENSVURG00010005412) #20 FAM241A (ENSVURG00010005397) #21 ENSVURG00010005319 #22 ENPEP (ENSVURG00010005197) #23 ENSVURG00010005176 ENSVURG00010005163 #24 EGF (ENSVURG00010005133) #25 LRIT3 (ENSVURG00010005124) #26 RRH (ENSVURG00010005113) #27 GAR1 (ENSVURG00010005078) #28 CFI (ENSVURG00010005029) #29 PLA2G12A (ENSVURG00010005003) #30 CASP6 (ENSVURG00010004981) #31 MCUB (ENSVURG00010004957) #32 SEC24B (ENSVURG00010004919) #33 COL25A1 (ENSVURG00010004195) #34 ETNPPL (ENSVURG00010004034) #35 ENSVURG00010004018 #36 Common wonbat MODERN SPECIES 455 ENSVURG00010008831 SPOCK1 (ENSVURG00010008813) TRPC7 (ENSVURG00010007929) ENSVURG00010007881 SMAD5 (ENSVURG00010007870) TGFBI (ENSVURG00010007852) ENSVURG00010007835 ENSVURG00010007828 ENSVURG00010007820 SLC25A48 (ENSVURG00010007792) CXCL14 (ENSVURG00010007772) NEUROG1 (ENSVURG00010007763) TIFAB (ENSVURG00010007756) ##19 MACROH2A1 (ENSVURG00010007745) ENSVURG00010007732 ##37 PITX1 (ENSVURG00010007721) #22 CATSPER3 (ENSVURG00010007695) PCBD2 (ENSVURG00010007681) TXNDC15 (ENSVURG00010007674) C5orf24 (ENSVURG00010007665) DDX46 (ENSVURG00010007646) CAMLG (ENSVURG00010007616) SEC24A (ENSVURG00010007591) ##33 SAR1B (ENSVURG00010007582) JADE2 (ENSVURG00010007533) CDKN2AIPNL (ENSVURG00010007514) ENSVURG00010007506 CDKL3 (ENSVURG00010007497) PPP2CA (ENSVURG00010007475) SKP1 (ENSVURG00010007470) TCF7 (ENSVURG00010007461) koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 90 NDST4 (ENSPCIG00000019562) #9 UGT8 (ENSPCIG00000019620) #10 ARSJ (ENSPCIG00000037210) #11 ENSPCIG00000020322 #12 ENSPCIG00000020301 #13 ENSPCIG00000020313 ENSPCIG00000020310 #13 LARP7 (ENSPCIG00000020284) #14 ENSPCIG00000020274 ENSPCIG00000036967 #16 NEUROG2 (ENSPCIG00000020272) #17 ALPK1 (ENSPCIG00000030072) #18 ENSPCIG00000030083 #19 AP1AR (ENSPCIG00000030086) #20 ENSPCIG00000036976 ENSPCIG00000023986 #22 ENPEP (ENSPCIG00000023987) #23 ENSPCIG00000024155 ENSPCIG00000012381 #24 EGF (ENSPCIG00000014187) #25 LRIT3 (ENSPCIG00000018919) #26 RRH (ENSPCIG00000018914) #27 GAR1 (ENSPCIG00000018912) #28 CFI (ENSPCIG00000032256) #29 ENSPCIG00000009719 #31 MCUB (ENSPCIG00000007235) #32 SEC24B (ENSPCIG00000006450) #33 COL25A1 (ENSPCIG00000020507) #34 ETNPPL (ENSPCIG00000026559) #35 ENSPCIG00000026714 #36 ENSPCIG00000026709 ##37 koala MODERN SPECIES 41 ENSPCIG00000024566 ENSPCIG00000015220 SPOCK1 (ENSPCIG00000015217) TRPC7 (ENSPCIG00000029570) SMIM32 (ENSPCIG00000029568) SMAD5 (ENSPCIG00000029566) TGFBI (ENSPCIG00000029557) ENSPCIG00000021223 ENSPCIG00000021236 ENSPCIG00000033171 SLC25A48 (ENSPCIG00000010841) CXCL14 (ENSPCIG00000010844) NEUROG1 (ENSPCIG00000009492) TIFAB (ENSPCIG00000015898) ##19 ENSPCIG00000015900 PITX1 (ENSPCIG00000006623) #22 CATSPER3 (ENSPCIG00000009633) TXNDC15 (ENSPCIG00000009213) DDX46 (ENSPCIG00000009215) CAMLG (ENSPCIG00000032820) SEC24A (ENSPCIG00000014097) ##33 SAR1B (ENSPCIG00000014092) JADE2 (ENSPCIG00000014090) CDKN2AIPNL (ENSPCIG00000034137) ENSPCIG00000021861 CDKL3 (ENSPCIG00000021862) SKP1 (ENSPCIG00000021864) ENSPCIG00000021868 ENSPCIG00000027455 C5orf15 (ENSPCIG00000021870) FSTL4 (ENSPCIG00000000975) Platypus DUPLICATION Platypus MODERN SPECIES 3 NDST3 (ENSOANG00000014942) NDST4 (ENSOANG00000009292) #9 ENSOANG00000037777 UGT8 (ENSOANG00000050420) #10 ARSJ (ENSOANG00000044613) #11 ENSOANG00000009295 #12 ANK2 (ENSOANG00000009296) #13 LARP7 (ENSOANG00000009298) #14 ENSOANG00000009299 #16 ENSOANG00000044444 NEUROG2 (ENSOANG00000047178) #17 ALPK1 (ENSOANG00000009300) #18 ENSOANG00000050963 #19 AP1AR (ENSOANG00000009302) #20 FAM241A (ENSOANG00000000694) #21 ENSOANG00000050415 #22 ENPEP (ENSOANG00000003669) #23 ELOVL6 (ENSOANG00000037661) #24 EGF (ENSOANG00000003668) #25 LRIT3 (ENSOANG00000003667) #26 RRH (ENSOANG00000003666) #27 GAR1 (ENSOANG00000003665) #28 CFI (ENSOANG00000003664) #29 PLA2G12A (ENSOANG00000039200) #30 CASP6 (ENSOANG00000003663) #31 MCUB (ENSOANG00000003662) #32 SEC24B (ENSOANG00000013878) #33 ETNPPL (ENSOANG00000009959) #35 OSTC (ENSOANG00000000770) #36 RPL34 (ENSOANG00000007856) #37 LEF1 (ENSOANG00000002638) Platypus DUPLICATION Platypus MODERN SPECIES 22 ENSOANG00000038227 ENSOANG00000039677 ENSOANG00000044765 ENSOANG00000042970 ENSOANG00000014889 ENSOANG00000011172 #22 ENSOANG00000043822 ENSOANG00000038302 Platypus MODERN SPECIES 84 PKD2L2 (ENSOANG00000009283) MYOT (ENSOANG00000009284) ENSOANG00000041421 ENSOANG00000015327 KLHL3 (ENSOANG00000048844) SPOCK1 (ENSOANG00000045148) ENSOANG00000021549 TRPC7 (ENSOANG00000013325) ENSOANG00000051232 ENSOANG00000009906 TGFBI (ENSOANG00000022501) SLC25A48 (ENSOANG00000041650) CXCL14 (ENSOANG00000004893) ENSOANG00000038031 ENSOANG00000046913 ENSOANG00000031547 #22 ENSOANG00000039928 ENSOANG00000046337 TXNDC15 (ENSOANG00000013063) ENSOANG00000037036 DDX46 (ENSOANG00000001842) CAMLG (ENSOANG00000001840) SEC24A (ENSOANG00000001838) ##33 SAR1B (ENSOANG00000001245) JADE2 (ENSOANG00000010024) CDKN2AIPNL (ENSOANG00000037080) UBE2B (ENSOANG00000050341) CDKL3 (ENSOANG00000000233) PPP2CA (ENSOANG00000037764) SKP1 (ENSOANG00000048044) ENSOANG00000040939 Sauria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c.a.a.b ENSGT00390000015484.c.a.a.a ENSGT00390000015484.c.a.b ENSGT00940000159491.c.a ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Chinese turtle DUPLICATION Chinese turtle MODERN SPECIES 773 ARSJ (ENSPSIG00000013643) #11 ENSPSIG00000013669 #12 ANK2 (ENSPSIG00000014200) #13 LARP7 (ENSPSIG00000014419) #14 ENSPSIG00000002399 ENSPSIG00000002402 #16 ENSPSIG00000002419 #18 ENSPSIG00000002420 #18 TIFA (ENSPSIG00000002422) #19 AP1AR (ENSPSIG00000002445) #20 FAM241A (ENSPSIG00000001561) #21 ENSPSIG00000002456 #22 ENSPSIG00000002492 #23 ENSPSIG00000002521 #23 ENSPSIG00000001565 ELOVL6 (ENSPSIG00000002798) #24 EGF (ENSPSIG00000002838) #25 ENSPSIG00000002933 #26 ENSPSIG00000002945 #26 RRH (ENSPSIG00000002949) #27 GAR1 (ENSPSIG00000002970) #28 CFI (ENSPSIG00000002999) #29 PLA2G12A (ENSPSIG00000003038) #30 CASP6 (ENSPSIG00000003046) #31 MCUB (ENSPSIG00000003056) #32 SEC24B (ENSPSIG00000003064) #33 ENSPSIG00000003097 ##33 Chinese turtle MODERN SPECIES 525 SPOCK1 (ENSPSIG00000016274) ENSPSIG00000003612 ENSPSIG00000000036 TRPC7 (ENSPSIG00000003622) SMAD5 (ENSPSIG00000003731) TGFBI (ENSPSIG00000003772) ENSPSIG00000004007 ENSPSIG00000004018 ENSPSIG00000004021 ENSPSIG00000004068 SLC25A48 (ENSPSIG00000004099) CXCL14 (ENSPSIG00000004117) NEUROG1 (ENSPSIG00000004125) MACROH2A1 (ENSPSIG00000004160) ENSPSIG00000000037 PITX1 (ENSPSIG00000004242) #22 CATSPER3 (ENSPSIG00000004301) PCBD2 (ENSPSIG00000004411) TXNDC15 (ENSPSIG00000004419) C5orf24 (ENSPSIG00000004507) DDX46 (ENSPSIG00000004522) CAMLG (ENSPSIG00000004577) SEC24A (ENSPSIG00000004594) ##33 SAR1B (ENSPSIG00000004800) JADE2 (ENSPSIG00000004841) CDKN2AIPNL (ENSPSIG00000004956) UBE2B (ENSPSIG00000004966) CDKL3 (ENSPSIG00000004969) PPP2CA (ENSPSIG00000004984) SKP1 (ENSPSIG00000004991) TCF7 (ENSPSIG00000004998) Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c.a.a.b ENSGT00390000015484.c.a.a.a.a.b ENSGT00390000015484.c.a.a.a.b ENSGT00390000015484.c.a.b ENSGT00940000159491.c.a ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c.a.a.b ENSGT01000000222195 ENSGT00390000015484.c.a.a.a.a.b ENSGT00390000015484.c.a.b ENSGT00940000159491.c.a ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 22 ENSGEVG00005006359 SPOCK1 (ENSGEVG00005006377) ENSGEVG00005006418 TRPC7 (ENSGEVG00005006453) ENSGEVG00005006606 SMAD5 (ENSGEVG00005006615) TGFBI (ENSGEVG00005006630) ENSGEVG00005006660 ENSGEVG00005006693 ENSGEVG00005006710 ENSGEVG00005006727 SLC25A48 (ENSGEVG00005006740) CXCL14 (ENSGEVG00005006774) NEUROG1 (ENSGEVG00005006791) MACROH2A1 (ENSGEVG00005006827) PITX1 (ENSGEVG00005006852) #22 CATSPER3 (ENSGEVG00005006893) TXNDC15 (ENSGEVG00005006986) C5orf24 (ENSGEVG00005007023) DDX46 (ENSGEVG00005007169) CAMLG (ENSGEVG00005007877) SEC24A (ENSGEVG00005007906) ##33 SAR1B (ENSGEVG00005007964) JADE2 (ENSGEVG00005007986) CDKN2AIPNL (ENSGEVG00005008010) UBE2B (ENSGEVG00005008019) CDKL3 (ENSGEVG00005008046) PPP2CA (ENSGEVG00005008076) SKP1 (ENSGEVG00005008099) TCF7 (ENSGEVG00005008118) VDAC1 (ENSGEVG00005008146) Abingdon island giant tortoise DUPLICATION Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 31 ENSCABG00000015861 ENSCABG00000015862 #22 ENPEP (ENSCABG00000015864) #23 ENSCABG00000015969 ENSCABG00000015970 ENSCABG00000015971 ENSCABG00000015974 ENSCABG00000015975 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 933 SLC25A48 (ENSCABG00000000993) CXCL14 (ENSCABG00000000997) NEUROG1 (ENSCABG00000000999) MACROH2A1 (ENSCABG00000001001) PITX1 (ENSCABG00000001007) #22 CATSPER3 (ENSCABG00000001011) PCBD2 (ENSCABG00000001064) TXNDC15 (ENSCABG00000001067) C5orf24 (ENSCABG00000001070) Emydidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437.hc ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c.a.a.b ENSGT00390000015484.c.a.a.a.a.b ENSGT00390000015484.c.a.a.a.a.a ENSGT00390000015484.c.a.a.a.b ENSGT00390000015484.c.a.b ENSGT00940000159491.c.a ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 306 TRPC7 (ENSTMTG00000021396) ENSTMTG00000021385 SMAD5 (ENSTMTG00000021379) TGFBI (ENSTMTG00000021370) ENSTMTG00000021365 ENSTMTG00000021362 ENSTMTG00000021359 ENSTMTG00000021348 ENSTMTG00000021341 ENSTMTG00000021335 SLC25A48 (ENSTMTG00000021328) CXCL14 (ENSTMTG00000021319) NEUROG1 (ENSTMTG00000021314) ENSTMTG00000021310 MACROH2A1 (ENSTMTG00000021300) PITX1 (ENSTMTG00000021296) #22 PCBD2 (ENSTMTG00000021293) TXNDC15 (ENSTMTG00000021288) C5orf24 (ENSTMTG00000021283) DDX46 (ENSTMTG00000021134) CAMLG (ENSTMTG00000021110) SEC24A (ENSTMTG00000021102) ##33 SAR1B (ENSTMTG00000021093) JADE2 (ENSTMTG00000021073) CDKN2AIPNL (ENSTMTG00000021068) UBE2B (ENSTMTG00000021063) CDKL3 (ENSTMTG00000021054) PPP2CA (ENSTMTG00000021047) SKP1 (ENSTMTG00000021043) TCF7 (ENSTMTG00000021039) VDAC1 (ENSTMTG00000021034) painted turtle DUPLICATION painted turtle MODERN SPECIES 734 LARP7 (ENSCPBG00000004919) #14 ENSCPBG00000004842 #16 NEUROG2 (ENSCPBG00000004822) #17 ALPK1 (ENSCPBG00000004794) #18 TIFA (ENSCPBG00000004778) #19 AP1AR (ENSCPBG00000004767) #20 FAM241A (ENSCPBG00000004755) #21 ENSCPBG00000004748 ENSCPBG00000004743 #22 ENPEP (ENSCPBG00000004492) #23 ELOVL6 (ENSCPBG00000004435) #24 EGF (ENSCPBG00000004365) #25 LRIT3 (ENSCPBG00000004330) #26 RRH (ENSCPBG00000004318) #27 GAR1 (ENSCPBG00000004310) #28 CFI (ENSCPBG00000004299) #29 PLA2G12A (ENSCPBG00000004295) #30 CASP6 (ENSCPBG00000004284) #31 MCUB (ENSCPBG00000004264) #32 SEC24B (ENSCPBG00000004242) #33 COL25A1 (ENSCPBG00000004206) #34 ETNPPL (ENSCPBG00000004186) #35 OSTC (ENSCPBG00000004175) #36 ENSCPBG00000004169 #37 painted turtle MODERN SPECIES 1397 PITX1 (ENSCPBG00000007703) #22 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.d ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 32 PRSS12 (ENSCPRG00005004901) NDST3 (ENSCPRG00005004913) PFN1 (ENSCPRG00005004928) NDST4 (ENSCPRG00005004945) #9 ENSCPRG00005005050 UGT8 (ENSCPRG00005005054) #10 ARSJ (ENSCPRG00005005061) #11 ENSCPRG00005005068 #12 ANK2 (ENSCPRG00005005086) #13 LARP7 (ENSCPRG00005005168) #14 ENSCPRG00005005192 #16 ALPK1 (ENSCPRG00005005236) #18 TIFA (ENSCPRG00005005271) #19 ENSCPRG00005005274 FAM241A (ENSCPRG00005005278) #21 PITX1 (ENSCPRG00005005301) #22 ENPEP (ENSCPRG00005005325) #23 ELOVL6 (ENSCPRG00005005580) #24 EGF (ENSCPRG00005005601) #25 LRIT3 (ENSCPRG00005005617) #26 ENSCPRG00005005622 GAR1 (ENSCPRG00005005627) #28 CFI (ENSCPRG00005005629) #29 PLA2G12A (ENSCPRG00005005654) #30 CASP6 (ENSCPRG00005005656) #31 MCUB (ENSCPRG00005005669) #32 SEC24B (ENSCPRG00005005675) #33 ETNPPL (ENSCPRG00005005724) #35 OSTC (ENSCPRG00005005807) #36 RPL34 (ENSCPRG00005005811) #37 LEF1 (ENSCPRG00005005834) Aves ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.d ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b African ostrich MODERN SPECIES 286 NDST4 (ENSSCUG00000001228) #9 UGT8 (ENSSCUG00000001225) #10 ARSJ (ENSSCUG00000001224) #11 ENSSCUG00000001221 #12 ANK2 (ENSSCUG00000001196) #13 LARP7 (ENSSCUG00000001188) #14 ENSSCUG00000001186 #16 ALPK1 (ENSSCUG00000001182) #18 TIFA (ENSSCUG00000001179) #19 AP1AR (ENSSCUG00000001177) #20 ENSSCUG00000001169 #22 ENPEP (ENSSCUG00000001158) #23 ELOVL6 (ENSSCUG00000001151) #24 EGF (ENSSCUG00000001142) #25 LRIT3 (ENSSCUG00000001140) #26 RRH (ENSSCUG00000001139) #27 GAR1 (ENSSCUG00000001138) #28 CFI (ENSSCUG00000001137) #29 PLA2G12A (ENSSCUG00000001136) #30 CASP6 (ENSSCUG00000001135) #31 MCUB (ENSSCUG00000001134) #32 Neognathae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.d ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b ENSGT00440000037499 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.d ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b ENSGT00440000037499 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b ENSGT00440000037499 ENSGT00940000158076 Great tit DUPLICATION Great tit MODERN SPECIES 23 ENSPMJG00000010316 YTHDC1 (ENSPMJG00000010314) ENSPMJG00000010280 ENSPMJG00000010276 ENSPMJG00000010274 AP5S1 (ENSPMJG00000010273) SH2D4A (ENSPMJG00000010271) CSGALNACT1 (ENSPMJG00000010269) INTS10 (ENSPMJG00000010264) HGSNAT (ENSPMJG00000010258) POMK (ENSPMJG00000010257) SMIM19 (ENSPMJG00000010253) SLC20A2 (ENSPMJG00000010250) FAM241A (ENSPMJG00000010249) #21 ENSPMJG00000010146 ENSPMJG00000010143 #22 ENPEP (ENSPMJG00000010139) #23 ELOVL6 (ENSPMJG00000010137) #24 EGF (ENSPMJG00000010116) #25 LRIT3 (ENSPMJG00000010115) #26 RRH (ENSPMJG00000010113) #27 GAR1 (ENSPMJG00000010111) #28 CFI (ENSPMJG00000010109) #29 PLA2G12A (ENSPMJG00000010108) #30 CASP6 (ENSPMJG00000010107) #31 MCUB (ENSPMJG00000010106) #32 SEC24B (ENSPMJG00000010105) #33 COL25A1 (ENSPMJG00000010085) #34 ETNPPL (ENSPMJG00000010084) #35 OSTC (ENSPMJG00000010082) #36 RPL34 (ENSPMJG00000010081) #37 Great tit MODERN SPECIES 4 HNRNPA0 (ENSPMJG00000008753) KLHL3 (ENSPMJG00000008754) SPOCK1 (ENSPMJG00000008764) TRPC7 (ENSPMJG00000008773) ENSPMJG00000009566 SMAD5 (ENSPMJG00000009567) TGFBI (ENSPMJG00000009604) LECT2 (ENSPMJG00000009607) ENSPMJG00000009608 ENSPMJG00000009609 SLC25A48 (ENSPMJG00000009610) CXCL14 (ENSPMJG00000009614) NEUROG1 (ENSPMJG00000009622) ENSPMJG00000009624 MACROH2A1 (ENSPMJG00000009625) ENSPMJG00000009628 #22 PCBD2 (ENSPMJG00000009629) TXNDC15 (ENSPMJG00000009630) C5orf24 (ENSPMJG00000009631) DDX46 (ENSPMJG00000009632) CAMLG (ENSPMJG00000009633) SEC24A (ENSPMJG00000009634) ##33 SAR1B (ENSPMJG00000009641) JADE2 (ENSPMJG00000009659) UBE2B (ENSPMJG00000009661) PPP2CA (ENSPMJG00000009662) SKP1 (ENSPMJG00000009663) TCF7 (ENSPMJG00000009664) ENSPMJG00000009665 VDAC1 (ENSPMJG00000009676) C5orf15 (ENSPMJG00000009680) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b ENSGT00440000037499 ENSGT00940000158076 Flycatcher DUPLICATION Flycatcher MODERN SPECIES 22 ENSFALG00000006595 ENSFALG00000006586 ENSFALG00000006581 ENSFALG00000006580 ENSFALG00000006565 ENSFALG00000006559 ENSFALG00000014272 SH2D4A (ENSFALG00000006557) ENSFALG00000006555 INTS10 (ENSFALG00000006539) ENSFALG00000006524 ENSFALG00000006517 ENSFALG00000027483 ENSFALG00000006499 FAM241A (ENSFALG00000006495) #21 ENSFALG00000006490 #22 ENPEP (ENSFALG00000006488) #23 ELOVL6 (ENSFALG00000006485) #24 EGF (ENSFALG00000006468) #25 LRIT3 (ENSFALG00000024429) #26 RRH (ENSFALG00000006451) #27 GAR1 (ENSFALG00000024007) #28 CFI (ENSFALG00000006443) #29 PLA2G12A (ENSFALG00000023889) #30 CASP6 (ENSFALG00000025277) #31 MCUB (ENSFALG00000024811) #32 SEC24B (ENSFALG00000006389) #33 NPNT (ENSFALG00000012382) TBCK (ENSFALG00000012364) AIMP1 (ENSFALG00000012349) GIMD1 (ENSFALG00000012345) Flycatcher MODERN SPECIES 4 ENSFALG00000014359 ENSFALG00000008105 ENSFALG00000014395 ENSFALG00000008101 TRPC7 (ENSFALG00000008079) ENSFALG00000027875 SMAD5 (ENSFALG00000008067) ENSFALG00000024691 TGFBI (ENSFALG00000008035) LECT2 (ENSFALG00000008019) FBXL21P (ENSFALG00000028067) ENSFALG00000028153 SLC25A48 (ENSFALG00000007985) CXCL14 (ENSFALG00000007978) MACROH2A1 (ENSFALG00000007972) PITX1 (ENSFALG00000026628) #22 PCBD2 (ENSFALG00000024599) TXNDC15 (ENSFALG00000007957) C5orf24 (ENSFALG00000027320) DDX46 (ENSFALG00000007947) CAMLG (ENSFALG00000007942) SEC24A (ENSFALG00000007938) ##33 SAR1B (ENSFALG00000007931) JADE2 (ENSFALG00000024209) UBE2B (ENSFALG00000026103) PPP2CA (ENSFALG00000024680) SKP1 (ENSFALG00000007917) TCF7 (ENSFALG00000023633) VDAC1 (ENSFALG00000007902) C5orf15 (ENSFALG00000028754) FSTL4 (ENSFALG00000001023) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b ENSGT00440000037499 ENSGT00940000158076 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b ENSGT00440000037499 ENSGT00940000158076 Zebra finch DUPLICATION Zebra finch MODERN SPECIES 25 ENSTGUG00000025345 ENSTGUG00000022601 YTHDC1 (ENSTGUG00000004452) ENSTGUG00000004414 ENSTGUG00000004380 ENSTGUG00000004379 AP5S1 (ENSTGUG00000004377) SH2D4A (ENSTGUG00000024448) CSGALNACT1 (ENSTGUG00000004359) INTS10 (ENSTGUG00000004335) HGSNAT (ENSTGUG00000004319) POMK (ENSTGUG00000023177) SMIM19 (ENSTGUG00000019137) SLC20A2 (ENSTGUG00000004289) FAM241A (ENSTGUG00000019365) #21 ENSTGUG00000004274 #22 ENPEP (ENSTGUG00000004244) #23 ELOVL6 (ENSTGUG00000027644) #24 EGF (ENSTGUG00000004206) #25 LRIT3 (ENSTGUG00000020459) #26 RRH (ENSTGUG00000004188) #27 GAR1 (ENSTGUG00000020041) #28 CFI (ENSTGUG00000004171) #29 PLA2G12A (ENSTGUG00000004164) #30 CASP6 (ENSTGUG00000004148) #31 MCUB (ENSTGUG00000004134) #32 SEC24B (ENSTGUG00000004095) #33 COL25A1 (ENSTGUG00000004089) #34 ETNPPL (ENSTGUG00000004067) #35 OSTC (ENSTGUG00000004065) #36 RPL34 (ENSTGUG00000027399) #37 Zebra finch MODERN SPECIES 4 MYOT (ENSTGUG00000001189) ENSTGUG00000001193 KLHL3 (ENSTGUG00000001194) SPOCK1 (ENSTGUG00000001204) TRPC7 (ENSTGUG00000001207) ENSTGUG00000027485 SMAD5 (ENSTGUG00000001214) TGFBI (ENSTGUG00000001216) ENSTGUG00000001227 ENSTGUG00000001232 ENSTGUG00000001237 SLC25A48 (ENSTGUG00000001239) CXCL14 (ENSTGUG00000017226) NEUROG1 (ENSTGUG00000001245) MACROH2A1 (ENSTGUG00000001246) PITX1 (ENSTGUG00000001251) #22 PCBD2 (ENSTGUG00000019159) TXNDC15 (ENSTGUG00000027749) C5orf24 (ENSTGUG00000028499) DDX46 (ENSTGUG00000001260) CAMLG (ENSTGUG00000001268) SEC24A (ENSTGUG00000001269) ##33 SAR1B (ENSTGUG00000027303) JADE2 (ENSTGUG00000001284) UBE2B (ENSTGUG00000022464) PPP2CA (ENSTGUG00000001287) SKP1 (ENSTGUG00000001291) TCF7 (ENSTGUG00000001295) VDAC1 (ENSTGUG00000001300) C5orf15 (ENSTGUG00000001302) FSTL4 (ENSTGUG00000001305) Common canary DUPLICATION Common canary MODERN SPECIES 2 ENSSCAG00000012472 ENSSCAG00000012475 YTHDC1 (ENSSCAG00000012480) ENSSCAG00000012495 ENSSCAG00000012504 ENSSCAG00000012511 ENSSCAG00000012518 SH2D4A (ENSSCAG00000012526) CSGALNACT1 (ENSSCAG00000012547) INTS10 (ENSSCAG00000012562) HGSNAT (ENSSCAG00000012574) POMK (ENSSCAG00000012582) SMIM19 (ENSSCAG00000012586) SLC20A2 (ENSSCAG00000012594) FAM241A (ENSSCAG00000012598) #21 ENSSCAG00000012613 #22 ENPEP (ENSSCAG00000012681) #23 ELOVL6 (ENSSCAG00000012933) #24 EGF (ENSSCAG00000012953) #25 LRIT3 (ENSSCAG00000012969) #26 RRH (ENSSCAG00000012977) #27 GAR1 (ENSSCAG00000012982) #28 CFI (ENSSCAG00000012987) #29 PLA2G12A (ENSSCAG00000012993) #30 CASP6 (ENSSCAG00000012997) #31 MCUB (ENSSCAG00000013002) #32 SEC24B (ENSSCAG00000013014) #33 ETNPPL (ENSSCAG00000013044) #35 OSTC (ENSSCAG00000013047) #36 RPL34 (ENSSCAG00000013050) #37 LEF1 (ENSSCAG00000013077) Common canary MODERN SPECIES 16 MYOT (ENSSCAG00000011092) ENSSCAG00000011089 ENSSCAG00000011086 KLHL3 (ENSSCAG00000011076) SPOCK1 (ENSSCAG00000011070) TRPC7 (ENSSCAG00000011002) ENSSCAG00000010987 SMAD5 (ENSSCAG00000010982) TGFBI (ENSSCAG00000010973) LECT2 (ENSSCAG00000010969) ENSSCAG00000010964 ENSSCAG00000010962 SLC25A48 (ENSSCAG00000010961) CXCL14 (ENSSCAG00000010960) MACROH2A1 (ENSSCAG00000010954) PITX1 (ENSSCAG00000010951) #22 PCBD2 (ENSSCAG00000010942) TXNDC15 (ENSSCAG00000010936) C5orf24 (ENSSCAG00000010932) DDX46 (ENSSCAG00000010927) CAMLG (ENSSCAG00000010922) SEC24A (ENSSCAG00000010912) ##33 SAR1B (ENSSCAG00000010903) JADE2 (ENSSCAG00000010894) UBE2B (ENSSCAG00000010887) PPP2CA (ENSSCAG00000010878) SKP1 (ENSSCAG00000010873) TCF7 (ENSSCAG00000010869) VDAC1 (ENSSCAG00000010861) C5orf15 (ENSSCAG00000010858) FSTL4 (ENSSCAG00000010845) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.d ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b ENSGT00440000037499 Golden eagle MODERN SPECIES 14 KLHL3 (ENSACCG00020015940) ENSACCG00020015968 SPOCK1 (ENSACCG00020015988) TRPC7 (ENSACCG00020016017) ENSACCG00020016048 SMAD5 (ENSACCG00020016058) TGFBI (ENSACCG00020016071) ENSACCG00020016086 ENSACCG00020016097 ENSACCG00020016103 ENSACCG00020016112 SLC25A48 (ENSACCG00020016127) CXCL14 (ENSACCG00020016148) NEUROG1 (ENSACCG00020016159) MACROH2A1 (ENSACCG00020016171) PITX1 (ENSACCG00020009463) #22 CATSPER3 (ENSACCG00020009481) PCBD2 (ENSACCG00020009501) TXNDC15 (ENSACCG00020009510) C5orf24 (ENSACCG00020009527) DDX46 (ENSACCG00020009551) CAMLG (ENSACCG00020009579) ENSACCG00020009593 SAR1B (ENSACCG00020009625) JADE2 (ENSACCG00020009669) UBE2B (ENSACCG00020009706) PPP2CA (ENSACCG00020009725) SKP1 (ENSACCG00020009740) TCF7 (ENSACCG00020009771) VDAC1 (ENSACCG00020009806) C5orf15 (ENSACCG00020009818) Kakapo DUPLICATION Kakapo MODERN SPECIES 24 YTHDC1 (ENSSHBG00005014993) ENSSHBG00005014975 ENSSHBG00005014969 ENSSHBG00005012544 ENSSHBG00005012309 ENSSHBG00005011901 SH2D4A (ENSSHBG00005011848) CSGALNACT1 (ENSSHBG00005011827) INTS10 (ENSSHBG00005011798) HGSNAT (ENSSHBG00005011757) POMK (ENSSHBG00005011742) SMIM19 (ENSSHBG00005011731) SLC20A2 (ENSSHBG00005011713) FAM241A (ENSSHBG00005011699) #21 ENSSHBG00005011683 ENSSHBG00005011648 #22 ENPEP (ENSSHBG00005011623) #23 ELOVL6 (ENSSHBG00005011604) #24 EGF (ENSSHBG00005011545) #25 LRIT3 (ENSSHBG00005011508) #26 RRH (ENSSHBG00005011482) #27 GAR1 (ENSSHBG00005011464) #28 CFI (ENSSHBG00005011356) #29 PLA2G12A (ENSSHBG00005011219) #30 CASP6 (ENSSHBG00005011178) #31 MCUB (ENSSHBG00005011137) #32 SEC24B (ENSSHBG00005011081) #33 COL25A1 (ENSSHBG00005011021) #34 ETNPPL (ENSSHBG00005010971) #35 OSTC (ENSSHBG00005010930) #36 RPL34 (ENSSHBG00005010895) #37 Kakapo MODERN SPECIES 6 FAM13B (ENSSHBG00005007860) PKD2L2 (ENSSHBG00005007766) MYOT (ENSSHBG00005007750) HNRNPA0 (ENSSHBG00005007726) KLHL3 (ENSSHBG00005007688) SPOCK1 (ENSSHBG00005007661) SMAD5 (ENSSHBG00005007633) TGFBI (ENSSHBG00005007609) ENSSHBG00005007597 ENSSHBG00005007584 ENSSHBG00005007567 ENSSHBG00005007552 SLC25A48 (ENSSHBG00005007537) NEUROG1 (ENSSHBG00005007501) MACROH2A1 (ENSSHBG00005007476) PITX1 (ENSSHBG00005007456) #22 PCBD2 (ENSSHBG00005007449) TXNDC15 (ENSSHBG00005007436) C5orf24 (ENSSHBG00005007424) DDX46 (ENSSHBG00005007082) CAMLG (ENSSHBG00005007012) SEC24A (ENSSHBG00005006963) ##33 SAR1B (ENSSHBG00005006933) JADE2 (ENSSHBG00005006895) UBE2B (ENSSHBG00005006853) PPP2CA (ENSSHBG00005006833) SKP1 (ENSSHBG00005006814) TCF7 (ENSSHBG00005006790) VDAC1 (ENSSHBG00005006771) C5orf15 (ENSSHBG00005006759) FSTL4 (ENSSHBG00005006742) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000158131 ENSGT00940000160665 ENSGT00940000157168 #9 ENSGT00940000156545 #10 ENSGT00940000159954 #11 ENSGT00940000159769.b #12 ENSGT00940000155279.C #13 ENSGT00940000154949.b #14 ENSGT00940000162335 #16 ENSGT00940000162895 #17 ENSGT00940000159753 #18 ENSGT00940000154589.b #19 ENSGT00390000002219 #20 ENSGT00940000154340.A #21 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000156946 #23 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627 #26 ENSGT01100000263524.I #27 ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00930000151042 #29 ENSGT00390000008798.c #30 ENSGT00940000155140 #31 ENSGT00940000158059 #32 ENSGT00950000182924.B.a.a #33 ENSGT00940000159823 #34 ENSGT00940000157910 #35 ENSGT00390000001376 #36 ENSGT00390000008294 #37 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.d ENSGT00390000015484.c ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000165985 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.ab.b ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b ENSGT00440000037499 Duck DUPLICATION Duck MODERN SPECIES 4023 ENSAPLG00000014069 #22 Duck MODERN SPECIES 5 MYOT (ENSAPLG00000012838) ENSAPLG00000011420 HNRNPA0 (ENSAPLG00000017729) KLHL3 (ENSAPLG00000000978) SPOCK1 (ENSAPLG00000002554) TRPC7 (ENSAPLG00000002677) ENSAPLG00000030156 SMAD5 (ENSAPLG00000003593) ENSAPLG00000030584 ENSAPLG00000004923 ENSAPLG00000005001 SLC25A48 (ENSAPLG00000005100) CXCL14 (ENSAPLG00000005214) NEUROG1 (ENSAPLG00000031251) MACROH2A1 (ENSAPLG00000005243) PITX1 (ENSAPLG00000028077) #22 PCBD2 (ENSAPLG00000013164) TXNDC15 (ENSAPLG00000017719) C5orf24 (ENSAPLG00000001548) DDX46 (ENSAPLG00000013208) CAMLG (ENSAPLG00000013700) ENSAPLG00000013847 SAR1B (ENSAPLG00000007369) JADE2 (ENSAPLG00000014696) UBE2B (ENSAPLG00000014846) PPP2CA (ENSAPLG00000014864) SKP1 (ENSAPLG00000015147) TCF7 (ENSAPLG00000015177) VDAC1 (ENSAPLG00000015267) C5orf15 (ENSAPLG00000016800) FSTL4 (ENSAPLG00000015488) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000158131 ENSGT00940000160665 ENSGT00940000157168 #9 ENSGT00940000156545 #10 ENSGT00940000159954 #11 ENSGT00940000159769.b #12 ENSGT00940000155279.C #13 ENSGT00940000154949.b #14 ENSGT00940000162335 #16 ENSGT00940000162895 #17 ENSGT00940000159753 #18 ENSGT00940000154589.b #19 ENSGT00390000002219 #20 ENSGT00940000154340.A #21 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000156946 #23 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627 #26 ENSGT01100000263524.I #27 ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00930000151042 #29 ENSGT00390000008798.c #30 ENSGT00940000155140 #31 ENSGT00940000158059 #32 ENSGT00940000155292 ENSGT00940000155919 ENSGT00950000182815.a.a.a.a.a ENSGT00390000014293.a ENSGT00940000161376 Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00550000075003 ENSGT00940000158131 ENSGT00940000160665 ENSGT00940000157168 #9 ENSGT00940000156545 #10 ENSGT00940000159954 #11 ENSGT00940000159769.b #12 ENSGT00940000155279.C #13 ENSGT00940000154949.b #14 ENSGT00940000162335 #16 ENSGT00940000162895 #17 ENSGT00940000159753 #18 ENSGT00940000154589.b #19 ENSGT00390000002219 #20 ENSGT00940000154340.A #21 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000156946 #23 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627 #26 ENSGT01100000263524.I #27 ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00930000151042 #29 ENSGT00390000008798.c #30 ENSGT00940000155140 #31 ENSGT00940000158059 #32 ENSGT00940000155292 ENSGT00940000155919 ENSGT00950000182815.a.a.a.a.a ENSGT00390000014293.a ENSGT00940000161376 Chicken MODERN SPECIES 33 METTL14 (ENSGALG00010005551) PRSS12 (ENSGALG00010005555) NDST3 (ENSGALG00010005567) NDST4 (ENSGALG00010003898) #9 UGT8 (ENSGALG00010003761) #10 ARSJ (ENSGALG00010003768) #11 CAMK2D (ENSGALG00010003914) #12 ANK2 (ENSGALG00010003978) #13 LARP7 (ENSGALG00010004001) #14 ENSGALG00010004007 #16 NEUROG2 (ENSGALG00010005569) #17 ALPK1 (ENSGALG00010004039) #18 TIFA (ENSGALG00010004065) #19 AP1AR (ENSGALG00010004079) #20 FAM241A (ENSGALG00010004082) #21 PITX2 (ENSGALG00010003740) #22 ENPEP (ENSGALG00010003726) #23 ELOVL6 (ENSGALG00010003790) #24 EGF (ENSGALG00010003806) #25 LRIT3 (ENSGALG00010003813) #26 RRH (ENSGALG00010003827) #27 GAR1 (ENSGALG00010003838) #28 CFI (ENSGALG00010003845) #29 PLA2G12A (ENSGALG00010003850) #30 CASP6 (ENSGALG00010003879) #31 MCUB (ENSGALG00010003896) #32 ENSGALG00010003897 PDLIM5 (ENSGALG00010004312) BMPR1B (ENSGALG00010004337) UNC5C (ENSGALG00010004366) RAP1GDS1 (ENSGALG00010004421) Turkey MODERN SPECIES 24 SEC24D (ENSMGAG00000010783) ##33 METTL14 (ENSMGAG00000010804) PRSS12 (ENSMGAG00000010824) NDST3 (ENSMGAG00000010843) NDST4 (ENSMGAG00000010849) #9 UGT8 (ENSMGAG00000010859) #10 ARSJ (ENSMGAG00000010871) #11 ENSMGAG00000010872 #12 ENSMGAG00000010896 #13 ENSMGAG00000017256 #13 LARP7 (ENSMGAG00000010947) #14 ENSMGAG00000010968 #16 ALPK1 (ENSMGAG00000010978) #18 TIFA (ENSMGAG00000015729) #19 AP1AR (ENSMGAG00000010986) #20 ENSMGAG00000021684 #22 ENPEP (ENSMGAG00000010993) #23 ELOVL6 (ENSMGAG00000019199) #24 EGF (ENSMGAG00000011026) #25 LRIT3 (ENSMGAG00000011046) #26 RRH (ENSMGAG00000011050) #27 GAR1 (ENSMGAG00000011058) #28 CFI (ENSMGAG00000011059) #29 PLA2G12A (ENSMGAG00000020955) #30 CASP6 (ENSMGAG00000011070) #31 MCUB (ENSMGAG00000011080) #32 PDLIM5 (ENSMGAG00000011086) BMPR1B (ENSMGAG00000011094) UNC5C (ENSMGAG00000011105) RAP1GDS1 (ENSMGAG00000011150) TSPAN5 (ENSMGAG00000011165) Japanese quail DUPLICATION Japanese quail MODERN SPECIES 22 METTL14 (ENSCJPG00005003753) PRSS12 (ENSCJPG00005003756) NDST3 (ENSCJPG00005003762) NDST4 (ENSCJPG00005003779) #9 UGT8 (ENSCJPG00005003794) #10 ARSJ (ENSCJPG00005003806) #11 ENSCJPG00005003811 #12 ANK2 (ENSCJPG00005003829) #13 LARP7 (ENSCJPG00005006784) #14 ENSCJPG00005006789 #16 NEUROG2 (ENSCJPG00005006790) #17 ALPK1 (ENSCJPG00005006791) #18 TIFA (ENSCJPG00005006794) #19 AP1AR (ENSCJPG00005006795) #20 FAM241A (ENSCJPG00005006796) #21 ENSCJPG00005006843 #22 ENPEP (ENSCJPG00005006861) #23 ELOVL6 (ENSCJPG00005006876) #24 EGF (ENSCJPG00005006885) #25 LRIT3 (ENSCJPG00005006892) #26 RRH (ENSCJPG00005006893) #27 GAR1 (ENSCJPG00005006897) #28 CFI (ENSCJPG00005006898) #29 PLA2G12A (ENSCJPG00005006899) #30 CASP6 (ENSCJPG00005006900) #31 MCUB (ENSCJPG00005006901) #32 PDLIM5 (ENSCJPG00005006904) BMPR1B (ENSCJPG00005006908) UNC5C (ENSCJPG00005006921) RAP1GDS1 (ENSCJPG00005006934) TSPAN5 (ENSCJPG00005006940) Japanese quail MODERN SPECIES 4 ENSCJPG00005005202 HNRNPA0 (ENSCJPG00005005201) KLHL3 (ENSCJPG00005005200) SPOCK1 (ENSCJPG00005005199) TRPC7 (ENSCJPG00005005195) ENSCJPG00005005193 SMAD5 (ENSCJPG00005005192) TGFBI (ENSCJPG00005005188) ENSCJPG00005005186 ENSCJPG00005005182 ENSCJPG00005005181 SLC25A48 (ENSCJPG00005005179) CXCL14 (ENSCJPG00005005173) NEUROG1 (ENSCJPG00005005172) MACROH2A1 (ENSCJPG00005005171) PITX1 (ENSCJPG00005005163) #22 PCBD2 (ENSCJPG00005005162) TXNDC15 (ENSCJPG00005005159) C5orf24 (ENSCJPG00005005156) DDX46 (ENSCJPG00005005147) CAMLG (ENSCJPG00005005143) SEC24A (ENSCJPG00005005137) ##33 SAR1B (ENSCJPG00005005136) JADE2 (ENSCJPG00005005135) UBE2B (ENSCJPG00005005133) PPP2CA (ENSCJPG00005005132) SKP1 (ENSCJPG00005005131) TCF7 (ENSCJPG00005005130) VDAC1 (ENSCJPG00005005127) C5orf15 (ENSCJPG00005005126) ENSCJPG00005005125 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00390000015484.d ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb tuatara MODERN SPECIES 1050 TRPC7 (ENSSPUG00000008551) ENSSPUG00000008560 SMAD5 (ENSSPUG00000008573) TGFBI (ENSSPUG00000008602) LECT2 (ENSSPUG00000008638) ENSSPUG00000008674 SLC25A48 (ENSSPUG00000008696) CXCL14 (ENSSPUG00000008767) NEUROG1 (ENSSPUG00000008778) MACROH2A1 (ENSSPUG00000008802) PITX1 (ENSSPUG00000008839) #22 CATSPER3 (ENSSPUG00000008855) PCBD2 (ENSSPUG00000008886) TXNDC15 (ENSSPUG00000008895) C5orf24 (ENSSPUG00000008904) DDX46 (ENSSPUG00000008985) CAMLG (ENSSPUG00000009378) SEC24A (ENSSPUG00000009401) ##33 SAR1B (ENSSPUG00000009441) JADE2 (ENSSPUG00000009471) ENSSPUG00000009508 UBE2B (ENSSPUG00000009524) CDKL3 (ENSSPUG00000009556) PPP2CA (ENSSPUG00000009588) SKP1 (ENSSPUG00000009612) TCF7 (ENSSPUG00000009678) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Laterata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT00950000186323 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831 Common wall lizard MODERN SPECIES 10 ENSPMRG00000005068 ENSPMRG00000005059 KLHL3 (ENSPMRG00000005048) SPOCK1 (ENSPMRG00000005039) ENSPMRG00000005036 TRPC7 (ENSPMRG00000005022) ENSPMRG00000005017 SMAD5 (ENSPMRG00000005010) ENSPMRG00000012148 TGFBI (ENSPMRG00000012138) ENSPMRG00000012134 SLC25A48 (ENSPMRG00000012132) ENSPMRG00000012131 NEUROG1 (ENSPMRG00000012128) MACROH2A1 (ENSPMRG00000012125) PITX1 (ENSPMRG00000012122) #22 CATSPER3 (ENSPMRG00000012117) PCBD2 (ENSPMRG00000012115) TXNDC15 (ENSPMRG00000012113) C5orf24 (ENSPMRG00000012110) DDX46 (ENSPMRG00000012038) ENSPMRG00000012023 SEC24A (ENSPMRG00000011870) ##33 ENSPMRG00000011845 ENSPMRG00000011842 ENSPMRG00000011840 CDKN2AIPNL (ENSPMRG00000011837) UBE2B (ENSPMRG00000011833) CDKL3 (ENSPMRG00000011826) PPP2CA (ENSPMRG00000011825) ENSPMRG00000011819 Argentine black and white tegu DUPLICATION Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 11 NDST3 (ENSSMRG00000015397) ENSSMRG00000015396 NDST4 (ENSSMRG00000015395) #9 UGT8 (ENSSMRG00000015393) #10 ENSSMRG00000015392 ARSJ (ENSSMRG00000015389) #11 ENSSMRG00000015388 #12 ANK2 (ENSSMRG00000015387) #13 LARP7 (ENSSMRG00000014711) #14 ENSSMRG00000014702 #16 NEUROG2 (ENSSMRG00000014699) #17 ALPK1 (ENSSMRG00000014696) #18 TIFA (ENSSMRG00000014694) #19 AP1AR (ENSSMRG00000014692) #20 FAM241A (ENSSMRG00000014689) #21 ENSSMRG00000014683 #22 ENPEP (ENSSMRG00000014677) #23 ELOVL6 (ENSSMRG00000014676) #24 EGF (ENSSMRG00000014673) #25 LRIT3 (ENSSMRG00000014672) #26 RRH (ENSSMRG00000014671) #27 GAR1 (ENSSMRG00000014670) #28 CFI (ENSSMRG00000014669) #29 PLA2G12A (ENSSMRG00000014668) #30 CASP6 (ENSSMRG00000014667) #31 MCUB (ENSSMRG00000014666) #32 SEC24B (ENSSMRG00000014665) #33 COL25A1 (ENSSMRG00000014662) #34 ETNPPL (ENSSMRG00000014660) #35 OSTC (ENSSMRG00000014659) #36 RPL34 (ENSSMRG00000014657) #37 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 1 ENSSMRG00000017392 ENSSMRG00000017394 KLHL3 (ENSSMRG00000017413) ENSSMRG00000017419 SPOCK1 (ENSSMRG00000017432) ENSSMRG00000017446 TRPC7 (ENSSMRG00000017452) ENSSMRG00000017493 SMAD5 (ENSSMRG00000017494) TGFBI (ENSSMRG00000017510) ENSSMRG00000017511 SLC25A48 (ENSSMRG00000017512) CXCL14 (ENSSMRG00000017516) NEUROG1 (ENSSMRG00000017521) MACROH2A1 (ENSSMRG00000017522) PITX1 (ENSSMRG00000017537) #22 CATSPER3 (ENSSMRG00000017557) PCBD2 (ENSSMRG00000017579) TXNDC15 (ENSSMRG00000017580) C5orf24 (ENSSMRG00000017582) DDX46 (ENSSMRG00000017584) CAMLG (ENSSMRG00000017636) SEC24A (ENSSMRG00000017637) ##33 ENSSMRG00000017681 JADE2 (ENSSMRG00000017697) CDKN2AIPNL (ENSSMRG00000017700) UBE2B (ENSSMRG00000017701) CDKL3 (ENSSMRG00000017704) PPP2CA (ENSSMRG00000017705) SKP1 (ENSSMRG00000017706) TCF7 (ENSSMRG00000017715) Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161122 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000159491 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb Elapidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000161122 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a.f ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831.a Indian cobra DUPLICATION Indian cobra MODERN SPECIES 3 FHDC1 (ENSNNAG00000005713) TRIM2 (ENSNNAG00000005557) TMEM131L (ENSNNAG00000005349) UGT8 (ENSNNAG00000005311) #10 ENSNNAG00000005297 ARSJ (ENSNNAG00000005286) #11 ENSNNAG00000005166 #12 ANK2 (ENSNNAG00000004461) #13 LARP7 (ENSNNAG00000004358) #14 ENSNNAG00000004137 #16 NEUROG2 (ENSNNAG00000004113) #17 ALPK1 (ENSNNAG00000004039) #18 TIFA (ENSNNAG00000004025) #19 AP1AR (ENSNNAG00000003989) #20 FAM241A (ENSNNAG00000003971) #21 ENSNNAG00000003947 #22 ENPEP (ENSNNAG00000003920) #23 ELOVL6 (ENSNNAG00000003899) #24 ENSNNAG00000003870 #25 LRIT3 (ENSNNAG00000003773) #26 RRH (ENSNNAG00000003727) #27 GAR1 (ENSNNAG00000003702) #28 CFI (ENSNNAG00000003639) #29 PLA2G12A (ENSNNAG00000003618) #30 CASP6 (ENSNNAG00000003598) #31 MCUB (ENSNNAG00000003567) #32 SEC24B (ENSNNAG00000003515) #33 ETNPPL (ENSNNAG00000003409) #35 OSTC (ENSNNAG00000003381) #36 RPL34 (ENSNNAG00000003366) #37 LEF1 (ENSNNAG00000003356) Indian cobra MODERN SPECIES 1 MYOT (ENSNNAG00000002422) ENSNNAG00000002430 HNRNPA0 (ENSNNAG00000002435) KLHL3 (ENSNNAG00000002444) SPOCK1 (ENSNNAG00000002463) ENSNNAG00000002470 TRPC7 (ENSNNAG00000002502) ENSNNAG00000002605 SMAD5 (ENSNNAG00000002611) TGFBI (ENSNNAG00000002618) ENSNNAG00000002628 SLC25A48 (ENSNNAG00000002634) CXCL14 (ENSNNAG00000002654) NEUROG1 (ENSNNAG00000002661) MACROH2A1 (ENSNNAG00000002667) PITX1 (ENSNNAG00000002679) #22 CATSPER3 (ENSNNAG00000002694) PCBD2 (ENSNNAG00000002727) TXNDC15 (ENSNNAG00000002732) C5orf24 (ENSNNAG00000002736) DDX46 (ENSNNAG00000002747) ENSNNAG00000002763 SEC24A (ENSNNAG00000002983) ##33 ENSNNAG00000006501 JADE2 (ENSNNAG00000006519) CDKN2AIPNL (ENSNNAG00000006543) UBE2B (ENSNNAG00000006559) CDKL3 (ENSNNAG00000006597) PPP2CA (ENSNNAG00000006645) SKP1 (ENSNNAG00000006670) TCF7 (ENSNNAG00000006715) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000161122 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a.f ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.d ENSGT00940000158570.c ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 1067 PITX1 (ENSLLTG00000007077) #22 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00940000161122 ENSGT00940000159795.a ENSGT00940000163511 ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00940000158371 ENSGT01060000248588.a.c.a.f ENSGT01030000235204 ENSGT00940000155437 ENSGT00530000063860.a ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000161455 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000164397.b ENSGT00940000158570.d ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00940000161317 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652.bb ENSGT00940000159831.a Eastern brown snake DUPLICATION Eastern brown snake MODERN SPECIES 9 MND1 (ENSPTXG00000016767) ENSPTXG00000016768 TMEM131L (ENSPTXG00000016769) UGT8 (ENSPTXG00000016771) #10 ARSJ (ENSPTXG00000016772) #11 ENSPTXG00000016774 #12 ANK2 (ENSPTXG00000016792) #13 LARP7 (ENSPTXG00000017656) #14 ENSPTXG00000017657 ENSPTXG00000007887 #16 NEUROG2 (ENSPTXG00000007889) #17 ALPK1 (ENSPTXG00000007891) #18 TIFA (ENSPTXG00000007893) #19 AP1AR (ENSPTXG00000007894) #20 FAM241A (ENSPTXG00000007896) #21 ENSPTXG00000007899 #22 ENPEP (ENSPTXG00000007905) #23 ELOVL6 (ENSPTXG00000007933) #24 EGF (ENSPTXG00000007934) #25 LRIT3 (ENSPTXG00000007938) #26 RRH (ENSPTXG00000007940) #27 GAR1 (ENSPTXG00000007942) #28 CFI (ENSPTXG00000007945) #29 PLA2G12A (ENSPTXG00000007947) #30 CASP6 (ENSPTXG00000007949) #31 MCUB (ENSPTXG00000007950) #32 SEC24B (ENSPTXG00000007954) #33 ETNPPL (ENSPTXG00000008058) #35 OSTC (ENSPTXG00000008062) #36 RPL34 (ENSPTXG00000008064) #37 LEF1 (ENSPTXG00000008066) Eastern brown snake MODERN SPECIES 6 PKD2L2 (ENSPTXG00000013259) MYOT (ENSPTXG00000013252) ENSPTXG00000013251 HNRNPA0 (ENSPTXG00000013250) KLHL3 (ENSPTXG00000013249) SPOCK1 (ENSPTXG00000013248) TRPC7 (ENSPTXG00000013208) ENSPTXG00000013205 SMAD5 (ENSPTXG00000013204) TGFBI (ENSPTXG00000013203) ENSPTXG00000013202 SLC25A48 (ENSPTXG00000013201) CXCL14 (ENSPTXG00000013200) NEUROG1 (ENSPTXG00000013199) MACROH2A1 (ENSPTXG00000007513) PITX1 (ENSPTXG00000007511) #22 CATSPER3 (ENSPTXG00000007508) PCBD2 (ENSPTXG00000007506) TXNDC15 (ENSPTXG00000007504) C5orf24 (ENSPTXG00000007502) DDX46 (ENSPTXG00000007500) CAMLG (ENSPTXG00000007498) SEC24A (ENSPTXG00000007493) ##33 ENSPTXG00000007491 JADE2 (ENSPTXG00000007487) CDKN2AIPNL (ENSPTXG00000007485) UBE2B (ENSPTXG00000007484) CDKL3 (ENSPTXG00000007480) PPP2CA (ENSPTXG00000007479) SKP1 (ENSPTXG00000007477) ENSPTXG00000007476 Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 24 MND1 (ENSNSUG00000004678) ENSNSUG00000004676 UGT8 (ENSNSUG00000004673) #10 ARSJ (ENSNSUG00000004671) #11 CAMK2D (ENSNSUG00000004208) ENSNSUG00000004195 ENSNSUG00000004189 #13 ENSNSUG00000004187 #13 LARP7 (ENSNSUG00000003937) #14 ENSNSUG00000003936 #16 NEUROG2 (ENSNSUG00000003935) #17 ALPK1 (ENSNSUG00000003921) #18 TIFA (ENSNSUG00000003918) #19 AP1AR (ENSNSUG00000003913) #20 FAM241A (ENSNSUG00000003912) #21 ENSNSUG00000003911 #22 ENPEP (ENSNSUG00000003744) #23 ELOVL6 (ENSNSUG00000003740) #24 ENSNSUG00000003739 #25 LRIT3 (ENSNSUG00000003735) #26 RRH (ENSNSUG00000003731) #27 GAR1 (ENSNSUG00000003730) #28 CFI (ENSNSUG00000003719) #29 PLA2G12A (ENSNSUG00000003717) #30 CASP6 (ENSNSUG00000003715) #31 MCUB (ENSNSUG00000003712) #32 SEC24B (ENSNSUG00000003701) #33 ETNPPL (ENSNSUG00000003698) #35 OSTC (ENSNSUG00000003694) #36 LEF1 (ENSNSUG00000003686) ENSNSUG00000003683 Mainland tiger snake MODERN SPECIES 4 HNRNPA0 (ENSNSUG00000003078) KLHL3 (ENSNSUG00000003079) SPOCK1 (ENSNSUG00000003088) ENSNSUG00000003090 ENSNSUG00000003091 ENSNSUG00000003093 TRPC7 (ENSNSUG00000003094) ENSNSUG00000003172 SMAD5 (ENSNSUG00000003173) TGFBI (ENSNSUG00000003177) ENSNSUG00000003227 SLC25A48 (ENSNSUG00000003228) CXCL14 (ENSNSUG00000003229) NEUROG1 (ENSNSUG00000003231) MACROH2A1 (ENSNSUG00000003232) PITX1 (ENSNSUG00000003233) #22 CATSPER3 (ENSNSUG00000003236) PCBD2 (ENSNSUG00000003269) TXNDC15 (ENSNSUG00000003272) C5orf24 (ENSNSUG00000003273) DDX46 (ENSNSUG00000003281) CAMLG (ENSNSUG00000004455) SEC24A (ENSNSUG00000004456) ##33 ENSNSUG00000004463 JADE2 (ENSNSUG00000004469) CDKN2AIPNL (ENSNSUG00000004477) UBE2B (ENSNSUG00000004480) CDKL3 (ENSNSUG00000004483) PPP2CA (ENSNSUG00000004490) SKP1 (ENSNSUG00000004491) TCF7 (ENSNSUG00000004495) Lizard DUPLICATION Lizard MODERN SPECIES 4 ANK2 (ENSACAG00000010704) #13 ENSACAG00000041599 ENSACAG00000044520 ENSACAG00000042033 LARP7 (ENSACAG00000010662) #14 ENSACAG00000010636 #16 ENSACAG00000042613 NEUROG2 (ENSACAG00000023148) #17 ALPK1 (ENSACAG00000010623) #18 ENSACAG00000045195 TIFA (ENSACAG00000044752) #19 AP1AR (ENSACAG00000010601) #20 FAM241A (ENSACAG00000024372) #21 ENSACAG00000045335 ENSACAG00000035516 ENSACAG00000010590 #22 ENPEP (ENSACAG00000010237) #23 ENSACAG00000037044 ELOVL6 (ENSACAG00000036240) #24 ENSACAG00000038842 EGF (ENSACAG00000010153) #25 LRIT3 (ENSACAG00000010138) #26 ENSACAG00000010114 #27 GAR1 (ENSACAG00000010031) #28 ENSACAG00000010059 #29 ENSACAG00000029395 #29 PLA2G12A (ENSACAG00000043243) #30 CASP6 (ENSACAG00000012875) #31 MCUB (ENSACAG00000012831) #32 SEC24B (ENSACAG00000012684) #33 ETNPPL (ENSACAG00000012569) #35 Lizard MODERN SPECIES 837 ENSACAG00000035973 ENSACAG00000036627 TRPC7 (ENSACAG00000000336) ENSACAG00000036444 SMAD5 (ENSACAG00000000815) TGFBI (ENSACAG00000000858) fbxl21p (ENSACAG00000045147) SLC25A48 (ENSACAG00000001174) CXCL14 (ENSACAG00000042727) NEUROG1 (ENSACAG00000001255) MACROH2A1 (ENSACAG00000001269) ENSACAG00000035237 ENSACAG00000043939 ENSACAG00000045294 #22 CATSPER3 (ENSACAG00000001386) PCBD2 (ENSACAG00000042954) TXNDC15 (ENSACAG00000001427) DDX46 (ENSACAG00000001437) CAMLG (ENSACAG00000001591) SEC24A (ENSACAG00000001623) ##33 SAR1B (ENSACAG00000001850) ENSACAG00000044786 ENSACAG00000035697 JADE2 (ENSACAG00000001897) Anura ANCESTRAL SPECIES 157 ENSGT00940000159491 ENSGT00390000015384 ENSGT00940000159354 ENSGT00390000000618 ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159541 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00390000007221.a.a ENSGT00390000002845 ENSGT00390000014889 ENSGT00940000157753 ENSGT00390000015996 ENSGT00950000182924.B.a.b ##33 ENSGT00940000160154 ENSGT00940000158570 ENSGT00390000008582 ENSGT00940000157177 ENSGT00940000156580 ENSGT00550000074618.a.a ENSGT00390000012652 ENSGT00940000159831 ENSGT00950000182869.e.a.b Frog MODERN SPECIES 3 ENSXETG00000046801 ccng1 (ENSXETG00000007909) ENSXETG00000031516 hmmr (ENSXETG00000007906) nudcd2 (ENSXETG00000007907) ENSXETG00000046765 ENSXETG00000038955 thg1l (ENSXETG00000007902) fbxl21p (ENSXETG00000007903) il9 (ENSXETG00000033564) slc25a48 (ENSXETG00000007900) ENSXETG00000040536 cxcl14 (ENSXETG00000007899) neurog1 (ENSXETG00000007898) macroh2a1 (ENSXETG00000007897) pitx1 (ENSXETG00000010401) #22 pcbd2 (ENSXETG00000039195) ENSXETG00000042850 txndc15 (ENSXETG00000010403) c5orf24 (ENSXETG00000010404) ddx46 (ENSXETG00000010405) camlg (ENSXETG00000010406) sco2 (ENSXETG00000010407) ##33 sar1b (ENSXETG00000010408) jade2 (ENSXETG00000010410) sting1 (ENSXETG00000016088) cdkn2aipnl (ENSXETG00000016090) ube2b (ENSXETG00000026236) ppp2ca (ENSXETG00000016092) tcf7 (ENSXETG00000016100) skp1 (ENSXETG00000016095) Leishan spiny toad DUPLICATION Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000004435 ENSLLEG00000004422 LEF1 (ENSLLEG00000004381) ENSLLEG00000004366 RPL34 (ENSLLEG00000004358) #37 OSTC (ENSLLEG00000004348) #36 ETNPPL (ENSLLEG00000004323) #35 COL25A1 (ENSLLEG00000004258) #34 ENSLLEG00000004186 ENSLLEG00000004181 ENSLLEG00000004180 SEC24B (ENSLLEG00000004146) #33 MCUB (ENSLLEG00000004126) #32 FAM241A (ENSLLEG00000004121) #21 ENSLLEG00000004119 ENSLLEG00000004108 #22 ENPEP (ENSLLEG00000004086) #23 ENSLLEG00000004082 ELOVL6 (ENSLLEG00000004077) #24 EGF (ENSLLEG00000004056) #25 LRIT3 (ENSLLEG00000004044) #26 ENSLLEG00000004040 CFI (ENSLLEG00000004014) #29 GAR1 (ENSLLEG00000003995) #28 RRH (ENSLLEG00000003989) #27 ENSLLEG00000003984 ENSLLEG00000003978 CASP6 (ENSLLEG00000003968) #31 AP1AR (ENSLLEG00000003961) #20 TIFA (ENSLLEG00000003955) #19 ALPK1 (ENSLLEG00000003941) #18 Leishan spiny toad MODERN SPECIES 6 ENSLLEG00000019160 MAG (ENSLLEG00000019238) ENSLLEG00000019702 P4HA2 (ENSLLEG00000020017) ENSLLEG00000020560 ENSLLEG00000020601 ENSLLEG00000020621 ENSLLEG00000020748 ENSLLEG00000022181 ENSLLEG00000022249 ENSLLEG00000022425 NEUROG1 (ENSLLEG00000022523) MACROH2A1 (ENSLLEG00000022585) ENSLLEG00000022777 ENSLLEG00000022797 PITX1 (ENSLLEG00000022830) #22 ENSLLEG00000022902 TXNDC15 (ENSLLEG00000022974) C5orf24 (ENSLLEG00000023126) ENSLLEG00000023183 DDX46 (ENSLLEG00000023221) CAMLG (ENSLLEG00000023589) ENSLLEG00000023641 SEC24A (ENSLLEG00000023670) ##33 ENSLLEG00000023866 JADE2 (ENSLLEG00000024085) ENSLLEG00000024339 ENSLLEG00000024392 ENSLLEG00000024405 ENSLLEG00000024427 ENSLLEG00000024486 Coelacanth DUPLICATION Coelacanth MODERN SPECIES 600 AP1AR (ENSLACG00000016120) #20 ENSLACG00000016071 FAM241A (ENSLACG00000015687) #21 ENSLACG00000012745 pitx2 (ENSLACG00000005617) #22 ENPEP (ENSLACG00000002781) #23 Coelacanth MODERN SPECIES 507 PITX1 (ENSLACG00000003428) #22 CATSPER3 (ENSLACG00000004902) PCBD2 (ENSLACG00000005929) TXNDC15 (ENSLACG00000007056) C5orf24 (ENSLACG00000007579) ENSLACG00000007781 DDX46 (ENSLACG00000007965) CAMLG (ENSLACG00000008877) SEC24A (ENSLACG00000009263) ##33 sar1b (ENSLACG00000010795) slc22a21 (ENSLACG00000011707) ENSLACG00000015018 ENSLACG00000016156 EIF4EBP3 (ENSLACG00000016472) ANKHD1 (ENSLACG00000016536) Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000156337 ENSGT00990000210463 ENSGT00940000155475.h ENSGT00940000153395.a ENSGT00940000159954 #11 ENSGT00940000155150.a ENSGT00940000155279.C #13 ENSGT00940000154949.b #14 ENSGT00940000162335 #16 ENSGT01030000234583.a.b.b.f ENSGT00390000017284.b ENSGT00940000162170 ENSGT00940000159753 #18 ENSGT00940000154589.b #19 ENSGT00940000154340.A #21 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000156946 #23 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT01100000263524.I #27 ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00390000013159 ENSGT00910000144274 ENSGT00960000189638 ENSGT00730000111645 ENSGT00390000011412 ENSGT00530000063169.a Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 410 ENSGT00940000154340.A #21 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000156946 #23 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 293 ENSGT00390000005644 ENSGT00940000156665.b ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000154194.c.b ENSGT00940000158205 ENSGT00940000164379 ENSGT00940000164529 ENSGT00940000154340.A #21 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000156946 #23 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 279 ENSGT00390000014316.c.a ENSGT00550000074940 ENSGT00940000157266.b.a ENSGT00940000159024.g ENSGT00940000154713.B.d ENSGT00910000144274.b ENSGT00390000013159.g ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT00940000156946.m.b #23 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a.a #26 ENSGT00940000154340.A.m #21 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000164529.b ENSGT00940000164379 ENSGT00940000158205 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000156665.b ENSGT00390000005644 Asian bonytongue MODERN SPECIES 20 shisa3 (ENSSFOG00015006116) atp8a1 (ENSSFOG00015006132) ENSSFOG00015027908 ENSSFOG00015030317 ENSSFOG00015004434 ENSSFOG00015032520 ENSSFOG00015004427 kctd8 (ENSSFOG00015004421) GNPDA2 (ENSSFOG00015004375) GUF1 (ENSSFOG00015004296) GABRA2 (ENSSFOG00015004249) gabra4 (ENSSFOG00015004191) ENSSFOG00015013379 dapp1 (ENSSFOG00015004100) LAMTOR3 (ENSSFOG00015004068) pitx2 (ENSSFOG00015004041) #22 elovl6 (ENSSFOG00015003973) #24 egf (ENSSFOG00015003886) #25 lrit3a (ENSSFOG00015003865) #26 FAM241A (ENSSFOG00015003843) #21 ENSSFOG00015003834 zgc:77938 (ENSSFOG00015003815) ENSSFOG00015003019 ENSSFOG00015002974 adh5 (ENSSFOG00015002969) metap1 (ENSSFOG00015002910) eif4ea (ENSSFOG00015002887) LINGO2 (ENSSFOG00015002874) PIGG (ENSSFOG00015002805) fnta (ENSSFOG00015002778) GSTP1 (ENSSFOG00015002770) P. kingsleyae DUPLICATION P. kingsleyae MODERN SPECIES 483 enpep (ENSPKIG00000018820) #23 ENSPKIG00000018921 #22 tdh (ENSPKIG00000018934) rrh (ENSPKIG00000018975) #27 gar1 (ENSPKIG00000018991) #28 lamtor3 (ENSPKIG00000019018) dapp1 (ENSPKIG00000019051) atp10d (ENSPKIG00000019099) ENSPKIG00000019131 P. kingsleyae MODERN SPECIES 190 kctd8 (ENSPKIG00000000965) GNPDA2 (ENSPKIG00000000934) GUF1 (ENSPKIG00000000883) GABRA2 (ENSPKIG00000000841) gabra4 (ENSPKIG00000000804) ENSPKIG00000000775 dapp1 (ENSPKIG00000000754) LAMTOR3 (ENSPKIG00000000669) pitx2 (ENSPKIG00000000649) #22 enpep (ENSPKIG00000000622) #23 elovl6 (ENSPKIG00000000586) #24 egf (ENSPKIG00000000516) #25 lrit3a (ENSPKIG00000000482) #26 FAM241A (ENSPKIG00000000475) #21 ap1ar (ENSPKIG00000000444) zgc:77938 (ENSPKIG00000000400) ENSPKIG00000000359 adh5 (ENSPKIG00000000330) metap1 (ENSPKIG00000000301) eif4ea (ENSPKIG00000000226) LINGO2 (ENSPKIG00000000207) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 181 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 125 ENSGT00390000006394 ENSGT00940000160322 ENSGT00940000158578 ENSGT00940000160246.c.b ENSGT00940000163364 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.a ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00950000183073.a.a.b ENSGT00390000003354 ENSGT00950000182866.D.d.b.cb ENSGT00390000014827.b ENSGT00940000158980 ENSGT00390000006394 ENSGT00940000160322 ENSGT00940000158578 ENSGT00940000160246.c.b ENSGT00940000163364 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.a ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Denticle herring MODERN SPECIES 9 mcm7 (ENSDCDG00000030464) ENSDCDG00000031128 COPS6 (ENSDCDG00000031129) ENSDCDG00000005646 ENSDCDG00000005651 mrpl18 (ENSDCDG00000005660) ENSDCDG00000005729 grhpra (ENSDCDG00000006140) ENSDCDG00000006177 ENSDCDG00000006206 LINGO2 (ENSDCDG00000006364) eif4ea (ENSDCDG00000006410) adh5 (ENSDCDG00000006501) gar1 (ENSDCDG00000006836) #28 adh5l (ENSDCDG00000006915) pitx2 (ENSDCDG00000006978) #22 elovl6 (ENSDCDG00000007102) #24 egf (ENSDCDG00000007469) #25 lrit3a (ENSDCDG00000011442) #26 gpm6aa (ENSDCDG00000011461) spata4 (ENSDCDG00000011575) ENSDCDG00000011584 neil3 (ENSDCDG00000011592) aga (ENSDCDG00000011642) TENM3 (ENSDCDG00000012722) ENSDCDG00000021605 tdo2a (ENSDCDG00000021606) CTSO (ENSDCDG00000021608) PDGFC (ENSDCDG00000021610) glrbb (ENSDCDG00000021613) gria2b (ENSDCDG00000021750) Atlantic herring MODERN SPECIES 22 ENSCHAG00000010520 ENSCHAG00000010551 ATG2A (ENSCHAG00000011380) JAKMIP1 (ENSCHAG00000014359) WFS1 (ENSCHAG00000014976) rtn4rl2b (ENSCHAG00000014983) ENSCHAG00000014991 zgc:77938 (ENSCHAG00000015019) ENSCHAG00000015390 ENSCHAG00000015410 ENSCHAG00000015426 ENSCHAG00000015431 ENSCHAG00000015455 ENSCHAG00000015482 ENSCHAG00000015496 pitx2 (ENSCHAG00000000703) #22 elovl6 (ENSCHAG00000000789) #24 egf (ENSCHAG00000000913) #25 lrit3a (ENSCHAG00000001090) #26 gpm6aa (ENSCHAG00000001184) spata4 (ENSCHAG00000001295) asb5a (ENSCHAG00000001344) neil3 (ENSCHAG00000001381) aga (ENSCHAG00000001418) TENM3 (ENSCHAG00000001878) ENSCHAG00000008931 tdo2a (ENSCHAG00000008964) CTSO (ENSCHAG00000009163) ENSCHAG00000009189 ENSCHAG00000009193 PDGFC (ENSCHAG00000009210) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 293 ENSGT00940000176100 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000159253 ENSGT00940000157465 ENSGT01050000244840.A.b.a ENSGT00390000015484.i ENSGT00940000155521.a.a Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000167634.c ENSGT00940000167634.d ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000159253 ENSGT00940000157465 ENSGT01050000244840.A.b.a ENSGT00390000015484.i ENSGT00940000155521.a.a Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 838 ENSGT00940000154518.a.e #22 ENSGT01050000244965.b.a.a #24 ENSGT00940000158366.t #25 ENSGT00940000156627.a.c #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.c ENSGT00910000144159.B.e ENSGT00940000165522.a.a ENSGT00940000153230.A.a Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00950000182859.A.a.b.b.d.b.a ENSGT00940000155650.a.a.g ENSGT00390000012944 ENSGT00940000161486.g ENSGT00940000153304.A.c ENSGT00940000159060.b ENSGT00940000159149.d ENSGT00940000160322.b ENSGT00940000158645.h ENSGT00940000156344.b.e ENSGT00940000156950.a.d ENSGT00420000029769.b.j ENSGT00390000012574.j.a ENSGT00940000167634.c ENSGT00940000167634.d.b ENSGT00940000154518.a.e #22 ENSGT01050000244965.b.a.a #24 ENSGT00940000158366.t #25 ENSGT00940000156627.a.c #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.c ENSGT00910000144159.B.e ENSGT00940000165522.a.a ENSGT00940000153230.A.a Common carp reference MODERN SPECIES 35 ebf3a (ENSCCRG00000060568) clint1a (ENSCCRG00000053927) LSM11 (ENSCCRG00000073242) ENSCCRG00000071752 trmt12 (ENSCCRG00000060895) sytl4 (ENSCCRG00000050668) ENSCCRG00000081130 ENSCCRG00000012911 PDGFC (ENSCCRG00000018720) glrbb (ENSCCRG00000016043) gria2b (ENSCCRG00000067734) GASK1B (ENSCCRG00000074349) tmem144b (ENSCCRG00000029120) adh5l (ENSCCRG00000077152) zgc:77938 (ENSCCRG00000062627) pitx2 (ENSCCRG00000043209) #22 elovl6 (ENSCCRG00000075942) #24 egf (ENSCCRG00000043237) #25 lrit3a (ENSCCRG00000020127) #26 gpm6aa (ENSCCRG00000072724) spata4 (ENSCCRG00000043598) asb5a (ENSCCRG00000072217) aga (ENSCCRG00000043616) neil3 (ENSCCRG00000043608) ENSCCRG00000026040 ENSCCRG00000082491 tdo2a (ENSCCRG00000027461) rnf130 (ENSCCRG00000042574) ENSCCRG00000042556 ENSCCRG00000042573 ENSCCRG00000063819 Golden-line barbel MODERN SPECIES 329 ZBTB3 (ENSSGRG00000021781) trmt12 (ENSSGRG00000021782) sytl4 (ENSSGRG00000021785) SRPX2 (ENSSGRG00000021790) ENSSGRG00000021872 mrpl18 (ENSSGRG00000021873) PDGFC (ENSSGRG00000021887) glrbb (ENSSGRG00000022094) gria2b (ENSSGRG00000022206) GASK1B (ENSSGRG00000027064) tmem144b (ENSSGRG00000027066) adh5l (ENSSGRG00000027074) ENSSGRG00000027639 zgc:77938 (ENSSGRG00000027640) zgc:77938 (ENSSGRG00000027641) pitx2 (ENSSGRG00000027642) #22 ENSSGRG00000027645 ENSSGRG00000027646 egf (ENSSGRG00000027648) #25 lrit3a (ENSSGRG00000027715) #26 gpm6aa (ENSSGRG00000027716) spata4 (ENSSGRG00000027722) asb5a (ENSSGRG00000027724) neil3 (ENSSGRG00000027740) aga (ENSSGRG00000027741) ENSSGRG00000027820 Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 2060 glrbb (ENSCARG00000061454) gria2b (ENSCARG00000060288) GASK1B (ENSCARG00000060258) tmem144b (ENSCARG00000060197) adh5l (ENSCARG00000059613) ENSCARG00000059584 pitx2 (ENSCARG00000059534) #22 ENSCARG00000059504 Goldfish MODERN SPECIES 199 pitx2 (ENSCARG00000031170) #22 Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 222 ENSGT00940000156184.b.a ENSGT00940000156184.b.b ENSGT00390000018550 ENSGT00530000064714 ENSGT00390000014666.b.e ENSGT00940000158585.g.a.a ENSGT00390000011381.k ENSGT00940000164982.a.a ENSGT00390000001197.d ENSGT00940000157609.l ENSGT00940000155337.ab.b ENSGT00530000063867.b.b.a ENSGT00940000157081.s.b ENSGT00810000125473.A.a ENSGT00940000155078.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000154518.a.f #22 ENSGT01050000244965.b.b #24 ENSGT00940000158366.s #25 ENSGT00940000156627.a.d #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.d ENSGT00910000144159.B.f ENSGT00940000165522.a.b ENSGT00940000153230.A.b ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.d ENSGT00390000008593.a.m.a ENSGT00940000159253.d ENSGT00940000157465.`b ENSGT00940000157474.h.a ENSGT00940000156603.e ENSGT00940000156644.e.b.c Goldfish DUPLICATION Goldfish MODERN SPECIES 2617 GASK1B (ENSCARG00000045791) ENSCARG00000045771 pitx2 (ENSCARG00000045715) #22 elovl6 (ENSCARG00000045694) #24 lrit3a (ENSCARG00000045469) #26 gpm6aa (ENSCARG00000045404) ENSCARG00000045282 asb5a (ENSCARG00000045235) ENSCARG00000041695 tdo2a (ENSCARG00000041269) CTSO (ENSCARG00000041241) rnf130 (ENSCARG00000041107) F2RL3 (ENSCARG00000041076) LECT2 (ENSCARG00000041043) ENSCARG00000040966 Goldfish MODERN SPECIES 32 adrb2a (ENSCARG00000021626) il12ba (ENSCARG00000021635) RNF145 (ENSCARG00000021649) ebf3a (ENSCARG00000021736) clint1a (ENSCARG00000021906) rnaseh2c (ENSCARG00000021971) ZBTB3 (ENSCARG00000021988) sytl4 (ENSCARG00000021992) SRPX2 (ENSCARG00000022029) ENSCARG00000022070 mrpl18 (ENSCARG00000022092) PDGFC (ENSCARG00000022101) glrbb (ENSCARG00000022109) gria2b (ENSCARG00000022122) GASK1B (ENSCARG00000022320) pitx2 (ENSCARG00000022396) #22 elovl6 (ENSCARG00000022412) #24 ENSCARG00000022447 lrit3a (ENSCARG00000022449) #26 gpm6aa (ENSCARG00000022458) ENSCARG00000022469 asb5a (ENSCARG00000022492) ENSCARG00000022498 ENSCARG00000022499 pdzd11 (ENSCARG00000022505) ENSCARG00000022512 DLG3 (ENSCARG00000022543) kdrl (ENSCARG00000022799) cdx4 (ENSCARG00000022827) chic1 (ENSCARG00000022834) lnx2b (ENSCARG00000041890) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 529 ENSGT00940000154518.a.f #22 ENSGT01050000244965.b.b #24 ENSGT00940000158366.s #25 ENSGT00940000156627.a.d #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.d ENSGT00910000144159.B.f ENSGT00940000165522.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.c ENSGT00390000008593.a.m.b ENSGT00940000159253.c ENSGT00940000157465.ab ENSGT01050000244840.A.b.a.j ENSGT00390000015484.i.q.a Common carp reference MODERN SPECIES 20 RNF145 (ENSCCRG00000037085) ebf3a (ENSCCRG00000051070) clint1a (ENSCCRG00000051054) ENSCCRG00000082456 rnaseh2c (ENSCCRG00000075716) trmt12 (ENSCCRG00000050670) ENSCCRG00000050968 ENSCCRG00000050953 mrpl18 (ENSCCRG00000036088) PDGFC (ENSCCRG00000050934) glrbb (ENSCCRG00000010375) gria2b (ENSCCRG00000062450) GASK1B (ENSCCRG00000023534) tmem144b (ENSCCRG00000023536) ENSCCRG00000056470 pitx2 (ENSCCRG00000078107) #22 ELOVL6 (ENSCCRG00000043218) #24 egf (ENSCCRG00000020133) #25 lrit3a (ENSCCRG00000066994) #26 gpm6aa (ENSCCRG00000020171) spata4 (ENSCCRG00000025862) asb5a (ENSCCRG00000058866) neil3 (ENSCCRG00000064049) ENSCCRG00000036898 ENSCCRG00000033857 ENSCCRG00000077911 tdo2a (ENSCCRG00000033847) rnf130 (ENSCCRG00000005301) ENSCCRG00000040196 ENSCCRG00000070528 ENSCCRG00000040098 Golden-line barbel MODERN SPECIES 1380 pitx2 (ENSSGRG00000024167) #22 elovl6 (ENSSGRG00000024179) #24 egf (ENSSGRG00000024183) #25 lrit3a (ENSSGRG00000024184) #26 gpm6aa (ENSSGRG00000024195) spata4 (ENSSGRG00000024201) asb5a (ENSSGRG00000024203) neil3 (ENSSGRG00000024205) aga (ENSSGRG00000024207) ENSSGRG00000024208 Zebrafish MODERN SPECIES 5 LSM11 (ENSDARG00000090854) ZBTB3 (ENSDARG00000036235) rnaseh2c (ENSDARG00000089637) trmt12 (ENSDARG00000060338) sytl4 (ENSDARG00000102433) SRPX2 (ENSDARG00000034559) ENSDARG00000079591 mrpl18 (ENSDARG00000060199) PDGFC (ENSDARG00000077588) glrbb (ENSDARG00000052769) gria2b (ENSDARG00000052765) GASK1B (ENSDARG00000077054) tmem144b (ENSDARG00000036247) adh5l (ENSDARG00000087262) zgc:77938 (ENSDARG00000088366) pitx2 (ENSDARG00000036194) #22 elovl6 (ENSDARG00000004402) #24 egf (ENSDARG00000052739) #25 lrit3a (ENSDARG00000055463) #26 gpm6aa (ENSDARG00000055455) spata4 (ENSDARG00000036189) asb5a (ENSDARG00000097938) neil3 (ENSDARG00000020079) aga (ENSDARG00000004889) ENSDARG00000087599 tdo2a (ENSDARG00000071429) CTSO (ENSDARG00000052855) rnf130 (ENSDARG00000089767) F2RL3 (ENSDARG00000079399) lect2.1 (ENSDARG00000033227) LECT2 (ENSDARG00000090889) Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 147 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.a ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000181162 ENSGT00940000163364 ENSGT00940000158578 ENSGT00940000160322 ENSGT00390000006394 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b ENSGT00390000012574 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.e Channel catfish MODERN SPECIES 27 PCDH1 (ENSIPUG00000004175) ENSIPUG00000004162 F2RL3 (ENSIPUG00000004142) rnf130 (ENSIPUG00000004123) ctso (ENSIPUG00000004102) TENM3 (ENSIPUG00000004060) aga (ENSIPUG00000003971) zgrf1 (ENSIPUG00000003935) fam198b (ENSIPUG00000003876) tmem144b (ENSIPUG00000003830) ENSIPUG00000003792 ENSIPUG00000003775 ENSIPUG00000003705 pitx2 (ENSIPUG00000003666) #22 elovl6 (ENSIPUG00000003619) #24 egf (ENSIPUG00000003528) #25 lrit3 (ENSIPUG00000003504) #26 gpm6aa (ENSIPUG00000003487) spata4 (ENSIPUG00000003464) gria2 (ENSIPUG00000003420) glrbb (ENSIPUG00000003364) pdgfc (ENSIPUG00000003348) mrpl18 (ENSIPUG00000003341) ENSIPUG00000003295 tomm5 (ENSIPUG00000003275) grhpra (ENSIPUG00000003223) LINGO2 (ENSIPUG00000003219) gar1 (ENSIPUG00000003194) #28 adh5 (ENSIPUG00000003169) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 234 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.e Characoidei ANCESTRAL SPECIES 303 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.e Mexicana tetra MODERN SPECIES 16 eif4ea (ENSAMXG00000038623) adh5 (ENSAMXG00000015767) cdk5r1a (ENSAMXG00000042525) gar1 (ENSAMXG00000015752) #28 LINGO2 (ENSAMXG00000035249) grhpra (ENSAMXG00000037725) tomm5 (ENSAMXG00000033871) ENSAMXG00000015718 mrpl18 (ENSAMXG00000015697) PDGFC (ENSAMXG00000043858) glrbb (ENSAMXG00000015663) gria2b (ENSAMXG00000042385) GASK1B (ENSAMXG00000015621) tmem144b (ENSAMXG00000035791) adh5l (ENSAMXG00000043581) pitx2 (ENSAMXG00000036432) #22 elovl6 (ENSAMXG00000037372) #24 ENSAMXG00000041385 #25 ENSAMXG00000037193 lrit3a (ENSAMXG00000041737) #26 gpm6aa (ENSAMXG00000015426) spata4 (ENSAMXG00000015408) asb5a (ENSAMXG00000043756) neil3 (ENSAMXG00000015365) aga (ENSAMXG00000015342) ENSAMXG00000015239 tdo2a (ENSAMXG00000032882) CTSO (ENSAMXG00000037835) rnf130 (ENSAMXG00000015143) ENSAMXG00000040420 F2RL3 (ENSAMXG00000031906) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 27 ENSPNAG00000003597 adh5 (ENSPNAG00000019668) gar1 (ENSPNAG00000019686) #28 LINGO2 (ENSPNAG00000019692) si:dkey-109l4.3 (ENSPNAG00000019711) tomm5 (ENSPNAG00000019715) grhpra (ENSPNAG00000019736) SSH3 (ENSPNAG00000019770) mrpl18 (ENSPNAG00000019789) PDGFC (ENSPNAG00000019800) khk (ENSPNAG00000019820) GASK1B (ENSPNAG00000019830) tmem144b (ENSPNAG00000019845) adh5l (ENSPNAG00000019866) pitx2 (ENSPNAG00000003615) #22 elovl6 (ENSPNAG00000019912) #24 egf (ENSPNAG00000019917) #25 lrit3a (ENSPNAG00000019934) #26 gpm6aa (ENSPNAG00000019958) spata4 (ENSPNAG00000019966) asb5a (ENSPNAG00000019973) neil3 (ENSPNAG00000019983) aga (ENSPNAG00000019999) TENM3 (ENSPNAG00000021169) tdo2a (ENSPNAG00000021285) CTSO (ENSPNAG00000021296) rnf130 (ENSPNAG00000021324) F2RL3 (ENSPNAG00000021338) lect2.1 (ENSPNAG00000021359) ENSPNAG00000021379 Electric eel MODERN SPECIES 216 pitx2 (ENSEEEG00000006380) #22 elovl6 (ENSEEEG00000006382) #24 egf (ENSEEEG00000006384) #25 lrit3a (ENSEEEG00000006386) #26 gpm6aa (ENSEEEG00000006389) spata4 (ENSEEEG00000006404) asb5a (ENSEEEG00000006408) neil3 (ENSEEEG00000006410) aga (ENSEEEG00000006411) TENM3 (ENSEEEG00000006416) tdo2a (ENSEEEG00000006429) CTSO (ENSEEEG00000006431) rnf130 (ENSEEEG00000006432) F2RL3 (ENSEEEG00000006434) lect2.1 (ENSEEEG00000006436) ENSEEEG00000006438 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 149 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000160738.n ENSGT00950000183201.b.b.b.a ENSGT00950000182915.a.a.a ENSGT00940000156526.a ENSGT00390000002781 ENSGT00390000006124 ENSGT00940000158554 ENSGT00940000157465 ENSGT01050000244840.A.b.a ENSGT00390000015484.i ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000160738.n ENSGT00950000183201.b.b.b.a.f ENSGT00950000182915.a.a.a.j ENSGT00940000156526.a.m ENSGT00390000002781.k ENSGT00390000006124 ENSGT00940000158554.a ENSGT00940000157465.o.b ENSGT01050000244840.A.b.a.e ENSGT00390000015484.i.m ENSGT00940000156665.a.c ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b.m.b ENSGT00730000111223.m #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a.g #22 ENSGT01050000244965.b.c.a #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a.e #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.a ENSGT00940000165522.a.e ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.h ENSGT00390000008593.a.e ENSGT00940000158645.f ENSGT00940000156344.b.b ENSGT00940000156950.a.p ENSGT00940000156950.b.c ENSGT00390000012574 ENSGT00940000158241.h.b ENSGT00390000010773.e.a ENSGT00940000154672.jb Huchen MODERN SPECIES MAML1 (ENSHHUG00000000656) canx (ENSHHUG00000000657) mgat4b (ENSHHUG00000000790) sqstm1 (ENSHHUG00000000816) ENSHHUG00000000831 TBC1D9B (ENSHHUG00000000838) rnf130 (ENSHHUG00000001258) F2RL3 (ENSHHUG00000001265) LECT2 (ENSHHUG00000001269) LINGO2 (ENSHHUG00000001340) ENSHHUG00000001348 ENSHHUG00000001356 ENSHHUG00000001373 gar1 (ENSHHUG00000001391) #28 ENSHHUG00000001408 pitx2 (ENSHHUG00000001426) #22 elovl6 (ENSHHUG00000001454) #24 ENSHHUG00000001480 egf (ENSHHUG00000001501) #25 lrit3a (ENSHHUG00000001510) #26 gpm6aa (ENSHHUG00000001547) asb5a (ENSHHUG00000001597) ENSHHUG00000001621 tdo2a (ENSHHUG00000003038) PDGFC (ENSHHUG00000003166) glrbb (ENSHHUG00000003175) gria2b (ENSHHUG00000003231) ENSHHUG00000004054 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000153137.a.b ENSGT00940000160738.n ENSGT00950000183201.b.b.b.a.f ENSGT00950000182915.a.a.a.j ENSGT00940000156526.a.m ENSGT00390000002781.k ENSGT00390000006124 ENSGT00940000158554.a ENSGT00940000157465.o.b ENSGT01050000244840.A.b.a.e ENSGT00390000015484.i.m ENSGT00940000156665.a.c ENSGT00940000164379.e.b.m.b ENSGT00730000111223.m #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a.g #22 ENSGT01050000244965.b.c.a #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a.e #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.a ENSGT00940000165522.a.e ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.h ENSGT00390000008593.a.e ENSGT00940000158645.f ENSGT00940000156344.b.b ENSGT00940000156950.a.p ENSGT00390000012574 ENSGT00940000158241.h.b ENSGT00390000010773.e.a ENSGT00940000154672.jb ENSGT00390000012736 Salmo ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000153137.a.b ENSGT00940000160738.n ENSGT00950000183201.b.b.b.a.f ENSGT00950000182915.a.a.a.j ENSGT00940000156526.a.m ENSGT00390000002781.k ENSGT00390000006124 ENSGT00940000158554.a ENSGT00940000157465.o.b ENSGT01050000244840.A.b.a.e ENSGT00390000015484.i.m ENSGT00940000156665.a.c ENSGT00940000164379.e.b.m.b ENSGT00730000111223.m #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a.g #22 ENSGT01050000244965.b.c.a #24 ENSGT00940000158366.o #25 ENSGT00940000156627.a.e #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.a ENSGT00940000165522.a.e ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.h ENSGT00390000008593.a.e ENSGT00940000158645.f ENSGT00940000156344.b.b ENSGT00940000156950.a.p ENSGT00390000012574 ENSGT00940000158241.h.b ENSGT00390000010773.e.a ENSGT00940000154672.jb ENSGT00390000012736 River trout MODERN SPECIES 4 LTC4S (ENSSTUG00000027520) MAML1 (ENSSTUG00000027510) canx (ENSSTUG00000027494) mgat4b (ENSSTUG00000027122) sqstm1 (ENSSTUG00000027093) ENSSTUG00000027088 TBC1D9B (ENSSTUG00000026593) rnf130 (ENSSTUG00000026535) F2RL3 (ENSSTUG00000026525) ENSSTUG00000026447 ENSSTUG00000026428 LINGO2 (ENSSTUG00000026423) ENSSTUG00000026280 gar1 (ENSSTUG00000026245) #28 adh5l (ENSSTUG00000026137) pitx2 (ENSSTUG00000026093) #22 elovl6 (ENSSTUG00000026065) #24 egf (ENSSTUG00000023337) #25 lrit3a (ENSSTUG00000023215) #26 gpm6aa (ENSSTUG00000023068) asb5a (ENSSTUG00000023050) ENSSTUG00000023048 ENSSTUG00000023042 TENM3 (ENSSTUG00000017931) tdo2a (ENSSTUG00000017576) PDGFC (ENSSTUG00000017565) glrbb (ENSSTUG00000017524) gria2b (ENSSTUG00000017349) tmem144b (ENSSTUG00000017329) rxfp1 (ENSSTUG00000017290) etfdh (ENSSTUG00000015364) Atlantic salmon MODERN SPECIES 28 LTC4S (ENSSSAG00000100228) ENSSSAG00000107190 canx (ENSSSAG00000073461) mgat4b (ENSSSAG00000118203) TBC1D9B (ENSSSAG00000073271) sqstm1 (ENSSSAG00000073443) rnf130 (ENSSSAG00000073187) ENSSSAG00000104182 ENSSSAG00000115953 ENSSSAG00000073159 ENSSSAG00000073155 ENSSSAG00000083049 ENSSSAG00000073130 ENSSSAG00000073128 #28 zgc:77938 (ENSSSAG00000073069) pitx2 (ENSSSAG00000073060) #22 elovl6 (ENSSSAG00000073055) #24 egf (ENSSSAG00000072853) #25 lrit3a (ENSSSAG00000113332) #26 dmb (ENSSSAG00000103423) asb5a (ENSSSAG00000074584) ENSSSAG00000070557 ENSSSAG00000070365 PDGFC (ENSSSAG00000070360) gria2b (ENSSSAG00000055905) TMEM144 (ENSSSAG00000055605) rxfp1 (ENSSSAG00000055549) ETFD (ENSSSAG00000053698) ppid (ENSSSAG00000053651) cssa09h4orf45 (ENSSSAG00000053641) RAPGEF2 (ENSSSAG00000040144) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000153137.a.b ENSGT00940000160738.n ENSGT00950000183201.b.b.b.a.f ENSGT00950000182915.a.a.a.j ENSGT00940000156526.a.m ENSGT00390000002781.k ENSGT00390000006124 ENSGT00940000158554.a ENSGT00940000157465.o.b ENSGT01050000244840.A.b.a.e ENSGT00390000015484.i.m ENSGT00940000156665.a.c ENSGT00940000164379.e.b.m.b ENSGT00730000111223.m #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a.g #22 ENSGT01050000244965.b.c.a #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a.e #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.a ENSGT00940000165522.a.e ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.h ENSGT00390000008593.a.e ENSGT00940000158645.f ENSGT00940000156344.b.b ENSGT00940000156950.a.p ENSGT00390000012574.`b ENSGT00940000158241.h.b ENSGT00390000010773.e.a ENSGT00940000154672.jb ENSGT00390000012736 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154518.a.g #22 Chinook salmon MODERN SPECIES 32 LTC4S (ENSOTSG00005044104) MAML1 (ENSOTSG00005044106) canx (ENSOTSG00005044108) mgat4b (ENSOTSG00005044114) sqstm1 (ENSOTSG00005044199) mrnip (ENSOTSG00005044200) TBC1D9B (ENSOTSG00005044202) rnf130 (ENSOTSG00005044448) F2RL3 (ENSOTSG00005044582) lect2.1 (ENSOTSG00005044586) ENSOTSG00005044588 LINGO2 (ENSOTSG00005044589) ENSOTSG00005044590 gar1 (ENSOTSG00005044591) #28 ENSOTSG00005044592 pitx2 (ENSOTSG00005044593) #22 elovl6 (ENSOTSG00005044595) #24 egf (ENSOTSG00005044598) #25 lrit3a (ENSOTSG00005044681) #26 gpm6aa (ENSOTSG00005044682) asb5a (ENSOTSG00005044732) ENSOTSG00005044737 PDGFC (ENSOTSG00005044909) glrbb (ENSOTSG00005044910) gria2b (ENSOTSG00005044922) tmem144b (ENSOTSG00005045320) rxfp1 (ENSOTSG00005045321) etfdh (ENSOTSG00005045322) ppid (ENSOTSG00005045687) C4orf45 (ENSOTSG00005045688) fstl5 (ENSOTSG00005045696) Rainbow trout MODERN SPECIES 23 canx (ENSOMYG00000044873) mgat4b (ENSOMYG00000044895) sqstm1 (ENSOMYG00000044911) ENSOMYG00000048178 TBC1D9B (ENSOMYG00000044940) rnf130 (ENSOMYG00000045010) ENSOMYG00000052242 ENSOMYG00000053921 lect2 (ENSOMYG00000045057) ENSOMYG00000045077 ENSOMYG00000076386 ENSOMYG00000035965 ENSOMYG00000055981 ENSOMYG00000050174 #28 zgc:77938 (ENSOMYG00000061228) pitx2 (ENSOMYG00000036024) #22 ELOVL6 (ENSOMYG00000012010) #24 egf (ENSOMYG00000036285) #25 lrit3a (ENSOMYG00000037605) #26 gpm6aa (ENSOMYG00000037664) asb5a (ENSOMYG00000037726) ENSOMYG00000039197 TDO2 (ENSOMYG00000064144) ENSOMYG00000065024 PDGFC (ENSOMYG00000042952) GLRB (ENSOMYG00000056278) gria2b (ENSOMYG00000043010) ENSOMYG00000069658 ENSOMYG00000053408 TMEM144 (ENSOMYG00000043312) rxfp1 (ENSOMYG00000043350) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 291 ENSGT00940000164379.e.b.m.a ENSGT00730000111223.n #28 ENSGT00940000154518.a.h #22 ENSGT01050000244965.b.c.b #24 ENSGT00940000156627.a.f #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a.f ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.g ENSGT00390000008593.a.f ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645.e ENSGT00940000156344.b.a ENSGT00940000156950.a.o ENSGT00420000029769.b ENSGT00940000158241.h.a Huchen MODERN SPECIES 751 pitx2 (ENSHHUG00000003637) #22 elovl6 (ENSHHUG00000003690) #24 lrit3a (ENSHHUG00000003729) #26 gpm6aa (ENSHHUG00000003737) spata4 (ENSHHUG00000003822) asb5a (ENSHHUG00000003827) neil3 (ENSHHUG00000003918) aga (ENSHHUG00000003929) ENSHHUG00000003951 tdo2a (ENSHHUG00000004702) CTSO (ENSHHUG00000004829) ENSHHUG00000004866 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160403.d ENSGT00940000160738.m ENSGT00950000183201.b.b.b.a.e ENSGT00950000182915.a.a.a.i ENSGT00940000156526.a.n ENSGT00390000002781.l ENSGT00940000158554.b ENSGT00940000157465.o.a ENSGT01050000244840.A.b.a.f ENSGT00390000015484.i.n ENSGT00940000156038.a.a.d.b.b.a.b ENSGT00940000156665.a.d ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b.m.a ENSGT00730000111223.n #28 ENSGT00940000154518.a.h #22 ENSGT01050000244965.b.c.b #24 ENSGT00940000156627.a.f #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a.f ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.g ENSGT00390000008593.a.f ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645.e ENSGT00940000156344.b.a ENSGT00940000156950.a.o ENSGT00420000029769.b ENSGT00940000158241.h.a Salmo ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000160403.d ENSGT00940000160738.m ENSGT00950000183201.b.b.b.a.e ENSGT00950000182915.a.a.a.i ENSGT00940000156526.a.n ENSGT00390000002781.l ENSGT00940000158554.b ENSGT00940000157465.o.a ENSGT01050000244840.A.b.a.f ENSGT00390000015484.i.n ENSGT00940000156038.a.a.d.b.b.a.b ENSGT00940000156665.a.d ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b.m.a ENSGT00730000111223.n #28 ENSGT00940000154518.a.h #22 ENSGT01050000244965.b.c.b #24 ENSGT00940000158366.p #25 ENSGT00940000156627.a.f #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a.f ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.g ENSGT00390000008593.a.f ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645.e ENSGT00940000156344.b.a ENSGT00940000156950.a.o ENSGT00420000029769.b Atlantic salmon MODERN SPECIES 24 ENSSSAG00000076189 LTC4S (ENSSSAG00000089536) ENSSSAG00000076182 canx (ENSSSAG00000076158) mgat4b (ENSSSAG00000076123) sqstm1 (ENSSSAG00000076115) TBC1D9B (ENSSSAG00000076038) rnf130 (ENSSSAG00000076016) ENSSSAG00000076013 ENSSSAG00000076003 ENSSSAG00000118276 ENSSSAG00000075996 ENSSSAG00000082752 adhx (ENSSSAG00000074737) ENSSSAG00000101189 #28 pitx2 (ENSSSAG00000102092) #22 elovl6 (ENSSSAG00000074658) #24 lrit3a (ENSSSAG00000098899) #26 gpm6aa (ENSSSAG00000074628) spata4 (ENSSSAG00000095061) asb5a (ENSSSAG00000072832) neil3 (ENSSSAG00000074568) aga (ENSSSAG00000074561) TENM3 (ENSSSAG00000074527) tdo2a (ENSSSAG00000074427) CTSO (ENSSSAG00000074413) PDGFC (ENSSSAG00000103393) glrb (ENSSSAG00000074389) gria2b (ENSSSAG00000063801) GASK1B (ENSSSAG00000063469) rxfp1 (ENSSSAG00000063369) River trout MODERN SPECIES 22 ENSSTUG00000040574 canx (ENSSTUG00000040523) mgat4b (ENSSTUG00000039183) sqstm1 (ENSSTUG00000039128) ENSSTUG00000039125 TBC1D9B (ENSSTUG00000034913) rnf130 (ENSSTUG00000034687) F2RL3 (ENSSTUG00000034679) ENSSTUG00000034653 ENSSTUG00000034641 LINGO2 (ENSSTUG00000034630) ENSSTUG00000034624 eif4ea (ENSSTUG00000034607) ENSSTUG00000034362 gar1 (ENSSTUG00000034345) #28 pitx2 (ENSSTUG00000034307) #22 elovl6 (ENSSTUG00000034288) #24 ENSSTUG00000034271 #25 lrit3a (ENSSTUG00000034257) #26 gpm6aa (ENSSTUG00000034224) spata4 (ENSSTUG00000034202) asb5a (ENSSTUG00000034195) neil3 (ENSSTUG00000034177) aga (ENSSTUG00000034134) TENM3 (ENSSTUG00000032439) tdo2a (ENSSTUG00000032068) CTSO (ENSSTUG00000032053) PDGFC (ENSSTUG00000032041) glrbb (ENSSTUG00000032009) gria2b (ENSSTUG00000029830) GASK1B (ENSSTUG00000029767) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000160403.d ENSGT00940000176194 ENSGT00950000183201.b.b.b.a.e ENSGT00950000182915.a.a.a.i ENSGT00940000156526.a.n ENSGT00390000002781.l ENSGT00940000158554.b ENSGT00940000157465.o.a ENSGT01050000244840.A.b.a.f ENSGT00390000015484.i.n ENSGT00940000156038.a.a.d.b.b.a.b ENSGT00940000156665.a.d ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b.m.a ENSGT00730000111223.n #28 ENSGT00940000154518.a.h #22 ENSGT01050000244965.b.c.b #24 ENSGT00940000156627.a.f #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a.f ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C.nb ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.g ENSGT00390000008593.a.f ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645.e ENSGT00940000156344.b.a ENSGT00940000156950.a.o ENSGT00420000029769.b ENSGT00940000155618.i.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160403.d ENSGT00940000176194 ENSGT00950000183201.b.b.b.a.e ENSGT00950000182915.a.a.a.i ENSGT00940000156526.a.n ENSGT00390000002781.l ENSGT00940000158554.b ENSGT00940000157465.o.a ENSGT01050000244840.A.b.a.f ENSGT00390000015484.i.n ENSGT00940000156038.a.a.d.b.b.a.b ENSGT00940000156665.a.d ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b.m.a ENSGT00730000111223.n #28 ENSGT00940000154518.a.h #22 ENSGT01050000244965.b.c.b #24 ENSGT00940000156627.a.f #26 ENSGT00390000006915.d.j.b.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a.f ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C.nb ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b.g ENSGT00390000008593.a.f ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645.e ENSGT00940000156344.b.a ENSGT00940000156950.a.o ENSGT00420000029769.b ENSGT00940000155618.i.b Coho salmon MODERN SPECIES 10 PCDH12 (ENSOKIG00005036097) ENSOKIG00005036115 MAML1 (ENSOKIG00005036142) canx (ENSOKIG00005036172) mgat4b (ENSOKIG00005036327) sqstm1 (ENSOKIG00005038304) TBC1D9B (ENSOKIG00005038477) rnf130 (ENSOKIG00005041817) F2RL3 (ENSOKIG00005042060) ENSOKIG00005042073 ENSOKIG00005042152 LINGO2 (ENSOKIG00005042223) eif4ea (ENSOKIG00005042234) ENSOKIG00005005956 gar1 (ENSOKIG00005006459) #28 pitx2 (ENSOKIG00005006469) #22 ELOVL6 (ENSOKIG00005006494) #24 lrit3a (ENSOKIG00005006501) #26 gpm6aa (ENSOKIG00005006513) spata4 (ENSOKIG00005006581) asb5a (ENSOKIG00005006609) neil3 (ENSOKIG00005006944) aga (ENSOKIG00005006966) TENM3 (ENSOKIG00005007193) tdo2a (ENSOKIG00005008444) CTSO (ENSOKIG00005008961) PDGFC (ENSOKIG00005008989) glrbb (ENSOKIG00005009005) gria2b (ENSOKIG00005009055) GASK1B (ENSOKIG00005009377) ENSOKIG00005009382 Chinook salmon MODERN SPECIES 13 PCDH12 (ENSOTSG00005045270) ENSOTSG00005045271 MAML1 (ENSOTSG00005045272) canx (ENSOTSG00005045278) mgat4b (ENSOTSG00005045367) sqstm1 (ENSOTSG00005045547) TBC1D9B (ENSOTSG00005045553) rnf130 (ENSOTSG00005045647) F2RL3 (ENSOTSG00005045648) ENSOTSG00005045649 ENSOTSG00005045650 LINGO2 (ENSOTSG00005045651) eif4ea (ENSOTSG00005045652) ENSOTSG00005045657 gar1 (ENSOTSG00005045676) #28 pitx2 (ENSOTSG00005045677) #22 elovl6 (ENSOTSG00005045678) #24 lrit3a (ENSOTSG00005045680) #26 gpm6aa (ENSOTSG00005045681) spata4 (ENSOTSG00005045685) asb5a (ENSOTSG00005045686) neil3 (ENSOTSG00005045811) aga (ENSOTSG00005045814) ENSOTSG00005045827 tdo2a (ENSOTSG00005046304) CTSO (ENSOTSG00005046356) ENSOTSG00005046358 PDGFC (ENSOTSG00005046359) glrbb (ENSOTSG00005046361) gria2b (ENSOTSG00005046363) RAPGEF2 (ENSOTSG00005046444) Rainbow trout MODERN SPECIES 5 ENSOMYG00000006057 canx (ENSOMYG00000006488) mgat4b (ENSOMYG00000006797) sqstm1 (ENSOMYG00000006893) TBC1D9B (ENSOMYG00000008326) RNF130 (ENSOMYG00000010945) ENSOMYG00000011201 ENSOMYG00000011205 ENSOMYG00000011228 ENSOMYG00000011269 ENSOMYG00000011286 ENSOMYG00000011377 ENSOMYG00000011968 #28 ENSOMYG00000066294 ENSOMYG00000065623 pitx2 (ENSOMYG00000061049) #22 elovl6 (ENSOMYG00000069885) #24 ENSOMYG00000055862 ENSOMYG00000074044 lrit3a (ENSOMYG00000012020) #26 gpm6aa (ENSOMYG00000012041) ENSOMYG00000058092 spata4 (ENSOMYG00000012080) asb5a (ENSOMYG00000012106) ENSOMYG00000049689 neil3 (ENSOMYG00000012187) aga (ENSOMYG00000012204) TENM3 (ENSOMYG00000012417) tdo2a (ENSOMYG00000016385) CTSO (ENSOMYG00000016770) PDGFC (ENSOMYG00000016779) Northern pike MODERN SPECIES 3 LTC4S (ENSELUG00000021842) MAML1 (ENSELUG00000021776) canx (ENSELUG00000021763) mgat4b (ENSELUG00000021707) sqstm1 (ENSELUG00000021590) ENSELUG00000026382 TBC1D9B (ENSELUG00000021561) rnf130 (ENSELUG00000021452) F2RL3 (ENSELUG00000021415) lect2 (ENSELUG00000030366) ENSELUG00000021375 LINGO2 (ENSELUG00000021135) eif4ea (ENSELUG00000021129) ENSELUG00000021119 gar1 (ENSELUG00000021108) #28 pitx2 (ENSELUG00000021088) #22 ELOVL6 (ENSELUG00000028127) #24 egf (ENSELUG00000021028) #25 lrit3a (ENSELUG00000020941) #26 gpm6aa (ENSELUG00000020925) spata4 (ENSELUG00000020902) asb5a (ENSELUG00000020840) neil3 (ENSELUG00000020834) aga (ENSELUG00000020776) TENM3 (ENSELUG00000020725) tdo2a (ENSELUG00000000908) CTSO (ENSELUG00000020644) ENSELUG00000020583 PDGFC (ENSELUG00000020558) glrbb (ENSELUG00000020518) gria2b (ENSELUG00000020476) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000153230.A ENSGT00950000183045.C ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00390000008593.a ENSGT00940000159253 ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Cod MODERN SPECIES 1 pcgf1 (ENSGMOG00000016075) lbx2 (ENSGMOG00000022499) ENSGMOG00000012732 LIMCH1 (ENSGMOG00000023784) ENSGMOG00000034262 TMEM33 (ENSGMOG00000012721) BBS7 (ENSGMOG00000012717) CCNA2 (ENSGMOG00000012712) ENSGMOG00000030162 ANXA5 (ENSGMOG00000019400) ENSGMOG00000032959 ENSGMOG00000008840 ENSGMOG00000012412 ENSGMOG00000012416 ENSGMOG00000012419 #28 pitx2 (ENSGMOG00000028593) #22 elovl6a (ENSGMOG00000002888) #24 ENSGMOG00000002900 lrit3a (ENSGMOG00000033751) #26 gpm6aa (ENSGMOG00000003070) asb5a (ENSGMOG00000016884) neil3 (ENSGMOG00000016867) aga (ENSGMOG00000006033) TENM3 (ENSGMOG00000012403) tdo2a (ENSGMOG00000012399) PDGFC (ENSGMOG00000000484) GLRB (ENSGMOG00000000970) gria2b (ENSGMOG00000005216) TMEM144 (ENSGMOG00000008437) rxfp1 (ENSGMOG00000008860) etfdh (ENSGMOG00000004026) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 1 spon2b (ENSMMDG00005021051) zgc:136929 (ENSMMDG00005020944) maea (ENSMMDG00005020929) ENSMMDG00005020923 ENSMMDG00005020918 KLHL3 (ENSMMDG00005020871) fam13b (ENSMMDG00005020855) cxcl14 (ENSMMDG00005020852) ENSMMDG00005020850 LINGO2 (ENSMMDG00005020847) ENSMMDG00005020845 eif4ea (ENSMMDG00005020753) ENSMMDG00005020646 gar1 (ENSMMDG00005020636) #28 zgc:77938 (ENSMMDG00005020627) pitx2 (ENSMMDG00005020622) #22 elovl6 (ENSMMDG00005020619) #24 egf (ENSMMDG00005020611) #25 lrit3a (ENSMMDG00005020602) #26 gpm6aa (ENSMMDG00005020571) spata4 (ENSMMDG00005020564) asb5a (ENSMMDG00005020560) CTSO (ENSMMDG00005020544) tdo2a (ENSMMDG00005020540) TENM3 (ENSMMDG00005020485) aga (ENSMMDG00005020472) neil3 (ENSMMDG00005020469) PDGFC (ENSMMDG00005020452) glrbb (ENSMMDG00005020446) gria2b (ENSMMDG00005020315) GASK1B (ENSMMDG00005020311) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 332 fgfrl1a (ENSHCOG00000007058) ENSHCOG00000007075 spon2b (ENSHCOG00000000213) zgc:136929 (ENSHCOG00000007124) maea (ENSHCOG00000000217) HNRNPA0 (ENSHCOG00000007174) ENSHCOG00000007180 KLHL3 (ENSHCOG00000007212) fam13b (ENSHCOG00000007275) cxcl14 (ENSHCOG00000007303) LINGO2 (ENSHCOG00000000239) ENSHCOG00000007314 eif4ea (ENSHCOG00000008501) ENSHCOG00000008614 gar1 (ENSHCOG00000008656) #28 pitx2 (ENSHCOG00000008663) #22 elovl6 (ENSHCOG00000008675) #24 egf (ENSHCOG00000008710) #25 lrit3a (ENSHCOG00000008728) #26 gpm6aa (ENSHCOG00000008745) spata4 (ENSHCOG00000008755) asb5a (ENSHCOG00000008763) ENSHCOG00000008787 tdo2a (ENSHCOG00000008820) ENSHCOG00000008873 ENSHCOG00000008886 aga (ENSHCOG00000008908) neil3 (ENSHCOG00000008952) dpf2l (ENSHCOG00000008986) ENSHCOG00000009021 zdhhc24 (ENSHCOG00000009041) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a.f ENSGT00420000029769.b ENSGT00940000158241 Fugu MODERN SPECIES 5 ENSTRUG00000030160 ENSTRUG00000015229 maea (ENSTRUG00000015332) spon2 (ENSTRUG00000015262) zgc:136929 (ENSTRUG00000015287) hnrnpa0b (ENSTRUG00000015362) ENSTRUG00000021494 KLHL3 (ENSTRUG00000015376) fam13b (ENSTRUG00000015447) cxcl14 (ENSTRUG00000024992) LINGO2 (ENSTRUG00000015501) eif4ea (ENSTRUG00000024250) ENSTRUG00000015516 gar1 (ENSTRUG00000020580) #28 zgc:77938 (ENSTRUG00000015558) pitx2 (ENSTRUG00000024395) #22 elovl6 (ENSTRUG00000029369) #24 CTSO (ENSTRUG00000015705) lrit3a (ENSTRUG00000015640) #26 gpm6aa (ENSTRUG00000015645) asb5a (ENSTRUG00000015664) tdo2a (ENSTRUG00000015711) TENM3 (ENSTRUG00000015740) aga (ENSTRUG00000015862) neil3 (ENSTRUG00000015875) PDGFC (ENSTRUG00000015892) glrbb (ENSTRUG00000015901) gria2b (ENSTRUG00000015959) GASK1B (ENSTRUG00000016120) rxfp1 (ENSTRUG00000016132) etfdh (ENSTRUG00000016171) Tetraodon MODERN SPECIES 14 slc7a7 (ENSTNIG00000013009) oxa1l (ENSTNIG00000013010) ENSTNIG00000013011 ENSTNIG00000013012 ppp1r14bb (ENSTNIG00000013013) brms1 (ENSTNIG00000013014) tmem179ba (ENSTNIG00000013015) ENSTNIG00000013016 snx15 (ENSTNIG00000013017) slc3a2a (ENSTNIG00000013018) ENSTNIG00000013019 PC (ENSTNIG00000013020) eif4ea (ENSTNIG00000013021) ENSTNIG00000013022 gar1 (ENSTNIG00000013023) #28 pitx2 (ENSTNIG00000013024) #22 elovl6 (ENSTNIG00000013025) #24 egf (ENSTNIG00000013026) #25 lrit3a (ENSTNIG00000000464) #26 gpm6aa (ENSTNIG00000013027) asb5a (ENSTNIG00000013028) ENSTNIG00000001669 CTSO (ENSTNIG00000013029) tdo2a (ENSTNIG00000013030) TENM3 (ENSTNIG00000013031) aga (ENSTNIG00000013032) neil3 (ENSTNIG00000013033) PDGFC (ENSTNIG00000013034) glrbb (ENSTNIG00000013035) gria2b (ENSTNIG00000013036) GASK1B (ENSTNIG00000013037) Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 231 pitx2 (ENSLBEG00000015939) #22 elovl6 (ENSLBEG00000015913) #24 egf (ENSLBEG00000015726) #25 lrit3a (ENSLBEG00000015626) #26 gpm6aa (ENSLBEG00000015571) spata4 (ENSLBEG00000015528) asb5a (ENSLBEG00000015430) CTSO (ENSLBEG00000015354) tdo2a (ENSLBEG00000015307) TENM3 (ENSLBEG00000015193) aga (ENSLBEG00000015102) neil3 (ENSLBEG00000015026) PDGFC (ENSLBEG00000014971) glrbb (ENSLBEG00000014891) gria2b (ENSLBEG00000014753) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000168781 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 1 ENSCGOG00000010311 ENSCGOG00000010249 spon2b (ENSCGOG00000010244) zgc:136929 (ENSCGOG00000010199) maea (ENSCGOG00000010098) ENSCGOG00000010096 HNRNPA0 (ENSCGOG00000010091) KLHL3 (ENSCGOG00000009950) fam13b (ENSCGOG00000009469) cxcl14 (ENSCGOG00000009462) LINGO2 (ENSCGOG00000009460) eif4ea (ENSCGOG00000009457) ENSCGOG00000008758 gar1 (ENSCGOG00000008734) #28 zgc:77938 (ENSCGOG00000008460) pitx2 (ENSCGOG00000008458) #22 elovl6 (ENSCGOG00000008455) #24 egf (ENSCGOG00000008453) #25 lrit3a (ENSCGOG00000008451) #26 gpm6aa (ENSCGOG00000008374) spata4 (ENSCGOG00000008369) asb5a (ENSCGOG00000008364) ENSCGOG00000008357 tdo2a (ENSCGOG00000008354) TENM3 (ENSCGOG00000005106) aga (ENSCGOG00000004955) neil3 (ENSCGOG00000004946) PDGFC (ENSCGOG00000004943) glrbb (ENSCGOG00000004734) gria2b (ENSCGOG00000003705) GASK1B (ENSCGOG00000003661) Pike perch MODERN SPECIES 185 eif4ea (ENSSLUG00000011566) ENSSLUG00000011231 gar1 (ENSSLUG00000011210) #28 zgc:77938 (ENSSLUG00000010935) pitx2 (ENSSLUG00000010906) #22 elovl6 (ENSSLUG00000010898) #24 egf (ENSSLUG00000010886) #25 lrit3a (ENSSLUG00000010880) #26 gpm6aa (ENSSLUG00000010854) spata4 (ENSSLUG00000010850) asb5a (ENSSLUG00000010847) CTSO (ENSSLUG00000010842) tdo2a (ENSSLUG00000010837) tdo2a (ENSSLUG00000010813) ENSSLUG00000010803 TENM3 (ENSSLUG00000010653) aga (ENSSLUG00000010486) neil3 (ENSSLUG00000010454) PDGFC (ENSSLUG00000010447) glrbb (ENSSLUG00000010242) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Lumpfish MODERN SPECIES 1 fgfrl1a (ENSCLMG00005004674) ENSCLMG00005004694 spon2b (ENSCLMG00005004748) zgc:136929 (ENSCLMG00005004841) maea (ENSCLMG00005007778) hnrnpa0b (ENSCLMG00005007798) HNRNPA0 (ENSCLMG00005007799) KLHL3 (ENSCLMG00005007803) fam13b (ENSCLMG00005007813) cxcl14 (ENSCLMG00005007814) LINGO2 (ENSCLMG00005007816) eif4ea (ENSCLMG00005007819) ENSCLMG00005007832 gar1 (ENSCLMG00005007940) #28 zgc:77938 (ENSCLMG00005007943) pitx2 (ENSCLMG00005007966) #22 elovl6 (ENSCLMG00005007969) #24 egf (ENSCLMG00005007970) #25 lrit3a (ENSCLMG00005007973) #26 gpm6aa (ENSCLMG00005007979) spata4 (ENSCLMG00005007987) asb5a (ENSCLMG00005008005) CTSO (ENSCLMG00005008020) tdo2a (ENSCLMG00005008021) TENM3 (ENSCLMG00005008027) aga (ENSCLMG00005009266) neil3 (ENSCLMG00005009270) PDGFC (ENSCLMG00005009271) glrbb (ENSCLMG00005009272) gria2b (ENSCLMG00005009278) GASK1B (ENSCLMG00005009436) Stickleback MODERN SPECIES 3 ENSGACG00000016424 fgfrl1a (ENSGACG00000016426) ENSGACG00000016428 spon2b (ENSGACG00000016431) zgc:136929 (ENSGACG00000016437) maea (ENSGACG00000016443) hnrnpa0b (ENSGACG00000016447) ENSGACG00000016449 KLHL3 (ENSGACG00000016452) fam13b (ENSGACG00000016458) cxcl14 (ENSGACG00000016464) LINGO2 (ENSGACG00000016470) eif4ea (ENSGACG00000016472) ENSGACG00000016474 zgc:77938 (ENSGACG00000016479) pitx2 (ENSGACG00000016483) #22 elovl6 (ENSGACG00000016488) #24 egf (ENSGACG00000016495) #25 lrit3a (ENSGACG00000016496) #26 gpm6aa (ENSGACG00000016498) asb5a (ENSGACG00000016501) ENSGACG00000016511 tdo2a (ENSGACG00000016513) TENM3 (ENSGACG00000016524) aga (ENSGACG00000016536) neil3 (ENSGACG00000016544) PDGFC (ENSGACG00000016550) glrbb (ENSGACG00000016556) gria2b (ENSGACG00000016558) GASK1B (ENSGACG00000016571) tmem144b (ENSGACG00000016577) Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b European seabass MODERN SPECIES 12 ENSDLAG00005002457 ENSDLAG00005002436 spon2b (ENSDLAG00005002407) CTBP1 (ENSDLAG00005001521) MAEA (ENSDLAG00005001329) ENSDLAG00005001313 ENSDLAG00005001297 ENSDLAG00005001234 ENSDLAG00005023239 cxcl14 (ENSDLAG00005029354) ENSDLAG00005023218 ENSDLAG00005023194 ENSDLAG00005023034 ENSDLAG00005023021 #28 zgc:77938 (ENSDLAG00005022963) pitx2 (ENSDLAG00005022950) #22 egf (ENSDLAG00005022914) #25 lrit3a (ENSDLAG00005022903) #26 gpm6aa (ENSDLAG00005022890) spata4 (ENSDLAG00005022886) ENSDLAG00005027088 #24 asb5a (ENSDLAG00005027407) tdo2a (ENSDLAG00005022830) ENSDLAG00005026738 TENM3 (ENSDLAG00005022486) ENSDLAG00005027331 aga (ENSDLAG00005022447) neil3 (ENSDLAG00005022434) PDGFC (ENSDLAG00005022429) GRIA2 (ENSDLAG00005020548) GASK1B (ENSDLAG00005020469) Large yellow croaker MODERN SPECIES ENSLCRG00005000039 ENSLCRG00005000040 ENSLCRG00005000041 ENSLCRG00005000042 ENSLCRG00005000043 ENSLCRG00005000477 ENSLCRG00005016998 LINGO2 (ENSLCRG00005016999) ENSLCRG00005017000 ENSLCRG00005017001 eif4ea (ENSLCRG00005017003) ENSLCRG00005017050 gar1 (ENSLCRG00005017208) #28 zgc:77938 (ENSLCRG00005017209) pitx2 (ENSLCRG00005017213) #22 elovl6 (ENSLCRG00005017225) #24 egf (ENSLCRG00005017229) #25 lrit3a (ENSLCRG00005017237) #26 gpm6aa (ENSLCRG00005017241) spata4 (ENSLCRG00005017271) asb5a (ENSLCRG00005017272) CTSO (ENSLCRG00005017276) tdo2a (ENSLCRG00005017278) TENM3 (ENSLCRG00005017307) aga (ENSLCRG00005019565) neil3 (ENSLCRG00005019575) PDGFC (ENSLCRG00005019602) glrbb (ENSLCRG00005019614) gria2b (ENSLCRG00005019791) GASK1B (ENSLCRG00005021440) Gilthead seabream MODERN SPECIES 9 ENSSAUG00010023273 ENSSAUG00010023275 spon2b (ENSSAUG00010023276) zgc:136929 (ENSSAUG00010023293) maea (ENSSAUG00010024088) HNRNPA0 (ENSSAUG00010024095) ENSSAUG00010024097 KLHL3 (ENSSAUG00010024099) fam13b (ENSSAUG00010024105) cxcl14 (ENSSAUG00010024114) LINGO2 (ENSSAUG00010024119) eif4ea (ENSSAUG00010024126) ENSSAUG00010024185 gar1 (ENSSAUG00010024603) #28 zgc:77938 (ENSSAUG00010024605) pitx2 (ENSSAUG00010024612) #22 elovl6 (ENSSAUG00010024626) #24 egf (ENSSAUG00010024632) #25 lrit3a (ENSSAUG00010024676) #26 gpm6aa (ENSSAUG00010002773) spata4 (ENSSAUG00010002919) asb5a (ENSSAUG00010002927) ENSSAUG00010002932 tdo2a (ENSSAUG00010002938) TENM3 (ENSSAUG00010003162) aga (ENSSAUG00010009967) neil3 (ENSSAUG00010009974) PDGFC (ENSSAUG00010009978) glrbb (ENSSAUG00010009989) gria2b (ENSSAUG00010010055) GASK1B (ENSSAUG00010011123) Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Carangaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Barramundi perch MODERN SPECIES 87 ENSLCAG00010021783 gar1 (ENSLCAG00010021842) #28 zgc:77938 (ENSLCAG00010021843) ENSLCAG00010021849 pitx2 (ENSLCAG00010021851) #22 elovl6 (ENSLCAG00010021855) #24 egf (ENSLCAG00010021862) #25 lrit3a (ENSLCAG00010021879) #26 gpm6aa (ENSLCAG00010021886) spata4 (ENSLCAG00010021900) asb5a (ENSLCAG00010021907) CTSO (ENSLCAG00010021922) tdo2a (ENSLCAG00010021929) TENM3 (ENSLCAG00010022042) aga (ENSLCAG00010022233) neil3 (ENSLCAG00010022238) PDGFC (ENSLCAG00010022245) glrbb (ENSLCAG00010022253) gria2b (ENSLCAG00010022371) GASK1B (ENSLCAG00010022603) Seriola ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3289 ENSSLDG00000022875 ENSSLDG00000022894 ENSSLDG00000022914 fam13b (ENSSLDG00000022930) cxcl14 (ENSSLDG00000022982) LINGO2 (ENSSLDG00000022992) eif4ea (ENSSLDG00000023001) ENSSLDG00000023010 zgc:77938 (ENSSLDG00000023056) gar1 (ENSSLDG00000023264) #28 pitx2 (ENSSLDG00000023274) #22 elovl6 (ENSSLDG00000023288) #24 egf (ENSSLDG00000023303) #25 lrit3a (ENSSLDG00000023331) #26 gpm6aa (ENSSLDG00000023345) spata4 (ENSSLDG00000023364) asb5a (ENSSLDG00000023391) CTSO (ENSSLDG00000023407) tdo2a (ENSSLDG00000023426) TENM3 (ENSSLDG00000023489) aga (ENSSLDG00000023578) neil3 (ENSSLDG00000023598) PDGFC (ENSSLDG00000023607) glrbb (ENSSLDG00000023630) gria2b (ENSSLDG00000023651) GASK1B (ENSSLDG00000023686) Greater amberjack MODERN SPECIES 113 ENSSDUG00000002614 ENSSDUG00000002593 spon2b (ENSSDUG00000002572) zgc:136929 (ENSSDUG00000002539) maea (ENSSDUG00000002472) ENSSDUG00000002431 ENSSDUG00000002394 KLHL3 (ENSSDUG00000002322) fam13b (ENSSDUG00000002262) cxcl14 (ENSSDUG00000002234) LINGO2 (ENSSDUG00000002227) eif4ea (ENSSDUG00000002220) ENSSDUG00000002196 gar1 (ENSSDUG00000002130) #28 zgc:77938 (ENSSDUG00000002118) pitx2 (ENSSDUG00000002101) #22 elovl6 (ENSSDUG00000002079) #24 egf (ENSSDUG00000001893) #25 lrit3a (ENSSDUG00000001861) #26 gpm6aa (ENSSDUG00000001824) spata4 (ENSSDUG00000001814) asb5a (ENSSDUG00000001799) CTSO (ENSSDUG00000001783) tdo2a (ENSSDUG00000001748) ENSSDUG00000001731 TENM3 (ENSSDUG00000001588) aga (ENSSDUG00000001544) neil3 (ENSSDUG00000001511) PDGFC (ENSSDUG00000001476) glrbb (ENSSDUG00000001441) gria2b (ENSSDUG00000001381) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000167175 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Tongue sole MODERN SPECIES 6 TENM3 (ENSCSEG00000003703) FAT4 (ENSCSEG00000003662) ANKRD50 (ENSCSEG00000003655) zgc:92045 (ENSCSEG00000003651) ENSCSEG00000003649 SRP72 (ENSCSEG00000003616) ARL9 (ENSCSEG00000003607) HTR4 (ENSCSEG00000003580) fam13b (ENSCSEG00000003561) cxcl14 (ENSCSEG00000003546) LINGO2 (ENSCSEG00000003543) eif4ea (ENSCSEG00000003535) ENSCSEG00000003528 gar1 (ENSCSEG00000003525) #28 zgc:77938 (ENSCSEG00000003521) pitx2 (ENSCSEG00000003514) #22 elovl6 (ENSCSEG00000003513) #24 egf (ENSCSEG00000003504) #25 lrit3a (ENSCSEG00000003496) #26 gpm6aa (ENSCSEG00000003489) asb5a (ENSCSEG00000003474) tdo2a (ENSCSEG00000003467) ENSCSEG00000003453 KLHL3 (ENSCSEG00000003437) hnrnpa0b (ENSCSEG00000003421) zgc:136929 (ENSCSEG00000003417) spon2b (ENSCSEG00000003405) maea (ENSCSEG00000003393) ENSCSEG00000003385 ENSCSEG00000003375 fgfrl1a (ENSCSEG00000003362) Turbot MODERN SPECIES 4 fgfrl1a (ENSSMAG00000010509) ENSSMAG00000029602 ENSSMAG00000010473 spon2b (ENSSMAG00000010439) CTBP1 (ENSSMAG00000010328) MAEA (ENSSMAG00000010319) ENSSMAG00000010279 ENSSMAG00000010246 ENSSMAG00000010196 ENSSMAG00000010115 cxcl14 (ENSSMAG00000010064) ENSSMAG00000010054 ENSSMAG00000010015 ENSSMAG00000009982 zgc:77938 (ENSSMAG00000009951) pitx2 (ENSSMAG00000009942) #22 ENSSMAG00000009976 #28 ELOVL6 (ENSSMAG00000022780) #24 egf (ENSSMAG00000009863) #25 lrit3a (ENSSMAG00000009860) #26 gpm6aa (ENSSMAG00000009851) spata4 (ENSSMAG00000009837) asb5a (ENSSMAG00000009821) ENSSMAG00000009797 tdo2a (ENSSMAG00000009775) TENM3 (ENSSMAG00000009729) aga (ENSSMAG00000009654) neil3 (ENSSMAG00000009621) glrbb (ENSSMAG00000009536) PDGFC (ENSSMAG00000009590) gria2b (ENSSMAG00000009501) Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 1 fgfrl1a (ENSMAMG00000025761) ENSMAMG00000027564 spon2b (ENSMAMG00000017786) CTBP1 (ENSMAMG00000027529) MAEA (ENSMAMG00000017757) ENSMAMG00000017754 ENSMAMG00000017728 ENSMAMG00000017687 ENSMAMG00000017652 cxcl14 (ENSMAMG00000027577) ENSMAMG00000017630 ENSMAMG00000017620 ENSMAMG00000017599 ENSMAMG00000017583 #28 zgc:77938 (ENSMAMG00000017576) pitx2 (ENSMAMG00000017568) #22 ELOVL6 (ENSMAMG00000026509) #24 egf (ENSMAMG00000017276) #25 lrit3a (ENSMAMG00000017243) #26 gpm6aa (ENSMAMG00000017222) spata4 (ENSMAMG00000017216) asb5a (ENSMAMG00000017199) ENSMAMG00000017185 tdo2a (ENSMAMG00000017158) TENM3 (ENSMAMG00000017097) aga (ENSMAMG00000017060) ENSMAMG00000004401 neil3 (ENSMAMG00000017052) glrbb (ENSMAMG00000016990) GRIA2 (ENSMAMG00000016971) GASK1B (ENSMAMG00000016951) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00950000183123 ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Climbing perch MODERN SPECIES 1 fgfrl1a (ENSATEG00000003292) ENSATEG00000003335 spon2b (ENSATEG00000003357) CTBP1 (ENSATEG00000003381) MAEA (ENSATEG00000003418) ENSATEG00000003423 ENSATEG00000003468 ENSATEG00000003526 ENSATEG00000003585 cxcl14 (ENSATEG00000026931) ENSATEG00000003631 ENSATEG00000003645 ENSATEG00000003684 ENSATEG00000003733 #28 zgc:77938 (ENSATEG00000003739) pitx2 (ENSATEG00000003773) #22 elovl6 (ENSATEG00000003784) #24 egf (ENSATEG00000003809) #25 lrit3a (ENSATEG00000003906) #26 gpm6aa (ENSATEG00000003928) spata4 (ENSATEG00000003948) asb5a (ENSATEG00000003971) ENSATEG00000003979 tdo2a (ENSATEG00000003992) TENM3 (ENSATEG00000004042) aga (ENSATEG00000004160) neil3 (ENSATEG00000004193) PDGFC (ENSATEG00000004260) glrbb (ENSATEG00000004300) gria2b (ENSATEG00000004338) GASK1B (ENSATEG00000004414) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 1 zgc:136929 (ENSBSLG00000017079) ENSBSLG00000017634 maea (ENSBSLG00000017650) ENSBSLG00000017718 ENSBSLG00000017722 KLHL3 (ENSBSLG00000017755) fam13b (ENSBSLG00000017811) cxcl14 (ENSBSLG00000018003) LINGO2 (ENSBSLG00000018021) ENSBSLG00000018023 ENSBSLG00000018027 ENSBSLG00000018169 eif4ea (ENSBSLG00000018224) ENSBSLG00000018502 gar1 (ENSBSLG00000018722) #28 pitx2 (ENSBSLG00000018785) #22 elovl6 (ENSBSLG00000018883) #24 egf (ENSBSLG00000018985) #25 lrit3a (ENSBSLG00000019305) #26 gpm6aa (ENSBSLG00000019308) ENSBSLG00000019330 asb5a (ENSBSLG00000019339) CTSO (ENSBSLG00000019348) tdo2a (ENSBSLG00000019436) TENM3 (ENSBSLG00000019618) aga (ENSBSLG00000020207) neil3 (ENSBSLG00000020215) PDGFC (ENSBSLG00000020943) glrbb (ENSBSLG00000021085) gria2b (ENSBSLG00000021351) GASK1B (ENSBSLG00000022303) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Poecilia ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175 ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a Sailfin molly MODERN SPECIES 1298 eif4ea (ENSPLAG00000014990) ENSPLAG00000015048 gar1 (ENSPLAG00000015056) #28 zgc:77938 (ENSPLAG00000000659) pitx2 (ENSPLAG00000015072) #22 elovl6 (ENSPLAG00000015095) #24 Amazon molly MODERN SPECIES 291 ENSPFOG00000022721 LINGO2 (ENSPFOG00000020535) eif4ea (ENSPFOG00000019121) ENSPFOG00000019112 gar1 (ENSPFOG00000024155) #28 zgc:77938 (ENSPFOG00000019089) pitx2 (ENSPFOG00000019077) #22 elovl6 (ENSPFOG00000019072) #24 egf (ENSPFOG00000019042) #25 lrit3a (ENSPFOG00000019036) #26 gpm6aa (ENSPFOG00000019023) spata4 (ENSPFOG00000019016) asb5a (ENSPFOG00000018998) CTSO (ENSPFOG00000018984) tdo2a (ENSPFOG00000018977) TENM3 (ENSPFOG00000018910) aga (ENSPFOG00000018876) neil3 (ENSPFOG00000018858) PDGFC (ENSPFOG00000018847) glrbb (ENSPFOG00000018789) gria2b (ENSPFOG00000023447) GASK1B (ENSPFOG00000018773) Guppy MODERN SPECIES 440 ENSPREG00000010729 spon2b (ENSPREG00000010719) zgc:136929 (ENSPREG00000010695) maea (ENSPREG00000010640) HNRNPA0 (ENSPREG00000010619) ENSPREG00000010603 ENSPREG00000010595 ENSPREG00000010585 fam13b (ENSPREG00000010514) cxcl14 (ENSPREG00000010487) LINGO2 (ENSPREG00000010461) eif4ea (ENSPREG00000010442) ENSPREG00000010421 gar1 (ENSPREG00000010377) #28 zgc:77938 (ENSPREG00000010355) pitx2 (ENSPREG00000010344) #22 elovl6 (ENSPREG00000010314) #24 egf (ENSPREG00000010189) #25 lrit3a (ENSPREG00000010172) #26 gpm6aa (ENSPREG00000010156) spata4 (ENSPREG00000010121) asb5a (ENSPREG00000010064) CTSO (ENSPREG00000010049) tdo2a (ENSPREG00000010030) TENM3 (ENSPREG00000009983) ENSPREG00000009955 aga (ENSPREG00000009915) neil3 (ENSPREG00000009841) PDGFC (ENSPREG00000009823) glrbb (ENSPREG00000009802) gria2b (ENSPREG00000008420) Platyfish MODERN SPECIES 15 zgc:136929 (ENSXMAG00000006454) ENSXMAG00000021111 maea (ENSXMAG00000005520) HNRNPA0 (ENSXMAG00000019804) HNRNPA0 (ENSXMAG00000029150) KLHL3 (ENSXMAG00000008532) fam13b (ENSXMAG00000008518) cxcl14 (ENSXMAG00000008516) ENSXMAG00000021320 LINGO2 (ENSXMAG00000019835) eif4ea (ENSXMAG00000002337) ENSXMAG00000002317 GAR1 (ENSXMAG00000002316) #28 zgc:77938 (ENSXMAG00000002302) ENSXMAG00000021589 pitx2 (ENSXMAG00000029490) #22 elovl6 (ENSXMAG00000027623) #24 egf (ENSXMAG00000002287) #25 lrit3a (ENSXMAG00000002285) #26 gpm6aa (ENSXMAG00000002281) spata4 (ENSXMAG00000002278) asb5a (ENSXMAG00000002275) CTSO (ENSXMAG00000022021) tdo2a (ENSXMAG00000002268) TENM3 (ENSXMAG00000002241) aga (ENSXMAG00000002238) neil3 (ENSXMAG00000028638) PDGFC (ENSXMAG00000002233) glrbb (ENSXMAG00000002229) gria2b (ENSXMAG00000002202) GASK1B (ENSXMAG00000002199) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT01030000234566.e.b.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Sheepshead minnow MODERN SPECIES 685 eif4ea (ENSCVAG00000002085) ENSCVAG00000002097 gar1 (ENSCVAG00000002103) #28 zgc:77938 (ENSCVAG00000002112) pitx2 (ENSCVAG00000002117) #22 elovl6 (ENSCVAG00000002125) #24 egf (ENSCVAG00000002143) #25 lrit3a (ENSCVAG00000002149) #26 gpm6aa (ENSCVAG00000002155) asb5a (ENSCVAG00000000071) CTSO (ENSCVAG00000002164) tdo2a (ENSCVAG00000002173) Mummichog MODERN SPECIES 2377 eif4ea (ENSFHEG00000008111) ENSFHEG00000008100 gar1 (ENSFHEG00000008068) #28 zgc:77938 (ENSFHEG00000008058) pitx2 (ENSFHEG00000008037) #22 elovl6 (ENSFHEG00000008028) #24 egf (ENSFHEG00000008020) #25 lrit3a (ENSFHEG00000007899) #26 gpm6aa (ENSFHEG00000007881) ENSFHEG00000007845 asb5a (ENSFHEG00000007816) CTSO (ENSFHEG00000007695) tdo2a (ENSFHEG00000007659) ENSFHEG00000007644 ENSFHEG00000007593 aga (ENSFHEG00000007580) neil3 (ENSFHEG00000007525) PDGFC (ENSFHEG00000007513) glrbb (ENSFHEG00000007492) gria2b (ENSFHEG00000007455) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00950000183123 ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00990000210540 ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Mangrove rivulus MODERN SPECIES 40 ENSKMAG00000010913 spon2b (ENSKMAG00000010887) zgc:136929 (ENSKMAG00000010853) maea (ENSKMAG00000010808) ENSKMAG00000010760 KLHL3 (ENSKMAG00000010712) fam13b (ENSKMAG00000010593) cxcl14 (ENSKMAG00000010539) LINGO2 (ENSKMAG00000010529) eif4ea (ENSKMAG00000010510) ENSKMAG00000010476 ENSKMAG00000010421 gar1 (ENSKMAG00000010402) #28 TUBE1 (ENSKMAG00000010381) zgc:77938 (ENSKMAG00000010357) pitx2 (ENSKMAG00000010340) #22 elovl6 (ENSKMAG00000010318) #24 egf (ENSKMAG00000010280) #25 lrit3a (ENSKMAG00000010265) #26 gpm6aa (ENSKMAG00000010248) ENSKMAG00000010234 asb5a (ENSKMAG00000010206) CTSO (ENSKMAG00000010142) tdo2a (ENSKMAG00000010159) TENM3 (ENSKMAG00000009989) aga (ENSKMAG00000009945) neil3 (ENSKMAG00000009895) PDGFC (ENSKMAG00000009846) glrbb (ENSKMAG00000009806) gria2b (ENSKMAG00000009709) GASK1B (ENSKMAG00000009673) Turquoise killifish MODERN SPECIES 1610 zgc:136929 (ENSNFUG00015004023) maea (ENSNFUG00015004184) hnrnpa0b (ENSNFUG00015004193) ENSNFUG00015004196 KLHL3 (ENSNFUG00015004210) fam13b (ENSNFUG00015004254) ENSNFUG00015004307 ENSNFUG00015004310 ENSNFUG00015004314 ENSNFUG00015004316 ENSNFUG00015004317 ENSNFUG00015004323 ADH5 (ENSNFUG00015004350) gar1 (ENSNFUG00015004396) #28 zgc:77938 (ENSNFUG00015004427) pitx2 (ENSNFUG00015004620) #22 ELOVL6 (ENSNFUG00015004628) #24 egf (ENSNFUG00015004655) #25 lrit3a (ENSNFUG00015004842) #26 GPM6AA (ENSNFUG00015004858) ENSNFUG00015004885 ENSNFUG00015004890 ENSNFUG00015004903 asb5a (ENSNFUG00015004919) CTSO (ENSNFUG00015004961) tdo2a (ENSNFUG00015004977) Nfu_g_1_004241 (ENSNFUG00015005099) AGA (ENSNFUG00015005500) neil3 (ENSNFUG00015005518) PDGFC (ENSNFUG00015000168) ENSNFUG00015000189 Oryzias ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000155719.b ENSGT00390000006503.b ENSGT00390000013264 ENSGT00940000159403 ENSGT01050000244840.A.b.a ENSGT00940000157465 ENSGT00940000158554 ENSGT00390000006124 ENSGT00390000002781 ENSGT00390000010318 ENSGT00390000011725.c ENSGT00530000063506.A ENSGT00950000183132.C ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b.m ENSGT00390000012574 Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000013264 ENSGT00940000159403 ENSGT01050000244840.A.b.a ENSGT00940000157465 ENSGT00940000158554 ENSGT00940000177669 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000177214 ENSGT00390000002781 ENSGT00390000010318 ENSGT00390000011725.c ENSGT00530000063506.A ENSGT00950000183132.C ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b.m ENSGT00390000012574 Javanese ricefish MODERN SPECIES 1 ENSOJAG00000011703 ENSOJAG00000011673 polr2b (ENSOJAG00000011424) GAR1 (ENSOJAG00000011381) #28 zgc:77938 (ENSOJAG00000011292) pitx2 (ENSOJAG00000011243) #22 ELOVL6 (ENSOJAG00000011221) #24 ENSOJAG00000011197 #25 lrit3a (ENSOJAG00000011185) #26 gpm6aa (ENSOJAG00000010985) asb5a (ENSOJAG00000010953) ENSOJAG00000010941 tdo2a (ENSOJAG00000010828) aga (ENSOJAG00000010436) neil3 (ENSOJAG00000010420) PDGFC (ENSOJAG00000010412) glrbb (ENSOJAG00000010388) gria2b (ENSOJAG00000008694) GASK1B (ENSOJAG00000008504) tmem144b (ENSOJAG00000008328) rxfp1 (ENSOJAG00000008307) Indian medaka MODERN SPECIES 634 rnf130 (ENSOMEG00000007534) TBC1D9B (ENSOMEG00000007636) ENSOMEG00000007665 ENSOMEG00000000195 ENSOMEG00000007683 sqstm1 (ENSOMEG00000007714) ENSOMEG00000007726 selenot2 (ENSOMEG00000007743) COX18 (ENSOMEG00000007800) polr2b (ENSOMEG00000007867) GAR1 (ENSOMEG00000007911) #28 zgc:77938 (ENSOMEG00000007934) pitx2 (ENSOMEG00000007946) #22 elovl6 (ENSOMEG00000007978) #24 egf (ENSOMEG00000008021) #25 lrit3a (ENSOMEG00000008052) #26 gpm6aa (ENSOMEG00000008077) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000169511 ENSGT00940000157165.e.b ENSGT00940000155719.b ENSGT00390000006503.b ENSGT00390000013264 ENSGT00940000159403 ENSGT01050000244840.A.b.a ENSGT00940000157465 ENSGT00940000158554 ENSGT00390000002781 ENSGT00390000010318 ENSGT00390000011725.c ENSGT00530000063506.A ENSGT00950000183132.C ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00390000002932 ENSGT00390000005922.b ENSGT00940000159225 ENSGT00940000165282.a ENSGT00390000006413 ENSGT00390000012030.b.a ENSGT00940000161151 ENSGT00390000013284 ENSGT00390000002414 ENSGT00390000014635.d ENSGT00940000158457 Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 1 ENSORLG00000025448 zgc:92045 (ENSORLG00000027722) SRP72 (ENSORLG00000020418) hvcn1 (ENSORLG00000020417) F2RL3 (ENSORLG00000030468) rnf130 (ENSORLG00000024708) TBC1D9B (ENSORLG00000020564) sqstm1 (ENSORLG00000020572) ENSORLG00000030157 ENSORLG00000020573 selenot2 (ENSORLG00000020575) COX18 (ENSORLG00000020576) polr2b (ENSORLG00000020579) gar1 (ENSORLG00000020583) #28 ENSORLG00000029194 pitx2 (ENSORLG00000020587) #22 elovl6 (ENSORLG00000020593) #24 egf (ENSORLG00000020598) #25 lrit3a (ENSORLG00000020599) #26 gpm6aa (ENSORLG00000024472) mlsl (ENSORLG00000020604) hars (ENSORLG00000020605) dnd1 (ENSORLG00000025449) gfra3 (ENSORLG00000020608) FBXO38 (ENSORLG00000020610) ENSORLG00000023176 rnf103 (ENSORLG00000025144) magt1 (ENSORLG00000020616) ENSORLG00000029142 tmem129 (ENSORLG00000020619) igbp1 (ENSORLG00000025316) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000153147.a.a ENSGT00940000165646.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 299 ENSHBUG00000023873 ENSHBUG00000023872 spon2b (ENSHBUG00000023871) zgc:136929 (ENSHBUG00000023870) maea (ENSHBUG00000023869) HNRNPA0 (ENSHBUG00000023868) ENSHBUG00000023867 ENSHBUG00000023866 fam13b (ENSHBUG00000023865) cxcl14 (ENSHBUG00000023864) LINGO2 (ENSHBUG00000023863) eif4ea (ENSHBUG00000023862) ENSHBUG00000023861 gar1 (ENSHBUG00000023860) #28 zgc:77938 (ENSHBUG00000023859) pitx2 (ENSHBUG00000023858) #22 elovl6 (ENSHBUG00000023857) #24 egf (ENSHBUG00000023856) #25 lrit3a (ENSHBUG00000023855) #26 gpm6aa (ENSHBUG00000023854) spata4 (ENSHBUG00000023853) asb5a (ENSHBUG00000023852) CTSO (ENSHBUG00000023851) tdo2a (ENSHBUG00000023850) TENM3 (ENSHBUG00000023849) neil3 (ENSHBUG00000023848) aga (ENSHBUG00000023847) PDGFC (ENSHBUG00000023846) glrbb (ENSHBUG00000023845) gria2b (ENSHBUG00000023844) GASK1B (ENSHBUG00000023843) Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b P. nyererei MODERN SPECIES 315 fgfrl1a (ENSPNYG00000020579) ENSPNYG00000020600 spon2b (ENSPNYG00000020614) zgc:136929 (ENSPNYG00000020630) maea (ENSPNYG00000020697) ENSPNYG00000020729 ENSPNYG00000020763 KLHL3 (ENSPNYG00000020787) fam13b (ENSPNYG00000020838) cxcl14 (ENSPNYG00000020877) LINGO2 (ENSPNYG00000020886) eif4ea (ENSPNYG00000020891) ENSPNYG00000020903 gar1 (ENSPNYG00000020926) #28 zgc:77938 (ENSPNYG00000020967) pitx2 (ENSPNYG00000020980) #22 elovl6 (ENSPNYG00000020985) #24 egf (ENSPNYG00000020993) #25 lrit3a (ENSPNYG00000021036) #26 gpm6aa (ENSPNYG00000021053) spata4 (ENSPNYG00000021072) asb5a (ENSPNYG00000021087) CTSO (ENSPNYG00000021109) tdo2a (ENSPNYG00000021128) TENM3 (ENSPNYG00000021172) ENSPNYG00000021236 aga (ENSPNYG00000021250) neil3 (ENSPNYG00000021276) PDGFC (ENSPNYG00000021293) glrbb (ENSPNYG00000021306) gria2b (ENSPNYG00000021331) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00740000115581.f ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Eastern happy MODERN SPECIES 11 spon2b (ENSACLG00000008926) zgc:136929 (ENSACLG00000008935) ENSACLG00000008947 maea (ENSACLG00000008954) HNRNPA0 (ENSACLG00000008973) ENSACLG00000008978 KLHL3 (ENSACLG00000009006) fam13b (ENSACLG00000009048) cxcl14 (ENSACLG00000009437) LINGO2 (ENSACLG00000009441) ENSACLG00000009807 eif4ea (ENSACLG00000009996) ENSACLG00000010003 gar1 (ENSACLG00000010029) #28 zgc:77938 (ENSACLG00000010043) pitx2 (ENSACLG00000010441) #22 elovl6 (ENSACLG00000010463) #24 egf (ENSACLG00000010483) #25 lrit3a (ENSACLG00000010540) #26 gpm6aa (ENSACLG00000010551) asb5a (ENSACLG00000010582) CTSO (ENSACLG00000010602) tdo2a (ENSACLG00000010615) TENM3 (ENSACLG00000010776) aga (ENSACLG00000011247) neil3 (ENSACLG00000011270) PDGFC (ENSACLG00000011276) glrbb (ENSACLG00000011452) gria2b (ENSACLG00000011481) GASK1B (ENSACLG00000011514) tmem144b (ENSACLG00000011517) Zebra mbuna MODERN SPECIES 1102 spon2b (ENSMZEG00005000941) zgc:136929 (ENSMZEG00005000965) maea (ENSMZEG00005001004) HNRNPA0 (ENSMZEG00005001055) ENSMZEG00005001063 KLHL3 (ENSMZEG00005001097) fam13b (ENSMZEG00005001152) cxcl14 (ENSMZEG00005001209) ENSMZEG00005001221 LINGO2 (ENSMZEG00005001231) ENSMZEG00005001237 eif4ea (ENSMZEG00005001254) ENSMZEG00005001266 gar1 (ENSMZEG00005001281) #28 zgc:77938 (ENSMZEG00005001293) pitx2 (ENSMZEG00005001300) #22 elovl6 (ENSMZEG00005001323) #24 egf (ENSMZEG00005001341) #25 lrit3a (ENSMZEG00005001362) #26 gpm6aa (ENSMZEG00005001374) spata4 (ENSMZEG00005001391) asb5a (ENSMZEG00005001403) CTSO (ENSMZEG00005001426) tdo2a (ENSMZEG00005001439) TENM3 (ENSMZEG00005001505) aga (ENSMZEG00005001642) neil3 (ENSMZEG00005001680) PDGFC (ENSMZEG00005001715) glrbb (ENSMZEG00005001726) gria2b (ENSMZEG00005001754) GASK1B (ENSMZEG00005001806) Lyretail cichlid MODERN SPECIES 348 pitx2 (ENSNBRG00000012743) #22 elovl6 (ENSNBRG00000012756) #24 egf (ENSNBRG00000012781) #25 lrit3a (ENSNBRG00000012910) #26 gpm6aa (ENSNBRG00000012916) spata4 (ENSNBRG00000012943) asb5a (ENSNBRG00000013020) CTSO (ENSNBRG00000013051) tdo2a (ENSNBRG00000013076) TENM3 (ENSNBRG00000013104) ENSNBRG00000013179 aga (ENSNBRG00000013189) neil3 (ENSNBRG00000013229) glrbb (ENSNBRG00000013272) gria2b (ENSNBRG00000013291) GASK1B (ENSNBRG00000013329) Nile tilapia MODERN SPECIES 11 ENSONIG00000042977 spon2b (ENSONIG00000001044) zgc:136929 (ENSONIG00000001046) maea (ENSONIG00000001054) hnrnpa0b (ENSONIG00000037027) ENSONIG00000042129 KLHL3 (ENSONIG00000001059) fam13b (ENSONIG00000001068) cxcl14 (ENSONIG00000033809) LINGO2 (ENSONIG00000020949) ENSONIG00000037748 eif4ea (ENSONIG00000029613) ENSONIG00000001078 gar1 (ENSONIG00000001085) #28 zgc:77938 (ENSONIG00000001086) pitx2 (ENSONIG00000035890) #22 elovl6 (ENSONIG00000001109) #24 egf (ENSONIG00000001112) #25 lrit3a (ENSONIG00000001124) #26 gpm6aa (ENSONIG00000001127) spata4 (ENSONIG00000001136) asb5a (ENSONIG00000001140) CTSO (ENSONIG00000001146) tdo2a (ENSONIG00000001149) TENM3 (ENSONIG00000001151) neil3 (ENSONIG00000001176) aga (ENSONIG00000001173) PDGFC (ENSONIG00000001182) glrbb (ENSONIG00000001184) gria2b (ENSONIG00000001193) ENSONIG00000012073 Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Bicolor damselfish MODERN SPECIES 396 fmr1 (ENSSPAG00000005758) rab33a (ENSSPAG00000005785) ENSSPAG00000005813 HDAC3 (ENSSPAG00000005839) ENSSPAG00000005892 ENSSPAG00000005922 eif4ea (ENSSPAG00000005937) ENSSPAG00000005953 gar1 (ENSSPAG00000005974) #28 zgc:77938 (ENSSPAG00000005986) pitx2 (ENSSPAG00000006003) #22 elovl6 (ENSSPAG00000006016) #24 egf (ENSSPAG00000006051) #25 lrit3a (ENSSPAG00000006147) #26 gpm6aa (ENSSPAG00000006157) spata4 (ENSSPAG00000006193) asb5a (ENSSPAG00000006202) CTSO (ENSSPAG00000006212) tdo2a (ENSSPAG00000006224) Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000154808.a.b.l ENSGT00940000154808.a.b.k ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Spiny chromis MODERN SPECIES 30 pitx2 (ENSAPOG00000022527) #22 elovl6 (ENSAPOG00000022498) #24 egf (ENSAPOG00000000639) #25 lrit3a (ENSAPOG00000022385) #26 gpm6aa (ENSAPOG00000022346) spata4 (ENSAPOG00000022315) asb5a (ENSAPOG00000000634) CTSO (ENSAPOG00000000975) tdo2a (ENSAPOG00000022252) TENM3 (ENSAPOG00000022179) aga (ENSAPOG00000022043) neil3 (ENSAPOG00000022031) PDGFC (ENSAPOG00000022016) glrbb (ENSAPOG00000022000) gria2b (ENSAPOG00000021949) GASK1B (ENSAPOG00000021874) Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000156736.c.a ENSGT00940000160999 ENSGT00940000159900 ENSGT00940000157061.a ENSGT00940000153203.B ENSGT00940000167175.c ENSGT00940000167175.d ENSGT00940000157891 ENSGT00950000183033.a.b.b ENSGT00390000000618 ENSGT00940000156665.a ENSGT00940000154194.c.a ENSGT00940000164379.e.b ENSGT00730000111223 #28 ENSGT00940000167634 ENSGT00940000154518.a #22 ENSGT01050000244965.b #24 ENSGT00940000158366 #25 ENSGT00940000156627.a #26 ENSGT00390000006915.d.j.b ENSGT00910000144159.B ENSGT00940000165522.a ENSGT00940000159253 ENSGT00390000008593.a ENSGT01030000234566.e.b.a.a.a.b ENSGT00950000183045.C ENSGT00940000153230.A ENSGT00940000158645 ENSGT00940000156344.b ENSGT00940000156950.a ENSGT00420000029769.b Orange clownfish MODERN SPECIES 4 ENSAPEG00000002409 spon2b (ENSAPEG00000002387) zgc:136929 (ENSAPEG00000002347) maea (ENSAPEG00000002314) ENSAPEG00000002274 ENSAPEG00000002224 KLHL3 (ENSAPEG00000002167) fam13b (ENSAPEG00000002131) cxcl14 (ENSAPEG00000002109) ENSAPEG00000002097 LINGO2 (ENSAPEG00000002091) eif4ea (ENSAPEG00000001758) ENSAPEG00000001690 gar1 (ENSAPEG00000001676) #28 zgc:77938 (ENSAPEG00000001665) pitx2 (ENSAPEG00000001615) #22 elovl6 (ENSAPEG00000001582) #24 egf (ENSAPEG00000001463) #25 lrit3a (ENSAPEG00000001430) #26 gpm6aa (ENSAPEG00000001405) spata4 (ENSAPEG00000001399) asb5a (ENSAPEG00000001382) CTSO (ENSAPEG00000001377) tdo2a (ENSAPEG00000001324) TENM3 (ENSAPEG00000001228) ENSAPEG00000001196 aga (ENSAPEG00000001171) neil3 (ENSAPEG00000001058) PDGFC (ENSAPEG00000001026) glrbb (ENSAPEG00000000965) gria2b (ENSAPEG00000000922) Clown anemonefish MODERN SPECIES 3339 eif4ea (ENSAOCG00000020871) ENSAOCG00000020934 gar1 (ENSAOCG00000020947) #28 zgc:77938 (ENSAOCG00000021000) pitx2 (ENSAOCG00000021021) #22 ENSAOCG00000021041 ENSAOCG00000021057 elovl6 (ENSAOCG00000021078) #24 egf (ENSAOCG00000021142) #25 lrit3a (ENSAOCG00000021171) #26 gpm6aa (ENSAOCG00000021198) spata4 (ENSAOCG00000021206) asb5a (ENSAOCG00000021230) CTSO (ENSAOCG00000021272) tdo2a (ENSAOCG00000001557) TENM3 (ENSAOCG00000021405) Reedfish MODERN SPECIES 15 ENSECRG00000008682 fabp2 (ENSECRG00000008688) pde5ab (ENSECRG00000008742) mad2l1 (ENSECRG00000008885) ARSJ (ENSECRG00000008904) #11 ENSECRG00000009026 #12 ANK2 (ENSECRG00000009559) #13 larp7 (ENSECRG00000010171) #14 ENSECRG00000010184 #16 ENSECRG00000010199 ALPK1 (ENSECRG00000010206) #18 TIFA (ENSECRG00000010220) #19 ap1ar (ENSECRG00000010232) ENSECRG00000010260 fam241a (ENSECRG00000010273) #21 pitx2 (ENSECRG00000010290) #22 enpep (ENSECRG00000010349) #23 elovl6 (ENSECRG00000010538) #24 egf (ENSECRG00000010608) #25 lrit3a (ENSECRG00000010702) #26 rrh (ENSECRG00000010709) #27 trmt10a (ENSECRG00000010724) mttp (ENSECRG00000010743) ENSECRG00000010762 dapp1 (ENSECRG00000010775) lamtor3 (ENSECRG00000010789) gar1 (ENSECRG00000010795) #28 ENSECRG00000010802 ENSECRG00000010809 slc1a1 (ENSECRG00000010813) RAP1GDS1 (ENSECRG00000010846) Elephant shark DUPLICATION Elephant shark MODERN SPECIES 1535 ARSJ (ENSCMIG00000009241) #11 CAMK2D (ENSCMIG00000008025) ENSCMIG00000007650 ENSCMIG00000007647 ANK2 (ENSCMIG00000007603) #13 ENSCMIG00000007559 larp7 (ENSCMIG00000007555) #15 ENSCMIG00000007548 #16 ALPK1 (ENSCMIG00000007529) #18 TIFA (ENSCMIG00000007521) #19 AP1AR (ENSCMIG00000007516) #20 FAM241A (ENSCMIG00000007507) #21 pitx2 (ENSCMIG00000007502) #22 enpep (ENSCMIG00000007462) #23 elovl6 (ENSCMIG00000007452) #24 egf (ENSCMIG00000007447) #25 lrit3b (ENSCMIG00000007444) #26 rrh (ENSCMIG00000007434) #27 gar1 (ENSCMIG00000007425) #28 ENSCMIG00000007417 cnot6l (ENSCMIG00000007404) mrpl1 (ENSCMIG00000007401) ENSCMIG00000007384 ENSCMIG00000007374 fras1 (ENSCMIG00000007343) ANXA3 (ENSCMIG00000007326) bmp2k (ENSCMIG00000007305) paqr3b (ENSCMIG00000007299) Elephant shark MODERN SPECIES 1572 ENSCMIG00000006581 FAM114A2 (ENSCMIG00000006580) MFAP3 (ENSCMIG00000006575) GALNT10 (ENSCMIG00000006572) ARHGAP26 (ENSCMIG00000006526) ENSCMIG00000006507 yipf5 (ENSCMIG00000006505) ENSCMIG00000006501 tgfbi (ENSCMIG00000006497) ENSCMIG00000006494 slc25a48 (ENSCMIG00000006493) cxcl14 (ENSCMIG00000006490) NEUROG1 (ENSCMIG00000006488) ENSCMIG00000006486 ##19 macroh2a1 (ENSCMIG00000006482) PITX1 (ENSCMIG00000006477) #22 ENSCMIG00000006474 PCBD2 (ENSCMIG00000006470) TXNDC15 (ENSCMIG00000006468) ENSCMIG00000006456 ddx46 (ENSCMIG00000006420) ENSCMIG00000006397 camlg (ENSCMIG00000006390) ENSCMIG00000006382 SEC24A (ENSCMIG00000006357) ##33 sar1b (ENSCMIG00000006330) JADE2 (ENSCMIG00000006326) cdkn2aipnl (ENSCMIG00000006324) ENSCMIG00000006290 ppp2cab (ENSCMIG00000006272) SKP1 (ENSCMIG00000006268) Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00940000167270 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00390000000046 ENSGT00390000007221.a.b ENSGT00950000182815.a.a.a.b ENSGT00950000182898.a.a.b ENSGT00940000155245 ENSGT00490000043902 ENSGT00940000163216 ENSGT00950000182924.B.b ##33 ENSGT00940000164397.a ENSGT00390000014627 ENSGT00940000157107 ENSGT00390000018119 ENSGT00390000018109 ENSGT00940000155590 ENSGT00950000183079.B Elephant shark MODERN SPECIES 1488 sec24c (ENSCMIG00000004321) ##33 ENSCMIG00000004211 myoz1b (ENSCMIG00000004202) USP54 (ENSCMIG00000004193) abcg2b (ENSCMIG00000004170) NEUROG3 (ENSCMIG00000004157) FAM241B (ENSCMIG00000004153) ##21 ENSCMIG00000004148 ENSCMIG00000004139 ENSCMIG00000004133 ENSCMIG00000004129 ENSCMIG00000004119 ENSCMIG00000004112 MACROH2A2 (ENSCMIG00000004103) GBF1 (ENSCMIG00000004041) pitx3 (ENSCMIG00000004016) ##22 sgpl1 (ENSCMIG00000003755) pcbd1 (ENSCMIG00000003687) unc5b (ENSCMIG00000003588) SLC29A3 (ENSCMIG00000003519) C10orf105 (ENSCMIG00000003517) ENSCMIG00000003514 cdh23 (ENSCMIG00000003356) bloc1s2 (ENSCMIG00000003273) ENSCMIG00000003260 ENSCMIG00000003228 ##33 ENSCMIG00000003178 tysnd1 (ENSCMIG00000003167) ddit4 (ENSCMIG00000003158) SPOCK2 (ENSCMIG00000003130) ascc1 (ENSCMIG00000003107) Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 252 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00940000155571.A ENSGT00940000167270 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00390000004582 Actinopterygii ANCESTRAL SPECIES 465 ENSGT00940000167270 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00950000182924.A.b.b ##33 ENSGT00390000004582 Reedfish DUPLICATION Reedfish MODERN SPECIES 10 ENSECRG00000019098 ENSECRG00000019022 ENSECRG00000018989 ENSECRG00000018958 ENSECRG00000018942 ENSECRG00000018859 ENSECRG00000018785 AP2A2 (ENSECRG00000018613) ENSECRG00000018487 ENSECRG00000018294 ret (ENSECRG00000018102) csgalnact2 (ENSECRG00000018040) nap1l4b (ENSECRG00000017975) ENSECRG00000016912 GBF1 (ENSECRG00000016579) pitx3 (ENSECRG00000016536) ##22 si:dkey-266f7.9 (ENSECRG00000016521) ENSECRG00000016512 ENSECRG00000016502 ENSECRG00000016495 ENSECRG00000016485 ENSECRG00000016470 ENSECRG00000016452 ENSECRG00000016440 rpz6 (ENSECRG00000016426) ENSECRG00000016408 ENSECRG00000016400 rpz4 (ENSECRG00000016386) ENSECRG00000016364 ENSECRG00000016341 ANKRD34A (ENSECRG00000016326) Reedfish MODERN SPECIES adra2b (ENSECRG00000000205) ENSECRG00000000206 dusp2 (ENSECRG00000000207) pgam2 (ENSECRG00000000208) gmcl1 (ENSECRG00000000209) tgfa (ENSECRG00000000210) fam136a (ENSECRG00000000211) snrpg (ENSECRG00000000212) pcyox1 (ENSECRG00000000213) tmem150aa (ENSECRG00000000214) rnf181 (ENSECRG00000000215) vamp8 (ENSECRG00000000216) ncaph (ENSECRG00000000217) pum3 (ENSECRG00000000218) ENSECRG00000000219 ENSECRG00000000220 ##22 ENSECRG00000000221 ##33 mrps24 (ENSECRG00000000222) nudcd3 (ENSECRG00000000223) zgc:65851 (ENSECRG00000000224) MXD1 (ENSECRG00000000225) snrnp27 (ENSECRG00000000226) add2 (ENSECRG00000000227) figla (ENSECRG00000000228) hk2 (ENSECRG00000000229) ENSECRG00000000230 tacr1b (ENSECRG00000000231) zgc:110329 (ENSECRG00000000232) SLC4A5 (ENSECRG00000000235) mthfd2 (ENSECRG00000000236) mob1a (ENSECRG00000000237) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000158282 ENSGT00940000155716 ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000154371.b ENSGT00940000161927 ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00390000017460 ENSGT00940000154551.b ENSGT01050000244965.a.b ##24 ENSGT00390000004582 ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000157425.B ENSGT00940000158482 ENSGT00390000008978 Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00940000154371.b ENSGT00940000161927 ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00940000155061.a.b.k.b ENSGT01050000244965.a.a ##24 ENSGT00390000004582 ENSGT00660000095541.a.a ENSGT00390000013968 ENSGT00940000166409 ENSGT00950000183148.b.b ENSGT00390000018613.a ENSGT01100000263540.A.a ENSGT00940000160793 ENSGT00940000158550 ENSGT00440000039984.a ENSGT00940000160277 Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000014666.b.j ENSGT01030000234543.D.m ENSGT00940000158184 ENSGT00390000014320.c.a.h ENSGT00940000157372 ENSGT00940000154628.C ENSGT00940000154628.A.a.b ENSGT00940000154628.A.a.a.a ENSGT00940000162682.A.a.b.a ENSGT00940000154371.b ENSGT00940000161927 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00940000165789 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 Asian bonytongue MODERN SPECIES 23 ap3m1 (ENSSFOG00015017575) ADK (ENSSFOG00015017628) KAT6B (ENSSFOG00015017723) ENSSFOG00015017788 ENSSFOG00015017797 dusp13a (ENSSFOG00015017803) nvl (ENSSFOG00015017830) ENSSFOG00015017860 ENSSFOG00015026275 ENSSFOG00015017876 NPY4R2 (ENSSFOG00015017878) hells (ENSSFOG00015017895) ENSSFOG00015018021 macroh2a2 (ENSSFOG00015018061) GBF1 (ENSSFOG00015018127) pitx3 (ENSSFOG00015018332) ##22 PNLIPRP2 (ENSSFOG00015018343) hspa12a (ENSSFOG00015018380) eno4 (ENSSFOG00015018490) shtn1 (ENSSFOG00015018508) atp6v1ba (ENSSFOG00015018533) vax1 (ENSSFOG00015018548) ENSSFOG00015018571 ENSSFOG00015018603 slc18a2 (ENSSFOG00015018629) PDZD8 (ENSSFOG00015032885) ENSSFOG00015027835 exo1 (ENSSFOG00015018815) yipf4 (ENSSFOG00015018831) BIRC6 (ENSSFOG00015018871) ttc27 (ENSSFOG00015019117) P. kingsleyae MODERN SPECIES 119 ADK (ENSPKIG00000011178) ENSPKIG00000011107 ENSPKIG00000011079 dusp13a (ENSPKIG00000011062) zgc:153981 (ENSPKIG00000011047) NPY4R2 (ENSPKIG00000011037) ENSPKIG00000011028 hells (ENSPKIG00000010890) ENSPKIG00000010820 ENSPKIG00000010806 ENSPKIG00000010771 ENSPKIG00000010748 ENSPKIG00000010729 macroh2a2 (ENSPKIG00000010711) GBF1 (ENSPKIG00000010267) pitx3 (ENSPKIG00000010100) ##22 ENSPKIG00000010075 PNLIPRP2 (ENSPKIG00000010033) hspa12a (ENSPKIG00000009974) eno4 (ENSPKIG00000009937) shtn1 (ENSPKIG00000009916) atp6v1ba (ENSPKIG00000009808) vax1 (ENSPKIG00000009767) ENSPKIG00000009740 kcnk18 (ENSPKIG00000009711) slc18a2 (ENSPKIG00000009658) PDZD8 (ENSPKIG00000009620) ENSPKIG00000009594 ENSPKIG00000009580 exo1 (ENSPKIG00000009478) yipf4 (ENSPKIG00000009413) Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 167 ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000154902 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 89 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034 ENSGT00940000166025.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 88 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034 ENSGT00940000166025.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.c.a Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 243 ENSGT00940000159518.a.d ENSGT00390000005029.g ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034.q ENSGT00940000166025.b.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00740000115593.c ENSGT00940000167270.f ENSGT00940000158302.d.a.j.b ENSGT00940000158120.j ENSGT00940000156925.v.k.b ENSGT00940000154518.b.c ##22 ENSGT00940000154551.b.l.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b.c ENSGT00940000161152.c ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i ENSGT00700000104522.c ENSGT00940000157593.t ENSGT00390000017746.k ENSGT00940000165200.e ENSGT00940000154902.tb.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B.b ENSGT00940000156126.b ENSGT00500000044929.c.a ENSGT00940000155823.B.f Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159518.a.d ENSGT00390000005029.g ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034.q ENSGT00940000166025.b.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b.d ENSGT00740000115593.c ENSGT00940000167270.f ENSGT00940000154865.vb.b ENSGT00940000158120.j ENSGT00940000156925.v.k.b ENSGT00940000154518.b.c ##22 ENSGT00940000154551.b.l.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b.c ENSGT00940000161152.c ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i ENSGT00700000104522.c ENSGT00940000157593.t ENSGT00390000017746.k ENSGT00940000165200.e ENSGT00940000154902.tb.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B.b ENSGT00940000156126.b ENSGT00500000044929.c.a ENSGT00940000155823.B.f Salmo ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000159518.a.d ENSGT00390000005029.g ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034.q ENSGT00940000166025.b.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b.d ENSGT00740000115593.c ENSGT00940000167270.f ENSGT00940000154865.vb.b ENSGT00940000158120.j ENSGT00940000156925.v.k.b ENSGT00940000154518.b.c ##22 ENSGT00940000154551.b.l.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b.c ENSGT00940000161152.c ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i ENSGT00700000104522.c ENSGT00940000157593.t ENSGT00390000017746.k ENSGT00940000165200.e ENSGT00940000154902.tb.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B.b ENSGT00500000044929.c.a ENSGT00940000155823.B.f ENSGT00940000158843.g River trout MODERN SPECIES 35 fgf8a (ENSSTUG00000007553) fbxw4 (ENSSTUG00000007530) cyp17a1 (ENSSTUG00000007509) borcs7 (ENSSTUG00000007494) nt5c2a (ENSSTUG00000006989) inaa (ENSSTUG00000006947) pcgf6 (ENSSTUG00000006916) ENSSTUG00000006905 calhm2.1 (ENSSTUG00000006901) CALHM3 (ENSSTUG00000006872) hells (ENSSTUG00000005197) ENSSTUG00000005002 ENSSTUG00000004984 macroh2a2 (ENSSTUG00000004938) GBF1 (ENSSTUG00000004539) pitx3 (ENSSTUG00000004502) ##22 hspa12a (ENSSTUG00000004185) shtn1 (ENSSTUG00000004139) atp6v1ba (ENSSTUG00000003351) vax1 (ENSSTUG00000003279) ENSSTUG00000003218 ENSSTUG00000003210 slc18a2 (ENSSTUG00000002972) PDZD8 (ENSSTUG00000002940) ENSSTUG00000002918 exo1 (ENSSTUG00000002874) yipf4 (ENSSTUG00000002782) ttc27 (ENSSTUG00000000711) LTBP1 (ENSSTUG00000000479) rasgrp3 (ENSSTUG00000000348) FAM98A (ENSSTUG00000000318) Atlantic salmon MODERN SPECIES 9 fgf8a (ENSSSAG00000098674) fbxw4 (ENSSSAG00000069868) cyp17a1 (ENSSSAG00000069890) borcs7 (ENSSSAG00000119087) nt5c2a (ENSSSAG00000069977) inaa (ENSSSAG00000072742) pcgf6 (ENSSSAG00000072746) ENSSSAG00000101552 ENSSSAG00000072757 ENSSSAG00000072792 ENSSSAG00000085939 ENSSSAG00000074124 ENSSSAG00000074170 ENSSSAG00000074264 H2AW (ENSSSAG00000074192) ENSSSAG00000075958 ##22 hspa12a (ENSSSAG00000001820) shtn1 (ENSSSAG00000076009) atp6v1ba (ENSSSAG00000076022) vax1 (ENSSSAG00000101324) pla2g4f (ENSSSAG00000076076) kcnk18 (ENSSSAG00000093804) SLC18A2 (ENSSSAG00000076093) PDZD8 (ENSSSAG00000076238) ENSSSAG00000100205 exo1 (ENSSSAG00000103371) yipf4 (ENSSSAG00000039940) ttc27 (ENSSSAG00000042355) LTBP1 (ENSSSAG00000044896) rasgrp3 (ENSSSAG00000054335) ENSSSAG00000116448 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159518.a.d ENSGT00390000005029.g ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034.q ENSGT00940000166025.b.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b.d ENSGT00740000115593.c ENSGT00940000167270.f ENSGT00940000158302.d.a.j.b ENSGT00940000158120.j ENSGT00940000156925.v.k.b ENSGT00940000154518.b.c ##22 ENSGT00940000154551.b.l.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b.c ENSGT00940000161152.c ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i ENSGT00940000165789 ENSGT00700000104522.c ENSGT00940000157593.t ENSGT00390000017746.k ENSGT00940000165200.e ENSGT00940000154902.tb.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B.b ENSGT00940000156126.b ENSGT00500000044929.c.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a.d ENSGT00390000005029.g ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034.q ENSGT00940000166025.b.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b.d ENSGT00740000115593.c ENSGT00940000167270.f ENSGT00940000158120.j ENSGT00940000156925.v.k.b ENSGT00940000154518.b.c ##22 ENSGT00940000154551.b.l.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b.c ENSGT00940000161152.c ENSGT01030000234606.a.a.a.b.i ENSGT00700000104522.c ENSGT00940000157593.t ENSGT00390000017746.k ENSGT00940000165200.e ENSGT00940000154902.tb.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B.b ENSGT00940000156126.b ENSGT00500000044929.c.a ENSGT00940000155823.B.f Chinook salmon MODERN SPECIES 30 slc2a15a (ENSOTSG00005035584) fgf8a (ENSOTSG00005035753) fbxw4 (ENSOTSG00005035754) cyp17a1 (ENSOTSG00005035756) borcs7 (ENSOTSG00005035757) nt5c2a (ENSOTSG00005035759) inaa (ENSOTSG00005036210) pcgf6 (ENSOTSG00005036212) ENSOTSG00005036213 ENSOTSG00005036214 calhm2.1 (ENSOTSG00005036217) hells (ENSOTSG00005036242) ENSOTSG00005036262 macroh2a2 (ENSOTSG00005036265) GBF1 (ENSOTSG00005036267) pitx3 (ENSOTSG00005036400) ##22 hspa12a (ENSOTSG00005036401) shtn1 (ENSOTSG00005036449) atp6v1ba (ENSOTSG00005036450) vax1 (ENSOTSG00005000729) ENSOTSG00005001025 kcnk18 (ENSOTSG00005001027) slc18a2 (ENSOTSG00005001033) PDZD8 (ENSOTSG00005001087) ENSOTSG00005001092 ENSOTSG00005001104 exo1 (ENSOTSG00005001128) yipf4 (ENSOTSG00005001383) BIRC6 (ENSOTSG00005001432) ttc27 (ENSOTSG00005002529) LTBP1 (ENSOTSG00005007387) Coho salmon MODERN SPECIES 24 fbxw4 (ENSOKIG00005008688) cyp17a1 (ENSOKIG00005008708) borcs7 (ENSOKIG00005008726) nt5c2a (ENSOKIG00005008775) inaa (ENSOKIG00005009179) pcgf6 (ENSOKIG00005009188) ENSOKIG00005009221 calhm2.1 (ENSOKIG00005009238) ENSOKIG00005009251 hells (ENSOKIG00005009326) ENSOKIG00005009572 ENSOKIG00005009632 ENSOKIG00005009641 macroh2a2 (ENSOKIG00005009648) GBF1 (ENSOKIG00005009693) pitx3 (ENSOKIG00005009765) ##22 hspa12a (ENSOKIG00005009791) shtn1 (ENSOKIG00005009885) atp6v1ba (ENSOKIG00005010025) vax1 (ENSOKIG00005011277) ENSOKIG00005011296 ENSOKIG00005011313 slc18a2 (ENSOKIG00005011345) PDZD8 (ENSOKIG00005011782) ENSOKIG00005011792 exo1 (ENSOKIG00005011806) yipf4 (ENSOKIG00005011823) BIRC6 (ENSOKIG00005012005) ttc27 (ENSOKIG00005013611) LTBP1 (ENSOKIG00005028598) rasgrp3 (ENSOKIG00005028899) Rainbow trout MODERN SPECIES fgf8a (ENSOMYG00000060026) fbxw4 (ENSOMYG00000003974) cyp17a1 (ENSOMYG00000004006) borcs7 (ENSOMYG00000004037) nt5c2a (ENSOMYG00000004691) inaa (ENSOMYG00000005199) pcgf6 (ENSOMYG00000005228) ENSOMYG00000005272 ENSOMYG00000005291 ENSOMYG00000005308 hells (ENSOMYG00000005852) ENSOMYG00000006563 ENSOMYG00000073245 macroh2a2 (ENSOMYG00000006631) ENSOMYG00000007886 pitx3 (ENSOMYG00000009122) ##22 hspa12a (ENSOMYG00000009142) shtn1 (ENSOMYG00000009169) atp6v1ba (ENSOMYG00000009477) vax1 (ENSOMYG00000065891) ENSOMYG00000010089 ENSOMYG00000010100 SLC18A2 (ENSOMYG00000010158) ENSOMYG00000010196 ENSOMYG00000056164 ENSOMYG00000010215 exo1 (ENSOMYG00000010296) yipf4 (ENSOMYG00000030331) BIRC6 (ENSOMYG00000010511) ENSOMYG00000072726 ttc27 (ENSOMYG00000011283) Huchen MODERN SPECIES 245 fgf8a (ENSHHUG00000048858) fbxw4 (ENSHHUG00000048838) ENSHHUG00000048835 cyp17a1 (ENSHHUG00000048782) borcs7 (ENSHHUG00000048776) nt5c2a (ENSHHUG00000048746) inaa (ENSHHUG00000048740) pcgf6 (ENSHHUG00000048735) ENSHHUG00000048723 calhm2.1 (ENSHHUG00000048720) hells (ENSHHUG00000048559) ENSHHUG00000048503 ENSHHUG00000048493 macroh2a2 (ENSHHUG00000048480) ENSHHUG00000048452 pitx3 (ENSHHUG00000048444) ##22 hspa12a (ENSHHUG00000048417) shtn1 (ENSHHUG00000048402) atp6v1ba (ENSHHUG00000048354) vax1 (ENSHHUG00000048353) ENSHHUG00000048341 kcnk18 (ENSHHUG00000048340) slc18a2 (ENSHHUG00000048330) PDZD8 (ENSHHUG00000048326) ENSHHUG00000048325 ENSHHUG00000048323 exo1 (ENSHHUG00000048317) yipf4 (ENSHHUG00000048315) ttc27 (ENSHHUG00000048146) LTBP1 (ENSHHUG00000047938) rasgrp3 (ENSHHUG00000047927) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00390000009155.c ENSGT00940000158698.b.b ENSGT00940000164611.a.b.b ENSGT00940000159518.a.c ENSGT00390000005029.h ENSGT00940000158034.r ENSGT00940000166025.b.a ENSGT00740000115593.d ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00940000167270.e ENSGT00940000154865 ENSGT01000000215701 ENSGT00940000158120.i ENSGT00940000156925.v.k.a ENSGT00940000156925.v.l ENSGT00940000154518.b.d ##22 ENSGT00940000154551.b.l.a ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00940000155068.a.b.d ENSGT00940000161152.d ENSGT01030000234606.a.a.a.b.j ENSGT00700000104522.d ENSGT00940000157593.s ENSGT00390000017746.l ENSGT00940000165200.f ENSGT00940000154902.tb.a.b ENSGT00940000153168.B.a ENSGT00940000156126.a ENSGT00500000044929.c.b ENSGT00940000155823.B.e ENSGT00940000158843.h Huchen MODERN SPECIES 1114 ENSHHUG00000005077 pitx3 (ENSHHUG00000005081) ##22 hspa12a (ENSHHUG00000005109) eno4 (ENSHHUG00000005157) ENSHHUG00000005168 hacd4 (ENSHHUG00000005228) C4orf54 (ENSHHUG00000005233) ENSHHUG00000005244 trmt10a (ENSHHUG00000005292) slc1a1 (ENSHHUG00000005296) ENSHHUG00000005331 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b ENSGT00810000125473.A.d ENSGT00390000009155.c ENSGT00940000158698.b.b ENSGT00940000164611.a.b.b ENSGT00940000159518.a.c ENSGT00390000005029.h ENSGT00940000158034.r ENSGT00940000166025.b.a ENSGT00740000115593.d ENSGT01030000234610.b.a.b.b.c ENSGT00940000167270.e ENSGT00940000154865.vb.a ENSGT00940000158120.i ENSGT00940000156925.v.k.a ENSGT00940000154518.b.d ##22 ENSGT00940000154551.b.l.a ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00940000155068.a.b.d ENSGT00940000161152.d ENSGT01030000234606.a.a.a.b.j ENSGT00700000104522.d ENSGT00940000157593.s ENSGT00390000017746.l ENSGT00940000165200.f ENSGT00940000153168.B.a ENSGT00940000156126.a ENSGT00500000044929.c.b ENSGT00940000155823.B.e ENSGT00940000158843.h ENSGT00440000037341.a.z.b Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b ENSGT00810000125473.A.d ENSGT00390000009155.c ENSGT00940000158698.b.b ENSGT00940000164611.a.b.b ENSGT00940000159518.a.c ENSGT00390000005029.h ENSGT00940000158034.r ENSGT00940000166025.b.a ENSGT00740000115593.d ENSGT01030000234610.b.a.b.b.c ENSGT00940000167270.e ENSGT00940000154865.vb.a ENSGT00940000158120.i ENSGT00940000156925.v.k.a ENSGT00940000154518.b.d ##22 ENSGT00940000154551.b.l.a ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00940000155068.a.b.d ENSGT00940000161152.d ENSGT01030000234606.a.a.a.b.j ENSGT00700000104522.d ENSGT00940000157593.s ENSGT00390000017746.l ENSGT00940000165200.f ENSGT00940000153168.B.a ENSGT00940000156126.a ENSGT00940000155823.B.e ENSGT00940000158843.h ENSGT00570000079239.g ENSGT00390000013448.a.a.a Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183045.C.mb.b ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b ENSGT00810000125473.A.d ENSGT00390000009155.c ENSGT00940000158698.b.b ENSGT00940000164611.a.b.b ENSGT00940000159518.a.c ENSGT00390000005029.h ENSGT00940000158034.r ENSGT00940000166025.b.a ENSGT00740000115593.d ENSGT01030000234610.b.a.b.b.c ENSGT00940000167270.e ENSGT00940000158120.i ENSGT00940000156925.v.k.a ENSGT00940000154518.b.d ##22 ENSGT00940000154551.b.l.a ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00940000155068.a.b.d ENSGT00940000161152.d ENSGT01030000234606.a.a.a.b.j ENSGT00700000104522.d ENSGT00940000157593.s ENSGT00390000017746.l ENSGT00940000165200.f ENSGT00940000153168.B.a ENSGT00940000156126.a ENSGT00940000155823.B.e ENSGT00940000158843.h ENSGT00570000079239.g ENSGT00390000013448.a.a.a Chinook salmon MODERN SPECIES SYNPO2L (ENSOTSG00005008637) zgc:153169 (ENSOTSG00005008639) ENSOTSG00005008641 cep68 (ENSOTSG00005008645) ENSOTSG00005008646 tlx1 (ENSOTSG00005008647) ENSOTSG00005008648 fgf8a (ENSOTSG00005008649) fbxw4 (ENSOTSG00005008650) pcgf6 (ENSOTSG00005008656) ENSOTSG00005008658 hells (ENSOTSG00005008668) ENSOTSG00005009960 macroh2a2 (ENSOTSG00005010028) GBF1 (ENSOTSG00005010041) pitx3 (ENSOTSG00005010053) ##22 hspa12a (ENSOTSG00005010059) eno4 (ENSOTSG00005010082) atp6v1ba (ENSOTSG00005010104) vax1 (ENSOTSG00005013057) ENSOTSG00005013059 kcnk18 (ENSOTSG00005013061) slc18a2 (ENSOTSG00005013064) PDZD8 (ENSOTSG00005013117) ENSOTSG00005013118 yipf4 (ENSOTSG00005013119) BIRC6 (ENSOTSG00005013120) LTBP1 (ENSOTSG00005013163) rasgrp3 (ENSOTSG00005013432) degs1 (ENSOTSG00005016628) fbxo28 (ENSOTSG00005016629) Coho salmon MODERN SPECIES 2 ENSOKIG00005048043 tlx1 (ENSOKIG00005048040) ENSOKIG00005048037 ENSOKIG00005048035 fgf8a (ENSOKIG00005048027) fbxw4 (ENSOKIG00005047999) ENSOKIG00005047981 ENSOKIG00005047965 hells (ENSOKIG00005047721) CALHM3 (ENSOKIG00005047689) ENSOKIG00005047665 ENSOKIG00005047628 ENSOKIG00005047612 macroh2a2 (ENSOKIG00005047591) GBF1 (ENSOKIG00005047404) pitx3 (ENSOKIG00005047372) ##22 hspa12a (ENSOKIG00005047314) eno4 (ENSOKIG00005047294) atp6v1ba (ENSOKIG00005047038) vax1 (ENSOKIG00005046994) ENSOKIG00005046965 kcnk18 (ENSOKIG00005046949) SLC18A2 (ENSOKIG00005046818) PDZD8 (ENSOKIG00005046777) ENSOKIG00005046768 yipf4 (ENSOKIG00005046762) BIRC6 (ENSOKIG00005046163) LTBP1 (ENSOKIG00005045568) ENSOKIG00005045536 rasgrp3 (ENSOKIG00005045499) nvl (ENSOKIG00005045464) Rainbow trout MODERN SPECIES 15 ENSOMYG00000042335 ENSOMYG00000042337 tlx1 (ENSOMYG00000042338) ENSOMYG00000042342 fgf8a (ENSOMYG00000042351) fbxw4 (ENSOMYG00000042367) ENSOMYG00000042394 ENSOMYG00000042401 ENSOMYG00000042443 ENSOMYG00000042758 ENSOMYG00000042781 ENSOMYG00000077179 macroh2a2 (ENSOMYG00000042807) ENSOMYG00000042851 ENSOMYG00000059612 pitx3 (ENSOMYG00000042905) ##22 hspa12a (ENSOMYG00000026525) eno4 (ENSOMYG00000026607) ENSOMYG00000077730 atp6v1ba (ENSOMYG00000027282) vax1 (ENSOMYG00000029820) ENSOMYG00000029834 kcnk18 (ENSOMYG00000076015) SLC18A2 (ENSOMYG00000030075) PDZD8 (ENSOMYG00000030310) ENSOMYG00000030317 yipf4 (ENSOMYG00000073100) BIRC6 (ENSOMYG00000030671) ENSOMYG00000064187 ttc27 (ENSOMYG00000060512) ENSOMYG00000065147 Salmo ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000155078.a.b.a.b.g.b ENSGT00810000125473.A.d ENSGT00390000009155.c ENSGT00940000158698.b.b ENSGT00940000164611.a.b.b ENSGT00940000159518.a.c ENSGT00390000005029.h ENSGT00940000158034.r ENSGT00940000166025.b.a ENSGT00740000115593.d ENSGT01030000234610.b.a.b.b.c ENSGT00940000167270.e ENSGT00940000154865.vb.a ENSGT00940000158120.i ENSGT00940000156925.v.k.a ENSGT00940000154518.b.d ##22 ENSGT00940000154551.b.l.a ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00940000155068.a.b.d ENSGT00940000161152.d ENSGT00700000104522.d ENSGT00940000157593.s ENSGT00390000017746.l ENSGT00940000165200.f ENSGT00940000153168.B.a ENSGT00940000156126.a ENSGT00500000044929.c.b ENSGT00940000155823.B.e ENSGT00940000158843.h ENSGT00440000037341.a.z.b ENSGT00570000079239.g River trout MODERN SPECIES 9 zgc:153169 (ENSSTUG00000031867) ENSSTUG00000031891 cep68 (ENSSTUG00000032111) ENSSTUG00000032122 tlx1 (ENSSTUG00000032131) ENSSTUG00000032153 fgf8a (ENSSTUG00000032164) fbxw4 (ENSSTUG00000032200) pcgf6 (ENSSTUG00000032319) ENSSTUG00000032338 hells (ENSSTUG00000032377) CALHM3 (ENSSTUG00000033080) ENSSTUG00000033111 macroh2a2 (ENSSTUG00000033196) GBF1 (ENSSTUG00000033240) pitx3 (ENSSTUG00000033791) ##22 hspa12a (ENSSTUG00000033806) eno4 (ENSSTUG00000034029) ENSSTUG00000034039 atp6v1ba (ENSSTUG00000034054) vax1 (ENSSTUG00000034155) kcnk18 (ENSSTUG00000034165) slc18a2 (ENSSTUG00000034186) PDZD8 (ENSSTUG00000034458) ENSSTUG00000034471 yipf4 (ENSSTUG00000034479) BIRC6 (ENSSTUG00000034521) ENSSTUG00000035136 LTBP1 (ENSSTUG00000035188) rasgrp3 (ENSSTUG00000036048) FAM98A (ENSSTUG00000036310) Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000068314 RAB1A (ENSSSAG00000090451) ENSSSAG00000068334 ENSSSAG00000109421 tlx1 (ENSSSAG00000068344) ENSSSAG00000094428 fgf8a (ENSSSAG00000068350) fbxw4 (ENSSSAG00000068356) ENSSSAG00000108556 ENSSSAG00000068371 ENSSSAG00000068387 ENSSSAG00000069017 ENSSSAG00000069079 ENSSSAG00000000766 macroh2a2 (ENSSSAG00000069088) ENSSSAG00000001804 ##22 hspa12a (ENSSSAG00000075965) eno4 (ENSSSAG00000001960) ENSSSAG00000001970 VATB2 (ENSSSAG00000001987) vax1 (ENSSSAG00000082494) kcnk18 (ENSSSAG00000002025) slc18a2 (ENSSSAG00000002046) PDZD8 (ENSSSAG00000002120) ENSSSAG00000099419 yipf4 (ENSSSAG00000084783) ttc27 (ENSSSAG00000101525) LTBP1 (ENSSSAG00000003342) rasgrp3 (ENSSSAG00000004411) ENSSSAG00000005447 NVL (ENSSSAG00000005504) Northern pike MODERN SPECIES 5 cyp17a1 (ENSELUG00000014836) ENSELUG00000015261 ENSELUG00000001250 borcs7 (ENSELUG00000015228) nt5c2a (ENSELUG00000015147) inaa (ENSELUG00000015029) pcgf6 (ENSELUG00000015010) ENSELUG00000014991 calhm2.1 (ENSELUG00000014966) CALHM3 (ENSELUG00000014947) hells (ENSELUG00000014909) ENSELUG00000014562 ENSELUG00000025259 macroh2a2 (ENSELUG00000014527) GBF1 (ENSELUG00000014474) pitx3 (ENSELUG00000014303) ##22 PNLIPRP2 (ENSELUG00000014287) hspa12a (ENSELUG00000014254) eno4 (ENSELUG00000014183) shtn1 (ENSELUG00000001085) atp6v1ba (ENSELUG00000014059) vax1 (ENSELUG00000014001) ENSELUG00000013969 slc18a2 (ENSELUG00000013933) PDZD8 (ENSELUG00000013841) ENSELUG00000013835 exo1 (ENSELUG00000013778) yipf4 (ENSELUG00000025107) BIRC6 (ENSELUG00000013694) ENSELUG00000013483 ttc27 (ENSELUG00000013525) Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 96 ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034 ENSGT00940000166025.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 Cod MODERN SPECIES 6 ENSGMOG00000016222 ENSGMOG00000016203 ENSGMOG00000016016 ENSGMOG00000012677 ENSGMOG00000012670 ENSGMOG00000026927 ENSGMOG00000036392 ENSGMOG00000017930 ENSGMOG00000017916 hells (ENSGMOG00000017884) ENSGMOG00000031326 ENSGMOG00000033488 ENSGMOG00000025595 macroh2a2 (ENSGMOG00000007928) ENSGMOG00000007931 pitx3 (ENSGMOG00000037230) ##22 PNLIPRP2 (ENSGMOG00000007955) hspa12a (ENSGMOG00000005300) eno4 (ENSGMOG00000015450) shtn1 (ENSGMOG00000024092) atp6v1ba (ENSGMOG00000000178) vax1 (ENSGMOG00000033199) kcnk18 (ENSGMOG00000029708) SLC18A2 (ENSGMOG00000000199) PDZD8 (ENSGMOG00000000209) ENSGMOG00000000216 exo1 (ENSGMOG00000000235) yipf4 (ENSGMOG00000000242) BIRC6 (ENSGMOG00000000246) ttc27 (ENSGMOG00000017589) LTBP1 (ENSGMOG00000008462) Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00940000155588.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00940000154418.a.a.a ENSGT00940000158034 ENSGT00940000166025.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 6 ENSMMDG00005024569 ENSMMDG00005024566 ENSMMDG00005024565 inaa (ENSMMDG00005024563) pcgf6 (ENSMMDG00005024561) ENSMMDG00005024559 calhm2.1 (ENSMMDG00005024558) CALHM3 (ENSMMDG00005024557) hells (ENSMMDG00005024554) ENSMMDG00005024553 ENSMMDG00005024552 ENSMMDG00005024551 ENSMMDG00005024550 macroh2a2 (ENSMMDG00005024548) GBF1 (ENSMMDG00005024541) pitx3 (ENSMMDG00005024535) ##22 PNLIPRP2 (ENSMMDG00005024531) hspa12a (ENSMMDG00005024516) eno4 (ENSMMDG00005024508) shtn1 (ENSMMDG00005024504) atp6v1ba (ENSMMDG00005024487) vax1 (ENSMMDG00005024482) ENSMMDG00005024481 ENSMMDG00005024480 ENSMMDG00005024479 ENSMMDG00005024476 slc18a2 (ENSMMDG00005024475) PDZD8 (ENSMMDG00005024474) ENSMMDG00005024472 exo1 (ENSMMDG00005024471) yipf4 (ENSMMDG00005024466) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 57 ENSGT00860000134673 ENSGT00740000115593 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 312 slc2a15a (ENSHCOG00000009371) fgf8a (ENSHCOG00000009341) fbxw4 (ENSHCOG00000009309) wbp1la (ENSHCOG00000009211) nt5c2a (ENSHCOG00000009200) borcs7 (ENSHCOG00000009167) cyp17a1 (ENSHCOG00000009148) ctu2 (ENSHCOG00000009126) cdk1 (ENSHCOG00000009089) HNRNPLL (ENSHCOG00000009062) galm (ENSHCOG00000009018) ENSHCOG00000008998 vps8 (ENSHCOG00000008947) GBF1 (ENSHCOG00000008538) pitx3 (ENSHCOG00000008464) ##22 PNLIPRP2 (ENSHCOG00000008453) ENSHCOG00000008441 hspa12a (ENSHCOG00000008434) eno4 (ENSHCOG00000008409) shtn1 (ENSHCOG00000008357) atp6v1ba (ENSHCOG00000000843) vax1 (ENSHCOG00000008321) ENSHCOG00000008308 ENSHCOG00000008280 ENSHCOG00000008255 slc18a2 (ENSHCOG00000008216) PDZD8 (ENSHCOG00000008187) ENSHCOG00000008171 ENSHCOG00000008164 exo1 (ENSHCOG00000008153) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00390000010672 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00570000079239 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00570000079239 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00570000079239 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00940000175244 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Clown anemonefish MODERN SPECIES 564 pcca (ENSAOCG00000005451) ENSAOCG00000005427 vps8 (ENSAOCG00000005373) ENSAOCG00000005160 ENSAOCG00000005132 macroh2a2 (ENSAOCG00000005073) GBF1 (ENSAOCG00000005026) pitx3 (ENSAOCG00000004900) ##22 PNLIPRP2 (ENSAOCG00000004838) hspa12a (ENSAOCG00000004810) eno4 (ENSAOCG00000004756) shtn1 (ENSAOCG00000004712) atp6v1ba (ENSAOCG00000004694) vax1 (ENSAOCG00000004654) ENSAOCG00000004643 slc18a2 (ENSAOCG00000004618) PDZD8 (ENSAOCG00000004592) ENSAOCG00000002094 ENSAOCG00000004551 exo1 (ENSAOCG00000004515) yipf4 (ENSAOCG00000004491) BIRC6 (ENSAOCG00000004455) ttc27 (ENSAOCG00000004346) Orange clownfish MODERN SPECIES 12 ENSAPEG00000002564 tk2 (ENSAPEG00000002582) aprt (ENSAPEG00000002623) CDT1 (ENSAPEG00000002650) PIEZO1 (ENSAPEG00000002697) tm9sf2 (ENSAPEG00000002870) ENSAPEG00000002938 pcca (ENSAPEG00000002955) ENSAPEG00000002973 vps8 (ENSAPEG00000003045) ENSAPEG00000003091 ENSAPEG00000003109 ENSAPEG00000003189 macroh2a2 (ENSAPEG00000003265) GBF1 (ENSAPEG00000003341) pitx3 (ENSAPEG00000003512) ##22 PNLIPRP2 (ENSAPEG00000003532) hspa12a (ENSAPEG00000003555) eno4 (ENSAPEG00000003625) shtn1 (ENSAPEG00000003722) atp6v1ba (ENSAPEG00000003743) vax1 (ENSAPEG00000003802) ENSAPEG00000003834 slc18a2 (ENSAPEG00000003925) PDZD8 (ENSAPEG00000003985) ENSAPEG00000004026 ENSAPEG00000004041 exo1 (ENSAPEG00000004076) yipf4 (ENSAPEG00000004236) BIRC6 (ENSAPEG00000004325) ttc27 (ENSAPEG00000004578) Spiny chromis MODERN SPECIES 189 ENSAPOG00000000786 ENSAPOG00000022039 macroh2a2 (ENSAPOG00000022008) GBF1 (ENSAPOG00000021947) pitx3 (ENSAPOG00000021757) ##22 PNLIPRP2 (ENSAPOG00000021732) hspa12a (ENSAPOG00000021698) eno4 (ENSAPOG00000000613) shtn1 (ENSAPOG00000021597) atp6v1ba (ENSAPOG00000021537) Bicolor damselfish MODERN SPECIES 283 macroh2a2 (ENSSPAG00000015993) GBF1 (ENSSPAG00000016028) pitx3 (ENSSPAG00000016160) ##22 PNLIPRP2 (ENSSPAG00000016183) hspa12a (ENSSPAG00000016216) eno4 (ENSSPAG00000016297) shtn1 (ENSSPAG00000016326) atp6v1ba (ENSSPAG00000016387) vax1 (ENSSPAG00000016445) ENSSPAG00000016464 slc18a2 (ENSSPAG00000016475) PDZD8 (ENSSPAG00000016510) ENSSPAG00000016518 ENSSPAG00000016529 exo1 (ENSSPAG00000016551) yipf4 (ENSSPAG00000016664) BIRC6 (ENSSPAG00000016696) ttc27 (ENSSPAG00000016863) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Midas cichlid MODERN SPECIES 858 GBF1 (ENSACIG00000007135) ENSACIG00000007236 ##22 ENSACIG00000007249 hspa12a (ENSACIG00000007372) Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000153566.b ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b Nile tilapia MODERN SPECIES 4 ENSONIG00000029462 ENSONIG00000036068 zswim8 (ENSONIG00000007126) ENSONIG00000030396 GBF1 (ENSONIG00000009136) macroh2a2 (ENSONIG00000009134) ENSONIG00000033885 ENSONIG00000035814 ENSONIG00000032728 LTBP1 (ENSONIG00000011223) ENSONIG00000035531 ENSONIG00000034519 ttc27 (ENSONIG00000004659) ENSONIG00000038728 ENSONIG00000037889 pitx3 (ENSONIG00000009139) ##22 ENSONIG00000036899 ENSONIG00000018544 ENSONIG00000037654 ENSONIG00000032996 ENSONIG00000018545 ENSONIG00000041190 RIN2 (ENSONIG00000038406) ENSONIG00000042161 BIRC6 (ENSONIG00000008016) ENSONIG00000036771 ENSONIG00000035181 hspa12a (ENSONIG00000009140) eno4 (ENSONIG00000009141) shtn1 (ENSONIG00000009143) atp6v1ba (ENSONIG00000009144) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000153566.b ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000153566.b ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b Haplochromini_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000153566.b ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00390000008797 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00940000155588.b Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT01030000235521.b ENSGT00940000153566.b ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00390000008797.g ENSGT00950000182909.b.b.b Zebra mbuna MODERN SPECIES 1095 ENSMZEG00005004178 elovl6l (ENSMZEG00005004171) ##24 ENSMZEG00005004164 abhd12 (ENSMZEG00005004140) gins1 (ENSMZEG00005004114) ninl (ENSMZEG00005004096) AIFM2 (ENSMZEG00005004083) entpd6 (ENSMZEG00005004067) vsx1 (ENSMZEG00005004056) ENSMZEG00005004047 acss1 (ENSMZEG00005004000) CALHM3 (ENSMZEG00005003977) ENSMZEG00005003921 macroh2a2 (ENSMZEG00005003876) GBF1 (ENSMZEG00005003745) pitx3 (ENSMZEG00005003703) ##22 smim7 (ENSMZEG00005003690) hspa12a (ENSMZEG00005003624) ENSMZEG00005003505 ANKRD1 (ENSMZEG00005003491) pcgf5a (ENSMZEG00005003485) HECTD2 (ENSMZEG00005003436) ppp1r3ca (ENSMZEG00005003419) ENSMZEG00005003415 ENSMZEG00005003151 ENSMZEG00005003113 cyp26c1 (ENSMZEG00005003086) ENSMZEG00005003040 ENSMZEG00005003025 ENSMZEG00005003016 slc22a15 (ENSMZEG00005002979) Eastern happy MODERN SPECIES 4 CDT1 (ENSACLG00000006664) aprt (ENSACLG00000006659) ENSACLG00000006658 tk2 (ENSACLG00000006650) nvl (ENSACLG00000006630) degs1 (ENSACLG00000006626) fbxo28 (ENSACLG00000006612) polr1c (ENSACLG00000006573) ENSACLG00000006569 NDST2 (ENSACLG00000006524) zswim8 (ENSACLG00000006424) CALHM3 (ENSACLG00000006418) ENSACLG00000006417 macroh2a2 (ENSACLG00000006212) GBF1 (ENSACLG00000006017) pitx3 (ENSACLG00000005981) ##22 ENSACLG00000005964 hspa12a (ENSACLG00000005915) eno4 (ENSACLG00000005900) shtn1 (ENSACLG00000005896) atp6v1ba (ENSACLG00000005481) vax1 (ENSACLG00000005465) kcnk18 (ENSACLG00000005460) slc18a2 (ENSACLG00000005409) PDZD8 (ENSACLG00000005404) ENSACLG00000005072 ENSACLG00000005035 exo1 (ENSACLG00000005020) yipf4 (ENSACLG00000005010) ENSACLG00000005002 ncapd3 (ENSACLG00000004944) P. nyererei MODERN SPECIES 492 macroh2a2 (ENSPNYG00000004133) ENSPNYG00000004112 GBF1 (ENSPNYG00000003951) pitx3 (ENSPNYG00000003909) ##22 hspa12a (ENSPNYG00000003856) eno4 (ENSPNYG00000003792) shtn1 (ENSPNYG00000003751) atp6v1ba (ENSPNYG00000003696) vax1 (ENSPNYG00000003674) ENSPNYG00000003648 kcnk18 (ENSPNYG00000003604) slc18a2 (ENSPNYG00000003555) PDZD8 (ENSPNYG00000003509) ENSPNYG00000003492 ENSPNYG00000003466 exo1 (ENSPNYG00000003414) yipf4 (ENSPNYG00000003344) ncapd3 (ENSPNYG00000002918) cdk1 (ENSPNYG00000002812) Burton s mouthbrooder MODERN SPECIES 1123 macroh2a2 (ENSHBUG00000008356) GBF1 (ENSHBUG00000008426) pitx3 (ENSHBUG00000008463) ##22 Lyretail cichlid DUPLICATION Lyretail cichlid MODERN SPECIES 866 ENSNBRG00000005387 ##22 Lyretail cichlid MODERN SPECIES 468 CALHM3 (ENSNBRG00000018477) ENSNBRG00000018492 macroh2a2 (ENSNBRG00000018499) GBF1 (ENSNBRG00000018531) pitx3 (ENSNBRG00000018586) ##22 hspa12a (ENSNBRG00000018638) eno4 (ENSNBRG00000018850) shtn1 (ENSNBRG00000018884) atp6v1ba (ENSNBRG00000018916) vax1 (ENSNBRG00000018945) slc18a2 (ENSNBRG00000018965) PDZD8 (ENSNBRG00000018994) ENSNBRG00000019022 ENSNBRG00000019028 exo1 (ENSNBRG00000019048) yipf4 (ENSNBRG00000019091) ncapd3 (ENSNBRG00000019145) cdk1 (ENSNBRG00000019289) ctu2 (ENSNBRG00000019315) RNF166 (ENSNBRG00000019353) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 67 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Oryzias ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159518.a ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000158698 ENSGT00390000009155 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00740000115593 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00940000153566.b ENSGT00940000153246.a.a.b.h ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT01070000253760.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00940000167313 ENSGT00940000165928 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000162528 ENSGT00390000004153.d ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000167270 ENSGT01070000253760.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00940000167313 ENSGT00940000165928 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000162528 ENSGT00390000004153.d ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00390000001859.f Indian medaka MODERN SPECIES 27 nkx6.2 (ENSOMEG00000001792) valopa (ENSOMEG00000001785) ENSOMEG00000001777 ENSOMEG00000001767 ENSOMEG00000001759 ENSOMEG00000001748 ENSOMEG00000001733 vox (ENSOMEG00000001730) ENSOMEG00000001729 dntt (ENSOMEG00000001723) ENSOMEG00000001709 ENSOMEG00000001703 macroh2a2 (ENSOMEG00000001698) GBF1 (ENSOMEG00000001687) GBF1 (ENSOMEG00000001669) pitx3 (ENSOMEG00000001662) ##22 hspa12a (ENSOMEG00000001644) eno4 (ENSOMEG00000001627) shtn1 (ENSOMEG00000001619) atp6v1ba (ENSOMEG00000001604) vax1 (ENSOMEG00000001595) ciao2b (ENSOMEG00000001588) ENSOMEG00000001578 ENSOMEG00000001574 ENSOMEG00000001567 ENSOMEG00000001557 ENSOMEG00000001550 ENSOMEG00000001546 ENSOMEG00000001542 TMEM41A (ENSOMEG00000001535) GPR155 (ENSOMEG00000001524) Javanese ricefish MODERN SPECIES 6 rab1ab (ENSOJAG00000007982) hells (ENSOJAG00000008349) CALHM3 (ENSOJAG00000008718) ncapd3 (ENSOJAG00000008815) stra6l (ENSOJAG00000009728) ENSOJAG00000009740 opn3 (ENSOJAG00000009755) kmo (ENSOJAG00000009801) ide (ENSOJAG00000009987) ide (ENSOJAG00000011010) ENSOJAG00000011972 ENSOJAG00000012035 ENSOJAG00000012540 macroh2a2 (ENSOJAG00000012551) GBF1 (ENSOJAG00000012579) pitx3 (ENSOJAG00000012831) ##22 hspa12a (ENSOJAG00000012888) eno4 (ENSOJAG00000013401) shtn1 (ENSOJAG00000013415) atp6v1ba (ENSOJAG00000013525) vax1 (ENSOJAG00000014413) ciao2b (ENSOJAG00000014429) ENSOJAG00000014435 ENSOJAG00000014457 ENSOJAG00000014469 ENSOJAG00000014479 ENSOJAG00000014485 ENSOJAG00000014501 ENSOJAG00000014554 ENSOJAG00000014561 TMEM41A (ENSOJAG00000014581) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159518.a ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000158698 ENSGT00390000009155 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00740000115593 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00940000153566.b ENSGT00940000153246.a.a.b.h ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT01070000253760.b.a.a.a.b.b ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00390000017697.b ENSGT00910000144296 ENSGT00940000165928 ENSGT00940000165226 ENSGT00940000162528 ENSGT00390000004153.d ENSGT00950000182919.C ENSGT00940000158988.a.b ENSGT00940000161503.b ENSGT00390000001859.f Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 6 tlx1 (ENSORLG00000000935) ENSORLG00000027360 ENSORLG00000024874 rab1ab (ENSORLG00000028104) hells (ENSORLG00000000987) CALHM3 (ENSORLG00000000995) ncapd3 (ENSORLG00000001014) ENSORLG00000025120 ENSORLG00000028371 ENSORLG00000001051 ENSORLG00000001066 ENSORLG00000027498 ENSORLG00000018201 macroh2a2 (ENSORLG00000001088) GBF1 (ENSORLG00000001139) pitx3 (ENSORLG00000027925) ##22 hspa12a (ENSORLG00000001174) eno4 (ENSORLG00000028334) shtn1 (ENSORLG00000023645) atp6v1ba (ENSORLG00000001220) vax1 (ENSORLG00000027781) ciao2b (ENSORLG00000026372) ENSORLG00000022974 cdh5 (ENSORLG00000001288) ENSORLG00000025505 tmem41ab (ENSORLG00000023287) ENSORLG00000001303 mtx2 (ENSORLG00000001332) ENSORLG00000001346 ENSORLG00000001349 ENSORLG00000001366 Chinese medaka MODERN SPECIES 800 ENSOSIG00000004281 ENSOSIG00000004330 pitx3 (ENSOSIG00000004352) ##22 hspa12a (ENSOSIG00000004356) hspa12a (ENSOSIG00000004363) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000155588.b ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Poeciliinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029.i ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000155588.b ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Poecilia ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029.i ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000155588.b ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d.a ENSGT00940000155823.B NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 159 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029.i ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000155588.b ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.a ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d.a ENSGT00940000155823.B Amazon molly MODERN SPECIES 698 hells (ENSPFOG00000001954) rab1ab (ENSPFOG00000001829) ENSPFOG00000001789 ENSPFOG00000001766 tlx1 (ENSPFOG00000001748) ENSPFOG00000001722 slc2a15a (ENSPFOG00000001511) fgf8a (ENSPFOG00000001304) fbxw4 (ENSPFOG00000001140) ENSPFOG00000001054 nt5c2a (ENSPFOG00000000907) borcs7 (ENSPFOG00000000793) cyp17a1 (ENSPFOG00000000699) GBF1 (ENSPFOG00000000359) pitx3 (ENSPFOG00000000330) ##22 hspa12a (ENSPFOG00000000277) eno4 (ENSPFOG00000000231) shtn1 (ENSPFOG00000024277) Sailfin molly MODERN SPECIES 1493 GBF1 (ENSPLAG00000023875) pitx3 (ENSPLAG00000023905) ##22 hspa12a (ENSPLAG00000002335) Guppy MODERN SPECIES 445 ncapd3 (ENSPREG00000020416) CALHM3 (ENSPREG00000020384) hells (ENSPREG00000020337) rab1ab (ENSPREG00000020321) ENSPREG00000020295 ENSPREG00000020277 tlx1 (ENSPREG00000020203) ENSPREG00000020178 slc2a15a (ENSPREG00000020156) fgf8a (ENSPREG00000020145) ENSPREG00000020136 nt5c2a (ENSPREG00000020101) borcs7 (ENSPREG00000020069) cyp17a1 (ENSPREG00000019128) GBF1 (ENSPREG00000018759) pitx3 (ENSPREG00000018702) ##22 hspa12a (ENSPREG00000018686) eno4 (ENSPREG00000018589) shtn1 (ENSPREG00000018561) atp6v1ba (ENSPREG00000018542) vax1 (ENSPREG00000018520) ENSPREG00000018490 slc18a2 (ENSPREG00000018431) PDZD8 (ENSPREG00000018413) ENSPREG00000018403 exo1 (ENSPREG00000018372) yipf4 (ENSPREG00000018363) ENSPREG00000018355 ttc27 (ENSPREG00000018264) LTBP1 (ENSPREG00000018199) rasgrp3 (ENSPREG00000018177) Platyfish MODERN SPECIES 14 hells (ENSXMAG00000005731) rab1ab (ENSXMAG00000005757) ENSXMAG00000021554 ENSXMAG00000021357 tlx1 (ENSXMAG00000005769) ENSXMAG00000020837 slc2a15a (ENSXMAG00000003577) fgf8a (ENSXMAG00000025032) fbxw4 (ENSXMAG00000027566) ENSXMAG00000005779 nt5c2a (ENSXMAG00000005784) borcs7 (ENSXMAG00000025827) cyp17a1 (ENSXMAG00000005813) ENSXMAG00000005854 GBF1 (ENSXMAG00000005864) pitx3 (ENSXMAG00000005921) ##22 hspa12a (ENSXMAG00000005923) eno4 (ENSXMAG00000000773) shtn1 (ENSXMAG00000000782) atp6v1ba (ENSXMAG00000003759) vax1 (ENSXMAG00000025346) ENSXMAG00000003754 slc18a2 (ENSXMAG00000003738) PDZD8 (ENSXMAG00000010508) ENSXMAG00000025067 ENSXMAG00000021291 exo1 (ENSXMAG00000010514) yipf4 (ENSXMAG00000010517) BIRC6 (ENSXMAG00000010525) ttc27 (ENSXMAG00000010575) LTBP1 (ENSXMAG00000026539) NAME_4 ANCESTRAL SPECIES 599 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 Mummichog MODERN SPECIES 48 pitx3 (ENSFHEG00000019114) ##22 Sheepshead minnow MODERN SPECIES 937 gfra1b (ENSCVAG00000010151) ENSCVAG00000010158 ENSCVAG00000010170 pitx3 (ENSCVAG00000010178) ##22 Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 75 ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000158698 ENSGT00390000009155 ENSGT00810000125473.A ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00740000115593 ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT00940000153566.b ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b.i ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00940000170261 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Mangrove rivulus MODERN SPECIES 60 ENSKMAG00000017448 tlx1 (ENSKMAG00000017438) ENSKMAG00000017422 ENSKMAG00000017386 rab1ab (ENSKMAG00000017357) hells (ENSKMAG00000017279) CALHM3 (ENSKMAG00000017261) calhm2.1 (ENSKMAG00000017248) ncapd3 (ENSKMAG00000017218) ENSKMAG00000017194 ENSKMAG00000017167 ENSKMAG00000017115 ENSKMAG00000016977 macroh2a2 (ENSKMAG00000016927) GBF1 (ENSKMAG00000016781) pitx3 (ENSKMAG00000016734) ##22 PNLIPRP2 (ENSKMAG00000016665) hspa12a (ENSKMAG00000016576) eno4 (ENSKMAG00000016525) shtn1 (ENSKMAG00000016499) atp6v1ba (ENSKMAG00000016461) vax1 (ENSKMAG00000016441) ENSKMAG00000016428 slc18a2 (ENSKMAG00000016396) PDZD8 (ENSKMAG00000016378) ENSKMAG00000016367 ENSKMAG00000016333 ENSKMAG00000016298 ENSKMAG00000016270 Turquoise killifish MODERN SPECIES 1612 rab1ab (ENSNFUG00015001545) ENSNFUG00015001550 ENSNFUG00015001556 tlx1 (ENSNFUG00015001561) ENSNFUG00015001570 slc2a15a (ENSNFUG00015001603) FGF8A (ENSNFUG00015001647) FBXW4 (ENSNFUG00015001665) WBP1LA (ENSNFUG00015001688) ENSNFUG00015001749 ENSNFUG00015001783 ENSNFUG00015001809 ENSNFUG00015001812 macroh2a2 (ENSNFUG00015001818) GBF1 (ENSNFUG00015001830) pitx3 (ENSNFUG00015001868) ##22 ENSNFUG00015001888 kcnk18 (ENSNFUG00015001909) SLC18A2 (ENSNFUG00015001958) PDZD8 (ENSNFUG00015002034) ENSNFUG00015002040 EDARADD (ENSNFUG00015002047) exo1 (ENSNFUG00015002054) ENSNFUG00015002069 YIPF4 (ENSNFUG00015002074) BIRC6 (ENSNFUG00015002101) ttc27 (ENSNFUG00015002298) LTBP1 (ENSNFUG00015002465) ENSNFUG00015002479 ENSNFUG00015002481 ENSNFUG00015002482 Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Percomorphaceae_D ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00570000079239 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00390000010672 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Anabantaria ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Climbing perch MODERN SPECIES 6 ENSATEG00000003618 aprt (ENSATEG00000003661) ENSATEG00000003686 PIEZO1 (ENSATEG00000003732) ENSATEG00000003926 ENSATEG00000003996 ENSATEG00000026832 ENSATEG00000028298 ENSATEG00000004080 ENSATEG00000004229 ENSATEG00000004256 ENSATEG00000004273 ENSATEG00000004364 macroh2a2 (ENSATEG00000004389) ENSATEG00000004428 pitx3 (ENSATEG00000004628) ##22 PNLIPRP2 (ENSATEG00000004645) hspa12a (ENSATEG00000004846) eno4 (ENSATEG00000004931) shtn1 (ENSATEG00000005018) atp6v1ba (ENSATEG00000005059) vax1 (ENSATEG00000005127) kcnk18 (ENSATEG00000027518) SLC18A2 (ENSATEG00000005173) PDZD8 (ENSATEG00000027211) ENSATEG00000005264 exo1 (ENSATEG00000005276) yipf4 (ENSATEG00000005311) BIRC6 (ENSATEG00000005336) ttc27 (ENSATEG00000005604) LTBP1 (ENSATEG00000005702) Siamese fighting fish MODERN SPECIES 6 ENSBSLG00000012078 ENSBSLG00000011720 ENSBSLG00000010760 ENSBSLG00000024464 ttc27 (ENSBSLG00000024294) yipf4 (ENSBSLG00000024277) exo1 (ENSBSLG00000024250) ENSBSLG00000024245 ENSBSLG00000024243 ENSBSLG00000024241 ENSBSLG00000024235 ENSBSLG00000024151 macroh2a2 (ENSBSLG00000024140) ENSBSLG00000024134 GBF1 (ENSBSLG00000023945) pitx3 (ENSBSLG00000023836) ##22 ENSBSLG00000023769 hspa12a (ENSBSLG00000023629) ENSBSLG00000023604 ENSBSLG00000023517 ENSBSLG00000023487 ENSBSLG00000023452 vax1 (ENSBSLG00000023400) NDST2 (ENSBSLG00000023311) zswim8 (ENSBSLG00000021426) chchd1 (ENSBSLG00000020206) ENSBSLG00000020204 ENSBSLG00000020188 galm (ENSBSLG00000020179) ENSBSLG00000020176 HNRNPLL (ENSBSLG00000019836) Zig-zag eel MODERN SPECIES 6 fbxo28 (ENSMAMG00000024850) ENSMAMG00000008700 ENSMAMG00000008673 ENSMAMG00000008615 zswim8 (ENSMAMG00000008438) ENSMAMG00000008421 chchd1 (ENSMAMG00000008418) ENSMAMG00000024883 ENSMAMG00000024731 ENSMAMG00000024620 ENSMAMG00000008320 ENSMAMG00000008296 ENSMAMG00000008227 macroh2a2 (ENSMAMG00000026624) ENSMAMG00000008002 pitx3 (ENSMAMG00000007953) ##22 PNLIPRP2 (ENSMAMG00000007932) hspa12a (ENSMAMG00000007877) eno4 (ENSMAMG00000007845) shtn1 (ENSMAMG00000007810) atp6v1ba (ENSMAMG00000007769) vax1 (ENSMAMG00000007747) ENSMAMG00000007714 ENSMAMG00000024700 ENSMAMG00000007655 ENSMAMG00000007547 yipf4 (ENSMAMG00000026886) BIRC6 (ENSMAMG00000007373) ttc27 (ENSMAMG00000007326) LTBP1 (ENSMAMG00000007270) ENSMAMG00000027488 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000170402 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 ENSGT00530000063956.b.b ENSGT00940000158005 ENSGT00390000017259 ENSGT00390000012337 ENSGT00940000157348 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Seriola ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000157563 ENSGT00940000156083 ENSGT00940000154200.A.b ENSGT00390000010672 ENSGT00940000164286.j.b.b ENSGT00940000170402 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3195 ttyh3b (ENSSLDG00000016344) ENSSLDG00000016376 ENSSLDG00000016429 mad1l1 (ENSSLDG00000016440) ELFN1 (ENSSLDG00000016471) ENSSLDG00000016483 tm9sf2 (ENSSLDG00000016503) pcca (ENSSLDG00000016568) ENSSLDG00000016657 vps8 (ENSSLDG00000016762) ENSSLDG00000017298 ENSSLDG00000017314 ENSSLDG00000017333 macroh2a2 (ENSSLDG00000017346) GBF1 (ENSSLDG00000017384) pitx3 (ENSSLDG00000017463) ##22 PNLIPRP2 (ENSSLDG00000017476) hspa12a (ENSSLDG00000017504) eno4 (ENSSLDG00000017570) shtn1 (ENSSLDG00000017599) atp6v1ba (ENSSLDG00000017647) vax1 (ENSSLDG00000017988) kcnk18 (ENSSLDG00000018002) slc18a2 (ENSSLDG00000018015) PDZD8 (ENSSLDG00000018047) ENSSLDG00000018076 ENSSLDG00000018088 exo1 (ENSSLDG00000018097) yipf4 (ENSSLDG00000018120) BIRC6 (ENSSLDG00000018161) ENSSLDG00000018367 Greater amberjack MODERN SPECIES 174 tm9sf2 (ENSSDUG00000021270) pcca (ENSSDUG00000021326) ENSSDUG00000021386 vps8 (ENSSDUG00000021424) ENSSDUG00000021659 ENSSDUG00000021665 ENSSDUG00000021671 ENSSDUG00000021679 macroh2a2 (ENSSDUG00000021693) GBF1 (ENSSDUG00000021709) pitx3 (ENSSDUG00000021736) ##22 PNLIPRP2 (ENSSDUG00000021751) ENSSDUG00000021759 hspa12a (ENSSDUG00000021769) ENSSDUG00000021791 ENSSDUG00000021800 eno4 (ENSSDUG00000021802) shtn1 (ENSSDUG00000021818) atp6v1ba (ENSSDUG00000021875) vax1 (ENSSDUG00000021885) kcnk18 (ENSSDUG00000021888) slc18a2 (ENSSDUG00000021891) PDZD8 (ENSSDUG00000021903) ENSSDUG00000021914 ENSSDUG00000021917 ENSSDUG00000021922 Barramundi perch DUPLICATION Barramundi perch MODERN SPECIES 561 zgc:175280 (ENSLCAG00010023098) macroh2a2 (ENSLCAG00010023103) GBF1 (ENSLCAG00010023120) pitx3 (ENSLCAG00010023138) ##22 ENSLCAG00010023142 Barramundi perch MODERN SPECIES 972 ENSLCAG00010004015 ##22 ENSLCAG00010004000 Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000157081 ENSGT00940000155884.a.c ENSGT00940000159583 ENSGT00390000018730.B ENSGT00950000183045.A.a.a ENSGT00940000155134.y ENSGT00940000156983.a.b ENSGT00910000147025 ENSGT00390000005537 ENSGT00940000158042 ENSGT00940000157361.b ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Turbot MODERN SPECIES 6 ENSSMAG00000015890 ENSSMAG00000030212 smap1 (ENSSMAG00000015928) b3gat2 (ENSSMAG00000022064) OGFRL1 (ENSSMAG00000015991) asrgl1 (ENSSMAG00000016011) RIMS1 (ENSSMAG00000016024) ENSSMAG00000016172 ENSSMAG00000036317 FANCL (ENSSMAG00000016189) ENSSMAG00000016222 CCDC85A (ENSSMAG00000031644) ENSSMAG00000016337 macroh2a2 (ENSSMAG00000016405) ENSSMAG00000016437 pitx3 (ENSSMAG00000016531) ##22 PNLIPRP2 (ENSSMAG00000016552) hspa12a (ENSSMAG00000016608) eno4 (ENSSMAG00000016658) shtn1 (ENSSMAG00000016666) atp6v1ba (ENSSMAG00000016694) vax1 (ENSSMAG00000027859) kcnk18 (ENSSMAG00000036387) SLC18A2 (ENSSMAG00000016741) PDZD8 (ENSSMAG00000016796) ENSSMAG00000016824 exo1 (ENSSMAG00000016851) yipf4 (ENSSMAG00000016884) ttc27 (ENSSMAG00000017147) LTBP1 (ENSSMAG00000017223) rasgrp3 (ENSSMAG00000017382) Tongue sole MODERN SPECIES 3 sertad2b (ENSCSEG00000000893) pcgf6 (ENSCSEG00000000895) ENSCSEG00000000901 vdac2 (ENSCSEG00000000908) comtd1 (ENSCSEG00000000915) ENSCSEG00000000924 polh (ENSCSEG00000000930) GTPBP2 (ENSCSEG00000000936) EHBP1 (ENSCSEG00000000951) otx1 (ENSCSEG00000000992) WDPCP (ENSCSEG00000001003) MDH1 (ENSCSEG00000001022) ugp2b (ENSCSEG00000001237) CCDC88A (ENSCSEG00000001262) GBF1 (ENSCSEG00000001430) ENSCSEG00000001453 ##22 macroh2a2 (ENSCSEG00000001483) ENSCSEG00000001495 ENSCSEG00000001568 ENSCSEG00000001580 lhb (ENSCSEG00000001582) rtn4a (ENSCSEG00000001594) ENSCSEG00000001598 rps27a (ENSCSEG00000001603) bmpr1aa (ENSCSEG00000001608) ldb3a (ENSCSEG00000001614) ENSCSEG00000001621 tspan14 (ENSCSEG00000001627) perp (ENSCSEG00000001633) TNFAIP3 (ENSCSEG00000001638) HNRNPLL (ENSCSEG00000001646) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154518.b ##22 Tetraodon MODERN SPECIES 26 fgb (ENSTNIG00000003110) ENSTNIG00000003111 CNGA1 (ENSTNIG00000003112) ENSTNIG00000000336 CORIN (ENSTNIG00000003113) ENSTNIG00000003114 ENSTNIG00000003115 RHPN1 (ENSTNIG00000003121) ENSTNIG00000003122 nppal (ENSTNIG00000003836) PPP6C (ENSTNIG00000003137) SCAI (ENSTNIG00000003138) sptan1 (ENSTNIG00000003139) dync2i2 (ENSTNIG00000003140) setb (ENSTNIG00000003141) pitx3 (ENSTNIG00000003142) ##22 cope (ENSTNIG00000003143) ENSTNIG00000003146 nlgn4xa (ENSTNIG00000003159) gtf2h4 (ENSTNIG00000000314) gtf2h4 (ENSTNIG00000003170) ENSTNIG00000003171 STX12 (ENSTNIG00000003172) BTBD3 (ENSTNIG00000003173) ssr1 (ENSTNIG00000003174) NEBL (ENSTNIG00000003175) cdk1 (ENSTNIG00000003176) HNRNPLL (ENSTNIG00000003177) pick1 (ENSTNIG00000003178) plbd1a (ENSTNIG00000003179) ENSTNIG00000003180 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Ballan wrasse MODERN SPECIES 18 acss1 (ENSLBEG00000028252) ENSLBEG00000028243 apmap (ENSLBEG00000028238) CST7 (ENSLBEG00000028232) ENSLBEG00000028229 SYNDIG1 (ENSLBEG00000028204) CUL7 (ENSLBEG00000028182) ENSLBEG00000028162 ENSLBEG00000028150 ppp2r5d (ENSLBEG00000028133) mea1 (ENSLBEG00000028116) ENSLBEG00000028111 ENSLBEG00000028084 macroh2a2 (ENSLBEG00000028058) GBF1 (ENSLBEG00000028029) pitx3 (ENSLBEG00000028018) ##22 PNLIPRP2 (ENSLBEG00000028003) hspa12a (ENSLBEG00000027962) shtn1 (ENSLBEG00000027938) atp6v1ba (ENSLBEG00000027920) vax1 (ENSLBEG00000027910) ENSLBEG00000027906 ENSLBEG00000027902 slc18a2 (ENSLBEG00000027865) PDZD8 (ENSLBEG00000027834) hells (ENSLBEG00000027807) rab1ab (ENSLBEG00000027781) cep68 (ENSLBEG00000027768) ENSLBEG00000027757 tlx1 (ENSLBEG00000027749) Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B European seabass MODERN SPECIES 1 slc2a15a (ENSDLAG00005005837) fgf8a (ENSDLAG00005005948) fbxw4 (ENSDLAG00005034129) nt5c2a (ENSDLAG00005006205) ENSDLAG00005007486 cyp17a1 (ENSDLAG00005007508) ENSDLAG00005007814 ENSDLAG00005034886 ENSDLAG00005034809 ENSDLAG00005026678 ENSDLAG00005007835 ENSDLAG00005028275 ENSDLAG00005031885 macroh2a2 (ENSDLAG00005007863) ENSDLAG00005007951 pitx3 (ENSDLAG00005031960) ##22 PNLIPRP2 (ENSDLAG00005010610) hspa12a (ENSDLAG00005010828) eno4 (ENSDLAG00005029158) shtn1 (ENSDLAG00005028218) atp6v1ba (ENSDLAG00005011103) vax1 (ENSDLAG00005026925) ENSDLAG00005034934 ENSDLAG00005011244 kcnk18 (ENSDLAG00005011279) ENSDLAG00005029778 slc18a2 (ENSDLAG00005011313) PDZD8 (ENSDLAG00005034084) exo1 (ENSDLAG00005011654) yipf4 (ENSDLAG00005011695) BIRC6 (ENSDLAG00005011719) Large yellow croaker MODERN SPECIES 47 ENSLCRG00005016946 ENSLCRG00005016947 macroh2a2 (ENSLCRG00005016948) GBF1 (ENSLCRG00005016963) pitx3 (ENSLCRG00005017015) ##22 ENSLCRG00005017020 Gilthead seabream MODERN SPECIES 6 ENSSAUG00010005730 ENSSAUG00010005732 ENSSAUG00010005752 ENSSAUG00010006169 macroh2a2 (ENSSAUG00010006235) GBF1 (ENSSAUG00010006241) pitx3 (ENSSAUG00010006247) ##22 PNLIPRP2 (ENSSAUG00010006256) ENSSAUG00010006495 hspa12a (ENSSAUG00010006500) eno4 (ENSSAUG00010007495) ENSSAUG00010007501 ENSSAUG00010007503 ENSSAUG00010007514 ENSSAUG00010007976 vax1 (ENSSAUG00010007979) ENSSAUG00010007980 ENSSAUG00010007982 kcnk18 (ENSSAUG00010007983) slc18a2 (ENSSAUG00010007986) PDZD8 (ENSSAUG00010007992) yipf4 (ENSSAUG00010007994) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00390000008797 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.e ENSGT00510000047589 ENSGT00390000014293.b ENSGT00390000007683 ENSGT00940000164412.a.a.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00570000079168.b.b.a ENSGT00950000183100.B ENSGT00390000002970 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT00700000104522 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d ENSGT00940000155823.B ENSGT00940000158843 Channel bull blenny MODERN SPECIES 6 ENSCGOG00000012952 cyp17a1 (ENSCGOG00000013001) borcs7 (ENSCGOG00000013875) nt5c2a (ENSCGOG00000013879) cdk1 (ENSCGOG00000014119) ENSCGOG00000014412 chchd1 (ENSCGOG00000014426) ENSCGOG00000014432 ENSCGOG00000014448 polr1c (ENSCGOG00000014458) fbxo28 (ENSCGOG00000014578) ENSCGOG00000014588 ENSCGOG00000014709 macroh2a2 (ENSCGOG00000014711) GBF1 (ENSCGOG00000014760) pitx3 (ENSCGOG00000016802) ##22 ENSCGOG00000016806 PNLIPRP2 (ENSCGOG00000016809) hspa12a (ENSCGOG00000016831) eno4 (ENSCGOG00000017132) shtn1 (ENSCGOG00000017143) atp6v1ba (ENSCGOG00000017175) vax1 (ENSCGOG00000017564) ENSCGOG00000017568 exo1 (ENSCGOG00000017571) yipf4 (ENSCGOG00000017597) BIRC6 (ENSCGOG00000004095) ttc27 (ENSCGOG00000004589) ENSCGOG00000005307 LTBP1 (ENSCGOG00000005321) ENSCGOG00000005465 Pike perch MODERN SPECIES 159 ENSSLUG00000019015 NDST2 (ENSSLUG00000019055) ENSSLUG00000020227 polr1c (ENSSLUG00000020236) fbxo28 (ENSSLUG00000020256) ENSSLUG00000020257 ENSSLUG00000020260 ENSSLUG00000020271 ENSSLUG00000020273 ENSSLUG00000020277 ENSSLUG00000020285 ENSSLUG00000020287 macroh2a2 (ENSSLUG00000020292) GBF1 (ENSSLUG00000020311) pitx3 (ENSSLUG00000020345) ##22 PNLIPRP2 (ENSSLUG00000020360) hspa12a (ENSSLUG00000020454) eno4 (ENSSLUG00000020473) shtn1 (ENSSLUG00000020484) atp6v1ba (ENSSLUG00000020585) vax1 (ENSSLUG00000020864) kcnk18 (ENSSLUG00000020871) ENSSLUG00000020875 slc18a2 (ENSSLUG00000020881) zgc:113176 (ENSSLUG00000020909) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 ENSGT01030000234606.a.a.a.b ENSGT00700000104522 ENSGT00940000157593 ENSGT00390000017746 ENSGT00940000165200 ENSGT00510000047676 ENSGT00940000153168.B ENSGT00940000156126 ENSGT00500000044929.d Stickleback MODERN SPECIES 537 ENSGACG00000014588 ENSGACG00000014589 ENSGACG00000014593 ENSGACG00000014594 macroh2a2 (ENSGACG00000014597) GBF1 (ENSGACG00000014607) pitx3 (ENSGACG00000014620) ##22 hspa12a (ENSGACG00000014625) eno4 (ENSGACG00000014633) atp6v1ba (ENSGACG00000014640) vax1 (ENSGACG00000014648) kcnk18 (ENSGACG00000014652) Lumpfish MODERN SPECIES 6 ENSCLMG00005015911 ENSCLMG00005015910 ENSCLMG00005015909 ENSCLMG00005015908 chchd1 (ENSCLMG00005015907) ENSCLMG00005015906 zswim8 (ENSCLMG00005007548) NDST2 (ENSCLMG00005005506) ENSCLMG00005005496 polr1c (ENSCLMG00005005493) fbxo28 (ENSCLMG00005005490) ENSCLMG00005005489 ENSCLMG00005005488 macroh2a2 (ENSCLMG00005005469) GBF1 (ENSCLMG00005005452) pitx3 (ENSCLMG00005005448) ##22 PNLIPRP2 (ENSCLMG00005005300) hspa12a (ENSCLMG00005004843) ENSCLMG00005004837 eno4 (ENSCLMG00005004833) shtn1 (ENSCLMG00005004825) atp6v1ba (ENSCLMG00005004516) vax1 (ENSCLMG00005004434) ENSCLMG00005004371 ENSCLMG00005021382 ENSCLMG00005021381 kcnk18 (ENSCLMG00005021380) slc18a2 (ENSCLMG00005021379) PDZD8 (ENSCLMG00005021378) ENSCLMG00005021377 exo1 (ENSCLMG00005021376) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 296 ENSGT00940000156883 ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT01030000235294 ENSGT01050000244965.a.b ##24 ENSGT00390000004582 ENSGT00660000095541.a.a ENSGT00390000013968 ENSGT00940000166409 ENSGT00950000183148.b.b ENSGT00390000018613.a ENSGT01100000263540.A.a ENSGT00940000160793 ENSGT00940000158550 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 344 ENSGT00940000156883 ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a ENSGT00740000115593 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00940000154551.b ENSGT00950000182805.a.b ENSGT00510000048167.a ENSGT00940000155068.a.b ENSGT00940000161152 Denticle herring MODERN SPECIES 18 papss2a (ENSDCDG00000029691) minpp1a (ENSDCDG00000029678) sgms1a (ENSDCDG00000029675) CHST15 (ENSDCDG00000029674) GPR26 (ENSDCDG00000029673) ENSDCDG00000029671 DAGLB (ENSDCDG00000029649) SPAG9 (ENSDCDG00000029319) DHX57 (ENSDCDG00000029279) galm (ENSDCDG00000029275) atl2 (ENSDCDG00000029106) ENSDCDG00000028917 ENSDCDG00000028900 macroh2a2 (ENSDCDG00000028894) GBF1 (ENSDCDG00000025174) pitx3 (ENSDCDG00000025042) ##22 PNLIPRP2 (ENSDCDG00000024970) hspa12a (ENSDCDG00000024026) eno4 (ENSDCDG00000024011) shtn1 (ENSDCDG00000024009) atp6v1ba (ENSDCDG00000021445) vax1 (ENSDCDG00000021379) hells (ENSDCDG00000020562) ENSDCDG00000020528 itgb3b (ENSDCDG00000016909) mettl9 (ENSDCDG00000016807) ENSDCDG00000016803 fam135a (ENSDCDG00000016781) ENSDCDG00000016765 ENSDCDG00000016753 ppp2r5d (ENSDCDG00000014346) Atlantic herring MODERN SPECIES 4 lrrfip2 (ENSCHAG00000008980) ATE1 (ENSCHAG00000008664) fgfr2 (ENSCHAG00000001587) ENSCHAG00000024901 ENSCHAG00000024894 ENSCHAG00000024889 NEU3 (ENSCHAG00000024887) DHX57 (ENSCHAG00000024807) galm (ENSCHAG00000024799) atl2 (ENSCHAG00000024497) hells (ENSCHAG00000024099) ENSCHAG00000024065 macroh2a2 (ENSCHAG00000024058) ENSCHAG00000024052 GBF1 (ENSCHAG00000023858) pitx3 (ENSCHAG00000023844) ##22 PNLIPRP2 (ENSCHAG00000023673) hspa12a (ENSCHAG00000023660) ENSCHAG00000023653 eno4 (ENSCHAG00000023646) shtn1 (ENSCHAG00000023623) atp6v1ba (ENSCHAG00000023063) vax1 (ENSCHAG00000023047) ENSCHAG00000023031 ENSCHAG00000023025 ENSCHAG00000023008 kmo (ENSCHAG00000022962) opn3 (ENSCHAG00000022951) cdc42ep3 (ENSCHAG00000022942) ENSCHAG00000022906 SRF (ENSCHAG00000022892) Otophysi ANCESTRAL SPECIES 313 ENSGT00940000156883 ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00390000004582 ENSGT00660000095541.a.a ENSGT00390000013968 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000155309.o ENSGT00940000154445.a ENSGT00940000156883 ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00390000013968 ENSGT00660000095541.a.a ENSGT00390000004582 ENSGT00940000160366 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000168728 ENSGT00940000164834.a ENSGT01030000234613.b.a.b.h ENSGT01030000234613.b.a.b.g ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a ENSGT00390000016478.c.b ENSGT00940000154862.x.b ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a ENSGT00940000154239.a Channel catfish MODERN SPECIES 22 pcdh15a (ENSIPUG00000001088) ENSIPUG00000002311 ckba (ENSIPUG00000002321) ENSIPUG00000002368 ENSIPUG00000002379 Cisd1 (ENSIPUG00000002387) DHX57 (ENSIPUG00000002412) galm (ENSIPUG00000002550) atl2 (ENSIPUG00000002603) ENSIPUG00000002624 HELLS (ENSIPUG00000002634) ENSIPUG00000002680 ENSIPUG00000002709 H2afy2 (ENSIPUG00000002757) gbf1 (ENSIPUG00000002803) pitx3 (ENSIPUG00000002981) ##22 PNLIPRP2 (ENSIPUG00000002993) gins1 (ENSIPUG00000003089) ninl (ENSIPUG00000003152) AIFM2 (ENSIPUG00000003201) ENSIPUG00000003245 ENSIPUG00000003257 exoc3l4 (ENSIPUG00000003285) ENSIPUG00000003305 eif5 (ENSIPUG00000003331) mark3 (ENSIPUG00000003398) ckba (ENSIPUG00000003503) trmt61a (ENSIPUG00000003613) bag5 (ENSIPUG00000003641) apopt1 (ENSIPUG00000003665) klc1 (ENSIPUG00000003683) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000155309.o ENSGT00940000154445.a ENSGT00940000156883 ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00390000013968 ENSGT00660000095541.a.a ENSGT00390000004582 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000168728 ENSGT00940000164834.a ENSGT01030000234613.b.a.b.h ENSGT01030000234613.b.a.b.g ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a ENSGT00390000016478.c.b ENSGT00940000154862.x.b ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a ENSGT00940000154239.a ENSGT00940000158888 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154704.d.b ENSGT00940000165723.b ENSGT00940000156675.c ENSGT00940000155309.o ENSGT00940000154445.a ENSGT00940000156883 ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000155139 ENSGT00390000013968 ENSGT00660000095541.a.a ENSGT00390000004582 ENSGT00940000160366 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000156837 ENSGT00940000164834.a ENSGT01030000234613.b.a.b.h ENSGT01030000234613.b.a.b.g ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a ENSGT00390000016478.c.b ENSGT00940000154862.x.b ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a ENSGT00940000154239.a Mexicana tetra MODERN SPECIES 17 ENSAMXG00000043287 ENSAMXG00000037132 ENSAMXG00000035834 ENSAMXG00000002153 cisd1 (ENSAMXG00000029084) DHX57 (ENSAMXG00000002141) galm (ENSAMXG00000002135) atl2 (ENSAMXG00000002117) ENSAMXG00000002107 hells (ENSAMXG00000002088) ENSAMXG00000042009 ENSAMXG00000040001 ENSAMXG00000002073 macroh2a2 (ENSAMXG00000002015) GBF1 (ENSAMXG00000002009) pitx3 (ENSAMXG00000029072) ##22 PNLIPRP2 (ENSAMXG00000002005) gins1 (ENSAMXG00000041281) ninl (ENSAMXG00000001987) AIFM2 (ENSAMXG00000001966) ENSAMXG00000034311 ENSAMXG00000029877 ENSAMXG00000035908 ENSAMXG00000038628 ENSAMXG00000033759 exoc3l4 (ENSAMXG00000001925) ENSAMXG00000001905 EIF5 (ENSAMXG00000001895) mark3a (ENSAMXG00000001870) ckba (ENSAMXG00000001864) trmt61a (ENSAMXG00000037952) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 10 nkx1.2la (ENSPNAG00000030090) prkg1a (ENSPNAG00000030089) dkk1a (ENSPNAG00000030084) pcdh15a (ENSPNAG00000030069) ENSPNAG00000030016 cisd1 (ENSPNAG00000030012) DHX57 (ENSPNAG00000030009) galm (ENSPNAG00000030001) atl2 (ENSPNAG00000029989) ENSPNAG00000029973 hells (ENSPNAG00000029968) ENSPNAG00000006895 ENSPNAG00000029953 macroh2a2 (ENSPNAG00000029946) GBF1 (ENSPNAG00000029938) pitx3 (ENSPNAG00000029928) ##22 PNLIPRP2 (ENSPNAG00000029920) gins1 (ENSPNAG00000029876) ninl (ENSPNAG00000029902) AIFM2 (ENSPNAG00000029863) ENSPNAG00000029857 ENSPNAG00000004680 ENSPNAG00000029833 ENSPNAG00000029830 ENSPNAG00000029823 ENSPNAG00000029810 ENSPNAG00000029805 exoc3l4 (ENSPNAG00000004678) ENSPNAG00000029768 EIF5 (ENSPNAG00000029712) mark3a (ENSPNAG00000029687) Electric eel MODERN SPECIES 1 st3gal7 (ENSEEEG00000003373) morn4 (ENSEEEG00000003374) nkx1.2la (ENSEEEG00000003375) prkg1a (ENSEEEG00000003379) dkk1a (ENSEEEG00000003389) pcdh15a (ENSEEEG00000003396) ENSEEEG00000003400 cisd1 (ENSEEEG00000003401) DHX57 (ENSEEEG00000003403) galm (ENSEEEG00000003433) atl2 (ENSEEEG00000003481) hells (ENSEEEG00000004554) ENSEEEG00000004611 macroh2a2 (ENSEEEG00000004618) ENSEEEG00000004622 pitx3 (ENSEEEG00000004623) ##22 PNLIPRP2 (ENSEEEG00000004628) gins1 (ENSEEEG00000004750) ninl (ENSEEEG00000004759) AIFM2 (ENSEEEG00000004763) ENSEEEG00000004768 ENSEEEG00000004773 ENSEEEG00000004775 EIF5 (ENSEEEG00000004780) mark3a (ENSEEEG00000004785) ckba (ENSEEEG00000004850) ENSEEEG00000004949 trmt61a (ENSEEEG00000004950) bag5 (ENSEEEG00000004951) coa8 (ENSEEEG00000004958) klc1a (ENSEEEG00000004989) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154141.B ENSGT00940000165391 ENSGT00940000164285.a.f ENSGT00940000154711.a.a ENSGT00940000155930.g.a ENSGT00940000156883 ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593 ENSGT00530000068411 ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865 ENSGT00940000158120 ENSGT00940000156925.v ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00390000013968.c ENSGT00660000095541.a.a ENSGT00390000004582 ENSGT00940000160366 ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000164834.a ENSGT01030000234613.b.a.b.h ENSGT01030000234613.b.a.b.g ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a ENSGT00390000016478.c.b ENSGT00940000154862.x.b ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a ENSGT01030000234848 ENSGT00940000154239.a ENSGT00940000158888 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 802 ENSGT00940000155930.g.a.a ENSGT00940000156883.g ENSGT00940000155710.a.k ENSGT00740000115593.b ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865.kc.a ENSGT00940000158120.h ENSGT00940000156925.v.b ENSGT00940000154518.b.i ##22 Goldfish MODERN SPECIES 4 ENSCARG00000063676 rgs17 (ENSCARG00000063664) ENSCARG00000063550 il22ra2 (ENSCARG00000063530) rab1ab (ENSCARG00000063350) tbp (ENSCARG00000063161) rhoua (ENSCARG00000063145) rab4a (ENSCARG00000063134) epas1b (ENSCARG00000062718) DHX57 (ENSCARG00000062466) atl2 (ENSCARG00000056846) hells (ENSCARG00000056179) ENSCARG00000055916 macroh2a2 (ENSCARG00000055870) GBF1 (ENSCARG00000055550) pitx3 (ENSCARG00000055479) ##22 ENSCARG00000055448 ENSCARG00000055436 exoc3l4 (ENSCARG00000055416) ENSCARG00000055390 EIF5 (ENSCARG00000055286) mark3a (ENSCARG00000054962) ENSCARG00000054937 ckba (ENSCARG00000054814) trmt61a (ENSCARG00000054803) bag5 (ENSCARG00000054747) coa8 (ENSCARG00000054688) klc1a (ENSCARG00000054267) ttl (ENSCARG00000054215) fignl1 (ENSCARG00000054206) ikzf1 (ENSCARG00000053923) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 216 ENSGT00950000182980.a.b.b.b.gc.a ENSGT00940000167263 ENSGT00940000158638.k ENSGT00940000154141.B.db ENSGT00940000165391.a ENSGT00940000164285.a.f.b ENSGT00940000154711.a.a.c ENSGT00940000155930.g.a.a ENSGT00940000156883.g ENSGT00940000155710.a.k ENSGT00740000115593.b ENSGT00940000167270 ENSGT00940000154865.kc.a ENSGT00940000158120.h ENSGT00940000156925.v.b ENSGT00940000154518.b.i ##22 ENSGT01030000234613.b.a.b.g.b ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a.a ENSGT00390000016478.c.b ENSGT00940000154862.x.b.l Common carp reference MODERN SPECIES 18 calm2a (ENSCCRG00000077289) si:ch211-93n23.7 (ENSCCRG00000027992) TTC7A (ENSCCRG00000027985) mcfd2 (ENSCCRG00000063255) ENSCCRG00000082634 socs5b (ENSCCRG00000067878) ENSCCRG00000075770 epas1b (ENSCCRG00000024181) ENSCCRG00000024186 atl2 (ENSCCRG00000060545) hells (ENSCCRG00000027223) ENSCCRG00000056281 ENSCCRG00000073729 macroh2a2 (ENSCCRG00000018156) ENSCCRG00000038554 pitx3 (ENSCCRG00000038544) ##22 ENSCCRG00000078542 ENSCCRG00000041921 ENSCCRG00000018934 ENSCCRG00000018498 EIF5 (ENSCCRG00000018349) mark3a (ENSCCRG00000074047) ckba (ENSCCRG00000018553) trmt61a (ENSCCRG00000055745) bag5 (ENSCCRG00000031680) coa8 (ENSCCRG00000020794) klc1a (ENSCCRG00000061513) ttl (ENSCCRG00000023529) fignl1 (ENSCCRG00000063996) ikzf1 (ENSCCRG00000080442) ENSCCRG00000054106 Golden-line barbel MODERN SPECIES 116 ENSSGRG00000024169 epas1b (ENSSGRG00000023515) galm (ENSSGRG00000023513) DHX57 (ENSSGRG00000023512) atl2 (ENSSGRG00000023176) hells (ENSSGRG00000022846) ENSSGRG00000022842 macroh2a2 (ENSSGRG00000022749) GBF1 (ENSSGRG00000022584) pitx3 (ENSSGRG00000022571) ##22 gins1 (ENSSGRG00000022567) ninl (ENSSGRG00000022553) ENSSGRG00000022547 ENSSGRG00000022546 ENSSGRG00000022544 ENSSGRG00000022543 ENSSGRG00000022540 ENSSGRG00000022536 ENSSGRG00000022422 mark3a (ENSSGRG00000020219) ENSSGRG00000020175 ckba (ENSSGRG00000020174) trmt61a (ENSSGRG00000020170) bag5 (ENSSGRG00000020163) coa8 (ENSSGRG00000020162) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000158638.l ENSGT00940000154141.B.eb ENSGT00940000165391.b ENSGT00940000164285.a.f.a ENSGT00940000154711.a.a.d ENSGT00940000155930.g.a.b ENSGT00940000156883.h ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a.l ENSGT00740000116794 ENSGT00740000115593.a ENSGT00530000068411 ENSGT00940000154865.kc.b ENSGT00940000158120.g ENSGT00940000156925.v.a ENSGT00940000154518.b.j ##22 ENSGT00390000013968.c ENSGT00660000095541.a.a.i ENSGT00390000004582.e ENSGT00940000160366.i ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000164834.a ENSGT01030000234613.b.a.b.g.b ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a.a ENSGT00390000016478.c.b ENSGT00940000154862.x.b.l ENSGT01100000266056 ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a.n ENSGT00940000154239.a.e.b ENSGT01030000234613.b.a.b.h ENSGT01030000234613.b.a.b.g.a Goldfish MODERN SPECIES 31 calm2a (ENSCARG00000058664) TTC7A (ENSCARG00000058641) mcfd2 (ENSCARG00000058626) ENSCARG00000058618 socs5b (ENSCARG00000058600) ENSCARG00000058592 PRKCE (ENSCARG00000058387) epas1b (ENSCARG00000056927) galm (ENSCARG00000056791) atl2 (ENSCARG00000052292) ENSCARG00000052052 hells (ENSCARG00000051495) ENSCARG00000051148 macroh2a2 (ENSCARG00000051088) GBF1 (ENSCARG00000050901) pitx3 (ENSCARG00000050860) ##22 gins1 (ENSCARG00000050815) ninl (ENSCARG00000050765) AIFM2 (ENSCARG00000050745) ENSCARG00000050720 ENSCARG00000050710 ENSCARG00000050690 exoc3l4 (ENSCARG00000050658) ENSCARG00000050635 ENSCARG00000050625 EIF5 (ENSCARG00000050598) mark3a (ENSCARG00000046908) ENSCARG00000046809 ckba (ENSCARG00000046562) trmt61a (ENSCARG00000046512) bag5 (ENSCARG00000046451) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT00950000182980.a.b.b.b.gc.b ENSGT00940000158638.l ENSGT00940000154141.B.eb ENSGT00940000165391.b ENSGT00940000164285.a.f.a ENSGT00940000154711.a.a.d ENSGT00940000155930.g.a.b ENSGT00940000156883.h ENSGT00510000047589 ENSGT00940000155710.a.l ENSGT00740000115593.a ENSGT00530000068411 ENSGT00940000154865.kc.b ENSGT00940000158120.g ENSGT00940000156925.v.a ENSGT00940000154518.b.j ##22 ENSGT00390000013968.c ENSGT00660000095541.a.a.i ENSGT00390000004582.e ENSGT00940000160366.i ENSGT00940000165073.a.b.b.b.a.b ENSGT00940000164834.a ENSGT01030000234613.b.a.b.h ENSGT01030000234613.b.a.b.g.a ENSGT01030000234613.b.a.a.c.a.b ENSGT00390000016478.c.a.b ENSGT00940000154862.x.b.k ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a.m ENSGT00940000154239.a.f ENSGT01030000234848 ENSGT00950000182772.A.a.b.`b.a.n Golden-line barbel MODERN SPECIES 44 ENSSGRG00000040434 pitx3 (ENSSGRG00000040436) ##22 ENSSGRG00000040449 ninl (ENSSGRG00000040452) AIFM2 (ENSSGRG00000040455) ENSSGRG00000040460 ENSSGRG00000040463 exoc3l4 (ENSSGRG00000040470) ENSSGRG00000040471 ENSSGRG00000040476 mark3a (ENSSGRG00000040691) ckba (ENSSGRG00000040901) ENSSGRG00000041627 trmt61a (ENSSGRG00000041629) bag5 (ENSSGRG00000041632) coa8 (ENSSGRG00000041635) klc1a (ENSSGRG00000041636) Common carp reference MODERN SPECIES 48 calm2a (ENSCCRG00000080623) TTC7A (ENSCCRG00000021494) mcfd2 (ENSCCRG00000025548) ENSCCRG00000079722 socs5b (ENSCCRG00000055545) ENSCCRG00000067455 epas1b (ENSCCRG00000027310) atl2 (ENSCCRG00000029458) galm (ENSCCRG00000058321) hells (ENSCCRG00000029434) ENSCCRG00000052977 ENSCCRG00000025131 ENSCCRG00000072851 macroh2a2 (ENSCCRG00000027439) ENSCCRG00000027640 pitx3 (ENSCCRG00000047836) ##22 ENSCCRG00000031584 gins1 (ENSCCRG00000018976) ninl (ENSCCRG00000018970) ENSCCRG00000018965 ENSCCRG00000055451 ENSCCRG00000018951 ENSCCRG00000018947 exoc3l4 (ENSCCRG00000075093) ENSCCRG00000018917 ENSCCRG00000067235 MARK3 (ENSCCRG00000018569) bag5 (ENSCCRG00000020801) ENSCCRG00000018566 coa8 (ENSCCRG00000037353) klc1a (ENSCCRG00000037373) Zebrafish MODERN SPECIES 4 si:ch211-93n23.7 (ENSDARG00000089552) TTC7A (ENSDARG00000074760) mcfd2 (ENSDARG00000039757) prop1 (ENSDARG00000039756) socs5b (ENSDARG00000062745) PRKCE (ENSDARG00000069928) epas1b (ENSDARG00000057671) DHX57 (ENSDARG00000057660) galm (ENSDARG00000057630) atl2 (ENSDARG00000057719) ENSDARG00000075943 hells (ENSDARG00000057738) ENSDARG00000092199 macroh2a2 (ENSDARG00000087897) GBF1 (ENSDARG00000027016) pitx3 (ENSDARG00000070069) ##22 ENSDARG00000093267 ENSDARG00000102319 ENSDARG00000058160 exoc3l4 (ENSDARG00000058180) ENSDARG00000061714 ENSDARG00000108535 AIFM2 (ENSDARG00000077549) ninl (ENSDARG00000098414) gins1 (ENSDARG00000007624) RPS6KA2 (ENSDARG00000028469) rnaset2 (ENSDARG00000036282) ENSDARG00000110698 csmd1a (ENSDARG00000044414) angpt2a (ENSDARG00000014946) mcph1 (ENSDARG00000058372) Spotted gar DUPLICATION Spotted gar MODERN SPECIES 671 ENSLOCG00000009344 alox5b.2 (ENSLOCG00000009354) marchf8 (ENSLOCG00000009384) zfand4 (ENSLOCG00000009414) ENSLOCG00000009434 ENSLOCG00000009449 NPY4R2 (ENSLOCG00000018240) ENSLOCG00000009464 hells (ENSLOCG00000009470) ENSLOCG00000009488 ENSLOCG00000009491 ENSLOCG00000009510 ENSLOCG00000009521 macroh2a2 (ENSLOCG00000009542) GBF1 (ENSLOCG00000009553) pitx3 (ENSLOCG00000009566) ##22 PNLIPRP2 (ENSLOCG00000009574) ENSLOCG00000009582 hspa12a (ENSLOCG00000009586) eno4 (ENSLOCG00000009597) shtn1 (ENSLOCG00000009606) ENSLOCG00000009623 ENSLOCG00000009629 vax1 (ENSLOCG00000009641) ENSLOCG00000009651 slc18a2 (ENSLOCG00000009666) PDZD8 (ENSLOCG00000009680) emx2 (ENSLOCG00000009698) ENSLOCG00000009702 RAB11FIP2 (ENSLOCG00000009709) fam204a (ENSLOCG00000009714) Spotted gar MODERN SPECIES 647 ENSLOCG00000015351 cds2 (ENSLOCG00000015345) arhgap25 (ENSLOCG00000015343) bmp10 (ENSLOCG00000015342) ENSLOCG00000015341 znf703 (ENSLOCG00000015339) ENSLOCG00000015332 C2orf42 (ENSLOCG00000015328) tia1 (ENSLOCG00000015324) zgc:65851 (ENSLOCG00000015323) MXD1 (ENSLOCG00000015320) snrnp27 (ENSLOCG00000015319) add2 (ENSLOCG00000015316) figla (ENSLOCG00000015315) hk2 (ENSLOCG00000015312) ENSLOCG00000015311 ##22 ENSLOCG00000015308 ##33 mrps24 (ENSLOCG00000015305) nudcd3 (ENSLOCG00000015304) camk2b1 (ENSLOCG00000015299) OGDH (ENSLOCG00000015292) ENSLOCG00000015289 ZMIZ2 (ENSLOCG00000015282) gnsb (ENSLOCG00000015279) polm (ENSLOCG00000015276) h2az2b (ENSLOCG00000015274) purbb (ENSLOCG00000015273) ENSLOCG00000015271 ENSLOCG00000015267 ENSLOCG00000015264 PAX8 (ENSLOCG00000015261) Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00940000155571.A ENSGT00940000158120 ENSGT00390000004582 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00940000155571.A ENSGT01000000215701 ENSGT00940000154865 Anura ANCESTRAL SPECIES 72 ENSGT00940000160223 ENSGT00390000005448 ENSGT00940000158426 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00940000156481 ENSGT00940000156237 ENSGT00940000156999 ENSGT00940000166242 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000158983 ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00940000155571.B Frog MODERN SPECIES 7 fam241b (ENSXETG00000006461) neurog3 (ENSXETG00000026423) ENSXETG00000048023 camk2g (ENSXETG00000006455) ndst2 (ENSXETG00000009997) zswim8 (ENSXETG00000010000) chchd1 (ENSXETG00000010005) usp54 (ENSXETG00000010009) sec24c (ENSXETG00000010012) ##33 synpo2l (ENSXETG00000038708) myoz1 (ENSXETG00000010013) ENSXETG00000047548 nolc1 (ENSXETG00000010014) elovl3 (ENSXETG00000046037) ##24 gbf1 (ENSXETG00000010019) pitx3 (ENSXETG00000036002) ##22 bc014685 (ENSXETG00000035095) vav2 (ENSXETG00000000013) ENSXETG00000044504 ENSXETG00000043799 ENSXETG00000043822 ENSXETG00000045341 PSD (ENSXETG00000038670) fbxl15 (ENSXETG00000014210) cuedc2 (ENSXETG00000014207) pax2 (ENSXETG00000014206) ENSXETG00000039000 hif1an (ENSXETG00000014204) sec31b (ENSXETG00000014203) wnt8b (ENSXETG00000023760) scd (ENSXETG00000023757) Leishan spiny toad MODERN SPECIES 9 ADAMTS14 (ENSLLEG00000017916) SCD (ENSLLEG00000017815) ENSLLEG00000017774 WNT8B (ENSLLEG00000017149) SEC31B (ENSLLEG00000016616) NDUFB8 (ENSLLEG00000016541) HIF1AN (ENSLLEG00000016381) ENSLLEG00000016354 PAX2 (ENSLLEG00000015451) CUEDC2 (ENSLLEG00000015294) FBXL15 (ENSLLEG00000015065) PSD (ENSLLEG00000030316) NFKB2 (ENSLLEG00000030239) ENSLLEG00000030212 GBF1 (ENSLLEG00000029742) ENSLLEG00000029622 ##22 ELOVL3 (ENSLLEG00000029611) ##24 NOLC1 (ENSLLEG00000029552) CAMK2G (ENSLLEG00000028889) ENSLLEG00000028798 ENSLLEG00000028783 NDST2 (ENSLLEG00000028708) ZSWIM8 (ENSLLEG00000028183) ENSLLEG00000028084 CHCHD1 (ENSLLEG00000028061) FUT11 (ENSLLEG00000028032) ENSLLEG00000027823 ##33 SYNPO2L (ENSLLEG00000027790) MYOZ1 (ENSLLEG00000027753) USP54 (ENSLLEG00000027357) ENSLLEG00000027301 Amniota ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 Sauria ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00390000011010.b ENSGT00530000064017.b ENSGT00940000159885 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317 ENSGT00940000155596 ENSGT00390000007636 ENSGT01070000253744.b.a.a.b ENSGT00960000189547 ENSGT00940000161253 ENSGT00940000162540 ENSGT00390000004149 ENSGT01050000244827.D.b.a ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154966 ENSGT00940000158670 ENSGT00390000005154 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000161605 ENSGT00940000154856.A.a ENSGT00940000161915 ENSGT00520000055570.A.b ENSGT00940000160571 ENSGT00940000158782 ENSGT00940000155847 ENSGT00940000153710.a ENSGT00940000154148.a.b ENSGT00940000159627 ENSGT00940000157631 Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000159885 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317 ENSGT00940000155596 ENSGT00390000007636 ENSGT01070000253744.b.a.a.b ENSGT00960000189547 ENSGT00940000161253 ENSGT00940000162540 ENSGT00390000004149 ENSGT01050000244827.D.b.a ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154966 ENSGT00940000158670 ENSGT00390000005154 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000161605 ENSGT00940000154856.A.a ENSGT01040000242490 ENSGT00940000161915 ENSGT00520000055570.A.b ENSGT00940000160571 ENSGT00940000158782 ENSGT00940000155847 ENSGT00940000153710.a ENSGT00940000154148.a.b ENSGT00940000159627 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00860000134673 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000156545 #10 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000155525 ENSGT00740000115593 ENSGT00860000134673 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683 ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 Lizard DUPLICATION Lizard MODERN SPECIES 810 ENSACAG00000014063 FBXL15 (ENSACAG00000014128) PSD (ENSACAG00000014133) NFKB2 (ENSACAG00000014215) ENSACAG00000038789 GBF1 (ENSACAG00000014475) ENSACAG00000014532 ##22 NOLC1 (ENSACAG00000014545) ENSACAG00000014577 ENSACAG00000014777 ENSACAG00000010260 ENSACAG00000010149 PPP3CB (ENSACAG00000010008) ENSACAG00000043417 USP54 (ENSACAG00000009939) MYOZ1 (ENSACAG00000009922) SYNPO2L (ENSACAG00000009895) ENSACAG00000009727 ##33 FUT11 (ENSACAG00000009701) CHCHD1 (ENSACAG00000036619) ENSACAG00000009560 ENSACAG00000045116 Lizard MODERN SPECIES 1454 ENSACAG00000000794 ENSACAG00000000705 ENSACAG00000037682 ENSACAG00000038581 ENSACAG00000000599 ITPRIPL1 (ENSACAG00000025480) ENSACAG00000038214 ##22 ENSACAG00000000434 TMEM127 (ENSACAG00000000419) Elapidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000156925.b ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154966.v ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683.m.a ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 Indian cobra DUPLICATION Indian cobra MODERN SPECIES 3 TMEM26 (ENSNNAG00000016022) ENSNNAG00000016016 CABCOCO1 (ENSNNAG00000016000) ENSNNAG00000015990 CAMK2G (ENSNNAG00000015809) NDST2 (ENSNNAG00000015733) ZSWIM8 (ENSNNAG00000015615) ENSNNAG00000015600 ENSNNAG00000015585 FUT11 (ENSNNAG00000015575) ENSNNAG00000006977 ##33 SYNPO2L (ENSNNAG00000006540) MYOZ1 (ENSNNAG00000006507) USP54 (ENSNNAG00000006435) GBF1 (ENSNNAG00000006353) ENSNNAG00000006333 ##22 ENSNNAG00000006260 PIK3AP1 (ENSNNAG00000006184) TM9SF3 (ENSNNAG00000006086) ANXA7 (ENSNNAG00000006057) ENSNNAG00000006044 ENSNNAG00000006032 ENSNNAG00000006002 KLHL2 (ENSNNAG00000005959) TMEM192 (ENSNNAG00000005923) ENSNNAG00000005896 SMIM31 (ENSNNAG00000005879) MARCHF1 (ENSNNAG00000005843) TMA16 (ENSNNAG00000005820) NPY1R (ENSNNAG00000005808) FSTL5 (ENSNNAG00000005556) Indian cobra MODERN SPECIES 7 AP3M2 (ENSNNAG00000004604) KAT6A (ENSNNAG00000004542) ENSNNAG00000004518 ENSNNAG00000004511 ENSNNAG00000004446 ENSNNAG00000004417 GPAT4 (ENSNNAG00000004385) ENSNNAG00000004369 ENSNNAG00000004282 ENSNNAG00000004239 ENSNNAG00000004168 ENSNNAG00000004145 ENSNNAG00000004134 ARID5A (ENSNNAG00000004097) NCAPH (ENSNNAG00000003925) ENSNNAG00000003874 ##22 ENSNNAG00000003658 CIAO1 (ENSNNAG00000003582) TMEM127 (ENSNNAG00000003565) STARD7 (ENSNNAG00000003547) ENSNNAG00000010619 DUSP2 (ENSNNAG00000010605) GPAT2 (ENSNNAG00000010566) FAHD2A (ENSNNAG00000010516) KCNIP3 (ENSNNAG00000010360) ENSNNAG00000010316 ENSNNAG00000010296 ENSNNAG00000010211 ENSNNAG00000010160 ENSNNAG00000010103 RASSF2 (ENSNNAG00000010087) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000156925.b ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154966.v ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683.m.a ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 Blue-lipped sea krait DUPLICATION Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 5782 ENSLLTG00000007620 ##22 ENSLLTG00000007637 Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 7467 NEURL3 (ENSLLTG00000004898) NCAPH (ENSLLTG00000004861) ITPRIPL1 (ENSLLTG00000004852) ENSLLTG00000004846 ##22 ENSLLTG00000004823 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000156925.b ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b ENSGT00950000183054.b ENSGT00950000182924.A.b.a.a ##33 ENSGT00940000158983 ENSGT00390000007683.m.a ENSGT00940000166242.b ENSGT00940000166242.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 Eastern brown snake DUPLICATION Eastern brown snake MODERN SPECIES 50 GBF1 (ENSPTXG00000003883) ENSPTXG00000003886 ##22 ENSPTXG00000003888 PIK3AP1 (ENSPTXG00000003893) TM9SF3 (ENSPTXG00000004039) EIF3F (ENSPTXG00000004043) ANXA7 (ENSPTXG00000004046) USP54 (ENSPTXG00000004052) MYOZ1 (ENSPTXG00000004062) SYNPO2L (ENSPTXG00000004064) ENSPTXG00000004067 ##33 FUT11 (ENSPTXG00000004069) CHCHD1 (ENSPTXG00000004072) ENSPTXG00000004074 ENSPTXG00000004075 ZSWIM8 (ENSPTXG00000004077) NDST2 (ENSPTXG00000004079) Eastern brown snake MODERN SPECIES 76 ENSPTXG00000012444 MAT2A (ENSPTXG00000012446) VDAC3 (ENSPTXG00000012447) IKBKB (ENSPTXG00000012462) PLAT (ENSPTXG00000013159) AP3M2 (ENSPTXG00000013223) KAT6A (ENSPTXG00000013226) ANK1 (ENSPTXG00000013234) NKX6-3 (ENSPTXG00000013954) GPAT4 (ENSPTXG00000013955) ENSPTXG00000013962 ARID5A (ENSPTXG00000013966) NEURL3 (ENSPTXG00000013970) NCAPH (ENSPTXG00000013971) ITPRIPL1 (ENSPTXG00000013973) ENSPTXG00000013974 ##22 SNRNP200 (ENSPTXG00000013977) CIAO1 (ENSPTXG00000014010) TMEM127 (ENSPTXG00000014012) STARD7 (ENSPTXG00000014013) DUSP2 (ENSPTXG00000014016) ASTL (ENSPTXG00000014029) ADRA2B (ENSPTXG00000014031) ENSPTXG00000014032 KCNIP3 (ENSPTXG00000014033) ENSPTXG00000014035 ENSPTXG00000014036 RASSF2 (ENSPTXG00000014037) SLC23A2 (ENSPTXG00000014038) TMEM230 (ENSPTXG00000014039) PCNA (ENSPTXG00000014040) Mainland tiger snake DUPLICATION Mainland tiger snake MODERN SPECIES 60 GBF1 (ENSNSUG00000020249) ENSNSUG00000020247 ##22 ENSNSUG00000020246 ENSNSUG00000020245 PIK3AP1 (ENSNSUG00000020244) TM9SF3 (ENSNSUG00000020243) EIF3F (ENSNSUG00000020242) ANXA7 (ENSNSUG00000020241) USP54 (ENSNSUG00000020240) MYOZ1 (ENSNSUG00000020239) SYNPO2L (ENSNSUG00000020238) ENSNSUG00000020237 ##33 FUT11 (ENSNSUG00000020236) ENSNSUG00000020235 ZSWIM8 (ENSNSUG00000020181) NDST2 (ENSNSUG00000020172) CAMK2G (ENSNSUG00000020164) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 448 ARID5A (ENSNSUG00000010634) NEURL3 (ENSNSUG00000010636) NCAPH (ENSNSUG00000010639) ITPRIPL1 (ENSNSUG00000010643) ENSNSUG00000010645 ##22 SNRNP200 (ENSNSUG00000010677) CIAO1 (ENSNSUG00000012972) TMEM127 (ENSNSUG00000012973) Laterata ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT01050000244827.D.b.a ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT00940000154966 ENSGT00940000158670 ENSGT00390000005154 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000161605 ENSGT00940000154856.A.a ENSGT00940000161915 ENSGT00520000055570.A.b ENSGT00940000160571 ENSGT00940000158782 Argentine black and white tegu DUPLICATION Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 47 ENSSMRG00000000918 PKD2L1 (ENSSMRG00000000957) SCD (ENSSMRG00000001367) WNT8B (ENSSMRG00000001374) NDUFB8 (ENSSMRG00000001375) HIF1AN (ENSSMRG00000001376) ENSSMRG00000001412 PAX2 (ENSSMRG00000001468) ENSSMRG00000001523 CUEDC2 (ENSSMRG00000001529) FBXL15 (ENSSMRG00000001549) PSD (ENSSMRG00000001565) NFKB2 (ENSSMRG00000001584) ENSSMRG00000001614 GBF1 (ENSSMRG00000001625) ENSSMRG00000001680 ##22 ENSSMRG00000001693 #10 NOLC1 (ENSSMRG00000001698) ENSSMRG00000001704 PIK3AP1 (ENSSMRG00000001707) TM9SF3 (ENSSMRG00000001719) EIF3F (ENSSMRG00000001726) ENSSMRG00000001762 ANXA7 (ENSSMRG00000001772) PPP3CB (ENSSMRG00000001783) USP54 (ENSSMRG00000001798) MYOZ1 (ENSSMRG00000001819) SYNPO2L (ENSSMRG00000001823) ENSSMRG00000001835 ##33 FUT11 (ENSSMRG00000001869) ENSSMRG00000001896 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 94 ITPRIPL1 (ENSSMRG00000015297) ENSSMRG00000015298 ##22 SNRNP200 (ENSSMRG00000015299) CIAO1 (ENSSMRG00000015302) TMEM127 (ENSSMRG00000015303) STARD7 (ENSSMRG00000015304) DUSP2 (ENSSMRG00000015305) PROM2 (ENSSMRG00000015306) KCNIP3 (ENSSMRG00000015309) FAHD2A (ENSSMRG00000015312) ENSSMRG00000015319 ADRA2B (ENSSMRG00000015321) ENSSMRG00000015323 ENSSMRG00000015325 TSR1 (ENSSMRG00000015485) ANXA4 (ENSSMRG00000015486) AAK1 (ENSSMRG00000015487) Common wall lizard DUPLICATION Common wall lizard MODERN SPECIES 13 ENSPMRG00000004737 PKD2L1 (ENSPMRG00000004742) SCD (ENSPMRG00000004749) WNT8B (ENSPMRG00000000205) NDUFB8 (ENSPMRG00000000239) ENSPMRG00000000259 HIF1AN (ENSPMRG00000000282) PAX2 (ENSPMRG00000000343) CUEDC2 (ENSPMRG00000000422) FBXL15 (ENSPMRG00000000450) ENSPMRG00000000472 PSD (ENSPMRG00000000496) NFKB2 (ENSPMRG00000000687) ENSPMRG00000001238 GBF1 (ENSPMRG00000001277) ENSPMRG00000001334 ##22 ENSPMRG00000001344 #10 NOLC1 (ENSPMRG00000001367) PIK3AP1 (ENSPMRG00000001430) TM9SF3 (ENSPMRG00000001569) EIF3F (ENSPMRG00000001588) ENSPMRG00000001597 ANXA7 (ENSPMRG00000001604) PPP3CB (ENSPMRG00000001624) MYOZ1 (ENSPMRG00000001808) SYNPO2L (ENSPMRG00000001820) ENSPMRG00000001829 ##33 ENSPMRG00000001838 ENSPMRG00000001845 ZSWIM8 (ENSPMRG00000001872) NDST2 (ENSPMRG00000001889) Common wall lizard MODERN SPECIES 14 ENSPMRG00000001954 ZBTB37 (ENSPMRG00000001995) SERPINC1 (ENSPMRG00000002006) RC3H1 (ENSPMRG00000002019) RABGAP1L (ENSPMRG00000002075) ENSPMRG00000002128 ENSPMRG00000002137 TNN (ENSPMRG00000002141) KIAA0040 (ENSPMRG00000002149) ENSPMRG00000002156 ENSPMRG00000002168 ENSPMRG00000002180 COP1 (ENSPMRG00000002185) PAPPA2 (ENSPMRG00000002205) ASTN1 (ENSPMRG00000002234) ENSPMRG00000002275 ##22 SEC16B (ENSPMRG00000002285) ENSPMRG00000002336 ENSPMRG00000002341 RASAL2 (ENSPMRG00000002443) RALGPS2 (ENSPMRG00000002754) ANGPTL1 (ENSPMRG00000002875) ENSPMRG00000002887 FAM20B (ENSPMRG00000002896) ABL2 (ENSPMRG00000002982) ENSPMRG00000003265 ENSPMRG00000003285 ENSPMRG00000003319 ENSPMRG00000003325 AXDND1 (ENSPMRG00000003340) NPHS2 (ENSPMRG00000003370) Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000161587 ENSGT00390000011010.b ENSGT00940000159885 ENSGT00940000160547 ENSGT00940000175342 ENSGT00940000161102 ENSGT00940000156317 ENSGT00940000155596 ENSGT00390000007636 ENSGT01070000253744.b.a.a.b ENSGT00960000189547 ENSGT00940000161253 ENSGT00940000162540 ENSGT00390000004149 ENSGT01050000244827.D.b.a ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00940000154966 ENSGT00940000158670 ENSGT00390000005154 ENSGT00940000157856 ENSGT00940000161605 ENSGT00940000154856.A.a Archosauria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161188.c.a.a.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00900000142007 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B Aves ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00900000142007 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B Neognathae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00900000142007 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b Great tit MODERN SPECIES 26 BLOC1S2 (ENSPMJG00000016014) ENSPMJG00000016013 PKD2L1 (ENSPMJG00000016012) SCD (ENSPMJG00000016011) WNT8B (ENSPMJG00000016010) SEC31B (ENSPMJG00000015532) NDUFB8 (ENSPMJG00000015531) HIF1AN (ENSPMJG00000015530) PAX2 (ENSPMJG00000015525) CUEDC2 (ENSPMJG00000015524) FBXL15 (ENSPMJG00000015523) PSD (ENSPMJG00000015522) NFKB2 (ENSPMJG00000015521) ENSPMJG00000015520 GBF1 (ENSPMJG00000015519) ENSPMJG00000015518 ##22 ELOVL3 (ENSPMJG00000015517) ##24 ENSPMJG00000015516 #10 NOLC1 (ENSPMJG00000015515) PIK3AP1 (ENSPMJG00000015514) TM9SF3 (ENSPMJG00000015513) TLL2 (ENSPMJG00000015512) ENSPMJG00000015511 ZP4 (ENSPMJG00000015510) HELLS (ENSPMJG00000015508) PDLIM1 (ENSPMJG00000015507) SORBS1 (ENSPMJG00000015505) EIF3F (ENSPMJG00000015503) ANXA7 (ENSPMJG00000015502) PPP3CB (ENSPMJG00000015501) USP54 (ENSPMJG00000015500) Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b Flycatcher MODERN SPECIES 25 BLOC1S2 (ENSFALG00000007378) ENSFALG00000007371 PKD2L1 (ENSFALG00000007367) SCD (ENSFALG00000007354) WNT8B (ENSFALG00000007338) SEC31B (ENSFALG00000007329) NDUFB8 (ENSFALG00000007321) HIF1AN (ENSFALG00000007314) PAX2 (ENSFALG00000007308) CUEDC2 (ENSFALG00000026563) FBXL15 (ENSFALG00000007300) PSD (ENSFALG00000007291) NFKB2 (ENSFALG00000007271) ENSFALG00000007258 GBF1 (ENSFALG00000007250) PITX3 (ENSFALG00000028716) ##22 ELOVL3 (ENSFALG00000007242) ##24 ENSFALG00000007237 #10 NOLC1 (ENSFALG00000007233) PIK3AP1 (ENSFALG00000007224) ENSFALG00000007218 ENSFALG00000007169 TLL2 (ENSFALG00000007191) HELLS (ENSFALG00000007136) PDLIM1 (ENSFALG00000007129) SORBS1 (ENSFALG00000007114) ENSFALG00000007100 ENSFALG00000007098 PPP3CB (ENSFALG00000007095) USP54 (ENSFALG00000007093) MYOZ1 (ENSFALG00000007092) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b Common canary MODERN SPECIES 7 ENSSCAG00000017193 PKD2L1 (ENSSCAG00000017196) SCD (ENSSCAG00000017200) WNT8B (ENSSCAG00000017202) SEC31B (ENSSCAG00000017212) NDUFB8 (ENSSCAG00000017220) HIF1AN (ENSSCAG00000017223) PAX2 (ENSSCAG00000017234) CUEDC2 (ENSSCAG00000017240) FBXL15 (ENSSCAG00000017242) PSD (ENSSCAG00000017246) NFKB2 (ENSSCAG00000017260) ENSSCAG00000017273 GBF1 (ENSSCAG00000017277) ENSSCAG00000000106 ENSSCAG00000000114 ##22 ELOVL3 (ENSSCAG00000000142) ##24 ENSSCAG00000000157 #10 NOLC1 (ENSSCAG00000000165) PIK3AP1 (ENSSCAG00000000184) TM9SF3 (ENSSCAG00000000215) TLL2 (ENSSCAG00000000304) ENSSCAG00000000466 ENSSCAG00000000477 HELLS (ENSSCAG00000000493) PDLIM1 (ENSSCAG00000000526) SORBS1 (ENSSCAG00000000608) EIF3F (ENSSCAG00000001070) ANXA7 (ENSSCAG00000001184) PPP3CB (ENSSCAG00000001421) USP54 (ENSSCAG00000002050) Zebra finch MODERN SPECIES 28 BLOC1S2 (ENSTGUG00000027541) ENSTGUG00000007742 PKD2L1 (ENSTGUG00000007707) SCD (ENSTGUG00000007683) WNT8B (ENSTGUG00000007673) SEC31B (ENSTGUG00000007660) NDUFB8 (ENSTGUG00000007648) HIF1AN (ENSTGUG00000007639) PAX2 (ENSTGUG00000007620) CUEDC2 (ENSTGUG00000007606) FBXL15 (ENSTGUG00000007604) PSD (ENSTGUG00000007566) NFKB2 (ENSTGUG00000007491) ENSTGUG00000027921 GBF1 (ENSTGUG00000007414) ENSTGUG00000007407 ##22 ENSTGUG00000007384 #10 ENSTGUG00000007368 PIK3AP1 (ENSTGUG00000007322) TM9SF3 (ENSTGUG00000007294) TLL2 (ENSTGUG00000007264) ENSTGUG00000007197 ZP4 (ENSTGUG00000007190) HELLS (ENSTGUG00000007157) PDLIM1 (ENSTGUG00000007148) SORBS1 (ENSTGUG00000007122) EIF3F (ENSTGUG00000007105) ANXA7 (ENSTGUG00000007092) PPP3CB (ENSTGUG00000007056) USP54 (ENSTGUG00000007036) MYOZ1 (ENSTGUG00000007029) Medium ground finch MODERN SPECIES 3 BLOC1S2 (ENSGFOG00000007004) ENSGFOG00000007010 PKD2L1 (ENSGFOG00000007027) SCD (ENSGFOG00000007037) WNT8B (ENSGFOG00000007041) SEC31B (ENSGFOG00000002565) NDUFB8 (ENSGFOG00000002592) HIF1AN (ENSGFOG00000002610) PAX2 (ENSGFOG00000002631) CUEDC2 (ENSGFOG00000002649) FBXL15 (ENSGFOG00000002673) PSD (ENSGFOG00000002711) NFKB2 (ENSGFOG00000003039) ENSGFOG00000003083 GBF1 (ENSGFOG00000003121) ENSGFOG00000003227 ##22 ELOVL3 (ENSGFOG00000003248) ##24 ENSGFOG00000003271 #10 NOLC1 (ENSGFOG00000003286) PIK3AP1 (ENSGFOG00000003354) TM9SF3 (ENSGFOG00000003534) TLL2 (ENSGFOG00000003865) ENSGFOG00000009467 ENSGFOG00000009490 HELLS (ENSGFOG00000009502) PDLIM1 (ENSGFOG00000009538) SORBS1 (ENSGFOG00000009564) EIF3F (ENSGFOG00000009663) ANXA7 (ENSGFOG00000009678) PPP3CB (ENSGFOG00000009698) USP54 (ENSGFOG00000010065) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B ENSGT00950000183027.a.b Golden eagle MODERN SPECIES 2 BLOC1S2 (ENSACCG00020009859) ENSACCG00020009871 PKD2L1 (ENSACCG00020009891) SCD (ENSACCG00020009904) WNT8B (ENSACCG00020009911) SEC31B (ENSACCG00020009939) NDUFB8 (ENSACCG00020009970) HIF1AN (ENSACCG00020009984) PAX2 (ENSACCG00020010111) CUEDC2 (ENSACCG00020010188) FBXL15 (ENSACCG00020010200) PSD (ENSACCG00020010299) NFKB2 (ENSACCG00020010399) ENSACCG00020010421 GBF1 (ENSACCG00020010470) ENSACCG00020010529 ##22 ELOVL3 (ENSACCG00020010550) ##24 ENSACCG00020010563 #10 NOLC1 (ENSACCG00020010582) PIK3AP1 (ENSACCG00020010598) TM9SF3 (ENSACCG00020010626) TLL2 (ENSACCG00020010674) ENSACCG00020010731 ZP4 (ENSACCG00020010751) HELLS (ENSACCG00020010774) PDLIM1 (ENSACCG00020010803) SORBS1 (ENSACCG00020010886) EIF3F (ENSACCG00020010984) ANXA7 (ENSACCG00020010999) PPP3CB (ENSACCG00020011013) USP54 (ENSACCG00020011027) Kakapo MODERN SPECIES 22 BLOC1S2 (ENSSHBG00005002580) ENSSHBG00005002554 PKD2L1 (ENSSHBG00005002526) SCD (ENSSHBG00005002508) WNT8B (ENSSHBG00005002490) SEC31B (ENSSHBG00005002421) NDUFB8 (ENSSHBG00005002384) HIF1AN (ENSSHBG00005002356) PAX2 (ENSSHBG00005002312) CUEDC2 (ENSSHBG00005002280) FBXL15 (ENSSHBG00005002271) PSD (ENSSHBG00005002237) NFKB2 (ENSSHBG00005002209) ENSSHBG00005002193 GBF1 (ENSSHBG00005002095) ENSSHBG00005002060 ##22 ENSSHBG00005002040 #10 NOLC1 (ENSSHBG00005002008) PIK3AP1 (ENSSHBG00005001952) TM9SF3 (ENSSHBG00005000264) TLL2 (ENSSHBG00005000253) ENSSHBG00005000220 ENSSHBG00005014242 ENSSHBG00005014225 HELLS (ENSSHBG00005014207) PDLIM1 (ENSSHBG00005014193) SORBS1 (ENSSHBG00005013689) EIF3F (ENSSHBG00005013468) ANXA7 (ENSSHBG00005013442) PPP3CB (ENSSHBG00005013416) USP54 (ENSSHBG00005013388) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00900000142007 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00900000142007 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00900000142007 ENSGT00940000158658 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B Turkey MODERN SPECIES 28 BLOC1S2 (ENSMGAG00000007586) ENSMGAG00000007532 PKD2L1 (ENSMGAG00000007479) SCD (ENSMGAG00000007446) WNT8B (ENSMGAG00000007401) SEC31B (ENSMGAG00000007326) NDUFB8 (ENSMGAG00000007315) HIF1AN (ENSMGAG00000007294) ENSMGAG00000007277 CUEDC2 (ENSMGAG00000006985) FBXL15 (ENSMGAG00000007004) PSD (ENSMGAG00000007010) NFKB2 (ENSMGAG00000007029) ENSMGAG00000007070 GBF1 (ENSMGAG00000007097) ENSMGAG00000007168 ##22 ELOVL3 (ENSMGAG00000007170) ##24 ENSMGAG00000007177 #10 NOLC1 (ENSMGAG00000007197) PIK3AP1 (ENSMGAG00000007240) ENSMGAG00000016449 TLL2 (ENSMGAG00000017191) ENSMGAG00000006918 ENSMGAG00000006863 HELLS (ENSMGAG00000006818) PDLIM1 (ENSMGAG00000006800) SORBS1 (ENSMGAG00000006720) ENSMGAG00000006693 ENSMGAG00000006662 PPP3CB (ENSMGAG00000006623) USP54 (ENSMGAG00000006587) Chicken MODERN SPECIES 35 BLOC1S2 (ENSGALG00010020632) ABCG2 (ENSGALG00010020622) PKD2L1 (ENSGALG00010019964) SCD (ENSGALG00010021083) WNT8B (ENSGALG00010021079) SEC31B (ENSGALG00010021077) NDUFB8 (ENSGALG00010021073) HIF1AN (ENSGALG00010021071) PAX2 (ENSGALG00010021060) CUEDC2 (ENSGALG00010021025) FBXL15 (ENSGALG00010021014) PSD (ENSGALG00010021004) NFKB2 (ENSGALG00010021000) TMEM150B (ENSGALG00010020979) GBF1 (ENSGALG00010020886) ENSGALG00010020809 ##22 ELOVL3 (ENSGALG00010020275) ##24 UGT8L (ENSGALG00010020269) #10 NOLC1 (ENSGALG00010020248) PIK3AP1 (ENSGALG00010023847) TM9SF3 (ENSGALG00010020228) TLL2 (ENSGALG00010021803) CYP2C18 (ENSGALG00010023886) ENSGALG00010021763 ZP4 (ENSGALG00010021757) HELLS (ENSGALG00010021750) PDLIM1 (ENSGALG00010021740) ENSGALG00010021711 SORBS1 (ENSGALG00010021617) EIF3F (ENSGALG00010021255) ANXA7 (ENSGALG00010021248) Japanese quail MODERN SPECIES 24 BLOC1S2 (ENSCJPG00005018856) ENSCJPG00005018855 PKD2L1 (ENSCJPG00005018854) SCD (ENSCJPG00005018853) WNT8B (ENSCJPG00005018852) SEC31B (ENSCJPG00005018851) NDUFB8 (ENSCJPG00005018850) HIF1AN (ENSCJPG00005018849) PAX2 (ENSCJPG00005018835) CUEDC2 (ENSCJPG00005018834) FBXL15 (ENSCJPG00005018833) PSD (ENSCJPG00005018780) NFKB2 (ENSCJPG00005018636) ENSCJPG00005018635 GBF1 (ENSCJPG00005018322) ENSCJPG00005018316 ##22 ELOVL3 (ENSCJPG00005018315) ##24 ENSCJPG00005018314 #10 NOLC1 (ENSCJPG00005018313) PIK3AP1 (ENSCJPG00005018312) TM9SF3 (ENSCJPG00005018311) TLL2 (ENSCJPG00005017433) ENSCJPG00005017392 ENSCJPG00005017389 ZP4 (ENSCJPG00005017388) HELLS (ENSCJPG00005017251) PDLIM1 (ENSCJPG00005017250) ENSCJPG00005016587 EIF3F (ENSCJPG00005016575) ANXA7 (ENSCJPG00005016506) PPP3CB (ENSCJPG00005016200) Anatidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000155736.D.c.a ENSGT00940000161324 ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155525 ENSGT00940000158658 ENSGT00900000142007 ENSGT00950000183073.a.a.a ENSGT00940000155278 ENSGT00940000154115.c.b ENSGT00940000155571.B Duck MODERN SPECIES 24 PKD2L1 (ENSAPLG00000015842) SCD (ENSAPLG00000015665) WNT8B (ENSAPLG00000015543) SEC31B (ENSAPLG00000015227) NDUFB8 (ENSAPLG00000015152) HIF1AN (ENSAPLG00000015134) PAX2 (ENSAPLG00000014579) ENSAPLG00000028928 ENSAPLG00000029656 ENSAPLG00000014474 FBXL15 (ENSAPLG00000014471) PSD (ENSAPLG00000014121) NFKB2 (ENSAPLG00000013409) ENSAPLG00000012179 ENSAPLG00000017204 ENSAPLG00000028393 ##22 ELOVL3 (ENSAPLG00000011982) ##24 ENSAPLG00000011857 #10 NOLC1 (ENSAPLG00000011816) PIK3AP1 (ENSAPLG00000011139) TM9SF3 (ENSAPLG00000010601) TLL2 (ENSAPLG00000009874) ENSAPLG00000027313 ZP4 (ENSAPLG00000002531) HELLS (ENSAPLG00000002649) PDLIM1 (ENSAPLG00000003394) SORBS1 (ENSAPLG00000003522) ENSAPLG00000023679 EIF3F (ENSAPLG00000004385) ANXA7 (ENSAPLG00000004494) PPP3CB (ENSAPLG00000005112) Pink-footed goose MODERN SPECIES 75 BLOC1S2 (ENSABRG00000013087) ENSABRG00000013092 PKD2L1 (ENSABRG00000013097) SCD (ENSABRG00000013113) WNT8B (ENSABRG00000013116) SEC31B (ENSABRG00000013130) NDUFB8 (ENSABRG00000013141) HIF1AN (ENSABRG00000000346) PAX2 (ENSABRG00000000430) CUEDC2 (ENSABRG00000001577) FBXL15 (ENSABRG00000001623) PSD (ENSABRG00000001650) NFKB2 (ENSABRG00000001716) ENSABRG00000001794 GBF1 (ENSABRG00000001837) ENSABRG00000001991 ##22 ELOVL3 (ENSABRG00000002006) ##24 ENSABRG00000002025 #10 NOLC1 (ENSABRG00000002047) PIK3AP1 (ENSABRG00000002087) TM9SF3 (ENSABRG00000002115) TLL2 (ENSABRG00000002573) ENSABRG00000007494 ENSABRG00000007520 HELLS (ENSABRG00000007595) PDLIM1 (ENSABRG00000007607) SORBS1 (ENSABRG00000007643) ENSABRG00000007981 African ostrich MODERN SPECIES 492 SCD (ENSSCUG00000006513) WNT8B (ENSSCUG00000006507) SEC31B (ENSSCUG00000006499) NDUFB8 (ENSSCUG00000006497) HIF1AN (ENSSCUG00000006494) PAX2 (ENSSCUG00000006489) CUEDC2 (ENSSCUG00000006486) FBXL15 (ENSSCUG00000006482) PSD (ENSSCUG00000006477) NFKB2 (ENSSCUG00000006475) ENSSCUG00000006469 ENSSCUG00000006461 ENSSCUG00000006457 ##22 ELOVL3 (ENSSCUG00000006456) ##24 ENSSCUG00000006452 #10 NOLC1 (ENSSCUG00000006448) PIK3AP1 (ENSSCUG00000006438) TM9SF3 (ENSSCUG00000006430) TLL2 (ENSSCUG00000006309) ENSSCUG00000006164 ZP4 (ENSSCUG00000006153) HELLS (ENSSCUG00000006139) ENSSCUG00000006136 SORBS1 (ENSSCUG00000006116) EIF3F (ENSSCUG00000006104) ANXA7 (ENSSCUG00000006101) PPP3CB (ENSSCUG00000006082) USP54 (ENSSCUG00000006048) Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 68 BLOC1S2 (ENSCPRG00005000593) ENSCPRG00005000613 PKD2L1 (ENSCPRG00005000640) SCD (ENSCPRG00005000657) WNT8B (ENSCPRG00005000688) SEC31B (ENSCPRG00005000707) NDUFB8 (ENSCPRG00005000747) HIF1AN (ENSCPRG00005000754) PAX2 (ENSCPRG00005000769) CUEDC2 (ENSCPRG00005000790) FBXL15 (ENSCPRG00005000799) PSD (ENSCPRG00005000805) NFKB2 (ENSCPRG00005000880) ENSCPRG00005001280 GBF1 (ENSCPRG00005001363) ENSCPRG00005001882 ##22 ENSCPRG00005001891 #10 NOLC1 (ENSCPRG00005001895) ENSCPRG00005001898 PIK3AP1 (ENSCPRG00005001906) TM9SF3 (ENSCPRG00005001917) TLL2 (ENSCPRG00005002074) ENSCPRG00005002715 HELLS (ENSCPRG00005002734) PDLIM1 (ENSCPRG00005002748) SORBS1 (ENSCPRG00005002790) EIF3F (ENSCPRG00005003182) ANXA7 (ENSCPRG00005003185) PPP3CB (ENSCPRG00005003196) USP54 (ENSCPRG00005003207) MYOZ1 (ENSCPRG00005003230) Cryptodira ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908 ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628 ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000155736.D.c.b.a.a ENSGT00940000158282 ENSGT00940000155716 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000154371.b ENSGT00940000169035.a ENSGT00940000169035.b ENSGT00940000161927 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908.v ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628.db ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000156111 ENSGT00940000158282.g ENSGT00940000155716 ENSGT00940000153997.b.a.a ENSGT00940000153997.b.b ENSGT00940000154371.b ENSGT00940000169035.a ENSGT00390000018316.b.b ENSGT00940000169035.b ENSGT00940000161927 Emydidae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908.v ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628.db ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00940000156111 painted turtle DUPLICATION painted turtle MODERN SPECIES 765 BLOC1S2 (ENSCPBG00000020592) ENSCPBG00000020580 PKD2L1 (ENSCPBG00000020573) ENSCPBG00000020571 WNT8B (ENSCPBG00000020569) SEC31B (ENSCPBG00000020557) NDUFB8 (ENSCPBG00000020556) HIF1AN (ENSCPBG00000020549) PAX2 (ENSCPBG00000020459) CUEDC2 (ENSCPBG00000020455) FBXL15 (ENSCPBG00000020452) PSD (ENSCPBG00000020451) NFKB2 (ENSCPBG00000020445) ENSCPBG00000020431 GBF1 (ENSCPBG00000020416) ENSCPBG00000020406 ##22 ELOVL3 (ENSCPBG00000020404) ##24 ENSCPBG00000020402 #10 ENSCPBG00000020399 painted turtle MODERN SPECIES 877 COX5B (ENSCPBG00000023216) SEMA4C (ENSCPBG00000023214) ANKRD39 (ENSCPBG00000023213) ENSCPBG00000023212 CNNM3 (ENSCPBG00000023211) CNNM4 (ENSCPBG00000023192) LMAN2L (ENSCPBG00000023186) ENSCPBG00000023183 ENSCPBG00000023178 KANSL3 (ENSCPBG00000023174) ENSCPBG00000023172 ARID5A (ENSCPBG00000023170) NEURL3 (ENSCPBG00000023169) NCAPH (ENSCPBG00000023162) ITPRIPL1 (ENSCPBG00000023161) ENSCPBG00000023160 ##22 ENSCPBG00000023158 SNRNP200 (ENSCPBG00000022571) CIAO1 (ENSCPBG00000022543) TMEM127 (ENSCPBG00000022541) STARD7 (ENSCPBG00000022540) DUSP2 (ENSCPBG00000022538) Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 144 ENSTMTG00000021615 BLOC1S2 (ENSTMTG00000021625) ENSTMTG00000021631 PKD2L1 (ENSTMTG00000021640) ENSTMTG00000021653 WNT8B (ENSTMTG00000021666) SEC31B (ENSTMTG00000021671) HIF1AN (ENSTMTG00000021693) PAX2 (ENSTMTG00000021723) CUEDC2 (ENSTMTG00000021753) FBXL15 (ENSTMTG00000021758) PSD (ENSTMTG00000021770) NFKB2 (ENSTMTG00000021795) ENSTMTG00000021811 GBF1 (ENSTMTG00000021874) ENSTMTG00000022086 ##22 ELOVL3 (ENSTMTG00000022093) ##24 ENSTMTG00000022104 #10 NOLC1 (ENSTMTG00000003245) PIK3AP1 (ENSTMTG00000003263) TM9SF3 (ENSTMTG00000003282) TLL2 (ENSTMTG00000003323) ENSTMTG00000003361 ALOX5 (ENSTMTG00000003387) Three-toed box turtle DUPLICATION Three-toed box turtle MODERN SPECIES 17 ENSTMTG00000000818 ENSTMTG00000000838 ENSTMTG00000000853 ENSTMTG00000000879 ENSTMTG00000000892 ENSTMTG00000000911 ENSTMTG00000000930 ENSTMTG00000000943 ENSTMTG00000000978 ENSTMTG00000001123 ENSTMTG00000001216 ENSTMTG00000001236 ENSTMTG00000001281 ENSTMTG00000001307 ENSTMTG00000001332 ENSTMTG00000001340 ##22 ENSTMTG00000001614 ENSTMTG00000002770 ENSTMTG00000002779 ENSTMTG00000002785 ENSTMTG00000002790 ENSTMTG00000002797 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 18 ENSTMTG00000003485 ENSTMTG00000003521 ENSTMTG00000003569 ENSTMTG00000003800 ENSTMTG00000003819 ENSTMTG00000003853 ENSTMTG00000003908 ENSTMTG00000003955 ENSTMTG00000003981 ENSTMTG00000004040 ENSTMTG00000004153 ENSTMTG00000004161 ENSTMTG00000000051 ENSTMTG00000000212 ENSTMTG00000000234 ENSTMTG00000000253 ##22 ENSTMTG00000000918 ENSTMTG00000002795 ENSTMTG00000002799 ENSTMTG00000002802 ENSTMTG00000002810 ASTL (ENSTMTG00000002826) ENSTMTG00000002835 Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000005889 ENSGT00940000162658.a.a ENSGT00940000157274 ENSGT00940000154908.v ENSGT00940000160584 ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00390000000628.db ENSGT00940000157409 ENSGT00940000157412.b ENSGT00390000014513 ENSGT00940000160250 ENSGT00940000155061.a.b ENSGT00940000160968 ENSGT01030000234578.A.b.a.a.a ENSGT00940000156925 ENSGT00940000154518.b ##22 ENSGT01050000244965.a ##24 ENSGT00730000111092 ENSGT00390000008787.b ENSGT00940000155493 ENSGT00940000160572 ENSGT00950000185185.b ENSGT00940000156111 ENSGT00940000155736.D.c.b.b.a Abingdon island giant tortoise DUPLICATION Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 606 ENSCABG00000006780 PKD2L1 (ENSCABG00000006768) ENSCABG00000006758 WNT8B (ENSCABG00000006757) SEC31B (ENSCABG00000006755) ENSCABG00000006753 HIF1AN (ENSCABG00000006752) PAX2 (ENSCABG00000006674) CUEDC2 (ENSCABG00000006669) FBXL15 (ENSCABG00000006666) PSD (ENSCABG00000006663) NFKB2 (ENSCABG00000006627) ENSCABG00000006619 ENSCABG00000006616 ENSCABG00000006615 ENSCABG00000006614 ##22 ELOVL3 (ENSCABG00000006613) ##24 ENSCABG00000006611 #10 NOLC1 (ENSCABG00000006610) PIK3AP1 (ENSCABG00000006608) TM9SF3 (ENSCABG00000006604) TLL2 (ENSCABG00000006593) ENSCABG00000006591 ALOX5 (ENSCABG00000006589) ENSCABG00000006398 ENSCABG00000005939 ENSCABG00000005926 ENSCABG00000005923 Abingdon island giant tortoise MODERN SPECIES 191 NEURL3 (ENSCABG00000020802) NCAPH (ENSCABG00000020797) ITPRIPL1 (ENSCABG00000020794) ENSCABG00000020792 ##22 SNRNP200 (ENSCABG00000020216) CIAO1 (ENSCABG00000020203) TMEM127 (ENSCABG00000020201) STARD7 (ENSCABG00000020188) DUSP2 (ENSCABG00000020177) NUDCD3 (ENSCABG00000020163) CAMK2B (ENSCABG00000020119) YKT6 (ENSCABG00000020104) GCK (ENSCABG00000020100) MYL7 (ENSCABG00000020098) POLD2 (ENSCABG00000020088) ENSCABG00000020085 Goode s thornscrub tortoise DUPLICATION Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 21 ENSGEVG00005005976 PKD2L1 (ENSGEVG00005005917) SCD (ENSGEVG00005005815) WNT8B (ENSGEVG00005005755) SEC31B (ENSGEVG00005005667) NDUFB8 (ENSGEVG00005005571) HIF1AN (ENSGEVG00005005529) PAX2 (ENSGEVG00005005417) CUEDC2 (ENSGEVG00005005376) FBXL15 (ENSGEVG00005005349) ENSGEVG00005013712 ENSGEVG00005013632 NFKB2 (ENSGEVG00005013585) ENSGEVG00005013484 GBF1 (ENSGEVG00005013116) ENSGEVG00005013059 ##22 ELOVL3 (ENSGEVG00005013044) ##24 ENSGEVG00005012983 #10 NOLC1 (ENSGEVG00005012883) PIK3AP1 (ENSGEVG00005012783) TM9SF3 (ENSGEVG00005012746) TLL2 (ENSGEVG00005012596) ENSGEVG00005012559 ALOX5 (ENSGEVG00005012524) ENSGEVG00005012492 ENSGEVG00005012251 ENSGEVG00005012167 ENSGEVG00005012124 ENSGEVG00005011901 ENSGEVG00005011519 ENSGEVG00005010732 Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 11 ENSGEVG00005001598 ACTR1B (ENSGEVG00005001617) COX5B (ENSGEVG00005001707) SEMA4C (ENSGEVG00005001730) ANKRD39 (ENSGEVG00005001751) ENSGEVG00005001770 CNNM3 (ENSGEVG00005001803) CNNM4 (ENSGEVG00005001819) LMAN2L (ENSGEVG00005001831) ENSGEVG00005001917 KANSL3 (ENSGEVG00005002082) ARID5A (ENSGEVG00005002130) NEURL3 (ENSGEVG00005002144) NCAPH (ENSGEVG00005002156) ITPRIPL1 (ENSGEVG00005002174) ENSGEVG00005002185 ##22 SNRNP200 (ENSGEVG00005002225) CIAO1 (ENSGEVG00005002337) TMEM127 (ENSGEVG00005002344) ENSGEVG00005002354 STARD7 (ENSGEVG00005002364) DUSP2 (ENSGEVG00005002377) ASTL (ENSGEVG00005002388) NUDCD3 (ENSGEVG00005002408) CAMK2B (ENSGEVG00005002455) YKT6 (ENSGEVG00005002508) GCK (ENSGEVG00005002523) MYL7 (ENSGEVG00005002543) ENSGEVG00005002551 POLD2 (ENSGEVG00005002560) ENSGEVG00005002568 Chinese turtle DUPLICATION Chinese turtle MODERN SPECIES 534 ENSPSIG00000009359 ENSPSIG00000001180 ENSPSIG00000008530 CUEDC2 (ENSPSIG00000008455) FBXL15 (ENSPSIG00000008451) PSD (ENSPSIG00000007972) GBF1 (ENSPSIG00000017086) ENSPSIG00000017078 ##22 ELOVL3 (ENSPSIG00000017049) ##24 ENSPSIG00000016673 #10 NOLC1 (ENSPSIG00000015813) PIK3AP1 (ENSPSIG00000015311) TM9SF3 (ENSPSIG00000014625) TLL2 (ENSPSIG00000014078) ALOX5 (ENSPSIG00000013359) ENSPSIG00000009829 ENSPSIG00000007949 ENSPSIG00000007757 Chinese turtle MODERN SPECIES 344 ENSPSIG00000011893 ##22 SNRNP200 (ENSPSIG00000008580) CIAO1 (ENSPSIG00000008452) TMEM127 (ENSPSIG00000008411) STARD7 (ENSPSIG00000006776) ASTL (ENSPSIG00000011428) Coelacanth DUPLICATION Coelacanth MODERN SPECIES 463 GBF1 (ENSLACG00000015854) pitx3 (ENSLACG00000015664) ##22 elovl6l (ENSLACG00000015310) ##24 NOLC1 (ENSLACG00000014934) ENSLACG00000014800 #10 CAMK2G (ENSLACG00000011877) ENSLACG00000006124 ZSWIM8 (ENSLACG00000003591) ENSLACG00000000665 Coelacanth MODERN SPECIES 3081 ITPRIPL1 (ENSLACG00000001533) ENSLACG00000005447 ##22