Mammalia ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000167290 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 ENSGT00950000182990.b Theria ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000167290 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 ENSGT00950000182990.b Eutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Primates ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00910000147558 #37 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00910000147558 #37 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.re.b ##22 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00910000147558 #37 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b Macaca ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.re.a.a ##22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00910000147558 #37 ENSGT00940000162923 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000174433.A.b #7 ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00910000147558 #37 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000161627.a.a.a.a.b.a.a.b.a.a.a.a.a.a.a.b.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b.a.a ##31 ENSGT00940000154332 Rhesus MODERN SPECIES 7 ENSMMUG00000057057 #7 ENSMMUG00000065160 #8 ENSMMUG00000058041 #9 SOX9 (ENSMMUG00000063817) #10 SLC39A11 (ENSMMUG00000014195) #11 SSTR2 (ENSMMUG00000051322) #12 ENSMMUG00000063103 #13 COG1 (ENSMMUG00000001266) #14 ENSMMUG00000060397 #15 FAM104A (ENSMMUG00000001268) #16 C16H17orf80 (ENSMMUG00000001269) #17 CPSF4L (ENSMMUG00000001271) #18 CDC42EP4 (ENSMMUG00000018148) #19 ENSMMUG00000059502 #20 SDK2 (ENSMMUG00000019970) #21 RPL38 (ENSMMUG00000020582) #22 TTYH2 (ENSMMUG00000003981) #23 DNAI2 (ENSMMUG00000020974) #24 KIF19 (ENSMMUG00000020975) #25 BTBD17 (ENSMMUG00000055658) #26 GPR142 (ENSMMUG00000019178) #27 ENSMMUG00000052991 #28 GPRC5C (ENSMMUG00000013324) #29 CD300A (ENSMMUG00000060412) #30 ENSMMUG00000053006 #31 CD300LB (ENSMMUG00000037742) #32 CD300C (ENSMMUG00000039401) #33 CD300H (ENSMMUG00000052500) #34 ENSMMUG00000057041 #35 ENSMMUG00000064052 #36 ENSMMUG00000058592 #37 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 7 KCNJ2 (ENSMFAG00000010019) ENSMFAG00000057143 #7 ENSMFAG00000065112 SOX9 (ENSMFAG00000039651) #10 SLC39A11 (ENSMFAG00000031162) #11 SSTR2 (ENSMFAG00000030140) #12 ENSMFAG00000054662 ##13 COG1 (ENSMFAG00000018901) #14 FAM104A (ENSMFAG00000042824) #16 C17orf80 (ENSMFAG00000046042) #17 ENSMFAG00000037840 ##31 CDC42EP4 (ENSMFAG00000056650) #19 SDK2 (ENSMFAG00000043895) #21 ENSMFAG00000034510 ENSMFAG00000058986 RPL38 (ENSMFAG00000039785) #22 TTYH2 (ENSMFAG00000038894) #23 DNAI2 (ENSMFAG00000035401) #24 KIF19 (ENSMFAG00000005945) #25 GPR142 (ENSMFAG00000000361) #27 GPRC5C (ENSMFAG00000044390) #29 CD300A (ENSMFAG00000032843) #30 CD300LB (ENSMFAG00000043746) #32 CD300C (ENSMFAG00000057201) #33 ENSMFAG00000048908 #35 CD300H (ENSMFAG00000004042) #34 CD300LD (ENSMFAG00000000921) #36 ENSMFAG00000053007 #37 CD300E (ENSMFAG00000060090) RAB37 (ENSMFAG00000038600) ENSMFAG00000063275 ##31 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.re.b ##22 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.re.b ##22 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Drill MODERN SPECIES 65 ENSMLEG00000035280 KCNJ16 (ENSMLEG00000040988) KCNJ2 (ENSMLEG00000027783) ENSMLEG00000008720 ENSMLEG00000040840 SOX9 (ENSMLEG00000043120) #10 SLC39A11 (ENSMLEG00000039135) #11 ENSMLEG00000027808 SSTR2 (ENSMLEG00000009848) #12 COG1 (ENSMLEG00000012489) #14 FAM104A (ENSMLEG00000037920) #16 C17orf80 (ENSMLEG00000043102) #17 CPSF4L (ENSMLEG00000038527) #18 SDK2 (ENSMLEG00000004609) #21 ENSMLEG00000043208 ENSMLEG00000037985 #22 TTYH2 (ENSMLEG00000029315) #23 DNAI2 (ENSMLEG00000043680) #24 KIF19 (ENSMLEG00000038617) #25 GPR142 (ENSMLEG00000020813) #27 GPRC5C (ENSMLEG00000028780) #29 CD300A (ENSMLEG00000033058) #30 CD300LB (ENSMLEG00000037357) #32 CD300C (ENSMLEG00000039668) #33 CD300H (ENSMLEG00000030567) #34 CD300LD (ENSMLEG00000029601) #36 CD300E (ENSMLEG00000030891) RAB37 (ENSMLEG00000030521) CD300LF (ENSMLEG00000029950) NHERF1 (ENSMLEG00000023881) NAT9 (ENSMLEG00000033072) Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.re.a.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.re.a.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.re.a.a ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 582 PAWR (ENSCATG00000034935) PPP1R12A (ENSCATG00000038278) OTOGL (ENSCATG00000038125) PTPRQ (ENSCATG00000039610) MYF6 (ENSCATG00000029151) MYF5 (ENSCATG00000042162) LIN7A (ENSCATG00000029939) ACSS3 (ENSCATG00000030914) PPFIA2 (ENSCATG00000040747) ENSCATG00000038856 ENSCATG00000031323 ENSCATG00000034351 CCDC59 (ENSCATG00000044760) METTL25 (ENSCATG00000044852) TMTC2 (ENSCATG00000040764) ENSCATG00000022828 ##22 SLC6A15 (ENSCATG00000041025) TSPAN19 (ENSCATG00000034141) LRRIQ1 (ENSCATG00000037866) ALX1 (ENSCATG00000041762) ENSCATG00000038524 RASSF9 (ENSCATG00000038528) NTS (ENSCATG00000039653) MGAT4C (ENSCATG00000019157) Macaca ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.re.a.a ##22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00910000147558 #37 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 432 ABCA5 (ENSMNEG00000013415) MAP2K6 (ENSMNEG00000036682) ENSMNEG00000028037 KCNJ16 (ENSMNEG00000021955) KCNJ2 (ENSMNEG00000009146) ENSMNEG00000033499 SOX9 (ENSMNEG00000042495) #10 SLC39A11 (ENSMNEG00000035521) #11 SSTR2 (ENSMNEG00000037800) #12 COG1 (ENSMNEG00000032253) #14 FAM104A (ENSMNEG00000002163) #16 C17orf80 (ENSMNEG00000019592) #17 CPSF4L (ENSMNEG00000045419) #18 SDK2 (ENSMNEG00000042378) #21 ENSMNEG00000030327 RPL38 (ENSMNEG00000044832) ##22 TTYH2 (ENSMNEG00000033098) #23 DNAI2 (ENSMNEG00000031905) #24 KIF19 (ENSMNEG00000035117) #25 BTBD17 (ENSMNEG00000044052) #26 GPR142 (ENSMNEG00000028608) #27 GPRC5C (ENSMNEG00000039239) #29 CD300A (ENSMNEG00000040443) #30 CD300LB (ENSMNEG00000044948) #32 CD300C (ENSMNEG00000030570) #33 CD300H (ENSMNEG00000031056) #34 CD300LD (ENSMNEG00000045430) #36 CD300E (ENSMNEG00000029895) RAB37 (ENSMNEG00000041357) CD300LF (ENSMNEG00000038869) NHERF1 (ENSMNEG00000032894) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159532 ENSGT00940000160135 ENSGT00950000182832.C.c.a ENSGT00390000006413 ENSGT00940000153203.A.b ENSGT00940000156588 ENSGT00940000156788.d ENSGT00910000147931 ENSGT00910000147074 ENSGT00510000048998 ENSGT00940000168371 ENSGT00940000162565 ENSGT00940000156114 ENSGT00940000155135 ENSGT00940000158503 ENSGT00390000003718.d.re.a.b ##22 ENSGT00940000162575 ENSGT00390000012177 ENSGT00940000158121 ENSGT00390000004352 ENSGT00940000163478 ENSGT00940000153094 ENSGT00940000164053.b ENSGT00940000162421.d ENSGT00940000154413.b.b.a.b.b ENSGT00940000164053.a ENSGT00840000130051 ENSGT00940000153770.s.b.a.b ENSGT00940000154039.a.a.b.b.b ENSGT00940000153048.B.c.b.a.a.a.a.a.a.b.d.b ENSGT00940000153048.B.c.b.a.a.b.a.a Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000007547.g.a ENSGT00940000159532 ENSGT00940000160135 ENSGT00950000182832.C.c.a ENSGT00390000006413 ENSGT00940000153203.A.b ENSGT00940000156588 ENSGT00940000156788.d ENSGT00910000147931 ENSGT00910000147074 ENSGT00510000048998 ENSGT00940000162565 ENSGT00940000156114 ENSGT00940000155135 ENSGT00940000158503 ENSGT00390000003718.d.re.a.b ##22 ENSGT00940000162575 ENSGT00390000012177 ENSGT00940000158121 ENSGT00390000004352 ENSGT00940000163478 ENSGT00940000153094.f ENSGT00940000154413.b.b.a.b.b ENSGT00940000164053.a ENSGT00840000130051 ENSGT00940000153770.s.b.a.b ENSGT00940000154039.a.a.b.b.b ENSGT00940000154413.b.b.b.a.b.a.b Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00940000153203.A.b ENSGT00940000156588 ENSGT00940000156788.d ENSGT00910000147931 ENSGT00910000147074 ENSGT00510000048998 ENSGT00940000162565 ENSGT00940000156114 ENSGT00940000155135 ENSGT00940000158503 ENSGT00390000003718.d.re.a.b ##22 ENSGT00940000162575 ENSGT00390000012177 ENSGT00940000158121 ENSGT00390000004352 ENSGT00940000163478 ENSGT00940000153094.f ENSGT00940000154413.b.b.a.b.b ENSGT00940000164053.a ENSGT00940000153770.s.b.a.b ENSGT00940000154039.a.a.b.b.b ENSGT00940000154413.b.b.b.a.b.a.b Drill MODERN SPECIES 1313 THNSL2 (ENSMLEG00000029887) ENSMLEG00000028626 ##22 FOXI3 (ENSMLEG00000027984) TEX37 (ENSMLEG00000027825) EIF2AK3 (ENSMLEG00000009953) RPIA (ENSMLEG00000005377) IGKC (ENSMLEG00000022333) IGKV4-1 (ENSMLEG00000039156) ENSMLEG00000038920 IGKV5-2 (ENSMLEG00000036822) ENSMLEG00000036647 ENSMLEG00000035965 ENSMLEG00000035825 Sooty mangabey MODERN SPECIES 289 RMND5A (ENSCATG00000002310) CD8A (ENSCATG00000003978) ENSCATG00000036485 ENSCATG00000034741 ENSCATG00000034755 KRCC1 (ENSCATG00000043332) SMYD1 (ENSCATG00000020543) FABP1 (ENSCATG00000035137) THNSL2 (ENSCATG00000031123) ENSCATG00000024547 ##22 FOXI3 (ENSCATG00000030139) EIF2AK3 (ENSCATG00000003348) RPIA (ENSCATG00000032077) IGKC (ENSCATG00000042749) IGKV4-1 (ENSCATG00000009930) ENSCATG00000009395 IGKV5-2 (ENSCATG00000014565) ENSCATG00000042626 ENSCATG00000042682 ENSCATG00000042800 ENSCATG00000042833 ENSCATG00000043296 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157836 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.re.b ##22 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00910000147558 #37 ENSGT00940000162923 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157836 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.re.b ##22 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT00390000012976.d.w.e.b.b.a ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.re.b ##22 ENSGT00910000147207 ENSGT00390000003718.d.se #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 Sooty mangabey MODERN SPECIES 519 ABCA5 (ENSCATG00000045332) MAP2K6 (ENSCATG00000044176) ENSCATG00000042046 KCNJ16 (ENSCATG00000027784) KCNJ2 (ENSCATG00000021487) ENSCATG00000044321 ENSCATG00000038337 SOX9 (ENSCATG00000039427) #10 SLC39A11 (ENSCATG00000037201) #11 SSTR2 (ENSCATG00000018657) #12 COG1 (ENSCATG00000035112) #14 FAM104A (ENSCATG00000017508) #16 C17orf80 (ENSCATG00000041538) #17 CPSF4L (ENSCATG00000044555) #18 SDK2 (ENSCATG00000038911) #21 RPL38 (ENSCATG00000044644) ##22 TTYH2 (ENSCATG00000038553) #23 DNAI2 (ENSCATG00000034158) #24 KIF19 (ENSCATG00000033235) #25 BTBD17 (ENSCATG00000040376) #26 GPR142 (ENSCATG00000019103) #27 GPRC5C (ENSCATG00000029731) #29 CD300A (ENSCATG00000037056) #30 CD300LB (ENSCATG00000033920) #32 CD300C (ENSCATG00000021569) #33 CD300LD (ENSCATG00000040044) #36 CD300H (ENSCATG00000042035) #34 CD300E (ENSCATG00000041331) CD300LF (ENSCATG00000036652) RAB37 (ENSCATG00000045330) NHERF1 (ENSCATG00000035401) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 400 ENSGT00940000153203.A.b ENSGT00940000156588 ENSGT00940000156788.d ENSGT00910000147074 ENSGT00510000048998 ENSGT00940000162565 ENSGT00940000156114 ENSGT00940000155135 ENSGT00940000158503 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00940000162575 ENSGT00390000012177 ENSGT00940000158121 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1895 RMND5A (ENSRBIG00000033920) CD8A (ENSRBIG00000033085) ENSRBIG00000033236 ENSRBIG00000026468 ENSRBIG00000028013 SMYD1 (ENSRBIG00000040066) FABP1 (ENSRBIG00000039010) THNSL2 (ENSRBIG00000040021) ENSRBIG00000040464 #22 FOXI3 (ENSRBIG00000028300) TEX37 (ENSRBIG00000034016) EIF2AK3 (ENSRBIG00000028761) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 83 ENSRBIG00000039775 ENSRBIG00000018435 #22 ADA2 (ENSRBIG00000042784) HDHD5 (ENSRBIG00000043979) ENSRBIG00000024898 IL17RA (ENSRBIG00000030702) GAB4 (ENSRBIG00000032342) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 768 VEZF1 (ENSRBIG00000033918) ENSRBIG00000015194 SOX9 (ENSRBIG00000028552) #10 ENSRBIG00000033035 SLC39A11 (ENSRBIG00000032451) #11 SSTR2 (ENSRBIG00000018111) #12 COG1 (ENSRBIG00000044301) #14 FAM104A (ENSRBIG00000031358) #16 C17orf80 (ENSRBIG00000037539) #17 CPSF4L (ENSRBIG00000029048) #18 SDK2 (ENSRBIG00000041498) #21 ENSRBIG00000037664 ENSRBIG00000041938 #22 TTYH2 (ENSRBIG00000033451) #23 DNAI2 (ENSRBIG00000035658) #24 KIF19 (ENSRBIG00000037520) #25 BTBD17 (ENSRBIG00000042635) #26 GPR142 (ENSRBIG00000036597) #27 GPRC5C (ENSRBIG00000036064) #29 CD300A (ENSRBIG00000027155) #30 CD300LB (ENSRBIG00000043517) #32 CD300C (ENSRBIG00000044743) #33 CD300LD (ENSRBIG00000034740) #36 ENSRBIG00000041731 #37 CD300E (ENSRBIG00000044803) RAB37 (ENSRBIG00000039720) CD300LF (ENSRBIG00000034408) NHERF1 (ENSRBIG00000027528) Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1832 CP (ENSRROG00000042142) HPS3 (ENSRROG00000009620) HLTF (ENSRROG00000028898) GYG1 (ENSRROG00000035996) CPA3 (ENSRROG00000031917) CPB1 (ENSRROG00000032160) AGTR1 (ENSRROG00000031154) ENSRROG00000041420 #22 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1436 ENSRROG00000016331 #22 ADA2 (ENSRROG00000033233) HDHD5 (ENSRROG00000041082) ENSRROG00000027112 IL17RA (ENSRROG00000042461) GAB4 (ENSRROG00000044995) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2085 RMND5A (ENSRROG00000038497) CD8A (ENSRROG00000038532) ENSRROG00000031301 ENSRROG00000030033 KRCC1 (ENSRROG00000012362) SMYD1 (ENSRROG00000036467) FABP1 (ENSRROG00000039760) THNSL2 (ENSRROG00000030444) ENSRROG00000029095 #22 FOXI3 (ENSRROG00000030891) TEX37 (ENSRROG00000033661) EIF2AK3 (ENSRROG00000039012) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2632 ENSRROG00000033547 #22 TTYH2 (ENSRROG00000029677) #23 DNAI2 (ENSRROG00000033625) #24 KIF19 (ENSRROG00000003635) #25 BTBD17 (ENSRROG00000030562) #26 GPR142 (ENSRROG00000041483) #27 GPRC5C (ENSRROG00000034200) #29 CD300A (ENSRROG00000034374) #30 CD300LB (ENSRROG00000029075) #32 CD300C (ENSRROG00000027660) #33 CD300LD (ENSRROG00000036601) #36 ENSRROG00000043695 #37 CD300H (ENSRROG00000038499) #34 CD300E (ENSRROG00000042204) CD300LF (ENSRROG00000042715) RAB37 (ENSRROG00000037238) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 849 ENSRROG00000016928 #22 LAMA4 (ENSRROG00000000789) ENSRROG00000026654 FAM229B (ENSRROG00000027891) TUBE1 (ENSRROG00000031663) CCN6 (ENSRROG00000041294) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 12 ENSNLEG00000034209 ENSNLEG00000035802 TACC3 (ENSNLEG00000000057) ENSNLEG00000000063 LETM1 (ENSNLEG00000000067) NSD2 (ENSNLEG00000000081) ENSNLEG00000000120 ENSNLEG00000030858 ENSNLEG00000035664 ENSNLEG00000000145 POLN (ENSNLEG00000000132) ENSNLEG00000036277 ENSNLEG00000000149 ZFYVE28 (ENSNLEG00000000151) ENSNLEG00000000154 ENSNLEG00000034085 #22 ENSNLEG00000031900 FAM193A (ENSNLEG00000000167) ENSNLEG00000000191 SH3BP2 (ENSNLEG00000000199) ADD1 (ENSNLEG00000000201) MFSD10 (ENSNLEG00000000234) NOP14 (ENSNLEG00000000239) GRK4 (ENSNLEG00000000261) HTT (ENSNLEG00000000273) ENSNLEG00000000286 ENSNLEG00000000287 HGFAC (ENSNLEG00000000301) DOK7 (ENSNLEG00000000308) LRPAP1 (ENSNLEG00000000309) ENSNLEG00000018645 Gibbon MODERN SPECIES 10 KLHL9 (ENSNLEG00000019003) IFNA5 (ENSNLEG00000036196) IFNW1 (ENSNLEG00000018982) IFNB1 (ENSNLEG00000018983) HACD4 (ENSNLEG00000031309) FOCAD (ENSNLEG00000017507) MLLT3 (ENSNLEG00000017518) ENSNLEG00000031226 SLC24A2 (ENSNLEG00000017526) ENSNLEG00000033918 ENSNLEG00000029682 ACER2 (ENSNLEG00000017530) ENSNLEG00000017532 DENND4C (ENSNLEG00000017539) ENSNLEG00000031450 ENSNLEG00000027546 #22 PLIN2 (ENSNLEG00000017545) HAUS6 (ENSNLEG00000017550) RRAGA (ENSNLEG00000018985) ENSNLEG00000035167 ENSNLEG00000017559 ENSNLEG00000030741 ADAMTSL1 (ENSNLEG00000017561) ENSNLEG00000031500 ENSNLEG00000033664 SH3GL2 (ENSNLEG00000017566) CNTLN (ENSNLEG00000017575) BNC2 (ENSNLEG00000017578) ENSNLEG00000017580 CCDC171 (ENSNLEG00000017581) ENSNLEG00000032210 Gibbon MODERN SPECIES 109 TTYH2 (ENSNLEG00000000082) #23 USP22 (ENSNLEG00000000079) DHRS7B (ENSNLEG00000000073) TMEM11 (ENSNLEG00000000069) ENSNLEG00000000066 ENSNLEG00000029022 #22 BTBD17 (ENSNLEG00000000065) #26 ENSNLEG00000032508 #27 ENSNLEG00000000064 ENSNLEG00000029720 #22 DNAI2 (ENSNLEG00000000060) #24 ENSNLEG00000000059 EFHC2 (ENSNLEG00000000052) Gibbon MODERN SPECIES 109 TTYH2 (ENSNLEG00000000082) #23 USP22 (ENSNLEG00000000079) DHRS7B (ENSNLEG00000000073) TMEM11 (ENSNLEG00000000069) ENSNLEG00000000066 ENSNLEG00000029022 #22 BTBD17 (ENSNLEG00000000065) #26 ENSNLEG00000032508 #27 ENSNLEG00000000064 ENSNLEG00000029720 #22 DNAI2 (ENSNLEG00000000060) #24 ENSNLEG00000000059 EFHC2 (ENSNLEG00000000052) Gibbon MODERN SPECIES 23 UBA5 (ENSNLEG00000003372) NPHP3 (ENSNLEG00000003236) TMEM108 (ENSNLEG00000003457) BFSP2 (ENSNLEG00000003460) CDV3 (ENSNLEG00000033236) TOPBP1 (ENSNLEG00000003485) TF (ENSNLEG00000003589) SRPRB (ENSNLEG00000003655) RAB6B (ENSNLEG00000003675) ENSNLEG00000003682 ENSNLEG00000029988 SLCO2A1 (ENSNLEG00000003683) RYK (ENSNLEG00000003710) AMOTL2 (ENSNLEG00000003726) ENSNLEG00000035076 ENSNLEG00000029031 #22 ANAPC13 (ENSNLEG00000003759) CEP63 (ENSNLEG00000003771) KY (ENSNLEG00000003783) EPHB1 (ENSNLEG00000003807) PPP2R3A (ENSNLEG00000003845) MSL2 (ENSNLEG00000003914) PCCB (ENSNLEG00000003922) ENSNLEG00000028321 STAG1 (ENSNLEG00000004010) ENSNLEG00000031585 SLC35G2 (ENSNLEG00000004084) ENSNLEG00000034003 NCK1 (ENSNLEG00000004091) IL20RB (ENSNLEG00000004107) SOX14 (ENSNLEG00000019028) Gibbon MODERN SPECIES ZNF264 (ENSNLEG00000010888) ENSNLEG00000035235 ENSNLEG00000010886 ENSNLEG00000010884 PEG3 (ENSNLEG00000027048) ENSNLEG00000031732 ZNF835 (ENSNLEG00000019189) SMIM17 (ENSNLEG00000010875) ENSNLEG00000029486 ENSNLEG00000010873 ZNF470 (ENSNLEG00000030367) ZFP28 (ENSNLEG00000031529) ZNF471 (ENSNLEG00000035719) ZNF667 (ENSNLEG00000010835) ZNF583 (ENSNLEG00000010817) ENSNLEG00000031161 #22 ZNF582 (ENSNLEG00000010794) EDDM13 (ENSNLEG00000030879) ZSCAN5A (ENSNLEG00000010791) ZSCAN5C (ENSNLEG00000010789) ZSCAN5B (ENSNLEG00000010781) GALP (ENSNLEG00000010775) ZNF444 (ENSNLEG00000034144) NLRP5 (ENSNLEG00000010742) NLRP8 (ENSNLEG00000010724) NLRP13 (ENSNLEG00000010718) NLRP4 (ENSNLEG00000010674) NLRP11 (ENSNLEG00000010660) ENSNLEG00000010648 ENSNLEG00000010640 ENSNLEG00000029211 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000162930 ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Gorilla MODERN SPECIES 18 ENSGGOG00000036820 ABCA5 (ENSGGOG00000014851) MAP2K6 (ENSGGOG00000006086) KCNJ16 (ENSGGOG00000038841) KCNJ2 (ENSGGOG00000038514) ENSGGOG00000039924 ENSGGOG00000024982 SOX9 (ENSGGOG00000001756) #10 ENSGGOG00000016888 SLC39A11 (ENSGGOG00000005444) #11 COG1 (ENSGGOG00000014608) #14 FAM104A (ENSGGOG00000014626) #16 C17orf80 (ENSGGOG00000012758) #17 CPSF4L (ENSGGOG00000026659) #18 SDK2 (ENSGGOG00000011094) #21 RPL38 (ENSGGOG00000000794) #22 TTYH2 (ENSGGOG00000000795) #23 DNAI2 (ENSGGOG00000000797) #24 KIF19 (ENSGGOG00000017046) #25 BTBD17 (ENSGGOG00000017055) #26 GPR142 (ENSGGOG00000038242) #27 GPRC5C (ENSGGOG00000003012) #29 CD300A (ENSGGOG00000003016) #30 CD300LB (ENSGGOG00000013480) #32 CD300C (ENSGGOG00000009026) #33 CD300H (ENSGGOG00000037028) #34 CD300LD (ENSGGOG00000009022) #36 CD300E (ENSGGOG00000038806) CD300LF (ENSGGOG00000013516) RAB37 (ENSGGOG00000003279) NHERF1 (ENSGGOG00000003285) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00910000147358 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Human MODERN SPECIES 8 ABCA6 (ENSG00000154262) ABCA10 (ENSG00000154263) ABCA5 (ENSG00000154265) MAP2K6 (ENSG00000108984) KCNJ16 (ENSG00000153822) KCNJ2 (ENSG00000123700) SOX9 (ENSG00000125398) #10 SLC39A11 (ENSG00000133195) #11 SSTR2 (ENSG00000180616) #12 COG1 (ENSG00000166685) #14 FAM104A (ENSG00000133193) #16 C17orf80 (ENSG00000141219) #17 CPSF4L (ENSG00000187959) #18 CDC42EP4 (ENSG00000179604) #19 SDK2 (ENSG00000069188) #21 RPL38 (ENSG00000172809) #22 TTYH2 (ENSG00000141540) #23 DNAI2 (ENSG00000171595) #24 KIF19 (ENSG00000196169) #25 BTBD17 (ENSG00000204347) #26 GPR142 (ENSG00000257008) #27 GPRC5C (ENSG00000170412) #29 CD300A (ENSG00000167851) #30 CD300LB (ENSG00000178789) #32 CD300C (ENSG00000167850) #33 CD300H (ENSG00000284690) #34 CD300LD (ENSG00000204345) #36 CD300E (ENSG00000186407) RAB37 (ENSG00000172794) CD300LF (ENSG00000186074) NHERF1 (ENSG00000109062) Pan ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT01030000234570.d.b.a.a.a.b.a.b.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00390000016654.h ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00950000183198.c.b.a ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Bonobo DUPLICATION Bonobo MODERN SPECIES 8 ABCA5 (ENSPPAG00000026755) MAP2K6 (ENSPPAG00000037391) ENSPPAG00000006075 KCNJ16 (ENSPPAG00000031417) KCNJ2 (ENSPPAG00000008705) ENSPPAG00000041429 SLC39A11 (ENSPPAG00000042131) #11 ENSPPAG00000040425 SSTR2 (ENSPPAG00000009833) #12 COG1 (ENSPPAG00000022776) #14 FAM104A (ENSPPAG00000026305) #16 C17orf80 (ENSPPAG00000013380) #17 ENSPPAG00000037000 #18 SDK2 (ENSPPAG00000029571) #21 ENSPPAG00000004056 ENSPPAG00000032390 #22 TTYH2 (ENSPPAG00000029136) #23 DNAI2 (ENSPPAG00000038808) #24 KIF19 (ENSPPAG00000031161) #25 BTBD17 (ENSPPAG00000042921) #26 ENSPPAG00000026117 #27 GPRC5C (ENSPPAG00000031875) #29 CD300A (ENSPPAG00000040554) #30 CD300LB (ENSPPAG00000026145) #32 CD300C (ENSPPAG00000030050) #33 CD300H (ENSPPAG00000033709) #34 CD300LD (ENSPPAG00000040676) #36 CD300E (ENSPPAG00000040237) RAB37 (ENSPPAG00000030513) CD300LF (ENSPPAG00000003708) NHERF1 (ENSPPAG00000013929) Bonobo MODERN SPECIES 7 FBXL19 (ENSPPAG00000037434) ORAI3 (ENSPPAG00000043816) ENSPPAG00000030470 HSD3B7 (ENSPPAG00000028637) STX1B (ENSPPAG00000041683) STX4 (ENSPPAG00000033630) ZNF668 (ENSPPAG00000043141) ENSPPAG00000004388 ZNF646 (ENSPPAG00000042912) PRSS53 (ENSPPAG00000042266) VKORC1 (ENSPPAG00000037377) BCKDK (ENSPPAG00000029384) KAT8 (ENSPPAG00000015780) PRSS8 (ENSPPAG00000018349) PRSS36 (ENSPPAG00000034979) ENSPPAG00000027648 #22 FUS (ENSPPAG00000029090) PYCARD (ENSPPAG00000043118) ENSPPAG00000028655 PYDC1 (ENSPPAG00000018387) ITGAM (ENSPPAG00000037254) ITGAX (ENSPPAG00000041068) COX6A2 (ENSPPAG00000030275) ZNF843 (ENSPPAG00000031687) ARMC5 (ENSPPAG00000031477) TGFB1I1 (ENSPPAG00000036616) SLC5A2 (ENSPPAG00000041538) RUSF1 (ENSPPAG00000036457) AHSP (ENSPPAG00000035085) ENSPPAG00000040941 ENSPPAG00000028676 Chimpanzee DUPLICATION Chimpanzee MODERN SPECIES 8 ABCA5 (ENSPTRG00000009587) MAP2K6 (ENSPTRG00000009588) KCNJ16 (ENSPTRG00000009589) KCNJ2 (ENSPTRG00000009590) ENSPTRG00000049344 SOX9 (ENSPTRG00000009592) #10 SLC39A11 (ENSPTRG00000009593) #11 ENSPTRG00000049580 SSTR2 (ENSPTRG00000043320) #12 COG1 (ENSPTRG00000009595) #14 FAM104A (ENSPTRG00000051372) #16 C17H17orf80 (ENSPTRG00000009597) #17 CPSF4L (ENSPTRG00000009598) #18 SDK2 (ENSPTRG00000009600) #21 ENSPTRG00000038867 RPL38 (ENSPTRG00000023234) #22 TTYH2 (ENSPTRG00000009603) #23 DNAI2 (ENSPTRG00000009604) #24 KIF19 (ENSPTRG00000051390) #25 BTBD17 (ENSPTRG00000030786) #26 GPR142 (ENSPTRG00000009605) #27 GPRC5C (ENSPTRG00000009607) #29 ENSPTRG00000050552 CD300A (ENSPTRG00000022952) #30 CD300LB (ENSPTRG00000009610) #32 CD300C (ENSPTRG00000009611) #33 CD300H (ENSPTRG00000050623) #34 CD300LD (ENSPTRG00000030785) #36 CD300E (ENSPTRG00000009613) RAB37 (ENSPTRG00000009614) CD300LF (ENSPTRG00000009615) Chimpanzee MODERN SPECIES 7 ORAI3 (ENSPTRG00000008022) SETD1A (ENSPTRG00000008024) HSD3B7 (ENSPTRG00000008025) ENSPTRG00000052370 STX1B (ENSPTRG00000047467) STX4 (ENSPTRG00000052011) ZNF668 (ENSPTRG00000008028) ENSPTRG00000041481 ZNF646 (ENSPTRG00000008029) PRSS53 (ENSPTRG00000031216) VKORC1 (ENSPTRG00000008031) BCKDK (ENSPTRG00000008032) KAT8 (ENSPTRG00000008034) PRSS8 (ENSPTRG00000008035) PRSS36 (ENSPTRG00000008036) ENSPTRG00000051899 #22 FUS (ENSPTRG00000008038) PYCARD (ENSPTRG00000008039) TRIM72 (ENSPTRG00000008040) PYDC1 (ENSPTRG00000008041) ITGAM (ENSPTRG00000008042) ITGAX (ENSPTRG00000008043) ITGAD (ENSPTRG00000008045) COX6A2 (ENSPTRG00000008046) ZNF843 (ENSPTRG00000008047) ARMC5 (ENSPTRG00000031215) TGFB1I1 (ENSPTRG00000008048) SLC5A2 (ENSPTRG00000008049) RUSF1 (ENSPTRG00000008050) AHSP (ENSPTRG00000008051) ENSPTRG00000043509 Orangutan DUPLICATION Orangutan MODERN SPECIES 8 ABCA5 (ENSPPYG00000008578) MAP2K6 (ENSPPYG00000008579) ENSPPYG00000032404 KCNJ16 (ENSPPYG00000008580) KCNJ2 (ENSPPYG00000008581) ENSPPYG00000033887 SOX9 (ENSPPYG00000008583) #10 SLC39A11 (ENSPPYG00000008584) #11 SSTR2 (ENSPPYG00000008585) #12 COG1 (ENSPPYG00000008586) #14 FAM104A (ENSPPYG00000035801) #16 C17H17orf80 (ENSPPYG00000008588) #17 CPSF4L (ENSPPYG00000008589) #18 CDC42EP4 (ENSPPYG00000008590) #19 SDK2 (ENSPPYG00000008591) #21 ENSPPYG00000008592 #22 TTYH2 (ENSPPYG00000040576) #23 DNAI2 (ENSPPYG00000008593) #24 KIF19 (ENSPPYG00000008594) #25 BTBD17 (ENSPPYG00000008596) #26 ENSPPYG00000036953 #27 GPRC5C (ENSPPYG00000008597) #29 CD300A (ENSPPYG00000008598) #30 CD300LB (ENSPPYG00000008599) #32 CD300C (ENSPPYG00000008600) #33 CD300H (ENSPPYG00000029659) #34 CD300LD (ENSPPYG00000008793) #36 CD300E (ENSPPYG00000030417) RAB37 (ENSPPYG00000008601) CD300LF (ENSPPYG00000008602) NHERF1 (ENSPPYG00000008603) Orangutan MODERN SPECIES 7 ENSPPYG00000007295 SETD1A (ENSPPYG00000007296) HSD3B7 (ENSPPYG00000007298) ENSPPYG00000007299 STX1B (ENSPPYG00000007300) STX4 (ENSPPYG00000007301) ZNF668 (ENSPPYG00000007302) ENSPPYG00000007303 ZNF646 (ENSPPYG00000007304) PRSS53 (ENSPPYG00000007305) VKORC1 (ENSPPYG00000007306) BCKDK (ENSPPYG00000007307) KAT8 (ENSPPYG00000007308) PRSS8 (ENSPPYG00000007309) PRSS36 (ENSPPYG00000007310) ENSPPYG00000037533 #22 FUS (ENSPPYG00000007311) PYCARD (ENSPPYG00000007312) TRIM72 (ENSPPYG00000007313) PYDC1 (ENSPPYG00000007314) ITGAM (ENSPPYG00000007315) ITGAX (ENSPPYG00000007316) ITGAD (ENSPPYG00000007720) COX6A2 (ENSPPYG00000029934) ENSPPYG00000038064 ARMC5 (ENSPPYG00000007722) TGFB1I1 (ENSPPYG00000007723) SLC5A2 (ENSPPYG00000007724) RUSF1 (ENSPPYG00000007725) ENSPPYG00000007726 ENSPPYG00000041445 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00390000005544.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00940000153340.A.f.b ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b.c ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 638 LYRM4 (ENSANAG00000024664) RPP40 (ENSANAG00000029246) CDYL (ENSANAG00000023827) ECI2 (ENSANAG00000028772) ENSANAG00000030717 FAM217A (ENSANAG00000004744) PRPF4B (ENSANAG00000021606) FAM50B (ENSANAG00000031334) ENSANAG00000021015 SLC22A23 (ENSANAG00000023717) PSMG4 (ENSANAG00000032191) TUBB2B (ENSANAG00000036086) TUBB2A (ENSANAG00000030561) ENSANAG00000020303 RIPK1 (ENSANAG00000033311) ENSANAG00000007502 #22 NQO2 (ENSANAG00000033860) Mas night monkey MODERN SPECIES 416 ANKRD13B (ENSANAG00000022739) CORO6 (ENSANAG00000037277) SSH2 (ENSANAG00000035004) EFCAB5 (ENSANAG00000029142) NSRP1 (ENSANAG00000036718) ENSANAG00000032683 SLC6A4 (ENSANAG00000037608) ENSANAG00000027013 TMIGD1 (ENSANAG00000033151) CPD (ENSANAG00000036274) GOSR1 (ENSANAG00000033659) OMG (ENSANAG00000019586) EVI2A (ENSANAG00000038419) NF1 (ENSANAG00000036517) RAB11FIP4 (ENSANAG00000025781) ENSANAG00000021628 #22 ENSANAG00000023634 ENSANAG00000021368 UTP6 (ENSANAG00000034603) ENSANAG00000019084 ENSANAG00000035949 SUZ12 (ENSANAG00000025936) CRLF3 (ENSANAG00000026772) ATAD5 (ENSANAG00000038293) ENSANAG00000030251 TEFM (ENSANAG00000037987) ADAP2 (ENSANAG00000020704) RNF135 (ENSANAG00000020022) ENSANAG00000029584 RHBDL3 (ENSANAG00000027744) C17orf75 (ENSANAG00000032338) Mas night monkey MODERN SPECIES 507 ABCA5 (ENSANAG00000029526) MAP2K6 (ENSANAG00000020617) ENSANAG00000002737 KCNJ16 (ENSANAG00000021020) KCNJ2 (ENSANAG00000019903) ENSANAG00000031447 SOX9 (ENSANAG00000023308) #10 SLC39A11 (ENSANAG00000024886) #11 SSTR2 (ENSANAG00000020060) #12 COG1 (ENSANAG00000030041) #14 FAM104A (ENSANAG00000029716) #16 C17orf80 (ENSANAG00000036430) #17 ENSANAG00000026558 #18 SDK2 (ENSANAG00000036105) #21 ENSANAG00000038317 ENSANAG00000030554 #22 TTYH2 (ENSANAG00000027441) #23 DNAI2 (ENSANAG00000035055) #24 KIF19 (ENSANAG00000036368) #25 BTBD17 (ENSANAG00000028515) #26 GPR142 (ENSANAG00000030423) #27 GPRC5C (ENSANAG00000024331) #29 ENSANAG00000025097 #30 CD300LB (ENSANAG00000032736) #32 CD300C (ENSANAG00000032831) #33 ENSANAG00000026050 CD300LF (ENSANAG00000023453) NHERF1 (ENSANAG00000008865) NAT9 (ENSANAG00000024596) TMEM104 (ENSANAG00000030776) GRIN2C (ENSANAG00000021040) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00390000005544.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00940000153340.A.f.b ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b.d ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Marmoset DUPLICATION Marmoset MODERN SPECIES 21 ENSCJAG00000006744 FKBP4 (ENSCJAG00000018746) ITFG2 (ENSCJAG00000018765) NRIP2 (ENSCJAG00000083523) TEX52 (ENSCJAG00000018779) RHNO1 (ENSCJAG00000018790) FOXM1 (ENSCJAG00000018781) ENSCJAG00000085073 ##31 TEAD4 (ENSCJAG00000018796) ENSCJAG00000018882 PRMT8 (ENSCJAG00000018891) ENSCJAG00000063173 CRACR2A (ENSCJAG00000018917) ENSCJAG00000082222 PARP11 (ENSCJAG00000001570) ENSCJAG00000021822 #22 ENSCJAG00000001586 CCND2 (ENSCJAG00000001593) TIGAR (ENSCJAG00000040111) FGF23 (ENSCJAG00000069632) FGF6 (ENSCJAG00000001613) ENSCJAG00000001628 ENSCJAG00000001647 ENSCJAG00000075610 ##31 KCNA6 (ENSCJAG00000061475) KCNA1 (ENSCJAG00000068371) KCNA5 (ENSCJAG00000068399) NTF3 (ENSCJAG00000000605) ANO2 (ENSCJAG00000000606) VWF (ENSCJAG00000000613) CD9 (ENSCJAG00000000659) Marmoset MODERN SPECIES 17 ENSCJAG00000082179 ##9 ABCA6 (ENSCJAG00000000190) ABCA5 (ENSCJAG00000000147) MAP2K6 (ENSCJAG00000000122) KCNJ16 (ENSCJAG00000023169) KCNJ2 (ENSCJAG00000000121) SOX9 (ENSCJAG00000087023) #10 SLC39A11 (ENSCJAG00000019941) #11 SSTR2 (ENSCJAG00000019937) #12 COG1 (ENSCJAG00000019919) #14 ENSCJAG00000047768 C17orf80 (ENSCJAG00000019913) #17 CDC42EP4 (ENSCJAG00000019909) #19 SDK2 (ENSCJAG00000019883) #21 ENSCJAG00000076995 ENSCJAG00000055219 #22 TTYH2 (ENSCJAG00000014989) #23 DNAI2 (ENSCJAG00000014971) #24 KIF19 (ENSCJAG00000014908) #25 BTBD17 (ENSCJAG00000014960) #26 GPR142 (ENSCJAG00000041453) #27 GPRC5C (ENSCJAG00000014900) #29 CD300A (ENSCJAG00000014894) #30 CD300LB (ENSCJAG00000014880) #32 CD300C (ENSCJAG00000079657) #33 CD300H (ENSCJAG00000040090) #34 ENSCJAG00000070338 ENSCJAG00000077630 RAB37 (ENSCJAG00000014808) CD300LF (ENSCJAG00000014849) NHERF1 (ENSCJAG00000014794) Marmoset MODERN SPECIES 15 ENSCJAG00000061286 ENSCJAG00000085934 ENSCJAG00000079596 APELA (ENSCJAG00000069932) ENSCJAG00000012493 SMIM31 (ENSCJAG00000043535) ENSCJAG00000082984 ENSCJAG00000075344 ##9 MARCHF1 (ENSCJAG00000012479) TMA16 (ENSCJAG00000012470) NPY5R (ENSCJAG00000012452) NPY1R (ENSCJAG00000012433) NAF1 (ENSCJAG00000012406) ENSCJAG00000077257 FSTL5 (ENSCJAG00000012371) ENSCJAG00000078061 #22 ENSCJAG00000070599 ENSCJAG00000086858 ##9 ENSCJAG00000061224 ENSCJAG00000076962 RAPGEF2 (ENSCJAG00000001355) C4orf45 (ENSCJAG00000001403) FNIP2 (ENSCJAG00000001410) ENSCJAG00000021808 ENSCJAG00000001437 ETFDH (ENSCJAG00000001451) C4orf46 (ENSCJAG00000070486) RXFP1 (ENSCJAG00000001492) TMEM144 (ENSCJAG00000001546) GASK1B (ENSCJAG00000001549) GRIA2 (ENSCJAG00000001564) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00390000005544.b ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00940000153340.A.f.b ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b.d ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Bolivian squirrel monkey DUPLICATION Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 47 DPCD (ENSSBOG00000024659) POLL (ENSSBOG00000035823) BTRC (ENSSBOG00000034480) LBX1 (ENSSBOG00000026504) ENSSBOG00000030742 KAZALD1 (ENSSBOG00000032715) SFXN3 (ENSSBOG00000032559) PDZD7 (ENSSBOG00000035647) LZTS2 (ENSSBOG00000032084) TWNK (ENSSBOG00000020346) MRPL43 (ENSSBOG00000022294) SEMA4G (ENSSBOG00000026805) SLF2 (ENSSBOG00000034063) ENSSBOG00000036188 PAX2 (ENSSBOG00000030216) ENSSBOG00000018963 #22 HIF1AN (ENSSBOG00000023430) NDUFB8 (ENSSBOG00000032796) SEC31B (ENSSBOG00000023347) WNT8B (ENSSBOG00000022114) SCD (ENSSBOG00000032833) PKD2L1 (ENSSBOG00000033363) ENSSBOG00000026797 BLOC1S2 (ENSSBOG00000020521) CWF19L1 (ENSSBOG00000027396) CHUK (ENSSBOG00000024074) ERLIN1 (ENSSBOG00000033053) ENSSBOG00000022350 CPN1 (ENSSBOG00000024485) DNMBP (ENSSBOG00000021393) ABCC2 (ENSSBOG00000034924) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 88 ABCA5 (ENSSBOG00000025946) MAP2K6 (ENSSBOG00000003586) KCNJ16 (ENSSBOG00000025747) KCNJ2 (ENSSBOG00000017466) ENSSBOG00000032441 SOX9 (ENSSBOG00000030686) #10 SLC39A11 (ENSSBOG00000036136) #11 SSTR2 (ENSSBOG00000019147) #12 COG1 (ENSSBOG00000022132) #14 FAM104A (ENSSBOG00000017682) #16 C17orf80 (ENSSBOG00000026614) #17 CPSF4L (ENSSBOG00000033940) #18 ENSSBOG00000035086 SDK2 (ENSSBOG00000011324) #21 ENSSBOG00000019924 RPL38 (ENSSBOG00000033282) #22 TTYH2 (ENSSBOG00000023406) #23 DNAI2 (ENSSBOG00000034286) #24 KIF19 (ENSSBOG00000027134) #25 BTBD17 (ENSSBOG00000034623) #26 GPR142 (ENSSBOG00000026458) #27 GPRC5C (ENSSBOG00000027422) #29 CD300A (ENSSBOG00000030593) #30 CD300LB (ENSSBOG00000027883) #32 CD300C (ENSSBOG00000025855) #33 CD300H (ENSSBOG00000014815) #34 CD300LF (ENSSBOG00000021597) RAB37 (ENSSBOG00000033362) NHERF1 (ENSSBOG00000027825) NAT9 (ENSSBOG00000034130) TMEM104 (ENSSBOG00000003454) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 226 ENSSBOG00000036314 ADGRG7 (ENSSBOG00000028526) TMEM45A (ENSSBOG00000022033) LNP1 (ENSSBOG00000004295) TOMM70 (ENSSBOG00000024449) NIT2 (ENSSBOG00000023356) TBC1D23 (ENSSBOG00000034769) ENSSBOG00000030153 FILIP1L (ENSSBOG00000023827) CMSS1 (ENSSBOG00000030980) COL8A1 (ENSSBOG00000026968) ENSSBOG00000029822 DCBLD2 (ENSSBOG00000023456) ST3GAL6 (ENSSBOG00000020549) CPOX (ENSSBOG00000015923) ENSSBOG00000024584 #22 CLDND1 (ENSSBOG00000032968) Capuchin DUPLICATION Capuchin MODERN SPECIES 58 LRRC4C (ENSCCAG00000019589) ENSCCAG00000026256 ENSCCAG00000021429 API5 (ENSCCAG00000031287) ENSCCAG00000026499 TTC17 (ENSCCAG00000035081) ENSCCAG00000019236 #22 HSD17B12 (ENSCCAG00000031540) ALKBH3 (ENSCCAG00000036907) C11orf96 (ENSCCAG00000006365) ACCSL (ENSCCAG00000037654) ACCS (ENSCCAG00000034085) EXT2 (ENSCCAG00000033740) ALX4 (ENSCCAG00000029037) ENSCCAG00000020098 ENSCCAG00000030210 CD82 (ENSCCAG00000037197) TSPAN18 (ENSCCAG00000025852) TP53I11 (ENSCCAG00000035507) PRDM11 (ENSCCAG00000028556) SYT13 (ENSCCAG00000033600) CHST1 (ENSCCAG00000009268) Capuchin MODERN SPECIES 266 ENSCCAG00000024034 #22 ENSCCAG00000007585 ENSCCAG00000036590 ENSCCAG00000024935 NOSIP (ENSCCAG00000038048) RCN3 (ENSCCAG00000035673) FCGRT (ENSCCAG00000030152) RPS11 (ENSCCAG00000037559) RPL13A (ENSCCAG00000022898) FLT3LG (ENSCCAG00000001876) ALDH16A1 (ENSCCAG00000012874) PIH1D1 (ENSCCAG00000027317) SLC17A7 (ENSCCAG00000026447) GFY (ENSCCAG00000030107) PTH2 (ENSCCAG00000026177) KASH5 (ENSCCAG00000029552) Capuchin MODERN SPECIES 93 KCNJ16 (ENSCCAG00000015334) KCNJ2 (ENSCCAG00000012647) ENSCCAG00000037146 SOX9 (ENSCCAG00000010950) #10 SLC39A11 (ENSCCAG00000036143) #11 ENSCCAG00000027558 SSTR2 (ENSCCAG00000027266) #12 COG1 (ENSCCAG00000025397) #14 FAM104A (ENSCCAG00000024331) #16 C17orf80 (ENSCCAG00000028752) #17 CPSF4L (ENSCCAG00000030566) #18 SDK2 (ENSCCAG00000016077) #21 ENSCCAG00000029613 RPL38 (ENSCCAG00000021269) #22 TTYH2 (ENSCCAG00000015369) #23 DNAI2 (ENSCCAG00000022991) #24 KIF19 (ENSCCAG00000028047) #25 BTBD17 (ENSCCAG00000032699) #26 GPRC5C (ENSCCAG00000032191) #29 CD300A (ENSCCAG00000029717) #30 CD300LB (ENSCCAG00000035465) #32 CD300C (ENSCCAG00000022126) #33 CD300H (ENSCCAG00000035813) #34 CD300LD (ENSCCAG00000035078) #36 RAB37 (ENSCCAG00000032419) CD300LF (ENSCCAG00000027275) ENSCCAG00000033036 NAT9 (ENSCCAG00000034844) TMEM104 (ENSCCAG00000026611) Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 6952 GLRB (ENSTSYG00000008031) ENSTSYG00000025454 #22 GRIA2 (ENSTSYG00000013618) ENSTSYG00000026717 DUSP6 (ENSTSYG00000005783) Tarsier MODERN SPECIES 2873 ENSTSYG00000004596 #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000154332.lb ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 133 ABCA8 (ENSOGAG00000001212) ENSOGAG00000001218 ABCA6 (ENSOGAG00000001225) ABCA5 (ENSOGAG00000001230) MAP2K6 (ENSOGAG00000010406) KCNJ16 (ENSOGAG00000032703) KCNJ2 (ENSOGAG00000012603) SOX9 (ENSOGAG00000027844) #10 SLC39A11 (ENSOGAG00000016069) #11 SSTR2 (ENSOGAG00000015033) #12 COG1 (ENSOGAG00000015034) #14 FAM104A (ENSOGAG00000015038) #16 C17orf80 (ENSOGAG00000013150) #17 CDC42EP4 (ENSOGAG00000031296) #19 SDK2 (ENSOGAG00000015042) #21 ENSOGAG00000000002 #22 TTYH2 (ENSOGAG00000000003) #23 DNAI2 (ENSOGAG00000000004) #24 KIF19 (ENSOGAG00000024135) #25 BTBD17 (ENSOGAG00000024690) #26 GPR142 (ENSOGAG00000025457) #27 GPRC5C (ENSOGAG00000006677) #29 CD300A (ENSOGAG00000027589) #30 CD300LB (ENSOGAG00000031160) #32 ENSOGAG00000025944 #33 CD300H (ENSOGAG00000029162) #34 ENSOGAG00000009272 ENSOGAG00000009269 ENSOGAG00000016856 RAB37 (ENSOGAG00000031986) NHERF1 (ENSOGAG00000033254) Bushbaby MODERN SPECIES 363 RAB9B (ENSOGAG00000015082) PLP1 (ENSOGAG00000015080) ENSOGAG00000005390 ENSOGAG00000030762 TCEAL1 (ENSOGAG00000011846) ENSOGAG00000011845 ENSOGAG00000005299 TCEAL4 (ENSOGAG00000030967) ENSOGAG00000034552 ENSOGAG00000027934 BEX3 (ENSOGAG00000014857) ENSOGAG00000014854 TCEAL7 (ENSOGAG00000028590) ENSOGAG00000014850 ENSOGAG00000025432 #22 ENSOGAG00000027892 TCEAL8 (ENSOGAG00000015533) ENSOGAG00000025040 ENSOGAG00000002202 ENSOGAG00000002201 ENSOGAG00000024066 ENSOGAG00000031379 Bushbaby MODERN SPECIES 211 SPNS1 (ENSOGAG00000013797) LAT (ENSOGAG00000032303) SBK1 (ENSOGAG00000025836) XPO6 (ENSOGAG00000012844) GSG1L (ENSOGAG00000015923) KATNIP (ENSOGAG00000015915) GTF3C1 (ENSOGAG00000000875) IL21R (ENSOGAG00000003848) IL4R (ENSOGAG00000024760) NSMCE1 (ENSOGAG00000004831) KDM8 (ENSOGAG00000011854) ZKSCAN2 (ENSOGAG00000009286) ENSOGAG00000009284 LCMT1 (ENSOGAG00000005091) ENSOGAG00000033291 ENSOGAG00000027071 #22 ENSOGAG00000001095 ARHGAP17 (ENSOGAG00000010272) SLC5A11 (ENSOGAG00000010270) TNRC6A (ENSOGAG00000006666) RBBP6 (ENSOGAG00000026986) CACNG3 (ENSOGAG00000027627) PRKCB (ENSOGAG00000001199) CHP2 (ENSOGAG00000005582) ERN2 (ENSOGAG00000005577) PLK1 (ENSOGAG00000005574) DCTN5 (ENSOGAG00000005573) NDUFAB1 (ENSOGAG00000005562) ENSOGAG00000033411 EARS2 (ENSOGAG00000001074) ENSOGAG00000001449 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000164782 #36 ENSGT00940000154332.lb ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Mouse lemur DUPLICATION Mouse lemur MODERN SPECIES 7 UTP6 (ENSMICG00000002632) COPRS (ENSMICG00000029453) RAB11FIP4 (ENSMICG00000002885) OMG (ENSMICG00000002876) NF1 (ENSMICG00000002852) ENSMICG00000037781 ENSMICG00000030136 WSB1 (ENSMICG00000012873) SLC39A11 (ENSMICG00000007456) #11 COG1 (ENSMICG00000007471) #14 FAM104A (ENSMICG00000026803) #16 C17orf80 (ENSMICG00000043063) #17 CPSF4L (ENSMICG00000007503) #18 CDC42EP4 (ENSMICG00000030496) #19 SDK2 (ENSMICG00000005164) #21 ENSMICG00000008493 #22 TTYH2 (ENSMICG00000008496) #23 DNAI2 (ENSMICG00000008509) #24 KIF19 (ENSMICG00000030912) #25 BTBD17 (ENSMICG00000045603) #26 GPR142 (ENSMICG00000035066) #27 GPRC5C (ENSMICG00000008563) #29 CD300A (ENSMICG00000042275) #30 CD300LB (ENSMICG00000037075) #32 ENSMICG00000043041 #33 CD300LD (ENSMICG00000010845) #36 CD300LF (ENSMICG00000010534) RAB37 (ENSMICG00000010541) NHERF1 (ENSMICG00000036133) NAT9 (ENSMICG00000010549) TMEM104 (ENSMICG00000028469) Mouse lemur MODERN SPECIES 29 PYROXD1 (ENSMICG00000043242) RECQL (ENSMICG00000002664) GOLT1B (ENSMICG00000041496) SPX (ENSMICG00000034641) GYS2 (ENSMICG00000017175) LDHB (ENSMICG00000017183) ENSMICG00000043089 KCNJ8 (ENSMICG00000035183) ABCC9 (ENSMICG00000009833) CMAS (ENSMICG00000004164) ENSMICG00000047152 ST8SIA1 (ENSMICG00000002516) C2CD5 (ENSMICG00000002294) ETNK1 (ENSMICG00000009917) ENSMICG00000041591 ENSMICG00000031363 #22 ENSMICG00000036516 ENSMICG00000004844 IRAG2 (ENSMICG00000030721) ETFRF1 (ENSMICG00000031339) DNAI7 (ENSMICG00000001474) LMNTD1 (ENSMICG00000038042) RASSF8 (ENSMICG00000006156) BHLHE41 (ENSMICG00000026785) SSPN (ENSMICG00000029815) ITPR2 (ENSMICG00000009476) INTS13 (ENSMICG00000037722) FGFR1OP2 (ENSMICG00000035135) SOX5 (ENSMICG00000046531) ENSMICG00000006940 AMN1 (ENSMICG00000034335) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000154332.lb ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 892 ENSPCOG00000015952 ABCA10 (ENSPCOG00000017146) ABCA5 (ENSPCOG00000027371) MAP2K6 (ENSPCOG00000025057) KCNJ16 (ENSPCOG00000025538) KCNJ2 (ENSPCOG00000026550) SOX9 (ENSPCOG00000027320) #10 SLC39A11 (ENSPCOG00000016525) #11 SSTR2 (ENSPCOG00000014031) #12 COG1 (ENSPCOG00000027077) #14 FAM104A (ENSPCOG00000028850) #16 C17orf80 (ENSPCOG00000000067) #17 CPSF4L (ENSPCOG00000021801) #18 CDC42EP4 (ENSPCOG00000023944) #19 SDK2 (ENSPCOG00000023677) #21 ENSPCOG00000021573 #22 TTYH2 (ENSPCOG00000008975) #23 DNAI2 (ENSPCOG00000015006) #24 KIF19 (ENSPCOG00000000664) #25 BTBD17 (ENSPCOG00000023303) #26 GPR142 (ENSPCOG00000021056) #27 GPRC5C (ENSPCOG00000002163) #29 CD300A (ENSPCOG00000020679) #30 CD300LB (ENSPCOG00000027652) #32 CD300LD (ENSPCOG00000022467) #36 RAB37 (ENSPCOG00000019537) CD300LF (ENSPCOG00000021028) NHERF1 (ENSPCOG00000024332) NAT9 (ENSPCOG00000026043) TMEM104 (ENSPCOG00000012180) GRIN2C (ENSPCOG00000026141) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 274 RNF13 (ENSPCOG00000020296) ENSPCOG00000016179 ANKUB1 (ENSPCOG00000021560) COMMD2 (ENSPCOG00000022761) WWTR1 (ENSPCOG00000022186) TM4SF4 (ENSPCOG00000025191) TM4SF1 (ENSPCOG00000000568) TM4SF18 (ENSPCOG00000028412) CP (ENSPCOG00000017783) HPS3 (ENSPCOG00000021848) HLTF (ENSPCOG00000021668) GYG1 (ENSPCOG00000023589) CPA3 (ENSPCOG00000017041) CPB1 (ENSPCOG00000021086) AGTR1 (ENSPCOG00000021803) ENSPCOG00000023791 #22 ZIC1 (ENSPCOG00000017619) ZIC4 (ENSPCOG00000012436) Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 122 PTPRU (ENSPSMG00000008032) MECR (ENSPSMG00000008225) SRSF4 (ENSPSMG00000008263) TMEM200B (ENSPSMG00000008276) EPB41 (ENSPSMG00000009246) OPRD1 (ENSPSMG00000010321) YTHDF2 (ENSPSMG00000010340) ENSPSMG00000010343 #22 GMEB1 (ENSPSMG00000010381) TAF12 (ENSPSMG00000010398) ENSPSMG00000010403 RAB42 (ENSPSMG00000010409) TRNAU1AP (ENSPSMG00000010448) RCC1 (ENSPSMG00000010510) PHACTR4 (ENSPSMG00000010641) MED18 (ENSPSMG00000010662) SESN2 (ENSPSMG00000010685) ATP5IF1 (ENSPSMG00000010696) DNAJC8 (ENSPSMG00000010707) PTAFR (ENSPSMG00000010713) EYA3 (ENSPSMG00000010772) XKR8 (ENSPSMG00000010782) SMPDL3B (ENSPSMG00000010811) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 641 TRARG1 (ENSPSMG00000000804) BHLHA9 (ENSPSMG00000000807) ENSPSMG00000000821 #22 ABR (ENSPSMG00000000941) TIMM22 (ENSPSMG00000000958) NXN (ENSPSMG00000000980) MRM3 (ENSPSMG00000000992) GLOD4 (ENSPSMG00000001005) ENSPSMG00000001013 ENSPSMG00000001019 GEMIN4 (ENSPSMG00000001025) TLCD3A (ENSPSMG00000001044) VPS53 (ENSPSMG00000001330) RFLNB (ENSPSMG00000001470) ENSPSMG00000001475 ENSPSMG00000001482 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 248 KCNJ16 (ENSPSMG00000025584) KCNJ2 (ENSPSMG00000025587) SOX9 (ENSPSMG00000025589) #10 SLC39A11 (ENSPSMG00000025593) #11 SSTR2 (ENSPSMG00000025596) #12 COG1 (ENSPSMG00000025611) #14 FAM104A (ENSPSMG00000025615) #16 C17orf80 (ENSPSMG00000025623) #17 CPSF4L (ENSPSMG00000025625) #18 SDK2 (ENSPSMG00000025632) #21 ENSPSMG00000025634 ENSPSMG00000025635 #22 TTYH2 (ENSPSMG00000025639) #23 DNAI2 (ENSPSMG00000025646) #24 KIF19 (ENSPSMG00000025648) #25 BTBD17 (ENSPSMG00000025649) #26 GPR142 (ENSPSMG00000025653) #27 GPRC5C (ENSPSMG00000025661) #29 CD300A (ENSPSMG00000025670) #30 ENSPSMG00000025672 #32 ENSPSMG00000025676 RAB37 (ENSPSMG00000000173) ENSPSMG00000000201 NHERF1 (ENSPSMG00000000248) NAT9 (ENSPSMG00000000300) TMEM104 (ENSPSMG00000000358) GRIN2C (ENSPSMG00000000373) Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 174 B3GAT1 (ENSPSMG00000005240) GLB1L2 (ENSPSMG00000005251) GLB1L3 (ENSPSMG00000005265) ENSPSMG00000005325 ACAD8 (ENSPSMG00000005451) THYN1 (ENSPSMG00000005475) VPS26B (ENSPSMG00000005506) NCAPD3 (ENSPSMG00000005553) JAM3 (ENSPSMG00000005642) IGSF9B (ENSPSMG00000005740) SPATA19 (ENSPSMG00000005756) ENSPSMG00000005767 #22 OPCML (ENSPSMG00000005792) ENSPSMG00000005810 NTM (ENSPSMG00000005877) SNX19 (ENSPSMG00000005926) ADAMTS15 (ENSPSMG00000005961) ENSPSMG00000005974 ENSPSMG00000005983 ZBTB44 (ENSPSMG00000005995) ENSPSMG00000006009 ST14 (ENSPSMG00000006055) APLP2 (ENSPSMG00000006405) PRDM10 (ENSPSMG00000007302) NFRKB (ENSPSMG00000007510) TMEM45B (ENSPSMG00000007519) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Tree shrew MODERN SPECIES 3810 RPL38 (ENSTBEG00000007401) #22 ENSTBEG00000007638 #23 Glires ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d #22 Pika MODERN SPECIES 8807 RPL38 (ENSOPRG00000011901) #22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 9 KCNMA1 (ENSOCUG00000009543) LRMDA (ENSOCUG00000008123) ZNF503 (ENSOCUG00000000028) COMTD1 (ENSOCUG00000009095) VDAC2 (ENSOCUG00000009082) SAMD8 (ENSOCUG00000009076) ENSOCUG00000009072 DUSP29 (ENSOCUG00000026189) KAT6B (ENSOCUG00000017344) ADK (ENSOCUG00000009950) ENSOCUG00000010613 ENSOCUG00000023858 AP3M1 (ENSOCUG00000009946) VCL (ENSOCUG00000003163) PLAU (ENSOCUG00000003155) ENSOCUG00000030476 #22 CAMK2G (ENSOCUG00000012578) NDST2 (ENSOCUG00000012569) ZSWIM8 (ENSOCUG00000020924) CHCHD1 (ENSOCUG00000037036) FUT11 (ENSOCUG00000012565) ENSOCUG00000023881 SYNPO2L (ENSOCUG00000025335) MYOZ1 (ENSOCUG00000012560) USP54 (ENSOCUG00000012547) PPP3CB (ENSOCUG00000012543) ANXA7 (ENSOCUG00000012532) CFAP70 (ENSOCUG00000007151) ENSOCUG00000023231 ENSOCUG00000007144 FAM149B1 (ENSOCUG00000007139) Rabbit MODERN SPECIES 432 GSN (ENSOCUG00000013676) RAB14 (ENSOCUG00000013654) ENSOCUG00000013616 ENSOCUG00000036155 C5 (ENSOCUG00000005673) TRAF1 (ENSOCUG00000005668) PHF19 (ENSOCUG00000005659) ENSOCUG00000022955 PSMD5 (ENSOCUG00000005644) B3GALT9 (ENSOCUG00000024774) FBXW2 (ENSOCUG00000005638) MEGF9 (ENSOCUG00000009745) CDK5RAP2 (ENSOCUG00000012568) ENSOCUG00000024566 BRINP1 (ENSOCUG00000001373) ENSOCUG00000021402 #22 ENSOCUG00000017167 TLR4 (ENSOCUG00000002216) ENSOCUG00000021237 ASTN2 (ENSOCUG00000000863) TRIM32 (ENSOCUG00000000866) ENSOCUG00000027196 ENSOCUG00000022590 PAPPA (ENSOCUG00000001465) ENSOCUG00000031986 ENSOCUG00000038521 TNC (ENSOCUG00000011500) TNFSF8 (ENSOCUG00000009977) TNFSF15 (ENSOCUG00000011701) TEX48 (ENSOCUG00000030181) TMEM268 (ENSOCUG00000004650) Rabbit MODERN SPECIES TXN (ENSOCUG00000030643) ENSOCUG00000029370 SVEP1 (ENSOCUG00000016227) MUSK (ENSOCUG00000017885) LPAR1 (ENSOCUG00000026842) ENSOCUG00000036935 ECPAS (ENSOCUG00000004268) ENSOCUG00000030397 ENSOCUG00000004283 PTGR1 (ENSOCUG00000004879) ENSOCUG00000025587 DNAJC25 (ENSOCUG00000008533) ENSOCUG00000031538 SHOC1 (ENSOCUG00000016284) UGCG (ENSOCUG00000014366) ENSOCUG00000021292 #22 SUSD1 (ENSOCUG00000010435) PTBP3 (ENSOCUG00000017670) HSDL2 (ENSOCUG00000016808) KIAA1958 (ENSOCUG00000016711) INIP (ENSOCUG00000016717) SNX30 (ENSOCUG00000009834) SLC46A2 (ENSOCUG00000009840) ENSOCUG00000026544 ZFP37 (ENSOCUG00000029203) SLC31A2 (ENSOCUG00000026691) FKBP15 (ENSOCUG00000005028) SLC31A1 (ENSOCUG00000005040) CDC26 (ENSOCUG00000005044) PRPF4 (ENSOCUG00000005046) RNF183 (ENSOCUG00000005054) Rabbit MODERN SPECIES 16 ZFP82 (ENSOCUG00000011716) ZFP14 (ENSOCUG00000017838) ENSOCUG00000038506 ENSOCUG00000029606 ZNF568 (ENSOCUG00000038373) ENSOCUG00000035222 ENSOCUG00000021288 ZNF793 (ENSOCUG00000028997) ZNF570 (ENSOCUG00000029052) ZNF569 (ENSOCUG00000003568) ZNF527 (ENSOCUG00000029050) ZNF383 (ENSOCUG00000029068) ENSOCUG00000032129 ZNF420 (ENSOCUG00000011900) ZNF345 (ENSOCUG00000029445) ENSOCUG00000027837 #22 ZNF540 (ENSOCUG00000029170) ZFP30 (ENSOCUG00000010157) ENSOCUG00000039458 ENSOCUG00000029453 ENSOCUG00000029740 ENSOCUG00000029451 ENSOCUG00000026812 ENSOCUG00000035771 ENSOCUG00000031373 ENSOCUG00000008460 SIPA1L3 (ENSOCUG00000009410) ENSOCUG00000002933 PPP1R14A (ENSOCUG00000023406) SPINT2 (ENSOCUG00000037643) ENSOCUG00000031226 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 637 Abca6 (ENSMAUG00000011072) Abca5 (ENSMAUG00000010936) Map2k6 (ENSMAUG00000021003) Kcnj16 (ENSMAUG00000020304) Kcnj2 (ENSMAUG00000020200) ENSMAUG00000006005 Sox9 (ENSMAUG00000020537) #10 ENSMAUG00000020169 Sstr2 (ENSMAUG00000001118) #12 Cog1 (ENSMAUG00000021256) #14 Fam104a (ENSMAUG00000013911) ENSMAUG00000017201 #17 ENSMAUG00000019519 #18 Cdc42ep4 (ENSMAUG00000018916) #19 Sdk2 (ENSMAUG00000007756) #21 ENSMAUG00000021474 #22 Ttyh2 (ENSMAUG00000020869) #23 Dnai2 (ENSMAUG00000018565) #24 Kif19a (ENSMAUG00000019643) #25 Btbd17 (ENSMAUG00000019869) #26 Gpr142 (ENSMAUG00000019626) #27 ENSMAUG00000019126 #29 Cd300a (ENSMAUG00000007287) Cd300lb (ENSMAUG00000020763) #32 ENSMAUG00000005676 #33 ENSMAUG00000019257 Cd300e (ENSMAUG00000019474) ENSMAUG00000018309 Rab37 (ENSMAUG00000021466) Nherf1 (ENSMAUG00000020214) Nat9 (ENSMAUG00000020329) Golden Hamster DUPLICATION Golden Hamster MODERN SPECIES 652 Pole2 (ENSMAUG00000001075) Klhdc2 (ENSMAUG00000012014) ENSMAUG00000009106 ENSMAUG00000000792 Vcpkmt (ENSMAUG00000001299) Sos2 (ENSMAUG00000013147) L2hgdh (ENSMAUG00000015336) Dmac2l (ENSMAUG00000020577) Cdkl1 (ENSMAUG00000020825) Map4k5 (ENSMAUG00000020655) Atl1 (ENSMAUG00000016977) Sav1 (ENSMAUG00000018575) Abhd12b (ENSMAUG00000011642) Pygl (ENSMAUG00000012424) Trim9 (ENSMAUG00000018818) ENSMAUG00000008858 #22 Tmx1 (ENSMAUG00000011486) Frmd6 (ENSMAUG00000015963) ENSMAUG00000016337 Psma3 (ENSMAUG00000020737) Arid4a (ENSMAUG00000016160) Tomm20l (ENSMAUG00000007310) Dact1 (ENSMAUG00000008693) Daam1 (ENSMAUG00000003647) L3hypdh (ENSMAUG00000008290) Jkamp (ENSMAUG00000013918) Ccdc175 (ENSMAUG00000012981) ENSMAUG00000016295 Lrrc9 (ENSMAUG00000002601) Pcnx4 (ENSMAUG00000005473) Gm4756 (ENSMAUG00000008532) Golden Hamster MODERN SPECIES 635 Gldn (ENSMAUG00000009445) Dmxl2 (ENSMAUG00000008761) Sh2d7 (ENSMAUG00000014940) Cib2 (ENSMAUG00000015394) ENSMAUG00000010674 Acsbg1 (ENSMAUG00000020558) Dnaja4 (ENSMAUG00000008986) Skic8 (ENSMAUG00000019417) Crabp1 (ENSMAUG00000019090) ENSMAUG00000020717 Hykk (ENSMAUG00000010181) Psma4 (ENSMAUG00000011209) Chrna5 (ENSMAUG00000016568) Chrna3 (ENSMAUG00000021282) Chrnb4 (ENSMAUG00000012409) ENSMAUG00000010400 #22 Ube2q2 (ENSMAUG00000015749) Fbxo22 (ENSMAUG00000011385) Nrg4 (ENSMAUG00000014620) Tmem266 (ENSMAUG00000017153) Etfa (ENSMAUG00000001806) Isl2 (ENSMAUG00000020574) Scaper (ENSMAUG00000016307) Rcn2 (ENSMAUG00000014484) Pstpip1 (ENSMAUG00000020112) Tspan3 (ENSMAUG00000014926) Peak1 (ENSMAUG00000017952) Hmg20a (ENSMAUG00000016986) Lingo1 (ENSMAUG00000015166) Odf3l1 (ENSMAUG00000016497) Cspg4 (ENSMAUG00000017916) Golden Hamster MODERN SPECIES 628 Scyl2 (ENSMAUG00000013849) ENSMAUG00000010233 ENSMAUG00000014661 Uhrf1bp1l (ENSMAUG00000013302) Anks1b (ENSMAUG00000010615) ENSMAUG00000007841 ENSMAUG00000022277 Slc25a3 (ENSMAUG00000017601) Tmpo (ENSMAUG00000014527) ENSMAUG00000015762 Nedd1 (ENSMAUG00000013081) ENSMAUG00000021431 ENSMAUG00000018845 Cdk17 (ENSMAUG00000017263) Elk3 (ENSMAUG00000009662) ENSMAUG00000008765 #22 Lta4h (ENSMAUG00000001152) Hal (ENSMAUG00000018900) Amdhd1 (ENSMAUG00000018875) Ccdc38 (ENSMAUG00000014067) ENSMAUG00000019737 Ntn4 (ENSMAUG00000004210) Usp44 (ENSMAUG00000000679) ENSMAUG00000014524 Vezt (ENSMAUG00000011049) Nr2c1 (ENSMAUG00000005656) ENSMAUG00000009984 Tmcc3 (ENSMAUG00000001274) Cep83 (ENSMAUG00000018689) Plxnc1 (ENSMAUG00000021960) Cradd (ENSMAUG00000022216) Golden Hamster MODERN SPECIES 624 ENSMAUG00000001140 ENSMAUG00000021221 ENSMAUG00000021673 ENSMAUG00000011217 Spata4 (ENSMAUG00000020002) Asb5 (ENSMAUG00000020509) Spcs3 (ENSMAUG00000010908) Vegfc (ENSMAUG00000022111) ENSMAUG00000018923 ENSMAUG00000010963 ENSMAUG00000019767 Dctd (ENSMAUG00000015286) ENSMAUG00000018016 #22 ENSMAUG00000020907 ENSMAUG00000019841 Cldn22 (ENSMAUG00000009702) Cldn24 (ENSMAUG00000022185) ENSMAUG00000019930 Ing2 (ENSMAUG00000012553) Rwdd4a (ENSMAUG00000001169) Trappc11 (ENSMAUG00000009056) Stox2 (ENSMAUG00000019263) Enpp6 (ENSMAUG00000007201) Irf2 (ENSMAUG00000009382) Casp3 (ENSMAUG00000004837) Cenpu (ENSMAUG00000006619) Acsl1 (ENSMAUG00000008881) Helt (ENSMAUG00000021096) Golden Hamster MODERN SPECIES 631 Kat14 (ENSMAUG00000003665) Pet117 (ENSMAUG00000020835) ENSMAUG00000021046 Mgme1 (ENSMAUG00000021458) Snx5 (ENSMAUG00000017363) ENSMAUG00000020068 Dstn (ENSMAUG00000004696) Bfsp1 (ENSMAUG00000012205) Otor (ENSMAUG00000006818) Snrpb2 (ENSMAUG00000006149) Kif16b (ENSMAUG00000017233) Flrt3 (ENSMAUG00000009243) ENSMAUG00000010487 #22 ENSMAUG00000020675 Sel1l2 (ENSMAUG00000016746) Ndufaf5 (ENSMAUG00000017597) Esf1 (ENSMAUG00000015975) ENSMAUG00000017761 Tasp1 (ENSMAUG00000016013) Ism1 (ENSMAUG00000019102) Sptlc3 (ENSMAUG00000017630) Btbd3 (ENSMAUG00000014183) Jag1 (ENSMAUG00000015416) Slx4ip (ENSMAUG00000019729) Mkks (ENSMAUG00000017675) Snap25 (ENSMAUG00000021765) Ankef1 (ENSMAUG00000014584) Pak5 (ENSMAUG00000011943) Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 16 ENSCGRG00001000138 2010106E10Rik (ENSCGRG00001018464) Zfp711 (ENSCGRG00001010150) Pof1b (ENSCGRG00001015632) Chm (ENSCGRG00001006793) Tpm3-rs7 (ENSCGRG00001006979) Dach2 (ENSCGRG00001023530) ENSCGRG00001006882 Klhl4 (ENSCGRG00001016767) ENSCGRG00001004881 ENSCGRG00001010570 ENSCGRG00001003703 ENSCGRG00001006460 ENSCGRG00001009434 Diaph2 (ENSCGRG00001018454) ENSCGRG00001023968 #22 ENSCGRG00001022345 Pcdh19 (ENSCGRG00001014584) Tnmd (ENSCGRG00001002116) Tspan6 (ENSCGRG00001023806) Srpx2 (ENSCGRG00001015475) Sytl4 (ENSCGRG00001016125) Cstf2 (ENSCGRG00001023023) Nox1 (ENSCGRG00001023137) Xkrx (ENSCGRG00001019171) Arl13a (ENSCGRG00001021947) Trmt2b (ENSCGRG00001021883) Tmem35a (ENSCGRG00001000179) Cenpi (ENSCGRG00001018101) Drp2 (ENSCGRG00001006902) Taf7l (ENSCGRG00001017096) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 92 Dsc3 (ENSCGRG00001018804) ENSCGRG00001000131 ENSCGRG00001020686 ENSCGRG00001019027 Cdh2 (ENSCGRG00001015862) Chst9 (ENSCGRG00001013825) Aqp4 (ENSCGRG00001023202) Kctd1 (ENSCGRG00001007208) ENSCGRG00001021440 Taf4b (ENSCGRG00001003694) Psma8 (ENSCGRG00001022616) Ss18 (ENSCGRG00001023153) Zfp521 (ENSCGRG00001024510) Hrh4 (ENSCGRG00001020367) Impact (ENSCGRG00001014462) ENSCGRG00001008388 #22 Osbpl1a (ENSCGRG00001000881) Cabyr (ENSCGRG00001010088) Ttc39c (ENSCGRG00001022129) Lama3 (ENSCGRG00001008813) Ankrd29 (ENSCGRG00001014314) Npc1 (ENSCGRG00001018684) Rmc1 (ENSCGRG00001014209) Riok3 (ENSCGRG00001013249) Tmem241 (ENSCGRG00001015184) Cables1 (ENSCGRG00001019802) Rbbp8 (ENSCGRG00001003771) Gata6 (ENSCGRG00001017414) Mib1 (ENSCGRG00001022564) Abhd3 (ENSCGRG00001007179) SNRPD1 (ENSCGRG00001021055) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 33 Abca9 (ENSCGRG00001024679) ENSCGRG00001011902 Abca5 (ENSCGRG00001015871) Map2k6 (ENSCGRG00001007180) Kcnj16 (ENSCGRG00001011301) Kcnj2 (ENSCGRG00001010050) ENSCGRG00001011159 Sox9 (ENSCGRG00001024460) #10 Slc39a11 (ENSCGRG00001010962) #11 Sstr2 (ENSCGRG00001016936) #12 Cog1 (ENSCGRG00001018435) #14 Fam104a (ENSCGRG00001011780) D11Wsu47e (ENSCGRG00001012424) #17 Cpsf4l (ENSCGRG00001020079) #18 Sdk2 (ENSCGRG00001025056) #21 Rpl38 (ENSCGRG00001019446) #22 Ttyh2 (ENSCGRG00001023114) #23 Dnai2 (ENSCGRG00001022508) #24 Kif19a (ENSCGRG00001020512) #25 Btbd17 (ENSCGRG00001024464) #26 Gpr142 (ENSCGRG00001005989) #27 Gprc5c (ENSCGRG00001010402) #29 Cd300a (ENSCGRG00001014069) Cd300lb (ENSCGRG00001008822) #32 ENSCGRG00001024453 #33 ENSCGRG00001007118 ENSCGRG00001018598 #33 ENSCGRG00001017837 Cd300e (ENSCGRG00001019219) Rab37 (ENSCGRG00001022608) ENSCGRG00001016617 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 111 Acer2 (ENSCGRG00001023025) ENSCGRG00001022215 ENSCGRG00001022609 Dennd4c (ENSCGRG00001004609) Plin2 (ENSCGRG00001016267) Saxo1 (ENSCGRG00001017278) Adamtsl1 (ENSCGRG00001004761) Sh3gl2 (ENSCGRG00001022450) Cntln (ENSCGRG00001005303) ENSCGRG00001006130 Bnc2 (ENSCGRG00001021192) Ccdc171 (ENSCGRG00001012100) Psip1 (ENSCGRG00001018077) Snapc3 (ENSCGRG00001021052) Ttc39b (ENSCGRG00001023116) ENSCGRG00001006351 #22 Frem1 (ENSCGRG00001012504) Cer1 (ENSCGRG00001014082) Zdhhc21 (ENSCGRG00001015866) Nfib (ENSCGRG00001018402) Mpdz (ENSCGRG00001023758) ENSCGRG00001017051 Lurap1l (ENSCGRG00001018238) Tyrp1 (ENSCGRG00001020616) Ptprd (ENSCGRG00001001921) Dmac1 (ENSCGRG00001012676) ENSCGRG00001003314 Kdm4c (ENSCGRG00001014973) Frmd3 (ENSCGRG00001020520) ENSCGRG00001022505 2310002L09Rik (ENSCGRG00001024634) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 15 Abca5 (ENSMOCG00000012456) Map2k6 (ENSMOCG00000017028) ENSMOCG00000002504 Kcnj16 (ENSMOCG00000013843) Kcnj2 (ENSMOCG00000021823) Sox9 (ENSMOCG00000006903) #10 ENSMOCG00000007307 ENSMOCG00000016669 Sstr2 (ENSMOCG00000016578) #12 Cog1 (ENSMOCG00000014351) #14 Fam104a (ENSMOCG00000018026) ENSMOCG00000013577 #17 ENSMOCG00000015313 #18 Cdc42ep4 (ENSMOCG00000018039) #19 Sdk2 (ENSMOCG00000022457) #21 ENSMOCG00000001940 #22 Ttyh2 (ENSMOCG00000004219) #23 Dnai2 (ENSMOCG00000019588) #24 Kif19a (ENSMOCG00000022165) #25 Btbd17 (ENSMOCG00000022850) #26 Gpr142 (ENSMOCG00000015525) #27 ENSMOCG00000015646 #29 ENSMOCG00000010022 #29 Cd300a (ENSMOCG00000017095) Cd300lb (ENSMOCG00000011178) #32 ENSMOCG00000011510 #33 ENSMOCG00000013747 ENSMOCG00000013708 ENSMOCG00000017967 Cd300e (ENSMOCG00000014452) Rab37 (ENSMOCG00000011264) Prairie vole MODERN SPECIES 89 ENSMOCG00000004072 #22 Ramp3 (ENSMOCG00000021345) Wap (ENSMOCG00000018434) Tbrg4 (ENSMOCG00000011927) Nacad (ENSMOCG00000016674) Ccm2 (ENSMOCG00000010957) Myo1g (ENSMOCG00000019055) ENSMOCG00000021550 ENSMOCG00000019036 Zmiz2 (ENSMOCG00000004069) Ogdh (ENSMOCG00000015048) Tmed4 (ENSMOCG00000018994) Ddx56 (ENSMOCG00000016782) Npc1l1 (ENSMOCG00000022891) ENSMOCG00000010822 Nudcd3 (ENSMOCG00000008685) Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 6 Mroh2b (ENSPEMG00000011744) C7 (ENSPEMG00000009708) Card6 (ENSPEMG00000000513) Rpl37 (ENSPEMG00000015291) ENSPEMG00000029179 Prkaa1 (ENSPEMG00000000574) Ttc33 (ENSPEMG00000026792) Ptger4 (ENSPEMG00000028671) ENSPEMG00000030159 Dab2 (ENSPEMG00000013156) C9 (ENSPEMG00000008329) Fyb (ENSPEMG00000001686) ENSPEMG00000014848 Rictor (ENSPEMG00000000667) Osmr (ENSPEMG00000008906) ENSPEMG00000030395 #22 Lifr (ENSPEMG00000004406) Egflam (ENSPEMG00000017044) Gdnf (ENSPEMG00000027275) Wdr70 (ENSPEMG00000008794) Nup155 (ENSPEMG00000019707) Cplane1 (ENSPEMG00000019802) Nipbl (ENSPEMG00000020126) Slc1a3 (ENSPEMG00000000375) Ranbp3l (ENSPEMG00000002400) Nadk2 (ENSPEMG00000011766) Skp2 (ENSPEMG00000019228) Lmbrd2 (ENSPEMG00000007175) ENSPEMG00000029009 ENSPEMG00000013123 ENSPEMG00000023652 Northern American deer mouse MODERN SPECIES 16 A2ml1 (ENSPEMG00000014330) Pzp (ENSPEMG00000001470) Fkbp4 (ENSPEMG00000018142) Itfg2 (ENSPEMG00000007999) Nrip2 (ENSPEMG00000028553) Tex52 (ENSPEMG00000008805) Foxm1 (ENSPEMG00000017790) Rhno1 (ENSPEMG00000008275) Tulp3 (ENSPEMG00000018388) Tead4 (ENSPEMG00000015684) Tspan9 (ENSPEMG00000025238) Tspan11 (ENSPEMG00000025349) Prmt8 (ENSPEMG00000015963) Cracr2a (ENSPEMG00000015307) Parp11 (ENSPEMG00000028145) ENSPEMG00000027566 #22 Ccnd2 (ENSPEMG00000024795) Tigar (ENSPEMG00000024358) Fgf23 (ENSPEMG00000011801) Fgf6 (ENSPEMG00000028297) D6Wsu163e (ENSPEMG00000016634) Rad51ap1 (ENSPEMG00000004516) Dyrk4 (ENSPEMG00000014698) ENSPEMG00000010840 Ndufa9 (ENSPEMG00000001578) ENSPEMG00000029830 Kcna6 (ENSPEMG00000001594) Kcna1 (ENSPEMG00000024438) Kcna5 (ENSPEMG00000008853) Ntf3 (ENSPEMG00000016431) Ano2 (ENSPEMG00000014319) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 19 Anxa9 (ENSPEMG00000011713) ENSPEMG00000030061 Cers2 (ENSPEMG00000016044) Setdb1 (ENSPEMG00000010553) Arnt (ENSPEMG00000029682) Ctsk (ENSPEMG00000001057) Ctss (ENSPEMG00000009697) Hormad1 (ENSPEMG00000012403) Golph3l (ENSPEMG00000029486) Ensa (ENSPEMG00000024023) ENSPEMG00000031072 Adamtsl4 (ENSPEMG00000008970) Ecm1 (ENSPEMG00000016753) Tars2 (ENSPEMG00000014203) Rprd2 (ENSPEMG00000013381) ENSPEMG00000024405 #22 Prpf3 (ENSPEMG00000011672) ENSPEMG00000030510 ENSPEMG00000013980 Ciart (ENSPEMG00000002076) BC028528 (ENSPEMG00000009975) Aph1a (ENSPEMG00000015896) Car14 (ENSPEMG00000011085) Anp32e (ENSPEMG00000000742) Plekho1 (ENSPEMG00000015477) Vps45 (ENSPEMG00000018774) ENSPEMG00000030134 Otud7b (ENSPEMG00000027312) Mtmr11 (ENSPEMG00000014402) Sf3b4 (ENSPEMG00000017568) Sv2a (ENSPEMG00000008887) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 19 ENSPEMG00000014978 ENSPEMG00000030368 ENSPEMG00000028451 ENSPEMG00000030827 Sis (ENSPEMG00000021707) Slitrk3 (ENSPEMG00000023543) Bche (ENSPEMG00000009079) Zbbx (ENSPEMG00000024380) Serpini2 (ENSPEMG00000021117) Wdr49 (ENSPEMG00000020883) Pdcd10 (ENSPEMG00000021913) Serpini1 (ENSPEMG00000023027) Gm29133 (ENSPEMG00000020735) Golim4 (ENSPEMG00000022394) Fstl5 (ENSPEMG00000023005) ENSPEMG00000025480 #22 ENSPEMG00000007742 ENSPEMG00000026604 ENSPEMG00000026618 Rapgef2 (ENSPEMG00000015242) ENSPEMG00000008022 Fnip2 (ENSPEMG00000010703) ENSPEMG00000018636 Ppid (ENSPEMG00000006560) Etfdh (ENSPEMG00000019193) 4930579G24Rik (ENSPEMG00000030550) Rxfp1 (ENSPEMG00000001130) ENSPEMG00000027441 Tmem144 (ENSPEMG00000007914) Gask1b (ENSPEMG00000000985) Gria2 (ENSPEMG00000015815) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 21 Abca9 (ENSPEMG00000010328) Abca6 (ENSPEMG00000000094) Abca5 (ENSPEMG00000007188) Map2k6 (ENSPEMG00000018826) Kcnj16 (ENSPEMG00000030590) Kcnj2 (ENSPEMG00000028431) ENSPEMG00000027731 Sox9 (ENSPEMG00000030843) #10 Slc39a11 (ENSPEMG00000025470) #11 Sstr2 (ENSPEMG00000027505) #12 Cog1 (ENSPEMG00000001847) #14 Fam104a (ENSPEMG00000024435) D11Wsu47e (ENSPEMG00000003795) #17 ENSPEMG00000011680 #18 Sdk2 (ENSPEMG00000020687) #21 Rpl38 (ENSPEMG00000020304) #22 Ttyh2 (ENSPEMG00000013547) #23 Dnai2 (ENSPEMG00000016984) #24 Kif19a (ENSPEMG00000011747) #25 Btbd17 (ENSPEMG00000010694) #26 Gpr142 (ENSPEMG00000001019) #27 Gprc5c (ENSPEMG00000009688) #29 Cd300a (ENSPEMG00000000132) ENSPEMG00000028784 #32 ENSPEMG00000029121 #33 ENSPEMG00000025711 #33 ENSPEMG00000024391 #33 ENSPEMG00000026923 #33 ENSPEMG00000017666 #33 ENSPEMG00000017788 ENSPEMG00000030396 #33 Murinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.k #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 1 ENSRNOG00000065020 Abca5 (ENSRNOG00000004378) Map2k6 (ENSRNOG00000004437) Kcnj16 (ENSRNOG00000004713) Kcnj2 (ENSRNOG00000064933) Sox9 (ENSRNOG00000002607) #10 Slc39a11 (ENSRNOG00000031213) #11 Sstr2 (ENSRNOG00000002793) #12 Cog1 (ENSRNOG00000002795) #14 Fam104a (ENSRNOG00000002851) #16 MGC95210 (ENSRNOG00000024780) #17 Cpsf4l (ENSRNOG00000056582) #18 Cdc42ep4 (ENSRNOG00000028946) #19 AABR07030729.1 (ENSRNOG00000030224) Sdk2 (ENSRNOG00000024711) #21 Rpl38-ps9 (ENSRNOG00000066047) #22 Ttyh2 (ENSRNOG00000024578) #23 Dnai2 (ENSRNOG00000024523) #24 Kif19 (ENSRNOG00000003105) #25 Btbd17 (ENSRNOG00000003109) #26 Gpr142 (ENSRNOG00000024446) #27 Gprc5c (ENSRNOG00000003144) #29 Cd300a (ENSRNOG00000057058) #33 Cd300lb (ENSRNOG00000070190) #32 RGD1562156 (ENSRNOG00000052940) Cd300ld (ENSRNOG00000042251) LOC100909671 (ENSRNOG00000046121) #33 RGD1562667 (ENSRNOG00000048771) #33 ENSRNOG00000063289 RGD1559482 (ENSRNOG00000046216) #33 Cd300c (ENSRNOG00000045888) #33 Rat MODERN SPECIES 46 Dmrtc1b (ENSRNOG00000022286) Fam236d (ENSRNOG00000069062) ENSRNOG00000064026 AABR07039334.1 (ENSRNOG00000022267) AABR07039336.2 (ENSRNOG00000003025) RGD1562521 (ENSRNOG00000003009) LOC100361671 (ENSRNOG00000003008) Cdx4 (ENSRNOG00000002974) Tsx (ENSRNOG00000037919) ENSRNOG00000037911 LOC367858 (ENSRNOG00000018301) Zcchc13 (ENSRNOG00000002923) ENSRNOG00000067012 LOC102546324 (ENSRNOG00000062346) Slc16a2 (ENSRNOG00000002832) LOC680353 (ENSRNOG00000033484) #22 Rlim (ENSRNOG00000045695) LOC103690100 (ENSRNOG00000065591) Nexmif (ENSRNOG00000021589) Abcb7 (ENSRNOG00000002790) Uprt (ENSRNOG00000063275) Zdhhc15 (ENSRNOG00000002751) Magee2 (ENSRNOG00000021400) Pbdc1 (ENSRNOG00000002662) Magee1 (ENSRNOG00000002660) Fgf16 (ENSRNOG00000061530) Atrx (ENSRNOG00000056703) Magt1 (ENSRNOG00000051408) Cox7b (ENSRNOG00000054689) ENSRNOG00000055485 Atp7a (ENSRNOG00000061367) Rat MODERN SPECIES 9 Rab27b (ENSRNOG00000012176) Dynapl1 (ENSRNOG00000028712) Dynap (ENSRNOG00000063474) LOC361346 (ENSRNOG00000028677) Stard6 (ENSRNOG00000026324) Poli (ENSRNOG00000012111) Mbd2 (ENSRNOG00000011853) AABR07032453.1 (ENSRNOG00000038592) ENSRNOG00000063041 Dcc (ENSRNOG00000033099) AABR07032457.1 (ENSRNOG00000015806) Mex3c (ENSRNOG00000015777) Smad4 (ENSRNOG00000051965) Elac1 (ENSRNOG00000000113) Me2 (ENSRNOG00000015582) LOC680512 (ENSRNOG00000033808) #22 Mro (ENSRNOG00000024426) Mapk4 (ENSRNOG00000015401) Ska1 (ENSRNOG00000015275) Cxxc1 (ENSRNOG00000014614) Cfap53 (ENSRNOG00000014585) Mbd1 (ENSRNOG00000024104) Myo5b (ENSRNOG00000014104) Acaa2 (ENSRNOG00000013766) Lipg (ENSRNOG00000018694) Slc25a6 (ENSRNOG00000042387) Rpl17 (ENSRNOG00000018680) Dym (ENSRNOG00000018425) Smad7 (ENSRNOG00000018359) Ctif (ENSRNOG00000018342) ENSRNOG00000067472 Rat MODERN SPECIES 17 Ubr5 (ENSRNOG00000006816) ENSRNOG00000066702 Odf1 (ENSRNOG00000006578) Klf10 (ENSRNOG00000006118) Azin1 (ENSRNOG00000005333) Atp6v1c1 (ENSRNOG00000004846) Baalc (ENSRNOG00000004697) Fzd6 (ENSRNOG00000004660) Cthrc1 (ENSRNOG00000004578) Slc25a32 (ENSRNOG00000004403) Dcaf13 (ENSRNOG00000004301) Rims2 (ENSRNOG00000004201) Dcstamp (ENSRNOG00000004704) Dpys (ENSRNOG00000004298) Lrp12 (ENSRNOG00000004152) LOC682793 (ENSRNOG00000029377) #22 ENSRNOG00000067069 Zfpm2 (ENSRNOG00000004109) Oxr1 (ENSRNOG00000056487) Rpl31-ps4 (ENSRNOG00000057824) Abra (ENSRNOG00000007999) LOC103692897 (ENSRNOG00000070941) ENSRNOG00000068130 Angpt1 (ENSRNOG00000005854) Rspo2 (ENSRNOG00000037687) Eif3e (ENSRNOG00000027690) Emc2 (ENSRNOG00000005123) Tmem74 (ENSRNOG00000065300) Trhr (ENSRNOG00000005048) Nudcd1 (ENSRNOG00000024929) Eny2 (ENSRNOG00000004681) Rat MODERN SPECIES 13 Eya2 (ENSRNOG00000019203) Zmynd8 (ENSRNOG00000019154) Ncoa3 (ENSRNOG00000005616) Sulf2 (ENSRNOG00000006052) AABR07054608.1 (ENSRNOG00000052603) Prex1 (ENSRNOG00000006952) ENSRNOG00000064408 Trp53rkb (ENSRNOG00000007285) Arfgef2 (ENSRNOG00000007485) Cse1l (ENSRNOG00000007665) Stau1 (ENSRNOG00000007781) Ddx27 (ENSRNOG00000008081) Znfx1 (ENSRNOG00000008194) Kcnb1 (ENSRNOG00000046949) AABR07054614.1 (ENSRNOG00000008245) Rpl38-ps9 (ENSRNOG00000048701) #22 B4galt5 (ENSRNOG00000008283) Slc9a8 (ENSRNOG00000008354) Spata2 (ENSRNOG00000009207) Rnf114 (ENSRNOG00000060821) Snai1 (ENSRNOG00000009594) LOC679539 (ENSRNOG00000025580) Peds1 (ENSRNOG00000060571) Cebpb (ENSRNOG00000057347) Ptpn1 (ENSRNOG00000010574) Ripor3 (ENSRNOG00000010791) Pard6b (ENSRNOG00000010883) Adnp (ENSRNOG00000010975) Dpm1 (ENSRNOG00000010993) Mocs3 (ENSRNOG00000025067) Kcng1 (ENSRNOG00000054314) Rat MODERN SPECIES 18 Cyp1a2 (ENSRNOG00000016173) Cyp1a1 (ENSRNOG00000019500) Edc3 (ENSRNOG00000019579) Clk3 (ENSRNOG00000030126) Arid3b (ENSRNOG00000019677) Ubl7 (ENSRNOG00000007442) Sema7a (ENSRNOG00000007687) Cyp11a1 (ENSRNOG00000008074) Ccdc33 (ENSRNOG00000008219) Stra6 (ENSRNOG00000008312) Islr (ENSRNOG00000048924) Islr2 (ENSRNOG00000050714) Pml (ENSRNOG00000008400) Stoml1 (ENSRNOG00000008530) Loxl1 (ENSRNOG00000008680) ENSRNOG00000069897 #22 Tbc1d21 (ENSRNOG00000008737) Insyn1 (ENSRNOG00000068374) Cd276 (ENSRNOG00000033608) Nptn (ENSRNOG00000009029) Rec114 (ENSRNOG00000009332) Hcn4 (ENSRNOG00000009450) Neo1 (ENSRNOG00000006490) Adpgk (ENSRNOG00000026178) Bbs4 (ENSRNOG00000026171) Arih1 (ENSRNOG00000009887) Tmem202 (ENSRNOG00000026112) Hexa (ENSRNOG00000010252) Celf6 (ENSRNOG00000052224) Parp6 (ENSRNOG00000011199) Pkm (ENSRNOG00000011329) Rat MODERN SPECIES 13 Trpc4ap (ENSRNOG00000019152) Myh7b (ENSRNOG00000018997) Gss (ENSRNOG00000018964) Acss2 (ENSRNOG00000018755) Ggt7 (ENSRNOG00000018441) Ncoa6 (ENSRNOG00000018288) Tp53inp2 (ENSRNOG00000018225) Pigu (ENSRNOG00000025181) Map1lc3a (ENSRNOG00000025443) Dynlrb1 (ENSRNOG00000025715) Itch (ENSRNOG00000059043) Ahcy (ENSRNOG00000017777) Asip (ENSRNOG00000017701) Eif2s2 (ENSRNOG00000017447) Raly (ENSRNOG00000017405) LOC690597 (ENSRNOG00000055182) #22 Chmp4b (ENSRNOG00000046585) AABR07054368.1 (ENSRNOG00000029996) ENSRNOG00000063087 Zfp341 (ENSRNOG00000017086) Pxmp4 (ENSRNOG00000016975) Actl10 (ENSRNOG00000036864) RGD1561517 (ENSRNOG00000016583) E2f1 (ENSRNOG00000016708) AABR07054362.1 (ENSRNOG00000050899) Sms-ps2 (ENSRNOG00000031275) Cbfa2t2 (ENSRNOG00000016352) Snta1 (ENSRNOG00000016062) ENSRNOG00000064935 LOC690507 (ENSRNOG00000015637) Bpifb5 (ENSRNOG00000025238) Rat MODERN SPECIES 11 Hsd3b5-ps1 (ENSRNOG00000070670) Hsd3b5 (ENSRNOG00000019417) Zfp697 (ENSRNOG00000065357) Phgdh (ENSRNOG00000019328) Hmgcs2 (ENSRNOG00000019120) Reg4 (ENSRNOG00000019046) Adam30 (ENSRNOG00000019044) Notch2 (ENSRNOG00000018835) Sec22b (ENSRNOG00000018673) Pde4dip (ENSRNOG00000018220) Gm17651 (ENSRNOG00000062826) Prkab2 (ENSRNOG00000018166) Fmo5 (ENSRNOG00000018076) Chd1l (ENSRNOG00000017669) Or13l2 (ENSRNOG00000017664) Rpl38-ps8 (ENSRNOG00000030747) #22 Bcl9 (ENSRNOG00000017516) Acp6 (ENSRNOG00000017494) Rhno1-ps2 (ENSRNOG00000067361) ENSRNOG00000068655 Gja5 (ENSRNOG00000017484) Gja8 (ENSRNOG00000046703) Gpr89b (ENSRNOG00000000095) Pdzk1 (ENSRNOG00000000096) Cd160 (ENSRNOG00000000097) Rnf115 (ENSRNOG00000000098) Polr3c (ENSRNOG00000033560) Nudt17 (ENSRNOG00000037217) Pias3 (ENSRNOG00000021218) Ankrd35 (ENSRNOG00000025108) Itga10 (ENSRNOG00000021217) Rat MODERN SPECIES 14 Tmem140 (ENSRNOG00000026965) Agbl3 (ENSRNOG00000010397) Cald1 (ENSRNOG00000010233) Bpgm (ENSRNOG00000010133) Akr1b7 (ENSRNOG00000009875) Akr1b8 (ENSRNOG00000009734) Akr1b10 (ENSRNOG00000027433) Akr1b1 (ENSRNOG00000009513) ENSRNOG00000070521 Slc35b4 (ENSRNOG00000008851) Lrguk (ENSRNOG00000008775) Exoc4 (ENSRNOG00000046023) Chchd3 (ENSRNOG00000013211) Plxna4 (ENSRNOG00000013072) LOC689042 (ENSRNOG00000027055) AABR07060145.1 (ENSRNOG00000032847) #22 Podxl (ENSRNOG00000012495) Mkln1 (ENSRNOG00000054514) Klf14 (ENSRNOG00000027557) ENSRNOG00000068074 Tsga13 (ENSRNOG00000011108) Copg2 (ENSRNOG00000011014) Mest (ENSRNOG00000048088) Cep41 (ENSRNOG00000010950) Cpa1 (ENSRNOG00000010725) Cpa5 (ENSRNOG00000010467) Cpa4 (ENSRNOG00000010463) Cpa2 (ENSRNOG00000028092) Ssmem1 (ENSRNOG00000010345) Tmem209 (ENSRNOG00000028219) Klhdc10 (ENSRNOG00000010267) Rat MODERN SPECIES 5 Vstm2a (ENSRNOG00000005180) Sec61g (ENSRNOG00000005203) Egfr (ENSRNOG00000004332) Fbxo48 (ENSRNOG00000023026) Plek (ENSRNOG00000005214) Cnrip1 (ENSRNOG00000005326) Pno1 (ENSRNOG00000005524) C1d (ENSRNOG00000005982) Hnrnpk-ps1 (ENSRNOG00000063529) Etaa1l1 (ENSRNOG00000006185) Meis1 (ENSRNOG00000004606) Spred2 (ENSRNOG00000004888) Actr2 (ENSRNOG00000004959) AABR07016566.1 (ENSRNOG00000051648) ENSRNOG00000070133 Rpl38 (ENSRNOG00000033686) #22 Rab1a (ENSRNOG00000004992) Cep68 (ENSRNOG00000027282) Slc1a4 (ENSRNOG00000005248) Sertad2 (ENSRNOG00000005393) Aftph (ENSRNOG00000005411) LOC108352861 (ENSRNOG00000029052) Lgalsl (ENSRNOG00000005464) LOC108352809 (ENSRNOG00000042277) Peli1 (ENSRNOG00000006329) Vps54 (ENSRNOG00000007125) Ugp2 (ENSRNOG00000008079) Mdh1 (ENSRNOG00000008103) Wdpcp (ENSRNOG00000054331) ENSRNOG00000065408 Otx1 (ENSRNOG00000065081) Rat MODERN SPECIES 7 LOC108348376 (ENSRNOG00000063958) RGD1562641 (ENSRNOG00000051457) RGD1563356 (ENSRNOG00000039624) LOC100911649 (ENSRNOG00000022798) LOC102552466 (ENSRNOG00000053759) Ralgds-ps4 (ENSRNOG00000056463) RGD1559508 (ENSRNOG00000056897) LOC108353078 (ENSRNOG00000063316) ENSRNOG00000066563 AABR07036505.1 (ENSRNOG00000052647) RGD1559508 (ENSRNOG00000068580) LOC102551632 (ENSRNOG00000066408) LOC120097482 (ENSRNOG00000065913) RGD1565329 (ENSRNOG00000063129) LOC100363883 (ENSRNOG00000069329) Rpl38-ps9 (ENSRNOG00000049047) #22 Grid1 (ENSRNOG00000055499) Wapl (ENSRNOG00000052513) Opn4 (ENSRNOG00000053893) Ldb3 (ENSRNOG00000059166) Bmpr1a (ENSRNOG00000052469) Mmrn2 (ENSRNOG00000051977) Sncg (ENSRNOG00000058006) Fam25a (ENSRNOG00000055025) Glud1 (ENSRNOG00000057367) Shld2 (ENSRNOG00000059057) Syt15 (ENSRNOG00000051688) Gprin2 (ENSRNOG00000055042) Npy4r (ENSRNOG00000061026) Anxa8 (ENSRNOG00000060949) Antxrl (ENSRNOG00000052152) Mus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.k.b #33 ENSGT00940000159622.k.a #33 ENSGT00940000154332.hc.a ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.hc.b ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Shrew mouse MODERN SPECIES 5 Abca9 (MGP_PahariEiJ_G0018487) Abca6 (MGP_PahariEiJ_G0018488) Abca5 (MGP_PahariEiJ_G0018489) Map2k6 (MGP_PahariEiJ_G0018490) Kcnj16 (MGP_PahariEiJ_G0018491) Kcnj2 (MGP_PahariEiJ_G0018492) Sox9 (MGP_PahariEiJ_G0018493) #10 Slc39a11 (MGP_PahariEiJ_G0018494) #11 Sstr2 (MGP_PahariEiJ_G0018495) #12 Cog1 (MGP_PahariEiJ_G0018496) #14 Fam104a (MGP_PahariEiJ_G0018497) D11Wsu47e (MGP_PahariEiJ_G0018498) #17 MGP_PahariEiJ_G0018499 #18 Cdc42ep4 (MGP_PahariEiJ_G0018500) #19 Sdk2 (MGP_PahariEiJ_G0018501) #21 Rpl38 (MGP_PahariEiJ_G0018502) #22 Ttyh2 (MGP_PahariEiJ_G0018503) #23 Dnai2 (MGP_PahariEiJ_G0018504) #24 Kif19a (MGP_PahariEiJ_G0018505) #25 Btbd17 (MGP_PahariEiJ_G0018506) #26 MGP_PahariEiJ_G0018507 #27 Gprc5c (MGP_PahariEiJ_G0018508) #29 MGP_PahariEiJ_G0018509 Cd300lb (MGP_PahariEiJ_G0018510) #32 MGP_PahariEiJ_G0018512 #33 MGP_PahariEiJ_G0018511 #33 MGP_PahariEiJ_G0018513 MGP_PahariEiJ_G0018515 MGP_PahariEiJ_G0018514 Cd300e (MGP_PahariEiJ_G0018516) Rab37 (MGP_PahariEiJ_G0018517) Mus_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.k.b #33 ENSGT00940000154332.hc.b.a.a ENSGT00940000159622.k.a #33 ENSGT00940000154332.hc.a ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.hc.b.a.b ENSGT00940000158883.b Ryukyu mouse MODERN SPECIES 2 Abca9 (MGP_CAROLIEiJ_G0017357) Abca6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017358) Abca5 (MGP_CAROLIEiJ_G0017359) Map2k6 (MGP_CAROLIEiJ_G0017360) Kcnj16 (MGP_CAROLIEiJ_G0017361) Kcnj2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017362) Sox9 (MGP_CAROLIEiJ_G0017363) #10 Slc39a11 (MGP_CAROLIEiJ_G0017364) #11 Sstr2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017365) #12 Cog1 (MGP_CAROLIEiJ_G0017366) #14 Fam104a (MGP_CAROLIEiJ_G0017367) D11Wsu47e (MGP_CAROLIEiJ_G0017368) #17 MGP_CAROLIEiJ_G0017369 #18 Cdc42ep4 (MGP_CAROLIEiJ_G0017370) #19 Sdk2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017371) #21 Rpl38 (MGP_CAROLIEiJ_G0017372) #22 Ttyh2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017373) #23 Dnai2 (MGP_CAROLIEiJ_G0017374) #24 Kif19a (MGP_CAROLIEiJ_G0017375) #25 Btbd17 (MGP_CAROLIEiJ_G0017376) #26 MGP_CAROLIEiJ_G0017377 #27 Gprc5c (MGP_CAROLIEiJ_G0017378) #29 Cd300a (MGP_CAROLIEiJ_G0017379) MGP_CAROLIEiJ_G0017380 #33 Cd300lb (MGP_CAROLIEiJ_G0017381) #32 Cd300c (MGP_CAROLIEiJ_G0017382) #33 MGP_CAROLIEiJ_G0017383 MGP_CAROLIEiJ_G0017384 Cd300e (MGP_CAROLIEiJ_G0017385) Rab37 (MGP_CAROLIEiJ_G0017386) MGP_CAROLIEiJ_G0017387 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.k.b #33 ENSGT00940000154332.hc.b.a.a ENSGT00940000159622.k.a #33 ENSGT00940000154332.hc.a ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.hc.b.a.b ENSGT00940000158883.b Mouse MODERN SPECIES 2 Abca9 (ENSMUSG00000041797) Abca6 (ENSMUSG00000044749) Abca5 (ENSMUSG00000018800) Map2k6 (ENSMUSG00000020623) Kcnj16 (ENSMUSG00000051497) Kcnj2 (ENSMUSG00000041695) Sox9 (ENSMUSG00000000567) #10 Slc39a11 (ENSMUSG00000041654) #11 Sstr2 (ENSMUSG00000047904) #12 Cog1 (ENSMUSG00000018661) #14 Fam104a (ENSMUSG00000041629) D11Wsu47e (ENSMUSG00000041623) #17 Cpsf4l (ENSMUSG00000018727) #18 Cdc42ep4 (ENSMUSG00000041598) #19 Sdk2 (ENSMUSG00000041592) #21 Rpl38 (ENSMUSG00000057322) #22 Ttyh2 (ENSMUSG00000034714) #23 Dnai2 (ENSMUSG00000034706) #24 Kif19a (ENSMUSG00000010021) #25 Btbd17 (ENSMUSG00000000202) #26 Gpr142 (ENSMUSG00000034677) #27 Gprc5c (ENSMUSG00000051043) #29 Cd300a (ENSMUSG00000034652) Cd300lb (ENSMUSG00000063193) #32 Cd300c (ENSMUSG00000058728) #33 Cd300ld (ENSMUSG00000034641) Cd300c2 (ENSMUSG00000044811) #33 Cd300ld2 (ENSMUSG00000089753) Cd300ld4 (ENSMUSG00000069609) Cd300ld5 (ENSMUSG00000089722) Cd300ld3 (ENSMUSG00000069607) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.k.b #33 ENSGT00940000154332.hc.b.a.a ENSGT00940000159622.k.a #33 ENSGT00940000154332.hc.a ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.hc.b.a.b ENSGT00940000158883.b spretus MODERN SPECIES 2 Abca9 (MGP_SPRETEiJ_G0018203) Abca6 (MGP_SPRETEiJ_G0018204) Abca5 (MGP_SPRETEiJ_G0018205) Map2k6 (MGP_SPRETEiJ_G0018206) Kcnj16 (MGP_SPRETEiJ_G0018207) Kcnj2 (MGP_SPRETEiJ_G0018208) Sox9 (MGP_SPRETEiJ_G0018209) #10 Slc39a11 (MGP_SPRETEiJ_G0018210) #11 Sstr2 (MGP_SPRETEiJ_G0018211) #12 Cog1 (MGP_SPRETEiJ_G0018212) #14 Fam104a (MGP_SPRETEiJ_G0018213) D11Wsu47e (MGP_SPRETEiJ_G0018214) #17 MGP_SPRETEiJ_G0018215 #18 Cdc42ep4 (MGP_SPRETEiJ_G0018216) #19 Sdk2 (MGP_SPRETEiJ_G0018217) #21 Rpl38 (MGP_SPRETEiJ_G0018218) #22 Ttyh2 (MGP_SPRETEiJ_G0018219) #23 Dnai2 (MGP_SPRETEiJ_G0018220) #24 Kif19a (MGP_SPRETEiJ_G0018221) #25 Btbd17 (MGP_SPRETEiJ_G0018222) #26 Gpr142 (MGP_SPRETEiJ_G0018223) #27 Gprc5c (MGP_SPRETEiJ_G0018224) #29 MGP_SPRETEiJ_G0018225 Cd300lb (MGP_SPRETEiJ_G0018226) #32 MGP_SPRETEiJ_G0018227 Cd300c2 (MGP_SPRETEiJ_G0018228) #33 Cd300ld (MGP_SPRETEiJ_G0018229) Cd300e (MGP_SPRETEiJ_G0018230) Rab37 (MGP_SPRETEiJ_G0018231) MGP_SPRETEiJ_G0018232 MGP_SPRETEiJ_G0018233 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 1113 ENSMSIG00000004208 #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3130 ENSMSIG00000018626 Katnal2 (ENSMSIG00000018633) Hdhd2 (ENSMSIG00000018790) ENSMSIG00000018819 Skor2 (ENSMSIG00000018834) Smad2 (ENSMSIG00000018887) ENSMSIG00000018946 #22 Zbtb7c (ENSMSIG00000018967) Ctif (ENSMSIG00000019005) ENSMSIG00000019110 Smad7 (ENSMSIG00000019123) Dym (ENSMSIG00000019180) ENSMSIG00000019247 BC031181 (ENSMSIG00000019259) Rpl17 (ENSMSIG00000019275) Lipg (ENSMSIG00000019321) ENSMSIG00000019349 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2702 ENSMSIG00000026969 #22 Prr30 (ENSMSIG00000026978) ENSMSIG00000026995 Steppe mouse MODERN SPECIES 3410 ENSMSIG00000009588 Jazf1 (ENSMSIG00000009609) Tax1bp1 (ENSMSIG00000009618) Hibadh (ENSMSIG00000009672) ENSMSIG00000009698 #22 Evx1 (ENSMSIG00000009707) ENSMSIG00000009733 ENSMSIG00000009764 Hoxa11 (ENSMSIG00000009809) ENSMSIG00000009817 Hoxa9 (ENSMSIG00000009832) Hoxa7 (ENSMSIG00000009836) Hoxa6 (ENSMSIG00000009850) ENSMSIG00000009856 Hoxa4 (ENSMSIG00000009874) Hoxa3 (ENSMSIG00000009863) ENSMSIG00000009893 ENSMSIG00000009910 Hoxa2 (ENSMSIG00000009914) Hoxa1 (ENSMSIG00000009971) Steppe mouse MODERN SPECIES 2635 ENSMSIG00000029722 #22 Ttyh2 (ENSMSIG00000029730) #23 Dnai2 (ENSMSIG00000029741) #24 Kif19a (ENSMSIG00000029752) #25 Btbd17 (ENSMSIG00000029759) #26 Gpr142 (ENSMSIG00000029761) #27 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1548 Pdgfrl (ENSNGAG00000009697) ENSNGAG00000013219 ENSNGAG00000017795 Fgl1 (ENSNGAG00000000116) Pcm1 (ENSNGAG00000008279) Asah1 (ENSNGAG00000010037) Frg1 (ENSNGAG00000016411) ENSNGAG00000013617 ENSNGAG00000013743 #22 Zfp42 (ENSNGAG00000012552) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 190 ENSNGAG00000012525 #22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1183 Hmgcs1 (ENSNGAG00000012790) Nim1k (ENSNGAG00000012494) Zfp131 (ENSNGAG00000016975) ENSNGAG00000014392 ENSNGAG00000013987 Ccdc152 (ENSNGAG00000000268) Ghr (ENSNGAG00000020869) ENSNGAG00000019160 Fbxo4 (ENSNGAG00000000112) Rimoc1 (ENSNGAG00000000034) Oxct1 (ENSNGAG00000010264) Plcxd3 (ENSNGAG00000020465) C6 (ENSNGAG00000015691) Mroh2b (ENSNGAG00000018783) C7 (ENSNGAG00000014593) ENSNGAG00000014031 #22 Card6 (ENSNGAG00000001444) ENSNGAG00000000693 Prkaa1 (ENSNGAG00000008327) Ttc33 (ENSNGAG00000005682) Ptger4 (ENSNGAG00000002797) ENSNGAG00000017678 ENSNGAG00000018186 C9 (ENSNGAG00000013631) Fyb (ENSNGAG00000008827) Rictor (ENSNGAG00000000546) Osmr (ENSNGAG00000016413) ENSNGAG00000009080 Lifr (ENSNGAG00000006273) Egflam (ENSNGAG00000019890) Gdnf (ENSNGAG00000017460) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 461 Maoa (ENSNGAG00000013137) ENSNGAG00000018371 #22 ENSNGAG00000015190 Gpr82 (ENSNGAG00000018110) Gpr34 (ENSNGAG00000018163) Cask (ENSNGAG00000008097) Nyx (ENSNGAG00000011629) Ddx3x (ENSNGAG00000018077) Usp9x (ENSNGAG00000012060) ENSNGAG00000022683 E330021D16Rik (ENSNGAG00000005804) Med14 (ENSNGAG00000000544) 1810030O07Rik (ENSNGAG00000018470) Atp6ap2 (ENSNGAG00000014902) ENSNGAG00000017147 ENSNGAG00000014390 ENSNGAG00000013284 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 758 Slc39a11 (ENSNGAG00000009824) #11 Sstr2 (ENSNGAG00000019704) #12 Cog1 (ENSNGAG00000023188) #14 Fam104a (ENSNGAG00000023714) ENSNGAG00000013491 #17 ENSNGAG00000009325 #18 Cdc42ep4 (ENSNGAG00000021922) #19 Sdk2 (ENSNGAG00000014009) #21 Rpl38 (ENSNGAG00000014393) #22 Ttyh2 (ENSNGAG00000018730) #23 Dnai2 (ENSNGAG00000010164) #24 Kif19a (ENSNGAG00000011623) #25 Btbd17 (ENSNGAG00000023471) #26 Gpr142 (ENSNGAG00000017647) #27 ENSNGAG00000016653 #29 Cd300a (ENSNGAG00000015799) Cd300lb (ENSNGAG00000023136) #32 ENSNGAG00000022778 #33 ENSNGAG00000022616 Cd300e (ENSNGAG00000002012) ENSNGAG00000020169 Rab37 (ENSNGAG00000022706) Nherf1 (ENSNGAG00000021857) Nat9 (ENSNGAG00000021022) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 56 ENSJJAG00000019045 Abca8a (ENSJJAG00000000958) Abca6 (ENSJJAG00000013278) Abca5 (ENSJJAG00000022327) Map2k6 (ENSJJAG00000000595) Kcnj16 (ENSJJAG00000005664) Kcnj2 (ENSJJAG00000021443) Sox9 (ENSJJAG00000019413) #10 Slc39a11 (ENSJJAG00000021397) #11 ENSJJAG00000021318 Sstr2 (ENSJJAG00000005617) #12 Cog1 (ENSJJAG00000021657) #14 Fam104a (ENSJJAG00000019845) Cdc42ep4 (ENSJJAG00000009509) #19 Sdk2 (ENSJJAG00000022268) #21 ENSJJAG00000005013 #22 Ttyh2 (ENSJJAG00000003046) #23 Dnai2 (ENSJJAG00000022616) #24 Kif19a (ENSJJAG00000022668) #25 Btbd17 (ENSJJAG00000020319) #26 Gprc5c (ENSJJAG00000011067) #29 Cd300lb (ENSJJAG00000020934) #32 ENSJJAG00000021118 Cd300e (ENSJJAG00000011989) Rab37 (ENSJJAG00000001784) ENSJJAG00000021355 Nherf1 (ENSJJAG00000009429) Nat9 (ENSJJAG00000022762) Tmem104 (ENSJJAG00000008164) Grin2c (ENSJJAG00000022967) ENSJJAG00000022983 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 58 ENSJJAG00000011152 Stim2 (ENSJJAG00000014478) Tbc1d19 (ENSJJAG00000015623) Cckar (ENSJJAG00000009819) Rbpj (ENSJJAG00000024408) Smim20 (ENSJJAG00000020734) Sel1l3 (ENSJJAG00000018980) Slc34a2 (ENSJJAG00000023515) ENSJJAG00000023054 Zcchc4 (ENSJJAG00000016627) Pi4k2b (ENSJJAG00000021578) Sepsecs (ENSJJAG00000001251) Lgi2 (ENSJJAG00000021018) Ccdc149 (ENSJJAG00000016740) Sod3 (ENSJJAG00000019475) ENSJJAG00000010774 #22 Dhx15 (ENSJJAG00000010364) ENSJJAG00000018377 ENSJJAG00000023479 Adgra3 (ENSJJAG00000000786) Kcnip4 (ENSJJAG00000016294) ENSJJAG00000008981 ENSJJAG00000020450 Slit2 (ENSJJAG00000018613) ENSJJAG00000017549 ENSJJAG00000017097 ENSJJAG00000020247 Ncapg (ENSJJAG00000023233) Fam184b (ENSJJAG00000014582) ENSJJAG00000022052 Lap3 (ENSJJAG00000016507) Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 45 Hmgcr (ENSJJAG00000010723) Cert1 (ENSJJAG00000023198) Polk (ENSJJAG00000004931) Ankdd1b (ENSJJAG00000013237) Poc5 (ENSJJAG00000019666) Sv2c (ENSJJAG00000012121) F2rl2 (ENSJJAG00000020545) Iqgap2 (ENSJJAG00000023927) F2r (ENSJJAG00000021467) F2rl1 (ENSJJAG00000005361) ENSJJAG00000018088 S100z (ENSJJAG00000013195) Crhbp (ENSJJAG00000010630) Prrc1 (ENSJJAG00000011454) Ctxn3 (ENSJJAG00000011014) ENSJJAG00000017426 #22 Slc12a2 (ENSJJAG00000019580) Fbn2 (ENSJJAG00000020592) ENSJJAG00000017710 Slc27a6 (ENSJJAG00000020519) Isoc1 (ENSJJAG00000019157) Adamts19 (ENSJJAG00000021431) Minar2 (ENSJJAG00000000279) Frmd4b (ENSJJAG00000023390) Mitf (ENSJJAG00000018472) Mdfic2 (ENSJJAG00000012963) Foxp1 (ENSJJAG00000022621) Eif4e3 (ENSJJAG00000002638) Gpr27 (ENSJJAG00000011153) Prok2 (ENSJJAG00000021320) Rybp (ENSJJAG00000017045) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 198 ENSJJAG00000023229 ENSJJAG00000022551 ENSJJAG00000022457 ENSJJAG00000013231 Gtpbp10 (ENSJJAG00000020189) ENSJJAG00000012837 #22 Cfap69 (ENSJJAG00000012835) Steap2 (ENSJJAG00000009382) ENSJJAG00000006325 Steap1 (ENSJJAG00000005981) ENSJJAG00000022424 ENSJJAG00000018724 ENSJJAG00000016638 Zfp804b (ENSJJAG00000015297) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 50 Entrep1 (ENSJJAG00000021132) Tjp2 (ENSJJAG00000003581) Fxn (ENSJJAG00000022666) Pip5k1b (ENSJJAG00000018154) Fam122a (ENSJJAG00000009421) Tmem252 (ENSJJAG00000015659) Pgm5 (ENSJJAG00000022690) ENSJJAG00000013817 ENSJJAG00000009646 ENSJJAG00000017231 ENSJJAG00000015498 Kank1 (ENSJJAG00000018774) Dmrt1 (ENSJJAG00000016690) Dmrt3 (ENSJJAG00000022573) Dmrt2 (ENSJJAG00000023959) ENSJJAG00000010719 #22 Smarca2 (ENSJJAG00000010867) Vldlr (ENSJJAG00000016440) ENSJJAG00000000409 Kcnv2 (ENSJJAG00000016782) Pum3 (ENSJJAG00000012563) ENSJJAG00000010263 Rfx3 (ENSJJAG00000010280) ENSJJAG00000024335 Glis3 (ENSJJAG00000011399) Slc1a1 (ENSJJAG00000018507) ENSJJAG00000020462 Spata6l (ENSJJAG00000022941) Plpp6 (ENSJJAG00000011277) Cdc37l1 (ENSJJAG00000024330) Ak3 (ENSJJAG00000023388) Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat MODERN SPECIES 525 ENSDORG00000028829 #22 Cd109 (ENSDORG00000014659) Slc17a5 (ENSDORG00000009247) Eef1a1 (ENSDORG00000009629) Mto1 (ENSDORG00000015529) Cgas (ENSDORG00000013413) Ddx43 (ENSDORG00000030010) Kangaroo rat MODERN SPECIES 326 Abca8b (ENSDORG00000009603) Abca9 (ENSDORG00000003282) Abca6 (ENSDORG00000007098) Abca5 (ENSDORG00000007101) Map2k6 (ENSDORG00000002434) Kcnj16 (ENSDORG00000027515) Kcnj2 (ENSDORG00000023305) ENSDORG00000013626 ENSDORG00000023663 Sstr2 (ENSDORG00000003377) #12 Cog1 (ENSDORG00000002500) #14 Fam104a (ENSDORG00000002501) Cdc42ep4 (ENSDORG00000024341) #19 Sdk2 (ENSDORG00000001248) #21 Rasd1 (ENSDORG00000024866) ENSDORG00000013146 #22 Ttyh2 (ENSDORG00000016517) #23 ENSDORG00000003288 Kif19a (ENSDORG00000019849) #25 Btbd17 (ENSDORG00000030071) #26 Gpr142 (ENSDORG00000003063) #27 Gprc5c (ENSDORG00000005420) #29 ENSDORG00000026736 #33 Dynll2 (ENSDORG00000025624) Srsf1 (ENSDORG00000015082) Vezf1 (ENSDORG00000023466) Cuedc1 (ENSDORG00000012960) Mrps23 (ENSDORG00000026921) Ccdc182 (ENSDORG00000005396) ENSDORG00000005394 ENSDORG00000028440 Rodentia_A DUPLICATION Rodentia_A DUPLICATION Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.a #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.a #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.a #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.a #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 76 METTL27 (ENSODEG00000015241) ENSODEG00000015892 ELN (ENSODEG00000016045) LIMK1 (ENSODEG00000015076) ENSODEG00000015854 ENSODEG00000016042 ENSODEG00000015354 CLIP2 (ENSODEG00000015462) GTF2IRD1 (ENSODEG00000015635) GTF2I (ENSODEG00000015405) NCF1 (ENSODEG00000015696) ENSODEG00000014736 RCC1L (ENSODEG00000014434) CASTOR2 (ENSODEG00000014375) ENSODEG00000015156 ENSODEG00000020386 #22 ENSODEG00000014573 ENSODEG00000020215 ENSODEG00000020176 ENSODEG00000014150 ENSODEG00000014737 AUTS2 (ENSODEG00000016622) ENSODEG00000020191 GALNT17 (ENSODEG00000016292) CALN1 (ENSODEG00000015050) ENSODEG00000014729 ENSODEG00000015687 ENSODEG00000016093 RABGEF1 (ENSODEG00000015206) KCTD7 (ENSODEG00000014785) TPST1 (ENSODEG00000015532) Degu MODERN SPECIES 203 ENSODEG00000003606 ENSODEG00000003620 ENSODEG00000003632 RPIA (ENSODEG00000003662) ENSODEG00000003712 EIF2AK3 (ENSODEG00000003775) TEX37 (ENSODEG00000003863) FOXI3 (ENSODEG00000003881) THNSL2 (ENSODEG00000003914) ENSODEG00000003963 ENSODEG00000003990 ENSODEG00000004001 ENSODEG00000002952 ENSODEG00000002964 RMND5A (ENSODEG00000002982) ENSODEG00000018853 #22 RNF103 (ENSODEG00000003000) ENSODEG00000003034 KDM3A (ENSODEG00000003061) REEP1 (ENSODEG00000003133) MRPL35 (ENSODEG00000003180) IMMT (ENSODEG00000003274) PTCD3 (ENSODEG00000003461) POLR1A (ENSODEG00000003542) ENSODEG00000018941 ST3GAL5 (ENSODEG00000003647) ATOH8 (ENSODEG00000003670) SFTPB (ENSODEG00000003695) USP39 (ENSODEG00000003717) C2orf68 (ENSODEG00000003734) TMEM150A (ENSODEG00000003753) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.b #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.b #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154284.a ENSGT00940000155667 ENSGT00940000157555 ENSGT00940000160416.p ENSGT00940000160416.o.a ENSGT00940000154682.C ENSGT00940000161548 ENSGT00530000063497.b ENSGT00940000162448 ENSGT00940000168548 ENSGT00390000017201 ENSGT00940000155151.b ENSGT00960000186747 ENSGT00940000157892 ENSGT00490000043442 ENSGT00390000003718.d.kd.b #22 ENSGT00390000017398 ENSGT01030000234635.a.a.a.a ENSGT00940000156924 ENSGT00950000183036.a.a ENSGT00950000183036.a.b ENSGT01050000244941.B.d ENSGT00390000007688 ENSGT00390000012891 ENSGT00390000003298 ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 166 ENSGT00940000154682.C ENSGT00940000161548 ENSGT00530000063497.b ENSGT00940000162448 ENSGT00390000017201 ENSGT00940000155151.b ENSGT00960000186747 ENSGT00940000157892 ENSGT00490000043442 ENSGT00390000003718.d.kd.b #22 ENSGT00390000017398.i ENSGT01030000234635.a.a.a.a ENSGT00940000156924 ENSGT00950000183036.a.a ENSGT00950000183036.a.b ENSGT01050000244941.B.d ENSGT00390000007688 ENSGT00390000012891 ENSGT00390000003298 ENSGT01100000263525.a.b.b.c.b ENSGT00940000153231.B.w ENSGT00390000002634.b ENSGT00940000153229.B ENSGT00940000163788 ENSGT00530000063936.b Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 330 CLCA1 (ENSUPAG00010012033) CLCA2 (ENSUPAG00010011985) ODF2L (ENSUPAG00010011819) ENSUPAG00010011804 ZNHIT6 (ENSUPAG00010011778) CCN1 (ENSUPAG00010011774) ENSUPAG00010011773 DDAH1 (ENSUPAG00010011761) BCL10 (ENSUPAG00010011755) ENSUPAG00010011746 #22 ENSUPAG00010011740 SYDE2 (ENSUPAG00010011732) DNAI3 (ENSUPAG00010011711) MCOLN3 (ENSUPAG00010011700) MCOLN2 (ENSUPAG00010011678) LPAR3 (ENSUPAG00010011664) SSX2IP (ENSUPAG00010011627) CTBS (ENSUPAG00010011611) ENSUPAG00010011599 ENSUPAG00010011592 RPF1 (ENSUPAG00010011580) DNASE2B (ENSUPAG00010011561) ENSUPAG00010011547 ENSUPAG00010011541 SAMD13 (ENSUPAG00010011529) Alpin marmot MODERN SPECIES 96 ENSMMMG00000006866 ENSMMMG00000006883 ENSMMMG00000007100 ENSMMMG00000008525 CLCA1 (ENSMMMG00000008544) CLCA2 (ENSMMMG00000008561) ODF2L (ENSMMMG00000008590) ENSMMMG00000008742 ENSMMMG00000008750 ENSMMMG00000008758 ZNHIT6 (ENSMMMG00000008767) CCN1 (ENSMMMG00000008796) ENSMMMG00000008810 DDAH1 (ENSMMMG00000008813) ENSMMMG00000008820 ENSMMMG00000008825 #22 C1orf52 (ENSMMMG00000008832) SYDE2 (ENSMMMG00000008839) DNAI3 (ENSMMMG00000008854) MCOLN3 (ENSMMMG00000008888) MCOLN2 (ENSMMMG00000008910) LPAR3 (ENSMMMG00000008955) SSX2IP (ENSMMMG00000008964) CTBS (ENSMMMG00000009025) ENSMMMG00000009057 GNG5 (ENSMMMG00000009067) RPF1 (ENSMMMG00000009079) DNASE2B (ENSMMMG00000009098) ENSMMMG00000009120 SAMD13 (ENSMMMG00000009129) ENSMMMG00000009152 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.b #22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.kd.b #22 Degu MODERN SPECIES 75 EYA4 (ENSODEG00000006283) ENSODEG00000019226 RPS12 (ENSODEG00000005641) SLC18B1 (ENSODEG00000006671) VNN1 (ENSODEG00000006669) TAAR2 (ENSODEG00000006052) ENSODEG00000019609 TAAR5 (ENSODEG00000019476) ENSODEG00000019155 TAAR9 (ENSODEG00000019442) ENSODEG00000008138 MOXD1 (ENSODEG00000006351) CCN2 (ENSODEG00000006255) ENSODEG00000005928 ENPP3 (ENSODEG00000005745) ENSODEG00000005845 #22 MED23 (ENSODEG00000007943) ARG1 (ENSODEG00000005285) ENSODEG00000007083 ENSODEG00000006795 EPB41L2 (ENSODEG00000006317) ENSODEG00000005885 TMEM200A (ENSODEG00000019233) SAMD3 (ENSODEG00000005370) L3MBTL3 (ENSODEG00000005114) ENSODEG00000019330 ARHGAP18 (ENSODEG00000007583) LAMA2 (ENSODEG00000005449) PTPRK (ENSODEG00000005439) ENSODEG00000004918 C6orf58 (ENSODEG00000006422) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.ld #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000162012 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.ld #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162012 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.ld #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000162012 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.ld #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 260 ENSCLAG00000002199 C17orf80 (ENSCLAG00000002268) #17 CDC42EP4 (ENSCLAG00000002587) #19 SDK2 (ENSCLAG00000002907) #21 RPL38 (ENSCLAG00000003126) #22 TTYH2 (ENSCLAG00000003329) #23 DNAI2 (ENSCLAG00000003498) #24 KIF19 (ENSCLAG00000003696) #25 BTBD17 (ENSCLAG00000002714) #26 ENSCLAG00000002729 #27 GPRC5C (ENSCLAG00000002852) #29 CD300A (ENSCLAG00000003067) #30 CD300LB (ENSCLAG00000003353) #32 CD300LF (ENSCLAG00000003757) CD300E (ENSCLAG00000008551) RAB37 (ENSCLAG00000008913) NHERF1 (ENSCLAG00000009078) NAT9 (ENSCLAG00000009404) TMEM104 (ENSCLAG00000008787) GRIN2C (ENSCLAG00000003739) Guinea pig MODERN SPECIES 76 SEPTIN9 (ENSCPOG00000012711) SEC14L1 (ENSCPOG00000002017) MGAT5B (ENSCPOG00000008729) ENSCPOG00000020782 MFSD11 (ENSCPOG00000004236) JMJD6 (ENSCPOG00000004229) ENSCPOG00000032632 ST6GALNAC1 (ENSCPOG00000002420) ENSCPOG00000024236 ENSCPOG00000024343 #12 ENSCPOG00000003587 #14 ENSCPOG00000014453 ENSCPOG00000023336 #17 CDC42EP4 (ENSCPOG00000036485) #19 SDK2 (ENSCPOG00000007401) #21 RPL38 (ENSCPOG00000008988) #22 TTYH2 (ENSCPOG00000022015) #23 DNAI2 (ENSCPOG00000014084) #24 KIF19 (ENSCPOG00000024655) #25 BTBD17 (ENSCPOG00000019720) #26 GPR142 (ENSCPOG00000014089) #27 GPRC5C (ENSCPOG00000026531) #29 CD300A (ENSCPOG00000038244) #30 CD300LB (ENSCPOG00000038725) #32 ENSCPOG00000009617 #33 ENSCPOG00000038474 CD300LF (ENSCPOG00000000795) RAB37 (ENSCPOG00000025645) NHERF1 (ENSCPOG00000038426) NAT9 (ENSCPOG00000001273) TMEM104 (ENSCPOG00000035482) Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 12 ABCA6 (ENSHGLG00000001770) ABCA5 (ENSHGLG00000001910) MAP2K6 (ENSHGLG00000002071) ENSHGLG00000046311 KCNJ16 (ENSHGLG00000044074) KCNJ2 (ENSHGLG00000031949) ENSHGLG00000050294 SOX9 (ENSHGLG00000045340) #10 SLC39A11 (ENSHGLG00000007931) #11 SSTR2 (ENSHGLG00000033129) #12 COG1 (ENSHGLG00000008414) #14 ENSHGLG00000009443 ENSHGLG00000010149 #17 CDC42EP4 (ENSHGLG00000035578) #19 SDK2 (ENSHGLG00000011656) #21 ENSHGLG00000038330 #22 TTYH2 (ENSHGLG00000009137) #23 DNAI2 (ENSHGLG00000010298) #24 KIF19 (ENSHGLG00000010834) #25 BTBD17 (ENSHGLG00000012810) #26 ENSHGLG00000048249 #27 GPRC5C (ENSHGLG00000040767) #29 ENSHGLG00000013459 #30 CD300LB (ENSHGLG00000040395) #32 ENSHGLG00000004186 #33 CD300LF (ENSHGLG00000004766) RAB37 (ENSHGLG00000004384) ENSHGLG00000005527 NAT9 (ENSHGLG00000006571) TMEM104 (ENSHGLG00000038206) GRIN2C (ENSHGLG00000004817) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 12 COL1A1 (ENSHGLG00000012240) ENSHGLG00000050519 SGCA (ENSHGLG00000014247) PPP1R9B (ENSHGLG00000014173) SAMD14 (ENSHGLG00000019370) ENSHGLG00000014448 ITGA3 (ENSHGLG00000012904) DLX3 (ENSHGLG00000013267) ENSHGLG00000012373 ENSHGLG00000041037 KAT7 (ENSHGLG00000012906) FAM117A (ENSHGLG00000013356) SLC35B1 (ENSHGLG00000041055) SPOP (ENSHGLG00000041837) NXPH3 (ENSHGLG00000011832) ENSHGLG00000040671 #22 NGFR (ENSHGLG00000012327) ENSHGLG00000011644 ZNF652 (ENSHGLG00000010452) PHOSPHO1 (ENSHGLG00000011269) ABI3 (ENSHGLG00000012283) GNGT2 (ENSHGLG00000048834) B4GALNT2 (ENSHGLG00000011792) IGF2BP1 (ENSHGLG00000010492) ENSHGLG00000010703 SNF8 (ENSHGLG00000011519) UBE2Z (ENSHGLG00000016280) ATP5MC1 (ENSHGLG00000035460) CALCOCO2 (ENSHGLG00000012114) TTLL6 (ENSHGLG00000019187) HOXB13 (ENSHGLG00000014634) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244.k ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.ld #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163943 #30 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 12 ENSSVLG00005010137 ABCA6 (ENSSVLG00005009839) ABCA5 (ENSSVLG00005009733) MAP2K6 (ENSSVLG00005009618) KCNJ16 (ENSSVLG00005009554) KCNJ2 (ENSSVLG00005009537) SOX9 (ENSSVLG00005009510) #10 SLC39A11 (ENSSVLG00005009483) #11 SSTR2 (ENSSVLG00005009470) #12 COG1 (ENSSVLG00005009382) #14 FAM104A (ENSSVLG00005009332) #16 C17orf80 (ENSSVLG00005009280) #17 ENSSVLG00005009215 #18 ENSSVLG00005009196 #19 SDK2 (ENSSVLG00005008917) #21 RPL38 (ENSSVLG00005008853) #22 TTYH2 (ENSSVLG00005008772) #23 DNAI2 (ENSSVLG00005008636) #24 KIF19 (ENSSVLG00005008611) #25 BTBD17 (ENSSVLG00005008582) #26 GPR142 (ENSSVLG00005008558) #27 GPRC5C (ENSSVLG00005008472) #29 ENSSVLG00005008438 #30 CD300LB (ENSSVLG00005008396) #32 ENSSVLG00005008371 #33 ENSSVLG00005008336 CD300LD (ENSSVLG00005008302) #36 CD300E (ENSSVLG00005008271) ENSSVLG00005008128 RAB37 (ENSSVLG00005007961) NHERF1 (ENSSVLG00005007906) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244.k ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.ld #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.ld #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 502 ENSUPAG00010002678 #11 SSTR2 (ENSUPAG00010002676) #12 COG1 (ENSUPAG00010002628) #14 FAM104A (ENSUPAG00010002623) #16 C17orf80 (ENSUPAG00010002605) #17 CPSF4L (ENSUPAG00010002597) #18 CDC42EP4 (ENSUPAG00010002588) #19 SDK2 (ENSUPAG00010002553) #21 RPL38 (ENSUPAG00010002541) #22 TTYH2 (ENSUPAG00010002527) #23 DNAI2 (ENSUPAG00010002506) #24 KIF19 (ENSUPAG00010002489) #25 BTBD17 (ENSUPAG00010002477) #26 GPR142 (ENSUPAG00010002465) #27 Squirrel MODERN SPECIES 255 KCNJ16 (ENSSTOG00000030465) KCNJ2 (ENSSTOG00000015811) SOX9 (ENSSTOG00000027556) #10 SLC39A11 (ENSSTOG00000003146) #11 SSTR2 (ENSSTOG00000001825) #12 COG1 (ENSSTOG00000001829) #14 ENSSTOG00000001842 C17orf80 (ENSSTOG00000001843) #17 CPSF4L (ENSSTOG00000001849) #18 CDC42EP4 (ENSSTOG00000028084) #19 SDK2 (ENSSTOG00000013250) #21 RPL38 (ENSSTOG00000019394) #22 TTYH2 (ENSSTOG00000001424) #23 ENSSTOG00000024869 KIF19 (ENSSTOG00000025305) #25 BTBD17 (ENSSTOG00000024917) #26 GPR142 (ENSSTOG00000019766) #27 GPRC5C (ENSSTOG00000027691) #29 CD300LB (ENSSTOG00000021566) #32 Alpin marmot DUPLICATION Alpin marmot MODERN SPECIES 87 MAP2K3 (ENSMMMG00000009924) ENSMMMG00000009964 ENSMMMG00000009984 ABCA5 (ENSMMMG00000010033) MAP2K6 (ENSMMMG00000010074) KCNJ16 (ENSMMMG00000010098) KCNJ2 (ENSMMMG00000010111) SLC39A11 (ENSMMMG00000010119) #11 SSTR2 (ENSMMMG00000010148) #12 COG1 (ENSMMMG00000010159) #14 ENSMMMG00000010211 C17orf80 (ENSMMMG00000010220) #17 CPSF4L (ENSMMMG00000010227) #18 CDC42EP4 (ENSMMMG00000010248) #19 SDK2 (ENSMMMG00000010254) #21 ENSMMMG00000010341 #22 TTYH2 (ENSMMMG00000010369) #23 DNAI2 (ENSMMMG00000010379) #24 KIF19 (ENSMMMG00000010407) #25 BTBD17 (ENSMMMG00000010430) #26 GPR142 (ENSMMMG00000010437) #27 GPRC5C (ENSMMMG00000010447) #29 ENSMMMG00000010487 #32 Alpin marmot MODERN SPECIES 15 GJB5 (ENSMMMG00000008213) C1orf94 (ENSMMMG00000008230) CSMD2 (ENSMMMG00000008266) HMGB4 (ENSMMMG00000008348) ZSCAN20 (ENSMMMG00000008353) ENSMMMG00000008439 ENSMMMG00000008441 ENSMMMG00000008460 ENSMMMG00000008473 A3GALT2 (ENSMMMG00000008476) ZNF362 (ENSMMMG00000008487) TRIM62 (ENSMMMG00000008518) AZIN2 (ENSMMMG00000008524) AK2 (ENSMMMG00000008543) RNF19B (ENSMMMG00000008563) ENSMMMG00000008574 #22 TMEM54 (ENSMMMG00000008582) HPCA (ENSMMMG00000008650) S100PBP (ENSMMMG00000008689) YARS1 (ENSMMMG00000008699) KIAA1522 (ENSMMMG00000008705) SYNC (ENSMMMG00000008715) RBBP4 (ENSMMMG00000008727) ENSMMMG00000008746 ZBTB8A (ENSMMMG00000008755) ZBTB8B (ENSMMMG00000008782) BSDC1 (ENSMMMG00000008793) TSSK3 (ENSMMMG00000008823) MARCKSL1 (ENSMMMG00000008829) HDAC1 (ENSMMMG00000008831) ENSMMMG00000008856 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.b ENSGT00940000162923 Felidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000162244.i ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a.c ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.b.b ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.o.b.a.a Cat DUPLICATION Cat MODERN SPECIES 239 ENSFCAG00000040752 TNFAIP6 (ENSFCAG00000027956) ENSFCAG00000053166 NMI (ENSFCAG00000008426) RBM43 (ENSFCAG00000046232) RND3 (ENSFCAG00000023508) MMADHC (ENSFCAG00000005210) LYPD6 (ENSFCAG00000038369) LYPD6B (ENSFCAG00000013261) KIF5C (ENSFCAG00000025089) EPC2 (ENSFCAG00000023979) MBD5 (ENSFCAG00000028925) ORC4 (ENSFCAG00000029890) ACVR2A (ENSFCAG00000023845) ENSFCAG00000037177 ENSFCAG00000022964 #22 ZEB2 (ENSFCAG00000015532) GTDC1 (ENSFCAG00000012314) ARHGAP15 (ENSFCAG00000011613) KYNU (ENSFCAG00000018501) LRP1B (ENSFCAG00000026584) NXPH2 (ENSFCAG00000039021) SPOPL (ENSFCAG00000040800) HNMT (ENSFCAG00000022918) THSD7B (ENSFCAG00000013556) CXCR4 (ENSFCAG00000015575) DARS1 (ENSFCAG00000014295) MCM6 (ENSFCAG00000013595) LCT (ENSFCAG00000009430) UBXN4 (ENSFCAG00000031029) R3HDM1 (ENSFCAG00000027113) Cat MODERN SPECIES 245 ABCA10 (ENSFCAG00000030918) ABCA5 (ENSFCAG00000041521) MAP2K6 (ENSFCAG00000015681) KCNJ16 (ENSFCAG00000022418) KCNJ2 (ENSFCAG00000045298) SOX9 (ENSFCAG00000044523) #10 SLC39A11 (ENSFCAG00000012544) #11 SSTR2 (ENSFCAG00000004735) #12 COG1 (ENSFCAG00000004736) #14 FAM104A (ENSFCAG00000004739) #16 CE1H17orf80 (ENSFCAG00000004742) #17 CPSF4L (ENSFCAG00000004745) #18 ENSFCAG00000049406 #18 CDC42EP4 (ENSFCAG00000033509) #19 SDK2 (ENSFCAG00000004747) #21 RPL38 (ENSFCAG00000010851) #22 TTYH2 (ENSFCAG00000010852) #23 KIF19 (ENSFCAG00000023450) #25 BTBD17 (ENSFCAG00000046609) #26 GPR142 (ENSFCAG00000035236) #27 GPRC5C (ENSFCAG00000008735) #29 ENSFCAG00000038384 ENSFCAG00000045428 #32 CD300C (ENSFCAG00000050735) #33 CD300H (ENSFCAG00000034499) #34 ENSFCAG00000051046 ENSFCAG00000048789 ENSFCAG00000049825 ENSFCAG00000052290 ENSFCAG00000052554 ENSFCAG00000053168 Cat MODERN SPECIES 237 TRIP11 (ENSFCAG00000022277) FBLN5 (ENSFCAG00000011801) ENSFCAG00000037997 TC2N (ENSFCAG00000033928) ENSFCAG00000045956 CATSPERB (ENSFCAG00000015048) PPP4R3A (ENSFCAG00000031178) CCDC88C (ENSFCAG00000001588) ENSFCAG00000001587 ENSFCAG00000042733 RPS6KA5 (ENSFCAG00000001585) TTC7B (ENSFCAG00000001583) ENSFCAG00000024994 NRDE2 (ENSFCAG00000011312) ENSFCAG00000011310 ENSFCAG00000013076 #22 KCNK13 (ENSFCAG00000046090) TDP1 (ENSFCAG00000005982) EFCAB11 (ENSFCAG00000033426) FOXN3 (ENSFCAG00000012929) TTC8 (ENSFCAG00000010921) EML5 (ENSFCAG00000036672) ENSFCAG00000012898 PTPN21 (ENSFCAG00000002955) SPATA7 (ENSFCAG00000002954) KCNK10 (ENSFCAG00000001433) GALC (ENSFCAG00000003064) FLRT2 (ENSFCAG00000024912) SEL1L (ENSFCAG00000009027) STON2 (ENSFCAG00000011706) GTF2A1 (ENSFCAG00000033149) Panthera ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000162244.i ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a.c ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.o.b.a.a ENSGT00940000158883.b Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000162244.i ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a.c ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.o.b.a.a ENSGT00940000158883.b lion DUPLICATION lion MODERN SPECIES 8 TNFAIP6 (ENSPLOG00000022459) NMI (ENSPLOG00000022481) RBM43 (ENSPLOG00000022483) RND3 (ENSPLOG00000022487) ENSPLOG00000022492 LYPD6 (ENSPLOG00000022514) LYPD6B (ENSPLOG00000022518) KIF5C (ENSPLOG00000022528) EPC2 (ENSPLOG00000022534) MBD5 (ENSPLOG00000022542) ENSPLOG00000022549 ORC4 (ENSPLOG00000022553) ACVR2A (ENSPLOG00000004697) ENSPLOG00000004702 ENSPLOG00000004716 ENSPLOG00000004721 #22 ZEB2 (ENSPLOG00000004758) GTDC1 (ENSPLOG00000004848) ARHGAP15 (ENSPLOG00000004919) KYNU (ENSPLOG00000004977) ENSPLOG00000005011 LRP1B (ENSPLOG00000005161) ENSPLOG00000005421 NXPH2 (ENSPLOG00000005437) SPOPL (ENSPLOG00000005460) HNMT (ENSPLOG00000005608) THSD7B (ENSPLOG00000005685) ENSPLOG00000005928 ENSPLOG00000005948 ENSPLOG00000005961 CXCR4 (ENSPLOG00000005971) lion MODERN SPECIES 14 ENSPLOG00000009374 ABCA10 (ENSPLOG00000007329) ABCA5 (ENSPLOG00000006586) MAP2K6 (ENSPLOG00000006493) KCNJ16 (ENSPLOG00000006460) KCNJ2 (ENSPLOG00000006443) SOX9 (ENSPLOG00000006411) #10 SLC39A11 (ENSPLOG00000006350) #11 SSTR2 (ENSPLOG00000006332) #12 COG1 (ENSPLOG00000006254) #14 FAM104A (ENSPLOG00000006201) #16 C17orf80 (ENSPLOG00000006147) #17 ENSPLOG00000006085 #18 CDC42EP4 (ENSPLOG00000006048) #19 SDK2 (ENSPLOG00000005989) #21 RPL38 (ENSPLOG00000005945) #22 TTYH2 (ENSPLOG00000005876) #23 DNAI2 (ENSPLOG00000005805) #24 KIF19 (ENSPLOG00000005742) #25 BTBD17 (ENSPLOG00000005716) #26 GPR142 (ENSPLOG00000005698) #27 GPRC5C (ENSPLOG00000005637) #29 ENSPLOG00000005585 ENSPLOG00000005553 #32 CD300C (ENSPLOG00000005529) #33 CD300H (ENSPLOG00000005513) #34 ENSPLOG00000005489 ENSPLOG00000005471 ENSPLOG00000005420 ENSPLOG00000017804 ENSPLOG00000017782 leopard DUPLICATION leopard MODERN SPECIES 1 RBM43 (ENSPPRG00000005153) RND3 (ENSPPRG00000007409) ENSPPRG00000007620 ENSPPRG00000008539 LYPD6 (ENSPPRG00000008921) LYPD6B (ENSPPRG00000009609) ENSPPRG00000009816 KIF5C (ENSPPRG00000009950) EPC2 (ENSPPRG00000010357) ENSPPRG00000016642 MBD5 (ENSPPRG00000011397) ORC4 (ENSPPRG00000012919) ACVR2A (ENSPPRG00000013771) ENSPPRG00000016836 ENSPPRG00000016855 ENSPPRG00000016894 #22 ZEB2 (ENSPPRG00000023971) GTDC1 (ENSPPRG00000002408) ARHGAP15 (ENSPPRG00000003769) KYNU (ENSPPRG00000004587) LRP1B (ENSPPRG00000009154) ENSPPRG00000017355 ENSPPRG00000017377 ENSPPRG00000012169 NXPH2 (ENSPPRG00000012365) SPOPL (ENSPPRG00000013080) HNMT (ENSPPRG00000013385) THSD7B (ENSPPRG00000024481) CXCR4 (ENSPPRG00000024427) DARS1 (ENSPPRG00000024294) MCM6 (ENSPPRG00000023335) leopard MODERN SPECIES 154 ENSPPRG00000012912 ENSPPRG00000012913 SLC6A6 (ENSPPRG00000013003) GRIP2 (ENSPPRG00000013151) CCDC174 (ENSPPRG00000013291) C3orf20 (ENSPPRG00000013356) FGD5 (ENSPPRG00000013574) NR2C2 (ENSPPRG00000013873) MRPS25 (ENSPPRG00000013901) RBSN (ENSPPRG00000013941) TRH (ENSPPRG00000013952) TMCC1 (ENSPPRG00000014113) PLXND1 (ENSPPRG00000014283) H1-8 (ENSPPRG00000014444) RHO (ENSPPRG00000014471) ENSPPRG00000014504 #22 IFT122 (ENSPPRG00000015865) MBD4 (ENSPPRG00000016480) EFCAB12 (ENSPPRG00000016816) RPL32 (ENSPPRG00000016964) CAND2 (ENSPPRG00000017246) TMEM40 (ENSPPRG00000018566) RAF1 (ENSPPRG00000021390) MKRN2 (ENSPPRG00000021887) MKRN2OS (ENSPPRG00000021987) leopard MODERN SPECIES 48 ABCA10 (ENSPPRG00000018434) ABCA5 (ENSPPRG00000022139) MAP2K6 (ENSPPRG00000024660) KCNJ16 (ENSPPRG00000014767) KCNJ2 (ENSPPRG00000014774) ENSPPRG00000024402 SOX9 (ENSPPRG00000024215) #10 SLC39A11 (ENSPPRG00000024005) #11 SSTR2 (ENSPPRG00000014805) #12 COG1 (ENSPPRG00000023290) #14 FAM104A (ENSPPRG00000022758) #16 C17orf80 (ENSPPRG00000000554) #17 CPSF4L (ENSPPRG00000001058) #18 CDC42EP4 (ENSPPRG00000001446) #19 SDK2 (ENSPPRG00000002866) #21 ENSPPRG00000003563 #22 TTYH2 (ENSPPRG00000004228) #23 DNAI2 (ENSPPRG00000006411) #24 KIF19 (ENSPPRG00000007303) #25 BTBD17 (ENSPPRG00000007594) #26 GPR142 (ENSPPRG00000008138) #27 GPRC5C (ENSPPRG00000008949) #29 ENSPPRG00000009422 CD300H (ENSPPRG00000009784) #34 CD300LF (ENSPPRG00000011653) RAB37 (ENSPPRG00000013413) NHERF1 (ENSPPRG00000014731) ENSPPRG00000000182 ENSPPRG00000000375 TMEM104 (ENSPPRG00000000545) GRIN2C (ENSPPRG00000001445) Tiger DUPLICATION Tiger MODERN SPECIES 243 ENSPTIG00000015310 ENSPTIG00000009533 #22 ZEB2 (ENSPTIG00000015892) GTDC1 (ENSPTIG00000017004) ARHGAP15 (ENSPTIG00000018060) KYNU (ENSPTIG00000018174) LRP1B (ENSPTIG00000018986) ENSPTIG00000009550 ENSPTIG00000009554 NXPH2 (ENSPTIG00000009560) SPOPL (ENSPTIG00000020249) HNMT (ENSPTIG00000020321) THSD7B (ENSPTIG00000020413) CXCR4 (ENSPTIG00000021235) Tiger MODERN SPECIES 353 ENSPTIG00000011700 #22 ENSPTIG00000011732 #23 ENSPTIG00000011821 #23 DNAI2 (ENSPTIG00000012001) #24 KIF19 (ENSPTIG00000012082) #25 GPR142 (ENSPTIG00000012176) #27 GPRC5C (ENSPTIG00000012248) #29 ENSPTIG00000012355 ENSPTIG00000012497 #32 ENSPTIG00000012536 #33 ENSPTIG00000012617 #34 CD300E (ENSPTIG00000012638) RAB37 (ENSPTIG00000012711) CD300LF (ENSPTIG00000012930) ENSPTIG00000013071 NAT9 (ENSPTIG00000013233) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.b ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a ENSGT00940000154332.o.b.b.a.b ENSGT00940000162923 Canidae ANCESTRAL SPECIES 28 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.a.b.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a ENSGT00940000154332.o.b.a.b.a Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.a.b.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a ENSGT00940000154332.o.b.a.b.a Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 328 ENSCAFG00020026350 ENSCAFG00020026351 ENSCAFG00020026352 ENSCAFG00020026354 NCAM2 (ENSCAFG00020026356) ENSCAFG00020026360 ENSCAFG00020026362 ENSCAFG00020026365 TMPRSS15 (ENSCAFG00020026375) CHODL (ENSCAFG00020026384) C21orf91 (ENSCAFG00020026389) BTG3 (ENSCAFG00020026390) CXADR (ENSCAFG00020026392) USP25 (ENSCAFG00020026422) ENSCAFG00020026525 ENSCAFG00020026527 #22 SAMSN1 (ENSCAFG00020026530) HSPA13 (ENSCAFG00020026532) ENSCAFG00020026534 ENSCAFG00020026540 RBM11 (ENSCAFG00020026541) LIPI (ENSCAFG00020026542) ENSCAFG00020026545 ENSCAFG00020026548 ENSCAFG00020026549 ROBO2 (ENSCAFG00020026553) ENSCAFG00020026658 ENSCAFG00020026669 ENSCAFG00020026688 ENSCAFG00020026690 GBE1 (ENSCAFG00020026699) Dingo MODERN SPECIES 277 BLTP3B (ENSCAFG00020024212) ENSCAFG00020024210 ENSCAFG00020024208 ENSCAFG00020024207 ENSCAFG00020024201 ENSCAFG00020024199 APAF1 (ENSCAFG00020023804) ENSCAFG00020023757 ENSCAFG00020023755 ENSCAFG00020023754 ENSCAFG00020023737 ENSCAFG00020023735 ENSCAFG00020023734 ENSCAFG00020023728 ENSCAFG00020023725 ENSCAFG00020023724 #22 CDK17 (ENSCAFG00020023345) ELK3 (ENSCAFG00020023280) LTA4H (ENSCAFG00020023272) HAL (ENSCAFG00020023260) AMDHD1 (ENSCAFG00020023254) CCDC38 (ENSCAFG00020023245) ENSCAFG00020023242 NTN4 (ENSCAFG00020023240) USP44 (ENSCAFG00020023237) METAP2 (ENSCAFG00020023202) VEZT (ENSCAFG00020023189) ENSCAFG00020023187 FGD6 (ENSCAFG00020023183) NR2C1 (ENSCAFG00020023077) NDUFA12 (ENSCAFG00020023057) Dingo MODERN SPECIES 68 SOX9 (ENSCAFG00020021501) #10 SLC39A11 (ENSCAFG00020021505) #11 SSTR2 (ENSCAFG00020021511) #12 COG1 (ENSCAFG00020021512) #14 ENSCAFG00020021518 C17orf80 (ENSCAFG00020021521) #17 ENSCAFG00020021525 #18 CDC42EP4 (ENSCAFG00020021528) #19 SDK2 (ENSCAFG00020021554) #21 ENSCAFG00020021803 #22 TTYH2 (ENSCAFG00020021807) #23 DNAI2 (ENSCAFG00020021809) #24 KIF19 (ENSCAFG00020021819) #25 BTBD17 (ENSCAFG00020021825) #26 GPR142 (ENSCAFG00020021826) #27 GPRC5C (ENSCAFG00020021828) #29 ENSCAFG00020021830 CD300H (ENSCAFG00020021831) #34 ENSCAFG00020021833 ENSCAFG00020021834 ENSCAFG00020021835 CD300E (ENSCAFG00020021837) ENSCAFG00020021838 ENSCAFG00020021839 ENSCAFG00020021842 Dingo MODERN SPECIES 80 DPH3 (ENSCAFG00020027350) OXNAD1 (ENSCAFG00020027343) RFTN1 (ENSCAFG00020027339) ENSCAFG00020027335 PLCL2 (ENSCAFG00020027333) TBC1D5 (ENSCAFG00020027311) SATB1 (ENSCAFG00020027296) ENSCAFG00020027293 KCNH8 (ENSCAFG00020027292) EFHB (ENSCAFG00020027289) RAB5A (ENSCAFG00020027287) PP2D1 (ENSCAFG00020027286) ENSCAFG00020027283 ENSCAFG00020027282 ENSCAFG00020027281 ENSCAFG00020027279 #22 ZNF385D (ENSCAFG00020027278) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 24 ENSCAFG00845026202 ENSCAFG00845026169 ENSCAFG00845026144 ENSCAFG00845026117 NCAM2 (ENSCAFG00845025818) ENSCAFG00845025739 ENSCAFG00845025706 ENSCAFG00845025654 TMPRSS15 (ENSCAFG00845025491) CHODL (ENSCAFG00845025297) C31H21orf91 (ENSCAFG00845025134) BTG3 (ENSCAFG00845025026) CXADR (ENSCAFG00845024704) USP25 (ENSCAFG00845023682) ENSCAFG00845023263 ENSCAFG00845023227 #22 SAMSN1 (ENSCAFG00845023015) HSPA13 (ENSCAFG00845022873) ENSCAFG00845022819 ENSCAFG00845021983 RBM11 (ENSCAFG00845021830) ENSCAFG00845021611 ENSCAFG00845021440 ROBO2 (ENSCAFG00845020871) ROBO1 (ENSCAFG00845020071) ENSCAFG00845019727 ENSCAFG00845019566 ENSCAFG00845019523 GBE1 (ENSCAFG00845019273) ENSCAFG00845019189 ENSCAFG00845019132 Dog MODERN SPECIES 6 ACTR6 (ENSCAFG00845005922) BLTP3B (ENSCAFG00845005817) ENSCAFG00845005753 ENSCAFG00845005730 GARIN6 (ENSCAFG00845005702) ENSCAFG00845027984 ANKS1B (ENSCAFG00845027643) APAF1 (ENSCAFG00845027232) IKBIP (ENSCAFG00845027049) SLC25A3 (ENSCAFG00845026910) TMPO (ENSCAFG00845026620) NEDD1 (ENSCAFG00845026200) ENSCAFG00845026133 ENSCAFG00845026114 CFAP54 (ENSCAFG00845025772) ENSCAFG00845025679 #22 ENSCAFG00845025653 CDK17 (ENSCAFG00845025438) ELK3 (ENSCAFG00845025317) LTA4H (ENSCAFG00845024692) HAL (ENSCAFG00845024266) AMDHD1 (ENSCAFG00845024156) CCDC38 (ENSCAFG00845024078) ENSCAFG00845023974 NTN4 (ENSCAFG00845023731) USP44 (ENSCAFG00845023662) METAP2 (ENSCAFG00845023414) VEZT (ENSCAFG00845023106) FGD6 (ENSCAFG00845022871) NR2C1 (ENSCAFG00845022744) NDUFA12 (ENSCAFG00845022634) Dog MODERN SPECIES 36 INSM2 (ENSCAFG00845002072) RALGAPA1 (ENSCAFG00845002236) BRMS1L (ENSCAFG00845002506) MBIP (ENSCAFG00845002536) ENSCAFG00845002614 NKX2-1 (ENSCAFG00845002630) NKX2-8 (ENSCAFG00845002657) PAX9 (ENSCAFG00845002669) SLC25A21 (ENSCAFG00845002697) ENSCAFG00845002744 MIPOL1 (ENSCAFG00845002871) FOXA1 (ENSCAFG00845002956) TTC6 (ENSCAFG00845003002) ENSCAFG00845003148 SSTR1 (ENSCAFG00845003155) ENSCAFG00845003193 #22 SEC23A (ENSCAFG00845003250) GEMIN2 (ENSCAFG00845003360) TRAPPC6B (ENSCAFG00845003425) PNN (ENSCAFG00845003456) MIA2 (ENSCAFG00845003556) FBXO33 (ENSCAFG00845003843) ENSCAFG00845003922 ENSCAFG00845003964 ENSCAFG00845003975 ENSCAFG00845003987 LRFN5 (ENSCAFG00845004006) ENSCAFG00845004072 C8H14orf28 (ENSCAFG00845004109) KLHL28 (ENSCAFG00845004145) TOGARAM1 (ENSCAFG00845001513) Dog MODERN SPECIES 35 TOR1AIP1 (ENSCAFG00845002082) ENSCAFG00845002008 ENSCAFG00845001988 ENSCAFG00845001973 ENSCAFG00845001949 ENSCAFG00845001932 ENSCAFG00845001892 CENPF (ENSCAFG00845001752) PTPN14 (ENSCAFG00845001665) ENSCAFG00845001638 SMYD2 (ENSCAFG00845001630) PROX1 (ENSCAFG00845001606) RPS6KC1 (ENSCAFG00845001399) ANGEL2 (ENSCAFG00845001293) VASH2 (ENSCAFG00845001231) ENSCAFG00845001182 #22 FLVCR1 (ENSCAFG00845001151) ENSCAFG00845001121 TATDN3 (ENSCAFG00845003857) ENSCAFG00845003831 NSL1 (ENSCAFG00845003808) BATF3 (ENSCAFG00845003785) ENSCAFG00845003779 GARIN4 (ENSCAFG00845003772) ATF3 (ENSCAFG00845003749) NENF (ENSCAFG00845003726) PACC1 (ENSCAFG00845003695) PPP2R5A (ENSCAFG00845003647) ENSCAFG00845003622 DTL (ENSCAFG00845003601) INTS7 (ENSCAFG00845003540) Dog MODERN SPECIES 37 ENSCAFG00845020989 ENSCAFG00845020949 ENSCAFG00845020841 ENSCAFG00845020801 ENSCAFG00845020739 ENSCAFG00845020612 SOX9 (ENSCAFG00845020385) #10 SLC39A11 (ENSCAFG00845020256) #11 SSTR2 (ENSCAFG00845020191) #12 COG1 (ENSCAFG00845019948) #14 FAM104A (ENSCAFG00845019846) #16 C17orf80 (ENSCAFG00845019740) #17 ENSCAFG00845019664 #18 ENSCAFG00845019597 #19 SDK2 (ENSCAFG00845019358) #21 ENSCAFG00845019152 #22 TTYH2 (ENSCAFG00845018975) #23 DNAI2 (ENSCAFG00845018881) #24 KIF19 (ENSCAFG00845018750) #25 BTBD17 (ENSCAFG00845018705) #26 GPR142 (ENSCAFG00845018655) #27 GPRC5C (ENSCAFG00845018501) #29 ENSCAFG00845018416 ENSCAFG00845018370 #32 ENSCAFG00845018335 #33 ENSCAFG00845018296 ENSCAFG00845018232 #34 ENSCAFG00845018198 ENSCAFG00845018168 ENSCAFG00845018130 ENSCAFG00845018064 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 19 ENSVVUG00000024180 NCAM2 (ENSVVUG00000024089) ENSVVUG00000024058 ENSVVUG00000024050 ENSVVUG00000024046 ENSVVUG00000024035 TMPRSS15 (ENSVVUG00000023928) CHODL (ENSVVUG00000023919) CUNH21orf91 (ENSVVUG00000023916) BTG3 (ENSVVUG00000023910) CXADR (ENSVVUG00000023909) USP25 (ENSVVUG00000023883) ENSVVUG00000023876 NRIP1 (ENSVVUG00000023868) ENSVVUG00000023865 ENSVVUG00000023863 #22 SAMSN1 (ENSVVUG00000023854) HSPA13 (ENSVVUG00000023850) ENSVVUG00000023849 ENSVVUG00000023824 RBM11 (ENSVVUG00000023818) LIPI (ENSVVUG00000023813) ENSVVUG00000023808 ENSVVUG00000023801 ROBO2 (ENSVVUG00000023795) ENSVVUG00000023790 ENSVVUG00000023789 ENSVVUG00000023744 ENSVVUG00000023067 ENSVVUG00000023032 ENSVVUG00000023029 Red fox MODERN SPECIES 31 ENSVVUG00000007817 ENSVVUG00000007823 ABCA5 (ENSVVUG00000007938) MAP2K6 (ENSVVUG00000009496) KCNJ16 (ENSVVUG00000009542) KCNJ2 (ENSVVUG00000009572) SOX9 (ENSVVUG00000009644) #10 SLC39A11 (ENSVVUG00000009661) #11 SSTR2 (ENSVVUG00000009681) #12 COG1 (ENSVVUG00000009684) #14 ENSVVUG00000009691 CUNH17orf80 (ENSVVUG00000009696) #17 CPSF4L (ENSVVUG00000009703) #18 ENSVVUG00000009713 #19 SDK2 (ENSVVUG00000009726) #21 ENSVVUG00000009847 #22 TTYH2 (ENSVVUG00000009859) #23 DNAI2 (ENSVVUG00000009926) #24 KIF19 (ENSVVUG00000009960) #25 BTBD17 (ENSVVUG00000009997) #26 GPR142 (ENSVVUG00000010004) #27 GPRC5C (ENSVVUG00000010007) #29 ENSVVUG00000010009 CD300LB (ENSVVUG00000010014) #32 ENSVVUG00000010015 #33 ENSVVUG00000010022 #34 ENSVVUG00000010042 ENSVVUG00000010044 ENSVVUG00000010045 ENSVVUG00000010049 CD300E (ENSVVUG00000010054) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.w #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.b ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.o.b.a.a Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.w #33 ENSGT00940000163948.b.a #34 ENSGT00940000163948.a #34 ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.o.b.a.a Ferret MODERN SPECIES 186 ENSMPUG00000014340 ENSMPUG00000014338 ABCA5 (ENSMPUG00000014324) MAP2K6 (ENSMPUG00000014320) KCNJ16 (ENSMPUG00000019919) KCNJ2 (ENSMPUG00000019918) SOX9 (ENSMPUG00000014303) #10 ENSMPUG00000014302 SLC39A11 (ENSMPUG00000014299) #11 COG1 (ENSMPUG00000014290) #14 C17orf80 (ENSMPUG00000014285) #17 CPSF4L (ENSMPUG00000014276) #18 CDC42EP4 (ENSMPUG00000019917) #19 SDK2 (ENSMPUG00000014260) #21 ENSMPUG00000014259 RPL38 (ENSMPUG00000014257) #22 ENSMPUG00000014254 TTYH2 (ENSMPUG00000014248) #23 DNAI2 (ENSMPUG00000014244) #24 ENSMPUG00000014240 KIF19 (ENSMPUG00000014236) #25 BTBD17 (ENSMPUG00000014232) #26 GPR142 (ENSMPUG00000014230) #27 GPRC5C (ENSMPUG00000014224) #29 ENSMPUG00000014220 CD300LB (ENSMPUG00000014213) #32 ENSMPUG00000014209 #33 ENSMPUG00000014206 #33 ENSMPUG00000014201 #34 ENSMPUG00000014197 #34 ENSMPUG00000014196 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.w #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a.b.a ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.b ENSGT00940000162923 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 6 ANO4 (ENSAMEG00000000600) GAS2L3 (ENSAMEG00000015215) NR1H4 (ENSAMEG00000015232) SLC17A8 (ENSAMEG00000015266) SCYL2 (ENSAMEG00000015298) ACTR6 (ENSAMEG00000015315) BLTP3B (ENSAMEG00000001959) GARIN6 (ENSAMEG00000029798) ENSAMEG00000010821 APAF1 (ENSAMEG00000010759) IKBIP (ENSAMEG00000010756) SLC25A3 (ENSAMEG00000010735) ENSAMEG00000010691 NEDD1 (ENSAMEG00000004999) CFAP54 (ENSAMEG00000024197) ENSAMEG00000025825 #22 CDK17 (ENSAMEG00000001927) ELK3 (ENSAMEG00000026087) LTA4H (ENSAMEG00000002029) HAL (ENSAMEG00000002098) AMDHD1 (ENSAMEG00000002115) CCDC38 (ENSAMEG00000002136) ENSAMEG00000002166 NTN4 (ENSAMEG00000002169) USP44 (ENSAMEG00000002189) METAP2 (ENSAMEG00000002192) ENSAMEG00000028699 VEZT (ENSAMEG00000002219) FGD6 (ENSAMEG00000002237) NR2C1 (ENSAMEG00000002266) NDUFA12 (ENSAMEG00000026868) Giant Panda MODERN SPECIES 4 ABCA9 (ENSAMEG00000010471) ABCA6 (ENSAMEG00000010449) ABCA5 (ENSAMEG00000007271) MAP2K6 (ENSAMEG00000007357) KCNJ16 (ENSAMEG00000019502) KCNJ2 (ENSAMEG00000019547) SOX9 (ENSAMEG00000016948) #10 SLC39A11 (ENSAMEG00000016490) #11 SSTR2 (ENSAMEG00000019456) #12 COG1 (ENSAMEG00000002629) #14 FAM104A (ENSAMEG00000002692) #16 C17orf80 (ENSAMEG00000024499) #17 CPSF4L (ENSAMEG00000002707) #18 CDC42EP4 (ENSAMEG00000019485) #19 SDK2 (ENSAMEG00000002727) #21 Rpl38 (ENSAMEG00000028906) #22 TTYH2 (ENSAMEG00000001274) #23 DNAI2 (ENSAMEG00000001316) #24 KIF19 (ENSAMEG00000001329) #25 BTBD17 (ENSAMEG00000024629) #26 GPR142 (ENSAMEG00000029256) #27 ENSAMEG00000026956 #29 ENSAMEG00000024568 #29 ENSAMEG00000030773 ENSAMEG00000026195 ENSAMEG00000024749 #32 ENSAMEG00000011400 #34 ENSAMEG00000000067 ENSAMEG00000028637 ENSAMEG00000008913 ENSAMEG00000008914 Giant Panda MODERN SPECIES 12 PSMA6 (ENSAMEG00000015614) NFKBIA (ENSAMEG00000015629) INSM2 (ENSAMEG00000019215) RALGAPA1 (ENSAMEG00000015649) BRMS1L (ENSAMEG00000015738) MBIP (ENSAMEG00000013537) NKX2-1 (ENSAMEG00000031459) NKX2-8 (ENSAMEG00000025998) PAX9 (ENSAMEG00000002906) SLC25A21 (ENSAMEG00000002915) MIPOL1 (ENSAMEG00000025357) FOXA1 (ENSAMEG00000024574) ENSAMEG00000007991 SSTR1 (ENSAMEG00000018831) CLEC14A (ENSAMEG00000007985) ENSAMEG00000027344 #22 SEC23A (ENSAMEG00000003803) GEMIN2 (ENSAMEG00000003856) TRAPPC6B (ENSAMEG00000003900) PNN (ENSAMEG00000025550) ENSAMEG00000003915 FBXO33 (ENSAMEG00000003964) ENSAMEG00000026178 LRFN5 (ENSAMEG00000001988) ENSAMEG00000024405 C14orf28 (ENSAMEG00000002215) KLHL28 (ENSAMEG00000002211) TOGARAM1 (ENSAMEG00000030775) PRPF39 (ENSAMEG00000002185) FKBP3 (ENSAMEG00000002172) FANCM (ENSAMEG00000002114) Ursus ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162012 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244.d ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.w #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a.b.a ENSGT00940000154332.o.b.a.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000154332.o.b.b.a.a.a ENSGT00940000154332.o.b.b.a.b Polar bear DUPLICATION Polar bear MODERN SPECIES 144 GARIN6 (ENSUMAG00000005822) ENSUMAG00000005819 ENSUMAG00000005755 APAF1 (ENSUMAG00000004438) IKBIP (ENSUMAG00000004254) SLC25A3 (ENSUMAG00000004245) ENSUMAG00000004236 ENSUMAG00000004233 NEDD1 (ENSUMAG00000004163) ENSUMAG00000004139 ENSUMAG00000004133 #22 CDK17 (ENSUMAG00000004126) ELK3 (ENSUMAG00000004121) LTA4H (ENSUMAG00000004113) HAL (ENSUMAG00000003632) AMDHD1 (ENSUMAG00000003541) CCDC38 (ENSUMAG00000003532) SNRPF (ENSUMAG00000003528) NTN4 (ENSUMAG00000003522) USP44 (ENSUMAG00000003519) METAP2 (ENSUMAG00000003511) ENSUMAG00000003472 VEZT (ENSUMAG00000003464) FGD6 (ENSUMAG00000003327) NR2C1 (ENSUMAG00000003306) NDUFA12 (ENSUMAG00000003277) Polar bear MODERN SPECIES 185 ABCA8 (ENSUMAG00000001532) ABCA9 (ENSUMAG00000004143) ABCA6 (ENSUMAG00000006225) ABCA5 (ENSUMAG00000007715) MAP2K6 (ENSUMAG00000007728) KCNJ16 (ENSUMAG00000007741) KCNJ2 (ENSUMAG00000007750) SLC39A11 (ENSUMAG00000007803) #11 SSTR2 (ENSUMAG00000007822) #12 COG1 (ENSUMAG00000007829) #14 FAM104B (ENSUMAG00000007848) C17orf80 (ENSUMAG00000007860) #17 CPSF4L (ENSUMAG00000007869) #18 CDC42EP4 (ENSUMAG00000007877) #19 SDK2 (ENSUMAG00000007888) #21 ENSUMAG00000007931 #22 TTYH2 (ENSUMAG00000007956) #23 DNAI2 (ENSUMAG00000008015) #24 KIF19 (ENSUMAG00000008029) #25 GPR142 (ENSUMAG00000008052) #27 GPRC5C (ENSUMAG00000008077) #29 ENSUMAG00000008086 CD300LB (ENSUMAG00000008095) #32 CD300C (ENSUMAG00000008100) #33 ENSUMAG00000008109 #34 ENSUMAG00000008114 ENSUMAG00000008117 ENSUMAG00000008124 ENSUMAG00000008128 CD300E (ENSUMAG00000008133) ENSUMAG00000008140 Polar bear MODERN SPECIES 98 FAM177A1 (ENSUMAG00000011232) PPP2R3C (ENSUMAG00000011228) PRORP (ENSUMAG00000011223) PSMA6 (ENSUMAG00000011220) ENSUMAG00000011219 RALGAPA1 (ENSUMAG00000008790) BRMS1L (ENSUMAG00000008493) MBIP (ENSUMAG00000008487) PAX9 (ENSUMAG00000008481) SLC25A21 (ENSUMAG00000008477) MIPOL1 (ENSUMAG00000008466) ENSUMAG00000008415 SSTR1 (ENSUMAG00000008405) ENSUMAG00000008400 ENSUMAG00000008396 ENSUMAG00000008392 #22 SEC23A (ENSUMAG00000008381) GEMIN2 (ENSUMAG00000008366) TRAPPC6B (ENSUMAG00000008360) PNN (ENSUMAG00000008357) ENSUMAG00000008351 ENSUMAG00000008340 ENSUMAG00000008335 ENSUMAG00000008325 LRFN5 (ENSUMAG00000008323) ENSUMAG00000008318 ENSUMAG00000008316 C14orf28 (ENSUMAG00000008262) KLHL28 (ENSUMAG00000008258) TOGARAM1 (ENSUMAG00000007784) PRPF39 (ENSUMAG00000007716) Polar bear MODERN SPECIES 115 ENSUMAG00000023763 ARHGAP35 (ENSUMAG00000023756) ENSUMAG00000023753 ENSUMAG00000023748 STRN4 (ENSUMAG00000023724) PRKD2 (ENSUMAG00000023719) GNG8 (ENSUMAG00000023717) ENSUMAG00000023716 ENSUMAG00000023715 CCDC8 (ENSUMAG00000023713) PNMA8C (ENSUMAG00000023712) PNMA8A (ENSUMAG00000023711) PPP5C (ENSUMAG00000023710) HIF3A (ENSUMAG00000023708) ENSUMAG00000023707 ENSUMAG00000023706 #22 ENSUMAG00000023704 PGLYRP1 (ENSUMAG00000023702) CCDC61 (ENSUMAG00000023701) NANOS2 (ENSUMAG00000023699) SYMPK (ENSUMAG00000023698) RSPH6A (ENSUMAG00000023697) DMPK (ENSUMAG00000023693) ENSUMAG00000023690 QPCTL (ENSUMAG00000023687) SNRPD2 (ENSUMAG00000023685) GIPR (ENSUMAG00000023684) EML2 (ENSUMAG00000023616) GPR4 (ENSUMAG00000023598) OPA3 (ENSUMAG00000023597) ENSUMAG00000023595 American black bear DUPLICATION American black bear MODERN SPECIES 396 ENSUAMG00000007992 ENSUAMG00000007997 #22 CDK17 (ENSUAMG00000008003) ELK3 (ENSUAMG00000008009) LTA4H (ENSUAMG00000008013) HAL (ENSUAMG00000008031) AMDHD1 (ENSUAMG00000008172) SNRPF (ENSUAMG00000008176) CCDC38 (ENSUAMG00000008179) NTN4 (ENSUAMG00000008182) American black bear MODERN SPECIES 1448 ENSUAMG00000022395 ENSUAMG00000022396 ENSUAMG00000022397 #22 American black bear MODERN SPECIES 3595 KCNQ3 (ENSUAMG00000002272) OC90 (ENSUAMG00000002245) ENSUAMG00000002240 #22 EFR3A (ENSUAMG00000002233) American black bear MODERN SPECIES 1346 HIF3A (ENSUAMG00000004049) ENSUAMG00000004054 ENSUAMG00000004056 #22 ENSUAMG00000004066 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000159622.ab #33 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.`b #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Horse DUPLICATION Horse MODERN SPECIES 22 CA7 (ENSECAG00000024943) NAE1 (ENSECAG00000021954) TERB1 (ENSECAG00000017824) DYNC1LI2 (ENSECAG00000020218) CMTM3 (ENSECAG00000017746) CMTM4 (ENSECAG00000018456) CMTM2 (ENSECAG00000016272) ENSECAG00000028022 CKLF (ENSECAG00000026929) ENSECAG00000029867 TK2 (ENSECAG00000007170) BEAN1 (ENSECAG00000007077) CDH5 (ENSECAG00000018507) ENSECAG00000036133 CDH11 (ENSECAG00000008823) ENSECAG00000007768 #22 CDH8 (ENSECAG00000007246) ENSECAG00000048613 GOT2 (ENSECAG00000016504) SLC38A7 (ENSECAG00000007736) CNOT1 (ENSECAG00000009889) SETD6 (ENSECAG00000008587) NDRG4 (ENSECAG00000000099) GINS3 (ENSECAG00000022245) PRSS54 (ENSECAG00000020386) CCDC113 (ENSECAG00000017990) CSNK2A2 (ENSECAG00000014130) CFAP20 (ENSECAG00000011027) MMP15 (ENSECAG00000000196) USB1 (ENSECAG00000019493) ZNF319 (ENSECAG00000019473) Horse MODERN SPECIES 2 ABCA10 (ENSECAG00000000323) ABCA5 (ENSECAG00000007880) ENSECAG00000032813 MAP2K6 (ENSECAG00000010077) KCNJ16 (ENSECAG00000002188) KCNJ2 (ENSECAG00000007922) SOX9 (ENSECAG00000022037) #10 SLC39A11 (ENSECAG00000021972) #11 SSTR2 (ENSECAG00000021481) #12 COG1 (ENSECAG00000008129) #14 FAM104A (ENSECAG00000005101) CPSF4L (ENSECAG00000050893) #18 C11H17orf80 (ENSECAG00000024819) #17 CDC42EP4 (ENSECAG00000001996) #19 SDK2 (ENSECAG00000020626) #21 RPL38 (ENSECAG00000018554) #22 ENSECAG00000054626 #23 TTYH2 (ENSECAG00000022780) #23 DNAI2 (ENSECAG00000013662) #24 KIF19 (ENSECAG00000019912) #25 GPR142 (ENSECAG00000019185) #27 BTBD17 (ENSECAG00000019896) #26 GPRC5C (ENSECAG00000017083) #29 CD300LB (ENSECAG00000010702) #32 ENSECAG00000012199 ENSECAG00000050019 #33 ENSECAG00000043506 #33 ENSECAG00000009285 ENSECAG00000047654 #32 CD300E (ENSECAG00000008576) ENSECAG00000007417 Horse MODERN SPECIES 30 UBE2V2 (ENSECAG00000027910) MCM4 (ENSECAG00000019276) PRKDC (ENSECAG00000020168) ENSECAG00000051008 ENSECAG00000056081 ENSECAG00000046405 ENSECAG00000049708 CEBPD (ENSECAG00000039817) SPIDR (ENSECAG00000026935) ENSECAG00000058632 ENSECAG00000044755 ENSECAG00000052913 RIPK2 (ENSECAG00000023011) NBN (ENSECAG00000013889) OSGIN2 (ENSECAG00000013560) ENSECAG00000037667 #22 DECR1 (ENSECAG00000022113) ENSECAG00000056912 CALB1 (ENSECAG00000000058) TMEM64 (ENSECAG00000008174) NECAB1 (ENSECAG00000009384) C8orf88 (ENSECAG00000050360) ENSECAG00000029843 PIP4P2 (ENSECAG00000012004) OTUD6B (ENSECAG00000018205) ENSECAG00000059759 SLC26A7 (ENSECAG00000003602) RUNX1T1 (ENSECAG00000000178) TRIQK (ENSECAG00000035852) CIBAR1 (ENSECAG00000007382) RBM12B (ENSECAG00000017870) Donkey DUPLICATION Donkey MODERN SPECIES 3 PPDPFL (ENSEASG00005024997) ENSEASG00005009186 CLXN (ENSEASG00005009190) UBE2V2 (ENSEASG00005024827) MCM4 (ENSEASG00005009194) ENSEASG00005035234 ENSEASG00005037902 PRKDC (ENSEASG00005009458) ENSEASG00005011359 ENSEASG00005011360 ENSEASG00005030668 ENSEASG00005027435 ENSEASG00005014064 OSGIN2 (ENSEASG00005028467) NBN (ENSEASG00005014058) ENSEASG00005014055 #22 ENSEASG00005014053 CALB1 (ENSEASG00005014050) TMEM64 (ENSEASG00005014049) NECAB1 (ENSEASG00005014047) ENSEASG00005026399 C8orf88 (ENSEASG00005036654) PIP4P2 (ENSEASG00005014038) OTUD6B (ENSEASG00005014036) SLC26A7 (ENSEASG00005014030) RUNX1T1 (ENSEASG00005016311) TRIQK (ENSEASG00005025608) ENSEASG00005031386 ENSEASG00005016300 RBM12B (ENSEASG00005016297) TMEM67 (ENSEASG00005016269) Donkey MODERN SPECIES 4 ABCA10 (ENSEASG00005018638) ABCA5 (ENSEASG00005018662) MAP2K6 (ENSEASG00005018727) KCNJ16 (ENSEASG00005027302) KCNJ2 (ENSEASG00005030860) ENSEASG00005018733 SOX9 (ENSEASG00005026548) #10 SLC39A11 (ENSEASG00005018746) #11 SSTR2 (ENSEASG00005036396) #12 COG1 (ENSEASG00005018752) #14 FAM104A (ENSEASG00005026702) #16 C17orf80 (ENSEASG00005018760) #17 CPSF4L (ENSEASG00005018763) #18 CDC42EP4 (ENSEASG00005023547) #19 SDK2 (ENSEASG00005018831) #21 ENSEASG00005030632 #22 TTYH2 (ENSEASG00005018958) #23 DNAI2 (ENSEASG00005031188) #24 KIF19 (ENSEASG00005018990) #25 BTBD17 (ENSEASG00005019002) #26 GPR142 (ENSEASG00005027297) #27 GPRC5C (ENSEASG00005019008) #29 ENSEASG00005024158 ENSEASG00005019013 #33 CD300LB (ENSEASG00005019025) #32 ENSEASG00005019010 #33 CD300H (ENSEASG00005019022) #34 ENSEASG00005019028 #32 ENSEASG00005019030 CD300LF (ENSEASG00005036807) RAB37 (ENSEASG00005034022) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Megabat MODERN SPECIES 2496 ENSPVAG00000017521 RPL38 (ENSPVAG00000017523) #22 TTYH2 (ENSPVAG00000017524) #23 ENSPVAG00000017526 KIF19 (ENSPVAG00000024104) #25 BTBD17 (ENSPVAG00000017528) #26 ENSPVAG00000017527 #27 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1750 ENSMLUG00000014454 #22 TTYH2 (ENSMLUG00000014458) #23 DNAI2 (ENSMLUG00000014465) #24 Microbat MODERN SPECIES 737 ENSMLUG00000022428 #22 Microbat MODERN SPECIES 939 ENSMLUG00000000421 UPF3B (ENSMLUG00000010821) ENSMLUG00000016812 NDUFA1 (ENSMLUG00000006685) NKAP (ENSMLUG00000008310) ENSMLUG00000007665 ENSMLUG00000025783 TMEM255A (ENSMLUG00000016410) ATP1B4 (ENSMLUG00000012306) LAMP2 (ENSMLUG00000012320) CUL4B (ENSMLUG00000013231) MCTS1 (ENSMLUG00000015101) C1GALT1C1 (ENSMLUG00000012757) GRIA3 (ENSMLUG00000007407) ENSMLUG00000013656 ENSMLUG00000027315 #22 XIAP (ENSMLUG00000001731) STAG2 (ENSMLUG00000009349) SH2D1A (ENSMLUG00000014879) ENSMLUG00000024778 TENM1 (ENSMLUG00000014882) ENSMLUG00000025681 ENSMLUG00000030179 ENSMLUG00000028867 ENSMLUG00000025675 DCAF12L2 (ENSMLUG00000015935) ENSMLUG00000029909 ENSMLUG00000025391 ENSMLUG00000016470 SMARCA1 (ENSMLUG00000029614) OCRL (ENSMLUG00000015997) Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 13 GLP2R (ENSRFEG00010005982) RCVRN (ENSRFEG00010005896) GAS7 (ENSRFEG00010005755) ENSRFEG00010005632 MYH13 (ENSRFEG00010005561) MYH8 (ENSRFEG00010005469) ENSRFEG00010018480 MYH1 (ENSRFEG00010018452) ENSRFEG00010018395 MYH3 (ENSRFEG00010018021) SCO1 (ENSRFEG00010017953) ADPRM (ENSRFEG00010017929) TMEM220 (ENSRFEG00010017812) TMEM238L (ENSRFEG00010017800) PIRT (ENSRFEG00010017784) ENSRFEG00010017770 #22 SHISA6 (ENSRFEG00010017537) DNAH9 (ENSRFEG00010015443) ZNF18 (ENSRFEG00010015327) MAP2K4 (ENSRFEG00010015194) MYOCD (ENSRFEG00010015068) ARHGAP44 (ENSRFEG00010014837) ELAC2 (ENSRFEG00010013625) HS3ST3A1 (ENSRFEG00010013442) COX10 (ENSRFEG00010013286) HS3ST3B1 (ENSRFEG00010013247) ENSRFEG00010013184 PMP22 (ENSRFEG00010013092) TEKT3 (ENSRFEG00010013034) CDRT4 (ENSRFEG00010012975) ENSRFEG00010012887 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 13 ABCA5 (ENSRFEG00010007821) MAP2K6 (ENSRFEG00010007955) KCNJ16 (ENSRFEG00010007999) KCNJ2 (ENSRFEG00010008023) ENSRFEG00010008052 SOX9 (ENSRFEG00010008096) #10 ENSRFEG00010008125 SLC39A11 (ENSRFEG00010008145) #11 SSTR2 (ENSRFEG00010008191) #12 COG1 (ENSRFEG00010008220) #14 FAM104A (ENSRFEG00010008303) #16 C17orf80 (ENSRFEG00010008375) #17 CPSF4L (ENSRFEG00010008491) #18 CDC42EP4 (ENSRFEG00010008544) #19 SDK2 (ENSRFEG00010008618) #21 ENSRFEG00010009028 #22 TTYH2 (ENSRFEG00010009086) #23 DNAI2 (ENSRFEG00010009158) #24 KIF19 (ENSRFEG00010009201) #25 BTBD17 (ENSRFEG00010009232) #26 GPR142 (ENSRFEG00010009260) #27 GPRC5C (ENSRFEG00010009287) #29 ENSRFEG00010009390 ENSRFEG00010009442 #32 ENSRFEG00010009501 #33 ENSRFEG00010009557 #32 ENSRFEG00010009594 CD300E (ENSRFEG00010009804) RAB37 (ENSRFEG00010009848) ENSRFEG00010010006 NHERF1 (ENSRFEG00010010046) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C Pig MODERN SPECIES 3 ABCA6 (ENSSSCG00000017256) ENSSSCG00000055960 ABCA5 (ENSSSCG00000017255) MAP2K6 (ENSSSCG00000017254) KCNJ16 (ENSSSCG00000034358) KCNJ2 (ENSSSCG00000039947) SOX9 (ENSSSCG00000017251) #10 SSTR2 (ENSSSCG00000017249) #12 SLC39A11 (ENSSSCG00000037754) #11 COG1 (ENSSSCG00000017248) #14 FAM104A (ENSSSCG00000031686) #16 C17orf80 (ENSSSCG00000017246) #17 ENSSSCG00000040611 #18 CDC42EP4 (ENSSSCG00000017245) #19 ENSSSCG00000046071 #21 RPL38 (ENSSSCG00000017239) #22 TTYH2 (ENSSSCG00000017238) #23 DNAI2 (ENSSSCG00000024357) #24 KIF19 (ENSSSCG00000021724) #25 BTBD17 (ENSSSCG00000059713) #26 GPR142 (ENSSSCG00000027923) #27 GPRC5C (ENSSSCG00000040989) #29 ENSSSCG00000033918 CD300LB (ENSSSCG00000017237) #32 CD300C (ENSSSCG00000017236) #33 ENSSSCG00000020967 #34 ENSSSCG00000017235 ENSSSCG00000043974 ENSSSCG00000035960 ENSSSCG00000037541 RAB37 (ENSSSCG00000017233) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Cetacea ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000155148.b ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 Dolphin MODERN SPECIES 1950 RPL38 (ENSTTRG00000007499) #22 TTYH2 (ENSTTRG00000007500) #23 ENSTTRG00000007501 KIF19 (ENSTTRG00000021374) #25 GPR142 (ENSTTRG00000007502) #27 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155148.b ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 Vaquita MODERN SPECIES 12 PRKAR1A (ENSPSNG00000022090) FAM20A (ENSPSNG00000022065) ABCA5 (ENSPSNG00000022027) MAP2K6 (ENSPSNG00000021990) KCNJ16 (ENSPSNG00000021975) KCNJ2 (ENSPSNG00000021960) SOX9 (ENSPSNG00000021947) #10 SSTR2 (ENSPSNG00000021933) #12 SLC39A11 (ENSPSNG00000021911) #11 COG1 (ENSPSNG00000021846) #14 FAM104A (ENSPSNG00000021820) #16 C17orf80 (ENSPSNG00000021795) #17 CPSF4L (ENSPSNG00000021750) #18 CDC42EP4 (ENSPSNG00000021735) #19 SDK2 (ENSPSNG00000021722) #21 RPL38 (ENSPSNG00000021704) #22 TTYH2 (ENSPSNG00000021661) #23 DNAI2 (ENSPSNG00000021616) #24 KIF19 (ENSPSNG00000021580) #25 BTBD17 (ENSPSNG00000021562) #26 GPR142 (ENSPSNG00000021551) #27 GPRC5C (ENSPSNG00000021478) #29 ENSPSNG00000021433 ENSPSNG00000021411 CD300LF (ENSPSNG00000021373) RAB37 (ENSPSNG00000021273) NHERF1 (ENSPSNG00000021218) NAT9 (ENSPSNG00000021176) TMEM104 (ENSPSNG00000021121) GRIN2C (ENSPSNG00000021017) FDXR (ENSPSNG00000020806) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000155148.b ENSGT00950000182951.A.b ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 ENSGT00950000182990.b Beluga whale MODERN SPECIES 26 PRKAR1A (ENSDLEG00000012421) FAM20A (ENSDLEG00000012388) ABCA5 (ENSDLEG00000012322) MAP2K6 (ENSDLEG00000012295) KCNJ16 (ENSDLEG00000012288) KCNJ2 (ENSDLEG00000012283) SOX9 (ENSDLEG00000012262) #10 SLC39A11 (ENSDLEG00000012227) #11 SSTR2 (ENSDLEG00000012213) #12 COG1 (ENSDLEG00000012145) #14 FAM104A (ENSDLEG00000012132) #16 CUNH17orf80 (ENSDLEG00000012118) #17 ENSDLEG00000012041 #18 CDC42EP4 (ENSDLEG00000012031) #19 SDK2 (ENSDLEG00000011514) #21 RPL38 (ENSDLEG00000011449) #22 TTYH2 (ENSDLEG00000011370) #23 DNAI2 (ENSDLEG00000011322) #24 KIF19 (ENSDLEG00000011275) #25 BTBD17 (ENSDLEG00000011259) #26 GPR142 (ENSDLEG00000011249) #27 GPRC5C (ENSDLEG00000011234) #29 ENSDLEG00000011211 CD300LF (ENSDLEG00000011191) RAB37 (ENSDLEG00000011164) SLC9A3R1 (ENSDLEG00000011137) NAT9 (ENSDLEG00000011038) TMEM104 (ENSDLEG00000010961) GRIN2C (ENSDLEG00000010808) FDXR (ENSDLEG00000010749) FADS6 (ENSDLEG00000010697) Narwhal MODERN SPECIES 316 FAM20A (ENSMMNG00015015558) ABCA5 (ENSMMNG00015015520) MAP2K6 (ENSMMNG00015015496) KCNJ16 (ENSMMNG00015015487) KCNJ2 (ENSMMNG00015015478) ENSMMNG00015015473 SOX9 (ENSMMNG00015015461) #10 SLC39A11 (ENSMMNG00015015444) #11 SSTR2 (ENSMMNG00015015437) #12 COG1 (ENSMMNG00015015409) #14 FAM104A (ENSMMNG00015015381) #16 C17orf80 (ENSMMNG00015015354) #17 ENSMMNG00015015300 #18 CDC42EP4 (ENSMMNG00015015273) #19 SDK2 (ENSMMNG00015015215) #21 RPL38 (ENSMMNG00015015175) #22 TTYH2 (ENSMMNG00015015142) #23 DNAI2 (ENSMMNG00015015100) #24 KIF19 (ENSMMNG00015015056) #25 BTBD17 (ENSMMNG00015015030) #26 GPR142 (ENSMMNG00015015018) #27 GPRC5C (ENSMMNG00015014979) #29 ENSMMNG00015014941 CD300LF (ENSMMNG00015014924) RAB37 (ENSMMNG00015021777) NHERF1 (ENSMMNG00015021756) NAT9 (ENSMMNG00015021736) TMEM104 (ENSMMNG00015021716) GRIN2C (ENSMMNG00015021672) FDXR (ENSMMNG00015021638) FADS6 (ENSMMNG00015021599) Sperm whale DUPLICATION Sperm whale MODERN SPECIES 475 RPL38 (ENSPCTG00005021341) #22 ENSPCTG00005021331 #23 Sperm whale MODERN SPECIES 9 GRM7 (ENSPCTG00005010372) ENSPCTG00005010665 ENSPCTG00005010694 EDEM1 (ENSPCTG00005010722) ARL8B (ENSPCTG00005010834) BHLHE40 (ENSPCTG00005010857) ENSPCTG00005010893 SUMF1 (ENSPCTG00005010949) ENSPCTG00005011064 LRRN1 (ENSPCTG00005011097) CRBN (ENSPCTG00005011120) TRNT1 (ENSPCTG00005011251) IL5RA (ENSPCTG00005011305) CNTN4 (ENSPCTG00005011901) CNTN6 (ENSPCTG00005016124) ENSPCTG00005016393 #22 CHL1 (ENSPCTG00005016433) ENSPCTG00005016580 CNTN3 (ENSPCTG00005016649) ENSPCTG00005016762 PDZRN3 (ENSPCTG00005016884) ENSPCTG00005017078 ENSPCTG00005017126 PPP4R2 (ENSPCTG00005017140) GXYLT2 (ENSPCTG00005017189) SHQ1 (ENSPCTG00005017281) ENSPCTG00005008959 RYBP (ENSPCTG00005008989) PROK2 (ENSPCTG00005009087) GPR27 (ENSPCTG00005009164) EIF4E3 (ENSPCTG00005009184) Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 11 TDP1 (ENSBMSG00010009895) EFCAB11 (ENSBMSG00010009857) ENSBMSG00010009834 ENSBMSG00010009820 ENSBMSG00010009723 EML5 (ENSBMSG00010009571) ENSBMSG00010009471 PTPN21 (ENSBMSG00010009445) SPATA7 (ENSBMSG00010009383) ENSBMSG00010009361 GPR65 (ENSBMSG00010009349) GALC (ENSBMSG00010009191) ENSBMSG00010009149 FLRT2 (ENSBMSG00010009140) ENSBMSG00010009131 ENSBMSG00010009125 #22 ENSBMSG00010009117 ENSBMSG00010009108 SEL1L (ENSBMSG00010009096) STON2 (ENSBMSG00010009055) GTF2A1 (ENSBMSG00010009013) ENSBMSG00010009001 CEP128 (ENSBMSG00010008981) ENSBMSG00010008967 NRXN3 (ENSBMSG00010008449) ADCK1 (ENSBMSG00010008328) SNW1 (ENSBMSG00010008304) SLIRP (ENSBMSG00010008287) ALKBH1 (ENSBMSG00010008274) ENSBMSG00010008264 SPTLC2 (ENSBMSG00010008255) Blue whale MODERN SPECIES 12 ABCA6 (ENSBMSG00010016377) ABCA5 (ENSBMSG00010016529) MAP2K6 (ENSBMSG00010016562) KCNJ16 (ENSBMSG00010016635) KCNJ2 (ENSBMSG00010016652) SOX9 (ENSBMSG00010016678) #10 SLC39A11 (ENSBMSG00010016747) #11 SSTR2 (ENSBMSG00010016798) #12 COG1 (ENSBMSG00010016811) #14 FAM104A (ENSBMSG00010016856) #16 C17orf80 (ENSBMSG00010016897) #17 CPSF4L (ENSBMSG00010016926) #18 CDC42EP4 (ENSBMSG00010016959) #19 SDK2 (ENSBMSG00010016998) #21 ENSBMSG00010017159 ENSBMSG00010017182 #22 TTYH2 (ENSBMSG00010017236) #23 DNAI2 (ENSBMSG00010017288) #24 KIF19 (ENSBMSG00010017400) #25 BTBD17 (ENSBMSG00010017481) #26 GPR142 (ENSBMSG00010017499) #27 GPRC5C (ENSBMSG00010017528) #29 ENSBMSG00010017572 ENSBMSG00010017596 RAB37 (ENSBMSG00010017664) CD300LF (ENSBMSG00010017849) NHERF1 (ENSBMSG00010017895) NAT9 (ENSBMSG00010017953) TMEM104 (ENSBMSG00010018040) GRIN2C (ENSBMSG00010018086) FDXR (ENSBMSG00010018277) Pecora DUPLICATION Pecora DUPLICATION Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.sb.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.sb.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.sb.a #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000155207.a.b ENSGT00940000155686 ENSGT00940000163266 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000159548 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00530000064267 ENSGT00940000163238 ENSGT00940000160964 ENSGT00940000159847 ENSGT00560000077266.b ENSGT00390000008610.a.b.a.a.b ENSGT00950000182802.A.ab.b.a.b.b ENSGT00950000183107.a.b.a ENSGT00500000044950 ENSGT00390000003718.d.sb.a #22 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525 ENSGT01030000235108 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00390000011422 ENSGT00940000155519 ENSGT00940000160450 ENSGT00390000017582 ENSGT01030000234667.a.a.a.b ENSGT00940000160993 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000156398.d ENSGT00390000000626 ENSGT00940000159820 Bos ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155686 ENSGT00940000163266 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000159548 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00530000064267 ENSGT00940000163238 ENSGT00940000160964 ENSGT00940000159847 ENSGT00560000077266.b ENSGT00390000008610.a.b.a.a.b ENSGT00950000182802.A.ab.b.a.b.b ENSGT00950000182802.A.bb ENSGT00950000183107.a.b.a ENSGT00500000044950 ENSGT00390000003718.d.sb.a #22 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525.h ENSGT01030000235108 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00390000011422 ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000155519 ENSGT00940000160450 ENSGT00390000017582 ENSGT01030000234667.a.a.a.b ENSGT00940000160993 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000156398.d ENSGT00390000000626 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000155207.a.b ENSGT00940000155686 ENSGT00940000163266 ENSGT00950000183004.a.b.a.b ENSGT00940000159548 ENSGT00940000154678.a.a ENSGT00530000064267 ENSGT00940000163238 ENSGT00940000160964 ENSGT00940000159847 ENSGT00560000077266.b ENSGT00390000008610.a.b.a.a.b ENSGT00950000182802.A.ab.b.a.b.b ENSGT00950000183107.a.b.a ENSGT00500000044950 ENSGT00390000003718.d.sb.a #22 ENSGT00940000156421 ENSGT00390000010145.c.b ENSGT00940000160525.h ENSGT01030000235108 ENSGT00390000016224.j.a ENSGT00390000011422 ENSGT00390000011666.h.a.a.b.a.a.a.a ENSGT00940000155519 ENSGT01100000263481.n.a.b.a.b.b.a.a.a.b.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000160450 ENSGT00390000017582 ENSGT01030000234667.a.a.a.b ENSGT00940000160993 ENSGT00940000156177 ENSGT00940000156398.d Wild yak MODERN SPECIES 2272 SH3BGR (ENSBMUG00000025661) LCA5L (ENSBMUG00000025646) GET1 (ENSBMUG00000025636) ENSBMUG00000025622 BRWD1 (ENSBMUG00000025609) PSMG1 (ENSBMUG00000025581) ENSBMUG00000025574 #22 ENSBMUG00000025570 ATP2C1 (ENSBMUG00000025505) ASTE1 (ENSBMUG00000025421) ENSBMUG00000025414 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.sb.a #22 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES ENSBIXG00005003909 DSCAM (ENSBIXG00005007073) PCP4 (ENSBIXG00005003943) ENSBIXG00005005999 ENSBIXG00005023175 B3GALT5 (ENSBIXG00005023200) ENSBIXG00005023221 SH3BGR (ENSBIXG00005023251) LCA5L (ENSBIXG00005003991) GET1 (ENSBIXG00005023381) ENSBIXG00005023486 ENSBIXG00005023526 BRWD1 (ENSBIXG00005023566) PSMG1 (ENSBIXG00005004043) ENSBIXG00005023658 ENSBIXG00005023680 #22 ATP2C1 (ENSBIXG00005023827) ASTE1 (ENSBIXG00005023909) NEK11 (ENSBIXG00005024096) NUDT16 (ENSBIXG00005024166) ENSBIXG00005007236 MRPL3 (ENSBIXG00005024272) ENSBIXG00005004151 CPNE4 (ENSBIXG00005006175) ACP3 (ENSBIXG00005024909) ENSBIXG00005004251 ENSBIXG00005024930 DNAJC13 (ENSBIXG00005024967) ACKR4 (ENSBIXG00005024999) ACAD11 (ENSBIXG00005025046) UBA5 (ENSBIXG00005004275) American bison MODERN SPECIES 2975 MX2 (ENSBBBG00000013811) FAM3B (ENSBBBG00000009103) BACE2 (ENSBBBG00000013772) DSCAM (ENSBBBG00000001524) ENSBBBG00000001530 PCP4 (ENSBBBG00000001532) ENSBBBG00000013694 B3GALT5 (ENSBBBG00000013686) SH3BGR (ENSBBBG00000013682) LCA5L (ENSBBBG00000013656) GET1 (ENSBBBG00000013645) ENSBBBG00000013623 BRWD1 (ENSBBBG00000013614) ENSBBBG00000013544 PSMG1 (ENSBBBG00000013540) ENSBBBG00000013524 #22 ATP2C1 (ENSBBBG00000013474) ASTE1 (ENSBBBG00000012900) NEK11 (ENSBBBG00000012886) NUDT16 (ENSBBBG00000012784) MRPL3 (ENSBBBG00000012774) CPNE4 (ENSBBBG00000001799) ENSBBBG00000002449 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.sb.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.sb.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT01050000244961.b ENSGT00940000161219 ENSGT00950000182933.C.a ENSGT00940000161142.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000161142.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000161142.a.b.a.a.a.b.c ENSGT00940000161142.a.a.a ENSGT00940000161142.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000161142.a.b.b.a.b ENSGT00940000161142.a.b.b.a.a ENSGT00940000160873 ENSGT00940000161142.a.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161142.a.a.b ENSGT00940000161267.a.a ENSGT00940000163677.a.b.b ENSGT00390000003718.d.sb.b #22 ENSGT00940000160770.B.b.a.b ENSGT00940000160770.D ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.a.b.a.a ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.a.b.a.b.a ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.a.b.a.b.b ENSGT00940000154411.`b.i.f ENSGT00960000186612.B.a.b.a.b.a.b ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.a Caprinae ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000161142.a.b.a.b.a.a.a.e.a ENSGT00940000161142.a.b.a.b.a.a.a.f ENSGT00940000160873 ENSGT00940000161142.a.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161142.a.a.b ENSGT00940000161267.a.a ENSGT00940000153165.a.a.c.b.f.a ENSGT00390000003718.d.sb.b #22 ENSGT00940000160770.B.b.a.b ENSGT00940000160770.D ENSGT00940000165608 ENSGT00940000160770.B.b.a.a ENSGT00940000154411.`b.i.f ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.a.b.a.b.b ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.a.b.a.b.a Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 5 ENSOARG00020016626 ENSOARG00020016500 ENSOARG00020016215 ENSOARG00020016119 ENSOARG00020016039 ENSOARG00020015999 NLRP12 (ENSOARG00020015907) ENSOARG00020015707 ENSOARG00020015596 ZNF331 (ENSOARG00020015521) ENSOARG00020015465 ENSOARG00020015298 ENSOARG00020015238 ENSOARG00020014575 ENSOARG00020014511 ENSOARG00020014490 #22 ENSOARG00020014439 ENSOARG00020014417 ENSOARG00020014379 ENSOARG00020014335 ENSOARG00020014290 ENSOARG00020014271 ENSOARG00020014239 ENSOARG00020013821 ENSOARG00020013696 ENSOARG00020013650 ENSOARG00020013581 ENSOARG00020013367 ENSOARG00020013216 ENSOARG00020013175 ENSOARG00020013141 Goat MODERN SPECIES 9 ENSCHIG00000012440 ENSCHIG00000018215 ENSCHIG00000026562 ENSCHIG00000014763 ENSCHIG00000019688 ENSCHIG00000000547 NLRP12 (ENSCHIG00000016717) ENSCHIG00000015100 ENSCHIG00000021719 ENSCHIG00000009884 ZNF331 (ENSCHIG00000017816) ENSCHIG00000025458 ENSCHIG00000013160 ENSCHIG00000022343 ENSCHIG00000013541 ENSCHIG00000012246 #22 ENSCHIG00000013939 ENSCHIG00000022883 ENSCHIG00000011363 ENSCHIG00000022011 ENSCHIG00000011276 ENSCHIG00000023440 ENSCHIG00000012436 ENSCHIG00000024769 ENSCHIG00000024124 ENSCHIG00000020931 ENSCHIG00000003665 ENSCHIG00000016689 ENSCHIG00000025144 ENSCHIG00000015590 ENSCHIG00000019008 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.sb.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.sb.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000161142.a.a.a ENSGT00940000161142.a.b.a.b.a.a.b.b ENSGT00940000161142.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000161142.a.b.a.b.a.a.b.a ENSGT00940000161142.a.b.b.a.b ENSGT00940000161142.a.b.b.a.a.a ENSGT00940000161142.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000161142.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161142.a.b.a.b.a.a.a.c ENSGT00940000161142.a.b.a.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000160873 ENSGT00940000161142.a.b.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161142.a.a.b ENSGT00940000161267.a.a ENSGT00940000163677.a.b.b ENSGT00390000003718.d.sb.b #22 ENSGT00940000160770.B.b.a.b ENSGT00940000160770.D ENSGT00940000165608 ENSGT00940000160770.B.b.a.a ENSGT00940000154411.`b.i.f ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.a.b.a.b.b ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.a.b.a.b.a ENSGT01100000263534.b.k.a.b.b.a.b.a.b.a.a ENSGT00940000154712 ENSGT00390000018141.i.a.b.b.b.a.b.a.b.a.b.b.b.a.a ENSGT01100000263534.b.k.a.b.a.g.a.a.b.a.b.a.a.a ENSGT01100000263534.b.k.a.b.a.g.b.a.b ENSGT01030000234576.D.a.b.a.b.b ENSGT01030000234576.D.a.b.a.a ENSGT01100000263534.b.k.a.b.a.g.a.a.b.b Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 9 ZNF331 (ENSBIXG00005018350) ENSBIXG00005018293 ENSBIXG00005018286 ENSBIXG00005007651 ENSBIXG00005018254 ENSBIXG00005002952 ENSBIXG00005018212 ENSBIXG00005018200 ENSBIXG00005018179 ENSBIXG00005006140 ENSBIXG00005018151 ENSBIXG00005018146 ENSBIXG00005018138 ENSBIXG00005018116 ENSBIXG00005018108 ENSBIXG00005018098 #22 ENSBIXG00005018084 ENSBIXG00005018076 ENSBIXG00005018064 ENSBIXG00005018044 ENSBIXG00005018025 ENSBIXG00005005431 ENSBIXG00005018001 ENSBIXG00005017996 ENSBIXG00005017988 ENSBIXG00005007051 ENSBIXG00005017974 ENSBIXG00005017968 ENSBIXG00005017949 ENSBIXG00005017886 ENSBIXG00005017873 American bison MODERN SPECIES 2662 ENSBBBG00000017314 #22 ENSBBBG00000007572 ENSBBBG00000007797 Yarkand deer MODERN SPECIES 27 ENSCHYG00000005834 ENSCHYG00000005768 ENSCHYG00000005718 NLRP12 (ENSCHYG00000005645) ENSCHYG00000005604 ENSCHYG00000005488 ZNF331 (ENSCHYG00000005458) ENSCHYG00000005437 ENSCHYG00000005431 ENSCHYG00000005398 ENSCHYG00000005374 ENSCHYG00000005359 ENSCHYG00000005338 ENSCHYG00000005316 ENSCHYG00000005299 ENSCHYG00000002335 #22 ENSCHYG00000002319 ENSCHYG00000002307 ENSCHYG00000002300 ENSCHYG00000002283 ENSCHYG00000002272 ENSCHYG00000002215 ENSCHYG00000002202 ENSCHYG00000002183 ENSCHYG00000002174 ENSCHYG00000002152 ENSCHYG00000002135 ENSCHYG00000002122 ENSCHYG00000002107 ENSCHYG00000002096 ENSCHYG00000002077 Pecora ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.tb #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b Percora_a DUPLICATION Percora_a DUPLICATION Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.tb.a.a #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1269 PI4K2B (ENSMMSG00000013983) ENSMMSG00000013962 ANAPC4 (ENSMMSG00000013938) ENSMMSG00000013917 SLC34A2 (ENSMMSG00000013857) SEL1L3 (ENSMMSG00000013767) ENSMMSG00000013746 ENSMMSG00000013732 RBPJ (ENSMMSG00000013568) CCKAR (ENSMMSG00000013523) ENSMMSG00000013500 TBC1D19 (ENSMMSG00000013351) STIM2 (ENSMMSG00000013185) ENSMMSG00000013164 ENSMMSG00000013140 ENSMMSG00000013133 #22 PCDH7 (ENSMMSG00000013089) ENSMMSG00000013078 ENSMMSG00000013060 ENSMMSG00000013043 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.tb.a.a #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000162224 ENSGT00390000015958 ENSGT00940000157294 ENSGT00390000007332 ENSGT00390000010434.a ENSGT00390000012556 ENSGT00390000004612 ENSGT00950000183177.a.a.b ENSGT00940000159983 ENSGT00390000002398.e.b ENSGT00390000005197.a ENSGT01100000263563.c.b ENSGT00390000015965 ENSGT00390000000214.a.b ENSGT00940000165919 ENSGT00390000003718.d.tb.a.a #22 ENSGT00940000157221 ENSGT00940000154788.ob ENSGT00940000160197 ENSGT00940000153404.b ENSGT00940000153648.b ENSGT00390000013778 ENSGT00940000159709 ENSGT00940000156247 ENSGT00940000157949.c.b ENSGT00940000157949.c.a ENSGT00940000157456 ENSGT00940000163662 ENSGT00940000162201 ENSGT00390000010054.b ENSGT00390000017929 Goat MODERN SPECIES 25 CCDC149 (ENSCHIG00000015517) LGI2 (ENSCHIG00000022089) SEPSECS (ENSCHIG00000010810) PI4K2B (ENSCHIG00000022484) ZCCHC4 (ENSCHIG00000022645) ANAPC4 (ENSCHIG00000023609) SLC34A2 (ENSCHIG00000015739) SEL1L3 (ENSCHIG00000020813) ENSCHIG00000016018 ENSCHIG00000026046 RBPJ (ENSCHIG00000022041) CCKAR (ENSCHIG00000024465) TBC1D19 (ENSCHIG00000015018) STIM2 (ENSCHIG00000004257) ENSCHIG00000013741 ENSCHIG00000010665 #22 PCDH7 (ENSCHIG00000003875) ENSCHIG00000023385 ENSCHIG00000009154 ARAP2 (ENSCHIG00000014093) ENSCHIG00000022196 DTHD1 (ENSCHIG00000018566) NWD2 (ENSCHIG00000004289) C4orf19 (ENSCHIG00000015946) RELL1 (ENSCHIG00000005379) ENSCHIG00000022059 PGM2 (ENSCHIG00000015657) ENSCHIG00000008333 KLF3 (ENSCHIG00000023066) TLR10 (ENSCHIG00000010004) TLR6 (ENSCHIG00000022377) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.tb.a.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.tb.a.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.d.tb.a.b #22 Goat MODERN SPECIES 17 TMEM270 (ENSCHIG00000018876) ENSCHIG00000018073 LIMK1 (ENSCHIG00000027103) EIF4H (ENSCHIG00000020637) ENSCHIG00000020053 RFC2 (ENSCHIG00000009030) CLIP2 (ENSCHIG00000020974) GTF2IRD1 (ENSCHIG00000020027) GTF2I (ENSCHIG00000008326) NCF1 (ENSCHIG00000022178) ENSCHIG00000011875 ENSCHIG00000006082 RCC1L (ENSCHIG00000019471) ENSCHIG00000019190 ENSCHIG00000026324 ENSCHIG00000016157 #22 AUTS2 (ENSCHIG00000016565) GALNT17 (ENSCHIG00000025267) CALN1 (ENSCHIG00000013488) ENSCHIG00000019510 SBDS (ENSCHIG00000026854) TMEM248 (ENSCHIG00000022725) RABGEF1 (ENSCHIG00000018633) KCTD7 (ENSCHIG00000014029) ENSCHIG00000023715 TPST1 (ENSCHIG00000020421) CRCP (ENSCHIG00000015299) ENSCHIG00000006914 ASL (ENSCHIG00000015704) ENSCHIG00000006969 ENSCHIG00000026715 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.tb.b #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.s.a #33 ENSGT00940000159622.s.b #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b Siberian musk deer DUPLICATION Siberian musk deer MODERN SPECIES 1204 ENSMMSG00000013950 ADGRB1 (ENSMMSG00000014062) ENSMMSG00000014234 ARC (ENSMMSG00000014398) ENSMMSG00000014409 #22 JRK (ENSMMSG00000014418) THEM6 (ENSMMSG00000014433) ENSMMSG00000014446 LYPD2 (ENSMMSG00000014453) ENSMMSG00000014465 LY6D (ENSMMSG00000014481) ENSMMSG00000014490 ENSMMSG00000014506 GML (ENSMMSG00000014555) LY6E (ENSMMSG00000014580) LY6L (ENSMMSG00000014617) LY6H (ENSMMSG00000018217) ENSMMSG00000018257 GLI4 (ENSMMSG00000018300) ZNF696 (ENSMMSG00000018336) Siberian musk deer MODERN SPECIES 88 IFRD1 (ENSMMSG00000006786) LSMEM1 (ENSMMSG00000006885) TMEM168 (ENSMMSG00000006914) BMT2 (ENSMMSG00000006965) GPR85 (ENSMMSG00000006987) ENSMMSG00000007005 ENSMMSG00000007022 PPP1R3A (ENSMMSG00000007054) FOXP2 (ENSMMSG00000007195) MDFIC (ENSMMSG00000009816) TFEC (ENSMMSG00000009921) TES (ENSMMSG00000010139) CAV2 (ENSMMSG00000010190) CAV1 (ENSMMSG00000010219) MET (ENSMMSG00000010268) ENSMMSG00000010444 #22 CAPZA2 (ENSMMSG00000010466) ST7 (ENSMMSG00000010605) WNT2 (ENSMMSG00000010995) ASZ1 (ENSMMSG00000011026) CFTR (ENSMMSG00000011163) CTTNBP2 (ENSMMSG00000012357) ENSMMSG00000012423 ENSMMSG00000012448 ENSMMSG00000012465 STARD3NL (ENSMMSG00000012493) EPDR1 (ENSMMSG00000012520) SFRP4 (ENSMMSG00000012546) NME8 (ENSMMSG00000012576) ENSMMSG00000012672 ENSMMSG00000012688 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1210 ENSMMSG00000023972 ABCA6 (ENSMMSG00000016969) ABCA10 (ENSMMSG00000015959) ABCA5 (ENSMMSG00000015703) MAP2K6 (ENSMMSG00000015667) KCNJ16 (ENSMMSG00000015647) KCNJ2 (ENSMMSG00000015635) SOX9 (ENSMMSG00000015625) #10 SLC39A11 (ENSMMSG00000015610) #11 SSTR2 (ENSMMSG00000015600) #12 COG1 (ENSMMSG00000015572) #14 ENSMMSG00000015555 ENSMMSG00000015538 #17 CDC42EP4 (ENSMMSG00000015423) #19 SDK2 (ENSMMSG00000015371) #21 RPL38 (ENSMMSG00000015306) #22 TTYH2 (ENSMMSG00000015285) #23 ENSMMSG00000015015 ENSMMSG00000014975 #25 BTBD17 (ENSMMSG00000014956) #26 GPR142 (ENSMMSG00000014946) #27 GPRC5C (ENSMMSG00000014857) #29 ENSMMSG00000014843 #33 ENSMMSG00000014808 CD300LB (ENSMMSG00000014791) #32 ENSMMSG00000014777 #33 ENSMMSG00000014764 #33 CD300H (ENSMMSG00000014749) #34 ENSMMSG00000014712 ENSMMSG00000014692 ENSMMSG00000014658 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.tb.b #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.s.a #33 ENSGT00940000159622.s.b #33 ENSGT00940000159622.t #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.tb.b #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.s.a.b #33 ENSGT00940000159622.s.b #33 ENSGT00940000159622.s.a.a.a #33 ENSGT00940000159622.t #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.ab Bos ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.tb.b #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.s.a.a.a #33 ENSGT00940000163981.e.b ENSGT00940000159622.s.a.b #33 ENSGT00940000159622.s.b #33 ENSGT00940000159622.t #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.bb Bos_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.tb.b #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.s.a.a.a #33 ENSGT00940000163981.e.b.c ENSGT00940000159622.s.a.a.b #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.bb ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b Wild yak DUPLICATION Wild yak MODERN SPECIES 261 RPL38 (ENSBMUG00000025717) #22 TTYH2 (ENSBMUG00000025747) #23 DNAI2 (ENSBMUG00000025761) #24 ENSBMUG00000025767 #25 Wild yak MODERN SPECIES 2254 ENSBMUG00000018857 #22 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 10 ABCA6 (ENSBGRG00000021612) ABCA10 (ENSBGRG00000024796) ABCA5 (ENSBGRG00000026451) MAP2K6 (ENSBGRG00000026459) ENSBGRG00000026465 ENSBGRG00000026466 KCNJ2 (ENSBGRG00000026471) SOX9 (ENSBGRG00000026479) #10 SLC39A11 (ENSBGRG00000026485) #11 SSTR2 (ENSBGRG00000026504) #12 COG1 (ENSBGRG00000026513) #14 ENSBGRG00000010799 ENSBGRG00000010887 #17 CDC42EP4 (ENSBGRG00000011323) #19 SDK2 (ENSBGRG00000011391) #21 ENSBGRG00000011604 #22 TTYH2 (ENSBGRG00000011751) #23 DNAI2 (ENSBGRG00000012006) #24 KIF19 (ENSBGRG00000012086) #25 BTBD17 (ENSBGRG00000012366) #26 GPR142 (ENSBGRG00000012476) #27 GPRC5C (ENSBGRG00000012539) #29 ENSBGRG00000012732 ENSBGRG00000013019 #32 CD300C (ENSBGRG00000013083) #33 ENSBGRG00000013213 CD300H (ENSBGRG00000013268) #34 ENSBGRG00000013426 CD300E (ENSBGRG00000013652) RAB37 (ENSBGRG00000013710) NHERF1 (ENSBGRG00000014075) Domestic yak MODERN SPECIES 24 MAPK12 (ENSBGRG00000003265) HDAC10 (ENSBGRG00000002796) SELENOO (ENSBGRG00000002527) TRABD (ENSBGRG00000002502) PANX2 (ENSBGRG00000002485) ENSBGRG00000002477 ENSBGRG00000002468 MLC1 (ENSBGRG00000002422) TTLL8 (ENSBGRG00000002326) ENSBGRG00000002290 PIM3 (ENSBGRG00000002237) CRELD2 (ENSBGRG00000002179) ALG12 (ENSBGRG00000002140) BRD1 (ENSBGRG00000001973) ENSBGRG00000001951 ENSBGRG00000001919 #22 ENSBGRG00000001883 TBC1D22A (ENSBGRG00000001779) CERK (ENSBGRG00000001730) GRAMD4 (ENSBGRG00000001647) CELSR1 (ENSBGRG00000001407) TRMU (ENSBGRG00000001351) GTSE1 (ENSBGRG00000001310) TTC38 (ENSBGRG00000001268) PKDREJ (ENSBGRG00000001224) CDPF1 (ENSBGRG00000001207) PPARA (ENSBGRG00000001198) WNT7B (ENSBGRG00000001139) ATXN10 (ENSBGRG00000001070) FBLN1 (ENSBGRG00000000902) RIBC2 (ENSBGRG00000000827) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.tb.b #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a.c.a #26 ENSGT00950000182983.A.a.a.d #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.s.a.a.a #33 ENSGT00940000159622.t #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.bb ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.ab Cow DUPLICATION Cow MODERN SPECIES 10 ABCA6 (ENSBTAG00000006921) ABCA10 (ENSBTAG00000006937) ENSBTAG00000049286 ABCA5 (ENSBTAG00000002747) MAP2K6 (ENSBTAG00000001609) KCNJ16 (ENSBTAG00000024903) KCNJ2 (ENSBTAG00000008294) SOX9 (ENSBTAG00000045824) #10 SLC39A11 (ENSBTAG00000018837) #11 SSTR2 (ENSBTAG00000017136) #12 COG1 (ENSBTAG00000006087) #14 FAM104A (ENSBTAG00000006088) C19H17orf80 (ENSBTAG00000006089) #17 CDC42EP4 (ENSBTAG00000053044) #19 SDK2 (ENSBTAG00000044195) #21 RPL38 (ENSBTAG00000030164) #22 TTYH2 (ENSBTAG00000011007) #23 DNAI2 (ENSBTAG00000016732) #24 ENSBTAG00000049295 #26 ENSBTAG00000050583 #26 ENSBTAG00000053274 #26 KIF19 (ENSBTAG00000004617) #25 BTBD17 (ENSBTAG00000030166) #26 GPR142 (ENSBTAG00000048415) #27 GPRC5C (ENSBTAG00000018663) #29 CD300A (ENSBTAG00000000812) CD300LB (ENSBTAG00000052102) #32 ENSBTAG00000008328 #33 CD300H (ENSBTAG00000050726) #34 ENSBTAG00000024901 CD300E (ENSBTAG00000053365) Cow MODERN SPECIES 24 TUBGCP6 (ENSBTAG00000000650) SELENOO (ENSBTAG00000000647) TRABD (ENSBTAG00000001931) PANX2 (ENSBTAG00000009297) ENSBTAG00000047080 MOV10L1 (ENSBTAG00000020341) MLC1 (ENSBTAG00000021626) TTLL8 (ENSBTAG00000011098) IL17REL (ENSBTAG00000045808) PIM3 (ENSBTAG00000045904) CRELD2 (ENSBTAG00000047801) ALG12 (ENSBTAG00000046173) ZBED4 (ENSBTAG00000049889) BRD1 (ENSBTAG00000046760) ENSBTAG00000014987 ENSBTAG00000030185 #22 TAFA5 (ENSBTAG00000022986) ENSBTAG00000051431 TBC1D22A (ENSBTAG00000012291) CERK (ENSBTAG00000046654) GRAMD4 (ENSBTAG00000021803) CELSR1 (ENSBTAG00000008036) TRMU (ENSBTAG00000005595) GTSE1 (ENSBTAG00000007102) TTC38 (ENSBTAG00000003017) ENSBTAG00000008066 ENSBTAG00000054859 ENSBTAG00000050005 CDPF1 (ENSBTAG00000008065) PPARA (ENSBTAG00000008063) WNT7B (ENSBTAG00000048365) Hybrid Bos Indicus DUPLICATION Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 10 KCNJ16 (ENSBIXG00005031094) KCNJ2 (ENSBIXG00005031092) ENSBIXG00005031084 SOX9 (ENSBIXG00005031066) #10 ENSBIXG00005031064 ENSBIXG00005031055 SLC39A11 (ENSBIXG00005031049) #11 SSTR2 (ENSBIXG00005031041) #12 ENSBIXG00005031039 ENSBIXG00005031038 COG1 (ENSBIXG00005031034) #14 FAM104A (ENSBIXG00005031028) #16 ENSBIXG00005031026 #17 CDC42EP4 (ENSBIXG00005031018) #19 SDK2 (ENSBIXG00005030990) #21 RPL38 (ENSBIXG00005030956) #22 TTYH2 (ENSBIXG00005030950) #23 DNAI2 (ENSBIXG00005030941) #24 KIF19 (ENSBIXG00005030921) #25 ENSBIXG00005030913 #26 BTBD17 (ENSBIXG00005030910) #26 GPR142 (ENSBIXG00005030905) #27 ENSBIXG00005030903 GPRC5C (ENSBIXG00005030892) #29 ENSBIXG00005030883 CD300LB (ENSBIXG00005030876) #32 ENSBIXG00005030873 #33 ENSBIXG00005030871 #33 ENSBIXG00005030868 #33 CD300H (ENSBIXG00005030865) #34 ENSBIXG00005030861 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 24 TRABD (ENSBIXG00005009416) PANX2 (ENSBIXG00005009391) MOV10L1 (ENSBIXG00005009370) ENSBIXG00005000483 ENSBIXG00005009321 MLC1 (ENSBIXG00005006195) ENSBIXG00005009302 TTLL8 (ENSBIXG00005009296) IL17REL (ENSBIXG00005000454) PIM3 (ENSBIXG00005009276) CRELD2 (ENSBIXG00005009248) ALG12 (ENSBIXG00005000424) ZBED4 (ENSBIXG00005000409) BRD1 (ENSBIXG00005009168) ENSBIXG00005009096 ENSBIXG00005009064 #22 ENSBIXG00005009030 TBC1D22A (ENSBIXG00005008971) CERK (ENSBIXG00005008917) GRAMD4 (ENSBIXG00005008897) CELSR1 (ENSBIXG00005008833) TRMU (ENSBIXG00005006403) ENSBIXG00005008760 ENSBIXG00005000254 ENSBIXG00005008698 ENSBIXG00005008693 CDPF1 (ENSBIXG00005008687) PPARA (ENSBIXG00005000246) WNT7B (ENSBIXG00005008635) ATXN10 (ENSBIXG00005008602) FBLN1 (ENSBIXG00005008557) American bison DUPLICATION American bison MODERN SPECIES 3285 ABCA6 (ENSBBBG00000023805) ABCA10 (ENSBBBG00000006125) ABCA5 (ENSBBBG00000006116) MAP2K6 (ENSBBBG00000023324) KCNJ16 (ENSBBBG00000006093) KCNJ2 (ENSBBBG00000006091) ENSBBBG00000023269 ENSBBBG00000006084 #10 SLC39A11 (ENSBBBG00000023247) #11 SSTR2 (ENSBBBG00000023240) #12 COG1 (ENSBBBG00000023237) #14 FAM104B (ENSBBBG00000023223) ENSBBBG00000023213 #17 CDC42EP4 (ENSBBBG00000000325) #19 SDK2 (ENSBBBG00000000365) #21 RPL38 (ENSBBBG00000023033) #22 TTYH2 (ENSBBBG00000023013) #23 DNAI2 (ENSBBBG00000022997) #24 KIF19 (ENSBBBG00000008480) #25 BTBD17 (ENSBBBG00000022903) #26 GPR142 (ENSBBBG00000022899) #27 GPRC5C (ENSBBBG00000022891) #29 ENSBBBG00000022844 ENSBBBG00000022838 CD300LB (ENSBBBG00000022820) #32 ENSBBBG00000006011 #33 ENSBBBG00000008622 #33 ENSBBBG00000005999 #33 ENSBBBG00000022787 ENSBBBG00000022750 CD300E (ENSBBBG00000022720) American bison MODERN SPECIES 3091 ENSBBBG00000006911 #22 ENSBBBG00000020452 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d.tb.b #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.e.a ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622.s.a #33 ENSGT00940000159622.s.b #33 ENSGT00940000163948 #34 ENSGT00940000154332.db ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332.cb ENSGT00940000158883.b Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 11 MDH1B (ENSOARG00020015160) DYTN (ENSOARG00020015031) FAM237A (ENSOARG00020014982) ADAM23 (ENSOARG00020014405) ZDBF2 (ENSOARG00020014286) GPR1 (ENSOARG00020014248) ENSOARG00020014163 NDUFS1 (ENSOARG00020013502) INO80D (ENSOARG00020013391) ENSOARG00020013371 NRP2 (ENSOARG00020013172) PARD3B (ENSOARG00020008587) ICOS (ENSOARG00020008420) CTLA4 (ENSOARG00020008302) CD28 (ENSOARG00020008197) ENSOARG00020008167 #22 RAPH1 (ENSOARG00020007863) ABI2 (ENSOARG00020007596) CYP20A1 (ENSOARG00020007538) NBEAL1 (ENSOARG00020007440) CARF (ENSOARG00020006968) WDR12 (ENSOARG00020006896) ICA1L (ENSOARG00020006778) FAM117B (ENSOARG00020006688) BMPR2 (ENSOARG00020006563) NOP58 (ENSOARG00020023408) SUMO1 (ENSOARG00020023283) KIAA2012 (ENSOARG00020023194) FZD7 (ENSOARG00020023182) CDK15 (ENSOARG00020022852) ALS2 (ENSOARG00020022676) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 2 ENSOARG00020011631 ABCA9 (ENSOARG00020011714) ABCA6 (ENSOARG00020012508) ABCA5 (ENSOARG00020025888) MAP2K6 (ENSOARG00020025921) ENSOARG00020025925 KCNJ16 (ENSOARG00020025931) KCNJ2 (ENSOARG00020025937) SOX9 (ENSOARG00020025942) #10 SLC39A11 (ENSOARG00020025945) #11 FAM104A (ENSOARG00020025961) #16 C17orf80 (ENSOARG00020025968) #17 ENSOARG00020025975 #18 ENSOARG00020025979 #19 SDK2 (ENSOARG00020025986) #21 ENSOARG00020026005 #22 TTYH2 (ENSOARG00020026011) #23 DNAI2 (ENSOARG00020026017) #24 KIF19 (ENSOARG00020026024) #25 BTBD17 (ENSOARG00020026032) #26 GPR142 (ENSOARG00020026034) #27 GPRC5C (ENSOARG00020026038) #29 ENSOARG00020026041 CD300LB (ENSOARG00020026045) #32 ENSOARG00020026048 #33 ENSOARG00020026055 #33 CD300H (ENSOARG00020003062) #34 ENSOARG00020003081 ENSOARG00020003106 RAB37 (ENSOARG00020003199) ENSOARG00020003502 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 4 ENSOARG00020007584 ENSOARG00020007621 ENSOARG00020007712 ENSOARG00020008696 YME1L1 (ENSOARG00020008735) MASTL (ENSOARG00020008948) ENSOARG00020009111 ABI1 (ENSOARG00020009594) PDSS1 (ENSOARG00020010480) ENSOARG00020010596 APBB1IP (ENSOARG00020010637) CCNY (ENSOARG00020010831) ENSOARG00020011089 CREM (ENSOARG00020011207) CUL2 (ENSOARG00020014397) ENSOARG00020014597 #22 PARD3 (ENSOARG00020014835) NRP1 (ENSOARG00020022479) ITGB1 (ENSOARG00020022585) ARL5B (ENSOARG00020022913) ENSOARG00020022950 PLXDC2 (ENSOARG00020023004) ENSOARG00020023295 NEBL (ENSOARG00020023328) ENSOARG00020023735 ENSOARG00020023745 SKIDA1 (ENSOARG00020023795) MLLT10 (ENSOARG00020023844) DNAJC1 (ENSOARG00020024307) ENSOARG00020024323 COMMD3 (ENSOARG00020024334) Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 10 ABCA6 (ENSCHIG00000012837) ABCA10 (ENSCHIG00000026664) ABCA5 (ENSCHIG00000020280) MAP2K6 (ENSCHIG00000024404) KCNJ16 (ENSCHIG00000008306) KCNJ2 (ENSCHIG00000002047) SOX9 (ENSCHIG00000021670) #10 SLC39A11 (ENSCHIG00000023051) #11 SSTR2 (ENSCHIG00000008409) #12 COG1 (ENSCHIG00000014490) #14 ENSCHIG00000026505 ENSCHIG00000015125 #17 CPSF4L (ENSCHIG00000021990) #18 CDC42EP4 (ENSCHIG00000010755) #19 SDK2 (ENSCHIG00000017613) #21 ENSCHIG00000026897 #22 TTYH2 (ENSCHIG00000014293) #23 RGS9 (ENSCHIG00000026807) DNAI2 (ENSCHIG00000024904) #24 KIF19 (ENSCHIG00000022827) #25 BTBD17 (ENSCHIG00000019492) #26 GPR142 (ENSCHIG00000025726) #27 GPRC5C (ENSCHIG00000019962) #29 ENSCHIG00000015790 CD300LB (ENSCHIG00000022091) #32 ENSCHIG00000003197 #33 CD300H (ENSCHIG00000018078) #34 ENSCHIG00000024899 ENSCHIG00000013863 ENSCHIG00000023164 ENSCHIG00000010800 Goat MODERN SPECIES 276 ENSCHIG00000012360 #22 JRK (ENSCHIG00000023921) Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 28 ABCA5 (ENSCHYG00000004346) MAP2K6 (ENSCHYG00000004301) KCNJ16 (ENSCHYG00000004281) KCNJ2 (ENSCHYG00000004266) SOX9 (ENSCHYG00000004243) #10 SSTR2 (ENSCHYG00000004231) #12 SLC39A11 (ENSCHYG00000004170) #11 COG1 (ENSCHYG00000004119) #14 FAM104A (ENSCHYG00000004095) #16 C17orf80 (ENSCHYG00000004074) #17 ENSCHYG00000004052 ENSCHYG00000004048 ENSCHYG00000004038 #19 SDK2 (ENSCHYG00000003979) #21 ENSCHYG00000003954 ENSCHYG00000003937 #22 TTYH2 (ENSCHYG00000003903) #23 DNAI2 (ENSCHYG00000003874) #24 KIF19 (ENSCHYG00000003830) #25 BTBD17 (ENSCHYG00000003812) #26 GPR142 (ENSCHYG00000003802) #27 GPRC5C (ENSCHYG00000003760) #29 ENSCHYG00000003713 CD300LB (ENSCHYG00000003694) #32 ENSCHYG00000003668 CD300H (ENSCHYG00000003629) #34 ENSCHYG00000003597 ENSCHYG00000003568 RAB37 (ENSCHYG00000003432) NHERF1 (ENSCHYG00000003364) NAT9 (ENSCHYG00000003325) Yarkand deer MODERN SPECIES 15 ENSCHYG00000024381 DUSP15 (ENSCHYG00000024424) ENSCHYG00000013727 TTLL9 (ENSCHYG00000013775) PDRG1 (ENSCHYG00000014206) XKR7 (ENSCHYG00000014332) CCM2L (ENSCHYG00000014395) HCK (ENSCHYG00000014533) TM9SF4 (ENSCHYG00000014694) PLAGL2 (ENSCHYG00000014956) POFUT1 (ENSCHYG00000015025) KIF3B (ENSCHYG00000015252) ASXL1 (ENSCHYG00000015391) ENSCHYG00000015855 NOL4L (ENSCHYG00000015953) ENSCHYG00000016198 #22 COMMD7 (ENSCHYG00000016228) DNMT3B (ENSCHYG00000016553) ENSCHYG00000017858 SUN5 (ENSCHYG00000017917) BPIFB2 (ENSCHYG00000018354) BPIFB6 (ENSCHYG00000018569) BPIFB3 (ENSCHYG00000018802) BPIFB4 (ENSCHYG00000018989) ENSCHYG00000019160 ENSCHYG00000019207 ENSCHYG00000019281 ENSCHYG00000019367 BPIFA3 (ENSCHYG00000019399) BPIFA1 (ENSCHYG00000019488) BPIFB1 (ENSCHYG00000019627) Camelidae ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000162673 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718.d #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981.f ENSGT00940000162729 #32 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 Alpaca MODERN SPECIES 2031 RPL38 (ENSVPAG00000001958) #22 Arabian camel MODERN SPECIES 7 ABCA10 (ENSCDRG00005004627) ABCA5 (ENSCDRG00005003730) MAP2K6 (ENSCDRG00005003593) KCNJ16 (ENSCDRG00005003498) KCNJ2 (ENSCDRG00005003485) SSTR2 (ENSCDRG00005003404) #12 SLC39A11 (ENSCDRG00005014349) #11 COG1 (ENSCDRG00005014194) #14 FAM104A (ENSCDRG00005014117) #16 C17orf80 (ENSCDRG00005014013) #17 CPSF4L (ENSCDRG00005013981) #18 CDC42EP4 (ENSCDRG00005013963) #19 ENSCDRG00005013899 #21 ENSCDRG00005013875 SDK2 (ENSCDRG00005013722) #21 RPL38 (ENSCDRG00005013632) #22 ENSCDRG00005013559 #23 ENSCDRG00005013468 #23 DNAI2 (ENSCDRG00005013392) #24 KIF19 (ENSCDRG00005013340) #25 BTBD17 (ENSCDRG00005013309) #26 GPR142 (ENSCDRG00005013257) #27 GPRC5C (ENSCDRG00005013143) #29 ENSCDRG00005013074 #33 ENSCDRG00005012916 CD300LB (ENSCDRG00005012864) #32 ENSCDRG00005012809 #33 ENSCDRG00005012716 CD300E (ENSCDRG00005012689) ENSCDRG00005012640 ENSCDRG00005012595 Boreoeutheria DUPLICATION Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Tarsier MODERN SPECIES 4423 ENSTSYG00000034714 ##22 CPE (ENSTSYG00000009705) MSMO1 (ENSTSYG00000035751) KLHL2 (ENSTSYG00000009268) TMEM192 (ENSTSYG00000025666) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Degu MODERN SPECIES 150 ENSODEG00000003582 BCL10 (ENSODEG00000003555) DDAH1 (ENSODEG00000003545) ENSODEG00000018975 CCN1 (ENSODEG00000003521) ZNHIT6 (ENSODEG00000003486) COL24A1 (ENSODEG00000003113) ENSODEG00000003023 ODF2L (ENSODEG00000002955) CLCA2 (ENSODEG00000002864) ENSODEG00000002790 ENSODEG00000002712 ENSODEG00000002677 ENSODEG00000002661 SH3GLB1 (ENSODEG00000003003) ENSODEG00000002911 ##22 ENSODEG00000002901 HS2ST1 (ENSODEG00000002834) ENSODEG00000018964 LMO4 (ENSODEG00000002768) ENSODEG00000002725 ENSODEG00000002715 PKN2 (ENSODEG00000006053) ENSODEG00000005921 ENSODEG00000005859 ENSODEG00000005800 ENSODEG00000019217 ENSODEG00000005607 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.a ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1277 C15orf40 (ENSMMSG00000022590) ENSMMSG00000022577 ENSMMSG00000022569 MEX3B (ENSMMSG00000022560) ENSMMSG00000022552 EFL1 (ENSMMSG00000022505) ENSMMSG00000022493 SAXO2 (ENSMMSG00000022484) ADAMTSL3 (ENSMMSG00000022467) SH3GL3 (ENSMMSG00000022448) ENSMMSG00000022431 HDGFL3 (ENSMMSG00000022420) TM6SF1 (ENSMMSG00000022373) ENSMMSG00000022350 BTBD1 (ENSMMSG00000022328) ENSMMSG00000022320 ##22 ENSMMSG00000022142 CTSH (ENSMMSG00000022021) RASGRF1 (ENSMMSG00000021865) ANKRD34C (ENSMMSG00000021838) TMED3 (ENSMMSG00000021823) MINAR1 (ENSMMSG00000021803) MTHFS (ENSMMSG00000021794) BCL2A1 (ENSMMSG00000021784) ZFAND6 (ENSMMSG00000021763) FAH (ENSMMSG00000021738) CTXND1 (ENSMMSG00000021726) ARNT2 (ENSMMSG00000021645) ABHD17C (ENSMMSG00000021617) CEMIP (ENSMMSG00000021478) ENSMMSG00000021452 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718.c.b ##22 Degu MODERN SPECIES 348 ENSODEG00000002764 ENSODEG00000002746 ENSODEG00000002729 ENSODEG00000002711 TM9SF1 (ENSODEG00000002690) IPO4 (ENSODEG00000002609) REC8 (ENSODEG00000002543) IRF9 (ENSODEG00000003004) RNF31 (ENSODEG00000002958) ENSODEG00000002926 EMC9 (ENSODEG00000002916) ENSODEG00000002910 FITM1 (ENSODEG00000002894) DCAF11 (ENSODEG00000002873) PCK2 (ENSODEG00000002837) ENSODEG00000018848 ##22 NRL (ENSODEG00000002799) CPNE6 (ENSODEG00000002787) CARMIL3 (ENSODEG00000002479) ENSODEG00000004848 ENSODEG00000019130 ENSODEG00000004815 ENSODEG00000004777 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 582 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00390000017585 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2162 PABPC4L (ENSDNOG00000031077) ENSDNOG00000045427 PCDH10 (ENSDNOG00000007670) ENSDNOG00000044169 ENSDNOG00000040801 #22 Armadillo MODERN SPECIES 307 FSHB (ENSDNOG00000014139) ARL14EP (ENSDNOG00000048452) ENSDNOG00000043073 MPPED2 (ENSDNOG00000047492) ENSDNOG00000041374 ENSDNOG00000034870 #22 ENSDNOG00000018185 DNAJC24 (ENSDNOG00000013512) ENSDNOG00000035466 ELP4 (ENSDNOG00000000757) PAX6 (ENSDNOG00000000761) ENSDNOG00000044782 ENSDNOG00000045369 WT1 (ENSDNOG00000003652) ENSDNOG00000048344 EIF3M (ENSDNOG00000012904) CCDC73 (ENSDNOG00000012922) PRRG4 (ENSDNOG00000025156) QSER1 (ENSDNOG00000046771) TCP11L1 (ENSDNOG00000012436) CSTF3 (ENSDNOG00000007366) Armadillo MODERN SPECIES 3355 ENSDNOG00000035446 ENSDNOG00000006404 RBBP7 (ENSDNOG00000010750) TXLNG (ENSDNOG00000010729) SYAP1 (ENSDNOG00000031545) CTPS2 (ENSDNOG00000044071) S100G (ENSDNOG00000009022) ENSDNOG00000004821 #22 ENSDNOG00000025767 ENSDNOG00000010096 Armadillo MODERN SPECIES 2619 RPL38 (ENSDNOG00000047328) #22 TTYH2 (ENSDNOG00000045346) #23 DNAI2 (ENSDNOG00000007046) #24 KIF19 (ENSDNOG00000007086) #25 ENSDNOG00000047230 BTBD17 (ENSDNOG00000007091) #26 GPR142 (ENSDNOG00000045254) #27 GPRC5C (ENSDNOG00000009824) #29 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C Tenrec MODERN SPECIES 6495 ENSETEG00000001873 #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000162444 ENSGT00940000162244 ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00940000163640 #16 ENSGT00510000049019 #17 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00940000160948 #27 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000163981 ENSGT00940000159622 #33 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000162923 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C Elephant MODERN SPECIES 424 ABCA9 (ENSLAFG00000000073) ABCA6 (ENSLAFG00000000080) ABCA5 (ENSLAFG00000011660) MAP2K6 (ENSLAFG00000004710) KCNJ16 (ENSLAFG00000026754) KCNJ2 (ENSLAFG00000007206) SOX9 (ENSLAFG00000001445) #10 ENSLAFG00000010007 #11 SSTR2 (ENSLAFG00000021371) #12 COG1 (ENSLAFG00000028753) #14 FAM104A (ENSLAFG00000010704) #16 C17orf80 (ENSLAFG00000010699) #17 CPSF4L (ENSLAFG00000010697) #18 CDC42EP4 (ENSLAFG00000025999) #19 SDK2 (ENSLAFG00000009465) #21 RPL38 (ENSLAFG00000000355) #22 TTYH2 (ENSLAFG00000000356) #23 DNAI2 (ENSLAFG00000000357) #24 KIF19 (ENSLAFG00000022583) #25 BTBD17 (ENSLAFG00000000364) #26 GPR142 (ENSLAFG00000000359) #27 GPRC5C (ENSLAFG00000010725) #29 ENSLAFG00000003208 ENSLAFG00000031744 #33 ENSLAFG00000026929 #33 ENSLAFG00000028781 ENSLAFG00000025749 ENSLAFG00000025914 ENSLAFG00000012026 RAB37 (ENSLAFG00000013798) NHERF1 (ENSLAFG00000007518) Hyrax MODERN SPECIES 7936 RPL38 (ENSPCAG00000009779) #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000162673.k.a ENSGT00940000162673.l ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000167290 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 ENSGT00950000182990.b ENSGT00390000017548.b ENSGT00940000156691 Opossum DUPLICATION Opossum MODERN SPECIES 2 TMEM170B (ENSMODG00000024618) ENSMODG00000010539 HIVEP1 (ENSMODG00000010547) EDN1 (ENSMODG00000010567) ENSMODG00000043769 PHACTR1 (ENSMODG00000010580) TBC1D7 (ENSMODG00000010617) GFOD1 (ENSMODG00000010625) SIRT5 (ENSMODG00000010636) NOL7 (ENSMODG00000010641) RANBP9 (ENSMODG00000010656) MCUR1 (ENSMODG00000050404) ENSMODG00000050817 RNF182 (ENSMODG00000024624) ENSMODG00000010683 ENSMODG00000024626 #22 JARID2 (ENSMODG00000010746) DTNBP1 (ENSMODG00000010762) MYLIP (ENSMODG00000010806) GMPR (ENSMODG00000044598) ATXN1 (ENSMODG00000010827) STMND1 (ENSMODG00000010886) RBM24 (ENSMODG00000037925) CAP2 (ENSMODG00000010920) FAM8A1 (ENSMODG00000024641) NUP153 (ENSMODG00000010951) KIF13A (ENSMODG00000011220) NHLRC1 (ENSMODG00000011227) TPMT (ENSMODG00000024655) KDM1B (ENSMODG00000011270) ENSMODG00000011291 Opossum MODERN SPECIES 1 ENSMODG00000040506 ABCA5 (ENSMODG00000006297) MAP2K6 (ENSMODG00000006330) KCNJ16 (ENSMODG00000023937) KCNJ2 (ENSMODG00000023938) SOX9 (ENSMODG00000006526) #10 ENSMODG00000041702 SLC39A11 (ENSMODG00000027766) #11 SSTR2 (ENSMODG00000023942) #12 COG1 (ENSMODG00000006576) #14 ENSMODG00000038809 ENSMODG00000025672 #18 ENSMODG00000006589 CDC42EP4 (ENSMODG00000023943) #19 SDK2 (ENSMODG00000006665) #21 RPL38 (ENSMODG00000006682) #22 TTYH2 (ENSMODG00000006708) #23 DNAI2 (ENSMODG00000006723) #24 KIF19 (ENSMODG00000006735) #25 BTBD17 (ENSMODG00000045357) #26 ENSMODG00000038625 GPRC5C (ENSMODG00000006818) #29 ENSMODG00000006834 RAB37 (ENSMODG00000006846) NHERF1 (ENSMODG00000006858) NAT9 (ENSMODG00000006867) TMEM104 (ENSMODG00000042603) GRIN2C (ENSMODG00000006915) FDXR (ENSMODG00000006942) FADS6 (ENSMODG00000049018) USH1G (ENSMODG00000007035) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000162673.k.a ENSGT00940000162673.l ENSGT00940000158172 ENSGT00940000157836 ENSGT01080000257365.a ENSGT01030000234586.B.a.a ENSGT00940000158269 #10 ENSGT00390000006167 #11 ENSGT00940000156544.a #12 ENSGT00390000017136 #14 ENSGT00390000001055 ENSGT00940000167290 ENSGT00940000162882 #18 ENSGT00940000161435.b #19 ENSGT00940000155761 #21 ENSGT00390000003718 #22 ENSGT00950000183060.a.b.a #23 ENSGT00940000161939 #24 ENSGT00940000160989 #25 ENSGT00950000182983.A.a.a #26 ENSGT00950000182961.a.a.a #29 ENSGT00940000154332 ENSGT00940000158883.b ENSGT00950000182849.B.c.b ENSGT00390000012745 ENSGT00390000001244 ENSGT00940000156964.C ENSGT00390000013574 ENSGT00950000182990.b ENSGT00390000017548.b ENSGT00940000156691 Tasmanian devil MODERN SPECIES 3 ENSSHAG00000001913 ENSSHAG00000010515 ABCA5 (ENSSHAG00000009567) ENSSHAG00000020945 KCNJ16 (ENSSHAG00000031466) KCNJ2 (ENSSHAG00000029622) ENSSHAG00000023810 SOX9 (ENSSHAG00000024026) #10 SLC39A11 (ENSSHAG00000016788) #11 SSTR2 (ENSSHAG00000029694) #12 COG1 (ENSSHAG00000015846) #14 ENSSHAG00000015769 ENSSHAG00000015735 CPSF4L (ENSSHAG00000023793) #18 CDC42EP4 (ENSSHAG00000026005) #19 RPL38 (ENSSHAG00000030107) #22 TTYH2 (ENSSHAG00000007722) #23 DNAI2 (ENSSHAG00000007002) #24 KIF19 (ENSSHAG00000005838) #25 BTBD17 (ENSSHAG00000005655) #26 ENSSHAG00000002908 #29 ENSSHAG00000026877 ENSSHAG00000028659 ENSSHAG00000028929 ENSSHAG00000024789 ENSSHAG00000024733 GRIN2C (ENSSHAG00000018815) FDXR (ENSSHAG00000018811) FADS6 (ENSSHAG00000018799) USH1G (ENSSHAG00000025760) OTOP2 (ENSSHAG00000018773) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718 #22 Wallaby MODERN SPECIES 12129 RPL38 (ENSMEUG00000015915) #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003718 #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1023 TLDC2 (ENSVURG00010018672) SAMHD1 (ENSVURG00010018664) ENSVURG00010018647 IFT52 (ENSVURG00010018633) MYBL2 (ENSVURG00010018620) ENSVURG00010018616 ENSVURG00010018613 ENSVURG00010014310 CHD6 (ENSVURG00010014105) EMILIN3 (ENSVURG00010014092) LPIN3 (ENSVURG00010014080) ZHX3 (ENSVURG00010014070) PLCG1 (ENSVURG00010014060) ENSVURG00010013722 MAFB (ENSVURG00010013689) ENSVURG00010013680 #22 DHX35 (ENSVURG00010013650) FAM83D (ENSVURG00010013639) PPP1R16B (ENSVURG00010013634) ACTR5 (ENSVURG00010013603) SLC32A1 (ENSVURG00010013591) ARHGAP40 (ENSVURG00010013577) RALGAPB (ENSVURG00010013555) RBL1 (ENSVURG00010013537) MROH8 (ENSVURG00010013467) RPN2 (ENSVURG00010013432) MANBAL (ENSVURG00010013423) SRC (ENSVURG00010013408) BLCAP (ENSVURG00010013396) CTNNBL1 (ENSVURG00010013367) VSTM2L (ENSVURG00010013359) Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1024 ENSVURG00010014713 ENSVURG00010014722 ENSVURG00010014733 ENSVURG00010014751 ENSVURG00010014764 ENSVURG00010014775 ENSVURG00010014787 ENSVURG00010014806 ENSVURG00010014810 ENSVURG00010014822 ENSVURG00010014830 ENSVURG00010014835 ENSVURG00010014845 ENSVURG00010014854 ENSVURG00010014868 ENSVURG00010014957 #22 ENSVURG00010014974 ENSVURG00010015115 ENSVURG00010015440 ENSVURG00010015452 ENSVURG00010015464 ENSVURG00010015475 ENSVURG00010015597 ENSVURG00010016274 ENSVURG00010016288 B3GALT9 (ENSVURG00010016305) ENSVURG00010016320 ENSVURG00010016445 ENSVURG00010016451 ENSVURG00010016476 ENSVURG00010016534 Common wonbat MODERN SPECIES 1024 RAD21L1 (ENSVURG00010003057) ENSVURG00010003081 ENSVURG00010003117 ENSVURG00010003125 ENSVURG00010003136 ENSVURG00010003148 ENSVURG00010003193 ENSVURG00010003199 ENSVURG00010003207 ENSVURG00010003279 ENSVURG00010003303 ENSVURG00010003307 ENSVURG00010003326 ENSVURG00010003359 ENSVURG00010003384 ENSVURG00010003556 #22 ENSVURG00010003627 ENSVURG00010003853 ENSVURG00010004564 ENSVURG00010004584 ENSVURG00010004648 ENSVURG00010004684 ENSVURG00010004925 ENSVURG00010007802 ENSVURG00010007836 ENSVURG00010007845 ENSVURG00010007864 ENSVURG00010007872 ENSVURG00010007899 ENSVURG00010007943 ENSVURG00010008012 Common wonbat MODERN SPECIES 715 ENSVURG00010007385 BORCS5 (ENSVURG00010007379) DUSP16 (ENSVURG00010007366) CREBL2 (ENSVURG00010007359) GPR19 (ENSVURG00010007354) CDKN1B (ENSVURG00010007349) APOLD1 (ENSVURG00010007343) DDX47 (ENSVURG00010007333) GPRC5A (ENSVURG00010007328) ##29 GPRC5D (ENSVURG00010007318) ##29 FAM234B (ENSVURG00010007299) GSG1 (ENSVURG00010007238) EMP1 (ENSVURG00010007225) ENSVURG00010007218 ENSVURG00010007213 ENSVURG00010007207 #22 GRIN2B (ENSVURG00010007178) ATF7IP (ENSVURG00010006767) PLBD1 (ENSVURG00010006743) GUCY2C (ENSVURG00010006419) ENSVURG00010006374 PEX5 (ENSVURG00010006333) CLSTN3 (ENSVURG00010006316) ENSVURG00010006311 Common wonbat MODERN SPECIES 1225 ENSVURG00010021926 SCARF2 (ENSVURG00010021921) KLHL22 (ENSVURG00010021917) ENSVURG00010021914 ENSVURG00010021907 SMPD4 (ENSVURG00010021870) ENSVURG00010021856 TUBA3D (ENSVURG00010021849) SLC7A4 (ENSVURG00010021845) PPIL2 (ENSVURG00010021827) YPEL1 (ENSVURG00010021818) ENSVURG00010021815 #22 MAPK1 (ENSVURG00010021810) PPM1F (ENSVURG00010021805) TOP3B (ENSVURG00010021796) ENSVURG00010021788 SDF2L1 (ENSVURG00010021784) YDJC (ENSVURG00010021777) ENSVURG00010021765 HIC2 (ENSVURG00010021757) SERPIND1 (ENSVURG00010021754) PI4KA (ENSVURG00010021720) SNAP29 (ENSVURG00010021707) CRKL (ENSVURG00010021705) AIFM3 (ENSVURG00010021692) LZTR1 (ENSVURG00010020811) THAP7 (ENSVURG00010020716) koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 212 ZNF385D (ENSPCIG00000035897) ENSPCIG00000023929 #22 ENSPCIG00000023932 ENSPCIG00000023933 ENSPCIG00000026104 UBE2E1 (ENSPCIG00000026105) NKIRAS1 (ENSPCIG00000026106) ENSPCIG00000026107 NR1D2 (ENSPCIG00000026108) THRB (ENSPCIG00000026110) RARB (ENSPCIG00000008578) TOP2B (ENSPCIG00000008674) NGLY1 (ENSPCIG00000010936) ENSPCIG00000036789 ENSPCIG00000010937 koala MODERN SPECIES 106 GALNT13 (ENSPCIG00000019129) ENSPCIG00000009709 KCNJ3 (ENSPCIG00000028769) ENSPCIG00000032559 ENSPCIG00000023300 ENSPCIG00000023299 NR4A2 (ENSPCIG00000015078) ENSPCIG00000015071 GPD2 (ENSPCIG00000015066) GALNT5 (ENSPCIG00000003972) ERMN (ENSPCIG00000003984) CYTIP (ENSPCIG00000003994) ACVR1C (ENSPCIG00000004001) ENSPCIG00000004022 #22 ACVR1 (ENSPCIG00000004031) UPP2 (ENSPCIG00000028123) ENSPCIG00000028794 PKP4 (ENSPCIG00000028795) ENSPCIG00000036633 DAPL1 (ENSPCIG00000037017) TANC1 (ENSPCIG00000002529) WDSUB1 (ENSPCIG00000002545) BAZ2B (ENSPCIG00000003070) MARCHF7 (ENSPCIG00000018311) CD302 (ENSPCIG00000018314) LY75 (ENSPCIG00000018322) ENSPCIG00000018379 PLA2R1 (ENSPCIG00000018373) ENSPCIG00000018386 koala MODERN SPECIES 271 ZNF644 (ENSPCIG00000014242) HFM1 (ENSPCIG00000014233) CDC7 (ENSPCIG00000014227) ENSPCIG00000014224 #22 TGFBR3 (ENSPCIG00000014213) BRDT (ENSPCIG00000014201) EPHX4 (ENSPCIG00000014196) ENSPCIG00000014192 BTBD8 (ENSPCIG00000009630) ENSPCIG00000005520 GLMN (ENSPCIG00000013755) RPAP2 (ENSPCIG00000013740) GFI1 (ENSPCIG00000013728) EVI5 (ENSPCIG00000013693) RPL5 (ENSPCIG00000013655) DIPK1A (ENSPCIG00000013652) ENSPCIG00000016260 ENSPCIG00000032163 ENSPCIG00000013642 koala MODERN SPECIES 55 FNIP2 (ENSPCIG00000030353) ETFDH (ENSPCIG00000030354) C4orf46 (ENSPCIG00000035856) ENSPCIG00000032471 RXFP1 (ENSPCIG00000030357) ENSPCIG00000030359 #22 ENSPCIG00000030361 TMEM144 (ENSPCIG00000018665) GASK1B (ENSPCIG00000018667) GRIA2 (ENSPCIG00000030491) ENSPCIG00000014583 GLRB (ENSPCIG00000033479) PDGFC (ENSPCIG00000024153) ENSPCIG00000024160 ENSPCIG00000029652 CTSO (ENSPCIG00000029653) TDO2 (ENSPCIG00000029612) ENSPCIG00000029615 GUCY1B1 (ENSPCIG00000029617) GUCY1A1 (ENSPCIG00000029620) ENSPCIG00000029623 Platypus MODERN SPECIES 6 ENSOANG00000044884 ENSOANG00000008072 ABCA5 (ENSOANG00000008073) MAP2K6 (ENSOANG00000008075) KCNJ16 (ENSOANG00000008076) KCNJ2 (ENSOANG00000008077) SOX9 (ENSOANG00000005850) #10 SLC39A11 (ENSOANG00000029590) #11 SSTR2 (ENSOANG00000004342) #12 COG1 (ENSOANG00000009570) #14 ENSOANG00000009566 ENSOANG00000009569 #17 ENSOANG00000009568 CDC42EP4 (ENSOANG00000009567) #19 SDK2 (ENSOANG00000009565) #21 RPL38 (ENSOANG00000043838) #22 TTYH2 (ENSOANG00000003282) #23 ENSOANG00000003283 KIF19 (ENSOANG00000003284) #25 BTBD17 (ENSOANG00000037701) #26 GPR142 (ENSOANG00000003286) #27 GPRC5C (ENSOANG00000003287) #29 ENSOANG00000031957 #33 ENSOANG00000003288 #33 ENSOANG00000003289 #33 ENSOANG00000040837 #33 ENSOANG00000049056 #33 ENSOANG00000039626 ENSOANG00000003291 ENSOANG00000042113 RAB40B (ENSOANG00000037660)