Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00950000182970.A.b ENSGT01030000234597.a.b.b.f ENSGT00410000025596.a.a ENSGT00940000160694 ENSGT00950000183149.B ##11 ENSGT00940000158197 ENSGT00390000006008 ENSGT00940000164879 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00490000043388.b ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473 ENSGT00390000005213 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000164689 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 ENSGT00390000003849 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000164689 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000164689 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Amniota ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Mammalia ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003248.a.a ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Theria ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Eutheria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 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ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Rodentia ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000003248.a.a.a.b.db ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 17 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#24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000154383.s.a #12 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000162274 #26 ENSGT00390000006173 #29 ENSGT00940000156408 #30 ENSGT00510000048688 #31 ENSGT00530000063829.A #32 ENSGT00940000156934 #33 ENSGT00390000007597 #34 ENSGT00530000063023.A.b #35 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ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000167616.a ENSGT00940000159294 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 52 ENSGT00940000156118 ENSGT00940000160438 ENSGT00950000182978.A.a.b.a ENSGT01090000260093.a ENSGT00390000001710 ENSGT00510000046470.a.a.a.d.a ENSGT00900000143241 ENSGT00950000183021.a.a.b ENSGT00940000159454 ENSGT01080000257410.B.a ENSGT00390000016584.p ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000167616.a ENSGT00940000159294 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 80 ENSUPAG00010019717 SDCBP (ENSUPAG00010019704) #17 NSMAF (ENSUPAG00010019682) #18 TOX (ENSUPAG00010019670) 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(ENSOCUG00000000440) ##16 BHLHE22 (ENSOCUG00000012968) ENSOCUG00000038967 ARMC1 (ENSOCUG00000000392) Tree shrew MODERN SPECIES 28 RAB2A (ENSTBEG00000001302) #22 CHD7 (ENSTBEG00000001540) #23 Primates ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.g.b.a #17 ENSGT00940000155059.e #18 ENSGT00940000154502.h #17 ENSGT00940000155059.f.a #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.g.b.a #17 ENSGT00940000155059.f.b #18 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000154502.h #17 ENSGT00940000155059.f.a.b #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 595 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1141 RAB2A (ENSRBIG00000037603) #22 ENSRBIG00000035328 CHD7 (ENSRBIG00000043575) #23 CLVS1 (ENSRBIG00000027946) #24 ASPH (ENSRBIG00000039872) #25 ENSRBIG00000034531 ENSRBIG00000030945 GGH (ENSRBIG00000043388) TTPA (ENSRBIG00000027922) YTHDF3 (ENSRBIG00000036465) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 876 CA8 (ENSRROG00000032644) #20 ENSRROG00000037868 RAB2A (ENSRROG00000031181) #22 CHD7 (ENSRROG00000008981) #23 CLVS1 (ENSRROG00000032606) #24 ASPH (ENSRROG00000042903) #25 NKAIN3 (ENSRROG00000030275) ENSRROG00000029992 GGH (ENSRROG00000037309) TTPA (ENSRROG00000033955) YTHDF3 (ENSRROG00000035231) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.g.b.a.a #17 ENSGT00940000155059.f.b #18 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000154502.h #17 ENSGT00940000155059.f.a.b #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Vervet Monkey MODERN SPECIES 27 ENSCSAG00000014589 MOS (ENSCSAG00000018547) PLAG1 (ENSCSAG00000014574) #7 CHCHD7 (ENSCSAG00000014569) SDR16C5 (ENSCSAG00000014558) #9 PENK (ENSCSAG00000014552) #11 BPNT2 (ENSCSAG00000014546) #13 ENSCSAG00000018548 FAM110B (ENSCSAG00000018549) #14 UBXN2B 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ENSGT00510000048041.p ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000148180 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Macaca ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00840000130804 ENSGT00910000147608 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000155762 ENSGT00940000154502.g.b.a.a #17 ENSGT00940000155059.f.b #18 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000154502.h #17 ENSGT00940000155059.f.a.b #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00910000147170 ENSGT00510000048041.p ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000148180 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 580 SDR16C5 (ENSMNEG00000032388) #9 PENK (ENSMNEG00000035854) #11 BPNT2 (ENSMNEG00000030740) #13 ENSMNEG00000042237 ENSMNEG00000023891 UBXN2B (ENSMNEG00000041477) #15 CYP7A1 (ENSMNEG00000040092) #16 ENSMNEG00000005216 SDCBP (ENSMNEG00000039350) #17 ENSMNEG00000006454 ENSMNEG00000033392 #18 TOX (ENSMNEG00000030315) #19 CA8 (ENSMNEG00000028797) #20 ENSMNEG00000036170 ENSMNEG00000044279 RAB2A (ENSMNEG00000037175) #22 CHD7 (ENSMNEG00000040978) #23 CLVS1 (ENSMNEG00000035587) #24 ASPH (ENSMNEG00000030091) #25 NKAIN3 (ENSMNEG00000028843) GGH (ENSMNEG00000030108) TTPA (ENSMNEG00000036364) YTHDF3 (ENSMNEG00000031200) ENSMNEG00000043151 ENSMNEG00000004932 ENSMNEG00000000587 BHLHE22 (ENSMNEG00000028116) CYP7B1 (ENSMNEG00000040346) ##16 ARMC1 (ENSMNEG00000036022) MTFR1 (ENSMNEG00000029834) PDE7A (ENSMNEG00000037086) Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.h #17 ENSGT00940000155059.f.a.b #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000154004.a Crab-eating macaque MODERN SPECIES 18 SDR16C5 (ENSMFAG00000002079) #9 ENSMFAG00000059119 #10 PENK (ENSMFAG00000031729) #11 ENSMFAG00000061878 BPNT2 (ENSMFAG00000034283) #13 FAM110B (ENSMFAG00000038229) #14 UBXN2B 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#18 TOX (ENSMMUG00000010971) #19 CA8 (ENSMMUG00000006437) #20 ENSMMUG00000037723 RAB2A (ENSMMUG00000017038) #22 CHD7 (ENSMMUG00000011584) #23 CLVS1 (ENSMMUG00000008774) #24 ASPH (ENSMMUG00000008777) #25 NKAIN3 (ENSMMUG00000009144) GGH (ENSMMUG00000055148) TTPA (ENSMMUG00000054577) YTHDF3 (ENSMMUG00000006729) BHLHE22 (ENSMMUG00000038208) CYP7B1 (ENSMMUG00000004411) ##16 ARMC1 (ENSMMUG00000028974) MTFR1 (ENSMMUG00000011263) PDE7A (ENSMMUG00000011262) DNAJC5B (ENSMMUG00000021585) ENSMMUG00000058626 TRIM55 (ENSMMUG00000021586) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000155762 ENSGT00940000154502.g.b.a.a #17 ENSGT00940000155059.f.b #18 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000154502.h #17 ENSGT00940000155059.f.a.b #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00910000147170 ENSGT00510000048041.p ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00940000154795 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000148180 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b Olive baboon MODERN SPECIES 18 ENSPANG00000048475 BPNT2 (ENSPANG00000008388) #13 ENSPANG00000050330 ENSPANG00000042702 ENSPANG00000042586 ENSPANG00000044863 ENSPANG00000041025 FAM110B (ENSPANG00000013667) #14 UBXN2B (ENSPANG00000014734) #15 CYP7A1 (ENSPANG00000017844) #16 ENSPANG00000032802 SDCBP (ENSPANG00000015123) #17 NSMAF (ENSPANG00000021868) #18 TOX (ENSPANG00000021717) #19 CA8 (ENSPANG00000018133) #20 RAB2A (ENSPANG00000021867) #22 CHD7 (ENSPANG00000018419) #23 CLVS1 (ENSPANG00000026086) #24 ASPH (ENSPANG00000008510) #25 NKAIN3 (ENSPANG00000030730) GGH (ENSPANG00000000687) TTPA (ENSPANG00000018418) YTHDF3 (ENSPANG00000008030) ENSPANG00000010710 ENSPANG00000044403 BHLHE22 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#23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00910000148230 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Orangutan MODERN SPECIES 21 LYN (ENSPPYG00000018598) ENSPPYG00000037731 MOS (ENSPPYG00000018601) PLAG1 (ENSPPYG00000018602) #7 ENSPPYG00000018604 SDR16C5 (ENSPPYG00000018605) #9 PENK (ENSPPYG00000018606) #11 ENSPPYG00000030167 BPNT2 (ENSPPYG00000018607) #13 UBXN2B (ENSPPYG00000018610) #15 CYP7A1 (ENSPPYG00000018611) #16 SDCBP (ENSPPYG00000018612) #17 NSMAF (ENSPPYG00000018613) #18 TOX (ENSPPYG00000018614) #19 CA8 (ENSPPYG00000018615) #20 RAB2A (ENSPPYG00000018617) #22 CHD7 (ENSPPYG00000018618) #23 ENSPPYG00000036142 ENSPPYG00000039758 CLVS1 (ENSPPYG00000018621) #24 ASPH (ENSPPYG00000018622) #25 NKAIN3 (ENSPPYG00000018623) GGH (ENSPPYG00000018624) TTPA (ENSPPYG00000040852) YTHDF3 (ENSPPYG00000018626) ENSPPYG00000018628 CYP7B1 (ENSPPYG00000018629) ##16 ENSPPYG00000030990 ARMC1 (ENSPPYG00000018630) MTFR1 (ENSPPYG00000018631) PDE7A (ENSPPYG00000018632) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00910000148739 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b.c.a #15 ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00520000055567.a.a.b.d #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.g.b.a #17 ENSGT00940000155059.e #18 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00950000183913 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00910000147170 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00900000143563.d ENSGT00390000016650.g.b ENSGT00940000153052.c.a.b ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000157752.b ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100.c ENSGT00950000183215.c.a.b Gorilla MODERN SPECIES 21 SDR16C5 (ENSGGOG00000004025) #9 PENK (ENSGGOG00000016266) #11 BPNT2 (ENSGGOG00000025130) #13 ENSGGOG00000036414 ENSGGOG00000027156 ENSGGOG00000043065 ENSGGOG00000044170 ENSGGOG00000016080 #15 CYP7A1 (ENSGGOG00000023783) #16 SDCBP (ENSGGOG00000009019) #17 NSMAF (ENSGGOG00000004827) #18 TOX (ENSGGOG00000012139) #19 ENSGGOG00000043542 CA8 (ENSGGOG00000026186) #20 ENSGGOG00000039477 RAB2A (ENSGGOG00000043049) #22 ENSGGOG00000043906 CHD7 (ENSGGOG00000012224) #23 ENSGGOG00000041942 ENSGGOG00000023384 ENSGGOG00000028098 CLVS1 (ENSGGOG00000007625) #24 ASPH (ENSGGOG00000008863) #25 ENSGGOG00000024136 NKAIN3 (ENSGGOG00000034874) GGH (ENSGGOG00000007739) ENSGGOG00000004878 YTHDF3 (ENSGGOG00000027681) ENSGGOG00000039212 ENSGGOG00000039770 ENSGGOG00000037514 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00910000148739 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b.c.a #15 ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00520000055567.a.a.b.d #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 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RAB2A (ENSG00000104388) #22 CHD7 (ENSG00000171316) #23 CLVS1 (ENSG00000177182) #24 ASPH (ENSG00000198363) #25 NKAIN3 (ENSG00000185942) GGH (ENSG00000137563) TTPA (ENSG00000137561) YTHDF3 (ENSG00000185728) BHLHE22 (ENSG00000180828) CYP7B1 (ENSG00000172817) ##16 ARMC1 (ENSG00000104442) MTFR1 (ENSG00000066855) PDE7A (ENSG00000205268) DNAJC5B (ENSG00000147570) TRIM55 (ENSG00000147573) CRH (ENSG00000147571) Pan ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000155238.k.b ENSGT00390000005254.i.a.b.n.a ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00910000148739 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b.c.a #15 ENSGT00940000153876.B.j.a.b.a ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.h #17 ENSGT00940000155059.e #18 ENSGT00910000147347 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00950000183913 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00390000016650.g.b ENSGT00940000153052.c.a.b ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000157752.b ENSGT00940000161484 ENSGT00940000154795.c ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100.c Chimpanzee MODERN SPECIES 21 ENSPTRG00000046053 ENSPTRG00000049159 BPNT2 (ENSPTRG00000020271) #13 ENSPTRG00000051826 ENSPTRG00000047634 FAM110B (ENSPTRG00000044402) #14 UBXN2B (ENSPTRG00000033886) #15 ENSPTRG00000051087 CYP7A1 (ENSPTRG00000020275) #16 SDCBP (ENSPTRG00000020277) #17 NSMAF (ENSPTRG00000020279) #18 ENSPTRG00000044166 TOX (ENSPTRG00000020281) #19 ENSPTRG00000045756 CA8 (ENSPTRG00000020283) #20 RAB2A (ENSPTRG00000020284) #22 CHD7 (ENSPTRG00000020286) #23 ENSPTRG00000048385 CLVS1 (ENSPTRG00000020288) #24 ENSPTRG00000052386 ASPH (ENSPTRG00000020289) #25 ENSPTRG00000042694 NKAIN3 (ENSPTRG00000020292) ENSPTRG00000046745 ENSPTRG00000043036 GGH (ENSPTRG00000020293) TTPA (ENSPTRG00000020294) YTHDF3 (ENSPTRG00000049135) ENSPTRG00000048438 ENSPTRG00000050724 ENSPTRG00000022575 Bonobo MODERN SPECIES 21 PENK (ENSPPAG00000043514) #11 ENSPPAG00000002731 ENSPPAG00000040415 BPNT2 (ENSPPAG00000042643) #13 ENSPPAG00000032162 ENSPPAG00000035036 #15 ENSPPAG00000037576 CYP7A1 (ENSPPAG00000043585) #16 ENSPPAG00000038846 #17 NSMAF (ENSPPAG00000028955) #18 ENSPPAG00000035380 ENSPPAG00000032155 TOX (ENSPPAG00000036301) #19 ENSPPAG00000036688 CA8 (ENSPPAG00000037018) #20 RAB2A (ENSPPAG00000030918) #22 CHD7 (ENSPPAG00000033330) #23 ENSPPAG00000036715 CLVS1 (ENSPPAG00000033393) #24 ENSPPAG00000028711 ASPH (ENSPPAG00000036467) #25 ENSPPAG00000029474 NKAIN3 (ENSPPAG00000034556) ENSPPAG00000035311 ENSPPAG00000032702 GGH (ENSPPAG00000036800) TTPA (ENSPPAG00000039436) ENSPPAG00000001547 YTHDF3 (ENSPPAG00000043483) ENSPPAG00000041014 ENSPPAG00000032241 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000153571.a.eb ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203.b ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Mas night monkey MODERN SPECIES 249 ENSANAG00000027241 PLAG1 (ENSANAG00000023401) #7 CHCHD7 (ENSANAG00000022037) SDR16C5 (ENSANAG00000035994) #9 PENK (ENSANAG00000017945) #11 ENSANAG00000002536 BPNT2 (ENSANAG00000021522) #13 FAM110B (ENSANAG00000019375) #14 ENSANAG00000038124 UBXN2B (ENSANAG00000034539) #15 CYP7A1 (ENSANAG00000019928) #16 SDCBP (ENSANAG00000029608) #17 NSMAF (ENSANAG00000027618) #18 TOX (ENSANAG00000037539) #19 CA8 (ENSANAG00000022483) #20 RAB2A (ENSANAG00000035405) #22 CHD7 (ENSANAG00000035300) #23 CLVS1 (ENSANAG00000036167) #24 ASPH (ENSANAG00000030226) #25 ENSANAG00000033475 GGH (ENSANAG00000037430) TTPA (ENSANAG00000026480) ENSANAG00000027281 YTHDF3 (ENSANAG00000037920) ENSANAG00000025634 ENSANAG00000025372 CYP7B1 (ENSANAG00000023804) ##16 ARMC1 (ENSANAG00000028594) MTFR1 (ENSANAG00000033406) PDE7A (ENSANAG00000021253) DNAJC5B (ENSANAG00000036123) Cebidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000153571.a.eb ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203.a ENSGT00940000159203.b ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000161696.c.a.a ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000153571.a.eb ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00940000153239.B.i.a.a ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203.b ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 116 ENSSBOG00000024676 PLAG1 (ENSSBOG00000033202) #7 CHCHD7 (ENSSBOG00000001463) SDR16C5 (ENSSBOG00000017860) #9 ENSSBOG00000030581 #10 PENK (ENSSBOG00000027180) #11 ENSSBOG00000023239 BPNT2 (ENSSBOG00000021056) #13 ENSSBOG00000020724 UBXN2B (ENSSBOG00000026177) #15 CYP7A1 (ENSSBOG00000021502) #16 SDCBP (ENSSBOG00000023954) #17 NSMAF (ENSSBOG00000025474) #18 TOX (ENSSBOG00000033601) #19 CA8 (ENSSBOG00000023844) #20 RAB2A (ENSSBOG00000025313) #22 CHD7 (ENSSBOG00000021462) #23 CLVS1 (ENSSBOG00000032167) #24 ASPH (ENSSBOG00000030161) #25 NKAIN3 (ENSSBOG00000027801) ENSSBOG00000030459 GGH (ENSSBOG00000023367) TTPA (ENSSBOG00000026827) YTHDF3 (ENSSBOG00000035287) ENSSBOG00000024487 ENSSBOG00000027805 CYP7B1 (ENSSBOG00000030196) ##16 ENSSBOG00000021813 ENSSBOG00000026145 PDE7A (ENSSBOG00000003831) DNAJC5B (ENSSBOG00000027072) Capuchin MODERN SPECIES 199 LRRC39 (ENSCCAG00000034937) TRMT13 (ENSCCAG00000023772) SASS6 (ENSCCAG00000025767) MFSD14A (ENSCCAG00000025510) ENSCCAG00000032084 AGL (ENSCCAG00000034060) FRRS1 (ENSCCAG00000015161) PALMD (ENSCCAG00000023066) FAM110B (ENSCCAG00000017213) #14 UBXN2B (ENSCCAG00000030065) #15 CYP7A1 (ENSCCAG00000021000) #16 SDCBP (ENSCCAG00000035282) #17 NSMAF (ENSCCAG00000034122) #18 TOX (ENSCCAG00000022985) #19 CA8 (ENSCCAG00000028223) #20 RAB2A (ENSCCAG00000025945) #22 CHD7 (ENSCCAG00000025831) #23 CLVS1 (ENSCCAG00000022708) #24 ASPH (ENSCCAG00000019698) #25 Marmoset MODERN SPECIES 7 FAM110B (ENSCJAG00000008657) #14 ENSCJAG00000073685 UBXN2B (ENSCJAG00000008666) #15 CYP7A1 (ENSCJAG00000008684) #16 SDCBP (ENSCJAG00000008697) #17 NSMAF (ENSCJAG00000008834) #18 ENSCJAG00000070948 ENSCJAG00000082557 ENSCJAG00000052054 TOX (ENSCJAG00000008958) #19 ENSCJAG00000051398 ENSCJAG00000072177 ENSCJAG00000044576 ENSCJAG00000078019 CA8 (ENSCJAG00000008976) #20 RAB2A (ENSCJAG00000009000) #22 CHD7 (ENSCJAG00000009025) #23 CLVS1 (ENSCJAG00000040445) #24 ASPH (ENSCJAG00000009122) #25 ENSCJAG00000073133 NKAIN3 (ENSCJAG00000067094) GGH (ENSCJAG00000009191) TTPA (ENSCJAG00000009205) YTHDF3 (ENSCJAG00000009217) ENSCJAG00000074156 CYP7B1 (ENSCJAG00000009244) ##16 ENSCJAG00000070972 ENSCJAG00000074189 ARMC1 (ENSCJAG00000009253) MTFR1 (ENSCJAG00000009268) ENSCJAG00000081095 Tarsier MODERN SPECIES 3109 RAB2A (ENSTSYG00000030301) #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Mouse lemur MODERN SPECIES 31 XKR4 (ENSMICG00000004668) ENSMICG00000031576 SOX17 (ENSMICG00000046540) MRPL15 (ENSMICG00000009779) LYPLA1 (ENSMICG00000015545) TCEA1 (ENSMICG00000029278) RGS20 (ENSMICG00000015672) ATP6V1H (ENSMICG00000015657) ENSMICG00000044219 OPRK1 (ENSMICG00000043008) ENSMICG00000003968 #17 NSMAF (ENSMICG00000003974) #18 TOX (ENSMICG00000032215) #19 CA8 (ENSMICG00000047348) #20 ENSMICG00000034084 RAB2A (ENSMICG00000034540) #22 CHD7 (ENSMICG00000002430) #23 CLVS1 (ENSMICG00000006968) #24 ASPH (ENSMICG00000006413) #25 NKAIN3 (ENSMICG00000006325) ENSMICG00000045812 TTPA (ENSMICG00000044191) YTHDF3 (ENSMICG00000036869) BHLHE22 (ENSMICG00000036458) CYP7B1 (ENSMICG00000002968) ##16 ARMC1 (ENSMICG00000044923) MTFR1 (ENSMICG00000012792) ENSMICG00000027344 PDE7A (ENSMICG00000012802) DNAJC5B (ENSMICG00000043410) TRIM55 (ENSMICG00000012826) Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 107 ENSGT00390000003248.a.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.c #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.f #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 853 LYN (ENSPCOG00000024655) ENSPCOG00000019798 CHCHD7 (ENSPCOG00000018176) SDR16C5 (ENSPCOG00000024871) #9 ENSPCOG00000000959 #10 PENK (ENSPCOG00000022168) #11 BPNT2 (ENSPCOG00000028648) #13 FAM110B (ENSPCOG00000026950) #14 UBXN2B (ENSPCOG00000025222) #15 CYP7A1 (ENSPCOG00000025220) #16 ENSPCOG00000026207 #17 NSMAF (ENSPCOG00000020110) #18 TOX (ENSPCOG00000016690) #19 ENSPCOG00000020627 CA8 (ENSPCOG00000028332) #20 RAB2A (ENSPCOG00000020717) #22 CHD7 (ENSPCOG00000013850) #23 CLVS1 (ENSPCOG00000014461) #24 ASPH (ENSPCOG00000022974) #25 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 663 ENSPSMG00000022896 RAB2A (ENSPSMG00000022892) #22 CHD7 (ENSPSMG00000022867) #23 CLVS1 (ENSPSMG00000022800) #24 ASPH (ENSPSMG00000022706) #25 Bushbaby MODERN SPECIES 349 CA8 (ENSOGAG00000001096) #20 ENSOGAG00000001097 RAB2A (ENSOGAG00000011201) #22 CHD7 (ENSOGAG00000013905) #23 CLVS1 (ENSOGAG00000007028) #24 ASPH (ENSOGAG00000007030) #25 Euarchontoglires DUPLICATION Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3268 ENSMSIG00000004660 Amy1 (ENSMSIG00000004684) Rnpc3 (ENSMSIG00000004723) Col11a1 (ENSMSIG00000004832) ENSMSIG00000004970 Olfm3 (ENSMSIG00000004986) S1pr1 (ENSMSIG00000005050) ENSMSIG00000005056 Dph5 (ENSMSIG00000005061) Slc30a7 (ENSMSIG00000005095) Extl2 (ENSMSIG00000005127) Vcam1 (ENSMSIG00000005169) Gpr88 (ENSMSIG00000005216) Cdc14a (ENSMSIG00000005239) ENSMSIG00000005433 ##22 ENSMSIG00000005461 ENSMSIG00000005524 Dbt (ENSMSIG00000005569) Lrrc39 (ENSMSIG00000005604) Trmt13 (ENSMSIG00000005639) Sass6 (ENSMSIG00000005689) Mfsd14a (ENSMSIG00000005946) Slc35a3 (ENSMSIG00000006013) Agl (ENSMSIG00000006035) Frrs1 (ENSMSIG00000006123) Palmd (ENSMSIG00000006299) ENSMSIG00000006393 ENSMSIG00000006399 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Degu MODERN SPECIES 61 GALM (ENSODEG00000009740) ENSODEG00000011016 SRSF7 (ENSODEG00000010029) GEMIN6 (ENSODEG00000011245) DHX57 (ENSODEG00000011626) ENSODEG00000009626 ARHGEF33 (ENSODEG00000010871) ENSODEG00000011783 SOS1 (ENSODEG00000012567) CDKL4 (ENSODEG00000010265) MAP4K3 (ENSODEG00000011426) TMEM178A (ENSODEG00000010204) ENSODEG00000010561 ENSODEG00000019855 SLC8A1 (ENSODEG00000010025) ENSODEG00000009978 ##22 ENSODEG00000019775 ENSODEG00000010136 ENSODEG00000019723 ##28 ENSODEG00000010490 PKDCC (ENSODEG00000014354) EML4 (ENSODEG00000011507) COX7A2L (ENSODEG00000011433) ENSODEG00000011166 KCNG3 (ENSODEG00000014536) ENSODEG00000012097 ENSODEG00000011091 ENSODEG00000019803 HAAO (ENSODEG00000010886) ENSODEG00000012111 ENSODEG00000010547 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 16 TRPA1 (ENSMMMG00000004948) MSC (ENSMMMG00000004901) EYA1 (ENSMMMG00000004783) XKR9 (ENSMMMG00000004758) LACTB2 (ENSMMMG00000004742) TRAM1 (ENSMMMG00000004176) ENSMMMG00000004157 ENSMMMG00000004137 NCOA2 (ENSMMMG00000003994) PRDM14 (ENSMMMG00000003951) SLCO5A1 (ENSMMMG00000003820) SDCBP (ENSMMMG00000003758) #17 NSMAF (ENSMMMG00000003716) #18 TOX (ENSMMMG00000003707) #19 CA8 (ENSMMMG00000003649) #20 ENSMMMG00000003620 ##22 ENSMMMG00000003618 #22 CHD7 (ENSMMMG00000003455) #23 CLVS1 (ENSMMMG00000003433) #24 ASPH (ENSMMMG00000003021) #25 NKAIN3 (ENSMMMG00000002955) GGH (ENSMMMG00000002919) TTPA (ENSMMMG00000002905) YTHDF3 (ENSMMMG00000002881) ENSMMMG00000002871 CYP7B1 (ENSMMMG00000002861) ##16 ENSMMMG00000002852 ENSMMMG00000002848 ARMC1 (ENSMMMG00000002830) MTFR1 (ENSMMMG00000002790) PDE7A (ENSMMMG00000002696) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.a ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 1608 ENSPSMG00000020157 ##22 ENSPSMG00000020155 ENSPSMG00000020152 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.e.b ##22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3419 Lcorl (ENSMSIG00000029653) Ncapg (ENSMSIG00000029676) Fam184b (ENSMSIG00000029687) Med28 (ENSMSIG00000029693) Lap3 (ENSMSIG00000029697) Clrn2 (ENSMSIG00000029703) Qdpr (ENSMSIG00000029706) Ldb2 (ENSMSIG00000029731) ENSMSIG00000029753 ##22 Tapt1 (ENSMSIG00000029756) Prom1 (ENSMSIG00000029762) Fgfbp1 (ENSMSIG00000030095) Cd38 (ENSMSIG00000030098) Bst1 (ENSMSIG00000030100) Fbxl5 (ENSMSIG00000030102) Cc2d2a (ENSMSIG00000030112) C1qtnf7 (ENSMSIG00000030162) Cpeb2 (ENSMSIG00000030167) Bod1l (ENSMSIG00000030207) Nkx3-2 (ENSMSIG00000030244) Rab28 (ENSMSIG00000030249) ENSMSIG00000030260 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00990000212811 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Equus ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00990000212811 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Horse MODERN SPECIES 30 SDR16C5 (ENSECAG00000008479) #9 ENSECAG00000006420 #10 PENK (ENSECAG00000024110) #11 ENSECAG00000056448 BPNT2 (ENSECAG00000020044) #13 ENSECAG00000028112 FAM110B (ENSECAG00000004777) #14 UBXN2B (ENSECAG00000017075) #15 CYP7A1 (ENSECAG00000012946) #16 SDCBP (ENSECAG00000015053) #17 NSMAF (ENSECAG00000000565) #18 TOX (ENSECAG00000022430) #19 ENSECAG00000040466 CA8 (ENSECAG00000018004) #20 ENSECAG00000056437 RAB2A (ENSECAG00000012124) #22 CHD7 (ENSECAG00000001445) #23 CLVS1 (ENSECAG00000000059) #24 ASPH (ENSECAG00000021447) #25 NKAIN3 (ENSECAG00000020663) GGH (ENSECAG00000014903) TTPA (ENSECAG00000045564) YTHDF3 (ENSECAG00000011093) BHLHE22 (ENSECAG00000039010) CYP7B1 (ENSECAG00000007540) ##16 ENSECAG00000054918 ARMC1 (ENSECAG00000022099) MTFR1 (ENSECAG00000018466) ENSECAG00000048660 PDE7A (ENSECAG00000017565) DNAJC5B (ENSECAG00000016455) Donkey MODERN SPECIES 3 PLAG1 (ENSEASG00005016361) #7 CHCHD7 (ENSEASG00005016359) SDR16C5 (ENSEASG00005016356) #9 ENSEASG00005016354 #10 PENK (ENSEASG00005030368) #11 BPNT2 (ENSEASG00005016346) #13 ENSEASG00005030180 FAM110B (ENSEASG00005024095) #14 UBXN2B (ENSEASG00005016334) #15 CYP7A1 (ENSEASG00005016330) #16 SDCBP (ENSEASG00005016275) #17 NSMAF (ENSEASG00005016270) #18 TOX (ENSEASG00005016265) #19 ENSEASG00005016264 CA8 (ENSEASG00005016262) #20 RAB2A (ENSEASG00005016261) #22 ENSEASG00005025791 CHD7 (ENSEASG00005016258) #23 CLVS1 (ENSEASG00005016256) #24 ASPH (ENSEASG00005029180) #25 NKAIN3 (ENSEASG00005016237) GGH (ENSEASG00005016231) TTPA (ENSEASG00005031026) YTHDF3 (ENSEASG00005016224) ENSEASG00005026428 ENSEASG00005026720 CYP7B1 (ENSEASG00005033874) ##16 ARMC1 (ENSEASG00005001743) MTFR1 (ENSEASG00005001735) PDE7A (ENSEASG00005001725) DNAJC5B (ENSEASG00005001709) Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.c ENSGT00940000154473.a Megabat MODERN SPECIES 6144 RAB2A (ENSPVAG00000006906) #22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 41 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.c ENSGT00940000154473.a Microbat MODERN SPECIES 954 RPS20 (ENSMLUG00000029059) MOS (ENSMLUG00000014866) PLAG1 (ENSMLUG00000022542) #7 CHCHD7 (ENSMLUG00000002085) SDR16C5 (ENSMLUG00000002087) #9 PENK (ENSMLUG00000002095) #11 BPNT2 (ENSMLUG00000030180) #13 FAM110B (ENSMLUG00000011997) #14 UBXN2B (ENSMLUG00000022243) #15 CYP7A1 (ENSMLUG00000004797) #16 ENSMLUG00000004807 #17 NSMAF (ENSMLUG00000004814) #18 TOX (ENSMLUG00000001247) #19 ENSMLUG00000001254 CA8 (ENSMLUG00000009024) #20 RAB2A (ENSMLUG00000002855) #22 ENSMLUG00000030659 CHD7 (ENSMLUG00000015266) #23 CLVS1 (ENSMLUG00000015754) #24 ASPH (ENSMLUG00000015756) #25 ENSMLUG00000027498 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 6 ENSRFEG00010010619 ENSRFEG00010010681 ENSRFEG00010010743 ENSRFEG00010010847 ENSRFEG00010010936 ENSRFEG00010010964 TTYH1 (ENSRFEG00010011026) LENG8 (ENSRFEG00010011172) LENG9 (ENSRFEG00010011236) CDC42EP5 (ENSRFEG00010011252) ENSRFEG00010011275 ENSRFEG00010011766 FCAR (ENSRFEG00010012892) NCR1 (ENSRFEG00010013100) ENSRFEG00010013450 ENSRFEG00010014407 #22 ENSRFEG00010014486 NLRP2 (ENSRFEG00010014517) ENSRFEG00010015159 RDH13 (ENSRFEG00010015233) ENSRFEG00010015343 EPS8L1 (ENSRFEG00010015399) PPP1R12C (ENSRFEG00010015728) TNNT1 (ENSRFEG00010015784) TNNI3 (ENSRFEG00010016024) DNAAF3 (ENSRFEG00010016317) SYT5 (ENSRFEG00010017140) PTPRH (ENSRFEG00010017321) TMEM86B (ENSRFEG00010017826) PPP6R1 (ENSRFEG00010017867) HSPBP1 (ENSRFEG00010017938) Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 5 PLAG1 (ENSRFEG00010008003) #7 CHCHD7 (ENSRFEG00010007883) SDR16C5 (ENSRFEG00010007843) #9 ENSRFEG00010007826 #10 PENK (ENSRFEG00010007792) #11 BPNT2 (ENSRFEG00010007765) #13 FAM110B (ENSRFEG00010007745) #14 ENSRFEG00010007735 UBXN2B (ENSRFEG00010007689) #15 CYP7A1 (ENSRFEG00010007643) #16 SDCBP (ENSRFEG00010007422) #17 NSMAF (ENSRFEG00010007360) #18 TOX (ENSRFEG00010007308) #19 ENSRFEG00010007288 CA8 (ENSRFEG00010007240) #20 ENSRFEG00010007105 #22 ENSRFEG00010007072 CHD7 (ENSRFEG00010006927) #23 ENSRFEG00010006898 CLVS1 (ENSRFEG00010006823) #24 ASPH (ENSRFEG00010006293) #25 NKAIN3 (ENSRFEG00010006061) GGH (ENSRFEG00010006024) TTPA (ENSRFEG00010005978) YTHDF3 (ENSRFEG00010005932) ENSRFEG00010005859 ENSRFEG00010005831 BHLHE22 (ENSRFEG00010005813) CYP7B1 (ENSRFEG00010005796) ##16 ARMC1 (ENSRFEG00010005774) MTFR1 (ENSRFEG00010005711) Carnivora ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Felidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Cat MODERN SPECIES 249 RPS20 (ENSFCAG00000029233) MOS (ENSFCAG00000003663) PLAG1 (ENSFCAG00000014980) #7 CHCHD7 (ENSFCAG00000032943) SDR16C5 (ENSFCAG00000014982) #9 PENK (ENSFCAG00000046182) #11 ENSFCAG00000026194 BPNT2 (ENSFCAG00000040896) #13 FAM110B (ENSFCAG00000042816) #14 UBXN2B (ENSFCAG00000022163) #15 CYP7A1 (ENSFCAG00000008003) #16 SDCBP (ENSFCAG00000026811) #17 NSMAF (ENSFCAG00000008007) #18 TOX (ENSFCAG00000005993) #19 CA8 (ENSFCAG00000010244) #20 RAB2A (ENSFCAG00000024352) #22 CHD7 (ENSFCAG00000003849) #23 CLVS1 (ENSFCAG00000010446) #24 ASPH (ENSFCAG00000046737) #25 NKAIN3 (ENSFCAG00000007885) GGH (ENSFCAG00000012709) YTHDF3 (ENSFCAG00000025314) ENSFCAG00000039101 ENSFCAG00000050327 ENSFCAG00000032717 BHLHE22 (ENSFCAG00000046121) CYP7B1 (ENSFCAG00000010211) ##16 ARMC1 (ENSFCAG00000034559) MTFR1 (ENSFCAG00000030908) PDE7A (ENSFCAG00000002055) DNAJC5B (ENSFCAG00000031311) Panthera ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Tiger MODERN SPECIES 216 CA8 (ENSPTIG00000007092) #20 RAB2A (ENSPTIG00000009758) #22 CHD7 (ENSPTIG00000011702) #23 CLVS1 (ENSPTIG00000019123) #24 ASPH (ENSPTIG00000019633) #25 GGH (ENSPTIG00000021128) TTPA (ENSPTIG00000021289) YTHDF3 (ENSPTIG00000021537) ENSPTIG00000005218 ENSPTIG00000005746 CYP7B1 (ENSPTIG00000006106) ##16 ARMC1 (ENSPTIG00000006567) MTFR1 (ENSPTIG00000008089) PDE7A (ENSPTIG00000009496) DNAJC5B (ENSPTIG00000012379) TRIM55 (ENSPTIG00000013229) ADHFE1 (ENSPTIG00000015037) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a leopard MODERN SPECIES 84 RPS20 (ENSPPRG00000001787) MOS (ENSPPRG00000014813) PLAG1 (ENSPPRG00000002026) #7 CHCHD7 (ENSPPRG00000002603) SDR16C5 (ENSPPRG00000003488) #9 PENK (ENSPPRG00000004334) #11 BPNT2 (ENSPPRG00000004394) #13 ENSPPRG00000014945 #14 ENSPPRG00000014954 #14 UBXN2B (ENSPPRG00000004977) #15 CYP7A1 (ENSPPRG00000005172) #16 SDCBP (ENSPPRG00000006324) #17 NSMAF (ENSPPRG00000009327) #18 TOX (ENSPPRG00000009925) #19 CA8 (ENSPPRG00000012015) #20 RAB2A (ENSPPRG00000012945) #22 CHD7 (ENSPPRG00000022248) #23 CLVS1 (ENSPPRG00000000763) #24 ENSPPRG00000001392 ENSPPRG00000002138 NKAIN3 (ENSPPRG00000002527) GGH (ENSPPRG00000002896) TTPA (ENSPPRG00000002962) YTHDF3 (ENSPPRG00000004665) ENSPPRG00000015827 ENSPPRG00000015847 ENSPPRG00000005195 BHLHE22 (ENSPPRG00000005341) CYP7B1 (ENSPPRG00000005718) ##16 ARMC1 (ENSPPRG00000006822) MTFR1 (ENSPPRG00000007511) lion MODERN SPECIES 509 LYN (ENSPLOG00000000327) ENSPLOG00000000280 MOS (ENSPLOG00000000254) PLAG1 (ENSPLOG00000000246) #7 CHCHD7 (ENSPLOG00000000226) SDR16C5 (ENSPLOG00000000199) #9 PENK (ENSPLOG00000000187) #11 BPNT2 (ENSPLOG00000000177) #13 FAM110B (ENSPLOG00000000166) #14 UBXN2B (ENSPLOG00000000158) #15 CYP7A1 (ENSPLOG00000000142) #16 SDCBP (ENSPLOG00000000123) #17 NSMAF (ENSPLOG00000000085) #18 TOX (ENSPLOG00000000065) #19 CA8 (ENSPLOG00000000055) #20 RAB2A (ENSPLOG00000000020) #22 CHD7 (ENSPLOG00000008970) #23 CLVS1 (ENSPLOG00000008886) #24 ASPH (ENSPLOG00000008617) #25 NKAIN3 (ENSPLOG00000008478) GGH (ENSPLOG00000008441) TTPA (ENSPLOG00000008405) YTHDF3 (ENSPLOG00000008320) ENSPLOG00000008263 BHLHE22 (ENSPLOG00000008231) CYP7B1 (ENSPLOG00000008188) ##16 ARMC1 (ENSPLOG00000008154) MTFR1 (ENSPLOG00000008073) PDE7A (ENSPLOG00000007872) DNAJC5B (ENSPLOG00000007818) TRIM55 (ENSPLOG00000007639) Caniformia ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00390000012818.o.a.a.a.a ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Ursidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000171038 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 Ursus ANCESTRAL SPECIES 110 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000171038.c ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT01030000240256 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a ENSGT00390000005213 American black bear MODERN SPECIES 2568 RAB2A (ENSUAMG00000018125) #22 Polar bear MODERN SPECIES 296 ENSUMAG00000009788 ENSUMAG00000009789 SDR16C5 (ENSUMAG00000009791) #9 PENK (ENSUMAG00000009792) #11 ENSUMAG00000009795 #13 ENSUMAG00000009802 FAM110B (ENSUMAG00000009815) #14 UBXN2B (ENSUMAG00000009820) #15 CYP7A1 (ENSUMAG00000009825) #16 ENSUMAG00000009836 SDCBP (ENSUMAG00000009840) #17 NSMAF (ENSUMAG00000009846) #18 ENSUMAG00000009852 TOX (ENSUMAG00000009857) #19 CA8 (ENSUMAG00000009870) #20 RAB2A (ENSUMAG00000009877) #22 CHD7 (ENSUMAG00000010436) #23 CLVS1 (ENSUMAG00000014042) #24 ASPH (ENSUMAG00000014054) #25 NKAIN3 (ENSUMAG00000014091) GGH (ENSUMAG00000014093) TTPA (ENSUMAG00000014098) YTHDF3 (ENSUMAG00000014104) CYP7B1 (ENSUMAG00000014112) ##16 ARMC1 (ENSUMAG00000014116) ENSUMAG00000014117 MTFR1 (ENSUMAG00000014119) PDE7A (ENSUMAG00000014127) DNAJC5B (ENSUMAG00000014199) TRIM55 (ENSUMAG00000014201) ADHFE1 (ENSUMAG00000014211) Giant Panda MODERN SPECIES 19 RPS20 (ENSAMEG00000006087) MOS (ENSAMEG00000019444) PLAG1 (ENSAMEG00000006089) #7 CHCHD7 (ENSAMEG00000006095) SDR16C5 (ENSAMEG00000006100) #9 PENK (ENSAMEG00000006117) #11 BPNT2 (ENSAMEG00000006121) #13 FAM110B (ENSAMEG00000019450) #14 UBXN2B (ENSAMEG00000006131) #15 CYP7A1 (ENSAMEG00000006149) #16 ENSAMEG00000024357 SDCBP (ENSAMEG00000006161) #17 NSMAF (ENSAMEG00000006217) #18 TOX (ENSAMEG00000005857) #19 CA8 (ENSAMEG00000005842) #20 RAB2A (ENSAMEG00000005810) #22 CHD7 (ENSAMEG00000005699) #23 CLVS1 (ENSAMEG00000005687) #24 ASPH (ENSAMEG00000005680) #25 ENSAMEG00000029572 NKAIN3 (ENSAMEG00000015503) GGH (ENSAMEG00000018121) TTPA (ENSAMEG00000024127) YTHDF3 (ENSAMEG00000018113) ENSAMEG00000024582 CYP7B1 (ENSAMEG00000012256) ##16 ENSAMEG00000025290 ARMC1 (ENSAMEG00000012275) MTFR1 (ENSAMEG00000012281) PDE7A (ENSAMEG00000012296) DNAJC5B (ENSAMEG00000012328) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 134 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.`b.b.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 American mink MODERN SPECIES 261 ENSNVIG00000002241 UBX2B (ENSNVIG00000002249) #15 CYP7A1 (ENSNVIG00000002275) #16 ENSNVIG00000002288 ENSNVIG00000002303 #17 NSMAF (ENSNVIG00000002488) #18 TOX (ENSNVIG00000003701) #19 CA8 (ENSNVIG00000003720) #20 RAB2A (ENSNVIG00000003752) #22 CHD7 (ENSNVIG00000003816) #23 Ferret MODERN SPECIES 435 CA8 (ENSMPUG00000002375) #20 RAB2A (ENSMPUG00000002345) #22 CHD7 (ENSMPUG00000002338) #23 ENSMPUG00000002337 CLVS1 (ENSMPUG00000002335) #24 ASPH (ENSMPUG00000002330) #25 Canidae ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.u.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 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ELAC1 (ENSCAFG00020021678) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b.j #22 Dog MODERN SPECIES 144 LANCL3 (ENSCAFG00845023634) XK (ENSCAFG00845023672) CYBB (ENSCAFG00845023727) DYNLT3 (ENSCAFG00845023973) SYTL5 (ENSCAFG00845024105) ENSCAFG00845024670 RPGR (ENSCAFG00845024867) OTC (ENSCAFG00845025700) ENSCAFG00845025837 TSPAN7 (ENSCAFG00845025872) MID1IP1 (ENSCAFG00845025983) BCOR (ENSCAFG00845026046) ENSCAFG00845026522 ATP6AP2 (ENSCAFG00845026626) ENSCAFG00845026922 ENSCAFG00845026994 #22 CXHXorf38 (ENSCAFG00845027009) MED14 (ENSCAFG00845027192) DDX3X (ENSCAFG00845024733) ENSCAFG00845025399 NYX (ENSCAFG00845025424) CASK (ENSCAFG00845025610) GPR82 (ENSCAFG00845026872) PPP1R2C (ENSCAFG00845026949) ENSCAFG00845027065 MAOA (ENSCAFG00845027245) MAOB (ENSCAFG00845027440) ENSCAFG00845027745 EFHC2 (ENSCAFG00845027895) ENSCAFG00845028141 FUNDC1 (ENSCAFG00845028259) Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 3 MOS (ENSVVUG00000017842) PLAG1 (ENSVVUG00000017846) #7 CHCHD7 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(ENSCDRG00005020252) #7 CHCHD7 (ENSCDRG00005020260) SDR16C5 (ENSCDRG00005020318) #9 ENSCDRG00005020328 #10 PENK (ENSCDRG00005020332) #11 ENSCDRG00005020337 #13 FAM110B (ENSCDRG00005020341) #14 UBXN2B (ENSCDRG00005020346) #15 CYP7A1 (ENSCDRG00005020352) #16 SDCBP (ENSCDRG00005020366) #17 NSMAF (ENSCDRG00005020419) #18 TOX (ENSCDRG00005020469) #19 CA8 (ENSCDRG00005020483) #20 RAB2A (ENSCDRG00005020500) #22 CHD7 (ENSCDRG00005020522) #23 CLVS1 (ENSCDRG00005020550) #24 ASPH (ENSCDRG00005020568) #25 NKAIN3 (ENSCDRG00005020651) GGH (ENSCDRG00005020657) TTPA (ENSCDRG00005020665) ENSCDRG00005020671 YTHDF3 (ENSCDRG00005020678) ENSCDRG00005020699 ENSCDRG00005020705 CYP7B1 (ENSCDRG00005020713) ##16 ENSCDRG00005020716 ARMC1 (ENSCDRG00005020720) MTFR1 (ENSCDRG00005020730) PDE7A (ENSCDRG00005020748) Alpaca MODERN SPECIES 2224 CA8 (ENSVPAG00000009097) #20 RAB2A (ENSVPAG00000009098) #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Pecora ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.o.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Yarkand deer MODERN SPECIES 13 PLAG1 (ENSCHYG00000024189) #7 CHCHD7 (ENSCHYG00000024223) ENSCHYG00000024371 #10 PENK (ENSCHYG00000024468) #11 BPNT2 (ENSCHYG00000024500) #13 ENSCHYG00000024535 ENSCHYG00000024542 FAM110B (ENSCHYG00000024557) #14 UBXN2B (ENSCHYG00000024580) #15 CYP7A1 (ENSCHYG00000024626) #16 SDCBP (ENSCHYG00000024674) #17 NSMAF (ENSCHYG00000024822) #18 TOX (ENSCHYG00000025044) #19 CA8 (ENSCHYG00000025104) #20 ENSCHYG00000025130 RAB2A (ENSCHYG00000025151) #22 CHD7 (ENSCHYG00000025292) #23 CLVS1 (ENSCHYG00000025501) #24 ASPH (ENSCHYG00000025689) #25 NKAIN3 (ENSCHYG00000026392) GGH (ENSCHYG00000026422) TTPA (ENSCHYG00000026444) ENSCHYG00000026461 ENSCHYG00000026479 ENSCHYG00000026491 ENSCHYG00000026500 CYP7B1 (ENSCHYG00000026509) ##16 ENSCHYG00000026517 ARMC1 (ENSCHYG00000026528) ENSCHYG00000026546 MTFR1 (ENSCHYG00000026556) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.o.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.o.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 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ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b.l ENSGT00950000183215.c.a.b.k ENSGT00940000157658.l Bos_a ANCESTRAL SPECIES 95 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00970000194954 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.o.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 Wild yak MODERN SPECIES 210 PLAG1 (ENSBMUG00000011659) #7 ENSBMUG00000011692 ENSBMUG00000011708 SDR16C5 (ENSBMUG00000011734) #9 ENSBMUG00000011743 #10 PENK (ENSBMUG00000011752) #11 BPNT2 (ENSBMUG00000011773) #13 ENSBMUG00000011795 ENSBMUG00000011815 #14 UBXN2B (ENSBMUG00000011833) #15 CYP7A1 (ENSBMUG00000011852) #16 ENSBMUG00000011917 #17 NSMAF (ENSBMUG00000012057) #18 TOX (ENSBMUG00000012126) #19 CA8 (ENSBMUG00000012155) #20 RAB2A (ENSBMUG00000012177) #22 ENSBMUG00000012195 ENSBMUG00000012219 #23 ENSBMUG00000012244 #23 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00970000194954 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.o.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 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ENSGT00960000187139 ENSGT00390000014547.c.k.a ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100.j ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 25 LYN (ENSOARG00020025503) RPS20 (ENSOARG00020025515) MOS (ENSOARG00020025525) PLAG1 (ENSOARG00020025527) #7 CHCHD7 (ENSOARG00020025533) SDR16C5 (ENSOARG00020025547) #9 ENSOARG00020025564 #10 PENK (ENSOARG00020025573) #11 BPNT2 (ENSOARG00020025578) #13 FAM110B (ENSOARG00020025582) #14 UBXN2B (ENSOARG00020025589) #15 CYP7A1 (ENSOARG00020025602) #16 SDCBP (ENSOARG00020025628) #17 TOX (ENSOARG00020025664) #19 CA8 (ENSOARG00020025684) #20 RAB2A (ENSOARG00020025690) #22 CHD7 (ENSOARG00020025706) #23 ENSOARG00020025727 #18 CLVS1 (ENSOARG00020025743) #24 ASPH (ENSOARG00020025751) #25 NKAIN3 (ENSOARG00020025781) ENSOARG00020025786 ENSOARG00020025790 ENSOARG00020025792 GGH (ENSOARG00020025795) TTPA (ENSOARG00020025797) 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Siberian musk deer MODERN SPECIES 181 PLAG1 (ENSMMSG00000018496) #7 CHCHD7 (ENSMMSG00000018418) SDR16C5 (ENSMMSG00000018350) #9 ENSMMSG00000018326 #10 PENK (ENSMMSG00000018295) #11 BPNT2 (ENSMMSG00000018264) #13 FAM110B (ENSMMSG00000018255) #14 UBXN2B (ENSMMSG00000018228) #15 CYP7A1 (ENSMMSG00000018193) #16 ENSMMSG00000018010 #17 NSMAF (ENSMMSG00000017867) #18 TOX (ENSMMSG00000017819) #19 ENSMMSG00000017777 CA8 (ENSMMSG00000017738) #20 ENSMMSG00000017715 RAB2A (ENSMMSG00000017612) #22 CHD7 (ENSMMSG00000017316) #23 CLVS1 (ENSMMSG00000017257) #24 ASPH (ENSMMSG00000016920) #25 NKAIN3 (ENSMMSG00000016854) ENSMMSG00000016830 GGH (ENSMMSG00000016780) TTPA (ENSMMSG00000016740) YTHDF3 (ENSMMSG00000016654) ENSMMSG00000016616 BHLHE22 (ENSMMSG00000016600) CYP7B1 (ENSMMSG00000016570) ##16 ARMC1 (ENSMMSG00000016484) ENSMMSG00000016368 PDE7A (ENSMMSG00000016241) Cetacea ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 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ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00970000193421.C.b.d.a.b ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.o.a #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153886.a.b.p #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000154706.gb ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 Dolphin MODERN SPECIES 3224 RAB2A (ENSTTRG00000009615) #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 19 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ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.q.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00970000193421.C.b.d.a.b ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.o.a #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153886.a.b.p #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000154706.gb ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162252.a.b.a ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 Narwhal MODERN SPECIES 300 MOS (ENSMMNG00015015102) PLAG1 (ENSMMNG00015015090) #7 CHCHD7 (ENSMMNG00015015047) SDR16C5 (ENSMMNG00015015011) #9 PENK (ENSMMNG00015014998) #11 BPNT2 (ENSMMNG00015014985) #13 ENSMMNG00015014975 FAM110B (ENSMMNG00015014967) #14 UBXN2B (ENSMMNG00015014945) #15 CYP7A1 (ENSMMNG00015014931) #16 ENSMMNG00015014889 #17 NSMAF (ENSMMNG00015014823) #18 TOX (ENSMMNG00015014789) #19 ENSMMNG00015014768 CA8 (ENSMMNG00015014739) #20 RAB2A 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(ENSPSNG00000002690) ENSPSNG00000002559 ENSPSNG00000002437 SERPINA11 (ENSPSNG00000002421) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000153887.A.y ENSGT00940000156927 ENSGT00940000164056 ENSGT00940000159071 ENSGT00940000156384 ENSGT00940000153577.B ENSGT00940000161060 ENSGT00940000155554 ENSGT00940000154598 ENSGT00390000015102.b ENSGT00390000009517.m ENSGT00620000087966.a ENSGT01030000234534.A.c.a ENSGT01030000234534.A.c.b ENSGT00700000106116 ENSGT00940000153886.a.b.o.b #22 ENSGT00390000006885.b.a ENSGT00390000006885.b.b ENSGT00540000070023.c.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00550000075082 ENSGT00440000039367 ENSGT00940000159056 ENSGT00940000156287 ENSGT00960000191322 ENSGT00940000160635 ENSGT00390000009405.a.b ENSGT00940000154392.a.c.b ENSGT00940000154392.a.c.a ENSGT00940000162217 ENSGT00940000160877 ENSGT00940000166310 Beluga whale MODERN SPECIES 24 EML1 (ENSDLEG00000000755) CYP46A1 (ENSDLEG00000000862) HHIPL1 (ENSDLEG00000000895) CCDC85C (ENSDLEG00000000927) CCNK (ENSDLEG00000000958) SETD3 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ENSGT00940000157658 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.q.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00970000193421.C.b.d.a.b ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.o.a #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153886.a.b.p #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000154706.gb ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00840000130804 ENSGT00950000183056.B.b #14 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TOX (ENSDLEG00000014593) #19 ENSDLEG00000014564 CA8 (ENSDLEG00000014524) #20 ENSDLEG00000014356 #22 CHD7 (ENSDLEG00000014252) #23 CLVS1 (ENSDLEG00000014225) #24 ASPH (ENSDLEG00000013927) #25 NKAIN3 (ENSDLEG00000013867) GGH (ENSDLEG00000013842) TTPA (ENSDLEG00000013829) YTHDF3 (ENSDLEG00000013813) ENSDLEG00000013804 ENSDLEG00000013798 ENSDLEG00000013782 ENSDLEG00000013768 BHLHE22 (ENSDLEG00000013759) ENSDLEG00000013748 CYP7B1 (ENSDLEG00000013719) ##16 ARMC1 (ENSDLEG00000013690) Suina ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00910000147681 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Chacoan peccary MODERN SPECIES 840 LYN (ENSCWAG00000008356) RPS20 (ENSCWAG00000008512) MOS (ENSCWAG00000008622) PLAG1 (ENSCWAG00000008649) #7 CHCHD7 (ENSCWAG00000008684) SDR16C5 (ENSCWAG00000008786) #9 PENK (ENSCWAG00000008910) #11 BPNT2 (ENSCWAG00000008943) #13 FAM110B (ENSCWAG00000008983) #14 UBXN2B (ENSCWAG00000009024) #15 CYP7A1 (ENSCWAG00000009085) #16 SDCBP (ENSCWAG00000009146) #17 NSMAF (ENSCWAG00000009476) #18 TOX (ENSCWAG00000009558) #19 CA8 (ENSCWAG00000009637) #20 RAB2A (ENSCWAG00000009724) #22 ENSCWAG00000009840 ENSCWAG00000009900 #23 ENSCWAG00000010023 #23 CLVS1 (ENSCWAG00000010069) #24 ASPH (ENSCWAG00000010208) #25 NKAIN3 (ENSCWAG00000011268) GGH (ENSCWAG00000011330) TTPA (ENSCWAG00000011411) YTHDF3 (ENSCWAG00000011547) ENSCWAG00000011664 BHLHE22 (ENSCWAG00000011698) CYP7B1 (ENSCWAG00000011713) ##16 ARMC1 (ENSCWAG00000011746) ENSCWAG00000011813 MTFR1 (ENSCWAG00000011862) Pig MODERN SPECIES 12 RPS20 (ENSSSCG00000040470) MOS (ENSSSCG00000006248) PLAG1 (ENSSSCG00000006247) #7 ENSSSCG00000032573 #8 SDR16C5 (ENSSSCG00000006245) #9 ENSSSCG00000036133 #10 PENK (ENSSSCG00000006243) #11 BPNT2 (ENSSSCG00000032846) #13 FAM110B (ENSSSCG00000006240) #14 UBXN2B (ENSSSCG00000006239) #15 CYP7A1 (ENSSSCG00000006238) #16 SDCBP (ENSSSCG00000006237) #17 NSMAF (ENSSSCG00000006236) #18 TOX (ENSSSCG00000006235) #19 CA8 (ENSSSCG00000006233) #20 RAB2A (ENSSSCG00000006232) #22 CHD7 (ENSSSCG00000006231) #23 CLVS1 (ENSSSCG00000006230) #24 ASPH (ENSSSCG00000025087) #25 NKAIN3 (ENSSSCG00000059747) GGH (ENSSSCG00000037637) TTPA (ENSSSCG00000058048) ENSSSCG00000050933 YTHDF3 (ENSSSCG00000033144) ENSSSCG00000063449 BHLHE22 (ENSSSCG00000059145) CYP7B1 (ENSSSCG00000022092) ##16 ARMC1 (ENSSSCG00000006220) MTFR1 (ENSSSCG00000006219) ENSSSCG00000035826 PDE7A (ENSSSCG00000006218) Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153886.a.b #22 Hedgehog MODERN SPECIES 781 RAB2A (ENSEEUG00000007700) #22 Common shrew MODERN SPECIES 402 RAB2A (ENSSARG00000013511) #22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 403 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 Sloth MODERN SPECIES 599 RAB2A (ENSCHOG00000013808) #22 Armadillo MODERN SPECIES 4739 ENSDNOG00000036184 ENSDNOG00000041445 FAM110B (ENSDNOG00000018453) #14 UBXN2B (ENSDNOG00000041883) #15 CYP7A1 (ENSDNOG00000004420) #16 SDCBP (ENSDNOG00000046259) #17 ENSDNOG00000010583 #18 TOX (ENSDNOG00000017905) #19 CA8 (ENSDNOG00000032080) #20 RAB2A (ENSDNOG00000004155) #22 CHD7 (ENSDNOG00000011674) #23 CLVS1 (ENSDNOG00000018070) #24 ASPH (ENSDNOG00000018072) #25 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Tenrec MODERN SPECIES 733 RAB2A (ENSETEG00000010340) #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Elephant MODERN SPECIES 567 UBE2V2 (ENSLAFG00000017749) MCM4 (ENSLAFG00000011550) ENSLAFG00000011517 ENSLAFG00000028477 OPRK1 (ENSLAFG00000027667) ATP6V1H (ENSLAFG00000005928) ENSLAFG00000005932 TCEA1 (ENSLAFG00000020829) ENSLAFG00000007156 SDCBP (ENSLAFG00000010757) #17 NSMAF (ENSLAFG00000014883) #18 TOX (ENSLAFG00000008007) #19 CA8 (ENSLAFG00000022921) #20 RAB2A (ENSLAFG00000015567) #22 CHD7 (ENSLAFG00000000403) #23 CLVS1 (ENSLAFG00000013282) #24 ASPH (ENSLAFG00000013283) #25 NKAIN3 (ENSLAFG00000017210) GGH (ENSLAFG00000011543) TTPA (ENSLAFG00000008681) YTHDF3 (ENSLAFG00000016052) ENSLAFG00000031948 CYP7B1 (ENSLAFG00000012756) ##16 ARMC1 (ENSLAFG00000007039) MTFR1 (ENSLAFG00000012850) PDE7A (ENSLAFG00000012855) DNAJC5B (ENSLAFG00000013696) TRIM55 (ENSLAFG00000001277) CRH (ENSLAFG00000000557) Hyrax MODERN SPECIES 544 RAB2A (ENSPCAG00000008515) #22 Marsupialia DUPLICATION Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000158723 ENSGT00940000153425.b.a.a ENSGT00940000163390 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000165216 ENSGT00940000160788 ENSGT00940000162313 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000159516 ENSGT00940000156974 ENSGT00940000158878 ENSGT00390000006758.b.b ENSGT00940000162359 ENSGT00390000007230.h ENSGT00940000160971 ENSGT00940000153886.a.b.c #22 ENSGT00390000005826.b.k ENSGT00940000161248 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000158723 ENSGT00940000153425.b.a.a ENSGT00940000163390 ENSGT00940000162539 ENSGT00940000165216 ENSGT00940000160788 ENSGT00940000162313 ENSGT00940000163347 ENSGT00940000159516 ENSGT00940000156974 ENSGT00940000158878 ENSGT00390000006758.b.b ENSGT00940000162359 ENSGT00390000007230.h ENSGT00940000160971 ENSGT00940000153886.a.b.c #22 ENSGT00390000005826.b.k ENSGT00940000161248 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 126 ENSGT00940000160971 ENSGT00940000153886.a.b.c #22 ENSGT00390000005826.b.k ENSGT00940000161248 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 122 ENSGT00940000160971 ENSGT00940000153886.a.b.c #22 ENSGT00390000005826.b.k ENSGT00940000161248 koala MODERN SPECIES 485 ENSPCIG00000006949 #22 Common wonbat MODERN SPECIES 1111 ENSVURG00010000351 SLITRK4 (ENSVURG00010000372) ENSVURG00010000390 #22 ENSVURG00010000486 ENSVURG00010000513 Tasmanian devil MODERN SPECIES 21 CD40LG (ENSSHAG00000021218) ARHGEF6 (ENSSHAG00000008171) ENSSHAG00000009439 ENSSHAG00000009891 ENSSHAG00000025401 ENSSHAG00000011122 ZIC3 (ENSSHAG00000029408) ENSSHAG00000031918 ENSSHAG00000023320 F9 (ENSSHAG00000008930) MCF2 (ENSSHAG00000009413) ATP11C (ENSSHAG00000010576) SOX3 (ENSSHAG00000007719) ENSSHAG00000011738 SLITRK4 (ENSSHAG00000028656) ENSSHAG00000031568 #22 ENSSHAG00000001348 SLITRK2 (ENSSHAG00000031278) ENSSHAG00000028924 ENSSHAG00000020828 ENSSHAG00000031221 ENSSHAG00000010068 FMR1 (ENSSHAG00000012940) ENSSHAG00000029814 AFF2 (ENSSHAG00000009556) ENSSHAG00000024523 ENSSHAG00000013671 ENSSHAG00000024398 ENSSHAG00000028992 ENSSHAG00000025667 ENSSHAG00000014983 Opossum MODERN SPECIES 627 ENSMODG00000014054 ENSMODG00000014039 ENSMODG00000014030 ENSMODG00000029210 ZIC3 (ENSMODG00000014029) ENSMODG00000014019 F9 (ENSMODG00000014012) MCF2 (ENSMODG00000014008) ATP11C (ENSMODG00000013991) ENSMODG00000025205 SOX3 (ENSMODG00000013932) ENSMODG00000025204 ENSMODG00000041855 SLITRK4 (ENSMODG00000013917) ENSMODG00000013912 ENSMODG00000013907 #22 ENSMODG00000013901 ENSMODG00000025197 SLITRK2 (ENSMODG00000013898) ENSMODG00000029108 ENSMODG00000043366 ENSMODG00000039381 POU3F4 (ENSMODG00000014279) ENSMODG00000014280 RPS6KA6 (ENSMODG00000014302) HDX (ENSMODG00000014307) ENSMODG00000014317 ENSMODG00000047117 ENSMODG00000014330 ENSMODG00000027748 ENSMODG00000014335 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.d #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00980000203407 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Opossum MODERN SPECIES 2 PLAG1 (ENSMODG00000043175) #7 ENSMODG00000024930 #8 SDR16C5 (ENSMODG00000009095) #9 ENSMODG00000009075 #10 PENK (ENSMODG00000049693) #11 ENSMODG00000038941 BPNT2 (ENSMODG00000008961) #13 FAM110B (ENSMODG00000008907) #14 UBXN2B (ENSMODG00000008866) #15 CYP7A1 (ENSMODG00000008855) #16 SDCBP (ENSMODG00000008819) #17 NSMAF (ENSMODG00000008797) #18 TOX (ENSMODG00000008712) #19 CA8 (ENSMODG00000008571) #20 ENSMODG00000040169 RAB2A (ENSMODG00000008556) #22 CHD7 (ENSMODG00000008488) #23 CLVS1 (ENSMODG00000008372) #24 ASPH (ENSMODG00000008351) #25 NKAIN3 (ENSMODG00000008298) ENSMODG00000040439 ENSMODG00000037349 GGH (ENSMODG00000008291) ENSMODG00000042561 TTPA (ENSMODG00000008268) YTHDF3 (ENSMODG00000008255) ENSMODG00000037783 ENSMODG00000008228 ENSMODG00000050164 ENSMODG00000008217 ##16 ARMC1 (ENSMODG00000008168) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.d #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00980000203407 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Tasmanian devil DUPLICATION Tasmanian devil MODERN SPECIES LAPTM4B (ENSSHAG00000002018) MATN2 (ENSSHAG00000004130) ENSSHAG00000023594 ENSSHAG00000001004 POP1 (ENSSHAG00000000296) NIPAL2 (ENSSHAG00000004100) KCNS2 (ENSSHAG00000029074) STK3 (ENSSHAG00000029839) OSR2 (ENSSHAG00000007793) VPS13B (ENSSHAG00000030906) ENSSHAG00000006581 RGS22 (ENSSHAG00000000912) FBXO43 (ENSSHAG00000026851) POLR2K (ENSSHAG00000022682) SPAG1 (ENSSHAG00000006506) ENSSHAG00000025709 #22 RNF19A (ENSSHAG00000007661) ANKRD46 (ENSSHAG00000023496) SNX31 (ENSSHAG00000010486) ENSSHAG00000025066 ENSSHAG00000012671 ENSSHAG00000014486 GRHL2 (ENSSHAG00000015849) NCALD (ENSSHAG00000028894) RRM2B (ENSSHAG00000017628) UBR5 (ENSSHAG00000017701) ENSSHAG00000029341 ENSSHAG00000028599 KLF10 (ENSSHAG00000018290) AZIN1 (ENSSHAG00000018535) ENSSHAG00000018681 Tasmanian devil MODERN SPECIES RPS20 (ENSSHAG00000031978) MOS (ENSSHAG00000030233) PLAG1 (ENSSHAG00000010371) #7 CHCHD7 (ENSSHAG00000010193) SDR16C5 (ENSSHAG00000009512) #9 ENSSHAG00000024007 #10 PENK (ENSSHAG00000022421) #11 BPNT2 (ENSSHAG00000030599) #13 FAM110B (ENSSHAG00000024247) #14 UBXN2B (ENSSHAG00000003004) #15 CYP7A1 (ENSSHAG00000013201) #16 SDCBP (ENSSHAG00000012826) #17 NSMAF (ENSSHAG00000012487) #18 TOX (ENSSHAG00000007522) #19 CA8 (ENSSHAG00000007782) #20 ENSSHAG00000021182 #22 ENSSHAG00000004796 CHD7 (ENSSHAG00000011522) #23 CLVS1 (ENSSHAG00000006016) #24 ASPH (ENSSHAG00000000974) #25 NKAIN3 (ENSSHAG00000031817) TTPA (ENSSHAG00000032102) GGH (ENSSHAG00000010843) YTHDF3 (ENSSHAG00000009482) ENSSHAG00000025212 ENSSHAG00000020524 ENSSHAG00000025575 ##16 ARMC1 (ENSSHAG00000015467) MTFR1 (ENSSHAG00000027884) PDE7A (ENSSHAG00000014928) DNAJC5B (ENSSHAG00000013754) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.d #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00980000203407 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Wallaby MODERN SPECIES 1359 ENSMEUG00000014459 #22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.a.a.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502.a #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b.d #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00980000203407 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1048 ENSVURG00010020326 #7 ENSVURG00010020342 ENSVURG00010020372 #9 ENSVURG00010020378 #10 ENSVURG00010020387 #11 ENSVURG00010020396 #13 ENSVURG00010020408 ENSVURG00010020425 #14 ENSVURG00010020433 #15 ENSVURG00010020451 #16 ENSVURG00010020487 #17 ENSVURG00010020495 #18 ENSVURG00010020540 #19 ENSVURG00010020551 ENSVURG00010020562 #20 ENSVURG00010020574 #22 ENSVURG00010020590 #23 ENSVURG00010020602 ENSVURG00010020610 #24 ENSVURG00010020622 #25 ENSVURG00010020638 ENSVURG00010020643 ENSVURG00010020644 ENSVURG00010020648 ENSVURG00010020650 ENSVURG00010020661 ENSVURG00010020665 ENSVURG00010020671 ENSVURG00010020676 ##16 ENSVURG00010020685 ENSVURG00010020690 Common wonbat MODERN SPECIES 1048 ENSVURG00010006519 ENSVURG00010006542 #9 ENSVURG00010006550 #10 ENSVURG00010006555 #11 ENSVURG00010006567 ENSVURG00010006577 #13 ENSVURG00010006594 ENSVURG00010006609 #14 ENSVURG00010006624 #15 ENSVURG00010006633 #16 ENSVURG00010006655 #17 ENSVURG00010006683 #18 ENSVURG00010006781 #19 ENSVURG00010006790 ENSVURG00010006797 #20 ENSVURG00010006806 #22 ENSVURG00010007085 #23 ENSVURG00010014124 ENSVURG00010014136 #24 ENSVURG00010014170 #25 ENSVURG00010014259 ENSVURG00010014266 ENSVURG00010014274 ENSVURG00010014281 ENSVURG00010014297 ENSVURG00010014323 ENSVURG00010014331 ENSVURG00010014354 ENSVURG00010014368 ##16 ENSVURG00010014407 ENSVURG00010014418 koala MODERN SPECIES 110 RPS20 (ENSPCIG00000011576) MOS (ENSPCIG00000011573) PLAG1 (ENSPCIG00000011571) #7 CHCHD7 (ENSPCIG00000011568) SDR16C5 (ENSPCIG00000011567) #9 PENK (ENSPCIG00000016638) #11 BPNT2 (ENSPCIG00000013018) #13 FAM110B (ENSPCIG00000013271) #14 UBXN2B (ENSPCIG00000005156) #15 CYP7A1 (ENSPCIG00000005169) #16 SDCBP (ENSPCIG00000000015) #17 NSMAF (ENSPCIG00000000016) #18 TOX (ENSPCIG00000032348) #19 ENSPCIG00000000020 CA8 (ENSPCIG00000000022) #20 ENSPCIG00000000024 #22 CHD7 (ENSPCIG00000000025) #23 Platypus MODERN SPECIES 18 LYN (ENSOANG00000005501) RPS20 (ENSOANG00000005502) MOS (ENSOANG00000038966) PLAG1 (ENSOANG00000005503) #7 CHCHD7 (ENSOANG00000005504) ENSOANG00000002450 #9 PENK (ENSOANG00000006273) #11 BPNT2 (ENSOANG00000005030) #13 FAM110B (ENSOANG00000030653) #14 UBXN2B (ENSOANG00000005031) #15 CYP7A1 (ENSOANG00000005032) #16 SDCBP (ENSOANG00000005034) #17 NSMAF (ENSOANG00000005036) #18 TOX (ENSOANG00000005038) #19 CA8 (ENSOANG00000005040) #20 RAB2A (ENSOANG00000041731) #22 CHD7 (ENSOANG00000005042) #23 CLVS1 (ENSOANG00000005044) #24 ASPH (ENSOANG00000005045) #25 NKAIN3 (ENSOANG00000005046) GGH (ENSOANG00000005049) TTPA (ENSOANG00000049899) YTHDF3 (ENSOANG00000005053) ENSOANG00000040949 ENSOANG00000005056 ##16 ARMC1 (ENSOANG00000039345) MTFR1 (ENSOANG00000002298) PDE7A (ENSOANG00000002300) DNAJC5B (ENSOANG00000002302) TRIM55 (ENSOANG00000002304) ENSOANG00000002306 Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT01030000234975 #8 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00960000189175 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000164689 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618 #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 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ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010318 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000158011 ENSGT00940000164689 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010318 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Elapidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000164689 ENSGT00390000003248.a.b ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010318 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Indian cobra MODERN SPECIES 2 LYN (ENSNNAG00000017409) ENSNNAG00000017424 ENSNNAG00000017465 MOS (ENSNNAG00000017474) PLAG1 (ENSNNAG00000017478) #7 ENSNNAG00000017484 #8 SDR16C5 (ENSNNAG00000017488) #9 PENK (ENSNNAG00000017493) #11 FAM110B (ENSNNAG00000017499) #14 UBXN2B (ENSNNAG00000017502) #15 CYP7A1 (ENSNNAG00000017519) #16 SDCBP (ENSNNAG00000017533) #17 NSMAF (ENSNNAG00000017542) #18 TOX (ENSNNAG00000017578) #19 CA8 (ENSNNAG00000007568) #20 RAB2A (ENSNNAG00000007582) #22 CHD7 (ENSNNAG00000007604) #23 ENSNNAG00000007742 #24 ENSNNAG00000007889 #24 ASPH (ENSNNAG00000007906) #25 ENSNNAG00000007957 #25 NKAIN3 (ENSNNAG00000008091) GGH (ENSNNAG00000008118) TTPA (ENSNNAG00000008150) RNF4 (ENSNNAG00000008176) ENSNNAG00000008197 YTHDF3 (ENSNNAG00000008225) ENSNNAG00000008280 CYP7B1 (ENSNNAG00000008296) ##16 ARMC1 (ENSNNAG00000008328) MTFR1 (ENSNNAG00000008363) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.b ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A.fb.a #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010318 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00390000018056 ENSGT00940000158011 ENSGT00390000003248.a.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A.fb.a #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010318 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000153244.B.ic.a ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 Eastern brown snake MODERN SPECIES 30 TGS1 (ENSPTXG00000004058) LYN (ENSPTXG00000004055) ENSPTXG00000004051 MOS (ENSPTXG00000004049) PLAG1 (ENSPTXG00000004047) #7 CHCHD7 (ENSPTXG00000004045) SDR16C5 (ENSPTXG00000004044) #9 PENK (ENSPTXG00000004042) #11 FAM110B (ENSPTXG00000004040) #14 UBXN2B (ENSPTXG00000004003) #15 CYP7A1 (ENSPTXG00000004000) #16 SDCBP (ENSPTXG00000003998) #17 NSMAF (ENSPTXG00000003992) #18 TOX (ENSPTXG00000003989) #19 CA8 (ENSPTXG00000003987) #20 RAB2A (ENSPTXG00000003983) #22 CHD7 (ENSPTXG00000003979) #23 ENSPTXG00000003977 #24 ENSPTXG00000003976 #24 ASPH (ENSPTXG00000003967) #25 NKAIN3 (ENSPTXG00000003963) GGH (ENSPTXG00000003961) TTPA (ENSPTXG00000003959) RNF4 (ENSPTXG00000003958) YTHDF3 (ENSPTXG00000003956) ENSPTXG00000003954 ENSPTXG00000003951 CYP7B1 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sea krait MODERN SPECIES 8759 RAB2A (ENSLLTG00000010433) #22 Lizard MODERN SPECIES 3 PKIA (ENSACAG00000013361) ENSACAG00000037966 PEX2 (ENSACAG00000013356) ZFHX4 (ENSACAG00000027516) ENSACAG00000043626 ENSACAG00000038282 FAM110B (ENSACAG00000005308) #14 UBXN2B (ENSACAG00000005315) #15 CYP7A1 (ENSACAG00000005350) #16 SDCBP (ENSACAG00000005405) #17 NSMAF (ENSACAG00000005468) #18 TOX (ENSACAG00000005632) #19 ENSACAG00000044708 ENSACAG00000044324 CA8 (ENSACAG00000005662) #20 RAB2A (ENSACAG00000038869) #22 CHD7 (ENSACAG00000005760) #23 ENSACAG00000040436 CLVS1 (ENSACAG00000006013) #24 ENSACAG00000040821 #25 ENSACAG00000006036 #25 NKAIN3 (ENSACAG00000039811) ENSACAG00000041738 ENSACAG00000041754 GGH (ENSACAG00000016891) TTPA (ENSACAG00000043920) ENSACAG00000016861 YTHDF3 (ENSACAG00000016837) ENSACAG00000043749 CYP7B1 (ENSACAG00000016805) ##16 ENSACAG00000041295 Laterata ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000003248.b ENSGT00390000003248.a.a ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 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(ENSPMRG00000007670) #19 ENSPMRG00000007663 ENSPMRG00000007660 CA8 (ENSPMRG00000007658) #20 RAB2A (ENSPMRG00000007640) #22 CHD7 (ENSPMRG00000007599) #23 ENSPMRG00000007584 ENSPMRG00000007575 #24 ENSPMRG00000007552 #25 ENSPMRG00000007540 ENSPMRG00000007535 NKAIN3 (ENSPMRG00000007529) GGH (ENSPMRG00000007511) ENSPMRG00000007494 TTPA (ENSPMRG00000007485) RNF4 (ENSPMRG00000007477) YTHDF3 (ENSPMRG00000007468) ENSPMRG00000007455 ENSPMRG00000007444 BHLHE22 (ENSPMRG00000007435) Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 29 ENSSMRG00000017201 #9 ENSSMRG00000017200 ENSSMRG00000017199 #9 ENSSMRG00000017197 #10 ENSSMRG00000017183 #9 ENSSMRG00000017180 ENSSMRG00000017176 #10 PENK (ENSSMRG00000017175) #11 FAM110B (ENSSMRG00000017165) #14 UBXN2B (ENSSMRG00000017158) #15 CYP7A1 (ENSSMRG00000017051) #16 SDCBP (ENSSMRG00000017046) #17 NSMAF (ENSSMRG00000017040) #18 TOX (ENSSMRG00000017038) #19 CA8 (ENSSMRG00000017022) #20 RAB2A (ENSSMRG00000017016) #22 CHD7 (ENSSMRG00000011869) #23 CLVS1 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ENSGT00940000159203 ENSGT00960000189659 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Aves ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000163618.c #10 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00940000163618.d #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A.ib #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00960000189659 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a African ostrich MODERN SPECIES 551 RPS20 (ENSSCUG00000007402) MOS (ENSSCUG00000007400) PLAG1 (ENSSCUG00000007397) #7 ENSSCUG00000007395 #8 SDR16C5 (ENSSCUG00000007392) #9 ENSSCUG00000007384 #10 PENK (ENSSCUG00000007375) #11 BPNT2 (ENSSCUG00000007372) #13 FAM110B (ENSSCUG00000007363) #14 UBXN2B (ENSSCUG00000007360) #15 CYP7A1 (ENSSCUG00000007358) #16 SDCBP (ENSSCUG00000007355) #17 NSMAF (ENSSCUG00000007349) #18 TOX (ENSSCUG00000007338) #19 CA8 (ENSSCUG00000007332) #20 RAB2A (ENSSCUG00000007329) #22 CHD7 (ENSSCUG00000007161) #23 CLVS1 (ENSSCUG00000007122) #24 ASPH (ENSSCUG00000007117) #25 ENSSCUG00000007111 #25 NKAIN3 (ENSSCUG00000007108) GGH (ENSSCUG00000007104) TTPA (ENSSCUG00000007102) ENSSCUG00000007100 YTHDF3 (ENSSCUG00000007099) CYP7B1 (ENSSCUG00000007089) ##16 ARMC1 (ENSSCUG00000007084) MTFR1 (ENSSCUG00000007082) PDE7A (ENSSCUG00000007075) Neognathae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000163618.c #10 ENSGT00940000156731 #9 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ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Great tit MODERN SPECIES 11 RPS20 (ENSPMJG00000015709) ENSPMJG00000015711 PLAG1 (ENSPMJG00000015712) #7 CHCHD7 (ENSPMJG00000015713) ENSPMJG00000015715 #10 SDR16C5 (ENSPMJG00000015716) #9 PENK (ENSPMJG00000015717) #11 BPNT2 (ENSPMJG00000015718) #13 FAM110B (ENSPMJG00000015721) #14 UBXN2B (ENSPMJG00000015723) #15 CYP7A1 (ENSPMJG00000015724) #16 SDCBP (ENSPMJG00000015725) #17 NSMAF (ENSPMJG00000015726) #18 TOX (ENSPMJG00000015727) #19 CA8 (ENSPMJG00000015731) #20 RAB2A (ENSPMJG00000015734) #22 CHD7 (ENSPMJG00000015736) #23 CLVS1 (ENSPMJG00000015741) #24 ENSPMJG00000015742 #25 ENSPMJG00000015743 #25 NKAIN3 (ENSPMJG00000015744) GGH (ENSPMJG00000015745) TTPA (ENSPMJG00000015746) YTHDF3 (ENSPMJG00000015747) BHLHE22 (ENSPMJG00000015752) CYP7B1 (ENSPMJG00000015753) ##16 ARMC1 (ENSPMJG00000000151) MTFR1 (ENSPMJG00000000165) PDE7A (ENSPMJG00000000190) DNAJC5B 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(ENSFALG00000010304) #9 PENK (ENSFALG00000010315) #11 BPNT2 (ENSFALG00000010322) #13 FAM110B (ENSFALG00000014836) #14 UBXN2B (ENSFALG00000027862) #15 CYP7A1 (ENSFALG00000010340) #16 SDCBP (ENSFALG00000010344) #17 NSMAF (ENSFALG00000010345) #18 TOX (ENSFALG00000010350) #19 CA8 (ENSFALG00000005638) #20 RAB2A (ENSFALG00000025952) #22 CHD7 (ENSFALG00000005570) #23 ENSFALG00000024079 CLVS1 (ENSFALG00000005552) #24 ASPH (ENSFALG00000005547) #25 NKAIN3 (ENSFALG00000005542) GGH (ENSFALG00000028797) TTPA (ENSFALG00000027010) YTHDF3 (ENSFALG00000005503) ENSFALG00000023358 CYP7B1 (ENSFALG00000005492) ##16 ARMC1 (ENSFALG00000025115) MTFR1 (ENSFALG00000005475) PDE7A (ENSFALG00000005464) DNAJC5B (ENSFALG00000005461) TRIM55 (ENSFALG00000005453) Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000163618.c #10 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A.ib #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00960000189659 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Medium ground finch MODERN SPECIES 49 CA8 (ENSGFOG00000013985) #20 RAB2A (ENSGFOG00000013982) #22 CHD7 (ENSGFOG00000013971) #23 CLVS1 (ENSGFOG00000013966) #24 ASPH (ENSGFOG00000013962) #25 NKAIN3 (ENSGFOG00000013960) GGH (ENSGFOG00000013957) TTPA (ENSGFOG00000013956) YTHDF3 (ENSGFOG00000013955) CYP7B1 (ENSGFOG00000013952) ##16 ARMC1 (ENSGFOG00000013951) MTFR1 (ENSGFOG00000013948) PDE7A (ENSGFOG00000013945) DNAJC5B (ENSGFOG00000013943) TRIM55 (ENSGFOG00000013938) ADHFE1 (ENSGFOG00000013932) ENSGFOG00000013928 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000163618.c #10 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A.ib #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00960000189659 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Common canary MODERN SPECIES LYN (ENSSCAG00000012839) MOS (ENSSCAG00000012851) PLAG1 (ENSSCAG00000012852) #7 ENSSCAG00000012861 #8 ENSSCAG00000012866 #10 SDR16C5 (ENSSCAG00000012869) #9 PENK (ENSSCAG00000012873) #11 BPNT2 (ENSSCAG00000012880) #13 FAM110B (ENSSCAG00000012889) #14 UBXN2B (ENSSCAG00000012891) #15 CYP7A1 (ENSSCAG00000012896) #16 SDCBP (ENSSCAG00000012899) #17 NSMAF (ENSSCAG00000012905) #18 TOX (ENSSCAG00000012920) #19 CA8 (ENSSCAG00000012935) #20 RAB2A (ENSSCAG00000012948) #22 CHD7 (ENSSCAG00000013076) #23 CLVS1 (ENSSCAG00000013722) #24 ASPH (ENSSCAG00000013744) #25 ENSSCAG00000013771 COPS5 (ENSSCAG00000013773) PPP1R42 (ENSSCAG00000013777) TCF24 (ENSSCAG00000013783) MCMDC2 (ENSSCAG00000013792) SGK3 (ENSSCAG00000013797) VCPIP1 (ENSSCAG00000013805) MYBL1 (ENSSCAG00000013810) VXN (ENSSCAG00000013825) ADHFE1 (ENSSCAG00000013830) CRH (ENSSCAG00000013837) TRIM55 (ENSSCAG00000013840) Zebra finch MODERN SPECIES 12 RPS20 (ENSTGUG00000011097) MOS (ENSTGUG00000024252) PLAG1 (ENSTGUG00000025027) #7 ENSTGUG00000028637 ENSTGUG00000011102 #10 SDR16C5 (ENSTGUG00000011110) #9 PENK (ENSTGUG00000011112) #11 BPNT2 (ENSTGUG00000025960) #13 FAM110B (ENSTGUG00000011117) #14 UBXN2B (ENSTGUG00000011120) #15 CYP7A1 (ENSTGUG00000011128) #16 SDCBP (ENSTGUG00000025408) #17 NSMAF (ENSTGUG00000011150) #18 TOX (ENSTGUG00000011174) #19 CA8 (ENSTGUG00000011176) #20 RAB2A (ENSTGUG00000011182) #22 CHD7 (ENSTGUG00000011196) #23 ENSTGUG00000021817 CLVS1 (ENSTGUG00000011217) #24 ASPH (ENSTGUG00000011226) #25 NKAIN3 (ENSTGUG00000011233) GGH (ENSTGUG00000011234) TTPA (ENSTGUG00000011241) YTHDF3 (ENSTGUG00000011243) BHLHE22 (ENSTGUG00000029320) CYP7B1 (ENSTGUG00000011247) ##16 ARMC1 (ENSTGUG00000011252) MTFR1 (ENSTGUG00000011257) PDE7A (ENSTGUG00000011264) DNAJC5B (ENSTGUG00000027657) TRIM55 (ENSTGUG00000011269) Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000163618.c #10 ENSGT00940000163618.d #10 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A.ib #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Kakapo MODERN SPECIES RPS20 (ENSSHBG00005003914) MOS (ENSSHBG00005003910) PLAG1 (ENSSHBG00005003901) #7 CHCHD7 (ENSSHBG00005003893) ENSSHBG00005003884 #10 ENSSHBG00005003878 #10 PENK (ENSSHBG00005003870) #11 BPNT2 (ENSSHBG00005003862) #13 FAM110B (ENSSHBG00005003853) #14 UBXN2B (ENSSHBG00005003839) #15 CYP7A1 (ENSSHBG00005003831) #16 SDCBP (ENSSHBG00005003824) #17 NSMAF (ENSSHBG00005003752) #18 TOX (ENSSHBG00005003713) #19 CA8 (ENSSHBG00005003708) #20 RAB2A (ENSSHBG00005003701) #22 CHD7 (ENSSHBG00005002196) #23 CLVS1 (ENSSHBG00005001627) #24 ENSSHBG00005001612 #25 ENSSHBG00005001581 #25 NKAIN3 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ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Japanese quail MODERN SPECIES 11 RPS20 (ENSCJPG00005010404) MOS (ENSCJPG00005010406) PLAG1 (ENSCJPG00005010407) #7 CHCHD7 (ENSCJPG00005010408) ENSCJPG00005010409 #9 ENSCJPG00005010410 #9 PENK (ENSCJPG00005010411) #11 BPNT2 (ENSCJPG00005010415) #13 FAM110B (ENSCJPG00005010421) #14 UBXN2B (ENSCJPG00005010423) #15 CYP7A1 (ENSCJPG00005010424) #16 SDCBP (ENSCJPG00005010425) #17 NSMAF (ENSCJPG00005010426) #18 TOX (ENSCJPG00005010427) #19 CA8 (ENSCJPG00005010429) #20 RAB2A (ENSCJPG00005010430) #22 CHD7 (ENSCJPG00005010431) #23 CLVS1 (ENSCJPG00005011531) #24 ASPH (ENSCJPG00005011534) #25 NKAIN3 (ENSCJPG00005011554) GGH (ENSCJPG00005011561) TTPA (ENSCJPG00005011581) YTHDF3 (ENSCJPG00005011583) BHLHE22 (ENSCJPG00005011601) CYP7B1 (ENSCJPG00005011602) ##16 ARMC1 (ENSCJPG00005011615) MTFR1 (ENSCJPG00005011616) PDE7A (ENSCJPG00005011623) DNAJC5B (ENSCJPG00005011625) TRIM55 (ENSCJPG00005011647) CRH (ENSCJPG00005011650) Phasianidae_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000164689 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A.ib #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484.b ENSGT00490000043388.b.a ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00860000135574 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a ENSGT00940000154473.a Chicken MODERN SPECIES 11 RPS20 (ENSGALG00010004081) MOS (ENSGALG00010005635) PLAG1 (ENSGALG00010004042) #7 CHCHD7 (ENSGALG00010003980) SDR16C5 (ENSGALG00010003994) #9 ERD2L (ENSGALG00010004005) #9 PENK (ENSGALG00010003972) #11 BPNT2 (ENSGALG00010003454) #13 FAM110B (ENSGALG00010003472) #14 UBXN2B (ENSGALG00010003511) #15 CYP7A1 (ENSGALG00010003518) #16 SDCBP (ENSGALG00010002916) #17 NSMAF (ENSGALG00010002983) #18 TOX (ENSGALG00010003042) #19 CA8 (ENSGALG00010002685) #20 RAB2A (ENSGALG00010002760) #22 CHD7 (ENSGALG00010002626) #23 CLVS1 (ENSGALG00010003877) #24 ASPH (ENSGALG00010003960) #25 NKAIN3 (ENSGALG00010004006) GGH (ENSGALG00010003063) TTPA (ENSGALG00010003074) YTHDF3 (ENSGALG00010003103) ENSGALG00010004014 CYP7B1 (ENSGALG00010003006) ##16 ARMC1 (ENSGALG00010003121) MTFR1 (ENSGALG00010003154) PDE7A (ENSGALG00010004047) DNAJC5B (ENSGALG00010004050) ENSGALG00010004579 TRIM55 (ENSGALG00010004122) Turkey MODERN SPECIES 22 RPS20 (ENSMGAG00000010999) MOS (ENSMGAG00000011001) PLAG1 (ENSMGAG00000011002) #7 CHCHD7 (ENSMGAG00000021415) ENSMGAG00000011012 #9 ENSMGAG00000018048 #9 PENK 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Chinese turtle MODERN SPECIES 333 UBXN2B (ENSPSIG00000006447) #15 CYP7A1 (ENSPSIG00000007385) #16 SDCBP (ENSPSIG00000008514) #17 NSMAF (ENSPSIG00000010760) #18 TOX (ENSPSIG00000011141) #19 CA8 (ENSPSIG00000011174) #20 RAB2A (ENSPSIG00000011994) #22 CHD7 (ENSPSIG00000012003) #23 CLVS1 (ENSPSIG00000014737) #24 ENSPSIG00000015090 #25 ENSPSIG00000015476 #25 NKAIN3 (ENSPSIG00000015661) ENSPSIG00000001808 GGH (ENSPSIG00000015668) TTPA (ENSPSIG00000015730) ENSPSIG00000015849 YTHDF3 (ENSPSIG00000015861) CYP7B1 (ENSPSIG00000016025) ##16 ENSPSIG00000001810 Anura ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00990000212811 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00520000055567.a.a.b #15 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 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rab2a (ENSECRG00000005260) #22 CHD7 (ENSECRG00000005307) #23 CLVS1 (ENSECRG00000005336) #24 ASPH (ENSECRG00000005384) #25 NKAIN3 (ENSECRG00000005438) ggh (ENSECRG00000005459) ttpa (ENSECRG00000005486) ythdf3 (ENSECRG00000005514) bhlhe22 (ENSECRG00000005539) armc1 (ENSECRG00000005544) mtfr1 (ENSECRG00000005554) pde7a (ENSECRG00000005574) DNAJC5B (ENSECRG00000005591) trim55b (ENSECRG00000005601) crhb (ENSECRG00000005610) rrs1 (ENSECRG00000005614) Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 40 ENSGT00940000158011 ENSGT00940000164689 ENSGT00390000003248.b ENSGT00940000160233 ENSGT00940000159246 #7 ENSGT00390000001029 ENSGT00940000156731 #9 ENSGT00950000183149.A #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000154502 #17 ENSGT00940000155059 #18 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000159947 #24 ENSGT00940000156304 #25 ENSGT00940000161484 ENSGT00490000043388.b.b ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158777 ENSGT00940000162962 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100 ENSGT00950000183215.c.a.b ENSGT00940000157658 ENSGT00940000154473.a ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a Spotted gar MODERN SPECIES 675 zgc:56231 (ENSLOCG00000005434) RPS20 (ENSLOCG00000005417) mos (ENSLOCG00000017815) plag1 (ENSLOCG00000005402) #7 chchd7 (ENSLOCG00000005393) sdr16c5b (ENSLOCG00000005373) #9 penka (ENSLOCG00000005341) #11 BPNT2 (ENSLOCG00000005325) #13 cyp7a1 (ENSLOCG00000005305) #16 cyp7a1 (ENSLOCG00000005289) #16 ENSLOCG00000005259 #16 SDCBP (ENSLOCG00000005245) #17 NSMAF (ENSLOCG00000005188) #18 tox (ENSLOCG00000005171) #19 ca8 (ENSLOCG00000005132) #20 rab2a (ENSLOCG00000005108) #22 CHD7 (ENSLOCG00000005062) #23 CLVS1 (ENSLOCG00000005043) #24 ASPH (ENSLOCG00000005026) #25 ENSLOCG00000005010 #25 NKAIN3 (ENSLOCG00000004986) ggh (ENSLOCG00000004962) ttpa (ENSLOCG00000004948) ythdf3 (ENSLOCG00000004932) bhlhe22 (ENSLOCG00000017814) CYP7B1 (ENSLOCG00000004895) ##16 armc1 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ENSGT00940000158863.n #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT01010000223470 ENSGT00940000159203 ENSGT00940000153141.B.b ##16 ENSGT00390000014100.l ENSGT00940000157658 ENSGT00940000159294 ENSGT00940000154004.a.e.b ENSGT00940000154473.a.g ENSGT00390000005213 ENSGT00940000157709 ENSGT00390000002854 ENSGT00940000153776.a.a.m ENSGT00940000162447.b.b ENSGT00390000015084.c.a ENSGT00940000157108 Asian bonytongue DUPLICATION Asian bonytongue MODERN SPECIES 22 CHMP5 (ENSSFOG00015032141) atp6v1h (ENSSFOG00015001452) ENSSFOG00015033140 ENSSFOG00015024407 xkr4 (ENSSFOG00015001371) TMEM68 (ENSSFOG00015001324) TGS1 (ENSSFOG00015001308) lyn (ENSSFOG00015014741) sdr16c5a (ENSSFOG00015001258) #9 penka (ENSSFOG00015001210) #11 bpnt2 (ENSSFOG00015032506) fam110b (ENSSFOG00015001157) #14 cyp7a1 (ENSSFOG00015000973) #16 tox (ENSSFOG00015032106) #19 ENSSFOG00015000896 #20 ENSSFOG00015031159 #22 ENSSFOG00015000834 ttpa (ENSSFOG00015000822) CYP7B1 (ENSSFOG00015000809) ##16 ARMC1 (ENSSFOG00015000765) PDE7A 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#22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 353 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 ENSGT00940000164519.c.a ENSGT00940000155899.e.b Acanthomorphata ANCESTRAL SPECIES 250 ENSGT00940000156200.A ENSGT01030000238371 ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161826.B ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01040000241001 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 ENSGT00940000164519.c.a ENSGT00940000155899.e.b ENSGT00950000183149.A.f #11 Euacanthomorphacea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000014771.a ENSGT00940000156700.d ENSGT00940000156473.f.b ENSGT00940000157657.c ENSGT00940000164061.c.a ENSGT00670000098080 ENSGT00920000149161 ENSGT00940000158543 ENSGT00390000003140.A ENSGT00940000165818 ENSGT00940000156200.A ENSGT01030000238371 ENSGT00940000154882 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01040000241001 ENSGT01010000223470 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 ENSGT00940000164519.c.a ENSGT00940000155899.e.b ENSGT00950000183149.A.f #11 ENSGT01040000240400.c.a.b.a.a.d ENSGT00390000018710 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000158610.d ENSGT00940000157718.c ENSGT00940000157704.a.a ENSGT00390000012596.e Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 8 RNF152 (ENSMMDG00005022935) ENSMMDG00005022937 buc (ENSMMDG00005022941) ENSMMDG00005022948 xkr4 (ENSMMDG00005022957) tmem68 (ENSMMDG00005022958) ENSMMDG00005022959 CNTNAP2 (ENSMMDG00005022967) si:dkey-94e7.2 (ENSMMDG00005022987) ENSMMDG00005022990 GPR141 (ENSMMDG00005022992) mcm6l (ENSMMDG00005023013) exoc3 (ENSMMDG00005023286) ENSMMDG00005023290 ca8 (ENSMMDG00005023292) #20 rab2a (ENSMMDG00005010671) #22 CHD7 (ENSMMDG00005010740) #23 ENSMMDG00005011755 ttpa (ENSMMDG00005011761) xpr1b (ENSMMDG00005011829) ENSMMDG00005011833 tyw3 (ENSMMDG00005011835) 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ENSHCOG00000014126 xrn1 (ENSHCOG00000014062) ENSHCOG00000013992 cop1 (ENSHCOG00000013977) ENSHCOG00000013891 ASTN1 (ENSHCOG00000013368) brinp2 (ENSHCOG00000013326) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00940000159432.C ENSGT00990000203911 ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT00390000005318.a.a.b ENSGT00940000156470.u.b Percomorphaceae_C ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00990000203911 ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT00390000005318.a.a.b ENSGT00940000156470.u.b Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00990000203911 ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT00390000005318.a.a.b ENSGT00940000156470.u.b Tetraodontidae ANCESTRAL SPECIES 58 ENSGT00940000154673.a.d.b ENSGT00390000001801 ENSGT00940000154654.a.a ENSGT00940000154499 ENSGT00940000164640 ENSGT00390000012596.e ENSGT00940000157704.a.a ENSGT00940000157718.c ENSGT00940000158610.d ENSGT00940000153304.C ENSGT00940000156181.B ENSGT00940000156304.c.b #25 ENSGT00940000159203 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166060 ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000155161 ENSGT00940000165818 ENSGT00390000003140.A ENSGT00940000158543 ENSGT00920000149161 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000049326.b.a ENSGT00940000157139.b ENSGT00940000158362 Fugu MODERN SPECIES 14 cdh6 (ENSTRUG00000011839) zgc:56556 (ENSTRUG00000012371) ARPC5 (ENSTRUG00000012488) rnf2 (ENSTRUG00000012510) ENSTRUG00000012634 AGL (ENSTRUG00000012741) ENSTRUG00000030605 ENSTRUG00000006446 ENSTRUG00000006277 ENSTRUG00000006024 tyw3 (ENSTRUG00000023563) ENSTRUG00000028321 ENSTRUG00000025918 #25 ttpa (ENSTRUG00000033036) ca8 (ENSTRUG00000004093) #20 rab2a (ENSTRUG00000030139) #22 CHD7 (ENSTRUG00000008632) #23 trnau1apb (ENSTRUG00000008608) fitm1l (ENSTRUG00000008592) ENSTRUG00000027440 ENSTRUG00000024658 ENSTRUG00000022223 ENSTRUG00000007758 lhx8a (ENSTRUG00000007669) klhl20 (ENSTRUG00000007338) brinp2 (ENSTRUG00000007120) ASTN1 (ENSTRUG00000006204) PAPPA2 (ENSTRUG00000005674) cop1 (ENSTRUG00000005262) xrn1 (ENSTRUG00000004895) toe1 (ENSTRUG00000030325) Tetraodon MODERN SPECIES 26 jph1b (ENSTNIG00000003444) blvra (ENSTNIG00000003445) paxip1 (ENSTNIG00000003446) ssr2 (ENSTNIG00000003448) mhc1zka (ENSTNIG00000003449) ENSTNIG00000003450 PCMTD2 (ENSTNIG00000003451) ENSTNIG00000003461 ENSTNIG00000001346 orc4 (ENSTNIG00000003466) ENSTNIG00000003467 FGD1 (ENSTNIG00000003468) tbrg1 (ENSTNIG00000003469) ENSTNIG00000003470 ENSTNIG00000003471 rab2a (ENSTNIG00000003472) #22 ppp2r1bb (ENSTNIG00000003473) med29 (ENSTNIG00000003474) mlf1 (ENSTNIG00000003475) pex10 (ENSTNIG00000003476) plch2a (ENSTNIG00000003477) tpi1b (ENSTNIG00000003478) ENSTNIG00000003479 ENSTNIG00000003480 RAB26 (ENSTNIG00000003481) laptm4b (ENSTNIG00000003482) rpl30 (ENSTNIG00000000674) ENSTNIG00000003483 ENSTNIG00000005199 nr1h5 (ENSTNIG00000003487) ENSTNIG00000003488 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00990000203911 ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B 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ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00990000203911 ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT00390000005318.a.a.b ENSGT00940000156470.u.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 13 ENSSAUG00010022726 ENSSAUG00010022723 xpr1b (ENSSAUG00010022719) ENSSAUG00010022715 ENSSAUG00010022713 ENSSAUG00010022456 ENSSAUG00010022450 dnai4 (ENSSAUG00010022448) ENSSAUG00010022444 fam151a (ENSSAUG00010022443) ENSSAUG00010022442 ACOT11 (ENSSAUG00010022426) mrpl37 (ENSSAUG00010022412) ENSSAUG00010022409 ca8 (ENSSAUG00010022407) #20 rab2a (ENSSAUG00010022405) #22 CHD7 (ENSSAUG00010022060) #23 Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00990000203911 ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT00390000005318.a.a.b ENSGT00940000156470.u.b European seabass MODERN SPECIES ENSDLAG00005005622 ENSDLAG00005005631 myh7 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(ENSLCRG00005002576) ENSLCRG00005002583 tox (ENSLCRG00005002586) #19 ca8 (ENSLCRG00005002590) #20 rab2a (ENSLCRG00005002596) #22 CHD7 (ENSLCRG00005002852) #23 ptbp2b (ENSLCRG00005008471) dpydb (ENSLCRG00005013062) odr4 (ENSLCRG00005013208) TPR (ENSLCRG00005013257) OLFML2B (ENSLCRG00005014488) ENSLCRG00005014491 kifap3b (ENSLCRG00005014508) PDC (ENSLCRG00005016278) rab36 (ENSLCRG00005016286) DEPDC5 (ENSLCRG00005016299) mfsd12a (ENSLCRG00005016365) csnk1g2a (ENSLCRG00005016436) mrpl37 (ENSLCRG00005017194) ACOT11 (ENSLCRG00005017196) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000165818 ENSGT00940000155161 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h 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ENSGT00390000005318.a.a.b ENSGT00940000156470.u.b Channel bull blenny MODERN SPECIES 8 RPL5 (ENSCGOG00000015380) dipk1aa (ENSCGOG00000015415) mtf2 (ENSCGOG00000015417) ccdc18 (ENSCGOG00000015421) scinlb (ENSCGOG00000015469) wls (ENSCGOG00000017242) GNG12 (ENSCGOG00000017441) gadd45aa (ENSCGOG00000017446) CASK (ENSCGOG00000017478) ankrd45 (ENSCGOG00000017913) bpnt2 (ENSCGOG00000017915) DARS2 (ENSCGOG00000017945) cryz (ENSCGOG00000018381) tox (ENSCGOG00000018389) #19 ca8 (ENSCGOG00000018396) #20 rab2a (ENSCGOG00000018412) #22 CHD7 (ENSCGOG00000018452) #23 ptbp2b (ENSCGOG00000018732) dpydb (ENSCGOG00000019732) TPR (ENSCGOG00000019998) prg4a (ENSCGOG00000020036) dusp12 (ENSCGOG00000020041) ENSCGOG00000020047 ENSCGOG00000020050 ENSCGOG00000020051 mrpl37 (ENSCGOG00000020054) ACOT11 (ENSCGOG00000020070) ENSCGOG00000020422 atg10 (ENSCGOG00000020424) fam110b (ENSCGOG00000020426) #14 ENSCGOG00000020427 Pike perch MODERN SPECIES 240 DARS2 (ENSSLUG00000025262) ENSSLUG00000025265 cryz 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ENSGT00730000111014.p ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b.h ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00530000064112.b.a.b ENSGT00940000161902.a.a ENSGT00940000167284.m.a ENSGT00940000167284.m.b ENSGT01030000234613.a.a ENSGT00940000166844 Lumpfish MODERN SPECIES 8 ca8 (ENSCLMG00005015890) #20 rab2a (ENSCLMG00005015892) #22 CHD7 (ENSCLMG00005015903) #23 ENSCLMG00005016283 dpydb (ENSCLMG00005016399) odr4 (ENSCLMG00005017463) prg4a (ENSCLMG00005001360) dusp12 (ENSCLMG00005001378) ENSCLMG00005001397 ENSCLMG00005001451 ENSCLMG00005001582 ENSCLMG00005001744 ENSCLMG00005001747 exoc3 (ENSCLMG00005001755) gad3 (ENSCLMG00005001849) cahz (ENSCLMG00005006995) ENSCLMG00005006998 Stickleback MODERN SPECIES 2 rap2b (ENSGACG00000015009) mbnl1 (ENSGACG00000015003) ENSGACG00000014996 ENSGACG00000014993 klhl20 (ENSGACG00000014972) lhx8a (ENSGACG00000014969) myh7 (ENSGACG00000014960) myh7l (ENSGACG00000014948) fitm1l (ENSGACG00000014947) trnau1apb (ENSGACG00000014944) ankrd45 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ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000159432.C Zig-zag eel MODERN SPECIES 8 ENSMAMG00000011277 ENSMAMG00000011300 CDH6 (ENSMAMG00000011319) ENSMAMG00000011371 ENSMAMG00000011376 ENSMAMG00000011391 CDH18 (ENSMAMG00000011430) ENSMAMG00000027555 #16 ENSMAMG00000011474 ENSMAMG00000011481 ENSMAMG00000011486 ENSMAMG00000011494 tox (ENSMAMG00000011519) #19 ENSMAMG00000024843 ca8 (ENSMAMG00000011532) #20 rab2a (ENSMAMG00000011549) #22 CHD7 (ENSMAMG00000011569) #23 ENSMAMG00000011582 ENSMAMG00000011621 ENSMAMG00000011672 odr4 (ENSMAMG00000011684) ENSMAMG00000011784 prg4a (ENSMAMG00000011941) ENSMAMG00000011975 ENSMAMG00000012018 ENSMAMG00000012052 ENSMAMG00000012070 ENSMAMG00000012124 ENSMAMG00000012153 ENSMAMG00000012174 trnau1apb (ENSMAMG00000012192) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 30 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00390000018710 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT00940000157790 ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT00390000005318.a.a.b Climbing perch MODERN SPECIES 8 myh7 (ENSATEG00000001704) myh7 (ENSATEG00000001888) myh7l (ENSATEG00000002051) ENSATEG00000002190 ENSATEG00000002196 ENSATEG00000002202 #16 ENSATEG00000002232 ENSATEG00000002233 ENSATEG00000002251 ENSATEG00000002262 ENSATEG00000002270 ENSATEG00000002313 tox (ENSATEG00000002446) #19 ca8 (ENSATEG00000025910) #20 ca8 (ENSATEG00000028855) #20 rab2a (ENSATEG00000002553) #22 CHD7 (ENSATEG00000002590) #23 ENSATEG00000002722 ENSATEG00000002731 odr4 (ENSATEG00000002841) ENSATEG00000002851 dusp12 (ENSATEG00000003117) ENSATEG00000003154 ENSATEG00000003164 ENSATEG00000003176 ENSATEG00000003309 ENSATEG00000003368 ENSATEG00000003390 ENSATEG00000003538 ENSATEG00000003877 ENSATEG00000003741 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 8 ENSBSLG00000013091 ENSBSLG00000011415 ENSBSLG00000009162 myh7l (ENSBSLG00000007956) fitm1l (ENSBSLG00000007861) trnau1apb (ENSBSLG00000007840) cyp7a1 (ENSBSLG00000007740) #16 TMEM70 (ENSBSLG00000007675) ENSBSLG00000007672 bpnt2 (ENSBSLG00000007667) DARS2 (ENSBSLG00000007032) cryz (ENSBSLG00000006791) cryz (ENSBSLG00000006699) tox (ENSBSLG00000006637) #19 ca8 (ENSBSLG00000006568) #20 rab2a (ENSBSLG00000006404) #22 CHD7 (ENSBSLG00000006021) #23 ptbp2b (ENSBSLG00000005965) pgap6 (ENSBSLG00000005953) rgs11 (ENSBSLG00000005358) ints15 (ENSBSLG00000005208) ENSBSLG00000005133 ENSBSLG00000004889 Carangaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000164640 ENSGT00940000154499 ENSGT00940000154654.a.a ENSGT00390000001801 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SPECIES 12 napgb (ENSCSEG00000016952) PIEZO2 (ENSCSEG00000016977) zgc:56556 (ENSCSEG00000017035) cdh6 (ENSCSEG00000017063) ENSCSEG00000017070 ENSCSEG00000017081 ENSCSEG00000017104 cyp7a1 (ENSCSEG00000017110) #16 ENSCSEG00000017114 TMEM70 (ENSCSEG00000017131) bpnt2 (ENSCSEG00000017120) DARS2 (ENSCSEG00000017136) cryz (ENSCSEG00000017160) tox (ENSCSEG00000017169) #19 ca8 (ENSCSEG00000017183) #20 rab2a (ENSCSEG00000017211) #22 CHD7 (ENSCSEG00000017886) #23 ptbp2b (ENSCSEG00000017942) dpydb (ENSCSEG00000017980) odr4 (ENSCSEG00000018012) TPR (ENSCSEG00000018077) dusp12 (ENSCSEG00000018154) ENSCSEG00000018165 ENSCSEG00000018169 kifap3b (ENSCSEG00000018181) ENSCSEG00000018199 trnau1apb (ENSCSEG00000018215) fitm1l (ENSCSEG00000018233) myh7l (ENSCSEG00000018616) myh7 (ENSCSEG00000020685) myh7 (ENSCSEG00000020930) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00990000203911.f ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00990000203911.e.a ENSGT00940000154805.b.g.f 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ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a Oryzias ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000155161 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d.i ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d.j ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c.e ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000165818 ENSGT00940000155161 ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d.i ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d.j ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c.e ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 8 brinp2 (ENSORLG00000013117) klhl20 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trnau1apb (ENSOSIG00000010967) bpnt2 (ENSOSIG00000010968) DARS2 (ENSOSIG00000010971) cryz (ENSOSIG00000012019) ENSOSIG00000012065 ENSOSIG00000012066 ca8 (ENSOSIG00000012067) #20 rab2a (ENSOSIG00000012069) #22 CHD7 (ENSOSIG00000012096) #23 ptbp2b (ENSOSIG00000012898) dpydb (ENSOSIG00000017085) TPR (ENSOSIG00000017181) prg4a (ENSOSIG00000017475) dusp12 (ENSOSIG00000017483) OLFML2B (ENSOSIG00000017493) ENSOSIG00000017499 kifap3b (ENSOSIG00000017501) PDC (ENSOSIG00000017506) ENSOSIG00000017515 TIMM44 (ENSOSIG00000017570) ENSOSIG00000017572 rab11bb (ENSOSIG00000017577) MARCHF2 (ENSOSIG00000017579) Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d.i ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d.j ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c.e ENSGT00940000159432.C ENSGT00990000203911.f ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c.f ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a ENSGT00940000158995.b Javanese ricefish MODERN SPECIES 8 cop1 (ENSOJAG00000021386) PAPPA2 (ENSOJAG00000021461) ASTN1 (ENSOJAG00000021591) brinp2 (ENSOJAG00000021725) klhl20 (ENSOJAG00000021840) lhx8a (ENSOJAG00000021967) ENSOJAG00000021985 fitm1l (ENSOJAG00000022782) trnau1apb (ENSOJAG00000022787) bpnt2 (ENSOJAG00000022792) DARS2 (ENSOJAG00000022820) cryz (ENSOJAG00000022906) ENSOJAG00000022952 tox (ENSOJAG00000022955) #19 ca8 (ENSOJAG00000022960) #20 rab2a (ENSOJAG00000022968) #22 ptbp2b (ENSOJAG00000009624) odr4 (ENSOJAG00000011649) TPR (ENSOJAG00000011778) prg4a (ENSOJAG00000014427) dusp12 (ENSOJAG00000014454) OLFML2B 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(ENSOMEG00000017767) rab11bb (ENSOMEG00000017806) MARCHF2 (ENSOMEG00000017834) Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00990000203911.e.b ENSGT00940000154805.b.g.f ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000154395.a.a.a.b.a ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00990000203911.e.b 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ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT01030000234515.a.b.b.b ENSGT00940000154412.C.c.a ENSGT00390000000051.b ENSGT00940000163126.a.a Mummichog MODERN SPECIES 2508 ENSFHEG00000001237 ENSFHEG00000001243 ENSFHEG00000001248 ENSFHEG00000001251 ENSFHEG00000001252 ENSFHEG00000000674 myh7l (ENSFHEG00000001258) fitm1l (ENSFHEG00000001261) trnau1apb (ENSFHEG00000001267) ENSFHEG00000001270 bpnt2 (ENSFHEG00000001277) DARS2 (ENSFHEG00000001285) cryz (ENSFHEG00000001290) tox (ENSFHEG00000001293) #19 ca8 (ENSFHEG00000001294) #20 rab2a (ENSFHEG00000001296) #22 CHD7 (ENSFHEG00000001311) #23 ptbp2b (ENSFHEG00000001320) dpydb (ENSFHEG00000001338) odr4 (ENSFHEG00000001356) TPR (ENSFHEG00000001411) prg4a (ENSFHEG00000001429) dusp12 (ENSFHEG00000001434) OLFML2B 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ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b Amazon molly MODERN SPECIES 422 myh7 (ENSPFOG00000002250) myh7 (ENSPFOG00000003432) ENSPFOG00000024715 kifap3b (ENSPFOG00000003506) PDC (ENSPFOG00000003868) ENSPFOG00000022209 fitm1l (ENSPFOG00000003918) trnau1apb (ENSPFOG00000003938) ENSPFOG00000004047 bpnt2 (ENSPFOG00000004054) DARS2 (ENSPFOG00000004144) cryz (ENSPFOG00000004423) ENSPFOG00000004532 tox (ENSPFOG00000004558) #19 ca8 (ENSPFOG00000004700) #20 rab2a (ENSPFOG00000004786) #22 CHD7 (ENSPFOG00000004891) #23 ptbp2b (ENSPFOG00000005646) dpydb (ENSPFOG00000005785) odr4 (ENSPFOG00000005978) ENSPFOG00000006006 prg4a (ENSPFOG00000006768) dusp12 (ENSPFOG00000006822) ENSPFOG00000020348 OLFML2B (ENSPFOG00000006875) ENSPFOG00000006956 CERS4 (ENSPFOG00000007021) TIMM44 (ENSPFOG00000007215) rab11bb (ENSPFOG00000024114) MARCHF2 (ENSPFOG00000007476) slc25a36a (ENSPFOG00000007512) Sailfin molly MODERN SPECIES 452 ENSPLAG00000023434 tox (ENSPLAG00000023423) #19 ca8 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ENSKMAG00000009312 ENSKMAG00000009283 kifap3b (ENSKMAG00000009197) PDC (ENSKMAG00000009178) ENSKMAG00000009157 CERS4 (ENSKMAG00000009138) CTXN1 (ENSKMAG00000009121) Ovalentaria_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159742.rb ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d ENSGT00990000203911.f ENSGT00940000154805.b.g.e.b.c ENSGT00990000203911.e.a ENSGT00940000159432.C ENSGT00530000063693.a.a ENSGT00940000166060 ENSGT00390000008829 ENSGT00940000164879 ENSGT01030000234618.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000161095 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT01050000244924.a.b.h ENSGT00500000044896 ENSGT00390000012568 ENSGT00730000111014.o.a ENSGT00530000063751.a.b ENSGT00930000151041 ENSGT00940000157757.g.b ENSGT00940000154149.b.a.h ENSGT00390000003574.b ENSGT00940000156236.a.b ENSGT00940000159687 ENSGT00390000016559 ENSGT00390000005318.a.a.b ENSGT00940000156470.u.b Pomacentridae ANCESTRAL SPECIES 114 ENSGT00940000154805.b.g.e.b.d 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ca8 (ENSGMOG00000013905) #20 ENSGMOG00000012074 #22 CHD7 (ENSGMOG00000004232) #23 ENSGMOG00000026957 ENSGMOG00000013468 ENSGMOG00000013438 ENSGMOG00000035283 ENSGMOG00000032553 ENSGMOG00000026465 ENSGMOG00000031338 ENSGMOG00000028682 ENSGMOG00000004039 ENSGMOG00000004023 ENSGMOG00000015316 ENSGMOG00000011750 ZMYND11 (ENSGMOG00000013209) DIP2C (ENSGMOG00000013194) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00950000183115.a.a.b.f ENSGT00940000161398.f ENSGT00940000156342.c ENSGT00940000164152.b ENSGT00390000006294.c ENSGT00940000163253.b.c.a.a ENSGT00940000155439.a.a ENSGT00950000183106.a.a.a ENSGT00940000154648.a.a ENSGT00940000156055 ENSGT00390000018687 ENSGT00940000162473 ENSGT00670000098080 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 ENSGT00940000164519.c.a ENSGT00940000155899.e.b ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00950000183056.B.b.g #14 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00950000183149.A.f #11 ENSGT00940000156731.q.b #9 ENSGT00940000156600.e ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000153304.C ENSGT00940000154882 ENSGT00530000063681.b.b Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1282 ENSGT00940000158863.d #20 ENSGT00940000153886.a.b.u #22 ENSGT00940000153649.A.y.a #23 Salmoninae_a DUPLICATION Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00730000114072 ENSGT01040000240444.A.b.a.a.j ENSGT00950000183115.a.a.b.e ENSGT00940000161398.f.e ENSGT00940000156342.c.j ENSGT00390000006294.c.b ENSGT00940000163253.b.c.a.a.b ENSGT00940000155439.a.a.c ENSGT00940000154648.a.a.o.a.a ENSGT00940000156055 ENSGT00390000018687.g ENSGT00940000162473.c ENSGT00670000098080.d ENSGT00940000159497.c.a #19 ENSGT00940000158863.c #20 ENSGT00940000153886.a.b.u.a #22 ENSGT00940000153649.A.y.b #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203.g ENSGT00940000164519.c.a.b ENSGT00940000153141.B.a.k #16 ENSGT00950000183056.B.b.g.a #14 ENSGT00940000160216.b #13 ENSGT00950000183149.A.f.e #11 ENSGT00940000156731.q.b.a #9 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(ENSOMYG00000047790) #23 ENSOMYG00000047812 ENSOMYG00000047813 ENSOMYG00000047814 ENSOMYG00000037603 #16 ENSOMYG00000077583 #14 ENSOMYG00000037626 penka (ENSOMYG00000037632) #11 sdr16c5a (ENSOMYG00000037663) #9 SLC44A5 (ENSOMYG00000037940) lhx8a (ENSOMYG00000038175) cryz (ENSOMYG00000038188) fam151a (ENSOMYG00000038204) acot11a (ENSOMYG00000038467) mrpl37 (ENSOMYG00000039653) Salmo ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00730000114072 ENSGT01040000240444.A.b.a.a.j ENSGT00950000183115.a.a.b.e ENSGT00940000161398.f.e ENSGT00940000156342.c.j ENSGT00390000006294.c.b ENSGT00940000163253.b.c.a.a.b ENSGT00940000155439.a.a.c ENSGT00940000154648.a.a.o.a.a ENSGT00940000156055 ENSGT00390000018687.g ENSGT00940000162473.c ENSGT00670000098080.d ENSGT00940000159497.c.a #19 ENSGT00940000158863.c #20 ENSGT00940000153886.a.b.u.a #22 ENSGT00940000153649.A.y.b #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203.g ENSGT00940000164519.c.a.b ENSGT00940000153141.B.a.k #16 ENSGT00950000183056.B.b.g.a #14 ENSGT00940000160216.b #13 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#22 ENSGT00940000153649.A.y.a #23 ENSGT01030000234567.B.a.b.a.b.a.i.a.b.a ENSGT00940000156304.c.b #25 ENSGT00940000159203.h ENSGT00940000164519.c.a.a ENSGT00940000155899.e.b ENSGT00940000153141.B.a.l #16 ENSGT00950000183056.B.b.g.b #14 ENSGT00940000160216.a #13 ENSGT00950000183149.A.f.f #11 ENSGT00940000156731.q.b.b.a #9 ENSGT00940000156600.e.a ENSGT00940000156200.A.c ENSGT00940000153304.C ENSGT00940000156460.A.a Coho salmon MODERN SPECIES 23 lpar5a (ENSOKIG00005035742) itm2cb (ENSOKIG00005035727) hes6 (ENSOKIG00005035705) per2 (ENSOKIG00005035689) ENSOKIG00005035636 ENSOKIG00005035618 CLCN2 (ENSOKIG00005034601) fam131aa (ENSOKIG00005034537) ENSOKIG00005034131 ubxn7 (ENSOKIG00005033969) ppp1r7 (ENSOKIG00005033894) ENSOKIG00005033876 xrn1 (ENSOKIG00005033644) tox (ENSOKIG00005033567) #19 ca8 (ENSOKIG00005033538) #20 rab2a (ENSOKIG00005033397) #22 CHD7 (ENSOKIG00005031755) #23 ENSOKIG00005031635 ENSOKIG00005031614 #25 TTPA (ENSOKIG00005031595) xpr1b (ENSOKIG00005031564) ENSOKIG00005031472 CYP7A1 (ENSOKIG00005031429) #16 FAM110B (ENSOKIG00005031419) #14 BPNT2 (ENSOKIG00005031411) #13 penka (ENSOKIG00005031406) #11 sdr16c5a (ENSOKIG00005031315) #9 sdr16c5a (ENSOKIG00005031302) #9 ENSOKIG00005031283 SLC44A5 (ENSOKIG00005030976) lhx8a (ENSOKIG00005030935) Rainbow trout MODERN SPECIES 29 itm2cb (ENSOMYG00000007130) hes6 (ENSOMYG00000007096) per2 (ENSOMYG00000006999) ENSOMYG00000057872 ENSOMYG00000006920 ENSOMYG00000006886 ENSOMYG00000006404 fam131aa (ENSOMYG00000068279) eif4g1a (ENSOMYG00000005870) ubxn7 (ENSOMYG00000005386) ppp1r7 (ENSOMYG00000005221) ENSOMYG00000005203 ENSOMYG00000004993 tox (ENSOMYG00000004662) #19 ca8 (ENSOMYG00000004617) #20 rab2a (ENSOMYG00000004550) #22 CHD7 (ENSOMYG00000003013) #23 ENSOMYG00000001656 ENSOMYG00000001472 ENSOMYG00000001295 ENSOMYG00000024980 ENSOMYG00000024817 #16 ENSOMYG00000024733 #14 BPNT2 (ENSOMYG00000024713) #13 penka (ENSOMYG00000024686) #11 sdr16c5a (ENSOMYG00000024621) #9 ENSOMYG00000018256 SLC44A5 (ENSOMYG00000024180) lhx8a (ENSOMYG00000023960) ENSOMYG00000023946 cryz (ENSOMYG00000023936) Salmo ANCESTRAL SPECIES 35 ENSGT00950000183115.a.a.b.f.a.a ENSGT00940000161398.f.f ENSGT00940000156342.c.i ENSGT00940000164152.b ENSGT00390000006294.c.a ENSGT00940000163253.b.c.a.a.a ENSGT00940000155439.a.a.d ENSGT00950000183106.a.a.a ENSGT00940000154648.a.a.o.a.b ENSGT00390000018687.h ENSGT00940000162473.d ENSGT01030000235544.A.b ENSGT00670000098080.c ENSGT00940000159497.c.b #19 ENSGT00940000158863.d #20 ENSGT00940000153886.a.b.u.b #22 ENSGT00940000153649.A.y.a #23 ENSGT00940000159203.h ENSGT00940000164519.c.a.a ENSGT00940000155899.e.b ENSGT00940000153141.B.a.l #16 ENSGT00950000183056.B.b.g.b #14 ENSGT00940000160216.a #13 ENSGT00950000183149.A.f.f #11 ENSGT00940000156731.q.b.b.a #9 ENSGT00940000156600.e.a ENSGT00940000156200.A.c ENSGT00940000170376.b ENSGT00940000154882.b ENSGT00940000156460.A.a ENSGT00950000182915.b.b.a.a.bb.a River trout MODERN SPECIES 13 hes6 (ENSSTUG00000047829) per2 (ENSSTUG00000047814) ENSSTUG00000047811 ENSSTUG00000047806 ENSSTUG00000047797 CLCN2 (ENSSTUG00000047749) fam131aa (ENSSTUG00000047735) eif4g1a (ENSSTUG00000047640) ubxn7 (ENSSTUG00000047597) ppp1r7 (ENSSTUG00000047579) ENSSTUG00000047570 xrn1 (ENSSTUG00000047406) tox (ENSSTUG00000047388) #19 ca8 (ENSSTUG00000047374) #20 ENSSTUG00000047372 rab2a (ENSSTUG00000047361) #22 CHD7 (ENSSTUG00000043231) #23 ENSSTUG00000042761 #25 ttpa (ENSSTUG00000042720) ENSSTUG00000042707 xpr1b (ENSSTUG00000042485) ENSSTUG00000041344 cyp7a1 (ENSSTUG00000041243) #16 FAM110B (ENSSTUG00000041227) #14 BPNT2 (ENSSTUG00000041203) #13 penka (ENSSTUG00000041177) #11 sdr16c5a (ENSSTUG00000041153) #9 SLC44A5 (ENSSTUG00000039347) lhx8a (ENSSTUG00000039289) ENSSTUG00000039282 cryz (ENSSTUG00000039263) Atlantic salmon MODERN SPECIES 5 ENSSSAG00000077077 ENSSSAG00000076981 ENSSSAG00000076974 ENSSSAG00000099781 ENSSSAG00000076967 ENSSSAG00000076832 fam131aa (ENSSSAG00000098049) ENSSSAG00000100423 eif4g1a 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#23 asph (ENSELUG00000024491) ttpa (ENSELUG00000020006) xpr1b (ENSELUG00000020061) ENSELUG00000020121 cyp7a1 (ENSELUG00000020133) #16 sdr16c5a (ENSELUG00000020173) #9 penka (ENSELUG00000020208) #11 IMPAD1 (ENSELUG00000020235) #13 FAM110B (ENSELUG00000030124) #14 SLC44A5 (ENSELUG00000001762) lhx8a (ENSELUG00000022992) tyw3 (ENSELUG00000023000) cryz (ENSELUG00000023028) ENSELUG00000023039 Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000156460.A ENSGT00530000063681.b.b ENSGT00940000161826.B ENSGT00940000154882 ENSGT00940000153304.C ENSGT00940000156200.A ENSGT00940000156600.e ENSGT00940000156731.q.b #9 ENSGT00950000183149.A.f #11 ENSGT00940000160216 #13 ENSGT00940000164879 ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 Otophysi ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000160749.a.b ENSGT00940000158655.f ENSGT00550000074822 ENSGT00940000158258.f ENSGT01060000248660 ENSGT00940000159311.d.a.b ENSGT00390000006671 ENSGT00940000154339 ENSGT00940000164907.a ENSGT00530000063408.B.c.a ENSGT00940000154284.a ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00390000008279.a ENSGT00390000002727 ENSGT00390000010157.a ENSGT00520000060044 ENSGT00390000014590 ENSGT00940000159218.a ENSGT00940000164586.h ENSGT00940000160852 ENSGT00390000012433.b.c.b ENSGT00980000198608 ENSGT00940000159923 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT00940000155098 ENSGT00940000160749.a.b ENSGT00940000158655.f ENSGT00550000074822 ENSGT00940000158258.f ENSGT00940000159311.d.a.b ENSGT00390000006671 ENSGT00940000154339 ENSGT00940000164907.a ENSGT00530000063408.B.c.a ENSGT00940000154284.a ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00390000008279.a ENSGT00390000002727 ENSGT00390000010157.a ENSGT00520000060044 ENSGT00390000014590 Channel catfish MODERN SPECIES 8 cldn11a (ENSIPUG00000006983) SLC7A14 (ENSIPUG00000007010) ENSIPUG00000007061 SLC2A2 (ENSIPUG00000007086) ENSIPUG00000007172 efna2a (ENSIPUG00000007182) rabggtb (ENSIPUG00000007190) ACADM (ENSIPUG00000007227) hectd3 (ENSIPUG00000007255) casp20 (ENSIPUG00000007315) ENSIPUG00000007325 rps8a (ENSIPUG00000007345) ENSIPUG00000007477 ENSIPUG00000007526 rab2a (ENSIPUG00000007539) #22 CHD7 (ENSIPUG00000007585) #23 ENSIPUG00000007698 ttpa (ENSIPUG00000007781) u2surp (ENSIPUG00000007822) tmem59 (ENSIPUG00000007919) ENSIPUG00000007934 ENSIPUG00000007945 ENSIPUG00000007958 pld1a (ENSIPUG00000007981) ghsra (ENSIPUG00000008055) nceh1a (ENSIPUG00000008081) pccb (ENSIPUG00000008096) PPP2R3A (ENSIPUG00000008145) slc35g2 (ENSIPUG00000008206) gyg1a (ENSIPUG00000008224) Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 63 ENSGT00940000155098 ENSGT00940000160749.a.b ENSGT00940000158655.f ENSGT00550000074822 ENSGT00940000158258.f ENSGT00940000159311.d.a.b ENSGT00390000006671 ENSGT00940000154339 ENSGT00940000164907.a ENSGT00530000063408.B.c.a ENSGT00940000154284.a ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00390000008279.a ENSGT00390000002727 ENSGT00390000010157.a ENSGT00520000060044 ENSGT00390000014590 ENSGT00940000159218.a ENSGT00940000164586.h ENSGT00940000160852 ENSGT00980000198608 ENSGT00390000012433.b.c.b ENSGT00940000159923 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 74 ENSGT00940000155098 ENSGT00940000160749.a.b ENSGT00940000158655.f ENSGT00550000074822 ENSGT00940000158258.f ENSGT00940000159311.d.a.b ENSGT00390000006671 ENSGT00940000154339 ENSGT00940000164907.a ENSGT00530000063408.B.c.a ENSGT00940000154284.a ENSGT00950000183056.B.b #14 ENSGT00940000153141.B.a #16 ENSGT00940000159497 #19 ENSGT00940000158863 #20 ENSGT00940000153886.a.b #22 ENSGT00940000153649.A #23 ENSGT00940000166547 ENSGT00940000159203 ENSGT00390000010687.a.a ENSGT00390000008279.a ENSGT00390000002727 ENSGT00390000010157.a ENSGT00520000060044 ENSGT00390000014590 ENSGT00940000159218.a ENSGT00940000164586.h ENSGT00940000160852 ENSGT00980000198608 ENSGT00390000012433.b.c.b ENSGT00940000159923 Mexicana tetra MODERN SPECIES 134 hs2st1a (ENSAMXG00000041451) selenof (ENSAMXG00000006147) fam110b (ENSAMXG00000025926) #14 cyp7a1 (ENSAMXG00000006152) #16 tox (ENSAMXG00000029536) #19 ca8 (ENSAMXG00000006163) #20 rab2a (ENSAMXG00000036772) #22 ENSAMXG00000039157 CHD7 (ENSAMXG00000006180) #23 ttpa (ENSAMXG00000006185) u2surp (ENSAMXG00000006189) tmem59 (ENSAMXG00000029497) lrrc42 (ENSAMXG00000006193) Red-bellied piranha MODERN SPECIES 119 stk25b (ENSPNAG00000010673) septin2 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