Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES		ENSGT00910000148804	ENSGT00390000008414 #7	ENSGT01050000244850.C.b #8	ENSGT00940000156872 #10	ENSGT00940000160731 #11	ENSGT00390000005294 #12	ENSGT00940000160097 #13	ENSGT00940000160260 #14	ENSGT00390000002240 #15	ENSGT00940000157451 #16	ENSGT00390000000709 #17	ENSGT00940000159420.a.b #18	ENSGT00530000063876.a #19	ENSGT00530000063629.a #20	ENSGT00940000155793 #21	ENSGT00940000154196.b #22	ENSGT00940000160954 #23	ENSGT00390000002089.a.b #24	ENSGT00940000156484.b #25	ENSGT00960000186787 #26	ENSGT00940000156989 #27	ENSGT00950000182836.b.a.b #28	ENSGT00390000011724 #29	ENSGT00530000064210 #30	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #31	ENSGT00390000017528 #32	ENSGT00940000162504 #33	ENSGT00940000156376 #34	ENSGT00940000162770 #35	ENSGT00940000161120 #36	ENSGT00390000001374 #37
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	21	ENSGT00910000148804	ENSGT00390000008414 #7	ENSGT01050000244850.C.b #8	ENSGT00940000156872 #10	ENSGT00940000160731 #11	ENSGT00390000005294 #12	ENSGT00940000160097 #13	ENSGT00940000160260 #14	ENSGT00390000002240 #15	ENSGT00940000157451 #16	ENSGT00390000000709 #17	ENSGT00940000159420.a.b #18	ENSGT00530000063876.a #19	ENSGT00530000063629.a #20	ENSGT00940000155793 #21	ENSGT00940000154196.b #22	ENSGT00940000160954 #23	ENSGT00390000002089.a.b #24	ENSGT00940000156484.b #25	ENSGT00960000186787 #26	ENSGT00940000156989 #27	ENSGT00950000182836.b.a.b #28	ENSGT00390000011724 #29	ENSGT00530000064210 #30	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #31	ENSGT00390000017528 #32	ENSGT00940000162504 #33	ENSGT00940000156376 #34	ENSGT00940000162770 #35	ENSGT00940000161120 #36	ENSGT00390000001374 #37
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	63	ENSGT00940000161381.l	ENSGT00390000008414 #7	ENSGT01050000244850.C.b #8	ENSGT00940000156872 #10	ENSGT00940000160731 #11	ENSGT00390000005294 #12	ENSGT00940000160097 #13	ENSGT00940000160260 #14	ENSGT00390000002240 #15	ENSGT00940000157451 #16	ENSGT00390000000709 #17	ENSGT00940000159420.b ##18	ENSGT00530000063876.a #19	ENSGT00530000063629.a #20	ENSGT00940000155793 #21	ENSGT00940000154196.b #22	ENSGT00940000160954 #23	ENSGT00390000002089.a.b #24	ENSGT00940000156484.b #25	ENSGT00960000186787 #26	ENSGT00940000156989 #27	ENSGT00950000182836.b.a.b #28	ENSGT00390000011724 #29	ENSGT00530000064210 #30	ENSGT01030000234620.a.b.b.b #31	ENSGT00390000017528 #32	ENSGT00940000162504 #33	ENSGT00940000156376 #34	ENSGT00940000162770 #35	ENSGT00940000161120 #36	ENSGT00390000001374 #37
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	49	CD34 (ENSUPAG00010016349) #7	PLXNA2 (ENSUPAG00010016355) #8	ENSUPAG00010016401 #9	CAMK1G (ENSUPAG00010016438) #10	LAMB3 (ENSUPAG00010016498) #11	G0S2 (ENSUPAG00010016551) #12	HSD11B1 (ENSUPAG00010016557) #13	TRAF3IP3 (ENSUPAG00010016581) #14	C1orf74 (ENSUPAG00010016689) #15	IRF6 (ENSUPAG00010016697) #16	UTP25 (ENSUPAG00010016705) #17	SYT14 (ENSUPAG00010016724) #18	SERTAD4 (ENSUPAG00010016763) #19	HHAT (ENSUPAG00010016783) #20	KCNH1 (ENSUPAG00010016824) #21	RCOR3 (ENSUPAG00010016853) #22	TRAF5 (ENSUPAG00010017058) #23	RD3 (ENSUPAG00010017064) #24	SLC30A1 (ENSUPAG00010017069) #25	ENSUPAG00010017072 #26	NEK2 (ENSUPAG00010017077) #27	LPGAT1 (ENSUPAG00010017120) #28	INTS7 (ENSUPAG00010017150) #29	DTL (ENSUPAG00010017177) #30	PPP2R5A (ENSUPAG00010017203) #31	PACC1 (ENSUPAG00010017213) #32	NENF (ENSUPAG00010017224) #33	ATF3 (ENSUPAG00010017228) #34	ENSUPAG00010017246 #35	BATF3 (ENSUPAG00010017257) #36	NSL1 (ENSUPAG00010017261) #37
Squirrel	MODERN SPECIES	157	ENSSTOG00000031483	CD34 (ENSSTOG00000025098) #7	PLXNA2 (ENSSTOG00000014052) #8	CAMK1G (ENSSTOG00000016540) #10	LAMB3 (ENSSTOG00000023256) #11	G0S2 (ENSSTOG00000020915) #12	HSD11B1 (ENSSTOG00000016541) #13	TRAF3IP3 (ENSSTOG00000016542) #14	C1orf74 (ENSSTOG00000016543) #15	IRF6 (ENSSTOG00000028204) #16	UTP25 (ENSSTOG00000016545) #17	SYT14 (ENSSTOG00000022494) ##18	SERTAD4 (ENSSTOG00000012625) #19	HHAT (ENSSTOG00000011967) #20	KCNH1 (ENSSTOG00000011975) #21	RCOR3 (ENSSTOG00000011987) #22	TRAF5 (ENSSTOG00000011997) #23	RD3 (ENSSTOG00000024456) #24	SLC30A1 (ENSSTOG00000019654) #25	NEK2 (ENSSTOG00000014117) #27	LPGAT1 (ENSSTOG00000019588) #28	INTS7 (ENSSTOG00000013543) #29	DTL (ENSSTOG00000013557) #30	PPP2R5A (ENSSTOG00000013569) #31	PACC1 (ENSSTOG00000023262) #32	ENSSTOG00000022293	ATF3 (ENSSTOG00000007121) #34	GARIN4 (ENSSTOG00000007130) #35	BATF3 (ENSSTOG00000007136) #36	NSL1 (ENSSTOG00000023856) #37	TATDN3 (ENSSTOG00000007141)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	12	CD34 (ENSMMMG00000001505) #7	PLXNA2 (ENSMMMG00000001414) #8	ENSMMMG00000001390	CAMK1G (ENSMMMG00000001301) #10	LAMB3 (ENSMMMG00000001176) #11	G0S2 (ENSMMMG00000001164) #12	HSD11B1 (ENSMMMG00000001148) #13	TRAF3IP3 (ENSMMMG00000001053) #14	C1orf74 (ENSMMMG00000001035) #15	IRF6 (ENSMMMG00000001014) #16	UTP25 (ENSMMMG00000000999) #17	SYT14 (ENSMMMG00000000958) #18	SERTAD4 (ENSMMMG00000000936) #19	HHAT (ENSMMMG00000000889) #20	KCNH1 (ENSMMMG00000000821) #21	RCOR3 (ENSMMMG00000000787) #22	TRAF5 (ENSMMMG00000000707) #23	RD3 (ENSMMMG00000000691) #24	NEK2 (ENSMMMG00000000670) #27	LPGAT1 (ENSMMMG00000000636) #28	INTS7 (ENSMMMG00000000585) #29	DTL (ENSMMMG00000000544) #30	PPP2R5A (ENSMMMG00000000523) #31	PACC1 (ENSMMMG00000000497) #32	ENSMMMG00000000478	ATF3 (ENSMMMG00000000462) #34	ENSMMMG00000000435 #35	BATF3 (ENSMMMG00000000419) #36	NSL1 (ENSMMMG00000000394) #37	TATDN3 (ENSMMMG00000000340)	ENSMMMG00000000314
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	3	PLXNA2 (ENSSVLG00005020885) #8	CAMK1G (ENSSVLG00005020715) #10	LAMB3 (ENSSVLG00005020531) #11	G0S2 (ENSSVLG00005020499) #12	HSD11B1 (ENSSVLG00005020474) #13	TRAF3IP3 (ENSSVLG00005020051) #14	C1orf74 (ENSSVLG00005019960) #15	IRF6 (ENSSVLG00005019827) #16	UTP25 (ENSSVLG00005019768) #17	ENSSVLG00005019515 #18	ENSSVLG00005019238 ##18	SERTAD4 (ENSSVLG00005019187) #19	HHAT (ENSSVLG00005018844) #20	KCNH1 (ENSSVLG00005018426) #21	ENSSVLG00005018344	RCOR3 (ENSSVLG00005018255) #22	TRAF5 (ENSSVLG00005018217) #23	RD3 (ENSSVLG00005018174) #24	ENSSVLG00005018155 #26	SLC30A1 (ENSSVLG00005018112) #25	NEK2 (ENSSVLG00005017885) #27	LPGAT1 (ENSSVLG00005017852) #28	INTS7 (ENSSVLG00005017717) #29	DTL (ENSSVLG00005017356) #30	ENSSVLG00005017261	PPP2R5A (ENSSVLG00005017066) #31	PACC1 (ENSSVLG00005016932) #32	NENF (ENSSVLG00005016898) #33	ENSSVLG00005016732 #34	GARIN4 (ENSSVLG00005016703) #35	BATF3 (ENSSVLG00005016663) #36