Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00560000078707 ENSGT00940000159244 ENSGT00390000014658 ENSGT00950000182975.a.a.b ENSGT00940000156880 ENSGT00390000000656 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182858.B.a.c ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.c ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.d ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000157589 ENSGT00940000159718 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000160316 ENSGT00560000078707 ENSGT00940000159244 ENSGT00390000014658 ENSGT00950000182975.a.a.b ENSGT00940000156880 ENSGT00390000000656 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.a.b ENSGT00950000182858.B.a.c ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.c ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.d ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000157589 ENSGT00940000159718 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154667.a ENSGT00530000065015 ENSGT00940000159734 ENSGT00940000160316 ENSGT00560000078707 ENSGT00940000159244 ENSGT00390000014658 ENSGT00950000182975.a.a.b ENSGT00940000156880 ENSGT00390000000656 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.c ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.d ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379.e.a ENSGT00940000158379.e.b ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000157589 ENSGT00940000159718 Sperm whale MODERN SPECIES 501 MED22 (ENSPCTG00005020972) #21 RPL7A (ENSPCTG00005020995) #22 SURF1 (ENSPCTG00005021027) #23 SURF2 (ENSPCTG00005021040) #24 SURF4 (ENSPCTG00005021058) #25 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154667.a ENSGT00530000065015 ENSGT00940000159734 ENSGT00940000160316 ENSGT00560000078707 ENSGT00940000159244 ENSGT00390000014658 ENSGT00950000182975.a.a.b ENSGT00940000156880 ENSGT00390000000656 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.c ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.d ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379.e.a ENSGT00940000158379.e.b ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000157589 ENSGT00940000159718 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154667.a ENSGT00530000065015 ENSGT00940000159734 ENSGT00940000160316 ENSGT00560000078707 ENSGT00940000159244 ENSGT00390000014658 ENSGT00950000182975.a.a.b ENSGT00940000156880 ENSGT00390000000656 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.c ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.d ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379.e.a ENSGT00940000158379.e.b ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000157589 ENSGT00940000159718 Vaquita MODERN SPECIES 17 GPSM1 (ENSPSNG00000003585) ENSPSNG00000003644 QSOX2 (ENSPSNG00000003669) LHX3 (ENSPSNG00000003704) TMEM250 (ENSPSNG00000003733) NACC2 (ENSPSNG00000003746) UBAC1 (ENSPSNG00000003773) CAMSAP1 (ENSPSNG00000003852) ENSPSNG00000003959 KCNT1 (ENSPSNG00000004784) ENSPSNG00000006678 ENSPSNG00000006708 ENSPSNG00000006760 SURF6 (ENSPSNG00000006826) MED22 (ENSPSNG00000006857) #21 ENSPSNG00000006905 #22 SURF1 (ENSPSNG00000007027) #23 SURF2 (ENSPSNG00000007081) #24 ENSPSNG00000007113 #25 ENSPSNG00000007227 ADAMTS13 (ENSPSNG00000007316) CACFD1 (ENSPSNG00000007556) SLC2A6 (ENSPSNG00000007615) MYMK (ENSPSNG00000007679) ADAMTSL2 (ENSPSNG00000007726) FAM163B (ENSPSNG00000007849) DBH (ENSPSNG00000007879) SARDH (ENSPSNG00000007978) VAV2 (ENSPSNG00000008237) BRD3 (ENSPSNG00000008397) WDR5 (ENSPSNG00000008438) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000154667.a ENSGT00530000065015 ENSGT00940000159734 ENSGT00940000160316 ENSGT00560000078707 ENSGT00940000159244 ENSGT00390000014658 ENSGT00950000182975.a.a.b ENSGT00940000156880 ENSGT00390000000656 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.a.a.a ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b.d ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379.e.a ENSGT00940000158379.e.b ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000157589 ENSGT00940000159718 Narwhal MODERN SPECIES 312 GPSM1 (ENSMMNG00015017768) ENSMMNG00015017632 QSOX2 (ENSMMNG00015017566) LHX3 (ENSMMNG00015017493) TMEM250 (ENSMMNG00015017465) NACC2 (ENSMMNG00015017441) UBAC1 (ENSMMNG00015017402) CAMSAP1 (ENSMMNG00015017305) KCNT1 (ENSMMNG00015015607) ENSMMNG00015015234 ENSMMNG00015015219 ENSMMNG00015015203 SURF6 (ENSMMNG00015015192) MED22 (ENSMMNG00015015176) #21 ENSMMNG00015015148 ENSMMNG00015015131 #22 SURF1 (ENSMMNG00015015113) #23 SURF2 (ENSMMNG00015015101) #24 ENSMMNG00015015083 #25 STKLD1 (ENSMMNG00015015057) ENSMMNG00015015033 ADAMTS13 (ENSMMNG00015014897) SLC2A6 (ENSMMNG00015014833) MYMK (ENSMMNG00015014813) ADAMTSL2 (ENSMMNG00015014791) FAM163B (ENSMMNG00015014778) DBH (ENSMMNG00015014752) SARDH (ENSMMNG00015014691) VAV2 (ENSMMNG00015014535) ENSMMNG00015014467 BRD3 (ENSMMNG00015014410) Pecora ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000166736 ENSGT00940000157589 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES COPB1 (ENSCHYG00000000002) PSMA1 (ENSCHYG00000018665) ENSCHYG00000018606 PDE3B (ENSCHYG00000018075) ENSCHYG00000018022 CYP2R1 (ENSCHYG00000017908) ENSCHYG00000017748 ENSCHYG00000017694 ENSCHYG00000017642 ENSCHYG00000017547 INSC (ENSCHYG00000017107) ENSCHYG00000017074 SOX6 (ENSCHYG00000016309) C11orf58 (ENSCHYG00000016095) PLEKHA7 (ENSCHYG00000015374) ENSCHYG00000015259 #22 PIK3C2A (ENSCHYG00000014721) NUCB2 (ENSCHYG00000014573) ENSCHYG00000014538 KCNJ11 (ENSCHYG00000014523) ABCC8 (ENSCHYG00000013838) USH1C (ENSCHYG00000013383) OTOG (ENSCHYG00000013158) MYOD1 (ENSCHYG00000013095) KCNC1 (ENSCHYG00000013038) SERGEF (ENSCHYG00000012902) TPH1 (ENSCHYG00000012793) SAAL1 (ENSCHYG00000012719) ENSCHYG00000012579 ZNF202 (ENSCHYG00000012502) SCN3B (ENSCHYG00000012415) Yarkand deer MODERN SPECIES 2 ENSCHYG00000006716 GPSM1 (ENSCHYG00000006855) CARD9 (ENSCHYG00000006923) SNAPC4 (ENSCHYG00000007022) ENTR1 (ENSCHYG00000007198) PMPCA (ENSCHYG00000007436) INPP5E (ENSCHYG00000007535) SEC16A (ENSCHYG00000007686) NOTCH1 (ENSCHYG00000008626) ENSCHYG00000008811 AGPAT2 (ENSCHYG00000009123) DIPK1B (ENSCHYG00000009252) ENSCHYG00000009352 SURF6 (ENSCHYG00000009401) MED22 (ENSCHYG00000009429) #21 ENSCHYG00000009488 #22 SURF1 (ENSCHYG00000009643) #23 SURF2 (ENSCHYG00000009850) #24 SURF4 (ENSCHYG00000009955) #25 ENSCHYG00000010174 REXO4 (ENSCHYG00000010246) ADAMTS13 (ENSCHYG00000010317) CACFD1 (ENSCHYG00000010507) SLC2A6 (ENSCHYG00000010600) MYMK (ENSCHYG00000010712) ADAMTSL2 (ENSCHYG00000010768) ENSCHYG00000011166 DBH (ENSCHYG00000011205) SARDH (ENSCHYG00000011277) VAV2 (ENSCHYG00000011531) ENSCHYG00000012265 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000166736 ENSGT00940000157589 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1178 ENSMMSG00000017799 GPSM1 (ENSMMSG00000017853) DNLZ (ENSMMSG00000018005) CARD9 (ENSMMSG00000018040) SNAPC4 (ENSMMSG00000018179) ENTR1 (ENSMMSG00000018277) PMPCA (ENSMMSG00000018461) INPP5E (ENSMMSG00000018533) SEC16A (ENSMMSG00000018596) NOTCH1 (ENSMMSG00000018769) EGFL7 (ENSMMSG00000018878) AGPAT2 (ENSMMSG00000018937) DIPK1B (ENSMMSG00000018999) SURF6 (ENSMMSG00000019063) MED22 (ENSMMSG00000019115) #21 ENSMMSG00000017005 #22 ENSMMSG00000017048 #23 SURF2 (ENSMMSG00000017092) #24 SURF4 (ENSMMSG00000017110) #25 REXO4 (ENSMMSG00000017141) 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ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000157589 ENSGT00940000159718 Goat DUPLICATION Goat MODERN SPECIES 2 ENSCHIG00000017713 DNLZ (ENSCHIG00000019744) CARD9 (ENSCHIG00000013779) SNAPC4 (ENSCHIG00000013796) ENTR1 (ENSCHIG00000018825) PMPCA (ENSCHIG00000013065) INPP5E (ENSCHIG00000004726) SEC16A (ENSCHIG00000020286) NOTCH1 (ENSCHIG00000021033) EGFL7 (ENSCHIG00000023457) AGPAT2 (ENSCHIG00000014858) 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(ENSOARG00020002270) MYMK (ENSOARG00020002247) ADAMTSL2 (ENSOARG00020002211) FAM163B (ENSOARG00020002181) DBH (ENSOARG00020002153) SARDH (ENSOARG00020001993) VAV2 (ENSOARG00020001789) ENSOARG00020001755 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a ENSGT00390000006980 ENSGT00390000004339.f #21 ENSGT00940000153294.m.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 ENSGT00940000159607 ENSGT00940000158379 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 ENSGT00940000159976 ENSGT00940000160710 ENSGT00940000159447 ENSGT00940000159387 ENSGT00530000063085.B ENSGT00940000166736 ENSGT00940000157589 American bison DUPLICATION American bison MODERN SPECIES 2049 MED22 (ENSBBBG00000023316) ##21 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Indicus MODERN SPECIES 2 CARD9 (ENSBIXG00005008353) SNAPC4 (ENSBIXG00005008329) ENTR1 (ENSBIXG00005008201) PMPCA (ENSBIXG00005008108) INPP5E (ENSBIXG00005000112) SEC16A (ENSBIXG00005007954) NOTCH1 (ENSBIXG00005029490) ENSBIXG00005029555 ENSBIXG00005029589 DIPK1B (ENSBIXG00005029611) ENSBIXG00005029644 ENSBIXG00005029668 ENSBIXG00005029686 SURF6 (ENSBIXG00005029689) MED22 (ENSBIXG00005029700) #21 ENSBIXG00005029716 #22 SURF1 (ENSBIXG00005029756) #23 SURF2 (ENSBIXG00005029782) #24 SURF4 (ENSBIXG00005029795) #25 STKLD1 (ENSBIXG00005029843) REXO4 (ENSBIXG00005029874) ADAMTS13 (ENSBIXG00005029885) CACFD1 (ENSBIXG00005029903) SLC2A6 (ENSBIXG00005029919) MYMK (ENSBIXG00005029930) ADAMTSL2 (ENSBIXG00005029943) FAM163B (ENSBIXG00005029953) DBH (ENSBIXG00005029981) SARDH (ENSBIXG00005030013) VAV2 (ENSBIXG00005030069) ENSBIXG00005030113 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 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