Euarchontoglires	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT00850000133605	ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b ##19	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.a ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00940000153294.m.a.c.b ##22	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35
Primates	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.b ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Haplorrhini	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.b ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Simiiformes	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Catarrhini	DUPLICATION
Catarrhini	DUPLICATION
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00390000014818.j	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Hominidae	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.d ##19	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00390000014818.j	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607.a #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.c #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00390000014818.j	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607.a #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22
Pan	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22
Chimpanzee	MODERN SPECIES	22	CFAP77 (ENSPTRG00000021497) #7	BARHL1 (ENSPTRG00000021499) #8	DDX31 (ENSPTRG00000021500) #9	GTF3C4 (ENSPTRG00000021501) #10	AK8 (ENSPTRG00000021502) #11	SPACA9 (ENSPTRG00000022917) #12	TSC1 (ENSPTRG00000021504) #13	GFI1B (ENSPTRG00000021505) #14	GTF3C5 (ENSPTRG00000021506) #15	RALGDS (ENSPTRG00000021509) #16	GBGT1 (ENSPTRG00000021510) #17	ENSPTRG00000021511 #18	ENSPTRG00000044289 #19	SURF6 (ENSPTRG00000021514) #20	MED22 (ENSPTRG00000021515) #21	RPL7A (ENSPTRG00000051833) #22	SURF1 (ENSPTRG00000021517) #23	SURF2 (ENSPTRG00000021518) #24	SURF4 (ENSPTRG00000021519) #25	STKLD1 (ENSPTRG00000024153) #26	REXO4 (ENSPTRG00000023363) #27	ADAMTS13 (ENSPTRG00000022942) #28	CACFD1 (ENSPTRG00000024267) #29	SLC2A6 (ENSPTRG00000023818) #30	MYMK (ENSPTRG00000023019) #31	ADAMTSL2 (ENSPTRG00000022572) #32	FAM163B (ENSPTRG00000047128) #33	DBH (ENSPTRG00000021521) #34	SARDH (ENSPTRG00000021522) #35	VAV2 (ENSPTRG00000021525) #36	BRD3OS (ENSPTRG00000047397) #37
Gorilla	MODERN SPECIES	9	ST8SIA5 (ENSGGOG00000013794)	LOXHD1 (ENSGGOG00000005588)	RNF165 (ENSGGOG00000005584)	HAUS1 (ENSGGOG00000010098)	ATP5F1A (ENSGGOG00000016560)	ENSGGOG00000041127	PSTPIP2 (ENSGGOG00000025030)	EPG5 (ENSGGOG00000007816)	SIGLEC15 (ENSGGOG00000007810)	SLC14A1 (ENSGGOG00000008152)	SLC14A2 (ENSGGOG00000001047)	SETBP1 (ENSGGOG00000014151)	SYT4 (ENSGGOG00000006097)	RIT2 (ENSGGOG00000005603)	PIK3C3 (ENSGGOG00000015471)	ENSGGOG00000023088 #22	CELF4 (ENSGGOG00000013920)	KIAA1328 (ENSGGOG00000011074)	ENSGGOG00000011061	FHOD3 (ENSGGOG00000011046)	MOCOS (ENSGGOG00000009642)	ELP2 (ENSGGOG00000004679)	SLC39A6 (ENSGGOG00000010347)	RPRD1A (ENSGGOG00000007369)	C18orf21 (ENSGGOG00000026334)	ENSGGOG00000036755	GALNT1 (ENSGGOG00000006840)	INO80C (ENSGGOG00000026291)	ZNF396 (ENSGGOG00000023692)	ZNF24 (ENSGGOG00000041313)	ENSGGOG00000016098
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22
Macaca	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	19	FGF8 (ENSMFAG00000003751)	FBXW4 (ENSMFAG00000044810)	DPCD (ENSMFAG00000036058)	POLL (ENSMFAG00000043080)	BTRC (ENSMFAG00000005295)	TLX1 (ENSMFAG00000045878)	KAZALD1 (ENSMFAG00000063924)	SFXN3 (ENSMFAG00000035501)	PDZD7 (ENSMFAG00000037794)	LZTS2 (ENSMFAG00000048904)	TWNK (ENSMFAG00000032824)	MRPL43 (ENSMFAG00000036954)	SEMA4G (ENSMFAG00000038405)	SLF2 (ENSMFAG00000042449)	PAX2 (ENSMFAG00000041514)	ENSMFAG00000004864 #22	HIF1AN (ENSMFAG00000043376)	ENSMFAG00000040760	SEC31B (ENSMFAG00000043520)	WNT8B (ENSMFAG00000035598)	ENSMFAG00000040755	PKD2L1 (ENSMFAG00000030987)	ENSMFAG00000031202	CHUK (ENSMFAG00000000426)	ENSMFAG00000062447	ERLIN1 (ENSMFAG00000042046)	ENSMFAG00000041054	CPN1 (ENSMFAG00000007369)	DNMBP (ENSMFAG00000002036)	ABCC2 (ENSMFAG00000042907)	CUTC (ENSMFAG00000031857)
Vervet Monkey	MODERN SPECIES	17	NPL (ENSCSAG00000012535)	RGS8 (ENSCSAG00000012525)	RGS16 (ENSCSAG00000012520)	RNASEL (ENSCSAG00000012514)	RGSL1 (ENSCSAG00000012503)	TEDDM1 (ENSCSAG00000000242)	ENSCSAG00000000241	GLUL (ENSCSAG00000012490)	ZNF648 (ENSCSAG00000000240)	CACNA1E (ENSCSAG00000012479)	IER5 (ENSCSAG00000000239)	MR1 (ENSCSAG00000012455)	STX6 (ENSCSAG00000012445)	KIAA1614 (ENSCSAG00000012424)	XPR1 (ENSCSAG00000012398)	ENSCSAG00000000238 #22	ACBD6 (ENSCSAG00000012394)	LHX4 (ENSCSAG00000012389)	QSOX1 (ENSCSAG00000012360)	CEP350 (ENSCSAG00000012261)	TOR1AIP1 (ENSCSAG00000012246)	TOR1AIP2 (ENSCSAG00000012239)	FAM163A (ENSCSAG00000012230)	TDRD5 (ENSCSAG00000012216)	NPHS2 (ENSCSAG00000012172)	AXDND1 (ENSCSAG00000012156)	SOAT1 (ENSCSAG00000012108)	ABL2 (ENSCSAG00000012097)	TOR3A (ENSCSAG00000012093)	FAM20B (ENSCSAG00000012087)	RALGPS2 (ENSCSAG00000012075)
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000014476 #7	ENSGT00940000160428 #8	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22	ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p ##22	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22
Cercopithecinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22	ENSGT00910000147066	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.a ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160428 #8	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b #19	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22	ENSGT00910000147066	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.a ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000159729	ENSGT00390000014476 #7	ENSGT00940000160428 #8	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00940000164691.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22	ENSGT00940000153294.m.b.s.f ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	6	CFAP77 (ENSMFAG00000001992) #7	BARHL1 (ENSMFAG00000001005) #8	DDX31 (ENSMFAG00000036342) #9	GTF3C4 (ENSMFAG00000041984) #10	AK8 (ENSMFAG00000032283) #11	SPACA9 (ENSMFAG00000033110) #12	TSC1 (ENSMFAG00000007299) #13	GFI1B (ENSMFAG00000043346) #14	GTF3C5 (ENSMFAG00000041901) #15	ENSMFAG00000050859	CEL (ENSMFAG00000042247)	RALGDS (ENSMFAG00000043674) #16	ENSMFAG00000058803 #19	ENSMFAG00000048334	SURF6 (ENSMFAG00000047763) #20	ENSMFAG00000036880 ##22	MED22 (ENSMFAG00000042665) #21	SURF1 (ENSMFAG00000032426) #23	SURF2 (ENSMFAG00000031802) #24	SURF4 (ENSMFAG00000045368) #25	ENSMFAG00000057657	STKLD1 (ENSMFAG00000041753) #26	REXO4 (ENSMFAG00000042425) #27	ADAMTS13 (ENSMFAG00000000040) #28	ENSMFAG00000038988 #29	SLC2A6 (ENSMFAG00000035331) #30	MYMK (ENSMFAG00000033845) #31	ADAMTSL2 (ENSMFAG00000001650) #32	FAM163B (ENSMFAG00000042458) #33	DBH (ENSMFAG00000041482) #34	SARDH (ENSMFAG00000038559) #35
Catarrhini	ANCESTRAL SPECIES	13	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22	ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p ##22	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Hominoidea	ANCESTRAL SPECIES	19	ENSGT00390000014476 #7	ENSGT00940000160428 #8	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00390000014818.j	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35
Gibbon	MODERN SPECIES	6	NIPAL2 (ENSNLEG00000002626)	POP1 (ENSNLEG00000002541)	RIDA (ENSNLEG00000027254)	ERICH5 (ENSNLEG00000002460)	ASPH (ENSNLEG00000002208)	CLVS1 (ENSNLEG00000002146)	ENSNLEG00000002143	ENSNLEG00000033932	ENSNLEG00000035467	ENSNLEG00000033557	CHD7 (ENSNLEG00000002027)	RAB2A (ENSNLEG00000036148)	ENSNLEG00000029912	CA8 (ENSNLEG00000001830)	TOX (ENSNLEG00000001791)	ENSNLEG00000035613 ##22	ENSNLEG00000032927	NSMAF (ENSNLEG00000001542)	SDCBP (ENSNLEG00000001408)	CYP7A1 (ENSNLEG00000001373)	ENSNLEG00000034722	UBXN2B (ENSNLEG00000033129)	BPNT2 (ENSNLEG00000001322)	ENSNLEG00000029194	PENK (ENSNLEG00000001307)	SDR16C5 (ENSNLEG00000001266)	ENSNLEG00000001238	PLAG1 (ENSNLEG00000031521)	MOS (ENSNLEG00000018389)	ENSNLEG00000001214	ENSNLEG00000001213
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Orangutan	MODERN SPECIES	22	AK8 (ENSPPYG00000019715) #11	ENSPPYG00000019716 #12	TSC1 (ENSPPYG00000019717) #13	GFI1B (ENSPPYG00000019718) #14	GTF3C5 (ENSPPYG00000019719) #15	ENSPPYG00000019720	ENSPPYG00000037482	RALGDS (ENSPPYG00000019723) #16	ENSPPYG00000019724	OBP2B (ENSPPYG00000019725) ##19	ENSPPYG00000031612 ##19	ABO (ENSPPYG00000032466) ##17	ENSPPYG00000034398	SURF6 (ENSPPYG00000031162) #20	MED22 (ENSPPYG00000031224) #21	ENSPPYG00000019730 ##22	ENSPPYG00000019731 #23	ENSPPYG00000019732 #24	SURF4 (ENSPPYG00000019733) #25	STKLD1 (ENSPPYG00000019734) #26	REXO4 (ENSPPYG00000019735) #27	ADAMTS13 (ENSPPYG00000019736) #28	CACFD1 (ENSPPYG00000019737) #29	SLC2A6 (ENSPPYG00000019738) #30	MYMK (ENSPPYG00000019739) #31	ADAMTSL2 (ENSPPYG00000019740) #32	FAM163B (ENSPPYG00000019741) #33	DBH (ENSPPYG00000019742) #34	SARDH (ENSPPYG00000019743) #35	VAV2 (ENSPPYG00000019744) #36	BRD3OS (ENSPPYG00000038396) #37
Homo/Pan/Gorilla group	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.c #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00390000014818.j	ENSGT00940000153294.m.b.r.a #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607.a #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35
Gorilla	MODERN SPECIES	22	DDX31 (ENSGGOG00000008314) #9	GTF3C4 (ENSGGOG00000008326) #10	AK8 (ENSGGOG00000002135) #11	SPACA9 (ENSGGOG00000002138) #12	TSC1 (ENSGGOG00000002139) #13	GFI1B (ENSGGOG00000015828) #14	GTF3C5 (ENSGGOG00000015837) #15	ENSGGOG00000015855	RALGDS (ENSGGOG00000003440) #16	GBGT1 (ENSGGOG00000003448) #17	ENSGGOG00000009459 #18	ENSGGOG00000006193 #19	ABO (ENSGGOG00000011353) ##17	SURF6 (ENSGGOG00000014426) #20	MED22 (ENSGGOG00000014437) #21	ENSGGOG00000014442 ##22	ENSGGOG00000024950	SURF1 (ENSGGOG00000039195) #23	SURF2 (ENSGGOG00000014467) #24	SURF4 (ENSGGOG00000014456) #25	STKLD1 (ENSGGOG00000014486) #26	REXO4 (ENSGGOG00000014508) #27	ADAMTS13 (ENSGGOG00000012541) #28	ENSGGOG00000012563 #29	SLC2A6 (ENSGGOG00000012569) #30	MYMK (ENSGGOG00000014738) #31	ADAMTSL2 (ENSGGOG00000011127) #32	FAM163B (ENSGGOG00000040732) #33	DBH (ENSGGOG00000016022) #34	SARDH (ENSGGOG00000016030) #35	VAV2 (ENSGGOG00000007911) #36
Homo/Pan group	ANCESTRAL SPECIES	16	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.d ##19	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607.a #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Pan	ANCESTRAL SPECIES	18	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.c #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607.a #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Chimpanzee	MODERN SPECIES		ELK4 (ENSPTRG00000001902)	SLC45A3 (ENSPTRG00000001903)	NUCKS1 (ENSPTRG00000048501)	RAB29 (ENSPTRG00000001905)	SLC41A1 (ENSPTRG00000001906)	PM20D1 (ENSPTRG00000001907)	SLC26A9 (ENSPTRG00000001908)	RAB7B (ENSPTRG00000048926)	CTSE (ENSPTRG00000022821)	RHEX (ENSPTRG00000023332)	AVPR1B (ENSPTRG00000023708)	ENSPTRG00000023098	SRGAP2 (ENSPTRG00000001909)	IKBKE (ENSPTRG00000001910)	RASSF5 (ENSPTRG00000001912)	ENSPTRG00000048979 ##22	EIF2D (ENSPTRG00000001913)	DYRK3 (ENSPTRG00000001914)	MAPKAPK2 (ENSPTRG00000001915)	ENSPTRG00000049056	IL10 (ENSPTRG00000001916)	IL19 (ENSPTRG00000001917)	IL20 (ENSPTRG00000001918)	IL24 (ENSPTRG00000001919)	FCMR (ENSPTRG00000001920)	PIGR (ENSPTRG00000001921)	FCAMR (ENSPTRG00000001922)	C1H1orf116 (ENSPTRG00000001923)	YOD1 (ENSPTRG00000045303)	PFKFB2 (ENSPTRG00000001925)	C4BPB (ENSPTRG00000001926)
Bonobo	DUPLICATION
Bonobo	MODERN SPECIES		SLC45A3 (ENSPPAG00000042471)	NUCKS1 (ENSPPAG00000031082)	ENSPPAG00000014956	RAB29 (ENSPPAG00000013675)	SLC41A1 (ENSPPAG00000033980)	PM20D1 (ENSPPAG00000042310)	SLC26A9 (ENSPPAG00000013194)	RAB7B (ENSPPAG00000037308)	CTSE (ENSPPAG00000037615)	RHEX (ENSPPAG00000025324)	AVPR1B (ENSPPAG00000036422)	ENSPPAG00000002734	SRGAP2 (ENSPPAG00000040467)	IKBKE (ENSPPAG00000038774)	RASSF5 (ENSPPAG00000030157)	ENSPPAG00000031189 ##22	EIF2D (ENSPPAG00000034016)	DYRK3 (ENSPPAG00000036822)	ENSPPAG00000027637	MAPKAPK2 (ENSPPAG00000036203)	IL10 (ENSPPAG00000008601)	ENSPPAG00000035187	IL20 (ENSPPAG00000029055)	IL24 (ENSPPAG00000036282)	FCMR (ENSPPAG00000041511)	PIGR (ENSPPAG00000035924)	FCAMR (ENSPPAG00000031523)	C1orf116 (ENSPPAG00000000106)	YOD1 (ENSPPAG00000033947)	PFKFB2 (ENSPPAG00000041619)	C4BPB (ENSPPAG00000034105)
Bonobo	MODERN SPECIES	22	DDX31 (ENSPPAG00000027761) #9	GTF3C4 (ENSPPAG00000014319) #10	AK8 (ENSPPAG00000035422) #11	SPACA9 (ENSPPAG00000028794) #12	TSC1 (ENSPPAG00000035459) #13	GFI1B (ENSPPAG00000030105) #14	GTF3C5 (ENSPPAG00000029135) #15	CEL (ENSPPAG00000034136)	RALGDS (ENSPPAG00000041413) #16	GBGT1 (ENSPPAG00000025608) #17	ENSPPAG00000040239 #18	ENSPPAG00000039342 #19	ABO (ENSPPAG00000035877) ##17	SURF6 (ENSPPAG00000032305) #20	MED22 (ENSPPAG00000042477) #21	ENSPPAG00000018940 ##22	SURF1 (ENSPPAG00000028495) #23	SURF2 (ENSPPAG00000031707) #24	SURF4 (ENSPPAG00000028946) #25	STKLD1 (ENSPPAG00000040907) #26	REXO4 (ENSPPAG00000027911) #27	ADAMTS13 (ENSPPAG00000030531) #28	ENSPPAG00000011930 #29	SLC2A6 (ENSPPAG00000036854) #30	MYMK (ENSPPAG00000032051) #31	ADAMTSL2 (ENSPPAG00000028971) #32	FAM163B (ENSPPAG00000037328) #33	DBH (ENSPPAG00000036112) #34	SARDH (ENSPPAG00000027059) #35	VAV2 (ENSPPAG00000037516) #36	BRD3OS (ENSPPAG00000003967) #37
Cercopithecidae	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00910000147066	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Rhinopithecus	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00910000147066	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00390000014818.h	ENSGT00940000153294.m.b.s ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Black snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	130	DDX31 (ENSRBIG00000042353) #9	GTF3C4 (ENSRBIG00000026348) #10	AK8 (ENSRBIG00000031522) #11	SPACA9 (ENSRBIG00000035119) #12	ENSRBIG00000030505	TSC1 (ENSRBIG00000035693) #13	GFI1B (ENSRBIG00000032113) #14	GTF3C5 (ENSRBIG00000031213) #15	CEL (ENSRBIG00000011705)	RALGDS (ENSRBIG00000040046) #16	GBGT1 (ENSRBIG00000032070) #17	ABO (ENSRBIG00000041187) ##17	SURF6 (ENSRBIG00000028268) #20	MED22 (ENSRBIG00000012741) #21	ENSRBIG00000042922	ENSRBIG00000029545 ##22	SURF1 (ENSRBIG00000039669) #23	SURF2 (ENSRBIG00000037030) #24	SURF4 (ENSRBIG00000044124) #25	STKLD1 (ENSRBIG00000037451) #26	REXO4 (ENSRBIG00000037515) #27	ADAMTS13 (ENSRBIG00000040768) #28	CACFD1 (ENSRBIG00000040728) #29	SLC2A6 (ENSRBIG00000030115) #30	MYMK (ENSRBIG00000037991) #31	ADAMTSL2 (ENSRBIG00000035951) #32	FAM163B (ENSRBIG00000042372) #33	DBH (ENSRBIG00000039871) #34	SARDH (ENSRBIG00000039189) #35	VAV2 (ENSRBIG00000006768) #36	BRD3OS (ENSRBIG00000009048) #37
Golden snub-nosed monkey	DUPLICATION
Golden snub-nosed monkey	DUPLICATION
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1695	DDX31 (ENSRROG00000044427) #9	GTF3C4 (ENSRROG00000011474) #10	AK8 (ENSRROG00000007267) #11	SPACA9 (ENSRROG00000035888) #12	TSC1 (ENSRROG00000040517) #13	GFI1B (ENSRROG00000032600) #14	GTF3C5 (ENSRROG00000038857) #15	CEL (ENSRROG00000043926)	RALGDS (ENSRROG00000039481) #16	ENSRROG00000035030 ##17	ABO (ENSRROG00000041717) ##17	SURF6 (ENSRROG00000012667) #20	ENSRROG00000045021	MED22 (ENSRROG00000034974) #21	ENSRROG00000031476	ENSRROG00000033341 ##22	SURF1 (ENSRROG00000041375) #23	SURF2 (ENSRROG00000028551) #24	SURF4 (ENSRROG00000037683) #25	STKLD1 (ENSRROG00000028757) #26	REXO4 (ENSRROG00000028864) #27	ADAMTS13 (ENSRROG00000040887) #28	CACFD1 (ENSRROG00000013285) #29	SLC2A6 (ENSRROG00000038890) #30	MYMK (ENSRROG00000034647) #31	ADAMTSL2 (ENSRROG00000037111) #32	FAM163B (ENSRROG00000042558) #33	DBH (ENSRROG00000044901) #34	SARDH (ENSRROG00000036454) #35	VAV2 (ENSRROG00000031220) #36	BRD3OS (ENSRROG00000003747) #37
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	1460														CTPS2 (ENSRROG00000008962)	S100G (ENSRROG00000038305)	ENSRROG00000022850 ##22	SYAP1 (ENSRROG00000044395)	TXLNG (ENSRROG00000040582)	ENSRROG00000044936	RBBP7 (ENSRROG00000041791)	REPS2 (ENSRROG00000026327)
Golden snub-nosed monkey	MODERN SPECIES	3131													MAP3K1 (ENSRROG00000035924)	SETD9 (ENSRROG00000041808)	MIER3 (ENSRROG00000041892)	ENSRROG00000041132 ##22	GPBP1 (ENSRROG00000032693)	ACTBL2 (ENSRROG00000006201)
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Cercopithecinae_a	DUPLICATION
Cercopithecinae_a	DUPLICATION
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22	ENSGT00910000147066	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.a ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Macaca	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b #19	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22	ENSGT00910000147066	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.a ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Pig-tailed macaque	MODERN SPECIES	490	SH3RF3 (ENSMNEG00000033434)	ENSMNEG00000030947	EDAR (ENSMNEG00000042159)	CCDC138 (ENSMNEG00000005767)	RANBP2 (ENSMNEG00000043706)	ENSMNEG00000024372	ENSMNEG00000003332	GCC2 (ENSMNEG00000022989)	ENSMNEG00000032891	SULT1C4 (ENSMNEG00000040683)	SULT1C2 (ENSMNEG00000039439)	SULT1C3 (ENSMNEG00000038187)	SURF6 (ENSMNEG00000033787) #20	MED22 (ENSMNEG00000031626) #21	ENSMNEG00000028959	ENSMNEG00000039240 ##22	SURF1 (ENSMNEG00000044047) #23	SURF2 (ENSMNEG00000039327) #24	SURF4 (ENSMNEG00000001598) #25	STKLD1 (ENSMNEG00000029920) #26	REXO4 (ENSMNEG00000031604) #27	ADAMTS13 (ENSMNEG00000034336) #28	CACFD1 (ENSMNEG00000028887) #29	SLC2A6 (ENSMNEG00000036657) #30	MYMK (ENSMNEG00000042261) #31	ADAMTSL2 (ENSMNEG00000037641) #32	FAM163B (ENSMNEG00000033369) #33	DBH (ENSMNEG00000035550) #34	SARDH (ENSMNEG00000002204) #35	VAV2 (ENSMNEG00000035639) #36	BRD3OS (ENSMNEG00000019590) #37
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.a ##22
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	4	TIA1 (ENSMFAG00000045951)	C2orf42 (ENSMFAG00000046692)	PCBP1 (ENSMFAG00000055458)	ENSMFAG00000036184	ASPRV1 (ENSMFAG00000027875)	ENSMFAG00000061563	MXD1 (ENSMFAG00000043046)	ENSMFAG00000040656	GMCL1 (ENSMFAG00000003922)	ANXA4 (ENSMFAG00000033651)	AAK1 (ENSMFAG00000032641)	ENSMFAG00000063272	NFU1 (ENSMFAG00000033270)	GFPT1 (ENSMFAG00000003721)	ANTXR1 (ENSMFAG00000044025)	ENSMFAG00000047324 ##22	GKN1 (ENSMFAG00000032957)	GKN2 (ENSMFAG00000044673)	BMP10 (ENSMFAG00000038780)	ARHGAP25 (ENSMFAG00000001418)	PROKR1 (ENSMFAG00000043932)	APLF (ENSMFAG00000045051)	FBXO48 (ENSMFAG00000038551)	PLEK (ENSMFAG00000054603)	CNRIP1 (ENSMFAG00000035167)	PPP3R1 (ENSMFAG00000031560)	PNO1 (ENSMFAG00000043544)	ENSMFAG00000064848	DNAAF10 (ENSMFAG00000042360)	ENSMFAG00000034261	ENSMFAG00000056299
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b.b #19	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00910000147066	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.a ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Olive baboon	MODERN SPECIES	4	DDX31 (ENSPANG00000025987) #9	GTF3C4 (ENSPANG00000026029) #10	AK8 (ENSPANG00000026030) #11	SPACA9 (ENSPANG00000026038) #12	TSC1 (ENSPANG00000026037) #13	GFI1B (ENSPANG00000024216) #14	GTF3C5 (ENSPANG00000021827) #15	ENSPANG00000046372	RALGDS (ENSPANG00000018172) #16	GBGT1 (ENSPANG00000034220) #17	ENSPANG00000015132 #18	ENSPANG00000026111 #19	ABO (ENSPANG00000003775) ##17	SURF6 (ENSPANG00000026036) #20	MED22 (ENSPANG00000046839) #21	ENSPANG00000026035 ##22	ENSPANG00000026034 #23	SURF2 (ENSPANG00000026033) #24	SURF4 (ENSPANG00000026032) #25	STKLD1 (ENSPANG00000026031) #26	REXO4 (ENSPANG00000026040) #27	ADAMTS13 (ENSPANG00000026041) #28	ENSPANG00000026049 #29	SLC2A6 (ENSPANG00000026048) #30	MYMK (ENSPANG00000026047) #31	ADAMTSL2 (ENSPANG00000026046) #32	FAM163B (ENSPANG00000026045) #33	ENSPANG00000026044 #34	ENSPANG00000051385 ##19	MRPS2 (ENSPANG00000045207)	PIERCE1 (ENSPANG00000032034)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	59													ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00910000147066	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.a ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01030000235088 #37
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	572													SURF6 (ENSCATG00000042004) #20	MED22 (ENSCATG00000043740) #21	ENSCATG00000037024	ENSCATG00000037203 ##22	SURF1 (ENSCATG00000042888) #23	SURF2 (ENSCATG00000044351) #24	SURF4 (ENSCATG00000034398) #25	STKLD1 (ENSCATG00000045287) #26	REXO4 (ENSCATG00000028646) #27	ADAMTS13 (ENSCATG00000045040) #28	CACFD1 (ENSCATG00000037924) #29	SLC2A6 (ENSCATG00000044478) #30	MYMK (ENSCATG00000040737) #31	ADAMTSL2 (ENSCATG00000041168) #32	FAM163B (ENSCATG00000029804) #33	DBH (ENSCATG00000016222) #34	SARDH (ENSCATG00000032494) #35	VAV2 (ENSCATG00000036350) #36	BRD3OS (ENSCATG00000022029) #37
Drill	MODERN SPECIES	237													SURF6 (ENSMLEG00000028750) #20	ENSMLEG00000030500	MED22 (ENSMLEG00000037247) #21	ENSMLEG00000025192 ##22	SURF1 (ENSMLEG00000031073) #23	SURF2 (ENSMLEG00000042010) #24	SURF4 (ENSMLEG00000029570) #25	STKLD1 (ENSMLEG00000041760) #26	REXO4 (ENSMLEG00000037716) #27	ADAMTS13 (ENSMLEG00000043762) #28	CACFD1 (ENSMLEG00000036516) #29	SLC2A6 (ENSMLEG00000035419) #30	MYMK (ENSMLEG00000011155) #31	ADAMTSL2 (ENSMLEG00000028870) #32	FAM163B (ENSMLEG00000027334) #33
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.b ##22
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.b ##22
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	149	ENSGT00390000006225	ENSGT00940000160618	ENSGT00390000006925	ENSGT00390000010354	ENSGT00910000146971	ENSGT00940000157211	ENSGT00940000153095.g.b.a.a.a.a	ENSGT00940000156332	ENSGT00940000163000	ENSGT00940000155984	ENSGT00910000147009	ENSGT00940000159862	ENSGT00940000159213	ENSGT00940000159158	ENSGT00940000154817.b.b.b	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.b ##22	ENSGT00390000014818.g.b.a.b	ENSGT00390000011515.d	ENSGT00940000153568.B	ENSGT00940000164023	ENSGT00940000160532
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	129	SCTR (ENSCATG00000035610)	ENSCATG00000032201	CFAP221 (ENSCATG00000020702)	ENSCATG00000014934	ENSCATG00000012333	PTPN4 (ENSCATG00000030920)	ENSCATG00000035581	EPB41L5 (ENSCATG00000040081)	ENSCATG00000036400	RALB (ENSCATG00000039216)	ENSCATG00000006617	INHBB (ENSCATG00000010576)	GLI2 (ENSCATG00000034671)	TFCP2L1 (ENSCATG00000044361)	CLASP1 (ENSCATG00000039063)	ENSCATG00000043420 ##22	ENSCATG00000043436	NIFK (ENSCATG00000015239)	TSN (ENSCATG00000032155)	ENSCATG00000032734
Drill	MODERN SPECIES	871	C2orf76 (ENSMLEG00000039378)	DBI (ENSMLEG00000001896)	TMEM37 (ENSMLEG00000033060)	SCTR (ENSMLEG00000029227)	CFAP221 (ENSMLEG00000042134)	ENSMLEG00000041704	PTPN4 (ENSMLEG00000040178)	ENSMLEG00000039838	EPB41L5 (ENSMLEG00000032344)	ENSMLEG00000027991	RALB (ENSMLEG00000008823)	ENSMLEG00000042162	GLI2 (ENSMLEG00000000952)	TFCP2L1 (ENSMLEG00000019949)	CLASP1 (ENSMLEG00000044177)	ENSMLEG00000017424 ##22	NIFK (ENSMLEG00000043516)	TSN (ENSMLEG00000038656)	ENSMLEG00000005825	CNTNAP5 (ENSMLEG00000030564)
Macaca	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.b ##22
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.s.e.b ##22
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	3	ENSMFAG00000002195	TMEM37 (ENSMFAG00000028075)	ENSMFAG00000051758	SCTR (ENSMFAG00000003037)	CFAP221 (ENSMFAG00000026339)	TMEM177 (ENSMFAG00000049249)	ENSMFAG00000044614	PTPN4 (ENSMFAG00000037071)	EPB41L5 (ENSMFAG00000000388)	TMEM185B (ENSMFAG00000016061)	ENSMFAG00000060262	RALB (ENSMFAG00000038532)	INHBB (ENSMFAG00000043042)	GLI2 (ENSMFAG00000003477)	TFCP2L1 (ENSMFAG00000013698)	ENSMFAG00000049923 ##22	CLASP1 (ENSMFAG00000032753)	NIFK (ENSMFAG00000031270)	TSN (ENSMFAG00000044217)	CNTNAP5 (ENSMFAG00000042003)	ENSMFAG00000003980	TEX51 (ENSMFAG00000000535)	BIN1 (ENSMFAG00000031946)	CYP27C1 (ENSMFAG00000041958)	ERCC3 (ENSMFAG00000003370)	MAP3K2 (ENSMFAG00000037837)	ENSMFAG00000051897	ENSMFAG00000058484	PROC (ENSMFAG00000044923)	IWS1 (ENSMFAG00000016975)	ENSMFAG00000062671
Cercopithecinae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.s.f ##22
Macaca	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.s.f ##22
Macaca_a	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00390000014476 #7	ENSGT00940000160428 #8	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00940000164691.a.a.a.a.b.a.b	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22	ENSGT00940000153294.m.b.s.f ##22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT00940000153385.b.a.a
Crab-eating macaque	MODERN SPECIES	14	SLC17A4 (ENSMFAG00000036410)	ENSMFAG00000060597	H2BC1 (ENSMFAG00000051470)	SCGN (ENSMFAG00000000166)	CARMIL1 (ENSMFAG00000040204)	ENSMFAG00000035592	RIPOR2 (ENSMFAG00000045840)	ARMH2 (ENSMFAG00000000821)	GMNN (ENSMFAG00000031787)	C6orf62 (ENSMFAG00000039257)	ENSMFAG00000064618	ENSMFAG00000035886	ENSMFAG00000064382	TDP2 (ENSMFAG00000045296)	KIAA0319 (ENSMFAG00000041252)	ENSMFAG00000063461 ##22	ALDH5A1 (ENSMFAG00000044209)	GPLD1 (ENSMFAG00000045533)	MRS2 (ENSMFAG00000038058)	ENSMFAG00000050294	ENSMFAG00000017743	DCDC2 (ENSMFAG00000001295)	NRSN1 (ENSMFAG00000036989)	ENSMFAG00000059419	ENSMFAG00000052064	ENSMFAG00000059385	PRL (ENSMFAG00000000707)	ENSMFAG00000052589	ENSMFAG00000053681	ENSMFAG00000060959	ENSMFAG00000052080
Rhesus	MODERN SPECIES	6	DDX31 (ENSMMUG00000004590) #9	GTF3C4 (ENSMMUG00000009915) #10	AK8 (ENSMMUG00000009916) #11	SPACA9 (ENSMMUG00000021158) #12	TSC1 (ENSMMUG00000009918) #13	GFI1B (ENSMMUG00000005948) #14	GTF3C5 (ENSMMUG00000001267) #15	CEL (ENSMMUG00000001272)	RALGDS (ENSMMUG00000015274) #16	ENSMMUG00000054901	ENSMMUG00000050399	ABO (ENSMMUG00000015100) ##17	WDR5 (ENSMMUG00000014159)	ENSMMUG00000065260	ENSMMUG00000065261	RPL7A (ENSMMUG00000022341) ##22	SURF6 (ENSMMUG00000022339) #20	SURF1 (ENSMMUG00000022344) #23	SURF2 (ENSMMUG00000022346) #24	SURF4 (ENSMMUG00000022348) #25	STKLD1 (ENSMMUG00000000934) #26	REXO4 (ENSMMUG00000000935) #27	ADAMTS13 (ENSMMUG00000000937) #28	SLC2A6 (ENSMMUG00000010981) #30	MYMK (ENSMMUG00000017202) #31	ADAMTSL2 (ENSMMUG00000017203) #32	FAM163B (ENSMMUG00000040914) #33	DBH (ENSMMUG00000017207) #34	SARDH (ENSMMUG00000017210) #35	VAV2 (ENSMMUG00000017214) #36	BRD3 (ENSMMUG00000005463)
Cercopithecinae_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00500000044938	ENSGT00920000149095.b	ENSGT00950000182767.b.b.d.hb.b.a.b.a.a.b.a	ENSGT00940000155352	ENSGT00640000091574	ENSGT00950000182839.A.c	ENSGT00940000153524.b.a.a.k.a	ENSGT00940000158251	ENSGT00940000163898	ENSGT00940000162858	ENSGT00940000163725	ENSGT00940000157277	ENSGT00940000156144	ENSGT00530000063745.b	ENSGT00390000006546	ENSGT00940000153294.m.b.s.f ##22	ENSGT00390000014818.g.b.a.a.a.b.b	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b	ENSGT00940000157479	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00940000159215	ENSGT00940000160698	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000155394	ENSGT00940000155142.i.a.a	ENSGT01100000263748	ENSGT00940000158014	ENSGT00940000157713
Olive baboon	DUPLICATION
Olive baboon	MODERN SPECIES	19	RASSF9 (ENSPANG00000023605)	ENSPANG00000018370	ENSPANG00000044234	ENSPANG00000049251	ALX1 (ENSPANG00000005930)	ENSPANG00000003192	TSPAN19 (ENSPANG00000016556)	LRRIQ1 (ENSPANG00000020393)	SLC6A15 (ENSPANG00000011238)	ENSPANG00000005733	ENSPANG00000049628	TMTC2 (ENSPANG00000008622)	ENSPANG00000032275	METTL25 (ENSPANG00000033969)	CCDC59 (ENSPANG00000023011)	ENSPANG00000049322 ##22	ENSPANG00000042647	ENSPANG00000035488	PPFIA2 (ENSPANG00000019704)	ACSS3 (ENSPANG00000019084)	LIN7A (ENSPANG00000005931)	MYF5 (ENSPANG00000020394)	MYF6 (ENSPANG00000044306)	ENSPANG00000005319	PTPRQ (ENSPANG00000014456)	OTOGL (ENSPANG00000012907)	ENSPANG00000047805	PPP1R12A (ENSPANG00000026354)	PAWR (ENSPANG00000009557)	SYT1 (ENSPANG00000009048)	ENSPANG00000040020
Olive baboon	MODERN SPECIES	14	NAMPT (ENSPANG00000025368)	SYPL1 (ENSPANG00000015695)	ENSPANG00000045478	ENSPANG00000050232	ATXN7L1 (ENSPANG00000009777)	ENSPANG00000049053	EFCAB10 (ENSPANG00000021182)	RINT1 (ENSPANG00000019820)	PUS7 (ENSPANG00000014230)	SRPK2 (ENSPANG00000026449)	KMT2E (ENSPANG00000005214)	LHFPL3 (ENSPANG00000030052)	ORC5 (ENSPANG00000007067)	ENSPANG00000037310	RELN (ENSPANG00000009099)	ENSPANG00000034951 ##22	ENSPANG00000043672	SLC26A5 (ENSPANG00000012991)	PSMC2 (ENSPANG00000021273)	DNAJC2 (ENSPANG00000019301)	PMPCB (ENSPANG00000011795)	NAPEPLD (ENSPANG00000006176)	ARMC10 (ENSPANG00000000473)	FBXL13 (ENSPANG00000018070)	LRRC17 (ENSPANG00000005425)	FAM185A (ENSPANG00000007609)	CCDC146 (ENSPANG00000020437)	FGL2 (ENSPANG00000019822)	GSAP (ENSPANG00000009852)	ENSPANG00000045115	PTPN12 (ENSPANG00000000974)
Cercopithecinae_d	ANCESTRAL SPECIES	3				ENSGT00940000155352	ENSGT00640000091574	ENSGT00950000182839.A.c	ENSGT00940000153524.b.a.a.k.a	ENSGT00940000158251	ENSGT00940000163898	ENSGT00940000162858	ENSGT00940000163725	ENSGT00940000157277	ENSGT00940000156144	ENSGT00530000063745.b	ENSGT00390000006546	ENSGT00940000153294.m.b.s.f ##22	ENSGT00390000014818.g.b.a.a.a.b.a	ENSGT01050000244900.a.a.a.a.b	ENSGT00940000157479	ENSGT00940000153222.a.a	ENSGT00950000182959.a.a	ENSGT00950000182959.a.b.b.a	ENSGT00940000159215	ENSGT00940000160698	ENSGT00940000156120.a	ENSGT00390000000406	ENSGT00940000155394	ENSGT00940000155142.i.a.a	ENSGT00390000003133.i.a	ENSGT00940000163914.c.a	ENSGT01100000263748
Sooty mangabey	MODERN SPECIES	582				MGAT4C (ENSCATG00000019157)	NTS (ENSCATG00000039653)	RASSF9 (ENSCATG00000038528)	ENSCATG00000038524	ALX1 (ENSCATG00000041762)	LRRIQ1 (ENSCATG00000037866)	TSPAN19 (ENSCATG00000034141)	SLC6A15 (ENSCATG00000041025)	ENSCATG00000022828	TMTC2 (ENSCATG00000040764)	METTL25 (ENSCATG00000044852)	CCDC59 (ENSCATG00000044760)	ENSCATG00000034351 ##22	ENSCATG00000031323	ENSCATG00000038856	PPFIA2 (ENSCATG00000040747)	ACSS3 (ENSCATG00000030914)	LIN7A (ENSCATG00000029939)	MYF5 (ENSCATG00000042162)	MYF6 (ENSCATG00000029151)	PTPRQ (ENSCATG00000039610)	OTOGL (ENSCATG00000038125)	PPP1R12A (ENSCATG00000038278)	PAWR (ENSCATG00000034935)	SYT1 (ENSCATG00000033541)	ENSCATG00000044466	ENSCATG00000040529	ENSCATG00000017337
Drill	DUPLICATION
Drill	MODERN SPECIES	1667					GDF11 (ENSMLEG00000032721)	CD63 (ENSMLEG00000037224)	RDH5 (ENSMLEG00000028776)	ITGA7 (ENSMLEG00000002509)	METTL7B (ENSMLEG00000033453)	ENSMLEG00000031889	ENSMLEG00000032453	OR10P1 (ENSMLEG00000021983)	OR6C4 (ENSMLEG00000021441)	OR6C2 (ENSMLEG00000027980)	OR6C65 (ENSMLEG00000036650)	ENSMLEG00000043588 ##22	OR6C75 (ENSMLEG00000022612)	OR6C3 (ENSMLEG00000036806)	OR6C74 (ENSMLEG00000017829)	OR10A7 (ENSMLEG00000043713)	ENSMLEG00000027776	OR9K2 (ENSMLEG00000027603)	ENSMLEG00000003880	NEUROD4 (ENSMLEG00000027380)	TESPA1 (ENSMLEG00000039181)	ENSMLEG00000043278
Drill	MODERN SPECIES	328																ENSMLEG00000036838 ##22	ENSMLEG00000027098	ENSMLEG00000026917	ENSMLEG00000029879	CDKN2B (ENSMLEG00000037377)	CDKN2A (ENSMLEG00000033190)	MTAP (ENSMLEG00000032984)	IFNE (ENSMLEG00000040652)	ENSMLEG00000030280
Platyrrhini	DUPLICATION
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.p #22
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.p #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.p #22
Capuchin	MODERN SPECIES	266	EHD2 (ENSCCAG00000035777)	BICRA (ENSCCAG00000026467)	ZNF541 (ENSCCAG00000037140)	NAPA (ENSCCAG00000033321)	KPTN (ENSCCAG00000027753)	SLC8A2 (ENSCCAG00000014965)	MEIS3 (ENSCCAG00000003816)	DHX34 (ENSCCAG00000028675)	C5AR1 (ENSCCAG00000035091)	CCDC9 (ENSCCAG00000028908)	ENSCCAG00000026596	SAE1 (ENSCCAG00000031780)	ZC3H4 (ENSCCAG00000037597)	TMEM160 (ENSCCAG00000031011)	NPAS1 (ENSCCAG00000032406)	ENSCCAG00000021097 #22	ARHGAP35 (ENSCCAG00000022601)	AP2S1 (ENSCCAG00000028431)	SLC1A5 (ENSCCAG00000033717)	FKRP (ENSCCAG00000015087)	STRN4 (ENSCCAG00000034066)	PRKD2 (ENSCCAG00000032043)	DACT3 (ENSCCAG00000008006)	GNG8 (ENSCCAG00000029845)	PTGIR (ENSCCAG00000021110)	ENSCCAG00000033630
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	42										ENSSBOG00000014231	FRY (ENSSBOG00000024918)	RXFP2 (ENSSBOG00000014035)	ENSSBOG00000024650	B3GLCT (ENSSBOG00000027304)	HSPH1 (ENSSBOG00000021221)	ENSSBOG00000023117 #22	TEX26 (ENSSBOG00000029547)	MEDAG (ENSSBOG00000014983)	ALOX5AP (ENSSBOG00000035529)	USPL1 (ENSSBOG00000028053)	ENSSBOG00000024496	ENSSBOG00000023208	KATNAL1 (ENSSBOG00000009792)	ENSSBOG00000020013 ##22	UBL3 (ENSSBOG00000009211)	ENSSBOG00000028866	SLC7A1 (ENSSBOG00000020061)	MTUS2 (ENSSBOG00000026505)	ENSSBOG00000019071	SLC46A3 (ENSSBOG00000025396)	POMP (ENSSBOG00000032229)
Platyrrhini	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.q #22
Mas night monkey	DUPLICATION
Mas night monkey	MODERN SPECIES	649	ENSANAG00000035878	NLRP1 (ENSANAG00000000698)	ENSANAG00000009039	MIS12 (ENSANAG00000015438)	ENSANAG00000031099	DHX33 (ENSANAG00000037748)	ENSANAG00000032527	RPAIN (ENSANAG00000028660)	NUP88 (ENSANAG00000032703)	RABEP1 (ENSANAG00000028248)	SCIMP (ENSANAG00000033409)	ZNF594 (ENSANAG00000023997)	ZNF232 (ENSANAG00000037004)	ZFP3 (ENSANAG00000019832)	SLC52A1 (ENSANAG00000024730)	ENSANAG00000033130 #22	KIF1C (ENSANAG00000029960)	INCA1 (ENSANAG00000038026)	CAMTA2 (ENSANAG00000031565)	SPAG7 (ENSANAG00000020862)	ENSANAG00000020318	PFN1 (ENSANAG00000002125)	RNF167 (ENSANAG00000034776)	SLC25A11 (ENSANAG00000034058)	ENSANAG00000032025	C17orf107 (ENSANAG00000032134)	CHRNE (ENSANAG00000037518)	MINK1 (ENSANAG00000024571)	PLD2 (ENSANAG00000022528)	C17orf114 (ENSANAG00000021901)	PSMB6 (ENSANAG00000032934)
Mas night monkey	MODERN SPECIES	728												PHKB (ENSANAG00000034968)	ENSANAG00000031204	ITFG1 (ENSANAG00000025551)	ENSANAG00000030138	ENSANAG00000024441 #22	DNAJA2 (ENSANAG00000036069)	ENSANAG00000028948	GPT2 (ENSANAG00000024936)	C16orf87 (ENSANAG00000027251)
Cebidae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.q #22
Cebidae_a	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b.q #22
Bolivian squirrel monkey	MODERN SPECIES	66	ENSSBOG00000035760	SCAF4 (ENSSBOG00000024068)	HUNK (ENSSBOG00000026563)	MIS18A (ENSSBOG00000033176)	MRAP (ENSSBOG00000029482)	URB1 (ENSSBOG00000027672)	EVA1C (ENSSBOG00000028646)	CFAP298 (ENSSBOG00000019656)	SYNJ1 (ENSSBOG00000021001)	PAXBP1 (ENSSBOG00000030172)	C21orf62 (ENSSBOG00000021330)	ENSSBOG00000016676	OLIG2 (ENSSBOG00000033043)	OLIG1 (ENSSBOG00000023447)	IFNAR2 (ENSSBOG00000031096)	ENSSBOG00000018437 #22	IFNAR1 (ENSSBOG00000021344)	ENSSBOG00000019424	IFNGR2 (ENSSBOG00000019645)	TMEM50B (ENSSBOG00000012972)	DNAJC28 (ENSSBOG00000035319)	GART (ENSSBOG00000027956)	SON (ENSSBOG00000020885)	ENSSBOG00000034050	CRYZL1 (ENSSBOG00000022246)	ITSN1 (ENSSBOG00000026172)	ENSSBOG00000029690	SLC5A3 (ENSSBOG00000019154)	MRPS6 (ENSSBOG00000034972)	SMIM11 (ENSSBOG00000032382)	ENSSBOG00000029680
Tarsier	MODERN SPECIES	5939														FYB1 (ENSTSYG00000006519)	C9 (ENSTSYG00000009398)	ENSTSYG00000036235 #22	DAB2 (ENSTSYG00000003683)	LRP4 (ENSTSYG00000010791)	ENSTSYG00000027636
Strepsirrhini	ANCESTRAL SPECIES	8	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00390000008220	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379.d #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Bushbaby	MODERN SPECIES	202	CARD9 (ENSOGAG00000024499)	SNAPC4 (ENSOGAG00000015861)	ENSOGAG00000015872	PMPCA (ENSOGAG00000015875)	ENSOGAG00000007682	ENSOGAG00000024858	INPP5E (ENSOGAG00000015883)	SEC16A (ENSOGAG00000015887)	NOTCH1 (ENSOGAG00000015908)	EGFL7 (ENSOGAG00000007178)	AGPAT2 (ENSOGAG00000025726)	DIPK1B (ENSOGAG00000008561)	ABO (ENSOGAG00000029319) ##17	SURF6 (ENSOGAG00000027199) #20	MED22 (ENSOGAG00000014026) #21	ENSOGAG00000014027 #22	ENSOGAG00000024295 #25	SURF2 (ENSOGAG00000031360) #24	STKLD1 (ENSOGAG00000014034) #26	REXO4 (ENSOGAG00000014040) #27	ENSOGAG00000014043 #28	SLC2A6 (ENSOGAG00000014051) #30	MYMK (ENSOGAG00000025687) #31	ADAMTSL2 (ENSOGAG00000014056) #32	FAM163B (ENSOGAG00000006830) #33	DBH (ENSOGAG00000006832) #34	SARDH (ENSOGAG00000006836) #35	VAV2 (ENSOGAG00000028052) #36	ENSOGAG00000031006	BRD3 (ENSOGAG00000004568)	WDR5 (ENSOGAG00000008960)
Lemuriformes	ANCESTRAL SPECIES	12	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00390000008220	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379.d #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Mouse lemur	MODERN SPECIES	1	GPSM1 (ENSMICG00000033412)	DNLZ (ENSMICG00000027594)	CARD9 (ENSMICG00000005799)	SNAPC4 (ENSMICG00000005804)	ENSMICG00000005829	PMPCA (ENSMICG00000005847)	INPP5E (ENSMICG00000005855)	SEC16A (ENSMICG00000005865)	NOTCH1 (ENSMICG00000009527)	EGFL7 (ENSMICG00000047232)	AGPAT2 (ENSMICG00000017382)	DIPK1B (ENSMICG00000015407)	ABO (ENSMICG00000012209) ##17	SURF6 (ENSMICG00000046077) #20	MED22 (ENSMICG00000028119) #21	ENSMICG00000036165 #22	SURF1 (ENSMICG00000007597) #23	SURF2 (ENSMICG00000007604) #24	SURF4 (ENSMICG00000037009) #25	STKLD1 (ENSMICG00000008399) #26	REXO4 (ENSMICG00000008422) #27	ENSMICG00000047114 #28	ENSMICG00000011799 #28	CACFD1 (ENSMICG00000031108) #29	SLC2A6 (ENSMICG00000012653) #30	MYMK (ENSMICG00000038732) #31	ADAMTSL2 (ENSMICG00000031225) #32	FAM163B (ENSMICG00000028608) #33	DBH (ENSMICG00000015378) #34	ENSMICG00000031652 #35	GLT6D1 (ENSMICG00000047100) ##17
Lemuriformes_a	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00390000008220	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379.d #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Greater bamboo lemur	MODERN SPECIES	1540													ABO (ENSPSMG00000010904) ##17	SURF6 (ENSPSMG00000010916) #20	MED22 (ENSPSMG00000010937) #21	ENSPSMG00000010946 #22	SURF1 (ENSPSMG00000010994) #23
Coquerels sifaka	DUPLICATION
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	1004												ENSPCOG00000012156	ABO (ENSPCOG00000015940) ##17	SURF6 (ENSPCOG00000015707) #20	MED22 (ENSPCOG00000021507) #21	ENSPCOG00000022601 #22	SURF1 (ENSPCOG00000021726) #23	SURF2 (ENSPCOG00000020075) #24	SURF4 (ENSPCOG00000023265) #25	STKLD1 (ENSPCOG00000021306) #26	REXO4 (ENSPCOG00000025466) #27	ADAMTS13 (ENSPCOG00000027644) #28	CACFD1 (ENSPCOG00000021787) #29	SLC2A6 (ENSPCOG00000020805) #30	MYMK (ENSPCOG00000016450) #31	ADAMTSL2 (ENSPCOG00000022674) #32	FAM163B (ENSPCOG00000020821) #33	DBH (ENSPCOG00000023145) #34	SARDH (ENSPCOG00000018819) #35	VAV2 (ENSPCOG00000015147) #36
Coquerels sifaka	MODERN SPECIES	128	EMG1 (ENSPCOG00000028560)	LPCAT3 (ENSPCOG00000021530)	C1S (ENSPCOG00000018942)	C1R (ENSPCOG00000021412)	C1RL (ENSPCOG00000025155)	RBP5 (ENSPCOG00000024308)	CLSTN3 (ENSPCOG00000022319)	PEX5 (ENSPCOG00000017563)	CD163L1 (ENSPCOG00000001924)	CD163 (ENSPCOG00000015026)	CLEC4E (ENSPCOG00000017330)	CLEC4D (ENSPCOG00000023414)	CLEC6A (ENSPCOG00000016396)	CLEC4A (ENSPCOG00000017101)	NECAP1 (ENSPCOG00000019762)	ENSPCOG00000026746 #22	FOXJ2 (ENSPCOG00000005417)	ENSPCOG00000009702	ENSPCOG00000025681	ENSPCOG00000019057	DPPA3 (ENSPCOG00000022180)	GDF3 (ENSPCOG00000025144)	APOBEC1 (ENSPCOG00000013957)	ENSPCOG00000019228	MFAP5 (ENSPCOG00000023526)	RIMKLB (ENSPCOG00000015009)	A2ML1 (ENSPCOG00000023058)	PHC1 (ENSPCOG00000021640)	M6PR (ENSPCOG00000014985)	KLRG1 (ENSPCOG00000018705)	A2M (ENSPCOG00000021109)
Euarchontoglires_A	ANCESTRAL SPECIES	10	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.a ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00940000153294.m.a.c.b ##22	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35
Glires	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.a ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00940000153294.m.a.c.b ##22	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35
Rodentia	ANCESTRAL SPECIES	9	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00950000182858.A.a.a ##17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.a ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00940000153294.m.a.c.b ##22	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT01050000248521	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34
Rodentia_B	ANCESTRAL SPECIES	85														ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22
Kangaroo rat	MODERN SPECIES	437														Surf6 (ENSDORG00000010761) #20	Med22 (ENSDORG00000006469) #21	ENSDORG00000006471 #22	Surf1 (ENSDORG00000025934) #23	Surf2 (ENSDORG00000026726) #24	Surf4 (ENSDORG00000006186) #25	Stkld1 (ENSDORG00000006187) #26	Rexo4 (ENSDORG00000006190) #27	Adamts13 (ENSDORG00000004424) #28	Cacfd1 (ENSDORG00000028197) #29	Slc2a6 (ENSDORG00000004429) #30	Mymk (ENSDORG00000010902) #31	Adamtsl2 (ENSDORG00000010903) #32	Fam163b (ENSDORG00000026782) #33	Dbh (ENSDORG00000015677) #34	Sardh (ENSDORG00000015678) #35	Vav2 (ENSDORG00000011913) #36	Brd3 (ENSDORG00000012653)
Myomorpha	ANCESTRAL SPECIES	101														ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22
Muroidea	ANCESTRAL SPECIES	122														ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22
Muroidea_A	ANCESTRAL SPECIES	65														ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22
Murinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b #22
Rat	DUPLICATION
Rat	DUPLICATION
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	13	Rpl9-ps31 (ENSRNOG00000030476)	ENSRNOG00000067433 #18	Abo3 (ENSRNOG00000039906) ##17	ENSRNOG00000064101	LOC681385 (ENSRNOG00000030708) #18	ENSRNOG00000069598	LOC681385 (ENSRNOG00000043494) #18	Abo2 (ENSRNOG00000045801) ##17	ENSRNOG00000070414	AABR07051348.1 (ENSRNOG00000059455)	AABR07051348.2 (ENSRNOG00000060791)	Rps13 (ENSRNOG00000067444)	Abo (ENSRNOG00000046958) ##17	Surf6 (ENSRNOG00000005031) #20	Med22 (ENSRNOG00000005059) #21	Rpl7a (ENSRNOG00000070974) #22	Surf4 (ENSRNOG00000060005) #25	Surf1 (ENSRNOG00000005247) #25	Surf2 (ENSRNOG00000066832) #24	Stkld1 (ENSRNOG00000027911) #26	Rexo4 (ENSRNOG00000027867) #27	Adamts13 (ENSRNOG00000005780) #28	Cacfd1 (ENSRNOG00000005840) #29	Slc2a6 (ENSRNOG00000005900) #30	Gm13398 (ENSRNOG00000070103)	Mymk (ENSRNOG00000006142)	Adamtsl2 (ENSRNOG00000027742) #32	Fam163b (ENSRNOG00000065438) #33	Dbh (ENSRNOG00000006641) #34	Sardh (ENSRNOG00000006916) #35	Vav2 (ENSRNOG00000007422) #36
Rat	MODERN SPECIES	9	ENSRNOG00000062351	ENSRNOG00000069260	Dsc1 (ENSRNOG00000056258)	Dsc2 (ENSRNOG00000039969)	Dsc3 (ENSRNOG00000017159)	Cdh2 (ENSRNOG00000015602)	AC118833.1 (ENSRNOG00000038412)	Chst9 (ENSRNOG00000015867)	Aqp4 (ENSRNOG00000016043)	Rpl39 (ENSRNOG00000034237)	Kctd1 (ENSRNOG00000016467)	Taf4b (ENSRNOG00000026023)	Psma8 (ENSRNOG00000030363)	Ss18 (ENSRNOG00000016800)	Zfp521 (ENSRNOG00000016874)	LOC108349606 (ENSRNOG00000031244) #22	Hrh4 (ENSRNOG00000016887)	Impact (ENSRNOG00000045844)	Osbpl1a (ENSRNOG00000054058)	Cabyr (ENSRNOG00000047436)	Ttc39c (ENSRNOG00000050949)	Lama3 (ENSRNOG00000011300)	Ankrd29 (ENSRNOG00000046744)	Npc1 (ENSRNOG00000012016)	Rmc1 (ENSRNOG00000012597)	Riok3 (ENSRNOG00000023376)	Tmem241 (ENSRNOG00000023412)	Cables1 (ENSRNOG00000012795)	Rbbp8 (ENSRNOG00000012899)	Gata6 (ENSRNOG00000023433)	ENSRNOG00000071008
Rat	MODERN SPECIES		LOC681006 (ENSRNOG00000025953)	Hspa12a (ENSRNOG00000018019)	ENSRNOG00000068353	Eno4 (ENSRNOG00000018310)	Shtn1 (ENSRNOG00000018350)	Vax1 (ENSRNOG00000008824)	Kcnk18 (ENSRNOG00000032706)	Slc18a2 (ENSRNOG00000008890)	Pdzd8 (ENSRNOG00000009460)	Emx2 (ENSRNOG00000009482)	Rab11fip2 (ENSRNOG00000009523)	Fam204a (ENSRNOG00000009830)	Prlhr (ENSRNOG00000009922)	Cacul1 (ENSRNOG00000009954)	LOC100359574 (ENSRNOG00000025154)	AABR07007121.1 (ENSRNOG00000033843) #22	Nanos1 (ENSRNOG00000025060)	Eif3a (ENSRNOG00000010117)	Dennd10 (ENSRNOG00000010230)	Sfxn4 (ENSRNOG00000036572)	Prdx3 (ENSRNOG00000010958)	Grk5 (ENSRNOG00000011439)	LOC102550291 (ENSRNOG00000032668)	LOC102550729 (ENSRNOG00000066489)	RGD1563099 (ENSRNOG00000051496)	Ces2i (ENSRNOG00000012034)	Ces2c (ENSRNOG00000036571)
Rat	DUPLICATION
Rat	MODERN SPECIES	14	Vom1r74 (ENSRNOG00000063497)	Vom1r73 (ENSRNOG00000062405)	Vom1r72 (ENSRNOG00000062606)	Vom1r71 (ENSRNOG00000047851)	Vom1r69 (ENSRNOG00000063291)	Vom1r68 (ENSRNOG00000062765)	ENSRNOG00000067683	Vom1r66 (ENSRNOG00000063440)	Vom1r67 (ENSRNOG00000070293)	Vom1r65 (ENSRNOG00000057387)	Nt5c3a (ENSRNOG00000005981)	Fkbp9 (ENSRNOG00000005478)	Kbtbd2 (ENSRNOG00000013809)	Avl9 (ENSRNOG00000013314)	Lsm5 (ENSRNOG00000042126)	ENSRNOG00000069707 #22	Pde1c (ENSRNOG00000012337)	Ppp1r17 (ENSRNOG00000012235)	Itprid1 (ENSRNOG00000012165)	Neurod6 (ENSRNOG00000026055)	Adcyap1r1 (ENSRNOG00000012098)	Ghrhr (ENSRNOG00000011808)	Aqp1 (ENSRNOG00000011648)	Mindy4 (ENSRNOG00000011530)	Inmt (ENSRNOG00000011250)	Crhr2 (ENSRNOG00000011145)	Gars1 (ENSRNOG00000011052)	AABR07060610.1 (ENSRNOG00000033748)	Ggct (ENSRNOG00000034084)	Nod1 (ENSRNOG00000010629)	Znrf2 (ENSRNOG00000049057)
Rat	MODERN SPECIES	1	Smurf2 (ENSRNOG00000014623)	Kpna2 (ENSRNOG00000015329)	C10h17orf58 (ENSRNOG00000043295)	Bptf (ENSRNOG00000047296)	Nol11 (ENSRNOG00000052934)	Pitpnc1 (ENSRNOG00000069160)	RGD1359290 (ENSRNOG00000027271)	ENSRNOG00000065925	Psmd12 (ENSRNOG00000003117)	Helz (ENSRNOG00000003213)	Cacng1 (ENSRNOG00000003245)	Cacng4 (ENSRNOG00000003262)	Cacng5 (ENSRNOG00000003288)	Prkca (ENSRNOG00000003491)	Apoh (ENSRNOG00000003566)	AABR07030630.1 (ENSRNOG00000052124) #22	Cep112 (ENSRNOG00000024557)	Axin2 (ENSRNOG00000055010)	RGD1565459 (ENSRNOG00000033613)	Rgs9 (ENSRNOG00000003800)	AC106648.1 (ENSRNOG00000042252)	Gna13 (ENSRNOG00000063135)	Amz2 (ENSRNOG00000000246)	Slc16a6 (ENSRNOG00000000245)	Arsg (ENSRNOG00000003931)	Wipi1 (ENSRNOG00000003827)	Prkar1a (ENSRNOG00000049876)	Fam20a (ENSRNOG00000003969)	RGD1559578 (ENSRNOG00000024233)	Abca8 (ENSRNOG00000004040)	Abca8a (ENSRNOG00000004147)
Rat	MODERN SPECIES	6	LOC120096939 (ENSRNOG00000065418)	ENSRNOG00000070413	Ptgdr (ENSRNOG00000031535)	LOC100363427 (ENSRNOG00000066375)	ENSRNOG00000063234	AABR07017236.2 (ENSRNOG00000057837)	AABR07017236.1 (ENSRNOG00000024504)	Flnb (ENSRNOG00000009470)	LOC108353015 (ENSRNOG00000061275)	Dnase1l3 (ENSRNOG00000009291)	Abhd6 (ENSRNOG00000008167)	Rpp14 (ENSRNOG00000039829)	Rpp14 (ENSRNOG00000063660)	Pxk (ENSRNOG00000008024)	Pdhb (ENSRNOG00000007895)	AABR07072440.1 (ENSRNOG00000033030) #22	ENSRNOG00000028821	Kctd6 (ENSRNOG00000007817)	Acox2 (ENSRNOG00000007378)	Fam107a (ENSRNOG00000033261)	Fam3d (ENSRNOG00000007320)	ENSRNOG00000070952	Cfap20dc (ENSRNOG00000007206)	Fhit (ENSRNOG00000064939)	Tpt1-ps2 (ENSRNOG00000070732)	Ptprg (ENSRNOG00000009419)	LOC103693281 (ENSRNOG00000063454)	RGD1306063 (ENSRNOG00000039871)	Fezf2 (ENSRNOG00000009206)	Cadps (ENSRNOG00000008570)	ENSRNOG00000068103
Mus	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b #22
Shrew mouse	MODERN SPECIES	16	Card9 (MGP_PahariEiJ_G0024769)	Snapc4 (MGP_PahariEiJ_G0024770)	Entr1 (MGP_PahariEiJ_G0024771)	Pmpca (MGP_PahariEiJ_G0024772)	Inpp5e (MGP_PahariEiJ_G0024773)	Sec16a (MGP_PahariEiJ_G0024774)	Notch1 (MGP_PahariEiJ_G0024775)	Egfl7 (MGP_PahariEiJ_G0024776)	MGP_PahariEiJ_G0024777	Agpat2 (MGP_PahariEiJ_G0024778)	Dipk1b (MGP_PahariEiJ_G0024779)	Lcn4 (MGP_PahariEiJ_G0024780) #18	Abo (MGP_PahariEiJ_G0024781) ##17	Surf6 (MGP_PahariEiJ_G0024782) #20	Med22 (MGP_PahariEiJ_G0024783) #21	MGP_PahariEiJ_G0024784 #22	Surf1 (MGP_PahariEiJ_G0024785) #23	Surf2 (MGP_PahariEiJ_G0024786) #24	Surf4 (MGP_PahariEiJ_G0024787) #25	Stkld1 (MGP_PahariEiJ_G0024788) #26	Rexo4 (MGP_PahariEiJ_G0024789) #27	Adamts13 (MGP_PahariEiJ_G0024790) #28	Cacfd1 (MGP_PahariEiJ_G0024791) #29	Slc2a6 (MGP_PahariEiJ_G0024792) #30	Mymk (MGP_PahariEiJ_G0024793) #31	Adamtsl2 (MGP_PahariEiJ_G0024794) #32	Fam163b (MGP_PahariEiJ_G0024795) #33	Dbh (MGP_PahariEiJ_G0024796) #34	Sardh (MGP_PahariEiJ_G0024797) #35	Vav2 (MGP_PahariEiJ_G0024798) #36	Brd3 (MGP_PahariEiJ_G0024799)
Mus_A	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b #22
Mus_B	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b #22
Mus_C	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b #22
Steppe mouse	DUPLICATION
Steppe mouse	MODERN SPECIES	35															Hecw1 (ENSMSIG00000017159)	ENSMSIG00000017216 #22	Arid4b (ENSMSIG00000017230)	Ggps1 (ENSMSIG00000017308)	Tbce (ENSMSIG00000017330)	B3galnt2 (ENSMSIG00000017362)	ENSMSIG00000017641	Gng4 (ENSMSIG00000017646)
Steppe mouse	MODERN SPECIES	3234						Crem (ENSMSIG00000021310)	Cul2 (ENSMSIG00000021240)	ENSMSIG00000021213 #16	Bambi (ENSMSIG00000021200)	ENSMSIG00000021196	ENSMSIG00000021191	ENSMSIG00000021186	Map3k8 (ENSMSIG00000021174)	Mtpap (ENSMSIG00000021163)	Jcad (ENSMSIG00000021144)	ENSMSIG00000021138 #22	Svil (ENSMSIG00000019710)	Zfp438 (ENSMSIG00000019631)	Zeb1 (ENSMSIG00000019545)	Arhgap12 (ENSMSIG00000019302)	Kif5b (ENSMSIG00000019257)	Epc1 (ENSMSIG00000019175)
Cricetidae	ANCESTRAL SPECIES	71														ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22
Cricetinae	ANCESTRAL SPECIES																	ENSGT00940000153294.m.b #22
Chinese hamster chok1gshd	DUPLICATION
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	1	Pja2 (ENSCGRG00001011203)	Fer (ENSCGRG00001004390)	Fbxl17 (ENSCGRG00001011618)	Efna5 (ENSCGRG00001003426)	ENSCGRG00001006211	ENSCGRG00001011066	Nudt12 (ENSCGRG00001006711)	ENSCGRG00001003228	Macir (ENSCGRG00001009855)	Ppip5k2 (ENSCGRG00001002274)	Gin1 (ENSCGRG00001004458)	Pam (ENSCGRG00001011006)	ENSCGRG00001010780	Slco4c1 (ENSCGRG00001010874)	ENSCGRG00001003799	ENSCGRG00001004644 #22	St8sia4 (ENSCGRG00001004612)	ENSCGRG00001010345	Fam174a (ENSCGRG00001002695)	Pdcd1 (ENSCGRG00001002477)	Neu4 (ENSCGRG00001009931)	ENSCGRG00001000728	D2hgdh (ENSCGRG00001002513)	Ing5 (ENSCGRG00001004863)	Dtymk (ENSCGRG00001000666)	Atg4b (ENSCGRG00001001760)	ENSCGRG00001006751	Thap4 (ENSCGRG00001002632)	Bok (ENSCGRG00001024808)	Stk25 (ENSCGRG00001005671)	Farp2 (ENSCGRG00001003923)
Chinese hamster chok1gshd	MODERN SPECIES	16	Steep1 (ENSCGRG00001022334)	ENSCGRG00001007178	Slc25a43 (ENSCGRG00001003699)	Akap17b (ENSCGRG00001018171)	Pgrmc1 (ENSCGRG00001019069)	ENSCGRG00001000825	Lonrf3 (ENSCGRG00001002226)	Zcchc12 (ENSCGRG00001011149)	Il13ra1 (ENSCGRG00001020150)	Dock11 (ENSCGRG00001021213)	Wdr44 (ENSCGRG00001022218)	Klhl13 (ENSCGRG00001021812)	ENSCGRG00001015227	ENSCGRG00001010136	Slc6a14 (ENSCGRG00001016499)	ENSCGRG00001015787 #22	Agtr2 (ENSCGRG00001009526)	ENSCGRG00001017952	ENSCGRG00001019114	Pls3 (ENSCGRG00001011289)	ENSCGRG00001004444	Lrch2 (ENSCGRG00001020464)	Il13ra2 (ENSCGRG00001001265)	Htr2c (ENSCGRG00001017187)	ENSCGRG00001012570	ENSCGRG00001019270	ENSCGRG00001021667	Amot (ENSCGRG00001022119)	Lhfpl1 (ENSCGRG00001022195)	Rtl4 (ENSCGRG00001001788)	Trpc5 (ENSCGRG00001002419)
Cricetidae_B	ANCESTRAL SPECIES	103														ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22
Prairie vole	DUPLICATION
Prairie vole	MODERN SPECIES	353	Klhl7 (ENSMOCG00000014969)	Nupl2 (ENSMOCG00000014431)	Gpnmb (ENSMOCG00000017232)	Malsu1 (ENSMOCG00000011177)	Igf2bp3 (ENSMOCG00000001740)	ENSMOCG00000014464	ENSMOCG00000007609	Ccdc126 (ENSMOCG00000004033)	Fam221a (ENSMOCG00000005873)	Stk31 (ENSMOCG00000005284)	Plekha8 (ENSMOCG00000012638)	Fkbp14 (ENSMOCG00000002920)	Scrn1 (ENSMOCG00000001909)	Wipf3 (ENSMOCG00000016079)	Prr15 (ENSMOCG00000008900)	ENSMOCG00000006975 #22	Chn2 (ENSMOCG00000020808)	ENSMOCG00000002376	Cpvl (ENSMOCG00000021500)	Tril (ENSMOCG00000001138)	Creb5 (ENSMOCG00000012076)	Jazf1 (ENSMOCG00000019670)	Tax1bp1 (ENSMOCG00000011041)	Hibadh (ENSMOCG00000020758)	Mturn (ENSMOCG00000019319)	ENSMOCG00000008922	Nod1 (ENSMOCG00000022664)	Ggct (ENSMOCG00000001055)	Gars (ENSMOCG00000017680)	Crhr2 (ENSMOCG00000019712)	Inmt (ENSMOCG00000015765)
Prairie vole	MODERN SPECIES	354	Inpp5d (ENSMOCG00000020774)	Atg16l1 (ENSMOCG00000022107)	Sag (ENSMOCG00000010548)	Dgkd (ENSMOCG00000013358)	Usp40 (ENSMOCG00000013866)	Dnajb3 (ENSMOCG00000005295)	Ugt1a1 (ENSMOCG00000006377)	Mroh2a (ENSMOCG00000016439)	Hjurp (ENSMOCG00000013256)	Trpm8 (ENSMOCG00000011314)	Spp2 (ENSMOCG00000019546)	Arl4c (ENSMOCG00000006232)	Sh3bp4 (ENSMOCG00000008692)	Agap1 (ENSMOCG00000017793)	Gbx2 (ENSMOCG00000000815)	ENSMOCG00000022588 #22	Asb18 (ENSMOCG00000021264)	Iqca (ENSMOCG00000001121)	Ackr3 (ENSMOCG00000011622)	ENSMOCG00000010460	Col6a3 (ENSMOCG00000012323)	Mlph (ENSMOCG00000002134)	Prlh (ENSMOCG00000018025)	Rab17 (ENSMOCG00000006448)	ENSMOCG00000017590	Rbm44 (ENSMOCG00000001523)	Ramp1 (ENSMOCG00000020434)	Ube2f (ENSMOCG00000015739)	Scly (ENSMOCG00000000935)	Espnl (ENSMOCG00000004560)	Klhl30 (ENSMOCG00000014281)
Northern American deer mouse	DUPLICATION
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	18	Cdk13 (ENSPEMG00000020703)	ENSPEMG00000027212	Rala (ENSPEMG00000026406)	Yae1d1 (ENSPEMG00000026901)	ENSPEMG00000020563	Vps41 (ENSPEMG00000022150)	Amph (ENSPEMG00000001572)	ENSPEMG00000030093	ENSPEMG00000030898	Stard3nl (ENSPEMG00000012415)	Epdr1 (ENSPEMG00000028013)	Sfrp4 (ENSPEMG00000023817)	Nme8 (ENSPEMG00000021510)	Gpr141b (ENSPEMG00000029118)	Gpr141 (ENSPEMG00000004105)	ENSPEMG00000027404 #22	Elmo1 (ENSPEMG00000018278)	Aoah (ENSPEMG00000010535)	Or2p2 (ENSPEMG00000005086)	ENSPEMG00000022745	Or2ad1 (ENSPEMG00000001338)	Trim27 (ENSPEMG00000022731)	Gpx5 (ENSPEMG00000022573)	Gpx6 (ENSPEMG00000013981)	Or2b28 (ENSPEMG00000027072)	ENSPEMG00000026606	Zkscan3 (ENSPEMG00000030234)	Zscan26 (ENSPEMG00000021720)	Nkapl (ENSPEMG00000027175)	Zkscan4 (ENSPEMG00000002530)	ENSPEMG00000030945
Northern American deer mouse	MODERN SPECIES	7	Bend3 (ENSPEMG00000031300)	Mtres1 (ENSPEMG00000019114)	ENSPEMG00000029014	ENSPEMG00000009329	Qrsl1 (ENSPEMG00000009855)	Rtn4ip1 (ENSPEMG00000009749)	Crybg1 (ENSPEMG00000006428)	Atg5 (ENSPEMG00000023746)	Prdm1 (ENSPEMG00000023622)	Prep (ENSPEMG00000015306)	Popdc3 (ENSPEMG00000012534)	Bves (ENSPEMG00000014540)	Lin28b (ENSPEMG00000015724)	Hace1 (ENSPEMG00000006907)	ENSPEMG00000025768	ENSPEMG00000028199 #22	ENSPEMG00000024704	Grik2 (ENSPEMG00000016459)	ENSPEMG00000013305	Ascc3 (ENSPEMG00000015319)	Sim1 (ENSPEMG00000029968)
Rodentia_A	ANCESTRAL SPECIES	11	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.b ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT01050000248521	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35
Hystricomorpha	ANCESTRAL SPECIES	7	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.a.c.b ##22	ENSGT00940000155193.a.a.f	ENSGT00390000014818	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT01050000248521	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Hystricomorpha_a	ANCESTRAL SPECIES	5	ENSGT00940000154667.a	ENSGT00390000008220	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.l #18	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01090000263159
Hystricomorpha_b	ANCESTRAL SPECIES	36	ENSGT00940000160570	ENSGT00940000160404	ENSGT00390000000560	ENSGT00940000156724	ENSGT00940000158199	ENSGT00940000159324	ENSGT00940000157157.b	ENSGT00940000160015	ENSGT00390000008726.h.a	ENSGT00390000006452.b.a	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.l #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.k.b #18	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.k.a #18	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36	ENSGT01090000263159
Long-tailed chinchilla	MODERN SPECIES	220	BARHL1 (ENSCLAG00000013082) #8	DDX31 (ENSCLAG00000008431) #9	GTF3C4 (ENSCLAG00000009930) #10	AK8 (ENSCLAG00000010073) #11	SPACA9 (ENSCLAG00000013602) #12	TSC1 (ENSCLAG00000012367) #13	GFI1B (ENSCLAG00000009914) #14	GTF3C5 (ENSCLAG00000011273) #15	CEL (ENSCLAG00000009166)	RALGDS (ENSCLAG00000004723) #16	GBGT1 (ENSCLAG00000005202) #17	ENSCLAG00000005378 #18	ENSCLAG00000005902 #18	SURF6 (ENSCLAG00000004429) #20	MED22 (ENSCLAG00000004487) #21	ENSCLAG00000006800 #22	SURF1 (ENSCLAG00000008095) #23	SURF2 (ENSCLAG00000009277) #24	SURF4 (ENSCLAG00000010537) #25	STKLD1 (ENSCLAG00000011038) #26	REXO4 (ENSCLAG00000006919) #27	ADAMTS13 (ENSCLAG00000007542) #28	CACFD1 (ENSCLAG00000008418) #29	SLC2A6 (ENSCLAG00000005054) #30	MYMK (ENSCLAG00000006416) #31	ADAMTSL2 (ENSCLAG00000009177) #32	FAM163B (ENSCLAG00000014453) #33	DBH (ENSCLAG00000011674) #34	SARDH (ENSCLAG00000004708) #35	VAV2 (ENSCLAG00000004486) #36	ENSCLAG00000017720
Degu	DUPLICATION
Degu	MODERN SPECIES	164	GPSM1 (ENSODEG00000015347)	DNLZ (ENSODEG00000015199)	CARD9 (ENSODEG00000015926)	ENSODEG00000015531	ENSODEG00000015730	PMPCA (ENSODEG00000014945)	INPP5E (ENSODEG00000015384)	SEC16A (ENSODEG00000015396)	NOTCH1 (ENSODEG00000015576)	EGFL7 (ENSODEG00000016479)	AGPAT2 (ENSODEG00000015549)	DIPK1B (ENSODEG00000015451)	ENSODEG00000015745 #18	SURF6 (ENSODEG00000015789) #20	MED22 (ENSODEG00000015723) #21	ENSODEG00000016465 #22	SURF1 (ENSODEG00000016201) #23	SURF2 (ENSODEG00000015768) #24	SURF4 (ENSODEG00000015392) #25	STKLD1 (ENSODEG00000015481) #26	REXO4 (ENSODEG00000015721) #27	ADAMTS13 (ENSODEG00000016041) #28	CACFD1 (ENSODEG00000015773) #29	SLC2A6 (ENSODEG00000016923) #30	MYMK (ENSODEG00000015871) #31	ADAMTSL2 (ENSODEG00000015642) #32	FAM163B (ENSODEG00000015539) #33	DBH (ENSODEG00000015985) #34	SARDH (ENSODEG00000016561) #35	VAV2 (ENSODEG00000015817) #36	BRD3 (ENSODEG00000016350)
Degu	MODERN SPECIES	147											ROBO1 (ENSODEG00000002460)	ROBO2 (ENSODEG00000002784)	LIPI (ENSODEG00000003255)	HSPA13 (ENSODEG00000000402)	SAMSN1 (ENSODEG00000000435)	ENSODEG00000018579 #22	NRIP1 (ENSODEG00000018584)	USP25 (ENSODEG00000000485)	ENSODEG00000000631	CXADR (ENSODEG00000000658)	ENSODEG00000000738	C21orf91 (ENSODEG00000000761)	CHODL (ENSODEG00000000802)	TMPRSS15 (ENSODEG00000000865)	ENSODEG00000000936
Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	6	ENSGT00940000159729	ENSGT00390000014476 #7	ENSGT00940000160428 #8	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	6	QSOX2 (ENSSVLG00005025160)	LHX3 (ENSSVLG00005025119)	TMEM250 (ENSSVLG00005025103)	NACC2 (ENSSVLG00005025091)	UBAC1 (ENSSVLG00005025073)	CAMSAP1 (ENSSVLG00005025049)	KCNT1 (ENSSVLG00005024585)	LCN9 (ENSSVLG00005024137) ##19	GLT6D1 (ENSSVLG00005024094) ##17	ENSSVLG00005024053	ENSSVLG00005024035 ##19	ENSSVLG00005024000 #18	ENSSVLG00005023982 #19	SURF6 (ENSSVLG00005023958) #20	MED22 (ENSSVLG00005023932) #21	ENSSVLG00005023881 #22	SURF1 (ENSSVLG00005023857) #23	SURF2 (ENSSVLG00005023844) #24	SURF4 (ENSSVLG00005023794) #25	STKLD1 (ENSSVLG00005023713) #26	REXO4 (ENSSVLG00005023657) #27	ENSSVLG00005023604 #28	ENSSVLG00005023576	CACFD1 (ENSSVLG00005023540) #29	SLC2A6 (ENSSVLG00005023408) #30	MYMK (ENSSVLG00005023355) #31	ADAMTSL2 (ENSSVLG00005023256) #32	FAM163B (ENSSVLG00005023227) #33	DBH (ENSSVLG00005023140) #34	SARDH (ENSSVLG00005023038) #35	VAV2 (ENSSVLG00005022963) #36
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	1	ENSGT00390000014476 #7	ENSGT00940000160428 #8	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	2	ENSGT00390000014476 #7	ENSGT00940000160428 #8	ENSGT00550000075041 #9	ENSGT00390000011873 #10	ENSGT00940000161613 #11	ENSGT00390000007746 #12	ENSGT00390000014148 #13	ENSGT00940000160010 #14	ENSGT00390000004458 #15	ENSGT00940000156231	ENSGT00940000153181.z #16	ENSGT00950000182858.A.b.b #17	ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b #18	ENSGT00390000006980 #20	ENSGT00390000004339 #21	ENSGT00940000153294.m.b #22	ENSGT00530000064194 #23	ENSGT00390000016800 #24	ENSGT00530000064123 #25	ENSGT00390000018038 #26	ENSGT00940000159607 #27	ENSGT00940000158379 #28	ENSGT00940000178229	ENSGT00390000000529 #29	ENSGT00940000159976 #30	ENSGT00940000160710 #31	ENSGT00940000159447 #32	ENSGT00940000159387 #33	ENSGT00530000063085.B #34	ENSGT00940000157589 #35	ENSGT00940000159718 #36
Squirrel	MODERN SPECIES	269														SURF6 (ENSSTOG00000020164) #20	MED22 (ENSSTOG00000029035) #21	ENSSTOG00000003671 #22	SURF1 (ENSSTOG00000003694) #23	SURF2 (ENSSTOG00000003709) #24	SURF4 (ENSSTOG00000003719) #25	STKLD1 (ENSSTOG00000003731) #26	REXO4 (ENSSTOG00000003754) #27	ADAMTS13 (ENSSTOG00000003765) #28	ENSSTOG00000029752	CACFD1 (ENSSTOG00000003808) #29	SLC2A6 (ENSSTOG00000003816) #30	MYMK (ENSSTOG00000025119) #31	ADAMTSL2 (ENSSTOG00000019622) #32	FAM163B (ENSSTOG00000020618) #33	DBH (ENSSTOG00000025607) #34	SARDH (ENSSTOG00000004316) #35	VAV2 (ENSSTOG00000028773) #36
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	156	CFAP77 (ENSUPAG00010011437) #7	BARHL1 (ENSUPAG00010011426) #8	DDX31 (ENSUPAG00010011408) #9	ENSUPAG00010011403 #10	AK8 (ENSUPAG00010011364) #11	SPACA9 (ENSUPAG00010011343) #12	TSC1 (ENSUPAG00010011312) #13	GFI1B (ENSUPAG00010011298) #14	GTF3C5 (ENSUPAG00010011268) #15	CEL (ENSUPAG00010011253)	RALGDS (ENSUPAG00010009287) #16	GBGT1 (ENSUPAG00010009274) #17	ENSUPAG00010009264 #18	SURF6 (ENSUPAG00010009255) #20	MED22 (ENSUPAG00010009242) #21	ENSUPAG00010009198 #22	SURF1 (ENSUPAG00010009179) #23	ENSUPAG00010009151 #24	SURF4 (ENSUPAG00010009141) #25	STKLD1 (ENSUPAG00010009115) #26	REXO4 (ENSUPAG00010008958) #27	ADAMTS13 (ENSUPAG00010008908) #28	ENSUPAG00010008892	CACFD1 (ENSUPAG00010008860) #29	SLC2A6 (ENSUPAG00010008783) #30	MYMK (ENSUPAG00010008772) #31	ADAMTSL2 (ENSUPAG00010008744) #32	FAM163B (ENSUPAG00010008738) #33	DBH (ENSUPAG00010008724) #34	SARDH (ENSUPAG00010008680) #35	VAV2 (ENSUPAG00010008660) #36
Alpin marmot	DUPLICATION
Alpin marmot	MODERN SPECIES	1	NDUFB1 (ENSMMMG00000021282)	ATXN3 (ENSMMMG00000021276)	ENSMMMG00000021267	FBLN5 (ENSMMMG00000021250)	TC2N (ENSMMMG00000021222)	ENSMMMG00000021215	ENSMMMG00000021204	PPP4R3A (ENSMMMG00000021190)	CCDC88C (ENSMMMG00000020527)	GPR68 (ENSMMMG00000020514)	RPS6KA5 (ENSMMMG00000020471)	TTC7B (ENSMMMG00000020445)	CALM1 (ENSMMMG00000020416)	NRDE2 (ENSMMMG00000020400)	PSMC1 (ENSMMMG00000020391)	ENSMMMG00000020367 #22	KCNK13 (ENSMMMG00000020361)	TDP1 (ENSMMMG00000020339)	EFCAB11 (ENSMMMG00000020326)	FOXN3 (ENSMMMG00000020285)	TTC8 (ENSMMMG00000020231)	EML5 (ENSMMMG00000020125)	ZC3H14 (ENSMMMG00000020046)	ENSMMMG00000020019	SPATA7 (ENSMMMG00000019962)	KCNK10 (ENSMMMG00000019948)	GPR65 (ENSMMMG00000019938)	GALC (ENSMMMG00000019834)	FLRT2 (ENSMMMG00000019832)	ENSMMMG00000019815	SEL1L (ENSMMMG00000019769)
Alpin marmot	MODERN SPECIES	106															MED22 (ENSMMMG00000013316) #21	ENSMMMG00000013289 #22	SURF1 (ENSMMMG00000013272) #23	SURF2 (ENSMMMG00000013265) #24	SURF4 (ENSMMMG00000013258) #25	STKLD1 (ENSMMMG00000013221) #26	REXO4 (ENSMMMG00000013212) #27	ADAMTS13 (ENSMMMG00000013143) #28	CACFD1 (ENSMMMG00000013114) #29	SLC2A6 (ENSMMMG00000013088) #30	MYMK (ENSMMMG00000013077) #31	ADAMTSL2 (ENSMMMG00000013058) #32	FAM163B (ENSMMMG00000013054) #33	DBH (ENSMMMG00000013038) #34	SARDH (ENSMMMG00000013013) #35	VAV2 (ENSMMMG00000012975) #36	ENSMMMG00000012966