Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 65 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b #22 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.b #22 Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 13 Rpl9-ps31 (ENSRNOG00000030476) #7 ENSRNOG00000067433 #8 Abo3 (ENSRNOG00000039906) #9 ENSRNOG00000064101 #10 LOC681385 (ENSRNOG00000030708) #11 ENSRNOG00000069598 #12 LOC681385 (ENSRNOG00000043494) #13 Abo2 (ENSRNOG00000045801) #14 ENSRNOG00000070414 #15 AABR07051348.1 (ENSRNOG00000059455) #16 AABR07051348.2 (ENSRNOG00000060791) #17 Rps13 (ENSRNOG00000067444) #18 Abo (ENSRNOG00000046958) #19 Surf6 (ENSRNOG00000005031) #20 Med22 (ENSRNOG00000005059) #21 Rpl7a (ENSRNOG00000070974) #22 Surf4 (ENSRNOG00000060005) #23 Surf1 (ENSRNOG00000005247) #24 Surf2 (ENSRNOG00000066832) #25 Stkld1 (ENSRNOG00000027911) #26 Rexo4 (ENSRNOG00000027867) #27 Adamts13 (ENSRNOG00000005780) #28 Cacfd1 (ENSRNOG00000005840) #29 Slc2a6 (ENSRNOG00000005900) #30 Gm13398 (ENSRNOG00000070103) #31 Mymk (ENSRNOG00000006142) #32 Adamtsl2 (ENSRNOG00000027742) #33 Fam163b (ENSRNOG00000065438) #34 Dbh (ENSRNOG00000006641) #35 Sardh (ENSRNOG00000006916) #36 Vav2 (ENSRNOG00000007422) #37 Rat MODERN SPECIES 9 ENSRNOG00000062351 ENSRNOG00000069260 Dsc1 (ENSRNOG00000056258) Dsc2 (ENSRNOG00000039969) Dsc3 (ENSRNOG00000017159) Cdh2 (ENSRNOG00000015602) AC118833.1 (ENSRNOG00000038412) Chst9 (ENSRNOG00000015867) Aqp4 (ENSRNOG00000016043) Rpl39 (ENSRNOG00000034237) Kctd1 (ENSRNOG00000016467) Taf4b (ENSRNOG00000026023) Psma8 (ENSRNOG00000030363) Ss18 (ENSRNOG00000016800) Zfp521 (ENSRNOG00000016874) LOC108349606 (ENSRNOG00000031244) ##22 Hrh4 (ENSRNOG00000016887) Impact (ENSRNOG00000045844) Osbpl1a (ENSRNOG00000054058) Cabyr (ENSRNOG00000047436) Ttc39c (ENSRNOG00000050949) Lama3 (ENSRNOG00000011300) Ankrd29 (ENSRNOG00000046744) Npc1 (ENSRNOG00000012016) Rmc1 (ENSRNOG00000012597) Riok3 (ENSRNOG00000023376) Tmem241 (ENSRNOG00000023412) Cables1 (ENSRNOG00000012795) Rbbp8 (ENSRNOG00000012899) Gata6 (ENSRNOG00000023433) ENSRNOG00000071008 Rat MODERN SPECIES LOC681006 (ENSRNOG00000025953) Hspa12a (ENSRNOG00000018019) ENSRNOG00000068353 Eno4 (ENSRNOG00000018310) Shtn1 (ENSRNOG00000018350) Vax1 (ENSRNOG00000008824) Kcnk18 (ENSRNOG00000032706) Slc18a2 (ENSRNOG00000008890) Pdzd8 (ENSRNOG00000009460) Emx2 (ENSRNOG00000009482) Rab11fip2 (ENSRNOG00000009523) Fam204a (ENSRNOG00000009830) Prlhr (ENSRNOG00000009922) Cacul1 (ENSRNOG00000009954) LOC100359574 (ENSRNOG00000025154) AABR07007121.1 (ENSRNOG00000033843) ##22 Nanos1 (ENSRNOG00000025060) Eif3a (ENSRNOG00000010117) Dennd10 (ENSRNOG00000010230) Sfxn4 (ENSRNOG00000036572) Prdx3 (ENSRNOG00000010958) Grk5 (ENSRNOG00000011439) LOC102550291 (ENSRNOG00000032668) LOC102550729 (ENSRNOG00000066489) RGD1563099 (ENSRNOG00000051496) Ces2i (ENSRNOG00000012034) Ces2c (ENSRNOG00000036571) Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 14 Vom1r74 (ENSRNOG00000063497) Vom1r73 (ENSRNOG00000062405) Vom1r72 (ENSRNOG00000062606) Vom1r71 (ENSRNOG00000047851) Vom1r69 (ENSRNOG00000063291) Vom1r68 (ENSRNOG00000062765) ENSRNOG00000067683 Vom1r66 (ENSRNOG00000063440) Vom1r67 (ENSRNOG00000070293) Vom1r65 (ENSRNOG00000057387) Nt5c3a (ENSRNOG00000005981) Fkbp9 (ENSRNOG00000005478) Kbtbd2 (ENSRNOG00000013809) Avl9 (ENSRNOG00000013314) Lsm5 (ENSRNOG00000042126) ENSRNOG00000069707 ##22 Pde1c (ENSRNOG00000012337) Ppp1r17 (ENSRNOG00000012235) Itprid1 (ENSRNOG00000012165) Neurod6 (ENSRNOG00000026055) Adcyap1r1 (ENSRNOG00000012098) Ghrhr (ENSRNOG00000011808) Aqp1 (ENSRNOG00000011648) Mindy4 (ENSRNOG00000011530) Inmt (ENSRNOG00000011250) Crhr2 (ENSRNOG00000011145) Gars1 (ENSRNOG00000011052) AABR07060610.1 (ENSRNOG00000033748) Ggct (ENSRNOG00000034084) Nod1 (ENSRNOG00000010629) Znrf2 (ENSRNOG00000049057) Rat MODERN SPECIES 1 Smurf2 (ENSRNOG00000014623) Kpna2 (ENSRNOG00000015329) C10h17orf58 (ENSRNOG00000043295) Bptf (ENSRNOG00000047296) Nol11 (ENSRNOG00000052934) Pitpnc1 (ENSRNOG00000069160) RGD1359290 (ENSRNOG00000027271) ENSRNOG00000065925 Psmd12 (ENSRNOG00000003117) Helz (ENSRNOG00000003213) Cacng1 (ENSRNOG00000003245) Cacng4 (ENSRNOG00000003262) Cacng5 (ENSRNOG00000003288) Prkca (ENSRNOG00000003491) Apoh (ENSRNOG00000003566) AABR07030630.1 (ENSRNOG00000052124) ##22 Cep112 (ENSRNOG00000024557) Axin2 (ENSRNOG00000055010) RGD1565459 (ENSRNOG00000033613) Rgs9 (ENSRNOG00000003800) AC106648.1 (ENSRNOG00000042252) Gna13 (ENSRNOG00000063135) Amz2 (ENSRNOG00000000246) Slc16a6 (ENSRNOG00000000245) Arsg (ENSRNOG00000003931) Wipi1 (ENSRNOG00000003827) Prkar1a (ENSRNOG00000049876) Fam20a (ENSRNOG00000003969) RGD1559578 (ENSRNOG00000024233) Abca8 (ENSRNOG00000004040) Abca8a (ENSRNOG00000004147) Rat MODERN SPECIES 6 LOC120096939 (ENSRNOG00000065418) ENSRNOG00000070413 Ptgdr (ENSRNOG00000031535) LOC100363427 (ENSRNOG00000066375) ENSRNOG00000063234 AABR07017236.2 (ENSRNOG00000057837) AABR07017236.1 (ENSRNOG00000024504) Flnb (ENSRNOG00000009470) LOC108353015 (ENSRNOG00000061275) Dnase1l3 (ENSRNOG00000009291) Abhd6 (ENSRNOG00000008167) Rpp14 (ENSRNOG00000039829) Rpp14 (ENSRNOG00000063660) Pxk (ENSRNOG00000008024) Pdhb (ENSRNOG00000007895) AABR07072440.1 (ENSRNOG00000033030) ##22 ENSRNOG00000028821 Kctd6 (ENSRNOG00000007817) Acox2 (ENSRNOG00000007378) Fam107a (ENSRNOG00000033261) Fam3d (ENSRNOG00000007320) ENSRNOG00000070952 Cfap20dc (ENSRNOG00000007206) Fhit (ENSRNOG00000064939) Tpt1-ps2 (ENSRNOG00000070732) Ptprg (ENSRNOG00000009419) LOC103693281 (ENSRNOG00000063454) RGD1306063 (ENSRNOG00000039871) Fezf2 (ENSRNOG00000009206) Cadps (ENSRNOG00000008570) ENSRNOG00000068103 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.b #22 Shrew mouse MODERN SPECIES 16 Card9 (MGP_PahariEiJ_G0024769) Snapc4 (MGP_PahariEiJ_G0024770) Entr1 (MGP_PahariEiJ_G0024771) Pmpca (MGP_PahariEiJ_G0024772) Inpp5e (MGP_PahariEiJ_G0024773) Sec16a (MGP_PahariEiJ_G0024774) Notch1 (MGP_PahariEiJ_G0024775) Egfl7 (MGP_PahariEiJ_G0024776) MGP_PahariEiJ_G0024777 Agpat2 (MGP_PahariEiJ_G0024778) Dipk1b (MGP_PahariEiJ_G0024779) Lcn4 (MGP_PahariEiJ_G0024780) #13 Abo (MGP_PahariEiJ_G0024781) #19 Surf6 (MGP_PahariEiJ_G0024782) #20 Med22 (MGP_PahariEiJ_G0024783) #21 MGP_PahariEiJ_G0024784 #22 Surf1 (MGP_PahariEiJ_G0024785) Surf2 (MGP_PahariEiJ_G0024786) #25 Surf4 (MGP_PahariEiJ_G0024787) #24 Stkld1 (MGP_PahariEiJ_G0024788) #26 Rexo4 (MGP_PahariEiJ_G0024789) #27 Adamts13 (MGP_PahariEiJ_G0024790) #28 Cacfd1 (MGP_PahariEiJ_G0024791) #29 Slc2a6 (MGP_PahariEiJ_G0024792) #30 Mymk (MGP_PahariEiJ_G0024793) Adamtsl2 (MGP_PahariEiJ_G0024794) #33 Fam163b (MGP_PahariEiJ_G0024795) #34 Dbh (MGP_PahariEiJ_G0024796) #35 Sardh (MGP_PahariEiJ_G0024797) #36 Vav2 (MGP_PahariEiJ_G0024798) #37 Brd3 (MGP_PahariEiJ_G0024799) Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.b #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.b #22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 35 Hecw1 (ENSMSIG00000017159) ENSMSIG00000017216 #22 Arid4b (ENSMSIG00000017230) Ggps1 (ENSMSIG00000017308) Tbce (ENSMSIG00000017330) B3galnt2 (ENSMSIG00000017362) ENSMSIG00000017641 Gng4 (ENSMSIG00000017646) Steppe mouse MODERN SPECIES 3234 Crem (ENSMSIG00000021310) Cul2 (ENSMSIG00000021240) ENSMSIG00000021213 Bambi (ENSMSIG00000021200) ENSMSIG00000021196 ENSMSIG00000021191 ENSMSIG00000021186 Map3k8 (ENSMSIG00000021174) Mtpap (ENSMSIG00000021163) Jcad (ENSMSIG00000021144) ENSMSIG00000021138 #22 Svil (ENSMSIG00000019710) Zfp438 (ENSMSIG00000019631) Zeb1 (ENSMSIG00000019545) Arhgap12 (ENSMSIG00000019302) Kif5b (ENSMSIG00000019257) Epc1 (ENSMSIG00000019175) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.b #22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Pja2 (ENSCGRG00001011203) Fer (ENSCGRG00001004390) Fbxl17 (ENSCGRG00001011618) Efna5 (ENSCGRG00001003426) ENSCGRG00001006211 ENSCGRG00001011066 Nudt12 (ENSCGRG00001006711) ENSCGRG00001003228 Macir (ENSCGRG00001009855) Ppip5k2 (ENSCGRG00001002274) Gin1 (ENSCGRG00001004458) Pam (ENSCGRG00001011006) ENSCGRG00001010780 Slco4c1 (ENSCGRG00001010874) ENSCGRG00001003799 ENSCGRG00001004644 #22 St8sia4 (ENSCGRG00001004612) ENSCGRG00001010345 Fam174a (ENSCGRG00001002695) Pdcd1 (ENSCGRG00001002477) Neu4 (ENSCGRG00001009931) ENSCGRG00001000728 D2hgdh (ENSCGRG00001002513) Ing5 (ENSCGRG00001004863) Dtymk (ENSCGRG00001000666) Atg4b (ENSCGRG00001001760) ENSCGRG00001006751 Thap4 (ENSCGRG00001002632) Bok (ENSCGRG00001024808) Stk25 (ENSCGRG00001005671) Farp2 (ENSCGRG00001003923) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 16 Steep1 (ENSCGRG00001022334) ENSCGRG00001007178 Slc25a43 (ENSCGRG00001003699) Akap17b (ENSCGRG00001018171) Pgrmc1 (ENSCGRG00001019069) ENSCGRG00001000825 Lonrf3 (ENSCGRG00001002226) Zcchc12 (ENSCGRG00001011149) Il13ra1 (ENSCGRG00001020150) Dock11 (ENSCGRG00001021213) Wdr44 (ENSCGRG00001022218) Klhl13 (ENSCGRG00001021812) ENSCGRG00001015227 ENSCGRG00001010136 Slc6a14 (ENSCGRG00001016499) ENSCGRG00001015787 #22 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