Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156231 #13 ENSGT00940000153181.z #14 ENSGT00950000182858.A.b.b #15 ENSGT00850000133605 ENSGT01050000244868.a.a.a.b.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT01050000244868.a.a.a.a.b ENSGT00950000182858.A.a.a #17 ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.a ##22 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 ENSGT00940000157589 #35 ENSGT00940000159718 #36 ENSGT01030000235088 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a 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ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 ENSGT00940000157589 #35 ENSGT00940000159718 #36 ENSGT00940000153385.b.a.a #37 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a #17 ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.a ##22 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 ENSGT00940000157589 #35 ENSGT00940000159718 #36 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00950000182858.A.a.a #17 ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 ENSGT00940000157589 #35 ENSGT00940000159718 #36 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.h ENSGT00950000182858.A.a.a #17 ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 ENSGT00940000157589 #35 ENSGT00940000159718 #36 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 53 Gtf3c4 (ENSJJAG00000017992) #7 Ak8 (ENSJJAG00000002840) #8 Spaca9 (ENSJJAG00000000472) #9 Tsc1 (ENSJJAG00000021403) #10 Gfi1b (ENSJJAG00000016355) #11 Gtf3c5 (ENSJJAG00000024195) #12 Cel (ENSJJAG00000022364) #13 Ralgds (ENSJJAG00000000521) #14 Gbgt1 (ENSJJAG00000023443) #15 ENSJJAG00000017040 #16 Abo (ENSJJAG00000018846) #17 ENSJJAG00000015760 #18 ENSJJAG00000019000 #19 Surf6 (ENSJJAG00000016287) #20 Med22 (ENSJJAG00000009802) #21 Rpl7a (ENSJJAG00000021747) #22 ENSJJAG00000009729 #23 Surf2 (ENSJJAG00000009756) #24 Surf4 (ENSJJAG00000010962) #25 Stkld1 (ENSJJAG00000009934) #26 Rexo4 (ENSJJAG00000013002) #27 Adamts13 (ENSJJAG00000021060) #28 Cacfd1 (ENSJJAG00000000810) #29 Slc2a6 (ENSJJAG00000023391) #30 Mymk (ENSJJAG00000011619) #31 ENSJJAG00000018204 #32 Fam163b (ENSJJAG00000021823) #33 Dbh (ENSJJAG00000022847) #34 Sardh (ENSJJAG00000017332) #35 Vav2 (ENSJJAG00000011963) #36 Brd3 (ENSJJAG00000004342) #37 Muroidea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.h ENSGT00950000182858.A.a.a #17 ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.a ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 ENSGT00940000157589 #35 ENSGT00940000159718 #36 ENSGT01020000230782 Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1249 Surf6 (ENSNGAG00000015358) #20 Med22 (ENSNGAG00000016629) #21 ENSNGAG00000018013 #22 Surf1 (ENSNGAG00000010694) #23 Surf2 (ENSNGAG00000013897) #24 Surf4 (ENSNGAG00000000231) #25 Stkld1 (ENSNGAG00000004625) #26 Rexo4 (ENSNGAG00000010700) #27 Adamts13 (ENSNGAG00000006298) #28 Cacfd1 (ENSNGAG00000016762) #29 Slc2a6 (ENSNGAG00000002630) #30 Mymk (ENSNGAG00000010978) #31 ENSNGAG00000004227 #32 Fam163b (ENSNGAG00000019126) #33 Dbh (ENSNGAG00000021288) #34 Sardh (ENSNGAG00000010560) #35 Vav2 (ENSNGAG00000016873) #36 Brd3 (ENSNGAG00000013052) #37 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1148 ENSNGAG00000017875 ENSNGAG00000020002 #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b.h ENSGT00950000182858.A.a.a #17 ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.a ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 ENSGT00940000157589 #35 ENSGT00940000159718 #36 ENSGT01020000230782 Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Rat MODERN SPECIES 17 Gm6569 (ENSRNOG00000065138) Mroh5 (ENSRNOG00000032827) Ptp4a3 (ENSRNOG00000007628) Slc45a4 (ENSRNOG00000007818) Dennd3 (ENSRNOG00000010794) RGD1564268 (ENSRNOG00000059955) Ptk2 (ENSRNOG00000007916) Ago2 (ENSRNOG00000008533) Chrac1 (ENSRNOG00000009103) Trappc9 (ENSRNOG00000027569) Kcnk9 (ENSRNOG00000009265) Col22a1 (ENSRNOG00000024824) Fam135b (ENSRNOG00000005159) Rps19l1 (ENSRNOG00000031474) Khdrbs3 (ENSRNOG00000009539) ENSRNOG00000070681 #22 Zfat (ENSRNOG00000025140) ENSRNOG00000067606 AABR07058284.1 (ENSRNOG00000062233) St3gal1 (ENSRNOG00000008209) Ndrg1 (ENSRNOG00000007393) Ccn4 (ENSRNOG00000007078) Sla (ENSRNOG00000056714) Tg (ENSRNOG00000006104) Phf20l1 (ENSRNOG00000005486) Tmem71 (ENSRNOG00000025460) ENSRNOG00000070626 Dnaaf11 (ENSRNOG00000005233) Kcnq3 (ENSRNOG00000005206) AABR07058254.1 (ENSRNOG00000054588) Oc90 (ENSRNOG00000025516) Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2727 Ascc3 (ENSMSIG00000031949) ENSMSIG00000031947 Sim1 (ENSMSIG00000031945) ENSMSIG00000031943 #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3314 Coch (ENSMSIG00000003151) Strn3 (ENSMSIG00000003232) Ap4s1 (ENSMSIG00000003653) Hectd1 (ENSMSIG00000003683) ENSMSIG00000003791 Heatr5a (ENSMSIG00000003804) Dtd2 (ENSMSIG00000003964) Gpr33 (ENSMSIG00000003989) Nubpl (ENSMSIG00000004004) Arhgap5 (ENSMSIG00000004050) Akap6 (ENSMSIG00000004164) Npas3 (ENSMSIG00000004473) ENSMSIG00000004706 ENSMSIG00000004720 Egln3 (ENSMSIG00000004731) ENSMSIG00000004766 #22 Steppe mouse MODERN SPECIES 3078 Eln (ENSMSIG00000017355) Limk1 (ENSMSIG00000017536) ENSMSIG00000017688 Lat2 (ENSMSIG00000017724) Rfc2 (ENSMSIG00000017808) ENSMSIG00000017829 #22 Syna (ENSMSIG00000017841) Clip2 (ENSMSIG00000017848) ENSMSIG00000017890 Gtf2ird1 (ENSMSIG00000017905) Gtf2i (ENSMSIG00000018304) Ncf1 (ENSMSIG00000019838) Gtf2ird2 (ENSMSIG00000019862) Rcc1l (ENSMSIG00000019888) ENSMSIG00000019903 Castor2 (ENSMSIG00000019905) Steppe mouse MODERN SPECIES 2666 Rtp2 (ENSMSIG00000026292) Sst (ENSMSIG00000026310) Rtp4 (ENSMSIG00000026325) Masp1 (ENSMSIG00000026344) Rtp1 (ENSMSIG00000026405) St6gal1 (ENSMSIG00000026429) ENSMSIG00000026450 #22 Adipoq (ENSMSIG00000026459) Rfc4 (ENSMSIG00000026466) Eif4a2 (ENSMSIG00000026500) ENSMSIG00000026633 Steppe mouse MODERN SPECIES 2854 Serpina3m (ENSMSIG00000011868) Serpina3a (ENSMSIG00000011911) Serpina3b (ENSMSIG00000011927) ENSMSIG00000011934 ENSMSIG00000011942 Serpina3i (ENSMSIG00000011979) Serpina3j (ENSMSIG00000011989) ENSMSIG00000012016 ENSMSIG00000012023 ENSMSIG00000012040 ENSMSIG00000012046 Dicer1 (ENSMSIG00000012054) Clmn (ENSMSIG00000012135) Syne3 (ENSMSIG00000012182) Glrx5 (ENSMSIG00000012449) 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Or10j3 (ENSPEMG00000029514) ENSPEMG00000014050 ENSPEMG00000002551 Or10j5 (ENSPEMG00000001889) Northern American deer mouse MODERN SPECIES P2ry2 (ENSPEMG00000031410) P2ry6 (ENSPEMG00000021012) Arhgef17 (ENSPEMG00000021637) Relt (ENSPEMG00000023784) Fam168a (ENSPEMG00000021865) Plekhb1 (ENSPEMG00000020658) Rab6a (ENSPEMG00000025121) Mrpl48 (ENSPEMG00000021769) ENSPEMG00000028127 Dnajb13 (ENSPEMG00000011854) Ucp2 (ENSPEMG00000022828) Ucp3 (ENSPEMG00000023921) C2cd3 (ENSPEMG00000020833) Ppme1 (ENSPEMG00000022717) P4ha3 (ENSPEMG00000023743) ENSPEMG00000021679 #22 Pgm2l1 (ENSPEMG00000021465) Kcne3 (ENSPEMG00000024743) Lipt2 (ENSPEMG00000009699) Pold3 (ENSPEMG00000016686) Chrdl2 (ENSPEMG00000000436) Rnf169 (ENSPEMG00000009722) Xrra1 (ENSPEMG00000022936) Spcs2 (ENSPEMG00000021621) Neu3 (ENSPEMG00000022579) Or2at1 (ENSPEMG00000001658) Or2at4 (ENSPEMG00000023224) Slco2b1 (ENSPEMG00000022027) Arrb1 (ENSPEMG00000024170) ENSPEMG00000027335 Rps3 (ENSPEMG00000021741) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000065015 ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00530000065015 ENSGT00940000154667.a ENSGT00390000008220 ENSGT00940000160570 ENSGT00940000160404 ENSGT00390000000560 ENSGT00940000156724 ENSGT00940000158199 ENSGT00940000159324 ENSGT00940000157157.b ENSGT00940000160015 ENSGT00390000008726.h.a ENSGT00390000006452.b.a ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT01050000248521 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Guinea pig MODERN SPECIES 18 ENSCPOG00000035077 GPSM1 (ENSCPOG00000027604) DNLZ (ENSCPOG00000022063) CARD9 (ENSCPOG00000015152) SNAPC4 (ENSCPOG00000006211) ENTR1 (ENSCPOG00000007252) PMPCA (ENSCPOG00000007258) INPP5E (ENSCPOG00000009596) SEC16A (ENSCPOG00000013586) NOTCH1 (ENSCPOG00000012958) ENSCPOG00000033928 AGPAT2 (ENSCPOG00000019769) DIPK1B (ENSCPOG00000025816) SURF6 (ENSCPOG00000030454) #20 MED22 (ENSCPOG00000001326) #21 RPL7A (ENSCPOG00000032895) #22 SURF1 (ENSCPOG00000001328) #23 SURF2 (ENSCPOG00000037286) #24 SURF4 (ENSCPOG00000035717) #25 STKLD1 (ENSCPOG00000021170) #26 REXO4 (ENSCPOG00000001386) #27 ADAMTS13 (ENSCPOG00000010285) #28 CACFD1 (ENSCPOG00000033970) #29 SLC2A6 (ENSCPOG00000011691) #30 MYMK (ENSCPOG00000021725) #31 ADAMTSL2 (ENSCPOG00000008139) #32 FAM163B (ENSCPOG00000035078) #33 DBH (ENSCPOG00000024518) #34 SARDH (ENSCPOG00000012251) #35 VAV2 (ENSCPOG00000000086) #36 ENSCPOG00000037823 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 43 ENSODEG00000016919 ENSODEG00000016623 ENSODEG00000016643 ENSODEG00000020344 ENSODEG00000016557 CAPN3 (ENSODEG00000017103) ENSODEG00000017288 GANC (ENSODEG00000016815) TMEM87A (ENSODEG00000016556) VPS39 (ENSODEG00000016980) PLA2G4F (ENSODEG00000016568) EHD4 (ENSODEG00000016665) JMJD7 (ENSODEG00000016738) ENSODEG00000016967 MGA (ENSODEG00000017016) ENSODEG00000020390 #22 ENSODEG00000020489 ENSODEG00000017041 ITPKA (ENSODEG00000016760) RTF1 (ENSODEG00000016921) CHP1 (ENSODEG00000016900) ENSODEG00000020443 ENSODEG00000017132 INO80 (ENSODEG00000016734) ENSODEG00000020409 CHAC1 (ENSODEG00000017045) DLL4 (ENSODEG00000017129) VPS18 (ENSODEG00000017271) ENSODEG00000016940 RHOV (ENSODEG00000017121) SPINT1 (ENSODEG00000017254) Degu MODERN SPECIES 54 ENSODEG00000006083 DNAJC3 (ENSODEG00000006169) DZIP1 (ENSODEG00000004942) ENSODEG00000005054 ABCC4 (ENSODEG00000005168) SOX21 (ENSODEG00000019452) GPR180 (ENSODEG00000007113) TGDS (ENSODEG00000005158) DCT (ENSODEG00000005228) GPC6 (ENSODEG00000005614) ENSODEG00000004646 #22 ENSODEG00000004771 ENSODEG00000004500 SLITRK5 (ENSODEG00000019086) ENSODEG00000019180 ENSODEG00000019443 SLITRK6 (ENSODEG00000007665) ENSODEG00000007865 ENSODEG00000019492 SLITRK1 (ENSODEG00000019121) ENSODEG00000019094 ENSODEG00000004945 SPRY2 (ENSODEG00000005276) NDFIP2 (ENSODEG00000005509) RBM26 (ENSODEG00000004663) OBI1 (ENSODEG00000005579) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 13 ENSSVLG00005003412 ENSSVLG00005003392 PCDH9 (ENSSVLG00005003324) ENSSVLG00005003304 ENSSVLG00005003295 ENSSVLG00005003280 ENSSVLG00005003268 ENSSVLG00005003249 ENSSVLG00005003235 ENSSVLG00005003218 TDRD3 (ENSSVLG00005003165) ENSSVLG00005003137 ENSSVLG00005003113 ENSSVLG00005003096 KLHL1 (ENSSVLG00005003019) ENSSVLG00005002970 #22 DACH1 (ENSSVLG00005002829) ENSSVLG00005002762 ENSSVLG00005002737 BORA (ENSSVLG00005002693) ENSSVLG00005002668 DIS3 (ENSSVLG00005002586) PIBF1 (ENSSVLG00005002538) KLF5 (ENSSVLG00005002517) KLF12 (ENSSVLG00005002485) TBC1D4 (ENSSVLG00005002276) ENSSVLG00005002138 COMMD6 (ENSSVLG00005002122) ENSSVLG00005002091 LMO7 (ENSSVLG00005001917) KCTD12 (ENSSVLG00005001791) Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 265 ENSUPAG00010004229 VWC2L (ENSUPAG00010004248) BARD1 (ENSUPAG00010004260) ENSUPAG00010004290 ABCA12 (ENSUPAG00010004294) ATIC (ENSUPAG00010004349) FN1 (ENSUPAG00010004397) MREG (ENSUPAG00010005248) PECR (ENSUPAG00010005257) TMEM169 (ENSUPAG00010005270) XRCC5 (ENSUPAG00010005275) MARCHF4 (ENSUPAG00010005287) ENSUPAG00010005289 #22 SMARCAL1 (ENSUPAG00010005292) RPL37A (ENSUPAG00010005317) Alpin marmot MODERN SPECIES 31 GABRP (ENSMMMG00000010504) KCNIP1 (ENSMMMG00000010524) ENSMMMG00000010588 KCNMB1 (ENSMMMG00000010599) LCP2 (ENSMMMG00000010608) C5orf58 (ENSMMMG00000010701) FOXI1 (ENSMMMG00000010708) DOCK2 (ENSMMMG00000010732) INSYN2B (ENSMMMG00000010818) SPDL1 (ENSMMMG00000010830) SLIT3 (ENSMMMG00000010861) ENSMMMG00000010921 RARS1 (ENSMMMG00000010943) WWC1 (ENSMMMG00000011450) TENM2 (ENSMMMG00000012441) ENSMMMG00000012514 #22 MAT2B (ENSMMMG00000012522) HMMR (ENSMMMG00000012544) ENSMMMG00000012622 NUDCD2 (ENSMMMG00000012628) CCNG1 (ENSMMMG00000012636) GABRG2 (ENSMMMG00000012646) GABRA1 (ENSMMMG00000012690) GABRA6 (ENSMMMG00000012710) GABRB2 (ENSMMMG00000012737) ATP10B (ENSMMMG00000012800) ENSMMMG00000012834 ENSMMMG00000012841 C1QTNF2 (ENSMMMG00000012860) CCNJL (ENSMMMG00000012864) FABP6 (ENSMMMG00000012902) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Pika MODERN SPECIES 5608 RPL7A (ENSOPRG00000005726) #22 Rabbit MODERN SPECIES 473 ENSOCUG00000037091 ENSOCUG00000037026 ENSOCUG00000026761 ENSOCUG00000029177 ENSOCUG00000017014 #17 ENSOCUG00000027911 ENSOCUG00000038941 ENSOCUG00000004760 ENSOCUG00000029529 ENSOCUG00000036317 ARL4A (ENSOCUG00000000108) ENSOCUG00000023854 ENSOCUG00000023576 ENSOCUG00000029686 ENSOCUG00000000307 ENSOCUG00000007825 #22 ENSOCUG00000039255 ENSOCUG00000013157 BRD3 (ENSOCUG00000005097) #37 Tree shrew MODERN SPECIES 2393 RPL7A (ENSTBEG00000008595) #22 MED22 (ENSTBEG00000000920) #21 SURF1 (ENSTBEG00000001205) #23 ENSTBEG00000002156 #24 SURF4 (ENSTBEG00000002959) #25 ENSTBEG00000003367 ENSTBEG00000004466 #28 Primates ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 #7 ENSGT00940000161613 #8 ENSGT00390000007746 #9 ENSGT00390000014148 #10 ENSGT00940000160010 #11 ENSGT00390000004458 #12 ENSGT00940000156231 #13 ENSGT00940000153181.z #14 ENSGT00950000182858.A.b.b #15 ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00940000178229 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 Mouse lemur MODERN SPECIES 2 NOM1 (ENSMICG00000017531) LMBR1 (ENSMICG00000015471) ENSMICG00000044577 RNF32 (ENSMICG00000015458) SHH (ENSMICG00000027721) RBM33 (ENSMICG00000037987) ENSMICG00000028627 EN2 (ENSMICG00000036243) INSIG1 (ENSMICG00000031879) ENSMICG00000030603 PAXIP1 (ENSMICG00000014321) DPP6 (ENSMICG00000017845) ENSMICG00000026837 ENSMICG00000031851 XRCC2 (ENSMICG00000032376) ENSMICG00000012707 #22 KMT2C (ENSMICG00000001060) ENSMICG00000001057 GALNTL5 (ENSMICG00000046553) PRKAG2 (ENSMICG00000008109) RHEB (ENSMICG00000033790) ENSMICG00000031581 CRYGN (ENSMICG00000008093) WDR86 (ENSMICG00000035281) NUB1 (ENSMICG00000004796) SMARCD3 (ENSMICG00000004795) CHPF2 (ENSMICG00000031520) ABCF2 (ENSMICG00000004786) IQCA1L (ENSMICG00000004778) ASB10 (ENSMICG00000036188) GBX1 (ENSMICG00000038356) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 #7 ENSGT00940000161613 #8 ENSGT00390000007746 #9 ENSGT00390000014148 #10 ENSGT00940000160010 #11 ENSGT00390000004458 #12 ENSGT00940000156231 #13 ENSGT00940000153181.z #14 ENSGT00950000182858.A.b.b #15 ENSGT01050000244868.a.a.a.a.a.b ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.b #22 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 Tarsier MODERN SPECIES 5822 CELF3 (ENSTSYG00000033066) SNX27 (ENSTSYG00000008074) TUFT1 (ENSTSYG00000008414) CGN (ENSTSYG00000012029) ENSTSYG00000028013 PARD3 (ENSTSYG00000009870) ENSTSYG00000026187 #22 Simiiformes DUPLICATION Simiiformes DUPLICATION Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.a #22 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.a #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.a #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.a #22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.a #22 Gorilla MODERN SPECIES 13 TSSK2 (ENSGGOG00000006183) ESS2 (ENSGGOG00000006187) GSC2 (ENSGGOG00000022383) ENSGGOG00000036832 SLC25A1 (ENSGGOG00000006198) CLTCL1 (ENSGGOG00000006207) HIRA (ENSGGOG00000000992) MRPL40 (ENSGGOG00000012336) ENSGGOG00000004101 UFD1 (ENSGGOG00000004104) CDC45 (ENSGGOG00000004116) SEPTIN5 (ENSGGOG00000016545) GP1BB (ENSGGOG00000025760) ENSGGOG00000009181 GNB1L (ENSGGOG00000039800) ENSGGOG00000038673 #22 ENSGGOG00000001980 COMT (ENSGGOG00000006699) ARVCF (ENSGGOG00000006706) TANGO2 (ENSGGOG00000004830) DGCR8 (ENSGGOG00000000780) TRMT2A (ENSGGOG00000000783) RANBP1 (ENSGGOG00000000784) ZDHHC8 (ENSGGOG00000000785) CCDC188 (ENSGGOG00000022917) RTN4R (ENSGGOG00000006055) DGCR6L (ENSGGOG00000006060) ENSGGOG00000015940 ENSGGOG00000015817 ZNF74 (ENSGGOG00000015829) SCARF2 (ENSGGOG00000015838) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.a #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.a #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.a #22 Capuchin MODERN SPECIES 209 NRXN1 (ENSCCAG00000035100) ENSCCAG00000036676 FSHR (ENSCCAG00000027381) LHCGR (ENSCCAG00000021729) GTF2A1L (ENSCCAG00000025702) STON1 (ENSCCAG00000025357) PPP1R21 (ENSCCAG00000032998) ENSCCAG00000027252 FOXN2 (ENSCCAG00000031206) ENSCCAG00000035618 FBXO11 (ENSCCAG00000030714) MSH6 (ENSCCAG00000032532) ENSCCAG00000025169 ENSCCAG00000035979 #22 KCNK12 (ENSCCAG00000018060) MSH2 (ENSCCAG00000018888) ENSCCAG00000006246 EPCAM (ENSCCAG00000021912) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.b #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.b #22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.b #22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.o.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 252 ENSCCAG00000026543 #22 OBI1 (ENSCCAG00000012651) POU4F1 (ENSCCAG00000027186) EDNRB (ENSCCAG00000023599) SLAIN1 (ENSCCAG00000005198) SCEL (ENSCCAG00000023597) MYCBP2 (ENSCCAG00000030797) FBXL3 (ENSCCAG00000036339) CLN5 (ENSCCAG00000029705) ACOD1 (ENSCCAG00000034149) ENSCCAG00000024251 Marmoset MODERN SPECIES 4 DOCK5 (ENSCJAG00000019986) NEFL (ENSCJAG00000020035) ENSCJAG00000010608 ENSCJAG00000082023 NEFM (ENSCJAG00000020047) ENSCJAG00000076019 ENSCJAG00000070069 ADAM7 (ENSCJAG00000020053) ADAMDEC1 (ENSCJAG00000020062) ADAM28 (ENSCJAG00000020075) ENSCJAG00000064111 ENSCJAG00000082609 STC1 (ENSCJAG00000081929) NKX2-6 (ENSCJAG00000085390) NKX3-1 (ENSCJAG00000060555) ENSCJAG00000061125 #22 SLC25A37 (ENSCJAG00000076826) LOXL2 (ENSCJAG00000020099) R3HCC1 (ENSCJAG00000020118) CHMP7 (ENSCJAG00000020123) TNFRSF10A (ENSCJAG00000041514) TNFRSF10B (ENSCJAG00000020135) RHOBTB2 (ENSCJAG00000020143) PEBP4 (ENSCJAG00000020158) EGR3 (ENSCJAG00000059573) ENSCJAG00000020166 CCAR2 (ENSCJAG00000020174) C8orf58 (ENSCJAG00000020218) PDLIM2 (ENSCJAG00000020226) SORBS3 (ENSCJAG00000020235) PPP3CC (ENSCJAG00000020251) Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014476 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 #7 ENSGT00940000161613 #8 ENSGT00390000007746 #9 ENSGT00390000014148 #10 ENSGT00940000160010 #11 ENSGT00390000004458 #12 ENSGT00940000156231 #13 ENSGT00940000153181.z #14 ENSGT00950000182858.A.b.b #15 ENSGT00950000182858.A.a.a #17 ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p #22 ENSGT00940000155193.a.a.f ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000160428 ENSGT00550000075041 ENSGT00390000011873 #7 ENSGT00940000161613 #8 ENSGT00390000007746 #9 ENSGT00390000014148 #10 ENSGT00940000160010 #11 ENSGT00390000004458 #12 ENSGT00940000156231 #13 ENSGT00940000153181.z #14 ENSGT00950000182858.A.b.b #15 ENSGT00950000182858.A.a.a #17 ENSGT00390000006980 #20 ENSGT00390000004339 #21 ENSGT00940000153294.m.b.r.b ##22 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p #22 ENSGT00390000014818 ENSGT00940000153294.m.b.s ##22 ENSGT00530000064194 #23 ENSGT00390000016800 #24 ENSGT00530000064123 #25 ENSGT00390000018038 #26 ENSGT00940000159607 #27 ENSGT00940000158379 #28 ENSGT00390000000529 #29 ENSGT00940000159976 #30 ENSGT00940000160710 #31 ENSGT00940000159447 #32 ENSGT00940000159387 #33 ENSGT00530000063085.B #34 ENSGT00940000157589 #35 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p #22 ENSGT00390000014818.i.b.a Gibbon DUPLICATION Gibbon MODERN SPECIES 23 CFAP77 (ENSNLEG00000012857) BARHL1 (ENSNLEG00000012866) DDX31 (ENSNLEG00000012870) GTF3C4 (ENSNLEG00000012911) #7 AK8 (ENSNLEG00000012917) #8 SPACA9 (ENSNLEG00000012923) #9 TSC1 (ENSNLEG00000012928) #10 GFI1B (ENSNLEG00000012963) #11 GTF3C5 (ENSNLEG00000012972) #12 CEL (ENSNLEG00000012996) #13 RALGDS (ENSNLEG00000013013) #14 GBGT1 (ENSNLEG00000028325) #15 SURF6 (ENSNLEG00000013079) #20 MED22 (ENSNLEG00000028828) #21 ENSNLEG00000035888 RPL7A (ENSNLEG00000013068) #22 SURF1 (ENSNLEG00000013086) #23 SURF2 (ENSNLEG00000031716) #24 SURF4 (ENSNLEG00000013096) #25 STKLD1 (ENSNLEG00000013124) #26 ENSNLEG00000013130 #27 ADAMTS13 (ENSNLEG00000013159) #28 ENSNLEG00000013216 #29 SLC2A6 (ENSNLEG00000013263) #30 ENSNLEG00000013310 #31 DBH (ENSNLEG00000013317) #34 SARDH (ENSNLEG00000013366) #35 VAV2 (ENSNLEG00000013392) #36 BRD3OS (ENSNLEG00000033990) ENSNLEG00000032159 BRD3 (ENSNLEG00000013441) #37 Gibbon MODERN SPECIES 4 MRPS9 (ENSNLEG00000032880) ENSNLEG00000029090 TMEM182 (ENSNLEG00000014717) MFSD9 (ENSNLEG00000014709) SLC9A2 (ENSNLEG00000014699) SLC9A4 (ENSNLEG00000014687) IL18RAP (ENSNLEG00000014668) IL18R1 (ENSNLEG00000014646) ENSNLEG00000014642 IL1RL2 (ENSNLEG00000014624) IL1R1 (ENSNLEG00000014597) ENSNLEG00000031543 IL1R2 (ENSNLEG00000014582) MAP4K4 (ENSNLEG00000014520) RFX8 (ENSNLEG00000014506) ENSNLEG00000030602 #22 RNF149 (ENSNLEG00000014483) CNOT11 (ENSNLEG00000014472) TBC1D8 (ENSNLEG00000014456) ENSNLEG00000014444 ENSNLEG00000028663 NPAS2 (ENSNLEG00000014404) ENSNLEG00000014393 NMS (ENSNLEG00000014380) ENSNLEG00000034460 CHST10 (ENSNLEG00000014368) LONRF2 (ENSNLEG00000014343) AFF3 (ENSNLEG00000014317) REV1 (ENSNLEG00000014240) EIF5B (ENSNLEG00000014172) TXNDC9 (ENSNLEG00000014159) Hominidae ANCESTRAL SPECIES 83 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p #22 ENSGT00390000014818.i.b.a Orangutan MODERN SPECIES 1 CCAR1 (ENSPPYG00000002392) TET1 (ENSPPYG00000002393) SLC25A16 (ENSPPYG00000002394) DNA2 (ENSPPYG00000002395) RUFY2 (ENSPPYG00000002396) HNRNPH3 (ENSPPYG00000002397) PBLD (ENSPPYG00000002398) ATOH7 (ENSPPYG00000030559) MYPN (ENSPPYG00000002399) HERC4 (ENSPPYG00000002400) SIRT1 (ENSPPYG00000002401) DNAJC12 (ENSPPYG00000002402) CTNNA3 (ENSPPYG00000002404) LRRTM3 (ENSPPYG00000002405) ENSPPYG00000002406 ENSPPYG00000040675 #22 ENSPPYG00000030513 REEP3 (ENSPPYG00000035618) JMJD1C (ENSPPYG00000002410) ENSPPYG00000035029 NRBF2 (ENSPPYG00000002411) EGR2 (ENSPPYG00000002412) ADO (ENSPPYG00000002413) ENSPPYG00000002414 ZNF365 (ENSPPYG00000002415) RTKN2 (ENSPPYG00000002416) ARID5B (ENSPPYG00000002417) CABCOCO1 (ENSPPYG00000002418) TMEM26 (ENSPPYG00000002419) RHOBTB1 (ENSPPYG00000002420) CDK1 (ENSPPYG00000002421) Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 101 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p #22 ENSGT00390000014818.i.b.a Gorilla MODERN SPECIES 16 POPDC2 (ENSGGOG00000004357) ENSGGOG00000005152 CFAP91 (ENSGGOG00000009828) NR1I2 (ENSGGOG00000007361) GSK3B (ENSGGOG00000007367) GPR156 (ENSGGOG00000005597) LRRC58 (ENSGGOG00000006581) ENSGGOG00000002305 ENSGGOG00000036304 NDUFB4 (ENSGGOG00000013923) HGD (ENSGGOG00000009039) RABL3 (ENSGGOG00000006059) GTF2E1 (ENSGGOG00000022773) STXBP5L (ENSGGOG00000034916) POLQ (ENSGGOG00000011565) ENSGGOG00000038094 #22 ARGFX (ENSGGOG00000005362) FBXO40 (ENSGGOG00000016785) HCLS1 (ENSGGOG00000016791) GOLGB1 (ENSGGOG00000010257) IQCB1 (ENSGGOG00000028124) EAF2 (ENSGGOG00000011594) SLC15A2 (ENSGGOG00000011601) ILDR1 (ENSGGOG00000002958) CD86 (ENSGGOG00000008578) CASR (ENSGGOG00000002159) CSTA (ENSGGOG00000024959) MIX23 (ENSGGOG00000001964) FAM162A (ENSGGOG00000022758) WDR5B (ENSGGOG00000003266) KPNA1 (ENSGGOG00000015957) Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 99 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p #22 ENSGT00390000014818.i.b.a Human MODERN SPECIES 21 DDX31 (ENSG00000125485) GTF3C4 (ENSG00000125484) #7 AK8 (ENSG00000165695) #8 SPACA9 (ENSG00000165698) #9 TSC1 (ENSG00000165699) #10 GFI1B (ENSG00000165702) #11 GTF3C5 (ENSG00000148308) #12 CEL (ENSG00000170835) #13 RALGDS (ENSG00000160271) #14 ENSG00000285245 GBGT1 (ENSG00000148288) #15 OBP2B (ENSG00000171102) ABO (ENSG00000175164) #17 SURF6 (ENSG00000148296) #20 MED22 (ENSG00000148297) #21 RPL7A (ENSG00000148303) #22 SURF1 (ENSG00000148290) #23 SURF2 (ENSG00000148291) #24 SURF4 (ENSG00000148248) #25 STKLD1 (ENSG00000198870) #26 REXO4 (ENSG00000148300) #27 ADAMTS13 (ENSG00000160323) #28 CACFD1 (ENSG00000160325) #29 SLC2A6 (ENSG00000160326) #30 MYMK (ENSG00000187616) #31 ADAMTSL2 (ENSG00000197859) #32 FAM163B (ENSG00000196990) #33 DBH (ENSG00000123454) #34 SARDH (ENSG00000123453) #35 VAV2 (ENSG00000160293) #36 BRD3OS (ENSG00000235106) Pan ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000162699 ENSGT00940000159843 ENSGT00940000157722.d ENSGT00950000183187.A ENSGT00530000063301.a.b ENSGT00490000043356.a ENSGT00950000182870.a.b ENSGT00950000182870.b ENSGT00950000183158.D.b.f ENSGT00390000018390.jc ENSGT00940000158030 ENSGT00940000154412.B.b ENSGT00940000157397 ENSGT01030000234532.A.b ENSGT00940000159303 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p #22 ENSGT00390000014818.i.b.a ENSGT00390000019406 ENSGT00510000047812 ENSGT00940000157545 ENSGT00390000009277 ENSGT00940000160700 ENSGT00390000011613 ENSGT00390000016025.b.h ENSGT00940000159452 ENSGT00940000161792 ENSGT00390000008240.m ENSGT00390000008240.n ENSGT00940000160291 ENSGT00550000074781.m.a ENSGT00550000074781.m.b Bonobo MODERN SPECIES 6 DTWD1 (ENSPPAG00000036510) FGF7 (ENSPPAG00000037132) ENSPPAG00000032776 FAM227B (ENSPPAG00000039634) GALK2 (ENSPPAG00000039106) COPS2 (ENSPPAG00000029471) SECISBP2L (ENSPPAG00000036433) SHC4 (ENSPPAG00000041946) CEP152 (ENSPPAG00000040355) FBN1 (ENSPPAG00000042323) DUT (ENSPPAG00000029777) SLC12A1 (ENSPPAG00000002733) CTXN2 (ENSPPAG00000016328) MYEF2 (ENSPPAG00000041556) SLC24A5 (ENSPPAG00000041586) ENSPPAG00000040924 #22 SEMA6D (ENSPPAG00000030511) SQOR (ENSPPAG00000044142) BLOC1S6 (ENSPPAG00000001302) SLC30A4 (ENSPPAG00000044143) ENSPPAG00000044140 SPATA5L1 (ENSPPAG00000044139) GATM (ENSPPAG00000044131) SLC28A2 (ENSPPAG00000039174) ENSPPAG00000019951 DUOX1 (ENSPPAG00000040927) ENSPPAG00000029567 DUOXA2 (ENSPPAG00000033072) DUOX2 (ENSPPAG00000041951) ENSPPAG00000010693 ENSPPAG00000042707 Chimpanzee MODERN SPECIES 6 FGF7 (ENSPTRG00000007057) ENSPTRG00000048941 FAM227B (ENSPTRG00000007055) GALK2 (ENSPTRG00000007052) COPS2 (ENSPTRG00000007051) SECISBP2L (ENSPTRG00000007050) SHC4 (ENSPTRG00000007048) CEP152 (ENSPTRG00000007047) ENSPTRG00000049195 FBN1 (ENSPTRG00000007046) DUT (ENSPTRG00000007044) SLC12A1 (ENSPTRG00000007043) CTXN2 (ENSPTRG00000042182) MYEF2 (ENSPTRG00000007042) SLC24A5 (ENSPTRG00000007041) ENSPTRG00000050173 #22 ENSPTRG00000043448 SEMA6D (ENSPTRG00000007040) SQOR (ENSPTRG00000007039) BLOC1S6 (ENSPTRG00000007038) SLC30A4 (ENSPTRG00000007036) C15H15orf48 (ENSPTRG00000007035) SPATA5L1 (ENSPTRG00000007034) GATM (ENSPTRG00000007033) SLC28A2 (ENSPTRG00000007031) SHF (ENSPTRG00000007030) DUOX1 (ENSPTRG00000007029) DUOXA1 (ENSPTRG00000007028) DUOXA2 (ENSPTRG00000007027) DUOX2 (ENSPTRG00000007026) SORD (ENSPTRG00000007025) Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.a #22 ENSGT00390000014818.g.b.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.a #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.a #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.a #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.a #22 Sooty mangabey DUPLICATION Sooty mangabey MODERN SPECIES 494 ENSCATG00000042953 CD207 (ENSCATG00000031165) ATP6V1B1 (ENSCATG00000032260) ANKRD53 (ENSCATG00000024083) TEX261 (ENSCATG00000028617) NAGK (ENSCATG00000040675) ENSCATG00000033210 MPHOSPH10 (ENSCATG00000034155) PAIP2B (ENSCATG00000033205) ZNF638 (ENSCATG00000032207) DYSF (ENSCATG00000007511) ENSCATG00000015448 ENSCATG00000015118 CYP26B1 (ENSCATG00000034632) EXOC6B (ENSCATG00000033450) ENSCATG00000028328 #22 ENSCATG00000038635 SPR (ENSCATG00000040755) EMX1 (ENSCATG00000031824) SFXN5 (ENSCATG00000034111) RAB11FIP5 (ENSCATG00000008095) NOTO (ENSCATG00000023664) SMYD5 (ENSCATG00000041216) PRADC1 (ENSCATG00000029853) ENSCATG00000041777 FBXO41 (ENSCATG00000045372) EGR4 (ENSCATG00000041090) ALMS1 (ENSCATG00000042992) ENSCATG00000037583 ENSCATG00000018308 TPRKB (ENSCATG00000038145) Sooty mangabey MODERN SPECIES 149 PDIA5 (ENSCATG00000041167) SEC22A (ENSCATG00000032303) ADCY5 (ENSCATG00000036726) HACD2 (ENSCATG00000027580) MYLK (ENSCATG00000041417) CCDC14 (ENSCATG00000042244) ENSCATG00000034888 KALRN (ENSCATG00000029527) UMPS (ENSCATG00000034479) ITGB5 (ENSCATG00000036722) MUC13 (ENSCATG00000010943) HEG1 (ENSCATG00000035383) ENSCATG00000038752 SLC12A8 (ENSCATG00000041565) ZNF148 (ENSCATG00000032676) ENSCATG00000041681 #22 SNX4 (ENSCATG00000039545) OSBPL11 (ENSCATG00000039022) ENSCATG00000009859 SLC41A3 (ENSCATG00000037455) ALDH1L1 (ENSCATG00000016625) KLF15 (ENSCATG00000040226) CFAP100 (ENSCATG00000018692) ZXDC (ENSCATG00000034628) UROC1 (ENSCATG00000038674) CHST13 (ENSCATG00000043948) C3orf22 (ENSCATG00000044733) ENSCATG00000024835 TXNRD3 (ENSCATG00000039687) CHCHD6 (ENSCATG00000043823) PLXNA1 (ENSCATG00000036814) Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 315 ENSGT00490000043976 ENSGT00940000161558 ENSGT00390000010017 ENSGT00730000110966 ENSGT00940000157039.b ENSGT00390000013956 ENSGT00940000155175.B ENSGT00940000166676 ENSGT00940000155175.A ENSGT00940000156877 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.a #22 ENSGT00390000014818.g.b.b ENSGT00950000183174.B.b ENSGT00390000011709 ENSGT00390000006601 ENSGT00940000158106 ENSGT00940000153313.B Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1793 ENSRROG00000032615 FOXO1 (ENSRROG00000041784) MRPS31 (ENSRROG00000040313) SLC25A15 (ENSRROG00000041123) ENSRROG00000043031 ELF1 (ENSRROG00000037511) WBP4 (ENSRROG00000044405) KBTBD6 (ENSRROG00000026268) ENSRROG00000037292 KBTBD7 (ENSRROG00000028641) MTRF1 (ENSRROG00000035345) ENSRROG00000015827 #22 ENSRROG00000024797 NAA16 (ENSRROG00000031116) RGCC (ENSRROG00000029679) VWA8 (ENSRROG00000043191) DGKH (ENSRROG00000030004) AKAP11 (ENSRROG00000030390) ENSRROG00000025518 TNFSF11 (ENSRROG00000028662) FAM216B (ENSRROG00000003798) ENSRROG00000034426 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.b #22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.b #22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 961 NPR3 (ENSRBIG00000032259) SUB1 (ENSRBIG00000031233) ENSRBIG00000032826 #22 ENSRBIG00000038722 #22 ENSRBIG00000019767 ENSRBIG00000001348 ENSRBIG00000032790 ZFR (ENSRBIG00000041561) MTMR12 (ENSRBIG00000021462) ENSRBIG00000043463 GOLPH3 (ENSRBIG00000010997) PDZD2 (ENSRBIG00000041700) ENSRBIG00000037141 ENSRBIG00000031548 C5orf22 (ENSRBIG00000042796) DROSHA (ENSRBIG00000032786) CDH6 (ENSRBIG00000030412) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1362 GATD3 (ENSRROG00000034542) PWP2 (ENSRROG00000031946) TRAPPC10 (ENSRROG00000043895) ENSRROG00000032758 #22 AGPAT3 (ENSRROG00000031040) RRP1 (ENSRROG00000039799) CSTB (ENSRROG00000038574) ENSRROG00000042411 ENSRROG00000030459 PDXK (ENSRROG00000044416) RRP1B (ENSRROG00000031499) HSF2BP (ENSRROG00000032823) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.b #22 Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.b #22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.c.b #22 Rhesus MODERN SPECIES 19 ENSMMUG00000002711 ENSMMUG00000063444 ZNF33B (ENSMMUG00000010528) ENSMMUG00000005404 ENSMMUG00000047658 ANKRD30BL (ENSMMUG00000004397) ENSMMUG00000040267 ENSMMUG00000055704 BMS1 (ENSMMUG00000007426) ENSMMUG00000051698 ENSMMUG00000059272 ENSMMUG00000039818 RET (ENSMMUG00000015400) CSGALNACT2 (ENSMMUG00000015405) RASGEF1A (ENSMMUG00000015406) ENSMMUG00000044393 #22 FXYD4 (ENSMMUG00000050889) HNRNPF (ENSMMUG00000020982) ENSMMUG00000050447 ENSMMUG00000060451 ZNF487 (ENSMMUG00000064260) ENSMMUG00000059075 ZNF239 (ENSMMUG00000054392) ZNF485 (ENSMMUG00000061713) ZNF32 (ENSMMUG00000062844) ENSMMUG00000053760 CXCL12 (ENSMMUG00000012181) TMEM72 (ENSMMUG00000056582) RASSF4 (ENSMMUG00000017489) DEPP1 (ENSMMUG00000055586) ZNF22 (ENSMMUG00000017492) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 98 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d #22 ENSGT00390000014818.g.b.a.b Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 971 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d #22 ENSGT00390000014818.g.b.a.b Golden snub-nosed monkey DUPLICATION Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1129 ENSRROG00000019622 #22 ENSRROG00000027102 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2238 ENSRROG00000038593 LGALS14 (ENSRROG00000038984) ENSRROG00000013132 LEUTX (ENSRROG00000039693) DYRK1B (ENSRROG00000035989) FBL (ENSRROG00000012374) ENSRROG00000034526 ENSRROG00000045327 PSMC4 (ENSRROG00000037105) ZNF546 (ENSRROG00000020484) ZNF780B (ENSRROG00000037216) ZNF780A (ENSRROG00000043418) MAP3K10 (ENSRROG00000039515) TTC9B (ENSRROG00000033407) CCNP (ENSRROG00000037151) ENSRROG00000030325 #22 AKT2 (ENSRROG00000043558) C19orf47 (ENSRROG00000030785) PLD3 (ENSRROG00000041287) HIPK4 (ENSRROG00000003245) PRX (ENSRROG00000030389) SERTAD1 (ENSRROG00000024643) SERTAD3 (ENSRROG00000010371) BLVRB (ENSRROG00000041386) SPTBN4 (ENSRROG00000032479) SHKBP1 (ENSRROG00000044422) LTBP4 (ENSRROG00000029262) NUMBL (ENSRROG00000041681) COQ8B (ENSRROG00000040191) ITPKC (ENSRROG00000045379) ACTMAP (ENSRROG00000030071) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3188 VWC2 (ENSRROG00000039188) ZPBP (ENSRROG00000037785) SPATA48 (ENSRROG00000029531) IKZF1 (ENSRROG00000038938) DDC (ENSRROG00000038098) GRB10 (ENSRROG00000039828) ENSRROG00000003479 #22 ENSRROG00000032094 COBL (ENSRROG00000025226) ENSRROG00000037436 ENSRROG00000034801 Black snub-nosed monkey DUPLICATION Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 961 NPR3 (ENSRBIG00000032259) SUB1 (ENSRBIG00000031233) ENSRBIG00000032826 #22 ENSRBIG00000038722 #22 ENSRBIG00000019767 ENSRBIG00000001348 ENSRBIG00000032790 ZFR (ENSRBIG00000041561) MTMR12 (ENSRBIG00000021462) ENSRBIG00000043463 GOLPH3 (ENSRBIG00000010997) PDZD2 (ENSRBIG00000041700) ENSRBIG00000037141 ENSRBIG00000031548 C5orf22 (ENSRBIG00000042796) DROSHA (ENSRBIG00000032786) CDH6 (ENSRBIG00000030412) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1507 ENSRBIG00000000400 FOXO1 (ENSRBIG00000026765) MRPS31 (ENSRBIG00000034673) SLC25A15 (ENSRBIG00000037546) ENSRBIG00000000771 ELF1 (ENSRBIG00000028865) WBP4 (ENSRBIG00000041962) KBTBD6 (ENSRBIG00000037297) ENSRBIG00000035054 ENSRBIG00000030206 MTRF1 (ENSRBIG00000007069) ENSRBIG00000043748 #22 ENSRBIG00000026954 NAA16 (ENSRBIG00000037675) RGCC (ENSRBIG00000031991) VWA8 (ENSRBIG00000034278) DGKH (ENSRBIG00000030309) AKAP11 (ENSRBIG00000036023) ENSRBIG00000037894 TNFSF11 (ENSRBIG00000036386) NDN (ENSRBIG00000009280) MAGEL2 (ENSRBIG00000007801) ENSRBIG00000028379 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 97 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d #22 ENSGT00390000014818.g.b.a.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 8 ENSCSAG00000013909 KCNQ5 (ENSCSAG00000013904) RIMS1 (ENSCSAG00000013893) OGFRL1 (ENSCSAG00000013882) B3GAT2 (ENSCSAG00000013881) SMAP1 (ENSCSAG00000013875) SDHAF4 (ENSCSAG00000013870) FAM135A (ENSCSAG00000013861) COL9A1 (ENSCSAG00000013786) ENSCSAG00000013634 LMBRD1 (ENSCSAG00000013548) ENSCSAG00000013541 ADGRB3 (ENSCSAG00000013526) PHF3 (ENSCSAG00000013501) PTP4A1 (ENSCSAG00000013493) ENSCSAG00000013484 #22 LGSN (ENSCSAG00000013469) KHDRBS2 (ENSCSAG00000013462) PRIM2 (ENSCSAG00000013452) RAB23 (ENSCSAG00000013438) BAG2 (ENSCSAG00000013425) ZNF451 (ENSCSAG00000013418) KIAA1586 (ENSCSAG00000013408) BEND6 (ENSCSAG00000013396) DST (ENSCSAG00000013375) COL21A1 (ENSCSAG00000013320) BMP5 (ENSCSAG00000013256) HMGCLL1 (ENSCSAG00000013243) GFRAL (ENSCSAG00000013236) HCRTR2 (ENSCSAG00000013222) FAM83B (ENSCSAG00000013206) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 113 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d #22 ENSGT00390000014818.g.b.a.b Cercopithecinae_b DUPLICATION Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 154 ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d.f #22 ENSGT00390000014818.g.a Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d.f #22 Drill DUPLICATION Drill MODERN SPECIES 133 RELN (ENSMLEG00000044412) ENSMLEG00000042107 ENSMLEG00000044018 #22 SLC26A5 (ENSMLEG00000035060) PSMC2 (ENSMLEG00000040494) DNAJC2 (ENSMLEG00000024782) PMPCB (ENSMLEG00000005693) NAPEPLD (ENSMLEG00000040979) ARMC10 (ENSMLEG00000042392) Drill MODERN SPECIES 494 NANOS2 (ENSMLEG00000001810) MYPOP (ENSMLEG00000034017) FOXA3 (ENSMLEG00000036460) SYMPK (ENSMLEG00000040508) RSPH6A (ENSMLEG00000038849) DMWD (ENSMLEG00000020384) DMPK (ENSMLEG00000039408) ENSMLEG00000037131 MEIOSIN (ENSMLEG00000038011) ENSMLEG00000038790 QPCTL (ENSMLEG00000013540) SNRPD2 (ENSMLEG00000033961) GIPR (ENSMLEG00000043576) ENSMLEG00000030229 GPR4 (ENSMLEG00000003807) ENSMLEG00000031803 #22 OPA3 (ENSMLEG00000040108) VASP (ENSMLEG00000041511) ENSMLEG00000013387 RTN2 (ENSMLEG00000031919) FOSB (ENSMLEG00000033569) ERCC1 (ENSMLEG00000029656) POLR1G (ENSMLEG00000043530) ENSMLEG00000031086 ERCC2 (ENSMLEG00000043492) KLC3 (ENSMLEG00000040381) ENSMLEG00000028116 CKM (ENSMLEG00000037963) MARK4 (ENSMLEG00000043604) EXOC3L2 (ENSMLEG00000043963) TRAPPC6A (ENSMLEG00000030819) Olive baboon MODERN SPECIES 5 FAM136A (ENSPANG00000007488) SNRPG (ENSPANG00000029931) PCYOX1 (ENSPANG00000018472) ENSPANG00000025129 C2orf42 (ENSPANG00000024173) PCBP1 (ENSPANG00000011314) ASPRV1 (ENSPANG00000004410) MXD1 (ENSPANG00000000314) ENSPANG00000007752 GMCL1 (ENSPANG00000007995) ANXA4 (ENSPANG00000006090) AAK1 (ENSPANG00000021878) NFU1 (ENSPANG00000019904) GFPT1 (ENSPANG00000006255) ANTXR1 (ENSPANG00000022518) ENSPANG00000034498 #22 ENSPANG00000047885 GKN1 (ENSPANG00000008629) GKN2 (ENSPANG00000020409) BMP10 (ENSPANG00000049229) ARHGAP25 (ENSPANG00000010754) PROKR1 (ENSPANG00000048102) APLF (ENSPANG00000010484) FBXO48 (ENSPANG00000019905) PLEK (ENSPANG00000005755) CNRIP1 (ENSPANG00000029881) PPP3R1 (ENSPANG00000024026) ENSPANG00000031684 DNAAF10 (ENSPANG00000011915) C1D (ENSPANG00000002886) ETAA1 (ENSPANG00000007449) Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d.g #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d.g #22 Drill MODERN SPECIES 253 C15orf61 (ENSMLEG00000044432) IQCH (ENSMLEG00000008461) AAGAB (ENSMLEG00000042581) SMAD3 (ENSMLEG00000032633) ENSMLEG00000039372 ENSMLEG00000033311 ENSMLEG00000039010 ENSMLEG00000036582 LCTL (ENSMLEG00000011538) ZWILCH (ENSMLEG00000031789) ENSMLEG00000043250 SNAPC5 (ENSMLEG00000044262) MAP2K1 (ENSMLEG00000034124) TIPIN (ENSMLEG00000031419) DIS3L (ENSMLEG00000034558) ENSMLEG00000039621 #22 MEGF11 (ENSMLEG00000042443) RAB11A (ENSMLEG00000032505) DENND4A (ENSMLEG00000041101) SLC24A1 (ENSMLEG00000039031) INTS14 (ENSMLEG00000027622) HACD3 (ENSMLEG00000005763) DPP8 (ENSMLEG00000039474) IGDCC4 (ENSMLEG00000028139) IGDCC3 (ENSMLEG00000038371) PARP16 (ENSMLEG00000035171) ENSMLEG00000027861 CILP (ENSMLEG00000042537) ENSMLEG00000029629 UBAP1L (ENSMLEG00000037677) KBTBD13 (ENSMLEG00000023512) Olive baboon MODERN SPECIES 19 CHST11 (ENSPANG00000012280) TXNRD1 (ENSPANG00000012060) NFYB (ENSPANG00000022085) HCFC2 (ENSPANG00000018237) GLT8D2 (ENSPANG00000012281) TDG (ENSPANG00000016817) UQCC6 (ENSPANG00000048898) HSP90B1 (ENSPANG00000018017) ENSPANG00000047864 NT5DC3 (ENSPANG00000019453) STAB2 (ENSPANG00000021932) C12orf42 (ENSPANG00000022132) ASCL1 (ENSPANG00000006618) ENSPANG00000038866 PAH (ENSPANG00000004048) ENSPANG00000020657 #22 IGF1 (ENSPANG00000004450) PMCH (ENSPANG00000015925) PARPBP (ENSPANG00000000345) NUP37 (ENSPANG00000000344) WASHC3 (ENSPANG00000003603) DRAM1 (ENSPANG00000018238) ENSPANG00000043079 ENSPANG00000049661 GNPTAB (ENSPANG00000000420) SYCP3 (ENSPANG00000000419) CHPT1 (ENSPANG00000004451) MYBPC1 (ENSPANG00000009790) ENSPANG00000045377 ENSPANG00000018239 UTP20 (ENSPANG00000020388) Macaca ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000014031 ENSGT00940000158515 ENSGT00940000159672 ENSGT00940000161756 ENSGT00940000158698 ENSGT00530000063555.B ENSGT01030000234641.b.a.b.a.a.m ENSGT00950000183002.C ENSGT00990000203892 ENSGT00940000154078.a.a ENSGT00390000004495 ENSGT00390000015375 ENSGT00940000157186 ENSGT00530000064017.a ENSGT00940000157412.b ENSGT00940000153294.m.a.c.b.p.d #22 ENSGT00390000014818.g.b.a.b ENSGT00940000157409 ENSGT00390000000628.w.a.a.a ENSGT00390000003175.a.a ENSGT00940000160584 ENSGT00910000147853 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14 ENSMFAG00000034144 ENSMFAG00000064133 ENSMFAG00000037584 RTN4IP1 (ENSMFAG00000045409) CRYBG1 (ENSMFAG00000038353) ENSMFAG00000051465 ATG5 (ENSMFAG00000041362) PRDM1 (ENSMFAG00000037637) PREP (ENSMFAG00000038505) POPDC3 (ENSMFAG00000040532) BVES (ENSMFAG00000045432) LIN28B (ENSMFAG00000065717) HACE1 (ENSMFAG00000039999) ENSMFAG00000052218 ENSMFAG00000064569 ENSMFAG00000000351 #22 GRIK2 (ENSMFAG00000040349) ENSMFAG00000062609 ASCC3 (ENSMFAG00000002081) ENSMFAG00000061583 SIM1 (ENSMFAG00000002878) MCHR2 (ENSMFAG00000040175) ENSMFAG00000049964 PRDM13 (ENSMFAG00000064719) ENSMFAG00000001955 CCNC (ENSMFAG00000030903) TSTD3 (ENSMFAG00000042059) USP45 (ENSMFAG00000038745) PNISR (ENSMFAG00000001373) COQ3 (ENSMFAG00000034338) FAXC (ENSMFAG00000041545) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 9 TSHZ1 (ENSMFAG00000037350) ENSMFAG00000001214 ENSMFAG00000063070 ENSMFAG00000055361 ZNF236 (ENSMFAG00000044643) ENSMFAG00000057120 ENSMFAG00000059268 ENSMFAG00000056251 ENSMFAG00000041988 GALR1 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