Bilateria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154681 #22 Chordata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154681 #22 Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 1137 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000154681 #22 Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 1729 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000154681 #22 Euteleostomi DUPLICATION Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 #8 ENSGT00390000015871 #9 ENSGT00940000159969.a #10 ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a #13 ENSGT00940000163562 #15 ENSGT00950000182863.B.a #17 ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.b #24 ENSGT01050000244824.A #25 ENSGT00940000155633.D #26 ENSGT00940000163032 #31 ENSGT00390000014654 #32 ENSGT00950000183117.b ENSGT00940000153804.A ENSGT00940000155086.A ENSGT00940000166976 ENSGT00490000043329.a.a.b ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000159992 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ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00390000014310.g.c.b ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a leopard MODERN SPECIES 32 NCOA3 (ENSPPRG00000012245) SULF2 (ENSPPRG00000014787) PREX1 (ENSPPRG00000017390) ARFGEF2 (ENSPPRG00000019059) CSE1L (ENSPPRG00000022681) STAU1 (ENSPPRG00000003436) DDX27 (ENSPPRG00000006728) ZNFX1 (ENSPPRG00000008291) KCNB1 (ENSPPRG00000008757) PTGIS (ENSPPRG00000009242) B4GALT5 (ENSPPRG00000009529) SLC9A8 (ENSPPRG00000012137) ENSPPRG00000016222 SPATA2 (ENSPPRG00000012563) RNF114 (ENSPPRG00000013120) 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ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a.g ENSGT00940000156405 Dolphin MODERN SPECIES 2613 SLC9A8 (ENSTTRG00000002023) SPATA2 (ENSTTRG00000002026) RNF114 (ENSTTRG00000002028) SNAI1 (ENSTTRG00000002029) #22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00390000014310.g.c.b ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847.l ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a.g ENSGT00940000156405 Vaquita MODERN SPECIES 6 ENSPSNG00000010614 ENSPSNG00000010546 PREX1 (ENSPSNG00000010157) ARFGEF2 (ENSPSNG00000010024) CSE1L (ENSPSNG00000009842) STAU1 (ENSPSNG00000021829) DDX27 (ENSPSNG00000021788) ZNFX1 (ENSPSNG00000021759) ENSPSNG00000021663 KCNB1 (ENSPSNG00000021638) PTGIS (ENSPSNG00000021556) B4GALT5 (ENSPSNG00000021518) SLC9A8 (ENSPSNG00000021429) SPATA2 (ENSPSNG00000021368) RNF114 (ENSPSNG00000021340) SNAI1 (ENSPSNG00000021307) #22 ENSPSNG00000021242 ##24 PEDS1 (ENSPSNG00000021182) CEBPB (ENSPSNG00000021163) PTPN1 (ENSPSNG00000021125) RIPOR3 (ENSPSNG00000020934) ENSPSNG00000020880 BCAS4 (ENSPSNG00000020852) ADNP (ENSPSNG00000020812) DPM1 (ENSPSNG00000020744) ENSPSNG00000020711 KCNG1 (ENSPSNG00000020680) NFATC2 (ENSPSNG00000020496) ATP9A (ENSPSNG00000020387) SALL4 (ENSPSNG00000020296) ZFP64 (ENSPSNG00000020170) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183080.a.b.a.b.b.sb ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00390000014310.g.c.b ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847.l ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a.g ENSGT00940000156405 Narwhal MODERN SPECIES 299 ENSMMNG00015002075 PREX1 (ENSMMNG00015001945) ARFGEF2 (ENSMMNG00015001852) CSE1L (ENSMMNG00015001792) STAU1 (ENSMMNG00015001735) DDX27 (ENSMMNG00015001700) ZNFX1 (ENSMMNG00015001649) ENSMMNG00015001590 KCNB1 (ENSMMNG00015001568) PTGIS (ENSMMNG00015001553) B4GALT5 (ENSMMNG00015001535) SLC9A8 (ENSMMNG00015001475) ENSMMNG00015001439 ENSMMNG00015001424 RNF114 (ENSMMNG00015001397) SNAI1 (ENSMMNG00015001375) #22 ENSMMNG00015001308 ##24 PEDS1 (ENSMMNG00015001247) CEBPB (ENSMMNG00015001228) PTPN1 (ENSMMNG00015001207) RIPOR3 (ENSMMNG00015001135) ENSMMNG00015001097 ENSMMNG00015001084 BCAS4 (ENSMMNG00015001066) ADNP (ENSMMNG00015001049) DPM1 (ENSMMNG00015001027) MOCS3 (ENSMMNG00015001013) KCNG1 (ENSMMNG00015000992) ENSMMNG00015000978 NFATC2 (ENSMMNG00015000875) ATP9A (ENSMMNG00015000677) Beluga whale MODERN SPECIES 36 PREX1 (ENSDLEG00000002562) ARFGEF2 (ENSDLEG00000002481) CSE1L (ENSDLEG00000002456) STAU1 (ENSDLEG00000002442) ENSDLEG00000002431 DDX27 (ENSDLEG00000002419) ZNFX1 (ENSDLEG00000002399) ENSDLEG00000002350 KCNB1 (ENSDLEG00000002346) PTGIS (ENSDLEG00000002340) B4GALT5 (ENSDLEG00000002327) ENSDLEG00000002315 ENSDLEG00000002307 SPATA2 (ENSDLEG00000002299) RNF114 (ENSDLEG00000002288) SNAI1 (ENSDLEG00000002278) #22 ENSDLEG00000002266 PEDS1 (ENSDLEG00000002253) CEBPB (ENSDLEG00000002250) PTPN1 (ENSDLEG00000002239) RIPOR3 (ENSDLEG00000002219) PARD6B (ENSDLEG00000002207) ENSDLEG00000002201 BCAS4 (ENSDLEG00000002183) ADNP (ENSDLEG00000002171) DPM1 (ENSDLEG00000002158) MOCS3 (ENSDLEG00000002146) KCNG1 (ENSDLEG00000002141) NFATC2 (ENSDLEG00000002111) ATP9A (ENSDLEG00000002017) SALL4 (ENSDLEG00000001990) Pecora ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00910000148217 ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a Yarkand deer MODERN SPECIES 15 ENSCHYG00000024739 NCOA3 (ENSCHYG00000024782) SULF2 (ENSCHYG00000024978) PREX1 (ENSCHYG00000025154) ARFGEF2 (ENSCHYG00000025228) CSE1L (ENSCHYG00000025610) STAU1 (ENSCHYG00000025698) DDX27 (ENSCHYG00000025747) ZNFX1 (ENSCHYG00000025872) KCNB1 (ENSCHYG00000025941) PTGIS (ENSCHYG00000025958) B4GALT5 (ENSCHYG00000025991) SLC9A8 (ENSCHYG00000026025) SPATA2 (ENSCHYG00000026150) ENSCHYG00000009682 SNAI1 (ENSCHYG00000009715) #22 ENSCHYG00000009784 ##24 ENSCHYG00000009981 PTPN1 (ENSCHYG00000010096) RIPOR3 (ENSCHYG00000010277) PARD6B (ENSCHYG00000010449) BCAS4 (ENSCHYG00000010495) ENSCHYG00000010533 ADNP (ENSCHYG00000010570) DPM1 (ENSCHYG00000010621) MOCS3 (ENSCHYG00000010694) KCNG1 (ENSCHYG00000010717) NFATC2 (ENSCHYG00000010759) ATP9A (ENSCHYG00000011270) SALL4 (ENSCHYG00000012194) ENSCHYG00000012287 Percora_a ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Siberian musk deer MODERN SPECIES 156 SULF2 (ENSMMSG00000001308) PREX1 (ENSMMSG00000001224) ARFGEF2 (ENSMMSG00000001152) CSE1L (ENSMMSG00000001079) STAU1 (ENSMMSG00000001032) DDX27 (ENSMMSG00000000937) ZNFX1 (ENSMMSG00000000896) KCNB1 (ENSMMSG00000000851) ENSMMSG00000000842 PTGIS (ENSMMSG00000000818) ENSMMSG00000000799 B4GALT5 (ENSMMSG00000000771) SLC9A8 (ENSMMSG00000000731) SPATA2 (ENSMMSG00000000719) RNF114 (ENSMMSG00000000644) SNAI1 (ENSMMSG00000000625) #22 ENSMMSG00000000577 ##24 ENSMMSG00000000519 ENSMMSG00000000499 CEBPB (ENSMMSG00000000488) ENSMMSG00000000476 PTPN1 (ENSMMSG00000000433) RIPOR3 (ENSMMSG00000000362) PARD6B (ENSMMSG00000000327) BCAS4 (ENSMMSG00000000296) ADNP (ENSMMSG00000000269) DPM1 (ENSMMSG00000000236) ENSMMSG00000000184 KCNG1 (ENSMMSG00000015644) NFATC2 (ENSMMSG00000015490) ATP9A (ENSMMSG00000015245) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000154897.g ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00940000154897.g ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Goat MODERN SPECIES 4 SULF2 (ENSCHIG00000014461) PREX1 (ENSCHIG00000014845) ARFGEF2 (ENSCHIG00000023890) CSE1L (ENSCHIG00000016579) ENSCHIG00000001799 DDX27 (ENSCHIG00000007753) ZNFX1 (ENSCHIG00000018393) KCNB1 (ENSCHIG00000025849) PTGIS (ENSCHIG00000011304) ENSCHIG00000023099 B4GALT5 (ENSCHIG00000017253) SLC9A8 (ENSCHIG00000019556) ENSCHIG00000016542 SPATA2 (ENSCHIG00000017318) RNF114 (ENSCHIG00000011500) SNAI1 (ENSCHIG00000014308) #22 ENSCHIG00000026963 ##24 ENSCHIG00000025237 CEBPB (ENSCHIG00000026165) PTPN1 (ENSCHIG00000018438) RIPOR3 (ENSCHIG00000021955) PARD6B (ENSCHIG00000024844) BCAS4 (ENSCHIG00000019980) ADNP (ENSCHIG00000026866) DPM1 (ENSCHIG00000024448) MOCS3 (ENSCHIG00000002985) KCNG1 (ENSCHIG00000023574) NFATC2 (ENSCHIG00000013486) ATP9A (ENSCHIG00000017687) SALL4 (ENSCHIG00000026270) ZFP64 (ENSCHIG00000013734) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 4 ENSOARG00020020143 NCOA3 (ENSOARG00020021755) SULF2 (ENSOARG00020021903) PREX1 (ENSOARG00020022226) ARFGEF2 (ENSOARG00020022817) CSE1L (ENSOARG00020023584) STAU1 (ENSOARG00020023667) DDX27 (ENSOARG00020023789) ZNFX1 (ENSOARG00020023841) KCNB1 (ENSOARG00020010013) PTGIS (ENSOARG00020010083) B4GALT5 (ENSOARG00020010276) SLC9A8 (ENSOARG00020010491) SPATA2 (ENSOARG00020010771) RNF114 (ENSOARG00020010828) SNAI1 (ENSOARG00020010897) #22 UBE2V1 (ENSOARG00020010955) ENSOARG00020011139 CEBPB (ENSOARG00020011295) PTPN1 (ENSOARG00020011319) PARD6B (ENSOARG00020011957) BCAS4 (ENSOARG00020011987) ADNP (ENSOARG00020012056) DPM1 (ENSOARG00020012189) MOCS3 (ENSOARG00020012279) KCNG1 (ENSOARG00020012313) NFATC2 (ENSOARG00020012410) ATP9A (ENSOARG00020013019) SALL4 (ENSOARG00020013545) ZFP64 (ENSOARG00020013675) TSHZ2 (ENSOARG00020013957) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT01010000224211.B ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00960000190565 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a American bison MODERN SPECIES 2976 NCOA3 (ENSBBBG00000011266) SULF2 (ENSBBBG00000011221) PREX1 (ENSBBBG00000011181) ARFGEF2 (ENSBBBG00000011155) CSE1L (ENSBBBG00000011120) STAU1 (ENSBBBG00000011072) DDX27 (ENSBBBG00000011032) ZNFX1 (ENSBBBG00000001981) KCNB1 (ENSBBBG00000010994) PTGIS (ENSBBBG00000010988) RUM1 (ENSBBBG00000010979) B4GALT5 (ENSBBBG00000010976) SLC9A8 (ENSBBBG00000008144) SPATA2 (ENSBBBG00000010928) RNF114 (ENSBBBG00000010917) SNAI1 (ENSBBBG00000010850) #22 ENSBBBG00000010845 ##24 PEDS1 (ENSBBBG00000008727) ENSBBBG00000010817 PTPN1 (ENSBBBG00000010813) RIPOR3 (ENSBBBG00000010794) ENSBBBG00000010784 ENSBBBG00000001888 ADNP (ENSBBBG00000010772) DPM1 (ENSBBBG00000010763) MOCS3 (ENSBBBG00000001882) KCNG1 (ENSBBBG00000007300) NFATC2 (ENSBBBG00000010742) Bos ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT01010000224211.B ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00960000190565 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a Bos_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT01010000224211.B ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000162354 ENSGT00960000190565 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 4 PREX1 (ENSBIXG00005019004) ARFGEF2 (ENSBIXG00005019137) CSE1L (ENSBIXG00005006810) ENSBIXG00005019225 STAU1 (ENSBIXG00005019320) DDX27 (ENSBIXG00005019451) ZNFX1 (ENSBIXG00005019475) KCNB1 (ENSBIXG00005019551) PTGIS (ENSBIXG00005019610) ENSBIXG00005019642 ENSBIXG00005019648 B4GALT5 (ENSBIXG00005019674) SLC9A8 (ENSBIXG00005019931) SPATA2 (ENSBIXG00005019973) RNF114 (ENSBIXG00005019999) SNAI1 (ENSBIXG00005020012) #22 UBE2V1 (ENSBIXG00005003288) PEDS1 (ENSBIXG00005020099) CEBPB (ENSBIXG00005003302) PTPN1 (ENSBIXG00005020158) RIPOR3 (ENSBIXG00005003360) ENSBIXG00005003390 ENSBIXG00005020294 ADNP (ENSBIXG00005020336) ENSBIXG00005020382 KCNG1 (ENSBIXG00005003446) NFATC2 (ENSBIXG00005020482) ATP9A (ENSBIXG00005020806) SALL4 (ENSBIXG00005020915) ENSBIXG00005020944 ZFP64 (ENSBIXG00005021039) Cow MODERN SPECIES 4 SULF2 (ENSBTAG00000007490) PREX1 (ENSBTAG00000015609) ARFGEF2 (ENSBTAG00000007120) CSE1L (ENSBTAG00000005957) STAU1 (ENSBTAG00000000241) ENSBTAG00000051252 DDX27 (ENSBTAG00000006671) ZNFX1 (ENSBTAG00000020166) KCNB1 (ENSBTAG00000027320) PTGIS (ENSBTAG00000017537) RUM1 (ENSBTAG00000053443) B4GALT5 (ENSBTAG00000012626) SLC9A8 (ENSBTAG00000008969) SPATA2 (ENSBTAG00000018063) RNF114 (ENSBTAG00000027317) SNAI1 (ENSBTAG00000014554) #22 UBE2V1 (ENSBTAG00000027316) PEDS1 (ENSBTAG00000010135) ENSBTAG00000049867 CEBPB (ENSBTAG00000051972) PTPN1 (ENSBTAG00000006616) RIPOR3 (ENSBTAG00000012297) PARD6B (ENSBTAG00000021601) BCAS4 (ENSBTAG00000038929) ADNP (ENSBTAG00000000340) DPM1 (ENSBTAG00000007721) MOCS3 (ENSBTAG00000049509) KCNG1 (ENSBTAG00000003398) NFATC2 (ENSBTAG00000018270) ATP9A (ENSBTAG00000007962) SALL4 (ENSBTAG00000003101) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154897.g ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Wild yak MODERN SPECIES 1112 DDX27 (ENSBMUG00000011955) ZNFX1 (ENSBMUG00000011933) KCNB1 (ENSBMUG00000011862) PTGIS (ENSBMUG00000011831) B4GALT5 (ENSBMUG00000011807) ENSBMUG00000011746 ENSBMUG00000011733 RNF114 (ENSBMUG00000011709) SNAI1 (ENSBMUG00000011700) #22 ENSBMUG00000011684 ##24 PEDS1 (ENSBMUG00000011633) ENSBMUG00000011615 PTPN1 (ENSBMUG00000011606) RIPOR3 (ENSBMUG00000011578) PARD6B (ENSBMUG00000011544) BCAS4 (ENSBMUG00000011522) ADNP (ENSBMUG00000011507) DPM1 (ENSBMUG00000011486) MOCS3 (ENSBMUG00000011469) KCNG1 (ENSBMUG00000011454) NFATC2 (ENSBMUG00000011413) ATP9A (ENSBMUG00000009140) ENSBMUG00000008019 ENSBMUG00000008004 Domestic yak MODERN SPECIES 3 ENSBGRG00000023948 NCOA3 (ENSBGRG00000024007) SULF2 (ENSBGRG00000024353) PREX1 (ENSBGRG00000024453) ARFGEF2 (ENSBGRG00000024845) CSE1L (ENSBGRG00000025002) STAU1 (ENSBGRG00000025224) DDX27 (ENSBGRG00000025331) ZNFX1 (ENSBGRG00000025480) KCNB1 (ENSBGRG00000025509) PTGIS (ENSBGRG00000025522) B4GALT5 (ENSBGRG00000025540) SLC9A8 (ENSBGRG00000003652) SPATA2 (ENSBGRG00000003769) RNF114 (ENSBGRG00000003790) SNAI1 (ENSBGRG00000003859) #22 ENSBGRG00000003892 ##24 PEDS1 (ENSBGRG00000003997) CEBPB (ENSBGRG00000004091) PTPN1 (ENSBGRG00000004126) RIPOR3 (ENSBGRG00000004295) ENSBGRG00000004869 ADNP (ENSBGRG00000005009) MOCS3 (ENSBGRG00000005144) KCNG1 (ENSBGRG00000005160) NFATC2 (ENSBGRG00000005184) ATP9A (ENSBGRG00000005270) ENSBGRG00000005594 ZFP64 (ENSBGRG00000005650) ENSBGRG00000005794 ENSBGRG00000005846 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00910000148217 ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 ENSGT00940000159181 Primates ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 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ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 Bonobo MODERN SPECIES 11 ENSPPAG00000018206 PREX1 (ENSPPAG00000027119) ARFGEF2 (ENSPPAG00000035013) CSE1L (ENSPPAG00000038391) STAU1 (ENSPPAG00000032023) ENSPPAG00000003696 DDX27 (ENSPPAG00000035843) ZNFX1 (ENSPPAG00000032191) KCNB1 (ENSPPAG00000030007) PTGIS (ENSPPAG00000042097) B4GALT5 (ENSPPAG00000029604) ENSPPAG00000037544 SLC9A8 (ENSPPAG00000035233) SPATA2 (ENSPPAG00000028008) RNF114 (ENSPPAG00000043607) SNAI1 (ENSPPAG00000041096) #22 ENSPPAG00000028780 ##24 PEDS1 (ENSPPAG00000028727) PTPN1 (ENSPPAG00000027528) RIPOR3 (ENSPPAG00000033751) ENSPPAG00000029645 PARD6B (ENSPPAG00000038274) ENSPPAG00000031066 ADNP (ENSPPAG00000035684) ENSPPAG00000035180 ENSPPAG00000038880 DPM1 (ENSPPAG00000042946) MOCS3 (ENSPPAG00000008891) KCNG1 (ENSPPAG00000032019) NFATC2 (ENSPPAG00000040722) ENSPPAG00000042667 Chimpanzee MODERN SPECIES 11 ENSPTRG00000052520 PREX1 (ENSPTRG00000013594) ARFGEF2 (ENSPTRG00000013597) CSE1L 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(ENSPPYG00000011123) CEBPB (ENSPPYG00000011124) PTPN1 (ENSPPYG00000011126) RIPOR3 (ENSPPYG00000011127) PARD6B (ENSPPYG00000038640) ENSPPYG00000037475 ENSPPYG00000030749 ADNP (ENSPPYG00000011130) DPM1 (ENSPPYG00000011131) MOCS3 (ENSPPYG00000011132) KCNG1 (ENSPPYG00000011133) NFATC2 (ENSPPYG00000011135) ENSPPYG00000011136 SALL4 (ENSPPYG00000011138) ENSPPYG00000019918 Gibbon MODERN SPECIES 3 PREX1 (ENSNLEG00000026693) ARFGEF2 (ENSNLEG00000006937) CSE1L (ENSNLEG00000006945) ENSNLEG00000034198 STAU1 (ENSNLEG00000006955) DDX27 (ENSNLEG00000006961) ZNFX1 (ENSNLEG00000006965) KCNB1 (ENSNLEG00000006970) PTGIS (ENSNLEG00000006971) B4GALT5 (ENSNLEG00000006975) ENSNLEG00000029455 SLC9A8 (ENSNLEG00000006976) SPATA2 (ENSNLEG00000006982) ENSNLEG00000032221 RNF114 (ENSNLEG00000006984) SNAI1 (ENSNLEG00000006985) #22 ENSNLEG00000006987 ##24 PEDS1 (ENSNLEG00000029433) ENSNLEG00000030867 RIPOR3 (ENSNLEG00000006989) PARD6B (ENSNLEG00000006993) ENSNLEG00000019226 ENSNLEG00000006994 ADNP (ENSNLEG00000006995) DPM1 (ENSNLEG00000006998) MOCS3 (ENSNLEG00000019227) KCNG1 (ENSNLEG00000007001) ENSNLEG00000019228 NFATC2 (ENSNLEG00000007002) ENSNLEG00000034112 ATP9A (ENSNLEG00000007005) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00910000147046 ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153404.a.m.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00910000147046 ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153404.a.m.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 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ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 ENSGT00940000159181 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153404.a.m.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00390000018318.u.b.a.b.a.b.e ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 Sooty mangabey MODERN SPECIES 648 PTGIS (ENSCATG00000013706) B4GALT5 (ENSCATG00000039260) SLC9A8 (ENSCATG00000044367) SPATA2 (ENSCATG00000012860) RNF114 (ENSCATG00000029285) ENSCATG00000035681 SNAI1 (ENSCATG00000041452) #22 ENSCATG00000039056 ##24 PEDS1 (ENSCATG00000041753) CEBPB (ENSCATG00000020712) PTPN1 (ENSCATG00000040422) ENSCATG00000039168 RIPOR3 (ENSCATG00000037442) PARD6B (ENSCATG00000006757) BCAS4 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ENSGT00390000018566.j Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2458 ENSRROG00000001690 ARFGEF2 (ENSRROG00000043149) CSE1L (ENSRROG00000021686) STAU1 (ENSRROG00000039008) DDX27 (ENSRROG00000024811) ENSRROG00000003252 ZNFX1 (ENSRROG00000029056) ENSRROG00000034942 KCNB1 (ENSRROG00000029157) PTGIS (ENSRROG00000043304) ENSRROG00000029732 B4GALT5 (ENSRROG00000028386) SLC9A8 (ENSRROG00000030129) SPATA2 (ENSRROG00000045660) RNF114 (ENSRROG00000038494) SNAI1 (ENSRROG00000043753) #22 ENSRROG00000030011 ##24 PEDS1 (ENSRROG00000041253) PTPN1 (ENSRROG00000042271) RIPOR3 (ENSRROG00000036177) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 897 DDX27 (ENSRBIG00000024112) ZNFX1 (ENSRBIG00000041059) ENSRBIG00000043627 ENSRBIG00000040052 KCNB1 (ENSRBIG00000035685) PTGIS (ENSRBIG00000004920) B4GALT5 (ENSRBIG00000032318) ENSRBIG00000034464 SLC9A8 (ENSRBIG00000028870) SPATA2 (ENSRBIG00000028973) RNF114 (ENSRBIG00000026643) SNAI1 (ENSRBIG00000026992) #22 ENSRBIG00000044255 ##24 PEDS1 (ENSRBIG00000043990) PTPN1 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ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 ENSGT00940000159181 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00910000147327 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041.c.a ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a Marmoset MODERN SPECIES 17 ENSCJAG00000071985 NCOA3 (ENSCJAG00000016602) SULF2 (ENSCJAG00000016568) PREX1 (ENSCJAG00000016539) ARFGEF2 (ENSCJAG00000016470) CSE1L (ENSCJAG00000016296) STAU1 (ENSCJAG00000016233) DDX27 (ENSCJAG00000016135) 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ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041.d ENSGT00940000158041.c.a ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 ENSGT00940000159181 Capuchin MODERN SPECIES 62 SERPINC1 (ENSCCAG00000019906) RC3H1 (ENSCCAG00000025652) ENSCCAG00000036604 RABGAP1L (ENSCCAG00000031099) ENSCCAG00000037602 MRPS14 (ENSCCAG00000023517) ENSCCAG00000036403 TNN (ENSCCAG00000035362) TNR (ENSCCAG00000027440) ENSCCAG00000016991 ENSCCAG00000009273 B4GALT5 (ENSCCAG00000033096) SLC9A8 (ENSCCAG00000030260) SPATA2 (ENSCCAG00000024428) RNF114 (ENSCCAG00000004234) SNAI1 (ENSCCAG00000029550) #22 ENSCCAG00000033814 ##24 PEDS1 (ENSCCAG00000024997) CEBPB (ENSCCAG00000018941) ENSCCAG00000027818 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 93 SULF2 (ENSSBOG00000019541) PREX1 (ENSSBOG00000022286) ARFGEF2 (ENSSBOG00000027163) CSE1L 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ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00910000148217 ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 138 SULF2 (ENSOGAG00000007199) ENSOGAG00000025638 PREX1 (ENSOGAG00000002497) ARFGEF2 (ENSOGAG00000002122) CSE1L (ENSOGAG00000002126) ENSOGAG00000002127 DDX27 (ENSOGAG00000002130) ZNFX1 (ENSOGAG00000002132) ENSOGAG00000029920 KCNB1 (ENSOGAG00000025413) PTGIS 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ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00910000148217 ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 70 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00910000148217 ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a Coquerels sifaka MODERN SPECIES 596 PREX1 (ENSPCOG00000022902) ARFGEF2 (ENSPCOG00000009483) CSE1L (ENSPCOG00000026411) STAU1 (ENSPCOG00000027746) DDX27 (ENSPCOG00000025327) ZNFX1 (ENSPCOG00000001474) KCNB1 (ENSPCOG00000024835) PTGIS (ENSPCOG00000023118) B4GALT5 (ENSPCOG00000011860) SLC9A8 (ENSPCOG00000011827) SPATA2 (ENSPCOG00000016446) RNF114 (ENSPCOG00000018300) SNAI1 (ENSPCOG00000020538) #22 ENSPCOG00000021361 ##24 PEDS1 (ENSPCOG00000014768) CEBPB (ENSPCOG00000026786) Greater bamboo lemur DUPLICATION Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 301 PREX1 (ENSPSMG00000011975) ARFGEF2 (ENSPSMG00000012064) ENSPSMG00000012084 ENSPSMG00000012217 STAU1 (ENSPSMG00000012281) ENSPSMG00000012300 DDX27 (ENSPSMG00000012321) ZNFX1 (ENSPSMG00000012403) ENSPSMG00000012474 KCNB1 (ENSPSMG00000012485) PTGIS (ENSPSMG00000012523) B4GALT5 (ENSPSMG00000012547) SLC9A8 (ENSPSMG00000012605) 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(ENSMICG00000006465) #23 ENSMICG00000009824 ##24 MCM4 (ENSMICG00000015638) #25 PRKDC (ENSMICG00000015567) #26 ENSMICG00000015552 #32 ENSMICG00000042808 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 Tree shrew MODERN SPECIES 7884 SNAI1 (ENSTBEG00000012262) #22 Glires ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b 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ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 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ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.ib.b.b ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.ib.b.b ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Golden Hamster MODERN SPECIES 664 Prex1 (ENSMAUG00000021873) Arfgef2 (ENSMAUG00000012203) Cse1l (ENSMAUG00000001362) Stau1 (ENSMAUG00000013846) Ddx27 (ENSMAUG00000000552) Znfx1 (ENSMAUG00000016416) Kcnb1 (ENSMAUG00000019058) Ptgis (ENSMAUG00000016166) B4galt5 (ENSMAUG00000015144) Slc9a8 (ENSMAUG00000018259) Spata2 (ENSMAUG00000020910) Rnf114 (ENSMAUG00000019385) Snai1 (ENSMAUG00000021592) #22 Ube2v1 (ENSMAUG00000020962) Peds1 (ENSMAUG00000016961) Ptpn1 (ENSMAUG00000010010) Ripor3 (ENSMAUG00000010157) Pard6b (ENSMAUG00000010497) Adnp (ENSMAUG00000020819) Dpm1 (ENSMAUG00000016233) Mocs3 (ENSMAUG00000007351) Kcng1 (ENSMAUG00000015676) Nfatc2 (ENSMAUG00000011773) Atp9a (ENSMAUG00000004916) Sall4 (ENSMAUG00000015814) Zfp64 (ENSMAUG00000015438) ENSMAUG00000003995 ENSMAUG00000015308 Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 195 ENSCGRG00001006183 Ncoa3 (ENSCGRG00001010532) Sulf2 (ENSCGRG00001004952) Prex1 (ENSCGRG00001012312) Arfgef2 (ENSCGRG00001018645) Cse1l (ENSCGRG00001005670) Stau1 (ENSCGRG00001013453) Ddx27 (ENSCGRG00001015330) Znfx1 (ENSCGRG00001017355) Kcnb1 (ENSCGRG00001019221) Ptgis (ENSCGRG00001019919) B4galt5 (ENSCGRG00001021312) Slc9a8 (ENSCGRG00001022939) Spata2 (ENSCGRG00001005279) Rnf114 (ENSCGRG00001006890) Snai1 (ENSCGRG00001007749) #22 Ube2v1 (ENSCGRG00001009565) Peds1 (ENSCGRG00001010523) Cebpb (ENSCGRG00001001737) Ptpn1 (ENSCGRG00001012267) Ripor3 (ENSCGRG00001013099) Pard6b (ENSCGRG00001014206) Adnp (ENSCGRG00001004111) Dpm1 (ENSCGRG00001007175) Mocs3 (ENSCGRG00001003680) Kcng1 (ENSCGRG00001009827) Nfatc2 (ENSCGRG00001012491) Atp9a (ENSCGRG00001017172) Sall4 (ENSCGRG00001019569) Zfp64 (ENSCGRG00001020443) ENSCGRG00001015533 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.ib.b.b ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Northern American deer mouse MODERN SPECIES 17 Ncoa3 (ENSPEMG00000020950) ENSPEMG00000007965 Prex1 (ENSPEMG00000016558) ENSPEMG00000022389 Arfgef2 (ENSPEMG00000022186) Cse1l (ENSPEMG00000000944) Stau1 (ENSPEMG00000022045) Ddx27 (ENSPEMG00000023215) Znfx1 (ENSPEMG00000008042) ENSPEMG00000001839 Ptgis (ENSPEMG00000018632) ENSPEMG00000000220 Slc9a8 (ENSPEMG00000022094) Spata2 (ENSPEMG00000027358) ENSPEMG00000023570 Snai1 (ENSPEMG00000023213) #22 ENSPEMG00000001442 Peds1 (ENSPEMG00000006010) Ptpn1 (ENSPEMG00000012811) Ripor3 (ENSPEMG00000011182) Pard6b (ENSPEMG00000015881) Adnp (ENSPEMG00000028284) Dpm1 (ENSPEMG00000022392) ENSPEMG00000023371 Kcng1 (ENSPEMG00000021560) Nfatc2 (ENSPEMG00000022457) ENSPEMG00000028160 Atp9a (ENSPEMG00000022700) Sall4 (ENSPEMG00000022706) Zfp64 (ENSPEMG00000014980) ENSPEMG00000014233 Prairie vole MODERN SPECIES 357 Ncoa3 (ENSMOCG00000019647) Sulf2 (ENSMOCG00000000726) Prex1 (ENSMOCG00000019092) ENSMOCG00000004008 Arfgef2 (ENSMOCG00000019572) Cse1l (ENSMOCG00000013597) Stau1 (ENSMOCG00000018743) Ddx27 (ENSMOCG00000019594) Znfx1 (ENSMOCG00000005411) Kcnb1 (ENSMOCG00000001197) Ptgis (ENSMOCG00000012430) B4galt5 (ENSMOCG00000011995) Slc9a8 (ENSMOCG00000004864) Spata2 (ENSMOCG00000017632) Rnf114 (ENSMOCG00000015529) Snai1 (ENSMOCG00000007847) #22 Ube2v1 (ENSMOCG00000012071) Peds1 (ENSMOCG00000010275) Cebpb (ENSMOCG00000010607) Ptpn1 (ENSMOCG00000001636) Ripor3 (ENSMOCG00000010739) Pard6b (ENSMOCG00000003321) ENSMOCG00000001467 Dpm1 (ENSMOCG00000015289) Mocs3 (ENSMOCG00000003624) Kcng1 (ENSMOCG00000009238) Nfatc2 (ENSMOCG00000000259) Atp9a (ENSMOCG00000016994) Sall4 (ENSMOCG00000018245) Zfp64 (ENSMOCG00000004895) ENSMOCG00000013704 Murinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.ib.b.b ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 13 Prex1 (ENSRNOG00000006952) ENSRNOG00000064408 Trp53rkb (ENSRNOG00000007285) Arfgef2 (ENSRNOG00000007485) Cse1l (ENSRNOG00000007665) Stau1 (ENSRNOG00000007781) Ddx27 (ENSRNOG00000008081) Znfx1 (ENSRNOG00000008194) Kcnb1 (ENSRNOG00000046949) AABR07054614.1 (ENSRNOG00000008245) Rpl38-ps9 (ENSRNOG00000048701) B4galt5 (ENSRNOG00000008283) Slc9a8 (ENSRNOG00000008354) Spata2 (ENSRNOG00000009207) Rnf114 (ENSRNOG00000060821) Snai1 (ENSRNOG00000009594) #22 LOC679539 (ENSRNOG00000025580) Peds1 (ENSRNOG00000060571) Cebpb (ENSRNOG00000057347) Ptpn1 (ENSRNOG00000010574) Ripor3 (ENSRNOG00000010791) Pard6b (ENSRNOG00000010883) Adnp (ENSRNOG00000010975) Dpm1 (ENSRNOG00000010993) Mocs3 (ENSRNOG00000025067) Kcng1 (ENSRNOG00000054314) Nfatc2 (ENSRNOG00000012175) Atp9a (ENSRNOG00000049484) Sall4 (ENSRNOG00000050035) Zfp93 (ENSRNOG00000012762) ENSRNOG00000067568 Rat MODERN SPECIES 2 Snai2 (ENSRNOG00000047699) #22 Clxn (ENSRNOG00000050091) #23 Ube2v2 (ENSRNOG00000001829) ##24 Mcm4 (ENSRNOG00000001833) #25 Prkdc (ENSRNOG00000025028) #26 Mzt2b (ENSRNOG00000066842) Spidr (ENSRNOG00000037851) #32 Cebpd (ENSRNOG00000050869) #31 AABR07034767.1 (ENSRNOG00000001825) Yars2 (ENSRNOG00000025252) Dnm1l (ENSRNOG00000001813) Fgd4 (ENSRNOG00000059491) LOC100912028 (ENSRNOG00000070534) LOC102546862 (ENSRNOG00000055545) Spag6l (ENSRNOG00000025787) Igll1 (ENSRNOG00000025990) Mus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.ib.b.b ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Shrew mouse MODERN SPECIES 16 Ncoa3 (MGP_PahariEiJ_G0026136) Sulf2 (MGP_PahariEiJ_G0026137) Prex1 (MGP_PahariEiJ_G0026138) Arfgef2 (MGP_PahariEiJ_G0026139) Cse1l (MGP_PahariEiJ_G0026140) Stau1 (MGP_PahariEiJ_G0026141) Ddx27 (MGP_PahariEiJ_G0026142) Znfx1 (MGP_PahariEiJ_G0026143) MGP_PahariEiJ_G0026144 Kcnb1 (MGP_PahariEiJ_G0026145) Ptgis (MGP_PahariEiJ_G0026146) B4galt5 (MGP_PahariEiJ_G0026147) Slc9a8 (MGP_PahariEiJ_G0026148) Spata2 (MGP_PahariEiJ_G0026149) Rnf114 (MGP_PahariEiJ_G0026150) Snai1 (MGP_PahariEiJ_G0026151) #22 MGP_PahariEiJ_G0026152 Peds1 (MGP_PahariEiJ_G0026153) Cebpb (MGP_PahariEiJ_G0026154) Ptpn1 (MGP_PahariEiJ_G0026155) Ripor3 (MGP_PahariEiJ_G0026156) Pard6b (MGP_PahariEiJ_G0026157) MGP_PahariEiJ_G0026158 Dpm1 (MGP_PahariEiJ_G0026159) Mocs3 (MGP_PahariEiJ_G0026160) Kcng1 (MGP_PahariEiJ_G0026161) Nfatc2 (MGP_PahariEiJ_G0026162) Atp9a (MGP_PahariEiJ_G0026163) Sall4 (MGP_PahariEiJ_G0026164) Zfp64 (MGP_PahariEiJ_G0026165) Tshz2 (MGP_PahariEiJ_G0026166) Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154897.k ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.ib.b.b ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B.g.b ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Ryukyu mouse MODERN SPECIES 11 Ncoa3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024694) Sulf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024695) Prex1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024696) Arfgef2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024697) Cse1l (MGP_CAROLIEiJ_G0024698) Stau1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024699) Ddx27 (MGP_CAROLIEiJ_G0024700) Znfx1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024701) MGP_CAROLIEiJ_G0024702 Kcnb1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024703) Ptgis (MGP_CAROLIEiJ_G0024704) B4galt5 (MGP_CAROLIEiJ_G0024705) Slc9a8 (MGP_CAROLIEiJ_G0024706) Spata2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024707) Rnf114 (MGP_CAROLIEiJ_G0024708) Snai1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024709) #22 MGP_CAROLIEiJ_G0024710 Peds1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024711) Cebpb (MGP_CAROLIEiJ_G0024712) Ptpn1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024713) Ripor3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024714) Pard6b (MGP_CAROLIEiJ_G0024715) Adnp (MGP_CAROLIEiJ_G0024716) MGP_CAROLIEiJ_G0024717 MGP_CAROLIEiJ_G0024718 Mocs3 (MGP_CAROLIEiJ_G0024719) Kcng1 (MGP_CAROLIEiJ_G0024720) Nfatc2 (MGP_CAROLIEiJ_G0024721) Atp9a (MGP_CAROLIEiJ_G0024722) Sall4 (MGP_CAROLIEiJ_G0024723) Zfp64 (MGP_CAROLIEiJ_G0024724) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000154897.k ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.ib.b.b ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B.g.b ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Mouse MODERN SPECIES 11 Ncoa3 (ENSMUSG00000027678) Sulf2 (ENSMUSG00000006800) Prex1 (ENSMUSG00000039621) Trp53rkb (ENSMUSG00000042854) Arfgef2 (ENSMUSG00000074582) Cse1l (ENSMUSG00000002718) Stau1 (ENSMUSG00000039536) Ddx27 (ENSMUSG00000017999) Znfx1 (ENSMUSG00000039501) Kcnb1 (ENSMUSG00000050556) Ptgis (ENSMUSG00000017969) B4galt5 (ENSMUSG00000017929) Slc9a8 (ENSMUSG00000039463) Spata2 (ENSMUSG00000047030) Rnf114 (ENSMUSG00000006418) Snai1 (ENSMUSG00000042821) #22 Ube2v1 (ENSMUSG00000078923) Gm20431 (ENSMUSG00000089739) Peds1 (ENSMUSG00000090213) Cebpb (ENSMUSG00000056501) Ptpn1 (ENSMUSG00000027540) Ripor3 (ENSMUSG00000074577) Pard6b (ENSMUSG00000044641) Adnp (ENSMUSG00000051149) Dpm1 (ENSMUSG00000078919) Mocs3 (ENSMUSG00000074576) Kcng1 (ENSMUSG00000074575) Nfatc2 (ENSMUSG00000027544) Atp9a (ENSMUSG00000027546) Sall4 (ENSMUSG00000027547) Zfp64 (ENSMUSG00000027551) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00390000018710 ENSGT00390000011717 ENSGT00940000156908 ENSGT00940000154977 ENSGT00940000157063 ENSGT00950000182878.b.a.c.a.b ENSGT00700000106212 ENSGT00390000008325.b.b ENSGT00940000155268 ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.ib.b.b ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B.g.b ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b spretus MODERN SPECIES 11 Sulf2 (MGP_SPRETEiJ_G0025614) Prex1 (MGP_SPRETEiJ_G0025615) MGP_SPRETEiJ_G0025616 Arfgef2 (MGP_SPRETEiJ_G0025617) Cse1l (MGP_SPRETEiJ_G0025618) Stau1 (MGP_SPRETEiJ_G0025619) Ddx27 (MGP_SPRETEiJ_G0025620) Znfx1 (MGP_SPRETEiJ_G0025621) MGP_SPRETEiJ_G0025622 Kcnb1 (MGP_SPRETEiJ_G0025623) Ptgis (MGP_SPRETEiJ_G0025624) B4galt5 (MGP_SPRETEiJ_G0025625) Slc9a8 (MGP_SPRETEiJ_G0025626) Spata2 (MGP_SPRETEiJ_G0025627) Rnf114 (MGP_SPRETEiJ_G0025628) Snai1 (MGP_SPRETEiJ_G0025629) #22 MGP_SPRETEiJ_G0025630 Peds1 (MGP_SPRETEiJ_G0025631) Cebpb (MGP_SPRETEiJ_G0025632) Ptpn1 (MGP_SPRETEiJ_G0025633) Ripor3 (MGP_SPRETEiJ_G0025634) Pard6b (MGP_SPRETEiJ_G0025635) Adnp (MGP_SPRETEiJ_G0025636) MGP_SPRETEiJ_G0025637 MGP_SPRETEiJ_G0025638 Mocs3 (MGP_SPRETEiJ_G0025639) Kcng1 (MGP_SPRETEiJ_G0025640) Nfatc2 (MGP_SPRETEiJ_G0025641) Atp9a (MGP_SPRETEiJ_G0025642) Sall4 (MGP_SPRETEiJ_G0025643) Zfp64 (MGP_SPRETEiJ_G0025644) Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2968 Arfgef2 (ENSMSIG00000031303) Cse1l (ENSMSIG00000031308) Stau1 (ENSMSIG00000031320) Ddx27 (ENSMSIG00000031324) Znfx1 (ENSMSIG00000031330) ENSMSIG00000031334 ENSMSIG00000031338 Kcnb1 (ENSMSIG00000031340) Ptgis (ENSMSIG00000031341) B4galt5 (ENSMSIG00000031348) Slc9a8 (ENSMSIG00000031352) ENSMSIG00000031374 Rnf114 (ENSMSIG00000031377) ENSMSIG00000031378 ENSMSIG00000031380 Snai1 (ENSMSIG00000031381) #22 Ube2v1 (ENSMSIG00000031383) ENSMSIG00000031391 ENSMSIG00000031393 Ptpn1 (ENSMSIG00000031396) Ripor3 (ENSMSIG00000031399) Pard6b (ENSMSIG00000031403) Adnp (ENSMSIG00000031404) ENSMSIG00000031406 Mocs3 (ENSMSIG00000031411) ENSMSIG00000031412 Kcng1 (ENSMSIG00000031413) Steppe mouse MODERN SPECIES 3199 ENSMSIG00000021597 Ntan1 (ENSMSIG00000021558) Pdxdc1 (ENSMSIG00000021508) ENSMSIG00000021498 Mpv17l (ENSMSIG00000021473) Ifitm7 (ENSMSIG00000021459) ENSMSIG00000021445 Bmerb1 (ENSMSIG00000021409) Marf1 (ENSMSIG00000021334) Nde1 (ENSMSIG00000021294) Myh11 (ENSMSIG00000021054) Cep20 (ENSMSIG00000021016) Abcc1 (ENSMSIG00000020982) ENSMSIG00000020974 ENSMSIG00000020951 ENSMSIG00000020941 #22 Efcab1 (ENSMSIG00000020927) #23 Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 107 ENSJJAG00000016360 Slc13a3 (ENSJJAG00000022617) ENSJJAG00000017483 Slc2a10 (ENSJJAG00000015033) Ncoa3 (ENSJJAG00000009506) Sulf2 (ENSJJAG00000009639) Arfgef2 (ENSJJAG00000010494) Cse1l (ENSJJAG00000016509) Stau1 (ENSJJAG00000020032) Ddx27 (ENSJJAG00000009056) Znfx1 (ENSJJAG00000019468) Kcnb1 (ENSJJAG00000015449) B4galt5 (ENSJJAG00000022264) Slc9a8 (ENSJJAG00000024393) Rnf114 (ENSJJAG00000021901) Snai1 (ENSJJAG00000017317) #22 Ube2v1 (ENSJJAG00000011640) Peds1 (ENSJJAG00000002964) Cebpb (ENSJJAG00000023307) Ptpn1 (ENSJJAG00000023377) Adnp (ENSJJAG00000022527) Dpm1 (ENSJJAG00000015047) Mocs3 (ENSJJAG00000001507) Kcng1 (ENSJJAG00000012496) Nfatc2 (ENSJJAG00000022151) Atp9a (ENSJJAG00000014602) Sall4 (ENSJJAG00000020688) Zfp64 (ENSJJAG00000013954) ENSJJAG00000002372 ENSJJAG00000002075 Bcas1 (ENSJJAG00000014333) Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 119 Gprc5b (ENSJJAG00000011842) Iqck (ENSJJAG00000010889) Knop1 (ENSJJAG00000007048) ENSJJAG00000024376 ENSJJAG00000023920 ENSJJAG00000023320 Gde1 (ENSJJAG00000021843) Tmc5 (ENSJJAG00000017322) Tmc7 (ENSJJAG00000018195) ENSJJAG00000016372 Itpripl2 (ENSJJAG00000014523) Syt17 (ENSJJAG00000020866) ENSJJAG00000020497 #17 ENSJJAG00000018914 ENSJJAG00000018155 ENSJJAG00000017495 #22 Efcab1 (ENSJJAG00000017074) #23 ENSJJAG00000021043 Shcbp1 (ENSJJAG00000019699) ENSJJAG00000017988 Prkdc (ENSJJAG00000000588) #26 ENSJJAG00000022819 Ube2v2 (ENSJJAG00000021864) #24 ENSJJAG00000020787 ENSJJAG00000018937 ENSJJAG00000017475 Abcg2 (ENSJJAG00000016240) Nap1l5 (ENSJJAG00000015528) Herc3 (ENSJJAG00000015660) Fam13a (ENSJJAG00000004621) Tigd2 (ENSJJAG00000002866) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154897 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00910000146955 ENSGT00940000159181 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000154897.p ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B.k ENSGT00940000153481.B.l ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a Marmotini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154897.p ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041.e ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B.l ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000154897.p ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041.e ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B.l ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 83 ENSUPAG00010021591 NCOA3 (ENSUPAG00010021604) SULF2 (ENSUPAG00010021962) PREX1 (ENSUPAG00010021977) ARFGEF2 (ENSUPAG00010021992) CSE1L (ENSUPAG00010022001) STAU1 (ENSUPAG00010022006) DDX27 (ENSUPAG00010022011) ZNFX1 (ENSUPAG00010022013) KCNB1 (ENSUPAG00010000021) PTGIS (ENSUPAG00010000049) B4GALT5 (ENSUPAG00010000085) SLC9A8 (ENSUPAG00010000132) SPATA2 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(ENSMMMG00000007891) SALL4 (ENSMMMG00000008074) ZFP64 (ENSMMMG00000008125) TSHZ2 (ENSMMMG00000008206) ENSMMMG00000008228 ZNF217 (ENSMMMG00000008233) Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 11 ENSSVLG00005003944 NCOA3 (ENSSVLG00005003963) SULF2 (ENSSVLG00005003995) PREX1 (ENSSVLG00005004040) ARFGEF2 (ENSSVLG00005004112) CSE1L (ENSSVLG00005004177) STAU1 (ENSSVLG00005004230) DDX27 (ENSSVLG00005004272) ZNFX1 (ENSSVLG00005004315) KCNB1 (ENSSVLG00005004367) PTGIS (ENSSVLG00005004394) B4GALT5 (ENSSVLG00005004427) SLC9A8 (ENSSVLG00005004467) SPATA2 (ENSSVLG00005004527) RNF114 (ENSSVLG00005004552) SNAI1 (ENSSVLG00005004568) #22 UBE2V1 (ENSSVLG00005004590) ENSSVLG00005004618 CEBPB (ENSSVLG00005004641) PTPN1 (ENSSVLG00005000174) RIPOR3 (ENSSVLG00005000232) ENSSVLG00005000290 ENSSVLG00005000318 BCAS4 (ENSSVLG00005000345) ADNP (ENSSVLG00005000370) DPM1 (ENSSVLG00005000398) MOCS3 (ENSSVLG00005000434) KCNG1 (ENSSVLG00005000448) NFATC2 (ENSSVLG00005000511) ATP9A (ENSSVLG00005000658) SALL4 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ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Guinea pig DUPLICATION Guinea pig MODERN SPECIES 45 ZMYND8 (ENSCPOG00000013351) NCOA3 (ENSCPOG00000008077) SULF2 (ENSCPOG00000036428) PREX1 (ENSCPOG00000030479) ARFGEF2 (ENSCPOG00000008910) ENSCPOG00000005554 STAU1 (ENSCPOG00000005566) DDX27 (ENSCPOG00000002009) ZNFX1 (ENSCPOG00000010937) KCNB1 (ENSCPOG00000002097) PTGIS (ENSCPOG00000034249) B4GALT5 (ENSCPOG00000013380) SLC9A8 (ENSCPOG00000013530) SPATA2 (ENSCPOG00000034717) RNF114 (ENSCPOG00000005093) SNAI1 (ENSCPOG00000026663) #22 ENSCPOG00000014413 ##24 PEDS1 (ENSCPOG00000023991) CEBPB 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ENSODEG00000006762 ENSODEG00000006564 Degu MODERN SPECIES 95 ENSODEG00000018873 ##7 ENSODEG00000002691 ENSODEG00000002737 ENSODEG00000002753 ENSODEG00000002823 ATP6V1H (ENSODEG00000002840) ENSODEG00000002936 OPRK1 (ENSODEG00000002988) NPBWR1 (ENSODEG00000019191) #8 ENSODEG00000003047 #9 ENSODEG00000003192 #9 ENSODEG00000003208 #10 ST18 (ENSODEG00000003288) PCMTD1 (ENSODEG00000003571) #13 SNTG1 (ENSODEG00000003621) #17 ENSODEG00000003654 #22 CLXN (ENSODEG00000003725) #23 ENSODEG00000003745 ENSODEG00000018960 ENSODEG00000019042 ENSODEG00000004479 ##24 MCM4 (ENSODEG00000004626) #25 PRKDC (ENSODEG00000004916) #26 CEBPD (ENSODEG00000002997) #31 ENSODEG00000003011 ENSODEG00000003049 ENSODEG00000003100 ENSODEG00000018938 PEX26 (ENSODEG00000003167) TUBA8 (ENSODEG00000003237) ENSODEG00000003289 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 6 NCOA3 (ENSHGLG00000005862) SULF2 (ENSHGLG00000005167) PREX1 (ENSHGLG00000004434) ARFGEF2 (ENSHGLG00000003963) ENSHGLG00000009067 ENSHGLG00000008730 DDX27 (ENSHGLG00000008388) ZNFX1 (ENSHGLG00000008068) ENSHGLG00000049086 KCNB1 (ENSHGLG00000038195) PTGIS (ENSHGLG00000007083) B4GALT5 (ENSHGLG00000006719) SLC9A8 (ENSHGLG00000006337) SPATA2 (ENSHGLG00000000487) RNF114 (ENSHGLG00000005669) SNAI1 (ENSHGLG00000005310) #22 ENSHGLG00000049806 ##24 PEDS1 (ENSHGLG00000005163) ENSHGLG00000042761 PTPN1 (ENSHGLG00000005082) ENSHGLG00000012434 RIPOR3 (ENSHGLG00000012260) PARD6B (ENSHGLG00000012058) ENSHGLG00000034848 ADNP (ENSHGLG00000011922) ENSHGLG00000011694 MOCS3 (ENSHGLG00000020809) KCNG1 (ENSHGLG00000011040) NFATC2 (ENSHGLG00000010406) ENSHGLG00000044936 ATP9A (ENSHGLG00000009412) Naked mole-rat female MODERN SPECIES 1 ENSHGLG00000003564 ENSHGLG00000015610 NPBWR1 (ENSHGLG00000021373) #8 ENSHGLG00000013146 RB1CC1 (ENSHGLG00000018518) #9 ALKAL1 (ENSHGLG00000038780) #10 ENSHGLG00000016233 ENSHGLG00000014452 PCMTD1 (ENSHGLG00000045944) #13 ENSHGLG00000045690 ENSHGLG00000048304 ENSHGLG00000044626 SNTG1 (ENSHGLG00000005037) #17 ENSHGLG00000050331 PPDPFL (ENSHGLG00000032230) #21 ENSHGLG00000009439 #22 CLXN (ENSHGLG00000010454) #23 ENSHGLG00000034668 ENSHGLG00000034089 UBE2V2 (ENSHGLG00000038834) #24 MCM4 (ENSHGLG00000018964) #25 PRKDC (ENSHGLG00000013287) #26 ENSHGLG00000020699 #31 ENSHGLG00000041479 ENSHGLG00000044988 #32 ENSHGLG00000011619 ENSHGLG00000041605 ENSHGLG00000042659 ENSHGLG00000012424 ENSHGLG00000014510 SLC6A12 (ENSHGLG00000005175) Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 112 ENSGT00940000156694.hb ENSGT00940000156694.gb ENSGT00390000009040 ENSGT00940000154185 ENSGT00940000155121 ENSGT00940000159123 ENSGT00390000003289 ENSGT00940000157341 ENSGT00940000161936 #8 ENSGT00390000015871 #9 ENSGT00940000159969.a #10 ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.a #13 ENSGT00940000163562 #15 ENSGT00390000009113.a.b #21 ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000159968 #23 ENSGT00740000115534.a.b.f.a.a #24 ENSGT01050000244824.A #25 ENSGT00940000163032 #31 ENSGT00390000014654 #32 Rabbit DUPLICATION Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 12 ENSOCUG00000032312 CEP128 (ENSOCUG00000004026) TSHR (ENSOCUG00000001374) STON2 (ENSOCUG00000012416) SEL1L (ENSOCUG00000011932) ENSOCUG00000034842 ENSOCUG00000034230 ENSOCUG00000011291 ENSOCUG00000039446 FLRT2 (ENSOCUG00000007881) ENSOCUG00000033878 ENSOCUG00000034672 ENSOCUG00000038735 #20 ENSOCUG00000026727 ENSOCUG00000037228 #20 ENSOCUG00000035244 #22 GALC (ENSOCUG00000009309) GPR65 (ENSOCUG00000008519) ENSOCUG00000029629 #20 KCNK10 (ENSOCUG00000015561) SPATA7 (ENSOCUG00000002033) PTPN21 (ENSOCUG00000002037) ZC3H14 (ENSOCUG00000015503) EML5 (ENSOCUG00000015515) TTC8 (ENSOCUG00000015555) FOXN3 (ENSOCUG00000004392) ENSOCUG00000027074 EFCAB11 (ENSOCUG00000015498) ENSOCUG00000025758 TDP1 (ENSOCUG00000002106) KCNK13 (ENSOCUG00000005405) Rabbit MODERN SPECIES 672 ENSOCUG00000000094 B4GALT5 (ENSOCUG00000005982) SLC9A8 (ENSOCUG00000011219) SPATA2 (ENSOCUG00000021907) RNF114 (ENSOCUG00000011229) SNAI1 (ENSOCUG00000005422) #22 Rabbit MODERN SPECIES 14 OPRK1 (ENSOCUG00000003120) NPBWR1 (ENSOCUG00000028231) #8 ENSOCUG00000033530 RB1CC1 (ENSOCUG00000016393) #9 ALKAL1 (ENSOCUG00000029695) #10 ST18 (ENSOCUG00000013284) ENSOCUG00000026814 PCMTD1 (ENSOCUG00000016958) #13 PXDNL (ENSOCUG00000005558) #15 ENSOCUG00000016910 ENSOCUG00000022155 SNTG1 (ENSOCUG00000016550) #17 ENSOCUG00000023403 ENSOCUG00000038370 PPDPFL (ENSOCUG00000029166) #21 ENSOCUG00000012254 #22 CLXN (ENSOCUG00000004518) #23 ENSOCUG00000006933 #24 MCM4 (ENSOCUG00000001710) #25 ENSOCUG00000025135 #31 SPIDR (ENSOCUG00000001687) #32 ZNF354A (ENSOCUG00000029378) CLK4 (ENSOCUG00000003228) COL23A1 (ENSOCUG00000003217) PHYKPL (ENSOCUG00000003211) HNRNPAB (ENSOCUG00000026424) NHP2 (ENSOCUG00000016057) ENSOCUG00000011198 B4GALT7 (ENSOCUG00000003023) ENSOCUG00000025345 ENSOCUG00000009182 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00390000009113.a.b #21 ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 1570 ENSGT00390000009113.a.b #21 ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000159968 #23 Sloth MODERN SPECIES 9618 ENSCHOG00000007046 #22 Armadillo DUPLICATION Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 1904 B4GALT5 (ENSDNOG00000001242) SLC9A8 (ENSDNOG00000008724) SPATA2 (ENSDNOG00000037737) ENSDNOG00000041784 RNF114 (ENSDNOG00000009113) ENSDNOG00000010139 ENSDNOG00000023834 #22 ENSDNOG00000013766 PEDS1 (ENSDNOG00000036975) ENSDNOG00000043335 PTPN1 (ENSDNOG00000032438) RIPOR3 (ENSDNOG00000032214) PARD6B (ENSDNOG00000010098) ENSDNOG00000045798 ADNP (ENSDNOG00000001749) DPM1 (ENSDNOG00000036829) MOCS3 (ENSDNOG00000008236) KCNG1 (ENSDNOG00000044743) Armadillo MODERN SPECIES 848 SLITRK5 (ENSDNOG00000013565) ENSDNOG00000024891 #22 SLITRK6 (ENSDNOG00000003423) ENSDNOG00000043858 Armadillo MODERN SPECIES 2317 PPDPFL (ENSDNOG00000008094) #21 ENSDNOG00000035997 #22 CLXN (ENSDNOG00000011775) #23 ENSDNOG00000037810 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 85 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Tenrec MODERN SPECIES 14883 ENSETEG00000005777 #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 87 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000162354 ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Elephant MODERN SPECIES 551 SLC9A8 (ENSLAFG00000015616) SPATA2 (ENSLAFG00000023307) RNF114 (ENSLAFG00000012571) SNAI1 (ENSLAFG00000030265) #22 UBE2V1 (ENSLAFG00000027359) PEDS1 (ENSLAFG00000007392) ENSLAFG00000026180 PTPN1 (ENSLAFG00000009137) RIPOR3 (ENSLAFG00000009142) PARD6B (ENSLAFG00000004136) BCAS4 (ENSLAFG00000004138) ADNP (ENSLAFG00000004139) MOCS3 (ENSLAFG00000004140) KCNG1 (ENSLAFG00000011027) ENSLAFG00000013693 NFATC2 (ENSLAFG00000015276) ATP9A (ENSLAFG00000004303) SALL4 (ENSLAFG00000004309) ZFP64 (ENSLAFG00000022960) Hyrax DUPLICATION Hyrax MODERN SPECIES 10282 SNAI1 (ENSPCAG00000011934) #22 Hyrax MODERN SPECIES 10595 ENSPCAG00000001788 #22 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00550000074997 ENSGT00940000155154.b ENSGT00390000008325.b.a 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(ENSGEVG00005006534) ENSGEVG00005006445 ENSGEVG00005005966 CSE1L (ENSGEVG00005005613) STAU1 (ENSGEVG00005005541) ENSGEVG00005005499 ENSGEVG00005005413 KCNB1 (ENSGEVG00005005379) PTGIS (ENSGEVG00005005340) B4GALT5 (ENSGEVG00005005309) SLC9A8 (ENSGEVG00005005269) ENSGEVG00005005232 SPATA2 (ENSGEVG00005005161) RNF114 (ENSGEVG00005005144) SNAI1 (ENSGEVG00005005118) #22 UBE2V1 (ENSGEVG00005005100) ENSGEVG00005005075 CEBPB (ENSGEVG00005005065) ENSGEVG00005005041 PTPN1 (ENSGEVG00005005024) RIPOR3 (ENSGEVG00005004951) PARD6B (ENSGEVG00005004914) BCAS4 (ENSGEVG00005004895) ADNP (ENSGEVG00005004865) DPM1 (ENSGEVG00005004806) MOCS3 (ENSGEVG00005004780) KCNG1 (ENSGEVG00005004753) NFATC2 (ENSGEVG00005004705) ATP9A (ENSGEVG00005004625) SALL4 (ENSGEVG00005004574) Emydidae ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854.b ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230.g ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 60 NCOA3 (ENSTMTG00000003606) SULF2 (ENSTMTG00000003496) PREX1 (ENSTMTG00000002559) ARFGEF2 (ENSTMTG00000002453) CSE1L (ENSTMTG00000002366) STAU1 (ENSTMTG00000002210) ENSTMTG00000002157 ENSTMTG00000002122 KCNB1 (ENSTMTG00000002113) PTGIS (ENSTMTG00000002102) B4GALT5 (ENSTMTG00000002093) SLC9A8 (ENSTMTG00000002081) ENSTMTG00000002072 SPATA2 (ENSTMTG00000002068) RNF114 (ENSTMTG00000002062) SNAI1 (ENSTMTG00000002055) #22 UBE2V1 (ENSTMTG00000002048) ENSTMTG00000002040 CEBPB (ENSTMTG00000002034) PTPN1 (ENSTMTG00000002024) RIPOR3 (ENSTMTG00000001968) PARD6B (ENSTMTG00000001950) BCAS4 (ENSTMTG00000001939) ADNP (ENSTMTG00000001931) DPM1 (ENSTMTG00000001915) MOCS3 (ENSTMTG00000001910) KCNG1 (ENSTMTG00000001902) NFATC2 (ENSTMTG00000001812) ATP9A (ENSTMTG00000001771) SALL4 (ENSTMTG00000001765) ZFP64 (ENSTMTG00000001756) Chinese turtle MODERN SPECIES 1549 B4GALT5 (ENSPSIG00000003679) ENSPSIG00000003666 ENSPSIG00000003663 ENSPSIG00000003660 SPATA2 (ENSPSIG00000003635) RNF114 (ENSPSIG00000003620) SNAI1 (ENSPSIG00000003607) #22 ENSPSIG00000000033 ENSPSIG00000016812 CEBPB (ENSPSIG00000016606) PTPN1 (ENSPSIG00000016536) ENSPSIG00000016269 ENSPSIG00000016266 PARD6B (ENSPSIG00000016185) BCAS4 (ENSPSIG00000015713) ADNP (ENSPSIG00000015209) DPM1 (ENSPSIG00000014853) MOCS3 (ENSPSIG00000014735) KCNG1 (ENSPSIG00000014441) NFATC2 (ENSPSIG00000013745) ATP9A (ENSPSIG00000009087) SALL4 (ENSPSIG00000009066) Archosauria ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00390000009113.a.b #21 ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES LYPLA1 (ENSCPRG00005016196) TCEA1 (ENSCPRG00005016187) RGS20 (ENSCPRG00005016184) ATP6V1H (ENSCPRG00005016178) OPRK1 (ENSCPRG00005016155) ENSCPRG00005016154 NPBWR1 (ENSCPRG00005016153) #8 RB1CC1 (ENSCPRG00005016150) #9 ALKAL1 (ENSCPRG00005016144) #10 ST18 (ENSCPRG00005016142) PCMTD1 (ENSCPRG00005016138) #13 PXDNL (ENSCPRG00005016130) #15 ENSCPRG00005016128 SNTG1 (ENSCPRG00005016125) #17 ENSCPRG00005016119 ENSCPRG00005016116 #22 ENSCPRG00005016112 UBE2V2 (ENSCPRG00005016092) #24 MCM4 (ENSCPRG00005016083) #25 PRKDC (ENSCPRG00005015476) #26 ENSCPRG00005015317 #31 CEBPD (ENSCPRG00005015316) #31 SPIDR (ENSCPRG00005015312) #32 ENSCPRG00005015309 ENSCPRG00005015308 MAPRE2 (ENSCPRG00005015306) DTNA (ENSCPRG00005015300) NOL4 (ENSCPRG00005015291) ASXL3 (ENSCPRG00005015279) KLHL14 (ENSCPRG00005015272) ENSCPRG00005015261 Aves ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00390000009113.a.b #21 ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 African ostrich MODERN SPECIES 894 PPDPFL (ENSSCUG00000013677) #21 ENSSCUG00000013675 #22 ENSSCUG00000013669 UBE2V2 (ENSSCUG00000013667) #24 MCM4 (ENSSCUG00000013664) #25 PRKDC (ENSSCUG00000013643) #26 SPIDR (ENSSCUG00000013630) #32 ENSSCUG00000013628 ENSSCUG00000013627 ENSSCUG00000013626 MAPRE2 (ENSSCUG00000013625) DTNA (ENSSCUG00000013622) NOL4 (ENSSCUG00000013616) ASXL3 (ENSSCUG00000013613) ENSSCUG00000013606 GAREM1 (ENSSCUG00000013600) MEP1B (ENSSCUG00000013598) Neognathae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00390000009113.a.b #21 ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000154897 ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.b.a #24 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a.z ENSGT00940000156405 Japanese quail DUPLICATION Japanese quail MODERN SPECIES 12 B4GALT5 (ENSCJPG00005007330) SLC9A8 (ENSCJPG00005007329) SPATA2 (ENSCJPG00005007328) RNF114 (ENSCJPG00005007327) ENSCJPG00005007326 #22 ENSCJPG00005007310 #24 ENSCJPG00005007309 CEBPB (ENSCJPG00005007308) PTPN1 (ENSCJPG00005007304) RIPOR3 (ENSCJPG00005007303) PARD6B (ENSCJPG00005007302) ADNP (ENSCJPG00005007301) DPM1 (ENSCJPG00005007297) MOCS3 (ENSCJPG00005007296) KCNG1 (ENSCJPG00005007295) NFATC2 (ENSCJPG00005007292) ATP9A (ENSCJPG00005007291) SALL4 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ENSGT00940000157210 ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a.z ENSGT00940000156405 ENSGT00950000183051.a.b Turkey DUPLICATION Turkey MODERN SPECIES 14 ENSMGAG00000009301 ENSMGAG00000009344 NFATC2 (ENSMGAG00000009346) ENSMGAG00000022874 ENSMGAG00000009354 ENSMGAG00000021003 ENSMGAG00000009359 ENSMGAG00000009385 PARD6B (ENSMGAG00000009390) ENSMGAG00000021421 ENSMGAG00000009421 ENSMGAG00000009391 ENSMGAG00000020444 ENSMGAG00000022811 ENSMGAG00000020197 ##24 ENSMGAG00000009447 #22 ENSMGAG00000009468 ENSMGAG00000010224 ENSMGAG00000010231 ENSMGAG00000010247 ENSMGAG00000019930 ENSMGAG00000004105 ENSMGAG00000004091 ENSMGAG00000017969 ENSMGAG00000022988 ENSMGAG00000004129 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ENSGT00950000183051.a.b Pink-footed goose DUPLICATION Pink-footed goose MODERN SPECIES 10 ENSABRG00000019080 NCOA3 (ENSABRG00000019239) SULF2 (ENSABRG00000019662) PREX1 (ENSABRG00000019940) ARFGEF2 (ENSABRG00000020216) CSE1L (ENSABRG00000020623) STAU1 (ENSABRG00000020968) ENSABRG00000021083 KCNB1 (ENSABRG00000021087) ENSABRG00000021090 B4GALT5 (ENSABRG00000021091) SLC9A8 (ENSABRG00000021093) ENSABRG00000021105 SPATA2 (ENSABRG00000021109) RNF114 (ENSABRG00000021113) ENSABRG00000021119 #22 ENSABRG00000021123 ##24 ENSABRG00000021125 CEBPB (ENSABRG00000021130) PTPN1 (ENSABRG00000021148) RIPOR3 (ENSABRG00000021155) PARD6B (ENSABRG00000021158) BCAS4 (ENSABRG00000021167) ENSABRG00000021174 ENSABRG00000021179 DPM1 (ENSABRG00000021185) KCNG1 (ENSABRG00000021189) NFATC2 (ENSABRG00000021208) ATP9A (ENSABRG00000021425) SALL4 (ENSABRG00000021954) ZFP64 (ENSABRG00000021962) Pink-footed goose MODERN SPECIES 13 OPRK1 (ENSABRG00000012517) NPBWR1 (ENSABRG00000012520) #8 RB1CC1 (ENSABRG00000012521) #9 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Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000154897 ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a 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ENSGT00940000155633.D #26 ENSGT00940000163032 #31 ENSGT00940000164631 ENSGT00390000014654 #32 ENSGT00950000183117.b ENSGT00490000043329.a.a.b ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000159992 ENSGT00520000055578.a.a.d ENSGT00940000159556 ENSGT00940000166646 ENSGT00530000063834.e.a ENSGT00950000183111.b.a Common canary MODERN SPECIES XKR4 (ENSSCAG00000012812) ENSSCAG00000012792 ENSSCAG00000012784 MRPL15 (ENSSCAG00000012779) LYPLA1 (ENSSCAG00000012773) TCEA1 (ENSSCAG00000012765) RGS20 (ENSSCAG00000012762) ATP6V1H (ENSSCAG00000012757) OPRK1 (ENSSCAG00000012744) NPBWR1 (ENSSCAG00000012738) #8 RB1CC1 (ENSSCAG00000012728) #9 ALKAL1 (ENSSCAG00000012718) #10 ST18 (ENSSCAG00000012704) PCMTD1 (ENSSCAG00000012702) #13 SNTG1 (ENSSCAG00000012661) #17 ENSSCAG00000012644 #22 ENSSCAG00000012634 UBE2V2 (ENSSCAG00000012600) #24 MCM4 (ENSSCAG00000012481) #25 PRKDC (ENSSCAG00000012431) #26 SPIDR (ENSSCAG00000012410) #32 ENSSCAG00000012390 MAPRE2 (ENSSCAG00000012383) DTNA (ENSSCAG00000012321) NOL4 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ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Golden eagle DUPLICATION Golden eagle MODERN SPECIES 19 ENSACCG00020009943 NCOA3 (ENSACCG00020009929) SULF2 (ENSACCG00020009897) PREX1 (ENSACCG00020009855) ARFGEF2 (ENSACCG00020009805) CSE1L (ENSACCG00020009753) STAU1 (ENSACCG00020009713) ENSACCG00020009654 KCNB1 (ENSACCG00020009641) B4GALT5 (ENSACCG00020009619) SLC9A8 (ENSACCG00020009595) ENSACCG00020009564 ENSACCG00020009538 ENSACCG00020009530 RNF114 (ENSACCG00020009519) ENSACCG00020009513 #22 ENSACCG00020009505 ##24 ENSACCG00020009490 CEBPB (ENSACCG00020009480) PTPN1 (ENSACCG00020009468) RIPOR3 (ENSACCG00020009436) PARD6B (ENSACCG00020009406) BCAS4 (ENSACCG00020009398) ADNP (ENSACCG00020009379) DPM1 (ENSACCG00020009351) MOCS3 (ENSACCG00020009342) KCNG1 (ENSACCG00020009334) NFATC2 (ENSACCG00020009326) ATP9A (ENSACCG00020009297) SALL4 (ENSACCG00020009275) ZFP64 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(ENSSPUG00000018227) SALL4 (ENSSPUG00000018274) ZFP64 (ENSSPUG00000018286) Episquamata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT01000000215962 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00940000165342 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.a ##24 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230 ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00510000046470.a.a.b ENSGT00950000183021.a.b ENSGT00940000159151 ENSGT00940000159925 ENSGT00940000158950 ENSGT00550000074884 ENSGT00940000157304 ENSGT00390000008325.b.a ENSGT00940000154899 ENSGT00940000153709.A ENSGT00940000158019 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00940000158854 ENSGT00940000163703.a ENSGT00940000162137 ENSGT00940000158041 ENSGT00940000153717.a.b ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00390000006790.a ENSGT00530000063631.b ENSGT00940000153481.B ENSGT00940000160847 ENSGT00940000159686 ENSGT00940000156230.m ENSGT00940000159181 ENSGT00940000155384.a ENSGT00940000156405 Indian cobra DUPLICATION Indian cobra MODERN SPECIES 2 ENSNNAG00000001257 NCOA3 (ENSNNAG00000001234) SULF2 (ENSNNAG00000001211) ENSNNAG00000001199 PREX1 (ENSNNAG00000001155) ARFGEF2 (ENSNNAG00000001086) CSE1L (ENSNNAG00000001043) STAU1 (ENSNNAG00000000957) ENSNNAG00000000927 KCNB1 (ENSNNAG00000000924) PTGIS (ENSNNAG00000000908) B4GALT5 (ENSNNAG00000000878) ENSNNAG00000000848 SPATA2 (ENSNNAG00000000828) RNF114 (ENSNNAG00000000821) ENSNNAG00000004537 #22 UBE2V1 (ENSNNAG00000004529) ENSNNAG00000004498 CEBPB (ENSNNAG00000004482) PTPN1 (ENSNNAG00000004419) RIPOR3 (ENSNNAG00000004260) PARD6B (ENSNNAG00000004236) BCAS4 (ENSNNAG00000004214) DPM1 (ENSNNAG00000004101) MOCS3 (ENSNNAG00000004079) KCNG1 (ENSNNAG00000004057) NFATC2 (ENSNNAG00000003856) ATP9A (ENSNNAG00000003775) SALL4 (ENSNNAG00000003718) ZFP64 (ENSNNAG00000003693) ENSNNAG00000003680 Indian cobra MODERN SPECIES 2 XKR4 (ENSNNAG00000017337) ENSNNAG00000017280 SOX17 (ENSNNAG00000017262) MRPL15 (ENSNNAG00000017230) LYPLA1 (ENSNNAG00000017221) TCEA1 (ENSNNAG00000017209) ENSNNAG00000017201 ATP6V1H (ENSNNAG00000017193) OPRK1 (ENSNNAG00000017186) NPBWR1 (ENSNNAG00000017183) #8 RB1CC1 (ENSNNAG00000017145) #9 ALKAL1 (ENSNNAG00000017134) #10 ST18 (ENSNNAG00000017018) PCMTD1 (ENSNNAG00000016981) #13 SNTG1 (ENSNNAG00000016965) #17 ENSNNAG00000016959 #22 UBE2V2 (ENSNNAG00000016952) #24 MCM4 (ENSNNAG00000016935) #25 PRKDC (ENSNNAG00000015678) #26 SPIDR (ENSNNAG00000015492) #32 MAPRE2 (ENSNNAG00000015462) ENSNNAG00000015442 ENSNNAG00000015400 ENSNNAG00000015369 ENSNNAG00000015361 NOL4 (ENSNNAG00000015349) ASXL3 (ENSNNAG00000015300) KLHL14 (ENSNNAG00000015223) ENSNNAG00000015202 GAREM1 (ENSNNAG00000015185) RNF138 (ENSNNAG00000015165) Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000154242.b ENSGT00940000156694 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DUPLICATION Lizard MODERN SPECIES 3 ENSACAG00000016230 PREX1 (ENSACAG00000016162) ARFGEF2 (ENSACAG00000016019) CSE1L (ENSACAG00000015951) ENSACAG00000015909 ENSACAG00000015892 ENSACAG00000036797 KCNB1 (ENSACAG00000043324) PTGIS (ENSACAG00000015827) B4GALT5 (ENSACAG00000015763) SLC9A8 (ENSACAG00000015679) ENSACAG00000037051 ENSACAG00000015668 RNF114 (ENSACAG00000015615) SPATA2 (ENSACAG00000015656) ENSACAG00000015607 #22 ENSACAG00000025937 ##24 ENSACAG00000015580 CEBPB (ENSACAG00000015567) ENSACAG00000040825 PHACTR3 (ENSACAG00000003686) ENSACAG00000043340 ENSACAG00000003951 ENSACAG00000036499 PPP1R3D (ENSACAG00000003895) FAM217B (ENSACAG00000025908) CDH26 (ENSACAG00000003897) ENSACAG00000037619 ENSACAG00000038730 ##30 ENSACAG00000035574 CDH4 (ENSACAG00000016236) Lizard MODERN SPECIES 821 PCMTD1 (ENSACAG00000017959) #13 SNTG1 (ENSACAG00000012344) #17 ENSACAG00000040179 PPDPFL (ENSACAG00000037526) #21 ENSACAG00000012332 #22 UBE2V2 (ENSACAG00000012315) #24 ENSACAG00000020934 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ENSEEEG00000010642 ENSEEEG00000010634 ENSEEEG00000010448 ENSEEEG00000010443 TMEM132C (ENSEEEG00000010439) Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 133 ENSGT00940000156056.B.c.b ENSGT00940000160805 ENSGT00940000159126 ENSGT00390000014839.a ENSGT00940000164727.b ENSGT00940000164727.a.a ENSGT00940000165535 ENSGT01100000263569.a.a ENSGT00940000158974 ENSGT00940000154365.a.a ENSGT00940000159586 ENSGT00390000015871 #9 ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.b.b.a ##13 ENSGT00950000182863.B.a #17 ENSGT00940000154681.a #22 ENSGT00740000115534.a.b.k.a #24 ENSGT01050000244824.A #25 ENSGT00940000163032 #31 ENSGT00390000014654 #32 ENSGT00490000043329.a.a.b ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000166855 ENSGT00940000171212 ENSGT00940000159556 ENSGT00950000182955.a.a.b ENSGT00940000154756.B.o.a ENSGT00390000001263 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000158992 ENSGT00940000164265.C ENSGT00950000182910.a.b.b.d ENSGT00940000156056.B.c.b.d ENSGT00940000160805 ENSGT00940000159126 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ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000166855 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000168428.b.b.a ENSGT00940000154756.A ENSGT00390000014839.a ENSGT00940000159126 ENSGT00940000160805 ENSGT00940000164727 ENSGT00940000165535 ENSGT01100000263569.a.a ENSGT00940000158974 ENSGT00940000154365.a.a ENSGT00940000159586 ENSGT00390000015871 #9 ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.b.b.a ##13 ENSGT00950000182863.B.a #17 ENSGT00940000154681.a.e #22 ENSGT00740000115534.a.b #24 ENSGT01050000244824.A #25 ENSGT00940000163032 #31 ENSGT00390000014654 #32 ENSGT00490000043329.a.a.b ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000166855 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 Haplochromini_A 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ENSGT00390000011196 Ballan wrasse MODERN SPECIES 336 ENSLBEG00000001687 ENSLBEG00000001649 ENSLBEG00000001624 abcb8 (ENSLBEG00000001537) cdk5 (ENSLBEG00000001455) ENSLBEG00000001420 ENSLBEG00000001405 zgc:92591 (ENSLBEG00000001382) asb10 (ENSLBEG00000001325) gbx1 (ENSLBEG00000001309) AGAP3 (ENSLBEG00000001302) RB1CC1 (ENSLBEG00000001203) #9 ST18 (ENSLBEG00000001117) pcmtd1 (ENSLBEG00000001073) ##13 SNTG1 (ENSLBEG00000000987) #17 snai2 (ENSLBEG00000000972) #22 ube2v2 (ENSLBEG00000000946) #24 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000154756.B.v ENSGT00940000154756.A ENSGT00390000014839.a ENSGT00940000159126 ENSGT00940000160805 ENSGT00940000164727 ENSGT01100000263569.a.a ENSGT00940000158974 ENSGT00940000154365.a.a ENSGT00940000159586 ENSGT00390000015871 #9 ENSGT01030000238439 ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.b.b.a ##13 ENSGT00950000182863.B.a #17 ENSGT00940000154681.a.e #22 ENSGT00740000115534.a.b #24 ENSGT01050000244824.A #25 ENSGT00940000163032 #31 ENSGT00390000014654 #32 ENSGT00490000043329.a.a.b ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000166855 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000155815.q ENSGT00940000154756.A ENSGT00390000014839.a ENSGT00940000159126 ENSGT00940000160805 ENSGT00940000164727 ENSGT01100000263569.a.a ENSGT00940000158974 ENSGT00940000154365.a.a ENSGT00940000159586 ENSGT00390000015871 #9 ENSGT00940000159905 ENSGT00950000183032.A.b.b.a ##13 ENSGT00950000182863.B.a #17 ENSGT00940000154511.b ENSGT00940000154681.a.e #22 ENSGT00740000115534.a.b #24 ENSGT01050000244824.A #25 ENSGT00940000163032 #31 ENSGT00390000014654 #32 ENSGT00490000043329.a.a.b ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000166855 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 Gilthead seabream MODERN SPECIES 13 guk1a (ENSSAUG00010002929) zgc:63882 (ENSSAUG00010002941) ENSSAUG00010002946 atg9b (ENSSAUG00010002962) abcb8 (ENSSAUG00010002978) cdk5 (ENSSAUG00010003127) asic1c (ENSSAUG00010003193) zgc:92591 (ENSSAUG00010003641) asb10 (ENSSAUG00010003644) gbx1 (ENSSAUG00010003647) AGAP3 (ENSSAUG00010003720) RB1CC1 (ENSSAUG00010006685) #9 ENSSAUG00010006749 pcmtd1 (ENSSAUG00010006752) ##13 SNTG1 (ENSSAUG00010006754) #17 snai2 (ENSSAUG00010006755) #22 ube2v2 (ENSSAUG00010006759) #24 mcm4 (ENSSAUG00010006897) #25 cebpd (ENSSAUG00010007393) #31 SPIDR (ENSSAUG00010007395) #32 mapre2 (ENSSAUG00010007398) dtna (ENSSAUG00010007409) ENSSAUG00010007444 KLHL14 (ENSSAUG00010007453) CACNA1E (ENSSAUG00010007497) RNF11 (ENSSAUG00010012109) rpe65a (ENSSAUG00010012127) SRSF11 (ENSSAUG00010012277) ENSSAUG00010012280 ZNF830 (ENSSAUG00010012313) EFCAB14 (ENSSAUG00010012315) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154756.B.v ENSGT00940000154756.A 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ENSGT00950000183032.A.b.b.a ##13 ENSGT00950000182863.B.a #17 ENSGT00940000154681.a.e #22 ENSGT00740000115534.a.b #24 ENSGT01050000244824.A #25 ENSGT00940000163032 #31 ENSGT00390000014654 #32 ENSGT00490000043329.a.a.b ENSGT00940000153897.a ENSGT00940000166855 ENSGT00940000159556 ENSGT00940000155601.h ENSGT00730000110988.wb.b ENSGT00950000182913.B.e ENSGT00730000110872.b.db ENSGT00950000182928.B.d.a ENSGT00390000012151 ENSGT00390000011196 Channel bull blenny MODERN SPECIES 8 guk1a (ENSCGOG00000002003) ENSCGOG00000002005 atg9b (ENSCGOG00000002008) abcb8 (ENSCGOG00000002017) cdk5 (ENSCGOG00000002062) asic1c (ENSCGOG00000002255) zgc:92591 (ENSCGOG00000002261) asb10 (ENSCGOG00000002262) ENSCGOG00000002263 gbx1 (ENSCGOG00000002264) AGAP3 (ENSCGOG00000002284) RB1CC1 (ENSCGOG00000003090) #9 ST18 (ENSCGOG00000003832) pcmtd1 (ENSCGOG00000003837) ##13 SNTG1 (ENSCGOG00000003844) #17 snai2 (ENSCGOG00000003944) #22 ube2v2 (ENSCGOG00000003950) #24 mcm4 (ENSCGOG00000004032) #25 cebpd 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ENSSMAG00000019897 ENSSMAG00000019907 ENSSMAG00000019932 Tongue sole MODERN SPECIES 12 ripk1l (ENSCSEG00000009905) opn7a (ENSCSEG00000009941) MEP1B (ENSCSEG00000009958) PHLPP1 (ENSCSEG00000010072) ENSCSEG00000010090 PHACTR1 (ENSCSEG00000010111) SIRT5 (ENSCSEG00000010122) adcy1b (ENSCSEG00000010136) IGFBP1 (ENSCSEG00000010195) IGFBP3 (ENSCSEG00000010197) TNS3 (ENSCSEG00000010201) DSP (ENSCSEG00000010216) ENSCSEG00000010237 ENSCSEG00000010255 SNTG1 (ENSCSEG00000010282) #17 snai2 (ENSCSEG00000010311) #22 ube2v2 (ENSCSEG00000010314) #24 mcm4 (ENSCSEG00000010327) #25 ENSCSEG00000010390 #32 cebpd (ENSCSEG00000010409) #31 mapre2 (ENSCSEG00000010441) dtna (ENSCSEG00000010470) ENSCSEG00000010507 KLHL14 (ENSCSEG00000010537) ENSCSEG00000010554 CACNA1E (ENSCSEG00000010561) rpe65a (ENSCSEG00000010662) RNF11 (ENSCSEG00000010710) ENSCSEG00000010721 ENSCSEG00000010734 ZNF830 (ENSCSEG00000010754) Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 8 cdk5 (ENSMMDG00005018899) ENSMMDG00005018896 ENSMMDG00005018893 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ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00570000079168.b.b.a ENSGT00950000183100.B ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3109 calhm2.1 (ENSSLDG00000019017) CALHM3 (ENSSLDG00000019000) hells (ENSSLDG00000018960) rab1ab (ENSSLDG00000018942) ENSSLDG00000018925 ENSSLDG00000018910 tlx1 (ENSSLDG00000018898) ENSSLDG00000018888 slc2a15a (ENSSLDG00000018856) fgf8a (ENSSLDG00000018838) fbxw4 (ENSSLDG00000018817) wbp1la (ENSSLDG00000018784) nt5c2a (ENSSLDG00000018749) borcs7 (ENSSLDG00000018734) cyp17a1 (ENSSLDG00000018716) ENSSLDG00000018704 #22 RNF166 (ENSSLDG00000018689) ctu2 (ENSSLDG00000018672) cdk1 (ENSSLDG00000018654) HNRNPLL (ENSSLDG00000018626) galm (ENSSLDG00000018600) ENSSLDG00000018554 chchd1 (ENSSLDG00000018533) ENSSLDG00000018475 zswim8 (ENSSLDG00000018377) NDST2 (ENSSLDG00000018320) ENSSLDG00000018307 polr1c (ENSSLDG00000018285) fbxo28 (ENSSLDG00000018259) degs1 (ENSSLDG00000018251) nvl (ENSSLDG00000018218) Barramundi perch MODERN SPECIES 338 calhm2.1 (ENSLCAG00010012756) CALHM3 (ENSLCAG00010012762) hells (ENSLCAG00010012788) rab1ab (ENSLCAG00010012896) cep68 (ENSLCAG00010012901) ENSLCAG00010012907 tlx1 (ENSLCAG00010012909) ENSLCAG00010012914 slc2a15a (ENSLCAG00010012928) fgf8a (ENSLCAG00010012964) fbxw4 (ENSLCAG00010012970) wbp1la (ENSLCAG00010012975) nt5c2a (ENSLCAG00010013040) borcs7 (ENSLCAG00010013169) cyp17a1 (ENSLCAG00010013188) ENSLCAG00010013228 #22 RNF166 (ENSLCAG00010013229) ctu2 (ENSLCAG00010013230) cdk1 (ENSLCAG00010013233) HNRNPLL (ENSLCAG00010013250) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000155588.b ENSGT00940000154681.a.f #22 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000008797 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ENSTRUG00000023025 ENSTRUG00000028920 tlx1 (ENSTRUG00000000431) ENSTRUG00000000457 slc2a15a (ENSTRUG00000000474) fgf8a (ENSTRUG00000000925) fbxw4 (ENSTRUG00000001025) wbp1la (ENSTRUG00000032138) nt5c2a (ENSTRUG00000001182) borcs7 (ENSTRUG00000032893) cyp17a1 (ENSTRUG00000001509) ENSTRUG00000026748 #22 RNF166 (ENSTRUG00000031483) FAM98A (ENSTRUG00000027624) ctu2 (ENSTRUG00000027026) ENSTRUG00000029940 vps8 (ENSTRUG00000026854) ENSTRUG00000026660 XPO1 (ENSTRUG00000027000) SANBR (ENSTRUG00000005912) pex13 (ENSTRUG00000006329) ENSTRUG00000028193 ENSTRUG00000031240 nt5c2a (ENSTRUG00000030293) borcs7 (ENSTRUG00000022564) cyp17a1 (ENSTRUG00000028854) ENSTRUG00000026497 #22 Fugu MODERN SPECIES 16 ENSTRUG00000026748 #22 RNF166 (ENSTRUG00000031483) FAM98A (ENSTRUG00000027624) ctu2 (ENSTRUG00000027026) ENSTRUG00000029940 vps8 (ENSTRUG00000026854) ENSTRUG00000026660 XPO1 (ENSTRUG00000027000) SANBR (ENSTRUG00000005912) pex13 (ENSTRUG00000006329) ENSTRUG00000028193 ENSTRUG00000031240 nt5c2a (ENSTRUG00000030293) borcs7 (ENSTRUG00000022564) cyp17a1 (ENSTRUG00000028854) ENSTRUG00000026497 #22 RNF166 (ENSTRUG00000023203) ctu2 (ENSTRUG00000024348) ENSTRUG00000027647 ENSTRUG00000027886 vps8 (ENSTRUG00000003896) ENSTRUG00000032710 pcca (ENSTRUG00000004990) XPO1 (ENSTRUG00000033434) pex13 (ENSTRUG00000028922) ENSTRUG00000023093 REL (ENSTRUG00000029404) ENSTRUG00000006394 papolg (ENSTRUG00000006410) haao (ENSTRUG00000006699) ENSTRUG00000030276 Tetraodon MODERN SPECIES 10 ENSTNIG00000004098 ENSTNIG00000001593 ENSTNIG00000004617 asah2 (ENSTNIG00000004618) ADGRL3 (ENSTNIG00000005139) gtf2e2 (ENSTNIG00000005140) DCTN6 (ENSTNIG00000005141) ENSTNIG00000019603 ENSTNIG00000018675 ENSTNIG00000000969 vps8 (ENSTNIG00000005465) FAM98A (ENSTNIG00000005464) ENSTNIG00000005463 ENSTNIG00000005961 cyp17a1 (ENSTNIG00000019678) ENSTNIG00000004434 #22 RNF166 (ENSTNIG00000004433) wbp1la (ENSTNIG00000005241) fbxw4 (ENSTNIG00000005242) fgf8a (ENSTNIG00000006362) slc2a15a (ENSTNIG00000006363) TENM3 (ENSTNIG00000005377) dctd (ENSTNIG00000010560) ENSTNIG00000010561 bdh2 (ENSTNIG00000010562) ENSTNIG00000010563 cnga1a (ENSTNIG00000010564) scpp5 (ENSTNIG00000010565) ENSTNIG00000010566 ENSTNIG00000000359 ENSTNIG00000010567 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000155588.b ENSGT00940000154681.a.f #22 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000008797 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.e ENSGT00510000047589 ENSGT00390000014293.b ENSGT00390000007683 ENSGT00940000164412.a.a.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00570000079168.b.b.a ENSGT00950000183100.B ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT01030000234610.b.a.a ENSGT01030000234610.b.a.b.b ENSGT00740000115593 ENSGT00940000155078.a.b.a.b ENSGT00810000125473.A ENSGT00390000009155 ENSGT00940000158698 ENSGT00940000164611.a.b ENSGT00940000164095.a ENSGT00940000159518.a ENSGT00390000005029 ENSGT00950000183109.c.a.a.a.a ENSGT00940000163289.b.a.b ENSGT00390000015849 ENSGT00940000155588.b ENSGT00940000154681.a.f #22 ENSGT00950000182909.b.b.b ENSGT00390000008797 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT01030000234642.a.b.b.d.a.e ENSGT00510000047589 ENSGT00390000014293.b ENSGT00390000007683 ENSGT00940000164412.a.a.a ENSGT00940000156999 ENSGT00940000156237 ENSGT00570000079168.b.b.a ENSGT00950000183100.B ENSGT00390000002970 ENSGT00390000013448.a.a ENSGT00570000079239 Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154681.a.f #22 Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154681.a.f #22 Channel bull blenny MODERN SPECIES 6 pitx3 (ENSCGOG00000016802) GBF1 (ENSCGOG00000014760) macroh2a2 (ENSCGOG00000014711) ENSCGOG00000014709 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ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000159233 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000159151 ENSGT00950000183029.C ENSGT00390000007823 ENSGT00940000161109 Osteoglossiformes DUPLICATION Osteoglossiformes ANCESTRAL SPECIES 76 ENSGT00940000158138.e ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a.i ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00940000158405.d ENSGT00390000004786.a ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000158901.c ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114.h ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.a ##22 ENSGT00390000013867.cc.a ENSGT00390000013764 ENSGT00390000018330.d ENSGT00940000159233 ENSGT00940000160331.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.a ENSGT00940000156477.c ENSGT00940000164502.b ENSGT00940000159151 ENSGT00950000183029.C ENSGT00390000007823.`b ENSGT00940000156478.c 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ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C.b ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT00390000013867 Atlantic herring MODERN SPECIES 20 b4galt5 (ENSCHAG00000022268) slc9a8 (ENSCHAG00000022479) opn7b (ENSCHAG00000022679) spata2 (ENSCHAG00000022711) rnf114 (ENSCHAG00000022713) mafba (ENSCHAG00000022719) dhx35 (ENSCHAG00000022734) rab5if (ENSCHAG00000022947) zhx3b (ENSCHAG00000022957) plcg1 (ENSCHAG00000022986) TOP1 (ENSCHAG00000023109) zgc:114123 (ENSCHAG00000023430) ENSCHAG00000023449 GGT7 (ENSCHAG00000023533) ENSCHAG00000000178 snai1b (ENSCHAG00000000196) ##22 samhd1 (ENSCHAG00000000210) gss (ENSCHAG00000000400) samhd1 (ENSCHAG00000001845) samhd1 (ENSCHAG00000002266) samhd1 (ENSCHAG00000002379) ENSCHAG00000004820 trpc4apb (ENSCHAG00000005024) ENSCHAG00000006169 ASB14 (ENSCHAG00000006505) DNAH12 (ENSCHAG00000006637) atp6ap1lb (ENSCHAG00000010172) slmapb (ENSCHAG00000010184) abhd6b (ENSCHAG00000010230) kctd6b (ENSCHAG00000010250) ENSCHAG00000010277 Denticle herring MODERN SPECIES 1 EMILIN3 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ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C.b ENSGT00940000154681.b.c ##22 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 73 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.d.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C.b ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT00950000182835.c.c.g.a ENSGT00940000155614.i.a ENSGT00940000157392.p ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000167932.b ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00940000155141.x ENSGT00940000158073.a ENSGT00390000011620.a.a.b.f ENSGT00940000156010.db ENSGT00940000159695 ENSGT00940000159853 Channel catfish MODERN SPECIES 6 FBLN2 (ENSIPUG00000016719) nup210 (ENSIPUG00000016553) opn7b (ENSIPUG00000016509) spata2 (ENSIPUG00000016496) rnf114 (ENSIPUG00000016483) MAFB (ENSIPUG00000016478) dhx35 (ENSIPUG00000016363) c15h20orf24 (ENSIPUG00000016326) zhx3b (ENSIPUG00000016291) PLCG1 (ENSIPUG00000016131) TOP1 (ENSIPUG00000015990) zgc:114123 (ENSIPUG00000015953) NCOA6 (ENSIPUG00000015933) ggt7 (ENSIPUG00000015865) tp53inp2 (ENSIPUG00000015849) snai1b (ENSIPUG00000015844) ##22 ENSIPUG00000015751 smc1al (ENSIPUG00000015670) socs2 (ENSIPUG00000015657) SMIM29 (ENSIPUG00000015649) ENSIPUG00000015643 ENSIPUG00000015631 dido1 (ENSIPUG00000015614) ENSIPUG00000015603 col9a3 (ENSIPUG00000015548) ogfr (ENSIPUG00000015539) kcnk15 (ENSIPUG00000015516) ENSIPUG00000015499 ENSIPUG00000015489 ENSIPUG00000015484 ENSIPUG00000015019 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 77 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.d.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C.b ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT00950000182835.c.c.g.a ENSGT00940000155614.i.a ENSGT00940000157392.p ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000167932.a.a ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.e ENSGT00940000160902.c.b ENSGT00940000167904 Characoidei ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.d.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C.b ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT00950000182835.c.c.g.a ENSGT00940000155614.i.a ENSGT00940000157392.p ENSGT00410000025882.b ENSGT00940000167932.a.a 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carp reference MODERN SPECIES 11 pacsin1a (ENSCCRG00000082067) ENSCCRG00000048972 spata2 (ENSCCRG00000015742) rnf114 (ENSCCRG00000015736) mafba (ENSCCRG00000074407) ENSCCRG00000075257 ENSCCRG00000070138 ENSCCRG00000074500 ENSCCRG00000065758 zhx3b (ENSCCRG00000075543) plcg1 (ENSCCRG00000032195) TOP1 (ENSCCRG00000032166) ENSCCRG00000082092 ENSCCRG00000071709 ENSCCRG00000075756 snai1b (ENSCCRG00000022786) ##22 ENSCCRG00000039558 ENSCCRG00000074563 ENSCCRG00000059595 ENSCCRG00000076275 tcp1 (ENSCCRG00000022560) ENSCCRG00000070429 ENSCCRG00000022612 ENSCCRG00000060531 ENSCCRG00000013509 ENSCCRG00000033104 CPEB2 (ENSCCRG00000073539) ndnf (ENSCCRG00000055993) prdm5 (ENSCCRG00000022853) ENSCCRG00000042344 ENSCCRG00000074702 Golden-line barbel MODERN SPECIES 658 GGT7 (ENSSGRG00000024667) ENSSGRG00000024666 snai1b (ENSSGRG00000024665) ##22 ENSSGRG00000024664 ENSSGRG00000024663 PRSS35 (ENSSGRG00000024661) tcp1 (ENSSGRG00000024470) PLEKHG1 (ENSSGRG00000024408) ENSSGRG00000024404 ENSSGRG00000024402 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tail seahorse MODERN SPECIES 404 ENSHCOG00000019924 pfkfb2a (ENSHCOG00000019938) ENSHCOG00000019961 scube3 (ENSHCOG00000020006) ENSHCOG00000020015 ANKS1A (ENSHCOG00000020105) taf11 (ENSHCOG00000020114) BLTP3A (ENSHCOG00000020148) ilrun (ENSHCOG00000000713) SPDEF (ENSHCOG00000020452) pacsin1a (ENSHCOG00000020474) SMIM29 (ENSHCOG00000020479) hmga1a (ENSHCOG00000020487) GRM4 (ENSHCOG00000020506) ENSHCOG00000000816 snai1b (ENSHCOG00000020556) ##22 samhd1 (ENSHCOG00000020558) cfap20 (ENSHCOG00000001687) ENSHCOG00000001701 KBTBD12 (ENSHCOG00000001709) SLC26A6 (ENSHCOG00000001784) ENSHCOG00000001824 ENSHCOG00000001846 p4htma (ENSHCOG00000001858) ENSHCOG00000001885 parapinopsina (ENSHCOG00000001902) ddx20 (ENSHCOG00000001915) kcnd3 (ENSHCOG00000001923) ENSHCOG00000001935 ENSHCOG00000001939 cttnbp2nlb (ENSHCOG00000001943) Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a 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ENSATEG00000004700 ENSATEG00000026968 ENSATEG00000004919 ENSATEG00000003856 ENSATEG00000027611 ENSATEG00000029166 ENSATEG00000003834 ENSATEG00000003786 ENSATEG00000025564 ENSATEG00000003704 ENSATEG00000003254 Siamese fighting fish MODERN SPECIES 18 opn7b (ENSBSLG00000008153) ENSBSLG00000008166 ENSBSLG00000008199 opn7b (ENSBSLG00000008203) spata2 (ENSBSLG00000008211) rnf114 (ENSBSLG00000008213) mafba (ENSBSLG00000008224) dhx35 (ENSBSLG00000008312) rab5if (ENSBSLG00000008663) zhx3b (ENSBSLG00000008669) plcg1 (ENSBSLG00000008707) TOP1 (ENSBSLG00000008883) NCOA6 (ENSBSLG00000009604) GGT7 (ENSBSLG00000009620) ENSBSLG00000009729 snai1b (ENSBSLG00000009787) ##22 ENSBSLG00000009793 samhd1 (ENSBSLG00000009871) ENSBSLG00000010134 ENSBSLG00000010600 ENSBSLG00000010647 SLC26A6 (ENSBSLG00000010789) ENSBSLG00000011074 p4htma (ENSBSLG00000011277) ENSBSLG00000011285 ENSBSLG00000011799 ddx20 (ENSBSLG00000012459) kcnd3 (ENSBSLG00000013133) ENSBSLG00000013458 cttnbp2nlb (ENSBSLG00000015035) capza1b (ENSBSLG00000015048) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000156963.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b Seriola ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867.eb ENSGT00390000013867.db.a ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3093 EMILIN3 (ENSSLDG00000025294) b4galt5 (ENSSLDG00000025296) slc9a8 (ENSSLDG00000025299) opn7b (ENSSLDG00000025305) spata2 (ENSSLDG00000025308) rnf114 (ENSSLDG00000025310) mafba (ENSSLDG00000025314) dhx35 (ENSSLDG00000025317) rab5if (ENSSLDG00000025331) zhx3b (ENSSLDG00000025332) plcg1 (ENSSLDG00000025335) TOP1 (ENSSLDG00000025343) ENSSLDG00000025349 GGT7 (ENSSLDG00000025350) ENSSLDG00000025358 snai1b (ENSSLDG00000025359) ##22 ENSSLDG00000025361 samhd1 (ENSSLDG00000025364) ENSSLDG00000025367 ENSSLDG00000025370 KBTBD12 (ENSSLDG00000025372) SLC26A6 (ENSSLDG00000025374) ENSSLDG00000000099 P4HTM (ENSSLDG00000000213) ENSSLDG00000000223 ENSSLDG00000000259 parapinopsina (ENSSLDG00000000286) ddx20 (ENSSLDG00000000437) ENSSLDG00000000451 kcnd3 (ENSSLDG00000000468) ENSSLDG00000000503 Greater amberjack MODERN SPECIES 24 opn7b (ENSSDUG00000016848) spata2 (ENSSDUG00000016901) rnf114 (ENSSDUG00000016912) mafba (ENSSDUG00000016930) dhx35 (ENSSDUG00000016954) rab5if (ENSSDUG00000017026) zhx3b (ENSSDUG00000017041) plcg1 (ENSSDUG00000017063) TOP1 (ENSSDUG00000017111) ENSSDUG00000017145 GGT7 (ENSSDUG00000017185) ENSSDUG00000017227 snai1b (ENSSDUG00000017250) ##22 ENSSDUG00000017256 ENSSDUG00000017268 samhd1 (ENSSDUG00000017287) ENSSDUG00000017314 Barramundi perch MODERN SPECIES 136 opn7b (ENSLCAG00010021805) spata2 (ENSLCAG00010021803) rnf114 (ENSLCAG00010021800) mafba (ENSLCAG00010021799) dhx35 (ENSLCAG00010021718) rab5if (ENSLCAG00010021694) zhx3b (ENSLCAG00010021690) plcg1 (ENSLCAG00010021637) TOP1 (ENSLCAG00010021519) NCOA6 (ENSLCAG00010021474) GGT7 (ENSLCAG00010021468) ENSLCAG00010021466 snai1b (ENSLCAG00010021464) ##22 ENSLCAG00010021462 samhd1 (ENSLCAG00010021453) ENSLCAG00010021361 ENSLCAG00010021328 KBTBD12 (ENSLCAG00010021319) SLC26A6 (ENSLCAG00010021282) ENSLCAG00010021263 ENSLCAG00010021257 p4htma (ENSLCAG00010021255) ENSLCAG00010021124 parapinopsina (ENSLCAG00010021061) ddx20 (ENSLCAG00010021048) kcnd3 (ENSLCAG00010021032) ENSLCAG00010020633 cttnbp2nlb (ENSLCAG00010020543) Pleuronectoidei ANCESTRAL SPECIES 71 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 Turbot MODERN SPECIES 2 ENSSMAG00000008194 b4galt5 (ENSSMAG00000008219) slc9a8 (ENSSMAG00000008304) opn7b (ENSSMAG00000037335) spata2 (ENSSMAG00000032305) rnf114 (ENSSMAG00000008383) mafba (ENSSMAG00000008395) dhx35 (ENSSMAG00000008419) rab5if (ENSSMAG00000008502) zhx3b (ENSSMAG00000008524) plcg1 (ENSSMAG00000008551) TOP1 (ENSSMAG00000008650) ENSSMAG00000008685 ENSSMAG00000008762 ENSSMAG00000008815 snai1b (ENSSMAG00000008834) ##22 ENSSMAG00000008850 ENSSMAG00000030879 ENSSMAG00000008945 ENSSMAG00000008964 ENSSMAG00000008990 ENSSMAG00000009025 p4htma (ENSSMAG00000009093) ENSSMAG00000009105 ENSSMAG00000009132 ENSSMAG00000009155 ENSSMAG00000009280 ENSSMAG00000009297 ENSSMAG00000009328 ENSSMAG00000009334 ENSSMAG00000009365 Tongue sole MODERN SPECIES 1 EMILIN3 (ENSCSEG00000020992) b4galt5 (ENSCSEG00000020993) slc9a8 (ENSCSEG00000020997) spata2 (ENSCSEG00000021000) rnf114 (ENSCSEG00000021001) mafba (ENSCSEG00000021002) dhx35 (ENSCSEG00000021003) rab5if (ENSCSEG00000021005) zhx3b (ENSCSEG00000021007) ENSCSEG00000021010 ENSCSEG00000021012 ENSCSEG00000021013 ENSCSEG00000021017 GGT7 (ENSCSEG00000021018) ENSCSEG00000021021 snai1b (ENSCSEG00000021022) ##22 samhd1 (ENSCSEG00000021024) SLC26A6 (ENSCSEG00000021027) ENSCSEG00000021028 p4htma (ENSCSEG00000021030) ENSCSEG00000021031 AMIGO3 (ENSCSEG00000021034) ENSCSEG00000021036 ENSCSEG00000021037 DAG1 (ENSCSEG00000021039) pcbp4 (ENSCSEG00000021041) DOCK3 (ENSCSEG00000021042) DCAF1 (ENSCSEG00000021043) ssuh2rs1 (ENSCSEG00000021044) rpl32 (ENSCSEG00000021045) BICD2 (ENSCSEG00000021046) Eupercaria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b 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ENSGT00950000182852.B.b Tetraodon MODERN SPECIES 24 ENSTNIG00000017871 b4galt5 (ENSTNIG00000017870) ENSTNIG00000017869 opn7b (ENSTNIG00000017868) spata2 (ENSTNIG00000017867) rnf114 (ENSTNIG00000017866) mafba (ENSTNIG00000017865) ENSTNIG00000017864 dhx35 (ENSTNIG00000017863) rab5if (ENSTNIG00000017862) zhx3b (ENSTNIG00000004293) plcg1 (ENSTNIG00000003869) TOP1 (ENSTNIG00000003868) NCOA6 (ENSTNIG00000003867) GGT7 (ENSTNIG00000003866) snai1b (ENSTNIG00000003865) ##22 samhd1 (ENSTNIG00000006139) ENSTNIG00000001456 KBTBD12 (ENSTNIG00000006140) SLC26A6 (ENSTNIG00000006141) ENSTNIG00000006142 ENSTNIG00000000389 p4htma (ENSTNIG00000006143) ENSTNIG00000019422 parapinopsina (ENSTNIG00000019423) ddx20 (ENSTNIG00000019425) kcnd3 (ENSTNIG00000019424) ENSTNIG00000004010 ENSTNIG00000004011 ENSTNIG00000004012 ENSTNIG00000015007 Fugu MODERN SPECIES 15 ENSTRUG00000002445 b4galt5 (ENSTRUG00000028184) slc9a8 (ENSTRUG00000001576) opn7b (ENSTRUG00000001427) spata2 (ENSTRUG00000025144) rnf114 (ENSTRUG00000023221) mafba (ENSTRUG00000025028) dhx35 (ENSTRUG00000001011) rab5if (ENSTRUG00000023756) zhx3b (ENSTRUG00000000835) plcg1 (ENSTRUG00000000710) TOP1 (ENSTRUG00000000575) NCOA6 (ENSTRUG00000031596) GGT7 (ENSTRUG00000000439) ENSTRUG00000024255 snai1b (ENSTRUG00000000419) ##22 samhd1 (ENSTRUG00000027672) KBTBD12 (ENSTRUG00000031674) ENSTRUG00000027974 ENSTRUG00000026345 p4htma (ENSTRUG00000027605) ENSTRUG00000020777 KBTBD12 (ENSTRUG00000031116) SLC26A6 (ENSTRUG00000003313) ENSTRUG00000005480 ENSTRUG00000005983 p4htma (ENSTRUG00000022821) ENSTRUG00000006166 parapinopsina (ENSTRUG00000006524) ddx20 (ENSTRUG00000023712) ENSTRUG00000026992 Eupecaria_A ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000164736 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b Ballan wrasse MODERN SPECIES 227 spata2 (ENSLBEG00000006291) rnf114 (ENSLBEG00000006315) mafba (ENSLBEG00000006331) dhx35 (ENSLBEG00000006365) rab5if (ENSLBEG00000006459) zhx3b (ENSLBEG00000006486) plcg1 (ENSLBEG00000006555) TOP1 (ENSLBEG00000006737) ENSLBEG00000006855 GGT7 (ENSLBEG00000006889) ENSLBEG00000006946 snai1b (ENSLBEG00000006963) ##22 CDH4 (ENSLBEG00000006989) kcnk15 (ENSLBEG00000007037) ogfr (ENSLBEG00000007068) ENSLBEG00000007087 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 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b4galt5 (ENSLCRG00005015311) slc9a8 (ENSLCRG00005015065) ENSLCRG00005015062 opn7b (ENSLCRG00005015061) spata2 (ENSLCRG00005015060) rnf114 (ENSLCRG00005015058) mafba (ENSLCRG00005015055) dhx35 (ENSLCRG00005014923) rab5if (ENSLCRG00005014918) zhx3b (ENSLCRG00005014917) plcg1 (ENSLCRG00005014782) TOP1 (ENSLCRG00005013921) NCOA6 (ENSLCRG00005013915) GGT7 (ENSLCRG00005013880) ENSLCRG00005013875 snai1b (ENSLCRG00005013873) ##22 ENSLCRG00005013871 samhd1 (ENSLCRG00005013032) ENSLCRG00005013025 SLC26A6 (ENSLCRG00005012484) mgll (ENSLCRG00005012466) prkar2aa (ENSLCRG00005012464) ENSLCRG00005012455 stac3 (ENSLCRG00005012448) ENSLCRG00005012445 ENSLCRG00005012443 kif5aa (ENSLCRG00005005717) ENSLCRG00005005659 KLHL10 (ENSLCRG00005005658) ENSLCRG00005005649 tgm2a (ENSLCRG00005004272) Gilthead seabream MODERN SPECIES 21 EMILIN3 (ENSSAUG00010015965) b4galt5 (ENSSAUG00010015937) slc9a8 (ENSSAUG00010015903) opn7b (ENSSAUG00010015892) spata2 (ENSSAUG00010015890) rnf114 (ENSSAUG00010015886) mafba (ENSSAUG00010015884) dhx35 (ENSSAUG00010015849) rab5if (ENSSAUG00010015844) zhx3b (ENSSAUG00010015841) plcg1 (ENSSAUG00010015476) TOP1 (ENSSAUG00010015283) NCOA6 (ENSSAUG00010015268) GGT7 (ENSSAUG00010015267) ENSSAUG00010015264 snai1b (ENSSAUG00010015260) ##22 ENSSAUG00010015258 ENSSAUG00010015256 DLGAP4 (ENSSAUG00010015253) pcbp2 (ENSSAUG00010015135) map3k12 (ENSSAUG00010015130) aaas (ENSSAUG00010014758) col2a1a (ENSSAUG00010014288) GLS2 (ENSSAUG00010013723) spryd4 (ENSSAUG00010013713) asic1a (ENSSAUG00010013700) GPD1 (ENSSAUG00010013694) G6PD (ENSSAUG00010013690) ENSSAUG00010013686 ADCY6 (ENSSAUG00010012879) cacnb3a (ENSSAUG00010012697) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000156963.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b Perciformes_a ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT01070000253760.b.a.a.b ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000156963.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b Pike perch MODERN SPECIES 31 slc9a8 (ENSSLUG00000004133) ENSSLUG00000004082 ENSSLUG00000004073 opn7b (ENSSLUG00000004065) spata2 (ENSSLUG00000004060) rnf114 (ENSSLUG00000004051) mafba (ENSSLUG00000004041) dhx35 (ENSSLUG00000004014) rab5if (ENSSLUG00000003996) zhx3b (ENSSLUG00000003989) plcg1 (ENSSLUG00000002779) TOP1 (ENSSLUG00000002565) NCOA6 (ENSSLUG00000002497) GGT7 (ENSSLUG00000002432) ENSSLUG00000002412 snai1b (ENSSLUG00000002409) ##22 ENSSLUG00000002406 samhd1 (ENSSLUG00000001794) ENSSLUG00000001511 KBTBD12 (ENSSLUG00000022930) ENSSLUG00000022887 ENSSLUG00000021444 ENSSLUG00000021336 p4htma (ENSSLUG00000021330) ENSSLUG00000020353 parapinopsina (ENSSLUG00000020269) ddx20 (ENSSLUG00000020230) kcnd3 (ENSSLUG00000020215) ENSSLUG00000017463 cttnbp2nlb (ENSSLUG00000017270) capza1b (ENSSLUG00000017066) Channel bull blenny MODERN SPECIES 21 b4galt5 (ENSCGOG00000019983) slc9a8 (ENSCGOG00000020589) opn7b (ENSCGOG00000020911) spata2 (ENSCGOG00000020916) rnf114 (ENSCGOG00000020922) mafba (ENSCGOG00000020927) dhx35 (ENSCGOG00000020936) rab5if (ENSCGOG00000021010) ENSCGOG00000021011 zhx3b (ENSCGOG00000021012) plcg1 (ENSCGOG00000021047) TOP1 (ENSCGOG00000022182) NCOA6 (ENSCGOG00000022309) GGT7 (ENSCGOG00000022320) ENSCGOG00000022366 snai1b (ENSCGOG00000022367) ##22 samhd1 (ENSCGOG00000022385) ENSCGOG00000000116 ENSCGOG00000000132 KBTBD12 (ENSCGOG00000000147) SLC26A6 (ENSCGOG00000000259) ENSCGOG00000000418 p4htma (ENSCGOG00000000877) ENSCGOG00000000878 ENSCGOG00000000929 parapinopsina (ENSCGOG00000001556) ddx20 (ENSCGOG00000001557) kcnd3 (ENSCGOG00000001568) ENSCGOG00000001578 ENSCGOG00000001910 cttnbp2nlb (ENSCGOG00000001914) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156172.a ENSGT00940000158060 ENSGT01020000230412.B.b.b.b ENSGT00940000159165 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(ENSCLMG00005016945) abcd1 (ENSCLMG00005017334) ENSCLMG00005017745 ENSCLMG00005017746 ENSCLMG00005017751 ENSCLMG00005000075 Stickleback MODERN SPECIES 197 ENSGACG00000001596 ENSGACG00000001598 NCOA6 (ENSGACG00000001600) GGT7 (ENSGACG00000001608) snai1b (ENSGACG00000001618) ##22 ENSGACG00000001624 ENSGACG00000001627 samhd1 (ENSGACG00000001630) samhd1 (ENSGACG00000001632) samhd1 (ENSGACG00000001639) Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 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ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000156963.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182958.b.a.a.b ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b Pomacentridae_A ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b 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ENSACIG00000009455 snai1b (ENSACIG00000009443) ##22 samhd1 (ENSACIG00000009319) Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138 ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a ENSGT00950000182909.b.b.a ENSGT00940000160486.c ENSGT00940000156142 ENSGT00390000004786 ENSGT00950000182893.a.a.b.a ENSGT00940000158901 ENSGT00940000155006.e.b.b ENSGT00730000111114 ENSGT00940000156917.a ENSGT00530000063829.C ENSGT00940000154681.b.c ##22 ENSGT00390000013867 ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000164203 ENSGT00940000177817 ENSGT00940000156963.a.a ENSGT01100000263502.A.b.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b Oryzias ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT01030000234633.B.b.a ENSGT00940000158138.l ENSGT00940000157210 ENSGT01100000263524.B.b.a.a ENSGT00530000063956.a 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ENSGT00390000013867.r ENSGT00390000013867.q.a.a.a ENSGT00940000158422.b ENSGT00940000160885 ENSGT00940000156836.b ENSGT01070000253775.a.d.a.b.b.h.a ENSGT00940000164714 ENSGT00940000164203 ENSGT00390000014570.b ENSGT00940000156963.a.a ENSGT00940000158400 ENSGT00940000155343.a.a ENSGT00950000182852.B.b ENSGT00950000183119.a.b ENSGT00940000165736 Javanese ricefish MODERN SPECIES 21 ENSOJAG00000003665 b4galt5 (ENSOJAG00000003488) slc9a8 (ENSOJAG00000003446) opn7b (ENSOJAG00000003421) spata2 (ENSOJAG00000003405) rnf114 (ENSOJAG00000003396) mafba (ENSOJAG00000003384) dhx35 (ENSOJAG00000003345) rab5if (ENSOJAG00000003316) zhx3b (ENSOJAG00000003307) plcg1 (ENSOJAG00000002657) TOP1 (ENSOJAG00000002142) NCOA6 (ENSOJAG00000001966) GGT7 (ENSOJAG00000001889) ENSOJAG00000001872 snai1b (ENSOJAG00000001867) ##22 samhd1 (ENSOJAG00000001716) ENSOJAG00000001603 ENSOJAG00000001547 ENSOJAG00000001540 ENSOJAG00000001525 KBTBD12 (ENSOJAG00000001503) SLC26A6 (ENSOJAG00000001406) ENSOJAG00000001304 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ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b Pinecone sodierfish MODERN SPECIES 19 opn1sw2 (ENSMMDG00005008017) opn1sw2 (ENSMMDG00005007982) hcfc1a (ENSMMDG00005007918) si:dkey-13a21.4 (ENSMMDG00005007907) gata1a (ENSMMDG00005007905) BCL2L1 (ENSMMDG00005007904) adnpa (ENSMMDG00005007898) ENSMMDG00005007895 MAFB (ENSMMDG00005007892) fam83d (ENSMMDG00005007889) ZHX3 (ENSMMDG00005007888) top1a (ENSMMDG00005007045) ENSMMDG00005007023 ENSMMDG00005007017 ENSMMDG00005007015 snai1a (ENSMMDG00005007012) ##22 myh7ba (ENSMMDG00005006989) trpc4apa (ENSMMDG00005006010) ENSMMDG00005005982 ndrg3a (ENSMMDG00005004130) PHF20 (ENSMMDG00005004009) arhgap46a (ENSMMDG00005004002) sulf2a (ENSMMDG00005021725) id1 (ENSMMDG00005021683) NCOA3 (ENSMMDG00005021679) ZMYND8 (ENSMMDG00005020267) ENSMMDG00005020192 ogfr2 (ENSMMDG00005020184) ENSMMDG00005020181 ENSMMDG00005020180 cdh4 (ENSMMDG00005019715) Percomorphaceae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000163461.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b Tiger tail seahorse MODERN SPECIES 280 gnl3l (ENSHCOG00000009877) ENSHCOG00000009761 ENSHCOG00000008361 opn1sw2 (ENSHCOG00000007007) opn1sw2 (ENSHCOG00000006937) opn1sw2 (ENSHCOG00000005841) HCFC1 (ENSHCOG00000003837) gata1a (ENSHCOG00000003808) ENSHCOG00000003780 adnpa (ENSHCOG00000003771) MAFB (ENSHCOG00000003739) fam83d (ENSHCOG00000003731) ENSHCOG00000003720 top1a (ENSHCOG00000003669) ENSHCOG00000000102 snai1a (ENSHCOG00000003407) ##22 ENSHCOG00000003397 ENSHCOG00000003377 trpc4apa (ENSHCOG00000003326) ENSHCOG00000003293 ndrg3a (ENSHCOG00000003247) PHF20 (ENSHCOG00000003224) arhgap46a (ENSHCOG00000003203) sulf2a (ENSHCOG00000003168) id1 (ENSHCOG00000003100) ENSHCOG00000003088 Percomorphaceae_B ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e Ovalentaria ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000165182.d Oryzias ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000165182.d Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155877 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000155218.A.c ENSGT00940000165182.d ENSGT00390000005939.a.b.b Indian medaka MODERN SPECIES 8 gnl3l (ENSOMEG00000023685) opn1lw1 (ENSOMEG00000023693) opn1sw2 (ENSOMEG00000023704) ENSOMEG00000023708 opn1sw2 (ENSOMEG00000023716) gata1a (ENSOMEG00000023720) ENSOMEG00000023723 adnpa (ENSOMEG00000023725) ENSOMEG00000000634 MAFB (ENSOMEG00000023734) fam83d (ENSOMEG00000023737) ENSOMEG00000023740 top1a (ENSOMEG00000023745) ENSOMEG00000023760 ENSOMEG00000000745 snai1a (ENSOMEG00000023773) ##22 trpc4apa (ENSOMEG00000023783) ENSOMEG00000023796 ndrg3a (ENSOMEG00000000639) ENSOMEG00000023815 arhgap46a (ENSOMEG00000023925) sulf2a 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ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00940000161930 ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a Nile tilapia MODERN SPECIES 17 opn1sw2 (ENSONIG00000020293) opn1sw2 (ENSONIG00000020294) hcfc1a (ENSONIG00000020295) si:dkey-13a21.4 (ENSONIG00000020296) gata1a (ENSONIG00000020297) ENSONIG00000020298 ENSONIG00000028248 ENSONIG00000020300 MAFB (ENSONIG00000020811) fam83d (ENSONIG00000020301) ENSONIG00000035626 top1a (ENSONIG00000020303) ENSONIG00000035826 ENSONIG00000033933 ENSONIG00000020304 snai1a (ENSONIG00000031723) ##22 myh7ba (ENSONIG00000020306) trpc4apa (ENSONIG00000020307) ENSONIG00000038267 ndrg3a (ENSONIG00000020308) PHF20 (ENSONIG00000020309) arhgap46a (ENSONIG00000020310) sulf2a (ENSONIG00000020311) id1 (ENSONIG00000040265) NCOA3 (ENSONIG00000020313) ZMYND8 (ENSONIG00000020314) ENSONIG00000020315 ENSONIG00000038101 ENSONIG00000029288 ENSONIG00000032490 cdh4 (ENSONIG00000020316) Pseudocrenilabrinae_A ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.f ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000155532 ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b Haplochromini ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a 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(ENSLBEG00000016522) ENSLBEG00000016461 Eupecaria_B ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT01100000265393 ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b Perciformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a 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ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000155532 ENSGT00390000002821 ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000158073.b Stickleback MODERN SPECIES 17 tfe3b (ENSGACG00000010355) gnl3l (ENSGACG00000010320) opn1lw1 (ENSGACG00000010287) opn1sw2 (ENSGACG00000010229) hcfc1a (ENSGACG00000010222) gata1a (ENSGACG00000010218) BCL2L1 (ENSGACG00000010199) adnpa (ENSGACG00000010194) ENSGACG00000010189 MAFB (ENSGACG00000010185) fam83d (ENSGACG00000010183) top1a (ENSGACG00000010175) ENSGACG00000010167 ENSGACG00000010157 ENSGACG00000010154 snai1a (ENSGACG00000010147) ##22 trpc4apa (ENSGACG00000010137) ndrg3a (ENSGACG00000010090) PHF20 (ENSGACG00000010085) arhgap46a (ENSGACG00000010079) sulf2a (ENSGACG00000010055) id1 (ENSGACG00000010046) 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ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000156010.eb European seabass MODERN SPECIES 10 opn1lw1 (ENSDLAG00005025724) opn1sw2 (ENSDLAG00005025726) opn1sw2 (ENSDLAG00005025729) hcfc1a (ENSDLAG00005025731) RAB7A (ENSDLAG00005031533) gata1a (ENSDLAG00005025735) ENSDLAG00005025736 adnpa (ENSDLAG00005025737) MAFB (ENSDLAG00005029273) ENSDLAG00005025739 fam83d (ENSDLAG00005025742) ENSDLAG00005004319 top1a (ENSDLAG00005004446) ENSDLAG00005005453 ENSDLAG00005005462 SNAI (ENSDLAG00005033824) ##22 myh7ba (ENSDLAG00005005626) trpc4apa (ENSDLAG00005005884) ndrg3a (ENSDLAG00005006458) ENSDLAG00005007665 arhgap46a (ENSDLAG00005007687) sulf2a (ENSDLAG00005007742) ID1 (ENSDLAG00005033925) ENSDLAG00005008706 ZMYND8 (ENSDLAG00005008873) ENSDLAG00005011550 ogfr2 (ENSDLAG00005026653) ENSDLAG00005029634 CDH4 (ENSDLAG00005011657) ENSDLAG00005013961 LSM14B (ENSDLAG00005013965) Large yellow croaker MODERN SPECIES 478 opn1lw1 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ENSMAMG00000020545 LSM14B (ENSMAMG00000020539) Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000156010.eb Siamese fighting fish MODERN SPECIES 16 opn1lw1 (ENSBSLG00000008207) opn1sw2 (ENSBSLG00000008155) opn1sw2 (ENSBSLG00000008108) hcfc1a (ENSBSLG00000007920) 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ENSATEG00000015047 top1a (ENSATEG00000015061) ENSATEG00000015102 ENSATEG00000025418 snai1a (ENSATEG00000015639) ##22 myh7ba (ENSATEG00000015668) trpc4apa (ENSATEG00000015800) ndrg3a (ENSATEG00000015891) ENSATEG00000015958 arhgap46a (ENSATEG00000016027) sulf2a (ENSATEG00000016107) id1 (ENSATEG00000027640) ENSATEG00000016287 ENSATEG00000016340 ENSATEG00000028433 ogfr2 (ENSATEG00000016414) ENSATEG00000016484 CDH4 (ENSATEG00000016519) ENSATEG00000028405 LSM14B (ENSATEG00000029061) Carangaria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 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ENSGT00940000155532 ENSGT01100000265393 ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000158073.b Tongue sole MODERN SPECIES 2 ENSCSEG00000010113 trib3 (ENSCSEG00000010107) pnp4a (ENSCSEG00000010100) REM1 (ENSCSEG00000010064) ENSCSEG00000010043 st3gal8 (ENSCSEG00000009925) gata1a (ENSCSEG00000009914) BCL2L1 (ENSCSEG00000009904) adnpa (ENSCSEG00000009901) ENSCSEG00000009888 MAFB (ENSCSEG00000009881) fam83d (ENSCSEG00000009869) ENSCSEG00000009843 top1a (ENSCSEG00000009818) ENSCSEG00000009754 snai1a (ENSCSEG00000009739) ##22 myh7ba (ENSCSEG00000009595) trpc4apa (ENSCSEG00000009550) ENSCSEG00000009539 ndrg3a (ENSCSEG00000009496) ENSCSEG00000009421 arhgap46a (ENSCSEG00000009402) sulf2a (ENSCSEG00000009315) id1 (ENSCSEG00000009288) NCOA3 (ENSCSEG00000009220) cxxc1b (ENSCSEG00000009093) ENSCSEG00000009082 ccdc120b (ENSCSEG00000009074) dnali1 (ENSCSEG00000009037) txnrd3 (ENSCSEG00000008988) CHST13 (ENSCSEG00000008981) Turbot MODERN SPECIES 18 opn1lw1 (ENSSMAG00000014476) opn1sw2 (ENSSMAG00000014457) opn1sw2 (ENSSMAG00000014006) hcfc1a (ENSSMAG00000013953) si:dkey-13a21.4 (ENSSMAG00000013945) gata1a (ENSSMAG00000013930) ENSSMAG00000028451 ENSSMAG00000013917 ENSSMAG00000013903 ENSSMAG00000013891 fam83d (ENSSMAG00000013878) ENSSMAG00000026820 top1a (ENSSMAG00000013729) ENSSMAG00000013722 ENSSMAG00000013670 snai1a (ENSSMAG00000013652) ##22 myh7ba (ENSSMAG00000013574) trpc4apa (ENSSMAG00000013512) ENSSMAG00000027630 ndrg3a (ENSSMAG00000013395) ENSSMAG00000013338 ENSSMAG00000037386 arhgap46a (ENSSMAG00000013248) sulf2a (ENSSMAG00000013143) id1 (ENSSMAG00000013135) ENSSMAG00000013056 ENSSMAG00000012925 ENSSMAG00000012892 ENSSMAG00000012877 ogfr2 (ENSSMAG00000012850) ENSSMAG00000012838 Carangaria_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000156010.eb Barramundi perch MODERN SPECIES 93 opn1sw2 (ENSLCAG00010019314) opn1sw2 (ENSLCAG00010019332) opn1sw2 (ENSLCAG00010019363) si:dkey-13a21.4 (ENSLCAG00010019380) gata1a (ENSLCAG00010019384) BCL2L1 (ENSLCAG00010019389) adnpa (ENSLCAG00010019391) ENSLCAG00010019393 ENSLCAG00010019399 MAFB (ENSLCAG00010019413) fam83d (ENSLCAG00010019414) ENSLCAG00010019417 top1a (ENSLCAG00010019460) ENSLCAG00010019685 GGT7 (ENSLCAG00010019687) snai1a (ENSLCAG00010019688) ##22 myh7ba (ENSLCAG00010019690) trpc4apa (ENSLCAG00010019718) ENSLCAG00010019825 ndrg3a (ENSLCAG00010019837) ENSLCAG00010019917 ENSLCAG00010019926 arhgap46a (ENSLCAG00010019930) sulf2a (ENSLCAG00010020064) id1 (ENSLCAG00010020359) NCOA3 (ENSLCAG00010020363) ZMYND8 (ENSLCAG00010020497) ENSLCAG00010021083 ENSLCAG00010021094 cdh4 (ENSLCAG00010021125) ENSLCAG00010021180 Seriola ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.d ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.c.a.b ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109 ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00390000018730.A.f ENSGT00940000160902.c.a ENSGT00940000158073.b ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000156010.eb Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 2037 opn1sw2 (ENSSLDG00000012230) opn1sw2 (ENSSLDG00000012051) opn1sw2 (ENSSLDG00000011730) hcfc1a (ENSSLDG00000011619) si:dkey-13a21.4 (ENSSLDG00000011597) gata1a (ENSSLDG00000011572) BCL2L1 (ENSSLDG00000011562) adnpa (ENSSLDG00000011550) MAFB (ENSSLDG00000011540) ENSSLDG00000011521 fam83d (ENSSLDG00000011509) ENSSLDG00000011497 top1a (ENSSLDG00000011470) ENSSLDG00000011453 GGT7 (ENSSLDG00000011429) snai1a (ENSSLDG00000011412) ##22 myh7ba (ENSSLDG00000011295) trpc4apa (ENSSLDG00000011202) ENSSLDG00000011157 ndrg3a (ENSSLDG00000011058) ENSSLDG00000010973 arhgap46a (ENSSLDG00000010943) sulf2a (ENSSLDG00000010897) id1 (ENSSLDG00000010877) NCOA3 (ENSSLDG00000010780) ZMYND8 (ENSSLDG00000010651) ENSSLDG00000010602 ENSSLDG00000010581 ENSSLDG00000010558 Greater amberjack MODERN SPECIES 37 opn1sw2 (ENSSDUG00000015046) opn1sw2 (ENSSDUG00000017835) opn1sw2 (ENSSDUG00000017946) hcfc1a (ENSSDUG00000019688) si:dkey-13a21.4 (ENSSDUG00000019738) gata1a (ENSSDUG00000019759) BCL2L1 (ENSSDUG00000019783) adnpa (ENSSDUG00000019791) ENSSDUG00000019804 MAFB (ENSSDUG00000019845) fam83d (ENSSDUG00000019848) ENSSDUG00000019863 top1a (ENSSDUG00000019876) ENSSDUG00000019899 GGT7 (ENSSDUG00000019918) snai1a (ENSSDUG00000019933) ##22 myh7ba (ENSSDUG00000019946) trpc4apa (ENSSDUG00000020023) ENSSDUG00000020064 ndrg3a (ENSSDUG00000020098) PHF20 (ENSSDUG00000020220) arhgap46a (ENSSDUG00000020279) sulf2a (ENSSDUG00000020359) id1 (ENSSDUG00000020580) NCOA3 (ENSSDUG00000020589) ZMYND8 (ENSSDUG00000020647) ENSSDUG00000020864 ogfr2 (ENSSDUG00000020893) ENSSDUG00000020910 cdh4 (ENSSDUG00000020918) ENSSDUG00000020966 Cod MODERN SPECIES 4 tfe3b (ENSGMOG00000018115) gnl3l (ENSGMOG00000018085) opn1sw2 (ENSGMOG00000018054) opn1sw2 (ENSGMOG00000018045) ENSGMOG00000018011 si:dkey-13a21.4 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NCOA3 (ENSHHUG00000028484) ZMYND8 (ENSHHUG00000028349) ENSHHUG00000028313 ENSHHUG00000028306 ENSHHUG00000028304 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT00940000166313.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT00940000164411.d ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000158405.h ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000154681.b.d.c ##22 ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000156477.d.a.j ENSGT00940000164502.a.b.d ENSGT00940000166926.d ENSGT00940000161109.n.b ENSGT00950000183021.a.b.d.d ENSGT00940000154897.r.d ENSGT00940000155532.vd.a.b.b ENSGT00940000155532.vd.a.b.a ENSGT00390000018730.A.f.p.a ENSGT00940000160902.c.a.b ENSGT00940000177296 ENSGT00940000158073.b.g Salmo ANCESTRAL SPECIES 33 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT00940000166313.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT00940000164411.d ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000158405.h ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000154681.b.d.c ##22 ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000156477.d.a.j ENSGT00940000164502.a.b.d ENSGT00940000166926.d ENSGT00940000161109.n.b ENSGT00950000183021.a.b.d.d ENSGT00940000154897.r.d ENSGT00940000155532.vd.a.b.b ENSGT00940000155532.vd.a.a ENSGT00390000018730.A.f.p.b ENSGT00390000018730.A.f.p.a ENSGT00940000160902.c.a.b ENSGT00940000158073.b.g Atlantic salmon MODERN SPECIES 3 ENSSSAG00000010443 opn1sw2 (ENSSSAG00000104363) ENSSSAG00000008592 ENSSSAG00000089688 gata1a (ENSSSAG00000008520) BCLX (ENSSSAG00000008513) adnpa (ENSSSAG00000008505) ENSSSAG00000008500 MAFB (ENSSSAG00000008494) fam83d (ENSSSAG00000110755) ENSSSAG00000008483 top1a (ENSSSAG00000006599) ENSSSAG00000006547 ENSSSAG00000006413 ENSSSAG00000089348 snai (ENSSSAG00000006387) ##22 ENSSSAG00000121631 ENSSSAG00000102416 ENSSSAG00000088124 trpc4apa (ENSSSAG00000005687) ENSSSAG00000005663 ndrg3a (ENSSSAG00000005546) ENSSSAG00000005509 arhgap46a (ENSSSAG00000005505) sulf2a (ENSSSAG00000005047) id1 (ENSSSAG00000004998) ENSSSAG00000004953 ENSSSAG00000004266 ENSSSAG00000081301 ENSSSAG00000111766 ENSSSAG00000081297 River trout MODERN SPECIES 5 ENSSTUG00000017145 ENSSTUG00000017235 opn1sw2 (ENSSTUG00000017425) HCFC1 (ENSSTUG00000017458) gata1a (ENSSTUG00000017690) BCL2L1 (ENSSTUG00000017701) adnpa (ENSSTUG00000017712) ENSSTUG00000017723 MAFB (ENSSTUG00000017739) fam83d (ENSSTUG00000017744) ENSSTUG00000017748 top1a (ENSSTUG00000017781) ENSSTUG00000018033 GGT7 (ENSSTUG00000018075) ENSSTUG00000018297 snai1a (ENSSTUG00000018304) ##22 trpc4apa (ENSSTUG00000018336) ENSSTUG00000018631 ndrg3a (ENSSTUG00000018686) ENSSTUG00000018894 arhgap46a (ENSSTUG00000018936) sulf2a (ENSSTUG00000018981) id1 (ENSSTUG00000019588) NCOA3 (ENSSTUG00000019605) ZMYND8 (ENSSTUG00000019792) ENSSTUG00000024392 ENSSTUG00000024377 ENSSTUG00000024400 ENSSTUG00000024412 KCNK15 (ENSSTUG00000024440) ENSSTUG00000024454 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155877 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT00940000166313.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT00940000164411.d ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000158405.h ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000154681.b.d.c ##22 ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000156477.d.a.j ENSGT00940000164502.a.b.d 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ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155877 ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.a ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161383.d.a.b ENSGT00940000166313.a.d ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.d ENSGT00530000063631.b.n.a.d ENSGT00940000164411.d ENSGT00940000160486.d.b ENSGT00940000158405.h ENSGT00950000182893.a.a.b.b.e ENSGT00940000155006.e.a.d ENSGT00390000018123.b.d ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461.b ENSGT00940000154681.b.d.c ##22 ENSGT00390000018330.f.b ENSGT00940000160331.f.b ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000156477.d.a.j ENSGT00940000164502.a.b.d ENSGT00940000166926.d ENSGT00940000161109.n.b ENSGT00950000183021.a.b.d.d ENSGT00940000154897.r.d ENSGT00940000155532.vd.a.b.a ENSGT00390000018730.A.f.p.a ENSGT00940000160902.c.a.b ENSGT00940000158073.b.g ENSGT00390000011620.a.a.b.e ENSGT00940000165182.d.c Coho salmon MODERN SPECIES gnl3l (ENSOKIG00005013946) ENSOKIG00005014066 opn1sw2 (ENSOKIG00005014210) ENSOKIG00005014220 HCFC1 (ENSOKIG00005014244) gata1a 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GGT7 (ENSOTSG00005042221) ENSOTSG00005042220 snai1a (ENSOTSG00005042218) ##22 trpc4apa (ENSOTSG00005042217) ENSOTSG00005042216 ndrg3a (ENSOTSG00005042210) ENSOTSG00005042203 arhgap46a (ENSOTSG00005042201) sulf2a (ENSOTSG00005042198) id1 (ENSOTSG00005042195) NCOA3 (ENSOTSG00005042192) ZMYND8 (ENSOTSG00005029575) ENSOTSG00005029557 ENSOTSG00005029555 cdh4 (ENSOTSG00005024227) TAF4 (ENSOTSG00005024127) ENSOTSG00005024125 ENSOTSG00005024124 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000166392.c.b ENSGT00940000157503.i.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.b ENSGT00940000161383.d.a.a ENSGT00940000166313.a.c ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.c ENSGT00530000063631.b.n.a.c ENSGT00940000164411.c ENSGT00940000160486.d.a ENSGT00940000158405.g ENSGT00950000182893.a.a.b.b.f ENSGT00940000155006.e.a.c ENSGT00390000018123.b.c ENSGT00980000199461.a ENSGT00940000154681.b.d.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330.f.a ENSGT00940000160331.f.a 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ENSGT00950000183021.a.b.d.c ENSGT00940000154897.r.c ENSGT00390000018730.A.f.o ENSGT00940000155532.vd.b ENSGT00940000160902.c.a.a ENSGT00940000158073.b.h ENSGT00940000156010.eb Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000164755.A ENSGT00940000166392.c.b ENSGT00940000157503.i.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.b ENSGT00940000161383.d.a.a ENSGT00940000166313.a.c ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.c ENSGT00530000063631.b.n.a.c ENSGT00940000164411.c ENSGT00940000160486.d.a ENSGT00940000158405.g ENSGT00950000182893.a.a.b.b.f ENSGT00940000155006.e.a.c ENSGT00390000018123.b.c ENSGT00980000199461.a ENSGT00940000154681.b.d.d ##22 ENSGT00390000018330.f.a ENSGT00940000160331.f.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.b.b ENSGT00940000156477.d.a.i ENSGT00940000164502.a.b.c ENSGT00940000166926.c ENSGT00940000161109.n.a ENSGT00950000183021.a.b.d.c ENSGT00940000154897.r.c ENSGT00390000018730.A.f.o ENSGT00940000155532.vd.b ENSGT00940000160902.c.a.a ENSGT00940000158073.b.h ENSGT00940000156010.eb Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00730000111044 ENSGT00940000166392.c.b ENSGT00940000157503.i.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.b ENSGT00940000161383.d.a.a ENSGT00940000166313.a.c ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.c ENSGT00530000063631.b.n.a.c ENSGT00940000164411.c ENSGT00940000160486.d.a ENSGT00940000158405.g ENSGT00950000182893.a.a.b.b.f ENSGT00940000155006.e.a.c ENSGT00390000018123.b.c ENSGT00980000199461.a ENSGT00940000154681.b.d.d ##22 ENSGT00390000018330.f.a ENSGT00940000160331.f.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.a.a ENSGT00940000156477.d.a.i ENSGT00940000164502.a.b.c ENSGT00940000166926.c ENSGT00940000161109.n.a ENSGT00950000183021.a.b.d.c ENSGT00940000154897.r.c ENSGT00390000018730.A.f.o ENSGT00940000155532.vd.b ENSGT00940000160902.c.a.a ENSGT00940000158073.b.h ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000165182.d.d Chinook salmon MODERN SPECIES 31 cxxc1b (ENSOTSG00005030449) tfe3b (ENSOTSG00005030461) ENSOTSG00005030472 HCFC1 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(ENSOKIG00005001007) ENSOKIG00005001012 top1a (ENSOKIG00005001118) ENSOKIG00005001519 snai1a (ENSOKIG00005001529) ##22 ENSOKIG00005001535 ENSOKIG00005001536 trpc4apa (ENSOKIG00005001626) ENSOKIG00005001853 ndrg3a (ENSOKIG00005002068) PHF20 (ENSOKIG00005002586) arhgap46a (ENSOKIG00005002629) sulf2a (ENSOKIG00005002779) id1 (ENSOKIG00005003231) NCOA3 (ENSOKIG00005003246) ZMYND8 (ENSOKIG00005003668) ENSOKIG00005010383 ENSOKIG00005010416 ENSOKIG00005010428 ENSOKIG00005010434 Rainbow trout MODERN SPECIES 28 ENSOMYG00000022325 ENSOMYG00000073696 ENSOMYG00000022484 gata1a (ENSOMYG00000022604) ENSOMYG00000053348 ENSOMYG00000022616 adnpa (ENSOMYG00000022627) ENSOMYG00000022642 ENSOMYG00000022692 fam83d (ENSOMYG00000022695) ENSOMYG00000022698 ENSOMYG00000053076 top1a (ENSOMYG00000023285) ENSOMYG00000026161 ENSOMYG00000026183 snai1a (ENSOMYG00000026142) ##22 ENSOMYG00000054528 trpc4apa (ENSOMYG00000026427) ndrg3a (ENSOMYG00000028426) ENSOMYG00000029013 arhgap46a (ENSOMYG00000029126) sulf2a (ENSOMYG00000029277) ENSOMYG00000073469 id1 (ENSOMYG00000029365) ENSOMYG00000029414 ENSOMYG00000029427 ENSOMYG00000030454 ENSOMYG00000035314 ENSOMYG00000048478 ENSOMYG00000033865 ENSOMYG00000065601 Salmo ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000154102.b.a.a.c ENSGT00950000183005.a.a.c ENSGT00940000166392.c.b ENSGT00940000157503.i.b.c ENSGT01030000234549.a.a.a.b.cb.a.b.b ENSGT00940000161383.d.a.a ENSGT00940000166313.a.c ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.l.c ENSGT00530000063631.b.n.a.c ENSGT00940000164411.c ENSGT00940000160486.d.a ENSGT00940000158405.g ENSGT00950000182893.a.a.b.b.f ENSGT00940000155006.e.a.c ENSGT00390000018123.b.c ENSGT00940000154681.b.d.d ##22 ENSGT00390000018330.f.a ENSGT00940000160331.f.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.b.a ENSGT00940000156477.d.a.i ENSGT00940000164502.a.b.c ENSGT00940000166926.c ENSGT00940000161109.n.a ENSGT00950000183021.a.b.d.c ENSGT00940000154897.r.c ENSGT00390000018730.A.f.o ENSGT00940000155532.vd.b ENSGT00940000160902.c.a.a ENSGT00940000158073.b.h ENSGT00940000156010.eb ENSGT00940000165182.d.d Atlantic salmon MODERN SPECIES 14 ccdc120b (ENSSSAG00000107262) mbd1b (ENSSSAG00000081317) cxxc1b (ENSSSAG00000081321) tfe3b (ENSSSAG00000081340) ENSSSAG00000081346 ENSSSAG00000081355 ENSSSAG00000081388 gata1a (ENSSSAG00000081386) adnpa (ENSSSAG00000081389) ENSSSAG00000081390 ENSSSAG00000113089 fam83d (ENSSSAG00000081395) ENSSSAG00000081397 top1a (ENSSSAG00000081414) ENSSSAG00000081438 snai1a (ENSSSAG00000117363) ##22 trpc4apa (ENSSSAG00000081452) ndrg3a (ENSSSAG00000081484) ENSSSAG00000081501 arhgap46a (ENSSSAG00000081502) sulf2a (ENSSSAG00000081516) ID1 (ENSSSAG00000081587) ENSSSAG00000081594 ENSSSAG00000097889 ENSSSAG00000081599 ENSSSAG00000085212 ENSSSAG00000104244 ENSSSAG00000119808 ENSSSAG00000081626 ENSSSAG00000081628 kcnkf (ENSSSAG00000081629) River trout MODERN SPECIES 7 comtb (ENSSTUG00000035786) ccdc120b (ENSSTUG00000035764) mbd1b (ENSSTUG00000035673) cxxc1b (ENSSTUG00000035005) tfe3b (ENSSTUG00000034951) ENSSTUG00000034912 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MODERN SPECIES 16 cxxc1b (ENSELUG00000004423) tfe3b (ENSELUG00000004498) gnl3l (ENSELUG00000004555) ENSELUG00000004583 hcfc1a (ENSELUG00000004626) gata1a (ENSELUG00000004641) BCL2L1 (ENSELUG00000004651) adnpa (ENSELUG00000004665) ENSELUG00000004696 MAFB (ENSELUG00000004717) fam83d (ENSELUG00000004726) ENSELUG00000004732 top1a (ENSELUG00000004758) ENSELUG00000004801 GGT7 (ENSELUG00000004827) snai1a (ENSELUG00000004844) ##22 ENSELUG00000004853 myh7ba (ENSELUG00000004892) trpc4apa (ENSELUG00000004927) SLA2 (ENSELUG00000004947) ndrg3a (ENSELUG00000004982) ENSELUG00000005071 arhgap46a (ENSELUG00000005147) sulf2a (ENSELUG00000005287) id1 (ENSELUG00000005365) ENSELUG00000005397 ZMYND8 (ENSELUG00000005483) ENSELUG00000033279 ENSELUG00000005607 ENSELUG00000031326 KCNK15 (ENSELUG00000000159) Otomorpha ANCESTRAL SPECIES 257 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166313.a ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 Clupeiformes ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00530000063687.b.b.b.u ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000161531.b ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00940000156917.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00940000161109.p.b ENSGT00950000183021.a.b.d ENSGT00940000154897.r ENSGT00940000158853 ENSGT00390000011067.C ENSGT00940000166842 ENSGT00940000165482 ENSGT00940000160586 ENSGT00940000162210 Denticle herring MODERN SPECIES 3 gnl3l (ENSDCDG00000023810) opn1lw1 (ENSDCDG00000023816) opn1sw2 (ENSDCDG00000023817) MECP2 (ENSDCDG00000023819) HCFC1 (ENSDCDG00000023838) si:dkey-13a21.4 (ENSDCDG00000023906) gata1a (ENSDCDG00000023920) adnpa (ENSDCDG00000023922) ENSDCDG00000023924 mafbb (ENSDCDG00000023928) fam83d (ENSDCDG00000023929) ENSDCDG00000023946 top1a (ENSDCDG00000023981) ENSDCDG00000024016 ENSDCDG00000024019 snai1a (ENSDCDG00000024020) ##22 trpc4apa (ENSDCDG00000024032) ENSDCDG00000024731 ndrg3a (ENSDCDG00000024758) ENSDCDG00000024782 arhgap46a (ENSDCDG00000024789) sulf2a (ENSDCDG00000024821) id1 (ENSDCDG00000026696) NCOA3 (ENSDCDG00000026700) ZMYND8 (ENSDCDG00000026756) map1lc3a (ENSDCDG00000028953) dynlrb1 (ENSDCDG00000028960) st3gal8 (ENSDCDG00000028963) ENSDCDG00000028990 ENSDCDG00000029676 cpne1 (ENSDCDG00000030000) Atlantic herring MODERN SPECIES 21 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ENSGT00530000063808.a ENSGT00950000183006.A.a.b ENSGT00950000182824.a.b.b.c.e ENSGT00390000016224 ENSGT00940000163461.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00950000182696.B.b.b ENSGT00520000055567.a.a.a ENSGT00950000183056.B.a.h ENSGT00390000002407.c ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.b.a.k ENSGT00940000158950 ENSGT00950000183211.a.a.a ENSGT00940000166364 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000164702.b ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000161531.b ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330 ENSGT00940000160331 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825.a.b ENSGT00730000111186 ENSGT00390000008224 ENSGT00940000157076.j.c ENSGT00390000016889 ENSGT00940000154563 Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 212 ENSGT00940000157503.i.b.b ENSGT00940000155877.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b.gb ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000164702.b.b ENSGT00940000166196.f ENSGT00940000166313.a.a ENSGT00530000063631.b.n.a.a ENSGT00940000164411.b ENSGT00940000161531.b.a ENSGT00940000158405.e ENSGT00950000182893.a.a.b.b.b ENSGT00940000155006.e.a.f ENSGT00390000018123.b.a ENSGT00530000063829.C.a.a ENSGT00940000154681.b.d.e ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330.n.b ENSGT00940000160331.l ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.g.a ENSGT00940000156477.d.a.k.a.b ENSGT00940000164502.a.b.b Goldfish MODERN SPECIES 142 ccdc120b (ENSCARG00000040903) mbd1b (ENSCARG00000040889) cxxc1b (ENSCARG00000040392) tfe3b (ENSCARG00000037442) ENSCARG00000037307 opn1sw2 (ENSCARG00000037260) hcfc1a (ENSCARG00000036717) gata1a (ENSCARG00000036620) adnpa (ENSCARG00000036603) mafbb (ENSCARG00000036595) fam83d (ENSCARG00000036570) ENSCARG00000036550 top1a (ENSCARG00000035362) ENSCARG00000035337 tp53inp2 (ENSCARG00000035332) snai1a (ENSCARG00000035323) ##22 myh7ba (ENSCARG00000035006) trpc4apa (ENSCARG00000034821) ndrg3a (ENSCARG00000034089) ENSCARG00000034061 arhgap46a (ENSCARG00000034008) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000157503.i.b.b ENSGT00940000155877.b ENSGT01030000234549.a.a.a.b.gb ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000164702.b.b ENSGT00940000166196.f ENSGT00940000166313.a.a ENSGT00530000063631.b.n.a.a ENSGT00940000164411.b ENSGT00940000161531.b.a ENSGT00940000158405.e ENSGT00950000182893.a.a.b.b.b ENSGT00940000155006.e.a.f ENSGT00390000018123.b.a ENSGT00530000063829.C.a.a ENSGT00940000154681.b.d.e ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00390000018330.n.b ENSGT00940000160331.l ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.g.a ENSGT00940000156477.d.a.l ENSGT00940000156477.d.a.k.a.b ENSGT00940000164502.a.b.b ENSGT00940000166926.a ENSGT00390000017780.f.db ENSGT00940000159825.a.b.b ENSGT00730000111186.a.a ENSGT00390000008224.e ENSGT00940000157076.j.c.c ENSGT00390000016889.m.b ENSGT00940000154563.ib.b.b Common carp reference MODERN SPECIES 42 ccdc120b (ENSCCRG00000040452) mbd1b (ENSCCRG00000079505) cxxc1b (ENSCCRG00000041918) ENSCCRG00000082624 tfe3b (ENSCCRG00000076795) ENSCCRG00000042194 opn1sw2 (ENSCCRG00000034760) hcfc1a (ENSCCRG00000058227) adnpa (ENSCCRG00000043343) ENSCCRG00000043364 fam83d (ENSCCRG00000043564) top1a (ENSCCRG00000076066) ENSCCRG00000043578 ENSCCRG00000063625 tp53inp2 (ENSCCRG00000043585) snai1a (ENSCCRG00000057413) ##22 myh7ba (ENSCCRG00000017821) trpc4apa (ENSCCRG00000017847) ndrg3a (ENSCCRG00000006676) ENSCCRG00000039400 arhgap46a (ENSCCRG00000003147) sulf2a (ENSCCRG00000041869) timm17a (ENSCCRG00000003079) ENSCCRG00000059754 shisa4 (ENSCCRG00000076617) ipo9 (ENSCCRG00000048310) kdm5ba (ENSCCRG00000048253) ENSCCRG00000048238 cyb5r1 (ENSCCRG00000047979) rnpep (ENSCCRG00000072647) inavab (ENSCCRG00000047975) Golden-line barbel MODERN SPECIES 1 ccdc120b (ENSSGRG00000027614) mbd1b (ENSSGRG00000027615) cxxc1b (ENSSGRG00000027621) tfe3b (ENSSGRG00000028032) gnl3l (ENSSGRG00000028038) LWS1 (ENSSGRG00000028050) opn1sw2 (ENSSGRG00000028454) hcfc1a (ENSSGRG00000028465) si:dkey-13a21.4 (ENSSGRG00000029365) ENSSGRG00000029367 ENSSGRG00000029368 mafbb (ENSSGRG00000029369) fam83d (ENSSGRG00000029370) top1a (ENSSGRG00000029390) tp53inp2 (ENSSGRG00000030273) snai1a (ENSSGRG00000030274) ##22 myh7ba (ENSSGRG00000030364) trpc4apa (ENSSGRG00000037498) trpc4apa (ENSSGRG00000037499) ENSSGRG00000037500 ndrg3a (ENSSGRG00000037502) ENSSGRG00000037577 arhgap46a (ENSSGRG00000037581) sulf2a (ENSSGRG00000037593) timm17a (ENSSGRG00000037628) LMOD1 (ENSSGRG00000037633) SHISA4 (ENSSGRG00000037634) ipo9 (ENSSGRG00000037642) kdm5ba (ENSSGRG00000037847) rabif (ENSSGRG00000038391) adipor1a (ENSSGRG00000038393) Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000157503.i.b.a ENSGT00940000155877.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b.fb ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000164702.b.a ENSGT00940000166196.e ENSGT00940000166313.a.b ENSGT00530000063631.b.n.a.b ENSGT00940000164411.a ENSGT00940000161531.b.b ENSGT00940000158405.f ENSGT00950000182893.a.a.b.b.a ENSGT00940000155006.e.a.e ENSGT00390000018123.b.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d.f ##22 ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00390000018330.n.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.h ENSGT00940000156477.d.a.k.a.a ENSGT00940000164502.a.b.a ENSGT00940000166926.b ENSGT00390000017780.f.eb ENSGT00940000159825.a.b.a ENSGT00730000111186.a.b ENSGT00390000008224.f ENSGT00940000157076.j.c.d ENSGT00390000016889.m.a ENSGT00940000154563.ib.b.a ENSGT00940000153962.b.k.a ENSGT00940000160431.c Goldfish MODERN SPECIES 2 tfe3b (ENSCARG00000010567) gnl3l (ENSCARG00000010084) ENSCARG00000010595 opn1sw2 (ENSCARG00000010620) hcfc1a (ENSCARG00000010684) si:dkey-13a21.4 (ENSCARG00000011198) gata1a (ENSCARG00000011209) adnpa (ENSCARG00000011224) ENSCARG00000011231 mafbb (ENSCARG00000011282) fam83d (ENSCARG00000011289) ENSCARG00000011309 top1a (ENSCARG00000011328) ENSCARG00000011508 ENSCARG00000011514 snai1a (ENSCARG00000011521) ##22 trpc4apa (ENSCARG00000011552) ENSCARG00000011729 ndrg3a (ENSCARG00000011862) ENSCARG00000013716 arhgap46a (ENSCARG00000013733) sulf2a (ENSCARG00000013910) timm17a (ENSCARG00000017108) LMOD1 (ENSCARG00000017139) shisa4 (ENSCARG00000017148) kdm5ba (ENSCARG00000017231) rabif (ENSCARG00000018237) adipor1a (ENSCARG00000018257) cyb5r1 (ENSCARG00000018428) rnpep (ENSCARG00000020111) inavab (ENSCARG00000020166) Cyprininae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000157503.i.b.a ENSGT00940000155877.a ENSGT01030000234549.a.a.a.b.fb ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000164702.b.a ENSGT00940000166196.e ENSGT00940000166313.a.b ENSGT00530000063631.b.n.a.b ENSGT00940000164411.a ENSGT00940000161531.b.b ENSGT00940000158405.f ENSGT00950000182893.a.a.b.b.a ENSGT00940000155006.e.a.e ENSGT00390000018123.b.b ENSGT00530000063829.C.a.b ENSGT00940000154681.b.d.f ##22 ENSGT00940000160318.c.a ENSGT00390000018330.n.a ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b.h ENSGT00940000156477.d.a.k.a.a ENSGT00940000164502.a.b.a ENSGT00940000166926.b ENSGT00390000017780.f.eb ENSGT00940000159825.a.b.a ENSGT00730000111186.a.b ENSGT00390000008224.f ENSGT00940000157076.j.c.d ENSGT00390000016889.m.a ENSGT00940000154563.ib.b.a ENSGT00940000153962.b.k.a ENSGT00940000160431.c Golden-line barbel MODERN SPECIES 2 mbd1b (ENSSGRG00000053211) cxxc1b (ENSSGRG00000053088) gnl3l (ENSSGRG00000053063) ENSSGRG00000053037 opn1sw2 (ENSSGRG00000053033) hcfc1a (ENSSGRG00000052971) si:dkey-13a21.4 (ENSSGRG00000052964) gata1a (ENSSGRG00000052963) adnpa (ENSSGRG00000052962) ENSSGRG00000052961 fam83d (ENSSGRG00000052960) ENSSGRG00000052959 top1a 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ENSGT00390000006988 Characiphysae_b ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000157503.i.b ENSGT00940000155877 ENSGT01030000234549.a.a.a.b ENSGT01030000234549.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000161383.d.a ENSGT00940000166196 ENSGT00940000166313.a ENSGT00530000063631.b.n.a ENSGT00940000164411 ENSGT00940000160486.d.d ENSGT00940000158405 ENSGT00950000182893.a.a.b.b ENSGT00940000155006.e.a ENSGT00390000018123.b ENSGT00980000199461 ENSGT00940000154681.b.d ##22 ENSGT00940000160318.c.b ENSGT00940000155224.c.a ENSGT00940000154360.A.a ENSGT00390000010265 ENSGT00940000159006.c.a ENSGT00940000154129.gd ENSGT01060000252161 ENSGT00940000160885 ENSGT00940000167008 ENSGT00950000182872.f.a.a.a.b ENSGT00940000156477.d.a ENSGT00940000164502.a.b ENSGT00940000166926 ENSGT00390000017780.f ENSGT00940000159825.a.b Electric eel MODERN SPECIES 55 ift52 (ENSEEEG00000011071) srsf6b (ENSEEEG00000011069) ENSEEEG00000011067 acot8 (ENSEEEG00000011064) HCFC1 (ENSEEEG00000010922) si:dkey-13a21.4 (ENSEEEG00000010920) gata1a 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gnao1b (ENSEBUG00000003692) WDR59 (ENSEBUG00000003703) Ecdysozoa ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154681 #22 Caenorhabditis elegans MODERN SPECIES 3 T07A9.15 (WBGene00045249) T07A9.10 (WBGene00020298) ears-2 (WBGene00001338) ssna-1 (WBGene00020300) T07A9.14 (WBGene00044789) rps-24 (WBGene00004493) spl-1 (WBGene00004981) fln-1 (WBGene00022048) cdh-8 (WBGene00017576) pxmp-4 (WBGene00017574) F18F11.4 (WBGene00017577) col-101 (WBGene00000675) drl-1 (WBGene00017578) grl-26 (WBGene00001735) dsc-4 (WBGene00001099) snai-1 (WBGene00019299) #22 swt-1 (WBGene00019300) pnp-1 (WBGene00019298) T21D12.7 (WBGene00020648) T21D12.14 (WBGene00045177) best-19 (WBGene00206487) sma-10 (WBGene00020649) srh-282 (WBGene00005487) T21D12.11 (WBGene00020650) T21D12.12 (WBGene00020651) pat-6 (WBGene00003932) pqbp-1.1 (WBGene00020647) dpy-9 (WBGene00001071) R02D3.8 (WBGene00019825) R02D3.7 (WBGene00019824) grl-19 (WBGene00001728)