Salmoninae_a	ANCESTRAL SPECIES	109								ENSGT00940000155293.a.a.j #8	ENSGT00940000165701.h #10	ENSGT00990000204854.c #9	ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11	ENSGT00940000157846.c.d #12	ENSGT00390000011433.s.a.e #20	ENSGT00390000007723	ENSGT00530000063603.B.g #21	ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22	ENSGT00940000157364.B.c #23	ENSGT00940000163055 #24	ENSGT00940000158817.f #25	ENSGT00390000006820.d #26	ENSGT00940000159118.h	ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28	ENSGT00940000161424.k.b #29	ENSGT00730000111139.n #31	ENSGT00940000156503.v.b #32	ENSGT00830000128368.b.f #34	ENSGT00940000156844.b.h ##36	ENSGT00940000155669.mc.b	ENSGT00940000153956.a.b.d #37	ENSGT00940000155896.k.b	ENSGT00940000155930.i.b
Salmo	ANCESTRAL SPECIES	31							ENSGT00390000008727.a.a.d.e #7	ENSGT00940000155293.a.a.j #8	ENSGT00940000165701.h #10	ENSGT00990000204854.c #9	ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11	ENSGT00940000157846.c.d #12	ENSGT00390000011433.s.a.e #20	ENSGT00390000007723	ENSGT00530000063603.B.g #21	ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22	ENSGT00940000157364.B.c #23	ENSGT00940000163055 #24	ENSGT00940000158817.f #25	ENSGT00390000006820.d #26	ENSGT00940000159118.h	ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28	ENSGT00940000161424.k.b #29	ENSGT00730000111139.n #31	ENSGT00940000156503.v.b #32	ENSGT00830000128368.b.f #34	ENSGT00940000156844.b.g.b.a #36	ENSGT00940000153956.a.b.d #37	ENSGT00940000155896.k.b	ENSGT00940000155930.i.b	ENSGT00940000154711.a.a.f.a
Atlantic salmon	MODERN SPECIES		ENSSSAG00000086413 #7	kcnk1b (ENSSSAG00000083691) #8	ENSSSAG00000056942 #9	ENSSSAG00000056522 #10	agpat4 (ENSSSAG00000056486) #11	ENSSSAG00000047444 #12	ENSSSAG00000025627 #13	ENSSSAG00000092780 #14	ENSSSAG00000091768 #15	ENSSSAG00000103525 #16	ENSSSAG00000103901 #17	ENSSSAG00000015935 #18	ENSSSAG00000101951 #19	PSME4 (ENSSSAG00000043370) #20	ERLEC1 (ENSSSAG00000043168) #21	NRXN1 (ENSSSAG00000004275) #22	LHCGR (ENSSSAG00000055360) #23	gtf2a1l (ENSSSAG00000088164) #24	STON1 (ENSSSAG00000003728) #25	ppp1r21 (ENSSSAG00000003694) #26	ENSSSAG00000089922 #27	ENSSSAG00000043666 #28	ENSSSAG00000111856 #29	ENSSSAG00000118030 #30	ENSSSAG00000003555 #31	itga9 (ENSSSAG00000003063) #32	ENSSSAG00000103405 #33	ENSSSAG00000002972 #34	ENSSSAG00000094286 #35	ENSSSAG00000101996 #36	ENSSSAG00000002924 #37
River trout	MODERN SPECIES	9	ENSSTUG00000021549	ENSSTUG00000021589	SLC35F3 (ENSSTUG00000021596) #7	ENSSTUG00000021648	kcnk1b (ENSSTUG00000021658) #8	ENSSTUG00000021823 #10	ENSSTUG00000027638 #9	agpat4 (ENSSTUG00000027647) #11	ENSSTUG00000027697 #12	ENSSTUG00000028029	ENSSTUG00000028059	PSME4 (ENSSTUG00000028118) #20	GPR75 (ENSSTUG00000029230)	erlec1 (ENSSTUG00000029257) #21	ENSSTUG00000029465	NRXN1 (ENSSTUG00000029529) #22	ENSSTUG00000031573	ENSSTUG00000031581	ENSSTUG00000031598	ENSSTUG00000031614	LHCGR (ENSSTUG00000031622) #23	gtf2a1l (ENSSTUG00000031656) #24	ENSSTUG00000031680	STON1 (ENSSTUG00000031687) #25	ppp1r21 (ENSSTUG00000031776) #26	FOXN2 (ENSSTUG00000033587)	ENSSTUG00000033616 #28	KCNK12 (ENSSTUG00000033822) #29	GOLGA4 (ENSSTUG00000033860) #31	itga9 (ENSSTUG00000034021) #32	ENSSTUG00000034666 #34
Oncorhynchus	ANCESTRAL SPECIES	17							ENSGT00940000155293.a.a.j #8	ENSGT00940000165701.h #10	ENSGT00990000204854.c #9	ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11	ENSGT00940000157846.c.d #12	ENSGT00390000011433.s.a.e #20	ENSGT00390000007723	ENSGT00530000063603.B.g #21	ENSGT00940000154292.a.b.d.h.b.a ##22	ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22	ENSGT00940000157364.B.c #23	ENSGT00940000163055 #24	ENSGT00940000158817.f #25	ENSGT00390000006820.d #26	ENSGT00940000159118.h	ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28	ENSGT00940000161424.k.b #29	ENSGT00730000111139.n #31	ENSGT00940000156503.v.a.a ##32	ENSGT00830000128368.b.f #34	ENSGT00940000156844.b.h ##36	ENSGT00940000155669.mc.b	ENSGT00940000153956.a.b.d #37	ENSGT00940000155896.k.b	ENSGT00940000155930.i.b
Rainbow trout	MODERN SPECIES	15	ENSOMYG00000052981	ENSOMYG00000024407	ENSOMYG00000024583 #12	ENSOMYG00000072637 ##13	ENSOMYG00000075183	ENSOMYG00000051807	ENSOMYG00000053929	ENSOMYG00000057002	PSME4 (ENSOMYG00000025175) #20	ENSOMYG00000077387	ENSOMYG00000026216	erlec1 (ENSOMYG00000026232) #21	ENSOMYG00000055620	ENSOMYG00000027535 ##22	ENSOMYG00000054114	NRXN1 (ENSOMYG00000026446) #22	LHCGR (ENSOMYG00000050586) #23	gtf2a1l (ENSOMYG00000037167) #24	STON1 (ENSOMYG00000037153) #25	ppp1r21 (ENSOMYG00000037105) #26	ENSOMYG00000048718	ENSOMYG00000037077	ENSOMYG00000034921 #28	ENSOMYG00000057037	ENSOMYG00000034742 #29	ENSOMYG00000034694 #31	itga9 (ENSOMYG00000034658) ##32	ENSOMYG00000034581 #34	ENSOMYG00000034628 #36	ENSOMYG00000034600	EPAS1 (ENSOMYG00000034554)
Oncorhynchus_a	ANCESTRAL SPECIES	13							ENSGT00940000155293.a.a.j #8	ENSGT00940000165701.h #10	ENSGT00990000204854.c #9	ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11	ENSGT00940000157846.c.d #12	ENSGT00390000011433.s.a.e #20	ENSGT00390000007723	ENSGT00530000063603.B.g #21	ENSGT00940000154292.a.b.d.h.b.a ##22	ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22	ENSGT00940000157364.B.c #23	ENSGT00940000163055 #24	ENSGT00940000158817.f #25	ENSGT00390000006820.d #26	ENSGT00940000159118.h	ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28	ENSGT00940000161424.k.b #29	ENSGT00730000111139.n #31	ENSGT00940000156503.v.a.a ##32	ENSGT00830000128368.b.f #34	ENSGT00940000156844.b.g.b.b ##36	ENSGT00940000155669.mc.b	ENSGT00940000153956.a.b.d #37	ENSGT00940000155896.k.b	ENSGT00940000155930.i.b
Chinook salmon	MODERN SPECIES		ENSOTSG00005026866	epas1b (ENSOTSG00005026875)	ENSOTSG00005029069	ENSOTSG00005029070	ENSOTSG00005029072	pcgf5a (ENSOTSG00005029077)	ENSOTSG00005029087 #37	ENSOTSG00005029089	ENSOTSG00005029093 ##36	ENSOTSG00005029102 #34	GOLGA4 (ENSOTSG00005029110) #31	PSME4 (ENSOTSG00005029152) #20	GPR75 (ENSOTSG00005035805)	erlec1 (ENSOTSG00005035877) #21	ENSOTSG00005036153 ##22	NRXN1 (ENSOTSG00005036190) #22	LHCGR (ENSOTSG00005036192) #23	gtf2a1l (ENSOTSG00005036193) #24	ENSOTSG00005036194 #25	ppp1r21 (ENSOTSG00005036205) #26	ENSOTSG00005039080	ENSOTSG00005039081	ENSOTSG00005039082	ENSOTSG00005039089 #28	KCNK12 (ENSOTSG00005039783) #29
Coho salmon	MODERN SPECIES	2								kcnk1b (ENSOKIG00005032111) #8	ENSOKIG00005032275 #10	agpat4 (ENSOKIG00005036311) #11	ENSOKIG00005036434 #9	ENSOKIG00005036450 #12	PSME4 (ENSOKIG00005036846) #20	GPR75 (ENSOKIG00005042312)	erlec1 (ENSOKIG00005042325) #21	NRXN1 (ENSOKIG00005042525) #22	ENSOKIG00005044766	ENSOKIG00005044777	LHCGR (ENSOKIG00005044786) #23	GTF2A1L (ENSOKIG00005044798) #24	PPP1R21 (ENSOKIG00005044830) #26	ENSOKIG00005045119	ENSOKIG00005045208 #28	KCNK12 (ENSOKIG00005046107) #29	GOLGA4 (ENSOKIG00005046116) #31	itga9 (ENSOKIG00005046299) ##32	ENSOKIG00005046838	ENSOKIG00005046845 #34	ENSOKIG00005046850 ##36	ENSOKIG00005046857	ANKRD1 (ENSOKIG00005046870) #37