Salmoninae DUPLICATION Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 273 ENSGT00940000157935.b ENSGT00940000157565 ENSGT00940000162787.c ENSGT00390000003939 ENSGT00990000208446 ENSGT00940000166602.B ENSGT00390000008727.a.a.d #7 ENSGT00940000155293.a.a.j #8 ENSGT00940000165701.h #10 ENSGT00990000204854.c #9 ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11 ENSGT00940000157846.c.d #12 ENSGT00390000011433.s.a.e #20 ENSGT00390000007723 ENSGT00530000063603.B.g #21 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22 ENSGT00940000157364.B.c #23 ENSGT00940000163055 #24 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 109 ENSGT00940000155293.a.a.j #8 ENSGT00940000165701.h #10 ENSGT00990000204854.c #9 ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11 ENSGT00940000157846.c.d #12 ENSGT00390000011433.s.a.e #20 ENSGT00390000007723 ENSGT00530000063603.B.g #21 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22 ENSGT00940000157364.B.c #23 ENSGT00940000163055 #24 ENSGT00940000158817.f #25 ENSGT00390000006820.d #26 ENSGT00940000159118.h ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28 ENSGT00940000161424.k.b #29 ENSGT00730000111139.n #31 ENSGT00940000156503.v.b #32 ENSGT00830000128368.b.f #34 ENSGT00940000156844.b.h ##36 ENSGT00940000155669.mc.b ENSGT00940000153956.a.b.d #37 ENSGT00940000155896.k.b ENSGT00940000155930.i.b Salmo ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00390000008727.a.a.d.e #7 ENSGT00940000155293.a.a.j #8 ENSGT00940000165701.h #10 ENSGT00990000204854.c #9 ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11 ENSGT00940000157846.c.d #12 ENSGT00390000011433.s.a.e #20 ENSGT00390000007723 ENSGT00530000063603.B.g #21 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22 ENSGT00940000157364.B.c #23 ENSGT00940000163055 #24 ENSGT00940000158817.f #25 ENSGT00390000006820.d #26 ENSGT00940000159118.h ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28 ENSGT00940000161424.k.b #29 ENSGT00730000111139.n #31 ENSGT00940000156503.v.b #32 ENSGT00830000128368.b.f #34 ENSGT00940000156844.b.g.b.a #36 ENSGT00940000153956.a.b.d #37 ENSGT00940000155896.k.b ENSGT00940000155930.i.b ENSGT00940000154711.a.a.f.a Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000086413 #7 kcnk1b (ENSSSAG00000083691) #8 ENSSSAG00000056942 #9 ENSSSAG00000056522 #10 agpat4 (ENSSSAG00000056486) #11 ENSSSAG00000047444 #12 ENSSSAG00000025627 #13 ENSSSAG00000092780 #14 ENSSSAG00000091768 #15 ENSSSAG00000103525 #16 ENSSSAG00000103901 #17 ENSSSAG00000015935 #18 ENSSSAG00000101951 #19 PSME4 (ENSSSAG00000043370) #20 ERLEC1 (ENSSSAG00000043168) #21 NRXN1 (ENSSSAG00000004275) #22 LHCGR (ENSSSAG00000055360) #23 gtf2a1l (ENSSSAG00000088164) #24 STON1 (ENSSSAG00000003728) #25 ppp1r21 (ENSSSAG00000003694) #26 ENSSSAG00000089922 #27 ENSSSAG00000043666 #28 ENSSSAG00000111856 #29 ENSSSAG00000118030 #30 ENSSSAG00000003555 #31 itga9 (ENSSSAG00000003063) #32 ENSSSAG00000103405 #33 ENSSSAG00000002972 #34 ENSSSAG00000094286 #35 ENSSSAG00000101996 #36 ENSSSAG00000002924 #37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155293.a.a.j #8 ENSGT00940000165701.h #10 ENSGT00990000204854.c #9 ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11 ENSGT00940000157846.c.d #12 ENSGT00390000011433.s.a.e #20 ENSGT00390000007723 ENSGT00530000063603.B.g #21 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.b.a ##22 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22 ENSGT00940000157364.B.c #23 ENSGT00940000163055 #24 ENSGT00940000158817.f #25 ENSGT00390000006820.d #26 ENSGT00940000159118.h ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28 ENSGT00940000161424.k.b #29 ENSGT00730000111139.n #31 ENSGT00940000156503.v.a.a ##32 ENSGT00830000128368.b.f #34 ENSGT00940000156844.b.h ##36 ENSGT00940000155669.mc.b ENSGT00940000153956.a.b.d #37 ENSGT00940000155896.k.b ENSGT00940000155930.i.b Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000155293.a.a.j #8 ENSGT00940000165701.h #10 ENSGT00990000204854.c #9 ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11 ENSGT00940000157846.c.d #12 ENSGT00390000011433.s.a.e #20 ENSGT00390000007723 ENSGT00530000063603.B.g #21 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.b.a ##22 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22 ENSGT00940000157364.B.c #23 ENSGT00940000163055 #24 ENSGT00940000158817.f #25 ENSGT00390000006820.d #26 ENSGT00940000159118.h ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28 ENSGT00940000161424.k.b #29 ENSGT00730000111139.n #31 ENSGT00940000156503.v.a.a ##32 ENSGT00830000128368.b.f #34 ENSGT00940000156844.b.g.b.b ##36 ENSGT00940000155669.mc.b ENSGT00940000153956.a.b.d #37 ENSGT00940000155896.k.b ENSGT00940000155930.i.b Coho salmon MODERN SPECIES 2 kcnk1b (ENSOKIG00005032111) #8 ENSOKIG00005032275 #10 agpat4 (ENSOKIG00005036311) #11 ENSOKIG00005036434 #9 ENSOKIG00005036450 #12 PSME4 (ENSOKIG00005036846) #20 GPR75 (ENSOKIG00005042312) erlec1 (ENSOKIG00005042325) #21 NRXN1 (ENSOKIG00005042525) #22 ENSOKIG00005044766 ENSOKIG00005044777 LHCGR (ENSOKIG00005044786) #23 GTF2A1L (ENSOKIG00005044798) #24 PPP1R21 (ENSOKIG00005044830) #26 ENSOKIG00005045119 ENSOKIG00005045208 #28 KCNK12 (ENSOKIG00005046107) #29 GOLGA4 (ENSOKIG00005046116) #31 itga9 (ENSOKIG00005046299) ##32 ENSOKIG00005046838 ENSOKIG00005046845 #34 ENSOKIG00005046850 ##36 ENSOKIG00005046857 ANKRD1 (ENSOKIG00005046870) #37 Huchen DUPLICATION Huchen DUPLICATION Huchen MODERN SPECIES 2581 ENSHHUG00000003767 #22 ENSHHUG00000003760 #22 Huchen MODERN SPECIES 2581 ENSHHUG00000003767 #22 ENSHHUG00000003760 #22 Huchen MODERN SPECIES 3081 ENSHHUG00000025095 #22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000177029.b ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.a ##22 ENSGT00940000157364.B.d ##23 ENSGT00940000158817.e ##25 ENSGT00390000006820.c ##26 ENSGT00940000159118.g ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.a ##28 ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424.k.a ##29 ENSGT00730000111139.m ##31 ENSGT00940000156503.u ##32 ENSGT00830000128368.b.e ##34 ENSGT00940000156844.b.g.a ##36 ENSGT00940000155669.mc.a ENSGT00940000157364.A ##23 ENSGT00940000153956.a.b.c ##37 ENSGT00940000155896.k.a Huchen MODERN SPECIES 2125 ENSHHUG00000024621 ##22 River trout MODERN SPECIES 1 ENSSTUG00000018821 zgc:171482 (ENSSTUG00000018804) kcnk1b (ENSSTUG00000018792) ##8 ENSSTUG00000018776 ##9 ENSSTUG00000018149 ##10 agpat4 (ENSSTUG00000018116) ##11 ENSSTUG00000018109 THBS2 (ENSSTUG00000016312) ##12 ENSSTUG00000016231 ENSSTUG00000016224 ENSSTUG00000016069 ##20 erlec1 (ENSSTUG00000015971) ##21 ENSSTUG00000015961 ENSSTUG00000015951 ENSSTUG00000015938 nrxn1b (ENSSTUG00000013680) ##22 LHCGR (ENSSTUG00000013262) ##23 STON1 (ENSSTUG00000013233) ##25 ppp1r21 (ENSSTUG00000012084) ##26 FOXN2 (ENSSTUG00000012050) ENSSTUG00000010533 ##28 msh6 (ENSSTUG00000010207) ENSSTUG00000010183 KCNK12 (ENSSTUG00000010180) ##29 GOLGA4 (ENSSTUG00000009954) ##31 itga9 (ENSSTUG00000009715) ##32 ZC3H6 (ENSSTUG00000009680) ENSSTUG00000009669 ##34 ENSSTUG00000009642 ##36 ENSSTUG00000009631 MERTK (ENSSTUG00000009479) Atlantic salmon MODERN SPECIES 20 ENSSSAG00000122151 ENSSSAG00000101173 ENSSSAG00000075553 ENSSSAG00000083955 ENSSSAG00000088446 ENSSSAG00000099101 ##35 ENSSSAG00000110104 kcnk1b (ENSSSAG00000075442) ##8 ENSSSAG00000075436 ##9 ENSSSAG00000072418 ##10 agpat4 (ENSSSAG00000072273) ##11 thbs2 (ENSSSAG00000071980) ##12 ENSSSAG00000071904 PSME4 (ENSSSAG00000071799) ##20 ERLEC1 (ENSSSAG00000071732) ##21 NRXN1 (ENSSSAG00000057796) ##22 LHCGR (ENSSSAG00000057492) ##23 ENSSSAG00000057485 ##25 ppp1r21 (ENSSSAG00000054096) ##26 ENSSSAG00000100373 ENSSSAG00000049879 ENSSSAG00000045454 ##28 ENSSSAG00000042313 ENSSSAG00000042206 ##29 ENSSSAG00000041544 ##31 itga9 (ENSSSAG00000040941) ##32 ENSSSAG00000091255 ZC3H6 (ENSSSAG00000040894) ENSSSAG00000100465 ##34 ENSSSAG00000002948 ##36 MERTK (ENSSSAG00000040437) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00940000157049.c.b.b ENSGT00530000064017.a.f ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b.h ENSGT00390000010434.b.d.b ENSGT00510000049375.g ENSGT01060000253683 ENSGT00940000165757.c.a.b ENSGT00940000155293.a.a.i ##8 ENSGT00940000165701.g ##10 ENSGT00950000182836.b.b.b.b.l ##11 ENSGT00940000157846.c.c ##12 ENSGT00390000012017 ENSGT00390000011433.s.a.f ##20 ENSGT00530000063603.B.h ##21 ENSGT00940000177029.b ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.a ##22 ENSGT00940000157364.B.d ##23 ENSGT00940000158817.e ##25 ENSGT00390000006820.c ##26 ENSGT00940000159118.g ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.a ##28 ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424.k.a ##29 ENSGT00730000111139.m ##31 ENSGT00940000156503.u ##32 ENSGT00940000157396.jc ENSGT00830000128368.b.e ##34 ENSGT00940000156844.b.g.a ##36 ENSGT00940000155669.mc.a ENSGT00940000157364.A ##23 ENSGT00940000153956.a.b.c ##37 Rainbow trout MODERN SPECIES 12 ENSOMYG00000043076 ENSOMYG00000043052 ENSOMYG00000043047 ENSOMYG00000071543 ENSOMYG00000048427 kcnk1b (ENSOMYG00000043033) ##8 ENSOMYG00000038592 ##10 agpat4 (ENSOMYG00000037674) ##11 ENSOMYG00000037486 ##12 ENSOMYG00000037387 ENSOMYG00000036954 ##20 ERLEC1 (ENSOMYG00000036803) ##21 ENSOMYG00000049636 ENSOMYG00000058306 ENSOMYG00000052965 ENSOMYG00000035998 ##22 LHCGR (ENSOMYG00000035803) ##23 ENSOMYG00000035787 ##25 PPP1R21 (ENSOMYG00000033214) ##26 ENSOMYG00000032741 ENSOMYG00000030467 ##28 ENSOMYG00000029486 ENSOMYG00000029262 ##29 ENSOMYG00000029080 ##31 itga9 (ENSOMYG00000028775) ##32 ZC3H6 (ENSOMYG00000028668) ENSOMYG00000069923 ENSOMYG00000028653 ##34 ENSOMYG00000028641 ##36 MERTK (ENSOMYG00000028465) lhcgr (ENSOMYG00000028304) ##23 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157049.c.b.b ENSGT00530000064017.a.f ENSGT00950000182926.b.d.a.a.b.h ENSGT00390000010434.b.d.b ENSGT00510000049375.g ENSGT01060000253683 ENSGT00940000165757.c.a.b ENSGT00940000155293.a.a.i ##8 ENSGT00940000165701.g ##10 ENSGT00950000182836.b.b.b.b.l ##11 ENSGT00940000157846.c.c ##12 ENSGT00390000012017 ENSGT00390000011433.s.a.f ##20 ENSGT00530000063603.B.h ##21 ENSGT00940000177029.b ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.a ##22 ENSGT00940000157364.B.d ##23 ENSGT00940000158817.e ##25 ENSGT00390000006820.c ##26 ENSGT00940000159118.g ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.a ##28 ENSGT00550000075024 ENSGT00940000161424.k.a ##29 ENSGT00730000111139.m ##31 ENSGT00940000156503.u ##32 ENSGT00940000157396.jc ENSGT00830000128368.b.e ##34 ENSGT00940000156844.b.g.a ##36 ENSGT00940000155669.mc.a ENSGT00940000157364.A ##23 ENSGT00940000153956.a.b.c ##37 Chinook salmon MODERN SPECIES 17 HPSE2 (ENSOTSG00005034422) CNNM1 (ENSOTSG00005034416) got1 (ENSOTSG00005034411) nkx2.3 (ENSOTSG00005034407) nkx3.3 (ENSOTSG00005034405) kcnk1b (ENSOTSG00005034403) ##8 ENSOTSG00005029107 ##10 agpat4 (ENSOTSG00005029064) ##11 THBS2 (ENSOTSG00005027465) ##12 ENSOTSG00005027451 ENSOTSG00005027450 PSME4 (ENSOTSG00005026777) ##20 erlec1 (ENSOTSG00005025375) ##21 ENSOTSG00005025372 ENSOTSG00005025370 NRXN1 (ENSOTSG00005023915) ##22 LHCGR (ENSOTSG00005023894) ##23 STON1 (ENSOTSG00005023892) ##25 ppp1r21 (ENSOTSG00005021526) ##26 FOXN2 (ENSOTSG00005021516) ENSOTSG00005021282 ##28 msh6 (ENSOTSG00005017579) KCNK12 (ENSOTSG00005017576) ##29 GOLGA4 (ENSOTSG00005017572) ##31 itga9 (ENSOTSG00005017301) ##32 ZC3H6 (ENSOTSG00005017280) ENSOTSG00005017277 ##34 ENSOTSG00005017273 ##36 MERTK (ENSOTSG00005017271) lhcgr (ENSOTSG00005017209) ##23 ANKRD1 (ENSOTSG00005017205) ##37 Coho salmon MODERN SPECIES 17 ENSOKIG00005018168 ENSOKIG00005018154 ENSOKIG00005018101 MARVELD1 (ENSOKIG00005018097) ENSOKIG00005018091 ENSOKIG00005018083 kcnk1b (ENSOKIG00005018080) ##8 ENSOKIG00005018075 ENSOKIG00005012935 ##10 agpat4 (ENSOKIG00005012600) ##11 THBS2 (ENSOKIG00005012323) ##12 ENSOKIG00005012263 ENSOKIG00005012249 PSME4 (ENSOKIG00005012067) ##20 ERLEC1 (ENSOKIG00005011136) ##21 NRXN1 (ENSOKIG00005009580) ##22 LHCGR (ENSOKIG00005009460) ##23 STON1 (ENSOKIG00005009449) ##25 ppp1r21 (ENSOKIG00005006947) ##26 FOXN2 (ENSOKIG00005006794) ENSOKIG00005006542 ##28 msh6 (ENSOKIG00005006274) KCNK12 (ENSOKIG00005020653) ##29 GOLGA4 (ENSOKIG00005020615) ##31 itga9 (ENSOKIG00005020483) ##32 ZC3H6 (ENSOKIG00005020439) ENSOKIG00005020425 ##34 ENSOKIG00005020407 ##36 MERTK (ENSOKIG00005020237) lhcgr (ENSOKIG00005020060) ##23 ANKRD1 (ENSOKIG00005020019) ##37 Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000155293.a.a.j #8 ENSGT00940000165701.h #10 ENSGT00990000204854.c #9 ENSGT00950000182836.b.b.b.b.k #11 ENSGT00940000157846.c.d #12 ENSGT00390000011433.s.a.e #20 ENSGT00390000007723 ENSGT00530000063603.B.g #21 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.b.a ##22 ENSGT00940000154292.a.b.d.h.a.b #22 ENSGT00940000157364.B.c #23 ENSGT00940000163055 #24 ENSGT00940000158817.f #25 ENSGT00390000006820.d #26 ENSGT00940000159118.h ENSGT00530000063425.a.a.a.b.i.a.b #28 ENSGT00940000161424.k.b #29 ENSGT00730000111139.n #31 ENSGT00940000156503.v.a.a ##32 ENSGT00830000128368.b.f #34 ENSGT00940000156844.b.h ##36 ENSGT00940000155669.mc.b ENSGT00940000153956.a.b.d #37 ENSGT00940000155896.k.b Chinook salmon MODERN SPECIES ENSOTSG00005026863 ENSOTSG00005026866 epas1b (ENSOTSG00005026875) ENSOTSG00005029069 ENSOTSG00005029070 ENSOTSG00005029072 pcgf5a (ENSOTSG00005029077) ENSOTSG00005029087 #37 ENSOTSG00005029089 ENSOTSG00005029093 ##36 ENSOTSG00005029102 #34 GOLGA4 (ENSOTSG00005029110) #31 PSME4 (ENSOTSG00005029152) #20 GPR75 (ENSOTSG00005035805) erlec1 (ENSOTSG00005035877) #21 ENSOTSG00005036153 ##22 NRXN1 (ENSOTSG00005036190) #22 LHCGR (ENSOTSG00005036192) #23 gtf2a1l (ENSOTSG00005036193) #24 ENSOTSG00005036194 #25 ppp1r21 (ENSOTSG00005036205) #26 ENSOTSG00005039080 ENSOTSG00005039081 ENSOTSG00005039082 ENSOTSG00005039089 #28 KCNK12 (ENSOTSG00005039783) #29 Huchen MODERN SPECIES 6159 ENSHHUG00000017629 ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154292.a.b.d.h.b.b ##22 Huchen MODERN SPECIES 779 ENSHHUG00000029858 ENSHHUG00000029853 ENSHHUG00000029844 med13a (ENSHHUG00000029764) rnft1 (ENSHHUG00000029756) ENSHHUG00000029713 VMP1 (ENSHHUG00000029688) ptrh2 (ENSHHUG00000029646) cltca (ENSHHUG00000029538) ENSHHUG00000029533 ENSHHUG00000029525 ##22 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154292.a.b.d.g ##22 Huchen MODERN SPECIES 5458 ENSHHUG00000005885 ##22 ENSHHUG00000005889 Northern pike MODERN SPECIES 4 fam135a (ENSELUG00000012515) zgc:172136 (ENSELUG00000001042) TARBP1 (ENSELUG00000012193) ENSELUG00000012130 ENSELUG00000012116 SLC35F3 (ENSELUG00000012062) #7 kcnk1b (ENSELUG00000000431) #8 ENSELUG00000011854 #10 ENSELUG00000011781 agpat4 (ENSELUG00000011759) #11 THBS2 (ENSELUG00000000425) #12 ENSELUG00000001497 PSME4 (ENSELUG00000011276) #20 GPR75 (ENSELUG00000011209) erlec1 (ENSELUG00000011166) #21 nrxn1b (ENSELUG00000011068) #22 LHCGR (ENSELUG00000010744) #23 gtf2a1l (ENSELUG00000034256) #24 STON1 (ENSELUG00000010706) #25 ppp1r21 (ENSELUG00000010645) #26 FOXN2 (ENSELUG00000010538) ENSELUG00000010499 #28 msh6 (ENSELUG00000010431) ENSELUG00000010344 mfsd13a (ENSELUG00000010231) SEMA4G (ENSELUG00000010193) RM43 (ENSELUG00000026129) twnk (ENSELUG00000010089) LZTS2 (ENSELUG00000010065) PDZD7 (ENSELUG00000010038) ENSELUG00000010023