Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 200 ENSGT00950000183144.B ENSGT00420000029753 #22 ENSGT00390000016650 #24 Gnathostomata DUPLICATION Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259 ENSGT00940000155705 ENSGT00940000157700 ENSGT00950000183144.B ENSGT00390000010768 ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277 ENSGT00510000047220 ENSGT00940000153167.B ENSGT00940000158765 ENSGT01070000253866 ENSGT00740000116213 ENSGT00390000003464 ENSGT00390000018130.b ENSGT00390000016466 ENSGT00530000063205.C ENSGT00390000016573 ENSGT00940000163957.e.a ENSGT00940000157263 Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 292 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00940000167241 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 92 ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00940000167241 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00390000003464 ENSGT00740000116213 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00510000049326.b.a ENSGT01050000244838.B ENSGT00940000158362 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000159923 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 62 ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00940000167241 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00390000003464 ENSGT00740000116213 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00510000049326.a ENSGT00940000158362 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SPECIES ENSGT00420000029753.b.p #22 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 2 ENSHGLG00000009994 ENSHGLG00000042008 ENSHGLG00000047105 ENSHGLG00000013661 PCDH20 (ENSHGLG00000047948) ENSHGLG00000004172 ENSHGLG00000018707 ENSHGLG00000018541 ENSHGLG00000045778 ENSHGLG00000032376 ENSHGLG00000045977 ENSHGLG00000051018 PCDH17 (ENSHGLG00000006849) ENSHGLG00000033401 ENSHGLG00000034074 ENSHGLG00000042301 #22 ENSHGLG00000047426 ENSHGLG00000036656 ENSHGLG00000003692 PCDH8 (ENSHGLG00000003306) ENSHGLG00000034939 ENSHGLG00000008247 ENSHGLG00000005329 ENSHGLG00000045934 WBP4 (ENSHGLG00000004585) KBTBD7 (ENSHGLG00000020078) MTRF1 (ENSHGLG00000003210) ENSHGLG00000003000 ENSHGLG00000040621 ENSHGLG00000039892 NAA16 (ENSHGLG00000008702) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000155505.a ENSGT00940000161237 ENSGT00500000045816 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00700000106049 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#22 ENSGT00390000006459 #23 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a.b.b ENSGT00390000003464 ENSGT00940000163965 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00940000158362 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000159923 ENSGT00510000047486 ENSGT00940000159901 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 612 Faah (ENSNGAG00000019634) Nsun4 (ENSNGAG00000023728) ENSNGAG00000023626 Uqcrh (ENSNGAG00000014974) ENSNGAG00000003373 Rad54l (ENSNGAG00000024213) Lurap1 (ENSNGAG00000023881) Pomgnt1 (ENSNGAG00000018844) Tspan1 (ENSNGAG00000012097) P3r3urf (ENSNGAG00000007932) Pik3r3 (ENSNGAG00000023327) ENSNGAG00000024080 ENSNGAG00000022633 Ipp (ENSNGAG00000017406) Tmem69 (ENSNGAG00000016321) Gpbp1l1 (ENSNGAG00000023885) #22 Ccdc17 (ENSNGAG00000022263) #23 Nasp (ENSNGAG00000016214) #24 ENSNGAG00000022751 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000155505.a ENSGT00940000161237 ENSGT00500000045816 ENSGT00940000153665.b.a.b 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MODERN SPECIES 111 Dmbx1 (ENSCGRG00001016330) Faah (ENSCGRG00001021029) Nsun4 (ENSCGRG00001019730) ENSCGRG00001024563 ENSCGRG00001011038 Lrrc41 (ENSCGRG00001010037) Rad54l (ENSCGRG00001014807) Lurap1 (ENSCGRG00001013238) Pomgnt1 (ENSCGRG00001014301) Tspan1 (ENSCGRG00001013103) P3r3urf (ENSCGRG00001011615) Pik3r3 (ENSCGRG00001016378) Mast2 (ENSCGRG00001023294) Ipp (ENSCGRG00001018588) Tmem69 (ENSCGRG00001005140) Gpbp1l1 (ENSCGRG00001022489) #22 Ccdc17 (ENSCGRG00001015801) #23 Nasp (ENSCGRG00001005027) #24 AKR1A1 (ENSCGRG00001023544) #25 Prdx1 (ENSCGRG00001019611) Mmachc (ENSCGRG00001019062) Ccdc163 (ENSCGRG00001009735) Tesk2 (ENSCGRG00001024966) Toe1 (ENSCGRG00001022323) Mutyh (ENSCGRG00001011424) Hpdl (ENSCGRG00001002433) Zswim5 (ENSCGRG00001013266) Urod (ENSCGRG00001010355) Hectd3 (ENSCGRG00001014938) Eif2b3 (ENSCGRG00001013546) Ptch2 (ENSCGRG00001013009) Golden Hamster MODERN SPECIES 648 Dmbx1 (ENSMAUG00000013192) Faah (ENSMAUG00000001088) Nsun4 (ENSMAUG00000013883) 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ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000006459 #23 ENSGT00900000143563.c ENSGT00390000016650.g.a #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a.b.b ENSGT00390000003464 ENSGT00940000165040 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00390000001376.ab.b.a.a.a.b.a ENSGT00940000158362 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000159923 Bonobo MODERN SPECIES FAAH (ENSPPAG00000032528) NSUN4 (ENSPPAG00000039566) UQCRH (ENSPPAG00000037608) LRRC41 (ENSPPAG00000030986) RAD54L (ENSPPAG00000031222) LURAP1 (ENSPPAG00000034121) POMGNT1 (ENSPPAG00000030808) P3R3URF (ENSPPAG00000033181) TSPAN1 (ENSPPAG00000041180) ENSPPAG00000039075 PIK3R3 (ENSPPAG00000009679) ENSPPAG00000033275 MAST2 (ENSPPAG00000039968) IPP (ENSPPAG00000037424) TMEM69 (ENSPPAG00000036310) GPBP1L1 (ENSPPAG00000039296) #22 CCDC17 (ENSPPAG00000039653) #23 ENSPPAG00000036044 NASP (ENSPPAG00000032932) #24 AKR1A1 (ENSPPAG00000030280) #25 PRDX1 (ENSPPAG00000001809) MMACHC (ENSPPAG00000042689) CCDC163 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ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00940000158362 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000159923 ENSGT00530000064130.c.a.a Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 329 ENSGT00940000156259.b ENSGT00390000012178.g.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000006459 #23 ENSGT00900000143563 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539.g #25 ENSGT00940000154277.a.b.a.a ENSGT00390000003464 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 693 FAAH (ENSRBIG00000033681) NSUN4 (ENSRBIG00000033827) ENSRBIG00000026841 LRRC41 (ENSRBIG00000032151) RAD54L (ENSRBIG00000043495) LURAP1 (ENSRBIG00000044781) POMGNT1 (ENSRBIG00000025961) TSPAN1 (ENSRBIG00000028021) P3R3URF (ENSRBIG00000029879) ENSRBIG00000007567 PIK3R3 (ENSRBIG00000010667) ENSRBIG00000014916 MAST2 (ENSRBIG00000039234) IPP (ENSRBIG00000031821) TMEM69 (ENSRBIG00000029272) GPBP1L1 (ENSRBIG00000040924) #22 CCDC17 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SPECIES 12 ENSCHYG00000025121 ENSCHYG00000025148 LRRC41 (ENSCHYG00000025182) RAD54L (ENSCHYG00000025239) ENSCHYG00000025272 LURAP1 (ENSCHYG00000025283) POMGNT1 (ENSCHYG00000025315) TSPAN1 (ENSCHYG00000025510) P3R3URF (ENSCHYG00000025545) PIK3R3 (ENSCHYG00000025628) MAST2 (ENSCHYG00000025735) ENSCHYG00000026038 IPP (ENSCHYG00000026048) TMEM69 (ENSCHYG00000026064) ENSCHYG00000026066 GPBP1L1 (ENSCHYG00000026077) #22 ENSCHYG00000026088 CCDC17 (ENSCHYG00000026094) #23 ENSCHYG00000013571 #24 AKR1A1 (ENSCHYG00000014116) #25 PRDX1 (ENSCHYG00000014220) MMACHC (ENSCHYG00000014375) ENSCHYG00000014448 TESK2 (ENSCHYG00000014667) TOE1 (ENSCHYG00000014810) MUTYH (ENSCHYG00000014878) HPDL (ENSCHYG00000015256) ZSWIM5 (ENSCHYG00000015288) ENSCHYG00000015501 UROD (ENSCHYG00000015580) HECTD3 (ENSCHYG00000015961) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163316 ENSGT00940000161237 ENSGT00500000045816 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00700000106049 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000006459 #23 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a.b.b.n ENSGT00390000003464 ENSGT00940000163965 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00940000158362 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000159923 ENSGT00510000047486 ENSGT00940000159901 Bovidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163316 ENSGT00940000161237 ENSGT00500000045816 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00700000106049 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000006459 #23 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a.b.b.n ENSGT00390000003464 ENSGT00940000163965 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00940000158362 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000159923 ENSGT00510000047486 ENSGT00940000159901 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155505.a ENSGT00940000163316 ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00700000106049 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000006459 #23 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a.b.b.n ENSGT00390000003464 ENSGT00940000165040 ENSGT01000000221833 ENSGT00390000007560.l ENSGT00940000163965 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00940000158362 ENSGT00390000018302 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000163316 ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00700000106049 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000158629 ENSGT01100000263480.a.b.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000006459 #23 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a.b.b.n ENSGT00390000003464 ENSGT00940000165040 ENSGT01000000221833 ENSGT00390000007560.l ENSGT00940000163965 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00950000182891.a.a.a.v ENSGT00940000158362 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163316 ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00700000106049 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000158629 ENSGT01100000263480.a.b.a.b.a.a.b.b.b 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TOE1 (ENSBIXG00005010766) MUTYH (ENSBIXG00005010713) HPDL (ENSBIXG00005000651) ENSBIXG00005010633 ZSWIM5 (ENSBIXG00005010611) UROD (ENSBIXG00005005475) HECTD3 (ENSBIXG00005010469) EIF2B3 (ENSBIXG00005010430) Cow MODERN SPECIES 22 ENSBTAG00000054510 FAAH (ENSBTAG00000007507) NSUN4 (ENSBTAG00000015891) UQCRH (ENSBTAG00000009603) LRRC41 (ENSBTAG00000045664) RAD54L (ENSBTAG00000019901) POMGNT1 (ENSBTAG00000013322) LURAP1 (ENSBTAG00000024144) TSPAN1 (ENSBTAG00000013320) P3R3URF (ENSBTAG00000048829) PIK3R3 (ENSBTAG00000002979) MAST2 (ENSBTAG00000020444) IPP (ENSBTAG00000016377) ENSBTAG00000051822 TMEM69 (ENSBTAG00000052979) GPBP1L1 (ENSBTAG00000008810) #22 CCDC17 (ENSBTAG00000008808) #23 NASP (ENSBTAG00000015346) #24 AKR1A1 (ENSBTAG00000000497) #25 PRDX1 (ENSBTAG00000003642) MMACHC (ENSBTAG00000017027) ENSBTAG00000017029 TESK2 (ENSBTAG00000011244) TOE1 (ENSBTAG00000011243) MUTYH (ENSBTAG00000011242) HPDL (ENSBTAG00000011241) ENSBTAG00000040435 ZSWIM5 (ENSBTAG00000012648) UROD (ENSBTAG00000012644) ENSBTAG00000048658 HECTD3 (ENSBTAG00000019013) Bos_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163316 ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00700000106049 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00940000158629 ENSGT01100000263480.a.b.a.b.a.a.b.b.b ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000006459 #23 ENSGT00390000016650 #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000154277.a.b.b.n ENSGT00390000003464 ENSGT00940000165040 ENSGT01000000221833 ENSGT00390000007560.l ENSGT00940000163965 ENSGT00940000158765 ENSGT00940000153167.B ENSGT00510000047220 ENSGT00530000063474.A ENSGT00950000182891.a.a.a.v ENSGT00940000158362 Domestic yak MODERN SPECIES 22 NSUN4 (ENSBGRG00000001974) ENSBGRG00000002005 ENSBGRG00000002038 LRRC41 (ENSBGRG00000002054) RAD54L (ENSBGRG00000002083) LURAP1 (ENSBGRG00000002137) POMGNT1 (ENSBGRG00000002161) 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Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183144.B ENSGT00390000010768 ENSGT00940000155828 ENSGT00940000161195 ENSGT00940000160152 ENSGT00940000161361 ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163316.a.b ENSGT00940000163316.a.a ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000012433.b ENSGT00940000160852 ENSGT00940000164586 ENSGT00940000159121 ENSGT00940000162474 ENSGT00940000162133 ENSGT00510000047486 ENSGT00940000159901 ENSGT00940000159923 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000158362 ENSGT00390000003464 ENSGT00740000116213 ENSGT01030000235254 ENSGT00940000158765 Laterata ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000163316.a.b ENSGT00940000163316.a.a ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000012433.b ENSGT00940000160852 ENSGT00940000164586 ENSGT00940000159121 ENSGT00940000162474 ENSGT00940000162133 ENSGT00510000047486 ENSGT00940000159901 ENSGT00940000159923 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000158362 ENSGT00390000003464 ENSGT00740000116213 ENSGT01030000235254 ENSGT00940000158765 Common wall lizard MODERN SPECIES 14 ENSPMRG00000008178 FAAH (ENSPMRG00000008196) NSUN4 (ENSPMRG00000008211) ENSPMRG00000008218 LRRC41 (ENSPMRG00000008224) RAD54L (ENSPMRG00000008267) LURAP1 (ENSPMRG00000008487) POMGNT1 (ENSPMRG00000008531) TSPAN1 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ENSGT00390000018302 ENSGT00940000158362 ENSGT00390000003464 ENSGT00740000116213 ENSGT01030000235254 ENSGT00940000158765 Elapidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000163316.a.b ENSGT00940000163316.a.a ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000012433.b ENSGT00940000160852 ENSGT00940000164586 ENSGT00940000159121 ENSGT00940000162474 ENSGT00940000162133 ENSGT00510000047486 ENSGT00940000159901 ENSGT00940000159923 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000158362 ENSGT00390000003464 ENSGT00740000116213 ENSGT01030000235254 ENSGT00940000158765 Elapidae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000163316.a.b ENSGT00940000163316.a.a ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000012433.b ENSGT00940000160852 ENSGT00940000164586 ENSGT00940000159121 ENSGT00940000162474 ENSGT00940000162133 ENSGT00510000047486 ENSGT00940000159901 ENSGT00940000159923 ENSGT00390000018302 ENSGT00940000158362 ENSGT00390000003464 ENSGT00740000116213 ENSGT01030000235254 ENSGT00940000158765 Acanthophiinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000163316.a.b ENSGT00940000163316.a.a ENSGT00940000161237 ENSGT00940000153665.b.a.b ENSGT00390000003860 ENSGT00390000015908 ENSGT00940000156897 ENSGT00530000063790.a ENSGT00530000063632.A ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.b ENSGT00940000155705.b ENSGT00950000183144.B ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318 ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000012433.b ENSGT00940000160852 ENSGT00940000164586 ENSGT00940000159121 ENSGT00940000162474 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MUTYH (ENSPTXG00000001612) HPDL (ENSPTXG00000001566) Eastern brown snake MODERN SPECIES 11 PRELID3A (ENSPTXG00000017052) SPIRE1 (ENSPTXG00000017054) ENSPTXG00000017083 CEP76 (ENSPTXG00000017086) PSMG2 (ENSPTXG00000017091) PTPN2 (ENSPTXG00000017196) SEH1L (ENSPTXG00000017200) ENSPTXG00000017204 ENSPTXG00000017206 LDLRAD4 (ENSPTXG00000017208) FAM210A (ENSPTXG00000017209) RNMT (ENSPTXG00000017211) MC5R (ENSPTXG00000017214) MC2R (ENSPTXG00000017216) ENSPTXG00000017218 ENSPTXG00000017220 #22 CDH7 (ENSPTXG00000017224) DSEL (ENSPTXG00000017275) TMX3 (ENSPTXG00000017278) DOK6 (ENSPTXG00000017280) ENSPTXG00000017284 ENSPTXG00000017285 RTTN (ENSPTXG00000017288) ENSPTXG00000017292 ENSPTXG00000017293 CBLN2 (ENSPTXG00000017294) NETO1 (ENSPTXG00000017295) ENSPTXG00000017296 FBXO15 (ENSPTXG00000017297) TIMM21 (ENSPTXG00000017298) CYB5A (ENSPTXG00000017299) Mainland tiger snake MODERN SPECIES 13 ENSNSUG00000016162 ENSNSUG00000016161 FAAH (ENSNSUG00000016160) NSUN4 (ENSNSUG00000016159) 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SPECIES 1 ENSMGAG00000017218 ENSMGAG00000010370 ENSMGAG00000010366 TOE1 (ENSMGAG00000010387) ENSMGAG00000010395 ENSMGAG00000021918 ENSMGAG00000022085 ENSMGAG00000010417 ENSMGAG00000010420 ENSMGAG00000010441 #25 ENSMGAG00000010470 #24 ENSMGAG00000010515 IPP (ENSMGAG00000010501) TMEM69 (ENSMGAG00000010500) ENSMGAG00000020097 GPBP1L1 (ENSMGAG00000019238) #22 ENSMGAG00000010530 PIK3R3 (ENSMGAG00000010604) ENSMGAG00000010574 ENSMGAG00000010616 LURAP1 (ENSMGAG00000010613) ENSMGAG00000010634 ENSMGAG00000020766 NSUN4 (ENSMGAG00000010675) ENSMGAG00000010666 LRRC41 (ENSMGAG00000010654) ENSMGAG00000010684 ENSMGAG00000010681 ENSMGAG00000010718 ENSMGAG00000010722 ENSMGAG00000010730 African ostrich MODERN SPECIES 819 PIK3R3 (ENSSCUG00000012437) MAST2 (ENSSCUG00000012361) ENSSCUG00000012303 IPP (ENSSCUG00000012299) TMEM69 (ENSSCUG00000012298) GPBP1L1 (ENSSCUG00000012296) #22 NASP (ENSSCUG00000012294) #24 AKR1A1 (ENSSCUG00000012291) #25 PRDX1 (ENSSCUG00000012290) MMACHC (ENSSCUG00000012289) 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toad MODERN SPECIES 11 KDM4A (ENSLLEG00000020119) ENSLLEG00000020649 ST3GAL3 (ENSLLEG00000020728) ENSLLEG00000020980 ENSLLEG00000021021 ENSLLEG00000021047 ENSLLEG00000021160 ENSLLEG00000021258 ENSLLEG00000021273 ENSLLEG00000021298 IPO13 (ENSLLEG00000021357) KISS1R (ENSLLEG00000022108) DPH2 (ENSLLEG00000022151) IPP (ENSLLEG00000022222) TMEM69 (ENSLLEG00000022361) GPBP1L1 (ENSLLEG00000022406) #22 ENSLLEG00000022625 ENSLLEG00000023634 NASP (ENSLLEG00000023672) #24 AKR1A1 (ENSLLEG00000024025) #25 TESK2 (ENSLLEG00000024084) TOE1 (ENSLLEG00000024230) MUTYH (ENSLLEG00000024329) ENSLLEG00000024703 ENSLLEG00000024825 ENSLLEG00000024849 ENSLLEG00000024878 ZSWIM5 (ENSLLEG00000025000) ENSLLEG00000025573 ENSLLEG00000025698 ENSLLEG00000025938 Coelacanth MODERN SPECIES 588 ENSLACG00000011696 IPP (ENSLACG00000011893) TMEM69 (ENSLACG00000012132) GPBP1L1 (ENSLACG00000012352) #22 ENSLACG00000012734 NASP (ENSLACG00000013351) #24 PRDX1 (ENSLACG00000014285) zte38 (ENSLACG00000014360) MMACHC 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Denticle herring MODERN SPECIES 4 pgm1 (ENSDCDG00000033253) efcab7 (ENSDCDG00000033215) alg6 (ENSDCDG00000033209) foxd3 (ENSDCDG00000033208) atg4c (ENSDCDG00000033205) angptl3 (ENSDCDG00000033204) DOCK7 (ENSDCDG00000030725) usp1 (ENSDCDG00000030622) ENSDCDG00000030619 ENSDCDG00000030618 pomgnt1 (ENSDCDG00000030604) TSPAN1 (ENSDCDG00000030597) PIK3R3 (ENSDCDG00000029931) MAST2 (ENSDCDG00000027559) tmem69 (ENSDCDG00000027488) GPBP1L1 (ENSDCDG00000027482) #22 ENSDCDG00000027481 nasp (ENSDCDG00000027480) #24 akr1a1b (ENSDCDG00000027469) #25 si:ch211-264f5.2 (ENSDCDG00000027463) GPR52 (ENSDCDG00000027460) RABGAP1L (ENSDCDG00000026560) FAM163A (ENSDCDG00000026509) ENSDCDG00000026507 nphs2 (ENSDCDG00000026506) nrd1b (ENSDCDG00000019301) ENSDCDG00000019039 atpaf1 (ENSDCDG00000019007) ENSDCDG00000018953 nfia (ENSDCDG00000018888) tm2d1 (ENSDCDG00000018877) Atlantic herring MODERN SPECIES 1 ENSCHAG00000025583 ENSCHAG00000025576 pgm1 (ENSCHAG00000025389) alg6 (ENSCHAG00000025361) foxd3 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ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00390000015318.b ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00940000167241 ENSGT00390000016650.c.a #24 ENSGT00940000156539 #25 Characiphysae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000154819.a.a.a.a ENSGT00940000156282.a.b ENSGT00390000006224 ENSGT00390000003015.c ENSGT00940000166725 ENSGT01030000234931 ENSGT00940000157693 ENSGT00940000166530 ENSGT00530000063498.B ENSGT00730000111085.A ENSGT00530000063632.A.l ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00390000015318.b ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00940000167241 ENSGT00390000016650.c.a #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000158468.a.b ENSGT00910000144243 ENSGT00940000155661 ENSGT00940000156746.a ENSGT00530000063000.a.a.a ENSGT00940000161645.b ENSGT00940000153733.B Channel catfish MODERN SPECIES 2 lrp8 (ENSIPUG00000005394) dmrt2b (ENSIPUG00000005442) fam183a 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ENSGT00940000166530 ENSGT00530000063498.B ENSGT00730000111085.A ENSGT00530000063632.A.l ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00390000015318.b ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00940000167241 ENSGT00390000016650.c.a #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000158468.a.b ENSGT00910000144243 ENSGT00940000155661 ENSGT00940000156746.a ENSGT00530000063000.a.a.a ENSGT00940000161645.b ENSGT00940000153733.B Characoidei ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000154819.a.a.a.a ENSGT00940000156282.a.b ENSGT00390000006224 ENSGT00390000003015.c ENSGT00940000166725 ENSGT00940000173535 ENSGT00940000157693 ENSGT00940000166530 ENSGT00530000063498.B ENSGT00730000111085.A ENSGT00530000063632.A.l ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00390000015318.b ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00940000167241 ENSGT00390000016650.c.a #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00940000157362.d ENSGT00940000166873 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000162747 ENSGT00940000158468.a.b ENSGT00910000144243 ENSGT00940000155661 ENSGT00940000156746.a ENSGT00530000063000.a.a.a ENSGT00940000161645.b ENSGT00940000153733.B Red-bellied piranha MODERN SPECIES 9 lrp8 (ENSPNAG00000010993) dmrt2b (ENSPNAG00000010744) cfap144 (ENSPNAG00000010724) TMEM125 (ENSPNAG00000010710) ap1m3 (ENSPNAG00000001432) si:ch73-185c24.2 (ENSPNAG00000010668) tie1 (ENSPNAG00000010620) mpl (ENSPNAG00000010486) orc1 (ENSPNAG00000010455) prpf38a (ENSPNAG00000010399) pomgnt1 (ENSPNAG00000010365) TSPAN1 (ENSPNAG00000010257) PIK3R3 (ENSPNAG00000010211) MAST2 (ENSPNAG00000010172) tmem69 (ENSPNAG00000010093) GPBP1L1 (ENSPNAG00000010086) #22 ENSPNAG00000010038 nasp (ENSPNAG00000010000) #24 akr1a1b (ENSPNAG00000009969) #25 ADCYAP1R1 (ENSPNAG00000009951) ENSPNAG00000009929 ENSPNAG00000005129 ENSPNAG00000009850 ENSPNAG00000009824 mafaa (ENSPNAG00000009815) KANK4 (ENSPNAG00000009805) usp1 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Electric eel MODERN SPECIES 480 MAST2 (ENSEEEG00000010863) ENSEEEG00000010879 tmem69 (ENSEEEG00000010880) GPBP1L1 (ENSEEEG00000010882) #22 nasp (ENSEEEG00000010887) #24 akr1a1b (ENSEEEG00000010899) #25 ADCYAP1R1 (ENSEEEG00000011119) ENSEEEG00000011147 ENSEEEG00000011161 ENSEEEG00000011163 Cyprinoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000156746.a ENSGT00940000155661 ENSGT00910000144243 ENSGT00940000158468.a.b ENSGT00940000162747 ENSGT00940000161068 ENSGT00940000164912 ENSGT00940000166873 ENSGT00940000157362.d ENSGT00530000063632.A.l ENSGT00940000158851 ENSGT00940000156259.a.b.a ENSGT00940000156259.a.a ENSGT00940000155705.b ENSGT00390000015318.b ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00940000167241 ENSGT00390000016650.c.a #24 ENSGT00940000156539 #25 ENSGT00730000111085.A ENSGT00530000063498.B ENSGT00940000166530 ENSGT00940000157693 ENSGT00510000048988 ENSGT01030000234931 ENSGT00940000166725 ENSGT00390000003015.c ENSGT00390000006224 ENSGT00940000156282.a.b ENSGT00940000154819.a.a.a.a ENSGT01030000234573.A.b.a.d Cyprininae DUPLICATION Cyprininae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00530000063000.a.a.a ENSGT00940000155661.z ENSGT00940000156746.a.b ENSGT00910000144243.n ENSGT00940000158468.a.b.b ENSGT00940000162747.a ENSGT00940000161068.d ENSGT00940000164912.c ENSGT00940000166873.b ENSGT00940000157362.d.a ENSGT00530000063632.A.l ENSGT00940000158851.f ENSGT00940000156259.a.b.a.a ENSGT00940000155705.b.w ENSGT00390000015318.b.b ENSGT00420000029753.b.y #22 ENSGT00390000016650.c.a.e #24 ENSGT00940000156539.v #25 ENSGT00730000111085.A.eb ENSGT00530000063498.B.a ENSGT00940000166530.b ENSGT00940000157693.m ENSGT00510000048988 ENSGT00940000166725.a ENSGT00390000003015.c.b ENSGT00390000006224 ENSGT00940000156282.a.b.d ENSGT00940000154819.a.a.a.a.b ENSGT01030000234573.A.b.a.d.b ENSGT00940000155665.a.a ENSGT00940000159829.d.b Goldfish MODERN SPECIES 46 atg4c (ENSCARG00000003780) DOCK7 (ENSCARG00000004893) angptl3 (ENSCARG00000020677) usp1 (ENSCARG00000020695) KANK4 (ENSCARG00000020714) 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ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Eupecaria_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000160185 ENSGT00940000169307 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Gilthead seabream MODERN SPECIES 13 rgs18 (ENSSAUG00010006983) ENSSAUG00010006987 rgs5b (ENSSAUG00010006990) ENSSAUG00010006991 DDR2 (ENSSAUG00010006996) hsd17b7 (ENSSAUG00010007001) ENSSAUG00010007026 slc35d1b (ENSSAUG00010007030) mier1b (ENSSAUG00010007092) dynlt5 (ENSSAUG00010007404) ENSSAUG00010007405 ENSSAUG00010007406 PIK3R3 (ENSSAUG00010007407) IPP (ENSSAUG00010007410) TMEM69 (ENSSAUG00010007423) GPBP1L1 (ENSSAUG00010007429) #22 NASP (ENSSAUG00010007431) #24 prdx1 (ENSSAUG00010007435) zte38 (ENSSAUG00010007440) aldh9a1b (ENSSAUG00010007448) uck2b (ENSSAUG00010007472) czib (ENSSAUG00010007473) scp2a (ENSSAUG00010007483) slc1a7a (ENSSAUG00010008847) SHISAL2A (ENSSAUG00010008925) ENSSAUG00010008927 tmem125b (ENSSAUG00010008929) LRP8 (ENSSAUG00010008935) ENSSAUG00010009215 ANGPTL3 (ENSSAUG00010009221) PGM1 (ENSSAUG00010009231) Eupercaria_incertae_sedis ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000160185 ENSGT00940000169307 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000155542.b ENSGT00390000006503.a Large yellow croaker MODERN SPECIES 483 rgs18 (ENSLCRG00005014433) ENSLCRG00005014435 rgs5b (ENSLCRG00005014436) ENSLCRG00005014437 DDR2 (ENSLCRG00005014439) hsd17b7 (ENSLCRG00005014585) ENSLCRG00005014827 slc35d1b (ENSLCRG00005014828) mier1b (ENSLCRG00005014836) dynlt5 (ENSLCRG00005002693) ENSLCRG00005002700 ENSLCRG00005002723 PIK3R3 (ENSLCRG00005002726) IPP (ENSLCRG00005002738) TMEM69 (ENSLCRG00005002759) GPBP1L1 (ENSLCRG00005002765) #22 NASP (ENSLCRG00005002786) #24 prdx1 (ENSLCRG00005002792) zte38 (ENSLCRG00005002797) aldh9a1b (ENSLCRG00005002808) uck2b (ENSLCRG00005003243) czib (ENSLCRG00005003255) scp2a (ENSLCRG00005003271) scp2a (ENSLCRG00005004264) slc1a7a (ENSLCRG00005004265) SHISAL2A (ENSLCRG00005004266) ENSLCRG00005004269 tmem125b (ENSLCRG00005004288) LRP8 (ENSLCRG00005004299) ENSLCRG00005004349 PGM1 (ENSLCRG00005004365) Perciformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b 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ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Pike perch MODERN SPECIES 12 rgs18 (ENSSLUG00000002619) ENSSLUG00000002611 rgs5b (ENSSLUG00000002605) ENSSLUG00000002582 DDR2 (ENSSLUG00000002561) hsd17b7 (ENSSLUG00000002531) ENSSLUG00000002513 slc35d1b (ENSSLUG00000002463) mier1b (ENSSLUG00000002437) ENSSLUG00000002427 dynlt5 (ENSSLUG00000002421) ENSSLUG00000002410 PIK3R3 (ENSSLUG00000001967) IPP (ENSSLUG00000001846) TMEM69 (ENSSLUG00000001840) GPBP1L1 (ENSSLUG00000001808) #22 ENSSLUG00000001776 #24 prdx1 (ENSSLUG00000001763) zte38 (ENSSLUG00000001750) aldh9a1b (ENSSLUG00000001698) uck2b (ENSSLUG00000001642) czib 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(ENSCGOG00000018152) ENSCGOG00000018147 ENSCGOG00000018144 ANGPTL3 (ENSCGOG00000018142) Cottioidei ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Stickleback MODERN SPECIES 2 ENSGACG00000016121 rgs18 (ENSGACG00000016122) ENSGACG00000016124 rgs5b (ENSGACG00000016127) ENSGACG00000016130 DDR2 (ENSGACG00000016132) 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ENSGT00940000155542.b Zig-zag eel MODERN SPECIES 8 rgs18 (ENSMAMG00000024725) ENSMAMG00000001739 rgs5b (ENSMAMG00000001704) ENSMAMG00000027602 ENSMAMG00000001656 ENSMAMG00000001605 ENSMAMG00000001591 SLC35D1 (ENSMAMG00000001540) MIER1 (ENSMAMG00000026666) ENSMAMG00000001510 DYNLT5 (ENSMAMG00000001499) ENSMAMG00000001485 PIK3R3 (ENSMAMG00000001465) IPP (ENSMAMG00000001378) TMEM69 (ENSMAMG00000001362) GPBP1L1 (ENSMAMG00000001301) #22 NASP (ENSMAMG00000001257) #24 prdx1 (ENSMAMG00000025842) zte38 (ENSMAMG00000001169) aldh9a1b (ENSMAMG00000001113) uck2b (ENSMAMG00000001099) czib (ENSMAMG00000000880) scp2a (ENSMAMG00000000798) slc1a7a (ENSMAMG00000000752) ENSMAMG00000000744 ENSMAMG00000000686 ENSMAMG00000000675 ENSMAMG00000000658 ENSMAMG00000000652 ENSMAMG00000000645 ENSMAMG00000000574 Anabantoidei ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b 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ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Seriola ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Yellowtail amberjack MODERN SPECIES 3153 ENSSLDG00000019919 rgs5b (ENSSLDG00000019935) ENSSLDG00000019954 ENSSLDG00000019966 DDR2 (ENSSLDG00000019977) hsd17b7 (ENSSLDG00000019998) ENSSLDG00000020011 slc35d1b (ENSSLDG00000020038) mier1b (ENSSLDG00000020062) DYNLT5 (ENSSLDG00000020086) ENSSLDG00000020092 SGIP1 (ENSSLDG00000020107) PIK3R3 (ENSSLDG00000020141) IPP (ENSSLDG00000020159) TMEM69 (ENSSLDG00000020190) GPBP1L1 (ENSSLDG00000020196) #22 NASP (ENSSLDG00000020216) #24 prdx1 (ENSSLDG00000020253) zte38 (ENSSLDG00000020269) aldh9a1b (ENSSLDG00000020284) uck2b 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ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Tongue sole MODERN SPECIES 12 SLC35D1 (ENSCSEG00000010059) ENSCSEG00000010078 hsd17b7 (ENSCSEG00000010094) DDR2 (ENSCSEG00000010135) ENSCSEG00000010154 rgs5b (ENSCSEG00000010163) mier1b (ENSCSEG00000010173) dynlt5 (ENSCSEG00000010198) ENSCSEG00000010192 SGIP1 (ENSCSEG00000010221) ENSCSEG00000010252 ENSCSEG00000010276 ahsg2 (ENSCSEG00000010291) IPP (ENSCSEG00000010295) TMEM69 (ENSCSEG00000010330) GPBP1L1 (ENSCSEG00000010334) #22 NASP (ENSCSEG00000010343) #24 prdx1 (ENSCSEG00000010384) zte38 (ENSCSEG00000010576) aldh9a1b (ENSCSEG00000010595) uck2b (ENSCSEG00000010633) czib (ENSCSEG00000010756) scp2a (ENSCSEG00000010767) slc1a7a (ENSCSEG00000010776) SHISAL2A (ENSCSEG00000010787) tmem125b (ENSCSEG00000010791) LRP8 (ENSCSEG00000010835) ZBTB41 (ENSCSEG00000011395) ENSCSEG00000011419 ENSCSEG00000011428 ENSCSEG00000011446 Turbot MODERN SPECIES 19 rgs18 (ENSSMAG00000009195) ENSSMAG00000009216 rgs5b (ENSSMAG00000009228) ENSSMAG00000009237 ENSSMAG00000009254 ENSSMAG00000009286 ENSSMAG00000009311 SLC35D1 (ENSSMAG00000009325) MIER1 (ENSSMAG00000009361) ENSSMAG00000034269 DYNLT5 (ENSSMAG00000028767) SGIP1 (ENSSMAG00000009394) PIK3R3 (ENSSMAG00000009411) IPP (ENSSMAG00000009426) ENSSMAG00000029389 GPBP1L1 (ENSSMAG00000009472) #22 NASP (ENSSMAG00000009509) #24 prdx1 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ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000160185 ENSGT00940000169307 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Cyprinodontoidei ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000158056 ENSGT00940000158561.b ENSGT00940000160907.l ENSGT00550000074794 ENSGT00940000164279.a ENSGT01000000214434.F ENSGT00940000162061.a.b ENSGT00390000011644 ENSGT00940000155091.eb.b ENSGT00530000063187.B.d ENSGT00940000156906.j.a.b ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 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ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b NAME_6 ANCESTRAL SPECIES 50 ENSGT00940000158056 ENSGT00940000158561.b ENSGT00940000160907.l ENSGT00550000074794 ENSGT01000000214434.F ENSGT00940000162061.a.b ENSGT00390000011644 ENSGT00940000155091.eb.b ENSGT00530000063187.B.d ENSGT00940000156906.j.a.b ENSGT00940000169307 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b ENSGT00390000006503.a Amazon molly MODERN SPECIES 318 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ENSPREG00000004885 tmem125b (ENSPREG00000004914) LRP8 (ENSPREG00000004944) ENSPREG00000004963 ENSPREG00000004983 PGM1 (ENSPREG00000005002) Platyfish MODERN SPECIES 20 MYOC (ENSXMAG00000028903) PLPP6 (ENSXMAG00000018278) ENSXMAG00000018279 fggy (ENSXMAG00000018286) JUN (ENSXMAG00000019972) TADA1 (ENSXMAG00000018304) angptl1b (ENSXMAG00000018324) ENSXMAG00000018334 ENSXMAG00000001799 ENSXMAG00000010295 ENSXMAG00000019973 ENSXMAG00000018365 PIK3R3 (ENSXMAG00000021498) IPP (ENSXMAG00000018395) TMEM69 (ENSXMAG00000018410) GPBP1L1 (ENSXMAG00000018411) #22 NASP (ENSXMAG00000018420) #24 ENSXMAG00000026368 prdx1 (ENSXMAG00000024196) zte38 (ENSXMAG00000025684) ENSXMAG00000028773 aldh9a1b (ENSXMAG00000017862) uck2b (ENSXMAG00000023144) ENSXMAG00000020835 czib (ENSXMAG00000023272) scp2a (ENSXMAG00000010540) slc1a7a (ENSXMAG00000010563) SHISAL2A (ENSXMAG00000011024) ENSXMAG00000024763 tmem125b (ENSXMAG00000019647) LRP8 (ENSXMAG00000000915) Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000157316.e.a ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b ENSGT00390000006503.a Mangrove rivulus MODERN SPECIES 52 RGS1 (ENSKMAG00000004979) rgs18 (ENSKMAG00000004989) ENSKMAG00000005006 rgs5b (ENSKMAG00000005020) ENSKMAG00000005031 DDR2 (ENSKMAG00000005054) hsd17b7 (ENSKMAG00000005084) ENSKMAG00000005104 SLC35D1 (ENSKMAG00000005155) mier1b (ENSKMAG00000005229) DYNLT5 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(ENSNFUG00015009715) #22 ENSNFUG00015009687 #24 ENSNFUG00015009673 prdx1 (ENSNFUG00015009619) zte38 (ENSNFUG00015009562) aldh9a1b (ENSNFUG00015008589) uck2a (ENSNFUG00015008482) ENSNFUG00015008464 scp2a (ENSNFUG00015008454) SLC1A7A (ENSNFUG00015008233) ENSNFUG00015008184 LRP8 (ENSNFUG00015008152) ANGPTL3 (ENSNFUG00015008131) PGM1 (ENSNFUG00015008103) KANK4 (ENSNFUG00015008090) LEPROT (ENSNFUG00015008078) Oryzias ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000157316.e.a ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Oryzias_b ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000157316.e.a ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Javanese ricefish MODERN SPECIES 8 ABCD2 (ENSOJAG00000011409) SLC2A13 (ENSOJAG00000011394) ENSOJAG00000011367 rgs5b (ENSOJAG00000011347) ENSOJAG00000011342 DDR2 (ENSOJAG00000010795) hsd17b7 (ENSOJAG00000010747) ENSOJAG00000010738 slc35d1b (ENSOJAG00000010720) mier1b (ENSOJAG00000010471) ENSOJAG00000010437 SGIP1 (ENSOJAG00000010424) PIK3R3 (ENSOJAG00000010407) IPP (ENSOJAG00000010283) TMEM69 (ENSOJAG00000010273) GPBP1L1 (ENSOJAG00000010166) #22 NASP (ENSOJAG00000010148) #24 prdx1 (ENSOJAG00000010112) zte38 (ENSOJAG00000010102) aldh9a1b (ENSOJAG00000009770) uck2b (ENSOJAG00000009687) czib (ENSOJAG00000009648) scp2a (ENSOJAG00000008320) slc1a7a (ENSOJAG00000008112) ENSOJAG00000008037 SHISAL2A (ENSOJAG00000008021) ENSOJAG00000008006 LRP8 (ENSOJAG00000007743) ENSOJAG00000007699 ENSOJAG00000007689 PGM1 (ENSOJAG00000007425) Indian medaka MODERN SPECIES 10 rgs18 (ENSOMEG00000010368) ENSOMEG00000010347 ENSOMEG00000010331 rgs5b (ENSOMEG00000010299) ENSOMEG00000010272 DDR2 (ENSOMEG00000010222) hsd17b7 (ENSOMEG00000010141) SERBP1 (ENSOMEG00000010108) SLC35D1 (ENSOMEG00000010065) mier1b (ENSOMEG00000010029) ENSOMEG00000010000 SGIP1 (ENSOMEG00000009986) PIK3R3 (ENSOMEG00000009969) IPP (ENSOMEG00000009935) TMEM69 (ENSOMEG00000009900) GPBP1L1 (ENSOMEG00000009887) #22 NASP (ENSOMEG00000009853) #24 prdx1 (ENSOMEG00000009829) zte38 (ENSOMEG00000009773) aldh9a1b (ENSOMEG00000009792) uck2b (ENSOMEG00000000238) czib (ENSOMEG00000009714) scp2a (ENSOMEG00000009665) slc1a7a (ENSOMEG00000009599) ENSOMEG00000009578 ENSOMEG00000009565 ENSOMEG00000009549 TMEM125 (ENSOMEG00000009534) LRP8 (ENSOMEG00000009513) ENSOMEG00000009475 PGM1 (ENSOMEG00000009445) Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a.c ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00940000157337.b ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000155542.b ENSGT00390000006503.a Japanese Medaka HdrR MODERN SPECIES 8 rgs18 (ENSORLG00000010916) ENSORLG00000010899 rgs5b (ENSORLG00000010887) ENSORLG00000010871 ENSORLG00000010857 HSD17B7 (ENSORLG00000010814) ENSORLG00000023634 SERBP1 (ENSORLG00000010782) slc35d1b (ENSORLG00000010746) mier1b (ENSORLG00000010703) ENSORLG00000021929 SGIP1 (ENSORLG00000010693) PIK3R3 (ENSORLG00000010655) IPP (ENSORLG00000010621) TMEM69 (ENSORLG00000010592) GPBP1L1 (ENSORLG00000010584) #22 NASP (ENSORLG00000010548) #24 prdx1 (ENSORLG00000010533) zte38 (ENSORLG00000010523) aldh9a1b (ENSORLG00000010514) uck2b (ENSORLG00000010485) czib (ENSORLG00000010467) scp2a (ENSORLG00000010459) ENSORLG00000030415 slc1a7a 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(ENSSPAG00000004026) SHISAL2A (ENSSPAG00000004064) ENSSPAG00000004086 tmem125b (ENSSPAG00000004092) ENSSPAG00000004161 ENSSPAG00000004678 ANGPTL3 (ENSSPAG00000004742) PGM1 (ENSSPAG00000004794) Cichlidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00940000166298 ENSGT00940000165058.b ENSGT00940000164081.a ENSGT00510000046975.a ENSGT00940000154842.a.b.f ENSGT00390000013340.c ENSGT00520000055591.a.b ENSGT00940000155665.b ENSGT01030000234573.A.b.a ENSGT00940000169307 ENSGT00940000160185 ENSGT00940000156301.a.b ENSGT00940000156259.a.b ENSGT00940000158629 ENSGT00390000015318.a ENSGT00420000029753.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01020000230412.A.c.b.c.b ENSGT00390000001523 ENSGT00940000154327.a ENSGT00940000156073.c.a.b ENSGT00940000161304.a.b ENSGT00940000176936 ENSGT00390000003015.d ENSGT00940000154819.a.a.b ENSGT00940000158468.a.a ENSGT00940000156746.b ENSGT00940000155542.b Pseudocrenilabrinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000166298 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Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000156450.d.c ENSGT00940000160247 ENSGT00940000158038.c.b.e ENSGT00390000013502.a.b.a ENSGT00940000158056.w.a ENSGT00940000158561.b.b ENSGT00940000164279.a.d ENSGT00940000162061.a.b.a ENSGT00390000011644.f ENSGT00940000155091.eb.b.e ENSGT00530000063187.B.d.c ENSGT00940000156906.j.a.b.f ENSGT00390000008608.w ENSGT00940000156259.a.b.c ENSGT00390000015318.a.b ENSGT00420000029753.b.`b.a #22 ENSGT00940000174970 ENSGT00940000154277.a.j ENSGT01100000263505.b.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000165396.B.a ENSGT01100000263505.a.i ENSGT01030000234576.D.a.a.b.a.a.b.a.b.b.a.a.b ENSGT00940000157535.m.b.b ENSGT00390000012496.b.g.c ENSGT00390000014633.e ENSGT00940000155451.ab.b ENSGT00390000010993.t ENSGT00950000182933.C.i.h ENSGT00940000160923.i.a ENSGT00950000182966.C.b.a.g ENSGT00940000166346.d Chinook salmon MODERN SPECIES 20 c8b (ENSOTSG00005016744) dab1b (ENSOTSG00005016742) ENSOTSG00005016739 ENSOTSG00005016305 ENSOTSG00005016299 MYOC (ENSOTSG00005016298) 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(ENSOMYG00000044369) Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT01000000214434.F ENSGT00940000162061.a.b.b ENSGT00390000011644.e ENSGT00940000155091.eb.b.f ENSGT00530000063187.B.d.d ENSGT00940000156906.j.a.b.e ENSGT00390000008608.x ENSGT00940000172254 ENSGT00530000063347.A.a ENSGT00950000183104.B.a.a ENSGT00550000074917.c ENSGT00950000182879.a.b.a.a.b.b.a.a ENSGT00940000156259.a.b.d ENSGT00940000158629.a ENSGT00390000015318.a.a ENSGT00420000029753.b.`b.b #22 ENSGT00390000016650.c.b #24 ENSGT00940000154277.a.i ENSGT00390000018130.b ENSGT00940000166372 ENSGT01100000263505.b.b.a.b.a.b.a ENSGT00940000165396.B.a ENSGT00940000157535.m.b.a ENSGT01000000217833 ENSGT00390000012496.b.g.d ENSGT00390000014633.f ENSGT00940000155451.ab.a ENSGT00390000010993.s ENSGT00950000182933.C.i.g ENSGT01100000263516.a.b.b.b.b.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000160923.i.b Huchen MODERN SPECIES 1941 grpel1 (ENSHHUG00000020920) tada2b (ENSHHUG00000020927) ccdc96 (ENSHHUG00000020936) ENSHHUG00000020943 ENSHHUG00000020961 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ENSGT00940000155496.a.a ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Neopterygii ANCESTRAL SPECIES 108 ENSGT00390000009578 ENSGT00390000017443 ENSGT00940000162045 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000014771.b.b ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000183297 ENSGT00510000051272 ENSGT00660000097043 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.a.a ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b Osteoglossocephalai ANCESTRAL SPECIES 672 ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739.d ENSGT00390000014771.b.b Clupeocephala ANCESTRAL SPECIES 636 ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739.d ENSGT00940000157368.n Euteleosteomorpha ANCESTRAL SPECIES 359 ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739.d ENSGT00390000014771.b.b ENSGT00940000157368.n ENSGT00990000209747 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c.b Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00940000153391.c.b.a.j.b ENSGT00930000151016 ENSGT00940000155742.a.a ENSGT01030000234582.f.b.b.b ENSGT00940000154412.A ENSGT00390000003837 ENSGT00940000157703 ENSGT00390000014940 ENSGT00940000159206.a ENSGT00940000157199 ENSGT00940000166580 ENSGT00390000011084 ENSGT00940000154938 ENSGT00390000016002.o.b ENSGT00390000016543.d ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739.d ENSGT00390000014771.b.b ENSGT00940000157368.n ENSGT00940000155674.oc ENSGT00950000183297 ENSGT00510000051272 ENSGT00660000097043 ENSGT00990000209747 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c.b ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b ENSGT00940000159168 Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 1259 ENSGT00390000016543.d ENSGT00940000160024.c.b ENSGT00420000029753.a ##22 Huchen MODERN SPECIES 2942 AJM1 (ENSHHUG00000044432) ENSHHUG00000044406 ENSHHUG00000044388 ##22 Salmoninae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000154412.A 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ENSGT00940000160287 Coho salmon MODERN SPECIES 15 CTXN3 (ENSOKIG00005042427) mogat3b (ENSOKIG00005042432) prrc1 (ENSOKIG00005042459) megf10 (ENSOKIG00005042575) ENSOKIG00005043391 ENSOKIG00005043415 C5orf63 (ENSOKIG00005043460) ENSOKIG00005043479 lmnb1 (ENSOKIG00005043507) ENSOKIG00005043571 phax (ENSOKIG00005043587) aldh7a1 (ENSOKIG00005043685) RABL6 (ENSOKIG00005044255) AJM1 (ENSOKIG00005044270) ENSOKIG00005044278 GPBP1 (ENSOKIG00005044304) ##22 ENSOKIG00005044334 PLK2 (ENSOKIG00005044356) ENSOKIG00005044514 RAB3C (ENSOKIG00005044520) PDE4D (ENSOKIG00005044709) DEPDC1B (ENSOKIG00005047029) ELOVL7 (ENSOKIG00005047088) ubxn8 (ENSOKIG00005047095) ppp2cb (ENSOKIG00005047099) ENSOKIG00005047102 PURG (ENSOKIG00005047107) WRN (ENSOKIG00005047120) nrg1 (ENSOKIG00005047199) ENSOKIG00005047503 ENSOKIG00005047569 Chinook salmon MODERN SPECIES 12 CTXN3 (ENSOTSG00005046485) prrc1 (ENSOTSG00005046484) megf10 (ENSOTSG00005046378) ENSOTSG00005046377 ENSOTSG00005046375 ENSOTSG00005046374 C5orf63 (ENSOTSG00005046372) ENSOTSG00005046371 lmnb1 (ENSOTSG00005046370) ENSOTSG00005046369 phax (ENSOTSG00005046368) aldh7a1 (ENSOTSG00005046205) RABL6 (ENSOTSG00005046199) AJM1 (ENSOTSG00005046197) ENSOTSG00005046195 ENSOTSG00005046194 ##22 ENSOTSG00005046193 PLK2 (ENSOTSG00005046191) ENSOTSG00005046190 hmgcs1 (ENSOTSG00005046187) tln1 (ENSOTSG00005045623) tpm2 (ENSOTSG00005045366) ENSOTSG00005045365 zgc:114200 (ENSOTSG00005045364) ENSOTSG00005045363 dcp2 (ENSOTSG00005045362) reep5 (ENSOTSG00005045361) chd1 (ENSOTSG00005043592) ENSOTSG00005043570 st8sia4 (ENSOTSG00005043569) ENSOTSG00005043568 Salmo ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000003837 ENSGT00940000157703 ENSGT00980000199984.B ENSGT00950000182977.B.b.b.c.b.b ENSGT01000000216166.A.b.a.a ENSGT00980000199984.A ENSGT00390000014940 ENSGT00940000159206.a ENSGT00940000157199 ENSGT00940000159103.j ENSGT00390000011084 ENSGT00940000154938 ENSGT00390000016002.o.b ENSGT00390000016543.d ENSGT00940000160024.c.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT01100000264154.b ENSGT00940000158739.d ENSGT01030000235757 ENSGT00940000157368.n ENSGT00940000155674.oc.a ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c.b ENSGT00390000018326 ENSGT00550000074618.a.b.e ENSGT00390000006260 ENSGT00950000183162.b.e ENSGT00940000159168 ENSGT00940000157326 ENSGT01020000230338.a.b.b.a.b.a.a.a.a.a.b ENSGT00940000160287 Atlantic salmon MODERN SPECIES ENSSSAG00000096569 ENSSSAG00000121907 ENSSSAG00000112526 ENSSSAG00000034728 ENSSSAG00000115263 ENSSSAG00000034837 cssa01h5orf63 (ENSSSAG00000111101) marchf3 (ENSSSAG00000035308) lmnb1 (ENSSSAG00000035636) ENSSSAG00000084128 phax (ENSSSAG00000036313) aldh7a1 (ENSSSAG00000036762) ENSSSAG00000039451 ENSSSAG00000039470 ENSSSAG00000039483 GPBP1 (ENSSSAG00000039520) ##22 PLK2 (ENSSSAG00000039671) ENSSSAG00000040736 RAB3C (ENSSSAG00000000378) PDE4D (ENSSSAG00000040888) DEPDC1B (ENSSSAG00000041603) ELOVL7 (ENSSSAG00000041651) ubxn8 (ENSSSAG00000041707) PP2AB (ENSSSAG00000041727) ENSSSAG00000114490 purg (ENSSSAG00000112054) WRN (ENSSSAG00000041819) nrg1 (ENSSSAG00000097705) ENSSSAG00000043816 fut10 (ENSSSAG00000102606) fut10 (ENSSSAG00000082882) River trout MODERN SPECIES 15 prrc1 (ENSSTUG00000019340) megf10 (ENSSTUG00000019475) ENSSTUG00000002922 ENSSTUG00000003174 ENSSTUG00000003394 ENSSTUG00000004038 C5orf63 (ENSSTUG00000004493) ENSSTUG00000004671 lmnb1 (ENSSTUG00000004681) ENSSTUG00000004700 phax (ENSSTUG00000004709) aldh7a1 (ENSSTUG00000004751) RABL6 (ENSSTUG00000006036) AJM1 (ENSSTUG00000006053) ENSSTUG00000006059 ENSSTUG00000006088 ##22 ENSSTUG00000006110 RAB3C (ENSSTUG00000006118) PLK2 (ENSSTUG00000006151) ENSSTUG00000006264 PDE4D (ENSSTUG00000006283) DEPDC1B (ENSSTUG00000006866) ELOVL7 (ENSSTUG00000006917) ubxn8 (ENSSTUG00000006928) ppp2cb (ENSSTUG00000006937) ENSSTUG00000006963 PURG (ENSSTUG00000006971) WRN (ENSSTUG00000006995) nrg1 (ENSSTUG00000007628) ENSSTUG00000007724 ENSSTUG00000007740 Northern pike MODERN SPECIES 13 fbxw2 (ENSELUG00000018951) slc12a2 (ENSELUG00000018889) mogat3b (ENSELUG00000018837) CTXN3 (ENSELUG00000018841) prrc1 (ENSELUG00000018828) megf10 (ENSELUG00000018795) C5orf63 (ENSELUG00000018730) ENSELUG00000018683 lmnb1 (ENSELUG00000018632) ENSELUG00000018609 phax (ENSELUG00000018603) aldh7a1 (ENSELUG00000018557) RABL6 (ENSELUG00000018426) ENSELUG00000030177 AJM1 (ENSELUG00000018386) GPBP1 (ENSELUG00000000776) ##22 PLK2 (ENSELUG00000000772) ENSELUG00000018337 RAB3C (ENSELUG00000032387) PDE4D (ENSELUG00000018270) DEPDC1B (ENSELUG00000018041) ELOVL7 (ENSELUG00000018023) ubxn8 (ENSELUG00000017992) ppp2cb (ENSELUG00000017918) ENSELUG00000017873 PURG (ENSELUG00000017851) WRN (ENSELUG00000017817) nrg1 (ENSELUG00000017711) fut10 (ENSELUG00000017684) ins (ENSELUG00000017617) ENSELUG00000017662 Spotted gar MODERN SPECIES 658 paqr3b (ENSLOCG00000007313) bmp2k (ENSLOCG00000007340) fras1 (ENSLOCG00000007363) mrpl1 (ENSLOCG00000007408) cnot6l (ENSLOCG00000007420) zgc:114200 (ENSLOCG00000007436) ENSLOCG00000007450 ENSLOCG00000007469 ENSLOCG00000007481 ENSLOCG00000007496 ENSLOCG00000007511 mrps36 (ENSLOCG00000007526) pdxp (ENSLOCG00000007538) SETD9 (ENSLOCG00000007551) mier3b (ENSLOCG00000007562) GPBP1 (ENSLOCG00000007574) ##22 plk2b (ENSLOCG00000007594) si:dkey-190g11.3 (ENSLOCG00000007623) rab3c (ENSLOCG00000007639) PDE4D (ENSLOCG00000007665) ENSLOCG00000017532 ENSLOCG00000007689 ENSLOCG00000007701 DEPDC1B (ENSLOCG00000007713) elovl7a (ENSLOCG00000007727) ercc8 (ENSLOCG00000007753) ndufaf2 (ENSLOCG00000007769) SMIM15 (ENSLOCG00000017533) ZSWIM6 (ENSLOCG00000007783) ENSLOCG00000007803 kif2a (ENSLOCG00000007823) Reedfish MODERN SPECIES 15 nrg1 (ENSECRG00000007677) fut10 (ENSECRG00000007688) PSD3 (ENSECRG00000007698) ENSECRG00000007708 ENSECRG00000007717 slc38a9 (ENSECRG00000007731) ddx4 (ENSECRG00000007753) ENSECRG00000007804 atp5mc3a (ENSECRG00000007829) ENSECRG00000007843 IL6ST (ENSECRG00000007862) ANKRD55 (ENSECRG00000007913) MAP3K1 (ENSECRG00000008003) SETD9 (ENSECRG00000008034) mier3b (ENSECRG00000008038) 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ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Coelacanth MODERN SPECIES 1780 MAP3K1 (ENSLACG00000007337) SETD9 (ENSLACG00000005919) MIER3 (ENSLACG00000005155) GPBP1 (ENSLACG00000001727) ##22 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000183297 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Amniota ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Mammalia ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159928 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 Theria ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00940000178250 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b 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ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00660000097043 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000157838.jb.b ENSGT00940000159154 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ENSGT00940000166869.a ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b Polar bear MODERN SPECIES 173 GPX8 (ENSUMAG00000009983) MCIDAS (ENSUMAG00000009979) DHX29 (ENSUMAG00000009971) MTREX (ENSUMAG00000009373) PLPP1 (ENSUMAG00000009322) ENSUMAG00000009320 SLC38A9 (ENSUMAG00000009309) DDX4 (ENSUMAG00000009291) IL31RA (ENSUMAG00000009184) IL6ST (ENSUMAG00000009177) ANKRD55 (ENSUMAG00000009149) ENSUMAG00000009135 MAP3K1 (ENSUMAG00000009059) SETD9 (ENSUMAG00000009051) MIER3 (ENSUMAG00000009049) GPBP1 (ENSUMAG00000009045) ##22 ACTBL2 (ENSUMAG00000009043) ENSUMAG00000009033 GAPT (ENSUMAG00000009032) RAB3C (ENSUMAG00000009017) ENSUMAG00000008990 PDE4D (ENSUMAG00000008988) ENSUMAG00000008976 ENSUMAG00000008962 DEPDC1B (ENSUMAG00000008922) ELOVL7 (ENSUMAG00000008913) ERCC8 (ENSUMAG00000008905) ENSUMAG00000008897 NDUFAF2 (ENSUMAG00000008892) SMIM15 (ENSUMAG00000008886) ZSWIM6 (ENSUMAG00000008851) American black bear MODERN SPECIES 1771 GPBP1 (ENSUAMG00000011362) ##22 ENSUAMG00000011365 Giant Panda MODERN SPECIES 13 MCIDAS (ENSAMEG00000009445) CCNO (ENSAMEG00000009442) ENSAMEG00000029744 DHX29 (ENSAMEG00000013838) MTREX (ENSAMEG00000013856) PLPP1 (ENSAMEG00000013923) SLC38A9 (ENSAMEG00000013926) DDX4 (ENSAMEG00000013960) IL31RA (ENSAMEG00000003578) IL6ST (ENSAMEG00000003582) ANKRD55 (ENSAMEG00000003651) ENSAMEG00000024978 MAP3K1 (ENSAMEG00000003644) SETD9 (ENSAMEG00000003650) MIER3 (ENSAMEG00000003653) GPBP1 (ENSAMEG00000003700) ##22 ACTBL2 (ENSAMEG00000024846) PLK2 (ENSAMEG00000003614) GAPT (ENSAMEG00000019221) RAB3C (ENSAMEG00000003602) ENSAMEG00000025045 PDE4D (ENSAMEG00000003551) DEPDC1B (ENSAMEG00000004311) ELOVL7 (ENSAMEG00000004294) ERCC8 (ENSAMEG00000004246) NDUFAF2 (ENSAMEG00000004243) ENSAMEG00000018913 SMIM15 (ENSAMEG00000018903) ZSWIM6 (ENSAMEG00000004216) ENSAMEG00000007287 KIF2A (ENSAMEG00000004156) Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 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(ENSNVIG00000008815) GPBP1 (ENSNVIG00000008720) ##22 ENSNVIG00000008711 ACTBL2 (ENSNVIG00000008701) PLK2 (ENSNVIG00000008640) GAPT (ENSNVIG00000008627) RAB3C (ENSNVIG00000008595) PDE4D (ENSNVIG00000008370) DEPDC1B (ENSNVIG00000008253) ELOV7 (ENSNVIG00000008194) ERCC8 (ENSNVIG00000008166) MIMIT (ENSNVIG00000008147) SMIM15 (ENSNVIG00000008139) ENSNVIG00000008125 ZSWIM6 (ENSNVIG00000008078) KIF2A (ENSNVIG00000007941) DIMT1 (ENSNVIG00000007887) Ferret MODERN SPECIES 175 GPX8 (ENSMPUG00000007679) MCIDAS (ENSMPUG00000007663) CCNO (ENSMPUG00000007657) DHX29 (ENSMPUG00000007636) MTREX (ENSMPUG00000007619) SLC38A9 (ENSMPUG00000007611) DDX4 (ENSMPUG00000007596) IL31RA (ENSMPUG00000007550) IL6ST (ENSMPUG00000007532) ENSMPUG00000007526 ANKRD55 (ENSMPUG00000007513) MAP3K1 (ENSMPUG00000007493) SETD9 (ENSMPUG00000007469) MIER3 (ENSMPUG00000007453) ENSMPUG00000007449 GPBP1 (ENSMPUG00000007439) ##22 ENSMPUG00000007431 PLK2 (ENSMPUG00000007421) RAB3C (ENSMPUG00000007411) PDE4D (ENSMPUG00000007399) ENSMPUG00000007391 ENSMPUG00000007388 DEPDC1B (ENSMPUG00000007378) ELOVL7 (ENSMPUG00000007367) ERCC8 (ENSMPUG00000007355) SMIM15 (ENSMPUG00000020042) ZSWIM6 (ENSMPUG00000007188) ENSMPUG00000007162 DIMT1 (ENSMPUG00000007145) IPO11 (ENSMPUG00000007026) ENSMPUG00000007021 Canidae ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT01050000245142.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00940000153336.j ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT01050000245142.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00940000153336.j ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Dingo MODERN SPECIES 41 CCNO (ENSCAFG00020024748) DHX29 (ENSCAFG00020024395) MTREX (ENSCAFG00020024352) ENSCAFG00020024350 PLPP1 (ENSCAFG00020024348) ENSCAFG00020024343 SLC38A9 (ENSCAFG00020024304) DDX4 (ENSCAFG00020024295) IL31RA (ENSCAFG00020024266) ENSCAFG00020024263 IL6ST (ENSCAFG00020024000) ANKRD55 (ENSCAFG00020023981) MAP3K1 (ENSCAFG00020023953) SETD9 (ENSCAFG00020023949) MIER3 (ENSCAFG00020023939) GPBP1 (ENSCAFG00020023933) ##22 ACTBL2 (ENSCAFG00020023927) ENSCAFG00020023925 ENSCAFG00020023923 PLK2 (ENSCAFG00020023920) GAPT (ENSCAFG00020023918) RAB3C (ENSCAFG00020023917) ENSCAFG00020023916 PDE4D (ENSCAFG00020023895) ENSCAFG00020023880 ENSCAFG00020023875 ENSCAFG00020023873 ENSCAFG00020023868 ENSCAFG00020023865 ENSCAFG00020023858 DEPDC1B (ENSCAFG00020023842) Dog MODERN SPECIES 11 MCIDAS (ENSCAFG00845026568) CCNO (ENSCAFG00845026622) DHX29 (ENSCAFG00845026675) MTREX (ENSCAFG00845027076) PLPP1 (ENSCAFG00845027433) ENSCAFG00845027553 SLC38A9 (ENSCAFG00845027599) ENSCAFG00845027734 IL31RA (ENSCAFG00845027862) ENSCAFG00845028281 IL6ST (ENSCAFG00845028368) ANKRD55 (ENSCAFG00845028592) MAP3K1 (ENSCAFG00845028679) SETD9 (ENSCAFG00845028740) MIER3 (ENSCAFG00845028806) GPBP1 (ENSCAFG00845029009) ##22 ACTBL2 (ENSCAFG00845029066) PLK2 (ENSCAFG00845029116) ENSCAFG00845029213 RAB3C (ENSCAFG00845006867) PDE4D (ENSCAFG00845007091) ENSCAFG00845007426 DEPDC1B (ENSCAFG00845007512) ELOVL7 (ENSCAFG00845007620) ERCC8 (ENSCAFG00845007681) NDUFAF2 (ENSCAFG00845007756) ENSCAFG00845007797 ENSCAFG00845007882 ZSWIM6 (ENSCAFG00845007959) KIF2A (ENSCAFG00845008357) ENSCAFG00845008802 Red fox MODERN SPECIES 4 DHX29 (ENSVVUG00000021328) MTREX (ENSVVUG00000021337) ENSVVUG00000021349 PLPP1 (ENSVVUG00000021353) SLC38A9 (ENSVVUG00000021357) ENSVVUG00000021361 DDX4 (ENSVVUG00000021369) ENSVVUG00000021400 ENSVVUG00000021408 IL6ST (ENSVVUG00000021415) ANKRD55 (ENSVVUG00000021427) ENSVVUG00000021432 MAP3K1 (ENSVVUG00000021439) SETD9 (ENSVVUG00000021441) MIER3 (ENSVVUG00000021443) GPBP1 (ENSVVUG00000021451) ##22 ACTBL2 (ENSVVUG00000021457) ENSVVUG00000021458 PLK2 (ENSVVUG00000021496) GAPT (ENSVVUG00000021709) RAB3C (ENSVVUG00000021713) ENSVVUG00000021726 PDE4D (ENSVVUG00000021728) ENSVVUG00000000147 ENSVVUG00000000189 ENSVVUG00000000336 DEPDC1B (ENSVVUG00000000387) ELOVL7 (ENSVVUG00000000433) ERCC8 (ENSVVUG00000000470) NDUFAF2 (ENSVVUG00000000524) SMIM15 (ENSVVUG00000000544) Felidae ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000184991 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.m.a.a ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Panthera ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b 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ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.m.a.a.a ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 lion MODERN SPECIES DHX29 (ENSPLOG00000008419) MTREX (ENSPLOG00000008258) PLPP1 (ENSPLOG00000008169) SLC38A9 (ENSPLOG00000007994) DDX4 (ENSPLOG00000007635) IL31RA (ENSPLOG00000007473) IL6ST (ENSPLOG00000007395) ENSPLOG00000007349 ANKRD55 (ENSPLOG00000007267) ENSPLOG00000007232 MAP3K1 (ENSPLOG00000007149) SETD9 (ENSPLOG00000007094) MIER3 (ENSPLOG00000007021) ENSPLOG00000006987 ENSPLOG00000006972 GPBP1 (ENSPLOG00000006820) ##22 ACTBL2 (ENSPLOG00000006775) PLK2 (ENSPLOG00000006685) GAPT (ENSPLOG00000006653) RAB3C (ENSPLOG00000006626) PDE4D (ENSPLOG00000006489) DEPDC1B (ENSPLOG00000006315) ELOVL7 (ENSPLOG00000006251) ERCC8 (ENSPLOG00000006152) NDUFAF2 (ENSPLOG00000006087) ENSPLOG00000006079 ZSWIM6 (ENSPLOG00000006054) KIF2A (ENSPLOG00000006009) DIMT1 (ENSPLOG00000005930) ENSPLOG00000005901 IPO11 (ENSPLOG00000005827) leopard MODERN SPECIES 63 GPX8 (ENSPPRG00000023333) MCIDAS (ENSPPRG00000023741) CCNO (ENSPPRG00000023872) DHX29 (ENSPPRG00000024000) MTREX (ENSPPRG00000019701) PLPP1 (ENSPPRG00000016093) SLC38A9 (ENSPPRG00000013047) DDX4 (ENSPPRG00000011417) IL31RA (ENSPPRG00000006813) IL6ST (ENSPPRG00000005507) ENSPPRG00000003754 ANKRD55 (ENSPPRG00000003671) MAP3K1 (ENSPPRG00000001640) SETD9 (ENSPPRG00000001377) MIER3 (ENSPPRG00000000817) GPBP1 (ENSPPRG00000024025) ##22 ACTBL2 (ENSPPRG00000021605) PLK2 (ENSPPRG00000017648) GAPT (ENSPPRG00000021514) RAB3C (ENSPPRG00000015469) PDE4D (ENSPPRG00000013829) ENSPPRG00000007512 DEPDC1B (ENSPPRG00000007174) ELOVL7 (ENSPPRG00000006864) ERCC8 (ENSPPRG00000006054) NDUFAF2 (ENSPPRG00000005776) ENSPPRG00000021285 ZSWIM6 (ENSPPRG00000005161) KIF2A (ENSPPRG00000004723) DIMT1 (ENSPPRG00000002058) IPO11 (ENSPPRG00000000856) Tiger MODERN SPECIES 134 CDC20B (ENSPTIG00000010212) MCIDAS (ENSPTIG00000010130) CCNO (ENSPTIG00000010029) DHX29 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ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Equus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 Donkey MODERN SPECIES CDC20B 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ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Megabat MODERN SPECIES 6472 GPBP1 (ENSPVAG00000010178) ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Microbat DUPLICATION Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 1248 NR2C2AP (ENSMLUG00000017355) NCAN (ENSMLUG00000017356) HAPLN4 (ENSMLUG00000017358) TM6SF2 (ENSMLUG00000027634) SUGP1 (ENSMLUG00000017360) MAU2 (ENSMLUG00000017362) GATAD2A (ENSMLUG00000017364) TSSK6 (ENSMLUG00000017365) NDUFA13 (ENSMLUG00000017367) YJEFN3 (ENSMLUG00000017368) CILP2 (ENSMLUG00000017369) LPAR2 (ENSMLUG00000007886) GMIP (ENSMLUG00000023678) ATP13A1 (ENSMLUG00000007903) LPL (ENSMLUG00000000724) ENSMLUG00000026606 ##22 Microbat MODERN SPECIES 1019 ZNF236 (ENSMLUG00000011089) ZNF516 (ENSMLUG00000003250) TSHZ1 (ENSMLUG00000000305) PTGR3 (ENSMLUG00000000306) ZNF407 (ENSMLUG00000001226) CNDP1 (ENSMLUG00000002726) CNDP2 (ENSMLUG00000002721) DIPK1C (ENSMLUG00000029517) C18orf63 (ENSMLUG00000028665) CYB5A (ENSMLUG00000011462) TIMM21 (ENSMLUG00000011440) FBXO15 (ENSMLUG00000011427) NETO1 (ENSMLUG00000010614) CBLN2 (ENSMLUG00000004727) ENSMLUG00000022821 ENSMLUG00000022614 ##22 ENSMLUG00000015784 SOCS6 (ENSMLUG00000006873) RTTN (ENSMLUG00000008228) ENSMLUG00000026202 CD226 (ENSMLUG00000008219) DOK6 (ENSMLUG00000008202) Microbat MODERN SPECIES 2035 ENSMLUG00000007462 ##22 Greater horseshoe bat DUPLICATION Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 21 ENSRFEG00010005704 DST (ENSRFEG00010006031) BEND6 (ENSRFEG00010006418) ENSRFEG00010006462 ZNF451 (ENSRFEG00010006493) BAG2 (ENSRFEG00010006575) RAB23 (ENSRFEG00010006611) PRIM2 (ENSRFEG00010006678) ENSRFEG00010006718 ENSRFEG00010006743 KHDRBS2 (ENSRFEG00010006772) LGSN (ENSRFEG00010006854) ENSRFEG00010006996 PTP4A1 (ENSRFEG00010007023) PHF3 (ENSRFEG00010007114) ENSRFEG00010008144 ##22 ADGRB3 (ENSRFEG00010008203) LMBRD1 (ENSRFEG00010008627) ENSRFEG00010008697 COL19A1 (ENSRFEG00010008757) COL9A1 (ENSRFEG00010009212) FAM135A (ENSRFEG00010009732) SDHAF4 (ENSRFEG00010010023) SMAP1 (ENSRFEG00010010074) B3GAT2 (ENSRFEG00010010262) OGFRL1 (ENSRFEG00010010417) RIMS1 (ENSRFEG00010010803) KCNQ5 (ENSRFEG00010012334) ENSRFEG00010014111 DPPA5 (ENSRFEG00010014186) ENSRFEG00010014247 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 25 CDC20B (ENSRFEG00010010612) GPX8 (ENSRFEG00010011132) MCIDAS (ENSRFEG00010011223) CCNO (ENSRFEG00010011344) DHX29 (ENSRFEG00010011420) MTREX (ENSRFEG00010011497) PLPP1 (ENSRFEG00010011593) SLC38A9 (ENSRFEG00010011664) DDX4 (ENSRFEG00010011980) IL31RA (ENSRFEG00010013055) IL6ST (ENSRFEG00010013742) ANKRD55 (ENSRFEG00010013992) MAP3K1 (ENSRFEG00010014430) SETD9 (ENSRFEG00010014496) MIER3 (ENSRFEG00010014589) GPBP1 (ENSRFEG00010014775) ##22 ACTBL2 (ENSRFEG00010015171) PLK2 (ENSRFEG00010015198) GAPT (ENSRFEG00010015469) RAB3C (ENSRFEG00010015492) ENSRFEG00010015544 PDE4D (ENSRFEG00010015613) ENSRFEG00010016321 DEPDC1B (ENSRFEG00010016346) ELOVL7 (ENSRFEG00010016427) ERCC8 (ENSRFEG00010016548) ENSRFEG00010016642 SMIM15 (ENSRFEG00010016747) ZSWIM6 (ENSRFEG00010016771) KIF2A (ENSRFEG00010016976) ENSRFEG00010017052 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Suina ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368.i ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.f ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000163637 Pig MODERN SPECIES 7 CCNO (ENSSSCG00000026849) DHX29 (ENSSSCG00000016907) MTREX (ENSSSCG00000016911) ENSSSCG00000062846 PLPP1 (ENSSSCG00000016912) ENSSSCG00000047477 SLC38A9 (ENSSSCG00000030343) DDX4 (ENSSSCG00000016913) IL31RA (ENSSSCG00000016915) IL6ST (ENSSSCG00000016916) ANKRD55 (ENSSSCG00000016917) ENSSSCG00000038692 MAP3K1 (ENSSSCG00000016918) SETD9 (ENSSSCG00000016919) MIER3 (ENSSSCG00000016920) GPBP1 (ENSSSCG00000016922) ##22 ENSSSCG00000048073 ACTBL2 (ENSSSCG00000016923) PLK2 (ENSSSCG00000016925) GAPT (ENSSSCG00000035276) RAB3C (ENSSSCG00000031796) PDE4D (ENSSSCG00000016929) ENSSSCG00000058828 ENSSSCG00000046737 ENSSSCG00000055745 DEPDC1B (ENSSSCG00000057381) ELOVL7 (ENSSSCG00000035012) ERCC8 (ENSSSCG00000016934) NDUFAF2 (ENSSSCG00000053180) ENSSSCG00000033814 ZSWIM6 (ENSSSCG00000025194) Chacoan peccary MODERN SPECIES 98 GPX8 (ENSCWAG00000000975) CDC20B (ENSCWAG00000000806) MCIDAS (ENSCWAG00000000761) CCNO (ENSCWAG00000000746) DHX29 (ENSCWAG00000000659) MTREX (ENSCWAG00000000555) PLPP1 (ENSCWAG00000000526) SLC38A9 (ENSCWAG00000000430) DDX4 (ENSCWAG00000000161) IL31RA (ENSCWAG00000000020) IL6ST (ENSCWAG00000004021) ANKRD55 (ENSCWAG00000003831) MAP3K1 (ENSCWAG00000003748) SETD9 (ENSCWAG00000003704) MIER3 (ENSCWAG00000003642) GPBP1 (ENSCWAG00000003618) ##22 ACTBL2 (ENSCWAG00000003609) PLK2 (ENSCWAG00000003584) GAPT (ENSCWAG00000003574) ENSCWAG00000003565 ENSCWAG00000003560 PDE4D (ENSCWAG00000003420) DEPDC1B (ENSCWAG00000003357) ELOVL7 (ENSCWAG00000003321) ERCC8 (ENSCWAG00000003294) NDUFAF2 (ENSCWAG00000003278) SMIM15 (ENSCWAG00000003271) ZSWIM6 (ENSCWAG00000003254) KIF2A (ENSCWAG00000003225) DIMT1 (ENSCWAG00000003201) ENSCWAG00000003185 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 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Blue whale MODERN SPECIES 14 CCNO (ENSBMSG00010005327) DHX29 (ENSBMSG00010005343) ENSBMSG00010005373 PLPP1 (ENSBMSG00010005419) SLC38A9 (ENSBMSG00010005443) DDX4 (ENSBMSG00010005616) ENSBMSG00010005776 ENSBMSG00010005786 ENSBMSG00010005820 ANKRD55 (ENSBMSG00010005861) MAP3K1 (ENSBMSG00010005939) SETD9 (ENSBMSG00010006020) MIER3 (ENSBMSG00010006049) ENSBMSG00010006071 ENSBMSG00010006086 GPBP1 (ENSBMSG00010006123) ##22 ENSBMSG00010006190 ENSBMSG00010006229 ENSBMSG00010006263 GAPT (ENSBMSG00010006270) RAB3C (ENSBMSG00010006292) ENSBMSG00010006308 PDE4D (ENSBMSG00010006462) DEPDC1B (ENSBMSG00010006592) ELOVL7 (ENSBMSG00010006624) ERCC8 (ENSBMSG00010006676) NDUFAF2 (ENSBMSG00010006699) SMIM15 (ENSBMSG00010006717) ZSWIM6 (ENSBMSG00010006737) KIF2A (ENSBMSG00010006783) DIMT1 (ENSBMSG00010006854) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155541.C.eb.a ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00390000001055 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000014845.j.b ENSGT00390000016972.a.a.b.b.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00730000111327.b ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b Sperm whale MODERN SPECIES 19 CDC20B (ENSPCTG00005006273) GPX8 (ENSPCTG00005006513) MCIDAS (ENSPCTG00005006552) CCNO (ENSPCTG00005006575) DHX29 (ENSPCTG00005006618) MTREX (ENSPCTG00005006859) PLPP1 (ENSPCTG00005006991) SLC38A9 (ENSPCTG00005007077) DDX4 (ENSPCTG00005007231) IL6ST (ENSPCTG00005007883) ANKRD55 (ENSPCTG00005008012) MAP3K1 (ENSPCTG00005008180) SETD9 (ENSPCTG00005008333) MIER3 (ENSPCTG00005008372) ENSPCTG00005008417 GPBP1 (ENSPCTG00005008461) ##22 ENSPCTG00005008643 PLK2 (ENSPCTG00005008711) GAPT (ENSPCTG00005009118) RAB3C (ENSPCTG00005009140) ENSPCTG00005009218 PDE4D (ENSPCTG00005009332) ENSPCTG00005010095 ENSPCTG00005010102 DEPDC1B (ENSPCTG00005010156) ENSPCTG00005010219 ELOVL7 (ENSPCTG00005010318) ERCC8 (ENSPCTG00005010440) NDUFAF2 (ENSPCTG00005010591) ENSPCTG00005010642 SMIM15 (ENSPCTG00005010661) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155541.C.eb.a ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00390000001055.f ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000014845.j.b ENSGT00390000016972.a.a.b.b.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00730000111327.b ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b Dolphin MODERN SPECIES 6537 GPBP1 (ENSTTRG00000004344) ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000155541.C.eb.a ENSGT00940000157507 ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00390000001055.f ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000014845.j.b ENSGT00390000016972.a.a.b.b.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00730000111327.b ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00940000154668.rb.b ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000155541.C.eb.a ENSGT00940000157507 ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00390000001055.f ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00390000014845.j.b ENSGT00390000016972.a.a.b.b.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00730000111327.b ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00940000154668.rb.b ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b Beluga whale MODERN SPECIES 71 CCNO (ENSDLEG00000009538) DHX29 (ENSDLEG00000009482) ENSDLEG00000009445 SKIV2L2 (ENSDLEG00000009383) PLPP1 (ENSDLEG00000009350) SLC38A9 (ENSDLEG00000009277) ENSDLEG00000009260 DDX4 (ENSDLEG00000009164) IL6ST (ENSDLEG00000009072) ANKRD55 (ENSDLEG00000008801) MAP3K1 (ENSDLEG00000008628) SETD9 (ENSDLEG00000008578) MIER3 (ENSDLEG00000008535) ENSDLEG00000008493 ENSDLEG00000008483 GPBP1 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ENSMMNG00015003096 DEPDC1B (ENSMMNG00015003133) ELOVL7 (ENSMMNG00015003191) ERCC8 (ENSMMNG00015003235) NDUFAF2 (ENSMMNG00015003327) SMIM15 (ENSMMNG00015003350) ZSWIM6 (ENSMMNG00015003372) Vaquita MODERN SPECIES 14 MCIDAS (ENSPSNG00000009107) CCNO (ENSPSNG00000009072) DHX29 (ENSPSNG00000009012) MTREX (ENSPSNG00000008960) PLPP1 (ENSPSNG00000008897) SLC38A9 (ENSPSNG00000008670) ENSPSNG00000008609 DDX4 (ENSPSNG00000008161) IL6ST (ENSPSNG00000007919) ENSPSNG00000007865 ANKRD55 (ENSPSNG00000007659) MAP3K1 (ENSPSNG00000007497) SETD9 (ENSPSNG00000007390) MIER3 (ENSPSNG00000007302) ENSPSNG00000007254 GPBP1 (ENSPSNG00000007173) ##22 ACTBL2 (ENSPSNG00000007125) ENSPSNG00000007100 PLK2 (ENSPSNG00000006985) GAPT (ENSPSNG00000006914) RAB3C (ENSPSNG00000006875) PDE4D (ENSPSNG00000006614) ENSPSNG00000006433 ENSPSNG00000006370 DEPDC1B (ENSPSNG00000006322) ELOVL7 (ENSPSNG00000006129) ERCC8 (ENSPSNG00000012215) NDUFAF2 (ENSPSNG00000012193) ZSWIM6 (ENSPSNG00000012031) KIF2A (ENSPSNG00000011885) DIMT1 (ENSPSNG00000011790) Pecora ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.g.a.a.b ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 17 MCIDAS (ENSCHYG00000023898) CCNO (ENSCHYG00000023862) DHX29 (ENSCHYG00000023078) MTREX (ENSCHYG00000022902) PLPP1 (ENSCHYG00000022811) SLC38A9 (ENSCHYG00000022437) ENSCHYG00000022385 DDX4 (ENSCHYG00000022343) IL31RA (ENSCHYG00000022153) IL6ST (ENSCHYG00000021849) ANKRD55 (ENSCHYG00000021687) ENSCHYG00000021592 MAP3K1 (ENSCHYG00000021347) SETD9 (ENSCHYG00000021190) MIER3 (ENSCHYG00000020709) ENSCHYG00000020266 ##22 ACTBL2 (ENSCHYG00000020222) PLK2 (ENSCHYG00000019756) ENSCHYG00000019719 ENSCHYG00000019672 ENSCHYG00000019650 ENSCHYG00000019268 ENSCHYG00000019164 ENSCHYG00000019040 ENSCHYG00000018955 ENSCHYG00000018847 ENSCHYG00000018755 ENSCHYG00000018737 ENSCHYG00000016828 ENSCHYG00000016691 ENSCHYG00000016430 Yarkand deer MODERN SPECIES 2 CDC42EP3 (ENSCHYG00000006618) QPCT (ENSCHYG00000006573) PRKD3 (ENSCHYG00000006534) NDUFAF7 (ENSCHYG00000006399) CEBPZ (ENSCHYG00000006370) CEBPZOS (ENSCHYG00000006295) SULT6B1 (ENSCHYG00000006276) EIF2AK2 (ENSCHYG00000006093) GPATCH11 (ENSCHYG00000006001) HEATR5B (ENSCHYG00000005877) ENSCHYG00000005849 STRN (ENSCHYG00000005706) VIT (ENSCHYG00000005531) ENSCHYG00000005408 CRIM1 (ENSCHYG00000005033) ENSCHYG00000004969 ##22 ENSCHYG00000004962 ENSCHYG00000004932 RASGRP3 (ENSCHYG00000022145) ENSCHYG00000022077 LTBP1 (ENSCHYG00000021234) ENSCHYG00000021142 ENSCHYG00000021113 TTC27 (ENSCHYG00000020861) BIRC6 (ENSCHYG00000019999) YIPF4 (ENSCHYG00000019901) NLRC4 (ENSCHYG00000019792) SLC30A6 (ENSCHYG00000019395) SPAST (ENSCHYG00000018191) ENSCHYG00000018039 MEMO1 (ENSCHYG00000017902) Percora_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00960000192181 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.g.b ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Siberian musk deer MODERN SPECIES 22 MCIDAS (ENSMMSG00000000277) CCNO (ENSMMSG00000000293) DHX29 (ENSMMSG00000000314) MTREX (ENSMMSG00000000381) PLPP1 (ENSMMSG00000000470) SLC38A9 (ENSMMSG00000000513) DDX4 (ENSMMSG00000000604) IL31RA (ENSMMSG00000000927) IL6ST (ENSMMSG00000001065) ENSMMSG00000001170 ENSMMSG00000001179 ENSMMSG00000001194 MAP3K1 (ENSMMSG00000001225) SETD9 (ENSMMSG00000001315) MIER3 (ENSMMSG00000001337) GPBP1 (ENSMMSG00000001371) ##22 ACTBL2 (ENSMMSG00000001416) PLK2 (ENSMMSG00000001441) GAPT (ENSMMSG00000001516) RAB3C (ENSMMSG00000001525) ENSMMSG00000001534 PDE4D (ENSMMSG00000001617) Bovidae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00960000192181 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.c ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.g.b.a ENSGT00940000155496.b Bovinae ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.c ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.g.a.a.a.b ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Bos ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00950000183198.c.a.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.c ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.g.a.a.b ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 121 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00950000183198.c.a.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.c ENSGT00940000162627 Wild yak MODERN SPECIES 903 ANKRD55 (ENSBMUG00000001200) MAP3K1 (ENSBMUG00000001265) SETD9 (ENSBMUG00000001287) MIER3 (ENSBMUG00000001310) ENSBMUG00000001323 GPBP1 (ENSBMUG00000001410) ##22 ENSBMUG00000001437 ACTBL2 (ENSBMUG00000001451) Bos_b ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT01100000263481.n.a.a.b.b.b.b.a.a.b.b ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.c ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.g.a.a.b ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 12 CCNO (ENSBIXG00005011751) ENSBIXG00005011769 DHX29 (ENSBIXG00005001183) MTREX (ENSBIXG00005011914) PLPP1 (ENSBIXG00005011965) ENSBIXG00005011978 SLC38A9 (ENSBIXG00005012214) DDX4 (ENSBIXG00005001293) IL31RA (ENSBIXG00005012353) IL6ST (ENSBIXG00005001329) ANKRD55 (ENSBIXG00005012491) MAP3K1 (ENSBIXG00005000296) SETD9 (ENSBIXG00005012763) MIER3 (ENSBIXG00005012800) ENSBIXG00005012815 GPBP1 (ENSBIXG00005001438) ##22 ENSBIXG00005001454 ACTBL2 (ENSBIXG00005001462) PLK2 (ENSBIXG00005013075) GAPT (ENSBIXG00005007710) RAB3C (ENSBIXG00005005703) ENSBIXG00005013160 PDE4D (ENSBIXG00005013419) ENSBIXG00005013502 ENSBIXG00005013524 DEPDC1B (ENSBIXG00005001652) ENSBIXG00005013580 ELOVL7 (ENSBIXG00005001659) ERCC8 (ENSBIXG00005006431) ENSBIXG00005013686 NDUFAF2 (ENSBIXG00005013703) Cow MODERN SPECIES 12 MCIDAS (ENSBTAG00000047087) CCNO (ENSBTAG00000047594) ENSBTAG00000048821 DHX29 (ENSBTAG00000010510) MTREX (ENSBTAG00000010518) PLPP1 (ENSBTAG00000010526) SLC38A9 (ENSBTAG00000033313) DDX4 (ENSBTAG00000008871) IL31RA (ENSBTAG00000004351) IL6ST (ENSBTAG00000017745) ANKRD55 (ENSBTAG00000001001) MAP3K1 (ENSBTAG00000013790) SETD9 (ENSBTAG00000013426) MIER3 (ENSBTAG00000014248) ENSBTAG00000053164 GPBP1 (ENSBTAG00000012124) ##22 ENSBTAG00000026505 ACTBL2 (ENSBTAG00000046468) PLK2 (ENSBTAG00000016771) GAPT (ENSBTAG00000016770) RAB3C (ENSBTAG00000007306) ENSBTAG00000052931 PDE4D (ENSBTAG00000000494) ENSBTAG00000051803 DEPDC1B (ENSBTAG00000017026) ENSBTAG00000049955 ELOVL7 (ENSBTAG00000007704) ERCC8 (ENSBTAG00000021606) NDUFAF2 (ENSBTAG00000021607) ENSBTAG00000053323 ZSWIM6 (ENSBTAG00000021224) American bison MODERN SPECIES 3242 SLC38A9 (ENSBBBG00000014727) DDX4 (ENSBBBG00000006951) IL31RA (ENSBBBG00000001237) IL6ST (ENSBBBG00000001001) ANKRD55 (ENSBBBG00000000905) MAP3K1 (ENSBBBG00000000840) SETD9 (ENSBBBG00000000829) MIER3 (ENSBBBG00000003636) GPBP1 (ENSBBBG00000003691) ##22 ENSBBBG00000000813 ACTBL2 (ENSBBBG00000003698) PLK2 (ENSBBBG00000003717) GAPT (ENSBBBG00000015005) RAB3C (ENSBBBG00000007173) ENSBBBG00000015021 PDE4D (ENSBBBG00000003548) DEPDC1B (ENSBBBG00000003776) ELOVL7 (ENSBBBG00000015260) ENSBBBG00000015268 ERCC8 (ENSBBBG00000003793) Caprinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286.c ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00960000192181 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT01030000234597.a.a.i.a.c ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743.o ENSGT00390000008903.g.b.a ENSGT00940000155496.b Goat MODERN SPECIES 12 GPX8 (ENSCHIG00000022755) MCIDAS (ENSCHIG00000020342) CCNO (ENSCHIG00000017129) ENSCHIG00000013568 ENSCHIG00000008951 MTREX (ENSCHIG00000024413) PLPP1 (ENSCHIG00000020725) SLC38A9 (ENSCHIG00000018284) DDX4 (ENSCHIG00000015567) IL31RA (ENSCHIG00000012832) IL6ST (ENSCHIG00000008069) ANKRD55 (ENSCHIG00000008524) MAP3K1 (ENSCHIG00000026351) SETD9 (ENSCHIG00000012396) MIER3 (ENSCHIG00000018553) GPBP1 (ENSCHIG00000009727) ##22 ENSCHIG00000023745 ACTBL2 (ENSCHIG00000006574) PLK2 (ENSCHIG00000025868) GAPT (ENSCHIG00000010671) RAB3C (ENSCHIG00000000529) PDE4D (ENSCHIG00000017295) ENSCHIG00000007320 ENSCHIG00000001049 DEPDC1B (ENSCHIG00000008856) ELOVL7 (ENSCHIG00000002685) ERCC8 (ENSCHIG00000016647) ENSCHIG00000026344 ENSCHIG00000027234 ENSCHIG00000008317 ZSWIM6 (ENSCHIG00000024877) Rambouillet Sheep DUPLICATION Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 20 TFEC (ENSOARG00020001041) MDFIC (ENSOARG00020001137) FOXP2 (ENSOARG00020001223) PPP1R3A (ENSOARG00020001807) ENSOARG00020001818 SMIM30 (ENSOARG00020001844) GPR85 (ENSOARG00020001848) BMT2 (ENSOARG00020001855) TMEM168 (ENSOARG00020001882) LSMEM1 (ENSOARG00020001907) IFRD1 (ENSOARG00020001965) ZNF277 (ENSOARG00020002033) DOCK4 (ENSOARG00020002182) IMMP2L (ENSOARG00020002972) LRRN3 (ENSOARG00020002986) ENSOARG00020002993 ##22 DNAJB9 (ENSOARG00020003016) THAP5 (ENSOARG00020003037) GPR141 (ENSOARG00020003064) ELMO1 (ENSOARG00020003116) ENSOARG00020003484 AOAH (ENSOARG00020003525) ANLN (ENSOARG00020003871) KIAA0895 (ENSOARG00020004088) EEPD1 (ENSOARG00020004192) SEPTIN7 (ENSOARG00020004276) HERPUD2 (ENSOARG00020004630) TBX20 (ENSOARG00020004800) DPY19L1 (ENSOARG00020005193) NPSR1 (ENSOARG00020005429) BMPER (ENSOARG00020005622) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 7 CDC20B (ENSOARG00020012773) MCIDAS (ENSOARG00020012677) CCNO (ENSOARG00020012617) DHX29 (ENSOARG00020012396) MTREX (ENSOARG00020011982) PLPP1 (ENSOARG00020011909) SLC38A9 (ENSOARG00020011663) DDX4 (ENSOARG00020011498) IL31RA (ENSOARG00020010588) IL6ST (ENSOARG00020010171) ENSOARG00020010060 ENSOARG00020009949 MAP3K1 (ENSOARG00020009639) SETD9 (ENSOARG00020009529) MIER3 (ENSOARG00020009384) GPBP1 (ENSOARG00020009240) ##22 ACTBL2 (ENSOARG00020009217) PLK2 (ENSOARG00020008862) GAPT (ENSOARG00020008840) RAB3C (ENSOARG00020008775) ENSOARG00020008765 PDE4D (ENSOARG00020007357) DEPDC1B (ENSOARG00020007191) ELOVL7 (ENSOARG00020007062) ERCC8 (ENSOARG00020006955) NDUFAF2 (ENSOARG00020006873) SMIM15 (ENSOARG00020006847) ZSWIM6 (ENSOARG00020006753) ENSOARG00020006726 KIF2A (ENSOARG00020006411) DIMT1 (ENSOARG00020006337) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Tree shrew MODERN SPECIES 2279 ENSTBEG00000001354 ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Rodentia ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Hystricomorpha DUPLICATION 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ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000154484.B.a.a Guinea pig MODERN SPECIES 29 MCIDAS (ENSCPOG00000024511) CCNO (ENSCPOG00000033518) DHX29 (ENSCPOG00000040097) MTREX (ENSCPOG00000009797) Plpp1 (ENSCPOG00000009814) SLC38A9 (ENSCPOG00000011733) ENSCPOG00000033206 ENSCPOG00000006916 DDX4 (ENSCPOG00000004327) IL31RA (ENSCPOG00000006477) IL6ST (ENSCPOG00000013354) ANKRD55 (ENSCPOG00000007787) MAP3K1 (ENSCPOG00000015017) SETD9 (ENSCPOG00000015025) ENSCPOG00000015027 GPBP1 (ENSCPOG00000012341) ##22 ACTBL2 (ENSCPOG00000011023) PLK2 (ENSCPOG00000021250) RAB3C (ENSCPOG00000001394) ENSCPOG00000039531 PDE4D (ENSCPOG00000004873) DEPDC1B (ENSCPOG00000011483) ELOVL7 (ENSCPOG00000037993) ENSCPOG00000035041 ENSCPOG00000009626 CRHBP (ENSCPOG00000002422) S100Z (ENSCPOG00000030952) F2RL1 (ENSCPOG00000033414) F2R (ENSCPOG00000032667) F2RL2 (ENSCPOG00000002801) IQGAP2 (ENSCPOG00000025031) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES 68 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a.l ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000154484.B.a.a ENSGT00950000182909.a Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 153 GPX8 (ENSCLAG00000008093) CDC20B (ENSCLAG00000007688) MCIDAS (ENSCLAG00000007584) CCNO (ENSCLAG00000007264) DHX29 (ENSCLAG00000007178) MTREX (ENSCLAG00000006622) PLPP1 (ENSCLAG00000006554) SLC38A9 (ENSCLAG00000006483) DDX4 (ENSCLAG00000005386) IL31RA (ENSCLAG00000006696) IL6ST (ENSCLAG00000006431) ANKRD55 (ENSCLAG00000006105) MAP3K1 (ENSCLAG00000008338) SETD9 (ENSCLAG00000008198) MIER3 (ENSCLAG00000007895) GPBP1 (ENSCLAG00000007663) ##22 ACTBL2 (ENSCLAG00000017702) PLK2 (ENSCLAG00000007849) RAB3C (ENSCLAG00000007246) PDE4D (ENSCLAG00000006363) DEPDC1B (ENSCLAG00000005223) ELOVL7 (ENSCLAG00000005072) ERCC8 (ENSCLAG00000004884) NDUFAF2 (ENSCLAG00000004493) SMIM15 (ENSCLAG00000004397) ZSWIM6 (ENSCLAG00000004297) KIF2A (ENSCLAG00000004123) DIMT1 (ENSCLAG00000004032) ENSCLAG00000003958 IPO11 (ENSCLAG00000003889) ENSCLAG00000003797 Degu MODERN SPECIES 42 CCNO (ENSODEG00000017316) DHX29 (ENSODEG00000017600) ENSODEG00000017015 MTREX (ENSODEG00000017234) PLPP1 (ENSODEG00000017162) ENSODEG00000017001 ENSODEG00000017023 ENSODEG00000016951 IL31RA (ENSODEG00000017222) IL6ST (ENSODEG00000016916) ENSODEG00000016853 ANKRD55 (ENSODEG00000017209) MAP3K1 (ENSODEG00000017328) SETD9 (ENSODEG00000016730) MIER3 (ENSODEG00000017718) GPBP1 (ENSODEG00000016954) ##22 PLK2 (ENSODEG00000016972) ENSODEG00000016930 RAB3C (ENSODEG00000016836) ENSODEG00000020417 ENSODEG00000017206 PDE4D (ENSODEG00000017385) DEPDC1B (ENSODEG00000016998) ELOVL7 (ENSODEG00000016616) ENSODEG00000017264 ERCC8 (ENSODEG00000016868) NDUFAF2 (ENSODEG00000016635) ENSODEG00000020436 ZSWIM6 (ENSODEG00000016625) ENSODEG00000016595 ENSODEG00000020416 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 7 DDX4 (ENSHGLG00000003594) ENSHGLG00000050818 IL31RA (ENSHGLG00000003029) IL6ST (ENSHGLG00000002605) ENSHGLG00000017887 ANKRD55 (ENSHGLG00000002248) ENSHGLG00000019923 ENSHGLG00000037743 ENSHGLG00000002155 MAP3K1 (ENSHGLG00000008852) ENSHGLG00000016353 SETD9 (ENSHGLG00000007843) MIER3 (ENSHGLG00000007522) ENSHGLG00000049674 ENSHGLG00000047590 GPBP1 (ENSHGLG00000006461) ##22 ENSHGLG00000048618 ACTBL2 (ENSHGLG00000020239) ENSHGLG00000005073 PLK2 (ENSHGLG00000004619) GAPT (ENSHGLG00000035104) RAB3C (ENSHGLG00000004380) ENSHGLG00000046236 ENSHGLG00000049862 ENSHGLG00000043409 ENSHGLG00000034016 PDE4D (ENSHGLG00000007099) DEPDC1B (ENSHGLG00000019523) ELOVL7 (ENSHGLG00000041515) ENSHGLG00000019517 NDUFAF2 (ENSHGLG00000049827) Sciuridae DUPLICATION Sciuridae DUPLICATION Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029753.a.m.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029753.a.m.a ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 2 TTK (ENSMMMG00000007904) ELOVL4 (ENSMMMG00000007894) SH3BGRL2 (ENSMMMG00000007878) ENSMMMG00000007865 ENSMMMG00000007848 ENSMMMG00000007837 COL12A1 (ENSMMMG00000007634) ENSMMMG00000007621 TMEM30A (ENSMMMG00000007574) FILIP1 (ENSMMMG00000007556) ENSMMMG00000007547 SENP6 (ENSMMMG00000007505) MYO6 (ENSMMMG00000006155) IMPG1 (ENSMMMG00000006044) ENSMMMG00000006020 ENSMMMG00000006015 ##22 HTR1B (ENSMMMG00000005994) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029753.a.m.a ##22 Squirrel MODERN SPECIES 419 ENSSTOG00000030531 ##22 USP51 (ENSSTOG00000016321) ENSSTOG00000028849 FOXR2 (ENSSTOG00000014071) ENSSTOG00000019963 RRAGB (ENSSTOG00000004660) ENSSTOG00000031660 KLF8 (ENSSTOG00000012012) UBQLN2 (ENSSTOG00000014053) ENSSTOG00000024953 NBDY (ENSSTOG00000033489) ENSSTOG00000030343 ENSSTOG00000020423 ENSSTOG00000033408 ENSSTOG00000025630 ENSSTOG00000019559 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 14 ENSSVLG00005002403 ENSSVLG00005002376 ORMDL2 (ENSSVLG00005002360) ENSSVLG00005002293 GDF11 (ENSSVLG00005002247) CD63 (ENSSVLG00005002220) RDH5 (ENSSVLG00005002174) ENSSVLG00005002152 ENSSVLG00005002143 ITGA7 (ENSSVLG00005002103) ENSSVLG00005002060 ENSSVLG00005002045 OR10P1 (ENSSVLG00005002039) ENSSVLG00005002027 ENSSVLG00005002010 ENSSVLG00005002004 ##22 ENSSVLG00005001990 ENSSVLG00005001981 ENSSVLG00005001973 ENSSVLG00005001958 ENSSVLG00005001941 ENSSVLG00005001926 ENSSVLG00005001907 ENSSVLG00005001893 OR2AP1 (ENSSVLG00005001879) OR6C4 (ENSSVLG00005001868) ENSSVLG00005001853 ENSSVLG00005001839 ENSSVLG00005001830 ENSSVLG00005001819 ENSSVLG00005001811 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00420000029753.a.m.b ##22 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 19 ENSSVLG00005012219 ENSSVLG00005012276 ENSSVLG00005012408 ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a.n ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.db.a ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 15 CCNO (ENSSVLG00005008344) DHX29 (ENSSVLG00005008305) MTREX (ENSSVLG00005008234) PLPP1 (ENSSVLG00005008180) SLC38A9 (ENSSVLG00005007887) DDX4 (ENSSVLG00005007457) ENSSVLG00005007344 ENSSVLG00005007316 IL31RA (ENSSVLG00005007167) IL6ST (ENSSVLG00005007036) ANKRD55 (ENSSVLG00005006848) MAP3K1 (ENSSVLG00005006689) SETD9 (ENSSVLG00005006657) MIER3 (ENSSVLG00005006429) ENSSVLG00005006401 GPBP1 (ENSSVLG00005006261) ##22 ACTBL2 (ENSSVLG00005006220) PLK2 (ENSSVLG00005006122) GAPT (ENSSVLG00005006102) RAB3C (ENSSVLG00005006067) ENSSVLG00005006055 PDE4D (ENSSVLG00005005695) DEPDC1B (ENSSVLG00005005445) ENSSVLG00005005400 ELOVL7 (ENSSVLG00005005357) ERCC8 (ENSSVLG00005005313) NDUFAF2 (ENSSVLG00005005295) ENSSVLG00005005285 ENSSVLG00005005269 ZSWIM6 (ENSSVLG00005005212) KIF2A (ENSSVLG00005004912) Marmotini ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a.n ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.db.a ENSGT00390000001455.eb.a ENSGT00940000155496.b Alpin marmot MODERN SPECIES 46 CDC20B (ENSMMMG00000009279) ENSMMMG00000009275 MCIDAS (ENSMMMG00000009257) CCNO (ENSMMMG00000009246) DHX29 (ENSMMMG00000009209) MTREX (ENSMMMG00000009158) PLPP1 (ENSMMMG00000009061) SLC38A9 (ENSMMMG00000009039) DDX4 (ENSMMMG00000008971) IL31RA (ENSMMMG00000008944) IL6ST (ENSMMMG00000008666) ANKRD55 (ENSMMMG00000008634) MAP3K1 (ENSMMMG00000008498) SETD9 (ENSMMMG00000008494) MIER3 (ENSMMMG00000008455) GPBP1 (ENSMMMG00000008405) ##22 ACTBL2 (ENSMMMG00000008397) ENSMMMG00000008389 ENSMMMG00000008369 PLK2 (ENSMMMG00000008351) GAPT (ENSMMMG00000008343) RAB3C (ENSMMMG00000008316) ENSMMMG00000008308 PDE4D (ENSMMMG00000008188) DEPDC1B (ENSMMMG00000008101) ELOVL7 (ENSMMMG00000008082) ERCC8 (ENSMMMG00000008052) NDUFAF2 (ENSMMMG00000008039) ENSMMMG00000008025 ENSMMMG00000008016 ZSWIM6 (ENSMMMG00000007892) Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 55 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a.n ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903.db.a ENSGT00390000001455.eb.a ENSGT00940000155496.b ENSGT00390000017673.b.h Arctic ground squirrel MODERN SPECIES 41 GPX8 (ENSUPAG00010005041) CDC20B (ENSUPAG00010004988) MCIDAS (ENSUPAG00010004982) CCNO (ENSUPAG00010004974) DHX29 (ENSUPAG00010004963) MTREX (ENSUPAG00010004859) PLPP1 (ENSUPAG00010004851) SLC38A9 (ENSUPAG00010004843) DDX4 (ENSUPAG00010004791) IL31RA (ENSUPAG00010004767) IL6ST (ENSUPAG00010004692) ANKRD55 (ENSUPAG00010004664) MAP3K1 (ENSUPAG00010004623) SETD9 (ENSUPAG00010004601) MIER3 (ENSUPAG00010004567) ENSUPAG00010004552 ##22 ACTBL2 (ENSUPAG00010004520) PLK2 (ENSUPAG00010004497) GAPT (ENSUPAG00010004489) RAB3C (ENSUPAG00010004466) Squirrel MODERN SPECIES 80 CDC20B (ENSSTOG00000032638) MCIDAS (ENSSTOG00000020163) CCNO (ENSSTOG00000010783) DHX29 (ENSSTOG00000010789) MTREX (ENSSTOG00000010802) PLPP1 (ENSSTOG00000023013) SLC38A9 (ENSSTOG00000024679) DDX4 (ENSSTOG00000021044) IL31RA (ENSSTOG00000004966) IL6ST (ENSSTOG00000005009) ANKRD55 (ENSSTOG00000003033) ENSSTOG00000011940 MAP3K1 (ENSSTOG00000007184) SETD9 (ENSSTOG00000007222) MIER3 (ENSSTOG00000007231) GPBP1 (ENSSTOG00000003057) ##22 PLK2 (ENSSTOG00000000137) RAB3C (ENSSTOG00000005011) ENSSTOG00000030888 PDE4D (ENSSTOG00000024554) DEPDC1B (ENSSTOG00000022557) ELOVL7 (ENSSTOG00000005290) ERCC8 (ENSSTOG00000005308) NDUFAF2 (ENSSTOG00000005330) SMIM15 (ENSSTOG00000033191) ENSSTOG00000033886 ZSWIM6 (ENSSTOG00000027393) ENSSTOG00000022617 KIF2A (ENSSTOG00000012710) DIMT1 (ENSSTOG00000012731) ENSSTOG00000033386 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Kangaroo rat MODERN SPECIES 360 Gpx8 (ENSDORG00000007995) Cdc20b (ENSDORG00000007992) Mcidas (ENSDORG00000029640) Ccno (ENSDORG00000006777) Dhx29 (ENSDORG00000006778) Mtrex (ENSDORG00000006782) Plpp1 (ENSDORG00000006787) Slc38a9 (ENSDORG00000006129) Ddx4 (ENSDORG00000012201) Il31ra (ENSDORG00000001445) Il6st (ENSDORG00000001454) Ankrd55 (ENSDORG00000013232) Map3k1 (ENSDORG00000009060) ENSDORG00000009063 Mier3 (ENSDORG00000009065) Gpbp1 (ENSDORG00000006390) ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Muroidea ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Murinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Rat MODERN SPECIES 11 Gzma (ENSRNOG00000010603) Gpx8 (ENSRNOG00000010461) Mcidas (ENSRNOG00000039588) Ccno (ENSRNOG00000010454) Dhx29 (ENSRNOG00000010369) Mtrex (ENSRNOG00000010125) Plpp1 (ENSRNOG00000009980) Slc38a9 (ENSRNOG00000009851) Ddx4 (ENSRNOG00000026686) Il31ra (ENSRNOG00000042080) Il6st (ENSRNOG00000013963) Ankrd55 (ENSRNOG00000013555) Map3k1 (ENSRNOG00000013177) Sub1 (ENSRNOG00000050563) Mier3 (ENSRNOG00000013121) Gpbp1 (ENSRNOG00000013002) ##22 Actbl2 (ENSRNOG00000043292) RGD1560402 (ENSRNOG00000026928) Plk2 (ENSRNOG00000011951) Gapt (ENSRNOG00000026989) Rab3c (ENSRNOG00000011623) AABR07008066.2 (ENSRNOG00000047236) Pde4d (ENSRNOG00000042536) Depdc1b (ENSRNOG00000010701) Elovl7 (ENSRNOG00000010450) Ercc8 (ENSRNOG00000009968) Ndufaf2 (ENSRNOG00000055079) Smim15 (ENSRNOG00000031995) Zswim6 (ENSRNOG00000014528) RGD1564606 (ENSRNOG00000029670) Kif2a (ENSRNOG00000014000) Mus ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Shrew mouse MODERN SPECIES 2 MGP_PahariEiJ_G0015972 Cdc20b (MGP_PahariEiJ_G0015971) Mcidas (MGP_PahariEiJ_G0015970) Ccno (MGP_PahariEiJ_G0015969) Dhx29 (MGP_PahariEiJ_G0015968) Mtrex (MGP_PahariEiJ_G0015967) Plpp1 (MGP_PahariEiJ_G0015966) Slc38a9 (MGP_PahariEiJ_G0015965) Ddx4 (MGP_PahariEiJ_G0015964) Il31ra (MGP_PahariEiJ_G0015963) MGP_PahariEiJ_G0015962 Ankrd55 (MGP_PahariEiJ_G0015961) Map3k1 (MGP_PahariEiJ_G0015960) Mier3 (MGP_PahariEiJ_G0015959) MGP_PahariEiJ_G0015958 Gpbp1 (MGP_PahariEiJ_G0015957) ##22 Actbl2 (MGP_PahariEiJ_G0015956) Plk2 (MGP_PahariEiJ_G0015955) Gapt (MGP_PahariEiJ_G0015954) Rab3c (MGP_PahariEiJ_G0015953) Pde4d (MGP_PahariEiJ_G0015952) Depdc1b (MGP_PahariEiJ_G0015951) Elovl7 (MGP_PahariEiJ_G0015950) Ercc8 (MGP_PahariEiJ_G0015949) Ndufaf2 (MGP_PahariEiJ_G0015948) Smim15 (MGP_PahariEiJ_G0015947) Zswim6 (MGP_PahariEiJ_G0015946) Kif2a (MGP_PahariEiJ_G0015945) Dimt1 (MGP_PahariEiJ_G0015944) Ipo11 (MGP_PahariEiJ_G0015943) MGP_PahariEiJ_G0015942 Mus_A ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00940000159371 ENSGT00900000143743 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00860000136260 ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Ryukyu mouse MODERN SPECIES 4 MGP_CAROLIEiJ_G0018901 Cdc20b (MGP_CAROLIEiJ_G0018900) Mcidas (MGP_CAROLIEiJ_G0018899) Ccno (MGP_CAROLIEiJ_G0018898) Dhx29 (MGP_CAROLIEiJ_G0018897) Mtrex (MGP_CAROLIEiJ_G0018896) Plpp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018895) Slc38a9 (MGP_CAROLIEiJ_G0018894) Ddx4 (MGP_CAROLIEiJ_G0018893) Il31ra (MGP_CAROLIEiJ_G0018892) Il6st (MGP_CAROLIEiJ_G0018891) Ankrd55 (MGP_CAROLIEiJ_G0018890) Map3k1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018889) Mier3 (MGP_CAROLIEiJ_G0018888) MGP_CAROLIEiJ_G0018887 Gpbp1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018886) ##22 Actbl2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018885) Plk2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018884) Gapt (MGP_CAROLIEiJ_G0018883) Rab3c (MGP_CAROLIEiJ_G0018882) Pde4d (MGP_CAROLIEiJ_G0018881) Depdc1b (MGP_CAROLIEiJ_G0018880) Elovl7 (MGP_CAROLIEiJ_G0018879) Ercc8 (MGP_CAROLIEiJ_G0018878) Ndufaf2 (MGP_CAROLIEiJ_G0018877) Smim15 (MGP_CAROLIEiJ_G0018876) Zswim6 (MGP_CAROLIEiJ_G0018875) MGP_CAROLIEiJ_G0018874 Kif2a (MGP_CAROLIEiJ_G0018873) Dimt1 (MGP_CAROLIEiJ_G0018872) Ipo11 (MGP_CAROLIEiJ_G0018871) Mus_B ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00940000159371 ENSGT00900000143743 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00860000136260 ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Mouse MODERN SPECIES 4 Gpx8 (ENSMUSG00000021760) Cdc20b (ENSMUSG00000078926) Mcidas (ENSMUSG00000074651) Ccno (ENSMUSG00000042417) Dhx29 (ENSMUSG00000042426) Mtrex (ENSMUSG00000016018) Plpp1 (ENSMUSG00000021759) Slc38a9 (ENSMUSG00000047789) Ddx4 (ENSMUSG00000021758) Il31ra (ENSMUSG00000050377) Il6st (ENSMUSG00000021756) Ankrd55 (ENSMUSG00000049985) Map3k1 (ENSMUSG00000021754) Mier3 (ENSMUSG00000032727) Gm49496 (ENSMUSG00000116016) Gpbp1 (ENSMUSG00000032745) ##22 Actbl2 (ENSMUSG00000055194) Plk2 (ENSMUSG00000021701) Gapt (ENSMUSG00000046006) Rab3c (ENSMUSG00000021700) Pde4d (ENSMUSG00000021699) Depdc1b (ENSMUSG00000021697) Elovl7 (ENSMUSG00000021696) Ercc8 (ENSMUSG00000021694) Smim15 (ENSMUSG00000071180) Ndufaf2 (ENSMUSG00000068184) Zswim6 (ENSMUSG00000032846) Kif2a (ENSMUSG00000021693) Dimt1 (ENSMUSG00000021692) Ipo11 (ENSMUSG00000042590) Htr1a (ENSMUSG00000021721) Mus_C ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000159371 ENSGT00900000143743 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00860000136260 ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Steppe mouse MODERN SPECIES 2308 Map3k1 (ENSMSIG00000021535) Mier3 (ENSMSIG00000021487) Gpbp1 (ENSMSIG00000021447) ##22 spretus MODERN SPECIES 4 MGP_SPRETEiJ_G0019780 Cdc20b (MGP_SPRETEiJ_G0019779) Mcidas (MGP_SPRETEiJ_G0019778) Ccno (MGP_SPRETEiJ_G0019777) Dhx29 (MGP_SPRETEiJ_G0019776) Mtrex (MGP_SPRETEiJ_G0019775) Plpp1 (MGP_SPRETEiJ_G0019774) Slc38a9 (MGP_SPRETEiJ_G0019773) Ddx4 (MGP_SPRETEiJ_G0019772) Il31ra (MGP_SPRETEiJ_G0019771) Il6st (MGP_SPRETEiJ_G0019770) Ankrd55 (MGP_SPRETEiJ_G0019769) Map3k1 (MGP_SPRETEiJ_G0019768) Mier3 (MGP_SPRETEiJ_G0019767) MGP_SPRETEiJ_G0019766 Gpbp1 (MGP_SPRETEiJ_G0019765) ##22 Actbl2 (MGP_SPRETEiJ_G0019764) Plk2 (MGP_SPRETEiJ_G0019763) Gapt (MGP_SPRETEiJ_G0019762) Rab3c (MGP_SPRETEiJ_G0019761) Pde4d (MGP_SPRETEiJ_G0019760) Depdc1b (MGP_SPRETEiJ_G0019759) Elovl7 (MGP_SPRETEiJ_G0019758) Ercc8 (MGP_SPRETEiJ_G0019757) Ndufaf2 (MGP_SPRETEiJ_G0019756) Smim15 (MGP_SPRETEiJ_G0019755) Zswim6 (MGP_SPRETEiJ_G0019754) MGP_SPRETEiJ_G0019753 Kif2a (MGP_SPRETEiJ_G0019752) Dimt1 (MGP_SPRETEiJ_G0019751) Ipo11 (MGP_SPRETEiJ_G0019750) Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00940000167010 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000161886 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00900000143365 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Golden Hamster MODERN SPECIES 620 Gzmk (ENSMAUG00000020659) Gzma (ENSMAUG00000018182) Gpx8 (ENSMAUG00000009131) Mcidas (ENSMAUG00000012630) Ccno (ENSMAUG00000020298) Dhx29 (ENSMAUG00000009094) Mtrex (ENSMAUG00000010727) Plpp1 (ENSMAUG00000016864) Slc38a9 (ENSMAUG00000018959) Ddx4 (ENSMAUG00000019873) Il31ra (ENSMAUG00000014393) ENSMAUG00000016443 ENSMAUG00000012026 Map3k1 (ENSMAUG00000007590) Mier3 (ENSMAUG00000018815) Gpbp1 (ENSMAUG00000008647) ##22 Actbl2 (ENSMAUG00000007066) Plk2 (ENSMAUG00000009118) Rab3c (ENSMAUG00000012132) ENSMAUG00000008276 Pde4d (ENSMAUG00000008303) Depdc1b (ENSMAUG00000007043) Elovl7 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(ENSCGRG00001006299) Kif2a (ENSCGRG00001004824) Dimt1 (ENSCGRG00001011778) Ipo11 (ENSCGRG00001012206) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 48 ENSGT00940000167010 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000154484.B.a.a Prairie vole MODERN SPECIES 6 Gpx8 (ENSMOCG00000012524) ENSMOCG00000019278 Mcidas (ENSMOCG00000000303) Ccno (ENSMOCG00000003116) Dhx29 (ENSMOCG00000010302) Mtrex (ENSMOCG00000019886) Plpp1 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##22 Actbl2 (ENSPEMG00000003637) Plk2 (ENSPEMG00000021774) Gapt (ENSPEMG00000026359) Rab3c (ENSPEMG00000022520) Pde4d (ENSPEMG00000022726) ENSPEMG00000030949 Depdc1b (ENSPEMG00000022724) Elovl7 (ENSPEMG00000026408) Ercc8 (ENSPEMG00000021860) Ndufaf2 (ENSPEMG00000000720) ENSPEMG00000030811 ENSPEMG00000023018 Kif2a (ENSPEMG00000024052) ENSPEMG00000008658 Ipo11 (ENSPEMG00000018393) Upper Galilee mountains blind mole rat DUPLICATION Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1141 ENSNGAG00000013843 Adarb2 (ENSNGAG00000015119) Wdr37 (ENSNGAG00000001285) ENSNGAG00000000502 ENSNGAG00000019194 ENSNGAG00000015934 Gtpbp4 (ENSNGAG00000015364) Larp4b (ENSNGAG00000001750) ENSNGAG00000019104 ##22 Dip2c (ENSNGAG00000014695) Zmynd11 (ENSNGAG00000020906) Chrm3 (ENSNGAG00000018133) Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1104 ENSNGAG00000021161 Mcidas (ENSNGAG00000020437) Ccno (ENSNGAG00000008766) Dhx29 (ENSNGAG00000018322) Mtrex (ENSNGAG00000011938) Plpp1 (ENSNGAG00000021095) Slc38a9 (ENSNGAG00000001933) Ddx4 (ENSNGAG00000013259) Il31ra (ENSNGAG00000001498) Il6st (ENSNGAG00000002301) ENSNGAG00000020926 Map3k1 (ENSNGAG00000021146) ENSNGAG00000014309 Mier3 (ENSNGAG00000005883) ENSNGAG00000001623 Gpbp1 (ENSNGAG00000013481) ##22 Lesser Egyptian jerboa DUPLICATION Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 99 ENSJJAG00000012956 ENSJJAG00000013966 Nsun3 (ENSJJAG00000011783) Stx19 (ENSJJAG00000013942) ENSJJAG00000010679 Pros1 (ENSJJAG00000000094) Epha3 (ENSJJAG00000023086) ENSJJAG00000022581 ENSJJAG00000016108 ENSJJAG00000015343 Zfp654 (ENSJJAG00000014040) Htr1f (ENSJJAG00000013994) Pou1f1 (ENSJJAG00000011761) Chmp2b (ENSJJAG00000010165) Vgll3 (ENSJJAG00000008774) ENSJJAG00000001124 ##22 ENSJJAG00000011025 Cadm2 (ENSJJAG00000001556) ENSJJAG00000018522 ENSJJAG00000017273 Nuf2 (ENSJJAG00000015135) Rgs5 (ENSJJAG00000015242) Rgs4 (ENSJJAG00000014256) Ccdc190 (ENSJJAG00000013635) Hsd17b7 (ENSJJAG00000012148) Ddr2 (ENSJJAG00000010116) Uap1 (ENSJJAG00000021659) 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ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00520000060104 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00940000155000.v ENSGT00950000182908.A ENSGT00520000060104 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00910000145427 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000018086.o.a.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000154568.q.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00940000155000.v ENSGT00950000182908.A ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b ENSGT00520000060104 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00940000154943.j ENSGT00940000155877.i.b ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00910000145427 ENSGT00940000155496.b Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000018086.o.a.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000154568.q.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000155000.v ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b ENSGT00520000060104 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00940000154943.j ENSGT00940000155877.i.b ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00910000145427 ENSGT00940000155496.b Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000018086.o.a.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000154568.q.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000154319.u.b.a.a ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000155000.v ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b ENSGT00520000060104 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000155674 ENSGT00910000147409 ENSGT00940000153877.g.b.a.a ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00940000154943.j ENSGT00940000155877.i.b ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 Macaca ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000018086.o.a.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000154568.q.b ENSGT00390000005646 ENSGT00940000154319.u.b.a.a ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00520000060104 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00940000155541.C.j ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000155674 ENSGT00910000147409 ENSGT00940000153877.g.b.a.a ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00940000154943.j ENSGT00940000155877.i.b ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000154319.u.b.a.a ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00940000155541.C.j ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00390000011255 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00940000154943.j ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Rhesus MODERN SPECIES 16 PLPP1 (ENSMMUG00000030099) ENSMMUG00000060908 ENSMMUG00000061973 SLC38A9 (ENSMMUG00000010466) DDX4 (ENSMMUG00000017386) IL31RA (ENSMMUG00000017394) IL6ST (ENSMMUG00000001893) ANKRD55 (ENSMMUG00000009729) ENSMMUG00000050786 ENSMMUG00000049885 ENSMMUG00000041620 MAP3K1 (ENSMMUG00000012387) SETD9 (ENSMMUG00000030085) MIER3 (ENSMMUG00000012389) ENSMMUG00000054721 GPBP1 (ENSMMUG00000014647) ##22 ACTBL2 (ENSMMUG00000001353) ENSMMUG00000053268 PLK2 (ENSMMUG00000005177) GAPT (ENSMMUG00000054535) RAB3C (ENSMMUG00000005181) ENSMMUG00000052511 PDE4D (ENSMMUG00000012132) DEPDC1B (ENSMMUG00000018379) ENSMMUG00000053194 ENSMMUG00000062023 ELOVL7 (ENSMMUG00000014211) ENSMMUG00000010445 ERCC8 (ENSMMUG00000021812) ENSMMUG00000054780 NDUFAF2 (ENSMMUG00000021813) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 16 MCIDAS (ENSMFAG00000063476) CCNO (ENSMFAG00000031385) DHX29 (ENSMFAG00000003740) MTREX (ENSMFAG00000031610) PLPP1 (ENSMFAG00000030691) SLC38A9 (ENSMFAG00000042280) ENSMFAG00000045335 DDX4 (ENSMFAG00000040186) IL31RA (ENSMFAG00000031804) ANKRD55 (ENSMFAG00000031576) MAP3K1 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ENSCSAG00000016031 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 183 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000018086.o.a.a.b.b.b.a.a.a ENSGT00940000154568.q.b ENSGT00390000005646 ENSGT01090000260115.e.a ENSGT00940000157507 ENSGT00940000153503.a.a.r ENSGT00390000008631.a.d.b ENSGT01020000230346.C.c.a.a.a.b ENSGT00520000060104 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00910000147231 ENSGT00940000155674 ENSGT00910000147652 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 3131 MAP3K1 (ENSRROG00000035924) SETD9 (ENSRROG00000041808) MIER3 (ENSRROG00000041892) ENSRROG00000041132 GPBP1 (ENSRROG00000032693) ##22 ACTBL2 (ENSRROG00000006201) Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 474 ENSRBIG00000028686 SLC38A9 (ENSRBIG00000028044) ENSRBIG00000033979 DDX4 (ENSRBIG00000028795) ENSRBIG00000015941 IL31RA (ENSRBIG00000015386) ENSRBIG00000036601 ENSRBIG00000039163 ANKRD55 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MODERN SPECIES 18 PLPP1 (ENSPTRG00000016880) ENSPTRG00000047963 SLC38A9 (ENSPTRG00000016883) DDX4 (ENSPTRG00000016884) ENSPTRG00000047738 ENSPTRG00000048965 IL31RA (ENSPTRG00000016886) IL6ST (ENSPTRG00000016887) ENSPTRG00000018925 ANKRD55 (ENSPTRG00000016888) ENSPTRG00000047789 ENSPTRG00000039819 MAP3K1 (ENSPTRG00000016891) SETD9 (ENSPTRG00000016892) MIER3 (ENSPTRG00000016893) GPBP1 (ENSPTRG00000016894) ##22 PLK2 (ENSPTRG00000016896) GAPT (ENSPTRG00000028710) RAB3C (ENSPTRG00000016898) ENSPTRG00000051791 PDE4D (ENSPTRG00000016900) DEPDC1B (ENSPTRG00000016902) ELOVL7 (ENSPTRG00000016903) ENSPTRG00000021940 ERCC8 (ENSPTRG00000016905) ENSPTRG00000048427 SMIM15 (ENSPTRG00000016908) ZSWIM6 (ENSPTRG00000016910) KIF2A (ENSPTRG00000016913) DIMT1 (ENSPTRG00000016914) LRRC70 (ENSPTRG00000040740) Bonobo MODERN SPECIES 18 MTREX (ENSPPAG00000039291) PLPP1 (ENSPPAG00000041332) ENSPPAG00000039501 ENSPPAG00000032097 SLC38A9 (ENSPPAG00000032086) DDX4 (ENSPPAG00000033915) ENSPPAG00000029811 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(ENSG00000062194) ##22 ACTBL2 (ENSG00000169067) PLK2 (ENSG00000145632) GAPT (ENSG00000175857) RAB3C (ENSG00000152932) PDE4D (ENSG00000113448) DEPDC1B (ENSG00000035499) ELOVL7 (ENSG00000164181) ERCC8 (ENSG00000049167) NDUFAF2 (ENSG00000164182) SMIM15 (ENSG00000188725) ZSWIM6 (ENSG00000130449) KIF2A (ENSG00000068796) DIMT1 (ENSG00000086189) IPO11 (ENSG00000086200) LRRC70 (ENSG00000186105) Gorilla MODERN SPECIES 8 ENSGGOG00000000661 PLPP1 (ENSGGOG00000001872) ENSGGOG00000001103 SLC38A9 (ENSGGOG00000013482) DDX4 (ENSGGOG00000002439) ENSGGOG00000040613 IL31RA (ENSGGOG00000002985) ENSGGOG00000003727 ENSGGOG00000006588 ANKRD55 (ENSGGOG00000016033) ENSGGOG00000037848 C5orf67 (ENSGGOG00000024041) MAP3K1 (ENSGGOG00000014603) SETD9 (ENSGGOG00000014616) MIER3 (ENSGGOG00000015237) GPBP1 (ENSGGOG00000008390) ##22 ACTBL2 (ENSGGOG00000014532) PLK2 (ENSGGOG00000012710) GAPT (ENSGGOG00000012725) RAB3C (ENSGGOG00000013532) ENSGGOG00000041944 PDE4D (ENSGGOG00000006975) DEPDC1B (ENSGGOG00000014855) ELOVL7 (ENSGGOG00000023181) ERCC8 (ENSGGOG00000003300) ENSGGOG00000039796 ENSGGOG00000024488 SMIM15 (ENSGGOG00000038030) ENSGGOG00000044066 ENSGGOG00000026121 ENSGGOG00000016230 Orangutan MODERN SPECIES 18 CDC20B (ENSPPYG00000015466) ENSPPYG00000033724 MCIDAS (ENSPPYG00000040237) ENSPPYG00000035186 DHX29 (ENSPPYG00000015468) MTREX (ENSPPYG00000015469) PLPP1 (ENSPPYG00000015470) SLC38A9 (ENSPPYG00000015471) DDX4 (ENSPPYG00000015472) IL31RA (ENSPPYG00000015473) IL6ST (ENSPPYG00000015475) ANKRD55 (ENSPPYG00000015476) MAP3K1 (ENSPPYG00000015478) SETD9 (ENSPPYG00000015479) MIER3 (ENSPPYG00000015480) GPBP1 (ENSPPYG00000015481) ##22 ACTBL2 (ENSPPYG00000015482) PLK2 (ENSPPYG00000015483) GAPT (ENSPPYG00000015484) RAB3C (ENSPPYG00000015485) PDE4D (ENSPPYG00000015486) DEPDC1B (ENSPPYG00000015488) ELOVL7 (ENSPPYG00000015489) ERCC8 (ENSPPYG00000015490) ENSPPYG00000041513 NDUFAF2 (ENSPPYG00000015491) SMIM15 (ENSPPYG00000015492) ZSWIM6 (ENSPPYG00000025925) ENSPPYG00000036952 KIF2A (ENSPPYG00000015496) DIMT1 (ENSPPYG00000015497) Gibbon MODERN SPECIES 8 ENSNLEG00000001526 ENSNLEG00000033338 SLC38A9 (ENSNLEG00000001529) DDX4 (ENSNLEG00000001662) ENSNLEG00000033054 ENSNLEG00000033964 IL31RA (ENSNLEG00000001947) IL6ST (ENSNLEG00000002075) ANKRD55 (ENSNLEG00000002215) ENSNLEG00000035446 ENSNLEG00000031541 ENSNLEG00000028269 MAP3K1 (ENSNLEG00000002250) SETD9 (ENSNLEG00000002266) MIER3 (ENSNLEG00000002269) GPBP1 (ENSNLEG00000002381) ##22 ENSNLEG00000032427 ACTBL2 (ENSNLEG00000018212) PLK2 (ENSNLEG00000002471) RAB3C (ENSNLEG00000002575) PDE4D (ENSNLEG00000002595) ENSNLEG00000034735 ENSNLEG00000030635 DEPDC1B (ENSNLEG00000002677) ELOVL7 (ENSNLEG00000031923) ERCC8 (ENSNLEG00000002757) ENSNLEG00000031593 NDUFAF2 (ENSNLEG00000002819) ENSNLEG00000002834 ENSNLEG00000029273 ENSNLEG00000002851 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 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ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00520000060104 ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000162627 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a.k ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 ENSGT00940000154484.B.a.a Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 57 CDC20B (ENSSBOG00000021532) MCIDAS (ENSSBOG00000027678) CCNO 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SMIM15 (ENSCJAG00000015387) ZSWIM6 (ENSCJAG00000015391) Mas night monkey MODERN SPECIES 454 CCNO (ENSANAG00000037719) DHX29 (ENSANAG00000005482) MTREX (ENSANAG00000023095) PLPP1 (ENSANAG00000038436) SLC38A9 (ENSANAG00000025892) DDX4 (ENSANAG00000029060) IL31RA (ENSANAG00000024402) IL6ST (ENSANAG00000021125) ENSANAG00000029312 ANKRD55 (ENSANAG00000036712) ENSANAG00000012283 ENSANAG00000033167 MAP3K1 (ENSANAG00000027994) SETD9 (ENSANAG00000034009) MIER3 (ENSANAG00000020585) GPBP1 (ENSANAG00000022115) ##22 ACTBL2 (ENSANAG00000019725) PLK2 (ENSANAG00000031564) RAB3C (ENSANAG00000027883) PDE4D (ENSANAG00000032922) ENSANAG00000036998 ELOVL7 (ENSANAG00000036488) ERCC8 (ENSANAG00000020580) ENSANAG00000036827 Tarsier MODERN SPECIES 4021 GPBP1 (ENSTSYG00000004165) ##22 ACTBL2 (ENSTSYG00000013181) Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 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ENSDNOG00000038464 ENSDNOG00000048451 ENSDNOG00000034690 ENSDNOG00000033511 DEPDC1B (ENSDNOG00000019455) Platypus MODERN SPECIES 1 IPO5 (ENSOANG00000005460) NUDT12 (ENSOANG00000005459) ENSOANG00000050029 ENSOANG00000005458 MACIR (ENSOANG00000005457) PPIP5K2 (ENSOANG00000005455) GIN1 (ENSOANG00000005453) PAM (ENSOANG00000005452) ENSOANG00000005449 ENSOANG00000005448 IL6ST (ENSOANG00000005447) ANKRD55 (ENSOANG00000010876) MAP3K1 (ENSOANG00000013632) SETD9 (ENSOANG00000045833) MIER3 (ENSOANG00000048775) GPBP1 (ENSOANG00000013639) ##22 PLK2 (ENSOANG00000013641) ENSOANG00000007024 SEPTIN11 (ENSOANG00000013643) CCNI (ENSOANG00000013645) CCNG2 (ENSOANG00000009391) CNOT6L (ENSOANG00000003561) MRPL1 (ENSOANG00000003564) ENSOANG00000003565 BMP2K (ENSOANG00000003566) ENSOANG00000003567 ANTXR2 (ENSOANG00000044651) ENSOANG00000049135 ENSOANG00000050861 ENSOANG00000043047 ENSOANG00000042950 Sauria ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a 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ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Archosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00960000189528 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00950000182960.b.e.a ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Aves ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00960000189528 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 Neognathae DUPLICATION Neognathae ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00960000189528 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.b ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.d ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.b ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.d ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 Anatidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000159928 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.a ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.c ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 Pink-footed goose MODERN SPECIES 118 ENSABRG00000021027 GPX8 (ENSABRG00000021028) ENSABRG00000021031 DHX29 (ENSABRG00000021035) MTREX (ENSABRG00000021038) PLPP1 (ENSABRG00000021044) SLC38A9 (ENSABRG00000021049) DDX4 (ENSABRG00000021052) IL31RA (ENSABRG00000021078) IL6ST (ENSABRG00000021086) ANKRD55 (ENSABRG00000021096) ENSABRG00000021100 MAP3K1 (ENSABRG00000021115) SETD9 (ENSABRG00000021128) ENSABRG00000021138 ENSABRG00000021172 ##22 PLK2 (ENSABRG00000021234) RAB3C (ENSABRG00000021239) PDE4D (ENSABRG00000021243) Duck MODERN SPECIES 4281 CDC20B (ENSAPLG00000020360) GPX8 (ENSAPLG00000016750) CCNO (ENSAPLG00000023666) DHX29 (ENSAPLG00000009145) MTREX (ENSAPLG00000009694) PLPP1 (ENSAPLG00000010771) SLC38A9 (ENSAPLG00000010983) DDX4 (ENSAPLG00000011662) ENSAPLG00000023168 ENSAPLG00000018243 IL6ST (ENSAPLG00000011926) ENSAPLG00000029992 ANKRD55 (ENSAPLG00000012756) MAP3K1 (ENSAPLG00000009424) SETD9 (ENSAPLG00000030605) GPBP1 (ENSAPLG00000006435) ##22 PLK2 (ENSAPLG00000005719) RAB3C (ENSAPLG00000005718) PDE4D (ENSAPLG00000005416) ENSAPLG00000017301 DEPDC1B (ENSAPLG00000009617) ELOVL7 (ENSAPLG00000009660) ERCC8 (ENSAPLG00000009673) NDUFAF2 (ENSAPLG00000009796) ENSAPLG00000021244 ZSWIM6 (ENSAPLG00000006992) KIF2A (ENSAPLG00000009519) DIMT1 (ENSAPLG00000009464) IPO11 (ENSAPLG00000009338) ENSAPLG00000022536 RNF180 (ENSAPLG00000009315) Phasianidae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.b ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.d ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 ENSGT00940000154484.B.a.a Japanese quail MODERN SPECIES 699 CCNO (ENSCJPG00005001200) MCIDAS (ENSCJPG00005001211) DHX29 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ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.b ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.d ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 ENSGT00940000154484.B.a.a Turkey MODERN SPECIES 1299 ENSMGAG00000019868 GZMA (ENSMGAG00000003872) CDC20B (ENSMGAG00000003864) GPX8 (ENSMGAG00000020879) PLPP1 (ENSMGAG00000004007) MTREX (ENSMGAG00000003980) DHX29 (ENSMGAG00000003948) SLC38A9 (ENSMGAG00000004034) ENSMGAG00000005813 ENSMGAG00000020152 IL6ST (ENSMGAG00000006482) ANKRD55 (ENSMGAG00000017750) MAP3K1 (ENSMGAG00000010456) SETD9 (ENSMGAG00000018598) MIER3 (ENSMGAG00000019088) GPBP1 (ENSMGAG00000009600) ##22 ENSMGAG00000019432 ENSMGAG00000022170 ENSMGAG00000022638 ENSMGAG00000004082 ENSMGAG00000021582 ENSMGAG00000004056 ENSMGAG00000018872 ENSMGAG00000015994 ERCC8 (ENSMGAG00000017141) ELOVL7 (ENSMGAG00000019503) ENSMGAG00000017037 ENSMGAG00000015439 ENSMGAG00000022008 IPO11 (ENSMGAG00000004204) KIF2A (ENSMGAG00000020549) Chicken MODERN SPECIES 131 GPX8 (ENSGALG00010015118) MCIDAS (ENSGALG00010013421) CCNO (ENSGALG00010013928) DHX29 (ENSGALG00010013953) SKIV2L2 (ENSGALG00010014041) PLPP1 (ENSGALG00010014125) SLC38A9 (ENSGALG00010014167) DDX4 (ENSGALG00010014189) IL31RA (ENSGALG00010014218) ENSGALG00010015204 IL6ST (ENSGALG00010012930) ANKRD55 (ENSGALG00010012961) MAP3K1 (ENSGALG00010013033) SETD9 (ENSGALG00010013106) MIER3 (ENSGALG00010013487) ENSGALG00010015148 ##22 PLK2 (ENSGALG00010015163) RAB3C (ENSGALG00010015167) PDE4D (ENSGALG00010015196) ENSGALG00010015667 DEPDC1B (ENSGALG00010013468) ELOVL7 (ENSGALG00010014717) ERCC8 (ENSGALG00010012669) NDUFAF2 (ENSGALG00010012688) SMIM15 (ENSGALG00010012704) ZSWIM6 (ENSGALG00010012722) KIF2A (ENSGALG00010014736) DIMT1 (ENSGALG00010014754) IPO11 (ENSGALG00010011972) LRRC70 (ENSGALG00010011996) HTR1A (ENSGALG00010012979) Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00990000204138 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00960000189528 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.b ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.d ENSGT00940000155570.j.b ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00990000204138 ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00960000189528 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.b ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00950000183297 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.c ENSGT00940000155496.b.d ENSGT00940000155570.j.b ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000163637 Golden eagle MODERN SPECIES 91 GZMA (ENSACCG00020014633) GPX8 (ENSACCG00020014623) ENSACCG00020014607 CCNO (ENSACCG00020014586) DHX29 (ENSACCG00020014551) MTREX (ENSACCG00020014491) PLPP1 (ENSACCG00020014456) SLC38A9 (ENSACCG00020014408) DDX4 (ENSACCG00020014368) IL31RA (ENSACCG00020014312) IL6ST (ENSACCG00020014258) ANKRD55 (ENSACCG00020014192) MAP3K1 (ENSACCG00020014030) SETD9 (ENSACCG00020013910) MIER3 (ENSACCG00020013891) GPBP1 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ERCC8 (ENSSHBG00005019875) NDUFAF2 (ENSSHBG00005019871) ENSSHBG00005019870 ENSSHBG00005019868 ENSSHBG00005019866 ENSSHBG00005019865 LRRC70 (ENSSHBG00005019863) Passeriformes ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.b ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.d.a ENSGT00940000155570.j.b ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000163637 ENSGT00390000014071 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00990000204138 ENSGT00940000155998 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ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.a ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.d.a ENSGT00940000155570.j.b ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000163637 Passeroidea ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159928 ENSGT00940000159371 ENSGT00990000204138 ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.b ENSGT00420000029753.a.w ##22 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.a ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b.d.a 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SPECIES ENSGT00420000029753.a.x ##22 Pink-footed goose MODERN SPECIES 626 ENSABRG00000001053 ##22 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 131 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.a ENSGT00420000029753.a.x ##22 Neognathae_c ANCESTRAL SPECIES 132 ENSGT01030000234573.A.b.b.b.a.a ENSGT00420000029753.a.x ##22 Kakapo MODERN SPECIES 4 ENSSHBG00005011326 ENSSHBG00005000971 ENSSHBG00005000975 ENSSHBG00005000987 ENSSHBG00005000997 ENSSHBG00005001000 ENSSHBG00005001002 ENSSHBG00005001006 ENSSHBG00005001009 ENSSHBG00005001010 ENSSHBG00005001012 ENSSHBG00005001015 ENSSHBG00005001017 ENSSHBG00005001020 ENSSHBG00005001023 ENSSHBG00005001025 ##22 African ostrich MODERN SPECIES 762 ENSSCUG00000011864 GZMA (ENSSCUG00000011865) GPX8 (ENSSCUG00000011866) ENSSCUG00000011867 DHX29 (ENSSCUG00000011868) MTREX (ENSSCUG00000011871) PLPP1 (ENSSCUG00000011878) SLC38A9 (ENSSCUG00000011882) DDX4 (ENSSCUG00000011889) IL31RA (ENSSCUG00000011897) IL6ST (ENSSCUG00000011908) ANKRD55 (ENSSCUG00000011928) MAP3K1 (ENSSCUG00000011950) 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ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00940000163637 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00960000189528 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00950000182960.b.e.a ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT00510000051272 ENSGT01030000234840 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00390000008903 ENSGT00940000165627 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a Emydidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b 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SMIM15 (ENSGEVG00005005657) ENSGEVG00005020377 ZSWIM6 (ENSGEVG00005020331) Chinese turtle MODERN SPECIES 241 ENSPSIG00000010020 GPBP1 (ENSPSIG00000009726) ##22 PLK2 (ENSPSIG00000007060) ENSPSIG00000000319 RAB3C (ENSPSIG00000006731) PDE4D (ENSPSIG00000006707) DEPDC1B (ENSPSIG00000005857) ELOVL7 (ENSPSIG00000014003) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 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ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01090000261499 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000163637 Eastern brown snake MODERN SPECIES 2 ENSPTXG00000009211 ENSPTXG00000009219 GPX8 (ENSPTXG00000009223) MCIDAS (ENSPTXG00000009224) CCNO (ENSPTXG00000009225) DHX29 (ENSPTXG00000009235) MTREX (ENSPTXG00000009489) PLPP1 (ENSPTXG00000009490) SLC38A9 (ENSPTXG00000009491) DDX4 (ENSPTXG00000009494) IL6ST (ENSPTXG00000009561) ANKRD55 (ENSPTXG00000009564) MAP3K1 (ENSPTXG00000009565) SETD9 (ENSPTXG00000009566) MIER3 (ENSPTXG00000009567) GPBP1 (ENSPTXG00000009568) ##22 PLK2 (ENSPTXG00000009569) RAB3C (ENSPTXG00000009571) PDE4D (ENSPTXG00000000043) ENSPTXG00000000078 ENSPTXG00000000098 DEPDC1B (ENSPTXG00000000108) ELOVL7 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(ENSNSUG00000003235) Blue-lipped sea krait MODERN SPECIES 9156 GPBP1 (ENSLLTG00000011334) ##22 Lizard MODERN SPECIES 1 GPX8 (ENSACAG00000015412) CDC20B (ENSACAG00000015417) MCIDAS (ENSACAG00000015405) CCNO (ENSACAG00000015399) DHX29 (ENSACAG00000015328) MTREX (ENSACAG00000015200) PLPP1 (ENSACAG00000015109) SLC38A9 (ENSACAG00000015025) DDX4 (ENSACAG00000014951) IL31RA (ENSACAG00000014938) IL6ST (ENSACAG00000014810) ANKRD55 (ENSACAG00000014766) MAP3K1 (ENSACAG00000014703) SETD9 (ENSACAG00000014688) MIER3 (ENSACAG00000028478) GPBP1 (ENSACAG00000014605) ##22 SMAD2 (ENSACAG00000018008) ZBTB7C (ENSACAG00000018007) CTIF (ENSACAG00000018006) SMAD7 (ENSACAG00000040103) ENSACAG00000045249 DYM (ENSACAG00000018002) C18orf32 (ENSACAG00000028947) ENSACAG00000017998 LIPG (ENSACAG00000017995) ACAA2 (ENSACAG00000017990) Laterata ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00950000183104.A.a.b ENSGT00940000159371 ENSGT00940000153270.b.a ENSGT00940000155998 ENSGT00940000157286 ENSGT00940000156183 ENSGT00940000156730 ENSGT00390000005646 ENSGT00940000157507 ENSGT00940000155603.A.b ENSGT00940000159608 ENSGT00950000182908.A ENSGT00940000159154 ENSGT00390000001437 ENSGT01030000234573.A.b.b.b ENSGT00420000029753.a ##22 ENSGT00940000158739 ENSGT00940000157368 ENSGT00940000155674 ENSGT01030000234840 ENSGT00510000051272 ENSGT00950000182976.b.b ENSGT01050000244838.H.c ENSGT00390000009065 ENSGT00390000002743 ENSGT00940000165045 ENSGT00940000155496.b ENSGT00940000155570 ENSGT00950000183142.a.a ENSGT00390000014071 ENSGT00940000154484.B.a.a Common wall lizard MODERN SPECIES 2 MCIDAS (ENSPMRG00000017048) CCNO (ENSPMRG00000017051) DHX29 (ENSPMRG00000017053) MTREX (ENSPMRG00000017057) PLPP1 (ENSPMRG00000017070) ENSPMRG00000017084 SLC38A9 (ENSPMRG00000017135) ENSPMRG00000017144 DDX4 (ENSPMRG00000017153) IL31RA (ENSPMRG00000017186) IL6ST (ENSPMRG00000017199) ANKRD55 (ENSPMRG00000017206) MAP3K1 (ENSPMRG00000017217) SETD9 (ENSPMRG00000017228) MIER3 (ENSPMRG00000017238) GPBP1 (ENSPMRG00000017248) ##22 PLK2 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ENSGT00940000153725.b ENSGT00940000161622 ENSGT00510000047710 ENSGT00940000155967 ENSGT00940000156571 Frog MODERN SPECIES gpx8 (ENSXETG00000028092) cdc20b (ENSXETG00000031301) mcidas (ENSXETG00000033274) ccno (ENSXETG00000028091) dhx29 (ENSXETG00000000367) mtrex (ENSXETG00000032798) slc38a9 (ENSXETG00000028090) ENSXETG00000046862 ENSXETG00000048995 ddx4 (ENSXETG00000030832) il6st (ENSXETG00000015503) ankrd55 (ENSXETG00000015510) map3k1 (ENSXETG00000015513) setd9 (ENSXETG00000015517) mier3 (ENSXETG00000015520) gpbp1 (ENSXETG00000015527) ##22 ENSXETG00000047127 ENSXETG00000045262 smyd5 (ENSXETG00000011764) ENSXETG00000044015 ENSXETG00000048571 ENSXETG00000049463 plk2 (ENSXETG00000018847) ENSXETG00000036149 ENSXETG00000044791 dazl (ENSXETG00000025199) rab3c (ENSXETG00000018853) pde4d (ENSXETG00000018854) ENSXETG00000045835 depdc1b (ENSXETG00000006073) ENSXETG00000026198 Leishan spiny toad MODERN SPECIES ENSLLEG00000010331 ENSLLEG00000010297 ZSWIM6 (ENSLLEG00000010156) SMIM15 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