Vertebrata ANCESTRAL SPECIES 84 ENSGT00390000005147 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000007890 ENSGT00950000182937.B Gnathostomata ANCESTRAL SPECIES 259 ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000018424 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A Euteleostomi ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000018424 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 Sarcopterygii ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00390000006913 ENSGT00940000161222 ENSGT01050000244940.b ENSGT00940000165344 ENSGT01000000214687 ENSGT00940000163109 ENSGT00940000155240.A ENSGT00940000157643 ENSGT00940000160401 ENSGT00940000159226 ENSGT00940000158420 ENSGT00440000039984.b ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000018424 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 Tetrapoda ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000006913 ENSGT00940000161222 ENSGT01050000244940.b ENSGT00940000165344 ENSGT01000000214687 ENSGT00940000163109 ENSGT00940000155240.A ENSGT00940000157643 ENSGT00940000160401 ENSGT00940000159226 ENSGT00940000158420 ENSGT00440000039984.b ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000018424 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 Amniota ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000161222 ENSGT01050000244940.b ENSGT00940000165344 ENSGT01050000248015 ENSGT00390000012979 ENSGT00940000163109 ENSGT00940000155240.A ENSGT00940000157643 ENSGT00940000160401 ENSGT00940000159226 ENSGT00940000158420 ENSGT00440000039984.b ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000179276 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 Mammalia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797 #22 Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 392 PLVAP (ENSPSMG00000025067) #7 CCDC194 (ENSPSMG00000025073) #8 MVB12A (ENSPSMG00000025080) #9 TMEM221 (ENSPSMG00000025084) #10 NXNL1 (ENSPSMG00000025092) #11 SLC27A1 (ENSPSMG00000025104) #12 PGLS (ENSPSMG00000025113) #13 NIBAN3 (ENSPSMG00000025145) #14 COLGALT1 (ENSPSMG00000025160) #15 ENSPSMG00000025267 #16 MAP1S (ENSPSMG00000025300) #17 FCHO1 (ENSPSMG00000025368) #18 B3GNT3 (ENSPSMG00000025381) #19 INSL3 (ENSPSMG00000025384) #20 JAK3 (ENSPSMG00000025390) #21 RPL18A (ENSPSMG00000025399) #22 SLC5A5 (ENSPSMG00000025406) #23 CCDC124 (ENSPSMG00000025412) #24 KCNN1 (ENSPSMG00000025418) #25 ARRDC2 (ENSPSMG00000025428) #26 IL12RB1 (ENSPSMG00000025429) #27 MAST3 (ENSPSMG00000025443) #28 PIK3R2 (ENSPSMG00000025461) #29 IFI30 (ENSPSMG00000025464) #30 MPV17L2 (ENSPSMG00000025466) #31 RAB3A (ENSPSMG00000025469) #32 PDE4C (ENSPSMG00000025493) #33 IQCN (ENSPSMG00000000071) #34 JUND (ENSPSMG00000000089) #35 LSM4 (ENSPSMG00000000120) #36 PGPEP1 (ENSPSMG00000000175) #37 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Mas night monkey MODERN SPECIES 1025 ENSANAG00000018049 GALNT13 (ENSANAG00000034184) ENSANAG00000024363 #22 ENSANAG00000032096 KCNJ3 (ENSANAG00000024065) NR4A2 (ENSANAG00000033869) GPD2 (ENSANAG00000029065) ENSANAG00000024064 GALNT5 (ENSANAG00000031318) ERMN (ENSANAG00000024435) CYTIP (ENSANAG00000021557) ACVR1C (ENSANAG00000020309) ENSANAG00000036181 ACVR1 (ENSANAG00000037191) UPP2 (ENSANAG00000014254) CCDC148 (ENSANAG00000030337) PKP4 (ENSANAG00000030283) ENSANAG00000027356 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Marmoset MODERN SPECIES 21 CD163L1 (ENSCJAG00000005091) ENSCJAG00000052734 DDX11 (ENSCJAG00000005153) ENSCJAG00000054104 ENSCJAG00000065230 ENSCJAG00000081130 ENSCJAG00000005234 ENSCJAG00000072529 CD163 (ENSCJAG00000005332) ENSCJAG00000079699 ENSCJAG00000074967 APOBEC1 (ENSCJAG00000005398) ENSCJAG00000086680 GDF3 (ENSCJAG00000005406) ENSCJAG00000072636 ENSCJAG00000071581 #22 ENSCJAG00000018999 ENSCJAG00000043823 ENSCJAG00000081220 ENSCJAG00000018988 FOXJ2 (ENSCJAG00000018955) C3AR1 (ENSCJAG00000083855) NECAP1 (ENSCJAG00000018934) CLEC4A (ENSCJAG00000018929) CLEC6A (ENSCJAG00000037433) CLEC4D (ENSCJAG00000080376) CLEC4E (ENSCJAG00000018899) AICDA (ENSCJAG00000018856) ENSCJAG00000077911 MFAP5 (ENSCJAG00000018846) RIMKLB (ENSCJAG00000018810) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000154966.l ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 46 RBM43 (ENSSBOG00000022371) NMI (ENSSBOG00000035067) TNFAIP6 (ENSSBOG00000034644) RIF1 (ENSSBOG00000029530) NEB (ENSSBOG00000031622) ARL5A (ENSSBOG00000034323) CACNB4 (ENSSBOG00000025206) ENSSBOG00000023639 ENSSBOG00000027242 ENSSBOG00000023807 FMNL2 (ENSSBOG00000027176) PRPF40A (ENSSBOG00000015435) ARL6IP6 (ENSSBOG00000029584) RPRM (ENSSBOG00000009917) GALNT13 (ENSSBOG00000024917) ENSSBOG00000030750 #22 KCNJ3 (ENSSBOG00000023474) NR4A2 (ENSSBOG00000021402) ENSSBOG00000027281 ENSSBOG00000023257 GALNT5 (ENSSBOG00000020422) ERMN (ENSSBOG00000031955) ENSSBOG00000028587 CYTIP (ENSSBOG00000025520) ENSSBOG00000035700 ACVR1C (ENSSBOG00000030313) ACVR1 (ENSSBOG00000025226) ENSSBOG00000005244 UPP2 (ENSSBOG00000025379) ENSSBOG00000018918 CCDC148 (ENSSBOG00000028768) Capuchin MODERN SPECIES 597 ENSCCAG00000024093 ENSCCAG00000020739 ENSCCAG00000030112 ZFP92 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ENSGT00390000016277.a ENSGT00940000157537 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000155365.a.a ENSGT00940000160695 ENSGT00420000029769.a ENSGT00940000163819 ENSGT00940000163753 ENSGT01020000230359.E ENSGT00940000153709.B ENSGT00940000154276.hb.a ENSGT00390000000596 ENSGT00910000147587 ENSGT00530000063629.b ENSGT00940000156360 ENSGT00940000160089 ENSGT00940000158548 ENSGT00940000160407 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 13 ENSMFAG00000064487 ENSMFAG00000054353 ENSMFAG00000063826 ENSMFAG00000062329 ENSMFAG00000047283 ENSMFAG00000065655 ENSMFAG00000057761 ENSMFAG00000048609 ENSMFAG00000058999 PAPOLB (ENSMFAG00000031074) ENSMFAG00000000208 AP5Z1 (ENSMFAG00000032526) ENSMFAG00000051721 FOXK1 (ENSMFAG00000041125) SDK1 (ENSMFAG00000032698) ENSMFAG00000064451 #22 ENSMFAG00000063614 ENSMFAG00000059642 CARD11 (ENSMFAG00000036800) ENSMFAG00000054681 GNA12 (ENSMFAG00000046194) AMZ1 (ENSMFAG00000045552) BRAT1 (ENSMFAG00000000395) IQCE 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(ENSMNEG00000041408) KLHL40 (ENSMNEG00000031823) ZBTB47 (ENSMNEG00000027370) NKTR (ENSMNEG00000041077) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 393 IFI27L2 (ENSMNEG00000032778) ENSMNEG00000029506 IFI27L1 (ENSMNEG00000029364) DDX24 (ENSMNEG00000043984) OTUB2 (ENSMNEG00000041748) CCDC197 (ENSMNEG00000045081) ASB2 (ENSMNEG00000042223) FAM181A (ENSMNEG00000029720) ENSMNEG00000019080 PRIMA1 (ENSMNEG00000031734) ENSMNEG00000044247 UNC79 (ENSMNEG00000030781) ENSMNEG00000029272 BTBD7 (ENSMNEG00000039208) UBR7 (ENSMNEG00000041654) ENSMNEG00000039800 #22 GON7 (ENSMNEG00000021848) LYSET (ENSMNEG00000005190) MOAP1 (ENSMNEG00000020717) ITPK1 (ENSMNEG00000032279) CHGA (ENSMNEG00000043753) GOLGA5 (ENSMNEG00000045156) LGMN (ENSMNEG00000039639) RIN3 (ENSMNEG00000043726) SLC24A4 (ENSMNEG00000042792) CPSF2 (ENSMNEG00000031584) ENSMNEG00000039060 ENSMNEG00000036179 ENSMNEG00000020081 TRIP11 (ENSMNEG00000040765) FBLN5 (ENSMNEG00000036802) Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Tree shrew MODERN SPECIES 9851 RPL18A (ENSTBEG00000010488) #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Alpin marmot MODERN SPECIES 24 ENSMMMG00000023560 ENSMMMG00000023562 MVB12A (ENSMMMG00000023564) #9 TMEM221 (ENSMMMG00000023566) #10 ENSMMMG00000023567 #11 SLC27A1 (ENSMMMG00000000227) #12 PGLS (ENSMMMG00000000284) #13 NIBAN3 (ENSMMMG00000000306) #14 ENSMMMG00000000381 #15 ENSMMMG00000000402 #15 ENSMMMG00000000424 ENSMMMG00000000547 #17 ENSMMMG00000000566 #18 INSL3 (ENSMMMG00000000672) #20 JAK3 (ENSMMMG00000000693) #21 RPL18A (ENSMMMG00000000829) #22 SLC5A5 (ENSMMMG00000000854) #23 CCDC124 (ENSMMMG00000000927) #24 KCNN1 (ENSMMMG00000000948) #25 ENSMMMG00000000971 #27 MAST3 (ENSMMMG00000000984) #28 ENSMMMG00000001094 #29 IFI30 (ENSMMMG00000001207) #30 MPV17L2 (ENSMMMG00000001276) #31 RAB3A (ENSMMMG00000001289) #32 ENSMMMG00000001307 #33 ENSMMMG00000001318 #33 ENSMMMG00000001330 ENSMMMG00000001343 #34 LSM4 (ENSMMMG00000001362) #36 PGPEP1 (ENSMMMG00000001398) #37 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000002505 ENSGT00950000182915.b.b.b.b ENSGT00940000155438.b ENSGT00940000163163 ENSGT00940000157924 ENSGT00390000013811 ENSGT00940000160466 ENSGT00940000161678 ENSGT00940000157246 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 Naked mole-rat female MODERN SPECIES 21 CHERP (ENSHGLG00000002993) ENSHGLG00000003381 EPS15L1 (ENSHGLG00000005235) ENSHGLG00000047567 AP1M1 (ENSHGLG00000041098) ENSHGLG00000003291 ENSHGLG00000042939 ENSHGLG00000039588 ENSHGLG00000002682 ENSHGLG00000042793 ENSHGLG00000002766 #18 B3GNT3 (ENSHGLG00000047384) #19 ENSHGLG00000003768 #20 JAK3 (ENSHGLG00000003869) #21 ENSHGLG00000041243 RPL18A (ENSHGLG00000002321) #22 SLC5A5 (ENSHGLG00000002528) #23 CCDC124 (ENSHGLG00000002655) #24 KCNN1 (ENSHGLG00000002697) #25 ARRDC2 (ENSHGLG00000003087) #26 IL12RB1 (ENSHGLG00000029940) #27 MAST3 (ENSHGLG00000003256) #28 IFI30 (ENSHGLG00000001756) #30 ENSHGLG00000001889 #31 RAB3A (ENSHGLG00000040086) #32 PDE4C (ENSHGLG00000002262) #33 ENSHGLG00000037483 #34 ENSHGLG00000032754 #35 LSM4 (ENSHGLG00000006568) #36 PGPEP1 (ENSHGLG00000006686) #37 GDF15 (ENSHGLG00000032564) Hystricomorpha_a DUPLICATION Hystricomorpha_a DUPLICATION Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.a #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.a #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 259 FAM3A (ENSODEG00000006189) UBL4A (ENSODEG00000006287) ENSODEG00000006315 PLXNA3 (ENSODEG00000006368) ENSODEG00000006510 GDI1 (ENSODEG00000006550) ATP6AP1 (ENSODEG00000003643) TAFAZZIN (ENSODEG00000003758) DNASE1L1 (ENSODEG00000003830) ENSODEG00000003868 EMD (ENSODEG00000003890) FLNA (ENSODEG00000004055) TKTL1 (ENSODEG00000004431) ENSODEG00000004454 ENSODEG00000004473 ENSODEG00000004516 #22 MECP2 (ENSODEG00000004523) IRAK1 (ENSODEG00000004583) HCFC1 (ENSODEG00000004823) RENBP (ENSODEG00000005065) ENSODEG00000005100 ARHGAP4 (ENSODEG00000005124) AVPR2 (ENSODEG00000005166) ENSODEG00000005204 L1CAM (ENSODEG00000005259) PDZD4 (ENSODEG00000005482) SSR4 (ENSODEG00000002732) IDH3G (ENSODEG00000002774) SRPK3 (ENSODEG00000002869) PLXNB3 (ENSODEG00000002965) ABCD1 (ENSODEG00000003127) Degu MODERN SPECIES 299 ENSODEG00000000731 #22 OLFM4 (ENSODEG00000000720) PCDH8 (ENSODEG00000000712) ENSODEG00000000702 ENSODEG00000000692 ENSODEG00000018599 CNMD (ENSODEG00000000669) Guinea pig MODERN SPECIES 56 NDUFS2 (ENSCPOG00000012481) ADAMTS4 (ENSCPOG00000014372) B4GALT3 (ENSCPOG00000038979) PPOX (ENSCPOG00000015323) USP21 (ENSCPOG00000015322) UFC1 (ENSCPOG00000026930) DEDD (ENSCPOG00000015321) NIT1 (ENSCPOG00000015320) PFDN2 (ENSCPOG00000035159) KLHDC9 (ENSCPOG00000005123) NECTIN4 (ENSCPOG00000015318) ARHGAP30 (ENSCPOG00000022193) USF1 (ENSCPOG00000003957) TSTD1 (ENSCPOG00000020739) F11R (ENSCPOG00000023572) ENSCPOG00000021022 #22 ENSCPOG00000023863 ENSCPOG00000030350 ENSCPOG00000037419 ENSCPOG00000038232 ENSCPOG00000036074 ENSCPOG00000002224 SLAMF7 (ENSCPOG00000036736) CD48 (ENSCPOG00000038301) SLAMF1 (ENSCPOG00000002925) CD84 (ENSCPOG00000008701) ENSCPOG00000006924 VANGL2 (ENSCPOG00000010224) NHLH1 (ENSCPOG00000021596) NCSTN (ENSCPOG00000014923) COPA (ENSCPOG00000014917) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.b #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 87 KIF20B (ENSODEG00000005304) ENSODEG00000019106 HTR7 (ENSODEG00000004910) ENSODEG00000004530 ANKRD1 (ENSODEG00000005129) PCGF5 (ENSODEG00000004787) ENSODEG00000005047 HECTD2 (ENSODEG00000004980) PPP1R3C (ENSODEG00000006013) TNKS2 (ENSODEG00000004816) BTAF1 (ENSODEG00000005172) ENSODEG00000005031 CPEB3 (ENSODEG00000004591) ENSODEG00000004464 MARCHF5 (ENSODEG00000004219) ENSODEG00000005936 #22 IDE (ENSODEG00000005398) KIF11 (ENSODEG00000006812) HHEX (ENSODEG00000006657) ENSODEG00000005404 ENSODEG00000019192 ENSODEG00000005119 ENSODEG00000019122 ENSODEG00000005000 ENSODEG00000005878 ENSODEG00000005365 EXOC6 (ENSODEG00000005032) CYP26C1 (ENSODEG00000006273) CYP26A1 (ENSODEG00000006141) ENSODEG00000006071 MYOF (ENSODEG00000004826) Degu MODERN SPECIES 317 ENSODEG00000018695 #22 ENSODEG00000001530 JPH4 (ENSODEG00000001519) ENSODEG00000018942 AP1G2 (ENSODEG00000002984) THTPA (ENSODEG00000002973) ZFHX2 (ENSODEG00000002856) NGDN (ENSODEG00000002730) MYH7 (ENSODEG00000002613) MYH6 (ENSODEG00000002284) CMTM5 (ENSODEG00000002188) IL25 (ENSODEG00000002172) EFS (ENSODEG00000002155) SLC22A17 (ENSODEG00000002123) ENSODEG00000002083 PPP1R3E (ENSODEG00000001965) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.b #22 Guinea pig MODERN SPECIES 72 ENSCPOG00000015029 ENSCPOG00000026080 ENSCPOG00000006749 ENSCPOG00000035498 ENSCPOG00000010168 ENSCPOG00000022226 OR4C11 (ENSCPOG00000014721) ENSCPOG00000039911 ENSCPOG00000030047 ENSCPOG00000021816 ENSCPOG00000034616 FCHO1 (ENSCPOG00000010411) #18 B3GNT3 (ENSCPOG00000039336) #19 INSL3 (ENSCPOG00000019362) #20 JAK3 (ENSCPOG00000015116) #21 RPL18A (ENSCPOG00000015205) #22 SLC5A5 (ENSCPOG00000002288) #23 CCDC124 (ENSCPOG00000024560) #24 KCNN1 (ENSCPOG00000021112) #25 ARRDC2 (ENSCPOG00000026098) #26 IL12RB1 (ENSCPOG00000025820) #27 MAST3 (ENSCPOG00000015590) #28 PIK3R2 (ENSCPOG00000024452) #29 Ifi30 (ENSCPOG00000005553) #30 RAB3A (ENSCPOG00000038085) #32 MPV17L2 (ENSCPOG00000039365) #31 PDE4C (ENSCPOG00000030930) #33 ENSCPOG00000035754 JUND (ENSCPOG00000025912) #35 LSM4 (ENSCPOG00000024117) #36 PGPEP1 (ENSCPOG00000031925) #37 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.b #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 188 GOSR1 (ENSCLAG00000010994) CPD (ENSCLAG00000008233) TMIGD1 (ENSCLAG00000005023) BLMH (ENSCLAG00000004413) SLC6A4 (ENSCLAG00000009083) NSRP1 (ENSCLAG00000005413) EFCAB5 (ENSCLAG00000006698) SSH2 (ENSCLAG00000004951) CORO6 (ENSCLAG00000009309) ANKRD13B (ENSCLAG00000006356) GIT1 (ENSCLAG00000005307) TP53I13 (ENSCLAG00000006219) ABHD15 (ENSCLAG00000006673) ENSCLAG00000006911 TAOK1 (ENSCLAG00000005510) ENSCLAG00000009994 #22 NUFIP2 (ENSCLAG00000007711) CRYBA1 (ENSCLAG00000010128) MYO18A (ENSCLAG00000009674) PIPOX (ENSCLAG00000006253) SEZ6 (ENSCLAG00000007089) PHF12 (ENSCLAG00000005916) DHRS13 (ENSCLAG00000012986) FLOT2 (ENSCLAG00000014550) ERAL1 (ENSCLAG00000004778) FAM222B (ENSCLAG00000007626) TRAF4 (ENSCLAG00000009205) NEK8 (ENSCLAG00000011158) TLCD1 (ENSCLAG00000005415) ENSCLAG00000007694 RAB34 (ENSCLAG00000009672) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000154929.B #16 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 127 Zdhhc7 (ENSJJAG00000011006) Crispld2 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ENSNGAG00000023710 #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938 ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938.s ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 112 Cnep1r1 (ENSCGRG00001009199) Heatr3 (ENSCGRG00001024755) Tent4b (ENSCGRG00001023597) Adcy7 (ENSCGRG00001014504) Brd7 (ENSCGRG00001003449) Nkd1 (ENSCGRG00001011787) Snx20 (ENSCGRG00001020312) Nod2 (ENSCGRG00001011531) Cyld (ENSCGRG00001000533) ENSCGRG00001019423 ##22 ENSCGRG00001023314 Tox3 (ENSCGRG00001021816) ENSCGRG00001001946 ENSCGRG00001010471 Gm19935 (ENSCGRG00001012263) ENSCGRG00001012667 #22 Chd9 (ENSCGRG00001016150) Rbl2 (ENSCGRG00001012793) ENSCGRG00001024361 ENSCGRG00001013457 Rpgrip1l (ENSCGRG00001020196) Fto (ENSCGRG00001013545) Irx3 (ENSCGRG00001022254) Irx5 (ENSCGRG00001019317) ENSCGRG00001021640 Irx6 (ENSCGRG00001005135) Mmp2 (ENSCGRG00001020567) Lpcat2 (ENSCGRG00001018067) Slc6a2 (ENSCGRG00001015472) Ces1a (ENSCGRG00001017007) ENSCGRG00001013949 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938 ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 137 ENSMOCG00000011490 ENSMOCG00000010137 ENSMOCG00000019154 #22 ENSMOCG00000018583 ENSMOCG00000016093 ENSMOCG00000010691 Rbl2 (ENSMOCG00000002758) Aktip (ENSMOCG00000000125) Rpgrip1l (ENSMOCG00000002757) Fto (ENSMOCG00000012365) Irx3 (ENSMOCG00000001570) Irx5 (ENSMOCG00000000963) Irx6 (ENSMOCG00000000419) Mmp2 (ENSMOCG00000000066) Lpcat2 (ENSMOCG00000010966) SLC6A2 (ENSMOCG00000016144) Ces1a (ENSMOCG00000010710) ENSMOCG00000000069 Prairie vole MODERN SPECIES 223 Cul1 (ENSMOCG00000014278) ENSMOCG00000019854 ENSMOCG00000008643 #22 Prairie vole MODERN SPECIES 1 Slc35a2 (ENSMOCG00000015110) Pqbp1 (ENSMOCG00000020123) Timm17b (ENSMOCG00000022137) Pcsk1n (ENSMOCG00000016403) Eras (ENSMOCG00000017489) Hdac6 (ENSMOCG00000022461) Gata1 (ENSMOCG00000018101) Glod5 (ENSMOCG00000018812) Suv39h1 (ENSMOCG00000013532) Was (ENSMOCG00000022215) Wdr13 (ENSMOCG00000000752) Rbm3 (ENSMOCG00000001511) Tbc1d25 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ENSPEMG00000012662 Fancb (ENSPEMG00000014927) Mospd2 (ENSPEMG00000016810) Asb9 (ENSPEMG00000012020) Asb11 (ENSPEMG00000004210) Piga (ENSPEMG00000029436) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000016851 ENSGT00940000157019 ENSGT00390000007029.j ENSGT00390000012240 ENSGT00390000007336 ENSGT00510000049316 ENSGT00390000016934 ENSGT00530000063974.a ENSGT00940000160748 ENSGT00940000162475 ENSGT00390000014361 ENSGT00940000156845 ENSGT00390000010974 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00900000143617 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 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ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.d.q.b #22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 Arabian camel MODERN SPECIES 14 CCDC194 (ENSCDRG00005015352) #8 ENSCDRG00005015336 MVB12A (ENSCDRG00005015302) #9 TMEM221 (ENSCDRG00005015271) #10 NXNL1 (ENSCDRG00005015249) #11 SLC27A1 (ENSCDRG00005015186) #12 PGLS (ENSCDRG00005015148) #13 NIBAN3 (ENSCDRG00005014472) #14 COLGALT1 (ENSCDRG00005014401) #15 UNC13A (ENSCDRG00005013982) MAP1S (ENSCDRG00005013868) #17 FCHO1 (ENSCDRG00005013455) #18 B3GNT3 (ENSCDRG00005013389) #19 INSL3 (ENSCDRG00005013353) #20 JAK3 (ENSCDRG00005013213) #21 ENSCDRG00005013110 #22 SLC5A5 (ENSCDRG00005012971) #23 CCDC124 (ENSCDRG00005012930) 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(ENSPLOG00000004132) #28 PIK3R2 (ENSPLOG00000004171) #29 IFI30 (ENSPLOG00000004199) #30 MPV17L2 (ENSPLOG00000000018) #31 RAB3A (ENSPLOG00000000031) #32 PDE4C (ENSPLOG00000000047) #33 ENSPLOG00000000074 #34 JUND (ENSPLOG00000000080) #35 LSM4 (ENSPLOG00000000089) #36 PGPEP1 (ENSPLOG00000000108) #37 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Sperm whale MODERN SPECIES 763 ENSPCTG00005015873 #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000017462 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a ENSGT00390000005254.i.a.a.b ENSGT00940000162106 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000161231.g ENSGT00940000156814 ENSGT00940000158747 ENSGT00390000009130.a.a.b.a ENSGT00390000011383 ENSGT00390000014416 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000010075 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000015797.d.r #22 ENSGT00940000154668 ENSGT00940000160020 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000003050 ENSGT00500000044987 ENSGT00940000153432.B ENSGT00390000004624.a.a ENSGT00940000158907 ENSGT00390000001442 ENSGT00940000158207 ENSGT00940000158944 ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00390000016326 Goat MODERN SPECIES 12 TTC33 (ENSCHIG00000020642) PRKAA1 (ENSCHIG00000017495) RPL37 (ENSCHIG00000014444) CARD6 (ENSCHIG00000020994) C7 (ENSCHIG00000016536) ENSCHIG00000012521 ENSCHIG00000002172 C6 (ENSCHIG00000021210) PLCXD3 (ENSCHIG00000016815) ENSCHIG00000012124 RIMOC1 (ENSCHIG00000000538) FBXO4 (ENSCHIG00000021750) GHR (ENSCHIG00000018928) CCDC152 (ENSCHIG00000011450) ENSCHIG00000006291 ENSCHIG00000023711 #22 ENSCHIG00000020006 NIM1K (ENSCHIG00000017425) HMGCS1 (ENSCHIG00000015096) CCL28 (ENSCHIG00000012602) TMEM267 (ENSCHIG00000007411) ENSCHIG00000008597 PAIP1 (ENSCHIG00000011111) NNT (ENSCHIG00000021958) FGF10 (ENSCHIG00000012683) MRPS30 (ENSCHIG00000018591) HCN1 (ENSCHIG00000024729) ENSCHIG00000009285 ENSCHIG00000017939 EMB (ENSCHIG00000012020) PARP8 (ENSCHIG00000017274) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 American bison MODERN SPECIES 2747 GHR (ENSBBBG00000014212) CCDC152 (ENSBBBG00000014253) ENSBBBG00000014273 ENSBBBG00000014278 #22 ENSBBBG00000003244 ZNF131 (ENSBBBG00000003267) NIM1K (ENSBBBG00000001415) HMGCS1 (ENSBBBG00000014374) CCL28 (ENSBBBG00000014385) TMEM267 (ENSBBBG00000003302) C5orf34 (ENSBBBG00000003312) ENSBBBG00000003349 NNT (ENSBBBG00000014553) Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.a #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.a #22 Cow MODERN SPECIES 1 SYNDIG1L (ENSBTAG00000052950) VRTN (ENSBTAG00000005774) ABCD4 (ENSBTAG00000014633) VSX2 (ENSBTAG00000014632) LIN52 (ENSBTAG00000030557) ALDH6A1 (ENSBTAG00000018469) ENSBTAG00000053938 BBOF1 (ENSBTAG00000018467) ENTPD5 (ENSBTAG00000020334) COQ6 (ENSBTAG00000020331) FAM161B (ENSBTAG00000020329) ZNF410 (ENSBTAG00000020327) PTGR2 (ENSBTAG00000003747) MIDEAS (ENSBTAG00000009272) PNMA1 (ENSBTAG00000009271) ENSBTAG00000009783 #22 DNAL1 (ENSBTAG00000015930) ENSBTAG00000010270 ENSBTAG00000009788 ACOT4 (ENSBTAG00000002843) ACOT2 (ENSBTAG00000046814) RIOX1 (ENSBTAG00000025372) HEATR4 (ENSBTAG00000002842) NUMB (ENSBTAG00000011683) PAPLN (ENSBTAG00000011680) PSEN1 (ENSBTAG00000011757) RBM25 (ENSBTAG00000017177) ZFYVE1 (ENSBTAG00000011041) DCAF4 (ENSBTAG00000008713) ENSBTAG00000046952 DPF3 (ENSBTAG00000025458) Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.b.a #22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.b.a #22 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 2 SYNDIG1L (ENSBGRG00000006594) VRTN (ENSBGRG00000006578) ABCD4 (ENSBGRG00000006381) VSX2 (ENSBGRG00000006307) LIN52 (ENSBGRG00000006226) ALDH6A1 (ENSBGRG00000006095) BBOF1 (ENSBGRG00000005994) ENTPD5 (ENSBGRG00000005910) COQ6 (ENSBGRG00000018611) FAM161B (ENSBGRG00000018523) ZNF410 (ENSBGRG00000018207) ENSBGRG00000018082 MIDEAS (ENSBGRG00000017732) PNMA1 (ENSBGRG00000017709) ENSBGRG00000017562 ENSBGRG00000017483 #22 ENSBGRG00000017419 #22 ENSBGRG00000017382 ACOT6 (ENSBGRG00000017306) ENSBGRG00000017115 ENSBGRG00000017051 RIOX1 (ENSBGRG00000016972) ENSBGRG00000016829 NUMB (ENSBGRG00000016469) PAPLN (ENSBGRG00000015385) PSEN1 (ENSBGRG00000015004) ENSBGRG00000014962 RBM25 (ENSBGRG00000014814) ZFYVE1 (ENSBGRG00000014619) ENSBGRG00000014589 ENSBGRG00000014407 Domestic yak MODERN SPECIES 2 VRTN (ENSBGRG00000006578) ABCD4 (ENSBGRG00000006381) VSX2 (ENSBGRG00000006307) LIN52 (ENSBGRG00000006226) ALDH6A1 (ENSBGRG00000006095) BBOF1 (ENSBGRG00000005994) ENTPD5 (ENSBGRG00000005910) COQ6 (ENSBGRG00000018611) FAM161B (ENSBGRG00000018523) ZNF410 (ENSBGRG00000018207) ENSBGRG00000018082 MIDEAS (ENSBGRG00000017732) PNMA1 (ENSBGRG00000017709) ENSBGRG00000017562 ENSBGRG00000017483 #22 ENSBGRG00000017419 #22 ENSBGRG00000017382 ACOT6 (ENSBGRG00000017306) ENSBGRG00000017115 ENSBGRG00000017051 RIOX1 (ENSBGRG00000016972) ENSBGRG00000016829 NUMB (ENSBGRG00000016469) PAPLN (ENSBGRG00000015385) PSEN1 (ENSBGRG00000015004) ENSBGRG00000014962 RBM25 (ENSBGRG00000014814) ZFYVE1 (ENSBGRG00000014619) ENSBGRG00000014589 ENSBGRG00000014407 ENSBGRG00000014383 Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159638 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000156761 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144.j ENSGT00940000162094 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00390000015797.d.r.b.b #22 ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000006264.c ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045.k.b ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000157554 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000156761 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144.j ENSGT00940000162094 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00920000150755 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00390000015797.d.r.b.b #22 ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000006264.c ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045.k.b ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000157554 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 PTPRU (ENSBIXG00005001071) MECR (ENSBIXG00005007751) SRSF4 (ENSBIXG00005011082) TMEM200B (ENSBIXG00005007469) EPB41 (ENSBIXG00005010985) OPRD1 (ENSBIXG00005010747) YTHDF2 (ENSBIXG00005000620) GMEB1 (ENSBIXG00005010684) TAF12 (ENSBIXG00005000915) RAB42 (ENSBIXG00005000908) ENSBIXG00005010590 TRNAU1AP (ENSBIXG00005000707) RCC1 (ENSBIXG00005010509) PHACTR4 (ENSBIXG00005000752) ENSBIXG00005010390 ENSBIXG00005010380 #22 MED18 (ENSBIXG00005010361) SESN2 (ENSBIXG00005000853) ATP5IF1 (ENSBIXG00005000831) DNAJC8 (ENSBIXG00005010254) ENSBIXG00005010236 PTAFR (ENSBIXG00005000806) EYA3 (ENSBIXG00005000796) XKR8 (ENSBIXG00005005690) SMPDL3B (ENSBIXG00005009947) ENSBIXG00005009925 THEMIS2 (ENSBIXG00005009901) PPP1R8 (ENSBIXG00005000665) STX12 (ENSBIXG00005009866) FAM76A (ENSBIXG00005009850) ENSBIXG00005000618 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000156761 ENSGT01100000263839 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144.j ENSGT00940000162094 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00390000015797.d.r.b.b #22 ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000006264.c ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00910000147719.b ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045.k.b ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163178 Domestic yak MODERN SPECIES 11 MECR (ENSBGRG00000021789) SRSF4 (ENSBGRG00000021699) TMEM200B (ENSBGRG00000021675) EPB41 (ENSBGRG00000016000) OPRD1 (ENSBGRG00000015656) YTHDF2 (ENSBGRG00000015573) ENSBGRG00000015547 ENSBGRG00000015523 GMEB1 (ENSBGRG00000015362) TAF12 (ENSBGRG00000015289) RAB42 (ENSBGRG00000015211) TRNAU1AP (ENSBGRG00000014936) RCC1 (ENSBGRG00000014760) ENSBGRG00000014684 PHACTR4 (ENSBGRG00000014359) ENSBGRG00000014301 #22 MED18 (ENSBGRG00000014253) SESN2 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B3GNT3 (ENSPVAG00000017375) #19 ENSPVAG00000024188 JAK3 (ENSPVAG00000017376) #21 RPL18A (ENSPVAG00000017378) #22 SLC5A5 (ENSPVAG00000017380) #23 CCDC124 (ENSPVAG00000017381) #24 KCNN1 (ENSPVAG00000017382) #25 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Horse MODERN SPECIES 13 PLVAP (ENSECAG00000022390) #7 CCDC194 (ENSECAG00000042865) #8 BST2 (ENSECAG00000003563) MVB12A (ENSECAG00000010140) #9 TMEM221 (ENSECAG00000030646) #10 SLC27A1 (ENSECAG00000016039) #12 PGLS (ENSECAG00000010333) #13 NIBAN3 (ENSECAG00000014855) #14 COLGALT1 (ENSECAG00000055037) #15 UNC13A (ENSECAG00000040200) MAP1S (ENSECAG00000000529) #17 FCHO1 (ENSECAG00000014766) #18 B3GNT3 (ENSECAG00000016435) #19 INSL3 (ENSECAG00000027990) #20 JAK3 (ENSECAG00000018212) #21 RPL18A (ENSECAG00000015258) #22 SLC5A5 (ENSECAG00000018632) #23 ENSECAG00000044798 ENSECAG00000037035 #15 CCDC124 (ENSECAG00000005483) #24 KCNN1 (ENSECAG00000009050) #25 ARRDC2 (ENSECAG00000016486) #26 IL12RB1 (ENSECAG00000021961) #27 MAST3 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ENSEASG00005025029 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.d.r #22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 Red fox MODERN SPECIES 5 GTPBP3 (ENSVVUG00000016125) PLVAP (ENSVVUG00000016116) #7 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American mink MODERN SPECIES 58 CCDC194 (ENSNVIG00000016047) #8 ENSNVIG00000016053 MVB12A (ENSNVIG00000016065) #9 TMEM221 (ENSNVIG00000016097) #10 NXNL1 (ENSNVIG00000016110) #11 SLC27A1 (ENSNVIG00000016132) #12 PGLS (ENSNVIG00000016149) #13 NIBAN3 (ENSNVIG00000016160) #14 COLGALT1 (ENSNVIG00000016232) #15 ENSNVIG00000016256 UNC13A (ENSNVIG00000016276) MAP1S (ENSNVIG00000016851) #17 FCHO1 (ENSNVIG00000016881) #18 INSL3 (ENSNVIG00000017040) #20 JAK3 (ENSNVIG00000017079) #21 ENSNVIG00000017221 #22 SLC5A5 (ENSNVIG00000017292) #23 CC124 (ENSNVIG00000017314) #24 KCNN1 (ENSNVIG00000017325) #25 ARRDC2 (ENSNVIG00000017355) #26 IL12RB1 (ENSNVIG00000017388) #27 MAST3 (ENSNVIG00000017439) #28 PIK3R2 (ENSNVIG00000017496) #29 IFI30 (ENSNVIG00000017558) #30 MPV17L2 (ENSNVIG00000017572) #31 RAB3A (ENSNVIG00000017588) #32 PDE4C (ENSNVIG00000017617) #33 ENSNVIG00000017808 #34 JUND (ENSNVIG00000017813) #35 LSM4 (ENSNVIG00000017819) #36 PGPI (ENSNVIG00000017857) #37 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 lion MODERN SPECIES 430 ENSPLOG00000021955 #22 Cat DUPLICATION Cat MODERN SPECIES 249 ODF1 (ENSFCAG00000042534) KLF10 (ENSFCAG00000026958) AZIN1 (ENSFCAG00000010031) ATP6V1C1 (ENSFCAG00000005022) BAALC (ENSFCAG00000040797) FZD6 (ENSFCAG00000005027) CTHRC1 (ENSFCAG00000005030) SLC25A32 (ENSFCAG00000005032) DCAF13 (ENSFCAG00000027256) RIMS2 (ENSFCAG00000027891) DCSTAMP (ENSFCAG00000008982) DPYS (ENSFCAG00000008985) LRP12 (ENSFCAG00000042764) ZFPM2 (ENSFCAG00000009078) OXR1 (ENSFCAG00000031132) ENSFCAG00000042579 #22 ABRA (ENSFCAG00000036061) ANGPT1 (ENSFCAG00000045651) RSPO2 (ENSFCAG00000005782) EIF3E (ENSFCAG00000003665) EMC2 (ENSFCAG00000025332) TMEM74 (ENSFCAG00000022184) TRHR (ENSFCAG00000010358) NUDCD1 (ENSFCAG00000008501) ENY2 (ENSFCAG00000030489) PKHD1L1 (ENSFCAG00000023829) EBAG9 (ENSFCAG00000025490) SYBU (ENSFCAG00000031166) KCNV1 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ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 ENSGT00940000161872 ENSGT00390000004001 Elephant MODERN SPECIES 270 ANO8 (ENSLAFG00000030710) GTPBP3 (ENSLAFG00000013978) PLVAP (ENSLAFG00000026924) #7 ENSLAFG00000031751 MVB12A (ENSLAFG00000007872) #9 NXNL1 (ENSLAFG00000002507) #11 ENSLAFG00000032127 #12 PGLS (ENSLAFG00000001116) #13 NIBAN3 (ENSLAFG00000009366) #14 COLGALT1 (ENSLAFG00000022736) #15 MAP1S (ENSLAFG00000003027) #17 FCHO1 (ENSLAFG00000004690) #18 B3GNT3 (ENSLAFG00000022942) #19 INSL3 (ENSLAFG00000025675) #20 JAK3 (ENSLAFG00000015363) #21 RPL18A (ENSLAFG00000006690) #22 SLC5A5 (ENSLAFG00000032175) #23 KCNN1 (ENSLAFG00000022005) #25 ARRDC2 (ENSLAFG00000026674) #26 IL12RB1 (ENSLAFG00000003581) #27 MAST3 (ENSLAFG00000026363) #28 PIK3R2 (ENSLAFG00000000711) #29 IFI30 (ENSLAFG00000013615) #30 MPV17L2 (ENSLAFG00000029124) #31 RAB3A (ENSLAFG00000013618) #32 PDE4C (ENSLAFG00000013627) #33 ENSLAFG00000021534 #34 LSM4 (ENSLAFG00000017459) #36 PGPEP1 (ENSLAFG00000029224) #37 ENSLAFG00000028458 ENSLAFG00000025978 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.s.a #22 koala MODERN SPECIES 1 BLK (ENSPCIG00000001657) GATA4 (ENSPCIG00000001683) NEIL2 (ENSPCIG00000001713) FDFT1 (ENSPCIG00000001794) CTSB (ENSPCIG00000001821) ENSPCIG00000001837 ENSPCIG00000004642 ENSPCIG00000004649 ENSPCIG00000001854 ENSPCIG00000001886 ENSPCIG00000035695 XKR5 (ENSPCIG00000009384) AGPAT5 (ENSPCIG00000009379) ANGPT2 (ENSPCIG00000011026) ENSPCIG00000003167 ENSPCIG00000002528 #22 ENSPCIG00000033132 CSMD1 (ENSPCIG00000008043) Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.s.b.a.a #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1024 ENSVURG00010000118 ENSVURG00010000158 ENSVURG00010000178 ENSVURG00010000219 ENSVURG00010000377 ENSVURG00010000392 ENSVURG00010000438 ENSVURG00010000492 ENSVURG00010000499 ENSVURG00010000508 ENSVURG00010000532 ENSVURG00010000572 ENSVURG00010000647 ENSVURG00010000680 ENSVURG00010000722 ENSVURG00010000793 #22 Common wonbat MODERN SPECIES 1024 ENSVURG00010010985 ENSVURG00010011001 ENSVURG00010011018 ENSVURG00010011034 ENSVURG00010011054 ENSVURG00010011149 ENSVURG00010011153 ENSVURG00010011177 ENSVURG00010011228 ENSVURG00010011234 ENSVURG00010011246 ENSVURG00010011291 ENSVURG00010011334 ENSVURG00010011340 ENSVURG00010011374 ENSVURG00010011385 #22 TSHZ3 (ENSVURG00010011394) ZNF536 (ENSVURG00010011415) URI1 (ENSVURG00010011452) CCNE1 (ENSVURG00010011492) C19orf12 (ENSVURG00010012490) PLEKHF1 (ENSVURG00010012501) POP4 (ENSVURG00010012509) VSTM2B (ENSVURG00010012523) UQCRFS1 (ENSVURG00010012533) SHCBP1 (ENSVURG00010012550) ENSVURG00010012592 VPS35 (ENSVURG00010012859) ORC6 (ENSVURG00010012881) C16orf87 (ENSVURG00010012890) ENSVURG00010012900 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 107 FAM13B (ENSPCIG00000015702) PKD2L2 (ENSPCIG00000015701) MYOT (ENSPCIG00000015700) SERPINA1 (ENSPCIG00000015699) SERPINA11 (ENSPCIG00000015697) ENSPCIG00000015696 ENSPCIG00000013924 ENSPCIG00000013889 ENSPCIG00000025094 SERPINA3 (ENSPCIG00000025093) GSC (ENSPCIG00000025092) DICER1 (ENSPCIG00000018004) CLMN (ENSPCIG00000018006) SYNE3 (ENSPCIG00000018008) GLRX5 (ENSPCIG00000018014) ENSPCIG00000009704 #22 ENSPCIG00000030664 ENSPCIG00000037366 ENSPCIG00000034405 koala MODERN SPECIES 93 RASSF10 (ENSPCIG00000025466) TEAD1 (ENSPCIG00000025456) PARVA (ENSPCIG00000025436) MICAL2 (ENSPCIG00000025387) DKK3 (ENSPCIG00000025375) USP47 (ENSPCIG00000025349) GALNT18 (ENSPCIG00000025287) EIF4G2 (ENSPCIG00000024888) CTR9 (ENSPCIG00000023374) IRAG1 (ENSPCIG00000023321) LYVE1 (ENSPCIG00000023314) RNF141 (ENSPCIG00000023312) AMPD3 (ENSPCIG00000023310) ADM (ENSPCIG00000005988) SBF2 (ENSPCIG00000005981) ENSPCIG00000005974 #22 SWAP70 (ENSPCIG00000005968) WEE1 (ENSPCIG00000005960) ZNF143 (ENSPCIG00000005957) IPO7 (ENSPCIG00000005946) TMEM41B (ENSPCIG00000005943) DENND5A (ENSPCIG00000005930) SCUBE2 (ENSPCIG00000005923) ENSPCIG00000005922 NRIP3 (ENSPCIG00000005921) TMEM9B (ENSPCIG00000005918) ASCL3 (ENSPCIG00000005917) ENSPCIG00000005914 DENND2B (ENSPCIG00000005827) ENSPCIG00000005818 TRIM66 (ENSPCIG00000005815) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.s.b.a.b #22 Common wonbat MODERN SPECIES 1142 ENSVURG00010011271 ENSVURG00010011267 ENSVURG00010011265 ENSVURG00010011259 #22 ARX (ENSVURG00010011250) POLA1 (ENSVURG00010011074) PCYT1B (ENSVURG00010011032) PDK3 (ENSVURG00010011005) ENSVURG00010010997 ENSVURG00010010984 ENSVURG00010010970 KLHL15 (ENSVURG00010010959) ENSVURG00010010951 APOO (ENSVURG00010010940) SAT1 (ENSVURG00010010927) koala MODERN SPECIES 9 DIPK2A (ENSPCIG00000037438) ENSPCIG00000018428 ENSPCIG00000007920 ENSPCIG00000029198 ENSPCIG00000013897 PLOD2 (ENSPCIG00000018522) ##15 PLSCR4 (ENSPCIG00000018533) PLSCR1 (ENSPCIG00000018535) PLSCR5 (ENSPCIG00000018538) ENSPCIG00000032139 #22 ENSPCIG00000023048 ENSPCIG00000023047 ZIC1 (ENSPCIG00000023051) ENSPCIG00000034512 AGTR1 (ENSPCIG00000023054) ENSPCIG00000023055 CPB1 (ENSPCIG00000005481) CPA3 (ENSPCIG00000005490) GYG1 (ENSPCIG00000005496) HLTF (ENSPCIG00000005506) HPS3 (ENSPCIG00000005526) CP (ENSPCIG00000005553) ENSPCIG00000005652 TM4SF18 (ENSPCIG00000005774) TM4SF1 (ENSPCIG00000004115) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.s.b.b #22 koala MODERN SPECIES 78 TMPRSS11A (ENSPCIG00000001569) TMPRSS11D (ENSPCIG00000001625) ENSPCIG00000001778 GNRHR (ENSPCIG00000001816) UBA6 (ENSPCIG00000002425) STAP1 (ENSPCIG00000012621) ENSPCIG00000012623 EPHA5 (ENSPCIG00000024027) ENSPCIG00000024026 ENSPCIG00000024024 TECRL (ENSPCIG00000006772) ENSPCIG00000012461 ADGRL3 (ENSPCIG00000017414) ENSPCIG00000030798 ENSPCIG00000017313 ENSPCIG00000017312 #22 ENSPCIG00000033025 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.t #22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1199 ENSVURG00010002748 ENSVURG00010002734 ENSVURG00010002701 ENSVURG00010002656 ENSVURG00010002624 ENSVURG00010002613 ENSVURG00010002439 ENSVURG00010002385 ENSVURG00010002379 ENSVURG00010002357 ENSVURG00010002329 PPDPFL (ENSVURG00010002320) ENSVURG00010002312 ENSVURG00010002159 ENSVURG00010002009 ENSVURG00010001954 #22 ENSVURG00010001692 ENSVURG00010001530 ENSVURG00010001460 ENSVURG00010001434 ENSVURG00010001378 ENSVURG00010001312 ENSVURG00010001295 ENSVURG00010001248 ENSVURG00010001212 ENSVURG00010001140 ENSVURG00010001119 ENSVURG00010001104 ENSVURG00010001096 ENSVURG00010001059 ENSVURG00010001017 Common wonbat MODERN SPECIES 1048 ENSVURG00010004445 ENSVURG00010004469 ENSVURG00010004480 ENSVURG00010004710 ENSVURG00010004780 ENSVURG00010004818 ENSVURG00010004991 ENSVURG00010005061 ENSVURG00010005099 ENSVURG00010005149 ENSVURG00010005168 ENSVURG00010005188 ENSVURG00010005253 ENSVURG00010005347 ENSVURG00010005439 ENSVURG00010005493 #22 ENSVURG00010005504 ENSVURG00010005584 ENSVURG00010005623 ENSVURG00010005639 ENSVURG00010005668 ENSVURG00010005677 ENSVURG00010005778 ENSVURG00010005809 ENSVURG00010005848 ENSVURG00010005886 ENSVURG00010005902 ENSVURG00010005916 ENSVURG00010005920 ENSVURG00010005956 ENSVURG00010006034 koala MODERN SPECIES 429 ENSPCIG00000015935 ENSPCIG00000035087 ENSPCIG00000022254 ENSPCIG00000015824 #22 Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000164119 ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Eutheria ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000016851 ENSGT00390000006166 #7 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 64 KDM1B (ENSSBOG00000031163) TPMT (ENSSBOG00000031874) NHLRC1 (ENSSBOG00000005358) KIF13A (ENSSBOG00000028035) NUP153 (ENSSBOG00000024532) FAM8A1 (ENSSBOG00000027114) CAP2 (ENSSBOG00000034008) RBM24 (ENSSBOG00000030002) ENSSBOG00000026237 STMND1 (ENSSBOG00000027713) ENSSBOG00000017381 GMPR (ENSSBOG00000022943) MYLIP (ENSSBOG00000021159) DTNBP1 (ENSSBOG00000027094) JARID2 (ENSSBOG00000021029) ENSSBOG00000028490 ##22 ENSSBOG00000035633 CD83 (ENSSBOG00000022214) RNF182 (ENSSBOG00000019678) ENSSBOG00000032159 RANBP9 (ENSSBOG00000029468) NOL7 (ENSSBOG00000020450) SIRT5 (ENSSBOG00000022870) GFOD1 (ENSSBOG00000026414) TBC1D7 (ENSSBOG00000025824) PHACTR1 (ENSSBOG00000019197) EDN1 (ENSSBOG00000021292) HIVEP1 (ENSSBOG00000017977) ENSSBOG00000015128 ENSSBOG00000031592 TMEM170B (ENSSBOG00000033304) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000154488.B ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 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(ENSGGOG00000008146) Orangutan MODERN SPECIES 242 NSDHL (ENSPPYG00000020834) ZNF185 (ENSPPYG00000029371) PNMA5 (ENSPPYG00000032957) PNMA3 (ENSPPYG00000020835) PNMA6A (ENSPPYG00000020836) MAGEA1 (ENSPPYG00000020837) PNMA6F (ENSPPYG00000020840) ZNF275 (ENSPPYG00000020839) ENSPPYG00000033472 ENSPPYG00000020841 HAUS7 (ENSPPYG00000020843) BGN (ENSPPYG00000020844) ATP2B3 (ENSPPYG00000020845) CCNQ (ENSPPYG00000020846) DUSP9 (ENSPPYG00000020847) ENSPPYG00000031169 ##22 ENSPPYG00000020848 SLC6A8 (ENSPPYG00000037616) BCAP31 (ENSPPYG00000020850) ABCD1 (ENSPPYG00000020852) SRPK3 (ENSPPYG00000020854) IDH3G (ENSPPYG00000020855) SSR4 (ENSPPYG00000020856) PDZD4 (ENSPPYG00000020857) ENSPPYG00000031511 L1CAM (ENSPPYG00000020858) ENSPPYG00000020859 ARHGAP4 (ENSPPYG00000020860) NAA10 (ENSPPYG00000020861) RENBP (ENSPPYG00000020862) HCFC1 (ENSPPYG00000020863) Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000033117 CETN2 (ENSNLEG00000033913) NSDHL (ENSNLEG00000013866) ZNF185 (ENSNLEG00000013907) PNMA3 (ENSNLEG00000018300) ENSNLEG00000014065 ENSNLEG00000031614 ENSNLEG00000027745 ZFP92 (ENSNLEG00000013228) ENSNLEG00000013237 ENSNLEG00000031253 BGN (ENSNLEG00000013250) ATP2B3 (ENSNLEG00000032741) CCNQ (ENSNLEG00000013298) DUSP9 (ENSNLEG00000013321) ENSNLEG00000027939 ##22 PNCK (ENSNLEG00000013336) BCAP31 (ENSNLEG00000013380) ABCD1 (ENSNLEG00000013458) PLXNB3 (ENSNLEG00000013475) ENSNLEG00000013518 IDH3G (ENSNLEG00000013540) SSR4 (ENSNLEG00000013602) PDZD4 (ENSNLEG00000013626) ENSNLEG00000034251 L1CAM (ENSNLEG00000013647) ENSNLEG00000031864 AVPR2 (ENSNLEG00000013671) ARHGAP4 (ENSNLEG00000013678) NAA10 (ENSNLEG00000013724) ENSNLEG00000013753 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000154488.B ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 195 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00940000154488.B ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 661 PNMA6F (ENSRBIG00000030196) ENSRBIG00000041318 PNMA6E (ENSRBIG00000025010) ZFP92 (ENSRBIG00000027712) HAUS7 (ENSRBIG00000038209) BGN (ENSRBIG00000043894) ATP2B3 (ENSRBIG00000030237) CCNQ (ENSRBIG00000034283) DUSP9 (ENSRBIG00000031725) ENSRBIG00000028856 ##22 PNCK (ENSRBIG00000039714) SLC6A8 (ENSRBIG00000040899) BCAP31 (ENSRBIG00000043421) ABCD1 (ENSRBIG00000044662) PLXNB3 (ENSRBIG00000026773) IDH3G (ENSRBIG00000035445) SSR4 (ENSRBIG00000015579) PDZD4 (ENSRBIG00000029436) L1CAM (ENSRBIG00000036638) ENSRBIG00000032383 ENSRBIG00000034619 ARHGAP4 (ENSRBIG00000031629) NAA10 (ENSRBIG00000040703) RENBP (ENSRBIG00000020101) HCFC1 (ENSRBIG00000038921) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 977 ENSRROG00000033043 ENSRROG00000028871 ZFP92 (ENSRROG00000031212) HAUS7 (ENSRROG00000005507) BGN (ENSRROG00000042294) ATP2B3 (ENSRROG00000043666) CCNQ (ENSRROG00000038429) DUSP9 (ENSRROG00000037162) ENSRROG00000039351 ##22 PNCK (ENSRROG00000044383) SLC6A8 (ENSRROG00000045113) BCAP31 (ENSRROG00000045725) ABCD1 (ENSRROG00000037289) PLXNB3 (ENSRROG00000039660) SRPK3 (ENSRROG00000011319) IDH3G (ENSRROG00000044366) SSR4 (ENSRROG00000035638) PDZD4 (ENSRROG00000042678) L1CAM (ENSRROG00000041494) AVPR2 (ENSRROG00000036522) ARHGAP4 (ENSRROG00000045508) NAA10 (ENSRROG00000041881) RENBP (ENSRROG00000034139) HCFC1 (ENSRROG00000004412) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000154488.B ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.c.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.c.a ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 792 ENSPANG00000048545 PTCHD1 (ENSPANG00000050101) DDX53 (ENSPANG00000037837) ENSPANG00000035706 ENSPANG00000045931 ENSPANG00000037872 CBLL2 (ENSPANG00000046007) ENSPANG00000037098 PHEX (ENSPANG00000010105) SMS (ENSPANG00000003155) MBTPS2 (ENSPANG00000024280) ENSPANG00000050152 SMPX (ENSPANG00000005741) KLHL34 (ENSPANG00000012353) CNKSR2 (ENSPANG00000011941) ENSPANG00000029508 ##22 ENSPANG00000006351 RPS6KA3 (ENSPANG00000016330) EIF1AX (ENSPANG00000030224) MAP7D2 (ENSPANG00000019661) BCLAF3 (ENSPANG00000004509) SH3KBP1 (ENSPANG00000006736) MAP3K15 (ENSPANG00000007384) ENSPANG00000035301 ADGRG2 (ENSPANG00000004239) PHKA2 (ENSPANG00000016122) ENSPANG00000029606 PPEF1 (ENSPANG00000010228) ENSPANG00000035243 CDKL5 (ENSPANG00000004460) ENSPANG00000041187 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.c.a ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 227 LIN28A (ENSCATG00000020825) DHDDS (ENSCATG00000021205) HMGN2 (ENSCATG00000044642) RPS6KA1 (ENSCATG00000032529) ARID1A (ENSCATG00000035561) PIGV (ENSCATG00000016281) ZDHHC18 (ENSCATG00000044376) SFN (ENSCATG00000006825) GPN2 (ENSCATG00000033688) GPATCH3 (ENSCATG00000033598) NR0B2 (ENSCATG00000044469) KDF1 (ENSCATG00000015571) TRNP1 (ENSCATG00000004345) TENT5B (ENSCATG00000017109) SLC9A1 (ENSCATG00000033651) ENSCATG00000033551 ##22 WDTC1 (ENSCATG00000044454) TMEM222 (ENSCATG00000044475) SYTL1 (ENSCATG00000044339) MAP3K6 (ENSCATG00000025890) FCN3 (ENSCATG00000020495) CD164L2 (ENSCATG00000044159) GPR3 (ENSCATG00000006977) WASF2 (ENSCATG00000027046) AHDC1 (ENSCATG00000004004) FGR (ENSCATG00000044439) IFI6 (ENSCATG00000016831) ENSCATG00000033546 FAM76A (ENSCATG00000033886) STX12 (ENSCATG00000032583) PPP1R8 (ENSCATG00000032635) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00530000063872.A ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Drill MODERN SPECIES 1411 PNMA6F (ENSMLEG00000035105) ENSMLEG00000040255 PNMA6E (ENSMLEG00000041204) ZFP92 (ENSMLEG00000013319) HAUS7 (ENSMLEG00000038483) BGN (ENSMLEG00000029067) ATP2B3 (ENSMLEG00000032665) CCNQ (ENSMLEG00000039950) DUSP9 (ENSMLEG00000042559) ENSMLEG00000027362 ##22 PNCK (ENSMLEG00000027716) SLC6A8 (ENSMLEG00000042530) BCAP31 (ENSMLEG00000042884) ABCD1 (ENSMLEG00000041428) PLXNB3 (ENSMLEG00000032454) IDH3G (ENSMLEG00000038908) SSR4 (ENSMLEG00000016802) PDZD4 (ENSMLEG00000004595) L1CAM (ENSMLEG00000036326) AVPR2 (ENSMLEG00000042889) ARHGAP4 (ENSMLEG00000038659) NAA10 (ENSMLEG00000032424) RENBP (ENSMLEG00000038487) HCFC1 (ENSMLEG00000042451) IRAK1 (ENSMLEG00000029062) Sooty mangabey MODERN SPECIES 286 ENSCATG00000032628 CCNQ (ENSCATG00000013187) DUSP9 (ENSCATG00000009164) ENSCATG00000003729 ##22 PNCK (ENSCATG00000041955) SLC6A8 (ENSCATG00000001771) BCAP31 (ENSCATG00000043253) ABCD1 (ENSCATG00000042536) PLXNB3 (ENSCATG00000037895) SRPK3 (ENSCATG00000045096) IDH3G (ENSCATG00000042112) SSR4 (ENSCATG00000006344) PDZD4 (ENSCATG00000043997) L1CAM (ENSCATG00000041515) AVPR2 (ENSCATG00000036647) ARHGAP4 (ENSCATG00000042499) NAA10 (ENSCATG00000038709) RENBP (ENSCATG00000037009) HCFC1 (ENSCATG00000022004) Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063872.A ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 390 PNMA6F (ENSMNEG00000031969) ENSMNEG00000039113 PNMA6E (ENSMNEG00000038171) ZFP92 (ENSMNEG00000042434) HAUS7 (ENSMNEG00000036428) BGN (ENSMNEG00000042759) ATP2B3 (ENSMNEG00000044784) CCNQ (ENSMNEG00000042079) DUSP9 (ENSMNEG00000040094) ENSMNEG00000028994 ##22 PNCK (ENSMNEG00000040586) SLC6A8 (ENSMNEG00000005457) BCAP31 (ENSMNEG00000028474) ABCD1 (ENSMNEG00000033571) PLXNB3 (ENSMNEG00000032414) SRPK3 (ENSMNEG00000030566) IDH3G (ENSMNEG00000042620) SSR4 (ENSMNEG00000042721) PDZD4 (ENSMNEG00000041450) L1CAM (ENSMNEG00000042796) AVPR2 (ENSMNEG00000029040) ARHGAP4 (ENSMNEG00000039860) NAA10 (ENSMNEG00000034261) RENBP (ENSMNEG00000038526) HCFC1 (ENSMNEG00000033780) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 Drill MODERN SPECIES 160 CCDC194 (ENSMLEG00000036184) #8 BST2 (ENSMLEG00000039385) MVB12A (ENSMLEG00000036382) #9 TMEM221 (ENSMLEG00000039109) #10 SLC27A1 (ENSMLEG00000029815) #12 PGLS (ENSMLEG00000039926) #13 NIBAN3 (ENSMLEG00000028581) #14 COLGALT1 (ENSMLEG00000030570) #15 ENSMLEG00000006653 UNC13A (ENSMLEG00000034347) MAP1S (ENSMLEG00000036842) #17 FCHO1 (ENSMLEG00000028939) #18 B3GNT3 (ENSMLEG00000032295) #19 INSL3 (ENSMLEG00000041971) #20 JAK3 (ENSMLEG00000034517) #21 ENSMLEG00000016788 ##22 SLC5A5 (ENSMLEG00000039188) #23 CCDC124 (ENSMLEG00000031049) #24 KCNN1 (ENSMLEG00000042986) #25 ARRDC2 (ENSMLEG00000033675) #26 IL12RB1 (ENSMLEG00000035938) #27 MAST3 (ENSMLEG00000038024) #28 PIK3R2 (ENSMLEG00000006536) #29 IFI30 (ENSMLEG00000042593) #30 MPV17L2 (ENSMLEG00000028030) #31 RAB3A (ENSMLEG00000040567) #32 PDE4C (ENSMLEG00000043449) #33 IQCN (ENSMLEG00000031635) #34 LSM4 (ENSMLEG00000027948) #36 PGPEP1 (ENSMLEG00000041283) #37 GDF15 (ENSMLEG00000043577) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00940000161627.a.a.a.b.a.b.b.a.a.b.b.a.a.a.a.a ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 10 ANKLE1 (ENSMFAG00000045052) ABHD8 (ENSMFAG00000028796) ENSMFAG00000044117 ENSMFAG00000064314 GTPBP3 (ENSMFAG00000004345) PLVAP (ENSMFAG00000040183) #7 ENSMFAG00000002669 MVB12A (ENSMFAG00000056814) #9 TMEM221 (ENSMFAG00000032087) #10 ENSMFAG00000034050 #15 UNC13A (ENSMFAG00000002929) ENSMFAG00000039483 #17 ENSMFAG00000059258 FCHO1 (ENSMFAG00000041892) #18 JAK3 (ENSMFAG00000034366) #21 ENSMFAG00000043962 ##22 SLC5A5 (ENSMFAG00000000036) #23 CCDC124 (ENSMFAG00000042756) #24 KCNN1 (ENSMFAG00000040924) #25 ARRDC2 (ENSMFAG00000003817) #26 IL12RB1 (ENSMFAG00000041911) #27 MAST3 (ENSMFAG00000040625) #28 PIK3R2 (ENSMFAG00000034445) #29 ENSMFAG00000062890 IFI30 (ENSMFAG00000034585) #30 RAB3A (ENSMFAG00000030826) #32 MPV17L2 (ENSMFAG00000041586) #31 PDE4C (ENSMFAG00000041375) #33 ENSMFAG00000049148 IQCN (ENSMFAG00000042967) #34 ENSMFAG00000049018 Rhesus MODERN SPECIES 10 MVB12A (ENSMMUG00000005830) #9 TMEM221 (ENSMMUG00000008991) #10 SLC27A1 (ENSMMUG00000000194) #12 PGLS (ENSMMUG00000000195) #13 NIBAN3 (ENSMMUG00000000196) #14 ENSMMUG00000059371 COLGALT1 (ENSMMUG00000000198) #15 UNC13A (ENSMMUG00000015476) MAP1S (ENSMMUG00000022742) #17 ENSMMUG00000051425 FCHO1 (ENSMMUG00000012277) #18 B3GNT3 (ENSMMUG00000012280) #19 INSL3 (ENSMMUG00000042375) #20 JAK3 (ENSMMUG00000010996) #21 ENSMMUG00000058896 ENSMMUG00000028844 ##22 SLC5A5 (ENSMMUG00000028843) #23 CCDC124 (ENSMMUG00000038308) #24 KCNN1 (ENSMMUG00000007398) #25 ARRDC2 (ENSMMUG00000007401) #26 ENSMMUG00000063870 IL12RB1 (ENSMMUG00000012096) #27 MAST3 (ENSMMUG00000003161) #28 PIK3R2 (ENSMMUG00000003162) #29 ENSMMUG00000059656 IFI30 (ENSMMUG00000051543) #30 MPV17L2 (ENSMMUG00000057067) #31 RAB3A (ENSMMUG00000011317) #32 PDE4C (ENSMMUG00000005028) #33 ENSMMUG00000065139 IQCN (ENSMMUG00000016354) #34 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4864 ENSTSYG00000034229 ##22 TOP1 (ENSTSYG00000003428) PLCG1 (ENSTSYG00000004168) ZHX3 (ENSTSYG00000033648) LPIN3 (ENSTSYG00000010513) EMILIN3 (ENSTSYG00000033682) Tarsier MODERN SPECIES 2092 ENSTSYG00000032591 ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Degu MODERN SPECIES 323 ENSODEG00000012816 ENSODEG00000012905 DDX11 (ENSODEG00000014673) ENSODEG00000012539 ENSODEG00000012918 ENSODEG00000012438 FCHO1 (ENSODEG00000013577) #18 B3GNT3 (ENSODEG00000013122) #19 JAK3 (ENSODEG00000013299) #21 ENSODEG00000012777 ##22 SLC5A5 (ENSODEG00000012721) #23 CCDC124 (ENSODEG00000013790) #24 KCNN1 (ENSODEG00000013162) #25 ARRDC2 (ENSODEG00000013689) #26 ENSODEG00000012843 #27 ENSODEG00000012781 #28 PIK3R2 (ENSODEG00000013440) #29 IFI30 (ENSODEG00000014388) #30 MPV17L2 (ENSODEG00000013238) #31 RAB3A (ENSODEG00000012269) #32 PDE4C (ENSODEG00000013172) #33 JUND (ENSODEG00000013414) #35 ENSODEG00000011712 #36 PGPEP1 (ENSODEG00000012364) #37 SSBP4 (ENSODEG00000012832) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 164 Ccdc194 (ENSMOCG00000016480) #8 Bst2 (ENSMOCG00000020132) Mvb12a (ENSMOCG00000020827) #9 Tmem221 (ENSMOCG00000011341) #10 Nxnl1 (ENSMOCG00000008986) #11 Slc27a1 (ENSMOCG00000010070) #12 Pgls (ENSMOCG00000019327) #13 Niban3 (ENSMOCG00000002532) #14 Colgalt1 (ENSMOCG00000001868) #15 Unc13a (ENSMOCG00000003295) Jak3 (ENSMOCG00000012314) #21 Insl3 (ENSMOCG00000008660) #20 B3gnt3 (ENSMOCG00000006137) #19 Fcho1 (ENSMOCG00000010497) #18 Map1s (ENSMOCG00000015944) #17 ENSMOCG00000002628 ##22 Slc5a5 (ENSMOCG00000007647) #23 Ccdc124 (ENSMOCG00000014017) #24 Kcnn1 (ENSMOCG00000003069) #25 Arrdc2 (ENSMOCG00000006806) #26 Il12rb1 (ENSMOCG00000000603) #27 Mast3 (ENSMOCG00000018587) #28 ENSMOCG00000019717 #29 Ifi30 (ENSMOCG00000001163) #30 Mpv17l2 (ENSMOCG00000009680) #31 Rab3a (ENSMOCG00000016750) #32 Pde4c (ENSMOCG00000015883) #33 Gm3336 (ENSMOCG00000017470) Iqcn (ENSMOCG00000009272) #34 Jund (ENSMOCG00000005294) #35 Lsm4 (ENSMOCG00000020861) #36 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Degu MODERN SPECIES 208 ADGRL4 (ENSODEG00000003241) ENSODEG00000018917 ##22 PTGFR (ENSODEG00000003205) ENSODEG00000003189 GIPC2 (ENSODEG00000002950) ENSODEG00000002929 ENSODEG00000002600 NEXN (ENSODEG00000003578) MIGA1 (ENSODEG00000003282) ENSODEG00000003224 ZZZ3 (ENSODEG00000003077) AK5 (ENSODEG00000002917) PIGK (ENSODEG00000002877) ST6GALNAC5 (ENSODEG00000002631) ENSODEG00000002611 ENSODEG00000018945 ENSODEG00000002590 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Degu MODERN SPECIES 263 SUPT4H1 (ENSODEG00000011183) TSPOAP1 (ENSODEG00000011140) MPO (ENSODEG00000011112) LPO (ENSODEG00000011990) MKS1 (ENSODEG00000012294) EPX (ENSODEG00000011351) ENSODEG00000020120 OR4D2 (ENSODEG00000019834) OR4D1 (ENSODEG00000019941) ENSODEG00000019998 DYNLL2 (ENSODEG00000013208) SRSF1 (ENSODEG00000011481) VEZF1 (ENSODEG00000011127) CUEDC1 (ENSODEG00000011861) MRPS23 (ENSODEG00000011027) ENSODEG00000011449 ##22 MSI2 (ENSODEG00000011974) TMEM238 (ENSODEG00000011450) ENSODEG00000011240 SCPEP1 (ENSODEG00000010769) COIL (ENSODEG00000012389) ENSODEG00000012139 TRIM25 (ENSODEG00000011829) DGKE (ENSODEG00000012600) C17orf67 (ENSODEG00000013079) NOG (ENSODEG00000020232) ENSODEG00000012707 ANKFN1 (ENSODEG00000012115) PCTP (ENSODEG00000014619) TMEM100 (ENSODEG00000019916) MMD (ENSODEG00000013055) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 368 Lin54 (ENSDORG00000002968) ENSDORG00000010518 ENSDORG00000015366 Tmem150c (ENSDORG00000028142) Enoph1 (ENSDORG00000000973) ENSDORG00000000968 Hnrnpd (ENSDORG00000012507) ENSDORG00000028788 Rasgef1b (ENSDORG00000008210) Prkg2 (ENSDORG00000008384) Bmp3 (ENSDORG00000008380) Cfap299 (ENSDORG00000000888) Fgf5 (ENSDORG00000013481) Prdm8 (ENSDORG00000015398) Antxr2 (ENSDORG00000008986) ENSDORG00000024213 ##22 Paqr3 (ENSDORG00000013893) Bmp2k (ENSDORG00000013890) Anxa3 (ENSDORG00000008315) Fras1 (ENSDORG00000008295) Mrpl1 (ENSDORG00000015752) Cnot6l (ENSDORG00000011458) Cxcl13 (ENSDORG00000029327) Ccng2 (ENSDORG00000007156) ENSDORG00000029625 Septin11 (ENSDORG00000015527) Sowahb (ENSDORG00000015525) ENSDORG00000025484 Shroom3 (ENSDORG00000012959) Ccdc158 (ENSDORG00000009456) Stbd1 (ENSDORG00000009454) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 284 Cep70 (ENSCGRG00001015901) Esyt3 (ENSCGRG00001005131) Mras (ENSCGRG00001019182) ENSCGRG00001016018 Armc8 (ENSCGRG00001022367) Dbr1 (ENSCGRG00001018497) A4gnt (ENSCGRG00001015651) Dzip1l (ENSCGRG00001015758) Cldn18 (ENSCGRG00001021119) Sox14 (ENSCGRG00001006423) Il20rb (ENSCGRG00001014104) Nck1 (ENSCGRG00001010690) Slc35g2 (ENSCGRG00001010655) Stag1 (ENSCGRG00001010804) Pccb (ENSCGRG00001010499) ENSCGRG00001022650 ##22 Msl2 (ENSCGRG00001018586) Ppp2r3a (ENSCGRG00001014468) ENSCGRG00001000374 Ephb1 (ENSCGRG00001023566) Ky (ENSCGRG00001005688) Cep63 (ENSCGRG00001022029) Anapc13 (ENSCGRG00001008030) Amotl2 (ENSCGRG00001004406) ENSCGRG00001024987 ENSCGRG00001022954 Slco2a1 (ENSCGRG00001020259) Rab6b (ENSCGRG00001013041) Srprb (ENSCGRG00001018121) Trf (ENSCGRG00001011853) Inhca (ENSCGRG00001005380) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 112 ENSCGRG00001021640 Irx5 (ENSCGRG00001019317) Irx3 (ENSCGRG00001022254) Fto (ENSCGRG00001013545) Rpgrip1l (ENSCGRG00001020196) ENSCGRG00001013457 ENSCGRG00001024361 Rbl2 (ENSCGRG00001012793) Chd9 (ENSCGRG00001016150) ENSCGRG00001012667 #22 Gm19935 (ENSCGRG00001012263) ENSCGRG00001010471 ENSCGRG00001001946 Tox3 (ENSCGRG00001021816) ENSCGRG00001023314 ENSCGRG00001019423 ##22 Cyld (ENSCGRG00001000533) Nod2 (ENSCGRG00001011531) Snx20 (ENSCGRG00001020312) Nkd1 (ENSCGRG00001011787) Brd7 (ENSCGRG00001003449) Adcy7 (ENSCGRG00001014504) Tent4b (ENSCGRG00001023597) Heatr3 (ENSCGRG00001024755) Cnep1r1 (ENSCGRG00001009199) Zfp423 (ENSCGRG00001023063) 4933402J07Rik (ENSCGRG00001021069) Cbln1 (ENSCGRG00001018308) N4bp1 (ENSCGRG00001014095) Siah1b (ENSCGRG00001006463) LONP2 (ENSCGRG00001009685) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 382 Usp25 (ENSCGRG00001019136) Nrip1 (ENSCGRG00001017624) Samsn1 (ENSCGRG00001011901) Hspa13 (ENSCGRG00001006769) Rbm11 (ENSCGRG00001013426) Lipi (ENSCGRG00001004574) Robo2 (ENSCGRG00001016343) Robo1 (ENSCGRG00001016390) ENSCGRG00001011950 Gbe1 (ENSCGRG00001024765) Cadm2 (ENSCGRG00001010982) Vgll3 (ENSCGRG00001015980) Chmp2b (ENSCGRG00001022834) Pou1f1 (ENSCGRG00001011471) ENSCGRG00001022071 ENSCGRG00001017747 ##22 Htr1f (ENSCGRG00001010649) Cggbp1 (ENSCGRG00001010279) Zfp654 (ENSCGRG00001020292) 4930453N24Rik (ENSCGRG00001015042) Csnka2ip (ENSCGRG00001014750) Epha3 (ENSCGRG00001006199) ENSCGRG00001009587 Stx19 (ENSCGRG00001001896) Arl13b (ENSCGRG00001022552) Nsun3 (ENSCGRG00001013850) ENSCGRG00001011827 ENSCGRG00001023290 ENSCGRG00001018957 ENSCGRG00001010094 Arl6 (ENSCGRG00001021791) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Rat MODERN SPECIES LOC100365363 (ENSRNOG00000059492) Vom1r17 (ENSRNOG00000064083) ENSRNOG00000067452 Vom1r19 (ENSRNOG00000063416) ENSRNOG00000068732 Vom1r20 (ENSRNOG00000028807) Vom1r21 (ENSRNOG00000064479) AABR07071891.2 (ENSRNOG00000045741) Zfp54 (ENSRNOG00000051578) Zfp51 (ENSRNOG00000056036) Zfp53 (ENSRNOG00000042347) Zfp52 (ENSRNOG00000042826) LOC102550851 (ENSRNOG00000063577) LOC108348215 (ENSRNOG00000058436) Zfp51l1 (ENSRNOG00000043341) AABR07001902.1 (ENSRNOG00000042547) ##22 Vom1r22 (ENSRNOG00000025949) Vom1r23 (ENSRNOG00000070251) Zfp748-ps1 (ENSRNOG00000058030) LOC102548728 (ENSRNOG00000066224) Vom2r-ps24 (ENSRNOG00000066654) AABR07001923.1 (ENSRNOG00000047884) ENSRNOG00000068098 Znf845l-ps1 (ENSRNOG00000051570) ENSRNOG00000065747 Zfp600 (ENSRNOG00000051867) Vom2r13 (ENSRNOG00000057050) AABR07002025.1 (ENSRNOG00000054417) Vom2r80 (ENSRNOG00000055298) ENSRNOG00000066415 LOC102555644 (ENSRNOG00000071050) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Donkey MODERN SPECIES CCDC194 (ENSEASG00005032333) #8 MVB12A (ENSEASG00005002931) #9 ENSEASG00005002921 TMEM221 (ENSEASG00005037644) #10 NXNL1 (ENSEASG00005002945) #11 SLC27A1 (ENSEASG00005002954) #12 PGLS (ENSEASG00005002963) #13 NIBAN3 (ENSEASG00005002991) #14 COLGALT1 (ENSEASG00005003057) #15 UNC13A (ENSEASG00005003323) MAP1S (ENSEASG00005005933) #17 ENSEASG00005005938 #18 ENSEASG00005034647 #19 INSL3 (ENSEASG00005026499) #20 JAK3 (ENSEASG00005005949) #21 ENSEASG00005005956 ##22 SLC5A5 (ENSEASG00005005964) #23 ENSEASG00005033168 #15 CCDC124 (ENSEASG00005005971) #24 KCNN1 (ENSEASG00005005977) #25 ARRDC2 (ENSEASG00005005980) #26 IL12RB1 (ENSEASG00005005987) #27 MAST3 (ENSEASG00005005993) #28 ENSEASG00005006025 #29 IFI30 (ENSEASG00005006219) #30 MPV17L2 (ENSEASG00005006220) #31 RAB3A (ENSEASG00005006221) #32 PDE4C (ENSEASG00005006231) #33 ENSEASG00005028857 ENSEASG00005038750 ENSEASG00005006233 #34 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00940000166941 ENSGT00610000086173 #36 Giant Panda MODERN SPECIES 1267 ENSAMEG00000026451 ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00940000154197.b.b.y.b.a ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000154929.B #16 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 ENSGT00940000161872 Polar bear MODERN SPECIES 255 ENSUMAG00000011835 ANO8 (ENSUMAG00000011803) PLVAP (ENSUMAG00000011789) #7 ENSUMAG00000011787 MVB12A (ENSUMAG00000011781) #9 ENSUMAG00000011774 #11 SLC27A1 (ENSUMAG00000011769) #12 ENSUMAG00000011752 PGLS (ENSUMAG00000011747) #13 NIBAN3 (ENSUMAG00000011737) #14 ENSUMAG00000011373 #16 MAP1S (ENSUMAG00000011311) #17 FCHO1 (ENSUMAG00000010837) #18 B3GNT3 (ENSUMAG00000010749) #19 JAK3 (ENSUMAG00000009973) #21 ENSUMAG00000009876 ##22 SLC5A5 (ENSUMAG00000009865) #23 CCDC124 (ENSUMAG00000009858) #24 ENSUMAG00000009850 #25 ENSUMAG00000009844 #26 IL12RB1 (ENSUMAG00000009832) #27 MAST3 (ENSUMAG00000009640) #28 PIK3R2 (ENSUMAG00000009514) #29 IFI30 (ENSUMAG00000009491) #30 MPV17L2 (ENSUMAG00000009485) #31 RAB3A (ENSUMAG00000009464) #32 PDE4C (ENSUMAG00000009070) #33 ENSUMAG00000009018 #34 LSM4 (ENSUMAG00000009013) #36 PGPEP1 (ENSUMAG00000009009) #37 GDF15 (ENSUMAG00000009006) American black bear MODERN SPECIES 2420 JAK3 (ENSUAMG00000018350) #21 ENSUAMG00000018348 ##22 SLC5A5 (ENSUAMG00000018347) #23 CCDC124 (ENSUAMG00000018346) #24 KCNN1 (ENSUAMG00000018345) #25 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Pig MODERN SPECIES 4 CLSTN2 (ENSSSCG00000011666) TRIM42 (ENSSSCG00000011668) SLC25A36 (ENSSSCG00000036855) SPSB4 (ENSSSCG00000034369) PXYLP1 (ENSSSCG00000011670) ZBTB38 (ENSSSCG00000022073) RASA2 (ENSSSCG00000011672) ENSSSCG00000041863 RNF7 (ENSSSCG00000029774) GRK7 (ENSSSCG00000011675) ENSSSCG00000011676 TFDP2 (ENSSSCG00000037647) ENSSSCG00000036302 ENSSSCG00000058234 ENSSSCG00000048998 ENSSSCG00000034370 ##22 ENSSSCG00000046587 GK5 (ENSSSCG00000011677) XRN1 (ENSSSCG00000011678) ATR (ENSSSCG00000011679) PLS1 (ENSSSCG00000011680) TRPC1 (ENSSSCG00000011681) PCOLCE2 (ENSSSCG00000011683) PAQR9 (ENSSSCG00000060874) U2SURP (ENSSSCG00000011684) CHST2 (ENSSSCG00000022031) SLC9A9 (ENSSSCG00000011686) DIPK2A (ENSSSCG00000036206) ENSSSCG00000011688 PLOD2 (ENSSSCG00000011689) ##15 PLSCR4 (ENSSSCG00000011690) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Blue whale MODERN SPECIES 10 ENSBMSG00010014287 CDH11 (ENSBMSG00010014302) ENSBMSG00010014330 CDH5 (ENSBMSG00010014359) BEAN1 (ENSBMSG00010014457) ENSBMSG00010014500 TK2 (ENSBMSG00010014551) CKLF (ENSBMSG00010014882) ENSBMSG00010015037 ENSBMSG00010015063 ENSBMSG00010015115 CMTM3 (ENSBMSG00010015159) CMTM4 (ENSBMSG00010015196) DYNC1LI2 (ENSBMSG00010015269) TERB1 (ENSBMSG00010015382) ENSBMSG00010015462 ##22 NAE1 (ENSBMSG00010015508) CA7 (ENSBMSG00010015659) ENSBMSG00010015711 PDP2 (ENSBMSG00010015722) CDH16 (ENSBMSG00010015858) RRAD (ENSBMSG00010016627) CIAO2B (ENSBMSG00010016650) CES2 (ENSBMSG00010016703) CBFB (ENSBMSG00010016805) ENSBMSG00010016852 B3GNT9 (ENSBMSG00010016876) TRADD (ENSBMSG00010016899) FBXL8 (ENSBMSG00010016923) HSF4 (ENSBMSG00010016951) NOL3 (ENSBMSG00010016979) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Dolphin MODERN SPECIES 6145 ENSTTRG00000008977 ##22 SLC5A5 (ENSTTRG00000008976) #23 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Vaquita MODERN SPECIES 19 ELF5 (ENSPSNG00000017789) CAT (ENSPSNG00000017719) ENSPSNG00000017692 ENSPSNG00000017670 NAT10 (ENSPSNG00000017510) CAPRIN1 (ENSPSNG00000017392) LMO2 (ENSPSNG00000017299) FBXO3 (ENSPSNG00000017093) ENSPSNG00000017059 C11orf91 (ENSPSNG00000017031) KIAA1549L (ENSPSNG00000016649) HIPK3 (ENSPSNG00000016514) CSTF3 (ENSPSNG00000016354) TCP11L1 (ENSPSNG00000016253) DEPDC7 (ENSPSNG00000016098) ENSPSNG00000016011 ##22 QSER1 (ENSPSNG00000015773) PRRG4 (ENSPSNG00000015680) CCDC73 (ENSPSNG00000015385) EIF3M (ENSPSNG00000015142) WT1 (ENSPSNG00000014606) ENSPSNG00000014483 RCN1 (ENSPSNG00000014435) PAX6 (ENSPSNG00000014287) ELP4 (ENSPSNG00000014087) IMMP1L (ENSPSNG00000013988) DNAJC24 (ENSPSNG00000013881) DCDC1 (ENSPSNG00000013124) MPPED2 (ENSPSNG00000012995) ARL14EP (ENSPSNG00000012948) ENSPSNG00000012904 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173.b #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 Beluga whale MODERN SPECIES 27 ENSDLEG00000001611 MVB12A (ENSDLEG00000001618) #9 TMEM221 (ENSDLEG00000001634) #10 NXNL1 (ENSDLEG00000001651) #11 SLC27A1 (ENSDLEG00000001665) #12 PGLS (ENSDLEG00000001686) #13 NIBAN3 (ENSDLEG00000001718) #14 ENSDLEG00000001832 #15 ENSDLEG00000001839 #15 ENSDLEG00000002440 #16 MAP1S (ENSDLEG00000005291) #17 ENSDLEG00000005304 FCHO1 (ENSDLEG00000005313) #18 INSL3 (ENSDLEG00000005322) #20 JAK3 (ENSDLEG00000005345) #21 ENSDLEG00000005579 ##22 SLC5A5 (ENSDLEG00000005599) #23 CCDC124 (ENSDLEG00000005617) #24 KCNN1 (ENSDLEG00000005628) #25 ARRDC2 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#26 IL12RB1 (ENSMMNG00015000529) #27 MAST3 (ENSMMNG00015000302) #28 PIK3R2 (ENSMMNG00015000176) #29 IFI30 (ENSMMNG00015000120) #30 MPV17L2 (ENSMMNG00015000089) #31 RAB3A (ENSMMNG00015000026) #32 PDE4C (ENSMMNG00015008093) #33 ENSMMNG00015008048 #34 JUND (ENSMMNG00015008033) #35 ENSMMNG00015008004 #36 ENSMMNG00015007982 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.f ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.e ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000164119 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 Marsupialia_b DUPLICATION Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.f ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.e ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a.i ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482.b #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT01030000234573.A.b.b.a ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.e ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a.i ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482.b #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01030000234573.A.b.b.a ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.e ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.a.i ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482.b #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 koala MODERN SPECIES 133 ENSPCIG00000022225 ENSPCIG00000033729 ENSPCIG00000035480 ENSPCIG00000022239 GNA11 (ENSPCIG00000034212) GNA15 (ENSPCIG00000027122) S1PR4 (ENSPCIG00000027123) NCLN (ENSPCIG00000027124) CELF5 (ENSPCIG00000027126) MAP1S (ENSPCIG00000027127) #17 FCHO1 (ENSPCIG00000027129) #18 B3GNT3 (ENSPCIG00000033076) #19 ENSPCIG00000027134 #20 JAK3 (ENSPCIG00000027139) #21 ENSPCIG00000027147 ENSPCIG00000027151 ##22 SLC5A5 (ENSPCIG00000027171) #23 ENSPCIG00000031020 #24 KCNN1 (ENSPCIG00000027183) #25 ARRDC2 (ENSPCIG00000027188) #26 ENSPCIG00000027201 #27 MAST3 (ENSPCIG00000027217) #28 PIK3R2 (ENSPCIG00000027485) #29 ENSPCIG00000031540 #30 MPV17L2 (ENSPCIG00000012258) #31 RAB3A (ENSPCIG00000012260) #32 PDE4C (ENSPCIG00000012289) #33 ENSPCIG00000018287 #34 JUND (ENSPCIG00000018288) #35 LSM4 (ENSPCIG00000037130) #36 PGPEP1 (ENSPCIG00000031873) #37 Common wonbat MODERN SPECIES 626 ENSVURG00010014208 ENSVURG00010014214 GNA11 (ENSVURG00010014220) GNA15 (ENSVURG00010014228) S1PR4 (ENSVURG00010014236) NCLN (ENSVURG00010014249) CELF5 (ENSVURG00010014264) MAP1S (ENSVURG00010014460) #17 FCHO1 (ENSVURG00010014674) #18 B3GNT3 (ENSVURG00010014702) #19 ENSVURG00010014710 #20 JAK3 (ENSVURG00010014721) #21 ENSVURG00010014755 ##22 SLC5A5 (ENSVURG00010014802) #23 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(ENSSHAG00000009738) #29 ENSSHAG00000022120 #30 MPV17L2 (ENSSHAG00000009989) #31 RAB3A (ENSSHAG00000010227) #32 PDE4C (ENSSHAG00000010359) #33 ENSSHAG00000028095 #34 JUND (ENSSHAG00000021787) #35 LSM4 (ENSSHAG00000021542) #36 PGPEP1 (ENSSHAG00000031355) #37 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.j ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.j ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 612 ENSVURG00010009222 ROR1 (ENSVURG00010009211) PGM1 (ENSVURG00010009200) EFCAB7 (ENSVURG00010009191) ENSVURG00010009182 ALG6 (ENSVURG00010009169) FOXD3 (ENSVURG00010009156) ATG4C (ENSVURG00010009137) ANGPTL3 (ENSVURG00010009124) DOCK7 (ENSVURG00010008347) USP1 (ENSVURG00010008279) KANK4 (ENSVURG00010008241) PATJ (ENSVURG00010008173) TM2D1 (ENSVURG00010008155) NFIA (ENSVURG00010008122) ENSVURG00010008077 ##22 ENSVURG00010008072 C1orf87 (ENSVURG00010008051) ENSVURG00010008037 ENSVURG00010008025 ENSVURG00010007958 HOOK1 (ENSVURG00010007915) FGGY (ENSVURG00010007865) JUN (ENSVURG00010007825) MYSM1 (ENSVURG00010007771) TACSTD2 (ENSVURG00010007751) OMA1 (ENSVURG00010007746) DAB1 (ENSVURG00010007713) C8A (ENSVURG00010007704) PRKAA2 (ENSVURG00010007682) PLPP3 (ENSVURG00010007675) Opossum MODERN SPECIES 2 AACS (ENSMODG00000015672) ENSMODG00000048892 DHX37 (ENSMODG00000015681) SCARB1 (ENSMODG00000015688) ENSMODG00000019140 GNA11 (ENSMODG00000019142) GNA15 (ENSMODG00000019144) S1PR4 (ENSMODG00000019145) NCLN (ENSMODG00000019149) ENSMODG00000019151 MAP1S (ENSMODG00000019153) #17 FCHO1 (ENSMODG00000028655) #18 B3GNT3 (ENSMODG00000019158) #19 ENSMODG00000037566 #20 JAK3 (ENSMODG00000019165) #21 RPL18A (ENSMODG00000037004) ##22 ENSMODG00000029513 #23 CCDC124 (ENSMODG00000042946) #24 KCNN1 (ENSMODG00000019170) #25 ENSMODG00000014682 ENSMODG00000041250 ENSMODG00000050288 ENSMODG00000023842 ENSMODG00000039698 ENSMODG00000044017 ENSMODG00000036910 ENSMODG00000014469 SLC1A6 (ENSMODG00000014481) ENSMODG00000014485 CASP14 (ENSMODG00000039253) OR1I1 (ENSMODG00000014497) Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 Primates ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 14 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Tarsier MODERN SPECIES 4137 DCTN6 (ENSTSYG00000013306) MBOAT4 (ENSTSYG00000006418) LEPROTL1 (ENSTSYG00000026663) SARAF (ENSTSYG00000003935) ENSTSYG00000028226 ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00910000147458 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Hominoidea DUPLICATION Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a ENSGT00550000075117.g ENSGT00910000146711 ENSGT01020000230359.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00530000063779.B ENSGT00950000183072.a ENSGT00390000005979.a ENSGT00390000008686.c ENSGT00910000148110 ENSGT00920000149157 ENSGT00940000161553 ENSGT00940000154992.b ENSGT00940000161691 ENSGT00390000015797.c.b.a.a ##22 ENSGT00940000160677 ENSGT00940000156210 ENSGT01000000214434.D ENSGT00940000162395 ENSGT00940000154607.b.a ENSGT00940000162134 ENSGT00510000048324 ENSGT01070000253936 ENSGT01030000234626.C ENSGT00390000006098 ENSGT00940000158392 ENSGT00940000160253 ENSGT01040000240451.a.b.b.d ENSGT00390000001627.f.a ENSGT00940000156503 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00950000183138.a.a.a ENSGT00950000183099.u.a.d.b.c.a.a ENSGT00550000075117.g ENSGT00910000146711 ENSGT01020000230359.B ENSGT01020000230359.A ENSGT00530000063779.B ENSGT00950000183072.a 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#33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 PLVAP (ENSSVLG00005024254) #7 CCDC194 (ENSSVLG00005024294) #8 MVB12A 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ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489.u #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 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#10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 Blue whale MODERN SPECIES SPTA1 (ENSBMSG00010003731) ENSBMSG00010003703 ENSBMSG00010003699 OR10K2 (ENSBMSG00010003694) OR10R2 (ENSBMSG00010003685) ENSBMSG00010003679 CD1E (ENSBMSG00010003526) ENSBMSG00010003495 ENSBMSG00010003489 ENSBMSG00010003480 ENSBMSG00010003471 KIRREL1 (ENSBMSG00010003396) ENSBMSG00010003372 CD5L (ENSBMSG00010003369) FCRL1 (ENSBMSG00010003353) ENSBMSG00010003344 ##22 FCRL3 (ENSBMSG00010003327) FCRL4 (ENSBMSG00010003313) ENSBMSG00010003295 ENSBMSG00010003284 ENSBMSG00010003274 ETV3 (ENSBMSG00010003261) ETV3L (ENSBMSG00010003249) ARHGEF11 (ENSBMSG00010001143) LRRC71 (ENSBMSG00010000517) PEAR1 (ENSBMSG00010000422) NTRK1 (ENSBMSG00010000221) INSRR (ENSBMSG00010000153) SH2D2A (ENSBMSG00010000123) PRCC (ENSBMSG00010000097) HDGF (ENSBMSG00010000074) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT01010000228911 ENSGT00940000154929.B #16 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173.a.a #36 Sperm whale MODERN SPECIES 17 TWF1 (ENSPCTG00005016400) IRAK4 (ENSPCTG00005016513) PUS7L (ENSPCTG00005016614) ADAMTS20 (ENSPCTG00005016684) PRICKLE1 (ENSPCTG00005016771) PPHLN1 (ENSPCTG00005016859) ZCRB1 (ENSPCTG00005017161) YAF2 (ENSPCTG00005017243) GXYLT1 (ENSPCTG00005017447) ENSPCTG00005017586 PDZRN4 (ENSPCTG00005017632) CNTN1 (ENSPCTG00005017912) LRRK2 (ENSPCTG00005018602) ENSPCTG00005018859 SLC2A13 (ENSPCTG00005018911) ENSPCTG00005019220 ##22 ABCD2 (ENSPCTG00005019234) KIF21A (ENSPCTG00005019438) CPNE8 (ENSPCTG00005000264) Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT01010000228911 ENSGT00940000154929.B #16 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 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ENSGT00610000086173.b #36 ENSGT00390000015368.a.a #37 Vaquita DUPLICATION Vaquita MODERN SPECIES 1 PUS7L (ENSPSNG00000019328) ENSPSNG00000019362 ADAMTS20 (ENSPSNG00000019420) PRICKLE1 (ENSPSNG00000019658) PPHLN1 (ENSPSNG00000019732) ZCRB1 (ENSPSNG00000019891) YAF2 (ENSPSNG00000019968) GXYLT1 (ENSPSNG00000020053) ENSPSNG00000020133 PDZRN4 (ENSPSNG00000020173) CNTN1 (ENSPSNG00000020359) ENSPSNG00000020747 LRRK2 (ENSPSNG00000020867) SLC2A13 (ENSPSNG00000020932) C12orf40 (ENSPSNG00000020991) ENSPSNG00000021130 ##22 ABCD2 (ENSPSNG00000021149) KIF21A (ENSPSNG00000021250) ENSPSNG00000021336 ENSPSNG00000021353 CPNE8 (ENSPSNG00000004195) ENSPSNG00000004229 SYT10 (ENSPSNG00000004264) PKP2 (ENSPSNG00000004294) ENSPSNG00000004323 YARS2 (ENSPSNG00000004339) DNM1L (ENSPSNG00000004469) ENSPSNG00000004600 FGD4 (ENSPSNG00000004764) ENSPSNG00000004851 ENSPSNG00000004862 Vaquita MODERN SPECIES 14 ENSPSNG00000000483 ENSPSNG00000000468 MVB12A (ENSPSNG00000000448) #9 TMEM221 (ENSPSNG00000000407) #10 NXNL1 (ENSPSNG00000000381) #11 SLC27A1 (ENSPSNG00000000343) #12 PGLS (ENSPSNG00000000313) #13 NIBAN3 (ENSPSNG00000000196) #14 COLGALT1 (ENSPSNG00000005159) #15 UNC13A (ENSPSNG00000004521) ENSPSNG00000004125 MAP1S (ENSPSNG00000004112) #17 FCHO1 (ENSPSNG00000004056) #18 INSL3 (ENSPSNG00000003971) #20 JAK3 (ENSPSNG00000003933) #21 RPL18A (ENSPSNG00000003841) ##22 SLC5A5 (ENSPSNG00000003806) #23 CCDC124 (ENSPSNG00000003776) #24 KCNN1 (ENSPSNG00000003747) #25 ARRDC2 (ENSPSNG00000003708) #26 IL12RB1 (ENSPSNG00000003645) #27 MAST3 (ENSPSNG00000003577) #28 PIK3R2 (ENSPSNG00000003482) #29 ENSPSNG00000003439 #30 MPV17L2 (ENSPSNG00000003411) #31 RAB3A (ENSPSNG00000003382) #32 PDE4C (ENSPSNG00000003220) #33 ENSPSNG00000003167 #34 JUND (ENSPSNG00000003153) #35 ENSPSNG00000003131 #36 PGPEP1 (ENSPSNG00000003067) #37 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013782.a ENSGT00390000013782.b ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 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ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013782.a ENSGT00390000013782.b ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994.a.a #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 32 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(ENSOARG00020010182) #13 NIBAN3 (ENSOARG00020009944) #14 COLGALT1 (ENSOARG00020009873) #15 UNC13A (ENSOARG00020006998) MAP1S (ENSOARG00020006765) #17 FCHO1 (ENSOARG00020006416) #18 B3GNT3 (ENSOARG00020006386) #19 INSL3 (ENSOARG00020006354) #20 JAK3 (ENSOARG00020006264) #21 RPL18A (ENSOARG00020006201) ##22 SLC5A5 (ENSOARG00020006146) #23 CCDC124 (ENSOARG00020006131) #24 KCNN1 (ENSOARG00020006098) #25 ARRDC2 (ENSOARG00020006027) #26 IL12RB1 (ENSOARG00020005715) #27 MAST3 (ENSOARG00020005583) #28 PIK3R2 (ENSOARG00020005480) #29 IFI30 (ENSOARG00020005418) #30 MPV17L2 (ENSOARG00020005392) #31 RAB3A (ENSOARG00020005307) #32 PDE4C (ENSOARG00020004959) #33 ENSOARG00020004884 #34 JUND (ENSOARG00020004870) #35 LSM4 (ENSOARG00020004808) #36 PGPEP1 (ENSOARG00020004669) #37 Bovinae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000013782.a ENSGT00390000013782.b.a ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 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ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 26 CCDC194 (ENSBIXG00005015250) #8 ENSBIXG00005015223 MVB12A (ENSBIXG00005015169) #9 TMEM221 (ENSBIXG00005015132) #10 NXNL1 (ENSBIXG00005015113) #11 SLC27A1 (ENSBIXG00005015078) #12 PGLS (ENSBIXG00005015006) #13 NIBAN3 (ENSBIXG00005014979) #14 COLGALT1 (ENSBIXG00005014871) #15 UNC13A (ENSBIXG00005006743) MAP1S (ENSBIXG00005014741) #17 FCHO1 (ENSBIXG00005014715) #18 B3GNT3 (ENSBIXG00005014673) #19 INSL3 (ENSBIXG00005002051) #20 JAK3 (ENSBIXG00005014624) #21 RPL18A (ENSBIXG00005014580) ##22 SLC5A5 (ENSBIXG00005007535) #23 CCDC124 (ENSBIXG00005001974) #24 KCNN1 (ENSBIXG00005014447) #25 ARRDC2 (ENSBIXG00005001918) #26 IL12RB1 (ENSBIXG00005014340) #27 MAST3 (ENSBIXG00005001845) #28 PIK3R2 (ENSBIXG00005013908) #29 IFI30 (ENSBIXG00005013854) #30 MPV17L2 (ENSBIXG00005013844) #31 RAB3A (ENSBIXG00005013822) #32 PDE4C (ENSBIXG00005007314) #33 ENSBIXG00005013722 JUND (ENSBIXG00005013693) #35 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##22 ZC3H12B (ENSVVUG00000022686) ZC4H2 (ENSVVUG00000022682) Red fox MODERN SPECIES 9 TMCC3 (ENSVVUG00000012324) CEP83 (ENSVVUG00000012315) PLXNC1 (ENSVVUG00000011903) ENSVVUG00000011872 ##22 CRADD (ENSVVUG00000011866) ENSVVUG00000011846 MRPL42 (ENSVVUG00000011842) ENSVVUG00000011840 NUDT4 (ENSVVUG00000011834) EEA1 (ENSVVUG00000011772) ENSVVUG00000011745 BTG1 (ENSVVUG00000011741) DCN (ENSVVUG00000011722) LUM (ENSVVUG00000011715) KERA (ENSVVUG00000011712) EPYC (ENSVVUG00000011701) CCER1 (ENSVVUG00000011693) ATP2B1 (ENSVVUG00000011650) ENSVVUG00000011636 Red fox MODERN SPECIES 212 PEX11G (ENSVVUG00000028238) TEX45 (ENSVVUG00000028234) ZNF358 (ENSVVUG00000028228) MCOLN1 (ENSVVUG00000028132) PNPLA6 (ENSVVUG00000027123) CAMSAP3 (ENSVVUG00000027095) XAB2 (ENSVVUG00000027092) PET100 (ENSVVUG00000027090) PCP2 (ENSVVUG00000027086) STXBP2 (ENSVVUG00000027084) RETN (ENSVVUG00000027083) ENSVVUG00000027082 ENSVVUG00000027080 ENSVVUG00000027079 CLEC4G (ENSVVUG00000027070) ENSVVUG00000027068 ##22 ENSVVUG00000027066 EVI5L (ENSVVUG00000027064) PRR36 (ENSVVUG00000027061) LRRC8E (ENSVVUG00000027058) MAP2K7 (ENSVVUG00000027000) SNAPC2 (ENSVVUG00000026998) CTXN1 (ENSVVUG00000026995) TIMM44 (ENSVVUG00000026990) ENSVVUG00000026988 ENSVVUG00000026986 FBN3 (ENSVVUG00000025403) CERS4 (ENSVVUG00000025222) ENSVVUG00000025221 NDUFA7 (ENSVVUG00000025219) RPS28 (ENSVVUG00000025217) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 46 ENSGT00390000013853 ENSGT00390000004263.a ENSGT00950000182995.e.b ENSGT00940000159405 ENSGT00440000038909 ENSGT00940000156357.e ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000158862 ENSGT00940000155788.e ENSGT00940000155788.f ENSGT00390000003465.b.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00940000153773.a.b ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000157094 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000158703 ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000154697.b ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00530000063692.a 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(ENSUMAG00000017073) OSR2 (ENSUMAG00000016994) STK3 (ENSUMAG00000016985) KCNS2 (ENSUMAG00000016978) NIPAL2 (ENSUMAG00000016967) POP1 (ENSUMAG00000016952) Giant Panda MODERN SPECIES 1265 ENSAMEG00000025738 ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00850000133633 #8 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 #9 ENSGT00390000001907 #10 ENSGT00940000161246 #11 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 #33 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 9 CCDC194 (ENSRFEG00010016797) #8 ENSRFEG00010016869 MVB12A (ENSRFEG00010016936) #9 TMEM221 (ENSRFEG00010017033) #10 NXNL1 (ENSRFEG00010017098) #11 SLC27A1 (ENSRFEG00010017146) #12 PGLS (ENSRFEG00010017226) #13 NIBAN3 (ENSRFEG00010017286) #14 COLGALT1 (ENSRFEG00010017748) #15 UNC13A (ENSRFEG00010017824) MAP1S (ENSRFEG00010018025) #17 FCHO1 (ENSRFEG00010018082) #18 B3GNT3 (ENSRFEG00010018164) #19 INSL3 (ENSRFEG00010018191) #20 JAK3 (ENSRFEG00010018227) #21 RPL18A (ENSRFEG00010018283) ##22 SLC5A5 (ENSRFEG00010018368) #23 CCDC124 (ENSRFEG00010018511) #24 KCNN1 (ENSRFEG00010018547) #25 ARRDC2 (ENSRFEG00010018589) #26 IL12RB1 (ENSRFEG00010018741) #27 MAST3 (ENSRFEG00010019088) #28 PIK3R2 (ENSRFEG00010019200) #29 IFI30 (ENSRFEG00010019241) #30 MPV17L2 (ENSRFEG00010019303) #31 RAB3A (ENSRFEG00010019319) #32 PDE4C (ENSRFEG00010019392) #33 ENSRFEG00010019539 ENSRFEG00010019579 #34 JUND (ENSRFEG00010019678) #35 LSM4 (ENSRFEG00010019692) #36 Microbat MODERN SPECIES 1868 RPL18A (ENSMLUG00000006701) ##22 SLC5A5 (ENSMLUG00000016564) #23 ENSMLUG00000027236 CCDC124 (ENSMLUG00000007894) #24 KCNN1 (ENSMLUG00000007908) #25 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b ##22 koala MODERN SPECIES 229 PARN (ENSPCIG00000001259) ENSPCIG00000002716 ENSPCIG00000002739 ENSPCIG00000002823 ZC3H7A (ENSPCIG00000001063) TXNDC11 (ENSPCIG00000001046) SNN (ENSPCIG00000001028) ENSPCIG00000004966 ENSPCIG00000004749 ENSPCIG00000004770 ENSPCIG00000037479 ENSPCIG00000004795 RMI2 (ENSPCIG00000034250) ENSPCIG00000004831 ENSPCIG00000004862 ENSPCIG00000010462 ##22 CLEC16A (ENSPCIG00000010455) ENSPCIG00000034176 CIITA (ENSPCIG00000005524) TVP23A (ENSPCIG00000006216) ENSPCIG00000006218 NUBP1 (ENSPCIG00000006220) TEKT5 (ENSPCIG00000006223) EMP2 (ENSPCIG00000006225) ENSPCIG00000016616 ENSPCIG00000023232 GRIN2A (ENSPCIG00000023234) Platypus MODERN SPECIES 11 ENSOANG00000045289 ETFRF1 (ENSOANG00000012351) KRAS (ENSOANG00000037990) ENSOANG00000043766 RASSF8 (ENSOANG00000046756) ENSOANG00000040055 SSPN (ENSOANG00000045085) ITPR2 (ENSOANG00000047995) INTS13 (ENSOANG00000020224) ENSOANG00000049521 FGFR1OP2 (ENSOANG00000047307) TM7SF3 (ENSOANG00000044283) MED21 (ENSOANG00000040060) STK38L (ENSOANG00000030510) PPFIBP1 (ENSOANG00000006286) RPL18A (ENSOANG00000009129) #22 KICS2 (ENSOANG00000043854) SRGAP1 (ENSOANG00000047717) RXYLT1 (ENSOANG00000008734) AVPR1A (ENSOANG00000002085) PPM1H (ENSOANG00000014788) MON2 (ENSOANG00000010807) USP15 (ENSOANG00000010808) TAFA2 (ENSOANG00000014659) SLC16A7 (ENSOANG00000009924) LRIG3 (ENSOANG00000007758) ATP23 (ENSOANG00000043095) RPAP3 (ENSOANG00000021025) AMIGO2 (ENSOANG00000039514) SLC38A4 (ENSOANG00000006348) SLC38A2 (ENSOANG00000006346) Sauria DUPLICATION Sauria DUPLICATION Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.a #22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.a #22 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.a #22 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00940000156961 ENSGT01090000260003.a.b.b.a.a.b.a ENSGT00950000183102.A.b.a ENSGT00940000158137.c.a ENSGT00520000055637.A.a ENSGT00940000161211 ENSGT00390000004385 ENSGT00390000017600 ENSGT00730000111317 ENSGT00940000158167 ENSGT00940000164469 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ENSGT00940000156962 ENSGT00940000155760 ENSGT00940000160545 ENSGT01030000234574.B.c.b.b ENSGT00940000167325 ENSGT00390000003246 ENSGT00390000000134.b ENSGT00940000159875 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 20 BCL2 (ENSTMTG00000006876) ENSTMTG00000006860 PHLPP1 (ENSTMTG00000006765) ZCCHC2 (ENSTMTG00000006726) TNFRSF11A (ENSTMTG00000006700) RELCH (ENSTMTG00000006610) PIGN (ENSTMTG00000005695) RNF152 (ENSTMTG00000005566) CDH20 (ENSTMTG00000005534) ENSTMTG00000005363 MC4R (ENSTMTG00000005343) C5orf22 (ENSTMTG00000005334) DROSHA (ENSTMTG00000002808) CDH6 (ENSTMTG00000002796) ENSTMTG00000002792 ENSTMTG00000002789 #22 CDH9 (ENSTMTG00000002774) POLB (ENSTMTG00000002765) DKK4 (ENSTMTG00000002762) VDAC3 (ENSTMTG00000002755) IKBKB (ENSTMTG00000002740) PLAT (ENSTMTG00000002728) AP3M2 (ENSTMTG00000002721) KAT6A (ENSTMTG00000002712) ANK1 (ENSTMTG00000002645) NKX6-3 (ENSTMTG00000002629) ENSTMTG00000002626 GPAT4 (ENSTMTG00000002615) ENSTMTG00000002609 GINS4 (ENSTMTG00000002606) GOLGA7 (ENSTMTG00000002601) Testudinidae ANCESTRAL SPECIES 338 ENSGT00390000015797.e.a #22 ENSGT00940000160496.b.c Goode s thornscrub tortoise MODERN SPECIES 11 VPS4B (ENSGEVG00005003984) KDSR (ENSGEVG00005003972) BCL2 (ENSGEVG00005003964) PHLPP1 (ENSGEVG00005003942) ZCCHC2 (ENSGEVG00005003897) TNFRSF11A (ENSGEVG00005003807) RELCH (ENSGEVG00005002567) PIGN (ENSGEVG00005002044) RNF152 (ENSGEVG00005002020) CDH20 (ENSGEVG00005002004) ENSGEVG00005001965 MC4R (ENSGEVG00005001944) C5orf22 (ENSGEVG00005001930) DROSHA (ENSGEVG00005001888) CDH6 (ENSGEVG00005001838) ENSGEVG00005001754 #22 ENSGEVG00005001739 ENSGEVG00005001720 DKK4 (ENSGEVG00005001705) POLB (ENSGEVG00005001632) ENSGEVG00005001584 ENSGEVG00005001568 ENSGEVG00005001521 ENSGEVG00005001478 ENSGEVG00005001446 ENSGEVG00005001421 FGFR1 (ENSGEVG00005001397) LETM2 (ENSGEVG00005001375) NSD3 (ENSGEVG00005001323) PLPP5 (ENSGEVG00005001286) DDHD2 (ENSGEVG00005001239) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.a #22 Episquamata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.a #22 Toxicofera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.a #22 Lizard MODERN SPECIES 1 ENSACAG00000043132 PPP4R2 (ENSACAG00000014851) GXYLT2 (ENSACAG00000014845) SHQ1 (ENSACAG00000014809) ENSACAG00000041376 ENSACAG00000040119 ENSACAG00000044810 RYBP (ENSACAG00000014789) PROK2 (ENSACAG00000013932) GPR27 (ENSACAG00000036221) EIF4E3 (ENSACAG00000035562) ENSACAG00000045210 ENSACAG00000028536 ENSACAG00000042966 ENSACAG00000038806 ENSACAG00000042406 #22 FOXP1 (ENSACAG00000013683) ENSACAG00000043836 MDFIC2 (ENSACAG00000013680) ENSACAG00000039576 ENSACAG00000041007 ENSACAG00000028935 MITF (ENSACAG00000036061) ENSACAG00000043457 ENSACAG00000035967 FRMD4B (ENSACAG00000015389) LMOD3 (ENSACAG00000015388) ARL6IP5 (ENSACAG00000034873) UBA3 (ENSACAG00000015287) TMF1 (ENSACAG00000015244) EOGT (ENSACAG00000015231) Sauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.b #22 Archelosauria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.b #22 Cryptodira ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.b #22 Testudinoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.b #22 Emydidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.e.b #22 Three-toed box turtle MODERN SPECIES 107 ENSTMTG00000018268 NEK4 (ENSTMTG00000018198) ENSTMTG00000018064 ITIH4 (ENSTMTG00000017860) ENSTMTG00000017615 MUSTN1 (ENSTMTG00000017576) STIMATE (ENSTMTG00000017551) SFMBT1 (ENSTMTG00000017516) RFT1 (ENSTMTG00000017465) PRKCD (ENSTMTG00000017366) ENSTMTG00000017325 ENSTMTG00000017315 SHISA5 (ENSTMTG00000017303) ATRIP (ENSTMTG00000017274) ENSTMTG00000017260 ENSTMTG00000017201 #22 IPPK (ENSTMTG00000017169) ECM2 (ENSTMTG00000017111) ASPN (ENSTMTG00000017064) OMD (ENSTMTG00000017048) OGN (ENSTMTG00000017031) CENPP (ENSTMTG00000017017) ENSTMTG00000016992 ENSTMTG00000016954 IARS1 (ENSTMTG00000016725) ENSTMTG00000016217 SLC6A11 (ENSTMTG00000016054) SLC6A1 (ENSTMTG00000015874) HRH1 (ENSTMTG00000015850) ATG7 (ENSTMTG00000015759) VGLL4 (ENSTMTG00000015729) Sauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00390000006913 ENSGT01050000244940.b ENSGT00940000165344 ENSGT01050000248015 ENSGT00390000012979 ENSGT00940000163109 ENSGT00940000155240.A ENSGT00940000157643 ENSGT00940000160401 ENSGT00940000159226 ENSGT00940000158420 ENSGT00440000039984.b ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797.f #22 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT00950000185713 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000179276 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a Archelosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158692 ENSGT00950000185293 ENSGT00390000006913 ENSGT01050000244940.b ENSGT00390000012979 ENSGT00940000163109 ENSGT00940000155240.A ENSGT00940000157643 ENSGT00940000160401 ENSGT00940000159226 ENSGT00940000158420 ENSGT00440000039984.b ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797.f #22 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT00950000185713 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 Archosauria ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158692 ENSGT00950000185293 ENSGT00390000006913 ENSGT01050000244940.b ENSGT00390000012979 ENSGT00940000163109 ENSGT00940000155240.A ENSGT00940000157643 ENSGT00940000160401 ENSGT00940000159226 ENSGT00940000158420 ENSGT00440000039984.b ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797.f #22 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 ENSGT00940000155486 Australian saltwater crocodile MODERN SPECIES 49 DYRK2 (ENSCPRG00005007307) CAND1 (ENSCPRG00005007329) GRIP1 (ENSCPRG00005007402) HELB (ENSCPRG00005007436) TMBIM4 (ENSCPRG00005007464) ENSCPRG00005007468 HMGA2 (ENSCPRG00005007495) MSRB3 (ENSCPRG00005007549) LEMD3 (ENSCPRG00005007573) WIF1 (ENSCPRG00005007599) TBC1D30 (ENSCPRG00005007616) GNS (ENSCPRG00005007622) RASSF3 (ENSCPRG00005007626) TBK1 (ENSCPRG00005007640) XPOT (ENSCPRG00005007647) RPL18A (ENSCPRG00005007683) #22 KICS2 (ENSCPRG00005007688) SRGAP1 (ENSCPRG00005007696) RXYLT1 (ENSCPRG00005007737) AVPR1A (ENSCPRG00005007753) PPM1H (ENSCPRG00005007789) MON2 (ENSCPRG00005007830) USP15 (ENSCPRG00005007897) TAFA2 (ENSCPRG00005007970) SLC16A7 (ENSCPRG00005008009) LRIG3 (ENSCPRG00005008046) ATP23 (ENSCPRG00005008090) RPAP3 (ENSCPRG00005008095) SLC38A4 (ENSCPRG00005008129) SLC38A2 (ENSCPRG00005008172) SLC38A1 (ENSCPRG00005008184) Aves ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000158692 ENSGT00950000185293 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(ENSSCUG00000004953) XPOT (ENSSCUG00000004957) RPL18A (ENSSCUG00000004959) #22 KICS2 (ENSSCUG00000004961) SRGAP1 (ENSSCUG00000004963) RXYLT1 (ENSSCUG00000004965) Neognathae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158692 ENSGT00950000185293 ENSGT00390000006913 ENSGT01050000244940.b ENSGT00390000012979 ENSGT00940000163109 ENSGT00940000155240.A ENSGT00940000157643 ENSGT00940000160401 ENSGT00940000159226 ENSGT00940000158420 ENSGT00440000039984.b ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797.f #22 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 ENSGT00940000155486 Neognathae_b ANCESTRAL SPECIES 2 ENSGT00390000017740.a.a ENSGT00940000158692 ENSGT00390000006913 ENSGT01050000244940.b ENSGT00390000012979 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ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797.f #22 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 ENSGT00940000155486 Passeriformes_d ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00940000158113 ENSGT00390000017740.a.a ENSGT00940000158692 ENSGT00390000006913 ENSGT01050000244940.b ENSGT00390000012979 ENSGT00940000163109 ENSGT00940000155240.A ENSGT00940000157643 ENSGT00940000160401 ENSGT00940000159226 ENSGT00940000158420 ENSGT00940000157502 ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797.f #22 ENSGT00390000009583 ENSGT00950000182824.a.a.a ENSGT00390000003526 ENSGT01050000244882.a.a.a.a ENSGT00940000160095 ENSGT00390000013286 ENSGT00940000154932.A ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 ENSGT00940000155486 Flycatcher MODERN SPECIES 10 IFNG (ENSFALG00000010070) CAND1 (ENSFALG00000010066) GRIP1 (ENSFALG00000010045) HELB (ENSFALG00000010025) TMBIM4 (ENSFALG00000010032) LLPH (ENSFALG00000024250) HMGA2 (ENSFALG00000010016) MSRB3 (ENSFALG00000010013) LEMD3 (ENSFALG00000009996) WIF1 (ENSFALG00000009986) TBC1D30 (ENSFALG00000009976) GNS (ENSFALG00000009967) RASSF3 (ENSFALG00000025525) TBK1 (ENSFALG00000009946) XPOT (ENSFALG00000009938) ENSFALG00000009932 #22 C12orf66 (ENSFALG00000023915) SRGAP1 (ENSFALG00000009882) RXYLT1 (ENSFALG00000009860) AVPR1A (ENSFALG00000009852) PPM1H (ENSFALG00000027933) MON2 (ENSFALG00000009828) USP15 (ENSFALG00000009821) TAFA2 (ENSFALG00000009815) SLC16A7 (ENSFALG00000007331) LRIG3 (ENSFALG00000007326) ATP23 (ENSFALG00000024277) RPAP3 (ENSFALG00000007312) AMIGO2 (ENSFALG00000015086) ENSFALG00000025756 ENSFALG00000024911 Passeriformes_g ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000158113 ENSGT00390000017740.a.a 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tit MODERN SPECIES 10 IFNG (ENSPMJG00000012612) DYRK2 (ENSPMJG00000012609) CAND1 (ENSPMJG00000012608) GRIP1 (ENSPMJG00000012607) HELB (ENSPMJG00000012606) LLPH (ENSPMJG00000012604) HMGA2 (ENSPMJG00000012603) MSRB3 (ENSPMJG00000012601) LEMD3 (ENSPMJG00000012600) WIF1 (ENSPMJG00000012598) TBC1D30 (ENSPMJG00000012596) GNS (ENSPMJG00000012595) RASSF3 (ENSPMJG00000012594) TBK1 (ENSPMJG00000012593) XPOT (ENSPMJG00000012592) RPL18A (ENSPMJG00000012589) #22 KICS2 (ENSPMJG00000012588) SRGAP1 (ENSPMJG00000012585) RXYLT1 (ENSPMJG00000012583) AVPR1A (ENSPMJG00000012582) PPM1H (ENSPMJG00000012553) MON2 (ENSPMJG00000011160) USP15 (ENSPMJG00000011152) TAFA2 (ENSPMJG00000011148) SLC16A7 (ENSPMJG00000011137) LRIG3 (ENSPMJG00000011115) ATP23 (ENSPMJG00000011109) RPAP3 (ENSPMJG00000011104) SLC38A4 (ENSPMJG00000011085) SLC38A2 (ENSPMJG00000011067) SLC38A1 (ENSPMJG00000011062) Galloanserae ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000017740.a.a ENSGT00940000158692 ENSGT00950000185293 ENSGT00390000006913 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turtle MODERN SPECIES 28 CAND1 (ENSTMTG00000015830) GRIP1 (ENSTMTG00000015716) HELB (ENSTMTG00000015686) TMBIM4 (ENSTMTG00000015667) LLPH (ENSTMTG00000015659) HMGA2 (ENSTMTG00000015646) MSRB3 (ENSTMTG00000015612) LEMD3 (ENSTMTG00000015581) WIF1 (ENSTMTG00000015389) TBC1D30 (ENSTMTG00000015300) GNS (ENSTMTG00000015285) ENSTMTG00000015281 RASSF3 (ENSTMTG00000015272) TBK1 (ENSTMTG00000015010) XPOT (ENSTMTG00000014927) ENSTMTG00000014873 #22 KICS2 (ENSTMTG00000014845) SRGAP1 (ENSTMTG00000014690) ENSTMTG00000014654 AVPR1A (ENSTMTG00000014644) PPM1H (ENSTMTG00000014615) MON2 (ENSTMTG00000014440) USP15 (ENSTMTG00000013841) ENSTMTG00000013792 ENSTMTG00000013788 ENSTMTG00000013765 ENSTMTG00000013753 ENSTMTG00000013745 LRIG3 (ENSTMTG00000013728) ATP23 (ENSTMTG00000013704) RPAP3 (ENSTMTG00000013678) Lepidosauria ANCESTRAL SPECIES 3 ENSGT00390000006913 ENSGT01050000244940.b.b ENSGT00940000165344 ENSGT01050000248015 ENSGT01050000244940.b.a ENSGT00390000012979 ENSGT00940000163109 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ENSGT00940000161214 ENSGT00940000157309 ENSGT00940000157098 ENSGT00390000010948 ENSGT00940000156749 ENSGT00950000183146.a.a ENSGT00940000158917 ENSGT00940000155486 Argentine black and white tegu MODERN SPECIES 15 GRIP1 (ENSSMRG00000016115) HELB (ENSSMRG00000016112) TMBIM4 (ENSSMRG00000016111) ENSSMRG00000016110 HMGA2 (ENSSMRG00000016109) ENSSMRG00000016108 ENSSMRG00000016107 MSRB3 (ENSSMRG00000016106) LEMD3 (ENSSMRG00000016105) WIF1 (ENSSMRG00000016104) TBC1D30 (ENSSMRG00000016103) GNS (ENSSMRG00000016102) RASSF3 (ENSSMRG00000016101) TBK1 (ENSSMRG00000016100) XPOT (ENSSMRG00000016099) RPL18A (ENSSMRG00000016097) #22 KICS2 (ENSSMRG00000016096) SRGAP1 (ENSSMRG00000016093) RXYLT1 (ENSSMRG00000016092) AVPR1A (ENSSMRG00000016090) PPM1H (ENSSMRG00000016089) MON2 (ENSSMRG00000016087) USP15 (ENSSMRG00000016086) TAFA2 (ENSSMRG00000016085) SLC16A7 (ENSSMRG00000016083) LRIG3 (ENSSMRG00000016082) ATP23 (ENSSMRG00000016080) RPAP3 (ENSSMRG00000016079) AMIGO2 (ENSSMRG00000016078) SLC38A4 (ENSSMRG00000016077) SLC38A2 (ENSSMRG00000016076) Common wall lizard DUPLICATION Common wall lizard MODERN SPECIES 1 ENSPMRG00000017718 GRIP1 (ENSPMRG00000017644) HELB (ENSPMRG00000017610) TMBIM4 (ENSPMRG00000017603) ENSPMRG00000017594 HMGA2 (ENSPMRG00000017587) MSRB3 (ENSPMRG00000017578) LEMD3 (ENSPMRG00000017567) WIF1 (ENSPMRG00000017554) TBC1D30 (ENSPMRG00000017527) GNS (ENSPMRG00000017516) RASSF3 (ENSPMRG00000017510) ENSPMRG00000017507 TBK1 (ENSPMRG00000016680) XPOT (ENSPMRG00000016531) ENSPMRG00000016502 #22 KICS2 (ENSPMRG00000016594) SRGAP1 (ENSPMRG00000016587) RXYLT1 (ENSPMRG00000016581) AVPR1A (ENSPMRG00000016578) PPM1H (ENSPMRG00000016572) MON2 (ENSPMRG00000016135) USP15 (ENSPMRG00000015456) TAFA2 (ENSPMRG00000015353) SLC16A7 (ENSPMRG00000015347) ENSPMRG00000015343 LRIG3 (ENSPMRG00000015318) ENSPMRG00000015303 ENSPMRG00000015296 RPAP3 (ENSPMRG00000015250) AMIGO2 (ENSPMRG00000015217) Common wall lizard MODERN SPECIES OBSL1 (ENSPMRG00000015819) TMEM198 (ENSPMRG00000015849) 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ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT01100000263474.a.b.a.b.a.d.m.a ENSGT00940000161860 ENSGT00940000158576.a.a ENSGT00940000164299.b.a ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000153377.A ENSGT00940000158990.t ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00940000160365 ENSGT00390000005388 ENSGT00940000157164 ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000014448 ENSGT00940000157983 ENSGT01020000230616 ENSGT00390000014443 Turbot MODERN SPECIES 11 ENSSMAG00000035341 ENSSMAG00000037682 ENSSMAG00000025869 ENSSMAG00000033602 ENSSMAG00000033492 ENSSMAG00000004869 ENSSMAG00000028658 ENSSMAG00000004901 ARHGAP8 (ENSSMAG00000004908) PHF21B (ENSSMAG00000004921) NUP50 (ENSSMAG00000004935) kiaa0930 (ENSSMAG00000004949) fbxo7 (ENSSMAG00000004980) RTCB (ENSSMAG00000005096) xpot (ENSSMAG00000005164) ENSSMAG00000038023 #22 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(ENSPNYG00000022733) #22 pthlha (ENSPNYG00000022731) C11orf98 (ENSPNYG00000022726) Haplochromini_B ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00950000183089.c.b ENSGT01100000263567.a.a.d.b.l ENSGT01100000263506.a.d.fb ENSGT01020000230360.d.f ENSGT00940000156944.a.a ENSGT00990000203553.c.a.a.b.a.a.b.a.a.b ENSGT00940000161860 ENSGT00940000158576.b ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000004933.k.a.e ENSGT00390000002634.a.f.b.b.a.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t ENSGT00940000161847.b.a.e.a.b.d.e.a.a ENSGT00950000183127.c.b.d.a.a.b.g.a ENSGT00950000182937.B.b ENSGT01020000230360.c.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00390000001285.i ENSGT00950000183039.A ENSGT00940000156088.c.a ENSGT00940000157212.B ENSGT01090000260851 ENSGT00940000161376 Eastern happy MODERN SPECIES 8 sco2 (ENSACLG00000007084) ncaph2 (ENSACLG00000007091) kcnd2 (ENSACLG00000007563) 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ENSGT00390000005388 ENSGT00940000160365 ENSGT00940000157164 ENSGT00940000156403.b Amphiprion ANCESTRAL SPECIES 199 ENSGT00940000158576.a.a ENSGT00940000164299.b.a.d ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t.h ENSGT00940000158990.t.g ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00390000005388 ENSGT00940000160365 ENSGT00940000157164 ENSGT00940000156403.b Orange clownfish DUPLICATION Orange clownfish MODERN SPECIES 13 ENSAPEG00000024588 svopl (ENSAPEG00000024594) atp6v1f (ENSAPEG00000024605) lamtor4 (ENSAPEG00000024609) arf5 (ENSAPEG00000024614) gcc1 (ENSAPEG00000024617) KCNA1 (ENSAPEG00000024619) ARHGAP8 (ENSAPEG00000024632) ENSAPEG00000024636 ENSAPEG00000024640 nup50 (ENSAPEG00000024643) ENSAPEG00000024647 fbxo7 (ENSAPEG00000024650) rtcb (ENSAPEG00000024653) xpot (ENSAPEG00000024660) rpl18a 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gpr19 (ENSAPEG00000024757) dusp16 (ENSAPEG00000024760) eps8a (ENSAPEG00000024766) Clown anemonefish MODERN SPECIES 2325 rpl18a (ENSAOCG00000022332) #22 Spiny chromis MODERN SPECIES 1822 etv4 (ENSAPOG00000001258) gcc1 (ENSAPOG00000001264) ENSAPOG00000001269 lamtor4 (ENSAPOG00000001271) ENSAPOG00000001290 svopl (ENSAPOG00000001307) ENSAPOG00000001314 ENSAPOG00000001318 lta4h (ENSAPOG00000001326) ENSAPOG00000001332 xpot (ENSAPOG00000001362) rpl18a (ENSAPOG00000001382) #22 Atherinomorphae ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00940000161860 ENSGT00940000158576.a.a ENSGT00940000164299.b.a ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00940000160365 ENSGT00390000005388 ENSGT00940000157164 ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000154814.b ENSGT00390000014448 ENSGT00940000157983 ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000163017 Cyprinodontiformes ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT00940000161105 ENSGT00940000160758 ENSGT00940000164299.b.a ENSGT00940000158576.a.a ENSGT00940000161860 ENSGT00390000013208 ENSGT00390000016053 ENSGT00940000156878.i.b.a.a ENSGT00940000153772.A ENSGT00390000005529.b ENSGT00940000156375 ENSGT00940000163529 ENSGT00940000155580.b.a.b.f ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00940000160365 ENSGT00390000005388 ENSGT00940000157164 ENSGT00940000156403.b ENSGT00390000014448 ENSGT00940000157983 ENSGT00940000153588.a.a.a ENSGT00940000164581.A.a.b ENSGT00940000163017 ENSGT00940000156566.d Aplocheiloidei ANCESTRAL SPECIES 150 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t.d 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20 ENSGT00390000013208 ENSGT00940000160974.a ENSGT00940000165748.a ENSGT00940000159926 ENSGT00530000063347.B ENSGT01030000234549.a.a.a.a.b ENSGT00940000157983 ENSGT00390000014448 ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00940000160365 ENSGT00390000005388 ENSGT00940000157164 ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000161860 ENSGT00940000158576.a.a ENSGT00940000164299.b.a ENSGT00940000174747 ENSGT00940000176985 ENSGT01020000230588 Oryzias_a ANCESTRAL SPECIES 15 ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190 ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797 #22 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT00940000169980 ENSGT00940000158990.t ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00940000160365 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ENSGT00940000176985 ENSGT01020000230588 ENSGT00940000175319 Javanese ricefish MODERN SPECIES 15 hcls1 (ENSOJAG00000021881) ENSOJAG00000021872 guca1a (ENSOJAG00000021865) orc5 (ENSOJAG00000021719) lhfpl3 (ENSOJAG00000021705) ENSOJAG00000021688 ndufb2 (ENSOJAG00000021680) KDM7A (ENSOJAG00000021647) ergic2 (ENSOJAG00000021598) si:dkey-97m3.1 (ENSOJAG00000021550) ENSOJAG00000021540 ENSOJAG00000021379 ENSOJAG00000021299 cd36 (ENSOJAG00000021242) SEMA3C (ENSOJAG00000020832) rpl18a (ENSOJAG00000020726) #22 ENSOJAG00000020707 ENSOJAG00000020704 ENSOJAG00000020690 pthlha (ENSOJAG00000020673) ENSOJAG00000020660 C11orf98 (ENSOJAG00000020646) ENSOJAG00000020639 gpr19 (ENSOJAG00000018565) crebl2 (ENSOJAG00000018552) eps8a (ENSOJAG00000017699) KCNA1 (ENSOJAG00000017167) ENSOJAG00000017148 ENSOJAG00000017131 ENSOJAG00000017114 ENSOJAG00000017098 Indian medaka MODERN SPECIES 2 atp6v1f (ENSOMEG00000020862) ENSOMEG00000020875 ENSOMEG00000020882 ENSOMEG00000020895 irf5 (ENSOMEG00000020932) tnpo3 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ENSGT00390000015797.u.a #22 Atlantic salmon MODERN SPECIES 139 ENSSSAG00000101537 ENSSSAG00000009988 #22 River trout MODERN SPECIES 134 rpl18a (ENSSTUG00000027899) #22 xpot (ENSSTUG00000027978) rtcb (ENSSTUG00000029494) fbxo7 (ENSSTUG00000029580) kiaa0930 (ENSSTUG00000029622) MFAP4 (ENSSTUG00000029714) nup50 (ENSSTUG00000029818) ENSSTUG00000029827 nup50 (ENSSTUG00000029831) MFAP4 (ENSSTUG00000029836) ENSSTUG00000029845 RTCB (ENSSTUG00000029866) rpl18a (ENSSTUG00000029989) #22 xpot (ENSSTUG00000030206) pthlha (ENSSTUG00000030380) pthlha (ENSSTUG00000022213) Oncorhynchus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.u.a #22 Rainbow trout MODERN SPECIES 13 ENSOMYG00000073231 ENSOMYG00000065904 ENSOMYG00000059684 ENSOMYG00000062269 ENSOMYG00000076670 ENSOMYG00000065681 ENSOMYG00000072642 ARHGAP8 (ENSOMYG00000048540) PHF21B (ENSOMYG00000060481) NUP50 (ENSOMYG00000077483) kiaa0930 (ENSOMYG00000048214) ENSOMYG00000048014 fbxo7 (ENSOMYG00000052484) rtcb (ENSOMYG00000053961) xpot (ENSOMYG00000068362) ENSOMYG00000073747 #22 ENSOMYG00000073782 pthlha (ENSOMYG00000039493) ENSOMYG00000066506 ENSOMYG00000059256 ENSOMYG00000068316 ENSOMYG00000069123 tbk1 (ENSOMYG00000039039) ENSOMYG00000051683 gpr19 (ENSOMYG00000076711) crebl2 (ENSOMYG00000049623) ENSOMYG00000052854 dusp16 (ENSOMYG00000025813) ENSOMYG00000071958 ENSOMYG00000067357 ENSOMYG00000074712 Oncorhynchus_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.u.a #22 Chinook salmon MODERN SPECIES 29 aqp4 (ENSOTSG00005011686) ENSOTSG00005011685 ENSOTSG00005011684 psma8 (ENSOTSG00005011680) rad54l (ENSOTSG00005011427) st3gal3a (ENSOTSG00005011424) ENSOTSG00005036935 ptprfa (ENSOTSG00005035285) ENSOTSG00005035265 smx5 (ENSOTSG00005035264) ENSOTSG00005035261 ENSOTSG00005035223 hyi (ENSOTSG00005035216) med8 (ENSOTSG00005035215) ENSOTSG00005035214 rpl18a (ENSOTSG00005035212) #22 pthlha (ENSOTSG00005035210) ENSOTSG00005035209 pbx1b (ENSOTSG00005035049) glula (ENSOTSG00005035046) ZNF648 (ENSOTSG00005035044) ENSOTSG00005035041 gadd45ab (ENSOTSG00005035039) GNG12 (ENSOTSG00005035038) ENSOTSG00005035035 dr1 (ENSOTSG00005035033) zgc:109982 (ENSOTSG00005035031) scinla (ENSOTSG00005034627) ENSOTSG00005034626 DIPK1A (ENSOTSG00005034625) RPL5 (ENSOTSG00005034450) Protacanthopterygii ANCESTRAL SPECIES 115 ENSGT00940000156154 ENSGT00940000158497 ENSGT00390000017181 ENSGT00940000161860 ENSGT00940000158576.a.a ENSGT00940000164299.b.a ENSGT00940000160758 ENSGT00940000161105 ENSGT00440000035348 ENSGT00390000004190.j ENSGT00940000154615.j ENSGT00390000004190.i ENSGT00390000006670 ENSGT00940000155911 ENSGT00390000007890 ENSGT00390000015797.u.b #22 ENSGT00390000004933.k.a ENSGT00390000002615 ENSGT01100000263936 ENSGT00940000158990.t ENSGT00950000182937.B.b ENSGT00940000160365 ENSGT00390000005388 ENSGT00940000157164 ENSGT00940000156403.b ENSGT00940000154814.b.nc.a ENSGT00440000039984.b ENSGT00940000158420 ENSGT00940000159226 ENSGT00390000007725.A.a ENSGT00940000155083.b.a.b Salmoninae ANCESTRAL SPECIES 174 ENSGT00390000011401 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(ENSEBUG00000004139) #22 ENSEBUG00000005991 ENSEBUG00000011756 ENSEBUG00000000823 ENSEBUG00000001806 ENSEBUG00000016532 Lamprey MODERN SPECIES 45 gnsa (ENSPMAG00000003527) ENSPMAG00000003558 zmynd10 (ENSPMAG00000003569) ENSPMAG00000003589 rpl18a (ENSPMAG00000003619) #22 ENSPMAG00000003627 HYAL2 (ENSPMAG00000003657) Cyclostomata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.b #22 Lamprey MODERN SPECIES 3398 rpl18a (ENSPMAG00000006077) #22