Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000154929.B #16 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 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(ENSJJAG00000004780) #35 Lsm4 (ENSJJAG00000017420) #36 ENSJJAG00000015593 #37 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1820 ENSNGAG00000022895 ENSNGAG00000023710 #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938 ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938.s ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 112 Cnep1r1 (ENSCGRG00001009199) Heatr3 (ENSCGRG00001024755) Tent4b (ENSCGRG00001023597) Adcy7 (ENSCGRG00001014504) Brd7 (ENSCGRG00001003449) Nkd1 (ENSCGRG00001011787) Snx20 (ENSCGRG00001020312) Nod2 (ENSCGRG00001011531) Cyld (ENSCGRG00001000533) ENSCGRG00001019423 ##22 ENSCGRG00001023314 Tox3 (ENSCGRG00001021816) ENSCGRG00001001946 ENSCGRG00001010471 Gm19935 (ENSCGRG00001012263) ENSCGRG00001012667 #22 Chd9 (ENSCGRG00001016150) Rbl2 (ENSCGRG00001012793) ENSCGRG00001024361 ENSCGRG00001013457 Rpgrip1l (ENSCGRG00001020196) Fto (ENSCGRG00001013545) Irx3 (ENSCGRG00001022254) Irx5 (ENSCGRG00001019317) ENSCGRG00001021640 Irx6 (ENSCGRG00001005135) Mmp2 (ENSCGRG00001020567) Lpcat2 (ENSCGRG00001018067) Slc6a2 (ENSCGRG00001015472) Ces1a (ENSCGRG00001017007) ENSCGRG00001013949 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938 ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 137 ENSMOCG00000011490 ENSMOCG00000010137 ENSMOCG00000019154 #22 ENSMOCG00000018583 ENSMOCG00000016093 ENSMOCG00000010691 Rbl2 (ENSMOCG00000002758) Aktip (ENSMOCG00000000125) Rpgrip1l (ENSMOCG00000002757) Fto (ENSMOCG00000012365) Irx3 (ENSMOCG00000001570) Irx5 (ENSMOCG00000000963) Irx6 (ENSMOCG00000000419) Mmp2 (ENSMOCG00000000066) Lpcat2 (ENSMOCG00000010966) SLC6A2 (ENSMOCG00000016144) Ces1a (ENSMOCG00000010710) ENSMOCG00000000069 Prairie vole MODERN SPECIES 223 Cul1 (ENSMOCG00000014278) ENSMOCG00000019854 ENSMOCG00000008643 #22 Prairie vole MODERN SPECIES 1 Slc35a2 (ENSMOCG00000015110) Pqbp1 (ENSMOCG00000020123) Timm17b (ENSMOCG00000022137) Pcsk1n (ENSMOCG00000016403) Eras 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ENSPEMG00000013968 ENSPEMG00000014145 Rab9 (ENSPEMG00000027764) Trappc2 (ENSPEMG00000016002) Ofd1 (ENSPEMG00000017896) Gpm6b (ENSPEMG00000000655) ENSPEMG00000024383 ENSPEMG00000009181 Glra2 (ENSPEMG00000010716) ENSPEMG00000012662 Fancb (ENSPEMG00000014927) Mospd2 (ENSPEMG00000016810) Asb9 (ENSPEMG00000012020) Asb11 (ENSPEMG00000004210) Piga (ENSPEMG00000029436) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000016851 ENSGT00940000157019 ENSGT00390000007029.j ENSGT00390000012240 ENSGT00390000007336 ENSGT00510000049316 ENSGT00390000016934 ENSGT00530000063974.a ENSGT00940000160748 ENSGT00940000162475 ENSGT00390000014361 ENSGT00940000156845 ENSGT00390000010974 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00900000143617 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 Mouse MODERN SPECIES 17 Plvap (ENSMUSG00000034845) Gtpbp3 (ENSMUSG00000007610) Ano8 (ENSMUSG00000034863) Dda1 (ENSMUSG00000074247) Mrpl34 (ENSMUSG00000034880) Abhd8 (ENSMUSG00000007950) Ankle1 (ENSMUSG00000046295) Babam1 (ENSMUSG00000031820) Ushbp1 (ENSMUSG00000034911) Nr2f6 (ENSMUSG00000002393) Ocel1 (ENSMUSG00000002396) Use1 (ENSMUSG00000002395) Myo9b (ENSMUSG00000004677) Haus8 (ENSMUSG00000035439) Map1s (ENSMUSG00000019261) #17 Rpl18a (ENSMUSG00000045128) #22 Slc5a5 (ENSMUSG00000000792) #23 Ccdc124 (ENSMUSG00000007721) #24 Kcnn1 (ENSMUSG00000002908) #25 Arrdc2 (ENSMUSG00000002910) #26 Il12rb1 (ENSMUSG00000000791) #27 Mast3 (ENSMUSG00000031833) #28 Pik3r2 (ENSMUSG00000031834) #29 Ifi30 (ENSMUSG00000031838) #30 Mpv17l2 (ENSMUSG00000035559) #31 Rab3a (ENSMUSG00000031840) #32 Pde4c (ENSMUSG00000031842) Gm3336 (ENSMUSG00000095026) #33 Iqcn (ENSMUSG00000110622) #34 Jund (ENSMUSG00000071076) #35 Lsm4 (ENSMUSG00000031848) #36 Mus_C ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Steppe mouse DUPLICATION Steppe mouse MODERN SPECIES 2686 Brms1l (ENSMSIG00000017523) Ralgapa1 (ENSMSIG00000017557) Insm2 (ENSMSIG00000018291) Aldoart2 (ENSMSIG00000018294) Nfkbia (ENSMSIG00000018300) Psma6 (ENSMSIG00000018324) ENSMSIG00000018360 #22 ENSMSIG00000018375 Steppe mouse MODERN SPECIES 2734 Map1s (ENSMSIG00000032089) #17 Rpl18a (ENSMSIG00000032086) #22 Slc5a5 (ENSMSIG00000032085) #23 Ccdc124 (ENSMSIG00000032084) #24 Kcnn1 (ENSMSIG00000032083) #25 Arrdc2 (ENSMSIG00000032082) #26 Il12rb1 (ENSMSIG00000032081) #27 Mast3 (ENSMSIG00000032079) #28 Pik3r2 (ENSMSIG00000032078) #29 Ifi30 (ENSMSIG00000032077) #30 Mpv17l2 (ENSMSIG00000032076) #31 Rab3a (ENSMSIG00000032075) #32 Pde4c (ENSMSIG00000032074) Gm3336 (ENSMSIG00000032073) #33 Iqcn (ENSMSIG00000032072) #34 ENSMSIG00000032071 #36 Pgpep1 (ENSMSIG00000032070) Steppe mouse MODERN SPECIES 2795 Arhgap33 (ENSMSIG00000005294) Proser3 (ENSMSIG00000005541) Hspb6 (ENSMSIG00000005622) Lin37 (ENSMSIG00000005641) Psenen (ENSMSIG00000005677) U2af1l4 (ENSMSIG00000005715) Igflr1 (ENSMSIG00000006148) Kmt2b (ENSMSIG00000006214) Zbtb32 (ENSMSIG00000006561) Upk1a (ENSMSIG00000006582) ENSMSIG00000006599 Etv2 (ENSMSIG00000006621) Rbm42 (ENSMSIG00000006648) Haus5 (ENSMSIG00000006715) Pmis2 (ENSMSIG00000006779) ENSMSIG00000006794 #22 Atp4a (ENSMSIG00000006805) Tmem147 (ENSMSIG00000006914) Gapdhs (ENSMSIG00000007027) ENSMSIG00000007048 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 7 Bst2 (ENSRNOG00000059900) Mvb12a (ENSRNOG00000017949) Tmem221 (ENSRNOG00000018167) Nxnl1 (ENSRNOG00000042658) Slc27a1 (ENSRNOG00000018170) #12 Pgls (ENSRNOG00000018326) #13 Niban3 (ENSRNOG00000039357) #14 Colgalt1 (ENSRNOG00000023317) #15 Unc13a (ENSRNOG00000018452) Insl3 (ENSRNOG00000068505) #20 Insl3 (ENSRNOG00000018669) #21 B3gnt3 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INSL3 (ENSMMMG00000000672) #20 JAK3 (ENSMMMG00000000693) #21 RPL18A (ENSMMMG00000000829) #22 SLC5A5 (ENSMMMG00000000854) #23 CCDC124 (ENSMMMG00000000927) #24 KCNN1 (ENSMMMG00000000948) #25 ENSMMMG00000000971 #27 MAST3 (ENSMMMG00000000984) #28 ENSMMMG00000001094 #29 IFI30 (ENSMMMG00000001207) #30 MPV17L2 (ENSMMMG00000001276) #31 RAB3A (ENSMMMG00000001289) #32 ENSMMMG00000001307 ENSMMMG00000001318 ENSMMMG00000001330 #33 ENSMMMG00000001343 #34 LSM4 (ENSMMMG00000001362) #36 PGPEP1 (ENSMMMG00000001398) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000002505 ENSGT00950000182915.b.b.b.b ENSGT00940000155438.b ENSGT00940000163163 ENSGT00940000157924 ENSGT00390000013811 ENSGT00940000160466 ENSGT00940000161678 ENSGT00940000157246 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.c.b ##22 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00610000086173 #36 ENSGT00390000015368.a.a Naked mole-rat female MODERN SPECIES 21 CHERP (ENSHGLG00000002993) ENSHGLG00000003381 EPS15L1 (ENSHGLG00000005235) ENSHGLG00000047567 AP1M1 (ENSHGLG00000041098) ENSHGLG00000003291 ENSHGLG00000042939 ENSHGLG00000039588 ENSHGLG00000002682 ENSHGLG00000042793 ENSHGLG00000002766 #18 B3GNT3 (ENSHGLG00000047384) #19 ENSHGLG00000003768 #20 JAK3 (ENSHGLG00000003869) #21 ENSHGLG00000041243 RPL18A (ENSHGLG00000002321) #22 SLC5A5 (ENSHGLG00000002528) #23 CCDC124 (ENSHGLG00000002655) #24 KCNN1 (ENSHGLG00000002697) #25 ARRDC2 (ENSHGLG00000003087) #26 IL12RB1 (ENSHGLG00000029940) #27 MAST3 (ENSHGLG00000003256) #28 IFI30 (ENSHGLG00000001756) #30 ENSHGLG00000001889 #31 RAB3A (ENSHGLG00000040086) #32 PDE4C (ENSHGLG00000002262) ENSHGLG00000037483 #34 ENSHGLG00000032754 #35 LSM4 (ENSHGLG00000006568) #36 PGPEP1 (ENSHGLG00000006686) GDF15 (ENSHGLG00000032564) Hystricomorpha_a DUPLICATION Hystricomorpha_a DUPLICATION Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.a #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.a #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 259 FAM3A (ENSODEG00000006189) UBL4A (ENSODEG00000006287) ENSODEG00000006315 PLXNA3 (ENSODEG00000006368) ENSODEG00000006510 GDI1 (ENSODEG00000006550) ATP6AP1 (ENSODEG00000003643) TAFAZZIN (ENSODEG00000003758) DNASE1L1 (ENSODEG00000003830) ENSODEG00000003868 EMD (ENSODEG00000003890) FLNA (ENSODEG00000004055) TKTL1 (ENSODEG00000004431) ENSODEG00000004454 ENSODEG00000004473 ENSODEG00000004516 #22 MECP2 (ENSODEG00000004523) IRAK1 (ENSODEG00000004583) HCFC1 (ENSODEG00000004823) RENBP (ENSODEG00000005065) ENSODEG00000005100 ARHGAP4 (ENSODEG00000005124) AVPR2 (ENSODEG00000005166) ENSODEG00000005204 L1CAM 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SLAMF1 (ENSCPOG00000002925) CD84 (ENSCPOG00000008701) ENSCPOG00000006924 VANGL2 (ENSCPOG00000010224) NHLH1 (ENSCPOG00000021596) NCSTN (ENSCPOG00000014923) COPA (ENSCPOG00000014917) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.b #22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.b #22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 87 KIF20B (ENSODEG00000005304) ENSODEG00000019106 HTR7 (ENSODEG00000004910) ENSODEG00000004530 ANKRD1 (ENSODEG00000005129) PCGF5 (ENSODEG00000004787) ENSODEG00000005047 HECTD2 (ENSODEG00000004980) PPP1R3C (ENSODEG00000006013) TNKS2 (ENSODEG00000004816) BTAF1 (ENSODEG00000005172) ENSODEG00000005031 CPEB3 (ENSODEG00000004591) ENSODEG00000004464 MARCHF5 (ENSODEG00000004219) ENSODEG00000005936 #22 IDE (ENSODEG00000005398) KIF11 (ENSODEG00000006812) HHEX (ENSODEG00000006657) ENSODEG00000005404 ENSODEG00000019192 ENSODEG00000005119 ENSODEG00000019122 ENSODEG00000005000 ENSODEG00000005878 ENSODEG00000005365 EXOC6 (ENSODEG00000005032) CYP26C1 (ENSODEG00000006273) CYP26A1 (ENSODEG00000006141) ENSODEG00000006071 MYOF (ENSODEG00000004826) Degu MODERN SPECIES 317 ENSODEG00000018695 #22 ENSODEG00000001530 JPH4 (ENSODEG00000001519) ENSODEG00000018942 AP1G2 (ENSODEG00000002984) THTPA (ENSODEG00000002973) ZFHX2 (ENSODEG00000002856) NGDN (ENSODEG00000002730) MYH7 (ENSODEG00000002613) MYH6 (ENSODEG00000002284) CMTM5 (ENSODEG00000002188) IL25 (ENSODEG00000002172) EFS (ENSODEG00000002155) SLC22A17 (ENSODEG00000002123) ENSODEG00000002083 PPP1R3E (ENSODEG00000001965) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.b #22 Guinea pig MODERN SPECIES 72 ENSCPOG00000015029 ENSCPOG00000026080 ENSCPOG00000006749 ENSCPOG00000035498 ENSCPOG00000010168 ENSCPOG00000022226 OR4C11 (ENSCPOG00000014721) ENSCPOG00000039911 ENSCPOG00000030047 ENSCPOG00000021816 ENSCPOG00000034616 FCHO1 (ENSCPOG00000010411) #18 B3GNT3 (ENSCPOG00000039336) #19 INSL3 (ENSCPOG00000019362) #20 JAK3 (ENSCPOG00000015116) #21 RPL18A (ENSCPOG00000015205) #22 SLC5A5 (ENSCPOG00000002288) #23 CCDC124 (ENSCPOG00000024560) #24 KCNN1 (ENSCPOG00000021112) #25 ARRDC2 (ENSCPOG00000026098) #26 IL12RB1 (ENSCPOG00000025820) #27 MAST3 (ENSCPOG00000015590) #28 PIK3R2 (ENSCPOG00000024452) #29 Ifi30 (ENSCPOG00000005553) #30 RAB3A (ENSCPOG00000038085) #32 MPV17L2 (ENSCPOG00000039365) #31 PDE4C (ENSCPOG00000030930) ENSCPOG00000035754 #33 JUND (ENSCPOG00000025912) #35 LSM4 (ENSCPOG00000024117) #36 PGPEP1 (ENSCPOG00000031925) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.b #22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 188 GOSR1 (ENSCLAG00000010994) CPD (ENSCLAG00000008233) TMIGD1 (ENSCLAG00000005023) BLMH (ENSCLAG00000004413) SLC6A4 (ENSCLAG00000009083) NSRP1 (ENSCLAG00000005413) EFCAB5 (ENSCLAG00000006698) SSH2 (ENSCLAG00000004951) CORO6 (ENSCLAG00000009309) ANKRD13B (ENSCLAG00000006356) GIT1 (ENSCLAG00000005307) TP53I13 (ENSCLAG00000006219) ABHD15 (ENSCLAG00000006673) ENSCLAG00000006911 TAOK1 (ENSCLAG00000005510) ENSCLAG00000009994 #22 NUFIP2 (ENSCLAG00000007711) CRYBA1 (ENSCLAG00000010128) MYO18A (ENSCLAG00000009674) PIPOX (ENSCLAG00000006253) SEZ6 (ENSCLAG00000007089) PHF12 (ENSCLAG00000005916) DHRS13 (ENSCLAG00000012986) FLOT2 (ENSCLAG00000014550) ERAL1 (ENSCLAG00000004778) FAM222B (ENSCLAG00000007626) TRAF4 (ENSCLAG00000009205) NEK8 (ENSCLAG00000011158) TLCD1 (ENSCLAG00000005415) ENSCLAG00000007694 RAB34 (ENSCLAG00000009672) Tree shrew MODERN SPECIES 9851 RPL18A (ENSTBEG00000010488) #22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 392 PLVAP (ENSPSMG00000025067) CCDC194 (ENSPSMG00000025073) MVB12A (ENSPSMG00000025080) TMEM221 (ENSPSMG00000025084) NXNL1 (ENSPSMG00000025092) SLC27A1 (ENSPSMG00000025104) #12 PGLS (ENSPSMG00000025113) #13 NIBAN3 (ENSPSMG00000025145) #14 COLGALT1 (ENSPSMG00000025160) #15 ENSPSMG00000025267 #16 MAP1S (ENSPSMG00000025300) #17 FCHO1 (ENSPSMG00000025368) #18 B3GNT3 (ENSPSMG00000025381) #19 INSL3 (ENSPSMG00000025384) #20 JAK3 (ENSPSMG00000025390) #21 RPL18A (ENSPSMG00000025399) #22 SLC5A5 (ENSPSMG00000025406) #23 CCDC124 (ENSPSMG00000025412) #24 KCNN1 (ENSPSMG00000025418) #25 ARRDC2 (ENSPSMG00000025428) #26 IL12RB1 (ENSPSMG00000025429) #27 MAST3 (ENSPSMG00000025443) #28 PIK3R2 (ENSPSMG00000025461) #29 IFI30 (ENSPSMG00000025464) #30 MPV17L2 (ENSPSMG00000025466) #31 RAB3A (ENSPSMG00000025469) #32 PDE4C (ENSPSMG00000025493) IQCN (ENSPSMG00000000071) #34 JUND (ENSPSMG00000000089) #35 LSM4 (ENSPSMG00000000120) #36 PGPEP1 (ENSPSMG00000000175) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Mas night monkey MODERN SPECIES 1025 ENSANAG00000018049 GALNT13 (ENSANAG00000034184) ENSANAG00000024363 #22 ENSANAG00000032096 KCNJ3 (ENSANAG00000024065) NR4A2 (ENSANAG00000033869) GPD2 (ENSANAG00000029065) ENSANAG00000024064 GALNT5 (ENSANAG00000031318) ERMN (ENSANAG00000024435) CYTIP (ENSANAG00000021557) ACVR1C (ENSANAG00000020309) ENSANAG00000036181 ACVR1 (ENSANAG00000037191) UPP2 (ENSANAG00000014254) CCDC148 (ENSANAG00000030337) PKP4 (ENSANAG00000030283) ENSANAG00000027356 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Marmoset MODERN SPECIES 21 CD163L1 (ENSCJAG00000005091) ENSCJAG00000052734 DDX11 (ENSCJAG00000005153) ENSCJAG00000054104 ENSCJAG00000065230 ENSCJAG00000081130 ENSCJAG00000005234 ENSCJAG00000072529 CD163 (ENSCJAG00000005332) ENSCJAG00000079699 ENSCJAG00000074967 APOBEC1 (ENSCJAG00000005398) ENSCJAG00000086680 GDF3 (ENSCJAG00000005406) ENSCJAG00000072636 ENSCJAG00000071581 #22 ENSCJAG00000018999 ENSCJAG00000043823 ENSCJAG00000081220 ENSCJAG00000018988 FOXJ2 (ENSCJAG00000018955) C3AR1 (ENSCJAG00000083855) NECAP1 (ENSCJAG00000018934) CLEC4A (ENSCJAG00000018929) CLEC6A (ENSCJAG00000037433) CLEC4D (ENSCJAG00000080376) CLEC4E (ENSCJAG00000018899) AICDA (ENSCJAG00000018856) ENSCJAG00000077911 MFAP5 (ENSCJAG00000018846) RIMKLB (ENSCJAG00000018810) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d #22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000154966.l ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 46 RBM43 (ENSSBOG00000022371) NMI (ENSSBOG00000035067) TNFAIP6 (ENSSBOG00000034644) RIF1 (ENSSBOG00000029530) NEB (ENSSBOG00000031622) ARL5A (ENSSBOG00000034323) CACNB4 (ENSSBOG00000025206) ENSSBOG00000023639 ENSSBOG00000027242 ENSSBOG00000023807 FMNL2 (ENSSBOG00000027176) PRPF40A (ENSSBOG00000015435) ARL6IP6 (ENSSBOG00000029584) RPRM (ENSSBOG00000009917) GALNT13 (ENSSBOG00000024917) ENSSBOG00000030750 #22 KCNJ3 (ENSSBOG00000023474) NR4A2 (ENSSBOG00000021402) ENSSBOG00000027281 ENSSBOG00000023257 GALNT5 (ENSSBOG00000020422) ERMN (ENSSBOG00000031955) ENSSBOG00000028587 CYTIP (ENSSBOG00000025520) ENSSBOG00000035700 ACVR1C (ENSSBOG00000030313) ACVR1 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#22 ENSMFAG00000063614 ENSMFAG00000059642 CARD11 (ENSMFAG00000036800) ENSMFAG00000054681 GNA12 (ENSMFAG00000046194) AMZ1 (ENSMFAG00000045552) BRAT1 (ENSMFAG00000000395) IQCE (ENSMFAG00000034441) ##34 ENSMFAG00000049292 LFNG (ENSMFAG00000039730) GRIFIN (ENSMFAG00000032493) ENSMFAG00000063448 ENSMFAG00000065612 EIF3B (ENSMFAG00000046100) SNX8 (ENSMFAG00000029647) Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 563 TGM4 (ENSMNEG00000043309) TMEM42 (ENSMNEG00000018990) KIF15 (ENSMNEG00000037057) KIAA1143 (ENSMNEG00000042776) ZNF501 (ENSMNEG00000010147) ZNF502 (ENSMNEG00000042158) ENSMNEG00000030508 ZNF35 (ENSMNEG00000032821) ZNF197 (ENSMNEG00000041364) ZKSCAN7 (ENSMNEG00000029823) ZNF852 (ENSMNEG00000036943) ZNF445 (ENSMNEG00000028149) TCAIM (ENSMNEG00000043134) TOPAZ1 (ENSMNEG00000031144) ABHD5 (ENSMNEG00000044413) ENSMNEG00000040974 #22 ANO10 (ENSMNEG00000042929) SNRK (ENSMNEG00000041373) POMGNT2 (ENSMNEG00000007091) GASK1A (ENSMNEG00000009108) KRBOX1 (ENSMNEG00000008513) ZNF662 (ENSMNEG00000028299) ACKR2 (ENSMNEG00000008943) CYP8B1 (ENSMNEG00000039233) HIGD1A (ENSMNEG00000043131) CCDC13 (ENSMNEG00000038681) ENSMNEG00000015697 HHATL (ENSMNEG00000041408) KLHL40 (ENSMNEG00000031823) ZBTB47 (ENSMNEG00000027370) NKTR (ENSMNEG00000041077) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 393 IFI27L2 (ENSMNEG00000032778) ENSMNEG00000029506 IFI27L1 (ENSMNEG00000029364) DDX24 (ENSMNEG00000043984) OTUB2 (ENSMNEG00000041748) CCDC197 (ENSMNEG00000045081) ASB2 (ENSMNEG00000042223) FAM181A (ENSMNEG00000029720) ENSMNEG00000019080 PRIMA1 (ENSMNEG00000031734) ENSMNEG00000044247 UNC79 (ENSMNEG00000030781) ENSMNEG00000029272 BTBD7 (ENSMNEG00000039208) UBR7 (ENSMNEG00000041654) ENSMNEG00000039800 #22 GON7 (ENSMNEG00000021848) LYSET (ENSMNEG00000005190) MOAP1 (ENSMNEG00000020717) ITPK1 (ENSMNEG00000032279) CHGA (ENSMNEG00000043753) GOLGA5 (ENSMNEG00000045156) LGMN (ENSMNEG00000039639) RIN3 (ENSMNEG00000043726) SLC24A4 (ENSMNEG00000042792) CPSF2 (ENSMNEG00000031584) ENSMNEG00000039060 ENSMNEG00000036179 ENSMNEG00000020081 TRIP11 (ENSMNEG00000040765) FBLN5 (ENSMNEG00000036802) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d #22 Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Dog MODERN SPECIES 12 NRADD (ENSCAFG00845010072) SETD2 (ENSCAFG00845009790) KIF9 (ENSCAFG00845009471) KLHL18 (ENSCAFG00845009371) PTPN23 (ENSCAFG00845008987) SCAP (ENSCAFG00845008845) ELP6 (ENSCAFG00845008773) ENSCAFG00845008748 CSPG5 (ENSCAFG00845008635) SMARCC1 (ENSCAFG00845008451) DHX30 (ENSCAFG00845008323) MAP4 (ENSCAFG00845007720) CDC25A (ENSCAFG00845007301) CAMP (ENSCAFG00845007235) NME6 (ENSCAFG00845007158) ENSCAFG00845006949 #22 SPINK8 (ENSCAFG00845006805) FBXW12 (ENSCAFG00845006725) PLXNB1 (ENSCAFG00845006452) CCDC51 (ENSCAFG00845006402) TMA7 (ENSCAFG00845006383) ATRIP (ENSCAFG00845006308) TREX1 (ENSCAFG00845006258) SHISA5 (ENSCAFG00845006188) PFKFB4 (ENSCAFG00845006054) UQCRC1 (ENSCAFG00845030975) TMEM89 (ENSCAFG00845030964) SLC26A6 (ENSCAFG00845030951) CELSR3 (ENSCAFG00845030576) NCKIPSD (ENSCAFG00845030141) IP6K2 (ENSCAFG00845030115) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 leopard MODERN SPECIES 5 ENSPPRG00000003843 SLC7A14 (ENSPPRG00000004129) CLDN11 (ENSPPRG00000004299) SKIL (ENSPPRG00000004486) PRKCI (ENSPPRG00000005041) PHC3 (ENSPPRG00000005562) GPR160 (ENSPPRG00000021415) SEC62 (ENSPPRG00000005909) SAMD7 (ENSPPRG00000006215) LRRC31 (ENSPPRG00000006481) LRRIQ4 (ENSPPRG00000006659) LRRC34 (ENSPPRG00000007013) MYNN (ENSPPRG00000007156) ACTRT3 (ENSPPRG00000007231) MECOM (ENSPPRG00000010185) ENSPPRG00000010474 #22 GOLIM4 (ENSPPRG00000011640) ENSPPRG00000011777 SERPINI1 (ENSPPRG00000012234) PDCD10 (ENSPPRG00000012947) WDR49 (ENSPPRG00000013148) SERPINI2 (ENSPPRG00000013570) ZBBX (ENSPPRG00000014159) ENSPPRG00000014837 BCHE (ENSPPRG00000015130) ENSPPRG00000015437 SLITRK3 (ENSPPRG00000021687) SI (ENSPPRG00000021215) ENSPPRG00000023810 OTOL1 (ENSPPRG00000023542) SPTSSB (ENSPPRG00000021831) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Arabian camel MODERN SPECIES 32 KCNK13 (ENSCDRG00005004223) TDP1 (ENSCDRG00005004174) EFCAB11 (ENSCDRG00005004092) FOXN3 (ENSCDRG00005004025) ENSCDRG00005003999 TTC8 (ENSCDRG00005003829) EML5 (ENSCDRG00005003568) ZC3H14 (ENSCDRG00005003316) PTPN21 (ENSCDRG00005003261) SPATA7 (ENSCDRG00005003225) KCNK10 (ENSCDRG00005003174) GPR65 (ENSCDRG00005003153) GALC (ENSCDRG00005003083) ENSCDRG00005003064 FLRT2 (ENSCDRG00005003058) ENSCDRG00005003051 #22 SEL1L (ENSCDRG00005003025) STON2 (ENSCDRG00005003009) ENSCDRG00005002988 GTF2A1 (ENSCDRG00005002959) TSHR (ENSCDRG00005002889) CEP128 (ENSCDRG00005002818) ENSCDRG00005002804 NRXN3 (ENSCDRG00005002200) ADCK1 (ENSCDRG00005002093) SNW1 (ENSCDRG00005002070) ENSCDRG00005002061 ALKBH1 (ENSCDRG00005002043) SPTLC2 (ENSCDRG00005002026) ENSCDRG00005002017 ENSCDRG00005002010 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Sperm whale MODERN SPECIES 7 CEP126 (ENSPCTG00005008482) ANGPTL5 (ENSPCTG00005008552) TRPC6 (ENSPCTG00005008688) ENSPCTG00005009589 PGR (ENSPCTG00005009652) ARHGAP42 (ENSPCTG00005009957) CNTN5 (ENSPCTG00005010190) JRKL (ENSPCTG00005011023) CCDC82 (ENSPCTG00005011035) MAML2 (ENSPCTG00005011167) MTMR2 (ENSPCTG00005011244) CEP57 (ENSPCTG00005011292) FAM76B (ENSPCTG00005011532) SESN3 (ENSPCTG00005011709) ENSPCTG00005011830 ENSPCTG00005011881 #22 ENDOD1 (ENSPCTG00005011905) ENSPCTG00005011937 ENSPCTG00005012004 ENSPCTG00005012039 CWC15 (ENSPCTG00005012079) AMOTL1 (ENSPCTG00005012114) PIWIL4 (ENSPCTG00005012159) FUT4 (ENSPCTG00005012401) C11orf97 (ENSPCTG00005012423) ANKRD49 (ENSPCTG00005012473) MRE11 (ENSPCTG00005004248) ENSPCTG00005004432 GPR83 (ENSPCTG00005004449) IZUMO1R (ENSPCTG00005004480) PANX1 (ENSPCTG00005004492) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a #22 Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a.a #22 Goat MODERN SPECIES 26 RPS23 (ENSCHIG00000014944) ATG10 (ENSCHIG00000023237) ENSCHIG00000013647 ENSCHIG00000020381 ACOT12 (ENSCHIG00000018595) ZCCHC9 (ENSCHIG00000024514) CKMT2 (ENSCHIG00000018578) RASGRF2 (ENSCHIG00000027194) MSH3 (ENSCHIG00000026585) ENSCHIG00000016160 ANKRD34B (ENSCHIG00000009844) FAM151B (ENSCHIG00000009422) ZFYVE16 (ENSCHIG00000022133) FBLL1 (ENSCHIG00000005751) RARS1 (ENSCHIG00000021126) ENSCHIG00000023409 #22 WWC1 (ENSCHIG00000012879) ENSCHIG00000018606 TENM2 (ENSCHIG00000025474) ENSCHIG00000027115 MAT2B (ENSCHIG00000027101) HMMR (ENSCHIG00000026654) ENSCHIG00000026565 CCNG1 (ENSCHIG00000004699) ENSCHIG00000013606 GABRG2 (ENSCHIG00000022523) GABRA1 (ENSCHIG00000019387) GABRA6 (ENSCHIG00000021600) GABRB2 (ENSCHIG00000024858) ATP10B (ENSCHIG00000024331) ENSCHIG00000027118 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 21 ENSOARG00020021132 TMEM167A (ENSOARG00020021065) RPS23 (ENSOARG00020020958) ENSOARG00020020926 ATG10 (ENSOARG00020020709) SSBP2 (ENSOARG00020017360) ACOT12 (ENSOARG00020017094) ENSOARG00020017025 CKMT2 (ENSOARG00020016978) RASGRF2 (ENSOARG00020016662) MSH3 (ENSOARG00020016326) DHFR (ENSOARG00020016220) ANKRD34B (ENSOARG00020016203) ZFYVE16 (ENSOARG00020015887) FBLL1 (ENSOARG00020015848) ENSOARG00020015828 #22 RARS1 (ENSOARG00020015698) WWC1 (ENSOARG00020015297) TENM2 (ENSOARG00020013483) ENSOARG00020013302 ENSOARG00020013238 ENSOARG00020013170 MAT2B (ENSOARG00020013000) ENSOARG00020012972 HMMR (ENSOARG00020012695) NUDCD2 (ENSOARG00020012608) CCNG1 (ENSOARG00020012387) ENSOARG00020012340 GABRG2 (ENSOARG00020011835) GABRA1 (ENSOARG00020011698) ENSOARG00020011653 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a.b #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 7 C9 (ENSOARG00020008908) DAB2 (ENSOARG00020008646) ENSOARG00020008514 PTGER4 (ENSOARG00020008466) TTC33 (ENSOARG00020008406) PRKAA1 (ENSOARG00020008087) RPL37 (ENSOARG00020007993) ENSOARG00020007543 C6 (ENSOARG00020007044) PLCXD3 (ENSOARG00020006984) OXCT1 (ENSOARG00020006708) ENSOARG00020006604 FBXO4 (ENSOARG00020006423) GHR (ENSOARG00020006196) CCDC152 (ENSOARG00020006118) ENSOARG00020006096 #22 ZNF131 (ENSOARG00020006056) NIM1K (ENSOARG00020006035) HMGCS1 (ENSOARG00020005999) CCL28 (ENSOARG00020005973) TMEM267 (ENSOARG00020005959) C5orf34 (ENSOARG00020005897) ENSOARG00020005767 NNT (ENSOARG00020005629) ENSOARG00020005588 FGF10 (ENSOARG00020005559) MRPS30 (ENSOARG00020005537) HCN1 (ENSOARG00020005457) PARP8 (ENSOARG00020004290) ISL1 (ENSOARG00020004124) PELO (ENSOARG00020004089) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.d.q.b #22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 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MPV17L2 (ENSCDRG00005011813) #31 RAB3A (ENSCDRG00005011718) #32 PDE4C (ENSCDRG00005011492) ENSCDRG00005011454 #33 ENSCDRG00005011380 #34 LSM4 (ENSCDRG00005011254) #36 PGPEP1 (ENSCDRG00005011120) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 #12 ENSGT00550000075110 #13 ENSGT00940000154149.b.b #14 ENSGT01030000234558.D.b #15 ENSGT00940000161905 ENSGT01010000228911 ENSGT00940000154929.B #16 ENSGT00940000160221 #17 ENSGT00940000160489 #18 ENSGT00940000159134 #19 ENSGT00940000163613 #20 ENSGT00940000161827 #21 ENSGT00390000015797.d.q.b #22 ENSGT00940000159489 #23 ENSGT00390000012482 #24 ENSGT00950000182904.a.b.b #25 ENSGT00940000159994 #26 ENSGT00390000012431 #27 ENSGT00940000157166 #28 ENSGT00940000157050 #29 ENSGT00390000010450 #30 ENSGT00940000160620 #31 ENSGT00940000158959.b #32 ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 #33 ENSGT00940000156018.A #34 ENSGT00940000162806 #35 ENSGT00940000166941 Blue whale MODERN SPECIES 14 ENSBMSG00010005594 ENSBMSG00010005583 MVB12A (ENSBMSG00010005572) TMEM221 (ENSBMSG00010005560) NXNL1 (ENSBMSG00010005552) SLC27A1 (ENSBMSG00010005539) #12 PGLS (ENSBMSG00010005528) #13 NIBAN3 (ENSBMSG00010005465) #14 COLGALT1 (ENSBMSG00010005433) #15 UNC13A (ENSBMSG00010005106) ENSBMSG00010005014 MAP1S (ENSBMSG00010004999) #17 FCHO1 (ENSBMSG00010004963) #18 INSL3 (ENSBMSG00010004940) #20 JAK3 (ENSBMSG00010004926) #21 ENSBMSG00010004907 #22 SLC5A5 (ENSBMSG00010004894) #23 CCDC124 (ENSBMSG00010004886) #24 KCNN1 (ENSBMSG00010004877) #25 ARRDC2 (ENSBMSG00010004858) #26 IL12RB1 (ENSBMSG00010004817) #27 MAST3 (ENSBMSG00010004789) #28 PIK3R2 (ENSBMSG00010004761) #29 ENSBMSG00010004729 #30 MPV17L2 (ENSBMSG00010004722) #31 RAB3A (ENSBMSG00010004711) #32 PDE4C (ENSBMSG00010004659) ENSBMSG00010004630 #33 ENSBMSG00010004618 #34 JUND (ENSBMSG00010004609) #35 LSM4 (ENSBMSG00010004583) #36 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Sperm whale MODERN SPECIES 59 FCHO1 (ENSPCTG00005021780) #18 INSL3 (ENSPCTG00005021747) #20 JAK3 (ENSPCTG00005021717) #21 RPL18A (ENSPCTG00005021691) #22 SLC5A5 (ENSPCTG00005021637) #23 CCDC124 (ENSPCTG00005021626) #24 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Yarkand deer MODERN SPECIES 32 ENSCHYG00000000725 MVB12A (ENSCHYG00000000695) TMEM221 (ENSCHYG00000000674) NXNL1 (ENSCHYG00000000658) SLC27A1 (ENSCHYG00000000634) #12 PGLS (ENSCHYG00000000614) #13 NIBAN3 (ENSCHYG00000000590) #14 COLGALT1 (ENSCHYG00000000524) #15 ENSCHYG00000000495 ##16 ENSCHYG00000000484 MAP1S (ENSCHYG00000000458) #17 FCHO1 (ENSCHYG00000000370) #18 B3GNT3 (ENSCHYG00000000342) #19 INSL3 (ENSCHYG00000022136) #20 JAK3 (ENSCHYG00000022013) #21 ENSCHYG00000021883 #22 SLC5A5 (ENSCHYG00000021720) #23 CCDC124 (ENSCHYG00000021668) #24 KCNN1 (ENSCHYG00000021533) #25 ARRDC2 (ENSCHYG00000021311) #26 IL12RB1 (ENSCHYG00000021152) #27 MAST3 (ENSCHYG00000020312) #28 PIK3R2 (ENSCHYG00000020125) #29 IFI30 (ENSCHYG00000019975) #30 MPV17L2 (ENSCHYG00000019897) #31 RAB3A (ENSCHYG00000019752) #32 PDE4C (ENSCHYG00000019445) ENSCHYG00000019351 #33 JUND (ENSCHYG00000019284) #35 LSM4 (ENSCHYG00000019053) #36 PGPEP1 (ENSCHYG00000018924) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b #22 Goat MODERN SPECIES 26 ENSCHIG00000015033 ENSCHIG00000015462 MVB12A (ENSCHIG00000015199) TMEM221 (ENSCHIG00000016338) NXNL1 (ENSCHIG00000027093) SLC27A1 (ENSCHIG00000027144) #12 PGLS (ENSCHIG00000024638) #13 NIBAN3 (ENSCHIG00000023840) #14 COLGALT1 (ENSCHIG00000020013) #15 UNC13A (ENSCHIG00000010742) MAP1S (ENSCHIG00000019831) #17 FCHO1 (ENSCHIG00000018069) #18 B3GNT3 (ENSCHIG00000025864) #19 INSL3 (ENSCHIG00000020939) #20 JAK3 (ENSCHIG00000009142) #21 ENSCHIG00000025646 #22 SLC5A5 (ENSCHIG00000020647) #23 CCDC124 (ENSCHIG00000018622) #24 KCNN1 (ENSCHIG00000014377) 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Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Sperm whale MODERN SPECIES 763 ENSPCTG00005015873 #22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000017462 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a ENSGT00390000005254.i.a.a.b ENSGT00940000162106 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000161231.g ENSGT00940000156814 ENSGT00940000158747 ENSGT00390000009130.a.a.b.a ENSGT00390000011383 ENSGT00390000014416 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000010075 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000015797.d.r #22 ENSGT00940000154668 ENSGT00940000160020 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000003050 ENSGT00500000044987 ENSGT00940000153432.B ENSGT00390000004624.a.a ENSGT00940000158907 ENSGT00390000001442 ENSGT00940000158207 ENSGT00940000158944 ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00390000016326 Goat MODERN SPECIES 12 TTC33 (ENSCHIG00000020642) PRKAA1 (ENSCHIG00000017495) RPL37 (ENSCHIG00000014444) CARD6 (ENSCHIG00000020994) C7 (ENSCHIG00000016536) ENSCHIG00000012521 ENSCHIG00000002172 C6 (ENSCHIG00000021210) PLCXD3 (ENSCHIG00000016815) ENSCHIG00000012124 RIMOC1 (ENSCHIG00000000538) FBXO4 (ENSCHIG00000021750) GHR (ENSCHIG00000018928) CCDC152 (ENSCHIG00000011450) ENSCHIG00000006291 ENSCHIG00000023711 #22 ENSCHIG00000020006 NIM1K (ENSCHIG00000017425) HMGCS1 (ENSCHIG00000015096) CCL28 (ENSCHIG00000012602) TMEM267 (ENSCHIG00000007411) ENSCHIG00000008597 PAIP1 (ENSCHIG00000011111) NNT (ENSCHIG00000021958) FGF10 (ENSCHIG00000012683) MRPS30 (ENSCHIG00000018591) HCN1 (ENSCHIG00000024729) ENSCHIG00000009285 ENSCHIG00000017939 EMB (ENSCHIG00000012020) PARP8 (ENSCHIG00000017274) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 American bison MODERN SPECIES 2747 GHR (ENSBBBG00000014212) CCDC152 (ENSBBBG00000014253) ENSBBBG00000014273 ENSBBBG00000014278 #22 ENSBBBG00000003244 ZNF131 (ENSBBBG00000003267) NIM1K (ENSBBBG00000001415) HMGCS1 (ENSBBBG00000014374) CCL28 (ENSBBBG00000014385) TMEM267 (ENSBBBG00000003302) C5orf34 (ENSBBBG00000003312) ENSBBBG00000003349 NNT (ENSBBBG00000014553) Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.a #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.a #22 Cow MODERN SPECIES 1 SYNDIG1L (ENSBTAG00000052950) VRTN (ENSBTAG00000005774) ABCD4 (ENSBTAG00000014633) VSX2 (ENSBTAG00000014632) LIN52 (ENSBTAG00000030557) ALDH6A1 (ENSBTAG00000018469) ENSBTAG00000053938 BBOF1 (ENSBTAG00000018467) ENTPD5 (ENSBTAG00000020334) COQ6 (ENSBTAG00000020331) FAM161B (ENSBTAG00000020329) ZNF410 (ENSBTAG00000020327) PTGR2 (ENSBTAG00000003747) MIDEAS (ENSBTAG00000009272) PNMA1 (ENSBTAG00000009271) ENSBTAG00000009783 #22 DNAL1 (ENSBTAG00000015930) ENSBTAG00000010270 ENSBTAG00000009788 ACOT4 (ENSBTAG00000002843) ACOT2 (ENSBTAG00000046814) RIOX1 (ENSBTAG00000025372) HEATR4 (ENSBTAG00000002842) NUMB (ENSBTAG00000011683) PAPLN 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ENSGT00940000156213 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000156761 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144.j ENSGT00940000162094 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00390000015797.d.r.b.b #22 ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000006264.c ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045.k.b ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000157554 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000156761 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144.j ENSGT00940000162094 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00920000150755 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00390000015797.d.r.b.b #22 ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000006264.c ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045.k.b ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000157554 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 PTPRU (ENSBIXG00005001071) MECR (ENSBIXG00005007751) SRSF4 (ENSBIXG00005011082) TMEM200B (ENSBIXG00005007469) EPB41 (ENSBIXG00005010985) OPRD1 (ENSBIXG00005010747) YTHDF2 (ENSBIXG00005000620) GMEB1 (ENSBIXG00005010684) TAF12 (ENSBIXG00005000915) RAB42 (ENSBIXG00005000908) ENSBIXG00005010590 TRNAU1AP (ENSBIXG00005000707) RCC1 (ENSBIXG00005010509) PHACTR4 (ENSBIXG00005000752) ENSBIXG00005010390 ENSBIXG00005010380 #22 MED18 (ENSBIXG00005010361) SESN2 (ENSBIXG00005000853) ATP5IF1 (ENSBIXG00005000831) DNAJC8 (ENSBIXG00005010254) ENSBIXG00005010236 PTAFR (ENSBIXG00005000806) EYA3 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ENSGT00940000159551 ENSGT00390000010376 ENSGT00940000158100 ENSGT00390000003967 ENSGT00940000162640 ENSGT00390000015797.d.r #22 ENSGT00390000014780 ENSGT00420000029802 ENSGT00410000025918 ENSGT00940000156157 ENSGT00950000182992.a.b.a.b ENSGT00440000033849 ENSGT00390000007057 ENSGT00940000155132 ENSGT00390000016108 ENSGT00390000006922.m.b.a.d ENSGT00950000182985.a.a ENSGT00940000161683 ENSGT00940000157624 ENSGT00940000153635.B ENSGT00940000157441 Pig MODERN SPECIES EIF2AK4 (ENSSSCG00000039061) SRP14 (ENSSSCG00000004785) BMF (ENSSSCG00000035284) BUB1B (ENSSSCG00000004782) PAK6 (ENSSSCG00000004781) ANKRD63 (ENSSSCG00000053436) PLCB2 (ENSSSCG00000004779) INAFM2 (ENSSSCG00000063043) CCDC9B (ENSSSCG00000023975) ENSSSCG00000059961 DISP2 (ENSSSCG00000004776) KNSTRN (ENSSSCG00000053306) IVD (ENSSSCG00000004774) BAHD1 (ENSSSCG00000004772) CHST14 (ENSSSCG00000004771) ENSSSCG00000004770 #22 CCDC32 (ENSSSCG00000038033) RPUSD2 (ENSSSCG00000036700) ENSSSCG00000042522 RAD51 (ENSSSCG00000004766) RMDN3 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Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Megabat MODERN SPECIES 2289 NXNL1 (ENSPVAG00000017359) SLC27A1 (ENSPVAG00000017360) #12 PGLS (ENSPVAG00000017363) #13 NIBAN3 (ENSPVAG00000017365) #14 COLGALT1 (ENSPVAG00000017366) #15 UNC13A (ENSPVAG00000017369) MAP1S (ENSPVAG00000017372) #17 FCHO1 (ENSPVAG00000017373) #18 B3GNT3 (ENSPVAG00000017375) #19 ENSPVAG00000024188 JAK3 (ENSPVAG00000017376) #21 RPL18A (ENSPVAG00000017378) #22 SLC5A5 (ENSPVAG00000017380) #23 CCDC124 (ENSPVAG00000017381) #24 KCNN1 (ENSPVAG00000017382) #25 Equus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Horse MODERN SPECIES 13 PLVAP (ENSECAG00000022390) CCDC194 (ENSECAG00000042865) BST2 (ENSECAG00000003563) MVB12A (ENSECAG00000010140) TMEM221 (ENSECAG00000030646) SLC27A1 (ENSECAG00000016039) #12 PGLS (ENSECAG00000010333) #13 NIBAN3 (ENSECAG00000014855) #14 COLGALT1 (ENSECAG00000055037) #15 UNC13A (ENSECAG00000040200) MAP1S 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IFI30 (ENSVVUG00000008281) #30 MPV17L2 (ENSVVUG00000008270) #31 RAB3A (ENSVVUG00000008188) #32 PDE4C (ENSVVUG00000008178) ENSVVUG00000008151 #34 LSM4 (ENSVVUG00000008136) #36 PGPEP1 (ENSVVUG00000008129) GDF15 (ENSVVUG00000008127) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 401 SMARCC1 (ENSCAFG00020020203) DHX30 (ENSCAFG00020020245) ENSCAFG00020020277 CDC25A (ENSCAFG00020020316) CAMP (ENSCAFG00020020390) ENSCAFG00020020391 ENSCAFG00020020393 #22 FBXW12 (ENSCAFG00020020394) CCDC51 (ENSCAFG00020020574) ENSCAFG00020020576 ATRIP (ENSCAFG00020020578) TREX1 (ENSCAFG00020020594) SHISA5 (ENSCAFG00020020603) PFKFB4 (ENSCAFG00020020611) UCN2 (ENSCAFG00020020632) UQCRC1 (ENSCAFG00020020695) TMEM89 (ENSCAFG00020020702) SLC26A6 (ENSCAFG00020020707) CELSR3 (ENSCAFG00020020726) NCKIPSD (ENSCAFG00020020775) IP6K2 (ENSCAFG00020020778) ENSCAFG00020020785 Dingo MODERN SPECIES 112 GTPBP3 (ENSCAFG00020010423) PLVAP (ENSCAFG00020010429) ENSCAFG00020010435 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ENSAMEG00000030555 #22 Giant Panda MODERN SPECIES 1274 ENSAMEG00000030896 #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r #22 American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 423 ENSNVIG00000004243 #22 ADAM28 (ENSNVIG00000004255) ADAMDEC1 (ENSNVIG00000004297) ADAM7 (ENSNVIG00000004347) American mink MODERN SPECIES 58 CCDC194 (ENSNVIG00000016047) ENSNVIG00000016053 MVB12A (ENSNVIG00000016065) TMEM221 (ENSNVIG00000016097) NXNL1 (ENSNVIG00000016110) SLC27A1 (ENSNVIG00000016132) #12 PGLS (ENSNVIG00000016149) #13 NIBAN3 (ENSNVIG00000016160) #14 COLGALT1 (ENSNVIG00000016232) #15 ENSNVIG00000016256 UNC13A (ENSNVIG00000016276) MAP1S (ENSNVIG00000016851) #17 FCHO1 (ENSNVIG00000016881) #18 INSL3 (ENSNVIG00000017040) #20 JAK3 (ENSNVIG00000017079) #21 ENSNVIG00000017221 #22 SLC5A5 (ENSNVIG00000017292) #23 CC124 (ENSNVIG00000017314) #24 KCNN1 (ENSNVIG00000017325) #25 ARRDC2 (ENSNVIG00000017355) #26 IL12RB1 (ENSNVIG00000017388) #27 MAST3 (ENSNVIG00000017439) #28 PIK3R2 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RSPO2 (ENSFCAG00000005782) EIF3E (ENSFCAG00000003665) EMC2 (ENSFCAG00000025332) TMEM74 (ENSFCAG00000022184) TRHR (ENSFCAG00000010358) NUDCD1 (ENSFCAG00000008501) ENY2 (ENSFCAG00000030489) PKHD1L1 (ENSFCAG00000023829) EBAG9 (ENSFCAG00000025490) SYBU (ENSFCAG00000031166) KCNV1 (ENSFCAG00000024822) CSMD3 (ENSFCAG00000031602) TRPS1 (ENSFCAG00000013890) Cat MODERN SPECIES 239 MCOLN3 (ENSFCAG00000011196) MCOLN2 (ENSFCAG00000011193) LPAR3 (ENSFCAG00000008799) SSX2IP (ENSFCAG00000023838) CTBS (ENSFCAG00000046319) SPATA1 (ENSFCAG00000022598) GNG5 (ENSFCAG00000038836) RPF1 (ENSFCAG00000025546) DNASE2B (ENSFCAG00000008789) UOX (ENSFCAG00000024210) ENSFCAG00000050042 SAMD13 (ENSFCAG00000045569) ENSFCAG00000049478 PRKACB (ENSFCAG00000027890) TTLL7 (ENSFCAG00000012519) ENSFCAG00000033151 #22 ADGRL2 (ENSFCAG00000025759) ADGRL4 (ENSFCAG00000031487) IFI44 (ENSFCAG00000022349) IFI44L (ENSFCAG00000013210) PTGFR (ENSFCAG00000004947) GIPC2 (ENSFCAG00000033966) DNAJB4 (ENSFCAG00000026143) FUBP1 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