Theria DUPLICATION Theria DUPLICATION Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b #22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 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ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Eurasian red squirrel MODERN SPECIES 7 PLVAP (ENSSVLG00005024254) CCDC194 (ENSSVLG00005024294) MVB12A (ENSSVLG00005024325) TMEM221 (ENSSVLG00005024354) NXNL1 (ENSSVLG00005024380) SLC27A1 (ENSSVLG00005024395) PGLS (ENSSVLG00005024422) NIBAN3 (ENSSVLG00005024462) COLGALT1 (ENSSVLG00005024596) 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chinchilla MODERN SPECIES 231 ENSCLAG00000008768 ENSCLAG00000010339 FCHO1 (ENSCLAG00000008754) B3GNT3 (ENSCLAG00000007898) ENSCLAG00000007832 JAK3 (ENSCLAG00000012380) RPL18A (ENSCLAG00000010952) #22 ENSCLAG00000007225 CCDC124 (ENSCLAG00000007029) KCNN1 (ENSCLAG00000006176) ARRDC2 (ENSCLAG00000005752) MAST3 (ENSCLAG00000012903) PIK3R2 (ENSCLAG00000014107) IFI30 (ENSCLAG00000016108) MPV17L2 (ENSCLAG00000015953) RAB3A (ENSCLAG00000015642) PDE4C (ENSCLAG00000016330) LSM4 (ENSCLAG00000010828) PGPEP1 (ENSCLAG00000010542) GDF15 (ENSCLAG00000010045) ENSCLAG00000009618 SSBP4 (ENSCLAG00000013009) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES 37 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 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Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 36 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000161827 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000160221 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Golden Hamster MODERN SPECIES 790 Tmem114 (ENSMAUG00000004886) Mettl22 (ENSMAUG00000005394) Abat (ENSMAUG00000006912) Pmm2 (ENSMAUG00000008157) Carhsp1 (ENSMAUG00000008339) Litafd (ENSMAUG00000008595) ENSMAUG00000008233 ENSMAUG00000008889 #22 Hapstr1 (ENSMAUG00000009053) Grin2a (ENSMAUG00000009472) Rpl39l 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ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A Northern American deer mouse MODERN SPECIES 8 Ccdc194 (ENSPEMG00000010170) Bst2 (ENSPEMG00000011254) Mvb12a (ENSPEMG00000011177) Tmem221 (ENSPEMG00000010509) Nxnl1 (ENSPEMG00000008351) Pgls (ENSPEMG00000013774) Niban3 (ENSPEMG00000009042) Colgalt1 (ENSPEMG00000010115) ENSPEMG00000027274 Unc13a (ENSPEMG00000012160) Jak3 (ENSPEMG00000010889) ENSPEMG00000014585 B3gnt3 (ENSPEMG00000013579) Fcho1 (ENSPEMG00000014923) Map1s (ENSPEMG00000029387) ENSPEMG00000014060 #22 Slc5a5 (ENSPEMG00000009527) Ccdc124 (ENSPEMG00000018475) ENSPEMG00000025541 Kcnn1 (ENSPEMG00000011392) ENSPEMG00000005917 Il12rb1 (ENSPEMG00000004871) ENSPEMG00000018323 ENSPEMG00000029300 Pik3r2 (ENSPEMG00000013483) Ifi30 (ENSPEMG00000016976) Rab3a (ENSPEMG00000021028) ENSPEMG00000008172 ENSPEMG00000010765 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Rhinopithecus DUPLICATION Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000164830 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b.c.a #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a ENSGT00940000161872 Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 975 CCDC194 (ENSRROG00000037197) BST2 (ENSRROG00000041878) MVB12A (ENSRROG00000031814) TMEM221 (ENSRROG00000029901) NXNL1 (ENSRROG00000035527) SLC27A1 (ENSRROG00000034378) PGLS (ENSRROG00000037348) NIBAN3 (ENSRROG00000030135) COLGALT1 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squirrel monkey MODERN SPECIES 97 ZNF326 (ENSSBOG00000034170) ENSSBOG00000025634 BARHL2 (ENSSBOG00000022168) ZNF644 (ENSSBOG00000025807) HFM1 (ENSSBOG00000027456) CDC7 (ENSSBOG00000026796) TGFBR3 (ENSSBOG00000034519) ENSSBOG00000032704 ENSSBOG00000026362 BRDT (ENSSBOG00000020614) EPHX4 (ENSSBOG00000029335) ENSSBOG00000033324 BTBD8 (ENSSBOG00000033979) C1orf146 (ENSSBOG00000017637) ENSSBOG00000024802 #22 GLMN (ENSSBOG00000011268) RPAP2 (ENSSBOG00000028835) GFI1 (ENSSBOG00000031300) EVI5 (ENSSBOG00000021898) DIPK1A (ENSSBOG00000020486) MTF2 (ENSSBOG00000021350) TMED5 (ENSSBOG00000034141) CCDC18 (ENSSBOG00000025896) DR1 (ENSSBOG00000021041) FNBP1L (ENSSBOG00000026856) BCAR3 (ENSSBOG00000020011) DNTTIP2 (ENSSBOG00000030305) GCLM (ENSSBOG00000025418) ENSSBOG00000019384 ABCA4 (ENSSBOG00000016235) Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 199 PLVAP (ENSSBOG00000025435) CCDC194 (ENSSBOG00000004159) BST2 (ENSSBOG00000027062) MVB12A (ENSSBOG00000030053) TMEM221 (ENSSBOG00000020623) SLC27A1 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013782.a ENSGT00390000013782.b ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994.a.a ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000013782.a ENSGT00390000013782.b ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 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ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 21 Bst-2B (ENSOARG00020010913) ENSOARG00020010745 MVB12A (ENSOARG00020010659) TMEM221 (ENSOARG00020010608) NXNL1 (ENSOARG00020010546) SLC27A1 (ENSOARG00020010283) PGLS (ENSOARG00020010182) NIBAN3 (ENSOARG00020009944) COLGALT1 (ENSOARG00020009873) UNC13A (ENSOARG00020006998) MAP1S (ENSOARG00020006765) FCHO1 (ENSOARG00020006416) B3GNT3 (ENSOARG00020006386) INSL3 (ENSOARG00020006354) JAK3 (ENSOARG00020006264) RPL18A (ENSOARG00020006201) #22 SLC5A5 (ENSOARG00020006146) CCDC124 (ENSOARG00020006131) KCNN1 (ENSOARG00020006098) ARRDC2 (ENSOARG00020006027) IL12RB1 (ENSOARG00020005715) MAST3 (ENSOARG00020005583) PIK3R2 (ENSOARG00020005480) IFI30 (ENSOARG00020005418) MPV17L2 (ENSOARG00020005392) RAB3A (ENSOARG00020005307) PDE4C (ENSOARG00020004959) ENSOARG00020004884 JUND (ENSOARG00020004870) LSM4 (ENSOARG00020004808) PGPEP1 (ENSOARG00020004669) Bovinae ANCESTRAL SPECIES 34 ENSGT00390000013782.a 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Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b #22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b #22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b #22 leopard MODERN SPECIES 18 KCNIP1 (ENSPPRG00000024956) LCP2 (ENSPPRG00000024344) C5orf58 (ENSPPRG00000024140) FOXI1 (ENSPPRG00000024120) INSYN2B (ENSPPRG00000024086) DOCK2 (ENSPPRG00000002292) SPDL1 (ENSPPRG00000003639) SLIT3 (ENSPPRG00000008973) PANK3 (ENSPPRG00000009464) FBLL1 (ENSPPRG00000020963) RARS1 (ENSPPRG00000009833) WWC1 (ENSPPRG00000021000) ENSPPRG00000022087 TENM2 (ENSPPRG00000023112) ENSPPRG00000000296 ENSPPRG00000000591 #22 MAT2B (ENSPPRG00000001422) HMMR (ENSPPRG00000003396) NUDCD2 (ENSPPRG00000003513) CCNG1 (ENSPPRG00000004940) ENSPPRG00000021299 GABRG2 (ENSPPRG00000009334) GABRA1 (ENSPPRG00000010417) GABRA6 (ENSPPRG00000010740) GABRB2 (ENSPPRG00000014982) Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.b #22 Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 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RNF19A (ENSUMAG00000017523) ENSUMAG00000017512 POLR2K (ENSUMAG00000017508) FBXO43 (ENSUMAG00000017505) ENSUMAG00000017503 RGS22 (ENSUMAG00000017490) COX6C (ENSUMAG00000017482) ENSUMAG00000017478 ENSUMAG00000017470 VPS13B (ENSUMAG00000017073) OSR2 (ENSUMAG00000016994) STK3 (ENSUMAG00000016985) KCNS2 (ENSUMAG00000016978) NIPAL2 (ENSUMAG00000016967) POP1 (ENSUMAG00000016952) Giant Panda MODERN SPECIES 1265 ENSAMEG00000025738 #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Greater horseshoe bat MODERN SPECIES 9 CCDC194 (ENSRFEG00010016797) ENSRFEG00010016869 MVB12A (ENSRFEG00010016936) TMEM221 (ENSRFEG00010017033) NXNL1 (ENSRFEG00010017098) SLC27A1 (ENSRFEG00010017146) PGLS (ENSRFEG00010017226) NIBAN3 (ENSRFEG00010017286) COLGALT1 (ENSRFEG00010017748) UNC13A (ENSRFEG00010017824) MAP1S (ENSRFEG00010018025) FCHO1 (ENSRFEG00010018082) B3GNT3 (ENSRFEG00010018164) INSL3 (ENSRFEG00010018191) JAK3 (ENSRFEG00010018227) RPL18A (ENSRFEG00010018283) #22 SLC5A5 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ENSPCIG00000004966 ENSPCIG00000004749 ENSPCIG00000004770 ENSPCIG00000037479 ENSPCIG00000004795 RMI2 (ENSPCIG00000034250) ENSPCIG00000004831 ENSPCIG00000004862 ENSPCIG00000010462 #22 CLEC16A (ENSPCIG00000010455) ENSPCIG00000034176 CIITA (ENSPCIG00000005524) TVP23A (ENSPCIG00000006216) ENSPCIG00000006218 NUBP1 (ENSPCIG00000006220) TEKT5 (ENSPCIG00000006223) EMP2 (ENSPCIG00000006225) ENSPCIG00000016616 ENSPCIG00000023232 GRIN2A (ENSPCIG00000023234) Theria ANCESTRAL SPECIES 31 ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000164119 ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 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ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 64 KDM1B (ENSSBOG00000031163) TPMT (ENSSBOG00000031874) NHLRC1 (ENSSBOG00000005358) KIF13A (ENSSBOG00000028035) NUP153 (ENSSBOG00000024532) FAM8A1 (ENSSBOG00000027114) CAP2 (ENSSBOG00000034008) RBM24 (ENSSBOG00000030002) ENSSBOG00000026237 STMND1 (ENSSBOG00000027713) ENSSBOG00000017381 GMPR (ENSSBOG00000022943) MYLIP (ENSSBOG00000021159) DTNBP1 (ENSSBOG00000027094) JARID2 (ENSSBOG00000021029) ENSSBOG00000028490 ##22 ENSSBOG00000035633 CD83 (ENSSBOG00000022214) RNF182 (ENSSBOG00000019678) ENSSBOG00000032159 RANBP9 (ENSSBOG00000029468) NOL7 (ENSSBOG00000020450) SIRT5 (ENSSBOG00000022870) GFOD1 (ENSSBOG00000026414) TBC1D7 (ENSSBOG00000025824) PHACTR1 (ENSSBOG00000019197) EDN1 (ENSSBOG00000021292) HIVEP1 (ENSSBOG00000017977) ENSSBOG00000015128 ENSSBOG00000031592 TMEM170B (ENSSBOG00000033304) Catarrhini ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000154488.B ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 29 ENSGT00530000063872.A ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00940000162921 ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e.a.b ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00390000009405.b.c.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT00940000167437 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 Hominidae ANCESTRAL SPECIES 8 ENSGT00940000155935 ENSGT00940000158229 ENSGT00530000063872.A ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a 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(ENSPPYG00000020845) CCNQ (ENSPPYG00000020846) DUSP9 (ENSPPYG00000020847) ENSPPYG00000031169 ##22 ENSPPYG00000020848 SLC6A8 (ENSPPYG00000037616) BCAP31 (ENSPPYG00000020850) ABCD1 (ENSPPYG00000020852) SRPK3 (ENSPPYG00000020854) IDH3G (ENSPPYG00000020855) SSR4 (ENSPPYG00000020856) PDZD4 (ENSPPYG00000020857) ENSPPYG00000031511 L1CAM (ENSPPYG00000020858) ENSPPYG00000020859 ARHGAP4 (ENSPPYG00000020860) NAA10 (ENSPPYG00000020861) RENBP (ENSPPYG00000020862) HCFC1 (ENSPPYG00000020863) Gibbon MODERN SPECIES 449 ENSNLEG00000033117 CETN2 (ENSNLEG00000033913) NSDHL (ENSNLEG00000013866) ZNF185 (ENSNLEG00000013907) PNMA3 (ENSNLEG00000018300) ENSNLEG00000014065 ENSNLEG00000031614 ENSNLEG00000027745 ZFP92 (ENSNLEG00000013228) ENSNLEG00000013237 ENSNLEG00000031253 BGN (ENSNLEG00000013250) ATP2B3 (ENSNLEG00000032741) CCNQ (ENSNLEG00000013298) DUSP9 (ENSNLEG00000013321) ENSNLEG00000027939 ##22 PNCK (ENSNLEG00000013336) BCAP31 (ENSNLEG00000013380) ABCD1 (ENSNLEG00000013458) PLXNB3 (ENSNLEG00000013475) ENSNLEG00000013518 IDH3G (ENSNLEG00000013540) SSR4 (ENSNLEG00000013602) PDZD4 (ENSNLEG00000013626) ENSNLEG00000034251 L1CAM (ENSNLEG00000013647) ENSNLEG00000031864 AVPR2 (ENSNLEG00000013671) ARHGAP4 (ENSNLEG00000013678) NAA10 (ENSNLEG00000013724) ENSNLEG00000013753 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 19 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000154488.B ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES 195 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00940000154488.B ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 661 PNMA6F (ENSRBIG00000030196) ENSRBIG00000041318 PNMA6E (ENSRBIG00000025010) ZFP92 (ENSRBIG00000027712) HAUS7 (ENSRBIG00000038209) BGN (ENSRBIG00000043894) ATP2B3 (ENSRBIG00000030237) CCNQ (ENSRBIG00000034283) DUSP9 (ENSRBIG00000031725) ENSRBIG00000028856 ##22 PNCK (ENSRBIG00000039714) SLC6A8 (ENSRBIG00000040899) BCAP31 (ENSRBIG00000043421) ABCD1 (ENSRBIG00000044662) PLXNB3 (ENSRBIG00000026773) IDH3G (ENSRBIG00000035445) SSR4 (ENSRBIG00000015579) PDZD4 (ENSRBIG00000029436) L1CAM (ENSRBIG00000036638) ENSRBIG00000032383 ENSRBIG00000034619 ARHGAP4 (ENSRBIG00000031629) NAA10 (ENSRBIG00000040703) RENBP (ENSRBIG00000020101) HCFC1 (ENSRBIG00000038921) Golden snub-nosed monkey MODERN SPECIES 977 ENSRROG00000033043 ENSRROG00000028871 ZFP92 (ENSRROG00000031212) HAUS7 (ENSRROG00000005507) BGN (ENSRROG00000042294) ATP2B3 (ENSRROG00000043666) CCNQ (ENSRROG00000038429) DUSP9 (ENSRROG00000037162) ENSRROG00000039351 ##22 PNCK (ENSRROG00000044383) SLC6A8 (ENSRROG00000045113) BCAP31 (ENSRROG00000045725) ABCD1 (ENSRROG00000037289) PLXNB3 (ENSRROG00000039660) SRPK3 (ENSRROG00000011319) IDH3G (ENSRROG00000044366) SSR4 (ENSRROG00000035638) PDZD4 (ENSRROG00000042678) L1CAM (ENSRROG00000041494) AVPR2 (ENSRROG00000036522) ARHGAP4 (ENSRROG00000045508) NAA10 (ENSRROG00000041881) RENBP (ENSRROG00000034139) HCFC1 (ENSRROG00000004412) Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000154488.B ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000164248 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a DUPLICATION Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.c.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.c.a ##22 Olive baboon MODERN SPECIES 792 ENSPANG00000048545 PTCHD1 (ENSPANG00000050101) DDX53 (ENSPANG00000037837) ENSPANG00000035706 ENSPANG00000045931 ENSPANG00000037872 CBLL2 (ENSPANG00000046007) ENSPANG00000037098 PHEX (ENSPANG00000010105) SMS (ENSPANG00000003155) MBTPS2 (ENSPANG00000024280) ENSPANG00000050152 SMPX (ENSPANG00000005741) KLHL34 (ENSPANG00000012353) CNKSR2 (ENSPANG00000011941) ENSPANG00000029508 ##22 ENSPANG00000006351 RPS6KA3 (ENSPANG00000016330) EIF1AX (ENSPANG00000030224) MAP7D2 (ENSPANG00000019661) BCLAF3 (ENSPANG00000004509) SH3KBP1 (ENSPANG00000006736) MAP3K15 (ENSPANG00000007384) ENSPANG00000035301 ADGRG2 (ENSPANG00000004239) PHKA2 (ENSPANG00000016122) ENSPANG00000029606 PPEF1 (ENSPANG00000010228) ENSPANG00000035243 CDKL5 (ENSPANG00000004460) ENSPANG00000041187 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.c.a ##22 Sooty mangabey MODERN SPECIES 227 LIN28A (ENSCATG00000020825) DHDDS (ENSCATG00000021205) HMGN2 (ENSCATG00000044642) RPS6KA1 (ENSCATG00000032529) ARID1A (ENSCATG00000035561) PIGV (ENSCATG00000016281) ZDHHC18 (ENSCATG00000044376) SFN (ENSCATG00000006825) GPN2 (ENSCATG00000033688) GPATCH3 (ENSCATG00000033598) NR0B2 (ENSCATG00000044469) KDF1 (ENSCATG00000015571) TRNP1 (ENSCATG00000004345) TENT5B (ENSCATG00000017109) SLC9A1 (ENSCATG00000033651) ENSCATG00000033551 ##22 WDTC1 (ENSCATG00000044454) TMEM222 (ENSCATG00000044475) SYTL1 (ENSCATG00000044339) MAP3K6 (ENSCATG00000025890) FCN3 (ENSCATG00000020495) CD164L2 (ENSCATG00000044159) GPR3 (ENSCATG00000006977) WASF2 (ENSCATG00000027046) AHDC1 (ENSCATG00000004004) FGR (ENSCATG00000044439) IFI6 (ENSCATG00000016831) ENSCATG00000033546 FAM76A (ENSCATG00000033886) STX12 (ENSCATG00000032583) PPP1R8 (ENSCATG00000032635) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 51 ENSGT00530000063872.A ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000012715.a ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 141 ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Drill MODERN SPECIES 1411 PNMA6F (ENSMLEG00000035105) ENSMLEG00000040255 PNMA6E (ENSMLEG00000041204) ZFP92 (ENSMLEG00000013319) HAUS7 (ENSMLEG00000038483) BGN (ENSMLEG00000029067) ATP2B3 (ENSMLEG00000032665) CCNQ (ENSMLEG00000039950) DUSP9 (ENSMLEG00000042559) ENSMLEG00000027362 ##22 PNCK (ENSMLEG00000027716) SLC6A8 (ENSMLEG00000042530) BCAP31 (ENSMLEG00000042884) ABCD1 (ENSMLEG00000041428) PLXNB3 (ENSMLEG00000032454) IDH3G (ENSMLEG00000038908) SSR4 (ENSMLEG00000016802) PDZD4 (ENSMLEG00000004595) L1CAM (ENSMLEG00000036326) AVPR2 (ENSMLEG00000042889) ARHGAP4 (ENSMLEG00000038659) NAA10 (ENSMLEG00000032424) RENBP (ENSMLEG00000038487) HCFC1 (ENSMLEG00000042451) IRAK1 (ENSMLEG00000029062) Sooty mangabey MODERN SPECIES 286 ENSCATG00000032628 CCNQ (ENSCATG00000013187) DUSP9 (ENSCATG00000009164) ENSCATG00000003729 ##22 PNCK (ENSCATG00000041955) SLC6A8 (ENSCATG00000001771) BCAP31 (ENSCATG00000043253) ABCD1 (ENSCATG00000042536) PLXNB3 (ENSCATG00000037895) SRPK3 (ENSCATG00000045096) IDH3G (ENSCATG00000042112) SSR4 (ENSCATG00000006344) PDZD4 (ENSCATG00000043997) L1CAM (ENSCATG00000041515) AVPR2 (ENSCATG00000036647) ARHGAP4 (ENSCATG00000042499) NAA10 (ENSCATG00000038709) RENBP (ENSCATG00000037009) HCFC1 (ENSCATG00000022004) Macaca ANCESTRAL SPECIES 13 ENSGT00530000063872.A ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.a ENSGT00940000165830 ENSGT00390000001700.a.b.b ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.c ENSGT00950000182890.D.c.b.a.a.a ENSGT01030000234522.C.b.e.a.a.a.a.a.b.d ENSGT00940000162887 ENSGT00390000003937 ENSGT00940000155311.C ENSGT00940000160765 ENSGT00940000155445.e ENSGT00940000161880 ENSGT00390000015797.c.a.c.b ##22 ENSGT00940000162187 ENSGT00940000155869.v ENSGT00390000011863.c ENSGT00950000182955.a.b.a ENSGT01020000230394.e.a.a.b.a.b ENSGT00940000157877.b ENSGT00950000182989.D.a.a.g.a ENSGT00390000008992 ENSGT00950000183062.a.b ENSGT00940000157506 ENSGT01050000244882.b.c.b ENSGT00950000182824.a.b.b ENSGT00550000074803 ENSGT00390000013740 ENSGT00940000161383 Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 390 PNMA6F (ENSMNEG00000031969) ENSMNEG00000039113 PNMA6E (ENSMNEG00000038171) ZFP92 (ENSMNEG00000042434) HAUS7 (ENSMNEG00000036428) BGN (ENSMNEG00000042759) ATP2B3 (ENSMNEG00000044784) CCNQ (ENSMNEG00000042079) DUSP9 (ENSMNEG00000040094) ENSMNEG00000028994 ##22 PNCK (ENSMNEG00000040586) SLC6A8 (ENSMNEG00000005457) BCAP31 (ENSMNEG00000028474) ABCD1 (ENSMNEG00000033571) PLXNB3 (ENSMNEG00000032414) SRPK3 (ENSMNEG00000030566) IDH3G (ENSMNEG00000042620) SSR4 (ENSMNEG00000042721) PDZD4 (ENSMNEG00000041450) L1CAM (ENSMNEG00000042796) AVPR2 (ENSMNEG00000029040) ARHGAP4 (ENSMNEG00000039860) NAA10 (ENSMNEG00000034261) RENBP (ENSMNEG00000038526) HCFC1 (ENSMNEG00000033780) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 Drill MODERN SPECIES 160 CCDC194 (ENSMLEG00000036184) BST2 (ENSMLEG00000039385) MVB12A (ENSMLEG00000036382) TMEM221 (ENSMLEG00000039109) SLC27A1 (ENSMLEG00000029815) PGLS (ENSMLEG00000039926) NIBAN3 (ENSMLEG00000028581) COLGALT1 (ENSMLEG00000030570) ENSMLEG00000006653 UNC13A (ENSMLEG00000034347) MAP1S (ENSMLEG00000036842) FCHO1 (ENSMLEG00000028939) B3GNT3 (ENSMLEG00000032295) INSL3 (ENSMLEG00000041971) JAK3 (ENSMLEG00000034517) ENSMLEG00000016788 ##22 SLC5A5 (ENSMLEG00000039188) CCDC124 (ENSMLEG00000031049) KCNN1 (ENSMLEG00000042986) ARRDC2 (ENSMLEG00000033675) IL12RB1 (ENSMLEG00000035938) MAST3 (ENSMLEG00000038024) PIK3R2 (ENSMLEG00000006536) IFI30 (ENSMLEG00000042593) MPV17L2 (ENSMLEG00000028030) RAB3A (ENSMLEG00000040567) PDE4C (ENSMLEG00000043449) IQCN (ENSMLEG00000031635) LSM4 (ENSMLEG00000027948) PGPEP1 (ENSMLEG00000041283) GDF15 (ENSMLEG00000043577) Macaca ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.a.a.a.b.a.b ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a.d ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00940000161627.a.a.a.b.a.b.b.a.a.b.b.a.a.a.a.a ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 10 ANKLE1 (ENSMFAG00000045052) ABHD8 (ENSMFAG00000028796) ENSMFAG00000044117 ENSMFAG00000064314 GTPBP3 (ENSMFAG00000004345) PLVAP (ENSMFAG00000040183) ENSMFAG00000002669 MVB12A (ENSMFAG00000056814) TMEM221 (ENSMFAG00000032087) ENSMFAG00000034050 UNC13A (ENSMFAG00000002929) ENSMFAG00000039483 ENSMFAG00000059258 FCHO1 (ENSMFAG00000041892) JAK3 (ENSMFAG00000034366) ENSMFAG00000043962 ##22 SLC5A5 (ENSMFAG00000000036) CCDC124 (ENSMFAG00000042756) KCNN1 (ENSMFAG00000040924) ARRDC2 (ENSMFAG00000003817) IL12RB1 (ENSMFAG00000041911) MAST3 (ENSMFAG00000040625) PIK3R2 (ENSMFAG00000034445) ENSMFAG00000062890 IFI30 (ENSMFAG00000034585) RAB3A (ENSMFAG00000030826) MPV17L2 (ENSMFAG00000041586) PDE4C (ENSMFAG00000041375) ENSMFAG00000049148 IQCN (ENSMFAG00000042967) ENSMFAG00000049018 Rhesus MODERN SPECIES 10 MVB12A (ENSMMUG00000005830) TMEM221 (ENSMMUG00000008991) SLC27A1 (ENSMMUG00000000194) PGLS (ENSMMUG00000000195) NIBAN3 (ENSMMUG00000000196) ENSMMUG00000059371 COLGALT1 (ENSMMUG00000000198) UNC13A (ENSMMUG00000015476) MAP1S (ENSMMUG00000022742) ENSMMUG00000051425 FCHO1 (ENSMMUG00000012277) B3GNT3 (ENSMMUG00000012280) INSL3 (ENSMMUG00000042375) JAK3 (ENSMMUG00000010996) ENSMMUG00000058896 ENSMMUG00000028844 ##22 SLC5A5 (ENSMMUG00000028843) CCDC124 (ENSMMUG00000038308) KCNN1 (ENSMMUG00000007398) ARRDC2 (ENSMMUG00000007401) ENSMMUG00000063870 IL12RB1 (ENSMMUG00000012096) MAST3 (ENSMMUG00000003161) PIK3R2 (ENSMMUG00000003162) ENSMMUG00000059656 IFI30 (ENSMMUG00000051543) MPV17L2 (ENSMMUG00000057067) RAB3A (ENSMMUG00000011317) PDE4C (ENSMMUG00000005028) ENSMMUG00000065139 IQCN (ENSMMUG00000016354) Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4864 ENSTSYG00000034229 ##22 TOP1 (ENSTSYG00000003428) PLCG1 (ENSTSYG00000004168) ZHX3 (ENSTSYG00000033648) LPIN3 (ENSTSYG00000010513) EMILIN3 (ENSTSYG00000033682) Tarsier MODERN SPECIES 2092 ENSTSYG00000032591 ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Rodentia DUPLICATION Rodentia DUPLICATION Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Degu MODERN SPECIES 323 ENSODEG00000012816 ENSODEG00000012905 DDX11 (ENSODEG00000014673) ENSODEG00000012539 ENSODEG00000012918 ENSODEG00000012438 FCHO1 (ENSODEG00000013577) B3GNT3 (ENSODEG00000013122) JAK3 (ENSODEG00000013299) ENSODEG00000012777 ##22 SLC5A5 (ENSODEG00000012721) CCDC124 (ENSODEG00000013790) KCNN1 (ENSODEG00000013162) ARRDC2 (ENSODEG00000013689) ENSODEG00000012843 ENSODEG00000012781 PIK3R2 (ENSODEG00000013440) IFI30 (ENSODEG00000014388) MPV17L2 (ENSODEG00000013238) RAB3A (ENSODEG00000012269) PDE4C (ENSODEG00000013172) JUND (ENSODEG00000013414) ENSODEG00000011712 PGPEP1 (ENSODEG00000012364) SSBP4 (ENSODEG00000012832) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 164 Ccdc194 (ENSMOCG00000016480) Bst2 (ENSMOCG00000020132) Mvb12a (ENSMOCG00000020827) Tmem221 (ENSMOCG00000011341) Nxnl1 (ENSMOCG00000008986) Slc27a1 (ENSMOCG00000010070) Pgls (ENSMOCG00000019327) Niban3 (ENSMOCG00000002532) Colgalt1 (ENSMOCG00000001868) Unc13a (ENSMOCG00000003295) Jak3 (ENSMOCG00000012314) Insl3 (ENSMOCG00000008660) B3gnt3 (ENSMOCG00000006137) Fcho1 (ENSMOCG00000010497) Map1s (ENSMOCG00000015944) ENSMOCG00000002628 ##22 Slc5a5 (ENSMOCG00000007647) Ccdc124 (ENSMOCG00000014017) Kcnn1 (ENSMOCG00000003069) Arrdc2 (ENSMOCG00000006806) Il12rb1 (ENSMOCG00000000603) Mast3 (ENSMOCG00000018587) ENSMOCG00000019717 Ifi30 (ENSMOCG00000001163) Mpv17l2 (ENSMOCG00000009680) Rab3a (ENSMOCG00000016750) Pde4c (ENSMOCG00000015883) Gm3336 (ENSMOCG00000017470) Iqcn (ENSMOCG00000009272) Jund (ENSMOCG00000005294) Lsm4 (ENSMOCG00000020861) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.g.b ##22 Degu MODERN SPECIES 208 ADGRL4 (ENSODEG00000003241) ENSODEG00000018917 ##22 PTGFR (ENSODEG00000003205) ENSODEG00000003189 GIPC2 (ENSODEG00000002950) ENSODEG00000002929 ENSODEG00000002600 NEXN (ENSODEG00000003578) MIGA1 (ENSODEG00000003282) ENSODEG00000003224 ZZZ3 (ENSODEG00000003077) AK5 (ENSODEG00000002917) PIGK (ENSODEG00000002877) ST6GALNAC5 (ENSODEG00000002631) ENSODEG00000002611 ENSODEG00000018945 ENSODEG00000002590 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Degu MODERN SPECIES 263 SUPT4H1 (ENSODEG00000011183) TSPOAP1 (ENSODEG00000011140) MPO (ENSODEG00000011112) LPO (ENSODEG00000011990) MKS1 (ENSODEG00000012294) EPX (ENSODEG00000011351) ENSODEG00000020120 OR4D2 (ENSODEG00000019834) OR4D1 (ENSODEG00000019941) ENSODEG00000019998 DYNLL2 (ENSODEG00000013208) SRSF1 (ENSODEG00000011481) VEZF1 (ENSODEG00000011127) CUEDC1 (ENSODEG00000011861) MRPS23 (ENSODEG00000011027) ENSODEG00000011449 ##22 MSI2 (ENSODEG00000011974) TMEM238 (ENSODEG00000011450) ENSODEG00000011240 SCPEP1 (ENSODEG00000010769) COIL (ENSODEG00000012389) ENSODEG00000012139 TRIM25 (ENSODEG00000011829) DGKE (ENSODEG00000012600) C17orf67 (ENSODEG00000013079) NOG (ENSODEG00000020232) ENSODEG00000012707 ANKFN1 (ENSODEG00000012115) PCTP (ENSODEG00000014619) TMEM100 (ENSODEG00000019916) MMD (ENSODEG00000013055) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Kangaroo rat MODERN SPECIES 368 Lin54 (ENSDORG00000002968) ENSDORG00000010518 ENSDORG00000015366 Tmem150c (ENSDORG00000028142) Enoph1 (ENSDORG00000000973) ENSDORG00000000968 Hnrnpd (ENSDORG00000012507) ENSDORG00000028788 Rasgef1b (ENSDORG00000008210) Prkg2 (ENSDORG00000008384) Bmp3 (ENSDORG00000008380) Cfap299 (ENSDORG00000000888) Fgf5 (ENSDORG00000013481) Prdm8 (ENSDORG00000015398) Antxr2 (ENSDORG00000008986) ENSDORG00000024213 ##22 Paqr3 (ENSDORG00000013893) Bmp2k (ENSDORG00000013890) Anxa3 (ENSDORG00000008315) Fras1 (ENSDORG00000008295) Mrpl1 (ENSDORG00000015752) Cnot6l (ENSDORG00000011458) Cxcl13 (ENSDORG00000029327) Ccng2 (ENSDORG00000007156) ENSDORG00000029625 Septin11 (ENSDORG00000015527) Sowahb (ENSDORG00000015525) ENSDORG00000025484 Shroom3 (ENSDORG00000012959) Ccdc158 (ENSDORG00000009456) Stbd1 (ENSDORG00000009454) Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 284 Cep70 (ENSCGRG00001015901) Esyt3 (ENSCGRG00001005131) Mras (ENSCGRG00001019182) ENSCGRG00001016018 Armc8 (ENSCGRG00001022367) Dbr1 (ENSCGRG00001018497) A4gnt (ENSCGRG00001015651) Dzip1l (ENSCGRG00001015758) Cldn18 (ENSCGRG00001021119) Sox14 (ENSCGRG00001006423) Il20rb (ENSCGRG00001014104) Nck1 (ENSCGRG00001010690) Slc35g2 (ENSCGRG00001010655) Stag1 (ENSCGRG00001010804) Pccb (ENSCGRG00001010499) ENSCGRG00001022650 ##22 Msl2 (ENSCGRG00001018586) Ppp2r3a (ENSCGRG00001014468) ENSCGRG00001000374 Ephb1 (ENSCGRG00001023566) Ky (ENSCGRG00001005688) Cep63 (ENSCGRG00001022029) Anapc13 (ENSCGRG00001008030) Amotl2 (ENSCGRG00001004406) ENSCGRG00001024987 ENSCGRG00001022954 Slco2a1 (ENSCGRG00001020259) Rab6b (ENSCGRG00001013041) Srprb (ENSCGRG00001018121) Trf (ENSCGRG00001011853) Inhca (ENSCGRG00001005380) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 112 ENSCGRG00001021640 Irx5 (ENSCGRG00001019317) Irx3 (ENSCGRG00001022254) Fto (ENSCGRG00001013545) Rpgrip1l (ENSCGRG00001020196) ENSCGRG00001013457 ENSCGRG00001024361 Rbl2 (ENSCGRG00001012793) Chd9 (ENSCGRG00001016150) ENSCGRG00001012667 ##22 Gm19935 (ENSCGRG00001012263) ENSCGRG00001010471 ENSCGRG00001001946 Tox3 (ENSCGRG00001021816) ENSCGRG00001023314 ENSCGRG00001019423 ##22 Cyld (ENSCGRG00001000533) Nod2 (ENSCGRG00001011531) Snx20 (ENSCGRG00001020312) Nkd1 (ENSCGRG00001011787) Brd7 (ENSCGRG00001003449) Adcy7 (ENSCGRG00001014504) Tent4b (ENSCGRG00001023597) Heatr3 (ENSCGRG00001024755) Cnep1r1 (ENSCGRG00001009199) Zfp423 (ENSCGRG00001023063) 4933402J07Rik (ENSCGRG00001021069) Cbln1 (ENSCGRG00001018308) N4bp1 (ENSCGRG00001014095) Siah1b (ENSCGRG00001006463) LONP2 (ENSCGRG00001009685) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 382 Usp25 (ENSCGRG00001019136) Nrip1 (ENSCGRG00001017624) Samsn1 (ENSCGRG00001011901) Hspa13 (ENSCGRG00001006769) Rbm11 (ENSCGRG00001013426) Lipi (ENSCGRG00001004574) Robo2 (ENSCGRG00001016343) Robo1 (ENSCGRG00001016390) ENSCGRG00001011950 Gbe1 (ENSCGRG00001024765) Cadm2 (ENSCGRG00001010982) Vgll3 (ENSCGRG00001015980) Chmp2b (ENSCGRG00001022834) Pou1f1 (ENSCGRG00001011471) ENSCGRG00001022071 ENSCGRG00001017747 ##22 Htr1f (ENSCGRG00001010649) Cggbp1 (ENSCGRG00001010279) Zfp654 (ENSCGRG00001020292) 4930453N24Rik (ENSCGRG00001015042) Csnka2ip (ENSCGRG00001014750) Epha3 (ENSCGRG00001006199) ENSCGRG00001009587 Stx19 (ENSCGRG00001001896) Arl13b (ENSCGRG00001022552) Nsun3 (ENSCGRG00001013850) ENSCGRG00001011827 ENSCGRG00001023290 ENSCGRG00001018957 ENSCGRG00001010094 Arl6 (ENSCGRG00001021791) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.h ##22 Rat MODERN SPECIES LOC100365363 (ENSRNOG00000059492) Vom1r17 (ENSRNOG00000064083) ENSRNOG00000067452 Vom1r19 (ENSRNOG00000063416) ENSRNOG00000068732 Vom1r20 (ENSRNOG00000028807) Vom1r21 (ENSRNOG00000064479) AABR07071891.2 (ENSRNOG00000045741) Zfp54 (ENSRNOG00000051578) Zfp51 (ENSRNOG00000056036) Zfp53 (ENSRNOG00000042347) Zfp52 (ENSRNOG00000042826) LOC102550851 (ENSRNOG00000063577) LOC108348215 (ENSRNOG00000058436) Zfp51l1 (ENSRNOG00000043341) AABR07001902.1 (ENSRNOG00000042547) ##22 Vom1r22 (ENSRNOG00000025949) Vom1r23 (ENSRNOG00000070251) Zfp748-ps1 (ENSRNOG00000058030) LOC102548728 (ENSRNOG00000066224) Vom2r-ps24 (ENSRNOG00000066654) AABR07001923.1 (ENSRNOG00000047884) ENSRNOG00000068098 Znf845l-ps1 (ENSRNOG00000051570) ENSRNOG00000065747 Zfp600 (ENSRNOG00000051867) Vom2r13 (ENSRNOG00000057050) AABR07002025.1 (ENSRNOG00000054417) Vom2r80 (ENSRNOG00000055298) ENSRNOG00000066415 LOC102555644 (ENSRNOG00000071050) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Equus ANCESTRAL SPECIES 23 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Donkey MODERN SPECIES CCDC194 (ENSEASG00005032333) MVB12A (ENSEASG00005002931) ENSEASG00005002921 TMEM221 (ENSEASG00005037644) NXNL1 (ENSEASG00005002945) SLC27A1 (ENSEASG00005002954) PGLS (ENSEASG00005002963) NIBAN3 (ENSEASG00005002991) COLGALT1 (ENSEASG00005003057) UNC13A (ENSEASG00005003323) MAP1S (ENSEASG00005005933) ENSEASG00005005938 ENSEASG00005034647 INSL3 (ENSEASG00005026499) JAK3 (ENSEASG00005005949) ENSEASG00005005956 ##22 SLC5A5 (ENSEASG00005005964) ENSEASG00005033168 CCDC124 (ENSEASG00005005971) KCNN1 (ENSEASG00005005977) ARRDC2 (ENSEASG00005005980) IL12RB1 (ENSEASG00005005987) MAST3 (ENSEASG00005005993) ENSEASG00005006025 IFI30 (ENSEASG00005006219) MPV17L2 (ENSEASG00005006220) RAB3A (ENSEASG00005006221) PDE4C (ENSEASG00005006231) ENSEASG00005028857 ENSEASG00005038750 ENSEASG00005006233 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00940000166941 ENSGT00610000086173 Giant Panda MODERN SPECIES 1267 ENSAMEG00000026451 ##22 Ursus ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00940000154197.b.b.y.b.a ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a ENSGT00940000161872 Polar bear MODERN SPECIES 255 ENSUMAG00000011835 ANO8 (ENSUMAG00000011803) PLVAP (ENSUMAG00000011789) ENSUMAG00000011787 MVB12A (ENSUMAG00000011781) ENSUMAG00000011774 SLC27A1 (ENSUMAG00000011769) ENSUMAG00000011752 PGLS (ENSUMAG00000011747) NIBAN3 (ENSUMAG00000011737) ENSUMAG00000011373 MAP1S (ENSUMAG00000011311) FCHO1 (ENSUMAG00000010837) B3GNT3 (ENSUMAG00000010749) JAK3 (ENSUMAG00000009973) ENSUMAG00000009876 ##22 SLC5A5 (ENSUMAG00000009865) CCDC124 (ENSUMAG00000009858) ENSUMAG00000009850 ENSUMAG00000009844 IL12RB1 (ENSUMAG00000009832) MAST3 (ENSUMAG00000009640) PIK3R2 (ENSUMAG00000009514) IFI30 (ENSUMAG00000009491) MPV17L2 (ENSUMAG00000009485) RAB3A (ENSUMAG00000009464) PDE4C (ENSUMAG00000009070) ENSUMAG00000009018 LSM4 (ENSUMAG00000009013) PGPEP1 (ENSUMAG00000009009) GDF15 (ENSUMAG00000009006) American black bear MODERN SPECIES 2420 JAK3 (ENSUAMG00000018350) ENSUAMG00000018348 ##22 SLC5A5 (ENSUAMG00000018347) CCDC124 (ENSUAMG00000018346) KCNN1 (ENSUAMG00000018345) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Suina ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Pig MODERN SPECIES 4 CLSTN2 (ENSSSCG00000011666) TRIM42 (ENSSSCG00000011668) SLC25A36 (ENSSSCG00000036855) SPSB4 (ENSSSCG00000034369) PXYLP1 (ENSSSCG00000011670) ZBTB38 (ENSSSCG00000022073) RASA2 (ENSSSCG00000011672) ENSSSCG00000041863 RNF7 (ENSSSCG00000029774) GRK7 (ENSSSCG00000011675) ENSSSCG00000011676 TFDP2 (ENSSSCG00000037647) ENSSSCG00000036302 ENSSSCG00000058234 ENSSSCG00000048998 ENSSSCG00000034370 ##22 ENSSSCG00000046587 GK5 (ENSSSCG00000011677) XRN1 (ENSSSCG00000011678) ATR (ENSSSCG00000011679) PLS1 (ENSSSCG00000011680) TRPC1 (ENSSSCG00000011681) PCOLCE2 (ENSSSCG00000011683) PAQR9 (ENSSSCG00000060874) U2SURP (ENSSSCG00000011684) CHST2 (ENSSSCG00000022031) SLC9A9 (ENSSSCG00000011686) DIPK2A (ENSSSCG00000036206) ENSSSCG00000011688 PLOD2 (ENSSSCG00000011689) PLSCR4 (ENSSSCG00000011690) Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Blue whale MODERN SPECIES 10 ENSBMSG00010014287 CDH11 (ENSBMSG00010014302) ENSBMSG00010014330 CDH5 (ENSBMSG00010014359) BEAN1 (ENSBMSG00010014457) ENSBMSG00010014500 TK2 (ENSBMSG00010014551) CKLF (ENSBMSG00010014882) ENSBMSG00010015037 ENSBMSG00010015063 ENSBMSG00010015115 CMTM3 (ENSBMSG00010015159) CMTM4 (ENSBMSG00010015196) DYNC1LI2 (ENSBMSG00010015269) TERB1 (ENSBMSG00010015382) ENSBMSG00010015462 ##22 NAE1 (ENSBMSG00010015508) CA7 (ENSBMSG00010015659) ENSBMSG00010015711 PDP2 (ENSBMSG00010015722) CDH16 (ENSBMSG00010015858) RRAD (ENSBMSG00010016627) CIAO2B (ENSBMSG00010016650) CES2 (ENSBMSG00010016703) CBFB (ENSBMSG00010016805) ENSBMSG00010016852 B3GNT9 (ENSBMSG00010016876) TRADD (ENSBMSG00010016899) FBXL8 (ENSBMSG00010016923) HSF4 (ENSBMSG00010016951) NOL3 (ENSBMSG00010016979) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Dolphin MODERN SPECIES 6145 ENSTTRG00000008977 ##22 SLC5A5 (ENSTTRG00000008976) Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a ##22 Vaquita MODERN SPECIES 19 ELF5 (ENSPSNG00000017789) CAT (ENSPSNG00000017719) ENSPSNG00000017692 ENSPSNG00000017670 NAT10 (ENSPSNG00000017510) CAPRIN1 (ENSPSNG00000017392) LMO2 (ENSPSNG00000017299) FBXO3 (ENSPSNG00000017093) ENSPSNG00000017059 C11orf91 (ENSPSNG00000017031) KIAA1549L (ENSPSNG00000016649) HIPK3 (ENSPSNG00000016514) CSTF3 (ENSPSNG00000016354) TCP11L1 (ENSPSNG00000016253) DEPDC7 (ENSPSNG00000016098) ENSPSNG00000016011 ##22 QSER1 (ENSPSNG00000015773) PRRG4 (ENSPSNG00000015680) CCDC73 (ENSPSNG00000015385) EIF3M (ENSPSNG00000015142) WT1 (ENSPSNG00000014606) ENSPSNG00000014483 RCN1 (ENSPSNG00000014435) PAX6 (ENSPSNG00000014287) ELP4 (ENSPSNG00000014087) IMMP1L (ENSPSNG00000013988) DNAJC24 (ENSPSNG00000013881) DCDC1 (ENSPSNG00000013124) MPPED2 (ENSPSNG00000012995) ARL14EP (ENSPSNG00000012948) ENSPSNG00000012904 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173.b ENSGT00390000015368.a.a Beluga whale MODERN SPECIES 27 ENSDLEG00000001611 MVB12A (ENSDLEG00000001618) TMEM221 (ENSDLEG00000001634) NXNL1 (ENSDLEG00000001651) SLC27A1 (ENSDLEG00000001665) PGLS (ENSDLEG00000001686) NIBAN3 (ENSDLEG00000001718) ENSDLEG00000001832 ENSDLEG00000001839 ENSDLEG00000002440 MAP1S (ENSDLEG00000005291) ENSDLEG00000005304 FCHO1 (ENSDLEG00000005313) INSL3 (ENSDLEG00000005322) JAK3 (ENSDLEG00000005345) ENSDLEG00000005579 ##22 SLC5A5 (ENSDLEG00000005599) CCDC124 (ENSDLEG00000005617) KCNN1 (ENSDLEG00000005628) ARRDC2 (ENSDLEG00000005651) IL12RB1 (ENSDLEG00000005677) MAST3 (ENSDLEG00000005703) PIK3R2 (ENSDLEG00000005809) ENSDLEG00000005840 MPV17L2 (ENSDLEG00000005851) RAB3A (ENSDLEG00000005860) PDE4C (ENSDLEG00000005873) KIAA1683 (ENSDLEG00000005933) JUND (ENSDLEG00000005939) LSM4 (ENSDLEG00000005942) PGPEP1 (ENSDLEG00000005952) Narwhal MODERN SPECIES 298 CCDC194 (ENSMMNG00015002120) ENSMMNG00015002096 MVB12A (ENSMMNG00015002061) TMEM221 (ENSMMNG00015002046) NXNL1 (ENSMMNG00015002026) SLC27A1 (ENSMMNG00015001998) PGLS (ENSMMNG00015001968) NIBAN3 (ENSMMNG00015001840) COLGALT1 (ENSMMNG00015001761) UNC13A (ENSMMNG00015001258) MAP1S (ENSMMNG00015000929) FCHO1 (ENSMMNG00015000832) B3GNT3 (ENSMMNG00015000799) INSL3 (ENSMMNG00015000784) JAK3 (ENSMMNG00015000739) ENSMMNG00015000695 ##22 SLC5A5 (ENSMMNG00015000653) CCDC124 (ENSMMNG00015000623) KCNN1 (ENSMMNG00015000605) ARRDC2 (ENSMMNG00015000567) IL12RB1 (ENSMMNG00015000529) MAST3 (ENSMMNG00015000302) PIK3R2 (ENSMMNG00015000176) IFI30 (ENSMMNG00015000120) MPV17L2 (ENSMMNG00015000089) RAB3A (ENSMMNG00015000026) PDE4C (ENSMMNG00015008093) ENSMMNG00015008048 JUND (ENSMMNG00015008033) ENSMMNG00015008004 ENSMMNG00015007982 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES 25 ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.f ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.e ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000164119 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a Marsupialia_b DUPLICATION Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.f ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.e ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a.i ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482.b ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES 54 ENSGT01030000234573.A.b.b.a ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.e ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a.i ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482.b ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES 53 ENSGT01030000234573.A.b.b.a ENSGT00940000155885 ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.a.g ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.b.e ENSGT01030000234519.e.a.a.b.a.a.b.a.b.a.b ENSGT00940000161033 ENSGT00940000161736 ENSGT01050000244887.B ENSGT00500000044945.a ENSGT00940000154201.a.a.b.d ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.a.i ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482.b ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a koala MODERN SPECIES 133 ENSPCIG00000022225 ENSPCIG00000033729 ENSPCIG00000035480 ENSPCIG00000022239 GNA11 (ENSPCIG00000034212) GNA15 (ENSPCIG00000027122) S1PR4 (ENSPCIG00000027123) NCLN (ENSPCIG00000027124) CELF5 (ENSPCIG00000027126) MAP1S (ENSPCIG00000027127) FCHO1 (ENSPCIG00000027129) B3GNT3 (ENSPCIG00000033076) ENSPCIG00000027134 JAK3 (ENSPCIG00000027139) ENSPCIG00000027147 ENSPCIG00000027151 ##22 SLC5A5 (ENSPCIG00000027171) ENSPCIG00000031020 KCNN1 (ENSPCIG00000027183) ARRDC2 (ENSPCIG00000027188) ENSPCIG00000027201 MAST3 (ENSPCIG00000027217) PIK3R2 (ENSPCIG00000027485) ENSPCIG00000031540 MPV17L2 (ENSPCIG00000012258) RAB3A (ENSPCIG00000012260) PDE4C (ENSPCIG00000012289) ENSPCIG00000018287 JUND (ENSPCIG00000018288) LSM4 (ENSPCIG00000037130) PGPEP1 (ENSPCIG00000031873) Common wonbat MODERN SPECIES 626 ENSVURG00010014208 ENSVURG00010014214 GNA11 (ENSVURG00010014220) GNA15 (ENSVURG00010014228) S1PR4 (ENSVURG00010014236) NCLN (ENSVURG00010014249) CELF5 (ENSVURG00010014264) MAP1S (ENSVURG00010014460) FCHO1 (ENSVURG00010014674) B3GNT3 (ENSVURG00010014702) ENSVURG00010014710 JAK3 (ENSVURG00010014721) ENSVURG00010014755 ##22 SLC5A5 (ENSVURG00010014802) CCDC124 (ENSVURG00010014813) KCNN1 (ENSVURG00010014819) ARRDC2 (ENSVURG00010014827) ENSVURG00010014856 MAST3 (ENSVURG00010014870) PIK3R2 (ENSVURG00010014929) ENSVURG00010014942 RAB3A (ENSVURG00010014950) PDE4C (ENSVURG00010014959) ENSVURG00010014977 JUND (ENSVURG00010014985) LSM4 (ENSVURG00010014994) PGPEP1 (ENSVURG00010015000) ENSVURG00010015005 Wallaby DUPLICATION Wallaby DUPLICATION Wallaby MODERN SPECIES 1486 ENSMEUG00000003228 ##22 Wallaby MODERN SPECIES 13140 ENSMEUG00000007090 ##22 Wallaby MODERN SPECIES 14359 ENSMEUG00000000992 ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000001133 SRP19 (ENSSHAG00000028906) ENSSHAG00000028339 ENSSHAG00000011965 ENSSHAG00000012433 ENSSHAG00000031446 ENSSHAG00000011078 ENSSHAG00000010037 ENSSHAG00000025081 RORB (ENSSHAG00000018693) TRPM6 (ENSSHAG00000018492) ENSSHAG00000027316 CARNMT1 (ENSSHAG00000027311) NMRK1 (ENSSHAG00000023471) OSTF1 (ENSSHAG00000029559) ENSSHAG00000027643 ##22 PCSK5 (ENSSHAG00000016513) ENSSHAG00000031182 ENSSHAG00000012135 ENSSHAG00000011874 ENSSHAG00000031026 ENSSHAG00000000234 ENSSHAG00000000710 KAT8 (ENSSHAG00000011710) BCKDK (ENSSHAG00000030980) ENSSHAG00000026062 PRSS53 (ENSSHAG00000011528) ZNF646 (ENSSHAG00000029925) ZNF668 (ENSSHAG00000026949) STX4 (ENSSHAG00000021046) STX1B (ENSSHAG00000026021) Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.j ##22 Tasmanian devil MODERN SPECIES ENSSHAG00000022969 ENSSHAG00000003187 ENSSHAG00000022567 ENSSHAG00000025822 ENSSHAG00000004602 ENSSHAG00000006119 ENSSHAG00000021365 ENSSHAG00000027184 S1PR4 (ENSSHAG00000007216) NCLN (ENSSHAG00000007494) ENSSHAG00000008823 ENSSHAG00000002099 B3GNT3 (ENSSHAG00000003539) ENSSHAG00000022068 JAK3 (ENSSHAG00000004978) ENSSHAG00000022561 ##22 SLC5A5 (ENSSHAG00000000675) CCDC124 (ENSSHAG00000021571) KCNN1 (ENSSHAG00000006692) ARRDC2 (ENSSHAG00000007311) ENSSHAG00000008318 MAST3 (ENSSHAG00000009059) PIK3R2 (ENSSHAG00000009738) ENSSHAG00000022120 MPV17L2 (ENSSHAG00000009989) RAB3A (ENSSHAG00000010227) PDE4C (ENSSHAG00000010359) ENSSHAG00000028095 JUND (ENSSHAG00000021787) LSM4 (ENSSHAG00000021542) PGPEP1 (ENSSHAG00000031355) Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.j ##22 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.c.a.j ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 612 ENSVURG00010009222 ROR1 (ENSVURG00010009211) PGM1 (ENSVURG00010009200) EFCAB7 (ENSVURG00010009191) ENSVURG00010009182 ALG6 (ENSVURG00010009169) FOXD3 (ENSVURG00010009156) ATG4C (ENSVURG00010009137) ANGPTL3 (ENSVURG00010009124) DOCK7 (ENSVURG00010008347) USP1 (ENSVURG00010008279) KANK4 (ENSVURG00010008241) PATJ (ENSVURG00010008173) TM2D1 (ENSVURG00010008155) NFIA (ENSVURG00010008122) ENSVURG00010008077 ##22 ENSVURG00010008072 C1orf87 (ENSVURG00010008051) ENSVURG00010008037 ENSVURG00010008025 ENSVURG00010007958 HOOK1 (ENSVURG00010007915) FGGY (ENSVURG00010007865) JUN (ENSVURG00010007825) MYSM1 (ENSVURG00010007771) TACSTD2 (ENSVURG00010007751) OMA1 (ENSVURG00010007746) DAB1 (ENSVURG00010007713) C8A (ENSVURG00010007704) PRKAA2 (ENSVURG00010007682) PLPP3 (ENSVURG00010007675) Opossum MODERN SPECIES 2 AACS (ENSMODG00000015672) ENSMODG00000048892 DHX37 (ENSMODG00000015681) SCARB1 (ENSMODG00000015688) ENSMODG00000019140 GNA11 (ENSMODG00000019142) GNA15 (ENSMODG00000019144) S1PR4 (ENSMODG00000019145) NCLN (ENSMODG00000019149) ENSMODG00000019151 MAP1S (ENSMODG00000019153) FCHO1 (ENSMODG00000028655) B3GNT3 (ENSMODG00000019158) ENSMODG00000037566 JAK3 (ENSMODG00000019165) RPL18A (ENSMODG00000037004) ##22 ENSMODG00000029513 CCDC124 (ENSMODG00000042946) KCNN1 (ENSMODG00000019170) ENSMODG00000014682 ENSMODG00000041250 ENSMODG00000050288 ENSMODG00000023842 ENSMODG00000039698 ENSMODG00000044017 ENSMODG00000036910 ENSMODG00000014469 SLC1A6 (ENSMODG00000014481) ENSMODG00000014485 CASP14 (ENSMODG00000039253) OR1I1 (ENSMODG00000014497) Theria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES 42 ENSGT00390000006166 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000164830 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000159489.f ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a ENSGT00940000161872 ENSGT00390000004001 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES 45 ENSGT00390000016851 ENSGT00390000006166 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000159489.f ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a ENSGT00940000161872 ENSGT00390000004001 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES 44 ENSGT00390000016851 ENSGT00390000006166 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000159489.f ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a ENSGT00940000161872 ENSGT00390000004001 Elephant MODERN SPECIES 270 ANO8 (ENSLAFG00000030710) GTPBP3 (ENSLAFG00000013978) PLVAP (ENSLAFG00000026924) ENSLAFG00000031751 MVB12A (ENSLAFG00000007872) NXNL1 (ENSLAFG00000002507) ENSLAFG00000032127 PGLS (ENSLAFG00000001116) NIBAN3 (ENSLAFG00000009366) COLGALT1 (ENSLAFG00000022736) MAP1S (ENSLAFG00000003027) FCHO1 (ENSLAFG00000004690) B3GNT3 (ENSLAFG00000022942) INSL3 (ENSLAFG00000025675) JAK3 (ENSLAFG00000015363) RPL18A (ENSLAFG00000006690) ##22 SLC5A5 (ENSLAFG00000032175) KCNN1 (ENSLAFG00000022005) ARRDC2 (ENSLAFG00000026674) IL12RB1 (ENSLAFG00000003581) MAST3 (ENSLAFG00000026363) PIK3R2 (ENSLAFG00000000711) IFI30 (ENSLAFG00000013615) MPV17L2 (ENSLAFG00000029124) RAB3A (ENSLAFG00000013618) PDE4C (ENSLAFG00000013627) ENSLAFG00000021534 LSM4 (ENSLAFG00000017459) PGPEP1 (ENSLAFG00000029224) ENSLAFG00000028458 ENSLAFG00000025978 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 9851 RPL18A (ENSTBEG00000010488) ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Alpin marmot MODERN SPECIES 24 ENSMMMG00000023560 ENSMMMG00000023562 MVB12A (ENSMMMG00000023564) TMEM221 (ENSMMMG00000023566) ENSMMMG00000023567 SLC27A1 (ENSMMMG00000000227) PGLS (ENSMMMG00000000284) NIBAN3 (ENSMMMG00000000306) ENSMMMG00000000381 ENSMMMG00000000402 ENSMMMG00000000424 ENSMMMG00000000547 ENSMMMG00000000566 INSL3 (ENSMMMG00000000672) JAK3 (ENSMMMG00000000693) RPL18A (ENSMMMG00000000829) ##22 SLC5A5 (ENSMMMG00000000854) CCDC124 (ENSMMMG00000000927) KCNN1 (ENSMMMG00000000948) ENSMMMG00000000971 MAST3 (ENSMMMG00000000984) ENSMMMG00000001094 IFI30 (ENSMMMG00000001207) MPV17L2 (ENSMMMG00000001276) RAB3A (ENSMMMG00000001289) ENSMMMG00000001307 ENSMMMG00000001318 ENSMMMG00000001330 ENSMMMG00000001343 LSM4 (ENSMMMG00000001362) PGPEP1 (ENSMMMG00000001398) Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES 47 ENSGT00390000002505 ENSGT00950000182915.b.b.b.b ENSGT00940000155438.b ENSGT00940000163163 ENSGT00940000157924 ENSGT00390000013811 ENSGT00940000160466 ENSGT00940000161678 ENSGT00940000157246 ENSGT01030000234542.b.b.a.a.a.b ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a Naked mole-rat female MODERN SPECIES 21 CHERP (ENSHGLG00000002993) ENSHGLG00000003381 EPS15L1 (ENSHGLG00000005235) ENSHGLG00000047567 AP1M1 (ENSHGLG00000041098) ENSHGLG00000003291 ENSHGLG00000042939 ENSHGLG00000039588 ENSHGLG00000002682 ENSHGLG00000042793 ENSHGLG00000002766 B3GNT3 (ENSHGLG00000047384) ENSHGLG00000003768 JAK3 (ENSHGLG00000003869) ENSHGLG00000041243 RPL18A (ENSHGLG00000002321) ##22 SLC5A5 (ENSHGLG00000002528) CCDC124 (ENSHGLG00000002655) KCNN1 (ENSHGLG00000002697) ARRDC2 (ENSHGLG00000003087) IL12RB1 (ENSHGLG00000029940) MAST3 (ENSHGLG00000003256) IFI30 (ENSHGLG00000001756) ENSHGLG00000001889 RAB3A (ENSHGLG00000040086) PDE4C (ENSHGLG00000002262) ENSHGLG00000037483 ENSHGLG00000032754 LSM4 (ENSHGLG00000006568) PGPEP1 (ENSHGLG00000006686) GDF15 (ENSHGLG00000032564) Hystricomorpha_a DUPLICATION Hystricomorpha_a DUPLICATION Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.a ##22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 259 FAM3A (ENSODEG00000006189) UBL4A (ENSODEG00000006287) ENSODEG00000006315 PLXNA3 (ENSODEG00000006368) ENSODEG00000006510 GDI1 (ENSODEG00000006550) ATP6AP1 (ENSODEG00000003643) TAFAZZIN (ENSODEG00000003758) DNASE1L1 (ENSODEG00000003830) ENSODEG00000003868 ##19 EMD (ENSODEG00000003890) FLNA (ENSODEG00000004055) TKTL1 (ENSODEG00000004431) ENSODEG00000004454 ENSODEG00000004473 ENSODEG00000004516 ##22 MECP2 (ENSODEG00000004523) IRAK1 (ENSODEG00000004583) HCFC1 (ENSODEG00000004823) RENBP (ENSODEG00000005065) ENSODEG00000005100 ARHGAP4 (ENSODEG00000005124) AVPR2 (ENSODEG00000005166) ENSODEG00000005204 L1CAM (ENSODEG00000005259) PDZD4 (ENSODEG00000005482) SSR4 (ENSODEG00000002732) IDH3G (ENSODEG00000002774) SRPK3 (ENSODEG00000002869) PLXNB3 (ENSODEG00000002965) ABCD1 (ENSODEG00000003127) Degu MODERN SPECIES 299 ENSODEG00000000731 ##22 OLFM4 (ENSODEG00000000720) PCDH8 (ENSODEG00000000712) ENSODEG00000000702 ENSODEG00000000692 ENSODEG00000018599 CNMD (ENSODEG00000000669) Guinea pig MODERN SPECIES 56 NDUFS2 (ENSCPOG00000012481) ADAMTS4 (ENSCPOG00000014372) B4GALT3 (ENSCPOG00000038979) PPOX (ENSCPOG00000015323) USP21 (ENSCPOG00000015322) UFC1 (ENSCPOG00000026930) DEDD (ENSCPOG00000015321) NIT1 (ENSCPOG00000015320) PFDN2 (ENSCPOG00000035159) KLHDC9 (ENSCPOG00000005123) NECTIN4 (ENSCPOG00000015318) ARHGAP30 (ENSCPOG00000022193) USF1 (ENSCPOG00000003957) TSTD1 (ENSCPOG00000020739) F11R (ENSCPOG00000023572) ENSCPOG00000021022 ##22 ENSCPOG00000023863 ENSCPOG00000030350 ENSCPOG00000037419 ENSCPOG00000038232 ENSCPOG00000036074 ENSCPOG00000002224 SLAMF7 (ENSCPOG00000036736) CD48 (ENSCPOG00000038301) SLAMF1 (ENSCPOG00000002925) CD84 (ENSCPOG00000008701) ENSCPOG00000006924 VANGL2 (ENSCPOG00000010224) NHLH1 (ENSCPOG00000021596) NCSTN (ENSCPOG00000014923) COPA (ENSCPOG00000014917) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.b ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.a.b ##22 Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 87 KIF20B (ENSODEG00000005304) ENSODEG00000019106 HTR7 (ENSODEG00000004910) ENSODEG00000004530 ANKRD1 (ENSODEG00000005129) PCGF5 (ENSODEG00000004787) ENSODEG00000005047 HECTD2 (ENSODEG00000004980) PPP1R3C (ENSODEG00000006013) TNKS2 (ENSODEG00000004816) BTAF1 (ENSODEG00000005172) ENSODEG00000005031 CPEB3 (ENSODEG00000004591) ENSODEG00000004464 MARCHF5 (ENSODEG00000004219) ENSODEG00000005936 ##22 IDE (ENSODEG00000005398) KIF11 (ENSODEG00000006812) HHEX (ENSODEG00000006657) ENSODEG00000005404 ENSODEG00000019192 ENSODEG00000005119 ENSODEG00000019122 ENSODEG00000005000 ENSODEG00000005878 ENSODEG00000005365 EXOC6 (ENSODEG00000005032) CYP26C1 (ENSODEG00000006273) CYP26A1 (ENSODEG00000006141) ENSODEG00000006071 MYOF (ENSODEG00000004826) Degu MODERN SPECIES 317 ENSODEG00000018695 ##22 ENSODEG00000001530 JPH4 (ENSODEG00000001519) ENSODEG00000018942 AP1G2 (ENSODEG00000002984) THTPA (ENSODEG00000002973) ZFHX2 (ENSODEG00000002856) NGDN (ENSODEG00000002730) MYH7 (ENSODEG00000002613) MYH6 (ENSODEG00000002284) CMTM5 (ENSODEG00000002188) IL25 (ENSODEG00000002172) EFS (ENSODEG00000002155) SLC22A17 (ENSODEG00000002123) ENSODEG00000002083 PPP1R3E (ENSODEG00000001965) Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.b ##22 Guinea pig MODERN SPECIES 72 ENSCPOG00000015029 ENSCPOG00000026080 ENSCPOG00000006749 ENSCPOG00000035498 ENSCPOG00000010168 ENSCPOG00000022226 OR4C11 (ENSCPOG00000014721) ENSCPOG00000039911 ENSCPOG00000030047 ENSCPOG00000021816 ENSCPOG00000034616 FCHO1 (ENSCPOG00000010411) B3GNT3 (ENSCPOG00000039336) INSL3 (ENSCPOG00000019362) JAK3 (ENSCPOG00000015116) RPL18A (ENSCPOG00000015205) ##22 SLC5A5 (ENSCPOG00000002288) CCDC124 (ENSCPOG00000024560) KCNN1 (ENSCPOG00000021112) ARRDC2 (ENSCPOG00000026098) IL12RB1 (ENSCPOG00000025820) MAST3 (ENSCPOG00000015590) PIK3R2 (ENSCPOG00000024452) Ifi30 (ENSCPOG00000005553) RAB3A (ENSCPOG00000038085) MPV17L2 (ENSCPOG00000039365) PDE4C (ENSCPOG00000030930) ENSCPOG00000035754 JUND (ENSCPOG00000025912) LSM4 (ENSCPOG00000024117) PGPEP1 (ENSCPOG00000031925) Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.b ##22 Long-tailed chinchilla MODERN SPECIES 188 GOSR1 (ENSCLAG00000010994) CPD (ENSCLAG00000008233) TMIGD1 (ENSCLAG00000005023) BLMH (ENSCLAG00000004413) SLC6A4 (ENSCLAG00000009083) NSRP1 (ENSCLAG00000005413) EFCAB5 (ENSCLAG00000006698) SSH2 (ENSCLAG00000004951) CORO6 (ENSCLAG00000009309) ANKRD13B (ENSCLAG00000006356) GIT1 (ENSCLAG00000005307) TP53I13 (ENSCLAG00000006219) ABHD15 (ENSCLAG00000006673) ENSCLAG00000006911 TAOK1 (ENSCLAG00000005510) ENSCLAG00000009994 ##22 NUFIP2 (ENSCLAG00000007711) CRYBA1 (ENSCLAG00000010128) MYO18A (ENSCLAG00000009674) PIPOX (ENSCLAG00000006253) SEZ6 (ENSCLAG00000007089) PHF12 (ENSCLAG00000005916) DHRS13 (ENSCLAG00000012986) FLOT2 (ENSCLAG00000014550) ERAL1 (ENSCLAG00000004778) FAM222B (ENSCLAG00000007626) TRAF4 (ENSCLAG00000009205) NEK8 (ENSCLAG00000011158) TLCD1 (ENSCLAG00000005415) ENSCLAG00000007694 RAB34 (ENSCLAG00000009672) Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES 43 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00390000015797.c.b #22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 127 Zdhhc7 (ENSJJAG00000011006) Crispld2 (ENSJJAG00000019183) ENSJJAG00000013110 Klhl36 (ENSJJAG00000007502) ENSJJAG00000000638 Slc27a1 (ENSJJAG00000005144) Pgls (ENSJJAG00000020229) Niban3 (ENSJJAG00000017157) ENSJJAG00000019428 ENSJJAG00000021570 Map1s (ENSJJAG00000024424) Fcho1 (ENSJJAG00000016420) B3gnt3 (ENSJJAG00000015210) Insl3 (ENSJJAG00000016872) Jak3 (ENSJJAG00000012029) Rpl18a (ENSJJAG00000007815) ##22 Slc5a5 (ENSJJAG00000009288) Ccdc124 (ENSJJAG00000019135) Kcnn1 (ENSJJAG00000020481) Arrdc2 (ENSJJAG00000022083) ENSJJAG00000012868 Mast3 (ENSJJAG00000017856) Pik3r2 (ENSJJAG00000009535) Ifi30 (ENSJJAG00000015896) Mpv17l2 (ENSJJAG00000017660) Rab3a (ENSJJAG00000018501) ENSJJAG00000010785 Iqcn (ENSJJAG00000019138) Jund (ENSJJAG00000004780) Lsm4 (ENSJJAG00000017420) ENSJJAG00000015593 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 1820 ENSNGAG00000022895 ENSNGAG00000023710 ##22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938 ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Cricetinae ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938.s ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 112 Cnep1r1 (ENSCGRG00001009199) Heatr3 (ENSCGRG00001024755) Tent4b (ENSCGRG00001023597) Adcy7 (ENSCGRG00001014504) Brd7 (ENSCGRG00001003449) Nkd1 (ENSCGRG00001011787) Snx20 (ENSCGRG00001020312) Nod2 (ENSCGRG00001011531) Cyld (ENSCGRG00001000533) ENSCGRG00001019423 ##22 ENSCGRG00001023314 Tox3 (ENSCGRG00001021816) ENSCGRG00001001946 ENSCGRG00001010471 Gm19935 (ENSCGRG00001012263) ENSCGRG00001012667 ##22 Chd9 (ENSCGRG00001016150) Rbl2 (ENSCGRG00001012793) ENSCGRG00001024361 ENSCGRG00001013457 Rpgrip1l (ENSCGRG00001020196) Fto (ENSCGRG00001013545) Irx3 (ENSCGRG00001022254) Irx5 (ENSCGRG00001019317) ENSCGRG00001021640 Irx6 (ENSCGRG00001005135) Mmp2 (ENSCGRG00001020567) Lpcat2 (ENSCGRG00001018067) Slc6a2 (ENSCGRG00001015472) Ces1a (ENSCGRG00001017007) ENSCGRG00001013949 Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000159811 ENSGT00390000014556 ENSGT00940000158492 ENSGT00390000008576 ENSGT00390000012529 ENSGT00940000158301 ENSGT00940000159096 ENSGT00950000183170.a ENSGT00440000033589.c ENSGT00530000063759.a ENSGT00940000160934 ENSGT00390000018123.a.a ENSGT00940000155938 ENSGT00940000158043 ENSGT00980000198839 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000155706 ENSGT00950000183202.a.b ENSGT00390000010125 ENSGT00520000055620.B ENSGT00390000017730 ENSGT00940000161299 ENSGT00940000159483 ENSGT00940000159909 ENSGT00940000158511 ENSGT01030000234574.A.b.a.a ENSGT00940000158960 ENSGT00940000158564.c.b ENSGT00940000154623.g.a.b ENSGT00940000154623.g.a.a ENSGT00940000158564.c.a.f.b Prairie vole DUPLICATION Prairie vole MODERN SPECIES 137 ENSMOCG00000011490 ENSMOCG00000010137 ENSMOCG00000019154 ##22 ENSMOCG00000018583 ENSMOCG00000016093 ENSMOCG00000010691 Rbl2 (ENSMOCG00000002758) Aktip (ENSMOCG00000000125) Rpgrip1l (ENSMOCG00000002757) Fto (ENSMOCG00000012365) Irx3 (ENSMOCG00000001570) Irx5 (ENSMOCG00000000963) Irx6 (ENSMOCG00000000419) Mmp2 (ENSMOCG00000000066) Lpcat2 (ENSMOCG00000010966) SLC6A2 (ENSMOCG00000016144) Ces1a (ENSMOCG00000010710) ENSMOCG00000000069 Prairie vole MODERN SPECIES 223 Cul1 (ENSMOCG00000014278) ENSMOCG00000019854 ENSMOCG00000008643 ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 1 Slc35a2 (ENSMOCG00000015110) Pqbp1 (ENSMOCG00000020123) Timm17b (ENSMOCG00000022137) Pcsk1n (ENSMOCG00000016403) Eras (ENSMOCG00000017489) Hdac6 (ENSMOCG00000022461) Gata1 (ENSMOCG00000018101) Glod5 (ENSMOCG00000018812) Suv39h1 (ENSMOCG00000013532) Was (ENSMOCG00000022215) Wdr13 (ENSMOCG00000000752) Rbm3 (ENSMOCG00000001511) Tbc1d25 (ENSMOCG00000006324) Ebp (ENSMOCG00000010008) Porcn (ENSMOCG00000012499) ENSMOCG00000008118 ##22 ENSMOCG00000000507 Slc38a5 (ENSMOCG00000015897) ENSMOCG00000015166 Lancl3 (ENSMOCG00000018888) Xk (ENSMOCG00000021048) ENSMOCG00000002347 ENSMOCG00000005328 Dynlt3 (ENSMOCG00000013937) Sytl5 (ENSMOCG00000020078) Srpx (ENSMOCG00000000503) Rpgr (ENSMOCG00000015129) Otc (ENSMOCG00000020681) Tspan7 (ENSMOCG00000021984) Mid1ip1 (ENSMOCG00000009515) ENSMOCG00000007720 Northern American deer mouse DUPLICATION Northern American deer mouse MODERN SPECIES 18 ENSPEMG00000002704 Cnep1r1 (ENSPEMG00000017702) Heatr3 (ENSPEMG00000016174) Tent4b (ENSPEMG00000029372) Adcy7 (ENSPEMG00000018675) Brd7 (ENSPEMG00000015843) Nkd1 (ENSPEMG00000028031) Snx20 (ENSPEMG00000015231) Nod2 (ENSPEMG00000016933) Cyld (ENSPEMG00000011322) Sall1 (ENSPEMG00000012331) ENSPEMG00000005035 ENSPEMG00000026839 Tox3 (ENSPEMG00000019689) Gm19935 (ENSPEMG00000026446) ENSPEMG00000028298 ##22 Chd9 (ENSPEMG00000021464) Rbl2 (ENSPEMG00000021671) Aktip (ENSPEMG00000022468) Rpgrip1l (ENSPEMG00000021815) Fto (ENSPEMG00000021137) Irx3 (ENSPEMG00000022357) Irx5 (ENSPEMG00000021761) Irx6 (ENSPEMG00000022413) Mmp2 (ENSPEMG00000023486) Lpcat2 (ENSPEMG00000024158) Slc6a2 (ENSPEMG00000021618) Ces1a (ENSPEMG00000022228) ENSPEMG00000021329 Ces1d (ENSPEMG00000023728) Ces1e (ENSPEMG00000022097) Northern American deer mouse MODERN SPECIES 475 ENSPEMG00000018218 ENSPEMG00000029015 ENSPEMG00000027995 ENSPEMG00000023915 Frmpd4 (ENSPEMG00000009073) ENSPEMG00000031423 Prps2 (ENSPEMG00000026950) Tlr7 (ENSPEMG00000000676) Tlr8 (ENSPEMG00000001415) Tmsb4x (ENSPEMG00000004099) ENSPEMG00000029647 ENSPEMG00000030086 Egfl6 (ENSPEMG00000012250) Tceanc (ENSPEMG00000025764) ENSPEMG00000013920 ENSPEMG00000030200 ##22 ENSPEMG00000013968 ENSPEMG00000014145 Rab9 (ENSPEMG00000027764) Trappc2 (ENSPEMG00000016002) Ofd1 (ENSPEMG00000017896) Gpm6b (ENSPEMG00000000655) ENSPEMG00000024383 ENSPEMG00000009181 Glra2 (ENSPEMG00000010716) ENSPEMG00000012662 Fancb (ENSPEMG00000014927) Mospd2 (ENSPEMG00000016810) Asb9 (ENSPEMG00000012020) Asb11 (ENSPEMG00000004210) Piga (ENSPEMG00000029436) Murinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Mus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Mus_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Mus_B ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00390000016851 ENSGT00940000157019 ENSGT00390000007029.j ENSGT00390000012240 ENSGT00390000007336 ENSGT00510000049316 ENSGT00390000016934 ENSGT00530000063974.a ENSGT00940000160748 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(ENSMSIG00000032076) Rab3a (ENSMSIG00000032075) Pde4c (ENSMSIG00000032074) Gm3336 (ENSMSIG00000032073) Iqcn (ENSMSIG00000032072) ENSMSIG00000032071 Pgpep1 (ENSMSIG00000032070) Steppe mouse MODERN SPECIES 2795 Arhgap33 (ENSMSIG00000005294) Proser3 (ENSMSIG00000005541) Hspb6 (ENSMSIG00000005622) Lin37 (ENSMSIG00000005641) Psenen (ENSMSIG00000005677) U2af1l4 (ENSMSIG00000005715) Igflr1 (ENSMSIG00000006148) Kmt2b (ENSMSIG00000006214) Zbtb32 (ENSMSIG00000006561) Upk1a (ENSMSIG00000006582) ENSMSIG00000006599 Etv2 (ENSMSIG00000006621) Rbm42 (ENSMSIG00000006648) Haus5 (ENSMSIG00000006715) Pmis2 (ENSMSIG00000006779) ENSMSIG00000006794 ##22 Atp4a (ENSMSIG00000006805) Tmem147 (ENSMSIG00000006914) Gapdhs (ENSMSIG00000007027) ENSMSIG00000007048 Rat DUPLICATION Rat MODERN SPECIES 7 Bst2 (ENSRNOG00000059900) Mvb12a (ENSRNOG00000017949) Tmem221 (ENSRNOG00000018167) Nxnl1 (ENSRNOG00000042658) Slc27a1 (ENSRNOG00000018170) Pgls (ENSRNOG00000018326) Niban3 (ENSRNOG00000039357) Colgalt1 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Ccdc71l (ENSRNOG00000039207) Pik3cg (ENSRNOG00000009385) Prkar2b (ENSRNOG00000009079) ENSRNOG00000063368 ##22 Hbp1 (ENSRNOG00000008927) Gpr22 (ENSRNOG00000008423) Cog5 (ENSRNOG00000056610) Dus4l (ENSRNOG00000008155) Bcap29 (ENSRNOG00000007884) Slc26a4 (ENSRNOG00000058692) Cbll1 (ENSRNOG00000007253) Slc26a3 (ENSRNOG00000006878) Dld (ENSRNOG00000006364) Lamb1 (ENSRNOG00000005678) Fam110c (ENSRNOG00000005660) Sh3yl1 (ENSRNOG00000005522) Acp1 (ENSRNOG00000005260) Alkal2 (ENSRNOG00000005154) Tmem18 (ENSRNOG00000005144) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 392 PLVAP (ENSPSMG00000025067) CCDC194 (ENSPSMG00000025073) MVB12A (ENSPSMG00000025080) TMEM221 (ENSPSMG00000025084) NXNL1 (ENSPSMG00000025092) SLC27A1 (ENSPSMG00000025104) PGLS (ENSPSMG00000025113) NIBAN3 (ENSPSMG00000025145) COLGALT1 (ENSPSMG00000025160) ENSPSMG00000025267 MAP1S (ENSPSMG00000025300) FCHO1 (ENSPSMG00000025368) B3GNT3 (ENSPSMG00000025381) INSL3 (ENSPSMG00000025384) JAK3 (ENSPSMG00000025390) RPL18A (ENSPSMG00000025399) ##22 SLC5A5 (ENSPSMG00000025406) CCDC124 (ENSPSMG00000025412) KCNN1 (ENSPSMG00000025418) ARRDC2 (ENSPSMG00000025428) IL12RB1 (ENSPSMG00000025429) MAST3 (ENSPSMG00000025443) PIK3R2 (ENSPSMG00000025461) IFI30 (ENSPSMG00000025464) MPV17L2 (ENSPSMG00000025466) RAB3A (ENSPSMG00000025469) PDE4C (ENSPSMG00000025493) IQCN (ENSPSMG00000000071) JUND (ENSPSMG00000000089) LSM4 (ENSPSMG00000000120) PGPEP1 (ENSPSMG00000000175) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 9 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Mas night monkey MODERN SPECIES 1025 ENSANAG00000018049 GALNT13 (ENSANAG00000034184) ENSANAG00000024363 ##22 ENSANAG00000032096 KCNJ3 (ENSANAG00000024065) NR4A2 (ENSANAG00000033869) GPD2 (ENSANAG00000029065) ENSANAG00000024064 GALNT5 (ENSANAG00000031318) ERMN (ENSANAG00000024435) CYTIP (ENSANAG00000021557) ACVR1C (ENSANAG00000020309) ENSANAG00000036181 ACVR1 (ENSANAG00000037191) UPP2 (ENSANAG00000014254) CCDC148 (ENSANAG00000030337) PKP4 (ENSANAG00000030283) ENSANAG00000027356 Cebidae ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000154574.d ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Marmoset MODERN SPECIES 21 CD163L1 (ENSCJAG00000005091) ENSCJAG00000052734 DDX11 (ENSCJAG00000005153) ENSCJAG00000054104 ENSCJAG00000065230 ENSCJAG00000081130 ENSCJAG00000005234 ENSCJAG00000072529 CD163 (ENSCJAG00000005332) ENSCJAG00000079699 ENSCJAG00000074967 APOBEC1 (ENSCJAG00000005398) ENSCJAG00000086680 GDF3 (ENSCJAG00000005406) ENSCJAG00000072636 ENSCJAG00000071581 ##22 ENSCJAG00000018999 ENSCJAG00000043823 ENSCJAG00000081220 ENSCJAG00000018988 FOXJ2 (ENSCJAG00000018955) C3AR1 (ENSCJAG00000083855) NECAP1 (ENSCJAG00000018934) CLEC4A (ENSCJAG00000018929) CLEC6A (ENSCJAG00000037433) CLEC4D (ENSCJAG00000080376) CLEC4E (ENSCJAG00000018899) AICDA (ENSCJAG00000018856) ENSCJAG00000077911 MFAP5 (ENSCJAG00000018846) RIMKLB (ENSCJAG00000018810) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00530000063686.a.b ENSGT00530000063686.a.a ENSGT00940000157201 ENSGT00390000012204 ENSGT00940000154533.b.d ENSGT00940000154714.v ENSGT00950000182837.b.b ENSGT00940000157055 ENSGT00620000089259 ENSGT00940000155515.a.b.b ENSGT00930000150980.a ENSGT00390000009987 ENSGT00950000183077.a.a.a.a.b ENSGT00390000010523.c.b ENSGT00940000158904 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT01080000257365.b.a.a.b.a ENSGT00950000183038.a.b.b.b ENSGT00390000001718.i ENSGT00940000154966.l ENSGT00940000159241 ENSGT01090000260082.d.a.a.a.b ENSGT00530000063734.a ENSGT00940000158842 ENSGT00940000154191.i.a.s ENSGT00940000160160 ENSGT00940000161094 ENSGT00940000153988.A ENSGT00940000155773.b ENSGT00940000165460 ENSGT00940000155655.B Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 46 RBM43 (ENSSBOG00000022371) NMI (ENSSBOG00000035067) TNFAIP6 (ENSSBOG00000034644) RIF1 (ENSSBOG00000029530) NEB (ENSSBOG00000031622) ARL5A (ENSSBOG00000034323) CACNB4 (ENSSBOG00000025206) ENSSBOG00000023639 ENSSBOG00000027242 ENSSBOG00000023807 FMNL2 (ENSSBOG00000027176) PRPF40A (ENSSBOG00000015435) ARL6IP6 (ENSSBOG00000029584) RPRM (ENSSBOG00000009917) GALNT13 (ENSSBOG00000024917) ENSSBOG00000030750 ##22 KCNJ3 (ENSSBOG00000023474) NR4A2 (ENSSBOG00000021402) ENSSBOG00000027281 ENSSBOG00000023257 GALNT5 (ENSSBOG00000020422) ERMN (ENSSBOG00000031955) ENSSBOG00000028587 CYTIP (ENSSBOG00000025520) ENSSBOG00000035700 ACVR1C (ENSSBOG00000030313) ACVR1 (ENSSBOG00000025226) 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(ENSPTRG00000024316) ZBTB47 (ENSPTRG00000014798) NKTR (ENSPTRG00000014797) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00510000047895 ENSGT00940000155018.a.b.b ENSGT00940000164233 ENSGT00940000165490 ENSGT00550000074847 ENSGT00390000006979.b ENSGT00510000049662 ENSGT00910000147805 ENSGT00940000155490 ENSGT00940000154730.a ENSGT00390000006240 ENSGT00910000147250 ENSGT00390000011802 ENSGT00390000006255.a ENSGT00390000014092 ENSGT00390000015797.d.n ##22 ENSGT00390000017610 ENSGT00490000044274 ENSGT00390000007473.g ENSGT01030000234522.C.b.e.b.b ENSGT00390000001278.b.a.a ENSGT00940000154206.a ENSGT00390000018470 ENSGT00940000154782.i ENSGT00940000158622 ENSGT01030000234532.A.a.b ENSGT00910000144260 ENSGT00390000005052.f ENSGT00390000001830.i.a ENSGT00710000106769.y ENSGT00940000158774 Gibbon MODERN SPECIES 14 SERPINA11 (ENSNLEG00000017281) SERPINA1 (ENSNLEG00000017269) SERPINA6 (ENSNLEG00000017267) SERPINA10 (ENSNLEG00000017265) PPP4R4 (ENSNLEG00000017253) IFI27L2 (ENSNLEG00000017252) IFI27L1 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Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000001296 ENSGT00940000153104.e.a.a.b ENSGT00940000163095 ENSGT00910000147018 ENSGT00940000162289 ENSGT00940000162801 ENSGT00940000163766 ENSGT00940000162985 ENSGT00940000165221 ENSGT00900000141186 ENSGT00390000012832 ENSGT00390000012495 ENSGT00390000016277.a ENSGT00940000157537 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000155365.a.a ENSGT00940000160695 ENSGT00420000029769.a ENSGT00940000163819 ENSGT00940000163753 ENSGT00940000153709.B ENSGT01020000230359.E ENSGT00940000154276.hb.a ENSGT00390000000596 ENSGT00530000063629.b ENSGT00940000156360 ENSGT00940000160089 ENSGT00940000158548 ENSGT00940000160407 ENSGT00940000159338 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000156463 ENSGT00390000001296 ENSGT00940000153104.e.a.a.b ENSGT00940000163095 ENSGT00910000147018 ENSGT00940000162289 ENSGT00940000162801 ENSGT00940000163766 ENSGT00940000162985 ENSGT00940000165221 ENSGT00900000141186 ENSGT00390000012832 ENSGT00390000012495 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ENSGT00390000001296 ENSGT00940000153104.e.a.a.b ENSGT00940000163095 ENSGT00940000162289 ENSGT00940000162801 ENSGT00940000162985 ENSGT00940000165221 ENSGT00900000141186 ENSGT00390000012832 ENSGT00390000012495 ENSGT00390000016277.a ENSGT00940000157537 ENSGT00390000015797.d ##22 ENSGT00940000155365.a.a ENSGT00940000160695 ENSGT00420000029769.a ENSGT00940000163819 ENSGT00940000163753 ENSGT01020000230359.E ENSGT00940000153709.B ENSGT00940000154276.hb.a ENSGT00390000000596 ENSGT00910000147587 ENSGT00530000063629.b ENSGT00940000156360 ENSGT00940000160089 ENSGT00940000158548 ENSGT00940000160407 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Crab-eating macaque MODERN SPECIES 13 ENSMFAG00000064487 ENSMFAG00000054353 ENSMFAG00000063826 ENSMFAG00000062329 ENSMFAG00000047283 ENSMFAG00000065655 ENSMFAG00000057761 ENSMFAG00000048609 ENSMFAG00000058999 PAPOLB (ENSMFAG00000031074) ENSMFAG00000000208 AP5Z1 (ENSMFAG00000032526) ENSMFAG00000051721 FOXK1 (ENSMFAG00000041125) SDK1 (ENSMFAG00000032698) ENSMFAG00000064451 ##22 ENSMFAG00000063614 ENSMFAG00000059642 CARD11 (ENSMFAG00000036800) ENSMFAG00000054681 GNA12 (ENSMFAG00000046194) AMZ1 (ENSMFAG00000045552) BRAT1 (ENSMFAG00000000395) IQCE (ENSMFAG00000034441) ENSMFAG00000049292 LFNG (ENSMFAG00000039730) GRIFIN (ENSMFAG00000032493) ENSMFAG00000063448 ENSMFAG00000065612 EIF3B (ENSMFAG00000046100) SNX8 (ENSMFAG00000029647) Pig-tailed macaque DUPLICATION Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 563 TGM4 (ENSMNEG00000043309) TMEM42 (ENSMNEG00000018990) KIF15 (ENSMNEG00000037057) KIAA1143 (ENSMNEG00000042776) ZNF501 (ENSMNEG00000010147) ZNF502 (ENSMNEG00000042158) ENSMNEG00000030508 ZNF35 (ENSMNEG00000032821) ZNF197 (ENSMNEG00000041364) ZKSCAN7 (ENSMNEG00000029823) ZNF852 (ENSMNEG00000036943) ZNF445 (ENSMNEG00000028149) TCAIM (ENSMNEG00000043134) TOPAZ1 (ENSMNEG00000031144) ABHD5 (ENSMNEG00000044413) ENSMNEG00000040974 ##22 ANO10 (ENSMNEG00000042929) SNRK (ENSMNEG00000041373) POMGNT2 (ENSMNEG00000007091) GASK1A (ENSMNEG00000009108) KRBOX1 (ENSMNEG00000008513) ZNF662 (ENSMNEG00000028299) ACKR2 (ENSMNEG00000008943) CYP8B1 (ENSMNEG00000039233) HIGD1A (ENSMNEG00000043131) CCDC13 (ENSMNEG00000038681) ENSMNEG00000015697 HHATL (ENSMNEG00000041408) KLHL40 (ENSMNEG00000031823) ZBTB47 (ENSMNEG00000027370) NKTR (ENSMNEG00000041077) Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 393 IFI27L2 (ENSMNEG00000032778) ENSMNEG00000029506 IFI27L1 (ENSMNEG00000029364) DDX24 (ENSMNEG00000043984) OTUB2 (ENSMNEG00000041748) CCDC197 (ENSMNEG00000045081) ASB2 (ENSMNEG00000042223) FAM181A (ENSMNEG00000029720) ENSMNEG00000019080 PRIMA1 (ENSMNEG00000031734) ENSMNEG00000044247 UNC79 (ENSMNEG00000030781) ENSMNEG00000029272 BTBD7 (ENSMNEG00000039208) UBR7 (ENSMNEG00000041654) ENSMNEG00000039800 ##22 GON7 (ENSMNEG00000021848) LYSET (ENSMNEG00000005190) MOAP1 (ENSMNEG00000020717) ITPK1 (ENSMNEG00000032279) CHGA (ENSMNEG00000043753) GOLGA5 (ENSMNEG00000045156) LGMN (ENSMNEG00000039639) RIN3 (ENSMNEG00000043726) SLC24A4 (ENSMNEG00000042792) CPSF2 (ENSMNEG00000031584) ENSMNEG00000039060 ENSMNEG00000036179 ENSMNEG00000020081 TRIP11 (ENSMNEG00000040765) FBLN5 (ENSMNEG00000036802) Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a DUPLICATION Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Dog MODERN SPECIES 12 NRADD (ENSCAFG00845010072) SETD2 (ENSCAFG00845009790) KIF9 (ENSCAFG00845009471) KLHL18 (ENSCAFG00845009371) PTPN23 (ENSCAFG00845008987) SCAP (ENSCAFG00845008845) ELP6 (ENSCAFG00845008773) ENSCAFG00845008748 CSPG5 (ENSCAFG00845008635) SMARCC1 (ENSCAFG00845008451) DHX30 (ENSCAFG00845008323) MAP4 (ENSCAFG00845007720) CDC25A (ENSCAFG00845007301) CAMP (ENSCAFG00845007235) NME6 (ENSCAFG00845007158) ENSCAFG00845006949 ##22 SPINK8 (ENSCAFG00845006805) FBXW12 (ENSCAFG00845006725) PLXNB1 (ENSCAFG00845006452) CCDC51 (ENSCAFG00845006402) TMA7 (ENSCAFG00845006383) ATRIP (ENSCAFG00845006308) TREX1 (ENSCAFG00845006258) SHISA5 (ENSCAFG00845006188) PFKFB4 (ENSCAFG00845006054) UQCRC1 (ENSCAFG00845030975) TMEM89 (ENSCAFG00845030964) SLC26A6 (ENSCAFG00845030951) CELSR3 (ENSCAFG00845030576) NCKIPSD (ENSCAFG00845030141) IP6K2 (ENSCAFG00845030115) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 leopard MODERN SPECIES 5 ENSPPRG00000003843 SLC7A14 (ENSPPRG00000004129) CLDN11 (ENSPPRG00000004299) SKIL (ENSPPRG00000004486) PRKCI (ENSPPRG00000005041) PHC3 (ENSPPRG00000005562) GPR160 (ENSPPRG00000021415) SEC62 (ENSPPRG00000005909) SAMD7 (ENSPPRG00000006215) LRRC31 (ENSPPRG00000006481) LRRIQ4 (ENSPPRG00000006659) LRRC34 (ENSPPRG00000007013) MYNN (ENSPPRG00000007156) ACTRT3 (ENSPPRG00000007231) MECOM (ENSPPRG00000010185) ENSPPRG00000010474 ##22 GOLIM4 (ENSPPRG00000011640) ENSPPRG00000011777 SERPINI1 (ENSPPRG00000012234) PDCD10 (ENSPPRG00000012947) WDR49 (ENSPPRG00000013148) SERPINI2 (ENSPPRG00000013570) ZBBX (ENSPPRG00000014159) ENSPPRG00000014837 BCHE (ENSPPRG00000015130) ENSPPRG00000015437 SLITRK3 (ENSPPRG00000021687) SI (ENSPPRG00000021215) ENSPPRG00000023810 OTOL1 (ENSPPRG00000023542) SPTSSB (ENSPPRG00000021831) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Arabian camel MODERN SPECIES 32 KCNK13 (ENSCDRG00005004223) TDP1 (ENSCDRG00005004174) EFCAB11 (ENSCDRG00005004092) FOXN3 (ENSCDRG00005004025) ENSCDRG00005003999 TTC8 (ENSCDRG00005003829) EML5 (ENSCDRG00005003568) ZC3H14 (ENSCDRG00005003316) PTPN21 (ENSCDRG00005003261) SPATA7 (ENSCDRG00005003225) KCNK10 (ENSCDRG00005003174) GPR65 (ENSCDRG00005003153) GALC (ENSCDRG00005003083) ENSCDRG00005003064 FLRT2 (ENSCDRG00005003058) ENSCDRG00005003051 ##22 SEL1L (ENSCDRG00005003025) STON2 (ENSCDRG00005003009) ENSCDRG00005002988 GTF2A1 (ENSCDRG00005002959) TSHR (ENSCDRG00005002889) CEP128 (ENSCDRG00005002818) ENSCDRG00005002804 NRXN3 (ENSCDRG00005002200) ADCK1 (ENSCDRG00005002093) SNW1 (ENSCDRG00005002070) ENSCDRG00005002061 ALKBH1 (ENSCDRG00005002043) SPTLC2 (ENSCDRG00005002026) ENSCDRG00005002017 ENSCDRG00005002010 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 7 CEP126 (ENSPCTG00005008482) ANGPTL5 (ENSPCTG00005008552) TRPC6 (ENSPCTG00005008688) ENSPCTG00005009589 PGR (ENSPCTG00005009652) ARHGAP42 (ENSPCTG00005009957) CNTN5 (ENSPCTG00005010190) JRKL (ENSPCTG00005011023) CCDC82 (ENSPCTG00005011035) MAML2 (ENSPCTG00005011167) MTMR2 (ENSPCTG00005011244) CEP57 (ENSPCTG00005011292) FAM76B (ENSPCTG00005011532) SESN3 (ENSPCTG00005011709) ENSPCTG00005011830 ENSPCTG00005011881 ##22 ENDOD1 (ENSPCTG00005011905) ENSPCTG00005011937 ENSPCTG00005012004 ENSPCTG00005012039 CWC15 (ENSPCTG00005012079) AMOTL1 (ENSPCTG00005012114) PIWIL4 (ENSPCTG00005012159) FUT4 (ENSPCTG00005012401) C11orf97 (ENSPCTG00005012423) ANKRD49 (ENSPCTG00005012473) MRE11 (ENSPCTG00005004248) ENSPCTG00005004432 GPR83 (ENSPCTG00005004449) IZUMO1R (ENSPCTG00005004480) PANX1 (ENSPCTG00005004492) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a ##22 Caprinae DUPLICATION Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a.a ##22 Goat MODERN SPECIES 26 RPS23 (ENSCHIG00000014944) ATG10 (ENSCHIG00000023237) ENSCHIG00000013647 ENSCHIG00000020381 ACOT12 (ENSCHIG00000018595) ZCCHC9 (ENSCHIG00000024514) CKMT2 (ENSCHIG00000018578) RASGRF2 (ENSCHIG00000027194) MSH3 (ENSCHIG00000026585) ENSCHIG00000016160 ANKRD34B (ENSCHIG00000009844) FAM151B (ENSCHIG00000009422) ZFYVE16 (ENSCHIG00000022133) FBLL1 (ENSCHIG00000005751) RARS1 (ENSCHIG00000021126) ENSCHIG00000023409 ##22 WWC1 (ENSCHIG00000012879) ENSCHIG00000018606 TENM2 (ENSCHIG00000025474) ENSCHIG00000027115 MAT2B (ENSCHIG00000027101) HMMR (ENSCHIG00000026654) ENSCHIG00000026565 CCNG1 (ENSCHIG00000004699) ENSCHIG00000013606 GABRG2 (ENSCHIG00000022523) GABRA1 (ENSCHIG00000019387) GABRA6 (ENSCHIG00000021600) GABRB2 (ENSCHIG00000024858) ATP10B (ENSCHIG00000024331) ENSCHIG00000027118 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 21 ENSOARG00020021132 TMEM167A (ENSOARG00020021065) RPS23 (ENSOARG00020020958) ENSOARG00020020926 ATG10 (ENSOARG00020020709) SSBP2 (ENSOARG00020017360) ACOT12 (ENSOARG00020017094) ENSOARG00020017025 CKMT2 (ENSOARG00020016978) RASGRF2 (ENSOARG00020016662) MSH3 (ENSOARG00020016326) DHFR (ENSOARG00020016220) ANKRD34B (ENSOARG00020016203) ZFYVE16 (ENSOARG00020015887) FBLL1 (ENSOARG00020015848) ENSOARG00020015828 ##22 RARS1 (ENSOARG00020015698) WWC1 (ENSOARG00020015297) TENM2 (ENSOARG00020013483) ENSOARG00020013302 ENSOARG00020013238 ENSOARG00020013170 MAT2B (ENSOARG00020013000) ENSOARG00020012972 HMMR (ENSOARG00020012695) NUDCD2 (ENSOARG00020012608) CCNG1 (ENSOARG00020012387) ENSOARG00020012340 GABRG2 (ENSOARG00020011835) GABRA1 (ENSOARG00020011698) ENSOARG00020011653 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.a.b ##22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 7 C9 (ENSOARG00020008908) DAB2 (ENSOARG00020008646) ENSOARG00020008514 PTGER4 (ENSOARG00020008466) TTC33 (ENSOARG00020008406) PRKAA1 (ENSOARG00020008087) RPL37 (ENSOARG00020007993) ENSOARG00020007543 C6 (ENSOARG00020007044) PLCXD3 (ENSOARG00020006984) OXCT1 (ENSOARG00020006708) ENSOARG00020006604 FBXO4 (ENSOARG00020006423) GHR (ENSOARG00020006196) CCDC152 (ENSOARG00020006118) ENSOARG00020006096 ##22 ZNF131 (ENSOARG00020006056) NIM1K (ENSOARG00020006035) HMGCS1 (ENSOARG00020005999) CCL28 (ENSOARG00020005973) TMEM267 (ENSOARG00020005959) C5orf34 (ENSOARG00020005897) ENSOARG00020005767 NNT (ENSOARG00020005629) ENSOARG00020005588 FGF10 (ENSOARG00020005559) MRPS30 (ENSOARG00020005537) HCN1 (ENSOARG00020005457) PARP8 (ENSOARG00020004290) ISL1 (ENSOARG00020004124) PELO (ENSOARG00020004089) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 64 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a Arabian camel MODERN SPECIES 14 CCDC194 (ENSCDRG00005015352) ENSCDRG00005015336 MVB12A (ENSCDRG00005015302) TMEM221 (ENSCDRG00005015271) NXNL1 (ENSCDRG00005015249) SLC27A1 (ENSCDRG00005015186) PGLS (ENSCDRG00005015148) NIBAN3 (ENSCDRG00005014472) COLGALT1 (ENSCDRG00005014401) UNC13A (ENSCDRG00005013982) MAP1S (ENSCDRG00005013868) FCHO1 (ENSCDRG00005013455) B3GNT3 (ENSCDRG00005013389) INSL3 (ENSCDRG00005013353) JAK3 (ENSCDRG00005013213) ENSCDRG00005013110 ##22 SLC5A5 (ENSCDRG00005012971) CCDC124 (ENSCDRG00005012930) KCNN1 (ENSCDRG00005012887) ARRDC2 (ENSCDRG00005012675) IL12RB1 (ENSCDRG00005012582) MAST3 (ENSCDRG00005012259) PIK3R2 (ENSCDRG00005011973) IFI30 (ENSCDRG00005011860) MPV17L2 (ENSCDRG00005011813) RAB3A (ENSCDRG00005011718) PDE4C (ENSCDRG00005011492) ENSCDRG00005011454 ENSCDRG00005011380 LSM4 (ENSCDRG00005011254) PGPEP1 (ENSCDRG00005011120) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 1 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT01010000228911 ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00940000166941 Blue whale MODERN SPECIES 14 ENSBMSG00010005594 ENSBMSG00010005583 MVB12A (ENSBMSG00010005572) TMEM221 (ENSBMSG00010005560) NXNL1 (ENSBMSG00010005552) SLC27A1 (ENSBMSG00010005539) PGLS (ENSBMSG00010005528) NIBAN3 (ENSBMSG00010005465) COLGALT1 (ENSBMSG00010005433) UNC13A (ENSBMSG00010005106) ENSBMSG00010005014 MAP1S (ENSBMSG00010004999) FCHO1 (ENSBMSG00010004963) INSL3 (ENSBMSG00010004940) JAK3 (ENSBMSG00010004926) ENSBMSG00010004907 ##22 SLC5A5 (ENSBMSG00010004894) CCDC124 (ENSBMSG00010004886) KCNN1 (ENSBMSG00010004877) ARRDC2 (ENSBMSG00010004858) IL12RB1 (ENSBMSG00010004817) MAST3 (ENSBMSG00010004789) PIK3R2 (ENSBMSG00010004761) ENSBMSG00010004729 MPV17L2 (ENSBMSG00010004722) RAB3A (ENSBMSG00010004711) PDE4C (ENSBMSG00010004659) ENSBMSG00010004630 ENSBMSG00010004618 JUND (ENSBMSG00010004609) LSM4 (ENSBMSG00010004583) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 59 FCHO1 (ENSPCTG00005021780) INSL3 (ENSPCTG00005021747) JAK3 (ENSPCTG00005021717) RPL18A (ENSPCTG00005021691) ##22 SLC5A5 (ENSPCTG00005021637) CCDC124 (ENSPCTG00005021626) Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 32 ENSCHYG00000000725 MVB12A (ENSCHYG00000000695) TMEM221 (ENSCHYG00000000674) NXNL1 (ENSCHYG00000000658) SLC27A1 (ENSCHYG00000000634) PGLS (ENSCHYG00000000614) NIBAN3 (ENSCHYG00000000590) COLGALT1 (ENSCHYG00000000524) ENSCHYG00000000495 ENSCHYG00000000484 MAP1S (ENSCHYG00000000458) FCHO1 (ENSCHYG00000000370) B3GNT3 (ENSCHYG00000000342) INSL3 (ENSCHYG00000022136) JAK3 (ENSCHYG00000022013) ENSCHYG00000021883 ##22 SLC5A5 (ENSCHYG00000021720) CCDC124 (ENSCHYG00000021668) KCNN1 (ENSCHYG00000021533) ARRDC2 (ENSCHYG00000021311) IL12RB1 (ENSCHYG00000021152) MAST3 (ENSCHYG00000020312) PIK3R2 (ENSCHYG00000020125) IFI30 (ENSCHYG00000019975) MPV17L2 (ENSCHYG00000019897) RAB3A (ENSCHYG00000019752) PDE4C (ENSCHYG00000019445) ENSCHYG00000019351 JUND (ENSCHYG00000019284) LSM4 (ENSCHYG00000019053) PGPEP1 (ENSCHYG00000018924) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 Goat MODERN SPECIES 26 ENSCHIG00000015033 ENSCHIG00000015462 MVB12A (ENSCHIG00000015199) TMEM221 (ENSCHIG00000016338) NXNL1 (ENSCHIG00000027093) SLC27A1 (ENSCHIG00000027144) PGLS (ENSCHIG00000024638) NIBAN3 (ENSCHIG00000023840) COLGALT1 (ENSCHIG00000020013) UNC13A (ENSCHIG00000010742) MAP1S (ENSCHIG00000019831) FCHO1 (ENSCHIG00000018069) B3GNT3 (ENSCHIG00000025864) INSL3 (ENSCHIG00000020939) JAK3 (ENSCHIG00000009142) ENSCHIG00000025646 ##22 SLC5A5 (ENSCHIG00000020647) CCDC124 (ENSCHIG00000018622) KCNN1 (ENSCHIG00000014377) ARRDC2 (ENSCHIG00000007606) IL12RB1 (ENSCHIG00000027177) MAST3 (ENSCHIG00000026065) PIK3R2 (ENSCHIG00000005705) IFI30 (ENSCHIG00000005544) ENSCHIG00000010984 RAB3A (ENSCHIG00000007327) MPV17L2 (ENSCHIG00000025758) PDE4C (ENSCHIG00000020852) ENSCHIG00000008980 LSM4 (ENSCHIG00000010928) PGPEP1 (ENSCHIG00000026514) Siberian musk deer MODERN SPECIES 1231 CCDC194 (ENSMMSG00000017079) ENSMMSG00000017103 ENSMMSG00000017120 MVB12A (ENSMMSG00000017136) TMEM221 (ENSMMSG00000017212) NXNL1 (ENSMMSG00000017240) SLC27A1 (ENSMMSG00000017266) NIBAN3 (ENSMMSG00000017343) COLGALT1 (ENSMMSG00000017887) UNC13A (ENSMMSG00000018091) MAP1S (ENSMMSG00000019879) FCHO1 (ENSMMSG00000019925) B3GNT3 (ENSMMSG00000020034) INSL3 (ENSMMSG00000020048) JAK3 (ENSMMSG00000020085) RPL18A (ENSMMSG00000020480) ##22 SLC5A5 (ENSMMSG00000020567) CCDC124 (ENSMMSG00000020650) KCNN1 (ENSMMSG00000020676) ARRDC2 (ENSMMSG00000020714) IL12RB1 (ENSMMSG00000020813) MAST3 (ENSMMSG00000020929) PIK3R2 (ENSMMSG00000021193) IFI30 (ENSMMSG00000021246) MPV17L2 (ENSMMSG00000021294) RAB3A (ENSMMSG00000021318) PDE4C (ENSMMSG00000021382) ENSMMSG00000021641 ENSMMSG00000021650 JUND (ENSMMSG00000021662) LSM4 (ENSMMSG00000021677) Suina ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000154929.B ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Pig MODERN SPECIES 10 CCDC194 (ENSSSCG00000041467) BST2 (ENSSSCG00000033453) MVB12A (ENSSSCG00000036568) TMEM221 (ENSSSCG00000059815) NXNL1 (ENSSSCG00000040328) SLC27A1 (ENSSSCG00000013879) PGLS (ENSSSCG00000013878) NIBAN3 (ENSSSCG00000013883) COLGALT1 (ENSSSCG00000053735) ENSSSCG00000013880 MAP1S (ENSSSCG00000013884) FCHO1 (ENSSSCG00000013885) B3GNT3 (ENSSSCG00000013886) INSL3 (ENSSSCG00000013887) JAK3 (ENSSSCG00000013888) ENSSSCG00000013889 ##22 SLC5A5 (ENSSSCG00000013890) CCDC124 (ENSSSCG00000013891) KCNN1 (ENSSSCG00000013892) ARRDC2 (ENSSSCG00000013893) IL12RB1 (ENSSSCG00000013894) MAST3 (ENSSSCG00000013895) 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ENSCWAG00000018273 JUND (ENSCWAG00000018303) LSM4 (ENSCWAG00000018311) PGPEP1 (ENSCWAG00000018354) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 Carnivora ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b 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SPECIES 17 ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221.b ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT01030000234883 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 Cat MODERN SPECIES 1 BST2 (ENSFCAG00000001009) MVB12A (ENSFCAG00000027607) TMEM221 (ENSFCAG00000007508) NXNL1 (ENSFCAG00000025044) SLC27A1 (ENSFCAG00000007509) PGLS (ENSFCAG00000030031) NIBAN3 (ENSFCAG00000007511) COLGALT1 (ENSFCAG00000007512) UNC13A (ENSFCAG00000007513) ENSFCAG00000033175 ENSFCAG00000050012 FCHO1 (ENSFCAG00000007515) 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ENSGT00940000157166 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 Tiger MODERN SPECIES 281 BABAM1 (ENSPTIG00000010797) ANKLE1 (ENSPTIG00000011082) ABHD8 (ENSPTIG00000011380) MRPL34 (ENSPTIG00000011413) DDA1 (ENSPTIG00000011651) ENSPTIG00000011806 ENSPTIG00000012457 MVB12A (ENSPTIG00000012785) NXNL1 (ENSPTIG00000012900) ENSPTIG00000013221 PGLS (ENSPTIG00000013389) NIBAN3 (ENSPTIG00000013851) COLGALT1 (ENSPTIG00000015423) UNC13A (ENSPTIG00000016142) FCHO1 (ENSPTIG00000018897) RPL18A (ENSPTIG00000020020) ##22 SLC5A5 (ENSPTIG00000020180) CCDC124 (ENSPTIG00000020559) KCNN1 (ENSPTIG00000020664) ARRDC2 (ENSPTIG00000020844) ENSPTIG00000021064 MAST3 (ENSPTIG00000021248) ENSPTIG00000002114 IFI30 (ENSPTIG00000003466) MPV17L2 (ENSPTIG00000003892) RAB3A (ENSPTIG00000004193) PDE4C (ENSPTIG00000005389) LSM4 (ENSPTIG00000006306) PGPEP1 (ENSPTIG00000006509) LRRC25 (ENSPTIG00000006894) SSBP4 (ENSPTIG00000007035) Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221.b ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d.q.b ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000174538 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 leopard MODERN SPECIES 68 PLVAP (ENSPPRG00000008926) CCDC194 (ENSPPRG00000008659) ENSPPRG00000008186 MVB12A (ENSPPRG00000007253) TMEM221 (ENSPPRG00000006724) NXNL1 (ENSPPRG00000006589) SLC27A1 (ENSPPRG00000006311) PGLS (ENSPPRG00000005338) NIBAN3 (ENSPPRG00000004789) COLGALT1 (ENSPPRG00000001516) UNC13A (ENSPPRG00000000701) FCHO1 (ENSPPRG00000010732) MAP1S (ENSPPRG00000005989) B3GNT3 (ENSPPRG00000004828) INSL3 (ENSPPRG00000004009) ENSPPRG00000000126 ##22 SLC5A5 (ENSPPRG00000023264) CCDC124 (ENSPPRG00000021900) KCNN1 (ENSPPRG00000018067) ARRDC2 (ENSPPRG00000015630) IL12RB1 (ENSPPRG00000013438) MAST3 (ENSPPRG00000009333) ENSPPRG00000017899 PIK3R2 (ENSPPRG00000006838) IFI30 (ENSPPRG00000005435) MPV17L2 (ENSPPRG00000005164) RAB3A (ENSPPRG00000004866) PDE4C (ENSPPRG00000004111) JUND (ENSPPRG00000017555) LSM4 (ENSPPRG00000018264) PGPEP1 (ENSPPRG00000016192) lion MODERN SPECIES 2 ENSPLOG00000002783 MVB12A (ENSPLOG00000002816) TMEM221 (ENSPLOG00000002852) NXNL1 (ENSPLOG00000002877) SLC27A1 (ENSPLOG00000002920) PGLS (ENSPLOG00000002965) NIBAN3 (ENSPLOG00000003045) COLGALT1 (ENSPLOG00000003136) UNC13A (ENSPLOG00000003435) ENSPLOG00000003789 ENSPLOG00000003803 FCHO1 (ENSPLOG00000003843) B3GNT3 (ENSPLOG00000003897) INSL3 (ENSPLOG00000003910) JAK3 (ENSPLOG00000003939) ENSPLOG00000003991 ##22 SLC5A5 (ENSPLOG00000004018) CCDC124 (ENSPLOG00000004042) KCNN1 (ENSPLOG00000004052) ARRDC2 (ENSPLOG00000004086) IL12RB1 (ENSPLOG00000004107) MAST3 (ENSPLOG00000004132) PIK3R2 (ENSPLOG00000004171) IFI30 (ENSPLOG00000004199) MPV17L2 (ENSPLOG00000000018) RAB3A (ENSPLOG00000000031) PDE4C (ENSPLOG00000000047) ENSPLOG00000000074 JUND (ENSPLOG00000000080) LSM4 (ENSPLOG00000000089) PGPEP1 (ENSPLOG00000000108) Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 763 ENSPCTG00005015873 ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 24 ENSGT00390000017462 ENSGT00940000158865 ENSGT00390000005254.i.a.a.a.a ENSGT00390000005254.i.a.a.b ENSGT00940000162106 ENSGT00940000156804 ENSGT00940000161231.g ENSGT00940000156814 ENSGT00940000158747 ENSGT00390000009130.a.a.b.a ENSGT00390000011383 ENSGT00390000014416 ENSGT00940000159987 ENSGT00390000010075 ENSGT00510000049326.b.b ENSGT00390000015797.d.r ##22 ENSGT00940000154668 ENSGT00940000160020 ENSGT00390000006096.a.b ENSGT00530000063923.a ENSGT00390000003050 ENSGT00500000044987 ENSGT00940000153432.B ENSGT00390000004624.a.a ENSGT00940000158907 ENSGT00390000001442 ENSGT00940000158207 ENSGT00940000158944 ENSGT00950000183129.b.a ENSGT00940000153731.a.a ENSGT00390000016326 Goat MODERN SPECIES 12 TTC33 (ENSCHIG00000020642) PRKAA1 (ENSCHIG00000017495) RPL37 (ENSCHIG00000014444) CARD6 (ENSCHIG00000020994) C7 (ENSCHIG00000016536) ENSCHIG00000012521 ENSCHIG00000002172 C6 (ENSCHIG00000021210) PLCXD3 (ENSCHIG00000016815) ENSCHIG00000012124 RIMOC1 (ENSCHIG00000000538) FBXO4 (ENSCHIG00000021750) GHR (ENSCHIG00000018928) CCDC152 (ENSCHIG00000011450) ENSCHIG00000006291 ENSCHIG00000023711 ##22 ENSCHIG00000020006 NIM1K (ENSCHIG00000017425) HMGCS1 (ENSCHIG00000015096) CCL28 (ENSCHIG00000012602) TMEM267 (ENSCHIG00000007411) ENSCHIG00000008597 PAIP1 (ENSCHIG00000011111) NNT (ENSCHIG00000021958) FGF10 (ENSCHIG00000012683) MRPS30 (ENSCHIG00000018591) HCN1 (ENSCHIG00000024729) ENSCHIG00000009285 ENSCHIG00000017939 EMB (ENSCHIG00000012020) PARP8 (ENSCHIG00000017274) Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 American bison MODERN SPECIES 2747 GHR (ENSBBBG00000014212) CCDC152 (ENSBBBG00000014253) ENSBBBG00000014273 ENSBBBG00000014278 ##22 ENSBBBG00000003244 ZNF131 (ENSBBBG00000003267) NIM1K (ENSBBBG00000001415) HMGCS1 (ENSBBBG00000014374) CCL28 (ENSBBBG00000014385) TMEM267 (ENSBBBG00000003302) C5orf34 (ENSBBBG00000003312) ENSBBBG00000003349 NNT (ENSBBBG00000014553) Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.a ##22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.a ##22 Cow MODERN SPECIES 1 SYNDIG1L (ENSBTAG00000052950) VRTN (ENSBTAG00000005774) ABCD4 (ENSBTAG00000014633) VSX2 (ENSBTAG00000014632) LIN52 (ENSBTAG00000030557) ALDH6A1 (ENSBTAG00000018469) ENSBTAG00000053938 BBOF1 (ENSBTAG00000018467) ENTPD5 (ENSBTAG00000020334) COQ6 (ENSBTAG00000020331) FAM161B (ENSBTAG00000020329) ZNF410 (ENSBTAG00000020327) PTGR2 (ENSBTAG00000003747) MIDEAS (ENSBTAG00000009272) PNMA1 (ENSBTAG00000009271) ENSBTAG00000009783 ##22 DNAL1 (ENSBTAG00000015930) ENSBTAG00000010270 ENSBTAG00000009788 ACOT4 (ENSBTAG00000002843) ACOT2 (ENSBTAG00000046814) RIOX1 (ENSBTAG00000025372) HEATR4 (ENSBTAG00000002842) NUMB (ENSBTAG00000011683) PAPLN (ENSBTAG00000011680) PSEN1 (ENSBTAG00000011757) RBM25 (ENSBTAG00000017177) ZFYVE1 (ENSBTAG00000011041) DCAF4 (ENSBTAG00000008713) ENSBTAG00000046952 DPF3 (ENSBTAG00000025458) Bos DUPLICATION Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.b.a ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r.b.a ##22 Domestic yak DUPLICATION Domestic yak MODERN SPECIES 2 SYNDIG1L (ENSBGRG00000006594) VRTN (ENSBGRG00000006578) ABCD4 (ENSBGRG00000006381) VSX2 (ENSBGRG00000006307) LIN52 (ENSBGRG00000006226) ALDH6A1 (ENSBGRG00000006095) BBOF1 (ENSBGRG00000005994) ENTPD5 (ENSBGRG00000005910) COQ6 (ENSBGRG00000018611) FAM161B (ENSBGRG00000018523) ZNF410 (ENSBGRG00000018207) ENSBGRG00000018082 MIDEAS (ENSBGRG00000017732) PNMA1 (ENSBGRG00000017709) ENSBGRG00000017562 ENSBGRG00000017483 ##22 ENSBGRG00000017419 ##22 ENSBGRG00000017382 ACOT6 (ENSBGRG00000017306) ENSBGRG00000017115 ENSBGRG00000017051 RIOX1 (ENSBGRG00000016972) ENSBGRG00000016829 NUMB (ENSBGRG00000016469) PAPLN (ENSBGRG00000015385) PSEN1 (ENSBGRG00000015004) ENSBGRG00000014962 RBM25 (ENSBGRG00000014814) ZFYVE1 (ENSBGRG00000014619) ENSBGRG00000014589 ENSBGRG00000014407 Domestic yak MODERN SPECIES 2 VRTN (ENSBGRG00000006578) ABCD4 (ENSBGRG00000006381) VSX2 (ENSBGRG00000006307) LIN52 (ENSBGRG00000006226) ALDH6A1 (ENSBGRG00000006095) BBOF1 (ENSBGRG00000005994) ENTPD5 (ENSBGRG00000005910) COQ6 (ENSBGRG00000018611) FAM161B (ENSBGRG00000018523) ZNF410 (ENSBGRG00000018207) ENSBGRG00000018082 MIDEAS (ENSBGRG00000017732) PNMA1 (ENSBGRG00000017709) ENSBGRG00000017562 ENSBGRG00000017483 ##22 ENSBGRG00000017419 ##22 ENSBGRG00000017382 ACOT6 (ENSBGRG00000017306) ENSBGRG00000017115 ENSBGRG00000017051 RIOX1 (ENSBGRG00000016972) ENSBGRG00000016829 NUMB (ENSBGRG00000016469) PAPLN (ENSBGRG00000015385) PSEN1 (ENSBGRG00000015004) ENSBGRG00000014962 RBM25 (ENSBGRG00000014814) ZFYVE1 (ENSBGRG00000014619) ENSBGRG00000014589 ENSBGRG00000014407 ENSBGRG00000014383 Bos ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00940000159638 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000156761 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144.j ENSGT00940000162094 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00390000015797.d.r.b.b ##22 ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000006264.c ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045.k.b ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000157554 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000156761 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144.j ENSGT00940000162094 ENSGT01100000263480.a.a.b.b.b.a.a.a.a.a.b.a.a.b.b.a.a.a.a.b.b ENSGT00920000150755 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00390000015797.d.r.b.b ##22 ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000006264.c ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045.k.b ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163178 ENSGT00940000157554 Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 11 PTPRU (ENSBIXG00005001071) MECR (ENSBIXG00005007751) SRSF4 (ENSBIXG00005011082) TMEM200B (ENSBIXG00005007469) EPB41 (ENSBIXG00005010985) OPRD1 (ENSBIXG00005010747) YTHDF2 (ENSBIXG00005000620) GMEB1 (ENSBIXG00005010684) TAF12 (ENSBIXG00005000915) RAB42 (ENSBIXG00005000908) ENSBIXG00005010590 TRNAU1AP (ENSBIXG00005000707) RCC1 (ENSBIXG00005010509) PHACTR4 (ENSBIXG00005000752) ENSBIXG00005010390 ENSBIXG00005010380 ##22 MED18 (ENSBIXG00005010361) SESN2 (ENSBIXG00005000853) ATP5IF1 (ENSBIXG00005000831) DNAJC8 (ENSBIXG00005010254) ENSBIXG00005010236 PTAFR (ENSBIXG00005000806) EYA3 (ENSBIXG00005000796) XKR8 (ENSBIXG00005005690) SMPDL3B (ENSBIXG00005009947) ENSBIXG00005009925 THEMIS2 (ENSBIXG00005009901) PPP1R8 (ENSBIXG00005000665) STX12 (ENSBIXG00005009866) FAM76A (ENSBIXG00005009850) ENSBIXG00005000618 Bos_a ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000157151 ENSGT00940000156592 ENSGT00940000156213 ENSGT00530000063698.b ENSGT00940000157833 ENSGT00940000157669 ENSGT00940000156761 ENSGT01100000263839 ENSGT00410000025596.a.b ENSGT00390000002144.j ENSGT00940000162094 ENSGT00940000156139 ENSGT00940000155543 ENSGT00940000157582 ENSGT00390000006707.r.h ENSGT00390000015797.d.r.b.b ##22 ENSGT00390000003312 ENSGT00950000183168.B.a ENSGT00390000006264.c ENSGT00390000012569.a ENSGT01060000248589.D ENSGT00910000147719.b ENSGT00950000182978.B ENSGT01090000260093.b ENSGT00950000183182.a.a ENSGT00390000010045.k.b ENSGT00530000063770.c.a ENSGT00940000156115 ENSGT01000000214440.A.a.b.a ENSGT00940000160073 ENSGT00940000163178 Domestic yak MODERN SPECIES 11 MECR (ENSBGRG00000021789) SRSF4 (ENSBGRG00000021699) TMEM200B (ENSBGRG00000021675) EPB41 (ENSBGRG00000016000) OPRD1 (ENSBGRG00000015656) YTHDF2 (ENSBGRG00000015573) ENSBGRG00000015547 ENSBGRG00000015523 GMEB1 (ENSBGRG00000015362) TAF12 (ENSBGRG00000015289) RAB42 (ENSBGRG00000015211) TRNAU1AP (ENSBGRG00000014936) RCC1 (ENSBGRG00000014760) ENSBGRG00000014684 PHACTR4 (ENSBGRG00000014359) ENSBGRG00000014301 ##22 MED18 (ENSBGRG00000014253) SESN2 (ENSBGRG00000014010) ATP5IF1 (ENSBGRG00000013915) DNAJC8 (ENSBGRG00000013806) PTAFR (ENSBGRG00000013703) ENSBGRG00000013691 EYA3 (ENSBGRG00000013293) XKR8 (ENSBGRG00000013224) SMPDL3B (ENSBGRG00000012884) ENSBGRG00000012726 ENSBGRG00000012694 THEMIS2 (ENSBGRG00000012596) ENSBGRG00000012570 PPP1R8 (ENSBGRG00000012519) STX12 (ENSBGRG00000012395) Suina ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00950000182998.B ENSGT00940000156798 ENSGT00390000008496.j ENSGT00390000017896 ENSGT00940000158912 ENSGT00940000156528 ENSGT00940000163025.a ENSGT00940000159326 ENSGT00390000005766 ENSGT00530000063950.a.a ENSGT00940000159551 ENSGT00390000010376 ENSGT00940000158100 ENSGT00390000003967 ENSGT00940000162640 ENSGT00390000015797.d.r ##22 ENSGT00390000014780 ENSGT00420000029802 ENSGT00410000025918 ENSGT00940000156157 ENSGT00950000182992.a.b.a.b ENSGT00440000033849 ENSGT00390000007057 ENSGT00940000155132 ENSGT00390000016108 ENSGT00390000006922.m.b.a.d ENSGT00950000182985.a.a ENSGT00940000161683 ENSGT00940000157624 ENSGT00940000153635.B ENSGT00940000157441 Pig MODERN SPECIES EIF2AK4 (ENSSSCG00000039061) SRP14 (ENSSSCG00000004785) BMF (ENSSSCG00000035284) BUB1B (ENSSSCG00000004782) PAK6 (ENSSSCG00000004781) ANKRD63 (ENSSSCG00000053436) PLCB2 (ENSSSCG00000004779) INAFM2 (ENSSSCG00000063043) CCDC9B (ENSSSCG00000023975) ENSSSCG00000059961 DISP2 (ENSSSCG00000004776) KNSTRN (ENSSSCG00000053306) IVD (ENSSSCG00000004774) BAHD1 (ENSSSCG00000004772) CHST14 (ENSSSCG00000004771) ENSSSCG00000004770 ##22 CCDC32 (ENSSSCG00000038033) RPUSD2 (ENSSSCG00000036700) ENSSSCG00000042522 RAD51 (ENSSSCG00000004766) RMDN3 (ENSSSCG00000004765) ENSSSCG00000061289 C15orf62 (ENSSSCG00000032022) DNAJC17 (ENSSSCG00000004762) ZFYVE19 (ENSSSCG00000004761) ENSSSCG00000005612 ENSSSCG00000004760 SPINT1 (ENSSSCG00000004759) RHOV (ENSSSCG00000004758) VPS18 (ENSSSCG00000004757) DLL4 (ENSSSCG00000004755) Chacoan peccary DUPLICATION Chacoan peccary MODERN SPECIES 97 THG1L (ENSCWAG00000003519) SOX30 (ENSCWAG00000003538) ENSCWAG00000003570 ADAM19 (ENSCWAG00000003580) NIPAL4 (ENSCWAG00000003616) CYFIP2 (ENSCWAG00000003746) FNDC9 (ENSCWAG00000006309) ITK (ENSCWAG00000006326) ENSCWAG00000006406 GARIN3 (ENSCWAG00000006421) MED7 (ENSCWAG00000006465) ENSCWAG00000006481 ENSCWAG00000006531 ENSCWAG00000006550 SGCD (ENSCWAG00000006596) ENSCWAG00000006850 ##22 MRPL22 (ENSCWAG00000006876) GEMIN5 (ENSCWAG00000006998) CNOT8 (ENSCWAG00000007035) FAXDC2 (ENSCWAG00000007118) ENSCWAG00000000040 LARP1 (ENSCWAG00000000081) HAND1 (ENSCWAG00000000167) SAP30L (ENSCWAG00000000208) GALNT10 (ENSCWAG00000000268) MFAP3 (ENSCWAG00000000307) FAM114A2 (ENSCWAG00000000362) GRIA1 (ENSCWAG00000000517) Chacoan peccary MODERN SPECIES 162 FSIP1 (ENSCWAG00000015636) GPR176 (ENSCWAG00000015730) EIF2AK4 (ENSCWAG00000015824) SRP14 (ENSCWAG00000015955) BMF 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KCNN1 (ENSECAG00000009050) ARRDC2 (ENSECAG00000016486) IL12RB1 (ENSECAG00000021961) MAST3 (ENSECAG00000008102) PIK3R2 (ENSECAG00000009499) IFI30 (ENSECAG00000013896) MPV17L2 (ENSECAG00000020604) RAB3A (ENSECAG00000023115) PDE4C (ENSECAG00000008059) ENSECAG00000032603 ENSECAG00000053894 Donkey MODERN SPECIES 20 PHLPP2 (ENSEASG00005013281) AP1G1 (ENSEASG00005013276) ENSEASG00005028421 ATXN1L (ENSEASG00005038235) ZNF821 (ENSEASG00005013267) IST1 (ENSEASG00005024334) ENSEASG00005038052 ENSEASG00005013259 DHODH (ENSEASG00005013256) ENSEASG00005013254 TXNL4B (ENSEASG00005013253) DHX38 (ENSEASG00005013249) PMFBP1 (ENSEASG00005013246) ZFHX3 (ENSEASG00005021387) ENSEASG00005037511 ENSEASG00005021380 ##22 ENSEASG00005027521 ENSEASG00005021363 NOB1 (ENSEASG00005021356) NQO1 (ENSEASG00005021351) NFAT5 (ENSEASG00005021339) CYB5B (ENSEASG00005033722) TERF2 (ENSEASG00005021319) TMED6 (ENSEASG00005028265) NIP7 (ENSEASG00005021312) COG8 (ENSEASG00005021309) PDF (ENSEASG00005021305) VPS4A (ENSEASG00005021299) SNTB2 (ENSEASG00005021295) UTP4 (ENSEASG00005021288) ENSEASG00005025029 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00850000133633 ENSGT00390000013782 ENSGT00940000160542 ENSGT00390000001907 ENSGT00940000161246 ENSGT00940000159323 ENSGT00550000075110 ENSGT00940000154149.b.b ENSGT01030000234558.D.b ENSGT00940000161905 ENSGT00940000160221 ENSGT00940000160489 ENSGT00940000159134 ENSGT00940000163613 ENSGT00940000161827 ENSGT00390000015797.d.r ##22 ENSGT00940000159489 ENSGT00390000012482 ENSGT00950000182904.a.b.b ENSGT00940000159994 ENSGT00390000012431 ENSGT00940000157166 ENSGT00940000157050 ENSGT00390000010450 ENSGT00940000160620 ENSGT00940000158959.b ENSGT00940000162285 ENSGT00940000156018.A ENSGT00940000162806 ENSGT00610000086173 ENSGT00390000015368.a.a Red fox MODERN SPECIES 5 GTPBP3 (ENSVVUG00000016125) PLVAP (ENSVVUG00000016116) BST2 (ENSVVUG00000016108) MVB12A (ENSVVUG00000016101) TMEM221 (ENSVVUG00000016094) NXNL1 (ENSVVUG00000016089) SLC27A1 (ENSVVUG00000016059) PGLS (ENSVVUG00000015986) COLGALT1 (ENSVVUG00000015136) ENSVVUG00000010420 MAP1S (ENSVVUG00000010278) FCHO1 (ENSVVUG00000010255) B3GNT3 (ENSVVUG00000010245) ENSVVUG00000010239 JAK3 (ENSVVUG00000010219) RPL18A (ENSVVUG00000010203) ##22 SLC5A5 (ENSVVUG00000010178) CCDC124 (ENSVVUG00000010167) KCNN1 (ENSVVUG00000010157) ARRDC2 (ENSVVUG00000010141) IL12RB1 (ENSVVUG00000010117) MAST3 (ENSVVUG00000009445) PIK3R2 (ENSVVUG00000008441) IFI30 (ENSVVUG00000008281) MPV17L2 (ENSVVUG00000008270) RAB3A (ENSVVUG00000008188) PDE4C (ENSVVUG00000008178) ENSVVUG00000008151 LSM4 (ENSVVUG00000008136) PGPEP1 (ENSVVUG00000008129) GDF15 (ENSVVUG00000008127) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Dingo DUPLICATION Dingo MODERN SPECIES 401 SMARCC1 (ENSCAFG00020020203) DHX30 (ENSCAFG00020020245) ENSCAFG00020020277 CDC25A (ENSCAFG00020020316) CAMP (ENSCAFG00020020390) ENSCAFG00020020391 ENSCAFG00020020393 ##22 FBXW12 (ENSCAFG00020020394) CCDC51 (ENSCAFG00020020574) ENSCAFG00020020576 ATRIP (ENSCAFG00020020578) TREX1 (ENSCAFG00020020594) SHISA5 (ENSCAFG00020020603) PFKFB4 (ENSCAFG00020020611) UCN2 (ENSCAFG00020020632) UQCRC1 (ENSCAFG00020020695) TMEM89 (ENSCAFG00020020702) SLC26A6 (ENSCAFG00020020707) CELSR3 (ENSCAFG00020020726) NCKIPSD (ENSCAFG00020020775) IP6K2 (ENSCAFG00020020778) ENSCAFG00020020785 Dingo MODERN SPECIES 112 GTPBP3 (ENSCAFG00020010423) PLVAP (ENSCAFG00020010429) ENSCAFG00020010435 TMEM221 (ENSCAFG00020010439) NXNL1 (ENSCAFG00020010448) SLC27A1 (ENSCAFG00020010450) PGLS (ENSCAFG00020010456) NIBAN3 (ENSCAFG00020010460) COLGALT1 (ENSCAFG00020010499) UNC13A (ENSCAFG00020011613) MAP1S (ENSCAFG00020011769) FCHO1 (ENSCAFG00020011779) B3GNT3 (ENSCAFG00020011816) INSL3 (ENSCAFG00020011823) JAK3 (ENSCAFG00020011827) ENSCAFG00020011844 ##22 SLC5A5 (ENSCAFG00020011860) ENSCAFG00020011867 CCDC124 (ENSCAFG00020011870) KCNN1 (ENSCAFG00020011873) ARRDC2 (ENSCAFG00020011878) IL12RB1 (ENSCAFG00020011880) MAST3 (ENSCAFG00020011887) PIK3R2 (ENSCAFG00020012042) IFI30 (ENSCAFG00020012054) MPV17L2 (ENSCAFG00020012062) RAB3A (ENSCAFG00020012068) PDE4C (ENSCAFG00020012094) ENSCAFG00020012098 ENSCAFG00020012108 LSM4 (ENSCAFG00020012137) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Giant Panda DUPLICATION Giant Panda MODERN SPECIES 1264 ENSAMEG00000030555 ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1274 ENSAMEG00000030896 ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 American mink DUPLICATION American mink MODERN SPECIES 423 ENSNVIG00000004243 ##22 ADAM28 (ENSNVIG00000004255) ADAMDEC1 (ENSNVIG00000004297) ADAM7 (ENSNVIG00000004347) American mink MODERN SPECIES 58 CCDC194 (ENSNVIG00000016047) ENSNVIG00000016053 MVB12A (ENSNVIG00000016065) TMEM221 (ENSNVIG00000016097) NXNL1 (ENSNVIG00000016110) SLC27A1 (ENSNVIG00000016132) PGLS (ENSNVIG00000016149) NIBAN3 (ENSNVIG00000016160) COLGALT1 (ENSNVIG00000016232) ENSNVIG00000016256 UNC13A (ENSNVIG00000016276) MAP1S (ENSNVIG00000016851) FCHO1 (ENSNVIG00000016881) INSL3 (ENSNVIG00000017040) JAK3 (ENSNVIG00000017079) ENSNVIG00000017221 ##22 SLC5A5 (ENSNVIG00000017292) CC124 (ENSNVIG00000017314) KCNN1 (ENSNVIG00000017325) ARRDC2 (ENSNVIG00000017355) IL12RB1 (ENSNVIG00000017388) MAST3 (ENSNVIG00000017439) PIK3R2 (ENSNVIG00000017496) IFI30 (ENSNVIG00000017558) MPV17L2 (ENSNVIG00000017572) RAB3A (ENSNVIG00000017588) PDE4C (ENSNVIG00000017617) ENSNVIG00000017808 JUND (ENSNVIG00000017813) LSM4 (ENSNVIG00000017819) PGPI (ENSNVIG00000017857) Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.r ##22 lion MODERN SPECIES 430 ENSPLOG00000021955 ##22 Cat DUPLICATION Cat MODERN SPECIES 249 ODF1 (ENSFCAG00000042534) KLF10 (ENSFCAG00000026958) AZIN1 (ENSFCAG00000010031) ATP6V1C1 (ENSFCAG00000005022) BAALC (ENSFCAG00000040797) FZD6 (ENSFCAG00000005027) CTHRC1 (ENSFCAG00000005030) SLC25A32 (ENSFCAG00000005032) DCAF13 (ENSFCAG00000027256) RIMS2 (ENSFCAG00000027891) DCSTAMP (ENSFCAG00000008982) DPYS (ENSFCAG00000008985) LRP12 (ENSFCAG00000042764) ZFPM2 (ENSFCAG00000009078) OXR1 (ENSFCAG00000031132) ENSFCAG00000042579 ##22 ABRA (ENSFCAG00000036061) ANGPT1 (ENSFCAG00000045651) RSPO2 (ENSFCAG00000005782) EIF3E (ENSFCAG00000003665) EMC2 (ENSFCAG00000025332) TMEM74 (ENSFCAG00000022184) TRHR (ENSFCAG00000010358) NUDCD1 (ENSFCAG00000008501) ENY2 (ENSFCAG00000030489) PKHD1L1 (ENSFCAG00000023829) EBAG9 (ENSFCAG00000025490) SYBU (ENSFCAG00000031166) KCNV1 (ENSFCAG00000024822) CSMD3 (ENSFCAG00000031602) TRPS1 (ENSFCAG00000013890) Cat MODERN SPECIES 239 MCOLN3 (ENSFCAG00000011196) MCOLN2 (ENSFCAG00000011193) LPAR3 (ENSFCAG00000008799) SSX2IP (ENSFCAG00000023838) CTBS (ENSFCAG00000046319) SPATA1 (ENSFCAG00000022598) GNG5 (ENSFCAG00000038836) RPF1 (ENSFCAG00000025546) DNASE2B (ENSFCAG00000008789) UOX (ENSFCAG00000024210) ENSFCAG00000050042 SAMD13 (ENSFCAG00000045569) ENSFCAG00000049478 PRKACB (ENSFCAG00000027890) TTLL7 (ENSFCAG00000012519) ENSFCAG00000033151 ##22 ADGRL2 (ENSFCAG00000025759) ADGRL4 (ENSFCAG00000031487) IFI44 (ENSFCAG00000022349) IFI44L (ENSFCAG00000013210) PTGFR (ENSFCAG00000004947) GIPC2 (ENSFCAG00000033966) DNAJB4 (ENSFCAG00000026143) FUBP1 (ENSFCAG00000010330) NEXN (ENSFCAG00000023913) MIGA1 (ENSFCAG00000019216) USP33 (ENSFCAG00000023180) ZZZ3 (ENSFCAG00000001415) AK5 (ENSFCAG00000001412) PIGK (ENSFCAG00000025576) ENSFCAG00000027990 Marsupialia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Marsupialia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Diprotodontia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d ##22 Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.s.a ##22 koala MODERN SPECIES 1 BLK (ENSPCIG00000001657) GATA4 (ENSPCIG00000001683) NEIL2 (ENSPCIG00000001713) FDFT1 (ENSPCIG00000001794) CTSB (ENSPCIG00000001821) ENSPCIG00000001837 ENSPCIG00000004642 ENSPCIG00000004649 ENSPCIG00000001854 ENSPCIG00000001886 ENSPCIG00000035695 XKR5 (ENSPCIG00000009384) AGPAT5 (ENSPCIG00000009379) ANGPT2 (ENSPCIG00000011026) ENSPCIG00000003167 ENSPCIG00000002528 ##22 ENSPCIG00000033132 CSMD1 (ENSPCIG00000008043) Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a DUPLICATION Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.s.b.a.a ##22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1024 ENSVURG00010000118 ENSVURG00010000158 ENSVURG00010000178 ENSVURG00010000219 ENSVURG00010000377 ENSVURG00010000392 ENSVURG00010000438 ENSVURG00010000492 ENSVURG00010000499 ENSVURG00010000508 ENSVURG00010000532 ENSVURG00010000572 ENSVURG00010000647 ENSVURG00010000680 ENSVURG00010000722 ENSVURG00010000793 ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1024 ENSVURG00010010985 ENSVURG00010011001 ENSVURG00010011018 ENSVURG00010011034 ENSVURG00010011054 ENSVURG00010011149 ENSVURG00010011153 ENSVURG00010011177 ENSVURG00010011228 ENSVURG00010011234 ENSVURG00010011246 ENSVURG00010011291 ENSVURG00010011334 ENSVURG00010011340 ENSVURG00010011374 ENSVURG00010011385 ##22 TSHZ3 (ENSVURG00010011394) ZNF536 (ENSVURG00010011415) URI1 (ENSVURG00010011452) CCNE1 (ENSVURG00010011492) C19orf12 (ENSVURG00010012490) PLEKHF1 (ENSVURG00010012501) POP4 (ENSVURG00010012509) VSTM2B (ENSVURG00010012523) UQCRFS1 (ENSVURG00010012533) SHCBP1 (ENSVURG00010012550) ENSVURG00010012592 VPS35 (ENSVURG00010012859) ORC6 (ENSVURG00010012881) C16orf87 (ENSVURG00010012890) ENSVURG00010012900 koala DUPLICATION koala MODERN SPECIES 107 FAM13B (ENSPCIG00000015702) PKD2L2 (ENSPCIG00000015701) MYOT (ENSPCIG00000015700) SERPINA1 (ENSPCIG00000015699) SERPINA11 (ENSPCIG00000015697) ENSPCIG00000015696 ENSPCIG00000013924 ENSPCIG00000013889 ENSPCIG00000025094 SERPINA3 (ENSPCIG00000025093) GSC (ENSPCIG00000025092) DICER1 (ENSPCIG00000018004) CLMN (ENSPCIG00000018006) SYNE3 (ENSPCIG00000018008) GLRX5 (ENSPCIG00000018014) ENSPCIG00000009704 ##22 ENSPCIG00000030664 ENSPCIG00000037366 ENSPCIG00000034405 koala MODERN SPECIES 93 RASSF10 (ENSPCIG00000025466) TEAD1 (ENSPCIG00000025456) PARVA (ENSPCIG00000025436) MICAL2 (ENSPCIG00000025387) DKK3 (ENSPCIG00000025375) USP47 (ENSPCIG00000025349) GALNT18 (ENSPCIG00000025287) EIF4G2 (ENSPCIG00000024888) CTR9 (ENSPCIG00000023374) IRAG1 (ENSPCIG00000023321) LYVE1 (ENSPCIG00000023314) RNF141 (ENSPCIG00000023312) AMPD3 (ENSPCIG00000023310) ADM (ENSPCIG00000005988) SBF2 (ENSPCIG00000005981) ENSPCIG00000005974 ##22 SWAP70 (ENSPCIG00000005968) WEE1 (ENSPCIG00000005960) ZNF143 (ENSPCIG00000005957) IPO7 (ENSPCIG00000005946) TMEM41B (ENSPCIG00000005943) DENND5A (ENSPCIG00000005930) SCUBE2 (ENSPCIG00000005923) ENSPCIG00000005922 NRIP3 (ENSPCIG00000005921) TMEM9B (ENSPCIG00000005918) ASCL3 (ENSPCIG00000005917) ENSPCIG00000005914 DENND2B (ENSPCIG00000005827) ENSPCIG00000005818 TRIM66 (ENSPCIG00000005815) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.s.b.a.b ##22 Common wonbat MODERN SPECIES 1142 ENSVURG00010011271 ENSVURG00010011267 ENSVURG00010011265 ENSVURG00010011259 ##22 ARX (ENSVURG00010011250) POLA1 (ENSVURG00010011074) PCYT1B (ENSVURG00010011032) PDK3 (ENSVURG00010011005) ENSVURG00010010997 ENSVURG00010010984 ENSVURG00010010970 KLHL15 (ENSVURG00010010959) ENSVURG00010010951 APOO (ENSVURG00010010940) SAT1 (ENSVURG00010010927) koala MODERN SPECIES 9 DIPK2A (ENSPCIG00000037438) ENSPCIG00000018428 ENSPCIG00000007920 ENSPCIG00000029198 ENSPCIG00000013897 PLOD2 (ENSPCIG00000018522) PLSCR4 (ENSPCIG00000018533) PLSCR1 (ENSPCIG00000018535) PLSCR5 (ENSPCIG00000018538) ENSPCIG00000032139 ##22 ENSPCIG00000023048 ENSPCIG00000023047 ZIC1 (ENSPCIG00000023051) ENSPCIG00000034512 AGTR1 (ENSPCIG00000023054) ENSPCIG00000023055 CPB1 (ENSPCIG00000005481) CPA3 (ENSPCIG00000005490) GYG1 (ENSPCIG00000005496) HLTF (ENSPCIG00000005506) HPS3 (ENSPCIG00000005526) CP (ENSPCIG00000005553) ENSPCIG00000005652 TM4SF18 (ENSPCIG00000005774) TM4SF1 (ENSPCIG00000004115) Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.s.b.b ##22 koala MODERN SPECIES 78 TMPRSS11A (ENSPCIG00000001569) TMPRSS11D (ENSPCIG00000001625) ENSPCIG00000001778 GNRHR (ENSPCIG00000001816) UBA6 (ENSPCIG00000002425) STAP1 (ENSPCIG00000012621) ENSPCIG00000012623 EPHA5 (ENSPCIG00000024027) ENSPCIG00000024026 ENSPCIG00000024024 TECRL (ENSPCIG00000006772) ENSPCIG00000012461 ADGRL3 (ENSPCIG00000017414) ENSPCIG00000030798 ENSPCIG00000017313 ENSPCIG00000017312 ##22 ENSPCIG00000033025 Diprotodontia_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000015797.d.t ##22 Common wonbat DUPLICATION Common wonbat MODERN SPECIES 1199 ENSVURG00010002748 ENSVURG00010002734 ENSVURG00010002701 ENSVURG00010002656 ENSVURG00010002624 ENSVURG00010002613 ENSVURG00010002439 ENSVURG00010002385 ENSVURG00010002379 ENSVURG00010002357 ENSVURG00010002329 PPDPFL (ENSVURG00010002320) ENSVURG00010002312 ENSVURG00010002159 ENSVURG00010002009 ENSVURG00010001954 ##22 ENSVURG00010001692 ENSVURG00010001530 ENSVURG00010001460 ENSVURG00010001434 ENSVURG00010001378 ENSVURG00010001312 ENSVURG00010001295 ENSVURG00010001248 ENSVURG00010001212 ENSVURG00010001140 ENSVURG00010001119 ENSVURG00010001104 ENSVURG00010001096 ENSVURG00010001059 ENSVURG00010001017 Common wonbat MODERN SPECIES 1048 ENSVURG00010004445 ENSVURG00010004469 ENSVURG00010004480 ENSVURG00010004710 ENSVURG00010004780 ENSVURG00010004818 ENSVURG00010004991 ENSVURG00010005061 ENSVURG00010005099 ENSVURG00010005149 ENSVURG00010005168 ENSVURG00010005188 ENSVURG00010005253 ENSVURG00010005347 ENSVURG00010005439 ENSVURG00010005493 ##22 ENSVURG00010005504 ENSVURG00010005584 ENSVURG00010005623 ENSVURG00010005639 ENSVURG00010005668 ENSVURG00010005677 ENSVURG00010005778 ENSVURG00010005809 ENSVURG00010005848 ENSVURG00010005886 ENSVURG00010005902 ENSVURG00010005916 ENSVURG00010005920 ENSVURG00010005956 ENSVURG00010006034 koala MODERN SPECIES 429 ENSPCIG00000015935 ENSPCIG00000035087 ENSPCIG00000022254 ENSPCIG00000015824 ##22