Sciuridae	ANCESTRAL SPECIES	38	ENSGT00940000156063	ENSGT00940000154978	ENSGT00940000163277	ENSGT00390000011932	ENSGT00940000160339	ENSGT00390000008611	ENSGT01100000263512.a.a.b	ENSGT00940000155201	ENSGT00940000158472	ENSGT00940000159559	ENSGT00940000159333	ENSGT00390000010038	ENSGT00940000154895.a.a #19	ENSGT00940000154778 #21	ENSGT01050000244827.C.c.a.a #20	ENSGT00390000018433.s.b #22	ENSGT00940000155694 #25	ENSGT00940000160791.A #23	ENSGT00950000182936.a.a.b #27	ENSGT00390000016644 #28	ENSGT00940000154986 #29	ENSGT00390000016183 #30	ENSGT00940000160195.b.b #31	ENSGT00950000183040.A.b #32	ENSGT00940000155128.a.b #33	ENSGT00940000155905.a #35	ENSGT00490000043413 #36	ENSGT00530000063614.a.b #37	ENSGT00940000156323	ENSGT00390000013075.b	ENSGT00940000156432.a
Marmotini	ANCESTRAL SPECIES	45	ENSGT00940000156063	ENSGT00940000154978	ENSGT00940000163277	ENSGT00390000011932	ENSGT00940000160339	ENSGT00390000008611	ENSGT01100000263512.a.a.b	ENSGT00940000155201	ENSGT00940000158472	ENSGT00940000159559	ENSGT00940000159333	ENSGT00390000010038	ENSGT00940000154895.a.a #19	ENSGT00940000154778 #21	ENSGT01050000244827.C.c.a.a #20	ENSGT00390000018433.s.b #22	ENSGT00940000155694 #25	ENSGT00940000160791.A #23	ENSGT00950000182936.a.a.b #27	ENSGT00390000016644 #28	ENSGT00940000154986 #29	ENSGT00390000016183 #30	ENSGT00940000160195.b.b #31	ENSGT00950000183040.A.b #32	ENSGT00940000155128.a.b #33	ENSGT00940000155905.a #35	ENSGT00490000043413 #36	ENSGT00530000063614.a.b #37	ENSGT00940000156323	ENSGT00390000013075.b	ENSGT00940000156432.a
Marmotini_b	ANCESTRAL SPECIES	119													ENSGT00940000154895.a.a #19	ENSGT00940000154778 #21	ENSGT01050000244827.C.c.a.a #20	ENSGT00390000018433.s.b #22	ENSGT00940000155694 #25	ENSGT00940000160791.A #23	ENSGT00950000182936.a.a.b #27	ENSGT00390000016644 #28	ENSGT00940000154986 #29	ENSGT00390000016183 #30	ENSGT00940000160195.b.b #31	ENSGT00950000183040.A.b #32	ENSGT00940000155128.a.b #33	ENSGT00940000155905.a #35	ENSGT00490000043413 #36	ENSGT00530000063614.a.b #37	ENSGT00940000156323	ENSGT00390000013075.b	ENSGT00940000156432.a
Arctic ground squirrel	MODERN SPECIES	32													DCLK2 (ENSUPAG00010018923) #19	MAB21L2 (ENSUPAG00010018918) #20	LRBA (ENSUPAG00010018745) #21	RPS3A (ENSUPAG00010018732) #22	PRSS48 (ENSUPAG00010018630) #23	ENSUPAG00010018617 #24	SH3D19 (ENSUPAG00010018552) #25	ENSUPAG00010018537 #26	FHIP1A (ENSUPAG00010018526) #27	GATB (ENSUPAG00010018482) #28	FBXW7 (ENSUPAG00010018370) #29	TMEM154 (ENSUPAG00010018356) #30	TIGD4 (ENSUPAG00010018343) #31	ARFIP1 (ENSUPAG00010018283) #32	ENSUPAG00010018268 #33	ENSUPAG00010018263 #34	TRIM2 (ENSUPAG00010018052) #35	MND1 (ENSUPAG00010018038) #36	TMEM131L (ENSUPAG00010017965) #37
Squirrel	DUPLICATION
Squirrel	MODERN SPECIES	289													DCLK2 (ENSSTOG00000009551) #19	LRBA (ENSSTOG00000009572) #21	MAB21L2 (ENSSTOG00000012240) #20	RPS3A (ENSSTOG00000024203) #22	SH3D19 (ENSSTOG00000009638) #25	PRSS48 (ENSSTOG00000012642) #23	FHIP1A (ENSSTOG00000026038) #27	GATB (ENSSTOG00000005689) #28	FBXW7 (ENSSTOG00000021503) #29	TMEM154 (ENSSTOG00000030085) #30	TIGD4 (ENSSTOG00000020903) #31	ARFIP1 (ENSSTOG00000025144) #32	ENSSTOG00000025555	FHDC1 (ENSSTOG00000026663) #33
Squirrel	MODERN SPECIES	73	GALNT15 (ENSSTOG00000021175)	ENSSTOG00000033525	OXNAD1 (ENSSTOG00000000071)	RFTN1 (ENSSTOG00000000072)	ENSSTOG00000022122	PLCL2 (ENSSTOG00000000749)	TBC1D5 (ENSSTOG00000028034)	SATB1 (ENSSTOG00000010856)	KCNH8 (ENSSTOG00000023006)	RAB5A (ENSSTOG00000026229)	PP2D1 (ENSSTOG00000012388)	KAT2B (ENSSTOG00000002904)	SGO1 (ENSSTOG00000003766)	ENSSTOG00000031366	ZNF385D (ENSSTOG00000005742)	ENSSTOG00000028898 #22	ENSSTOG00000034552	UBE2E1 (ENSSTOG00000025799)	NKIRAS1 (ENSSTOG00000010538)	ENSSTOG00000011153	ENSSTOG00000022967	ENSSTOG00000002444	THRB (ENSSTOG00000005197)	RARB (ENSSTOG00000007994)	TOP2B (ENSSTOG00000008012)	NGLY1 (ENSSTOG00000000939)	OXSM (ENSSTOG00000004977)	LRRC3B (ENSSTOG00000010920)	NEK10 (ENSSTOG00000012142)	SLC4A7 (ENSSTOG00000012151)	ENSSTOG00000023565
Alpin marmot	MODERN SPECIES	14	MMAA (ENSMMMG00000001552)	ZNF827 (ENSMMMG00000001587)	LSM6 (ENSMMMG00000001638)	REELD1 (ENSMMMG00000001660)	SLC10A7 (ENSMMMG00000001688)	ENSMMMG00000001799	ENSMMMG00000001810	EDNRA (ENSMMMG00000001819)	TMEM184C (ENSMMMG00000001829)	PRMT9 (ENSMMMG00000001857)	ARHGAP10 (ENSMMMG00000001915)	NR3C2 (ENSMMMG00000002054)	DCLK2 (ENSMMMG00000002234) #19	LRBA (ENSMMMG00000002285) #21	MAB21L2 (ENSMMMG00000002553) #20	RPS3A (ENSMMMG00000002563) #22	ENSMMMG00000002583	PRSS48 (ENSMMMG00000002611) #23	ENSMMMG00000002661 #24	FHIP1A (ENSMMMG00000002679) #27	GATB (ENSMMMG00000002702) #28	FBXW7 (ENSMMMG00000002767) #29	ENSMMMG00000002965	TIGD4 (ENSMMMG00000002976) #31	ARFIP1 (ENSMMMG00000002979) #32	FHDC1 (ENSMMMG00000003033) #33	TRIM2 (ENSMMMG00000003057) #35	MND1 (ENSMMMG00000003217) #36	TMEM131L (ENSMMMG00000003263) #37	TLR2 (ENSMMMG00000003813)	RNF175 (ENSMMMG00000003821)
Eurasian red squirrel	MODERN SPECIES	18	LSM6 (ENSSVLG00005009971)	REELD1 (ENSSVLG00005010007)	SLC10A7 (ENSSVLG00005010105)	POU4F2 (ENSSVLG00005010171)	TTC29 (ENSSVLG00005010213)	EDNRA (ENSSVLG00005010545)	TMEM184C (ENSSVLG00005010646)	PRMT9 (ENSSVLG00005010674)	ARHGAP10 (ENSSVLG00005010815)	NR3C2 (ENSSVLG00005010872)	ENSSVLG00005011096	DCLK2 (ENSSVLG00005011376) #19	LRBA (ENSSVLG00005012409) #21	ENSSVLG00005013232	ENSSVLG00005013273 #21	RPS3A (ENSSVLG00005013409) #22	SH3D19 (ENSSVLG00005013694) #25	ENSSVLG00005013874	ENSSVLG00005013994	FHIP1A (ENSSVLG00005014177) #27	GATB (ENSSVLG00005014243) #28	FBXW7 (ENSSVLG00005014357) #29	ENSSVLG00005014649	TMEM154 (ENSSVLG00005014705) #30	TIGD4 (ENSSVLG00005014754) #31	ARFIP1 (ENSSVLG00005014796) #32	FHDC1 (ENSSVLG00005014939) #33	TRIM2 (ENSSVLG00005014985) #35	ENSSVLG00005015249	ENSSVLG00005015369 #36	TMEM131L (ENSSVLG00005015633) #37