Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00940000154257.i.a.a #34 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Orangutan MODERN SPECIES 17 REELD1 (ENSPPYG00000038439) #7 SLC10A7 (ENSPPYG00000015106) #8 POU4F2 (ENSPPYG00000015107) #9 TTC29 (ENSPPYG00000015108) #10 EDNRA (ENSPPYG00000015109) #11 TMEM184C (ENSPPYG00000034968) #12 PRMT9 (ENSPPYG00000015111) #13 ARHGAP10 (ENSPPYG00000015112) #14 NR3C2 (ENSPPYG00000015113) #15 IQCM (ENSPPYG00000015114) #16 DCLK2 (ENSPPYG00000015115) #17 LRBA (ENSPPYG00000015116) #18 MAB21L2 (ENSPPYG00000015117) #19 ENSPPYG00000031388 #20 ENSPPYG00000035707 #21 RPS3A (ENSPPYG00000025869) #22 SH3D19 (ENSPPYG00000015118) #23 PRSS48 (ENSPPYG00000015119) #24 FHIP1A (ENSPPYG00000015120) #25 GATB (ENSPPYG00000015121) #26 FBXW7 (ENSPPYG00000015122) #27 TMEM154 (ENSPPYG00000015124) #28 TIGD4 (ENSPPYG00000015125) #29 ARFIP1 (ENSPPYG00000015126) #30 ENSPPYG00000039750 #31 FHDC1 (ENSPPYG00000015127) #32 TRIM2 (ENSPPYG00000015128) #33 ENSPPYG00000039576 #34 MND1 (ENSPPYG00000015129) #35 TMEM131L (ENSPPYG00000015130) #36 ENSPPYG00000036033 #37 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Bonobo MODERN SPECIES 17 POU4F2 (ENSPPAG00000035263) #9 TTC29 (ENSPPAG00000039325) #10 ENSPPAG00000027341 EDNRA (ENSPPAG00000037609) #11 TMEM184C (ENSPPAG00000032567) #12 PRMT9 (ENSPPAG00000043067) #13 ARHGAP10 (ENSPPAG00000003388) #14 NR3C2 (ENSPPAG00000031751) #15 IQCM (ENSPPAG00000041665) #16 DCLK2 (ENSPPAG00000041046) #17 LRBA (ENSPPAG00000042647) #18 ENSPPAG00000044104 MAB21L2 (ENSPPAG00000024444) #19 ENSPPAG00000044106 #20 ENSPPAG00000044108 ##21 ENSPPAG00000044109 #22 ENSPPAG00000044129 #23 PRSS48 (ENSPPAG00000037675) #24 FHIP1A (ENSPPAG00000032398) #25 GATB (ENSPPAG00000041690) #26 FBXW7 (ENSPPAG00000035178) #27 TMEM154 (ENSPPAG00000036040) #28 TIGD4 (ENSPPAG00000012681) #29 ARFIP1 (ENSPPAG00000031157) #30 ENSPPAG00000043551 ##31 FHDC1 (ENSPPAG00000028121) #32 TRIM2 (ENSPPAG00000038637) #33 ENSPPAG00000040974 #34 MND1 (ENSPPAG00000032409) #35 TMEM131L (ENSPPAG00000035999) #36 ENSPPAG00000043739 #37 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Drill MODERN SPECIES 1565 ENSMLEG00000016739 CAMK1D (ENSMLEG00000003491) CCDC3 (ENSMLEG00000030418) ENSMLEG00000035233 OPTN (ENSMLEG00000026081) ENSMLEG00000037306 MCM10 (ENSMLEG00000037584) UCMA (ENSMLEG00000034904) PHYH (ENSMLEG00000032777) ENSMLEG00000041585 ENSMLEG00000005976 #22 ENSMLEG00000016771 PRPF18 (ENSMLEG00000031715) ENSMLEG00000038593 ENSMLEG00000042543 ENSMLEG00000004764 FAM107B (ENSMLEG00000041121) CDNF (ENSMLEG00000032491) HSPA14 (ENSMLEG00000039837) ENSMLEG00000044215 DCLRE1C (ENSMLEG00000044355) ENSMLEG00000008746 ACBD7 (ENSMLEG00000027471) ENSMLEG00000039491 NMT2 (ENSMLEG00000041367) FAM171A1 (ENSMLEG00000034787) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154978.h.a ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201.g.b #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00940000154257.i.a.a #34 ENSGT00490000043413.a.a.a #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154978.h.a ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201.g.b #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00940000154257.i.a.a #34 ENSGT00490000043413.a.a.a #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 812 ZNF16 (ENSCCAG00000020536) ENSCCAG00000020238 ZNF250 (ENSCCAG00000029410) COMMD5 (ENSCCAG00000013590) ENSCCAG00000025292 ZNF7 (ENSCCAG00000024294) ZNF517 (ENSCCAG00000019662) ENSCCAG00000032759 ENSCCAG00000023353 ENSCCAG00000018165 RPS3A (ENSCCAG00000023774) #22 PRSS48 (ENSCCAG00000025335) #24 SH3D19 (ENSCCAG00000021260) #23 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413.c.b #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 156 ZNF827 (ENSOGAG00000005635) ENSOGAG00000026665 SLC10A7 (ENSOGAG00000008690) #8 POU4F2 (ENSOGAG00000028626) #9 TTC29 (ENSOGAG00000010351) #10 EDNRA (ENSOGAG00000015817) #11 TMEM184C (ENSOGAG00000015819) #12 PRMT9 (ENSOGAG00000015825) #13 ENSOGAG00000014000 #14 NR3C2 (ENSOGAG00000014008) #15 ENSOGAG00000033581 DCLK2 (ENSOGAG00000003223) #17 ENSOGAG00000003228 #18 MAB21L2 (ENSOGAG00000029639) #19 ENSOGAG00000031521 #18 ENSOGAG00000007634 #22 SH3D19 (ENSOGAG00000012447) #23 ENSOGAG00000024160 #24 FHIP1A (ENSOGAG00000032830) #25 GATB (ENSOGAG00000014181) #26 FBXW7 (ENSOGAG00000011827) #27 TMEM154 (ENSOGAG00000013516) #28 ENSOGAG00000026906 TIGD4 (ENSOGAG00000005277) #29 ARFIP1 (ENSOGAG00000005278) #30 FHDC1 (ENSOGAG00000032525) #32 TRIM2 (ENSOGAG00000013235) #33 ENSOGAG00000011987 #35 TMEM131L (ENSOGAG00000000832) #36 ENSOGAG00000032650 TLR2 (ENSOGAG00000027703) Bushbaby MODERN SPECIES 224 ENOX2 (ENSOGAG00000003494) ARHGAP36 (ENSOGAG00000000291) IGSF1 (ENSOGAG00000013044) ENSOGAG00000025500 ENSOGAG00000026712 OR13H1 (ENSOGAG00000026372) ENSOGAG00000027130 STK26 (ENSOGAG00000002621) FRMD7 (ENSOGAG00000002622) RAP2C (ENSOGAG00000003141) MBNL3 (ENSOGAG00000003143) HS6ST2 (ENSOGAG00000006658) ENSOGAG00000029621 GPC4 (ENSOGAG00000007022) ENSOGAG00000007481 ENSOGAG00000027754 #22 ENSOGAG00000033085 ENSOGAG00000028310 CCDC160 (ENSOGAG00000032387) PHF6 (ENSOGAG00000003877) HPRT1 (ENSOGAG00000003881) PLAC1 (ENSOGAG00000013655) PABIR2 (ENSOGAG00000005733) MOSPD1 (ENSOGAG00000005739) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.n ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413.c.a #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.n ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413.c.b #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 330 AKAP1 (ENSPSMG00000020414) SCPEP1 (ENSPSMG00000020459) COIL (ENSPSMG00000020468) TRIM25 (ENSPSMG00000020499) DGKE (ENSPSMG00000020514) ENSPSMG00000020520 C17orf67 (ENSPSMG00000020529) ENSPSMG00000020534 NOG (ENSPSMG00000020542) ANKFN1 (ENSPSMG00000020557) IQCM (ENSPSMG00000020578) #16 DCLK2 (ENSPSMG00000020757) #17 LRBA (ENSPSMG00000021044) #18 MAB21L2 (ENSPSMG00000021119) #19 ENSPSMG00000021150 #22 SH3D19 (ENSPSMG00000021327) #23 ENSPSMG00000021366 FHIP1A (ENSPSMG00000021372) #25 GATB (ENSPSMG00000021442) #26 FBXW7 (ENSPSMG00000021518) #27 TMEM154 (ENSPSMG00000021541) #28 TIGD4 (ENSPSMG00000021545) #29 ARFIP1 (ENSPSMG00000021599) #30 FHDC1 (ENSPSMG00000021613) #32 TRIM2 (ENSPSMG00000021653) #33 MND1 (ENSPSMG00000021692) #35 TMEM131L (ENSPSMG00000021736) #36 TLR2 (ENSPSMG00000021752) RNF175 (ENSPSMG00000021767) SFRP2 (ENSPSMG00000021778) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 951 ABHD12B (ENSPCOG00000024199) NIN (ENSPCOG00000008345) SAV1 (ENSPCOG00000017075) ATL1 (ENSPCOG00000015429) MAP4K5 (ENSPCOG00000016345) CDKL1 (ENSPCOG00000023543) DMAC2L (ENSPCOG00000014032) L2HGDH (ENSPCOG00000028342) SOS2 (ENSPCOG00000016272) VCPKMT (ENSPCOG00000020609) ARF6 (ENSPCOG00000000684) NEMF (ENSPCOG00000013328) KLHDC2 (ENSPCOG00000027810) ENSPCOG00000013951 POLE2 (ENSPCOG00000027285) ENSPCOG00000008650 #22 DNAAF2 (ENSPCOG00000022293) ENSPCOG00000012793 LRR1 (ENSPCOG00000026498) ENSPCOG00000024671 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 6 LSM6 (ENSOCUG00000017495) REELD1 (ENSOCUG00000034608) #7 SLC10A7 (ENSOCUG00000012552) #8 POU4F2 (ENSOCUG00000012636) #9 TTC29 (ENSOCUG00000021290) #10 ENSOCUG00000031243 EDNRA (ENSOCUG00000001250) #11 TMEM184C (ENSOCUG00000001732) #12 PRMT9 (ENSOCUG00000003110) #13 ARHGAP10 (ENSOCUG00000003124) #14 NR3C2 (ENSOCUG00000003137) #15 ENSOCUG00000025176 IQCM (ENSOCUG00000027563) #16 DCLK2 (ENSOCUG00000008443) #17 LRBA (ENSOCUG00000008453) #18 ENSOCUG00000007011 #22 ENSOCUG00000022119 PRSS48 (ENSOCUG00000021850) #24 SH3D19 (ENSOCUG00000007014) #23 FHIP1A (ENSOCUG00000002636) #25 GATB (ENSOCUG00000016875) #26 FBXW7 (ENSOCUG00000008440) #27 TMEM154 (ENSOCUG00000029467) #28 TIGD4 (ENSOCUG00000012496) #29 ARFIP1 (ENSOCUG00000014132) #30 FHDC1 (ENSOCUG00000003876) #32 ENSOCUG00000037579 RBM46 (ENSOCUG00000017859) LRAT (ENSOCUG00000017861) ENSOCUG00000011239 FGB (ENSOCUG00000011235) Rabbit MODERN SPECIES 4 NGF (ENSOCUG00000000659) VANGL1 (ENSOCUG00000016240) CASQ2 (ENSOCUG00000010594) SLC22A15 (ENSOCUG00000015370) MAB21L3 (ENSOCUG00000015382) ##19 ATP1A1 (ENSOCUG00000001324) IGSF3 (ENSOCUG00000005284) CD2 (ENSOCUG00000008474) PTGFRN (ENSOCUG00000000608) CD101 (ENSOCUG00000000612) TTF2 (ENSOCUG00000000613) TRIM45 (ENSOCUG00000000237) VTCN1 (ENSOCUG00000026343) MAN1A2 (ENSOCUG00000012648) ENSOCUG00000026654 ENSOCUG00000027717 #22 GDAP2 (ENSOCUG00000007568) WDR3 (ENSOCUG00000007572) SPAG17 (ENSOCUG00000007586) TBX15 (ENSOCUG00000012320) WARS2 (ENSOCUG00000012330) HAO2 (ENSOCUG00000017949) ENSOCUG00000004132 ZNF697 (ENSOCUG00000014070) PHGDH (ENSOCUG00000005759) HMGCS2 (ENSOCUG00000005767) ENSOCUG00000005773 ADAM30 (ENSOCUG00000013791) PDE4DIP (ENSOCUG00000011228) SEC22B (ENSOCUG00000026877) NOTCH2 (ENSOCUG00000016565) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 665 Ptpn2 (ENSMAUG00000012805) Psmg2 (ENSMAUG00000008209) Cep76 (ENSMAUG00000011313) Spire1 (ENSMAUG00000012928) Prelid3a (ENSMAUG00000017262) ENSMAUG00000017978 Tubb6 (ENSMAUG00000000304) Cidea (ENSMAUG00000012752) Impa2 (ENSMAUG00000016787) ENSMAUG00000017689 Chmp1b (ENSMAUG00000016862) ENSMAUG00000011645 Mc4r (ENSMAUG00000016776) ENSMAUG00000017277 Pmaip1 (ENSMAUG00000011163) ENSMAUG00000017643 #22 Ccbe1 (ENSMAUG00000019440) Lman1 (ENSMAUG00000012020) Cplx4 (ENSMAUG00000014766) Rax (ENSMAUG00000016678) Sec11c (ENSMAUG00000019336) Oacyl (ENSMAUG00000007635) Zfp532 (ENSMAUG00000014049) Malt1 (ENSMAUG00000003952) Alpk2 (ENSMAUG00000011821) Nedd4l (ENSMAUG00000013017) Atp8b1 (ENSMAUG00000008405) Nars (ENSMAUG00000016087) Fech (ENSMAUG00000001873) Onecut2 (ENSMAUG00000009580) St8sia3 (ENSMAUG00000000556) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 ENSHGLG00000021239 PRIM2 (ENSHGLG00000017861) ENSHGLG00000045680 ENSHGLG00000033625 RAB23 (ENSHGLG00000013030) ENSHGLG00000018722 ZNF451 (ENSHGLG00000018721) ENSHGLG00000044728 ENSHGLG00000016807 ENSHGLG00000015021 ENSHGLG00000042791 ENSHGLG00000049299 ENSHGLG00000017371 ENSHGLG00000039205 ENSHGLG00000043295 ENSHGLG00000021000 #22 ENSHGLG00000041746 ENSHGLG00000016044 ENSHGLG00000016555 ENSHGLG00000045218 ENSHGLG00000016253 ENSHGLG00000047769 ENSHGLG00000009668 ENSHGLG00000009488 ENSHGLG00000032934 ENSHGLG00000009673 ENSHGLG00000039274 ENSHGLG00000005827 FANCC (ENSHGLG00000013830) ENSHGLG00000044815 ENSHGLG00000012042 Naked mole-rat female MODERN SPECIES CCR6 (ENSHGLG00000050244) ENSHGLG00000003848 ENSHGLG00000002675 RPS6KA2 (ENSHGLG00000003392) MPC1 (ENSHGLG00000034371) SFT2D1 (ENSHGLG00000002919) ENSHGLG00000049190 ENSHGLG00000032835 ENSHGLG00000040761 ENSHGLG00000041990 TBXT (ENSHGLG00000002638) PDE10A (ENSHGLG00000003609) C6orf118 (ENSHGLG00000040311) ENSHGLG00000002800 ENSHGLG00000033943 ENSHGLG00000020018 #22 QKI (ENSHGLG00000003074) ENSHGLG00000040590 PACRG (ENSHGLG00000048524) ENSHGLG00000041594 ENSHGLG00000050950 PRKN (ENSHGLG00000006873) ENSHGLG00000034284 AGPAT4 (ENSHGLG00000008163) MAP3K4 (ENSHGLG00000011068) ENSHGLG00000017452 ENSHGLG00000017477 ENSHGLG00000050994 ENSHGLG00000034005 ENSHGLG00000017482 ENSHGLG00000014427 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Common shrew MODERN SPECIES 3215 ENSSARG00000000717 #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Megabat MODERN SPECIES 6817 ENSPVAG00000015406 #22 SH3D19 (ENSPVAG00000015408) #23 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Dog MODERN SPECIES 29 GPD2 (ENSCAFG00845025352) ENSCAFG00845025564 ENSCAFG00845025578 GALNT5 (ENSCAFG00845025607) ERMN (ENSCAFG00845025677) CYTIP (ENSCAFG00845025755) ACVR1C (ENSCAFG00845026018) ACVR1 (ENSCAFG00845026311) CCDC148 (ENSCAFG00845026619) PKP4 (ENSCAFG00845026973) DAPL1 (ENSCAFG00845027456) ENSCAFG00845027531 ENSCAFG00845027802 WDSUB1 (ENSCAFG00845027961) BAZ2B (ENSCAFG00845028154) ENSCAFG00845028381 #22 ENSCAFG00845028418 ENSCAFG00845028511 MARCHF7 (ENSCAFG00845028624) CD302 (ENSCAFG00845028722) LY75 (ENSCAFG00845028773) PLA2R1 (ENSCAFG00845028931) ITGB6 (ENSCAFG00845029158) RBMS1 (ENSCAFG00845029501) TANK (ENSCAFG00845029606) ENSCAFG00845029635 PSMD14 (ENSCAFG00845029657) TBR1 (ENSCAFG00845029675) SLC4A10 (ENSCAFG00845029772) ENSCAFG00845029990 DPP4 (ENSCAFG00845030056) Red fox DUPLICATION Red fox MODERN SPECIES 52 CTC1 (ENSVVUG00000028125) PFAS (ENSVVUG00000028138) SLC25A35 (ENSVVUG00000028153) RANGRF (ENSVVUG00000028160) ENSVVUG00000028168 ENSVVUG00000028180 KRBA2 (ENSVVUG00000028186) RPL26 (ENSVVUG00000028189) RNF222 (ENSVVUG00000028195) NDEL1 (ENSVVUG00000028199) MYH10 (ENSVVUG00000028322) CCDC42 (ENSVVUG00000028872) MFSD6L (ENSVVUG00000028874) PIK3R6 (ENSVVUG00000028876) PIK3R5 (ENSVVUG00000028888) ENSVVUG00000028892 #22 NTN1 (ENSVVUG00000028894) STX8 (ENSVVUG00000028896) USP43 (ENSVVUG00000028904) DHRS7C (ENSVVUG00000028908) ENSVVUG00000028911 GLP2R (ENSVVUG00000028914) RCVRN (ENSVVUG00000028918) GAS7 (ENSVVUG00000028920) MYH13 (ENSVVUG00000029033) ENSVVUG00000029387 ENSVVUG00000029396 ENSVVUG00000029408 ENSVVUG00000029445 MYH1 (ENSVVUG00000029610) ENSVVUG00000029624 Red fox MODERN SPECIES 66 SERPINI1 (ENSVVUG00000000154) ENSVVUG00000000200 ENSVVUG00000000244 GOLIM4 (ENSVVUG00000000297) MECOM (ENSVVUG00000000408) ENSVVUG00000000467 ACTRT3 (ENSVVUG00000000497) MYNN (ENSVVUG00000000510) LRRC34 (ENSVVUG00000000575) LRRIQ4 (ENSVVUG00000000662) LRRC31 (ENSVVUG00000000681) ENSVVUG00000000692 SAMD7 (ENSVVUG00000000702) SEC62 (ENSVVUG00000000766) PHC3 (ENSVVUG00000000912) ENSVVUG00000001040 #22 PRKCI (ENSVVUG00000001057) SKIL (ENSVVUG00000001083) CLDN11 (ENSVVUG00000001091) SLC7A14 (ENSVVUG00000001102) ENSVVUG00000001121 RPL22L1 (ENSVVUG00000001132) EIF5A2 (ENSVVUG00000001140) ENSVVUG00000001154 SLC2A2 (ENSVVUG00000001163) ENSVVUG00000001177 TNIK (ENSVVUG00000001221) PLD1 (ENSVVUG00000001416) TMEM212 (ENSVVUG00000001592) FNDC3B (ENSVVUG00000001630) GHSR (ENSVVUG00000001716) Red fox MODERN SPECIES 32 TMTC1 (ENSVVUG00000007025) ENSVVUG00000007116 #22 IPO8 (ENSVVUG00000007129) CAPRIN2 (ENSVVUG00000007217) SINHCAF (ENSVVUG00000007293) DENND5B (ENSVVUG00000007385) ETFBKMT (ENSVVUG00000012506) AMN1 (ENSVVUG00000012511) KIAA1551 (ENSVVUG00000012517) BICD1 (ENSVVUG00000012549) FGD4 (ENSVVUG00000012593) DNM1L (ENSVVUG00000012652) YARS2 (ENSVVUG00000012736) PKP2 (ENSVVUG00000012741) SYT10 (ENSVVUG00000012752) ENSVVUG00000012762 ENSVVUG00000012767 Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES 82 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00390000011576.a ENSGT00390000014876 ENSGT00940000153763.b ENSGT00940000158460 ENSGT00940000155875 American mink MODERN SPECIES 266 ENSNVIG00000009740 #22 ENSNVIG00000009616 #24 PRSS48 (ENSNVIG00000009457) #24 SH3D19 (ENSNVIG00000009212) #23 FHIP1A (ENSNVIG00000009145) #25 GATB (ENSNVIG00000009094) #26 FBXW7 (ENSNVIG00000008986) #27 TM154 (ENSNVIG00000008959) #28 TIGD4 (ENSNVIG00000008950) #29 ARFIP1 (ENSNVIG00000008921) #30 FHDC1 (ENSNVIG00000008899) #32 TRIM2 (ENSNVIG00000008862) #33 MFAP3L (ENSNVIG00000008842) ENSNVIG00000008836 ENSNVIG00000008830 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 American black bear DUPLICATION American black bear MODERN SPECIES 8911 ENSUAMG00000001612 #22 American black bear MODERN SPECIES 133 ENSUAMG00000002113 #22 TBX5 (ENSUAMG00000002094) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Arabian camel MODERN SPECIES 11 C4orf51 (ENSCDRG00005020225) ZNF827 (ENSCDRG00005020126) LSM6 (ENSCDRG00005020097) REELD1 (ENSCDRG00005020091) #7 SLC10A7 (ENSCDRG00005020015) #8 POU4F2 (ENSCDRG00005019973) #9 TTC29 (ENSCDRG00005019850) #10 EDNRA (ENSCDRG00005019808) #11 TMEM184C (ENSCDRG00005019797) #12 PRMT9 (ENSCDRG00005019766) #13 ARHGAP10 (ENSCDRG00005019732) #14 NR3C2 (ENSCDRG00005019699) #15 DCLK2 (ENSCDRG00005019609) #17 MAB21L2 (ENSCDRG00005019587) #19 LRBA (ENSCDRG00005019229) #18 RPS3A (ENSCDRG00005019167) #22 SH3D19 (ENSCDRG00005018965) #23 PRSS48 (ENSCDRG00005018930) #24 FHIP1A (ENSCDRG00005018885) #25 GATB (ENSCDRG00005018830) #26 FBXW7 (ENSCDRG00005018704) #27 TMEM154 (ENSCDRG00005018674) #28 TIGD4 (ENSCDRG00005018659) #29 ARFIP1 (ENSCDRG00005018580) #30 FHDC1 (ENSCDRG00005018522) #32 TRIM2 (ENSCDRG00005018429) #33 MND1 (ENSCDRG00005018329) #35 TMEM131L (ENSCDRG00005016677) #36 RNF175 (ENSCDRG00005016510) SFRP2 (ENSCDRG00005016484) ENSCDRG00005016436 Alpaca MODERN SPECIES 1904 ENSVPAG00000004226 #17 LRBA (ENSVPAG00000004227) #18 ENSVPAG00000004235 #22 SH3D19 (ENSVPAG00000004238) #23 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Blue whale DUPLICATION Blue whale MODERN SPECIES 16 ZNF827 (ENSBMSG00010002746) LSM6 (ENSBMSG00010003073) REELD1 (ENSBMSG00010003085) #7 SLC10A7 (ENSBMSG00010003119) #8 POU4F2 (ENSBMSG00010003153) #9 TTC29 (ENSBMSG00010003177) #10 EDNRA (ENSBMSG00010003277) #11 TMEM184C (ENSBMSG00010003315) #12 PRMT9 (ENSBMSG00010003326) #13 ARHGAP10 (ENSBMSG00010003339) #14 NR3C2 (ENSBMSG00010000098) #15 DCLK2 (ENSBMSG00010000211) #17 LRBA (ENSBMSG00010000269) #18 MAB21L2 (ENSBMSG00010000320) #19 ENSBMSG00010000334 ENSBMSG00010000355 #22 SH3D19 (ENSBMSG00010000484) #23 ENSBMSG00010000685 PRSS48 (ENSBMSG00010000700) #24 FHIP1A (ENSBMSG00010000741) #25 GATB (ENSBMSG00010000775) #26 FBXW7 (ENSBMSG00010000836) #27 ENSBMSG00010000895 TMEM154 (ENSBMSG00010000916) #28 ARFIP1 (ENSBMSG00010000954) #30 FHDC1 (ENSBMSG00010001001) #32 TRIM2 (ENSBMSG00010001046) #33 MND1 (ENSBMSG00010001093) #35 TMEM131L (ENSBMSG00010001155) #36 TLR2 (ENSBMSG00010001186) SFRP2 (ENSBMSG00010001204) Blue whale MODERN SPECIES 7 ENTPD1 (ENSBMSG00010017599) TCTN3 (ENSBMSG00010017781) ALDH18A1 (ENSBMSG00010017908) SORBS1 (ENSBMSG00010018518) ENSBMSG00010021832 ENSBMSG00010021844 HELLS (ENSBMSG00010021861) TBC1D12 (ENSBMSG00010021878) NOC3L (ENSBMSG00010021889) SLC35G1 (ENSBMSG00010021974) LGI1 (ENSBMSG00010021984) FRA10AC1 (ENSBMSG00010022001) PDE6C (ENSBMSG00010022010) RBP4 (ENSBMSG00010022013) ENSBMSG00010022016 ENSBMSG00010022018 #22 CEP55 (ENSBMSG00010022021) MYOF (ENSBMSG00010022038) CYP26A1 (ENSBMSG00010022052) CYP26C1 (ENSBMSG00010022056) EXOC6 (ENSBMSG00010022075) HHEX (ENSBMSG00010022091) KIF11 (ENSBMSG00010022092) IDE (ENSBMSG00010022094) MARCHF5 (ENSBMSG00010022096) CPEB3 (ENSBMSG00010022099) BTAF1 (ENSBMSG00010022106) FGFBP3 (ENSBMSG00010022112) TNKS2 (ENSBMSG00010022115) PPP1R3C (ENSBMSG00010022118) HECTD2 (ENSBMSG00010022121) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183123.g.b.b.g.a ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000155384.a.h ENSGT00940000157094 ENSGT01060000248806.b ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00980000199387.d.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000156357 ENSGT00440000038909 ENSGT00940000159405 ENSGT00950000182995.e.b.c.a ENSGT00390000004263.a ENSGT00390000013853 ENSGT00940000158485 ENSGT00390000018094 ENSGT01030000234881 ENSGT00390000012436.d ENSGT00920000149145 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Vaquita MODERN SPECIES 16 MMAA (ENSPSNG00000014172) ZNF827 (ENSPSNG00000013982) LSM6 (ENSPSNG00000013905) SLC10A7 (ENSPSNG00000013581) #8 POU4F2 (ENSPSNG00000013436) #9 TTC29 (ENSPSNG00000013058) #10 EDNRA (ENSPSNG00000012879) #11 TMEM184C (ENSPSNG00000012807) #12 PRMT9 (ENSPSNG00000012767) #13 ARHGAP10 (ENSPSNG00000012644) #14 NR3C2 (ENSPSNG00000012520) #15 DCLK2 (ENSPSNG00000012086) #17 MAB21L2 (ENSPSNG00000012010) #19 LRBA (ENSPSNG00000011879) #18 ENSPSNG00000011823 ENSPSNG00000011717 #22 ENSPSNG00000011692 SH3D19 (ENSPSNG00000011168) #23 FHIP1A (ENSPSNG00000010974) #25 GATB (ENSPSNG00000010878) #26 ENSPSNG00000010818 FBXW7 (ENSPSNG00000010559) #27 TMEM154 (ENSPSNG00000010480) #28 TIGD4 (ENSPSNG00000010453) #29 ARFIP1 (ENSPSNG00000010310) #30 FHDC1 (ENSPSNG00000010257) #32 TRIM2 (ENSPSNG00000010022) #33 MND1 (ENSPSNG00000009919) #35 TMEM131L (ENSPSNG00000009760) #36 TLR2 (ENSPSNG00000006991) RNF175 (ENSPSNG00000006939) Sperm whale MODERN SPECIES 18 LSM6 (ENSPCTG00005001901) SLC10A7 (ENSPCTG00005001951) #8 POU4F2 (ENSPCTG00005002032) #9 TTC29 (ENSPCTG00005002054) #10 ENSPCTG00005002142 EDNRA (ENSPCTG00005002154) #11 TMEM184C (ENSPCTG00005002203) #12 PRMT9 (ENSPCTG00005002225) #13 ARHGAP10 (ENSPCTG00005002260) #14 NR3C2 (ENSPCTG00005002287) #15 ENSPCTG00005002306 DCLK2 (ENSPCTG00005002361) #17 LRBA (ENSPCTG00005002441) #18 MAB21L2 (ENSPCTG00005002519) #19 ENSPCTG00005002525 ENSPCTG00005002537 #22 SH3D19 (ENSPCTG00005002589) #23 PRSS48 (ENSPCTG00005002685) #24 FHIP1A (ENSPCTG00005002716) #25 GATB (ENSPCTG00005002750) #26 FBXW7 (ENSPCTG00005002824) #27 ENSPCTG00005002861 TMEM154 (ENSPCTG00005002881) #28 ENSPCTG00005002902 #32 ARFIP1 (ENSPCTG00005002925) #30 TIGD4 (ENSPCTG00005002959) #29 TRIM2 (ENSPCTG00005003026) #33 TMEM131L (ENSPCTG00005003230) #36 TLR2 (ENSPCTG00005003249) SFRP2 (ENSPCTG00005003256) ENSPCTG00005003270 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1247 WNT5B (ENSMMSG00000014636) ADIPOR2 (ENSMMSG00000014605) ENSMMSG00000014517 LRTM2 (ENSMMSG00000014502) ENSMMSG00000014466 DCP1B (ENSMMSG00000014448) ENSMMSG00000014423 ENSMMSG00000014345 IL17RA (ENSMMSG00000014317) ENSMMSG00000014301 HDHD5 (ENSMMSG00000014272) ADA2 (ENSMMSG00000014193) ATP6V1E1 (ENSMMSG00000013750) ENSMMSG00000013663 BID (ENSMMSG00000013621) ENSMMSG00000018983 #22 MICAL3 (ENSMMSG00000018708) PEX26 (ENSMMSG00000018617) TUBA8 (ENSMMSG00000018574) CDC42EP1 (ENSMMSG00000018551) LGALS2 (ENSMMSG00000018515) GGA1 (ENSMMSG00000018276) SH3BP1 (ENSMMSG00000018209) PDXP (ENSMMSG00000018187) ENSMMSG00000018156 NOL12 (ENSMMSG00000018131) ENSMMSG00000018107 ENSMMSG00000018048 H1-0 (ENSMMSG00000018029) GCAT (ENSMMSG00000017960) GALR3 (ENSMMSG00000017921) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000155485.a.a.a.b.g.a ENSGT01090000260076.b.b ENSGT00390000013549.a.b.b.o.b ENSGT00940000167876 ENSGT00950000182900.D.d.b ENSGT00390000018199.b.b.b ENSGT00940000163449 ENSGT00950000183066.a.a.a.d.c ENSGT00950000183066.a.a.a.d.d ENSGT01030000235726 ENSGT00940000160633 ENSGT00550000074891 ENSGT00940000156040 ENSGT01030000234646.B.a.b ENSGT00390000013549.a.b.b.o.a.g.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00390000013549.a.b.b.o.a.g.b ENSGT00940000158684 ENSGT00550000074801.g.b.b ENSGT00940000159116 ENSGT00510000048637 ENSGT00530000063666.b ENSGT00950000183121.b.b.b.b ENSGT00390000005330 ENSGT00940000153430.a.a ENSGT00940000157080 ENSGT00940000164183 ENSGT00950000185346 ENSGT00940000157313 ENSGT00870000136506 ENSGT00940000167584 Cow MODERN SPECIES 177 IL1RAPL1 (ENSBTAG00000053869) ENSBTAG00000050834 ENSBTAG00000011750 ENSBTAG00000054034 ENSBTAG00000052068 PPP4R3C (ENSBTAG00000008511) ENSBTAG00000053213 ENSBTAG00000018583 ENSBTAG00000053624 ENSBTAG00000048848 ARX (ENSBTAG00000050504) POLA1 (ENSBTAG00000008170) PCYT1B (ENSBTAG00000016107) PDK3 (ENSBTAG00000017832) ENSBTAG00000006384 ENSBTAG00000006383 #22 ZFX (ENSBTAG00000007730) EIF2S3 (ENSBTAG00000014337) KLHL15 (ENSBTAG00000020561) CXHXorf58 (ENSBTAG00000010939) APOO (ENSBTAG00000010937) SAT1 (ENSBTAG00000017363) ACOT9 (ENSBTAG00000011258) PRDX4 (ENSBTAG00000006165) PTCHD1 (ENSBTAG00000020987) ENSBTAG00000046635 ENSBTAG00000049480 PHEX (ENSBTAG00000000419) ENSBTAG00000052700 SMS (ENSBTAG00000018382) MBTPS2 (ENSBTAG00000008183) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 315 ENSBIXG00005022231 ENSBIXG00005022260 ENSBIXG00005022280 ENSBIXG00005003800 ENSBIXG00005022382 MAGEB18 (ENSBIXG00005022439) ENSBIXG00005022466 ENSBIXG00005022474 ENSBIXG00005022491 ARX (ENSBIXG00005022524) ENSBIXG00005003841 POLA1 (ENSBIXG00005022900) PCYT1B (ENSBIXG00005023067) PDK3 (ENSBIXG00005023130) ENSBIXG00005003945 ENSBIXG00005023185 #22 ENSBIXG00005023233 ENSBIXG00005023490 ENSBIXG00005004027 KLHL15 (ENSBIXG00005023551) CXorf58 (ENSBIXG00005023583) APOO (ENSBIXG00005023656) ENSBIXG00005006902 SAT1 (ENSBIXG00005023734) ACOT9 (ENSBIXG00005023796) PRDX4 (ENSBIXG00005023849) PTCHD1 (ENSBIXG00005023943) ENSBIXG00005024020 ENSBIXG00005024079 ENSBIXG00005024121 PHEX (ENSBIXG00005024241) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Domestic yak MODERN SPECIES 8 SYNM (ENSBGRG00000005981) TTC23 (ENSBGRG00000005798) LRRC28 (ENSBGRG00000005615) MEF2A (ENSBGRG00000005494) LYSMD4 (ENSBGRG00000005456) ADAMTS17 (ENSBGRG00000004987) CERS3 (ENSBGRG00000004770) LINS1 (ENSBGRG00000004716) ASB7 (ENSBGRG00000004639) ENSBGRG00000004632 ALDH1A3 (ENSBGRG00000004521) LRRK1 (ENSBGRG00000004461) CHSY1 (ENSBGRG00000004426) SELENOS (ENSBGRG00000004321) ENSBGRG00000004294 ENSBGRG00000004250 #22 GABRG3 (ENSBGRG00000004154) GABRA5 (ENSBGRG00000004069) ENSBGRG00000004040 GABRB3 (ENSBGRG00000003940) ENSBGRG00000003908 ATP10A (ENSBGRG00000003850) UBE3A (ENSBGRG00000003821) SNRPN (ENSBGRG00000023848) SNURF (ENSBGRG00000023752) ENSBGRG00000023739 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 8 MMAA (ENSOARG00020024857) C4orf51 (ENSOARG00020024840) ZNF827 (ENSOARG00020024616) POU4F2 (ENSOARG00020024207) #9 TTC29 (ENSOARG00020024092) #10 EDNRA (ENSOARG00020024024) #11 TMEM184C (ENSOARG00020023997) #12 PRMT9 (ENSOARG00020023961) #13 ARHGAP10 (ENSOARG00020023485) #14 NR3C2 (ENSOARG00020023338) #15 ENSOARG00020023315 IQCM (ENSOARG00020023274) #16 DCLK2 (ENSOARG00020022528) #17 MAB21L2 (ENSOARG00020022453) #19 LRBA (ENSOARG00020021581) #18 ENSOARG00020021320 #22 PRSS48 (ENSOARG00020021133) #24 FHIP1A (ENSOARG00020021013) #25 GATB (ENSOARG00020020844) #26 FBXW7 (ENSOARG00020020349) #27 TMEM154 (ENSOARG00020020174) #28 TIGD4 (ENSOARG00020020159) #29 ARFIP1 (ENSOARG00020019865) #30 FHDC1 (ENSOARG00020019747) #32 ENSOARG00020019717 TRIM2 (ENSOARG00020019393) #33 MND1 (ENSOARG00020019027) #35 TMEM131L (ENSOARG00020017957) #36 RNF175 (ENSOARG00020017703) SFRP2 (ENSOARG00020017587) ENSOARG00020017458 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 28 REELD1 (ENSCHYG00000001740) #7 SLC10A7 (ENSCHYG00000001854) #8 POU4F2 (ENSCHYG00000002171) #9 TTC29 (ENSCHYG00000002186) #10 EDNRA (ENSCHYG00000002219) #11 ENSCHYG00000002240 ENSCHYG00000002250 TMEM184C (ENSCHYG00000002271) #12 PRMT9 (ENSCHYG00000002291) #13 ARHGAP10 (ENSCHYG00000002323) #14 NR3C2 (ENSCHYG00000002397) #15 DCLK2 (ENSCHYG00000002537) #17 LRBA (ENSCHYG00000002706) #18 MAB21L2 (ENSCHYG00000002890) #19 ENSCHYG00000002898 ENSCHYG00000002911 #22 ENSCHYG00000002979 #23 ENSCHYG00000003142 #24 PRSS48 (ENSCHYG00000003160) #24 ENSCHYG00000003187 FHIP1A (ENSCHYG00000003200) #25 GATB (ENSCHYG00000003235) #26 FBXW7 (ENSCHYG00000003330) #27 TMEM154 (ENSCHYG00000003416) #28 TIGD4 (ENSCHYG00000003442) #29 ENSCHYG00000003448 ARFIP1 (ENSCHYG00000003479) #30 FHDC1 (ENSCHYG00000003520) #32 TRIM2 (ENSCHYG00000003564) #33 MND1 (ENSCHYG00000003669) #35 ENSCHYG00000003717 Yarkand deer MODERN SPECIES 26 MAP3K20 (ENSCHYG00000019464) ENSCHYG00000019193 SP3 (ENSCHYG00000019030) ENSCHYG00000018536 SP9 (ENSCHYG00000018463) CIR1 (ENSCHYG00000018323) ENSCHYG00000018263 GPR155 (ENSCHYG00000018083) ENSCHYG00000017877 CHRNA1 (ENSCHYG00000017619) ENSCHYG00000017575 CHN1 (ENSCHYG00000017015) ATF2 (ENSCHYG00000016575) ATP5MC3 (ENSCHYG00000016464) ENSCHYG00000016417 ENSCHYG00000016391 #22 LNPK (ENSCHYG00000016125) HOXD13 (ENSCHYG00000015985) HOXD12 (ENSCHYG00000015954) ENSCHYG00000015846 HOXD10 (ENSCHYG00000015831) HOXD9 (ENSCHYG00000015808) HOXD8 (ENSCHYG00000015741) HOXD4 (ENSCHYG00000015683) HOXD3 (ENSCHYG00000015650) HOXD1 (ENSCHYG00000015562) MTX2 (ENSCHYG00000015392) ENSCHYG00000015305 ENSCHYG00000015038 NFE2L2 (ENSCHYG00000024719) AGPS (ENSCHYG00000024578)