Eutheria DUPLICATION Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Primates ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Simiiformes ANCESTRAL SPECIES 10 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00940000154257.i.a.a #34 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Orangutan MODERN SPECIES 17 REELD1 (ENSPPYG00000038439) #7 SLC10A7 (ENSPPYG00000015106) #8 POU4F2 (ENSPPYG00000015107) #9 TTC29 (ENSPPYG00000015108) #10 EDNRA (ENSPPYG00000015109) #11 TMEM184C (ENSPPYG00000034968) #12 PRMT9 (ENSPPYG00000015111) #13 ARHGAP10 (ENSPPYG00000015112) #14 NR3C2 (ENSPPYG00000015113) #15 IQCM (ENSPPYG00000015114) #16 DCLK2 (ENSPPYG00000015115) #17 LRBA (ENSPPYG00000015116) #18 MAB21L2 (ENSPPYG00000015117) #19 ENSPPYG00000031388 #20 ENSPPYG00000035707 #21 RPS3A (ENSPPYG00000025869) #22 SH3D19 (ENSPPYG00000015118) #23 PRSS48 (ENSPPYG00000015119) #24 FHIP1A (ENSPPYG00000015120) #25 GATB (ENSPPYG00000015121) #26 FBXW7 (ENSPPYG00000015122) #27 TMEM154 (ENSPPYG00000015124) #28 TIGD4 (ENSPPYG00000015125) #29 ARFIP1 (ENSPPYG00000015126) #30 ENSPPYG00000039750 #31 FHDC1 (ENSPPYG00000015127) #32 TRIM2 (ENSPPYG00000015128) #33 ENSPPYG00000039576 #34 MND1 (ENSPPYG00000015129) #35 TMEM131L (ENSPPYG00000015130) #36 ENSPPYG00000036033 #37 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Bonobo MODERN SPECIES 17 POU4F2 (ENSPPAG00000035263) #9 TTC29 (ENSPPAG00000039325) #10 ENSPPAG00000027341 EDNRA (ENSPPAG00000037609) #11 TMEM184C (ENSPPAG00000032567) #12 PRMT9 (ENSPPAG00000043067) #13 ARHGAP10 (ENSPPAG00000003388) #14 NR3C2 (ENSPPAG00000031751) #15 IQCM (ENSPPAG00000041665) #16 DCLK2 (ENSPPAG00000041046) #17 LRBA (ENSPPAG00000042647) #18 ENSPPAG00000044104 MAB21L2 (ENSPPAG00000024444) #19 ENSPPAG00000044106 #20 ENSPPAG00000044108 ##21 ENSPPAG00000044109 #22 ENSPPAG00000044129 #23 PRSS48 (ENSPPAG00000037675) #24 FHIP1A (ENSPPAG00000032398) #25 GATB (ENSPPAG00000041690) #26 FBXW7 (ENSPPAG00000035178) #27 TMEM154 (ENSPPAG00000036040) #28 TIGD4 (ENSPPAG00000012681) #29 ARFIP1 (ENSPPAG00000031157) #30 ENSPPAG00000043551 ##31 FHDC1 (ENSPPAG00000028121) #32 TRIM2 (ENSPPAG00000038637) #33 ENSPPAG00000040974 #34 MND1 (ENSPPAG00000032409) #35 TMEM131L (ENSPPAG00000035999) #36 ENSPPAG00000043739 #37 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Drill MODERN SPECIES 1565 ENSMLEG00000016739 CAMK1D (ENSMLEG00000003491) CCDC3 (ENSMLEG00000030418) ENSMLEG00000035233 OPTN (ENSMLEG00000026081) ENSMLEG00000037306 MCM10 (ENSMLEG00000037584) UCMA (ENSMLEG00000034904) PHYH (ENSMLEG00000032777) ENSMLEG00000041585 ENSMLEG00000005976 #22 ENSMLEG00000016771 PRPF18 (ENSMLEG00000031715) ENSMLEG00000038593 ENSMLEG00000042543 ENSMLEG00000004764 FAM107B (ENSMLEG00000041121) CDNF (ENSMLEG00000032491) HSPA14 (ENSMLEG00000039837) ENSMLEG00000044215 DCLRE1C (ENSMLEG00000044355) ENSMLEG00000008746 ACBD7 (ENSMLEG00000027471) ENSMLEG00000039491 NMT2 (ENSMLEG00000041367) FAM171A1 (ENSMLEG00000034787) Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES 5 ENSGT00940000154978.h.a ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201.g.b #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00940000154257.i.a.a #34 ENSGT00490000043413.a.a.a #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Cebidae ANCESTRAL SPECIES 4 ENSGT00940000154978.h.a ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201.g.b #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00950000184824 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00940000154257.i.a.a #34 ENSGT00490000043413.a.a.a #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Capuchin MODERN SPECIES 812 ZNF16 (ENSCCAG00000020536) ENSCCAG00000020238 ZNF250 (ENSCCAG00000029410) COMMD5 (ENSCCAG00000013590) ENSCCAG00000025292 ZNF7 (ENSCCAG00000024294) ZNF517 (ENSCCAG00000019662) ENSCCAG00000032759 ENSCCAG00000023353 ENSCCAG00000018165 RPS3A (ENSCCAG00000023774) #22 PRSS48 (ENSCCAG00000025335) #24 SH3D19 (ENSCCAG00000021260) #23 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES 32 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413.c.b #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 156 ZNF827 (ENSOGAG00000005635) ENSOGAG00000026665 SLC10A7 (ENSOGAG00000008690) #8 POU4F2 (ENSOGAG00000028626) #9 TTC29 (ENSOGAG00000010351) #10 EDNRA (ENSOGAG00000015817) #11 TMEM184C (ENSOGAG00000015819) #12 PRMT9 (ENSOGAG00000015825) #13 ENSOGAG00000014000 #14 NR3C2 (ENSOGAG00000014008) #15 ENSOGAG00000033581 DCLK2 (ENSOGAG00000003223) #17 ENSOGAG00000003228 #18 MAB21L2 (ENSOGAG00000029639) #19 ENSOGAG00000031521 #18 ENSOGAG00000007634 #22 SH3D19 (ENSOGAG00000012447) #23 ENSOGAG00000024160 #24 FHIP1A (ENSOGAG00000032830) #25 GATB (ENSOGAG00000014181) #26 FBXW7 (ENSOGAG00000011827) #27 TMEM154 (ENSOGAG00000013516) #28 ENSOGAG00000026906 TIGD4 (ENSOGAG00000005277) #29 ARFIP1 (ENSOGAG00000005278) #30 FHDC1 (ENSOGAG00000032525) #32 TRIM2 (ENSOGAG00000013235) #33 ENSOGAG00000011987 #35 TMEM131L (ENSOGAG00000000832) #36 ENSOGAG00000032650 TLR2 (ENSOGAG00000027703) Bushbaby MODERN SPECIES 224 ENOX2 (ENSOGAG00000003494) ARHGAP36 (ENSOGAG00000000291) IGSF1 (ENSOGAG00000013044) ENSOGAG00000025500 ENSOGAG00000026712 OR13H1 (ENSOGAG00000026372) ENSOGAG00000027130 STK26 (ENSOGAG00000002621) FRMD7 (ENSOGAG00000002622) RAP2C (ENSOGAG00000003141) MBNL3 (ENSOGAG00000003143) HS6ST2 (ENSOGAG00000006658) ENSOGAG00000029621 GPC4 (ENSOGAG00000007022) ENSOGAG00000007481 ENSOGAG00000027754 #22 ENSOGAG00000033085 ENSOGAG00000028310 CCDC160 (ENSOGAG00000032387) PHF6 (ENSOGAG00000003877) HPRT1 (ENSOGAG00000003881) PLAC1 (ENSOGAG00000013655) PABIR2 (ENSOGAG00000005733) MOSPD1 (ENSOGAG00000005739) Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES 38 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.n ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413.c.a #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES 61 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978.n ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413.c.b #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a ENSGT00940000162999 Greater bamboo lemur MODERN SPECIES 330 AKAP1 (ENSPSMG00000020414) SCPEP1 (ENSPSMG00000020459) COIL (ENSPSMG00000020468) TRIM25 (ENSPSMG00000020499) DGKE (ENSPSMG00000020514) ENSPSMG00000020520 C17orf67 (ENSPSMG00000020529) ENSPSMG00000020534 NOG (ENSPSMG00000020542) ANKFN1 (ENSPSMG00000020557) IQCM (ENSPSMG00000020578) #16 DCLK2 (ENSPSMG00000020757) #17 LRBA (ENSPSMG00000021044) #18 MAB21L2 (ENSPSMG00000021119) #19 ENSPSMG00000021150 #22 SH3D19 (ENSPSMG00000021327) #23 ENSPSMG00000021366 FHIP1A (ENSPSMG00000021372) #25 GATB (ENSPSMG00000021442) #26 FBXW7 (ENSPSMG00000021518) #27 TMEM154 (ENSPSMG00000021541) #28 TIGD4 (ENSPSMG00000021545) #29 ARFIP1 (ENSPSMG00000021599) #30 FHDC1 (ENSPSMG00000021613) #32 TRIM2 (ENSPSMG00000021653) #33 MND1 (ENSPSMG00000021692) #35 TMEM131L (ENSPSMG00000021736) #36 TLR2 (ENSPSMG00000021752) RNF175 (ENSPSMG00000021767) SFRP2 (ENSPSMG00000021778) Coquerels sifaka MODERN SPECIES 951 ABHD12B (ENSPCOG00000024199) NIN (ENSPCOG00000008345) SAV1 (ENSPCOG00000017075) ATL1 (ENSPCOG00000015429) MAP4K5 (ENSPCOG00000016345) CDKL1 (ENSPCOG00000023543) DMAC2L (ENSPCOG00000014032) L2HGDH (ENSPCOG00000028342) SOS2 (ENSPCOG00000016272) VCPKMT (ENSPCOG00000020609) ARF6 (ENSPCOG00000000684) NEMF (ENSPCOG00000013328) KLHDC2 (ENSPCOG00000027810) ENSPCOG00000013951 POLE2 (ENSPCOG00000027285) ENSPCOG00000008650 #22 DNAAF2 (ENSPCOG00000022293) ENSPCOG00000012793 LRR1 (ENSPCOG00000026498) ENSPCOG00000024671 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES 69 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES 6 LSM6 (ENSOCUG00000017495) REELD1 (ENSOCUG00000034608) #7 SLC10A7 (ENSOCUG00000012552) #8 POU4F2 (ENSOCUG00000012636) #9 TTC29 (ENSOCUG00000021290) #10 ENSOCUG00000031243 EDNRA (ENSOCUG00000001250) #11 TMEM184C (ENSOCUG00000001732) #12 PRMT9 (ENSOCUG00000003110) #13 ARHGAP10 (ENSOCUG00000003124) #14 NR3C2 (ENSOCUG00000003137) #15 ENSOCUG00000025176 IQCM (ENSOCUG00000027563) #16 DCLK2 (ENSOCUG00000008443) #17 LRBA (ENSOCUG00000008453) #18 ENSOCUG00000007011 #22 ENSOCUG00000022119 PRSS48 (ENSOCUG00000021850) #24 SH3D19 (ENSOCUG00000007014) #23 FHIP1A (ENSOCUG00000002636) #25 GATB (ENSOCUG00000016875) #26 FBXW7 (ENSOCUG00000008440) #27 TMEM154 (ENSOCUG00000029467) #28 TIGD4 (ENSOCUG00000012496) #29 ARFIP1 (ENSOCUG00000014132) #30 FHDC1 (ENSOCUG00000003876) #32 ENSOCUG00000037579 RBM46 (ENSOCUG00000017859) LRAT (ENSOCUG00000017861) ENSOCUG00000011239 FGB (ENSOCUG00000011235) Rabbit MODERN SPECIES 4 NGF (ENSOCUG00000000659) VANGL1 (ENSOCUG00000016240) CASQ2 (ENSOCUG00000010594) SLC22A15 (ENSOCUG00000015370) MAB21L3 (ENSOCUG00000015382) ##19 ATP1A1 (ENSOCUG00000001324) IGSF3 (ENSOCUG00000005284) CD2 (ENSOCUG00000008474) PTGFRN (ENSOCUG00000000608) CD101 (ENSOCUG00000000612) TTF2 (ENSOCUG00000000613) TRIM45 (ENSOCUG00000000237) VTCN1 (ENSOCUG00000026343) MAN1A2 (ENSOCUG00000012648) ENSOCUG00000026654 ENSOCUG00000027717 #22 GDAP2 (ENSOCUG00000007568) WDR3 (ENSOCUG00000007572) SPAG17 (ENSOCUG00000007586) TBX15 (ENSOCUG00000012320) WARS2 (ENSOCUG00000012330) HAO2 (ENSOCUG00000017949) ENSOCUG00000004132 ZNF697 (ENSOCUG00000014070) PHGDH (ENSOCUG00000005759) HMGCS2 (ENSOCUG00000005767) ENSOCUG00000005773 ADAM30 (ENSOCUG00000013791) PDE4DIP (ENSOCUG00000011228) SEC22B (ENSOCUG00000026877) NOTCH2 (ENSOCUG00000016565) Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Golden Hamster MODERN SPECIES 665 Ptpn2 (ENSMAUG00000012805) Psmg2 (ENSMAUG00000008209) Cep76 (ENSMAUG00000011313) Spire1 (ENSMAUG00000012928) Prelid3a (ENSMAUG00000017262) ENSMAUG00000017978 Tubb6 (ENSMAUG00000000304) Cidea (ENSMAUG00000012752) Impa2 (ENSMAUG00000016787) ENSMAUG00000017689 Chmp1b (ENSMAUG00000016862) ENSMAUG00000011645 Mc4r (ENSMAUG00000016776) ENSMAUG00000017277 Pmaip1 (ENSMAUG00000011163) ENSMAUG00000017643 #22 Ccbe1 (ENSMAUG00000019440) Lman1 (ENSMAUG00000012020) Cplx4 (ENSMAUG00000014766) Rax (ENSMAUG00000016678) Sec11c (ENSMAUG00000019336) Oacyl (ENSMAUG00000007635) Zfp532 (ENSMAUG00000014049) Malt1 (ENSMAUG00000003952) Alpk2 (ENSMAUG00000011821) Nedd4l (ENSMAUG00000013017) Atp8b1 (ENSMAUG00000008405) Nars (ENSMAUG00000016087) Fech (ENSMAUG00000001873) Onecut2 (ENSMAUG00000009580) St8sia3 (ENSMAUG00000000556) Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Naked mole-rat female DUPLICATION Naked mole-rat female MODERN SPECIES 14 ENSHGLG00000021239 PRIM2 (ENSHGLG00000017861) ENSHGLG00000045680 ENSHGLG00000033625 RAB23 (ENSHGLG00000013030) ENSHGLG00000018722 ZNF451 (ENSHGLG00000018721) ENSHGLG00000044728 ENSHGLG00000016807 ENSHGLG00000015021 ENSHGLG00000042791 ENSHGLG00000049299 ENSHGLG00000017371 ENSHGLG00000039205 ENSHGLG00000043295 ENSHGLG00000021000 #22 ENSHGLG00000041746 ENSHGLG00000016044 ENSHGLG00000016555 ENSHGLG00000045218 ENSHGLG00000016253 ENSHGLG00000047769 ENSHGLG00000009668 ENSHGLG00000009488 ENSHGLG00000032934 ENSHGLG00000009673 ENSHGLG00000039274 ENSHGLG00000005827 FANCC (ENSHGLG00000013830) ENSHGLG00000044815 ENSHGLG00000012042 Naked mole-rat female MODERN SPECIES CCR6 (ENSHGLG00000050244) ENSHGLG00000003848 ENSHGLG00000002675 RPS6KA2 (ENSHGLG00000003392) MPC1 (ENSHGLG00000034371) SFT2D1 (ENSHGLG00000002919) ENSHGLG00000049190 ENSHGLG00000032835 ENSHGLG00000040761 ENSHGLG00000041990 TBXT (ENSHGLG00000002638) PDE10A (ENSHGLG00000003609) C6orf118 (ENSHGLG00000040311) ENSHGLG00000002800 ENSHGLG00000033943 ENSHGLG00000020018 #22 QKI (ENSHGLG00000003074) ENSHGLG00000040590 PACRG (ENSHGLG00000048524) ENSHGLG00000041594 ENSHGLG00000050950 PRKN (ENSHGLG00000006873) ENSHGLG00000034284 AGPAT4 (ENSHGLG00000008163) MAP3K4 (ENSHGLG00000011068) ENSHGLG00000017452 ENSHGLG00000017477 ENSHGLG00000050994 ENSHGLG00000034005 ENSHGLG00000017482 ENSHGLG00000014427 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Eulipotyphla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Common shrew MODERN SPECIES 3215 ENSSARG00000000717 #22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Megabat MODERN SPECIES 6817 ENSPVAG00000015406 #22 SH3D19 (ENSPVAG00000015408) #23 Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Canidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Dog MODERN SPECIES 29 GPD2 (ENSCAFG00845025352) ENSCAFG00845025564 ENSCAFG00845025578 GALNT5 (ENSCAFG00845025607) ERMN (ENSCAFG00845025677) CYTIP (ENSCAFG00845025755) ACVR1C (ENSCAFG00845026018) ACVR1 (ENSCAFG00845026311) CCDC148 (ENSCAFG00845026619) PKP4 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ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00390000011576.a ENSGT00390000014876 ENSGT00940000153763.b ENSGT00940000158460 ENSGT00940000155875 American mink MODERN SPECIES 266 ENSNVIG00000009740 #22 ENSNVIG00000009616 #24 PRSS48 (ENSNVIG00000009457) #24 SH3D19 (ENSNVIG00000009212) #23 FHIP1A (ENSNVIG00000009145) #25 GATB (ENSNVIG00000009094) #26 FBXW7 (ENSNVIG00000008986) #27 TM154 (ENSNVIG00000008959) #28 TIGD4 (ENSNVIG00000008950) #29 ARFIP1 (ENSNVIG00000008921) #30 FHDC1 (ENSNVIG00000008899) #32 TRIM2 (ENSNVIG00000008862) #33 MFAP3L (ENSNVIG00000008842) ENSNVIG00000008836 ENSNVIG00000008830 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Ursus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 American black bear DUPLICATION American black bear MODERN SPECIES 8911 ENSUAMG00000001612 #22 American black bear MODERN SPECIES 133 ENSUAMG00000002113 #22 TBX5 (ENSUAMG00000002094) Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Camelidae ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Arabian camel MODERN SPECIES 11 C4orf51 (ENSCDRG00005020225) ZNF827 (ENSCDRG00005020126) LSM6 (ENSCDRG00005020097) REELD1 (ENSCDRG00005020091) #7 SLC10A7 (ENSCDRG00005020015) #8 POU4F2 (ENSCDRG00005019973) #9 TTC29 (ENSCDRG00005019850) #10 EDNRA (ENSCDRG00005019808) #11 TMEM184C (ENSCDRG00005019797) #12 PRMT9 (ENSCDRG00005019766) #13 ARHGAP10 (ENSCDRG00005019732) #14 NR3C2 (ENSCDRG00005019699) #15 DCLK2 (ENSCDRG00005019609) #17 MAB21L2 (ENSCDRG00005019587) #19 LRBA (ENSCDRG00005019229) #18 RPS3A (ENSCDRG00005019167) #22 SH3D19 (ENSCDRG00005018965) #23 PRSS48 (ENSCDRG00005018930) #24 FHIP1A (ENSCDRG00005018885) #25 GATB (ENSCDRG00005018830) #26 FBXW7 (ENSCDRG00005018704) #27 TMEM154 (ENSCDRG00005018674) #28 TIGD4 (ENSCDRG00005018659) #29 ARFIP1 (ENSCDRG00005018580) #30 FHDC1 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(ENSBMSG00010000484) #23 ENSBMSG00010000685 PRSS48 (ENSBMSG00010000700) #24 FHIP1A (ENSBMSG00010000741) #25 GATB (ENSBMSG00010000775) #26 FBXW7 (ENSBMSG00010000836) #27 ENSBMSG00010000895 TMEM154 (ENSBMSG00010000916) #28 ARFIP1 (ENSBMSG00010000954) #30 FHDC1 (ENSBMSG00010001001) #32 TRIM2 (ENSBMSG00010001046) #33 MND1 (ENSBMSG00010001093) #35 TMEM131L (ENSBMSG00010001155) #36 TLR2 (ENSBMSG00010001186) SFRP2 (ENSBMSG00010001204) Blue whale MODERN SPECIES 7 ENTPD1 (ENSBMSG00010017599) TCTN3 (ENSBMSG00010017781) ALDH18A1 (ENSBMSG00010017908) SORBS1 (ENSBMSG00010018518) ENSBMSG00010021832 ENSBMSG00010021844 HELLS (ENSBMSG00010021861) TBC1D12 (ENSBMSG00010021878) NOC3L (ENSBMSG00010021889) SLC35G1 (ENSBMSG00010021974) LGI1 (ENSBMSG00010021984) FRA10AC1 (ENSBMSG00010022001) PDE6C (ENSBMSG00010022010) RBP4 (ENSBMSG00010022013) ENSBMSG00010022016 ENSBMSG00010022018 #22 CEP55 (ENSBMSG00010022021) MYOF (ENSBMSG00010022038) CYP26A1 (ENSBMSG00010022052) CYP26C1 (ENSBMSG00010022056) EXOC6 (ENSBMSG00010022075) HHEX (ENSBMSG00010022091) KIF11 (ENSBMSG00010022092) IDE (ENSBMSG00010022094) MARCHF5 (ENSBMSG00010022096) CPEB3 (ENSBMSG00010022099) BTAF1 (ENSBMSG00010022106) FGFBP3 (ENSBMSG00010022112) TNKS2 (ENSBMSG00010022115) PPP1R3C (ENSBMSG00010022118) HECTD2 (ENSBMSG00010022121) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 17 ENSGT00950000183123.g.b.b.g.a ENSGT00940000154684 ENSGT00940000162275 ENSGT00500000044936 ENSGT00530000063692.a ENSGT00390000008918.a.b ENSGT00940000154697.a.b ENSGT00940000158703 ENSGT00940000155384.a.h ENSGT00940000157094 ENSGT01060000248806.b ENSGT00950000183212.A ENSGT00940000153773.a.b ENSGT01090000260040.a.a.a ENSGT00390000003465.b.b ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00980000199387.d.b ENSGT00940000155788 ENSGT00940000158862 ENSGT00390000013305.a.b ENSGT00940000156357 ENSGT00440000038909 ENSGT00940000159405 ENSGT00950000182995.e.b.c.a ENSGT00390000004263.a ENSGT00390000013853 ENSGT00940000158485 ENSGT00390000018094 ENSGT01030000234881 ENSGT00390000012436.d ENSGT00920000149145 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Vaquita MODERN SPECIES 16 MMAA (ENSPSNG00000014172) ZNF827 (ENSPSNG00000013982) LSM6 (ENSPSNG00000013905) SLC10A7 (ENSPSNG00000013581) #8 POU4F2 (ENSPSNG00000013436) #9 TTC29 (ENSPSNG00000013058) #10 EDNRA (ENSPSNG00000012879) #11 TMEM184C (ENSPSNG00000012807) #12 PRMT9 (ENSPSNG00000012767) #13 ARHGAP10 (ENSPSNG00000012644) #14 NR3C2 (ENSPSNG00000012520) #15 DCLK2 (ENSPSNG00000012086) #17 MAB21L2 (ENSPSNG00000012010) #19 LRBA (ENSPSNG00000011879) #18 ENSPSNG00000011823 ENSPSNG00000011717 #22 ENSPSNG00000011692 SH3D19 (ENSPSNG00000011168) #23 FHIP1A (ENSPSNG00000010974) #25 GATB (ENSPSNG00000010878) #26 ENSPSNG00000010818 FBXW7 (ENSPSNG00000010559) #27 TMEM154 (ENSPSNG00000010480) #28 TIGD4 (ENSPSNG00000010453) #29 ARFIP1 (ENSPSNG00000010310) #30 FHDC1 (ENSPSNG00000010257) #32 TRIM2 (ENSPSNG00000010022) #33 MND1 (ENSPSNG00000009919) #35 TMEM131L (ENSPSNG00000009760) #36 TLR2 (ENSPSNG00000006991) RNF175 (ENSPSNG00000006939) Sperm whale MODERN SPECIES 18 LSM6 (ENSPCTG00005001901) SLC10A7 (ENSPCTG00005001951) #8 POU4F2 (ENSPCTG00005002032) #9 TTC29 (ENSPCTG00005002054) #10 ENSPCTG00005002142 EDNRA (ENSPCTG00005002154) #11 TMEM184C (ENSPCTG00005002203) #12 PRMT9 (ENSPCTG00005002225) #13 ARHGAP10 (ENSPCTG00005002260) #14 NR3C2 (ENSPCTG00005002287) #15 ENSPCTG00005002306 DCLK2 (ENSPCTG00005002361) #17 LRBA (ENSPCTG00005002441) #18 MAB21L2 (ENSPCTG00005002519) #19 ENSPCTG00005002525 ENSPCTG00005002537 #22 SH3D19 (ENSPCTG00005002589) #23 PRSS48 (ENSPCTG00005002685) #24 FHIP1A (ENSPCTG00005002716) #25 GATB (ENSPCTG00005002750) #26 FBXW7 (ENSPCTG00005002824) #27 ENSPCTG00005002861 TMEM154 (ENSPCTG00005002881) #28 ENSPCTG00005002902 #32 ARFIP1 (ENSPCTG00005002925) #30 TIGD4 (ENSPCTG00005002959) #29 TRIM2 (ENSPCTG00005003026) #33 TMEM131L (ENSPCTG00005003230) #36 TLR2 (ENSPCTG00005003249) SFRP2 (ENSPCTG00005003256) ENSPCTG00005003270 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1247 WNT5B (ENSMMSG00000014636) ADIPOR2 (ENSMMSG00000014605) ENSMMSG00000014517 LRTM2 (ENSMMSG00000014502) ENSMMSG00000014466 DCP1B (ENSMMSG00000014448) ENSMMSG00000014423 ENSMMSG00000014345 IL17RA (ENSMMSG00000014317) ENSMMSG00000014301 HDHD5 (ENSMMSG00000014272) ADA2 (ENSMMSG00000014193) ATP6V1E1 (ENSMMSG00000013750) ENSMMSG00000013663 BID (ENSMMSG00000013621) ENSMMSG00000018983 #22 MICAL3 (ENSMMSG00000018708) PEX26 (ENSMMSG00000018617) TUBA8 (ENSMMSG00000018574) CDC42EP1 (ENSMMSG00000018551) LGALS2 (ENSMMSG00000018515) GGA1 (ENSMMSG00000018276) SH3BP1 (ENSMMSG00000018209) PDXP (ENSMMSG00000018187) ENSMMSG00000018156 NOL12 (ENSMMSG00000018131) ENSMMSG00000018107 ENSMMSG00000018048 H1-0 (ENSMMSG00000018029) GCAT (ENSMMSG00000017960) GALR3 (ENSMMSG00000017921) Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Bos_b ANCESTRAL SPECIES 39 ENSGT00940000155485.a.a.a.b.g.a ENSGT01090000260076.b.b ENSGT00390000013549.a.b.b.o.b ENSGT00940000167876 ENSGT00950000182900.D.d.b ENSGT00390000018199.b.b.b ENSGT00940000163449 ENSGT00950000183066.a.a.a.d.c ENSGT00950000183066.a.a.a.d.d ENSGT01030000235726 ENSGT00940000160633 ENSGT00550000074891 ENSGT00940000156040 ENSGT01030000234646.B.a.b ENSGT00390000013549.a.b.b.o.a.g.a ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 ENSGT00390000013549.a.b.b.o.a.g.b ENSGT00940000158684 ENSGT00550000074801.g.b.b ENSGT00940000159116 ENSGT00510000048637 ENSGT00530000063666.b ENSGT00950000183121.b.b.b.b ENSGT00390000005330 ENSGT00940000153430.a.a ENSGT00940000157080 ENSGT00940000164183 ENSGT00950000185346 ENSGT00940000157313 ENSGT00870000136506 ENSGT00940000167584 Cow MODERN SPECIES 177 IL1RAPL1 (ENSBTAG00000053869) ENSBTAG00000050834 ENSBTAG00000011750 ENSBTAG00000054034 ENSBTAG00000052068 PPP4R3C (ENSBTAG00000008511) ENSBTAG00000053213 ENSBTAG00000018583 ENSBTAG00000053624 ENSBTAG00000048848 ARX (ENSBTAG00000050504) POLA1 (ENSBTAG00000008170) PCYT1B (ENSBTAG00000016107) PDK3 (ENSBTAG00000017832) ENSBTAG00000006384 ENSBTAG00000006383 #22 ZFX (ENSBTAG00000007730) EIF2S3 (ENSBTAG00000014337) KLHL15 (ENSBTAG00000020561) CXHXorf58 (ENSBTAG00000010939) APOO (ENSBTAG00000010937) SAT1 (ENSBTAG00000017363) ACOT9 (ENSBTAG00000011258) PRDX4 (ENSBTAG00000006165) PTCHD1 (ENSBTAG00000020987) ENSBTAG00000046635 ENSBTAG00000049480 PHEX (ENSBTAG00000000419) ENSBTAG00000052700 SMS (ENSBTAG00000018382) MBTPS2 (ENSBTAG00000008183) Hybrid Bos Indicus MODERN SPECIES 315 ENSBIXG00005022231 ENSBIXG00005022260 ENSBIXG00005022280 ENSBIXG00005003800 ENSBIXG00005022382 MAGEB18 (ENSBIXG00005022439) ENSBIXG00005022466 ENSBIXG00005022474 ENSBIXG00005022491 ARX (ENSBIXG00005022524) ENSBIXG00005003841 POLA1 (ENSBIXG00005022900) PCYT1B (ENSBIXG00005023067) PDK3 (ENSBIXG00005023130) ENSBIXG00005003945 ENSBIXG00005023185 #22 ENSBIXG00005023233 ENSBIXG00005023490 ENSBIXG00005004027 KLHL15 (ENSBIXG00005023551) CXorf58 (ENSBIXG00005023583) APOO (ENSBIXG00005023656) ENSBIXG00005006902 SAT1 (ENSBIXG00005023734) ACOT9 (ENSBIXG00005023796) PRDX4 (ENSBIXG00005023849) PTCHD1 (ENSBIXG00005023943) ENSBIXG00005024020 ENSBIXG00005024079 ENSBIXG00005024121 PHEX (ENSBIXG00005024241) Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Domestic yak MODERN SPECIES 8 SYNM (ENSBGRG00000005981) TTC23 (ENSBGRG00000005798) LRRC28 (ENSBGRG00000005615) MEF2A (ENSBGRG00000005494) LYSMD4 (ENSBGRG00000005456) ADAMTS17 (ENSBGRG00000004987) CERS3 (ENSBGRG00000004770) LINS1 (ENSBGRG00000004716) ASB7 (ENSBGRG00000004639) ENSBGRG00000004632 ALDH1A3 (ENSBGRG00000004521) LRRK1 (ENSBGRG00000004461) CHSY1 (ENSBGRG00000004426) SELENOS (ENSBGRG00000004321) ENSBGRG00000004294 ENSBGRG00000004250 #22 GABRG3 (ENSBGRG00000004154) GABRA5 (ENSBGRG00000004069) ENSBGRG00000004040 GABRB3 (ENSBGRG00000003940) ENSBGRG00000003908 ATP10A (ENSBGRG00000003850) UBE3A (ENSBGRG00000003821) SNRPN (ENSBGRG00000023848) SNURF (ENSBGRG00000023752) ENSBGRG00000023739 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 8 MMAA (ENSOARG00020024857) C4orf51 (ENSOARG00020024840) ZNF827 (ENSOARG00020024616) POU4F2 (ENSOARG00020024207) #9 TTC29 (ENSOARG00020024092) #10 EDNRA (ENSOARG00020024024) #11 TMEM184C (ENSOARG00020023997) #12 PRMT9 (ENSOARG00020023961) #13 ARHGAP10 (ENSOARG00020023485) #14 NR3C2 (ENSOARG00020023338) #15 ENSOARG00020023315 IQCM (ENSOARG00020023274) #16 DCLK2 (ENSOARG00020022528) #17 MAB21L2 (ENSOARG00020022453) #19 LRBA (ENSOARG00020021581) #18 ENSOARG00020021320 #22 PRSS48 (ENSOARG00020021133) #24 FHIP1A (ENSOARG00020021013) #25 GATB (ENSOARG00020020844) #26 FBXW7 (ENSOARG00020020349) #27 TMEM154 (ENSOARG00020020174) #28 TIGD4 (ENSOARG00020020159) #29 ARFIP1 (ENSOARG00020019865) #30 FHDC1 (ENSOARG00020019747) #32 ENSOARG00020019717 TRIM2 (ENSOARG00020019393) #33 MND1 (ENSOARG00020019027) #35 TMEM131L (ENSOARG00020017957) #36 RNF175 (ENSOARG00020017703) SFRP2 (ENSOARG00020017587) ENSOARG00020017458 Yarkand deer DUPLICATION Yarkand deer MODERN SPECIES 28 REELD1 (ENSCHYG00000001740) #7 SLC10A7 (ENSCHYG00000001854) #8 POU4F2 (ENSCHYG00000002171) #9 TTC29 (ENSCHYG00000002186) #10 EDNRA (ENSCHYG00000002219) #11 ENSCHYG00000002240 ENSCHYG00000002250 TMEM184C (ENSCHYG00000002271) #12 PRMT9 (ENSCHYG00000002291) #13 ARHGAP10 (ENSCHYG00000002323) #14 NR3C2 (ENSCHYG00000002397) #15 DCLK2 (ENSCHYG00000002537) #17 LRBA (ENSCHYG00000002706) #18 MAB21L2 (ENSCHYG00000002890) #19 ENSCHYG00000002898 ENSCHYG00000002911 #22 ENSCHYG00000002979 #23 ENSCHYG00000003142 #24 PRSS48 (ENSCHYG00000003160) #24 ENSCHYG00000003187 FHIP1A (ENSCHYG00000003200) #25 GATB (ENSCHYG00000003235) #26 FBXW7 (ENSCHYG00000003330) #27 TMEM154 (ENSCHYG00000003416) #28 TIGD4 (ENSCHYG00000003442) #29 ENSCHYG00000003448 ARFIP1 (ENSCHYG00000003479) #30 FHDC1 (ENSCHYG00000003520) #32 TRIM2 (ENSCHYG00000003564) #33 MND1 (ENSCHYG00000003669) #35 ENSCHYG00000003717 Yarkand deer MODERN SPECIES 26 MAP3K20 (ENSCHYG00000019464) ENSCHYG00000019193 SP3 (ENSCHYG00000019030) ENSCHYG00000018536 SP9 (ENSCHYG00000018463) CIR1 (ENSCHYG00000018323) ENSCHYG00000018263 GPR155 (ENSCHYG00000018083) ENSCHYG00000017877 CHRNA1 (ENSCHYG00000017619) ENSCHYG00000017575 CHN1 (ENSCHYG00000017015) ATF2 (ENSCHYG00000016575) ATP5MC3 (ENSCHYG00000016464) ENSCHYG00000016417 ENSCHYG00000016391 #22 LNPK (ENSCHYG00000016125) HOXD13 (ENSCHYG00000015985) HOXD12 (ENSCHYG00000015954) ENSCHYG00000015846 HOXD10 (ENSCHYG00000015831) HOXD9 (ENSCHYG00000015808) HOXD8 (ENSCHYG00000015741) HOXD4 (ENSCHYG00000015683) HOXD3 (ENSCHYG00000015650) HOXD1 (ENSCHYG00000015562) MTX2 (ENSCHYG00000015392) ENSCHYG00000015305 ENSCHYG00000015038 NFE2L2 (ENSCHYG00000024719) AGPS (ENSCHYG00000024578) Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.b #22 Hyrax MODERN SPECIES 11519 ENSPCAG00000015040 #22 Eutheria DUPLICATION Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Tenrec MODERN SPECIES 12451 ENSETEG00000001788 ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Caprinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Goat MODERN SPECIES 30 ENSCHIG00000018808 CD40LG (ENSCHIG00000000168) ARHGEF6 (ENSCHIG00000000132) ENSCHIG00000000095 ENSCHIG00000000060 ENSCHIG00000009593 ENSCHIG00000007648 ZIC3 (ENSCHIG00000021756) ENSCHIG00000018935 FGF13 (ENSCHIG00000016286) F9 (ENSCHIG00000013903) MCF2 (ENSCHIG00000009737) ATP11C (ENSCHIG00000009648) ENSCHIG00000000404 SOX3 (ENSCHIG00000000368) ENSCHIG00000000337 ##22 LDOC1 (ENSCHIG00000019266) ENSCHIG00000000231 ENSCHIG00000000195 ENSCHIG00000018613 SLITRK4 (ENSCHIG00000019228) ENSCHIG00000000062 IGSF1 (ENSCHIG00000008777) ENSCHIG00000024386 ENSCHIG00000020888 ENSCHIG00000018529 OR13H1 (ENSCHIG00000019695) ENSCHIG00000019833 ENOX2 (ENSCHIG00000009635) ENSCHIG00000009925 ENSCHIG00000000453 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 210 ZNF622 (ENSSBOG00000026590) RETREG1 (ENSSBOG00000015734) MYO10 (ENSSBOG00000028705) ENSSBOG00000008808 ##22 ENSSBOG00000029272 CDH18 (ENSSBOG00000020211) Tarsier MODERN SPECIES 5629 CASP12 (ENSTSYG00000003898) ENSTSYG00000011687 ENSTSYG00000009588 ENSTSYG00000030707 GRIA4 (ENSTSYG00000009882) MSANTD4 (ENSTSYG00000029032) KBTBD3 (ENSTSYG00000011191) AASDHPPT (ENSTSYG00000005102) ENSTSYG00000026481 ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 100 ENSJJAG00000000352 ENSJJAG00000020322 ENSJJAG00000020138 ENSJJAG00000019717 Alkbh3 (ENSJJAG00000018577) ENSJJAG00000017944 Hsd17b12 (ENSJJAG00000016592) Ttc17 (ENSJJAG00000015016) ENSJJAG00000012684 ENSJJAG00000011016 ENSJJAG00000013372 ENSJJAG00000007632 ENSJJAG00000017160 ENSJJAG00000017063 Lrrc4c (ENSJJAG00000013472) ENSJJAG00000014713 ##22 ENSJJAG00000013563 ENSJJAG00000013437 ENSJJAG00000013448 ENSJJAG00000012660 ENSJJAG00000012569 ENSJJAG00000011964 ENSJJAG00000011770 ENSJJAG00000013751 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.a ##22 Guinea pig MODERN SPECIES 165 ENSCPOG00000010355 ENSCPOG00000024703 ENSCPOG00000022971 ##22 ZSWIM5 (ENSCPOG00000012994) UROD (ENSCPOG00000024542) HECTD3 (ENSCPOG00000012988) ENSCPOG00000035741 EIF2B3 (ENSCPOG00000002171) PTCH2 (ENSCPOG00000012790) BTBD19 (ENSCPOG00000036128) DYNLT4 (ENSCPOG00000025746) PLK3 (ENSCPOG00000002167) BEST4 (ENSCPOG00000023264) RPS8 (ENSCPOG00000000723) KIF2C (ENSCPOG00000002161) ARMH1 (ENSCPOG00000002158) TMEM53 (ENSCPOG00000012006) RNF220 (ENSCPOG00000011998) Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Sperm whale MODERN SPECIES 6 ZNF696 (ENSPCTG00005014299) GLI4 (ENSPCTG00005014326) ZFP41 (ENSPCTG00005014395) LY6H (ENSPCTG00005014505) LY6E (ENSPCTG00005014593) ENSPCTG00005014680 ENSPCTG00005014909 ENSPCTG00005014963 TSNARE1 (ENSPCTG00005014986) ADGRB1 (ENSPCTG00005015167) ARC (ENSPCTG00005015916) JRK (ENSPCTG00005015935) PSCA (ENSPCTG00005015964) THEM6 (ENSPCTG00005015996) SLC45A4 (ENSPCTG00005016157) ENSPCTG00005016197 ##22 ENSPCTG00005016216 PTK2 (ENSPCTG00005016344) AGO2 (ENSPCTG00005017440) ENSPCTG00005017514 CHRAC1 (ENSPCTG00005017581) TRAPPC9 (ENSPCTG00005017633) ENSPCTG00005017670 COL22A1 (ENSPCTG00005017754) FAM135B (ENSPCTG00005018956) KHDRBS3 (ENSPCTG00005019130) ZFAT (ENSPCTG00005019229) TG (ENSPCTG00005019930) PHF20L1 (ENSPCTG00005020226) TMEM71 (ENSPCTG00005020318) LRRC6 (ENSPCTG00005020472) Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Tarsier MODERN SPECIES 232 ENSTSYG00000034069 ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.b.a.b ##22 Tenrec MODERN SPECIES 10414 ENSETEG00000013950 ##22 Eutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Boreoeutheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Laurasiatheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Laurasiatheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Artiodactyla ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Artiodactyla_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b DUPLICATION Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a ##22 Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a ##22 Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a ##22 Beluga whale MODERN SPECIES 53 SLC10A7 (ENSDLEG00000015846) #8 POU4F2 (ENSDLEG00000015837) #9 TTC29 (ENSDLEG00000015814) #10 EDNRA (ENSDLEG00000015808) #11 ENSDLEG00000015796 ENSDLEG00000015792 TMEM184C (ENSDLEG00000015783) #12 PRMT9 (ENSDLEG00000015745) #13 ENSDLEG00000015737 ARHGAP10 (ENSDLEG00000015639) #14 NR3C2 (ENSDLEG00000015618) #15 DCLK2 (ENSDLEG00000015561) #17 MAB21L2 (ENSDLEG00000015547) #19 LRBA (ENSDLEG00000015473) #18 ENSDLEG00000015456 ENSDLEG00000015435 ##22 ENSDLEG00000015422 SH3D19 (ENSDLEG00000015331) #23 FHIP1A (ENSDLEG00000015284) #25 GATB (ENSDLEG00000015234) #26 FBXW7 (ENSDLEG00000015186) #27 ENSDLEG00000015165 #28 TIGD4 (ENSDLEG00000015161) #29 ARFIP1 (ENSDLEG00000015132) #30 FHDC1 (ENSDLEG00000015095) #32 TRIM2 (ENSDLEG00000015055) #33 MND1 (ENSDLEG00000014994) #35 TMEM131L (ENSDLEG00000014921) #36 TLR2 (ENSDLEG00000014910) SFRP2 (ENSDLEG00000014900) ENSDLEG00000014886 Narwhal MODERN SPECIES 307 REELD1 (ENSMMNG00015016914) #7 SLC10A7 (ENSMMNG00015016983) #8 POU4F2 (ENSMMNG00015017044) #9 TTC29 (ENSMMNG00015017062) #10 EDNRA (ENSMMNG00015017085) #11 ENSMMNG00015017155 TMEM184C (ENSMMNG00015017180) #12 PRMT9 (ENSMMNG00015017236) #13 ARHGAP10 (ENSMMNG00015017349) #14 NR3C2 (ENSMMNG00015017740) #15 DCLK2 (ENSMMNG00015017930) #17 LRBA (ENSMMNG00015018026) #18 MAB21L2 (ENSMMNG00015018109) #19 ENSMMNG00015018125 ENSMMNG00015018150 ENSMMNG00015018175 ##22 SH3D19 (ENSMMNG00015018299) #23 ENSMMNG00015018587 FHIP1A (ENSMMNG00015018610) #25 GATB (ENSMMNG00015018644) #26 FBXW7 (ENSMMNG00015018727) #27 TMEM154 (ENSMMNG00015018865) #28 ARFIP1 (ENSMMNG00015018903) #30 FHDC1 (ENSMMNG00015018979) #32 TRIM2 (ENSMMNG00015019031) #33 MND1 (ENSMMNG00015019145) #35 TMEM131L (ENSMMNG00015019219) #36 TLR2 (ENSMMNG00015019314) RNF175 (ENSMMNG00015019342) SFRP2 (ENSMMNG00015019388) ENSMMNG00015019414 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.a ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 33 ENSMMSG00000016109 ##22 PRSS48 (ENSMMSG00000015964) #24 SH3D19 (ENSMMSG00000015636) #23 FHIP1A (ENSMMSG00000015562) #25 GATB (ENSMMSG00000015487) #26 ENSMMSG00000015447 FBXW7 (ENSMMSG00000015345) #27 Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b ##22 Cetacea ANCESTRAL SPECIES 12 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Odontoceti ANCESTRAL SPECIES 11 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00520000060562 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00940000163277 #7 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00910000148620.c.b ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 ENSGT00390000013075.b ENSGT00940000156432.a Dolphin MODERN SPECIES 5268 ENSTTRG00000013094 ##22 SH3D19 (ENSTTRG00000013099) #23 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b ##22 Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.a.b ##22 Siberian musk deer MODERN SPECIES 1202 ENSMMSG00000021528 NAXE (ENSMMSG00000021541) IQGAP3 (ENSMMSG00000021624) MEF2D (ENSMMSG00000021733) RHBG (ENSMMSG00000021854) TSACC (ENSMMSG00000021888) CCT3 (ENSMMSG00000021905) GLMP (ENSMMSG00000021977) TMEM79 (ENSMMSG00000022007) SMG5 (ENSMMSG00000022024) PAQR6 (ENSMMSG00000022081) BGLAP (ENSMMSG00000022141) PMF1 (ENSMMSG00000022165) SLC25A44 (ENSMMSG00000022189) SEMA4A (ENSMMSG00000022204) ENSMMSG00000022232 ##22 LMNA (ENSMMSG00000022290) MEX3A (ENSMMSG00000022428) RAB25 (ENSMMSG00000022435) LAMTOR2 (ENSMMSG00000022447) UBQLN4 (ENSMMSG00000022457) SSR2 (ENSMMSG00000022486) ARHGEF2 (ENSMMSG00000022532) RXFP4 (ENSMMSG00000022594) KHDC4 (ENSMMSG00000022609) RIT1 (ENSMMSG00000004820) SYT11 (ENSMMSG00000004948) ENSMMSG00000005075 ENSMMSG00000006603 MSTO1 (ENSMMSG00000006647) DAP3 (ENSMMSG00000006783) Artiodactyla_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Pecora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Yarkand deer MODERN SPECIES 1323 XKRX (ENSCHYG00000024532) NOX1 (ENSCHYG00000024449) CSTF2 (ENSCHYG00000024275) SYTL4 (ENSCHYG00000024186) ENSCHYG00000024160 SERPINA7 (ENSCHYG00000024130) NRK (ENSCHYG00000023940) ENSCHYG00000023902 IL1RAPL2 (ENSCHYG00000023820) ENSCHYG00000023788 FAM199X (ENSCHYG00000023762) ENSCHYG00000023748 ENSCHYG00000023725 ENSCHYG00000023695 ZNF185 (ENSCHYG00000023363) ENSCHYG00000023322 ##22 NSDHL (ENSCHYG00000023286) CETN2 (ENSCHYG00000023256) ENSCHYG00000023224 GABRQ (ENSCHYG00000023094) ENSCHYG00000023057 GABRA3 (ENSCHYG00000022962) MAGEA10 (ENSCHYG00000022936) GABRE (ENSCHYG00000022888) ENSCHYG00000022871 CNGA2 (ENSCHYG00000022833) ENSCHYG00000022815 PRRG3 (ENSCHYG00000022752) VMA21 (ENSCHYG00000022693) GPR50 (ENSCHYG00000022662) CD99L2 (ENSCHYG00000022547) Percora_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Bovidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Bovinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Bos ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Bos_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Wild yak MODERN SPECIES 19 ENSBMUG00000011065 ##22 ENSBMUG00000011087 ENSBMUG00000011112 ENSBMUG00000011121 Caprinae ANCESTRAL SPECIES 26 ENSGT00940000153335.a.b ENSGT00950000182841.b.a.a.b.a.a.a.b.n.a.a.b.b ENSGT00940000159995 ENSGT00390000014794.b ENSGT00390000004181 ENSGT00940000161078 ENSGT00940000157470 ENSGT00530000063713.a ENSGT00390000014082.b ENSGT00940000158394 ENSGT00390000000984 ENSGT00940000158210 ENSGT00940000158794 ENSGT01030000234543.B.f ENSGT00940000160543 ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 ENSGT00940000159378 ENSGT00940000159406 ENSGT00940000158924 ENSGT00940000153441.a.b ENSGT00940000161556 ENSGT00390000017595 ENSGT00940000157720 ENSGT00940000155595 ENSGT00780000122010 ENSGT00940000157520 ENSGT00940000158935 ENSGT00530000063672.a ENSGT00520000055589.c ENSGT00940000155901.b ENSGT00940000155043.bb.a.a Goat MODERN SPECIES 20 ARID5B (ENSCHIG00000019296) RTKN2 (ENSCHIG00000011108) ZNF365 (ENSCHIG00000024289) ENSCHIG00000010161 ADO (ENSCHIG00000026433) EGR2 (ENSCHIG00000018766) ENSCHIG00000007340 ENSCHIG00000010873 JMJD1C (ENSCHIG00000022251) ENSCHIG00000010880 REEP3 (ENSCHIG00000015558) ENSCHIG00000016083 LRRTM3 (ENSCHIG00000023535) ENSCHIG00000010807 ENSCHIG00000019480 ENSCHIG00000008056 ##22 DNAJC12 (ENSCHIG00000024728) ENSCHIG00000015880 ENSCHIG00000010127 SIRT1 (ENSCHIG00000011027) HERC4 (ENSCHIG00000012304) MYPN (ENSCHIG00000015250) ATOH7 (ENSCHIG00000019874) PBLD (ENSCHIG00000013854) ENSCHIG00000026467 RUFY2 (ENSCHIG00000010345) DNA2 (ENSCHIG00000018956) SLC25A16 (ENSCHIG00000013881) TET1 (ENSCHIG00000009920) CCAR1 (ENSCHIG00000000354) STOX1 (ENSCHIG00000000317) Rambouillet Sheep MODERN SPECIES 17 CDK1 (ENSOARG00020024130) RHOBTB1 (ENSOARG00020024171) TMEM26 (ENSOARG00020024213) CABCOCO1 (ENSOARG00020024239) ARID5B (ENSOARG00020024263) RTKN2 (ENSOARG00020024459) ZNF365 (ENSOARG00020024513) ADO (ENSOARG00020024530) EGR2 (ENSOARG00020024540) NRBF2 (ENSOARG00020024553) JMJD1C (ENSOARG00020024597) REEP3 (ENSOARG00020024896) CTNNA3 (ENSOARG00020006501) ENSOARG00020006636 LRRTM3 (ENSOARG00020006696) ENSOARG00020006759 ##22 ENSOARG00020006783 SIRT1 (ENSOARG00020006830) HERC4 (ENSOARG00020007038) MYPN (ENSOARG00020007679) ATOH7 (ENSOARG00020007963) PBLD (ENSOARG00020007987) ENSOARG00020008090 HNRNPH3 (ENSOARG00020008115) RUFY2 (ENSOARG00020008371) DNA2 (ENSOARG00020009086) SLC25A16 (ENSOARG00020009295) TET1 (ENSOARG00020009369) CCAR1 (ENSOARG00020009447) STOX1 (ENSOARG00020009603) DDX50 (ENSOARG00020009681) Cetacea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Blue whale MODERN SPECIES 40 ENSBMSG00010021649 ENSBMSG00010021625 MAGEB1 (ENSBMSG00010021617) ENSBMSG00010021614 IL1RAPL1 (ENSBMSG00010021606) ENSBMSG00010021594 ENSBMSG00010021587 ENSBMSG00010021580 ENSBMSG00010021571 PPP4R3C (ENSBMSG00010021567) ENSBMSG00010021566 MAGEB5 (ENSBMSG00010021560) MAGEB18 (ENSBMSG00010021557) ENSBMSG00010021551 ENSBMSG00010021547 ENSBMSG00010021542 ##22 ENSBMSG00010021537 ARX (ENSBMSG00010021534) POLA1 (ENSBMSG00010021507) PCYT1B (ENSBMSG00010021451) PDK3 (ENSBMSG00010021431) ENSBMSG00010021424 ENSBMSG00010021421 ENSBMSG00010021408 EIF2S3 (ENSBMSG00010021391) ENSBMSG00010021384 KLHL15 (ENSBMSG00010021380) CXorf58 (ENSBMSG00010021372) ENSBMSG00010021365 APOO (ENSBMSG00010021360) SAT1 (ENSBMSG00010021343) Odontoceti ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Odontoceti_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Odontoceti_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Vaquita MODERN SPECIES 5 KDSR (ENSPSNG00000018828) VPS4B (ENSPSNG00000018789) SERPINB5 (ENSPSNG00000018661) ENSPSNG00000018474 SERPINB2 (ENSPSNG00000018420) SERPINB10 (ENSPSNG00000018388) SERPINB8 (ENSPSNG00000018298) CDH7 (ENSPSNG00000018107) CDH19 (ENSPSNG00000017916) ENSPSNG00000017890 DSEL (ENSPSNG00000017875) TMX3 (ENSPSNG00000017796) CCDC102B (ENSPSNG00000017671) DOK6 (ENSPSNG00000017574) CD226 (ENSPSNG00000017461) ENSPSNG00000017429 ##22 RTTN (ENSPSNG00000016449) SOCS6 (ENSPSNG00000016372) CBLN2 (ENSPSNG00000016259) NETO1 (ENSPSNG00000016051) FBXO15 (ENSPSNG00000016021) TIMM21 (ENSPSNG00000015973) ENSPSNG00000015834 C18orf63 (ENSPSNG00000015663) DIPK1C (ENSPSNG00000015542) CNDP2 (ENSPSNG00000015447) CNDP1 (ENSPSNG00000015211) ZNF407 (ENSPSNG00000015129) PTGR3 (ENSPSNG00000015074) TSHZ1 (ENSPSNG00000015019) ZNF516 (ENSPSNG00000014900) Monodontidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.b ##22 Narwhal MODERN SPECIES 302 TMEFF2 (ENSMMNG00015005588) SLC39A10 (ENSMMNG00015005544) DNAH7 (ENSMMNG00015005467) STK17B (ENSMMNG00015005421) HECW2 (ENSMMNG00015005408) ENSMMNG00015005381 GTF3C3 (ENSMMNG00015005350) C2orf66 (ENSMMNG00015005331) PGAP1 (ENSMMNG00015005302) ANKRD44 (ENSMMNG00015005236) SF3B1 (ENSMMNG00015005194) COQ10B (ENSMMNG00015005170) ENSMMNG00015005160 ENSMMNG00015005152 MOB4 (ENSMMNG00015005131) ENSMMNG00015005118 ##22 RFTN2 (ENSMMNG00015009156) MARS2 (ENSMMNG00015009149) ENSMMNG00015009146 PLCL1 (ENSMMNG00015009132) ENSMMNG00015009121 SATB2 (ENSMMNG00015009088) FTCDNL1 (ENSMMNG00015009064) C2orf69 (ENSMMNG00015009051) TYW5 (ENSMMNG00015009041) MAIP1 (ENSMMNG00015009034) SPATS2L (ENSMMNG00015008966) KCTD18 (ENSMMNG00015008930) ENSMMNG00015008923 ENSMMNG00015008917 AOX1 (ENSMMNG00015008883) Laurasiatheria_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Laurasiatheria_c ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Chiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Microchiroptera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Microbat DUPLICATION Microbat MODERN SPECIES 986 ENSMLUG00000010141 GLRA2 (ENSMLUG00000015270) ENSMLUG00000015275 MOSPD2 (ENSMLUG00000015281) ASB9 (ENSMLUG00000017696) ASB11 (ENSMLUG00000017697) PIGA (ENSMLUG00000017698) VEGFD (ENSMLUG00000017699) PIR (ENSMLUG00000017700) BMX (ENSMLUG00000017701) ACE2 (ENSMLUG00000017702) ENSMLUG00000025064 CA5B (ENSMLUG00000009760) ENSMLUG00000009780 AP1S2 (ENSMLUG00000009794) ENSMLUG00000025644 ##22 GRPR (ENSMLUG00000007561) ##11 ENSMLUG00000010201 ENSMLUG00000027452 S100G (ENSMLUG00000006174) CTPS2 (ENSMLUG00000006158) SYAP1 (ENSMLUG00000006176) TXLNG (ENSMLUG00000006186) RBBP7 (ENSMLUG00000006194) ENSMLUG00000028073 REPS2 (ENSMLUG00000008125) NHS (ENSMLUG00000015408) ENSMLUG00000029397 RAI2 (ENSMLUG00000015416) SCML2 (ENSMLUG00000015450) CDKL5 (ENSMLUG00000006808) Microbat MODERN SPECIES 963 STAR (ENSMLUG00000003732) ASH2L (ENSMLUG00000003723) EIF4EBP1 (ENSMLUG00000007526) ADRB3 (ENSMLUG00000007514) GOT1L1 (ENSMLUG00000007485) RAB11FIP1 (ENSMLUG00000007472) BRF2 (ENSMLUG00000030280) ADGRA2 (ENSMLUG00000022283) PLPBP (ENSMLUG00000007448) ERLIN2 (ENSMLUG00000011778) ZNF703 (ENSMLUG00000011770) ENSMLUG00000025710 ENSMLUG00000026031 ENSMLUG00000028845 UNC5D (ENSMLUG00000005073) ENSMLUG00000024514 ##22 ENSMLUG00000027529 DUSP26 (ENSMLUG00000002772) RNF122 (ENSMLUG00000012520) TTI2 (ENSMLUG00000002764) MAK16 (ENSMLUG00000002758) FUT10 (ENSMLUG00000002754) ENSMLUG00000025759 ENSMLUG00000010211 ENSMLUG00000013804 WRN (ENSMLUG00000005863) PURG (ENSMLUG00000024424) ENSMLUG00000024122 ENSMLUG00000016793 ENSMLUG00000008035 TEX15 (ENSMLUG00000014276) Carnivora ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Caniformia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Canidae ANCESTRAL SPECIES 60 ENSGT00940000156063 ENSGT00940000154978 ENSGT00390000011932 #8 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00920000150804 ENSGT00390000008828.k ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a.d #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00530000063614.a.b #36 ENSGT00940000156323 Red fox MODERN SPECIES 26 TBPL1 (ENSVVUG00000019078) SLC2A12 (ENSVVUG00000000065) SGK1 (ENSVVUG00000000114) ENSVVUG00000000216 ALDH8A1 (ENSVVUG00000000258) HBS1L (ENSVVUG00000000295) MYB (ENSVVUG00000000361) AHI1 (ENSVVUG00000000451) ENSVVUG00000000569 PDE7B (ENSVVUG00000000584) MTFR2 (ENSVVUG00000000593) ENSVVUG00000000603 ENSVVUG00000000623 MAP7 (ENSVVUG00000000652) MAP3K5 (ENSVVUG00000000760) ENSVVUG00000002154 ##22 PEX7 (ENSVVUG00000002175) SLC35D3 (ENSVVUG00000002202) IL20RA (ENSVVUG00000002217) IL22RA2 (ENSVVUG00000002229) IFNGR1 (ENSVVUG00000002286) ENSVVUG00000002326 ENSVVUG00000002335 OLIG3 (ENSVVUG00000002352) ENSVVUG00000002359 TNFAIP3 (ENSVVUG00000002369) ENSVVUG00000002382 ARFGEF3 (ENSVVUG00000002408) HEBP2 (ENSVVUG00000002586) NHSL1 (ENSVVUG00000002603) CCDC28A (ENSVVUG00000002636) Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus DUPLICATION Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 18 ENSGT00940000157028 ENSGT01050000244864.B.b ENSGT01030000234513.B.b.i ENSGT01030000234513.B.b.j ENSGT00390000007182 ENSGT00390000015473 ENSGT00940000161739 ENSGT00390000016366 ENSGT00940000153139.A ENSGT00940000159161 ENSGT00390000003152.j ENSGT00500000045005 ENSGT00390000008171 ENSGT00940000153716.A ENSGT00950000183079.A.b.c.b ENSGT00390000018433.s.a.a.e.a ##22 ENSGT00940000160956 ENSGT00940000159187 ENSGT00390000016695 ENSGT00940000153259.a.a.b ENSGT00510000047137.i ENSGT00950000183171.B ENSGT00730000111659 ENSGT00940000154936.qb ENSGT00940000154103.a ENSGT00530000063529.A ENSGT00940000158055 ENSGT00730000111111 ENSGT00940000157332 ENSGT00940000157443 ENSGT00940000165049 Dingo MODERN SPECIES 304 ENSCAFG00020001972 ZMYM2 (ENSCAFG00020001106) GJB2 (ENSCAFG00020000961) GJB6 (ENSCAFG00020000958) CRYL1 (ENSCAFG00020000954) IFT88 (ENSCAFG00020000222) IL17D (ENSCAFG00020000155) EEF1AKMT1 (ENSCAFG00020025480) XPO4 (ENSCAFG00020025455) LATS2 (ENSCAFG00020025447) ENSCAFG00020025445 SKA3 (ENSCAFG00020025442) MRPL57 (ENSCAFG00020025438) ZDHHC20 (ENSCAFG00020025434) MICU2 (ENSCAFG00020025432) ENSCAFG00020025430 ##22 FGF9 (ENSCAFG00020025429) SGCG (ENSCAFG00020025426) SACS (ENSCAFG00020025414) TNFRSF19 (ENSCAFG00020025407) ENSCAFG00020025406 MIPEP (ENSCAFG00020025404) ENSCAFG00020025402 ENSCAFG00020025398 ENSCAFG00020025393 ENSCAFG00020025389 AMER2 (ENSCAFG00020025387) MTMR6 (ENSCAFG00020025382) ENSCAFG00020025380 NUP58 (ENSCAFG00020025357) ATP8A2 (ENSCAFG00020025331) Dog MODERN SPECIES 17 ZMYM2 (ENSCAFG00845023531) GJA3 (ENSCAFG00845023462) GJB2 (ENSCAFG00845023429) GJB6 (ENSCAFG00845023360) CRYL1 (ENSCAFG00845023166) IFT88 (ENSCAFG00845022012) IL17D (ENSCAFG00845021741) EEF1AKMT1 (ENSCAFG00845021658) XPO4 (ENSCAFG00845021422) LATS2 (ENSCAFG00845021300) SAP18 (ENSCAFG00845021235) SKA3 (ENSCAFG00845021073) MRPL57 (ENSCAFG00845021002) ZDHHC20 (ENSCAFG00845020710) MICU2 (ENSCAFG00845020415) ENSCAFG00845020344 ##22 FGF9 (ENSCAFG00845020297) SGCG (ENSCAFG00845020198) SACS (ENSCAFG00845020013) TNFRSF19 (ENSCAFG00845019643) ENSCAFG00845019573 MIPEP (ENSCAFG00845019295) ENSCAFG00845019187 ENSCAFG00845018985 ENSCAFG00845018801 ENSCAFG00845018627 ENSCAFG00845018528 ENSCAFG00845018481 MTMR6 (ENSCAFG00845018288) NUP58 (ENSCAFG00845017878) ATP8A2 (ENSCAFG00845017077) Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 16 ENSGT00940000160339 #9 ENSGT00390000008611 #10 ENSGT01100000263512.a.a.b #11 ENSGT00940000155201 #12 ENSGT00940000158472 #13 ENSGT00940000168784 ENSGT00940000159559 #14 ENSGT00940000159333 #15 ENSGT00390000010038 #16 ENSGT00950000182869.e.b.b.o.b ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00390000003248.a.a.b ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00940000162325.B.l ENSGT00390000018433.s.a.a.e.b ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00950000183198.c.b.b.g.a.a ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000008828.k.a ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 ENSGT00950000183040.A.b #30 ENSGT00940000155128.a.b #32 ENSGT00940000155905.a.d #33 ENSGT00490000043413 #35 ENSGT00940000154770.ib ENSGT00530000063614.a.b #36 Dingo MODERN SPECIES 277 SLC10A7 (ENSCAFG00020025908) #8 POU4F2 (ENSCAFG00020025916) #9 TTC29 (ENSCAFG00020025920) #10 EDNRA (ENSCAFG00020025935) #11 TMEM184C (ENSCAFG00020025936) #12 PRMT9 (ENSCAFG00020025939) #13 ENSCAFG00020025962 ARHGAP10 (ENSCAFG00020025975) #14 NR3C2 (ENSCAFG00020025992) #15 ENSCAFG00020026009 DCLK2 (ENSCAFG00020026012) #17 LRBA (ENSCAFG00020026144) #18 ENSCAFG00020026662 MAB21L2 (ENSCAFG00020026663) #19 ENSCAFG00020026664 ENSCAFG00020026665 ##22 SH3D19 (ENSCAFG00020026668) #23 PRSS48 (ENSCAFG00020026672) #24 ENSCAFG00020026675 FHIP1A (ENSCAFG00020026678) #25 GATB (ENSCAFG00020026686) #26 ENSCAFG00020026719 FBXW7 (ENSCAFG00020026731) #27 ENSCAFG00020026769 ENSCAFG00020026770 TIGD4 (ENSCAFG00020001422) #29 ARFIP1 (ENSCAFG00020001430) #30 FHDC1 (ENSCAFG00020001445) #32 ENSCAFG00020001503 #33 TRIM2 (ENSCAFG00020001512) #33 MND1 (ENSCAFG00020001543) #35 Canis_lupus ANCESTRAL SPECIES 27 ENSGT00940000159675 ENSGT00940000160165 ENSGT00900000141083.d ENSGT00390000006095 ENSGT00390000007772.y.a ENSGT00390000007772.z ENSGT00390000007772.y.b ENSGT00940000157522 ENSGT00390000007364 ENSGT00390000009029 ENSGT00940000161072 ENSGT00940000156353 ENSGT00940000162486 ENSGT00390000003033 ENSGT00510000047481 ENSGT00390000018433.s.a.a.f ##22 ENSGT00510000047981.d ENSGT00940000160898 ENSGT00940000158655 ENSGT00940000160749.b ENSGT00940000170852 ENSGT00510000048354 ENSGT00540000070023.c.b.a.a.b ENSGT00940000156601 ENSGT00940000153249.b.d ENSGT00950000182972.a.a.a.b ENSGT00940000157741 ENSGT00390000016814 ENSGT00940000154659.b ENSGT00940000155297 ENSGT00390000002887 Dingo MODERN SPECIES 80 ENSCAFG00020008237 ENSCAFG00020008235 ENSCAFG00020008234 ENSCAFG00020008230 ENSCAFG00020008227 PIK3CB (ENSCAFG00020008199) FAIM (ENSCAFG00020008189) ENSCAFG00020008186 CEP70 (ENSCAFG00020008176) ESYT3 (ENSCAFG00020008113) ENSCAFG00020008091 MRAS (ENSCAFG00020008087) ENSCAFG00020008081 ARMC8 (ENSCAFG00020008068) DBR1 (ENSCAFG00020008060) ENSCAFG00020008057 ##22 A4GNT (ENSCAFG00020008054) CLDN18 (ENSCAFG00020008047) SOX14 (ENSCAFG00020008039) ENSCAFG00020008023 IL20RB (ENSCAFG00020008018) ENSCAFG00020008010 NCK1 (ENSCAFG00020007999) SLC35G2 (ENSCAFG00020007989) STAG1 (ENSCAFG00020002071) PCCB (ENSCAFG00020001466) MSL2 (ENSCAFG00020027583) PPP2R3A (ENSCAFG00020027582) EPHB1 (ENSCAFG00020027580) KY (ENSCAFG00020027578) CEP63 (ENSCAFG00020027577) Dog DUPLICATION Dog MODERN SPECIES 15 MRPS22 (ENSCAFG00845027000) ENSCAFG00845026965 ENSCAFG00845026940 ENSCAFG00845026883 PRR23A (ENSCAFG00845026853) PIK3CB (ENSCAFG00845025921) FAIM (ENSCAFG00845025733) ENSCAFG00845025691 ENSCAFG00845025659 CEP70 (ENSCAFG00845025346) ESYT3 (ENSCAFG00845024743) MRAS (ENSCAFG00845024583) NME9 (ENSCAFG00845024321) ARMC8 (ENSCAFG00845023706) DBR1 (ENSCAFG00845023502) ENSCAFG00845023449 ##22 A4GNT (ENSCAFG00845023425) ENSCAFG00845023325 CLDN18 (ENSCAFG00845023238) SOX14 (ENSCAFG00845023200) ENSCAFG00845022964 IL20RB (ENSCAFG00845022899) ENSCAFG00845022866 NCK1 (ENSCAFG00845022785) SLC35G2 (ENSCAFG00845022747) ENSCAFG00845022720 STAG1 (ENSCAFG00845021253) PCCB (ENSCAFG00845020335) MSL2 (ENSCAFG00845020138) PPP2R3A (ENSCAFG00845019705) EPHB1 (ENSCAFG00845019520) Dog MODERN SPECIES 15 TBC1D5 (ENSCAFG00845021936) ENSCAFG00845022287 PLCL2 (ENSCAFG00845022325) DAZL (ENSCAFG00845022414) RFTN1 (ENSCAFG00845022667) OXNAD1 (ENSCAFG00845022998) DPH3 (ENSCAFG00845023089) GALNT15 (ENSCAFG00845023124) ANKRD28 (ENSCAFG00845023341) BTD (ENSCAFG00845024081) ENSCAFG00845024606 EAF1 (ENSCAFG00845026720) SH3BP5 (ENSCAFG00845026935) ENSCAFG00845027174 ENSCAFG00845027371 ENSCAFG00845027616 ##22 COL6A5 (ENSCAFG00845027693) COL6A6 (ENSCAFG00845027892) PIK3R4 (ENSCAFG00845028045) ATP2C1 (ENSCAFG00845028382) ASTE1 (ENSCAFG00845028741) NEK11 (ENSCAFG00845028794) NUDT16 (ENSCAFG00845028871) MRPL3 (ENSCAFG00845028932) CPNE4 (ENSCAFG00845029026) ACP3 (ENSCAFG00845029185) DNAJC13 (ENSCAFG00845029276) ACAD11 (ENSCAFG00845029398) ACKR4 (ENSCAFG00845029452) UBA5 (ENSCAFG00845029497) NPHP3 (ENSCAFG00845029572) Caniformia_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Ursidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Giant Panda MODERN SPECIES 1596 ENSAMEG00000024814 ##22 Mustelinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 American mink MODERN SPECIES 83 SLITRK4 (ENSNVIG00000022627) ENSNVIG00000022631 LDOC1 (ENSNVIG00000022636) ENSNVIG00000022637 SOX3 (ENSNVIG00000022644) ENSNVIG00000000062 ENSNVIG00000000077 ATP11C (ENSNVIG00000000083) MCF2 (ENSNVIG00000000331) FA9 (ENSNVIG00000000999) FGF13 (ENSNVIG00000001046) ENSNVIG00000001107 ENSNVIG00000001135 ##22 ZIC3 (ENSNVIG00000001184) GPR101 (ENSNVIG00000001200) ENSNVIG00000001206 RBMX (ENSNVIG00000001236) ARHGEF6 (ENSNVIG00000001293) CD40LG (ENSNVIG00000001334) ENSNVIG00000001366 HTATSF1 (ENSNVIG00000001372) BRS3 (ENSNVIG00000001386) ##11 ADGRG4 (ENSNVIG00000001403) ENSNVIG00000001467 FHL1 (ENSNVIG00000001503) SLC9A6 (ENSNVIG00000001615) MMGT1 (ENSNVIG00000001915) Ferret MODERN SPECIES 224 MMAA (ENSMPUG00000006877) C4orf51 (ENSMPUG00000006910) ZNF827 (ENSMPUG00000006921) LSM6 (ENSMPUG00000006936) ENSMPUG00000006949 #7 SLC10A7 (ENSMPUG00000006955) #8 POU4F2 (ENSMPUG00000006963) #9 TTC29 (ENSMPUG00000006968) #10 ENSMPUG00000006979 EDNRA (ENSMPUG00000006985) #11 TMEM184C (ENSMPUG00000006995) #12 PRMT9 (ENSMPUG00000007003) #13 ARHGAP10 (ENSMPUG00000007012) #14 NR3C2 (ENSMPUG00000007025) #15 ENSMPUG00000007034 #16 ENSMPUG00000007041 ##22 DCLK2 (ENSMPUG00000007082) #17 LRBA (ENSMPUG00000007098) #18 MAB21L2 (ENSMPUG00000019989) #19 ENSMPUG00000019992 RPS3A (ENSMPUG00000007139) ##22 ENSMPUG00000019994 SH3D19 (ENSMPUG00000007143) #23 ENSMPUG00000007291 #24 PRSS48 (ENSMPUG00000007310) #24 FHIP1A (ENSMPUG00000007380) #25 GATB (ENSMPUG00000007394) #26 FBXW7 (ENSMPUG00000007404) #27 ENSMPUG00000007417 TMEM154 (ENSMPUG00000007425) #28 TIGD4 (ENSMPUG00000019997) #29 Felidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Cat MODERN SPECIES ENSFCAG00000045423 XRCC4 (ENSFCAG00000029944) VCAN (ENSFCAG00000023191) HAPLN1 (ENSFCAG00000037432) EDIL3 (ENSFCAG00000002497) ENSFCAG00000050071 ENSFCAG00000022528 COX7C (ENSFCAG00000034705) RASA1 (ENSFCAG00000004825) CCNH (ENSFCAG00000004828) ENSFCAG00000048547 ENSFCAG00000050982 TMEM161B (ENSFCAG00000031564) MEF2C (ENSFCAG00000011595) CETN3 (ENSFCAG00000022808) ENSFCAG00000024204 ##22 MBLAC2 (ENSFCAG00000029005) ENSFCAG00000032444 LYSMD3 (ENSFCAG00000029406) ADGRV1 (ENSFCAG00000012405) ARRDC3 (ENSFCAG00000019203) ENSFCAG00000024804 NR2F1 (ENSFCAG00000034642) FAM172A (ENSFCAG00000025443) KIAA0825 (ENSFCAG00000028992) SLF1 (ENSFCAG00000024671) MCTP1 (ENSFCAG00000014397) FAM81B (ENSFCAG00000013183) SKIC3 (ENSFCAG00000010817) ARSK (ENSFCAG00000022411) GPR150 (ENSFCAG00000041866) Panthera ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Panthera_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 leopard MODERN SPECIES 6 ENSPPRG00000023608 #14 NR3C2 (ENSPPRG00000000130) #15 ENSPPRG00000000395 ##22 IQCM (ENSPPRG00000001385) #16 DCLK2 (ENSPPRG00000003879) #17 MAB21L2 (ENSPPRG00000017133) #19 ENSPPRG00000004503 LRBA (ENSPPRG00000012725) #18 ENSPPRG00000013249 RPS3A (ENSPPRG00000013732) ##22 SH3D19 (ENSPPRG00000001261) #23 ENSPPRG00000017765 FHIP1A (ENSPPRG00000002729) #25 GATB (ENSPPRG00000004993) #26 FBXW7 (ENSPPRG00000006952) #27 TMEM154 (ENSPPRG00000009481) #28 TIGD4 (ENSPPRG00000017931) #29 ARFIP1 (ENSPPRG00000013285) #30 Euarchontoglires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Euarchontoglires_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Tree shrew MODERN SPECIES 6242 ENSTBEG00000008523 ##22 Glires ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Lagomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Rabbit DUPLICATION Rabbit MODERN SPECIES MRE11 (ENSOCUG00000014899) GPR83 (ENSOCUG00000015502) IZUMO1R (ENSOCUG00000013431) PANX1 (ENSOCUG00000009473) HEPHL1 (ENSOCUG00000009466) ENSOCUG00000029520 VSTM5 (ENSOCUG00000026554) MED17 (ENSOCUG00000012818) C11orf54 (ENSOCUG00000012810) ENSOCUG00000001096 CEP295 (ENSOCUG00000029678) DEUP1 (ENSOCUG00000000199) SLC36A4 (ENSOCUG00000000649) MTNR1B (ENSOCUG00000008196) FAT3 (ENSOCUG00000007427) ENSOCUG00000023399 ##22 ENSOCUG00000014147 NAALAD2 (ENSOCUG00000014137) ENSOCUG00000036248 ENSOCUG00000011049 ENSOCUG00000027036 ENSOCUG00000008705 TRIM77 (ENSOCUG00000026390) FOLH1 (ENSOCUG00000026120) NOX4 (ENSOCUG00000016685) TYR (ENSOCUG00000009965) ENSOCUG00000029319 ENSOCUG00000012817 CTSC (ENSOCUG00000014527) ENSOCUG00000014522 ENSOCUG00000032429 Rabbit MODERN SPECIES 5 ENSOCUG00000003966 IFT57 (ENSOCUG00000003973) ENSOCUG00000001452 ENSOCUG00000024027 ENSOCUG00000006159 ENSOCUG00000031726 CIP2A (ENSOCUG00000003095) DZIP3 (ENSOCUG00000003105) ENSOCUG00000026237 TRAT1 (ENSOCUG00000002916) ENSOCUG00000029310 ENSOCUG00000032539 MORC1 (ENSOCUG00000008369) ENSOCUG00000003175 ENSOCUG00000003051 ENSOCUG00000022089 ##22 ENSOCUG00000029031 NECTIN3 (ENSOCUG00000000727) ENSOCUG00000017796 ZBED2 (ENSOCUG00000029023) CD96 (ENSOCUG00000001351) PHLDB2 (ENSOCUG00000003962) ABHD10 (ENSOCUG00000003969) TAGLN3 (ENSOCUG00000003970) TMPRSS7 (ENSOCUG00000009920) C3orf52 (ENSOCUG00000009929) GCSAM (ENSOCUG00000009933) SLC9C1 (ENSOCUG00000009937) ENSOCUG00000029264 CD200 (ENSOCUG00000009949) ENSOCUG00000033491 Rodentia ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Rodentia_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Hystricomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Hystricomorpha_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Hystricomorpha_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu DUPLICATION Degu MODERN SPECIES 142 NR3C2 (ENSODEG00000003225) #15 ENSODEG00000003336 #16 DCLK2 (ENSODEG00000003440) #17 ENSODEG00000004657 #18 MAB21L2 (ENSODEG00000019067) #19 ENSODEG00000004828 #18 ENSODEG00000004947 ##22 SH3D19 (ENSODEG00000005021) #23 PRSS48 (ENSODEG00000005073) #24 ENSODEG00000019141 FHIP1A (ENSODEG00000005324) #25 GATB (ENSODEG00000005429) #26 FBXW7 (ENSODEG00000003259) #27 ENSODEG00000003371 TMEM154 (ENSODEG00000003532) #28 TIGD4 (ENSODEG00000018999) #29 ARFIP1 (ENSODEG00000003601) #30 FHDC1 (ENSODEG00000003809) #32 TRIM2 (ENSODEG00000003924) #33 MND1 (ENSODEG00000004042) #35 TMEM131L (ENSODEG00000004133) #36 SFRP2 (ENSODEG00000004384) Degu MODERN SPECIES 161 ENSODEG00000003181 KCNG2 (ENSODEG00000003142) CTDP1 (ENSODEG00000003029) ENSODEG00000002960 NFATC1 (ENSODEG00000002866) ATP9B (ENSODEG00000002792) SALL3 (ENSODEG00000002692) GALR1 (ENSODEG00000002674) MBP (ENSODEG00000002651) ZNF236 (ENSODEG00000003041) ZNF516 (ENSODEG00000002971) ENSODEG00000002953 ENSODEG00000002943 PTGR3 (ENSODEG00000002932) ENSODEG00000002919 ENSODEG00000018901 ##22 ENSODEG00000002905 CNDP1 (ENSODEG00000002852) CNDP2 (ENSODEG00000002825) DIPK1C (ENSODEG00000002789) ENSODEG00000002757 ENSODEG00000018841 ENSODEG00000002747 TIMM21 (ENSODEG00000002726) FBXO15 (ENSODEG00000002700) ENSODEG00000002681 Degu MODERN SPECIES 65 HBS1L (ENSODEG00000008959) ENSODEG00000008684 ENSODEG00000019597 ENSODEG00000006953 ENSODEG00000007137 PDE7B (ENSODEG00000007023) MTFR2 (ENSODEG00000006976) ENSODEG00000006806 MAP7 (ENSODEG00000008448) ENSODEG00000008040 ENSODEG00000008240 SLC35D3 (ENSODEG00000006620) IL20RA (ENSODEG00000006756) IL22RA2 (ENSODEG00000007775) ENSODEG00000008408 ENSODEG00000019506 ##22 OLIG3 (ENSODEG00000019534) ENSODEG00000019565 TNFAIP3 (ENSODEG00000008925) ENSODEG00000008459 ARFGEF3 (ENSODEG00000008382) ENSODEG00000009708 HEBP2 (ENSODEG00000007586) NHSL1 (ENSODEG00000008039) ENSODEG00000007997 ENSODEG00000009059 ENSODEG00000009581 ENSODEG00000009856 ECT2L (ENSODEG00000011163) REPS1 (ENSODEG00000007604) ENSODEG00000008655 Degu MODERN SPECIES 91 ENSODEG00000019836 PLPP2 (ENSODEG00000011021) ENSODEG00000012210 ENSODEG00000010516 ENSODEG00000012644 ENSODEG00000011468 ENSODEG00000019982 CYP4F8 (ENSODEG00000012418) CYP4F22 (ENSODEG00000011011) ENSODEG00000019784 PGLYRP2 (ENSODEG00000010857) ENSODEG00000011358 WIZ (ENSODEG00000011172) AKAP8L (ENSODEG00000010840) AKAP8 (ENSODEG00000011314) ENSODEG00000010978 ##22 BRD4 (ENSODEG00000011937) EPHX3 (ENSODEG00000010791) NOTCH3 (ENSODEG00000011730) ILVBL (ENSODEG00000011511) SYDE1 (ENSODEG00000010751) CASP14 (ENSODEG00000010016) CCDC105 (ENSODEG00000011650) SLC1A6 (ENSODEG00000011064) ENSODEG00000010232 COL1A2 (ENSODEG00000010146) CASD1 (ENSODEG00000010520) ENSODEG00000009551 PEG10 (ENSODEG00000009969) PPP1R9A (ENSODEG00000010739) PON1 (ENSODEG00000009868) Sciuridae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Marmotini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Marmotini_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Squirrel MODERN SPECIES 508 ZSCAN23 (ENSSTOG00000004477) ENSSTOG00000025625 GPX6 (ENSSTOG00000015419) ENSSTOG00000015422 ENSSTOG00000022052 ##22 TRIM27 (ENSSTOG00000000235) ZNF311 (ENSSTOG00000032887) ENSSTOG00000022034 ENSSTOG00000032966 Rodentia_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Myomorpha ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Lesser Egyptian jerboa MODERN SPECIES 44 Taar5 (ENSJJAG00000017753) Taar4 (ENSJJAG00000002217) Taar3 (ENSJJAG00000003037) Taar2 (ENSJJAG00000022531) ENSJJAG00000002766 Vnn1 (ENSJJAG00000023296) Vnn3 (ENSJJAG00000013692) Slc18b1 (ENSJJAG00000012667) ENSJJAG00000004347 ENSJJAG00000006059 Eya4 (ENSJJAG00000012851) Tcf21 (ENSJJAG00000010513) ENSJJAG00000007350 Slc2a12 (ENSJJAG00000003595) Sgk1 (ENSJJAG00000003911) ENSJJAG00000009072 ##22 Aldh8a1 (ENSJJAG00000014136) ENSJJAG00000017024 Myb (ENSJJAG00000023989) Ahi1 (ENSJJAG00000010372) Pde7b (ENSJJAG00000001518) Bclaf1 (ENSJJAG00000011803) Map7 (ENSJJAG00000023344) ENSJJAG00000012639 Pex7 (ENSJJAG00000016195) Slc35d3 (ENSJJAG00000014674) Il20ra (ENSJJAG00000019171) Il22ra2 (ENSJJAG00000007140) Olig3 (ENSJJAG00000001512) ENSJJAG00000020726 Perp (ENSJJAG00000021130) Muroidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Upper Galilee mountains blind mole rat MODERN SPECIES 910 Spata2 (ENSNGAG00000018425) Rnf114 (ENSNGAG00000017673) Snai1 (ENSNGAG00000017185) Ube2v1 (ENSNGAG00000015973) ENSNGAG00000013302 Cebpb (ENSNGAG00000012015) Ptpn1 (ENSNGAG00000010216) Ripor3 (ENSNGAG00000013334) Pard6b (ENSNGAG00000013685) ENSNGAG00000011839 ENSNGAG00000001117 Mocs3 (ENSNGAG00000011771) Kcng1 (ENSNGAG00000022351) Nfatc2 (ENSNGAG00000010940) ENSNGAG00000006990 ##22 Atp9a (ENSNGAG00000000818) Sall4 (ENSNGAG00000017833) Zfp64 (ENSNGAG00000018331) ENSNGAG00000016474 Zfp217 (ENSNGAG00000016391) Bcas1 (ENSNGAG00000015655) Cyp24a1 (ENSNGAG00000013537) Pfdn4 (ENSNGAG00000001025) Dok5 (ENSNGAG00000013135) Cbln4 (ENSNGAG00000000535) Mc3r (ENSNGAG00000002843) Muroidea_A ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Cricetidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Cricetinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Chinese hamster chok1gshd DUPLICATION Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 1 Scly (ENSCGRG00001024710) ENSCGRG00001010672 Ramp1 (ENSCGRG00001024580) Rbm44 (ENSCGRG00001001293) ENSCGRG00001024654 Col6a3 (ENSCGRG00001024539) Cops8 (ENSCGRG00001024515) Ackr3 (ENSCGRG00001010122) Iqca (ENSCGRG00001024459) Asb18 (ENSCGRG00001024506) Gbx2 (ENSCGRG00001024158) Agap1 (ENSCGRG00001001480) ENSCGRG00001009648 ENSCGRG00001024137 Sh3bp4 (ENSCGRG00001009956) ENSCGRG00001024628 ##22 Arl4c (ENSCGRG00001010866) Spp2 (ENSCGRG00001024730) Trpm8 (ENSCGRG00001024258) Hjurp (ENSCGRG00001024392) Mroh2a (ENSCGRG00001000590) Dnajb3 (ENSCGRG00001009691) ENSCGRG00001000882 Usp40 (ENSCGRG00001007804) Dgkd (ENSCGRG00001024793) Sag (ENSCGRG00001024487) Atg16l1 (ENSCGRG00001024596) Inpp5d (ENSCGRG00001023640) NEU2 (ENSCGRG00001023529) Ngef (ENSCGRG00001001643) Snorc (ENSCGRG00001000683) Chinese hamster chok1gshd MODERN SPECIES 226 Rnf150 (ENSCGRG00001022877) ENSCGRG00001023417 ENSCGRG00001014103 Zfp330 (ENSCGRG00001001331) Il15 (ENSCGRG00001010668) Inpp4b (ENSCGRG00001016742) Usp38 (ENSCGRG00001008922) Gab1 (ENSCGRG00001010681) Smarca5 (ENSCGRG00001012719) Hhip (ENSCGRG00001017452) ENSCGRG00001017973 Abce1 (ENSCGRG00001000394) Otud4 (ENSCGRG00001004451) ENSCGRG00001006596 Mmaa (ENSCGRG00001013056) ENSCGRG00001014492 ##22 1700011L22Rik (ENSCGRG00001015849) Zfp827 (ENSCGRG00001020514) Lsm6 (ENSCGRG00001017142) Slc10a7 (ENSCGRG00001018803) #8 ENSCGRG00001013716 Pou4f2 (ENSCGRG00001001534) #9 Ttc29 (ENSCGRG00001003512) #10 Ednra (ENSCGRG00001005013) #11 ENSCGRG00001005844 #12 Prmt9 (ENSCGRG00001012400) #13 Arhgap10 (ENSCGRG00001015571) #14 Nr3c2 (ENSCGRG00001008894) #15 Iqcm (ENSCGRG00001013562) #16 Rasd2 (ENSCGRG00001006448) Mcm5 (ENSCGRG00001009878) Cricetidae_B ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Prairie vole MODERN SPECIES 13 Opcml (ENSMOCG00000019238) Spata19 (ENSMOCG00000007560) Igsf9b (ENSMOCG00000019146) Jam3 (ENSMOCG00000000897) Ncapd3 (ENSMOCG00000001819) Vps26b (ENSMOCG00000015004) Thyn1 (ENSMOCG00000010854) Acad8 (ENSMOCG00000021466) Gm1110 (ENSMOCG00000008188) Glb1l2 (ENSMOCG00000020254) B3gat1 (ENSMOCG00000022917) Eepd1 (ENSMOCG00000020176) Septin7 (ENSMOCG00000013002) Herpud2 (ENSMOCG00000014682) ENSMOCG00000005080 ENSMOCG00000005481 ##22 Tbx20 (ENSMOCG00000016154) Dpy19l2 (ENSMOCG00000003608) Dpy19l1 (ENSMOCG00000009241) Npsr1 (ENSMOCG00000011218) Bmper (ENSMOCG00000021320) Bbs9 (ENSMOCG00000014729) Rp9 (ENSMOCG00000020161) 9530077C05Rik (ENSMOCG00000017716) Anln (ENSMOCG00000013010) Zfp810 (ENSMOCG00000002039) Zfp599 (ENSMOCG00000023026) ENSMOCG00000022973 ENSMOCG00000018031 Pigyl (ENSMOCG00000017172) Acp5 (ENSMOCG00000015161) Kangaroo rat DUPLICATION Kangaroo rat MODERN SPECIES 326 Akap1 (ENSDORG00000030157) Scpep1 (ENSDORG00000003013) Coil (ENSDORG00000027289) Trim25 (ENSDORG00000012159) Dgke (ENSDORG00000004135) Gm525 (ENSDORG00000000733) Nog (ENSDORG00000029051) ENSDORG00000028536 Ankfn1 (ENSDORG00000007824) Pctp (ENSDORG00000012691) Tmem100 (ENSDORG00000028016) Mmd (ENSDORG00000026049) Hlf (ENSDORG00000026285) Stxbp4 (ENSDORG00000015457) Tom1l1 (ENSDORG00000001206) ENSDORG00000029230 ##22 Car10 (ENSDORG00000011701) ENSDORG00000029998 Utp18 (ENSDORG00000005965) ENSDORG00000005964 Nme2 (ENSDORG00000005962) Nme1 (ENSDORG00000029493) Spag9 (ENSDORG00000005649) Tob1 (ENSDORG00000013844) Wfikkn2 (ENSDORG00000027958) Luc7l3 (ENSDORG00000001260) Ankrd40 (ENSDORG00000026320) Abcc3 (ENSDORG00000004963) Cacna1g (ENSDORG00000009130) Spata20 (ENSDORG00000009128) Epn3 (ENSDORG00000009127) Kangaroo rat MODERN SPECIES 441 Dclk2 (ENSDORG00000001007) #17 ENSDORG00000024190 #18 Mab21l2 (ENSDORG00000028902) #19 ENSDORG00000005601 #18 ENSDORG00000024347 ##22 Sh3d19 (ENSDORG00000002251) #23 Prss48 (ENSDORG00000010411) #24 Fhip1a (ENSDORG00000010240) #25 Gatb (ENSDORG00000010241) #26 Fbxw7 (ENSDORG00000007531) #27 Tmem154 (ENSDORG00000013371) #28 Tigd4 (ENSDORG00000008170) #29 Arfip1 (ENSDORG00000024563) #30 Fhdc1 (ENSDORG00000015867) #32 Trim2 (ENSDORG00000004512) #33 Mnd1 (ENSDORG00000004514) #35 ENSDORG00000027965 #36 Sfrp2 (ENSDORG00000028019) Dchs2 (ENSDORG00000014105) Plrg1 (ENSDORG00000016294) Primates ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Strepsirrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Lemuriformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Lemuriformes_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Coquerels sifaka DUPLICATION Coquerels sifaka MODERN SPECIES 812 TBCE (ENSPCOG00000021439) B3GALNT2 (ENSPCOG00000023952) GNG4 (ENSPCOG00000004047) LYST (ENSPCOG00000019565) NID1 (ENSPCOG00000009614) GPR137B (ENSPCOG00000016957) ERO1B (ENSPCOG00000006144) EDARADD (ENSPCOG00000024505) LGALS8 (ENSPCOG00000028427) HEATR1 (ENSPCOG00000018534) ACTN2 (ENSPCOG00000026369) MTR (ENSPCOG00000027883) ENSPCOG00000003558 RYR2 (ENSPCOG00000016610) ZP4 (ENSPCOG00000024830) ENSPCOG00000027601 ##22 Coquerels sifaka MODERN SPECIES 162 CACHD1 (ENSPCOG00000018645) RAVER2 (ENSPCOG00000028379) JAK1 (ENSPCOG00000018189) ENSPCOG00000025120 #21 DNAJC6 (ENSPCOG00000021196) LEPROT (ENSPCOG00000027148) LEPR (ENSPCOG00000017023) ENSPCOG00000016467 KCNMB2 (ENSPCOG00000021563) ZMAT3 (ENSPCOG00000022835) PIK3CA (ENSPCOG00000019539) KCNMB3 (ENSPCOG00000006968) ZNF639 (ENSPCOG00000025183) MFN1 (ENSPCOG00000018204) GNB4 (ENSPCOG00000023050) ENSPCOG00000023805 ##22 ACTL6A (ENSPCOG00000027739) MRPL47 (ENSPCOG00000019367) ENSPCOG00000025389 ENSPCOG00000023588 USP13 (ENSPCOG00000000179) ENSPCOG00000028880 PEX5L (ENSPCOG00000002922) TTC14 (ENSPCOG00000027629) CCDC39 (ENSPCOG00000018971) ENSPCOG00000026996 ENSPCOG00000025037 FXR1 (ENSPCOG00000020057) DNAJC19 (ENSPCOG00000022644) Bushbaby DUPLICATION Bushbaby MODERN SPECIES 389 NPY2R (ENSOGAG00000001832) MAP9 (ENSOGAG00000001837) ENSOGAG00000026965 ##22 GUCY1A1 (ENSOGAG00000017072) GUCY1B1 (ENSOGAG00000004323) ASIC5 (ENSOGAG00000004325) TDO2 (ENSOGAG00000004327) CTSO (ENSOGAG00000004328) Bushbaby MODERN SPECIES 271 PAFAH2 (ENSOGAG00000000574) STMN1 (ENSOGAG00000002109) PAQR7 (ENSOGAG00000024814) AUNIP (ENSOGAG00000034108) MTFR1L (ENSOGAG00000002104) ENSOGAG00000024972 MAN1C1 (ENSOGAG00000002102) LDLRAP1 (ENSOGAG00000002101) MACO1 (ENSOGAG00000033230) ENSOGAG00000011983 TMEM50A (ENSOGAG00000028512) RSRP1 (ENSOGAG00000011942) SYF2 (ENSOGAG00000009962) RUNX3 (ENSOGAG00000025633) CLIC4 (ENSOGAG00000014620) ENSOGAG00000025062 ##22 ENSOGAG00000030641 SRRM1 (ENSOGAG00000010210) NCMAP (ENSOGAG00000008361) RCAN3 (ENSOGAG00000015460) NIPAL3 (ENSOGAG00000011036) STPG1 (ENSOGAG00000011033) GRHL3 (ENSOGAG00000011027) ENSOGAG00000010712 IL22RA1 (ENSOGAG00000024442) MYOM3 (ENSOGAG00000010702) SRSF10 (ENSOGAG00000015374) PNRC2 (ENSOGAG00000024747) CNR2 (ENSOGAG00000011818) FUCA1 (ENSOGAG00000009383) HMGCL (ENSOGAG00000009381) Bushbaby MODERN SPECIES 231 PRR14L (ENSOGAG00000007564) PISD (ENSOGAG00000034158) ABHD14B (ENSOGAG00000012132) SFI1 (ENSOGAG00000007556) EIF4ENIF1 (ENSOGAG00000012272) DRG1 (ENSOGAG00000012268) ENSOGAG00000030736 ERO1B (ENSOGAG00000015531) GPR137B (ENSOGAG00000027989) NID1 (ENSOGAG00000014737) LYST (ENSOGAG00000000135) GNG4 (ENSOGAG00000007427) B3GALNT2 (ENSOGAG00000007425) TBCE (ENSOGAG00000007422) GGPS1 (ENSOGAG00000013760) ENSOGAG00000006640 ##22 ARID4B (ENSOGAG00000012476) RBM34 (ENSOGAG00000012470) TOMM20 (ENSOGAG00000032693) IRF2BP2 (ENSOGAG00000002391) TARBP1 (ENSOGAG00000002379) SLC35F3 (ENSOGAG00000002376) KCNK1 (ENSOGAG00000002272) MAP3K21 (ENSOGAG00000010128) PCNX2 (ENSOGAG00000004635) NTPCR (ENSOGAG00000004633) MAP10 (ENSOGAG00000024613) SIPA1L2 (ENSOGAG00000007607) DISC1 (ENSOGAG00000009237) ENSOGAG00000005575 EGLN1 (ENSOGAG00000033024) Haplorrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Simiiformes ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Platyrrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Cebidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Marmoset MODERN SPECIES 18 SCTR (ENSCJAG00000021438) CFAP221 (ENSCJAG00000021440) TMEM177 (ENSCJAG00000080051) PTPN4 (ENSCJAG00000013214) ENSCJAG00000073015 ENSCJAG00000082465 EPB41L5 (ENSCJAG00000013283) TMEM185B (ENSCJAG00000004108) ENSCJAG00000013326 ENSCJAG00000074220 INHBB (ENSCJAG00000048402) GLI2 (ENSCJAG00000013342) TFCP2L1 (ENSCJAG00000013356) ENSCJAG00000082293 CLASP1 (ENSCJAG00000013398) ENSCJAG00000081768 ##22 ENSCJAG00000023039 ENSCJAG00000041121 NIFK (ENSCJAG00000013386) ENSCJAG00000071090 CNTNAP5 (ENSCJAG00000018447) GYPC (ENSCJAG00000084616) TEX51 (ENSCJAG00000041118) ENSCJAG00000047222 ENSCJAG00000083000 ENSCJAG00000015271 ENSCJAG00000064504 MYO1B (ENSCJAG00000003380) NABP1 (ENSCJAG00000082844) CAVIN2 (ENSCJAG00000065456) TMEFF2 (ENSCJAG00000003484) Cebidae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Bolivian squirrel monkey MODERN SPECIES 48 CLHC1 (ENSSBOG00000031988) RTN4 (ENSSBOG00000032024) EML6 (ENSSBOG00000024484) SPTBN1 (ENSSBOG00000027662) C2orf73 (ENSSBOG00000033884) ACYP2 (ENSSBOG00000030505) ENSSBOG00000021730 GPR75 (ENSSBOG00000019537) ERLEC1 (ENSSBOG00000022814) ASB3 (ENSSBOG00000034288) CHAC2 (ENSSBOG00000030058) NRXN1 (ENSSBOG00000026811) ENSSBOG00000034030 ENSSBOG00000028134 FSHR (ENSSBOG00000033299) ENSSBOG00000020971 ##22 LHCGR (ENSSBOG00000019216) GTF2A1L (ENSSBOG00000023060) STON1 (ENSSBOG00000034719) ENSSBOG00000036123 FOXN2 (ENSSBOG00000025167) ENSSBOG00000032584 FBXO11 (ENSSBOG00000027980) MSH6 (ENSSBOG00000011609) KCNK12 (ENSSBOG00000000094) MSH2 (ENSSBOG00000027484) ENSSBOG00000021194 SOWAHC (ENSSBOG00000020617) ENSSBOG00000027814 SH3RF3 (ENSSBOG00000019575) EDAR (ENSSBOG00000029515) Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey DUPLICATION Mas night monkey MODERN SPECIES 1281 PLEKHM2 (ENSANAG00000037103) SLC25A34 (ENSANAG00000036756) TMEM82 (ENSANAG00000026990) FBLIM1 (ENSANAG00000032942) SPEN (ENSANAG00000034428) ZBTB17 (ENSANAG00000027752) ENSANAG00000018563 SRARP (ENSANAG00000030546) HSPB7 (ENSANAG00000020521) ENSANAG00000023434 FAM131C (ENSANAG00000026130) EPHA2 (ENSANAG00000037528) ARHGEF19 (ENSANAG00000038160) CPLANE2 (ENSANAG00000032645) FBXO42 (ENSANAG00000022274) ENSANAG00000005361 ##22 SZRD1 (ENSANAG00000031853) ENSANAG00000029564 CROCC (ENSANAG00000026909) MFAP2 (ENSANAG00000025087) ATP13A2 (ENSANAG00000022398) SDHB (ENSANAG00000037432) PADI2 (ENSANAG00000027403) ENSANAG00000036441 PADI1 (ENSANAG00000000052) PADI3 (ENSANAG00000037603) PADI4 (ENSANAG00000038460) PADI6 (ENSANAG00000033689) RCC2 (ENSANAG00000024788) ARHGEF10L (ENSANAG00000030027) ACTL8 (ENSANAG00000011638) Mas night monkey MODERN SPECIES 658 ZFYVE27 (ENSANAG00000038112) MARVELD1 (ENSANAG00000031120) AVPI1 (ENSANAG00000029881) MORN4 (ENSANAG00000023217) PI4K2A (ENSANAG00000019727) ANKRD2 (ENSANAG00000038359) UBTD1 (ENSANAG00000035205) MMS19 (ENSANAG00000023237) ZDHHC16 (ENSANAG00000032609) EXOSC1 (ENSANAG00000034669) PGAM1 (ENSANAG00000023598) RRP12 (ENSANAG00000037485) ARHGAP19 (ENSANAG00000003403) ENSANAG00000021580 SLIT1 (ENSANAG00000033563) ENSANAG00000037982 ##22 LCOR (ENSANAG00000033126) ENSANAG00000033782 PIK3AP1 (ENSANAG00000008972) TM9SF3 (ENSANAG00000028656) TLL2 (ENSANAG00000037945) OPALIN (ENSANAG00000038093) DNTT (ENSANAG00000037070) BLNK (ENSANAG00000027173) ZNF518A (ENSANAG00000037819) ENSANAG00000037354 ENSANAG00000026742 ENSANAG00000019403 ENSANAG00000024392 ENTPD1 (ENSANAG00000029369) TCTN3 (ENSANAG00000030005) Mas night monkey MODERN SPECIES 814 CDKL5 (ENSANAG00000034696) RS1 (ENSANAG00000029033) PPEF1 (ENSANAG00000023404) PHKA2 (ENSANAG00000038435) ADGRG2 (ENSANAG00000034597) PDHA1 (ENSANAG00000030855) MAP3K15 (ENSANAG00000034023) ENSANAG00000030233 ENSANAG00000034832 ENSANAG00000026646 MAP7D2 (ENSANAG00000037417) ENSANAG00000030856 ENSANAG00000025820 RPS6KA3 (ENSANAG00000026591) ENSANAG00000000067 ENSANAG00000019923 ##22 CNKSR2 (ENSANAG00000030385) KLHL34 (ENSANAG00000020210) SMPX (ENSANAG00000035900) ENSANAG00000034743 MBTPS2 (ENSANAG00000022738) SMS (ENSANAG00000031156) ENSANAG00000032026 ENSANAG00000030126 PHEX (ENSANAG00000021236) CBLL2 (ENSANAG00000024818) ENSANAG00000023417 Catarrhini ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae DUPLICATION Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a ##22 Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a ##22 Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a ##22 Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a ##22 Drill MODERN SPECIES 871 DDX18 (ENSMLEG00000038065) ENSMLEG00000035866 CCDC93 (ENSMLEG00000029873) INSIG2 (ENSMLEG00000031649) ENSMLEG00000035636 ##22 MARCO (ENSMLEG00000034132) C1QL2 (ENSMLEG00000033421) STEAP3 (ENSMLEG00000037794) C2orf76 (ENSMLEG00000039378) DBI (ENSMLEG00000001896) TMEM37 (ENSMLEG00000033060) SCTR (ENSMLEG00000029227) CFAP221 (ENSMLEG00000042134) ENSMLEG00000041704 PTPN4 (ENSMLEG00000040178) ENSMLEG00000039838 EPB41L5 (ENSMLEG00000032344) ENSMLEG00000027991 RALB (ENSMLEG00000008823) ENSMLEG00000042162 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.a ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 2438 CCDC93 (ENSRBIG00000043000) INSIG2 (ENSRBIG00000029052) ENSRBIG00000038781 ##22 Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.b ##22 Rhinopithecus ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.v.b ##22 Black snub-nosed monkey MODERN SPECIES 1359 RNF149 (ENSRBIG00000042294) CNOT11 (ENSRBIG00000006823) TBC1D8 (ENSRBIG00000044656) ENSRBIG00000035177 NPAS2 (ENSRBIG00000014017) ENSRBIG00000028100 ENSRBIG00000028051 NMS (ENSRBIG00000037420) ENSRBIG00000041087 CHST10 (ENSRBIG00000039203) LONRF2 (ENSRBIG00000037046) AFF3 (ENSRBIG00000029993) ENSRBIG00000042889 RGS7 (ENSRBIG00000041312) ENSRBIG00000038076 ##22 ENSRBIG00000032971 KMO (ENSRBIG00000041269) OPN3 (ENSRBIG00000034420) WDR64 (ENSRBIG00000007151) EXO1 (ENSRBIG00000036604) MAP1LC3C (ENSRBIG00000027745) PLD5 (ENSRBIG00000032911) CEP170 (ENSRBIG00000037096) SDCCAG8 (ENSRBIG00000031769) AKT3 (ENSRBIG00000040845) Cercopithecidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.w ##22 Cercopithecinae ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000007883 ENSGT00730000111142 ENSGT00390000011475 ENSGT00940000155122.a ENSGT00940000155165.a ENSGT01100000264463 ENSGT00390000007237 ENSGT00940000162236 ENSGT00390000008994 ENSGT00390000018074 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000002172.B ENSGT00390000018433.s.a.a.w ##22 ENSGT00390000013370 ENSGT00390000004147 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a ENSGT00940000158903 ENSGT00390000007848.b ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d ENSGT00940000154717 ENSGT00390000012719.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000161828 ENSGT01020000230351.D.b ENSGT01020000230351.D.a.a.b.l ENSGT00510000046406.f.a.b Vervet Monkey MODERN SPECIES 2 CCDC62 (ENSCSAG00000002091) DENR (ENSCSAG00000002095) HCAR1 (ENSCSAG00000018949) ENSCSAG00000018948 KNTC1 (ENSCSAG00000002105) RSRC2 (ENSCSAG00000002113) ZCCHC8 (ENSCSAG00000002121) CLIP1 (ENSCSAG00000002132) VPS33A (ENSCSAG00000002138) B3GNT4 (ENSCSAG00000002141) DIABLO (ENSCSAG00000002145) LRRC43 (ENSCSAG00000002152) IL31 (ENSCSAG00000002153) MLXIP (ENSCSAG00000002159) BCL7A (ENSCSAG00000002164) ENSCSAG00000018947 ##22 CFAP251 (ENSCSAG00000002175) PSMD9 (ENSCSAG00000002179) HPD (ENSCSAG00000002182) SETD1B (ENSCSAG00000002187) RHOF (ENSCSAG00000002190) TMEM120B (ENSCSAG00000002193) MORN3 (ENSCSAG00000002195) ORAI1 (ENSCSAG00000002198) KDM2B (ENSCSAG00000002201) RNF34 (ENSCSAG00000002204) ANAPC5 (ENSCSAG00000002207) CAMKK2 (ENSCSAG00000002211) P2RX4 (ENSCSAG00000002217) P2RX7 (ENSCSAG00000002219) OASL (ENSCSAG00000002221) Cercopithecinae_a ANCESTRAL SPECIES 7 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000007883 ENSGT00730000111142 ENSGT00390000011475 ENSGT00940000155122.a ENSGT00940000155165.a ENSGT01100000264463 ENSGT00390000007237 ENSGT00940000162236 ENSGT00390000008994 ENSGT00390000018074 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000002172.B ENSGT00390000018433.s.a.a.w ##22 ENSGT00390000013370 ENSGT00390000004147 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a ENSGT00940000158903 ENSGT00390000007848.b ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d ENSGT00940000154717 ENSGT00390000012719.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000161828 ENSGT01020000230351.D.b ENSGT01020000230351.D.a.a.b.l ENSGT00510000046406.f.a.b Cercopithecinae_b ANCESTRAL SPECIES 56 ENSGT00940000156227.f ENSGT00940000156625 ENSGT00940000156232.b ENSGT00390000001376.bb.b.a.b ENSGT00440000037780.a ENSGT00940000154101.b ENSGT00390000003031 ENSGT00910000147147 ENSGT00390000018433.s.a.a.w ##22 ENSGT00940000159227.l ENSGT01050000248507 ENSGT00940000154653.oe.a.c ENSGT00390000015348 ENSGT00940000158582 ENSGT00940000158806 ENSGT00940000159227.k ENSGT00940000154653.oe.a.d ENSGT00390000014526 ENSGT00950000183123.g.b.b.j ENSGT00950000183208.B ENSGT00950000182860.a.a.b ENSGT00940000154801 ENSGT00510000047537.g.b ENSGT00940000155003.e.a Cercopithecinae_d ANCESTRAL SPECIES 173 ENSGT00440000037780.a ENSGT00940000154101.b ENSGT00390000003031 ENSGT00910000147147 ENSGT00390000018433.s.a.a.w ##22 ENSGT00940000159227.l ENSGT00940000154653.oe.a.c ENSGT00740000115534.a.b.f.a.b.n.a ENSGT00390000015348 ENSGT00940000158582 ENSGT00940000158806 ENSGT00940000159227.k ENSGT00940000154653.oe.a.d ENSGT00390000014526 ENSGT00950000183123.g.b.b.j ENSGT00950000183208.B ENSGT00950000182860.a.a.b ENSGT00940000154801 ENSGT00510000047537.g.b ENSGT00940000155003.e.a Sooty mangabey MODERN SPECIES 253 ENSCATG00000031712 ENSCATG00000019296 ##22 ENSCATG00000035171 SVIL (ENSCATG00000021892) ENSCATG00000020748 JCAD (ENSCATG00000036286) MTPAP (ENSCATG00000035677) MAP3K8 (ENSCATG00000035664) ENSCATG00000028858 ENSCATG00000023564 ZNF438 (ENSCATG00000019097) ENSCATG00000001588 ZEB1 (ENSCATG00000017202) ARHGAP12 (ENSCATG00000016616) KIF5B (ENSCATG00000007099) ENSCATG00000009794 EPC1 (ENSCATG00000004828) Drill MODERN SPECIES 1270 ENSMLEG00000027071 WAC (ENSMLEG00000037194) ENSMLEG00000041735 BAMBI (ENSMLEG00000030277) ENSMLEG00000027765 ENSMLEG00000031493 ENSMLEG00000031895 ENSMLEG00000036774 ENSMLEG00000037497 ENSMLEG00000027128 ##22 ENSMLEG00000033813 Olive baboon MODERN SPECIES 2 ENSPANG00000047067 PTCHD3 (ENSPANG00000030115) MKX (ENSPANG00000022998) ODAD2 (ENSPANG00000022989) MPP7 (ENSPANG00000022992) ENSPANG00000048963 ENSPANG00000050280 ENSPANG00000017854 ENSPANG00000041254 WAC (ENSPANG00000022987) ENSPANG00000048040 ENSPANG00000047231 ENSPANG00000050196 BAMBI (ENSPANG00000042499) ENSPANG00000048136 ENSPANG00000009635 ##22 ENSPANG00000022984 ENSPANG00000040042 SVIL (ENSPANG00000022931) ENSPANG00000018403 ENSPANG00000038549 JCAD (ENSPANG00000022942) MTPAP (ENSPANG00000022927) MAP3K8 (ENSPANG00000022919) ENSPANG00000022921 ZNF438 (ENSPANG00000022917) ZEB1 (ENSPANG00000022899) ARHGAP12 (ENSPANG00000022901) KIF5B (ENSPANG00000022905) ENSPANG00000037456 ENSPANG00000044355 Macaca ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00400000022269 ENSGT00390000014349 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000007883 ENSGT00730000111142 ENSGT00390000011475 ENSGT00940000155122.a ENSGT00940000155165.a ENSGT00390000007237 ENSGT00940000162236 ENSGT00390000008994 ENSGT00390000018074 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000002172.B ENSGT00390000018433.s.a.a.w ##22 ENSGT00390000013370 ENSGT00390000004147 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a ENSGT00940000158903 ENSGT00390000007848.b ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d ENSGT00940000154717 ENSGT00390000012719.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000161828 ENSGT01020000230351.D.b ENSGT01020000230351.D.a.a.b.l ENSGT00510000046406.f.a.b Pig-tailed macaque MODERN SPECIES 562 ACBD5 (ENSMNEG00000035816) ENSMNEG00000039132 PTCHD3 (ENSMNEG00000015528) RAB18 (ENSMNEG00000038180) MKX (ENSMNEG00000039776) ODAD2 (ENSMNEG00000022625) ENSMNEG00000029878 MPP7 (ENSMNEG00000042436) ENSMNEG00000029850 WAC (ENSMNEG00000032060) BAMBI (ENSMNEG00000035278) ENSMNEG00000025322 ENSMNEG00000040949 ENSMNEG00000000290 ENSMNEG00000045334 ENSMNEG00000040731 ##22 ENSMNEG00000040316 ENSMNEG00000031013 JCAD (ENSMNEG00000018085) MTPAP (ENSMNEG00000039635) MAP3K8 (ENSMNEG00000032888) ENSMNEG00000028826 ENSMNEG00000041348 ZNF438 (ENSMNEG00000033720) ENSMNEG00000038566 ZEB1 (ENSMNEG00000034471) ARHGAP12 (ENSMNEG00000004167) KIF5B (ENSMNEG00000040057) ENSMNEG00000009982 EPC1 (ENSMNEG00000021935) ENSMNEG00000035008 Macaca_a ANCESTRAL SPECIES 6 ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.b ENSGT00990000203619.A.b.b.b.b.a.a.a ENSGT00390000007883 ENSGT00730000111142 ENSGT00390000011475 ENSGT00940000161627.a.a.a.b.b.b.b.a.a.a.a.a.a.b.a.b.a.c ENSGT00940000155122.a ENSGT00940000155165.a ENSGT00390000007237 ENSGT00940000162236 ENSGT00390000008994 ENSGT01100000263493.a.b.a.a.a.b.a.a.b.b.a.b.a.b.b.d.b ENSGT00390000018074 ENSGT00940000158691 ENSGT00390000002172.B ENSGT00390000018433.s.a.a.w ##22 ENSGT00390000013370 ENSGT00390000004147 ENSGT00530000063474.B.e.a ENSGT00940000154575.a ENSGT00940000158903 ENSGT00390000007848.b ENSGT00940000159285 ENSGT00390000015354.d ENSGT01100000263493.a.b.a.b.a.a.b.a.b.a.b.a.a.b ENSGT00940000167556.b.b.a.b.a.a.a.a.a.b.a ENSGT00940000154717 ENSGT00390000012719.b ENSGT00390000018674 ENSGT00940000161828 ENSGT01020000230351.D.b Crab-eating macaque DUPLICATION Crab-eating macaque MODERN SPECIES 2 HCAR1 (ENSMFAG00000028540) ENSMFAG00000036514 KNTC1 (ENSMFAG00000045398) RSRC2 (ENSMFAG00000036398) ZCCHC8 (ENSMFAG00000045203) ENSMFAG00000060843 CLIP1 (ENSMFAG00000043612) VPS33A (ENSMFAG00000019477) DIABLO (ENSMFAG00000002957) B3GNT4 (ENSMFAG00000032438) LRRC43 (ENSMFAG00000038285) ENSMFAG00000060500 IL31 (ENSMFAG00000040210) MLXIP (ENSMFAG00000030662) BCL7A (ENSMFAG00000045274) ENSMFAG00000043535 ##22 CFAP251 (ENSMFAG00000025564) PSMD9 (ENSMFAG00000037177) HPD (ENSMFAG00000046346) ENSMFAG00000059943 RHOF (ENSMFAG00000032227) TMEM120B (ENSMFAG00000003634) MORN3 (ENSMFAG00000045300) ORAI1 (ENSMFAG00000036297) ENSMFAG00000055002 ENSMFAG00000058549 ENSMFAG00000047469 ENSMFAG00000037613 RNF34 (ENSMFAG00000037026) ANAPC5 (ENSMFAG00000038352) CAMKK2 (ENSMFAG00000045272) Crab-eating macaque MODERN SPECIES 19 FRA10AC1 (ENSMFAG00000045302) LGI1 (ENSMFAG00000037131) SLC35G1 (ENSMFAG00000039807) PLCE1 (ENSMFAG00000020572) NOC3L (ENSMFAG00000032429) HELLS (ENSMFAG00000044053) CYP2C18 (ENSMFAG00000058429) H2AZ1 (ENSMFAG00000001222) CYP2C9 (ENSMFAG00000005983) CYP2C8 (ENSMFAG00000034299) ENSMFAG00000041843 CYP2C93 (ENSMFAG00000032581) ENSMFAG00000055400 PDLIM1 (ENSMFAG00000030298) SORBS1 (ENSMFAG00000030641) ENSMFAG00000050945 ##22 ALDH18A1 (ENSMFAG00000001272) TCTN3 (ENSMFAG00000001575) CC2D2B (ENSMFAG00000038060) ENSMFAG00000045985 CCNJ (ENSMFAG00000037933) BLNK (ENSMFAG00000043139) DNTT (ENSMFAG00000034600) OPALIN (ENSMFAG00000043114) TLL2 (ENSMFAG00000002794) TM9SF3 (ENSMFAG00000002926) PIK3AP1 (ENSMFAG00000046259) ENSMFAG00000050833 ENSMFAG00000060072 LCOR (ENSMFAG00000039632) SLIT1 (ENSMFAG00000045033) Hominoidea DUPLICATION Hominoidea DUPLICATION Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.x.a ##22 Gibbon MODERN SPECIES ENSNLEG00000005835 NTN4 (ENSNLEG00000005820) USP44 (ENSNLEG00000005816) METAP2 (ENSNLEG00000005813) VEZT (ENSNLEG00000005798) ENSNLEG00000032922 ENSNLEG00000032302 FGD6 (ENSNLEG00000005781) ENSNLEG00000032465 NR2C1 (ENSNLEG00000005775) NDUFA12 (ENSNLEG00000005766) TMCC3 (ENSNLEG00000005764) ENSNLEG00000005763 CEP83 (ENSNLEG00000005742) PLXNC1 (ENSNLEG00000005722) ENSNLEG00000034769 ##22 ENSNLEG00000030035 CRADD (ENSNLEG00000005714) SOCS2 (ENSNLEG00000005710) MRPL42 (ENSNLEG00000005699) ENSNLEG00000005695 ENSNLEG00000005674 EEA1 (ENSNLEG00000005649) ENSNLEG00000029636 ENSNLEG00000005642 ENSNLEG00000005638 ENSNLEG00000005634 ENSNLEG00000005637 BTG1 (ENSNLEG00000029316) DCN (ENSNLEG00000005597) LUM (ENSNLEG00000005594) Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES 22 ENSGT00950000183254 ENSGT00940000158701 ENSGT00390000011891 ENSGT00940000156677 ENSGT00940000161523 ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00940000162599 ENSGT01050000244866.A.a.b.b ENSGT00390000003582.e.d.a ENSGT01050000244866.A.a.b.a ENSGT01050000244866.A.b ENSGT00390000018016.c ENSGT00900000141074.e.a.b.b.b.a ENSGT00390000016216 ENSGT00440000038181.eb.a.b ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 ENSGT00950000183075.a.a.a.b ENSGT00900000141074.e.a.b.b.b.b ENSGT00940000160367 ENSGT00390000000491 ENSGT00940000155342.l ENSGT00940000164290 ENSGT00390000004927 ENSGT00940000157393 ENSGT00950000182843.a.a.a.a ENSGT00940000157336 ENSGT00940000156092 ENSGT00940000159230 ENSGT00940000159481 ENSGT00530000063596.B ENSGT01030000234606.a.a.a.a Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES 21 ENSGT00950000183254 ENSGT00940000158701 ENSGT00390000011891 ENSGT00940000156677 ENSGT00940000161523 ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00940000162599 ENSGT01050000244866.A.a.b.b ENSGT00390000003582.e.d.a ENSGT01050000244866.A.a.b.a ENSGT01050000244866.A.b ENSGT00390000018016.c ENSGT00900000141074.e.a.b.b.b.a ENSGT00390000016216 ENSGT00440000038181.eb.a.b ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 ENSGT00950000183075.a.a.a.b ENSGT00940000160367 ENSGT00390000000491 ENSGT00940000155342.l ENSGT00940000164290 ENSGT00390000004927 ENSGT00940000157393 ENSGT00950000182843.a.a.a.a ENSGT00940000157336 ENSGT00940000156092 ENSGT00940000159230 ENSGT00940000159481 ENSGT00530000063596.B ENSGT01030000234606.a.a.a.a ENSGT01030000234606.a.a.a.b.a.a Pan ANCESTRAL SPECIES 20 ENSGT00390000009048.a.a.c ENSGT00940000158701 ENSGT00390000011891 ENSGT00940000156677 ENSGT00940000161523 ENSGT00950000183113.b.a ENSGT00940000162599 ENSGT01050000244866.A.a.b.b ENSGT00390000003582.e.d.a ENSGT01050000244866.A.a.b.a ENSGT01050000244866.A.b ENSGT00390000018016.c ENSGT00900000141074.e.a.b.b.b.a ENSGT00390000016216 ENSGT00440000038181.eb.a.b ENSGT00390000018433.s.a.a.x.b ##22 ENSGT00950000183075.a.a.a.b ENSGT00940000160367 ENSGT00390000000491 ENSGT00940000155342.l ENSGT00940000164290 ENSGT00390000004927 ENSGT00940000157393 ENSGT00950000182843.a.a.a.a ENSGT00940000157336 ENSGT00940000156092 ENSGT00940000159230 ENSGT00940000159481 ENSGT00530000063596.B ENSGT01030000234606.a.a.a.a ENSGT01030000234606.a.a.a.b.a.a Chimpanzee MODERN SPECIES 6 ENSPTRG00000006998 ENSPTRG00000052429 PPIP5K1 (ENSPTRG00000022996) MAP1A (ENSPTRG00000006995) TP53BP1 (ENSPTRG00000006994) TUBGCP4 (ENSPTRG00000006993) ZSCAN29 (ENSPTRG00000006992) ADAL (ENSPTRG00000006991) TGM7 (ENSPTRG00000006990) ENSPTRG00000052524 TGM5 (ENSPTRG00000006989) EPB42 (ENSPTRG00000006988) CCNDBP1 (ENSPTRG00000006987) TMEM62 (ENSPTRG00000006986) ENSPTRG00000044632 ENSPTRG00000052090 ##22 UBR1 (ENSPTRG00000006985) TTBK2 (ENSPTRG00000006982) CDAN1 (ENSPTRG00000006981) ENSPTRG00000048274 STARD9 (ENSPTRG00000006980) HAUS2 (ENSPTRG00000006977) LRRC57 (ENSPTRG00000006976) SNAP23 (ENSPTRG00000006975) ZNF106 (ENSPTRG00000006974) CAPN3 (ENSPTRG00000034200) GANC (ENSPTRG00000006973) TMEM87A (ENSPTRG00000006972) VPS39 (ENSPTRG00000006971) PLA2G4F (ENSPTRG00000006970) PLA2G4D (ENSPTRG00000006969) Gorilla MODERN SPECIES 6 ENSGGOG00000004651 ENSGGOG00000039820 MAP1A (ENSGGOG00000004634) TP53BP1 (ENSGGOG00000002588) TUBGCP4 (ENSGGOG00000002882) ZSCAN29 (ENSGGOG00000002879) ADAL (ENSGGOG00000015145) TGM7 (ENSGGOG00000007605) TGM5 (ENSGGOG00000006555) EPB42 (ENSGGOG00000006553) ENSGGOG00000006546 CCNDBP1 (ENSGGOG00000028557) ENSGGOG00000036568 TMEM62 (ENSGGOG00000006542) ENSGGOG00000038492 RPS3A (ENSGGOG00000022640) ##22 ENSGGOG00000009724 ENSGGOG00000041967 ENSGGOG00000014329 CDAN1 (ENSGGOG00000014297) ENSGGOG00000041553 STARD9 (ENSGGOG00000006926) HAUS2 (ENSGGOG00000036248) LRRC57 (ENSGGOG00000009597) SNAP23 (ENSGGOG00000015801) ZNF106 (ENSGGOG00000007774) CAPN3 (ENSGGOG00000012597) GANC (ENSGGOG00000010835) TMEM87A (ENSGGOG00000000376) VPS39 (ENSGGOG00000000372) PLA2G4F (ENSGGOG00000000369) Gibbon MODERN SPECIES 449 ATRX (ENSNLEG00000001144) MAGT1 (ENSNLEG00000001330) ATP7A (ENSNLEG00000001351) ENSNLEG00000001423 TAF9B (ENSNLEG00000001378) CYSLTR1 (ENSNLEG00000002067) ENSNLEG00000002074 LPAR4 (ENSNLEG00000019046) P2RY10 (ENSNLEG00000002088) ENSNLEG00000034148 GPR174 (ENSNLEG00000019047) TBX22 (ENSNLEG00000002116) ENSNLEG00000029546 BRWD3 (ENSNLEG00000002210) ENSNLEG00000034470 ENSNLEG00000034864 ##22 HMGN5 (ENSNLEG00000034708) SH3BGRL (ENSNLEG00000002464) ENSNLEG00000028823 ENSNLEG00000032492 CYLC1 (ENSNLEG00000002527) RPS6KA6 (ENSNLEG00000002544) HDX (ENSNLEG00000002624) APOOL (ENSNLEG00000002634) ZNF711 (ENSNLEG00000002656) POF1B (ENSNLEG00000002694) ENSNLEG00000032608 CHM (ENSNLEG00000002762) ENSNLEG00000027890 DACH2 (ENSNLEG00000002793) ENSNLEG00000002822 Hominoidea ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y ##22 Hominidae ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y ##22 Homo/Pan/Gorilla group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y ##22 Homo/Pan group ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y ##22 Pan ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a.y ##22 Chimpanzee MODERN SPECIES 18 ANKRD34B (ENSPTRG00000049125) FAM151B (ENSPTRG00000017039) ENSPTRG00000051397 ZFYVE16 (ENSPTRG00000017038) ENSPTRG00000040617 ENSPTRG00000042769 SERINC5 (ENSPTRG00000017032) THBS4 (ENSPTRG00000017031) MTX3 (ENSPTRG00000051488) ENSPTRG00000039087 CMYA5 (ENSPTRG00000023686) TENT2 (ENSPTRG00000017028) HOMER1 (ENSPTRG00000017026) ENSPTRG00000048128 JMY (ENSPTRG00000017025) ENSPTRG00000043319 ##22 BHMT2 (ENSPTRG00000017022) DMGDH (ENSPTRG00000017020) ARSB (ENSPTRG00000017019) LHFPL2 (ENSPTRG00000045309) SCAMP1 (ENSPTRG00000047664) AP3B1 (ENSPTRG00000017015) TBCA (ENSPTRG00000017013) OTP (ENSPTRG00000017012) ENSPTRG00000023613 WDR41 (ENSPTRG00000017011) PDE8B (ENSPTRG00000017010) ENSPTRG00000042930 ENSPTRG00000046179 ZBED3 (ENSPTRG00000050050) AGGF1 (ENSPTRG00000017008) Gorilla MODERN SPECIES 1 DYDC1 (ENSGGOG00000002717) DYDC2 (ENSGGOG00000003755) PRXL2A (ENSGGOG00000013246) TSPAN14 (ENSGGOG00000005770) ENSGGOG00000006297 ENSGGOG00000024160 ENSGGOG00000036412 NRG3 (ENSGGOG00000011517) GHITM (ENSGGOG00000011008) C10orf99 (ENSGGOG00000012510) CDHR1 (ENSGGOG00000012764) LRIT2 (ENSGGOG00000012781) LRIT1 (ENSGGOG00000012795) RGR (ENSGGOG00000012798) CCSER2 (ENSGGOG00000003034) RPS3A (ENSGGOG00000027203) ##22 GRID1 (ENSGGOG00000012289) ENSGGOG00000038056 WAPL (ENSGGOG00000015781) OPN4 (ENSGGOG00000013063) LDB3 (ENSGGOG00000013070) BMPR1A (ENSGGOG00000003720) MMRN2 (ENSGGOG00000009082) ENSGGOG00000009093 ADIRF (ENSGGOG00000024607) ENSGGOG00000042297 ENSGGOG00000036535 ENSGGOG00000015764 GLUD1 (ENSGGOG00000015770) ENSGGOG00000043476 ENSGGOG00000042516 Tarsier DUPLICATION Tarsier MODERN SPECIES 4445 ENSTSYG00000035467 ##22 GALNTL6 (ENSTSYG00000033426) Tarsier MODERN SPECIES 3899 ENSTSYG00000033581 ##22 Atlantogenata ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Afrotheria ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Afrotheria_a ANCESTRAL SPECIES ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 Elephant DUPLICATION Elephant MODERN SPECIES 325 RAB4A (ENSLAFG00000000757) CCSAP (ENSLAFG00000003975) ACTA1 (ENSLAFG00000006306) NUP133 (ENSLAFG00000006310) ABCB10 (ENSLAFG00000006318) TAF5L (ENSLAFG00000012480) URB2 (ENSLAFG00000012484) FASLG (ENSLAFG00000013064) SUCO (ENSLAFG00000016383) PIGC (ENSLAFG00000026118) DNM3 (ENSLAFG00000013295) METTL13 (ENSLAFG00000008601) VAMP4 (ENSLAFG00000004038) MYOC (ENSLAFG00000017243) PRRC2C (ENSLAFG00000017227) ENSLAFG00000031524 ##22 FMO4 (ENSLAFG00000005836) FMO1 (ENSLAFG00000022265) FMO2 (ENSLAFG00000016530) ENSLAFG00000009092 MROH9 (ENSLAFG00000006740) PRRX1 (ENSLAFG00000007385) GORAB (ENSLAFG00000029502) NTMT2 (ENSLAFG00000001800) KIFAP3 (ENSLAFG00000018434) SCYL3 (ENSLAFG00000018090) C1orf112 (ENSLAFG00000014427) METTL18 (ENSLAFG00000014426) SELE (ENSLAFG00000007166) SELL (ENSLAFG00000007162) SELP (ENSLAFG00000014536) Elephant MODERN SPECIES 388 SAMD7 (ENSLAFG00000006504) SEC62 (ENSLAFG00000006508) PHC3 (ENSLAFG00000013315) PRKCI (ENSLAFG00000004925) SKIL (ENSLAFG00000023277) CLDN11 (ENSLAFG00000011475) SLC7A14 (ENSLAFG00000006924) RPL22L1 (ENSLAFG00000013220) EIF5A2 (ENSLAFG00000013225) SLC2A2 (ENSLAFG00000012114) TNIK (ENSLAFG00000017445) PLD1 (ENSLAFG00000000014) FNDC3B (ENSLAFG00000017259) GHSR (ENSLAFG00000017284) TNFSF10 (ENSLAFG00000014313) ENSLAFG00000026187 ##22 NCEH1 (ENSLAFG00000010083) ECT2 (ENSLAFG00000007798) SPATA16 (ENSLAFG00000009211) ENSLAFG00000025798 NLGN1 (ENSLAFG00000010162) TBL1XR1 (ENSLAFG00000021750) KCNMB2 (ENSLAFG00000004923) ZMAT3 (ENSLAFG00000000897) PIK3CA (ENSLAFG00000003071) KCNMB3 (ENSLAFG00000003072) ZNF639 (ENSLAFG00000001733) Tenrec DUPLICATION Tenrec MODERN SPECIES 18511 ENSETEG00000009996 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 4083 ENSETEG00000017902 ##22 Tenrec MODERN SPECIES 8851 TOP3A (ENSETEG00000004392) ENSETEG00000004398 ##22 SMCR8 (ENSETEG00000004404) SHMT1 (ENSETEG00000004407) Xenarthra ANCESTRAL SPECIES 348 ENSGT00940000154895.a.a #17 ENSGT01050000244827.C.c.a.a #19 ENSGT00940000154778 #18 ENSGT00390000018433.s.b ##22 ENSGT00390000018433.s.a.a ##22 ENSGT00940000155694 #23 ENSGT00940000160791.A #24 ENSGT00950000182936.a.a.b #25 ENSGT00390000016644 #26 ENSGT00940000154986 #27 ENSGT00390000016183 #28 ENSGT00940000160195.b.b #29 Sloth MODERN SPECIES 3735 ENSCHOG00000007238 ##22 SH3D19 (ENSCHOG00000007244) #23 Armadillo DUPLICATION Armadillo MODERN SPECIES 2027 ENSDNOG00000043976 RC3H2 (ENSDNOG00000014557) ZBTB6 (ENSDNOG00000014591) ZBTB26 (ENSDNOG00000045813) ENSDNOG00000037259 RABGAP1 (ENSDNOG00000013366) STRBP (ENSDNOG00000043330) CRB2 (ENSDNOG00000038587) DENND1A (ENSDNOG00000034926) ENSDNOG00000045998 LHX2 (ENSDNOG00000000465) NEK6 (ENSDNOG00000015320) PSMB7 (ENSDNOG00000015332) ADGRD2 (ENSDNOG00000015410) NR5A1 (ENSDNOG00000040922) ENSDNOG00000032252 ##22 NR6A1 (ENSDNOG00000017832) ENSDNOG00000033680 OLFML2A (ENSDNOG00000040474) WDR38 (ENSDNOG00000046480) ENSDNOG00000033968 GOLGA1 (ENSDNOG00000000005) SCAI (ENSDNOG00000000007) PPP6C (ENSDNOG00000045474) RABEPK (ENSDNOG00000015327) HSPA5 (ENSDNOG00000031601) GAPVD1 (ENSDNOG00000009683) MAPKAP1 (ENSDNOG00000038808) PBX3 (ENSDNOG00000043756) Armadillo MODERN SPECIES 1097 SPHKAP (ENSDNOG00000013373) DAW1 (ENSDNOG00000001360) CCL20 (ENSDNOG00000039621) ENSDNOG00000031125 ENSDNOG00000036199 ENSDNOG00000039100 ENSDNOG00000034281 ##22 AGFG1 (ENSDNOG00000016360) TM4SF20 (ENSDNOG00000008559) ENSDNOG00000008541 COL4A3 (ENSDNOG00000014502) COL4A4 (ENSDNOG00000000093) RHBDD1 (ENSDNOG00000039149) IRS1 (ENSDNOG00000031407) ENSDNOG00000035388